SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_013819451.1 NCBI__GCF_000214665.1:WP_013819451.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

A0R220 Threonine synthase; TS; EC 4.2.3.1 from Mycolicibacterium smegmatis (strain ATCC 700084 / mc(2)155) (Mycobacterium smegmatis) (see paper)
57% identity, 96% coverage: 2:350/364 of query aligns to 7:349/360 of A0R220

query
sites
A0R220
A
 
A
T
 
V
Q
 
H
Q
 
Q
R
 
P
Y
 
W
T
 
P
G
 
G
L
 
L
I
 
I
E
 
E
R
 
A
Y
 
Y
R
 
R
D
 
D
R
 
R
L
 
L
P
 
P
V
 
I
S
 
G
A
 
D
D
 
D
T
 
W
R
 
T
L
 
T
I
 
V
S
 
T
L
 
L
C
 
L
E
 
E
G
 
G
N
 
G
T
 
T
P
 
P
L
 
L
I
 
I
R
 
H
L
 
A
E
 
K
N
 
R
I
 
I
P
 
S
R
 
E
L
 
L
I
 
T
G
 
G
K
 
-
D
 
-
V
 
C
D
 
T
I
 
V
Y
 
H
V
 
L
K
 
K
F
 
V
E
 
E
G
 
G
L
 
L
N
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
F
 
F
K
 
K
D
 
D
R
 
R
G
 
G
M
 
M
T
 
T
M
 
V
A
 
A
V
 
V
T
 
T
K
 
E
A
 
S
V
 
L
E
 
A
E
 
R
G
 
G
S
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
I
 
V
I
 
L
C
 
C
A
 
A
S
 
S
T
 
T
G
 
G
N
 
N
T
 
T
S
 
S
A
 
A
S
 
S
A
 
A
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
V
 
A
R
 
R
A
 
A
G
 
G
I
 
I
K
 
T
A
 
C
F
 
A
V
 
V
L
 
L
I
 
I
P
 
P
E
 
Q
G
 
G
K
 
K
I
 
I
A
 
A
L
 
M
G
 
G
K
 
K
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
T
 
A
L
 
V
M
 
M
Y
 
H
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
I
 
I
I
 
I
Q
 
Q
I
 
V
N
 
D
G
 
G
N
 
N
F
 
F
D
 
D
A
 
D
G
 
C
M
 
L
N
 
E
I
 
L
V
 
A
K
 
R
Q
x
K
I
 
L
-
 
T
A
 
A
D
 
D
H
 
F
A
 
P
P
 
T
V
 
I
A
 
A
I
 
L
V
 
V
N
 
N
S
 
S
I
 
V
N
 
N
P
 
P
F
 
Y
R
 
R
L
 
I
Q
 
E
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
T
 
T
A
 
A
A
 
A
F
 
F
E
 
E
I
 
I
I
 
V
D
 
D
E
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
T
A
 
A
P
 
P
D
 
D
Y
 
V
H
 
H
C
 
A
L
 
L
P
 
P
V
 
V
G
 
G
N
 
N
A
 
A
G
 
G
N
 
N
I
 
I
S
 
T
A
 
A
Y
 
Y
W
 
W
M
 
K
G
 
G
Y
 
Y
T
 
S
E
 
E
Y
 
Y
A
 
H
Q
 
R
D
 
D
L
 
-
P
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
-
A
 
G
V
 
V
A
 
S
D
 
D
K
 
R
R
 
L
P
 
P
I
 
R
M
 
M
C
 
L
G
 
G
Y
 
T
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
P
 
P
F
 
L
V
 
V
A
 
T
G
 
G
K
 
A
M
 
P
I
 
V
D
 
K
H
 
D
P
 
P
E
 
E
T
 
T
V
 
I
A
 
A
T
 
T
A
 
A
I
 
I
R
 
R
I
 
I
G
 
G
H
 
S
P
 
P
Q
 
A
S
 
S
W
 
W
D
 
N
L
 
S
A
 
A
W
 
V
N
 
E
A
 
A
Q
 
Q
K
 
Q
E
 
Q
S
 
S
G
 
D
G
 
G
W
 
R
F
 
F
D
 
L
S
 
A
Q
 
A
T
 
T
D
 
D
Q
 
E
Q
 
E
I
 
I
L
 
L
A
 
A
A
 
A
Q
 
Y
K
 
H
M
 
L
L
 
V
S
 
A
Q
 
R
Y
 
T
E
 
E
G
 
G
V
 
V
F
 
F
C
 
V
E
 
E
P
 
P
A
 
A
S
 
S
A
 
A
A
 
A
S
 
S
L
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
L
L
 
L
Q
 
K
D
 
S
I
 
V
G
 
E
S
 
D
G
 
G
K
 
W
I
 
V
P
 
K
E
 
R
G
 
G
S
 
S
R
 
T
I
 
V
V
 
V
C
 
C
T
 
T
L
 
V
T
 
T
G
 
G
N
 
N
G
 
G
I
 
L
K
 
K
D
 
D
P
 
P
D
 
D
I
 
T
A
 
A
I
 
L
S
 
K
Q
 
G
C
 
M
K
 
P
D
 
Q
A
 
V
H
 
T
P
 
P
V
 
V
T
 
P
I
 
V
E
 
D

2zsjA Crystal structure of threonine synthase from aquifex aeolicus vf5
55% identity, 98% coverage: 6:360/364 of query aligns to 1:348/350 of 2zsjA

query
sites
2zsjA
R
 
R
Y
 
W
T
 
Q
G
 
G
L
 
I
I
 
I
E
 
K
R
 
Q
Y
 
Y
R
 
K
D
 
K
R
 
Y
L
 
L
P
 
P
V
 
V
S
 
D
A
 
E
D
 
N
T
 
T
R
 
P
L
 
I
I
 
V
S
 
T
L
 
L
C
 
Y
E
 
E
G
 
G
N
 
N
T
 
T
P
 
P
L
 
L
I
 
I
R
 
E
L
 
A
E
 
D
N
 
N
I
 
L
P
 
A
R
 
R
L
 
A
I
 
I
G
 
G
K
 
F
D
 
K
V
 
G
D
 
K
I
 
I
Y
 
Y
V
 
L
K
 
K
F
 
Y
E
 
E
G
 
G
L
 
L
N
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
F
|
F
K
|
K
D
 
D
R
 
R
G
 
G
M
 
M
T
 
T
M
 
L
A
 
A
V
 
I
T
 
S
K
 
K
A
 
A
V
 
V
E
 
E
E
 
A
G
 
G
S
 
K
Q
 
R
A
 
A
I
 
V
I
 
I
C
 
C
A
 
A
S
 
S
T
|
T
G
 
G
N
|
N
T
 
T
S
 
S
A
 
A
S
 
S
A
 
A
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
V
 
A
R
 
R
A
 
A
G
 
G
I
 
L
K
 
R
A
 
A
F
 
Y
V
 
V
L
 
L
I
 
L
P
 
P
E
 
K
G
 
G
K
 
A
I
 
V
A
 
A
L
 
I
G
 
G
K
 
K
L
 
L
A
 
S
Q
 
Q
T
 
A
L
 
M
M
 
I
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
I
 
V
I
 
L
Q
 
A
I
 
I
N
 
Q
G
 
G
N
 
T
F
 
F
D
 
D
A
 
D
G
 
A
M
 
L
N
 
N
I
 
I
V
 
V
K
 
R
Q
 
K
I
 
I
A
 
G
D
 
E
H
 
N
A
 
F
P
 
P
V
 
V
A
 
E
I
 
I
V
 
V
N
 
N
S
 
S
I
 
V
N
 
N
P
 
P
F
 
Y
R
 
R
L
 
I
Q
 
E
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
T
 
T
A
 
A
A
 
A
F
 
F
E
 
E
I
 
I
I
 
C
D
 
D
E
 
T
L
 
L
G
 
G
G
 
E
A
 
A
P
 
P
D
 
D
Y
 
Y
H
 
H
C
 
F
L
 
I
P
 
P
V
|
V
G
|
G
N
|
N
A
|
A
G
|
G
N
|
N
I
 
I
S
 
T
A
 
A
Y
 
Y
W
 
W
M
 
K
G
 
G
Y
 
F
T
 
K
E
 
I
Y
 
Y
A
 
Y
Q
 
E
D
 
E
L
 
-
P
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
-
A
 
G
V
 
K
A
 
I
D
 
T
K
 
K
R
 
L
P
 
P
I
 
R
M
 
M
C
 
M
G
 
G
Y
 
W
Q
|
Q
A
 
A
A
 
E
G
 
G
A
|
A
A
 
A
P
 
P
F
 
I
V
 
V
A
 
K
G
 
G
K
 
Y
M
 
P
I
 
I
D
 
K
H
 
N
P
 
P
E
 
Q
T
 
T
V
 
I
A
 
A
T
 
T
A
|
A
I
 
I
R
 
K
I
 
I
G
 
G
H
 
N
P
 
P
Q
 
Y
S
 
S
W
 
W
D
 
K
L
 
S
A
 
A
W
 
L
N
 
K
A
 
A
Q
 
A
K
 
Q
E
 
E
S
 
S
G
 
G
G
 
G
W
 
K
F
 
I
D
 
D
S
 
A
Q
 
V
T
 
S
D
 
D
Q
 
S
Q
 
E
I
 
I
L
 
L
A
 
Y
A
 
A
Q
 
Y
K
 
K
M
 
L
L
 
I
S
 
A
Q
 
S
Y
 
T
E
 
E
G
 
G
V
 
V
F
 
F
C
 
C
E
 
E
P
 
P
A
 
A
S
 
S
A
 
A
A
 
A
S
 
S
L
 
V
A
 
A
G
 
G
A
 
L
L
 
I
Q
 
K
D
 
L
I
 
V
G
 
R
S
 
E
G
 
G
K
 
F
I
 
F
P
 
K
E
 
G
G
 
G
S
 
E
R
 
V
I
 
V
V
 
T
C
 
C
T
 
T
L
 
L
T
|
T
G
|
G
N
 
N
G
 
G
I
 
L
K
 
K
D
 
D
P
 
P
D
 
D
I
 
T
A
 
A
I
 
I
S
 
K
Q
 
V
C
 
C
K
 
E
D
 
E
A
 
-
H
 
-
P
 
P
V
 
I
T
 
T
I
 
V
E
 
P
A
 
P
N
 
D
L
 
F
D
 
D
A
 
E
V
 
V
K
 
V
K
 
K
A
 
V
I
 
L

P9WG59 Threonine synthase; TS; EC 4.2.3.1 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see 2 papers)
59% identity, 93% coverage: 2:338/364 of query aligns to 7:337/360 of P9WG59

query
sites
P9WG59
A
 
A
T
 
T
Q
 
H
Q
 
Q
R
 
P
Y
 
W
T
 
P
G
 
G
L
 
V
I
 
I
E
 
A
R
 
A
Y
 
Y
R
 
R
D
 
D
R
 
R
L
 
L
P
 
P
V
 
V
S
 
G
A
 
D
D
 
D
T
 
W
R
 
T
L
 
P
I
 
V
S
 
T
L
 
L
C
 
L
E
 
E
G
 
G
N
 
G
T
 
T
P
 
P
L
 
L
I
 
I
R
 
A
L
 
A
E
 
T
N
 
N
I
 
L
P
 
S
R
 
K
L
 
Q
I
 
T
G
 
G
K
 
-
D
 
-
V
 
C
D
 
T
I
 
I
Y
 
H
V
 
L
K
 
K
F
 
V
E
 
E
G
 
G
L
 
L
N
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
F
 
F
K
|
K
D
 
D
R
 
R
G
 
G
M
 
M
T
 
T
M
 
M
A
 
A
V
 
V
T
 
T
K
 
D
A
 
A
V
 
L
E
 
A
E
 
H
G
 
G
S
 
Q
Q
 
R
A
 
A
I
 
V
I
 
L
C
 
C
A
 
A
S
 
S
T
 
T
G
 
G
N
|
N
T
 
T
S
 
S
A
 
A
S
 
S
A
 
A
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
V
 
A
R
 
R
A
 
A
G
 
G
I
 
I
K
 
T
A
 
C
F
 
A
V
 
V
L
 
L
I
 
I
P
 
P
E
 
Q
G
 
G
K
 
K
I
 
I
A
 
A
L
 
M
G
 
G
K
 
K
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
T
 
A
L
 
V
M
 
M
Y
 
H
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
I
 
I
I
 
I
Q
 
Q
I
 
I
N
 
D
G
 
G
N
 
N
F
 
F
D
 
D
A
 
D
G
 
C
M
 
L
N
 
E
I
 
L
V
 
A
K
 
R
Q
x
K
I
 
M
A
 
A
-
 
A
D
 
D
H
 
F
A
 
P
P
 
T
V
 
I
A
 
S
I
 
L
V
 
V
N
 
N
S
 
S
I
 
V
N
 
N
P
 
P
F
 
V
R
 
R
L
 
I
Q
 
E
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
T
 
T
A
 
A
A
 
A
F
 
F
E
 
E
I
 
I
I
 
V
D
 
D
E
 
V
L
 
L
G
 
G
G
 
T
A
 
A
P
 
P
D
 
D
Y
 
V
H
 
H
C
 
A
L
 
L
P
 
P
V
 
V
G
|
G
N
|
N
A
|
A
G
|
G
N
|
N
I
 
I
S
 
T
A
 
A
Y
 
Y
W
 
W
M
 
K
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
E
 
E
Y
 
Y
A
 
H
Q
 
Q
D
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
L
A
 
G
V
 
L
A
 
I
D
 
D
K
 
K
R
 
L
P
 
P
I
 
R
M
 
M
C
 
L
G
 
G
Y
 
T
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
P
 
P
F
 
L
V
 
V
A
 
L
G
 
G
K
 
E
M
 
P
I
 
V
D
 
S
H
 
H
P
 
P
E
 
E
T
 
T
V
 
I
A
 
A
T
 
T
A
 
A
I
 
I
R
 
R
I
 
I
G
 
G
H
 
S
P
 
P
Q
 
A
S
 
S
W
 
W
D
 
T
L
 
S
A
 
A
W
 
V
N
 
E
A
 
A
Q
 
Q
K
 
Q
E
 
Q
S
 
S
G
 
K
G
 
G
W
 
R
F
 
F
D
 
L
S
 
A
Q
 
A
T
 
S
D
 
D
Q
 
E
Q
 
E
I
 
I
L
 
L
A
 
A
A
 
A
Q
 
Y
K
 
H
M
 
L
L
 
V
S
 
A
Q
 
R
Y
 
V
E
 
E
G
 
G
V
 
V
F
 
F
C
 
V
E
 
E
P
 
P
A
 
A
S
 
S
A
 
A
A
 
A
S
 
S
L
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
L
L
 
L
Q
 
K
D
 
A
I
 
I
G
 
D
S
 
D
G
 
G
K
 
W
I
 
V
P
 
A
E
 
R
G
 
G
S
 
S
R
 
T
I
 
V
V
 
V
C
 
C
T
 
T
L
 
V
T
|
T
G
 
G
N
 
N
G
 
G
I
 
L
K
 
K
D
 
D
P
 
P
D
 
D
I
 
T
A
 
A
I
 
L

2d1fA Structure of mycobacterium tuberculosis threonine synthase (see paper)
59% identity, 92% coverage: 5:338/364 of query aligns to 1:328/349 of 2d1fA

query
sites
2d1fA
Q
 
Q
R
 
P
Y
 
W
T
 
P
G
 
G
L
 
V
I
 
I
E
 
A
R
 
A
Y
 
Y
R
 
R
D
 
D
R
 
R
L
 
L
P
 
P
V
 
V
S
 
G
A
 
D
D
 
D
T
 
W
R
 
T
L
 
P
I
 
V
S
 
T
L
 
L
C
 
L
E
 
E
G
 
G
N
 
G
T
 
T
P
 
P
L
 
L
I
 
I
R
 
A
L
 
A
E
 
T
N
 
N
I
 
L
P
 
S
R
 
K
L
 
Q
I
 
T
G
 
G
K
 
-
D
 
-
V
 
C
D
 
T
I
 
I
Y
 
H
V
 
L
K
 
K
F
 
V
E
 
E
G
 
G
L
 
L
N
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
F
|
F
K
|
K
D
 
D
R
 
R
G
 
G
M
 
M
T
 
T
M
 
M
A
 
A
V
 
V
T
 
T
K
 
D
A
 
A
V
 
L
E
 
A
E
 
H
G
 
G
S
 
Q
Q
 
R
A
 
A
I
 
V
I
 
L
C
 
C
A
 
A
S
 
S
T
|
T
G
 
G
N
|
N
T
 
T
S
 
S
A
 
A
S
 
S
A
 
A
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
V
 
A
R
 
R
A
 
A
G
 
G
I
 
I
K
 
T
A
 
C
F
 
A
V
 
V
L
 
L
I
 
I
P
 
P
E
 
Q
G
 
G
K
 
K
I
 
I
A
 
A
L
 
M
G
 
G
K
 
K
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
T
 
A
L
 
V
M
 
M
Y
 
H
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
I
 
I
I
 
I
Q
 
Q
I
 
I
N
 
D
G
 
G
N
 
N
F
 
F
D
 
D
A
 
D
G
 
C
M
 
L
N
 
E
I
 
L
V
 
A
K
 
R
Q
 
K
I
 
M
A
 
A
-
 
A
D
 
D
H
 
F
A
 
P
P
 
T
V
 
I
A
 
S
I
 
L
V
 
V
N
 
N
S
 
S
I
 
V
N
 
N
P
 
P
F
 
V
R
 
R
L
 
I
Q
 
E
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
T
 
T
A
 
A
A
 
A
F
 
F
E
 
E
I
 
I
I
 
V
D
 
D
E
 
V
L
 
L
G
 
G
G
 
T
A
 
A
P
 
P
D
 
D
Y
 
V
H
 
H
C
 
A
L
 
L
P
 
P
V
|
V
G
|
G
N
|
N
A
|
A
G
|
G
N
|
N
I
 
I
S
 
T
A
 
A
Y
 
Y
W
 
W
M
 
K
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
E
 
E
Y
 
Y
A
 
H
Q
 
Q
D
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
L
A
 
G
V
 
L
A
 
I
D
|
D
K
 
K
R
 
L
P
 
P
I
x
R
M
 
M
C
x
L
G
 
G
Y
 
T
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
P
 
P
F
 
L
V
 
V
A
 
L
G
 
G
K
 
E
M
 
P
I
 
V
D
 
S
H
 
H
P
 
P
E
 
E
T
 
T
V
 
I
A
 
A
T
 
T
A
|
A
I
 
I
R
 
R
I
 
I
G
 
G
H
 
S
P
 
P
Q
 
A
S
 
S
W
 
W
D
 
T
L
 
S
A
 
A
W
 
V
N
 
E
A
 
A
Q
 
Q
K
 
Q
E
 
Q
S
 
S
G
 
K
G
 
G
W
 
R
F
 
F
D
 
L
S
 
A
Q
 
A
T
 
S
D
 
D
Q
 
E
Q
 
E
I
 
I
L
 
L
A
 
A
A
 
A
Q
 
Y
K
 
H
M
 
L
L
 
V
S
 
A
Q
 
R
Y
 
V
E
 
E
G
 
G
V
 
V
F
 
F
C
 
V
E
 
E
P
 
P
A
 
A
S
 
S
A
 
A
A
 
A
S
 
S
L
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
L
L
 
L
Q
 
K
D
 
A
I
 
I
G
 
D
S
 
D
G
 
G
K
 
W
I
 
V
P
 
A
E
 
R
G
 
G
S
 
S
R
 
T
I
 
V
V
 
V
C
 
C
T
 
T
L
 
V
T
|
T
G
 
G
N
 
N
G
 
G
I
 
L
K
 
K
D
 
D
P
 
P
D
 
D
I
 
T
A
 
A
I
 
L

1uimA Crystal structure of threonine synthase from thermus thermophilus hb8, orthorhombic crystal form (see paper)
56% identity, 93% coverage: 10:347/364 of query aligns to 5:337/350 of 1uimA

query
sites
1uimA
L
 
L
I
 
I
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
R
 
R
D
 
N
R
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
V
S
 
S
A
 
E
D
 
K
T
 
T
R
 
P
L
 
V
I
 
I
S
 
S
L
 
L
C
 
L
E
 
E
G
 
G
N
 
S
T
 
T
P
 
P
L
 
L
I
 
I
R
 
P
L
 
L
E
 
K
N
 
G
I
 
P
P
 
E
R
 
E
L
 
A
I
 
R
G
 
K
K
 
K
D
 
G
V
 
I
D
 
R
I
 
L
Y
 
Y
V
 
A
K
 
K
F
 
Y
E
 
E
G
 
G
L
 
L
N
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
F
|
F
K
|
K
D
 
D
R
 
R
G
 
G
M
 
M
T
 
T
M
 
L
A
 
A
V
 
V
T
 
S
K
 
K
A
 
A
V
 
V
E
 
E
E
 
G
G
 
G
S
 
A
Q
 
Q
A
 
A
I
 
V
I
 
A
C
 
C
A
 
A
S
 
S
T
|
T
G
 
G
N
|
N
T
 
T
S
 
A
A
 
A
S
 
S
A
 
A
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
V
 
A
R
 
R
A
 
A
G
 
G
I
 
I
K
 
L
A
 
A
F
 
I
V
 
V
L
 
V
I
 
L
P
 
P
E
 
A
G
 
G
K
 
Y
I
 
V
A
 
A
L
 
L
G
 
G
K
 
K
L
 
V
A
 
A
Q
 
Q
T
 
S
L
 
L
M
 
V
Y
 
H
G
 
G
A
 
A
Q
 
R
I
 
I
I
 
V
Q
 
Q
I
 
V
N
 
E
G
 
G
N
 
N
F
 
F
D
 
D
A
 
D
G
 
A
M
 
L
N
 
R
I
 
L
V
 
T
K
 
Q
Q
 
K
I
 
L
A
 
T
D
 
E
H
 
A
A
 
F
P
 
P
V
 
V
A
 
A
I
 
L
V
 
V
N
 
N
S
 
S
I
 
V
N
 
N
P
 
P
F
 
H
R
 
R
L
 
L
Q
 
E
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
T
 
T
A
 
L
A
 
A
F
 
F
E
 
E
I
 
V
I
 
V
D
 
D
E
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
D
A
 
A
P
 
P
D
 
H
Y
 
Y
H
 
H
C
 
A
L
 
L
P
 
P
V
 
V
G
|
G
N
|
N
A
|
A
G
|
G
N
|
N
I
 
I
S
 
T
A
 
A
Y
 
H
W
 
W
M
 
M
G
 
G
Y
 
Y
T
 
K
E
 
A
Y
 
Y
A
 
H
Q
 
A
D
 
L
L
 
-
P
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
-
A
 
G
V
 
K
A
 
A
D
 
K
K
 
R
R
 
L
P
|
P
I
 
R
M
 
M
C
 
L
G
|
G
Y
 
F
Q
|
Q
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
P
 
P
F
 
L
V
 
V
A
 
L
G
 
G
K
 
R
M
 
P
I
 
V
D
 
E
H
 
R
P
 
P
E
 
E
T
 
T
V
 
L
A
 
A
T
 
T
A
|
A
I
 
I
R
 
R
I
 
I
G
 
G
H
 
N
P
 
P
Q
 
A
S
 
S
W
 
W
D
 
Q
L
 
G
A
 
A
W
 
V
N
 
R
A
 
A
Q
 
K
K
 
E
E
 
E
S
 
S
G
 
G
G
 
G
W
 
V
F
 
I
D
 
E
S
 
A
Q
 
V
T
 
T
D
 
D
Q
 
E
Q
 
E
I
 
I
L
 
L
A
 
F
A
 
A
Q
 
Y
K
 
R
M
 
Y
L
 
L
S
 
A
Q
 
R
Y
 
E
E
 
E
G
 
G
V
 
I
F
 
F
C
 
C
E
|
E
P
 
P
A
 
A
S
 
S
A
 
A
A
 
A
S
 
A
L
 
M
A
 
A
G
 
G
A
 
V
L
 
F
Q
 
K
D
 
L
I
 
L
G
 
R
S
 
E
G
 
G
K
 
R
I
 
L
P
 
E
E
 
P
G
 
E
S
 
S
R
 
T
I
 
V
V
 
V
C
 
L
T
 
T
L
 
L
T
|
T
G
|
G
N
 
H
G
 
G
I
 
L
K
 
K
D
 
D
P
 
P
D
 
A
I
 
T
A
 
A
I
 
E
S
 
R
Q
 
V
C
 
A
K
 
E
D
 
L
A
 
P
H
 
P
P
 
P
V
 
V

3aeyA Apo form of threonine synthase from thermus thermophilus hb8 (see paper)
56% identity, 93% coverage: 10:347/364 of query aligns to 4:336/350 of 3aeyA

query
sites
3aeyA
L
 
L
I
 
I
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
R
 
R
D
 
N
R
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
V
S
 
S
A
 
E
D
 
K
T
 
T
R
 
P
L
 
V
I
 
I
S
 
S
L
 
L
C
 
L
E
 
E
G
 
G
N
 
S
T
 
T
P
 
P
L
 
L
I
 
I
R
 
P
L
 
L
E
 
K
N
 
G
I
 
P
P
 
E
R
 
E
L
 
A
I
 
R
G
 
K
K
 
K
D
 
G
V
 
I
D
 
R
I
 
L
Y
 
Y
V
 
A
K
 
K
F
 
Y
E
 
E
G
 
G
L
 
L
N
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
F
 
F
K
|
K
D
 
D
R
 
R
G
 
G
M
 
M
T
 
T
M
 
L
A
 
A
V
 
V
T
 
S
K
 
K
A
 
A
V
 
V
E
 
E
E
 
G
G
 
G
S
 
A
Q
 
Q
A
 
A
I
 
V
I
 
A
C
 
C
A
 
A
S
 
S
T
|
T
G
|
G
N
|
N
T
|
T
S
 
A
A
 
A
S
 
S
A
 
A
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
V
 
A
R
 
R
A
 
A
G
 
G
I
 
I
K
 
L
A
 
A
F
 
I
V
 
V
L
 
V
I
 
L
P
 
P
E
 
A
G
 
G
K
 
Y
I
 
V
A
 
A
L
 
L
G
 
G
K
 
K
L
 
V
A
 
A
Q
 
Q
T
 
S
L
 
L
M
 
V
Y
 
H
G
 
G
A
 
A
Q
 
R
I
 
I
I
 
V
Q
 
Q
I
 
V
N
 
E
G
 
G
N
 
N
F
 
F
D
 
D
A
 
D
G
 
A
M
 
L
N
 
R
I
 
L
V
 
T
K
 
Q
Q
 
K
I
 
L
A
 
T
D
 
E
H
 
A
A
 
F
P
 
P
V
 
V
A
 
A
I
 
L
V
 
V
N
 
N
S
|
S
I
 
V
N
 
N
P
 
P
F
 
H
R
|
R
L
 
L
Q
 
E
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
T
 
T
A
 
L
A
 
A
F
 
F
E
 
E
I
 
V
I
 
V
D
 
D
E
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
D
A
 
A
P
 
P
D
 
H
Y
 
Y
H
 
H
C
 
A
L
 
L
P
 
P
V
 
V
G
 
G
N
|
N
A
 
A
G
 
G
N
 
N
I
 
I
S
 
T
A
 
A
Y
 
H
W
 
W
M
 
M
G
 
G
Y
 
Y
T
 
K
E
 
A
Y
 
Y
A
 
H
Q
 
A
D
 
L
L
 
-
P
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
-
A
 
G
V
 
K
A
 
A
D
 
K
K
 
R
R
 
L
P
|
P
I
 
R
M
 
M
C
 
L
G
|
G
Y
 
F
Q
|
Q
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
P
 
P
F
 
L
V
 
V
A
 
L
G
 
G
K
x
R
M
 
P
I
x
V
D
x
E
H
x
R
P
 
P
E
 
E
T
 
T
V
 
L
A
 
A
T
 
T
A
|
A
I
 
I
R
 
R
I
 
I
G
 
G
H
 
N
P
 
P
Q
 
A
S
 
S
W
 
W
D
 
Q
L
 
G
A
 
A
W
 
V
N
 
R
A
 
A
Q
 
K
K
 
E
E
 
E
S
 
S
G
 
G
G
 
G
W
 
V
F
 
I
D
 
E
S
 
A
Q
 
V
T
 
T
D
 
D
Q
 
E
Q
 
E
I
 
I
L
 
L
A
 
F
A
 
A
Q
 
Y
K
 
R
M
 
Y
L
 
L
S
 
A
Q
 
R
Y
 
E
E
 
E
G
 
G
V
 
I
F
 
F
C
 
C
E
 
E
P
 
P
A
 
A
S
 
S
A
 
A
A
 
A
S
 
A
L
 
M
A
 
A
G
 
G
A
 
V
L
 
F
Q
 
K
D
 
L
I
 
L
G
 
R
S
 
E
G
 
G
K
 
R
I
 
L
P
 
E
E
 
P
G
 
E
S
 
S
R
 
T
I
 
V
V
 
V
C
 
L
T
 
T
L
 
L
T
|
T
G
 
G
N
 
H
G
 
G
I
 
L
K
 
K
D
 
D
P
 
P
D
 
A
I
 
T
A
 
A
I
 
E
S
 
R
Q
 
V
C
 
A
K
 
E
D
 
L
A
 
P
H
 
P
P
 
P
V
 
V

3aexA Catalytic intermediate analogue of threonine synthase from thermus thermophilus hb8 (see paper)
56% identity, 93% coverage: 10:347/364 of query aligns to 5:337/351 of 3aexA

query
sites
3aexA
L
 
L
I
 
I
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
R
 
R
D
 
N
R
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
V
S
 
S
A
 
E
D
 
K
T
 
T
R
 
P
L
 
V
I
 
I
S
 
S
L
 
L
C
 
L
E
 
E
G
 
G
N
 
S
T
 
T
P
 
P
L
 
L
I
 
I
R
 
P
L
 
L
E
 
K
N
 
G
I
 
P
P
 
E
R
 
E
L
 
A
I
 
R
G
 
K
K
 
K
D
 
G
V
 
I
D
 
R
I
 
L
Y
 
Y
V
 
A
K
 
K
F
 
Y
E
 
E
G
 
G
L
 
L
N
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
F
 
F
K
|
K
D
 
D
R
 
R
G
 
G
M
 
M
T
 
T
M
 
L
A
 
A
V
 
V
T
 
S
K
 
K
A
 
A
V
 
V
E
 
E
E
 
G
G
 
G
S
 
A
Q
 
Q
A
 
A
I
 
V
I
 
A
C
 
C
A
 
A
S
|
S
T
|
T
G
 
G
N
|
N
T
|
T
S
 
A
A
 
A
S
 
S
A
 
A
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
V
 
A
R
 
R
A
 
A
G
 
G
I
 
I
K
 
L
A
 
A
F
 
I
V
 
V
L
 
V
I
 
L
P
 
P
E
 
A
G
 
G
K
 
Y
I
 
V
A
 
A
L
 
L
G
 
G
K
 
K
L
 
V
A
 
A
Q
 
Q
T
 
S
L
 
L
M
 
V
Y
 
H
G
 
G
A
 
A
Q
 
R
I
 
I
I
 
V
Q
 
Q
I
 
V
N
 
E
G
 
G
N
 
N
F
 
F
D
 
D
A
 
D
G
 
A
M
 
L
N
 
R
I
 
L
V
 
T
K
 
Q
Q
 
K
I
 
L
A
 
T
D
 
E
H
 
A
A
 
F
P
 
P
V
 
V
A
 
A
I
 
L
V
 
V
N
|
N
S
|
S
I
 
V
N
 
N
P
 
P
F
 
H
R
|
R
L
 
L
Q
 
E
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
T
 
T
A
 
L
A
 
A
F
 
F
E
 
E
I
 
V
I
 
V
D
 
D
E
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
D
A
 
A
P
 
P
D
 
H
Y
 
Y
H
 
H
C
 
A
L
 
L
P
 
P
V
|
V
G
|
G
N
|
N
A
|
A
G
|
G
N
|
N
I
 
I
S
 
T
A
 
A
Y
 
H
W
 
W
M
 
M
G
 
G
Y
 
Y
T
 
K
E
 
A
Y
 
Y
A
 
H
Q
 
A
D
 
L
L
 
-
P
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
-
A
 
G
V
 
K
A
 
A
D
 
K
K
 
R
R
 
L
P
|
P
I
 
R
M
 
M
C
 
L
G
|
G
Y
 
F
Q
|
Q
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
P
 
P
F
 
L
V
 
V
A
 
L
G
 
G
K
 
R
M
 
P
I
 
V
D
 
E
H
 
R
P
 
P
E
 
E
T
 
T
V
 
L
A
 
A
T
 
T
A
|
A
I
|
I
R
 
R
I
 
I
G
 
G
H
 
N
P
 
P
Q
 
A
S
 
S
W
 
W
D
 
Q
L
 
G
A
 
A
W
 
V
N
 
R
A
 
A
Q
 
K
K
 
E
E
 
E
S
 
S
G
 
G
G
 
G
W
 
V
F
 
I
D
 
E
S
 
A
Q
 
V
T
 
T
D
 
D
Q
 
E
Q
 
E
I
 
I
L
 
L
A
 
F
A
 
A
Q
 
Y
K
 
R
M
 
Y
L
 
L
S
 
A
Q
 
R
Y
 
E
E
 
E
G
 
G
V
 
I
F
 
F
C
 
C
E
|
E
P
 
P
A
 
A
S
 
S
A
 
A
A
 
A
S
 
A
L
 
M
A
 
A
G
 
G
A
 
V
L
 
F
Q
 
K
D
 
L
I
 
L
G
 
R
S
 
E
G
 
G
K
 
R
I
 
L
P
 
E
E
 
P
G
 
E
S
 
S
R
 
T
I
 
V
V
 
V
C
 
L
T
 
T
L
 
L
T
|
T
G
 
G
N
 
H
G
 
G
I
 
L
K
 
K
D
 
D
P
 
P
D
 
A
I
 
T
A
 
A
I
 
E
S
 
R
Q
 
V
C
 
A
K
 
E
D
 
L
A
 
P
H
 
P
P
 
P
V
 
V

1v7cA Crystal structure of threonine synthase from thermus thermophilus hb8 in complex with a substrate analogue (see paper)
56% identity, 93% coverage: 10:347/364 of query aligns to 5:337/351 of 1v7cA

query
sites
1v7cA
L
 
L
I
 
I
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
R
 
R
D
 
N
R
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
V
S
 
S
A
 
E
D
 
K
T
 
T
R
 
P
L
 
V
I
 
I
S
 
S
L
 
L
C
 
L
E
 
E
G
 
G
N
 
S
T
 
T
P
 
P
L
 
L
I
 
I
R
 
P
L
 
L
E
 
K
N
 
G
I
 
P
P
 
E
R
 
E
L
 
A
I
 
R
G
 
K
K
 
K
D
 
G
V
 
I
D
 
R
I
 
L
Y
 
Y
V
 
A
K
 
K
F
 
Y
E
 
E
G
 
G
L
 
L
N
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
F
 
F
K
|
K
D
 
D
R
 
R
G
 
G
M
 
M
T
 
T
M
 
L
A
 
A
V
 
V
T
 
S
K
 
K
A
 
A
V
 
V
E
 
E
E
 
G
G
 
G
S
 
A
Q
 
Q
A
 
A
I
 
V
I
 
A
C
 
C
A
 
A
S
|
S
T
|
T
G
 
G
N
|
N
T
|
T
S
 
A
A
 
A
S
 
S
A
 
A
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
V
 
A
R
 
R
A
 
A
G
 
G
I
 
I
K
 
L
A
 
A
F
 
I
V
 
V
L
 
V
I
 
L
P
 
P
E
 
A
G
 
G
K
 
Y
I
 
V
A
 
A
L
 
L
G
 
G
K
 
K
L
 
V
A
 
A
Q
 
Q
T
 
S
L
 
L
M
 
V
Y
 
H
G
 
G
A
 
A
Q
 
R
I
 
I
I
 
V
Q
 
Q
I
 
V
N
 
E
G
 
G
N
 
N
F
|
F
D
 
D
A
 
D
G
 
A
M
 
L
N
 
R
I
 
L
V
 
T
K
 
Q
Q
 
K
I
 
L
A
 
T
D
 
E
H
 
A
A
 
F
P
 
P
V
 
V
A
 
A
I
 
L
V
 
V
N
|
N
S
|
S
I
 
V
N
 
N
P
 
P
F
 
H
R
|
R
L
 
L
Q
 
E
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
T
 
T
A
 
L
A
 
A
F
 
F
E
 
E
I
 
V
I
 
V
D
 
D
E
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
D
A
 
A
P
 
P
D
 
H
Y
 
Y
H
 
H
C
 
A
L
 
L
P
 
P
V
|
V
G
|
G
N
|
N
A
|
A
G
|
G
N
|
N
I
 
I
S
 
T
A
 
A
Y
 
H
W
 
W
M
 
M
G
 
G
Y
 
Y
T
 
K
E
 
A
Y
 
Y
A
 
H
Q
 
A
D
 
L
L
 
-
P
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
-
A
 
G
V
 
K
A
 
A
D
 
K
K
 
R
R
 
L
P
|
P
I
 
R
M
 
M
C
 
L
G
|
G
Y
 
F
Q
|
Q
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
P
 
P
F
 
L
V
 
V
A
 
L
G
 
G
K
 
R
M
 
P
I
 
V
D
 
E
H
 
R
P
 
P
E
 
E
T
 
T
V
 
L
A
 
A
T
 
T
A
|
A
I
|
I
R
 
R
I
 
I
G
 
G
H
 
N
P
 
P
Q
 
A
S
 
S
W
 
W
D
 
Q
L
 
G
A
 
A
W
 
V
N
 
R
A
 
A
Q
 
K
K
 
E
E
 
E
S
 
S
G
 
G
G
 
G
W
 
V
F
 
I
D
 
E
S
 
A
Q
 
V
T
 
T
D
 
D
Q
 
E
Q
 
E
I
 
I
L
 
L
A
 
F
A
 
A
Q
 
Y
K
 
R
M
 
Y
L
 
L
S
 
A
Q
 
R
Y
 
E
E
 
E
G
 
G
V
 
I
F
 
F
C
 
C
E
|
E
P
 
P
A
 
A
S
 
S
A
 
A
A
 
A
S
 
A
L
 
M
A
 
A
G
 
G
A
 
V
L
 
F
Q
 
K
D
 
L
I
 
L
G
 
R
S
 
E
G
 
G
K
 
R
I
 
L
P
 
E
E
 
P
G
 
E
S
 
S
R
 
T
I
 
V
V
 
V
C
 
L
T
 
T
L
 
L
T
|
T
G
 
G
N
 
H
G
 
G
I
 
L
K
 
K
D
 
D
P
 
P
D
 
A
I
 
T
A
 
A
I
 
E
S
 
R
Q
 
V
C
 
A
K
 
E
D
 
L
A
 
P
H
 
P
P
 
P
V
 
V

6nmxA Threonine synthase from bacillus subtilis atcc 6633 with plp and appa (see paper)
54% identity, 96% coverage: 7:356/364 of query aligns to 3:343/350 of 6nmxA

query
sites
6nmxA
Y
 
W
T
 
K
G
 
G
L
 
L
I
 
I
E
 
H
R
 
Q
Y
 
Y
R
 
K
D
 
E
R
 
F
L
 
L
P
 
P
V
 
V
S
 
T
A
 
D
D
 
Q
T
 
T
R
 
P
L
 
A
I
 
L
S
 
T
L
 
L
C
 
H
E
 
E
G
 
G
N
 
N
T
 
T
P
 
P
L
 
L
I
 
I
R
 
H
L
 
L
E
 
P
N
 
K
I
 
L
P
 
S
R
 
E
L
 
Q
I
 
L
G
 
G
K
 
-
D
 
-
V
 
I
D
 
E
I
 
L
Y
 
H
V
 
V
K
 
K
F
 
T
E
 
E
G
 
G
L
 
V
N
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
F
 
F
K
|
K
D
 
D
R
 
R
G
 
G
M
 
M
T
 
V
M
 
M
A
 
A
V
 
V
T
 
A
K
 
K
A
 
A
V
 
K
E
 
E
E
 
E
G
 
G
S
 
N
Q
 
D
A
 
T
I
 
I
I
 
M
C
 
C
A
 
A
S
|
S
T
|
T
G
 
G
N
|
N
T
|
T
S
 
S
A
 
A
S
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
V
 
A
R
 
R
A
 
A
G
 
N
I
 
M
K
 
K
A
 
C
F
 
I
V
 
V
L
 
I
I
 
I
P
 
P
E
 
N
G
 
G
K
 
K
I
 
I
A
 
A
L
 
F
G
 
G
K
 
K
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
T
 
A
L
 
V
M
 
M
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
Q
 
E
I
 
I
I
 
I
Q
 
A
I
 
I
N
 
D
G
 
G
N
 
N
F
|
F
D
 
D
A
 
D
G
 
A
M
 
L
N
 
K
I
 
I
V
 
V
K
 
R
Q
 
S
I
 
I
A
 
C
D
 
E
H
 
K
A
 
S
P
 
P
V
 
I
A
 
A
I
 
L
V
 
V
N
|
N
S
|
S
I
 
V
N
 
N
P
 
P
F
 
Y
R
|
R
L
 
L
Q
 
E
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
T
 
T
A
 
A
A
 
A
F
 
F
E
 
E
I
 
V
I
 
C
D
 
E
E
 
Q
L
 
L
G
 
G
G
 
E
A
 
A
P
 
P
D
 
D
Y
 
V
H
 
L
C
 
A
L
 
I
P
 
P
V
|
V
G
|
G
N
|
N
A
|
A
G
|
G
N
|
N
I
 
I
S
 
S
A
 
A
Y
 
Y
W
 
W
M
 
K
G
 
G
Y
 
F
T
 
K
E
 
E
Y
 
Y
A
 
H
Q
 
E
D
 
K
L
 
-
P
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
-
A
 
-
V
 
N
A
 
G
D
 
T
K
 
S
R
 
L
P
 
P
I
 
K
M
 
M
C
 
R
G
 
G
Y
 
F
Q
x
E
A
 
A
A
 
E
G
 
G
A
x
S
A
 
A
P
 
A
F
 
I
V
 
V
A
 
R
G
 
N
K
 
E
M
 
V
I
 
I
D
 
E
H
 
N
P
 
P
E
 
E
T
 
T
V
 
I
A
 
A
T
 
T
A
|
A
I
|
I
R
 
R
I
 
I
G
 
G
H
 
N
P
 
P
Q
 
A
S
 
S
W
 
W
D
 
D
L
 
K
A
 
A
W
 
V
N
 
K
A
 
A
Q
 
A
K
 
E
E
 
E
S
 
S
G
 
N
G
 
G
W
 
K
F
 
I
D
 
D
S
 
E
Q
 
V
T
 
T
D
 
D
Q
 
D
Q
 
E
I
 
I
L
 
L
A
 
H
A
 
A
Q
 
Y
K
 
Q
M
 
L
L
 
I
S
 
A
Q
 
R
Y
 
E
E
 
E
G
 
G
V
 
V
F
 
F
C
 
A
E
|
E
P
 
P
A
 
G
S
 
S
A
 
C
A
 
A
S
 
S
L
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
V
L
 
L
Q
 
K
D
 
Q
I
 
V
G
 
K
S
 
S
G
 
G
K
 
E
I
 
I
P
 
P
E
 
K
G
 
G
S
 
S
R
 
K
I
 
V
V
 
V
C
 
A
T
 
V
L
 
L
T
|
T
G
 
G
N
 
N
G
 
G
I
 
L
K
 
K
D
 
D
P
 
P
D
 
N
I
 
T
A
 
A
I
 
V
S
 
-
Q
 
D
C
 
I
K
 
S
D
 
E
A
 
I
H
 
K
P
 
P
V
 
V
T
 
T
I
 
L
E
 
P
A
 
T
N
 
N
L
 
E
D
 
D
A
 
S
V
 
I

6cgqB Threonine synthase from bacillus subtilis atcc 6633 with plp and plp- ala (see paper)
54% identity, 96% coverage: 7:356/364 of query aligns to 1:341/345 of 6cgqB

query
sites
6cgqB
Y
 
W
T
 
K
G
 
G
L
 
L
I
 
I
E
 
H
R
 
Q
Y
 
Y
R
 
K
D
 
E
R
 
F
L
 
L
P
 
P
V
 
V
S
 
T
A
 
D
D
 
Q
T
 
T
R
 
P
L
 
A
I
 
L
S
 
T
L
 
L
C
 
H
E
 
E
G
 
G
N
 
N
T
 
T
P
 
P
L
 
L
I
 
I
R
 
H
L
 
L
E
 
P
N
 
K
I
 
L
P
 
S
R
 
E
L
 
Q
I
 
L
G
 
G
K
 
-
D
 
-
V
 
I
D
 
E
I
 
L
Y
 
H
V
 
V
K
 
K
F
 
T
E
 
E
G
 
G
L
 
V
N
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
F
 
F
K
|
K
D
 
D
R
 
R
G
 
G
M
 
M
T
 
V
M
 
M
A
 
A
V
 
V
T
 
A
K
 
K
A
 
A
V
 
K
E
 
E
E
 
E
G
 
G
S
 
N
Q
 
D
A
 
T
I
 
I
I
 
M
C
 
C
A
 
A
S
|
S
T
|
T
G
 
G
N
|
N
T
|
T
S
 
S
A
 
A
S
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
V
 
A
R
 
R
A
 
A
G
 
N
I
 
M
K
 
K
A
 
C
F
 
I
V
 
V
L
 
I
I
 
I
P
 
P
E
 
N
G
 
G
K
 
K
I
 
I
A
 
A
L
 
F
G
 
G
K
 
K
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
T
 
A
L
 
V
M
 
M
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
Q
 
E
I
 
I
I
 
I
Q
 
A
I
 
I
N
 
D
G
 
G
N
 
N
F
 
F
D
 
D
A
 
D
G
 
A
M
 
L
N
 
K
I
 
I
V
 
V
K
 
R
Q
 
S
I
 
I
A
 
C
D
 
E
H
 
K
A
 
S
P
 
P
V
 
I
A
 
A
I
 
L
V
 
V
N
|
N
S
|
S
I
 
V
N
 
N
P
 
P
F
 
Y
R
|
R
L
 
L
Q
 
E
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
T
 
T
A
 
A
A
 
A
F
 
F
E
 
E
I
 
V
I
 
C
D
 
E
E
 
Q
L
 
L
G
 
G
G
 
E
A
 
A
P
 
P
D
 
D
Y
 
V
H
 
L
C
 
A
L
 
I
P
 
P
V
|
V
G
|
G
N
|
N
A
|
A
G
 
G
N
|
N
I
 
I
S
 
S
A
 
A
Y
 
Y
W
 
W
M
 
K
G
 
G
Y
 
F
T
 
K
E
 
E
Y
 
Y
A
 
H
Q
 
E
D
 
K
L
 
-
P
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
-
A
 
-
V
 
N
A
 
G
D
 
T
K
 
S
R
 
L
P
 
P
I
 
K
M
 
M
C
 
R
G
 
G
Y
 
F
Q
x
E
A
 
A
A
 
E
G
 
G
A
x
S
A
 
A
P
 
A
F
 
I
V
 
V
A
 
R
G
 
N
K
 
E
M
 
V
I
 
I
D
 
E
H
 
N
P
 
P
E
 
E
T
 
T
V
 
I
A
 
A
T
 
T
A
|
A
I
|
I
R
 
R
I
 
I
G
 
G
H
 
N
P
 
P
Q
 
A
S
 
S
W
 
W
D
 
D
L
 
K
A
 
A
W
 
V
N
 
K
A
 
A
Q
 
A
K
 
E
E
 
E
S
 
S
G
 
N
G
 
G
W
 
K
F
 
I
D
 
D
S
 
E
Q
 
V
T
 
T
D
 
D
Q
 
D
Q
 
E
I
 
I
L
 
L
A
 
H
A
 
A
Q
 
Y
K
 
Q
M
 
L
L
 
I
S
 
A
Q
 
R
Y
 
E
E
 
E
G
 
G
V
 
V
F
 
F
C
 
A
E
|
E
P
 
P
A
 
G
S
 
S
A
 
C
A
 
A
S
 
S
L
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
V
L
 
L
Q
 
K
D
 
Q
I
 
V
G
 
K
S
 
S
G
 
G
K
 
E
I
 
I
P
 
P
E
 
K
G
 
G
S
 
S
R
 
K
I
 
V
V
 
V
C
 
A
T
 
V
L
 
L
T
|
T
G
 
G
N
 
N
G
 
G
I
 
L
K
 
K
D
 
D
P
 
P
D
 
N
I
 
T
A
 
A
I
 
V
S
 
-
Q
 
D
C
 
I
K
 
S
D
 
E
A
 
I
H
 
K
P
 
P
V
 
V
T
 
T
I
 
L
E
 
P
A
 
T
N
 
N
L
 
E
D
 
D
A
 
S
V
 
I

6cgqA Threonine synthase from bacillus subtilis atcc 6633 with plp and plp- ala (see paper)
53% identity, 96% coverage: 9:356/364 of query aligns to 1:333/339 of 6cgqA

query
sites
6cgqA
G
 
G
L
 
L
I
 
I
E
 
H
R
 
Q
Y
 
Y
R
 
K
D
 
E
R
 
F
L
 
L
P
 
P
V
 
V
S
 
T
A
 
D
D
 
Q
T
 
T
R
 
P
L
 
A
I
 
L
S
 
T
L
 
L
C
 
H
E
 
E
G
 
G
N
 
N
T
 
T
P
 
P
L
 
L
I
 
I
R
 
H
L
 
L
E
 
P
N
 
K
I
 
L
P
 
S
R
 
E
L
 
Q
I
 
L
G
 
G
K
 
-
D
 
-
V
 
I
D
 
E
I
 
L
Y
 
H
V
 
V
K
 
K
F
 
T
E
 
E
G
 
G
L
 
V
N
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
F
|
F
K
|
K
D
 
D
R
 
R
G
 
G
M
 
M
T
 
V
M
 
M
A
 
A
V
 
V
T
 
A
K
 
K
A
 
A
V
 
K
E
 
E
E
 
E
G
 
G
S
 
N
Q
 
D
A
 
T
I
 
I
I
 
M
C
 
C
A
 
A
S
 
S
T
|
T
G
 
G
N
|
N
T
 
T
S
 
S
A
 
A
S
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
V
 
A
R
 
R
A
 
A
G
 
N
I
 
M
K
 
K
A
 
C
F
 
I
V
 
V
L
 
I
I
 
I
P
 
P
E
 
-
G
 
-
K
 
-
I
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
N
K
 
K
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
T
 
A
L
 
V
M
 
M
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
Q
 
E
I
 
I
I
 
I
Q
 
A
I
 
I
N
 
D
G
 
G
N
 
N
F
 
F
D
 
D
A
 
D
G
 
A
M
 
L
N
 
K
I
 
I
V
 
V
K
 
R
Q
 
S
I
 
I
A
 
C
D
 
E
H
 
K
A
 
S
P
 
P
V
 
I
A
 
A
I
 
L
V
 
V
N
 
N
S
 
S
I
 
V
N
 
N
P
 
P
F
 
Y
R
 
R
L
 
L
Q
 
E
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
T
 
T
A
 
A
A
 
A
F
 
F
E
 
E
I
 
V
I
 
C
D
 
E
E
 
Q
L
 
L
G
 
G
G
 
E
A
 
A
P
 
P
D
 
D
Y
 
V
H
 
L
C
 
A
L
 
I
P
 
P
V
|
V
G
|
G
N
|
N
A
|
A
G
|
G
N
|
N
I
 
I
S
 
S
A
 
A
Y
 
Y
W
 
W
M
 
K
G
 
G
Y
 
F
T
 
K
E
 
E
Y
 
Y
A
 
H
Q
 
E
D
 
K
L
 
-
P
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
-
A
 
-
V
 
N
A
 
G
D
 
T
K
 
S
R
 
L
P
 
P
I
 
K
M
 
M
C
 
R
G
 
G
Y
 
F
Q
x
E
A
 
A
A
 
E
G
 
G
A
x
S
A
 
A
P
 
A
F
 
I
V
 
V
A
 
R
G
 
N
K
 
E
M
 
V
I
 
I
D
 
E
H
 
N
P
 
P
E
 
E
T
 
T
V
 
I
A
 
A
T
 
T
A
|
A
I
 
I
R
 
R
I
 
I
G
 
G
H
 
N
P
 
P
Q
 
A
S
 
S
W
 
W
D
 
D
L
 
K
A
 
A
W
 
V
N
 
K
A
 
A
Q
 
A
K
 
E
E
 
E
S
 
S
G
 
N
G
 
G
W
 
K
F
 
I
D
 
D
S
 
E
Q
 
V
T
 
T
D
 
D
Q
 
D
Q
 
E
I
 
I
L
 
L
A
 
H
A
 
A
Q
 
Y
K
 
Q
M
 
L
L
 
I
S
 
A
Q
 
R
Y
 
E
E
 
E
G
 
G
V
 
V
F
 
F
C
 
A
E
|
E
P
 
P
A
 
G
S
 
S
A
 
C
A
 
A
S
 
S
L
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
V
L
 
L
Q
 
K
D
 
Q
I
 
V
G
 
K
S
 
S
G
 
G
K
 
E
I
 
I
P
 
P
E
 
K
G
 
G
S
 
S
R
 
K
I
 
V
V
 
V
C
 
A
T
 
V
L
 
L
T
|
T
G
|
G
N
 
N
G
 
G
I
 
L
K
 
K
D
 
D
P
 
P
D
 
N
I
 
T
A
 
A
I
 
V
S
 
-
Q
 
D
C
 
I
K
 
S
D
 
E
A
 
I
H
 
K
P
 
P
V
 
V
T
 
T
I
 
L
E
 
P
A
 
T
N
 
N
L
 
E
D
 
D
A
 
S
V
 
I

Q9S7B5 Threonine synthase 1, chloroplastic; Protein METHIONINE OVER-ACCUMULATOR 2; EC 4.2.3.1 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see 2 papers)
33% identity, 93% coverage: 18:356/364 of query aligns to 155:511/526 of Q9S7B5

query
sites
Q9S7B5
L
 
L
P
 
P
V
 
E
S
 
I
A
 
D
D
 
D
T
 
D
R
 
D
L
 
I
I
 
V
S
 
S
L
 
A
C
 
F
E
 
E
G
 
G
N
 
N
T
 
S
P
x
N
L
|
L
I
 
F
R
 
W
L
 
A
E
 
E
N
 
R
I
 
F
P
 
G
R
x
K
L
 
Q
I
 
F
G
 
L
K
 
G
D
 
M
V
x
N
D
 
D
I
 
L
Y
 
W
V
 
V
K
 
K
F
 
H
E
 
C
G
 
G
L
 
I
N
 
S
P
 
H
T
 
T
G
 
G
S
 
S
F
 
F
K
 
K
D
 
D
R
x
L
G
 
G
M
 
M
T
 
T
M
 
V
A
 
L
V
 
V
T
 
S
-
 
Q
-
 
V
-
 
N
-
 
R
-
 
L
K
 
R
A
 
K
V
 
M
E
 
K
E
 
R
G
 
P
S
 
V
Q
 
V
A
 
G
I
 
V
I
 
G
C
 
C
A
 
A
S
 
S
T
 
T
G
 
G
N
 
D
T
 
T
S
 
S
A
 
A
S
 
A
A
 
L
A
 
S
A
 
A
Y
 
Y
A
 
C
V
 
A
R
 
S
A
 
A
G
 
G
I
 
I
K
 
P
A
 
S
F
 
I
V
 
V
L
 
F
I
 
L
P
 
P
E
 
A
G
 
N
K
 
K
I
 
I
A
 
S
L
 
M
G
 
A
K
 
Q
L
 
L
A
 
V
Q
 
Q
T
 
P
L
 
I
M
 
A
Y
 
N
G
 
G
A
 
A
Q
 
F
I
 
V
I
 
L
Q
 
S
I
 
I
N
 
D
G
 
T
N
 
D
F
 
F
D
 
D
A
 
G
G
 
C
M
 
M
N
 
K
I
 
L
V
 
I
K
 
R
Q
 
E
I
 
I
A
 
T
D
 
A
H
 
E
A
 
L
P
 
P
V
 
I
A
 
Y
I
 
L
V
 
A
N
 
N
S
 
S
I
 
L
N
 
N
P
 
S
F
 
L
R
 
R
L
 
L
Q
 
E
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
T
 
T
A
 
A
A
 
A
F
 
I
E
 
E
I
 
I
I
 
L
D
 
Q
E
 
Q
L
 
F
G
 
D
G
 
W
-
 
Q
A
 
V
P
 
P
D
 
D
Y
 
W
H
 
V
C
 
I
L
 
V
P
 
P
V
 
G
G
 
G
N
 
N
A
 
L
G
 
G
N
 
N
I
 
I
S
 
Y
A
 
A
Y
 
F
W
 
Y
M
 
K
G
 
G
Y
 
F
T
 
-
E
 
K
Y
 
M
A
 
C
Q
 
Q
D
 
E
L
 
L
P
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
-
A
 
G
V
 
L
A
 
V
D
 
D
K
 
R
R
 
I
P
 
P
I
 
R
M
 
M
C
 
V
G
 
C
Y
 
A
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
G
 
N
A
 
A
A
 
N
P
 
P
F
 
L
V
 
Y
A
 
L
G
 
H
-
 
Y
-
 
K
-
 
S
-
 
G
-
 
W
-
 
K
-
 
D
-
 
F
K
 
K
M
 
P
I
 
M
D
 
T
H
 
A
P
 
S
E
 
T
T
 
T
V
 
F
A
 
A
T
 
S
A
 
A
I
 
I
R
 
Q
I
 
I
G
 
G
H
 
D
P
 
P
Q
 
V
S
 
S
W
 
I
D
 
D
L
 
R
A
 
A
W
 
V
N
 
Y
A
 
A
Q
 
L
K
 
K
E
 
K
S
 
C
G
 
N
G
 
G
W
 
I
F
 
V
D
 
E
S
 
E
Q
 
A
T
 
T
D
 
E
Q
 
E
Q
 
E
I
 
L
L
 
M
A
 
D
A
 
A
Q
 
M
K
 
A
M
 
Q
L
 
-
S
 
A
Q
 
D
Y
 
S
E
 
T
G
 
G
V
 
M
F
 
F
C
 
I
E
 
C
P
 
P
A
 
H
S
 
T
A
 
G
A
 
V
S
 
A
L
 
L
A
 
T
G
 
A
A
 
L
L
 
F
Q
 
K
D
 
L
I
 
R
G
 
N
S
 
Q
G
 
G
K
 
V
I
 
I
P
 
A
E
 
P
G
 
T
S
 
D
R
 
R
I
 
T
V
 
V
C
 
V
T
 
V
L
 
S
T
 
T
G
 
A
N
 
H
G
 
G
I
 
L
K
 
K
D
 
F
-
 
T
-
 
Q
-
 
S
-
 
K
-
 
I
-
 
D
-
 
Y
-
 
H
-
 
S
-
 
N
-
 
A
-
 
I
P
 
P
D
 
D
I
 
M
A
 
A
I
 
-
S
 
-
Q
 
-
C
 
C
K
 
R
D
 
F
A
 
S
H
 
N
-
 
P
P
 
P
V
 
V
T
 
D
I
 
V
E
 
K
A
 
A
N
 
D
L
 
F
D
 
G
A
 
A
V
 
V

2c2bA Crystallographic structure of arabidopsis thaliana threonine synthase complexed with pyridoxal phosphate and s-adenosylmethionine (see paper)
32% identity, 96% coverage: 8:356/364 of query aligns to 70:436/444 of 2c2bA

query
sites
2c2bA
T
 
S
G
 
G
L
 
V
I
 
W
E
 
S
R
 
K
Y
 
K
R
 
E
D
 
W
R
 
V
L
 
L
P
 
P
V
 
E
S
 
I
A
 
D
D
 
D
T
 
D
R
 
D
L
 
I
I
 
V
S
|
S
L
 
A
C
x
F
E
 
E
G
 
G
N
 
N
T
 
S
P
x
N
L
|
L
I
 
F
R
x
W
L
 
A
E
 
E
N
 
R
I
 
F
P
 
G
R
 
K
L
 
Q
I
 
F
G
 
L
K
 
G
D
 
M
V
 
N
D
 
D
I
 
L
Y
x
W
V
 
V
K
 
K
F
 
H
E
 
C
G
 
G
L
 
I
N
 
S
P
 
H
T
 
T
G
 
G
S
 
S
F
|
F
K
|
K
D
 
D
R
 
L
G
 
G
M
 
M
T
 
T
M
 
V
A
 
L
V
 
V
T
 
S
-
 
Q
-
 
V
-
 
N
-
 
R
-
 
L
K
 
R
A
 
K
V
 
M
E
 
K
E
 
R
G
 
P
S
 
V
Q
 
V
A
 
G
I
 
V
I
 
G
C
 
C
A
 
A
S
 
S
T
 
T
G
 
G
N
x
D
T
 
T
S
 
S
A
 
A
S
 
A
A
 
L
A
 
S
A
 
A
Y
 
Y
A
 
C
V
 
A
R
 
S
A
 
A
G
 
G
I
 
I
K
 
P
A
 
S
F
 
I
V
 
V
L
 
F
I
 
L
P
 
P
E
 
A
G
 
N
K
 
K
I
 
I
A
 
S
L
 
M
G
 
A
K
 
Q
L
 
L
A
 
V
Q
 
Q
T
 
P
L
 
I
M
 
A
Y
 
N
G
 
G
A
 
A
Q
 
F
I
 
V
I
 
L
Q
 
S
I
 
I
N
 
D
G
 
T
N
 
D
F
 
F
D
 
D
A
 
G
G
 
C
M
 
M
N
 
K
I
 
L
V
 
I
K
 
R
Q
 
E
I
 
I
A
 
T
D
 
A
H
 
E
A
 
L
P
 
P
V
 
I
A
 
Y
I
 
L
V
 
A
N
 
N
S
 
S
I
 
L
N
 
N
P
 
S
F
 
L
R
 
R
L
 
L
Q
 
E
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
T
 
T
A
 
A
A
 
A
F
 
I
E
 
E
I
 
I
I
 
L
D
 
Q
E
x
Q
L
x
F
G
 
D
G
 
W
-
 
Q
A
 
V
P
 
P
D
 
D
Y
 
W
H
 
V
C
 
I
L
 
V
P
 
P
V
x
G
G
|
G
N
|
N
A
x
L
G
|
G
N
|
N
I
 
I
S
 
Y
A
 
A
Y
 
F
W
 
Y
M
 
K
G
 
G
Y
 
F
T
 
-
E
 
K
Y
 
M
A
 
C
Q
 
Q
D
 
E
L
 
L
P
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
-
A
 
G
V
 
L
A
 
V
D
 
D
K
 
R
R
 
I
P
 
P
I
 
R
M
 
M
C
 
V
G
 
C
Y
 
A
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
G
 
N
A
 
A
A
 
N
P
 
P
F
 
L
V
 
Y
A
 
L
G
 
H
-
 
Y
-
 
K
-
 
S
-
 
G
-
 
W
-
 
K
-
 
D
-
 
F
K
 
K
M
 
P
I
 
M
D
 
T
H
 
A
P
 
S
E
 
T
T
 
T
V
 
F
A
 
A
T
 
S
A
|
A
I
 
I
R
 
Q
I
 
I
G
 
G
H
 
D
P
 
P
Q
 
V
S
 
S
W
 
I
D
 
D
L
 
R
A
 
A
W
 
V
N
 
Y
A
 
A
Q
 
L
K
 
K
E
 
K
S
 
C
G
 
N
G
 
G
W
 
I
F
 
V
D
 
E
S
 
E
Q
 
A
T
 
T
D
 
E
Q
 
E
Q
 
E
I
 
L
L
 
M
A
 
D
A
 
A
Q
 
M
K
 
A
M
 
Q
L
 
-
S
 
A
Q
 
D
Y
 
S
E
 
T
G
 
G
V
 
M
F
 
F
C
 
I
E
 
C
P
 
P
A
x
H
S
 
T
A
 
G
A
 
V
S
 
A
L
 
L
A
 
T
G
 
A
A
 
L
L
 
F
Q
 
K
D
 
L
I
 
R
G
 
N
S
 
Q
G
 
G
K
 
V
I
 
I
P
 
A
E
 
P
G
 
T
S
 
D
R
 
R
I
 
T
V
 
V
C
 
V
T
 
V
L
 
S
T
|
T
G
 
A
N
 
H
G
 
G
I
 
L
K
 
K
D
 
F
-
 
T
-
 
Q
-
 
S
-
 
K
-
 
I
-
 
D
-
 
Y
-
 
H
-
 
S
-
 
N
-
 
A
-
 
I
P
 
P
D
 
D
I
 
M
A
 
A
I
 
-
S
 
-
Q
 
-
C
 
C
K
 
R
D
 
F
A
 
S
H
 
N
-
 
P
P
 
P
V
 
V
T
 
D
I
 
V
E
 
K
A
 
A
N
 
D
L
 
F
D
 
G
A
 
A
V
 
V

Sites not aligning to the query:

2c2gA Crystal structure of threonine synthase from arabidopsis thaliana in complex with its cofactor pyridoxal phosphate (see paper)
31% identity, 96% coverage: 8:356/364 of query aligns to 88:438/448 of 2c2gA

query
sites
2c2gA
T
 
S
G
 
G
L
 
V
I
 
W
E
 
S
R
 
K
Y
 
K
R
 
E
D
 
W
R
 
V
L
 
L
P
 
P
V
 
E
S
 
I
A
 
D
D
 
D
T
 
D
R
 
D
L
 
I
I
 
V
S
 
S
L
 
A
C
 
F
E
 
E
G
 
G
N
 
N
T
 
S
P
 
N
L
 
L
I
 
F
R
 
W
L
 
A
E
 
E
N
 
R
I
 
F
P
 
G
R
 
K
L
 
Q
I
 
F
G
 
L
K
 
G
D
 
M
V
 
N
D
 
D
I
 
L
Y
 
W
V
 
V
K
 
K
F
 
H
E
 
C
G
 
G
L
 
I
N
 
S
P
 
H
T
 
T
G
 
G
S
 
S
F
 
F
K
|
K
D
 
D
R
 
L
G
 
G
M
 
M
T
 
T
M
 
V
A
 
L
V
 
V
T
 
S
-
 
Q
-
 
V
-
 
N
-
 
R
-
 
L
K
 
R
A
 
K
V
 
M
E
 
K
E
 
R
G
 
P
S
 
V
Q
 
V
A
 
G
I
 
V
I
 
G
C
 
C
A
 
A
S
|
S
T
 
T
G
 
G
N
 
D
T
|
T
S
 
S
A
 
A
S
 
A
A
 
L
A
 
S
A
 
A
Y
 
Y
A
 
C
V
 
A
R
 
S
A
 
A
G
 
G
I
 
I
K
 
P
A
 
S
F
 
I
V
 
V
L
 
F
I
 
L
P
 
P
E
 
A
G
 
N
K
 
K
I
 
I
A
 
S
L
 
M
G
 
A
K
 
Q
L
 
L
A
 
V
Q
 
Q
T
 
P
L
 
I
M
 
A
Y
 
N
G
 
G
A
 
A
Q
 
F
I
 
V
I
 
L
Q
 
S
I
 
I
N
 
D
G
 
T
N
 
D
F
 
F
D
 
D
A
 
G
G
 
C
M
 
M
N
 
K
I
 
L
V
 
I
K
 
R
Q
 
E
I
 
I
A
 
T
D
 
A
H
 
E
A
 
L
P
 
P
V
 
I
A
 
Y
I
 
L
V
 
A
N
 
N
S
|
S
I
 
L
N
 
N
P
 
S
F
 
L
R
|
R
L
 
L
Q
 
E
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
T
 
T
A
 
A
A
 
A
F
 
I
E
 
E
I
 
I
I
 
L
D
 
Q
E
 
Q
L
 
F
G
 
D
G
 
W
-
 
Q
A
 
V
P
 
P
D
 
D
Y
 
W
H
 
V
C
 
I
L
 
V
P
 
P
V
 
G
G
 
G
N
|
N
A
 
L
G
 
G
N
 
N
I
 
I
S
 
Y
A
 
A
Y
 
F
W
 
Y
M
 
K
G
 
G
Y
 
F
T
 
-
E
 
K
Y
 
M
A
 
C
Q
 
Q
D
 
E
L
 
L
P
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
-
A
 
G
V
 
L
A
 
V
D
 
D
K
 
R
R
 
I
P
 
P
I
 
R
M
 
M
C
 
V
G
 
C
Y
 
A
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
G
 
N
A
 
A
A
 
N
P
 
P
F
 
L
V
 
Y
A
 
L
G
 
-
K
 
-
M
 
-
I
 
-
D
 
-
H
 
-
P
 
-
E
 
-
T
 
H
V
 
Y
A
 
K
T
 
S
A
 
G
I
 
W
R
 
K
I
 
D
G
 
F
H
 
K
P
 
P
Q
 
V
S
 
S
W
 
I
D
 
D
L
 
R
A
 
A
W
 
V
N
 
Y
A
 
A
Q
 
L
K
 
K
E
 
K
S
 
C
G
 
N
G
 
G
W
 
I
F
 
V
D
 
E
S
 
E
Q
 
A
T
 
T
D
 
E
Q
 
E
Q
 
E
I
 
L
L
 
M
A
 
D
A
 
A
Q
 
M
K
 
A
M
 
Q
L
 
-
S
 
A
Q
 
D
Y
 
S
E
 
T
G
 
G
V
 
M
F
 
F
C
 
I
E
 
C
P
 
P
A
 
H
S
 
T
A
 
G
A
 
V
S
 
A
L
 
L
A
 
T
G
 
A
A
 
L
L
 
F
Q
 
K
D
 
L
I
 
R
G
 
N
S
 
Q
G
 
G
K
 
V
I
 
I
P
 
A
E
 
P
G
 
T
S
 
D
R
 
R
I
 
T
V
 
V
C
 
V
T
 
V
L
 
S
T
 
T
G
 
A
N
 
H
G
 
G
I
 
L
K
 
K
D
 
F
-
 
T
-
 
Q
-
 
S
-
 
K
-
 
I
-
 
D
-
 
Y
-
 
H
-
 
S
-
 
N
-
 
A
-
 
I
P
 
P
D
 
D
I
 
M
A
 
A
I
 
-
S
 
-
Q
 
-
C
 
C
K
 
R
D
 
F
A
 
S
H
 
N
-
 
P
P
 
P
V
 
V
T
 
D
I
 
V
E
 
K
A
 
A
N
 
D
L
 
F
D
 
G
A
 
A
V
 
V

3pc4A Full length structure of cystathionine beta-synthase from drosophila in complex with serine (see paper)
31% identity, 46% coverage: 32:198/364 of query aligns to 48:225/504 of 3pc4A

query
sites
3pc4A
G
 
G
N
 
C
T
 
T
P
 
P
L
 
L
I
 
V
R
 
K
L
 
L
E
 
N
N
 
N
I
 
I
P
 
P
R
 
A
L
 
S
I
 
D
G
 
G
K
 
I
D
 
E
V
 
C
D
 
E
I
 
M
Y
 
Y
V
 
A
K
 
K
F
 
C
E
 
E
G
 
F
L
 
L
N
 
N
P
 
P
T
 
G
G
 
G
S
 
S
F
 
V
K
|
K
D
 
D
R
 
R
G
 
I
M
 
G
T
 
Y
M
 
R
A
 
M
V
 
V
T
 
Q
K
 
D
A
 
A
V
 
E
E
 
E
E
 
Q
G
 
G
-
 
L
-
 
L
-
 
K
-
 
P
S
 
G
Q
 
Y
A
 
T
I
 
I
I
 
I
C
 
E
A
 
P
S
x
T
T
x
S
G
 
G
N
|
N
T
|
T
S
 
G
A
 
I
S
 
G
A
 
L
A
 
A
A
 
M
Y
 
A
A
 
C
V
 
A
R
 
V
A
 
K
G
 
G
I
 
Y
K
 
K
A
 
C
F
 
I
V
 
I
L
 
V
I
 
M
P
 
P
E
 
E
G
 
-
K
 
K
I
 
M
A
 
S
L
 
N
G
 
E
K
 
K
L
 
V
A
 
S
Q
 
A
T
 
L
L
 
R
M
 
T
Y
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
I
 
I
I
 
I
Q
 
R
-
 
T
-
 
P
I
 
T
N
 
E
G
 
A
N
 
A
F
 
Y
D
 
D
A
 
S
G
 
P
M
 
E
N
 
G
I
 
L
V
 
I
-
 
Y
-
 
V
-
 
A
K
 
Q
Q
 
Q
I
 
L
A
 
Q
D
 
R
H
 
E
A
 
T
P
 
P
V
 
N
A
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
-
S
 
-
I
 
L
N
 
D
P
x
Q
F
 
Y
R
 
R
L
 
N
Q
x
A
G
 
G
Q
 
N
K
x
P
T
x
L
A
 
A
A
 
H
F
x
Y
-
 
D
-
 
G
-
 
T
-
 
A
-
 
A
E
 
E
I
 
I
I
 
L
D
 
W
E
 
Q
L
 
L
G
 
D
G
 
N
A
 
K
P
 
V
D
 
D
Y
 
M
H
 
I
C
 
V
L
 
V
P
 
S
V
x
A
G
|
G
N
x
T
A
|
A
G
 
G
N
x
T
I
 
I
S
 
S

Sites not aligning to the query:

3pc3A Full length structure of cystathionine beta-synthase from drosophila in complex with aminoacrylate (see paper)
31% identity, 46% coverage: 32:198/364 of query aligns to 48:225/504 of 3pc3A

query
sites
3pc3A
G
 
G
N
 
C
T
 
T
P
 
P
L
 
L
I
 
V
R
 
K
L
 
L
E
 
N
N
 
N
I
 
I
P
 
P
R
 
A
L
 
S
I
 
D
G
 
G
K
 
I
D
 
E
V
 
C
D
 
E
I
 
M
Y
 
Y
V
 
A
K
 
K
F
 
C
E
 
E
G
 
F
L
 
L
N
 
N
P
 
P
T
 
G
G
 
G
S
 
S
F
 
V
K
|
K
D
 
D
R
 
R
G
 
I
M
 
G
T
 
Y
M
 
R
A
 
M
V
 
V
T
 
Q
K
 
D
A
 
A
V
 
E
E
 
E
E
 
Q
G
 
G
-
 
L
-
 
L
-
 
K
-
 
P
S
 
G
Q
 
Y
A
 
T
I
 
I
I
 
I
C
 
E
A
 
P
S
x
T
T
x
S
G
 
G
N
|
N
T
|
T
S
 
G
A
 
I
S
 
G
A
 
L
A
 
A
A
 
M
Y
 
A
A
 
C
V
 
A
R
 
V
A
 
K
G
 
G
I
 
Y
K
 
K
A
 
C
F
 
I
V
 
I
L
 
V
I
 
M
P
 
P
E
 
E
G
 
-
K
 
K
I
 
M
A
 
S
L
 
N
G
 
E
K
 
K
L
 
V
A
 
S
Q
 
A
T
 
L
L
 
R
M
 
T
Y
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
I
 
I
I
 
I
Q
 
R
-
 
T
-
 
P
I
 
T
N
 
E
G
 
A
N
 
A
F
 
Y
D
 
D
A
 
S
G
 
P
M
 
E
N
 
G
I
 
L
V
 
I
-
 
Y
-
 
V
-
 
A
K
 
Q
Q
 
Q
I
 
L
A
 
Q
D
 
R
H
 
E
A
 
T
P
 
P
V
 
N
A
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
-
S
 
-
I
 
L
N
 
D
P
x
Q
F
 
Y
R
 
R
L
 
N
Q
x
A
G
 
G
Q
 
N
K
x
P
T
x
L
A
 
A
A
 
H
F
x
Y
-
 
D
-
 
G
-
 
T
-
 
A
-
 
A
E
 
E
I
 
I
I
 
L
D
 
W
E
 
Q
L
 
L
G
 
D
G
 
N
A
 
K
P
 
V
D
 
D
Y
 
M
H
 
I
C
 
V
L
 
V
P
 
S
V
x
A
G
|
G
N
x
T
A
|
A
G
 
G
N
x
T
I
 
I
S
 
S

Sites not aligning to the query:

3pc2A Full length structure of cystathionine beta-synthase from drosophila (see paper)
31% identity, 46% coverage: 32:198/364 of query aligns to 46:223/500 of 3pc2A

query
sites
3pc2A
G
 
G
N
 
C
T
 
T
P
 
P
L
 
L
I
 
V
R
 
K
L
 
L
E
 
N
N
 
N
I
 
I
P
 
P
R
 
A
L
 
S
I
 
D
G
 
G
K
 
I
D
 
E
V
 
C
D
 
E
I
 
M
Y
 
Y
V
 
A
K
 
K
F
 
C
E
 
E
G
 
F
L
 
L
N
 
N
P
 
P
T
 
G
G
 
G
S
 
S
F
 
V
K
|
K
D
 
D
R
 
R
G
 
I
M
 
G
T
 
Y
M
 
R
A
 
M
V
 
V
T
 
Q
K
 
D
A
 
A
V
 
E
E
 
E
E
 
Q
G
 
G
-
 
L
-
 
L
-
 
K
-
 
P
S
 
G
Q
 
Y
A
 
T
I
 
I
I
 
I
C
 
E
A
 
P
S
 
T
T
 
S
G
 
G
N
|
N
T
 
T
S
 
G
A
 
I
S
 
G
A
 
L
A
 
A
A
 
M
Y
 
A
A
 
C
V
 
A
R
 
V
A
 
K
G
 
G
I
 
Y
K
 
K
A
 
C
F
 
I
V
 
I
L
 
V
I
 
M
P
 
P
E
 
E
G
 
-
K
 
K
I
 
M
A
 
S
L
 
N
G
 
E
K
 
K
L
 
V
A
 
S
Q
 
A
T
 
L
L
 
R
M
 
T
Y
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
I
 
I
I
 
I
Q
 
R
-
 
T
-
 
P
I
 
T
N
 
E
G
 
A
N
 
A
F
 
Y
D
 
D
A
 
S
G
 
P
M
 
E
N
 
G
I
 
L
V
 
I
-
 
Y
-
 
V
-
 
A
K
 
Q
Q
 
Q
I
 
L
A
 
Q
D
 
R
H
 
E
A
 
T
P
 
P
V
 
N
A
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
-
S
 
-
I
 
L
N
 
D
P
 
Q
F
 
Y
R
 
R
L
 
N
Q
x
A
G
 
G
Q
 
N
K
x
P
T
x
L
A
 
A
A
 
H
F
x
Y
-
 
D
-
 
G
-
 
T
-
 
A
-
 
A
E
 
E
I
 
I
I
 
L
D
 
W
E
 
Q
L
 
L
G
 
D
G
 
N
A
 
K
P
 
V
D
 
D
Y
 
M
H
 
I
C
 
V
L
 
V
P
 
S
V
x
A
G
|
G
N
x
T
A
|
A
G
 
G
N
x
T
I
 
I
S
 
S

Sites not aligning to the query:

5ohxA Structure of active cystathionine b-synthase from apis mellifera (see paper)
32% identity, 43% coverage: 32:186/364 of query aligns to 40:205/488 of 5ohxA

query
sites
5ohxA
G
 
G
N
 
Q
T
 
T
P
 
P
L
 
L
I
 
I
R
 
K
L
 
L
E
 
N
N
 
N
I
 
I
P
 
P
R
 
K
L
 
S
I
 
Y
G
 
G
K
 
I
D
 
K
V
 
C
D
 
E
I
 
I
Y
 
Y
V
 
A
K
 
K
F
 
C
E
 
E
G
 
F
L
 
L
N
 
N
P
 
P
T
 
G
G
 
G
S
 
S
F
 
V
K
|
K
D
 
D
R
 
R
G
 
I
M
 
A
T
 
Y
M
 
R
A
 
M
V
 
I
T
 
Q
K
 
D
A
 
A
V
 
E
E
 
D
E
 
K
G
 
G
-
 
L
-
 
L
-
 
K
-
 
P
S
 
G
Q
 
C
A
 
T
I
 
I
I
 
I
C
 
E
A
 
P
S
 
T
T
 
S
G
 
G
N
|
N
T
 
T
S
 
G
A
 
I
S
 
G
A
 
L
A
 
A
A
 
M
Y
 
A
A
 
A
V
 
A
R
 
V
A
 
R
G
 
G
I
 
Y
K
 
K
A
 
C
F
 
I
V
 
I
L
 
V
I
 
M
P
 
P
E
 
E
G
 
-
K
 
K
I
 
M
A
 
S
L
 
D
G
 
E
K
 
K
L
 
I
A
 
S
Q
 
T
T
 
L
L
 
Y
M
 
A
Y
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
I
 
I
I
 
I
Q
 
R
I
 
T
N
 
P
G
 
T
N
 
E
F
 
A
-
 
S
-
 
W
-
 
H
-
 
S
-
 
P
D
 
E
A
 
A
G
 
H
M
 
I
N
 
S
I
 
V
V
 
A
K
 
Q
Q
 
K
I
 
L
A
 
Q
D
 
K
H
 
E
A
 
I
P
 
P
V
 
N
A
 
S
I
 
I
V
 
I
-
 
L
-
 
D
-
 
Q
-
 
Y
-
 
T
N
 
N
S
x
P
I
 
G
N
 
N
P
|
P
F
 
L
R
 
A
L
 
H
Q
x
Y
G
 
D
Q
 
Q
K
 
-
T
 
-
A
 
T
A
 
A
F
 
I
E
 
E
I
 
I
I
 
W
D
 
K
E
 
Q
L
 
C
G
 
E
G
 
G
A
 
K
P
 
I
D
 
D
Y
 
Y

Sites not aligning to the query:

Q2V0C9 Cystathionine beta-synthase; EC 4.2.1.22 from Apis mellifera (Honeybee) (see paper)
32% identity, 43% coverage: 32:186/364 of query aligns to 44:209/504 of Q2V0C9

query
sites
Q2V0C9
G
 
G
N
 
Q
T
 
T
P
 
P
L
 
L
I
 
I
R
 
K
L
 
L
E
 
N
N
 
N
I
 
I
P
 
P
R
 
K
L
 
S
I
 
Y
G
 
G
K
 
I
D
 
K
V
 
C
D
 
E
I
 
I
Y
 
Y
V
 
A
K
 
K
F
 
C
E
 
E
G
 
F
L
 
L
N
 
N
P
 
P
T
 
G
G
 
G
S
 
S
F
 
V
K
|
K
D
 
D
R
 
R
G
 
I
M
 
A
T
 
Y
M
 
R
A
 
M
V
 
I
T
 
Q
K
 
D
A
 
A
V
 
E
E
 
D
E
 
K
G
 
G
-
 
L
-
 
L
-
 
K
-
 
P
S
 
G
Q
 
C
A
 
T
I
 
I
I
 
I
C
 
E
A
 
P
S
 
T
T
 
S
G
 
G
N
|
N
T
 
T
S
 
G
A
 
I
S
 
G
A
 
L
A
 
A
A
 
M
Y
 
A
A
 
A
V
 
A
R
 
V
A
 
R
G
 
G
I
 
Y
K
 
K
A
 
C
F
 
I
V
 
I
L
 
V
I
 
M
P
 
P
E
 
E
G
 
-
K
 
K
I
 
M
A
 
S
L
 
D
G
 
E
K
 
K
L
 
I
A
 
S
Q
 
T
T
 
L
L
 
Y
M
 
A
Y
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
I
 
I
I
 
I
Q
 
R
I
 
T
N
 
P
G
 
T
N
 
E
F
 
A
-
 
S
-
 
W
-
 
H
-
 
S
-
 
P
D
 
E
A
 
A
G
 
H
M
 
I
N
 
S
I
 
V
V
 
A
K
 
Q
Q
 
K
I
 
L
A
 
Q
D
 
K
H
 
E
A
 
I
P
 
P
V
 
N
A
 
S
I
 
I
V
 
I
-
 
L
-
 
D
-
 
Q
-
 
Y
-
 
T
N
 
N
S
 
P
I
 
G
N
 
N
P
 
P
F
 
L
R
 
A
L
 
H
Q
 
Y
G
 
D
Q
 
Q
K
 
-
T
 
-
A
 
T
A
 
A
F
 
I
E
 
E
I
 
I
I
 
W
D
 
K
E
 
Q
L
 
C
G
 
E
G
 
G
A
 
K
P
 
I
D
 
D
Y
 
Y

Sites not aligning to the query:

Q8VBT2 L-serine dehydratase/L-threonine deaminase; SDH; L-serine deaminase; L-threonine dehydratase; TDH; EC 4.3.1.17; EC 4.3.1.19 from Mus musculus (Mouse)
24% identity, 82% coverage: 33:331/364 of query aligns to 10:308/327 of Q8VBT2

query
sites
Q8VBT2
N
 
K
T
 
T
P
 
P
L
 
L
I
 
R
R
 
D
L
 
S
E
 
M
N
 
A
I
 
L
P
 
S
R
 
K
L
 
L
I
 
A
G
 
G
K
 
T
D
 
S
V
 
V
D
 
-
I
 
-
Y
 
F
V
 
L
K
 
K
F
 
M
E
 
D
G
 
S
L
 
S
N
 
Q
P
 
P
T
 
S
G
 
G
S
 
S
F
 
F
K
 
K
D
 
I
R
 
R
G
 
G
M
 
I
T
 
G
M
 
H
A
 
L
V
 
C
T
 
K
K
 
M
A
 
K
V
 
A
E
 
K
E
 
Q
G
 
G
S
 
C
Q
 
R
A
 
H
I
 
F
I
 
V
C
 
C
A
 
S
S
 
S
T
 
A
G
 
G
N
 
N
T
 
A
S
 
G
A
 
M
S
 
A
A
 
T
A
 
A
A
 
Y
Y
 
A
A
 
A
V
 
R
R
 
R
A
 
L
G
 
G
I
 
I
K
 
P
A
 
A
F
 
T
V
 
I
L
 
V
I
 
V
P
 
P
E
 
N
G
 
T
K
 
T
I
 
P
A
 
A
L
 
L
G
 
-
K
 
T
L
 
I
A
 
E
Q
 
R
T
 
L
L
 
K
M
 
N
Y
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
T
I
 
V
I
 
E
Q
 
V
I
 
V
N
 
G
G
 
E
N
 
M
F
 
L
D
 
D
A
 
E
G
 
A
M
 
I
N
 
Q
I
 
V
V
 
A
K
 
K
Q
 
A
I
 
L
A
 
E
D
 
K
H
 
N
A
 
N
P
 
P
-
 
G
-
 
W
V
 
V
A
 
Y
I
 
I
V
 
S
N
 
P
S
 
F
I
 
D
N
 
D
P
 
P
F
 
L
R
 
I
L
 
W
Q
 
E
G
 
G
Q
 
H
K
 
T
T
 
S
A
 
L
A
 
V
F
 
K
E
 
E
I
 
L
I
 
K
D
 
E
E
 
T
L
 
L
G
 
S
G
 
A
A
 
K
P
 
P
D
 
-
Y
 
-
H
 
-
C
 
-
L
 
-
P
 
-
V
 
-
G
 
-
N
 
-
A
 
-
G
 
G
N
 
A
I
 
I
S
 
V
A
 
L
Y
 
S
W
 
V
M
 
G
G
 
G
Y
 
G
T
 
G
E
 
L
Y
 
L
A
 
C
Q
 
G
D
 
V
L
 
V
P
 
Q
G
 
G
L
 
L
P
 
R
A
 
E
V
 
V
A
 
G
D
 
W
K
 
E
R
 
D
P
 
V
I
 
P
M
 
I
C
 
I
G
 
A
Y
 
M
Q
 
E
A
 
T
A
 
F
G
 
G
A
 
A
A
 
H
P
 
S
F
 
F
V
 
H
A
 
A
-
 
A
-
 
I
-
 
K
-
 
E
G
 
G
K
 
K
M
 
L
I
 
V
D
 
T
H
 
L
P
 
P
E
 
K
T
 
I
V
 
T
A
 
S
T
 
V
A
 
A
I
 
K
R
 
A
I
 
L
G
 
G
H
 
V
P
 
N
Q
 
T
S
 
V
W
 
G
D
 
A
L
 
Q
A
 
T
W
 
L
N
 
K
A
 
L
Q
 
F
K
 
Y
E
 
E
S
 
H
G
 
P
G
 
I
W
 
F
F
 
S
D
 
E
S
 
V
Q
 
I
T
 
S
D
 
D
Q
 
Q
Q
 
E
I
 
A
L
 
V
A
 
S
A
 
A
Q
 
L
K
 
E
M
 
K
L
 
F
S
 
V
Q
 
D
Y
 
D
E
 
E
G
 
K
V
 
I
F
 
L
C
 
V
E
 
E
P
 
P
A
 
A
S
 
C
A
 
G
A
 
A
S
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
A
A
 
V
-
 
Y
-
 
S
-
 
R
-
 
V
-
 
V
-
 
C
-
 
R
L
 
L
Q
 
Q
D
 
D
I
 
E
G
 
G
S
 
R
G
 
L
K
 
Q
I
 
T
P
 
P
E
 
L
G
 
A
S
 
S
R
 
L
I
 
V
V
 
V
C
 
I
T
 
V
L
 
C
T
 
G
G
 
G
N
 
S
G
 
N
I
 
I

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_013819451.1 NCBI__GCF_000214665.1:WP_013819451.1
MATQQRYTGLIERYRDRLPVSADTRLISLCEGNTPLIRLENIPRLIGKDVDIYVKFEGLN
PTGSFKDRGMTMAVTKAVEEGSQAIICASTGNTSASAAAYAVRAGIKAFVLIPEGKIALG
KLAQTLMYGAQIIQINGNFDAGMNIVKQIADHAPVAIVNSINPFRLQGQKTAAFEIIDEL
GGAPDYHCLPVGNAGNISAYWMGYTEYAQDLPGLPAVADKRPIMCGYQAAGAAPFVAGKM
IDHPETVATAIRIGHPQSWDLAWNAQKESGGWFDSQTDQQILAAQKMLSQYEGVFCEPAS
AASLAGALQDIGSGKIPEGSRIVCTLTGNGIKDPDIAISQCKDAHPVTIEANLDAVKKAI
LDSM

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory