SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_013817863.1 NCBI__GCF_000214665.1:WP_013817863.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1h5yB Hisf protein from pyrobaculum aerophilum (see paper)
49% identity, 96% coverage: 5:248/253 of query aligns to 6:249/253 of 1h5yB

query
sites
1h5yB
R
 
R
I
 
I
I
 
I
A
 
P
R
 
C
L
 
L
D
|
D
I
 
I
K
 
D
T
 
G
A
 
G
N
 
A
-
 
K
-
 
V
V
 
V
V
 
V
K
|
K
G
 
G
I
 
V
R
 
N
F
 
F
E
 
Q
G
 
G
L
 
I
R
 
R
I
 
E
M
 
V
G
 
G
K
 
D
P
 
P
D
 
V
E
 
E
L
 
M
A
 
A
T
 
V
R
 
R
Y
 
Y
Y
 
E
E
 
E
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
D
E
 
E
L
 
I
L
 
A
Y
 
I
I
 
L
D
 
D
T
 
I
V
 
T
A
 
A
S
 
A
L
 
P
Y
 
E
G
 
G
R
 
R
N
 
A
N
 
T
L
 
F
S
 
I
D
 
D
V
 
S
V
 
V
K
 
K
Q
 
R
A
 
V
A
 
A
S
 
E
H
 
A
I
 
V
F
 
S
I
 
I
P
 
P
M
 
V
T
 
L
V
 
V
G
 
G
G
|
G
G
|
G
I
 
V
R
 
R
T
 
S
V
 
L
G
 
E
D
 
D
A
 
A
Q
 
T
T
 
T
L
 
L
L
 
F
R
 
R
S
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
K
 
K
I
 
V
A
 
S
I
 
V
N
|
N
T
|
T
A
 
A
A
 
A
V
 
V
K
 
R
N
 
N
P
 
P
K
 
Q
L
 
L
I
 
V
K
 
A
E
 
L
L
 
L
A
 
A
S
 
R
I
 
E
L
 
F
G
 
G
S
 
S
Q
 
Q
A
 
S
I
 
T
V
 
V
V
 
V
S
x
A
L
 
I
Q
x
D
V
 
A
K
 
K
C
 
W
V
 
N
G
 
G
P
 
-
E
 
E
K
 
Y
W
 
Y
E
 
E
I
 
V
Y
 
Y
V
 
V
D
 
K
N
x
G
G
 
G
R
 
R
E
 
E
K
 
A
T
 
T
G
 
G
L
 
L
D
 
D
A
 
A
M
 
V
D
 
K
W
 
W
A
 
A
K
 
K
Q
 
E
V
 
V
E
 
E
E
 
E
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
G
E
 
E
L
 
I
L
 
L
V
 
L
T
|
T
S
 
S
V
 
I
D
 
D
R
 
R
D
|
D
G
|
G
T
 
T
G
 
G
L
 
L
G
 
G
F
 
Y
D
 
D
E
 
V
Q
 
E
F
 
L
I
 
I
S
 
R
R
 
R
L
 
V
A
 
A
S
 
D
N
 
S
V
 
V
S
 
R
L
 
I
P
 
P
V
 
V
V
 
I
A
 
A
G
 
S
G
 
G
G
 
G
A
 
A
K
 
-
G
 
G
P
 
R
Q
 
V
D
 
E
I
 
H
S
 
F
H
 
Y
I
 
E
L
 
A
S
 
A
E
 
A
T
 
A
D
 
G
A
 
A
S
 
D
A
 
A
V
 
V
A
 
L
I
x
A
A
|
A
S
|
S
M
 
L
L
 
F
H
 
H
Y
 
F
G
 
R
R
 
V
A
 
L
T
 
S
I
 
I
G
 
A
E
 
Q
I
 
V
K
 
K
Q
 
R
E
 
Y
L
 
L
T
 
K
K
 
E
V
 
R
G
 
G
I
 
V

Q9X0C6 Imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF; IGP synthase cyclase subunit; IGP synthase subunit HisF; ImGP synthase subunit HisF; IGPS subunit HisF; EC 4.3.2.10 from Thermotoga maritima (strain ATCC 43589 / DSM 3109 / JCM 10099 / NBRC 100826 / MSB8) (see paper)
43% identity, 98% coverage: 1:249/253 of query aligns to 1:247/253 of Q9X0C6

query
sites
Q9X0C6
M
 
M
Q
 
L
K
 
A
P
 
K
R
 
R
I
 
I
I
 
I
A
 
A
R
x
C
L
 
L
D
|
D
I
 
V
K
 
K
T
 
D
A
 
G
N
 
R
V
 
V
V
 
V
K
|
K
G
 
G
I
 
T
R
 
N
F
 
F
E
 
E
G
 
N
L
 
L
R
 
R
I
 
D
M
 
S
G
 
G
K
 
D
P
 
P
D
 
V
E
 
E
L
 
L
A
 
G
T
 
K
R
 
F
Y
 
Y
Y
 
S
E
 
E
Q
 
I
G
 
G
A
 
I
D
 
D
E
 
E
L
 
L
L
 
V
Y
 
F
I
 
L
D
|
D
T
 
I
V
 
T
A
 
A
S
 
S
L
 
V
Y
 
E
G
 
K
R
 
R
N
 
K
N
 
T
L
 
M
S
 
L
D
 
E
V
 
L
V
 
V
K
 
E
Q
 
K
A
 
V
A
 
A
S
 
E
H
 
Q
I
 
I
F
 
D
I
 
I
P
 
P
M
 
F
T
 
T
V
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
I
 
I
R
 
H
T
 
D
V
 
F
G
 
E
D
 
T
A
 
A
Q
 
S
T
 
E
L
 
L
L
 
I
R
 
L
S
 
R
G
 
G
A
 
A
D
 
D
K
 
K
I
 
V
A
 
S
I
 
I
N
|
N
T
 
T
A
 
A
A
 
A
V
 
V
K
 
E
N
 
N
P
 
P
K
 
S
L
 
L
I
 
I
K
 
T
E
 
Q
L
 
I
A
 
A
S
 
Q
I
 
T
L
 
F
G
 
G
S
 
S
Q
 
Q
A
 
A
I
 
V
V
 
V
V
 
V
S
 
A
L
 
I
Q
x
D
V
 
A
K
 
K
C
 
R
V
 
V
G
 
D
P
 
G
E
 
E
K
 
-
W
 
F
E
 
M
I
 
V
Y
 
F
V
 
T
D
 
Y
N
 
S
G
 
G
R
 
K
E
 
K
K
 
N
T
 
T
G
 
G
L
 
I
D
 
L
A
 
L
M
 
R
D
 
D
W
 
W
A
 
V
K
 
V
Q
 
E
V
 
V
E
 
E
E
 
K
L
 
R
G
 
G
A
 
A
G
 
G
E
 
E
L
 
I
L
 
L
V
 
L
T
 
T
S
 
S
V
 
I
D
 
D
R
 
R
D
|
D
G
 
G
T
 
T
G
 
K
L
 
S
G
 
G
F
 
Y
D
|
D
E
 
T
Q
 
E
F
 
M
I
 
I
S
 
R
R
 
F
L
 
V
A
 
R
S
 
P
N
 
L
V
 
T
S
 
T
L
 
L
P
 
P
V
 
I
V
 
I
A
 
A
G
 
S
G
 
G
G
 
G
A
 
A
K
 
-
G
 
-
P
 
-
Q
 
G
D
 
K
I
 
M
S
 
E
H
 
H
I
 
F
L
 
L
S
 
E
-
 
A
-
 
F
E
 
L
T
 
A
D
 
G
A
 
A
S
 
D
A
 
A
V
 
A
A
 
L
I
 
A
A
 
A
S
 
S
M
 
V
L
 
F
H
 
H
Y
 
F
G
 
R
R
 
E
A
 
I
T
 
D
I
 
V
G
 
R
E
 
E
I
 
L
K
 
K
Q
 
E
E
 
Y
L
 
L
T
 
K
K
 
K
V
 
H
G
 
G
I
 
V
S
 
N

7ac8A Molecular basis for the unique allosteric activation mechanism of the heterodimeric imidazole glycerol phosphate synthase complex. (see paper)
43% identity, 98% coverage: 1:249/253 of query aligns to 1:247/252 of 7ac8A

query
sites
7ac8A
M
 
M
Q
 
L
K
 
A
P
 
K
R
 
R
I
 
I
I
 
I
A
 
A
R
 
C
L
 
L
D
|
D
I
 
V
K
 
K
T
 
D
A
 
G
N
 
R
V
 
V
V
 
V
K
 
K
G
 
G
I
 
T
R
 
N
F
 
F
E
 
E
G
 
N
L
 
L
R
 
R
I
 
D
M
 
S
G
 
G
K
 
D
P
 
P
D
 
V
E
 
E
L
 
L
A
 
G
T
 
K
R
 
F
Y
 
Y
Y
 
S
E
 
E
Q
 
I
G
 
G
A
 
I
D
 
D
E
 
E
L
 
L
L
 
V
Y
 
F
I
x
L
D
 
D
T
x
I
V
 
T
A
 
A
S
 
S
L
 
V
Y
 
E
G
 
K
R
 
R
N
 
K
N
 
T
L
 
M
S
 
L
D
 
E
V
 
L
V
 
V
K
 
E
Q
 
K
A
 
V
A
 
A
S
 
E
H
 
Q
I
 
I
F
 
D
I
 
I
P
 
P
M
 
F
T
 
T
V
 
V
G
 
G
G
 
G
G
|
G
I
 
I
R
 
H
T
 
D
V
 
F
G
 
E
D
 
T
A
 
A
Q
 
S
T
 
E
L
 
L
L
 
I
R
 
L
S
 
R
G
 
G
A
 
A
D
 
D
K
 
K
I
 
V
A
 
S
I
 
I
N
|
N
T
|
T
A
 
A
A
 
A
V
 
V
K
 
E
N
 
N
P
 
P
K
 
S
L
 
L
I
 
I
K
 
T
E
 
Q
L
 
I
A
 
A
S
 
Q
I
 
T
L
 
F
G
 
G
S
 
S
Q
 
Q
A
 
A
I
 
V
V
 
V
V
 
V
S
 
A
L
 
I
Q
x
D
V
 
A
K
 
K
C
 
R
V
 
V
G
 
D
P
 
G
E
 
E
K
 
-
W
 
F
E
 
M
I
 
V
Y
 
F
V
 
T
D
 
Y
N
x
S
G
 
G
R
 
K
E
 
K
K
 
N
T
 
T
G
 
G
L
 
I
D
 
L
A
 
L
M
 
R
D
 
D
W
 
W
A
 
V
K
 
V
Q
 
E
V
 
V
E
 
E
E
 
K
L
 
R
G
 
G
A
 
A
G
 
G
E
 
E
L
 
I
L
 
L
V
 
L
T
 
T
S
 
S
V
 
I
D
 
D
R
 
R
D
|
D
G
|
G
T
 
T
G
 
K
L
 
S
G
 
G
F
 
Y
D
 
D
E
 
T
Q
 
E
F
 
M
I
 
I
S
 
R
R
 
F
L
 
V
A
 
R
S
 
P
N
 
L
V
 
T
S
 
T
L
 
L
P
 
P
V
 
I
V
 
I
A
 
A
G
x
S
G
 
G
G
 
G
A
 
A
K
 
-
G
 
-
P
 
-
Q
 
G
D
 
K
I
 
M
S
 
E
H
 
H
I
 
F
L
 
L
S
 
E
-
 
A
-
 
F
E
 
L
T
 
A
D
 
G
A
 
A
S
 
D
A
 
A
V
 
A
A
 
L
I
 
A
A
 
A
S
|
S
M
 
V
L
 
F
H
 
H
Y
 
F
G
 
R
R
 
E
A
 
I
T
 
D
I
 
V
G
 
R
E
 
E
I
 
L
K
 
K
Q
 
E
E
 
Y
L
 
L
T
 
K
K
 
K
V
 
H
G
 
G
I
 
V
S
 
N

1gpwC Structural evidence for ammonia tunneling across the (beta/alpha)8 barrel of the imidazole glycerol phosphate synthase bienzyme complex. (see paper)
42% identity, 98% coverage: 1:249/253 of query aligns to 1:247/253 of 1gpwC

query
sites
1gpwC
M
 
M
Q
 
L
K
 
A
P
 
K
R
 
R
I
 
I
I
 
I
A
 
A
R
 
C
L
 
L
D
x
N
I
 
V
K
 
K
T
 
D
A
 
G
N
 
R
V
 
V
V
 
V
K
 
K
G
 
G
I
 
T
R
 
N
F
 
F
E
 
E
G
 
N
L
 
L
R
 
R
I
 
D
M
 
S
G
 
G
K
 
D
P
 
P
D
 
V
E
 
E
L
 
L
A
 
G
T
 
K
R
 
F
Y
 
Y
Y
 
S
E
 
E
Q
 
I
G
 
G
A
 
I
D
 
D
E
 
E
L
 
L
L
 
V
Y
 
F
I
 
L
D
 
D
T
 
I
V
 
T
A
 
A
S
 
S
L
 
V
Y
 
E
G
 
K
R
 
R
N
 
K
N
 
T
L
 
M
S
 
L
D
 
E
V
 
L
V
 
V
K
 
E
Q
 
K
A
 
V
A
 
A
S
 
E
H
 
Q
I
 
I
F
 
D
I
 
I
P
 
P
M
 
F
T
 
T
V
 
V
G
 
G
G
 
G
G
|
G
I
 
I
R
 
H
T
 
D
V
 
F
G
 
E
D
 
T
A
 
A
Q
 
S
T
 
E
L
 
L
L
 
I
R
 
L
S
 
R
G
 
G
A
 
A
D
 
D
K
 
K
I
 
V
A
 
S
I
 
I
N
|
N
T
|
T
A
 
A
A
 
A
V
 
V
K
 
E
N
 
N
P
 
P
K
 
S
L
 
L
I
 
I
K
 
T
E
 
Q
L
 
I
A
 
A
S
 
Q
I
 
T
L
 
F
G
 
G
S
 
S
Q
 
Q
A
 
A
I
 
V
V
 
V
V
 
V
S
 
A
L
 
I
Q
x
D
V
 
A
K
 
K
C
 
R
V
 
V
G
 
D
P
 
G
E
 
E
K
 
-
W
 
F
E
 
M
I
 
V
Y
 
F
V
 
T
D
 
Y
N
 
S
G
 
G
R
 
K
E
 
K
K
 
N
T
 
T
G
 
G
L
 
I
D
 
L
A
 
L
M
 
R
D
 
D
W
 
W
A
 
V
K
 
V
Q
 
E
V
 
V
E
 
E
E
 
K
L
 
R
G
 
G
A
 
A
G
 
G
E
 
E
L
 
I
L
 
L
V
 
L
T
 
T
S
 
S
V
 
I
D
 
D
R
 
R
D
|
D
G
|
G
T
 
T
G
 
K
L
 
S
G
 
G
F
 
Y
D
 
D
E
 
T
Q
 
E
F
 
M
I
 
I
S
 
R
R
 
F
L
 
V
A
 
R
S
 
P
N
 
L
V
 
T
S
 
T
L
 
L
P
 
P
V
 
I
V
 
I
A
 
A
G
 
S
G
 
G
G
 
G
A
 
A
K
 
-
G
 
-
P
 
-
Q
 
G
D
 
K
I
 
M
S
 
E
H
 
H
I
 
F
L
 
L
S
 
E
-
 
A
-
 
F
E
 
L
T
 
A
D
 
G
A
 
A
S
 
D
A
 
A
V
 
A
A
 
L
I
 
A
A
 
A
S
|
S
M
 
V
L
 
F
H
 
H
Y
 
F
G
 
R
R
 
E
A
 
I
T
 
D
I
 
V
G
 
R
E
 
E
I
 
L
K
 
K
Q
 
E
E
 
Y
L
 
L
T
 
K
K
 
K
V
 
H
G
 
G
I
 
V
S
 
N

7qc8A Imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF (see paper)
43% identity, 97% coverage: 5:249/253 of query aligns to 5:247/250 of 7qc8A

query
sites
7qc8A
R
 
R
I
 
I
I
 
I
A
 
A
R
 
A
L
 
L
D
x
E
I
 
V
K
 
K
T
 
D
A
 
G
N
 
R
V
 
V
V
 
V
K
 
K
G
 
G
I
 
T
R
 
N
F
 
F
E
 
E
G
 
N
L
 
L
R
 
R
I
 
D
M
 
S
G
 
G
K
 
D
P
 
P
D
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
G
T
 
K
R
 
F
Y
 
Y
Y
 
S
E
 
E
Q
 
I
G
 
G
A
 
I
D
 
D
E
 
E
L
 
L
L
 
V
Y
 
F
I
x
H
D
 
D
T
x
H
V
 
T
A
 
A
S
 
S
L
 
V
Y
 
E
G
 
K
R
 
R
N
 
K
N
 
T
L
 
M
S
 
L
D
 
E
V
 
L
V
 
V
K
 
E
Q
 
K
A
 
V
A
 
A
S
 
E
H
 
Q
I
 
I
F
 
D
I
 
I
P
 
P
M
 
F
T
 
T
V
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
I
 
I
R
 
H
T
 
D
V
 
F
G
 
E
D
 
T
A
 
A
Q
 
S
T
 
E
L
 
L
L
 
I
R
 
L
S
 
R
G
 
G
A
 
A
D
 
D
K
 
K
I
 
V
A
 
S
I
 
I
N
 
N
T
 
T
A
 
A
A
 
A
V
 
V
K
 
E
N
 
N
P
 
P
K
 
S
L
 
L
I
 
I
K
 
T
E
 
Q
L
 
I
A
 
A
S
 
Q
I
 
T
L
 
F
G
 
G
S
 
S
Q
 
Q
A
 
A
I
 
V
V
 
V
V
 
V
S
 
A
L
 
I
Q
 
D
V
 
A
K
 
K
C
 
R
V
 
V
G
 
D
P
 
G
E
 
E
K
 
-
W
 
F
E
 
M
I
 
V
Y
 
F
V
 
T
D
 
Y
N
 
S
G
 
G
R
 
K
E
 
K
K
 
N
T
 
T
G
 
G
L
 
I
D
 
L
A
 
L
M
 
R
D
 
D
W
 
W
A
 
V
K
 
V
Q
 
E
V
 
V
E
 
E
E
 
K
L
 
R
G
 
G
A
 
A
G
 
G
E
 
E
L
 
I
L
 
L
V
 
L
T
 
T
S
 
S
V
 
I
D
 
D
R
 
R
D
 
D
G
 
G
T
 
T
G
 
K
L
 
S
G
 
G
F
 
Y
D
 
D
E
 
T
Q
 
E
F
 
M
I
 
I
S
 
R
R
 
F
L
 
V
A
 
R
S
 
P
N
 
L
V
 
T
S
 
T
L
 
L
P
 
P
V
 
I
V
 
I
A
 
A
G
 
S
G
 
G
G
 
G
A
 
A
K
 
-
G
 
-
P
 
-
Q
 
G
D
 
K
I
 
M
S
 
E
H
 
H
I
 
F
L
 
L
S
 
E
-
 
A
-
 
F
E
 
L
T
 
A
D
 
G
A
 
A
S
 
D
A
 
A
V
 
A
A
 
L
I
 
A
A
 
A
S
 
S
M
 
V
L
 
F
H
 
H
Y
 
F
G
 
R
R
 
E
A
 
I
T
 
D
I
 
V
G
 
R
E
 
E
I
 
L
K
 
K
Q
 
E
E
 
Y
L
 
L
T
 
K
K
 
K
V
 
H
G
 
G
I
 
V
S
 
N

5d2tA Directed evolutionary changes in kemp eliminase ke07 - crystal 3 wild type
41% identity, 98% coverage: 5:253/253 of query aligns to 3:249/251 of 5d2tA

query
sites
5d2tA
R
 
R
I
 
I
I
 
I
A
 
A
R
 
A
L
 
L
D
 
I
I
 
V
K
 
K
T
 
D
A
 
G
N
 
R
V
 
V
V
 
V
K
 
K
G
 
G
I
 
S
R
 
N
F
 
F
E
 
E
G
 
N
L
 
L
R
 
R
I
 
D
M
 
S
G
 
G
K
 
D
P
 
P
D
 
V
E
 
E
L
 
L
A
 
G
T
 
K
R
 
F
Y
 
Y
Y
 
S
E
 
E
Q
 
I
G
 
G
A
 
I
D
 
D
E
 
E
L
 
L
L
 
S
Y
 
F
I
x
W
D
 
D
T
 
I
V
 
T
A
 
A
S
 
S
L
 
V
Y
 
E
G
 
K
R
 
R
N
 
K
N
 
T
L
 
M
S
 
L
D
 
E
V
 
L
V
 
V
K
 
E
Q
 
K
A
 
V
A
 
A
S
 
E
H
 
Q
I
 
I
F
 
D
I
 
I
P
 
P
M
 
F
T
 
T
V
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
I
 
I
R
 
H
T
 
D
V
 
F
G
 
E
D
 
T
A
 
A
Q
 
S
T
 
E
L
 
L
L
 
I
R
 
L
S
 
R
G
 
G
A
 
A
D
 
D
K
 
K
I
 
V
A
x
E
I
 
I
N
 
N
T
 
T
A
 
A
A
 
A
V
 
V
K
 
E
N
 
N
P
 
P
K
 
S
L
 
L
I
 
I
K
 
T
E
 
Q
L
 
I
A
 
A
S
 
Q
I
 
T
L
 
F
G
 
G
S
 
S
Q
 
Q
A
 
A
I
 
V
V
 
V
V
 
V
S
x
Y
L
 
I
Q
 
A
V
 
A
K
 
K
C
 
R
V
 
V
G
 
D
P
 
G
E
 
E
K
 
-
W
 
F
E
 
M
I
 
V
Y
 
F
V
 
T
D
 
Y
N
 
S
G
 
G
R
 
K
E
 
K
K
 
N
T
 
T
G
 
G
L
 
I
D
 
L
A
 
L
M
 
R
D
 
D
W
 
W
A
 
V
K
 
V
Q
 
E
V
 
V
E
 
E
E
 
K
L
 
R
G
 
G
A
 
A
G
 
G
E
 
E
L
 
I
L
 
V
V
 
L
T
 
G
S
 
S
V
 
I
D
 
D
R
 
R
D
 
L
G
 
G
T
 
T
G
 
K
L
 
S
G
 
G
F
 
Y
D
 
D
E
 
T
Q
 
E
F
 
M
I
 
I
S
 
R
R
 
F
L
 
V
A
 
R
S
 
P
N
 
L
V
 
T
S
 
T
L
 
L
P
 
P
V
 
I
V
 
I
A
 
A
G
 
H
G
 
G
G
 
G
A
 
A
-
 
G
K
 
K
G
 
M
P
 
E
Q
 
H
D
 
F
I
 
L
S
 
E
H
 
A
I
 
F
L
 
L
S
 
A
E
 
G
T
 
A
D
 
D
A
 
A
S
 
A
A
x
K
V
 
A
A
 
-
I
 
-
A
 
N
S
 
S
M
 
V
L
 
L
H
 
H
Y
 
F
G
 
R
R
 
E
A
 
I
T
 
D
I
 
V
G
 
R
E
 
E
I
 
L
K
 
K
Q
 
E
E
 
Y
L
 
L
T
 
K
K
 
K
V
 
H
G
 
G
I
 
V
S
 
N
T
 
V
A
 
R
R
 
L
H
 
H

4ewnD Structure of hisf-d130v+d176v with bound rcdrp (see paper)
41% identity, 97% coverage: 5:249/253 of query aligns to 4:240/243 of 4ewnD

query
sites
4ewnD
R
 
R
I
 
I
I
 
I
A
 
A
R
 
C
L
 
L
D
 
D
I
 
V
K
 
K
T
 
D
A
 
G
N
 
R
V
 
V
V
 
V
K
 
K
G
 
G
I
 
T
R
 
N
F
 
F
E
 
E
G
 
N
L
 
L
R
 
R
I
 
D
M
 
S
G
 
G
K
 
D
P
 
P
D
 
V
E
 
E
L
 
L
A
 
G
T
 
K
R
 
F
Y
 
Y
Y
 
S
E
 
E
Q
 
I
G
 
G
A
 
I
D
 
D
E
 
E
L
 
L
L
 
V
Y
 
F
I
 
L
D
 
D
T
 
I
V
 
T
A
 
K
S
 
T
L
 
M
Y
 
L
G
 
-
R
 
-
N
 
-
N
 
-
L
 
-
S
 
-
D
 
E
V
 
L
V
 
V
K
 
E
Q
 
K
A
 
V
A
 
A
S
 
E
H
 
Q
I
 
I
F
 
D
I
 
I
P
 
P
M
 
F
T
 
T
V
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
I
 
I
R
 
H
T
 
D
V
 
F
G
 
E
D
 
T
A
 
A
Q
 
S
T
 
E
L
 
L
L
 
I
R
 
L
S
 
R
G
 
G
A
 
A
D
 
D
K
 
K
I
 
V
A
 
S
I
 
I
N
 
N
T
 
T
A
 
A
A
 
A
V
 
V
K
 
E
N
 
N
P
 
P
K
 
S
L
 
L
I
 
I
K
 
T
E
 
Q
L
 
I
A
 
A
S
 
Q
I
 
T
L
 
F
G
 
G
S
 
S
Q
 
Q
A
 
A
I
 
V
V
 
V
V
 
V
S
 
A
L
 
I
Q
x
V
V
 
A
K
 
K
C
 
R
V
 
V
G
 
D
P
 
G
E
 
E
K
 
-
W
 
F
E
 
M
I
 
V
Y
 
F
V
 
T
D
 
Y
N
 
S
G
 
G
R
 
K
E
 
K
K
 
N
T
 
T
G
 
G
L
 
I
D
 
L
A
 
L
M
 
R
D
 
D
W
 
W
A
 
V
K
 
V
Q
 
E
V
 
V
E
 
E
E
 
K
L
 
R
G
 
G
A
 
A
G
 
G
E
 
E
L
 
I
L
 
L
V
 
L
T
 
T
S
 
S
V
 
I
D
 
D
R
 
R
D
 
V
G
|
G
T
 
T
G
 
K
L
 
S
G
 
G
F
 
Y
D
 
D
E
 
T
Q
 
E
F
 
M
I
 
I
S
 
R
R
 
F
L
 
V
A
 
R
S
 
P
N
 
L
V
 
T
S
 
T
L
 
L
P
 
P
V
 
I
V
 
I
A
 
A
G
x
S
G
|
G
G
|
G
A
 
A
K
 
-
G
 
-
P
 
-
Q
 
G
D
 
K
I
 
M
S
 
E
H
 
H
I
 
F
L
 
L
S
 
E
-
 
A
-
 
F
E
 
L
T
 
A
D
 
G
A
 
A
S
 
D
A
 
A
V
 
A
A
x
L
I
x
A
A
|
A
S
|
S
M
 
V
L
 
F
H
 
H
Y
 
F
G
 
R
R
 
E
A
 
I
T
 
D
I
 
V
G
 
R
E
 
E
I
 
L
K
 
K
Q
 
E
E
 
Y
L
 
L
T
 
K
K
 
K
V
 
H
G
 
G
I
 
V
S
 
N

3zr4E Structural evidence for ammonia tunneling across the (beta-alpha)8 barrel of the imidazole glycerol phosphate synthase bienzyme complex (see paper)
41% identity, 98% coverage: 1:249/253 of query aligns to 1:238/244 of 3zr4E

query
sites
3zr4E
M
 
M
Q
 
L
K
 
A
P
 
K
R
 
R
I
 
I
I
 
I
A
 
A
R
 
C
L
 
L
D
|
D
I
 
V
K
 
K
T
 
D
A
 
G
N
 
R
V
 
V
V
 
V
K
 
K
G
 
S
I
 
-
R
 
-
F
 
-
E
 
-
G
 
-
L
 
-
R
 
-
I
 
-
M
 
-
G
 
G
K
 
D
P
 
P
D
 
V
E
 
E
L
 
L
A
 
G
T
 
K
R
 
F
Y
 
Y
Y
 
S
E
 
E
Q
 
I
G
 
G
A
 
I
D
 
D
E
 
E
L
 
L
L
 
V
Y
 
F
I
 
L
D
 
D
T
 
I
V
 
T
A
 
A
S
 
S
L
 
V
Y
 
E
G
 
K
R
 
R
N
 
K
N
 
T
L
 
M
S
 
L
D
 
E
V
 
L
V
 
V
K
 
E
Q
 
K
A
 
V
A
 
A
S
 
E
H
 
Q
I
 
I
F
 
D
I
 
I
P
 
P
M
 
F
T
 
T
V
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
I
 
I
R
 
H
T
 
D
V
 
F
G
 
E
D
 
T
A
 
A
Q
 
S
T
 
E
L
 
L
L
 
I
R
 
L
S
 
R
G
 
G
A
 
A
D
 
D
K
 
K
I
 
V
A
 
S
I
 
I
N
 
N
T
 
T
A
 
A
A
 
A
V
 
V
K
 
E
N
 
N
P
 
P
K
 
S
L
 
L
I
 
I
K
 
T
E
 
Q
L
 
I
A
 
A
S
 
Q
I
 
T
L
 
F
G
 
G
S
 
S
Q
 
Q
A
 
A
I
 
V
V
 
V
V
 
V
S
 
A
L
 
I
Q
x
D
V
 
A
K
 
K
C
 
R
V
 
V
G
 
D
P
 
G
E
 
E
K
 
-
W
 
F
E
 
M
I
 
V
Y
 
F
V
 
T
D
 
Y
N
 
S
G
 
G
R
 
K
E
 
K
K
 
N
T
 
T
G
 
G
L
 
I
D
 
L
A
 
L
M
 
R
D
 
D
W
 
W
A
 
V
K
 
V
Q
 
E
V
 
V
E
 
E
E
 
K
L
 
R
G
 
G
A
 
A
G
 
G
E
 
E
L
 
I
L
 
L
V
 
L
T
 
T
S
 
S
V
 
I
D
 
D
R
 
R
D
 
D
G
 
G
T
 
T
G
 
K
L
 
S
G
 
G
F
 
Y
D
 
D
E
 
T
Q
 
E
F
 
M
I
 
I
S
x
R
R
 
F
L
 
V
A
 
R
S
 
P
N
 
L
V
 
T
S
 
T
L
 
L
P
 
P
V
 
I
V
 
I
A
 
A
G
 
S
G
 
G
G
 
G
A
 
A
K
 
-
G
 
-
P
 
-
Q
 
G
D
 
K
I
 
M
S
 
E
H
 
H
I
 
F
L
 
L
S
 
E
-
 
A
-
 
F
E
x
L
T
 
A
D
 
G
A
 
A
S
 
D
A
 
A
V
 
A
A
 
L
I
 
A
A
 
A
S
 
S
M
 
V
L
 
F
H
 
H
Y
 
F
G
 
R
R
 
E
A
 
I
T
 
D
I
 
V
G
 
R
E
 
E
I
 
L
K
 
K
Q
 
E
E
 
Y
L
 
L
T
 
K
K
 
K
V
 
H
G
 
G
I
 
V
S
 
N

6dnjA Directed evolutionary changes in kemp eliminase ke07 - crystal 28 round 5 (see paper)
40% identity, 97% coverage: 5:249/253 of query aligns to 4:246/250 of 6dnjA

query
sites
6dnjA
R
 
R
I
 
I
I
 
D
A
 
A
R
 
A
L
 
L
D
 
I
I
 
M
K
 
K
T
 
D
A
 
G
N
 
R
V
 
V
V
 
V
K
 
K
G
 
G
I
 
S
R
 
N
F
 
F
E
 
E
G
 
N
L
 
L
R
 
R
I
 
D
M
 
S
G
 
G
K
 
D
P
 
P
D
 
V
E
 
E
L
 
L
A
 
G
T
 
K
R
 
F
Y
 
Y
Y
 
S
E
 
E
Q
 
I
G
 
G
A
 
I
D
 
D
E
 
E
L
 
L
L
 
S
Y
 
F
I
x
W
D
 
D
T
 
I
V
 
T
A
 
A
S
 
S
L
 
V
Y
 
E
G
 
K
R
 
R
N
 
K
N
 
T
L
 
M
S
 
L
D
 
E
V
 
L
V
 
V
K
 
E
Q
 
K
A
 
V
A
 
A
S
 
E
H
 
Q
I
 
I
F
 
D
I
 
I
P
 
P
M
 
F
T
 
T
V
 
V
G
|
G
G
|
G
G
 
G
I
 
I
R
 
H
T
 
D
V
 
F
G
 
E
D
 
T
A
 
A
Q
 
S
T
 
E
L
 
L
L
 
I
R
 
L
S
 
R
G
 
G
A
 
A
D
 
D
K
 
K
I
 
V
A
 
E
I
 
I
N
|
N
T
 
T
A
 
A
A
 
A
V
 
V
K
 
E
N
 
N
P
 
P
K
 
S
L
 
L
I
 
I
K
 
T
E
 
Q
L
 
I
A
 
A
S
 
Q
I
 
T
L
 
F
G
 
G
S
 
S
Q
 
Q
A
 
A
I
 
V
V
 
V
V
 
V
S
x
Y
L
 
I
Q
 
A
V
 
A
K
 
K
C
 
R
V
 
V
G
 
D
P
 
G
E
 
E
K
 
-
W
 
F
E
 
M
I
 
V
Y
 
F
V
 
T
D
 
Y
N
 
S
G
 
G
R
 
K
E
 
K
K
 
N
T
 
T
G
 
G
L
 
I
D
 
L
A
 
L
M
 
R
D
 
D
W
 
W
A
 
V
K
 
V
Q
 
E
V
 
V
E
 
E
E
 
K
L
 
R
G
 
G
A
 
A
G
 
G
E
 
E
L
 
I
L
 
V
V
 
L
T
 
G
S
 
S
V
 
I
D
 
D
R
 
R
D
 
L
G
 
G
T
 
T
G
 
K
L
 
S
G
 
G
F
 
Y
D
 
D
E
 
T
Q
 
E
F
 
M
I
 
I
S
 
R
R
 
F
L
 
V
A
 
R
S
 
P
N
 
L
V
 
T
S
 
T
L
 
L
P
 
P
V
 
I
V
 
I
A
 
A
G
 
H
G
 
R
G
 
G
A
 
A
-
 
G
K
 
K
G
 
M
P
 
E
Q
 
H
D
 
F
I
 
L
S
 
E
H
 
A
I
 
F
L
 
L
S
 
A
E
 
G
T
 
A
D
 
D
A
 
A
S
 
A
A
 
K
V
 
A
A
 
-
I
 
-
A
 
D
S
 
S
M
 
V
L
 
F
H
 
H
Y
 
F
G
 
R
R
 
E
A
 
I
T
 
D
I
 
V
G
 
R
E
 
E
I
 
L
K
 
K
Q
 
E
E
 
Y
L
 
L
T
 
K
K
 
K
V
 
H
G
 
G
I
 
V
S
 
N

2wjzE Crystal structure of (hish) k181a y138a mutant of imidazoleglycerolphosphate synthase (hish hisf) which displays constitutive glutaminase activity (see paper)
39% identity, 98% coverage: 1:249/253 of query aligns to 1:233/237 of 2wjzE

query
sites
2wjzE
M
 
M
Q
 
L
K
 
A
P
 
K
R
 
R
I
 
I
I
 
I
A
 
A
R
 
C
L
 
L
D
|
D
I
 
V
K
 
K
T
 
D
A
 
G
N
 
-
V
 
-
V
 
-
K
 
-
G
 
-
I
 
-
R
 
-
F
 
-
E
 
-
G
 
-
L
 
-
R
 
R
I
 
V
M
 
V
G
 
G
K
 
D
P
 
P
D
 
V
E
 
E
L
 
L
A
 
G
T
 
K
R
 
F
Y
 
Y
Y
 
S
E
 
E
Q
 
I
G
 
G
A
 
I
D
 
D
E
 
E
L
 
L
L
 
V
Y
 
F
I
 
L
D
 
D
T
 
I
V
 
T
A
 
A
S
 
K
L
 
-
Y
 
-
G
 
-
R
 
R
N
 
K
N
 
T
L
 
M
S
 
L
D
 
E
V
 
L
V
 
V
K
 
E
Q
 
K
A
 
V
A
 
A
S
 
E
H
 
Q
I
 
I
F
 
D
I
 
I
P
 
P
M
 
F
T
 
T
V
 
V
G
 
G
G
 
G
G
|
G
I
 
I
R
 
H
T
 
D
V
 
F
G
 
E
D
 
T
A
 
A
Q
 
S
T
 
E
L
 
L
L
 
I
R
 
L
S
 
R
G
 
G
A
 
A
D
 
D
K
 
K
I
 
V
A
 
S
I
 
I
N
|
N
T
|
T
A
 
A
A
 
A
V
 
V
K
 
E
N
 
N
P
 
P
K
 
S
L
 
L
I
 
I
K
 
T
E
 
Q
L
 
I
A
 
A
S
 
Q
I
 
T
L
 
F
G
 
G
S
 
S
Q
 
Q
A
 
A
I
 
V
V
 
V
V
 
V
S
 
A
L
 
I
Q
x
D
V
 
A
K
 
K
C
 
R
V
 
V
G
 
D
P
 
G
E
 
E
K
 
-
W
 
F
E
 
M
I
 
V
Y
 
F
V
 
T
D
 
Y
N
 
S
G
 
G
R
 
K
E
 
K
K
 
N
T
 
T
G
 
G
L
 
I
D
 
L
A
 
L
M
 
R
D
 
D
W
 
W
A
 
V
K
 
V
Q
 
E
V
 
V
E
 
E
E
 
K
L
 
R
G
 
G
A
 
A
G
 
G
E
 
E
L
 
I
L
 
L
V
 
L
T
 
T
S
 
S
V
 
I
D
 
D
R
 
R
D
 
D
G
 
G
T
 
T
G
 
K
L
 
S
G
 
G
F
 
Y
D
 
D
E
 
T
Q
 
E
F
 
M
I
 
I
S
 
R
R
 
F
L
 
V
A
 
R
S
 
P
N
 
L
V
 
T
S
 
T
L
 
L
P
 
P
V
 
I
V
 
I
A
 
A
G
 
S
G
 
G
G
 
G
A
 
A
K
 
-
G
 
-
P
 
-
Q
 
G
D
 
K
I
 
M
S
 
E
H
 
H
I
 
F
L
 
L
S
 
E
-
 
A
-
 
F
E
 
L
T
 
A
D
 
G
A
 
A
S
 
D
A
 
A
V
 
A
A
 
L
I
 
A
A
 
A
S
 
S
M
 
V
L
 
F
H
 
H
Y
 
F
G
 
R
R
 
E
A
 
I
T
 
D
I
 
V
G
 
R
E
 
E
I
 
L
K
 
K
Q
 
E
E
 
Y
L
 
L
T
 
K
K
 
K
V
 
H
G
 
G
I
 
V
S
 
N

3iivB Evolutionary optimization of computationally designed enzymes: kemp eliminases of the ke07 series (see paper)
40% identity, 97% coverage: 5:249/253 of query aligns to 5:246/262 of 3iivB

query
sites
3iivB
R
 
R
I
 
I
I
 
D
A
 
A
R
 
A
L
 
L
D
 
I
I
 
L
K
 
K
T
 
D
A
 
G
N
 
R
V
 
V
V
 
V
K
 
K
G
 
G
I
 
S
R
 
N
F
 
F
E
 
E
G
 
N
L
 
L
R
 
R
I
 
D
M
 
S
G
 
G
K
 
D
P
 
P
D
 
V
E
 
E
L
 
L
A
 
G
T
 
K
R
 
F
Y
 
Y
Y
 
S
E
 
E
Q
 
I
G
 
G
A
 
I
D
 
D
E
 
E
L
 
L
L
 
S
Y
 
F
I
 
W
D
 
D
T
 
I
V
 
T
A
 
A
S
 
S
L
 
V
Y
 
E
G
 
K
R
 
K
N
 
T
N
 
M
L
 
L
S
 
-
D
 
E
V
 
L
V
 
V
K
 
E
Q
 
K
A
 
V
A
 
A
S
 
E
H
 
Q
I
 
I
F
 
D
I
 
I
P
 
P
M
 
I
T
 
T
V
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
I
 
I
R
 
Y
T
 
D
V
 
F
G
 
E
D
 
T
A
 
A
Q
 
S
T
 
E
L
 
L
L
 
I
R
 
L
S
 
R
G
 
G
A
 
A
D
 
D
K
 
K
I
 
V
A
x
E
I
 
I
N
 
N
T
 
T
A
 
A
A
 
A
V
 
V
K
 
E
N
 
N
P
 
P
K
 
S
L
 
L
I
 
I
K
 
T
E
 
Q
L
 
I
A
 
A
S
 
Q
I
 
T
L
 
F
G
 
G
S
 
S
Q
 
Q
A
 
A
I
 
V
V
 
V
V
 
V
S
 
Y
L
 
I
Q
 
A
V
 
A
K
 
K
C
 
R
V
 
V
G
 
D
P
 
G
E
 
E
K
 
-
W
 
F
E
 
M
I
 
V
Y
 
F
V
 
T
D
 
Y
N
 
S
G
 
G
R
 
T
E
 
K
K
 
N
T
 
T
G
 
G
L
 
I
D
 
L
A
 
L
M
 
R
D
 
D
W
 
W
A
 
V
K
 
V
Q
 
E
V
 
V
E
 
E
E
 
K
L
 
R
G
 
G
A
 
A
G
 
G
E
 
E
L
 
I
L
 
V
V
 
L
T
 
G
S
 
S
V
 
I
D
 
D
R
 
R
D
 
L
G
 
G
T
 
T
G
 
K
L
 
S
G
 
G
F
 
Y
D
 
D
E
 
T
Q
 
E
F
 
M
I
 
I
S
 
R
R
 
F
L
 
V
A
 
R
S
 
P
N
 
L
V
 
T
S
 
T
L
 
L
P
 
P
V
 
I
V
 
I
A
 
A
G
 
H
G
 
R
G
 
G
A
 
A
-
 
G
K
 
K
G
 
T
P
 
E
Q
 
H
D
 
F
I
 
L
S
 
E
H
 
A
I
 
F
L
 
L
S
 
A
E
 
G
T
 
A
D
 
D
A
 
A
S
 
A
A
x
K
V
 
A
A
 
-
I
 
-
A
 
D
S
 
S
M
 
V
L
 
F
H
 
H
Y
 
S
G
 
R
R
 
E
A
 
I
T
 
D
I
 
V
G
 
R
E
 
E
I
 
L
K
 
K
Q
 
E
E
 
Y
L
 
L
T
 
K
K
 
K
V
 
H
G
 
G
I
 
V
S
 
N

P60664 Imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF; IGP synthase cyclase subunit; IGP synthase subunit HisF; ImGP synthase subunit HisF; IGPS subunit HisF; EC 4.3.2.10 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
35% identity, 98% coverage: 1:248/253 of query aligns to 1:253/258 of P60664

query
sites
P60664
M
 
M
Q
 
L
K
 
A
P
 
K
R
|
R
I
 
I
I
 
I
A
 
P
R
 
C
L
 
L
D
 
D
I
 
V
K
 
R
T
 
D
A
 
G
N
 
Q
V
 
V
V
 
V
K
 
K
G
 
G
I
 
V
R
 
Q
F
 
F
E
 
R
G
 
N
L
 
H
R
 
E
I
 
I
M
 
I
G
 
G
K
 
D
P
 
I
D
 
V
E
 
P
L
 
L
A
 
A
T
 
K
R
 
R
Y
 
Y
Y
 
A
E
 
E
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
D
E
|
E
L
 
L
L
 
V
Y
 
F
I
 
Y
D
 
D
T
 
I
V
 
T
A
 
A
S
 
S
L
 
S
Y
 
D
G
 
G
R
 
R
N
 
V
N
 
V
L
 
D
S
 
K
D
 
S
V
 
W
V
 
V
K
 
S
Q
 
R
A
 
V
A
 
A
S
 
E
H
 
V
I
 
I
F
 
D
I
 
I
P
 
P
M
 
F
T
 
C
V
 
V
G
 
A
G
 
G
G
 
G
I
 
I
R
 
K
T
 
S
V
 
L
G
 
E
D
 
D
A
 
A
Q
 
A
T
 
K
L
 
I
L
 
L
R
 
S
S
 
F
G
 
G
A
 
A
D
 
D
K
 
K
I
 
I
A
 
S
I
 
I
N
 
N
T
 
S
A
 
P
A
 
A
V
 
L
K
 
A
N
 
D
P
 
P
K
 
T
L
 
L
I
 
I
K
 
T
E
 
R
L
 
L
A
 
A
S
 
D
I
 
R
L
 
F
G
 
G
S
 
V
Q
|
Q
A
x
C
I
 
I
V
 
V
V
 
V
S
 
G
L
 
I
Q
 
D
V
 
T
K
 
-
C
 
W
V
 
Y
G
 
D
P
 
A
E
 
E
K
 
T
W
 
G
E
 
K
I
 
Y
Y
 
H
V
 
V
-
 
N
-
 
Q
-
 
Y
-
 
T
-
 
G
D
 
D
N
 
E
G
 
S
R
 
R
E
 
T
K
 
R
-
 
V
T
 
T
G
 
Q
L
 
W
D
 
E
A
 
T
M
 
L
D
 
D
W
 
W
A
 
V
K
 
Q
Q
 
E
V
 
V
E
 
Q
E
 
K
L
 
R
G
 
G
A
 
A
G
 
G
E
 
E
L
 
I
L
 
V
V
 
L
T
 
N
S
 
M
V
 
M
D
 
N
R
 
Q
D
 
D
G
 
G
T
 
V
G
 
R
L
 
N
G
 
G
F
 
Y
D
 
D
E
 
L
Q
 
E
F
 
Q
I
 
L
S
 
K
R
 
K
L
 
V
A
 
R
S
 
E
N
 
V
V
 
C
S
 
H
L
 
V
P
 
P
V
 
L
V
 
I
A
 
A
G
 
S
G
 
G
G
 
G
A
 
A
K
 
G
G
 
T
P
 
M
Q
 
E
D
 
H
I
 
F
S
 
L
H
 
E
I
 
A
L
 
F
S
 
R
E
 
D
T
 
A
D
 
D
A
 
V
S
 
D
A
 
G
V
 
A
A
 
L
I
 
A
A
 
A
S
 
S
M
 
V
L
 
F
H
 
H
Y
 
K
G
 
Q
R
 
I
A
 
I
T
 
N
I
 
I
G
 
G
E
 
E
I
 
L
K
 
K
Q
 
A
E
 
Y
L
 
L
T
 
A
K
 
T
V
 
Q
G
 
G
I
 
V

P33734 Imidazole glycerol phosphate synthase hisHF; IGP synthase; IGPS; ImGP synthase; EC 4.3.2.10; EC 3.5.1.2 from Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (Baker's yeast) (see paper)
32% identity, 96% coverage: 5:248/253 of query aligns to 239:545/552 of P33734

query
sites
P33734
R
|
R
I
 
I
I
 
I
A
 
A
R
 
C
L
 
L
D
 
D
I
 
V
K
 
R
T
 
T
A
 
N
N
 
D
-
 
Q
-
 
G
-
 
D
-
 
L
-
 
V
V
 
V
V
 
T
K
|
K
G
 
G
I
 
D
R
 
Q
F
 
Y
E
 
D
-
 
V
-
 
R
-
 
E
-
 
K
-
 
S
-
 
D
-
 
G
-
 
K
G
 
G
L
 
V
R
 
R
I
 
N
M
 
L
G
 
G
K
 
K
P
 
P
D
 
V
E
 
Q
L
 
L
A
 
A
T
 
Q
R
 
K
Y
 
Y
Y
 
Y
E
 
Q
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
D
 
D
E
 
E
L
 
V
L
 
T
Y
 
F
I
 
L
D
 
N
T
 
I
V
 
T
A
 
S
-
 
F
-
 
R
-
 
D
S
 
C
L
 
P
Y
 
L
G
 
K
R
 
D
N
 
T
N
 
P
L
 
M
S
 
L
D
 
E
V
 
V
V
 
L
K
 
K
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
S
 
K
H
 
T
I
 
V
F
 
F
I
 
V
P
 
P
M
 
L
T
 
T
V
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
I
 
I
R
 
K
T
 
D
V
 
I
G
 
V
D
 
D
-
 
V
-
 
D
-
 
G
-
 
T
-
 
K
-
 
I
-
 
P
-
 
A
-
 
L
-
 
E
-
 
V
A
 
A
Q
 
S
T
 
L
L
 
Y
L
 
F
R
 
R
S
 
S
G
 
G
A
 
A
D
 
D
K
|
K
I
 
V
A
 
S
I
 
I
N
 
G
T
 
T
A
 
D
A
 
A
V
 
V
K
 
Y
N
 
A
P
 
A
K
 
E
L
 
K
I
 
Y
K
 
Y
E
 
E
L
 
L
-
 
G
-
 
N
-
 
R
-
 
G
-
 
D
-
 
G
-
 
T
-
 
S
-
 
P
-
 
I
-
 
E
-
 
T
-
 
I
A
 
S
S
 
K
I
 
A
L
 
Y
G
 
G
S
 
A
Q
 
Q
A
 
A
I
 
V
V
 
V
V
 
I
S
 
S
L
 
V
Q
 
D
V
 
P
K
 
K
C
 
R
V
 
V
-
 
Y
-
 
V
-
 
N
-
 
S
-
 
Q
-
 
A
-
 
D
-
 
T
-
 
K
-
 
N
-
 
K
-
 
V
-
 
F
-
 
E
-
 
T
-
 
E
-
 
Y
-
 
P
G
 
G
P
 
P
-
 
N
-
 
G
E
 
E
K
 
K
W
 
Y
E
 
C
I
 
W
Y
 
Y
-
 
Q
-
 
C
-
 
T
V
 
I
D
 
K
N
 
G
G
 
G
R
 
R
E
 
E
K
 
S
T
 
R
G
 
D
L
 
L
D
 
G
A
 
V
M
 
W
D
 
E
W
 
L
A
 
T
K
 
R
Q
 
A
V
 
C
E
 
E
E
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
G
E
 
E
L
 
I
L
 
L
V
 
L
T
 
N
S
 
C
V
 
I
D
 
D
R
 
K
D
 
D
G
 
G
T
 
S
G
 
N
L
 
S
G
 
G
F
 
Y
D
 
D
E
 
L
Q
 
E
F
 
L
I
 
I
S
 
E
R
 
H
L
 
V
A
 
K
S
 
D
N
 
A
V
 
V
S
 
K
L
 
I
P
 
P
V
 
V
V
 
I
A
 
A
G
 
S
G
 
S
G
 
G
A
 
A
K
 
G
G
 
V
P
 
P
Q
 
E
D
 
H
I
 
F
S
 
E
H
 
E
I
 
A
L
 
F
S
 
L
E
 
K
T
 
T
D
 
R
A
 
A
S
 
D
A
 
A
V
 
C
A
 
L
I
 
G
A
 
A
S
 
G
M
 
M
L
 
F
H
 
H
Y
 
R
G
 
G
R
 
E
A
 
F
T
 
T
I
 
V
G
 
N
E
 
D
I
 
V
K
 
K
Q
 
E
E
 
Y
L
 
L
T
 
L
K
 
E
V
 
H
G
 
G
I
 
L

1ox5A Towards understanding the mechanism of the complex cyclization reaction catalyzed by imidazole glycerophosphate synthase (see paper)
33% identity, 96% coverage: 5:248/253 of query aligns to 242:527/532 of 1ox5A

query
sites
1ox5A
R
 
R
I
 
I
I
 
I
A
 
A
R
 
C
L
 
L
D
|
D
I
 
V
K
 
R
T
 
T
A
 
N
N
 
D
V
 
Q
V
 
G
K
 
D
G
 
L
I
 
V
R
 
-
F
 
-
E
 
-
G
 
-
L
 
V
R
 
T
I
 
K
M
 
L
G
 
G
K
 
K
P
 
P
D
 
V
E
 
Q
L
 
L
A
 
A
T
 
Q
R
 
K
Y
 
Y
Y
 
Y
E
 
Q
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
D
 
D
E
 
E
L
 
V
L
 
T
Y
 
F
I
x
L
D
 
N
T
x
I
V
 
T
A
 
C
S
 
P
L
 
L
Y
 
K
G
 
D
R
 
T
N
 
P
N
 
M
L
 
L
S
 
-
D
 
E
V
 
V
V
 
L
K
 
K
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
S
 
K
H
 
T
I
 
V
F
 
F
I
 
V
P
 
P
M
 
L
T
 
T
V
 
V
G
 
G
G
|
G
G
 
G
I
 
I
R
 
K
T
 
D
V
 
I
G
 
V
D
 
D
-
 
V
-
 
D
-
 
G
-
 
T
-
 
K
-
 
I
-
 
P
-
 
A
-
 
L
-
 
E
-
 
V
A
 
A
Q
 
S
T
 
L
L
 
Y
L
 
F
R
 
R
S
 
S
G
 
G
A
 
A
D
 
D
K
 
K
I
 
V
A
 
S
I
 
I
N
x
G
T
|
T
A
 
D
A
 
A
V
 
V
K
 
Y
N
 
A
P
 
A
K
 
E
L
 
K
I
 
Y
K
 
Y
E
 
E
L
 
L
-
 
G
-
 
N
-
 
R
-
 
G
-
 
D
-
 
G
-
 
T
-
 
S
-
 
P
-
 
I
-
 
E
-
 
T
-
 
I
A
 
S
S
 
K
I
 
A
L
 
Y
G
 
G
S
 
A
Q
 
Q
A
 
A
I
 
V
V
 
V
V
 
I
S
|
S
L
 
V
Q
x
D
V
 
P
K
 
K
C
 
R
V
 
V
-
 
Y
-
 
V
-
 
N
-
 
S
-
 
Q
-
 
A
-
 
D
-
 
T
-
 
K
-
 
N
-
 
K
-
 
V
-
 
F
-
 
E
-
 
T
-
 
E
-
 
Y
-
 
P
G
 
G
P
 
P
-
 
N
-
 
G
E
 
E
K
 
K
W
 
Y
E
 
C
I
 
W
Y
 
Y
-
 
Q
-
 
C
-
 
T
V
 
I
D
 
K
N
x
G
G
 
G
R
 
R
E
 
E
K
 
S
T
 
R
G
 
D
L
 
L
D
 
G
A
 
V
M
 
W
D
 
E
W
 
L
A
 
T
K
 
R
Q
 
A
V
 
C
E
 
E
E
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
G
E
 
E
L
 
I
L
 
L
V
 
L
T
x
N
S
 
C
V
 
I
D
 
D
R
 
K
D
|
D
G
|
G
T
 
S
G
 
N
L
 
S
G
 
G
F
 
Y
D
 
D
E
 
L
Q
 
E
F
 
L
I
 
I
S
 
E
R
 
H
L
 
V
A
 
K
S
 
D
N
 
A
V
 
V
S
 
K
L
 
I
P
 
P
V
 
V
V
 
I
A
 
A
G
 
S
G
x
S
G
 
G
A
 
A
K
 
G
G
 
V
P
 
P
Q
 
E
D
 
H
I
 
F
S
 
E
H
 
E
I
 
A
L
 
F
S
 
L
E
 
K
T
 
T
D
 
R
A
 
A
S
 
D
A
 
A
V
 
C
A
 
L
I
 
G
A
|
A
S
x
G
M
 
M
L
 
F
H
 
H
Y
 
R
G
 
G
R
 
E
A
 
F
T
 
T
I
 
V
G
 
N
E
 
D
I
 
V
K
 
K
Q
 
E
E
 
Y
L
 
L
T
 
L
K
 
E
V
 
H
G
 
G
I
 
L

1ox4B Towards understanding the mechanism of the complex cyclization reaction catalyzed by imidazole glycerophosphate synthase (see paper)
32% identity, 96% coverage: 5:248/253 of query aligns to 242:533/538 of 1ox4B

query
sites
1ox4B
R
 
R
I
 
I
I
 
I
A
 
A
R
 
C
L
 
L
D
|
D
I
 
V
K
 
R
T
 
T
A
 
N
N
 
D
-
 
Q
-
 
G
-
 
D
-
 
L
-
 
V
V
 
V
V
 
T
K
 
K
G
 
G
I
 
D
R
 
-
F
 
-
E
 
-
G
 
-
L
 
-
R
 
-
I
 
-
M
 
L
G
 
G
K
 
K
P
 
P
D
 
V
E
 
Q
L
 
L
A
 
A
T
 
Q
R
 
K
Y
 
Y
Y
 
Y
E
 
Q
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
D
 
D
E
 
E
L
 
V
L
 
T
Y
 
F
I
 
L
D
 
N
T
 
I
V
 
T
A
 
S
-
 
F
-
 
R
-
 
D
S
 
C
L
 
P
Y
 
L
G
 
K
R
 
D
N
 
T
N
 
P
L
 
M
S
 
L
D
 
E
V
 
V
V
 
L
K
 
K
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
S
 
K
H
 
T
I
 
V
F
 
F
I
 
V
P
 
P
M
 
L
T
 
T
V
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
I
 
I
R
 
K
T
 
D
V
 
I
G
 
V
D
 
D
-
 
V
-
 
D
-
 
G
-
 
T
-
 
K
-
 
I
-
 
P
-
 
A
-
 
L
-
 
E
-
 
V
A
 
A
Q
 
S
T
 
L
L
 
Y
L
 
F
R
 
R
S
 
S
G
 
G
A
 
A
D
 
D
K
 
K
I
 
V
A
 
S
I
 
I
N
 
G
T
 
T
A
 
D
A
 
A
V
 
V
K
 
Y
N
 
A
P
 
A
K
 
E
L
 
K
I
 
Y
K
 
Y
E
 
E
L
 
L
-
 
G
-
 
N
-
 
R
-
 
G
-
 
D
-
 
G
-
 
T
-
 
S
-
 
P
-
 
I
-
 
E
-
 
T
-
 
I
A
 
S
S
 
K
I
 
A
L
 
Y
G
 
G
S
 
A
Q
 
Q
A
 
A
I
 
V
V
 
V
V
 
I
S
 
S
L
 
V
Q
x
D
V
 
P
K
 
K
C
 
R
V
 
V
-
 
Y
-
 
V
-
 
N
-
 
S
-
 
Q
-
 
A
-
 
D
-
 
T
-
 
K
-
 
N
-
 
K
-
 
V
-
 
F
-
 
E
-
 
T
-
 
E
-
 
Y
-
 
P
G
 
G
P
 
P
-
 
N
-
 
G
E
 
E
K
 
K
W
 
Y
E
 
C
I
 
W
Y
 
Y
-
 
Q
-
 
C
-
 
T
V
 
I
D
 
K
N
 
G
G
 
G
R
 
R
E
 
E
K
 
S
T
 
R
G
 
D
L
 
L
D
 
G
A
 
V
M
 
W
D
 
E
W
 
L
A
 
T
K
 
R
Q
 
A
V
 
C
E
 
E
E
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
G
E
 
E
L
 
I
L
 
L
V
 
L
T
 
N
S
 
C
V
 
I
D
 
D
R
 
K
D
 
D
G
|
G
T
 
S
G
 
N
L
 
S
G
 
G
F
 
Y
D
 
D
E
 
L
Q
 
E
F
 
L
I
 
I
S
 
E
R
 
H
L
 
V
A
 
K
S
 
D
N
 
A
V
 
V
S
 
K
L
 
I
P
 
P
V
 
V
V
 
I
A
 
A
G
 
S
G
x
S
G
 
G
A
 
A
K
 
G
G
 
V
P
 
P
Q
 
E
D
 
H
I
 
F
S
 
E
H
 
E
I
 
A
L
 
F
S
 
L
E
 
K
T
 
T
D
 
R
A
 
A
S
 
D
A
 
A
V
 
C
A
 
L
I
 
G
A
|
A
S
x
G
M
 
M
L
 
F
H
 
H
Y
 
R
G
 
G
R
 
E
A
 
F
T
 
T
I
 
V
G
 
N
E
 
D
I
 
V
K
 
K
Q
 
E
E
 
Y
L
 
L
T
 
L
K
 
E
V
 
H
G
 
G
I
 
L

3tdmA Computationally designed tim-barrel protein, halfflr (see paper)
42% identity, 33% coverage: 123:205/253 of query aligns to 1:82/120 of 3tdmA

query
sites
3tdmA
Q
 
Q
A
 
A
I
 
V
V
 
V
V
 
V
S
 
A
L
 
I
Q
 
D
V
 
A
K
 
K
C
 
R
V
 
V
G
 
D
P
 
G
E
 
E
K
 
-
W
 
F
E
 
M
I
 
V
Y
 
F
V
 
T
D
 
Y
N
 
S
G
 
G
R
 
K
E
 
K
K
 
N
T
 
T
G
 
G
L
 
I
D
 
L
A
 
L
M
 
R
D
 
D
W
 
W
A
 
V
K
 
V
Q
 
E
V
 
V
E
 
E
E
 
K
L
 
R
G
 
G
A
 
A
G
 
G
E
 
E
L
 
I
L
 
L
V
 
L
T
 
T
S
 
S
V
 
I
D
 
D
R
 
R
D
|
D
G
|
G
T
 
T
G
 
K
L
 
S
G
 
G
F
 
Y
D
 
D
E
 
T
Q
 
E
F
 
M
I
 
I
S
 
R
R
 
F
L
 
V
A
 
R
S
 
P
N
 
L
V
 
T
S
 
T
L
 
L
P
 
P
V
 
I
V
 
I
A
 
A
G
 
S
G
 
G
G
 
G
A
 
A

Sites not aligning to the query:

5ab3A S.Enterica hisa mutant d7n, d10g, dup13-15, q24l, g102a (see paper)
26% identity, 93% coverage: 6:241/253 of query aligns to 2:237/241 of 5ab3A

query
sites
5ab3A
I
 
I
I
 
I
A
 
P
R
 
A
L
 
L
D
x
N
I
 
L
K
 
I
T
 
G
A
 
G
N
 
T
V
 
V
V
 
V
K
 
R
G
 
V
I
 
V
R
|
R
-
 
L
-
 
H
-
 
Q
-
 
G
-
 
D
F
x
Y
E
 
A
G
 
R
L
 
L
R
 
R
I
 
D
M
 
Y
G
 
G
K
 
N
-
 
D
P
 
P
D
 
L
E
 
P
L
 
R
A
 
L
T
 
Q
R
 
D
Y
 
Y
Y
 
A
E
 
A
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
D
 
G
E
 
V
L
 
L
L
 
H
Y
 
L
I
x
V
D
 
D
T
 
L
V
 
T
A
 
G
S
 
A
L
 
K
Y
 
D
G
 
P
R
 
A
N
 
K
N
 
R
L
 
Q
S
 
I
D
 
P
V
 
L
V
 
I
K
 
K
Q
 
T
A
 
L
A
 
V
S
 
A
H
 
G
I
 
V
F
 
N
I
 
V
P
 
P
M
 
V
T
 
Q
V
 
V
G
 
G
G
 
G
G
|
G
I
 
V
R
 
R
T
 
T
V
 
E
G
 
E
D
 
D
A
 
V
Q
 
A
T
 
A
L
 
L
L
 
L
R
 
K
S
 
A
G
 
G
A
 
V
D
 
A
K
 
R
I
 
V
A
 
V
I
 
I
N
x
A
T
x
S
A
 
T
A
 
A
V
 
V
K
 
K
N
 
S
P
 
P
K
 
D
L
 
V
I
 
V
K
 
K
E
 
G
L
 
W
A
 
F
S
 
E
I
 
R
L
 
F
G
 
G
S
 
A
Q
 
Q
A
 
A
I
 
L
V
 
V
V
 
L
S
x
A
L
 
L
Q
x
D
V
 
V
K
 
R
C
 
-
V
 
-
G
 
-
P
 
-
E
 
-
K
 
-
W
 
-
E
 
-
I
 
-
Y
 
I
V
 
D
D
 
E
N
 
H
G
 
G
R
 
T
E
 
K
K
 
Q
T
 
V
G
 
A
L
 
V
D
 
S
A
 
G
M
 
V
D
 
S
W
 
L
A
 
E
K
 
Q
Q
 
L
V
 
V
E
 
E
-
 
T
-
 
Y
-
 
L
E
 
P
L
 
V
G
 
G
A
 
L
G
 
K
E
 
H
L
 
V
L
 
L
V
 
C
T
 
T
S
 
D
V
 
I
D
 
S
R
 
R
D
 
D
G
|
G
T
 
T
G
 
L
L
 
A
G
 
G
F
 
S
D
 
N
E
 
V
Q
 
S
F
 
L
I
 
Y
S
 
E
R
 
E
L
 
V
A
 
C
S
 
A
N
 
R
V
 
-
S
 
-
L
 
Y
P
 
P
V
 
Q
V
 
I
A
 
A
G
 
F
G
 
Q
G
 
S
A
x
S
K
x
G
G
|
G
P
 
I
Q
 
G
D
 
D
I
 
I
S
 
D
H
 
D
I
 
I
-
 
A
-
 
A
L
 
L
S
 
R
E
 
G
T
 
T
D
 
G
A
 
V
S
 
R
A
 
G
V
 
V
A
 
I
I
 
V
A
x
G
S
x
R
M
 
A
L
 
L
H
 
L
Y
 
E
G
 
G
R
 
K
A
 
F
T
 
T
I
 
V
G
 
K
E
 
E
I
 
A
K
 
I
Q
 
Q

5abtA S.Enterica hisa mutant d7n, g102a, v106m, d176a
26% identity, 80% coverage: 39:241/253 of query aligns to 38:240/246 of 5abtA

query
sites
5abtA
Y
 
Y
Y
 
A
E
 
A
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
D
 
G
E
 
V
L
 
L
L
 
H
Y
 
L
I
x
V
D
 
D
T
x
L
V
 
T
A
 
G
S
 
A
L
 
K
Y
 
D
G
 
P
R
 
A
N
 
K
N
 
R
L
 
Q
S
 
I
D
 
P
V
 
L
V
 
I
K
 
K
Q
 
T
A
 
L
A
 
V
S
 
A
H
 
G
I
 
V
F
 
N
I
 
V
P
 
P
M
 
V
T
 
Q
V
 
V
G
 
G
G
 
G
G
|
G
I
 
V
R
|
R
T
 
T
V
 
E
G
 
E
D
 
D
A
 
V
Q
 
A
T
 
A
L
 
L
L
 
L
R
 
K
S
 
A
G
 
G
A
 
V
D
 
A
K
 
R
I
 
V
A
x
V
I
 
I
N
x
A
T
x
S
A
 
T
A
 
A
V
 
M
K
 
K
N
 
S
P
 
P
K
 
D
L
 
V
I
 
V
K
 
K
E
 
G
L
 
W
A
 
F
S
 
E
I
 
R
L
 
F
G
 
G
S
 
A
Q
 
Q
A
 
A
I
 
L
V
 
V
V
 
L
S
 
A
L
 
L
Q
x
D
V
 
V
K
 
R
C
 
I
V
 
D
G
 
E
P
 
H
E
 
G
K
 
T
W
 
K
E
 
Q
I
 
V
Y
 
A
V
 
V
D
 
S
N
x
G
G
x
W
R
 
Q
E
 
E
K
 
N
T
 
S
G
 
G
L
 
V
D
 
S
A
 
L
M
 
E
D
 
Q
W
 
L
A
 
V
K
 
E
Q
 
T
V
 
Y
E
 
L
E
 
P
L
 
V
G
 
G
A
 
L
G
 
K
E
 
H
L
 
V
L
 
L
V
 
C
T
 
T
S
 
D
V
 
I
D
 
S
R
 
R
D
 
A
G
|
G
T
 
T
G
 
L
L
 
A
G
 
G
F
 
S
D
 
N
E
 
V
Q
 
S
F
 
L
I
 
Y
S
 
E
R
 
E
L
 
V
A
 
C
S
 
A
N
 
R
V
 
-
S
 
-
L
 
Y
P
 
P
V
 
Q
V
 
I
A
 
A
G
 
F
G
 
Q
G
 
S
A
x
S
K
x
G
G
 
G
P
 
I
Q
 
G
D
 
D
I
 
I
S
 
D
H
 
D
I
 
I
-
 
A
-
 
A
L
 
L
S
 
R
E
 
G
T
 
T
D
 
G
A
 
V
S
 
R
A
 
G
V
 
V
A
x
I
I
 
V
A
x
G
S
x
R
M
 
A
L
 
L
H
 
L
Y
 
E
G
 
G
R
 
K
A
 
F
T
 
T
I
 
V
G
 
K
E
 
E
I
 
A
K
 
I
Q
 
Q

Sites not aligning to the query:

2y85A Crystal structure of mycobacterium tuberculosis phosphoribosyl isomerase with bound rcdrp (see paper)
24% identity, 87% coverage: 12:232/253 of query aligns to 6:209/234 of 2y85A

query
sites
2y85A
I
 
L
K
 
P
T
 
A
A
 
V
N
x
D
V
 
V
V
 
V
K
 
E
G
 
G
-
 
R
-
 
A
I
 
V
R
 
R
F
 
T
E
 
E
G
 
-
L
 
-
R
 
-
I
 
-
M
 
Y
G
 
G
K
 
S
P
 
A
D
 
V
E
 
D
L
 
A
A
 
A
T
 
L
R
 
G
Y
 
W
Y
 
Q
E
 
R
Q
 
D
G
 
G
A
 
A
D
 
E
E
 
W
L
 
I
L
x
H
Y
 
L
I
x
V
D
 
D
T
x
L
V
 
D
A
 
A
S
x
A
L
 
-
Y
 
F
G
 
G
R
 
R
N
 
G
N
 
S
L
 
N
S
 
H
D
 
E
V
 
L
V
 
L
K
 
A
Q
 
E
A
 
V
A
 
V
S
 
G
H
 
K
I
 
L
F
 
D
I
 
V
P
 
Q
M
 
V
T
 
E
V
 
L
G
x
S
G
 
G
G
 
G
I
 
I
R
 
R
T
 
D
V
 
D
G
 
E
D
 
S
A
 
L
Q
 
A
T
 
A
L
 
A
L
 
L
R
 
A
S
 
T
G
 
G
A
 
C
D
 
A
K
 
R
I
 
V
A
 
N
I
 
V
N
 
G
T
 
T
A
 
A
A
 
A
V
 
L
K
 
E
N
 
N
P
 
P
K
 
Q
L
 
W
I
 
C
K
 
A
E
 
R
L
 
V
A
 
I
S
 
G
I
 
E
L
 
H
G
 
G
S
 
D
Q
 
Q
A
 
-
I
 
V
V
 
A
V
 
V
S
 
G
L
 
L
Q
x
D
V
 
V
K
 
Q
C
 
I
V
 
I
G
 
D
P
 
G
E
 
E
K
 
-
W
 
-
E
 
H
I
 
R
Y
 
L
V
 
R
D
 
G
N
x
R
G
 
G
R
 
W
E
 
E
K
 
T
T
 
D
G
 
G
L
 
G
D
 
D
A
 
L
M
 
W
D
 
D
W
 
V
A
 
L
K
 
E
Q
 
R
V
 
L
E
 
D
E
 
S
L
 
E
G
 
G
A
 
C
G
 
S
E
 
R
L
 
F
L
 
V
V
 
V
T
 
T
S
 
D
V
 
I
D
 
T
R
 
K
D
|
D
G
|
G
T
 
T
G
 
L
L
 
G
G
 
G
F
 
P
D
 
N
E
 
L
Q
 
D
F
 
L
I
 
L
S
 
A
R
 
G
L
 
V
A
 
A
S
 
D
N
 
R
V
 
T
S
 
D
L
 
A
P
 
P
V
 
V
V
 
I
A
 
A
G
x
S
G
|
G
G
|
G
A
 
V
K
 
S
G
 
S
P
 
L
Q
 
D
D
 
D
I
 
L
S
 
R
H
 
-
I
 
-
L
 
-
S
 
-
E
 
-
T
 
-
D
 
-
A
 
-
S
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
A
I
 
I
A
 
A
S
 
T
M
 
L
L
 
T
H
 
H
Y
 
R
G
 
G

Sites not aligning to the query:

3zs4A Crystal structure of mycobacterium tuberculosis phosphoribosyl isomerase with bound prfar
24% identity, 80% coverage: 30:232/253 of query aligns to 31:218/244 of 3zs4A

query
sites
3zs4A
G
 
G
K
 
S
P
 
A
D
 
V
E
 
D
L
 
A
A
 
A
T
 
L
R
 
G
Y
 
W
Y
 
Q
E
 
R
Q
 
D
G
 
G
A
 
A
D
 
E
E
 
W
L
 
I
L
 
H
Y
 
L
I
 
V
D
 
D
T
 
L
V
 
D
A
 
A
S
x
A
L
 
-
Y
x
F
G
 
G
R
 
R
N
 
G
N
 
S
L
 
N
S
 
H
D
 
E
V
 
L
V
 
L
K
 
A
Q
 
E
A
 
V
A
 
V
S
 
G
H
 
K
I
 
L
F
 
D
I
 
V
P
 
Q
M
 
V
T
 
E
V
 
L
G
x
S
G
 
G
G
|
G
I
 
I
R
|
R
T
 
D
V
 
D
G
 
E
D
 
S
A
 
L
Q
 
A
T
 
A
L
 
A
L
 
L
R
 
A
S
 
T
G
 
G
A
 
C
D
 
A
K
 
R
I
 
V
A
 
N
I
 
V
N
x
G
T
|
T
A
 
A
A
 
A
V
 
L
K
 
E
N
 
N
P
 
P
K
 
Q
L
 
W
I
 
C
K
 
A
E
 
R
L
 
V
A
 
I
S
 
G
I
 
E
L
 
H
G
 
G
S
 
D
Q
 
Q
A
 
-
I
 
V
V
 
A
V
 
V
S
 
G
L
 
L
Q
x
D
V
 
V
K
 
Q
C
 
I
V
 
I
G
 
D
P
 
G
E
 
E
K
 
-
W
 
-
E
 
H
I
 
R
Y
 
L
V
 
R
D
 
G
N
 
R
G
|
G
R
x
W
E
 
E
K
 
T
T
 
D
G
 
G
L
 
G
D
 
D
A
 
L
M
 
W
D
 
D
W
 
V
A
 
L
K
 
E
Q
 
R
V
 
L
E
 
D
E
 
S
L
 
E
G
 
G
A
 
C
G
 
S
E
 
R
L
 
F
L
 
V
V
 
V
T
 
T
S
 
D
V
 
I
D
 
T
R
 
K
D
|
D
G
|
G
T
 
T
G
 
L
L
 
G
G
 
G
F
 
P
D
 
N
E
 
L
Q
 
D
F
 
L
I
 
L
S
 
A
R
 
G
L
 
V
A
 
A
S
 
D
N
 
R
V
 
T
S
 
D
L
 
A
P
 
P
V
 
V
V
 
I
A
 
A
G
 
S
G
|
G
G
|
G
A
 
V
K
 
S
G
 
S
P
 
L
Q
 
D
D
 
D
I
 
L
S
 
R
H
 
-
I
 
-
L
 
-
S
 
-
E
 
-
T
 
-
D
 
-
A
 
-
S
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
A
I
 
I
A
 
A
S
 
T
M
 
L
L
 
T
H
 
H
Y
 
R
G
 
G

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_013817863.1 NCBI__GCF_000214665.1:WP_013817863.1
MQKPRIIARLDIKTANVVKGIRFEGLRIMGKPDELATRYYEQGADELLYIDTVASLYGRN
NLSDVVKQAASHIFIPMTVGGGIRTVGDAQTLLRSGADKIAINTAAVKNPKLIKELASIL
GSQAIVVSLQVKCVGPEKWEIYVDNGREKTGLDAMDWAKQVEELGAGELLVTSVDRDGTG
LGFDEQFISRLASNVSLPVVAGGGAKGPQDISHILSETDASAVAIASMLHYGRATIGEIK
QELTKVGISTARH

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory