SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_013707330.1 NCBI__GCF_000195295.1:WP_013707330.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1ef9A The crystal structure of methylmalonyl coa decarboxylase complexed with 2s-carboxypropyl coa (see paper)
51% identity, 97% coverage: 10:259/259 of query aligns to 12:261/261 of 1ef9A

query
sites
1ef9A
N
 
N
A
 
K
I
 
V
G
 
A
I
 
V
I
 
I
T
 
E
F
 
F
D
 
-
N
 
N
Y
 
Y
D
 
G
R
 
R
R
 
K
-
 
L
N
 
N
A
 
A
L
 
L
S
 
S
K
 
K
A
 
V
F
 
F
I
 
I
A
 
D
D
 
D
I
 
L
M
 
M
T
 
Q
A
 
A
M
 
L
N
 
S
S
 
D
L
 
L
L
 
N
Y
 
R
E
 
P
E
 
E
V
 
I
R
 
R
V
 
C
I
 
I
I
 
I
F
 
L
R
 
R
A
 
A
H
 
P
P
 
S
G
 
G
A
 
S
K
 
K
V
 
V
W
 
F
S
 
S
A
|
A
G
 
G
H
|
H
D
|
D
I
|
I
M
x
H
E
 
E
L
|
L
E
 
P
R
 
S
P
 
G
G
 
G
R
 
R
D
 
D
P
 
P
L
 
L
G
 
S
Y
 
Y
Y
x
D
D
 
D
P
 
P
L
 
L
E
x
R
K
 
Q
I
 
I
I
 
T
R
 
R
A
 
M
I
 
I
Q
 
Q
N
 
K
C
 
F
P
 
P
T
 
K
P
 
P
V
 
I
I
 
I
A
 
S
L
 
M
I
 
V
E
 
E
G
 
G
G
 
S
V
 
V
W
|
W
G
 
G
G
|
G
A
 
A
C
 
F
E
|
E
L
 
M
A
 
I
C
 
M
I
 
S
C
 
S
D
 
D
I
 
L
L
 
I
I
 
I
G
 
A
G
 
A
P
 
S
N
 
T
A
 
S
S
 
T
F
 
F
T
 
S
I
 
M
T
|
T
P
|
P
S
 
V
R
 
N
F
 
L
G
 
G
I
x
V
P
 
P
Y
|
Y
N
|
N
P
 
L
S
 
V
G
 
G
I
 
I
L
 
H
H
 
N
L
 
L
I
 
T
N
 
R
R
 
D
C
 
A
G
 
G
L
 
F
G
 
H
A
 
I
A
 
V
K
 
K
E
 
E
M
 
L
F
 
I
F
 
F
T
 
T
A
 
A
Q
 
S
S
 
P
V
 
I
N
 
T
A
 
A
E
 
Q
R
 
R
A
 
A
L
 
L
R
 
A
L
 
V
G
 
G
I
 
I
L
 
L
N
 
N
H
 
H
L
 
V
V
 
V
A
 
E
A
 
V
T
 
E
E
 
E
L
 
L
E
 
E
D
 
D
F
 
F
T
 
T
Y
 
L
D
 
Q
L
 
M
A
 
A
G
 
H
A
 
H
I
 
I
A
 
S
R
 
E
N
 
K
S
 
A
P
 
P
L
 
L
S
 
A
V
 
I
S
 
A
V
 
V
I
 
I
K
 
K
E
 
E
Q
 
E
L
 
L
R
 
R
I
 
V
F
 
L
S
 
G
N
 
E
A
 
A
L
 
H
A
 
T
L
 
M
N
 
N
P
 
S
E
 
D
T
 
E
F
 
F
E
|
E
R
 
R
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
L
 
M
R
 
R
R
 
R
L
 
A
V
 
V
W
x
Y
D
 
D
S
 
S
E
 
E
D
 
D
Y
 
Y
I
 
Q
E
 
E
G
 
G
K
 
M
K
 
N
A
 
A
F
 
F
L
 
L
E
 
E
K
|
K
R
 
R
A
 
K
P
 
P
I
 
N
F
 
F
K
 
V
G
 
G
E
 
H

P52045 Methylmalonyl-CoA decarboxylase; MMCD; Transcarboxylase; EC 4.1.1.- from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
51% identity, 97% coverage: 10:259/259 of query aligns to 12:261/261 of P52045

query
sites
P52045
N
 
N
A
 
K
I
 
V
G
 
A
I
 
V
I
 
I
T
 
E
F
 
F
D
 
-
N
 
N
Y
 
Y
D
 
G
R
 
R
R
 
K
-
 
L
N
 
N
A
 
A
L
 
L
S
 
S
K
 
K
A
 
V
F
 
F
I
 
I
A
 
D
D
 
D
I
 
L
M
 
M
T
 
Q
A
 
A
M
 
L
N
 
S
S
 
D
L
 
L
L
 
N
Y
 
R
E
 
P
E
 
E
V
 
I
R
 
R
V
 
C
I
 
I
I
 
I
F
 
L
R
 
R
A
 
A
H
 
P
P
 
S
G
 
G
A
 
S
K
 
K
V
 
V
W
 
F
S
 
S
A
 
A
G
 
G
H
 
H
D
 
D
I
 
I
M
 
H
E
 
E
L
 
L
E
 
P
R
 
S
P
 
G
G
 
G
R
 
R
D
 
D
P
 
P
L
 
L
G
 
S
Y
 
Y
Y
 
D
D
 
D
P
 
P
L
 
L
E
 
R
K
 
Q
I
 
I
I
 
T
R
 
R
A
 
M
I
 
I
Q
 
Q
N
 
K
C
 
F
P
 
P
T
 
K
P
 
P
V
 
I
I
 
I
A
 
S
L
 
M
I
 
V
E
 
E
G
 
G
G
 
S
V
 
V
W
 
W
G
 
G
G
|
G
A
 
A
C
 
F
E
 
E
L
 
M
A
 
I
C
 
M
I
 
S
C
 
S
D
 
D
I
 
L
L
 
I
I
 
I
G
 
A
G
 
A
P
 
S
N
 
T
A
 
S
S
 
T
F
 
F
T
 
S
I
 
M
T
|
T
P
 
P
S
 
V
R
 
N
F
 
L
G
 
G
I
 
V
P
 
P
Y
 
Y
N
 
N
P
 
L
S
 
V
G
 
G
I
 
I
L
 
H
H
 
N
L
 
L
I
 
T
N
 
R
R
 
D
C
 
A
G
 
G
L
 
F
G
 
H
A
 
I
A
 
V
K
 
K
E
 
E
M
 
L
F
 
I
F
 
F
T
 
T
A
 
A
Q
 
S
S
 
P
V
 
I
N
 
T
A
 
A
E
 
Q
R
 
R
A
 
A
L
 
L
R
 
A
L
 
V
G
 
G
I
 
I
L
 
L
N
 
N
H
 
H
L
 
V
V
 
V
A
 
E
A
 
V
T
 
E
E
 
E
L
 
L
E
 
E
D
 
D
F
 
F
T
 
T
Y
 
L
D
 
Q
L
 
M
A
 
A
G
 
H
A
 
H
I
 
I
A
 
S
R
 
E
N
 
K
S
 
A
P
 
P
L
 
L
S
 
A
V
 
I
S
 
A
V
 
V
I
 
I
K
 
K
E
 
E
Q
 
E
L
 
L
R
 
R
I
 
V
F
 
L
S
 
G
N
 
E
A
 
A
L
 
H
A
 
T
L
 
M
N
 
N
P
 
S
E
 
D
T
 
E
F
 
F
E
 
E
R
 
R
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
L
 
M
R
 
R
R
 
R
L
 
A
V
 
V
W
 
Y
D
 
D
S
 
S
E
 
E
D
 
D
Y
 
Y
I
 
Q
E
 
E
G
 
G
K
 
M
K
 
N
A
 
A
F
 
F
L
 
L
E
 
E
K
|
K
R
 
R
A
 
K
P
 
P
I
 
N
F
 
F
K
 
V
G
 
G
E
 
H

6n97A Methylmalonyl-coa decarboxylase in complex with 2-sulfonate-propionyl- amino(dethia)-coa (see paper)
51% identity, 97% coverage: 10:259/259 of query aligns to 11:260/260 of 6n97A

query
sites
6n97A
N
 
N
A
 
K
I
 
V
G
 
A
I
 
V
I
 
I
T
 
E
F
 
F
D
 
-
N
 
N
Y
 
Y
D
 
G
R
 
R
R
 
K
-
x
L
N
 
N
A
 
A
L
 
L
S
 
S
K
 
K
A
 
V
F
 
F
I
 
I
A
 
D
D
 
D
I
 
L
M
 
M
T
 
Q
A
 
A
M
 
L
N
 
S
S
 
D
L
 
L
L
 
N
Y
 
R
E
 
P
E
 
E
V
 
I
R
 
R
V
 
C
I
 
I
I
 
I
F
 
L
R
 
R
A
 
A
H
 
P
P
 
S
G
 
G
A
 
S
K
|
K
V
 
V
W
 
F
S
 
S
A
|
A
G
 
G
H
|
H
D
|
D
I
|
I
M
 
H
E
 
E
L
|
L
E
 
P
R
 
S
P
 
G
G
 
G
R
 
R
D
 
D
P
 
P
L
 
L
G
 
S
Y
 
Y
Y
 
D
D
 
D
P
 
P
L
 
L
E
 
R
K
 
Q
I
 
I
I
 
T
R
 
R
A
 
M
I
 
I
Q
 
Q
N
 
K
C
 
F
P
 
P
T
 
K
P
 
P
V
 
I
I
 
I
A
 
S
L
 
M
I
 
V
E
 
E
G
 
G
G
 
S
V
 
V
W
|
W
G
|
G
G
|
G
A
 
A
C
 
F
E
|
E
L
 
M
A
 
I
C
 
M
I
 
S
C
 
S
D
 
D
I
 
L
L
 
I
I
 
I
G
 
A
G
 
A
P
 
S
N
 
T
A
 
S
S
 
T
F
 
F
T
 
S
I
 
M
T
|
T
P
|
P
S
 
V
R
 
N
F
x
L
G
 
G
I
x
V
P
 
P
Y
|
Y
N
 
N
P
 
L
S
 
V
G
 
G
I
 
I
L
 
H
H
 
N
L
 
L
I
 
T
N
 
R
R
 
D
C
 
A
G
 
G
L
 
F
G
 
H
A
 
I
A
 
V
K
 
K
E
 
E
M
 
L
F
 
I
F
 
F
T
 
T
A
 
A
Q
 
S
S
 
P
V
 
I
N
 
T
A
 
A
E
 
Q
R
 
R
A
 
A
L
 
L
R
 
A
L
 
V
G
 
G
I
 
I
L
 
L
N
 
N
H
 
H
L
 
V
V
 
V
A
 
E
A
 
V
T
 
E
E
 
E
L
 
L
E
 
E
D
 
D
F
 
F
T
 
T
Y
 
L
D
 
Q
L
 
M
A
 
A
G
 
H
A
 
H
I
 
I
A
 
S
R
 
E
N
 
K
S
 
A
P
 
P
L
 
L
S
 
A
V
 
I
S
 
A
V
 
V
I
 
I
K
 
K
E
 
E
Q
 
E
L
 
L
R
 
R
I
 
V
F
 
L
S
 
G
N
 
E
A
 
A
L
 
H
A
 
T
L
 
M
N
 
N
P
 
S
E
 
D
T
 
E
F
 
F
E
|
E
R
 
R
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
L
 
M
R
 
R
R
 
R
L
 
A
V
 
V
W
x
Y
D
 
D
S
 
S
E
 
E
D
 
D
Y
 
Y
I
 
Q
E
 
E
G
 
G
K
 
M
K
 
N
A
 
A
F
|
F
L
 
L
E
 
E
K
|
K
R
 
R
A
 
K
P
 
P
I
 
N
F
 
F
K
 
V
G
 
G
E
 
H

6n96A Methylmalonyl-coa decarboxylase in complex with 2-sulfonate-propionyl- oxa(dethia)-coa (see paper)
51% identity, 97% coverage: 10:259/259 of query aligns to 11:260/260 of 6n96A

query
sites
6n96A
N
 
N
A
 
K
I
 
V
G
 
A
I
 
V
I
 
I
T
 
E
F
 
F
D
 
-
N
 
N
Y
 
Y
D
 
G
R
 
R
R
 
K
-
 
L
N
 
N
A
 
A
L
 
L
S
 
S
K
 
K
A
 
V
F
 
F
I
 
I
A
 
D
D
 
D
I
 
L
M
 
M
T
 
Q
A
 
A
M
 
L
N
 
S
S
 
D
L
 
L
L
 
N
Y
 
R
E
 
P
E
 
E
V
 
I
R
 
R
V
 
C
I
 
I
I
 
I
F
 
L
R
 
R
A
 
A
H
 
P
P
 
S
G
 
G
A
 
S
K
|
K
V
 
V
W
 
F
S
 
S
A
|
A
G
 
G
H
|
H
D
|
D
I
|
I
M
x
H
E
 
E
L
|
L
E
 
P
R
 
S
P
 
G
G
 
G
R
 
R
D
 
D
P
 
P
L
 
L
G
 
S
Y
 
Y
Y
 
D
D
 
D
P
 
P
L
 
L
E
 
R
K
 
Q
I
 
I
I
 
T
R
 
R
A
 
M
I
 
I
Q
 
Q
N
 
K
C
 
F
P
 
P
T
 
K
P
 
P
V
 
I
I
 
I
A
 
S
L
 
M
I
 
V
E
 
E
G
 
G
G
 
S
V
 
V
W
|
W
G
|
G
G
|
G
A
 
A
C
 
F
E
|
E
L
 
M
A
 
I
C
 
M
I
 
S
C
 
S
D
 
D
I
 
L
L
 
I
I
 
I
G
 
A
G
 
A
P
 
S
N
 
T
A
 
S
S
 
T
F
 
F
T
 
S
I
 
M
T
|
T
P
|
P
S
 
V
R
 
N
F
x
L
G
 
G
I
x
V
P
 
P
Y
|
Y
N
 
N
P
 
L
S
 
V
G
 
G
I
 
I
L
 
H
H
 
N
L
 
L
I
 
T
N
 
R
R
 
D
C
 
A
G
 
G
L
 
F
G
 
H
A
 
I
A
 
V
K
 
K
E
 
E
M
 
L
F
 
I
F
 
F
T
 
T
A
 
A
Q
 
S
S
 
P
V
 
I
N
 
T
A
 
A
E
 
Q
R
 
R
A
 
A
L
 
L
R
 
A
L
 
V
G
 
G
I
 
I
L
 
L
N
 
N
H
 
H
L
 
V
V
 
V
A
 
E
A
 
V
T
 
E
E
 
E
L
 
L
E
 
E
D
 
D
F
 
F
T
 
T
Y
 
L
D
 
Q
L
 
M
A
 
A
G
 
H
A
 
H
I
 
I
A
 
S
R
 
E
N
 
K
S
 
A
P
 
P
L
 
L
S
 
A
V
 
I
S
 
A
V
 
V
I
 
I
K
 
K
E
 
E
Q
 
E
L
 
L
R
 
R
I
 
V
F
 
L
S
 
G
N
 
E
A
 
A
L
 
H
A
 
T
L
 
M
N
 
N
P
 
S
E
 
D
T
 
E
F
 
F
E
|
E
R
 
R
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
L
 
M
R
 
R
R
 
R
L
 
A
V
 
V
W
x
Y
D
 
D
S
 
S
E
 
E
D
 
D
Y
 
Y
I
 
Q
E
 
E
G
 
G
K
 
M
K
 
N
A
 
A
F
|
F
L
 
L
E
 
E
K
|
K
R
 
R
A
 
K
P
 
P
I
 
N
F
 
F
K
 
V
G
 
G
E
 
H

6n95A Methylmalonyl-coa decarboxylase in complex with 2-sulfonate-propionyl- coa (see paper)
51% identity, 97% coverage: 10:259/259 of query aligns to 11:260/260 of 6n95A

query
sites
6n95A
N
 
N
A
 
K
I
 
V
G
 
A
I
 
V
I
 
I
T
 
E
F
 
F
D
 
-
N
 
N
Y
 
Y
D
 
G
R
 
R
R
x
K
-
x
L
N
 
N
A
 
A
L
 
L
S
 
S
K
 
K
A
 
V
F
 
F
I
 
I
A
 
D
D
 
D
I
 
L
M
 
M
T
 
Q
A
 
A
M
 
L
N
 
S
S
 
D
L
 
L
L
 
N
Y
 
R
E
 
P
E
 
E
V
 
I
R
 
R
V
 
C
I
 
I
I
 
I
F
 
L
R
 
R
A
 
A
H
 
P
P
 
S
G
 
G
A
 
S
K
|
K
V
 
V
W
 
F
S
 
S
A
|
A
G
 
G
H
|
H
D
|
D
I
|
I
M
x
H
E
 
E
L
|
L
E
 
P
R
 
S
P
 
G
G
 
G
R
 
R
D
 
D
P
 
P
L
 
L
G
 
S
Y
 
Y
Y
 
D
D
 
D
P
 
P
L
 
L
E
 
R
K
 
Q
I
 
I
I
 
T
R
 
R
A
 
M
I
 
I
Q
 
Q
N
 
K
C
 
F
P
 
P
T
 
K
P
 
P
V
 
I
I
 
I
A
 
S
L
 
M
I
 
V
E
 
E
G
 
G
G
 
S
V
 
V
W
|
W
G
|
G
G
|
G
A
 
A
C
 
F
E
|
E
L
 
M
A
 
I
C
 
M
I
 
S
C
 
S
D
 
D
I
 
L
L
 
I
I
 
I
G
 
A
G
 
A
P
 
S
N
 
T
A
 
S
S
 
T
F
 
F
T
 
S
I
 
M
T
|
T
P
|
P
S
 
V
R
 
N
F
x
L
G
 
G
I
x
V
P
 
P
Y
|
Y
N
 
N
P
 
L
S
 
V
G
 
G
I
 
I
L
 
H
H
 
N
L
 
L
I
 
T
N
 
R
R
 
D
C
 
A
G
 
G
L
 
F
G
 
H
A
 
I
A
 
V
K
 
K
E
 
E
M
 
L
F
 
I
F
 
F
T
 
T
A
 
A
Q
 
S
S
 
P
V
 
I
N
 
T
A
 
A
E
 
Q
R
 
R
A
 
A
L
 
L
R
 
A
L
 
V
G
 
G
I
 
I
L
 
L
N
 
N
H
 
H
L
 
V
V
 
V
A
 
E
A
 
V
T
 
E
E
 
E
L
 
L
E
 
E
D
 
D
F
 
F
T
 
T
Y
 
L
D
 
Q
L
 
M
A
 
A
G
 
H
A
 
H
I
 
I
A
 
S
R
 
E
N
 
K
S
 
A
P
 
P
L
 
L
S
 
A
V
 
I
S
 
A
V
 
V
I
 
I
K
 
K
E
 
E
Q
 
E
L
 
L
R
 
R
I
 
V
F
 
L
S
 
G
N
 
E
A
 
A
L
 
H
A
 
T
L
 
M
N
 
N
P
 
S
E
 
D
T
 
E
F
 
F
E
|
E
R
 
R
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
L
 
M
R
 
R
R
 
R
L
 
A
V
 
V
W
x
Y
D
 
D
S
 
S
E
 
E
D
 
D
Y
 
Y
I
 
Q
E
 
E
G
 
G
K
 
M
K
 
N
A
 
A
F
|
F
L
 
L
E
 
E
K
|
K
R
 
R
A
 
K
P
 
P
I
 
N
F
 
F
K
 
V
G
 
G
E
 
H

6n94A Methylmalonyl-coa decarboxylase in complex with 2-nitronate-propionyl- amino(dethia)-coa (see paper)
51% identity, 97% coverage: 10:259/259 of query aligns to 11:260/260 of 6n94A

query
sites
6n94A
N
 
N
A
 
K
I
 
V
G
 
A
I
 
V
I
 
I
T
 
E
F
 
F
D
 
-
N
 
N
Y
 
Y
D
 
G
R
 
R
R
x
K
-
x
L
N
 
N
A
 
A
L
 
L
S
 
S
K
 
K
A
 
V
F
 
F
I
 
I
A
 
D
D
 
D
I
 
L
M
 
M
T
 
Q
A
 
A
M
 
L
N
 
S
S
 
D
L
 
L
L
 
N
Y
 
R
E
 
P
E
 
E
V
 
I
R
 
R
V
 
C
I
 
I
I
 
I
F
 
L
R
 
R
A
 
A
H
 
P
P
 
S
G
 
G
A
 
S
K
 
K
V
 
V
W
 
F
S
 
S
A
|
A
G
 
G
H
|
H
D
|
D
I
|
I
M
x
H
E
 
E
L
|
L
E
 
P
R
 
S
P
 
G
G
 
G
R
 
R
D
 
D
P
 
P
L
 
L
G
 
S
Y
 
Y
Y
 
D
D
 
D
P
 
P
L
 
L
E
 
R
K
 
Q
I
 
I
I
 
T
R
 
R
A
 
M
I
 
I
Q
 
Q
N
 
K
C
 
F
P
 
P
T
 
K
P
 
P
V
 
I
I
 
I
A
 
S
L
 
M
I
 
V
E
 
E
G
 
G
G
 
S
V
 
V
W
|
W
G
|
G
G
|
G
A
 
A
C
 
F
E
|
E
L
 
M
A
 
I
C
 
M
I
 
S
C
 
S
D
 
D
I
 
L
L
 
I
I
 
I
G
 
A
G
 
A
P
 
S
N
 
T
A
 
S
S
 
T
F
 
F
T
 
S
I
 
M
T
|
T
P
|
P
S
 
V
R
 
N
F
 
L
G
 
G
I
x
V
P
 
P
Y
|
Y
N
 
N
P
 
L
S
 
V
G
 
G
I
 
I
L
 
H
H
 
N
L
 
L
I
 
T
N
 
R
R
 
D
C
 
A
G
 
G
L
 
F
G
 
H
A
 
I
A
 
V
K
 
K
E
 
E
M
 
L
F
 
I
F
 
F
T
 
T
A
 
A
Q
 
S
S
 
P
V
 
I
N
 
T
A
 
A
E
 
Q
R
 
R
A
 
A
L
 
L
R
 
A
L
 
V
G
 
G
I
 
I
L
 
L
N
 
N
H
 
H
L
 
V
V
 
V
A
 
E
A
 
V
T
 
E
E
 
E
L
 
L
E
 
E
D
 
D
F
 
F
T
 
T
Y
 
L
D
 
Q
L
 
M
A
 
A
G
 
H
A
 
H
I
 
I
A
 
S
R
 
E
N
 
K
S
 
A
P
 
P
L
 
L
S
 
A
V
 
I
S
 
A
V
 
V
I
 
I
K
 
K
E
 
E
Q
 
E
L
 
L
R
 
R
I
 
V
F
 
L
S
 
G
N
 
E
A
 
A
L
 
H
A
 
T
L
 
M
N
 
N
P
 
S
E
 
D
T
 
E
F
 
F
E
|
E
R
 
R
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
L
 
M
R
 
R
R
 
R
L
 
A
V
 
V
W
x
Y
D
 
D
S
 
S
E
 
E
D
 
D
Y
 
Y
I
 
Q
E
 
E
G
 
G
K
 
M
K
 
N
A
 
A
F
 
F
L
 
L
E
 
E
K
 
K
R
 
R
A
 
K
P
 
P
I
 
N
F
 
F
K
 
V
G
 
G
E
 
H

6n93A Methylmalonyl-coa decarboxylase in complex with 2-nitronate-propionyl- oxa(dethia)-coa (see paper)
51% identity, 97% coverage: 10:259/259 of query aligns to 11:260/260 of 6n93A

query
sites
6n93A
N
 
N
A
 
K
I
 
V
G
 
A
I
 
V
I
 
I
T
 
E
F
 
F
D
 
-
N
 
N
Y
 
Y
D
 
G
R
 
R
R
 
K
-
x
L
N
 
N
A
 
A
L
 
L
S
 
S
K
 
K
A
 
V
F
 
F
I
 
I
A
 
D
D
 
D
I
 
L
M
 
M
T
 
Q
A
 
A
M
 
L
N
 
S
S
 
D
L
 
L
L
 
N
Y
 
R
E
 
P
E
 
E
V
 
I
R
 
R
V
 
C
I
 
I
I
 
I
F
 
L
R
 
R
A
 
A
H
 
P
P
 
S
G
 
G
A
 
S
K
 
K
V
 
V
W
 
F
S
 
S
A
|
A
G
 
G
H
|
H
D
|
D
I
|
I
M
x
H
E
 
E
L
|
L
E
 
P
R
 
S
P
 
G
G
 
G
R
 
R
D
 
D
P
 
P
L
 
L
G
 
S
Y
 
Y
Y
 
D
D
 
D
P
 
P
L
 
L
E
 
R
K
 
Q
I
 
I
I
 
T
R
 
R
A
 
M
I
 
I
Q
 
Q
N
 
K
C
 
F
P
 
P
T
 
K
P
 
P
V
 
I
I
 
I
A
 
S
L
 
M
I
 
V
E
 
E
G
 
G
G
 
S
V
 
V
W
|
W
G
 
G
G
|
G
A
 
A
C
 
F
E
|
E
L
 
M
A
 
I
C
 
M
I
 
S
C
 
S
D
 
D
I
 
L
L
 
I
I
 
I
G
 
A
G
 
A
P
 
S
N
 
T
A
 
S
S
 
T
F
 
F
T
 
S
I
 
M
T
|
T
P
|
P
S
 
V
R
 
N
F
x
L
G
 
G
I
x
V
P
 
P
Y
|
Y
N
 
N
P
 
L
S
 
V
G
 
G
I
 
I
L
 
H
H
 
N
L
 
L
I
 
T
N
 
R
R
 
D
C
 
A
G
 
G
L
 
F
G
 
H
A
 
I
A
 
V
K
 
K
E
 
E
M
 
L
F
 
I
F
 
F
T
 
T
A
 
A
Q
 
S
S
 
P
V
 
I
N
 
T
A
 
A
E
 
Q
R
 
R
A
 
A
L
 
L
R
 
A
L
 
V
G
 
G
I
 
I
L
 
L
N
 
N
H
 
H
L
 
V
V
 
V
A
 
E
A
 
V
T
 
E
E
 
E
L
 
L
E
 
E
D
 
D
F
 
F
T
 
T
Y
 
L
D
 
Q
L
 
M
A
 
A
G
 
H
A
 
H
I
 
I
A
 
S
R
 
E
N
 
K
S
 
A
P
 
P
L
 
L
S
 
A
V
 
I
S
 
A
V
 
V
I
 
I
K
 
K
E
 
E
Q
 
E
L
 
L
R
 
R
I
 
V
F
 
L
S
 
G
N
 
E
A
 
A
L
 
H
A
 
T
L
 
M
N
 
N
P
 
S
E
 
D
T
 
E
F
 
F
E
|
E
R
 
R
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
L
 
M
R
 
R
R
 
R
L
 
A
V
 
V
W
x
Y
D
 
D
S
 
S
E
 
E
D
 
D
Y
 
Y
I
 
Q
E
 
E
G
 
G
K
 
M
K
 
N
A
 
A
F
|
F
L
 
L
E
 
E
K
|
K
R
 
R
A
 
K
P
 
P
I
 
N
F
 
F
K
 
V
G
 
G
E
 
H

6n92F Methylmalonyl-coa decarboxylase in complex with 2-nitronate-propionyl- coa (see paper)
51% identity, 97% coverage: 10:259/259 of query aligns to 11:260/260 of 6n92F

query
sites
6n92F
N
 
N
A
 
K
I
 
V
G
 
A
I
 
V
I
 
I
T
 
E
F
 
F
D
 
-
N
 
N
Y
 
Y
D
 
G
R
|
R
R
x
K
-
x
L
N
 
N
A
 
A
L
 
L
S
 
S
K
 
K
A
 
V
F
 
F
I
 
I
A
 
D
D
 
D
I
 
L
M
 
M
T
 
Q
A
 
A
M
 
L
N
 
S
S
 
D
L
 
L
L
 
N
Y
 
R
E
 
P
E
 
E
V
 
I
R
 
R
V
 
C
I
 
I
I
 
I
F
 
L
R
 
R
A
 
A
H
 
P
P
 
S
G
 
G
A
 
S
K
 
K
V
 
V
W
 
F
S
 
S
A
|
A
G
 
G
H
|
H
D
|
D
I
 
I
M
 
H
E
 
E
L
|
L
E
 
P
R
 
S
P
 
G
G
 
G
R
 
R
D
 
D
P
 
P
L
 
L
G
 
S
Y
 
Y
Y
 
D
D
 
D
P
 
P
L
 
L
E
 
R
K
 
Q
I
 
I
I
 
T
R
 
R
A
 
M
I
 
I
Q
 
Q
N
 
K
C
 
F
P
 
P
T
 
K
P
 
P
V
 
I
I
 
I
A
 
S
L
 
M
I
 
V
E
 
E
G
 
G
G
x
S
V
 
V
W
|
W
G
|
G
G
|
G
A
 
A
C
 
F
E
|
E
L
 
M
A
 
I
C
 
M
I
 
S
C
 
S
D
 
D
I
 
L
L
 
I
I
 
I
G
 
A
G
 
A
P
 
S
N
 
T
A
 
S
S
x
T
F
|
F
T
x
S
I
 
M
T
|
T
P
|
P
S
 
V
R
 
N
F
 
L
G
 
G
I
x
V
P
 
P
Y
|
Y
N
 
N
P
 
L
S
 
V
G
 
G
I
 
I
L
 
H
H
 
N
L
 
L
I
 
T
N
 
R
R
 
D
C
 
A
G
 
G
L
 
F
G
 
H
A
 
I
A
 
V
K
 
K
E
 
E
M
 
L
F
 
I
F
 
F
T
 
T
A
 
A
Q
x
S
S
x
P
V
 
I
N
 
T
A
 
A
E
 
Q
R
 
R
A
 
A
L
 
L
R
 
A
L
 
V
G
 
G
I
 
I
L
 
L
N
 
N
H
 
H
L
 
V
V
 
V
A
 
E
A
 
V
T
 
E
E
 
E
L
 
L
E
 
E
D
 
D
F
 
F
T
 
T
Y
 
L
D
 
Q
L
 
M
A
 
A
G
 
H
A
 
H
I
 
I
A
 
S
R
 
E
N
 
K
S
 
A
P
 
P
L
 
L
S
 
A
V
 
I
S
 
A
V
 
V
I
 
I
K
 
K
E
 
E
Q
 
E
L
 
L
R
 
R
I
 
V
F
 
L
S
 
G
N
 
E
A
 
A
L
 
H
A
 
T
L
 
M
N
 
N
P
 
S
E
 
D
T
 
E
F
 
F
E
|
E
R
 
R
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
L
 
M
R
 
R
R
 
R
L
 
A
V
 
V
W
x
Y
D
 
D
S
 
S
E
|
E
D
 
D
Y
 
Y
I
 
Q
E
 
E
G
 
G
K
 
M
K
 
N
A
 
A
F
|
F
L
 
L
E
 
E
K
 
K
R
 
R
A
 
K
P
 
P
I
 
N
F
 
F
K
 
V
G
 
G
E
x
H

6n92A Methylmalonyl-coa decarboxylase in complex with 2-nitronate-propionyl- coa (see paper)
51% identity, 97% coverage: 10:259/259 of query aligns to 11:260/260 of 6n92A

query
sites
6n92A
N
 
N
A
 
K
I
 
V
G
 
A
I
 
V
I
 
I
T
 
E
F
 
F
D
 
-
N
 
N
Y
 
Y
D
 
G
R
 
R
R
 
K
-
x
L
N
 
N
A
 
A
L
 
L
S
 
S
K
 
K
A
 
V
F
 
F
I
 
I
A
 
D
D
 
D
I
 
L
M
 
M
T
 
Q
A
 
A
M
 
L
N
 
S
S
 
D
L
 
L
L
 
N
Y
 
R
E
 
P
E
 
E
V
 
I
R
 
R
V
 
C
I
 
I
I
 
I
F
 
L
R
 
R
A
 
A
H
 
P
P
 
S
G
 
G
A
 
S
K
 
K
V
 
V
W
 
F
S
 
S
A
|
A
G
 
G
H
|
H
D
|
D
I
|
I
M
x
H
E
 
E
L
|
L
E
 
P
R
 
S
P
 
G
G
 
G
R
 
R
D
 
D
P
 
P
L
 
L
G
 
S
Y
 
Y
Y
 
D
D
 
D
P
 
P
L
 
L
E
 
R
K
 
Q
I
 
I
I
 
T
R
 
R
A
 
M
I
 
I
Q
 
Q
N
 
K
C
 
F
P
 
P
T
 
K
P
 
P
V
 
I
I
 
I
A
 
S
L
 
M
I
 
V
E
 
E
G
 
G
G
 
S
V
 
V
W
|
W
G
|
G
G
|
G
A
 
A
C
 
F
E
|
E
L
 
M
A
 
I
C
 
M
I
 
S
C
 
S
D
 
D
I
 
L
L
 
I
I
 
I
G
 
A
G
 
A
P
 
S
N
 
T
A
 
S
S
 
T
F
 
F
T
 
S
I
 
M
T
|
T
P
|
P
S
 
V
R
 
N
F
 
L
G
 
G
I
x
V
P
 
P
Y
|
Y
N
 
N
P
 
L
S
 
V
G
 
G
I
 
I
L
 
H
H
 
N
L
 
L
I
 
T
N
 
R
R
 
D
C
 
A
G
 
G
L
 
F
G
 
H
A
 
I
A
 
V
K
 
K
E
 
E
M
 
L
F
 
I
F
 
F
T
 
T
A
 
A
Q
 
S
S
 
P
V
 
I
N
 
T
A
 
A
E
 
Q
R
 
R
A
 
A
L
 
L
R
 
A
L
 
V
G
 
G
I
 
I
L
 
L
N
 
N
H
 
H
L
 
V
V
 
V
A
 
E
A
 
V
T
 
E
E
 
E
L
 
L
E
 
E
D
 
D
F
 
F
T
 
T
Y
 
L
D
 
Q
L
 
M
A
 
A
G
 
H
A
 
H
I
 
I
A
 
S
R
 
E
N
 
K
S
 
A
P
 
P
L
 
L
S
 
A
V
 
I
S
 
A
V
 
V
I
 
I
K
 
K
E
 
E
Q
 
E
L
 
L
R
 
R
I
 
V
F
 
L
S
 
G
N
 
E
A
 
A
L
 
H
A
 
T
L
 
M
N
 
N
P
 
S
E
 
D
T
 
E
F
 
F
E
|
E
R
 
R
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
L
 
M
R
 
R
R
 
R
L
 
A
V
 
V
W
x
Y
D
 
D
S
 
S
E
 
E
D
 
D
Y
 
Y
I
 
Q
E
 
E
G
 
G
K
 
M
K
 
N
A
 
A
F
|
F
L
 
L
E
 
E
K
|
K
R
 
R
A
 
K
P
 
P
I
 
N
F
 
F
K
 
V
G
 
G
E
 
H

5jbxB Crystal structure of liuc in complex with coenzyme a and malonic acid (see paper)
32% identity, 97% coverage: 7:258/259 of query aligns to 10:260/261 of 5jbxB

query
sites
5jbxB
E
 
D
V
 
A
R
 
R
N
 
G
A
 
P
I
 
I
G
 
E
I
 
I
I
 
W
T
 
T
F
 
I
D
 
D
N
 
G
Y
 
E
D
x
S
R
|
R
R
|
R
N
 
N
A
|
A
L
 
I
S
 
S
K
 
R
A
 
A
F
 
M
I
 
L
-
 
K
-
 
E
-
 
L
A
 
G
D
 
E
I
 
L
M
 
V
T
 
T
A
 
R
M
 
V
N
 
S
S
 
S
L
 
-
L
 
-
Y
 
S
E
 
R
E
 
D
V
 
V
R
 
R
V
 
A
I
 
V
I
 
V
F
 
I
R
 
-
A
 
T
H
 
G
P
 
A
G
 
G
A
 
D
K
 
K
V
 
A
W
 
F
S
 
C
A
|
A
G
 
G
H
x
A
D
|
D
I
x
L
M
x
K
E
 
E
L
x
R
E
 
A
R
 
T
P
 
M
G
 
A
R
 
E
D
 
D
P
 
E
L
 
V
-
 
R
G
 
A
Y
 
F
Y
x
L
D
 
D
P
 
G
L
 
L
E
x
R
K
 
R
I
 
T
I
 
F
R
 
R
A
 
A
I
 
I
Q
 
E
N
 
K
C
 
S
P
 
D
T
 
C
P
 
V
V
 
F
I
 
I
A
 
A
L
 
A
I
 
I
E
 
N
G
 
G
G
 
A
V
 
A
W
x
L
G
|
G
G
|
G
A
 
G
C
 
T
E
|
E
L
 
L
A
 
A
C
 
L
I
 
A
C
 
C
D
 
D
I
 
L
L
 
R
I
 
V
G
 
A
G
 
A
P
 
P
N
 
A
A
 
A
S
 
E
F
 
L
T
 
G
I
 
L
T
|
T
P
x
E
S
 
V
R
 
K
F
x
L
G
 
G
I
|
I
P
 
I
Y
x
P
N
x
G
P
 
G
S
 
G
G
 
G
I
 
T
L
 
Q
H
 
R
L
 
L
I
 
A
N
 
R
R
 
L
C
 
V
G
 
G
L
 
P
G
 
G
A
 
R
A
 
A
K
 
K
E
 
D
M
 
L
F
 
I
F
 
L
T
 
T
A
 
A
Q
 
R
S
x
R
V
 
I
N
 
N
A
 
A
E
 
A
R
 
E
A
 
A
L
 
F
R
 
S
L
 
V
G
 
G
I
 
L
L
 
A
N
 
N
H
 
R
L
 
L
V
 
A
A
 
P
A
 
E
T
 
G
E
 
H
L
 
L
E
 
L
D
 
A
F
 
V
T
 
A
Y
 
Y
D
 
G
L
 
L
A
 
A
G
 
E
A
 
S
I
 
V
A
 
V
R
 
E
N
 
N
S
 
A
P
 
P
L
 
I
S
 
A
V
 
V
S
 
A
V
 
T
I
 
A
K
 
K
E
 
H
Q
 
A
L
 
I
R
 
D
-
 
E
-
 
G
-
 
T
-
 
G
-
 
L
I
 
E
F
 
L
S
 
D
N
 
D
A
 
A
L
 
L
A
|
A
L
 
L
N
 
E
P
 
L
E
 
R
T
 
K
F
 
Y
E
 
E
R
 
E
I
 
I
Q
 
-
G
 
-
L
 
-
R
 
-
R
 
-
L
 
-
V
 
-
W
x
L
D
 
K
S
 
T
E
 
E
D
 
D
Y
 
R
I
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
L
K
 
R
A
 
A
F
 
F
L
 
A
E
 
E
K
 
K
R
 
R
A
 
A
P
 
P
I
 
V
F
 
Y
K
 
K
G
 
G

5zaiC Crystal structure of 3-hydroxypropionyl-coa dehydratase from metallosphaera sedula (see paper)
32% identity, 95% coverage: 15:259/259 of query aligns to 17:259/259 of 5zaiC

query
sites
5zaiC
I
 
I
T
 
T
F
 
L
D
 
N
N
 
R
Y
 
P
D
 
D
R
x
K
R
x
L
N
 
N
A
 
A
L
 
L
S
 
N
K
 
A
A
 
K
F
 
L
I
 
L
A
 
E
D
 
E
I
 
L
M
 
D
T
 
R
A
 
A
M
 
V
N
 
S
S
 
Q
L
 
A
L
 
E
Y
 
S
E
 
D
-
 
P
E
 
E
V
 
I
R
 
R
V
 
V
I
 
I
I
 
I
F
 
I
R
 
T
A
 
G
H
 
K
P
 
-
G
 
-
A
 
G
K
 
K
V
 
A
W
 
F
S
 
C
A
|
A
G
|
G
H
x
A
D
|
D
I
|
I
M
 
T
E
 
Q
L
x
F
E
 
N
R
 
Q
-
 
L
-
 
T
P
 
P
G
 
A
R
 
-
D
 
E
P
 
A
L
 
W
G
 
K
Y
 
F
Y
x
S
D
 
K
P
 
K
L
 
G
E
x
R
K
 
E
I
 
I
I
 
M
R
 
D
A
 
K
I
 
I
Q
 
E
N
 
A
C
 
L
P
 
S
T
 
K
P
 
P
V
 
T
I
 
I
A
 
A
L
 
M
I
 
I
E
 
N
G
 
G
G
 
Y
V
 
A
W
 
L
G
 
G
G
|
G
A
 
G
C
 
L
E
|
E
L
 
L
A
 
A
C
 
L
I
 
A
C
 
C
D
 
D
I
 
I
L
 
R
I
 
I
G
 
A
G
 
A
P
 
E
N
 
E
A
 
A
S
 
Q
F
 
L
T
 
G
I
 
L
T
x
P
P
x
E
S
 
I
R
 
N
F
 
L
G
 
G
I
|
I
P
 
Y
Y
x
P
N
x
G
P
 
Y
S
 
G
G
 
G
I
 
T
L
 
Q
H
 
R
L
 
L
I
 
T
N
 
R
R
 
V
C
 
I
G
 
G
L
 
K
G
 
G
A
 
R
A
 
A
K
 
L
E
 
E
M
 
M
F
 
M
F
 
M
T
 
T
A
 
G
Q
 
D
S
x
R
V
 
I
N
 
P
A
 
G
E
 
K
R
 
D
A
 
A
L
 
E
R
 
K
L
 
Y
G
 
G
I
 
L
L
 
V
N
 
N
H
 
R
L
 
V
V
 
V
A
 
P
A
 
L
T
 
A
E
 
N
L
 
L
E
 
E
D
 
Q
F
 
E
T
 
T
Y
 
R
D
 
K
L
 
L
A
 
A
G
 
E
A
 
K
I
 
I
A
 
A
R
 
K
N
 
K
S
 
S
P
 
P
L
 
I
S
 
S
V
 
L
S
 
A
V
 
L
I
 
I
K
 
K
E
 
E
Q
 
V
L
 
V
R
 
N
I
 
R
F
 
G
S
 
L
N
 
D
A
 
S
L
 
P
A
 
L
L
 
L
N
 
S
P
 
G
E
 
L
T
x
A
F
 
L
E
 
E
R
 
S
I
 
V
Q
 
G
G
 
-
L
 
-
R
 
W
R
 
G
L
 
V
V
 
V
W
x
F
D
 
S
S
 
T
E
 
E
D
 
D
Y
 
K
I
 
K
E
 
E
G
 
G
K
 
V
K
 
S
A
 
A
F
|
F
L
 
L
E
 
E
K
|
K
R
 
R
A
 
E
P
 
P
I
 
T
F
 
F
K
 
K
G
 
G
E
 
K

5du6A Crystal structure of m. Tuberculosis echa6 bound to ligand gsk059a. (see paper)
28% identity, 96% coverage: 10:258/259 of query aligns to 9:241/242 of 5du6A

query
sites
5du6A
N
 
E
A
 
A
I
 
V
G
 
L
I
 
T
I
 
I
T
 
E
F
 
L
D
 
Q
N
 
R
Y
 
P
D
 
E
R
 
R
R
 
R
N
 
N
A
 
A
L
 
L
S
 
N
K
 
S
A
 
Q
F
 
L
I
 
V
A
 
E
D
 
E
I
 
L
M
 
T
T
 
Q
A
 
A
M
 
I
N
 
R
S
 
K
L
 
A
L
 
G
Y
 
D
E
 
G
E
 
S
V
 
A
R
 
R
V
 
A
I
 
I
I
 
V
F
 
L
R
 
T
A
 
G
H
 
Q
P
 
G
G
 
T
A
 
A
K
 
-
V
 
-
W
 
F
S
 
C
A
 
A
G
 
G
H
x
A
D
 
D
I
 
L
M
 
S
E
 
G
L
 
F
E
 
-
R
 
-
P
 
-
G
 
-
R
 
-
D
 
-
P
 
A
L
 
A
G
 
D
Y
 
Y
Y
x
P
D
 
D
P
 
R
L
|
L
E
x
I
K
 
E
I
 
L
I
 
H
R
 
K
A
 
A
I
 
M
Q
x
D
N
 
A
C
 
S
P
 
P
T
 
M
P
 
P
V
 
V
I
 
V
A
 
G
L
 
A
I
 
I
E
 
N
G
 
G
G
 
P
V
 
A
W
 
I
G
 
G
G
x
A
A
 
G
C
 
L
E
x
Q
L
 
L
A
 
A
C
 
M
I
 
Q
C
 
C
D
 
D
I
 
L
L
 
R
I
 
V
G
 
V
G
 
A
P
 
P
N
 
D
A
 
A
S
 
F
F
 
F
T
 
Q
I
 
F
T
x
P
P
x
T
S
 
S
R
 
K
F
 
Y
G
 
G
I
x
L
P
 
A
Y
x
L
N
x
D
P
 
N
S
x
W
G
 
S
I
 
I
L
 
R
H
 
R
L
 
L
I
 
S
N
 
S
R
 
L
C
 
V
G
 
G
L
 
H
G
 
G
A
 
R
A
 
A
K
 
R
E
 
A
M
 
M
F
 
L
F
 
L
T
 
S
A
 
A
Q
 
E
S
 
K
V
 
L
N
 
T
A
 
A
E
 
E
R
 
I
A
 
A
L
 
L
R
 
H
L
 
T
G
 
G
I
 
M
L
 
A
N
 
N
H
 
R
L
 
I
V
 
G
A
 
T
A
 
L
T
 
A
E
 
D
L
 
A
E
 
Q
D
 
A
F
 
W
T
 
-
Y
 
-
D
 
-
L
 
-
A
 
A
G
 
A
A
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
N
 
L
S
 
A
P
 
P
L
 
L
S
 
A
V
 
I
S
 
Q
V
 
H
I
 
A
K
 
K
E
 
-
Q
 
-
L
 
-
R
 
R
I
 
V
F
 
L
S
 
N
N
 
D
A
 
D
L
 
G
A
 
A
L
 
I
N
 
E
P
 
-
E
 
E
T
x
A
F
 
W
E
x
P
R
 
A
I
 
H
Q
x
K
G
 
E
L
 
L
R
x
F
R
 
D
L
 
K
V
 
A
W
|
W
D
 
G
S
 
S
E
 
Q
D
 
D
Y
 
V
I
 
I
E
 
E
G
 
A
K
 
Q
K
 
V
A
 
A
F
 
R
L
 
M
E
 
E
K
 
K
R
 
R
A
 
P
P
 
P
I
 
K
F
 
F
K
 
Q
G
 
G

5ducA Crystal structure of m. Tuberculosis echa6 bound to ligand gsk951a (see paper)
28% identity, 96% coverage: 10:258/259 of query aligns to 9:243/244 of 5ducA

query
sites
5ducA
N
 
E
A
 
A
I
 
V
G
 
L
I
 
T
I
 
I
T
 
E
F
 
L
D
 
Q
N
 
R
Y
 
P
D
 
E
R
 
R
R
 
R
N
 
N
A
 
A
L
 
L
S
 
N
K
 
S
A
 
Q
F
 
L
I
 
V
A
 
E
D
 
E
I
 
L
M
 
T
T
 
Q
A
 
A
M
 
I
N
 
R
S
 
K
L
 
A
L
 
G
Y
 
D
E
 
G
E
 
S
V
 
A
R
 
R
V
 
A
I
 
I
I
 
V
F
 
L
R
 
T
A
 
G
H
 
Q
P
 
G
G
 
T
A
 
A
K
 
-
V
 
-
W
 
F
S
 
C
A
 
A
G
 
G
H
x
A
D
 
D
I
 
L
M
 
-
E
 
-
L
 
-
E
 
-
R
 
-
P
 
-
G
 
S
R
 
G
D
|
D
P
 
A
L
 
F
G
 
A
-
 
A
-
 
D
Y
 
Y
Y
x
P
D
 
D
P
 
R
L
|
L
E
x
I
K
 
E
I
 
L
I
x
H
R
 
K
A
 
A
I
 
M
Q
x
D
N
 
A
C
 
S
P
 
P
T
 
M
P
 
P
V
 
V
I
 
V
A
 
G
L
 
A
I
 
I
E
 
N
G
 
G
G
 
P
V
 
A
W
 
I
G
 
G
G
x
A
A
 
G
C
 
L
E
x
Q
L
 
L
A
 
A
C
 
M
I
 
Q
C
 
C
D
 
D
I
 
L
L
 
R
I
 
V
G
 
V
G
 
A
P
 
P
N
 
D
A
 
A
S
 
F
F
 
F
T
 
Q
I
 
F
T
x
P
P
x
T
S
 
S
R
 
K
F
 
Y
G
 
G
I
x
L
P
 
A
Y
x
L
N
x
D
P
 
N
S
x
W
G
 
S
I
 
I
L
 
R
H
 
R
L
 
L
I
 
S
N
 
S
R
 
L
C
 
V
G
 
G
L
 
H
G
 
G
A
 
R
A
 
A
K
 
R
E
 
A
M
 
M
F
 
L
F
 
L
T
 
S
A
 
A
Q
 
E
S
 
K
V
 
L
N
 
T
A
 
A
E
 
E
R
 
I
A
 
A
L
 
L
R
 
H
L
 
T
G
 
G
I
 
M
L
 
A
N
 
N
H
 
R
L
 
I
V
 
G
A
 
T
A
 
L
T
 
A
E
 
D
L
 
A
E
 
Q
D
 
A
F
 
W
T
 
-
Y
 
-
D
 
-
L
 
-
A
 
A
G
 
A
A
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
N
 
L
S
 
A
P
 
P
L
 
L
S
 
A
V
 
I
S
 
Q
V
 
H
I
 
A
K
 
K
E
 
-
Q
 
-
L
 
-
R
 
R
I
 
V
F
 
L
S
 
N
N
 
D
A
 
D
L
 
G
A
 
A
L
 
I
N
 
E
P
 
-
E
 
E
T
 
A
F
 
W
E
x
P
R
 
A
I
 
H
Q
 
K
G
 
E
L
 
L
R
x
F
R
 
D
L
 
K
V
 
A
W
|
W
D
 
G
S
 
S
E
 
Q
D
 
D
Y
 
V
I
 
I
E
 
E
G
 
A
K
 
Q
K
 
V
A
 
A
F
 
R
L
 
M
E
 
E
K
 
K
R
 
R
A
 
P
P
 
P
I
 
K
F
 
F
K
 
Q
G
 
G

5du4A Crystal structure of m. Tuberculosis echa6 bound to ligand gsk366a (see paper)
28% identity, 96% coverage: 10:258/259 of query aligns to 9:243/244 of 5du4A

query
sites
5du4A
N
 
E
A
 
A
I
 
V
G
 
L
I
 
T
I
 
I
T
 
E
F
 
L
D
 
Q
N
 
R
Y
 
P
D
 
E
R
 
R
R
 
R
N
 
N
A
 
A
L
 
L
S
 
N
K
 
S
A
 
Q
F
 
L
I
 
V
A
 
E
D
 
E
I
 
L
M
 
T
T
 
Q
A
 
A
M
 
I
N
 
R
S
 
K
L
 
A
L
 
G
Y
 
D
E
 
G
E
 
S
V
 
A
R
 
R
V
 
A
I
 
I
I
 
V
F
 
L
R
 
T
A
 
G
H
 
Q
P
 
G
G
 
T
A
 
A
K
 
-
V
 
-
W
 
F
S
 
C
A
 
A
G
 
G
H
x
A
D
 
D
I
 
L
M
 
-
E
 
-
L
 
-
E
 
-
R
 
-
P
 
-
G
 
S
R
 
G
D
|
D
P
 
A
L
 
F
G
 
A
-
 
A
-
 
D
Y
 
Y
Y
x
P
D
 
D
P
 
R
L
|
L
E
x
I
K
 
E
I
 
L
I
x
H
R
 
K
A
 
A
I
 
M
Q
x
D
N
 
A
C
 
S
P
 
P
T
 
M
P
 
P
V
 
V
I
 
V
A
 
G
L
 
A
I
 
I
E
 
N
G
 
G
G
 
P
V
 
A
W
 
I
G
 
G
G
x
A
A
 
G
C
 
L
E
x
Q
L
 
L
A
 
A
C
 
M
I
 
Q
C
 
C
D
 
D
I
 
L
L
 
R
I
 
V
G
 
V
G
 
A
P
 
P
N
 
D
A
 
A
S
 
F
F
 
F
T
 
Q
I
 
F
T
x
P
P
x
T
S
 
S
R
 
K
F
 
Y
G
 
G
I
x
L
P
 
A
Y
x
L
N
x
D
P
 
N
S
x
W
G
 
S
I
 
I
L
 
R
H
 
R
L
 
L
I
 
S
N
 
S
R
 
L
C
 
V
G
 
G
L
 
H
G
 
G
A
 
R
A
 
A
K
 
R
E
 
A
M
 
M
F
 
L
F
 
L
T
 
S
A
 
A
Q
 
E
S
 
K
V
 
L
N
 
T
A
 
A
E
 
E
R
 
I
A
 
A
L
 
L
R
 
H
L
 
T
G
 
G
I
 
M
L
 
A
N
 
N
H
 
R
L
 
I
V
 
G
A
 
T
A
 
L
T
 
A
E
 
D
L
 
A
E
 
Q
D
 
A
F
 
W
T
 
-
Y
 
-
D
 
-
L
 
-
A
 
A
G
 
A
A
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
N
 
L
S
 
A
P
 
P
L
 
L
S
 
A
V
 
I
S
 
Q
V
 
H
I
 
A
K
 
K
E
 
-
Q
 
-
L
 
-
R
 
R
I
 
V
F
 
L
S
 
N
N
 
D
A
 
D
L
 
G
A
 
A
L
 
I
N
 
E
P
 
-
E
 
E
T
 
A
F
 
W
E
x
P
R
 
A
I
 
H
Q
 
K
G
 
E
L
 
L
R
 
F
R
 
D
L
 
K
V
 
A
W
|
W
D
 
G
S
 
S
E
 
Q
D
 
D
Y
 
V
I
 
I
E
 
E
G
 
A
K
 
Q
K
 
V
A
 
A
F
 
R
L
 
M
E
 
E
K
 
K
R
 
R
A
 
P
P
 
P
I
 
K
F
 
F
K
 
Q
G
 
G

5dtwA Crystal structure of m. Tuberculosis echa6 bound to c20-coa (see paper)
28% identity, 96% coverage: 10:258/259 of query aligns to 9:243/244 of 5dtwA

query
sites
5dtwA
N
 
E
A
 
A
I
 
V
G
 
L
I
 
T
I
 
I
T
 
E
F
 
L
D
 
Q
N
x
R
Y
 
P
D
x
E
R
|
R
R
|
R
N
 
N
A
|
A
L
 
L
S
 
N
K
 
S
A
 
Q
F
 
L
I
 
V
A
 
E
D
 
E
I
 
L
M
 
T
T
 
Q
A
 
A
M
 
I
N
 
R
S
 
K
L
 
A
L
 
G
Y
 
D
E
 
G
E
 
S
V
 
A
R
 
R
V
 
A
I
 
I
I
 
V
F
 
L
R
 
T
A
 
G
H
 
Q
P
 
G
G
 
T
A
 
A
K
 
-
V
 
-
W
 
F
S
 
C
A
|
A
G
 
G
H
x
A
D
|
D
I
x
L
M
 
-
E
 
-
L
 
-
E
 
-
R
 
-
P
 
-
G
 
S
R
 
G
D
|
D
P
 
A
L
 
F
G
 
A
-
 
A
-
 
D
Y
 
Y
Y
x
P
D
 
D
P
 
R
L
 
L
E
x
I
K
 
E
I
 
L
I
x
H
R
 
K
A
 
A
I
 
M
Q
x
D
N
 
A
C
 
S
P
 
P
T
 
M
P
 
P
V
 
V
I
 
V
A
 
G
L
 
A
I
 
I
E
 
N
G
 
G
G
 
P
V
 
A
W
 
I
G
|
G
G
x
A
A
 
G
C
 
L
E
x
Q
L
 
L
A
 
A
C
 
M
I
 
Q
C
 
C
D
 
D
I
 
L
L
 
R
I
 
V
G
 
V
G
 
A
P
 
P
N
 
D
A
 
A
S
 
F
F
 
F
T
 
Q
I
 
F
T
x
P
P
x
T
S
 
S
R
 
K
F
x
Y
G
 
G
I
x
L
P
 
A
Y
x
L
N
x
D
P
 
N
S
x
W
G
 
S
I
 
I
L
 
R
H
 
R
L
 
L
I
 
S
N
 
S
R
 
L
C
 
V
G
 
G
L
 
H
G
 
G
A
 
R
A
 
A
K
 
R
E
 
A
M
 
M
F
 
L
F
 
L
T
 
S
A
 
A
Q
 
E
S
 
K
V
 
L
N
 
T
A
 
A
E
 
E
R
 
I
A
 
A
L
 
L
R
 
H
L
 
T
G
 
G
I
 
M
L
 
A
N
 
N
H
 
R
L
 
I
V
 
G
A
 
T
A
 
L
T
 
A
E
 
D
L
 
A
E
 
Q
D
 
A
F
 
W
T
 
-
Y
 
-
D
 
-
L
 
-
A
 
A
G
 
A
A
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
N
 
L
S
 
A
P
 
P
L
 
L
S
 
A
V
 
I
S
 
Q
V
 
H
I
 
A
K
 
K
E
 
-
Q
 
-
L
 
-
R
 
R
I
 
V
F
 
L
S
 
N
N
 
D
A
 
D
L
 
G
A
 
A
L
 
I
N
 
E
P
 
-
E
 
E
T
 
A
F
 
W
E
x
P
R
 
A
I
 
H
Q
 
K
G
 
E
L
 
L
R
 
F
R
 
D
L
 
K
V
 
A
W
|
W
D
 
G
S
 
S
E
 
Q
D
 
D
Y
 
V
I
 
I
E
 
E
G
 
A
K
 
Q
K
 
V
A
 
A
F
 
R
L
 
M
E
 
E
K
 
K
R
 
R
A
 
P
P
 
P
I
 
K
F
 
F
K
 
Q
G
 
G

Q8GYN9 1,4-dihydroxy-2-naphthoyl-CoA synthase, peroxisomal; DHNS; Enoyl-CoA hydratase/isomerase D; ECHID; Naphthoate synthase; EC 4.1.3.36 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
28% identity, 95% coverage: 11:256/259 of query aligns to 86:330/337 of Q8GYN9

query
sites
Q8GYN9
A
 
G
I
 
I
G
 
A
I
 
K
I
 
I
T
 
T
F
 
I
D
 
N
N
 
R
Y
 
P
D
 
E
R
 
R
R
 
R
N
 
N
A
 
A
L
 
F
S
 
R
K
 
P
A
 
Q
F
 
T
I
 
V
A
 
K
D
 
E
I
 
L
M
 
M
T
 
R
A
 
A
M
 
F
N
 
N
S
 
D
L
 
A
L
 
R
Y
 
D
E
 
D
E
 
S
V
 
S
R
 
V
V
 
G
I
 
V
I
 
I
F
 
I
R
 
L
A
 
T
H
 
G
P
 
K
G
 
G
A
 
T
K
 
K
V
 
A
W
 
F
S
 
C
A
 
S
G
 
G
H
 
G
D
 
D
I
 
-
M
 
-
E
 
-
L
 
-
E
 
-
R
 
Q
P
 
A
G
 
L
R
 
R
D
 
T
P
 
Q
L
 
D
G
 
G
Y
 
Y
Y
 
A
D
 
D
P
 
P
L
 
N
E
 
D
-
 
V
-
 
G
-
 
R
-
 
L
-
 
N
-
 
V
-
 
L
K
 
D
I
 
L
I
 
Q
R
 
V
A
 
Q
I
 
I
Q
 
R
N
 
R
C
 
L
P
 
P
T
 
K
P
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
A
L
 
M
I
 
V
E
 
A
G
 
G
G
 
Y
V
 
A
W
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
G
C
 
H
E
 
I
L
 
L
A
 
H
C
 
M
I
 
V
C
 
C
D
 
D
I
 
L
L
 
T
I
 
I
G
 
A
G
 
A
P
 
D
N
 
N
A
 
A
S
 
I
F
 
F
T
 
G
I
 
Q
T
 
T
P
 
G
S
 
P
R
 
K
-
 
V
-
 
G
-
 
S
F
 
F
G
 
D
I
 
A
P
 
G
Y
 
Y
N
 
G
P
 
S
S
 
S
G
 
I
I
 
M
L
 
S
H
 
R
L
 
L
I
 
V
N
 
-
R
 
-
C
 
-
G
 
G
L
 
P
G
 
K
A
 
K
A
 
A
K
 
R
E
 
E
M
 
M
F
 
W
F
 
F
T
 
M
A
 
T
Q
 
R
S
 
F
V
 
Y
N
 
T
A
 
A
E
 
S
R
 
E
A
 
A
L
 
E
R
 
K
L
 
M
G
 
G
I
 
L
L
 
I
N
 
N
H
 
T
L
 
V
V
 
V
A
 
P
A
 
L
T
 
E
E
 
D
L
 
L
E
 
E
D
 
K
F
 
E
T
 
T
Y
 
V
D
 
K
L
 
W
A
 
C
G
 
R
A
 
E
I
 
I
A
 
L
R
 
R
N
 
N
S
 
S
P
 
P
L
 
T
S
 
A
V
 
I
S
 
R
V
 
V
I
 
L
K
 
K
E
 
A
Q
 
A
L
 
L
R
 
N
I
 
A
F
 
V
S
 
D
N
 
D
A
 
G
L
 
H
A
 
A
L
 
-
N
 
-
P
 
-
E
 
-
T
 
-
F
 
-
E
 
-
R
 
G
I
 
L
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
-
 
G
-
 
G
-
 
D
-
 
A
R
 
T
R
 
L
L
 
L
V
 
F
W
 
Y
D
 
G
S
 
T
E
 
E
D
 
E
Y
 
A
I
 
T
E
 
E
G
 
G
K
 
R
K
 
T
A
 
A
F
 
Y
L
 
M
E
 
H
K
 
R
R
 
R
A
 
P
P
 
P
I
 
D
F
 
F

Sites not aligning to the query:

5dufA Crystal structure of m. Tuberculosis echa6 bound to ligand gsk729a (see paper)
28% identity, 96% coverage: 10:258/259 of query aligns to 10:244/245 of 5dufA

query
sites
5dufA
N
 
E
A
 
A
I
 
V
G
 
L
I
 
T
I
 
I
T
 
E
F
 
L
D
 
Q
N
 
R
Y
 
P
D
 
E
R
 
R
R
 
R
N
 
N
A
 
A
L
 
L
S
 
N
K
 
S
A
 
Q
F
 
L
I
 
V
A
 
E
D
 
E
I
 
L
M
 
T
T
 
Q
A
 
A
M
 
I
N
 
R
S
 
K
L
 
A
L
 
G
Y
 
D
E
 
G
E
 
S
V
 
A
R
 
R
V
 
A
I
 
I
I
 
V
F
 
L
R
 
T
A
 
G
H
 
Q
P
 
G
G
 
T
A
 
A
K
 
-
V
 
-
W
 
F
S
 
C
A
 
A
G
 
G
H
x
A
D
 
D
I
 
L
M
 
-
E
 
-
L
 
-
E
 
-
R
 
-
P
 
-
G
 
S
R
 
G
D
|
D
P
 
A
L
 
F
G
 
A
-
 
A
-
 
D
Y
 
Y
Y
x
P
D
 
D
P
 
R
L
|
L
E
x
I
K
 
E
I
 
L
I
x
H
R
 
K
A
 
A
I
 
M
Q
x
D
N
 
A
C
 
S
P
 
P
T
 
M
P
 
P
V
 
V
I
 
V
A
 
G
L
 
A
I
 
I
E
 
N
G
 
G
G
 
P
V
 
A
W
 
I
G
 
G
G
x
A
A
 
G
C
 
L
E
x
Q
L
 
L
A
 
A
C
 
M
I
 
Q
C
 
C
D
 
D
I
 
L
L
 
R
I
 
V
G
 
V
G
 
A
P
 
P
N
 
D
A
 
A
S
 
F
F
 
F
T
 
Q
I
 
F
T
x
P
P
x
T
S
 
S
R
 
K
F
 
Y
G
 
G
I
x
L
P
 
A
Y
x
L
N
x
D
P
 
N
S
x
W
G
 
S
I
 
I
L
 
R
H
 
R
L
 
L
I
 
S
N
 
S
R
 
L
C
 
V
G
 
G
L
 
H
G
 
G
A
 
R
A
 
A
K
 
R
E
 
A
M
 
M
F
 
L
F
 
L
T
 
S
A
 
A
Q
 
E
S
 
K
V
 
L
N
 
T
A
 
A
E
 
E
R
 
I
A
 
A
L
 
L
R
 
H
L
 
T
G
 
G
I
 
M
L
 
A
N
 
N
H
 
R
L
 
I
V
 
G
A
 
T
A
 
L
T
 
A
E
 
D
L
 
A
E
 
Q
D
 
A
F
 
W
T
 
-
Y
 
-
D
 
-
L
 
-
A
 
A
G
 
A
A
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
N
 
L
S
 
A
P
 
P
L
 
L
S
 
A
V
 
I
S
 
Q
V
 
H
I
 
A
K
 
K
E
 
-
Q
 
-
L
 
-
R
 
R
I
 
V
F
 
L
S
 
N
N
 
D
A
 
D
L
 
G
A
 
A
L
 
I
N
 
E
P
 
-
E
 
E
T
 
A
F
 
W
E
x
P
R
 
A
I
 
H
Q
 
K
G
 
E
L
 
L
R
 
F
R
 
D
L
 
K
V
 
A
W
|
W
D
 
G
S
 
S
E
 
Q
D
 
D
Y
 
V
I
 
I
E
 
E
G
 
A
K
 
Q
K
 
V
A
 
A
F
 
R
L
 
M
E
 
E
K
 
K
R
 
R
A
 
P
P
 
P
I
 
K
F
 
F
K
 
Q
G
 
G

Q7CQ56 1,4-dihydroxy-2-naphthoyl-CoA synthase; DHNA-CoA synthase; EC 4.1.3.36 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720)
27% identity, 95% coverage: 10:256/259 of query aligns to 32:278/285 of Q7CQ56

query
sites
Q7CQ56
N
 
D
A
 
G
I
 
I
G
 
A
I
 
K
I
 
I
T
 
T
F
 
I
D
 
N
N
 
R
Y
 
P
D
 
Q
R
 
V
R
 
R
N
 
N
A
 
A
L
 
F
S
 
R
K
 
P
A
 
L
F
 
T
I
 
V
A
 
K
D
 
E
I
 
M
M
 
I
T
 
Q
A
 
A
M
 
L
N
 
A
S
 
D
L
 
A
L
 
R
Y
 
Y
E
 
D
E
 
D
V
 
N
R
 
V
V
 
G
I
 
V
I
 
I
F
 
I
R
 
L
A
 
T
H
 
G
P
 
E
G
 
G
A
 
D
K
 
K
V
 
A
W
 
F
S
 
C
A
 
A
G
 
G
H
 
G
D
 
D
I
 
-
M
 
-
E
 
-
L
 
-
E
 
Q
R
 
K
P
 
V
G
 
R
R
 
G
D
 
D
P
 
Y
L
 
G
G
 
G
Y
 
Y
Y
 
Q
D
 
D
P
 
D
-
 
S
-
 
G
-
 
V
-
 
H
-
 
H
-
 
L
-
 
N
L
 
V
E
 
L
K
 
D
I
 
F
I
 
Q
R
 
R
A
 
Q
I
 
I
Q
 
R
N
 
T
C
 
C
P
 
P
T
 
K
P
 
P
V
 
V
I
 
V
A
 
A
L
 
M
I
 
V
E
 
A
G
 
G
G
 
Y
V
 
S
W
 
I
G
 
G
G
 
G
A
 
G
C
 
H
E
 
V
L
 
L
A
 
H
C
 
M
I
 
M
C
 
C
D
 
D
I
 
L
L
 
T
I
 
I
G
 
A
G
 
A
P
 
E
N
 
N
A
 
A
S
 
I
F
 
F
T
 
G
I
x
Q
T
|
T
P
x
G
S
 
P
R
 
K
F
 
V
G
 
G
I
 
S
P
 
F
Y
 
D
N
 
G
P
 
G
S
 
W
G
 
G
I
 
A
L
 
S
H
 
Y
L
 
M
I
 
A
N
 
R
R
 
I
C
 
V
G
 
G
L
 
Q
G
 
K
A
 
K
A
 
A
K
 
R
E
 
E
M
 
I
F
 
W
F
 
F
T
 
L
A
 
C
Q
 
R
S
 
Q
V
 
Y
N
 
D
A
 
A
E
 
Q
R
 
Q
A
 
A
L
 
L
R
 
D
L
 
M
G
 
G
I
 
L
L
 
V
N
 
N
H
 
T
L
 
V
V
 
V
A
 
P
A
 
L
T
 
A
E
 
D
L
 
L
E
 
E
D
 
K
F
 
E
T
 
T
Y
 
V
D
 
R
L
 
W
A
 
C
G
 
R
A
 
E
I
 
M
A
 
L
R
 
Q
N
 
N
S
 
S
P
 
P
L
 
M
S
 
A
V
 
L
S
 
R
V
 
C
I
 
L
K
 
K
E
 
A
Q
 
A
L
 
L
R
 
-
I
 
-
F
 
-
S
 
-
N
 
N
A
 
A
L
 
D
A
 
C
L
 
D
N
 
G
P
 
Q
E
 
A
T
 
G
F
 
L
E
 
Q
R
 
E
I
 
L
Q
 
A
G
 
G
-
 
N
L
 
A
R
 
T
R
 
M
L
 
L
V
 
F
W
 
Y
D
 
M
S
 
T
E
 
E
D
 
E
Y
 
G
I
 
Q
E
 
E
G
 
G
K
 
R
K
 
N
A
 
A
F
 
F
L
 
N
E
 
Q
K
 
K
R
 
R
A
 
Q
P
 
P
I
 
D
F
 
F

2uzfA Crystal structure of staphylococcus aureus 1,4-dihydroxy-2-naphthoyl coa synthase (menb) in complex with acetoacetyl coa (see paper)
28% identity, 97% coverage: 7:256/259 of query aligns to 13:253/260 of 2uzfA

query
sites
2uzfA
E
 
E
V
 
F
R
 
Y
N
 
E
A
 
G
I
 
I
G
 
A
I
 
K
I
 
V
T
 
T
F
 
I
D
 
N
N
 
R
Y
 
P
D
 
E
R
x
V
R
|
R
N
 
N
A
 
A
L
 
F
S
 
T
K
 
P
A
 
K
F
 
T
I
 
V
A
 
A
D
 
E
I
 
M
M
 
I
T
 
D
A
 
A
M
 
F
N
 
S
S
 
R
L
 
A
L
 
R
Y
 
D
E
 
D
E
 
Q
-
 
N
V
 
V
R
 
S
V
 
V
I
 
I
I
 
V
F
 
L
R
 
T
A
 
G
H
 
E
P
 
G
G
 
D
A
 
L
K
 
A
V
 
F
W
 
C
S
|
S
A
x
G
G
|
G
H
x
D
D
 
Q
I
 
K
M
 
G
E
 
E
L
 
D
E
 
Q
R
 
I
P
 
P
G
x
R
R
 
L
D
 
N
P
 
V
L
|
L
G
 
-
Y
 
-
Y
 
-
D
 
-
P
 
D
L
 
L
E
 
Q
K
 
R
I
 
L
I
 
I
R
 
R
A
 
I
I
 
I
Q
 
-
N
 
-
C
 
-
P
 
P
T
 
K
P
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
A
L
 
M
I
 
V
E
 
K
G
 
G
G
x
Y
V
 
A
W
 
V
G
 
G
G
|
G
A
 
G
C
 
N
E
x
V
L
 
L
A
 
N
C
 
V
I
 
V
C
 
C
D
 
D
I
 
L
L
 
T
I
 
I
G
 
A
G
 
A
P
 
D
N
 
N
A
 
A
S
 
I
F
 
F
T
 
G
I
 
Q
T
|
T
P
x
G
S
 
P
R
 
K
F
 
V
G
 
G
I
x
S
P
 
F
Y
x
D
N
x
A
P
 
G
S
 
Y
G
 
G
I
 
S
L
 
G
H
 
Y
L
 
L
I
 
A
N
 
R
R
 
I
C
 
V
G
 
G
L
 
H
G
 
K
A
 
K
A
 
A
K
 
R
E
 
E
M
 
I
F
 
W
F
 
Y
T
 
L
A
 
C
Q
 
R
S
 
Q
V
 
Y
N
 
N
A
 
A
E
 
Q
R
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
D
L
 
M
G
 
G
I
 
L
L
 
V
N
 
N
H
 
T
L
 
V
V
 
V
A
 
P
A
 
L
T
 
E
E
 
K
L
 
V
E
 
E
D
 
D
F
 
E
T
 
T
Y
 
V
D
 
Q
L
 
W
A
 
C
G
 
K
A
 
E
I
 
I
A
 
M
R
 
K
N
 
H
S
 
S
P
 
P
L
 
T
S
 
A
V
 
L
S
 
R
V
 
F
I
 
L
K
 
K
E
 
A
Q
 
A
L
 
M
R
 
N
I
 
A
F
 
D
S
 
T
N
 
D
A
 
G
L
 
L
A
 
A
L
 
-
N
 
-
P
 
-
E
 
-
T
 
G
F
 
L
E
 
Q
R
 
Q
I
 
M
Q
x
A
G
 
G
L
 
D
R
 
A
R
 
T
L
 
L
V
 
L
W
 
Y
D
x
Y
S
 
T
E
 
T
D
 
D
Y
 
E
I
 
A
-
 
K
E
 
E
G
 
G
K
 
R
K
 
D
A
 
A
F
 
F
L
 
K
E
 
E
K
 
K
R
 
R
A
 
D
P
 
P
I
 
D
F
 
F

3q0jC Crystal structure of the mycobacterium tuberculosis crotonase in complex with the inhibitor acetoacetylcoa
29% identity, 98% coverage: 4:256/259 of query aligns to 6:254/255 of 3q0jC

query
sites
3q0jC
V
 
I
I
 
L
Q
 
V
E
 
E
V
 
R
R
 
D
N
 
Q
A
 
R
I
 
V
G
 
G
I
 
I
I
 
I
T
 
T
F
 
L
D
 
N
N
 
R
Y
 
P
D
x
Q
R
x
A
R
x
L
N
 
N
A
|
A
L
 
L
S
 
N
K
 
S
A
 
Q
F
 
V
I
 
M
A
 
N
D
 
E
I
 
V
M
 
T
T
 
S
A
 
A
M
 
A
N
 
T
S
 
E
L
 
L
L
 
D
Y
 
D
E
 
D
-
 
P
E
 
D
V
 
I
R
 
G
V
 
A
I
 
I
I
 
I
F
 
I
R
 
T
A
 
G
H
 
S
P
 
-
G
 
-
A
 
A
K
 
K
V
 
A
W
 
F
S
 
A
A
|
A
G
|
G
H
x
A
D
|
D
I
|
I
M
x
K
E
 
E
L
x
M
E
 
A
R
 
-
P
 
-
G
 
-
R
 
-
D
 
-
P
 
D
L
 
L
G
 
T
Y
 
F
Y
 
A
D
 
D
P
 
A
L
 
F
E
x
T
K
 
A
I
 
D
I
 
F
R
x
F
A
 
A
-
 
T
-
 
W
-
 
G
-
 
K
I
 
L
Q
 
A
N
 
A
C
 
V
P
 
R
T
 
T
P
 
P
V
 
T
I
 
I
A
 
A
L
 
A
I
 
V
E
 
A
G
 
G
G
 
Y
V
 
A
W
 
L
G
|
G
G
|
G
A
 
G
C
 
C
E
|
E
L
 
L
A
 
A
C
 
M
I
 
M
C
 
C
D
 
D
I
 
V
L
 
L
I
 
I
G
 
A
G
 
A
P
 
D
N
 
T
A
 
A
S
 
K
F
 
F
T
 
G
I
 
Q
T
x
P
P
x
E
S
 
I
R
 
K
F
 
L
G
 
G
I
x
V
P
 
L
Y
x
P
N
x
G
P
x
M
S
 
G
G
 
G
I
 
S
L
 
Q
H
 
R
L
 
L
I
 
T
N
 
R
R
 
A
C
 
I
G
 
G
L
 
K
G
 
A
A
 
K
A
 
A
K
 
M
E
 
D
M
 
L
F
 
I
F
 
L
T
 
T
A
 
G
Q
 
R
S
 
T
V
 
M
N
 
D
A
 
A
E
 
A
R
 
E
A
 
A
L
 
E
R
 
R
L
 
S
G
 
G
I
 
L
L
 
V
N
 
S
H
 
R
L
 
V
V
 
V
A
 
P
A
 
A
T
 
D
E
 
D
L
 
L
E
 
L
D
 
T
F
 
E
T
 
A
Y
 
R
D
 
A
L
 
T
A
 
A
G
 
T
A
 
T
I
 
I
A
 
S
R
 
Q
N
 
M
S
 
S
P
 
A
L
 
S
S
 
A
V
 
A
S
 
R
V
 
M
I
 
A
K
 
K
E
 
E
Q
 
A
L
 
V
-
 
N
R
 
R
I
 
A
F
 
F
S
 
E
N
 
S
A
 
S
L
 
L
A
 
S
L
 
-
N
 
-
P
 
-
E
 
-
T
 
-
F
 
-
E
 
-
R
 
-
I
 
-
Q
 
E
G
 
G
L
 
L
-
x
L
-
 
Y
-
 
E
R
 
R
R
 
R
L
 
L
-
 
F
-
 
H
-
 
S
V
 
A
W
x
F
D
 
A
S
 
T
E
 
E
D
 
D
Y
 
Q
I
 
S
E
 
E
G
 
G
K
 
M
K
 
A
A
 
A
F
 
F
L
 
I
E
 
E
K
 
K
R
 
R
A
 
A
P
 
P
I
 
Q
F
 
F

Query Sequence

>WP_013707330.1 NCBI__GCF_000195295.1:WP_013707330.1
MSLVIQEVRNAIGIITFDNYDRRNALSKAFIADIMTAMNSLLYEEVRVIIFRAHPGAKVW
SAGHDIMELERPGRDPLGYYDPLEKIIRAIQNCPTPVIALIEGGVWGGACELACICDILI
GGPNASFTITPSRFGIPYNPSGILHLINRCGLGAAKEMFFTAQSVNAERALRLGILNHLV
AATELEDFTYDLAGAIARNSPLSVSVIKEQLRIFSNALALNPETFERIQGLRRLVWDSED
YIEGKKAFLEKRAPIFKGE

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory