SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_013836016.1 NCBI__GCF_000214825.1:WP_013836016.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5br4A E. Coli lactaldehyde reductase (fuco) m185c mutant (see paper)
35% identity, 55% coverage: 85:297/388 of query aligns to 87:294/385 of 5br4A

query
sites
5br4A
Q
 
S
G
 
G
I
 
A
E
 
D
L
 
Y
V
 
L
I
 
I
G
 
A
F
 
I
G
 
G
G
|
G
G
|
G
S
|
S
V
 
P
L
 
Q
D
|
D
A
 
T
A
 
C
K
 
K
A
 
A
V
 
I
A
 
-
G
 
G
L
 
I
L
 
I
-
 
S
-
 
N
-
 
N
P
 
P
E
 
E
R
 
-
F
 
F
S
 
A
V
 
D
V
 
V
D
 
R
Y
 
S
L
 
L
E
 
E
G
 
G
V
 
L
G
 
S
C
 
P
G
 
T
R
 
N
K
 
K
I
 
-
Q
 
-
H
 
-
T
 
P
P
 
S
V
 
V
P
 
P
F
 
I
M
 
L
A
 
A
V
 
I
P
 
P
T
|
T
T
|
T
A
 
A
G
 
G
T
|
T
G
 
A
S
 
A
E
 
E
T
 
V
T
|
T
K
 
I
N
|
N
A
 
Y
V
|
V
I
 
I
S
 
T
K
 
D
L
 
-
G
 
E
E
 
E
Y
 
K
K
 
R
K
 
R
S
x
K
F
 
F
R
 
V
-
 
C
-
 
V
D
 
D
D
 
P
R
 
H
L
 
D
L
 
I
A
 
P
K
 
Q
Q
 
V
A
 
A
W
 
F
L
 
I
D
 
D
P
 
A
A
 
D
F
 
M
L
 
M
P
 
D
H
x
G
C
|
C
P
 
P
A
 
P
S
 
A
V
x
L
L
 
K
Y
 
A
P
 
A
T
 
T
A
 
G
M
 
V
D
|
D
A
 
A
F
 
L
T
 
T
Q
x
H
L
 
A
L
 
I
E
 
E
S
 
G
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
L
 
R
K
 
G
A
 
A
N
 
W
P
 
A
I
 
L
T
 
T
D
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
H
W
 
I
Q
 
K
G
 
A
M
 
I
C
 
E
L
 
I
F
 
I
K
 
A
G
 
G
A
 
A
F
 
L
D
 
R
L
 
G
I
 
S
A
 
V
S
 
A
N
 
G
D
 
D
P
 
K
T
 
D
C
 
A
Q
 
G
Q
 
E
Q
 
E
G
 
-
Y
 
-
G
 
-
Q
 
-
L
 
M
M
 
A
L
 
L
A
 
G
A
 
Q
S
 
Y
L
 
V
S
 
A
G
 
G
M
 
M
T
 
G
L
 
F
A
 
S
N
 
N
A
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
L
V
 
V
H
|
H
G
 
G
L
 
M
A
 
A
G
 
H
P
 
P
I
 
L
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
F
 
Y
E
 
N
A
 
T
P
 
P
H
|
H
G
 
G
V
 
V
V
 
A
C
 
N
A
 
A
R
 
I
L
 
L
L
 
L
A
 
P
P
 
H
I
 
V
T
 
M
R
 
R
A
 
Y
N
 
N
I
 
A
E
 
D

Sites not aligning to the query:

1rrmA Crystal structure of lactaldehyde reductase
35% identity, 55% coverage: 85:297/388 of query aligns to 86:293/385 of 1rrmA

query
sites
1rrmA
Q
 
S
G
 
G
I
 
A
E
 
D
L
 
Y
V
 
L
I
 
I
G
 
A
F
 
I
G
 
G
G
|
G
G
|
G
S
|
S
V
 
P
L
 
Q
D
 
D
A
 
T
A
 
C
K
 
K
A
 
A
V
 
I
A
 
-
G
 
G
L
 
I
L
 
I
-
 
S
-
 
N
-
 
N
P
 
P
E
 
E
R
 
-
F
 
F
S
 
A
V
 
D
V
 
V
D
 
R
Y
 
S
L
 
L
E
 
E
G
 
G
V
 
L
G
 
S
C
 
P
G
 
T
R
 
N
K
 
K
I
 
-
Q
 
-
H
 
-
T
 
P
P
 
S
V
 
V
P
 
P
F
 
I
M
 
L
A
 
A
V
 
I
P
 
P
T
|
T
T
|
T
A
 
A
G
 
G
T
|
T
G
 
A
S
 
A
E
 
E
T
 
V
T
 
T
K
 
I
N
 
N
A
 
Y
V
|
V
I
 
I
S
 
T
K
 
D
L
 
E
G
 
-
E
 
E
Y
 
K
K
 
R
K
 
R
S
x
K
F
 
F
R
 
V
-
 
C
-
 
V
D
 
D
D
 
P
R
 
H
L
 
D
L
 
I
A
 
P
K
 
Q
Q
 
V
A
 
A
W
 
F
L
 
I
D
 
D
P
 
A
A
 
D
F
 
M
L
 
M
P
 
D
H
x
G
C
x
M
P
 
P
A
 
P
S
 
A
V
x
L
L
 
K
Y
 
A
P
 
A
T
 
T
A
 
G
M
 
V
D
|
D
A
 
A
F
 
L
T
 
T
Q
x
H
L
 
A
L
 
I
E
 
E
S
 
G
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
L
 
R
K
 
G
A
 
A
N
 
W
P
 
A
I
 
L
T
 
T
D
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
H
W
 
I
Q
 
K
G
 
A
M
 
I
C
 
E
L
 
I
F
 
I
K
 
A
G
 
G
A
 
A
F
 
L
D
 
R
L
 
G
I
 
S
A
 
V
S
 
A
N
 
G
D
 
D
P
 
K
T
 
D
C
 
A
Q
 
G
Q
 
E
Q
 
E
G
 
-
Y
 
-
G
 
-
Q
 
-
L
 
M
M
 
A
L
 
L
A
 
G
A
 
Q
S
 
Y
L
 
V
S
 
A
G
 
G
M
 
M
T
 
G
L
 
F
A
 
S
N
 
N
A
 
V
G
 
G
L
|
L
G
 
G
A
 
L
V
 
V
H
|
H
G
 
G
L
 
M
A
 
A
G
 
H
P
 
P
I
 
L
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
F
 
Y
E
 
N
A
 
T
P
 
P
H
|
H
G
 
G
V
 
V
V
 
A
C
 
N
A
 
A
R
 
I
L
 
L
L
 
L
A
 
P
P
 
H
I
 
V
T
 
M
R
 
R
A
 
Y
N
 
N
I
 
A
E
 
D

Sites not aligning to the query:

2bi4A Lactaldehyde:1,2-propanediol oxidoreductase of escherichia coli (see paper)
35% identity, 55% coverage: 85:297/388 of query aligns to 86:293/382 of 2bi4A

query
sites
2bi4A
Q
 
S
G
 
G
I
 
A
E
 
D
L
 
Y
V
 
L
I
 
I
G
 
A
F
 
I
G
 
G
G
|
G
G
|
G
S
|
S
V
 
P
L
 
Q
D
 
D
A
 
T
A
 
C
K
 
K
A
 
A
V
 
I
A
 
-
G
 
G
L
 
I
L
 
I
-
 
S
-
 
N
-
 
N
P
 
P
E
 
E
R
 
-
F
 
F
S
 
A
V
 
D
V
 
V
D
 
R
Y
 
S
L
 
L
E
 
E
G
 
G
V
 
L
G
 
S
C
 
P
G
 
T
R
 
N
K
 
K
I
 
-
Q
 
-
H
 
-
T
 
P
P
 
S
V
 
V
P
 
P
F
 
I
M
 
L
A
 
A
V
 
I
P
 
P
T
|
T
T
|
T
A
 
A
G
 
G
T
 
T
G
 
A
S
 
A
E
 
E
T
 
V
T
 
T
K
 
I
N
 
N
A
 
Y
V
|
V
I
 
I
S
 
T
K
 
D
L
 
E
G
 
-
E
 
E
Y
 
K
K
 
R
K
 
R
S
x
K
F
 
F
R
 
V
-
 
C
-
 
V
D
 
D
D
 
P
R
 
H
L
 
D
L
 
I
A
 
P
K
 
Q
Q
 
V
A
 
A
W
 
F
L
 
I
D
 
D
P
 
A
A
 
D
F
 
M
L
 
M
P
 
D
H
x
G
C
x
M
P
 
P
A
 
P
S
 
A
V
x
L
L
 
K
Y
 
A
P
 
A
T
 
T
A
 
G
M
 
V
D
|
D
A
 
A
F
 
L
T
 
T
Q
x
H
L
 
A
L
 
I
E
 
E
S
 
G
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
L
 
R
K
 
G
A
 
A
N
 
W
P
 
A
I
 
L
T
 
T
D
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
H
W
 
I
Q
 
K
G
 
A
M
 
I
C
 
E
L
 
I
F
 
I
K
 
A
G
 
G
A
 
A
F
 
L
D
 
R
L
 
G
I
 
S
A
 
V
S
 
A
N
 
G
D
 
D
P
 
K
T
 
D
C
 
A
Q
 
G
Q
 
E
Q
 
E
G
 
-
Y
 
-
G
 
-
Q
 
-
L
 
M
M
 
A
L
 
L
A
 
G
A
 
Q
S
 
Y
L
 
V
S
 
A
G
 
G
M
 
M
T
 
G
L
 
F
A
 
S
N
 
N
A
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
L
V
 
V
H
|
H
G
 
G
L
 
M
A
 
A
G
 
H
P
 
P
I
 
L
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
F
 
Y
E
 
N
A
 
T
P
 
P
H
|
H
G
 
G
V
 
V
V
 
A
C
 
N
A
 
A
R
 
I
L
 
L
L
 
L
A
 
P
P
 
H
I
 
V
T
 
M
R
 
R
A
 
Y
N
 
N
I
 
A
E
 
D

Sites not aligning to the query:

P0A9S1 Lactaldehyde reductase; Propanediol oxidoreductase; EC 1.1.1.77 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
35% identity, 55% coverage: 85:297/388 of query aligns to 86:293/382 of P0A9S1

query
sites
P0A9S1
Q
 
S
G
 
G
I
 
A
E
 
D
L
 
Y
V
 
L
I
 
I
G
 
A
F
 
I
G
 
G
G
|
G
G
 
G
S
 
S
V
 
P
L
 
Q
D
 
D
A
 
T
A
 
C
K
 
K
A
 
A
V
 
I
A
 
-
G
 
G
L
 
I
L
 
I
-
 
S
-
 
N
-
 
N
P
 
P
E
 
E
R
 
-
F
 
F
S
 
A
V
 
D
V
 
V
D
 
R
Y
 
S
L
 
L
E
 
E
G
 
G
V
 
L
G
 
S
C
 
P
G
 
T
R
 
N
K
 
K
I
 
-
Q
 
-
H
 
-
T
 
P
P
 
S
V
 
V
P
 
P
F
 
I
M
 
L
A
 
A
V
 
I
P
 
P
T
 
T
T
 
T
A
 
A
G
 
G
T
 
T
G
 
A
S
 
A
E
 
E
T
 
V
T
 
T
K
 
I
N
 
N
A
 
Y
V
 
V
I
 
I
S
 
T
K
 
D
L
 
E
G
 
-
E
 
E
Y
 
K
K
 
R
K
 
R
S
 
K
F
 
F
R
 
V
-
 
C
-
 
V
D
 
D
D
 
P
R
 
H
L
 
D
L
 
I
A
 
P
K
 
Q
Q
 
V
A
 
A
W
 
F
L
 
I
D
 
D
P
 
A
A
 
D
F
 
M
L
 
M
P
 
D
H
 
G
C
 
M
P
 
P
A
 
P
S
 
A
V
 
L
L
 
K
Y
 
A
P
 
A
T
 
T
A
 
G
M
 
V
D
|
D
A
 
A
F
 
L
T
 
T
Q
x
H
L
 
A
L
 
I
E
 
E
S
 
G
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
L
 
R
K
 
G
A
 
A
N
 
W
P
 
A
I
 
L
T
 
T
D
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
H
W
 
I
Q
 
K
G
 
A
M
 
I
C
 
E
L
 
I
F
 
I
K
 
A
G
 
G
A
 
A
F
 
L
D
 
R
L
 
G
I
 
S
A
 
V
S
 
A
N
 
G
D
 
D
P
 
K
T
 
D
C
 
A
Q
 
G
Q
 
E
Q
 
E
G
 
-
Y
 
-
G
 
-
Q
 
-
L
 
M
M
 
A
L
 
L
A
 
G
A
 
Q
S
 
Y
L
 
V
S
 
A
G
 
G
M
 
M
T
 
G
L
 
F
A
 
S
N
 
N
A
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
L
V
 
V
H
 
H
G
 
G
L
 
M
A
 
A
G
 
H
P
 
P
I
 
L
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
F
 
Y
E
 
N
A
 
T
P
 
P
H
 
H
G
 
G
V
 
V
V
 
A
C
 
N
A
 
A
R
 
I
L
 
L
L
 
L
A
 
P
P
 
H
I
 
V
T
 
M
R
 
R
A
 
Y
N
 
N
I
 
A
E
 
D

Sites not aligning to the query:

P31005 NAD-dependent methanol dehydrogenase; MDH; MEDH; Type 3 alcohol dehydrogenase; EC 1.1.1.244 from Bacillus methanolicus (see 3 papers)
28% identity, 83% coverage: 68:388/388 of query aligns to 65:381/381 of P31005

query
sites
P31005
R
 
K
G
 
A
E
 
Q
P
 
P
S
 
D
P
 
P
A
 
A
V
 
-
V
 
-
D
 
D
K
 
T
L
 
Q
V
 
V
A
 
H
E
 
E
A
 
G
-
 
V
-
 
D
-
 
V
-
 
F
-
 
K
P
 
Q
Q
 
E
G
 
N
I
 
C
E
x
D
L
 
A
V
 
L
I
 
V
G
 
S
F
 
I
G
 
G
G
|
G
G
 
G
S
|
S
V
 
S
L
 
H
D
|
D
A
 
T
A
 
A
K
|
K
A
 
A
V
 
I
A
 
-
G
 
G
L
 
L
L
 
V
P
 
A
E
 
A
R
 
N
F
 
G
S
 
G
V
 
R
V
 
I
D
 
N
Y
 
D
L
 
Y
E
 
Q
G
 
G
V
 
V
G
 
-
C
 
-
G
 
-
R
 
N
K
 
S
I
 
V
Q
 
E
H
 
K
T
 
P
P
 
V
V
 
V
P
 
P
F
 
V
M
 
V
A
 
A
V
 
I
P
 
T
T
 
T
T
 
T
A
 
A
G
 
G
T
 
T
G
 
G
S
 
S
E
 
E
T
 
T
T
 
T
K
 
S
N
 
L
A
 
A
V
 
V
I
 
I
S
 
T
K
 
D
L
 
S
G
 
A
-
 
R
E
 
K
Y
 
V
K
 
K
K
 
M
S
 
P
F
 
V
R
 
I
D
 
D
D
 
E
R
 
K
L
 
I
L
 
T
A
 
P
K
 
T
Q
 
V
A
 
A
W
 
I
L
 
V
D
 
D
P
 
P
A
 
E
F
 
L
L
 
M
P
 
V
H
 
K
C
 
K
P
 
P
A
 
A
S
 
G
V
 
L
L
 
T
Y
 
I
P
 
A
T
 
T
A
 
G
M
 
M
D
 
D
A
 
A
F
 
L
T
 
S
Q
 
H
L
 
A
L
 
I
E
 
E
S
 
A
Y
 
Y
V
 
V
T
 
A
L
 
K
K
 
G
A
 
A
N
 
T
P
 
P
I
 
V
T
 
T
D
 
D
A
 
A
L
 
F
A
 
A
W
 
I
Q
 
Q
G
 
A
M
 
M
C
 
K
L
 
L
F
 
I
K
 
N
G
 
E
A
 
Y
F
 
L
D
 
P
L
 
K
I
 
A
A
 
V
S
 
A
N
 
N
D
 
G
P
 
E
T
 
D
C
 
I
Q
 
E
Q
 
A
Q
 
R
-
 
E
-
 
A
-
 
M
G
 
A
Y
 
Y
G
 
A
Q
 
Q
L
 
Y
M
 
M
L
 
-
A
 
-
A
 
-
S
 
-
L
 
-
S
 
A
G
 
G
M
 
V
T
 
A
L
 
F
A
 
N
N
 
N
A
 
G
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
L
V
 
V
H
 
H
G
 
S
L
 
I
A
 
S
G
 
H
P
 
Q
I
 
V
G
 
G
A
 
G
Y
 
V
F
 
Y
E
 
K
A
 
L
P
 
Q
H
 
H
G
 
G
V
 
I
V
 
C
C
 
N
A
 
S
R
 
V
L
 
N
L
 
M
A
 
P
P
 
H
I
 
V
T
 
C
R
 
A
A
 
F
N
 
N
I
 
L
E
 
-
A
 
-
L
 
-
Q
 
-
I
 
I
A
 
A
S
 
K
S
 
T
E
 
E
Q
 
-
A
 
-
T
 
-
T
 
-
A
 
-
L
 
-
N
 
-
K
 
R
Y
 
F
V
 
A
Q
 
H
V
 
I
A
 
A
E
 
E
L
 
L
L
 
L
T
 
G
G
 
-
H
 
-
R
 
E
G
 
N
L
 
V
A
 
S
G
 
G
L
 
L
-
 
S
-
 
T
-
 
A
-
 
A
-
 
A
-
 
A
-
 
E
-
 
R
-
 
A
V
 
I
A
 
V
Y
 
A
L
 
L
E
 
E
Q
 
R
M
 
Y
S
 
N
A
 
K
D
 
N
Y
 
F
-
 
G
V
 
I
P
 
P
Q
 
S
G
 
G
L
 
Y
A
 
A
E
 
E
F
 
M
G
 
G
L
 
V
R
 
K
A
 
E
D
 
E
N
 
D
L
 
I
A
 
-
P
 
E
V
 
L
L
 
L
A
 
A
-
 
K
-
 
N
-
 
A
-
 
F
-
 
E
-
 
D
-
 
V
C
 
C
C
 
T
R
 
Q
A
 
S
G
 
-
S
 
-
M
 
-
L
 
-
G
 
-
N
 
N
P
 
P
L
 
R
V
 
V
L
 
A
S
 
T
D
 
V
Q
 
Q
A
 
D
L
 
I
K
 
A
Q
 
Q
A
 
I
M
 
I
M
 
K
A
 
N
A
 
A
L
 
L

Sites not aligning to the query:

P0DJA2 Alcohol dehydrogenase 2; Alcohol dehydrogenase II; ADH II; EC 1.1.1.1 from Zymomonas mobilis subsp. mobilis (strain ATCC 31821 / ZM4 / CP4) (see 2 papers)
27% identity, 90% coverage: 14:361/388 of query aligns to 13:354/383 of P0DJA2

query
sites
P0DJA2
E
 
E
F
 
M
G
 
G
W
 
E
G
 
G
C
 
S
T
 
L
D
 
E
S
 
K
R
 
A
L
 
I
A
 
K
D
 
D
A
 
L
I
 
N
L
 
G
A
 
S
Q
 
G
S
 
F
Q
 
K
N
 
N
Q
 
-
V
 
A
M
 
L
L
 
I
I
 
V
S
 
S
G
x
D
G
 
A
Y
 
F
A
 
M
D
 
N
A
 
K
H
 
S
F
 
G
V
 
V
E
 
V
P
 
K
R
 
Q
L
 
V
A
 
A
R
 
D
V
 
L
F
 
L
E
 
K
C
 
A
R
 
Q
K
 
G
V
 
I
H
 
N
R
 
S
V
 
A
V
 
V
V
 
Y
R
 
D
G
 
G
-
 
V
E
 
M
P
 
P
S
x
N
P
 
P
-
 
T
-
 
V
-
 
T
A
 
A
V
 
V
V
 
L
D
 
E
K
 
G
L
 
L
V
 
K
A
 
I
E
 
L
A
 
K
P
 
D
Q
 
N
G
 
N
I
 
S
E
 
D
L
 
F
V
 
V
I
 
I
G
 
S
F
 
L
G
 
G
G
 
G
G
|
G
S
|
S
V
 
P
L
 
H
D
 
D
A
 
C
A
 
A
K
 
K
A
 
A
V
 
I
A
 
A
G
 
L
L
 
V
L
 
A
P
 
T
E
 
N
R
 
G
F
 
G
S
 
E
V
 
V
V
 
K
D
 
D
Y
 
Y
L
 
-
E
 
E
G
 
G
V
 
I
G
 
D
C
 
K
G
 
S
R
 
K
K
 
K
I
 
-
Q
 
-
H
 
-
T
 
P
P
 
A
V
 
L
P
 
P
F
 
L
M
 
M
A
 
S
V
 
I
P
 
N
T
|
T
T
|
T
A
 
A
G
 
G
T
 
T
G
 
A
S
 
S
E
 
E
T
 
M
T
|
T
K
 
R
N
x
F
A
 
C
V
 
I
I
 
I
S
 
T
-
 
D
K
 
E
L
 
V
G
 
R
E
 
H
Y
 
V
K
|
K
K
 
M
S
 
A
F
 
I
R
 
V
D
 
D
D
 
R
R
 
H
L
 
V
L
 
T
A
 
P
K
 
M
Q
 
V
A
 
S
W
 
V
L
 
N
D
 
D
P
 
P
A
 
L
F
x
L
L
 
M
P
 
V
H
x
G
C
x
M
P
 
P
A
 
K
S
 
G
V
 
L
L
 
T
Y
 
A
P
 
A
T
 
T
A
 
G
M
 
M
D
|
D
A
 
A
F
 
L
T
 
T
Q
x
H
L
 
A
L
 
F
E
 
E
S
 
A
Y
 
Y
V
 
S
T
 
S
L
 
T
K
 
A
A
 
A
N
 
T
P
 
P
I
 
I
T
 
T
D
 
D
A
 
A
L
 
C
A
 
A
W
 
L
Q
 
K
G
 
A
M
 
A
C
 
S
L
 
M
F
 
I
K
 
A
G
 
K
A
 
N
F
 
L
D
 
K
L
 
T
I
 
A
A
 
C
S
 
D
N
 
N
D
 
G
-
 
K
-
 
D
-
 
M
P
 
P
T
 
A
C
 
R
Q
 
E
Q
 
A
Q
 
M
G
 
A
Y
 
Y
G
 
A
Q
 
Q
L
 
F
M
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
S
 
-
L
 
L
S
 
A
G
 
G
M
 
M
T
 
A
L
 
F
A
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
S
L
 
L
G
 
G
A
 
Y
V
 
V
H
|
H
G
 
A
L
 
M
A
 
A
G
x
H
P
 
Q
I
 
L
G
 
G
A
 
G
Y
 
Y
F
 
Y
E
 
N
A
 
L
P
 
P
H
|
H
G
 
G
V
 
V
V
 
C
C
 
N
A
 
A
R
 
V
L
 
L
L
 
L
A
 
P
P
 
H
I
 
V
T
 
L
R
 
A
A
 
Y
N
 
N
I
 
A
E
 
-
A
 
-
L
 
-
Q
 
S
I
 
V
A
 
V
S
 
A
S
 
G
E
 
R
Q
 
L
A
 
K
T
 
D
T
 
V
A
 
G
L
 
V
N
 
A
K
 
M
Y
 
G
V
 
L
Q
 
D
V
 
I
A
 
A
E
 
N
L
 
L
L
 
G
T
 
D
G
 
K
H
 
E
R
 
G
G
 
A
L
 
E
A
 
A
G
 
T
L
 
I
V
 
Q
A
 
A
Y
 
V
L
 
R
E
 
D
Q
 
L
M
 
A
S
 
A
A
 
S
D
 
I
Y
 
G
V
 
I
P
 
P
Q
 
A
G
 
N
L
 
L
A
 
T
E
 
E
F
 
L
G
 
G
L
 
A
R
 
K
A
 
K
D
 
E
N
 
D
L
 
V
A
 
-
P
 
P
V
 
L
L
 
L
A
 
A

Sites not aligning to the query:

3ox4A Structures of iron-dependent alcohol dehydrogenase 2 from zymomonas mobilis zm4 complexed with NAD cofactor (see paper)
27% identity, 90% coverage: 14:361/388 of query aligns to 12:353/382 of 3ox4A

query
sites
3ox4A
E
 
E
F
 
M
G
 
G
W
 
E
G
 
G
C
 
S
T
 
L
D
 
E
S
 
K
R
 
A
L
 
I
A
 
K
D
 
D
A
 
L
I
 
N
L
 
G
A
 
S
Q
 
G
S
 
F
Q
 
K
N
 
N
Q
 
-
V
 
A
M
 
L
L
 
I
I
 
V
S
 
S
G
x
D
G
 
A
Y
x
F
A
x
M
D
 
N
A
 
K
H
 
S
F
 
G
V
 
V
E
 
V
P
 
K
R
 
Q
L
 
V
A
 
A
R
 
D
V
 
L
F
 
L
E
 
K
C
 
A
R
 
Q
K
 
G
V
 
I
H
 
N
R
 
S
V
 
A
V
 
V
V
 
Y
R
 
D
G
 
G
-
 
V
E
 
M
P
 
P
S
x
N
P
 
P
-
 
T
-
 
V
-
 
T
A
 
A
V
 
V
V
 
L
D
 
E
K
 
G
L
 
L
V
 
K
A
 
I
E
 
L
A
 
K
P
 
D
Q
 
N
G
 
N
I
 
S
E
 
D
L
 
F
V
 
V
I
 
I
G
 
S
F
 
L
G
 
G
G
|
G
G
|
G
S
|
S
V
 
P
L
 
H
D
 
D
A
 
C
A
 
A
K
 
K
A
 
A
V
 
I
A
 
A
G
 
L
L
 
V
L
 
A
P
 
T
E
 
N
R
 
G
F
 
G
S
 
E
V
 
V
V
 
K
D
 
D
Y
 
Y
L
 
-
E
 
E
G
 
G
V
 
I
G
 
D
C
 
K
G
 
S
R
 
K
K
 
K
I
 
-
Q
 
-
H
 
-
T
 
P
P
 
A
V
 
L
P
 
P
F
 
L
M
 
M
A
 
S
V
 
I
P
 
N
T
|
T
T
|
T
A
 
A
G
 
G
T
 
T
G
 
A
S
 
S
E
 
E
T
 
M
T
 
T
K
 
R
N
x
F
A
 
C
V
x
I
I
 
I
S
 
T
-
 
D
K
 
E
L
 
V
G
 
R
E
 
H
Y
 
V
K
 
K
K
 
M
S
 
A
F
 
I
R
 
V
D
 
D
D
 
R
R
 
H
L
 
V
L
 
T
A
 
P
K
 
M
Q
 
V
A
 
S
W
 
V
L
 
N
D
 
D
P
 
P
A
 
L
F
 
L
L
 
M
P
 
V
H
x
G
C
x
M
P
 
P
A
 
K
S
 
G
V
x
L
L
 
T
Y
 
A
P
 
A
T
 
T
A
 
G
M
 
M
D
|
D
A
 
A
F
 
L
T
 
T
Q
x
H
L
 
A
L
 
F
E
 
E
S
 
A
Y
 
Y
V
 
S
T
 
S
L
 
T
K
 
A
A
 
A
N
 
T
P
 
P
I
 
I
T
 
T
D
 
D
A
 
A
L
 
C
A
 
A
W
 
L
Q
 
K
G
 
A
M
 
A
C
 
S
L
 
M
F
 
I
K
 
A
G
 
K
A
 
N
F
 
L
D
 
K
L
 
T
I
 
A
A
 
C
S
 
D
N
 
N
D
 
G
-
 
K
-
 
D
-
 
M
P
 
P
T
 
A
C
 
R
Q
 
E
Q
 
A
Q
 
M
G
 
A
Y
 
Y
G
 
A
Q
 
Q
L
 
F
M
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
S
 
-
L
 
L
S
 
A
G
 
G
M
 
M
T
 
A
L
 
F
A
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
S
L
 
L
G
 
G
A
 
Y
V
 
V
H
|
H
G
 
A
L
 
M
A
 
A
G
 
H
P
 
Q
I
 
L
G
 
G
A
 
G
Y
 
Y
F
 
Y
E
 
N
A
 
L
P
 
P
H
|
H
G
 
G
V
 
V
V
 
C
C
 
N
A
 
A
R
 
V
L
 
L
L
 
L
A
 
P
P
 
H
I
 
V
T
 
L
R
 
A
A
 
Y
N
 
N
I
 
A
E
 
-
A
 
-
L
 
-
Q
 
S
I
 
V
A
 
V
S
 
A
S
 
G
E
 
R
Q
 
L
A
 
K
T
 
D
T
 
V
A
 
G
L
 
V
N
 
A
K
 
M
Y
 
G
V
 
L
Q
 
D
V
 
I
A
 
A
E
 
N
L
 
L
L
 
G
T
 
D
G
 
K
H
 
E
R
 
G
G
 
A
L
 
E
A
 
A
G
 
T
L
 
I
V
 
Q
A
 
A
Y
 
V
L
 
R
E
 
D
Q
 
L
M
 
A
S
 
A
A
 
S
D
 
I
Y
 
G
V
 
I
P
 
P
Q
 
A
G
 
N
L
 
L
A
 
T
E
 
E
F
 
L
G
 
G
L
 
A
R
 
K
A
 
K
D
 
E
N
 
D
L
 
V
A
 
-
P
 
P
V
 
L
L
 
L
A
 
A

3owoA Structures of iron-dependent alcohol dehydrogenase 2 from zymomonas mobilis zm4 with and without NAD cofactor (see paper)
27% identity, 90% coverage: 14:361/388 of query aligns to 12:353/382 of 3owoA

query
sites
3owoA
E
 
E
F
 
M
G
 
G
W
 
E
G
 
G
C
 
S
T
 
L
D
 
E
S
 
K
R
 
A
L
 
I
A
 
K
D
 
D
A
 
L
I
 
N
L
 
G
A
 
S
Q
 
G
S
 
F
Q
 
K
N
 
N
Q
 
-
V
 
A
M
 
L
L
 
I
I
 
V
S
 
S
G
 
D
G
 
A
Y
 
F
A
 
M
D
 
N
A
 
K
H
 
S
F
 
G
V
 
V
E
 
V
P
 
K
R
 
Q
L
 
V
A
 
A
R
 
D
V
 
L
F
 
L
E
 
K
C
 
A
R
 
Q
K
 
G
V
 
I
H
 
N
R
 
S
V
 
A
V
 
V
V
 
Y
R
 
D
G
 
G
-
 
V
E
 
M
P
 
P
S
 
N
P
 
P
-
 
T
-
 
V
-
 
T
A
 
A
V
 
V
V
 
L
D
 
E
K
 
G
L
 
L
V
 
K
A
 
I
E
 
L
A
 
K
P
 
D
Q
 
N
G
 
N
I
 
S
E
 
D
L
 
F
V
 
V
I
 
I
G
 
S
F
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
S
V
 
P
L
 
H
D
 
D
A
 
C
A
 
A
K
 
K
A
 
A
V
 
I
A
 
A
G
 
L
L
 
V
L
 
A
P
 
T
E
 
N
R
 
G
F
 
G
S
 
E
V
 
V
V
 
K
D
 
D
Y
 
Y
L
 
-
E
 
E
G
 
G
V
 
I
G
 
D
C
 
K
G
 
S
R
 
K
K
 
K
I
 
-
Q
 
-
H
 
-
T
 
P
P
 
A
V
 
L
P
 
P
F
 
L
M
 
M
A
 
S
V
 
I
P
 
N
T
 
T
T
 
T
A
 
A
G
 
G
T
 
T
G
 
A
S
 
S
E
 
E
T
 
M
T
 
T
K
 
R
N
 
F
A
 
C
V
 
I
I
 
I
S
 
T
-
 
D
K
 
E
L
 
V
G
 
R
E
 
H
Y
 
V
K
 
K
K
 
M
S
 
A
F
 
I
R
 
V
D
 
D
D
 
R
R
 
H
L
 
V
L
 
T
A
 
P
K
 
M
Q
 
V
A
 
S
W
 
V
L
 
N
D
 
D
P
 
P
A
 
L
F
 
L
L
 
M
P
 
V
H
 
G
C
 
M
P
 
P
A
 
K
S
 
G
V
 
L
L
 
T
Y
 
A
P
 
A
T
 
T
A
 
G
M
 
M
D
|
D
A
 
A
F
 
L
T
 
T
Q
x
H
L
 
A
L
 
F
E
 
E
S
 
A
Y
 
Y
V
 
S
T
 
S
L
 
T
K
 
A
A
 
A
N
 
T
P
 
P
I
 
I
T
 
T
D
 
D
A
 
A
L
 
C
A
 
A
W
 
L
Q
 
K
G
 
A
M
 
A
C
 
S
L
 
M
F
 
I
K
 
A
G
 
K
A
 
N
F
 
L
D
 
K
L
 
T
I
 
A
A
 
C
S
 
D
N
 
N
D
 
G
-
 
K
-
 
D
-
 
M
P
 
P
T
 
A
C
 
R
Q
 
E
Q
 
A
Q
 
M
G
 
A
Y
 
Y
G
 
A
Q
 
Q
L
 
F
M
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
S
 
-
L
 
L
S
 
A
G
 
G
M
 
M
T
 
A
L
 
F
A
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
S
L
 
L
G
 
G
A
 
Y
V
 
V
H
|
H
G
 
A
L
 
M
A
 
A
G
 
H
P
 
Q
I
 
L
G
 
G
A
 
G
Y
 
Y
F
 
Y
E
 
N
A
 
L
P
 
P
H
|
H
G
 
G
V
 
V
V
 
C
C
 
N
A
 
A
R
 
V
L
 
L
L
 
L
A
 
P
P
 
H
I
 
V
T
 
L
R
 
A
A
 
Y
N
 
N
I
 
A
E
 
-
A
 
-
L
 
-
Q
 
S
I
 
V
A
 
V
S
 
A
S
 
G
E
 
R
Q
 
L
A
 
K
T
 
D
T
 
V
A
 
G
L
 
V
N
 
A
K
 
M
Y
 
G
V
 
L
Q
 
D
V
 
I
A
 
A
E
 
N
L
 
L
L
 
G
T
 
D
G
 
K
H
 
E
R
 
G
G
 
A
L
 
E
A
 
A
G
 
T
L
 
I
V
 
Q
A
 
A
Y
 
V
L
 
R
E
 
D
Q
 
L
M
 
A
S
 
A
A
 
S
D
 
I
Y
 
G
V
 
I
P
 
P
Q
 
A
G
 
N
L
 
L
A
 
T
E
 
E
F
 
L
G
 
G
L
 
A
R
 
K
A
 
K
D
 
E
N
 
D
L
 
V
A
 
-
P
 
P
V
 
L
L
 
L
A
 
A

3bfjA Crystal structure analysis of 1,3-propanediol oxidoreductase (see paper)
30% identity, 80% coverage: 70:380/388 of query aligns to 68:374/382 of 3bfjA

query
sites
3bfjA
E
 
E
P
 
P
S
 
N
P
 
P
A
 
K
-
 
D
-
 
T
-
 
N
V
 
V
V
 
R
D
 
D
K
 
G
L
 
L
V
 
A
A
 
V
E
 
F
A
 
R
P
 
R
Q
 
E
G
 
Q
I
 
C
E
 
D
L
 
I
V
 
I
I
 
V
G
 
T
F
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
S
V
 
P
L
 
H
D
 
D
A
 
C
A
 
G
K
 
K
A
 
G
V
 
I
A
 
G
G
 
I
L
 
A
L
 
A
P
 
T
E
 
H
R
 
E
F
 
G
S
 
D
V
 
L
V
 
Y
D
 
Q
Y
 
Y
L
 
-
E
 
-
G
 
-
V
 
-
G
 
-
C
 
A
G
 
G
R
 
I
K
 
E
I
 
T
Q
 
L
H
 
T
T
 
N
P
 
P
V
 
L
P
 
P
-
 
P
F
 
I
M
 
V
A
 
A
V
 
V
P
 
N
T
 
T
T
 
T
A
 
A
G
 
G
T
 
T
G
 
A
S
 
S
E
 
E
T
 
V
T
 
T
K
 
R
N
 
H
A
 
C
V
 
V
I
 
L
S
 
T
K
 
N
L
 
T
G
 
-
E
 
E
Y
 
T
K
 
K
K
 
V
S
 
K
F
 
F
R
 
V
-
 
I
-
 
V
D
 
S
D
 
W
R
 
R
L
 
N
L
 
L
A
 
P
K
 
S
Q
 
V
A
 
S
W
 
I
L
 
N
D
 
D
P
 
P
A
 
L
F
 
L
L
 
M
P
 
I
H
 
G
C
 
K
P
 
P
A
 
A
S
 
A
V
 
L
L
 
T
Y
 
A
P
 
A
T
 
T
A
 
G
M
 
M
D
|
D
A
 
A
F
 
L
T
 
T
Q
x
H
L
 
A
L
 
V
E
 
E
S
 
A
Y
 
Y
V
 
I
T
 
S
L
 
K
K
 
D
A
 
A
N
 
N
P
 
P
I
 
V
T
 
T
D
 
D
A
 
A
L
 
A
A
 
A
W
 
M
Q
 
Q
G
 
A
M
 
I
C
 
R
L
 
L
F
 
I
K
 
A
G
 
R
A
 
N
F
 
L
D
 
R
L
 
Q
I
 
A
A
 
V
S
 
A
N
 
L
D
 
G
P
 
S
T
 
N
C
 
L
Q
 
Q
Q
 
A
Q
 
R
G
 
E
Y
 
Y
G
 
-
Q
 
-
L
 
M
M
 
A
L
 
Y
A
 
A
A
 
S
S
 
L
L
 
L
S
 
A
G
 
G
M
 
M
T
 
A
L
 
F
A
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
N
L
 
L
G
 
G
A
 
Y
V
 
V
H
|
H
G
 
A
L
 
M
A
 
A
G
 
H
P
 
Q
I
 
L
G
 
G
A
 
G
Y
 
L
F
 
Y
E
 
D
A
 
M
P
 
P
H
|
H
G
 
G
V
 
V
V
 
A
C
 
N
A
 
A
R
 
V
L
 
L
L
 
L
A
 
P
P
 
H
I
 
V
T
 
A
R
 
R
A
 
Y
N
 
N
I
 
L
E
 
-
A
 
-
L
 
-
Q
 
-
I
 
I
A
 
A
S
 
N
S
 
P
E
 
E
Q
 
-
A
 
-
T
 
-
T
 
-
A
 
-
L
 
-
N
 
-
K
 
K
Y
 
F
V
 
A
Q
 
D
V
 
I
A
 
A
E
 
E
L
 
L
L
 
M
T
 
G
G
 
E
H
 
N
-
 
I
R
 
T
G
 
G
L
 
L
A
 
S
G
 
T
L
 
L
-
 
D
-
 
A
-
 
A
-
 
E
-
 
K
-
 
A
V
 
I
A
 
A
Y
 
A
L
 
I
E
 
T
Q
 
R
M
 
L
S
 
S
A
 
M
D
 
D
Y
 
I
-
 
G
V
 
I
P
 
P
Q
 
Q
G
 
H
L
 
L
A
 
R
E
 
D
F
 
L
G
 
G
L
 
V
R
 
K
A
 
E
D
 
T
N
 
D
L
 
F
A
 
-
P
 
P
V
 
Y
L
 
M
A
 
A
-
 
E
-
 
M
C
 
A
C
 
L
R
 
K
A
 
D
G
 
G
S
 
N
M
 
A
L
 
F
G
 
S
N
 
N
P
 
P
L
 
R
V
 
K
L
 
G
S
 
N
D
 
E
Q
 
Q
A
 
E
L
 
I

7qlgAAA Lactaldehyde reductase (see paper)
34% identity, 55% coverage: 85:297/388 of query aligns to 85:292/383 of 7qlgAAA

query
sites
7qlgAAA
Q
 
S
G
 
G
I
 
A
E
 
D
L
 
Y
V
 
L
I
 
I
G
 
A
F
 
I
G
 
G
G
|
G
G
|
G
S
|
S
V
 
P
L
 
Q
D
|
D
A
 
T
A
 
C
K
 
K
A
 
A
V
 
I
A
 
-
G
 
G
L
 
I
L
 
I
-
 
S
-
 
N
-
 
N
P
 
P
E
 
E
R
 
-
F
 
F
S
 
A
V
 
D
V
 
V
D
 
R
Y
 
S
L
 
L
E
 
E
G
 
G
V
 
L
G
 
S
C
 
P
G
 
T
R
 
N
K
 
K
I
 
-
Q
 
-
H
 
-
T
 
P
P
 
S
V
 
V
P
 
P
F
 
I
M
 
L
A
 
A
V
 
I
P
 
P
T
|
T
T
|
T
A
 
A
G
 
G
T
|
T
G
 
A
S
 
A
E
 
E
T
 
V
T
|
T
K
 
I
N
|
N
A
 
Y
V
 
V
I
 
I
S
 
T
K
 
D
L
 
E
G
 
-
E
 
E
Y
 
K
K
 
R
K
 
R
S
x
K
F
 
F
R
 
V
-
 
C
-
 
V
D
 
D
D
 
P
R
 
H
L
 
D
L
 
I
A
 
P
K
 
Q
Q
 
V
A
 
A
W
 
F
L
 
I
D
 
D
P
 
A
A
 
D
F
 
M
L
 
M
P
 
D
H
 
G
C
 
M
P
 
P
A
 
P
S
 
A
V
x
L
L
 
K
Y
 
A
P
 
A
T
 
T
A
 
G
M
 
V
D
|
D
A
 
A
F
 
L
T
 
T
Q
x
H
L
 
A
L
 
I
E
 
E
S
 
G
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
L
 
R
K
 
G
A
 
A
N
 
W
P
 
A
I
 
L
T
 
T
D
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
H
W
 
I
Q
 
K
G
 
A
M
 
I
C
 
E
L
 
I
F
 
I
K
 
A
G
 
G
A
 
A
F
 
L
D
 
R
L
 
G
I
 
S
A
 
V
S
 
A
N
 
G
D
 
D
P
 
K
T
 
D
C
 
A
Q
 
G
Q
 
E
Q
 
E
G
 
-
Y
 
-
G
 
-
Q
 
-
L
 
M
M
 
A
L
 
L
A
 
G
A
 
Q
S
 
Y
L
 
V
S
 
A
G
 
G
M
 
M
T
 
G
L
 
F
A
 
S
N
 
N
A
 
V
G
 
G
L
 
V
G
 
G
A
 
L
V
 
V
H
|
H
G
 
G
L
 
M
A
 
A
G
 
H
P
 
P
I
 
L
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
F
 
Y
E
 
N
A
 
T
P
 
P
H
|
H
G
 
G
V
 
V
V
 
A
C
 
N
A
 
A
R
 
I
L
 
L
L
 
L
A
 
P
P
 
H
I
 
V
T
 
M
R
 
R
A
 
Y
N
 
N
I
 
A
E
 
D

Sites not aligning to the query:

3zdrA Structure of the alcohol dehydrogenase (adh) domain of a bifunctional adhe dehydrogenase from geobacillus thermoglucosidasius ncimb 11955 (see paper)
31% identity, 68% coverage: 70:331/388 of query aligns to 67:337/403 of 3zdrA

query
sites
3zdrA
E
 
E
P
 
P
S
 
D
P
 
P
A
 
S
V
 
I
-
 
E
-
 
T
-
 
V
-
 
M
-
 
K
-
 
G
V
 
V
D
 
D
K
 
M
L
 
M
V
 
R
A
 
S
E
 
F
A
 
E
P
 
P
Q
 
-
G
 
-
I
 
-
E
 
D
L
 
V
V
 
I
I
 
I
G
 
A
F
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
S
V
 
P
L
 
M
D
 
D
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
A
V
 
M
A
 
W
G
 
L
L
 
F
L
 
Y
P
 
E
E
 
H
R
 
P
F
 
T
S
 
A
V
 
D
V
 
F
D
 
N
Y
 
A
L
 
L
E
 
K
G
 
Q
-
 
K
-
 
F
V
 
L
G
 
D
C
 
I
G
 
R
R
 
K
K
 
R
I
 
V
Q
 
Y
H
 
K
T
 
Y
P
 
P
-
 
K
-
 
L
-
 
G
-
 
Q
-
 
K
V
 
A
P
 
K
F
 
F
M
 
V
A
 
A
V
 
I
P
 
P
T
 
T
T
 
T
A
 
S
G
 
G
T
 
T
G
 
G
S
 
S
E
 
E
T
 
V
T
 
T
K
 
S
N
 
F
A
 
A
V
 
V
I
 
I
S
 
T
-
 
D
K
 
K
L
 
K
G
 
T
E
 
N
Y
 
I
K
 
K
K
 
Y
S
 
P
F
 
L
R
 
A
D
 
D
D
 
Y
R
 
E
L
 
L
L
 
T
A
 
P
K
 
D
Q
 
V
A
 
A
W
 
I
L
 
V
D
 
D
P
 
P
A
 
Q
F
 
F
L
 
V
P
 
M
H
 
T
C
 
V
P
 
P
A
 
K
S
 
H
V
 
V
L
 
T
Y
 
A
P
 
D
T
 
T
A
 
G
M
 
M
D
|
D
A
 
V
F
 
L
T
 
T
Q
x
H
L
 
A
L
 
I
E
 
E
S
 
A
Y
 
Y
V
 
V
T
 
S
L
 
N
K
 
M
A
 
A
N
 
N
P
 
D
I
 
Y
T
 
T
D
 
D
A
 
G
L
 
L
A
 
A
W
 
M
Q
 
K
G
 
A
M
 
I
C
 
Q
L
 
L
F
 
-
K
 
-
G
 
-
A
 
V
F
 
F
D
 
E
L
 
Y
I
 
L
A
 
-
S
 
-
N
 
-
D
 
-
P
 
P
T
 
R
C
 
A
Q
 
Y
Q
 
Q
Q
 
N
G
 
G
Y
 
A
G
 
D
Q
 
E
L
 
L
M
 
A
L
 
R
-
 
E
-
 
K
-
 
M
-
 
H
-
 
N
A
 
A
A
 
S
S
 
T
L
 
I
S
 
A
G
 
G
M
 
M
T
 
A
L
 
F
A
 
A
N
 
N
A
 
A
G
 
F
L
 
L
G
 
G
A
 
I
V
 
N
H
|
H
G
 
S
L
 
L
A
 
A
G
 
H
P
 
K
I
 
L
G
 
G
A
 
A
Y
 
E
F
 
F
E
 
H
A
 
I
P
 
P
H
|
H
G
 
G
V
 
R
V
 
A
C
 
N
A
 
T
R
 
I
L
 
L
L
 
M
A
 
P
P
 
H
I
 
V
T
 
I
R
 
R
A
 
Y
N
 
N
I
 
-
E
 
-
A
 
-
L
 
-
Q
 
-
I
 
A
A
 
A
S
 
K
S
 
P
E
 
K
Q
 
K
A
 
Y
T
 
F
T
 
K
A
 
A
L
 
D
N
 
Q
K
 
R
Y
 
Y
V
 
A
Q
 
E
V
 
I
A
 
A
E
 
R
L
 
M
L
 
L
-
 
G
-
 
L
-
 
P
-
 
A
-
 
R
T
 
T
G
 
T
H
 
E
R
 
E
G
 
G
L
 
V
A
 
E
G
 
S
L
 
L
V
 
V

7qlqAAA Lactaldehyde reductase (see paper)
34% identity, 55% coverage: 85:297/388 of query aligns to 85:292/383 of 7qlqAAA

query
sites
7qlqAAA
Q
 
S
G
 
G
I
 
A
E
 
D
L
 
Y
V
 
L
I
 
I
G
 
A
F
 
I
G
 
G
G
|
G
G
|
G
S
|
S
V
 
P
L
 
Q
D
 
D
A
 
T
A
 
C
K
 
K
A
 
A
V
 
I
A
 
-
G
 
G
L
 
I
L
 
I
-
 
S
-
 
N
-
 
N
P
 
P
E
 
E
R
 
-
F
 
F
S
 
A
V
 
D
V
 
V
D
 
R
Y
 
S
L
 
L
E
 
E
G
 
G
V
 
L
G
 
S
C
 
P
G
 
T
R
 
N
K
 
K
I
 
-
Q
 
-
H
 
-
T
 
P
P
 
S
V
 
V
P
 
P
F
 
I
M
 
L
A
 
A
V
 
I
P
 
P
T
|
T
T
|
T
A
 
A
G
 
G
T
|
T
G
 
A
S
 
A
E
 
E
T
 
V
T
 
T
K
 
I
N
x
G
A
 
Y
V
 
V
I
 
I
S
 
T
K
 
D
L
 
E
G
 
-
E
 
E
Y
 
K
K
 
R
K
 
R
S
x
K
F
 
F
R
 
V
-
 
C
-
x
V
D
 
D
D
 
P
R
 
H
L
 
D
L
 
I
A
 
P
K
 
Q
Q
 
V
A
 
A
W
 
F
L
 
I
D
 
D
P
 
A
A
 
D
F
 
M
L
 
M
P
 
D
H
x
G
C
x
M
P
 
P
A
 
P
S
 
A
V
x
L
L
 
K
Y
 
A
P
 
A
T
 
T
A
 
G
M
 
V
D
|
D
A
 
A
F
 
L
T
 
T
Q
x
H
L
 
A
L
 
I
E
 
E
S
 
G
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
L
 
R
K
 
G
A
 
A
N
 
W
P
 
A
I
 
L
T
 
T
D
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
H
W
 
I
Q
 
K
G
 
A
M
 
I
C
 
E
L
 
I
F
 
I
K
 
A
G
 
G
A
 
A
F
 
L
D
 
R
L
 
G
I
 
S
A
 
V
S
 
A
N
 
G
D
 
D
P
 
K
T
 
D
C
 
A
Q
 
G
Q
 
E
Q
 
E
G
 
-
Y
 
-
G
 
-
Q
 
-
L
 
M
M
 
A
L
 
L
A
 
G
A
 
Q
S
 
Y
L
 
V
S
 
A
G
 
G
M
 
M
T
 
G
L
x
F
A
x
S
N
 
N
A
 
V
G
 
G
L
 
V
G
 
G
A
 
L
V
 
V
H
|
H
G
 
G
L
 
M
A
 
A
G
 
H
P
 
P
I
 
L
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
F
 
Y
E
 
N
A
 
T
P
 
P
H
|
H
G
 
G
V
 
V
V
 
A
C
 
N
A
 
A
R
 
I
L
 
L
L
 
L
A
 
P
P
 
H
I
 
V
T
 
M
R
 
R
A
 
Y
N
 
N
I
 
A
E
 
D

Sites not aligning to the query:

Q59104 4-hydroxybutyrate dehydrogenase; 4HbD; Gamma-hydroxybutyrate dehydrogenase; GHBDH; EC 1.1.1.61 from Cupriavidus necator (Alcaligenes eutrophus) (Ralstonia eutropha) (see paper)
28% identity, 75% coverage: 70:361/388 of query aligns to 67:354/382 of Q59104

query
sites
Q59104
E
 
N
P
 
P
S
 
T
P
 
E
A
 
A
V
 
M
V
 
V
D
 
R
K
 
K
L
 
A
V
 
A
A
 
A
E
 
Q
A
 
Y
P
 
R
Q
 
E
-
 
A
G
 
G
I
 
C
E
 
D
L
 
G
V
 
L
I
 
V
G
 
A
F
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
S
V
 
S
L
 
I
D
 
D
A
 
L
A
 
A
K
 
K
A
 
G
V
 
I
A
 
A
G
 
I
L
 
L
L
 
A
P
 
T
E
 
H
R
 
E
F
 
G
S
 
E
V
 
L
V
 
T
D
 
T
Y
 
Y
L
 
A
E
 
T
G
 
I
V
 
E
G
 
G
C
 
G
G
 
S
R
 
A
K
 
R
I
 
I
Q
 
T
H
 
D
T
 
K
P
 
A
V
 
A
P
 
P
F
 
L
M
 
I
A
 
A
V
 
V
P
 
P
T
 
T
T
 
T
A
 
S
G
 
G
T
 
T
G
 
G
S
 
S
E
 
E
T
 
V
T
 
A
K
 
R
N
 
G
A
 
A
V
 
I
I
 
I
S
 
I
K
 
L
L
 
D
G
 
D
E
 
G
Y
 
R
K
 
K
K
 
L
S
 
G
F
 
F
R
 
H
D
 
S
D
 
W
R
 
H
L
 
L
L
 
L
A
 
P
K
 
K
Q
 
S
A
 
A
W
 
V
L
 
C
D
 
D
P
 
P
A
 
E
F
 
L
L
 
T
P
 
L
H
 
G
C
 
L
P
 
P
A
 
A
S
 
G
V
 
L
L
 
T
Y
 
A
P
 
A
T
 
T
A
 
G
M
 
M
D
|
D
A
 
A
F
 
I
T
 
A
Q
x
H
L
 
C
L
 
I
E
 
E
S
 
T
Y
 
F
V
 
L
T
 
A
L
 
P
K
 
A
A
 
F
N
 
N
P
 
P
I
 
P
T
 
A
D
 
D
A
 
G
L
 
I
A
 
A
W
 
L
Q
 
D
G
 
G
M
 
L
C
 
E
L
 
R
F
 
G
K
 
W
G
 
G
A
 
H
F
 
I
D
 
E
L
 
R
I
 
-
A
 
A
S
 
T
N
 
R
D
 
D
P
 
-
T
 
-
C
 
G
Q
 
Q
Q
 
D
Q
 
R
G
 
D
Y
 
A
G
 
R
Q
 
L
L
 
N
M
 
M
L
 
M
A
 
S
A
 
A
S
 
S
L
 
M
S
 
Q
G
 
G
M
 
A
T
 
M
L
 
A
A
 
F
N
 
Q
A
 
K
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
C
V
 
V
H
|
H
G
 
S
L
 
L
A
 
S
G
x
H
P
 
P
I
 
L
G
 
G
A
 
G
Y
 
L
-
 
K
-
 
I
-
 
D
-
 
G
-
 
R
F
 
T
E
 
G
A
 
L
P
 
H
H
|
H
G
 
G
V
 
T
V
 
L
C
 
N
A
 
A
R
 
V
L
 
V
L
 
M
A
 
P
P
 
A
I
 
V
T
 
L
R
 
R
A
 
F
N
 
N
I
 
A
E
 
D
A
 
A
L
 
P
Q
 
T
I
 
V
A
 
V
S
 
R
S
 
D
E
 
-
Q
 
-
A
 
-
T
 
-
T
 
-
A
 
-
L
 
-
N
 
D
K
 
R
Y
 
Y
V
 
A
Q
 
R
V
 
L
A
 
R
E
 
R
L
 
A
L
 
M
T
 
H
G
 
L
H
 
P
R
 
D
G
 
G
L
 
-
A
 
A
G
 
D
L
 
I
V
 
A
A
 
Q
Y
 
A
L
 
V
E
 
H
Q
 
D
M
 
M
S
 
T
A
 
V
D
 
R
Y
 
L
-
 
G
V
 
L
P
 
P
Q
 
T
G
 
G
L
 
L
A
 
R
E
 
Q
F
 
M
G
 
G
L
 
V
R
 
T
A
 
E
D
 
D
N
 
M
L
 
F
A
 
D
P
 
K
V
 
V
L
 
I
A
 
A

7bvpA Adhe spirosome in extended conformation (see paper)
30% identity, 83% coverage: 37:359/388 of query aligns to 489:829/869 of 7bvpA

query
sites
7bvpA
M
x
F
L
 
L
I
 
F
S
 
N
G
 
N
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
D
 
D
A
 
-
H
 
-
F
 
-
V
 
-
E
 
-
P
 
-
R
 
Q
L
 
I
A
 
T
R
 
S
V
 
V
F
 
L
E
 
K
C
 
A
R
 
A
K
 
G
V
 
V
H
 
E
R
 
T
V
 
E
V
 
V
-
 
F
-
 
F
-
 
E
V
 
V
R
 
E
G
 
A
E
x
D
P
 
P
S
 
T
P
 
L
A
 
S
V
 
I
V
 
V
D
 
R
K
 
K
L
 
-
V
 
G
A
 
A
E
 
E
A
 
L
P
 
A
Q
 
N
G
 
S
I
 
F
-
 
K
-
 
P
E
 
D
L
 
V
V
 
I
I
 
I
G
 
A
F
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
P
L
 
M
D
|
D
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
I
V
 
M
A
 
W
G
 
V
L
 
M
L
 
Y
-
 
E
-
 
H
P
 
P
E
 
E
R
 
T
F
 
H
S
 
F
V
 
E
V
 
E
D
 
L
Y
 
A
L
 
L
E
 
R
G
 
F
V
 
M
G
 
D
C
 
I
G
 
R
R
 
K
K
 
R
I
 
I
Q
 
Y
H
 
K
T
 
F
P
 
P
-
 
K
-
 
M
-
 
G
-
 
V
-
 
K
V
 
A
P
 
K
F
 
M
M
 
I
A
 
A
V
 
V
P
 
T
T
|
T
T
|
T
A
 
S
G
 
G
T
|
T
G
 
G
S
 
S
E
 
E
T
 
V
T
 
T
K
 
P
N
 
F
A
 
A
V
|
V
I
 
V
S
 
T
K
 
D
L
 
D
G
 
A
E
 
T
Y
 
G
K
 
Q
K
|
K
-
 
Y
S
 
P
F
 
L
R
 
A
D
 
D
D
 
Y
R
 
A
L
 
L
L
 
T
A
 
P
K
 
D
Q
 
M
A
 
A
W
 
I
L
 
V
D
 
D
P
 
A
A
 
N
F
 
L
L
 
V
P
 
M
H
 
D
C
 
M
P
 
P
A
 
K
S
 
S
V
x
L
L
 
C
Y
 
A
P
 
F
T
 
G
A
 
G
M
 
L
D
|
D
A
 
A
F
 
V
T
 
T
Q
x
H
L
 
A
L
 
M
E
 
E
S
 
A
Y
 
Y
V
 
V
T
 
S
L
 
V
K
 
L
A
 
A
N
 
S
P
 
E
I
 
F
T
 
S
D
 
D
A
 
G
L
 
Q
A
 
A
W
 
L
Q
 
Q
G
 
A
M
 
L
C
 
K
L
 
L
F
 
L
K
 
K
G
 
E
-
 
Y
-
 
L
-
 
P
A
 
A
F
 
S
D
 
Y
L
 
H
I
 
E
A
 
G
S
 
S
N
 
K
D
 
N
P
 
P
T
 
V
C
 
A
Q
 
R
Q
 
E
Q
 
R
G
 
V
Y
 
H
G
 
S
Q
 
-
L
 
-
M
 
-
L
 
-
A
 
A
A
 
A
S
 
T
L
 
I
S
 
A
G
 
G
M
 
I
T
 
A
L
 
F
A
 
A
N
 
N
A
 
A
G
 
F
L
 
L
G
 
G
A
 
V
V
 
C
H
|
H
G
 
S
L
 
M
A
 
A
G
 
H
P
 
K
I
 
L
G
 
G
A
 
S
Y
 
Q
F
 
F
E
 
H
A
 
I
P
 
P
H
|
H
G
 
G
V
 
L
V
 
A
C
 
N
A
 
A
R
 
L
L
 
L
L
 
I
A
 
C
P
 
N
I
 
V
T
 
I
R
 
R
A
 
Y
N
 
N
I
 
A
E
 
N
-
 
D
-
 
N
-
 
P
A
 
T
L
 
K
Q
 
Q
I
 
T
A
 
A
S
 
F
S
 
S
E
 
Q
-
 
Y
Q
 
D
A
 
R
T
 
P
T
 
Q
A
 
A
L
 
R
N
 
R
K
 
R
Y
 
Y
V
 
A
Q
 
E
V
 
I
A
 
A
E
 
D
L
 
H
L
 
L
-
 
G
-
 
L
-
 
S
-
 
A
T
 
P
G
 
G
H
 
D
R
 
R
G
 
T
L
 
A
A
 
A
-
 
K
-
 
I
-
 
E
G
 
K
L
 
L
V
 
L
A
 
A
Y
 
W
L
 
L
E
 
E
Q
 
T
M
 
L
S
 
K
A
 
A
D
 
E
Y
 
L
-
 
G
V
 
I
P
 
P
Q
 
K
G
 
S
L
 
I
A
 
R
E
 
E
F
 
A
G
 
G
L
 
V
R
 
Q
-
 
E
A
 
A
D
 
D
N
 
F
L
 
L
A
 
A
P
 
N
V
 
V

Sites not aligning to the query:

6tqmA Escherichia coli adhe structure in its compact conformation (see paper)
30% identity, 83% coverage: 37:359/388 of query aligns to 489:829/869 of 6tqmA

query
sites
6tqmA
M
 
F
L
|
L
I
 
F
S
 
N
G
 
N
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
D
 
D
A
 
-
H
 
-
F
 
-
V
 
-
E
 
-
P
 
-
R
 
Q
L
 
I
A
 
T
R
 
S
V
 
V
F
 
L
E
 
K
C
 
A
R
 
A
K
 
G
V
 
V
H
 
E
R
 
T
V
 
E
V
 
V
-
 
F
-
 
F
-
 
E
V
 
V
R
 
E
G
 
A
E
 
D
P
 
P
S
 
T
P
 
L
A
 
S
V
 
I
V
 
V
D
 
R
K
 
K
L
 
-
V
 
G
A
 
A
E
 
E
A
 
L
P
 
A
Q
 
N
G
 
S
I
 
F
-
 
K
-
 
P
E
 
D
L
 
V
V
 
I
I
 
I
G
 
A
F
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
S
|
S
V
 
P
L
 
M
D
|
D
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
I
V
 
M
A
 
W
G
 
V
L
 
M
L
 
Y
-
 
E
-
 
H
P
 
P
E
 
E
R
 
T
F
 
H
S
 
F
V
 
E
V
 
E
D
 
L
Y
 
A
L
 
L
E
 
R
G
 
F
V
 
M
G
 
D
C
 
I
G
 
R
R
 
K
K
 
R
I
 
I
Q
 
Y
H
 
K
T
 
F
P
 
P
-
 
K
-
 
M
-
 
G
-
 
V
-
 
K
V
 
A
P
 
K
F
 
M
M
 
I
A
 
A
V
 
V
P
 
T
T
|
T
T
 
T
A
 
S
G
 
G
T
 
T
G
 
G
S
|
S
E
 
E
T
 
V
T
 
T
K
 
P
N
x
F
A
 
A
V
 
V
I
 
V
S
 
T
K
 
D
L
 
D
G
 
A
E
 
T
Y
 
G
K
 
Q
K
 
K
-
 
Y
S
 
P
F
 
L
R
 
A
D
 
D
D
 
Y
R
 
A
L
 
L
L
 
T
A
 
P
K
 
D
Q
 
M
A
 
A
W
 
I
L
 
V
D
 
D
P
 
A
A
 
N
F
 
L
L
 
V
P
 
M
H
 
D
C
 
M
P
 
P
A
 
K
S
 
S
V
x
L
L
 
C
Y
 
A
P
 
F
T
 
G
A
 
G
M
 
L
D
|
D
A
 
A
F
 
V
T
 
T
Q
x
H
L
 
A
L
 
M
E
 
E
S
 
A
Y
 
Y
V
 
V
T
 
S
L
 
V
K
 
L
A
 
A
N
 
S
P
 
E
I
 
F
T
 
S
D
 
D
A
 
G
L
 
Q
A
 
A
W
 
L
Q
 
Q
G
 
A
M
 
L
C
 
K
L
 
L
F
 
L
K
 
K
G
 
E
-
 
Y
-
 
L
-
 
P
A
 
A
F
 
S
D
 
Y
L
 
H
I
 
E
A
 
G
S
 
S
N
 
K
D
 
N
P
 
P
T
 
V
C
 
A
Q
 
R
Q
 
E
Q
 
R
G
 
V
Y
 
H
G
 
S
Q
 
-
L
 
-
M
 
-
L
 
-
A
 
A
A
 
A
S
 
T
L
 
I
S
 
A
G
 
G
M
 
I
T
 
A
L
 
F
A
 
A
N
 
N
A
 
A
G
 
F
L
 
L
G
 
G
A
 
V
V
 
C
H
|
H
G
 
S
L
 
M
A
 
A
G
x
H
P
 
K
I
 
L
G
 
G
A
 
S
Y
 
Q
F
 
F
E
 
H
A
 
I
P
 
P
H
|
H
G
 
G
V
 
L
V
 
A
C
 
N
A
 
A
R
 
L
L
 
L
L
 
I
A
 
C
P
 
N
I
 
V
T
 
I
R
 
R
A
 
Y
N
 
N
I
 
A
E
 
N
-
 
D
-
 
N
-
 
P
A
 
T
L
 
K
Q
 
Q
I
 
T
A
 
A
S
 
F
S
 
S
E
 
Q
-
 
Y
Q
 
D
A
 
R
T
 
P
T
 
Q
A
 
A
L
 
R
N
 
R
K
 
R
Y
 
Y
V
 
A
Q
 
E
V
 
I
A
 
A
E
 
D
L
 
H
L
 
L
-
 
G
-
 
L
-
 
S
-
 
A
T
 
P
G
 
G
H
 
D
R
 
R
G
 
T
L
 
A
A
 
A
-
 
K
-
 
I
-
 
E
G
 
K
L
 
L
V
 
L
A
 
A
Y
 
W
L
 
L
E
 
E
Q
 
T
M
 
L
S
 
K
A
 
A
D
 
E
Y
 
L
-
 
G
V
 
I
P
 
P
Q
 
K
G
 
S
L
 
I
A
 
R
E
 
E
F
 
A
G
 
G
L
 
V
R
 
Q
-
 
E
A
 
A
D
 
D
N
 
F
L
 
L
A
 
A
P
 
N
V
 
V

Sites not aligning to the query:

P0A9Q7 Bifunctional aldehyde-alcohol dehydrogenase AdhE; Alcohol dehydrogenase E; EC 1.2.1.10; EC 1.1.1.1 from Escherichia coli (strain K12) (see 8 papers)
30% identity, 83% coverage: 37:359/388 of query aligns to 489:829/891 of P0A9Q7

query
sites
P0A9Q7
M
 
F
L
 
L
I
 
F
S
 
N
G
 
N
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
D
 
D
A
 
-
H
 
-
F
 
-
V
 
-
E
 
-
P
 
-
R
 
Q
L
 
I
A
 
T
R
 
S
V
 
V
F
 
L
E
 
K
C
 
A
R
 
A
K
 
G
V
 
V
H
 
E
R
 
T
V
 
E
V
 
V
-
 
F
-
 
F
-
 
E
V
 
V
R
 
E
G
 
A
E
x
D
P
 
P
S
 
T
P
 
L
A
 
S
V
 
I
V
 
V
D
 
R
K
 
K
L
 
-
V
 
G
A
 
A
E
 
E
A
 
L
P
 
A
Q
 
N
G
 
S
I
 
F
-
 
K
-
 
P
E
 
D
L
 
V
V
 
I
I
 
I
G
 
A
F
 
L
G
 
G
G
 
G
G
|
G
S
|
S
V
x
P
L
x
M
D
|
D
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
I
V
 
M
A
 
W
G
 
V
L
 
M
L
 
Y
-
 
E
-
 
H
P
 
P
E
 
E
R
 
T
F
 
H
S
 
F
V
 
E
V
x
E
D
 
L
Y
 
A
L
 
L
E
 
R
G
 
F
V
 
M
G
 
D
C
 
I
G
 
R
R
 
K
K
 
R
I
 
I
Q
 
Y
H
 
K
T
 
F
P
 
P
-
 
K
-
 
M
-
 
G
-
 
V
-
 
K
V
 
A
P
 
K
F
 
M
M
 
I
A
 
A
V
 
V
P
 
T
T
 
T
T
 
T
A
 
S
G
 
G
T
 
T
G
 
G
S
 
S
E
 
E
T
 
V
T
 
T
K
 
P
N
 
F
A
 
A
V
|
V
I
 
V
S
 
T
K
 
D
L
 
D
G
 
A
E
 
T
Y
 
G
K
 
Q
K
|
K
-
 
Y
S
 
P
F
 
L
R
 
A
D
 
D
D
 
Y
R
 
A
L
 
L
L
 
T
A
 
P
K
 
D
Q
 
M
A
 
A
W
 
I
L
 
V
D
 
D
P
 
A
A
 
N
F
 
L
L
 
V
P
 
M
H
 
D
C
 
M
P
 
P
A
 
K
S
 
S
V
 
L
L
 
C
Y
 
A
P
 
F
T
 
G
A
 
G
M
 
L
D
|
D
A
 
A
F
 
V
T
 
T
Q
x
H
L
 
A
L
 
M
E
 
E
S
 
A
Y
 
Y
V
 
V
T
 
S
L
 
V
K
 
L
A
 
A
N
 
S
P
 
E
I
x
F
T
 
S
D
 
D
A
 
G
L
 
Q
A
 
A
W
 
L
Q
 
Q
G
 
A
M
 
L
C
 
K
L
 
L
F
 
L
K
 
K
G
 
E
-
 
Y
-
 
L
-
 
P
A
 
A
F
 
S
D
 
Y
L
 
H
I
 
E
A
 
G
S
 
S
N
 
K
D
 
N
P
 
P
T
 
V
C
 
A
Q
 
R
Q
 
E
Q
 
R
G
 
V
Y
 
H
G
 
S
Q
 
-
L
 
-
M
 
-
L
 
-
A
 
A
A
 
A
S
 
T
L
 
I
S
 
A
G
 
G
M
 
I
T
 
A
L
 
F
A
 
A
N
 
N
A
 
A
G
 
F
L
 
L
G
 
G
A
 
V
V
 
C
H
|
H
G
 
S
L
 
M
A
 
A
G
 
H
P
 
K
I
 
L
G
 
G
A
 
S
Y
 
Q
F
 
F
E
 
H
A
 
I
P
 
P
H
|
H
G
 
G
V
 
L
V
 
A
C
 
N
A
 
A
R
 
L
L
 
L
L
 
I
A
 
C
P
 
N
I
 
V
T
 
I
R
 
R
A
 
Y
N
 
N
I
 
A
E
 
N
-
 
D
-
 
N
-
 
P
A
 
T
L
 
K
Q
 
Q
I
 
T
A
 
A
S
 
F
S
 
S
E
 
Q
-
 
Y
Q
 
D
A
 
R
T
 
P
T
 
Q
A
 
A
L
 
R
N
 
R
K
 
R
Y
 
Y
V
 
A
Q
 
E
V
 
I
A
 
A
E
 
D
L
 
H
L
 
L
-
 
G
-
 
L
-
 
S
-
 
A
T
 
P
G
 
G
H
 
D
R
 
R
G
 
T
L
 
A
A
 
A
-
 
K
-
 
I
-
 
E
G
 
K
L
 
L
V
 
L
A
 
A
Y
 
W
L
 
L
E
 
E
Q
 
T
M
 
L
S
 
K
A
 
A
D
 
E
Y
 
L
-
 
G
V
 
I
P
 
P
Q
 
K
G
 
S
L
 
I
A
 
R
E
 
E
F
 
A
G
 
G
L
 
V
R
 
Q
-
 
E
A
 
A
D
 
D
N
 
F
L
 
L
A
 
A
P
 
N
V
 
V

Sites not aligning to the query:

P0A9Q8 Bifunctional aldehyde-alcohol dehydrogenase AdhE; Alcohol dehydrogenase E; EC 1.2.1.10; EC 1.1.1.1 from Escherichia coli O157:H7 (see paper)
30% identity, 83% coverage: 37:359/388 of query aligns to 489:829/891 of P0A9Q8

query
sites
P0A9Q8
M
 
F
L
 
L
I
 
F
S
 
N
G
 
N
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
D
 
D
A
 
-
H
 
-
F
 
-
V
 
-
E
 
-
P
 
-
R
 
Q
L
 
I
A
 
T
R
 
S
V
 
V
F
 
L
E
 
K
C
 
A
R
 
A
K
 
G
V
 
V
H
 
E
R
 
T
V
 
E
V
 
V
-
 
F
-
 
F
-
 
E
V
 
V
R
 
E
G
 
A
E
x
D
P
 
P
S
 
T
P
 
L
A
 
S
V
 
I
V
 
V
D
 
R
K
 
K
L
 
-
V
 
G
A
 
A
E
 
E
A
 
L
P
 
A
Q
 
N
G
 
S
I
 
F
-
 
K
-
 
P
E
 
D
L
 
V
V
 
I
I
 
I
G
 
A
F
 
L
G
 
G
G
 
G
G
|
G
S
|
S
V
x
P
L
x
M
D
|
D
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
I
V
 
M
A
 
W
G
 
V
L
 
M
L
 
Y
-
 
E
-
 
H
P
 
P
E
 
E
R
 
T
F
 
H
S
 
F
V
 
E
V
 
E
D
 
L
Y
 
A
L
 
L
E
 
R
G
 
F
V
 
M
G
 
D
C
 
I
G
 
R
R
 
K
K
 
R
I
 
I
Q
 
Y
H
 
K
T
 
F
P
 
P
-
 
K
-
 
M
-
 
G
-
 
V
-
 
K
V
 
A
P
 
K
F
 
M
M
 
I
A
 
A
V
 
V
P
 
T
T
|
T
T
|
T
A
 
S
G
 
G
T
 
T
G
 
G
S
 
S
E
 
E
T
 
V
T
 
T
K
 
P
N
 
F
A
 
A
V
 
V
I
 
V
S
 
T
K
 
D
L
 
D
G
 
A
E
 
T
Y
 
G
K
 
Q
K
 
K
-
 
Y
S
 
P
F
 
L
R
 
A
D
 
D
D
 
Y
R
 
A
L
 
L
L
 
T
A
 
P
K
 
D
Q
 
M
A
 
A
W
 
I
L
 
V
D
 
D
P
 
A
A
 
N
F
x
L
L
 
V
P
 
M
H
 
D
C
 
M
P
 
P
A
 
K
S
 
S
V
 
L
L
 
C
Y
 
A
P
 
F
T
 
G
A
 
G
M
 
L
D
|
D
A
 
A
F
 
V
T
 
T
Q
x
H
L
 
A
L
 
M
E
 
E
S
 
A
Y
 
Y
V
 
V
T
 
S
L
 
V
K
 
L
A
 
A
N
 
S
P
 
E
I
 
F
T
 
S
D
 
D
A
 
G
L
 
Q
A
 
A
W
 
L
Q
 
Q
G
 
A
M
 
L
C
 
K
L
 
L
F
 
L
K
 
K
G
 
E
-
 
Y
-
 
L
-
 
P
A
 
A
F
 
S
D
 
Y
L
 
H
I
 
E
A
 
G
S
 
S
N
 
K
D
 
N
P
 
P
T
 
V
C
 
A
Q
 
R
Q
 
E
Q
 
R
G
 
V
Y
 
H
G
 
S
Q
 
-
L
 
-
M
 
-
L
 
-
A
 
A
A
 
A
S
 
T
L
 
I
S
 
A
G
 
G
M
 
I
T
 
A
L
 
F
A
 
A
N
 
N
A
 
A
G
 
F
L
 
L
G
 
G
A
 
V
V
 
C
H
|
H
G
 
S
L
 
M
A
 
A
G
 
H
P
 
K
I
 
L
G
 
G
A
 
S
Y
 
Q
F
 
F
E
 
H
A
 
I
P
 
P
H
|
H
G
 
G
V
 
L
V
 
A
C
 
N
A
 
A
R
 
L
L
 
L
L
 
I
A
 
C
P
 
N
I
 
V
T
 
I
R
 
R
A
 
Y
N
 
N
I
 
A
E
 
N
-
 
D
-
 
N
-
 
P
A
 
T
L
 
K
Q
 
Q
I
 
T
A
 
A
S
 
F
S
 
S
E
 
Q
-
 
Y
Q
 
D
A
 
R
T
 
P
T
 
Q
A
 
A
L
 
R
N
 
R
K
 
R
Y
 
Y
V
 
A
Q
 
E
V
 
I
A
 
A
E
 
D
L
 
H
L
 
L
-
 
G
-
 
L
-
 
S
-
 
A
T
 
P
G
 
G
H
 
D
R
 
R
G
 
T
L
 
A
A
 
A
-
 
K
-
 
I
-
 
E
G
 
K
L
 
L
V
 
L
A
 
A
Y
 
W
L
 
L
E
 
E
Q
 
T
M
 
L
S
 
K
A
 
A
D
 
E
Y
 
L
-
 
G
V
 
I
P
 
P
Q
 
K
G
 
S
L
 
I
A
 
R
E
 
E
F
 
A
G
 
G
L
 
V
R
 
Q
-
 
E
A
 
A
D
 
D
N
 
F
L
 
L
A
 
A
P
 
N
V
 
V

Sites not aligning to the query:

6scgA Structure of adhe form 1 (see paper)
29% identity, 83% coverage: 37:359/388 of query aligns to 40:366/406 of 6scgA

query
sites
6scgA
M
x
F
L
 
L
I
 
F
S
 
N
G
 
N
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
D
 
D
A
 
-
H
 
-
F
 
-
V
 
-
E
 
-
P
 
-
R
 
Q
L
 
I
A
 
T
R
 
S
V
 
V
F
 
L
E
 
K
C
 
A
R
 
A
K
 
G
V
 
V
H
 
E
R
 
T
V
 
E
V
 
V
-
 
F
-
 
F
-
 
E
V
 
V
R
 
E
G
x
A
E
x
D
P
 
P
S
 
T
P
 
L
A
 
S
V
 
I
V
 
V
D
 
R
K
 
K
L
 
-
V
 
G
A
 
A
E
 
E
A
 
L
P
 
A
Q
 
N
G
 
S
I
 
F
-
 
K
-
 
P
E
 
D
L
 
V
V
 
I
I
 
I
G
 
A
F
 
L
G
 
G
G
|
G
G
|
G
S
|
S
V
 
P
L
 
M
D
 
D
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
I
V
 
M
A
 
W
G
 
V
L
 
M
L
 
Y
-
 
E
-
 
H
P
 
P
E
 
E
R
 
T
F
 
H
S
 
F
V
 
E
V
 
E
D
 
L
Y
 
A
L
 
L
E
 
R
G
 
F
V
 
M
G
 
D
C
 
I
G
 
R
R
 
K
K
 
R
I
 
I
Q
 
Y
H
 
K
T
 
F
P
 
P
-
 
K
-
 
M
-
 
G
-
 
V
-
 
K
V
 
A
P
 
K
F
 
M
M
 
I
A
 
A
V
 
V
P
 
T
T
|
T
T
|
T
A
 
S
G
 
G
T
|
T
G
 
G
S
 
S
E
 
E
T
 
V
T
 
T
K
 
P
N
 
F
A
 
A
V
|
V
I
 
V
S
 
T
K
 
D
L
 
D
G
 
A
E
 
T
Y
 
G
K
 
Q
K
 
K
-
 
Y
S
 
P
F
 
L
R
 
A
D
 
D
D
 
Y
R
 
A
L
 
L
L
 
T
A
 
P
K
 
D
Q
 
M
A
 
A
W
 
I
L
 
V
D
 
D
P
 
A
A
 
N
F
 
L
L
 
V
P
 
M
H
 
D
C
 
M
P
 
P
A
 
K
S
 
S
V
x
L
L
 
C
Y
 
A
P
 
F
T
 
G
A
 
G
M
 
L
D
|
D
A
 
A
F
 
V
T
 
T
Q
x
H
L
 
A
L
 
M
E
 
E
S
 
A
Y
 
Y
V
 
V
T
 
S
L
 
V
K
 
L
A
 
A
N
 
S
P
 
E
I
 
F
T
 
S
D
 
D
A
 
G
L
 
Q
A
 
A
W
 
L
Q
 
Q
G
 
A
M
 
L
C
 
K
L
 
L
F
 
L
K
 
K
G
 
E
-
 
Y
-
 
L
-
 
P
A
 
A
F
 
S
D
 
Y
L
 
H
I
 
E
A
 
G
S
 
S
N
 
K
D
 
N
P
 
P
T
 
V
C
 
A
Q
 
R
Q
 
E
Q
 
R
G
 
V
Y
 
H
G
 
S
Q
 
-
L
 
-
M
 
-
L
 
-
A
 
A
A
 
A
S
 
T
L
 
I
S
 
A
G
 
G
M
 
I
T
 
A
L
 
F
A
 
A
N
 
N
A
 
A
G
 
F
L
 
L
G
 
G
A
 
V
V
 
C
H
|
H
G
 
S
L
 
M
A
 
A
G
x
H
P
 
K
I
 
L
G
 
G
A
 
S
Y
 
Q
F
 
F
E
 
H
A
 
I
P
 
P
H
|
H
G
 
G
V
 
L
V
 
A
C
 
N
A
 
A
R
 
L
L
 
L
L
 
I
A
 
C
P
 
N
I
 
V
T
 
I
R
 
R
A
 
Y
N
 
N
I
 
A
E
 
N
A
 
P
L
 
-
Q
 
-
I
 
-
A
 
-
S
 
-
S
 
-
E
 
-
Q
 
-
A
 
-
T
 
-
T
 
Q
A
 
A
L
 
R
N
 
R
K
 
R
Y
 
Y
V
 
A
Q
 
E
V
 
I
A
 
A
E
 
D
L
 
H
L
 
L
-
 
G
-
 
L
-
 
S
-
 
A
T
 
P
G
 
G
H
 
D
R
 
R
-
 
T
-
 
A
-
 
A
G
 
K
L
 
I
A
 
E
G
 
K
L
 
L
V
 
L
A
 
A
Y
 
W
L
 
L
E
 
E
Q
 
T
M
 
L
S
 
K
A
 
A
D
 
E
Y
 
L
-
 
G
V
 
I
P
 
P
Q
 
K
G
 
S
L
 
I
A
 
R
E
 
E
F
 
A
G
 
G
L
 
V
R
 
Q
-
 
E
A
 
A
D
 
D
N
 
F
L
 
L
A
 
A
P
 
N
V
 
V

Sites not aligning to the query:

A0A0S1X9S7 Alcohol dehydrogenase; EC 1.1.1.1 from Thermococcus barophilus (see paper)
28% identity, 66% coverage: 67:321/388 of query aligns to 64:306/378 of A0A0S1X9S7

query
sites
A0A0S1X9S7
V
 
V
R
 
P
G
 
A
E
 
E
P
 
P
S
 
S
P
 
Y
A
 
E
V
 
Y
V
 
V
D
 
E
K
 
S
L
 
I
V
 
M
A
 
P
E
 
K
A
 
V
P
 
R
Q
 
E
-
 
F
G
 
Q
I
 
P
E
 
D
L
 
L
V
 
I
I
 
V
G
 
A
F
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
S
V
 
V
L
 
I
D
 
D
A
 
V
A
 
A
K
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
K
G
 
V
L
 
F
L
 
Y
-
 
D
-
 
A
P
 
P
E
 
E
-
 
L
R
 
K
F
 
F
S
 
E
V
 
E
V
 
V
D
 
A
Y
 
F
L
 
I
E
 
S
G
 
R
V
 
F
G
 
E
C
 
K
G
 
P
R
 
K
K
 
P
I
 
I
Q
 
P
H
 
K
T
 
L
P
 
K
V
 
T
P
 
P
F
 
L
M
 
I
A
 
A
V
 
I
P
 
P
T
 
S
T
 
T
A
 
S
G
 
G
T
 
A
G
 
G
S
 
S
E
 
E
T
 
V
T
 
S
K
 
A
N
 
A
A
 
S
V
 
V
I
 
L
S
 
K
K
 
K
L
 
-
G
 
G
E
 
D
Y
 
I
K
 
K
K
 
Y
S
 
N
F
 
L
R
 
V
D
 
S
D
 
F
R
 
E
L
 
I
L
 
A
A
 
P
K
 
E
Q
 
F
A
 
A
W
 
I
L
 
L
D
 
D
P
 
P
A
 
R
F
 
L
L
 
P
P
 
R
H
 
T
C
 
M
P
 
P
A
 
K
S
 
E
V
 
V
L
 
A
Y
 
R
P
 
N
T
 
S
A
 
G
M
 
L
D
|
D
A
 
V
F
 
L
T
 
V
Q
x
H
L
 
G
L
 
I
E
 
E
S
 
A
Y
 
Y
V
 
T
T
 
T
L
 
T
K
 
A
A
 
A
N
 
T
P
 
P
I
 
F
T
 
S
D
 
D
A
 
A
L
 
M
A
 
A
W
 
I
Q
 
K
G
 
A
M
 
I
C
 
K
L
 
L
F
 
V
K
 
Y
G
 
K
A
 
W
F
 
L
D
 
P
L
 
L
I
 
S
A
 
V
S
 
Q
N
 
G
D
 
D
P
 
E
T
 
K
C
 
A
Q
 
R
Q
 
E
Q
 
-
G
 
-
Y
 
-
G
 
-
Q
 
N
L
 
V
M
 
H
L
 
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
T
L
 
M
S
 
A
G
 
G
M
 
I
T
 
A
L
 
F
A
 
L
N
 
N
A
 
A
G
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
L
V
 
C
H
|
H
G
 
S
L
 
L
A
 
S
G
x
H
P
 
-
I
 
-
G
 
K
A
 
A
Y
 
A
F
 
W
E
 
I
A
 
A
P
 
P
H
|
H
G
 
G
V
 
L
V
 
L
C
 
N
A
 
A
R
 
I
L
 
F
L
 
L
A
 
P
P
 
Y
I
 
V
T
 
M
R
 
E
A
 
F
N
 
N
I
 
M
E
 
-
A
 
-
L
 
-
Q
 
-
I
 
-
A
 
-
S
 
-
S
 
-
E
 
-
Q
 
R
A
 
S
T
 
E
T
 
Y
A
 
A
L
 
R
N
 
K
K
 
R
Y
 
Y
V
 
A
Q
 
E
V
 
I
A
 
A
E
 
R
L
 
E
L
 
L

6jkpA Crystal structure of sulfoacetaldehyde reductase from bifidobacterium kashiwanohense in complex with NAD+ (see paper)
25% identity, 76% coverage: 88:380/388 of query aligns to 88:365/376 of 6jkpA

query
sites
6jkpA
E
 
E
L
 
F
V
 
V
I
 
V
G
 
A
F
 
M
G
 
G
G
 
G
G
|
G
S
 
S
V
 
A
L
 
M
D
|
D
A
 
V
A
 
S
K
 
K
A
 
A
V
 
A
A
 
A
G
 
S
L
 
I
L
 
C
P
 
L
E
 
T
R
 
D
F
 
D
S
 
S
V
 
I
V
 
A
D
 
D
Y
 
Y
L
 
H
E
 
-
G
 
-
V
 
-
G
 
G
C
 
T
G
 
G
R
 
K
K
 
A
I
 
M
Q
 
P
H
 
Q
T
 
K
P
 
H
V
 
L
P
 
P
F
 
I
M
 
I
A
 
A
V
 
L
P
 
P
T
|
T
T
|
T
A
 
A
G
 
G
T
|
T
G
 
G
S
|
S
E
 
E
T
 
V
T
|
T
K
 
C
N
 
V
A
 
S
V
 
V
I
 
L
S
 
T
-
 
N
-
 
R
K
 
K
L
 
L
G
 
G
E
 
K
Y
 
-
K
 
K
K
 
A
S
 
P
F
 
I
R
 
V
D
 
S
D
 
D
R
 
G
L
 
F
L
 
F
A
 
P
K
 
S
Q
 
V
A
 
A
W
 
I
L
 
V
D
 
D
P
 
P
A
 
E
F
 
L
L
 
T
P
 
Y
H
x
S
C
x
V
P
|
P
A
 
P
S
 
K
V
 
I
L
 
T
Y
 
A
P
 
S
T
 
T
A
 
G
M
 
M
D
 
D
A
 
V
F
 
L
T
 
S
Q
 
Q
L
 
A
L
 
I
E
 
E
S
 
G
Y
 
F
V
 
W
T
 
S
L
 
K
K
 
G
A
 
H
N
 
Q
P
 
P
I
 
I
T
 
C
D
 
D
A
 
S
L
 
C
A
 
A
W
 
A
Q
 
H
G
 
A
M
 
A
C
 
K
L
 
L
-
 
V
F
 
F
K
 
K
G
 
-
A
 
-
F
 
Y
D
 
L
L
 
P
I
 
I
A
 
A
S
 
V
N
 
A
D
 
E
P
 
P
T
 
H
C
 
-
Q
 
N
Q
 
E
Q
 
E
G
 
A
Y
 
R
G
 
E
Q
 
K
L
 
M
M
 
C
L
 
E
A
 
A
A
 
S
S
 
V
L
 
I
S
 
A
G
 
G
M
 
L
T
 
A
L
 
F
A
 
T
N
 
L
A
 
P
G
 
K
L
 
T
G
 
T
A
 
S
V
 
S
H
 
H
G
 
A
L
 
C
A
 
S
G
 
F
P
 
P
I
 
L
G
 
T
A
 
N
Y
 
I
F
 
H
E
 
G
A
 
I
P
 
P
H
 
H
G
 
G
V
 
E
V
 
A
C
 
C
A
 
G
R
 
L
L
 
T
L
 
L
A
 
D
P
 
Y
I
 
F
T
 
A
R
 
R
A
 
I
N
 
N
I
 
K
E
 
D
A
 
A
L
 
-
Q
 
-
I
 
-
A
 
-
S
 
-
S
 
-
E
 
-
Q
 
-
A
 
-
T
 
-
T
 
-
A
 
-
L
 
-
N
 
-
K
 
Q
Y
 
H
V
 
G
Q
 
R
V
 
V
A
 
Q
E
 
E
L
 
F
L
 
A
-
 
R
-
 
G
T
 
I
G
 
G
H
 
F
R
 
K
G
 
D
L
 
V
A
 
D
G
 
A
L
 
M
V
 
A
A
 
D
Y
 
A
L
 
I
E
 
H
Q
 
D
M
 
L
S
 
K
A
 
V
D
 
R
Y
 
I
-
 
G
V
 
M
P
 
R
Q
 
T
G
 
G
L
 
L
A
 
K
E
 
D
F
 
L
G
 
N
L
 
L
R
 
T
A
 
E
D
 
E
N
 
Q
L
 
I
A
 
A
P
 
D
V
 
L
L
 
V
A
 
R
C
 
I
C
 
S
R
 
R
A
 
H
G
 
P
S
 
N
M
 
L
L
 
Y
G
 
N
N
 
N
P
 
P
L
 
V
V
 
E
L
 
I
S
 
T
D
 
D
Q
 
D
A
 
M
L
 
L

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_013836016.1 NCBI__GCF_000214825.1:WP_013836016.1
MINSFSLAQMPAIEFGWGCTDSRLADAILAQSQNQVMLISGGYADAHFVEPRLARVFECR
KVHRVVVRGEPSPAVVDKLVAEAPQGIELVIGFGGGSVLDAAKAVAGLLPERFSVVDYLE
GVGCGRKIQHTPVPFMAVPTTAGTGSETTKNAVISKLGEYKKSFRDDRLLAKQAWLDPAF
LPHCPASVLYPTAMDAFTQLLESYVTLKANPITDALAWQGMCLFKGAFDLIASNDPTCQQ
QGYGQLMLAASLSGMTLANAGLGAVHGLAGPIGAYFEAPHGVVCARLLAPITRANIEALQ
IASSEQATTALNKYVQVAELLTGHRGLAGLVAYLEQMSADYVPQGLAEFGLRADNLAPVL
ACCRAGSMLGNPLVLSDQALKQAMMAAL

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory