SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_013520542.1 NCBI__GCF_000204645.1:WP_013520542.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
39% identity, 99% coverage: 1:253/255 of query aligns to 2:244/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
M
 
M
Q
 
S
G
 
R
L
 
L
K
 
Q
N
 
D
Q
 
K
T
 
V
V
 
A
I
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
 
A
G
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
S
 
L
A
 
E
T
 
A
C
 
A
R
 
R
R
 
V
F
 
F
A
 
M
A
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
A
 
V
V
 
I
F
 
A
D
|
D
M
x
F
N
 
N
P
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
G
E
 
K
E
 
E
V
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
A
I
 
V
R
 
E
A
 
A
A
 
N
G
 
P
G
 
G
Q
 
-
A
 
V
A
 
V
A
 
F
F
 
I
Q
 
R
C
x
V
D
|
D
I
x
V
T
 
S
D
 
D
R
 
R
A
 
E
Q
 
S
V
 
V
D
 
H
A
 
R
A
 
L
V
 
V
A
 
E
A
 
N
T
 
V
G
 
A
A
 
E
Q
 
R
L
 
F
G
 
G
P
 
K
V
 
I
G
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
W
x
I
D
 
T
V
 
R
F
x
D
K
 
S
P
 
M
F
 
L
V
 
S
K
|
K
T
 
M
V
 
T
P
 
V
A
 
D
E
 
Q
W
 
F
D
 
Q
R
 
Q
L
 
V
I
 
I
A
 
N
I
 
V
N
|
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
V
L
 
F
H
 
H
M
 
C
L
 
T
H
 
Q
A
 
A
V
 
V
L
 
L
P
 
P
G
 
Y
M
 
M
S
 
A
E
 
E
R
 
Q
R
 
G
S
 
K
G
 
G
H
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
x
T
A
 
S
S
|
S
D
 
V
A
 
T
A
 
G
R
 
T
G
 
Y
G
 
G
S
x
N
S
x
V
G
 
G
E
x
Q
A
 
T
V
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
C
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
I
A
 
G
L
 
M
S
 
T
K
 
K
T
 
T
L
 
W
A
 
A
R
 
K
E
 
E
H
 
L
A
 
A
R
 
R
H
 
K
G
 
G
I
 
I
N
 
N
V
 
V
N
 
N
V
 
A
V
 
V
C
 
A
P
|
P
G
 
G
P
x
F
T
|
T
D
 
E
T
|
T
A
 
A
L
x
M
L
 
V
A
 
A
G
 
E
V
 
V
A
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
R
 
-
D
 
-
P
 
P
A
 
E
K
 
K
L
 
V
I
 
I
E
 
E
A
x
K
F
 
M
K
 
K
S
 
A
A
 
Q
I
 
V
P
 
P
M
 
M
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
K
P
 
P
E
 
E
D
 
D
L
 
I
A
 
A
S
 
N
A
 
A
I
 
Y
V
 
L
F
 
F
F
 
L
G
 
A
S
 
S
D
 
H
D
 
E
A
 
S
S
 
D
F
 
Y
I
 
V
T
 
N
G
 
G
Q
 
H
V
 
V
I
 
L
S
 
H
V
 
V
S
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
I
T
 
M
M
 
M

7tzpG Crystal structure of putataive short-chain dehydrogenase/reductase (fabg) from klebsiella pneumoniae subsp. Pneumoniae ntuh-k2044 in complex with nadh (see paper)
38% identity, 98% coverage: 4:253/255 of query aligns to 6:247/247 of 7tzpG

query
sites
7tzpG
L
 
L
K
 
A
N
 
S
Q
 
K
T
 
T
V
 
A
I
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
 
A
G
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
S
 
F
A
 
G
T
 
I
C
 
A
R
 
Q
R
 
V
F
 
L
A
 
A
A
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
R
V
 
V
A
 
I
V
 
I
F
 
A
D
|
D
M
x
R
N
 
D
P
 
-
A
 
A
A
 
H
A
 
G
E
 
E
E
 
A
V
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
S
I
 
L
R
 
R
A
 
E
A
 
S
G
 
G
G
 
A
Q
 
Q
A
 
A
A
 
L
A
 
F
F
 
I
Q
 
S
C
|
C
D
 
N
I
|
I
T
 
A
D
 
E
R
 
K
A
 
T
Q
 
Q
V
 
V
D
 
E
A
 
A
A
 
L
V
 
F
A
 
S
A
 
Q
T
 
A
G
 
E
A
 
E
Q
 
A
L
 
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
G
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
W
x
I
D
 
N
V
 
R
F
 
D
K
 
A
P
 
M
F
 
L
V
 
H
K
 
K
T
 
L
V
 
T
P
 
E
A
 
A
E
 
D
W
 
W
D
 
D
R
 
T
L
 
V
I
 
I
A
 
D
I
x
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
A
 
T
L
 
F
H
 
L
M
 
C
L
 
M
H
 
Q
A
 
Q
V
 
A
L
 
A
P
 
I
G
 
R
M
 
M
S
 
R
E
 
E
R
 
R
R
 
G
S
 
A
G
 
G
H
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
 
I
A
 
A
S
 
S
D
 
-
A
 
A
A
 
S
R
 
W
G
 
L
G
 
G
S
 
N
S
 
V
G
 
G
E
 
Q
A
 
T
V
 
N
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
C
 
S
K
|
K
G
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
V
A
 
G
L
 
M
S
 
T
K
 
K
T
 
T
L
 
A
A
 
C
R
 
R
E
 
E
H
 
L
A
 
A
R
 
K
H
 
K
G
 
G
I
 
V
N
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
A
V
 
I
C
 
C
P
 
P
G
 
G
P
 
F
T
x
I
D
 
D
T
|
T
A
 
D
L
 
M
L
x
T
A
 
R
G
 
G
V
 
V
A
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
R
 
-
D
 
-
P
 
P
A
 
E
K
 
N
L
 
V
I
 
W
E
 
Q
A
 
I
F
 
M
K
 
V
S
 
S
A
 
K
I
 
I
P
 
P
M
 
A
G
 
G
R
 
Y
L
 
A
G
 
G
R
 
E
P
 
A
E
 
K
D
 
D
L
 
V
A
 
G
S
 
E
A
 
C
I
 
V
V
 
A
F
 
F
F
 
L
G
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
G
A
 
A
S
 
R
F
 
Y
I
 
I
T
 
N
G
 
G
Q
 
E
V
 
V
I
 
I
S
 
N
V
 
V
S
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
M
T
 
V
M
 
L

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
38% identity, 98% coverage: 4:253/255 of query aligns to 3:247/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
L
 
L
K
 
Q
N
 
G
Q
 
K
T
 
V
V
 
A
I
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
x
S
G
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
S
 
R
A
 
D
T
 
I
C
 
A
R
 
I
R
 
N
F
 
L
A
 
A
A
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
N
V
 
I
A
 
-
V
 
F
F
 
F
D
x
N
M
x
Y
N
|
N
-
x
G
-
x
S
P
 
P
A
 
E
A
 
A
A
 
A
E
 
E
E
 
E
V
 
T
A
 
A
A
 
K
G
 
L
I
 
V
R
 
A
A
 
E
A
 
H
G
 
G
G
 
V
Q
 
E
A
 
V
A
 
E
A
 
A
F
 
M
Q
 
K
C
 
A
D
x
N
I
x
V
T
 
A
D
 
I
R
 
A
A
 
E
Q
 
D
V
 
V
D
 
D
A
 
A
A
 
F
V
 
F
A
 
K
A
 
Q
T
 
A
G
 
I
A
 
E
Q
 
R
L
 
F
G
 
G
P
 
R
V
 
V
G
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
W
x
I
D
 
T
V
 
R
F
 
D
K
 
N
P
 
L
F
 
L
V
 
M
K
 
R
T
 
M
V
 
K
P
 
E
A
 
D
E
 
E
W
 
W
D
 
D
R
 
D
L
 
V
I
 
I
A
 
N
I
|
I
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
A
 
T
L
 
F
H
 
L
M
 
C
L
 
T
H
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
S
P
 
R
G
 
T
M
 
M
S
 
M
E
 
K
R
 
Q
R
 
R
S
 
A
G
 
G
H
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
 
M
A
 
A
S
|
S
D
 
V
A
 
V
A
 
G
R
 
L
G
 
I
G
 
G
S
 
N
S
 
A
G
 
G
E
x
Q
A
 
A
V
 
N
Y
|
Y
S
 
V
A
 
A
C
 
S
K
|
K
G
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
I
A
 
G
L
 
L
S
 
T
K
 
K
T
 
T
L
 
T
A
 
A
R
 
R
E
 
E
H
 
L
A
 
A
R
 
P
H
 
R
G
 
G
I
 
I
N
 
N
V
 
V
N
 
N
V
 
A
V
 
V
C
 
A
P
|
P
G
 
G
P
 
F
T
x
I
D
 
T
T
|
T
A
 
D
L
 
M
L
 
T
A
 
D
G
 
K
V
 
L
A
 
D
E
 
E
G
 
K
A
 
T
R
 
K
D
 
-
P
 
-
A
 
-
K
 
-
L
 
-
I
 
-
E
 
E
A
 
A
F
 
M
K
 
L
S
 
A
A
 
Q
I
 
I
P
 
P
M
 
L
G
 
G
R
 
A
L
 
Y
G
 
G
R
 
T
P
 
T
E
 
E
D
 
D
L
 
I
A
 
A
S
 
N
A
 
A
I
 
V
V
 
L
F
 
F
F
 
L
G
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
A
A
 
S
S
 
K
F
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
V
 
T
I
 
L
S
 
S
V
 
V
S
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M
T
 
V
M
 
M

3osuA Crystal structure of the 3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase, fabg, from staphylococcus aureus
36% identity, 97% coverage: 7:253/255 of query aligns to 5:246/246 of 3osuA

query
sites
3osuA
Q
 
K
T
 
S
V
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
G
 
S
G
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
S
 
R
A
 
S
T
 
I
C
 
A
R
 
L
R
 
Q
F
 
L
A
 
A
A
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
Y
K
 
N
V
 
V
A
 
A
V
 
V
-
 
N
F
 
Y
D
 
A
M
 
G
N
 
S
P
 
K
A
 
E
A
 
K
A
 
A
E
 
E
E
 
A
V
 
V
A
 
V
A
 
E
G
 
E
I
 
I
R
 
K
A
 
A
A
 
K
G
 
G
G
 
V
Q
 
D
A
 
S
A
 
F
A
 
A
F
 
I
Q
 
Q
C
 
A
D
 
N
I
 
V
T
 
A
D
 
D
R
 
A
A
 
D
Q
 
E
V
 
V
D
 
K
A
 
A
A
 
M
V
 
I
A
 
K
A
 
E
T
 
V
G
 
V
A
 
S
Q
 
Q
L
 
F
G
 
G
P
 
S
V
 
L
G
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
W
 
I
D
 
T
V
 
R
F
 
D
K
 
N
P
 
L
F
 
L
V
 
M
K
 
R
T
 
M
V
 
K
P
 
E
A
 
Q
E
 
E
W
 
W
D
 
D
R
 
D
L
 
V
I
 
I
A
 
D
I
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
A
 
V
L
 
F
H
 
N
M
 
C
L
 
I
H
 
Q
A
 
K
V
 
A
L
 
T
P
 
P
G
 
Q
M
 
M
S
 
L
E
 
R
R
 
Q
R
 
R
S
 
S
G
 
G
H
 
A
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
 
L
A
 
S
S
|
S
D
 
V
A
 
V
A
 
G
R
 
A
G
 
V
G
 
G
S
 
N
S
 
P
G
 
G
E
x
Q
A
 
A
V
 
N
Y
|
Y
S
 
V
A
 
A
C
 
T
K
|
K
G
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
I
A
 
G
L
 
L
S
 
T
K
 
K
T
 
S
L
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
E
H
 
L
A
 
A
R
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
I
N
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
A
V
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
P
 
-
T
 
-
D
 
-
T
 
-
A
 
F
L
 
I
L
 
V
A
 
S
G
 
D
V
 
M
A
 
T
E
 
D
G
 
A
A
 
L
R
 
S
D
 
D
P
 
E
A
 
L
K
 
K
L
 
-
I
 
-
E
 
E
A
 
Q
F
 
M
K
 
L
S
 
T
A
 
Q
I
 
I
P
 
P
M
 
L
G
 
A
R
 
R
L
 
F
G
 
G
R
 
Q
P
 
D
E
 
T
D
 
D
L
 
I
A
 
A
S
 
N
A
 
T
I
 
V
V
 
A
F
 
F
F
 
L
G
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
K
A
 
A
S
 
K
F
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
V
 
T
I
 
I
S
 
H
V
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
T
 
Y
M
 
M

1edoA The x-ray structure of beta-keto acyl carrier protein reductase from brassica napus complexed with NADP+ (see paper)
39% identity, 96% coverage: 9:253/255 of query aligns to 4:244/244 of 1edoA

query
sites
1edoA
V
 
V
I
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
x
S
G
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
S
 
K
A
 
A
T
 
I
C
 
A
R
 
L
R
 
S
F
 
L
A
 
G
A
 
K
E
 
A
G
 
G
A
 
C
K
 
K
V
 
V
A
 
L
V
 
V
-
x
N
F
x
Y
D
x
A
M
x
R
N
x
S
P
 
A
A
 
K
A
 
A
A
 
A
E
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
S
A
 
K
G
 
Q
I
 
I
R
 
E
A
 
A
A
 
Y
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
A
 
I
A
 
T
F
 
F
Q
 
G
C
 
G
D
|
D
I
x
V
T
 
S
D
 
K
R
 
E
A
 
A
Q
 
D
V
 
V
D
 
E
A
 
A
A
 
M
V
 
M
A
 
K
A
 
T
T
 
A
G
 
I
A
 
D
Q
 
A
L
 
W
G
 
G
P
 
T
V
 
I
G
 
D
V
 
V
L
 
V
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
W
 
I
D
 
T
V
 
R
F
 
D
K
 
T
P
 
L
F
 
L
V
 
I
K
 
R
T
 
M
V
 
K
P
 
K
A
 
S
E
 
Q
W
 
W
D
 
D
R
 
E
L
 
V
I
 
I
A
 
D
I
 
L
N
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
V
L
 
F
H
 
L
M
 
C
L
 
T
H
 
Q
A
 
A
V
 
A
L
 
T
P
 
K
G
 
I
M
 
M
S
 
M
E
 
K
R
 
K
R
 
R
S
 
K
G
 
G
H
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
 
I
A
 
A
S
|
S
D
 
V
A
 
V
A
 
G
R
 
L
G
 
I
G
 
G
S
 
N
S
 
I
G
 
G
E
 
Q
A
 
A
V
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
C
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
I
A
 
G
L
 
F
S
 
S
K
 
K
T
 
T
L
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
E
H
 
G
A
 
A
R
 
S
H
 
R
G
 
N
I
 
I
N
 
N
V
 
V
N
 
N
V
 
V
V
 
V
C
 
C
P
|
P
G
|
G
P
 
F
T
x
I
D
 
A
T
x
S
A
 
D
L
x
M
L
 
T
A
 
A
G
 
K
V
 
L
A
 
G
E
 
E
G
 
-
A
 
-
R
 
-
D
 
D
P
 
M
A
 
E
K
 
K
L
 
K
I
 
I
E
 
L
A
 
G
F
 
-
K
 
-
S
 
-
A
 
T
I
 
I
P
 
P
M
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
T
G
 
G
R
 
Q
P
 
P
E
 
E
D
 
N
L
 
V
A
 
A
S
 
G
A
 
L
I
 
V
V
 
E
F
 
F
F
 
L
G
 
A
-
 
L
S
 
S
D
 
P
D
 
A
A
 
A
S
 
S
F
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
V
 
A
I
 
F
S
 
T
V
 
I
S
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
I
T
 
A
M
 
I

6zzqA Crystal structure of (r)-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from acinetobacter baumannii complexed with NAD+ and acetoacetate (see paper)
35% identity, 98% coverage: 4:252/255 of query aligns to 4:258/260 of 6zzqA

query
sites
6zzqA
L
 
L
K
 
D
N
 
G
Q
 
K
T
 
V
V
 
A
I
 
F
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
S
G
 
A
G
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
S
 
L
A
 
E
T
 
I
C
 
A
R
 
K
R
 
K
F
 
F
A
 
A
A
 
Q
E
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
A
 
V
V
 
I
F
 
S
D
|
D
M
|
M
N
 
N
P
 
A
A
 
E
A
 
K
A
 
C
E
 
Q
E
 
E
V
 
T
A
 
A
A
 
N
G
 
S
I
 
L
R
 
K
A
 
E
A
 
Q
G
 
G
G
 
F
Q
 
D
A
 
A
A
 
L
A
 
S
F
 
A
Q
 
P
C
 
C
D
|
D
I
x
V
T
 
T
D
 
D
R
 
E
A
 
D
Q
 
A
V
 
Y
D
 
K
A
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
E
A
 
L
T
 
T
G
 
Q
A
 
K
Q
 
T
L
 
F
G
 
G
P
 
T
V
 
V
G
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
W
 
F
D
x
Q
V
 
H
F
 
V
K
 
A
P
 
P
F
 
I
V
 
E
K
 
E
T
 
F
V
 
P
P
 
T
A
 
A
E
 
V
W
 
F
D
 
Q
R
 
K
L
 
L
I
 
V
A
 
Q
I
 
V
N
 
M
L
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
F
H
 
I
M
 
G
L
 
I
H
 
K
A
 
H
V
 
V
L
 
L
P
 
P
G
 
I
M
 
M
S
 
K
E
 
A
R
 
Q
R
 
K
S
 
Y
G
 
G
H
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
x
M
A
|
A
S
|
S
D
 
I
A
 
N
A
 
G
R
 
L
G
 
I
G
 
G
S
 
F
S
 
A
G
 
G
E
x
K
A
 
A
V
 
G
Y
|
Y
S
 
N
A
 
S
C
 
A
K
|
K
G
 
H
G
 
G
L
 
V
V
 
I
A
 
G
L
 
L
S
 
T
K
 
K
T
 
V
L
 
A
A
 
A
R
 
L
E
 
E
H
 
C
A
 
A
R
 
R
H
 
D
G
 
G
I
 
I
N
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
A
V
 
L
C
 
C
P
 
P
G
 
G
P
x
Y
T
x
V
D
 
D
T
|
T
A
 
P
L
 
L
L
 
V
A
 
R
G
 
G
-
x
Q
V
 
I
A
 
A
E
 
D
G
 
L
A
 
A
R
 
K
D
 
T
-
 
R
-
 
N
-
 
V
-
 
S
-
 
L
P
 
D
A
 
S
K
 
A
L
 
L
I
 
E
E
 
D
A
 
V
F
 
I
K
 
L
S
 
A
A
 
M
I
 
V
P
 
P
M
 
Q
G
 
K
R
 
R
L
 
L
G
 
L
R
 
S
P
 
V
E
 
E
D
 
E
L
 
I
A
 
A
S
 
D
A
 
Y
I
 
A
V
 
I
F
 
F
F
 
L
G
 
A
S
 
S
D
 
S
D
 
K
A
 
A
S
 
G
F
 
G
I
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
V
 
A
I
 
V
S
 
V
V
 
M
S
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
Y
T
 
T

6zzsD Crystal structure of (r)-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from acinetobacter baumannii complexed with NAD+ and 3-oxovalerate (see paper)
35% identity, 98% coverage: 4:252/255 of query aligns to 5:259/261 of 6zzsD

query
sites
6zzsD
L
 
L
K
 
D
N
 
G
Q
 
K
T
 
V
V
 
A
I
 
F
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
S
G
 
A
G
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
S
 
L
A
 
E
T
 
I
C
 
A
R
 
K
R
 
K
F
 
F
A
 
A
A
 
Q
E
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
A
 
V
V
 
I
F
 
S
D
|
D
M
|
M
N
 
N
P
 
A
A
 
E
A
 
K
A
 
C
E
 
Q
E
 
E
V
 
T
A
 
A
A
 
N
G
 
S
I
 
L
R
 
K
A
 
E
A
 
Q
G
 
G
G
 
F
Q
 
D
A
 
A
A
 
L
A
 
S
F
 
A
Q
 
P
C
 
C
D
|
D
I
x
V
T
 
T
D
 
D
R
 
E
A
 
D
Q
 
A
V
 
Y
D
 
K
A
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
E
A
 
L
T
 
T
G
 
Q
A
 
K
Q
 
T
L
 
F
G
 
G
P
 
T
V
 
V
G
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
W
 
F
D
x
Q
V
 
H
F
 
V
K
 
A
P
 
P
F
 
I
V
 
E
K
 
E
T
 
F
V
 
P
P
 
T
A
 
A
E
 
V
W
 
F
D
 
Q
R
 
K
L
 
L
I
 
V
A
 
Q
I
 
V
N
 
M
L
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
F
H
 
I
M
 
G
L
 
I
H
 
K
A
 
H
V
 
V
L
 
L
P
 
P
G
 
I
M
 
M
S
 
K
E
 
A
R
 
Q
R
 
K
S
 
Y
G
 
G
H
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
x
M
A
|
A
S
|
S
D
 
I
A
x
N
A
 
G
R
 
L
G
 
I
G
 
G
S
 
F
S
 
A
G
 
G
E
x
K
A
 
A
V
 
G
Y
|
Y
S
 
N
A
 
S
C
 
A
K
|
K
G
 
H
G
 
G
L
 
V
V
 
I
A
 
G
L
 
L
S
 
T
K
 
K
T
 
V
L
 
A
A
 
A
R
 
L
E
 
E
H
 
C
A
 
A
R
 
R
H
 
D
G
 
G
I
 
I
N
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
A
V
 
L
C
 
C
P
|
P
G
|
G
P
 
Y
T
x
V
D
 
D
T
|
T
A
 
P
L
|
L
L
 
V
A
 
R
G
 
G
-
x
Q
V
 
I
A
 
A
E
 
D
G
 
L
A
 
A
R
 
K
D
 
T
-
 
R
-
 
N
-
 
V
-
 
S
-
 
L
P
 
D
A
 
S
K
 
A
L
 
L
I
 
E
E
 
D
A
 
V
F
 
I
K
 
L
S
 
A
A
 
M
I
 
V
P
 
P
M
 
Q
G
 
K
R
 
R
L
 
L
G
 
L
R
 
S
P
 
V
E
 
E
D
 
E
L
 
I
A
 
A
S
 
D
A
 
Y
I
 
A
V
 
I
F
 
F
F
 
L
G
 
A
S
 
S
D
 
S
D
 
K
A
 
A
S
 
G
F
 
G
I
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
V
 
A
I
 
V
S
 
V
V
 
M
S
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
Y
T
 
T

H9XP47 Meso-2,3-butanediol dehydrogenase; BDH; meso-2,3-BDH; (R,S)-butane-2,3-diol dehydrogenase; NAD(H)-dependent meso-2,3-BDH; SmBdh; EC 1.1.1.- from Serratia marcescens (see paper)
36% identity, 98% coverage: 4:252/255 of query aligns to 3:242/251 of H9XP47

query
sites
H9XP47
L
 
F
K
 
D
N
 
N
Q
 
K
T
 
V
V
 
V
I
 
V
V
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
A
G
 
G
G
x
N
G
 
G
I
x
M
G
 
G
S
 
E
A
 
A
T
 
A
C
 
A
R
 
R
R
 
R
F
 
F
A
 
S
A
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
I
V
 
V
A
 
V
V
 
L
F
 
A
D
|
D
M
 
W
N
 
A
P
 
K
A
 
E
A
 
A
A
 
V
E
 
D
E
 
K
V
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
S
I
 
L
R
 
-
A
 
-
A
 
P
G
 
K
G
 
G
Q
 
R
A
 
A
A
 
M
A
 
A
F
 
V
Q
 
H
C
 
I
D
|
D
I
x
V
T
 
S
D
 
D
R
 
H
A
 
V
Q
 
A
V
 
V
D
 
E
A
 
K
A
 
M
V
 
M
A
 
N
A
 
E
T
 
V
G
 
A
A
 
E
Q
 
K
L
 
L
G
 
G
P
 
R
V
 
I
G
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
L
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
W
 
V
D
 
H
V
 
V
F
 
A
K
 
G
P
 
S
F
 
V
V
 
L
K
 
E
T
 
T
V
 
S
P
 
I
A
 
D
E
 
D
W
 
W
D
 
R
R
 
R
L
 
I
I
 
A
A
 
G
I
 
V
N
 
D
L
 
I
T
 
D
G
 
G
A
 
V
L
 
V
H
 
F
M
 
C
L
 
S
H
 
K
A
 
F
V
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
H
M
 
L
S
 
L
E
 
K
R
 
T
R
 
K
S
 
-
G
 
G
H
 
C
I
 
I
V
 
V
N
 
N
V
 
T
A
 
A
S
|
S
D
x
V
A
x
S
A
 
G
R
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
D
S
 
W
G
 
G
E
 
A
A
 
A
V
 
Y
Y
|
Y
S
 
C
A
 
A
C
 
A
K
|
K
G
 
G
G
 
A
L
 
V
V
 
V
A
 
N
L
 
L
S
 
T
K
 
R
T
 
A
L
 
M
A
 
A
R
 
L
E
 
D
H
 
H
A
 
G
R
 
G
H
 
D
G
 
G
I
 
V
N
 
R
V
 
I
N
 
N
V
 
S
V
 
V
C
 
C
P
 
P
G
 
S
P
 
L
T
x
V
D
 
K
T
|
T
A
 
N
L
 
M
L
 
T
A
 
N
G
 
G
V
 
W
A
 
P
E
 
Q
G
 
E
A
 
I
R
|
R
D
|
D
P
x
K
A
 
-
K
 
-
L
 
-
I
 
-
E
 
-
A
 
-
F
 
F
K
 
N
S
 
E
A
 
R
I
 
I
P
 
A
M
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
A
G
 
A
R
 
E
P
 
P
E
 
E
D
 
E
L
 
V
A
 
A
S
 
A
A
 
V
I
 
M
V
 
A
F
 
F
F
 
L
G
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
D
A
 
A
S
 
S
F
 
F
I
 
I
T
 
N
G
 
G
Q
 
A
V
 
N
I
 
I
S
 
P
V
 
V
S
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
A
T
 
T

Sites not aligning to the query:

6xewA Structure of serratia marcescens 2,3-butanediol dehydrogenase (see paper)
36% identity, 98% coverage: 4:252/255 of query aligns to 3:242/251 of 6xewA

query
sites
6xewA
L
 
F
K
 
D
N
 
N
Q
 
K
T
 
V
V
 
V
I
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
 
G
G
x
N
G
|
G
I
x
M
G
 
G
S
 
E
A
 
A
T
 
A
C
 
A
R
 
R
R
 
R
F
 
F
A
 
S
A
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
I
V
 
V
A
 
V
V
 
L
F
 
A
D
|
D
M
x
W
N
x
A
P
 
K
A
 
E
A
 
A
A
 
V
E
 
D
E
 
K
V
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
S
I
 
L
R
 
-
A
 
-
A
 
P
G
 
K
G
 
G
Q
 
R
A
 
A
A
 
M
A
 
A
F
 
V
Q
 
H
C
x
I
D
|
D
I
x
V
T
 
S
D
 
D
R
 
H
A
 
V
Q
 
A
V
 
V
D
 
E
A
 
K
A
 
M
V
 
M
A
 
N
A
 
E
T
 
V
G
 
A
A
 
E
Q
 
K
L
 
L
G
 
G
P
 
R
V
 
I
G
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
L
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
W
 
V
D
 
H
V
 
V
F
 
A
K
 
G
P
 
S
F
 
V
V
 
L
K
 
E
T
 
T
V
 
S
P
 
I
A
 
D
E
 
D
W
 
W
D
 
R
R
 
R
L
 
I
I
 
A
A
 
G
I
x
V
N
 
D
L
 
I
T
 
D
G
 
G
A
 
V
L
 
V
H
 
F
M
 
C
L
 
S
H
 
K
A
 
F
V
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
H
M
 
L
S
 
L
E
 
K
R
 
T
R
 
K
S
 
-
G
 
G
H
 
C
I
 
I
V
 
V
N
 
N
V
x
T
A
 
A
S
|
S
D
 
V
A
x
S
A
 
G
R
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
D
S
 
W
G
 
G
E
 
A
A
 
A
V
 
Y
Y
|
Y
S
 
C
A
 
A
C
 
A
K
|
K
G
 
G
G
 
A
L
 
V
V
 
V
A
 
N
L
 
L
S
 
T
K
 
R
T
 
A
L
 
M
A
 
A
R
 
L
E
 
D
H
 
H
A
 
G
R
 
G
H
 
D
G
 
G
I
 
V
N
 
R
V
 
I
N
 
N
V
 
S
V
 
V
C
 
C
P
 
P
G
x
S
P
x
L
T
x
V
D
 
K
T
|
T
A
x
N
L
x
M
L
x
T
A
 
N
G
 
G
V
 
W
A
 
P
E
 
Q
G
 
E
A
 
I
R
 
R
D
 
D
P
 
K
A
 
-
K
 
-
L
 
-
I
 
-
E
 
-
A
 
-
F
 
F
K
 
N
S
 
E
A
 
R
I
 
I
P
 
A
M
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
A
G
 
A
R
 
E
P
 
P
E
 
E
D
 
E
L
 
V
A
 
A
S
 
A
A
 
V
I
 
M
V
 
A
F
 
F
F
 
L
G
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
D
A
 
A
S
 
S
F
 
F
I
 
I
T
 
N
G
 
G
Q
 
A
V
 
N
I
 
I
S
 
P
V
 
V
S
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
A
T
 
T

6vspB Structure of serratia marcescens 2,3-butanediol dehydrogenase mutant q247a (see paper)
36% identity, 98% coverage: 4:252/255 of query aligns to 5:244/252 of 6vspB

query
sites
6vspB
L
 
F
K
 
D
N
 
N
Q
 
K
T
 
V
V
 
V
I
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
 
G
G
x
N
G
|
G
I
 
M
G
 
G
S
 
E
A
 
A
T
 
A
C
 
A
R
 
R
R
 
R
F
 
F
A
 
S
A
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
I
V
 
V
A
 
V
V
 
L
F
 
A
D
|
D
M
x
W
N
 
A
P
 
K
A
 
E
A
 
A
A
 
V
E
 
D
E
 
K
V
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
S
I
 
L
R
 
-
A
 
-
A
 
P
G
 
K
G
 
G
Q
 
R
A
 
A
A
 
M
A
 
A
F
 
V
Q
 
H
C
x
I
D
|
D
I
x
V
T
 
S
D
 
D
R
 
H
A
 
V
Q
 
A
V
 
V
D
 
E
A
 
K
A
 
M
V
 
M
A
 
N
A
 
E
T
 
V
G
 
A
A
 
E
Q
 
K
L
 
L
G
 
G
P
 
R
V
 
I
G
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
L
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
|
G
W
 
V
D
 
H
V
 
V
F
 
A
K
 
G
P
 
S
F
 
V
V
 
L
K
 
E
T
 
T
V
 
S
P
 
I
A
 
D
E
 
D
W
 
W
D
 
R
R
 
R
L
 
I
I
 
A
A
 
G
I
 
V
N
 
D
L
 
I
T
 
D
G
 
G
A
 
V
L
 
V
H
 
F
M
 
C
L
 
S
H
 
K
A
 
F
V
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
H
M
 
L
S
 
L
E
 
K
R
 
T
R
 
K
S
 
-
G
 
G
H
 
C
I
 
I
V
 
V
N
 
N
V
 
T
A
 
A
S
|
S
D
 
V
A
 
S
A
 
G
R
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
D
S
 
W
G
 
G
E
 
A
A
 
A
V
 
Y
Y
|
Y
S
 
C
A
 
A
C
 
A
K
 
K
G
 
G
G
 
A
L
 
V
V
 
V
A
 
N
L
 
L
S
 
T
K
 
R
T
 
A
L
 
M
A
 
A
R
 
L
E
 
D
H
 
H
A
 
G
R
 
G
H
 
D
G
 
G
I
 
V
N
 
R
V
 
I
N
 
N
V
 
S
V
 
V
C
 
C
P
 
P
G
 
S
P
 
L
T
 
V
D
 
K
T
 
T
A
 
N
L
 
M
L
 
T
A
 
N
G
 
G
V
 
W
A
 
P
E
 
Q
G
 
E
A
 
I
R
 
R
D
 
D
P
 
K
A
 
-
K
 
-
L
 
-
I
 
-
E
 
-
A
 
-
F
 
F
K
 
N
S
 
E
A
 
R
I
 
I
P
 
A
M
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
A
G
 
A
R
 
E
P
 
P
E
 
E
D
 
E
L
 
V
A
 
A
S
 
A
A
 
V
I
 
M
V
 
A
F
 
F
F
 
L
G
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
D
A
 
A
S
 
S
F
 
F
I
 
I
T
 
N
G
 
G
Q
 
A
V
 
N
I
 
I
S
 
P
V
 
V
S
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
A
T
 
T

Q9KJF1 (2S)-[(R)-hydroxy(phenyl)methyl]succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; (S,R)-2-(alpha-hydroxybenzyl)succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; EC 1.1.1.429 from Thauera aromatica (see 2 papers)
36% identity, 98% coverage: 3:253/255 of query aligns to 2:245/248 of Q9KJF1

query
sites
Q9KJF1
G
 
G
L
 
I
K
 
Q
N
 
N
Q
 
R
T
 
V
V
 
A
I
 
L
V
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
S
G
 
A
G
x
S
G
 
G
I
 
M
G
 
G
S
 
K
A
 
Q
T
 
T
C
 
A
R
 
L
R
 
R
F
 
F
A
 
A
A
 
E
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
K
 
A
V
 
V
A
 
V
V
 
I
F
 
N
D
|
D
M
 
I
N
 
D
P
 
A
A
 
E
A
 
K
A
 
V
E
 
R
E
 
A
V
 
T
A
 
V
A
 
D
G
 
E
I
 
F
R
 
S
A
 
A
A
 
R
G
 
G
G
 
H
Q
 
R
A
 
V
A
 
L
A
 
G
F
 
A
Q
 
V
C
 
A
D
|
D
I
|
I
T
 
G
D
 
N
R
 
K
A
 
A
Q
 
A
V
 
V
D
 
D
A
 
G
A
 
M
V
 
V
A
 
K
A
 
Q
T
 
T
G
 
I
A
 
D
Q
 
A
L
 
F
G
 
G
P
 
R
V
 
I
G
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
W
 
M
D
 
E
V
 
R
F
 
A
K
 
G
P
 
A
F
 
L
V
 
R
K
 
K
T
 
L
V
 
S
P
 
E
A
 
A
E
 
D
W
 
W
D
 
D
R
 
V
L
 
T
I
 
I
A
 
N
I
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
A
 
T
L
 
F
H
 
L
M
 
C
L
 
T
H
 
Q
A
 
A
V
 
V
L
 
H
P
 
G
G
 
H
M
 
M
S
 
V
E
 
E
R
 
N
R
 
K
S
 
H
G
 
G
H
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
V
 
I
A
 
A
S
 
S
D
 
R
A
 
A
A
 
W
R
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
-
S
 
A
G
 
G
E
 
Q
A
 
T
V
 
P
Y
|
Y
S
 
S
A
 
S
C
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
V
A
 
G
L
 
M
S
 
T
K
 
R
T
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
I
E
 
E
H
 
L
A
 
G
R
 
R
H
 
A
G
 
G
I
 
I
N
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
C
V
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
P
 
L
T
 
I
D
 
H
T
 
T
A
 
P
L
 
M
L
 
W
A
 
D
G
 
E
V
 
L
A
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
R
 
-
D
 
-
P
 
P
A
 
E
K
 
K
L
 
D
I
 
Q
E
 
Q
A
 
F
F
 
L
K
 
L
S
 
S
A
 
R
I
 
Q
P
 
P
M
 
T
G
 
G
R
 
K
L
 
L
G
 
G
R
 
E
P
 
P
E
 
D
D
 
D
L
 
I
A
 
A
S
 
N
A
 
T
I
 
L
V
 
L
F
 
F
F
 
L
G
 
A
S
 
D
D
 
D
D
 
D
A
 
S
S
 
G
F
 
F
I
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
I
 
L
S
 
Y
V
 
V
S
 
C
G
 
G
G
 
G
L
 
R
T
 
S
M
 
L

Sites not aligning to the query:

7pcsB Structure of the heterotetrameric sdr family member bbscd (see paper)
36% identity, 98% coverage: 3:253/255 of query aligns to 1:244/247 of 7pcsB

query
sites
7pcsB
G
 
G
L
 
I
K
 
Q
N
 
N
Q
 
R
T
 
V
V
 
A
I
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
S
G
 
A
G
 
S
G
 
G
I
x
M
G
 
G
S
 
K
A
 
Q
T
 
T
C
 
A
R
 
L
R
 
R
F
 
F
A
 
A
A
 
E
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
K
 
A
V
 
V
A
 
V
V
 
I
F
 
N
D
|
D
M
x
I
N
 
D
P
 
A
A
 
E
A
 
K
A
 
V
E
 
R
E
 
A
V
 
T
A
 
V
A
 
D
G
 
E
I
 
F
R
 
S
A
 
A
A
 
R
G
 
G
G
 
H
Q
 
R
A
 
V
A
 
L
A
 
G
F
 
A
Q
 
V
C
 
A
D
 
D
I
|
I
T
 
G
D
 
N
R
 
K
A
 
A
Q
 
A
V
 
V
D
 
D
A
 
G
A
 
M
V
 
V
A
 
K
A
 
Q
T
 
T
G
 
I
A
 
D
Q
 
A
L
 
F
G
 
G
P
 
R
V
 
I
G
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
W
 
M
D
 
E
V
 
R
F
 
A
K
 
G
P
 
A
F
 
L
V
 
R
K
 
K
T
 
L
V
 
S
P
 
E
A
 
A
E
 
D
W
 
W
D
 
D
R
 
V
L
 
T
I
 
I
A
 
N
I
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
A
 
T
L
 
F
H
 
L
M
 
C
L
 
T
H
 
Q
A
 
A
V
 
V
L
 
H
P
 
G
G
 
H
M
 
M
S
 
V
E
 
E
R
 
N
R
 
K
S
 
H
G
 
G
H
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
V
x
I
A
 
A
S
|
S
D
 
R
A
 
A
A
 
W
R
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
-
S
 
A
G
 
G
E
 
Q
A
 
T
V
 
P
Y
|
Y
S
 
S
A
 
S
C
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
V
A
 
G
L
 
M
S
 
T
K
 
R
T
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
I
E
 
E
H
 
L
A
 
G
R
 
R
H
 
A
G
 
G
I
 
I
N
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
C
V
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
P
 
L
T
x
I
D
 
H
T
 
T
A
 
P
L
 
M
L
 
W
A
 
D
G
 
E
V
 
L
A
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
R
 
-
D
 
-
P
 
P
A
 
E
K
 
K
L
 
D
I
 
Q
E
 
Q
A
 
F
F
 
L
K
 
L
S
 
S
A
 
R
I
 
Q
P
 
P
M
 
T
G
 
G
R
 
K
L
 
L
G
 
G
R
 
E
P
 
P
E
 
D
D
 
D
L
 
I
A
 
A
S
 
N
A
 
T
I
 
L
V
 
L
F
 
F
F
 
L
G
 
A
S
 
D
D
 
D
D
 
D
A
 
S
S
 
G
F
 
F
I
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
I
 
L
S
 
Y
V
 
V
S
 
C
G
 
G
G
 
G
L
 
R
T
 
S
M
 
L

6vspA Structure of serratia marcescens 2,3-butanediol dehydrogenase mutant q247a (see paper)
36% identity, 98% coverage: 4:252/255 of query aligns to 3:242/251 of 6vspA

query
sites
6vspA
L
 
F
K
 
D
N
 
N
Q
 
K
T
 
V
V
 
V
I
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
 
G
G
x
N
G
|
G
I
x
M
G
 
G
S
 
E
A
 
A
T
 
A
C
 
A
R
 
R
R
 
R
F
 
F
A
 
S
A
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
I
V
 
V
A
 
V
V
 
L
F
 
A
D
|
D
M
x
W
N
x
A
P
 
K
A
 
E
A
 
A
A
 
V
E
 
D
E
 
K
V
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
S
I
 
L
R
 
-
A
 
-
A
 
P
G
 
K
G
 
G
Q
 
R
A
 
A
A
 
M
A
 
A
F
 
V
Q
 
H
C
x
I
D
|
D
I
x
V
T
 
S
D
 
D
R
 
H
A
 
V
Q
 
A
V
 
V
D
 
E
A
 
K
A
 
M
V
 
M
A
 
N
A
 
E
T
 
V
G
 
A
A
 
E
Q
 
K
L
 
L
G
 
G
P
 
R
V
 
I
G
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
L
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
W
x
V
D
 
H
V
 
V
F
 
A
K
 
G
P
 
S
F
 
V
V
 
L
K
 
E
T
 
T
V
 
S
P
 
I
A
 
D
E
 
D
W
 
W
D
 
R
R
 
R
L
 
I
I
 
A
A
 
G
I
x
V
N
 
D
L
 
I
T
 
D
G
 
G
A
 
V
L
 
V
H
 
F
M
 
C
L
 
S
H
 
K
A
 
F
V
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
H
M
 
L
S
 
L
E
 
K
R
 
T
R
 
K
S
 
-
G
 
G
H
 
C
I
 
I
V
 
V
N
 
N
V
x
T
A
 
A
S
|
S
D
 
V
A
 
S
A
 
G
R
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
D
S
 
W
G
 
G
E
 
A
A
 
A
V
 
Y
Y
|
Y
S
 
C
A
 
A
C
 
A
K
|
K
G
 
G
G
 
A
L
 
V
V
 
V
A
 
N
L
 
L
S
 
T
K
 
R
T
 
A
L
 
M
A
 
A
R
 
L
E
 
D
H
 
H
A
 
G
R
 
G
H
 
D
G
 
G
I
 
V
N
 
R
V
 
I
N
 
N
V
 
S
V
 
V
C
 
C
P
|
P
G
x
S
P
x
L
T
x
V
D
 
K
T
|
T
A
x
N
L
x
M
L
x
T
A
 
N
G
 
G
V
 
W
A
 
P
E
 
Q
G
 
E
A
 
I
R
 
R
D
 
D
P
 
K
A
 
-
K
 
-
L
 
-
I
 
-
E
 
-
A
 
-
F
 
F
K
 
N
S
 
E
A
 
R
I
 
I
P
 
A
M
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
A
G
 
A
R
 
E
P
 
P
E
 
E
D
 
E
L
 
V
A
 
A
S
 
A
A
 
V
I
 
M
V
 
A
F
 
F
F
 
L
G
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
D
A
 
A
S
 
S
F
 
F
I
 
I
T
 
N
G
 
G
Q
 
A
V
 
N
I
 
I
S
 
P
V
 
V
S
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
A
T
 
T

P73826 Acetoacetyl-CoA reductase; EC 1.1.1.36 from Synechocystis sp. (strain PCC 6803 / Kazusa) (see paper)
36% identity, 97% coverage: 3:249/255 of query aligns to 5:236/240 of P73826

query
sites
P73826
G
 
G
L
 
L
K
 
E
N
 
D
Q
 
K
T
 
V
V
 
I
I
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
G
 
N
G
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
S
 
A
A
 
A
T
 
I
C
 
V
R
 
K
R
 
L
F
 
L
A
 
Q
A
 
E
E
 
M
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
A
 
A
V
 
F
F
 
T
D
 
D
M
 
L
N
 
A
P
 
T
A
 
D
A
 
G
A
 
G
E
 
N
E
 
T
V
 
E
A
 
A
A
 
L
G
 
G
I
 
V
R
 
V
A
 
A
A
 
-
G
 
-
G
 
-
Q
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
F
 
-
Q
 
-
C
 
-
D
 
N
I
 
V
T
 
T
D
 
D
R
 
L
A
 
E
Q
 
S
V
 
M
D
 
T
A
 
A
A
 
A
V
 
A
A
 
A
A
 
E
T
 
I
G
 
T
A
 
D
Q
 
K
L
 
L
G
 
G
P
 
P
V
 
V
G
 
Y
V
 
G
L
 
V
V
 
V
N
 
A
N
 
N
A
 
A
G
 
G
W
 
I
D
 
T
V
 
K
F
 
D
K
 
N
P
 
F
F
 
F
V
 
P
K
 
K
T
 
L
V
 
T
P
 
P
A
 
A
E
 
D
W
 
W
D
 
D
R
 
A
L
 
V
I
 
L
A
 
N
I
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
A
 
V
L
 
A
H
 
Y
M
 
S
L
 
I
H
 
K
A
 
P
V
 
F
L
 
I
P
 
E
G
 
G
M
 
M
S
 
Y
E
 
E
R
 
R
R
 
K
S
 
A
G
 
G
H
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
A
V
 
I
A
 
S
S
|
S
D
 
I
A
 
S
A
 
G
R
 
E
G
 
R
G
 
G
S
 
N
S
 
V
G
 
G
E
 
Q
A
 
T
V
 
N
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
C
 
T
K
|
K
G
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
I
A
 
G
L
 
M
S
 
M
K
 
K
T
 
S
L
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
H
 
G
A
 
A
R
 
R
H
 
Y
G
 
G
I
 
V
N
 
R
V
 
A
N
 
N
V
 
A
V
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
P
 
F
T
 
I
D
 
D
T
 
T
A
 
E
L
 
M
L
 
T
A
 
L
G
 
A
V
 
I
A
 
R
E
 
E
G
 
D
A
 
I
R
 
R
D
 
-
P
 
-
A
 
-
K
 
-
L
 
-
I
 
-
E
 
E
A
 
K
F
 
I
K
 
T
S
 
K
A
 
E
I
 
I
P
 
P
M
 
F
G
 
R
R
 
R
L
 
F
G
 
G
R
 
K
P
 
P
E
 
E
D
 
E
L
 
I
A
 
A
S
 
W
A
 
A
I
 
V
V
 
A
F
 
F
F
 
L
G
 
L
S
 
S
D
 
P
D
 
V
A
 
A
-
 
S
S
 
S
F
 
Y
I
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
V
 
V
I
 
L
S
 
R
V
 
V
S
 
N
G
 
G

6t77A Crystal structure of klebsiella pneumoniae fabg(NADPH-dependent) NADP- complex at 1.75 a resolution (see paper)
34% identity, 98% coverage: 4:253/255 of query aligns to 3:243/244 of 6t77A

query
sites
6t77A
L
 
F
K
 
E
N
 
G
Q
 
K
T
 
I
V
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
x
S
G
x
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
S
 
R
A
 
A
T
 
I
C
 
A
R
 
E
R
 
T
F
 
L
A
 
V
A
 
A
E
 
R
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
A
 
I
V
 
G
F
 
T
D
 
A
M
x
T
N
 
S
P
 
E
A
 
S
A
 
G
A
 
A
E
 
Q
E
 
A
V
 
I
A
 
S
A
 
D
G
 
Y
I
 
L
R
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
G
G
 
A
Q
 
N
A
 
G
A
 
K
A
 
G
F
 
L
Q
 
M
C
x
L
D
x
N
I
x
V
T
 
T
D
 
D
R
 
P
A
 
A
Q
 
S
V
 
I
D
 
E
A
 
S
A
 
V
V
 
L
A
 
E
A
 
N
T
 
V
G
 
R
A
 
A
Q
 
E
L
 
F
G
 
G
P
 
E
V
 
V
G
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
|
A
G
|
G
W
x
I
D
 
T
V
 
R
F
 
D
K
 
N
P
 
L
F
 
L
V
 
M
K
 
R
T
 
M
V
 
K
P
 
D
A
 
D
E
 
E
W
 
W
D
 
N
R
 
D
L
 
I
I
 
I
A
 
E
I
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
S
G
 
S
A
 
V
L
 
F
H
 
R
M
 
L
L
 
S
H
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
M
P
 
R
G
 
A
M
 
M
S
 
M
E
 
K
R
 
K
R
 
R
S
 
H
G
 
G
H
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
V
 
I
A
 
G
S
|
S
D
 
V
A
 
V
A
 
G
R
 
T
G
 
M
G
 
G
S
 
N
S
 
A
G
 
G
E
 
Q
A
 
A
V
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
C
 
A
K
 
K
G
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
I
A
 
G
L
 
F
S
 
S
K
 
K
T
 
S
L
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
H
 
V
A
 
A
R
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
I
N
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
V
V
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
P
 
F
T
 
I
D
 
E
T
 
T
A
 
D
L
 
M
L
 
T
A
 
R
G
 
A
V
 
L
A
 
T
E
 
D
G
 
E
A
 
Q
R
 
R
D
 
-
P
 
-
A
 
-
K
 
-
L
 
-
I
 
-
E
 
A
A
 
G
F
 
T
K
 
L
S
 
A
A
 
A
I
 
V
P
 
P
M
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
T
P
 
P
E
 
N
D
 
E
L
 
I
A
 
A
S
 
S
A
 
A
I
 
V
V
 
A
F
 
F
F
 
L
G
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
E
A
 
A
S
 
S
F
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
V
 
T
I
 
L
S
 
H
V
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
T
 
Y
M
 
M

7emgB Carbonyl reductase variant 4 (r123c/l209p/f183y/v61k) from serratia marcescens complexed with NADP+ (see paper)
34% identity, 98% coverage: 4:253/255 of query aligns to 2:242/243 of 7emgB

query
sites
7emgB
L
 
F
K
 
E
N
 
G
Q
 
K
T
 
I
V
 
V
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
x
S
G
x
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
S
 
R
A
 
A
T
 
I
C
 
A
R
 
E
R
 
T
F
 
F
A
 
V
A
 
A
E
 
R
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
A
 
I
V
 
G
F
 
T
D
 
A
M
x
T
N
 
S
P
 
E
A
 
S
A
 
G
A
 
A
E
 
E
E
 
A
V
 
I
A
 
S
A
 
G
G
 
Y
I
 
L
R
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
G
G
 
A
Q
 
N
A
 
G
A
 
K
A
 
G
F
 
F
Q
 
M
C
 
L
D
x
N
I
x
V
T
 
K
D
 
D
R
 
A
A
 
Q
Q
 
S
V
 
I
D
 
D
A
 
S
A
 
V
V
 
L
A
 
A
A
 
S
T
 
I
G
 
R
A
 
A
Q
 
E
L
 
F
G
 
G
P
 
E
V
 
I
G
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
W
x
I
D
 
T
V
 
R
F
 
D
K
 
N
P
 
L
F
 
L
V
 
M
K
 
R
T
 
M
V
 
K
P
 
D
A
 
D
E
 
E
W
 
W
D
 
E
R
 
D
L
 
I
I
 
L
A
 
D
I
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
S
A
 
V
L
 
F
H
 
R
M
 
L
L
 
S
H
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
M
P
 
C
G
 
A
M
 
M
S
 
M
E
 
K
R
 
K
R
 
R
S
 
F
G
 
G
H
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
V
 
I
A
 
G
S
 
S
D
 
V
A
 
V
A
 
G
R
 
T
G
 
M
G
 
G
S
 
N
S
 
A
G
 
G
E
 
Q
A
 
A
V
 
N
Y
 
Y
S
 
A
A
 
A
C
 
A
K
 
K
G
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
I
A
 
G
L
 
F
S
 
S
K
 
K
T
 
S
L
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
H
 
V
A
 
A
R
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
I
N
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
V
V
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
P
 
Y
T
 
I
D
 
E
T
 
T
A
 
D
L
 
M
L
 
T
A
 
R
G
 
A
V
 
L
A
 
T
E
 
D
G
 
D
A
 
Q
R
 
R
D
 
-
P
 
-
A
 
-
K
 
-
L
 
-
I
 
-
E
 
A
A
 
G
F
 
I
K
 
L
S
 
S
A
 
S
I
 
V
P
 
P
M
 
A
G
 
N
R
 
R
L
 
P
G
 
G
R
 
D
P
 
A
E
 
K
D
 
E
L
 
I
A
 
A
S
 
S
A
 
A
I
 
V
V
 
A
F
 
F
F
 
L
G
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
E
A
 
A
S
 
G
F
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
V
 
T
I
 
L
S
 
H
V
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
T
 
Y
M
 
M

7x5jC Acp-dependent oxoacyl reductase
36% identity, 98% coverage: 4:253/255 of query aligns to 2:253/256 of 7x5jC

query
sites
7x5jC
L
 
L
K
 
Q
N
 
K
Q
 
R
T
 
V
V
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
x
S
G
 
G
G
|
G
I
x
L
G
 
G
S
 
R
A
 
V
T
 
H
C
 
A
R
 
L
R
 
T
F
 
L
A
 
A
A
 
Q
E
 
N
G
 
G
A
 
A
K
 
D
V
 
V
A
 
A
V
 
V
F
 
T
-
 
G
D
x
N
M
x
R
N
|
N
P
 
I
A
 
D
A
 
K
A
 
A
E
 
E
E
 
S
V
 
V
A
 
A
A
 
N
G
 
E
I
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
L
G
 
G
G
 
R
Q
 
K
A
 
A
A
 
L
A
 
A
F
 
I
Q
 
K
C
 
V
D
|
D
I
x
V
T
 
S
D
 
N
R
 
E
A
 
D
Q
 
E
V
 
V
D
 
N
A
 
E
A
 
G
V
 
V
A
 
E
A
 
K
T
 
I
G
 
K
A
 
K
Q
 
E
L
 
L
G
 
G
P
 
S
V
 
V
G
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
x
A
W
 
S
D
 
G
V
 
I
F
 
V
K
 
R
P
 
A
F
 
T
V
 
L
-
 
I
-
 
E
K
 
K
T
 
T
V
 
A
P
 
K
A
 
E
E
 
D
W
 
W
D
 
D
R
 
Q
L
 
D
I
 
L
A
 
R
I
x
V
N
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
F
H
 
N
M
 
C
L
 
I
H
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
I
P
 
P
G
 
D
M
 
M
S
 
K
E
 
K
R
 
N
R
 
N
S
 
W
G
 
G
H
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
x
I
A
 
S
S
 
S
D
 
V
A
 
T
A
 
G
R
 
T
G
 
M
G
 
G
S
 
G
S
 
S
G
 
G
E
 
Q
A
 
C
V
 
S
Y
|
Y
S
 
A
A
 
T
C
 
T
K
|
K
G
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
I
A
 
G
L
 
L
S
 
T
K
 
K
T
 
T
L
 
V
A
 
A
R
 
L
E
 
E
H
 
G
A
 
A
R
 
R
H
 
Y
G
 
N
I
 
I
N
 
T
V
 
C
N
 
N
V
 
-
V
 
-
C
 
-
P
 
-
G
 
-
P
 
-
T
 
-
D
 
-
T
 
-
A
 
A
L
 
L
L
 
V
A
x
L
G
|
G
V
|
V
-
 
F
-
 
G
A
 
G
E
 
R
G
 
G
A
x
R
R
 
E
D
 
D
P
x
S
A
x
S
-
 
F
-
 
Y
K
 
D
L
 
V
I
 
A
E
 
E
A
 
P
F
 
F
K
 
R
S
 
E
A
 
R
I
 
I
-
 
I
-
 
K
-
 
R
-
 
T
P
 
A
M
 
M
G
 
R
R
 
R
L
 
P
G
 
G
R
 
D
P
 
P
E
 
K
D
 
E
L
 
L
A
 
S
S
 
N
A
 
V
I
 
L
V
 
A
F
 
F
F
 
L
G
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
E
A
 
A
S
 
S
F
 
Y
I
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
D
V
 
A
I
 
I
S
 
V
V
 
V
S
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
I
T
 
D
M
 
L

9febA Short-chain dehydrogenase/reductase (sdr) from thermus caliditerrae in complex with NADP
37% identity, 100% coverage: 2:255/255 of query aligns to 4:261/261 of 9febA

query
sites
9febA
Q
 
K
G
 
S
L
 
L
K
 
V
N
 
G
Q
 
K
T
 
H
V
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
x
S
G
x
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
S
 
A
A
 
A
T
 
I
C
 
A
R
 
E
R
 
A
F
 
L
A
 
A
A
 
Q
E
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
R
V
 
L
A
 
T
V
 
L
F
 
V
D
 
A
M
x
R
N
x
K
P
 
L
A
 
Q
A
 
D
A
 
L
E
 
E
E
 
E
V
 
R
A
 
V
A
 
E
G
 
R
I
 
L
R
 
R
A
 
A
A
 
-
G
 
W
G
 
T
Q
 
E
A
 
V
A
 
Q
A
 
G
F
 
E
Q
 
V
C
 
G
D
|
D
I
 
V
T
 
A
D
 
D
R
 
P
A
 
Q
Q
 
A
V
 
M
D
 
E
A
 
S
A
 
L
V
 
V
A
 
H
A
 
R
T
 
A
G
 
Q
A
 
E
Q
 
R
L
 
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
G
 
A
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
|
G
W
 
F
D
x
V
V
 
L
F
 
T
K
 
A
P
 
P
F
 
F
V
 
L
K
 
E
T
 
I
V
 
N
P
 
E
A
 
E
E
 
L
W
 
W
D
 
Q
R
 
R
L
 
H
I
 
I
A
 
E
I
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
G
G
 
A
A
 
A
L
 
Y
H
 
R
M
 
L
L
 
I
H
 
R
A
 
L
V
 
L
L
 
L
P
 
P
G
 
G
M
 
M
S
 
L
E
 
E
R
 
M
R
 
G
S
 
W
G
 
G
H
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
 
I
A
 
S
S
 
S
D
 
T
A
 
A
A
 
G
R
 
L
G
 
T
G
 
G
S
 
Y
S
 
P
G
 
Y
E
 
A
A
 
V
V
 
P
Y
 
Y
S
 
C
A
 
A
C
 
A
K
 
K
G
 
H
G
 
G
L
 
L
V
 
I
A
 
G
L
 
L
S
 
T
K
 
R
T
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
L
E
 
E
H
 
L
A
 
A
R
 
Q
H
 
R
G
 
G
I
 
I
N
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
A
V
 
I
C
 
C
P
 
P
G
 
G
P
 
F
T
 
T
D
 
D
T
 
T
A
 
D
L
 
L
L
 
L
A
 
Q
G
 
A
-
 
S
-
 
V
-
 
L
-
 
R
V
 
V
A
 
A
E
 
Q
-
 
R
G
 
T
A
 
A
R
 
R
D
 
A
P
 
P
A
 
E
K
 
A
L
 
V
I
 
L
E
 
E
A
 
L
F
 
F
K
 
A
S
 
R
A
 
R
I
 
N
P
 
P
M
 
Q
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
V
R
 
R
P
 
P
E
 
E
D
 
E
L
 
V
A
 
A
S
 
W
A
 
A
I
 
V
V
 
V
F
 
W
F
 
L
G
 
C
S
 
S
D
 
E
D
 
K
A
 
A
S
 
A
F
 
A
I
 
I
T
 
N
G
 
G
Q
 
Q
V
 
A
I
 
I
S
 
A
V
 
V
S
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
E
T
 
V
M
 
M
H
 
V
G
 
G

9fe6B Short-chain dehydrogenase/reductase (sdr) from thermus caliditerrae
37% identity, 100% coverage: 2:255/255 of query aligns to 4:261/261 of 9fe6B

query
sites
9fe6B
Q
 
K
G
 
S
L
 
L
K
 
V
N
 
G
Q
 
K
T
 
H
V
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
G
 
S
G
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
S
 
A
A
 
A
T
 
I
C
 
A
R
 
E
R
 
A
F
 
L
A
 
A
A
 
Q
E
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
R
V
 
L
A
 
T
V
 
L
F
 
V
D
 
A
M
 
R
N
 
K
P
x
L
A
 
Q
A
 
D
A
 
L
E
 
E
E
 
E
V
 
R
A
 
V
A
 
E
G
 
R
I
 
L
R
|
R
A
 
A
A
 
-
G
 
W
G
 
T
Q
 
E
A
x
V
A
 
Q
A
x
G
F
 
E
Q
 
V
C
 
G
D
 
D
I
 
V
T
 
A
D
 
D
R
 
P
A
 
Q
Q
 
A
V
 
M
D
 
E
A
 
S
A
 
L
V
 
V
A
 
H
A
 
R
T
 
A
G
 
Q
A
 
E
Q
x
R
L
 
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
G
 
A
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
W
 
F
D
 
V
V
 
L
F
 
T
K
 
A
P
 
P
F
 
F
V
 
L
K
 
E
T
 
I
V
 
N
P
 
E
A
 
E
E
 
L
W
 
W
D
 
Q
R
 
R
L
 
H
I
 
I
A
 
E
I
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
G
G
 
A
A
 
A
L
 
Y
H
 
R
M
 
L
L
 
I
H
 
R
A
 
L
V
 
L
L
 
L
P
 
P
G
 
G
M
 
M
S
 
L
E
 
E
R
 
M
R
 
G
S
 
W
G
 
G
H
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
 
I
A
 
S
S
 
S
D
 
T
A
 
A
A
 
G
R
 
L
G
 
T
G
 
G
S
 
Y
S
 
P
G
 
Y
E
 
A
A
 
V
V
 
P
Y
 
Y
S
 
C
A
 
A
C
 
A
K
 
K
G
 
H
G
 
G
L
 
L
V
 
I
A
 
G
L
 
L
S
 
T
K
 
R
T
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
L
E
 
E
H
 
L
A
 
A
R
 
Q
H
 
R
G
 
G
I
 
I
N
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
A
V
 
I
C
 
C
P
 
P
G
 
G
P
 
F
T
 
T
D
 
D
T
 
T
A
 
D
L
 
L
L
 
L
A
 
Q
G
 
A
-
 
S
-
 
V
-
 
L
-
 
R
V
 
V
A
 
A
E
 
Q
-
 
R
G
 
T
A
 
A
R
 
R
D
 
A
P
 
P
A
 
E
K
 
A
L
 
V
I
 
L
E
 
E
A
 
L
F
 
F
K
 
A
S
 
R
A
 
R
I
 
N
P
 
P
M
 
Q
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
V
R
 
R
P
 
P
E
 
E
D
 
E
L
 
V
A
 
A
S
 
W
A
 
A
I
 
V
V
 
V
F
 
W
F
 
L
G
 
C
S
 
S
D
 
E
D
 
K
A
 
A
S
 
A
F
 
A
I
 
I
T
 
N
G
 
G
Q
 
Q
V
 
A
I
 
I
S
 
A
V
 
V
S
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
E
T
 
V
M
 
M
H
 
V
G
 
G

4cqlI Crystal structure of heterotetrameric human ketoacyl reductase complexed with NAD (see paper)
36% identity, 98% coverage: 4:253/255 of query aligns to 6:251/251 of 4cqlI

query
sites
4cqlI
L
 
L
K
 
R
N
 
S
Q
 
A
T
 
L
V
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
G
 
G
G
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
S
 
R
A
 
A
T
 
V
C
 
S
R
 
V
R
 
R
F
 
L
A
 
A
A
 
G
E
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
T
V
 
V
A
 
A
V
 
A
F
 
C
D
|
D
M
x
L
N
 
D
P
 
R
A
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
Q
E
 
E
V
 
T
A
 
V
A
 
R
G
 
L
I
 
L
R
 
G
A
 
G
A
 
P
G
 
G
G
 
S
Q
 
N
A
 
H
A
 
A
A
 
A
F
 
F
Q
 
Q
C
x
A
D
|
D
I
x
V
T
 
S
D
 
E
R
 
A
A
 
R
Q
 
A
V
 
A
D
 
R
A
 
C
A
 
L
V
 
L
A
 
E
A
 
Q
T
 
V
G
 
Q
A
 
A
Q
 
C
L
 
F
G
 
S
-
 
R
P
 
P
V
 
P
G
 
S
V
 
V
L
 
V
V
 
V
N
 
S
N
x
C
A
|
A
G
|
G
W
x
I
D
 
T
V
 
Q
F
 
D
K
 
E
P
 
F
F
 
L
V
 
L
K
 
H
T
 
M
V
 
S
P
 
E
A
 
D
E
 
D
W
 
W
D
 
D
R
 
K
L
 
V
I
 
I
A
 
A
I
x
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
A
 
T
L
 
F
H
 
L
M
 
V
L
 
T
H
 
Q
A
 
A
V
 
A
L
 
A
P
 
Q
G
 
A
M
 
L
-
 
V
S
 
S
E
 
N
R
 
G
R
 
C
S
 
R
G
 
G
H
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
x
I
A
 
S
S
|
S
D
 
I
A
 
V
A
 
G
R
 
K
G
 
V
G
 
G
S
 
N
S
 
V
G
 
G
E
 
Q
A
 
T
V
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
C
 
S
K
|
K
G
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
I
A
 
G
L
 
L
S
 
T
K
 
Q
T
 
T
L
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
E
H
 
L
A
 
G
R
 
R
H
 
H
G
 
G
I
 
I
N
 
R
V
 
C
N
 
N
V
 
S
V
 
V
C
 
L
P
|
P
G
|
G
P
 
F
T
x
I
D
 
A
T
|
T
A
 
P
L
x
M
L
 
T
A
 
Q
G
 
K
V
 
V
A
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
R
 
-
D
 
-
P
 
P
A
 
Q
K
 
K
L
 
V
I
 
V
E
 
D
A
 
K
F
 
I
K
 
T
S
 
E
A
 
M
I
 
I
P
 
P
M
 
M
G
 
G
R
 
H
L
 
L
G
 
G
R
 
D
P
 
P
E
 
E
D
 
D
L
 
V
A
 
A
S
 
D
A
 
V
I
 
V
V
 
A
F
 
F
F
 
L
G
 
A
S
 
S
D
 
E
D
 
D
A
 
S
S
 
G
F
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
T
V
 
S
I
 
V
S
 
E
V
 
V
S
 
T
G
 
G
G
 
G
L
 
L
T
 
F
M
 
M

Query Sequence

>WP_013520542.1 NCBI__GCF_000204645.1:WP_013520542.1
MQGLKNQTVIVTGGGGGIGSATCRRFAAEGAKVAVFDMNPAAAEEVAAGIRAAGGQAAAF
QCDITDRAQVDAAVAATGAQLGPVGVLVNNAGWDVFKPFVKTVPAEWDRLIAINLTGALH
MLHAVLPGMSERRSGHIVNVASDAARGGSSGEAVYSACKGGLVALSKTLAREHARHGINV
NVVCPGPTDTALLAGVAEGARDPAKLIEAFKSAIPMGRLGRPEDLASAIVFFGSDDASFI
TGQVISVSGGLTMHG

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory