SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_013644771.1 NCBI__GCF_000191585.1:WP_013644771.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1ct9A Crystal structure of asparagine synthetase b from escherichia coli (see paper)
30% identity, 91% coverage: 25:475/495 of query aligns to 25:437/497 of 1ct9A

query
sites
1ct9A
K
 
R
T
 
L
M
 
M
E
 
R
H
 
H
R
 
R
G
 
G
P
 
P
D
 
D
G
 
W
S
 
S
R
 
G
I
 
I
C
 
Y
L
 
-
D
 
-
G
 
-
K
 
-
L
 
-
V
 
-
T
 
-
G
 
-
D
 
-
L
 
-
E
 
-
T
 
A
T
 
S
D
 
D
L
 
-
P
 
-
F
 
-
A
 
-
N
 
N
I
 
A
G
 
I
L
 
L
G
 
A
H
 
H
N
 
E
L
x
R
L
|
L
S
 
S
I
|
I
V
|
V
G
 
D
T
 
V
E
 
N
V
 
A
-
 
G
S
 
A
Q
 
Q
P
 
P
L
 
L
V
 
Y
-
 
N
-
 
Q
K
 
Q
H
 
K
G
 
T
L
 
H
V
 
V
L
 
L
V
 
A
A
 
V
N
|
N
A
x
G
E
|
E
I
 
I
Y
 
Y
N
 
N
Y
 
H
R
 
Q
E
 
A
L
 
L
K
 
R
N
 
A
F
 
E
Y
 
Y
D
 
G
E
 
D
C
 
R
Y
 
Y
F
 
Q
-
 
F
-
 
Q
T
 
T
D
 
G
S
 
S
D
|
D
C
 
C
E
 
E
V
 
V
I
 
I
L
 
L
T
 
A
L
 
L
V
 
Y
N
 
Q
K
 
E
Y
 
K
Y
 
G
K
 
P
N
 
E
S
 
F
L
 
L
V
 
D
D
 
D
A
 
-
V
 
-
N
 
-
T
 
-
T
 
-
I
 
-
K
 
-
E
 
-
L
 
L
D
 
Q
G
 
G
D
 
M
Y
 
F
A
 
A
F
 
F
A
 
A
I
 
L
S
 
Y
N
 
D
G
 
S
K
 
E
E
 
K
-
 
D
-
 
A
L
 
Y
V
 
L
V
 
I
V
 
G
R
 
R
D
 
D
E
 
H
L
 
L
G
 
G
V
 
I
K
 
I
P
 
P
V
 
L
Y
 
Y
Y
 
M
A
 
G
T
 
Y
D
 
D
H
 
E
K
 
H
R
 
G
D
 
Q
L
 
L
F
 
Y
A
 
V
F
 
-
A
 
A
S
 
S
E
 
E
R
 
M
K
 
K
A
 
A
L
 
L
W
 
V
K
 
P
L
 
V
G
 
-
I
 
C
K
 
R
D
 
T
V
 
I
N
 
K
V
 
E
L
 
F
K
 
P
P
 
A
G
 
G
E
 
S
M
 
Y
I
 
L
L
 
W
N
 
S
N
 
Q
K
 
D
T
 
G
I
 
E
S
 
I
K
 
R
P
 
S
Q
 
Y
T
 
Y
K
 
H
K
 
R
K
 
D
T
 
W
M
 
F
P
 
D
I
 
Y
P
 
D
N
 
A
V
 
V
R
 
K
D
 
D
G
 
N
N
 
V
E
 
T
S
 
D
F
 
-
P
 
-
Q
 
-
Y
 
-
G
 
-
S
 
-
N
 
-
Y
 
-
Y
 
-
K
 
K
N
 
N
L
 
E
L
 
L
K
 
R
K
 
Q
V
 
A
L
 
L
I
 
E
D
 
D
S
 
S
V
 
V
K
 
K
K
 
S
R
 
H
V
 
L
V
 
M
G
 
S
L
 
D
D
 
V
R
 
P
V
 
Y
G
 
G
I
 
V
I
x
L
F
x
L
S
|
S
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
 
D
S
|
S
S
 
S
I
 
I
L
 
I
A
 
S
K
 
A
L
 
I
S
 
T
K
 
K
D
 
K
L
 
Y
E
 
A
V
 
L
E
 
H
T
 
S
F
 
F
L
 
-
Y
 
-
T
x
A
V
|
V
G
 
G
T
 
L
E
 
P
N
 
G
S
 
S
S
 
P
D
|
D
M
 
L
K
 
K
Y
 
A
A
 
A
K
 
Q
Q
 
E
V
 
V
A
 
A
N
 
N
S
 
H
L
 
L
-
 
G
-
 
T
-
 
V
-
 
H
-
 
H
-
 
E
-
 
I
D
 
H
L
 
F
P
 
T
L
 
V
K
 
Q
S
 
E
K
 
G
I
 
L
V
 
D
A
 
A
L
 
I
D
 
R
D
 
D
I
 
V
K
 
I
H
 
Y
Y
 
H
T
 
-
G
 
-
L
 
-
V
 
-
L
 
-
N
 
-
A
 
-
I
 
I
E
 
E
E
 
T
Y
 
Y
N
 
D
V
 
V
M
x
T
K
 
T
I
 
I
G
x
R
V
 
A
G
 
S
M
 
T
P
 
P
S
 
M
Y
 
Y
I
 
L
A
x
M
S
 
S
E
 
R
L
 
K
A
 
I
S
 
K
Q
 
A
D
 
M
G
 
G
I
 
I
R
 
K
V
 
M
M
 
V
L
 
L
S
|
S
G
|
G
Q
x
E
G
 
G
A
 
S
D
 
D
E
 
E
I
 
V
F
 
F
A
 
G
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
L
R
 
Y
Y
 
F
T
 
H
Q
 
K
F
 
A
-
 
P
-
 
N
Y
 
A
Q
 
K
E
 
E
Y
 
L
G
 
H
E
 
E
K
 
E
T
 
T
T
 
V
E
 
R
Y
 
K
L
 
L
E
 
L
A
 
A
D
 
-
V
 
-
S
 
-
N
 
-
L
 
L
Y
 
H
H
x
M
V
 
Y
N
 
D
L
 
C
Q
 
A
R
 
R
D
 
A
D
 
N
A
 
K
V
 
A
T
 
M
M
 
S
A
 
A
N
 
W
S
 
G
V
 
V
E
 
E
L
 
A
R
 
R
V
 
V
P
 
P
Y
 
F
L
 
L
D
 
D
S
 
K
K
 
K
V
 
F
V
 
L
N
 
D
V
 
V
G
 
A
L
 
M
N
 
R
I
 
I
P
 
N
M
 
P
K
 
Q
Y
 
D
K
 
K
L
 
M
G
 
C
H
 
-
D
 
-
P
 
-
D
 
-
D
 
K
L
 
M
R
 
E
K
 
K
C
 
H
I
 
I
L
 
L
R
 
R
R
 
E
L
 
-
A
 
C
L
 
F
D
 
E
L
 
A
E
 
Y
V
 
L
P
 
P
M
 
A
E
 
S
A
 
V
V
 
A
L
 
W
R
 
R
P
 
Q
K
 
K
K
 
E
A
 
-
A
 
-
Q
 
Q
Y
 
F
G
 
S
S
 
D
G
 
G
I
 
V

Sites not aligning to the query:

P22106 Asparagine synthetase B [glutamine-hydrolyzing]; AS-B; EC 6.3.5.4 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
28% identity, 96% coverage: 1:475/495 of query aligns to 1:457/554 of P22106

query
sites
P22106
M
|
M
C
|
C
A
 
S
I
 
I
A
 
F
G
 
G
I
 
V
L
 
F
S
 
D
I
 
I
N
 
K
G
 
T
K
 
D
Q
 
A
A
 
V
-
 
E
L
 
L
G
 
R
E
 
K
D
 
K
L
 
A
I
 
L
C
 
E
M
 
L
L
 
S
K
 
R
T
 
L
M
 
M
E
 
R
H
|
H
R
 
R
G
 
G
P
 
P
D
|
D
G
 
W
S
 
S
R
 
G
I
 
I
C
 
Y
L
 
A
D
 
S
G
 
D
K
 
N
L
 
A
V
 
I
T
 
-
G
 
-
D
 
-
L
 
-
E
 
-
T
 
-
T
 
-
D
 
-
L
 
-
P
 
-
F
 
-
A
 
-
N
 
-
I
 
-
G
 
-
L
 
L
G
 
A
H
 
H
N
 
E
L
 
R
L
 
L
S
 
S
I
 
I
V
 
V
G
 
D
T
 
V
E
 
N
V
 
A
-
 
G
S
 
A
Q
 
Q
P
 
P
L
 
L
V
 
Y
-
 
N
-
 
Q
K
 
Q
H
 
K
G
 
T
L
 
H
V
 
V
L
 
L
V
 
A
A
 
V
N
 
N
A
 
G
E
 
E
I
 
I
Y
 
Y
N
 
N
Y
x
H
R
 
Q
E
 
A
L
 
L
K
 
R
N
 
A
F
 
E
Y
 
Y
D
 
G
E
 
D
C
 
R
Y
 
Y
F
 
Q
-
 
F
-
 
Q
T
 
T
D
 
G
S
 
S
D
 
D
C
 
C
E
 
E
V
 
V
I
 
I
L
 
L
T
x
A
L
 
L
V
 
Y
N
 
Q
K
 
E
Y
 
K
Y
 
G
K
 
P
N
 
E
S
 
F
L
 
L
V
 
D
D
 
D
A
 
-
V
 
-
N
 
-
T
 
-
T
 
-
I
 
-
K
 
-
E
 
-
L
 
L
D
 
Q
G
 
G
D
 
M
Y
 
F
A
 
A
F
 
F
A
 
A
I
 
L
S
 
Y
N
 
D
G
 
S
K
 
E
E
 
K
-
 
D
-
 
A
L
 
Y
V
 
L
V
 
I
V
 
G
R
 
R
D
 
D
E
 
H
L
 
L
G
 
G
V
 
I
K
 
I
P
 
P
V
 
L
Y
 
Y
Y
 
M
A
 
G
T
 
Y
D
 
D
H
 
E
K
 
H
R
 
G
D
 
Q
L
 
L
F
 
Y
A
 
V
F
 
-
A
 
A
S
 
S
E
 
E
R
 
M
K
 
K
A
 
A
L
 
L
W
 
V
K
 
P
L
 
V
G
 
-
I
 
C
K
 
R
D
 
T
V
 
I
N
 
K
V
 
E
L
 
F
K
 
P
P
 
A
G
 
G
E
 
S
M
 
Y
I
 
L
L
 
W
N
 
S
N
 
Q
K
 
D
T
 
G
I
 
E
S
 
I
K
 
R
P
 
S
Q
 
Y
T
 
Y
K
 
H
K
 
R
K
 
D
T
 
W
M
 
F
P
 
D
I
 
Y
P
 
D
N
 
A
V
 
V
R
 
K
D
 
D
G
 
N
N
 
V
E
 
T
S
 
D
F
 
-
P
 
-
Q
 
-
Y
 
-
G
 
-
S
 
-
N
 
-
Y
 
-
Y
 
-
K
 
K
N
 
N
L
 
E
L
 
L
K
 
R
K
 
Q
V
 
A
L
 
L
I
 
E
D
 
D
S
 
S
V
 
V
K
 
K
K
 
S
R
 
H
V
 
L
V
 
M
G
 
S
L
 
D
D
 
V
R
 
P
V
 
Y
G
 
G
I
 
V
I
 
L
F
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
 
D
S
 
S
S
 
S
I
 
I
L
 
I
A
 
S
K
 
A
L
 
I
S
 
T
K
 
K
D
 
K
L
 
Y
E
 
A
V
 
A
-
 
R
-
 
R
-
 
V
-
 
E
-
 
D
-
 
Q
-
 
E
-
 
R
-
 
S
E
 
E
T
 
A
F
 
W
L
 
W
-
 
P
-
 
Q
-
 
L
-
 
H
-
 
S
Y
 
F
T
 
A
V
 
V
G
 
G
T
 
L
E
 
P
N
 
G
S
 
S
S
 
P
D
 
D
M
 
L
K
 
K
Y
 
A
A
 
A
K
 
Q
Q
 
E
V
 
V
A
 
A
N
 
N
S
 
H
L
 
L
-
 
G
-
 
T
-
 
V
-
 
H
-
 
H
-
 
E
-
 
I
D
 
H
L
 
F
P
 
T
L
 
V
K
 
Q
S
 
E
K
 
G
I
 
L
V
 
D
A
 
A
L
 
I
D
 
R
D
 
D
I
 
V
K
 
I
H
 
Y
Y
 
H
T
 
-
G
 
-
L
 
-
V
 
-
L
 
-
N
 
-
A
 
-
I
 
I
E
 
E
E
 
T
Y
 
Y
N
 
D
V
 
V
M
 
T
K
 
T
I
 
I
G
 
R
V
 
A
G
 
S
M
 
T
P
 
P
S
 
M
Y
 
Y
I
 
L
A
 
M
S
 
S
E
 
R
L
 
K
A
 
I
S
 
K
Q
 
A
D
 
M
G
 
G
I
 
I
R
 
K
V
 
M
M
 
V
L
 
L
S
 
S
G
 
G
Q
x
E
G
 
G
A
 
S
D
 
D
E
 
E
I
 
V
F
 
F
A
 
G
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
L
R
 
Y
Y
 
F
T
 
H
Q
 
K
F
 
A
-
 
P
-
 
N
Y
 
A
Q
 
K
E
 
E
Y
 
L
G
 
H
E
 
E
K
 
E
T
 
T
T
 
V
E
 
R
Y
 
K
L
 
L
E
 
L
A
 
A
D
 
-
V
 
-
S
 
-
N
 
-
L
 
L
Y
 
H
H
 
M
V
 
Y
N
 
D
L
 
C
Q
 
A
R
 
R
D
 
A
D
 
N
A
 
K
V
 
A
T
 
M
M
 
S
A
 
A
N
 
W
S
 
G
V
 
V
E
 
E
L
 
A
R
 
R
V
 
V
P
 
P
Y
 
F
L
 
L
D
 
D
S
 
K
K
 
K
V
 
F
V
 
L
N
 
D
V
 
V
G
 
A
L
 
M
N
 
R
I
 
I
P
 
N
M
 
P
K
 
Q
Y
 
D
K
 
K
L
 
M
G
 
C
H
 
G
D
 
N
P
 
-
D
 
G
D
 
K
L
 
M
R
 
E
K
 
K
C
 
H
I
 
I
L
 
L
R
 
R
R
 
E
L
 
-
A
 
C
L
 
F
D
 
E
L
 
A
E
 
Y
V
 
L
P
 
P
M
 
A
E
 
S
A
 
V
V
 
A
L
 
W
R
 
R
P
 
Q
K
 
K
K
 
E
A
 
-
A
 
-
Q
 
Q
Y
 
F
G
 
S
S
 
D
G
 
G
I
 
V

P78753 Probable asparagine synthetase [glutamine-hydrolyzing]; Glutamine-dependent asparagine synthetase; EC 6.3.5.4 from Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) (Fission yeast) (see paper)
29% identity, 88% coverage: 1:436/495 of query aligns to 1:429/557 of P78753

query
sites
P78753
M
 
M
C
 
C
A
 
G
I
 
I
A
 
L
G
 
A
I
 
V
L
 
H
S
 
H
I
 
V
N
 
A
G
 
E
K
 
D
-
 
I
Q
 
E
A
 
A
L
 
F
G
 
K
E
 
P
D
 
K
L
 
A
I
 
L
C
 
H
M
 
L
L
 
S
K
 
K
T
 
Q
M
 
L
E
 
R
H
 
H
R
 
R
G
 
G
P
 
P
D
 
D
G
 
W
S
 
S
R
 
G
I
 
K
C
 
A
L
 
I
D
 
R
G
 
N
K
 
Q
L
 
T
V
 
I
T
 
-
G
 
-
D
 
-
L
 
-
E
 
-
T
 
-
T
 
-
D
 
-
L
 
-
P
 
-
F
 
-
A
 
-
N
 
-
I
 
-
G
 
-
L
 
L
G
 
C
H
 
H
N
 
E
L
 
R
L
 
L
S
 
A
I
 
I
V
 
V
G
 
G
T
 
V
E
 
E
V
 
S
-
 
G
S
 
A
Q
 
Q
P
 
P
L
 
L
V
 
V
K
 
S
H
 
D
G
 
D
-
 
G
-
 
K
L
 
L
V
 
V
L
 
L
V
 
T
A
 
V
N
 
N
A
 
G
E
 
E
I
 
I
Y
 
Y
N
 
N
Y
 
H
R
 
L
E
 
K
L
 
L
K
 
R
-
 
E
N
 
N
F
 
L
Y
 
K
D
 
G
E
 
N
C
 
Y
Y
 
K
F
 
F
-
 
K
T
 
T
D
 
Y
S
 
S
D
 
D
C
 
C
E
 
E
V
 
V
I
 
I
L
 
L
T
 
Y
L
 
L
V
 
-
N
 
-
K
 
-
Y
 
-
Y
 
Y
K
 
R
N
 
E
S
 
H
L
 
G
V
 
P
D
 
A
A
 
C
V
 
A
N
 
N
T
 
M
T
 
-
I
 
-
K
 
-
E
 
-
L
 
L
D
 
D
G
 
G
D
 
M
Y
 
F
A
 
S
F
 
W
A
 
V
I
 
L
-
 
Y
-
 
D
S
 
Q
N
 
D
G
 
K
K
 
D
E
 
K
L
 
V
V
 
V
V
 
A
V
 
A
R
 
R
D
 
D
E
 
P
L
 
I
G
 
G
V
 
I
K
 
T
P
 
T
V
 
L
Y
 
Y
-
 
Q
-
 
G
Y
 
F
A
 
S
T
 
S
D
 
D
H
 
S
K
 
P
R
 
-
D
 
D
L
 
T
F
 
A
A
 
Y
F
 
F
A
 
A
S
 
S
E
 
E
R
 
L
K
 
K
A
 
A
L
 
L
W
 
H
K
 
P
L
 
V
G
 
C
I
 
D
K
 
K
D
 
-
V
 
I
N
 
I
V
 
A
L
 
F
K
 
P
P
 
P
G
 
G
E
 
H
M
 
Y
I
 
Y
L
 
-
N
 
-
N
 
-
K
 
-
T
 
-
I
 
-
S
 
-
K
 
D
P
 
S
Q
 
E
T
 
T
K
 
K
K
 
Q
K
 
T
T
 
V
M
 
R
P
 
Y
I
 
F
-
 
K
P
 
P
N
 
S
V
 
W
R
 
W
D
 
D
G
 
E
N
 
N
E
 
K
S
 
-
F
 
I
P
 
P
Q
 
S
Y
 
N
G
 
P
S
 
V
N
 
D
Y
 
Y
Y
 
-
K
 
-
N
 
K
L
 
L
L
 
L
K
 
R
K
 
E
V
 
T
L
 
L
I
 
E
D
 
A
S
 
S
V
 
V
K
 
R
K
 
K
R
 
R
V
 
L
V
 
M
G
 
A
L
 
E
D
 
V
R
 
P
V
 
Y
G
 
G
I
 
V
I
 
L
F
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
 
D
S
 
S
S
 
S
I
 
L
L
 
I
A
 
A
K
 
S
L
 
I
-
 
A
-
 
A
-
 
R
-
 
E
-
 
T
-
 
E
-
 
K
-
 
L
-
 
A
-
 
N
-
 
S
-
 
T
S
 
S
K
 
Q
D
 
S
L
 
E
E
 
E
V
 
A
E
 
R
T
 
T
F
 
I
L
 
T
-
 
A
-
 
W
-
 
P
-
 
K
-
 
L
-
 
H
-
 
S
Y
 
F
T
 
A
V
 
I
G
 
G
T
 
L
E
 
P
N
 
G
S
 
S
S
 
P
D
 
D
M
 
L
K
 
L
Y
 
A
A
 
A
K
 
R
Q
 
K
V
 
V
A
 
A
N
 
D
S
 
F
L
 
L
D
 
H
L
 
T
P
 
F
L
 
H
K
 
H
S
 
E
K
 
H
I
 
T
V
 
F
A
 
T
L
 
I
D
 
D
D
 
E
I
 
G
K
 
L
H
 
D
Y
 
A
T
 
L
G
 
R
L
 
D
V
 
V
L
 
I
N
 
Y
A
 
H
I
 
L
E
 
E
E
 
T
Y
 
Y
N
 
D
V
 
V
M
 
T
K
 
T
I
 
I
G
 
R
V
 
A
G
 
S
M
 
T
P
 
P
S
 
M
Y
 
Y
I
 
L
A
 
L
S
 
S
E
 
R
L
 
K
A
 
I
S
 
K
Q
 
A
D
 
Q
G
 
G
I
 
V
R
 
K
V
 
M
M
 
V
L
 
L
S
 
S
G
 
G
Q
 
E
G
 
G
A
 
S
D
 
D
E
 
E
I
 
I
F
 
F
A
 
G
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
L
R
 
Y
Y
 
F
-
 
G
-
 
N
-
 
A
-
 
P
-
 
S
-
 
R
T
 
E
Q
 
A
F
 
F
Y
 
H
Q
 
S
E
 
E
Y
 
C
G
 
V
E
 
R
K
 
R
T
 
-
T
 
-
E
 
-
Y
 
-
L
 
-
E
 
-
A
 
-
D
 
-
V
 
V
S
 
K
N
 
N
L
 
L
Y
 
H
H
 
L
V
x
S
N
 
D
L
 
C
Q
 
L
R
 
R
D
 
A
D
 
N
A
 
K
V
 
S
T
 
T
M
 
M
A
 
A
N
 
W
S
 
G
V
 
L
E
 
E
L
 
A
R
 
R
V
 
V
P
 
P
Y
 
F
L
 
L
D
 
D
S
 
K
K
 
D
V
 
F
V
 
L
N
 
E
V
 
V
G
 
A
L
 
L
N
 
N
I
 
I
P
 
D
M
 
P
K
 
E
Y
 
E
K
 
K
L
 
M

Sites not aligning to the query:

P08243 Asparagine synthetase [glutamine-hydrolyzing]; Cell cycle control protein TS11; Glutamine-dependent asparagine synthetase; EC 6.3.5.4 from Homo sapiens (Human) (see 7 papers)
29% identity, 96% coverage: 1:475/495 of query aligns to 1:474/561 of P08243

query
sites
P08243
M
 
M
C
|
C
A
 
G
I
 
I
A
 
W
G
x
A
I
 
L
L
 
F
S
 
G
I
 
S
N
 
D
G
 
-
K
 
-
Q
 
D
A
 
C
L
 
L
G
 
S
E
 
V
D
 
Q
L
 
C
I
 
L
C
 
S
M
 
A
L
 
M
K
 
K
T
 
-
M
 
I
E
 
A
H
 
H
R
 
R
G
 
G
P
 
P
D
 
D
G
 
A
S
 
F
R
 
R
I
 
F
C
 
-
L
 
-
D
 
-
G
 
-
K
 
E
L
 
N
V
 
V
T
 
N
G
 
G
D
 
-
L
 
-
E
 
-
T
 
-
T
 
-
D
 
-
L
 
-
P
 
-
F
 
Y
A
 
T
N
 
N
I
 
C
G
 
C
L
 
F
G
 
G
H
 
F
N
 
H
L
 
R
L
 
L
S
 
A
I
 
V
V
 
V
G
 
D
T
 
P
E
 
L
V
 
F
S
 
G
-
 
M
Q
 
Q
P
 
P
L
 
I
-
 
R
V
 
V
K
 
K
H
 
K
G
 
Y
-
 
P
-
 
Y
L
 
L
V
 
W
L
 
L
V
 
C
A
 
Y
N
 
N
A
 
G
E
 
E
I
 
I
Y
 
Y
N
 
N
Y
 
H
R
 
K
E
 
K
L
 
M
K
 
Q
N
 
Q
F
 
H
Y
 
F
D
 
E
E
 
F
C
 
E
Y
 
Y
F
 
Q
T
 
T
D
 
K
S
 
V
D
 
D
C
 
G
E
 
E
V
 
I
I
 
I
L
 
L
T
 
H
L
 
L
V
 
Y
N
 
D
K
 
K
Y
 
-
Y
 
-
K
 
-
N
 
-
S
 
-
L
 
-
V
 
-
D
 
G
A
 
G
V
 
I
N
 
E
T
 
Q
T
 
T
I
 
I
K
 
C
E
 
M
L
 
L
D
 
D
G
 
G
D
 
V
Y
 
F
A
 
A
F
 
F
A
 
V
I
 
L
-
 
L
-
 
D
S
 
T
N
 
A
G
 
N
K
 
K
E
 
K
L
 
V
V
 
F
V
 
L
V
 
G
R
 
R
D
 
D
E
 
T
L
 
Y
G
 
G
V
 
V
K
 
R
P
 
P
V
 
L
Y
 
F
Y
 
K
A
 
A
T
 
M
D
 
T
H
 
-
K
 
E
R
 
D
D
 
G
L
 
F
F
 
L
A
 
A
F
 
V
A
 
C
S
 
S
E
 
E
R
 
A
K
 
K
A
 
G
L
 
L
W
 
V
K
 
T
L
 
L
G
 
K
I
 
H
K
 
S
D
 
A
V
 
T
N
 
P
V
 
F
L
 
L
K
 
K
-
 
V
-
 
E
-
 
P
-
 
F
-
 
L
P
 
P
G
 
G
-
 
H
-
 
Y
-
 
E
-
 
V
-
 
L
E
 
D
M
 
L
I
 
K
L
 
P
N
 
N
N
 
G
K
 
K
T
 
V
I
 
A
S
 
S
K
 
V
P
 
E
Q
 
M
T
 
V
K
 
K
K
 
Y
-
 
H
-
 
H
-
 
C
K
 
R
T
 
D
M
x
V
P
 
P
I
 
L
P
 
H
N
 
A
V
 
L
R
 
Y
D
 
D
G
 
N
N
 
V
E
 
E
S
 
K
-
 
L
F
 
F
P
 
P
Q
 
G
Y
 
F
G
 
E
S
 
I
N
 
E
Y
 
T
Y
 
V
K
 
K
N
 
N
L
 
N
L
 
L
K
 
R
K
 
I
V
 
L
L
 
F
I
 
N
D
 
N
S
 
A
V
 
V
K
 
K
K
 
K
R
 
R
V
 
L
V
 
M
G
 
T
L
 
D
D
 
R
R
 
R
V
 
I
G
 
G
I
 
C
I
 
L
F
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
 
D
S
 
S
S
 
S
I
 
L
L
 
V
A
 
A
-
 
A
-
 
T
-
 
L
-
 
L
K
 
K
L
 
Q
S
 
L
K
 
K
D
 
E
L
 
A
E
 
Q
V
 
V
E
 
Q
T
 
Y
F
 
P
L
 
L
-
 
Q
-
 
T
Y
 
F
T
 
A
V
 
I
G
 
G
T
 
M
E
 
E
N
 
D
S
 
S
S
 
P
D
 
D
M
 
L
K
 
L
Y
 
A
A
 
A
K
 
R
Q
 
K
V
 
V
A
 
A
N
 
D
S
 
H
L
 
I
-
 
G
-
 
S
-
 
E
-
 
H
-
 
Y
D
 
E
L
 
V
P
 
L
L
 
F
K
 
N
S
 
S
K
 
E
-
 
E
-
 
G
I
 
I
V
 
Q
A
 
A
L
 
L
D
 
D
D
 
E
I
 
-
K
 
-
H
 
-
Y
 
-
T
 
-
G
 
-
L
 
-
V
 
V
L
 
I
N
 
F
A
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
T
Y
 
Y
N
 
D
V
 
I
M
 
T
K
 
T
I
 
V
G
 
R
V
 
A
G
 
S
M
 
V
P
 
G
S
 
M
Y
 
Y
I
 
L
A
 
I
S
 
S
E
 
K
L
 
Y
A
 
I
S
 
R
Q
 
K
-
 
N
-
 
T
D
 
D
G
 
S
I
 
V
R
 
-
V
 
V
M
 
I
L
x
F
S
 
S
G
 
G
Q
 
E
G
 
G
A
 
S
D
 
D
E
 
E
I
 
L
F
 
T
A
 
Q
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
I
R
 
Y
Y
 
F
T
 
H
Q
 
K
F
 
-
Y
 
-
Q
 
A
E
 
P
Y
 
S
G
 
P
E
 
E
K
 
K
T
 
A
T
 
E
E
 
E
Y
 
E
L
 
S
E
 
E
A
 
R
D
 
L
V
 
L
S
 
R
N
 
E
L
 
L
Y
 
Y
H
 
L
V
 
F
N
 
D
L
 
V
Q
 
L
R
 
R
D
 
A
D
 
D
A
 
R
V
 
T
T
 
T
M
 
A
A
 
A
N
 
H
S
 
G
V
 
L
E
 
E
L
 
L
R
 
R
V
 
V
P
 
P
Y
 
F
L
 
L
D
 
D
S
 
H
K
 
R
V
 
F
V
 
S
N
 
S
V
 
Y
G
 
Y
L
 
L
N
 
S
I
 
L
P
 
P
M
 
P
K
 
E
Y
 
M
K
 
R
L
 
I
G
 
-
H
 
-
D
 
P
P
 
K
D
 
N
D
 
G
L
 
I
R
 
E
K
 
K
C
 
H
I
 
L
L
 
L
R
 
R
R
 
E
L
 
T
A
 
F
L
 
E
D
 
D
L
 
S
E
 
N
-
 
L
V
 
I
P
 
P
M
 
K
E
 
E
A
 
I
V
 
L
L
 
W
R
 
R
P
 
P
K
 
K
K
 
E
A
 
A
A
 
-
Q
 
-
Y
 
F
G
 
S
S
 
D
G
 
G
I
 
I

Sites not aligning to the query:

6gq3A Human asparagine synthetase (asns) in complex with 6-diazo-5-oxo-l- norleucine (don) at 1.85 a resolution (see paper)
28% identity, 93% coverage: 5:465/495 of query aligns to 1:453/509 of 6gq3A

query
sites
6gq3A
A
x
C
G
 
G
I
 
I
L
x
W
S
 
A
I
 
L
N
 
F
G
 
G
K
 
S
Q
 
D
-
 
D
A
 
C
L
 
L
G
 
S
E
 
V
D
 
Q
L
 
C
I
 
L
C
 
S
M
 
A
L
 
M
K
 
K
T
 
-
M
 
I
E
 
A
H
 
H
R
 
R
G
 
G
P
 
P
D
 
D
G
 
A
S
 
F
R
 
R
I
 
F
C
 
-
L
 
-
D
 
-
G
 
-
K
 
E
L
 
N
V
 
V
T
 
N
G
 
G
D
 
-
L
 
-
E
 
-
T
 
-
T
 
-
D
 
-
L
 
-
P
 
-
F
 
Y
A
 
T
N
 
N
I
 
C
G
 
C
L
 
F
G
 
G
H
 
F
N
 
H
L
x
R
L
|
L
S
 
A
I
x
V
V
|
V
G
 
D
T
 
P
E
 
L
V
 
F
S
 
G
-
 
M
Q
 
Q
P
 
P
L
 
I
-
 
R
V
 
V
K
 
K
H
 
K
G
 
Y
-
 
P
-
 
Y
L
 
L
V
 
W
L
 
L
V
 
C
A
x
Y
N
|
N
A
x
G
E
|
E
I
 
I
Y
 
Y
N
 
N
Y
 
H
R
 
K
E
 
K
L
 
M
K
 
Q
N
 
Q
F
 
H
Y
 
F
D
 
E
E
 
F
C
 
E
Y
 
Y
F
 
Q
T
 
T
D
 
K
S
x
V
D
|
D
C
 
G
E
 
E
V
 
I
I
 
I
L
 
L
T
 
H
L
 
L
V
 
Y
N
 
D
K
 
K
Y
 
-
Y
 
-
K
 
-
N
 
-
S
 
-
L
 
-
V
 
-
D
 
G
A
 
G
V
 
I
N
 
E
T
 
Q
T
 
T
I
 
I
K
 
C
E
 
M
L
 
L
D
 
D
G
 
G
D
 
V
Y
 
F
A
 
A
F
 
F
A
 
V
I
 
L
-
 
L
-
 
D
S
 
T
N
 
A
G
 
N
K
 
K
E
 
K
L
 
V
V
 
F
V
 
L
V
 
G
R
 
R
D
 
D
E
 
T
L
 
Y
G
 
G
V
 
V
K
 
R
P
 
P
V
 
L
Y
 
F
Y
 
K
A
 
A
T
 
M
D
 
T
H
 
-
K
 
E
R
 
D
D
 
G
L
 
F
F
 
L
A
 
A
F
 
V
A
 
C
S
 
S
E
 
E
R
 
A
K
 
K
A
 
G
L
 
L
W
 
V
K
 
T
L
 
L
G
 
K
I
 
H
K
 
S
D
 
A
V
 
T
N
 
P
V
 
F
L
 
L
K
 
K
P
 
V
G
 
E
E
 
P
M
 
F
I
 
L
L
 
P
N
 
G
N
 
H
K
 
Y
T
 
E
I
 
V
S
 
L
-
 
D
-
 
L
K
 
K
P
 
P
Q
 
N
T
 
G
K
 
K
K
 
V
K
 
A
T
 
S
M
 
V
P
 
E
I
 
M
P
 
V
N
 
K
V
 
Y
R
 
H
D
 
H
G
 
C
N
 
R
E
 
D
S
 
V
F
 
F
P
 
P
Q
 
G
Y
 
F
G
 
E
S
 
I
N
 
E
Y
 
T
Y
 
V
K
 
K
N
 
N
L
 
N
L
 
L
K
 
R
K
 
I
V
 
L
L
 
F
I
 
N
D
 
N
S
 
A
V
 
V
K
 
K
K
 
K
R
 
R
V
 
L
V
 
M
G
 
T
L
 
D
D
 
R
R
 
R
V
 
I
G
 
G
I
 
C
I
 
L
F
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
 
D
S
 
S
S
 
S
I
 
L
L
 
V
A
 
A
-
 
A
-
 
T
-
 
L
-
 
L
K
 
K
L
 
Q
S
 
L
K
 
K
D
 
E
L
 
A
E
 
Q
V
 
V
E
 
Q
T
 
Y
F
 
P
L
 
L
-
 
Q
-
 
T
Y
 
F
T
 
A
V
 
I
G
 
G
T
 
M
E
 
E
N
 
D
S
 
S
S
 
P
D
 
D
M
 
L
K
 
L
Y
 
A
A
 
A
K
 
R
Q
 
K
V
 
V
A
 
A
N
 
D
S
 
H
L
 
I
-
 
G
-
 
S
-
 
E
-
 
H
-
 
Y
D
 
E
L
 
V
P
 
L
L
 
F
K
 
N
S
 
S
K
 
E
-
 
E
-
 
G
I
 
I
V
 
Q
A
 
A
L
 
L
D
 
D
D
 
E
I
 
-
K
 
-
H
 
-
Y
 
-
T
 
-
G
 
-
L
 
-
V
 
V
L
 
I
N
 
F
A
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
T
Y
 
Y
N
 
D
V
 
I
M
x
T
K
 
T
I
 
V
G
x
R
V
 
A
G
 
S
M
 
V
P
 
G
S
 
M
Y
 
Y
I
 
L
A
 
I
S
 
S
E
 
K
L
 
Y
A
 
I
S
 
R
Q
 
K
-
 
N
-
 
T
D
 
D
G
 
S
I
 
V
R
 
-
V
 
V
M
 
I
L
 
F
S
 
S
G
 
G
Q
 
E
G
 
G
A
 
S
D
 
D
E
 
E
I
 
L
F
 
T
A
 
Q
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
I
R
 
Y
Y
 
F
T
 
H
Q
 
K
F
 
-
Y
 
-
Q
 
A
E
 
P
Y
 
S
G
 
P
E
 
E
K
 
K
T
 
A
T
 
E
E
 
E
Y
 
E
L
 
S
E
 
E
A
 
R
D
 
L
V
 
L
S
 
R
N
 
E
L
 
L
Y
 
Y
H
 
L
V
 
F
N
 
D
L
 
V
Q
 
L
R
 
R
D
 
A
D
 
D
A
 
R
V
 
T
T
 
T
M
 
A
A
 
A
N
 
H
S
 
G
V
 
L
E
 
E
L
 
L
R
 
R
V
 
V
P
 
P
Y
 
F
L
 
L
D
 
D
S
 
H
K
 
R
V
 
F
V
 
S
N
 
S
V
 
Y
G
 
Y
L
 
L
N
 
S
I
 
L
P
 
P
M
 
P
K
 
E
Y
 
M
K
 
R
L
 
I
G
 
-
H
 
-
D
 
P
P
 
K
D
 
N
D
 
G
L
 
I
R
 
E
K
 
K
C
 
H
I
 
L
L
 
L
R
 
R
R
 
E
L
 
T
A
 
F
L
 
E
D
 
D
L
 
S
E
 
N
-
 
L
V
 
I
P
 
P
M
 
K
E
 
E
A
 
I
V
 
L
L
 
W
R
 
R
P
 
P

1q19A Carbapenam synthetase (see paper)
25% identity, 76% coverage: 101:477/495 of query aligns to 74:453/500 of 1q19A

query
sites
1q19A
E
 
E
C
 
A
Y
 
Y
F
 
L
T
 
A
D
 
N
S
 
-
D
 
D
C
 
A
E
 
E
V
 
L
I
 
L
L
 
A
T
 
L
L
 
L
V
 
F
N
 
T
K
 
R
Y
 
L
Y
 
G
K
 
A
N
 
N
S
 
A
L
 
L
V
 
A
D
 
L
A
 
A
V
 
-
N
 
-
T
 
-
T
 
-
I
 
-
K
 
-
E
 
-
L
 
-
D
 
E
G
 
G
D
 
D
Y
 
F
A
 
C
F
 
F
A
 
F
I
 
I
S
 
D
-
 
E
-
 
P
N
 
N
G
 
G
K
 
-
E
 
E
L
 
L
V
 
T
V
 
V
V
 
I
R
 
T
D
 
E
E
 
S
L
 
R
G
 
G
V
 
F
K
 
S
P
 
P
V
 
V
Y
 
H
Y
 
V
A
 
V
T
 
Q
D
 
G
H
 
K
K
 
K
R
 
A
-
 
W
-
 
M
-
 
T
-
 
N
-
 
S
-
 
L
D
 
K
L
 
L
F
 
V
A
 
T
F
 
A
A
 
A
S
 
E
E
 
G
R
 
E
K
 
G
A
 
A
L
 
L
W
 
W
-
 
F
-
 
E
-
 
E
-
 
E
-
 
A
-
 
L
-
 
V
-
 
C
-
 
Q
-
 
S
-
 
L
-
 
M
-
 
R
-
 
A
-
 
D
-
 
T
K
 
Y
L
 
T
G
 
P
I
 
V
K
 
K
D
 
N
V
 
A
N
 
Q
V
 
R
L
 
L
K
 
K
P
 
P
G
 
G
E
 
A
-
 
V
-
 
H
-
 
V
M
 
L
I
 
T
L
 
H
N
 
D
N
 
S
K
 
E
T
 
G
I
 
Y
S
 
S
K
 
F
P
 
V
Q
 
E
T
 
S
K
 
R
K
 
T
K
 
L
T
 
T
M
 
T
P
 
P
I
 
A
P
 
S
N
 
N
V
 
Q
R
 
L
D
 
L
G
 
A
N
 
L
E
 
P
S
 
R
F
 
E
P
 
P
Q
 
L
Y
 
L
G
 
A
S
 
-
N
 
-
Y
 
-
Y
 
-
K
 
-
N
 
-
L
 
L
L
 
I
K
 
D
K
 
R
V
 
Y
L
 
L
I
 
N
D
 
A
S
 
P
V
 
L
K
 
E
K
 
D
R
 
L
V
 
A
V
 
P
G
 
R
L
 
F
D
 
D
R
 
T
V
 
V
G
 
G
I
 
I
I
x
P
F
x
L
S
|
S
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
|
D
S
|
S
S
 
S
I
 
L
L
 
V
A
 
T
K
 
A
L
 
L
S
 
A
K
 
S
D
 
R
L
 
H
E
 
F
V
 
K
E
 
K
T
 
L
F
 
N
L
 
T
Y
 
Y
T
x
S
V
x
I
G
 
G
T
 
T
E
 
E
N
 
L
S
 
S
S
 
N
D
 
E
M
 
F
K
 
E
Y
 
F
A
 
S
K
 
Q
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
N
 
D
S
 
A
L
 
L
D
 
G
L
 
T
P
 
H
L
 
H
K
 
Q
S
 
M
K
 
K
I
 
I
V
 
L
A
 
S
L
 
E
D
 
T
D
 
E
I
 
-
K
 
-
H
 
-
Y
 
-
T
 
-
G
 
-
L
 
-
V
 
V
L
 
I
N
 
N
A
 
G
I
 
I
E
 
I
E
 
E
-
 
S
-
 
I
-
 
Y
Y
 
Y
N
 
N
V
 
-
M
 
-
K
 
E
I
 
I
G
 
F
V
 
D
G
 
G
M
x
L
P
 
S
S
 
A
Y
x
E
I
 
I
A
 
Q
S
 
S
E
 
G
L
 
L
-
 
F
-
 
N
-
 
V
-
 
Y
-
 
R
A
 
Q
S
 
A
Q
 
Q
D
 
G
G
 
Q
I
 
V
R
 
S
V
 
C
M
 
M
L
 
L
S
x
T
G
|
G
Q
x
Y
G
|
G
A
 
S
D
|
D
E
x
L
I
 
L
F
 
F
A
 
G
G
 
G
Y
 
I
Q
 
L
R
 
K
Y
 
P
T
 
G
Q
 
A
F
 
Q
Y
 
Y
Q
 
D
E
 
N
Y
 
P
G
 
N
E
 
Q
K
 
L
T
 
L
T
 
A
E
 
E
Y
 
-
L
 
-
E
 
-
A
 
-
D
 
-
V
 
-
S
 
-
N
 
Q
L
 
V
Y
 
Y
H
x
R
V
 
T
N
 
R
L
 
W
Q
 
T
R
 
G
D
x
E
D
 
F
A
 
A
V
 
T
T
 
H
M
 
G
A
 
A
N
 
S
-
 
C
-
 
Y
S
 
G
V
 
I
E
 
D
L
 
I
R
 
R
V
 
H
P
 
P
Y
 
F
L
 
W
D
 
S
S
 
H
K
 
S
V
 
L
V
 
I
N
 
S
V
 
L
G
 
C
L
 
H
N
 
A
I
 
L
P
 
H
M
 
P
K
 
D
Y
 
Y
K
 
K
L
 
I
G
 
F
H
 
-
D
 
-
P
 
-
D
 
D
D
 
N
L
 
E
R
 
V
K
 
K
C
 
N
I
 
I
L
 
L
R
 
R
R
 
E
L
 
Y
A
 
A
L
 
D
D
 
S
L
 
L
E
 
Q
-
 
L
V
 
L
P
 
P
M
 
K
E
 
D
A
 
I
V
 
V
L
 
W
R
 
R
P
 
K
K
|
K
K
x
I
A
x
G
A
x
I
Q
 
H
Y
 
E
G
 
G
S
 
S
G
 
S
I
 
V
H
 
N
R
 
Q

Sites not aligning to the query:

Q9XB61 Carbapenam-3-carboxylate synthase; Carbapenam-3-carboxylate ligase; EC 6.3.3.6 from Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum (Erwinia carotovora subsp. carotovora) (see 3 papers)
25% identity, 76% coverage: 101:477/495 of query aligns to 75:454/503 of Q9XB61

query
sites
Q9XB61
E
 
E
C
 
A
Y
 
Y
F
 
L
T
 
A
D
 
N
S
 
-
D
 
D
C
 
A
E
 
E
V
 
L
I
 
L
L
 
A
T
 
L
L
 
L
V
 
F
N
 
T
K
 
R
Y
 
L
Y
 
G
K
 
A
N
 
N
S
 
A
L
 
L
V
 
A
D
 
L
A
 
A
V
 
-
N
 
-
T
 
-
T
 
-
I
 
-
K
 
-
E
 
-
L
 
-
D
 
E
G
 
G
D
 
D
Y
 
F
A
 
C
F
 
F
A
 
F
I
 
I
S
 
D
-
 
E
-
 
P
N
 
N
G
 
G
K
 
-
E
 
E
L
 
L
V
 
T
V
 
V
V
 
I
R
 
T
D
 
E
E
 
S
L
 
R
G
 
G
V
 
F
K
 
S
P
 
P
V
 
V
Y
 
H
Y
 
V
A
 
V
T
 
Q
D
 
G
H
 
K
K
 
K
R
 
A
-
 
W
-
 
M
-
 
T
-
 
N
-
 
S
-
 
L
D
 
K
L
 
L
F
 
V
A
 
T
F
 
A
A
 
A
S
 
E
E
 
G
R
 
E
K
 
G
A
 
A
L
 
L
W
 
W
-
 
F
-
 
E
-
 
E
-
 
E
-
 
A
-
 
L
-
 
V
-
 
C
-
 
Q
-
 
S
-
 
L
-
 
M
-
 
R
-
 
A
-
 
D
-
 
T
K
 
Y
L
 
T
G
 
P
I
 
V
K
 
K
D
 
N
V
 
A
N
 
Q
V
 
R
L
 
L
K
 
K
P
 
P
G
 
G
E
 
A
-
 
V
-
 
H
-
 
V
M
 
L
I
 
T
L
 
H
N
 
D
N
 
S
K
 
E
T
 
G
I
 
Y
S
 
S
K
 
F
P
 
V
Q
 
E
T
 
S
K
 
R
K
 
T
K
 
L
T
 
T
M
 
T
P
 
P
I
 
A
P
 
S
N
 
N
V
 
Q
R
 
L
D
 
L
G
 
A
N
 
L
E
 
P
S
 
R
F
 
E
P
 
P
Q
 
L
Y
 
L
G
 
A
S
 
-
N
 
-
Y
 
-
Y
 
-
K
 
-
N
 
-
L
 
L
L
 
I
K
 
D
K
 
R
V
 
Y
L
 
L
I
 
N
D
 
A
S
 
P
V
 
L
K
 
E
K
 
D
R
 
L
V
 
A
V
 
P
G
 
R
L
 
F
D
 
D
R
 
T
V
 
V
G
 
G
I
 
I
I
x
P
F
x
L
S
|
S
G
|
G
G
|
G
L
|
L
D
|
D
S
|
S
S
 
S
I
 
L
L
 
V
A
 
T
K
 
A
L
 
L
S
 
A
K
 
S
D
 
R
L
 
H
E
 
F
V
 
K
E
 
K
T
 
L
F
 
N
L
 
T
Y
 
Y
T
 
S
V
x
I
G
 
G
T
 
T
E
 
E
N
 
L
S
 
S
S
 
N
D
 
E
M
 
F
K
 
E
Y
 
F
A
 
S
K
 
Q
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
N
 
D
S
 
A
L
 
L
D
 
G
L
 
T
P
 
H
L
 
H
K
 
Q
S
 
M
K
 
K
I
 
I
V
 
L
A
 
S
L
 
E
D
 
T
D
 
E
I
 
-
K
 
-
H
 
-
Y
 
-
T
 
-
G
 
-
L
 
-
V
 
V
L
 
I
N
 
N
A
 
G
I
 
I
E
 
I
E
 
E
-
 
S
-
 
I
-
 
Y
Y
 
Y
N
 
N
V
 
-
M
 
-
K
 
E
I
 
I
G
 
F
V
 
D
G
 
G
M
 
L
P
 
S
S
 
A
Y
 
E
I
 
I
A
 
Q
S
 
S
E
 
G
L
 
L
-
 
F
-
 
N
-
 
V
-
 
Y
-
 
R
A
 
Q
S
 
A
Q
 
Q
D
 
G
G
 
Q
I
 
V
R
 
S
V
 
C
M
 
M
L
 
L
S
 
T
G
|
G
Q
x
Y
G
|
G
A
x
S
D
|
D
E
 
L
I
 
L
F
 
F
A
 
G
G
 
G
Y
 
I
Q
 
L
R
 
K
Y
 
P
T
 
G
Q
 
A
F
 
Q
Y
 
Y
Q
 
D
E
 
N
Y
 
P
G
 
N
E
 
Q
K
 
L
T
 
L
T
 
A
E
 
E
Y
 
-
L
 
-
E
 
-
A
 
-
D
 
-
V
 
-
S
 
-
N
x
Q
L
 
V
Y
 
Y
H
x
R
V
 
T
N
 
R
L
 
W
Q
 
T
R
 
G
D
x
E
D
 
F
A
 
A
V
 
T
T
 
H
M
 
G
A
 
A
N
 
S
-
 
C
-
 
Y
S
 
G
V
 
I
E
 
D
L
 
I
R
 
R
V
 
H
P
 
P
Y
 
F
L
 
W
D
 
S
S
 
H
K
 
S
V
 
L
V
 
I
N
 
S
V
 
L
G
 
C
L
 
H
N
 
A
I
 
L
P
 
H
M
 
P
K
 
D
Y
 
Y
K
 
K
L
 
I
G
 
F
H
 
-
D
 
-
P
 
-
D
 
D
D
 
N
L
 
E
R
 
V
K
|
K
C
 
N
I
 
I
L
 
L
R
 
R
R
 
E
L
 
Y
A
 
A
L
 
D
D
 
S
L
 
L
E
 
Q
-
 
L
V
 
L
P
 
P
M
 
K
E
 
D
A
 
I
V
 
V
L
 
W
R
 
R
P
 
K
K
|
K
K
x
I
A
x
G
A
x
I
Q
 
H
Y
 
E
G
 
G
S
 
S
G
 
S
I
 
V
H
 
N
R
 
Q

1mc1A Beta-lactam synthetase with product (dgpc), amp and ppi (see paper)
22% identity, 84% coverage: 72:487/495 of query aligns to 51:448/491 of 1mc1A

query
sites
1mc1A
V
 
V
S
 
A
Q
 
R
P
 
S
L
 
L
V
 
T
K
 
G
H
 
A
G
 
P
L
 
T
V
 
T
L
 
A
V
 
V
A
 
L
N
x
A
A
x
G
E
 
E
I
 
I
Y
 
Y
N
 
N
Y
 
R
R
 
D
E
 
E
L
 
L
K
 
L
N
 
S
F
 
V
Y
 
L
D
 
P
E
 
A
C
 
G
Y
 
P
F
 
A
T
 
P
D
 
E
S
 
G
D
 
D
C
 
A
E
 
E
V
 
L
I
 
V
L
 
L
T
 
R
L
 
L
V
 
L
N
 
E
K
 
R
Y
 
Y
Y
 
D
K
 
L
N
 
H
S
 
A
L
 
F
V
 
-
D
 
-
A
 
-
V
 
-
N
 
-
T
 
-
T
 
-
I
 
-
K
 
R
E
 
L
L
 
V
D
 
N
G
 
G
D
 
R
Y
 
F
A
 
A
F
 
T
A
 
V
I
 
V
S
 
R
N
 
T
G
 
G
K
 
D
E
 
R
L
 
V
V
 
L
V
 
L
V
 
A
R
 
T
D
 
D
E
 
H
L
 
A
G
 
G
V
 
S
K
 
V
P
 
P
V
 
L
Y
 
Y
Y
 
T
-
 
C
-
 
V
-
 
A
-
 
P
-
 
G
-
 
E
-
 
V
-
 
R
A
 
A
T
 
S
D
 
T
H
 
E
K
 
A
R
 
K
D
 
A
L
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
G
F
 
F
A
 
P
F
 
L
A
 
A
S
 
D
E
 
A
R
 
R
K
 
R
A
 
V
L
 
A
W
 
G
K
 
L
L
 
T
G
 
G
I
 
V
K
 
Y
D
 
Q
V
 
V
N
 
-
V
 
-
L
 
-
K
 
-
P
 
P
G
 
A
E
 
G
M
 
A
I
 
V
L
 
M
N
 
D
N
 
I
K
 
D
T
 
L
I
 
G
S
 
S
K
 
G
P
 
T
Q
 
A
T
 
V
K
 
T
K
 
H
K
 
R
T
 
T
M
 
W
P
 
-
I
 
T
P
 
P
N
 
G
V
 
L
R
 
-
D
 
-
G
 
S
N
 
R
E
 
R
S
 
I
F
 
L
P
 
P
Q
 
E
Y
 
-
G
 
-
S
 
-
N
 
G
Y
 
E
Y
 
A
K
 
V
N
 
A
L
 
A
L
 
V
K
 
R
K
 
A
V
 
A
L
 
L
I
 
E
D
 
K
S
 
A
V
 
V
K
 
A
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
V
 
T
G
 
P
L
 
G
D
 
D
R
 
T
V
 
P
G
 
L
I
 
V
I
x
V
F
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
L
 
I
D
|
D
S
|
S
S
 
S
I
 
G
L
 
V
A
 
A
K
 
A
L
 
C
S
 
A
K
 
H
D
 
R
L
 
A
E
 
A
V
 
G
E
 
E
T
 
L
F
 
D
L
 
T
Y
 
V
T
x
S
V
x
M
G
 
G
T
 
T
E
 
D
N
 
T
S
 
S
S
 
N
D
 
E
M
 
F
K
 
R
Y
 
E
A
 
A
K
 
R
Q
 
A
V
 
V
A
 
V
N
 
D
S
 
H
L
 
L
D
 
R
L
 
T
P
 
R
L
 
H
K
 
R
S
 
E
K
 
I
I
 
T
V
 
I
A
 
P
L
 
T
D
 
T
D
 
E
I
 
L
K
 
L
H
 
A
Y
 
Q
T
 
L
G
 
P
L
 
Y
V
 
A
L
 
V
N
 
W
A
 
A
I
 
S
E
 
E
E
 
S
Y
 
V
N
 
D
V
 
P
M
x
D
K
 
I
I
 
I
G
 
E
V
x
Y
G
 
L
M
 
L
P
 
P
S
 
-
Y
 
-
I
 
L
A
 
T
S
 
A
E
 
L
L
 
Y
A
 
R
S
 
A
Q
 
L
D
 
D
G
 
G
I
 
P
-
 
E
R
 
R
V
 
R
M
 
I
L
 
L
S
 
T
G
|
G
Q
x
Y
G
|
G
A
 
A
D
|
D
E
x
I
I
 
P
F
 
L
A
 
G
G
 
G
Y
 
M
Q
 
H
R
 
R
Y
 
E
T
 
D
Q
 
R
F
 
L
Y
 
-
Q
 
-
E
 
-
Y
 
-
G
 
-
E
 
P
K
 
A
T
 
L
T
 
D
E
 
T
Y
 
V
L
 
L
E
 
A
A
 
H
D
|
D
V
 
M
S
 
A
N
 
T
L
 
F
Y
 
D
H
 
G
V
 
L
N
 
N
L
x
E
Q
 
M
R
 
S
D
 
P
D
 
V
A
 
L
V
 
S
T
 
T
M
 
L
A
 
A
N
 
G
S
 
H
V
 
W
E
 
T
L
 
T
R
 
H
V
 
-
P
 
P
Y
 
Y
L
 
W
D
 
D
S
 
R
K
 
E
V
 
V
V
 
L
N
 
D
-
 
L
-
 
L
V
 
V
G
 
S
L
 
L
N
 
E
I
 
A
P
 
G
M
 
L
K
 
K
Y
 
R
K
 
R
L
 
H
G
 
G
H
 
R
D
 
D
P
 
-
D
 
-
D
 
-
L
 
-
R
 
-
K
|
K
C
 
W
I
 
V
L
 
L
R
 
R
R
 
A
L
 
A
A
 
M
L
 
A
D
 
D
L
 
-
E
 
A
V
 
L
P
 
P
M
 
A
E
 
E
A
 
T
V
 
V
L
 
N
R
 
R
P
 
P
K
|
K
K
x
L
A
 
G
A
x
V
Q
 
H
Y
 
E
G
 
G
S
 
S
G
 
G
I
 
T
H
 
T
R
 
S
L
 
S
L
 
F
V
 
S
K
 
R
K
 
L
V
 
L
L
 
L
K
 
D
D
 
H
G
 
G

1mbzA Beta-lactam synthetase with trapped intermediate (see paper)
22% identity, 84% coverage: 72:487/495 of query aligns to 55:453/496 of 1mbzA

query
sites
1mbzA
V
 
V
S
 
A
Q
 
R
P
 
S
L
 
L
V
 
T
K
 
G
H
 
A
G
 
P
L
 
T
V
 
T
L
 
A
V
 
V
A
 
L
N
x
A
A
x
G
E
 
E
I
 
I
Y
 
Y
N
 
N
Y
 
R
R
 
D
E
 
E
L
 
L
K
 
L
N
 
S
F
 
V
Y
 
L
D
 
P
E
 
A
C
 
G
Y
 
P
F
 
A
T
 
P
D
 
E
S
 
G
D
 
D
C
 
A
E
 
E
V
 
L
I
 
V
L
 
L
T
 
R
L
 
L
V
 
L
N
 
E
K
 
R
Y
 
Y
Y
 
D
K
 
L
N
 
H
S
 
A
L
 
F
V
 
-
D
 
-
A
 
-
V
 
-
N
 
-
T
 
-
T
 
-
I
 
-
K
 
R
E
 
L
L
 
V
D
 
N
G
 
G
D
 
R
Y
 
F
A
 
A
F
 
T
A
 
V
I
 
V
S
 
R
N
 
T
G
 
G
K
 
D
E
 
R
L
 
V
V
 
L
V
 
L
V
 
A
R
 
T
D
 
D
E
 
H
L
 
A
G
 
G
V
 
S
K
 
V
P
 
P
V
 
L
Y
 
Y
Y
 
T
-
 
C
-
 
V
-
 
A
-
 
P
-
 
G
-
 
E
-
 
V
-
 
R
A
 
A
T
 
S
D
 
T
H
 
E
K
 
A
R
 
K
D
 
A
L
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
H
-
 
G
F
 
F
A
 
P
F
 
L
A
 
A
S
 
D
E
 
A
R
 
R
K
 
R
A
 
V
L
 
A
W
 
G
K
 
L
L
 
T
G
 
G
I
 
V
K
 
Y
D
 
Q
V
 
V
N
 
-
V
 
-
L
 
-
K
 
-
P
 
P
G
 
A
E
 
G
M
 
A
I
 
V
L
 
M
N
 
D
N
 
I
K
 
D
T
 
L
I
 
G
S
 
S
K
 
G
P
 
T
Q
 
A
T
 
V
K
 
T
K
 
H
K
 
R
T
 
T
M
 
W
P
 
-
I
 
T
P
 
P
N
 
G
V
 
L
R
 
-
D
 
-
G
 
S
N
 
R
E
 
R
S
 
I
F
 
L
P
 
P
Q
 
E
Y
 
-
G
 
-
S
 
-
N
 
G
Y
 
E
Y
 
A
K
 
V
N
 
A
L
 
A
L
 
V
K
 
R
K
 
A
V
 
A
L
 
L
I
 
E
D
 
K
S
 
A
V
 
V
K
 
A
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
V
 
T
G
 
P
L
 
G
D
 
D
R
 
T
V
 
P
G
 
L
I
 
V
I
x
V
F
x
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
L
 
I
D
|
D
S
|
S
S
 
S
I
 
G
L
 
V
A
 
A
K
 
A
L
 
C
S
 
A
K
 
H
D
 
R
L
 
A
E
 
A
V
 
G
E
 
E
T
 
L
F
 
D
L
 
T
Y
 
V
T
x
S
V
x
M
G
 
G
T
 
T
E
 
D
N
 
T
S
 
S
S
 
N
D
 
E
M
 
F
K
 
R
Y
 
E
A
 
A
K
 
R
Q
 
A
V
 
V
A
 
V
N
 
D
S
 
H
L
 
L
D
 
R
L
 
T
P
 
R
L
 
H
K
 
R
S
 
E
K
 
I
I
 
T
V
 
I
A
 
P
L
 
T
D
 
T
D
 
E
I
 
L
K
 
L
H
 
A
Y
 
Q
T
 
L
G
 
P
L
 
Y
V
 
A
L
 
V
N
 
W
A
 
A
I
 
S
E
 
E
E
 
S
Y
 
V
N
 
D
V
 
P
M
x
D
K
 
I
I
 
I
G
 
E
V
x
Y
G
 
L
M
 
L
P
 
P
S
 
-
Y
 
-
I
x
L
A
 
T
S
 
A
E
 
L
L
 
Y
A
 
R
S
 
A
Q
 
L
D
 
D
G
 
G
I
 
P
-
 
E
R
 
R
V
 
R
M
 
I
L
 
L
S
 
T
G
|
G
Q
x
Y
G
|
G
A
 
A
D
|
D
E
x
I
I
 
P
F
 
L
A
 
G
G
 
G
Y
 
M
Q
 
H
R
 
R
Y
 
E
T
 
D
Q
 
R
F
 
L
Y
 
-
Q
 
-
E
 
-
Y
 
-
G
 
-
E
 
P
K
 
A
T
 
L
T
 
D
E
 
T
Y
 
V
L
 
L
E
 
A
A
 
H
D
|
D
V
 
M
S
 
A
N
 
T
L
 
F
Y
 
D
H
 
G
V
 
L
N
 
N
L
x
E
Q
 
M
R
 
S
D
 
P
D
 
V
A
 
L
V
 
S
T
 
T
M
 
L
A
 
A
N
 
G
S
 
H
V
 
W
E
 
T
L
 
T
R
 
H
V
 
-
P
 
P
Y
 
Y
L
 
W
D
 
D
S
 
R
K
 
E
V
 
V
V
 
L
N
 
D
-
 
L
-
 
L
V
 
V
G
 
S
L
 
L
N
 
E
I
 
A
P
 
G
M
 
L
K
 
K
Y
 
R
K
 
R
L
 
H
G
 
G
H
 
R
D
 
D
P
 
-
D
 
-
D
 
-
L
 
-
R
 
-
K
|
K
C
 
W
I
 
V
L
 
L
R
 
R
R
 
A
L
 
A
A
 
M
L
 
A
D
 
D
L
 
-
E
 
A
V
 
L
P
 
P
M
 
A
E
 
E
A
 
T
V
 
V
L
 
N
R
 
R
P
 
P
K
|
K
K
x
L
A
x
G
A
x
V
Q
 
H
Y
 
E
G
 
G
S
 
S
G
 
G
I
 
T
H
 
T
R
 
S
L
 
S
L
 
F
V
 
S
K
 
R
K
 
L
V
 
L
L
 
L
K
 
D
D
 
H
G
 
G

1ao0A Glutamine phosphoribosylpyrophosphate (prpp) amidotransferase from b. Subtilis complexed with adp and gmp (see paper)
26% identity, 40% coverage: 5:201/495 of query aligns to 1:214/455 of 1ao0A

query
sites
1ao0A
A
x
C
G
 
G
I
 
V
L
 
F
S
 
G
I
 
I
N
 
W
G
 
G
K
 
H
Q
 
E
A
 
E
L
 
A
G
 
P
E
 
Q
D
 
I
L
 
T
I
 
Y
C
 
Y
M
 
G
L
 
L
K
 
H
T
 
S
M
 
L
E
 
Q
H
|
H
R
 
R
G
|
G
P
 
Q
D
 
E
G
 
G
S
 
A
R
 
G
I
 
I
-
 
V
C
 
A
L
 
T
D
 
D
G
 
G
K
 
E
-
 
K
-
 
L
-
 
T
-
 
A
-
 
H
-
 
K
-
 
G
-
 
Q
-
 
G
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
 
E
D
 
V
L
 
F
E
 
Q
T
 
N
T
 
G
D
 
E
L
 
L
P
 
S
F
 
K
-
 
V
-
 
K
A
 
G
N
 
K
I
 
G
G
 
A
L
 
I
G
 
G
H
 
H
N
 
-
L
 
V
L
 
R
S
 
Y
I
 
A
V
 
T
G
 
G
T
 
Y
E
 
E
V
 
N
S
 
V
Q
 
Q
P
 
P
L
 
L
V
 
L
-
 
F
-
 
R
-
 
S
-
 
Q
-
 
N
K
 
N
H
 
G
G
 
S
L
 
L
V
 
A
L
 
L
V
 
A
A
 
H
N
|
N
A
x
G
E
 
N
I
 
L
Y
 
V
N
 
N
Y
 
A
R
 
T
E
 
Q
L
 
L
K
 
K
N
 
Q
F
 
Q
Y
 
L
D
 
E
-
 
N
-
 
Q
-
 
G
E
 
S
C
 
I
Y
 
F
F
 
Q
T
 
T
D
 
S
S
 
S
D
 
D
C
 
T
E
 
E
V
 
V
I
 
L
L
 
A
T
 
H
L
 
L
V
 
I
N
 
K
K
 
R
Y
 
S
Y
 
G
K
 
H
N
 
F
S
 
T
L
 
L
V
 
K
D
 
D
A
 
Q
V
 
I
N
 
K
T
 
N
T
 
S
I
 
L
K
 
S
E
 
M
L
 
L
D
 
K
G
 
G
D
 
A
Y
 
Y
A
 
A
F
 
F
A
 
L
I
 
I
S
 
M
N
 
T
G
 
E
K
 
T
E
 
E
L
 
M
V
 
I
V
 
V
V
 
A
R
 
L
D
 
D
E
 
P
L
 
N
G
 
G
V
 
L
K
 
R
P
 
P
V
 
L
Y
 
-
Y
 
-
A
 
S
T
 
I
D
 
G
H
 
M
K
 
M
R
 
G
D
 
D
L
 
A
F
 
Y
A
 
V
F
 
V
A
 
A
S
 
S
E
 
E
R
 
T
K
 
C
A
 
A
L
 
F
W
 
D
K
 
V
L
 
V
G
 
G
I
 
A
K
 
T
D
 
Y
V
 
L
N
 
R
V
 
E
L
 
V
K
 
E
P
 
P
G
 
G
E
 
E
M
 
M
I
 
L
L
 
I
N
 
I
N
 
N

Sites not aligning to the query:

P00497 Amidophosphoribosyltransferase; ATase; Glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase; GPATase; EC 2.4.2.14 from Bacillus subtilis (strain 168) (see 5 papers)
26% identity, 40% coverage: 5:201/495 of query aligns to 12:229/476 of P00497

query
sites
P00497
A
x
C
G
 
G
I
 
V
L
 
F
S
 
G
I
 
I
N
 
W
G
 
G
K
 
H
Q
 
E
A
 
E
L
 
A
G
 
P
E
 
Q
D
 
I
L
 
T
I
 
Y
C
 
Y
M
 
G
L
 
L
K
 
H
T
 
S
M
 
L
E
 
Q
H
 
H
R
 
R
G
 
G
P
 
Q
D
 
E
G
 
G
S
 
A
R
 
G
I
 
I
-
 
V
C
 
A
L
 
T
D
 
D
G
 
G
K
 
E
-
 
K
-
 
L
-
 
T
-
 
A
-
 
H
-
 
K
-
 
G
-
 
Q
-
 
G
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
 
E
D
 
V
L
 
F
E
 
Q
T
 
N
T
 
G
D
 
E
L
 
L
P
 
S
F
 
K
-
 
V
-
 
K
A
 
G
N
 
K
I
 
G
G
 
A
L
 
I
G
 
G
H
 
H
N
 
V
L
 
R
L
 
Y
S
 
A
I
 
T
V
 
A
G
 
G
T
 
G
-
 
G
-
 
G
-
 
Y
E
 
E
V
 
N
S
 
V
Q
 
Q
P
 
P
L
 
L
V
 
L
-
 
F
-
 
R
-
 
S
-
 
Q
-
 
N
K
 
N
H
 
G
G
 
S
L
 
L
V
 
A
L
 
L
V
 
A
A
 
H
N
 
N
A
 
G
E
 
N
I
 
L
Y
 
V
N
 
N
Y
 
A
R
 
T
E
 
Q
L
 
L
K
 
K
N
 
Q
F
 
Q
Y
 
L
D
 
E
-
 
N
-
 
Q
-
 
G
E
 
S
C
 
I
Y
 
F
F
 
Q
T
 
T
D
 
S
S
 
S
D
 
D
C
 
T
E
 
E
V
 
V
I
 
L
L
 
A
T
 
H
L
 
L
V
 
I
N
 
K
K
 
R
Y
 
S
Y
 
G
K
 
H
N
 
F
S
 
T
L
 
L
V
 
K
D
 
D
A
 
Q
V
 
I
N
 
K
T
 
N
T
 
S
I
 
L
K
 
S
E
 
M
L
 
L
D
 
K
G
 
G
D
 
A
Y
 
Y
A
 
A
F
 
F
A
 
L
I
 
I
S
 
M
N
 
T
G
 
E
K
 
T
E
 
E
L
 
M
V
 
I
V
 
V
V
 
A
R
 
L
D
 
D
E
 
P
L
 
N
G
 
G
V
 
L
K
 
R
P
 
P
V
 
L
Y
 
-
Y
 
-
A
 
S
T
 
I
D
 
G
H
 
M
K
 
M
R
 
G
D
 
D
L
 
A
F
 
Y
A
 
V
F
 
V
A
 
A
S
 
S
E
 
E
R
 
T
K
 
C
A
 
A
L
 
F
W
 
D
K
 
V
L
 
V
G
 
G
I
 
A
K
 
T
D
 
Y
V
 
L
N
 
R
V
 
E
L
 
V
K
 
E
P
 
P
G
 
G
E
 
E
M
 
M
I
 
L
L
 
I
N
 
I
N
 
N

Sites not aligning to the query:

1gph1 Structure of the allosteric regulatory enzyme of purine biosynthesis (see paper)
26% identity, 40% coverage: 5:201/495 of query aligns to 1:218/465 of 1gph1

query
sites
1gph1
A
 
C
G
 
G
I
 
V
L
 
F
S
 
G
I
 
I
N
 
W
G
 
G
K
 
H
Q
 
E
A
 
E
L
 
A
G
 
P
E
 
Q
D
 
I
L
 
T
I
 
Y
C
 
Y
M
 
G
L
 
L
K
 
H
T
 
S
M
 
L
E
 
Q
H
 
H
R
 
R
G
 
G
P
 
Q
D
 
E
G
 
G
S
 
A
R
 
G
I
 
I
-
 
V
C
 
A
L
 
T
D
 
D
G
 
G
K
 
E
-
 
K
-
 
L
-
 
T
-
 
A
-
 
H
-
 
K
-
 
G
-
 
Q
-
 
G
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
 
E
D
 
V
L
 
F
E
 
Q
T
 
N
T
 
G
D
 
E
L
 
L
P
 
S
F
 
K
-
 
V
-
 
K
A
 
G
N
 
K
I
 
G
G
 
A
L
 
I
G
 
G
H
 
H
N
 
V
L
 
R
L
 
Y
S
 
A
I
 
T
V
 
A
G
 
G
T
 
G
-
 
G
-
 
G
-
 
Y
E
 
E
V
 
N
S
 
V
Q
 
Q
P
 
P
L
 
L
V
 
L
-
 
F
-
 
R
-
 
S
-
 
Q
-
 
N
K
 
N
H
 
G
G
 
S
L
 
L
V
 
A
L
 
L
V
 
A
A
 
H
N
 
N
A
 
G
E
 
N
I
 
L
Y
 
V
N
 
N
Y
 
A
R
 
T
E
 
Q
L
 
L
K
 
K
N
 
Q
F
 
Q
Y
 
L
D
 
E
-
 
N
-
 
Q
-
 
G
E
 
S
C
 
I
Y
 
F
F
 
Q
T
 
T
D
 
S
S
 
S
D
 
D
C
 
T
E
 
E
V
 
V
I
 
L
L
 
A
T
 
H
L
 
L
V
 
I
N
 
K
K
 
R
Y
 
S
Y
 
G
K
 
H
N
 
F
S
 
T
L
 
L
V
 
K
D
 
D
A
 
Q
V
 
I
N
 
K
T
 
N
T
 
S
I
 
L
K
 
S
E
 
M
L
 
L
D
 
K
G
 
G
D
 
A
Y
 
Y
A
 
A
F
 
F
A
 
L
I
 
I
S
 
M
N
 
T
G
 
E
K
 
T
E
 
E
L
 
M
V
 
I
V
 
V
V
 
A
R
 
L
D
 
D
E
 
P
L
 
N
G
 
G
V
 
L
K
 
R
P
 
P
V
 
L
Y
 
-
Y
 
-
A
 
S
T
 
I
D
 
G
H
 
M
K
 
M
R
 
G
D
 
D
L
 
A
F
 
Y
A
 
V
F
 
V
A
 
A
S
 
S
E
 
E
R
 
T
K
 
C
A
 
A
L
 
F
W
 
D
K
 
V
L
 
V
G
 
G
I
 
A
K
 
T
D
 
Y
V
 
L
N
 
R
V
 
E
L
 
V
K
 
E
P
 
P
G
 
G
E
 
E
M
 
M
I
 
L
L
 
I
N
 
I
N
 
N

Sites not aligning to the query:

1jgtB Crystal structure of beta-lactam synthetase (see paper)
22% identity, 85% coverage: 72:492/495 of query aligns to 59:466/500 of 1jgtB

query
sites
1jgtB
V
 
V
S
 
A
Q
 
R
P
 
S
L
 
L
V
 
T
K
 
G
H
 
A
G
 
P
L
 
T
V
 
T
L
 
A
V
 
V
A
 
L
N
x
A
A
x
G
E
 
E
I
 
I
Y
 
Y
N
 
N
Y
 
R
R
 
D
E
 
E
L
 
L
K
 
L
N
 
S
F
 
V
Y
 
L
D
 
P
E
 
A
C
 
G
Y
 
P
F
 
A
T
 
P
D
 
E
S
 
G
D
 
D
C
 
A
E
 
E
V
 
L
I
 
V
L
 
L
T
 
R
L
 
L
V
 
L
N
 
E
K
 
R
Y
 
Y
Y
 
D
K
 
L
N
 
H
S
 
A
L
 
F
V
 
-
D
 
-
A
 
-
V
 
-
N
 
-
T
 
-
T
 
-
I
 
-
K
 
R
E
 
L
L
 
V
D
 
N
G
 
G
D
 
R
Y
 
F
A
 
A
F
 
T
A
 
V
I
 
V
S
 
R
N
 
T
G
 
G
K
 
D
E
 
R
L
 
V
V
 
L
V
 
L
V
 
A
R
 
T
D
 
D
E
 
H
L
 
A
G
 
G
V
 
S
K
 
V
P
 
P
V
 
L
Y
 
Y
Y
 
T
-
 
C
-
 
V
-
 
A
-
 
P
-
 
G
-
 
E
-
 
V
-
 
R
-
 
A
A
 
S
T
 
T
D
 
E
H
 
A
K
 
K
-
 
A
-
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
H
R
 
R
D
 
D
L
 
P
-
 
K
-
 
G
F
 
F
A
 
P
F
 
L
A
 
A
S
 
D
E
 
A
R
 
R
K
 
R
A
 
V
L
 
A
W
 
G
K
 
L
L
 
T
G
 
G
I
 
V
K
 
Y
D
 
Q
V
 
V
N
 
-
V
 
-
L
 
-
K
 
-
P
 
P
G
 
A
E
 
G
M
 
A
I
 
V
L
 
M
N
 
D
N
 
I
K
 
D
T
 
L
I
 
G
S
 
S
K
 
G
P
 
T
Q
 
A
T
 
V
K
 
T
K
 
H
K
 
R
T
 
T
M
 
W
P
 
-
I
 
T
P
 
P
N
 
G
V
 
L
R
 
-
D
 
-
G
 
S
N
 
R
E
 
R
S
 
I
F
 
L
P
 
P
Q
 
E
Y
 
-
G
 
-
S
 
-
N
 
G
Y
 
E
Y
 
A
K
 
V
N
 
A
L
 
A
L
 
V
K
 
R
K
 
A
V
 
A
L
 
L
I
 
E
D
 
K
S
 
A
V
 
V
K
 
A
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
V
 
T
G
 
P
L
 
G
D
 
D
R
 
T
V
 
P
G
 
L
I
 
V
I
x
V
F
x
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
L
x
I
D
|
D
S
|
S
S
 
S
I
 
G
L
 
V
A
 
A
K
 
A
L
 
C
S
 
A
K
 
H
D
 
R
L
 
A
E
 
A
V
 
G
E
 
E
T
 
L
F
 
D
L
 
T
Y
 
V
T
x
S
V
x
M
G
 
G
T
 
T
E
 
D
N
 
T
S
 
S
S
 
N
D
 
E
M
 
F
K
 
R
Y
 
E
A
 
A
K
 
R
Q
 
A
V
 
V
A
 
V
N
 
D
S
 
H
L
 
L
D
 
R
L
 
T
P
 
R
L
 
H
K
 
R
S
 
E
K
 
I
I
 
T
V
 
I
A
 
P
L
 
T
D
 
T
D
 
E
I
 
L
K
 
L
H
 
A
Y
 
Q
T
 
L
G
 
P
L
 
Y
V
 
A
L
 
V
N
 
W
A
 
A
I
 
S
E
 
E
E
 
S
Y
 
V
N
 
D
V
 
P
M
x
D
K
 
I
I
 
I
G
 
E
V
x
Y
G
 
L
M
 
L
P
 
P
S
 
-
Y
 
-
I
x
L
A
 
T
S
 
A
E
 
L
L
 
Y
A
 
R
S
 
A
Q
 
L
D
 
D
G
 
G
I
 
P
-
 
E
R
 
R
V
 
R
M
 
I
L
 
L
S
 
T
G
|
G
Q
x
Y
G
|
G
A
 
A
D
|
D
E
x
I
I
 
P
F
 
L
A
 
G
G
 
G
Y
x
M
Q
 
H
R
 
R
Y
 
E
T
 
D
Q
 
R
F
 
L
Y
 
-
Q
 
-
E
 
-
Y
 
-
G
 
-
E
 
P
K
 
A
T
 
L
T
 
D
E
 
T
Y
 
V
L
 
L
E
 
A
A
 
H
D
|
D
V
 
M
S
 
A
N
 
T
L
 
F
Y
 
D
H
 
G
V
 
L
N
 
N
L
x
E
Q
 
M
R
 
S
D
 
P
D
 
V
A
 
L
V
 
S
T
 
T
M
 
L
A
 
A
N
 
G
S
 
H
V
 
W
E
 
T
L
 
T
R
 
H
V
 
-
P
 
P
Y
 
Y
L
 
W
D
 
D
S
 
R
K
 
E
V
 
V
V
 
L
N
 
D
-
 
L
-
 
L
V
 
V
G
 
S
L
 
L
N
 
E
I
 
A
P
 
G
M
 
L
K
 
K
Y
 
R
K
 
R
L
 
H
G
 
G
H
 
R
D
 
D
P
 
-
D
 
-
D
 
-
L
 
-
R
 
-
K
|
K
C
 
W
I
 
V
L
 
L
R
 
R
R
 
A
L
 
A
A
 
M
L
 
A
D
 
D
L
 
-
E
 
A
V
 
L
P
 
P
M
 
A
E
 
E
A
 
T
V
 
V
L
 
N
R
 
R
P
 
P
K
|
K
K
 
L
A
 
S
A
 
G
Q
 
T
Y
 
T
G
 
S
S
 
S
G
 
F
I
 
S
H
 
R
R
 
L
L
 
L
L
 
L
V
 
D
K
 
H
K
 
G
V
 
V
L
 
A
K
 
E
D
 
D
G
 
R
S
 
V
Y
 
H
K
 
E
A
 
A
Q
 
K

P0AG16 Amidophosphoribosyltransferase; ATase; Glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase; GPATase; EC 2.4.2.14 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
26% identity, 40% coverage: 1:198/495 of query aligns to 1:231/505 of P0AG16

query
sites
P0AG16
M
|
M
C
|
C
A
 
-
I
 
-
A
 
-
G
 
G
I
 
I
L
 
V
S
 
G
I
 
I
N
 
A
G
 
G
K
 
V
Q
 
M
A
 
P
L
 
V
G
 
N
E
 
Q
D
 
S
L
 
I
I
 
Y
C
 
D
M
 
A
L
 
L
K
 
T
T
 
V
M
 
L
E
 
Q
H
 
H
R
 
R
G
 
G
P
 
Q
D
 
D
G
 
A
S
 
A
R
 
G
I
 
I
-
 
I
-
 
T
-
 
I
-
 
D
-
 
A
-
 
N
-
 
N
C
 
C
L
 
F
D
 
R
G
 
L
K
 
R
-
 
K
-
 
A
-
 
N
-
 
G
L
 
L
V
 
V
T
 
S
G
 
D
D
 
V
L
 
F
E
 
E
T
 
A
T
 
R
D
 
H
L
 
M
P
 
Q
F
 
R
-
 
L
-
 
Q
A
 
G
N
 
N
I
 
M
G
 
G
L
 
I
G
 
G
H
 
H
N
 
V
L
 
R
L
 
Y
S
 
P
I
 
T
V
 
A
G
 
G
T
 
S
E
 
S
V
 
S
-
 
A
-
 
S
-
 
E
S
 
A
Q
 
Q
P
 
P
L
 
F
V
 
Y
-
 
V
-
 
N
-
 
S
K
 
P
H
 
Y
G
 
G
L
 
I
V
 
T
L
 
L
V
 
A
A
 
H
N
 
N
A
 
G
E
 
N
I
 
L
Y
 
T
N
 
N
Y
 
A
R
 
H
E
 
E
L
 
L
-
 
R
K
 
K
N
 
K
F
 
L
Y
 
F
D
 
E
E
 
E
-
 
K
-
 
R
-
 
R
C
 
H
Y
 
I
F
 
N
T
 
T
D
 
T
S
 
S
D
 
D
C
 
S
E
 
E
V
 
I
I
 
L
L
 
L
T
 
N
L
 
I
V
 
F
N
 
A
K
 
S
Y
 
E
Y
 
L
K
 
D
N
 
N
-
 
F
-
 
R
-
 
H
-
 
Y
-
 
P
-
 
L
-
 
E
-
 
A
-
 
D
S
 
N
L
 
I
V
 
F
D
 
A
A
 
A
V
 
I
N
 
A
T
 
A
T
 
T
I
 
N
K
 
R
E
 
L
L
 
I
D
 
R
G
 
G
D
 
A
Y
 
Y
A
 
A
-
 
C
F
 
V
A
 
A
I
 
M
S
 
I
N
 
I
G
 
G
K
 
H
E
 
G
L
 
M
V
 
V
V
 
A
V
 
F
R
 
R
D
 
D
E
 
P
L
 
N
G
 
G
V
 
I
K
 
R
P
 
P
V
 
L
Y
 
V
Y
 
L
A
 
G
-
 
K
-
 
R
-
 
D
T
 
I
D
 
D
H
 
E
K
 
N
R
 
R
D
 
T
L
 
E
F
 
Y
A
 
M
F
 
V
A
 
A
S
 
S
E
 
E
R
 
S
K
 
V
A
 
A
L
 
L
W
 
D
K
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
F
K
 
D
D
 
F
V
 
L
N
 
R
V
 
D
L
 
V
K
 
A
P
 
P
G
 
G
E
 
E
M
 
A
I
 
I

8w7dA Crystal structure of ecppat-fr901483 complex (see paper)
27% identity, 39% coverage: 5:198/495 of query aligns to 1:225/470 of 8w7dA

query
sites
8w7dA
A
 
C
G
 
G
I
 
I
L
 
V
S
 
G
I
 
I
N
 
A
G
 
G
K
 
V
Q
 
M
A
 
P
L
 
V
G
 
N
E
 
Q
D
 
S
L
 
I
I
 
Y
C
 
D
M
 
A
L
 
L
K
 
T
T
 
V
M
 
L
E
 
Q
H
 
H
R
 
R
G
 
G
P
 
Q
D
 
D
G
 
A
S
 
A
R
 
G
I
 
I
-
 
I
-
 
T
-
 
I
-
 
D
-
 
A
-
 
N
-
 
N
C
 
C
L
 
F
D
 
R
G
 
L
K
 
R
-
 
K
-
 
A
-
 
N
-
 
G
L
 
L
V
 
V
T
 
S
G
 
D
D
 
V
L
 
F
E
 
E
T
 
A
T
 
R
D
 
H
L
 
M
P
 
Q
F
 
R
-
 
L
-
 
Q
A
 
G
N
 
N
I
 
M
G
 
G
L
 
I
G
 
G
H
 
H
N
 
V
L
 
R
L
 
Y
S
 
P
I
 
T
V
 
S
G
 
S
T
 
A
E
 
S
V
 
E
S
 
A
Q
 
Q
P
 
P
L
 
F
V
 
Y
-
 
V
-
 
N
-
 
S
K
 
P
H
 
Y
G
 
G
L
 
I
V
 
T
L
 
L
V
 
A
A
 
H
N
 
N
A
 
G
E
 
N
I
 
L
Y
 
T
N
 
N
Y
 
A
R
 
H
E
 
E
L
 
L
-
 
R
K
 
K
N
 
K
F
 
L
Y
 
F
D
 
E
E
 
E
-
 
K
-
 
R
-
 
R
C
 
H
Y
 
I
F
 
N
T
 
T
D
 
T
S
 
S
D
 
D
C
 
S
E
 
E
V
 
I
I
 
L
L
 
L
T
 
N
L
 
I
V
 
F
N
 
A
K
 
S
Y
 
E
Y
 
L
K
 
D
N
 
N
-
 
F
-
 
R
-
 
H
-
 
Y
-
 
P
-
 
L
-
 
E
-
 
A
-
 
D
S
 
N
L
 
I
V
 
F
D
 
A
A
 
A
V
 
I
N
 
A
T
 
A
T
 
T
I
 
N
K
 
R
E
 
L
L
 
I
D
 
R
G
 
G
D
 
A
Y
 
Y
A
 
A
-
 
C
F
 
V
A
 
A
I
 
M
S
 
I
N
 
I
G
 
G
K
 
H
E
 
G
L
 
M
V
 
V
V
 
A
V
 
F
R
 
R
D
 
D
E
 
P
L
 
N
G
 
G
V
 
I
K
 
R
P
 
P
-
 
L
V
 
V
Y
 
L
Y
 
G
A
 
K
T
 
R
D
 
D
H
 
I
K
 
D
R
 
R
D
 
T
L
 
E
F
 
Y
A
 
M
F
 
V
A
 
A
S
 
S
E
 
E
R
 
S
K
 
V
A
 
A
L
 
L
W
 
D
K
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
F
K
 
D
D
 
F
V
 
L
N
 
R
V
 
D
L
 
V
K
 
A
P
 
P
G
 
G
E
 
E
M
 
A
I
 
I

Sites not aligning to the query:

1ecbA Escherichia coli glutamine phosphoribosylpyrophosphate (prpp) amidotransferase complexed with 2 gmp, 1 mg per subunit (see paper)
26% identity, 39% coverage: 5:198/495 of query aligns to 1:230/475 of 1ecbA

query
sites
1ecbA
A
x
C
G
 
G
I
 
I
L
 
V
S
 
G
I
 
I
N
 
A
G
 
G
K
 
V
Q
 
M
A
 
P
L
 
V
G
 
N
E
 
Q
D
 
S
L
 
I
I
 
Y
C
 
D
M
 
A
L
 
L
K
 
T
T
 
V
M
 
L
E
 
Q
H
|
H
R
 
R
G
|
G
P
 
Q
D
 
D
G
 
A
S
 
A
R
 
G
I
 
I
-
 
I
-
 
T
-
 
I
-
 
D
-
 
A
-
 
N
-
 
N
C
 
C
L
 
F
D
 
R
G
 
L
K
 
R
-
 
K
-
 
A
-
 
N
-
 
G
L
 
L
V
 
V
T
 
S
G
 
D
D
 
V
L
 
F
E
 
E
T
 
A
T
 
R
D
 
H
L
 
M
P
 
Q
F
 
R
-
 
L
-
 
Q
A
 
G
N
 
N
I
 
M
G
 
G
L
 
I
G
 
G
H
 
H
N
 
V
L
 
R
L
x
Y
S
 
P
I
 
T
V
 
A
G
 
G
T
 
S
E
 
S
V
 
S
-
 
A
-
 
S
-
 
E
S
 
A
Q
 
Q
P
 
P
L
 
F
V
 
Y
-
 
V
-
 
N
-
 
S
K
 
P
H
 
Y
G
 
G
L
 
I
V
 
T
L
 
L
V
 
A
A
 
H
N
|
N
A
x
G
E
 
N
I
 
L
Y
 
T
N
 
N
Y
 
A
R
 
H
E
 
E
L
 
L
-
 
R
K
 
K
N
 
K
F
 
L
Y
 
F
D
 
E
E
 
E
-
 
K
-
 
R
-
 
R
C
 
H
Y
 
I
F
 
N
T
 
T
D
 
T
S
 
S
D
 
D
C
 
S
E
 
E
V
 
I
I
 
L
L
 
L
T
 
N
L
 
I
V
 
F
N
 
A
K
 
S
Y
 
E
Y
 
L
K
 
D
N
 
N
-
 
F
-
 
R
-
 
H
-
 
Y
-
 
P
-
 
L
-
 
E
-
 
A
-
 
D
S
 
N
L
 
I
V
 
F
D
 
A
A
 
A
V
 
I
N
 
A
T
 
A
T
 
T
I
 
N
K
 
R
E
 
L
L
 
I
D
 
R
G
 
G
D
 
A
Y
 
Y
A
 
A
-
 
C
F
 
V
A
 
A
I
 
M
S
 
I
N
 
I
G
 
G
K
 
H
E
 
G
L
 
M
V
 
V
V
 
A
V
 
F
R
 
R
D
 
D
E
 
P
L
 
N
G
 
G
V
 
I
K
 
R
P
 
P
V
 
L
Y
 
V
Y
 
L
A
 
G
-
 
K
-
 
R
-
 
D
T
 
I
D
 
D
H
 
E
K
 
N
R
 
R
D
 
T
L
 
E
F
 
Y
A
 
M
F
 
V
A
 
A
S
 
S
E
 
E
R
 
S
K
 
V
A
 
A
L
 
L
W
 
D
K
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
F
K
 
D
D
 
F
V
 
L
N
 
R
V
 
D
L
 
V
K
 
A
P
 
P
G
 
G
E
 
E
M
 
A
I
 
I

Sites not aligning to the query:

6czfA The structure of e. Coli purf in complex with ppgpp-mg (see paper)
26% identity, 39% coverage: 5:198/495 of query aligns to 1:230/498 of 6czfA

query
sites
6czfA
A
x
C
G
 
G
I
 
I
L
 
V
S
 
G
I
 
I
N
 
A
G
 
G
K
 
V
Q
 
M
A
 
P
L
 
V
G
 
N
E
 
Q
D
 
S
L
 
I
I
 
Y
C
 
D
M
 
A
L
 
L
K
 
T
T
 
V
M
 
L
E
 
Q
H
 
H
R
 
R
G
|
G
P
 
Q
D
 
D
G
 
A
S
 
A
R
 
G
I
 
I
-
 
I
-
 
T
-
 
I
-
 
D
-
 
A
-
 
N
-
 
N
C
 
C
L
 
F
D
 
R
G
 
L
K
x
R
-
x
K
-
 
A
-
x
N
-
 
G
L
 
L
V
 
V
T
 
S
G
 
D
D
 
V
L
 
F
E
 
E
T
 
A
T
 
R
D
 
H
L
 
M
P
 
Q
F
x
R
-
 
L
-
 
Q
A
 
G
N
 
N
I
 
M
G
 
G
L
 
I
G
 
G
H
 
H
N
 
V
L
 
R
L
 
Y
S
 
P
I
 
T
V
 
A
G
 
G
T
 
S
E
 
S
V
 
S
-
x
A
-
x
S
-
x
E
S
 
A
Q
 
Q
P
 
P
L
 
F
-
 
Y
-
 
V
-
 
N
V
 
S
K
 
P
H
 
Y
G
 
G
L
 
I
V
 
T
L
 
L
V
 
A
A
 
H
N
|
N
A
x
G
E
 
N
I
 
L
Y
 
T
N
 
N
Y
 
A
R
 
H
E
 
E
L
 
L
-
 
R
K
 
K
N
 
K
F
 
L
Y
 
F
D
 
E
E
 
E
-
 
K
-
 
R
-
 
R
C
 
H
Y
 
I
F
 
N
T
 
T
D
 
T
S
 
S
D
 
D
C
 
S
E
 
E
V
 
I
I
 
L
L
 
L
T
 
N
L
 
I
V
 
F
N
 
A
K
 
S
Y
 
E
Y
 
L
K
 
D
N
 
N
-
 
F
-
 
R
-
 
H
-
 
Y
-
 
P
-
 
L
-
 
E
-
 
A
-
 
D
S
 
N
L
 
I
V
 
F
D
 
A
A
 
A
V
 
I
N
 
A
T
 
A
T
 
T
I
 
N
K
 
R
E
 
L
L
 
I
D
 
R
G
 
G
D
 
A
Y
 
Y
A
 
A
-
 
C
F
 
V
A
 
A
I
 
M
S
 
I
N
 
I
G
 
G
K
 
H
E
 
G
L
 
M
V
 
V
V
 
A
V
 
F
R
 
R
D
 
D
E
 
P
L
 
N
G
 
G
V
 
I
K
 
R
P
 
P
V
 
L
Y
 
V
Y
 
L
A
 
G
-
 
K
-
 
R
-
 
D
T
 
I
D
 
D
H
 
E
K
 
N
R
 
R
D
 
T
L
 
E
F
 
Y
A
 
M
F
 
V
A
 
A
S
 
S
E
 
E
R
 
S
K
 
V
A
 
A
L
 
L
W
 
D
K
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
F
K
 
D
D
 
F
V
 
L
N
 
R
V
 
D
L
 
V
K
 
A
P
 
P
G
 
G
E
 
E
M
 
A
I
 
I

Sites not aligning to the query:

1ecfB Escherichia coli glutamine phosphoribosylpyrophosphate (prpp) amidotransferase (see paper)
26% identity, 39% coverage: 5:198/495 of query aligns to 1:230/500 of 1ecfB

query
sites
1ecfB
A
x
C
G
 
G
I
 
I
L
 
V
S
 
G
I
 
I
N
 
A
G
 
G
K
 
V
Q
 
M
A
 
P
L
 
V
G
 
N
E
 
Q
D
 
S
L
 
I
I
 
Y
C
 
D
M
 
A
L
 
L
K
 
T
T
 
V
M
 
L
E
 
Q
H
 
H
R
 
R
G
|
G
P
 
Q
D
 
D
G
 
A
S
 
A
R
 
G
I
 
I
-
 
I
-
 
T
-
 
I
-
 
D
-
 
A
-
 
N
-
 
N
C
 
C
L
 
F
D
 
R
G
 
L
K
x
R
-
x
K
-
 
A
-
 
N
-
 
G
L
 
L
V
 
V
T
 
S
G
 
D
D
 
V
L
 
F
E
 
E
T
 
A
T
 
R
D
 
H
L
 
M
P
 
Q
F
x
R
-
 
L
-
 
Q
A
 
G
N
 
N
I
 
M
G
 
G
L
 
I
G
 
G
H
 
H
N
 
V
L
 
R
L
 
Y
S
 
P
I
 
T
V
 
A
G
 
G
T
 
S
E
 
S
V
 
S
-
 
A
-
 
S
-
x
E
S
 
A
Q
 
Q
P
 
P
L
 
F
-
x
Y
-
x
V
-
x
N
V
 
S
K
 
P
H
 
Y
G
 
G
L
 
I
V
 
T
L
 
L
V
 
A
A
 
H
N
|
N
A
x
G
E
 
N
I
 
L
Y
 
T
N
 
N
Y
 
A
R
 
H
E
 
E
L
 
L
-
 
R
K
 
K
N
 
K
F
 
L
Y
 
F
D
 
E
E
 
E
-
 
K
-
 
R
-
 
R
C
 
H
Y
 
I
F
 
N
T
 
T
D
 
T
S
 
S
D
 
D
C
 
S
E
 
E
V
 
I
I
 
L
L
 
L
T
 
N
L
 
I
V
 
F
N
 
A
K
 
S
Y
 
E
Y
 
L
K
 
D
N
 
N
-
 
F
-
 
R
-
 
H
-
 
Y
-
 
P
-
 
L
-
 
E
-
 
A
-
 
D
S
 
N
L
 
I
V
 
F
D
 
A
A
 
A
V
 
I
N
 
A
T
 
A
T
 
T
I
 
N
K
 
R
E
 
L
L
 
I
D
 
R
G
 
G
D
 
A
Y
 
Y
A
 
A
-
 
C
F
 
V
A
 
A
I
 
M
S
 
I
N
 
I
G
 
G
K
 
H
E
 
G
L
 
M
V
 
V
V
 
A
V
 
F
R
 
R
D
 
D
E
 
P
L
 
N
G
 
G
V
 
I
K
 
R
P
 
P
V
 
L
Y
 
V
Y
 
L
A
 
G
-
 
K
-
 
R
-
 
D
T
 
I
D
 
D
H
 
E
K
 
N
R
 
R
D
 
T
L
 
E
F
 
Y
A
 
M
F
 
V
A
 
A
S
 
S
E
 
E
R
 
S
K
 
V
A
 
A
L
 
L
W
 
D
K
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
F
K
 
D
D
 
F
V
 
L
N
 
R
V
 
D
L
 
V
K
 
A
P
 
P
G
 
G
E
 
E
M
 
A
I
 
I

Sites not aligning to the query:

6ottA Structure of purf in complex with ppapp (see paper)
26% identity, 39% coverage: 5:198/495 of query aligns to 1:230/496 of 6ottA

query
sites
6ottA
A
x
C
G
 
G
I
 
I
L
 
V
S
 
G
I
 
I
N
 
A
G
 
G
K
 
V
Q
 
M
A
 
P
L
 
V
G
 
N
E
 
Q
D
 
S
L
 
I
I
 
Y
C
 
D
M
 
A
L
 
L
K
 
T
T
 
V
M
 
L
E
 
Q
H
 
H
R
 
R
G
|
G
P
 
Q
D
 
D
G
 
A
S
 
A
R
 
G
I
 
I
-
 
I
-
 
T
-
 
I
-
 
D
-
 
A
-
 
N
-
 
N
C
 
C
L
 
F
D
 
R
G
 
L
K
 
R
-
 
K
-
 
A
-
 
N
-
 
G
L
 
L
V
 
V
T
 
S
G
 
D
D
 
V
L
 
F
E
 
E
T
 
A
T
x
R
D
x
H
L
 
M
P
 
Q
F
x
R
-
 
L
-
 
Q
A
 
G
N
 
N
I
 
M
G
 
G
L
 
I
G
 
G
H
 
H
N
 
V
L
 
R
L
 
Y
S
 
P
I
 
T
V
 
A
G
 
G
T
 
S
E
 
S
V
 
S
-
 
A
-
 
S
-
 
E
S
 
A
Q
 
Q
P
 
P
L
 
F
-
 
Y
-
 
V
-
 
N
V
 
S
K
 
P
H
 
Y
G
 
G
L
 
I
V
 
T
L
 
L
V
 
A
A
 
H
N
|
N
A
x
G
E
 
N
I
 
L
Y
 
T
N
 
N
Y
 
A
R
 
H
E
 
E
L
 
L
-
 
R
K
 
K
N
 
K
F
 
L
Y
 
F
D
 
E
E
 
E
-
 
K
-
 
R
-
 
R
C
 
H
Y
 
I
F
 
N
T
 
T
D
 
T
S
 
S
D
 
D
C
 
S
E
 
E
V
 
I
I
 
L
L
 
L
T
 
N
L
 
I
V
 
F
N
 
A
K
 
S
Y
 
E
Y
 
L
K
 
D
N
 
N
-
 
F
-
 
R
-
 
H
-
 
Y
-
 
P
-
 
L
-
 
E
-
 
A
-
 
D
S
 
N
L
 
I
V
 
F
D
 
A
A
 
A
V
 
I
N
 
A
T
 
A
T
 
T
I
 
N
K
 
R
E
 
L
L
 
I
D
 
R
G
 
G
D
 
A
Y
 
Y
A
 
A
-
 
C
F
 
V
A
 
A
I
 
M
S
 
I
N
 
I
G
 
G
K
 
H
E
 
G
L
 
M
V
 
V
V
 
A
V
 
F
R
 
R
D
 
D
E
 
P
L
 
N
G
 
G
V
 
I
K
 
R
P
 
P
V
 
L
Y
 
V
Y
 
L
A
 
G
-
 
K
-
 
R
-
 
D
T
 
I
D
 
D
H
 
E
K
 
N
R
 
R
D
 
T
L
 
E
F
 
Y
A
 
M
F
 
V
A
 
A
S
 
S
E
 
E
R
 
S
K
 
V
A
 
A
L
 
L
W
 
D
K
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
F
K
 
D
D
 
F
V
 
L
N
 
R
V
 
D
L
 
V
K
 
A
P
 
P
G
 
G
E
 
E
M
 
A
I
 
I

Sites not aligning to the query:

1ecjA Escherichia coli glutamine phosphoribosylpyrophosphate (prpp) amidotransferase complexed with 2 amp per tetramer (see paper)
26% identity, 39% coverage: 5:198/495 of query aligns to 1:230/492 of 1ecjA

query
sites
1ecjA
A
x
C
G
 
G
I
 
I
L
 
V
S
 
G
I
 
I
N
 
A
G
 
G
K
 
V
Q
 
M
A
 
P
L
 
V
G
 
N
E
 
Q
D
 
S
L
 
I
I
 
Y
C
 
D
M
 
A
L
 
L
K
 
T
T
 
V
M
 
L
E
 
Q
H
 
H
R
 
R
G
|
G
P
 
Q
D
 
D
G
 
A
S
 
A
R
 
G
I
 
I
-
 
I
-
 
T
-
 
I
-
 
D
-
 
A
-
 
N
-
 
N
C
 
C
L
 
F
D
 
R
G
 
L
K
 
R
-
 
K
-
 
A
-
 
N
-
 
G
L
 
L
V
 
V
T
 
S
G
 
D
D
 
V
L
 
F
E
 
E
T
 
A
T
 
R
D
 
H
L
 
M
P
 
Q
F
 
R
-
 
L
-
 
Q
A
 
G
N
 
N
I
 
M
G
 
G
L
 
I
G
 
G
H
 
H
N
 
V
L
 
R
L
x
Y
S
 
P
I
 
T
V
 
A
G
 
G
T
 
S
E
 
S
V
 
S
-
 
A
-
 
S
-
 
E
S
 
A
Q
 
Q
P
 
P
L
 
F
V
 
Y
-
 
V
-
 
N
-
 
S
K
 
P
H
 
Y
G
 
G
L
 
I
V
 
T
L
 
L
V
 
A
A
 
H
N
|
N
A
x
G
E
 
N
I
 
L
Y
 
T
N
 
N
Y
 
A
R
 
H
E
 
E
L
 
L
-
 
R
K
 
K
N
 
K
F
 
L
Y
 
F
D
 
E
E
 
E
-
 
K
-
 
R
-
 
R
C
 
H
Y
 
I
F
 
N
T
 
T
D
 
T
S
 
S
D
 
D
C
 
S
E
 
E
V
 
I
I
 
L
L
 
L
T
 
N
L
 
I
V
 
F
N
 
A
K
 
S
Y
 
E
Y
 
L
K
 
D
N
 
N
-
 
F
-
 
R
-
 
H
-
 
Y
-
 
P
-
 
L
-
 
E
-
 
A
-
 
D
S
 
N
L
 
I
V
 
F
D
 
A
A
 
A
V
 
I
N
 
A
T
 
A
T
 
T
I
 
N
K
 
R
E
 
L
L
 
I
D
 
R
G
 
G
D
 
A
Y
 
Y
A
 
A
-
 
C
F
 
V
A
 
A
I
 
M
S
 
I
N
 
I
G
 
G
K
 
H
E
 
G
L
 
M
V
 
V
V
 
A
V
 
F
R
 
R
D
 
D
E
 
P
L
 
N
G
 
G
V
 
I
K
 
R
P
 
P
V
 
L
Y
 
V
Y
 
L
A
 
G
-
 
K
-
 
R
-
 
D
T
 
I
D
 
D
H
 
E
K
 
N
R
 
R
D
 
T
L
 
E
F
 
Y
A
 
M
F
 
V
A
 
A
S
 
S
E
 
E
R
 
S
K
 
V
A
 
A
L
 
L
W
 
D
K
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
F
K
 
D
D
 
F
V
 
L
N
 
R
V
 
D
L
 
V
K
 
A
P
 
P
G
 
G
E
 
E
M
 
A
I
 
I

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_013644771.1 NCBI__GCF_000191585.1:WP_013644771.1
MCAIAGILSINGKQALGEDLICMLKTMEHRGPDGSRICLDGKLVTGDLETTDLPFANIGL
GHNLLSIVGTEVSQPLVKHGLVLVANAEIYNYRELKNFYDECYFTDSDCEVILTLVNKYY
KNSLVDAVNTTIKELDGDYAFAISNGKELVVVRDELGVKPVYYATDHKRDLFAFASERKA
LWKLGIKDVNVLKPGEMILNNKTISKPQTKKKTMPIPNVRDGNESFPQYGSNYYKNLLKK
VLIDSVKKRVVGLDRVGIIFSGGLDSSILAKLSKDLEVETFLYTVGTENSSDMKYAKQVA
NSLDLPLKSKIVALDDIKHYTGLVLNAIEEYNVMKIGVGMPSYIASELASQDGIRVMLSG
QGADEIFAGYQRYTQFYQEYGEKTTEYLEADVSNLYHVNLQRDDAVTMANSVELRVPYLD
SKVVNVGLNIPMKYKLGHDPDDLRKCILRRLALDLEVPMEAVLRPKKAAQYGSGIHRLLV
KKVLKDGSYKAQFES

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory