SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_013707094.1 NCBI__GCF_000195295.1:WP_013707094.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

2izzA Crystal structure of human pyrroline-5-carboxylate reductase
47% identity, 95% coverage: 10:268/273 of query aligns to 7:272/272 of 2izzA

query
sites
2izzA
I
 
I
G
|
G
V
x
A
G
|
G
N
x
Q
M
x
L
G
 
A
S
 
F
A
 
A
L
 
L
T
 
A
R
 
K
A
 
G
W
 
F
L
 
T
Q
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
I
 
L
E
 
A
P
 
A
A
 
H
S
 
K
I
 
I
C
 
M
L
 
A
A
 
S
-
x
S
-
x
P
D
 
D
A
 
M
D
 
D
T
 
L
E
 
A
R
 
T
L
 
V
R
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
R
A
 
-
E
 
K
L
 
M
G
 
G
V
 
V
Q
 
K
-
 
L
T
 
T
A
 
P
D
 
H
N
|
N
R
 
K
Q
 
E
A
 
T
V
 
V
A
 
Q
-
 
H
A
 
S
D
 
D
I
 
V
V
 
L
I
 
F
L
 
L
A
|
A
V
|
V
K
|
K
P
 
P
Q
 
H
I
 
I
I
 
I
P
 
P
E
 
F
V
x
I
L
 
L
T
 
D
D
 
E
I
 
I
R
 
G
N
 
A
R
 
D
I
 
I
G
 
E
A
 
D
S
 
R
H
 
H
L
 
I
I
 
V
I
 
V
S
 
S
I
x
C
A
|
A
A
|
A
G
 
G
L
 
V
P
 
T
L
 
I
S
 
S
Y
 
S
L
 
I
E
 
E
E
 
K
M
 
K
L
 
L
-
 
S
-
 
A
-
 
F
-
 
R
P
 
P
R
 
A
A
 
P
R
 
R
L
 
V
L
 
I
R
 
R
V
 
C
M
|
M
P
x
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
L
 
V
L
 
V
I
 
V
R
 
R
A
 
E
G
 
G
V
 
A
A
 
T
A
 
V
I
 
Y
A
 
A
Q
 
T
G
 
G
T
 
T
R
 
H
A
 
A
T
 
Q
A
 
V
Q
 
E
D
 
D
L
 
G
D
 
R
L
 
L
A
 
M
R
 
E
K
 
Q
L
 
L
F
 
L
D
 
S
S
 
S
V
 
V
G
 
G
R
 
F
S
 
C
V
 
T
I
 
E
V
 
V
E
 
E
E
 
E
K
 
D
F
 
L
M
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
L
 
T
F
 
A
L
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
V
K
 
K
M
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
Q
 
R
T
 
L
A
 
A
L
 
V
L
 
R
L
 
L
A
 
G
A
 
A
Q
 
Q
T
 
A
I
 
L
L
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
A
A
 
K
L
 
M
F
 
L
L
 
L
E
 
H
S
 
S
G
 
E
H
 
Q
H
 
H
P
 
P
G
 
G
I
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
Q
 
N
V
 
V
A
 
S
S
 
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
I
 
I
T
 
H
G
 
A
L
 
L
H
 
H
V
 
V
L
 
L
E
 
E
A
 
S
G
 
G
G
 
G
F
 
F
R
 
R
G
 
S
L
 
L
I
 
L
M
 
I
S
 
N
A
 
A
V
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
S
T
 
C
S
 
I
R
 
R
S
 
T
Q
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
Q
T
 
S
V
 
M

8td5A Structure of pycr1 complexed with nadh and tetrahydrothiophene-2- carboxylic acid
47% identity, 95% coverage: 10:268/273 of query aligns to 13:278/280 of 8td5A

query
sites
8td5A
I
 
I
G
|
G
V
x
A
G
|
G
N
x
Q
M
x
L
G
 
A
S
 
F
A
 
A
L
 
L
T
 
A
R
 
K
A
 
G
W
 
F
L
 
T
Q
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
I
 
L
E
 
A
P
 
A
A
 
H
S
 
K
I
 
I
C
 
M
L
 
A
A
 
S
-
x
S
-
x
P
D
 
D
A
 
M
D
 
D
T
x
L
E
 
A
R
 
T
L
 
V
R
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
R
A
 
-
E
 
K
L
 
M
G
 
G
V
 
V
Q
 
K
-
 
L
T
 
T
A
 
P
D
 
H
N
|
N
R
 
K
Q
 
E
A
 
T
V
 
V
A
 
Q
-
 
H
A
 
S
D
 
D
I
 
V
V
 
L
I
 
F
L
 
L
A
|
A
V
|
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
I
 
I
I
 
I
P
 
P
E
 
F
V
x
I
L
 
L
T
 
D
D
 
E
I
 
I
R
 
G
N
 
A
R
 
D
I
 
I
G
 
E
A
 
D
S
 
R
H
 
H
L
 
I
I
 
V
I
 
V
S
 
S
I
x
C
A
|
A
A
|
A
G
 
G
L
 
V
P
 
T
L
 
I
S
 
S
Y
 
S
L
 
I
E
 
E
E
 
K
M
 
K
L
 
L
-
 
S
-
 
A
-
 
F
-
 
R
P
 
P
R
 
A
A
 
P
R
 
R
L
 
V
L
 
I
R
 
R
V
 
C
M
|
M
P
 
T
N
 
N
T
|
T
P
 
P
L
 
V
L
 
V
I
 
V
R
 
R
A
 
E
G
 
G
V
 
A
A
 
T
A
 
V
I
 
Y
A
 
A
Q
 
T
G
 
G
T
 
T
R
 
H
A
 
A
T
 
Q
A
 
V
Q
 
E
D
 
D
L
 
G
D
 
R
L
 
L
A
 
M
R
 
E
K
 
Q
L
 
L
F
 
L
D
 
S
S
 
S
V
 
V
G
 
G
R
 
F
S
 
C
V
 
T
I
 
E
V
 
V
E
 
E
E
 
E
K
 
D
F
 
L
M
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
L
 
T
F
 
A
L
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
V
K
 
K
M
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
Q
 
R
T
 
L
A
 
A
L
 
V
L
 
R
L
 
L
A
 
G
A
 
A
Q
 
Q
T
 
A
I
 
L
L
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
A
A
 
K
L
 
M
F
 
L
L
 
L
E
 
H
S
 
S
G
 
E
H
 
Q
H
 
H
P
 
P
G
 
G
I
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
Q
 
N
V
 
V
A
 
S
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
x
A
T
|
T
I
 
I
T
 
H
G
 
A
L
 
L
H
 
H
V
 
V
L
 
L
E
 
E
A
 
S
G
 
G
G
 
G
F
 
F
R
 
R
G
 
S
L
 
L
I
 
L
M
 
I
S
 
N
A
 
A
V
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
S
T
 
C
S
 
I
R
 
R
S
 
T
Q
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
Q
T
 
S
V
 
M

8td1A Structure of pycr1 complexed with 3-(6-oxa-9-azaspiro(4.5)decane-9- carbonyl)benzoic acid (see paper)
47% identity, 95% coverage: 10:268/273 of query aligns to 13:278/280 of 8td1A

query
sites
8td1A
I
 
I
G
 
G
V
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
 
L
G
 
A
S
 
F
A
 
A
L
 
L
T
 
A
R
 
K
A
 
G
W
 
F
L
 
T
Q
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
I
 
L
E
 
A
P
 
A
A
 
H
S
 
K
I
 
I
C
 
M
L
 
A
A
 
S
-
 
S
-
 
P
D
 
D
A
 
M
D
 
D
T
 
L
E
 
A
R
 
T
L
 
V
R
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
R
A
 
-
E
 
K
L
 
M
G
 
G
V
 
V
Q
 
K
-
 
L
T
 
T
A
 
P
D
 
H
N
 
N
R
 
K
Q
 
E
A
 
T
V
 
V
A
 
Q
-
 
H
A
 
S
D
 
D
I
 
V
V
 
L
I
 
F
L
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
I
 
I
I
 
I
P
 
P
E
 
F
V
 
I
L
 
L
T
 
D
D
 
E
I
 
I
R
 
G
N
 
A
R
 
D
I
 
I
G
 
E
A
 
D
S
 
R
H
 
H
L
 
I
I
 
V
I
 
V
S
 
S
I
 
C
A
|
A
A
|
A
G
 
G
L
 
V
P
 
T
L
 
I
S
 
S
Y
 
S
L
 
I
E
 
E
E
 
K
M
 
K
L
 
L
-
 
S
-
 
A
-
 
F
-
 
R
P
 
P
R
 
A
A
 
P
R
 
R
L
 
V
L
 
I
R
 
R
V
 
C
M
|
M
P
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
L
 
V
L
 
V
I
 
V
R
 
R
A
 
E
G
 
G
V
 
A
A
 
T
A
 
V
I
 
Y
A
 
A
Q
 
T
G
 
G
T
 
T
R
 
H
A
 
A
T
 
Q
A
 
V
Q
 
E
D
 
D
L
 
G
D
 
R
L
 
L
A
 
M
R
 
E
K
 
Q
L
 
L
F
 
L
D
 
S
S
 
S
V
 
V
G
 
G
R
 
F
S
 
C
V
 
T
I
 
E
V
 
V
E
 
E
E
 
E
K
 
D
F
 
L
M
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
L
 
T
F
 
A
L
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
V
K
 
K
M
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
Q
 
R
T
 
L
A
 
A
L
 
V
L
 
R
L
 
L
A
 
G
A
 
A
Q
 
Q
T
 
A
I
 
L
L
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
A
A
 
K
L
 
M
F
 
L
L
 
L
E
 
H
S
 
S
G
 
E
H
 
Q
H
 
H
P
 
P
G
 
G
I
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
Q
 
N
V
 
V
A
 
S
S
 
S
P
 
P
G
 
G
G
|
G
T
x
A
T
|
T
I
 
I
T
 
H
G
 
A
L
 
L
H
 
H
V
 
V
L
 
L
E
 
E
A
 
S
G
 
G
G
 
G
F
 
F
R
 
R
G
 
S
L
 
L
I
 
L
M
 
I
S
 
N
A
 
A
V
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
S
T
 
C
S
 
I
R
 
R
S
 
T
Q
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
Q
T
 
S
V
 
M

8td0A Structure of pycr1 complexed with 5-oxo-7a-phenyl-hexahydropyrrolo[2, 1-b][1,3]thiazole-3-carboxylic acid (see paper)
47% identity, 95% coverage: 10:268/273 of query aligns to 13:278/280 of 8td0A

query
sites
8td0A
I
 
I
G
 
G
V
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
x
L
G
 
A
S
 
F
A
 
A
L
 
L
T
 
A
R
 
K
A
 
G
W
 
F
L
 
T
Q
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
I
 
L
E
 
A
P
 
A
A
 
H
S
 
K
I
 
I
C
 
M
L
 
A
A
 
S
-
 
S
-
 
P
D
 
D
A
 
M
D
 
D
T
 
L
E
 
A
R
 
T
L
 
V
R
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
R
A
 
-
E
 
K
L
 
M
G
 
G
V
 
V
Q
 
K
-
 
L
T
 
T
A
 
P
D
 
H
N
 
N
R
 
K
Q
 
E
A
 
T
V
 
V
A
 
Q
-
 
H
A
 
S
D
 
D
I
 
V
V
 
L
I
 
F
L
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
I
 
I
I
 
I
P
 
P
E
 
F
V
 
I
L
 
L
T
 
D
D
 
E
I
 
I
R
 
G
N
 
A
R
 
D
I
 
I
G
 
E
A
 
D
S
 
R
H
 
H
L
 
I
I
 
V
I
 
V
S
 
S
I
 
C
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
P
 
T
L
 
I
S
 
S
Y
 
S
L
 
I
E
 
E
E
 
K
M
 
K
L
 
L
-
 
S
-
 
A
-
 
F
-
 
R
P
 
P
R
 
A
A
 
P
R
 
R
L
 
V
L
 
I
R
 
R
V
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
T
|
T
P
 
P
L
 
V
L
 
V
I
 
V
R
 
R
A
 
E
G
 
G
V
 
A
A
 
T
A
 
V
I
 
Y
A
 
A
Q
 
T
G
 
G
T
 
T
R
 
H
A
 
A
T
 
Q
A
 
V
Q
 
E
D
 
D
L
 
G
D
 
R
L
 
L
A
 
M
R
 
E
K
 
Q
L
 
L
F
 
L
D
 
S
S
 
S
V
 
V
G
 
G
R
 
F
S
 
C
V
 
T
I
 
E
V
 
V
E
 
E
E
 
E
K
 
D
F
 
L
M
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
|
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
L
 
T
F
 
A
L
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
V
K
 
K
M
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
Q
 
R
T
 
L
A
 
A
L
 
V
L
 
R
L
 
L
A
 
G
A
 
A
Q
 
Q
T
 
A
I
 
L
L
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
A
A
 
K
L
 
M
F
 
L
L
 
L
E
 
H
S
 
S
G
 
E
H
 
Q
H
 
H
P
 
P
G
 
G
I
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
Q
 
N
V
 
V
A
 
S
S
 
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
I
 
I
T
 
H
G
 
A
L
 
L
H
 
H
V
 
V
L
 
L
E
 
E
A
 
S
G
 
G
G
 
G
F
 
F
R
 
R
G
 
S
L
 
L
I
 
L
M
 
I
S
 
N
A
 
A
V
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
S
T
 
C
S
 
I
R
 
R
S
 
T
Q
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
Q
T
 
S
V
 
M

8tczA Structure of pycr1 complexed with 2-(pyridin-2-yl)cyclopropane-1- carboxylic acid (see paper)
47% identity, 95% coverage: 10:268/273 of query aligns to 13:278/280 of 8tczA

query
sites
8tczA
I
 
I
G
 
G
V
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
 
L
G
 
A
S
 
F
A
 
A
L
 
L
T
 
A
R
 
K
A
 
G
W
 
F
L
 
T
Q
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
I
 
L
E
 
A
P
 
A
A
 
H
S
 
K
I
 
I
C
 
M
L
 
A
A
 
S
-
 
S
-
 
P
D
 
D
A
 
M
D
 
D
T
 
L
E
 
A
R
 
T
L
 
V
R
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
R
A
 
-
E
 
K
L
 
M
G
 
G
V
 
V
Q
 
K
-
 
L
T
 
T
A
 
P
D
 
H
N
 
N
R
 
K
Q
 
E
A
 
T
V
 
V
A
 
Q
-
 
H
A
 
S
D
 
D
I
 
V
V
 
L
I
 
F
L
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
I
 
I
I
 
I
P
 
P
E
 
F
V
 
I
L
 
L
T
 
D
D
 
E
I
 
I
R
 
G
N
 
A
R
 
D
I
 
I
G
 
E
A
 
D
S
 
R
H
 
H
L
 
I
I
 
V
I
 
V
S
 
S
I
 
C
A
 
A
A
|
A
G
 
G
L
 
V
P
 
T
L
 
I
S
 
S
Y
 
S
L
 
I
E
 
E
E
 
K
M
 
K
L
 
L
-
 
S
-
 
A
-
 
F
-
 
R
P
 
P
R
 
A
A
 
P
R
 
R
L
 
V
L
 
I
R
 
R
V
 
C
M
|
M
P
x
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
L
 
V
L
 
V
I
 
V
R
 
R
A
 
E
G
 
G
V
 
A
A
 
T
A
 
V
I
 
Y
A
 
A
Q
 
T
G
 
G
T
 
T
R
 
H
A
 
A
T
 
Q
A
 
V
Q
 
E
D
 
D
L
 
G
D
 
R
L
 
L
A
 
M
R
 
E
K
 
Q
L
 
L
F
 
L
D
 
S
S
 
S
V
 
V
G
 
G
R
 
F
S
 
C
V
 
T
I
 
E
V
 
V
E
 
E
E
 
E
K
 
D
F
 
L
M
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
L
 
T
F
 
A
L
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
V
K
 
K
M
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
Q
 
R
T
 
L
A
 
A
L
 
V
L
 
R
L
 
L
A
 
G
A
 
A
Q
 
Q
T
 
A
I
 
L
L
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
A
A
 
K
L
 
M
F
 
L
L
 
L
E
 
H
S
 
S
G
 
E
H
 
Q
H
 
H
P
 
P
G
 
G
I
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
Q
 
N
V
 
V
A
 
S
S
 
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
I
 
I
T
 
H
G
 
A
L
 
L
H
 
H
V
 
V
L
 
L
E
 
E
A
 
S
G
 
G
G
 
G
F
 
F
R
 
R
G
 
S
L
 
L
I
 
L
M
 
I
S
 
N
A
 
A
V
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
S
T
 
C
S
 
I
R
 
R
S
 
T
Q
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
Q
T
 
S
V
 
M

8tcxA Structure of pycr1 complexed with 2,4-dioxo-1,2,3,4- tetrahydroquinazoline-6-carboxylic acid (see paper)
47% identity, 95% coverage: 10:268/273 of query aligns to 13:278/280 of 8tcxA

query
sites
8tcxA
I
 
I
G
 
G
V
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
x
L
G
 
A
S
 
F
A
 
A
L
 
L
T
 
A
R
 
K
A
 
G
W
 
F
L
 
T
Q
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
I
 
L
E
 
A
P
 
A
A
 
H
S
 
K
I
 
I
C
 
M
L
 
A
A
 
S
-
 
S
-
 
P
D
 
D
A
 
M
D
 
D
T
 
L
E
 
A
R
 
T
L
 
V
R
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
R
A
 
-
E
 
K
L
 
M
G
 
G
V
 
V
Q
 
K
-
 
L
T
 
T
A
 
P
D
 
H
N
 
N
R
 
K
Q
 
E
A
 
T
V
 
V
A
 
Q
-
 
H
A
 
S
D
 
D
I
 
V
V
 
L
I
 
F
L
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
I
 
I
I
 
I
P
 
P
E
 
F
V
 
I
L
 
L
T
 
D
D
 
E
I
 
I
R
 
G
N
 
A
R
 
D
I
 
I
G
 
E
A
 
D
S
 
R
H
 
H
L
 
I
I
 
V
I
 
V
S
 
S
I
x
C
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
P
 
T
L
 
I
S
 
S
Y
 
S
L
 
I
E
 
E
E
 
K
M
 
K
L
 
L
-
 
S
-
 
A
-
 
F
-
 
R
P
 
P
R
 
A
A
 
P
R
 
R
L
 
V
L
 
I
R
 
R
V
 
C
M
|
M
P
x
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
L
 
V
L
 
V
I
 
V
R
 
R
A
 
E
G
 
G
V
 
A
A
 
T
A
 
V
I
 
Y
A
 
A
Q
 
T
G
 
G
T
 
T
R
 
H
A
 
A
T
 
Q
A
 
V
Q
 
E
D
 
D
L
 
G
D
 
R
L
 
L
A
 
M
R
 
E
K
 
Q
L
 
L
F
 
L
D
 
S
S
 
S
V
 
V
G
 
G
R
 
F
S
 
C
V
 
T
I
 
E
V
 
V
E
 
E
E
 
E
K
 
D
F
 
L
M
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
L
 
T
F
 
A
L
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
V
K
 
K
M
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
Q
 
R
T
 
L
A
 
A
L
 
V
L
 
R
L
 
L
A
 
G
A
 
A
Q
 
Q
T
 
A
I
 
L
L
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
A
A
 
K
L
 
M
F
 
L
L
 
L
E
 
H
S
 
S
G
 
E
H
 
Q
H
 
H
P
 
P
G
 
G
I
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
Q
 
N
V
 
V
A
 
S
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
|
T
I
 
I
T
 
H
G
 
A
L
 
L
H
 
H
V
 
V
L
 
L
E
 
E
A
 
S
G
 
G
G
 
G
F
 
F
R
 
R
G
 
S
L
 
L
I
 
L
M
 
I
S
 
N
A
 
A
V
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
S
T
 
C
S
 
I
R
 
R
S
 
T
Q
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
Q
T
 
S
V
 
M

5uatC Structure of human pycr-1 complexed with NADPH (see paper)
47% identity, 95% coverage: 10:268/273 of query aligns to 10:275/277 of 5uatC

query
sites
5uatC
I
 
I
G
 
G
V
x
A
G
|
G
N
x
Q
M
x
L
G
 
A
S
 
F
A
 
A
L
 
L
T
 
A
R
 
K
A
 
G
W
 
F
L
 
T
Q
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
I
 
L
E
 
A
P
 
A
A
 
H
S
 
K
I
 
I
C
 
M
L
 
A
A
 
S
-
x
S
-
x
P
D
|
D
A
 
M
D
 
D
T
 
L
E
 
A
R
 
T
L
 
V
R
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
R
A
 
-
E
 
K
L
 
M
G
 
G
V
 
V
Q
 
K
-
 
L
T
 
T
A
 
P
D
 
H
N
|
N
R
 
K
Q
 
E
A
 
T
V
 
V
A
 
Q
-
 
H
A
 
S
D
 
D
I
 
V
V
 
L
I
 
F
L
 
L
A
|
A
V
|
V
K
|
K
P
|
P
Q
 
H
I
 
I
I
 
I
P
 
P
E
 
F
V
x
I
L
 
L
T
 
D
D
 
E
I
 
I
R
 
G
N
 
A
R
 
D
I
 
I
G
 
E
A
 
D
S
 
R
H
 
H
L
 
I
I
 
V
I
 
V
S
 
S
I
x
C
A
|
A
A
|
A
G
 
G
L
 
V
P
 
T
L
 
I
S
 
S
Y
 
S
L
 
I
E
 
E
E
 
K
M
 
K
L
 
L
-
 
S
-
 
A
-
 
F
-
 
R
P
 
P
R
 
A
A
 
P
R
 
R
L
 
V
L
 
I
R
 
R
V
 
C
M
|
M
P
 
T
N
 
N
T
|
T
P
 
P
L
 
V
L
 
V
I
 
V
R
 
R
A
 
E
G
 
G
V
 
A
A
 
T
A
 
V
I
 
Y
A
 
A
Q
 
T
G
 
G
T
 
T
R
 
H
A
 
A
T
 
Q
A
 
V
Q
 
E
D
 
D
L
 
G
D
 
R
L
 
L
A
 
M
R
 
E
K
 
Q
L
 
L
F
 
L
D
 
S
S
 
S
V
 
V
G
 
G
R
 
F
S
 
C
V
 
T
I
 
E
V
 
V
E
 
E
E
 
E
K
 
D
F
 
L
M
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
L
 
T
F
 
A
L
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
V
K
 
K
M
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
Q
 
R
T
 
L
A
 
A
L
 
V
L
 
R
L
 
L
A
 
G
A
 
A
Q
 
Q
T
 
A
I
 
L
L
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
A
A
 
K
L
 
M
F
 
L
L
 
L
E
 
H
S
 
S
G
 
E
H
 
Q
H
 
H
P
 
P
G
 
G
I
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
Q
 
N
V
 
V
A
 
S
S
 
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
I
 
I
T
 
H
G
 
A
L
 
L
H
 
H
V
 
V
L
 
L
E
 
E
A
 
S
G
 
G
G
 
G
F
 
F
R
 
R
G
 
S
L
 
L
I
 
L
M
 
I
S
 
N
A
 
A
V
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
S
T
 
C
S
 
I
R
 
R
S
 
T
Q
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
Q
T
 
S
V
 
M

8td6B Structure of pycr1 complexed with nadh and 2-(methylthio)acetic acid
47% identity, 95% coverage: 10:268/273 of query aligns to 12:277/281 of 8td6B

query
sites
8td6B
I
 
I
G
|
G
V
x
A
G
|
G
N
x
Q
M
x
L
G
 
A
S
 
F
A
 
A
L
 
L
T
 
A
R
 
K
A
 
G
W
 
F
L
 
T
Q
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
I
 
L
E
 
A
P
 
A
A
 
H
S
 
K
I
 
I
C
 
M
L
 
A
A
 
S
-
 
S
-
x
P
D
 
D
A
 
M
D
 
D
T
 
L
E
 
A
R
 
T
L
 
V
R
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
R
A
 
-
E
 
K
L
 
M
G
 
G
V
 
V
Q
 
K
-
 
L
T
 
T
A
 
P
D
 
H
N
|
N
R
 
K
Q
 
E
A
 
T
V
 
V
A
 
Q
-
 
H
A
 
S
D
 
D
I
 
V
V
 
L
I
 
F
L
 
L
A
|
A
V
|
V
K
|
K
P
 
P
Q
 
H
I
|
I
I
 
I
P
 
P
E
 
F
V
x
I
L
 
L
T
 
D
D
 
E
I
 
I
R
 
G
N
 
A
R
 
D
I
 
I
G
 
E
A
 
D
S
 
R
H
 
H
L
 
I
I
 
V
I
 
V
S
 
S
I
x
C
A
|
A
A
|
A
G
 
G
L
 
V
P
 
T
L
 
I
S
 
S
Y
 
S
L
 
I
E
 
E
E
 
K
M
 
K
L
 
L
-
 
S
-
 
A
-
 
F
-
 
R
P
 
P
R
 
A
A
 
P
R
 
R
L
 
V
L
 
I
R
 
R
V
 
C
M
|
M
P
x
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
L
 
V
L
 
V
I
 
V
R
 
R
A
 
E
G
 
G
V
 
A
A
 
T
A
 
V
I
 
Y
A
 
A
Q
 
T
G
 
G
T
 
T
R
 
H
A
 
A
T
 
Q
A
 
V
Q
 
E
D
 
D
L
 
G
D
 
R
L
 
L
A
 
M
R
 
E
K
 
Q
L
 
L
F
 
L
D
 
S
S
 
S
V
 
V
G
 
G
R
 
F
S
 
C
V
 
T
I
 
E
V
 
V
E
 
E
E
 
E
K
 
D
F
 
L
M
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
|
G
S
|
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
L
 
T
F
 
A
L
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
V
K
 
K
M
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
Q
 
R
T
 
L
A
 
A
L
 
V
L
 
R
L
 
L
A
 
G
A
 
A
Q
 
Q
T
 
A
I
 
L
L
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
A
A
 
K
L
 
M
F
 
L
L
 
L
E
 
H
S
 
S
G
 
E
H
 
Q
H
 
H
P
 
P
G
 
G
I
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
Q
 
N
V
 
V
A
 
S
S
 
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
I
 
I
T
 
H
G
 
A
L
 
L
H
 
H
V
 
V
L
 
L
E
 
E
A
 
S
G
 
G
G
 
G
F
 
F
R
 
R
G
 
S
L
 
L
I
 
L
M
 
I
S
 
N
A
 
A
V
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
S
T
 
C
S
 
I
R
 
R
S
 
T
Q
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
Q
T
 
S
V
 
M

8td3A Structure of pycr1 complexed with nadh and (s)-tetrahydro-2h-pyran-2- carboxylic acid
47% identity, 95% coverage: 10:268/273 of query aligns to 12:277/281 of 8td3A

query
sites
8td3A
I
 
I
G
|
G
V
x
A
G
|
G
N
x
Q
M
x
L
G
 
A
S
 
F
A
 
A
L
 
L
T
 
A
R
 
K
A
 
G
W
 
F
L
 
T
Q
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
I
 
L
E
 
A
P
 
A
A
 
H
S
 
K
I
 
I
C
 
M
L
 
A
A
 
S
-
x
S
-
x
P
D
 
D
A
 
M
D
 
D
T
 
L
E
 
A
R
 
T
L
 
V
R
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
R
A
 
-
E
 
K
L
 
M
G
 
G
V
 
V
Q
 
K
-
 
L
T
 
T
A
 
P
D
 
H
N
|
N
R
 
K
Q
 
E
A
 
T
V
 
V
A
 
Q
-
 
H
A
 
S
D
 
D
I
 
V
V
 
L
I
 
F
L
 
L
A
|
A
V
|
V
K
|
K
P
 
P
Q
 
H
I
|
I
I
 
I
P
 
P
E
 
F
V
 
I
L
 
L
T
 
D
D
 
E
I
 
I
R
 
G
N
 
A
R
 
D
I
 
I
G
 
E
A
 
D
S
 
R
H
 
H
L
 
I
I
 
V
I
 
V
S
 
S
I
x
C
A
|
A
A
|
A
G
 
G
L
 
V
P
 
T
L
 
I
S
 
S
Y
 
S
L
 
I
E
 
E
E
 
K
M
 
K
L
 
L
-
 
S
-
 
A
-
 
F
-
 
R
P
 
P
R
 
A
A
 
P
R
 
R
L
 
V
L
 
I
R
 
R
V
 
C
M
|
M
P
x
T
N
 
N
T
|
T
P
 
P
L
 
V
L
 
V
I
 
V
R
 
R
A
 
E
G
 
G
V
 
A
A
 
T
A
 
V
I
 
Y
A
 
A
Q
 
T
G
 
G
T
 
T
R
 
H
A
 
A
T
 
Q
A
 
V
Q
 
E
D
 
D
L
 
G
D
 
R
L
 
L
A
 
M
R
 
E
K
 
Q
L
 
L
F
 
L
D
 
S
S
 
S
V
 
V
G
 
G
R
 
F
S
 
C
V
 
T
I
 
E
V
 
V
E
 
E
E
 
E
K
 
D
F
 
L
M
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
|
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
L
 
T
F
 
A
L
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
V
K
 
K
M
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
Q
 
R
T
 
L
A
 
A
L
 
V
L
 
R
L
 
L
A
 
G
A
 
A
Q
 
Q
T
 
A
I
 
L
L
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
A
A
 
K
L
 
M
F
 
L
L
 
L
E
 
H
S
 
S
G
 
E
H
 
Q
H
 
H
P
 
P
G
 
G
I
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
Q
 
N
V
|
V
A
 
S
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
|
T
I
 
I
T
 
H
G
 
A
L
 
L
H
 
H
V
 
V
L
 
L
E
 
E
A
 
S
G
 
G
G
 
G
F
 
F
R
 
R
G
 
S
L
 
L
I
 
L
M
 
I
S
 
N
A
 
A
V
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
S
T
 
C
S
 
I
R
 
R
S
 
T
Q
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
Q
T
 
S
V
 
M

8tcyA Structure of pycr1 complexed with 7-fluoro-2-oxo-1,2,3,4- tetrahydroquinoline-6-carboxylic acid (see paper)
47% identity, 95% coverage: 10:268/273 of query aligns to 13:278/281 of 8tcyA

query
sites
8tcyA
I
 
I
G
 
G
V
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
x
L
G
 
A
S
 
F
A
 
A
L
 
L
T
 
A
R
 
K
A
 
G
W
 
F
L
 
T
Q
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
I
 
L
E
 
A
P
 
A
A
 
H
S
 
K
I
 
I
C
 
M
L
 
A
A
 
S
-
 
S
-
 
P
D
 
D
A
 
M
D
 
D
T
 
L
E
 
A
R
 
T
L
 
V
R
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
R
A
 
-
E
 
K
L
 
M
G
 
G
V
 
V
Q
 
K
-
 
L
T
 
T
A
 
P
D
 
H
N
 
N
R
 
K
Q
 
E
A
 
T
V
 
V
A
 
Q
-
 
H
A
 
S
D
 
D
I
 
V
V
 
L
I
 
F
L
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
I
 
I
I
 
I
P
 
P
E
 
F
V
 
I
L
 
L
T
 
D
D
 
E
I
 
I
R
 
G
N
 
A
R
 
D
I
 
I
G
 
E
A
 
D
S
 
R
H
 
H
L
 
I
I
 
V
I
 
V
S
 
S
I
x
C
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
P
 
T
L
 
I
S
 
S
Y
 
S
L
 
I
E
 
E
E
 
K
M
 
K
L
 
L
-
 
S
-
 
A
-
 
F
-
 
R
P
 
P
R
 
A
A
 
P
R
 
R
L
 
V
L
 
I
R
 
R
V
 
C
M
|
M
P
x
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
L
 
V
L
 
V
I
 
V
R
 
R
A
 
E
G
 
G
V
 
A
A
 
T
A
 
V
I
 
Y
A
 
A
Q
 
T
G
 
G
T
 
T
R
 
H
A
 
A
T
 
Q
A
 
V
Q
 
E
D
 
D
L
 
G
D
 
R
L
 
L
A
 
M
R
 
E
K
 
Q
L
 
L
F
 
L
D
 
S
S
 
S
V
 
V
G
 
G
R
 
F
S
 
C
V
 
T
I
 
E
V
 
V
E
 
E
E
 
E
K
 
D
F
 
L
M
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
L
 
T
F
 
A
L
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
V
K
 
K
M
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
Q
 
R
T
 
L
A
 
A
L
 
V
L
 
R
L
 
L
A
 
G
A
 
A
Q
 
Q
T
 
A
I
 
L
L
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
A
A
 
K
L
 
M
F
 
L
L
 
L
E
 
H
S
 
S
G
 
E
H
 
Q
H
 
H
P
 
P
G
 
G
I
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
Q
 
N
V
 
V
A
 
S
S
 
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
I
 
I
T
 
H
G
 
A
L
 
L
H
 
H
V
 
V
L
 
L
E
 
E
A
 
S
G
 
G
G
 
G
F
 
F
R
 
R
G
 
S
L
 
L
I
 
L
M
 
I
S
 
N
A
 
A
V
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
S
T
 
C
S
 
I
R
 
R
S
 
T
Q
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
Q
T
 
S
V
 
M

5uavA Structure of human pycr-1 complexed with NADPH and l-tetrahydrofuroic acid (see paper)
47% identity, 96% coverage: 7:268/273 of query aligns to 7:275/278 of 5uavA

query
sites
5uavA
L
 
V
A
 
G
V
 
F
I
 
I
G
|
G
V
x
A
G
|
G
N
x
Q
M
x
L
G
 
A
S
 
F
A
 
A
L
 
L
T
 
A
R
 
K
A
 
G
W
 
F
L
 
T
Q
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
I
 
L
E
 
A
P
 
A
A
 
H
S
 
K
I
 
I
C
 
M
L
 
A
A
 
S
-
x
S
-
x
P
D
|
D
A
 
M
D
 
D
T
 
L
E
 
A
R
 
T
L
 
V
R
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
R
A
 
-
E
 
K
L
 
M
G
 
G
V
 
V
Q
 
K
-
 
L
T
 
T
A
 
P
D
 
H
N
|
N
R
 
K
Q
 
E
A
 
T
V
 
V
A
 
Q
-
 
H
A
 
S
D
 
D
I
 
V
V
 
L
I
 
F
L
 
L
A
|
A
V
|
V
K
|
K
P
 
P
Q
 
H
I
 
I
I
 
I
P
 
P
E
 
F
V
x
I
L
 
L
T
 
D
D
 
E
I
 
I
R
 
G
N
 
A
R
 
D
I
 
I
G
 
E
A
 
D
S
 
R
H
 
H
L
 
I
I
 
V
I
 
V
S
 
S
I
x
C
A
|
A
A
|
A
G
 
G
L
 
V
P
 
T
L
 
I
S
 
S
Y
 
S
L
 
I
E
 
E
E
 
K
M
 
K
L
 
L
-
 
S
-
 
A
-
 
F
-
 
R
P
 
P
R
 
A
A
 
P
R
 
R
L
 
V
L
 
I
R
 
R
V
 
C
M
|
M
P
x
T
N
 
N
T
|
T
P
 
P
L
 
V
L
 
V
I
 
V
R
 
R
A
 
E
G
 
G
V
 
A
A
 
T
A
 
V
I
 
Y
A
 
A
Q
 
T
G
 
G
T
 
T
R
 
H
A
 
A
T
 
Q
A
 
V
Q
 
E
D
 
D
L
 
G
D
 
R
L
 
L
A
 
M
R
 
E
K
 
Q
L
 
L
F
 
L
D
 
S
S
 
S
V
 
V
G
 
G
R
 
F
S
 
C
V
 
T
I
 
E
V
 
V
E
 
E
E
 
E
K
 
D
F
 
L
M
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
L
 
T
F
 
A
L
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
V
K
 
K
M
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
Q
 
R
T
 
L
A
 
A
L
 
V
L
 
R
L
 
L
A
 
G
A
 
A
Q
 
Q
T
 
A
I
 
L
L
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
A
A
 
K
L
 
M
F
 
L
L
 
L
E
 
H
S
 
S
G
 
E
H
 
Q
H
 
H
P
 
P
G
 
G
I
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
Q
 
N
V
 
V
A
 
S
S
 
S
P
 
P
G
 
G
G
|
G
T
x
A
T
|
T
I
 
I
T
 
H
G
 
A
L
 
L
H
 
H
V
 
V
L
 
L
E
 
E
A
 
S
G
 
G
G
 
G
F
 
F
R
 
R
G
 
S
L
 
L
I
 
L
M
 
I
S
 
N
A
 
A
V
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
S
T
 
C
S
 
I
R
 
R
S
 
T
Q
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
Q
T
 
S
V
 
M

8tdcA Structure of pycr1 complexed with nadh and 1,3-dithiane-2-carboxylic acid
47% identity, 95% coverage: 10:268/273 of query aligns to 7:272/276 of 8tdcA

query
sites
8tdcA
I
 
I
G
|
G
V
x
A
G
|
G
N
x
Q
M
x
L
G
 
A
S
 
F
A
 
A
L
 
L
T
 
A
R
 
K
A
 
G
W
 
F
L
 
T
Q
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
I
 
L
E
 
A
P
 
A
A
 
H
S
 
K
I
 
I
C
 
M
L
 
A
A
 
S
-
x
S
-
x
P
D
 
D
A
 
M
D
 
D
T
 
L
E
 
A
R
 
T
L
 
V
R
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
R
A
 
-
E
 
K
L
 
M
G
 
G
V
 
V
Q
 
K
-
 
L
T
 
T
A
 
P
D
 
H
N
|
N
R
 
K
Q
 
E
A
 
T
V
 
V
A
 
Q
-
 
H
A
 
S
D
 
D
I
 
V
V
 
L
I
 
F
L
 
L
A
|
A
V
|
V
K
|
K
P
 
P
Q
 
H
I
 
I
I
 
I
P
 
P
E
 
F
V
x
I
L
 
L
T
 
D
D
 
E
I
 
I
R
 
G
N
 
A
R
 
D
I
 
I
G
 
E
A
 
D
S
 
R
H
 
H
L
 
I
I
 
V
I
 
V
S
 
S
I
x
C
A
|
A
A
|
A
G
 
G
L
 
V
P
 
T
L
 
I
S
 
S
Y
 
S
L
 
I
E
 
E
E
 
K
M
 
K
L
 
L
-
 
S
-
 
A
-
 
F
-
 
R
P
 
P
R
 
A
A
 
P
R
 
R
L
 
V
L
 
I
R
 
R
V
 
C
M
|
M
P
x
T
N
 
N
T
|
T
P
 
P
L
 
V
L
 
V
I
 
V
R
 
R
A
 
E
G
 
G
V
 
A
A
 
T
A
 
V
I
 
Y
A
 
A
Q
 
T
G
 
G
T
 
T
R
 
H
A
 
A
T
 
Q
A
 
V
Q
 
E
D
 
D
L
 
G
D
 
R
L
 
L
A
 
M
R
 
E
K
 
Q
L
 
L
F
 
L
D
 
S
S
 
S
V
 
V
G
 
G
R
 
F
S
 
C
V
 
T
I
 
E
V
 
V
E
 
E
E
 
E
K
 
D
F
 
L
M
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
L
 
T
F
 
A
L
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
V
K
 
K
M
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
Q
 
R
T
 
L
A
 
A
L
 
V
L
 
R
L
 
L
A
 
G
A
 
A
Q
 
Q
T
 
A
I
 
L
L
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
A
A
 
K
L
 
M
F
 
L
L
 
L
E
 
H
S
 
S
G
 
E
H
 
Q
H
 
H
P
 
P
G
 
G
I
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
Q
 
N
V
|
V
A
 
S
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
|
G
T
x
A
T
|
T
I
 
I
T
 
H
G
 
A
L
 
L
H
 
H
V
 
V
L
 
L
E
 
E
A
 
S
G
 
G
G
 
G
F
 
F
R
 
R
G
 
S
L
 
L
I
 
L
M
 
I
S
 
N
A
 
A
V
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
S
T
 
C
S
 
I
R
 
R
S
 
T
Q
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
Q
T
 
S
V
 
M

8td8A Structure of pycr1 complexed with nadh and 2s-hydroxy-3,3- dimethylbutyric acid
47% identity, 95% coverage: 10:268/273 of query aligns to 7:272/276 of 8td8A

query
sites
8td8A
I
 
I
G
|
G
V
x
A
G
|
G
N
x
Q
M
x
L
G
 
A
S
 
F
A
 
A
L
 
L
T
 
A
R
 
K
A
 
G
W
 
F
L
 
T
Q
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
I
 
L
E
 
A
P
 
A
A
 
H
S
 
K
I
 
I
C
 
M
L
 
A
A
 
S
-
 
S
-
x
P
D
 
D
A
 
M
D
 
D
T
 
L
E
 
A
R
 
T
L
 
V
R
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
R
A
 
-
E
 
K
L
 
M
G
 
G
V
 
V
Q
 
K
-
 
L
T
 
T
A
 
P
D
 
H
N
|
N
R
 
K
Q
 
E
A
 
T
V
 
V
A
 
Q
-
 
H
A
 
S
D
 
D
I
 
V
V
 
L
I
 
F
L
 
L
A
|
A
V
|
V
K
|
K
P
 
P
Q
 
H
I
 
I
I
 
I
P
 
P
E
 
F
V
 
I
L
 
L
T
 
D
D
 
E
I
 
I
R
 
G
N
 
A
R
 
D
I
 
I
G
 
E
A
 
D
S
 
R
H
 
H
L
 
I
I
 
V
I
 
V
S
 
S
I
x
C
A
|
A
A
|
A
G
 
G
L
 
V
P
 
T
L
 
I
S
 
S
Y
 
S
L
 
I
E
 
E
E
 
K
M
 
K
L
 
L
-
 
S
-
 
A
-
 
F
-
 
R
P
 
P
R
 
A
A
 
P
R
 
R
L
 
V
L
 
I
R
 
R
V
 
C
M
|
M
P
x
T
N
 
N
T
|
T
P
 
P
L
 
V
L
 
V
I
 
V
R
 
R
A
 
E
G
 
G
V
 
A
A
 
T
A
 
V
I
 
Y
A
 
A
Q
 
T
G
 
G
T
 
T
R
 
H
A
 
A
T
 
Q
A
 
V
Q
 
E
D
 
D
L
 
G
D
 
R
L
 
L
A
 
M
R
 
E
K
 
Q
L
 
L
F
 
L
D
 
S
S
 
S
V
 
V
G
 
G
R
 
F
S
 
C
V
 
T
I
 
E
V
 
V
E
 
E
E
 
E
K
 
D
F
 
L
M
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
L
 
T
F
 
A
L
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
V
K
 
K
M
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
Q
 
R
T
 
L
A
 
A
L
 
V
L
 
R
L
 
L
A
 
G
A
 
A
Q
 
Q
T
 
A
I
 
L
L
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
A
A
 
K
L
 
M
F
 
L
L
 
L
E
 
H
S
 
S
G
 
E
H
 
Q
H
 
H
P
 
P
G
 
G
I
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
Q
 
N
V
|
V
A
 
S
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
|
T
I
 
I
T
 
H
G
 
A
L
 
L
H
 
H
V
 
V
L
 
L
E
 
E
A
 
S
G
 
G
G
 
G
F
 
F
R
 
R
G
 
S
L
 
L
I
 
L
M
 
I
S
 
N
A
 
A
V
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
S
T
 
C
S
 
I
R
 
R
S
 
T
Q
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
Q
T
 
S
V
 
M

8td2A Structure of pycr1 complexed with nadh and cyclobutane-1,1- dicarboxylic acid
47% identity, 95% coverage: 10:268/273 of query aligns to 7:272/276 of 8td2A

query
sites
8td2A
I
 
I
G
|
G
V
 
A
G
|
G
N
x
Q
M
x
L
G
 
A
S
 
F
A
 
A
L
 
L
T
 
A
R
 
K
A
 
G
W
 
F
L
 
T
Q
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
I
 
L
E
 
A
P
 
A
A
 
H
S
 
K
I
 
I
C
 
M
L
 
A
A
 
S
-
 
S
-
x
P
D
 
D
A
 
M
D
 
D
T
x
L
E
 
A
R
 
T
L
 
V
R
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
R
A
 
-
E
 
K
L
 
M
G
 
G
V
 
V
Q
 
K
-
 
L
T
 
T
A
 
P
D
 
H
N
|
N
R
 
K
Q
 
E
A
 
T
V
 
V
A
 
Q
-
 
H
A
 
S
D
 
D
I
 
V
V
 
L
I
 
F
L
 
L
A
|
A
V
|
V
K
 
K
P
|
P
Q
 
H
I
 
I
I
 
I
P
 
P
E
 
F
V
x
I
L
 
L
T
 
D
D
 
E
I
 
I
R
 
G
N
 
A
R
 
D
I
 
I
G
 
E
A
 
D
S
 
R
H
 
H
L
 
I
I
 
V
I
 
V
S
 
S
I
x
C
A
|
A
A
|
A
G
 
G
L
 
V
P
 
T
L
 
I
S
 
S
Y
 
S
L
 
I
E
 
E
E
 
K
M
 
K
L
 
L
-
 
S
-
 
A
-
 
F
-
 
R
P
 
P
R
 
A
A
 
P
R
 
R
L
 
V
L
 
I
R
 
R
V
 
C
M
|
M
P
x
T
N
 
N
T
|
T
P
 
P
L
 
V
L
 
V
I
 
V
R
 
R
A
 
E
G
 
G
V
 
A
A
 
T
A
 
V
I
 
Y
A
 
A
Q
 
T
G
 
G
T
 
T
R
 
H
A
 
A
T
 
Q
A
 
V
Q
 
E
D
 
D
L
 
G
D
 
R
L
 
L
A
 
M
R
 
E
K
 
Q
L
 
L
F
 
L
D
 
S
S
 
S
V
 
V
G
 
G
R
 
F
S
 
C
V
 
T
I
 
E
V
 
V
E
 
E
E
 
E
K
 
D
F
 
L
M
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
L
 
T
F
 
A
L
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
V
K
 
K
M
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
Q
 
R
T
 
L
A
 
A
L
 
V
L
 
R
L
 
L
A
 
G
A
 
A
Q
 
Q
T
 
A
I
 
L
L
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
A
A
 
K
L
 
M
F
 
L
L
 
L
E
 
H
S
 
S
G
 
E
H
 
Q
H
 
H
P
 
P
G
 
G
I
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
Q
 
N
V
|
V
A
 
S
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
x
A
T
|
T
I
 
I
T
 
H
G
 
A
L
 
L
H
 
H
V
 
V
L
 
L
E
 
E
A
 
S
G
 
G
G
 
G
F
 
F
R
 
R
G
 
S
L
 
L
I
 
L
M
 
I
S
 
N
A
 
A
V
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
S
T
 
C
S
 
I
R
 
R
S
 
T
Q
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
Q
T
 
S
V
 
M

8td7A Structure of pycr1 complexed with 2s-hydroxy-3-methylbutyric acid
47% identity, 95% coverage: 10:268/273 of query aligns to 13:278/282 of 8td7A

query
sites
8td7A
I
 
I
G
 
G
V
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
 
L
G
 
A
S
 
F
A
 
A
L
 
L
T
 
A
R
 
K
A
 
G
W
 
F
L
 
T
Q
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
I
 
L
E
 
A
P
 
A
A
 
H
S
 
K
I
 
I
C
 
M
L
 
A
A
 
S
-
 
S
-
 
P
D
 
D
A
 
M
D
 
D
T
 
L
E
 
A
R
 
T
L
 
V
R
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
R
A
 
-
E
 
K
L
 
M
G
 
G
V
 
V
Q
 
K
-
 
L
T
 
T
A
 
P
D
 
H
N
 
N
R
 
K
Q
 
E
A
 
T
V
 
V
A
 
Q
-
 
H
A
 
S
D
 
D
I
 
V
V
 
L
I
 
F
L
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
I
 
I
I
 
I
P
 
P
E
 
F
V
 
I
L
 
L
T
 
D
D
 
E
I
 
I
R
 
G
N
 
A
R
 
D
I
 
I
G
 
E
A
 
D
S
 
R
H
 
H
L
 
I
I
 
V
I
 
V
S
 
S
I
 
C
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
P
 
T
L
 
I
S
 
S
Y
 
S
L
 
I
E
 
E
E
 
K
M
 
K
L
 
L
-
 
S
-
 
A
-
 
F
-
 
R
P
 
P
R
 
A
A
 
P
R
 
R
L
 
V
L
 
I
R
 
R
V
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
L
 
V
L
 
V
I
 
V
R
 
R
A
 
E
G
 
G
V
 
A
A
 
T
A
 
V
I
 
Y
A
 
A
Q
 
T
G
 
G
T
 
T
R
 
H
A
 
A
T
 
Q
A
 
V
Q
 
E
D
 
D
L
 
G
D
 
R
L
 
L
A
 
M
R
 
E
K
 
Q
L
 
L
F
 
L
D
 
S
S
 
S
V
 
V
G
 
G
R
 
F
S
 
C
V
 
T
I
 
E
V
 
V
E
 
E
E
 
E
K
 
D
F
 
L
M
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
L
 
T
F
 
A
L
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
V
K
 
K
M
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
Q
 
R
T
 
L
A
 
A
L
 
V
L
 
R
L
 
L
A
 
G
A
 
A
Q
 
Q
T
 
A
I
 
L
L
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
A
A
 
K
L
 
M
F
 
L
L
 
L
E
 
H
S
 
S
G
 
E
H
 
Q
H
 
H
P
 
P
G
 
G
I
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
Q
 
N
V
 
V
A
 
S
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
|
T
I
 
I
T
 
H
G
 
A
L
 
L
H
 
H
V
 
V
L
 
L
E
 
E
A
 
S
G
 
G
G
 
G
F
 
F
R
 
R
G
 
S
L
 
L
I
 
L
M
 
I
S
 
N
A
 
A
V
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
S
T
 
C
S
 
I
R
 
R
S
 
T
Q
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
Q
T
 
S
V
 
M

8tcwA Structure of pycr1 complexed with 2-methyl-3-(2-oxoimidazolidin-1-yl) benzoic acid (see paper)
47% identity, 95% coverage: 10:268/273 of query aligns to 13:278/282 of 8tcwA

query
sites
8tcwA
I
 
I
G
 
G
V
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
 
L
G
 
A
S
 
F
A
 
A
L
 
L
T
 
A
R
 
K
A
 
G
W
 
F
L
 
T
Q
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
I
 
L
E
 
A
P
 
A
A
 
H
S
 
K
I
 
I
C
 
M
L
 
A
A
 
S
-
 
S
-
 
P
D
 
D
A
 
M
D
 
D
T
 
L
E
 
A
R
 
T
L
 
V
R
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
R
A
 
-
E
 
K
L
 
M
G
 
G
V
 
V
Q
 
K
-
 
L
T
 
T
A
 
P
D
 
H
N
 
N
R
 
K
Q
 
E
A
 
T
V
 
V
A
 
Q
-
 
H
A
 
S
D
 
D
I
 
V
V
 
L
I
 
F
L
 
L
A
 
A
V
|
V
K
 
K
P
|
P
Q
 
H
I
 
I
I
 
I
P
 
P
E
 
F
V
 
I
L
 
L
T
 
D
D
 
E
I
 
I
R
 
G
N
 
A
R
 
D
I
 
I
G
 
E
A
 
D
S
 
R
H
 
H
L
 
I
I
 
V
I
 
V
S
 
S
I
 
C
A
|
A
A
|
A
G
 
G
L
 
V
P
 
T
L
 
I
S
 
S
Y
 
S
L
 
I
E
 
E
E
 
K
M
 
K
L
 
L
-
 
S
-
 
A
-
 
F
-
 
R
P
 
P
R
 
A
A
 
P
R
 
R
L
 
V
L
 
I
R
 
R
V
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
L
 
V
L
 
V
I
 
V
R
 
R
A
 
E
G
 
G
V
 
A
A
 
T
A
 
V
I
 
Y
A
 
A
Q
 
T
G
 
G
T
 
T
R
 
H
A
 
A
T
 
Q
A
 
V
Q
 
E
D
 
D
L
 
G
D
 
R
L
 
L
A
 
M
R
 
E
K
 
Q
L
 
L
F
 
L
D
 
S
S
 
S
V
 
V
G
 
G
R
 
F
S
 
C
V
 
T
I
 
E
V
 
V
E
 
E
E
 
E
K
 
D
F
 
L
M
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
L
 
T
F
 
A
L
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
V
K
 
K
M
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
Q
 
R
T
 
L
A
 
A
L
 
V
L
 
R
L
 
L
A
 
G
A
 
A
Q
 
Q
T
 
A
I
 
L
L
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
A
A
 
K
L
 
M
F
 
L
L
 
L
E
 
H
S
 
S
G
 
E
H
 
Q
H
 
H
P
 
P
G
 
G
I
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
Q
 
N
V
 
V
A
 
S
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
|
G
T
x
A
T
|
T
I
 
I
T
 
H
G
 
A
L
 
L
H
 
H
V
 
V
L
 
L
E
 
E
A
 
S
G
 
G
G
 
G
F
 
F
R
 
R
G
 
S
L
 
L
I
 
L
M
 
I
S
 
N
A
 
A
V
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
S
T
 
C
S
 
I
R
 
R
S
 
T
Q
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
Q
T
 
S
V
 
M

6xp1A Structure of human pycr1 complexed with l-thiazolidine-2-carboxylate (see paper)
47% identity, 94% coverage: 12:268/273 of query aligns to 6:264/266 of 6xp1A

query
sites
6xp1A
V
 
I
G
 
G
N
 
Q
M
 
L
G
 
A
S
 
F
A
 
A
L
 
L
T
 
A
R
 
K
A
 
G
W
 
F
L
 
T
Q
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
I
 
L
E
 
A
P
 
A
A
 
H
S
 
K
I
 
I
C
 
M
L
 
A
A
 
S
D
 
L
A
 
A
D
 
T
T
 
V
E
 
S
R
 
A
L
 
L
R
 
R
A
 
K
L
 
M
A
 
G
A
 
V
E
 
K
L
 
L
G
 
-
V
 
-
Q
 
-
T
 
T
A
 
P
D
 
H
N
 
N
R
 
K
Q
 
E
A
 
T
V
 
V
A
 
Q
-
 
H
A
 
S
D
 
D
I
 
V
V
 
L
I
 
F
L
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
I
 
I
I
 
I
P
 
P
E
 
F
V
 
I
L
 
L
T
 
D
D
 
E
I
 
I
R
 
G
N
 
A
R
 
D
I
 
I
G
 
E
A
 
D
S
 
R
H
 
H
L
 
I
I
 
V
I
 
V
S
 
S
I
 
C
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
P
 
T
L
 
I
S
 
S
Y
 
S
L
 
I
E
 
E
E
 
K
M
 
K
L
 
L
-
 
S
-
 
A
-
 
F
-
 
R
P
 
P
R
 
A
A
 
P
R
 
R
L
 
V
L
 
I
R
 
R
V
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
L
 
V
L
 
V
I
 
V
R
 
R
A
 
E
G
 
G
V
 
A
A
 
T
A
 
V
I
 
Y
A
 
A
Q
 
T
G
 
G
T
 
T
R
 
H
A
 
A
T
 
Q
A
 
V
Q
 
E
D
 
D
L
 
G
D
 
R
L
 
L
A
 
M
R
 
E
K
 
Q
L
 
L
F
 
L
D
 
S
S
 
S
V
 
V
G
 
G
R
 
F
S
 
C
V
 
T
I
 
E
V
 
V
E
 
E
E
 
E
K
 
D
F
 
L
M
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
L
 
T
F
 
A
L
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
V
K
 
K
M
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
Q
 
R
T
 
L
A
 
A
L
 
V
L
 
R
L
 
L
A
 
G
A
 
A
Q
 
Q
T
 
A
I
 
L
L
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
A
A
 
K
L
 
M
F
 
L
L
 
L
E
 
H
S
 
S
G
 
E
H
 
Q
H
 
H
P
 
P
G
 
G
I
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
Q
 
N
V
 
V
A
 
S
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
|
T
I
 
I
T
 
H
G
 
A
L
 
L
H
 
H
V
 
V
L
 
L
E
 
E
A
 
S
G
 
G
G
 
G
F
 
F
R
 
R
G
 
S
L
 
L
I
 
L
M
 
I
S
 
N
A
 
A
V
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
S
T
 
C
S
 
I
R
 
R
S
 
T
Q
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
Q
T
 
S
V
 
M

8tddA Structure of pycr1 complexed with nadh and 2-(furan-2-yl)acetic acid
47% identity, 95% coverage: 10:268/273 of query aligns to 9:274/278 of 8tddA

query
sites
8tddA
I
 
I
G
|
G
V
x
A
G
|
G
N
x
Q
M
x
L
G
 
A
S
 
F
A
 
A
L
 
L
T
 
A
R
 
K
A
 
G
W
 
F
L
 
T
Q
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
I
 
L
E
 
A
P
 
A
A
 
H
S
 
K
I
 
I
C
 
M
L
 
A
A
 
S
-
x
S
-
x
P
D
 
D
A
 
M
D
 
D
T
 
L
E
 
A
R
 
T
L
 
V
R
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
R
A
 
-
E
 
K
L
 
M
G
 
G
V
 
V
Q
 
K
-
 
L
T
 
T
A
 
P
D
 
H
N
|
N
R
 
K
Q
 
E
A
 
T
V
 
V
A
 
Q
-
 
H
A
 
S
D
 
D
I
 
V
V
 
L
I
 
F
L
 
L
A
|
A
V
|
V
K
 
K
P
|
P
Q
 
H
I
 
I
I
 
I
P
 
P
E
 
F
V
x
I
L
 
L
T
 
D
D
 
E
I
 
I
R
 
G
N
 
A
R
 
D
I
 
I
G
 
E
A
 
D
S
 
R
H
 
H
L
 
I
I
 
V
I
 
V
S
 
S
I
x
C
A
|
A
A
|
A
G
 
G
L
 
V
P
 
T
L
 
I
S
 
S
Y
 
S
L
 
I
E
 
E
E
 
K
M
 
K
L
 
L
-
 
S
-
 
A
-
 
F
-
 
R
P
 
P
R
 
A
A
 
P
R
 
R
L
 
V
L
 
I
R
 
R
V
 
C
M
|
M
P
x
T
N
 
N
T
|
T
P
 
P
L
 
V
L
 
V
I
 
V
R
 
R
A
 
E
G
 
G
V
 
A
A
 
T
A
 
V
I
 
Y
A
 
A
Q
 
T
G
 
G
T
 
T
R
 
H
A
 
A
T
 
Q
A
 
V
Q
 
E
D
 
D
L
 
G
D
 
R
L
 
L
A
 
M
R
 
E
K
 
Q
L
 
L
F
 
L
D
 
S
S
 
S
V
 
V
G
 
G
R
 
F
S
 
C
V
 
T
I
 
E
V
 
V
E
 
E
E
 
E
K
 
D
F
 
L
M
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
|
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
|
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
L
 
T
F
 
A
L
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
V
K
 
K
M
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
Q
 
R
T
 
L
A
 
A
L
 
V
L
 
R
L
 
L
A
 
G
A
 
A
Q
 
Q
T
 
A
I
 
L
L
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
A
A
 
K
L
 
M
F
 
L
L
 
L
E
 
H
S
 
S
G
 
E
H
 
Q
H
 
H
P
 
P
G
 
G
I
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
Q
 
N
V
 
V
A
 
S
S
 
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
I
 
I
T
 
H
G
 
A
L
 
L
H
 
H
V
 
V
L
 
L
E
 
E
A
 
S
G
 
G
G
 
G
F
 
F
R
 
R
G
 
S
L
 
L
I
 
L
M
 
I
S
 
N
A
 
A
V
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
S
T
 
C
S
 
I
R
 
R
S
 
T
Q
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
Q
T
 
S
V
 
M

8td9A Structure of pycr1 complexed with nadh and l-pipecolic acid
47% identity, 96% coverage: 7:268/273 of query aligns to 7:275/279 of 8td9A

query
sites
8td9A
L
 
V
A
 
G
V
 
F
I
 
I
G
|
G
V
x
A
G
|
G
N
x
Q
M
x
L
G
 
A
S
 
F
A
 
A
L
 
L
T
 
A
R
 
K
A
 
G
W
 
F
L
 
T
Q
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
I
 
L
E
 
A
P
 
A
A
 
H
S
 
K
I
 
I
C
 
M
L
 
A
A
 
S
-
x
S
-
x
P
D
 
D
A
 
M
D
 
D
T
x
L
E
 
A
R
 
T
L
 
V
R
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
R
A
 
-
E
 
K
L
 
M
G
 
G
V
 
V
Q
 
K
-
 
L
T
 
T
A
 
P
D
 
H
N
|
N
R
 
K
Q
 
E
A
 
T
V
 
V
A
 
Q
-
 
H
A
 
S
D
 
D
I
 
V
V
 
L
I
 
F
L
 
L
A
|
A
V
|
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
I
 
I
I
 
I
P
 
P
E
 
F
V
x
I
L
 
L
T
 
D
D
 
E
I
 
I
R
 
G
N
 
A
R
 
D
I
 
I
G
 
E
A
 
D
S
 
R
H
 
H
L
 
I
I
 
V
I
 
V
S
 
S
I
x
C
A
|
A
A
|
A
G
 
G
L
 
V
P
 
T
L
 
I
S
 
S
Y
 
S
L
 
I
E
 
E
E
 
K
M
 
K
L
 
L
-
 
S
-
 
A
-
 
F
-
 
R
P
 
P
R
 
A
A
 
P
R
 
R
L
 
V
L
 
I
R
 
R
V
 
C
M
|
M
P
 
T
N
 
N
T
|
T
P
 
P
L
 
V
L
 
V
I
 
V
R
 
R
A
 
E
G
 
G
V
 
A
A
 
T
A
 
V
I
 
Y
A
 
A
Q
 
T
G
 
G
T
 
T
R
 
H
A
 
A
T
 
Q
A
 
V
Q
 
E
D
 
D
L
 
G
D
 
R
L
 
L
A
 
M
R
 
E
K
 
Q
L
 
L
F
 
L
D
 
S
S
 
S
V
 
V
G
 
G
R
 
F
S
 
C
V
 
T
I
 
E
V
 
V
E
 
E
E
 
E
K
 
D
F
 
L
M
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
|
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
L
 
T
F
 
A
L
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
V
K
 
K
M
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
Q
 
R
T
 
L
A
 
A
L
 
V
L
 
R
L
 
L
A
 
G
A
 
A
Q
 
Q
T
 
A
I
 
L
L
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
A
A
 
K
L
 
M
F
 
L
L
 
L
E
 
H
S
 
S
G
 
E
H
 
Q
H
 
H
P
 
P
G
 
G
I
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
Q
 
N
V
|
V
A
 
S
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
|
T
I
 
I
T
 
H
G
 
A
L
 
L
H
 
H
V
 
V
L
 
L
E
 
E
A
 
S
G
 
G
G
 
G
F
 
F
R
 
R
G
 
S
L
 
L
I
 
L
M
 
I
S
 
N
A
 
A
V
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
S
T
 
C
S
 
I
R
 
R
S
 
T
Q
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
Q
T
 
S
V
 
M

8td4A Structure of pycr1 complexed with nadh and 1,3-dithiolane-2-carboxylic acid
47% identity, 95% coverage: 10:268/273 of query aligns to 9:274/279 of 8td4A

query
sites
8td4A
I
 
I
G
|
G
V
x
A
G
|
G
N
x
Q
M
x
L
G
 
A
S
 
F
A
 
A
L
 
L
T
 
A
R
 
K
A
 
G
W
 
F
L
 
T
Q
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
I
 
L
E
 
A
P
 
A
A
 
H
S
 
K
I
 
I
C
 
M
L
 
A
A
 
S
-
x
S
-
x
P
D
 
D
A
 
M
D
 
D
T
x
L
E
 
A
R
 
T
L
 
V
R
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
R
A
 
-
E
 
K
L
 
M
G
 
G
V
 
V
Q
 
K
-
 
L
T
 
T
A
 
P
D
 
H
N
|
N
R
 
K
Q
 
E
A
 
T
V
 
V
A
 
Q
-
 
H
A
 
S
D
 
D
I
 
V
V
 
L
I
 
F
L
 
L
A
|
A
V
|
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
I
 
I
I
 
I
P
 
P
E
 
F
V
x
I
L
 
L
T
 
D
D
 
E
I
 
I
R
 
G
N
 
A
R
 
D
I
 
I
G
 
E
A
 
D
S
 
R
H
 
H
L
 
I
I
 
V
I
 
V
S
 
S
I
x
C
A
|
A
A
|
A
G
 
G
L
 
V
P
 
T
L
 
I
S
 
S
Y
 
S
L
 
I
E
 
E
E
 
K
M
 
K
L
 
L
-
 
S
-
 
A
-
 
F
-
 
R
P
 
P
R
 
A
A
 
P
R
 
R
L
 
V
L
 
I
R
 
R
V
 
C
M
|
M
P
x
T
N
 
N
T
|
T
P
 
P
L
 
V
L
 
V
I
 
V
R
 
R
A
 
E
G
 
G
V
 
A
A
 
T
A
 
V
I
 
Y
A
 
A
Q
 
T
G
 
G
T
 
T
R
 
H
A
 
A
T
 
Q
A
 
V
Q
 
E
D
 
D
L
 
G
D
 
R
L
 
L
A
 
M
R
 
E
K
 
Q
L
 
L
F
 
L
D
 
S
S
 
S
V
 
V
G
 
G
R
 
F
S
 
C
V
 
T
I
 
E
V
 
V
E
 
E
E
 
E
K
 
D
F
 
L
M
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
L
 
T
F
 
A
L
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
V
K
 
K
M
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
Q
 
R
T
 
L
A
 
A
L
 
V
L
 
R
L
 
L
A
 
G
A
 
A
Q
 
Q
T
 
A
I
 
L
L
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
A
A
 
K
L
 
M
F
 
L
L
 
L
E
 
H
S
 
S
G
 
E
H
 
Q
H
 
H
P
 
P
G
 
G
I
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
Q
 
N
V
|
V
A
 
S
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
x
A
T
|
T
I
 
I
T
 
H
G
 
A
L
 
L
H
 
H
V
 
V
L
 
L
E
 
E
A
 
S
G
 
G
G
 
G
F
 
F
R
 
R
G
 
S
L
 
L
I
 
L
M
 
I
S
 
N
A
 
A
V
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
S
T
 
C
S
 
I
R
 
R
S
 
T
Q
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
Q
T
 
S
V
 
M

Query Sequence

>WP_013707094.1 NCBI__GCF_000195295.1:WP_013707094.1
MSIEKKLAVIGVGNMGSALTRAWLQAGLIEPASICLADADTERLRALAAELGVQTADNRQ
AVAADIVILAVKPQIIPEVLTDIRNRIGASHLIISIAAGLPLSYLEEMLPRARLLRVMPN
TPLLIRAGVAAIAQGTRATAQDLDLARKLFDSVGRSVIVEEKFMDAVTGLSGSGPAYVFL
FLEALADGGVKMGLPRQTALLLAAQTILGSAALFLESGHHPGILKDQVASPGGTTITGLH
VLEAGGFRGLIMSAVEAATSRSQELATVRPTRP

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory