SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_013431069.1 NCBI__GCF_000166775.1:WP_013431069.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3r6vG Crystal structure of aspartase from bacillus sp. Ym55-1 with bound l- aspartate (see paper)
50% identity, 99% coverage: 3:457/461 of query aligns to 3:457/463 of 3r6vG

query
sites
3r6vG
R
 
R
I
 
I
E
 
E
K
 
K
D
 
D
F
 
F
L
 
L
G
 
G
S
 
E
I
 
K
E
 
E
L
 
I
S
 
P
D
 
K
I
 
D
E
 
A
L
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
I
 
V
H
 
Q
T
 
T
K
 
I
R
 
R
A
 
A
F
 
T
A
 
E
N
 
N
F
 
F
N
 
P
V
 
I
S
 
T
G
 
G
K
 
Y
S
 
R
V
 
I
D
 
H
K
 
P
D
 
E
L
 
L
I
 
I
K
 
K
A
 
S
F
 
L
V
 
G
M
 
I
V
 
V
K
 
K
K
 
K
A
 
S
C
 
A
A
 
A
I
 
L
A
 
A
N
 
N
Y
 
M
E
 
E
V
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
K
K
 
E
I
 
V
K
 
G
D
 
Q
A
 
Y
I
 
I
V
 
V
F
 
K
A
 
A
C
 
A
D
 
D
E
 
E
I
 
V
L
 
I
A
 
E
G
 
G
K
 
K
Y
 
W
D
 
N
D
 
D
Q
 
Q
F
 
F
I
 
I
V
 
V
D
 
D
R
 
P
F
 
I
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
 
G
T
 
T
S
 
S
T
 
I
N
 
N
M
 
M
N
 
N
V
 
A
N
 
N
E
 
E
V
 
V
I
 
I
A
 
A
N
 
N
V
 
R
A
 
A
L
 
L
T
 
E
H
 
L
I
 
M
G
 
G
R
 
E
K
 
E
P
 
K
G
 
G
E
 
N
Y
 
Y
D
 
S
I
 
K
I
 
I
H
 
S
P
 
P
I
 
N
N
 
S
H
 
H
V
 
V
N
 
N
M
 
M
S
 
S
Q
 
Q
S
 
S
T
 
T
N
 
N
D
 
D
V
 
A
Y
 
F
P
 
P
T
 
T
A
 
A
L
 
T
R
 
H
I
 
I
A
 
A
T
 
V
I
 
L
W
 
S
N
 
L
V
 
L
R
 
N
E
 
Q
L
 
L
S
 
I
E
 
E
E
 
T
C
 
T
A
 
K
E
 
Y
L
 
M
Q
 
Q
K
 
Q
S
 
E
L
 
F
Q
 
M
K
 
K
K
 
K
E
 
A
H
 
D
E
 
E
F
 
F
E
 
A
D
 
G
V
 
V
I
 
I
K
 
K
A
 
M
G
 
G
R
 
R
T
 
T
Q
x
H
L
 
L
Q
 
Q
D
 
D
A
 
A
L
 
V
P
 
P
V
 
I
T
 
L
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
E
 
E
F
 
F
G
 
E
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
Q
 
R
A
 
V
I
 
I
S
 
A
R
 
R
D
 
D
R
 
I
W
 
E
R
 
R
L
 
I
Y
 
A
K
 
N
V
 
T
E
 
R
E
 
N
R
 
N
L
 
L
R
 
Y
V
 
D
V
 
I
N
 
N
L
 
M
G
 
G
A
 
A
T
 
T
A
 
A
V
 
V
G
 
G
T
 
T
G
 
G
V
 
L
N
 
N
A
 
A
P
 
D
L
 
P
K
 
E
Y
 
Y
I
 
I
F
 
S
K
 
I
V
 
V
I
 
T
E
 
E
I
 
H
L
 
L
R
 
A
N
 
K
L
 
F
T
 
S
K
 
G
I
 
H
G
 
P
L
 
L
A
 
R
R
 
S
S
 
A
D
 
Q
Y
 
H
L
 
L
M
 
V
D
 
D
A
 
A
T
 
T
Q
 
Q
N
 
N
A
 
T
D
 
D
V
 
C
F
 
Y
V
 
T
E
 
E
C
 
V
S
 
S
G
 
S
L
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
V
L
 
C
A
 
M
V
 
I
N
 
N
L
 
M
S
 
S
K
 
K
I
 
I
A
 
A
N
 
N
D
 
D
L
 
L
R
 
R
L
 
L
L
 
M
S
 
A
S
 
S
G
 
G
P
 
P
N
 
R
T
 
A
G
 
G
L
 
L
N
 
S
E
 
E
I
 
I
N
 
V
M
 
L
P
 
P
A
 
A
V
 
R
Q
 
Q
A
 
P
G
|
G
S
|
S
S
|
S
I
 
I
M
 
M
P
 
P
G
 
G
K
|
K
V
 
V
N
 
N
P
 
P
V
 
V
I
 
M
P
 
P
E
|
E
L
 
V
I
 
M
N
 
N
T
 
Q
V
 
V
A
 
A
F
 
F
Q
 
Q
V
 
V
M
 
F
A
 
G
N
 
N
D
 
D
F
 
L
A
 
T
I
 
I
T
 
T
L
 
S
A
 
A
A
 
S
Q
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
L
 
F
E
 
E
L
 
L
N
 
N
A
 
V
F
 
M
L
 
E
P
 
P
L
 
V
I
 
L
A
 
F
N
 
F
N
 
N
L
 
L
L
 
I
E
 
Q
S
 
S
L
 
I
K
 
S
I
 
I
L
 
M
K
 
T
N
 
N
G
 
V
I
 
F
K
 
K
I
 
S
F
 
F
R
 
T
Q
 
E
Q
 
N
C
 
C
I
 
L
D
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
K
A
 
A
N
 
N
K
 
E
E
 
E
K
 
R
C
 
M
L
 
K
E
 
E
Y
 
Y
A
 
V
K
 
E
K
 
K
T
 
S
P
 
I
A
 
G
I
 
I
A
 
I
A
 
T
S
 
A
L
 
I
I
 
N
D
 
P
R
 
H
I
 
V
G
 
G
Y
 
Y
D
 
E
K
 
T
A
 
A
A
 
A
E
 
K
I
 
L
A
 
A
K
 
R
K
 
E
A
 
A
I
 
Y
L
 
L
E
 
T
N
 
G
K
 
E
Q
 
S
I
 
I
I
 
R
D
 
E
V
 
L
V
 
C
K
 
I
E
 
K
L
 
Y
N
 
G
I
 
V
M
 
L
D
 
T
E
 
E
K
 
E
E
 
Q
A
 
L
Q
 
N
E
 
E
L
 
I
L
 
L
N
 
N
P
 
P
F
 
Y
E
 
E
F
 
M
I
 
I

3r6qA A triclinic-lattice structure of aspartase from bacillus sp. Ym55-1 (see paper)
50% identity, 99% coverage: 3:457/461 of query aligns to 2:456/462 of 3r6qA

query
sites
3r6qA
R
 
R
I
 
I
E
 
E
K
 
K
D
 
D
F
 
F
L
 
L
G
 
G
S
 
E
I
 
K
E
 
E
L
 
I
S
 
P
D
 
K
I
 
D
E
 
A
L
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
I
 
V
H
 
Q
T
 
T
K
 
I
R
 
R
A
 
A
F
 
T
A
 
E
N
 
N
F
 
F
N
 
P
V
 
I
S
 
T
G
 
G
K
 
Y
S
 
R
V
 
I
D
 
H
K
 
P
D
 
E
L
 
L
I
 
I
K
 
K
A
 
S
F
 
L
V
 
G
M
 
I
V
 
V
K
 
K
K
 
K
A
 
S
C
 
A
A
 
A
I
 
L
A
 
A
N
 
N
Y
 
M
E
 
E
V
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
K
K
 
E
I
 
V
K
 
G
D
 
Q
A
 
Y
I
 
I
V
 
V
F
 
K
A
 
A
C
 
A
D
 
D
E
 
E
I
 
V
L
 
I
A
 
E
G
 
G
K
 
K
Y
 
W
D
 
N
D
 
D
Q
 
Q
F
 
F
I
 
I
V
 
V
D
 
D
R
 
P
F
 
I
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
 
G
T
 
T
S
 
S
T
 
I
N
 
N
M
 
M
N
 
N
V
 
A
N
 
N
E
 
E
V
 
V
I
 
I
A
 
A
N
 
N
V
 
R
A
 
A
L
 
L
T
 
E
H
 
L
I
 
M
G
 
G
R
 
E
K
 
E
P
 
K
G
 
G
E
 
N
Y
 
Y
D
 
S
I
 
K
I
 
I
H
 
S
P
 
P
I
 
N
N
 
S
H
 
H
V
 
V
N
 
N
M
 
M
S
 
S
Q
 
Q
S
 
S
T
 
T
N
 
N
D
 
D
V
 
A
Y
 
F
P
 
P
T
 
T
A
 
A
L
 
T
R
 
H
I
 
I
A
 
A
T
 
V
I
 
L
W
 
S
N
 
L
V
 
L
R
 
N
E
 
Q
L
 
L
S
 
I
E
 
E
E
 
T
C
 
T
A
 
K
E
 
Y
L
 
M
Q
 
Q
K
 
Q
S
 
E
L
 
F
Q
 
M
K
 
K
K
 
K
E
 
A
H
 
D
E
 
E
F
 
F
E
 
A
D
 
G
V
 
V
I
 
I
K
 
K
A
 
M
G
 
G
R
 
R
T
 
T
Q
x
H
L
 
L
Q
 
Q
D
 
D
A
 
A
L
 
V
P
 
P
V
 
I
T
 
L
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
E
 
E
F
 
F
G
 
E
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
Q
 
R
A
 
V
I
 
I
S
 
A
R
 
R
D
 
D
R
 
I
W
 
E
R
 
R
L
 
I
Y
 
A
K
 
N
V
 
T
E
 
R
E
 
N
R
 
N
L
 
L
R
 
Y
V
 
D
V
 
I
N
 
N
L
 
M
G
 
G
A
 
A
T
 
T
A
 
A
V
 
V
G
 
G
T
 
T
G
 
G
V
 
L
N
 
N
A
 
A
P
 
D
L
 
P
K
 
E
Y
 
Y
I
 
I
F
 
S
K
 
I
V
 
V
I
 
T
E
 
E
I
 
H
L
 
L
R
 
A
N
 
K
L
 
F
T
 
S
K
 
G
I
 
H
G
 
P
L
 
L
A
 
R
R
 
S
S
 
A
D
 
Q
Y
 
H
L
 
L
M
 
V
D
 
D
A
 
A
T
 
T
Q
 
Q
N
 
N
A
 
T
D
 
D
V
 
C
F
 
Y
V
 
T
E
 
E
C
 
V
S
 
S
G
 
S
L
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
V
L
 
C
A
 
M
V
 
I
N
 
N
L
 
M
S
 
S
K
 
K
I
 
I
A
 
A
N
 
N
D
 
D
L
 
L
R
 
R
L
 
L
L
 
M
S
 
A
S
 
S
G
 
G
P
 
P
N
 
R
T
 
A
G
 
G
L
 
L
N
 
S
E
 
E
I
 
I
N
 
V
M
 
L
P
 
P
A
 
A
V
 
R
Q
 
Q
A
 
P
G
 
G
S
|
S
S
 
S
I
 
I
M
 
M
P
 
P
G
 
G
K
|
K
V
 
V
N
 
N
P
 
P
V
 
V
I
 
M
P
 
P
E
|
E
L
 
V
I
 
M
N
 
N
T
 
Q
V
 
V
A
 
A
F
 
F
Q
 
Q
V
 
V
M
 
F
A
 
G
N
 
N
D
 
D
F
 
L
A
 
T
I
 
I
T
 
T
L
 
S
A
 
A
A
 
S
Q
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
L
 
F
E
 
E
L
 
L
N
 
N
A
 
V
F
 
M
L
 
E
P
 
P
L
 
V
I
 
L
A
 
F
N
 
F
N
 
N
L
 
L
L
 
I
E
 
Q
S
 
S
L
 
I
K
 
S
I
 
I
L
 
M
K
 
T
N
 
N
G
 
V
I
 
F
K
 
K
I
 
S
F
 
F
R
 
T
Q
 
E
Q
 
N
C
 
C
I
 
L
D
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
K
A
|
A
N
 
N
K
x
E
E
 
E
K
 
R
C
 
M
L
 
K
E
 
E
Y
 
Y
A
 
V
K
 
E
K
 
K
T
 
S
P
 
I
A
 
G
I
 
I
A
 
I
A
 
T
S
 
A
L
 
I
I
 
N
D
 
P
R
 
H
I
 
V
G
 
G
Y
 
Y
D
 
E
K
 
T
A
 
A
A
 
A
E
 
K
I
 
L
A
 
A
K
 
R
K
 
E
A
 
A
I
 
Y
L
 
L
E
 
T
N
 
G
K
 
E
Q
 
S
I
 
I
I
 
R
D
 
E
V
 
L
V
 
C
K
 
I
E
 
K
L
 
Y
N
 
G
I
 
V
M
 
L
D
 
T
E
 
E
K
 
E
E
 
Q
A
 
L
Q
 
N
E
 
E
L
 
I
L
 
L
N
 
N
P
 
P
F
 
Y
E
 
E
F
 
M
I
 
I

Q9LCC6 Aspartate ammonia-lyase; Aspartase; EC 4.3.1.1 from Bacillus sp. (see 3 papers)
50% identity, 98% coverage: 3:456/461 of query aligns to 6:459/468 of Q9LCC6

query
sites
Q9LCC6
R
 
R
I
 
I
E
 
E
K
 
K
D
 
D
F
 
F
L
 
L
G
 
G
S
 
E
I
 
K
E
 
E
L
 
I
S
 
P
D
 
K
I
 
D
E
 
A
L
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
I
 
V
H
 
Q
T
 
T
K
 
I
R
 
R
A
 
A
F
 
T
A
 
E
N
 
N
F
 
F
N
 
P
V
 
I
S
 
T
G
 
G
K
 
Y
S
 
R
V
 
I
D
 
H
K
 
P
D
 
E
L
 
L
I
 
I
K
 
K
A
 
S
F
 
L
V
 
G
M
 
I
V
 
V
K
 
K
K
 
K
A
 
S
C
 
A
A
 
A
I
 
L
A
 
A
N
 
N
Y
 
M
E
 
E
V
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
K
K
 
E
I
 
V
K
 
G
D
 
Q
A
 
Y
I
 
I
V
 
V
F
 
K
A
 
A
C
 
A
D
 
D
E
 
E
I
 
V
L
 
I
A
 
E
G
 
G
K
 
K
Y
 
W
D
 
N
D
 
D
Q
 
Q
F
 
F
I
 
I
V
 
V
D
 
D
R
 
P
F
 
I
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
 
G
T
|
T
S
 
S
T
 
I
N
 
N
M
 
M
N
 
N
V
 
A
N
 
N
E
 
E
V
 
V
I
 
I
A
 
A
N
 
N
V
 
R
A
 
A
L
 
L
T
 
E
H
 
L
I
 
M
G
 
G
R
 
E
K
 
E
P
 
K
G
 
G
E
 
N
Y
 
Y
D
 
S
I
 
K
I
 
I
H
 
S
P
 
P
I
 
N
N
 
S
H
|
H
V
 
V
N
 
N
M
 
M
S
 
S
Q
 
Q
S
|
S
T
|
T
N
|
N
D
 
D
V
 
A
Y
 
F
P
 
P
T
 
T
A
 
A
L
 
T
R
 
H
I
 
I
A
 
A
T
 
V
I
 
L
W
 
S
N
 
L
V
 
L
R
 
N
E
 
Q
L
 
L
S
 
I
E
 
E
E
 
T
C
 
T
A
 
K
E
 
Y
L
 
M
Q
 
Q
K
 
Q
S
 
E
L
 
F
Q
 
M
K
 
K
K
 
K
E
 
A
H
 
D
E
 
E
F
 
F
E
 
A
D
 
G
V
 
V
I
 
I
K
|
K
A
 
M
G
 
G
R
 
R
T
|
T
Q
x
H
L
 
L
Q
 
Q
D
 
D
A
 
A
L
 
V
P
 
P
V
 
I
T
 
L
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
E
 
E
F
 
F
G
 
E
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
Q
 
R
A
 
V
I
 
I
S
 
A
R
 
R
D
 
D
R
 
I
W
 
E
R
 
R
L
 
I
Y
 
A
K
 
N
V
 
T
E
 
R
E
 
N
R
 
N
L
 
L
R
 
Y
V
 
D
V
 
I
N
 
N
L
 
M
G
 
G
A
 
A
T
 
T
A
 
A
V
 
V
G
 
G
T
 
T
G
 
G
V
 
L
N
 
N
A
 
A
P
 
D
L
 
P
K
 
E
Y
 
Y
I
 
I
F
 
S
K
 
I
V
 
V
I
 
T
E
 
E
I
 
H
L
 
L
R
 
A
N
 
K
L
 
F
T
 
S
K
 
G
I
 
H
G
 
P
L
 
L
A
 
R
R
 
S
S
 
A
D
 
Q
Y
 
H
L
 
L
M
 
V
D
 
D
A
 
A
T
 
T
Q
 
Q
N
 
N
A
 
T
D
 
D
V
 
C
F
 
Y
V
 
T
E
 
E
C
 
V
S
 
S
G
 
S
L
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
V
L
 
C
A
 
M
V
 
I
N
 
N
L
 
M
S
 
S
K
 
K
I
 
I
A
 
A
N
 
N
D
 
D
L
 
L
R
 
R
L
 
L
L
 
M
S
 
A
S
 
S
G
 
G
P
 
P
N
 
R
T
 
A
G
 
G
L
 
L
N
 
S
E
 
E
I
 
I
N
 
V
M
 
L
P
 
P
A
 
A
V
 
R
Q
 
Q
A
 
P
G
 
G
S
|
S
S
|
S
I
|
I
M
|
M
P
|
P
G
 
G
K
|
K
V
 
V
N
|
N
P
 
P
V
 
V
I
 
M
P
 
P
E
 
E
L
 
V
I
 
M
N
 
N
T
 
Q
V
 
V
A
 
A
F
 
F
Q
 
Q
V
 
V
M
 
F
A
 
G
N
 
N
D
 
D
F
 
L
A
 
T
I
 
I
T
 
T
L
 
S
A
 
A
A
 
S
Q
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
L
 
F
E
 
E
L
 
L
N
 
N
A
 
V
F
 
M
L
 
E
P
 
P
L
 
V
I
 
L
A
 
F
N
 
F
N
 
N
L
 
L
L
 
I
E
 
Q
S
 
S
L
 
I
K
 
S
I
 
I
L
 
M
K
 
T
N
 
N
G
 
V
I
 
F
K
 
K
I
 
S
F
 
F
R
 
T
Q
 
E
Q
 
N
C
 
C
I
 
L
D
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
K
A
 
A
N
 
N
K
 
E
E
 
E
K
 
R
C
 
M
L
 
K
E
 
E
Y
 
Y
A
 
V
K
 
E
K
 
K
T
 
S
P
 
I
A
 
G
I
 
I
A
 
I
A
 
T
S
 
A
L
 
I
I
 
N
D
 
P
R
 
H
I
 
V
G
 
G
Y
 
Y
D
 
E
K
 
T
A
 
A
A
 
A
E
 
K
I
 
L
A
 
A
K
 
R
K
 
E
A
 
A
I
 
Y
L
 
L
E
 
T
N
 
G
K
 
E
Q
 
S
I
 
I
I
 
R
D
 
E
V
 
L
V
 
C
K
 
I
E
 
K
L
 
Y
N
 
G
I
 
V
M
 
L
D
 
T
E
 
E
K
 
E
E
 
Q
A
 
L
Q
 
N
E
 
E
L
 
I
L
 
L
N
 
N
P
 
P
F
 
Y
E
 
E
F
 
M

3oceA Crystal structure of fumarate lyase:delta crystallin from brucella melitensis bound to cobalt
50% identity, 94% coverage: 1:435/461 of query aligns to 1:437/461 of 3oceA

query
sites
3oceA
M
 
M
S
 
T
R
 
R
I
 
R
E
 
E
K
 
Q
D
 
D
F
 
S
L
 
L
G
 
G
S
 
E
I
 
R
E
 
D
L
 
I
S
 
P
D
 
M
I
 
D
E
 
A
L
 
Y
Y
 
F
G
 
G
I
 
I
H
 
Q
T
 
T
K
 
L
R
 
R
A
 
A
F
 
V
A
 
E
N
 
N
F
 
F
N
 
S
V
 
L
S
 
S
G
 
D
K
 
V
S
 
A
V
 
L
D
 
N
K
 
H
-
 
I
-
 
P
D
 
A
L
 
L
I
 
V
K
 
R
A
 
A
F
 
L
V
 
A
M
 
M
V
 
V
K
 
K
K
 
K
A
 
A
C
 
A
A
 
A
I
 
T
A
 
A
N
 
N
Y
 
Y
E
 
K
V
 
L
G
 
R
L
 
Q
L
 
L
D
 
P
E
 
E
K
 
P
I
 
K
K
 
Y
D
 
A
A
 
A
I
 
I
V
 
V
F
 
A
A
 
A
C
 
C
D
 
D
E
 
D
I
 
I
L
 
I
A
 
D
G
 
G
K
 
L
Y
 
L
D
 
M
D
 
E
Q
 
Q
F
 
F
I
 
V
V
 
V
D
 
D
R
 
V
F
 
F
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
 
G
T
 
T
S
 
S
T
 
S
N
 
N
M
 
M
N
 
N
V
 
A
N
 
N
E
 
E
V
 
V
I
 
I
A
 
A
N
 
N
V
 
R
A
 
A
L
 
L
T
 
E
H
 
H
I
 
L
G
 
G
R
 
R
K
 
P
P
 
R
G
 
G
E
 
D
Y
 
Y
D
 
Q
I
 
T
I
 
I
H
 
H
P
 
P
I
 
N
N
 
D
H
 
D
V
 
V
N
 
N
M
 
M
S
 
S
Q
 
Q
S
 
S
T
 
T
N
 
N
D
 
D
V
 
V
Y
 
Y
P
 
P
T
 
T
A
 
A
L
 
V
R
 
R
I
 
L
A
 
A
T
 
L
I
 
L
W
 
L
N
 
S
V
 
Q
R
 
N
E
 
Q
L
 
V
S
 
Q
E
 
T
E
 
A
C
 
L
A
 
H
E
 
R
L
 
L
Q
 
I
K
 
A
S
 
A
L
 
F
Q
 
E
K
 
A
K
 
K
E
 
G
H
 
R
E
 
E
F
 
F
E
 
A
D
 
T
V
 
V
I
 
I
K
 
K
A
 
I
G
 
G
R
 
R
T
 
T
Q
|
Q
L
 
L
Q
 
Q
D
 
D
A
 
A
L
 
V
P
 
P
V
 
I
T
 
T
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
E
 
E
F
 
F
G
 
E
A
 
A
Y
 
F
A
 
A
Q
 
A
A
 
T
I
 
L
S
 
R
R
 
E
D
 
D
R
 
T
W
 
A
R
 
R
L
 
L
Y
 
E
K
 
E
V
 
V
E
 
A
E
 
A
R
 
L
L
 
F
R
 
R
V
 
E
V
 
V
N
 
N
L
 
L
G
 
G
A
 
G
T
 
T
A
 
A
V
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
A
P
 
S
L
 
H
K
 
A
Y
 
Y
I
 
A
F
 
E
K
 
Q
V
 
A
I
 
I
E
 
V
I
 
E
L
 
L
R
 
S
N
 
Q
L
 
I
T
 
S
K
 
G
I
 
I
G
 
E
L
 
L
A
 
K
R
 
A
S
 
T
D
 
G
Y
 
N
L
 
L
M
 
V
D
x
E
A
 
A
T
 
S
Q
 
W
N
x
D
A
 
T
D
 
G
V
 
A
F
 
F
V
 
V
E
 
T
C
 
F
S
 
S
G
 
G
L
 
I
L
 
L
K
 
R
A
 
R
L
 
I
A
 
A
V
 
V
N
 
K
L
 
L
S
 
S
K
 
K
I
 
I
A
 
A
N
 
N
D
 
D
L
 
L
R
 
R
L
 
L
L
 
L
S
 
S
S
 
S
G
 
G
P
 
P
N
 
R
T
 
S
G
 
G
L
 
L
N
 
G
E
 
E
I
 
I
N
 
R
M
 
L
P
 
P
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
A
 
P
G
 
G
S
|
S
S
 
S
I
 
I
M
 
M
P
 
P
G
 
G
K
|
K
V
 
V
N
 
N
P
 
P
V
 
V
I
 
I
P
 
P
E
|
E
L
 
S
I
 
V
N
 
N
T
 
Q
V
 
V
A
 
C
F
 
Y
Q
 
Q
V
 
V
M
 
I
A
 
G
N
 
N
D
 
D
F
 
L
A
 
T
I
 
V
T
 
T
L
 
M
A
 
A
A
 
A
Q
 
E
A
 
S
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
E
 
Q
L
 
L
N
 
N
A
 
A
F
 
F
L
 
E
P
 
P
L
 
L
I
 
I
A
 
V
N
 
Y
N
 
N
L
 
I
L
 
L
E
 
S
S
 
S
L
 
M
K
 
R
I
 
L
L
 
L
K
 
G
N
 
R
G
 
A
I
 
M
K
 
T
I
 
N
F
 
L
R
 
A
Q
 
E
Q
 
R
C
 
C
I
 
V
D
 
D
G
 
G
I
 
I
T
 
E
A
 
A
N
 
N
K
 
V
E
 
E
K
 
R
C
 
C
L
 
R
E
 
A
Y
 
G
A
 
A
K
 
E
K
 
E
T
 
S
P
 
I
A
 
S
I
 
L
A
 
A
A
 
T
S
 
A
L
 
L
I
 
V
D
 
P
R
 
V
I
 
V
G
 
G
Y
 
Y
D
 
A
K
 
R
A
 
A
A
 
A
E
 
E
I
 
I
A
 
A
K
 
K
K
 
Q
A
 
A
I
 
L
L
 
A
E
 
S
N
 
G
K
 
Q
Q
 
T
I
 
V
I
 
M
D
 
E
V
 
V

6wngA Crystal structure of an aspartate ammonia-lyase from elizabethkingia anophelis nuhp1
48% identity, 98% coverage: 3:453/461 of query aligns to 4:456/466 of 6wngA

query
sites
6wngA
R
 
R
I
 
I
E
 
E
K
 
S
D
 
D
F
 
L
L
 
I
G
 
G
S
 
E
I
 
L
E
 
K
L
 
V
S
 
P
D
 
V
I
 
N
E
 
A
L
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
I
 
V
H
 
Q
T
 
T
K
 
Q
R
 
R
A
 
A
F
 
I
A
 
D
N
 
N
F
 
F
N
 
K
V
 
I
S
 
S
G
 
N
K
 
D
-
 
H
-
 
L
S
 
S
V
 
D
D
 
H
K
 
P
D
 
E
L
 
F
I
 
I
K
 
K
A
 
A
F
 
F
V
 
A
M
 
F
V
 
V
K
 
K
K
 
K
A
 
A
C
 
A
A
 
A
I
 
Q
A
 
T
N
 
N
Y
 
F
E
 
E
V
 
L
G
 
G
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
K
 
I
I
 
I
K
 
N
D
 
K
A
 
N
I
 
I
V
 
A
F
 
T
A
 
A
C
 
C
D
 
D
E
 
E
I
 
I
L
 
I
A
 
A
G
 
G
K
 
K
Y
 
M
D
 
H
D
 
K
Q
 
E
F
 
F
I
 
P
V
 
T
D
 
D
R
 
M
F
 
I
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
 
G
T
|
T
S
 
S
T
 
M
N
 
N
M
 
M
N
 
N
V
 
A
N
 
N
E
 
E
V
 
V
I
 
I
A
 
A
N
 
N
V
 
R
A
 
A
L
 
L
T
 
E
H
 
L
I
 
M
G
 
G
R
 
H
K
 
Q
P
 
K
G
 
G
E
 
E
Y
 
Y
D
 
Q
I
 
F
I
 
C
H
 
S
P
 
P
I
 
N
N
 
D
H
 
H
V
 
V
N
 
N
M
 
L
S
 
S
Q
 
Q
S
|
S
T
|
T
N
|
N
D
 
D
V
 
A
Y
 
Y
P
 
P
T
 
T
A
 
A
L
 
I
R
 
R
I
 
I
A
 
A
T
 
-
I
 
L
W
 
Y
N
 
N
V
 
L
-
 
N
R
 
K
E
 
T
L
 
L
S
 
V
E
 
E
E
 
R
C
 
L
A
 
E
E
 
L
L
 
L
Q
 
I
K
 
Q
S
 
S
L
 
F
Q
 
R
K
 
K
K
 
K
E
 
A
H
 
D
E
 
D
F
 
L
E
 
K
D
 
D
V
 
V
I
 
I
K
 
K
A
 
M
G
 
G
R
 
R
T
|
T
Q
|
Q
L
 
L
Q
 
Q
D
 
D
A
 
A
L
 
V
P
 
P
V
 
M
T
 
T
L
 
M
G
 
G
Q
 
Q
E
 
E
F
 
F
G
 
N
A
 
A
Y
 
F
A
 
A
Q
 
N
A
 
T
I
 
L
S
 
Q
R
 
E
D
 
E
R
 
I
W
 
A
R
 
R
L
 
L
Y
 
N
K
 
T
V
 
N
E
 
A
E
 
D
R
 
L
L
 
F
R
 
L
V
 
E
V
 
T
N
 
N
L
 
M
G
 
G
A
 
A
T
 
T
A
 
A
V
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
V
 
L
N
 
N
A
 
A
P
 
H
L
 
P
K
 
D
Y
 
Y
I
 
A
F
 
V
K
 
K
V
 
C
I
 
T
E
 
E
I
 
N
L
 
L
R
 
A
N
 
K
L
 
I
T
 
S
K
 
G
I
 
A
G
 
D
L
 
V
A
 
V
R
 
L
S
 
A
D
 
S
Y
 
D
L
 
L
M
 
V
D
 
E
A
 
A
T
 
T
Q
 
P
N
 
D
A
 
T
D
 
G
V
 
A
F
 
Y
V
 
V
E
 
I
C
 
Y
S
 
S
G
 
S
L
 
A
L
 
M
K
 
K
A
 
R
L
 
M
A
 
A
V
 
V
N
 
K
L
 
L
S
 
S
K
 
K
I
 
I
A
 
C
N
 
N
D
 
D
L
 
L
R
 
R
L
 
L
L
 
L
S
 
A
S
 
S
G
 
G
P
 
P
N
 
R
T
 
A
G
 
G
L
 
L
N
 
Y
E
 
E
I
 
I
N
 
N
M
 
L
P
 
P
A
 
K
V
 
M
Q
 
Q
A
 
P
G
 
G
S
|
S
S
|
S
I
 
I
M
|
M
P
 
P
G
 
G
K
|
K
V
 
V
N
 
N
P
 
P
V
 
V
I
 
I
P
 
P
E
 
E
L
 
V
I
 
V
N
 
N
T
 
Q
V
 
V
A
 
C
F
 
F
Q
 
K
V
 
V
M
 
I
A
 
G
N
 
N
D
 
D
F
 
L
A
 
T
I
 
V
T
 
T
L
 
F
A
 
A
A
 
A
Q
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
E
 
Q
L
 
L
N
 
N
A
 
V
F
 
M
L
 
E
P
 
P
L
 
V
I
 
L
A
 
T
N
 
Q
N
 
S
L
 
I
L
 
M
E
 
E
S
 
S
L
 
I
K
 
R
I
 
F
L
 
L
K
 
K
N
 
N
G
 
A
I
 
M
K
 
D
I
 
T
F
 
L
R
 
R
Q
 
E
Q
 
K
C
 
C
I
 
I
D
 
D
G
 
G
I
 
I
T
 
T
A
 
A
N
 
N
K
 
K
E
 
E
K
 
I
C
 
C
L
 
L
E
 
N
Y
 
M
A
 
V
K
 
K
K
 
N
T
 
S
P
 
I
A
 
G
I
 
I
A
 
V
A
 
T
S
 
A
L
 
L
I
 
N
D
 
P
R
 
Y
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
D
 
K
K
 
N
A
 
S
A
 
T
E
 
K
I
 
I
A
 
A
K
 
K
K
 
E
A
 
A
I
 
L
L
 
D
E
 
T
N
 
G
K
 
K
Q
 
S
I
 
V
I
 
Y
D
 
D
V
 
L
V
 
V
K
 
L
E
 
E
L
 
H
N
 
E
I
 
L
M
 
L
D
 
S
E
 
K
K
 
E
E
 
K
A
 
L
Q
 
D
E
 
E
L
 
I
L
 
L
N
 
A
P
 
P

P0AC38 Aspartate ammonia-lyase; Aspartase; EC 4.3.1.1 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
45% identity, 98% coverage: 3:453/461 of query aligns to 6:465/478 of P0AC38

query
sites
P0AC38
R
 
R
I
 
I
E
 
E
K
 
E
D
|
D
F
 
L
L
 
L
G
 
G
S
 
T
I
x
R
E
 
E
L
 
V
S
 
P
D
 
A
I
 
D
E
 
A
L
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
I
 
V
H
|
H
T
 
T
K
 
L
R
|
R
A
 
A
F
 
I
A
 
E
N
 
N
F
 
F
N
 
Y
V
 
I
S
 
S
G
 
N
K
 
N
S
 
K
V
 
I
D
 
S
-
 
D
-
 
I
K
 
P
D
 
E
L
 
F
I
 
V
K
 
R
A
 
G
F
 
M
V
 
V
M
 
M
V
 
V
K
|
K
K
 
K
A
 
A
C
 
A
A
 
A
I
 
M
A
 
A
N
 
N
Y
 
K
E
 
E
V
 
L
G
 
Q
L
 
T
L
 
I
D
 
P
E
 
K
K
 
S
I
 
V
K
 
A
D
 
N
A
 
A
I
 
I
V
 
I
F
 
A
A
 
A
C
 
C
D
 
D
E
 
E
I
 
V
L
 
L
A
 
N
-
 
N
G
 
G
K
 
K
Y
 
C
D
 
M
D
 
D
Q
 
Q
F
 
F
I
 
P
V
 
V
D
 
D
R
 
V
F
 
Y
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
 
G
T
 
T
S
 
S
T
 
V
N
 
N
M
 
M
N
 
N
V
 
T
N
 
N
E
 
E
V
 
V
I
 
L
A
 
A
N
 
N
V
 
I
A
 
G
L
 
L
T
 
E
H
 
L
I
 
M
G
 
G
R
x
H
K
 
Q
P
 
K
G
 
G
E
 
E
Y
 
Y
D
 
Q
I
 
Y
I
 
L
H
 
N
P
 
P
I
 
N
N
 
D
H
 
H
V
 
V
N
 
N
M
 
K
S
 
C
Q
 
Q
S
|
S
T
 
T
N
 
N
D
 
D
V
 
A
Y
 
Y
P
 
P
T
 
T
A
 
G
L
 
F
R
 
R
I
 
I
A
 
A
T
 
V
I
 
Y
W
 
S
N
 
S
V
 
L
R
 
I
E
 
K
L
 
L
S
 
V
E
 
D
E
 
A
C
 
I
A
 
N
E
 
Q
L
 
L
Q
 
R
K
 
E
S
 
G
L
 
F
Q
 
E
K
 
R
K
 
K
E
 
A
H
 
V
E
 
E
F
 
F
E
 
Q
D
 
D
V
 
I
I
 
L
K
 
K
A
 
M
G
 
G
R
 
R
T
 
T
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
Q
D
 
D
A
 
A
L
 
V
P
 
P
V
 
M
T
 
T
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
E
 
E
F
 
F
G
 
R
A
 
A
Y
 
F
A
 
S
Q
 
I
A
 
L
I
 
L
S
 
K
R
 
E
D
 
E
R
 
V
W
 
K
R
 
N
L
 
I
Y
 
Q
K
 
R
V
 
T
E
 
A
E
 
E
R
 
L
L
 
L
R
 
L
V
 
E
V
 
V
N
 
N
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
T
A
 
A
V
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
V
 
L
N
 
N
A
 
T
P
 
P
L
 
K
K
 
E
Y
 
Y
I
 
S
F
 
P
K
 
L
V
 
A
I
 
V
E
 
K
I
 
K
L
 
L
R
 
A
N
 
E
L
 
V
T
 
T
K
 
G
I
 
F
G
 
P
L
 
C
A
 
V
R
 
P
S
 
A
D
 
E
Y
 
D
L
 
L
M
 
I
D
 
E
A
 
A
T
 
T
Q
 
S
N
 
D
A
 
C
D
 
G
V
 
A
F
 
Y
V
 
V
E
 
M
C
 
V
S
 
H
G
 
G
L
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
R
L
 
L
A
 
A
V
 
V
N
 
K
L
 
M
S
 
S
K
 
K
I
 
I
A
 
C
N
 
N
D
 
D
L
 
L
R
 
R
L
 
L
L
 
L
S
 
S
S
 
S
G
 
G
P
 
P
N
 
R
T
 
A
G
 
G
L
 
L
N
 
N
E
 
E
I
 
I
N
 
N
M
 
L
P
 
P
A
 
E
V
 
L
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
S
 
S
S
 
S
I
 
I
M
 
M
P
 
P
G
 
A
K
|
K
V
 
V
N
 
N
P
 
P
V
 
V
I
 
V
P
 
P
E
 
E
L
 
V
I
 
V
N
 
N
T
 
Q
V
 
V
A
 
C
F
 
F
Q
 
K
V
 
V
M
 
I
A
 
G
N
 
N
D
 
D
F
 
T
A
 
T
I
 
V
T
 
T
L
 
M
A
 
A
A
 
A
Q
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
E
 
Q
L
 
L
N
 
N
A
 
V
F
 
M
L
 
E
P
 
P
L
 
V
I
 
I
A
 
G
N
 
Q
N
 
A
L
 
M
L
 
F
E
 
E
S
 
S
L
 
V
K
 
H
I
 
I
L
 
L
K
 
T
N
 
N
G
 
A
I
 
C
K
 
Y
I
 
N
F
 
L
R
 
L
Q
 
E
Q
 
K
C
|
C
I
 
I
D
 
N
G
 
G
I
 
I
T
 
T
A
 
A
N
 
N
K
 
K
E
 
E
K
 
V
C
 
C
L
 
E
E
 
G
Y
 
Y
A
 
V
K
 
Y
K
 
N
T
 
S
P
 
I
A
 
G
I
 
I
A
 
V
A
 
T
S
 
Y
L
 
L
I
 
N
D
 
P
R
 
F
I
 
I
G
 
G
Y
 
H
D
 
H
K
 
N
A
 
G
A
 
D
E
 
I
I
 
V
A
 
G
K
 
K
K
 
I
A
 
C
I
 
A
L
 
E
E
 
T
N
 
G
K
 
K
Q
 
S
I
 
V
I
 
R
D
 
E
V
 
V
V
 
V
K
 
L
E
 
E
L
 
R
N
 
G
I
 
L
M
 
L
D
 
T
E
 
E
K
 
A
E
 
E
-
 
L
-
 
D
-
 
D
-
 
I
-
 
F
-
 
S
A
 
V
Q
 
Q
E
 
N
L
 
L
L
 
M
N
 
H
P
 
P

P9WN93 Fumarate hydratase class II; Fumarase C; Aerobic fumarase; Iron-independent fumarase; EC 4.2.1.2 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see 2 papers)
43% identity, 98% coverage: 3:452/461 of query aligns to 11:455/474 of P9WN93

query
sites
P9WN93
R
 
R
I
 
I
E
 
E
K
 
H
D
 
D
F
 
T
L
 
M
G
 
G
S
 
E
I
 
V
E
 
R
L
 
V
S
 
P
D
 
A
I
 
K
E
 
A
L
 
L
Y
 
W
G
 
R
I
 
A
H
 
Q
T
 
T
K
 
Q
R
 
R
A
 
A
F
 
V
A
 
E
N
 
N
F
 
F
N
 
P
V
 
I
S
 
S
G
 
G
K
 
R
S
 
G
V
 
L
D
 
E
K
 
R
D
 
T
L
 
Q
I
 
I
K
 
R
A
 
A
F
 
L
V
 
G
M
 
L
V
 
L
K
 
K
K
 
G
A
 
A
C
 
C
A
 
A
I
 
Q
A
 
V
N
 
N
Y
 
S
E
 
D
V
 
L
G
 
G
L
 
L
L
 
L
D
 
A
E
 
P
K
 
E
I
 
K
K
 
A
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
I
F
 
A
A
 
A
C
 
A
D
 
A
E
 
E
I
 
I
L
 
A
A
 
D
G
 
G
K
 
Q
Y
 
H
D
 
D
D
 
D
Q
 
Q
F
 
F
I
 
P
V
 
I
D
 
D
R
 
V
F
 
F
Q
 
Q
G
 
T
G
 
G
A
x
S
G
|
G
T
|
T
S
 
S
T
 
S
N
 
N
M
 
M
N
 
N
V
 
T
N
 
N
E
 
E
V
 
V
I
 
I
A
 
A
N
 
S
V
 
I
A
 
A
L
 
A
T
 
-
H
 
-
I
 
-
G
 
-
R
 
-
K
 
K
P
 
G
G
 
G
E
 
V
Y
 
-
D
 
-
I
 
T
I
 
L
H
 
H
P
 
P
I
 
N
N
 
D
H
 
D
V
 
V
N
 
N
M
 
M
S
 
S
Q
 
Q
S
|
S
T
x
S
N
|
N
D
 
D
V
 
T
Y
 
F
P
 
P
T
 
T
A
 
A
L
 
T
R
 
H
I
 
I
A
 
A
-
 
A
T
 
T
I
 
E
W
 
A
N
 
A
V
 
V
R
 
A
E
 
H
L
 
L
S
 
I
E
 
P
E
 
A
C
 
L
A
 
Q
E
 
Q
L
 
L
Q
 
H
K
 
D
S
 
A
L
 
L
Q
 
A
K
 
A
K
 
K
E
 
A
H
 
L
E
 
D
F
 
W
E
 
H
D
 
T
V
 
V
I
 
V
K
 
K
A
 
S
G
 
G
R
 
R
T
|
T
Q
 
H
L
 
L
Q
 
M
D
 
D
A
 
A
L
 
V
P
 
P
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
E
 
E
F
 
F
G
 
S
A
 
G
Y
 
Y
A
 
A
Q
 
R
A
 
Q
I
 
I
S
 
E
R
 
A
D
 
G
R
 
I
W
 
E
R
 
R
L
 
V
Y
 
R
K
 
A
V
 
C
E
 
L
E
 
P
R
 
R
L
 
L
R
 
G
V
 
E
V
 
L
N
 
A
L
 
I
G
 
G
A
 
G
T
 
T
A
 
A
V
 
V
G
 
G
T
 
T
G
 
G
V
 
L
N
 
N
A
 
A
P
 
P
L
 
D
K
 
D
Y
 
F
I
 
G
F
 
V
K
 
R
V
 
V
I
 
V
E
 
A
I
 
V
L
 
L
-
 
V
-
 
A
-
 
Q
R
 
T
N
 
G
L
 
L
T
 
S
K
 
E
I
 
L
G
 
R
L
 
T
A
 
A
R
 
A
S
 
N
D
 
S
Y
 
F
L
 
E
M
 
A
D
 
Q
A
 
A
T
 
A
Q
 
R
N
 
-
A
 
-
D
 
D
V
 
G
F
 
L
V
 
V
E
 
E
C
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
A
L
 
L
K
 
R
A
 
T
L
 
I
A
 
A
V
 
V
N
 
S
L
 
L
S
 
T
K
 
K
I
 
I
A
 
A
N
 
N
D
 
D
L
 
I
R
 
R
L
 
W
L
 
M
S
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
N
 
L
T
 
T
G
 
G
L
 
L
N
 
A
E
 
E
I
 
I
N
 
Q
M
 
L
P
 
P
A
 
D
V
 
L
Q
 
Q
A
 
P
G
 
G
S
|
S
S
|
S
I
 
I
M
 
M
P
 
P
G
 
G
K
|
K
V
|
V
N
|
N
P
 
P
V
 
V
I
 
L
P
 
P
E
 
E
L
 
A
I
 
V
N
 
T
T
 
Q
V
 
V
A
 
A
F
 
A
Q
 
Q
V
 
V
M
 
I
A
 
G
N
 
N
D
 
D
F
 
A
A
 
A
I
 
I
T
 
A
L
 
W
A
 
G
A
 
G
Q
 
A
A
 
N
G
 
G
Q
 
A
L
 
F
E
 
E
L
 
L
N
 
N
A
 
V
F
 
Y
L
 
I
P
 
P
L
 
M
I
 
M
A
 
A
N
 
R
N
 
N
L
 
I
L
 
L
E
 
E
S
 
S
L
 
F
K
 
K
I
 
L
L
 
L
K
 
T
N
 
N
G
 
V
I
 
S
K
 
R
I
 
L
F
 
F
R
 
A
Q
 
Q
Q
 
R
C
 
C
I
 
I
D
 
A
G
 
G
I
 
L
T
 
T
A
 
A
N
 
N
K
 
V
E
 
E
K
 
H
C
 
L
L
 
R
E
 
R
Y
 
L
A
 
A
K
 
E
K
 
S
T
 
S
P
 
P
A
 
S
I
 
I
A
 
V
A
 
T
S
 
P
L
 
L
I
 
N
D
 
S
R
 
A
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
D
 
E
K
 
E
A
 
A
A
 
A
E
 
A
I
 
V
A
 
A
K
 
K
K
 
Q
A
 
A
I
 
L
L
 
K
E
 
E
N
 
R
K
 
K
Q
 
T
I
 
I
I
 
R
D
 
Q
V
 
T
V
 
V
K
 
I
E
 
D
L
 
R
N
 
G
I
 
L
M
 
I
D
 
G
E
 
D
K
 
R
E
 
L
A
 
S
Q
 
I
E
 
E
L
 
D
L
 
L
N
 
D

4adlA Crystal structures of rv1098c in complex with malate (see paper)
43% identity, 98% coverage: 3:452/461 of query aligns to 3:447/459 of 4adlA

query
sites
4adlA
R
 
R
I
 
I
E
 
E
K
 
H
D
 
D
F
 
T
L
 
M
G
 
G
S
 
E
I
 
V
E
 
R
L
 
V
S
 
P
D
 
A
I
 
K
E
 
A
L
 
L
Y
 
W
G
 
R
I
 
A
H
 
Q
T
 
T
K
 
Q
R
 
R
A
 
A
F
 
V
A
 
E
N
 
N
F
 
F
N
 
P
V
 
I
S
 
S
G
 
G
K
 
R
S
 
G
V
 
L
D
 
E
K
 
R
D
 
T
L
 
Q
I
 
I
K
 
R
A
 
A
F
 
L
V
 
G
M
 
L
V
 
L
K
 
K
K
 
G
A
 
A
C
 
C
A
 
A
I
 
Q
A
 
V
N
 
N
Y
 
S
E
 
D
V
 
L
G
 
G
L
 
L
L
 
L
D
 
A
E
 
P
K
 
E
I
 
K
K
 
A
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
I
F
 
A
A
 
A
C
 
A
D
 
A
E
 
E
I
 
I
L
 
A
A
 
D
G
 
G
K
 
Q
Y
 
H
D
 
D
D
 
D
Q
 
Q
F
 
F
I
 
P
V
 
I
D
 
D
R
 
V
F
 
F
Q
 
Q
G
 
T
G
 
G
A
x
S
G
 
G
T
|
T
S
 
S
T
 
S
N
 
N
M
 
M
N
 
N
V
 
T
N
 
N
E
 
E
V
 
V
I
 
I
A
 
A
N
 
S
V
 
I
A
 
A
L
 
A
T
 
-
H
 
-
I
 
-
G
 
-
R
 
-
K
 
K
P
 
G
G
 
G
E
 
V
Y
 
-
D
 
-
I
 
T
I
 
L
H
 
H
P
 
P
I
 
N
N
 
D
H
 
D
V
 
V
N
 
N
M
 
M
S
 
S
Q
 
Q
S
|
S
T
x
S
N
|
N
D
 
D
V
 
T
Y
 
F
P
 
P
T
 
T
A
 
A
L
 
T
R
 
H
I
 
I
A
 
A
-
 
A
T
 
T
I
 
E
W
 
A
N
 
A
V
 
V
R
 
A
E
 
H
L
 
L
S
 
I
E
 
P
E
 
A
C
 
L
A
 
Q
E
 
Q
L
 
L
Q
 
H
K
 
D
S
 
A
L
 
L
Q
 
A
K
 
A
K
 
K
E
 
A
H
 
L
E
 
D
F
 
W
E
 
H
D
 
T
V
 
V
I
 
V
K
 
K
A
 
S
G
 
G
R
 
R
T
|
T
Q
x
H
L
 
L
Q
 
M
D
 
D
A
 
A
L
 
V
P
 
P
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
E
 
E
F
 
F
G
 
S
A
 
G
Y
 
Y
A
 
A
Q
 
R
A
 
Q
I
 
I
S
 
E
R
 
A
D
 
G
R
 
I
W
 
E
R
 
R
L
 
V
Y
 
R
K
 
A
V
 
C
E
 
L
E
 
P
R
 
R
L
 
L
R
 
G
V
 
E
V
 
L
N
 
A
L
 
I
G
 
G
A
 
G
T
 
T
A
 
A
V
 
V
G
 
G
T
 
T
G
 
G
V
 
L
N
 
N
A
 
A
P
 
P
L
 
D
K
 
D
Y
 
F
I
 
G
F
 
V
K
 
R
V
 
V
I
 
V
E
 
A
I
 
V
L
 
L
-
 
V
-
 
A
-
 
Q
R
 
T
N
 
G
L
 
L
T
 
S
K
 
E
I
 
L
G
 
R
L
 
T
A
 
A
R
 
A
S
 
N
D
 
S
Y
 
F
L
 
E
M
 
A
D
 
Q
A
 
A
T
 
A
Q
 
R
N
 
-
A
 
-
D
 
D
V
 
G
F
 
L
V
 
V
E
 
E
C
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
A
L
 
L
K
 
R
A
 
T
L
 
I
A
 
A
V
 
V
N
 
S
L
 
L
S
 
T
K
 
K
I
 
I
A
 
A
N
 
N
D
 
D
L
 
I
R
 
R
L
 
W
L
 
M
S
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
N
 
L
T
 
T
G
 
G
L
 
L
N
 
A
E
 
E
I
 
I
N
 
Q
M
 
L
P
 
P
A
 
D
V
 
L
Q
 
Q
A
 
P
G
 
G
S
|
S
S
|
S
I
 
I
M
 
M
P
 
P
G
 
G
K
|
K
V
 
V
N
 
N
P
 
P
V
 
V
I
 
L
P
 
P
E
|
E
L
 
A
I
 
V
N
 
T
T
 
Q
V
 
V
A
 
A
F
 
A
Q
 
Q
V
 
V
M
 
I
A
 
G
N
 
N
D
 
D
F
 
A
A
 
A
I
 
I
T
 
A
L
 
W
A
 
G
A
 
G
Q
 
A
A
 
N
G
 
G
Q
 
A
L
 
F
E
 
E
L
 
L
N
 
N
A
 
V
F
 
Y
L
 
I
P
 
P
L
 
M
I
 
M
A
 
A
N
 
R
N
 
N
L
 
I
L
 
L
E
 
E
S
 
S
L
 
F
K
 
K
I
 
L
L
 
L
K
 
T
N
 
N
G
 
V
I
 
S
K
 
R
I
 
L
F
 
F
R
 
A
Q
 
Q
Q
 
R
C
 
C
I
 
I
D
 
A
G
 
G
I
 
L
T
 
T
A
 
A
N
 
N
K
 
V
E
 
E
K
 
H
C
 
L
L
 
R
E
 
R
Y
 
L
A
 
A
K
 
E
K
 
S
T
 
S
P
 
P
A
 
S
I
 
I
A
 
V
A
 
T
S
 
P
L
 
L
I
 
N
D
 
S
R
 
A
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
D
 
E
K
 
E
A
 
A
A
 
A
E
 
A
I
 
V
A
 
A
K
 
K
K
 
Q
A
 
A
I
 
L
L
 
K
E
 
E
N
 
R
K
 
K
Q
 
T
I
 
I
I
 
R
D
 
Q
V
 
T
V
 
V
K
 
I
E
 
D
L
 
R
N
 
G
I
 
L
M
 
I
D
 
G
E
 
D
K
 
R
E
 
L
A
 
S
Q
 
I
E
 
E
L
 
D
L
 
L
N
 
D

4apbD Crystal structure of mycobacterium tuberculosis fumarase (rv1098c) s318c in complex with fumarate (see paper)
43% identity, 98% coverage: 3:452/461 of query aligns to 3:447/462 of 4apbD

query
sites
4apbD
R
 
R
I
 
I
E
 
E
K
 
H
D
 
D
F
 
T
L
 
M
G
 
G
S
 
E
I
 
V
E
 
R
L
 
V
S
 
P
D
 
A
I
 
K
E
 
A
L
 
L
Y
 
W
G
 
R
I
 
A
H
 
Q
T
 
T
K
 
Q
R
 
R
A
 
A
F
 
V
A
 
E
N
 
N
F
 
F
N
 
P
V
 
I
S
 
S
G
 
G
K
 
R
S
 
G
V
 
L
D
 
E
K
 
R
D
 
T
L
 
Q
I
 
I
K
 
R
A
 
A
F
 
L
V
 
G
M
 
L
V
 
L
K
 
K
K
 
G
A
 
A
C
 
C
A
 
A
I
 
Q
A
 
V
N
 
N
Y
 
S
E
 
D
V
 
L
G
 
G
L
 
L
L
 
L
D
 
A
E
 
P
K
 
E
I
 
K
K
 
A
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
I
F
 
A
A
 
A
C
 
A
D
 
A
E
 
E
I
 
I
L
 
A
A
 
D
G
 
G
K
 
Q
Y
 
H
D
 
D
D
 
D
Q
 
Q
F
 
F
I
 
P
V
 
I
D
 
D
R
 
V
F
 
F
Q
 
Q
G
 
T
G
 
G
A
 
S
G
 
G
T
|
T
S
 
S
T
 
S
N
 
N
M
 
M
N
 
N
V
 
T
N
 
N
E
 
E
V
 
V
I
 
I
A
 
A
N
 
S
V
 
I
A
 
A
L
 
A
T
 
-
H
 
-
I
 
-
G
 
-
R
 
-
K
 
K
P
 
G
G
 
G
E
 
V
Y
 
-
D
 
-
I
 
T
I
 
L
H
 
H
P
 
P
I
 
N
N
 
D
H
 
D
V
 
V
N
 
N
M
 
M
S
 
S
Q
 
Q
S
|
S
T
x
S
N
|
N
D
 
D
V
 
T
Y
 
F
P
 
P
T
 
T
A
 
A
L
 
T
R
 
H
I
 
I
A
 
A
-
 
A
T
 
T
I
 
E
W
 
A
N
 
A
V
 
V
R
 
A
E
 
H
L
 
L
S
 
I
E
 
P
E
 
A
C
 
L
A
 
Q
E
 
Q
L
 
L
Q
 
H
K
 
D
S
 
A
L
 
L
Q
 
A
K
 
A
K
 
K
E
 
A
H
 
L
E
 
D
F
 
W
E
 
H
D
 
T
V
 
V
I
 
V
K
 
K
A
 
S
G
 
G
R
 
R
T
|
T
Q
x
H
L
 
L
Q
 
M
D
 
D
A
 
A
L
 
V
P
 
P
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
E
 
E
F
 
F
G
 
S
A
 
G
Y
 
Y
A
 
A
Q
 
R
A
 
Q
I
 
I
S
 
E
R
 
A
D
 
G
R
 
I
W
 
E
R
 
R
L
 
V
Y
 
R
K
 
A
V
 
C
E
 
L
E
 
P
R
 
R
L
 
L
R
 
G
V
 
E
V
 
L
N
 
A
L
 
I
G
 
G
A
 
G
T
 
T
A
 
A
V
 
V
G
 
G
T
 
T
G
 
G
V
 
L
N
 
N
A
 
A
P
 
P
L
 
D
K
 
D
Y
 
F
I
 
G
F
 
V
K
 
R
V
 
V
I
 
V
E
 
A
I
 
V
L
 
L
-
 
V
-
 
A
-
 
Q
R
 
T
N
 
G
L
 
L
T
 
S
K
 
E
I
 
L
G
 
R
L
 
T
A
 
A
R
 
A
S
 
N
D
 
S
Y
 
F
L
 
E
M
 
A
D
 
Q
A
 
A
T
 
A
Q
 
R
N
 
-
A
 
-
D
 
D
V
 
G
F
 
L
V
 
V
E
 
E
C
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
A
L
 
L
K
 
R
A
 
T
L
 
I
A
 
A
V
 
V
N
 
S
L
 
L
S
 
T
K
 
K
I
 
I
A
 
A
N
 
N
D
 
D
L
 
I
R
 
R
L
 
W
L
 
M
S
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
N
 
L
T
 
T
G
 
G
L
 
L
N
 
A
E
 
E
I
 
I
N
 
Q
M
 
L
P
 
P
A
 
D
V
 
L
Q
 
Q
A
 
P
G
 
G
S
x
C
S
|
S
I
 
I
M
|
M
P
 
P
G
 
G
K
|
K
V
 
V
N
|
N
P
 
P
V
 
V
I
 
L
P
 
P
E
|
E
L
 
A
I
 
V
N
 
T
T
 
Q
V
 
V
A
 
A
F
 
A
Q
 
Q
V
 
V
M
 
I
A
 
G
N
 
N
D
 
D
F
 
A
A
 
A
I
 
I
T
 
A
L
 
W
A
 
G
A
 
G
Q
 
A
A
 
N
G
 
G
Q
 
A
L
 
F
E
 
E
L
 
L
N
 
N
A
 
V
F
 
Y
L
 
I
P
 
P
L
 
M
I
 
M
A
 
A
N
 
R
N
 
N
L
 
I
L
 
L
E
 
E
S
 
S
L
 
F
K
 
K
I
 
L
L
 
L
K
 
T
N
 
N
G
 
V
I
 
S
K
 
R
I
 
L
F
 
F
R
 
A
Q
 
Q
Q
 
R
C
 
C
I
 
I
D
 
A
G
 
G
I
 
L
T
 
T
A
 
A
N
 
N
K
 
V
E
 
E
K
 
H
C
 
L
L
 
R
E
 
R
Y
 
L
A
 
A
K
 
E
K
 
S
T
 
S
P
 
P
A
 
S
I
 
I
A
 
V
A
 
T
S
 
P
L
 
L
I
 
N
D
 
S
R
 
A
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
D
 
E
K
 
E
A
 
A
A
 
A
E
 
A
I
 
V
A
 
A
K
 
K
K
 
Q
A
 
A
I
 
L
L
 
K
E
 
E
N
 
R
K
 
K
Q
 
T
I
 
I
I
 
R
D
 
Q
V
 
T
V
 
V
K
 
I
E
 
D
L
 
R
N
 
G
I
 
L
M
 
I
D
 
G
E
 
D
K
 
R
E
 
L
A
 
S
Q
 
I
E
 
E
L
 
D
L
 
L
N
 
D

P08417 Fumarate hydratase, mitochondrial; Fumarase; EC 4.2.1.2 from Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (Baker's yeast) (see 2 papers)
41% identity, 98% coverage: 3:453/461 of query aligns to 29:481/488 of P08417

query
sites
P08417
R
|
R
I
x
T
E
|
E
K
x
T
D
|
D
F
x
A
L
x
F
G
|
G
S
x
E
I
|
I
E
x
H
L
x
V
S
x
P
D
x
A
I
x
D
E
x
K
L
 
Y
Y
 
W
G
 
G
I
 
A
H
 
Q
T
 
T
K
 
Q
R
 
R
A
 
S
F
 
F
A
 
Q
N
 
N
F
 
F
N
 
K
V
 
I
S
 
G
G
 
G
-
 
A
-
 
R
K
 
E
S
 
R
V
 
M
D
 
P
K
 
L
D
 
P
L
 
L
I
 
V
K
 
H
A
 
A
F
 
F
V
 
G
M
 
V
V
 
L
K
 
K
K
 
K
A
 
S
C
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
V
N
 
N
Y
 
E
E
 
S
V
 
L
G
 
G
L
 
G
L
 
L
D
 
D
E
 
P
K
 
K
I
 
I
K
 
S
D
 
K
A
 
A
I
 
I
V
 
Q
F
 
Q
A
 
A
C
 
A
D
 
D
E
 
E
I
 
V
L
 
A
A
 
S
G
 
G
K
 
K
Y
 
L
D
 
D
D
 
D
Q
 
H
F
 
F
I
 
P
V
 
L
D
 
V
R
 
V
F
 
F
Q
 
Q
G
 
T
G
 
G
A
 
S
G
 
G
T
 
T
S
 
Q
T
 
S
N
 
N
M
 
M
N
 
N
V
 
A
N
 
N
E
 
E
V
 
V
I
 
I
A
 
S
N
 
N
V
 
R
A
 
A
L
 
I
T
 
E
H
 
I
I
 
L
G
 
G
R
 
G
K
 
K
P
 
I
G
 
G
E
 
S
Y
 
K
D
 
Q
I
 
V
I
 
-
H
|
H
P
 
P
I
 
N
N
 
N
H
 
H
V
 
C
N
 
N
M
 
Q
S
 
S
Q
 
Q
S
 
S
T
 
S
N
 
N
D
 
D
V
 
T
Y
 
F
P
 
P
T
 
T
A
 
V
L
 
M
R
 
H
I
 
I
A
 
A
T
 
A
I
 
S
W
 
L
N
 
Q
V
 
I
R
 
Q
-
 
N
E
 
E
L
 
L
S
 
I
E
 
P
E
 
E
C
 
L
A
 
T
E
 
N
L
 
L
Q
 
K
K
 
N
S
 
A
L
 
L
Q
 
E
K
 
A
K
 
K
E
 
S
H
 
K
E
 
E
F
 
F
E
 
D
D
 
H
V
 
I
I
 
V
K
 
K
A
 
I
G
 
G
R
 
R
T
 
T
Q
 
H
L
 
L
Q
 
Q
D
 
D
A
 
A
L
 
T
P
 
P
V
 
L
T
 
T
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
E
 
E
F
 
F
G
 
S
A
 
G
Y
 
Y
A
 
V
Q
 
Q
A
 
Q
I
 
V
S
 
E
R
 
N
D
 
G
R
 
I
W
 
Q
R
 
R
L
 
V
Y
 
A
K
 
H
V
 
S
E
 
L
E
 
K
R
 
T
L
 
L
R
 
S
V
 
F
V
 
L
N
 
A
L
 
Q
G
 
G
A
 
G
T
 
T
A
 
A
V
 
V
G
 
G
T
 
T
G
 
G
V
 
L
N
 
N
A
 
T
P
 
K
L
 
P
K
 
G
Y
 
F
I
 
D
F
 
V
K
 
K
V
 
I
I
 
A
E
 
E
I
 
Q
L
 
I
R
 
S
N
 
K
L
 
E
T
 
T
K
 
G
I
 
L
G
 
K
L
 
F
A
 
Q
R
 
T
S
 
A
D
 
P
Y
 
N
L
 
K
M
 
F
D
 
E
A
 
A
T
 
L
Q
 
A
N
 
A
A
 
H
D
 
D
V
 
A
F
 
I
V
 
V
E
 
E
C
 
C
S
 
S
G
 
G
L
 
A
L
 
L
K
 
N
A
 
T
L
 
L
A
 
A
V
 
C
N
 
S
L
 
L
S
 
F
K
 
K
I
 
I
A
 
A
N
 
Q
D
 
D
L
 
I
R
 
R
L
 
Y
L
 
L
S
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
N
 
R
T
 
C
G
 
G
L
 
Y
N
 
H
E
 
E
I
 
L
N
 
M
M
 
L
P
 
P
A
 
E
V
 
N
Q
 
E
A
 
P
G
 
G
S
 
S
S
 
S
I
 
I
M
 
M
P
 
P
G
 
G
K
 
K
V
 
V
N
 
N
P
 
P
V
 
T
I
 
Q
P
 
N
E
 
E
L
 
A
I
 
L
N
 
T
T
 
Q
V
 
V
A
 
C
F
 
V
Q
 
Q
V
 
V
M
 
M
A
 
G
N
 
N
D
 
N
F
 
A
A
 
A
I
 
I
T
 
T
L
 
F
A
 
A
A
 
G
Q
 
S
A
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
L
 
F
E
 
E
L
 
L
N
 
N
A
 
V
F
 
F
L
 
K
P
 
P
L
 
V
I
 
M
A
 
I
N
 
A
N
 
N
L
 
L
L
 
L
E
 
N
S
 
S
L
 
I
K
 
R
I
 
L
L
 
I
K
 
T
N
 
D
G
 
A
I
 
A
K
 
Y
I
 
S
F
 
F
R
 
R
Q
 
V
Q
 
H
C
 
C
I
 
V
D
 
E
G
 
G
I
 
I
T
 
K
A
 
A
N
 
N
K
 
E
E
 
P
K
 
R
C
 
I
L
 
H
E
 
E
Y
 
L
A
 
L
K
 
T
K
 
K
T
 
S
P
 
L
A
 
M
I
 
L
A
 
V
A
 
T
S
 
A
L
 
L
I
 
N
D
 
P
R
 
K
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
K
 
A
A
 
A
A
 
S
E
 
K
I
 
V
A
 
A
K
 
K
K
 
N
A
 
A
I
 
H
L
 
K
E
 
K
N
 
G
K
 
I
Q
 
T
I
 
L
I
 
K
D
 
E
V
 
S
V
 
A
K
 
L
E
 
E
L
 
L
N
 
G
I
 
V
M
 
L
D
 
T
E
 
E
K
 
K
E
 
E
A
 
F
Q
 
D
E
 
E
L
 
W
L
 
V
N
 
V
P
 
P

Sites not aligning to the query:

7c18B Crystal structure of fumarasec from mannheimia succiniciproducens in complex with fumarate
44% identity, 92% coverage: 3:425/461 of query aligns to 4:428/464 of 7c18B

query
sites
7c18B
R
 
R
I
 
I
E
 
E
K
 
K
D
 
D
F
 
T
L
 
M
G
 
G
S
 
E
I
 
V
E
 
Q
L
 
V
S
 
P
D
 
A
I
 
D
E
 
K
L
 
Y
Y
 
W
G
 
A
I
 
A
H
 
Q
T
 
T
K
 
E
R
 
R
A
 
S
F
 
R
A
 
N
N
 
N
F
 
F
N
 
K
V
 
I
S
 
G
-
 
P
G
 
A
K
 
A
S
 
S
V
 
M
D
 
P
K
 
H
D
 
E
L
 
I
I
 
I
K
 
E
A
 
A
F
 
F
V
 
G
M
 
Y
V
 
L
K
 
K
K
 
K
A
 
A
C
 
A
A
 
A
I
 
F
A
 
A
N
 
N
Y
 
T
E
 
D
V
 
L
G
 
G
L
 
V
L
 
L
D
 
P
E
 
A
K
 
E
I
 
K
K
 
R
D
 
D
A
 
L
I
 
I
V
 
G
F
 
Q
A
 
A
C
 
C
D
 
D
E
 
E
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
R
K
 
K
Y
 
L
D
 
D
D
 
D
Q
 
Q
F
 
F
I
 
P
V
 
L
D
 
V
R
 
I
F
 
W
Q
 
Q
G
 
T
G
 
G
A
 
S
G
 
G
T
|
T
S
 
Q
T
 
S
N
 
N
M
 
M
N
 
N
V
 
L
N
 
N
E
 
E
V
 
V
I
 
I
A
 
A
N
 
N
V
 
R
A
 
A
L
 
H
T
 
V
H
 
I
I
 
N
G
 
G
R
 
G
K
 
K
P
 
L
G
 
G
E
 
E
Y
 
K
D
 
S
I
 
I
I
 
I
H
 
H
P
 
P
I
 
N
N
 
D
H
 
D
V
 
V
N
 
N
M
 
K
S
 
S
Q
 
Q
S
|
S
T
x
S
N
|
N
D
 
D
V
 
T
Y
 
Y
P
 
P
T
 
T
A
 
A
L
 
M
R
 
H
I
 
I
A
 
A
T
 
A
I
 
Y
W
 
K
N
 
K
V
 
V
R
 
V
E
 
E
L
 
A
S
 
T
E
 
I
E
 
P
C
 
A
A
 
V
E
 
E
-
 
R
L
 
L
Q
 
Q
K
 
K
S
 
T
L
 
L
Q
 
A
K
 
A
K
 
K
E
 
A
H
 
A
E
 
E
F
 
F
E
 
K
D
 
D
V
 
V
I
 
V
K
 
K
A
 
I
G
 
G
R
 
R
T
|
T
Q
x
H
L
 
L
Q
 
M
D
 
D
A
 
A
L
 
T
P
 
P
V
 
L
T
 
T
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
E
 
E
F
 
F
G
 
S
A
 
G
Y
 
Y
A
 
A
Q
 
A
A
 
Q
I
 
L
S
 
S
R
 
F
D
 
G
R
 
L
W
 
T
R
 
A
L
 
I
Y
 
K
K
 
N
V
 
T
E
 
L
E
 
P
R
 
H
L
 
L
R
 
R
V
 
Q
V
 
L
N
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
G
T
 
T
A
 
A
V
 
V
G
 
G
T
 
T
G
 
G
V
 
L
N
 
N
A
 
T
P
 
P
L
 
K
K
 
G
Y
 
Y
I
 
D
F
 
V
K
 
K
V
 
V
I
 
A
E
 
E
I
 
Y
L
 
I
R
 
A
N
 
K
L
 
F
T
 
T
K
 
G
I
 
L
G
 
P
L
 
F
A
 
I
R
 
T
S
 
A
D
 
E
Y
 
N
L
 
K
M
 
F
D
 
E
A
 
A
T
 
L
Q
 
A
N
 
T
A
 
H
D
 
D
V
 
A
F
 
I
V
 
V
E
 
E
C
 
T
S
 
H
G
 
G
L
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
Q
L
 
V
A
 
A
V
 
M
N
 
S
L
 
L
S
 
F
K
 
K
I
 
I
A
 
A
N
 
N
D
 
D
L
 
I
R
 
R
L
 
L
L
 
L
S
 
A
S
 
S
G
 
G
P
 
P
N
 
R
T
 
S
G
 
G
L
 
I
N
 
G
E
 
E
I
 
I
N
 
L
M
 
I
P
 
P
A
 
E
V
 
N
Q
 
E
A
 
P
G
 
G
S
x
C
S
|
S
I
 
I
M
|
M
P
 
P
G
 
G
K
|
K
V
 
V
N
|
N
P
 
P
V
 
T
I
 
Q
P
 
C
E
 
E
L
 
A
I
 
M
N
 
T
T
 
M
V
 
V
A
 
A
F
 
A
Q
 
Q
V
 
V
M
 
L
A
 
G
N
 
N
D
 
D
F
 
T
A
 
T
I
 
I
T
 
S
L
 
F
A
 
A
A
 
G
Q
 
S
A
 
Q
G
 
G
Q
 
H
L
 
F
E
 
E
L
 
L
N
 
N
A
 
V
F
 
F
L
 
K
P
 
P
L
 
V
I
 
M
A
 
A
N
 
A
N
 
N
L
 
F
L
 
L
E
 
Q
S
 
S
L
 
A
K
 
Q
I
 
L
L
 
I
K
 
A
N
 
D
G
 
V
I
 
C
K
 
I
I
 
S
F
 
F
R
 
D
Q
 
E
Q
 
H
C
 
C
I
 
A
D
 
T
G
 
G
I
 
I
T
 
Q
A
 
P
N
 
N
K
 
T
E
 
P
K
 
R
C
 
I
L
 
Q
E
 
H
Y
 
L
A
 
L
K
 
D
K
 
S
T
 
S
P
 
L
A
 
M
I
 
L
A
 
V
A
 
T
S
 
A
L
 
L
I
 
N
D
 
T
R
 
H
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
D
 
E
K
 
N
A
 
A
A
 
A
E
 
K
I
 
I
A
 
A
K
 
K
K
 
T
A
 
A

P05042 Fumarate hydratase class II; Fumarase C; Aerobic fumarase; Iron-independent fumarase; EC 4.2.1.2 from Escherichia coli (strain K12) (see 4 papers)
38% identity, 99% coverage: 3:457/461 of query aligns to 5:460/467 of P05042

query
sites
P05042
R
 
R
I
 
S
E
 
E
K
 
K
D
 
D
F
 
S
L
 
M
G
 
G
S
 
A
I
 
I
E
 
D
L
 
V
S
 
P
D
 
A
I
 
D
E
 
K
L
 
L
Y
 
W
G
 
G
I
 
A
H
 
Q
T
 
T
K
 
Q
R
 
R
A
 
S
F
 
L
A
 
E
N
 
H
F
 
F
N
 
R
V
 
I
S
 
S
G
 
T
K
 
E
S
 
K
V
 
M
D
 
P
K
 
T
D
 
S
L
 
L
I
 
I
K
 
H
A
 
A
F
 
L
V
 
A
M
 
L
V
 
T
K
 
K
K
 
R
A
 
A
C
 
A
A
 
A
I
 
K
A
 
V
N
 
N
Y
 
E
E
 
D
V
 
L
G
 
G
L
 
L
L
 
L
D
 
S
E
 
E
K
 
E
I
 
K
K
 
A
D
 
S
A
 
A
I
 
I
V
 
R
F
 
Q
A
 
A
C
 
A
D
 
D
E
 
E
I
 
V
L
 
L
A
 
A
G
 
G
K
 
Q
Y
 
H
D
 
D
D
 
D
Q
 
E
F
 
F
I
 
P
V
 
L
D
 
A
R
 
I
F
 
W
Q
 
Q
G
 
T
G
 
G
A
 
S
G
 
G
T
 
T
S
 
Q
T
 
S
N
 
N
M
 
M
N
 
N
V
 
M
N
 
N
E
 
E
V
 
V
I
 
L
A
 
A
N
 
N
V
 
R
A
 
A
L
 
S
T
 
E
H
 
L
I
 
L
G
 
G
R
 
G
K
 
V
P
 
R
G
 
G
E
 
M
Y
 
E
D
x
R
I
x
K
I
 
V
H
|
H
P
|
P
I
x
N
N
x
D
H
 
D
V
 
V
N
 
N
M
 
K
S
 
S
Q
 
Q
S
|
S
T
x
S
N
|
N
D
 
D
V
 
V
Y
 
F
P
 
P
T
 
T
A
 
A
L
 
M
R
 
H
I
 
V
A
 
A
T
 
A
I
 
L
W
 
L
N
 
A
V
 
L
R
 
R
-
 
K
E
 
Q
L
 
L
S
 
I
E
 
P
E
 
Q
C
 
L
A
 
K
E
 
T
L
 
L
Q
 
T
K
 
Q
S
 
T
L
 
L
Q
 
N
K
 
E
K
 
K
E
 
S
H
 
R
E
 
A
F
 
F
E
 
A
D
 
D
V
 
I
I
 
V
K
 
K
A
 
I
G
 
G
R
 
R
T
 
T
Q
x
H
L
 
L
Q
 
Q
D
 
D
A
 
A
L
 
T
P
 
P
V
 
L
T
 
T
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
E
 
E
F
 
I
G
 
S
A
 
G
Y
 
W
A
 
V
Q
 
A
A
 
M
I
 
L
S
 
E
R
 
H
D
 
N
R
 
L
W
 
K
R
 
H
L
 
I
Y
 
E
K
 
Y
V
 
S
E
 
L
E
 
P
R
 
H
L
 
V
R
 
A
V
 
E
V
 
L
N
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
G
T
 
T
A
 
A
V
 
V
G
 
G
T
 
T
G
 
G
V
 
L
N
 
N
A
 
T
P
 
H
L
 
P
K
 
E
Y
 
Y
I
 
A
F
 
R
K
 
R
V
 
V
I
 
A
E
 
D
I
 
E
L
 
L
R
 
A
N
 
V
L
 
I
T
 
T
K
 
C
I
 
A
G
 
P
L
 
F
A
 
V
R
 
T
S
 
A
D
 
P
Y
 
N
L
 
K
M
 
F
D
 
E
A
 
A
T
 
L
Q
 
A
N
 
T
A
 
C
D
 
D
V
 
A
F
 
L
V
 
V
E
 
Q
C
 
A
S
 
H
G
 
G
L
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
G
L
 
L
A
 
A
V
 
A
N
 
S
L
 
L
S
 
M
K
 
K
I
 
I
A
 
A
N
 
N
D
 
D
L
 
V
R
 
R
L
 
W
L
 
L
S
 
A
S
 
S
G
 
G
P
 
P
N
 
R
T
 
C
G
 
G
L
 
I
N
 
G
E
 
E
I
 
I
N
 
S
M
 
I
P
 
P
A
 
E
V
 
N
Q
x
E
A
 
P
G
 
G
S
 
S
S
 
S
I
 
I
M
 
M
P
 
P
G
 
G
K
 
K
V
 
V
N
 
N
P
 
P
V
 
T
I
 
Q
P
 
C
E
 
E
L
 
A
I
 
L
N
 
T
T
 
M
V
 
L
A
 
C
F
 
C
Q
 
Q
V
 
V
M
 
M
A
 
G
N
 
N
D
 
D
F
 
V
A
 
A
I
 
I
T
 
N
L
 
M
A
 
G
A
 
G
Q
 
A
A
 
S
G
 
G
Q
 
N
L
 
F
E
 
E
L
 
L
N
 
N
A
 
V
F
 
F
L
 
R
P
 
P
L
 
M
I
 
V
A
 
I
N
 
H
N
 
N
L
 
F
L
 
L
E
 
Q
S
 
S
L
 
V
K
 
R
I
 
L
L
 
L
K
 
A
N
 
D
G
 
G
I
 
M
K
 
E
I
 
S
F
 
F
R
 
N
Q
 
K
Q
 
H
C
 
C
I
 
A
D
 
V
G
 
G
I
 
I
T
 
E
A
 
P
N
 
N
K
 
R
E
 
E
K
 
R
C
 
I
L
 
N
E
 
Q
Y
 
L
A
 
L
K
 
N
K
 
E
T
 
S
P
 
L
A
 
M
I
 
L
A
 
V
A
 
T
S
 
A
L
 
L
I
 
N
D
 
T
R
 
H
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
A
 
A
A
 
A
E
 
E
I
 
I
A
 
A
K
 
K
K
 
K
A
 
A
I
 
H
L
 
K
E
 
E
N
 
G
K
 
L
Q
 
T
I
 
L
I
 
K
D
 
A
V
 
A
V
 
A
K
 
L
E
 
A
L
 
L
N
 
G
I
 
Y
M
 
L
D
 
S
E
 
E
K
 
A
E
 
E
A
 
F
Q
 
D
E
 
S
L
 
W
L
 
V
N
 
R
P
 
P
F
 
E
E
 
Q
F
 
M
I
 
V

1fuqA Fumarase with bound 3-trimethylsilylsuccinic acid (see paper)
39% identity, 98% coverage: 3:453/461 of query aligns to 2:453/456 of 1fuqA

query
sites
1fuqA
R
 
R
I
 
S
E
 
E
K
 
K
D
 
D
F
 
S
L
 
M
G
 
G
S
 
A
I
 
I
E
 
D
L
 
V
S
 
P
D
 
A
I
 
D
E
 
K
L
 
L
Y
 
W
G
 
G
I
 
A
H
 
Q
T
 
T
K
 
Q
R
 
R
A
 
S
F
 
L
A
 
E
N
 
H
F
 
F
N
 
R
V
 
I
S
 
S
G
 
T
K
 
E
S
 
K
V
 
M
D
 
P
K
 
T
D
 
S
L
 
L
I
 
I
K
 
H
A
 
A
F
 
L
V
 
A
M
 
L
V
 
T
K
 
K
K
 
R
A
 
A
C
 
A
A
 
A
I
 
K
A
 
V
N
 
N
Y
 
E
E
 
D
V
 
L
G
 
G
L
 
L
L
 
L
D
 
S
E
 
E
K
 
E
I
 
K
K
 
A
D
 
S
A
 
A
I
 
I
V
 
R
F
 
Q
A
 
A
C
 
A
D
 
D
E
 
E
I
 
V
L
 
L
A
 
A
G
 
G
K
 
Q
Y
 
H
D
 
D
D
 
D
Q
 
E
F
 
F
I
 
P
V
 
L
D
 
A
R
 
I
F
 
W
Q
 
Q
G
 
T
G
 
G
A
 
S
G
 
G
T
|
T
S
 
Q
T
 
S
N
 
N
M
 
M
N
 
N
V
 
M
N
|
N
E
 
E
V
 
V
I
 
L
A
 
A
N
 
N
V
 
R
A
 
A
L
 
S
T
 
E
H
 
L
I
 
L
G
 
G
R
 
G
K
 
V
P
 
R
G
 
G
E
 
M
Y
 
E
D
x
R
I
 
K
I
 
V
H
|
H
P
|
P
I
x
N
N
x
D
H
 
D
V
 
V
N
 
N
M
 
K
S
 
S
Q
 
Q
S
|
S
T
x
S
N
|
N
D
 
D
V
 
V
Y
 
F
P
 
P
T
 
T
A
 
A
L
 
M
R
 
H
I
 
V
A
 
A
T
 
A
I
 
L
W
 
L
N
 
A
V
 
L
R
 
R
-
 
K
E
 
Q
L
 
L
S
 
I
E
 
P
E
 
Q
C
 
L
A
 
K
E
 
T
L
 
L
Q
 
T
K
 
Q
S
 
T
L
 
L
Q
 
N
K
 
E
K
 
K
E
 
S
H
 
R
E
 
A
F
 
F
E
 
A
D
 
D
V
 
I
I
 
V
K
 
K
A
 
I
G
 
G
R
 
R
T
|
T
Q
x
H
L
 
L
Q
 
Q
D
 
D
A
 
A
L
 
T
P
 
P
V
 
L
T
 
T
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
E
 
E
F
 
I
G
 
S
A
 
G
Y
 
W
A
 
V
Q
 
A
A
 
M
I
 
L
S
 
E
R
 
H
D
 
N
R
 
L
W
 
K
R
 
H
L
 
I
Y
 
E
K
 
Y
V
 
S
E
 
L
E
 
P
R
 
H
L
 
V
R
 
A
V
 
E
V
 
L
N
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
G
T
 
T
A
 
A
V
 
V
G
 
G
T
 
T
G
 
G
V
 
L
N
 
N
A
 
T
P
 
H
L
 
P
K
 
E
Y
 
Y
I
 
A
F
 
R
K
 
R
V
 
V
I
 
A
E
 
D
I
 
E
L
 
L
R
 
A
N
 
V
L
 
I
T
 
T
K
 
C
I
 
A
G
 
P
L
 
F
A
 
V
R
 
T
S
 
A
D
 
P
Y
 
N
L
 
K
M
 
F
D
 
E
A
 
A
T
 
L
Q
 
A
N
 
T
A
 
C
D
 
D
V
 
A
F
 
L
V
 
V
E
 
Q
C
 
A
S
 
H
G
 
G
L
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
G
L
 
L
A
 
A
V
 
A
N
 
S
L
 
L
S
 
M
K
 
K
I
 
I
A
 
A
N
 
N
D
 
D
L
 
V
R
 
R
L
 
W
L
 
L
S
 
A
S
 
S
G
 
G
P
 
P
N
 
R
T
 
C
G
 
G
L
 
I
N
 
G
E
 
E
I
 
I
N
 
S
M
 
I
P
 
P
A
 
E
V
 
N
Q
 
E
A
 
P
G
 
G
S
|
S
S
 
S
I
 
I
M
 
M
P
 
P
G
 
G
K
|
K
V
 
V
N
 
N
P
 
P
V
 
T
I
 
Q
P
 
C
E
|
E
L
 
A
I
 
L
N
 
T
T
 
M
V
 
L
A
 
C
F
 
C
Q
 
Q
V
 
V
M
 
M
A
 
G
N
 
N
D
 
D
F
 
V
A
 
A
I
 
I
T
 
N
L
 
M
A
 
G
A
 
G
Q
 
A
A
 
S
G
 
G
Q
 
N
L
 
F
E
 
E
L
 
L
N
 
N
A
 
V
F
 
F
L
 
R
P
 
P
L
 
M
I
 
V
A
 
I
N
 
H
N
 
N
L
 
F
L
 
L
E
 
Q
S
 
S
L
 
V
K
 
R
I
 
L
L
 
L
K
 
A
N
 
D
G
 
G
I
 
M
K
 
E
I
 
S
F
 
F
R
 
N
Q
 
K
Q
 
H
C
 
C
I
 
A
D
 
V
G
 
G
I
 
I
T
 
E
A
 
P
N
 
N
K
 
R
E
 
E
K
 
R
C
 
I
L
 
N
E
 
Q
Y
 
L
A
 
L
K
 
N
K
 
E
T
 
S
P
 
L
A
 
M
I
 
L
A
 
V
A
 
T
S
 
A
L
 
L
I
 
N
D
 
T
R
 
H
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
A
 
A
A
 
A
E
 
E
I
 
I
A
 
A
K
 
K
K
 
K
A
 
A
I
 
H
L
 
K
E
 
E
N
 
G
K
 
L
Q
 
T
I
 
L
I
 
K
D
 
A
V
 
A
V
 
A
K
 
L
E
 
A
L
 
L
N
 
G
I
 
Y
M
 
L
D
 
S
E
 
E
K
 
A
E
 
E
A
 
F
Q
 
D
E
 
S
L
 
W
L
 
V
N
 
R
P
 
P

1fuoA FumarasE C with bound citrate (see paper)
39% identity, 98% coverage: 3:453/461 of query aligns to 2:453/456 of 1fuoA

query
sites
1fuoA
R
 
R
I
 
S
E
 
E
K
 
K
D
 
D
F
 
S
L
 
M
G
 
G
S
 
A
I
 
I
E
 
D
L
 
V
S
 
P
D
 
A
I
 
D
E
 
K
L
 
L
Y
 
W
G
 
G
I
 
A
H
 
Q
T
 
T
K
 
Q
R
 
R
A
 
S
F
 
L
A
 
E
N
 
H
F
 
F
N
 
R
V
 
I
S
 
S
G
 
T
K
 
E
S
 
K
V
 
M
D
 
P
K
 
T
D
 
S
L
 
L
I
 
I
K
 
H
A
 
A
F
 
L
V
 
A
M
 
L
V
 
T
K
 
K
K
 
R
A
 
A
C
 
A
A
 
A
I
 
K
A
 
V
N
 
N
Y
 
E
E
 
D
V
 
L
G
 
G
L
 
L
L
 
L
D
 
S
E
 
E
K
 
E
I
 
K
K
 
A
D
 
S
A
 
A
I
 
I
V
 
R
F
 
Q
A
 
A
C
 
A
D
 
D
E
 
E
I
 
V
L
 
L
A
 
A
G
 
G
K
 
Q
Y
 
H
D
 
D
D
 
D
Q
 
E
F
 
F
I
 
P
V
 
L
D
 
A
R
 
I
F
 
W
Q
 
Q
G
 
T
G
 
G
A
 
S
G
 
G
T
|
T
S
 
Q
T
 
S
N
 
N
M
 
M
N
 
N
V
 
M
N
|
N
E
 
E
V
 
V
I
 
L
A
 
A
N
 
N
V
 
R
A
 
A
L
 
S
T
 
E
H
 
L
I
 
L
G
 
G
R
 
G
K
 
V
P
 
R
G
 
G
E
 
M
Y
 
E
D
 
R
I
 
K
I
 
V
H
 
H
P
 
P
I
 
N
N
 
D
H
 
D
V
 
V
N
 
N
M
 
K
S
 
S
Q
 
Q
S
|
S
T
x
S
N
|
N
D
 
D
V
 
V
Y
 
F
P
 
P
T
 
T
A
 
A
L
 
M
R
 
H
I
 
V
A
 
A
T
 
A
I
 
L
W
 
L
N
 
A
V
 
L
R
 
R
-
 
K
E
 
Q
L
 
L
S
 
I
E
 
P
E
 
Q
C
 
L
A
 
K
E
 
T
L
 
L
Q
 
T
K
 
Q
S
 
T
L
 
L
Q
 
N
K
 
E
K
 
K
E
 
S
H
 
R
E
 
A
F
 
F
E
 
A
D
 
D
V
 
I
I
 
V
K
 
K
A
 
I
G
 
G
R
 
R
T
|
T
Q
x
H
L
 
L
Q
 
Q
D
 
D
A
 
A
L
 
T
P
 
P
V
 
L
T
 
T
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
E
 
E
F
 
I
G
 
S
A
 
G
Y
 
W
A
 
V
Q
 
A
A
 
M
I
 
L
S
 
E
R
 
H
D
 
N
R
 
L
W
 
K
R
 
H
L
 
I
Y
 
E
K
 
Y
V
 
S
E
 
L
E
 
P
R
 
H
L
 
V
R
 
A
V
 
E
V
 
L
N
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
G
T
 
T
A
 
A
V
 
V
G
 
G
T
 
T
G
 
G
V
 
L
N
 
N
A
 
T
P
 
H
L
 
P
K
 
E
Y
 
Y
I
 
A
F
 
R
K
 
R
V
 
V
I
 
A
E
 
D
I
 
E
L
 
L
R
 
A
N
 
V
L
 
I
T
 
T
K
 
C
I
 
A
G
 
P
L
 
F
A
 
V
R
 
T
S
 
A
D
 
P
Y
 
N
L
 
K
M
 
F
D
 
E
A
 
A
T
 
L
Q
 
A
N
 
T
A
 
C
D
 
D
V
 
A
F
 
L
V
 
V
E
 
Q
C
 
A
S
 
H
G
 
G
L
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
G
L
 
L
A
 
A
V
 
A
N
 
S
L
 
L
S
 
M
K
 
K
I
 
I
A
 
A
N
 
N
D
 
D
L
 
V
R
 
R
L
 
W
L
 
L
S
 
A
S
 
S
G
 
G
P
 
P
N
 
R
T
 
C
G
 
G
L
 
I
N
 
G
E
 
E
I
 
I
N
 
S
M
 
I
P
 
P
A
 
E
V
 
N
Q
 
E
A
 
P
G
 
G
S
|
S
S
 
S
I
 
I
M
 
M
P
 
P
G
 
G
K
|
K
V
 
V
N
 
N
P
 
P
V
 
T
I
 
Q
P
 
C
E
|
E
L
 
A
I
 
L
N
 
T
T
 
M
V
 
L
A
 
C
F
 
C
Q
 
Q
V
 
V
M
 
M
A
 
G
N
 
N
D
 
D
F
 
V
A
 
A
I
 
I
T
 
N
L
 
M
A
 
G
A
 
G
Q
 
A
A
 
S
G
 
G
Q
 
N
L
 
F
E
 
E
L
 
L
N
 
N
A
 
V
F
 
F
L
 
R
P
 
P
L
 
M
I
 
V
A
 
I
N
 
H
N
 
N
L
 
F
L
 
L
E
 
Q
S
 
S
L
 
V
K
 
R
I
 
L
L
 
L
K
 
A
N
 
D
G
 
G
I
 
M
K
 
E
I
 
S
F
 
F
R
 
N
Q
 
K
Q
 
H
C
 
C
I
 
A
D
 
V
G
 
G
I
 
I
T
 
E
A
 
P
N
 
N
K
 
R
E
 
E
K
 
R
C
 
I
L
 
N
E
 
Q
Y
 
L
A
 
L
K
 
N
K
 
E
T
 
S
P
 
L
A
 
M
I
 
L
A
 
V
A
 
T
S
 
A
L
 
L
I
 
N
D
 
T
R
 
H
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
A
 
A
A
 
A
E
 
E
I
 
I
A
 
A
K
 
K
K
 
K
A
 
A
I
 
H
L
 
K
E
 
E
N
 
G
K
 
L
Q
 
T
I
 
L
I
 
K
D
 
A
V
 
A
V
 
A
K
 
L
E
 
A
L
 
L
N
 
G
I
 
Y
M
 
L
D
 
S
E
 
E
K
 
A
E
 
E
A
 
F
Q
 
D
E
 
S
L
 
W
L
 
V
N
 
R
P
 
P

1fupA Fumarase with bound pyromellitic acid (see paper)
39% identity, 98% coverage: 3:453/461 of query aligns to 1:452/455 of 1fupA

query
sites
1fupA
R
 
R
I
 
S
E
 
E
K
 
K
D
 
D
F
 
S
L
 
M
G
 
G
S
 
A
I
 
I
E
 
D
L
 
V
S
 
P
D
 
A
I
 
D
E
 
K
L
 
L
Y
 
W
G
 
G
I
 
A
H
 
Q
T
 
T
K
 
Q
R
 
R
A
 
S
F
 
L
A
 
E
N
 
H
F
 
F
N
 
R
V
 
I
S
 
S
G
 
T
K
 
E
S
 
K
V
 
M
D
 
P
K
 
T
D
 
S
L
 
L
I
 
I
K
 
H
A
 
A
F
 
L
V
 
A
M
 
L
V
 
T
K
 
K
K
 
R
A
 
A
C
 
A
A
 
A
I
 
K
A
 
V
N
 
N
Y
 
E
E
 
D
V
 
L
G
 
G
L
 
L
L
 
L
D
 
S
E
 
E
K
 
E
I
 
K
K
 
A
D
 
S
A
 
A
I
 
I
V
 
R
F
 
Q
A
 
A
C
 
A
D
 
D
E
 
E
I
 
V
L
 
L
A
 
A
G
 
G
K
 
Q
Y
 
H
D
 
D
D
 
D
Q
 
E
F
 
F
I
 
P
V
 
L
D
 
A
R
 
I
F
 
W
Q
 
Q
G
 
T
G
 
G
A
 
S
G
 
G
T
|
T
S
 
Q
T
 
S
N
 
N
M
 
M
N
 
N
V
 
M
N
|
N
E
 
E
V
 
V
I
 
L
A
 
A
N
 
N
V
 
R
A
 
A
L
 
S
T
 
E
H
 
L
I
 
L
G
 
G
R
 
G
K
 
V
P
 
R
G
 
G
E
 
M
Y
 
E
D
 
R
I
 
K
I
 
V
H
 
H
P
 
P
I
 
N
N
 
D
H
 
D
V
 
V
N
 
N
M
 
K
S
 
S
Q
 
Q
S
|
S
T
x
S
N
 
N
D
 
D
V
 
V
Y
 
F
P
 
P
T
 
T
A
 
A
L
 
M
R
 
H
I
 
V
A
 
A
T
 
A
I
 
L
W
 
L
N
 
A
V
 
L
R
 
R
-
 
K
E
 
Q
L
 
L
S
 
I
E
 
P
E
 
Q
C
 
L
A
 
K
E
 
T
L
 
L
Q
 
T
K
 
Q
S
 
T
L
 
L
Q
 
N
K
 
E
K
 
K
E
 
S
H
 
R
E
 
A
F
 
F
E
 
A
D
 
D
V
 
I
I
 
V
K
 
K
A
 
I
G
 
G
R
 
R
T
|
T
Q
x
H
L
 
L
Q
 
Q
D
 
D
A
 
A
L
 
T
P
 
P
V
 
L
T
 
T
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
E
 
E
F
 
I
G
 
S
A
 
G
Y
 
W
A
 
V
Q
 
A
A
 
M
I
 
L
S
 
E
R
 
H
D
 
N
R
 
L
W
 
K
R
 
H
L
 
I
Y
 
E
K
 
Y
V
 
S
E
 
L
E
 
P
R
 
H
L
 
V
R
 
A
V
 
E
V
 
L
N
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
G
T
 
T
A
 
A
V
 
V
G
 
G
T
 
T
G
 
G
V
 
L
N
 
N
A
 
T
P
 
H
L
 
P
K
 
E
Y
 
Y
I
 
A
F
 
R
K
 
R
V
 
V
I
 
A
E
 
D
I
 
E
L
 
L
R
 
A
N
 
V
L
 
I
T
 
T
K
 
C
I
 
A
G
 
P
L
 
F
A
 
V
R
 
T
S
 
A
D
 
P
Y
 
N
L
 
K
M
 
F
D
 
E
A
 
A
T
 
L
Q
 
A
N
 
T
A
 
C
D
 
D
V
 
A
F
 
L
V
 
V
E
 
Q
C
 
A
S
 
H
G
 
G
L
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
G
L
 
L
A
 
A
V
 
A
N
 
S
L
 
L
S
 
M
K
 
K
I
 
I
A
 
A
N
 
N
D
 
D
L
 
V
R
 
R
L
 
W
L
 
L
S
 
A
S
 
S
G
 
G
P
 
P
N
 
R
T
 
C
G
 
G
L
 
I
N
 
G
E
 
E
I
 
I
N
 
S
M
 
I
P
 
P
A
 
E
V
 
N
Q
 
E
A
 
P
G
 
G
S
|
S
S
 
S
I
 
I
M
 
M
P
 
P
G
 
G
K
|
K
V
 
V
N
 
N
P
 
P
V
 
T
I
 
Q
P
 
C
E
|
E
L
 
A
I
 
L
N
 
T
T
 
M
V
 
L
A
 
C
F
 
C
Q
 
Q
V
 
V
M
 
M
A
 
G
N
 
N
D
 
D
F
 
V
A
 
A
I
 
I
T
 
N
L
 
M
A
 
G
A
 
G
Q
 
A
A
 
S
G
 
G
Q
 
N
L
 
F
E
 
E
L
 
L
N
 
N
A
 
V
F
 
F
L
 
R
P
 
P
L
 
M
I
 
V
A
 
I
N
 
H
N
 
N
L
 
F
L
 
L
E
 
Q
S
 
S
L
 
V
K
 
R
I
 
L
L
 
L
K
 
A
N
 
D
G
 
G
I
 
M
K
 
E
I
 
S
F
 
F
R
 
N
Q
 
K
Q
 
H
C
 
C
I
 
A
D
 
V
G
 
G
I
 
I
T
 
E
A
 
P
N
 
N
K
 
R
E
 
E
K
 
R
C
 
I
L
 
N
E
 
Q
Y
 
L
A
 
L
K
 
N
K
 
E
T
 
S
P
 
L
A
 
M
I
 
L
A
 
V
A
 
T
S
 
A
L
 
L
I
 
N
D
 
T
R
 
H
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
A
 
A
A
 
A
E
 
E
I
 
I
A
 
A
K
 
K
K
 
K
A
 
A
I
 
H
L
 
K
E
 
E
N
 
G
K
 
L
Q
 
T
I
 
L
I
 
K
D
 
A
V
 
A
V
 
A
K
 
L
E
 
A
L
 
L
N
 
G
I
 
Y
M
 
L
D
 
S
E
 
E
K
 
A
E
 
E
A
 
F
Q
 
D
E
 
S
L
 
W
L
 
V
N
 
R
P
 
P

6s88A Fumarate hydratase of mycobacterium tuberculosis in complex with formate and allosteric modulator n-(2-methoxy-5-((1,2,4,5-tetrahydro- 3h-benzo[d]azepin-3-yl)sulfonyl)phenyl)-2-(4-oxo-3,4- dihydrophthalazin-1-yl)acetamide (see paper)
42% identity, 98% coverage: 3:452/461 of query aligns to 2:438/450 of 6s88A

query
sites
6s88A
R
 
R
I
 
I
E
 
E
K
 
H
D
 
D
F
 
T
L
 
M
G
 
G
S
 
E
I
 
V
E
 
R
L
 
V
S
 
P
D
 
A
I
 
K
E
 
A
L
 
L
Y
 
W
G
 
R
I
 
A
H
 
Q
T
 
T
K
 
Q
R
 
R
A
 
A
F
 
V
A
 
E
N
 
N
F
 
F
N
 
P
V
 
I
S
 
S
G
 
G
K
 
R
S
 
G
V
 
L
D
 
E
K
 
R
D
 
T
L
 
Q
I
 
I
K
 
R
A
 
A
F
 
L
V
 
G
M
 
L
V
 
L
K
 
K
K
 
G
A
 
A
C
 
C
A
 
A
I
 
Q
A
 
V
N
 
N
Y
 
S
E
 
D
V
 
L
G
 
G
L
 
L
L
 
L
D
 
A
E
 
P
K
 
E
I
 
K
K
 
A
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
I
F
 
A
A
 
A
C
 
A
D
 
A
E
 
E
I
 
I
L
 
A
A
 
D
G
 
G
K
 
Q
Y
 
H
D
 
D
D
 
D
Q
 
Q
F
 
F
I
 
P
V
 
I
D
 
D
R
 
V
F
 
F
Q
 
Q
G
 
T
G
 
G
A
 
S
G
 
G
T
 
T
S
 
S
T
 
S
N
 
N
M
 
M
N
 
N
V
 
T
N
 
N
E
 
E
V
 
V
I
 
I
A
 
A
N
 
S
V
 
I
A
 
A
L
 
A
T
 
-
H
 
-
I
 
-
G
 
-
R
 
-
K
 
K
P
 
G
G
 
G
E
 
V
Y
 
-
D
 
-
I
 
T
I
 
L
H
 
H
P
 
P
I
 
N
N
 
D
H
 
D
V
 
V
N
 
N
M
 
M
S
 
S
Q
 
Q
S
 
S
T
 
S
N
 
N
D
 
D
V
 
T
Y
 
F
P
 
P
T
 
T
A
 
A
L
 
T
R
 
H
I
 
I
A
 
A
-
 
A
T
 
T
I
 
E
W
 
A
N
 
A
V
 
V
R
 
A
E
 
H
L
 
L
S
 
I
E
 
P
E
 
A
C
 
L
A
 
Q
E
 
Q
L
 
L
Q
 
H
K
 
D
S
 
A
L
 
L
Q
 
A
K
 
A
K
 
K
E
 
A
H
 
L
E
 
D
F
 
W
E
 
H
D
 
T
V
 
V
I
 
V
K
 
K
A
 
S
G
 
G
R
 
R
T
 
T
Q
 
H
L
 
L
Q
 
M
D
 
D
A
 
A
L
 
V
P
 
P
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
E
 
E
F
 
F
G
 
S
A
 
G
Y
 
Y
A
 
A
Q
 
R
A
 
Q
I
 
I
S
 
E
R
 
A
D
 
G
R
 
I
W
 
E
R
 
R
L
 
V
Y
 
R
K
 
A
V
 
C
E
 
L
E
 
P
R
 
R
L
 
L
R
 
G
V
 
E
V
 
L
N
 
A
L
 
I
G
 
G
A
 
G
T
 
T
A
 
A
V
 
V
G
 
G
T
 
T
G
 
G
V
 
L
N
 
N
A
 
A
P
 
P
L
 
D
K
 
D
Y
 
F
I
 
G
F
 
V
K
 
R
V
 
V
I
 
V
E
 
A
I
 
V
L
 
L
-
 
V
-
 
A
-
 
Q
R
 
T
N
 
G
L
 
L
T
 
S
K
 
E
I
 
L
G
 
R
L
 
T
A
 
A
R
 
A
S
 
N
D
 
S
Y
 
F
L
 
E
M
 
A
D
 
Q
A
 
A
T
 
A
Q
 
R
N
 
-
A
 
-
D
 
D
V
 
G
F
 
L
V
 
V
E
 
E
C
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
A
L
 
L
K
 
R
A
 
T
L
 
I
A
 
A
V
 
V
N
 
S
L
 
L
S
 
T
K
 
K
I
 
I
A
 
A
N
 
N
D
 
D
L
 
I
R
 
R
L
 
W
L
 
M
S
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
N
x
L
T
 
T
G
 
G
L
 
L
N
x
A
E
 
E
I
 
I
N
 
Q
M
 
L
P
 
P
A
 
D
V
 
L
Q
 
-
A
 
-
G
 
-
S
 
-
S
 
-
I
 
-
M
 
-
P
 
-
G
 
G
K
 
K
V
 
V
N
 
N
P
 
P
V
 
V
I
 
L
P
 
P
E
 
E
L
 
A
I
 
V
N
 
T
T
 
Q
V
 
V
A
 
A
F
 
A
Q
 
Q
V
 
V
M
 
I
A
 
G
N
 
N
D
 
D
F
 
A
A
 
A
I
 
I
T
 
A
L
 
W
A
 
G
A
 
G
Q
 
A
A
 
N
G
 
G
Q
 
A
L
 
F
E
 
E
L
 
L
N
 
N
A
 
V
F
 
Y
L
 
I
P
 
P
L
 
M
I
 
M
A
 
A
N
 
R
N
 
N
L
 
I
L
 
L
E
 
E
S
 
S
L
 
F
K
 
K
I
 
L
L
 
L
K
 
T
N
 
N
G
 
V
I
 
S
K
 
R
I
 
L
F
 
F
R
 
A
Q
 
Q
Q
 
R
C
 
C
I
 
I
D
 
A
G
 
G
I
 
L
T
 
T
A
 
A
N
 
N
K
 
V
E
 
E
K
x
H
C
 
L
L
 
R
E
 
R
Y
x
L
A
 
A
K
 
E
K
 
S
T
 
S
P
 
P
A
 
S
I
 
I
A
 
V
A
 
T
S
 
P
L
 
L
I
 
N
D
 
S
R
 
A
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
D
 
E
K
 
E
A
 
A
A
 
A
E
 
A
I
 
V
A
 
A
K
 
K
K
 
Q
A
 
A
I
x
L
L
 
K
E
 
E
N
x
R
K
 
K
Q
 
T
I
 
I
I
 
R
D
 
Q
V
 
T
V
 
V
K
 
I
E
 
D
L
 
R
N
 
G
I
 
L
M
 
I
D
 
G
E
 
D
K
 
R
E
 
L
A
 
S
Q
 
I
E
 
E
L
 
D
L
 
L
N
 
D

6s7wA Fumarate hydratase of mycobacterium tuberculosis in complex with formate and allosteric modulator n-(5-(azepan-1-ylsulfonyl)-2- methoxyphenyl)-2-(quinolin-4-yl)acetamide (see paper)
42% identity, 98% coverage: 3:452/461 of query aligns to 2:438/450 of 6s7wA

query
sites
6s7wA
R
 
R
I
 
I
E
 
E
K
 
H
D
 
D
F
 
T
L
 
M
G
 
G
S
 
E
I
 
V
E
 
R
L
 
V
S
 
P
D
 
A
I
 
K
E
 
A
L
 
L
Y
 
W
G
 
R
I
 
A
H
 
Q
T
 
T
K
 
Q
R
 
R
A
 
A
F
 
V
A
 
E
N
 
N
F
 
F
N
 
P
V
 
I
S
 
S
G
 
G
K
 
R
S
 
G
V
 
L
D
 
E
K
 
R
D
 
T
L
 
Q
I
 
I
K
 
R
A
 
A
F
 
L
V
 
G
M
 
L
V
 
L
K
 
K
K
 
G
A
 
A
C
 
C
A
 
A
I
 
Q
A
 
V
N
 
N
Y
 
S
E
 
D
V
 
L
G
 
G
L
 
L
L
 
L
D
 
A
E
 
P
K
 
E
I
 
K
K
 
A
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
I
F
 
A
A
 
A
C
 
A
D
 
A
E
 
E
I
 
I
L
 
A
A
 
D
G
 
G
K
 
Q
Y
 
H
D
 
D
D
 
D
Q
 
Q
F
 
F
I
 
P
V
 
I
D
 
D
R
 
V
F
 
F
Q
 
Q
G
 
T
G
 
G
A
 
S
G
 
G
T
 
T
S
 
S
T
 
S
N
 
N
M
 
M
N
 
N
V
 
T
N
 
N
E
 
E
V
 
V
I
 
I
A
 
A
N
 
S
V
 
I
A
 
A
L
 
A
T
 
-
H
 
-
I
 
-
G
 
-
R
 
-
K
 
K
P
 
G
G
 
G
E
 
V
Y
 
-
D
 
-
I
 
T
I
 
L
H
 
H
P
 
P
I
 
N
N
 
D
H
 
D
V
 
V
N
 
N
M
 
M
S
 
S
Q
 
Q
S
 
S
T
 
S
N
 
N
D
 
D
V
 
T
Y
 
F
P
 
P
T
 
T
A
 
A
L
 
T
R
 
H
I
 
I
A
 
A
-
 
A
T
 
T
I
 
E
W
 
A
N
 
A
V
 
V
R
 
A
E
 
H
L
 
L
S
 
I
E
 
P
E
 
A
C
 
L
A
 
Q
E
 
Q
L
 
L
Q
 
H
K
 
D
S
 
A
L
 
L
Q
 
A
K
 
A
K
 
K
E
 
A
H
 
L
E
 
D
F
 
W
E
 
H
D
 
T
V
 
V
I
 
V
K
 
K
A
 
S
G
 
G
R
 
R
T
 
T
Q
 
H
L
 
L
Q
 
M
D
 
D
A
 
A
L
 
V
P
 
P
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
E
 
E
F
 
F
G
 
S
A
 
G
Y
 
Y
A
 
A
Q
 
R
A
 
Q
I
 
I
S
 
E
R
 
A
D
 
G
R
 
I
W
 
E
R
 
R
L
 
V
Y
 
R
K
 
A
V
 
C
E
 
L
E
 
P
R
 
R
L
 
L
R
 
G
V
 
E
V
 
L
N
 
A
L
 
I
G
 
G
A
 
G
T
 
T
A
 
A
V
 
V
G
 
G
T
 
T
G
 
G
V
 
L
N
 
N
A
 
A
P
 
P
L
 
D
K
 
D
Y
 
F
I
 
G
F
 
V
K
 
R
V
 
V
I
 
V
E
 
A
I
 
V
L
 
L
-
 
V
-
 
A
-
 
Q
R
 
T
N
 
G
L
 
L
T
 
S
K
 
E
I
 
L
G
 
R
L
 
T
A
 
A
R
 
A
S
 
N
D
 
S
Y
 
F
L
 
E
M
 
A
D
 
Q
A
 
A
T
 
A
Q
 
R
N
 
-
A
 
-
D
 
D
V
 
G
F
 
L
V
 
V
E
 
E
C
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
A
L
 
L
K
 
R
A
 
T
L
 
I
A
 
A
V
 
V
N
 
S
L
 
L
S
 
T
K
 
K
I
 
I
A
 
A
N
 
N
D
 
D
L
 
I
R
 
R
L
 
W
L
 
M
S
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
N
x
L
T
|
T
G
 
G
L
 
L
N
x
A
E
 
E
I
 
I
N
 
Q
M
 
L
P
 
P
A
 
D
V
 
L
Q
 
-
A
 
-
G
 
-
S
 
-
S
 
-
I
 
-
M
 
-
P
 
-
G
 
G
K
 
K
V
 
V
N
 
N
P
 
P
V
 
V
I
 
L
P
 
P
E
 
E
L
 
A
I
 
V
N
 
T
T
 
Q
V
 
V
A
 
A
F
 
A
Q
 
Q
V
 
V
M
 
I
A
 
G
N
 
N
D
 
D
F
 
A
A
 
A
I
 
I
T
 
A
L
 
W
A
 
G
A
 
G
Q
 
A
A
 
N
G
 
G
Q
 
A
L
 
F
E
 
E
L
 
L
N
 
N
A
 
V
F
 
Y
L
 
I
P
 
P
L
 
M
I
 
M
A
 
A
N
 
R
N
 
N
L
 
I
L
 
L
E
 
E
S
 
S
L
 
F
K
 
K
I
 
L
L
 
L
K
 
T
N
 
N
G
 
V
I
 
S
K
 
R
I
 
L
F
 
F
R
 
A
Q
 
Q
Q
 
R
C
 
C
I
 
I
D
 
A
G
 
G
I
 
L
T
 
T
A
 
A
N
 
N
K
 
V
E
 
E
K
x
H
C
 
L
L
 
R
E
x
R
Y
x
L
A
 
A
K
 
E
K
 
S
T
 
S
P
 
P
A
 
S
I
 
I
A
 
V
A
 
T
S
 
P
L
 
L
I
 
N
D
 
S
R
 
A
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
D
 
E
K
 
E
A
 
A
A
 
A
E
 
A
I
 
V
A
 
A
K
 
K
K
 
Q
A
 
A
I
 
L
L
 
K
E
 
E
N
x
R
K
 
K
Q
 
T
I
 
I
I
 
R
D
 
Q
V
 
T
V
 
V
K
 
I
E
 
D
L
 
R
N
 
G
I
 
L
M
 
I
D
 
G
E
 
D
K
 
R
E
 
L
A
 
S
Q
 
I
E
 
E
L
 
D
L
 
L
N
 
D

6s7sA Fumarate hydratase of mycobacterium tuberculosis in complex with formate and allosteric modulator n-(2-methoxy-5-(n-phenylsulfamoyl) phenyl)-2-(4-oxo-3,4-dihydrophthalazin-1-yl)acetamide (see paper)
42% identity, 98% coverage: 3:452/461 of query aligns to 2:438/450 of 6s7sA

query
sites
6s7sA
R
 
R
I
 
I
E
 
E
K
 
H
D
 
D
F
 
T
L
 
M
G
 
G
S
 
E
I
 
V
E
 
R
L
 
V
S
 
P
D
 
A
I
 
K
E
 
A
L
 
L
Y
 
W
G
 
R
I
 
A
H
 
Q
T
 
T
K
 
Q
R
 
R
A
 
A
F
 
V
A
 
E
N
 
N
F
 
F
N
 
P
V
 
I
S
 
S
G
 
G
K
 
R
S
 
G
V
 
L
D
 
E
K
 
R
D
 
T
L
 
Q
I
 
I
K
 
R
A
 
A
F
 
L
V
 
G
M
 
L
V
 
L
K
 
K
K
 
G
A
 
A
C
 
C
A
 
A
I
 
Q
A
 
V
N
 
N
Y
 
S
E
 
D
V
 
L
G
 
G
L
 
L
L
 
L
D
 
A
E
 
P
K
 
E
I
 
K
K
 
A
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
I
F
 
A
A
 
A
C
 
A
D
 
A
E
 
E
I
 
I
L
 
A
A
 
D
G
 
G
K
 
Q
Y
 
H
D
 
D
D
 
D
Q
 
Q
F
 
F
I
 
P
V
 
I
D
 
D
R
 
V
F
 
F
Q
 
Q
G
 
T
G
 
G
A
 
S
G
 
G
T
 
T
S
 
S
T
 
S
N
 
N
M
 
M
N
 
N
V
 
T
N
 
N
E
 
E
V
 
V
I
 
I
A
 
A
N
 
S
V
 
I
A
 
A
L
 
A
T
 
-
H
 
-
I
 
-
G
 
-
R
 
-
K
 
K
P
 
G
G
 
G
E
 
V
Y
 
-
D
 
-
I
 
T
I
 
L
H
 
H
P
 
P
I
 
N
N
 
D
H
 
D
V
 
V
N
 
N
M
 
M
S
 
S
Q
 
Q
S
 
S
T
 
S
N
 
N
D
 
D
V
 
T
Y
 
F
P
 
P
T
 
T
A
 
A
L
 
T
R
 
H
I
 
I
A
 
A
-
 
A
T
 
T
I
 
E
W
 
A
N
 
A
V
 
V
R
 
A
E
 
H
L
 
L
S
 
I
E
 
P
E
 
A
C
 
L
A
 
Q
E
 
Q
L
 
L
Q
 
H
K
 
D
S
 
A
L
 
L
Q
 
A
K
 
A
K
 
K
E
 
A
H
 
L
E
 
D
F
 
W
E
 
H
D
 
T
V
 
V
I
 
V
K
 
K
A
 
S
G
 
G
R
 
R
T
 
T
Q
 
H
L
 
L
Q
 
M
D
 
D
A
 
A
L
 
V
P
 
P
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
E
 
E
F
 
F
G
 
S
A
 
G
Y
 
Y
A
 
A
Q
 
R
A
 
Q
I
 
I
S
 
E
R
 
A
D
 
G
R
 
I
W
 
E
R
 
R
L
 
V
Y
 
R
K
 
A
V
 
C
E
 
L
E
 
P
R
 
R
L
 
L
R
 
G
V
 
E
V
 
L
N
 
A
L
 
I
G
 
G
A
 
G
T
 
T
A
 
A
V
 
V
G
 
G
T
 
T
G
 
G
V
 
L
N
 
N
A
 
A
P
 
P
L
 
D
K
 
D
Y
 
F
I
 
G
F
 
V
K
 
R
V
 
V
I
 
V
E
 
A
I
 
V
L
 
L
-
 
V
-
 
A
-
 
Q
R
 
T
N
 
G
L
 
L
T
 
S
K
 
E
I
 
L
G
 
R
L
 
T
A
 
A
R
 
A
S
 
N
D
 
S
Y
 
F
L
 
E
M
 
A
D
 
Q
A
 
A
T
 
A
Q
 
R
N
 
-
A
 
-
D
 
D
V
 
G
F
 
L
V
 
V
E
 
E
C
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
A
L
 
L
K
 
R
A
 
T
L
 
I
A
 
A
V
 
V
N
 
S
L
 
L
S
 
T
K
 
K
I
 
I
A
 
A
N
 
N
D
 
D
L
 
I
R
 
R
L
 
W
L
 
M
S
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
N
x
L
T
|
T
G
 
G
L
 
L
N
x
A
E
 
E
I
 
I
N
 
Q
M
 
L
P
 
P
A
 
D
V
 
L
Q
 
-
A
 
-
G
 
-
S
 
-
S
 
-
I
 
-
M
 
-
P
 
-
G
 
G
K
 
K
V
 
V
N
 
N
P
 
P
V
 
V
I
 
L
P
 
P
E
 
E
L
 
A
I
 
V
N
 
T
T
 
Q
V
 
V
A
 
A
F
 
A
Q
 
Q
V
 
V
M
 
I
A
 
G
N
 
N
D
 
D
F
 
A
A
 
A
I
 
I
T
 
A
L
 
W
A
 
G
A
 
G
Q
 
A
A
 
N
G
 
G
Q
 
A
L
 
F
E
 
E
L
 
L
N
 
N
A
 
V
F
 
Y
L
 
I
P
 
P
L
 
M
I
 
M
A
 
A
N
 
R
N
 
N
L
 
I
L
 
L
E
 
E
S
 
S
L
 
F
K
 
K
I
 
L
L
 
L
K
 
T
N
 
N
G
 
V
I
 
S
K
 
R
I
 
L
F
 
F
R
 
A
Q
 
Q
Q
 
R
C
 
C
I
 
I
D
 
A
G
 
G
I
 
L
T
 
T
A
 
A
N
|
N
K
 
V
E
 
E
K
x
H
C
 
L
L
 
R
E
x
R
Y
x
L
A
 
A
K
 
E
K
 
S
T
 
S
P
 
P
A
 
S
I
 
I
A
 
V
A
 
T
S
 
P
L
 
L
I
 
N
D
 
S
R
 
A
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
D
 
E
K
 
E
A
 
A
A
 
A
E
 
A
I
 
V
A
 
A
K
 
K
K
 
Q
A
 
A
I
x
L
L
 
K
E
 
E
N
x
R
K
 
K
Q
 
T
I
 
I
I
 
R
D
 
Q
V
 
T
V
 
V
K
 
I
E
 
D
L
 
R
N
 
G
I
 
L
M
 
I
D
 
G
E
 
D
K
 
R
E
 
L
A
 
S
Q
 
I
E
 
E
L
 
D
L
 
L
N
 
D

6s7uA Fumarate hydratase of mycobacterium tuberculosis in complex with formate and allosteric modulator n-(5-(azepan-1-ylsulfonyl)-2- methoxyphenyl)-2-(1h-indol-3-yl)acetamide (see paper)
42% identity, 98% coverage: 3:452/461 of query aligns to 2:438/450 of 6s7uA

query
sites
6s7uA
R
 
R
I
 
I
E
 
E
K
 
H
D
 
D
F
 
T
L
 
M
G
 
G
S
 
E
I
 
V
E
 
R
L
 
V
S
 
P
D
 
A
I
 
K
E
 
A
L
 
L
Y
 
W
G
 
R
I
 
A
H
 
Q
T
 
T
K
 
Q
R
 
R
A
 
A
F
 
V
A
 
E
N
 
N
F
 
F
N
 
P
V
 
I
S
 
S
G
 
G
K
 
R
S
 
G
V
 
L
D
 
E
K
 
R
D
 
T
L
 
Q
I
 
I
K
 
R
A
 
A
F
 
L
V
 
G
M
 
L
V
 
L
K
 
K
K
 
G
A
 
A
C
 
C
A
 
A
I
 
Q
A
 
V
N
 
N
Y
 
S
E
 
D
V
 
L
G
 
G
L
 
L
L
 
L
D
 
A
E
 
P
K
 
E
I
 
K
K
 
A
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
I
F
 
A
A
 
A
C
 
A
D
 
A
E
 
E
I
 
I
L
 
A
A
 
D
G
 
G
K
 
Q
Y
 
H
D
 
D
D
 
D
Q
 
Q
F
 
F
I
 
P
V
 
I
D
 
D
R
 
V
F
 
F
Q
 
Q
G
 
T
G
 
G
A
 
S
G
 
G
T
 
T
S
 
S
T
 
S
N
 
N
M
 
M
N
 
N
V
 
T
N
 
N
E
 
E
V
 
V
I
 
I
A
 
A
N
 
S
V
 
I
A
 
A
L
 
A
T
 
-
H
 
-
I
 
-
G
 
-
R
 
-
K
 
K
P
 
G
G
 
G
E
 
V
Y
 
-
D
 
-
I
 
T
I
 
L
H
 
H
P
 
P
I
 
N
N
 
D
H
 
D
V
 
V
N
 
N
M
 
M
S
 
S
Q
 
Q
S
 
S
T
 
S
N
 
N
D
 
D
V
 
T
Y
 
F
P
 
P
T
 
T
A
 
A
L
 
T
R
 
H
I
 
I
A
 
A
-
 
A
T
 
T
I
 
E
W
 
A
N
 
A
V
 
V
R
 
A
E
 
H
L
 
L
S
 
I
E
 
P
E
 
A
C
 
L
A
 
Q
E
 
Q
L
 
L
Q
 
H
K
 
D
S
 
A
L
 
L
Q
 
A
K
 
A
K
 
K
E
 
A
H
 
L
E
 
D
F
 
W
E
 
H
D
 
T
V
 
V
I
 
V
K
 
K
A
 
S
G
 
G
R
 
R
T
 
T
Q
 
H
L
 
L
Q
 
M
D
 
D
A
 
A
L
 
V
P
 
P
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
E
 
E
F
 
F
G
 
S
A
 
G
Y
 
Y
A
 
A
Q
 
R
A
 
Q
I
 
I
S
 
E
R
 
A
D
 
G
R
 
I
W
 
E
R
 
R
L
 
V
Y
 
R
K
 
A
V
 
C
E
 
L
E
 
P
R
 
R
L
 
L
R
 
G
V
 
E
V
 
L
N
 
A
L
 
I
G
 
G
A
 
G
T
 
T
A
 
A
V
 
V
G
 
G
T
 
T
G
 
G
V
 
L
N
 
N
A
 
A
P
 
P
L
 
D
K
 
D
Y
 
F
I
 
G
F
 
V
K
 
R
V
 
V
I
 
V
E
 
A
I
 
V
L
 
L
-
 
V
-
 
A
-
 
Q
R
 
T
N
 
G
L
 
L
T
 
S
K
 
E
I
 
L
G
 
R
L
 
T
A
 
A
R
 
A
S
 
N
D
 
S
Y
 
F
L
 
E
M
 
A
D
 
Q
A
 
A
T
 
A
Q
 
R
N
 
-
A
 
-
D
 
D
V
 
G
F
 
L
V
 
V
E
 
E
C
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
A
L
 
L
K
 
R
A
 
T
L
 
I
A
 
A
V
 
V
N
 
S
L
 
L
S
 
T
K
 
K
I
 
I
A
 
A
N
 
N
D
 
D
L
 
I
R
 
R
L
 
W
L
 
M
S
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
N
x
L
T
|
T
G
 
G
L
 
L
N
 
A
E
 
E
I
 
I
N
 
Q
M
 
L
P
 
P
A
 
D
V
 
L
Q
 
Q
A
 
-
G
 
-
S
 
-
S
 
-
I
 
-
M
 
-
P
 
-
G
 
-
K
 
K
V
 
V
N
 
N
P
 
P
V
 
V
I
 
L
P
 
P
E
 
E
L
 
A
I
 
V
N
 
T
T
 
Q
V
 
V
A
 
A
F
 
A
Q
 
Q
V
 
V
M
 
I
A
 
G
N
 
N
D
 
D
F
 
A
A
 
A
I
 
I
T
 
A
L
 
W
A
 
G
A
 
G
Q
 
A
A
 
N
G
 
G
Q
 
A
L
 
F
E
 
E
L
 
L
N
 
N
A
 
V
F
 
Y
L
 
I
P
 
P
L
 
M
I
 
M
A
 
A
N
 
R
N
 
N
L
 
I
L
 
L
E
 
E
S
 
S
L
 
F
K
 
K
I
 
L
L
 
L
K
 
T
N
 
N
G
 
V
I
 
S
K
 
R
I
 
L
F
 
F
R
 
A
Q
 
Q
Q
 
R
C
 
C
I
 
I
D
 
A
G
 
G
I
 
L
T
 
T
A
 
A
N
 
N
K
 
V
E
 
E
K
x
H
C
 
L
L
 
R
E
x
R
Y
x
L
A
 
A
K
 
E
K
 
S
T
 
S
P
 
P
A
 
S
I
 
I
A
 
V
A
 
T
S
 
P
L
 
L
I
 
N
D
 
S
R
 
A
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
D
 
E
K
 
E
A
 
A
A
 
A
E
 
A
I
 
V
A
 
A
K
 
K
K
 
Q
A
 
A
I
 
L
L
 
K
E
 
E
N
x
R
K
 
K
Q
 
T
I
 
I
I
 
R
D
 
Q
V
 
T
V
 
V
K
 
I
E
 
D
L
 
R
N
 
G
I
 
L
M
 
I
D
 
G
E
 
D
K
 
R
E
 
L
A
 
S
Q
 
I
E
 
E
L
 
D
L
 
L
N
 
D

6s7kA Fumarate hydratase of mycobacterium tuberculosis in complex with formate and allosteric modulator n-(2-methoxy-5-(n-methylsulfamoyl) phenyl)-2-(4-oxo-3,4-dihydrophthalazin-1-yl)acetamide (see paper)
42% identity, 98% coverage: 3:452/461 of query aligns to 2:438/450 of 6s7kA

query
sites
6s7kA
R
 
R
I
 
I
E
 
E
K
 
H
D
 
D
F
 
T
L
 
M
G
 
G
S
 
E
I
 
V
E
 
R
L
 
V
S
 
P
D
 
A
I
 
K
E
 
A
L
 
L
Y
 
W
G
 
R
I
 
A
H
 
Q
T
 
T
K
 
Q
R
 
R
A
 
A
F
 
V
A
 
E
N
 
N
F
 
F
N
 
P
V
 
I
S
 
S
G
 
G
K
 
R
S
 
G
V
 
L
D
 
E
K
 
R
D
 
T
L
 
Q
I
 
I
K
 
R
A
 
A
F
 
L
V
 
G
M
 
L
V
 
L
K
 
K
K
 
G
A
 
A
C
 
C
A
 
A
I
 
Q
A
 
V
N
 
N
Y
 
S
E
 
D
V
 
L
G
 
G
L
 
L
L
 
L
D
 
A
E
 
P
K
 
E
I
 
K
K
 
A
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
I
F
 
A
A
 
A
C
 
A
D
 
A
E
 
E
I
 
I
L
 
A
A
 
D
G
 
G
K
 
Q
Y
 
H
D
 
D
D
 
D
Q
 
Q
F
 
F
I
 
P
V
 
I
D
 
D
R
 
V
F
 
F
Q
 
Q
G
 
T
G
 
G
A
 
S
G
 
G
T
 
T
S
 
S
T
 
S
N
 
N
M
 
M
N
 
N
V
 
T
N
 
N
E
 
E
V
 
V
I
 
I
A
 
A
N
 
S
V
 
I
A
 
A
L
 
A
T
 
-
H
 
-
I
 
-
G
 
-
R
 
-
K
 
K
P
 
G
G
 
G
E
 
V
Y
 
-
D
 
-
I
 
T
I
 
L
H
 
H
P
 
P
I
 
N
N
 
D
H
 
D
V
 
V
N
 
N
M
 
M
S
 
S
Q
 
Q
S
 
S
T
 
S
N
 
N
D
 
D
V
 
T
Y
 
F
P
 
P
T
 
T
A
 
A
L
 
T
R
 
H
I
 
I
A
 
A
-
 
A
T
 
T
I
 
E
W
 
A
N
 
A
V
 
V
R
 
A
E
 
H
L
 
L
S
 
I
E
 
P
E
 
A
C
 
L
A
 
Q
E
 
Q
L
 
L
Q
 
H
K
 
D
S
 
A
L
 
L
Q
 
A
K
 
A
K
 
K
E
 
A
H
 
L
E
 
D
F
 
W
E
 
H
D
 
T
V
 
V
I
 
V
K
 
K
A
 
S
G
 
G
R
 
R
T
 
T
Q
 
H
L
 
L
Q
 
M
D
 
D
A
 
A
L
 
V
P
 
P
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
E
 
E
F
 
F
G
 
S
A
 
G
Y
 
Y
A
 
A
Q
 
R
A
 
Q
I
 
I
S
 
E
R
 
A
D
 
G
R
 
I
W
 
E
R
 
R
L
 
V
Y
 
R
K
 
A
V
 
C
E
 
L
E
 
P
R
 
R
L
 
L
R
 
G
V
 
E
V
 
L
N
 
A
L
 
I
G
 
G
A
 
G
T
 
T
A
 
A
V
 
V
G
 
G
T
 
T
G
 
G
V
 
L
N
 
N
A
 
A
P
 
P
L
 
D
K
 
D
Y
 
F
I
 
G
F
 
V
K
 
R
V
 
V
I
 
V
E
 
A
I
 
V
L
 
L
-
 
V
-
 
A
-
 
Q
R
 
T
N
 
G
L
 
L
T
 
S
K
 
E
I
 
L
G
 
R
L
 
T
A
 
A
R
 
A
S
 
N
D
 
S
Y
 
F
L
 
E
M
 
A
D
 
Q
A
 
A
T
 
A
Q
 
R
N
 
-
A
 
-
D
 
D
V
 
G
F
 
L
V
 
V
E
 
E
C
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
A
L
 
L
K
 
R
A
 
T
L
 
I
A
 
A
V
 
V
N
 
S
L
 
L
S
 
T
K
 
K
I
 
I
A
 
A
N
 
N
D
 
D
L
 
I
R
 
R
L
 
W
L
 
M
S
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
N
x
L
T
 
T
G
 
G
L
 
L
N
x
A
E
 
E
I
 
I
N
 
Q
M
 
L
P
 
P
A
 
D
V
 
L
Q
 
Q
A
 
-
G
 
-
S
 
-
S
 
-
I
 
-
M
 
-
P
 
-
G
 
-
K
 
K
V
 
V
N
 
N
P
 
P
V
 
V
I
 
L
P
 
P
E
 
E
L
 
A
I
 
V
N
 
T
T
 
Q
V
 
V
A
 
A
F
 
A
Q
 
Q
V
 
V
M
 
I
A
 
G
N
 
N
D
 
D
F
 
A
A
 
A
I
 
I
T
 
A
L
 
W
A
 
G
A
 
G
Q
 
A
A
 
N
G
 
G
Q
 
A
L
 
F
E
 
E
L
 
L
N
 
N
A
 
V
F
 
Y
L
 
I
P
 
P
L
 
M
I
 
M
A
 
A
N
 
R
N
 
N
L
 
I
L
 
L
E
 
E
S
 
S
L
 
F
K
 
K
I
 
L
L
 
L
K
 
T
N
 
N
G
 
V
I
 
S
K
 
R
I
 
L
F
 
F
R
 
A
Q
 
Q
Q
 
R
C
 
C
I
 
I
D
 
A
G
 
G
I
 
L
T
 
T
A
 
A
N
 
N
K
 
V
E
 
E
K
x
H
C
 
L
L
 
R
E
x
R
Y
x
L
A
 
A
K
 
E
K
 
S
T
 
S
P
 
P
A
 
S
I
 
I
A
 
V
A
 
T
S
 
P
L
 
L
I
 
N
D
 
S
R
 
A
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
D
 
E
K
 
E
A
 
A
A
 
A
E
 
A
I
 
V
A
 
A
K
 
K
K
 
Q
A
 
A
I
x
L
L
 
K
E
 
E
N
x
R
K
 
K
Q
 
T
I
 
I
I
 
R
D
 
Q
V
 
T
V
 
V
K
 
I
E
 
D
L
 
R
N
 
G
I
 
L
M
 
I
D
 
G
E
 
D
K
 
R
E
 
L
A
 
S
Q
 
I
E
 
E
L
 
D
L
 
L
N
 
D

Query Sequence

>WP_013431069.1 NCBI__GCF_000166775.1:WP_013431069.1
MSRIEKDFLGSIELSDIELYGIHTKRAFANFNVSGKSVDKDLIKAFVMVKKACAIANYEV
GLLDEKIKDAIVFACDEILAGKYDDQFIVDRFQGGAGTSTNMNVNEVIANVALTHIGRKP
GEYDIIHPINHVNMSQSTNDVYPTALRIATIWNVRELSEECAELQKSLQKKEHEFEDVIK
AGRTQLQDALPVTLGQEFGAYAQAISRDRWRLYKVEERLRVVNLGATAVGTGVNAPLKYI
FKVIEILRNLTKIGLARSDYLMDATQNADVFVECSGLLKALAVNLSKIANDLRLLSSGPN
TGLNEINMPAVQAGSSIMPGKVNPVIPELINTVAFQVMANDFAITLAAQAGQLELNAFLP
LIANNLLESLKILKNGIKIFRQQCIDGITANKEKCLEYAKKTPAIAASLIDRIGYDKAAE
IAKKAILENKQIIDVVKELNIMDEKEAQELLNPFEFIKFKE

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory