SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_013537965.1 NCBI__GCF_000185805.1:WP_013537965.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

Q96C36 Pyrroline-5-carboxylate reductase 2; P5C reductase 2; P5CR 2; EC 1.5.1.2 from Homo sapiens (Human) (see paper)
39% identity, 97% coverage: 5:270/273 of query aligns to 3:274/320 of Q96C36

query
sites
Q96C36
V
 
V
G
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
 
L
A
 
A
E
 
Y
A
 
A
F
 
L
I
 
A
S
 
R
A
 
G
F
 
F
V
 
T
E
 
A
G
 
A
E
 
G
F
 
I
L
 
L
P
 
S
P
 
A
G
 
H
N
 
K
I
 
I
F
 
I
V
 
A
S
 
S
D
 
S
V
 
-
R
 
-
P
 
P
E
 
E
-
 
M
R
 
N
L
 
L
K
 
P
E
 
T
L
 
V
Q
 
S
T
 
A
L
 
L
-
 
R
-
 
K
Y
 
M
G
 
G
V
 
V
N
 
N
T
 
L
T
 
T
L
 
R
N
 
S
N
 
N
S
 
K
E
 
E
V
 
T
V
 
V
L
 
K
N
 
H
S
 
S
D
 
D
I
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
V
 
I
M
 
I
P
 
P
A
 
F
V
 
I
L
 
L
R
 
D
E
 
E
I
 
I
A
 
G
E
 
A
V
 
D
V
 
V
T
 
Q
P
 
A
A
 
R
Q
 
H
V
 
I
V
 
V
V
 
V
S
 
S
M
 
C
A
 
A
A
 
A
G
 
G
F
 
V
P
 
T
M
 
I
R
 
S
S
 
S
I
 
V
E
 
E
A
 
K
L
 
K
L
 
L
-
 
M
-
 
A
-
 
F
G
 
Q
D
 
P
D
 
A
K
 
P
K
 
K
I
 
V
A
 
I
R
|
R
I
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
I
 
T
M
 
P
V
 
V
K
 
V
V
 
V
R
 
Q
S
 
E
G
 
G
V
 
A
V
 
T
A
 
V
Y
 
Y
C
 
A
D
 
T
N
 
G
S
 
T
R
 
H
L
 
A
L
 
L
D
 
V
E
 
E
E
 
D
R
 
G
E
 
Q
R
 
L
V
 
L
L
 
E
S
 
Q
L
 
L
L
 
M
E
 
S
V
 
S
T
 
V
G
 
G
A
 
F
V
 
C
F
 
T
R
 
E
L
 
V
S
 
E
E
 
E
S
 
D
L
 
L
F
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
G
V
 
L
A
 
S
G
 
G
S
 
S
S
 
G
P
 
P
A
 
A
F
 
Y
F
 
A
F
 
F
A
 
M
I
 
A
I
 
L
E
 
D
A
 
A
A
 
L
C
 
A
D
 
D
G
 
G
A
 
G
V
 
V
K
 
K
V
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
R
V
 
L
A
 
A
K
 
I
E
 
Q
M
 
L
V
 
G
L
 
A
K
 
Q
V
 
A
L
 
L
E
 
L
G
 
G
C
 
A
V
 
A
K
 
K
M
 
M
A
 
L
A
 
L
D
 
D
-
 
S
-
 
E
E
 
Q
H
 
H
P
 
P
E
 
C
V
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
R
 
N
V
 
V
T
 
C
S
 
S
P
 
P
A
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
I
 
I
E
 
H
G
 
A
L
 
L
F
 
H
A
 
F
L
 
L
E
 
E
R
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
F
R
|
R
A
 
S
S
 
L
I
 
L
I
 
I
E
 
N
A
 
A
V
 
V
S
 
E
A
 
A
A
 
S
C
 
C
R
 
I
R
 
R
S
 
T
K
 
R
E
 
E
I
 
L
S
 
Q
D
 
S
L
 
M
I
 
A
E
 
D
K
 
Q

Sites not aligning to the query:

5uavA Structure of human pycr-1 complexed with NADPH and l-tetrahydrofuroic acid (see paper)
38% identity, 97% coverage: 5:270/273 of query aligns to 7:278/278 of 5uavA

query
sites
5uavA
V
 
V
G
 
G
F
 
F
I
 
I
G
|
G
G
x
A
G
|
G
N
x
Q
M
x
L
A
 
A
E
 
F
A
 
A
F
 
L
I
 
A
S
 
K
A
 
G
F
 
F
V
 
T
E
 
A
G
 
A
E
 
G
F
 
V
L
 
L
P
 
A
P
 
A
G
 
H
N
 
K
I
 
I
F
 
M
V
 
A
S
 
S
-
x
S
-
x
P
D
|
D
V
 
M
R
 
D
P
 
L
E
 
A
R
 
T
L
 
V
K
 
S
E
 
A
L
 
L
Q
 
R
T
 
K
L
 
M
Y
 
-
G
 
G
V
 
V
N
 
K
T
 
L
T
 
T
L
 
P
N
 
H
N
|
N
S
 
K
E
 
E
V
 
T
V
 
V
L
 
Q
N
 
H
S
 
S
D
 
D
I
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
|
A
V
|
V
K
|
K
P
 
P
Q
 
H
V
 
I
M
 
I
P
 
P
A
 
F
V
x
I
L
 
L
R
 
D
E
 
E
I
 
I
A
 
G
E
 
A
V
 
D
V
 
I
T
 
E
P
 
D
A
 
R
Q
 
H
V
 
I
V
 
V
V
 
V
S
 
S
M
x
C
A
|
A
A
|
A
G
 
G
F
 
V
P
 
T
M
 
I
R
 
S
S
 
S
I
 
I
E
 
E
A
 
K
L
 
K
L
 
L
G
 
S
D
 
A
D
 
F
K
 
R
-
 
P
-
 
A
-
 
P
K
 
R
I
 
V
A
 
I
R
 
R
I
 
C
M
|
M
P
x
T
N
 
N
I
x
T
M
 
P
V
 
V
K
 
V
V
 
V
R
 
R
S
 
E
G
 
G
V
 
A
V
 
T
A
 
V
Y
 
Y
C
 
A
D
 
T
N
 
G
S
 
T
R
 
H
L
 
A
L
 
Q
D
 
V
E
 
E
E
 
D
R
 
G
E
 
R
R
 
L
V
 
M
L
 
E
S
 
Q
L
 
L
L
 
L
E
 
S
V
 
S
T
 
V
G
 
G
A
 
F
V
 
C
F
 
T
R
 
E
L
 
V
S
 
E
E
 
E
S
 
D
L
 
L
F
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
G
V
 
L
A
 
S
G
 
G
S
 
S
S
 
G
P
 
P
A
 
A
F
 
Y
F
 
A
F
 
F
A
 
T
I
 
A
I
 
L
E
 
D
A
 
A
A
 
L
C
 
A
D
 
D
G
 
G
A
 
G
V
 
V
K
 
K
V
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
R
V
 
L
A
 
A
K
 
V
E
 
R
M
 
L
V
 
G
L
 
A
K
 
Q
V
 
A
L
 
L
E
 
L
G
 
G
C
 
A
V
 
A
K
 
K
M
 
M
-
 
L
-
 
L
A
 
H
A
 
S
D
 
E
E
 
Q
H
 
H
P
 
P
E
 
G
V
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
R
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
A
 
G
G
|
G
T
x
A
T
|
T
I
 
I
E
 
H
G
 
A
L
 
L
F
 
H
A
 
V
L
 
L
E
 
E
R
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
F
R
 
R
A
 
S
S
 
L
I
 
L
I
 
I
E
 
N
A
 
A
V
 
V
S
 
E
A
 
A
A
 
S
C
 
C
R
 
I
R
 
R
S
 
T
K
 
R
E
 
E
I
 
L
S
 
Q
D
 
S
L
 
M
I
 
A
E
 
D
K
 
Q

8tcyA Structure of pycr1 complexed with 7-fluoro-2-oxo-1,2,3,4- tetrahydroquinoline-6-carboxylic acid (see paper)
38% identity, 97% coverage: 5:270/273 of query aligns to 10:281/281 of 8tcyA

query
sites
8tcyA
V
 
V
G
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
x
L
A
 
A
E
 
F
A
 
A
F
 
L
I
 
A
S
 
K
A
 
G
F
 
F
V
 
T
E
 
A
G
 
A
E
 
G
F
 
V
L
 
L
P
 
A
P
 
A
G
 
H
N
 
K
I
 
I
F
 
M
V
 
A
S
 
S
-
 
S
-
 
P
D
 
D
V
 
M
R
 
D
P
 
L
E
 
A
R
 
T
L
 
V
K
 
S
E
 
A
L
 
L
Q
 
R
T
 
K
L
 
M
Y
 
-
G
 
G
V
 
V
N
 
K
T
 
L
T
 
T
L
 
P
N
 
H
N
 
N
S
 
K
E
 
E
V
 
T
V
 
V
L
 
Q
N
 
H
S
 
S
D
 
D
I
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
V
 
I
M
 
I
P
 
P
A
 
F
V
 
I
L
 
L
R
 
D
E
 
E
I
 
I
A
 
G
E
 
A
V
 
D
V
 
I
T
 
E
P
 
D
A
 
R
Q
 
H
V
 
I
V
 
V
V
 
V
S
 
S
M
x
C
A
 
A
A
 
A
G
 
G
F
 
V
P
 
T
M
 
I
R
 
S
S
 
S
I
 
I
E
 
E
A
 
K
L
 
K
L
 
L
G
 
S
D
 
A
D
 
F
K
 
R
-
 
P
-
 
A
-
 
P
K
 
R
I
 
V
A
 
I
R
 
R
I
 
C
M
|
M
P
x
T
N
 
N
I
 
T
M
 
P
V
 
V
K
 
V
V
 
V
R
 
R
S
 
E
G
 
G
V
 
A
V
 
T
A
 
V
Y
 
Y
C
 
A
D
 
T
N
 
G
S
 
T
R
 
H
L
 
A
L
 
Q
D
 
V
E
 
E
E
 
D
R
 
G
E
 
R
R
 
L
V
 
M
L
 
E
S
 
Q
L
 
L
L
 
L
E
 
S
V
 
S
T
 
V
G
 
G
A
 
F
V
 
C
F
 
T
R
 
E
L
 
V
S
 
E
E
 
E
S
 
D
L
 
L
F
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
G
V
 
L
A
 
S
G
 
G
S
 
S
S
 
G
P
 
P
A
 
A
F
 
Y
F
 
A
F
 
F
A
 
T
I
 
A
I
 
L
E
 
D
A
 
A
A
 
L
C
 
A
D
 
D
G
 
G
A
 
G
V
 
V
K
 
K
V
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
R
V
 
L
A
 
A
K
 
V
E
 
R
M
 
L
V
 
G
L
 
A
K
 
Q
V
 
A
L
 
L
E
 
L
G
 
G
C
 
A
V
 
A
K
 
K
M
 
M
-
 
L
-
 
L
A
 
H
A
 
S
D
 
E
E
 
Q
H
 
H
P
 
P
E
 
G
V
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
R
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
A
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
I
 
I
E
 
H
G
 
A
L
 
L
F
 
H
A
 
V
L
 
L
E
 
E
R
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
F
R
 
R
A
 
S
S
 
L
I
 
L
I
 
I
E
 
N
A
 
A
V
 
V
S
 
E
A
 
A
A
 
S
C
 
C
R
 
I
R
 
R
S
 
T
K
 
R
E
 
E
I
 
L
S
 
Q
D
 
S
L
 
M
I
 
A
E
 
D
K
 
Q

5uauA Structure of human pycr-1 complexed with proline (see paper)
38% identity, 97% coverage: 5:270/273 of query aligns to 3:274/274 of 5uauA

query
sites
5uauA
V
 
V
G
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
 
L
A
 
A
E
 
F
A
 
A
F
 
L
I
 
A
S
 
K
A
 
G
F
 
F
V
 
T
E
 
A
G
 
A
E
 
G
F
 
V
L
 
L
P
 
A
P
 
A
G
 
H
N
 
K
I
 
I
F
 
M
V
 
A
S
 
S
-
 
S
-
 
P
D
 
D
V
 
M
R
 
D
P
 
L
E
 
A
R
 
T
L
 
V
K
 
S
E
 
A
L
 
L
Q
 
R
T
 
K
L
 
M
Y
 
-
G
 
G
V
 
V
N
 
K
T
 
L
T
 
T
L
 
P
N
 
H
N
 
N
S
 
K
E
 
E
V
 
T
V
 
V
L
 
Q
N
 
H
S
 
S
D
 
D
I
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
V
 
I
M
 
I
P
 
P
A
 
F
V
 
I
L
 
L
R
 
D
E
 
E
I
 
I
A
 
G
E
 
A
V
 
D
V
 
I
T
 
E
P
 
D
A
 
R
Q
 
H
V
 
I
V
 
V
V
 
V
S
 
S
M
 
C
A
 
A
A
 
A
G
 
G
F
 
V
P
 
T
M
 
I
R
 
S
S
 
S
I
 
I
E
 
E
A
 
K
L
 
K
L
 
L
G
 
S
D
 
A
D
 
F
K
 
R
-
 
P
-
 
A
-
 
P
K
 
R
I
 
V
A
 
I
R
 
R
I
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
I
 
T
M
 
P
V
 
V
K
 
V
V
 
V
R
 
R
S
 
E
G
 
G
V
 
A
V
 
T
A
 
V
Y
 
Y
C
 
A
D
x
T
N
 
G
S
 
T
R
 
H
L
 
A
L
 
Q
D
 
V
E
 
E
E
 
D
R
 
G
E
 
R
R
 
L
V
 
M
L
 
E
S
 
Q
L
 
L
L
 
L
E
 
S
V
 
S
T
 
V
G
 
G
A
 
F
V
 
C
F
 
T
R
 
E
L
 
V
S
x
E
E
|
E
S
 
D
L
 
L
F
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
G
V
 
L
A
 
S
G
 
G
S
 
S
S
 
G
P
 
P
A
 
A
F
 
Y
F
 
A
F
 
F
A
 
T
I
 
A
I
 
L
E
 
D
A
 
A
A
 
L
C
 
A
D
 
D
G
 
G
A
 
G
V
 
V
K
 
K
V
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
R
V
 
L
A
 
A
K
 
V
E
 
R
M
 
L
V
 
G
L
 
A
K
 
Q
V
 
A
L
 
L
E
 
L
G
 
G
C
 
A
V
 
A
K
 
K
M
 
M
-
 
L
-
 
L
A
 
H
A
 
S
D
 
E
E
 
Q
H
 
H
P
 
P
E
 
G
V
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
R
 
N
V
 
V
T
 
S
S
|
S
P
 
P
A
 
G
G
 
G
T
x
A
T
|
T
I
 
I
E
 
H
G
 
A
L
 
L
F
 
H
A
 
V
L
 
L
E
 
E
R
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
F
R
 
R
A
 
S
S
 
L
I
 
L
I
 
I
E
 
N
A
 
A
V
 
V
S
 
E
A
 
A
A
 
S
C
 
C
R
 
I
R
 
R
S
 
T
K
 
R
E
 
E
I
 
L
S
 
Q
D
 
S
L
 
M
I
 
A
E
 
D
K
 
Q

8tcwA Structure of pycr1 complexed with 2-methyl-3-(2-oxoimidazolidin-1-yl) benzoic acid (see paper)
38% identity, 97% coverage: 5:270/273 of query aligns to 10:281/282 of 8tcwA

query
sites
8tcwA
V
 
V
G
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
 
L
A
 
A
E
 
F
A
 
A
F
 
L
I
 
A
S
 
K
A
 
G
F
 
F
V
 
T
E
 
A
G
 
A
E
 
G
F
 
V
L
 
L
P
 
A
P
 
A
G
 
H
N
 
K
I
 
I
F
 
M
V
 
A
S
 
S
-
 
S
-
 
P
D
 
D
V
 
M
R
 
D
P
 
L
E
 
A
R
 
T
L
 
V
K
 
S
E
 
A
L
 
L
Q
 
R
T
 
K
L
 
M
Y
 
-
G
 
G
V
 
V
N
 
K
T
 
L
T
 
T
L
 
P
N
 
H
N
 
N
S
 
K
E
 
E
V
 
T
V
 
V
L
 
Q
N
 
H
S
 
S
D
 
D
I
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
V
|
V
K
 
K
P
|
P
Q
 
H
V
 
I
M
 
I
P
 
P
A
 
F
V
 
I
L
 
L
R
 
D
E
 
E
I
 
I
A
 
G
E
 
A
V
 
D
V
 
I
T
 
E
P
 
D
A
 
R
Q
 
H
V
 
I
V
 
V
V
 
V
S
 
S
M
 
C
A
|
A
A
|
A
G
 
G
F
 
V
P
 
T
M
 
I
R
 
S
S
 
S
I
 
I
E
 
E
A
 
K
L
 
K
L
 
L
G
 
S
D
 
A
D
 
F
K
 
R
-
 
P
-
 
A
-
 
P
K
 
R
I
 
V
A
 
I
R
 
R
I
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
I
 
T
M
 
P
V
 
V
K
 
V
V
 
V
R
 
R
S
 
E
G
 
G
V
 
A
V
 
T
A
 
V
Y
 
Y
C
 
A
D
 
T
N
 
G
S
 
T
R
 
H
L
 
A
L
 
Q
D
 
V
E
 
E
E
 
D
R
 
G
E
 
R
R
 
L
V
 
M
L
 
E
S
 
Q
L
 
L
L
 
L
E
 
S
V
 
S
T
 
V
G
 
G
A
 
F
V
 
C
F
 
T
R
 
E
L
 
V
S
 
E
E
 
E
S
 
D
L
 
L
F
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
G
V
 
L
A
 
S
G
 
G
S
 
S
S
 
G
P
 
P
A
 
A
F
 
Y
F
 
A
F
 
F
A
 
T
I
 
A
I
 
L
E
 
D
A
 
A
A
 
L
C
 
A
D
 
D
G
 
G
A
 
G
V
 
V
K
 
K
V
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
R
V
 
L
A
 
A
K
 
V
E
 
R
M
 
L
V
 
G
L
 
A
K
 
Q
V
 
A
L
 
L
E
 
L
G
 
G
C
 
A
V
 
A
K
 
K
M
 
M
-
 
L
-
 
L
A
 
H
A
 
S
D
 
E
E
 
Q
H
 
H
P
 
P
E
 
G
V
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
R
 
N
V
 
V
T
 
S
S
|
S
P
 
P
A
 
G
G
|
G
T
x
A
T
|
T
I
 
I
E
 
H
G
 
A
L
 
L
F
 
H
A
 
V
L
 
L
E
 
E
R
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
F
R
 
R
A
 
S
S
 
L
I
 
L
I
 
I
E
 
N
A
 
A
V
 
V
S
 
E
A
 
A
A
 
S
C
 
C
R
 
I
R
 
R
S
 
T
K
 
R
E
 
E
I
 
L
S
 
Q
D
 
S
L
 
M
I
 
A
E
 
D
K
 
Q

2graA Crystal structure of human pyrroline-5-carboxylate reductase complexed with NADP (see paper)
38% identity, 97% coverage: 5:270/273 of query aligns to 5:276/277 of 2graA

query
sites
2graA
V
 
V
G
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
 
L
A
 
A
E
 
F
A
 
A
F
 
L
I
 
A
S
 
K
A
 
G
F
 
F
V
 
T
E
 
A
G
 
A
E
 
G
F
 
V
L
 
L
P
 
A
P
 
A
G
 
H
N
 
K
I
 
I
F
 
M
V
 
A
S
 
S
-
 
S
-
 
P
D
 
D
V
 
M
R
 
D
P
 
L
E
 
A
R
 
T
L
 
V
K
 
S
E
 
A
L
 
L
Q
 
R
T
 
K
L
 
M
Y
 
-
G
 
G
V
 
V
N
 
K
T
 
L
T
 
T
L
 
P
N
 
H
N
 
N
S
 
K
E
 
E
V
 
T
V
 
V
L
 
Q
N
 
H
S
 
S
D
 
D
I
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
V
 
I
M
 
I
P
 
P
A
 
F
V
 
I
L
 
L
R
 
D
E
 
E
I
 
I
A
 
G
E
 
A
V
 
D
V
 
I
T
 
E
P
 
D
A
 
R
Q
 
H
V
 
I
V
 
V
V
 
V
S
 
S
M
 
C
A
 
A
A
 
A
G
 
G
F
 
V
P
 
T
M
 
I
R
 
S
S
 
S
I
 
I
E
 
E
A
 
K
L
 
K
L
 
L
G
 
S
D
 
A
D
 
F
K
 
R
-
 
P
-
 
A
-
 
P
K
 
R
I
 
V
A
 
I
R
 
R
I
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
I
 
T
M
 
P
V
 
V
K
 
V
V
 
V
R
|
R
S
x
E
G
 
G
V
 
A
V
 
T
A
 
V
Y
 
Y
C
 
A
D
 
T
N
 
G
S
 
T
R
 
H
L
 
A
L
 
Q
D
 
V
E
 
E
E
 
D
R
 
G
E
 
R
R
 
L
V
 
M
L
 
E
S
 
Q
L
 
L
L
 
L
E
x
S
V
x
S
T
 
V
G
|
G
A
x
F
V
 
C
F
 
T
R
 
E
L
 
V
S
 
E
E
 
E
S
 
D
L
 
L
F
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
G
V
 
L
A
 
S
G
 
G
S
 
S
S
 
G
P
 
P
A
 
A
F
 
Y
F
 
A
F
 
F
A
 
T
I
 
A
I
 
L
E
 
D
A
 
A
A
 
L
C
 
A
D
 
D
G
 
G
A
 
G
V
 
V
K
 
K
V
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
R
V
 
L
A
 
A
K
 
V
E
 
R
M
 
L
V
 
G
L
 
A
K
 
Q
V
 
A
L
 
L
E
 
L
G
 
G
C
 
A
V
 
A
K
 
K
M
 
M
-
 
L
-
x
L
A
x
H
A
x
S
D
 
E
E
 
Q
H
 
H
P
 
P
E
 
G
V
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
R
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
A
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
I
 
I
E
 
H
G
 
A
L
 
L
F
 
H
A
 
V
L
 
L
E
 
E
R
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
F
R
 
R
A
 
S
S
 
L
I
 
L
I
 
I
E
 
N
A
 
A
V
 
V
S
 
E
A
 
A
A
 
S
C
 
C
R
 
I
R
 
R
S
 
T
K
 
R
E
 
E
I
 
L
S
 
Q
D
 
S
L
 
M
I
 
A
E
 
D
K
 
Q

2gr9A Crystal structure of p5cr complexed with nadh (see paper)
38% identity, 97% coverage: 5:270/273 of query aligns to 5:276/277 of 2gr9A

query
sites
2gr9A
V
 
V
G
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
 
L
A
 
A
E
 
F
A
 
A
F
 
L
I
 
A
S
 
K
A
 
G
F
 
F
V
 
T
E
 
A
G
 
A
E
 
G
F
 
V
L
 
L
P
 
A
P
 
A
G
 
H
N
 
K
I
 
I
F
 
M
V
 
A
S
 
S
-
 
S
-
 
P
D
 
D
V
 
M
R
 
D
P
 
L
E
 
A
R
 
T
L
 
V
K
 
S
E
 
A
L
 
L
Q
 
R
T
 
K
L
 
M
Y
 
-
G
 
G
V
 
V
N
 
K
T
 
L
T
 
T
L
 
P
N
 
H
N
 
N
S
 
K
E
 
E
V
 
T
V
 
V
L
 
Q
N
 
H
S
 
S
D
 
D
I
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
V
 
I
M
 
I
P
 
P
A
 
F
V
 
I
L
 
L
R
 
D
E
 
E
I
 
I
A
 
G
E
 
A
V
 
D
V
 
I
T
 
E
P
 
D
A
 
R
Q
 
H
V
 
I
V
 
V
V
 
V
S
 
S
M
 
C
A
 
A
A
 
A
G
 
G
F
 
V
P
 
T
M
 
I
R
 
S
S
 
S
I
 
I
E
 
E
A
 
K
L
 
K
L
 
L
G
 
S
D
 
A
D
 
F
K
 
R
-
 
P
-
 
A
-
 
P
K
 
R
I
 
V
A
 
I
R
 
R
I
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
I
 
T
M
 
P
V
 
V
K
 
V
V
 
V
R
|
R
S
x
E
G
 
G
V
 
A
V
 
T
A
 
V
Y
 
Y
C
 
A
D
 
T
N
 
G
S
 
T
R
 
H
L
 
A
L
 
Q
D
 
V
E
 
E
E
 
D
R
 
G
E
 
R
R
 
L
V
 
M
L
 
E
S
 
Q
L
 
L
L
 
L
E
x
S
V
 
S
T
 
V
G
|
G
A
x
F
V
 
C
F
 
T
R
 
E
L
 
V
S
 
E
E
 
E
S
 
D
L
 
L
F
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
G
V
 
L
A
 
S
G
 
G
S
 
S
S
 
G
P
 
P
A
 
A
F
 
Y
F
 
A
F
 
F
A
 
T
I
 
A
I
 
L
E
 
D
A
 
A
A
 
L
C
 
A
D
 
D
G
 
G
A
 
G
V
 
V
K
 
K
V
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
R
V
 
L
A
 
A
K
 
V
E
 
R
M
 
L
V
 
G
L
 
A
K
 
Q
V
 
A
L
 
L
E
 
L
G
 
G
C
 
A
V
 
A
K
 
K
M
 
M
-
 
L
-
x
L
A
x
H
A
 
S
D
 
E
E
 
Q
H
 
H
P
 
P
E
 
G
V
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
R
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
A
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
I
 
I
E
 
H
G
 
A
L
 
L
F
 
H
A
 
V
L
 
L
E
 
E
R
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
F
R
 
R
A
 
S
S
 
L
I
 
L
I
 
I
E
 
N
A
 
A
V
 
V
S
 
E
A
 
A
A
 
S
C
 
C
R
 
I
R
 
R
S
 
T
K
 
R
E
 
E
I
 
L
S
 
Q
D
 
S
L
 
M
I
 
A
E
 
D
K
 
Q

8tcvB Structure of pycr1 complexed with 4-bromobenzene-1,3-dicarboxylic acid (see paper)
38% identity, 97% coverage: 5:269/273 of query aligns to 9:279/279 of 8tcvB

query
sites
8tcvB
V
 
V
G
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
 
L
A
 
A
E
 
F
A
 
A
F
 
L
I
 
A
S
 
K
A
 
G
F
 
F
V
 
T
E
 
A
G
 
A
E
 
G
F
 
V
L
 
L
P
 
A
P
 
A
G
 
H
N
 
K
I
 
I
F
 
M
V
 
A
S
 
S
-
 
S
-
 
P
D
 
D
V
 
M
R
 
D
P
 
L
E
 
A
R
 
T
L
 
V
K
 
S
E
 
A
L
 
L
Q
 
R
T
 
K
L
 
M
Y
 
-
G
 
G
V
 
V
N
 
K
T
 
L
T
 
T
L
 
P
N
 
H
N
 
N
S
 
K
E
 
E
V
 
T
V
 
V
L
 
Q
N
 
H
S
 
S
D
 
D
I
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
V
 
I
M
 
I
P
 
P
A
 
F
V
 
I
L
 
L
R
 
D
E
 
E
I
 
I
A
 
G
E
 
A
V
 
D
V
 
I
T
 
E
P
 
D
A
 
R
Q
 
H
V
 
I
V
 
V
V
 
V
S
 
S
M
 
C
A
 
A
A
 
A
G
 
G
F
 
V
P
 
T
M
 
I
R
 
S
S
 
S
I
 
I
E
 
E
A
 
K
L
 
K
L
 
L
G
 
S
D
 
A
D
 
F
K
 
R
-
 
P
-
 
A
-
 
P
K
 
R
I
 
V
A
 
I
R
 
R
I
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
I
 
T
M
 
P
V
 
V
K
 
V
V
 
V
R
 
R
S
 
E
G
 
G
V
 
A
V
 
T
A
 
V
Y
 
Y
C
 
A
D
 
T
N
 
G
S
 
T
R
 
H
L
 
A
L
 
Q
D
 
V
E
 
E
E
 
D
R
 
G
E
 
R
R
 
L
V
 
M
L
 
E
S
 
Q
L
 
L
L
 
L
E
 
S
V
 
S
T
 
V
G
 
G
A
 
F
V
 
C
F
 
T
R
 
E
L
 
V
S
 
E
E
 
E
S
 
D
L
 
L
F
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
G
V
 
L
A
 
S
G
 
G
S
 
S
S
 
G
P
 
P
A
 
A
F
 
Y
F
 
A
F
 
F
A
 
T
I
 
A
I
 
L
E
 
D
A
 
A
A
 
L
C
 
A
D
 
D
G
 
G
A
 
G
V
 
V
K
 
K
V
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
R
V
 
L
A
 
A
K
 
V
E
 
R
M
 
L
V
 
G
L
 
A
K
 
Q
V
 
A
L
 
L
E
 
L
G
 
G
C
 
A
V
 
A
K
 
K
M
 
M
-
 
L
-
 
L
A
 
H
A
 
S
D
 
E
E
 
Q
H
 
H
P
 
P
E
 
G
V
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
R
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
A
 
G
G
|
G
T
x
A
T
|
T
I
 
I
E
 
H
G
 
A
L
 
L
F
 
H
A
 
V
L
 
L
E
 
E
R
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
F
R
 
R
A
 
S
S
 
L
I
 
L
I
 
I
E
 
N
A
 
A
V
 
V
S
 
E
A
 
A
A
 
S
C
 
C
R
 
I
R
 
R
S
 
T
K
 
R
E
 
E
I
 
L
S
 
Q
D
 
S
L
 
M
I
 
A
E
 
D

8td1A Structure of pycr1 complexed with 3-(6-oxa-9-azaspiro(4.5)decane-9- carbonyl)benzoic acid (see paper)
38% identity, 97% coverage: 5:269/273 of query aligns to 10:280/280 of 8td1A

query
sites
8td1A
V
 
V
G
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
 
L
A
 
A
E
 
F
A
 
A
F
 
L
I
 
A
S
 
K
A
 
G
F
 
F
V
 
T
E
 
A
G
 
A
E
 
G
F
 
V
L
 
L
P
 
A
P
 
A
G
 
H
N
 
K
I
 
I
F
 
M
V
 
A
S
 
S
-
 
S
-
 
P
D
 
D
V
 
M
R
 
D
P
 
L
E
 
A
R
 
T
L
 
V
K
 
S
E
 
A
L
 
L
Q
 
R
T
 
K
L
 
M
Y
 
-
G
 
G
V
 
V
N
 
K
T
 
L
T
 
T
L
 
P
N
 
H
N
 
N
S
 
K
E
 
E
V
 
T
V
 
V
L
 
Q
N
 
H
S
 
S
D
 
D
I
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
V
 
I
M
 
I
P
 
P
A
 
F
V
 
I
L
 
L
R
 
D
E
 
E
I
 
I
A
 
G
E
 
A
V
 
D
V
 
I
T
 
E
P
 
D
A
 
R
Q
 
H
V
 
I
V
 
V
V
 
V
S
 
S
M
 
C
A
|
A
A
|
A
G
 
G
F
 
V
P
 
T
M
 
I
R
 
S
S
 
S
I
 
I
E
 
E
A
 
K
L
 
K
L
 
L
G
 
S
D
 
A
D
 
F
K
 
R
-
 
P
-
 
A
-
 
P
K
 
R
I
 
V
A
 
I
R
 
R
I
 
C
M
|
M
P
 
T
N
 
N
I
 
T
M
 
P
V
 
V
K
 
V
V
 
V
R
 
R
S
 
E
G
 
G
V
 
A
V
 
T
A
 
V
Y
 
Y
C
 
A
D
 
T
N
 
G
S
 
T
R
 
H
L
 
A
L
 
Q
D
 
V
E
 
E
E
 
D
R
 
G
E
 
R
R
 
L
V
 
M
L
 
E
S
 
Q
L
 
L
L
 
L
E
 
S
V
 
S
T
 
V
G
 
G
A
 
F
V
 
C
F
 
T
R
 
E
L
 
V
S
 
E
E
 
E
S
 
D
L
 
L
F
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
G
V
 
L
A
 
S
G
 
G
S
 
S
S
 
G
P
 
P
A
 
A
F
 
Y
F
 
A
F
 
F
A
 
T
I
 
A
I
 
L
E
 
D
A
 
A
A
 
L
C
 
A
D
 
D
G
 
G
A
 
G
V
 
V
K
 
K
V
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
R
V
 
L
A
 
A
K
 
V
E
 
R
M
 
L
V
 
G
L
 
A
K
 
Q
V
 
A
L
 
L
E
 
L
G
 
G
C
 
A
V
 
A
K
 
K
M
 
M
-
 
L
-
 
L
A
 
H
A
 
S
D
 
E
E
 
Q
H
 
H
P
 
P
E
 
G
V
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
R
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
A
 
G
G
|
G
T
x
A
T
|
T
I
 
I
E
 
H
G
 
A
L
 
L
F
 
H
A
 
V
L
 
L
E
 
E
R
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
F
R
 
R
A
 
S
S
 
L
I
 
L
I
 
I
E
 
N
A
 
A
V
 
V
S
 
E
A
 
A
A
 
S
C
 
C
R
 
I
R
 
R
S
 
T
K
 
R
E
 
E
I
 
L
S
 
Q
D
 
S
L
 
M
I
 
A
E
 
D

8td0A Structure of pycr1 complexed with 5-oxo-7a-phenyl-hexahydropyrrolo[2, 1-b][1,3]thiazole-3-carboxylic acid (see paper)
38% identity, 97% coverage: 5:269/273 of query aligns to 10:280/280 of 8td0A

query
sites
8td0A
V
 
V
G
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
x
L
A
 
A
E
 
F
A
 
A
F
 
L
I
 
A
S
 
K
A
 
G
F
 
F
V
 
T
E
 
A
G
 
A
E
 
G
F
 
V
L
 
L
P
 
A
P
 
A
G
 
H
N
 
K
I
 
I
F
 
M
V
 
A
S
 
S
-
 
S
-
 
P
D
 
D
V
 
M
R
 
D
P
 
L
E
 
A
R
 
T
L
 
V
K
 
S
E
 
A
L
 
L
Q
 
R
T
 
K
L
 
M
Y
 
-
G
 
G
V
 
V
N
 
K
T
 
L
T
 
T
L
 
P
N
 
H
N
 
N
S
 
K
E
 
E
V
 
T
V
 
V
L
 
Q
N
 
H
S
 
S
D
 
D
I
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
V
 
I
M
 
I
P
 
P
A
 
F
V
 
I
L
 
L
R
 
D
E
 
E
I
 
I
A
 
G
E
 
A
V
 
D
V
 
I
T
 
E
P
 
D
A
 
R
Q
 
H
V
 
I
V
 
V
V
 
V
S
 
S
M
 
C
A
 
A
A
 
A
G
 
G
F
 
V
P
 
T
M
 
I
R
 
S
S
 
S
I
 
I
E
 
E
A
 
K
L
 
K
L
 
L
G
 
S
D
 
A
D
 
F
K
 
R
-
 
P
-
 
A
-
 
P
K
 
R
I
 
V
A
 
I
R
 
R
I
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
I
x
T
M
 
P
V
 
V
K
 
V
V
 
V
R
 
R
S
 
E
G
 
G
V
 
A
V
 
T
A
 
V
Y
 
Y
C
 
A
D
 
T
N
 
G
S
 
T
R
 
H
L
 
A
L
 
Q
D
 
V
E
 
E
E
 
D
R
 
G
E
 
R
R
 
L
V
 
M
L
 
E
S
 
Q
L
 
L
L
 
L
E
 
S
V
 
S
T
 
V
G
 
G
A
 
F
V
 
C
F
 
T
R
 
E
L
 
V
S
 
E
E
 
E
S
 
D
L
 
L
F
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
G
V
 
L
A
 
S
G
|
G
S
 
S
S
 
G
P
 
P
A
 
A
F
 
Y
F
 
A
F
 
F
A
 
T
I
 
A
I
 
L
E
 
D
A
 
A
A
 
L
C
 
A
D
 
D
G
 
G
A
 
G
V
 
V
K
 
K
V
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
R
V
 
L
A
 
A
K
 
V
E
 
R
M
 
L
V
 
G
L
 
A
K
 
Q
V
 
A
L
 
L
E
 
L
G
 
G
C
 
A
V
 
A
K
 
K
M
 
M
-
 
L
-
 
L
A
 
H
A
 
S
D
 
E
E
 
Q
H
 
H
P
 
P
E
 
G
V
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
R
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
A
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
I
 
I
E
 
H
G
 
A
L
 
L
F
 
H
A
 
V
L
 
L
E
 
E
R
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
F
R
 
R
A
 
S
S
 
L
I
 
L
I
 
I
E
 
N
A
 
A
V
 
V
S
 
E
A
 
A
A
 
S
C
 
C
R
 
I
R
 
R
S
 
T
K
 
R
E
 
E
I
 
L
S
 
Q
D
 
S
L
 
M
I
 
A
E
 
D

8tczA Structure of pycr1 complexed with 2-(pyridin-2-yl)cyclopropane-1- carboxylic acid (see paper)
38% identity, 97% coverage: 5:269/273 of query aligns to 10:280/280 of 8tczA

query
sites
8tczA
V
 
V
G
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
 
L
A
 
A
E
 
F
A
 
A
F
 
L
I
 
A
S
 
K
A
 
G
F
 
F
V
 
T
E
 
A
G
 
A
E
 
G
F
 
V
L
 
L
P
 
A
P
 
A
G
 
H
N
 
K
I
 
I
F
 
M
V
 
A
S
 
S
-
 
S
-
 
P
D
 
D
V
 
M
R
 
D
P
 
L
E
 
A
R
 
T
L
 
V
K
 
S
E
 
A
L
 
L
Q
 
R
T
 
K
L
 
M
Y
 
-
G
 
G
V
 
V
N
 
K
T
 
L
T
 
T
L
 
P
N
 
H
N
 
N
S
 
K
E
 
E
V
 
T
V
 
V
L
 
Q
N
 
H
S
 
S
D
 
D
I
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
V
 
I
M
 
I
P
 
P
A
 
F
V
 
I
L
 
L
R
 
D
E
 
E
I
 
I
A
 
G
E
 
A
V
 
D
V
 
I
T
 
E
P
 
D
A
 
R
Q
 
H
V
 
I
V
 
V
V
 
V
S
 
S
M
 
C
A
 
A
A
|
A
G
 
G
F
 
V
P
 
T
M
 
I
R
 
S
S
 
S
I
 
I
E
 
E
A
 
K
L
 
K
L
 
L
G
 
S
D
 
A
D
 
F
K
 
R
-
 
P
-
 
A
-
 
P
K
 
R
I
 
V
A
 
I
R
 
R
I
 
C
M
|
M
P
x
T
N
 
N
I
 
T
M
 
P
V
 
V
K
 
V
V
 
V
R
 
R
S
 
E
G
 
G
V
 
A
V
 
T
A
 
V
Y
 
Y
C
 
A
D
 
T
N
 
G
S
 
T
R
 
H
L
 
A
L
 
Q
D
 
V
E
 
E
E
 
D
R
 
G
E
 
R
R
 
L
V
 
M
L
 
E
S
 
Q
L
 
L
L
 
L
E
 
S
V
 
S
T
 
V
G
 
G
A
 
F
V
 
C
F
 
T
R
 
E
L
 
V
S
 
E
E
 
E
S
 
D
L
 
L
F
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
G
V
 
L
A
 
S
G
 
G
S
 
S
S
 
G
P
 
P
A
 
A
F
 
Y
F
 
A
F
 
F
A
 
T
I
 
A
I
 
L
E
 
D
A
 
A
A
 
L
C
 
A
D
 
D
G
 
G
A
 
G
V
 
V
K
 
K
V
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
R
V
 
L
A
 
A
K
 
V
E
 
R
M
 
L
V
 
G
L
 
A
K
 
Q
V
 
A
L
 
L
E
 
L
G
 
G
C
 
A
V
 
A
K
 
K
M
 
M
-
 
L
-
 
L
A
 
H
A
 
S
D
 
E
E
 
Q
H
 
H
P
 
P
E
 
G
V
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
R
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
A
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
I
 
I
E
 
H
G
 
A
L
 
L
F
 
H
A
 
V
L
 
L
E
 
E
R
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
F
R
 
R
A
 
S
S
 
L
I
 
L
I
 
I
E
 
N
A
 
A
V
 
V
S
 
E
A
 
A
A
 
S
C
 
C
R
 
I
R
 
R
S
 
T
K
 
R
E
 
E
I
 
L
S
 
Q
D
 
S
L
 
M
I
 
A
E
 
D

8tcxA Structure of pycr1 complexed with 2,4-dioxo-1,2,3,4- tetrahydroquinazoline-6-carboxylic acid (see paper)
38% identity, 97% coverage: 5:269/273 of query aligns to 10:280/280 of 8tcxA

query
sites
8tcxA
V
 
V
G
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
x
L
A
 
A
E
 
F
A
 
A
F
 
L
I
 
A
S
 
K
A
 
G
F
 
F
V
 
T
E
 
A
G
 
A
E
 
G
F
 
V
L
 
L
P
 
A
P
 
A
G
 
H
N
 
K
I
 
I
F
 
M
V
 
A
S
 
S
-
 
S
-
 
P
D
 
D
V
 
M
R
 
D
P
 
L
E
 
A
R
 
T
L
 
V
K
 
S
E
 
A
L
 
L
Q
 
R
T
 
K
L
 
M
Y
 
-
G
 
G
V
 
V
N
 
K
T
 
L
T
 
T
L
 
P
N
 
H
N
 
N
S
 
K
E
 
E
V
 
T
V
 
V
L
 
Q
N
 
H
S
 
S
D
 
D
I
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
V
 
I
M
 
I
P
 
P
A
 
F
V
 
I
L
 
L
R
 
D
E
 
E
I
 
I
A
 
G
E
 
A
V
 
D
V
 
I
T
 
E
P
 
D
A
 
R
Q
 
H
V
 
I
V
 
V
V
 
V
S
 
S
M
x
C
A
 
A
A
 
A
G
 
G
F
 
V
P
 
T
M
 
I
R
 
S
S
 
S
I
 
I
E
 
E
A
 
K
L
 
K
L
 
L
G
 
S
D
 
A
D
 
F
K
 
R
-
 
P
-
 
A
-
 
P
K
 
R
I
 
V
A
 
I
R
 
R
I
 
C
M
|
M
P
x
T
N
 
N
I
 
T
M
 
P
V
 
V
K
 
V
V
 
V
R
 
R
S
 
E
G
 
G
V
 
A
V
 
T
A
 
V
Y
 
Y
C
 
A
D
 
T
N
 
G
S
 
T
R
 
H
L
 
A
L
 
Q
D
 
V
E
 
E
E
 
D
R
 
G
E
 
R
R
 
L
V
 
M
L
 
E
S
 
Q
L
 
L
L
 
L
E
 
S
V
 
S
T
 
V
G
 
G
A
 
F
V
 
C
F
 
T
R
 
E
L
 
V
S
 
E
E
 
E
S
 
D
L
 
L
F
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
G
V
 
L
A
 
S
G
 
G
S
 
S
S
 
G
P
 
P
A
 
A
F
 
Y
F
 
A
F
 
F
A
 
T
I
 
A
I
 
L
E
 
D
A
 
A
A
 
L
C
 
A
D
 
D
G
 
G
A
 
G
V
 
V
K
 
K
V
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
R
V
 
L
A
 
A
K
 
V
E
 
R
M
 
L
V
 
G
L
 
A
K
 
Q
V
 
A
L
 
L
E
 
L
G
 
G
C
 
A
V
 
A
K
 
K
M
 
M
-
 
L
-
 
L
A
 
H
A
 
S
D
 
E
E
 
Q
H
 
H
P
 
P
E
 
G
V
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
R
 
N
V
 
V
T
 
S
S
|
S
P
 
P
A
 
G
G
 
G
T
 
A
T
|
T
I
 
I
E
 
H
G
 
A
L
 
L
F
 
H
A
 
V
L
 
L
E
 
E
R
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
F
R
 
R
A
 
S
S
 
L
I
 
L
I
 
I
E
 
N
A
 
A
V
 
V
S
 
E
A
 
A
A
 
S
C
 
C
R
 
I
R
 
R
S
 
T
K
 
R
E
 
E
I
 
L
S
 
Q
D
 
S
L
 
M
I
 
A
E
 
D

P32322 Pyrroline-5-carboxylate reductase 1, mitochondrial; P5C reductase 1; P5CR 1; EC 1.5.1.2 from Homo sapiens (Human) (see 4 papers)
38% identity, 97% coverage: 5:270/273 of query aligns to 3:274/319 of P32322

query
sites
P32322
V
 
V
G
 
G
F
 
F
I
|
I
G
|
G
G
x
A
G
|
G
N
x
Q
M
x
L
A
 
A
E
 
F
A
 
A
F
 
L
I
 
A
S
 
K
A
 
G
F
 
F
V
 
T
E
 
A
G
 
A
E
 
G
F
 
V
L
 
L
P
 
A
P
 
A
G
 
H
N
 
K
I
 
I
F
 
M
V
 
A
S
 
S
-
x
S
-
 
P
D
 
D
V
 
M
R
 
D
P
 
L
E
 
A
R
 
T
L
 
V
K
 
S
E
 
A
L
 
L
Q
 
R
T
 
K
L
 
M
Y
 
-
G
 
G
V
 
V
N
 
K
T
 
L
T
 
T
L
 
P
N
 
H
N
|
N
S
 
K
E
 
E
V
 
T
V
 
V
L
 
Q
N
 
H
S
 
S
D
 
D
I
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
|
A
V
|
V
K
|
K
P
|
P
Q
 
H
V
 
I
M
 
I
P
 
P
A
 
F
V
 
I
L
 
L
R
 
D
E
 
E
I
 
I
A
 
G
E
 
A
V
 
D
V
 
I
T
 
E
P
 
D
A
 
R
Q
 
H
V
 
I
V
 
V
V
 
V
S
 
S
M
x
C
A
|
A
A
|
A
G
 
G
F
 
V
P
 
T
M
 
I
R
 
S
S
 
S
I
 
I
E
 
E
A
 
K
L
 
K
L
 
L
G
 
S
D
 
A
D
 
F
K
 
R
-
 
P
-
 
A
-
 
P
K
 
R
I
 
V
A
 
I
R
 
R
I
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
I
 
T
M
 
P
V
 
V
K
 
V
V
 
V
R
 
R
S
 
E
G
 
G
V
 
A
V
 
T
A
 
V
Y
 
Y
C
 
A
D
 
T
N
 
G
S
 
T
R
 
H
L
 
A
L
 
Q
D
 
V
E
 
E
E
 
D
R
 
G
E
 
R
R
 
L
V
 
M
L
 
E
S
 
Q
L
 
L
L
 
L
E
 
S
V
 
S
T
 
V
G
 
G
A
 
F
V
 
C
F
 
T
R
 
E
L
 
V
S
 
E
E
 
E
S
 
D
L
 
L
F
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
G
V
 
L
A
 
S
G
 
G
S
 
S
S
 
G
P
 
P
A
 
A
F
 
Y
F
 
A
F
 
F
A
 
T
I
 
A
I
 
L
E
 
D
A
 
A
A
 
L
C
x
A
D
 
D
G
 
G
A
 
G
V
 
V
K
 
K
V
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
R
V
 
L
A
 
A
K
 
V
E
 
R
M
 
L
V
 
G
L
 
A
K
 
Q
V
 
A
L
 
L
E
 
L
G
 
G
C
 
A
V
 
A
K
 
K
M
 
M
-
 
L
-
 
L
A
 
H
A
 
S
D
x
E
E
 
Q
H
 
H
P
 
P
E
 
G
V
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
R
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
A
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
I
 
I
E
 
H
G
 
A
L
 
L
F
 
H
A
 
V
L
 
L
E
 
E
R
 
S
G
|
G
G
 
G
V
 
F
R
 
R
A
 
S
S
 
L
I
 
L
I
 
I
E
 
N
A
 
A
V
 
V
S
 
E
A
 
A
A
 
S
C
 
C
R
 
I
R
 
R
S
 
T
K
x
R
E
 
E
I
 
L
S
 
Q
D
 
S
L
 
M
I
 
A
E
 
D
K
 
Q

Sites not aligning to the query:

8tcuA Structure of pycr1 complexed with 2-chloro-5-(2-oxoimidazolidin-1-yl) benzoic acid (see paper)
39% identity, 96% coverage: 5:267/273 of query aligns to 10:278/279 of 8tcuA

query
sites
8tcuA
V
 
V
G
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
 
L
A
 
A
E
 
F
A
 
A
F
 
L
I
 
A
S
 
K
A
 
G
F
 
F
V
 
T
E
 
A
G
 
A
E
 
G
F
 
V
L
 
L
P
 
A
P
 
A
G
 
H
N
 
K
I
 
I
F
 
M
V
 
A
S
 
S
-
 
S
-
 
P
D
 
D
V
 
M
R
 
D
P
 
L
E
 
A
R
 
T
L
 
V
K
 
S
E
 
A
L
 
L
Q
 
R
T
 
K
L
 
M
Y
 
-
G
 
G
V
 
V
N
 
K
T
 
L
T
 
T
L
 
P
N
 
H
N
 
N
S
 
K
E
 
E
V
 
T
V
 
V
L
 
Q
N
 
H
S
 
S
D
 
D
I
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
|
A
V
|
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
V
 
I
M
 
I
P
 
P
A
 
F
V
 
I
L
 
L
R
 
D
E
 
E
I
 
I
A
 
G
E
 
A
V
 
D
V
 
I
T
 
E
P
 
D
A
 
R
Q
 
H
V
 
I
V
 
V
V
 
V
S
 
S
M
 
C
A
|
A
A
|
A
G
 
G
F
 
V
P
 
T
M
 
I
R
 
S
S
 
S
I
 
I
E
 
E
A
 
K
L
 
K
L
 
L
G
 
S
D
 
A
D
 
F
K
 
R
-
 
P
-
 
A
-
 
P
K
 
R
I
 
V
A
 
I
R
 
R
I
 
C
M
|
M
P
 
T
N
 
N
I
 
T
M
 
P
V
 
V
K
 
V
V
 
V
R
 
R
S
 
E
G
 
G
V
 
A
V
 
T
A
 
V
Y
 
Y
C
 
A
D
 
T
N
 
G
S
 
T
R
 
H
L
 
A
L
 
Q
D
 
V
E
 
E
E
 
D
R
 
G
E
 
R
R
 
L
V
 
M
L
 
E
S
 
Q
L
 
L
L
 
L
E
 
S
V
 
S
T
 
V
G
 
G
A
 
F
V
 
C
F
 
T
R
 
E
L
 
V
S
 
E
E
 
E
S
 
D
L
 
L
F
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
G
V
 
L
A
 
S
G
 
G
S
 
S
S
 
G
P
 
P
A
 
A
F
 
Y
F
 
A
F
 
F
A
 
T
I
 
A
I
 
L
E
 
D
A
 
A
A
 
L
C
 
A
D
 
D
G
 
G
A
 
G
V
 
V
K
 
K
V
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
R
V
 
L
A
 
A
K
 
V
E
 
R
M
 
L
V
 
G
L
 
A
K
 
Q
V
 
A
L
 
L
E
 
L
G
 
G
C
 
A
V
 
A
K
 
K
M
 
M
-
 
L
-
 
L
A
 
H
A
 
S
D
 
E
E
 
Q
H
 
H
P
 
P
E
 
G
V
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
R
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
A
 
G
G
|
G
T
x
A
T
|
T
I
 
I
E
 
H
G
 
A
L
 
L
F
 
H
A
 
V
L
 
L
E
 
E
R
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
F
R
 
R
A
 
S
S
 
L
I
 
L
I
 
I
E
 
N
A
 
A
V
 
V
S
 
E
A
 
A
A
 
S
C
 
C
R
 
I
R
 
R
S
 
T
K
 
R
E
 
E
I
 
L
S
 
Q
D
 
S
L
 
M

2izzA Crystal structure of human pyrroline-5-carboxylate reductase
39% identity, 96% coverage: 5:267/273 of query aligns to 4:272/272 of 2izzA

query
sites
2izzA
V
 
V
G
 
G
F
 
F
I
 
I
G
|
G
G
x
A
G
|
G
N
x
Q
M
x
L
A
 
A
E
 
F
A
 
A
F
 
L
I
 
A
S
 
K
A
 
G
F
 
F
V
 
T
E
 
A
G
 
A
E
 
G
F
 
V
L
 
L
P
 
A
P
 
A
G
 
H
N
 
K
I
 
I
F
 
M
V
 
A
S
 
S
-
x
S
-
x
P
D
 
D
V
 
M
R
 
D
P
 
L
E
 
A
R
 
T
L
 
V
K
 
S
E
 
A
L
 
L
Q
 
R
T
 
K
L
 
M
Y
 
-
G
 
G
V
 
V
N
 
K
T
 
L
T
 
T
L
 
P
N
 
H
N
|
N
S
 
K
E
 
E
V
 
T
V
 
V
L
 
Q
N
 
H
S
 
S
D
 
D
I
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
|
A
V
|
V
K
|
K
P
 
P
Q
 
H
V
 
I
M
 
I
P
 
P
A
 
F
V
x
I
L
 
L
R
 
D
E
 
E
I
 
I
A
 
G
E
 
A
V
 
D
V
 
I
T
 
E
P
 
D
A
 
R
Q
 
H
V
 
I
V
 
V
V
 
V
S
 
S
M
x
C
A
|
A
A
|
A
G
 
G
F
 
V
P
 
T
M
 
I
R
 
S
S
 
S
I
 
I
E
 
E
A
 
K
L
 
K
L
 
L
G
 
S
D
 
A
D
 
F
K
 
R
-
 
P
-
 
A
-
 
P
K
 
R
I
 
V
A
 
I
R
 
R
I
 
C
M
|
M
P
x
T
N
 
N
I
 
T
M
 
P
V
 
V
K
 
V
V
 
V
R
 
R
S
 
E
G
 
G
V
 
A
V
 
T
A
 
V
Y
 
Y
C
 
A
D
 
T
N
 
G
S
 
T
R
 
H
L
 
A
L
 
Q
D
 
V
E
 
E
E
 
D
R
 
G
E
 
R
R
 
L
V
 
M
L
 
E
S
 
Q
L
 
L
L
 
L
E
 
S
V
 
S
T
 
V
G
 
G
A
 
F
V
 
C
F
 
T
R
 
E
L
 
V
S
 
E
E
 
E
S
 
D
L
 
L
F
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
G
V
 
L
A
 
S
G
 
G
S
 
S
S
 
G
P
 
P
A
 
A
F
 
Y
F
 
A
F
 
F
A
 
T
I
 
A
I
 
L
E
 
D
A
 
A
A
 
L
C
 
A
D
 
D
G
 
G
A
 
G
V
 
V
K
 
K
V
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
R
V
 
L
A
 
A
K
 
V
E
 
R
M
 
L
V
 
G
L
 
A
K
 
Q
V
 
A
L
 
L
E
 
L
G
 
G
C
 
A
V
 
A
K
 
K
M
 
M
-
 
L
-
 
L
A
 
H
A
 
S
D
 
E
E
 
Q
H
 
H
P
 
P
E
 
G
V
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
R
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
A
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
I
 
I
E
 
H
G
 
A
L
 
L
F
 
H
A
 
V
L
 
L
E
 
E
R
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
F
R
 
R
A
 
S
S
 
L
I
 
L
I
 
I
E
 
N
A
 
A
V
 
V
S
 
E
A
 
A
A
 
S
C
 
C
R
 
I
R
 
R
S
 
T
K
 
R
E
 
E
I
 
L
S
 
Q
D
 
S
L
 
M

5uatC Structure of human pycr-1 complexed with NADPH (see paper)
38% identity, 97% coverage: 5:269/273 of query aligns to 7:277/277 of 5uatC

query
sites
5uatC
V
 
V
G
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
x
A
G
|
G
N
x
Q
M
x
L
A
 
A
E
 
F
A
 
A
F
 
L
I
 
A
S
 
K
A
 
G
F
 
F
V
 
T
E
 
A
G
 
A
E
 
G
F
 
V
L
 
L
P
 
A
P
 
A
G
 
H
N
 
K
I
 
I
F
 
M
V
 
A
S
 
S
-
x
S
-
x
P
D
|
D
V
 
M
R
 
D
P
 
L
E
 
A
R
 
T
L
 
V
K
 
S
E
 
A
L
 
L
Q
 
R
T
 
K
L
 
M
Y
 
-
G
 
G
V
 
V
N
 
K
T
 
L
T
 
T
L
 
P
N
 
H
N
|
N
S
 
K
E
 
E
V
 
T
V
 
V
L
 
Q
N
 
H
S
 
S
D
 
D
I
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
|
A
V
|
V
K
|
K
P
|
P
Q
 
H
V
 
I
M
 
I
P
 
P
A
 
F
V
x
I
L
 
L
R
 
D
E
 
E
I
 
I
A
 
G
E
 
A
V
 
D
V
 
I
T
 
E
P
 
D
A
 
R
Q
 
H
V
 
I
V
 
V
V
 
V
S
 
S
M
x
C
A
|
A
A
|
A
G
 
G
F
 
V
P
 
T
M
 
I
R
 
S
S
 
S
I
 
I
E
 
E
A
 
K
L
 
K
L
 
L
G
 
S
D
 
A
D
 
F
K
 
R
-
 
P
-
 
A
-
 
P
K
 
R
I
 
V
A
 
I
R
 
R
I
 
C
M
|
M
P
 
T
N
 
N
I
x
T
M
 
P
V
 
V
K
 
V
V
 
V
R
 
R
S
 
E
G
 
G
V
 
A
V
 
T
A
 
V
Y
 
Y
C
 
A
D
 
T
N
 
G
S
 
T
R
 
H
L
 
A
L
 
Q
D
 
V
E
 
E
E
 
D
R
 
G
E
 
R
R
 
L
V
 
M
L
 
E
S
 
Q
L
 
L
L
 
L
E
 
S
V
 
S
T
 
V
G
 
G
A
 
F
V
 
C
F
 
T
R
 
E
L
 
V
S
 
E
E
 
E
S
 
D
L
 
L
F
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
G
V
 
L
A
 
S
G
 
G
S
 
S
S
 
G
P
 
P
A
 
A
F
 
Y
F
 
A
F
 
F
A
 
T
I
 
A
I
 
L
E
 
D
A
 
A
A
 
L
C
 
A
D
 
D
G
 
G
A
 
G
V
 
V
K
 
K
V
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
R
V
 
L
A
 
A
K
 
V
E
 
R
M
 
L
V
 
G
L
 
A
K
 
Q
V
 
A
L
 
L
E
 
L
G
 
G
C
 
A
V
 
A
K
 
K
M
 
M
-
 
L
-
 
L
A
 
H
A
 
S
D
 
E
E
 
Q
H
 
H
P
 
P
E
 
G
V
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
R
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
A
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
I
 
I
E
 
H
G
 
A
L
 
L
F
 
H
A
 
V
L
 
L
E
 
E
R
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
F
R
 
R
A
 
S
S
 
L
I
 
L
I
 
I
E
 
N
A
 
A
V
 
V
S
 
E
A
 
A
A
 
S
C
 
C
R
 
I
R
 
R
S
 
T
K
 
R
E
 
E
I
 
L
S
 
Q
D
 
S
L
 
M
I
 
A
E
 
D

6xp3A Structure of human pycr1 complexed with cyclopentanecarboxylic acid (see paper)
38% identity, 97% coverage: 5:269/273 of query aligns to 6:276/276 of 6xp3A

query
sites
6xp3A
V
 
V
G
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
 
L
A
 
A
E
 
F
A
 
A
F
 
L
I
 
A
S
 
K
A
 
G
F
 
F
V
 
T
E
 
A
G
 
A
E
 
G
F
 
V
L
 
L
P
 
A
P
 
A
G
 
H
N
 
K
I
 
I
F
 
M
V
 
A
S
 
S
-
 
S
-
 
P
D
 
D
V
 
M
R
 
D
P
 
L
E
 
A
R
 
T
L
 
V
K
 
S
E
 
A
L
 
L
Q
 
R
T
 
K
L
 
M
Y
 
-
G
 
G
V
 
V
N
 
K
T
 
L
T
 
T
L
 
P
N
 
H
N
 
N
S
 
K
E
 
E
V
 
T
V
 
V
L
 
Q
N
 
H
S
 
S
D
 
D
I
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
V
 
I
M
 
I
P
 
P
A
 
F
V
 
I
L
 
L
R
 
D
E
 
E
I
 
I
A
 
G
E
 
A
V
 
D
V
 
I
T
 
E
P
 
D
A
 
R
Q
 
H
V
 
I
V
 
V
V
 
V
S
 
S
M
 
C
A
 
A
A
 
A
G
 
G
F
 
V
P
 
T
M
 
I
R
 
S
S
 
S
I
 
I
E
 
E
A
 
K
L
 
K
L
 
L
G
 
S
D
 
A
D
 
F
K
 
R
-
 
P
-
 
A
-
 
P
K
 
R
I
 
V
A
 
I
R
 
R
I
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
I
 
T
M
 
P
V
 
V
K
 
V
V
 
V
R
 
R
S
 
E
G
 
G
V
 
A
V
 
T
A
 
V
Y
 
Y
C
 
A
D
 
T
N
 
G
S
 
T
R
 
H
L
 
A
L
 
Q
D
 
V
E
 
E
E
 
D
R
 
G
E
 
R
R
 
L
V
 
M
L
 
E
S
 
Q
L
 
L
L
 
L
E
 
S
V
 
S
T
 
V
G
 
G
A
 
F
V
 
C
F
 
T
R
 
E
L
 
V
S
 
E
E
 
E
S
 
D
L
 
L
F
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
|
T
A
 
G
V
 
L
A
 
S
G
|
G
S
 
S
S
 
G
P
 
P
A
 
A
F
 
Y
F
 
A
F
 
F
A
 
T
I
 
A
I
 
L
E
 
D
A
 
A
A
 
L
C
 
A
D
 
D
G
 
G
A
 
G
V
 
V
K
 
K
V
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
R
V
 
L
A
 
A
K
 
V
E
 
R
M
 
L
V
 
G
L
 
A
K
 
Q
V
 
A
L
 
L
E
 
L
G
 
G
C
 
A
V
 
A
K
 
K
M
 
M
-
 
L
-
 
L
A
 
H
A
 
S
D
 
E
E
 
Q
H
 
H
P
 
P
E
 
G
V
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
R
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
A
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
I
 
I
E
 
H
G
 
A
L
 
L
F
 
H
A
 
V
L
 
L
E
 
E
R
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
F
R
 
R
A
 
S
S
 
L
I
 
L
I
 
I
E
 
N
A
 
A
V
 
V
S
 
E
A
 
A
A
 
S
C
 
C
R
 
I
R
 
R
S
 
T
K
 
R
E
 
E
I
 
L
S
 
Q
D
 
S
L
 
M
I
 
A
E
 
D

6xp0A Structure of human pycr1 complexed with n-formyl l-proline (see paper)
38% identity, 97% coverage: 5:269/273 of query aligns to 5:272/272 of 6xp0A

query
sites
6xp0A
V
 
V
G
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
 
L
A
 
A
E
 
F
A
 
A
F
 
L
I
 
A
S
 
K
A
 
G
F
 
F
V
 
T
E
 
A
G
 
A
E
 
G
F
 
V
L
 
L
P
 
A
P
 
A
G
 
H
N
 
K
I
 
I
F
 
M
V
 
A
S
 
S
D
 
S
V
 
-
R
 
-
P
 
P
E
 
L
R
 
A
L
 
T
K
 
V
E
 
S
L
 
A
Q
 
L
T
 
R
L
 
K
Y
 
M
G
 
G
V
 
V
N
 
K
T
 
L
T
 
T
L
 
P
N
 
H
N
 
N
S
 
K
E
 
E
V
 
T
V
 
V
L
 
Q
N
 
H
S
 
S
D
 
D
I
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
V
 
I
M
 
I
P
 
P
A
 
F
V
 
I
L
 
L
R
 
D
E
 
E
I
 
I
A
 
G
E
 
A
V
 
D
V
 
I
T
 
E
P
 
D
A
 
R
Q
 
H
V
 
I
V
 
V
V
 
V
S
 
S
M
 
C
A
 
A
A
 
A
G
 
G
F
 
V
P
 
T
M
 
I
R
 
S
S
 
S
I
 
I
E
 
E
A
 
K
L
 
K
L
 
L
G
 
S
D
 
A
D
 
F
K
 
R
-
 
P
-
 
A
-
 
P
K
 
R
I
 
V
A
 
I
R
 
R
I
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
I
 
T
M
 
P
V
 
V
K
 
V
V
 
V
R
 
R
S
 
E
G
 
G
V
 
A
V
 
T
A
 
V
Y
 
Y
C
 
A
D
 
T
N
 
G
S
 
T
R
 
H
L
 
A
L
 
Q
D
 
V
E
 
E
E
 
D
R
 
G
E
 
R
R
 
L
V
 
M
L
 
E
S
 
Q
L
 
L
L
 
L
E
 
S
V
 
S
T
 
V
G
 
G
A
 
F
V
 
C
F
 
T
R
 
E
L
 
V
S
 
E
E
 
E
S
 
D
L
 
L
F
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
G
V
 
L
A
 
S
G
 
G
S
 
S
S
 
G
P
 
P
A
 
A
F
 
Y
F
 
A
F
 
F
A
 
T
I
 
A
I
 
L
E
 
D
A
 
A
A
 
L
C
 
A
D
 
D
G
 
G
A
 
G
V
 
V
K
 
K
V
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
R
V
 
L
A
 
A
K
 
V
E
 
R
M
 
L
V
 
G
L
 
A
K
 
Q
V
 
A
L
 
L
E
 
L
G
 
G
C
 
A
V
 
A
K
 
K
M
 
M
-
 
L
-
 
L
A
 
H
A
 
S
D
 
E
E
 
Q
H
 
H
P
 
P
E
 
G
V
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
R
 
N
V
|
V
T
 
S
S
|
S
P
 
P
A
 
G
G
 
G
T
x
A
T
|
T
I
 
I
E
 
H
G
 
A
L
 
L
F
 
H
A
 
V
L
 
L
E
 
E
R
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
F
R
 
R
A
 
S
S
 
L
I
 
L
I
 
I
E
 
N
A
 
A
V
 
V
S
 
E
A
 
A
A
 
S
C
 
C
R
 
I
R
 
R
S
 
T
K
 
R
E
 
E
I
 
L
S
 
Q
D
 
S
L
 
M
I
 
A
E
 
D

6xp2A Structure of human pycr1 complexed with l-thiazolidine-4-carboxylate (see paper)
38% identity, 97% coverage: 5:270/273 of query aligns to 3:267/267 of 6xp2A

query
sites
6xp2A
V
 
V
G
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
-
G
 
-
N
 
Q
M
 
L
A
 
A
E
 
F
A
 
A
F
 
L
I
 
A
S
 
K
A
 
G
F
 
F
V
 
T
E
 
A
G
 
A
E
 
G
F
 
V
L
 
L
P
 
A
P
 
A
G
 
H
N
 
K
I
 
I
F
 
M
V
 
A
S
 
S
D
 
L
V
 
A
R
 
T
P
 
V
E
 
S
R
 
A
L
 
L
K
 
R
E
 
K
L
 
M
Q
 
-
T
 
-
L
 
-
Y
 
-
G
 
G
V
 
V
N
 
K
T
 
L
T
 
T
L
 
P
N
 
H
N
 
N
S
 
K
E
 
E
V
 
T
V
 
V
L
 
Q
N
 
H
S
 
S
D
 
D
I
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
V
 
I
M
 
I
P
 
P
A
 
F
V
 
I
L
 
L
R
 
D
E
 
E
I
 
I
A
 
G
E
 
A
V
 
D
V
 
I
T
 
E
P
 
D
A
 
R
Q
 
H
V
 
I
V
 
V
V
 
V
S
 
S
M
 
C
A
 
A
A
 
A
G
 
G
F
 
V
P
 
T
M
 
I
R
 
S
S
 
S
I
 
I
E
 
E
A
 
K
L
 
K
L
 
L
G
 
S
D
 
A
D
 
F
K
 
R
-
 
P
-
 
A
-
 
P
K
 
R
I
 
V
A
 
I
R
 
R
I
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
I
 
T
M
 
P
V
 
V
K
 
V
V
 
V
R
 
R
S
 
E
G
 
G
V
 
A
V
 
T
A
 
V
Y
 
Y
C
 
A
D
 
T
N
 
G
S
 
T
R
 
H
L
 
A
L
 
Q
D
 
V
E
 
E
E
 
D
R
 
G
E
 
R
R
 
L
V
 
M
L
 
E
S
 
Q
L
 
L
L
 
L
E
 
S
V
 
S
T
 
V
G
 
G
A
 
F
V
 
C
F
 
T
R
 
E
L
 
V
S
 
E
E
 
E
S
 
D
L
 
L
F
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
G
V
 
L
A
 
S
G
 
G
S
 
S
S
 
G
P
 
P
A
 
A
F
 
Y
F
 
A
F
 
F
A
 
T
I
 
A
I
 
L
E
 
D
A
 
A
A
 
L
C
 
A
D
 
D
G
 
G
A
 
G
V
 
V
K
 
K
V
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
R
V
 
L
A
 
A
K
 
V
E
 
R
M
 
L
V
 
G
L
 
A
K
 
Q
V
 
A
L
 
L
E
 
L
G
 
G
C
 
A
V
 
A
K
 
K
M
 
M
-
 
L
-
 
L
A
 
H
A
 
S
D
 
E
E
 
Q
H
 
H
P
 
P
E
 
G
V
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
R
 
N
V
|
V
T
 
S
S
|
S
P
 
P
A
 
G
G
 
G
T
x
A
T
|
T
I
 
I
E
 
H
G
 
A
L
 
L
F
 
H
A
 
V
L
 
L
E
 
E
R
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
F
R
 
R
A
 
S
S
 
L
I
 
L
I
 
I
E
 
N
A
 
A
V
 
V
S
 
E
A
 
A
A
 
S
C
 
C
R
 
I
R
 
R
S
 
T
K
 
R
E
 
E
I
 
L
S
 
Q
D
 
S
L
 
M
I
 
A
E
 
D
K
 
Q

6xp1A Structure of human pycr1 complexed with l-thiazolidine-2-carboxylate (see paper)
38% identity, 97% coverage: 5:269/273 of query aligns to 3:266/266 of 6xp1A

query
sites
6xp1A
V
 
V
G
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
-
G
 
-
N
 
Q
M
 
L
A
 
A
E
 
F
A
 
A
F
 
L
I
 
A
S
 
K
A
 
G
F
 
F
V
 
T
E
 
A
G
 
A
E
 
G
F
 
V
L
 
L
P
 
A
P
 
A
G
 
H
N
 
K
I
 
I
F
 
M
V
 
A
S
 
S
D
 
L
V
 
A
R
 
T
P
 
V
E
 
S
R
 
A
L
 
L
K
 
R
E
 
K
L
 
M
Q
 
-
T
 
-
L
 
-
Y
 
-
G
 
G
V
 
V
N
 
K
T
 
L
T
 
T
L
 
P
N
 
H
N
 
N
S
 
K
E
 
E
V
 
T
V
 
V
L
 
Q
N
 
H
S
 
S
D
 
D
I
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
V
 
I
M
 
I
P
 
P
A
 
F
V
 
I
L
 
L
R
 
D
E
 
E
I
 
I
A
 
G
E
 
A
V
 
D
V
 
I
T
 
E
P
 
D
A
 
R
Q
 
H
V
 
I
V
 
V
V
 
V
S
 
S
M
 
C
A
 
A
A
 
A
G
 
G
F
 
V
P
 
T
M
 
I
R
 
S
S
 
S
I
 
I
E
 
E
A
 
K
L
 
K
L
 
L
G
 
S
D
 
A
D
 
F
K
 
R
-
 
P
-
 
A
-
 
P
K
 
R
I
 
V
A
 
I
R
 
R
I
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
I
 
T
M
 
P
V
 
V
K
 
V
V
 
V
R
 
R
S
 
E
G
 
G
V
 
A
V
 
T
A
 
V
Y
 
Y
C
 
A
D
 
T
N
 
G
S
 
T
R
 
H
L
 
A
L
 
Q
D
 
V
E
 
E
E
 
D
R
 
G
E
 
R
R
 
L
V
 
M
L
 
E
S
 
Q
L
 
L
L
 
L
E
 
S
V
 
S
T
 
V
G
 
G
A
 
F
V
 
C
F
 
T
R
 
E
L
 
V
S
 
E
E
 
E
S
 
D
L
 
L
F
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
G
V
 
L
A
 
S
G
 
G
S
 
S
S
 
G
P
 
P
A
 
A
F
 
Y
F
 
A
F
 
F
A
 
T
I
 
A
I
 
L
E
 
D
A
 
A
A
 
L
C
 
A
D
 
D
G
 
G
A
 
G
V
 
V
K
 
K
V
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
R
V
 
L
A
 
A
K
 
V
E
 
R
M
 
L
V
 
G
L
 
A
K
 
Q
V
 
A
L
 
L
E
 
L
G
 
G
C
 
A
V
 
A
K
 
K
M
 
M
-
 
L
-
 
L
A
 
H
A
 
S
D
 
E
E
 
Q
H
 
H
P
 
P
E
 
G
V
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
R
 
N
V
 
V
T
 
S
S
|
S
P
 
P
A
 
G
G
 
G
T
 
A
T
|
T
I
 
I
E
 
H
G
 
A
L
 
L
F
 
H
A
 
V
L
 
L
E
 
E
R
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
F
R
 
R
A
 
S
S
 
L
I
 
L
I
 
I
E
 
N
A
 
A
V
 
V
S
 
E
A
 
A
A
 
S
C
 
C
R
 
I
R
 
R
S
 
T
K
 
R
E
 
E
I
 
L
S
 
Q
D
 
S
L
 
M
I
 
A
E
 
D

Query Sequence

>WP_013537965.1 NCBI__GCF_000185805.1:WP_013537965.1
MNYRVGFIGGGNMAEAFISAFVEGEFLPPGNIFVSDVRPERLKELQTLYGVNTTLNNSEV
VLNSDILFLAVKPQVMPAVLREIAEVVTPAQVVVSMAAGFPMRSIEALLGDDKKIARIMP
NIMVKVRSGVVAYCDNSRLLDEERERVLSLLEVTGAVFRLSESLFDAVTAVAGSSPAFFF
AIIEAACDGAVKVGLPRDVAKEMVLKVLEGCVKMAADEHPEVLKDRVTSPAGTTIEGLFA
LERGGVRASIIEAVSAACRRSKEISDLIEKSLG

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory