SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_013553340.1 NCBI__GCF_000186245.1:WP_013553340.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5bshA Crystal structure of medicago truncatula (delta)1-pyrroline-5- carboxylate reductase (mtp5cr) in complex with l-proline (see paper)
34% identity, 98% coverage: 5:246/248 of query aligns to 13:271/272 of 5bshA

query
sites
5bshA
L
 
F
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
N
 
K
M
 
M
G
 
A
G
 
E
A
 
S
M
 
I
L
 
A
E
 
K
G
 
G
L
 
A
R
 
V
E
 
R
Y
 
S
D
 
G
V
 
V
-
 
L
-
 
S
-
 
P
-
 
S
-
 
R
-
 
I
-
 
K
T
 
T
V
 
A
V
 
I
E
 
H
A
 
S
Y
 
N
E
 
P
P
 
A
R
 
R
R
 
R
K
 
T
E
 
A
L
 
F
A
 
E
A
 
S
L
 
I
Y
 
G
P
 
I
N
 
T
I
 
V
T
 
L
L
 
S
Q
 
S
N
 
N
T
 
D
I
 
D
P
 
V
P
 
V
L
 
R
D
 
D
G
 
S
Y
 
N
V
 
V
V
 
V
L
 
V
L
 
F
A
 
S
I
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
Q
S
 
L
L
 
L
D
 
K
A
 
D
L
 
V
E
 
V
V
 
L
E
 
K
-
 
L
-
 
K
-
 
P
-
 
L
-
 
L
G
 
T
R
 
K
A
 
D
E
 
K
A
 
L
L
 
L
I
 
V
S
 
S
I
 
V
L
 
A
A
 
A
G
 
G
T
 
I
P
 
K
L
 
M
A
 
K
R
 
D
L
 
L
K
 
Q
E
 
E
K
 
W
I
 
A
D
 
G
A
 
H
E
 
E
A
 
R
Y
 
F
I
 
I
R
 
R
A
 
V
M
 
M
P
 
P
N
 
N
I
 
T
A
 
A
A
 
A
L
 
T
-
 
V
-
 
G
K
 
E
R
 
A
K
 
A
S
 
S
V
 
V
T
 
M
S
 
S
V
 
L
T
 
G
G
 
G
D
 
A
E
 
A
S
 
T
F
 
E
K
 
E
E
 
D
E
 
A
A
 
N
L
 
L
-
 
I
-
 
S
K
 
Q
I
 
L
L
 
F
S
 
G
S
 
S
I
 
I
G
 
G
K
 
K
A
 
-
I
 
I
W
 
W
L
 
K
N
 
A
S
 
D
E
 
D
K
 
K
E
 
Y
L
 
F
D
 
D
I
 
A
A
 
I
T
 
T
G
 
G
I
 
L
G
 
S
G
 
G
S
 
S
A
 
G
P
 
P
A
 
A
W
 
Y
M
 
I
A
 
Y
L
 
L
V
 
A
A
 
I
E
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
G
 
G
A
 
G
V
 
V
N
 
A
L
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
A
 
D
V
 
L
S
 
A
Y
 
L
E
 
S
Y
 
L
V
 
A
A
 
S
A
 
Q
L
 
T
M
 
V
D
 
L
G
 
G
M
 
A
G
 
A
A
 
S
L
 
M
L
 
A
E
 
T
E
 
Q
-
 
S
-
 
G
E
 
K
H
 
H
P
 
P
A
 
G
L
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
K
 
D
V
|
V
M
 
T
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
|
T
T
|
T
A
 
I
A
 
A
G
 
G
Y
 
V
A
 
H
K
 
E
L
 
L
E
 
E
E
 
K
G
 
A
G
 
G
V
 
F
R
 
R
D
 
G
S
 
I
F
 
L
I
 
M
K
 
N
A
 
A
M
 
V
E
 
V
A
 
A
C
 
A
Y
 
A
R
 
K
R
 
R
S
 
S
L
 
Q
E
 
E
L
 
L

5bsgA Crystal structure of medicago truncatula (delta)1-pyrroline-5- carboxylate reductase (mtp5cr) in complex with NADP+ (see paper)
34% identity, 98% coverage: 5:246/248 of query aligns to 13:271/272 of 5bsgA

query
sites
5bsgA
L
 
F
I
 
I
G
|
G
A
 
A
G
|
G
N
x
K
M
|
M
G
 
A
G
 
E
A
 
S
M
 
I
L
 
A
E
 
K
G
 
G
L
 
A
R
 
V
E
 
R
Y
 
S
D
 
G
V
 
V
-
 
L
-
 
S
-
 
P
-
 
S
-
 
R
-
 
I
-
 
K
T
 
T
V
 
A
V
 
I
E
x
H
A
x
S
Y
x
N
E
 
P
P
 
A
R
 
R
R
 
R
K
 
T
E
 
A
L
 
F
A
 
E
A
 
S
L
 
I
Y
 
G
P
 
I
N
 
T
I
 
V
T
 
L
L
 
S
Q
 
S
N
|
N
T
 
D
I
 
D
P
 
V
P
 
V
L
 
R
D
 
D
G
 
S
Y
 
N
V
 
V
V
 
V
L
 
V
L
 
F
A
x
S
I
x
V
K
|
K
P
 
P
Q
 
Q
S
x
L
L
 
L
D
 
K
A
 
D
L
x
V
E
 
V
V
 
L
E
 
K
-
 
L
-
 
K
-
 
P
-
 
L
-
 
L
G
 
T
R
 
K
A
 
D
E
 
K
A
 
L
L
 
L
I
 
V
S
 
S
I
x
V
L
x
A
A
|
A
G
 
G
T
 
I
P
 
K
L
 
M
A
 
K
R
 
D
L
 
L
K
 
Q
E
 
E
K
 
W
I
 
A
D
 
G
A
 
H
E
 
E
A
 
R
Y
 
F
I
 
I
R
 
R
A
 
V
M
 
M
P
|
P
N
 
N
I
 
T
A
 
A
A
 
A
L
 
T
-
 
V
-
 
G
K
 
E
R
 
A
K
 
A
S
 
S
V
 
V
T
 
M
S
 
S
V
 
L
T
 
G
G
 
G
D
 
A
E
 
A
S
 
T
F
 
E
K
 
E
E
 
D
E
 
A
A
 
N
L
 
L
-
 
I
-
 
S
K
 
Q
I
 
L
L
 
F
S
 
G
S
 
S
I
 
I
G
 
G
K
 
K
A
 
-
I
 
I
W
 
W
L
 
K
N
 
A
S
 
D
E
 
D
K
 
K
E
 
Y
L
 
F
D
 
D
I
 
A
A
 
I
T
 
T
G
 
G
I
 
L
G
 
S
G
 
G
S
 
S
A
 
G
P
 
P
A
 
A
W
 
Y
M
 
I
A
 
Y
L
 
L
V
 
A
A
 
I
E
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
G
 
G
A
 
G
V
 
V
N
 
A
L
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
A
 
D
V
 
L
S
 
A
Y
 
L
E
 
S
Y
 
L
V
 
A
A
 
S
A
 
Q
L
 
T
M
 
V
D
 
L
G
 
G
M
 
A
G
 
A
A
 
S
L
 
M
L
 
A
E
 
T
E
 
Q
-
 
S
-
 
G
E
 
K
H
 
H
P
 
P
A
 
G
L
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
K
 
D
V
 
V
M
 
T
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
T
T
|
T
A
 
I
A
 
A
G
 
G
Y
 
V
A
 
H
K
 
E
L
 
L
E
 
E
E
 
K
G
 
A
G
 
G
V
 
F
R
 
R
D
 
G
S
 
I
F
 
L
I
 
M
K
 
N
A
 
A
M
 
V
E
 
V
A
 
A
C
 
A
Y
 
A
R
 
K
R
 
R
S
 
S
L
 
Q
E
 
E
L
 
L

5bsfA Crystal structure of medicago truncatula (delta)1-pyrroline-5- carboxylate reductase (mtp5cr) in complex with NAD+ (see paper)
34% identity, 98% coverage: 5:246/248 of query aligns to 13:271/272 of 5bsfA

query
sites
5bsfA
L
 
F
I
 
I
G
|
G
A
 
A
G
|
G
N
x
K
M
|
M
G
 
A
G
 
E
A
 
S
M
 
I
L
 
A
E
 
K
G
 
G
L
 
A
R
 
V
E
 
R
Y
 
S
D
 
G
V
 
V
-
 
L
-
 
S
-
 
P
-
 
S
-
 
R
-
 
I
-
 
K
T
 
T
V
 
A
V
 
I
E
x
H
A
 
S
Y
 
N
E
 
P
P
 
A
R
 
R
R
 
R
K
 
T
E
 
A
L
 
F
A
 
E
A
 
S
L
 
I
Y
 
G
P
 
I
N
 
T
I
 
V
T
 
L
L
 
S
Q
 
S
N
|
N
T
 
D
I
 
D
P
 
V
P
 
V
L
 
R
D
 
D
G
 
S
Y
 
N
V
 
V
V
 
V
L
 
V
L
 
F
A
x
S
I
x
V
K
|
K
P
 
P
Q
 
Q
S
x
L
L
 
L
D
 
K
A
 
D
L
x
V
E
 
V
V
 
L
E
 
K
-
 
L
-
 
K
-
 
P
-
 
L
-
 
L
G
 
T
R
 
K
A
 
D
E
 
K
A
 
L
L
 
L
I
 
V
S
 
S
I
x
V
L
 
A
A
|
A
G
 
G
T
 
I
P
 
K
L
 
M
A
 
K
R
 
D
L
 
L
K
 
Q
E
 
E
K
 
W
I
 
A
D
 
G
A
 
H
E
 
E
A
 
R
Y
 
F
I
 
I
R
 
R
A
 
V
M
 
M
P
|
P
N
 
N
I
 
T
A
 
A
A
 
A
L
 
T
-
 
V
-
 
G
K
 
E
R
 
A
K
 
A
S
 
S
V
 
V
T
 
M
S
 
S
V
 
L
T
 
G
G
 
G
D
 
A
E
 
A
S
 
T
F
 
E
K
 
E
E
 
D
E
 
A
A
 
N
L
 
L
-
 
I
-
 
S
K
 
Q
I
 
L
L
 
F
S
 
G
S
 
S
I
 
I
G
 
G
K
 
K
A
 
-
I
 
I
W
 
W
L
 
K
N
 
A
S
 
D
E
 
D
K
 
K
E
 
Y
L
 
F
D
 
D
I
 
A
A
 
I
T
 
T
G
 
G
I
 
L
G
 
S
G
 
G
S
 
S
A
 
G
P
 
P
A
 
A
W
 
Y
M
 
I
A
 
Y
L
 
L
V
 
A
A
 
I
E
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
G
 
G
A
 
G
V
 
V
N
 
A
L
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
A
 
D
V
 
L
S
 
A
Y
 
L
E
 
S
Y
 
L
V
 
A
A
 
S
A
 
Q
L
 
T
M
 
V
D
 
L
G
 
G
M
 
A
G
 
A
A
 
S
L
 
M
L
 
A
E
 
T
E
 
Q
-
 
S
-
 
G
E
 
K
H
 
H
P
 
P
A
 
G
L
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
K
 
D
V
 
V
M
 
T
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
T
T
|
T
A
 
I
A
 
A
G
 
G
Y
 
V
A
 
H
K
 
E
L
 
L
E
 
E
E
 
K
G
 
A
G
 
G
V
 
F
R
 
R
D
 
G
S
 
I
F
 
L
I
 
M
K
 
N
A
 
A
M
 
V
E
 
V
A
 
A
C
 
A
Y
 
A
R
 
K
R
 
R
S
 
S
L
 
Q
E
 
E
L
 
L

5bseA Crystal structure of medicago truncatula (delta)1-pyrroline-5- carboxylate reductase (mtp5cr) (see paper)
34% identity, 98% coverage: 5:246/248 of query aligns to 13:271/272 of 5bseA

query
sites
5bseA
L
 
F
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
N
 
K
M
 
M
G
 
A
G
 
E
A
 
S
M
 
I
L
 
A
E
 
K
G
 
G
L
 
A
R
 
V
E
 
R
Y
 
S
D
 
G
V
 
V
-
 
L
-
 
S
-
 
P
-
 
S
-
 
R
-
 
I
-
 
K
T
 
T
V
 
A
V
 
I
E
 
H
A
 
S
Y
 
N
E
 
P
P
 
A
R
 
R
R
 
R
K
 
T
E
 
A
L
 
F
A
 
E
A
 
S
L
 
I
Y
 
G
P
 
I
N
 
T
I
 
V
T
 
L
L
 
S
Q
 
S
N
 
N
T
 
D
I
 
D
P
 
V
P
 
V
L
 
R
D
 
D
G
 
S
Y
 
N
V
 
V
V
 
V
L
 
V
L
 
F
A
 
S
I
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
Q
S
 
L
L
 
L
D
 
K
A
 
D
L
 
V
E
 
V
V
 
L
E
 
K
-
 
L
-
 
K
-
 
P
-
 
L
-
 
L
G
 
T
R
 
K
A
 
D
E
 
K
A
 
L
L
 
L
I
 
V
S
 
S
I
 
V
L
 
A
A
 
A
G
 
G
T
 
I
P
 
K
L
 
M
A
 
K
R
 
D
L
 
L
K
 
Q
E
 
E
K
 
W
I
 
A
D
 
G
A
 
H
E
 
E
A
 
R
Y
 
F
I
 
I
R
 
R
A
 
V
M
 
M
P
 
P
N
 
N
I
 
T
A
 
A
A
 
A
L
 
T
-
 
V
-
 
G
K
 
E
R
 
A
K
 
A
S
 
S
V
 
V
T
 
M
S
 
S
V
 
L
T
 
G
G
 
G
D
 
A
E
 
A
S
 
T
F
 
E
K
 
E
E
 
D
E
 
A
A
 
N
L
 
L
-
 
I
-
 
S
K
 
Q
I
 
L
L
 
F
S
 
G
S
 
S
I
 
I
G
 
G
K
 
K
A
 
-
I
 
I
W
 
W
L
 
K
N
 
A
S
 
D
E
 
D
K
 
K
E
 
Y
L
 
F
D
 
D
I
 
A
A
 
I
T
 
T
G
 
G
I
 
L
G
 
S
G
 
G
S
 
S
A
 
G
P
 
P
A
 
A
W
 
Y
M
 
I
A
 
Y
L
 
L
V
 
A
A
 
I
E
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
G
 
G
A
 
G
V
 
V
N
 
A
L
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
A
 
D
V
 
L
S
 
A
Y
 
L
E
 
S
Y
 
L
V
 
A
A
 
S
A
 
Q
L
 
T
M
 
V
D
 
L
G
 
G
M
 
A
G
 
A
A
 
S
L
 
M
L
 
A
E
 
T
E
 
Q
-
 
S
-
 
G
E
 
K
H
 
H
P
 
P
A
 
G
L
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
K
 
D
V
 
V
M
 
T
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
T
T
|
T
A
 
I
A
 
A
G
 
G
Y
 
V
A
 
H
K
 
E
L
 
L
E
 
E
E
 
K
G
 
A
G
 
G
V
 
F
R
 
R
D
 
G
S
 
I
F
 
L
I
 
M
K
 
N
A
 
A
M
 
V
E
 
V
A
 
A
C
 
A
Y
 
A
R
 
K
R
 
R
S
 
S
L
 
Q
E
 
E
L
 
L

Q96C36 Pyrroline-5-carboxylate reductase 2; P5C reductase 2; P5CR 2; EC 1.5.1.2 from Homo sapiens (Human) (see paper)
30% identity, 99% coverage: 1:246/248 of query aligns to 1:268/320 of Q96C36

query
sites
Q96C36
M
|
M
K
x
S
I
 
V
L
 
G
L
 
F
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
 
L
G
 
A
G
 
Y
A
 
A
M
 
L
L
 
A
E
 
R
G
 
G
L
 
F
R
 
T
E
 
A
Y
 
A
D
 
G
V
 
I
-
 
L
-
 
S
-
 
A
-
 
H
-
 
K
-
 
I
-
 
I
-
 
A
T
 
S
V
 
S
V
 
P
E
 
E
A
 
M
Y
 
N
E
 
L
P
 
P
R
 
T
R
 
V
K
 
S
E
 
A
L
 
L
A
 
R
A
 
K
L
 
M
Y
 
G
P
 
V
N
 
N
I
 
L
T
 
T
L
 
R
Q
 
S
N
 
N
T
 
K
I
 
E
P
 
T
P
 
V
L
 
K
D
 
H
G
 
S
Y
 
D
V
 
V
V
 
L
L
 
F
L
 
L
A
 
A
I
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
S
 
I
L
 
I
D
 
P
A
 
F
L
 
I
-
 
L
-
 
D
-
 
E
-
 
I
-
 
G
-
 
A
E
 
D
V
 
V
E
 
Q
G
 
A
R
 
R
A
 
-
E
 
H
A
 
I
L
 
V
I
 
V
S
 
S
I
 
C
L
 
A
A
 
A
G
 
G
T
 
V
P
 
T
L
 
I
A
 
S
R
 
S
L
 
V
K
 
E
E
 
K
K
 
K
I
 
L
-
 
M
-
 
A
-
 
F
-
 
Q
D
 
P
A
 
A
E
 
P
A
 
K
Y
 
V
I
 
I
R
|
R
A
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
I
 
T
A
 
P
A
 
V
L
 
V
K
 
V
R
 
Q
K
 
E
S
 
G
V
 
A
T
 
T
S
 
V
-
 
Y
V
 
A
T
 
T
G
 
G
D
 
T
E
 
H
S
 
A
F
 
L
K
 
V
E
 
E
E
 
D
A
 
G
L
 
Q
-
 
L
-
 
L
-
 
E
K
 
Q
I
 
L
L
 
M
S
 
S
S
 
S
I
 
V
G
 
G
K
 
F
A
 
C
I
 
T
W
 
E
L
 
V
N
 
E
S
 
-
E
 
E
K
 
D
E
 
L
L
 
I
D
 
D
I
 
A
A
 
V
T
 
T
G
 
G
I
 
L
G
 
S
G
 
G
S
 
S
A
 
G
P
 
P
A
 
A
W
 
Y
M
 
A
A
 
F
L
 
M
V
 
A
A
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
G
 
G
A
 
G
V
 
V
N
 
K
L
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
A
 
R
V
 
L
S
 
A
Y
 
I
E
 
Q
Y
 
L
V
 
G
A
 
A
A
 
Q
L
 
A
M
 
L
D
 
L
G
 
G
M
 
A
G
 
A
A
 
K
L
 
M
L
 
L
-
 
L
-
 
D
E
 
S
E
 
E
E
 
Q
H
 
H
P
 
P
A
 
C
L
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
K
 
N
V
 
V
M
 
C
S
 
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
A
 
I
A
 
H
G
 
A
Y
 
L
A
 
H
K
 
F
L
 
L
E
 
E
E
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
F
R
|
R
D
 
S
S
 
L
F
 
L
I
 
I
K
 
N
A
 
A
M
 
V
E
 
E
A
 
A
C
 
S
Y
 
C
R
 
I
R
 
R
S
 
T
L
 
R
E
 
E
L
 
L

2ahrE Crystal structures of 1-pyrroline-5-carboxylate reductase from human pathogen streptococcus pyogenes (see paper)
31% identity, 99% coverage: 1:246/248 of query aligns to 4:259/259 of 2ahrE

query
sites
2ahrE
M
 
M
K
 
K
I
 
I
L
 
G
L
 
I
I
 
I
G
 
G
A
 
V
G
|
G
N
x
K
M
|
M
G
 
A
G
 
S
A
 
A
M
 
I
L
 
I
E
 
K
G
 
G
L
 
L
R
 
K
E
 
Q
-
 
T
-
 
P
Y
 
H
D
 
E
V
 
L
T
 
I
V
 
I
V
 
S
E
x
G
A
x
S
Y
 
S
E
 
L
P
 
E
R
|
R
R
 
S
K
 
K
E
 
E
L
 
I
A
 
A
-
 
E
-
 
Q
-
 
L
A
 
A
L
 
L
Y
 
P
P
 
Y
N
 
A
I
 
M
T
 
S
L
x
H
Q
 
Q
N
 
D
T
 
L
I
 
I
P
 
D
P
 
Q
L
 
V
D
 
D
G
 
-
Y
 
-
V
 
L
V
 
V
L
 
I
L
 
L
A
 
G
I
|
I
K
 
K
P
|
P
Q
 
Q
S
x
L
L
 
F
D
 
E
A
 
T
-
 
V
L
 
L
E
 
K
V
 
P
E
 
L
G
 
H
R
 
F
A
 
K
E
 
Q
A
 
P
L
 
I
I
 
I
S
 
S
I
x
M
L
x
A
A
|
A
G
 
G
T
 
I
P
 
S
L
 
L
A
 
Q
R
 
R
L
 
L
K
 
A
E
 
T
K
 
F
I
 
V
D
 
G
A
 
Q
E
 
D
-
 
L
A
 
P
Y
 
L
I
 
L
R
 
R
A
 
I
M
|
M
P
|
P
N
 
N
I
 
M
A
 
N
A
 
A
L
 
Q
K
 
I
R
 
L
K
 
Q
S
 
S
V
 
S
T
 
T
S
 
A
V
 
L
T
 
T
G
 
G
D
 
N
-
 
A
-
 
L
-
 
V
-
 
S
E
 
Q
S
 
E
F
 
L
K
 
Q
E
 
A
E
 
R
A
 
V
L
 
R
K
 
D
I
 
L
L
 
T
S
 
D
S
 
S
I
 
F
G
 
G
K
 
S
A
 
T
I
 
F
W
 
D
L
 
I
N
 
-
S
 
S
E
 
E
K
 
K
E
 
D
L
 
F
D
 
D
I
 
T
A
 
F
T
 
T
G
 
A
I
 
L
G
 
A
G
 
G
S
 
S
A
 
S
P
 
P
A
 
A
W
 
Y
M
 
I
A
 
Y
L
 
L
V
 
F
A
 
I
E
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
K
G
 
A
A
 
G
V
 
V
N
 
K
L
 
N
G
 
G
L
 
I
P
 
P
R
 
K
A
 
A
V
 
K
S
 
A
Y
 
L
E
 
E
Y
 
I
V
 
V
A
 
T
A
 
Q
L
 
T
M
 
V
D
 
L
G
 
A
M
 
S
G
 
A
A
 
S
L
 
N
L
 
L
E
 
K
-
 
T
-
 
S
E
 
S
E
 
Q
H
 
S
P
 
P
A
 
H
L
 
D
L
 
F
K
 
I
D
 
D
K
 
A
V
 
I
M
 
C
S
 
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
T
T
 
T
A
 
I
A
 
A
G
 
G
Y
 
L
A
 
M
K
 
E
L
 
L
E
 
E
E
 
R
G
 
L
G
 
G
V
 
L
R
 
T
D
 
A
S
 
T
F
 
V
I
 
S
K
 
S
A
 
A
M
 
I
E
 
D
A
 
K
C
 
T
Y
 
I
R
 
D
R
 
K
S
 
A
L
 
K
E
 
S
L
 
L

2amfA Crystal structure of 1-pyrroline-5-carboxylate reductase from human pathogen streptococcus pyogenes (see paper)
31% identity, 99% coverage: 1:246/248 of query aligns to 2:257/257 of 2amfA

query
sites
2amfA
M
 
M
K
 
K
I
 
I
L
 
G
L
 
I
I
 
I
G
 
G
A
 
V
G
 
G
N
 
K
M
|
M
G
 
A
G
 
S
A
 
A
M
 
I
L
 
I
E
 
K
G
 
G
L
 
L
R
 
K
E
 
Q
-
 
T
-
 
P
Y
 
H
D
 
E
V
 
L
T
 
I
V
 
I
V
 
S
E
 
G
A
 
S
Y
 
S
E
 
L
P
 
E
R
 
R
R
 
S
K
 
K
E
 
E
L
 
I
A
 
A
-
 
E
-
 
Q
-
 
L
A
 
A
L
 
L
Y
 
P
P
 
Y
N
 
A
I
 
M
T
 
S
L
 
H
Q
 
Q
N
 
D
T
 
L
I
 
I
P
 
D
P
 
Q
L
 
V
D
 
D
G
 
-
Y
 
-
V
 
L
V
 
V
L
 
I
L
 
L
A
 
G
I
 
I
K
 
K
P
 
P
Q
 
Q
S
 
L
L
 
F
D
 
E
A
 
T
-
 
V
L
 
L
E
 
K
V
 
P
E
 
L
G
 
H
R
 
F
A
 
K
E
 
Q
A
 
P
L
 
I
I
 
I
S
 
S
I
 
M
L
 
A
A
 
A
G
 
G
T
 
I
P
 
S
L
 
L
A
 
Q
R
 
R
L
 
L
K
 
A
E
 
T
K
 
F
I
 
V
D
 
G
A
 
Q
E
 
D
-
 
L
A
 
P
Y
 
L
I
 
L
R
 
R
A
 
I
M
|
M
P
|
P
N
 
N
I
 
M
A
 
N
A
 
A
L
 
Q
K
 
I
R
 
L
K
 
Q
S
 
S
V
 
S
T
 
T
S
 
A
V
 
L
T
 
T
G
 
G
D
 
N
-
 
A
-
 
L
-
 
V
-
 
S
E
 
Q
S
 
E
F
 
L
K
 
Q
E
 
A
E
 
R
A
 
V
L
 
R
K
 
D
I
 
L
L
 
T
S
 
D
S
 
S
I
 
F
G
 
G
K
 
S
A
 
T
I
 
F
W
 
D
L
 
I
N
 
-
S
 
S
E
 
E
K
 
K
E
 
D
L
 
F
D
 
D
I
 
T
A
 
F
T
 
T
G
 
A
I
 
L
G
 
A
G
 
G
S
 
S
A
 
S
P
 
P
A
 
A
W
 
Y
M
 
I
A
 
Y
L
 
L
V
 
F
A
 
I
E
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
K
G
 
A
A
 
G
V
 
V
N
 
K
L
 
N
G
 
G
L
 
I
P
 
P
R
 
K
A
 
A
V
 
K
S
 
A
Y
 
L
E
 
E
Y
 
I
V
 
V
A
 
T
A
 
Q
L
 
T
M
 
V
D
 
L
G
 
A
M
 
S
G
 
A
A
 
S
L
 
N
L
 
L
E
 
K
-
 
T
-
 
S
E
 
S
E
 
Q
H
 
S
P
 
P
A
 
H
L
 
D
L
 
F
K
 
I
D
 
D
K
 
A
V
 
I
M
 
C
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
|
G
T
|
T
T
|
T
A
 
I
A
 
A
G
 
G
Y
 
L
A
 
M
K
 
E
L
 
L
E
 
E
E
 
R
G
 
L
G
 
G
V
 
L
R
 
T
D
 
A
S
 
T
F
 
V
I
 
S
K
 
S
A
 
A
M
 
I
E
 
D
A
 
K
C
 
T
Y
 
I
R
 
D
R
 
K
S
 
A
L
 
K
E
 
S
L
 
L

5uauA Structure of human pycr-1 complexed with proline (see paper)
32% identity, 99% coverage: 1:246/248 of query aligns to 1:268/274 of 5uauA

query
sites
5uauA
M
 
M
K
 
S
I
 
V
L
 
G
L
 
F
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
 
L
G
 
A
G
 
F
A
 
A
M
 
L
L
 
A
E
 
K
G
 
G
L
 
F
R
 
T
-
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
V
-
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
H
-
 
K
-
 
I
-
 
M
-
 
A
-
 
S
-
 
S
-
 
P
E
 
D
Y
 
M
D
 
D
V
 
L
T
 
A
V
 
T
V
 
V
E
 
S
A
 
A
Y
 
L
E
 
-
P
 
-
R
 
-
R
 
R
K
 
K
E
 
M
L
 
G
A
 
V
A
 
K
L
 
L
Y
 
T
P
 
P
N
 
H
I
 
N
T
 
-
L
 
-
Q
 
K
N
 
E
T
 
T
I
 
V
P
 
Q
P
 
H
L
 
S
D
 
D
G
 
-
Y
 
-
V
 
V
V
 
L
L
 
F
L
 
L
A
 
A
I
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
S
 
I
-
 
I
-
 
P
-
 
F
-
 
I
L
 
L
D
 
D
A
 
E
L
 
I
-
 
G
-
 
A
E
 
D
V
 
I
E
 
E
G
 
D
R
 
R
A
 
-
E
 
H
A
 
I
L
 
V
I
 
V
S
 
S
I
 
C
L
 
A
A
 
A
G
 
G
T
 
V
P
 
T
L
 
I
A
 
S
R
 
S
L
 
I
K
 
E
E
 
K
K
 
K
I
 
L
D
 
S
A
 
A
-
 
F
-
 
R
-
 
P
-
 
A
E
 
P
A
 
R
Y
 
V
I
 
I
R
 
R
A
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
I
 
T
A
 
P
A
 
V
L
 
V
K
 
V
R
 
R
K
 
E
S
 
G
V
 
A
T
 
T
S
 
V
-
 
Y
V
 
A
T
|
T
G
 
G
D
 
T
E
 
H
S
 
A
F
 
Q
K
 
V
E
 
E
E
 
D
A
 
G
L
 
R
-
 
L
-
 
M
-
 
E
K
 
Q
I
 
L
L
 
L
S
 
S
S
 
S
I
 
V
G
 
G
K
 
F
A
 
C
I
 
T
W
 
E
L
 
V
N
x
E
S
 
-
E
|
E
K
 
D
E
 
L
L
 
I
D
 
D
I
 
A
A
 
V
T
 
T
G
 
G
I
 
L
G
 
S
G
 
G
S
 
S
A
 
G
P
 
P
A
 
A
W
 
Y
M
 
A
A
 
F
L
 
T
V
 
A
A
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
G
 
G
A
 
G
V
 
V
N
 
K
L
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
A
 
R
V
 
L
S
 
A
Y
 
V
E
 
R
Y
 
L
V
 
G
A
 
A
A
 
Q
L
 
A
M
 
L
D
 
L
G
 
G
M
 
A
G
 
A
A
 
K
L
 
M
L
 
L
-
 
L
-
 
H
E
 
S
E
 
E
E
 
Q
H
 
H
P
 
P
A
 
G
L
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
K
 
N
V
 
V
M
 
S
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
x
A
T
|
T
A
 
I
A
 
H
G
 
A
Y
 
L
A
 
H
K
 
V
L
 
L
E
 
E
E
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
F
R
 
R
D
 
S
S
 
L
F
 
L
I
 
I
K
 
N
A
 
A
M
 
V
E
 
E
A
 
A
C
 
S
Y
 
C
R
 
I
R
 
R
S
 
T
L
 
R
E
 
E
L
 
L

8td4A Structure of pycr1 complexed with nadh and 1,3-dithiolane-2-carboxylic acid
32% identity, 99% coverage: 1:246/248 of query aligns to 4:271/279 of 8td4A

query
sites
8td4A
M
 
M
K
 
S
I
 
V
L
 
G
L
 
F
I
 
I
G
|
G
A
|
A
G
|
G
N
x
Q
M
x
L
G
 
A
G
 
F
A
 
A
M
 
L
L
 
A
E
 
K
G
 
G
L
 
F
R
 
T
-
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
V
-
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
H
-
 
K
-
 
I
-
 
M
-
 
A
-
 
S
-
x
S
-
x
P
E
 
D
Y
 
M
D
 
D
V
x
L
T
 
A
V
 
T
V
 
V
E
 
S
A
 
A
Y
 
L
E
 
-
P
 
-
R
 
-
R
 
R
K
 
K
E
 
M
L
 
G
A
 
V
A
 
K
L
 
L
Y
 
T
P
 
P
N
 
H
I
x
N
T
 
-
L
 
-
Q
 
K
N
 
E
T
 
T
I
 
V
P
 
Q
P
 
H
L
 
S
D
 
D
G
 
-
Y
 
-
V
 
V
V
 
L
L
 
F
L
 
L
A
|
A
I
x
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
S
 
I
-
 
I
-
 
P
-
 
F
-
x
I
L
 
L
D
 
D
A
 
E
L
 
I
-
 
G
-
 
A
E
 
D
V
 
I
E
 
E
G
 
D
R
 
R
A
 
-
E
 
H
A
 
I
L
 
V
I
 
V
S
 
S
I
x
C
L
x
A
A
|
A
G
 
G
T
 
V
P
 
T
L
 
I
A
 
S
R
 
S
L
 
I
K
 
E
E
 
K
K
 
K
I
 
L
D
 
S
A
 
A
-
 
F
-
 
R
-
 
P
-
 
A
E
 
P
A
 
R
Y
 
V
I
 
I
R
 
R
A
 
C
M
|
M
P
x
T
N
 
N
I
x
T
A
 
P
A
 
V
L
 
V
K
 
V
R
 
R
K
 
E
S
 
G
V
 
A
T
 
T
S
 
V
-
 
Y
V
 
A
T
 
T
G
 
G
D
 
T
E
 
H
S
 
A
F
 
Q
K
 
V
E
 
E
E
 
D
A
 
G
L
 
R
-
 
L
-
 
M
-
 
E
K
 
Q
I
 
L
L
 
L
S
 
S
S
 
S
I
 
V
G
 
G
K
 
F
A
 
C
I
 
T
W
 
E
L
 
V
N
 
E
S
 
-
E
 
E
K
 
D
E
 
L
L
 
I
D
 
D
I
 
A
A
 
V
T
 
T
G
 
G
I
 
L
G
 
S
G
 
G
S
 
S
A
 
G
P
 
P
A
 
A
W
 
Y
M
 
A
A
 
F
L
 
T
V
 
A
A
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
G
 
G
A
 
G
V
 
V
N
 
K
L
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
A
 
R
V
 
L
S
 
A
Y
 
V
E
 
R
Y
 
L
V
 
G
A
 
A
A
 
Q
L
 
A
M
 
L
D
 
L
G
 
G
M
 
A
G
 
A
A
 
K
L
 
M
L
 
L
-
 
L
-
 
H
E
 
S
E
 
E
E
 
Q
H
 
H
P
 
P
A
 
G
L
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
K
 
N
V
|
V
M
 
S
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
x
A
T
|
T
A
 
I
A
 
H
G
 
A
Y
 
L
A
 
H
K
 
V
L
 
L
E
 
E
E
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
F
R
 
R
D
 
S
S
 
L
F
 
L
I
 
I
K
 
N
A
 
A
M
 
V
E
 
E
A
 
A
C
 
S
Y
 
C
R
 
I
R
 
R
S
 
T
L
 
R
E
 
E
L
 
L

8tdbA Structure of pycr1 complexed with nadh and 1-hydroxyethane-1-sulfonate
32% identity, 99% coverage: 1:246/248 of query aligns to 1:268/275 of 8tdbA

query
sites
8tdbA
M
 
M
K
 
S
I
 
V
L
 
G
L
 
F
I
 
I
G
|
G
A
|
A
G
|
G
N
x
Q
M
x
L
G
 
A
G
 
F
A
 
A
M
 
L
L
 
A
E
 
K
G
 
G
L
 
F
R
 
T
-
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
V
-
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
H
-
 
K
-
 
I
-
 
M
-
 
A
-
 
S
-
x
S
-
x
P
E
 
D
Y
 
M
D
 
D
V
 
L
T
 
A
V
 
T
V
 
V
E
 
S
A
 
A
Y
 
L
E
 
-
P
 
-
R
 
-
R
 
R
K
 
K
E
 
M
L
 
G
A
 
V
A
 
K
L
 
L
Y
 
T
P
 
P
N
 
H
I
x
N
T
 
-
L
 
-
Q
 
K
N
 
E
T
 
T
I
 
V
P
 
Q
P
 
H
L
 
S
D
 
D
G
 
-
Y
 
-
V
 
V
V
 
L
L
 
F
L
 
L
A
 
A
I
x
V
K
|
K
P
|
P
Q
 
H
S
 
I
-
 
I
-
 
P
-
 
F
-
x
I
L
 
L
D
 
D
A
 
E
L
 
I
-
 
G
-
 
A
E
 
D
V
 
I
E
 
E
G
 
D
R
 
R
A
 
-
E
 
H
A
 
I
L
 
V
I
 
V
S
 
S
I
 
C
L
x
A
A
|
A
G
 
G
T
 
V
P
 
T
L
 
I
A
 
S
R
 
S
L
 
I
K
 
E
E
 
K
K
 
K
I
 
L
D
 
S
A
 
A
-
 
F
-
 
R
-
 
P
-
 
A
E
 
P
A
 
R
Y
 
V
I
 
I
R
 
R
A
 
C
M
 
M
P
x
T
N
 
N
I
x
T
A
 
P
A
 
V
L
 
V
K
 
V
R
 
R
K
 
E
S
 
G
V
 
A
T
 
T
S
 
V
-
 
Y
V
 
A
T
 
T
G
 
G
D
 
T
E
 
H
S
 
A
F
 
Q
K
 
V
E
 
E
E
 
D
A
 
G
L
 
R
-
 
L
-
 
M
-
 
E
K
 
Q
I
 
L
L
 
L
S
 
S
S
 
S
I
 
V
G
 
G
K
 
F
A
 
C
I
 
T
W
 
E
L
 
V
N
 
E
S
 
-
E
 
E
K
 
D
E
 
L
L
 
I
D
 
D
I
 
A
A
 
V
T
 
T
G
 
G
I
 
L
G
 
S
G
 
G
S
 
S
A
 
G
P
 
P
A
 
A
W
 
Y
M
 
A
A
 
F
L
 
T
V
 
A
A
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
G
 
G
A
 
G
V
 
V
N
 
K
L
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
A
 
R
V
 
L
S
 
A
Y
 
V
E
 
R
Y
 
L
V
 
G
A
 
A
A
 
Q
L
 
A
M
 
L
D
 
L
G
 
G
M
 
A
G
 
A
A
 
K
L
 
M
L
 
L
-
 
L
-
 
H
E
 
S
E
 
E
E
 
Q
H
 
H
P
 
P
A
 
G
L
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
K
 
N
V
|
V
M
 
S
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
|
T
A
 
I
A
 
H
G
 
A
Y
 
L
A
 
H
K
 
V
L
 
L
E
 
E
E
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
F
R
 
R
D
 
S
S
 
L
F
 
L
I
 
I
K
 
N
A
 
A
M
 
V
E
 
E
A
 
A
C
 
S
Y
 
C
R
 
I
R
 
R
S
 
T
L
 
R
E
 
E
L
 
L

8td7A Structure of pycr1 complexed with 2s-hydroxy-3-methylbutyric acid
32% identity, 99% coverage: 1:246/248 of query aligns to 8:275/282 of 8td7A

query
sites
8td7A
M
 
M
K
 
S
I
 
V
L
 
G
L
 
F
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
 
L
G
 
A
G
 
F
A
 
A
M
 
L
L
 
A
E
 
K
G
 
G
L
 
F
R
 
T
-
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
V
-
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
H
-
 
K
-
 
I
-
 
M
-
 
A
-
 
S
-
 
S
-
 
P
E
 
D
Y
 
M
D
 
D
V
 
L
T
 
A
V
 
T
V
 
V
E
 
S
A
 
A
Y
 
L
E
 
-
P
 
-
R
 
-
R
 
R
K
 
K
E
 
M
L
 
G
A
 
V
A
 
K
L
 
L
Y
 
T
P
 
P
N
 
H
I
 
N
T
 
-
L
 
-
Q
 
K
N
 
E
T
 
T
I
 
V
P
 
Q
P
 
H
L
 
S
D
 
D
G
 
-
Y
 
-
V
 
V
V
 
L
L
 
F
L
 
L
A
 
A
I
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
S
 
I
-
 
I
-
 
P
-
 
F
-
 
I
L
 
L
D
 
D
A
 
E
L
 
I
-
 
G
-
 
A
E
 
D
V
 
I
E
 
E
G
 
D
R
 
R
A
 
-
E
 
H
A
 
I
L
 
V
I
 
V
S
 
S
I
 
C
L
 
A
A
 
A
G
 
G
T
 
V
P
 
T
L
 
I
A
 
S
R
 
S
L
 
I
K
 
E
E
 
K
K
 
K
I
 
L
D
 
S
A
 
A
-
 
F
-
 
R
-
 
P
-
 
A
E
 
P
A
 
R
Y
 
V
I
 
I
R
 
R
A
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
I
 
T
A
 
P
A
 
V
L
 
V
K
 
V
R
 
R
K
 
E
S
 
G
V
 
A
T
 
T
S
 
V
-
 
Y
V
 
A
T
 
T
G
 
G
D
 
T
E
 
H
S
 
A
F
 
Q
K
 
V
E
 
E
E
 
D
A
 
G
L
 
R
-
 
L
-
 
M
-
 
E
K
 
Q
I
 
L
L
 
L
S
 
S
S
 
S
I
 
V
G
 
G
K
 
F
A
 
C
I
 
T
W
 
E
L
 
V
N
 
E
S
 
-
E
 
E
K
 
D
E
 
L
L
 
I
D
 
D
I
 
A
A
 
V
T
 
T
G
 
G
I
 
L
G
 
S
G
 
G
S
 
S
A
 
G
P
 
P
A
 
A
W
 
Y
M
 
A
A
 
F
L
 
T
V
 
A
A
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
G
 
G
A
 
G
V
 
V
N
 
K
L
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
A
 
R
V
 
L
S
 
A
Y
 
V
E
 
R
Y
 
L
V
 
G
A
 
A
A
 
Q
L
 
A
M
 
L
D
 
L
G
 
G
M
 
A
G
 
A
A
 
K
L
 
M
L
 
L
-
 
L
-
 
H
E
 
S
E
 
E
E
 
Q
H
 
H
P
 
P
A
 
G
L
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
K
 
N
V
 
V
M
 
S
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
|
T
A
 
I
A
 
H
G
 
A
Y
 
L
A
 
H
K
 
V
L
 
L
E
 
E
E
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
F
R
 
R
D
 
S
S
 
L
F
 
L
I
 
I
K
 
N
A
 
A
M
 
V
E
 
E
A
 
A
C
 
S
Y
 
C
R
 
I
R
 
R
S
 
T
L
 
R
E
 
E
L
 
L

8tcwA Structure of pycr1 complexed with 2-methyl-3-(2-oxoimidazolidin-1-yl) benzoic acid (see paper)
32% identity, 99% coverage: 1:246/248 of query aligns to 8:275/282 of 8tcwA

query
sites
8tcwA
M
 
M
K
 
S
I
 
V
L
 
G
L
 
F
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
 
L
G
 
A
G
 
F
A
 
A
M
 
L
L
 
A
E
 
K
G
 
G
L
 
F
R
 
T
-
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
V
-
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
H
-
 
K
-
 
I
-
 
M
-
 
A
-
 
S
-
 
S
-
 
P
E
 
D
Y
 
M
D
 
D
V
 
L
T
 
A
V
 
T
V
 
V
E
 
S
A
 
A
Y
 
L
E
 
-
P
 
-
R
 
-
R
 
R
K
 
K
E
 
M
L
 
G
A
 
V
A
 
K
L
 
L
Y
 
T
P
 
P
N
 
H
I
 
N
T
 
-
L
 
-
Q
 
K
N
 
E
T
 
T
I
 
V
P
 
Q
P
 
H
L
 
S
D
 
D
G
 
-
Y
 
-
V
 
V
V
 
L
L
 
F
L
 
L
A
 
A
I
x
V
K
 
K
P
|
P
Q
 
H
S
 
I
-
 
I
-
 
P
-
 
F
-
 
I
L
 
L
D
 
D
A
 
E
L
 
I
-
 
G
-
 
A
E
 
D
V
 
I
E
 
E
G
 
D
R
 
R
A
 
-
E
 
H
A
 
I
L
 
V
I
 
V
S
 
S
I
 
C
L
x
A
A
|
A
G
 
G
T
 
V
P
 
T
L
 
I
A
 
S
R
 
S
L
 
I
K
 
E
E
 
K
K
 
K
I
 
L
D
 
S
A
 
A
-
 
F
-
 
R
-
 
P
-
 
A
E
 
P
A
 
R
Y
 
V
I
 
I
R
 
R
A
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
I
 
T
A
 
P
A
 
V
L
 
V
K
 
V
R
 
R
K
 
E
S
 
G
V
 
A
T
 
T
S
 
V
-
 
Y
V
 
A
T
 
T
G
 
G
D
 
T
E
 
H
S
 
A
F
 
Q
K
 
V
E
 
E
E
 
D
A
 
G
L
 
R
-
 
L
-
 
M
-
 
E
K
 
Q
I
 
L
L
 
L
S
 
S
S
 
S
I
 
V
G
 
G
K
 
F
A
 
C
I
 
T
W
 
E
L
 
V
N
 
E
S
 
-
E
 
E
K
 
D
E
 
L
L
 
I
D
 
D
I
 
A
A
 
V
T
 
T
G
 
G
I
 
L
G
 
S
G
 
G
S
 
S
A
 
G
P
 
P
A
 
A
W
 
Y
M
 
A
A
 
F
L
 
T
V
 
A
A
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
G
 
G
A
 
G
V
 
V
N
 
K
L
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
A
 
R
V
 
L
S
 
A
Y
 
V
E
 
R
Y
 
L
V
 
G
A
 
A
A
 
Q
L
 
A
M
 
L
D
 
L
G
 
G
M
 
A
G
 
A
A
 
K
L
 
M
L
 
L
-
 
L
-
 
H
E
 
S
E
 
E
E
 
Q
H
 
H
P
 
P
A
 
G
L
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
K
 
N
V
 
V
M
 
S
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
|
G
T
x
A
T
|
T
A
 
I
A
 
H
G
 
A
Y
 
L
A
 
H
K
 
V
L
 
L
E
 
E
E
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
F
R
 
R
D
 
S
S
 
L
F
 
L
I
 
I
K
 
N
A
 
A
M
 
V
E
 
E
A
 
A
C
 
S
Y
 
C
R
 
I
R
 
R
S
 
T
L
 
R
E
 
E
L
 
L

8td6B Structure of pycr1 complexed with nadh and 2-(methylthio)acetic acid
32% identity, 99% coverage: 1:246/248 of query aligns to 7:274/281 of 8td6B

query
sites
8td6B
M
 
M
K
 
S
I
 
V
L
 
G
L
 
F
I
 
I
G
|
G
A
|
A
G
|
G
N
x
Q
M
x
L
G
 
A
G
 
F
A
 
A
M
 
L
L
 
A
E
 
K
G
 
G
L
 
F
R
 
T
-
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
V
-
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
H
-
 
K
-
 
I
-
 
M
-
 
A
-
 
S
-
 
S
-
x
P
E
 
D
Y
 
M
D
 
D
V
 
L
T
 
A
V
 
T
V
 
V
E
 
S
A
 
A
Y
 
L
E
 
-
P
 
-
R
 
-
R
 
R
K
 
K
E
 
M
L
 
G
A
 
V
A
 
K
L
 
L
Y
 
T
P
 
P
N
 
H
I
x
N
T
 
-
L
 
-
Q
 
K
N
 
E
T
 
T
I
 
V
P
 
Q
P
 
H
L
 
S
D
 
D
G
 
-
Y
 
-
V
 
V
V
 
L
L
 
F
L
 
L
A
|
A
I
x
V
K
|
K
P
 
P
Q
 
H
S
x
I
-
 
I
-
 
P
-
 
F
-
x
I
L
 
L
D
 
D
A
 
E
L
 
I
-
 
G
-
 
A
E
 
D
V
 
I
E
 
E
G
 
D
R
 
R
A
 
-
E
 
H
A
 
I
L
 
V
I
 
V
S
 
S
I
x
C
L
x
A
A
|
A
G
 
G
T
 
V
P
 
T
L
 
I
A
 
S
R
 
S
L
 
I
K
 
E
E
 
K
K
 
K
I
 
L
D
 
S
A
 
A
-
 
F
-
 
R
-
 
P
-
 
A
E
 
P
A
 
R
Y
 
V
I
 
I
R
 
R
A
 
C
M
|
M
P
x
T
N
 
N
I
 
T
A
 
P
A
 
V
L
 
V
K
 
V
R
 
R
K
 
E
S
 
G
V
 
A
T
 
T
S
 
V
-
 
Y
V
 
A
T
 
T
G
 
G
D
 
T
E
 
H
S
 
A
F
 
Q
K
 
V
E
 
E
E
 
D
A
 
G
L
 
R
-
 
L
-
 
M
-
 
E
K
 
Q
I
 
L
L
 
L
S
 
S
S
 
S
I
 
V
G
 
G
K
 
F
A
 
C
I
 
T
W
 
E
L
 
V
N
 
E
S
 
-
E
 
E
K
 
D
E
 
L
L
 
I
D
 
D
I
 
A
A
 
V
T
 
T
G
 
G
I
 
L
G
 
S
G
|
G
S
|
S
A
 
G
P
 
P
A
 
A
W
 
Y
M
 
A
A
 
F
L
 
T
V
 
A
A
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
G
 
G
A
 
G
V
 
V
N
 
K
L
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
A
 
R
V
 
L
S
 
A
Y
 
V
E
 
R
Y
 
L
V
 
G
A
 
A
A
 
Q
L
 
A
M
 
L
D
 
L
G
 
G
M
 
A
G
 
A
A
 
K
L
 
M
L
 
L
-
 
L
-
 
H
E
 
S
E
 
E
E
 
Q
H
 
H
P
 
P
A
 
G
L
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
K
 
N
V
 
V
M
 
S
S
 
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
A
 
I
A
 
H
G
 
A
Y
 
L
A
 
H
K
 
V
L
 
L
E
 
E
E
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
F
R
 
R
D
 
S
S
 
L
F
 
L
I
 
I
K
 
N
A
 
A
M
 
V
E
 
E
A
 
A
C
 
S
Y
 
C
R
 
I
R
 
R
S
 
T
L
 
R
E
 
E
L
 
L

8td3A Structure of pycr1 complexed with nadh and (s)-tetrahydro-2h-pyran-2- carboxylic acid
32% identity, 99% coverage: 1:246/248 of query aligns to 7:274/281 of 8td3A

query
sites
8td3A
M
 
M
K
 
S
I
 
V
L
 
G
L
 
F
I
 
I
G
|
G
A
|
A
G
|
G
N
x
Q
M
x
L
G
 
A
G
 
F
A
 
A
M
 
L
L
 
A
E
 
K
G
 
G
L
 
F
R
 
T
-
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
V
-
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
H
-
 
K
-
 
I
-
 
M
-
 
A
-
 
S
-
x
S
-
x
P
E
 
D
Y
 
M
D
 
D
V
 
L
T
 
A
V
 
T
V
 
V
E
 
S
A
 
A
Y
 
L
E
 
-
P
 
-
R
 
-
R
 
R
K
 
K
E
 
M
L
 
G
A
 
V
A
 
K
L
 
L
Y
 
T
P
 
P
N
 
H
I
x
N
T
 
-
L
 
-
Q
 
K
N
 
E
T
 
T
I
 
V
P
 
Q
P
 
H
L
 
S
D
 
D
G
 
-
Y
 
-
V
 
V
V
 
L
L
 
F
L
 
L
A
|
A
I
x
V
K
|
K
P
 
P
Q
 
H
S
x
I
-
 
I
-
 
P
-
 
F
-
 
I
L
 
L
D
 
D
A
 
E
L
 
I
-
 
G
-
 
A
E
 
D
V
 
I
E
 
E
G
 
D
R
 
R
A
 
-
E
 
H
A
 
I
L
 
V
I
 
V
S
 
S
I
x
C
L
x
A
A
|
A
G
 
G
T
 
V
P
 
T
L
 
I
A
 
S
R
 
S
L
 
I
K
 
E
E
 
K
K
 
K
I
 
L
D
 
S
A
 
A
-
 
F
-
 
R
-
 
P
-
 
A
E
 
P
A
 
R
Y
 
V
I
 
I
R
 
R
A
 
C
M
|
M
P
x
T
N
 
N
I
x
T
A
 
P
A
 
V
L
 
V
K
 
V
R
 
R
K
 
E
S
 
G
V
 
A
T
 
T
S
 
V
-
 
Y
V
 
A
T
 
T
G
 
G
D
 
T
E
 
H
S
 
A
F
 
Q
K
 
V
E
 
E
E
 
D
A
 
G
L
 
R
-
 
L
-
 
M
-
 
E
K
 
Q
I
 
L
L
 
L
S
 
S
S
 
S
I
 
V
G
 
G
K
 
F
A
 
C
I
 
T
W
 
E
L
 
V
N
 
E
S
 
-
E
 
E
K
 
D
E
 
L
L
 
I
D
 
D
I
 
A
A
 
V
T
 
T
G
 
G
I
 
L
G
 
S
G
|
G
S
 
S
A
 
G
P
 
P
A
 
A
W
 
Y
M
 
A
A
 
F
L
 
T
V
 
A
A
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
G
 
G
A
 
G
V
 
V
N
 
K
L
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
A
 
R
V
 
L
S
 
A
Y
 
V
E
 
R
Y
 
L
V
 
G
A
 
A
A
 
Q
L
 
A
M
 
L
D
 
L
G
 
G
M
 
A
G
 
A
A
 
K
L
 
M
L
 
L
-
 
L
-
 
H
E
 
S
E
 
E
E
 
Q
H
 
H
P
 
P
A
 
G
L
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
K
 
N
V
|
V
M
 
S
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
|
T
A
 
I
A
 
H
G
 
A
Y
 
L
A
 
H
K
 
V
L
 
L
E
 
E
E
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
F
R
 
R
D
 
S
S
 
L
F
 
L
I
 
I
K
 
N
A
 
A
M
 
V
E
 
E
A
 
A
C
 
S
Y
 
C
R
 
I
R
 
R
S
 
T
L
 
R
E
 
E
L
 
L

8tcyA Structure of pycr1 complexed with 7-fluoro-2-oxo-1,2,3,4- tetrahydroquinoline-6-carboxylic acid (see paper)
32% identity, 99% coverage: 1:246/248 of query aligns to 8:275/281 of 8tcyA

query
sites
8tcyA
M
 
M
K
 
S
I
 
V
L
 
G
L
 
F
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
x
L
G
 
A
G
 
F
A
 
A
M
 
L
L
 
A
E
 
K
G
 
G
L
 
F
R
 
T
-
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
V
-
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
H
-
 
K
-
 
I
-
 
M
-
 
A
-
 
S
-
 
S
-
 
P
E
 
D
Y
 
M
D
 
D
V
 
L
T
 
A
V
 
T
V
 
V
E
 
S
A
 
A
Y
 
L
E
 
-
P
 
-
R
 
-
R
 
R
K
 
K
E
 
M
L
 
G
A
 
V
A
 
K
L
 
L
Y
 
T
P
 
P
N
 
H
I
 
N
T
 
-
L
 
-
Q
 
K
N
 
E
T
 
T
I
 
V
P
 
Q
P
 
H
L
 
S
D
 
D
G
 
-
Y
 
-
V
 
V
V
 
L
L
 
F
L
 
L
A
 
A
I
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
S
 
I
-
 
I
-
 
P
-
 
F
-
 
I
L
 
L
D
 
D
A
 
E
L
 
I
-
 
G
-
 
A
E
 
D
V
 
I
E
 
E
G
 
D
R
 
R
A
 
-
E
 
H
A
 
I
L
 
V
I
 
V
S
 
S
I
x
C
L
 
A
A
 
A
G
 
G
T
 
V
P
 
T
L
 
I
A
 
S
R
 
S
L
 
I
K
 
E
E
 
K
K
 
K
I
 
L
D
 
S
A
 
A
-
 
F
-
 
R
-
 
P
-
 
A
E
 
P
A
 
R
Y
 
V
I
 
I
R
 
R
A
 
C
M
|
M
P
x
T
N
 
N
I
 
T
A
 
P
A
 
V
L
 
V
K
 
V
R
 
R
K
 
E
S
 
G
V
 
A
T
 
T
S
 
V
-
 
Y
V
 
A
T
 
T
G
 
G
D
 
T
E
 
H
S
 
A
F
 
Q
K
 
V
E
 
E
E
 
D
A
 
G
L
 
R
-
 
L
-
 
M
-
 
E
K
 
Q
I
 
L
L
 
L
S
 
S
S
 
S
I
 
V
G
 
G
K
 
F
A
 
C
I
 
T
W
 
E
L
 
V
N
 
E
S
 
-
E
 
E
K
 
D
E
 
L
L
 
I
D
 
D
I
 
A
A
 
V
T
 
T
G
 
G
I
 
L
G
 
S
G
 
G
S
 
S
A
 
G
P
 
P
A
 
A
W
 
Y
M
 
A
A
 
F
L
 
T
V
 
A
A
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
G
 
G
A
 
G
V
 
V
N
 
K
L
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
A
 
R
V
 
L
S
 
A
Y
 
V
E
 
R
Y
 
L
V
 
G
A
 
A
A
 
Q
L
 
A
M
 
L
D
 
L
G
 
G
M
 
A
G
 
A
A
 
K
L
 
M
L
 
L
-
 
L
-
 
H
E
 
S
E
 
E
E
 
Q
H
 
H
P
 
P
A
 
G
L
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
K
 
N
V
 
V
M
 
S
S
 
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
A
 
I
A
 
H
G
 
A
Y
 
L
A
 
H
K
 
V
L
 
L
E
 
E
E
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
F
R
 
R
D
 
S
S
 
L
F
 
L
I
 
I
K
 
N
A
 
A
M
 
V
E
 
E
A
 
A
C
 
S
Y
 
C
R
 
I
R
 
R
S
 
T
L
 
R
E
 
E
L
 
L

6xp3A Structure of human pycr1 complexed with cyclopentanecarboxylic acid (see paper)
32% identity, 99% coverage: 1:246/248 of query aligns to 4:271/276 of 6xp3A

query
sites
6xp3A
M
 
M
K
 
S
I
 
V
L
 
G
L
 
F
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
 
L
G
 
A
G
 
F
A
 
A
M
 
L
L
 
A
E
 
K
G
 
G
L
 
F
R
 
T
-
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
V
-
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
H
-
 
K
-
 
I
-
 
M
-
 
A
-
 
S
-
 
S
-
 
P
E
 
D
Y
 
M
D
 
D
V
 
L
T
 
A
V
 
T
V
 
V
E
 
S
A
 
A
Y
 
L
E
 
-
P
 
-
R
 
-
R
 
R
K
 
K
E
 
M
L
 
G
A
 
V
A
 
K
L
 
L
Y
 
T
P
 
P
N
 
H
I
 
N
T
 
-
L
 
-
Q
 
K
N
 
E
T
 
T
I
 
V
P
 
Q
P
 
H
L
 
S
D
 
D
G
 
-
Y
 
-
V
 
V
V
 
L
L
 
F
L
 
L
A
 
A
I
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
S
 
I
-
 
I
-
 
P
-
 
F
-
 
I
L
 
L
D
 
D
A
 
E
L
 
I
-
 
G
-
 
A
E
 
D
V
 
I
E
 
E
G
 
D
R
 
R
A
 
-
E
 
H
A
 
I
L
 
V
I
 
V
S
 
S
I
 
C
L
 
A
A
 
A
G
 
G
T
 
V
P
 
T
L
 
I
A
 
S
R
 
S
L
 
I
K
 
E
E
 
K
K
 
K
I
 
L
D
 
S
A
 
A
-
 
F
-
 
R
-
 
P
-
 
A
E
 
P
A
 
R
Y
 
V
I
 
I
R
 
R
A
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
I
 
T
A
 
P
A
 
V
L
 
V
K
 
V
R
 
R
K
 
E
S
 
G
V
 
A
T
 
T
S
 
V
-
 
Y
V
 
A
T
 
T
G
 
G
D
 
T
E
 
H
S
 
A
F
 
Q
K
 
V
E
 
E
E
 
D
A
 
G
L
 
R
-
 
L
-
 
M
-
 
E
K
 
Q
I
 
L
L
 
L
S
 
S
S
 
S
I
 
V
G
 
G
K
 
F
A
 
C
I
 
T
W
 
E
L
 
V
N
 
E
S
 
-
E
 
E
K
 
D
E
 
L
L
 
I
D
 
D
I
 
A
A
 
V
T
|
T
G
 
G
I
 
L
G
 
S
G
|
G
S
 
S
A
 
G
P
 
P
A
 
A
W
 
Y
M
 
A
A
 
F
L
 
T
V
 
A
A
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
G
 
G
A
 
G
V
 
V
N
 
K
L
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
A
 
R
V
 
L
S
 
A
Y
 
V
E
 
R
Y
 
L
V
 
G
A
 
A
A
 
Q
L
 
A
M
 
L
D
 
L
G
 
G
M
 
A
G
 
A
A
 
K
L
 
M
L
 
L
-
 
L
-
 
H
E
 
S
E
 
E
E
 
Q
H
 
H
P
 
P
A
 
G
L
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
K
 
N
V
 
V
M
 
S
S
 
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
A
 
I
A
 
H
G
 
A
Y
 
L
A
 
H
K
 
V
L
 
L
E
 
E
E
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
F
R
 
R
D
 
S
S
 
L
F
 
L
I
 
I
K
 
N
A
 
A
M
 
V
E
 
E
A
 
A
C
 
S
Y
 
C
R
 
I
R
 
R
S
 
T
L
 
R
E
 
E
L
 
L

8tdcA Structure of pycr1 complexed with nadh and 1,3-dithiane-2-carboxylic acid
32% identity, 99% coverage: 1:246/248 of query aligns to 2:269/276 of 8tdcA

query
sites
8tdcA
M
 
M
K
 
S
I
 
V
L
 
G
L
 
F
I
 
I
G
|
G
A
|
A
G
|
G
N
x
Q
M
x
L
G
 
A
G
 
F
A
 
A
M
 
L
L
 
A
E
 
K
G
 
G
L
 
F
R
 
T
-
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
V
-
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
H
-
 
K
-
 
I
-
 
M
-
 
A
-
 
S
-
x
S
-
x
P
E
 
D
Y
 
M
D
 
D
V
 
L
T
 
A
V
 
T
V
 
V
E
 
S
A
 
A
Y
 
L
E
 
-
P
 
-
R
 
-
R
 
R
K
 
K
E
 
M
L
 
G
A
 
V
A
 
K
L
 
L
Y
 
T
P
 
P
N
 
H
I
x
N
T
 
-
L
 
-
Q
 
K
N
 
E
T
 
T
I
 
V
P
 
Q
P
 
H
L
 
S
D
 
D
G
 
-
Y
 
-
V
 
V
V
 
L
L
 
F
L
 
L
A
|
A
I
x
V
K
|
K
P
 
P
Q
 
H
S
 
I
-
 
I
-
 
P
-
 
F
-
x
I
L
 
L
D
 
D
A
 
E
L
 
I
-
 
G
-
 
A
E
 
D
V
 
I
E
 
E
G
 
D
R
 
R
A
 
-
E
 
H
A
 
I
L
 
V
I
 
V
S
 
S
I
x
C
L
x
A
A
|
A
G
 
G
T
 
V
P
 
T
L
 
I
A
 
S
R
 
S
L
 
I
K
 
E
E
 
K
K
 
K
I
 
L
D
 
S
A
 
A
-
 
F
-
 
R
-
 
P
-
 
A
E
 
P
A
 
R
Y
 
V
I
 
I
R
 
R
A
 
C
M
|
M
P
x
T
N
 
N
I
x
T
A
 
P
A
 
V
L
 
V
K
 
V
R
 
R
K
 
E
S
 
G
V
 
A
T
 
T
S
 
V
-
 
Y
V
 
A
T
 
T
G
 
G
D
 
T
E
 
H
S
 
A
F
 
Q
K
 
V
E
 
E
E
 
D
A
 
G
L
 
R
-
 
L
-
 
M
-
 
E
K
 
Q
I
 
L
L
 
L
S
 
S
S
 
S
I
 
V
G
 
G
K
 
F
A
 
C
I
 
T
W
 
E
L
 
V
N
 
E
S
 
-
E
 
E
K
 
D
E
 
L
L
 
I
D
 
D
I
 
A
A
 
V
T
 
T
G
 
G
I
 
L
G
 
S
G
 
G
S
 
S
A
 
G
P
 
P
A
 
A
W
 
Y
M
 
A
A
 
F
L
 
T
V
 
A
A
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
G
 
G
A
 
G
V
 
V
N
 
K
L
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
A
 
R
V
 
L
S
 
A
Y
 
V
E
 
R
Y
 
L
V
 
G
A
 
A
A
 
Q
L
 
A
M
 
L
D
 
L
G
 
G
M
 
A
G
 
A
A
 
K
L
 
M
L
 
L
-
 
L
-
 
H
E
 
S
E
 
E
E
 
Q
H
 
H
P
 
P
A
 
G
L
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
K
 
N
V
|
V
M
 
S
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
|
G
T
x
A
T
|
T
A
 
I
A
 
H
G
 
A
Y
 
L
A
 
H
K
 
V
L
 
L
E
 
E
E
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
F
R
 
R
D
 
S
S
 
L
F
 
L
I
 
I
K
 
N
A
 
A
M
 
V
E
 
E
A
 
A
C
 
S
Y
 
C
R
 
I
R
 
R
S
 
T
L
 
R
E
 
E
L
 
L

8td8A Structure of pycr1 complexed with nadh and 2s-hydroxy-3,3- dimethylbutyric acid
32% identity, 99% coverage: 1:246/248 of query aligns to 2:269/276 of 8td8A

query
sites
8td8A
M
 
M
K
 
S
I
 
V
L
 
G
L
 
F
I
 
I
G
|
G
A
|
A
G
|
G
N
x
Q
M
x
L
G
 
A
G
 
F
A
 
A
M
 
L
L
 
A
E
 
K
G
 
G
L
 
F
R
 
T
-
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
V
-
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
H
-
 
K
-
 
I
-
 
M
-
 
A
-
 
S
-
 
S
-
x
P
E
 
D
Y
 
M
D
 
D
V
 
L
T
 
A
V
 
T
V
 
V
E
 
S
A
 
A
Y
 
L
E
 
-
P
 
-
R
 
-
R
 
R
K
 
K
E
 
M
L
 
G
A
 
V
A
 
K
L
 
L
Y
 
T
P
 
P
N
 
H
I
x
N
T
 
-
L
 
-
Q
 
K
N
 
E
T
 
T
I
 
V
P
 
Q
P
 
H
L
 
S
D
 
D
G
 
-
Y
 
-
V
 
V
V
 
L
L
 
F
L
 
L
A
|
A
I
x
V
K
|
K
P
 
P
Q
 
H
S
 
I
-
 
I
-
 
P
-
 
F
-
 
I
L
 
L
D
 
D
A
 
E
L
 
I
-
 
G
-
 
A
E
 
D
V
 
I
E
 
E
G
 
D
R
 
R
A
 
-
E
 
H
A
 
I
L
 
V
I
 
V
S
 
S
I
x
C
L
x
A
A
|
A
G
 
G
T
 
V
P
 
T
L
 
I
A
 
S
R
 
S
L
 
I
K
 
E
E
 
K
K
 
K
I
 
L
D
 
S
A
 
A
-
 
F
-
 
R
-
 
P
-
 
A
E
 
P
A
 
R
Y
 
V
I
 
I
R
 
R
A
 
C
M
|
M
P
x
T
N
 
N
I
x
T
A
 
P
A
 
V
L
 
V
K
 
V
R
 
R
K
 
E
S
 
G
V
 
A
T
 
T
S
 
V
-
 
Y
V
 
A
T
 
T
G
 
G
D
 
T
E
 
H
S
 
A
F
 
Q
K
 
V
E
 
E
E
 
D
A
 
G
L
 
R
-
 
L
-
 
M
-
 
E
K
 
Q
I
 
L
L
 
L
S
 
S
S
 
S
I
 
V
G
 
G
K
 
F
A
 
C
I
 
T
W
 
E
L
 
V
N
 
E
S
 
-
E
 
E
K
 
D
E
 
L
L
 
I
D
 
D
I
 
A
A
 
V
T
 
T
G
 
G
I
 
L
G
 
S
G
 
G
S
 
S
A
 
G
P
 
P
A
 
A
W
 
Y
M
 
A
A
 
F
L
 
T
V
 
A
A
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
G
 
G
A
 
G
V
 
V
N
 
K
L
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
A
 
R
V
 
L
S
 
A
Y
 
V
E
 
R
Y
 
L
V
 
G
A
 
A
A
 
Q
L
 
A
M
 
L
D
 
L
G
 
G
M
 
A
G
 
A
A
 
K
L
 
M
L
 
L
-
 
L
-
 
H
E
 
S
E
 
E
E
 
Q
H
 
H
P
 
P
A
 
G
L
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
K
 
N
V
|
V
M
 
S
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
|
T
A
 
I
A
 
H
G
 
A
Y
 
L
A
 
H
K
 
V
L
 
L
E
 
E
E
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
F
R
 
R
D
 
S
S
 
L
F
 
L
I
 
I
K
 
N
A
 
A
M
 
V
E
 
E
A
 
A
C
 
S
Y
 
C
R
 
I
R
 
R
S
 
T
L
 
R
E
 
E
L
 
L

8td2A Structure of pycr1 complexed with nadh and cyclobutane-1,1- dicarboxylic acid
32% identity, 99% coverage: 1:246/248 of query aligns to 2:269/276 of 8td2A

query
sites
8td2A
M
 
M
K
 
S
I
 
V
L
 
G
L
 
F
I
 
I
G
|
G
A
 
A
G
|
G
N
x
Q
M
x
L
G
 
A
G
 
F
A
 
A
M
 
L
L
 
A
E
 
K
G
 
G
L
 
F
R
 
T
-
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
V
-
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
H
-
 
K
-
 
I
-
 
M
-
 
A
-
 
S
-
 
S
-
x
P
E
 
D
Y
 
M
D
 
D
V
x
L
T
 
A
V
 
T
V
 
V
E
 
S
A
 
A
Y
 
L
E
 
-
P
 
-
R
 
-
R
 
R
K
 
K
E
 
M
L
 
G
A
 
V
A
 
K
L
 
L
Y
 
T
P
 
P
N
 
H
I
x
N
T
 
-
L
 
-
Q
 
K
N
 
E
T
 
T
I
 
V
P
 
Q
P
 
H
L
 
S
D
 
D
G
 
-
Y
 
-
V
 
V
V
 
L
L
 
F
L
 
L
A
|
A
I
x
V
K
 
K
P
|
P
Q
 
H
S
 
I
-
 
I
-
 
P
-
 
F
-
x
I
L
 
L
D
 
D
A
 
E
L
 
I
-
 
G
-
 
A
E
 
D
V
 
I
E
 
E
G
 
D
R
 
R
A
 
-
E
 
H
A
 
I
L
 
V
I
 
V
S
 
S
I
x
C
L
x
A
A
|
A
G
 
G
T
 
V
P
 
T
L
 
I
A
 
S
R
 
S
L
 
I
K
 
E
E
 
K
K
 
K
I
 
L
D
 
S
A
 
A
-
 
F
-
 
R
-
 
P
-
 
A
E
 
P
A
 
R
Y
 
V
I
 
I
R
 
R
A
 
C
M
|
M
P
x
T
N
 
N
I
x
T
A
 
P
A
 
V
L
 
V
K
 
V
R
 
R
K
 
E
S
 
G
V
 
A
T
 
T
S
 
V
-
 
Y
V
 
A
T
 
T
G
 
G
D
 
T
E
 
H
S
 
A
F
 
Q
K
 
V
E
 
E
E
 
D
A
 
G
L
 
R
-
 
L
-
 
M
-
 
E
K
 
Q
I
 
L
L
 
L
S
 
S
S
 
S
I
 
V
G
 
G
K
 
F
A
 
C
I
 
T
W
 
E
L
 
V
N
 
E
S
 
-
E
 
E
K
 
D
E
 
L
L
 
I
D
 
D
I
 
A
A
 
V
T
 
T
G
 
G
I
 
L
G
 
S
G
 
G
S
 
S
A
 
G
P
 
P
A
 
A
W
 
Y
M
 
A
A
 
F
L
 
T
V
 
A
A
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
G
 
G
A
 
G
V
 
V
N
 
K
L
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
A
 
R
V
 
L
S
 
A
Y
 
V
E
 
R
Y
 
L
V
 
G
A
 
A
A
 
Q
L
 
A
M
 
L
D
 
L
G
 
G
M
 
A
G
 
A
A
 
K
L
 
M
L
 
L
-
 
L
-
 
H
E
 
S
E
 
E
E
 
Q
H
 
H
P
 
P
A
 
G
L
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
K
 
N
V
|
V
M
 
S
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
x
A
T
|
T
A
 
I
A
 
H
G
 
A
Y
 
L
A
 
H
K
 
V
L
 
L
E
 
E
E
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
F
R
 
R
D
 
S
S
 
L
F
 
L
I
 
I
K
 
N
A
 
A
M
 
V
E
 
E
A
 
A
C
 
S
Y
 
C
R
 
I
R
 
R
S
 
T
L
 
R
E
 
E
L
 
L

2graA Crystal structure of human pyrroline-5-carboxylate reductase complexed with NADP (see paper)
32% identity, 99% coverage: 1:246/248 of query aligns to 3:270/277 of 2graA

query
sites
2graA
M
 
M
K
 
S
I
 
V
L
 
G
L
 
F
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
 
L
G
 
A
G
 
F
A
 
A
M
 
L
L
 
A
E
 
K
G
 
G
L
 
F
R
 
T
-
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
V
-
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
H
-
 
K
-
 
I
-
 
M
-
 
A
-
 
S
-
 
S
-
 
P
E
 
D
Y
 
M
D
 
D
V
 
L
T
 
A
V
 
T
V
 
V
E
 
S
A
 
A
Y
 
L
E
 
-
P
 
-
R
 
-
R
 
R
K
 
K
E
 
M
L
 
G
A
 
V
A
 
K
L
 
L
Y
 
T
P
 
P
N
 
H
I
 
N
T
 
-
L
 
-
Q
 
K
N
 
E
T
 
T
I
 
V
P
 
Q
P
 
H
L
 
S
D
 
D
G
 
-
Y
 
-
V
 
V
V
 
L
L
 
F
L
 
L
A
 
A
I
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
S
 
I
-
 
I
-
 
P
-
 
F
-
 
I
L
 
L
D
 
D
A
 
E
L
 
I
-
 
G
-
 
A
E
 
D
V
 
I
E
 
E
G
 
D
R
 
R
A
 
-
E
 
H
A
 
I
L
 
V
I
 
V
S
 
S
I
 
C
L
 
A
A
 
A
G
 
G
T
 
V
P
 
T
L
 
I
A
 
S
R
 
S
L
 
I
K
 
E
E
 
K
K
 
K
I
 
L
D
 
S
A
 
A
-
 
F
-
 
R
-
 
P
-
 
A
E
 
P
A
 
R
Y
 
V
I
 
I
R
 
R
A
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
I
 
T
A
 
P
A
 
V
L
 
V
K
 
V
R
|
R
K
x
E
S
 
G
V
 
A
T
 
T
S
 
V
-
 
Y
V
 
A
T
 
T
G
 
G
D
 
T
E
 
H
S
 
A
F
 
Q
K
 
V
E
 
E
E
 
D
A
 
G
L
 
R
-
 
L
-
 
M
-
 
E
K
 
Q
I
 
L
L
 
L
S
|
S
S
|
S
I
 
V
G
|
G
K
x
F
A
 
C
I
 
T
W
 
E
L
 
V
N
 
E
S
 
-
E
 
E
K
 
D
E
 
L
L
 
I
D
 
D
I
 
A
A
 
V
T
 
T
G
 
G
I
 
L
G
 
S
G
 
G
S
 
S
A
 
G
P
 
P
A
 
A
W
 
Y
M
 
A
A
 
F
L
 
T
V
 
A
A
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
G
 
G
A
 
G
V
 
V
N
 
K
L
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
A
 
R
V
 
L
S
 
A
Y
 
V
E
 
R
Y
 
L
V
 
G
A
 
A
A
 
Q
L
 
A
M
 
L
D
 
L
G
 
G
M
 
A
G
 
A
A
 
K
L
 
M
L
 
L
-
x
L
-
x
H
E
x
S
E
 
E
E
 
Q
H
 
H
P
 
P
A
 
G
L
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
K
 
N
V
 
V
M
 
S
S
 
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
A
 
I
A
 
H
G
 
A
Y
 
L
A
 
H
K
 
V
L
 
L
E
 
E
E
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
F
R
 
R
D
 
S
S
 
L
F
 
L
I
 
I
K
 
N
A
 
A
M
 
V
E
 
E
A
 
A
C
 
S
Y
 
C
R
 
I
R
 
R
S
 
T
L
 
R
E
 
E
L
 
L

Query Sequence

>WP_013553340.1 NCBI__GCF_000186245.1:WP_013553340.1
MKILLIGAGNMGGAMLEGLREYDVTVVEAYEPRRKELAALYPNITLQNTIPPLDGYVVLL
AIKPQSLDALEVEGRAEALISILAGTPLARLKEKIDAEAYIRAMPNIAALKRKSVTSVTG
DESFKEEALKILSSIGKAIWLNSEKELDIATGIGGSAPAWMALVAEALADGAVNLGLPRA
VSYEYVAALMDGMGALLEEEHPALLKDKVMSPGGTTAAGYAKLEEGGVRDSFIKAMEACY
RRSLELGK

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory