SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_014625858.1 NCBI__GCF_000013085.1:WP_014625858.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6uecA Pseudomonas aeruginosa lpxd complex structure with ligand (see paper)
35% identity, 97% coverage: 5:362/369 of query aligns to 2:337/337 of 6uecA

query
sites
6uecA
L
 
L
P
 
S
M
 
Y
T
 
T
L
 
L
T
 
G
Q
 
Q
V
 
L
A
 
A
E
 
A
A
 
H
L
 
V
G
 
G
G
 
A
T
 
E
L
 
V
H
 
R
G
 
G
Q
 
D
G
 
A
D
 
D
L
 
L
I
 
P
I
 
I
R
 
-
R
 
-
P
 
-
V
 
-
H
 
-
P
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
-
E
 
Q
G
 
G
V
 
L
T
 
A
D
 
T
L
 
L
A
 
Q
V
 
E
A
 
A
M
 
-
E
 
G
P
 
P
A
 
A
L
 
Q
L
 
L
A
 
S
A
 
F
L
 
L
E
 
A
G
 
N
S
 
P
A
 
Q
A
 
Y
R
 
R
A
 
K
A
 
Y
L
 
L
-
 
P
-
 
E
-
 
S
V
 
R
A
 
A
G
 
G
G
 
A
A
 
V
V
 
L
P
 
L
P
 
T
A
 
A
G
 
A
S
 
D
V
 
A
D
 
D
G
 
G
W
 
F
-
 
A
-
 
G
-
 
T
-
 
A
I
 
L
E
 
V
V
 
V
G
 
A
R
 
N
P
 
P
R
 
Y
F
 
L
A
 
A
M
 
Y
H
 
A
V
 
S
I
 
L
T
 
S
G
 
H
R
 
L
F
 
F
E
 
D
Q
 
R
P
 
K
A
 
P
R
 
K
L
 
A
A
 
A
P
 
A
G
 
G
I
 
I
H
 
H
P
 
P
S
 
T
A
 
A
V
 
I
V
 
V
E
 
A
E
 
A
G
 
D
A
 
A
E
 
E
I
 
V
G
 
D
E
 
P
G
 
S
A
 
A
A
 
S
L
 
V
G
 
G
P
 
A
F
 
Y
V
 
A
H
 
V
V
 
I
G
 
E
F
 
S
G
 
G
A
 
A
R
 
R
V
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
S
 
V
R
 
S
V
 
I
H
 
G
S
 
A
G
 
H
V
 
C
S
 
V
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
R
A
 
S
V
 
V
V
 
I
G
 
G
A
 
E
D
 
G
C
 
G
L
 
W
L
 
L
H
 
A
P
 
P
G
 
R
V
 
V
R
 
T
I
 
L
G
 
Y
E
 
H
R
 
D
V
 
V
R
 
T
V
 
I
G
 
G
D
 
A
R
 
R
V
 
V
I
 
S
L
 
I
H
 
Q
A
 
S
N
 
G
A
 
A
V
 
V
I
 
I
G
 
G
A
 
G
D
 
E
G
 
G
F
 
F
S
 
G
F
 
F
V
 
A
T
 
N
P
 
-
E
 
E
P
 
K
G
 
G
S
 
V
V
 
W
E
 
Q
S
 
-
A
 
-
K
 
-
A
 
-
T
 
-
G
 
-
R
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
-
I
 
-
N
 
-
S
 
-
R
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
K
I
 
I
A
 
A
S
 
Q
L
 
I
G
 
G
A
 
G
V
 
V
V
 
T
L
 
I
G
 
G
D
 
D
D
 
D
V
 
V
E
 
E
I
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
N
T
 
T
C
 
T
I
 
I
D
 
D
R
 
R
G
 
G
T
 
A
L
 
L
D
 
S
D
 
D
T
 
T
R
 
L
I
 
I
G
 
G
D
 
N
G
 
G
T
 
V
K
 
K
I
 
L
D
 
D
D
 
N
M
 
Q
V
 
I
M
 
M
I
 
I
G
 
A
H
 
H
N
 
N
V
 
V
R
 
Q
V
 
I
G
 
G
R
 
D
L
 
H
C
 
T
M
 
A
L
 
M
C
 
A
A
 
A
Q
 
C
V
 
V
G
 
G
I
 
I
A
x
S
G
 
G
S
 
S
A
 
A
V
 
K
I
 
I
G
 
G
D
 
R
G
 
H
V
 
C
V
 
M
L
 
L
A
 
A
G
 
G
R
 
G
V
 
V
G
 
G
V
 
L
A
x
V
D
 
G
H
 
H
I
 
I
T
 
E
I
 
I
G
 
C
D
 
D
N
 
N
A
 
V
V
 
F
V
 
V
G
 
T
A
 
G
G
 
M
S
 
T
G
x
M
V
 
V
G
 
T
S
 
R
N
 
S
I
 
I
-
 
T
P
 
E
P
 
P
R
 
G
S
 
S
V
 
Y
W
 
S
M
 
S
G
 
G
Y
 
T
P
 
A
A
 
M
L
 
Q
P
 
P
K
 
A
D
 
A
Q
 
E
A
 
W
T
 
K
E
 
K
H
 
S
Y
 
A
L
 
A
F
 
R
S
 
I
R
 
R
R
 
Q
L
 
L
K
 
D
H
 
D
L
 
M
F
 
A
K
 
R
D
 
R
V
 
L
S
 
Q
E
 
Q
L
 
L
K
 
E
K
 
K
R
 
R
I
 
L

3pmoA The structure of lpxd from pseudomonas aeruginosa at 1.3 a resolution (see paper)
35% identity, 97% coverage: 5:362/369 of query aligns to 22:357/357 of 3pmoA

query
sites
3pmoA
L
 
L
P
 
S
M
 
Y
T
 
T
L
 
L
T
 
G
Q
 
Q
V
 
L
A
 
A
E
 
A
A
 
H
L
 
V
G
 
G
G
 
A
T
 
E
L
 
V
H
 
R
G
 
G
Q
 
D
G
 
A
D
 
D
L
 
L
I
 
P
I
 
I
R
 
-
R
 
-
P
 
-
V
 
-
H
 
-
P
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
-
E
 
Q
G
 
G
V
 
L
T
 
A
D
 
T
L
 
L
A
 
Q
V
 
E
A
 
A
M
 
-
E
 
G
P
 
P
A
 
A
L
 
Q
L
 
L
A
 
S
A
 
F
L
 
L
E
x
A
G
 
N
S
 
P
A
 
Q
A
x
Y
R
 
R
A
 
K
A
 
Y
L
 
L
-
 
P
-
 
E
-
 
S
V
 
R
A
 
A
G
 
G
G
 
A
A
 
V
V
 
L
P
 
L
P
 
T
A
 
A
G
 
A
S
 
D
V
 
A
D
 
D
G
 
G
W
 
F
-
 
A
-
 
G
-
 
T
-
 
A
I
 
L
E
 
V
V
 
V
G
 
A
R
 
N
P
 
P
R
 
Y
F
 
L
A
 
A
M
 
Y
H
 
A
V
 
S
I
 
L
T
 
S
G
 
H
R
 
L
F
 
F
E
 
D
Q
 
R
P
 
K
A
 
P
R
 
K
L
 
A
A
 
A
P
 
A
G
 
G
I
 
I
H
 
H
P
 
P
S
 
T
A
 
A
V
 
I
V
 
V
E
 
A
E
 
A
G
 
D
A
 
A
E
 
E
I
 
V
G
 
D
E
 
P
G
 
S
A
 
A
A
 
S
L
 
V
G
 
G
P
 
A
F
 
Y
V
 
A
H
 
V
V
 
I
G
 
E
F
 
S
G
 
G
A
 
A
R
 
R
V
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
S
 
V
R
 
S
V
 
I
H
 
G
S
 
A
G
 
H
V
 
C
S
 
V
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
R
A
 
S
V
 
V
V
 
I
G
 
G
A
 
E
D
 
G
C
 
G
L
 
W
L
 
L
H
 
A
P
 
P
G
 
R
V
 
V
R
 
T
I
 
L
G
 
Y
E
 
H
R
 
D
V
 
V
R
 
T
V
 
I
G
 
G
D
 
A
R
 
R
V
 
V
I
 
S
L
 
I
H
 
Q
A
 
S
N
 
G
A
 
A
V
 
V
I
 
I
G
 
G
A
 
G
D
 
E
G
 
G
F
 
F
S
 
G
F
 
F
V
 
A
T
 
N
P
 
-
E
 
E
P
 
K
G
 
G
S
 
V
V
 
W
E
 
Q
S
 
-
A
 
-
K
 
-
A
 
-
T
 
-
G
 
-
R
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
-
I
 
-
N
 
-
S
 
-
R
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
K
I
 
I
A
 
A
S
 
Q
L
 
I
G
 
G
A
 
G
V
 
V
V
 
T
L
 
I
G
 
G
D
 
D
D
 
D
V
 
V
E
 
E
I
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
N
T
 
T
C
 
T
I
 
I
D
 
D
R
 
R
G
 
G
T
 
A
L
 
L
D
 
S
D
 
D
T
 
T
R
 
L
I
 
I
G
 
G
D
 
N
G
 
G
T
 
V
K
 
K
I
 
L
D
 
D
D
 
N
M
 
Q
V
 
I
M
 
M
I
 
I
G
 
A
H
 
H
N
 
N
V
 
V
R
 
Q
V
 
I
G
 
G
R
 
D
L
 
H
C
 
T
M
 
A
L
 
M
C
 
A
A
 
A
Q
 
C
V
 
V
G
 
G
I
 
I
A
 
S
G
 
G
S
 
S
A
 
A
V
 
K
I
 
I
G
 
G
D
 
R
G
 
H
V
 
C
V
 
M
L
 
L
A
 
A
G
 
G
R
 
G
V
 
V
G
 
G
V
 
L
A
 
V
D
 
G
H
 
H
I
 
I
T
 
E
I
 
I
G
 
C
D
 
D
N
 
N
A
 
V
V
 
F
V
 
V
G
 
T
A
 
G
G
 
M
S
 
T
G
 
M
V
 
V
G
 
T
S
 
R
N
 
S
I
 
I
-
 
T
P
 
E
P
 
P
R
 
G
S
 
S
V
 
Y
W
 
S
M
 
S
G
 
G
Y
 
T
P
 
A
A
 
M
L
 
Q
P
 
P
K
 
A
D
 
A
Q
 
E
A
 
W
T
 
K
E
 
K
H
 
S
Y
 
A
L
 
A
F
 
R
S
 
I
R
 
R
R
 
Q
L
 
L
K
 
D
H
 
D
L
 
M
F
 
A
K
 
R
D
 
R
V
 
L
S
 
Q
E
 
Q
L
 
L
K
 
E
K
 
K
R
 
R
I
 
L

Sites not aligning to the query:

P0CD76 UDP-3-O-acylglucosamine N-acyltransferase; EC 2.3.1.191 from Chlamydia trachomatis serovar D (strain ATCC VR-885 / DSM 19411 / UW-3/Cx) (see paper)
38% identity, 70% coverage: 107:365/369 of query aligns to 105:347/354 of P0CD76

query
sites
P0CD76
P
 
P
G
 
G
I
 
I
H
 
H
P
 
P
S
 
T
A
 
A
V
 
V
V
 
I
E
 
H
E
 
P
G
 
T
A
 
A
E
 
I
I
 
I
G
 
E
E
 
D
G
 
H
A
 
V
A
 
C
L
 
I
G
 
E
P
 
P
F
 
Y
V
 
A
H
 
V
V
 
V
G
 
C
F
 
Q
G
 
H
A
 
A
R
 
H
V
 
V
G
 
G
A
 
S
G
 
A
S
 
C
R
 
H
V
 
I
H
 
G
S
 
S
G
 
G
V
 
S
S
 
V
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
Y
A
 
S
V
 
T
V
 
V
G
 
G
A
 
E
D
 
H
C
 
S
L
 
Y
L
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
R
V
 
V
R
 
V
I
 
I
G
 
R
E
 
E
R
 
R
V
 
V
R
 
S
V
 
I
G
 
G
D
 
K
R
 
R
V
 
V
I
 
I
L
 
I
H
 
Q
A
 
P
N
 
G
A
 
A
V
 
V
I
 
I
G
 
G
A
 
S
D
 
C
G
 
G
F
 
F
S
 
G
F
 
Y
V
 
V
T
 
T
P
 
S
E
 
A
P
 
F
G
 
G
S
 
Q
V
 
H
E
 
K
S
 
H
A
 
L
K
 
K
A
 
-
T
 
-
G
 
-
R
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
-
I
 
-
N
 
-
S
 
-
R
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
-
I
 
-
A
 
-
S
 
H
L
 
L
G
 
G
A
 
K
V
 
V
V
 
I
L
 
I
G
 
E
D
 
D
D
 
D
V
 
V
E
 
E
I
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
N
T
 
T
C
 
T
I
 
I
D
 
D
R
 
R
G
 
G
T
 
R
L
 
F
D
 
K
D
 
H
T
 
S
R
 
V
I
 
V
G
 
R
D
 
E
G
 
G
T
 
S
K
 
K
I
 
I
D
|
D
D
 
N
M
 
L
V
 
V
M
x
Q
I
 
I
G
 
A
H
 
H
N
x
Q
V
 
V
R
 
E
V
 
V
G
 
G
R
 
Q
L
 
H
C
 
S
M
 
M
L
 
I
C
 
V
A
 
A
Q
 
Q
V
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
A
G
 
G
S
|
S
A
 
T
V
 
K
I
 
I
G
 
G
D
 
N
G
 
H
V
 
V
V
 
I
L
 
I
A
 
G
G
 
G
R
 
Q
V
 
A
G
 
G
V
 
I
A
 
T
D
 
G
H
|
H
I
 
I
T
 
C
I
 
I
G
 
A
D
 
D
N
 
H
A
 
V
V
 
I
V
 
M
G
 
M
A
 
A
G
 
Q
S
 
T
G
 
G
V
 
V
G
 
T
S
 
K
N
 
S
I
 
I
P
 
T
P
 
S
R
 
P
S
 
G
V
 
I
W
 
Y
M
 
G
G
 
G
Y
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
R
P
 
P
K
 
Y
D
 
Q
Q
 
E
A
 
I
T
 
H
E
 
R
H
 
Q
Y
 
V
L
 
A
F
 
K
S
 
V
R
 
R
R
 
N
L
 
L
K
 
P
H
 
R
L
 
L
F
 
E
K
 
E
D
 
R
V
 
I
S
 
A
E
 
A
L
 
L
K
 
E
K
 
K
R
 
L
I
 
V
R
 
Q
S
 
K
L
 
L

2iu8A Chlamydia trachomatis lpxd with 25mm udpglcnac (complex i) (see paper)
38% identity, 70% coverage: 107:364/369 of query aligns to 105:346/346 of 2iu8A

query
sites
2iu8A
P
 
P
G
 
G
I
 
I
H
 
H
P
 
P
S
 
T
A
 
A
V
 
V
V
 
I
E
 
H
E
 
P
G
 
T
A
 
A
E
 
I
I
 
I
G
 
E
E
 
D
G
 
H
A
 
V
A
 
C
L
 
I
G
 
E
P
 
P
F
 
Y
V
 
A
H
 
V
V
 
V
G
 
C
F
 
Q
G
 
H
A
 
A
R
 
H
V
 
V
G
 
G
A
 
S
G
 
A
S
 
C
R
 
H
V
 
I
H
 
G
S
 
S
G
 
G
V
 
S
S
 
V
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
Y
A
 
S
V
 
T
V
 
V
G
 
G
A
 
E
D
 
H
C
 
S
L
 
Y
L
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
R
V
 
V
R
 
V
I
 
I
G
 
R
E
 
E
R
 
R
V
 
V
R
 
S
V
 
I
G
 
G
D
 
K
R
 
R
V
 
V
I
 
I
L
 
I
H
 
Q
A
 
P
N
 
G
A
 
A
V
 
V
I
 
I
G
 
G
A
 
S
D
 
C
G
 
G
F
|
F
S
x
G
F
 
Y
V
 
V
T
 
T
P
 
S
E
 
A
P
 
F
G
 
G
S
 
Q
V
 
H
E
 
K
S
 
H
A
 
L
K
 
K
A
 
-
T
 
-
G
 
-
R
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
-
I
 
-
N
 
-
S
 
-
R
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
-
I
 
-
A
 
-
S
 
H
L
 
L
G
 
G
A
 
K
V
 
V
V
 
I
L
 
I
G
 
E
D
 
D
D
 
D
V
 
V
E
 
E
I
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
N
T
 
T
C
 
T
I
 
I
D
 
D
R
 
R
G
 
G
T
 
R
L
 
F
D
 
K
D
 
H
T
 
S
R
 
V
I
 
V
G
 
R
D
 
E
G
 
G
T
 
S
K
 
K
I
 
I
D
|
D
D
 
N
M
 
L
V
 
V
M
x
Q
I
 
I
G
x
A
H
|
H
N
x
Q
V
 
V
R
 
E
V
 
V
G
 
G
R
 
Q
L
 
H
C
 
S
M
 
M
L
 
I
C
 
V
A
 
A
Q
 
Q
V
 
A
G
 
G
I
 
I
A
|
A
G
|
G
S
 
S
A
 
T
V
 
K
I
 
I
G
 
G
D
 
N
G
 
H
V
 
V
V
 
I
L
 
I
A
 
G
G
 
G
R
 
Q
V
 
A
G
|
G
V
 
I
A
x
T
D
x
G
H
|
H
I
 
I
T
 
C
I
 
I
G
 
A
D
 
D
N
 
H
A
 
V
V
 
I
V
 
M
G
 
M
A
|
A
G
x
Q
S
 
T
G
 
G
V
 
V
G
x
T
S
 
K
N
 
S
I
 
I
P
 
T
P
 
S
R
 
P
S
 
G
V
 
I
W
 
Y
M
 
G
G
 
G
Y
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
R
P
 
P
K
 
Y
D
 
Q
Q
 
E
A
 
I
T
 
H
E
 
R
H
 
Q
Y
 
V
L
 
A
F
 
K
S
 
V
R
 
R
R
 
N
L
 
L
K
 
P
H
 
R
L
 
L
F
 
E
K
 
E
D
 
R
V
 
I
S
 
A
E
 
A
L
 
L
K
 
E
K
 
K
R
 
L
I
 
V
R
 
Q
S
 
K

4ihhE Chasing acyl carrier protein through a catalytic cycle of lipid a production (see paper)
27% identity, 97% coverage: 9:365/369 of query aligns to 7:334/340 of 4ihhE

query
sites
4ihhE
L
 
L
T
 
A
Q
 
D
V
 
L
A
 
A
E
 
Q
A
 
Q
L
 
L
G
 
D
G
 
A
T
 
E
L
 
L
H
 
H
G
 
G
Q
 
D
G
 
G
D
 
D
L
 
I
I
 
V
I
 
I
R
 
T
R
 
G
P
 
V
V
 
A
H
 
S
P
 
M
A
 
Q
R
 
S
A
 
A
E
 
Q
A
 
T
G
 
G
E
 
H
G
 
-
V
 
-
T
 
-
D
 
-
L
 
I
A
 
T
V
 
F
A
 
M
M
 
V
E
 
N
P
 
P
A
 
K
L
 
Y
L
 
R
A
 
E
A
 
H
L
 
L
E
 
G
G
 
L
S
 
C
A
 
Q
A
 
A
R
 
S
A
 
A
A
 
V
L
 
V
V
 
M
A
 
T
G
 
Q
G
 
D
A
 
D
V
 
L
P
 
P
P
 
F
A
 
A
G
 
K
S
 
S
V
 
A
D
 
A
G
 
-
W
 
-
I
 
L
E
 
V
V
 
V
G
 
K
R
 
N
P
 
P
R
 
Y
F
 
L
A
 
T
M
 
Y
H
 
A
V
 
R
I
 
M
T
 
A
G
 
Q
R
 
I
F
 
L
E
 
D
Q
 
T
P
 
T
A
 
P
R
 
Q
L
 
P
A
 
A
P
 
Q
G
 
N
I
 
I
H
 
A
P
 
P
S
 
S
A
 
A
V
 
V
V
 
I
E
 
D
E
 
A
G
 
T
A
 
A
E
 
K
I
 
L
G
 
G
E
 
N
G
 
N
A
 
V
A
 
S
L
 
I
G
 
G
P
 
A
F
 
N
V
 
A
H
 
V
V
 
I
G
 
E
F
 
S
G
 
G
A
 
V
R
 
E
V
 
L
G
 
G
A
 
D
G
 
N
S
 
V
R
 
I
V
 
I
H
 
G
S
 
A
G
 
G
V
 
C
S
 
F
I
 
V
G
 
G
A
 
K
G
 
N
A
 
S
V
 
K
V
 
I
G
 
G
A
 
A
D
 
G
C
 
S
L
 
R
L
 
L
H
 
W
P
 
A
G
 
N
V
 
V
R
 
T
I
 
I
G
 
Y
E
 
H
R
 
E
V
 
I
R
 
Q
V
 
I
G
 
G
D
 
Q
R
 
N
V
 
C
I
 
L
L
 
I
H
 
Q
A
 
S
N
 
G
A
 
T
V
 
V
I
 
V
G
 
G
A
 
A
D
 
D
G
 
G
F
 
F
S
 
G
F
 
Y
V
 
A
T
 
N
P
 
D
E
 
R
P
 
G
G
 
N
S
 
W
V
 
V
E
 
-
S
 
-
A
 
-
K
 
-
A
 
-
T
 
-
G
 
-
R
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
-
I
 
-
N
 
-
S
 
-
R
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
K
I
 
I
A
 
P
S
 
Q
L
 
I
G
 
G
A
 
R
V
 
V
V
 
I
L
 
I
G
 
G
D
 
D
D
 
R
V
 
V
E
 
E
I
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
C
T
 
T
C
 
T
I
 
I
D
 
D
R
 
R
G
 
G
T
 
A
L
 
L
D
 
D
D
 
D
T
 
T
R
 
I
I
 
I
G
 
G
D
 
N
G
 
G
T
 
V
K
 
I
I
 
I
D
 
D
D
 
N
M
 
Q
V
 
C
M
 
Q
I
 
I
G
 
A
H
|
H
N
|
N
V
 
V
R
 
V
V
 
I
G
 
G
R
 
D
L
 
N
C
 
T
M
 
A
L
 
V
C
 
A
A
 
G
Q
 
G
V
 
V
G
 
I
I
 
M
A
 
A
G
|
G
S
 
S
A
 
L
V
 
K
I
 
I
G
 
G
D
 
R
G
 
Y
V
 
C
V
 
M
L
 
I
A
 
G
G
 
G
R
 
A
V
 
S
G
 
V
V
 
I
A
x
N
D
 
G
H
 
H
I
 
M
T
 
E
I
 
I
G
 
C
D
 
D
N
 
K
-
 
V
A
 
T
V
 
V
V
x
T
G
|
G
A
 
M
G
 
G
S
x
M
G
x
V
V
x
M
G
 
R
S
 
P
N
 
I
I
 
T
P
 
E
P
 
P
R
 
G
S
 
V
V
 
Y
W
 
S
M
 
S
G
 
G
Y
 
I
P
 
P
A
 
L
L
 
Q
P
 
P
K
x
N
D
 
K
Q
 
-
A
 
-
T
 
-
E
 
-
H
 
-
Y
 
-
L
 
-
F
 
V
S
 
W
R
|
R
R
 
K
L
 
T
K
 
A
H
 
A
L
 
L
F
 
V
K
 
M
D
 
N
V
 
I
S
 
D
E
 
D
L
 
M
K
 
S
K
 
K
R
 
R
I
 
L
R
 
K
S
 
S
L
 
L

P21645 UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)glucosamine N-acyltransferase; UDP-3-O-(3-OHC14)-GlcN N-acyltransferase; Protein FirA; Rifampicin resistance protein; UDP-3-O-(3-hydroxytetradecanoyl)glucosamine N-acyltransferase; EC 2.3.1.191 from Escherichia coli (strain K12) (see 4 papers)
27% identity, 97% coverage: 9:365/369 of query aligns to 6:333/341 of P21645

query
sites
P21645
L
 
L
T
 
A
Q
 
D
V
 
L
A
 
A
E
 
Q
A
 
Q
L
 
L
G
 
D
G
 
A
T
 
E
L
 
L
H
 
H
G
 
G
Q
 
D
G
 
G
D
 
D
L
 
I
I
 
V
I
 
I
R
 
T
R
 
G
P
 
V
V
 
A
H
 
S
P
 
M
A
 
Q
R
 
S
A
 
A
E
 
Q
A
 
T
G
 
G
E
 
H
G
 
-
V
 
-
T
 
-
D
 
-
L
 
I
A
 
T
V
x
F
A
 
M
M
 
V
E
 
N
P
 
P
A
 
K
L
 
Y
L
 
R
A
 
E
A
 
H
L
 
L
E
 
G
G
 
L
S
 
C
A
 
Q
A
 
A
R
 
S
A
 
A
A
 
V
L
 
V
V
 
M
A
 
T
G
 
Q
G
 
D
A
 
D
V
 
L
P
 
P
P
 
F
A
 
A
G
 
K
S
 
S
V
 
A
D
 
A
G
 
-
W
 
-
I
 
L
E
 
V
V
 
V
G
 
K
R
 
N
P
 
P
R
 
Y
F
 
L
A
 
T
M
 
Y
H
 
A
V
 
R
I
 
M
T
 
A
G
 
Q
R
 
I
F
 
L
E
 
D
Q
 
T
P
 
T
A
 
P
R
 
Q
L
 
P
A
 
A
P
 
Q
G
 
N
I
 
I
H
 
A
P
 
P
S
 
S
A
 
A
V
 
V
V
 
I
E
 
D
E
 
A
G
 
T
A
 
A
E
 
K
I
 
L
G
 
G
E
 
N
G
 
N
A
 
V
A
 
S
L
 
I
G
 
G
P
 
A
F
 
N
V
 
A
H
 
V
V
 
I
G
 
E
F
 
S
G
 
G
A
 
V
R
 
E
V
 
L
G
 
G
A
 
D
G
 
N
S
 
V
R
 
I
V
 
I
H
 
G
S
 
A
G
 
G
V
 
C
S
 
F
I
 
V
G
 
G
A
 
K
G
 
N
A
 
S
V
 
K
V
 
I
G
 
G
A
 
A
D
 
G
C
 
S
L
 
R
L
 
L
H
 
W
P
 
A
G
 
N
V
 
V
R
 
T
I
 
I
G
 
Y
E
 
H
R
 
E
V
 
I
R
x
Q
V
 
I
G
 
G
D
 
Q
R
 
N
V
 
C
I
 
L
L
 
I
H
 
Q
A
 
S
N
 
G
A
 
T
V
 
V
I
 
V
G
 
G
A
 
A
D
 
D
G
 
G
F
 
F
S
 
G
F
 
Y
V
 
A
T
 
N
P
 
D
E
 
R
P
 
G
G
 
N
S
 
W
V
 
V
E
 
-
S
 
-
A
 
-
K
 
-
A
 
-
T
 
-
G
 
-
R
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
-
I
 
-
N
 
-
S
 
-
R
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
K
I
 
I
A
 
P
S
 
Q
L
 
I
G
 
G
A
 
R
V
 
V
V
 
I
L
 
I
G
 
G
D
 
D
D
 
R
V
 
V
E
 
E
I
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
C
T
 
T
C
 
T
I
 
I
D
 
D
R
 
R
G
 
G
T
 
A
L
 
L
D
 
D
D
 
D
T
 
T
R
 
I
I
 
I
G
 
G
D
 
N
G
|
G
T
 
V
K
 
I
I
 
I
D
 
D
D
 
N
M
 
Q
V
 
C
M
 
Q
I
 
I
G
 
A
H
|
H
N
 
N
V
 
V
R
 
V
V
 
I
G
 
G
R
 
D
L
 
N
C
 
T
M
 
A
L
 
V
C
 
A
A
 
G
Q
x
G
V
 
V
G
 
I
I
 
M
A
 
A
G
 
G
S
 
S
A
 
L
V
 
K
I
 
I
G
 
G
D
 
R
G
 
Y
V
 
C
V
 
M
L
 
I
A
 
G
G
 
G
R
 
A
V
x
S
G
 
V
V
 
I
A
 
N
D
 
G
H
|
H
I
 
M
T
 
E
I
 
I
G
 
C
D
 
D
N
 
K
-
 
V
A
 
T
V
 
V
V
 
T
G
 
G
A
 
M
G
 
G
S
x
M
G
 
V
V
x
M
G
 
R
S
 
P
N
 
I
I
 
T
P
 
E
P
 
P
R
 
G
S
 
V
V
 
Y
W
 
S
M
 
S
G
 
G
Y
 
I
P
 
P
A
 
L
L
 
Q
P
 
P
K
 
N
D
 
K
Q
 
-
A
 
-
T
 
-
E
 
-
H
 
-
Y
 
-
L
 
-
F
 
V
S
 
W
R
 
R
R
 
K
L
 
T
K
 
A
H
 
A
L
 
L
F
 
V
K
 
M
D
 
N
V
 
I
S
 
D
E
 
D
L
 
M
K
 
S
K
 
K
R
 
R
I
 
L
R
 
K
S
 
S
L
 
L

Sites not aligning to the query:

6p8aA E.Coli lpxd in complex with compound 8.1 (see paper)
27% identity, 97% coverage: 9:365/369 of query aligns to 4:331/335 of 6p8aA

query
sites
6p8aA
L
 
L
T
 
A
Q
 
D
V
 
L
A
 
A
E
 
Q
A
 
Q
L
 
L
G
 
D
G
 
A
T
 
E
L
 
L
H
 
H
G
 
G
Q
 
D
G
 
G
D
 
D
L
 
I
I
 
V
I
 
I
R
 
T
R
 
G
P
 
V
V
 
A
H
 
S
P
 
M
A
 
Q
R
 
S
A
 
A
E
 
Q
A
 
T
G
 
G
E
 
H
G
 
-
V
 
-
T
 
-
D
 
-
L
 
I
A
 
T
V
 
F
A
 
M
M
 
V
E
 
N
P
 
P
A
 
K
L
 
Y
L
 
R
A
 
E
A
 
H
L
 
L
E
 
G
G
 
L
S
 
C
A
 
Q
A
 
A
R
 
S
A
 
A
A
 
V
L
 
V
V
 
M
A
 
T
G
 
Q
G
 
D
A
 
D
V
 
L
P
 
P
P
 
F
A
 
A
G
 
K
S
 
S
V
 
A
D
 
A
G
 
-
W
 
-
I
 
L
E
 
V
V
 
V
G
 
K
R
 
N
P
 
P
R
 
Y
F
 
L
A
 
T
M
 
Y
H
 
A
V
 
R
I
 
M
T
 
A
G
 
Q
R
 
I
F
 
L
E
 
D
Q
 
T
P
 
T
A
 
P
R
 
Q
L
 
P
A
 
A
P
 
Q
G
 
N
I
 
I
H
 
A
P
 
P
S
 
S
A
 
A
V
 
V
V
 
I
E
 
D
E
 
A
G
 
T
A
 
A
E
 
K
I
 
L
G
 
G
E
 
N
G
 
N
A
 
V
A
 
S
L
 
I
G
 
G
P
 
A
F
 
N
V
 
A
H
 
V
V
 
I
G
 
E
F
 
S
G
 
G
A
 
V
R
 
E
V
 
L
G
 
G
A
 
D
G
 
N
S
 
V
R
 
I
V
 
I
H
 
G
S
 
A
G
 
G
V
 
C
S
 
F
I
 
V
G
 
G
A
 
K
G
 
N
A
 
S
V
 
K
V
 
I
G
 
G
A
 
A
D
 
G
C
 
S
L
 
R
L
 
L
H
 
W
P
 
A
G
 
N
V
 
V
R
 
T
I
 
I
G
 
Y
E
 
H
R
 
E
V
 
I
R
 
Q
V
 
I
G
 
G
D
 
Q
R
 
N
V
 
C
I
 
L
L
 
I
H
 
Q
A
 
S
N
 
G
A
 
T
V
 
V
I
 
V
G
 
G
A
 
A
D
 
D
G
 
G
F
|
F
S
 
G
F
 
Y
V
 
A
T
 
N
P
 
D
E
 
R
P
 
G
G
 
N
S
 
W
V
 
V
E
 
-
S
 
-
A
 
-
K
 
-
A
 
-
T
 
-
G
 
-
R
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
-
I
 
-
N
 
-
S
 
-
R
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
K
I
 
I
A
 
P
S
 
Q
L
 
I
G
 
G
A
 
R
V
 
V
V
 
I
L
 
I
G
 
G
D
 
D
D
 
R
V
 
V
E
 
E
I
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
C
T
 
T
C
 
T
I
 
I
D
 
D
R
 
R
G
 
G
T
 
A
L
 
L
D
 
D
D
 
D
T
 
T
R
 
I
I
 
I
G
 
G
D
 
N
G
 
G
T
 
V
K
 
I
I
 
I
D
 
D
D
 
N
M
 
Q
V
 
C
M
 
Q
I
 
I
G
 
A
H
 
H
N
 
N
V
 
V
R
 
V
V
 
I
G
 
G
R
 
D
L
 
N
C
 
T
M
x
A
L
 
V
C
x
A
A
 
G
Q
 
G
V
 
V
G
x
I
I
 
M
A
|
A
G
 
G
S
 
S
A
 
L
V
 
K
I
 
I
G
 
G
D
 
R
G
 
Y
V
 
C
V
x
M
L
x
I
A
x
G
G
 
G
R
 
A
V
 
S
G
 
V
V
 
I
A
 
N
D
 
G
H
 
H
I
 
M
T
 
E
I
 
I
G
 
C
D
 
D
N
 
K
-
 
V
A
 
T
V
 
V
V
x
T
G
|
G
A
 
M
G
 
G
S
 
M
G
 
V
V
 
M
G
 
R
S
 
P
N
 
I
I
 
T
P
 
E
P
 
P
R
 
G
S
 
V
V
 
Y
W
 
S
M
 
S
G
 
G
Y
 
I
P
 
P
A
 
L
L
 
Q
P
 
P
K
 
N
D
 
K
Q
 
-
A
 
-
T
 
-
E
 
-
H
 
-
Y
 
-
L
 
-
F
 
V
S
 
W
R
 
R
R
 
K
L
 
T
K
 
A
H
 
A
L
 
L
F
 
V
K
 
M
D
 
N
V
 
I
S
 
D
E
 
D
L
 
M
K
 
S
K
 
K
R
 
R
I
 
L
R
 
K
S
 
S
L
 
L

6p89A E.Coli lpxd in complex with compound 7 (see paper)
27% identity, 97% coverage: 9:365/369 of query aligns to 4:331/335 of 6p89A

query
sites
6p89A
L
 
L
T
 
A
Q
 
D
V
 
L
A
 
A
E
 
Q
A
 
Q
L
 
L
G
 
D
G
 
A
T
 
E
L
 
L
H
 
H
G
 
G
Q
 
D
G
 
G
D
 
D
L
 
I
I
 
V
I
 
I
R
 
T
R
 
G
P
 
V
V
 
A
H
 
S
P
 
M
A
 
Q
R
 
S
A
 
A
E
 
Q
A
 
T
G
 
G
E
 
H
G
 
-
V
 
-
T
 
-
D
 
-
L
 
I
A
 
T
V
 
F
A
 
M
M
 
V
E
 
N
P
 
P
A
 
K
L
 
Y
L
 
R
A
 
E
A
 
H
L
 
L
E
 
G
G
 
L
S
 
C
A
 
Q
A
 
A
R
 
S
A
 
A
A
 
V
L
 
V
V
 
M
A
 
T
G
 
Q
G
 
D
A
 
D
V
 
L
P
 
P
P
 
F
A
 
A
G
 
K
S
 
S
V
 
A
D
 
A
G
 
-
W
 
-
I
 
L
E
 
V
V
 
V
G
 
K
R
 
N
P
 
P
R
 
Y
F
 
L
A
 
T
M
 
Y
H
 
A
V
 
R
I
 
M
T
 
A
G
 
Q
R
 
I
F
 
L
E
 
D
Q
 
T
P
 
T
A
 
P
R
 
Q
L
 
P
A
 
A
P
 
Q
G
 
N
I
 
I
H
 
A
P
 
P
S
 
S
A
 
A
V
 
V
V
 
I
E
 
D
E
 
A
G
 
T
A
 
A
E
 
K
I
 
L
G
 
G
E
 
N
G
 
N
A
 
V
A
 
S
L
 
I
G
 
G
P
 
A
F
 
N
V
 
A
H
 
V
V
 
I
G
 
E
F
 
S
G
 
G
A
 
V
R
 
E
V
 
L
G
 
G
A
 
D
G
 
N
S
 
V
R
 
I
V
 
I
H
 
G
S
 
A
G
 
G
V
 
C
S
 
F
I
 
V
G
 
G
A
 
K
G
 
N
A
 
S
V
 
K
V
 
I
G
 
G
A
 
A
D
 
G
C
 
S
L
 
R
L
 
L
H
 
W
P
 
A
G
 
N
V
 
V
R
 
T
I
 
I
G
 
Y
E
 
H
R
 
E
V
 
I
R
 
Q
V
 
I
G
 
G
D
 
Q
R
 
N
V
 
C
I
 
L
L
 
I
H
 
Q
A
 
S
N
 
G
A
 
T
V
 
V
I
 
V
G
 
G
A
 
A
D
 
D
G
 
G
F
|
F
S
 
G
F
 
Y
V
 
A
T
 
N
P
 
D
E
 
R
P
 
G
G
 
N
S
 
W
V
 
V
E
 
-
S
 
-
A
 
-
K
 
-
A
 
-
T
 
-
G
 
-
R
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
-
I
 
-
N
 
-
S
 
-
R
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
K
I
 
I
A
 
P
S
 
Q
L
 
I
G
 
G
A
 
R
V
 
V
V
 
I
L
 
I
G
 
G
D
 
D
D
 
R
V
 
V
E
 
E
I
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
C
T
 
T
C
 
T
I
 
I
D
 
D
R
 
R
G
 
G
T
 
A
L
 
L
D
 
D
D
 
D
T
 
T
R
 
I
I
 
I
G
 
G
D
 
N
G
 
G
T
 
V
K
 
I
I
 
I
D
 
D
D
 
N
M
 
Q
V
 
C
M
 
Q
I
 
I
G
 
A
H
 
H
N
 
N
V
 
V
R
 
V
V
 
I
G
 
G
R
 
D
L
 
N
C
 
T
M
 
A
L
 
V
C
 
A
A
 
G
Q
 
G
V
 
V
G
x
I
I
 
M
A
|
A
G
 
G
S
 
S
A
 
L
V
 
K
I
 
I
G
 
G
D
 
R
G
 
Y
V
 
C
V
x
M
L
x
I
A
x
G
G
 
G
R
 
A
V
 
S
G
 
V
V
 
I
A
 
N
D
 
G
H
 
H
I
 
M
T
 
E
I
 
I
G
 
C
D
 
D
N
 
K
-
 
V
A
 
T
V
 
V
V
x
T
G
|
G
A
 
M
G
 
G
S
 
M
G
 
V
V
 
M
G
 
R
S
 
P
N
 
I
I
 
T
P
 
E
P
 
P
R
 
G
S
 
V
V
 
Y
W
 
S
M
 
S
G
 
G
Y
 
I
P
 
P
A
 
L
L
 
Q
P
 
P
K
 
N
D
 
K
Q
 
-
A
 
-
T
 
-
E
 
-
H
 
-
Y
 
-
L
 
-
F
 
V
S
 
W
R
 
R
R
 
K
L
 
T
K
 
A
H
 
A
L
 
L
F
 
V
K
 
M
D
 
N
V
 
I
S
 
D
E
 
D
L
 
M
K
 
S
K
 
K
R
 
R
I
 
L
R
 
K
S
 
S
L
 
L

6p88A E.Coli lpxd in complex with compound 6 (see paper)
27% identity, 97% coverage: 9:365/369 of query aligns to 4:331/335 of 6p88A

query
sites
6p88A
L
 
L
T
 
A
Q
 
D
V
 
L
A
 
A
E
 
Q
A
 
Q
L
 
L
G
 
D
G
 
A
T
 
E
L
 
L
H
 
H
G
 
G
Q
 
D
G
 
G
D
 
D
L
 
I
I
 
V
I
 
I
R
 
T
R
 
G
P
 
V
V
 
A
H
 
S
P
 
M
A
 
Q
R
 
S
A
 
A
E
 
Q
A
 
T
G
 
G
E
 
H
G
 
-
V
 
-
T
 
-
D
 
-
L
 
I
A
 
T
V
 
F
A
 
M
M
 
V
E
 
N
P
 
P
A
 
K
L
 
Y
L
 
R
A
 
E
A
 
H
L
 
L
E
 
G
G
 
L
S
 
C
A
 
Q
A
 
A
R
 
S
A
 
A
A
 
V
L
 
V
V
 
M
A
 
T
G
 
Q
G
 
D
A
 
D
V
 
L
P
 
P
P
 
F
A
 
A
G
 
K
S
 
S
V
 
A
D
 
A
G
 
-
W
 
-
I
 
L
E
 
V
V
 
V
G
 
K
R
 
N
P
 
P
R
 
Y
F
 
L
A
 
T
M
 
Y
H
 
A
V
 
R
I
 
M
T
 
A
G
 
Q
R
 
I
F
 
L
E
 
D
Q
 
T
P
 
T
A
 
P
R
 
Q
L
 
P
A
 
A
P
 
Q
G
 
N
I
 
I
H
 
A
P
 
P
S
 
S
A
 
A
V
 
V
V
 
I
E
 
D
E
 
A
G
 
T
A
 
A
E
 
K
I
 
L
G
 
G
E
 
N
G
 
N
A
 
V
A
 
S
L
 
I
G
 
G
P
 
A
F
 
N
V
 
A
H
 
V
V
 
I
G
 
E
F
 
S
G
 
G
A
 
V
R
 
E
V
 
L
G
 
G
A
 
D
G
 
N
S
 
V
R
 
I
V
 
I
H
 
G
S
 
A
G
 
G
V
 
C
S
 
F
I
 
V
G
 
G
A
 
K
G
 
N
A
 
S
V
 
K
V
 
I
G
 
G
A
 
A
D
 
G
C
 
S
L
 
R
L
 
L
H
 
W
P
 
A
G
 
N
V
 
V
R
 
T
I
 
I
G
 
Y
E
 
H
R
 
E
V
 
I
R
 
Q
V
 
I
G
 
G
D
 
Q
R
 
N
V
 
C
I
 
L
L
 
I
H
 
Q
A
 
S
N
 
G
A
 
T
V
 
V
I
 
V
G
 
G
A
 
A
D
 
D
G
 
G
F
|
F
S
 
G
F
x
Y
V
 
A
T
 
N
P
 
D
E
 
R
P
 
G
G
 
N
S
 
W
V
 
V
E
 
-
S
 
-
A
 
-
K
 
-
A
 
-
T
 
-
G
 
-
R
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
-
I
 
-
N
 
-
S
 
-
R
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
K
I
 
I
A
 
P
S
 
Q
L
 
I
G
 
G
A
 
R
V
 
V
V
 
I
L
 
I
G
 
G
D
 
D
D
 
R
V
 
V
E
 
E
I
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
C
T
 
T
C
 
T
I
 
I
D
 
D
R
 
R
G
 
G
T
 
A
L
 
L
D
 
D
D
 
D
T
 
T
R
 
I
I
 
I
G
 
G
D
 
N
G
 
G
T
 
V
K
 
I
I
 
I
D
 
D
D
 
N
M
 
Q
V
 
C
M
 
Q
I
 
I
G
 
A
H
 
H
N
 
N
V
 
V
R
 
V
V
 
I
G
 
G
R
 
D
L
 
N
C
 
T
M
 
A
L
 
V
C
x
A
A
 
G
Q
 
G
V
 
V
G
x
I
I
 
M
A
|
A
G
 
G
S
 
S
A
 
L
V
 
K
I
 
I
G
 
G
D
 
R
G
 
Y
V
 
C
V
x
M
L
 
I
A
 
G
G
 
G
R
 
A
V
 
S
G
 
V
V
 
I
A
 
N
D
 
G
H
 
H
I
 
M
T
 
E
I
 
I
G
 
C
D
 
D
N
 
K
-
 
V
A
 
T
V
 
V
V
 
T
G
|
G
A
 
M
G
 
G
S
 
M
G
 
V
V
 
M
G
 
R
S
 
P
N
 
I
I
 
T
P
 
E
P
 
P
R
 
G
S
 
V
V
 
Y
W
 
S
M
 
S
G
 
G
Y
 
I
P
 
P
A
 
L
L
 
Q
P
 
P
K
 
N
D
 
K
Q
 
-
A
 
-
T
 
-
E
 
-
H
 
-
Y
 
-
L
 
-
F
 
V
S
 
W
R
 
R
R
 
K
L
 
T
K
 
A
H
 
A
L
 
L
F
 
V
K
 
M
D
 
N
V
 
I
S
 
D
E
 
D
L
 
M
K
 
S
K
 
K
R
 
R
I
 
L
R
 
K
S
 
S
L
 
L

6p87A E.Coli lpxd in complex with compound 5 (see paper)
27% identity, 97% coverage: 9:365/369 of query aligns to 4:331/335 of 6p87A

query
sites
6p87A
L
 
L
T
 
A
Q
 
D
V
 
L
A
 
A
E
 
Q
A
 
Q
L
 
L
G
 
D
G
 
A
T
 
E
L
 
L
H
 
H
G
 
G
Q
 
D
G
 
G
D
 
D
L
 
I
I
 
V
I
 
I
R
 
T
R
 
G
P
 
V
V
 
A
H
 
S
P
 
M
A
 
Q
R
 
S
A
 
A
E
 
Q
A
 
T
G
 
G
E
 
H
G
 
-
V
 
-
T
 
-
D
 
-
L
 
I
A
 
T
V
 
F
A
 
M
M
 
V
E
 
N
P
 
P
A
 
K
L
 
Y
L
 
R
A
 
E
A
 
H
L
 
L
E
 
G
G
 
L
S
 
C
A
 
Q
A
 
A
R
 
S
A
 
A
A
 
V
L
 
V
V
 
M
A
 
T
G
 
Q
G
 
D
A
 
D
V
 
L
P
 
P
P
 
F
A
 
A
G
 
K
S
 
S
V
 
A
D
 
A
G
 
-
W
 
-
I
 
L
E
 
V
V
 
V
G
 
K
R
 
N
P
 
P
R
 
Y
F
 
L
A
 
T
M
 
Y
H
 
A
V
 
R
I
 
M
T
 
A
G
 
Q
R
 
I
F
 
L
E
 
D
Q
 
T
P
 
T
A
 
P
R
 
Q
L
 
P
A
 
A
P
 
Q
G
 
N
I
 
I
H
 
A
P
 
P
S
 
S
A
 
A
V
 
V
V
 
I
E
 
D
E
 
A
G
 
T
A
 
A
E
 
K
I
 
L
G
 
G
E
 
N
G
 
N
A
 
V
A
 
S
L
 
I
G
 
G
P
 
A
F
 
N
V
 
A
H
 
V
V
 
I
G
 
E
F
 
S
G
 
G
A
 
V
R
 
E
V
 
L
G
 
G
A
 
D
G
 
N
S
 
V
R
 
I
V
 
I
H
 
G
S
 
A
G
 
G
V
 
C
S
 
F
I
 
V
G
 
G
A
 
K
G
 
N
A
 
S
V
 
K
V
 
I
G
 
G
A
 
A
D
 
G
C
 
S
L
 
R
L
 
L
H
 
W
P
 
A
G
 
N
V
 
V
R
 
T
I
 
I
G
 
Y
E
 
H
R
 
E
V
 
I
R
 
Q
V
 
I
G
 
G
D
 
Q
R
 
N
V
 
C
I
 
L
L
 
I
H
 
Q
A
 
S
N
 
G
A
 
T
V
 
V
I
 
V
G
 
G
A
 
A
D
 
D
G
 
G
F
|
F
S
 
G
F
 
Y
V
 
A
T
 
N
P
 
D
E
 
R
P
 
G
G
 
N
S
 
W
V
 
V
E
 
-
S
 
-
A
 
-
K
 
-
A
 
-
T
 
-
G
 
-
R
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
-
I
 
-
N
 
-
S
 
-
R
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
K
I
 
I
A
 
P
S
 
Q
L
 
I
G
 
G
A
 
R
V
 
V
V
 
I
L
 
I
G
 
G
D
 
D
D
 
R
V
 
V
E
 
E
I
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
C
T
 
T
C
 
T
I
 
I
D
 
D
R
 
R
G
 
G
T
 
A
L
 
L
D
 
D
D
 
D
T
 
T
R
 
I
I
 
I
G
 
G
D
 
N
G
 
G
T
 
V
K
 
I
I
 
I
D
 
D
D
 
N
M
 
Q
V
 
C
M
 
Q
I
 
I
G
 
A
H
 
H
N
 
N
V
 
V
R
 
V
V
 
I
G
 
G
R
 
D
L
 
N
C
 
T
M
 
A
L
 
V
C
x
A
A
 
G
Q
 
G
V
 
V
G
x
I
I
 
M
A
|
A
G
 
G
S
 
S
A
 
L
V
 
K
I
 
I
G
 
G
D
 
R
G
 
Y
V
 
C
V
x
M
L
 
I
A
x
G
G
|
G
R
 
A
V
 
S
G
 
V
V
 
I
A
 
N
D
 
G
H
 
H
I
 
M
T
 
E
I
 
I
G
 
C
D
 
D
N
 
K
-
 
V
A
 
T
V
 
V
V
x
T
G
|
G
A
 
M
G
 
G
S
 
M
G
 
V
V
 
M
G
 
R
S
 
P
N
 
I
I
 
T
P
 
E
P
 
P
R
 
G
S
 
V
V
 
Y
W
 
S
M
 
S
G
 
G
Y
 
I
P
 
P
A
 
L
L
 
Q
P
 
P
K
 
N
D
 
K
Q
 
-
A
 
-
T
 
-
E
 
-
H
 
-
Y
 
-
L
 
-
F
 
V
S
 
W
R
 
R
R
 
K
L
 
T
K
 
A
H
 
A
L
 
L
F
 
V
K
 
M
D
 
N
V
 
I
S
 
D
E
 
D
L
 
M
K
 
S
K
 
K
R
 
R
I
 
L
R
 
K
S
 
S
L
 
L

6p86A E.Coli lpxd in complex with compound 4.1 (see paper)
27% identity, 97% coverage: 9:365/369 of query aligns to 4:331/335 of 6p86A

query
sites
6p86A
L
 
L
T
 
A
Q
 
D
V
 
L
A
 
A
E
 
Q
A
 
Q
L
 
L
G
 
D
G
 
A
T
 
E
L
 
L
H
 
H
G
 
G
Q
 
D
G
 
G
D
 
D
L
 
I
I
 
V
I
 
I
R
 
T
R
 
G
P
 
V
V
 
A
H
 
S
P
 
M
A
 
Q
R
 
S
A
 
A
E
 
Q
A
 
T
G
 
G
E
 
H
G
 
-
V
 
-
T
 
-
D
 
-
L
 
I
A
 
T
V
 
F
A
 
M
M
 
V
E
 
N
P
 
P
A
 
K
L
 
Y
L
 
R
A
 
E
A
 
H
L
 
L
E
 
G
G
 
L
S
 
C
A
 
Q
A
 
A
R
 
S
A
 
A
A
 
V
L
 
V
V
 
M
A
 
T
G
 
Q
G
 
D
A
 
D
V
 
L
P
 
P
P
 
F
A
 
A
G
 
K
S
 
S
V
 
A
D
 
A
G
 
-
W
 
-
I
 
L
E
 
V
V
 
V
G
 
K
R
 
N
P
 
P
R
 
Y
F
 
L
A
 
T
M
 
Y
H
 
A
V
 
R
I
 
M
T
 
A
G
 
Q
R
 
I
F
 
L
E
 
D
Q
 
T
P
 
T
A
 
P
R
 
Q
L
 
P
A
 
A
P
 
Q
G
 
N
I
 
I
H
 
A
P
 
P
S
 
S
A
 
A
V
 
V
V
 
I
E
 
D
E
 
A
G
 
T
A
 
A
E
 
K
I
 
L
G
 
G
E
 
N
G
 
N
A
 
V
A
 
S
L
 
I
G
 
G
P
 
A
F
 
N
V
 
A
H
 
V
V
 
I
G
 
E
F
 
S
G
 
G
A
 
V
R
 
E
V
 
L
G
 
G
A
 
D
G
 
N
S
 
V
R
 
I
V
 
I
H
 
G
S
 
A
G
 
G
V
 
C
S
 
F
I
 
V
G
 
G
A
 
K
G
 
N
A
 
S
V
 
K
V
 
I
G
 
G
A
 
A
D
 
G
C
 
S
L
 
R
L
 
L
H
 
W
P
 
A
G
 
N
V
 
V
R
 
T
I
 
I
G
 
Y
E
 
H
R
 
E
V
 
I
R
 
Q
V
 
I
G
 
G
D
 
Q
R
 
N
V
 
C
I
 
L
L
 
I
H
 
Q
A
 
S
N
 
G
A
 
T
V
 
V
I
 
V
G
 
G
A
 
A
D
 
D
G
 
G
F
|
F
S
 
G
F
 
Y
V
 
A
T
 
N
P
 
D
E
 
R
P
 
G
G
 
N
S
 
W
V
 
V
E
 
-
S
 
-
A
 
-
K
 
-
A
 
-
T
 
-
G
 
-
R
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
-
I
 
-
N
 
-
S
 
-
R
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
K
I
 
I
A
 
P
S
 
Q
L
 
I
G
 
G
A
 
R
V
 
V
V
 
I
L
 
I
G
 
G
D
 
D
D
 
R
V
 
V
E
 
E
I
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
C
T
 
T
C
 
T
I
 
I
D
 
D
R
 
R
G
 
G
T
 
A
L
 
L
D
 
D
D
 
D
T
 
T
R
 
I
I
 
I
G
 
G
D
 
N
G
 
G
T
 
V
K
 
I
I
 
I
D
 
D
D
 
N
M
 
Q
V
 
C
M
 
Q
I
 
I
G
 
A
H
 
H
N
 
N
V
 
V
R
 
V
V
 
I
G
 
G
R
 
D
L
 
N
C
 
T
M
x
A
L
 
V
C
x
A
A
 
G
Q
 
G
V
 
V
G
x
I
I
 
M
A
|
A
G
 
G
S
 
S
A
 
L
V
 
K
I
 
I
G
 
G
D
 
R
G
 
Y
V
 
C
V
 
M
L
 
I
A
x
G
G
|
G
R
 
A
V
 
S
G
 
V
V
 
I
A
 
N
D
 
G
H
 
H
I
 
M
T
 
E
I
 
I
G
 
C
D
 
D
N
 
K
-
 
V
A
 
T
V
 
V
V
x
T
G
|
G
A
 
M
G
 
G
S
 
M
G
 
V
V
 
M
G
 
R
S
 
P
N
 
I
I
 
T
P
 
E
P
 
P
R
 
G
S
 
V
V
 
Y
W
 
S
M
 
S
G
 
G
Y
 
I
P
 
P
A
 
L
L
 
Q
P
 
P
K
 
N
D
 
K
Q
 
-
A
 
-
T
 
-
E
 
-
H
 
-
Y
 
-
L
 
-
F
 
V
S
 
W
R
 
R
R
 
K
L
 
T
K
 
A
H
 
A
L
 
L
F
 
V
K
 
M
D
 
N
V
 
I
S
 
D
E
 
D
L
 
M
K
 
S
K
 
K
R
 
R
I
 
L
R
 
K
S
 
S
L
 
L

6p85A E.Coli lpxd in complex with compound 3 (see paper)
27% identity, 97% coverage: 9:365/369 of query aligns to 4:331/335 of 6p85A

query
sites
6p85A
L
 
L
T
 
A
Q
 
D
V
 
L
A
 
A
E
 
Q
A
 
Q
L
 
L
G
 
D
G
 
A
T
 
E
L
 
L
H
 
H
G
 
G
Q
 
D
G
 
G
D
 
D
L
 
I
I
 
V
I
 
I
R
 
T
R
 
G
P
 
V
V
 
A
H
 
S
P
 
M
A
 
Q
R
 
S
A
 
A
E
 
Q
A
 
T
G
 
G
E
 
H
G
 
-
V
 
-
T
 
-
D
 
-
L
 
I
A
 
T
V
 
F
A
 
M
M
 
V
E
 
N
P
 
P
A
 
K
L
 
Y
L
 
R
A
 
E
A
 
H
L
 
L
E
 
G
G
 
L
S
 
C
A
 
Q
A
 
A
R
 
S
A
 
A
A
 
V
L
 
V
V
 
M
A
 
T
G
 
Q
G
 
D
A
 
D
V
 
L
P
 
P
P
 
F
A
 
A
G
 
K
S
 
S
V
 
A
D
 
A
G
 
-
W
 
-
I
 
L
E
 
V
V
 
V
G
 
K
R
 
N
P
 
P
R
 
Y
F
 
L
A
 
T
M
 
Y
H
 
A
V
 
R
I
 
M
T
 
A
G
 
Q
R
 
I
F
 
L
E
 
D
Q
 
T
P
 
T
A
 
P
R
 
Q
L
 
P
A
 
A
P
 
Q
G
 
N
I
 
I
H
 
A
P
 
P
S
 
S
A
 
A
V
 
V
V
 
I
E
 
D
E
 
A
G
 
T
A
 
A
E
 
K
I
 
L
G
 
G
E
 
N
G
 
N
A
 
V
A
 
S
L
 
I
G
 
G
P
 
A
F
 
N
V
 
A
H
 
V
V
 
I
G
 
E
F
 
S
G
 
G
A
 
V
R
 
E
V
 
L
G
 
G
A
 
D
G
 
N
S
 
V
R
 
I
V
 
I
H
 
G
S
 
A
G
 
G
V
 
C
S
 
F
I
 
V
G
 
G
A
 
K
G
 
N
A
 
S
V
 
K
V
 
I
G
 
G
A
 
A
D
 
G
C
 
S
L
 
R
L
 
L
H
 
W
P
 
A
G
 
N
V
 
V
R
 
T
I
 
I
G
 
Y
E
 
H
R
 
E
V
 
I
R
 
Q
V
 
I
G
 
G
D
 
Q
R
 
N
V
 
C
I
 
L
L
 
I
H
 
Q
A
 
S
N
 
G
A
 
T
V
 
V
I
 
V
G
 
G
A
 
A
D
 
D
G
 
G
F
|
F
S
 
G
F
 
Y
V
 
A
T
 
N
P
 
D
E
 
R
P
 
G
G
 
N
S
 
W
V
 
V
E
 
-
S
 
-
A
 
-
K
 
-
A
 
-
T
 
-
G
 
-
R
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
-
I
 
-
N
 
-
S
 
-
R
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
K
I
 
I
A
 
P
S
 
Q
L
 
I
G
 
G
A
 
R
V
 
V
V
 
I
L
 
I
G
 
G
D
 
D
D
 
R
V
 
V
E
 
E
I
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
C
T
 
T
C
 
T
I
 
I
D
 
D
R
 
R
G
 
G
T
 
A
L
 
L
D
 
D
D
 
D
T
 
T
R
 
I
I
 
I
G
 
G
D
 
N
G
 
G
T
 
V
K
 
I
I
 
I
D
 
D
D
 
N
M
 
Q
V
 
C
M
 
Q
I
 
I
G
 
A
H
 
H
N
 
N
V
 
V
R
 
V
V
 
I
G
 
G
R
 
D
L
 
N
C
 
T
M
 
A
L
 
V
C
x
A
A
 
G
Q
 
G
V
 
V
G
x
I
I
 
M
A
|
A
G
 
G
S
 
S
A
 
L
V
 
K
I
 
I
G
 
G
D
 
R
G
 
Y
V
 
C
V
 
M
L
 
I
A
x
G
G
|
G
R
 
A
V
 
S
G
 
V
V
 
I
A
 
N
D
 
G
H
 
H
I
 
M
T
 
E
I
 
I
G
 
C
D
 
D
N
 
K
-
 
V
A
 
T
V
 
V
V
 
T
G
|
G
A
 
M
G
 
G
S
 
M
G
 
V
V
 
M
G
 
R
S
 
P
N
 
I
I
 
T
P
 
E
P
 
P
R
 
G
S
 
V
V
 
Y
W
 
S
M
 
S
G
 
G
Y
 
I
P
 
P
A
 
L
L
 
Q
P
 
P
K
 
N
D
 
K
Q
 
-
A
 
-
T
 
-
E
 
-
H
 
-
Y
 
-
L
 
-
F
 
V
S
 
W
R
 
R
R
 
K
L
 
T
K
 
A
H
 
A
L
 
L
F
 
V
K
 
M
D
 
N
V
 
I
S
 
D
E
 
D
L
 
M
K
 
S
K
 
K
R
 
R
I
 
L
R
 
K
S
 
S
L
 
L

6p84A E.Coli lpxd in complex with compound 2o (see paper)
27% identity, 97% coverage: 9:365/369 of query aligns to 4:331/335 of 6p84A

query
sites
6p84A
L
 
L
T
 
A
Q
 
D
V
 
L
A
 
A
E
 
Q
A
 
Q
L
 
L
G
 
D
G
 
A
T
 
E
L
 
L
H
 
H
G
 
G
Q
 
D
G
 
G
D
 
D
L
 
I
I
 
V
I
 
I
R
 
T
R
 
G
P
 
V
V
 
A
H
 
S
P
 
M
A
 
Q
R
 
S
A
 
A
E
 
Q
A
 
T
G
 
G
E
 
H
G
 
-
V
 
-
T
 
-
D
 
-
L
 
I
A
 
T
V
 
F
A
 
M
M
 
V
E
 
N
P
 
P
A
 
K
L
 
Y
L
 
R
A
 
E
A
 
H
L
 
L
E
 
G
G
 
L
S
 
C
A
 
Q
A
 
A
R
 
S
A
 
A
A
 
V
L
 
V
V
 
M
A
 
T
G
 
Q
G
 
D
A
 
D
V
 
L
P
 
P
P
 
F
A
 
A
G
 
K
S
 
S
V
 
A
D
 
A
G
 
-
W
 
-
I
 
L
E
 
V
V
 
V
G
 
K
R
 
N
P
 
P
R
 
Y
F
 
L
A
 
T
M
 
Y
H
 
A
V
 
R
I
 
M
T
 
A
G
 
Q
R
 
I
F
 
L
E
 
D
Q
 
T
P
 
T
A
 
P
R
 
Q
L
 
P
A
 
A
P
 
Q
G
 
N
I
 
I
H
 
A
P
 
P
S
 
S
A
 
A
V
 
V
V
 
I
E
 
D
E
 
A
G
 
T
A
 
A
E
 
K
I
 
L
G
 
G
E
 
N
G
 
N
A
 
V
A
 
S
L
 
I
G
 
G
P
 
A
F
 
N
V
 
A
H
 
V
V
 
I
G
 
E
F
 
S
G
 
G
A
 
V
R
 
E
V
 
L
G
 
G
A
 
D
G
 
N
S
 
V
R
 
I
V
 
I
H
 
G
S
 
A
G
 
G
V
 
C
S
 
F
I
 
V
G
 
G
A
 
K
G
 
N
A
 
S
V
 
K
V
 
I
G
 
G
A
 
A
D
 
G
C
 
S
L
 
R
L
 
L
H
 
W
P
 
A
G
 
N
V
 
V
R
 
T
I
 
I
G
 
Y
E
 
H
R
 
E
V
 
I
R
 
Q
V
 
I
G
 
G
D
 
Q
R
 
N
V
 
C
I
 
L
L
 
I
H
 
Q
A
 
S
N
 
G
A
 
T
V
 
V
I
 
V
G
 
G
A
 
A
D
 
D
G
 
G
F
|
F
S
 
G
F
 
Y
V
 
A
T
 
N
P
 
D
E
 
R
P
 
G
G
 
N
S
 
W
V
 
V
E
 
-
S
 
-
A
 
-
K
 
-
A
 
-
T
 
-
G
 
-
R
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
-
I
 
-
N
 
-
S
 
-
R
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
K
I
 
I
A
 
P
S
 
Q
L
 
I
G
 
G
A
 
R
V
 
V
V
 
I
L
 
I
G
 
G
D
 
D
D
 
R
V
 
V
E
 
E
I
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
C
T
 
T
C
 
T
I
 
I
D
 
D
R
 
R
G
 
G
T
 
A
L
 
L
D
 
D
D
 
D
T
 
T
R
 
I
I
 
I
G
 
G
D
 
N
G
 
G
T
 
V
K
 
I
I
 
I
D
 
D
D
 
N
M
 
Q
V
 
C
M
 
Q
I
 
I
G
 
A
H
 
H
N
 
N
V
 
V
R
 
V
V
 
I
G
 
G
R
 
D
L
 
N
C
 
T
M
 
A
L
 
V
C
x
A
A
 
G
Q
 
G
V
 
V
G
x
I
I
 
M
A
|
A
G
 
G
S
 
S
A
 
L
V
 
K
I
 
I
G
 
G
D
 
R
G
 
Y
V
 
C
V
x
M
L
x
I
A
x
G
G
|
G
R
 
A
V
 
S
G
 
V
V
 
I
A
 
N
D
 
G
H
 
H
I
 
M
T
 
E
I
 
I
G
 
C
D
 
D
N
 
K
-
 
V
A
 
T
V
 
V
V
 
T
G
 
G
A
 
M
G
 
G
S
 
M
G
 
V
V
 
M
G
 
R
S
 
P
N
 
I
I
 
T
P
 
E
P
 
P
R
 
G
S
 
V
V
 
Y
W
 
S
M
 
S
G
 
G
Y
 
I
P
 
P
A
 
L
L
 
Q
P
 
P
K
 
N
D
 
K
Q
 
-
A
 
-
T
 
-
E
 
-
H
 
-
Y
 
-
L
 
-
F
 
V
S
 
W
R
 
R
R
 
K
L
 
T
K
 
A
H
 
A
L
 
L
F
 
V
K
 
M
D
 
N
V
 
I
S
 
D
E
 
D
L
 
M
K
 
S
K
 
K
R
 
R
I
 
L
R
 
K
S
 
S
L
 
L

6p83A E.Coli lpxd in complex with compound 1o (see paper)
27% identity, 97% coverage: 9:365/369 of query aligns to 4:331/335 of 6p83A

query
sites
6p83A
L
 
L
T
 
A
Q
 
D
V
 
L
A
 
A
E
 
Q
A
 
Q
L
 
L
G
 
D
G
 
A
T
 
E
L
 
L
H
 
H
G
 
G
Q
 
D
G
 
G
D
 
D
L
 
I
I
 
V
I
 
I
R
 
T
R
 
G
P
 
V
V
 
A
H
 
S
P
 
M
A
 
Q
R
 
S
A
 
A
E
 
Q
A
 
T
G
 
G
E
 
H
G
 
-
V
 
-
T
 
-
D
 
-
L
 
I
A
 
T
V
 
F
A
 
M
M
 
V
E
 
N
P
 
P
A
 
K
L
 
Y
L
 
R
A
 
E
A
 
H
L
 
L
E
 
G
G
 
L
S
 
C
A
 
Q
A
 
A
R
 
S
A
 
A
A
 
V
L
 
V
V
 
M
A
 
T
G
 
Q
G
 
D
A
 
D
V
 
L
P
 
P
P
 
F
A
 
A
G
 
K
S
 
S
V
 
A
D
 
A
G
 
-
W
 
-
I
 
L
E
 
V
V
 
V
G
 
K
R
 
N
P
 
P
R
 
Y
F
 
L
A
 
T
M
 
Y
H
 
A
V
 
R
I
 
M
T
 
A
G
 
Q
R
 
I
F
 
L
E
 
D
Q
 
T
P
 
T
A
 
P
R
 
Q
L
 
P
A
 
A
P
 
Q
G
 
N
I
 
I
H
 
A
P
 
P
S
 
S
A
 
A
V
 
V
V
 
I
E
 
D
E
 
A
G
 
T
A
 
A
E
 
K
I
 
L
G
 
G
E
 
N
G
 
N
A
 
V
A
 
S
L
 
I
G
 
G
P
 
A
F
 
N
V
 
A
H
 
V
V
 
I
G
 
E
F
 
S
G
 
G
A
 
V
R
 
E
V
 
L
G
 
G
A
 
D
G
 
N
S
 
V
R
 
I
V
 
I
H
 
G
S
 
A
G
 
G
V
 
C
S
 
F
I
 
V
G
 
G
A
 
K
G
 
N
A
 
S
V
 
K
V
 
I
G
 
G
A
 
A
D
 
G
C
 
S
L
 
R
L
 
L
H
 
W
P
 
A
G
 
N
V
 
V
R
 
T
I
 
I
G
 
Y
E
 
H
R
 
E
V
 
I
R
 
Q
V
 
I
G
 
G
D
 
Q
R
 
N
V
 
C
I
 
L
L
 
I
H
 
Q
A
 
S
N
 
G
A
 
T
V
 
V
I
 
V
G
 
G
A
 
A
D
 
D
G
 
G
F
|
F
S
 
G
F
 
Y
V
 
A
T
 
N
P
 
D
E
 
R
P
 
G
G
 
N
S
 
W
V
 
V
E
 
-
S
 
-
A
 
-
K
 
-
A
 
-
T
 
-
G
 
-
R
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
-
I
 
-
N
 
-
S
 
-
R
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
K
I
 
I
A
 
P
S
 
Q
L
 
I
G
 
G
A
 
R
V
 
V
V
 
I
L
 
I
G
 
G
D
 
D
D
 
R
V
 
V
E
 
E
I
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
C
T
 
T
C
 
T
I
 
I
D
 
D
R
 
R
G
 
G
T
 
A
L
 
L
D
 
D
D
 
D
T
 
T
R
 
I
I
 
I
G
 
G
D
 
N
G
 
G
T
 
V
K
 
I
I
 
I
D
 
D
D
 
N
M
 
Q
V
 
C
M
 
Q
I
 
I
G
 
A
H
 
H
N
 
N
V
 
V
R
 
V
V
 
I
G
 
G
R
 
D
L
 
N
C
 
T
M
 
A
L
 
V
C
x
A
A
 
G
Q
 
G
V
 
V
G
x
I
I
 
M
A
|
A
G
 
G
S
 
S
A
 
L
V
 
K
I
 
I
G
 
G
D
 
R
G
 
Y
V
 
C
V
x
M
L
x
I
A
x
G
G
|
G
R
 
A
V
 
S
G
 
V
V
 
I
A
 
N
D
 
G
H
 
H
I
 
M
T
 
E
I
 
I
G
 
C
D
 
D
N
 
K
-
 
V
A
 
T
V
|
V
V
 
T
G
 
G
A
 
M
G
 
G
S
 
M
G
 
V
V
 
M
G
 
R
S
 
P
N
 
I
I
 
T
P
 
E
P
 
P
R
 
G
S
 
V
V
 
Y
W
 
S
M
 
S
G
 
G
Y
 
I
P
 
P
A
 
L
L
 
Q
P
 
P
K
 
N
D
 
K
Q
 
-
A
 
-
T
 
-
E
 
-
H
 
-
Y
 
-
L
 
-
F
 
V
S
 
W
R
 
R
R
 
K
L
 
T
K
 
A
H
 
A
L
 
L
F
 
V
K
 
M
D
 
N
V
 
I
S
 
D
E
 
D
L
 
M
K
 
S
K
 
K
R
 
R
I
 
L
R
 
K
S
 
S
L
 
L

4ihgE Chasing acyl carrier protein through a catalytic cycle of lipid a production (see paper)
27% identity, 97% coverage: 9:365/369 of query aligns to 5:332/337 of 4ihgE

query
sites
4ihgE
L
 
L
T
 
A
Q
 
D
V
 
L
A
 
A
E
 
Q
A
 
Q
L
 
L
G
 
D
G
 
A
T
 
E
L
 
L
H
 
H
G
 
G
Q
 
D
G
 
G
D
 
D
L
 
I
I
 
V
I
 
I
R
 
T
R
 
G
P
 
V
V
 
A
H
 
S
P
 
M
A
 
Q
R
 
S
A
 
A
E
 
Q
A
 
T
G
 
G
E
 
H
G
 
-
V
 
-
T
 
-
D
 
-
L
 
I
A
 
T
V
 
F
A
 
M
M
 
V
E
 
N
P
 
P
A
 
K
L
 
Y
L
 
R
A
 
E
A
 
H
L
 
L
E
 
G
G
 
L
S
 
C
A
 
Q
A
 
A
R
 
S
A
 
A
A
 
V
L
 
V
V
 
M
A
 
T
G
 
Q
G
 
D
A
 
D
V
 
L
P
 
P
P
 
F
A
 
A
G
 
K
S
 
S
V
 
A
D
 
A
G
 
-
W
 
-
I
 
L
E
 
V
V
 
V
G
 
K
R
 
N
P
 
P
R
 
Y
F
 
L
A
 
T
M
 
Y
H
 
A
V
 
R
I
 
M
T
 
A
G
 
Q
R
 
I
F
 
L
E
 
D
Q
 
T
P
 
T
A
 
P
R
 
Q
L
 
P
A
 
A
P
 
Q
G
 
N
I
 
I
H
 
A
P
 
P
S
 
S
A
 
A
V
 
V
V
 
I
E
 
D
E
 
A
G
 
T
A
 
A
E
 
K
I
 
L
G
 
G
E
 
N
G
 
N
A
 
V
A
 
S
L
 
I
G
 
G
P
 
A
F
 
N
V
 
A
H
 
V
V
 
I
G
 
E
F
 
S
G
 
G
A
 
V
R
 
E
V
 
L
G
 
G
A
 
D
G
 
N
S
 
V
R
 
I
V
 
I
H
 
G
S
 
A
G
 
G
V
 
C
S
 
F
I
 
V
G
 
G
A
 
K
G
 
N
A
 
S
V
 
K
V
 
I
G
 
G
A
 
A
D
 
G
C
 
S
L
 
R
L
 
L
H
 
W
P
 
A
G
 
N
V
 
V
R
 
T
I
 
I
G
 
Y
E
 
H
R
 
E
V
 
I
R
 
Q
V
 
I
G
 
G
D
 
Q
R
 
N
V
 
C
I
 
L
L
 
I
H
 
Q
A
 
S
N
 
G
A
 
T
V
 
V
I
 
V
G
 
G
A
 
A
D
 
D
G
 
G
F
 
F
S
 
G
F
 
Y
V
 
A
T
 
N
P
 
D
E
 
R
P
 
G
G
 
N
S
 
W
V
 
V
E
 
-
S
 
-
A
 
-
K
 
-
A
 
-
T
 
-
G
 
-
R
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
-
I
 
-
N
 
-
S
 
-
R
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
K
I
 
I
A
 
P
S
 
Q
L
 
I
G
 
G
A
 
R
V
 
V
V
 
I
L
 
I
G
 
G
D
 
D
D
 
R
V
 
V
E
 
E
I
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
C
T
 
T
C
 
T
I
 
I
D
 
D
R
 
R
G
 
G
T
 
A
L
 
L
D
 
D
D
 
D
T
 
T
R
 
I
I
 
I
G
 
G
D
 
N
G
 
G
T
 
V
K
 
I
I
 
I
D
 
D
D
 
N
M
 
Q
V
 
C
M
 
Q
I
 
I
G
 
A
H
|
H
N
|
N
V
 
V
R
 
V
V
 
I
G
 
G
R
 
D
L
 
N
C
 
T
M
 
A
L
 
V
C
 
A
A
 
G
Q
 
G
V
 
V
G
 
I
I
 
M
A
 
A
G
|
G
S
 
S
A
 
L
V
 
K
I
 
I
G
 
G
D
 
R
G
 
Y
V
 
C
V
 
M
L
 
I
A
 
G
G
 
G
R
 
A
V
 
S
G
 
V
V
 
I
A
 
N
D
 
G
H
 
H
I
 
M
T
 
E
I
 
I
G
 
C
D
 
D
N
 
K
-
 
V
A
 
T
V
 
V
V
 
T
G
 
G
A
 
M
G
 
G
S
 
M
G
 
V
V
 
M
G
 
R
S
 
P
N
 
I
I
 
T
P
 
E
P
 
P
R
 
G
S
 
V
V
 
Y
W
 
S
M
 
S
G
 
G
Y
 
I
P
 
P
A
 
L
L
 
Q
P
 
P
K
 
N
D
 
K
Q
 
-
A
 
-
T
 
-
E
 
-
H
 
-
Y
 
-
L
 
-
F
 
V
S
 
W
R
|
R
R
 
K
L
 
T
K
x
A
H
 
A
L
 
L
F
 
V
K
 
M
D
 
N
V
 
I
S
 
D
E
 
D
L
 
M
K
 
S
K
 
K
R
 
R
I
 
L
R
 
K
S
 
S
L
 
L

P0A1X4 UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)glucosamine N-acyltransferase; UDP-3-O-(3-OHC14)-GlcN N-acyltransferase; UDP-3-O-(3-hydroxytetradecanoyl)glucosamine N-acyltransferase; EC 2.3.1.191 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
28% identity, 97% coverage: 9:365/369 of query aligns to 6:333/341 of P0A1X4

query
sites
P0A1X4
L
 
L
T
 
A
Q
 
D
V
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
Q
L
 
L
G
 
D
G
 
A
T
 
E
L
 
L
H
 
H
G
 
G
Q
 
D
G
 
G
D
 
D
L
 
I
I
 
V
I
 
I
R
 
T
R
 
G
P
 
V
V
 
A
H
 
S
P
 
M
A
 
Q
R
 
S
A
 
A
E
 
T
A
 
T
G
 
G
E
 
H
G
 
-
V
 
-
T
 
-
D
 
-
L
 
I
A
 
T
V
 
F
A
 
M
M
 
V
E
 
N
P
 
P
A
 
K
L
 
Y
L
 
R
A
 
E
A
 
H
L
 
L
E
 
G
G
 
L
S
 
C
A
 
Q
A
 
A
R
 
S
A
 
A
A
 
V
L
 
V
V
 
M
A
 
T
G
 
Q
G
 
D
A
 
D
V
 
L
P
 
P
P
 
F
A
 
A
G
 
K
S
 
S
V
 
-
D
 
-
G
 
A
W
 
A
I
 
L
E
 
V
V
 
V
G
 
K
R
 
N
P
 
P
R
 
Y
F
 
L
A
 
T
M
 
Y
H
 
A
V
 
R
I
 
M
T
 
A
G
 
Q
R
 
I
F
 
L
E
 
D
Q
 
T
P
 
T
A
 
P
R
 
Q
L
 
P
A
 
A
P
 
Q
G
 
N
I
 
I
H
 
A
P
 
P
S
 
S
A
 
A
V
 
V
V
 
I
E
 
D
E
 
A
G
 
T
A
 
A
E
 
T
I
 
L
G
 
G
E
 
S
G
 
N
A
 
V
A
 
S
L
 
V
G
 
G
P
 
A
F
 
N
V
 
A
H
 
V
V
 
I
G
 
E
F
 
S
G
 
G
A
 
V
R
 
Q
V
 
L
G
 
G
A
 
D
G
 
N
S
 
V
R
 
V
V
 
I
H
 
G
S
 
A
G
 
G
V
 
C
S
 
F
I
 
V
G
 
G
A
 
K
G
 
N
A
 
S
V
 
K
V
 
I
G
 
G
A
 
A
D
 
G
C
 
S
L
 
R
L
 
L
H
 
W
P
 
A
G
 
N
V
 
V
R
 
T
I
 
I
G
 
Y
E
 
H
R
 
D
V
 
I
R
 
Q
V
 
I
G
 
G
D
 
E
R
 
N
V
 
C
I
 
L
L
 
I
H
 
Q
A
 
S
N
 
S
A
 
T
V
 
V
I
 
I
G
 
G
A
 
A
D
 
D
G
 
G
F
 
F
S
 
G
F
 
Y
V
 
A
T
 
N
P
 
D
E
 
R
P
 
G
G
 
N
S
 
W
V
 
V
E
 
-
S
 
-
A
 
-
K
 
-
A
 
-
T
 
-
G
 
-
R
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
-
I
 
-
N
 
-
S
 
-
R
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
K
I
 
I
A
 
P
S
 
Q
L
 
L
G
 
G
A
 
R
V
 
V
V
 
I
L
 
I
G
 
G
D
 
D
D
 
R
V
 
V
E
 
E
I
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
C
T
 
T
C
 
T
I
 
I
D
 
D
R
 
R
G
 
G
T
 
A
L
 
L
D
 
D
D
 
D
T
 
T
R
 
V
I
 
I
G
 
G
D
 
N
G
 
G
T
 
V
K
 
I
I
 
I
D
 
D
D
 
N
M
 
Q
V
 
C
M
 
Q
I
 
I
G
 
A
H
 
H
N
 
N
V
 
V
R
 
V
V
 
I
G
 
G
R
 
D
L
 
N
C
 
T
M
 
A
L
 
V
C
 
A
A
 
G
Q
 
G
V
 
V
G
 
I
I
 
M
A
 
A
G
 
G
S
 
S
A
 
L
V
 
K
I
 
I
G
 
G
D
 
R
G
 
Y
V
 
C
V
 
M
L
 
I
A
 
G
G
 
G
R
 
A
V
 
S
G
 
V
V
 
I
A
 
N
D
 
G
H
 
H
I
 
M
T
 
E
I
 
I
G
 
C
D
 
D
N
 
K
-
 
V
A
 
T
V
 
V
V
 
T
G
 
G
A
 
M
G
 
G
S
 
M
G
x
V
V
 
M
G
 
R
S
 
P
N
 
I
I
 
T
P
 
E
P
 
P
R
 
G
S
 
V
V
 
Y
W
 
S
M
 
S
G
 
G
Y
 
I
P
 
P
A
 
L
L
 
Q
P
 
P
K
 
N
D
 
K
Q
 
-
A
 
-
T
 
-
E
 
-
H
 
-
Y
 
-
L
 
-
F
 
V
S
 
W
R
 
R
R
 
K
L
 
T
K
 
A
H
 
A
L
 
L
F
 
V
K
 
M
D
 
N
V
 
I
S
 
D
E
 
D
L
 
M
K
 
S
K
 
K
R
 
R
I
 
L
R
 
K
S
 
A
L
 
I

4ihfA Chasing acyl carrier protein through a catalytic cycle of lipid a production (see paper)
27% identity, 97% coverage: 9:365/369 of query aligns to 4:331/336 of 4ihfA

query
sites
4ihfA
L
 
L
T
 
A
Q
 
D
V
 
L
A
 
A
E
 
Q
A
 
Q
L
 
L
G
 
D
G
 
A
T
 
E
L
 
L
H
 
H
G
 
G
Q
 
D
G
 
G
D
 
D
L
 
I
I
 
V
I
 
I
R
 
T
R
 
G
P
 
V
V
 
A
H
 
S
P
 
M
A
 
Q
R
 
S
A
 
A
E
 
Q
A
 
T
G
 
G
E
 
H
G
 
-
V
 
-
T
 
-
D
 
-
L
 
I
A
 
T
V
 
F
A
 
M
M
 
V
E
 
N
P
 
P
A
 
K
L
 
Y
L
 
R
A
 
E
A
 
H
L
 
L
E
 
G
G
 
L
S
 
C
A
 
Q
A
 
A
R
 
S
A
 
A
A
 
V
L
 
V
V
 
M
A
 
T
G
 
Q
G
 
D
A
 
D
V
 
L
P
 
P
P
 
F
A
 
A
G
 
K
S
 
S
V
 
A
D
 
A
G
 
-
W
 
-
I
 
L
E
 
V
V
 
V
G
 
K
R
 
N
P
 
P
R
 
Y
F
 
L
A
 
T
M
 
Y
H
 
A
V
 
R
I
 
M
T
 
A
G
 
Q
R
 
I
F
 
L
E
 
D
Q
 
T
P
 
T
A
 
P
R
 
Q
L
 
P
A
 
A
P
 
Q
G
 
N
I
 
I
H
 
A
P
 
P
S
 
S
A
 
A
V
 
V
V
 
I
E
 
D
E
 
A
G
 
T
A
 
A
E
 
K
I
 
L
G
 
G
E
 
N
G
 
N
A
 
V
A
 
S
L
 
I
G
 
G
P
 
A
F
 
N
V
 
A
H
 
V
V
 
I
G
 
E
F
 
S
G
 
G
A
 
V
R
 
E
V
 
L
G
 
G
A
 
D
G
 
N
S
 
V
R
 
I
V
 
I
H
 
G
S
 
A
G
 
G
V
 
C
S
 
F
I
 
V
G
 
G
A
 
K
G
 
N
A
 
S
V
 
K
V
 
I
G
 
G
A
 
A
D
 
G
C
 
S
L
 
R
L
 
L
H
 
W
P
 
A
G
 
N
V
 
V
R
 
T
I
 
I
G
 
Y
E
 
H
R
 
E
V
 
I
R
 
Q
V
 
I
G
 
G
D
 
Q
R
 
N
V
 
C
I
 
L
L
 
I
H
 
Q
A
 
S
N
 
G
A
 
T
V
 
V
I
 
V
G
 
G
A
 
A
D
 
D
G
 
G
F
|
F
S
 
G
F
 
Y
V
 
A
T
 
N
P
 
D
E
 
R
P
 
G
G
 
N
S
 
W
V
 
V
E
 
-
S
 
-
A
 
-
K
 
-
A
 
-
T
 
-
G
 
-
R
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
-
I
 
-
N
 
-
S
 
-
R
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
K
I
 
I
A
 
P
S
 
Q
L
 
I
G
 
G
A
 
R
V
 
V
V
 
I
L
 
I
G
 
G
D
 
D
D
 
R
V
 
V
E
 
E
I
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
C
T
 
T
C
 
T
I
 
I
D
 
D
R
 
R
G
 
G
T
 
A
L
 
L
D
 
D
D
 
D
T
 
T
R
 
I
I
 
I
G
 
G
D
 
N
G
 
G
T
 
V
K
 
I
I
 
I
D
|
D
D
 
N
M
 
Q
V
 
C
M
 
Q
I
 
I
G
x
A
H
x
A
N
|
N
V
 
V
R
 
V
V
 
I
G
 
G
R
 
D
L
 
N
C
 
T
M
 
A
L
 
V
C
 
A
A
x
G
Q
 
G
V
 
V
G
x
I
I
 
M
A
|
A
G
|
G
S
 
S
A
 
L
V
 
K
I
 
I
G
 
G
D
 
R
G
 
Y
V
 
C
V
 
M
L
 
I
A
 
G
G
|
G
R
 
A
V
 
S
G
x
V
V
 
I
A
x
N
D
 
G
H
 
H
I
 
M
T
 
E
I
 
I
G
 
C
D
 
D
N
 
K
-
 
V
A
 
T
V
 
V
V
x
T
G
|
G
A
 
M
G
 
G
S
 
M
G
x
V
V
 
M
G
 
R
S
 
P
N
 
I
I
 
T
P
 
E
P
 
P
R
 
G
S
 
V
V
 
Y
W
 
S
M
 
S
G
 
G
Y
 
I
P
 
P
A
 
L
L
 
Q
P
 
P
K
x
N
D
 
K
Q
 
-
A
 
-
T
 
-
E
 
-
H
 
-
Y
 
-
L
 
-
F
 
V
S
 
W
R
|
R
R
 
K
L
 
T
K
 
A
H
 
A
L
 
L
F
 
V
K
 
M
D
 
N
V
 
I
S
 
D
E
 
D
L
 
M
K
 
S
K
 
K
R
 
R
I
 
L
R
 
K
S
 
S
L
 
L

4eqyG Crystal structure of acyl-[acyl-carrier-protein]--udp-n- acetylglucosamine o-acyltransferase from burkholderia thailandensis (see paper)
30% identity, 61% coverage: 109:334/369 of query aligns to 2:188/260 of 4eqyG

query
sites
4eqyG
I
 
I
H
 
H
P
 
P
S
 
T
A
 
A
V
 
I
V
 
I
E
 
E
E
 
P
G
 
G
A
 
A
E
 
Q
I
 
L
G
 
H
E
 
E
G
 
T
A
 
V
A
 
E
L
 
V
G
 
G
P
 
P
F
 
Y
V
 
A
H
 
I
V
 
V
G
 
G
F
 
-
G
 
-
A
 
-
R
 
-
V
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
S
 
-
R
 
-
V
 
-
H
 
-
S
 
S
G
 
N
V
 
V
S
 
T
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
R
A
 
T
V
 
T
V
 
I
G
 
G
A
 
S
D
 
H
C
 
S
L
 
V
L
 
I
H
 
E
P
 
G
G
 
H
V
 
T
R
 
T
I
 
I
G
 
G
E
|
E
R
 
D
V
 
N
R
 
R
V
 
I
G
 
G
D
 
-
R
 
-
V
 
-
I
 
-
L
 
-
H
 
H
A
 
Y
N
 
A
A
 
S
V
 
V
I
 
G
G
 
G
A
 
R
D
 
P
G
 
Q
F
 
D
S
 
M
F
 
K
V
 
Y
T
 
K
P
 
D
E
 
E
P
 
P
G
 
-
S
 
-
V
 
-
E
 
-
S
 
-
A
 
-
K
 
-
A
 
-
T
 
-
G
 
-
R
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
-
I
 
-
N
 
-
S
 
T
R
 
R
L
 
L
A
 
-
R
 
-
I
 
-
A
 
-
S
 
-
L
 
-
G
 
-
A
 
-
V
 
-
V
 
V
L
 
I
G
 
G
D
|
D
D
 
R
V
 
N
E
 
T
I
 
I
G
 
R
A
 
E
N
 
F
T
 
T
C
 
T
I
 
I
D
 
H
R
 
T
G
 
G
T
 
T
L
 
V
D
 
Q
D
 
D
-
 
A
-
 
G
-
 
V
T
 
T
R
 
T
I
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
D
T
 
N
K
 
W
I
 
I
D
 
M
D
 
A
M
 
Y
V
 
V
M
 
H
I
 
I
G
 
G
H
 
H
N
 
D
V
 
C
R
 
R
V
 
V
G
 
G
R
 
S
L
 
H
C
 
V
M
 
V
L
 
L
C
 
S
A
 
S
Q
 
N
V
 
A
G
 
Q
I
 
M
A
 
A
G
 
G
S
 
H
A
 
V
V
 
E
I
 
I
G
 
G
D
 
D
G
 
W
V
 
A
V
 
I
L
 
V
A
 
G
G
 
G
R
 
M
V
 
S
G
 
G
V
 
V
A
 
H
D
 
Q
H
 
Y
I
 
V
T
 
R
I
 
I
G
 
G
D
 
A
N
 
H
A
 
S
V
 
M
V
 
L
G
 
G
A
 
G
G
 
A
S
 
S
G
 
A
V
 
L
G
 
V
S
 
Q
N
 
D
I
 
I
P
 
P
P
 
P
R
 
F
S
 
V
V
 
I
W
 
A
M
 
A
G
 
G
Y
 
N
P
 
K
A
 
A
L
 
E
P
 
P

6p9tA E.Coli lpxa in complex with udp-3-o-(r-3-hydroxymyristoyl)-glcnac and compound 8 (see paper)
27% identity, 61% coverage: 109:334/369 of query aligns to 8:194/263 of 6p9tA

query
sites
6p9tA
I
 
V
H
 
H
P
 
P
S
 
T
A
 
A
V
 
I
V
 
V
E
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
A
E
 
-
I
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
-
P
 
-
F
 
-
V
 
-
H
 
-
V
 
-
G
 
-
F
 
-
G
 
-
A
 
-
R
 
-
V
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
S
 
-
R
 
-
V
 
-
H
 
-
S
 
-
G
 
-
V
 
-
S
 
S
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
N
A
 
A
V
 
H
V
 
I
G
 
G
A
 
P
D
 
F
C
 
C
L
 
I
L
 
V
H
 
G
P
 
P
G
 
H
V
 
V
R
 
E
I
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
G
V
 
T
R
 
V
V
 
L
G
 
K
D
 
S
R
 
H
V
 
V
I
 
V
L
 
V
H
 
N
A
 
G
N
 
H
A
 
T
V
 
K
I
 
I
G
 
G
A
 
R
D
 
D
G
 
N
F
 
E
S
 
I
F
 
Y
V
 
Q
T
 
F
P
 
A
E
 
S
P
 
I
G
 
G
S
 
E
V
 
V
E
 
-
S
 
-
A
 
-
K
 
-
A
 
-
T
 
-
G
 
-
R
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
-
I
 
-
N
 
N
S
 
Q
R
x
D
L
|
L
A
x
K
R
 
Y
I
 
A
A
 
G
S
 
E
L
 
P
G
 
T
A
 
R
V
 
V
V
 
E
L
 
I
G
 
G
D
 
D
D
 
R
V
 
N
E
 
R
I
 
I
G
 
R
A
 
E
N
 
S
T
 
V
C
 
T
I
 
I
D
 
H
R
 
R
G
 
G
T
 
T
L
 
V
D
 
Q
D
 
G
-
 
G
-
 
G
-
 
L
T
 
T
R
 
K
I
 
V
G
 
G
D
 
S
G
 
D
T
 
N
K
 
L
I
 
L
D
 
M
D
 
I
M
 
N
V
 
A
M
x
H
I
 
I
G
x
A
H
|
H
N
x
D
V
 
C
R
 
T
V
 
V
G
 
G
R
 
N
L
 
R
C
 
C
M
 
I
L
 
L
C
 
A
A
 
N
Q
 
N
V
 
A
G
 
T
I
 
L
A
|
A
G
|
G
S
x
H
A
 
V
V
 
S
I
 
V
G
 
D
D
 
D
G
 
F
V
 
A
V
 
I
L
 
I
A
 
G
G
 
G
R
 
M
V
 
T
G
x
A
V
 
V
A
x
H
D
x
Q
H
 
F
I
 
C
T
 
I
I
 
I
G
 
G
D
 
A
N
 
H
A
 
V
V
 
M
V
 
V
G
 
G
A
 
G
G
 
C
S
 
S
G
 
G
V
 
V
G
 
A
S
 
Q
N
 
D
I
 
V
P
 
P
P
 
P
R
 
Y
S
 
V
V
 
I
W
 
A
M
 
Q
G
 
G
Y
 
N
P
x
H
A
 
A
L
 
T
P
 
P

6p9sA E.Coli lpxa in complex with udp-3-o-(r-3-hydroxymyristoyl)-glcnac and compound 7 (see paper)
27% identity, 61% coverage: 109:334/369 of query aligns to 8:194/263 of 6p9sA

query
sites
6p9sA
I
 
V
H
 
H
P
 
P
S
 
T
A
 
A
V
 
I
V
 
V
E
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
A
E
 
-
I
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
-
P
 
-
F
 
-
V
 
-
H
 
-
V
 
-
G
 
-
F
 
-
G
 
-
A
 
-
R
 
-
V
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
S
 
-
R
 
-
V
 
-
H
 
-
S
 
-
G
 
-
V
 
-
S
 
S
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
N
A
 
A
V
 
H
V
 
I
G
 
G
A
 
P
D
 
F
C
 
C
L
 
I
L
 
V
H
 
G
P
 
P
G
 
H
V
 
V
R
 
E
I
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
G
V
 
T
R
 
V
V
 
L
G
 
K
D
 
S
R
 
H
V
 
V
I
 
V
L
 
V
H
 
N
A
 
G
N
 
H
A
 
T
V
 
K
I
 
I
G
 
G
A
 
R
D
 
D
G
 
N
F
 
E
S
 
I
F
 
Y
V
 
Q
T
 
F
P
 
A
E
 
S
P
 
I
G
 
G
S
 
E
V
 
V
E
 
-
S
 
-
A
 
-
K
 
-
A
 
-
T
 
-
G
 
-
R
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
-
I
 
-
N
 
N
S
 
Q
R
x
D
L
|
L
A
x
K
R
 
Y
I
 
A
A
 
G
S
 
E
L
 
P
G
 
T
A
 
R
V
 
V
V
 
E
L
 
I
G
 
G
D
 
D
D
 
R
V
 
N
E
 
R
I
 
I
G
 
R
A
 
E
N
 
S
T
 
V
C
 
T
I
 
I
D
 
H
R
 
R
G
 
G
T
 
T
L
 
V
D
 
Q
D
 
G
-
 
G
-
 
G
-
 
L
T
 
T
R
 
K
I
 
V
G
 
G
D
 
S
G
 
D
T
 
N
K
 
L
I
 
L
D
 
M
D
 
I
M
 
N
V
 
A
M
x
H
I
 
I
G
x
A
H
|
H
N
x
D
V
 
C
R
 
T
V
 
V
G
 
G
R
 
N
L
 
R
C
 
C
M
 
I
L
 
L
C
 
A
A
 
N
Q
 
N
V
 
A
G
x
T
I
 
L
A
|
A
G
|
G
S
x
H
A
 
V
V
 
S
I
 
V
G
 
D
D
 
D
G
 
F
V
 
A
V
 
I
L
 
I
A
 
G
G
 
G
R
 
M
V
 
T
G
x
A
V
 
V
A
x
H
D
x
Q
H
 
F
I
 
C
T
 
I
I
 
I
G
 
G
D
 
A
N
 
H
A
 
V
V
 
M
V
 
V
G
 
G
A
 
G
G
 
C
S
 
S
G
 
G
V
 
V
G
 
A
S
 
Q
N
 
D
I
 
V
P
 
P
P
 
P
R
 
Y
S
 
V
V
 
I
W
 
A
M
 
Q
G
 
G
Y
 
N
P
x
H
A
 
A
L
 
T
P
 
P

Query Sequence

>WP_014625858.1 NCBI__GCF_000013085.1:WP_014625858.1
MTQPLPMTLTQVAEALGGTLHGQGDLIIRRPVHPARAEAGEGVTDLAVAMEPALLAALEG
SAARAALVAGGAVPPAGSVDGWIEVGRPRFAMHVITGRFEQPARLAPGIHPSAVVEEGAE
IGEGAALGPFVHVGFGARVGAGSRVHSGVSIGAGAVVGADCLLHPGVRIGERVRVGDRVI
LHANAVIGADGFSFVTPEPGSVESAKATGRVDAINSRLARIASLGAVVLGDDVEIGANTC
IDRGTLDDTRIGDGTKIDDMVMIGHNVRVGRLCMLCAQVGIAGSAVIGDGVVLAGRVGVA
DHITIGDNAVVGAGSGVGSNIPPRSVWMGYPALPKDQATEHYLFSRRLKHLFKDVSELKK
RIRSLTVPS

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory