SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_014025935.1 NCBI__GCF_000223395.1:WP_014025935.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

2btyA Acetylglutamate kinase from thermotoga maritima complexed with its inhibitor arginine (see paper)
40% identity, 94% coverage: 3:255/270 of query aligns to 24:263/282 of 2btyA

query
sites
2btyA
L
 
F
V
 
V
V
 
I
K
|
K
A
 
F
G
|
G
G
|
G
R
 
S
A
 
A
L
 
M
E
 
K
Q
 
Q
N
 
E
M
 
N
E
 
A
R
 
K
-
 
K
-
 
A
I
 
F
L
 
I
D
 
Q
S
 
D
I
 
I
A
 
I
W
 
L
A
 
L
V
 
K
Q
 
Y
E
 
T
G
 
G
H
 
I
K
 
K
V
 
P
V
 
I
F
 
I
V
 
V
H
 
H
G
|
G
G
|
G
G
|
G
D
 
P
L
 
A
V
 
I
T
 
S
E
 
Q
Y
 
M
S
 
M
K
 
K
K
 
D
M
 
L
G
 
G
V
 
I
E
 
E
P
 
P
K
 
-
I
 
-
M
 
-
M
 
V
S
 
F
A
 
K
S
 
N
G
 
G
V
 
-
R
 
-
F
 
H
R
 
R
Y
 
V
T
 
T
D
 
D
E
 
E
E
 
K
E
 
T
L
 
M
E
 
E
V
 
I
F
 
V
V
 
E
M
 
M
V
 
V
L
 
L
A
 
V
G
 
G
L
 
K
L
 
I
N
 
N
K
 
K
R
 
E
I
 
I
V
 
V
A
 
M
G
 
N
L
 
L
E
 
N
K
 
L
R
 
H
G
 
G
V
 
G
K
 
R
A
 
A
L
 
V
G
 
G
V
 
I
S
 
C
G
 
G
V
 
K
D
 
D
A
 
S
G
 
K
M
 
L
I
 
I
R
 
V
A
 
A
E
 
E
R
 
K
K
 
-
K
 
-
H
 
-
V
 
-
I
 
-
V
 
-
I
 
-
D
 
-
P
 
-
E
 
E
T
 
T
G
 
K
R
 
H
K
 
G
R
 
D
L
 
I
L
 
-
P
 
-
G
 
-
G
 
G
Y
 
Y
T
 
V
G
 
G
K
 
K
I
 
V
R
 
K
S
 
K
V
 
V
D
 
N
A
 
P
N
 
E
A
 
I
M
 
L
T
 
H
R
 
A
L
 
L
L
 
I
D
 
E
A
 
N
G
 
D
F
 
Y
T
 
I
L
 
P
V
 
V
V
 
I
A
 
A
P
 
P
L
 
V
A
 
G
L
 
I
G
 
G
T
 
E
E
 
D
G
 
G
E
 
H
M
 
S
L
 
Y
N
 
N
V
 
I
D
x
N
G
 
A
D
|
D
Q
 
T
A
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
E
I
 
I
A
 
A
K
 
K
A
 
S
L
 
L
R
 
M
A
 
A
D
 
E
K
|
K
L
 
L
I
 
I
L
 
L
L
 
L
T
 
T
D
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
L
 
V
L
 
L
I
 
K
D
 
D
G
 
G
K
 
K
L
 
L
V
 
I
E
x
S
S
 
T
L
 
L
T
 
T
P
 
P
D
 
D
E
 
E
A
 
A
R
 
E
A
 
E
L
 
L
L
 
I
E
 
R
-
 
D
-
 
G
K
 
T
I
 
V
G
 
T
P
 
G
G
 
G
M
 
M
N
 
I
R
 
P
K
|
K
V
 
V
M
 
E
M
 
C
A
 
A
V
 
V
E
 
S
A
 
A
L
 
V
E
 
R
A
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
G
E
 
A
V
 
V
V
 
H
I
 
I
G
 
I
S
 
N
G
 
G
L
 
G
R
 
L
E
 
E
N
 
H
P
 
A
I
 
I

Sites not aligning to the query:

Q9X2A4 Acetylglutamate kinase; N-acetyl-L-glutamate 5-phosphotransferase; NAG kinase; NAGK; EC 2.7.2.8 from Thermotoga maritima (strain ATCC 43589 / DSM 3109 / JCM 10099 / NBRC 100826 / MSB8) (see paper)
40% identity, 94% coverage: 3:255/270 of query aligns to 24:263/282 of Q9X2A4

query
sites
Q9X2A4
L
 
F
V
 
V
V
 
I
K
 
K
A
 
F
G
 
G
G
 
G
R
 
S
A
 
A
L
 
M
E
 
K
Q
 
Q
N
 
E
M
 
N
E
 
A
R
 
K
-
 
K
-
 
A
I
 
F
L
 
I
D
 
Q
S
 
D
I
 
I
A
 
I
W
 
L
A
 
L
V
 
K
Q
 
Y
E
 
T
G
 
G
H
 
I
K
 
K
V
 
P
V
 
I
F
 
I
V
 
V
H
 
H
G
 
G
G
 
G
G
 
G
D
 
P
L
 
A
V
 
I
T
 
S
E
 
Q
Y
 
M
S
 
M
K
 
K
K
 
D
M
 
L
G
 
G
V
 
I
E
 
E
P
 
P
K
 
-
I
 
-
M
 
-
M
 
V
S
 
F
A
 
K
S
 
N
G
 
G
V
 
-
R
 
-
F
 
H
R
 
R
Y
 
V
T
 
T
D
 
D
E
 
E
E
 
K
E
 
T
L
 
M
E
 
E
V
 
I
F
 
V
V
 
E
M
 
M
V
 
V
L
 
L
A
 
V
G
 
G
L
 
K
L
 
I
N
 
N
K
 
K
R
 
E
I
 
I
V
 
V
A
 
M
G
 
N
L
 
L
E
 
N
K
 
L
R
 
H
G
 
G
V
 
G
K
 
R
A
 
A
L
 
V
G
 
G
V
 
I
S
 
C
G
 
G
V
 
K
D
 
D
A
 
S
G
 
K
M
 
L
I
 
I
R
 
V
A
 
A
E
 
E
R
 
K
K
 
-
K
 
-
H
 
-
V
 
-
I
 
-
V
 
-
I
 
-
D
 
-
P
 
-
E
 
E
T
 
T
G
 
K
R
 
H
K
 
G
R
 
D
L
 
I
L
 
-
P
 
-
G
 
-
G
 
G
Y
 
Y
T
 
V
G
 
G
K
 
K
I
 
V
R
 
K
S
 
K
V
 
V
D
 
N
A
 
P
N
 
E
A
 
I
M
 
L
T
 
H
R
 
A
L
 
L
L
 
I
D
 
E
A
 
N
G
 
D
F
 
Y
T
 
I
L
 
P
V
 
V
V
 
I
A
 
A
P
 
P
L
 
V
A
 
G
L
 
I
G
 
G
T
 
E
E
 
D
G
 
G
E
 
H
M
 
S
L
 
Y
N
|
N
V
 
I
D
 
N
G
 
A
D
 
D
Q
 
T
A
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
E
I
 
I
A
 
A
K
 
K
A
 
S
L
 
L
R
 
M
A
 
A
D
 
E
K
|
K
L
 
L
I
 
I
L
 
L
L
 
L
T
 
T
D
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
L
 
V
L
 
L
I
 
K
D
 
D
G
 
G
K
 
K
L
 
L
V
 
I
E
x
S
S
 
T
L
 
L
T
 
T
P
 
P
D
 
D
E
 
E
A
 
A
R
 
E
A
 
E
L
 
L
L
 
I
E
 
R
-
 
D
-
 
G
K
 
T
I
 
V
G
 
T
P
 
G
G
 
G
M
 
M
N
 
I
R
 
P
K
 
K
V
 
V
M
 
E
M
 
C
A
 
A
V
 
V
E
 
S
A
 
A
L
 
V
E
 
R
A
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
G
E
 
A
V
 
V
V
 
H
I
 
I
G
 
I
S
 
N
G
 
G
L
 
G
R
 
L
E
 
E
N
 
H
P
 
A
I
 
I

Sites not aligning to the query:

3wwmA Crystal structure of lysz from thermus thermophilus with adp (see paper)
37% identity, 96% coverage: 2:261/270 of query aligns to 1:263/269 of 3wwmA

query
sites
3wwmA
L
 
M
L
 
I
V
 
V
V
 
V
K
|
K
A
 
V
G
 
G
G
|
G
R
 
-
A
 
A
L
 
E
E
 
G
Q
 
I
N
 
N
M
 
Y
E
 
E
R
 
A
I
 
V
L
 
A
D
 
K
S
 
D
I
 
A
A
 
A
W
 
S
A
 
L
V
 
W
Q
 
K
E
 
E
G
 
G
H
 
V
K
 
K
V
 
L
V
 
L
F
 
L
V
 
V
H
 
H
G
|
G
G
|
G
G
x
S
D
 
A
L
 
E
V
 
T
T
 
N
E
 
K
Y
 
V
S
 
A
K
 
E
K
 
A
M
 
L
G
 
G
V
 
H
E
 
P
P
 
P
K
 
R
I
 
F
M
 
L
M
 
T
S
 
H
A
 
P
S
 
G
G
 
G
V
 
Q
R
 
V
F
 
S
R
 
R
Y
 
L
T
 
T
D
 
D
E
 
R
E
 
K
E
 
T
L
 
L
E
 
E
V
 
I
F
 
F
V
 
E
M
 
M
V
 
V
L
x
Y
A
 
C
G
 
G
L
 
L
L
 
V
N
 
N
K
 
K
R
 
R
I
 
L
V
 
V
A
 
E
G
 
L
L
 
L
E
 
Q
K
 
K
R
 
E
G
 
G
V
 
A
K
 
N
A
 
A
L
 
I
G
 
G
V
 
L
S
 
S
G
 
G
V
 
L
D
 
D
A
 
G
G
 
R
M
 
L
I
 
F
R
 
V
A
 
G
E
 
R
R
 
R
K
 
K
K
 
T
H
 
A
V
 
V
I
 
K
V
 
Y
I
 
V
D
 
-
P
 
-
E
 
E
T
 
N
G
 
G
R
 
K
K
 
V
R
 
K
L
 
V
L
 
H
P
 
R
G
 
G
G
 
D
Y
 
Y
T
 
T
G
 
G
K
 
T
I
 
V
R
 
E
S
 
E
V
 
V
D
 
N
A
 
K
N
 
A
A
 
L
M
 
L
T
 
D
R
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
Q
A
 
A
G
 
G
F
 
Y
T
 
L
L
 
P
V
 
V
V
 
L
A
 
T
P
 
P
L
 
P
A
 
A
L
 
L
G
 
S
T
 
Y
E
 
E
G
 
N
E
 
E
M
 
A
L
 
I
N
 
N
V
 
T
D
 
D
G
 
G
D
|
D
Q
 
Q
A
 
I
A
 
A
A
 
A
E
 
L
I
 
L
A
 
A
K
 
T
A
 
L
L
 
Y
R
 
G
A
 
A
D
 
E
K
 
A
L
 
L
I
 
V
L
 
Y
L
 
L
T
 
S
D
 
N
V
 
V
D
 
P
G
 
G
L
 
L
L
 
L
I
 
-
D
 
-
G
 
-
K
 
-
L
 
-
V
 
-
E
 
-
S
 
A
L
 
R
T
x
Y
P
 
P
D
 
D
E
 
E
A
 
A
R
 
S
A
 
L
L
 
V
L
 
R
E
 
E
-
 
I
-
 
P
-
 
V
-
 
E
-
 
R
-
 
I
-
 
E
-
 
D
-
 
P
-
 
E
-
 
Y
-
 
L
K
 
A
I
 
L
G
 
A
P
 
Q
G
 
G
-
 
R
M
|
M
N
 
K
R
 
R
K
|
K
V
 
V
M
 
M
M
 
G
A
 
A
V
 
V
E
 
E
A
 
A
L
 
V
E
 
R
A
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
K
E
 
R
V
 
V
V
 
V
I
 
F
G
 
A
S
 
D
G
 
A
L
 
R
R
 
V
E
 
E
N
 
N
P
 
P
I
 
I
R
 
R
E
 
R
L
 
A
L
 
L
E
 
S
G
 
G

O50147 [LysW]-aminoadipate kinase; EC 2.7.2.17 from Thermus thermophilus (strain ATCC BAA-163 / DSM 7039 / HB27) (see paper)
37% identity, 96% coverage: 2:261/270 of query aligns to 1:263/269 of O50147

query
sites
O50147
L
 
M
L
 
I
V
 
V
V
 
V
K
 
K
A
 
V
G
 
G
G
 
G
R
 
-
A
 
A
L
 
E
E
 
G
Q
 
I
N
 
N
M
 
Y
E
 
E
R
 
A
I
 
V
L
 
A
D
 
K
S
 
D
I
 
A
A
 
A
W
 
S
A
 
L
V
 
W
Q
 
K
E
 
E
G
 
G
H
 
V
K
 
K
V
 
L
V
 
L
F
 
L
V
 
V
H
 
H
G
 
G
G
 
G
G
 
S
D
 
A
L
 
E
V
 
T
T
 
N
E
 
K
Y
 
V
S
 
A
K
 
E
K
 
A
M
 
L
G
 
G
V
 
H
E
 
P
P
 
P
K
 
R
I
 
F
M
 
L
M
 
T
S
x
H
A
 
P
S
 
G
G
 
G
V
 
Q
R
 
V
F
 
S
R
 
R
Y
 
L
T
 
T
D
 
D
E
 
R
E
 
K
E
 
T
L
 
L
E
 
E
V
 
I
F
 
F
V
 
E
M
 
M
V
 
V
L
 
Y
A
 
C
G
 
G
L
 
L
L
 
V
N
 
N
K
 
K
R
 
R
I
 
L
V
 
V
A
 
E
G
 
L
L
 
L
E
 
Q
K
 
K
R
 
E
G
 
G
V
 
A
K
 
N
A
 
A
L
 
I
G
 
G
V
 
L
S
 
S
G
 
G
V
 
L
D
 
D
A
 
G
G
 
R
M
 
L
I
 
F
R
 
V
A
 
G
E
x
R
R
|
R
K
|
K
K
 
T
H
 
A
V
 
V
I
x
K
V
 
Y
I
 
V
D
 
-
P
 
-
E
 
E
T
 
N
G
 
G
R
x
K
K
 
V
R
x
K
L
 
V
L
 
H
P
x
R
G
 
G
G
 
D
Y
 
Y
T
 
T
G
 
G
K
 
T
I
 
V
R
 
E
S
 
E
V
 
V
D
 
N
A
 
K
N
 
A
A
 
L
M
 
L
T
 
D
R
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
Q
A
 
A
G
 
G
F
 
Y
T
 
L
L
 
P
V
 
V
V
 
L
A
 
T
P
 
P
L
 
P
A
 
A
L
 
L
G
 
S
T
 
Y
E
 
E
G
 
N
E
 
E
M
 
A
L
 
I
N
 
N
V
 
T
D
 
D
G
 
G
D
 
D
Q
 
Q
A
 
I
A
 
A
A
 
A
E
 
L
I
 
L
A
 
A
K
 
T
A
 
L
L
 
Y
R
 
G
A
 
A
D
 
E
K
 
A
L
 
L
I
 
V
L
 
Y
L
 
L
T
 
S
D
 
N
V
 
V
D
 
P
G
 
G
L
 
L
L
 
L
I
 
-
D
 
-
G
 
-
K
 
-
L
 
-
V
 
-
E
 
-
S
 
A
L
 
R
T
 
Y
P
 
P
D
 
D
E
 
E
A
 
A
R
 
S
A
 
L
L
 
V
L
 
R
E
 
E
-
 
I
-
 
P
-
 
V
-
 
E
-
 
R
-
 
I
-
 
E
-
 
D
-
 
P
-
 
E
-
 
Y
-
 
L
K
 
A
I
 
L
G
 
A
P
 
Q
G
 
G
-
x
R
M
 
M
N
 
K
R
|
R
K
|
K
V
 
V
M
 
M
M
 
G
A
 
A
V
 
V
E
 
E
A
 
A
L
 
V
E
 
R
A
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
K
E
 
R
V
 
V
V
 
V
I
 
F
G
 
A
S
 
D
G
 
A
L
 
R
R
 
V
E
 
E
N
 
N
P
 
P
I
 
I
R
 
R
E
 
R
L
 
A
L
 
L
E
 
S
G
 
G

2v5hB Controlling the storage of nitrogen as arginine: the complex of pii and acetylglutamate kinase from synechococcus elongatus pcc 7942 (see paper)
31% identity, 93% coverage: 3:252/270 of query aligns to 25:288/289 of 2v5hB

query
sites
2v5hB
L
 
V
V
 
V
V
 
V
K
|
K
A
 
Y
G
 
G
G
|
G
R
 
A
A
 
A
L
 
M
E
 
K
Q
 
Q
N
 
E
-
 
E
-
 
L
M
 
K
E
 
E
R
 
A
I
 
V
L
 
M
D
 
R
S
 
D
I
 
I
A
 
V
W
 
F
A
 
L
V
 
A
Q
 
C
E
 
V
G
 
G
H
 
M
K
 
R
V
 
P
V
 
V
F
 
V
V
 
V
H
 
H
G
|
G
G
 
G
G
|
G
D
 
P
L
 
E
V
 
I
T
 
N
E
 
A
Y
 
W
S
 
L
K
 
G
K
 
R
M
 
V
G
 
G
V
 
I
E
 
E
P
 
P
K
 
Q
I
 
F
M
 
H
M
 
N
S
 
G
A
 
-
S
 
-
G
 
-
V
 
-
R
 
-
F
 
L
R
|
R
Y
 
V
T
 
T
D
 
D
E
 
A
E
 
D
E
 
T
L
 
M
E
 
E
V
 
V
F
 
V
V
 
E
M
 
M
V
 
V
L
 
L
A
 
V
G
 
G
L
 
R
L
 
V
N
 
N
K
 
K
R
 
D
I
 
I
V
 
V
A
 
S
G
 
R
L
 
I
E
 
N
K
 
T
R
 
T
G
 
G
V
 
G
K
 
R
A
 
A
L
 
V
G
 
G
V
 
F
S
 
C
G
 
G
V
 
T
D
 
D
A
 
G
G
 
R
M
 
L
I
 
V
R
 
L
A
 
A
E
 
R
R
 
P
K
 
H
K
 
D
H
 
Q
V
 
E
I
 
G
V
 
I
I
 
-
D
 
-
P
 
-
E
 
-
T
 
-
G
 
-
R
 
-
K
 
-
R
 
-
L
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
-
G
 
G
Y
 
F
T
 
V
G
 
G
K
 
E
I
 
V
R
 
N
S
 
S
V
 
V
D
 
N
A
 
S
N
 
E
A
 
V
M
 
I
T
 
E
R
 
P
L
 
L
L
 
L
D
 
E
A
 
R
G
 
G
F
 
Y
T
 
I
L
 
P
V
 
V
V
 
I
A
 
S
P
 
S
L
 
V
A
 
A
L
 
A
G
 
D
T
 
E
E
 
N
G
 
G
E
 
Q
M
 
S
L
 
F
N
|
N
V
 
I
D
 
N
G
x
A
D
|
D
Q
 
T
A
 
V
A
 
A
A
 
G
E
 
E
I
 
I
A
 
A
K
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
N
A
 
A
D
 
E
K
 
K
L
 
L
I
 
I
L
 
L
L
 
L
T
 
T
D
 
D
V
 
T
D
 
R
G
 
G
L
 
I
L
 
L
I
 
E
D
 
D
G
 
P
K
 
K
L
 
R
V
 
P
E
 
E
S
 
S
L
 
L
T
 
I
P
 
P
-
 
R
-
 
L
-
 
N
-
 
I
D
 
P
E
 
Q
A
 
S
R
 
R
A
 
E
L
 
L
L
 
I
E
 
A
K
 
Q
-
 
G
-
 
I
I
 
V
G
 
G
P
 
G
G
 
G
M
 
M
N
 
I
R
 
P
K
|
K
V
 
V
M
 
D
M
 
C
A
 
C
V
 
I
E
 
R
A
 
S
L
 
L
-
 
A
-
 
Q
-
 
G
-
 
V
-
 
R
-
 
A
-
 
A
-
 
H
-
 
I
-
 
I
-
 
D
-
 
G
-
 
R
-
 
I
-
 
P
-
 
H
-
 
A
-
 
L
-
 
L
-
 
L
-
 
E
-
 
I
-
 
F
-
 
T
E
 
D
A
 
A
G
 
G
V
 
I
G
 
G
E
 
T
V
 
M
V
 
I
I
 
V
G
 
G
S
 
S
G
 
G
L
 
Y
R
 
H
E
 
E

2bufC Arginine feed-back inhibitable acetylglutamate kinase (see paper)
33% identity, 96% coverage: 3:260/270 of query aligns to 29:283/298 of 2bufC

query
sites
2bufC
L
 
L
V
 
V
V
 
I
K
|
K
A
 
Y
G
 
G
G
|
G
R
x
N
A
 
A
L
 
M
E
 
E
Q
 
S
N
 
-
M
 
-
E
 
E
R
 
E
I
 
L
L
 
K
D
 
A
S
 
G
I
 
F
A
 
A
W
 
R
A
 
D
V
 
V
-
 
V
-
 
L
-
 
M
-
 
K
Q
 
A
E
 
V
G
 
G
H
 
I
K
 
N
V
 
P
V
 
V
F
 
V
V
 
V
H
 
H
G
 
G
G
 
G
G
|
G
D
 
P
L
 
Q
V
 
I
T
 
G
E
 
D
Y
 
L
S
 
L
K
 
K
K
 
R
M
 
L
G
 
S
V
 
I
E
 
E
P
 
S
K
 
H
I
 
F
M
 
I
M
 
D
S
 
G
A
 
-
S
 
-
G
 
-
V
 
-
R
 
-
F
 
M
R
 
R
Y
 
V
T
 
T
D
 
D
E
 
A
E
 
A
E
 
T
L
 
M
E
 
D
V
 
V
F
 
V
V
 
E
M
 
M
V
 
V
L
 
L
A
 
G
G
 
G
L
 
Q
L
 
V
N
 
N
K
 
K
R
 
D
I
 
I
V
 
V
A
 
N
G
 
L
L
 
I
E
 
N
K
 
R
R
 
H
G
 
G
V
 
G
K
 
S
A
 
A
L
 
I
G
 
G
V
 
L
S
 
T
G
 
G
V
 
K
D
 
D
A
 
A
G
 
E
M
 
L
I
 
I
R
 
R
A
 
A
E
 
-
R
 
K
K
 
K
K
 
L
H
 
T
V
 
V
I
 
T
V
 
R
I
 
Q
D
 
T
P
 
P
E
 
E
T
 
M
G
 
T
R
 
K
K
 
P
R
 
E
L
 
I
L
 
I
P
 
D
G
 
I
G
 
G
Y
 
H
T
 
V
G
 
G
K
 
E
I
 
V
R
 
T
S
 
G
V
 
V
D
 
N
A
 
V
N
 
G
A
 
L
M
 
L
T
 
N
R
 
M
L
 
L
L
 
V
D
 
K
A
 
G
G
 
D
F
 
F
T
 
I
L
 
P
V
 
V
V
 
I
A
 
A
P
 
P
L
 
I
A
 
G
L
 
V
G
 
G
T
 
S
E
 
N
G
 
G
E
 
E
M
 
S
L
 
Y
N
 
N
V
 
I
D
 
N
G
 
A
D
|
D
Q
 
L
A
 
V
A
 
A
A
 
G
E
 
K
I
 
V
A
 
A
K
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
K
A
 
A
D
 
E
K
 
K
L
 
L
I
 
M
L
 
L
L
 
L
T
 
T
D
x
N
V
 
I
D
 
A
G
 
G
L
|
L
L
x
M
-
 
D
I
 
K
D
 
Q
G
 
G
K
 
Q
L
 
V
V
 
L
E
 
T
S
 
G
L
 
L
T
 
S
P
 
T
D
 
E
E
 
Q
A
 
V
R
 
N
A
 
E
L
 
L
L
 
I
E
 
A
-
 
D
-
 
G
K
x
T
I
|
I
G
x
Y
P
 
G
G
|
G
M
|
M
N
 
L
R
 
P
K
|
K
V
 
I
M
 
R
M
 
C
A
 
A
V
 
L
E
 
E
A
 
A
L
 
V
E
 
Q
A
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
T
E
 
S
V
 
A
V
 
H
I
 
I
G
 
I
S
 
D
G
 
G
L
 
R
R
 
V
E
 
P
N
 
N
P
 
A
I
 
V
R
 
-
E
 
-
L
 
L
L
 
L
E
 
E

Q9HTN2 Acetylglutamate kinase; N-acetyl-L-glutamate 5-phosphotransferase; NAG kinase; NAGK; EC 2.7.2.8 from Pseudomonas aeruginosa (strain ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1) (see 2 papers)
33% identity, 96% coverage: 3:260/270 of query aligns to 30:284/301 of Q9HTN2

query
sites
Q9HTN2
L
 
L
V
 
V
V
 
I
K
 
K
A
 
Y
G
 
G
G
 
G
R
 
N
A
 
A
L
 
M
E
 
E
Q
 
S
N
 
-
M
 
-
E
 
E
R
 
E
I
 
L
L
 
K
D
 
A
S
 
G
I
 
F
A
 
A
W
 
R
A
 
D
V
 
V
-
 
V
-
 
L
-
 
M
-
 
K
Q
 
A
E
 
V
G
 
G
H
 
I
K
 
N
V
 
P
V
 
V
F
 
V
V
 
V
H
 
H
G
 
G
G
 
G
G
 
G
D
 
P
L
 
Q
V
 
I
T
 
G
E
 
D
Y
 
L
S
 
L
K
 
K
K
 
R
M
 
L
G
 
S
V
 
I
E
 
E
P
 
S
K
 
H
I
 
F
M
 
I
M
 
D
S
 
G
A
 
-
S
 
-
G
 
-
V
 
-
R
 
-
F
 
M
R
|
R
Y
 
V
T
 
T
D
 
D
E
 
A
E
 
A
E
 
T
L
 
M
E
 
D
V
 
V
F
 
V
V
 
E
M
 
M
V
 
V
L
 
L
A
 
G
G
 
G
L
 
Q
L
 
V
N
 
N
K
 
K
R
 
D
I
 
I
V
 
V
A
 
N
G
 
L
L
 
I
E
 
N
K
 
R
R
 
H
G
 
G
V
 
G
K
 
S
A
 
A
L
 
I
G
 
G
V
 
L
S
 
T
G
 
G
V
 
K
D
 
D
A
 
A
G
 
E
M
 
L
I
 
I
R
 
R
A
 
A
E
 
-
R
 
K
K
 
K
K
 
L
H
 
T
V
 
V
I
 
T
V
 
R
I
 
Q
D
 
T
P
 
P
E
 
E
T
 
M
G
 
T
R
 
K
K
 
P
R
 
E
L
 
I
L
 
I
P
 
D
G
 
I
G
 
G
Y
 
H
T
 
V
G
 
G
K
 
E
I
 
V
R
 
T
S
 
G
V
 
V
D
 
N
A
 
V
N
 
G
A
 
L
M
 
L
T
 
N
R
 
M
L
 
L
L
 
V
D
 
K
A
 
G
G
 
D
F
 
F
T
 
I
L
 
P
V
 
V
V
 
I
A
 
A
P
 
P
L
 
I
A
 
G
L
 
V
G
 
G
T
 
S
E
 
N
G
 
G
E
 
E
M
 
S
L
 
Y
N
|
N
V
 
I
D
 
N
G
 
A
D
 
D
Q
 
L
A
 
V
A
 
A
A
 
G
E
 
K
I
 
V
A
 
A
K
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
K
A
 
A
D
 
E
K
 
K
L
 
L
I
 
M
L
 
L
L
 
L
T
 
T
D
 
N
V
 
I
D
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
M
-
 
D
I
 
K
D
 
Q
G
 
G
K
 
Q
L
 
V
V
 
L
E
 
T
S
 
G
L
 
L
T
 
S
P
 
T
D
 
E
E
 
Q
A
 
V
R
 
N
A
 
E
L
 
L
L
 
I
E
 
A
-
 
D
-
 
G
K
 
T
I
 
I
G
 
Y
P
 
G
G
 
G
M
 
M
N
 
L
R
 
P
K
 
K
V
 
I
M
 
R
M
 
C
A
 
A
V
 
L
E
 
E
A
 
A
L
 
V
E
 
Q
A
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
T
E
 
S
V
 
A
V
 
H
I
 
I
G
 
I
S
 
D
G
 
G
L
 
R
R
 
V
E
 
P
N
 
N
P
 
A
I
 
V
R
 
-
E
 
-
L
 
L
L
 
L
E
 
E

Sites not aligning to the query:

2bufA Arginine feed-back inhibitable acetylglutamate kinase (see paper)
32% identity, 96% coverage: 3:260/270 of query aligns to 29:275/292 of 2bufA

query
sites
2bufA
L
 
L
V
 
V
V
 
I
K
|
K
A
 
Y
G
 
G
G
|
G
R
 
N
A
 
A
L
 
M
E
 
E
Q
 
S
N
 
-
M
 
-
E
 
E
R
 
E
I
 
L
L
 
K
D
 
A
S
 
G
I
 
F
A
 
A
W
 
R
A
 
D
V
 
V
-
 
V
-
 
L
-
 
M
-
 
K
Q
 
A
E
 
V
G
 
G
H
 
I
K
 
N
V
 
P
V
 
V
F
 
V
V
 
V
H
 
H
G
|
G
G
|
G
G
|
G
D
 
P
L
 
Q
V
 
I
T
 
G
E
 
D
Y
 
L
S
 
L
K
 
K
K
 
R
M
 
L
G
 
S
V
 
I
E
 
E
P
 
S
K
 
H
I
 
F
M
 
I
M
 
D
S
 
G
A
 
-
S
 
-
G
 
-
V
 
-
R
 
-
F
 
M
R
|
R
Y
 
V
T
 
T
D
 
D
E
 
A
E
 
A
E
 
T
L
 
M
E
 
D
V
 
V
F
 
V
V
 
E
M
 
M
V
 
V
L
 
L
A
 
G
G
 
G
L
 
Q
L
 
V
N
 
N
K
 
K
R
 
D
I
 
I
V
 
V
A
 
N
G
 
L
L
 
I
E
 
N
K
 
R
R
 
H
G
 
G
V
 
G
K
 
S
A
 
A
L
 
I
G
 
G
V
 
L
S
 
T
G
 
G
V
 
K
D
 
D
A
 
A
G
 
E
M
 
L
I
 
I
R
 
R
A
 
A
E
 
K
R
 
K
K
 
L
K
 
-
H
 
-
V
 
-
I
 
-
V
 
-
I
 
-
D
 
-
P
 
-
E
 
-
T
 
T
G
 
V
R
 
T
K
 
R
R
 
Q
L
 
I
L
 
I
P
 
D
G
 
I
G
 
G
Y
 
H
T
 
V
G
 
G
K
 
E
I
 
V
R
 
T
S
 
G
V
 
V
D
 
N
A
 
V
N
 
G
A
 
L
M
 
L
T
 
N
R
 
M
L
 
L
L
 
V
D
 
K
A
 
G
G
 
D
F
 
F
T
 
I
L
 
P
V
 
V
V
 
I
A
 
A
P
 
P
L
 
I
A
 
G
L
 
V
G
 
G
T
 
S
E
 
N
G
 
G
E
 
E
M
 
S
L
 
Y
N
|
N
V
 
I
D
 
N
G
x
A
D
|
D
Q
 
L
A
 
V
A
 
A
A
 
G
E
 
K
I
 
V
A
 
A
K
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
K
A
 
A
D
 
E
K
 
K
L
 
L
I
 
M
L
 
L
L
 
L
T
 
T
D
 
N
V
 
I
D
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
M
-
 
D
I
 
K
D
 
Q
G
 
G
K
 
Q
L
 
V
V
 
L
E
 
T
S
 
G
L
 
L
T
 
S
P
 
T
D
 
E
E
 
Q
A
 
V
R
 
N
A
 
E
L
 
L
L
 
I
E
 
A
-
 
D
-
 
G
K
 
T
I
 
I
G
 
Y
P
 
G
G
 
G
M
 
M
N
 
L
R
 
P
K
|
K
V
 
I
M
 
R
M
 
C
A
 
A
V
 
L
E
 
E
A
 
A
L
 
V
E
 
Q
A
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
T
E
 
S
V
 
A
V
 
H
I
 
I
G
 
I
S
 
D
G
 
G
L
 
R
R
 
V
E
 
P
N
 
N
P
 
A
I
 
V
R
 
-
E
 
-
L
 
L
L
 
L
E
 
E

2bufK Arginine feed-back inhibitable acetylglutamate kinase (see paper)
32% identity, 94% coverage: 3:255/270 of query aligns to 29:257/273 of 2bufK

query
sites
2bufK
L
 
L
V
 
V
V
 
I
K
|
K
A
 
Y
G
 
G
G
|
G
R
 
N
A
 
A
L
 
M
E
 
E
Q
 
S
N
 
-
M
 
-
E
 
E
R
 
E
I
 
L
L
 
K
D
 
A
S
 
G
I
 
F
A
 
A
W
 
R
A
 
D
V
 
V
-
 
V
-
 
L
-
 
M
-
 
K
Q
 
A
E
 
V
G
 
G
H
 
I
K
 
N
V
 
P
V
 
V
F
 
V
V
 
V
H
 
H
G
 
G
G
 
G
G
|
G
D
 
P
L
 
Q
V
 
I
T
 
G
E
 
D
Y
 
L
S
 
L
K
 
K
K
 
R
M
 
L
G
 
S
V
 
I
E
 
E
P
 
-
K
 
-
I
 
-
M
 
-
M
 
-
S
 
-
A
 
-
S
 
-
G
 
-
V
 
-
R
 
S
F
 
H
R
|
R
Y
 
V
T
 
T
D
 
D
E
 
A
E
 
A
E
 
T
L
 
M
E
 
D
V
 
V
F
 
V
V
 
E
M
 
M
V
 
V
L
 
L
A
 
G
G
 
G
L
 
Q
L
 
V
N
 
N
K
 
K
R
 
D
I
 
I
V
 
V
A
 
N
G
 
L
L
 
I
E
 
N
K
 
R
R
 
H
G
 
G
V
 
G
K
 
S
A
 
A
L
 
I
G
 
G
V
 
L
S
 
T
G
 
G
V
 
K
D
 
D
A
 
A
G
 
E
M
 
L
I
 
I
R
 
R
A
 
A
E
 
-
R
 
-
K
 
-
K
 
-
H
 
-
V
 
-
I
 
-
V
 
-
I
 
-
D
 
-
P
 
-
E
 
-
T
 
-
G
 
-
R
 
-
K
 
K
R
 
K
L
 
L
L
 
T
P
 
V
G
 
G
G
 
E
Y
 
V
T
 
T
G
 
G
K
 
-
I
 
-
R
 
-
S
 
-
V
 
V
D
 
N
A
 
V
N
 
G
A
 
L
M
 
L
T
 
N
R
 
M
L
 
L
L
 
V
D
 
K
A
 
G
G
 
D
F
 
F
T
 
I
L
 
P
V
 
V
V
 
I
A
 
A
P
 
P
L
 
I
A
 
G
L
 
V
G
 
G
T
 
S
E
 
N
G
 
G
E
 
E
M
 
S
L
 
Y
N
|
N
V
 
I
D
x
N
G
x
A
D
|
D
Q
 
L
A
 
V
A
 
A
A
 
G
E
 
K
I
 
V
A
 
A
K
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
K
A
 
A
D
 
E
K
 
K
L
 
L
I
 
M
L
 
L
L
 
L
T
 
T
D
 
N
V
 
I
D
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
M
-
 
D
I
 
K
D
 
Q
G
 
G
K
 
Q
L
 
V
V
 
L
E
 
T
S
 
G
L
 
L
T
 
S
P
 
T
D
 
E
E
 
Q
A
 
V
R
 
N
A
 
E
L
 
L
L
 
I
E
 
A
-
 
D
-
 
G
K
 
T
I
 
I
G
 
Y
P
 
G
G
 
G
M
 
M
N
 
L
R
 
P
K
|
K
V
 
I
M
 
R
M
 
C
A
 
A
V
 
L
E
 
E
A
 
A
L
 
V
E
 
Q
A
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
T
E
 
S
V
 
A
V
 
H
I
 
I
G
 
I
S
 
D
G
 
G
L
 
R
R
 
V
E
 
P
N
 
N
P
 
A
I
 
V

Q9SCL7 Acetylglutamate kinase, chloroplastic; N-acetyl-L-glutamate 5-phosphotransferase; NAG kinase; AtNAGK; EC 2.7.2.8 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see 3 papers)
29% identity, 93% coverage: 3:253/270 of query aligns to 88:329/347 of Q9SCL7

query
sites
Q9SCL7
L
 
I
V
 
V
V
 
V
K
 
K
A
 
Y
G
 
G
G
|
G
R
x
A
A
 
A
L
 
M
E
 
T
Q
 
S
N
 
P
-
 
E
-
 
L
M
 
K
E
 
S
R
 
S
I
 
V
L
 
V
D
 
S
S
 
D
I
 
L
A
 
V
W
 
L
A
 
L
V
 
A
Q
 
C
E
 
V
G
 
G
H
 
L
K
 
R
V
 
P
V
 
I
F
 
L
V
 
V
H
 
H
G
 
G
G
|
G
G
 
G
D
 
P
L
 
D
V
 
I
T
 
N
E
 
R
Y
 
Y
S
 
L
K
 
K
K
 
Q
M
 
L
G
 
N
V
 
I
E
 
P
P
 
A
K
 
E
I
 
F
M
 
R
M
 
D
S
 
G
A
 
-
S
 
-
G
 
-
V
 
-
R
 
-
F
 
L
R
|
R
Y
 
V
T
 
T
D
 
D
E
 
A
E
 
T
E
 
T
L
 
M
E
 
E
V
 
I
F
 
V
V
 
S
M
 
M
V
 
V
L
 
L
A
 
V
G
 
G
L
 
K
L
 
V
N
 
N
K
 
K
R
 
N
I
 
L
V
 
V
A
 
S
G
 
L
L
 
I
E
 
N
K
 
A
R
 
A
G
 
G
V
 
A
K
 
T
A
 
A
L
 
V
G
 
G
V
 
L
S
 
S
G
 
G
V
 
H
D
 
D
A
 
G
G
 
R
M
 
L
I
 
L
R
 
T
A
 
A
E
 
R
R
 
-
K
 
-
K
 
-
H
 
-
V
 
-
I
 
-
V
 
-
I
 
-
D
 
-
P
 
P
E
 
V
T
 
P
G
 
N
R
 
S
K
 
A
R
 
Q
L
 
L
L
 
-
P
 
-
G
 
-
G
 
G
Y
 
F
T
 
V
G
 
G
K
 
E
I
 
V
R
 
A
S
 
R
V
 
V
D
 
D
A
 
P
N
 
S
A
 
V
M
 
L
T
 
R
R
 
P
L
 
L
L
 
V
D
 
D
A
 
Y
G
 
G
F
 
Y
T
 
I
L
 
P
V
 
V
V
 
I
A
 
A
P
 
S
L
 
V
A
 
A
L
 
A
G
 
D
T
 
D
E
 
S
G
 
G
E
 
Q
M
 
A
L
 
Y
N
|
N
V
x
I
D
x
N
G
x
A
D
 
D
Q
 
T
A
 
V
A
 
A
A
 
G
E
 
E
I
 
L
A
 
A
K
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
G
A
 
A
D
 
E
K
|
K
L
 
L
I
 
I
L
 
L
L
 
L
T
|
T
D
|
D
V
 
V
D
 
A
G
 
G
L
 
I
L
|
L
I
 
E
D
 
N
-
 
K
-
 
E
-
 
D
-
 
P
G
 
S
K
 
S
L
 
L
V
 
I
E
x
K
S
 
E
L
 
I
T
 
D
P
 
I
D
 
K
E
 
G
A
 
V
R
 
K
A
 
K
L
 
M
L
 
I
E
 
E
-
 
D
-
 
G
K
|
K
I
x
V
G
x
A
P
x
G
G
|
G
M
|
M
N
x
I
R
x
P
K
|
K
V
 
V
M
 
K
M
 
C
A
 
C
V
 
I
E
 
R
A
 
S
L
 
L
E
 
A
A
 
Q
G
 
G
V
 
V
G
 
K
E
 
T
V
 
A
V
 
S
I
 
I
G
 
I
S
 
D
G
 
G
L
 
R
R
 
R
E
 
Q
N
 
H

Sites not aligning to the query:

4usjB N-acetylglutamate kinase from arabidopsis thaliana in complex with pii from chlamydomonas reinhardtii (see paper)
29% identity, 93% coverage: 3:253/270 of query aligns to 22:263/281 of 4usjB

query
sites
4usjB
L
 
I
V
 
V
V
 
V
K
|
K
A
 
Y
G
 
G
G
|
G
R
 
A
A
 
A
L
 
M
E
 
T
Q
 
S
N
 
P
-
 
E
-
 
L
M
 
K
E
 
S
R
 
S
I
 
V
L
 
V
D
 
S
S
 
D
I
 
L
A
 
V
W
 
L
A
 
L
V
 
A
Q
 
C
E
 
V
G
 
G
H
 
L
K
 
R
V
 
P
V
 
I
F
 
L
V
 
V
H
 
H
G
|
G
G
|
G
G
|
G
D
 
P
L
 
D
V
 
I
T
 
N
E
 
R
Y
 
Y
S
 
L
K
 
K
K
 
Q
M
 
L
G
 
N
V
 
I
E
 
P
P
 
A
K
 
E
I
 
F
M
 
R
M
 
D
S
 
G
A
 
-
S
 
-
G
 
-
V
 
-
R
 
-
F
 
L
R
|
R
Y
 
V
T
 
T
D
 
D
E
 
A
E
 
T
E
 
T
L
 
M
E
 
E
V
 
I
F
 
V
V
 
S
M
 
M
V
 
V
L
 
L
A
 
V
G
 
G
L
 
K
L
 
V
N
 
N
K
 
K
R
 
N
I
 
L
V
 
V
A
 
S
G
 
L
L
 
I
E
 
N
K
 
A
R
 
A
G
 
G
V
 
A
K
 
T
A
 
A
L
 
V
G
 
G
V
 
L
S
 
S
G
 
G
V
 
H
D
 
D
A
 
G
G
 
R
M
 
L
I
 
L
R
 
T
A
 
A
E
 
R
R
 
-
K
 
-
K
 
-
H
 
-
V
 
-
I
 
-
V
 
-
I
 
-
D
 
-
P
 
P
E
 
V
T
 
P
G
 
N
R
 
S
K
 
A
R
 
Q
L
 
L
L
 
-
P
 
-
G
 
-
G
 
G
Y
 
F
T
 
V
G
 
G
K
 
E
I
 
V
R
 
A
S
 
R
V
 
V
D
 
D
A
 
P
N
 
S
A
 
V
M
 
L
T
 
R
R
 
P
L
 
L
L
 
V
D
 
D
A
 
Y
G
 
G
F
 
Y
T
 
I
L
 
P
V
 
V
V
 
I
A
 
A
P
 
S
L
 
V
A
 
A
L
 
A
G
 
D
T
 
D
E
 
S
G
 
G
E
 
Q
M
 
A
L
 
Y
N
|
N
V
 
I
D
 
N
G
x
A
D
|
D
Q
 
T
A
 
V
A
 
A
A
 
G
E
 
E
I
 
L
A
 
A
K
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
G
A
 
A
D
 
E
K
|
K
L
 
L
I
 
I
L
 
L
L
 
L
T
 
T
D
 
D
V
 
V
D
 
A
G
 
G
L
 
I
L
 
L
I
 
E
D
 
N
-
 
K
-
 
E
-
 
D
-
 
P
G
 
S
K
 
S
L
 
L
V
 
I
E
x
K
S
 
E
L
 
I
T
 
D
P
 
I
D
 
K
E
 
G
A
 
V
R
 
K
A
 
K
L
 
M
L
 
I
E
 
E
-
 
D
-
 
G
K
 
K
I
 
V
G
 
A
P
 
G
G
 
G
M
 
M
N
 
I
R
 
P
K
|
K
V
 
V
M
 
K
M
 
C
A
 
C
V
 
I
E
 
R
A
 
S
L
 
L
E
 
A
A
 
Q
G
 
G
V
 
V
G
 
K
E
 
T
V
 
A
V
 
S
I
 
I
G
 
I
S
 
D
G
 
G
L
 
R
R
 
R
E
 
Q
N
 
H

Sites not aligning to the query:

2rd5B Structural basis for the regulation of n-acetylglutamate kinase by pii in arabidopsis thaliana (see paper)
29% identity, 93% coverage: 3:253/270 of query aligns to 24:265/283 of 2rd5B

query
sites
2rd5B
L
 
I
V
 
V
V
 
V
K
|
K
A
 
Y
G
 
G
G
|
G
R
x
A
A
 
A
L
 
M
E
 
T
Q
 
S
N
 
P
-
 
E
-
 
L
M
 
K
E
 
S
R
 
S
I
 
V
L
 
V
D
 
S
S
 
D
I
 
L
A
 
V
W
 
L
A
 
L
V
 
A
Q
 
C
E
 
V
G
 
G
H
 
L
K
 
R
V
 
P
V
 
I
F
 
L
V
 
V
H
 
H
G
|
G
G
 
G
G
|
G
D
 
P
L
 
D
V
 
I
T
 
N
E
 
R
Y
 
Y
S
 
L
K
 
K
K
 
Q
M
 
L
G
 
N
V
 
I
E
 
P
P
 
A
K
 
E
I
 
F
M
 
R
M
 
D
S
 
G
A
 
-
S
 
-
G
 
-
V
 
-
R
 
-
F
 
L
R
|
R
Y
 
V
T
 
T
D
 
D
E
 
A
E
 
T
E
 
T
L
 
M
E
 
E
V
 
I
F
 
V
V
 
S
M
 
M
V
 
V
L
 
L
A
 
V
G
 
G
L
 
K
L
 
V
N
 
N
K
 
K
R
 
N
I
 
L
V
 
V
A
 
S
G
 
L
L
 
I
E
 
N
K
 
A
R
 
A
G
 
G
V
 
A
K
 
T
A
 
A
L
 
V
G
 
G
V
 
L
S
 
S
G
 
G
V
 
H
D
 
D
A
 
G
G
 
R
M
 
L
I
 
L
R
 
T
A
 
A
E
 
R
R
 
-
K
 
-
K
 
-
H
 
-
V
 
-
I
 
-
V
 
-
I
 
-
D
 
-
P
 
P
E
 
V
T
 
P
G
 
N
R
 
S
K
 
A
R
 
Q
L
 
L
L
 
-
P
 
-
G
 
-
G
 
G
Y
 
F
T
 
V
G
 
G
K
 
E
I
 
V
R
 
A
S
 
R
V
 
V
D
 
D
A
 
P
N
 
S
A
 
V
M
 
L
T
 
R
R
 
P
L
 
L
L
 
V
D
 
D
A
 
Y
G
 
G
F
 
Y
T
 
I
L
 
P
V
 
V
V
 
I
A
 
A
P
 
S
L
 
V
A
 
A
L
 
A
G
 
D
T
 
D
E
 
S
G
 
G
E
 
Q
M
 
A
L
 
Y
N
|
N
V
 
I
D
x
N
G
x
A
D
|
D
Q
 
T
A
 
V
A
 
A
A
 
G
E
 
E
I
 
L
A
 
A
K
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
G
A
 
A
D
 
E
K
|
K
L
 
L
I
 
I
L
 
L
L
 
L
T
|
T
D
|
D
V
 
V
D
 
A
G
 
G
L
 
I
L
|
L
I
 
E
D
 
N
-
x
K
-
 
E
-
 
D
-
 
P
G
 
S
K
 
S
L
 
L
V
 
I
E
x
K
S
 
E
L
 
I
T
 
D
P
 
I
D
 
K
E
 
G
A
 
V
R
 
K
A
 
K
L
 
M
L
 
I
E
 
E
-
 
D
-
 
G
K
 
K
I
 
V
G
x
A
P
 
G
G
|
G
M
|
M
N
 
I
R
 
P
K
|
K
V
 
V
M
 
K
M
 
C
A
 
C
V
 
I
E
 
R
A
 
S
L
 
L
E
 
A
A
 
Q
G
 
G
V
 
V
G
 
K
E
 
T
V
 
A
V
 
S
I
 
I
G
 
I
S
 
D
G
 
G
L
 
R
R
 
R
E
 
Q
N
 
H

Sites not aligning to the query:

3t7bB Crystal structure of n-acetyl-l-glutamate kinase from yersinia pestis
31% identity, 99% coverage: 3:268/270 of query aligns to 5:257/258 of 3t7bB

query
sites
3t7bB
L
 
L
V
 
V
V
 
I
K
|
K
A
 
L
G
 
G
G
|
G
R
 
V
A
 
L
L
 
L
-
 
D
-
 
S
E
 
E
Q
 
E
N
 
A
M
 
L
E
 
E
R
 
R
I
 
L
L
 
F
D
 
T
S
 
A
I
 
L
A
 
V
W
 
-
A
 
T
V
 
Y
Q
 
R
E
 
E
G
 
K
H
 
H
K
 
E
-
 
R
-
 
P
V
 
L
V
 
V
F
 
I
V
 
M
H
 
H
G
 
G
G
 
G
G
|
G
D
 
C
L
 
L
V
 
V
T
 
D
E
 
E
Y
 
L
S
 
M
K
 
K
K
 
R
M
 
L
G
 
A
V
 
L
E
 
P
P
 
-
K
 
-
I
 
-
M
 
V
M
 
V
S
 
K
A
 
K
S
 
N
G
 
G
V
 
-
R
 
-
F
 
L
R
|
R
Y
 
V
T
 
T
D
 
P
E
 
A
E
 
D
E
 
Q
L
 
I
E
 
D
V
 
I
F
 
I
V
 
T
M
 
G
V
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
T
L
 
A
N
 
N
K
 
K
R
 
T
I
 
L
V
 
L
A
 
A
G
 
W
L
 
A
E
 
V
K
 
K
R
 
H
G
 
Q
V
 
I
K
 
N
A
 
A
L
 
V
G
 
G
V
 
L
S
 
C
G
 
L
V
 
A
D
 
D
A
 
G
G
 
N
M
 
T
I
 
V
R
 
T
A
 
-
E
 
-
R
 
-
K
 
-
K
 
-
H
 
-
V
 
V
I
 
T
V
 
L
I
 
L
D
 
D
P
 
A
E
 
E
T
 
L
G
 
G
R
 
-
K
 
-
R
 
-
L
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
-
G
 
-
Y
 
H
T
 
V
G
 
G
K
 
K
I
 
A
R
 
Q
S
 
P
V
 
G
D
 
S
A
 
A
N
 
A
A
 
L
M
 
V
T
 
Q
R
 
T
L
 
L
L
 
L
D
 
A
A
 
A
G
 
G
F
 
Y
T
 
M
L
 
P
V
 
I
V
 
I
A
 
S
P
 
S
L
 
I
A
 
G
L
 
I
G
 
T
T
 
V
E
 
E
G
 
G
E
 
Q
M
 
L
L
 
M
N
|
N
V
 
V
D
x
N
G
x
A
D
|
D
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
T
E
 
A
I
 
L
A
 
A
K
 
A
A
 
T
L
 
L
R
 
G
A
 
A
D
 
D
K
 
-
L
 
L
I
 
I
L
 
L
L
 
L
T
 
S
D
 
D
V
 
V
D
 
S
G
 
G
L
 
I
L
 
L
I
 
-
D
 
D
G
 
G
K
 
K
-
 
G
-
 
Q
L
 
R
V
 
I
E
 
A
S
 
E
L
 
M
T
 
T
P
 
A
D
 
Q
E
 
K
A
 
A
R
 
E
A
 
Q
L
 
L
L
 
I
E
 
A
K
 
Q
-
 
G
-
 
I
I
 
I
G
 
T
P
 
D
G
 
G
M
 
M
N
 
V
R
 
V
K
|
K
V
 
V
M
 
N
M
 
A
A
 
A
V
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
A
E
 
R
A
 
S
G
 
L
V
 
G
G
 
R
E
 
P
V
 
V
V
 
D
I
 
I
G
 
A
S
 
S
G
 
W
L
 
R
R
 
H
E
 
S
N
 
E
P
 
Q
I
 
L
R
 
P
E
 
A
L
 
L
L
 
F
E
 
N
G
 
G
A
 
V
P
 
P
-
 
I
A
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
I
A
 
S

3l86A The crystal structure of smu.665 from streptococcus mutans ua159
28% identity, 92% coverage: 2:250/270 of query aligns to 4:236/245 of 3l86A

query
sites
3l86A
L
 
I
L
 
I
V
 
V
V
 
I
K
|
K
A
 
I
G
 
G
G
|
G
R
 
V
A
 
A
L
 
S
E
 
Q
Q
 
Q
N
 
L
M
 
S
E
 
G
R
 
D
I
 
F
L
 
L
D
 
S
S
 
Q
I
 
I
A
 
K
W
 
N
A
 
W
V
 
Q
Q
 
D
E
 
A
G
 
G
H
 
K
K
 
Q
V
 
L
V
 
V
F
 
I
V
 
V
H
 
H
G
|
G
G
|
G
G
|
G
D
 
F
L
 
A
V
x
I
T
 
N
E
 
K
Y
 
L
S
 
M
K
 
E
K
 
E
M
 
N
G
 
Q
V
 
V
E
 
P
P
 
V
K
 
K
I
 
K
M
 
I
M
 
N
S
 
G
A
 
-
S
 
-
G
 
-
V
 
-
R
 
-
F
 
L
R
|
R
Y
 
V
T
 
T
D
 
S
E
 
K
E
 
D
E
 
D
L
 
M
E
 
V
V
 
L
F
 
V
V
 
S
M
 
H
V
 
A
L
 
L
A
 
L
G
 
D
L
 
L
L
 
V
N
 
G
K
 
K
R
 
N
I
 
L
V
 
Q
A
 
E
G
 
K
L
 
L
E
 
R
K
 
Q
R
 
-
G
 
-
V
 
-
K
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
-
V
 
-
S
 
A
G
 
G
V
 
V
D
 
S
A
 
C
G
 
Q
M
 
Q
I
 
L
R
 
K
A
 
S
E
 
D
R
 
I
K
 
K
K
 
-
H
 
H
V
 
V
I
 
V
-
 
A
-
 
A
-
 
D
V
 
Y
I
 
L
D
 
D
P
 
K
E
 
D
T
 
T
G
 
Y
R
 
-
K
 
-
R
 
-
L
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
-
G
 
G
Y
 
Y
T
 
V
G
 
G
K
 
D
I
 
V
R
 
T
S
 
H
V
 
I
D
 
N
A
 
K
N
 
R
A
 
V
M
 
I
T
 
E
R
 
E
L
 
F
L
 
L
D
 
E
A
 
N
G
 
R
F
 
Q
T
 
I
L
 
P
V
 
I
V
 
L
A
 
A
P
x
S
L
 
L
A
 
G
L
 
Y
G
 
S
T
 
K
E
 
E
G
 
G
E
 
D
M
 
M
L
 
L
N
|
N
V
x
I
D
x
N
G
x
A
D
|
D
Q
 
Y
A
 
L
A
 
A
A
 
T
E
 
A
I
 
V
A
 
A
K
 
V
A
 
A
L
 
L
R
 
A
A
 
A
D
 
D
K
 
K
L
 
L
I
 
I
L
 
L
L
 
M
T
|
T
D
 
N
V
 
V
D
 
K
G
 
G
L
 
V
L
|
L
I
 
E
D
 
N
G
 
G
K
 
A
L
 
V
V
 
L
E
 
E
S
 
K
L
 
I
T
 
T
P
 
S
D
 
H
E
 
Q
A
 
V
R
 
Q
A
 
E
L
 
K
L
 
I
E
 
D
K
 
T
-
 
A
-
 
V
I
 
I
G
x
T
P
 
A
G
|
G
M
|
M
N
 
I
R
 
P
K
|
K
V
 
I
M
 
E
M
 
S
A
 
A
V
 
A
E
 
K
A
 
T
L
 
V
E
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
G
E
 
Q
V
 
V
V
 
L
I
 
I
G
 
G
S
 
D
G
 
N
L
 
L

4i49A Structure of ngnags bound with bisubstrate analog coa-NAG (see paper)
31% identity, 91% coverage: 3:249/270 of query aligns to 22:249/424 of 4i49A

query
sites
4i49A
L
 
L
V
 
V
V
 
A
K
 
G
A
 
I
G
 
D
G
 
G
R
 
R
A
 
L
L
 
L
E
 
E
Q
 
G
-
 
G
N
 
T
M
 
L
E
 
N
R
 
K
I
 
L
L
 
A
D
 
A
S
 
D
I
 
I
A
 
G
W
 
L
A
 
L
V
 
S
Q
 
Q
E
 
L
G
 
G
H
 
I
K
 
R
V
 
L
V
 
V
F
 
L
V
 
I
H
 
H
G
 
G
G
 
A
G
 
Y
D
 
H
L
 
F
V
 
L
T
 
D
E
 
R
Y
 
L
S
 
A
K
 
A
K
 
A
M
 
Q
G
 
G
V
 
R
E
 
T
P
 
P
K
 
H
I
 
Y
M
 
C
M
 
R
S
 
G
A
 
-
S
 
-
G
 
-
V
 
-
R
 
-
F
 
L
R
 
R
Y
 
V
T
 
T
D
 
D
E
 
E
E
 
T
E
 
S
L
 
L
E
 
G
V
 
Q
F
 
-
V
 
A
M
 
Q
V
 
Q
L
 
F
A
 
A
G
 
G
L
 
T
L
 
V
N
 
R
K
 
S
R
 
R
I
 
F
V
 
E
A
 
A
G
 
A
L
 
L
E
 
C
K
 
G
R
 
S
G
 
S
V
 
V
K
 
P
A
 
L
L
 
V
G
 
S
V
 
G
S
 
N
G
 
F
V
 
L
D
 
T
A
 
A
G
 
-
M
 
-
I
 
-
R
 
-
A
 
-
E
 
-
R
 
-
K
 
-
K
 
R
H
 
P
V
 
I
I
 
G
V
 
V
I
 
I
D
 
D
P
 
G
E
 
T
T
 
D
G
 
M
R
 
E
K
 
-
R
 
-
L
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
-
G
 
-
Y
 
Y
T
 
A
G
 
G
K
 
V
I
 
I
R
 
R
S
 
K
V
 
T
D
 
D
A
 
T
N
 
A
A
 
A
M
 
L
T
 
R
R
 
F
L
 
Q
L
 
L
D
 
D
A
 
A
G
 
G
F
 
N
T
 
I
L
 
V
V
 
W
V
 
M
A
 
P
P
 
P
L
 
L
A
 
G
L
 
H
G
 
S
T
 
Y
E
 
G
G
 
G
E
 
K
M
 
T
L
 
F
N
 
N
V
 
L
D
 
D
G
 
M
D
 
V
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
S
I
 
V
A
 
A
K
 
V
A
 
S
L
 
L
R
 
Q
A
 
A
D
 
E
K
 
K
L
 
L
I
 
V
L
 
Y
L
 
L
T
 
T
D
 
L
V
 
S
D
 
D
G
 
G
L
 
I
L
 
S
-
 
R
I
 
P
D
 
D
G
 
G
K
 
T
L
 
L
V
 
A
E
 
E
S
 
T
L
 
L
T
 
S
P
 
A
D
 
Q
E
 
E
A
 
A
R
 
Q
A
 
S
L
 
L
L
 
A
E
 
E
K
 
H
I
 
A
G
 
A
P
 
S
G
 
E
M
 
T
N
 
R
R
 
R
K
 
L
V
 
I
M
 
S
M
 
S
A
 
A
V
 
V
E
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
H
E
 
R
V
 
V
V
 
Q
I
 
I
G
 
L
S
 
N
G
 
G

Sites not aligning to the query:

3d2mA Crystal structure of n-acetylglutamate synthase from neisseria gonorrhoeae complexed with coenzyme a and l-glutamate (see paper)
31% identity, 91% coverage: 3:249/270 of query aligns to 22:249/424 of 3d2mA

query
sites
3d2mA
L
 
L
V
 
V
V
 
A
K
 
G
A
x
I
G
 
D
G
 
G
R
 
R
A
 
L
L
 
L
E
 
E
Q
 
G
-
 
G
N
 
T
M
 
L
E
 
N
R
 
K
I
 
L
L
 
A
D
 
A
S
 
D
I
 
I
A
 
G
W
 
L
A
 
L
V
 
S
Q
 
Q
E
 
L
G
 
G
H
 
I
K
 
R
V
 
L
V
 
V
F
 
L
V
 
I
H
 
H
G
 
G
G
 
A
G
 
Y
D
 
H
L
 
F
V
 
L
T
 
D
E
 
R
Y
 
L
S
 
A
K
 
A
K
 
A
M
 
Q
G
 
G
V
 
R
E
 
T
P
 
P
K
 
H
I
 
Y
M
 
C
M
 
R
S
 
G
A
 
-
S
 
-
G
 
-
V
 
-
R
 
-
F
 
L
R
 
R
Y
 
V
T
 
T
D
 
D
E
 
E
E
 
T
E
 
S
L
 
L
E
 
G
V
 
Q
F
 
-
V
 
A
M
 
Q
V
 
Q
L
 
F
A
 
A
G
 
G
L
 
T
L
 
V
N
 
R
K
 
S
R
 
R
I
 
F
V
 
E
A
 
A
G
 
A
L
 
L
E
 
C
K
 
G
R
 
S
G
 
S
V
 
V
K
 
P
A
 
L
L
 
V
G
 
S
V
 
G
S
 
N
G
 
F
V
 
L
D
 
T
A
 
A
G
 
-
M
 
-
I
 
-
R
 
-
A
 
-
E
 
-
R
 
-
K
 
-
K
 
R
H
 
P
V
 
I
I
 
G
V
 
V
I
 
I
D
 
D
P
 
G
E
 
T
T
 
D
G
 
M
R
 
E
K
 
-
R
 
-
L
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
-
G
 
-
Y
 
Y
T
 
A
G
 
G
K
 
V
I
 
I
R
 
R
S
 
K
V
 
T
D
 
D
A
 
T
N
 
A
A
 
A
M
 
L
T
 
R
R
 
F
L
 
Q
L
 
L
D
 
D
A
 
A
G
 
G
F
 
N
T
 
I
L
 
V
V
 
W
V
 
M
A
 
P
P
 
P
L
 
L
A
 
G
L
 
H
G
 
S
T
 
Y
E
 
G
G
 
G
E
 
K
M
 
T
L
 
F
N
 
N
V
 
L
D
 
D
G
 
M
D
 
V
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
S
I
 
V
A
 
A
K
 
V
A
 
S
L
 
L
R
 
Q
A
 
A
D
 
E
K
 
K
L
 
L
I
 
V
L
 
Y
L
 
L
T
 
T
D
 
L
V
 
S
D
 
D
G
 
G
L
 
I
L
 
S
-
 
R
I
 
P
D
 
D
G
 
G
K
 
T
L
 
L
V
 
A
E
 
E
S
 
T
L
 
L
T
 
S
P
 
A
D
 
Q
E
 
E
A
 
A
R
 
Q
A
 
S
L
 
L
L
 
A
E
 
E
K
 
H
I
 
A
G
 
A
P
 
S
G
 
E
M
 
T
N
 
R
R
 
R
K
 
L
V
 
I
M
 
S
M
 
S
A
 
A
V
 
V
E
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
H
E
 
R
V
 
V
V
 
Q
I
 
I
G
 
L
S
 
N
G
 
G

Sites not aligning to the query:

3b8gA Crysta structure of n-acetylglutamate synthase from neisseria gonorrhoeae complexed with coenzyme a and n-acetyl-glutamate (see paper)
31% identity, 91% coverage: 3:249/270 of query aligns to 22:249/424 of 3b8gA

query
sites
3b8gA
L
 
L
V
 
V
V
 
A
K
 
G
A
x
I
G
 
D
G
 
G
R
 
R
A
 
L
L
 
L
E
 
E
Q
 
G
-
 
G
N
 
T
M
 
L
E
 
N
R
 
K
I
 
L
L
 
A
D
 
A
S
 
D
I
 
I
A
 
G
W
 
L
A
 
L
V
 
S
Q
 
Q
E
 
L
G
 
G
H
 
I
K
 
R
V
 
L
V
 
V
F
 
L
V
 
I
H
 
H
G
 
G
G
 
A
G
 
Y
D
 
H
L
 
F
V
 
L
T
 
D
E
 
R
Y
 
L
S
 
A
K
 
A
K
 
A
M
 
Q
G
 
G
V
 
R
E
 
T
P
 
P
K
 
H
I
 
Y
M
 
C
M
 
R
S
 
G
A
 
-
S
 
-
G
 
-
V
 
-
R
 
-
F
 
L
R
 
R
Y
 
V
T
 
T
D
 
D
E
 
E
E
 
T
E
 
S
L
 
L
E
 
G
V
 
Q
F
 
-
V
 
A
M
 
Q
V
 
Q
L
 
F
A
 
A
G
 
G
L
 
T
L
 
V
N
 
R
K
 
S
R
 
R
I
 
F
V
 
E
A
 
A
G
 
A
L
 
L
E
 
C
K
 
G
R
 
S
G
 
S
V
 
V
K
 
P
A
 
L
L
 
V
G
 
S
V
 
G
S
 
N
G
 
F
V
 
L
D
 
T
A
 
A
G
 
-
M
 
-
I
 
-
R
 
-
A
 
-
E
 
-
R
 
-
K
 
-
K
 
R
H
 
P
V
 
I
I
 
G
V
 
V
I
 
I
D
 
D
P
 
G
E
 
T
T
 
D
G
 
M
R
 
E
K
 
-
R
 
-
L
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
-
G
 
-
Y
 
Y
T
 
A
G
 
G
K
 
V
I
 
I
R
 
R
S
 
K
V
 
T
D
 
D
A
 
T
N
 
A
A
 
A
M
 
L
T
 
R
R
 
F
L
 
Q
L
 
L
D
 
D
A
 
A
G
 
G
F
 
N
T
 
I
L
 
V
V
 
W
V
 
M
A
 
P
P
 
P
L
 
L
A
 
G
L
 
H
G
 
S
T
 
Y
E
 
G
G
 
G
E
 
K
M
 
T
L
 
F
N
 
N
V
 
L
D
 
D
G
 
M
D
 
V
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
S
I
 
V
A
 
A
K
 
V
A
 
S
L
 
L
R
 
Q
A
 
A
D
 
E
K
 
K
L
 
L
I
 
V
L
 
Y
L
 
L
T
 
T
D
 
L
V
 
S
D
 
D
G
 
G
L
 
I
L
 
S
-
 
R
I
 
P
D
 
D
G
 
G
K
 
T
L
 
L
V
 
A
E
 
E
S
 
T
L
 
L
T
 
S
P
 
A
D
 
Q
E
 
E
A
 
A
R
 
Q
A
 
S
L
 
L
L
 
A
E
 
E
K
 
H
I
 
A
G
 
A
P
 
S
G
 
E
M
 
T
N
 
R
R
 
R
K
 
L
V
 
I
M
 
S
M
 
S
A
 
A
V
 
V
E
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
H
E
 
R
V
 
V
V
 
Q
I
 
I
G
 
L
S
 
N
G
 
G

Sites not aligning to the query:

2r8vA Native structure of n-acetylglutamate synthase from neisseria gonorrhoeae (see paper)
31% identity, 91% coverage: 3:249/270 of query aligns to 22:249/424 of 2r8vA

query
sites
2r8vA
L
 
L
V
 
V
V
 
A
K
 
G
A
x
I
G
 
D
G
 
G
R
 
R
A
 
L
L
 
L
E
 
E
Q
 
G
-
 
G
N
 
T
M
 
L
E
 
N
R
 
K
I
 
L
L
 
A
D
 
A
S
 
D
I
 
I
A
 
G
W
 
L
A
 
L
V
 
S
Q
 
Q
E
 
L
G
 
G
H
 
I
K
 
R
V
 
L
V
 
V
F
 
L
V
 
I
H
 
H
G
 
G
G
 
A
G
 
Y
D
 
H
L
 
F
V
 
L
T
 
D
E
 
R
Y
 
L
S
 
A
K
 
A
K
 
A
M
 
Q
G
 
G
V
 
R
E
 
T
P
 
P
K
 
H
I
 
Y
M
 
C
M
 
R
S
 
G
A
 
-
S
 
-
G
 
-
V
 
-
R
 
-
F
 
L
R
 
R
Y
 
V
T
 
T
D
 
D
E
 
E
E
 
T
E
 
S
L
 
L
E
 
G
V
 
Q
F
 
-
V
 
A
M
 
Q
V
 
Q
L
 
F
A
 
A
G
 
G
L
 
T
L
 
V
N
 
R
K
 
S
R
 
R
I
 
F
V
 
E
A
 
A
G
 
A
L
 
L
E
 
C
K
 
G
R
 
S
G
 
S
V
 
V
K
 
P
A
 
L
L
 
V
G
 
S
V
 
G
S
 
N
G
 
F
V
 
L
D
 
T
A
 
A
G
 
-
M
 
-
I
 
-
R
 
-
A
 
-
E
 
-
R
 
-
K
 
-
K
 
R
H
 
P
V
 
I
I
 
G
V
 
V
I
 
I
D
 
D
P
 
G
E
 
T
T
 
D
G
 
M
R
 
E
K
 
-
R
 
-
L
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
-
G
 
-
Y
 
Y
T
 
A
G
 
G
K
 
V
I
 
I
R
 
R
S
 
K
V
 
T
D
 
D
A
 
T
N
 
A
A
 
A
M
 
L
T
 
R
R
 
F
L
 
Q
L
 
L
D
 
D
A
 
A
G
 
G
F
 
N
T
 
I
L
 
V
V
 
W
V
 
M
A
 
P
P
 
P
L
 
L
A
 
G
L
 
H
G
 
S
T
 
Y
E
 
G
G
 
G
E
 
K
M
 
T
L
 
F
N
 
N
V
 
L
D
 
D
G
 
M
D
 
V
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
S
I
 
V
A
 
A
K
 
V
A
 
S
L
 
L
R
 
Q
A
 
A
D
 
E
K
 
K
L
 
L
I
 
V
L
 
Y
L
 
L
T
 
T
D
 
L
V
 
S
D
 
D
G
 
G
L
 
I
L
 
S
-
 
R
I
 
P
D
 
D
G
 
G
K
 
T
L
 
L
V
 
A
E
 
E
S
 
T
L
 
L
T
 
S
P
 
A
D
 
Q
E
 
E
A
 
A
R
 
Q
A
 
S
L
 
L
L
 
A
E
 
E
K
 
H
I
 
A
G
 
A
P
 
S
G
 
E
M
 
T
N
 
R
R
 
R
K
 
L
V
 
I
M
 
S
M
 
S
A
 
A
V
 
V
E
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
H
E
 
R
V
 
V
V
 
Q
I
 
I
G
 
L
S
 
N
G
 
G

Sites not aligning to the query:

3d2pA Crystal structure of n-acetylglutamate synthase from neisseria gonorrhoeae complexed with coenzyme a and l-arginine (see paper)
31% identity, 91% coverage: 3:249/270 of query aligns to 22:257/424 of 3d2pA

query
sites
3d2pA
L
 
L
V
 
V
V
 
A
K
 
G
A
x
I
G
 
D
G
 
G
R
 
R
A
 
L
L
 
L
E
 
E
Q
 
G
-
 
G
N
 
T
M
 
L
E
 
N
R
 
K
I
 
L
L
 
A
D
 
A
S
 
D
I
 
I
A
 
G
W
 
L
A
 
L
V
 
S
Q
 
Q
E
 
L
G
 
G
H
 
I
K
 
R
V
 
L
V
 
V
F
 
L
V
 
I
H
 
H
G
 
G
G
 
A
G
 
Y
D
 
H
L
 
F
V
 
L
T
 
D
E
 
R
Y
 
L
S
 
A
K
 
A
K
 
A
M
 
Q
G
 
G
V
 
R
E
 
T
P
 
P
K
 
H
I
 
Y
M
 
C
M
 
R
S
 
G
A
 
-
S
 
-
G
 
-
V
 
-
R
 
-
F
 
L
R
 
R
Y
 
V
T
 
T
D
 
D
E
 
E
E
 
T
E
 
S
L
 
L
E
 
G
V
 
Q
F
 
-
V
 
A
M
 
Q
V
 
Q
L
 
F
A
 
A
G
 
G
L
 
T
L
 
V
N
 
R
K
 
S
R
 
R
I
 
F
V
 
E
A
 
A
G
 
A
L
 
L
E
 
C
K
 
G
R
 
S
-
 
V
-
 
S
-
 
G
G
 
F
V
 
A
K
 
R
A
 
A
L
 
P
G
 
S
V
 
V
S
 
P
G
 
L
V
 
V
D
 
S
A
 
G
G
 
N
M
 
F
I
 
L
R
 
T
A
 
A
E
 
-
R
 
-
K
 
-
K
 
R
H
 
P
V
 
I
I
 
G
V
 
V
I
 
I
D
 
D
P
 
G
E
 
T
T
 
D
G
 
M
R
 
E
K
 
-
R
 
-
L
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
-
G
 
-
Y
 
Y
T
 
A
G
 
G
K
 
V
I
 
I
R
 
R
S
 
K
V
 
T
D
 
D
A
 
T
N
 
A
A
 
A
M
 
L
T
 
R
R
 
F
L
 
Q
L
 
L
D
 
D
A
 
A
G
 
G
F
 
N
T
 
I
L
 
V
V
 
W
V
 
M
A
 
P
P
 
P
L
 
L
A
 
G
L
 
H
G
 
S
T
 
Y
E
 
G
G
 
G
E
 
K
M
 
T
L
 
F
N
 
N
V
 
L
D
 
D
G
 
M
D
 
V
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
S
I
 
V
A
 
A
K
 
V
A
 
S
L
 
L
R
 
Q
A
 
A
D
 
E
K
|
K
L
 
L
I
 
V
L
 
Y
L
 
L
T
 
T
D
 
L
V
 
S
D
 
D
G
 
G
L
 
I
L
 
S
-
 
R
I
 
P
D
 
D
G
 
G
K
 
T
L
 
L
V
 
A
E
|
E
S
 
T
L
 
L
T
 
S
P
 
A
D
 
Q
E
 
E
A
 
A
R
 
Q
A
 
S
L
 
L
L
 
A
E
 
E
K
 
H
I
 
A
G
 
A
P
 
S
G
 
E
M
 
T
N
 
R
R
 
R
K
 
L
V
 
I
M
 
S
M
 
S
A
 
A
V
 
V
E
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
H
E
 
R
V
 
V
V
x
Q
I
 
I
G
 
L
S
 
N
G
 
G

Sites not aligning to the query:

7nloA Crystal structure of mycobacterium tuberculosis argb in complex with l-arginine
32% identity, 90% coverage: 2:244/270 of query aligns to 25:258/289 of 7nloA

query
sites
7nloA
L
 
V
L
 
V
V
 
V
V
 
V
K
 
K
A
 
Y
G
 
G
G
 
G
R
 
N
A
 
A
L
 
M
E
 
T
Q
 
D
N
 
D
M
 
T
E
 
L
R
 
R
-
 
R
-
 
A
I
 
F
L
 
A
D
 
A
S
 
D
I
 
M
A
 
A
W
 
F
A
 
L
V
 
R
Q
 
N
E
 
C
G
 
G
H
 
I
K
 
H
V
 
P
V
 
V
F
 
V
V
 
V
H
 
H
G
 
G
G
 
G
G
 
G
D
 
P
L
 
Q
V
 
I
T
 
T
E
 
A
Y
 
M
S
 
L
K
 
R
K
 
R
M
 
L
G
 
G
V
 
I
E
 
E
P
 
G
K
 
D
I
 
F
M
 
K
M
 
G
S
 
G
A
 
-
S
 
-
G
 
-
V
 
-
R
 
-
F
 
F
R
 
R
Y
 
V
T
 
T
D
 
T
E
 
P
E
 
E
E
 
V
L
 
L
E
 
D
V
 
V
F
 
A
V
 
R
M
 
M
V
 
V
L
 
L
A
 
F
G
 
G
L
 
Q
L
 
V
N
 
G
K
 
R
R
 
E
I
 
L
V
 
V
A
 
N
G
 
L
L
 
I
E
 
N
K
 
A
R
 
H
G
 
G
V
 
P
K
 
Y
A
 
A
L
 
V
G
 
G
V
 
I
S
 
T
G
 
G
V
 
E
D
 
D
A
 
A
G
 
Q
M
 
L
I
 
F
R
 
T
A
 
A
E
 
V
R
 
R
K
 
R
K
 
S
H
 
-
V
 
-
I
 
V
V
 
T
I
 
V
D
 
D
P
 
G
E
 
V
T
 
A
G
 
T
R
 
D
K
 
I
R
 
-
L
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
-
G
 
G
Y
 
L
T
 
V
G
 
G
K
 
D
I
 
V
R
 
D
S
 
Q
V
 
V
D
 
N
A
 
T
N
 
A
A
 
A
M
 
M
T
 
L
R
 
D
L
 
L
L
 
V
D
 
A
A
 
A
G
 
G
F
 
R
T
 
I
L
 
P
V
 
V
V
 
V
A
 
S
P
 
T
L
 
L
A
 
A
L
 
P
G
 
D
T
 
A
E
 
D
G
 
G
E
 
V
M
 
V
L
 
H
N
 
N
V
 
I
D
 
N
G
 
A
D
 
D
Q
 
T
A
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
A
I
 
V
A
 
A
K
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
G
A
 
A
D
 
E
K
|
K
L
 
L
I
 
L
L
 
M
L
 
L
T
 
T
D
 
D
V
 
I
D
 
D
G
 
G
L
 
L
L
 
Y
I
 
T
D
 
R
G
 
W
K
 
P
L
 
D
V
 
R
E
 
D
S
 
S
L
 
L
T
 
V
P
x
S
D
 
E
E
 
I
A
 
D
R
 
T
A
 
G
L
 
T
L
 
L
E
 
A
K
 
Q
I
 
L
G
 
L
P
 
P
G
 
T
M
 
L
N
 
E
R
 
S
K
 
G
V
 
M
M
 
V
M
 
P
A
 
K
V
 
V
E
 
E
A
 
A
-
 
C
L
 
L
E
 
R
A
 
A
G
 
V
V
 
I
G
 
G
E
 
G
V
 
V

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_014025935.1 NCBI__GCF_000223395.1:WP_014025935.1
MLLVVKAGGRALEQNMERILDSIAWAVQEGHKVVFVHGGGDLVTEYSKKMGVEPKIMMSA
SGVRFRYTDEEELEVFVMVLAGLLNKRIVAGLEKRGVKALGVSGVDAGMIRAERKKHVIV
IDPETGRKRLLPGGYTGKIRSVDANAMTRLLDAGFTLVVAPLALGTEGEMLNVDGDQAAA
EIAKALRADKLILLTDVDGLLIDGKLVESLTPDEARALLEKIGPGMNRKVMMAVEALEAG
VGEVVIGSGLRENPIRELLEGAPATRLARG

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory