SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_013452079.1 NCBI__GCF_000183405.1:WP_013452079.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3ectA Crystal structure of the hexapeptide-repeat containing- acetyltransferase vca0836 from vibrio cholerae
29% identity, 70% coverage: 43:171/183 of query aligns to 38:168/176 of 3ectA

query
sites
3ectA
V
 
A
L
 
L
L
 
Q
L
 
R
R
 
E
I
 
L
F
 
F
G
 
G
A
 
-
K
 
H
I
 
L
G
 
G
K
 
H
N
 
K
V
 
S
V
 
C
I
 
V
K
 
Q
P
 
P
C
 
P
V
 
F
N
 
H
I
 
C
K
 
E
Y
 
F
P
 
G
W
 
K
F
 
T
L
 
I
K
 
R
I
 
I
G
 
G
D
 
D
N
 
H
V
 
T
W
 
F
I
 
I
G
 
N
E
 
M
N
 
N
V
 
V
W
 
V
I
 
M
D
 
L
N
 
D
L
 
G
T
 
A
T
 
P
V
 
I
E
 
T
I
 
I
G
 
G
N
 
D
N
 
H
V
 
V
C
 
L
I
 
I
S
 
G
Q
 
P
G
 
S
A
 
T
Y
 
Q
I
 
F
F
 
Y
T
 
T
G
 
A
N
 
S
H
 
H
N
 
S
Y
 
L
-
 
D
-
 
Y
-
 
R
K
 
R
T
 
R
Q
 
Q
S
 
A
F
 
W
D
 
E
L
 
T
I
 
I
I
 
C
K
 
K
P
 
P
V
 
I
I
 
V
I
 
I
E
 
E
D
 
D
G
 
D
V
 
V
W
 
W
I
 
I
G
 
G
A
 
G
K
 
N
A
 
V
I
 
V
V
 
I
C
 
N
P
 
Q
G
|
G
V
 
V
R
 
T
C
 
I
K
 
G
S
 
A
H
 
R
S
 
S
I
 
V
L
 
V
S
 
A
V
 
A
G
 
N
S
 
S
V
 
V
A
 
V
T
 
N
K
 
Q
D
|
D
L
 
V
E
 
P
E
 
P
Y
 
D
T
 
T
V
 
L
Y
 
V
Q
 
G
G
 
G
N
 
T
P
 
P
A
 
A

3nz2C Crystal structure of hexapeptide-repeat containing-acetyltransferase vca0836 complexed with acetyl co enzyme a from vibrio cholerae o1 biovar eltor
29% identity, 70% coverage: 43:171/183 of query aligns to 45:175/183 of 3nz2C

query
sites
3nz2C
V
 
A
L
 
L
L
 
Q
L
 
R
R
 
E
I
 
L
F
 
F
G
 
G
A
 
-
K
 
H
I
 
L
G
 
G
K
 
H
N
 
K
V
 
S
V
 
C
I
 
V
K
 
Q
P
 
P
C
 
P
V
 
F
N
 
H
I
 
C
K
 
E
Y
 
F
P
 
G
W
 
K
F
 
T
L
 
I
K
 
R
I
 
I
G
 
G
D
 
D
N
 
H
V
 
T
W
 
F
I
 
I
G
 
N
E
 
M
N
 
N
V
 
V
W
 
V
I
 
M
D
 
L
N
 
D
L
 
G
T
 
A
T
 
P
V
 
I
E
 
T
I
 
I
G
 
G
N
 
D
N
 
H
V
 
V
C
 
L
I
 
I
S
 
G
Q
 
P
G
 
S
A
 
T
Y
 
Q
I
 
F
F
x
Y
T
 
T
G
 
A
N
 
S
H
|
H
N
 
S
Y
 
L
-
 
D
-
 
Y
-
 
R
K
 
R
T
 
R
Q
 
Q
S
 
A
F
 
W
D
 
E
L
 
T
I
 
I
I
 
C
K
 
K
P
 
P
V
 
I
I
 
V
I
 
I
E
 
E
D
 
D
G
 
D
V
 
V
W
 
W
I
 
I
G
|
G
A
 
G
K
 
N
A
 
V
I
 
V
V
 
I
C
 
N
P
 
Q
G
 
G
V
 
V
R
 
T
C
 
I
K
 
G
S
 
A
H
 
R
S
 
S
I
 
V
L
 
V
S
x
A
V
x
A
G
x
N
S
 
S
V
 
V
A
 
V
T
x
N
K
 
Q
D
 
D
L
 
V
E
 
P
E
 
P
Y
 
D
T
 
T
V
 
L
Y
 
V
Q
x
G
G
 
G
N
x
T
P
|
P
A
 
A

Sites not aligning to the query:

3nz2J Crystal structure of hexapeptide-repeat containing-acetyltransferase vca0836 complexed with acetyl co enzyme a from vibrio cholerae o1 biovar eltor
29% identity, 70% coverage: 43:171/183 of query aligns to 48:178/185 of 3nz2J

query
sites
3nz2J
V
 
A
L
 
L
L
 
Q
L
 
R
R
 
E
I
 
L
F
 
F
G
 
G
A
 
-
K
 
H
I
 
L
G
 
G
K
 
H
N
 
K
V
 
S
V
 
C
I
 
V
K
 
Q
P
 
P
C
 
P
V
 
F
N
 
H
I
 
C
K
 
E
Y
 
F
P
 
G
W
 
K
F
 
T
L
 
I
K
 
R
I
 
I
G
 
G
D
 
D
N
 
H
V
 
T
W
 
F
I
 
I
G
 
N
E
 
M
N
 
N
V
 
V
W
 
V
I
 
M
D
 
L
N
 
D
L
 
G
T
 
A
T
 
P
V
 
I
E
 
T
I
 
I
G
 
G
N
 
D
N
 
H
V
 
V
C
 
L
I
 
I
S
x
G
Q
 
P
G
 
S
A
 
T
Y
 
Q
I
 
F
F
x
Y
T
 
T
G
 
A
N
 
S
H
|
H
N
 
S
Y
 
L
-
 
D
-
 
Y
-
 
R
K
 
R
T
 
R
Q
 
Q
S
 
A
F
 
W
D
 
E
L
 
T
I
 
I
I
 
C
K
 
K
P
 
P
V
 
I
I
 
V
I
 
I
E
 
E
D
 
D
G
 
D
V
 
V
W
|
W
I
 
I
G
|
G
A
 
G
K
 
N
A
 
V
I
 
V
V
 
I
C
 
N
P
 
Q
G
 
G
V
 
V
R
 
T
C
 
I
K
 
G
S
 
A
H
 
R
S
 
S
I
 
V
L
 
V
S
x
A
V
x
A
G
 
N
S
 
S
V
 
V
A
 
V
T
x
N
K
 
Q
D
 
D
L
 
V
E
 
P
E
 
P
Y
 
D
T
 
T
V
 
L
Y
 
V
Q
x
G
G
 
G
N
x
T
P
|
P
A
 
A

Sites not aligning to the query:

4isxA The crystal structure of maltose o-acetyltransferase from clostridium difficile 630 in complex with acetyl-coa
30% identity, 78% coverage: 29:171/183 of query aligns to 34:178/186 of 4isxA

query
sites
4isxA
L
 
L
F
 
F
F
 
N
K
 
N
T
 
T
S
 
L
I
 
E
P
 
D
Y
 
E
P
 
Y
S
 
E
K
 
K
I
 
R
K
 
E
V
 
D
L
 
I
L
 
L
L
 
R
R
 
Q
I
 
L
F
 
F
G
 
G
A
 
S
K
 
-
I
 
V
G
 
G
K
 
K
N
 
Q
V
 
I
V
 
N
I
 
V
K
 
E
P
 
Q
C
 
N
V
 
I
N
 
R
I
 
C
K
 
D
Y
 
Y
P
 
G
W
 
Y
F
 
N
L
 
I
K
 
H
I
 
V
G
 
G
D
 
E
N
 
N
V
 
F
W
 
F
I
 
A
G
x
N
E
 
Y
N
 
D
V
 
C
W
 
I
I
 
F
D
 
L
N
 
D
L
 
V
T
 
C
T
 
K
V
 
I
E
 
E
I
 
I
G
 
G
N
 
D
N
 
N
V
 
V
C
 
M
I
 
L
S
x
A
Q
 
P
G
 
N
A
 
V
Y
 
Q
I
 
I
F
 
Y
T
 
T
G
 
A
N
 
Y
H
 
H
N
 
P
Y
 
I
K
 
D
T
 
A
Q
 
Q
S
 
L
F
 
R
D
 
N
L
 
S
I
 
G
I
 
I
K
 
E
-
 
Y
-
 
G
-
 
S
P
 
P
V
 
V
I
 
K
I
 
I
E
 
G
D
 
D
G
 
N
V
 
V
W
|
W
I
 
I
G
|
G
A
x
G
K
 
G
A
 
V
I
 
I
V
 
I
C
 
T
P
 
P
G
 
G
V
 
I
R
 
T
C
 
I
K
 
G
S
 
D
H
 
N
S
 
V
I
 
V
L
 
I
S
 
G
V
x
A
G
 
G
S
 
S
V
 
V
A
 
V
T
 
T
K
 
K
D
 
D
L
 
I
E
 
P
E
 
P
Y
 
N
T
 
T
V
 
V
Y
 
A
Q
x
V
G
 
G
N
 
N
P
 
P
A
 
C

Sites not aligning to the query:

5u2kA Crystal structure of galactoside o-acetyltransferase complex with coa (h3 space group)
30% identity, 75% coverage: 39:176/183 of query aligns to 44:183/190 of 5u2kA

query
sites
5u2kA
S
 
N
K
 
K
I
 
R
K
 
K
V
 
E
L
 
L
L
 
I
L
 
D
R
 
Q
I
 
L
F
 
F
G
 
Q
A
 
T
K
 
T
I
 
T
G
 
-
K
 
D
N
 
N
V
 
V
V
 
S
I
 
I
K
 
S
P
 
I
C
 
P
V
 
F
N
 
D
I
 
T
K
 
D
Y
 
Y
P
 
G
W
 
W
F
 
N
L
 
V
K
 
K
I
 
L
G
 
G
D
 
K
N
 
N
V
 
V
W
 
Y
I
 
V
G
 
N
E
 
T
N
 
N
V
 
C
W
 
Y
I
 
F
D
x
M
N
 
D
L
 
G
T
 
G
T
 
Q
V
 
I
E
 
T
I
 
I
G
 
G
N
 
D
N
 
N
V
 
V
C
 
F
I
 
I
S
 
G
Q
 
P
G
 
N
A
 
C
Y
 
G
I
 
F
F
x
Y
T
 
T
G
x
A
N
 
T
H
|
H
-
 
P
-
 
L
-
 
N
-
 
F
N
 
H
Y
 
H
K
 
R
T
 
N
Q
 
E
S
 
G
F
 
F
D
 
E
L
 
K
I
 
A
I
 
-
K
 
G
P
 
P
V
 
I
I
 
H
I
 
I
E
 
G
D
 
S
G
 
N
V
 
T
W
 
W
I
 
F
G
 
G
A
 
G
K
 
H
A
 
V
I
 
A
V
 
V
C
x
L
P
 
P
G
 
G
V
 
V
R
 
T
C
 
I
K
 
G
S
 
E
H
 
G
S
 
S
I
 
V
L
 
I
S
 
G
V
 
A
G
 
G
S
 
S
V
 
V
A
 
V
T
|
T
K
|
K
D
 
D
L
 
I
E
 
P
E
 
P
Y
 
H
T
 
S
V
 
L
Y
 
A
Q
 
V
G
 
G
N
 
N
P
 
P
A
 
C
V
 
K
P
 
V
K
 
V
R
 
R
K
 
K

1krrA Galactoside acetyltransferase in complex with acetyl-coenzyme a (see paper)
29% identity, 78% coverage: 29:170/183 of query aligns to 31:177/200 of 1krrA

query
sites
1krrA
L
 
L
F
 
M
F
 
Y
K
 
E
T
 
F
S
 
N
I
 
H
P
 
S
Y
 
H
P
 
P
S
 
S
K
 
E
I
 
V
-
 
E
-
 
K
K
 
R
V
 
E
L
 
S
L
 
L
L
 
I
R
 
K
I
 
E
F
 
M
G
 
F
A
 
A
K
 
T
I
 
V
G
 
G
K
 
E
N
 
N
V
 
A
V
 
W
I
 
V
K
 
E
P
 
P
C
 
P
V
 
V
N
 
Y
I
 
F
K
 
S
Y
 
Y
P
 
G
W
 
S
F
 
N
L
 
I
K
 
H
I
 
I
G
 
G
D
 
R
N
 
N
V
 
F
W
 
Y
I
 
A
G
x
N
E
 
F
N
 
N
V
 
L
W
 
T
I
 
I
D
 
V
N
 
D
L
 
D
T
 
Y
T
 
T
V
 
V
E
 
T
I
 
I
G
 
G
N
 
D
N
 
N
V
 
V
C
 
L
I
|
I
S
x
A
Q
x
P
G
 
N
A
 
V
Y
 
T
I
 
L
-
 
S
F
 
V
T
|
T
G
 
G
N
x
H
-
 
P
-
 
V
H
 
H
N
 
H
Y
 
E
K
 
L
T
 
R
Q
 
K
S
 
N
F
 
G
D
 
E
L
 
M
I
 
Y
I
 
S
K
 
F
P
 
P
V
 
I
I
 
T
I
 
I
E
 
G
D
 
N
G
 
N
V
 
V
W
 
W
I
 
I
G
|
G
A
x
S
K
 
H
A
 
V
I
 
V
V
 
I
C
x
N
P
 
P
G
 
G
V
 
V
R
 
T
C
 
I
K
 
G
S
 
D
H
 
N
S
 
S
I
 
V
L
 
I
S
x
G
V
x
A
G
 
G
S
 
S
V
 
I
A
 
V
T
 
T
K
 
K
D
 
D
L
 
I
E
 
P
E
 
P
Y
 
N
T
 
V
V
 
V
Y
 
A
Q
x
A
G
 
G
N
 
V
P
|
P

Sites not aligning to the query:

P07464 Galactoside O-acetyltransferase; GAT; Acetyl-CoA:galactoside 6-O-acetyltransferase; Thiogalactoside acetyltransferase; Thiogalactoside transacetylase; EC 2.3.1.18 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
29% identity, 78% coverage: 29:170/183 of query aligns to 32:178/203 of P07464

query
sites
P07464
L
 
L
F
 
M
F
 
Y
K
 
E
T
 
F
S
 
N
I
 
H
P
 
S
Y
 
H
P
 
P
S
 
S
K
 
E
I
 
V
-
 
E
-
 
K
K
 
R
V
 
E
L
 
S
L
 
L
L
 
I
R
 
K
I
 
E
F
 
M
G
 
F
A
 
A
K
 
T
I
 
V
G
 
G
K
 
E
N
 
N
V
 
A
V
 
W
I
 
V
K
 
E
P
 
P
C
 
P
V
 
V
N
 
Y
I
 
F
K
x
S
Y
 
Y
P
 
G
W
 
S
F
 
N
L
 
I
K
 
H
I
 
I
G
 
G
D
 
R
N
 
N
V
 
F
W
 
Y
I
 
A
G
x
N
E
 
F
N
 
N
V
 
L
W
 
T
I
 
I
D
 
V
N
 
D
L
x
D
T
 
Y
T
 
T
V
 
V
E
 
T
I
 
I
G
 
G
N
 
D
N
 
N
V
 
V
C
 
L
I
 
I
S
 
A
Q
 
P
G
 
N
A
 
V
Y
 
T
I
 
L
-
 
S
F
 
V
T
 
T
G
 
G
N
x
H
-
 
P
-
 
V
H
 
H
N
 
H
Y
 
E
K
 
L
T
 
R
Q
 
K
S
 
N
F
 
G
D
 
E
L
 
M
I
 
Y
I
 
S
K
 
F
P
 
P
V
 
I
I
 
T
I
 
I
E
 
G
D
 
N
G
 
N
V
 
V
W
 
W
I
 
I
G
 
G
A
x
S
K
 
H
A
 
V
I
 
V
V
 
I
C
 
N
P
 
P
G
 
G
V
 
V
R
 
T
C
 
I
K
 
G
S
 
D
H
 
N
S
 
S
I
 
V
L
 
I
S
 
G
V
x
A
G
 
G
S
 
S
V
 
I
A
 
V
T
|
T
K
|
K
D
 
D
L
 
I
E
 
P
E
 
P
Y
 
N
T
 
V
V
 
V
Y
 
A
Q
 
A
G
 
G
N
 
V
P
 
P

Sites not aligning to the query:

1krvA Galactoside acetyltransferase in complex with coa and pnp-beta-gal (see paper)
29% identity, 78% coverage: 29:170/183 of query aligns to 31:177/201 of 1krvA

query
sites
1krvA
L
 
L
F
 
M
F
 
Y
K
 
E
T
 
F
S
 
N
I
 
H
P
 
S
Y
 
H
P
 
P
S
 
S
K
 
E
I
 
V
-
 
E
-
 
K
K
 
R
V
 
E
L
 
S
L
 
L
L
 
I
R
 
K
I
 
E
F
 
M
G
 
F
A
 
A
K
 
T
I
 
V
G
 
G
K
 
E
N
 
N
V
 
A
V
 
W
I
 
V
K
 
E
P
 
P
C
 
P
V
 
V
N
 
Y
I
 
F
K
x
S
Y
 
Y
P
 
G
W
 
S
F
 
N
L
 
I
K
 
H
I
 
I
G
 
G
D
 
R
N
 
N
V
 
F
W
x
Y
I
 
A
G
x
N
E
 
F
N
 
N
V
 
L
W
 
T
I
 
I
D
x
V
N
 
D
L
x
D
T
 
Y
T
 
T
V
 
V
E
 
T
I
 
I
G
 
G
N
 
D
N
 
N
V
 
V
C
 
L
I
 
I
S
x
A
Q
 
P
G
 
N
A
 
V
Y
 
T
I
 
L
-
x
S
F
 
V
T
|
T
G
 
G
N
 
H
-
 
P
-
 
V
H
 
H
N
 
H
Y
 
E
K
 
L
T
 
R
Q
 
K
S
 
N
F
 
G
D
 
E
L
x
M
I
 
Y
I
 
S
K
 
F
P
 
P
V
 
I
I
 
T
I
 
I
E
 
G
D
 
N
G
 
N
V
 
V
W
|
W
I
 
I
G
|
G
A
x
S
K
 
H
A
 
V
I
 
V
V
 
I
C
x
N
P
 
P
G
 
G
V
 
V
R
 
T
C
 
I
K
 
G
S
 
D
H
 
N
S
 
S
I
 
V
L
 
I
S
 
G
V
x
A
G
 
G
S
 
S
V
 
I
A
 
V
T
 
T
K
 
K
D
 
D
L
 
I
E
 
P
E
 
P
Y
 
N
T
 
V
V
 
V
Y
 
A
Q
 
A
G
 
G
N
 
V
P
|
P

Sites not aligning to the query:

1kruA Galactoside acetyltransferase in complex with iptg and coenzyme a (see paper)
29% identity, 78% coverage: 29:170/183 of query aligns to 31:177/201 of 1kruA

query
sites
1kruA
L
 
L
F
 
M
F
 
Y
K
 
E
T
 
F
S
 
N
I
 
H
P
 
S
Y
 
H
P
 
P
S
 
S
K
 
E
I
 
V
-
 
E
-
 
K
K
 
R
V
 
E
L
 
S
L
 
L
L
 
I
R
 
K
I
 
E
F
 
M
G
 
F
A
 
A
K
 
T
I
 
V
G
 
G
K
 
E
N
 
N
V
 
A
V
x
W
I
 
V
K
 
E
P
 
P
C
 
P
V
 
V
N
 
Y
I
 
F
K
x
S
Y
 
Y
P
 
G
W
 
S
F
 
N
L
 
I
K
 
H
I
 
I
G
 
G
D
 
R
N
 
N
V
 
F
W
x
Y
I
 
A
G
x
N
E
 
F
N
 
N
V
 
L
W
 
T
I
 
I
D
x
V
N
 
D
L
x
D
T
 
Y
T
 
T
V
 
V
E
 
T
I
 
I
G
 
G
N
 
D
N
 
N
V
 
V
C
x
L
I
 
I
S
 
A
Q
 
P
G
 
N
A
 
V
Y
 
T
I
 
L
-
 
S
F
 
V
T
 
T
G
 
G
N
x
H
-
 
P
-
 
V
H
 
H
N
 
H
Y
 
E
K
 
L
T
 
R
Q
 
K
S
 
N
F
 
G
D
 
E
L
x
M
I
 
Y
I
 
S
K
 
F
P
 
P
V
 
I
I
 
T
I
 
I
E
 
G
D
 
N
G
 
N
V
 
V
W
|
W
I
 
I
G
|
G
A
x
S
K
 
H
A
 
V
I
 
V
V
 
I
C
 
N
P
 
P
G
 
G
V
 
V
R
 
T
C
 
I
K
 
G
S
 
D
H
 
N
S
 
S
I
 
V
L
 
I
S
x
G
V
x
A
G
 
G
S
 
S
V
 
I
A
 
V
T
 
T
K
 
K
D
 
D
L
 
I
E
 
P
E
 
P
Y
 
N
T
 
V
V
 
V
Y
 
A
Q
 
A
G
 
G
N
 
V
P
|
P

Sites not aligning to the query:

3igjC Crystal structure of maltose o-acetyltransferase complexed with acetyl coenzyme a from bacillus anthracis
30% identity, 70% coverage: 43:171/183 of query aligns to 49:180/188 of 3igjC

query
sites
3igjC
V
 
T
L
 
L
L
 
L
L
 
N
R
 
Q
I
 
L
F
 
L
G
 
G
A
 
S
K
 
S
I
 
A
G
 
D
K
 
G
N
 
K
V
 
A
V
 
Q
I
 
I
K
 
N
P
 
P
C
 
D
V
 
F
N
 
R
I
 
C
K
 
D
Y
 
Y
P
 
G
W
 
Y
F
 
N
L
 
I
K
 
H
I
 
V
G
 
G
D
 
K
N
 
S
V
 
F
W
x
F
I
 
A
G
 
N
E
 
F
N
 
N
V
 
C
W
 
V
I
 
I
D
 
L
N
 
D
L
 
V
T
 
C
T
 
E
V
 
V
E
 
R
I
 
I
G
 
G
N
 
D
N
 
H
V
 
C
C
 
M
I
 
F
S
x
A
Q
 
P
G
 
G
A
 
V
Y
 
H
I
 
I
F
x
Y
T
 
T
G
x
A
N
 
T
H
|
H
N
 
P
Y
 
L
-
 
H
-
 
P
-
 
V
K
 
E
T
 
R
Q
 
N
S
 
S
F
 
G
D
 
K
L
 
E
I
 
Y
I
 
G
K
 
K
P
 
P
V
 
V
I
 
K
I
 
I
E
 
G
D
 
N
G
 
N
V
 
V
W
 
W
I
 
V
G
|
G
A
 
G
K
 
G
A
 
A
I
 
I
V
 
I
C
x
N
P
 
P
G
 
G
V
 
V
R
 
S
C
 
I
K
 
G
S
 
D
H
 
N
S
 
A
I
 
V
L
 
I
S
x
A
V
x
S
G
 
G
S
 
A
V
 
V
A
 
V
T
|
T
K
 
K
D
 
D
L
 
V
E
 
P
E
 
N
Y
 
N
T
 
V
V
 
V
Y
 
V
Q
 
G
G
 
G
N
|
N
P
 
P
A
 
A

8j40A Crystal structure of catb8 in complex with chloramphenicol (see paper)
26% identity, 52% coverage: 86:181/183 of query aligns to 51:167/209 of 8j40A

query
sites
8j40A
D
 
E
N
 
D
L
 
V
T
 
D
T
 
K
V
 
L
E
 
I
I
 
I
G
 
G
N
 
S
N
 
F
V
 
C
C
 
S
I
 
I
S
 
G
Q
 
S
G
 
G
A
 
A
-
 
S
Y
 
F
I
 
I
F
 
M
T
 
A
G
 
G
N
 
N
H
 
Q
N
 
G
Y
 
H
K
 
Q
-
 
H
-
 
D
-
 
W
-
 
A
-
 
S
-
 
S
-
 
F
-
 
P
-
 
F
-
 
F
-
x
Y
-
 
M
-
 
Q
-
 
E
-
 
E
-
 
P
-
 
A
-
 
F
T
 
S
Q
 
R
S
 
A
F
 
L
D
 
D
L
 
A
I
 
F
I
 
Q
K
 
R
P
 
A
-
 
G
-
 
D
V
 
T
I
 
V
I
 
I
E
 
G
D
 
N
G
 
D
V
 
V
W
|
W
I
 
I
G
 
G
A
 
S
K
 
E
A
 
A
I
 
M
V
 
I
C
 
M
P
 
P
G
 
G
V
 
I
R
 
K
C
 
I
K
 
G
S
 
D
H
 
G
S
 
A
I
x
V
L
 
I
S
 
G
V
x
S
G
 
R
S
 
S
V
 
L
A
 
V
T
 
T
K
 
K
D
 
D
L
 
V
E
 
E
E
 
P
Y
 
Y
T
 
A
V
 
I
Y
 
I
Q
 
G
G
 
G
N
 
N
P
 
P
A
 
A
V
 
K
P
 
Q
K
 
I
R
 
K
K
 
K
R
 
R
I
 
F
I
 
S
D
 
D
D
 
E

Sites not aligning to the query:

2xatA Complex of the hexapeptide xenobiotic acetyltransferase with chloramphenicol and desulfo-coenzyme a (see paper)
28% identity, 52% coverage: 86:180/183 of query aligns to 50:165/208 of 2xatA

query
sites
2xatA
D
 
D
N
 
D
L
 
V
T
 
D
T
 
K
V
 
L
E
 
V
I
 
I
G
 
G
N
 
S
N
 
F
V
 
C
C
 
S
I
 
I
S
 
G
Q
 
S
G
 
G
A
 
A
-
 
A
Y
 
F
I
 
I
F
 
M
T
 
A
G
 
G
N
 
N
H
 
Q
N
 
G
Y
 
H
K
 
R
T
 
A
Q
 
E
-
 
W
-
 
A
-
 
S
-
 
T
-
 
F
S
 
P
F
 
F
D
 
H
L
 
F
I
 
M
I
 
H
K
 
E
P
 
E
-
 
P
-
 
A
-
 
F
-
 
A
-
 
G
-
 
A
-
 
V
-
 
N
-
 
G
-
 
Y
-
 
Q
-
 
P
-
 
A
-
 
G
-
 
D
V
 
T
I
 
L
I
 
I
E
 
G
D
 
H
G
 
E
V
 
V
W
 
W
I
 
I
G
|
G
A
x
T
K
 
E
A
 
A
I
 
M
V
 
F
C
 
M
P
 
P
G
 
G
V
 
V
R
 
R
C
 
V
K
 
G
S
 
H
H
 
G
S
 
A
I
 
I
L
 
I
S
x
G
V
x
S
G
 
R
S
 
A
V
 
L
A
 
V
T
 
T
K
 
G
D
 
D
L
 
V
E
 
E
E
 
P
Y
 
Y
T
 
A
V
 
I
Y
 
V
Q
x
G
G
|
G
N
 
N
P
 
P
A
 
A
V
 
R
P
 
T
K
x
I
R
 
R
K
 
K
R
 
R
I
 
F
I
 
S
D
 
D

Sites not aligning to the query:

3dhoA Structure of streptogramin acetyltransferase in complex with an inhibitor
36% identity, 32% coverage: 124:181/183 of query aligns to 114:171/203 of 3dhoA

query
sites
3dhoA
V
 
T
I
 
I
I
 
I
E
 
G
D
 
N
G
 
D
V
 
V
W
 
W
I
 
I
G
 
G
A
 
K
K
 
D
A
 
V
I
 
V
V
 
I
C
 
M
P
 
P
G
 
G
V
 
V
R
 
K
C
 
I
K
 
G
S
 
D
H
 
G
S
 
A
I
|
I
L
 
V
S
x
A
V
 
A
G
 
N
S
 
S
V
 
V
A
 
V
T
x
V
K
 
K
D
 
D
L
 
I
E
 
A
E
 
P
Y
 
Y
T
 
M
V
x
L
Y
 
A
Q
x
G
G
 
G
N
 
N
P
|
P
A
 
A
V
 
N
P
 
E
K
x
I
R
 
K
K
 
Q
R
 
R
I
 
F
I
 
D
D
 
Q
D
 
D

Sites not aligning to the query:

1khrA Crystal structure of vat(d) in complex with virginiamycin and coenzyme a (see paper)
36% identity, 32% coverage: 124:181/183 of query aligns to 114:171/206 of 1khrA

query
sites
1khrA
V
 
T
I
 
I
I
 
I
E
 
G
D
 
N
G
 
D
V
 
V
W
|
W
I
 
I
G
 
G
A
 
K
K
 
D
A
 
V
I
 
V
V
 
I
C
 
M
P
 
P
G
 
G
V
 
V
R
 
K
C
 
I
K
 
G
S
 
D
H
 
G
S
 
A
I
 
I
L
 
V
S
x
A
V
x
A
G
 
N
S
 
S
V
 
V
A
 
V
T
x
V
K
 
K
D
 
D
L
 
I
E
 
A
E
 
P
Y
 
Y
T
 
M
V
x
L
Y
 
A
Q
x
G
G
 
G
N
 
N
P
|
P
A
 
A
V
 
N
P
 
E
K
x
I
R
 
K
K
 
Q
R
 
R
I
 
F
I
 
D
D
 
Q
D
 
D

Sites not aligning to the query:

P50870 Streptogramin A acetyltransferase; Virginiamycin acetyltransferase D; Vat(D); EC 2.3.1.- from Enterococcus faecium (Streptococcus faecium) (see paper)
36% identity, 32% coverage: 124:181/183 of query aligns to 114:171/209 of P50870

query
sites
P50870
V
 
T
I
 
I
I
 
I
E
 
G
D
 
N
G
 
D
V
 
V
W
 
W
I
 
I
G
 
G
A
 
K
K
 
D
A
 
V
I
 
V
V
 
I
C
 
M
P
 
P
G
 
G
V
 
V
R
 
K
C
 
I
K
 
G
S
 
D
H
 
G
S
 
A
I
 
I
L
 
V
S
 
A
V
 
A
G
 
N
S
 
S
V
 
V
A
 
V
T
 
V
K
 
K
D
 
D
L
 
I
E
 
A
E
 
P
Y
 
Y
T
 
M
V
 
L
Y
 
A
Q
 
G
G
 
G
N
 
N
P
 
P
A
 
A
V
 
N
P
 
E
K
 
I
R
 
K
K
 
Q
R
 
R
I
 
F
I
 
D
D
 
Q
D
 
D

Sites not aligning to the query:

1mrlA Crystal structure of streptogramin a acetyltransferase with dalfopristin (see paper)
36% identity, 32% coverage: 124:181/183 of query aligns to 114:171/204 of 1mrlA

query
sites
1mrlA
V
 
T
I
 
I
I
 
I
E
 
G
D
 
N
G
 
D
V
 
V
W
 
W
I
 
I
G
 
G
A
 
K
K
 
D
A
 
V
I
 
V
V
 
I
C
 
M
P
 
P
G
 
G
V
 
V
R
 
K
C
 
I
K
 
G
S
 
D
H
 
G
S
 
A
I
 
I
L
 
V
S
 
A
V
 
A
G
 
N
S
 
S
V
 
V
A
 
V
T
 
V
K
 
K
D
 
D
L
 
I
E
 
A
E
 
P
Y
 
Y
T
 
M
V
 
L
Y
 
A
Q
 
G
G
 
G
N
 
N
P
 
P
A
 
A
V
 
N
P
 
E
K
 
I
R
 
K
K
 
Q
R
 
R
I
 
F
I
 
D
D
 
Q
D
 
D

Sites not aligning to the query:

1kk4A Crystal structure of vat(d) in complex with acetyl-coa (see paper)
36% identity, 32% coverage: 124:181/183 of query aligns to 114:171/205 of 1kk4A

query
sites
1kk4A
V
 
T
I
 
I
I
 
I
E
 
G
D
 
N
G
 
D
V
 
V
W
|
W
I
 
I
G
|
G
A
x
K
K
 
D
A
 
V
I
 
V
V
 
I
C
 
M
P
 
P
G
 
G
V
 
V
R
 
K
C
 
I
K
 
G
S
 
D
H
 
G
S
 
A
I
 
I
L
 
V
S
x
A
V
x
A
G
 
N
S
 
S
V
 
V
A
 
V
T
x
V
K
|
K
D
 
D
L
 
I
E
 
A
E
 
P
Y
 
Y
T
 
M
V
x
L
Y
 
A
Q
x
G
G
|
G
N
 
N
P
|
P
A
 
A
V
 
N
P
 
E
K
x
I
R
 
K
K
 
Q
R
 
R
I
 
F
I
 
D
D
 
Q
D
 
D

Sites not aligning to the query:

4hurA Crystal structure of streptogramin group a antibiotic acetyltransferase vata from staphylococcus aureus in complex with acetyl coenzyme a (see paper)
33% identity, 59% coverage: 73:180/183 of query aligns to 56:169/211 of 4hurA

query
sites
4hurA
I
 
I
G
 
G
D
 
D
N
 
K
V
 
L
W
 
I
I
 
I
G
 
G
E
 
R
N
 
F
V
 
C
W
x
S
I
|
I
D
x
G
N
 
P
L
 
G
T
 
T
T
 
T
-
 
F
V
 
I
E
 
M
I
 
N
G
 
G
N
x
A
N
|
N
V
 
H
C
 
R
I
 
M
S
 
D
Q
 
G
G
 
S
A
 
T
Y
 
Y
I
 
P
F
 
F
-
 
H
-
 
L
-
 
F
-
 
R
T
 
M
G
 
G
N
 
W
H
 
E
N
 
K
Y
 
Y
K
 
M
T
 
P
Q
 
S
S
 
L
F
 
K
D
 
D
L
 
L
I
 
P
I
 
L
K
|
K
P
 
G
V
 
D
I
 
I
-
 
E
I
 
I
E
 
G
D
 
N
G
 
D
V
 
V
W
|
W
I
|
I
G
|
G
A
x
R
K
 
D
A
 
V
I
 
T
V
 
I
C
x
M
P
 
P
G
 
G
V
 
V
R
 
K
C
 
I
K
 
G
S
 
D
H
 
G
S
 
A
I
 
I
L
 
I
S
x
A
V
x
A
G
 
E
S
 
A
V
 
V
A
 
V
T
|
T
K
 
K
D
 
N
L
 
V
E
 
A
E
 
P
Y
 
Y
T
 
S
V
 
I
Y
 
V
Q
x
G
G
 
G
N
 
N
P
|
P
A
 
L
V
 
K
P
 
F
K
x
I
R
|
R
K
 
K
R
 
R
I
 
F
I
 
S
D
 
D

Sites not aligning to the query:

6u9cA The 2.2 a crystal structure of the type b chloramphenicol acetyltransferase from vibrio cholerae in the complex with acetyl coa
28% identity, 52% coverage: 86:180/183 of query aligns to 51:165/206 of 6u9cA

query
sites
6u9cA
D
 
D
N
 
D
L
 
V
T
 
D
T
 
K
V
 
L
E
 
V
I
 
I
G
 
G
N
 
S
N
 
F
V
 
C
C
 
S
I
 
I
S
 
G
Q
 
S
G
 
G
A
 
A
-
 
V
Y
 
F
I
 
M
F
 
M
T
 
A
G
 
G
N
 
N
H
 
Q
N
 
G
Y
 
H
K
 
R
T
 
S
-
 
D
-
 
W
-
 
I
Q
 
S
S
 
T
F
 
F
D
 
P
L
 
F
I
 
F
I
 
Y
K
 
Q
P
 
D
-
 
N
-
 
D
-
 
N
-
 
F
-
 
A
-
 
D
-
 
A
-
 
R
-
 
D
-
 
G
-
 
F
-
 
T
-
 
R
-
 
S
-
 
G
-
 
D
V
 
T
I
 
I
I
 
I
E
 
G
D
 
H
G
 
D
V
 
V
W
|
W
I
 
I
G
 
G
A
 
T
K
 
E
A
 
A
I
 
M
V
 
I
C
 
M
P
 
P
G
 
G
V
 
V
R
 
K
C
 
I
K
 
G
S
 
H
H
 
G
S
 
A
I
 
I
L
 
I
S
x
A
V
 
S
G
 
R
S
 
S
V
 
V
A
 
V
T
 
T
K
 
K
D
 
D
L
 
V
E
 
A
E
 
P
Y
 
Y
T
 
E
V
 
V
Y
 
V
Q
 
G
G
 
S
N
 
N
P
 
P
A
 
A
V
 
K
P
 
H
K
x
I
R
 
K
K
 
F
R
 
R
I
 
F
I
 
S
D
 
D

6x3jA Crystal structure of streptogramin a acetyltransferase vata from staphylococcus aureus in complex with streptogramin analog f0224 (46) (see paper)
33% identity, 59% coverage: 73:180/183 of query aligns to 56:169/206 of 6x3jA

query
sites
6x3jA
I
 
I
G
 
G
D
 
D
N
 
K
V
 
L
W
 
I
I
 
I
G
 
G
E
 
R
N
 
F
V
 
C
W
 
S
I
 
I
D
x
G
N
 
P
L
 
G
T
 
T
T
 
T
-
 
F
V
 
I
E
 
M
I
 
N
G
 
G
N
x
A
N
 
N
V
x
H
C
 
R
I
 
M
S
 
D
Q
 
G
G
 
S
A
 
T
Y
 
Y
I
 
P
F
 
F
-
x
H
-
x
L
-
 
F
-
 
R
T
 
M
G
 
G
N
 
W
H
 
E
N
 
K
Y
 
Y
K
x
M
T
x
P
Q
 
S
S
 
L
F
 
K
D
 
D
L
|
L
I
 
P
I
 
L
K
 
K
P
 
G
V
 
D
I
 
I
-
 
E
I
 
I
E
 
G
D
 
N
G
 
D
V
 
V
W
|
W
I
 
I
G
|
G
A
 
R
K
 
D
A
 
V
I
 
T
V
 
I
C
 
M
P
 
P
G
 
G
V
 
V
R
 
K
C
 
I
K
 
G
S
 
D
H
 
G
S
 
A
I
 
I
L
 
I
S
 
A
V
 
A
G
 
E
S
 
A
V
 
V
A
 
V
T
 
T
K
 
K
D
 
N
L
 
V
E
 
A
E
 
P
Y
 
Y
T
 
S
V
 
I
Y
 
V
Q
 
G
G
 
G
N
 
N
P
 
P
A
 
L
V
 
K
P
 
F
K
 
I
R
 
R
K
 
K
R
 
R
I
 
F
I
 
S
D
 
D

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_013452079.1 NCBI__GCF_000183405.1:WP_013452079.1
MVDLSKYDNSWYDPGNKIKILIWYFINLLFFKTSIPYPSKIKVLLLRIFGAKIGKNVVIK
PCVNIKYPWFLKIGDNVWIGENVWIDNLTTVEIGNNVCISQGAYIFTGNHNYKTQSFDLI
IKPVIIEDGVWIGAKAIVCPGVRCKSHSILSVGSVATKDLEEYTVYQGNPAVPKRKRIID
DGT

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory