SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_013840426.1 NCBI__GCF_000215085.1:WP_013840426.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1tj7B Structure determination and refinement at 2.44 a resolution of argininosuccinate lyase from e. Coli (see paper)
49% identity, 98% coverage: 8:456/459 of query aligns to 1:450/451 of 1tj7B

query
sites
1tj7B
R
 
R
F
 
F
Q
 
T
K
 
Q
T
 
A
T
 
A
D
 
D
H
 
Q
L
 
R
V
 
F
E
 
K
D
 
Q
F
 
F
H
 
N
S
 
D
S
 
S
I
 
L
S
 
R
F
 
F
D
 
D
Q
 
Y
R
 
R
L
 
L
Y
 
A
K
 
E
Q
 
Q
D
 
D
I
 
I
Q
 
V
G
 
G
S
 
S
I
 
V
A
 
A
H
 
W
A
 
S
T
 
K
M
 
A
L
 
L
G
 
V
R
 
T
V
 
V
G
 
G
V
 
V
I
 
L
S
 
T
P
 
A
E
 
E
E
 
E
A
 
Q
G
 
A
Q
 
Q
I
 
L
V
 
E
E
 
E
G
 
A
L
 
L
R
 
N
E
 
V
I
 
L
L
 
L
K
 
E
E
 
D
I
 
V
E
 
R
E
 
A
G
 
R
N
 
P
V
 
Q
E
 
Q
-
 
I
F
 
L
D
 
E
V
 
S
A
 
D
A
 
A
E
 
E
D
 
D
I
 
I
H
 
H
M
 
S
N
 
W
V
 
V
E
 
E
Q
 
G
L
 
K
L
 
L
T
 
I
A
 
D
K
 
K
I
 
V
G
 
G
A
 
Q
V
 
L
G
 
G
K
 
K
K
 
K
L
 
L
H
 
H
T
 
T
A
 
G
R
 
R
S
 
S
R
 
R
N
 
N
D
 
D
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
V
 
T
D
 
D
I
 
L
R
 
K
M
 
L
Y
 
W
L
 
C
K
 
K
D
 
D
E
 
T
I
 
V
K
 
S
E
 
E
I
 
L
R
 
L
S
 
T
Q
 
A
L
 
N
R
 
R
E
 
Q
L
 
L
V
 
Q
E
 
S
T
 
A
L
 
L
L
 
V
N
 
E
L
 
T
A
 
A
E
 
Q
Q
 
N
H
 
N
L
 
Q
S
 
D
T
 
A
V
 
V
M
 
M
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
H
|
H
M
 
L
Q
 
Q
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
P
 
P
I
 
V
T
 
T
L
 
F
S
 
A
H
 
H
H
 
W
L
 
C
M
 
L
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
Q
 
E
M
 
M
F
 
L
L
 
A
R
 
R
D
 
D
M
 
E
D
 
S
R
 
R
L
 
L
A
 
Q
D
 
D
C
 
A
Y
 
L
R
 
K
R
 
R
T
 
L
D
 
D
V
 
V
M
 
S
P
 
P
L
 
L
G
 
G
S
 
C
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
G
T
 
T
T
 
A
F
 
Y
P
 
E
L
 
I
D
 
D
R
 
R
E
 
E
Y
 
Q
T
 
L
A
 
A
E
 
G
L
 
W
L
 
L
G
 
G
F
 
F
A
 
A
A
 
S
V
 
A
S
 
T
D
 
R
N
 
N
S
 
S
L
 
L
D
 
D
A
 
S
V
 
V
S
 
S
D
 
D
R
 
R
D
 
D
F
 
H
A
 
V
V
 
L
E
 
E
F
 
L
C
 
L
A
 
S
A
 
A
S
 
A
S
 
A
L
 
I
I
 
G
M
 
M
M
 
V
H
 
H
L
 
L
S
 
S
R
 
R
F
 
F
C
 
A
E
 
E
E
 
D
I
 
L
I
 
I
L
 
F
W
 
F
A
 
N
T
 
T
G
 
G
E
 
E
F
 
A
A
 
G
F
 
F
I
 
V
E
 
E
L
 
L
D
 
S
D
 
D
A
 
R
Y
 
V
S
 
T
T
 
S
G
 
G
S
|
S
S
 
S
I
 
L
M
|
M
P
 
P
Q
 
Q
K
|
K
K
 
K
N
 
N
P
 
P
D
 
D
V
 
A
A
 
L
E
|
E
L
 
L
I
 
I
R
 
R
G
 
G
K
 
K
T
 
C
G
 
G
R
 
R
V
 
V
Y
 
Q
G
 
G
D
 
A
L
 
L
L
 
T
G
 
G
L
 
M
L
 
M
T
 
M
M
 
T
L
 
L
K
 
K
G
 
G
L
 
L
P
 
P
M
 
L
A
 
A
Y
 
Y
N
 
N
K
 
K
D
 
D
M
 
M
Q
 
Q
E
 
E
D
 
D
K
 
K
E
 
E
A
 
G
L
 
L
F
 
F
D
 
D
A
 
A
I
 
L
D
 
D
T
 
T
V
 
W
K
 
L
G
 
D
C
 
C
L
 
L
L
 
H
V
 
M
F
 
A
R
 
A
P
 
L
M
 
V
V
 
L
A
 
D
T
 
G
M
 
I
T
 
Q
V
 
V
R
 
K
K
 
R
E
 
P
N
 
R
M
 
C
A
 
Q
G
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
Q
G
 
Q
G
 
G
F
 
Y
T
 
A
N
 
N
A
 
A
T
 
T
D
 
E
V
 
L
A
 
A
D
 
D
Y
 
Y
L
 
L
A
 
V
K
 
A
K
 
K
G
 
G
V
 
V
P
 
P
F
 
F
R
 
R
E
 
E
A
 
A
H
 
H
E
 
H
V
 
I
V
 
V
G
 
G
K
 
E
A
 
A
V
 
V
F
 
V
Y
 
E
C
 
A
L
 
I
Q
 
R
H
 
Q
Q
 
G
K
 
K
N
 
P
L
 
L
E
 
E
A
 
D
L
 
L
T
 
P
L
 
L
E
 
S
E
 
E
Y
 
L
Q
 
Q
A
 
K
L
 
F
S
 
S
P
 
Q
A
 
V
F
 
I
A
 
D
E
 
E
D
 
D
I
 
V
Y
 
Y
A
 
P
A
 
I
I
 
L
G
 
S
V
 
L
E
 
Q
Y
 
S
C
 
C
A
 
L
A
 
D
A
 
K
R
 
R
K
 
A
V
 
A
R
 
K
G
 
G
G
 
G
P
 
V
A
 
S
P
 
P
E
 
Q
A
 
Q
V
 
V
Q
 
A
Q
 
Q
A
 
A
I
 
I
G
 
A
V
 
F
A
 
A
K
 
Q
A
 
A
R
 
R
L
 
L

2e9fB Crystal structure of t.Th.Hb8 argininosuccinate lyase complexed with l-arginine
50% identity, 96% coverage: 14:453/459 of query aligns to 3:444/450 of 2e9fB

query
sites
2e9fB
D
 
D
H
 
A
L
 
L
V
 
A
E
 
A
D
 
R
F
 
F
H
 
N
S
 
A
S
 
S
I
 
L
S
 
A
F
 
F
D
 
D
Q
 
R
R
 
A
L
 
L
Y
 
W
K
 
R
Q
 
E
D
 
D
I
 
L
Q
 
W
G
 
Q
S
 
N
I
 
R
A
 
V
H
 
H
A
 
A
T
 
R
M
 
M
L
 
L
G
 
H
R
 
A
V
 
V
G
 
G
V
 
L
I
 
L
S
 
S
P
 
A
E
 
E
E
 
E
A
 
L
G
 
E
Q
 
A
I
 
I
V
 
L
E
 
K
G
 
G
L
 
L
R
 
D
E
 
R
I
 
I
L
 
E
K
 
E
E
 
E
I
 
I
E
 
E
E
 
A
G
 
G
N
 
T
V
 
F
E
 
P
F
 
W
D
 
R
V
 
E
A
 
E
A
 
L
E
|
E
D
 
D
I
 
V
H
 
H
M
 
M
N
 
N
V
 
L
E
 
E
Q
 
A
L
 
R
L
 
L
T
 
T
A
 
E
K
 
L
I
 
V
G
 
G
A
 
P
V
 
P
G
 
G
K
 
G
K
 
K
L
 
L
H
 
H
T
 
T
A
 
A
R
 
R
S
 
S
R
|
R
N
|
N
D
 
D
Q
 
Q
V
|
V
A
 
A
V
 
T
D
 
D
I
 
L
R
 
R
M
 
L
Y
 
Y
L
 
L
K
 
R
D
 
G
E
 
A
I
 
I
K
 
D
E
 
E
I
 
L
R
 
L
S
 
A
Q
 
L
L
 
L
R
 
L
E
 
A
L
 
L
V
 
R
E
 
R
T
 
V
L
 
L
L
 
V
N
 
R
L
 
E
A
 
A
E
 
E
Q
 
K
H
 
H
L
 
L
S
 
D
T
 
P
-
 
L
-
 
Y
V
 
V
M
 
L
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
T
|
T
H
|
H
M
 
L
Q
 
Q
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
P
 
P
I
 
V
T
 
L
L
 
L
S
 
A
H
 
H
H
 
W
L
 
F
M
 
L
A
 
A
Y
 
Y
V
 
Y
Q
 
E
M
 
M
F
 
L
L
 
K
R
 
R
D
 
D
M
 
A
D
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
E
D
 
D
C
 
A
Y
 
K
R
 
E
R
 
R
T
 
L
D
 
N
V
 
E
M
 
S
P
 
P
L
 
L
G
 
G
S
 
A
G
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
G
T
 
T
T
 
G
F
 
F
P
 
P
L
 
I
D
 
D
R
 
R
E
 
H
Y
 
F
T
 
T
A
 
A
E
 
R
L
 
E
L
 
L
G
 
G
F
 
F
A
 
K
A
 
A
V
 
P
S
 
M
D
 
R
N
 
N
S
 
S
L
 
L
D
 
D
A
 
A
V
 
V
S
 
A
D
 
S
R
 
R
D
 
D
F
 
F
A
 
A
V
 
L
E
 
E
F
 
V
C
 
L
A
 
S
A
 
A
S
 
L
S
 
N
L
 
I
I
 
G
M
 
M
M
 
L
H
 
H
L
 
L
S
 
S
R
 
R
F
 
M
C
 
A
E
 
E
E
 
E
I
 
L
I
 
I
L
 
L
W
 
Y
A
 
S
T
 
T
G
 
E
E
 
E
F
 
F
A
 
G
F
 
F
I
 
V
E
 
E
L
 
V
D
 
P
D
 
D
A
 
A
Y
 
F
S
 
A
T
 
T
G
 
G
S
|
S
S
|
S
I
 
I
M
 
M
P
 
P
Q
 
Q
K
|
K
K
 
K
N
 
N
P
 
P
D
 
D
V
 
I
A
 
L
E
|
E
L
 
L
I
 
I
R
 
R
G
 
A
K
 
K
T
 
A
G
 
G
R
 
R
V
 
V
Y
 
L
G
 
G
D
 
A
L
 
F
L
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
S
T
 
A
M
 
V
L
 
V
K
 
K
G
 
G
L
 
L
P
 
P
M
 
L
A
 
A
Y
|
Y
N
 
N
K
 
K
D
 
D
M
 
L
Q
|
Q
E
 
E
D
 
D
K
|
K
E
 
E
A
 
P
L
 
L
F
 
L
D
 
D
A
 
A
I
 
L
D
 
A
T
 
T
V
 
Y
K
 
R
G
 
D
C
 
S
L
 
L
L
 
R
V
 
L
F
 
L
R
 
A
P
 
A
M
 
L
V
 
L
A
 
P
T
 
G
M
 
L
T
 
K
V
 
W
R
 
R
K
 
R
E
 
E
N
 
R
M
 
M
A
 
W
G
 
R
A
 
A
A
 
A
R
 
E
G
 
G
G
 
G
F
 
Y
T
 
T
N
 
L
A
 
A
T
 
T
D
 
E
V
 
L
A
 
A
D
 
D
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
K
 
E
K
 
K
G
 
G
V
 
L
P
 
P
F
 
F
R
 
R
E
 
E
A
 
A
H
 
H
E
 
H
V
 
V
V
 
V
G
 
G
K
 
R
A
 
L
V
 
V
F
 
R
Y
 
R
C
 
L
L
 
V
Q
 
E
H
 
E
Q
 
G
K
 
R
N
 
A
L
 
L
E
 
K
A
 
D
L
 
L
T
 
T
L
 
L
E
 
E
E
 
E
Y
 
L
Q
 
Q
A
 
A
L
 
H
S
 
H
P
 
P
A
 
L
F
 
F
A
 
A
E
 
E
D
 
D
I
 
A
Y
 
L
A
 
P
A
 
L
I
 
L
G
 
R
V
 
L
E
 
E
Y
 
T
C
 
A
A
 
I
A
 
H
A
 
R
R
 
R
K
 
R
V
 
S
R
 
Y
G
 
G
G
 
G
P
 
T
A
 
A
P
 
P
E
 
E
A
 
A
V
 
V
Q
 
R
Q
 
E
A
 
R
I
 
L
G
 
E
V
 
E
A
 
A
K
 
K

P24058 Argininosuccinate lyase; ASAL; Arginosuccinase; Delta crystallin II; Delta-2 crystallin; EC 4.3.2.1 from Anas platyrhynchos (Mallard) (Anas boschas) (see 4 papers)
44% identity, 100% coverage: 3:459/459 of query aligns to 9:460/468 of P24058

query
sites
P24058
K
 
K
L
 
L
W
|
W
G
 
G
G
 
G
R
 
R
F
 
F
Q
 
S
K
 
G
T
 
S
T
 
T
D
 
D
H
 
P
L
 
I
V
 
M
E
 
E
D
 
K
F
 
L
H
 
N
S
 
S
S
|
S
I
 
I
S
 
A
F
 
Y
D
|
D
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
Y
 
S
K
 
E
Q
 
V
D
 
D
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
S
 
S
I
 
M
A
 
A
H
 
Y
A
 
A
T
 
K
M
 
A
L
 
L
G
 
E
R
 
K
V
 
A
G
 
G
V
 
I
I
 
L
S
 
T
P
 
K
E
 
T
E
 
E
A
 
L
G
 
E
Q
 
K
I
 
I
V
 
L
E
 
S
G
 
G
L
 
L
R
 
E
E
 
K
I
 
I
L
 
S
K
 
E
E
 
E
I
 
W
E
 
S
E
 
K
G
 
G
N
 
V
V
 
F
E
 
V
F
 
V
D
 
K
V
 
Q
A
 
S
A
 
D
E
 
E
D
|
D
I
 
I
H
 
H
M
 
T
N
 
A
V
 
N
E
 
E
Q
 
R
L
 
R
L
 
L
T
 
K
A
 
E
K
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
D
V
 
I
G
 
A
K
 
G
K
 
K
L
 
L
H
 
H
T
 
T
A
 
G
R
 
R
S
 
S
R
 
R
N
|
N
D
|
D
Q
 
Q
V
 
V
A
 
V
V
 
T
D
 
D
I
 
L
R
 
K
M
 
L
Y
 
F
L
 
M
K
 
K
D
 
N
E
 
S
I
 
L
K
 
S
E
 
I
I
 
I
R
 
S
S
 
T
Q
 
H
L
 
L
R
 
L
E
 
Q
L
 
L
V
 
I
E
 
K
T
 
T
L
 
L
L
 
V
N
 
E
L
 
R
A
 
A
E
 
A
Q
 
I
H
 
E
L
 
I
S
 
D
T
 
V
V
 
I
M
 
L
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
T
|
T
H
|
H
M
 
L
Q
 
Q
R
 
K
A
 
A
Q
 
Q
P
 
P
I
 
I
T
 
R
L
 
W
S
 
S
H
 
Q
H
 
F
L
 
L
M
 
L
A
 
S
Y
 
H
V
 
A
Q
 
V
M
 
A
F
 
L
L
 
T
R
 
R
D
 
D
M
 
S
D
 
E
R
 
R
L
 
L
A
 
G
D
 
E
C
 
V
Y
 
K
R
 
K
R
 
R
T
 
I
D
 
N
V
 
V
M
 
L
P
 
P
L
 
L
G
 
G
S
 
S
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
G
T
 
N
T
 
P
F
 
L
P
 
D
L
 
I
D
 
D
R
 
R
E
 
E
Y
 
M
T
 
L
A
 
R
E
 
S
L
 
E
L
 
L
G
 
E
F
 
F
A
 
A
A
 
S
V
 
I
S
 
S
D
 
L
N
 
N
S
 
S
L
 
M
D
 
D
A
 
A
V
 
I
S
 
S
D
 
E
R
|
R
D
 
D
F
 
F
A
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
C
 
L
A
 
S
A
 
F
S
 
A
S
 
T
L
 
L
I
 
L
M
 
M
M
 
I
H
 
H
L
 
L
S
 
S
R
 
K
F
 
M
C
 
A
E
 
E
E
 
D
I
 
L
I
 
I
L
 
I
W
 
Y
A
 
S
T
 
T
G
 
S
E
 
E
F
 
F
A
 
G
F
 
F
I
 
L
E
 
T
L
 
L
D
 
S
D
 
D
A
 
A
Y
 
F
S
 
S
T
|
T
G
 
G
S
|
S
S
 
S
I
 
L
M
 
M
P
 
P
Q
 
Q
K
 
K
K
 
K
N
|
N
P
 
P
D
|
D
V
 
S
A
 
L
E
|
E
L
 
L
I
 
I
R
 
R
G
 
S
K
 
K
T
 
A
G
 
G
R
 
R
V
 
V
Y
 
F
G
 
G
D
 
R
L
 
L
L
 
A
G
 
S
L
 
I
L
 
L
T
 
M
M
 
V
L
 
L
K
 
K
G
 
G
L
 
L
P
 
P
M
 
S
A
 
T
Y
|
Y
N
 
N
K
|
K
D
 
D
M
 
L
Q
|
Q
E
 
E
D
|
D
K
|
K
E
 
E
A
 
A
L
 
V
F
 
F
D
 
D
A
 
V
I
 
V
D
 
D
T
 
T
V
 
L
K
 
T
G
 
A
C
 
V
L
 
L
L
 
Q
V
 
V
F
 
A
R
 
T
P
 
G
M
 
V
V
 
I
A
 
S
T
 
T
M
 
L
T
 
Q
V
 
I
R
 
S
K
 
K
E
 
E
N
 
N
M
 
M
A
 
E
G
 
K
A
 
A
A
 
L
R
 
T
G
 
P
G
 
E
F
 
M
T
 
L
N
 
-
A
 
A
T
 
T
D
 
D
V
 
L
A
 
A
D
 
L
Y
 
Y
L
 
L
A
 
V
K
 
R
K
 
K
G
 
G
V
 
V
P
 
P
F
 
F
R
 
R
E
 
Q
A
 
A
H
 
H
E
 
T
V
 
A
V
 
S
G
 
G
K
 
K
A
 
A
V
 
V
F
 
H
Y
 
L
C
 
A
L
 
E
Q
 
T
H
 
K
Q
 
G
K
 
I
N
 
T
L
 
I
E
 
N
A
 
K
L
 
L
T
 
S
L
 
L
E
 
E
E
 
D
Y
 
L
Q
 
K
A
 
S
L
 
I
S
 
S
P
 
P
A
 
Q
F
 
F
A
 
S
E
 
S
D
 
D
I
 
V
Y
 
S
A
 
Q
A
 
V
I
 
F
G
 
N
V
 
F
E
 
V
Y
 
N
C
 
S
A
 
V
A
 
E
A
 
Q
R
 
Y
K
 
T
V
 
A
R
 
L
G
 
A
G
 
G
P
 
T
A
 
A
P
 
K
E
 
S
A
 
S
V
 
V
Q
 
T
Q
 
T
A
 
Q
I
 
I
G
 
-
V
 
-
A
 
-
K
 
-
A
 
E
R
 
Q
L
 
L
R
 
R
E
 
E
I
 
L

P04424 Argininosuccinate lyase; ASAL; Arginosuccinase; EC 4.3.2.1 from Homo sapiens (Human) (see 12 papers)
45% identity, 99% coverage: 3:457/459 of query aligns to 7:460/464 of P04424

query
sites
P04424
K
 
K
L
 
L
W
 
W
G
 
G
G
 
G
R
|
R
F
 
F
Q
 
V
K
 
G
T
 
A
T
 
V
D
 
D
H
 
P
L
 
I
V
 
M
E
 
E
D
 
K
F
 
F
H
 
N
S
 
A
S
 
S
I
 
I
S
 
A
F
 
Y
D
|
D
Q
 
R
R
 
H
L
 
L
Y
 
W
K
 
E
Q
 
V
D
 
D
I
 
V
Q
 
Q
G
 
G
S
 
S
I
 
K
A
 
A
H
 
Y
A
 
S
T
 
R
M
 
G
L
 
L
G
 
E
R
x
K
V
 
A
G
 
G
V
 
L
I
 
L
S
 
T
P
 
K
E
 
A
E
 
E
A
 
M
G
 
D
Q
 
Q
I
 
I
V
 
L
E
 
H
G
 
G
L
 
L
R
 
D
E
x
K
I
 
V
L
 
A
K
 
E
E
|
E
I
 
W
E
 
A
E
 
Q
G
 
G
N
 
T
V
 
F
E
 
K
F
 
L
D
 
N
V
 
S
A
 
N
A
 
D
E
 
E
D
|
D
I
 
I
H
|
H
M
 
T
N
 
A
V
 
N
E
 
E
Q
x
R
L
x
R
L
 
L
T
 
K
A
 
E
K
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
A
V
 
T
G
 
A
K
 
G
K
 
K
L
 
L
H
 
H
T
 
T
A
 
G
R
 
R
S
 
S
R
|
R
N
 
N
D
 
D
Q
 
Q
V
 
V
A
 
V
V
 
T
D
|
D
I
 
L
R
 
R
M
 
L
Y
 
W
L
 
M
K
 
R
D
 
Q
E
 
T
I
 
C
K
 
S
E
 
T
I
 
L
R
 
S
S
 
G
Q
 
L
L
 
L
R
 
W
E
 
E
L
 
L
V
 
I
E
 
R
T
 
T
L
 
M
L
 
V
N
 
D
L
 
R
A
 
A
E
 
E
Q
 
A
H
 
E
L
 
R
S
 
D
T
 
V
V
 
L
M
 
F
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
H
 
H
M
 
L
Q
 
Q
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
P
 
P
I
 
I
T
 
R
L
 
W
S
 
S
H
 
H
H
 
W
L
 
I
M
 
L
A
 
S
Y
 
H
V
 
A
Q
x
V
M
 
A
F
 
L
L
x
T
R
|
R
D
 
D
M
 
S
D
 
E
R
|
R
L
 
L
A
 
L
D
 
E
C
 
V
Y
 
R
R
 
K
R
 
R
T
 
I
D
 
N
V
 
V
M
 
L
P
 
P
L
 
L
G
|
G
S
 
S
G
 
G
A
 
A
L
 
I
A
 
A
G
 
G
T
 
N
T
 
P
F
 
L
P
 
G
L
 
V
D
 
D
R
 
R
E
 
E
Y
 
L
T
 
L
A
 
R
E
 
A
L
 
E
L
 
L
G
 
N
F
 
F
A
 
G
A
 
A
V
 
I
S
 
T
D
 
L
N
 
N
S
 
S
L
 
M
D
 
D
A
 
A
V
 
T
S
 
S
D
 
E
R
|
R
D
|
D
F
 
F
A
 
V
V
 
A
E
 
E
F
 
F
C
 
L
A
 
F
A
 
W
S
 
A
S
 
S
L
 
L
I
 
C
M
 
M
M
 
T
H
 
H
L
 
L
S
 
S
R
 
R
F
 
M
C
 
A
E
 
E
E
 
D
I
 
L
I
 
I
L
 
L
W
 
Y
A
 
C
T
 
T
G
 
K
E
 
E
F
 
F
A
 
S
F
 
F
I
 
V
E
 
Q
L
 
L
D
 
S
D
 
D
A
 
A
Y
 
Y
S
 
S
T
 
T
G
 
G
S
 
S
S
 
S
I
 
L
M
 
M
P
 
P
Q
|
Q
K
 
K
K
|
K
N
 
N
P
 
P
D
 
D
V
 
S
A
 
L
E
 
E
L
 
L
I
 
I
R
|
R
G
 
S
K
 
K
T
 
A
G
 
G
R
 
R
V
 
V
Y
 
F
G
 
G
D
x
R
L
 
C
L
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
L
T
 
M
M
 
T
L
 
L
K
 
K
G
 
G
L
 
L
P
 
P
M
 
S
A
 
T
Y
 
Y
N
 
N
K
 
K
D
 
D
M
 
L
Q
|
Q
E
 
E
D
 
D
K
 
K
E
 
E
A
 
A
L
 
V
F
 
F
D
 
E
A
x
V
I
 
S
D
 
D
T
 
T
V
 
M
K
 
S
G
 
A
C
 
V
L
 
L
L
 
Q
V
 
V
F
 
A
R
 
T
P
 
G
M
 
V
V
 
I
A
 
S
T
 
T
M
 
L
T
 
Q
V
 
I
R
 
H
K
 
Q
E
 
E
N
 
N
M
|
M
A
 
-
G
 
G
A
 
Q
A
 
A
R
 
L
G
 
S
G
 
P
F
 
D
T
 
M
N
 
L
A
 
A
T
 
T
D
 
D
V
 
L
A
 
A
D
 
Y
Y
 
Y
L
 
L
A
 
V
K
 
R
K
 
K
G
 
G
V
x
M
P
 
P
F
 
F
R
|
R
E
 
Q
A
 
A
H
|
H
E
 
E
V
 
A
V
 
S
G
 
G
K
 
K
A
 
A
V
 
V
F
 
F
Y
 
M
C
x
A
L
 
E
Q
 
T
H
 
K
Q
 
G
K
 
V
N
 
A
L
 
L
E
 
N
A
 
Q
L
 
L
T
 
S
L
 
L
E
 
Q
E
 
E
Y
 
L
Q
 
Q
A
 
T
L
 
I
S
 
S
P
 
P
A
 
L
F
 
F
A
 
S
E
 
G
D
 
D
I
 
V
Y
 
I
A
 
C
A
 
V
I
 
W
G
 
D
V
 
Y
E
 
G
Y
 
H
C
 
S
A
 
V
A
 
E
A
 
Q
R
 
Y
K
 
G
V
 
A
R
 
L
G
 
G
G
 
G
P
 
T
A
 
A
P
 
R
E
 
S
A
 
S
V
 
V
Q
 
D
Q
 
W
A
 
Q
I
 
I
G
 
R
V
 
Q
A
 
V
K
x
R
A
 
A
R
 
L
L
 
L
R
 
Q

1k7wD Crystal structure of s283a duck delta 2 crystallin mutant (see paper)
44% identity, 98% coverage: 12:459/459 of query aligns to 1:443/450 of 1k7wD

query
sites
1k7wD
T
 
S
T
 
T
D
 
D
H
 
P
L
 
I
V
 
M
E
 
E
D
 
K
F
 
L
H
 
N
S
 
S
S
 
S
I
 
I
S
 
A
F
 
Y
D
 
D
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
Y
 
S
K
 
E
Q
 
V
D
 
D
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
S
 
S
I
 
M
A
 
A
H
 
Y
A
 
A
T
 
K
M
 
A
L
 
L
G
 
E
R
 
K
V
 
A
G
 
G
V
 
I
I
 
L
S
 
T
P
 
K
E
 
T
E
 
E
A
 
L
G
 
E
Q
 
K
I
 
I
V
 
L
E
 
S
G
 
G
L
 
L
R
 
E
E
 
K
I
 
I
L
 
S
K
 
E
E
 
E
I
 
W
E
 
S
E
 
K
G
 
G
N
 
V
V
 
F
E
 
V
F
 
V
D
 
K
V
 
Q
A
 
S
A
 
D
E
|
E
D
 
D
I
 
I
H
 
H
M
 
T
N
 
A
V
 
N
E
 
E
Q
 
R
L
 
R
L
 
L
T
 
K
A
 
E
K
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
D
V
 
I
G
 
A
K
 
G
K
 
K
L
 
L
H
 
H
T
 
T
A
 
G
R
 
R
S
 
S
R
|
R
N
|
N
D
 
D
Q
 
Q
V
|
V
A
 
V
V
 
T
D
 
D
I
 
L
R
 
K
M
 
L
Y
 
F
L
 
M
K
 
K
D
 
N
E
 
S
I
 
L
K
 
S
E
 
I
I
 
I
R
 
S
S
 
T
Q
 
H
L
 
L
R
 
L
E
 
Q
L
 
L
V
 
I
E
 
K
T
 
T
L
 
L
L
 
V
N
 
E
L
 
R
A
 
A
E
 
A
Q
 
I
H
 
E
L
 
I
S
 
D
T
 
V
V
 
I
M
 
L
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
T
|
T
H
|
H
M
 
L
Q
 
Q
R
 
K
A
 
A
Q
 
Q
P
 
P
I
 
I
T
 
R
L
 
W
S
 
S
H
 
Q
H
 
F
L
 
L
M
 
L
A
 
S
Y
 
H
V
 
A
Q
 
V
M
 
A
F
 
L
L
 
T
R
 
R
D
 
D
M
 
S
D
 
E
R
 
R
L
 
L
A
 
G
D
 
E
C
 
V
Y
 
K
R
 
K
R
 
R
T
 
I
D
 
N
V
 
V
M
 
L
P
 
P
L
 
L
G
 
G
S
 
S
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
G
T
 
N
T
 
P
F
 
L
P
 
D
L
 
I
D
 
D
R
 
R
E
 
E
Y
 
M
T
 
L
A
 
R
E
 
S
L
 
E
L
 
L
G
 
E
F
 
F
A
 
A
A
 
S
V
 
I
S
 
S
D
 
L
N
 
N
S
 
S
L
 
M
D
 
D
A
 
A
V
 
I
S
 
S
D
 
E
R
 
R
D
 
D
F
 
F
A
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
C
 
L
A
 
S
A
 
F
S
 
A
S
 
T
L
 
L
I
 
L
M
 
M
M
 
I
H
 
H
L
 
L
S
 
S
R
 
K
F
 
M
C
 
A
E
 
E
E
 
D
I
 
L
I
 
I
L
 
I
W
 
Y
A
 
S
T
 
T
G
 
S
E
 
E
F
 
F
A
 
G
F
 
F
I
 
L
E
 
T
L
 
L
D
 
S
D
 
D
A
 
A
Y
 
F
S
 
S
T
 
T
G
 
G
S
x
A
S
|
S
I
 
L
M
 
M
P
 
P
Q
 
Q
K
|
K
K
 
K
N
 
N
P
 
P
D
 
D
V
 
S
A
 
L
E
|
E
L
 
L
I
 
I
R
 
R
G
 
S
K
 
K
T
 
A
G
 
G
R
 
R
V
 
V
Y
 
F
G
 
G
D
 
R
L
 
L
L
 
A
G
 
S
L
 
I
L
 
L
T
 
M
M
 
V
L
 
L
K
 
K
G
 
G
L
 
L
P
 
P
M
 
S
A
 
T
Y
|
Y
N
 
N
K
 
K
D
 
D
M
 
L
Q
|
Q
E
 
E
D
 
D
K
|
K
E
 
E
A
 
A
L
 
V
F
 
F
D
 
D
A
 
V
I
 
V
D
 
D
T
 
T
V
 
L
K
 
T
G
 
A
C
 
V
L
 
L
L
 
Q
V
 
V
F
 
A
R
 
T
P
 
G
M
 
V
V
 
I
A
 
S
T
 
T
M
 
L
T
 
Q
V
 
I
R
 
S
K
 
K
E
 
E
N
 
N
M
 
M
A
 
E
G
 
K
A
 
A
A
 
L
R
 
T
G
 
P
G
 
E
F
 
M
T
 
L
N
 
-
A
 
A
T
 
T
D
 
D
V
 
L
A
 
A
D
 
L
Y
 
Y
L
 
L
A
 
V
K
 
R
K
 
K
G
 
G
V
 
V
P
 
P
F
 
F
R
 
R
E
 
Q
A
 
A
H
 
H
E
 
T
V
 
A
V
 
S
G
 
G
K
 
K
A
 
A
V
 
V
F
 
H
Y
 
L
C
 
A
L
 
E
Q
 
T
H
 
K
Q
 
G
K
 
I
N
 
T
L
 
I
E
 
N
A
 
K
L
 
L
T
 
S
L
 
L
E
 
E
E
 
D
Y
 
L
Q
 
K
A
 
S
L
 
I
S
 
S
P
 
P
A
 
Q
F
 
F
A
 
S
E
 
S
D
 
D
I
 
V
Y
 
S
A
 
Q
A
 
V
I
 
F
G
 
N
V
 
F
E
 
V
Y
 
N
C
 
S
A
 
V
A
 
E
A
 
Q
R
 
Y
K
 
T
V
 
A
R
 
L
G
 
G
G
 
G
P
 
T
A
 
A
P
 
K
E
 
S
A
 
S
V
 
V
Q
 
T
Q
 
T
A
 
Q
I
 
I
G
 
-
V
 
-
A
 
-
K
 
-
A
 
E
R
 
Q
L
 
L
R
 
R
E
 
E
I
 
L

1hy0A Crystal structure of wild type duck delta 1 crystallin (eye lens protein) (see paper)
42% identity, 97% coverage: 14:459/459 of query aligns to 1:441/447 of 1hy0A

query
sites
1hy0A
D
 
D
H
 
P
L
 
I
V
 
M
E
 
Q
D
 
M
F
 
L
H
 
S
S
 
T
S
 
S
I
 
I
S
 
S
F
 
T
D
 
E
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
Y
 
S
K
 
E
Q
 
V
D
 
D
I
 
I
Q
 
Q
G
 
A
S
 
S
I
 
I
A
 
A
H
 
Y
A
 
A
T
 
K
M
 
A
L
 
L
G
 
E
R
 
K
V
 
A
G
 
G
V
 
I
I
 
L
S
 
T
P
 
K
E
 
T
E
 
E
A
 
L
G
 
E
Q
 
K
I
 
I
V
 
L
E
 
S
G
 
G
L
 
L
R
 
E
E
 
K
I
 
I
L
 
S
K
 
E
E
 
E
I
 
L
E
 
S
E
 
K
G
 
G
N
 
V
V
 
I
E
 
V
F
 
V
D
 
T
V
 
Q
A
 
S
A
 
D
E
|
E
D
 
D
I
 
I
H
 
Q
M
 
T
N
 
A
V
 
N
E
 
E
Q
 
R
L
 
R
L
 
L
T
 
K
A
 
E
K
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
D
V
 
I
G
 
A
K
 
G
K
 
K
L
 
L
H
 
H
T
 
T
A
 
G
R
 
R
S
 
S
R
 
R
N
 
N
D
 
E
Q
 
Q
V
 
V
A
 
V
V
 
T
D
 
D
I
 
L
R
 
K
M
 
L
Y
 
F
L
 
M
K
 
K
D
 
N
E
 
S
I
 
L
K
 
S
E
 
I
I
 
I
R
 
S
S
 
T
Q
 
H
L
 
L
R
 
L
E
 
Q
L
 
L
V
 
I
E
 
K
T
 
T
L
 
L
L
 
V
N
 
E
L
 
R
A
 
A
E
 
A
Q
 
I
H
 
E
L
 
I
S
 
D
T
 
V
V
 
I
M
 
L
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
T
|
T
H
|
H
M
 
L
Q
 
Q
R
 
K
A
 
A
Q
 
Q
P
 
P
I
 
I
T
 
R
L
 
W
S
 
S
H
 
Q
H
 
F
L
 
L
M
 
L
A
 
S
Y
 
H
V
 
A
Q
 
V
M
 
A
F
 
L
L
 
T
R
 
R
D
 
D
M
 
S
D
 
E
R
 
R
L
 
L
A
 
G
D
 
E
C
 
V
Y
 
K
R
 
K
R
 
R
T
 
I
D
 
N
V
 
V
M
 
L
P
 
P
L
 
L
G
 
G
S
 
S
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
G
T
 
N
T
 
P
F
 
L
P
 
D
L
 
I
D
 
D
R
 
R
E
 
E
Y
 
M
T
 
L
A
 
R
E
 
S
L
 
E
L
 
L
G
 
E
F
 
F
A
 
A
A
 
S
V
 
I
S
 
S
D
 
L
N
 
N
S
 
S
L
 
M
D
 
D
A
 
A
V
 
I
S
 
S
D
 
E
R
 
R
D
 
D
F
 
F
A
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
C
 
L
A
 
S
A
 
V
S
 
A
S
 
T
L
 
L
I
 
L
M
 
L
M
 
I
H
 
H
L
 
L
S
 
S
R
 
K
F
 
M
C
 
A
E
 
E
E
 
D
I
 
L
I
 
I
L
 
I
W
 
Y
A
 
S
T
 
T
G
 
S
E
 
E
F
 
F
A
 
G
F
 
F
I
 
L
E
 
T
L
 
L
D
 
S
D
 
D
A
 
A
Y
 
F
S
 
S
T
 
T
G
 
G
S
|
S
S
|
S
I
 
L
M
|
M
P
 
P
Q
 
Q
K
|
K
K
 
K
N
|
N
P
 
P
D
 
D
V
 
S
A
 
L
E
|
E
L
 
L
I
 
I
R
 
R
G
 
S
K
 
K
T
 
S
G
 
G
R
 
R
V
 
V
Y
 
F
G
 
G
D
 
R
L
 
L
L
 
A
G
 
S
L
 
I
L
 
L
T
 
M
M
 
V
L
 
L
K
 
K
G
 
G
L
 
L
P
 
P
M
 
S
A
 
T
Y
 
Y
N
 
N
K
 
K
D
 
D
M
 
L
Q
 
Q
E
 
E
D
 
D
K
 
K
E
 
E
A
 
A
L
 
V
F
 
I
D
 
D
A
 
V
I
 
V
D
 
D
T
 
T
V
 
L
K
 
T
G
 
A
C
 
V
L
 
L
L
 
Q
V
 
V
F
 
A
R
 
T
P
 
G
M
 
V
V
 
I
A
 
S
T
 
T
M
 
L
T
 
Q
V
 
I
R
 
S
K
 
K
E
 
E
N
 
N
M
 
M
A
 
E
G
 
K
A
 
A
A
 
L
R
 
T
G
 
P
G
 
E
F
 
M
T
 
L
N
 
-
A
 
A
T
 
T
D
 
D
V
 
L
A
 
A
D
 
L
Y
 
Y
L
 
L
A
 
V
K
 
R
K
 
K
G
 
G
V
 
M
P
 
P
F
 
F
R
 
R
E
 
Q
A
 
A
H
 
H
E
 
T
V
 
A
V
 
S
G
 
G
K
 
K
A
 
A
V
 
V
F
 
H
Y
 
L
C
 
A
L
 
E
Q
 
T
H
 
K
Q
 
G
K
 
I
N
 
A
L
 
I
E
 
N
A
 
N
L
 
L
T
 
T
L
 
L
E
 
E
E
 
D
Y
 
L
Q
 
K
A
 
S
L
 
I
S
 
S
P
 
P
A
 
L
F
 
F
A
 
S
E
 
S
D
 
D
I
 
V
Y
 
S
A
 
Q
A
 
V
I
 
F
G
 
N
V
 
F
E
 
V
Y
 
N
C
 
S
A
 
V
A
 
E
A
 
Q
R
 
Y
K
 
T
V
 
A
R
 
L
G
 
G
G
 
G
P
 
T
A
 
A
P
 
K
E
 
S
A
 
S
V
 
V
Q
 
T
Q
 
T
A
 
Q
I
 
I
G
 
-
V
 
-
A
 
-
K
 
-
A
 
E
R
 
Q
L
 
L
R
 
R
E
 
E
I
 
L

P02521 Delta-1 crystallin; Delta crystallin I from Gallus gallus (Chicken) (see paper)
42% identity, 100% coverage: 3:459/459 of query aligns to 7:458/466 of P02521

query
sites
P02521
K
 
K
L
 
L
W
 
L
G
 
G
G
 
G
R
 
R
F
 
F
Q
 
V
K
 
G
T
 
S
T
 
T
D
 
D
H
 
P
L
 
I
V
 
M
E
 
E
D
 
I
F
 
L
H
 
S
S
 
S
S
 
S
I
 
I
S
 
S
F
 
T
D
 
E
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
Y
 
T
K
 
E
Q
 
V
D
 
D
I
 
I
Q
 
Q
G
 
A
S
 
S
I
 
M
A
 
A
H
 
Y
A
 
A
T
 
K
M
 
A
L
 
L
G
 
E
R
 
K
V
 
A
G
 
S
V
 
I
I
 
L
S
 
T
P
 
K
E
 
T
E
 
E
A
 
L
G
 
E
Q
 
K
I
 
I
V
 
L
E
 
S
G
 
G
L
 
L
R
 
E
E
 
K
I
 
I
L
 
S
K
 
E
E
 
E
I
 
S
E
 
S
E
 
K
G
 
G
N
 
V
V
 
L
E
 
V
F
 
M
D
 
T
V
 
Q
A
 
S
A
 
D
E
 
E
D
 
D
I
 
I
H
 
Q
M
 
T
N
 
A
V
 
I
E
 
E
Q
 
R
L
 
R
L
 
L
T
 
K
A
 
E
K
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
D
V
 
I
G
 
A
K
 
G
K
 
K
L
 
L
H
 
Q
T
 
T
A
 
G
R
 
R
S
 
S
R
 
R
N
 
N
D
 
E
Q
 
Q
V
 
V
A
 
V
V
 
T
D
 
D
I
 
L
R
 
K
M
 
L
Y
 
L
L
 
L
K
 
K
D
 
S
E
 
S
I
 
I
K
 
S
E
 
V
I
 
I
R
 
S
S
 
T
Q
 
H
L
 
L
R
 
L
E
 
Q
L
 
L
V
 
I
E
 
K
T
 
T
L
 
L
L
 
V
N
 
E
L
 
R
A
 
A
E
 
A
Q
 
I
H
 
E
L
 
I
S
 
D
T
 
I
V
 
I
M
 
M
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
H
 
H
M
 
L
Q
 
Q
R
 
K
A
 
A
Q
 
L
P
 
P
I
 
I
T
 
R
L
 
W
S
 
S
H
 
Q
H
 
F
L
 
L
M
 
L
A
 
S
Y
 
H
V
 
A
Q
 
V
M
 
A
F
 
L
L
 
T
R
 
R
D
 
D
M
 
S
D
 
E
R
 
R
L
 
L
A
 
G
D
 
E
C
 
V
Y
 
K
R
 
K
R
 
R
T
 
I
D
 
T
V
 
V
M
 
L
P
 
P
L
 
L
G
 
G
S
 
S
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
G
T
 
N
T
 
P
F
 
L
P
 
E
L
 
I
D
 
D
R
 
R
E
 
E
Y
 
L
T
 
L
A
 
R
E
 
S
L
 
E
L
 
L
G
 
D
F
 
M
A
 
T
A
 
S
V
 
I
S
 
T
D
 
L
N
 
N
S
 
S
L
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
I
S
 
S
D
 
E
R
 
R
D
 
D
F
 
F
A
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
L
C
 
I
A
 
S
A
 
V
S
 
A
S
 
T
L
 
L
I
 
L
M
 
M
M
 
I
H
 
H
L
 
L
S
 
S
R
 
K
F
 
L
C
 
A
E
 
E
E
 
D
I
 
L
I
 
I
L
 
I
W
 
F
A
 
S
T
 
T
G
 
T
E
 
E
F
 
F
A
 
G
F
 
F
I
 
V
E
 
T
L
 
L
D
 
S
D
 
D
A
 
A
Y
 
Y
S
 
S
T
 
T
G
 
G
S
 
S
S
 
S
I
 
L
M
 
L
P
 
P
Q
 
Q
K
 
K
K
 
K
N
 
N
P
 
P
D
 
D
V
 
S
A
 
L
E
 
E
L
 
L
I
 
I
R
 
R
G
 
S
K
 
K
T
 
A
G
 
G
R
 
R
V
 
V
Y
 
F
G
 
G
D
 
R
L
 
L
L
 
A
G
 
A
L
 
I
L
 
L
T
 
M
M
 
V
L
 
L
K
 
K
G
 
G
L
 
I
P
 
P
M
 
S
A
 
T
Y
 
F
N
 
S
K
 
K
D
 
D
M
 
L
Q
 
Q
E
 
E
D
 
D
K
 
K
E
 
E
A
 
A
L
 
V
F
 
L
D
 
D
A
 
V
I
 
V
D
 
D
T
 
T
V
 
L
K
 
T
G
 
A
C
 
V
L
 
L
L
 
Q
V
 
V
F
 
A
R
 
T
P
 
G
M
 
V
V
 
I
A
 
S
T
 
T
M
 
L
T
 
Q
V
 
V
R
 
N
K
 
K
E
 
E
N
 
N
M
 
M
A
 
E
G
 
K
A
 
A
A
 
L
R
 
T
G
 
P
G
 
E
F
 
L
T
 
L
N
 
-
A
 
S
T
 
T
D
 
D
V
 
L
A
 
A
D
 
L
Y
 
Y
L
 
L
A
 
V
K
 
R
K
 
K
G
 
G
V
 
M
P
 
P
F
 
I
R
 
R
E
 
Q
A
 
A
H
 
Q
E
 
T
V
 
A
V
 
S
G
 
G
K
 
K
A
 
A
V
 
V
F
 
H
Y
 
L
C
 
A
L
 
E
Q
 
T
H
 
K
Q
 
G
K
 
I
N
 
T
L
 
I
E
 
N
A
 
N
L
 
L
T
 
T
L
 
L
E
 
E
E
 
D
Y
 
L
Q
 
K
A
 
S
L
 
I
S
 
S
P
 
P
A
 
L
F
 
F
A
 
A
E
 
S
D
 
D
I
 
V
Y
 
S
A
 
Q
A
 
V
I
 
F
G
 
S
V
 
V
E
 
V
Y
 
N
C
 
S
A
 
V
A
 
E
A
 
Q
R
 
Y
K
 
T
V
 
A
R
 
V
G
 
G
G
 
G
P
 
T
A
 
A
P
 
K
E
 
S
A
 
S
V
 
V
Q
 
T
Q
 
A
A
 
Q
I
 
I
G
 
-
V
 
-
A
 
-
K
 
-
A
 
E
R
 
Q
L
 
L
R
 
R
E
 
E
I
 
L

Sites not aligning to the query:

6ienB Substrate/product bound argininosuccinate lyase from mycobacterium tuberculosis (see paper)
43% identity, 95% coverage: 20:457/459 of query aligns to 8:449/454 of 6ienB

query
sites
6ienB
F
 
L
H
 
S
S
 
K
S
 
S
I
 
T
S
 
H
F
 
F
D
 
D
Q
 
W
R
 
V
L
 
L
Y
 
A
K
 
P
Q
 
Y
D
 
D
I
 
L
Q
 
T
G
 
A
S
 
S
I
 
R
A
 
A
H
 
H
A
 
T
T
 
M
M
 
V
L
 
L
G
 
F
R
 
R
V
 
A
G
 
G
V
 
L
I
 
L
S
 
T
P
 
E
E
 
E
E
 
Q
A
 
R
G
 
D
Q
 
G
I
 
L
V
 
L
E
 
A
G
 
G
L
 
L
R
 
D
E
 
S
I
 
L
L
 
A
K
 
Q
E
 
D
I
 
V
E
 
A
E
 
D
G
 
G
N
 
S
V
 
F
E
 
G
F
 
P
D
 
L
V
 
V
A
 
T
A
 
D
E
 
E
D
 
D
I
 
V
H
 
H
M
 
A
N
 
A
V
 
L
E
 
E
Q
 
R
L
 
G
L
 
L
T
 
I
A
 
D
K
 
R
I
 
V
G
 
G
A
 
P
-
 
D
V
 
L
G
 
G
K
 
G
K
 
R
L
 
L
H
 
R
T
 
A
A
 
G
R
 
R
S
|
S
R
|
R
N
|
N
D
 
D
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
V
 
A
D
 
L
I
 
F
R
 
R
M
 
M
Y
 
W
L
 
L
K
 
R
D
 
D
E
 
A
I
 
V
K
 
R
E
 
R
I
 
V
R
 
A
S
 
T
Q
 
G
L
 
V
R
 
L
E
 
D
L
 
V
V
 
V
E
 
G
T
 
A
L
 
L
L
 
A
N
 
E
L
 
Q
A
 
A
E
 
A
Q
 
A
H
 
H
L
 
P
S
 
S
T
 
A
V
 
I
M
 
M
P
 
P
G
 
G
Y
 
K
T
|
T
H
|
H
M
 
L
Q
 
Q
R
 
S
A
 
A
Q
 
Q
P
 
P
I
 
I
T
 
L
L
 
L
S
 
A
H
 
H
H
 
H
L
 
L
M
 
L
A
 
A
Y
 
H
V
 
A
Q
 
H
M
 
P
F
 
L
L
 
L
R
 
R
D
 
D
M
 
L
D
 
D
R
 
R
L
 
I
A
 
V
D
 
D
C
 
F
Y
 
D
R
 
K
R
 
R
T
 
A
D
 
A
V
 
V
M
 
S
P
 
P
L
 
Y
G
 
G
S
 
S
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
G
T
 
S
T
 
S
F
 
L
P
 
G
L
 
L
D
 
D
R
 
P
E
 
D
Y
 
A
T
 
I
A
 
A
E
 
A
L
 
D
L
 
L
G
 
G
F
 
F
A
 
S
A
 
A
V
 
A
S
 
A
D
 
D
N
 
N
S
 
S
L
 
V
D
 
D
A
 
A
V
 
T
S
 
A
D
 
A
R
 
R
D
 
D
F
 
F
A
 
A
V
 
A
E
 
E
F
 
A
C
 
A
A
 
F
A
 
V
S
 
F
S
 
A
L
 
M
I
 
I
M
 
A
M
 
V
H
 
D
L
 
L
S
 
S
R
 
R
F
 
L
C
 
A
E
 
E
E
 
D
I
 
I
I
 
I
L
 
V
W
 
W
A
 
S
T
 
S
G
 
T
E
 
E
F
 
F
A
 
G
F
 
Y
I
 
V
E
 
T
L
 
L
D
 
H
D
 
D
A
 
S
Y
 
W
S
 
S
T
 
T
G
 
G
S
|
S
S
|
S
I
 
I
M
|
M
P
 
P
Q
 
Q
K
|
K
K
 
K
N
 
N
P
 
P
D
 
D
V
 
I
A
 
A
E
 
E
L
 
L
I
 
A
R
 
R
G
 
G
K
 
K
T
 
S
G
 
G
R
 
R
V
 
L
Y
 
I
G
 
G
D
 
N
L
 
L
L
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
L
T
 
A
M
 
T
L
 
L
K
 
K
G
 
A
L
 
Q
P
 
P
M
 
L
A
 
A
Y
|
Y
N
 
N
K
 
R
D
 
D
M
 
L
Q
|
Q
E
 
E
D
 
D
K
|
K
E
 
E
A
 
P
L
 
V
F
 
F
D
 
D
A
 
S
I
 
V
D
 
A
T
 
Q
V
 
L
K
 
E
G
 
L
C
 
L
L
 
L
L
 
P
V
 
A
F
 
M
R
 
A
P
 
G
M
 
L
V
 
V
A
 
A
T
 
S
M
 
L
T
 
T
V
 
F
R
 
N
K
 
V
E
 
Q
N
 
R
M
 
M
A
 
A
G
 
E
A
 
L
A
 
A
R
 
P
G
 
A
G
 
G
F
 
Y
T
 
T
N
 
L
A
 
A
T
 
T
D
 
D
V
 
L
A
 
A
D
 
E
Y
 
W
L
 
L
A
 
V
K
 
R
K
 
Q
G
 
G
V
 
V
P
 
P
F
 
F
R
 
R
E
 
S
A
 
A
H
 
H
E
 
E
V
 
A
V
 
A
G
 
G
K
 
A
A
 
A
V
 
V
F
 
R
Y
 
A
C
 
A
L
 
E
Q
 
Q
H
 
R
Q
 
G
K
 
V
N
 
G
L
 
L
E
 
Q
A
 
E
L
 
L
T
 
T
L
 
D
E
 
D
E
 
E
Y
 
L
Q
 
A
A
 
A
L
 
I
S
 
S
P
 
P
A
 
E
F
 
L
A
 
T
E
 
P
D
 
Q
I
 
V
Y
 
R
A
 
E
A
 
V
I
 
L
G
 
T
V
 
I
E
 
E
Y
 
G
C
 
S
A
 
V
A
 
S
A
 
A
R
 
R
K
 
D
V
 
C
R
 
R
G
 
G
G
 
G
P
 
T
A
 
A
P
 
P
E
 
G
A
 
R
V
 
V
Q
 
A
Q
 
E
-
 
Q
-
 
L
-
 
N
A
 
A
I
 
I
G
 
G
V
 
E
A
 
A
K
 
A
A
 
E
R
 
R
L
 
L
R
 
R

6ienA Substrate/product bound argininosuccinate lyase from mycobacterium tuberculosis (see paper)
43% identity, 95% coverage: 20:457/459 of query aligns to 8:447/452 of 6ienA

query
sites
6ienA
F
 
L
H
 
S
S
 
K
S
 
S
I
 
T
S
 
H
F
 
F
D
 
D
Q
 
W
R
 
V
L
 
L
Y
 
A
K
 
P
Q
 
Y
D
 
D
I
 
L
Q
 
T
G
 
A
S
 
S
I
 
R
A
 
A
H
 
H
A
 
T
T
 
M
M
 
V
L
 
L
G
 
F
R
 
R
V
 
A
G
 
G
V
 
L
I
 
L
S
 
T
P
 
E
E
 
E
E
 
Q
A
 
R
G
 
D
Q
 
G
I
 
L
V
 
L
E
 
A
G
 
G
L
 
L
R
 
D
E
 
S
I
 
L
L
 
A
K
 
Q
E
 
D
I
 
V
E
 
A
E
 
D
G
 
G
N
 
S
V
 
F
E
 
G
F
 
P
D
 
L
V
 
V
A
 
T
A
 
D
E
 
E
D
 
D
I
 
V
H
 
H
M
 
A
N
 
A
V
 
L
E
 
E
Q
 
R
L
 
G
L
 
L
T
 
I
A
 
D
K
 
R
I
 
V
G
 
G
A
 
P
-
 
D
V
 
L
G
 
G
K
 
G
K
 
R
L
 
L
H
 
R
T
 
A
A
 
G
R
 
R
S
 
S
R
|
R
N
|
N
D
 
D
Q
 
Q
V
|
V
A
 
A
V
 
A
D
 
L
I
 
F
R
 
R
M
 
M
Y
 
W
L
 
L
K
 
R
D
 
D
E
 
A
I
 
V
K
 
R
E
 
R
I
 
V
R
 
A
S
 
T
Q
 
G
L
 
V
R
 
L
E
 
D
L
 
V
V
 
V
E
 
G
T
 
A
L
 
L
L
 
A
N
 
E
L
 
Q
A
 
A
E
 
A
Q
 
A
H
 
H
L
 
P
S
 
S
T
 
A
V
 
I
M
 
M
P
 
P
G
 
G
Y
 
K
T
|
T
H
|
H
M
 
L
Q
 
Q
R
 
S
A
 
A
Q
 
Q
P
 
P
I
 
I
T
 
L
L
 
L
S
 
A
H
 
H
H
 
H
L
 
L
M
 
L
A
 
A
Y
 
H
V
 
A
Q
 
H
M
 
P
F
 
L
L
 
L
R
 
R
D
 
D
M
 
L
D
 
D
R
 
R
L
 
I
A
 
V
D
 
D
C
 
F
Y
 
D
R
 
K
R
 
R
T
 
A
D
 
A
V
 
V
M
 
S
P
 
P
L
 
Y
G
 
G
S
 
S
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
G
T
 
S
T
 
S
F
 
L
P
 
G
L
 
L
D
 
D
R
 
P
E
 
D
Y
 
A
T
 
I
A
 
A
E
 
A
L
 
D
L
 
L
G
 
G
F
 
F
A
 
S
A
 
A
V
 
A
S
 
A
D
 
D
N
 
N
S
 
S
L
 
V
D
 
D
A
 
A
V
 
T
S
 
A
D
 
A
R
 
R
D
 
D
F
 
F
A
 
A
V
 
A
E
 
E
F
 
A
C
 
A
A
 
F
A
 
V
S
 
F
S
 
A
L
 
M
I
 
I
M
 
A
M
 
V
H
 
D
L
 
L
S
 
S
R
 
R
F
 
L
C
 
A
E
 
E
E
 
D
I
 
I
I
 
I
L
 
V
W
 
W
A
 
S
T
 
S
G
 
T
E
 
E
F
 
F
A
 
G
F
 
Y
I
 
V
E
 
T
L
 
L
D
 
H
D
 
D
A
 
S
Y
 
W
S
 
S
T
 
T
G
 
G
S
|
S
S
|
S
I
 
-
M
 
-
P
 
P
Q
 
Q
K
|
K
K
 
K
N
|
N
P
 
P
D
 
D
V
 
I
A
 
A
E
 
E
L
 
L
I
 
A
R
 
R
G
 
G
K
 
K
T
 
S
G
 
G
R
 
R
V
 
L
Y
 
I
G
 
G
D
 
N
L
 
L
L
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
L
T
 
A
M
 
T
L
 
L
K
 
K
G
 
A
L
 
Q
P
 
P
M
 
L
A
 
A
Y
|
Y
N
 
N
K
 
R
D
 
D
M
 
L
Q
|
Q
E
 
E
D
 
D
K
|
K
E
 
E
A
 
P
L
 
V
F
 
F
D
 
D
A
 
S
I
 
V
D
 
A
T
 
Q
V
 
L
K
 
E
G
 
L
C
 
L
L
 
L
L
 
P
V
 
A
F
 
M
R
 
A
P
 
G
M
 
L
V
 
V
A
 
A
T
 
S
M
 
L
T
 
T
V
 
F
R
 
N
K
 
V
E
 
Q
N
 
R
M
 
M
A
 
A
G
 
E
A
 
L
A
 
A
R
 
P
G
 
A
G
 
G
F
 
Y
T
 
T
N
 
L
A
 
A
T
 
T
D
 
D
V
 
L
A
 
A
D
 
E
Y
 
W
L
 
L
A
 
V
K
 
R
K
 
Q
G
 
G
V
 
V
P
 
P
F
 
F
R
 
R
E
 
S
A
 
A
H
 
H
E
 
E
V
 
A
V
 
A
G
 
G
K
 
A
A
 
A
V
 
V
F
 
R
Y
 
A
C
 
A
L
 
E
Q
 
Q
H
 
R
Q
 
G
K
 
V
N
 
G
L
 
L
E
 
Q
A
 
E
L
 
L
T
 
T
L
 
D
E
 
D
E
 
E
Y
 
L
Q
 
A
A
 
A
L
 
I
S
 
S
P
 
P
A
 
E
F
 
L
A
 
T
E
 
P
D
 
Q
I
 
V
Y
 
R
A
 
E
A
 
V
I
 
L
G
 
T
V
 
I
E
 
E
Y
 
G
C
 
S
A
 
V
A
 
S
A
 
A
R
 
R
K
 
D
V
 
C
R
 
R
G
 
G
G
 
G
P
 
T
A
 
A
P
 
P
E
 
G
A
 
R
V
 
V
Q
 
A
Q
 
E
-
 
Q
-
 
L
-
 
N
A
 
A
I
 
I
G
 
G
V
 
E
A
 
A
K
 
A
A
 
E
R
 
R
L
 
L
R
 
R

6ienC Substrate/product bound argininosuccinate lyase from mycobacterium tuberculosis (see paper)
41% identity, 95% coverage: 20:457/459 of query aligns to 8:413/418 of 6ienC

query
sites
6ienC
F
 
L
H
 
S
S
 
K
S
 
S
I
 
T
S
 
H
F
 
F
D
 
D
Q
 
W
R
 
V
L
 
L
Y
 
A
K
 
P
Q
 
Y
D
 
D
I
 
L
Q
 
T
G
 
A
S
 
S
I
 
R
A
 
A
H
 
H
A
 
T
T
 
M
M
 
V
L
 
L
G
 
F
R
 
R
V
 
A
G
 
G
V
 
L
I
 
L
S
 
T
P
 
E
E
 
E
E
 
Q
A
 
R
G
 
D
Q
 
G
I
 
L
V
 
L
E
 
A
G
 
G
L
 
L
R
 
D
E
 
S
I
 
L
L
 
A
K
 
Q
E
 
D
I
 
V
E
 
A
E
 
D
G
 
G
N
 
S
V
 
F
E
 
G
F
 
P
D
 
L
V
 
V
A
 
T
A
 
D
E
 
E
D
 
D
I
 
V
H
 
H
M
 
A
N
 
A
V
 
L
E
 
E
Q
 
R
L
 
G
L
 
L
T
 
I
A
 
D
K
 
R
I
 
V
G
 
G
A
 
P
-
 
D
V
 
L
G
 
G
K
 
G
K
 
R
L
 
L
H
 
R
T
 
A
A
 
G
R
 
R
S
|
S
R
|
R
N
|
N
D
 
D
Q
 
Q
V
|
V
A
 
A
V
 
A
D
 
L
I
 
F
R
 
R
M
 
M
Y
 
W
L
 
L
K
 
R
D
 
D
E
 
A
I
 
V
K
 
R
E
 
R
I
 
V
R
 
A
S
 
T
Q
 
G
L
 
V
R
 
L
E
 
D
L
 
V
V
 
V
E
 
G
T
 
A
L
 
L
L
 
A
N
 
E
L
 
Q
A
 
A
E
 
A
Q
 
A
H
 
H
L
 
P
S
 
S
T
 
A
V
 
I
M
 
M
P
 
P
G
 
G
Y
 
K
T
|
T
H
|
H
M
 
L
Q
 
Q
R
 
S
A
 
A
Q
 
Q
P
 
P
I
 
I
T
 
L
L
 
L
S
 
A
H
 
H
H
 
H
L
 
L
M
 
L
A
 
A
Y
 
H
V
 
A
Q
 
H
M
 
P
F
 
L
L
 
L
R
 
R
D
 
D
M
 
L
D
 
D
R
 
R
L
 
I
A
 
V
D
 
D
C
 
F
Y
 
D
R
 
K
R
 
R
T
 
A
D
 
A
V
 
V
M
 
S
P
 
P
L
 
Y
G
 
G
S
 
S
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
G
T
 
S
T
 
S
F
 
L
P
 
G
L
 
L
D
 
D
R
 
P
E
 
D
Y
 
A
T
 
I
A
 
A
E
 
A
L
 
D
L
 
L
G
 
G
F
 
F
A
 
S
A
 
A
V
 
A
S
 
A
D
 
D
N
 
N
S
 
S
L
 
V
D
 
D
A
 
A
V
 
T
S
 
A
D
 
A
R
 
R
D
 
D
F
 
F
A
 
A
V
 
A
E
 
E
F
 
A
C
 
A
A
 
F
A
 
V
S
 
F
S
 
A
L
 
M
I
 
I
M
 
A
M
 
V
H
 
D
L
 
L
S
 
S
R
 
R
F
 
L
C
 
A
E
 
E
E
 
D
I
 
I
I
 
I
L
 
V
W
 
W
A
 
S
T
 
S
G
 
T
E
 
E
F
 
F
A
 
G
F
 
Y
I
 
V
E
 
T
L
 
L
D
 
H
D
 
D
A
 
S
Y
 
W
S
 
S
T
 
T
G
 
G
S
|
S
S
|
S
I
 
I
M
|
M
P
 
P
Q
 
Q
K
|
K
K
 
K
N
 
N
P
 
P
D
 
D
V
 
I
A
 
A
E
 
E
L
 
L
I
 
A
R
 
R
G
 
G
K
 
K
T
 
S
G
 
G
R
 
R
V
 
L
Y
 
I
G
 
G
D
 
N
L
 
L
L
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
L
T
 
A
M
 
T
L
 
L
K
 
K
G
 
A
L
 
Q
P
 
P
M
 
L
A
 
A
Y
|
Y
N
 
N
K
 
R
D
 
D
M
 
L
Q
|
Q
E
 
E
D
 
D
K
|
K
E
 
E
A
 
P
L
 
V
F
 
F
D
 
D
A
 
S
I
 
V
D
 
A
T
 
Q
V
 
L
K
 
E
G
 
L
C
 
L
L
 
L
L
 
P
V
 
A
F
 
M
R
 
A
P
 
G
M
 
L
V
 
V
A
 
A
T
 
S
M
 
L
T
 
T
V
 
F
R
 
N
K
 
V
E
 
Q
N
 
R
M
 
M
A
 
A
G
 
E
A
 
L
A
 
A
R
 
P
G
 
A
G
 
G
F
 
Y
T
 
T
N
 
L
A
 
A
T
 
T
D
 
D
V
 
L
A
 
A
D
 
E
Y
 
W
L
 
L
A
 
V
K
 
R
K
 
Q
G
 
G
V
 
V
P
 
P
F
 
F
R
 
R
E
 
S
A
 
A
H
 
H
E
 
R
V
 
-
V
 
-
G
 
-
K
 
-
A
 
-
V
 
-
F
 
-
Y
 
-
C
 
-
L
 
-
Q
 
-
H
 
-
Q
 
-
K
 
-
N
 
-
L
 
-
E
 
E
A
 
V
L
 
L
T
 
T
L
 
-
E
 
-
E
 
-
Y
 
-
Q
 
-
A
 
-
L
 
-
S
 
-
P
 
-
A
 
-
F
 
-
A
 
-
E
 
-
D
 
-
I
 
-
Y
 
-
A
 
-
A
 
-
I
 
-
G
 
-
V
 
I
E
 
E
Y
 
G
C
 
S
A
 
V
A
 
S
A
 
A
R
 
R
K
 
D
V
 
C
R
 
R
G
 
G
G
 
G
P
 
T
A
 
A
P
 
P
E
 
G
A
 
R
V
 
V
Q
 
A
Q
 
E
-
 
Q
-
 
L
-
 
N
A
 
A
I
 
I
G
 
G
V
 
E
A
 
A
K
 
A
A
 
E
R
 
R
L
 
L
R
 
R

6g3iA Crystal structure of edds lyase in complex with n-(2-aminoethyl) aspartic acid (aeaa) (see paper)
32% identity, 96% coverage: 19:458/459 of query aligns to 23:463/496 of 6g3iA

query
sites
6g3iA
D
 
D
F
 
F
H
 
D
S
 
A
S
 
A
-
 
A
I
 
L
S
 
T
F
 
L
D
 
T
Q
 
S
R
 
A
L
 
V
Y
 
F
K
 
P
Q
 
Y
D
 
D
I
 
S
Q
 
Q
G
 
I
S
 
H
I
 
R
A
 
A
H
 
H
A
 
V
T
 
V
M
 
M
L
 
L
G
 
T
R
 
E
V
 
Q
G
 
G
V
 
I
I
 
L
S
 
T
P
 
V
E
 
E
E
 
E
A
 
S
G
 
A
Q
 
T
I
 
I
V
 
L
E
 
S
G
 
G
L
 
L
R
 
A
E
 
Q
I
 
V
L
 
-
K
 
-
E
 
-
I
 
-
E
 
-
E
 
-
G
 
-
N
 
-
V
 
-
E
 
-
F
 
D
D
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
T
D
 
D
-
 
G
-
 
S
-
 
L
-
 
R
I
 
T
H
 
Y
M
 
L
N
 
P
V
 
Y
E
 
E
Q
 
A
L
 
A
L
 
L
T
 
K
A
 
R
K
 
T
I
 
I
G
 
G
A
 
S
V
 
V
G
 
A
K
 
G
K
 
K
L
 
M
H
 
H
T
 
I
A
 
G
R
 
R
S
 
S
R
 
R
N
 
N
D
 
D
Q
 
L
V
 
A
A
 
N
V
 
A
D
 
G
I
 
K
R
 
R
M
 
M
Y
 
F
L
 
L
K
 
R
D
 
D
E
 
Q
I
 
L
K
 
L
E
 
R
I
 
T
R
 
I
S
 
E
Q
 
A
L
 
V
R
 
I
E
 
G
L
 
Y
V
 
R
E
 
E
T
 
A
L
 
V
L
 
V
N
 
H
L
 
K
A
 
A
E
 
A
Q
 
D
H
 
H
L
 
L
S
 
D
T
 
T
V
 
V
M
 
M
P
 
V
G
 
V
Y
 
Y
T
 
T
H
 
Q
M
 
R
Q
 
K
R
 
E
A
 
A
Q
 
Q
P
 
P
I
 
I
T
 
T
L
 
L
S
 
G
H
 
H
H
 
Y
L
 
L
M
 
M
A
 
A
Y
 
I
V
 
S
Q
 
E
M
 
N
F
 
L
L
 
A
R
 
K
D
 
N
M
 
L
D
 
D
R
 
R
L
 
Y
A
 
R
D
 
E
C
 
L
Y
 
Y
R
 
A
R
 
R
T
 
I
D
 
N
V
 
L
M
 
C
P
 
P
L
 
L
G
 
G
S
 
A
G
 
A
A
 
A
L
 
T
A
 
A
G
 
G
T
 
T
T
 
G
F
 
W
P
 
P
L
 
L
D
 
N
R
 
R
E
 
D
Y
 
R
T
 
T
A
 
S
E
 
A
L
 
L
L
 
L
G
 
G
F
 
F
A
 
D
A
 
G
V
 
L
S
 
V
D
 
V
N
 
N
S
 
S
L
 
I
D
 
E
A
 
G
V
 
V
S
 
A
D
 
G
R
 
W
D
 
D
F
 
H
A
 
V
V
 
A
E
 
E
F
 
H
C
 
A
A
 
F
A
 
V
S
 
N
S
 
A
L
 
V
I
 
F
M
 
L
M
 
S
H
 
G
L
 
L
S
 
S
R
 
R
F
 
L
C
 
A
E
 
S
E
 
E
I
 
I
I
 
Q
L
 
L
W
 
W
A
 
S
T
 
T
G
 
D
E
 
E
F
 
Y
A
 
Q
F
 
V
I
 
A
E
 
E
L
 
L
D
 
D
D
 
A
A
 
S
Y
 
F
S
 
A
T
 
G
G
 
T
S
|
S
S
|
S
I
 
I
M
|
M
P
 
P
Q
 
Q
K
|
K
K
 
K
N
|
N
P
 
P
D
|
D
V
 
S
A
 
L
E
 
E
L
x
R
I
 
S
R
 
R
G
 
K
K
 
A
T
 
A
G
 
F
R
 
A
V
 
A
Y
 
M
G
 
G
D
 
P
L
 
L
L
 
V
G
 
G
L
 
I
L
 
L
T
 
T
M
 
S
L
 
L
K
 
N
G
 
A
L
 
I
P
 
E
M
 
Y
A
 
Q
Y
 
Y
N
 
S
K
 
A
D
 
A
M
 
R
Q
 
V
E
 
E
-
 
L
-
 
E
-
 
P
-
 
R
D
 
S
K
 
I
E
 
D
A
 
A
L
 
L
F
 
I
D
 
A
A
 
A
I
 
T
D
 
H
T
 
A
V
 
M
K
 
T
G
 
G
C
 
V
L
 
V
L
 
R
V
 
T
F
 
L
R
 
H
P
 
P
M
 
-
V
 
-
A
 
-
T
 
-
M
 
-
T
 
-
V
 
-
R
 
N
K
 
K
E
 
E
N
 
R
M
 
M
A
 
R
G
 
Q
A
 
Y
A
 
A
R
 
A
G
 
E
G
 
N
F
 
Y
T
 
S
N
 
T
A
 
M
T
 
T
D
 
D
V
 
L
A
 
T
D
 
D
Y
 
M
L
 
L
A
 
V
K
 
R
K
 
R
-
 
V
G
 
G
V
 
I
P
 
D
F
 
Y
R
 
R
E
 
E
A
 
A
H
 
H
E
 
E
V
 
I
V
 
V
G
 
A
K
 
H
A
 
V
V
 
V
F
 
I
Y
 
T
C
 
A
L
 
I
Q
 
E
H
 
K
Q
 
G
K
 
I
N
 
K
L
 
A
E
 
N
A
 
K
L
 
I
T
 
G
L
 
L
E
 
D
E
 
L
Y
 
V
Q
 
Q
A
 
E
L
 
A
S
 
A
P
 
V
A
 
A
-
 
Q
-
 
T
-
 
G
-
 
A
-
 
G
-
 
I
-
 
N
-
 
V
F
 
S
A
 
A
E
 
D
D
 
D
I
 
I
Y
 
K
A
 
D
A
 
A
I
 
L
G
 
D
V
 
P
E
 
W
Y
 
Q
C
 
N
A
 
V
A
 
L
A
 
R
R
 
R
K
 
E
V
 
G
R
 
K
G
 
G
G
 
M
P
 
P
A
 
A
P
 
P
E
 
M
A
 
S
V
 
V
Q
 
K
Q
 
A
A
 
S
I
 
I
G
 
D
V
 
D
A
 
A
K
 
M
A
 
A
R
 
E
L
 
L
R
 
H
E
 
K

Sites not aligning to the query:

6g3hA Crystal structure of edds lyase in complex with ss-edds (see paper)
32% identity, 96% coverage: 19:458/459 of query aligns to 23:463/497 of 6g3hA

query
sites
6g3hA
D
 
D
F
 
F
H
 
D
S
 
A
S
 
A
-
 
A
I
 
L
S
 
T
F
 
L
D
 
T
Q
 
S
R
 
A
L
 
V
Y
 
F
K
 
P
Q
 
Y
D
 
D
I
 
S
Q
 
Q
G
 
I
S
 
H
I
 
R
A
 
A
H
 
H
A
 
V
T
 
V
M
 
M
L
 
L
G
 
T
R
 
E
V
 
Q
G
 
G
V
 
I
I
 
L
S
 
T
P
 
V
E
 
E
E
 
E
A
 
S
G
 
A
Q
 
T
I
 
I
V
 
L
E
 
S
G
 
G
L
 
L
R
 
A
E
 
Q
I
 
V
L
 
-
K
 
-
E
 
-
I
 
-
E
 
-
E
 
-
G
 
-
N
 
-
V
 
-
E
 
-
F
 
D
D
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
T
D
 
D
-
 
G
-
 
S
-
 
L
-
 
R
I
 
T
H
 
Y
M
 
L
N
 
P
V
 
Y
E
 
E
Q
 
A
L
 
A
L
 
L
T
 
K
A
 
R
K
 
T
I
 
I
G
 
G
A
 
S
V
 
V
G
 
A
K
 
G
K
 
K
L
 
M
H
 
H
T
 
I
A
 
G
R
 
R
S
 
S
R
 
R
N
 
N
D
 
D
Q
 
L
V
 
A
A
 
N
V
 
A
D
 
G
I
 
K
R
 
R
M
 
M
Y
 
F
L
 
L
K
 
R
D
 
D
E
 
Q
I
 
L
K
 
L
E
 
R
I
 
T
R
 
I
S
 
E
Q
 
A
L
 
V
R
 
I
E
 
G
L
 
Y
V
 
R
E
 
E
T
 
A
L
 
V
L
 
V
N
 
H
L
 
K
A
 
A
E
 
A
Q
 
D
H
 
H
L
 
L
S
 
D
T
 
T
V
 
V
M
 
M
P
 
V
G
 
V
Y
 
Y
T
 
T
H
 
Q
M
 
R
Q
 
K
R
 
E
A
 
A
Q
 
Q
P
 
P
I
 
I
T
 
T
L
 
L
S
 
G
H
 
H
H
 
Y
L
 
L
M
 
M
A
 
A
Y
 
I
V
 
S
Q
 
E
M
 
N
F
 
L
L
 
A
R
 
K
D
 
N
M
 
L
D
 
D
R
 
R
L
 
Y
A
 
R
D
 
E
C
 
L
Y
 
Y
R
 
A
R
 
R
T
 
I
D
 
N
V
 
L
M
 
C
P
 
P
L
 
L
G
 
G
S
 
A
G
 
A
A
 
A
L
 
T
A
 
A
G
 
G
T
 
T
T
 
G
F
 
W
P
 
P
L
 
L
D
 
N
R
 
R
E
 
D
Y
 
R
T
 
T
A
 
S
E
 
A
L
 
L
L
 
L
G
 
G
F
 
F
A
 
D
A
 
G
V
 
L
S
 
V
D
 
V
N
 
N
S
 
S
L
 
I
D
 
E
A
 
G
V
 
V
S
 
A
D
 
G
R
 
W
D
 
D
F
 
H
A
 
V
V
 
A
E
 
E
F
 
H
C
 
A
A
 
F
A
 
V
S
 
N
S
 
A
L
 
V
I
 
F
M
 
L
M
 
S
H
 
G
L
 
L
S
 
S
R
 
R
F
 
L
C
 
A
E
 
S
E
 
E
I
 
I
I
 
Q
L
 
L
W
 
W
A
 
S
T
 
T
G
 
D
E
 
E
F
 
Y
A
 
Q
F
 
V
I
 
A
E
 
E
L
 
L
D
 
D
D
 
A
A
 
S
Y
 
F
S
 
A
T
 
G
G
 
T
S
|
S
S
|
S
I
 
I
M
|
M
P
 
P
Q
 
Q
K
|
K
K
 
K
N
|
N
P
 
P
D
|
D
V
 
S
A
 
L
E
 
E
L
x
R
I
 
S
R
 
R
G
 
K
K
 
A
T
 
A
G
 
F
R
 
A
V
 
A
Y
 
M
G
 
G
D
 
P
L
 
L
L
 
V
G
 
G
L
 
I
L
 
L
T
 
T
M
 
S
L
 
L
K
 
N
G
 
A
L
 
I
P
 
E
M
 
Y
A
 
Q
Y
 
Y
N
 
S
K
 
A
D
 
A
M
 
R
Q
 
V
E
 
E
-
 
L
-
 
E
-
 
P
-
 
R
D
 
S
K
 
I
E
 
D
A
 
A
L
 
L
F
 
I
D
 
A
A
 
A
I
 
T
D
 
H
T
 
A
V
 
M
K
 
T
G
 
G
C
 
V
L
 
V
L
 
R
V
 
T
F
 
L
R
 
H
P
 
P
M
 
-
V
 
-
A
 
-
T
 
-
M
 
-
T
 
-
V
 
-
R
 
N
K
 
K
E
 
E
N
 
R
M
 
M
A
 
R
G
 
Q
A
 
Y
A
 
A
R
 
A
G
 
E
G
 
N
F
 
Y
T
 
S
N
 
T
A
 
M
T
 
T
D
 
D
V
 
L
A
 
T
D
 
D
Y
 
M
L
 
L
A
 
V
K
 
R
K
 
R
-
 
V
G
 
G
V
 
I
P
 
D
F
 
Y
R
 
R
E
 
E
A
 
A
H
 
H
E
 
E
V
 
I
V
 
V
G
 
A
K
 
H
A
 
V
V
 
V
F
 
I
Y
 
T
C
 
A
L
 
I
Q
 
E
H
 
K
Q
 
G
K
 
I
N
 
K
L
 
A
E
 
N
A
 
K
L
 
I
T
 
G
L
 
L
E
 
D
E
 
L
Y
 
V
Q
 
Q
A
 
E
L
 
A
S
 
A
P
 
V
A
 
A
-
 
Q
-
 
T
-
 
G
-
 
A
-
 
G
-
 
I
-
 
N
-
 
V
F
 
S
A
 
A
E
 
D
D
 
D
I
 
I
Y
 
K
A
 
D
A
 
A
I
 
L
G
 
D
V
 
P
E
 
W
Y
 
Q
C
 
N
A
 
V
A
 
L
A
 
R
R
 
R
K
 
E
V
 
G
R
 
K
G
 
G
G
 
M
P
 
P
A
 
A
P
 
P
E
 
M
A
 
S
V
 
V
Q
 
K
Q
 
A
A
 
S
I
 
I
G
 
D
V
 
D
A
 
A
K
 
M
A
 
A
R
 
E
L
 
L
R
 
H
E
 
K

Sites not aligning to the query:

6g3gA Crystal structure of edds lyase in complex with succinate (see paper)
32% identity, 96% coverage: 19:458/459 of query aligns to 23:463/497 of 6g3gA

query
sites
6g3gA
D
 
D
F
 
F
H
 
D
S
 
A
S
 
A
-
 
A
I
 
L
S
 
T
F
 
L
D
 
T
Q
 
S
R
 
A
L
 
V
Y
 
F
K
 
P
Q
 
Y
D
 
D
I
 
S
Q
 
Q
G
 
I
S
 
H
I
 
R
A
 
A
H
 
H
A
 
V
T
 
V
M
 
M
L
 
L
G
 
T
R
 
E
V
 
Q
G
 
G
V
 
I
I
 
L
S
 
T
P
 
V
E
 
E
E
 
E
A
 
S
G
 
A
Q
 
T
I
 
I
V
 
L
E
 
S
G
 
G
L
 
L
R
 
A
E
 
Q
I
 
V
L
 
-
K
 
-
E
 
-
I
 
-
E
 
-
E
 
-
G
 
-
N
 
-
V
 
-
E
 
-
F
 
D
D
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
T
D
 
D
-
 
G
-
 
S
-
 
L
-
 
R
I
 
T
H
 
Y
M
 
L
N
 
P
V
 
Y
E
 
E
Q
 
A
L
 
A
L
 
L
T
 
K
A
 
R
K
 
T
I
 
I
G
 
G
A
 
S
V
 
V
G
 
A
K
 
G
K
 
K
L
 
M
H
 
H
T
 
I
A
 
G
R
 
R
S
 
S
R
 
R
N
 
N
D
 
D
Q
 
L
V
 
A
A
 
N
V
 
A
D
 
G
I
 
K
R
 
R
M
 
M
Y
 
F
L
 
L
K
 
R
D
 
D
E
 
Q
I
 
L
K
 
L
E
 
R
I
 
T
R
 
I
S
 
E
Q
 
A
L
 
V
R
 
I
E
 
G
L
 
Y
V
 
R
E
 
E
T
 
A
L
 
V
L
 
V
N
 
H
L
 
K
A
 
A
E
 
A
Q
 
D
H
 
H
L
 
L
S
 
D
T
 
T
V
 
V
M
 
M
P
 
V
G
 
V
Y
 
Y
T
 
T
H
 
Q
M
 
R
Q
 
K
R
 
E
A
 
A
Q
 
Q
P
 
P
I
 
I
T
 
T
L
 
L
S
 
G
H
 
H
H
 
Y
L
 
L
M
 
M
A
 
A
Y
 
I
V
 
S
Q
 
E
M
 
N
F
 
L
L
 
A
R
 
K
D
 
N
M
 
L
D
 
D
R
 
R
L
 
Y
A
 
R
D
 
E
C
 
L
Y
 
Y
R
 
A
R
 
R
T
 
I
D
 
N
V
 
L
M
 
C
P
 
P
L
 
L
G
 
G
S
 
A
G
 
A
A
 
A
L
 
T
A
 
A
G
 
G
T
 
T
T
 
G
F
 
W
P
 
P
L
 
L
D
 
N
R
 
R
E
 
D
Y
 
R
T
 
T
A
 
S
E
 
A
L
 
L
L
 
L
G
 
G
F
 
F
A
 
D
A
 
G
V
 
L
S
 
V
D
 
V
N
 
N
S
 
S
L
 
I
D
 
E
A
 
G
V
 
V
S
 
A
D
 
G
R
 
W
D
 
D
F
 
H
A
 
V
V
 
A
E
 
E
F
 
H
C
 
A
A
 
F
A
 
V
S
 
N
S
 
A
L
 
V
I
 
F
M
 
L
M
 
S
H
 
G
L
 
L
S
 
S
R
 
R
F
 
L
C
 
A
E
 
S
E
 
E
I
 
I
I
 
Q
L
 
L
W
 
W
A
 
S
T
 
T
G
 
D
E
 
E
F
 
Y
A
 
Q
F
 
V
I
 
A
E
 
E
L
 
L
D
 
D
D
 
A
A
 
S
Y
 
F
S
 
A
T
 
G
G
 
T
S
|
S
S
|
S
I
 
I
M
|
M
P
 
P
Q
 
Q
K
|
K
K
 
K
N
|
N
P
 
P
D
 
D
V
 
S
A
 
L
E
 
E
L
 
R
I
 
S
R
 
R
G
 
K
K
 
A
T
 
A
G
 
F
R
 
A
V
 
A
Y
 
M
G
 
G
D
 
P
L
 
L
L
 
V
G
 
G
L
 
I
L
 
L
T
 
T
M
 
S
L
 
L
K
 
N
G
 
A
L
 
I
P
 
E
M
 
Y
A
 
Q
Y
 
Y
N
 
S
K
 
A
D
 
A
M
 
R
Q
 
V
E
 
E
-
 
L
-
 
E
-
 
P
-
 
R
D
 
S
K
 
I
E
 
D
A
 
A
L
 
L
F
 
I
D
 
A
A
 
A
I
 
T
D
 
H
T
 
A
V
 
M
K
 
T
G
 
G
C
 
V
L
 
V
L
 
R
V
 
T
F
 
L
R
 
H
P
 
P
M
 
-
V
 
-
A
 
-
T
 
-
M
 
-
T
 
-
V
 
-
R
 
N
K
 
K
E
 
E
N
 
R
M
 
M
A
 
R
G
 
Q
A
 
Y
A
 
A
R
 
A
G
 
E
G
 
N
F
 
Y
T
 
S
N
 
T
A
 
M
T
 
T
D
 
D
V
 
L
A
 
T
D
 
D
Y
 
M
L
 
L
A
 
V
K
 
R
K
 
R
-
 
V
G
 
G
V
 
I
P
 
D
F
 
Y
R
 
R
E
 
E
A
 
A
H
 
H
E
 
E
V
 
I
V
 
V
G
 
A
K
 
H
A
 
V
V
 
V
F
 
I
Y
 
T
C
 
A
L
 
I
Q
 
E
H
 
K
Q
 
G
K
 
I
N
 
K
L
 
A
E
 
N
A
 
K
L
 
I
T
 
G
L
 
L
E
 
D
E
 
L
Y
 
V
Q
 
Q
A
 
E
L
 
A
S
 
A
P
 
V
A
 
A
-
 
Q
-
 
T
-
 
G
-
 
A
-
 
G
-
 
I
-
 
N
-
 
V
F
 
S
A
 
A
E
 
D
D
 
D
I
 
I
Y
 
K
A
 
D
A
 
A
I
 
L
G
 
D
V
 
P
E
 
W
Y
 
Q
C
 
N
A
 
V
A
 
L
A
 
R
R
 
R
K
 
E
V
 
G
R
 
K
G
 
G
G
 
M
P
 
P
A
 
A
P
 
P
E
 
M
A
 
S
V
 
V
Q
 
K
Q
 
A
A
 
S
I
 
I
G
 
D
V
 
D
A
 
A
K
 
M
A
 
A
R
 
E
L
 
L
R
 
H
E
 
K

6g3fA Crystal structure of edds lyase in complex with fumarate (see paper)
32% identity, 96% coverage: 19:458/459 of query aligns to 23:463/497 of 6g3fA

query
sites
6g3fA
D
 
D
F
 
F
H
 
D
S
 
A
S
 
A
-
 
A
I
 
L
S
 
T
F
 
L
D
 
T
Q
 
S
R
 
A
L
 
V
Y
 
F
K
 
P
Q
 
Y
D
 
D
I
 
S
Q
 
Q
G
 
I
S
 
H
I
 
R
A
 
A
H
 
H
A
 
V
T
 
V
M
 
M
L
 
L
G
 
T
R
 
E
V
 
Q
G
 
G
V
 
I
I
 
L
S
 
T
P
 
V
E
 
E
E
 
E
A
 
S
G
 
A
Q
 
T
I
 
I
V
 
L
E
 
S
G
 
G
L
 
L
R
 
A
E
 
Q
I
 
V
L
 
-
K
 
-
E
 
-
I
 
-
E
 
-
E
 
-
G
 
-
N
 
-
V
 
-
E
 
-
F
 
D
D
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
T
D
 
D
-
 
G
-
 
S
-
 
L
-
 
R
I
 
T
H
 
Y
M
 
L
N
 
P
V
 
Y
E
 
E
Q
 
A
L
 
A
L
 
L
T
 
K
A
 
R
K
 
T
I
 
I
G
 
G
A
 
S
V
 
V
G
 
A
K
 
G
K
 
K
L
 
M
H
 
H
T
 
I
A
 
G
R
 
R
S
 
S
R
 
R
N
 
N
D
 
D
Q
 
L
V
 
A
A
 
N
V
 
A
D
 
G
I
 
K
R
 
R
M
 
M
Y
 
F
L
 
L
K
 
R
D
 
D
E
 
Q
I
 
L
K
 
L
E
 
R
I
 
T
R
 
I
S
 
E
Q
 
A
L
 
V
R
 
I
E
 
G
L
 
Y
V
 
R
E
 
E
T
 
A
L
 
V
L
 
V
N
 
H
L
 
K
A
 
A
E
 
A
Q
 
D
H
 
H
L
 
L
S
 
D
T
 
T
V
 
V
M
 
M
P
 
V
G
 
V
Y
 
Y
T
 
T
H
 
Q
M
 
R
Q
 
K
R
 
E
A
 
A
Q
 
Q
P
 
P
I
 
I
T
 
T
L
 
L
S
 
G
H
 
H
H
 
Y
L
 
L
M
 
M
A
 
A
Y
 
I
V
 
S
Q
 
E
M
 
N
F
 
L
L
 
A
R
 
K
D
 
N
M
 
L
D
 
D
R
 
R
L
 
Y
A
 
R
D
 
E
C
 
L
Y
 
Y
R
 
A
R
 
R
T
 
I
D
 
N
V
 
L
M
 
C
P
 
P
L
 
L
G
 
G
S
 
A
G
 
A
A
 
A
L
 
T
A
 
A
G
 
G
T
 
T
T
 
G
F
 
W
P
 
P
L
 
L
D
 
N
R
 
R
E
 
D
Y
 
R
T
 
T
A
 
S
E
 
A
L
 
L
L
 
L
G
 
G
F
 
F
A
 
D
A
 
G
V
 
L
S
 
V
D
 
V
N
 
N
S
 
S
L
 
I
D
 
E
A
 
G
V
 
V
S
 
A
D
 
G
R
 
W
D
 
D
F
 
H
A
 
V
V
 
A
E
 
E
F
 
H
C
 
A
A
 
F
A
 
V
S
 
N
S
 
A
L
 
V
I
 
F
M
 
L
M
 
S
H
 
G
L
 
L
S
 
S
R
 
R
F
 
L
C
 
A
E
 
S
E
 
E
I
 
I
I
 
Q
L
 
L
W
 
W
A
 
S
T
 
T
G
 
D
E
 
E
F
 
Y
A
 
Q
F
 
V
I
 
A
E
 
E
L
 
L
D
 
D
D
 
A
A
 
S
Y
 
F
S
 
A
T
 
G
G
 
T
S
|
S
S
|
S
I
 
I
M
|
M
P
 
P
Q
 
Q
K
|
K
K
 
K
N
|
N
P
 
P
D
 
D
V
 
S
A
 
L
E
 
E
L
 
R
I
 
S
R
 
R
G
 
K
K
 
A
T
 
A
G
 
F
R
 
A
V
 
A
Y
 
M
G
 
G
D
 
P
L
 
L
L
 
V
G
 
G
L
 
I
L
 
L
T
 
T
M
 
S
L
 
L
K
 
N
G
 
A
L
 
I
P
 
E
M
 
Y
A
 
Q
Y
 
Y
N
 
S
K
 
A
D
 
A
M
 
R
Q
 
V
E
 
E
-
 
L
-
 
E
-
 
P
-
 
R
D
 
S
K
 
I
E
 
D
A
 
A
L
 
L
F
 
I
D
 
A
A
 
A
I
 
T
D
 
H
T
 
A
V
 
M
K
 
T
G
 
G
C
 
V
L
 
V
L
 
R
V
 
T
F
 
L
R
 
H
P
 
P
M
 
-
V
 
-
A
 
-
T
 
-
M
 
-
T
 
-
V
 
-
R
 
N
K
 
K
E
 
E
N
 
R
M
 
M
A
 
R
G
 
Q
A
 
Y
A
 
A
R
 
A
G
 
E
G
 
N
F
 
Y
T
 
S
N
 
T
A
 
M
T
 
T
D
 
D
V
 
L
A
 
T
D
 
D
Y
 
M
L
 
L
A
 
V
K
 
R
K
 
R
-
 
V
G
 
G
V
 
I
P
 
D
F
 
Y
R
 
R
E
 
E
A
 
A
H
 
H
E
 
E
V
 
I
V
 
V
G
 
A
K
 
H
A
 
V
V
 
V
F
 
I
Y
 
T
C
 
A
L
 
I
Q
 
E
H
 
K
Q
 
G
K
 
I
N
 
K
L
 
A
E
 
N
A
 
K
L
 
I
T
 
G
L
 
L
E
 
D
E
 
L
Y
 
V
Q
 
Q
A
 
E
L
 
A
S
 
A
P
 
V
A
 
A
-
 
Q
-
 
T
-
 
G
-
 
A
-
 
G
-
 
I
-
 
N
-
 
V
F
 
S
A
 
A
E
 
D
D
 
D
I
 
I
Y
 
K
A
 
D
A
 
A
I
 
L
G
 
D
V
 
P
E
 
W
Y
 
Q
C
 
N
A
 
V
A
 
L
A
 
R
R
 
R
K
 
E
V
 
G
R
 
K
G
 
G
G
 
M
P
 
P
A
 
A
P
 
P
E
 
M
A
 
S
V
 
V
Q
 
K
Q
 
A
A
 
S
I
 
I
G
 
D
V
 
D
A
 
A
K
 
M
A
 
A
R
 
E
L
 
L
R
 
H
E
 
K

3r6qA A triclinic-lattice structure of aspartase from bacillus sp. Ym55-1 (see paper)
29% identity, 39% coverage: 128:308/459 of query aligns to 149:345/462 of 3r6qA

query
sites
3r6qA
I
 
V
R
 
L
S
 
S
Q
 
L
L
 
L
R
 
N
E
 
Q
L
 
L
V
 
I
E
 
E
T
 
T
-
 
T
-
 
K
-
 
Y
-
 
M
-
 
Q
-
 
Q
-
 
E
L
 
F
L
 
M
N
 
K
L
 
K
A
 
A
E
 
D
Q
 
E
H
 
F
L
 
A
S
 
G
T
 
V
V
 
I
M
 
K
P
 
M
G
 
G
Y
 
R
T
 
T
H
|
H
M
 
L
Q
 
Q
R
 
D
A
 
A
Q
 
V
P
 
P
I
 
I
T
 
L
L
 
L
S
 
G
H
 
Q
H
 
E
L
 
F
M
 
E
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
Q
 
R
M
 
V
F
 
I
L
 
A
R
 
R
D
 
D
M
 
I
D
 
E
R
 
R
L
 
I
A
 
A
D
 
N
C
 
T
Y
 
-
R
 
-
R
 
R
T
 
N
D
 
N
V
 
L
M
 
Y
P
 
D
L
 
I
G
 
N
S
 
M
G
 
G
A
 
A
L
 
T
A
 
A
-
 
V
G
 
G
T
 
T
T
 
G
F
 
L
P
 
N
L
 
A
D
 
D
R
 
P
E
 
E
Y
 
Y
-
 
I
-
 
S
-
 
I
-
 
V
T
 
T
A
 
E
E
 
H
L
 
L
L
 
A
G
 
K
F
 
F
A
 
S
A
 
G
-
 
H
-
 
P
-
 
L
-
 
R
V
 
S
S
 
A
D
 
Q
N
 
H
S
 
L
L
 
V
D
 
D
A
 
A
V
 
T
S
 
Q
D
 
N
R
 
T
D
 
D
F
 
C
A
 
Y
V
 
T
E
 
E
F
 
V
C
 
S
A
 
S
A
 
A
S
 
L
S
 
K
L
 
V
I
 
C
M
 
M
M
 
I
H
 
N
L
 
M
S
 
S
R
 
K
F
 
I
C
 
A
E
 
N
E
 
D
I
 
L
I
 
R
L
 
L
W
 
M
A
 
A
T
 
S
G
 
G
E
 
P
F
 
R
A
 
A
F
 
G
I
 
L
E
 
S
-
 
E
-
 
I
L
 
V
D
 
L
D
 
P
A
 
A
Y
 
R
S
 
Q
T
 
P
G
 
G
S
|
S
S
 
S
I
 
I
M
 
M
P
 
P
Q
 
G
K
|
K
K
 
V
N
 
N
P
 
P
D
 
V
V
 
M
A
 
P
E
|
E
L
 
V
I
 
M
R
 
N
G
 
Q
K
 
V
T
 
A
G
 
F
R
 
Q
V
 
V
Y
 
F
G
 
G
D
 
N
L
 
D
L
 
L
G
 
T
L
 
I
L
 
T
T
 
S

Sites not aligning to the query:

3r6vG Crystal structure of aspartase from bacillus sp. Ym55-1 with bound l- aspartate (see paper)
29% identity, 39% coverage: 128:308/459 of query aligns to 150:346/463 of 3r6vG

query
sites
3r6vG
I
 
V
R
 
L
S
 
S
Q
 
L
L
 
L
R
 
N
E
 
Q
L
 
L
V
 
I
E
 
E
T
 
T
-
 
T
-
 
K
-
 
Y
-
 
M
-
 
Q
-
 
Q
-
 
E
L
 
F
L
 
M
N
 
K
L
 
K
A
 
A
E
 
D
Q
 
E
H
 
F
L
 
A
S
 
G
T
 
V
V
 
I
M
 
K
P
 
M
G
 
G
Y
 
R
T
 
T
H
|
H
M
 
L
Q
 
Q
R
 
D
A
 
A
Q
 
V
P
 
P
I
 
I
T
 
L
L
 
L
S
 
G
H
 
Q
H
 
E
L
 
F
M
 
E
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
Q
 
R
M
 
V
F
 
I
L
 
A
R
 
R
D
 
D
M
 
I
D
 
E
R
 
R
L
 
I
A
 
A
D
 
N
C
 
T
Y
 
-
R
 
-
R
 
R
T
 
N
D
 
N
V
 
L
M
 
Y
P
 
D
L
 
I
G
 
N
S
 
M
G
 
G
A
 
A
L
 
T
A
 
A
-
 
V
G
 
G
T
 
T
T
 
G
F
 
L
P
 
N
L
 
A
D
 
D
R
 
P
E
 
E
Y
 
Y
-
 
I
-
 
S
-
 
I
-
 
V
T
 
T
A
 
E
E
 
H
L
 
L
L
 
A
G
 
K
F
 
F
A
 
S
A
 
G
-
 
H
-
 
P
-
 
L
-
 
R
V
 
S
S
 
A
D
 
Q
N
 
H
S
 
L
L
 
V
D
 
D
A
 
A
V
 
T
S
 
Q
D
 
N
R
 
T
D
 
D
F
 
C
A
 
Y
V
 
T
E
 
E
F
 
V
C
 
S
A
 
S
A
 
A
S
 
L
S
 
K
L
 
V
I
 
C
M
 
M
M
 
I
H
 
N
L
 
M
S
 
S
R
 
K
F
 
I
C
 
A
E
 
N
E
 
D
I
 
L
I
 
R
L
 
L
W
 
M
A
 
A
T
 
S
G
 
G
E
 
P
F
 
R
A
 
A
F
 
G
I
 
L
E
 
S
-
 
E
-
 
I
L
 
V
D
 
L
D
 
P
A
 
A
Y
 
R
S
 
Q
T
 
P
G
|
G
S
|
S
S
|
S
I
 
I
M
 
M
P
 
P
Q
 
G
K
|
K
K
 
V
N
 
N
P
 
P
D
 
V
V
 
M
A
 
P
E
|
E
L
 
V
I
 
M
R
 
N
G
 
Q
K
 
V
T
 
A
G
 
F
R
 
Q
V
 
V
Y
 
F
G
 
G
D
 
N
L
 
D
L
 
L
G
 
T
L
 
I
L
 
T
T
 
S

Q9LCC6 Aspartate ammonia-lyase; Aspartase; EC 4.3.1.1 from Bacillus sp. (see 3 papers)
29% identity, 39% coverage: 128:308/459 of query aligns to 153:349/468 of Q9LCC6

query
sites
Q9LCC6
I
 
V
R
 
L
S
 
S
Q
 
L
L
 
L
R
 
N
E
 
Q
L
 
L
V
 
I
E
 
E
T
 
T
-
 
T
-
 
K
-
 
Y
-
 
M
-
 
Q
-
 
Q
-
 
E
L
 
F
L
 
M
N
 
K
L
 
K
A
 
A
E
 
D
Q
 
E
H
 
F
L
 
A
S
 
G
T
 
V
V
 
I
M
x
K
P
 
M
G
 
G
Y
 
R
T
|
T
H
|
H
M
 
L
Q
 
Q
R
 
D
A
 
A
Q
 
V
P
 
P
I
 
I
T
 
L
L
 
L
S
 
G
H
 
Q
H
 
E
L
 
F
M
 
E
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
Q
 
R
M
 
V
F
 
I
L
 
A
R
 
R
D
 
D
M
 
I
D
 
E
R
 
R
L
 
I
A
 
A
D
 
N
C
 
T
Y
 
-
R
 
-
R
 
R
T
 
N
D
 
N
V
 
L
M
 
Y
P
 
D
L
 
I
G
 
N
S
 
M
G
 
G
A
 
A
L
 
T
A
 
A
-
 
V
G
 
G
T
 
T
T
 
G
F
 
L
P
 
N
L
 
A
D
 
D
R
 
P
E
 
E
Y
 
Y
-
 
I
-
 
S
-
 
I
-
 
V
T
 
T
A
 
E
E
 
H
L
 
L
L
 
A
G
 
K
F
 
F
A
 
S
A
 
G
-
 
H
-
 
P
-
 
L
-
 
R
V
 
S
S
 
A
D
 
Q
N
 
H
S
 
L
L
 
V
D
 
D
A
 
A
V
 
T
S
 
Q
D
 
N
R
 
T
D
 
D
F
 
C
A
 
Y
V
 
T
E
 
E
F
 
V
C
 
S
A
 
S
A
 
A
S
 
L
S
 
K
L
 
V
I
 
C
M
 
M
M
 
I
H
 
N
L
 
M
S
 
S
R
 
K
F
 
I
C
 
A
E
 
N
E
 
D
I
 
L
I
 
R
L
 
L
W
 
M
A
 
A
T
 
S
G
 
G
E
 
P
F
 
R
A
 
A
F
 
G
I
 
L
E
 
S
-
 
E
-
 
I
L
 
V
D
 
L
D
 
P
A
 
A
Y
 
R
S
 
Q
T
 
P
G
 
G
S
|
S
S
|
S
I
|
I
M
|
M
P
|
P
Q
 
G
K
|
K
K
 
V
N
|
N
P
 
P
D
 
V
V
 
M
A
 
P
E
 
E
L
 
V
I
 
M
R
 
N
G
 
Q
K
 
V
T
 
A
G
 
F
R
 
Q
V
 
V
Y
 
F
G
 
G
D
 
N
L
 
D
L
 
L
G
 
T
L
 
I
L
 
T
T
 
S

Sites not aligning to the query:

P12047 Adenylosuccinate lyase; ASL; Adenylosuccinase; ASase; Glutamyl--tRNA ligase regulatory factor; EC 4.3.2.2 from Bacillus subtilis (strain 168) (see paper)
25% identity, 73% coverage: 22:356/459 of query aligns to 11:341/431 of P12047

query
sites
P12047
S
 
S
S
 
A
I
 
I
S
 
W
F
 
T
D
 
D
Q
 
E
R
 
N
L
 
R
Y
 
F
K
 
Q
Q
 
A
D
 
W
I
 
L
Q
 
E
G
 
V
S
 
E
I
 
I
A
 
L
H
 
A
A
 
C
T
 
E
M
 
A
L
 
W
G
 
A
R
 
E
V
 
L
G
 
G
V
 
V
I
 
I
S
 
P
P
 
K
E
 
E
E
 
D
A
 
V
G
 
K
Q
 
V
I
 
M
V
 
R
E
 
E
G
 
N
-
 
A
-
 
S
-
 
F
-
 
D
L
 
I
R
 
N
E
 
R
I
 
I
L
 
L
K
 
-
E
 
E
I
 
I
E
 
E
E
 
K
G
 
-
N
 
D
V
 
T
E
 
R
F
 
H
D
 
D
V
 
V
A
 
V
A
 
A
E
 
-
D
 
-
I
 
-
H
 
-
M
 
-
N
 
-
V
 
F
E
 
T
Q
 
R
L
 
A
L
 
V
T
 
S
A
 
E
K
 
S
I
 
L
G
 
G
A
 
E
V
 
E
G
 
R
K
 
K
K
 
W
L
 
V
H
|
H
T
 
Y
A
 
G
R
 
L
S
 
T
R
 
S
N
 
T
D
 
D
Q
 
V
V
 
V
A
 
D
V
 
T
D
 
A
I
 
L
R
 
S
M
 
Y
Y
 
L
L
 
L
K
 
K
D
 
Q
E
 
A
I
 
N
K
 
D
E
 
I
I
 
L
R
 
L
S
 
K
Q
 
D
L
 
L
R
 
E
E
 
R
L
 
F
V
 
V
E
 
D
T
 
I
L
 
I
L
 
K
N
 
E
L
 
K
A
 
A
E
 
K
Q
 
E
H
 
H
L
 
K
S
 
Y
T
 
T
V
 
V
M
 
M
P
 
M
G
 
G
Y
 
R
T
 
T
H
|
H
M
 
G
Q
 
V
R
 
H
A
 
A
Q
 
E
P
 
P
I
 
T
T
 
T
L
 
F
S
 
G
H
 
L
H
 
K
L
 
L
M
 
A
A
 
L
Y
 
W
V
 
H
Q
 
E
M
 
E
F
 
M
L
 
K
R
 
R
D
 
N
M
 
L
D
 
E
R
 
R
L
 
F
A
 
K
D
 
Q
C
 
A
Y
 
K
R
 
A
R
 
G
T
 
I
D
 
E
V
 
V
M
 
G
P
 
K
L
 
I
G
 
-
S
 
S
G
 
G
A
 
A
L
 
V
A
 
G
-
 
T
-
 
Y
G
 
A
T
 
N
T
 
I
F
 
D
P
 
P
L
 
F
D
 
V
R
 
E
E
 
Q
Y
 
Y
T
 
V
A
 
C
E
 
E
L
 
K
L
 
L
G
 
G
F
 
L
-
 
K
-
 
A
A
 
A
A
 
P
V
 
I
S
 
S
D
 
T
N
x
Q
S
 
T
L
 
L
D
 
-
A
 
-
V
 
-
S
 
-
D
 
Q
R
 
R
D
 
D
F
 
R
A
 
H
V
 
A
E
 
D
F
 
Y
C
 
M
A
 
A
A
 
T
S
 
L
S
 
A
L
 
L
I
 
I
M
 
A
M
 
T
H
 
S
L
 
I
S
 
E
R
 
K
F
 
F
C
 
A
E
 
V
E
 
E
I
 
I
I
 
R
L
 
G
W
 
L
A
 
Q
T
 
K
G
 
S
E
 
E
F
 
T
A
 
R
F
 
-
I
 
-
E
 
E
L
 
V
D
 
E
D
 
E
A
 
F
Y
 
F
S
 
A
-
 
K
-
 
G
-
 
Q
T
 
K
G
 
G
S
 
S
S
 
S
I
 
A
M
 
M
P
 
P
Q
 
H
K
 
K
K
 
R
N
|
N
P
 
P
D
 
I
V
 
G
A
 
S
E
 
E
L
 
N
I
 
M
R
 
T
G
 
G
K
 
M
T
 
A
G
 
R
R
 
V
V
 
I
Y
 
R
G
 
G
D
 
-
L
 
-
L
 
-
G
 
Y
L
 
M
L
 
M
T
 
T
M
 
A
L
 
Y
K
 
E
G
 
N
L
 
V
P
 
P
M
 
L
A
 
W
Y
 
H
N
 
E
K
x
R
D
 
D
M
 
I
Q
 
S
E
 
H
-
 
S
-
 
S
-
 
A
D
 
E
K
 
R
E
 
I
A
 
I
L
 
L
F
 
P
D
 
D
A
 
A
I
 
T
D
 
I
T
 
A
V
 
L
K
 
N
G
 
Y
C
 
M
L
 
L
L
 
N
V
 
R
F
 
F
R
 
S
P
 
N
M
 
I
V
 
V
A
 
K
T
 
N
M
 
L
T
 
T
V
 
V
R
 
F
K
 
P
E
 
E
N
 
N
M
 
M

2x75A Staphylococcus aureus adenylosuccinate lyase (see paper)
24% identity, 73% coverage: 22:356/459 of query aligns to 10:340/427 of 2x75A

query
sites
2x75A
S
 
S
S
 
N
I
 
I
S
 
W
F
 
T
D
 
D
Q
 
Q
R
 
N
L
 
R
Y
 
Y
K
 
E
Q
 
A
D
 
W
I
 
L
Q
 
E
G
 
V
S
 
E
I
 
I
A
 
L
H
 
A
A
 
C
T
 
E
M
 
A
L
 
W
G
 
S
R
 
E
V
 
L
G
 
G
V
 
H
I
 
I
S
 
P
P
 
K
E
 
A
E
 
D
A
 
V
G
 
Q
Q
 
K
I
 
I
V
 
R
E
 
Q
G
 
N
L
 
A
R
 
K
-
 
V
-
 
N
-
 
V
E
 
E
I
 
R
L
 
A
K
 
Q
E
 
E
I
 
I
E
 
E
E
 
Q
G
 
-
N
 
E
V
 
T
E
 
R
F
x
H
D
 
D
V
 
V
A
 
V
A
 
A
E
 
-
D
 
-
I
 
-
H
 
-
M
 
-
N
 
-
V
 
F
E
 
T
Q
 
R
L
 
Q
L
 
V
T
 
S
A
 
E
K
 
T
I
 
L
G
 
G
A
 
E
V
 
E
G
 
R
K
 
K
K
 
W
L
 
V
H
 
H
T
 
Y
A
 
G
R
 
L
S
 
T
R
 
S
N
 
T
D
 
D
Q
 
V
V
 
V
A
 
D
V
 
T
D
 
A
I
 
L
R
 
S
M
 
F
Y
 
V
L
 
I
K
 
K
D
 
Q
E
 
A
I
 
N
K
 
D
E
 
I
I
 
I
R
 
E
S
 
K
Q
 
D
L
 
L
R
 
E
E
 
R
L
 
F
V
 
I
E
 
D
T
 
V
L
 
L
L
 
A
N
 
E
L
 
K
A
 
A
E
 
K
Q
 
N
H
 
Y
L
 
K
S
 
Y
T
 
T
V
 
L
M
 
M
P
 
M
G
 
G
Y
 
R
T
|
T
H
|
H
M
 
G
Q
 
V
R
 
H
A
 
A
Q
 
E
P
 
P
I
 
T
T
 
T
L
 
F
S
 
G
H
 
V
H
 
K
L
 
M
M
 
A
A
 
L
Y
 
W
V
 
Y
Q
 
T
M
 
E
F
 
M
L
 
Q
R
 
R
D
 
N
M
 
L
D
 
Q
R
 
R
L
 
F
A
 
K
D
 
Q
C
 
V
Y
 
R
R
 
E
R
 
E
T
 
I
D
 
E
V
 
V
M
 
G
P
 
K
L
 
M
G
 
S
S
 
G
G
 
A
A
 
V
L
 
G
A
 
T
G
 
F
T
 
A
T
 
N
F
 
I
P
 
P
L
 
P
D
 
E
R
 
I
E
 
E
-
 
S
Y
 
Y
T
 
V
A
 
C
E
 
K
L
 
H
L
 
L
G
 
G
F
 
I
-
 
G
-
 
T
A
 
A
A
 
P
V
 
V
S
 
S
D
 
T
N
 
Q
S
 
T
L
 
L
D
 
-
A
 
-
V
 
-
S
 
-
D
 
Q
R
 
R
D
 
D
F
 
R
A
 
H
V
 
A
E
 
Y
F
 
Y
C
 
I
A
 
A
A
 
T
S
 
L
S
 
A
L
 
L
I
 
I
M
 
A
M
 
T
H
 
S
L
 
L
S
 
E
R
 
K
F
 
F
C
 
A
E
 
V
E
 
E
I
 
I
I
 
R
L
 
N
W
 
L
A
 
Q
T
 
K
G
 
T
E
 
E
F
 
T
A
 
R
F
 
-
I
 
-
E
 
E
L
 
V
D
 
E
D
 
E
A
 
A
Y
 
F
S
 
A
-
 
K
-
 
G
-
 
Q
T
 
K
G
 
G
S
|
S
S
|
S
I
 
A
M
 
M
P
 
P
Q
 
H
K
|
K
K
 
R
N
 
N
P
 
P
D
 
I
V
 
G
A
 
S
E
|
E
L
x
N
I
 
I
R
 
T
G
 
G
K
 
I
T
 
S
G
 
R
R
 
V
V
 
I
Y
 
R
G
 
G
D
 
-
L
 
-
L
 
-
G
 
Y
L
 
I
L
 
T
T
 
T
M
 
A
L
 
Y
K
 
E
G
 
N
L
 
V
P
 
P
M
 
L
A
 
W
Y
 
H
N
 
E
K
 
R
D
 
D
M
 
I
Q
 
S
E
 
H
-
 
S
-
 
S
-
 
A
D
 
E
K
 
R
E
 
I
A
 
M
L
 
L
F
 
P
D
 
D
A
 
V
I
 
T
D
 
I
T
 
A
V
 
L
K
 
D
G
 
Y
C
 
A
L
 
L
L
 
N
V
 
R
F
 
F
R
 
T
P
 
N
M
 
I
V
 
V
A
 
D
T
 
R
M
 
L
T
 
T
V
 
V
R
 
F
K
 
E
E
 
D
N
 
N
M
 
M

Sites not aligning to the query:

4adlA Crystal structures of rv1098c in complex with malate (see paper)
25% identity, 47% coverage: 85:302/459 of query aligns to 101:335/459 of 4adlA

query
sites
4adlA
H
 
N
M
 
M
N
 
N
V
 
T
E
 
N
Q
 
E
L
 
V
L
 
I
T
 
A
A
 
S
K
 
I
I
 
A
G
 
A
A
 
K
V
 
G
G
 
G
K
 
V
K
 
T
L
 
L
H
 
H
T
 
P
-
 
N
-
 
D
-
 
D
-
 
V
-
 
N
-
 
M
A
 
S
R
 
Q
S
|
S
R
x
S
N
|
N
D
 
D
Q
 
T
V
 
F
A
 
P
V
 
T
D
 
A
I
 
T
R
 
H
M
 
I
Y
 
A
L
 
A
K
 
T
D
 
E
E
 
A
-
 
A
I
 
V
K
 
A
E
 
H
I
 
L
R
 
I
S
 
P
Q
 
A
L
 
L
R
 
Q
E
 
Q
L
 
L
V
 
H
E
 
D
T
 
A
L
 
L
L
 
A
N
 
A
L
 
K
A
 
A
E
 
L
Q
 
D
H
 
W
L
 
H
S
 
T
T
 
V
V
 
V
M
 
K
P
 
S
G
 
G
Y
 
R
T
|
T
H
|
H
M
 
L
Q
 
M
R
 
D
A
 
A
Q
 
V
P
 
P
I
 
V
T
 
T
L
 
L
S
 
G
H
 
Q
H
 
E
L
 
F
M
 
S
A
 
G
Y
 
Y
V
 
A
Q
 
R
M
 
Q
F
 
I
L
 
E
R
 
A
D
 
G
M
 
I
D
 
E
R
 
R
L
 
V
A
 
R
D
 
A
C
 
C
Y
 
L
R
 
P
R
 
R
T
 
L
D
 
G
V
 
E
M
 
L
P
 
A
L
 
I
G
 
G
S
 
G
G
 
T
A
 
A
L
 
V
A
 
G
-
 
T
G
 
G
T
 
L
T
 
N
F
 
A
P
 
P
L
 
D
D
 
D
-
 
F
-
 
G
R
 
V
E
 
R
Y
 
V
T
 
V
A
 
A
E
 
V
L
 
L
L
 
V
G
 
A
F
 
Q
A
 
T
A
 
G
V
 
L
S
 
S
D
 
E
-
 
L
-
 
R
-
 
T
-
 
A
-
 
A
N
 
N
S
 
S
L
 
F
D
 
E
A
 
A
V
 
Q
S
 
A
D
 
A
R
 
R
D
 
D
F
 
G
A
 
L
V
 
V
E
 
E
F
 
A
C
 
S
A
 
G
A
 
A
S
 
L
S
 
R
L
 
T
I
 
I
M
 
A
M
 
V
H
 
S
L
 
L
S
 
T
R
 
K
F
 
I
C
 
A
E
 
N
E
 
D
I
 
I
I
 
R
L
 
W
W
 
M
A
 
G
T
 
S
G
 
G
E
 
P
-
 
L
-
 
T
-
 
G
F
 
L
A
 
A
F
 
E
I
 
I
E
 
Q
L
 
L
D
 
P
D
 
D
A
 
-
Y
 
L
S
 
Q
T
 
P
G
 
G
S
|
S
S
|
S
I
 
I
M
 
M
P
 
P
Q
 
G
K
|
K
K
 
V
N
 
N
P
 
P
D
 
V
V
 
L
A
 
P
E
|
E
L
 
A
I
 
V
R
 
T
G
 
Q
K
 
V
T
 
A
G
 
A
R
 
Q
V
 
V
Y
 
I
G
 
G
D
 
N

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_013840426.1 NCBI__GCF_000215085.1:WP_013840426.1
MTKLWGGRFQKTTDHLVEDFHSSISFDQRLYKQDIQGSIAHATMLGRVGVISPEEAGQIV
EGLREILKEIEEGNVEFDVAAEDIHMNVEQLLTAKIGAVGKKLHTARSRNDQVAVDIRMY
LKDEIKEIRSQLRELVETLLNLAEQHLSTVMPGYTHMQRAQPITLSHHLMAYVQMFLRDM
DRLADCYRRTDVMPLGSGALAGTTFPLDREYTAELLGFAAVSDNSLDAVSDRDFAVEFCA
ASSLIMMHLSRFCEEIILWATGEFAFIELDDAYSTGSSIMPQKKNPDVAELIRGKTGRVY
GDLLGLLTMLKGLPMAYNKDMQEDKEALFDAIDTVKGCLLVFRPMVATMTVRKENMAGAA
RGGFTNATDVADYLAKKGVPFREAHEVVGKAVFYCLQHQKNLEALTLEEYQALSPAFAED
IYAAIGVEYCAAARKVRGGPAPEAVQQAIGVAKARLREI

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory