SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_013683759.1 NCBI__GCF_000194625.1:WP_013683759.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

Q8TPT4 L-aspartate semialdehyde sulfurtransferase; EC 2.8.1.16 from Methanosarcina acetivorans (strain ATCC 35395 / DSM 2834 / JCM 12185 / C2A) (see 2 papers)
57% identity, 100% coverage: 2:490/490 of query aligns to 4:498/500 of Q8TPT4

query
sites
Q8TPT4
K
 
K
T
 
S
V
 
V
E
 
H
E
 
E
I
 
I
N
 
N
E
 
K
R
 
K
I
 
I
R
 
E
E
 
D
G
 
G
N
 
S
V
 
V
C
 
N
V
 
V
V
 
V
T
 
T
A
 
A
S
 
E
E
 
E
M
 
M
K
 
V
E
 
G
L
 
I
V
 
V
A
 
E
E
 
N
L
 
L
G
 
G
A
 
V
E
 
E
K
 
G
A
 
A
A
 
A
K
 
R
E
 
E
V
 
V
D
 
D
V
 
V
V
 
V
T
 
T
T
 
T
G
 
G
T
 
T
F
 
F
G
 
G
A
 
A
M
 
M
C
|
C
S
 
S
S
 
S
G
 
G
V
 
L
F
 
M
M
 
L
N
 
N
F
 
L
G
 
G
H
 
H
S
 
S
D
 
E
P
 
P
P
 
P
I
 
I
K
 
K
M
 
I
Q
 
Q
K
 
K
I
 
L
W
 
W
L
 
F
N
 
N
D
 
N
V
 
V
E
 
E
A
 
A
Y
 
Y
T
 
S
G
 
G
I
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
V
D
 
D
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
V
 
A
T
 
A
Q
 
Q
V
 
I
S
 
S
E
 
D
K
 
T
H
 
R
E
 
G
-
 
I
E
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
A
 
A
H
 
H
V
 
V
I
 
I
E
 
E
E
 
D
L
 
L
V
 
L
R
 
R
G
 
G
R
 
K
E
 
E
V
 
L
V
 
D
L
 
V
R
 
H
A
 
A
I
 
T
S
 
S
K
 
Y
G
 
G
T
 
T
D
 
D
C
|
C
Y
 
Y
P
 
P
R
 
R
K
 
K
E
 
V
I
 
L
I
 
D
T
 
T
E
 
R
I
 
I
A
 
T
L
 
L
E
 
D
D
 
D
L
 
L
N
 
N
Q
 
E
A
 
A
E
 
V
M
 
L
L
 
L
N
 
N
P
 
P
R
 
R
N
 
N
A
 
A
Y
 
Y
Q
 
Q
R
 
K
Y
 
Y
K
 
A
A
 
A
A
 
A
T
 
T
N
 
N
S
 
S
S
 
S
Q
 
K
Q
 
R
L
 
I
L
 
L
R
 
N
T
 
T
Y
 
Y
M
 
M
G
 
G
T
 
E
L
 
L
L
 
L
P
 
P
N
 
N
F
 
F
G
 
G
N
 
N
V
 
V
T
 
T
F
 
Y
A
 
S
G
 
G
C
 
A
G
 
G
E
 
V
I
 
L
S
 
S
P
 
P
L
 
L
N
 
S
N
 
N
D
 
D
P
 
P
E
 
D
Y
 
Y
R
 
E
T
 
T
I
 
I
G
 
G
V
 
M
G
 
G
T
 
T
R
 
R
I
 
I
F
 
F
L
 
M
C
 
G
G
 
G
A
 
A
K
 
Q
G
 
G
Y
 
Y
V
 
I
I
 
I
G
 
G
E
 
N
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
H
 
H
C
 
S
P
 
P
-
 
S
-
 
S
P
 
S
F
 
F
G
 
G
T
 
T
L
 
L
M
 
M
V
 
L
K
 
K
G
 
G
N
 
N
L
 
L
K
 
K
E
 
E
M
 
M
K
 
S
P
 
S
E
 
D
F
 
Y
M
 
L
R
 
R
A
 
A
A
 
A
V
 
S
F
 
F
P
 
A
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
V
 
T
T
 
T
M
 
L
Y
 
Y
V
 
M
G
 
G
I
 
I
G
 
G
I
 
I
P
 
P
I
 
I
P
 
P
I
 
I
L
 
L
D
 
N
A
 
E
D
 
K
M
 
I
A
 
A
R
 
A
A
 
S
T
 
T
A
 
A
I
 
V
R
 
R
D
 
D
E
 
E
E
 
D
I
 
I
W
 
F
T
 
T
E
 
D
I
 
I
I
 
L
D
 
D
F
 
Y
G
 
A
V
 
V
P
 
G
R
 
S
R
 
R
Q
 
D
R
 
K
P
 
P
V
 
V
V
 
I
K
 
K
K
 
Q
V
 
V
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
E
 
E
L
 
L
K
 
R
S
 
S
G
 
G
K
 
S
V
 
I
E
 
E
I
 
L
N
 
E
G
 
G
E
 
K
E
 
N
V
 
T
R
 
P
V
 
T
S
 
S
P
 
S
L
 
L
S
 
S
S
 
S
F
 
F
Y
 
K
M
 
N
A
 
A
E
 
R
K
 
K
I
 
I
M
 
A
E
 
N
E
 
E
L
 
L
K
 
K
R
 
E
Q
 
W
I
 
V
E
 
K
R
 
H
A
 
G
E
 
K
F
 
F
F
 
F
L
 
V
S
 
S
P
 
M
P
 
P
A
 
V
E
 
E
R
 
K
I
 
L
S
 
S
R
 
R
E
 
E
C
 
G
N
 
S
F
 
A
K
 
K
P
 
S
M
 
M
R
 
K
Q
 
Q
R
 
T
E
 
Q
-
 
A
V
 
V
K
 
P
F
 
L
V
 
V
R
 
K
S
 
D
V
 
V
M
 
M
T
 
A
P
 
D
A
 
F
I
 
I
-
 
V
T
 
T
I
 
I
E
 
K
P
 
K
E
 
N
T
 
Q
S
 
T
V
 
V
D
 
Q
E
 
D
A
 
A
S
 
A
R
 
K
I
 
K
M
 
I
I
 
W
Q
 
E
K
 
N
G
 
S
V
 
F
N
 
N
H
 
H
L
 
L
P
 
A
V
 
V
V
 
V
K
 
S
D
 
D
-
 
T
G
 
G
R
 
E
L
 
L
V
 
V
G
 
G
I
 
I
V
 
L
T
 
T
S
 
A
W
 
W
D
 
D
I
 
I
A
 
S
K
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
A
T
 
E
K
 
N
K
 
I
T
 
F
G
 
D
N
 
S
V
 
V
A
 
E
E
 
S
I
 
V
M
 
M
T
 
T
R
 
K
K
 
K
V
 
V
I
 
L
T
 
T
A
 
C
L
 
A
P
 
P
D
 
N
E
 
E
P
 
P
V
 
V
E
 
D
I
 
L
A
 
A
A
 
A
R
 
R
K
 
R
M
 
L
E
 
D
K
 
R
H
 
Y
N
 
G
I
 
V
S
 
S
A
 
A
L
 
M
P
 
P
V
 
V
V
 
I
D
 
D
A
 
T
K
 
Q
Q
 
R
R
 
K
V
 
V
I
 
L
G
 
G
M
 
I
V
 
I
T
 
T
S
 
S
E
 
D
D
 
N
L
 
I
S
 
S
K
 
K
L
 
L
L
 
L
V
 
A
R
 
R

Q57564 L-aspartate semialdehyde sulfurtransferase; EC 2.8.1.16 from Methanocaldococcus jannaschii (strain ATCC 43067 / DSM 2661 / JAL-1 / JCM 10045 / NBRC 100440) (Methanococcus jannaschii) (see paper)
56% identity, 100% coverage: 1:488/490 of query aligns to 3:505/509 of Q57564

query
sites
Q57564
M
 
M
K
 
K
T
 
T
V
 
I
E
 
K
E
 
E
I
 
I
N
 
N
E
 
E
R
 
K
I
 
I
R
 
K
E
 
K
G
 
G
N
 
E
V
 
A
C
 
V
V
 
V
V
 
V
T
 
T
A
 
A
S
 
E
E
 
E
M
 
M
K
 
I
E
 
K
L
 
I
V
 
V
A
 
E
E
 
E
L
 
E
G
 
G
A
 
A
E
 
K
K
 
R
A
 
A
A
 
A
K
 
D
E
 
Y
V
 
V
D
 
D
V
 
V
V
 
V
T
 
T
T
 
T
G
 
G
T
 
T
F
 
F
G
 
G
A
 
A
M
 
M
C
 
C
S
 
S
S
 
S
G
 
G
V
 
V
F
 
F
M
 
I
N
 
N
F
 
F
G
 
G
H
 
H
S
 
S
D
 
D
P
 
P
P
 
P
I
 
I
K
 
K
M
 
M
Q
 
L
K
 
R
I
 
I
W
 
Y
L
 
L
N
 
N
D
 
N
V
 
V
E
 
E
A
 
A
Y
 
Y
T
 
G
G
 
G
I
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
V
D
 
D
A
 
A
Y
 
Y
L
 
I
G
 
G
V
 
A
T
 
A
Q
 
Q
V
 
P
S
 
N
E
 
E
K
 
D
H
 
P
E
 
D
-
 
V
-
 
D
-
 
I
E
 
D
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
A
 
A
H
 
H
V
 
V
I
 
I
E
 
E
E
 
D
L
 
L
V
 
V
R
 
R
G
 
G
R
 
K
E
 
E
V
 
V
V
 
E
L
 
L
R
 
Y
A
 
A
I
 
E
S
 
G
K
 
Y
G
 
T
T
 
T
D
 
D
C
 
C
Y
 
Y
P
 
P
R
 
R
K
 
K
E
 
E
I
 
V
I
 
N
T
 
V
E
 
R
I
 
I
A
 
T
L
 
L
E
 
D
D
 
D
L
 
V
N
 
N
Q
 
Q
A
 
A
E
 
I
M
 
M
L
 
V
N
 
N
P
 
P
R
 
R
N
 
N
A
 
C
Y
 
Y
Q
 
Q
R
 
T
Y
 
Y
K
 
A
A
 
A
A
 
A
T
 
T
N
 
N
S
 
S
S
 
R
Q
 
E
Q
 
E
L
 
K
L
 
I
R
 
Y
T
 
T
Y
 
Y
M
 
M
G
 
G
T
 
I
L
 
L
L
 
L
P
 
P
N
 
E
F
 
Y
G
 
N
N
 
N
V
 
V
T
 
H
F
 
Y
A
 
S
G
 
G
C
 
A
G
 
G
E
 
Q
I
 
L
S
 
N
P
 
P
L
 
L
N
 
Q
N
 
N
D
 
D
-
 
Y
-
 
N
P
 
P
E
 
E
-
 
T
-
 
K
-
 
S
Y
 
F
R
 
N
T
 
T
I
 
I
G
 
G
V
 
I
G
 
G
T
 
T
R
 
R
I
 
I
F
 
F
L
 
L
C
 
G
G
 
G
A
 
G
K
 
I
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
I
 
I
G
 
G
E
 
E
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
H
 
H
C
 
N
P
 
P
P
 
P
F
 
F
G
 
G
T
 
T
L
 
L
M
 
M
V
 
V
K
 
K
G
 
G
N
 
D
L
 
L
K
 
K
E
 
Q
M
 
M
K
 
N
P
 
P
E
 
K
F
 
F
M
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
A
V
 
T
F
 
M
P
 
P
G
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
S
T
 
T
M
 
L
Y
 
Y
V
 
V
G
 
G
I
 
I
G
 
G
I
 
I
P
 
P
I
 
I
P
 
P
I
 
V
L
 
L
D
 
N
A
 
E
D
 
K
M
 
I
A
 
A
R
 
E
A
 
R
T
 
C
A
 
A
I
 
I
R
 
R
D
 
D
E
 
E
E
 
D
I
 
I
W
 
E
T
 
V
E
 
P
I
 
I
I
 
Y
D
 
D
F
 
Y
G
 
G
V
 
F
P
 
P
R
 
R
R
 
R
Q
 
D
R
 
R
P
 
P
V
 
L
V
 
I
K
 
A
K
 
K
V
 
T
N
 
N
Y
 
Y
A
 
K
E
 
V
L
 
L
K
 
R
S
 
S
G
 
G
K
 
K
V
 
I
E
 
T
I
 
L
N
 
N
-
 
V
-
 
N
-
 
I
-
 
D
G
 
G
E
 
K
E
 
D
-
 
V
-
 
E
-
 
K
-
 
T
V
 
V
R
 
K
V
 
T
S
 
G
P
 
S
L
 
V
S
 
S
S
 
S
F
 
Y
Y
 
K
M
 
M
A
 
A
E
 
R
K
 
E
I
 
V
M
 
A
E
 
E
E
 
T
L
 
L
K
 
K
R
 
Q
Q
 
W
I
 
I
E
 
L
R
 
D
A
 
G
E
 
K
F
 
F
F
 
L
L
 
L
S
 
T
P
 
E
P
 
R
A
 
V
E
 
D
R
 
T
I
 
L
S
 
G
R
 
R
E
 
A
C
 
E
N
 
N
F
 
-
K
 
K
P
 
P
M
 
M
R
 
K
Q
 
S
R
 
-
E
 
P
V
 
I
K
 
T
F
 
L
V
 
V
R
 
K
S
 
D
V
 
I
M
 
L
T
x
S
-
 
K
P
 
P
A
 
P
I
|
I
T
 
T
I
 
A
E
 
H
P
 
S
E
 
N
T
 
I
S
 
S
V
 
I
D
 
M
E
 
E
A
 
A
S
 
A
R
 
K
I
 
I
M
 
L
I
 
I
Q
 
K
K
 
H
G
 
N
V
 
I
N
 
N
H
|
H
L
 
L
P
 
P
V
 
I
V
 
V
K
 
D
D
 
E
-
 
H
G
 
G
R
 
K
L
 
L
V
 
V
G
 
G
I
 
I
V
 
I
T
 
T
S
 
S
W
 
W
D
|
D
I
 
I
A
 
A
K
 
K
A
 
A
V
 
L
A
 
A
T
 
Q
K
 
N
K
 
K
T
 
K
G
 
-
N
 
T
V
 
I
A
 
E
E
 
E
I
 
I
M
 
M
T
|
T
R
 
R
K
 
N
V
 
V
I
|
I
T
 
T
A
 
A
L
 
H
P
 
E
D
 
D
E
 
E
P
 
P
V
 
V
E
 
D
I
 
H
A
 
V
A
 
A
R
 
I
K
 
K
M
 
M
E
 
S
K
 
K
H
 
Y
N
|
N
I
|
I
S
|
S
A
x
G
L
 
V
P
 
P
V
 
V
V
 
V
D
 
D
A
 
D
K
 
Y
Q
 
R
R
 
R
V
 
V
I
 
V
G
 
G
M
 
I
V
 
V
T
|
T
S
|
S
E
|
E
D
|
D
L
 
I
S
 
S
K
 
R
L
 
L
L
 
F

3kpcA Crystal structure of the cbs domain pair of protein mj0100 in complex with 5 -methylthioadenosine and s-adenosyl-l-methionine (see paper)
53% identity, 24% coverage: 371:488/490 of query aligns to 2:120/124 of 3kpcA

query
sites
3kpcA
V
 
I
K
 
T
F
 
L
V
 
V
R
 
K
S
 
D
V
 
I
M
 
L
T
x
S
-
 
K
P
 
P
A
 
P
I
|
I
T
 
T
I
 
A
E
 
H
P
 
S
E
 
N
T
 
I
S
 
S
V
 
I
D
 
M
E
 
E
A
 
A
S
 
A
R
 
K
I
 
I
M
 
L
I
 
I
Q
 
K
K
 
H
G
 
N
V
x
I
N
|
N
H
|
H
L
 
L
P
 
P
V
 
I
V
 
V
K
 
D
D
 
E
-
 
H
G
 
G
R
 
K
L
 
L
V
 
V
G
 
G
I
|
I
V
 
I
T
 
T
S
 
S
W
|
W
D
|
D
I
 
I
A
 
A
K
 
K
A
 
A
V
 
L
A
 
A
T
 
Q
K
 
N
K
 
K
T
 
K
G
 
-
N
 
T
V
 
I
A
 
E
E
 
E
I
 
I
M
 
M
T
|
T
R
 
R
K
 
N
V
|
V
I
|
I
T
 
T
A
 
A
L
 
H
P
 
E
D
 
D
E
 
E
P
 
P
V
 
V
E
 
D
I
 
H
A
 
V
A
 
A
R
 
I
K
 
K
M
 
M
E
 
S
K
 
K
H
 
Y
N
|
N
I
|
I
S
|
S
A
x
G
L
 
V
P
 
P
V
 
V
V
 
V
D
 
D
A
 
D
K
 
Y
Q
 
R
R
 
R
V
 
V
I
 
V
G
 
G
M
x
I
V
 
V
T
|
T
S
 
S
E
|
E
D
|
D
L
 
I
S
 
S
K
 
R
L
 
L
L
 
F

3lfzA Crystal structure of protein mj1225 from methanocaldococcus jannaschii, a putative archaeal homolog of g-ampk. (see paper)
38% identity, 21% coverage: 386:486/490 of query aligns to 163:277/280 of 3lfzA

query
sites
3lfzA
P
 
P
E
 
G
T
 
E
S
 
R
V
 
L
D
 
K
E
 
D
A
 
V
S
 
A
R
 
R
I
 
T
M
 
M
I
 
V
Q
 
R
K
 
N
G
 
G
V
x
F
N
x
R
H
x
R
L
 
L
P
 
P
V
 
V
V
 
V
K
 
S
D
 
E
G
 
G
R
 
R
L
 
L
V
 
V
G
 
G
I
|
I
V
 
I
T
|
T
S
 
S
W
x
T
D
|
D
I
 
F
A
 
I
K
 
K
A
 
L
V
 
L
A
 
G
T
 
S
K
 
D
-
 
W
-
 
A
-
 
F
-
 
N
-
 
H
-
 
M
K
 
Q
T
 
T
G
 
G
N
 
N
V
 
V
-
 
R
-
 
E
-
 
I
-
 
T
-
 
N
-
 
V
-
 
R
-
 
M
A
 
E
E
 
E
I
 
I
M
 
M
T
 
K
R
 
R
K
 
D
V
|
V
I
|
I
T
 
T
A
 
A
L
 
K
P
 
E
D
 
G
E
 
D
P
 
K
V
 
L
E
 
K
I
 
K
A
 
I
A
 
A
R
 
E
K
 
I
M
 
M
E
 
V
K
 
T
H
 
N
N
 
D
I
 
I
S
x
G
A
 
A
L
 
L
P
 
P
V
 
V
V
 
V
D
 
D
A
 
E
K
 
N
Q
 
L
R
 
R
V
 
I
I
 
K
G
 
G
M
x
I
V
 
I
T
|
T
S
 
E
E
x
K
D
|
D
L
 
V
S
 
L
K
 
K

Sites not aligning to the query:

5g5xA Cbs domain tandem of site-2 protease from archaeoglobus fulgidus in complex with llama nanobody - nucleotide-bound form (see paper)
34% identity, 22% coverage: 379:487/490 of query aligns to 6:110/119 of 5g5xA

query
sites
5g5xA
T
 
T
P
 
E
A
x
V
I
x
V
T
 
T
I
 
V
E
 
T
P
 
P
E
 
E
T
 
M
S
 
T
V
 
V
D
 
S
E
 
E
A
 
V
S
 
I
R
 
D
I
 
L
M
 
I
I
 
L
Q
 
K
K
 
T
G
 
K
V
x
H
N
 
L
H
 
G
L
x
F
P
 
P
V
 
V
V
 
V
K
 
E
D
 
G
G
 
E
R
 
R
L
 
L
V
 
V
G
 
G
I
|
I
V
 
I
T
|
T
S
 
L
W
x
H
D
|
D
I
 
I
A
 
I
K
 
G
A
 
V
V
 
E
A
 
P
T
 
E
K
 
E
K
 
R
T
 
V
G
 
G
N
 
N
V
 
-
A
 
-
E
 
-
I
 
I
M
 
M
T
x
S
R
 
R
K
 
E
V
|
V
I
x
V
T
 
A
A
 
V
L
 
S
P
 
P
D
 
N
E
 
Q
P
 
S
V
 
A
E
 
F
I
 
E
A
 
A
A
 
F
R
 
K
K
 
I
M
 
M
E
 
S
K
 
E
H
 
M
N
 
G
I
|
I
S
x
G
A
x
R
L
 
L
P
 
P
V
 
V
V
 
V
D
 
E
A
 
-
K
 
H
Q
 
G
R
 
R
V
 
V
I
 
V
G
 
G
M
x
I
V
 
V
T
x
S
S
 
R
E
 
S
D
|
D
L
 
L
S
 
M
K
 
R
L
 
I

2yzqA Crystal structure of uncharacterized conserved protein from pyrococcus horikoshii
44% identity, 17% coverage: 405:489/490 of query aligns to 138:224/224 of 2yzqA

query
sites
2yzqA
L
 
L
P
 
P
V
 
V
V
 
V
-
 
D
K
 
S
D
 
E
G
 
G
R
 
N
L
 
L
V
 
V
G
 
G
I
|
I
V
 
V
T
x
D
S
 
E
W
x
T
D
|
D
I
 
L
A
 
L
K
 
R
-
 
D
A
 
S
V
 
E
A
 
I
T
 
V
K
 
R
K
 
P
T
 
N
G
 
K
N
 
P
V
 
V
A
 
A
E
 
E
I
 
I
M
 
M
T
|
T
R
 
R
K
 
D
V
|
V
I
|
I
T
 
V
A
 
A
L
 
T
P
 
P
D
 
H
E
 
M
P
 
T
V
 
V
E
 
H
I
 
E
A
 
V
A
 
A
R
 
L
K
 
K
M
 
M
E
 
A
K
 
K
H
 
Y
N
x
S
I
|
I
S
x
E
A
x
Q
L
 
L
P
 
P
V
 
V
V
 
I
D
 
R
A
 
G
K
 
E
Q
 
G
R
 
D
V
 
L
I
 
I
G
 
G
M
 
L
V
 
I
T
 
R
S
 
D
E
 
F
D
 
D
L
 
L
S
 
L
K
 
K
L
 
V
L
 
L
V
 
V

P9WKI7 Inosine-5'-monophosphate dehydrogenase; IMP dehydrogenase; IMPD; IMPDH; IMPDH2; EC 1.1.1.205 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see paper)
33% identity, 22% coverage: 377:486/490 of query aligns to 129:238/529 of P9WKI7

query
sites
P9WKI7
V
 
M
M
 
V
T
 
T
P
 
D
A
 
P
I
 
V
T
 
T
I
 
C
E
 
R
P
 
P
E
 
D
T
 
N
S
 
T
V
 
L
D
 
A
E
 
Q
A
 
V
S
 
D
R
 
A
I
 
L
M
 
C
I
 
A
Q
 
R
K
 
F
G
 
R
V
 
I
N
 
S
H
 
G
L
 
L
P
 
P
V
 
V
V
 
V
K
 
D
D
 
D
-
 
D
G
 
G
R
 
A
L
 
L
V
 
V
G
 
G
I
 
I
V
 
I
T
 
T
S
 
N
W
 
R
D
 
D
I
 
M
A
 
R
K
 
F
A
 
E
V
 
V
A
 
D
T
 
Q
K
 
S
K
 
K
T
 
-
G
 
-
N
 
Q
V
 
V
A
 
A
E
 
E
I
 
V
M
 
M
T
 
T
R
 
K
K
 
A
-
 
P
V
 
L
I
 
I
T
 
T
A
 
A
L
 
Q
P
 
E
D
 
G
E
 
V
P
 
S
V
 
A
E
 
S
I
 
A
A
 
A
A
 
L
R
 
G
K
 
L
M
 
L
E
 
R
K
 
R
H
 
N
N
 
K
I
 
I
S
 
E
A
 
K
L
 
L
P
 
P
V
 
V
V
 
V
D
 
D
A
 
G
K
 
R
Q
 
G
R
 
R
V
 
L
I
 
T
G
 
G
M
 
L
V
 
I
T
 
T
S
 
V
E
 
K
D
 
D
L
 
F
S
 
V
K
 
K

Sites not aligning to the query:

4gqyA Crystal structure of cbsx2 in complex with amp (see paper)
31% identity, 22% coverage: 374:480/490 of query aligns to 4:134/147 of 4gqyA

query
sites
4gqyA
V
 
V
R
 
G
S
 
D
V
 
F
M
 
M
T
 
T
P
 
P
A
 
R
I
 
Q
T
 
N
-
 
L
-
 
H
-
 
V
I
 
V
E
 
K
P
 
P
E
 
S
T
 
T
S
 
S
V
 
V
D
 
D
E
 
D
A
 
A
S
 
L
R
 
E
I
 
L
M
 
L
I
 
V
Q
 
E
K
 
K
G
 
K
V
 
V
N
 
T
H
 
G
L
 
L
P
 
P
V
 
V
V
 
I
K
 
D
D
 
D
G
 
N
-
 
W
R
 
T
L
 
L
V
 
V
G
 
G
I
x
V
V
 
V
T
x
S
S
 
D
W
 
Y
D
|
D
I
 
L
-
 
L
-
 
A
-
 
L
-
 
D
-
 
S
-
 
I
-
 
S
A
 
G
K
 
D
A
 
V
V
 
D
A
 
S
T
 
T
K
 
W
K
 
K
T
 
T
G
 
F
N
 
N
-
 
E
-
 
L
-
 
Q
-
 
K
-
 
L
-
 
I
-
 
S
-
 
K
-
 
T
-
 
Y
-
 
G
-
 
K
-
 
V
V
 
V
A
 
G
E
 
D
I
 
L
M
 
M
T
|
T
R
 
P
K
 
S
V
x
P
I
x
L
T
 
V
A
 
V
L
 
R
P
 
D
D
 
S
E
 
T
P
 
N
V
 
L
E
 
E
I
 
D
A
 
A
A
 
A
R
 
R
K
 
L
M
 
L
E
 
L
K
 
E
H
 
T
N
 
K
I
x
F
S
x
R
A
x
R
L
 
L
P
 
P
V
 
V
V
 
V
D
 
D
A
 
A
K
 
D
Q
 
G
R
 
K
V
 
L
I
 
I
G
 
G
M
 
I
V
 
L
T
 
T

7pjiA Crystal structure of pseudomonas aeruginosa guab (imp dehydrogenase) bound to atp and gdp at 1.65a resolution (see paper)
31% identity, 26% coverage: 359:486/490 of query aligns to 79:202/445 of 7pjiA

query
sites
7pjiA
R
 
Q
E
 
A
C
 
A
N
 
E
F
 
V
K
 
R
P
 
K
M
 
V
R
 
K
Q
x
K
R
 
H
E
 
E
V
 
T
K
 
A
F
 
I
V
|
V
R
 
R
S
 
D
V
 
-
M
 
-
T
 
-
P
 
-
A
x
P
I
x
V
T
 
T
I
 
V
E
 
T
P
 
P
E
 
S
T
 
T
S
 
K
V
 
I
D
 
I
E
 
E
A
 
L
S
 
L
R
 
Q
I
 
M
M
 
A
I
 
R
Q
 
E
K
 
Y
G
 
G
V
x
F
N
x
S
H
x
G
L
 
F
P
 
P
V
 
V
V
 
V
K
 
E
D
 
Q
G
 
G
R
 
E
L
 
L
V
 
V
G
 
G
I
 
I
V
 
V
T
|
T
S
 
G
W
x
R
D
|
D
I
 
L
A
 
-
K
 
-
A
 
R
V
 
V
A
 
K
T
 
P
K
 
N
K
 
A
T
 
G
G
 
D
N
 
T
V
 
V
A
 
A
E
 
A
I
 
I
M
 
M
T
|
T
-
 
P
-
 
K
R
 
D
K
 
K
V
x
L
I
x
V
T
 
T
A
 
A
L
 
R
P
 
E
D
 
G
E
 
T
P
 
P
V
 
L
E
 
E
I
 
E
A
 
M
A
 
K
R
 
A
K
 
K
M
 
L
E
 
Y
K
 
E
H
 
N
N
 
R
I
|
I
S
 
E
A
x
K
L
 
M
P
 
L
V
 
V
V
 
V
D
 
D
A
 
E
K
 
N
Q
 
F
R
 
Y
V
 
L
I
 
R
G
 
G
M
 
L
V
 
V
T
|
T
S
 
F
E
x
R
D
|
D
L
 
I
S
 
E
K
 
K

Sites not aligning to the query:

7qemB Bacterial impdh chimera (see paper)
32% identity, 24% coverage: 368:486/490 of query aligns to 86:204/428 of 7qemB

query
sites
7qemB
Q
 
R
R
 
R
E
 
V
V
 
K
K
 
K
F
 
H
V
 
E
R
 
S
S
 
A
V
 
I
M
 
V
T
 
R
P
 
D
A
 
P
I
 
V
T
 
T
I
 
V
E
 
T
P
 
P
E
 
S
T
 
T
S
 
K
V
 
I
D
 
I
E
 
E
A
 
L
S
 
L
R
 
Q
I
 
M
M
 
A
I
 
R
Q
 
E
K
 
Y
G
 
G
V
 
F
N
 
S
H
 
G
L
 
F
P
 
P
V
 
V
V
 
V
K
 
E
D
 
Q
G
 
G
R
 
E
L
 
L
V
 
V
G
 
G
I
 
I
V
 
V
T
 
T
S
 
G
W
 
R
D
 
D
I
 
L
A
 
-
K
 
-
A
 
R
V
 
V
A
 
K
T
 
P
K
 
N
K
 
A
T
 
G
G
 
D
N
 
T
V
 
V
A
 
A
E
 
A
I
 
I
M
 
M
T
 
T
-
 
P
-
 
K
R
 
D
K
 
K
V
 
L
I
 
V
T
 
T
A
 
A
L
 
R
P
 
E
D
 
G
E
 
T
P
 
P
V
 
L
E
 
E
I
 
E
A
 
M
A
 
K
R
 
A
K
 
K
M
 
L
E
 
Y
K
 
E
H
 
N
N
 
R
I
 
I
S
 
E
A
 
K
L
 
M
P
 
L
V
 
V
V
 
V
D
 
D
A
 
E
K
 
N
Q
 
F
R
 
Y
V
 
L
I
 
R
G
 
G
M
 
L
V
 
V
T
 
T
S
 
F
E
 
R
D
 
D
L
 
I
S
 
E
K
 
K

Sites not aligning to the query:

P0C0H6 Inosine-5'-monophosphate dehydrogenase; IMP dehydrogenase; IMPD; IMPDH; EC 1.1.1.205 from Streptococcus pyogenes (see paper)
30% identity, 21% coverage: 384:488/490 of query aligns to 104:210/493 of P0C0H6

query
sites
P0C0H6
I
 
L
E
 
T
P
 
P
E
 
E
T
 
H
S
 
K
V
 
V
D
 
S
E
 
E
A
 
A
S
 
E
R
 
E
I
 
L
M
 
M
I
 
Q
Q
 
R
K
 
Y
G
 
R
V
 
I
N
 
S
H
 
G
L
 
V
P
 
P
V
 
I
V
 
V
K
 
E
-
 
T
-
 
L
-
 
A
D
 
N
G
 
R
R
 
K
L
 
L
V
 
V
G
 
G
I
 
I
V
 
I
T
 
T
S
 
N
W
 
R
D
 
D
I
 
M
A
 
R
K
 
-
A
 
-
V
 
F
A
 
I
T
 
S
K
 
D
K
 
Y
T
 
N
G
 
A
N
 
P
V
 
I
A
 
S
E
 
E
I
 
H
M
 
M
T
 
T
R
 
S
K
 
E
-
 
H
V
 
L
I
 
V
T
 
T
A
 
A
L
 
A
P
 
V
D
 
G
E
 
T
P
 
D
V
 
L
E
 
E
I
 
T
A
 
A
A
 
E
R
 
R
K
 
I
M
 
L
E
 
H
K
 
E
H
 
H
N
 
R
I
 
I
S
 
E
A
 
K
L
 
L
P
 
P
V
 
L
V
 
V
D
 
D
A
 
N
K
 
S
Q
 
G
R
 
R
V
 
L
I
 
S
G
 
G
M
 
L
V
 
I
T
 
T
S
 
I
E
 
K
D
 
D
L
 
I
S
 
E
K
 
K
L
 
V
L
 
I

Sites not aligning to the query:

1zfjA Inosine monophosphate dehydrogenase (impdh; ec 1.1.1.205) from streptococcus pyogenes (see paper)
30% identity, 21% coverage: 384:488/490 of query aligns to 103:209/476 of 1zfjA

query
sites
1zfjA
I
 
L
E
 
T
P
 
P
E
 
E
T
 
H
S
 
K
V
 
V
D
 
S
E
 
E
A
 
A
S
 
E
R
 
E
I
 
L
M
 
M
I
 
Q
Q
 
R
K
 
Y
G
 
R
V
 
I
N
 
S
H
 
G
L
 
V
P
 
P
V
 
I
V
 
V
K
 
E
-
 
T
-
 
L
-
 
A
D
 
N
G
 
R
R
 
K
L
 
L
V
 
V
G
 
G
I
 
I
V
 
I
T
 
T
S
 
N
W
 
R
D
 
D
I
 
M
A
 
R
K
 
-
A
 
-
V
 
F
A
 
I
T
 
S
K
 
D
K
 
Y
T
 
N
G
 
A
N
 
P
V
 
I
A
 
S
E
 
E
I
 
H
M
 
M
T
 
T
R
 
S
K
 
E
-
 
H
V
 
L
I
 
V
T
 
T
A
 
A
L
 
A
P
 
V
D
 
G
E
 
T
P
 
D
V
 
L
E
 
E
I
 
T
A
 
A
A
 
E
R
 
R
K
 
I
M
 
L
E
 
H
K
 
E
H
 
H
N
 
R
I
 
I
S
 
E
A
 
K
L
 
L
P
 
P
V
 
L
V
 
V
D
 
D
A
 
N
K
 
S
Q
 
G
R
 
R
V
 
L
I
 
S
G
 
G
M
 
L
V
 
I
T
 
T
S
 
I
E
 
K
D
 
D
L
 
I
S
 
E
K
 
K
L
 
V
L
 
I

Sites not aligning to the query:

6gk9A Inhibited structure of impdh from pseudomonas aeruginosa (see paper)
30% identity, 26% coverage: 361:486/490 of query aligns to 82:197/424 of 6gk9A

query
sites
6gk9A
C
 
A
N
 
E
F
 
V
K
 
R
P
 
K
M
 
V
R
 
K
Q
 
K
R
 
H
E
 
E
V
 
T
K
 
A
F
 
I
V
 
V
R
 
R
S
 
D
V
 
-
M
 
-
T
 
-
P
 
-
A
 
P
I
 
V
T
 
T
I
 
V
E
 
T
P
 
P
E
 
S
T
 
T
S
 
K
V
 
I
D
 
I
E
 
E
A
 
L
S
 
L
R
 
Q
I
 
M
M
 
A
I
 
R
Q
 
E
K
 
Y
G
 
G
V
 
F
N
 
S
H
x
G
L
 
F
P
 
P
V
 
V
V
 
V
K
 
E
D
 
Q
G
 
G
R
 
E
L
 
L
V
 
V
G
 
G
I
|
I
V
 
V
T
 
T
S
 
G
W
 
R
D
 
D
I
 
L
A
 
R
K
 
D
A
 
-
V
 
-
A
 
-
T
 
-
K
 
-
K
 
-
T
 
-
G
 
-
N
 
T
V
 
V
A
 
A
E
 
A
I
 
I
M
 
M
T
 
T
-
 
P
-
 
K
R
 
D
K
 
K
V
 
L
I
x
V
T
 
T
A
 
A
L
 
R
P
 
E
D
 
G
E
 
T
P
 
P
V
 
L
E
 
E
I
 
E
A
 
M
A
 
K
R
 
A
K
 
K
M
 
L
E
 
Y
K
 
E
H
 
N
N
 
R
I
|
I
S
 
E
A
x
K
L
 
M
P
 
L
V
 
V
V
 
V
D
 
D
A
 
E
K
 
N
Q
 
F
R
 
Y
V
 
L
I
 
R
G
 
G
M
 
L
V
 
V
T
 
T
S
 
F
E
 
R
D
 
D
L
 
I
S
 
E
K
 
K

7qdxA Bacterial impdh chimera (see paper)
33% identity, 24% coverage: 368:486/490 of query aligns to 81:198/402 of 7qdxA

query
sites
7qdxA
Q
 
R
R
 
R
E
 
V
V
 
K
K
 
K
F
 
H
V
 
E
R
 
S
S
 
A
V
 
I
M
 
V
T
 
R
P
 
D
A
 
P
I
x
V
T
 
T
I
 
V
E
 
T
P
 
P
E
 
S
T
 
T
S
 
K
V
 
I
D
 
I
E
 
E
A
 
L
S
 
L
R
 
Q
I
 
M
M
 
A
I
 
R
Q
 
E
K
 
Y
G
 
G
V
x
F
N
 
S
H
 
G
L
 
F
P
 
P
V
 
V
V
 
V
K
 
E
D
 
Q
G
 
G
R
 
E
L
 
L
V
 
V
G
 
G
I
|
I
V
 
V
T
|
T
S
 
G
W
x
R
D
|
D
I
 
L
A
 
-
K
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
R
T
 
V
K
 
K
K
 
P
T
 
N
G
 
G
N
 
D
-
 
T
V
 
V
A
 
A
E
 
A
I
 
I
M
 
M
T
|
T
-
 
P
-
 
K
R
 
D
K
 
K
V
x
L
I
x
V
T
 
T
A
 
A
L
 
R
P
 
E
D
 
G
E
 
T
P
 
P
V
 
L
E
 
E
I
 
E
A
 
M
A
 
K
R
 
A
K
 
K
M
 
L
E
 
Y
K
 
E
H
 
N
N
 
R
I
|
I
S
x
E
A
x
K
L
 
M
P
 
L
V
 
V
V
 
V
D
 
D
A
 
E
K
 
N
Q
 
F
R
 
Y
V
 
L
I
 
R
G
 
G
M
x
L
V
 
V
T
|
T
S
 
F
E
x
R
D
|
D
L
 
I
S
 
E
K
 
K

4fryB The structure of a putative signal-transduction protein with cbs domains from burkholderia ambifaria mc40-6 (see paper)
32% identity, 22% coverage: 383:489/490 of query aligns to 20:129/138 of 4fryB

query
sites
4fryB
T
 
T
I
 
V
E
 
T
P
 
K
E
 
N
T
 
D
S
 
F
V
 
V
D
 
Y
E
 
D
A
 
A
S
 
I
R
 
K
I
 
L
M
 
M
I
 
A
Q
 
E
K
 
K
G
 
G
V
x
I
N
x
G
H
x
A
L
 
L
P
 
L
V
 
V
V
 
V
K
 
D
D
 
G
G
 
D
R
 
D
L
 
I
V
 
A
G
 
G
I
|
I
V
 
V
T
|
T
S
 
E
W
x
R
D
|
D
I
 
Y
A
 
A
K
 
R
A
 
K
V
 
V
A
 
V
-
 
L
-
 
Q
-
 
E
-
 
R
T
 
S
K
 
S
K
 
K
T
 
A
G
 
T
N
 
R
V
 
V
A
 
E
E
 
E
I
 
I
M
 
M
T
|
T
R
 
A
K
 
K
V
|
V
I
x
R
T
 
Y
A
 
V
L
 
E
P
 
P
D
 
S
E
 
Q
P
 
S
V
 
T
E
 
D
I
 
E
A
 
C
A
 
M
R
 
A
K
 
L
M
|
M
E
x
T
K
 
E
H
 
H
N
x
R
I
x
M
S
x
R
A
x
H
L
 
L
P
 
P
V
 
V
V
 
L
D
 
D
A
 
G
K
 
G
Q
 
-
R
 
K
V
 
L
I
 
I
G
 
G
M
x
L
V
 
I
T
x
S
S
 
I
E
x
G
D
|
D
L
 
L
S
 
V
K
|
K
L
 
S
L
 
V
V
 
I

Sites not aligning to the query:

4z87A Structure of the imp dehydrogenase from ashbya gossypii bound to gdp (see paper)
30% identity, 25% coverage: 366:486/490 of query aligns to 107:229/498 of 4z87A

query
sites
4z87A
M
 
M
R
 
V
Q
 
R
R
 
R
E
 
V
V
 
K
K
|
K
F
 
Y
V
x
E
R
x
N
S
x
G
V
 
F
M
 
I
T
 
N
P
 
A
A
x
P
I
x
V
T
 
V
I
 
V
E
 
G
P
 
P
E
 
D
T
 
A
S
 
T
V
 
V
D
 
A
E
 
D
A
 
V
S
 
R
R
 
R
I
 
M
M
 
K
I
 
N
Q
 
E
K
 
F
G
 
G
V
x
F
N
x
A
H
x
G
L
 
F
P
 
P
V
 
V
V
 
T
K
 
D
D
 
D
G
 
G
R
 
K
-
 
P
-
 
T
-
 
G
-
 
K
L
 
L
V
 
Q
G
 
G
I
 
I
V
 
I
T
|
T
S
 
S
W
 
R
D
|
D
I
 
I
A
 
Q
K
 
-
A
 
-
V
 
F
A
 
V
T
 
E
K
 
D
K
 
E
T
 
T
G
 
L
N
 
L
V
 
V
A
 
S
E
 
E
I
 
I
M
 
M
T
|
T
R
 
K
K
x
D
V
|
V
I
|
I
T
 
T
A
 
G
L
 
K
P
 
Q
D
 
G
E
 
I
P
 
N
V
 
L
E
|
E
I
 
E
A
 
A
A
x
N
R
 
Q
K
 
I
M
 
L
E
 
K
K
 
N
H
 
T
N
 
K
I
x
K
S
x
G
A
x
K
L
 
L
P
 
P
V
 
I
V
 
V
D
 
D
A
 
E
K
 
A
Q
 
G
R
 
C
V
 
L
I
 
V
G
 
S
M
 
M
V
 
L
T
 
S
S
 
R
E
x
T
D
|
D
L
 
L
S
 
M
K
 
K

Sites not aligning to the query:

7oj1B Bacillus subtilis impdh in complex with ap4a (see paper)
27% identity, 23% coverage: 375:488/490 of query aligns to 94:208/425 of 7oj1B

query
sites
7oj1B
R
 
R
S
 
G
V
x
I
M
 
T
T
 
N
P
 
P
A
 
-
I
x
F
T
 
F
I
 
L
E
 
T
P
 
P
E
 
D
T
 
H
S
 
Q
V
 
V
D
 
F
E
 
D
A
 
A
S
 
E
R
 
H
I
 
L
M
 
M
I
 
G
Q
 
K
K
 
Y
G
 
R
V
x
I
N
x
S
H
 
G
L
 
V
P
 
P
V
 
I
V
 
V
-
 
N
-
 
N
-
 
E
K
 
E
D
 
D
G
 
Q
R
 
K
L
 
L
V
 
V
G
 
G
I
|
I
V
 
I
T
|
T
S
 
N
W
 
R
D
 
D
I
 
L
A
 
-
K
 
R
A
 
F
V
 
I
A
 
A
T
 
D
K
 
Y
K
 
S
T
 
M
G
 
-
N
 
K
V
 
I
A
 
S
E
 
D
I
 
V
M
 
M
T
 
T
R
 
K
K
 
E
-
 
E
V
 
L
I
x
V
T
 
T
A
 
A
L
 
S
P
 
V
D
 
G
E
 
T
P
 
T
V
 
L
E
 
D
I
 
E
A
 
A
A
 
E
R
 
K
K
 
I
M
 
L
E
 
Q
K
 
K
H
 
H
N
 
K
I
|
I
S
x
E
A
x
K
L
 
L
P
 
P
V
 
L
V
 
V
D
 
D
A
 
D
K
 
Q
Q
 
N
R
 
K
V
 
L
I
 
K
G
 
G
M
x
L
V
 
I
T
|
T
S
 
I
E
x
K
D
|
D
L
 
I
S
 
E
K
 
K
L
 
V
L
 
I

5tc3A Structure of imp dehydrogenase from ashbya gossypii bound to atp and gdp (see paper)
30% identity, 25% coverage: 366:486/490 of query aligns to 107:229/488 of 5tc3A

query
sites
5tc3A
M
 
M
R
 
V
Q
 
R
R
 
R
E
 
V
V
 
K
K
|
K
F
 
Y
V
x
E
R
x
N
S
x
G
V
 
F
M
x
I
T
 
N
P
 
A
A
x
P
I
x
V
T
 
V
I
 
V
E
 
G
P
 
P
E
 
D
T
 
A
S
 
T
V
 
V
D
 
A
E
 
D
A
 
V
S
 
R
R
 
R
I
 
M
M
 
K
I
 
N
Q
 
E
K
 
F
G
 
G
V
x
F
N
x
A
H
x
G
L
 
F
P
 
P
V
 
V
V
 
T
K
 
D
D
 
D
G
 
G
R
 
K
-
 
P
-
 
T
-
 
G
-
 
K
L
 
L
V
 
Q
G
 
G
I
 
I
V
 
I
T
|
T
S
 
S
W
x
R
D
|
D
I
 
I
A
 
Q
K
 
-
A
 
-
V
 
F
A
 
V
T
 
E
K
 
D
K
 
E
T
 
T
G
 
L
N
 
L
V
 
V
A
 
S
E
 
E
I
 
I
M
 
M
T
|
T
R
 
K
K
 
D
V
|
V
I
|
I
T
 
T
A
 
G
L
 
K
P
 
Q
D
 
G
E
 
I
P
 
N
V
 
L
E
 
E
I
 
E
A
 
A
A
x
N
R
 
Q
K
 
I
M
 
L
E
 
K
K
 
N
H
 
T
N
 
K
I
 
K
S
x
G
A
x
K
L
 
L
P
 
P
V
 
I
V
 
V
D
 
D
A
 
E
K
 
A
Q
 
G
R
 
C
V
 
L
I
 
V
G
 
S
M
|
M
V
 
L
T
x
S
S
 
R
E
x
T
D
|
D
L
|
L
S
 
M
K
|
K

Sites not aligning to the query:

5mcpC Structure of imp dehydrogenase from ashbya gossypii bound to atp (see paper)
30% identity, 25% coverage: 366:486/490 of query aligns to 110:232/446 of 5mcpC

query
sites
5mcpC
M
 
M
R
 
V
Q
 
R
R
 
R
E
 
V
V
 
K
K
 
K
F
 
Y
V
 
E
R
 
N
S
 
G
V
 
F
M
x
I
T
 
N
P
 
A
A
 
P
I
x
V
T
 
V
I
 
V
E
 
G
P
 
P
E
 
D
T
 
A
S
 
T
V
 
V
D
 
A
E
 
D
A
 
V
S
 
R
R
 
R
I
 
M
M
 
K
I
 
N
Q
 
E
K
 
F
G
 
G
V
x
F
N
 
A
H
x
G
L
 
F
P
 
P
V
 
V
V
 
T
K
 
D
D
 
D
G
 
G
R
 
K
-
 
P
-
 
T
-
 
G
-
 
K
L
 
L
V
 
Q
G
 
G
I
|
I
V
 
I
T
|
T
S
|
S
W
x
R
D
|
D
I
 
I
A
 
Q
K
 
-
A
 
-
V
 
F
A
 
V
T
 
E
K
 
D
K
 
E
T
 
T
G
 
L
N
 
L
V
 
V
A
 
S
E
 
E
I
 
I
M
 
M
T
 
T
R
 
K
K
 
D
V
 
V
I
|
I
T
 
T
A
 
G
L
 
K
P
 
Q
D
 
G
E
 
I
P
 
N
V
 
L
E
 
E
I
 
E
A
 
A
A
 
N
R
 
Q
K
 
I
M
 
L
E
 
K
K
 
N
H
 
T
N
 
K
I
 
K
S
x
G
A
x
K
L
 
L
P
 
P
V
 
I
V
 
V
D
 
D
A
 
E
K
 
A
Q
 
G
R
 
C
V
 
L
I
 
V
G
 
S
M
|
M
V
 
L
T
x
S
S
 
R
E
x
T
D
|
D
L
 
L
S
 
M
K
 
K

Sites not aligning to the query:

5x9gA Crystal structure of the cytosolic domain of the mg2+ channel mgte in complex with atp (see paper)
40% identity, 16% coverage: 411:488/490 of query aligns to 174:248/248 of 5x9gA

query
sites
5x9gA
G
 
G
R
 
R
L
 
L
V
 
K
G
 
G
I
x
V
V
 
L
T
x
S
S
 
L
W
x
R
D
|
D
I
 
L
A
 
I
K
 
-
A
 
-
V
 
V
A
 
A
T
 
D
K
 
P
K
 
R
T
 
T
G
 
-
N
 
R
V
 
V
A
 
A
E
 
E
I
 
I
M
 
M
T
 
N
R
 
P
K
 
K
V
 
V
I
x
V
T
 
Y
A
 
V
L
 
R
P
 
T
D
 
D
E
 
T
P
 
D
V
 
Q
E
 
E
I
 
E
A
 
V
A
 
A
R
 
R
K
 
L
M
 
M
E
 
A
K
 
D
H
 
Y
N
 
D
I
x
F
S
 
T
A
 
V
L
 
L
P
 
P
V
 
V
V
 
V
D
 
D
A
 
E
K
 
E
Q
 
G
R
 
R
V
 
L
I
 
V
G
 
G
M
 
I
V
 
V
T
 
T
S
 
V
E
 
D
D
|
D
L
 
V
S
 
L
K
 
D
L
 
V
L
 
L

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_013683759.1 NCBI__GCF_000194625.1:WP_013683759.1
MKTVEEINERIREGNVCVVTASEMKELVAELGAEKAAKEVDVVTTGTFGAMCSSGVFMNF
GHSDPPIKMQKIWLNDVEAYTGIAAVDAYLGVTQVSEKHEEYGGAHVIEELVRGREVVLR
AISKGTDCYPRKEIITEIALEDLNQAEMLNPRNAYQRYKAATNSSQQLLRTYMGTLLPNF
GNVTFAGCGEISPLNNDPEYRTIGVGTRIFLCGAKGYVIGEGTQHCPPFGTLMVKGNLKE
MKPEFMRAAVFPGYGVTMYVGIGIPIPILDADMARATAIRDEEIWTEIIDFGVPRRQRPV
VKKVNYAELKSGKVEINGEEVRVSPLSSFYMAEKIMEELKRQIERAEFFLSPPAERISRE
CNFKPMRQREVKFVRSVMTPAITIEPETSVDEASRIMIQKGVNHLPVVKDGRLVGIVTSW
DIAKAVATKKTGNVAEIMTRKVITALPDEPVEIAARKMEKHNISALPVVDAKQRVIGMVT
SEDLSKLLVR

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory