SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_013537199.1 NCBI__GCF_000185805.1:WP_013537199.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 10 hits to proteins with known functional sites (download)

2qjgA M. Jannaschii adh synthase complexed with f1,6p (see paper)
61% identity, 99% coverage: 3:264/264 of query aligns to 10:271/272 of 2qjgA

query
sites
2qjgA
I
 
L
G
 
G
K
 
K
A
 
L
I
 
V
R
 
R
M
 
L
E
 
E
R
 
R
I
 
I
I
 
F
N
 
N
R
 
R
E
 
E
T
 
S
G
 
E
N
 
K
T
 
T
V
 
V
I
 
I
I
 
V
P
 
P
M
 
M
D
 
D
H
|
H
G
 
G
V
 
V
S
|
S
M
 
N
G
 
G
P
 
P
I
 
I
P
 
K
G
 
G
I
 
L
I
 
I
D
 
D
I
 
I
R
 
R
E
 
K
S
 
T
I
 
V
D
 
N
K
 
D
V
 
V
A
 
A
N
 
E
G
 
G
G
 
G
A
 
A
N
 
N
A
 
A
V
 
V
I
 
L
I
 
L
H
 
H
K
 
K
G
 
G
L
 
I
V
 
V
R
 
R
H
 
H
G
 
G
H
 
H
R
 
R
K
 
G
R
 
Y
G
 
G
K
 
K
D
 
D
V
 
V
G
 
G
L
 
L
I
 
I
V
 
I
H
 
H
L
 
L
S
 
S
A
 
G
S
 
G
T
 
T
N
 
A
L
 
I
S
 
S
P
 
P
K
 
N
P
 
P
N
 
L
S
 
K
K
 
K
V
 
V
L
 
I
V
 
V
C
 
T
T
 
T
V
 
V
E
 
E
E
 
E
A
 
A
I
 
I
K
 
R
L
 
M
G
 
G
A
 
A
D
 
D
G
 
A
V
 
V
S
 
S
V
 
I
H
 
H
V
 
V
N
 
N
L
 
V
G
 
G
D
 
S
V
 
D
N
 
E
E
 
D
D
 
W
K
 
E
M
 
A
L
 
Y
E
 
R
D
 
D
L
 
L
G
 
G
R
 
M
V
 
I
A
 
A
E
 
E
K
 
T
C
 
C
L
 
E
E
 
Y
W
 
W
G
 
G
M
 
M
P
 
P
L
 
L
I
 
I
A
 
A
M
 
M
M
 
M
Y
|
Y
A
 
P
R
|
R
G
 
G
E
 
K
H
 
H
I
 
I
E
 
Q
N
 
N
P
 
E
F
 
R
D
 
D
P
 
P
D
 
E
T
 
L
V
 
V
A
 
A
H
 
H
C
 
A
A
 
A
R
 
R
V
 
L
A
 
G
A
 
A
E
 
E
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
I
V
 
V
K
|
K
V
 
T
A
 
S
Y
 
Y
T
 
T
G
 
G
D
 
D
P
 
I
Q
 
D
T
 
S
F
 
F
E
 
R
R
 
D
V
 
V
T
 
V
K
 
K
G
 
G
C
 
C
P
 
P
I
 
A
P
 
P
V
 
V
V
 
V
I
 
V
A
 
A
G
|
G
G
|
G
P
 
P
K
 
K
M
 
T
S
 
N
N
 
T
D
 
D
M
 
E
E
 
E
I
 
F
L
 
L
E
 
Q
M
 
M
V
 
I
E
 
K
G
 
D
A
 
A
M
 
M
K
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
A
G
 
G
V
 
V
S
 
A
I
x
V
G
|
G
R
|
R
N
 
N
A
 
I
F
 
F
Q
 
Q
H
 
H
D
 
D
D
 
D
P
 
V
E
 
V
K
 
G
I
 
I
V
 
T
R
 
R
A
 
A
I
 
V
A
 
C
A
 
K
I
 
I
V
 
V
H
 
H
E
 
E
G
 
N
K
 
A
S
 
D
A
 
V
K
 
E
E
 
E
A
 
A
V
 
L
E
 
K
Y
 
E
L
 
I
K
 
R

P58315 Fructose-bisphosphate aldolase class 1; Fructose-bisphosphate aldolase class I; FBP aldolase; FBPA; EC 4.1.2.13 from Thermoproteus tenax (strain ATCC 35583 / DSM 2078 / JCM 9277 / NBRC 100435 / Kra 1) (see paper)
35% identity, 95% coverage: 8:258/264 of query aligns to 7:259/263 of P58315

query
sites
P58315
R
 
K
M
 
F
E
 
L
R
 
R
I
 
I
I
 
F
N
 
A
R
 
R
E
 
R
T
 
-
G
 
G
N
 
K
T
 
S
V
 
I
I
 
I
I
 
L
P
 
A
M
 
Y
D
 
D
H
 
H
G
 
G
V
 
I
S
 
E
M
 
H
G
 
G
P
 
P
I
 
A
-
 
D
-
 
F
-
 
M
-
 
D
-
 
N
P
 
P
G
 
D
I
 
S
I
 
A
D
 
D
I
 
P
R
 
E
E
 
Y
S
 
I
I
 
L
D
 
R
K
 
L
V
 
A
A
 
R
N
 
D
G
 
A
G
 
G
A
 
F
N
 
D
A
 
G
V
 
V
I
 
V
I
 
F
H
 
Q
K
 
R
G
 
G
L
 
I
V
 
-
R
 
-
H
 
-
G
 
A
H
 
E
R
 
K
K
 
Y
R
 
Y
G
 
D
K
 
G
D
 
S
V
 
V
G
 
P
L
 
L
I
 
I
V
 
L
H
 
K
L
 
L
S
 
N
A
 
G
S
 
K
T
 
T
N
 
T
L
 
L
S
 
Y
P
 
N
K
 
G
P
 
E
N
 
P
S
 
V
K
 
S
V
 
V
L
 
A
V
 
N
C
 
C
T
 
S
V
 
V
E
 
E
E
 
E
A
 
A
I
 
V
K
 
S
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
S
G
 
A
V
 
V
S
 
G
V
 
Y
H
 
T
V
 
I
N
 
Y
L
 
P
G
 
G
D
 
S
V
 
G
N
 
F
E
 
E
D
 
W
K
 
K
M
 
M
L
 
F
E
 
E
D
 
E
L
 
L
G
 
A
R
 
R
V
 
I
A
 
K
E
 
R
K
 
D
C
 
A
L
 
V
E
 
K
W
 
F
G
 
D
M
 
L
P
 
P
L
 
L
I
 
V
A
 
V
M
x
W
M
 
S
Y
|
Y
A
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
G
H
 
K
I
 
V
E
 
V
N
 
N
P
 
E
F
 
T
D
 
A
P
 
P
D
 
E
T
 
I
V
 
V
A
 
A
H
 
Y
C
 
A
A
 
A
R
 
R
V
 
I
A
 
A
A
 
L
E
 
E
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
A
V
 
M
K
 
K
V
 
I
A
 
K
Y
 
Y
T
 
T
G
 
G
D
 
D
P
 
P
Q
 
K
T
 
T
F
 
F
E
 
S
R
 
W
V
 
A
T
 
V
K
 
K
-
 
V
G
 
A
C
 
G
P
 
K
I
 
V
P
 
P
V
 
V
V
 
L
I
 
M
A
 
S
G
 
G
G
 
G
P
 
P
K
 
K
M
 
T
S
 
K
N
 
T
D
 
E
M
 
E
E
 
D
I
 
F
L
 
L
E
 
K
M
 
Q
V
 
V
E
 
E
G
 
G
A
 
V
M
 
L
K
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
L
G
 
G
V
 
I
S
 
A
I
 
V
G
 
G
R
 
R
N
 
N
A
 
V
F
 
W
Q
 
Q
H
 
R
D
 
R
D
 
D
P
 
A
E
 
L
K
 
K
I
 
F
V
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
E
I
 
L
V
 
V
H
 
Y
E
 
G
G
 
G
K
 
K
S
 
K
A
 
L
K
 
A
E
 
E

2yceE Structure of an archaeal fructose-1,6-bisphosphate aldolase with the catalytic lys covalently bound to the carbinolamine intermediate of the substrate. (see paper)
35% identity, 94% coverage: 8:254/264 of query aligns to 5:253/255 of 2yceE

query
sites
2yceE
R
 
K
M
 
F
E
 
L
R
 
R
I
 
I
I
 
F
N
 
A
R
 
R
E
 
R
T
 
-
G
 
G
N
 
K
T
 
S
V
 
I
I
 
I
I
 
L
P
 
A
M
 
Y
D
|
D
H
|
H
G
 
G
V
 
I
S
 
E
M
x
H
G
 
G
P
 
P
I
 
A
-
 
D
-
 
F
-
 
M
-
 
D
-
 
N
P
 
P
G
 
D
I
 
S
I
 
A
D
 
D
I
 
P
R
 
E
E
 
Y
S
 
I
I
 
L
D
 
R
K
 
L
V
 
A
A
 
R
N
 
D
G
 
A
G
 
G
A
 
F
N
 
D
A
 
G
V
 
V
I
 
V
I
 
F
H
 
Q
K
 
R
G
 
G
L
 
I
V
 
-
R
 
-
H
 
-
G
 
A
H
 
E
R
 
K
K
 
Y
R
 
Y
G
 
D
K
 
G
D
 
S
V
 
V
G
 
P
L
 
L
I
 
I
V
 
L
H
 
K
L
 
L
S
 
N
A
 
G
S
 
K
T
 
T
N
 
T
L
 
L
S
 
Y
P
 
N
K
 
G
P
 
E
N
 
P
S
 
V
K
 
S
V
 
V
L
 
A
V
 
N
C
 
C
T
 
S
V
 
V
E
 
E
E
 
E
A
 
A
I
 
V
K
 
S
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
S
G
 
A
V
 
V
S
 
G
V
 
Y
H
 
T
V
 
I
N
 
Y
L
 
P
G
 
G
D
 
S
V
 
G
N
 
F
E
 
E
D
 
W
K
 
K
M
 
M
L
 
F
E
 
E
D
 
E
L
 
L
G
 
A
R
 
R
V
 
I
A
 
K
E
 
R
K
 
D
C
 
A
L
 
V
E
 
K
W
 
F
G
 
D
M
 
L
P
 
P
L
 
L
I
 
V
A
 
V
M
x
W
M
 
S
Y
 
F
A
 
P
R
|
R
G
 
G
E
 
G
H
 
K
I
 
V
E
 
V
N
 
N
P
 
E
F
 
T
D
 
A
P
 
P
D
 
E
T
 
I
V
 
V
A
 
A
H
 
Y
C
 
A
A
 
A
R
 
R
V
 
I
A
 
A
A
 
L
E
 
E
L
 
L
G
 
G
A
 
S
D
 
D
I
 
A
V
 
M
K
|
K
V
 
I
A
x
K
Y
 
Y
T
 
T
G
 
G
D
 
D
P
 
P
Q
 
K
T
 
T
F
 
F
E
 
S
R
 
W
V
 
A
T
 
V
K
 
K
-
 
V
G
 
A
C
 
G
P
 
K
I
 
V
P
 
P
V
 
V
V
 
L
I
 
M
A
 
S
G
|
G
G
|
G
P
 
P
K
 
K
M
 
T
S
 
K
N
 
T
D
 
E
M
 
E
E
 
D
I
 
F
L
 
L
E
 
K
M
 
Q
V
 
V
E
 
E
G
 
G
A
 
V
M
 
L
K
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
L
G
 
G
V
 
I
S
 
A
I
x
V
G
|
G
R
|
R
N
 
N
A
 
V
F
 
W
Q
 
Q
H
 
R
D
 
R
D
 
D
P
 
A
E
 
L
K
 
K
I
 
F
V
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
E
I
 
L
V
 
V
H
 
Y
E
 
G
G
 
G
K
 
K

1w8sA The mechanism of the schiff base forming fructose-1,6-bisphosphate aldolase: structural analysis of reaction intermediates (see paper)
35% identity, 92% coverage: 8:251/264 of query aligns to 5:250/250 of 1w8sA

query
sites
1w8sA
R
 
K
M
 
F
E
 
L
R
 
R
I
 
I
I
 
F
N
 
A
R
 
R
E
 
R
T
 
-
G
 
G
N
 
K
T
 
S
V
 
I
I
 
I
I
 
L
P
x
A
M
 
Y
D
|
D
H
|
H
G
 
G
V
 
I
S
 
E
M
x
H
G
 
G
P
 
P
I
 
A
-
 
D
-
 
F
-
 
M
-
 
D
-
 
N
P
 
P
G
 
D
I
 
S
I
 
A
D
 
D
I
 
P
R
 
E
E
 
Y
S
 
I
I
 
L
D
 
R
K
 
L
V
 
A
A
 
R
N
 
D
G
 
A
G
 
G
A
 
F
N
 
D
A
 
G
V
 
V
I
 
V
I
 
F
H
 
Q
K
 
R
G
 
G
L
 
I
V
 
-
R
 
-
H
 
-
G
 
A
H
 
E
R
 
K
K
 
Y
R
 
Y
G
 
D
K
 
G
D
 
S
V
 
V
G
 
P
L
 
L
I
 
I
V
 
L
H
 
K
L
 
L
S
 
N
A
 
G
S
 
K
T
 
T
N
 
T
L
 
L
S
 
Y
P
 
N
K
 
G
P
 
E
N
 
P
S
 
V
K
 
S
V
 
V
L
 
A
V
 
N
C
 
C
T
 
S
V
 
V
E
 
E
E
 
E
A
 
A
I
 
V
K
 
S
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
S
G
 
A
V
 
V
S
 
G
V
 
Y
H
 
T
V
 
I
N
 
Y
L
 
P
G
 
G
D
 
S
V
 
G
N
 
F
E
 
E
D
 
W
K
 
K
M
 
M
L
 
F
E
 
E
D
 
E
L
 
L
G
 
A
R
 
R
V
 
I
A
 
K
E
 
R
K
 
D
C
 
A
L
 
V
E
 
K
W
 
F
G
 
D
M
 
L
P
 
P
L
 
L
I
 
V
A
 
V
M
 
E
M
 
S
Y
 
F
A
 
P
R
|
R
G
 
G
E
 
G
H
 
K
I
 
V
E
 
V
N
 
N
P
 
E
F
 
T
D
 
A
P
 
P
D
 
E
T
 
I
V
 
V
A
 
A
H
 
Y
C
 
A
A
 
A
R
 
R
V
 
I
A
 
A
A
 
L
E
 
E
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
A
V
 
M
K
|
K
V
 
I
A
x
K
Y
 
Y
T
 
T
G
 
G
D
 
D
P
 
P
Q
 
K
T
 
T
F
 
F
E
 
S
R
 
W
V
 
A
T
 
V
K
 
K
-
 
V
G
 
A
C
 
G
P
 
K
I
 
V
P
 
P
V
 
V
V
 
L
I
 
M
A
x
S
G
|
G
G
|
G
P
 
P
K
 
K
M
 
T
S
 
K
N
 
T
D
 
E
M
 
E
E
 
D
I
 
F
L
 
L
E
 
K
M
 
Q
V
 
V
E
 
E
G
 
G
A
 
V
M
 
L
K
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
L
G
 
G
V
 
I
S
 
A
I
x
V
G
|
G
R
|
R
N
 
N
A
 
V
F
 
W
Q
 
Q
H
 
R
D
 
R
D
 
D
P
 
A
E
 
L
K
 
K
I
 
F
V
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
E
I
 
L
V
 
V
H
 
Y

P58314 Fructose-bisphosphate aldolase class 1; Fructose-bisphosphate aldolase class I; FBP aldolase; EC 4.1.2.13 from Pyrococcus furiosus (strain ATCC 43587 / DSM 3638 / JCM 8422 / Vc1) (see paper)
33% identity, 92% coverage: 18:259/264 of query aligns to 21:274/281 of P58314

query
sites
P58314
G
 
G
N
 
R
T
 
A
V
 
L
I
 
I
I
 
F
P
 
A
M
 
M
D
 
D
H
 
H
G
 
G
V
 
F
S
 
E
M
 
H
G
 
G
P
 
P
-
 
T
-
 
D
-
 
F
-
 
E
-
 
P
I
 
V
P
 
W
G
 
E
I
 
H
I
 
V
D
 
N
I
 
P
R
 
R
E
 
V
S
 
I
I
 
I
D
 
R
K
 
K
V
 
V
A
 
V
N
 
R
G
 
A
G
 
G
A
 
I
N
 
D
A
 
G
V
 
V
I
 
M
I
 
M
H
 
L
K
 
P
G
 
G
L
 
L
V
 
A
R
 
R
H
 
I
G
 
A
H
 
G
R
 
D
K
 
E
R
 
V
G
 
K
K
 
P
D
 
E
V
 
V
G
 
G
L
 
L
I
 
M
V
 
I
H
 
K
L
 
L
S
 
T
A
 
S
S
 
K
T
 
T
N
 
N
L
 
L
S
 
R
P
 
P
K
 
K
P
 
P
N
 
E
S
 
Q
-
 
L
-
 
L
K
 
Q
V
 
S
L
 
Q
V
 
L
C
 
G
T
 
F
V
 
V
E
 
D
E
 
D
A
 
A
I
 
I
K
 
K
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
G
 
A
V
 
I
S
 
A
V
 
A
H
 
T
V
 
V
N
 
Y
L
 
W
G
 
G
D
 
S
V
 
P
N
 
Q
E
 
E
D
 
D
K
 
V
M
 
M
L
 
M
E
 
R
D
 
Q
L
 
F
G
 
A
R
 
E
V
 
I
A
 
V
E
 
S
K
 
Y
C
 
A
L
 
H
E
 
D
W
 
L
G
 
G
M
 
Y
P
 
P
L
 
V
I
 
V
A
 
Q
M
 
F
M
 
A
Y
 
Y
A
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
P
H
 
Y
I
 
I
E
 
D
N
 
E
P
 
K
F
 
Y
-
 
G
-
 
K
-
 
K
-
 
E
D
 
D
P
 
Y
D
 
R
T
 
V
V
 
V
A
 
M
H
 
Y
C
 
G
A
 
A
R
 
R
V
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
S
G
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
M
V
 
I
K
|
K
V
 
T
A
 
Y
Y
 
W
T
 
T
G
 
G
D
 
S
P
 
K
Q
 
E
T
 
T
F
 
F
E
 
A
R
 
K
V
 
V
T
 
V
K
 
E
G
 
A
C
 
A
P
 
A
-
 
G
I
 
V
P
 
P
V
 
V
V
 
L
I
 
L
A
 
S
G
 
G
G
 
G
P
 
A
K
 
K
M
 
T
S
 
E
N
 
N
D
 
P
M
 
V
E
 
D
I
 
F
L
 
L
E
 
K
M
 
V
V
 
V
E
 
W
G
 
E
A
 
V
M
 
I
K
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
G
K
 
A
G
 
G
V
 
A
S
 
V
I
 
V
G
 
G
R
 
R
N
 
N
A
 
I
F
 
F
Q
 
Q
H
 
R
D
 
E
D
 
N
P
 
P
E
 
E
K
 
P
I
 
M
V
 
I
R
 
K
A
 
A
I
 
L
A
 
I
A
 
R
I
 
V
V
 
I
H
 
H
E
 
R
G
 
N
K
 
E
S
 
D
A
 
P
K
 
E
E
 
E
A
 
A

P76143 3-hydroxy-5-phosphonooxypentane-2,4-dione thiolase; EC 2.3.1.245 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
30% identity, 100% coverage: 1:263/264 of query aligns to 32:287/291 of P76143

query
sites
P76143
M
 
L
K
 
D
I
 
W
G
 
G
K
 
M
A
 
Q
I
 
S
R
 
R
M
 
L
E
 
S
R
 
R
I
 
I
I
 
F
N
 
N
R
 
P
E
 
K
T
 
T
G
 
G
N
 
K
T
 
T
V
 
V
I
 
M
I
 
L
P
 
A
M
 
F
D
|
D
H
 
H
G
 
G
V
 
Y
S
 
F
M
 
Q
G
 
G
P
 
P
I
 
T
P
 
T
G
 
G
I
 
L
I
 
E
D
 
R
I
 
I
R
 
D
E
 
I
S
 
N
I
 
I
D
 
A
K
 
P
V
 
L
A
 
F
N
 
E
G
 
H
G
 
-
A
 
A
N
 
D
A
 
V
V
 
L
I
 
M
I
 
C
H
 
T
K
 
R
G
 
G
L
 
I
V
 
L
R
 
R
H
 
-
G
 
S
H
 
V
R
 
V
K
 
P
R
 
P
G
 
A
K
 
T
D
 
N
V
 
R
G
 
P
L
 
V
I
 
V
V
 
L
H
 
R
L
 
A
S
 
S
A
 
G
S
 
A
T
 
N
N
 
S
L
 
I
S
 
L
P
 
A
K
 
E
P
 
L
N
 
S
S
 
N
K
 
E
V
 
A
L
 
V
V
 
A
C
 
L
T
 
S
V
 
M
E
 
D
E
 
D
A
 
A
I
 
V
K
 
R
L
 
L
G
 
N
A
 
S
D
 
C
G
 
A
V
 
V
S
 
A
V
 
A
H
 
Q
V
 
V
N
 
Y
L
 
I
G
 
G
D
 
S
V
 
E
N
 
Y
E
 
E
D
 
H
K
 
Q
M
 
S
L
 
I
E
 
K
D
 
N
L
 
I
G
 
I
R
 
Q
V
 
L
A
 
V
E
 
D
K
 
A
C
 
G
L
 
M
E
 
K
W
 
V
G
 
G
M
 
M
P
 
P
L
 
T
I
 
M
A
 
A
M
 
V
M
 
T
Y
 
G
A
 
V
R
 
G
G
 
K
E
 
D
H
 
M
I
 
V
E
 
R
N
 
-
P
 
-
F
 
-
D
 
D
P
 
Q
D
 
R
T
 
Y
V
 
F
A
 
S
H
 
L
C
 
A
A
 
T
R
 
R
V
 
I
A
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
M
G
 
G
A
 
A
D
 
Q
I
 
I
V
 
I
K
|
K
V
 
T
A
 
Y
Y
 
Y
T
 
V
G
 
-
D
 
-
P
 
E
Q
 
K
T
 
G
F
 
F
E
 
E
R
 
R
V
 
I
T
 
V
K
 
A
G
 
G
C
 
C
P
 
P
I
 
V
P
 
P
V
 
I
V
 
V
I
 
I
A
 
A
G
 
G
G
 
G
P
 
K
K
 
K
M
 
L
S
 
P
N
 
-
D
 
E
M
 
R
E
 
E
I
 
A
L
 
L
E
 
E
M
 
M
V
 
C
E
 
W
G
 
Q
A
 
A
M
 
I
K
 
D
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
K
 
S
G
 
G
V
 
V
S
x
D
I
 
M
G
 
G
R
 
R
N
 
N
A
 
I
F
 
F
Q
 
Q
H
 
S
D
 
D
D
 
H
P
 
P
E
 
V
K
 
A
I
 
M
V
 
M
R
 
K
A
 
A
I
 
V
A
 
Q
A
 
A
I
 
V
V
 
V
H
 
H
E
 
H
G
 
N
K
 
E
S
 
T
A
 
A
K
 
D
E
 
R
A
 
A
V
 
Y
E
 
E
-
 
L
Y
 
Y
L
 
L

4p2vA Structure of the ai-2 processing enzyme lsrf in complex with the product of the lsrg reaction p-hpd (see paper)
29% identity, 100% coverage: 1:264/264 of query aligns to 24:280/281 of 4p2vA

query
sites
4p2vA
M
 
L
K
 
D
I
 
W
G
 
G
K
 
M
A
 
Q
I
 
S
R
 
R
M
 
L
E
 
S
R
 
R
I
 
I
I
 
F
N
 
N
R
 
P
E
 
K
T
 
T
G
 
G
N
 
K
T
 
T
V
 
V
I
 
M
I
 
L
P
 
A
M
 
F
D
 
D
H
|
H
G
 
G
V
 
Y
S
 
F
M
 
Q
G
 
G
P
 
P
I
 
T
P
 
T
G
 
G
I
 
L
I
 
E
D
 
R
I
 
I
R
 
D
E
 
I
S
 
N
I
 
I
D
 
A
K
 
P
V
 
L
A
 
F
N
 
E
G
 
H
G
 
-
A
 
A
N
 
D
A
 
V
V
 
L
I
 
M
I
 
C
H
 
T
K
 
R
G
 
G
L
 
I
V
 
L
R
 
R
H
 
-
G
 
S
H
 
V
R
 
V
K
 
P
R
 
P
G
 
A
K
 
T
D
 
N
V
 
R
G
 
P
L
 
V
I
 
V
V
 
L
H
 
R
L
 
A
S
 
S
A
 
G
S
 
A
T
 
N
N
 
S
L
 
I
S
 
L
P
 
A
K
 
E
P
 
L
N
 
S
S
 
N
K
 
E
V
 
A
L
 
V
V
 
A
C
 
L
T
 
S
V
 
M
E
 
D
E
 
D
A
 
A
I
 
V
K
 
R
L
 
L
G
 
N
A
 
S
D
 
C
G
 
A
V
 
V
S
 
A
V
 
A
H
 
Q
V
 
V
N
 
Y
L
 
I
G
 
G
D
 
S
V
 
E
N
 
Y
E
 
E
D
 
H
K
 
Q
M
 
S
L
 
I
E
 
K
D
 
N
L
 
I
G
 
I
R
 
Q
V
 
L
A
 
V
E
 
D
K
 
A
C
 
G
L
 
M
E
 
K
W
 
V
G
 
G
M
 
M
P
 
P
L
 
T
I
 
M
A
 
A
M
 
V
M
 
T
Y
 
G
A
 
V
R
 
G
G
 
K
E
 
D
H
 
M
I
 
V
E
 
R
N
 
-
P
 
-
F
 
-
D
 
D
P
 
Q
D
 
R
T
 
Y
V
 
F
A
 
S
H
 
L
C
 
A
A
 
T
R
 
R
V
 
I
A
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
M
G
 
G
A
 
A
D
 
Q
I
 
I
V
 
I
K
 
A
V
 
T
A
x
Y
Y
 
Y
T
 
V
G
 
-
D
 
-
P
 
E
Q
 
K
T
 
G
F
 
F
E
 
E
R
 
R
V
 
I
T
 
V
K
 
A
G
 
G
C
 
C
P
 
P
I
 
V
P
 
P
V
 
I
V
 
V
I
 
I
A
 
A
G
|
G
G
|
G
P
 
K
K
 
K
M
 
L
S
 
P
N
 
-
D
 
E
M
 
R
E
 
E
I
 
A
L
 
L
E
 
E
M
 
M
V
 
C
E
 
W
G
 
Q
A
 
A
M
 
I
K
 
D
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
K
 
S
G
 
G
V
 
V
S
 
D
I
 
M
G
|
G
R
|
R
N
 
N
A
 
I
F
 
F
Q
 
Q
H
 
S
D
 
D
D
 
H
P
 
P
E
 
V
K
 
A
I
 
M
V
 
M
R
 
K
A
 
A
I
 
V
A
 
Q
A
 
A
I
 
V
V
 
V
H
 
H
E
 
H
G
 
N
K
 
E
S
 
T
A
 
A
K
 
D
E
 
R
A
 
A
V
 
Y
E
 
E
-
 
L
Y
 
Y
L
 
L
K
 
S

3gndA Crystal structure of e. Coli lsrf in complex with ribulose-5-phosphate (see paper)
30% identity, 100% coverage: 1:264/264 of query aligns to 23:275/276 of 3gndA

query
sites
3gndA
M
 
L
K
 
D
I
 
W
G
 
G
K
 
M
A
 
Q
I
 
S
R
 
R
M
 
L
E
 
S
R
 
R
I
 
I
I
 
F
N
 
N
R
 
P
E
 
K
T
 
T
G
 
G
N
 
K
T
 
T
V
 
V
I
 
M
I
 
L
P
 
A
M
 
F
D
|
D
H
|
H
G
 
G
V
x
Y
S
 
F
M
 
Q
G
 
G
P
 
P
I
 
T
P
 
T
G
 
G
I
 
L
I
 
E
D
 
R
I
 
I
R
 
D
E
 
I
S
 
N
I
 
I
D
 
A
K
 
P
V
 
L
A
 
F
N
 
E
G
 
H
G
 
-
A
 
A
N
 
D
A
 
V
V
 
L
I
 
M
I
 
C
H
 
T
K
 
R
G
 
G
L
 
I
V
 
L
R
 
R
H
 
-
G
 
S
H
 
V
R
 
V
K
 
P
R
 
P
G
 
A
K
 
T
D
 
N
V
 
R
G
 
P
L
 
V
I
 
V
V
 
L
H
 
R
L
 
A
S
 
S
A
 
G
S
 
A
T
 
N
N
 
S
L
 
I
S
 
L
P
 
A
K
 
E
P
 
L
N
 
S
S
 
N
K
 
E
V
 
A
L
 
V
V
 
A
C
 
L
T
 
S
V
 
M
E
 
D
E
 
D
A
 
A
I
 
V
K
 
R
L
 
L
G
 
N
A
 
S
D
 
C
G
 
A
V
 
V
S
 
A
V
 
A
H
 
Q
V
 
V
N
 
Y
L
 
I
G
 
G
D
 
S
V
 
E
N
 
Y
E
 
E
D
 
H
K
 
Q
M
 
S
L
 
I
E
 
K
D
 
N
L
 
I
G
 
I
R
 
Q
V
 
L
A
 
V
E
 
D
K
 
A
C
 
G
L
 
M
E
 
K
W
 
V
G
 
G
M
 
M
P
 
P
L
 
T
I
 
M
A
 
A
M
 
V
M
 
T
-
 
G
Y
 
V
A
 
V
R
 
R
G
 
-
E
 
-
H
 
-
I
 
-
E
 
-
N
 
-
P
 
-
F
 
-
D
 
D
P
 
Q
D
 
R
T
 
Y
V
 
F
A
 
S
H
 
L
C
 
A
A
 
T
R
 
R
V
 
I
A
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
M
G
 
G
A
 
A
D
 
Q
I
 
I
V
 
I
K
|
K
V
 
T
A
 
Y
Y
 
Y
T
 
V
G
 
-
D
 
-
P
 
E
Q
 
K
T
 
G
F
 
F
E
 
E
R
 
R
V
 
I
T
 
V
K
 
A
G
 
G
C
 
C
P
 
P
I
 
V
P
 
P
V
 
I
V
 
V
I
 
I
A
 
A
G
|
G
G
|
G
P
 
K
K
 
K
M
 
L
S
 
P
N
 
-
D
 
E
M
 
R
E
 
E
I
 
A
L
 
L
E
 
E
M
 
M
V
 
C
E
 
W
G
 
Q
A
 
A
M
 
I
K
 
D
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
K
 
S
G
 
G
V
 
V
S
x
D
I
x
M
G
|
G
R
|
R
N
 
N
A
 
I
F
 
F
Q
 
Q
H
 
S
D
 
D
D
 
H
P
 
P
E
 
V
K
 
A
I
 
M
V
 
M
R
 
K
A
 
A
I
 
V
A
 
Q
A
 
A
I
 
V
V
 
V
H
 
H
E
 
H
G
 
N
K
 
E
S
 
T
A
 
A
K
 
D
E
 
R
A
 
A
V
 
Y
E
 
E
-
 
L
Y
 
Y
L
 
L
K
 
S

3glcA Crystal structure of e. Coli lsrf in complex with ribose-5-phosphate (see paper)
30% identity, 100% coverage: 1:264/264 of query aligns to 23:275/276 of 3glcA

query
sites
3glcA
M
 
L
K
 
D
I
 
W
G
 
G
K
 
M
A
 
Q
I
 
S
R
 
R
M
 
L
E
 
S
R
 
R
I
 
I
I
 
F
N
 
N
R
 
P
E
 
K
T
 
T
G
 
G
N
 
K
T
 
T
V
 
V
I
 
M
I
 
L
P
 
A
M
 
F
D
|
D
H
|
H
G
 
G
V
 
Y
S
 
F
M
 
Q
G
 
G
P
 
P
I
 
T
P
 
T
G
 
G
I
 
L
I
 
E
D
 
R
I
 
I
R
 
D
E
 
I
S
 
N
I
 
I
D
 
A
K
 
P
V
 
L
A
 
F
N
 
E
G
 
H
G
 
-
A
 
A
N
 
D
A
 
V
V
 
L
I
 
M
I
 
C
H
 
T
K
 
R
G
 
G
L
 
I
V
 
L
R
 
R
H
 
-
G
 
S
H
 
V
R
 
V
K
 
P
R
 
P
G
 
A
K
 
T
D
 
N
V
 
R
G
 
P
L
 
V
I
 
V
V
 
L
H
 
R
L
 
A
S
 
S
A
 
G
S
 
A
T
 
N
N
 
S
L
 
I
S
 
L
P
 
A
K
 
E
P
 
L
N
 
S
S
 
N
K
 
E
V
 
A
L
 
V
V
 
A
C
 
L
T
 
S
V
 
M
E
 
D
E
 
D
A
 
A
I
 
V
K
 
R
L
 
L
G
 
N
A
 
S
D
 
C
G
 
A
V
 
V
S
 
A
V
 
A
H
 
Q
V
 
V
N
 
Y
L
 
I
G
 
G
D
 
S
V
 
E
N
 
Y
E
 
E
D
 
H
K
 
Q
M
 
S
L
 
I
E
 
K
D
 
N
L
 
I
G
 
I
R
 
Q
V
 
L
A
 
V
E
 
D
K
 
A
C
 
G
L
 
M
E
 
K
W
 
V
G
 
G
M
 
M
P
 
P
L
 
T
I
 
M
A
 
A
M
 
V
M
 
T
-
 
G
Y
 
V
A
 
V
R
 
R
G
 
-
E
 
-
H
 
-
I
 
-
E
 
-
N
 
-
P
 
-
F
 
-
D
 
D
P
 
Q
D
 
R
T
 
Y
V
 
F
A
 
S
H
 
L
C
 
A
A
 
T
R
 
R
V
 
I
A
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
M
G
 
G
A
 
A
D
 
Q
I
 
I
V
 
I
K
|
K
V
 
T
A
 
Y
Y
 
Y
T
 
V
G
 
-
D
 
-
P
 
E
Q
 
K
T
 
G
F
 
F
E
 
E
R
 
R
V
 
I
T
 
V
K
 
A
G
 
G
C
 
C
P
 
P
I
 
V
P
 
P
V
 
I
V
 
V
I
 
I
A
 
A
G
|
G
G
|
G
P
 
K
K
 
K
M
 
L
S
 
P
N
 
-
D
 
E
M
 
R
E
 
E
I
 
A
L
 
L
E
 
E
M
 
M
V
 
C
E
 
W
G
 
Q
A
 
A
M
 
I
K
 
D
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
K
 
S
G
 
G
V
 
V
S
 
D
I
 
M
G
|
G
R
|
R
N
 
N
A
 
I
F
 
F
Q
 
Q
H
 
S
D
 
D
D
 
H
P
 
P
E
 
V
K
 
A
I
 
M
V
 
M
R
 
K
A
 
A
I
 
V
A
 
Q
A
 
A
I
 
V
V
 
V
H
 
H
E
 
H
G
 
N
K
 
E
S
 
T
A
 
A
K
 
D
E
 
R
A
 
A
V
 
Y
E
 
E
-
 
L
Y
 
Y
L
 
L
K
 
S

P0A991 Fructose-bisphosphate aldolase class 1; Fructose-bisphosphate aldolase class I; FBP aldolase; EC 4.1.2.13 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
23% identity, 90% coverage: 17:254/264 of query aligns to 65:346/350 of P0A991

query
sites
P0A991
T
 
T
G
 
G
N
 
Y
T
 
L
V
 
S
I
 
I
I
 
L
P
 
P
M
 
V
D
 
D
H
 
Q
G
 
G
V
 
V
-
 
E
-
 
H
-
 
S
-
 
A
-
 
G
-
 
A
S
 
S
M
 
F
G
 
A
P
 
A
I
 
N
P
 
P
G
 
L
I
 
Y
I
 
F
D
 
D
I
 
P
R
 
K
E
 
N
S
 
I
I
 
V
D
 
E
K
 
L
V
 
A
A
 
I
N
 
E
G
 
A
G
 
G
A
 
C
N
 
N
A
 
C
V
 
V
I
 
A
I
 
S
H
 
T
K
 
Y
G
 
G
L
 
V
V
 
L
R
 
A
H
 
S
G
 
V
H
 
S
R
 
R
K
 
R
R
 
Y
G
 
A
K
 
H
D
 
R
V
 
I
G
 
P
L
 
F
I
 
L
V
 
V
H
 
K
L
 
L
S
 
N
A
 
H
S
 
N
T
 
E
N
 
T
L
 
L
S
 
S
-
 
Y
P
 
P
K
 
N
P
 
T
N
 
Y
S
 
D
K
 
Q
V
 
T
L
 
L
V
 
Y
C
 
A
T
 
S
V
 
V
E
 
E
E
 
Q
A
 
A
I
 
F
K
 
N
L
 
M
G
 
G
A
 
A
D
 
V
G
 
A
V
 
V
S
 
G
V
 
A
H
 
T
V
 
I
N
 
Y
L
 
F
G
 
G
D
 
S
V
 
E
N
 
E
E
 
S
D
 
R
K
 
R
M
 
Q
L
 
I
E
 
E
D
 
E
L
 
I
G
 
S
R
 
A
V
 
A
A
 
F
E
 
E
K
 
R
C
 
A
L
 
H
E
 
E
W
 
L
G
 
G
M
 
M
P
 
V
L
 
T
I
 
V
A
 
L
M
 
W
M
 
A
Y
 
Y
A
 
L
R
 
R
G
 
N
-
 
S
-
 
A
-
 
F
-
x
K
-
 
K
E
 
D
H
 
G
I
 
V
E
 
D
N
 
Y
P
 
H
F
 
V
D
 
S
P
 
A
D
 
D
T
 
L
V
 
T
A
 
G
H
 
Q
C
 
A
A
 
N
R
 
H
V
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
T
L
 
I
G
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
I
V
 
V
K
|
K
-
 
Q
-
x
K
-
 
M
-
 
A
-
 
E
-
 
N
-
 
N
-
 
G
-
 
G
-
 
Y
-
 
K
-
 
A
-
 
I
-
 
N
V
 
Y
A
 
G
Y
 
Y
T
 
T
G
 
-
D
 
D
P
 
D
Q
 
R
T
 
V
F
 
Y
E
 
S
R
x
K
V
 
L
T
 
T
K
 
S
G
 
E
C
 
N
P
 
P
I
 
I
P
 
D
V
 
L
V
 
V
-
 
R
-
 
Y
-
 
Q
-
 
L
-
 
A
-
 
N
-
 
C
-
 
Y
-
 
M
-
 
G
-
 
R
-
 
A
-
 
G
-
 
L
I
 
I
A
 
N
G
 
S
G
 
G
P
 
G
K
 
A
M
 
A
S
 
G
N
 
G
D
 
E
M
 
T
E
 
D
I
 
L
L
 
S
E
 
D
M
 
A
V
 
V
E
 
R
G
 
T
A
 
A
M
 
V
-
 
I
-
 
N
-
 
K
K
 
R
A
 
A
G
 
G
A
 
G
K
 
M
G
 
G
V
 
L
S
 
I
I
 
L
G
 
G
R
 
R
N
 
K
A
 
A
F
 
F
Q
 
K
H
 
K
D
 
S
-
 
M
-
 
A
D
 
D
P
 
G
E
 
V
K
 
K
I
 
L
V
 
I
R
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
Q
A
 
D
I
 
V
V
 
Y
H
 
L
E
 
D
G
 
S
K
 
K

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_013537199.1 NCBI__GCF_000185805.1:WP_013537199.1
MKIGKAIRMERIINRETGNTVIIPMDHGVSMGPIPGIIDIRESIDKVANGGANAVIIHKG
LVRHGHRKRGKDVGLIVHLSASTNLSPKPNSKVLVCTVEEAIKLGADGVSVHVNLGDVNE
DKMLEDLGRVAEKCLEWGMPLIAMMYARGEHIENPFDPDTVAHCARVAAELGADIVKVAY
TGDPQTFERVTKGCPIPVVIAGGPKMSNDMEILEMVEGAMKAGAKGVSIGRNAFQHDDPE
KIVRAIAAIVHEGKSAKEAVEYLK

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory