SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_013518722.1 NCBI__GCF_000204645.1:WP_013518722.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 17 hits to proteins with known functional sites (download)

5c65A Structure of the human glucose transporter glut3 / slc2a3
32% identity, 39% coverage: 66:237/446 of query aligns to 49:205/457 of 5c65A

query
sites
5c65A
P
 
P
A
 
P
D
 
S
E
 
E
P
 
V
L
 
L
V
 
L
T
 
T
V
 
S
M
x
L
-
 
W
-
 
S
L
 
L
S
 
S
V
 
V
A
 
A
V
 
I
F
 
F
G
 
S
V
 
V
G
 
G
F
 
G
I
 
M
T
 
-
R
 
-
P
 
-
L
 
I
G
 
G
G
 
S
L
x
F
L
x
S
I
 
V
G
 
G
A
x
L
F
 
F
A
 
V
D
 
N
R
 
R
A
 
F
G
 
G
R
 
R
K
x
R
P
 
N
A
 
S
M
 
M
L
 
L
L
 
I
T
 
V
I
 
N
A
x
L
L
|
L
I
 
A
T
 
V
V
 
T
G
 
G
T
 
G
I
 
C
G
 
F
M
 
M
A
 
G
L
 
L
T
 
C
P
 
K
S
 
V
Y
 
A
A
 
K
S
 
S
I
 
V
G
 
E
L
 
M
A
 
-
A
 
-
P
 
-
I
 
-
I
 
-
V
 
L
I
 
I
A
 
L
C
 
G
R
 
R
L
|
L
V
 
V
Q
 
I
G
 
G
L
 
L
A
 
F
L
 
C
G
 
G
G
 
L
E
 
C
V
 
T
G
 
G
P
 
F
S
 
V
T
 
P
T
 
M
Y
 
Y
L
 
I
I
 
G
E
 
E
I
 
I
A
 
S
P
 
P
Q
 
T
G
 
A
R
 
L
R
 
R
G
 
G
L
 
A
Y
 
F
G
 
G
S
 
T
W
 
L
Q
 
N
L
 
Q
A
 
L
S
 
G
Q
 
I
G
 
V
I
 
V
A
 
G
S
 
I
L
 
L
A
 
V
A
 
A
G
 
Q
I
 
I
V
 
F
G
 
G
I
 
-
V
 
-
L
 
L
T
 
E
L
 
F
A
 
I
L
 
L
S
 
G
K
 
S
E
 
E
Q
 
E
M
 
L
L
 
-
A
 
-
W
 
W
G
 
-
W
 
-
R
 
-
I
 
-
P
 
P
F
 
L
L
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
F
A
 
T
L
 
I
I
 
L
P
 
P
I
 
-
A
 
A
V
 
I
F
 
L
L
 
Q
R
 
S
R
 
A
H
 
A
M
 
L
P
|
P
E
 
F
S
 
C
L
 
P
E
 
E
Q
 
S
P
 
P

Sites not aligning to the query:

4zw9A Crystal structure of human glut3 bound to d-glucose in the outward- occluded conformation at 1.5 angstrom (see paper)
32% identity, 39% coverage: 66:237/446 of query aligns to 53:209/470 of 4zw9A

query
sites
4zw9A
P
 
P
A
 
P
D
 
S
E
 
E
P
 
V
L
 
L
V
 
L
T
 
T
V
 
S
M
 
L
-
 
W
-
 
S
L
 
L
S
 
S
V
 
V
A
 
A
V
 
I
F
 
F
G
 
S
V
 
V
G
 
G
F
 
G
I
 
M
T
 
-
R
 
-
P
 
-
L
 
I
G
 
G
G
 
S
L
 
F
L
 
S
I
 
V
G
 
G
A
 
L
F
 
F
A
 
V
D
 
N
R
 
R
A
 
F
G
 
G
R
 
R
K
 
R
P
 
N
A
 
S
M
 
M
L
 
L
L
 
I
T
 
V
I
 
N
A
 
L
L
 
L
I
 
A
T
 
V
V
 
T
G
 
G
T
 
G
I
 
C
G
 
F
M
 
M
A
 
G
L
 
L
T
 
C
P
 
K
S
 
V
Y
 
A
A
 
K
S
 
S
I
 
V
G
 
E
L
 
M
A
 
-
A
 
-
P
 
-
I
 
-
I
 
-
V
 
L
I
 
I
A
 
L
C
 
G
R
 
R
L
 
L
V
 
V
Q
 
I
G
 
G
L
 
L
A
 
F
L
 
C
G
 
G
G
 
L
E
 
C
V
 
T
G
 
G
P
 
F
S
 
V
T
 
P
T
 
M
Y
 
Y
L
 
I
I
 
G
E
 
E
I
 
I
A
 
S
P
 
P
Q
 
T
G
 
A
R
 
L
R
 
R
G
 
G
L
 
A
Y
 
F
G
 
G
S
 
T
W
 
L
Q
 
N
L
x
Q
A
 
L
S
 
G
Q
x
I
G
 
V
I
 
V
A
 
G
S
x
I
L
 
L
A
 
V
A
 
A
G
 
Q
I
 
I
V
 
F
G
 
G
I
 
-
V
 
-
L
 
L
T
 
E
L
 
F
A
 
I
L
 
L
S
 
G
K
 
S
E
 
E
Q
 
E
M
 
L
L
 
-
A
 
-
W
 
W
G
 
-
W
 
-
R
 
-
I
 
-
P
 
P
F
 
L
L
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
F
A
 
T
L
 
I
I
 
L
P
 
P
I
 
-
A
 
A
V
 
I
F
 
L
L
 
Q
R
 
S
R
 
A
H
 
A
M
 
L
P
 
P
E
 
F
S
 
C
L
 
P
E
 
E
Q
 
S
P
 
P

Sites not aligning to the query:

7sptA Crystal structure of exofacial state human glucose transporter glut3 (see paper)
32% identity, 39% coverage: 66:237/446 of query aligns to 53:209/470 of 7sptA

query
sites
7sptA
P
 
P
A
 
P
D
 
S
E
 
E
P
 
V
L
 
L
V
 
L
T
 
T
V
 
S
M
 
L
-
 
W
-
 
W
L
 
L
S
 
S
V
 
V
A
 
A
V
 
I
F
 
F
G
 
S
V
 
V
G
 
G
F
 
G
I
 
M
T
 
-
R
 
-
P
 
-
L
 
I
G
 
G
G
 
S
L
 
F
L
 
S
I
 
V
G
 
G
A
 
L
F
 
F
A
 
V
D
 
N
R
 
R
A
 
F
G
 
G
R
 
R
K
 
R
P
 
N
A
 
S
M
 
M
L
 
L
L
 
I
T
 
V
I
 
N
A
 
L
L
 
L
I
 
A
T
 
V
V
 
T
G
 
G
T
 
G
I
 
C
G
 
F
M
 
M
A
 
G
L
 
L
T
 
C
P
 
K
S
 
V
Y
 
A
A
 
K
S
 
S
I
 
V
G
 
E
L
 
M
A
 
-
A
 
-
P
 
-
I
 
-
I
 
-
V
 
L
I
 
I
A
 
L
C
 
G
R
 
R
L
 
L
V
 
V
Q
 
I
G
 
G
L
 
L
A
 
F
L
 
C
G
 
G
G
 
L
E
 
C
V
 
T
G
 
G
P
 
F
S
 
V
T
 
P
T
 
M
Y
 
Y
L
 
I
I
 
G
E
 
E
I
 
I
A
 
S
P
 
P
Q
 
T
G
 
A
R
 
L
R
 
R
G
 
G
L
 
A
Y
 
F
G
 
G
S
 
T
W
 
L
Q
 
N
L
x
Q
A
 
L
S
 
G
Q
 
I
G
 
V
I
 
V
A
 
G
S
x
I
L
 
L
A
 
V
A
 
A
G
 
Q
I
 
I
V
 
F
G
 
G
I
 
-
V
 
-
L
 
L
T
 
E
L
 
F
A
 
I
L
 
L
S
 
G
K
 
S
E
 
E
Q
 
E
M
 
L
L
 
-
A
 
-
W
 
W
G
 
-
W
 
-
R
 
-
I
 
-
P
 
P
F
 
L
L
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
F
A
 
T
L
 
I
I
 
L
P
 
P
I
 
-
A
 
A
V
 
I
F
 
L
L
 
Q
R
 
S
R
 
A
H
 
A
M
 
L
P
 
P
E
 
F
S
 
C
L
 
P
E
 
E
Q
 
S
P
 
P

Sites not aligning to the query:

7crzA Crystal structure of human glucose transporter glut3 bound with c3361 (see paper)
32% identity, 39% coverage: 66:237/446 of query aligns to 51:207/469 of 7crzA

query
sites
7crzA
P
 
P
A
 
P
D
 
S
E
 
E
P
 
V
L
 
L
V
 
L
T
 
T
V
 
S
M
 
L
-
 
W
-
 
S
L
 
L
S
 
S
V
 
V
A
|
A
V
 
I
F
 
F
G
x
S
V
 
V
G
 
G
F
 
G
I
 
M
T
 
-
R
 
-
P
 
-
L
 
I
G
 
G
G
 
S
L
 
F
L
 
S
I
 
V
G
 
G
A
 
L
F
 
F
A
 
V
D
 
N
R
 
R
A
 
F
G
 
G
R
 
R
K
 
R
P
 
N
A
 
S
M
 
M
L
 
L
L
 
I
T
 
V
I
 
N
A
 
L
L
 
L
I
 
A
T
 
V
V
 
T
G
 
G
T
 
G
I
 
C
G
 
F
M
 
M
A
 
G
L
 
L
T
 
C
P
 
K
S
 
V
Y
 
A
A
 
K
S
 
S
I
 
V
G
 
E
L
 
M
A
 
-
A
 
-
P
 
-
I
 
-
I
 
-
V
 
L
I
 
I
A
 
L
C
 
G
R
 
R
L
 
L
V
 
V
Q
 
I
G
 
G
L
 
L
A
 
F
L
 
C
G
 
G
G
 
L
E
 
C
V
 
T
G
 
G
P
 
F
S
 
V
T
 
P
T
 
M
Y
 
Y
L
 
I
I
 
G
E
 
E
I
 
I
A
 
S
P
 
P
Q
 
T
G
 
A
R
 
L
R
 
R
G
 
G
L
 
A
Y
 
F
G
 
G
S
 
T
W
 
L
Q
 
N
L
x
Q
A
 
L
S
 
G
Q
 
I
G
 
V
I
 
V
A
 
G
S
x
I
L
 
L
A
 
V
A
 
A
G
 
Q
I
 
I
V
 
F
G
 
G
I
 
-
V
 
-
L
 
L
T
 
E
L
 
F
A
 
I
L
 
L
S
 
G
K
 
S
E
 
E
Q
 
E
M
 
L
L
 
-
A
 
-
W
 
W
G
 
-
W
 
-
R
 
-
I
 
-
P
 
P
F
 
L
L
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
F
A
 
T
L
 
I
I
 
L
P
 
P
I
 
-
A
 
A
V
 
I
F
 
L
L
 
Q
R
 
S
R
 
A
H
 
A
M
 
L
P
 
P
E
 
F
S
 
C
L
 
P
E
 
E
Q
 
S
P
 
P

Sites not aligning to the query:

7spsA Crystal structure of human glucose transporter glut3 bound with exofacial inhibitor sa47 (see paper)
32% identity, 39% coverage: 66:237/446 of query aligns to 50:206/468 of 7spsA

query
sites
7spsA
P
 
P
A
 
P
D
 
S
E
 
E
P
 
V
L
 
L
V
 
L
T
 
T
V
 
S
M
 
L
-
 
W
-
 
S
L
 
L
S
 
S
V
 
V
A
 
A
V
 
I
F
 
F
G
 
S
V
 
V
G
 
G
F
 
G
I
 
M
T
 
-
R
 
-
P
 
-
L
 
I
G
 
G
G
 
S
L
 
F
L
 
S
I
 
V
G
 
G
A
 
L
F
 
F
A
 
V
D
 
N
R
 
R
A
 
F
G
 
G
R
 
R
K
 
R
P
 
N
A
 
S
M
 
M
L
 
L
L
 
I
T
 
V
I
 
N
A
 
L
L
 
L
I
 
A
T
 
V
V
 
T
G
 
G
T
 
G
I
 
C
G
 
F
M
 
M
A
 
G
L
 
L
T
 
C
P
 
K
S
 
V
Y
 
A
A
 
K
S
 
S
I
 
V
G
 
E
L
 
M
A
 
-
A
 
-
P
 
-
I
 
-
I
 
-
V
 
L
I
 
I
A
 
L
C
 
G
R
 
R
L
 
L
V
 
V
Q
 
I
G
 
G
L
 
L
A
 
F
L
 
C
G
 
G
G
 
L
E
 
C
V
 
T
G
 
G
P
 
F
S
 
V
T
 
P
T
 
M
Y
 
Y
L
 
I
I
 
G
E
 
E
I
 
I
A
 
S
P
 
P
Q
 
T
G
 
A
R
 
L
R
 
R
G
 
G
L
 
A
Y
 
F
G
 
G
S
 
T
W
 
L
Q
 
N
L
x
Q
A
 
L
S
 
G
Q
 
I
G
 
V
I
 
V
A
 
G
S
x
I
L
 
L
A
 
V
A
 
A
G
 
Q
I
 
I
V
 
F
G
 
G
I
 
-
V
 
-
L
 
L
T
 
E
L
 
F
A
 
I
L
 
L
S
 
G
K
 
S
E
 
E
Q
 
E
M
 
L
L
 
-
A
 
-
W
 
W
G
 
-
W
 
-
R
 
-
I
 
-
P
 
P
F
 
L
L
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
F
A
 
T
L
 
I
I
 
L
P
 
P
I
 
-
A
 
A
V
 
I
F
 
L
L
 
Q
R
 
S
R
 
A
H
 
A
M
 
L
P
 
P
E
 
F
S
 
C
L
 
P
E
 
E
Q
 
S
P
 
P

Sites not aligning to the query:

P11169 Solute carrier family 2, facilitated glucose transporter member 3; Glucose transporter type 3, brain; GLUT-3 from Homo sapiens (Human) (see paper)
32% identity, 39% coverage: 66:237/446 of query aligns to 53:209/496 of P11169

query
sites
P11169
P
 
P
A
 
P
D
 
S
E
 
E
P
 
V
L
 
L
V
 
L
T
 
T
V
 
S
M
 
L
-
 
W
-
 
S
L
 
L
S
 
S
V
 
V
A
 
A
V
 
I
F
 
F
G
 
S
V
 
V
G
 
G
F
 
G
I
 
M
T
 
-
R
 
-
P
 
-
L
 
I
G
 
G
G
 
S
L
 
F
L
 
S
I
 
V
G
 
G
A
 
L
F
 
F
A
 
V
D
 
N
R
 
R
A
 
F
G
 
G
R
 
R
K
 
R
P
 
N
A
 
S
M
 
M
L
 
L
L
 
I
T
 
V
I
 
N
A
 
L
L
 
L
I
 
A
T
 
V
V
 
T
G
 
G
T
 
G
I
 
C
G
 
F
M
 
M
A
 
G
L
 
L
T
 
C
P
 
K
S
 
V
Y
 
A
A
 
K
S
 
S
I
 
V
G
 
E
L
 
M
A
 
-
A
 
-
P
 
-
I
 
-
I
 
-
V
 
L
I
 
I
A
 
L
C
 
G
R
 
R
L
 
L
V
 
V
Q
 
I
G
 
G
L
 
L
A
 
F
L
 
C
G
 
G
G
 
L
E
 
C
V
 
T
G
 
G
P
 
F
S
 
V
T
 
P
T
 
M
Y
 
Y
L
 
I
I
 
G
E
 
E
I
 
I
A
 
S
P
 
P
Q
 
T
G
 
A
R
 
L
R
 
R
G
 
G
L
 
A
Y
 
F
G
 
G
S
 
T
W
 
L
Q
 
N
L
x
Q
A
 
L
S
 
G
Q
 
I
G
 
V
I
 
V
A
 
G
S
 
I
L
 
L
A
 
V
A
 
A
G
 
Q
I
 
I
V
 
F
G
 
G
I
 
-
V
 
-
L
 
L
T
 
E
L
 
F
A
 
I
L
 
L
S
 
G
K
 
S
E
 
E
Q
 
E
M
 
L
L
 
-
A
 
-
W
 
W
G
 
-
W
 
-
R
 
-
I
 
-
P
 
P
F
 
L
L
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
F
A
 
T
L
 
I
I
 
L
P
 
P
I
 
-
A
 
A
V
 
I
F
 
L
L
 
Q
R
 
S
R
 
A
H
 
A
M
 
L
P
 
P
E
 
F
S
 
C
L
 
P
E
 
E
Q
 
S
P
 
P

Sites not aligning to the query:

Q9Y7Q9 Probable metabolite transporter C2H8.02 from Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) (Fission yeast) (see paper)
31% identity, 35% coverage: 90:246/446 of query aligns to 98:260/583 of Q9Y7Q9

query
sites
Q9Y7Q9
L
 
M
G
 
G
G
 
Q
L
 
L
L
 
L
I
 
F
G
 
G
A
 
F
F
 
L
A
 
G
D
 
D
R
 
F
A
 
F
G
 
G
R
 
R
K
 
K
P
 
F
A
 
V
M
 
Y
L
 
G
L
 
K
T
 
E
I
 
M
A
 
M
L
 
V
I
 
V
T
 
I
V
 
I
G
 
A
T
 
T
I
 
I
G
 
L
M
 
I
A
 
I
L
 
C
T
 
L
P
 
P
S
 
D
Y
 
R
A
 
I
S
 
P
I
 
T
G
 
P
L
 
T
A
 
A
A
 
K
P
 
M
I
 
M
I
 
W
V
 
L
I
 
F
A
 
A
C
 
F
R
 
R
L
 
V
V
 
M
Q
 
L
G
 
G
L
 
I
A
 
G
L
 
I
G
 
G
G
 
G
E
 
D
V
 
Y
G
 
P
P
 
M
S
 
S
T
 
A
T
 
S
Y
 
I
L
 
T
I
 
S
E
 
E
I
 
Q
A
 
S
P
 
L
Q
 
I
G
 
N
R
 
R
R
 
R
G
 
G
L
 
A
Y
 
L
G
 
L
S
 
A
W
 
W
Q
 
I
L
 
F
A
 
S
S
 
N
Q
 
Q
G
 
G
I
 
W
A
 
G
S
 
T
L
 
L
A
 
-
A
 
A
G
 
G
I
 
C
V
 
V
G
 
A
I
 
T
V
 
L
L
 
I
T
 
I
L
 
L
A
 
A
L
 
C
S
 
F
K
 
E
E
 
K
Q
 
P
M
 
L
L
 
N
A
 
D
W
 
R
G
 
G
-
 
E
-
 
Y
-
 
T
-
 
K
-
 
L
-
 
N
-
 
G
-
 
V
W
 
W
R
 
R
I
 
I
P
 
Q
F
 
F
L
 
-
L
 
-
G
 
G
L
 
I
A
 
A
L
 
L
I
 
F
P
 
P
I
 
A
A
 
V
V
 
I
F
 
V
L
 
L
-
 
I
-
 
P
R
 
R
R
 
L
H
 
R
M
 
M
P
 
Q
E
 
E
S
 
S
L
 
-
E
 
E
Q
 
Q
P
 
F
T
 
K
H
 
N
S
 
S
G
 
K
P
 
N
I
 
M
K
 
K
S
 
S
P
 
P

Sites not aligning to the query:

Q8NLB7 Gentisate transporter from Corynebacterium glutamicum (strain ATCC 13032 / DSM 20300 / JCM 1318 / BCRC 11384 / CCUG 27702 / LMG 3730 / NBRC 12168 / NCIMB 10025 / NRRL B-2784 / 534) (see paper)
27% identity, 55% coverage: 13:256/446 of query aligns to 12:239/444 of Q8NLB7

query
sites
Q8NLB7
L
 
V
S
 
T
P
 
E
T
 
S
S
 
T
Q
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
S
N
 
N
I
 
S
S
 
S
T
 
Q
A
 
T
A
 
I
T
 
E
S
 
N
K
 
K
-
 
G
-
 
L
-
 
T
-
 
I
-
 
L
-
 
G
V
 
I
Q
 
S
P
 
G
R
 
R
V
 
R
V
 
L
A
 
A
A
 
A
T
 
V
V
 
L
A
 
I
G
 
G
N
 
W
A
 
F
L
 
F
E
 
V
F
 
I
F
 
F
D
|
D
F
 
-
T
 
-
T
 
G
Y
 
Y
A
x
D
F
 
L
F
 
I
A
 
V
V
 
Y
Y
 
G
I
 
T
G
 
V
Q
 
Q
T
 
S
F
 
A
F
 
L
P
 
A
A
 
K
D
 
E
E
 
W
P
 
N
L
 
L
V
 
S
T
 
S
V
 
A
M
 
T
L
 
L
-
 
G
-
 
T
-
 
I
-
 
G
S
 
S
V
 
T
A
 
A
V
 
F
F
 
F
G
 
G
V
 
M
G
 
A
F
 
-
I
 
-
T
 
-
R
 
-
P
 
-
L
 
I
G
 
G
G
 
A
L
 
V
L
 
F
I
 
I
G
 
G
A
 
R
F
 
L
A
 
S
D
 
D
R
|
R
A
 
V
G
 
G
R
 
R
K
 
K
P
 
A
A
 
A
M
 
V
L
 
I
L
 
G
T
 
S
I
 
V
A
 
L
L
 
I
I
 
L
T
 
S
V
 
V
G
 
F
T
 
T
I
 
M
G
 
L
M
 
C
A
 
A
L
 
F
T
 
A
P
 
P
S
 
N
Y
 
-
A
 
-
S
 
-
I
 
-
G
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
P
I
 
W
I
 
V
V
 
F
I
 
G
A
 
A
C
 
F
R
 
R
L
 
F
V
 
I
Q
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
G
L
 
L
G
 
G
G
 
G
E
 
L
V
 
V
G
 
P
P
 
S
S
 
V
T
 
N
T
 
A
Y
 
M
L
 
T
I
 
S
E
 
D
I
 
L
A
 
V
P
 
P
Q
 
R
G
 
K
R
 
T
R
 
M
G
 
S
L
 
A
Y
 
W
G
 
A
S
 
T
W
 
V
Q
 
M
L
 
M
A
 
S
S
 
G
Q
 
V
G
 
P
I
 
I
A
 
G
S
 
G
L
 
S
A
 
I
A
 
A
G
 
A
I
 
V
V
 
L
G
 
A
I
 
L
V
 
V
L
 
V
T
 
V
L
 
-
A
 
-
L
 
P
S
 
S
K
 
S
E
 
E
Q
 
E
M
 
-
L
 
-
A
 
-
W
 
W
G
 
G
W
 
W
R
 
R
I
 
F
P
 
M
F
 
F
L
 
L
L
 
-
G
 
-
L
 
I
A
 
A
L
 
L
I
 
I
P
 
P
I
 
L
A
 
V
V
 
V
F
 
G
L
 
L
R
 
-
R
 
-
H
 
-
M
 
-
P
 
P
E
 
I
S
 
A
L
 
M
E
 
K
Q
 
V
P
 
I
T
 
P
H
 
S
S
 
D
G
 
K
P
 
A
I
 
I
K
 
K
S
 
A
P
 
D
L
 
-
A
 
H
D
 
D
I
 
I
R
 
R
H
 
E
-
 
G
H
 
H
L
 
D
R
 
E
P
 
P

Sites not aligning to the query:

A0A0H2VG78 Glucose transporter GlcP; Glucose/H(+) symporter from Staphylococcus epidermidis (strain ATCC 12228 / FDA PCI 1200) (see paper)
34% identity, 31% coverage: 96:233/446 of query aligns to 63:184/446 of A0A0H2VG78

query
sites
A0A0H2VG78
G
 
G
A
 
P
F
 
L
A
 
A
D
 
D
R
 
K
A
 
L
G
 
G
R
 
R
K
 
R
P
 
R
A
 
L
M
 
V
L
 
M
L
 
L
T
 
I
I
 
A
A
 
I
L
 
V
I
 
F
T
 
I
V
 
I
G
 
G
T
 
A
I
 
L
G
 
I
M
 
L
A
 
A
L
 
-
T
 
-
P
 
-
S
 
-
Y
 
-
A
 
A
S
 
S
I
 
T
G
 
N
L
 
L
A
 
A
A
 
-
P
 
-
I
 
-
I
 
L
V
 
L
I
 
I
A
 
I
C
 
G
R
|
R
L
 
L
V
 
I
Q
x
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
L
 
V
G
 
G
G
 
G
E
 
S
V
 
M
G
 
S
P
 
T
S
 
V
T
 
P
T
 
V
Y
 
Y
L
 
L
I
 
S
E
|
E
I
 
M
A
 
A
P
 
P
Q
 
T
G
 
E
R
 
Y
R
 
R
G
 
G
L
 
S
Y
 
L
G
 
G
S
 
S
W
 
L
Q
 
N
L
x
Q
A
 
L
S
 
M
Q
 
I
G
 
T
I
 
I
A
 
G
S
 
I
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
Y
I
 
L
V
 
V
G
 
-
I
 
-
V
 
-
L
 
-
T
 
N
L
 
Y
A
 
A
L
 
F
S
 
A
K
 
D
E
 
I
Q
 
E
M
 
-
L
 
-
A
 
-
W
 
-
G
 
G
W
 
W
R
 
R
I
 
-
P
 
-
F
 
W
L
 
M
L
 
L
G
 
G
L
 
L
A
 
A
L
 
V
I
 
V
P
 
P
I
 
S
A
 
V
V
 
I
F
 
L
L
 
L
R
 
V
-
 
G
-
 
I
R
 
Y
H
 
F
M
 
M
P
 
P
E
 
E
S
 
S

Sites not aligning to the query:

8fvzA Pipt y150a
24% identity, 93% coverage: 32:446/446 of query aligns to 2:429/433 of 8fvzA

query
sites
8fvzA
Q
 
Q
P
 
I
R
 
K
V
 
L
V
 
V
A
 
L
A
 
L
T
 
A
V
 
G
A
 
V
G
 
G
N
 
F
A
 
F
L
 
L
E
 
D
F
 
A
F
 
Y
D
 
D
F
 
L
T
 
F
T
 
I
Y
 
I
A
 
N
F
 
Q
F
 
V
A
 
A
V
 
P
Y
 
M
I
 
L
G
 
A
Q
 
Q
T
 
V
F
 
Y
F
 
F
P
 
P
A
 
K
D
 
T
E
 
G
-
 
L
P
 
P
L
 
A
V
 
Q
T
 
R
V
 
Q
M
 
D
L
 
L
S
 
M
V
 
K
A
 
A
V
 
A
F
 
A
G
 
N
V
 
I
G
 
G
F
 
C
I
 
V
T
 
-
R
 
-
P
 
-
L
 
V
G
 
G
G
 
Q
L
 
V
L
 
M
I
 
F
G
 
G
A
 
V
F
 
L
A
 
G
D
 
D
R
 
S
A
 
F
G
 
G
R
 
R
K
 
K
P
 
F
A
 
V
M
 
Y
L
 
G
L
 
K
T
 
E
I
 
L
A
 
I
L
 
L
I
 
I
T
 
I
V
 
V
G
 
A
T
 
T
I
 
I
G
 
F
M
 
Q
A
 
M
L
 
S
T
 
A
P
 
P
S
 
S
Y
 
H
A
 
W
S
 
D
I
 
G
G
 
N
L
 
R
A
 
V
A
 
L
P
 
T
I
 
W
I
 
I
V
 
T
I
 
I
A
 
-
C
 
C
R
 
R
L
 
V
V
 
F
Q
 
L
G
 
G
L
 
I
A
 
G
L
 
I
G
 
G
G
 
G
E
 
D
V
 
A
G
 
P
P
 
M
S
 
S
T
 
A
T
 
T
Y
 
V
L
 
V
I
 
S
E
 
D
I
 
R
A
 
A
P
 
N
Q
 
I
G
 
H
R
 
R
R
 
R
G
 
G
L
 
T
Y
 
L
G
 
L
S
 
C
W
 
F
Q
 
I
L
x
F
A
 
A
S
 
N
Q
 
Q
G
 
G
I
 
W
A
 
G
S
 
S
L
 
F
A
 
V
A
 
G
G
 
S
I
 
L
V
 
V
G
 
T
I
 
I
V
 
V
L
 
-
T
 
T
L
 
I
A
 
S
L
 
G
S
 
F
K
 
K
E
 
H
Q
 
R
M
 
L
-
 
K
-
 
S
-
 
G
-
 
H
-
 
T
-
 
H
-
 
D
L
 
V
A
 
D
W
 
K
G
 
A
W
 
W
R
 
R
I
 
I
P
 
-
F
 
-
L
 
L
L
 
I
G
 
G
L
 
L
A
 
S
L
 
L
I
 
I
P
 
P
-
 
A
I
 
F
A
 
G
V
 
T
F
 
L
L
 
Y
R
 
Q
R
 
R
H
 
L
M
 
T
P
 
G
E
 
V
S
 
I
L
 
A
E
 
S
Q
 
K
P
 
K
T
 
A
H
 
H
S
 
W
G
 
Q
P
 
E
I
 
F
K
 
V
S
 
A
P
 
Y
L
 
F
A
 
S
D
 
-
I
 
T
R
 
W
H
 
N
H
 
H
L
 
F
R
 
R
P
 
N
I
 
L
M
 
L
-
 
G
-
 
S
-
 
M
-
 
L
-
 
G
-
x
W
-
 
F
L
 
L
A
 
V
L
x
D
M
 
I
V
 
A
I
 
F
L
x
Y
G
 
G
V
 
I
T
 
N
I
 
L
S
 
N
T
 
Q
Y
 
S
A
 
V
A
 
V
I
 
L
Y
 
A
M
 
Q
T
 
I
T
 
G
Y
 
F
A
 
A
V
 
G
T
 
K
T
 
T
L
 
G
K
 
D
L
 
V
S
 
Y
A
 
D
T
 
K
I
 
L
A
 
F
M
 
Q
S
 
L
A
 
A
T
 
T
-
 
G
-
 
N
-
 
I
I
 
I
V
 
V
F
 
T
G
 
A
V
 
L
A
 
G
T
 
F
W
 
L
A
 
P
G
 
G
A
 
Y
L
 
Y
L
 
F
G
 
T
G
 
L
W
 
F
L
 
L
S
 
I
D
 
D
L
 
I
Y
 
V
G
 
G
R
 
R
K
 
K
P
 
K
V
 
L
M
 
Q
L
 
F
W
 
M
A
 
G
R
 
F
V
 
I
-
 
M
-
 
S
A
 
G
L
 
L
F
 
F
V
 
L
L
 
A
V
 
I
Y
 
L
P
 
A
A
 
G
Y
 
E
M
 
-
L
 
-
L
 
-
I
 
I
E
 
D
H
 
H
T
 
I
S
 
G
V
 
K
A
 
G
T
 
P
L
 
L
A
 
-
L
 
L
A
 
A
T
 
C
A
 
F
L
 
T
L
 
F
A
 
M
L
 
Q
L
 
F
T
 
F
G
 
F
I
 
N
G
 
F
G
 
G
A
 
A
P
x
N
-
 
T
-
 
T
T
 
T
L
 
F
V
 
I
A
 
V
I
 
A
P
 
A
E
 
E
L
 
L
F
 
F
P
 
P
G
 
T
H
 
R
V
 
I
R
 
R
A
 
A
L
 
S
G
 
A
L
 
H
S
 
G
I
 
I
A
 
S
Y
 
A
A
 
A
F
 
A
G
 
G
V
 
K
A
 
C
L
 
-
F
 
-
G
 
G
G
 
A
T
 
I
A
 
L
Q
 
S
L
 
S
V
 
L
I
 
V
T
 
F
W
 
N
L
 
Q
I
 
L
K
 
K
V
 
A
T
 
K
D
 
I
N
 
G
P
 
T
A
 
S
A
 
A
P
 
V
A
 
L
L
 
W
Y
 
I
V
 
F
L
 
F
I
 
S
T
 
T
S
 
C
L
 
I
I
 
L
A
 
G
I
 
F
V
 
I
G
 
S
I
 
T
L
 
F
L
 
L
M
 
I
R
 
D
E
 
E
T
 
T
G
 
M
G
 
G
-
 
V
-
 
D
-
 
P
-
 
D
D
 
E
K
 
K
E
 
D
L
 
L
Q
 
E
K
 
E

8uo9A Structure of synaptic vesicle protein 2a in complex with a nanobody (see paper)
28% identity, 20% coverage: 90:176/446 of query aligns to 65:143/555 of 8uo9A

query
sites
8uo9A
L
 
V
G
 
G
G
 
A
L
 
F
L
 
L
I
 
W
G
 
G
A
 
G
F
 
L
A
 
A
D
 
D
R
 
R
A
 
L
G
 
G
R
 
R
K
 
R
P
 
Q
A
 
C
M
 
L
L
 
L
L
 
I
T
 
S
I
 
L
A
 
S
L
 
V
I
 
N
T
 
S
V
 
V
G
 
F
T
 
A
I
 
F
G
 
F
M
 
S
A
 
S
L
 
F
T
 
V
P
 
Q
S
 
G
Y
 
Y
A
 
G
S
 
T
I
 
F
G
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
-
I
 
-
I
 
-
V
 
-
I
 
L
A
 
F
C
 
C
R
 
R
L
 
L
V
 
L
Q
 
S
G
 
G
L
 
V
A
 
G
L
 
I
G
 
G
G
 
G
E
 
S
V
 
I
G
 
P
P
 
I
S
 
V
T
 
F
T
 
S
Y
 
Y
L
 
F
I
 
S
E
 
E
I
 
F
A
 
L
P
 
A
Q
 
Q
G
 
E
R
 
K
R
 
R
G
 
G
L
 
E
Y
 
H
G
 
L
S
 
S
W
 
W

Sites not aligning to the query:

8k77A Synaptic vesicle glycoprotein 2A (see paper)
28% identity, 20% coverage: 90:176/446 of query aligns to 81:159/592 of 8k77A

query
sites
8k77A
L
 
V
G
 
G
G
 
A
L
 
F
L
 
L
I
 
W
G
 
G
A
 
G
F
 
L
A
 
A
D
 
D
R
 
R
A
 
L
G
 
G
R
 
R
K
 
R
P
 
Q
A
 
C
M
 
L
L
 
L
L
 
I
T
 
S
I
 
L
A
 
S
L
 
V
I
 
N
T
 
S
V
 
V
G
 
F
T
 
A
I
 
F
G
 
F
M
 
S
A
 
S
L
 
F
T
 
V
P
 
Q
S
 
G
Y
 
Y
A
 
G
S
 
T
I
 
F
G
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
-
I
 
-
I
 
-
V
 
-
I
 
L
A
 
F
C
 
C
R
 
R
L
 
L
V
 
L
Q
 
S
G
 
G
L
 
V
A
 
G
L
 
I
G
 
G
G
 
G
E
 
S
V
 
I
G
 
P
P
 
I
S
 
V
T
 
F
T
 
S
Y
 
Y
L
 
F
I
 
S
E
 
E
I
 
F
A
 
L
P
 
A
Q
 
Q
G
 
E
R
 
K
R
 
R
G
 
G
L
 
E
Y
 
H
G
 
L
S
 
S
W
 
W

Sites not aligning to the query:

8jlhA Cryo-em structure of sv2a dimer in complex with bont/a2 hc and levetiracetam (see paper)
28% identity, 20% coverage: 90:176/446 of query aligns to 81:159/592 of 8jlhA

query
sites
8jlhA
L
 
V
G
 
G
G
 
A
L
 
F
L
 
L
I
 
W
G
 
G
A
 
G
F
 
L
A
 
A
D
 
D
R
 
R
A
 
L
G
 
G
R
 
R
K
 
R
P
 
Q
A
 
C
M
 
L
L
 
L
L
 
I
T
 
S
I
 
L
A
 
S
L
 
V
I
 
N
T
 
S
V
 
V
G
 
F
T
 
A
I
 
F
G
 
F
M
 
S
A
 
S
L
 
F
T
 
V
P
 
Q
S
 
G
Y
 
Y
A
 
G
S
 
T
I
 
F
G
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
-
I
 
-
I
 
-
V
 
-
I
 
L
A
 
F
C
 
C
R
 
R
L
 
L
V
 
L
Q
 
S
G
 
G
L
 
V
A
 
G
L
 
I
G
 
G
G
 
G
E
 
S
V
 
I
G
 
P
P
 
I
S
 
V
T
 
F
T
 
S
Y
 
Y
L
 
F
I
 
S
E
 
E
I
 
F
A
 
L
P
 
A
Q
 
Q
G
 
E
R
 
K
R
 
R
G
 
G
L
 
E
Y
 
H
G
 
L
S
 
S
W
 
W

Sites not aligning to the query:

8jlcA Synaptic vesicle glycoprotein 2A (see paper)
28% identity, 20% coverage: 90:176/446 of query aligns to 81:159/592 of 8jlcA

query
sites
8jlcA
L
 
V
G
 
G
G
 
A
L
 
F
L
 
L
I
 
W
G
 
G
A
 
G
F
 
L
A
 
A
D
 
D
R
 
R
A
 
L
G
 
G
R
 
R
K
 
R
P
 
Q
A
 
C
M
 
L
L
 
L
L
 
I
T
 
S
I
 
L
A
 
S
L
 
V
I
 
N
T
 
S
V
 
V
G
 
F
T
 
A
I
 
F
G
 
F
M
 
S
A
 
S
L
 
F
T
 
V
P
 
Q
S
 
G
Y
 
Y
A
 
G
S
 
T
I
 
F
G
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
-
I
 
-
I
 
-
V
 
-
I
 
L
A
 
F
C
 
C
R
 
R
L
 
L
V
 
L
Q
 
S
G
 
G
L
 
V
A
 
G
L
 
I
G
 
G
G
 
G
E
 
S
V
x
I
G
 
P
P
 
I
S
 
V
T
 
F
T
 
S
Y
 
Y
L
 
F
I
 
S
E
 
E
I
 
F
A
 
L
P
 
A
Q
 
Q
G
 
E
R
 
K
R
 
R
G
 
G
L
 
E
Y
 
H
G
 
L
S
 
S
W
 
W

Sites not aligning to the query:

P32037 Solute carrier family 2, facilitated glucose transporter member 3; Glucose transporter type 3, brain; GLUT-3 from Mus musculus (Mouse) (see paper)
30% identity, 36% coverage: 76:237/446 of query aligns to 65:209/493 of P32037

query
sites
P32037
L
 
L
S
 
C
V
 
V
A
 
A
V
 
I
F
 
F
G
 
S
V
 
V
G
 
G
F
 
G
I
 
M
T
 
-
R
 
-
P
 
-
L
 
I
G
 
G
G
 
S
L
 
F
L
 
S
I
 
V
G
 
G
A
 
L
F
 
F
A
 
V
D
 
N
R
 
R
A
 
F
G
 
G
R
 
R
K
 
R
P
 
N
A
 
S
M
 
M
L
 
L
L
 
L
T
 
V
I
 
N
A
 
L
L
 
L
I
 
A
T
 
I
V
 
I
G
 
A
T
 
G
I
 
C
G
 
L
M
 
M
A
 
G
L
 
-
T
 
-
P
 
-
S
 
-
Y
 
F
A
 
A
S
 
K
I
 
I
G
 
A
L
 
E
A
 
S
A
 
V
P
 
E
I
 
M
I
 
L
V
 
I
I
 
L
A
 
G
C
 
-
R
 
R
L
 
L
V
 
L
Q
 
I
G
 
G
L
 
I
A
 
F
L
 
C
G
 
G
G
 
L
E
 
C
V
 
T
G
 
G
P
 
F
S
 
V
T
 
P
T
 
M
Y
 
Y
L
 
I
I
 
G
E
 
E
I
 
V
A
 
S
P
 
P
Q
 
T
G
 
A
R
 
L
R
 
R
G
 
G
L
 
A
Y
 
F
G
 
G
S
 
T
W
 
L
Q
 
N
L
 
Q
A
 
L
S
 
G
Q
 
I
G
 
V
I
 
V
A
 
G
S
 
I
L
 
L
A
 
V
A
 
A
G
 
Q
I
 
I
V
 
F
G
 
G
I
 
-
V
 
-
L
 
L
T
 
D
L
 
F
A
 
I
L
 
L
S
 
G
K
 
S
E
 
E
Q
 
E
M
 
L
L
 
-
A
 
-
W
 
W
G
 
-
W
 
-
R
 
-
I
 
-
P
 
P
F
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
L
A
 
T
L
 
I
I
 
I
P
 
P
I
 
-
A
 
A
V
 
I
F
 
L
L
 
Q
R
 
S
R
 
A
H
 
A
M
 
L
P
 
P
E
 
F
S
 
C
L
 
P
E
 
E
Q
 
S
P
 
P

Sites not aligning to the query:

Q02563 Synaptic vesicle glycoprotein 2A; Synaptic vesicle protein 2; Synaptic vesicle protein 2A from Rattus norvegicus (Rat) (see 2 papers)
28% identity, 20% coverage: 90:176/446 of query aligns to 217:295/742 of Q02563

query
sites
Q02563
L
 
V
G
 
G
G
 
A
L
 
F
L
 
L
I
 
W
G
 
G
A
 
G
F
 
L
A
 
A
D
 
D
R
 
R
A
 
L
G
 
G
R
 
R
K
 
R
P
 
Q
A
 
C
M
 
L
L
 
L
L
 
I
T
 
S
I
 
L
A
 
S
L
 
V
I
 
N
T
 
S
V
 
V
G
 
F
T
 
A
I
 
F
G
 
F
M
 
S
A
 
S
L
 
F
T
 
V
P
 
Q
S
 
G
Y
 
Y
A
 
G
S
 
T
I
 
F
G
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
-
I
 
-
I
 
-
V
 
-
I
 
L
A
 
F
C
 
C
R
 
R
L
 
L
V
 
L
Q
 
S
G
 
G
L
 
V
A
 
G
L
 
I
G
 
G
G
 
G
E
 
S
V
 
I
G
 
P
P
 
I
S
 
V
T
 
F
T
 
S
Y
 
Y
L
 
F
I
 
S
E
 
E
I
 
F
A
 
L
P
 
A
Q
 
Q
G
 
E
R
 
K
R
 
R
G
 
G
L
 
E
Y
 
H
G
 
L
S
 
S
W
 
W

Sites not aligning to the query:

8sc2A Human oct1 bound to diltiazem in inward-open conformation (see paper)
30% identity, 38% coverage: 79:246/446 of query aligns to 135:280/453 of 8sc2A

query
sites
8sc2A
A
 
S
V
 
C
F
 
L
G
 
N
V
 
A
G
 
G
F
 
F
I
 
L
T
 
-
R
 
-
P
 
-
L
 
F
G
 
G
G
 
S
L
 
L
L
 
G
I
 
V
G
 
G
A
 
Y
F
 
F
A
 
A
D
 
D
R
 
R
A
 
F
G
 
G
R
 
R
K
 
K
P
 
L
A
 
C
M
 
L
L
 
L
L
 
G
T
 
T
I
 
V
A
 
L
L
 
V
I
 
N
T
 
A
V
 
V
G
 
S
T
 
G
I
 
V
G
 
L
M
 
M
A
 
A
L
 
F
T
 
S
P
 
P
S
 
N
Y
 
Y
A
 
M
S
 
S
I
 
M
G
 
L
L
 
L
A
 
F
A
 
-
P
 
-
I
 
-
I
 
-
V
 
-
I
 
-
A
 
-
C
 
-
R
 
R
L
 
L
V
 
L
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
A
 
V
L
 
S
G
 
K
G
 
G
E
 
N
V
x
W
G
 
M
P
 
A
S
 
G
T
 
Y
T
 
T
Y
 
L
L
 
I
I
 
T
E
 
E
I
 
F
A
 
V
P
 
G
Q
 
S
G
 
G
-
 
S
R
 
R
R
 
R
G
 
T
L
 
V
Y
 
A
G
 
I
S
 
M
W
 
Y
Q
|
Q
L
 
M
A
 
A
S
 
-
Q
 
-
G
 
-
I
 
-
A
 
-
S
 
-
L
x
F
A
 
T
A
 
V
G
 
G
I
 
L
V
 
V
G
 
A
I
 
L
V
 
T
-
 
G
L
 
L
T
 
A
L
 
Y
A
 
A
L
 
L
S
 
P
K
 
H
E
 
-
Q
 
-
M
 
-
L
 
-
A
 
-
W
 
W
G
 
R
W
 
W
R
 
-
I
 
-
P
 
-
F
 
-
L
 
-
L
 
L
G
 
Q
L
 
L
A
 
A
L
 
V
-
 
S
I
 
L
P
 
P
I
 
T
A
 
F
V
 
L
F
 
F
L
 
L
R
 
L
R
 
Y
H
 
Y
-
 
W
-
 
C
M
 
V
P
 
P
E
 
E
S
 
S
L
 
P
E
 
R
Q
 
S
P
 
P
T
 
S
H
 
F
S
 
A
G
 
D
P
 
L
I
 
F
K
 
R
S
 
T
P
 
P

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_013518722.1 NCBI__GCF_000204645.1:WP_013518722.1
MGIQNSSMGDVALSPTSQGASNISTAATSKVQPRVVAATVAGNALEFFDFTTYAFFAVYI
GQTFFPADEPLVTVMLSVAVFGVGFITRPLGGLLIGAFADRAGRKPAMLLTIALITVGTI
GMALTPSYASIGLAAPIIVIACRLVQGLALGGEVGPSTTYLIEIAPQGRRGLYGSWQLAS
QGIASLAAGIVGIVLTLALSKEQMLAWGWRIPFLLGLALIPIAVFLRRHMPESLEQPTHS
GPIKSPLADIRHHLRPIMLALMVILGVTISTYAAIYMTTYAVTTLKLSATIAMSATIVFG
VATWAGALLGGWLSDLYGRKPVMLWARVALFVLVYPAYMLLIEHTSVATLALATALLALL
TGIGGAPTLVAIPELFPGHVRALGLSIAYAFGVALFGGTAQLVITWLIKVTDNPAAPALY
VLITSLIAIVGILLMRETGGDKELQK

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory