SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_013553403.1 NCBI__GCF_000186245.1:WP_013553403.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 14 hits to proteins with known functional sites (download)

2akoA Crystal structure of glutamate 5-kinase from campylobacter jejuni
51% identity, 95% coverage: 2:252/263 of query aligns to 1:241/241 of 2akoA

query
sites
2akoA
K
 
K
R
 
R
I
 
I
V
 
V
I
 
V
K
 
K
V
 
V
G
 
G
S
 
S
H
|
H
V
 
V
L
 
I
T
 
S
E
 
E
E
 
E
G
 
N
E
 
T
I
 
L
A
 
S
L
 
F
E
 
E
R
 
R
M
 
L
R
 
K
A
 
N
L
 
L
V
 
V
D
 
A
L
 
F
I
 
L
A
 
A
D
 
K
L
 
L
I
 
M
R
 
E
G
 
K
G
 
-
R
 
Y
E
 
E
V
 
V
I
 
I
L
 
L
V
 
V
S
 
T
S
 
S
G
 
A
A
 
A
V
 
I
A
 
S
A
 
A
G
 
G
Y
 
H
T
 
T
Q
 
K
L
 
L
R
 
D
L
 
I
D
 
D
R
 
R
S
 
K
D
 
N
V
 
L
A
 
I
Q
 
N
K
 
K
Q
 
Q
A
 
V
L
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
Y
 
F
L
 
L
L
 
I
K
 
S
L
 
V
Y
 
Y
Q
 
N
S
 
E
K
 
L
F
 
L
A
 
A
H
 
K
H
 
F
G
 
N
I
 
K
L
 
L
S
 
G
A
 
G
Q
 
Q
L
 
I
L
 
L
L
 
L
S
 
T
A
 
G
D
 
K
D
 
D
F
 
F
D
 
D
S
 
S
R
 
R
R
 
K
R
 
A
T
 
T
R
 
K
H
 
H
A
 
A
R
 
K
N
 
N
A
 
A
V
 
I
E
 
D
E
 
M
L
 
M
L
 
I
K
 
N
H
 
L
R
 
G
V
 
I
V
 
L
P
 
P
I
 
I
V
 
I
N
 
N
E
 
E
N
 
N
D
 
D
V
 
A
V
 
T
A
 
A
T
 
I
E
 
E
E
 
E
L
 
I
V
 
V
F
 
F
G
 
G
D
 
D
N
 
N
D
 
D
R
 
S
L
 
L
S
 
S
A
 
A
H
 
Y
V
 
A
A
 
T
H
 
H
Y
 
F
F
 
F
D
 
D
A
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
L
V
 
V
I
 
I
L
 
L
S
|
S
D
|
D
I
|
I
D
 
D
G
 
G
Y
x
F
Y
|
Y
D
 
D
K
 
K
D
x
N
P
|
P
H
 
S
R
 
E
Y
 
F
P
 
S
D
 
D
A
 
A
R
 
K
L
 
R
R
 
L
K
 
E
V
 
K
V
 
I
C
 
T
A
 
H
L
 
I
D
 
K
A
 
E
K
 
E
E
 
W
L
 
L
E
 
H
A
 
-
E
 
-
C
 
-
T
 
-
P
 
-
H
 
-
N
 
-
A
 
-
F
 
-
A
 
G
T
|
T
G
 
G
G
|
G
I
 
I
V
 
V
T
 
T
K
|
K
L
 
L
Q
 
K
A
 
A
A
 
A
D
 
K
F
 
F
L
 
L
L
 
L
K
 
E
R
 
H
G
 
N
G
 
K
R
 
K
M
 
M
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
G
 
G
F
 
F
D
 
D
L
 
L
A
 
S
D
 
V
V
 
A
Q
 
K
S
 
T
L
 
F
L
 
L
L
 
L
E
 
E
G
 
D
V
 
K
H
 
Q
R
 
I
G
 
G
G
 
G
T
 
T
L
 
L
F
 
F
E
 
E

2j5tD Glutamate 5-kinase from escherichia coli complexed with glutamate (see paper)
39% identity, 96% coverage: 2:253/263 of query aligns to 3:255/365 of 2j5tD

query
sites
2j5tD
K
 
Q
R
 
T
I
 
L
V
 
V
I
 
V
K
 
K
V
 
L
G
 
G
S
 
T
H
 
S
V
 
V
L
 
L
T
 
T
E
 
G
E
 
-
G
 
G
E
 
S
I
 
R
A
 
R
L
 
L
E
 
N
R
 
R
-
 
A
-
 
H
M
 
I
R
 
V
A
 
E
L
 
L
V
 
V
D
 
R
L
 
Q
I
 
C
A
 
A
D
 
Q
L
 
L
I
 
H
R
 
A
G
 
A
G
 
G
R
 
H
E
 
R
V
 
I
I
 
V
L
 
I
V
 
V
S
 
T
S
|
S
G
|
G
A
|
A
V
 
I
A
 
A
A
 
A
G
 
G
Y
 
R
T
 
E
Q
 
H
L
 
L
R
 
G
L
 
Y
D
 
P
R
 
E
-
 
L
-
 
P
S
 
A
D
 
T
V
 
I
A
 
A
Q
 
S
K
 
K
Q
 
Q
A
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
V
G
 
G
Q
 
Q
P
 
S
Y
 
R
L
 
L
L
 
I
K
 
Q
L
 
L
Y
 
W
Q
 
E
S
 
Q
K
 
L
F
 
F
A
 
S
H
 
I
H
 
Y
G
 
G
I
 
I
L
 
H
S
 
V
A
 
G
Q
 
Q
L
 
M
L
 
L
L
 
L
S
 
T
A
 
R
D
 
A
D
 
D
F
 
M
D
 
E
S
 
D
R
 
R
R
 
E
R
 
R
T
 
F
R
 
L
H
 
N
A
 
A
R
 
R
N
 
D
A
 
T
V
 
L
E
 
R
E
 
A
L
 
L
L
 
L
K
 
D
H
 
N
R
 
N
V
 
V
V
 
V
P
 
P
I
 
V
V
 
I
N
|
N
E
 
E
N
 
N
D
|
D
V
 
A
V
 
V
A
 
A
T
 
T
E
 
A
E
 
E
L
 
I
V
 
K
F
 
V
G
 
G
D
|
D
N
|
N
D
 
D
R
 
N
L
 
L
S
 
S
A
 
A
H
 
L
V
 
A
A
 
A
H
 
I
Y
 
L
F
 
A
D
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
K
L
 
L
V
 
L
I
 
L
L
 
L
S
 
T
D
 
D
I
 
Q
D
 
K
G
 
G
Y
 
L
Y
 
Y
D
 
T
K
 
A
D
 
D
P
 
P
H
 
R
R
 
S
Y
 
N
P
 
P
D
 
Q
A
 
A
R
 
E
L
 
L
R
 
I
K
 
K
V
 
D
V
 
V
C
 
Y
A
 
G
L
 
I
D
 
D
A
 
D
K
 
A
E
 
L
L
 
R
E
 
A
A
 
I
E
 
A
C
 
G
T
 
D
P
 
S
H
 
V
N
 
S
A
 
G
F
 
L
A
 
G
T
 
T
G
 
G
G
 
G
I
 
M
V
 
S
T
 
T
K
 
K
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
D
 
D
F
 
V
L
 
A
L
 
C
K
 
R
R
 
A
G
 
G
G
 
I
R
 
D
M
 
T
F
 
I
L
 
I
A
 
A
S
 
A
G
 
G
F
 
S
D
 
K
L
 
-
A
 
P
D
 
G
V
 
V
Q
 
I
S
 
G
L
 
D
L
 
V
L
 
M
E
 
E
G
 
G
V
 
I
H
 
S
R
 
V
G
 
-
G
 
G
T
 
T
L
 
L
F
 
F
E
 
H
S
 
A

Sites not aligning to the query:

P0A7B5 Glutamate 5-kinase; Gamma-glutamyl kinase; GK; EC 2.7.2.11 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
38% identity, 96% coverage: 2:253/263 of query aligns to 5:257/367 of P0A7B5

query
sites
P0A7B5
K
 
Q
R
 
T
I
 
L
V
 
V
I
 
V
K
 
K
V
 
L
G
 
G
S
 
T
H
 
S
V
 
V
L
 
L
T
 
T
E
 
G
E
 
-
G
 
G
E
 
S
I
 
R
A
 
R
L
 
L
E
 
N
R
 
R
-
 
A
-
 
H
M
 
I
R
 
V
A
 
E
L
 
L
V
 
V
D
 
R
L
 
Q
I
 
C
A
 
A
D
 
Q
L
 
L
I
 
H
R
 
A
G
 
A
G
 
G
R
 
H
E
 
R
V
 
I
I
 
V
L
 
I
V
 
V
S
 
T
S
|
S
G
 
G
A
 
A
V
 
I
A
 
A
A
 
A
G
 
G
Y
 
R
T
 
E
Q
 
H
L
 
L
R
 
G
L
 
Y
D
 
P
R
 
E
-
 
L
-
 
P
S
 
A
D
 
T
V
 
I
A
 
A
Q
 
S
K
 
K
Q
 
Q
A
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
V
G
 
G
Q
 
Q
P
 
S
Y
 
R
L
 
L
L
 
I
K
 
Q
L
 
L
Y
 
W
Q
 
E
S
 
Q
K
 
L
F
 
F
A
 
S
H
 
I
H
 
Y
G
 
G
I
 
I
L
 
H
S
 
V
A
 
G
Q
 
Q
L
 
M
L
 
L
L
 
L
S
 
T
A
 
R
D
 
A
D
 
D
F
 
M
D
 
E
S
 
D
R
 
R
R
 
E
R
 
R
T
 
F
R
 
L
H
 
N
A
 
A
R
 
R
N
 
D
A
 
T
V
 
L
E
 
R
E
 
A
L
 
L
L
 
L
K
 
D
H
 
N
R
 
N
V
 
I
V
 
V
P
 
P
I
 
V
V
 
I
N
 
N
E
 
E
N
 
N
D
|
D
V
 
A
V
 
V
A
 
A
T
 
T
E
 
A
E
 
E
L
 
I
V
 
K
F
 
V
G
 
G
D
 
D
N
|
N
D
 
D
R
 
N
L
 
L
S
 
S
A
 
A
H
 
L
V
 
A
A
 
A
H
 
I
Y
 
L
F
 
A
D
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
K
L
 
L
V
 
L
I
 
L
L
 
L
S
 
T
D
 
D
I
 
Q
D
 
K
G
 
G
Y
 
L
Y
 
Y
D
 
T
K
 
A
D
 
D
P
 
P
H
 
R
R
 
S
Y
 
N
P
 
P
D
 
Q
A
 
A
R
 
E
L
 
L
R
 
I
K
 
K
V
 
D
V
 
V
C
 
Y
A
 
G
L
 
I
D
 
D
A
 
D
K
 
A
E
 
L
L
 
R
E
 
A
A
 
I
E
 
A
C
 
G
T
 
D
P
 
S
H
 
V
N
 
S
A
 
G
F
 
L
A
 
G
T
 
T
G
 
G
G
 
G
I
 
M
V
 
S
T
 
T
K
 
K
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
D
 
D
F
 
V
L
 
A
L
 
C
K
 
R
R
 
A
G
 
G
G
 
I
R
 
D
M
 
T
F
 
I
L
 
I
A
 
A
S
 
A
G
 
G
F
 
S
D
 
K
L
 
-
A
 
P
D
 
G
V
 
V
Q
 
I
S
 
G
L
 
D
L
 
V
L
 
M
E
 
E
G
 
G
V
 
I
H
 
S
R
 
V
G
 
-
G
 
G
T
 
T
L
 
L
F
 
F
E
 
H
S
 
A

7wx3B Gk domain of drosophila p5cs filament with glutamate, atp, and NADPH (see paper)
31% identity, 95% coverage: 2:251/263 of query aligns to 13:256/258 of 7wx3B

query
sites
7wx3B
K
 
R
R
 
R
I
 
L
V
 
V
I
 
V
K
 
K
V
 
L
G
 
G
S
 
S
H
 
A
V
 
V
L
 
I
T
 
T
E
 
R
E
 
E
G
 
D
E
 
N
-
 
H
-
 
G
I
 
L
A
 
A
L
 
L
E
 
G
R
 
R
M
 
L
R
 
A
A
 
S
L
 
I
V
 
V
D
 
E
L
 
Q
I
 
V
A
 
A
D
 
E
L
 
C
I
 
H
R
 
L
G
 
E
G
 
G
R
 
R
E
 
E
V
 
V
I
 
M
L
 
M
V
 
V
S
 
T
S
|
S
G
 
G
A
|
A
V
 
V
A
 
A
A
 
F
G
 
G
Y
 
K
T
 
Q
Q
 
K
L
 
L
-
 
A
-
 
Q
-
x
E
-
 
L
-
 
L
-
x
M
-
 
S
-
x
L
R
x
S
L
x
M
D
x
R
R
 
E
S
 
T
D
 
L
V
 
N
A
 
L
Q
 
E
K
 
P
Q
 
R
A
 
A
L
 
A
A
 
A
A
 
A
I
 
V
G
 
G
Q
 
Q
P
 
S
Y
 
G
L
 
L
L
 
M
K
 
S
L
 
L
Y
 
Y
Q
 
D
S
 
A
K
 
M
F
 
F
A
 
A
H
 
Q
H
 
Y
G
 
G
I
 
V
L
 
K
S
 
I
A
 
A
Q
 
Q
L
 
V
L
 
L
L
 
V
S
 
T
A
 
K
D
 
P
D
 
D
F
 
F
D
 
Y
S
 
N
R
 
E
R
 
E
R
 
T
T
 
R
R
 
N
H
 
N
A
 
L
R
 
F
N
 
C
A
 
T
V
 
L
E
 
S
E
 
E
L
 
L
L
 
I
K
 
S
H
 
L
R
 
N
V
 
I
V
 
V
P
 
P
I
 
I
V
 
I
N
|
N
E
x
T
N
 
N
D
|
D
V
 
A
V
 
V
A
 
S
T
 
P
E
 
P
E
x
M
L
 
F
V
 
I
-
 
P
F
 
I
G
 
K
D
 
D
N
|
N
D
 
D
R
 
S
L
 
L
S
 
S
A
 
A
H
 
M
V
 
L
A
 
A
H
 
A
Y
 
E
F
 
V
D
 
Q
A
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
L
V
 
I
I
 
L
L
 
M
S
 
S
D
 
D
I
 
V
D
 
D
G
 
G
Y
 
I
Y
 
Y
D
 
N
K
 
K
D
 
P
P
 
P
H
 
W
R
 
E
Y
 
-
P
 
D
D
 
G
A
 
A
R
 
K
L
 
L
R
 
M
K
 
H
V
 
T
V
 
Y
C
 
T
A
 
S
L
 
D
D
 
D
A
 
S
K
 
N
E
 
S
L
 
I
E
 
-
A
 
-
E
 
-
C
 
-
T
 
-
P
 
-
H
 
-
N
 
-
A
 
-
F
 
-
A
 
-
T
 
-
G
 
-
G
 
-
I
 
M
V
 
D
T
 
S
K
 
K
L
 
V
Q
 
K
A
 
A
A
 
A
D
 
T
F
 
W
L
 
A
L
 
L
K
 
D
R
 
R
G
 
G
G
 
V
R
 
S
M
 
V
F
 
V
L
 
I
A
 
C
S
 
N
G
 
G
F
 
M
D
 
Q
L
 
E
A
 
K
D
 
A
V
 
I
Q
 
K
S
 
T
L
 
I
L
 
I
L
 
-
E
 
-
G
 
G
V
 
G
H
 
R
R
 
K
G
 
V
G
 
G
T
 
T
L
 
F
F
 
F

7f5xA Gk domain of drosophila p5cs filament with glutamate (see paper)
33% identity, 95% coverage: 2:251/263 of query aligns to 13:234/236 of 7f5xA

query
sites
7f5xA
K
 
R
R
 
R
I
 
L
V
 
V
I
 
V
K
 
K
V
 
L
G
 
G
S
 
S
H
 
A
V
 
V
L
 
I
T
 
T
E
 
R
E
 
E
G
 
D
E
 
N
-
 
H
-
 
G
I
 
L
A
 
A
L
 
L
E
 
G
R
 
R
M
 
L
R
 
A
A
 
S
L
 
I
V
 
V
D
 
E
L
 
Q
I
 
V
A
 
A
D
 
E
L
 
C
I
 
H
R
 
L
G
 
E
G
 
G
R
 
R
E
 
E
V
 
V
I
 
M
L
 
M
V
 
V
S
 
T
S
|
S
G
 
G
A
|
A
V
 
V
A
 
A
A
 
F
G
 
G
Y
 
K
T
 
Q
Q
 
K
L
 
L
-
 
A
-
 
Q
R
 
E
L
 
L
D
 
L
R
 
M
S
 
S
D
 
L
V
 
S
A
 
M
Q
 
R
K
 
P
Q
 
R
A
 
A
L
 
A
A
 
A
A
 
A
I
 
V
G
 
G
Q
 
Q
P
 
S
Y
 
G
L
 
L
L
 
M
K
 
S
L
 
L
Y
 
Y
Q
 
D
S
 
A
K
 
M
F
 
F
A
 
A
H
 
Q
H
 
Y
G
 
G
I
 
V
L
 
K
S
 
I
A
 
A
Q
 
Q
L
 
V
L
 
L
L
 
V
S
 
T
A
 
K
D
 
P
D
 
D
F
 
F
D
 
Y
S
 
N
R
 
E
R
 
E
R
 
T
T
 
R
R
 
N
H
 
N
A
 
L
R
 
F
N
 
C
A
 
T
V
 
L
E
 
S
E
 
E
L
 
L
L
 
I
K
 
S
H
 
L
R
 
N
V
 
I
V
 
V
P
 
P
I
 
I
V
 
I
N
|
N
E
 
T
N
 
N
D
|
D
V
 
A
V
 
V
A
 
S
T
 
P
E
 
-
E
 
-
L
 
-
V
 
-
F
 
-
G
 
-
D
 
D
N
 
N
D
 
D
R
 
S
L
 
L
S
 
S
A
 
A
H
 
M
V
 
L
A
 
A
H
 
A
Y
 
E
F
 
V
D
 
Q
A
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
L
V
 
I
I
 
L
L
 
M
S
 
S
D
 
D
I
 
V
D
 
D
G
 
G
Y
 
I
Y
 
Y
D
 
N
K
 
K
D
 
P
P
 
P
H
 
W
R
 
E
Y
 
-
P
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
-
L
 
-
R
 
-
K
 
-
V
 
-
V
 
-
C
 
-
A
 
-
L
 
-
D
 
D
A
 
G
K
 
A
E
 
K
L
 
L
E
 
M
A
 
H
E
 
T
C
 
Y
T
 
T
P
 
-
H
 
-
N
 
-
A
 
-
F
 
-
A
 
-
T
 
-
G
 
-
G
 
-
I
 
-
V
 
-
T
 
S
K
 
K
L
 
V
Q
 
K
A
 
A
A
 
A
D
 
T
F
 
W
L
 
A
L
 
L
K
 
D
R
 
R
G
 
G
G
 
V
R
 
S
M
 
V
F
 
V
L
 
I
A
 
C
S
 
N
G
 
G
F
 
M
D
 
Q
L
 
E
A
 
K
D
 
A
V
 
I
Q
 
K
S
 
T
L
 
I
L
 
I
L
 
-
E
 
-
G
 
G
V
 
G
H
 
R
R
 
K
G
 
V
G
 
G
T
 
T
L
 
F
F
 
F

2j5vB Glutamate 5-kinase from escherichia coli complexed with glutamyl-5- phosphate and pyroglutamic acid (see paper)
34% identity, 96% coverage: 2:253/263 of query aligns to 3:215/325 of 2j5vB

query
sites
2j5vB
K
 
Q
R
 
T
I
 
L
V
 
V
I
 
V
K
|
K
V
 
L
G
 
G
S
x
T
H
 
S
V
 
V
L
 
L
T
 
T
E
 
G
E
 
-
G
 
G
E
 
S
I
 
R
A
 
R
L
 
L
E
 
N
R
 
R
-
 
A
-
 
H
M
 
I
R
 
V
A
 
E
L
 
L
V
 
V
D
 
R
L
 
Q
I
 
C
A
 
A
D
 
Q
L
 
L
I
 
H
R
 
A
G
 
A
G
 
G
R
 
H
E
 
R
V
 
I
I
 
V
L
 
I
V
 
V
S
 
T
S
|
S
G
|
G
A
|
A
V
x
I
A
|
A
A
 
A
G
 
G
Y
 
R
T
 
E
Q
 
H
L
 
L
R
 
G
L
 
Y
D
 
P
R
 
E
-
 
L
-
 
P
S
 
A
D
 
T
V
 
I
A
 
A
Q
 
S
K
 
K
Q
 
Q
A
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
V
G
 
G
Q
 
Q
P
 
S
Y
 
R
L
 
L
L
 
I
K
 
Q
L
 
L
Y
 
W
Q
 
E
S
 
Q
K
 
L
F
 
F
A
 
S
H
 
I
H
 
Y
G
 
G
I
 
I
L
 
H
S
 
V
A
 
G
Q
 
Q
L
 
M
L
 
L
L
 
L
S
 
T
A
 
R
D
 
A
D
 
D
F
 
M
D
 
E
S
 
D
R
 
R
R
 
E
R
 
R
T
 
F
R
 
L
H
 
N
A
 
A
R
 
R
N
 
D
A
 
T
V
 
L
E
 
R
E
 
A
L
 
L
L
 
L
K
 
D
H
 
N
R
 
N
V
 
V
V
 
V
P
 
P
I
 
V
V
 
I
N
 
N
E
 
E
N
 
N
D
|
D
V
 
A
V
 
V
A
 
A
T
 
T
E
 
A
E
 
E
L
 
I
V
 
K
F
 
V
G
|
G
D
|
D
N
|
N
D
 
D
R
 
N
L
 
L
S
 
S
A
 
A
H
 
L
V
 
A
A
 
A
H
 
I
Y
 
L
F
 
A
D
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
K
L
 
L
V
 
L
I
 
L
L
 
L
S
 
T
D
 
D
I
 
-
D
 
-
G
 
-
Y
 
-
Y
 
-
D
 
-
K
 
-
D
 
-
P
 
-
H
 
-
R
 
-
Y
 
-
P
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
-
L
 
-
R
 
-
K
 
-
V
 
-
V
 
-
C
 
-
A
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
-
K
 
-
E
 
-
L
 
-
E
 
-
A
 
-
E
 
-
C
 
-
T
 
-
P
 
-
H
 
-
N
 
-
A
 
-
F
 
-
A
 
-
T
 
Q
G
 
G
G
 
G
I
 
M
V
 
S
T
 
T
K
 
K
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
D
 
D
F
 
V
L
 
A
L
 
C
K
 
R
R
 
A
G
 
G
G
 
I
R
 
D
M
 
T
F
 
I
L
 
I
A
 
A
S
 
A
G
 
G
F
 
S
D
 
K
L
 
-
A
 
P
D
 
G
V
 
V
Q
 
I
S
 
G
L
 
D
L
 
V
L
 
M
E
 
E
G
 
G
V
 
I
H
 
S
R
 
V
G
 
-
G
 
G
T
 
T
L
 
L
F
 
F
E
 
H
S
 
A

2j5vA Glutamate 5-kinase from escherichia coli complexed with glutamyl-5- phosphate and pyroglutamic acid (see paper)
41% identity, 62% coverage: 2:164/263 of query aligns to 3:168/323 of 2j5vA

query
sites
2j5vA
K
 
Q
R
 
T
I
 
L
V
 
V
I
 
V
K
|
K
V
 
L
G
|
G
S
x
T
H
 
S
V
 
V
L
 
L
T
 
T
E
 
G
E
 
-
G
 
G
E
 
S
I
 
R
A
 
R
L
 
L
E
 
N
R
 
R
-
 
A
-
 
H
M
 
I
R
 
V
A
 
E
L
 
L
V
 
V
D
 
R
L
 
Q
I
 
C
A
 
A
D
 
Q
L
 
L
I
 
H
R
 
A
G
 
A
G
 
G
R
 
H
E
 
R
V
 
I
I
 
V
L
 
I
V
 
V
S
 
T
S
|
S
G
|
G
A
|
A
V
x
I
A
 
A
A
 
A
G
 
G
Y
 
R
T
 
E
Q
 
H
L
 
L
R
 
G
L
 
Y
D
 
P
R
 
E
-
 
L
-
 
P
S
 
A
D
 
T
V
 
I
A
 
A
Q
 
S
K
 
K
Q
 
Q
A
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
V
G
 
G
Q
 
Q
P
 
S
Y
 
R
L
 
L
L
 
I
K
 
Q
L
 
L
Y
 
W
Q
 
E
S
 
Q
K
 
L
F
 
F
A
 
S
H
 
I
H
 
Y
G
 
G
I
 
I
L
 
H
S
 
V
A
 
G
Q
 
Q
L
 
M
L
 
L
L
 
L
S
 
T
A
 
R
D
 
A
D
 
D
F
 
M
D
 
E
S
 
D
R
 
R
R
 
E
R
 
R
T
 
F
R
 
L
H
 
N
A
 
A
R
 
R
N
 
D
A
 
T
V
 
L
E
 
R
E
 
A
L
 
L
L
 
L
K
 
D
H
 
N
R
 
N
V
 
V
V
 
V
P
 
P
I
 
V
V
 
I
N
 
N
E
 
E
N
 
N
D
|
D
V
 
A
V
 
V
A
 
A
T
 
T
E
 
A
E
 
E
L
 
I
V
 
K
F
 
V
G
 
G
D
|
D
N
|
N
D
 
D
R
 
N
L
 
L
S
 
S
A
 
A
H
 
L
V
 
A
A
 
A
H
 
I
Y
 
L
F
 
A
D
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
K
L
 
L
V
 
L
I
 
L
L
|
L
S
 
T
D
 
D

8j0gB Gk monomer complexes with glutamate and atp
37% identity, 66% coverage: 1:173/263 of query aligns to 7:193/274 of 8j0gB

query
sites
8j0gB
M
 
V
K
 
K
R
 
R
I
 
I
V
 
V
I
 
V
K
|
K
V
 
V
G
|
G
S
x
T
H
x
A
V
 
V
L
 
V
T
 
T
E
 
G
E
 
K
G
 
G
-
 
G
E
 
R
I
 
L
A
 
A
L
 
L
E
 
G
R
 
R
M
 
L
R
 
G
A
 
A
L
 
I
V
 
C
D
 
E
L
 
Q
I
 
L
A
 
A
D
 
E
L
 
L
I
 
N
R
 
S
G
 
D
G
 
G
R
 
F
E
 
E
V
 
V
I
 
I
L
 
L
V
 
V
S
 
S
S
 
S
G
 
G
A
|
A
V
 
V
A
 
G
A
 
L
G
 
G
Y
 
R
T
 
Q
Q
 
R
L
 
L
R
 
R
L
x
Y
D
 
R
R
 
Q
-
x
L
-
x
V
-
 
N
-
 
S
-
 
S
-
x
F
S
 
A
D
 
D
V
 
L
A
 
Q
Q
 
K
K
 
P
Q
 
Q
-
 
M
-
 
E
-
 
L
-
 
D
-
 
G
-
 
K
A
 
A
L
 
C
A
 
A
A
 
G
I
 
V
G
 
G
Q
 
Q
P
 
S
Y
 
S
L
 
L
L
 
M
K
 
A
L
 
Y
Y
 
Y
Q
 
E
S
 
T
K
 
M
F
 
F
A
 
D
H
 
Q
H
 
L
G
 
D
I
 
V
L
 
T
S
 
V
A
 
A
Q
 
Q
L
 
M
L
 
L
L
 
V
S
 
T
A
 
D
D
 
S
D
 
S
F
 
F
D
 
R
S
 
D
R
 
K
R
 
D
R
 
F
T
 
R
R
 
K
H
 
Q
A
 
L
R
 
S
N
 
E
A
 
T
V
 
V
E
 
K
E
 
A
L
 
M
L
 
L
K
 
R
H
 
M
R
 
R
V
 
V
V
 
I
P
 
P
I
 
V
V
 
F
N
|
N
E
 
E
N
 
N
D
|
D
V
 
A
V
 
I
A
 
S
T
 
T
E
 
R
E
 
R
L
 
T
-
 
G
V
 
I
F
 
F
G
 
W
D
 
D
N
|
N
D
 
D
R
 
S
L
 
L
S
 
A
A
 
A
H
 
L
V
 
L
A
 
S
H
 
L
Y
 
E
F
 
L
D
 
K
A
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
L
V
 
I
I
 
L
L
 
L
S
 
S
D
 
D
I
x
V
D
 
E
G
 
G
Y
 
L
Y
 
Y
D
 
T
K
x
G
D
 
P
P
|
P

Sites not aligning to the query:

8j0eB Gk monomer complexes with catalytic intermediate
37% identity, 66% coverage: 1:173/263 of query aligns to 10:192/269 of 8j0eB

query
sites
8j0eB
M
 
V
K
 
K
R
 
R
I
 
I
V
 
V
I
 
V
K
|
K
V
 
V
G
|
G
S
x
T
H
x
A
V
 
V
L
 
V
T
 
T
E
 
G
E
 
K
G
 
G
-
 
G
E
 
R
I
 
L
A
 
A
L
 
L
E
 
G
R
 
R
M
 
L
R
 
G
A
 
A
L
 
I
V
 
C
D
 
E
L
 
Q
I
 
L
A
 
A
D
 
E
L
 
L
I
 
N
R
 
S
G
 
D
G
 
G
R
 
F
E
 
E
V
 
V
I
 
I
L
 
L
V
 
V
S
 
S
S
|
S
G
|
G
A
 
A
V
|
V
A
 
G
A
 
L
G
 
G
Y
 
R
T
 
Q
Q
 
R
L
 
L
R
 
R
L
x
Y
D
 
R
R
 
Q
-
x
L
-
x
V
-
 
N
-
x
S
-
 
S
-
x
F
S
 
A
D
 
D
V
 
L
A
x
Q
Q
 
K
K
 
P
Q
 
Q
-
 
M
-
 
E
-
 
L
-
 
D
-
 
G
-
 
K
A
 
A
L
 
C
A
 
A
A
 
G
I
 
V
G
 
G
Q
 
Q
P
 
S
Y
 
S
L
 
L
L
 
M
K
 
A
L
 
Y
Y
 
Y
Q
 
E
S
 
T
K
 
M
F
 
F
A
 
D
H
 
Q
H
 
L
G
 
D
I
 
V
L
 
T
S
 
V
A
 
A
Q
 
Q
L
 
M
L
 
L
L
 
V
S
 
T
A
 
D
D
 
S
D
 
S
F
 
F
D
 
R
S
 
D
R
 
K
R
 
D
R
 
F
T
 
R
R
 
K
H
 
Q
A
 
L
R
 
S
N
 
E
A
 
T
V
 
V
E
 
K
E
 
A
L
 
M
L
 
L
K
 
R
H
 
M
R
 
R
V
 
V
V
 
I
P
 
P
I
 
V
V
 
F
N
 
N
E
 
E
N
 
N
D
|
D
V
 
A
V
 
I
A
 
S
T
 
T
E
 
R
E
 
-
L
 
-
V
 
-
F
 
F
G
 
W
D
 
D
N
|
N
D
|
D
R
 
S
L
 
L
S
 
A
A
 
A
H
 
L
V
 
L
A
 
S
H
 
L
Y
 
E
F
 
L
D
 
K
A
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
L
V
 
I
I
 
L
L
 
L
S
 
S
D
 
D
I
x
V
D
 
E
G
 
G
Y
 
L
Y
 
Y
D
 
T
K
 
G
D
 
P
P
|
P

Sites not aligning to the query:

8j0fA Gk tetramer with adjacent hooks at reaction state (see paper)
37% identity, 66% coverage: 1:173/263 of query aligns to 11:192/270 of 8j0fA

query
sites
8j0fA
M
 
V
K
 
K
R
 
R
I
 
I
V
 
V
I
 
V
K
|
K
V
 
V
G
 
G
S
x
T
H
x
A
V
 
V
L
 
V
T
 
T
E
 
G
E
 
K
G
 
G
-
 
G
E
 
R
I
 
L
A
 
A
L
 
L
E
 
G
R
 
R
M
 
L
R
 
G
A
 
A
L
 
I
V
 
C
D
 
E
L
 
Q
I
 
L
A
 
A
D
 
E
L
 
L
I
 
N
R
 
S
G
 
D
G
 
G
R
 
F
E
 
E
V
 
V
I
 
I
L
 
L
V
 
V
S
 
S
S
|
S
G
 
G
A
 
A
V
 
V
A
 
G
A
 
L
G
 
G
Y
 
R
T
 
Q
Q
 
R
L
 
L
R
 
R
L
 
Y
D
 
R
R
 
Q
-
x
L
-
x
V
-
x
N
-
x
S
-
x
S
-
x
F
S
x
A
D
 
D
V
x
L
A
 
Q
Q
 
K
K
 
P
Q
 
Q
-
 
M
-
 
E
-
 
L
-
 
D
-
 
G
-
 
K
A
 
A
L
 
C
A
 
A
A
 
G
I
 
V
G
 
G
Q
 
Q
P
 
S
Y
 
S
L
 
L
L
 
M
K
 
A
L
 
Y
Y
 
Y
Q
 
E
S
 
T
K
 
M
F
 
F
A
 
D
H
 
Q
H
 
L
G
 
D
I
 
V
L
 
T
S
 
V
A
 
A
Q
 
Q
L
 
M
L
 
L
L
 
V
S
 
T
A
 
D
D
 
S
D
 
S
F
 
F
D
 
R
S
 
D
R
 
K
R
 
D
R
 
F
T
 
R
R
 
K
H
 
Q
A
 
L
R
 
S
N
 
E
A
 
T
V
 
V
E
 
K
E
 
A
L
 
M
L
 
L
K
 
R
H
 
M
R
 
R
V
 
V
V
 
I
P
 
P
I
 
V
V
 
F
N
 
N
E
 
E
N
 
N
D
|
D
V
 
A
V
 
I
A
 
S
T
 
T
E
 
R
E
 
W
L
 
-
V
 
-
F
 
-
G
 
-
D
 
D
N
|
N
D
 
D
R
 
S
L
 
L
S
 
A
A
 
A
H
 
L
V
 
L
A
 
S
H
 
L
Y
 
E
F
 
L
D
 
K
A
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
L
V
 
I
I
 
L
L
 
L
S
 
S
D
|
D
I
x
V
D
 
E
G
 
G
Y
 
L
Y
|
Y
D
 
T
K
x
G
D
 
P
P
 
P

Sites not aligning to the query:

3c1mC Cyrstal structure of threonine-sensitive aspartokinase from methanococcus jannaschii with mgamp-pnp and l-aspartate (see paper)
30% identity, 37% coverage: 96:193/263 of query aligns to 157:259/468 of 3c1mC

query
sites
3c1mC
L
 
I
L
 
I
S
 
T
A
 
D
D
 
N
D
 
N
F
 
F
D
 
G
S
 
S
R
 
A
R
 
R
R
 
V
T
 
K
R
 
R
-
 
L
H
 
E
A
 
V
R
 
K
N
 
E
A
 
R
V
 
L
E
 
L
E
 
P
L
 
L
L
 
L
K
 
K
H
 
E
R
 
G
V
 
I
V
 
I
P
 
P
I
 
V
V
 
V
N
 
T
E
 
-
N
 
G
D
x
F
V
 
I
V
 
G
A
 
T
T
 
T
E
 
E
E
 
E
-
 
G
-
 
Y
-
 
I
-
 
T
-
 
T
L
 
L
V
 
G
F
x
R
G
|
G
D
 
G
N
x
S
D
 
D
R
 
Y
L
 
S
S
 
A
A
 
A
H
 
L
V
 
I
A
 
G
H
 
Y
Y
 
G
F
 
L
D
 
D
A
 
A
D
 
D
L
 
I
L
 
I
V
 
E
I
 
I
L
 
W
S
x
T
D
|
D
I
 
V
D
 
S
G
 
G
Y
 
V
Y
|
Y
D
 
T
K
 
T
D
|
D
P
|
P
H
x
R
R
 
L
Y
 
V
P
 
P
D
 
T
A
 
A
R
 
R
L
 
R
R
 
I
K
 
P
V
 
K
V
 
L
C
 
S
A
 
Y
L
 
I
D
 
E
A
 
A
K
 
M
E
 
E
L
 
L

Sites not aligning to the query:

3c1nA Crystal structure of allosteric inhibition threonine-sensitive aspartokinase from methanococcus jannaschii with l-threonine (see paper)
30% identity, 37% coverage: 96:193/263 of query aligns to 156:258/458 of 3c1nA

query
sites
3c1nA
L
 
I
L
 
I
S
 
T
A
 
D
D
 
N
D
 
N
F
 
F
D
 
G
S
 
S
R
 
A
R
 
R
R
 
V
T
 
K
R
 
R
-
 
L
H
 
E
A
 
V
R
 
K
N
 
E
A
 
R
V
 
L
E
 
L
E
 
P
L
 
L
L
 
L
K
 
K
H
 
E
R
 
G
V
 
I
V
 
I
P
 
P
I
 
V
V
 
V
N
 
T
E
 
-
N
 
G
D
 
F
V
 
I
V
 
G
A
 
T
T
 
T
E
 
E
E
 
E
-
 
G
-
 
Y
-
 
I
-
 
T
-
 
T
L
 
L
V
 
G
F
 
R
G
 
G
D
 
G
N
 
S
D
 
D
R
 
Y
L
 
S
S
 
A
A
 
A
H
 
L
V
 
I
A
 
G
H
 
Y
Y
 
G
F
 
L
D
 
D
A
 
A
D
 
D
L
 
I
L
 
I
V
 
E
I
 
I
L
x
W
S
x
T
D
|
D
I
 
V
D
 
S
G
 
G
Y
 
V
Y
 
Y
D
 
T
K
 
T
D
 
D
P
 
P
H
 
R
R
 
L
Y
 
V
P
 
P
D
 
T
A
 
A
R
 
R
L
 
R
R
 
I
K
 
P
V
 
K
V
 
L
C
 
S
A
 
Y
L
 
I
D
 
E
A
 
A
K
 
M
E
 
E
L
 
L

Sites not aligning to the query:

2hmfA Structure of a threonine sensitive aspartokinase from methanococcus jannaschii complexed with mg-adp and aspartate (see paper)
30% identity, 37% coverage: 96:193/263 of query aligns to 157:259/464 of 2hmfA

query
sites
2hmfA
L
 
I
L
 
I
S
 
T
A
 
D
D
 
N
D
 
N
F
 
F
D
 
G
S
 
S
R
 
A
R
 
R
R
 
V
T
 
K
R
 
R
-
 
L
H
 
E
A
 
V
R
 
K
N
 
E
A
 
R
V
 
L
E
 
L
E
 
P
L
 
L
L
 
L
K
 
K
H
 
E
R
 
G
V
 
I
V
 
I
P
 
P
I
 
V
V
 
V
N
 
T
E
 
-
N
 
G
D
x
F
V
 
I
V
 
G
A
 
T
T
 
T
E
 
E
E
 
E
-
 
G
-
 
Y
-
 
I
-
 
T
-
 
T
L
 
L
V
 
G
F
x
R
G
|
G
D
 
G
N
x
S
D
 
D
R
 
Y
L
 
S
S
 
A
A
 
A
H
 
L
V
 
I
A
 
G
H
 
Y
Y
 
G
F
 
L
D
 
D
A
 
A
D
 
D
L
 
I
L
 
I
V
 
E
I
 
I
L
 
W
S
x
T
D
|
D
I
x
V
D
 
S
G
 
G
Y
 
V
Y
|
Y
D
 
T
K
x
T
D
|
D
P
|
P
H
x
R
R
 
L
Y
 
V
P
 
P
D
 
T
A
 
A
R
 
R
L
 
R
R
 
I
K
 
P
V
 
K
V
 
L
C
 
S
A
 
Y
L
 
I
D
 
E
A
 
A
K
 
M
E
 
E
L
 
L

Sites not aligning to the query:

3ll5A Crystal structure of t. Acidophilum isopentenyl phosphate kinase product complex (see paper)
22% identity, 77% coverage: 4:206/263 of query aligns to 3:207/233 of 3ll5A

query
sites
3ll5A
I
 
M
V
 
I
I
 
L
K
|
K
V
 
I
G
|
G
S
x
G
H
x
S
V
 
V
L
 
I
T
 
T
E
 
D
E
x
K
G
 
S
E
 
A
I
 
Y
A
 
R
L
 
T
E
 
A
R
 
R
M
 
T
R
 
Y
A
 
A
L
 
I
V
 
R
D
 
S
L
 
I
I
 
V
A
 
K
D
 
-
L
 
V
I
 
L
R
 
S
G
 
G
G
 
I
R
 
E
E
 
D
V
 
L
I
 
V
L
 
C
V
 
V
S
 
V
S
 
H
G
|
G
A
x
G
V
x
G
A
 
S
A
 
F
G
|
G
Y
x
H
T
 
I
Q
 
K
L
 
-
R
 
A
L
 
M
D
 
E
R
 
F
S
 
G
D
 
L
V
 
P
A
 
G
Q
 
P
K
 
K
Q
 
N
A
 
P
L
 
R
A
 
S
A
 
S
I
 
I
G
 
G
Q
 
Y
P
 
S
Y
 
I
L
 
V
L
 
H
K
 
R
-
 
D
-
 
M
-
 
E
-
 
N
-
 
L
-
 
D
-
 
L
L
 
M
Y
 
V
Q
 
I
S
 
D
K
 
A
F
 
M
A
 
I
H
 
E
H
 
M
G
 
G
I
 
M
L
 
R
S
 
P
A
 
I
Q
 
S
L
 
V
L
 
P
L
 
I
S
 
S
A
 
A
D
 
L
D
 
R
F
 
Y
D
 
D
S
 
G
R
 
R
R
 
-
R
 
-
T
 
-
R
 
-
H
 
F
A
 
D
R
 
Y
N
 
T
A
 
P
V
 
L
E
 
I
E
 
R
L
 
Y
L
 
I
K
 
D
H
 
A
R
 
G
V
 
F
V
 
V
P
 
P
I
 
-
V
 
V
N
 
S
E
 
Y
N
x
G
D
 
D
V
 
V
V
 
Y
A
 
I
T
 
K
E
 
D
E
 
E
L
 
H
V
 
S
F
 
Y
G
 
G
-
 
I
-
 
Y
D
x
S
N
x
G
D
 
D
R
 
D
L
 
I
S
 
M
A
 
A
H
 
D
V
 
M
A
 
A
H
 
E
Y
 
L
F
 
L
D
 
K
A
 
P
D
 
D
L
 
V
L
 
A
V
 
V
I
 
F
L
 
L
S
 
T
D
|
D
I
 
V
D
 
D
G
 
G
Y
 
I
Y
|
Y
D
 
S
K
 
K
D
|
D
P
|
P
H
x
K
R
 
R
Y
 
N
P
 
P
D
 
D
A
 
A
R
 
V
L
 
L
R
 
L
K
 
R
V
 
D
V
 
I
C
 
D
A
 
T
L
 
N
D
x
I
A
 
G
K
 
K
E
x
K
L
 
F
E
 
E
A
 
S
E
 
M
C
 
V
T
 
K
P
 
M
H
 
K
N
 
S
A
 
S
F
 
V
A
 
K
T
 
N
G
 
G

Query Sequence

>WP_013553403.1 NCBI__GCF_000186245.1:WP_013553403.1
MKRIVIKVGSHVLTEEGEIALERMRALVDLIADLIRGGREVILVSSGAVAAGYTQLRLDR
SDVAQKQALAAIGQPYLLKLYQSKFAHHGILSAQLLLSADDFDSRRRTRHARNAVEELLK
HRVVPIVNENDVVATEELVFGDNDRLSAHVAHYFDADLLVILSDIDGYYDKDPHRYPDAR
LRKVVCALDAKELEAECTPHNAFATGGIVTKLQAADFLLKRGGRMFLASGFDLADVQSLL
LEGVHRGGTLFESSDARRGEEDE

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory