SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_013842893.1 NCBI__GCF_000215085.1:WP_013842893.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 15 hits to proteins with known functional sites (download)

6cyzA Mycobacterial homoserine kinase thrb in complex with amppnp
42% identity, 92% coverage: 4:279/300 of query aligns to 9:282/295 of 6cyzA

query
sites
6cyzA
S
 
A
V
 
T
K
 
T
V
 
V
T
 
L
V
 
V
P
 
P
A
 
A
T
 
S
T
 
S
A
 
A
N
 
N
M
 
L
G
 
G
P
 
P
G
 
G
F
 
F
D
 
D
C
 
S
L
 
L
G
 
G
M
 
I
A
 
A
L
 
L
K
 
S
L
 
L
Y
 
Y
N
 
D
Q
 
E
V
 
I
E
 
E
I
 
V
S
 
N
P
 
T
T
 
T
D
 
E
G
 
S
G
 
G
L
 
L
A
 
K
I
 
V
E
 
A
I
 
V
Q
 
E
G
 
G
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
 
E
I
x
V
R
 
P
K
 
L
D
 
D
E
 
G
G
 
S
N
x
H
I
 
L
V
 
V
F
 
V
K
 
R
A
 
A
V
 
I
E
 
E
R
 
R
L
 
G
F
 
L
Q
 
A
E
 
A
A
 
G
G
 
G
R
 
A
P
 
A
C
 
A
P
 
P
G
 
G
L
 
L
V
 
I
I
 
V
K
 
Q
L
 
C
T
 
H
N
 
N
H
 
K
I
 
I
P
 
P
A
x
H
A
x
S
R
 
R
G
|
G
L
 
L
G
 
G
S
|
S
S
|
S
A
 
A
S
 
A
A
 
A
I
 
A
V
 
V
G
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
G
A
 
V
A
 
A
N
 
N
R
 
G
L
 
L
A
 
L
G
 
A
D
 
K
P
 
A
-
 
G
-
 
R
-
 
A
-
 
V
F
 
L
T
 
S
P
 
D
E
 
D
K
 
V
L
 
L
L
 
V
A
 
Q
L
 
L
A
 
A
T
 
S
E
 
E
L
 
F
E
 
E
G
 
G
H
 
H
P
 
P
D
 
D
N
 
N
V
 
A
A
 
A
P
 
A
A
 
S
L
 
V
L
 
L
G
 
G
G
 
G
I
 
A
I
 
V
I
 
V
S
 
S
V
 
-
V
 
-
Q
 
-
E
 
-
G
 
-
K
 
-
V
 
-
H
 
-
W
 
W
L
 
S
K
 
E
I
 
T
T
 
T
P
 
P
P
 
I
D
 
Y
G
 
A
L
 
A
S
 
T
T
 
R
V
 
L
V
 
D
A
 
V
V
 
H
P
 
P
D
 
D
F
 
I
K
 
K
L
 
I
-
 
V
-
 
A
S
 
A
T
 
I
R
 
P
A
 
E
A
 
T
R
 
R
E
 
V
V
 
L
L
 
L
P
 
P
K
 
Q
T
 
A
V
 
V
S
 
T
L
 
H
Q
 
V
D
 
D
A
 
A
V
 
R
F
 
F
N
 
N
L
 
I
S
 
S
R
 
R
S
 
V
A
 
A
L
 
L
L
 
L
V
 
T
G
 
V
A
 
A
L
 
L
C
 
T
G
 
A
K
 
-
R
 
R
L
 
P
D
 
D
L
 
L
L
 
L
Q
 
M
V
 
T
A
 
A
G
 
T
E
 
E
D
 
D
L
 
R
L
 
L
H
 
H
Q
 
Q
P
 
P
Y
 
Q
R
 
R
S
 
A
Q
 
S
L
 
A
V
 
M
P
 
P
G
 
A
M
 
S
T
 
A
E
 
D
V
 
V
I
 
L
S
 
A
N
 
Y
A
 
L
R
 
R
R
 
S
A
 
Q
G
 
G
A
 
V
L
 
A
N
 
A
V
 
V
T
 
-
L
 
L
S
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
G
P
 
P
A
 
A
V
 
V
I
 
L
A
 
A
L
 
L
T
 
T
-
 
T
-
 
V
D
 
D
G
 
L
P
 
P
N
 
D
P
 
S
Q
 
A
V
 
V
A
 
K
Q
 
Y
V
 
A
M
 
E
E
 
D
N
 
Q
S
 
G
F
 
F
A
 
S

P00547 Homoserine kinase; HK; HSK; EC 2.7.1.39 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
33% identity, 87% coverage: 5:266/300 of query aligns to 2:273/310 of P00547

query
sites
P00547
V
 
V
K
 
K
V
 
V
T
 
Y
V
 
A
P
 
P
A
 
A
T
 
S
T
 
S
A
 
A
N
 
N
M
 
M
G
 
S
P
 
V
G
 
G
F
 
F
D
 
D
C
 
V
L
 
L
G
 
G
M
 
A
A
 
A
L
 
-
K
 
-
L
 
-
Y
 
-
N
 
-
Q
 
-
V
 
-
E
 
-
I
 
V
S
 
T
P
 
P
T
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
A
L
 
L
-
 
L
-
 
G
-
 
D
-
 
V
-
 
V
-
 
T
-
 
V
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
E
-
 
T
-
 
F
A
 
S
I
 
L
E
 
N
I
 
N
Q
 
L
G
 
G
E
 
R
G
 
F
A
 
A
G
 
D
D
 
K
I
 
L
R
 
P
K
 
S
D
 
E
-
 
P
E
 
R
G
 
E
N
 
N
I
 
I
V
 
V
F
 
Y
K
 
Q
A
 
C
V
 
W
E
 
E
R
 
R
L
 
F
F
 
C
Q
 
Q
E
 
E
A
 
L
G
 
G
R
 
K
P
 
Q
C
 
I
P
 
P
G
 
-
L
 
V
V
 
A
I
 
M
K
 
T
L
 
L
T
 
E
N
 
K
H
 
N
I
 
M
P
 
P
A
 
I
A
 
G
R
 
S
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
S
S
 
S
A
 
A
S
 
C
A
 
S
I
 
V
V
 
V
G
 
A
G
 
A
L
 
L
V
 
M
A
 
A
A
 
M
N
 
N
R
 
E
L
 
H
A
 
C
G
 
G
D
 
K
P
 
P
F
 
L
T
 
N
P
 
D
E
 
T
K
 
R
L
 
L
L
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
M
T
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
G
 
G
-
 
R
-
 
I
-
 
S
-
 
G
-
 
S
-
 
I
H
|
H
P
 
Y
D
 
D
N
 
N
V
 
V
A
 
A
P
 
P
A
 
C
L
 
F
L
 
L
G
 
G
G
 
G
I
 
M
I
 
Q
I
 
L
S
 
-
V
 
M
V
 
I
Q
 
E
E
 
E
G
 
N
K
 
D
V
 
I
H
 
I
W
 
S
L
 
Q
K
 
Q
I
 
V
T
 
P
P
 
G
P
 
F
D
 
D
G
 
E
L
 
W
S
 
L
T
 
W
V
 
V
V
 
L
A
 
A
V
 
Y
P
 
P
D
 
G
F
 
I
K
 
K
L
 
V
S
 
S
T
 
T
R
 
A
A
 
E
A
 
A
R
 
R
E
 
A
V
 
I
L
 
L
P
 
P
K
 
A
T
 
Q
V
 
Y
S
 
R
L
 
R
Q
 
Q
D
 
D
A
 
C
V
 
I
F
 
A
N
x
H
L
 
G
S
 
R
R
x
H
S
 
L
A
 
A
L
 
G
L
 
F
V
 
I
G
 
H
A
 
A
L
 
C
C
 
Y
G
 
S
K
 
R
R
 
Q
L
 
P
D
 
E
L
 
L
L
 
A
Q
 
A
V
 
K
A
 
L
G
 
M
E
 
K
D
 
D
L
 
V
L
 
I
H
 
A
Q
 
E
P
 
P
Y
 
Y
R
|
R
S
 
E
Q
 
R
L
 
L
V
 
L
P
 
P
G
 
G
M
 
F
T
 
R
E
 
Q
V
 
A
I
 
R
S
 
Q
N
 
A
A
 
V
R
 
A
R
 
E
A
 
I
G
 
G
A
 
A
L
 
V
N
 
A
V
 
S
T
 
G
L
 
I
S
 
S
G
 
G
A
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
T
V
 
L
I
 
F
A
 
A
L
 
L
T
 
C
D
 
D
G
 
K
P
 
P

1h74B Crystal structure of homoserine kinase complexed with ile (see paper)
32% identity, 91% coverage: 4:276/300 of query aligns to 2:275/296 of 1h74B

query
sites
1h74B
S
 
K
V
 
V
K
 
R
V
 
V
T
 
K
V
 
A
P
 
P
A
 
C
T
 
T
T
 
S
A
|
A
N
|
N
M
 
L
G
 
G
P
 
V
G
 
G
F
 
F
D
|
D
C
 
V
L
 
F
G
 
G
M
 
L
A
 
C
L
 
L
K
 
K
L
 
E
-
 
P
Y
 
Y
N
 
D
Q
 
V
V
 
I
E
 
E
I
 
V
S
 
E
P
 
A
T
 
I
D
 
D
G
 
D
G
 
K
-
 
E
L
 
I
A
 
I
I
 
I
E
 
E
I
 
V
Q
 
D
G
 
D
E
 
K
G
 
N
A
 
I
-
 
P
G
 
T
D
 
D
I
 
P
R
 
D
K
 
K
D
x
N
E
x
V
G
 
A
N
 
G
I
 
I
V
 
V
F
 
A
K
 
K
A
 
K
V
 
M
E
 
I
R
 
D
L
 
D
F
 
F
Q
 
N
E
 
-
A
 
I
G
 
G
R
 
K
P
 
-
C
 
-
P
 
-
G
 
G
L
 
V
V
 
K
I
 
I
K
 
T
L
 
I
T
 
K
N
x
K
H
 
G
I
 
V
P
 
K
A
|
A
A
x
G
R
 
S
G
|
G
L
 
L
G
|
G
S
|
S
S
|
S
A
 
A
S
 
A
A
x
S
I
 
S
V
 
A
G
 
G
G
 
T
L
 
A
V
 
Y
A
 
A
A
 
I
N
 
N
R
 
E
L
 
L
A
 
F
G
 
K
D
 
L
P
 
N
F
 
L
T
 
D
P
 
K
E
 
L
K
 
K
L
 
L
L
 
V
A
 
D
L
 
Y
A
 
A
T
 
S
E
 
Y
L
 
G
E
|
E
-
 
L
-
 
A
-
x
S
-
 
S
-
 
G
-
 
A
G
 
K
H
|
H
P
 
A
D
|
D
N
|
N
V
 
V
A
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
I
L
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
F
I
 
T
I
 
M
S
 
-
V
 
V
V
 
T
Q
 
N
E
 
Y
G
 
E
K
 
P
V
 
L
H
 
E
W
 
V
L
 
L
K
 
H
I
 
I
T
 
P
P
 
I
P
 
D
D
 
F
G
 
K
L
 
L
S
 
D
T
 
I
V
 
L
V
 
I
A
 
A
V
 
I
P
 
P
D
 
N
F
 
I
K
 
S
L
 
I
S
 
N
T
|
T
R
 
K
A
 
E
A
 
A
R
|
R
E
 
E
V
 
I
L
 
L
P
 
P
K
 
K
T
 
A
V
 
V
S
 
G
L
 
L
Q
 
K
D
 
D
A
 
L
V
 
V
F
 
N
N
 
N
L
 
V
S
 
G
R
 
K
S
 
A
A
 
C
L
 
G
L
 
M
V
 
V
G
 
Y
A
 
A
L
 
L
C
 
Y
G
 
N
K
 
K
R
 
D
L
 
K
D
 
S
L
 
L
L
 
F
-
 
G
Q
 
R
V
 
Y
A
 
M
G
 
M
E
 
S
D
 
D
L
 
K
L
 
V
H
 
I
Q
 
E
P
 
P
Y
 
V
R
|
R
S
 
G
Q
 
K
L
 
L
V
 
I
P
 
P
G
 
N
M
 
Y
T
 
F
E
 
K
V
 
-
I
 
I
S
 
K
N
 
E
A
 
E
R
 
V
R
 
K
A
 
D
G
 
K
A
 
V
L
 
Y
N
 
G
V
 
I
T
 
T
L
 
I
S
 
S
G
|
G
A
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
S
V
 
I
I
 
I
A
 
A
L
 
F
T
 
-
D
 
-
G
 
-
P
 
P
N
 
K
P
 
E
Q
 
E
V
 
F
A
 
I
Q
 
D
V
 
E
M
 
V
E
 
E
N
 
N

1h74A Crystal structure of homoserine kinase complexed with ile (see paper)
32% identity, 91% coverage: 4:276/300 of query aligns to 2:275/296 of 1h74A

query
sites
1h74A
S
 
K
V
 
V
K
 
R
V
 
V
T
 
K
V
 
A
P
 
P
A
 
C
T
 
T
T
 
S
A
 
A
N
|
N
M
 
L
G
 
G
P
 
V
G
 
G
F
|
F
D
|
D
C
 
V
L
 
F
G
 
G
M
 
L
A
 
C
L
 
L
K
 
K
L
 
E
-
 
P
Y
 
Y
N
 
D
Q
 
V
V
 
I
E
 
E
I
 
V
S
 
E
P
 
A
T
 
I
D
 
D
G
 
D
G
 
K
-
 
E
L
 
I
A
 
I
I
 
I
E
 
E
I
 
V
Q
 
D
G
 
D
E
 
K
G
 
N
A
x
I
-
 
P
G
 
T
D
 
D
I
 
P
R
 
D
K
 
K
D
x
N
E
x
V
G
 
A
N
 
G
I
 
I
V
 
V
F
 
A
K
 
K
A
 
K
V
 
M
E
 
I
R
 
D
L
 
D
F
 
F
Q
 
N
E
 
-
A
 
I
G
 
G
R
 
K
P
 
-
C
 
-
P
 
-
G
 
G
L
 
V
V
 
K
I
 
I
K
 
T
L
 
I
T
 
K
N
x
K
H
 
G
I
 
V
P
 
K
A
|
A
A
x
G
R
 
S
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
|
S
S
|
S
A
 
A
S
 
A
A
x
S
I
 
S
V
 
A
G
 
G
G
 
T
L
 
A
V
 
Y
A
 
A
A
 
I
N
 
N
R
 
E
L
 
L
A
 
F
G
 
K
D
 
L
P
 
N
F
 
L
T
 
D
P
 
K
E
 
L
K
 
K
L
 
L
L
 
V
A
 
D
L
 
Y
A
 
A
T
 
S
E
 
Y
L
 
G
E
|
E
-
 
L
-
 
A
-
 
S
-
 
S
-
 
G
-
 
A
G
 
K
H
|
H
P
 
A
D
 
D
N
 
N
V
 
V
A
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
I
L
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
F
I
 
T
I
 
M
S
 
-
V
 
V
V
 
T
Q
 
N
E
 
Y
G
 
E
K
 
P
V
 
L
H
 
E
W
 
V
L
 
L
K
 
H
I
 
I
T
 
P
P
 
I
P
 
D
D
 
F
G
 
K
L
 
L
S
 
D
T
 
I
V
 
L
V
 
I
A
 
A
V
 
I
P
 
P
D
 
N
F
 
I
K
 
S
L
 
I
S
 
N
T
|
T
R
 
K
A
 
E
A
 
A
R
|
R
E
 
E
V
 
I
L
 
L
P
 
P
K
 
K
T
 
A
V
 
V
S
 
G
L
 
L
Q
 
K
D
 
D
A
 
L
V
 
V
F
 
N
N
 
N
L
 
V
S
 
G
R
 
K
S
 
A
A
 
C
L
 
G
L
 
M
V
 
V
G
 
Y
A
 
A
L
 
L
C
 
Y
G
 
N
K
 
K
R
 
D
L
 
K
D
 
S
L
 
L
L
 
F
-
 
G
Q
 
R
V
 
Y
A
 
M
G
 
M
E
 
S
D
 
D
L
 
K
L
 
V
H
 
I
Q
 
E
P
 
P
Y
 
V
R
|
R
S
 
G
Q
 
K
L
 
L
V
 
I
P
 
P
G
 
N
M
 
Y
T
 
F
E
 
K
V
 
-
I
 
I
S
 
K
N
 
E
A
 
E
R
 
V
R
 
K
A
 
D
G
 
K
A
 
V
L
 
Y
N
 
G
V
 
I
T
 
T
L
 
I
S
 
S
G
 
G
A
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
S
V
 
I
I
 
I
A
 
A
L
 
F
T
 
-
D
 
-
G
 
-
P
 
P
N
 
K
P
 
E
Q
 
E
V
 
F
A
 
I
Q
 
D
V
 
E
M
 
V
E
 
E
N
 
N

1h73A Crystal structure of homoserine kinase complexed with threonine (see paper)
32% identity, 91% coverage: 4:276/300 of query aligns to 2:275/296 of 1h73A

query
sites
1h73A
S
 
K
V
 
V
K
 
R
V
 
V
T
 
K
V
 
A
P
 
P
A
 
C
T
 
T
T
 
S
A
 
A
N
|
N
M
 
L
G
 
G
P
 
V
G
 
G
F
 
F
D
|
D
C
 
V
L
 
F
G
 
G
M
 
L
A
 
C
L
 
L
K
 
K
L
 
E
-
 
P
Y
 
Y
N
 
D
Q
 
V
V
 
I
E
 
E
I
 
V
S
 
E
P
 
A
T
 
I
D
 
D
G
 
D
G
 
K
-
 
E
L
 
I
A
 
I
I
 
I
E
 
E
I
 
V
Q
 
D
G
 
D
E
 
K
G
 
N
A
x
I
-
 
P
G
 
T
D
 
D
I
 
P
R
 
D
K
 
K
D
x
N
E
x
V
G
 
A
N
 
G
I
 
I
V
 
V
F
 
A
K
 
K
A
 
K
V
 
M
E
 
I
R
 
D
L
 
D
F
 
F
Q
 
N
E
 
-
A
 
I
G
 
G
R
 
K
P
 
-
C
 
-
P
 
-
G
 
G
L
 
V
V
 
K
I
 
I
K
 
T
L
 
I
T
 
K
N
x
K
H
 
G
I
 
V
P
 
K
A
|
A
A
x
G
R
 
S
G
|
G
L
|
L
G
|
G
S
|
S
S
|
S
A
 
A
S
 
A
A
x
S
I
 
S
V
 
A
G
 
G
G
 
T
L
 
A
V
 
Y
A
 
A
A
 
I
N
 
N
R
 
E
L
 
L
A
 
F
G
 
K
D
 
L
P
 
N
F
 
L
T
 
D
P
 
K
E
 
L
K
 
K
L
 
L
L
 
V
A
 
D
L
 
Y
A
 
A
T
 
S
E
 
Y
L
 
G
E
|
E
-
 
L
-
 
A
-
 
S
-
 
S
-
 
G
-
 
A
G
 
K
H
 
H
P
 
A
D
 
D
N
 
N
V
 
V
A
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
I
L
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
F
I
 
T
I
 
M
S
 
-
V
 
V
V
 
T
Q
 
N
E
 
Y
G
 
E
K
 
P
V
 
L
H
 
E
W
 
V
L
 
L
K
 
H
I
 
I
T
 
P
P
 
I
P
 
D
D
 
F
G
 
K
L
 
L
S
 
D
T
 
I
V
 
L
V
 
I
A
 
A
V
 
I
P
 
P
D
 
N
F
 
I
K
 
S
L
 
I
S
 
N
T
|
T
R
 
K
A
 
E
A
 
A
R
|
R
E
 
E
V
 
I
L
 
L
P
 
P
K
 
K
T
 
A
V
 
V
S
 
G
L
 
L
Q
 
K
D
 
D
A
 
L
V
 
V
F
 
N
N
 
N
L
 
V
S
 
G
R
 
K
S
 
A
A
 
C
L
 
G
L
 
M
V
 
V
G
 
Y
A
 
A
L
 
L
C
 
Y
G
 
N
K
 
K
R
 
D
L
 
K
D
 
S
L
 
L
L
 
F
-
 
G
Q
 
R
V
 
Y
A
 
M
G
 
M
E
 
S
D
 
D
L
 
K
L
 
V
H
 
I
Q
 
E
P
 
P
Y
 
V
R
|
R
S
 
G
Q
 
K
L
 
L
V
 
I
P
 
P
G
 
N
M
 
Y
T
 
F
E
 
K
V
 
-
I
 
I
S
 
K
N
 
E
A
 
E
R
 
V
R
 
K
A
 
D
G
 
K
A
 
V
L
 
Y
N
 
G
V
 
I
T
 
T
L
 
I
S
 
S
G
 
G
A
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
S
V
 
I
I
 
I
A
 
A
L
 
F
T
 
-
D
 
-
G
 
-
P
 
P
N
 
K
P
 
E
Q
 
E
V
 
F
A
 
I
Q
 
D
V
 
E
M
 
V
E
 
E
N
 
N

1h72C Crystal structure of homoserine kinase complexed with hse (see paper)
32% identity, 91% coverage: 4:276/300 of query aligns to 2:275/296 of 1h72C

query
sites
1h72C
S
 
K
V
 
V
K
 
R
V
 
V
T
 
K
V
 
A
P
 
P
A
 
C
T
 
T
T
 
S
A
 
A
N
|
N
M
 
L
G
 
G
P
 
V
G
 
G
F
|
F
D
|
D
C
 
V
L
 
F
G
 
G
M
 
L
A
 
C
L
 
L
K
 
K
L
 
E
-
 
P
Y
 
Y
N
 
D
Q
 
V
V
 
I
E
 
E
I
 
V
S
 
E
P
 
A
T
 
I
D
 
D
G
 
D
G
 
K
-
 
E
L
 
I
A
 
I
I
 
I
E
 
E
I
 
V
Q
 
D
G
 
D
E
 
K
G
 
N
A
x
I
-
 
P
G
 
T
D
 
D
I
 
P
R
 
D
K
 
K
D
x
N
E
x
V
G
 
A
N
 
G
I
 
I
V
 
V
F
 
A
K
 
K
A
 
K
V
 
M
E
 
I
R
 
D
L
 
D
F
 
F
Q
 
N
E
 
-
A
 
I
G
 
G
R
 
K
P
 
-
C
 
-
P
 
-
G
 
G
L
 
V
V
 
K
I
 
I
K
 
T
L
 
I
T
 
K
N
x
K
H
 
G
I
 
V
P
 
K
A
|
A
A
x
G
R
 
S
G
|
G
L
|
L
G
|
G
S
|
S
S
|
S
A
 
A
S
 
A
A
x
S
I
 
S
V
 
A
G
 
G
G
 
T
L
 
A
V
 
Y
A
 
A
A
 
I
N
 
N
R
 
E
L
 
L
A
 
F
G
 
K
D
 
L
P
 
N
F
 
L
T
 
D
P
 
K
E
 
L
K
 
K
L
 
L
L
 
V
A
 
D
L
 
Y
A
 
A
T
 
S
E
 
Y
L
 
G
E
|
E
-
 
L
-
 
A
-
x
S
-
 
S
-
 
G
-
 
A
G
 
K
H
 
H
P
 
A
D
|
D
N
|
N
V
 
V
A
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
I
L
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
F
I
 
T
I
 
M
S
 
-
V
 
V
V
 
T
Q
 
N
E
 
Y
G
 
E
K
 
P
V
 
L
H
 
E
W
 
V
L
 
L
K
 
H
I
 
I
T
 
P
P
 
I
P
 
D
D
 
F
G
 
K
L
 
L
S
 
D
T
 
I
V
 
L
V
 
I
A
 
A
V
 
I
P
 
P
D
 
N
F
 
I
K
 
S
L
 
I
S
 
N
T
|
T
R
 
K
A
 
E
A
 
A
R
|
R
E
 
E
V
 
I
L
 
L
P
 
P
K
 
K
T
 
A
V
 
V
S
 
G
L
 
L
Q
 
K
D
 
D
A
 
L
V
 
V
F
 
N
N
 
N
L
 
V
S
 
G
R
 
K
S
 
A
A
 
C
L
 
G
L
 
M
V
 
V
G
 
Y
A
 
A
L
 
L
C
 
Y
G
 
N
K
 
K
R
 
D
L
 
K
D
 
S
L
 
L
L
 
F
-
 
G
Q
 
R
V
 
Y
A
 
M
G
 
M
E
 
S
D
 
D
L
 
K
L
 
V
H
 
I
Q
 
E
P
 
P
Y
 
V
R
|
R
S
 
G
Q
 
K
L
 
L
V
 
I
P
 
P
G
 
N
M
 
Y
T
 
F
E
 
K
V
 
-
I
 
I
S
 
K
N
 
E
A
 
E
R
 
V
R
 
K
A
 
D
G
 
K
A
 
V
L
 
Y
N
 
G
V
 
I
T
 
T
L
 
I
S
 
S
G
 
G
A
x
S
G
 
G
P
 
P
A
 
S
V
 
I
I
 
I
A
 
A
L
 
F
T
 
-
D
 
-
G
 
-
P
 
P
N
 
K
P
 
E
Q
 
E
V
 
F
A
 
I
Q
 
D
V
 
E
M
 
V
E
 
E
N
 
N

1fwkA Crystal structure of homoserine kinase complexed with adp (see paper)
32% identity, 91% coverage: 4:276/300 of query aligns to 2:275/296 of 1fwkA

query
sites
1fwkA
S
 
K
V
 
V
K
 
R
V
 
V
T
 
K
V
 
A
P
 
P
A
 
C
T
 
T
T
 
S
A
 
A
N
 
N
M
 
L
G
 
G
P
 
V
G
 
G
F
 
F
D
 
D
C
 
V
L
 
F
G
 
G
M
 
L
A
 
C
L
 
L
K
 
K
L
 
E
-
 
P
Y
 
Y
N
 
D
Q
 
V
V
 
I
E
 
E
I
 
V
S
 
E
P
 
A
T
 
I
D
 
D
G
 
D
G
 
K
-
 
E
L
 
I
A
 
I
I
 
I
E
 
E
I
 
V
Q
 
D
G
 
D
E
 
K
G
 
N
A
x
I
-
 
P
G
 
T
D
 
D
I
 
P
R
 
D
K
 
K
D
x
N
E
x
V
G
 
A
N
 
G
I
 
I
V
 
V
F
 
A
K
 
K
A
 
K
V
 
M
E
 
I
R
 
D
L
 
D
F
 
F
Q
 
N
E
 
-
A
 
I
G
 
G
R
 
K
P
 
-
C
 
-
P
 
-
G
 
G
L
 
V
V
 
K
I
 
I
K
 
T
L
 
I
T
 
K
N
x
K
H
 
G
I
 
V
P
 
K
A
 
A
A
 
G
R
 
S
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
|
S
S
|
S
A
 
A
S
 
A
A
x
S
I
 
S
V
 
A
G
 
G
G
 
T
L
 
A
V
 
Y
A
 
A
A
 
I
N
 
N
R
 
E
L
 
L
A
 
F
G
 
K
D
 
L
P
 
N
F
 
L
T
 
D
P
 
K
E
 
L
K
 
K
L
 
L
L
 
V
A
 
D
L
 
Y
A
 
A
T
 
S
E
 
Y
L
 
G
E
|
E
-
 
L
-
 
A
-
 
S
-
 
S
-
 
G
-
 
A
G
 
K
H
 
H
P
 
A
D
 
D
N
 
N
V
 
V
A
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
I
L
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
F
I
 
T
I
 
M
S
 
-
V
 
V
V
 
T
Q
 
N
E
 
Y
G
 
E
K
 
P
V
 
L
H
 
E
W
 
V
L
 
L
K
 
H
I
 
I
T
 
P
P
 
I
P
 
D
D
 
F
G
 
K
L
 
L
S
 
D
T
 
I
V
 
L
V
 
I
A
 
A
V
 
I
P
 
P
D
 
N
F
 
I
K
 
S
L
 
I
S
 
N
T
|
T
R
 
K
A
 
E
A
 
A
R
 
R
E
 
E
V
 
I
L
 
L
P
 
P
K
 
K
T
 
A
V
 
V
S
 
G
L
 
L
Q
 
K
D
 
D
A
 
L
V
 
V
F
 
N
N
 
N
L
 
V
S
 
G
R
 
K
S
 
A
A
 
C
L
 
G
L
 
M
V
 
V
G
 
Y
A
 
A
L
 
L
C
 
Y
G
 
N
K
 
K
R
 
D
L
 
K
D
 
S
L
 
L
L
 
F
-
 
G
Q
 
R
V
 
Y
A
 
M
G
 
M
E
 
S
D
 
D
L
 
K
L
 
V
H
 
I
Q
 
E
P
 
P
Y
 
V
R
 
R
S
 
G
Q
 
K
L
 
L
V
 
I
P
 
P
G
 
N
M
 
Y
T
 
F
E
 
K
V
 
-
I
 
I
S
 
K
N
 
E
A
 
E
R
 
V
R
 
K
A
 
D
G
 
K
A
 
V
L
 
Y
N
 
G
V
 
I
T
 
T
L
 
I
S
 
S
G
 
G
A
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
S
V
 
I
I
 
I
A
 
A
L
 
F
T
 
-
D
 
-
G
 
-
P
 
P
N
 
K
P
 
E
Q
 
E
V
 
F
A
 
I
Q
 
D
V
 
E
M
 
V
E
 
E
N
 
N

Q8L7R2 Homoserine kinase; Protein DOWNY MILDEW RESISTANT 1; EC 2.7.1.39 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
33% identity, 87% coverage: 4:264/300 of query aligns to 53:326/370 of Q8L7R2

query
sites
Q8L7R2
S
 
S
V
 
V
K
 
K
V
 
T
T
 
F
V
 
A
P
 
P
A
 
A
T
 
T
T
 
V
A
 
A
N
 
N
M
 
L
G
 
G
P
 
P
G
 
G
F
 
F
D
 
D
C
 
F
L
 
L
G
 
G
M
 
C
A
 
A
L
 
V
-
 
D
-
 
G
-
 
L
-
 
G
-
 
D
K
 
H
L
 
V
Y
 
T
N
 
L
Q
 
R
V
 
V
E
 
D
I
 
P
S
 
S
P
 
V
T
 
R
D
 
A
G
 
G
G
 
E
L
 
V
A
 
S
I
 
I
-
 
S
E
 
E
I
 
I
Q
 
T
G
 
G
E
 
T
G
 
T
A
 
T
G
 
K
D
 
L
I
 
S
R
 
T
K
 
N
D
 
P
E
 
L
G
 
R
N
 
N
I
 
C
V
 
A
F
x
G
K
 
I
A
 
A
V
 
A
E
 
I
R
 
A
L
 
T
F
 
M
Q
 
K
E
 
M
A
 
L
G
 
G
R
 
I
P
 
R
C
 
S
P
 
V
G
 
G
L
 
L
V
 
S
I
 
L
K
 
D
L
 
L
T
 
H
N
 
K
H
 
G
I
 
L
P
 
P
A
 
L
A
 
G
R
 
S
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
S
S
 
S
A
 
A
S
 
A
A
 
S
I
 
A
V
 
A
G
 
A
G
 
A
L
 
A
V
 
V
A
 
A
A
 
V
N
 
N
R
 
E
L
 
I
A
 
F
G
 
G
D
 
R
P
 
K
F
 
L
T
 
G
P
 
S
E
 
D
K
 
Q
L
 
L
L
 
V
A
 
L
L
 
A
A
x
G
T
 
L
E
 
E
L
 
S
E
 
E
G
 
A
-
 
K
-
 
V
-
 
S
-
 
G
-
 
Y
H
 
H
P
 
A
D
 
D
N
 
N
V
 
I
A
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
I
L
 
M
G
 
G
G
|
G
-
 
F
I
 
V
I
 
L
I
 
I
S
 
R
V
 
N
V
 
Y
Q
 
E
E
 
P
G
 
L
K
 
D
V
 
L
H
 
K
W
 
P
L
 
L
K
 
R
I
 
F
T
 
P
P
 
S
P
 
D
D
 
K
G
 
D
L
 
L
S
 
F
T
 
F
V
 
V
V
 
L
A
 
V
V
 
S
P
 
P
D
 
D
F
 
F
K
 
E
L
 
A
S
 
P
T
 
T
R
 
K
A
 
K
A
x
M
R
 
R
E
 
A
V
 
A
L
 
L
P
 
P
K
 
T
T
 
E
V
 
I
S
 
P
L
 
M
Q
 
V
D
 
H
A
 
H
V
 
V
F
 
W
N
 
N
L
 
S
S
 
S
R
 
Q
S
 
A
A
 
A
L
 
A
L
 
L
V
 
V
G
 
A
A
|
A
L
 
V
C
 
L
-
 
E
G
 
G
K
 
D
R
 
A
L
 
V
D
 
M
L
 
L
L
 
G
Q
 
K
V
 
A
A
 
L
G
 
S
E
 
S
D
 
D
L
 
K
L
 
I
H
 
V
Q
 
E
P
 
P
Y
 
T
R
 
R
S
 
A
Q
 
P
L
 
L
V
 
I
P
 
P
G
 
G
M
 
M
T
 
E
E
 
A
V
 
V
I
 
K
S
 
K
N
 
A
A
 
A
R
 
L
R
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
F
N
 
G
V
 
C
T
 
T
L
 
I
S
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
G
P
 
P
A
 
T
V
 
A
I
 
V
A
 
A
L
 
V
T
 
I
D
 
D

Sites not aligning to the query:

4dxlA Crystal structure of ispe (4-diphosphocytidyl-2-c-methyl-d-erythritol kinase) from mycobacterium abscessus, bound to cmp and atp (see paper)
28% identity, 92% coverage: 26:300/300 of query aligns to 41:304/304 of 4dxlA

query
sites
4dxlA
A
 
A
L
 
V
K
 
S
L
 
L
Y
 
A
N
 
D
Q
 
D
V
 
V
E
 
T
I
 
V
S
 
R
P
 
D
T
 
A
D
 
D
G
 
V
G
 
-
L
 
L
A
 
S
I
 
I
E
 
D
I
 
V
Q
 
V
G
 
G
E
 
Q
G
 
G
A
 
E
G
 
G
D
 
T
I
 
V
R
 
P
K
 
T
D
 
D
E
 
E
G
 
R
N
|
N
I
x
L
V
 
A
F
 
W
K
 
Q
A
 
A
V
 
A
E
 
E
R
 
L
L
 
F
F
 
A
Q
 
D
E
 
H
A
 
V
G
 
G
R
 
R
P
 
-
C
 
A
P
 
P
G
 
D
L
 
V
V
 
S
I
 
I
K
 
F
L
 
I
T
 
N
N
x
K
H
 
D
I
 
I
P
 
P
A
x
V
A
|
A
R
 
G
G
|
G
L
 
M
G
x
A
S
x
G
S
x
G
A
 
S
S
 
A
A
x
D
I
 
A
V
 
A
G
 
A
G
 
V
L
 
L
V
 
V
A
 
A
A
 
M
N
 
N
R
 
E
L
 
L
A
 
W
G
 
H
D
 
A
P
 
G
F
 
V
T
 
P
P
 
R
E
 
R
K
 
D
L
 
L
L
 
H
A
 
H
L
 
L
A
 
A
T
 
A
E
 
Q
L
 
L
E
 
-
G
 
-
H
 
-
P
 
G
D
x
S
N
x
D
V
 
V
A
 
P
P
 
F
A
 
A
L
 
L
L
 
H
G
 
G
G
 
G
I
 
T
-
 
A
-
 
L
-
 
G
-
 
T
-
 
G
-
x
R
-
 
G
-
 
E
-
 
Q
I
 
L
I
 
A
S
 
T
V
 
V
V
 
L
Q
 
A
E
 
R
G
 
N
K
 
V
V
 
F
H
 
H
W
 
W
L
 
V
K
 
F
I
 
A
T
 
F
P
 
A
P
 
D
D
 
G
G
 
G
L
 
L
S
 
A
T
|
T
V
 
-
V
 
-
A
 
-
V
 
-
P
 
P
D
 
Q
-
 
V
F
|
F
K
 
K
L
 
E
S
 
I
T
 
D
R
 
R
A
 
L
A
 
R
R
 
E
E
 
N
V
 
G
L
 
D
P
 
P
K
 
P
T
 
R
V
 
L
S
 
A
L
 
E
Q
 
A
D
 
D
A
 
E
V
 
-
F
 
-
N
 
-
L
 
-
S
 
-
R
 
-
S
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
L
V
 
L
G
 
G
A
 
A
L
 
L
-
 
A
C
 
A
G
 
G
K
 
D
R
 
A
L
 
R
D
 
R
L
 
L
L
 
A
Q
 
P
V
 
L
A
 
L
G
 
G
E
 
N
D
 
E
L
 
L
L
 
-
H
 
-
Q
 
Q
P
 
A
Y
 
A
R
 
A
S
 
V
Q
 
S
L
 
L
V
 
N
P
 
P
G
 
E
M
 
L
T
 
R
E
 
R
V
 
T
I
 
L
S
 
R
N
 
A
A
 
G
R
 
E
R
 
S
A
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
L
N
 
A
V
 
G
T
 
I
L
 
V
S
 
S
G
 
G
A
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
T
V
 
C
I
 
A
A
 
F
L
 
L
T
 
C
D
 
T
G
 
S
P
 
A
N
 
D
P
 
D
Q
 
A
V
 
V
A
 
Q
Q
 
V
V
 
S
M
 
A
E
 
E
N
 
-
S
 
-
F
 
L
A
 
A
A
 
G
A
 
A
G
 
G
V
 
V
K
 
C
C
 
R
L
 
T
V
 
V
K
 
R
V
 
V
L
 
A
E
 
S
P
 
G
T
 
P
V
 
V
A
 
H
G
 
G
A
 
A
E
 
Q
I
 
V
I
 
I

Sites not aligning to the query:

3pyeA Mycobacterium tuberculosis 4-diphosphocytidyl-2-c-methyl-d-erythritol kinase (ispe) in complex with cdpme
25% identity, 92% coverage: 26:300/300 of query aligns to 37:300/301 of 3pyeA

query
sites
3pyeA
A
 
A
L
 
V
K
 
S
L
 
L
Y
 
V
N
 
D
Q
 
E
V
 
V
E
 
T
I
 
V
S
 
R
P
 
N
T
 
A
D
 
D
G
 
V
G
 
-
L
 
L
A
 
S
I
 
L
E
 
E
I
 
L
Q
 
V
G
 
G
E
 
E
G
 
G
A
 
A
G
 
D
D
 
Q
I
 
L
R
 
P
K
 
T
D
 
D
E
 
E
G
 
R
N
 
N
I
 
L
V
 
A
F
 
W
K
 
Q
A
 
A
V
 
A
E
 
E
R
 
L
L
 
M
F
 
A
Q
 
E
E
 
H
A
 
V
G
 
G
R
 
R
P
 
-
C
 
A
P
 
P
G
 
D
L
 
V
V
 
S
I
 
I
K
 
M
L
 
I
T
 
D
N
 
K
H
 
S
I
 
I
P
 
P
A
 
V
A
 
A
R
 
G
G
 
G
L
 
M
G
 
A
S
 
G
S
 
G
A
 
S
S
 
A
A
 
D
I
 
A
V
 
A
G
 
A
G
 
V
L
 
L
V
 
V
A
 
A
A
 
M
N
 
N
R
 
S
L
 
L
A
 
W
G
 
E
D
 
L
P
 
N
F
 
V
T
 
P
P
 
R
E
 
R
K
 
D
L
 
L
L
 
R
A
 
M
L
 
L
A
 
A
T
 
A
E
 
R
L
 
L
E
 
G
G
 
-
H
 
-
P
 
-
D
 
S
N
x
D
V
 
V
A
 
P
P
 
F
A
 
A
L
 
L
L
 
H
G
 
G
G
 
G
I
 
T
-
 
A
-
 
L
-
 
G
-
 
T
-
 
G
-
 
R
-
 
G
-
 
E
-
 
E
I
 
L
I
 
A
S
 
T
V
 
V
V
 
L
Q
 
S
E
 
R
G
 
N
K
 
T
V
 
F
H
 
H
W
 
W
L
 
-
K
 
-
I
 
-
T
 
-
P
 
-
P
 
-
D
 
-
G
 
-
L
 
-
S
 
-
T
 
-
V
 
V
V
 
L
A
 
A
V
 
F
P
 
A
D
 
D
F
 
S
K
 
G
L
 
L
S
 
L
T
 
T
R
 
S
A
 
A
A
 
V
R
x
Y
E
 
N
V
 
E
L
 
L
P
 
D
K
 
R
T
 
L
V
 
R
S
 
E
L
 
V
Q
 
G
D
 
D
A
 
P
V
 
P
F
 
R
N
 
L
L
 
G
S
 
E
R
 
P
S
 
G
A
 
P
L
 
V
L
 
L
V
 
A
G
 
A
A
 
L
L
 
A
C
 
A
G
 
G
K
 
D
R
 
P
L
 
D
D
 
Q
L
 
L
L
 
A
Q
 
P
V
 
L
A
 
L
G
 
G
E
 
N
D
 
E
L
 
M
L
 
-
H
 
-
Q
 
Q
P
 
A
Y
 
A
R
 
A
S
 
V
Q
 
S
L
 
L
V
 
D
P
 
P
G
 
A
M
 
L
T
 
A
E
 
R
V
 
A
I
 
L
S
 
R
N
 
A
A
 
G
R
 
V
R
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
L
N
 
A
V
 
G
T
 
I
L
 
V
S
 
S
G
 
G
A
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
T
V
 
C
I
 
A
A
 
F
L
 
L
T
 
C
D
 
T
G
 
S
P
 
A
N
 
S
P
 
S
Q
 
A
V
 
I
A
 
D
Q
 
-
V
 
-
M
 
V
E
 
G
N
 
A
S
 
Q
F
 
L
A
 
S
A
 
G
A
 
A
G
 
G
V
 
V
K
 
C
C
 
R
L
 
T
V
 
V
K
 
R
V
 
V
L
 
A
E
 
T
P
 
G
T
 
P
V
 
V
A
 
P
G
 
G
A
 
A
E
 
R
I
 
V
I
 
V

Sites not aligning to the query:

3pyfA Mycobacterium tuberculosis 4-diphosphocytidyl-2-c-methyl-d-erythritol kinase (ispe) in complex with amp-pnp
25% identity, 92% coverage: 26:300/300 of query aligns to 33:296/296 of 3pyfA

query
sites
3pyfA
A
 
A
L
 
V
K
 
S
L
 
L
Y
 
V
N
 
D
Q
 
E
V
 
V
E
 
T
I
 
V
S
 
R
P
 
N
T
 
A
D
 
D
G
 
V
G
 
-
L
 
L
A
 
S
I
 
L
E
 
E
I
 
L
Q
 
V
G
 
G
E
 
E
G
 
G
A
 
A
G
 
D
D
 
Q
I
x
L
R
 
P
K
 
T
D
 
D
E
 
E
G
 
R
N
|
N
I
x
L
V
 
A
F
 
W
K
 
Q
A
 
A
V
 
A
E
 
E
R
 
L
L
 
M
F
 
A
Q
 
E
E
 
H
A
 
V
G
 
G
R
 
R
P
 
-
C
 
A
P
 
P
G
 
D
L
 
V
V
 
S
I
 
I
K
 
M
L
 
I
T
 
D
N
 
K
H
 
S
I
 
I
P
 
P
A
x
V
A
|
A
R
 
G
G
|
G
L
 
M
G
x
A
S
x
G
S
x
G
A
 
S
S
 
A
A
 
D
I
 
A
V
 
A
G
 
A
G
 
V
L
 
L
V
 
V
A
 
A
A
 
M
N
 
N
R
 
S
L
 
L
A
 
W
G
 
E
D
 
L
P
 
N
F
 
V
T
 
P
P
 
R
E
 
R
K
 
D
L
 
L
L
 
R
A
 
M
L
 
L
A
 
A
T
 
A
E
 
R
L
 
L
E
 
G
G
 
-
H
 
-
P
 
-
D
 
S
N
x
D
V
 
V
A
 
P
P
 
F
A
 
A
L
 
L
L
 
H
G
 
G
G
 
G
I
 
T
-
 
A
-
 
L
-
 
G
-
 
T
-
 
G
-
 
R
-
 
G
-
 
E
-
 
E
I
 
L
I
 
A
S
 
T
V
 
V
V
 
L
Q
 
S
E
 
R
G
 
N
K
 
T
V
 
F
H
 
H
W
 
W
L
 
-
K
 
-
I
 
-
T
 
-
P
 
-
P
 
-
D
 
-
G
 
-
L
 
-
S
 
-
T
 
-
V
 
V
V
 
L
A
 
A
V
 
F
P
 
A
D
 
D
F
 
S
K
 
G
L
 
L
S
 
L
T
 
T
R
 
S
A
 
A
A
 
V
R
 
Y
E
 
N
V
 
E
L
 
L
P
 
D
K
 
R
T
 
L
V
 
R
S
 
E
L
 
V
Q
 
G
D
 
D
A
 
P
V
 
P
F
 
R
N
 
L
L
 
G
S
 
E
R
 
P
S
 
G
A
 
P
L
 
V
L
 
L
V
 
A
G
 
A
A
 
L
L
 
A
C
 
A
G
 
G
K
 
D
R
 
P
L
 
D
D
 
Q
L
 
L
L
 
A
Q
 
P
V
 
L
A
 
L
G
 
G
E
 
N
D
 
E
L
 
M
L
 
-
H
 
-
Q
 
Q
P
 
A
Y
 
A
R
 
A
S
 
V
Q
 
S
L
 
L
V
 
D
P
 
P
G
 
A
M
 
L
T
 
A
E
 
R
V
 
A
I
 
L
S
 
R
N
 
A
A
 
G
R
 
V
R
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
L
N
 
A
V
 
G
T
 
I
L
 
V
S
 
S
G
 
G
A
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
T
V
 
C
I
 
A
A
 
F
L
 
L
T
 
C
D
 
T
G
 
S
P
 
A
N
 
S
P
 
S
Q
 
A
V
 
I
A
 
D
Q
 
-
V
 
-
M
 
V
E
 
G
N
 
A
S
 
Q
F
 
L
A
 
S
A
 
G
A
 
A
G
 
G
V
 
V
K
 
C
C
 
R
L
 
T
V
 
V
K
 
R
V
 
V
L
 
A
E
 
T
P
 
G
T
 
P
V
 
V
A
 
P
G
 
G
A
 
A
E
 
R
I
 
V
I
 
V

Sites not aligning to the query:

3pygA Mycobacterium tuberculosis 4-diphosphocytidyl-2-c-methyl-d-erythritol kinase (ispe) in complex with adp
25% identity, 92% coverage: 26:300/300 of query aligns to 34:297/298 of 3pygA

query
sites
3pygA
A
 
A
L
 
V
K
 
S
L
 
L
Y
 
V
N
 
D
Q
 
E
V
 
V
E
 
T
I
 
V
S
 
R
P
 
N
T
 
A
D
 
D
G
 
V
G
 
-
L
 
L
A
 
S
I
 
L
E
 
E
I
 
L
Q
 
V
G
 
G
E
 
E
G
 
G
A
 
A
G
 
D
D
 
Q
I
 
L
R
 
P
K
 
T
D
 
D
E
 
E
G
 
R
N
 
N
I
 
L
V
 
A
F
 
W
K
 
Q
A
 
A
V
 
A
E
 
E
R
 
L
L
 
M
F
 
A
Q
 
E
E
 
H
A
 
V
G
 
G
R
 
R
P
 
-
C
 
A
P
 
P
G
 
D
L
 
V
V
 
S
I
 
I
K
 
M
L
 
I
T
 
D
N
 
K
H
 
S
I
 
I
P
 
P
A
x
V
A
|
A
R
 
G
G
|
G
L
x
M
G
x
A
S
x
G
S
x
G
A
 
S
S
 
A
A
 
D
I
 
A
V
 
A
G
 
A
G
 
V
L
 
L
V
 
V
A
 
A
A
 
M
N
 
N
R
 
S
L
 
L
A
 
W
G
 
E
D
 
L
P
 
N
F
 
V
T
 
P
P
 
R
E
 
R
K
 
D
L
 
L
L
 
R
A
 
M
L
 
L
A
 
A
T
 
A
E
 
R
L
 
L
E
 
G
G
 
-
H
 
-
P
 
-
D
 
S
N
x
D
V
 
V
A
 
P
P
 
F
A
 
A
L
 
L
L
 
H
G
 
G
G
 
G
I
 
T
-
 
A
-
 
L
-
 
G
-
 
T
-
 
G
-
 
R
-
 
G
-
 
E
-
 
E
I
 
L
I
 
A
S
 
T
V
 
V
V
 
L
Q
 
S
E
 
R
G
 
N
K
 
T
V
 
F
H
 
H
W
 
W
L
 
-
K
 
-
I
 
-
T
 
-
P
 
-
P
 
-
D
 
-
G
 
-
L
 
-
S
 
-
T
 
-
V
 
V
V
 
L
A
 
A
V
 
F
P
 
A
D
 
D
F
 
S
K
 
G
L
 
L
S
 
L
T
 
T
R
 
S
A
 
A
A
 
V
R
 
Y
E
 
N
V
 
E
L
 
L
P
 
D
K
 
R
T
 
L
V
 
R
S
 
E
L
 
V
Q
 
G
D
 
D
A
 
P
V
 
P
F
 
R
N
 
L
L
 
G
S
 
E
R
 
P
S
 
G
A
 
P
L
 
V
L
 
L
V
 
A
G
 
A
A
 
L
L
 
A
C
 
A
G
 
G
K
 
D
R
 
P
L
 
D
D
 
Q
L
 
L
L
 
A
Q
 
P
V
 
L
A
 
L
G
 
G
E
 
N
D
 
E
L
 
M
L
 
-
H
 
-
Q
 
Q
P
 
A
Y
 
A
R
 
A
S
 
V
Q
 
S
L
 
L
V
 
D
P
 
P
G
 
A
M
 
L
T
 
A
E
 
R
V
 
A
I
 
L
S
 
R
N
 
A
A
 
G
R
 
V
R
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
L
N
 
A
V
 
G
T
 
I
L
 
V
S
 
S
G
 
G
A
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
T
V
 
C
I
 
A
A
 
F
L
 
L
T
 
C
D
 
T
G
 
S
P
 
A
N
 
S
P
 
S
Q
 
A
V
 
I
A
 
D
Q
 
-
V
 
-
M
 
V
E
 
G
N
 
A
S
 
Q
F
 
L
A
 
S
A
 
G
A
 
A
G
 
G
V
 
V
K
 
C
C
 
R
L
 
T
V
 
V
K
 
R
V
 
V
L
 
A
E
 
T
P
 
G
T
 
P
V
 
V
A
 
P
G
 
G
A
 
A
E
 
R
I
 
V
I
 
V

Sites not aligning to the query:

6mdeA Mevalonate kinase from methanosarcina mazei with mevalonate bound (see paper)
23% identity, 75% coverage: 76:299/300 of query aligns to 75:301/302 of 6mdeA

query
sites
6mdeA
P
 
P
C
 
I
P
 
N
G
 
G
L
 
V
V
 
F
I
 
L
K
 
T
L
 
V
T
 
D
N
 
S
H
 
D
I
 
I
P
 
P
A
 
V
A
 
G
R
 
S
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
S
S
 
S
A
 
A
S
 
A
A
 
V
I
 
T
V
 
I
G
 
A
G
 
S
L
 
I
V
 
G
A
 
A
A
 
L
N
 
N
R
 
E
L
 
L
A
 
F
G
 
G
D
 
F
P
 
G
F
 
L
T
 
S
P
 
L
E
 
Q
K
 
E
L
 
I
L
 
A
A
 
K
L
 
L
A
 
G
T
 
H
E
 
E
L
 
I
E
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
V
-
 
Q
-
 
G
-
 
A
G
 
A
H
 
S
P
 
P
D
 
T
N
 
D
V
 
T
A
 
Y
P
 
V
A
 
S
L
 
T
L
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
-
I
 
V
I
 
V
S
 
T
V
 
I
V
 
P
Q
 
E
E
 
R
G
 
R
K
 
K
V
 
L
H
 
K
W
 
-
L
 
-
K
 
-
I
 
-
T
 
T
P
 
P
P
 
D
D
 
C
G
 
G
L
 
I
-
 
V
-
 
I
-
 
G
-
 
D
-
 
T
S
 
G
T
 
V
V
 
F
V
 
S
A
 
S
V
 
T
P
 
K
D
 
E
F
 
L
K
 
V
L
 
A
S
 
N
T
 
V
R
 
R
A
 
Q
A
 
L
R
 
R
E
 
E
V
 
S
L
 
Y
P
 
P
K
 
D
T
 
L
V
 
I
S
 
E
-
 
P
L
 
L
Q
 
M
D
 
T
A
 
S
V
 
I
F
 
G
N
 
K
L
 
I
S
 
S
R
 
R
-
 
I
-
 
G
-
 
E
-
 
Q
-
 
L
-
 
V
-
 
L
-
 
S
-
 
G
S
 
D
A
 
Y
L
 
A
L
 
S
V
 
I
G
 
G
A
 
R
L
 
L
C
 
M
G
 
N
K
 
V
R
 
N
L
 
Q
D
 
G
L
 
L
L
 
L
Q
 
D
V
 
A
A
 
L
G
 
G
E
 
V
D
 
N
L
 
I
L
 
L
H
 
E
Q
 
-
P
 
-
Y
 
-
R
 
-
S
 
-
Q
 
-
L
 
-
V
 
-
P
 
-
G
 
-
M
 
L
T
 
S
E
 
Q
V
 
L
I
 
I
S
 
Y
N
 
S
A
 
A
R
 
R
R
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
F
N
 
G
V
 
A
T
 
K
L
 
I
S
 
T
G
|
G
A
|
A
-
 
G
-
 
G
G
 
G
P
 
G
A
 
C
V
 
M
I
 
V
A
 
A
L
 
L
T
 
T
D
 
-
G
 
-
P
 
-
N
 
A
P
 
P
Q
 
E
V
 
K
A
 
C
Q
 
N
V
 
Q
M
 
V
E
 
A
N
 
E
S
 
A
F
 
V
A
 
A
A
 
G
A
 
A
G
 
G
V
 
G
K
 
K
C
 
-
L
 
-
V
 
V
K
 
T
V
 
I
L
 
T
E
 
K
P
 
P
T
 
T
V
 
E
A
 
Q
G
 
G
A
 
L
E
 
K
I
 
V

Sites not aligning to the query:

6mdfA Mevalonate kinase from methanosarcina mazei with 5-phosphomevalonate bound (see paper)
23% identity, 75% coverage: 76:299/300 of query aligns to 76:302/303 of 6mdfA

query
sites
6mdfA
P
 
P
C
 
I
P
 
N
G
 
G
L
 
V
V
 
F
I
 
L
K
 
T
L
 
V
T
 
D
N
 
S
H
 
D
I
 
I
P
 
P
A
 
V
A
 
G
R
 
S
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
S
S
 
S
A
 
A
S
 
A
A
 
V
I
 
T
V
 
I
G
 
A
G
 
S
L
 
I
V
 
G
A
 
A
A
 
L
N
 
N
R
 
E
L
 
L
A
 
F
G
 
G
D
 
F
P
 
G
F
 
L
T
 
S
P
 
L
E
 
Q
K
 
E
L
 
I
L
 
A
A
 
K
L
 
L
A
 
G
T
 
H
E
 
E
L
 
I
E
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
V
-
 
Q
-
 
G
-
 
A
G
 
A
H
 
S
P
 
P
D
 
T
N
x
D
V
 
T
A
 
Y
P
 
V
A
 
S
L
 
T
L
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
-
I
 
V
I
 
V
S
 
T
V
 
I
V
 
P
Q
 
E
E
 
R
G
 
R
K
 
K
V
 
L
H
 
K
W
 
-
L
 
-
K
 
-
I
 
-
T
 
T
P
 
P
P
 
D
D
 
C
G
 
G
L
 
I
-
 
V
-
 
I
-
 
G
-
 
D
-
 
T
S
 
G
T
 
V
V
 
F
V
 
S
A
 
S
V
 
T
P
 
K
D
 
E
F
 
L
K
 
V
L
 
A
S
 
N
T
 
V
R
 
R
A
 
Q
A
 
L
R
 
R
E
 
E
V
 
S
L
 
Y
P
 
P
K
 
D
T
 
L
V
 
I
S
 
E
-
 
P
L
 
L
Q
 
M
D
 
T
A
 
S
V
 
I
F
 
G
N
 
K
L
 
I
S
 
S
R
 
R
-
 
I
-
 
G
-
 
E
-
 
Q
-
 
L
-
 
V
-
 
L
-
 
S
-
 
G
S
 
D
A
 
Y
L
 
A
L
 
S
V
 
I
G
 
G
A
 
R
L
 
L
C
 
M
G
 
N
K
 
V
R
 
N
L
 
Q
D
 
G
L
 
L
L
 
L
Q
 
D
V
 
A
A
 
L
G
 
G
E
 
V
D
 
N
L
 
I
L
 
L
H
 
E
Q
 
-
P
 
-
Y
 
-
R
 
-
S
 
-
Q
 
-
L
 
-
V
 
-
P
 
-
G
 
-
M
 
L
T
 
S
E
 
Q
V
 
L
I
 
I
S
 
Y
N
 
S
A
 
A
R
 
R
R
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
F
N
 
G
V
 
A
T
 
K
L
 
I
S
 
T
G
|
G
A
|
A
-
 
G
-
 
G
G
 
G
P
 
G
A
 
C
V
 
M
I
 
V
A
 
A
L
 
L
T
 
T
D
 
-
G
 
-
P
 
-
N
 
A
P
 
P
Q
 
E
V
 
K
A
 
C
Q
 
N
V
 
Q
M
 
V
E
 
A
N
 
E
S
 
A
F
 
V
A
 
A
A
 
G
A
 
A
G
 
G
V
 
G
K
 
K
C
 
-
L
 
-
V
 
V
K
 
T
V
 
I
L
 
T
E
 
K
P
 
P
T
 
T
V
 
E
A
 
Q
G
 
G
A
 
L
E
 
K
I
 
V

Sites not aligning to the query:

4hacA Crystal structure of the mevalonate kinase from an archaeon methanosarcina mazei (see paper)
23% identity, 75% coverage: 76:299/300 of query aligns to 85:311/312 of 4hacA

query
sites
4hacA
P
 
P
C
 
I
P
 
N
G
 
G
L
 
V
V
 
F
I
 
L
K
 
T
L
 
V
T
 
D
N
 
S
H
 
D
I
 
I
P
 
P
A
 
V
A
 
G
R
 
S
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
S
S
 
S
A
 
A
S
 
A
A
 
V
I
 
T
V
 
I
G
 
A
G
 
S
L
 
I
V
 
G
A
 
A
A
 
L
N
 
N
R
 
E
L
 
L
A
 
F
G
 
G
D
 
F
P
 
G
F
 
L
T
 
S
P
 
L
E
 
Q
K
 
E
L
 
I
L
 
A
A
 
K
L
 
L
A
 
G
T
 
H
E
 
E
L
 
I
E
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
V
-
 
Q
-
 
G
-
 
A
G
 
A
H
 
S
P
 
P
D
 
T
N
 
D
V
 
T
A
 
Y
P
 
V
A
 
S
L
 
T
L
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
-
I
 
V
I
 
V
S
 
T
V
 
I
V
 
P
Q
 
E
E
 
R
G
 
R
K
 
K
V
 
L
H
 
K
W
 
-
L
 
-
K
 
-
I
 
-
T
 
T
P
 
P
P
 
D
D
 
C
G
 
G
L
 
I
-
 
V
-
 
I
-
 
G
-
 
D
-
 
T
S
 
G
T
 
V
V
 
F
V
 
S
A
 
S
V
 
T
P
 
K
D
 
E
F
 
L
K
 
V
L
 
A
S
 
N
T
 
V
R
 
R
A
 
Q
A
 
L
R
 
R
E
 
E
V
 
S
L
 
Y
P
 
P
K
 
D
T
 
L
V
 
I
S
 
E
-
 
P
L
 
L
Q
 
M
D
 
T
A
 
S
V
 
I
F
 
G
N
 
K
L
 
I
S
 
S
R
 
R
-
 
I
-
 
G
-
 
E
-
 
Q
-
 
L
-
 
V
-
 
L
-
 
S
-
 
G
S
 
D
A
 
Y
L
 
A
L
 
S
V
 
I
G
 
G
A
 
R
L
 
L
C
 
M
G
 
N
K
 
V
R
 
N
L
 
Q
D
 
G
L
 
L
L
 
L
Q
 
D
V
 
A
A
 
L
G
 
G
E
 
V
D
 
N
L
 
I
L
 
L
H
 
E
Q
 
-
P
 
-
Y
 
-
R
 
-
S
 
-
Q
 
-
L
 
-
V
 
-
P
 
-
G
 
-
M
 
L
T
 
S
E
 
Q
V
 
L
I
 
I
S
 
Y
N
 
S
A
 
A
R
 
R
R
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
F
N
 
G
V
 
A
T
 
K
L
 
I
S
 
T
G
 
G
A
 
A
-
 
G
-
 
G
G
 
G
P
 
G
A
 
C
V
 
M
I
 
V
A
 
A
L
 
L
T
 
T
D
 
-
G
 
-
P
 
-
N
 
A
P
 
P
Q
 
E
V
 
K
A
 
C
Q
 
N
V
 
Q
M
 
V
E
 
A
N
 
E
S
 
A
F
 
V
A
 
A
A
 
G
A
 
A
G
 
G
V
 
G
K
 
K
C
 
-
L
 
-
V
 
V
K
 
T
V
 
I
L
 
T
E
 
K
P
 
P
T
 
T
V
 
E
A
 
Q
G
 
G
A
 
L
E
 
K
I
 
V

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_013842893.1 NCBI__GCF_000215085.1:WP_013842893.1
MNNSVKVTVPATTANMGPGFDCLGMALKLYNQVEISPTDGGLAIEIQGEGAGDIRKDEGN
IVFKAVERLFQEAGRPCPGLVIKLTNHIPAARGLGSSASAIVGGLVAANRLAGDPFTPEK
LLALATELEGHPDNVAPALLGGIIISVVQEGKVHWLKITPPDGLSTVVAVPDFKLSTRAA
REVLPKTVSLQDAVFNLSRSALLVGALCGKRLDLLQVAGEDLLHQPYRSQLVPGMTEVIS
NARRAGALNVTLSGAGPAVIALTDGPNPQVAQVMENSFAAAGVKCLVKVLEPTVAGAEII

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory