SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_013645946.1 NCBI__GCF_000191585.1:WP_013645946.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5x6bJ Crystal structure of sepcyse-sepcyss in complex with trnacys from methanocaldococcus jannaschii (see paper)
60% identity, 97% coverage: 9:375/379 of query aligns to 14:373/377 of 5x6bJ

query
sites
5x6bJ
L
 
L
T
 
T
R
 
R
D
 
S
T
 
L
E
 
T
R
 
R
K
 
E
N
 
F
L
 
I
N
 
N
L
 
L
N
 
N
P
 
P
L
 
I
Q
 
Q
R
 
R
G
 
G
G
 
G
V
 
I
L
 
L
P
 
P
L
 
K
E
 
E
A
 
A
R
 
K
K
 
K
A
 
A
L
 
V
Y
 
Y
E
 
E
F
 
Y
S
 
W
D
 
D
G
 
G
Y
 
Y
S
 
S
V
 
V
C
 
C
D
 
D
Y
 
-
C
 
-
S
 
-
G
 
-
R
 
-
L
 
-
D
 
-
E
 
E
I
 
V
T
 
T
K
 
C
P
 
P
Q
 
P
I
 
I
N
 
K
G
 
D
F
 
F
L
 
L
E
 
E
D
 
D
L
 
I
A
 
A
G
 
K
F
 
F
I
 
L
N
 
N
T
 
M
D
 
D
F
 
C
A
 
A
R
 
R
T
 
P
V
 
T
H
 
H
G
 
G
A
 
A
R
 
R
E
 
E
G
 
G
K
 
K
F
 
F
A
 
I
V
 
V
M
 
M
H
 
H
A
 
A
L
 
I
C
 
C
E
 
K
P
 
E
G
 
G
D
 
D
T
 
Y
I
 
V
V
 
V
I
 
L
D
 
D
G
 
K
N
 
N
A
 
A
H
 
H
Y
 
Y
T
 
T
T
 
S
H
 
Y
V
 
V
A
 
A
A
 
A
E
 
E
R
 
R
V
 
A
G
 
K
L
 
L
N
 
N
M
 
V
V
 
A
D
 
E
V
 
V
P
 
G
-
 
Y
N
 
E
T
 
E
D
 
E
Y
 
Y
P
 
P
N
 
T
Y
 
Y
E
 
K
V
 
I
T
 
N
P
 
L
E
 
E
S
 
G
Y
 
Y
K
 
K
E
 
E
V
 
V
L
 
I
D
 
D
D
 
N
L
 
L
Y
 
E
D
 
D
Q
 
K
G
 
G
E
 
K
E
 
N
V
 
V
S
 
G
L
 
L
V
 
I
L
 
L
L
 
L
T
 
T
H
 
H
V
 
V
D
 
D
G
 
G
N
 
E
Y
 
Y
G
 
G
N
 
N
L
 
L
A
 
N
D
 
D
A
 
A
R
 
K
S
 
K
I
 
V
G
 
G
K
 
K
I
 
I
A
 
A
H
 
K
D
 
E
A
 
K
G
 
G
V
 
I
P
 
P
L
 
F
L
 
L
L
 
L
N
 
N
C
 
C
A
 
A
Y
 
Y
S
 
T
M
 
V
G
 
G
R
 
R
L
 
M
P
 
P
I
 
V
D
 
N
A
 
G
K
 
K
A
 
E
L
 
V
N
 
K
A
 
A
D
 
D
F
 
F
V
 
I
V
 
V
G
 
A
S
 
S
G
 
G
H
 
H
K
 
K
S
 
S
M
 
M
A
 
A
A
 
A
S
 
S
G
 
A
P
 
P
I
 
C
G
 
G
V
 
I
L
 
L
G
 
A
L
 
F
K
 
S
E
 
E
E
 
E
W
 
F
A
 
S
D
 
D
I
 
K
I
 
I
L
 
T
K
 
K
R
 
T
S
 
S
D
 
E
R
 
K
A
x
F
Q
 
P
V
 
V
K
|
K
E
 
E
L
 
I
E
 
E
M
 
M
L
 
L
G
 
G
C
 
C
T
 
T
S
 
S
R
 
R
G
 
G
A
 
L
P
 
P
V
 
I
A
 
V
T
 
T
L
 
L
M
 
M
A
 
A
S
 
S
F
 
F
P
 
P
H
 
H
V
 
V
I
 
V
D
 
E
R
 
R
V
 
V
K
 
K
K
 
K
W
 
W
D
 
D
V
 
E
E
 
E
V
 
L
K
 
K
E
 
K
T
 
T
R
 
R
K
 
Y
F
 
V
V
 
V
E
 
D
T
 
E
L
 
L
E
 
E
N
 
K
I
 
I
E
 
-
G
 
G
I
 
F
N
 
K
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
K
 
I
K
 
K
P
 
P
K
 
K
E
 
E
H
 
H
D
 
D
L
 
L
V
 
I
R
 
K
F
 
F
E
 
E
T
 
T
P
 
P
I
 
V
F
 
L
D
 
D
E
 
E
I
 
I
A
 
A
K
 
K
H
 
K
H
 
D
T
 
K
R
 
R
R
 
R
G
 
G
F
 
F
F
 
F
L
 
F
Y
 
Y
E
 
D
E
 
E
L
 
L
K
 
K
K
 
K
R
 
R
K
 
G
I
 
I
V
 
G
G
 
G
I
 
I
K
 
R
R
 
A
G
 
G
Q
 
V
T
 
T
K
 
K
W
 
E
F
 
I
K
 
K
C
 
M
S
 
S
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
F
 
L
S
 
E
A
 
W
E
 
E
Q
 
Q
K
 
V
E
 
E
Y
 
Y
I
 
V
A
 
V
E
 
N
T
 
A
F
 
I
V
 
K
D
 
E
I
 
I
A
 
V

O30207 O-phospho-L-seryl-tRNA:Cys-tRNA synthase 1; Sep-tRNA:Cys-tRNA synthase 1; SepCysS 1; EC 2.5.1.73 from Archaeoglobus fulgidus (strain ATCC 49558 / DSM 4304 / JCM 9628 / NBRC 100126 / VC-16) (see paper)
53% identity, 95% coverage: 18:377/379 of query aligns to 10:369/371 of O30207

query
sites
O30207
L
 
I
N
 
N
L
 
I
N
 
D
P
 
P
L
 
L
Q
 
Q
R
 
T
G
 
G
G
 
G
V
 
K
L
 
L
P
 
T
L
 
E
E
 
E
A
 
A
R
 
R
K
 
Q
A
 
A
L
 
L
Y
 
L
E
 
E
F
 
W
S
 
G
D
 
D
G
 
G
Y
 
Y
S
 
S
V
 
V
C
 
C
D
 
D
Y
 
F
C
 
C
S
 
T
-
 
T
G
 
G
R
 
R
L
 
L
D
 
D
E
 
E
I
 
I
T
 
K
K
 
T
P
 
P
Q
 
P
I
 
I
N
 
H
G
 
D
F
 
F
L
 
I
E
 
H
D
 
N
-
 
Q
L
 
L
A
 
P
G
 
K
F
 
F
I
 
L
N
 
G
T
 
C
D
 
D
F
 
V
A
 
A
R
 
R
T
 
V
V
 
T
H
 
N
G
 
G
A
|
A
R
|
R
E
 
E
G
 
A
K
 
K
F
 
F
A
 
A
V
 
V
M
 
M
H
 
H
A
 
S
L
 
L
C
 
A
E
 
K
P
 
K
G
 
D
D
 
A
T
 
W
I
 
V
V
 
V
I
 
M
D
 
D
G
 
E
N
 
N
A
 
C
H
 
H
Y
 
Y
T
 
S
T
 
S
H
 
Y
V
 
V
A
 
A
A
 
A
E
 
E
R
 
R
V
 
A
G
 
G
L
 
L
N
 
N
M
 
I
V
 
A
D
 
L
V
 
V
P
 
P
N
 
K
T
 
T
D
 
D
Y
 
Y
P
 
P
N
 
D
Y
 
Y
E
 
A
V
 
I
T
 
T
P
 
P
E
 
E
S
 
N
Y
 
F
K
 
A
E
 
Q
V
 
T
L
 
I
D
 
E
D
 
E
L
 
T
Y
 
K
D
 
K
Q
 
R
G
 
G
E
 
E
E
 
-
V
 
V
S
 
V
L
 
L
V
 
A
L
 
L
L
 
I
T
 
T
H
 
Y
V
 
P
D
 
D
G
 
G
N
 
N
Y
 
Y
G
 
G
N
 
N
L
 
L
A
 
P
D
 
D
A
 
V
R
 
K
S
 
K
I
 
I
G
 
A
K
 
K
I
 
V
A
 
C
H
 
S
D
 
E
A
 
Y
G
 
D
V
 
V
P
 
P
L
 
L
L
 
L
L
 
V
N
|
N
C
 
G
A
 
A
Y
 
Y
S
 
A
M
 
I
G
 
G
R
 
R
L
 
M
P
 
P
I
 
V
D
 
S
A
 
L
K
 
K
A
 
E
L
 
I
N
 
G
A
 
A
D
 
D
F
 
F
V
 
I
V
 
V
G
 
G
S
|
S
G
|
G
H
|
H
K
|
K
S
 
S
M
 
M
A
 
A
A
 
A
S
 
S
G
 
G
P
 
P
I
 
I
G
 
G
V
 
V
L
 
M
G
 
G
L
 
M
K
 
K
E
 
E
E
 
E
W
 
W
A
 
A
D
 
E
I
 
I
I
 
V
L
 
L
K
 
R
R
 
R
S
 
S
D
 
E
R
 
K
A
 
Y
Q
 
K
V
 
N
K
 
K
E
 
E
L
 
V
E
 
E
M
 
L
L
 
L
G
 
G
C
 
C
T
 
T
S
 
A
R
 
R
G
 
G
A
 
A
P
 
T
V
 
I
A
 
I
T
 
T
L
 
L
M
 
M
A
 
A
S
 
S
F
 
F
P
 
P
H
 
H
V
 
V
I
 
R
D
 
E
R
 
R
V
 
I
K
 
K
K
 
R
W
 
W
D
 
D
V
 
E
E
 
E
V
 
V
K
 
E
E
 
K
T
 
A
R
 
R
K
 
R
F
 
F
V
 
A
E
 
A
T
 
E
L
 
M
E
 
E
N
 
K
I
 
L
E
 
-
G
 
G
I
 
I
N
 
K
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
K
 
D
K
 
N
P
 
P
K
 
H
E
 
N
H
 
H
D
 
D
L
 
L
V
 
M
R
 
F
F
 
F
E
 
H
T
 
A
P
 
E
I
 
V
F
 
L
D
 
Y
E
 
E
I
 
I
A
 
S
K
 
K
H
 
K
H
 
A
T
 
K
R
 
G
R
 
G
G
 
R
F
 
F
F
 
F
L
 
L
Y
 
Y
E
 
R
E
 
E
L
 
L
K
 
K
K
 
S
R
 
R
K
 
K
I
 
I
V
 
H
G
 
G
I
 
I
K
 
K
R
 
P
G
 
G
Q
 
L
T
 
T
K
 
R
W
 
Y
F
 
F
K
 
K
C
 
L
S
 
S
V
 
T
Y
 
Y
G
 
G
F
 
L
S
 
S
A
 
D
E
 
E
Q
 
E
K
 
V
E
 
D
Y
 
Y
I
 
V
A
 
L
E
 
N
T
 
A
F
 
F
V
 
K
D
 
E
I
 
I
A
 
I
S
 
E
K
 
K

2e7iA Crystal structure of sep-trna:cys-tRNA synthase from archaeoglobus fulgidus (see paper)
49% identity, 95% coverage: 18:377/379 of query aligns to 3:342/344 of 2e7iA

query
sites
2e7iA
L
 
I
N
 
N
L
 
I
N
 
D
P
 
P
L
 
L
Q
 
Q
R
 
T
G
 
G
G
 
G
V
 
K
L
 
L
P
 
T
L
 
E
E
 
E
A
 
A
R
 
R
K
 
Q
A
 
A
L
 
L
Y
 
L
E
 
E
F
 
W
S
 
-
D
 
-
G
 
-
Y
 
-
S
 
-
V
 
-
C
 
-
D
 
-
Y
 
-
C
 
-
S
 
-
G
 
-
R
 
-
L
 
-
D
 
-
E
 
-
I
 
-
T
 
-
K
 
-
P
 
P
Q
 
P
I
 
I
N
 
H
G
 
D
F
 
F
L
 
I
E
 
H
D
 
N
-
 
Q
L
 
L
A
 
P
G
 
K
F
 
F
I
 
L
N
 
G
T
 
C
D
 
D
F
 
V
A
 
A
R
 
R
T
 
V
V
 
T
H
 
N
G
|
G
A
|
A
R
|
R
E
 
E
G
 
A
K
 
K
F
 
F
A
 
A
V
 
V
M
 
M
H
 
H
A
 
S
L
 
L
C
 
A
E
 
K
P
 
K
G
 
D
D
 
A
T
 
W
I
 
V
V
 
V
I
 
M
D
 
D
G
 
E
N
 
N
A
 
C
H
|
H
Y
|
Y
T
 
S
T
 
S
H
 
Y
V
 
V
A
 
A
A
 
A
E
 
E
R
 
R
V
 
A
G
 
G
L
 
L
N
 
N
M
 
I
V
 
A
D
 
L
V
 
V
P
 
P
N
 
K
T
 
T
D
 
D
Y
 
Y
P
 
P
N
 
D
Y
 
Y
E
 
A
V
 
I
T
 
T
P
 
P
E
 
E
S
 
N
Y
 
F
K
 
A
E
 
Q
V
 
T
L
 
I
D
 
E
D
 
E
L
 
T
Y
 
K
D
 
K
Q
 
R
G
 
G
E
 
E
E
 
-
V
 
V
S
 
V
L
 
L
V
 
A
L
 
L
L
 
I
T
 
T
H
 
Y
V
 
P
D
 
D
G
 
G
N
 
N
Y
 
Y
G
 
G
N
 
N
L
 
L
A
 
P
D
 
D
A
 
V
R
 
K
S
 
K
I
 
I
G
 
A
K
 
K
I
 
V
A
 
C
H
 
S
D
 
E
A
 
Y
G
 
D
V
 
V
P
 
P
L
 
L
L
 
L
L
 
V
N
|
N
C
 
G
A
|
A
Y
|
Y
S
 
A
M
 
I
G
 
G
R
 
R
L
 
M
P
 
P
I
 
V
D
 
S
A
 
L
K
 
K
A
 
E
L
 
I
N
 
G
A
 
A
D
 
D
F
 
F
V
 
I
V
 
V
G
 
G
S
|
S
G
 
G
H
|
H
K
|
K
S
 
S
M
 
M
A
 
A
A
 
A
S
 
S
G
 
G
P
 
P
I
 
I
G
 
G
V
 
V
L
 
M
G
 
G
L
 
M
K
 
K
E
 
E
E
 
E
W
 
W
A
 
A
D
 
E
I
 
I
I
 
V
L
 
L
K
 
R
R
 
R
S
 
S
D
 
E
R
 
K
A
 
Y
Q
 
K
V
 
N
K
 
K
E
 
E
L
 
V
E
 
E
M
 
L
L
 
L
G
 
G
C
 
C
T
 
T
S
 
A
R
 
R
G
 
G
A
 
A
P
 
T
V
 
I
A
 
I
T
 
T
L
 
L
M
 
M
A
 
A
S
 
S
F
 
F
P
 
P
H
 
H
V
 
V
I
 
R
D
 
E
R
|
R
V
 
I
K
 
K
K
x
R
W
 
W
D
 
D
V
 
E
E
 
E
V
 
V
K
 
E
E
 
K
T
 
A
R
 
R
K
 
R
F
 
F
V
 
A
E
 
A
T
 
E
L
 
M
E
 
E
N
 
K
I
 
L
E
 
-
G
 
G
I
 
I
N
 
K
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
K
 
D
K
 
N
P
 
P
K
 
H
E
 
N
H
 
H
D
 
D
L
 
L
V
 
M
R
 
F
F
 
F
E
 
H
T
 
A
P
 
E
I
 
V
F
 
L
D
 
Y
E
 
E
I
 
I
A
 
S
K
 
K
H
 
K
H
 
A
T
 
K
R
 
G
R
 
G
G
 
R
F
 
F
F
 
F
L
 
L
Y
 
Y
E
 
R
E
 
E
L
 
L
K
 
K
K
 
S
R
 
R
K
 
K
I
 
I
V
 
H
G
 
G
I
 
I
K
 
K
R
 
P
G
 
G
Q
 
L
T
 
T
K
 
R
W
 
Y
F
 
F
K
 
K
C
 
L
S
 
S
V
 
T
Y
 
Y
G
 
G
F
 
L
S
 
S
A
 
D
E
 
E
Q
 
E
K
 
V
E
 
D
Y
 
Y
I
 
V
A
 
L
E
 
N
T
 
A
F
 
F
V
 
K
D
 
E
I
 
I
A
 
I
S
 
E
K
 
K

Q8KUU5 Cysteine desulfurase; CyD; EC 2.8.1.7 from Synechococcus elongatus (strain ATCC 33912 / PCC 7942 / FACHB-805) (Anacystis nidulans R2) (see paper)
33% identity, 37% coverage: 99:238/379 of query aligns to 331:465/626 of Q8KUU5

query
sites
Q8KUU5
G
 
G
D
 
D
T
 
E
I
 
I
V
 
V
I
 
I
D
 
T
G
 
W
N
 
L
A
 
E
H
 
H
Y
 
H
T
 
A
T
 
N
H
 
I
V
 
V
A
 
P
A
 
W
E
 
Q
R
 
Q
V
 
L
-
 
S
-
 
A
-
 
E
-
 
T
G
 
G
L
 
A
N
 
R
M
 
L
V
 
R
D
 
V
V
 
V
P
 
P
N
 
V
T
 
D
D
 
D
Y
 
Y
P
 
-
N
 
-
Y
 
G
E
 
Q
V
 
V
T
 
R
P
 
L
E
 
D
S
 
E
Y
 
Y
K
 
Q
E
 
K
V
 
L
L
 
L
D
 
S
D
 
D
L
 
-
Y
 
-
D
 
-
Q
 
-
G
 
-
E
 
-
E
 
R
V
 
T
S
 
K
L
 
I
V
 
V
L
 
S
L
 
F
T
 
T
H
 
Q
V
 
V
D
 
S
G
 
N
N
 
A
Y
 
L
G
 
G
N
 
T
L
 
I
A
 
T
D
 
P
A
 
A
R
 
K
S
 
E
I
 
I
G
 
I
K
 
E
I
 
L
A
 
A
H
 
H
D
 
R
A
 
Y
G
 
G
V
 
A
P
 
K
L
 
V
L
 
L
L
 
L
N
 
D
C
 
G
A
 
A
Y
 
Q
S
 
S
M
 
V
G
 
S
R
 
H
L
 
L
P
 
A
I
 
V
D
 
D
A
 
V
K
 
Q
A
 
A
L
 
L
N
 
D
A
 
C
D
 
D
F
 
W
V
 
F
V
 
V
G
 
F
S
 
S
G
 
G
H
 
H
K
 
K
S
 
V
M
 
F
A
 
G
A
 
P
S
 
T
G
 
G
P
 
-
I
 
I
G
 
G
V
 
V
L
 
L
G
 
Y
L
 
G
K
 
K
E
 
Q
E
 
E
W
 
L
A
 
L
D
 
D
I
 
A
I
 
T
L
 
L

Sites not aligning to the query:

5b87A Crystal structure of a cysteine desulfurase from thermococcus onnurineus na1 in complex with alanine at 2.3 angstrom resolution (see paper)
30% identity, 36% coverage: 99:235/379 of query aligns to 103:234/397 of 5b87A

query
sites
5b87A
G
 
G
D
 
D
T
 
K
I
 
I
V
 
V
I
 
T
D
 
T
G
 
P
N
 
Y
A
 
E
H
|
H
Y
 
H
T
 
S
T
 
D
H
 
L
V
 
L
A
 
P
-
 
W
-
 
Q
-
 
R
-
 
L
A
 
A
E
 
T
R
 
K
V
 
L
G
 
G
L
 
L
N
 
K
M
 
L
V
 
E
D
 
F
V
 
I
P
 
E
N
 
G
T
 
D
D
 
D
Y
 
E
P
 
G
N
 
N
Y
 
L
E
 
D
V
 
-
T
 
-
P
 
-
E
 
-
S
 
-
Y
 
-
K
 
-
E
 
-
V
 
-
L
 
L
D
 
S
D
 
D
L
 
A
Y
 
E
D
 
K
Q
 
K
G
 
I
E
 
K
E
 
G
V
 
A
S
 
K
L
 
L
V
 
V
L
 
A
L
 
V
T
 
Q
H
 
H
V
 
V
D
 
S
G
x
N
N
 
A
Y
 
L
G
 
G
N
 
V
L
 
I
A
 
H
D
 
E
A
 
V
R
 
E
S
 
E
I
 
L
G
 
G
K
 
K
I
 
I
A
 
A
H
 
K
D
 
D
A
 
E
G
 
G
V
 
A
P
 
I
L
 
F
L
 
V
L
 
V
N
x
D
C
 
A
A
|
A
Y
x
Q
S
 
S
M
 
A
G
 
G
R
 
H
L
 
M
P
 
E
I
 
V
D
 
N
A
 
V
K
 
K
A
 
K
L
 
L
N
 
H
A
 
A
D
 
D
F
 
F
V
 
L
V
 
A
G
 
F
S
|
S
G
 
G
H
|
H
K
|
K
S
 
G
M
 
P
A
 
M
A
 
G
S
 
P
G
 
T
P
 
G
I
 
I
G
 
G
V
 
V
L
 
L
G
 
Y
L
 
I
K
 
R
E
 
E
E
 
E
W
 
F
A
 
F
D
 
D

Sites not aligning to the query:

5b7uA Apo structure of cysteine desulfurase from thermococcus onnurineus na1 at 1.89a (see paper)
30% identity, 36% coverage: 99:235/379 of query aligns to 109:240/402 of 5b7uA

query
sites
5b7uA
G
 
G
D
 
D
T
 
K
I
 
I
V
 
V
I
 
T
D
 
T
G
 
P
N
 
Y
A
 
E
H
|
H
Y
 
H
T
 
S
T
 
D
H
 
L
V
 
L
A
 
P
-
 
W
-
 
Q
-
 
R
-
 
L
A
 
A
E
 
T
R
 
K
V
 
L
G
 
G
L
 
L
N
 
K
M
 
L
V
 
E
D
 
F
V
 
I
P
 
E
N
 
G
T
 
D
D
 
D
Y
 
E
P
 
G
N
 
N
Y
 
L
E
 
D
V
 
-
T
 
-
P
 
-
E
 
-
S
 
-
Y
 
-
K
 
-
E
 
-
V
 
-
L
 
L
D
 
S
D
 
D
L
 
A
Y
 
E
D
 
K
Q
 
K
G
 
I
E
 
K
E
 
G
V
 
A
S
 
K
L
 
L
V
 
V
L
 
A
L
 
V
T
 
Q
H
 
H
V
 
V
D
 
S
G
 
N
N
 
A
Y
 
L
G
 
G
N
 
V
L
 
I
A
 
H
D
 
E
A
 
V
R
 
E
S
 
E
I
 
L
G
 
G
K
 
K
I
 
I
A
 
A
H
 
K
D
 
D
A
 
E
G
 
G
V
 
A
P
 
I
L
 
F
L
 
V
L
 
V
N
x
D
C
 
A
A
|
A
Y
x
Q
S
 
S
M
 
A
G
 
G
R
 
H
L
 
M
P
 
E
I
 
V
D
 
N
A
 
V
K
 
K
A
 
K
L
 
L
N
 
H
A
 
A
D
 
D
F
 
F
V
 
L
V
 
A
G
 
F
S
 
S
G
 
G
H
 
H
K
|
K
S
 
G
M
 
P
A
 
M
A
 
G
S
 
P
G
 
T
P
 
G
I
 
I
G
 
G
V
 
V
L
 
L
G
 
Y
L
 
I
K
 
R
E
 
E
E
 
E
W
 
F
A
 
F
D
 
D

Sites not aligning to the query:

1t3iA Structure of slr0077/sufs, the essential cysteine desulfurase from synechocystis pcc 6803 (see paper)
36% identity, 21% coverage: 153:232/379 of query aligns to 160:238/406 of 1t3iA

query
sites
1t3iA
E
 
E
E
 
K
V
 
T
S
 
K
L
 
L
V
 
V
L
 
T
L
 
V
T
 
V
H
 
H
V
 
I
D
 
S
G
x
N
N
 
T
Y
 
L
G
 
G
N
 
C
L
 
V
A
 
N
D
 
P
A
 
A
R
 
E
S
 
E
I
 
I
G
 
A
K
 
Q
I
 
L
A
 
A
H
 
H
D
 
Q
A
 
A
G
 
G
V
 
A
P
 
K
L
 
V
L
 
L
L
 
V
N
x
D
C
 
A
A
x
C
Y
x
Q
S
 
S
M
 
A
G
 
P
R
 
H
L
 
Y
P
 
P
I
 
L
D
 
D
A
 
V
K
 
Q
A
 
L
L
 
I
N
 
D
A
 
C
D
 
D
F
 
W
V
 
L
V
 
V
G
 
A
S
|
S
G
 
G
H
|
H
K
|
K
S
 
M
M
 
C
A
 
A
A
 
P
S
 
T
G
 
G
P
 
-
I
 
I
G
 
G
V
 
F
L
 
L
G
 
Y
L
 
G
K
 
K
E
 
E
E
 
E

Sites not aligning to the query:

Q9EXP2 Cysteine desulfurase; Selenocysteine beta-lyase; SCL; Selenocysteine lyase; Selenocysteine reductase; EC 2.8.1.7; EC 4.4.1.16 from Dickeya dadantii (strain 3937) (Erwinia chrysanthemi (strain 3937)) (see paper)
29% identity, 46% coverage: 97:271/379 of query aligns to 116:286/412 of Q9EXP2

query
sites
Q9EXP2
E
 
Q
P
 
P
G
 
G
D
 
D
T
 
N
I
 
L
V
 
V
I
 
I
D
 
S
G
 
E
N
 
M
A
 
E
H
 
H
Y
 
H
T
 
A
T
 
N
H
 
I
V
 
V
A
 
P
-
 
W
-
 
Q
-
 
M
-
 
L
A
 
A
E
 
Q
R
 
A
V
 
R
G
 
G
L
 
L
N
 
T
M
 
L
V
 
R
D
 
V
V
 
L
P
 
P
N
 
I
T
 
T
D
 
D
Y
 
-
P
 
-
N
 
D
Y
 
G
E
 
E
V
 
L
T
 
D
P
 
M
E
 
A
S
 
Q
Y
 
L
K
 
P
E
 
A
V
 
L
L
 
L
D
 
D
D
 
-
L
 
-
Y
 
-
D
 
-
Q
 
-
G
 
-
E
 
E
E
 
R
V
 
T
S
 
R
L
 
L
V
 
V
L
 
A
L
 
V
T
 
T
H
 
Q
V
 
V
D
 
S
G
 
N
N
 
V
Y
 
L
G
 
G
N
 
T
L
 
V
A
 
N
D
 
P
A
 
L
R
 
A
S
 
E
I
 
I
G
 
I
K
 
R
I
 
Q
A
 
A
H
 
H
D
 
A
A
 
C
G
 
G
V
 
A
P
 
K
L
 
V
L
 
L
L
 
V
N
 
D
C
 
G
A
 
A
Y
 
Q
S
 
A
M
 
V
G
 
M
R
 
H
L
 
Q
P
 
A
I
 
V
D
 
D
A
 
V
K
 
Q
A
 
A
L
 
L
N
 
D
A
 
C
D
 
D
F
 
F
V
 
Y
V
 
A
G
 
F
S
 
S
G
 
G
H
 
H
K
 
K
S
 
L
M
 
Y
A
 
G
A
 
P
S
 
S
G
 
G
P
 
-
I
 
I
G
 
G
V
 
V
L
 
L
G
 
Y
L
 
G
K
 
K
E
 
S
E
 
E
W
 
L
A
 
L
D
 
Q
I
 
A
I
 
M
L
 
P
K
 
P
-
 
W
R
 
E
S
 
G
D
 
G
R
 
G
A
 
A
Q
 
M
V
 
I
K
 
R
E
 
E
L
 
V
E
 
S
M
 
L
L
 
T
G
 
Q
C
 
G
T
 
T
S
 
T
R
 
Y
G
 
A
A
 
D
P
 
P
V
 
P
A
 
W
T
 
R
L
 
F
M
 
E
A
 
A
S
 
G
F
 
S
P
 
P
H
 
H
V
 
V

Sites not aligning to the query:

1kmkA E. Coli nifs/csdb protein at 2.20a with the cysteine perselenide intermediate (residue csz). (see paper)
30% identity, 42% coverage: 72:231/379 of query aligns to 78:239/405 of 1kmkA

query
sites
1kmkA
F
 
F
I
 
I
N
 
N
T
 
A
D
 
R
F
 
S
A
 
A
R
 
E
T
 
E
-
 
L
-
 
V
-
 
F
V
 
V
H
 
R
G
 
G
A
x
T
R
x
T
E
 
E
G
 
G
K
 
I
F
 
N
A
 
L
V
 
V
M
 
A
H
 
N
A
 
S
L
 
W
-
 
G
-
 
N
-
 
S
-
 
N
C
 
V
E
 
R
P
 
A
G
 
G
D
 
D
T
 
N
I
 
I
V
 
I
I
 
I
D
 
S
G
 
Q
N
 
M
A
 
E
H
|
H
Y
 
H
T
 
A
T
 
N
H
 
I
V
 
V
A
 
P
A
 
W
E
 
Q
-
 
M
-
 
L
-
 
C
-
 
A
R
 
R
V
 
V
G
 
G
L
 
A
N
 
E
M
 
L
V
 
R
D
 
V
V
 
I
P
 
P
N
 
L
T
 
N
D
 
P
Y
 
D
P
 
G
N
 
T
Y
 
L
E
 
Q
V
 
L
T
 
-
P
 
-
E
 
-
S
 
-
Y
 
-
K
 
-
E
 
E
V
 
T
L
 
L
D
 
P
D
 
T
L
 
L
Y
 
F
D
 
D
Q
 
-
G
 
-
E
 
E
E
 
K
V
 
T
S
 
R
L
 
L
V
 
L
L
 
A
L
 
I
T
 
T
H
 
H
V
 
V
D
 
S
G
x
N
N
 
V
Y
 
L
G
 
G
N
 
T
L
 
E
A
 
N
D
 
P
A
 
L
R
 
A
S
 
E
I
 
M
G
 
I
K
 
T
I
 
L
A
 
A
H
 
H
D
 
Q
A
 
H
G
 
G
V
 
A
P
 
K
L
 
V
L
 
L
L
 
V
N
x
D
C
 
G
A
|
A
Y
x
Q
S
 
A
M
 
V
G
 
M
R
 
H
L
 
H
P
 
P
I
 
V
D
 
D
A
 
V
K
 
Q
A
 
A
L
 
L
N
 
D
A
 
C
D
 
D
F
 
F
V
 
Y
V
 
V
G
 
F
S
|
S
G
 
G
H
|
H
K
|
K
S
 
L
M
 
Y
A
 
G
A
 
P
S
 
T
G
 
G
P
 
-
I
 
I
G
 
G
V
 
I
L
 
L
G
 
Y
L
 
V
K
 
K
E
 
E

Sites not aligning to the query:

1i29A Crystal structure of csdb complexed with l-propargylglycine (see paper)
30% identity, 42% coverage: 72:231/379 of query aligns to 78:239/405 of 1i29A

query
sites
1i29A
F
 
F
I
 
I
N
 
N
T
 
A
D
 
R
F
 
S
A
 
A
R
 
E
T
 
E
-
 
L
-
 
V
-
 
F
V
 
V
H
 
R
G
 
G
A
x
T
R
x
T
E
 
E
G
 
G
K
 
I
F
 
N
A
 
L
V
 
V
M
 
A
H
 
N
A
 
S
L
 
W
-
 
G
-
 
N
-
 
S
-
 
N
C
 
V
E
 
R
P
 
A
G
 
G
D
 
D
T
 
N
I
 
I
V
 
I
I
 
I
D
 
S
G
 
Q
N
 
M
A
 
E
H
|
H
Y
 
H
T
 
A
T
 
N
H
 
I
V
 
V
A
 
P
A
 
W
E
 
Q
-
 
M
-
 
L
-
 
C
-
 
A
R
 
R
V
 
V
G
 
G
L
 
A
N
 
E
M
 
L
V
 
R
D
 
V
V
 
I
P
 
P
N
 
L
T
 
N
D
 
P
Y
 
D
P
 
G
N
 
T
Y
 
L
E
 
Q
V
 
L
T
 
-
P
 
-
E
 
-
S
 
-
Y
 
-
K
 
-
E
 
E
V
 
T
L
 
L
D
 
P
D
 
T
L
 
L
Y
 
F
D
 
D
Q
 
-
G
 
-
E
 
E
E
 
K
V
 
T
S
 
R
L
 
L
V
 
L
L
 
A
L
 
I
T
 
T
H
 
H
V
 
V
D
 
S
G
 
N
N
 
V
Y
 
L
G
 
G
N
 
T
L
 
E
A
 
N
D
 
P
A
 
L
R
 
A
S
 
E
I
 
M
G
 
I
K
 
T
I
 
L
A
 
A
H
 
H
D
 
Q
A
 
H
G
 
G
V
 
A
P
 
K
L
 
V
L
 
L
L
 
V
N
x
D
C
 
G
A
|
A
Y
x
Q
S
 
A
M
 
V
G
 
M
R
 
H
L
 
H
P
 
P
I
 
V
D
 
D
A
 
V
K
 
Q
A
 
A
L
 
L
N
 
D
A
 
C
D
 
D
F
 
F
V
 
Y
V
 
V
G
 
F
S
|
S
G
 
G
H
|
H
K
|
K
S
 
L
M
 
Y
A
 
G
A
 
P
S
 
T
G
 
G
P
 
-
I
 
I
G
 
G
V
 
I
L
 
L
G
 
Y
L
 
V
K
 
K
E
 
E

Sites not aligning to the query:

5db5A Crystal structure of plp-bound e. Coli sufs (cysteine persulfide intermediate) in space group p21
30% identity, 42% coverage: 72:231/379 of query aligns to 77:238/404 of 5db5A

query
sites
5db5A
F
 
F
I
 
I
N
 
N
T
 
A
D
 
R
F
 
S
A
 
A
R
 
E
T
 
E
-
 
L
-
 
V
-
 
F
V
 
V
H
 
R
G
 
G
A
x
T
R
x
T
E
 
E
G
 
G
K
 
I
F
 
N
A
 
L
V
 
V
M
 
A
H
 
N
A
 
S
L
 
W
-
 
G
-
 
N
-
 
S
-
 
N
C
 
V
E
 
R
P
 
A
G
 
G
D
 
D
T
 
N
I
 
I
V
 
I
I
 
I
D
 
S
G
 
Q
N
 
M
A
 
E
H
|
H
Y
 
H
T
 
A
T
 
N
H
 
I
V
 
V
A
 
P
A
 
W
E
 
Q
-
 
M
-
 
L
-
 
C
-
 
A
R
 
R
V
 
V
G
 
G
L
 
A
N
 
E
M
 
L
V
 
R
D
 
V
V
 
I
P
 
P
N
 
L
T
 
N
D
 
P
Y
 
D
P
 
G
N
 
T
Y
 
L
E
 
Q
V
 
L
T
 
-
P
 
-
E
 
-
S
 
-
Y
 
-
K
 
-
E
 
E
V
 
T
L
 
L
D
 
P
D
 
T
L
 
L
Y
 
F
D
 
D
Q
 
-
G
 
-
E
 
E
E
 
K
V
 
T
S
 
R
L
 
L
V
 
L
L
 
A
L
 
I
T
 
T
H
 
H
V
 
V
D
 
S
G
 
N
N
 
V
Y
 
L
G
 
G
N
 
T
L
 
E
A
 
N
D
 
P
A
 
L
R
 
A
S
 
E
I
 
M
G
 
I
K
 
T
I
 
L
A
 
A
H
 
H
D
 
Q
A
 
H
G
 
G
V
 
A
P
 
K
L
 
V
L
 
L
L
 
V
N
x
D
C
 
G
A
|
A
Y
x
Q
S
 
A
M
 
V
G
 
M
R
 
H
L
 
H
P
 
P
I
 
V
D
 
D
A
 
V
K
 
Q
A
 
A
L
 
L
N
 
D
A
 
C
D
 
D
F
 
F
V
 
Y
V
 
V
G
 
F
S
|
S
G
 
G
H
|
H
K
|
K
S
 
L
M
 
Y
A
 
G
A
 
P
S
 
T
G
 
G
P
 
-
I
 
I
G
 
G
V
 
I
L
 
L
G
 
Y
L
 
V
K
 
K
E
 
E

Sites not aligning to the query:

6ndnA Crystal structure of selenocysteine lyase from escherichia coli
30% identity, 42% coverage: 72:231/379 of query aligns to 79:240/406 of 6ndnA

query
sites
6ndnA
F
 
F
I
 
I
N
 
N
T
 
A
D
 
R
F
 
S
A
 
A
R
 
E
T
 
E
-
 
L
-
 
V
-
 
F
V
 
V
H
 
R
G
 
G
A
x
T
R
x
T
E
 
E
G
 
G
K
 
I
F
 
N
A
 
L
V
 
V
M
 
A
H
 
N
A
 
S
L
 
W
-
 
G
-
 
N
-
 
S
-
 
N
C
 
V
E
 
R
P
 
A
G
 
G
D
 
D
T
 
N
I
 
I
V
 
I
I
 
I
D
 
S
G
 
Q
N
 
M
A
 
E
H
|
H
Y
 
H
T
 
A
T
 
N
H
 
I
V
 
V
A
 
P
A
 
W
E
 
Q
-
 
M
-
 
L
-
 
C
-
 
A
R
 
R
V
 
V
G
 
G
L
 
A
N
 
E
M
 
L
V
 
R
D
 
V
V
 
I
P
 
P
N
 
L
T
 
N
D
 
P
Y
 
D
P
 
G
N
 
T
Y
 
L
E
 
Q
V
 
L
T
 
-
P
 
-
E
 
-
S
 
-
Y
 
-
K
 
-
E
 
E
V
 
T
L
 
L
D
 
P
D
 
T
L
 
L
Y
 
F
D
 
D
Q
 
-
G
 
-
E
 
E
E
 
K
V
 
T
S
 
R
L
 
L
V
 
L
L
 
A
L
 
I
T
 
T
H
 
H
V
 
V
D
 
S
G
x
N
N
 
V
Y
 
L
G
 
G
N
 
T
L
 
E
A
 
N
D
 
P
A
 
L
R
 
A
S
 
E
I
 
M
G
 
I
K
 
T
I
 
L
A
 
A
H
 
H
D
 
Q
A
 
H
G
 
G
V
 
A
P
 
K
L
 
V
L
 
L
L
 
V
N
x
D
C
 
G
A
|
A
Y
x
Q
S
 
A
M
 
V
G
 
M
R
 
H
L
 
H
P
 
P
I
 
V
D
 
D
A
 
V
K
 
Q
A
 
A
L
 
L
N
 
D
A
 
C
D
 
D
F
 
F
V
 
Y
V
 
V
G
 
F
S
|
S
G
 
G
H
|
H
K
|
K
S
 
L
M
 
Y
A
 
G
A
 
P
S
 
T
G
 
G
P
 
-
I
 
I
G
 
G
V
 
I
L
 
L
G
 
Y
L
 
V
K
 
K
E
 
E

P77444 Cysteine desulfurase; Cysteine sulfinate desulfinase; CSD; Selenocysteine beta-lyase; SCL; Selenocysteine lyase; Selenocysteine reductase; EC 2.8.1.7; EC 3.13.1.-; EC 4.4.1.16 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
30% identity, 42% coverage: 72:231/379 of query aligns to 79:240/406 of P77444

query
sites
P77444
F
 
F
I
 
I
N
 
N
T
 
A
D
 
R
F
 
S
A
 
A
R
 
E
T
 
E
-
 
L
-
 
V
-
 
F
V
 
V
H
 
R
G
 
G
A
 
T
R
 
T
E
 
E
G
 
G
K
 
I
F
 
N
A
 
L
V
 
V
M
 
A
H
 
N
A
 
S
L
 
W
-
 
G
-
 
N
-
 
S
-
 
N
C
 
V
E
 
R
P
 
A
G
 
G
D
 
D
T
 
N
I
 
I
V
 
I
I
 
I
D
 
S
G
 
Q
N
 
M
A
 
E
H
|
H
Y
 
H
T
 
A
T
 
N
H
 
I
V
 
V
A
 
P
A
 
W
E
 
Q
-
 
M
-
 
L
-
 
C
-
 
A
R
 
R
V
 
V
G
 
G
L
 
A
N
 
E
M
 
L
V
 
R
D
 
V
V
 
I
P
 
P
N
 
L
T
 
N
D
 
P
Y
 
D
P
 
G
N
 
T
Y
 
L
E
 
Q
V
 
L
T
 
-
P
 
-
E
 
-
S
 
-
Y
 
-
K
 
-
E
 
E
V
 
T
L
 
L
D
 
P
D
 
T
L
 
L
Y
 
F
D
 
D
Q
 
-
G
 
-
E
 
E
E
 
K
V
 
T
S
 
R
L
 
L
V
 
L
L
 
A
L
 
I
T
 
T
H
 
H
V
 
V
D
 
S
G
 
N
N
 
V
Y
 
L
G
 
G
N
 
T
L
 
E
A
 
N
D
 
P
A
 
L
R
 
A
S
 
E
I
 
M
G
 
I
K
 
T
I
 
L
A
 
A
H
 
H
D
 
Q
A
 
H
G
 
G
V
 
A
P
 
K
L
 
V
L
 
L
L
 
V
N
 
D
C
 
G
A
 
A
Y
 
Q
S
 
A
M
 
V
G
 
M
R
 
H
L
 
H
P
 
P
I
 
V
D
 
D
A
 
V
K
 
Q
A
 
A
L
 
L
N
 
D
A
 
C
D
 
D
F
 
F
V
 
Y
V
 
V
G
 
F
S
 
S
G
 
G
H
 
H
K
 
K
S
 
L
M
 
Y
A
 
G
A
 
P
S
 
T
G
 
G
P
 
-
I
 
I
G
 
G
V
 
I
L
 
L
G
 
Y
L
 
V
K
 
K
E
 
E

Sites not aligning to the query:

6o11A E. Coli cysteine desulfurase sufs c364a with a cys-aldimine intermediate (see paper)
30% identity, 42% coverage: 72:231/379 of query aligns to 79:240/406 of 6o11A

query
sites
6o11A
F
 
F
I
 
I
N
 
N
T
 
A
D
 
R
F
 
S
A
 
A
R
 
E
T
 
E
-
 
L
-
 
V
-
 
F
V
 
V
H
 
R
G
 
G
A
x
T
R
x
T
E
 
E
G
 
G
K
 
I
F
 
N
A
 
L
V
 
V
M
 
A
H
 
N
A
 
S
L
 
W
-
 
G
-
 
N
-
 
S
-
 
N
C
 
V
E
 
R
P
 
A
G
 
G
D
 
D
T
 
N
I
 
I
V
 
I
I
 
I
D
 
S
G
 
Q
N
 
M
A
 
E
H
|
H
Y
 
H
T
 
A
T
 
N
H
 
I
V
 
V
A
 
P
A
 
W
E
 
Q
-
 
M
-
 
L
-
 
C
-
 
A
R
 
R
V
 
V
G
 
G
L
 
A
N
 
E
M
 
L
V
 
R
D
 
V
V
 
I
P
 
P
N
 
L
T
 
N
D
 
P
Y
 
D
P
 
G
N
 
T
Y
 
L
E
 
Q
V
 
L
T
 
-
P
 
-
E
 
-
S
 
-
Y
 
-
K
 
-
E
 
E
V
 
T
L
 
L
D
 
P
D
 
T
L
 
L
Y
 
F
D
 
D
Q
 
-
G
 
-
E
 
E
E
 
K
V
 
T
S
 
R
L
 
L
V
 
L
L
 
A
L
 
I
T
 
T
H
 
H
V
 
V
D
 
S
G
x
N
N
 
V
Y
 
L
G
 
G
N
 
T
L
 
E
A
 
N
D
 
P
A
 
L
R
 
A
S
 
E
I
 
M
G
 
I
K
 
T
I
 
L
A
 
A
H
 
H
D
 
Q
A
 
H
G
 
G
V
 
A
P
 
K
L
 
V
L
 
L
L
 
V
N
x
D
C
 
G
A
|
A
Y
x
Q
S
 
A
M
 
V
G
 
M
R
 
H
L
 
H
P
 
P
I
 
V
D
 
D
A
 
V
K
 
Q
A
 
A
L
 
L
N
 
D
A
 
C
D
 
D
F
 
F
V
 
Y
V
 
V
G
 
F
S
|
S
G
 
G
H
|
H
K
|
K
S
 
L
M
 
Y
A
 
G
A
 
P
S
 
T
G
 
G
P
 
-
I
 
I
G
 
G
V
 
I
L
 
L
G
 
Y
L
 
V
K
 
K
E
 
E

Sites not aligning to the query:

6o13A E. Coli cysteine desulfurase sufs h123a with a cys-ketimine intermediate (see paper)
36% identity, 23% coverage: 143:231/379 of query aligns to 154:239/405 of 6o13A

query
sites
6o13A
E
 
E
V
 
T
L
 
L
D
 
P
D
 
T
L
 
L
Y
 
F
D
 
D
Q
 
-
G
 
-
E
 
E
E
 
K
V
 
T
S
 
R
L
 
L
V
 
L
L
 
A
L
 
I
T
 
T
H
 
H
V
 
V
D
 
S
G
x
N
N
 
V
Y
 
L
G
 
G
N
 
T
L
 
E
A
 
N
D
 
P
A
 
L
R
 
A
S
 
E
I
 
M
G
 
I
K
 
T
I
 
L
A
 
A
H
 
H
D
 
Q
A
 
H
G
 
G
V
 
A
P
 
K
L
 
V
L
 
L
L
 
V
N
x
D
C
 
G
A
|
A
Y
x
Q
S
 
A
M
 
V
G
 
M
R
 
H
L
 
H
P
 
P
I
 
V
D
 
D
A
 
V
K
 
Q
A
 
A
L
 
L
N
 
D
A
 
C
D
 
D
F
 
F
V
 
Y
V
 
V
G
 
F
S
|
S
G
 
G
H
|
H
K
|
K
S
 
L
M
 
Y
A
 
G
A
 
P
S
 
T
G
 
G
P
 
-
I
 
I
G
 
G
V
 
I
L
 
L
G
 
Y
L
 
V
K
 
K
E
 
E

Sites not aligning to the query:

5ft8A Crystal structure of the complex between the cysteine desulfurase csda and the sulfur-acceptor csde in the persulfurated state at 2.50 angstroem resolution
24% identity, 63% coverage: 97:334/379 of query aligns to 107:347/401 of 5ft8A

query
sites
5ft8A
E
 
Q
P
 
P
G
 
G
D
 
D
T
 
E
I
 
I
V
 
I
I
 
V
D
 
S
G
 
V
N
 
A
A
 
E
H
|
H
Y
 
H
T
 
A
T
 
N
H
 
L
V
 
V
-
 
P
-
 
W
-
 
L
-
 
M
A
 
V
A
 
A
E
 
Q
R
 
Q
V
 
T
G
 
G
L
 
A
N
 
K
M
 
V
V
 
V
D
 
K
V
 
L
P
 
P
-
 
L
-
 
N
N
 
A
T
 
Q
D
 
R
Y
 
L
P
 
P
N
 
D
Y
 
V
E
 
D
V
 
L
T
 
L
P
 
P
E
 
E
S
 
L
Y
 
-
K
 
-
E
 
-
V
 
-
L
 
-
D
 
-
D
 
-
L
 
I
Y
 
T
D
 
P
Q
 
R
G
 
S
E
 
R
E
 
I
V
 
L
S
 
A
L
 
L
V
 
G
L
 
Q
L
 
M
T
 
S
H
 
N
V
 
V
D
 
T
G
 
G
N
 
G
Y
 
C
G
 
P
N
 
D
L
 
L
A
 
A
D
 
R
A
 
A
R
 
I
S
 
T
I
 
F
G
 
-
K
 
-
I
 
-
A
 
A
H
 
H
D
 
S
A
 
A
G
 
G
V
 
M
P
 
V
L
 
V
L
 
M
L
 
V
N
x
D
C
 
G
A
|
A
Y
x
Q
S
 
G
M
 
A
G
 
V
R
 
H
L
 
F
P
 
P
I
 
A
D
 
D
A
 
V
K
 
Q
A
 
Q
L
 
L
N
 
D
A
 
I
D
 
D
F
 
F
V
 
Y
V
 
A
G
 
F
S
|
S
G
 
G
H
|
H
K
|
K
S
 
L
M
 
Y
A
 
G
A
 
P
S
 
T
G
 
G
P
 
-
I
 
I
G
 
G
V
 
V
L
 
L
G
 
Y
L
 
G
K
 
K
E
 
S
E
 
E
W
 
L
A
 
L
D
 
E
I
 
A
I
 
M
L
 
S
K
 
P
R
 
W
S
 
L
D
 
G
R
 
G
A
 
G
Q
 
K
-
 
M
V
 
V
K
 
H
E
 
E
L
 
V
E
 
S
M
 
F
L
 
D
G
 
G
C
 
F
T
 
T
S
 
T
R
 
Q
G
 
S
A
 
A
P
 
P
V
 
W
A
 
-
T
 
K
L
 
L
M
 
E
A
 
A
S
 
G
F
 
T
P
 
P
H
 
N
V
 
V
-
 
A
-
 
G
-
 
V
-
 
I
-
 
G
I
 
L
D
 
S
R
 
A
V
 
A
K
 
L
K
 
E
W
 
W
-
 
L
-
 
A
D
 
D
V
 
Y
E
 
D
V
 
I
K
 
N
E
 
Q
T
 
A
R
 
E
K
 
S
F
 
W
V
 
S
E
 
R
T
 
S
L
 
L
E
 
A
N
 
T
I
 
L
E
 
A
G
 
E
I
 
-
N
 
D
Q
 
A
L
 
L
G
 
A
K
 
K
K
 
R
P
 
P
K
 
G
E
 
F
H
 
R
D
 
S
L
 
F
V
 
R
R
 
C
F
 
Q
E
 
D
T
 
S
P
 
S
I
 
L
-
 
L
-
 
A
F
 
F
D
 
D
E
 
F
I
 
A
A
 
G
K
 
V
H
 
H
H
 
H
T
 
S
R
 
D
R
 
M
G
 
V
F
 
T
F
 
L
L
 
L
Y
 
A
E
 
E

Sites not aligning to the query:

Q46925 Cysteine desulfurase CsdA; Cysteine sulfinate desulfinase; CSD; Selenocysteine lyase; EC 2.8.1.7; EC 3.13.1.-; EC 4.4.1.16 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
24% identity, 63% coverage: 97:334/379 of query aligns to 107:347/401 of Q46925

query
sites
Q46925
E
 
Q
P
 
P
G
 
G
D
 
D
T
 
E
I
 
I
V
 
I
I
 
V
D
 
S
G
 
V
N
 
A
A
 
E
H
 
H
Y
 
H
T
 
A
T
 
N
H
 
L
V
 
V
-
 
P
-
 
W
-
 
L
-
 
M
A
 
V
A
 
A
E
 
Q
R
 
Q
V
 
T
G
 
G
L
 
A
N
 
K
M
 
V
V
 
V
D
 
K
V
 
L
P
 
P
-
 
L
-
 
N
N
 
A
T
 
Q
D
 
R
Y
 
L
P
 
P
N
 
D
Y
 
V
E
 
D
V
 
L
T
 
L
P
 
P
E
 
E
S
 
L
Y
 
-
K
 
-
E
 
-
V
 
-
L
 
-
D
 
-
D
 
-
L
 
I
Y
 
T
D
 
P
Q
 
R
G
 
S
E
 
R
E
 
I
V
 
L
S
 
A
L
 
L
V
 
G
L
 
Q
L
 
M
T
 
S
H
 
N
V
 
V
D
 
T
G
 
G
N
 
G
Y
x
C
G
 
P
N
 
D
L
 
L
A
 
A
D
 
R
A
 
A
R
 
I
S
 
T
I
 
F
G
 
-
K
 
-
I
 
-
A
 
A
H
 
H
D
 
S
A
 
A
G
 
G
V
 
M
P
 
V
L
 
V
L
 
M
L
 
V
N
 
D
C
 
G
A
 
A
Y
 
Q
S
 
G
M
 
A
G
 
V
R
 
H
L
 
F
P
 
P
I
 
A
D
 
D
A
 
V
K
 
Q
A
 
Q
L
 
L
N
 
D
A
 
I
D
 
D
F
 
F
V
 
Y
V
 
A
G
 
F
S
 
S
G
 
G
H
 
H
K
 
K
S
 
L
M
 
Y
A
 
G
A
 
P
S
 
T
G
 
G
P
 
-
I
 
I
G
 
G
V
 
V
L
 
L
G
 
Y
L
 
G
K
 
K
E
 
S
E
 
E
W
 
L
A
 
L
D
 
E
I
 
A
I
 
M
L
 
S
K
 
P
R
 
W
S
 
L
D
 
G
R
 
G
A
 
G
Q
 
K
-
 
M
V
 
V
K
 
H
E
 
E
L
 
V
E
 
S
M
 
F
L
 
D
G
 
G
C
 
F
T
 
T
S
 
T
R
 
Q
G
 
S
A
 
A
P
 
P
V
 
W
A
 
-
T
 
K
L
 
L
M
 
E
A
 
A
S
 
G
F
 
T
P
 
P
H
 
N
V
 
V
-
 
A
-
 
G
-
 
V
-
 
I
-
 
G
I
 
L
D
 
S
R
 
A
V
 
A
K
 
L
K
 
E
W
 
W
-
 
L
-
 
A
D
 
D
V
 
Y
E
 
D
V
 
I
K
 
N
E
 
Q
T
 
A
R
 
E
K
 
S
F
 
W
V
 
S
E
 
R
T
 
S
L
 
L
E
 
A
N
 
T
I
 
L
E
 
A
G
 
E
I
 
-
N
 
D
Q
 
A
L
 
L
G
 
A
K
 
K
K
 
R
P
 
P
K
 
G
E
 
F
H
 
R
D
 
S
L
 
F
V
 
R
R
x
C
F
 
Q
E
 
D
T
 
S
P
 
S
I
 
L
-
 
L
-
 
A
F
 
F
D
 
D
E
 
F
I
 
A
A
 
G
K
 
V
H
 
H
H
 
H
T
 
S
R
 
D
R
 
M
G
 
V
F
 
T
F
 
L
L
 
L
Y
 
A
E
 
E

Sites not aligning to the query:

Q93WX6 Cysteine desulfurase 1, chloroplastic; NIFS-like protein 1; CpNifS1; Plastid sufS-like protein; Protein AtCpNifS; Selenocysteine lyase; EC 2.8.1.7; EC 4.4.1.16 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see 2 papers)
23% identity, 73% coverage: 31:307/379 of query aligns to 89:380/463 of Q93WX6

query
sites
Q93WX6
L
 
L
E
 
D
A
 
A
R
 
L
K
 
Q
A
 
N
L
 
Y
Y
 
Y
E
 
E
F
 
F
-
 
Y
-
 
N
S
 
S
D
 
N
G
 
V
Y
 
H
S
 
R
V
 
G
C
 
I
D
 
H
Y
 
Y
C
 
L
S
 
S
G
 
A
R
 
K
-
 
A
L
 
T
D
 
D
E
 
E
I
 
F
T
 
E
K
 
L
P
 
A
Q
 
R
I
 
-
N
 
-
G
 
-
F
 
-
L
 
-
E
 
K
D
 
K
L
 
V
A
 
A
G
 
R
F
 
F
I
 
I
N
 
N
T
 
A
D
 
S
F
 
D
A
 
S
R
 
R
T
 
E
V
 
I
H
 
V
G
 
F
A
 
T
R
 
R
E
 
N
G
 
A
K
 
T
F
 
E
A
 
A
V
 
I
M
 
N
H
 
L
A
 
V
L
 
A
-
 
Y
-
 
S
-
 
W
-
 
G
-
 
L
-
 
S
-
 
N
C
 
L
E
 
K
P
 
P
G
 
G
D
 
D
T
 
E
I
 
V
V
 
I
I
 
L
D
 
T
G
 
V
N
 
A
A
 
E
H
 
H
Y
 
H
T
 
S
T
 
C
-
 
I
-
 
V
-
 
P
-
 
W
H
 
Q
V
 
I
A
 
V
A
 
S
E
 
Q
R
 
K
V
 
T
G
 
G
-
 
A
-
 
V
-
 
L
-
 
K
-
 
F
-
 
V
-
 
T
L
 
L
N
 
N
M
 
E
V
 
D
D
 
E
V
 
V
P
 
P
N
 
D
T
 
I
D
 
N
Y
 
K
P
 
L
N
 
R
Y
 
E
E
 
L
V
 
I
T
 
S
P
 
P
E
 
K
S
 
T
Y
 
-
K
 
-
E
 
-
V
 
-
L
 
-
D
 
-
D
 
-
L
 
-
Y
 
-
D
 
-
Q
 
-
G
 
-
E
 
-
E
 
-
V
 
-
S
 
K
L
 
L
V
 
V
L
 
A
L
 
V
T
 
H
H
 
H
V
 
V
D
 
S
G
 
N
N
 
V
Y
 
L
G
 
A
N
 
S
L
 
S
A
 
L
D
 
P
A
 
I
R
 
E
S
 
E
I
 
I
G
 
V
K
 
V
I
 
W
A
 
A
H
 
H
D
 
D
A
 
V
G
 
G
V
 
A
P
 
K
L
 
V
L
 
L
L
 
V
N
 
D
C
 
A
A
 
C
Y
 
Q
S
 
S
M
 
V
G
 
P
R
 
H
L
 
M
P
 
V
I
 
V
D
 
D
A
 
V
K
 
Q
A
 
K
L
 
L
N
 
N
A
 
A
D
 
D
F
 
F
V
 
L
V
 
V
G
 
A
S
 
S
G
 
S
H
 
H
K
 
K
S
 
-
M
 
-
A
 
-
A
 
M
S
 
C
G
 
G
P
 
P
I
 
T
G
 
G
V
 
I
-
 
G
-
 
F
-
 
L
-
 
Y
-
 
G
-
 
K
-
 
S
-
 
D
-
 
L
-
 
L
-
 
H
-
 
S
-
 
M
-
 
P
-
 
P
-
 
F
L
 
L
G
 
G
L
 
G
K
 
G
E
 
E
E
 
M
W
 
I
A
 
S
D
 
D
I
 
V
I
 
F
L
 
L
K
 
D
R
 
H
S
 
S
D
 
T
R
 
Y
A
 
A
Q
 
E
V
 
P
K
 
P
E
 
S
L
 
R
E
 
F
M
 
E
L
 
A
G
 
G
C
 
T
T
 
P
S
 
A
R
 
I
G
 
G
A
 
E
P
 
A
V
 
I
A
 
A
T
 
-
L
 
L
M
 
G
A
 
A
S
 
A
F
 
V
P
 
D
H
 
Y
V
 
L
-
 
S
-
 
G
I
 
I
D
 
G
R
 
M
V
 
P
K
 
K
K
 
I
W
 
H
D
 
E
V
 
Y
E
 
E
V
 
V
K
 
E
E
 
I
T
 
G
R
 
K
K
 
Y
F
 
L
V
 
Y
E
 
E
T
 
K
L
 
L
E
 
S
N
 
S
I
 
L
E
 
P
G
 
D
I
 
V
N
 
R
Q
 
I
L
 
Y
G
 
G
K
 
P
K
 
R
P
 
P
K
 
S
E
 
E

Sites not aligning to the query:

P83788 Kynureninase; L-kynurenine hydrolase; EC 3.7.1.3 from Pseudomonas fluorescens (see paper)
26% identity, 22% coverage: 137:218/379 of query aligns to 154:229/416 of P83788

query
sites
P83788
T
 
S
P
 
P
E
 
E
S
 
E
Y
 
L
K
 
P
E
 
Q
V
 
A
L
 
I
D
 
D
D
 
-
L
 
-
Y
 
-
D
 
-
Q
 
-
G
 
-
E
 
Q
E
 
D
V
 
T
S
 
A
L
 
V
V
 
V
L
 
M
L
 
L
T
|
T
H
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
Y
N
 
K
Y
 
T
G
 
G
N
 
Y
L
 
M
A
 
H
D
 
D
A
 
M
R
 
Q
S
 
A
I
 
L
G
 
T
K
 
A
I
 
L
A
 
S
H
 
H
D
 
E
A
 
C
G
 
G
V
 
A
P
 
L
L
 
A
L
 
I
L
 
W
N
x
D
C
 
L
A
 
A
Y
x
H
S
 
S
M
 
A
G
 
G
R
 
A
L
 
V
P
 
P
I
 
V
D
 
D
A
 
L
K
 
H
A
 
Q
L
 
A
N
 
G
A
 
A
D
 
D
F
 
Y
V
 
A
V
 
I
G
 
G
S
 
C
G
 
T
H
 
Y
K
 
K
S
 
Y
M
 
L

Sites not aligning to the query:

1qz9A The three dimensional structure of kynureninase from pseudomonas fluorescens (see paper)
26% identity, 22% coverage: 137:218/379 of query aligns to 153:228/404 of 1qz9A

query
sites
1qz9A
T
 
S
P
 
P
E
 
E
S
 
E
Y
 
L
K
 
P
E
 
Q
V
 
A
L
 
I
D
 
D
D
 
-
L
 
-
Y
 
-
D
 
-
Q
 
-
G
 
-
E
 
Q
E
 
D
V
 
T
S
 
A
L
 
V
V
 
V
L
 
M
L
 
L
T
|
T
H
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
Y
N
 
K
Y
 
T
G
 
G
N
 
Y
L
 
M
A
 
H
D
 
D
A
 
M
R
 
Q
S
 
A
I
 
L
G
 
T
K
 
A
I
 
L
A
 
S
H
 
H
D
 
E
A
 
C
G
 
G
V
 
A
P
 
L
L
 
A
L
 
I
L
 
W
N
x
D
C
 
L
A
|
A
Y
x
H
S
 
S
M
 
A
G
 
G
R
 
A
L
 
V
P
 
P
I
 
V
D
 
D
A
 
L
K
 
H
A
 
Q
L
 
A
N
 
G
A
 
A
D
 
D
F
 
Y
V
 
A
V
 
I
G
 
G
S
x
C
G
 
T
H
x
Y
K
|
K
S
 
Y
M
 
L

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_013645946.1 NCBI__GCF_000191585.1:WP_013645946.1
MDECQDYGLTRDTERKNLNLNPLQRGGVLPLEARKALYEFSDGYSVCDYCSGRLDEITKP
QINGFLEDLAGFINTDFARTVHGAREGKFAVMHALCEPGDTIVIDGNAHYTTHVAAERVG
LNMVDVPNTDYPNYEVTPESYKEVLDDLYDQGEEVSLVLLTHVDGNYGNLADARSIGKIA
HDAGVPLLLNCAYSMGRLPIDAKALNADFVVGSGHKSMAASGPIGVLGLKEEWADIILKR
SDRAQVKELEMLGCTSRGAPVATLMASFPHVIDRVKKWDVEVKETRKFVETLENIEGINQ
LGKKPKEHDLVRFETPIFDEIAKHHTRRGFFLYEELKKRKIVGIKRGQTKWFKCSVYGFS
AEQKEYIAETFVDIASKDY

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory