SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_015331161.1 NCBI__GCF_000331105.1:WP_015331161.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4f4cA The crystal structure of the multi-drug transporter (see paper)
30% identity, 75% coverage: 155:621/626 of query aligns to 193:647/1250 of 4f4cA

query
sites
4f4cA
F
 
L
Y
 
F
D
 
D
K
 
N
L
 
L
E
 
E
R
 
R
A
 
V
R
 
K
R
 
E
Q
 
G
T
 
T
N
 
G
G
 
D
R
 
K
T
 
-
V
 
-
L
 
-
L
 
I
S
 
G
G
 
M
V
 
A
F
 
F
G
 
Q
Q
 
Y
V
 
L
Q
 
S
Q
 
Q
L
 
F
I
 
I
S
 
T
V
 
-
G
 
G
F
 
F
L
 
I
A
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
V
A
 
A
V
 
F
Y
 
T
N
 
H
P
 
S
W
 
W
L
 
Q
L
 
L
L
 
T
L
 
L
I
 
V
A
 
M
V
 
L
A
 
A
V
 
V
T
 
T
P
 
P
-
 
I
-
 
Q
S
 
A
F
 
L
I
 
C
G
 
G
D
 
-
N
 
-
Y
 
-
F
 
-
N
 
-
R
 
-
K
 
-
S
 
-
Y
 
F
S
 
A
L
 
I
S
 
A
R
 
K
S
 
S
W
 
M
T
 
S
-
 
T
-
 
F
P
 
A
E
 
I
R
 
R
R
 
E
E
 
T
L
 
L
D
 
R
Y
 
Y
L
 
A
R
 
K
Y
 
A
V
 
G
G
 
K
A
 
V
S
 
V
D
 
E
E
 
E
T
 
T
A
 
I
K
 
S
E
 
S
V
 
I
K
 
R
-
 
T
I
 
V
F
 
V
G
 
S
L
 
L
S
 
N
G
 
G
-
 
L
-
 
R
F
 
Y
L
 
E
I
 
L
D
 
E
R
 
R
F
 
Y
R
 
S
T
 
T
L
 
-
S
 
-
T
 
-
E
 
-
Y
 
-
L
 
-
K
 
-
K
 
-
N
 
-
Q
 
-
A
 
-
I
 
-
A
 
A
V
 
V
S
 
E
R
 
E
A
 
A
G
 
K
W
 
K
G
 
A
T
 
G
L
 
V
L
 
L
T
 
K
G
 
G
L
 
L
G
 
F
T
 
L
A
 
G
G
 
I
Y
 
S
Y
 
F
G
 
G
A
 
A
-
 
M
-
 
Q
-
 
A
-
 
S
-
 
N
-
 
F
-
 
I
-
 
S
-
 
F
-
 
A
-
 
L
-
 
A
-
 
F
Y
 
Y
V
 
I
-
 
G
-
 
V
-
 
G
W
 
W
I
 
V
V
 
H
Q
 
D
R
 
-
A
 
-
V
 
-
T
 
-
G
 
G
Q
 
S
I
 
L
S
 
N
L
 
F
G
 
G
D
 
D
L
 
M
-
 
L
-
 
T
T
 
T
F
 
F
L
 
S
A
 
S
G
 
V
S
 
M
F
 
M
R
 
G
Q
 
S
V
 
M
R
 
A
S
 
L
S
 
G
L
 
L
E
 
A
G
 
G
I
 
P
L
 
Q
L
 
L
Q
 
A
F
 
V
S
 
L
S
 
G
L
 
T
T
 
A
Q
 
Q
E
 
G
A
 
A
V
 
A
Y
 
-
L
 
-
Q
 
S
D
 
G
L
 
I
F
 
Y
D
 
E
Y
 
V
F
 
L
A
 
D
I
 
R
Q
 
K
P
 
P
L
 
V
I
 
I
H
 
D
S
 
S
P
 
S
K
 
S
T
 
K
A
 
A
L
 
G
P
 
R
F
 
K
P
 
D
A
 
M
Q
 
K
V
 
I
R
 
K
S
 
G
G
 
D
F
 
I
T
 
T
F
 
V
E
 
E
N
 
N
V
 
V
G
 
H
F
 
F
K
 
T
Y
 
Y
-
 
P
A
 
S
N
 
R
S
 
P
D
 
D
R
 
V
W
 
P
A
 
I
L
 
L
R
 
R
G
 
G
L
 
M
S
 
N
F
 
L
T
 
R
L
 
V
Q
 
N
A
 
A
G
 
G
E
 
Q
K
 
T
L
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
G
 
G
E
 
S
N
 
S
G
 
G
A
 
C
G
 
G
K
 
K
T
 
S
T
 
T
L
 
I
V
 
I
K
 
S
L
 
L
L
 
L
A
 
L
R
 
R
L
 
Y
Y
 
Y
D
 
D
P
 
V
T
 
L
E
 
K
G
 
G
R
 
K
I
 
I
L
 
T
L
 
I
D
 
D
G
 
G
H
 
V
D
 
D
L
 
V
R
 
R
D
 
D
Y
 
I
D
 
N
L
 
L
D
 
E
D
 
F
L
 
L
R
 
R
R
 
K
H
 
N
I
 
V
G
 
A
V
 
V
I
 
V
F
 
S
Q
 
Q
D
 
E
Y
 
P
I
 
A
R
 
L
F
 
F
K
 
N
M
 
C
S
 
T
A
 
I
G
 
E
T
 
E
N
 
N
I
 
I
A
 
S
V
 
L
G
 
G
D
 
K
I
 
-
D
 
-
E
 
E
R
 
G
T
 
I
N
 
T
Q
 
R
P
 
E
R
 
E
I
 
M
E
 
V
T
 
A
S
 
A
A
 
C
Q
 
K
R
 
M
S
 
A
L
 
N
A
 
A
D
 
E
T
 
K
V
 
F
I
 
I
A
 
K
K
 
T
L
 
L
A
 
P
G
 
N
G
 
G
Y
 
Y
S
 
N
Q
 
T
Q
 
L
L
 
V
G
 
G
K
 
-
S
 
-
F
 
-
N
 
D
Q
 
R
G
 
G
V
 
T
E
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
W
 
K
Q
 
Q
K
 
R
V
 
I
A
 
A
L
 
I
G
 
A
R
 
R
A
 
A
Y
 
L
M
 
V
R
 
R
D
 
N
A
 
P
Q
 
K
L
 
I
I
 
L
I
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
A
T
 
T
A
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
A
R
 
E
A
 
S
E
 
E
Y
 
G
E
 
I
V
 
V
F
 
Q
Q
 
Q
R
 
A
F
 
L
N
 
D
A
 
K
L
 
A
T
 
A
E
 
K
G
 
G
K
 
R
S
 
T
S
 
T
V
 
I
I
 
I
I
 
I
S
 
A
H
 
H
R
 
R
F
 
L
S
 
S
T
 
T
V
 
I
R
 
R
M
 
N
A
 
A
D
 
D
R
 
L
I
 
I
L
 
I
V
 
S
L
 
C
E
 
K
N
 
N
G
 
G
Q
 
Q
L
 
V
L
 
V
E
 
E
I
 
V
G
 
G
S
 
D
H
 
H
E
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
M
A
 
A
Q
 
Q
K
 
Q
G
 
G
R
 
L
Y
 
Y
A
 
Y
E
 
D
L
 
L
F
 
V
T
 
T
L
 
A
Q
 
Q

Sites not aligning to the query:

P40416 Iron-sulfur clusters transporter ATM1, mitochondrial; EC 7.-.-.- from Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (Baker's yeast) (see 3 papers)
34% identity, 59% coverage: 252:621/626 of query aligns to 308:674/690 of P40416

query
sites
P40416
V
 
V
K
 
K
I
 
Y
F
 
F
G
 
N
L
 
N
S
 
E
G
 
K
F
 
Y
L
 
L
I
 
A
D
 
D
R
 
K
F
 
Y
R
 
N
T
 
G
L
 
S
S
 
L
T
 
M
E
 
N
Y
 
Y
-
 
R
-
 
D
-
 
S
-
 
Q
L
 
I
K
 
K
K
 
V
N
 
S
Q
 
Q
A
 
S
I
 
L
A
 
A
V
 
F
S
 
L
R
x
N
A
x
S
G
|
G
W
x
Q
G
 
N
T
 
L
L
 
I
L
 
F
T
 
T
G
 
T
L
 
A
G
 
L
T
 
T
A
 
A
G
 
M
Y
 
M
Y
 
Y
G
 
M
A
 
G
Y
 
C
V
 
T
W
 
G
I
 
V
V
 
I
Q
 
-
R
 
-
A
 
-
V
 
-
T
 
G
G
 
G
Q
 
N
I
 
L
S
 
T
L
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
T
 
V
F
 
L
L
 
I
A
 
N
G
 
Q
S
 
L
F
 
V
R
 
F
Q
 
Q
V
 
L
R
 
S
S
 
V
S
 
P
L
 
L
E
 
N
G
 
F
I
 
L
L
 
G
L
 
S
Q
 
V
F
 
Y
S
 
R
S
 
D
L
 
L
T
 
K
Q
 
Q
E
 
S
A
 
L
V
 
I
Y
 
D
L
 
M
Q
 
E
D
 
T
L
 
L
F
 
F
D
 
K
Y
 
L
F
 
R
A
 
K
I
 
N
Q
 
E
P
 
V
L
 
K
I
 
I
H
 
K
S
 
N
P
 
A
K
 
E
T
 
R
A
 
P
L
 
L
P
 
M
F
 
L
P
 
P
A
 
E
Q
 
N
V
 
V
R
 
P
S
 
Y
G
 
D
F
 
I
T
 
T
F
 
F
E
 
E
N
 
N
V
 
V
G
 
T
F
 
F
K
 
G
Y
 
Y
A
 
-
N
 
H
S
 
P
D
 
D
R
 
R
W
 
K
A
 
I
L
 
L
R
 
K
G
 
N
L
 
A
S
 
S
F
 
F
T
 
T
L
 
I
Q
 
P
A
 
A
G
 
G
E
 
W
K
 
K
L
 
T
A
 
A
L
 
I
V
 
V
G
 
G
E
 
S
N
 
S
G
 
G
A
 
S
G
 
G
K
|
K
T
 
S
T
 
T
L
 
I
V
 
L
K
 
K
L
 
L
L
 
V
A
 
F
R
 
R
L
 
F
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
T
 
E
E
 
S
G
 
G
R
 
R
I
 
I
L
 
L
L
 
I
D
 
N
G
 
G
H
 
R
D
 
D
L
 
I
R
 
K
D
 
E
Y
 
Y
D
 
D
L
 
I
D
 
D
D
 
A
L
 
L
R
 
R
R
 
K
H
 
V
I
 
I
G
 
G
V
 
V
I
 
V
F
 
P
Q
 
Q
D
 
D
Y
 
T
I
 
P
R
 
L
F
 
F
K
 
N
M
 
D
S
 
T
A
 
I
G
 
W
T
 
E
N
 
N
I
 
V
A
 
K
V
 
F
G
 
G
D
 
R
I
 
I
D
 
D
E
 
A
R
 
-
T
 
T
N
 
D
Q
 
E
P
 
E
R
 
V
I
 
I
E
 
T
T
 
V
S
 
V
A
 
E
Q
 
K
R
 
A
S
 
Q
L
 
L
A
 
A
D
 
-
T
 
P
V
 
L
I
 
I
A
 
K
K
 
K
L
 
L
A
 
P
G
 
Q
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
Q
 
T
Q
 
I
L
 
V
G
 
G
K
 
E
S
 
-
F
 
-
N
 
-
Q
 
R
G
 
G
V
 
L
E
 
M
L
 
I
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
W
 
K
Q
 
Q
K
 
R
V
 
L
A
 
A
L
 
I
G
 
A
R
 
R
A
 
V
Y
 
L
M
 
L
R
 
K
D
 
N
A
 
A
Q
 
R
L
 
I
I
 
M
I
 
F
L
 
F
D
 
D
E
|
E
P
 
A
T
 
T
A
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
T
R
 
H
A
 
T
E
 
E
Y
 
Q
E
 
A
V
 
L
F
 
L
Q
 
R
-
 
T
-
 
I
R
 
R
F
 
D
N
 
N
A
 
F
L
 
T
T
 
S
E
 
G
G
 
S
K
 
R
S
 
T
S
 
S
V
 
V
I
 
Y
I
 
I
S
 
A
H
 
H
R
 
R
F
 
L
S
 
R
T
 
T
V
 
I
R
 
A
M
 
D
A
 
A
D
 
D
R
 
K
I
 
I
L
 
I
V
 
V
L
 
L
E
 
D
N
 
N
G
 
G
Q
 
R
L
 
V
L
 
R
E
 
E
I
 
E
G
 
G
S
 
K
H
 
H
E
 
L
A
 
E
L
 
L
L
 
L
A
 
A
Q
 
M
K
 
P
G
 
G
R
 
S
-
x
L
Y
|
Y
A
x
R
E
|
E
L
|
L
F
x
W
T
|
T
L
x
I
Q
|
Q

Sites not aligning to the query:

4myhB Structure of the glutathione bound mitochondrial abc transporter, atm1 (see paper)
34% identity, 59% coverage: 252:621/626 of query aligns to 211:577/598 of 4myhB

query
sites
4myhB
V
 
V
K
 
K
I
 
Y
F
 
F
G
 
N
L
 
N
S
 
E
G
 
K
F
 
Y
L
 
L
I
 
A
D
 
D
R
 
K
F
 
Y
R
 
N
T
 
G
L
 
S
S
 
L
T
 
M
E
 
N
Y
 
Y
-
 
R
-
 
D
-
 
S
-
 
Q
L
 
I
K
 
K
K
 
V
N
 
S
Q
 
Q
A
 
S
I
 
L
A
 
A
V
 
F
S
 
L
R
 
N
A
 
S
G
 
G
W
 
Q
G
 
N
T
 
L
L
 
I
L
 
F
T
 
T
G
 
T
L
 
A
G
 
L
T
 
T
A
 
A
G
 
M
Y
 
M
Y
 
Y
G
 
M
A
 
G
Y
 
C
V
 
T
W
 
G
I
 
V
V
 
I
Q
 
-
R
 
-
A
 
-
V
 
-
T
 
G
G
 
G
Q
 
N
I
 
L
S
 
T
L
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
T
 
V
F
 
L
L
 
I
A
 
N
G
 
Q
S
 
L
F
 
V
R
 
F
Q
 
Q
V
 
L
R
 
S
S
 
V
S
 
P
L
 
L
E
 
N
G
 
F
I
 
L
L
 
G
L
x
S
Q
 
V
F
 
Y
S
 
R
S
 
D
L
 
L
T
 
K
Q
 
Q
E
 
S
A
 
L
V
 
I
Y
 
D
L
 
M
Q
 
E
D
 
T
L
 
L
F
 
F
D
 
K
Y
 
L
F
 
R
A
 
K
I
 
N
Q
 
E
P
 
V
L
 
K
I
 
I
H
 
K
S
 
N
P
 
A
K
 
E
T
 
R
A
 
P
L
 
L
P
 
M
F
 
L
P
 
P
A
 
E
Q
 
N
V
 
V
R
 
P
S
 
Y
G
 
D
F
 
I
T
 
T
F
 
F
E
 
E
N
 
N
V
 
V
G
 
T
F
 
F
K
 
G
Y
 
Y
A
 
-
N
 
H
S
 
P
D
 
D
R
 
R
W
 
K
A
 
I
L
 
L
R
 
K
G
 
N
L
 
A
S
 
S
F
 
F
T
 
T
L
 
I
Q
 
P
A
 
A
G
 
G
E
 
W
K
 
K
L
 
T
A
 
A
L
 
I
V
 
V
G
 
G
E
 
S
N
 
S
G
 
G
A
 
S
G
 
G
K
 
K
T
 
S
T
 
T
L
 
I
V
 
L
K
 
K
L
 
L
L
 
V
A
 
F
R
 
R
L
 
F
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
T
 
E
E
 
S
G
 
G
R
 
R
I
 
I
L
 
L
L
 
I
D
 
N
G
 
G
H
 
R
D
 
D
L
 
I
R
 
K
D
 
E
Y
 
Y
D
 
D
L
 
I
D
 
D
D
 
A
L
 
L
R
 
R
R
 
K
H
 
V
I
 
I
G
 
G
V
 
V
I
 
V
F
 
P
Q
 
Q
D
 
D
Y
 
T
I
 
P
R
 
L
F
 
F
K
 
N
M
 
D
S
 
T
A
 
I
G
 
W
T
 
E
N
 
N
I
 
V
A
 
K
V
 
F
G
 
G
D
 
R
I
 
I
D
 
D
E
 
A
R
 
-
T
 
T
N
 
D
Q
 
E
P
 
E
R
 
V
I
 
I
E
 
T
T
 
V
S
 
V
A
 
E
Q
 
K
R
 
A
S
 
Q
L
 
L
A
 
A
D
 
-
T
 
P
V
 
L
I
 
I
A
 
K
K
 
K
L
 
L
A
 
P
G
 
Q
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
Q
 
T
Q
 
I
L
 
V
G
 
G
K
 
E
S
 
-
F
 
-
N
 
-
Q
 
R
G
 
G
V
 
L
E
 
M
L
 
I
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
W
 
K
Q
 
Q
K
 
R
V
 
L
A
 
A
L
 
I
G
 
A
R
 
R
A
 
V
Y
 
L
M
 
L
R
 
K
D
 
N
A
 
A
Q
 
R
L
 
I
I
 
M
I
 
F
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
A
T
 
T
A
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
T
R
 
H
A
 
T
E
 
E
Y
 
Q
E
 
A
V
 
L
F
 
L
Q
 
R
-
 
T
-
 
I
R
 
R
F
 
D
N
 
N
A
 
F
L
 
T
T
 
S
E
 
G
G
 
S
K
 
R
S
 
T
S
 
S
V
 
V
I
 
Y
I
 
I
S
 
A
H
 
H
R
 
R
F
 
L
S
 
R
T
 
T
V
 
I
R
 
A
M
 
D
A
 
A
D
 
D
R
 
K
I
 
I
L
 
I
V
 
V
L
 
L
E
 
D
N
 
N
G
 
G
Q
 
R
L
 
V
L
 
R
E
 
E
I
 
E
G
 
G
S
 
K
H
 
H
E
 
L
A
 
E
L
 
L
L
 
L
A
 
A
Q
 
M
K
 
P
G
 
G
R
 
S
-
 
L
Y
 
Y
A
 
R
E
 
E
L
 
L
F
 
W
T
 
T
L
 
I
Q
 
Q

Sites not aligning to the query:

7psnA S. Cerevisiae atm1 in msp1e3d1 nanodiscs with bound amp-pnp and mg2+ (see paper)
34% identity, 59% coverage: 252:621/626 of query aligns to 217:583/585 of 7psnA

query
sites
7psnA
V
 
V
K
 
K
I
 
Y
F
 
F
G
 
N
L
 
N
S
 
E
G
 
K
F
 
Y
L
 
L
I
 
A
D
 
D
R
 
K
F
 
Y
R
 
N
T
 
G
L
 
S
S
 
L
T
 
M
E
 
N
Y
 
Y
-
 
R
-
 
D
-
 
S
-
 
Q
L
 
I
K
 
K
K
 
V
N
 
S
Q
 
Q
A
 
S
I
 
L
A
 
A
V
 
F
S
 
L
R
 
N
A
 
S
G
 
G
W
 
Q
G
 
N
T
 
L
L
 
I
L
 
F
T
 
T
G
 
T
L
 
A
G
 
L
T
 
T
A
 
A
G
 
M
Y
 
M
Y
 
Y
G
 
M
A
 
G
Y
 
C
V
 
T
W
 
G
I
 
V
V
 
I
Q
 
G
R
 
-
A
 
-
V
 
-
T
 
-
G
 
G
Q
 
N
I
 
L
S
 
T
L
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
T
 
V
F
 
L
L
 
I
A
 
N
G
 
Q
S
 
L
F
 
V
R
 
F
Q
 
Q
V
 
L
R
 
S
S
 
V
S
 
P
L
 
L
E
 
N
G
 
F
I
 
L
L
 
G
L
 
S
Q
 
V
F
 
Y
S
 
R
S
 
D
L
 
L
T
 
K
Q
 
Q
E
 
S
A
 
L
V
 
I
Y
 
D
L
 
M
Q
 
E
D
 
T
L
 
L
F
 
F
D
 
K
Y
 
L
F
 
R
A
 
K
I
 
N
Q
 
E
P
 
V
L
 
K
I
 
I
H
 
K
S
 
N
P
 
A
K
 
E
T
 
R
A
 
P
L
 
L
P
 
M
F
 
L
P
 
P
A
 
E
Q
 
N
V
 
V
R
 
P
S
 
Y
G
 
D
F
 
I
T
 
T
F
 
F
E
 
E
N
 
N
V
 
V
G
 
T
F
 
F
K
 
G
Y
|
Y
A
 
-
N
x
H
S
 
P
D
 
D
R
|
R
W
 
K
A
 
I
L
 
L
R
 
K
G
 
N
L
 
A
S
 
S
F
 
F
T
 
T
L
 
I
Q
 
P
A
 
A
G
 
G
E
 
W
K
 
K
L
 
T
A
 
A
L
 
I
V
 
V
G
 
G
E
 
S
N
 
S
G
|
G
A
 
S
G
 
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
I
V
 
L
K
 
K
L
 
L
L
 
V
A
 
F
R
 
R
L
 
F
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
T
 
E
E
 
S
G
 
G
R
 
R
I
 
I
L
 
L
L
 
I
D
 
N
G
 
G
H
 
R
D
 
D
L
 
I
R
 
K
D
 
E
Y
 
Y
D
 
D
L
 
I
D
 
D
D
 
A
L
 
L
R
 
R
R
 
K
H
 
V
I
 
I
G
 
G
V
 
V
I
 
V
F
 
P
Q
|
Q
D
 
D
Y
 
T
I
 
P
R
 
L
F
 
F
K
 
N
M
 
D
S
 
T
A
 
I
G
 
W
T
 
E
N
 
N
I
 
V
A
 
K
V
 
F
G
 
G
D
 
R
I
 
I
D
 
D
E
 
A
R
 
-
T
 
T
N
 
D
Q
 
E
P
 
E
R
 
V
I
 
I
E
 
T
T
 
V
S
 
V
A
 
E
Q
 
K
R
 
A
S
 
Q
L
 
L
A
 
A
D
 
-
T
 
P
V
 
L
I
 
I
A
 
K
K
 
K
L
 
L
A
 
P
G
 
Q
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
Q
 
T
Q
 
I
L
 
V
G
 
G
K
 
E
S
 
-
F
 
-
N
 
-
Q
 
R
G
 
G
V
 
L
E
x
M
L
x
I
S
|
S
G
 
G
G
 
G
E
|
E
W
 
K
Q
 
Q
K
 
R
V
 
L
A
 
A
L
 
I
G
 
A
R
 
R
A
 
V
Y
 
L
M
 
L
R
 
K
D
 
N
A
 
A
Q
 
R
L
 
I
I
 
M
I
 
F
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
A
T
 
T
A
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
T
R
 
H
A
 
T
E
 
E
Y
 
Q
E
 
A
V
 
L
F
 
L
Q
 
R
-
 
T
-
 
I
R
 
R
F
 
D
N
 
N
A
 
F
L
 
T
T
 
S
E
 
G
G
 
S
K
 
R
S
 
T
S
 
S
V
 
V
I
 
Y
I
 
I
S
 
A
H
|
H
R
 
R
F
 
L
S
 
R
T
 
T
V
 
I
R
 
A
M
 
D
A
 
A
D
 
D
R
 
K
I
 
I
L
 
I
V
 
V
L
 
L
E
 
D
N
 
N
G
 
G
Q
 
R
L
 
V
L
 
R
E
 
E
I
 
E
G
 
G
S
 
K
H
 
H
E
 
L
A
 
E
L
 
L
L
 
L
A
 
A
Q
 
M
K
 
P
G
 
G
R
 
S
-
 
L
Y
 
Y
A
 
R
E
 
E
L
 
L
F
 
W
T
 
T
L
 
I
Q
 
Q

Sites not aligning to the query:

7psmA S. Cerevisiae atm1 in msp1d1 nanodiscs with bound amp-pnp and mg2+ (see paper)
34% identity, 59% coverage: 252:621/626 of query aligns to 217:583/585 of 7psmA

query
sites
7psmA
V
 
V
K
 
K
I
 
Y
F
 
F
G
 
N
L
 
N
S
 
E
G
 
K
F
 
Y
L
 
L
I
 
A
D
 
D
R
 
K
F
 
Y
R
 
N
T
 
G
L
 
S
S
 
L
T
 
M
E
 
N
Y
 
Y
-
 
R
-
 
D
-
 
S
-
 
Q
L
 
I
K
 
K
K
 
V
N
 
S
Q
 
Q
A
 
S
I
 
L
A
 
A
V
 
F
S
 
L
R
 
N
A
 
S
G
 
G
W
 
Q
G
 
N
T
 
L
L
 
I
L
 
F
T
 
T
G
 
T
L
 
A
G
 
L
T
 
T
A
 
A
G
 
M
Y
 
M
Y
 
Y
G
 
M
A
 
G
Y
 
C
V
 
T
W
 
G
I
 
V
V
 
I
Q
 
G
R
 
-
A
 
-
V
 
-
T
 
-
G
 
G
Q
 
N
I
 
L
S
 
T
L
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
T
 
V
F
 
L
L
 
I
A
 
N
G
 
Q
S
 
L
F
 
V
R
 
F
Q
 
Q
V
 
L
R
 
S
S
 
V
S
 
P
L
 
L
E
 
N
G
 
F
I
 
L
L
 
G
L
 
S
Q
 
V
F
 
Y
S
 
R
S
 
D
L
 
L
T
 
K
Q
 
Q
E
 
S
A
 
L
V
 
I
Y
 
D
L
 
M
Q
 
E
D
 
T
L
 
L
F
 
F
D
 
K
Y
 
L
F
 
R
A
 
K
I
 
N
Q
 
E
P
 
V
L
 
K
I
 
I
H
 
K
S
 
N
P
 
A
K
 
E
T
 
R
A
 
P
L
 
L
P
 
M
F
 
L
P
 
P
A
 
E
Q
 
N
V
 
V
R
 
P
S
 
Y
G
 
D
F
 
I
T
 
T
F
 
F
E
 
E
N
 
N
V
 
V
G
 
T
F
 
F
K
 
G
Y
|
Y
A
 
-
N
 
H
S
 
P
D
 
D
R
|
R
W
 
K
A
 
I
L
 
L
R
 
K
G
 
N
L
 
A
S
 
S
F
 
F
T
 
T
L
 
I
Q
 
P
A
 
A
G
 
G
E
 
W
K
 
K
L
 
T
A
 
A
L
 
I
V
 
V
G
 
G
E
 
S
N
x
S
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
T
 
S
T
|
T
L
 
I
V
 
L
K
 
K
L
 
L
L
 
V
A
 
F
R
 
R
L
 
F
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
T
 
E
E
 
S
G
 
G
R
 
R
I
 
I
L
 
L
L
 
I
D
 
N
G
 
G
H
 
R
D
 
D
L
 
I
R
 
K
D
 
E
Y
 
Y
D
 
D
L
 
I
D
 
D
D
 
A
L
 
L
R
 
R
R
 
K
H
 
V
I
 
I
G
 
G
V
 
V
I
 
V
F
 
P
Q
|
Q
D
 
D
Y
 
T
I
 
P
R
 
L
F
 
F
K
 
N
M
 
D
S
 
T
A
 
I
G
 
W
T
 
E
N
 
N
I
 
V
A
 
K
V
 
F
G
 
G
D
 
R
I
 
I
D
 
D
E
 
A
R
 
-
T
 
T
N
 
D
Q
 
E
P
 
E
R
 
V
I
 
I
E
 
T
T
 
V
S
 
V
A
 
E
Q
 
K
R
 
A
S
 
Q
L
 
L
A
 
A
D
 
-
T
 
P
V
 
L
I
 
I
A
 
K
K
 
K
L
 
L
A
 
P
G
 
Q
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
Q
 
T
Q
 
I
L
 
V
G
 
G
K
 
E
S
 
-
F
 
-
N
 
-
Q
 
R
G
 
G
V
 
L
E
x
M
L
x
I
S
|
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
W
 
K
Q
 
Q
K
 
R
V
 
L
A
 
A
L
 
I
G
 
A
R
 
R
A
 
V
Y
 
L
M
 
L
R
 
K
D
 
N
A
 
A
Q
 
R
L
 
I
I
 
M
I
 
F
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
A
T
 
T
A
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
T
R
 
H
A
 
T
E
 
E
Y
 
Q
E
 
A
V
 
L
F
 
L
Q
 
R
-
 
T
-
 
I
R
 
R
F
 
D
N
 
N
A
 
F
L
 
T
T
 
S
E
 
G
G
 
S
K
 
R
S
 
T
S
 
S
V
 
V
I
 
Y
I
 
I
S
 
A
H
 
H
R
 
R
F
 
L
S
 
R
T
 
T
V
 
I
R
 
A
M
 
D
A
 
A
D
 
D
R
 
K
I
 
I
L
 
I
V
 
V
L
 
L
E
 
D
N
 
N
G
 
G
Q
 
R
L
 
V
L
 
R
E
 
E
I
 
E
G
 
G
S
 
K
H
 
H
E
 
L
A
 
E
L
 
L
L
 
L
A
 
A
Q
 
M
K
 
P
G
 
G
R
 
S
-
 
L
Y
 
Y
A
 
R
E
 
E
L
 
L
F
 
W
T
 
T
L
 
I
Q
 
Q

Sites not aligning to the query:

7pslA S. Cerevisiae atm1 in msp1d1 nanodiscs in nucleotide-free state (see paper)
34% identity, 59% coverage: 252:621/626 of query aligns to 217:583/600 of 7pslA

query
sites
7pslA
V
 
V
K
 
K
I
 
Y
F
 
F
G
 
N
L
 
N
S
 
E
G
 
K
F
 
Y
L
 
L
I
 
A
D
 
D
R
 
K
F
 
Y
R
 
N
T
 
G
L
 
S
S
 
L
T
 
M
E
 
N
Y
 
Y
-
 
R
-
 
D
-
 
S
-
 
Q
L
 
I
K
 
K
K
 
V
N
 
S
Q
 
Q
A
 
S
I
 
L
A
 
A
V
 
F
S
 
L
R
 
N
A
 
S
G
 
G
W
 
Q
G
 
N
T
 
L
L
 
I
L
 
F
T
 
T
G
 
T
L
 
A
G
 
L
T
 
T
A
 
A
G
 
M
Y
 
M
Y
 
Y
G
 
M
A
 
G
Y
 
C
V
 
T
W
 
G
I
 
V
V
 
I
Q
 
-
R
 
-
A
 
-
V
 
-
T
 
G
G
 
G
Q
 
N
I
 
L
S
 
T
L
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
T
 
V
F
 
L
L
 
I
A
 
N
G
 
Q
S
 
L
F
 
V
R
 
F
Q
 
Q
V
 
L
R
 
S
S
 
V
S
 
P
L
 
L
E
 
N
G
 
F
I
 
L
L
 
G
L
 
S
Q
 
V
F
 
Y
S
 
R
S
 
D
L
 
L
T
 
K
Q
 
Q
E
 
S
A
 
L
V
 
I
Y
 
D
L
 
M
Q
 
E
D
 
T
L
 
L
F
 
F
D
 
K
Y
 
L
F
 
R
A
 
K
I
 
N
Q
 
E
P
 
V
L
 
K
I
 
I
H
 
K
S
 
N
P
 
A
K
 
E
T
 
R
A
 
P
L
 
L
P
 
M
F
 
L
P
 
P
A
 
E
Q
 
N
V
 
V
R
 
P
S
 
Y
G
 
D
F
 
I
T
 
T
F
 
F
E
 
E
N
 
N
V
 
V
G
 
T
F
 
F
K
 
G
Y
 
Y
A
 
-
N
 
H
S
 
P
D
 
D
R
 
R
W
 
K
A
 
I
L
 
L
R
 
K
G
 
N
L
 
A
S
 
S
F
 
F
T
 
T
L
 
I
Q
 
P
A
 
A
G
 
G
E
 
W
K
 
K
L
 
T
A
 
A
L
 
I
V
 
V
G
 
G
E
 
S
N
 
S
G
 
G
A
 
S
G
 
G
K
 
K
T
 
S
T
 
T
L
 
I
V
 
L
K
 
K
L
 
L
L
 
V
A
 
F
R
 
R
L
 
F
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
T
 
E
E
 
S
G
 
G
R
 
R
I
 
I
L
 
L
L
 
I
D
 
N
G
 
G
H
 
R
D
 
D
L
 
I
R
 
K
D
 
E
Y
 
Y
D
 
D
L
 
I
D
 
D
D
 
A
L
 
L
R
 
R
R
 
K
H
 
V
I
 
I
G
 
G
V
 
V
I
 
V
F
 
P
Q
 
Q
D
 
D
Y
 
T
I
 
P
R
 
L
F
 
F
K
 
N
M
 
D
S
 
T
A
 
I
G
 
W
T
 
E
N
 
N
I
 
V
A
 
K
V
 
F
G
 
G
D
 
R
I
 
I
D
 
D
E
 
A
R
 
-
T
 
T
N
 
D
Q
 
E
P
 
E
R
 
V
I
 
I
E
 
T
T
 
V
S
 
V
A
 
E
Q
 
K
R
 
A
S
 
Q
L
 
L
A
 
A
D
 
-
T
 
P
V
 
L
I
 
I
A
 
K
K
 
K
L
 
L
A
 
P
G
 
Q
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
Q
 
T
Q
 
I
L
 
V
G
 
G
K
 
E
S
 
-
F
 
-
N
 
-
Q
 
R
G
 
G
V
 
L
E
 
M
L
 
I
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
W
 
K
Q
 
Q
K
 
R
V
 
L
A
 
A
L
 
I
G
 
A
R
 
R
A
 
V
Y
 
L
M
 
L
R
 
K
D
 
N
A
 
A
Q
 
R
L
 
I
I
 
M
I
 
F
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
A
T
 
T
A
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
T
R
 
H
A
 
T
E
 
E
Y
 
Q
E
 
A
V
 
L
F
 
L
Q
 
R
-
 
T
-
 
I
R
 
R
F
 
D
N
 
N
A
 
F
L
 
T
T
 
S
E
 
G
G
 
S
K
 
R
S
 
T
S
 
S
V
 
V
I
 
Y
I
 
I
S
 
A
H
 
H
R
 
R
F
 
L
S
 
R
T
 
T
V
 
I
R
 
A
M
 
D
A
 
A
D
 
D
R
 
K
I
 
I
L
 
I
V
 
V
L
 
L
E
 
D
N
 
N
G
 
G
Q
 
R
L
 
V
L
 
R
E
 
E
I
 
E
G
 
G
S
 
K
H
 
H
E
 
L
A
 
E
L
 
L
L
 
L
A
 
A
Q
 
M
K
 
P
G
 
G
R
 
S
-
 
L
Y
 
Y
A
 
R
E
 
E
L
 
L
F
 
W
T
 
T
L
 
I
Q
 
Q

Sites not aligning to the query:

7a6fA Nanodisc reconstituted human abcb1 in complex with mrk16 fab and zosuquidar (see paper)
39% identity, 42% coverage: 361:622/626 of query aligns to 904:1163/1164 of 7a6fA

query
sites
7a6fA
P
 
P
L
 
L
I
 
I
H
 
D
S
 
S
P
 
Y
K
 
S
T
 
T
A
 
E
L
 
G
P
 
L
F
 
M
P
 
P
A
 
N
Q
 
T
V
 
L
R
 
E
S
 
G
G
 
N
F
 
V
T
 
T
F
 
F
E
 
G
N
 
E
V
 
V
G
 
V
F
 
F
K
 
N
Y
 
Y
A
 
P
N
 
T
-
 
R
S
 
P
D
 
D
R
 
I
W
 
P
A
 
V
L
 
L
R
 
Q
G
 
G
L
 
L
S
 
S
F
 
L
T
 
E
L
 
V
Q
 
K
A
 
K
G
 
G
E
 
Q
K
 
T
L
 
L
A
 
A
L
 
L
V
 
V
G
 
G
E
 
S
N
 
S
G
 
G
A
 
C
G
 
G
K
 
K
T
 
S
T
 
T
L
 
V
V
 
V
K
 
Q
L
 
L
L
 
L
A
 
E
R
 
R
L
 
F
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
T
 
L
E
 
A
G
 
G
R
 
K
I
 
V
L
 
L
L
 
L
D
 
D
G
 
G
H
 
K
D
 
E
L
 
I
R
 
K
D
 
R
Y
 
L
D
 
N
L
 
V
D
 
Q
D
 
W
L
 
L
R
 
R
R
 
A
H
 
H
I
 
L
G
 
G
V
 
I
I
 
V
F
 
S
Q
 
Q
D
 
E
Y
 
P
I
 
I
R
 
L
F
 
F
K
 
D
M
 
C
S
 
S
A
 
I
G
 
A
T
 
E
N
 
N
I
 
I
A
 
A
V
 
Y
G
 
G
D
 
D
I
 
N
D
 
S
E
 
R
R
 
V
T
 
V
N
 
S
Q
 
Q
P
 
E
R
 
E
I
 
I
E
 
V
T
 
R
S
 
A
A
 
A
Q
 
K
R
 
E
S
 
A
L
 
N
A
 
I
D
 
H
T
 
A
V
 
F
I
 
I
A
 
E
K
 
S
L
 
L
A
 
P
G
 
N
G
 
K
Y
 
Y
S
 
S
Q
 
T
Q
 
K
L
 
V
G
 
G
K
 
-
S
 
-
F
 
-
N
 
D
Q
 
K
G
 
G
V
 
T
E
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
W
 
K
Q
 
Q
K
 
R
V
 
I
A
 
A
L
 
I
G
 
A
R
 
R
A
 
A
Y
 
L
M
 
V
R
 
R
D
 
Q
A
 
P
Q
 
H
L
 
I
I
 
L
I
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
A
T
 
T
A
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
T
R
 
E
A
 
S
E
 
E
Y
 
K
E
 
V
V
 
V
F
 
Q
Q
 
E
R
 
A
F
 
L
N
 
D
A
 
K
L
 
A
T
 
R
E
 
E
G
 
G
K
 
R
S
 
T
S
 
C
V
 
I
I
 
V
I
 
I
S
 
A
H
 
H
R
 
R
F
 
L
S
 
S
T
 
T
V
 
I
R
 
Q
M
 
N
A
 
A
D
 
D
R
 
L
I
 
I
L
 
V
V
 
V
L
 
F
E
 
Q
N
 
N
G
 
G
Q
 
R
L
 
V
L
 
K
E
 
E
I
 
H
G
 
G
S
 
T
H
 
H
E
 
Q
A
 
Q
L
 
L
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
K
 
K
G
 
G
R
 
I
Y
 
Y
A
 
F
E
 
S
L
 
M
F
 
V
T
 
S
L
 
V
Q
 
Q
A
 
A

Sites not aligning to the query:

7a6eA Nanodisc reconstituted human abcb1 in complex with mrk16 fab and tariquidar (see paper)
39% identity, 42% coverage: 361:622/626 of query aligns to 904:1163/1164 of 7a6eA

query
sites
7a6eA
P
 
P
L
 
L
I
 
I
H
 
D
S
 
S
P
 
Y
K
 
S
T
 
T
A
 
E
L
 
G
P
 
L
F
 
M
P
 
P
A
 
N
Q
 
T
V
 
L
R
 
E
S
 
G
G
 
N
F
 
V
T
 
T
F
 
F
E
 
G
N
 
E
V
 
V
G
 
V
F
 
F
K
 
N
Y
 
Y
A
 
P
N
 
T
-
 
R
S
 
P
D
 
D
R
 
I
W
 
P
A
 
V
L
 
L
R
 
Q
G
 
G
L
 
L
S
 
S
F
 
L
T
 
E
L
 
V
Q
 
K
A
 
K
G
 
G
E
 
Q
K
 
T
L
 
L
A
 
A
L
 
L
V
 
V
G
 
G
E
 
S
N
 
S
G
 
G
A
 
C
G
 
G
K
 
K
T
 
S
T
 
T
L
 
V
V
 
V
K
 
Q
L
 
L
L
 
L
A
 
E
R
 
R
L
 
F
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
T
 
L
E
 
A
G
 
G
R
 
K
I
 
V
L
 
L
L
 
L
D
 
D
G
 
G
H
 
K
D
 
E
L
 
I
R
 
K
D
 
R
Y
 
L
D
 
N
L
 
V
D
 
Q
D
 
W
L
 
L
R
 
R
R
 
A
H
 
H
I
 
L
G
 
G
V
 
I
I
 
V
F
 
S
Q
 
Q
D
 
E
Y
 
P
I
 
I
R
 
L
F
 
F
K
 
D
M
 
C
S
 
S
A
 
I
G
 
A
T
 
E
N
 
N
I
 
I
A
 
A
V
 
Y
G
 
G
D
 
D
I
 
N
D
 
S
E
 
R
R
 
V
T
 
V
N
 
S
Q
 
Q
P
 
E
R
 
E
I
 
I
E
 
V
T
 
R
S
 
A
A
 
A
Q
 
K
R
 
E
S
 
A
L
 
N
A
 
I
D
 
H
T
 
A
V
 
F
I
 
I
A
 
E
K
 
S
L
 
L
A
 
P
G
 
N
G
 
K
Y
 
Y
S
 
S
Q
 
T
Q
 
K
L
 
V
G
 
G
K
 
-
S
 
-
F
 
-
N
 
D
Q
 
K
G
 
G
V
 
T
E
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
W
 
K
Q
 
Q
K
 
R
V
 
I
A
 
A
L
 
I
G
 
A
R
 
R
A
 
A
Y
 
L
M
 
V
R
 
R
D
 
Q
A
 
P
Q
 
H
L
 
I
I
 
L
I
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
A
T
 
T
A
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
T
R
 
E
A
 
S
E
 
E
Y
 
K
E
 
V
V
 
V
F
 
Q
Q
 
E
R
 
A
F
 
L
N
 
D
A
 
K
L
 
A
T
 
R
E
 
E
G
 
G
K
 
R
S
 
T
S
 
C
V
 
I
I
 
V
I
 
I
S
 
A
H
 
H
R
 
R
F
 
L
S
 
S
T
 
T
V
 
I
R
 
Q
M
 
N
A
 
A
D
 
D
R
 
L
I
 
I
L
 
V
V
 
V
L
 
F
E
 
Q
N
 
N
G
 
G
Q
 
R
L
 
V
L
 
K
E
 
E
I
 
H
G
 
G
S
 
T
H
 
H
E
 
Q
A
 
Q
L
 
L
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
K
 
K
G
 
G
R
 
I
Y
 
Y
A
 
F
E
 
S
L
 
M
F
 
V
T
 
S
L
 
V
Q
 
Q
A
 
A

Sites not aligning to the query:

7a6cA Nanodisc reconstituted human abcb1 in complex with mrk16 fab and elacridar (see paper)
39% identity, 42% coverage: 361:622/626 of query aligns to 904:1163/1164 of 7a6cA

query
sites
7a6cA
P
 
P
L
 
L
I
 
I
H
 
D
S
 
S
P
 
Y
K
 
S
T
 
T
A
 
E
L
 
G
P
 
L
F
 
M
P
 
P
A
 
N
Q
 
T
V
 
L
R
 
E
S
 
G
G
 
N
F
 
V
T
 
T
F
 
F
E
 
G
N
 
E
V
 
V
G
 
V
F
 
F
K
 
N
Y
 
Y
A
 
P
N
 
T
-
 
R
S
 
P
D
 
D
R
 
I
W
 
P
A
 
V
L
 
L
R
 
Q
G
 
G
L
 
L
S
 
S
F
 
L
T
 
E
L
 
V
Q
 
K
A
 
K
G
 
G
E
 
Q
K
 
T
L
 
L
A
 
A
L
 
L
V
 
V
G
 
G
E
 
S
N
 
S
G
 
G
A
 
C
G
 
G
K
 
K
T
 
S
T
 
T
L
 
V
V
 
V
K
 
Q
L
 
L
L
 
L
A
 
E
R
 
R
L
 
F
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
T
 
L
E
 
A
G
 
G
R
 
K
I
 
V
L
 
L
L
 
L
D
 
D
G
 
G
H
 
K
D
 
E
L
 
I
R
 
K
D
 
R
Y
 
L
D
 
N
L
 
V
D
 
Q
D
 
W
L
 
L
R
 
R
R
 
A
H
 
H
I
 
L
G
 
G
V
 
I
I
 
V
F
 
S
Q
 
Q
D
 
E
Y
 
P
I
 
I
R
 
L
F
 
F
K
 
D
M
 
C
S
 
S
A
 
I
G
 
A
T
 
E
N
 
N
I
 
I
A
 
A
V
 
Y
G
 
G
D
 
D
I
 
N
D
 
S
E
 
R
R
 
V
T
 
V
N
 
S
Q
 
Q
P
 
E
R
 
E
I
 
I
E
 
V
T
 
R
S
 
A
A
 
A
Q
 
K
R
 
E
S
 
A
L
 
N
A
 
I
D
 
H
T
 
A
V
 
F
I
 
I
A
 
E
K
 
S
L
 
L
A
 
P
G
 
N
G
 
K
Y
 
Y
S
 
S
Q
 
T
Q
 
K
L
 
V
G
 
G
K
 
-
S
 
-
F
 
-
N
 
D
Q
 
K
G
 
G
V
 
T
E
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
W
 
K
Q
 
Q
K
 
R
V
 
I
A
 
A
L
 
I
G
 
A
R
 
R
A
 
A
Y
 
L
M
 
V
R
 
R
D
 
Q
A
 
P
Q
 
H
L
 
I
I
 
L
I
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
A
T
 
T
A
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
T
R
 
E
A
 
S
E
 
E
Y
 
K
E
 
V
V
 
V
F
 
Q
Q
 
E
R
 
A
F
 
L
N
 
D
A
 
K
L
 
A
T
 
R
E
 
E
G
 
G
K
 
R
S
 
T
S
 
C
V
 
I
I
 
V
I
 
I
S
 
A
H
 
H
R
 
R
F
 
L
S
 
S
T
 
T
V
 
I
R
 
Q
M
 
N
A
 
A
D
 
D
R
 
L
I
 
I
L
 
V
V
 
V
L
 
F
E
 
Q
N
 
N
G
 
G
Q
 
R
L
 
V
L
 
K
E
 
E
I
 
H
G
 
G
S
 
T
H
 
H
E
 
Q
A
 
Q
L
 
L
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
K
 
K
G
 
G
R
 
I
Y
 
Y
A
 
F
E
 
S
L
 
M
F
 
V
T
 
S
L
 
V
Q
 
Q
A
 
A

Sites not aligning to the query:

7a69A Nanodisc reconstituted human abcb1 in complex with mrk16 fab and vincristine (see paper)
39% identity, 42% coverage: 361:622/626 of query aligns to 904:1163/1164 of 7a69A

query
sites
7a69A
P
 
P
L
 
L
I
 
I
H
 
D
S
 
S
P
 
Y
K
 
S
T
 
T
A
 
E
L
 
G
P
 
L
F
 
M
P
 
P
A
 
N
Q
 
T
V
 
L
R
 
E
S
 
G
G
 
N
F
 
V
T
 
T
F
 
F
E
 
G
N
 
E
V
 
V
G
 
V
F
 
F
K
 
N
Y
 
Y
A
 
P
N
 
T
-
 
R
S
 
P
D
 
D
R
 
I
W
 
P
A
 
V
L
 
L
R
 
Q
G
 
G
L
 
L
S
 
S
F
 
L
T
 
E
L
 
V
Q
 
K
A
 
K
G
 
G
E
 
Q
K
 
T
L
 
L
A
 
A
L
 
L
V
 
V
G
 
G
E
 
S
N
 
S
G
 
G
A
 
C
G
 
G
K
 
K
T
 
S
T
 
T
L
 
V
V
 
V
K
 
Q
L
 
L
L
 
L
A
 
E
R
 
R
L
 
F
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
T
 
L
E
 
A
G
 
G
R
 
K
I
 
V
L
 
L
L
 
L
D
 
D
G
 
G
H
 
K
D
 
E
L
 
I
R
 
K
D
 
R
Y
 
L
D
 
N
L
 
V
D
 
Q
D
 
W
L
 
L
R
 
R
R
 
A
H
 
H
I
 
L
G
 
G
V
 
I
I
 
V
F
 
S
Q
 
Q
D
 
E
Y
 
P
I
 
I
R
 
L
F
 
F
K
 
D
M
 
C
S
 
S
A
 
I
G
 
A
T
 
E
N
 
N
I
 
I
A
 
A
V
 
Y
G
 
G
D
 
D
I
 
N
D
 
S
E
 
R
R
 
V
T
 
V
N
 
S
Q
 
Q
P
 
E
R
 
E
I
 
I
E
 
V
T
 
R
S
 
A
A
 
A
Q
 
K
R
 
E
S
 
A
L
 
N
A
 
I
D
 
H
T
 
A
V
 
F
I
 
I
A
 
E
K
 
S
L
 
L
A
 
P
G
 
N
G
 
K
Y
 
Y
S
 
S
Q
 
T
Q
 
K
L
 
V
G
 
G
K
 
-
S
 
-
F
 
-
N
 
D
Q
 
K
G
 
G
V
 
T
E
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
W
 
K
Q
 
Q
K
 
R
V
 
I
A
 
A
L
 
I
G
 
A
R
 
R
A
 
A
Y
 
L
M
 
V
R
 
R
D
 
Q
A
 
P
Q
 
H
L
 
I
I
 
L
I
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
A
T
 
T
A
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
T
R
 
E
A
 
S
E
 
E
Y
 
K
E
 
V
V
 
V
F
 
Q
Q
 
E
R
 
A
F
 
L
N
 
D
A
 
K
L
 
A
T
 
R
E
 
E
G
 
G
K
 
R
S
 
T
S
 
C
V
 
I
I
 
V
I
 
I
S
 
A
H
 
H
R
 
R
F
 
L
S
 
S
T
 
T
V
 
I
R
 
Q
M
 
N
A
 
A
D
 
D
R
 
L
I
 
I
L
 
V
V
 
V
L
 
F
E
 
Q
N
 
N
G
 
G
Q
 
R
L
 
V
L
 
K
E
 
E
I
 
H
G
 
G
S
 
T
H
 
H
E
 
Q
A
 
Q
L
 
L
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
K
 
K
G
 
G
R
 
I
Y
 
Y
A
 
F
E
 
S
L
 
M
F
 
V
T
 
S
L
 
V
Q
 
Q
A
 
A

Sites not aligning to the query:

7o9wA Encequidar-bound human p-glycoprotein in complex with uic2-fab (see paper)
39% identity, 42% coverage: 361:622/626 of query aligns to 909:1168/1169 of 7o9wA

query
sites
7o9wA
P
 
P
L
 
L
I
 
I
H
 
D
S
 
S
P
 
Y
K
 
S
T
 
T
A
 
E
L
 
G
P
 
L
F
 
M
P
 
P
A
 
N
Q
 
T
V
 
L
R
 
E
S
 
G
G
 
N
F
 
V
T
 
T
F
 
F
E
 
G
N
 
E
V
 
V
G
 
V
F
 
F
K
 
N
Y
 
Y
A
 
P
N
 
T
-
 
R
S
 
P
D
 
D
R
 
I
W
 
P
A
 
V
L
 
L
R
 
Q
G
 
G
L
 
L
S
 
S
F
 
L
T
 
E
L
 
V
Q
 
K
A
 
K
G
 
G
E
 
Q
K
 
T
L
 
L
A
 
A
L
 
L
V
 
V
G
 
G
E
 
S
N
 
S
G
 
G
A
 
C
G
 
G
K
 
K
T
 
S
T
 
T
L
 
V
V
 
V
K
 
Q
L
 
L
L
 
L
A
 
E
R
 
R
L
 
F
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
T
 
L
E
 
A
G
 
G
R
 
K
I
 
V
L
 
L
L
 
L
D
 
D
G
 
G
H
 
K
D
 
E
L
 
I
R
 
K
D
 
R
Y
 
L
D
 
N
L
 
V
D
 
Q
D
 
W
L
 
L
R
 
R
R
 
A
H
 
H
I
 
L
G
 
G
V
 
I
I
 
V
F
 
S
Q
 
Q
D
 
E
Y
 
P
I
 
I
R
 
L
F
 
F
K
 
D
M
 
C
S
 
S
A
 
I
G
 
A
T
 
E
N
 
N
I
 
I
A
 
A
V
 
Y
G
 
G
D
 
D
I
 
N
D
 
S
E
 
R
R
 
V
T
 
V
N
 
S
Q
 
Q
P
 
E
R
 
E
I
 
I
E
 
V
T
 
R
S
 
A
A
 
A
Q
 
K
R
 
E
S
 
A
L
 
N
A
 
I
D
 
H
T
 
A
V
 
F
I
 
I
A
 
E
K
 
S
L
 
L
A
 
P
G
 
N
G
 
K
Y
 
Y
S
 
S
Q
 
T
Q
 
K
L
 
V
G
 
G
K
 
-
S
 
-
F
 
-
N
 
D
Q
 
K
G
 
G
V
 
T
E
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
W
 
K
Q
 
Q
K
 
R
V
 
I
A
 
A
L
 
I
G
 
A
R
 
R
A
 
A
Y
 
L
M
 
V
R
 
R
D
 
Q
A
 
P
Q
 
H
L
 
I
I
 
L
I
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
A
T
 
T
A
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
T
R
 
E
A
 
S
E
 
E
Y
 
K
E
 
V
V
 
V
F
 
Q
Q
 
E
R
 
A
F
 
L
N
 
D
A
 
K
L
 
A
T
 
R
E
 
E
G
 
G
K
 
R
S
 
T
S
 
C
V
 
I
I
 
V
I
 
I
S
 
A
H
 
H
R
 
R
F
 
L
S
 
S
T
 
T
V
 
I
R
 
Q
M
 
N
A
 
A
D
 
D
R
 
L
I
 
I
L
 
V
V
 
V
L
 
F
E
 
Q
N
 
N
G
 
G
Q
 
R
L
 
V
L
 
K
E
 
E
I
 
H
G
 
G
S
 
T
H
 
H
E
 
Q
A
 
Q
L
 
L
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
K
 
K
G
 
G
R
 
I
Y
 
Y
A
 
F
E
 
S
L
 
M
F
 
V
T
 
S
L
 
V
Q
 
Q
A
 
A

Sites not aligning to the query:

6qexA Nanodisc reconstituted human abcb1 in complex with uic2 fab and taxol (see paper)
39% identity, 42% coverage: 361:622/626 of query aligns to 922:1181/1182 of 6qexA

query
sites
6qexA
P
 
P
L
 
L
I
 
I
H
 
D
S
 
S
P
 
Y
K
 
S
T
 
T
A
 
E
L
 
G
P
 
L
F
 
M
P
 
P
A
 
N
Q
 
T
V
 
L
R
 
E
S
 
G
G
 
N
F
 
V
T
 
T
F
 
F
E
 
G
N
 
E
V
 
V
G
 
V
F
 
F
K
 
N
Y
 
Y
A
 
P
N
 
T
-
 
R
S
 
P
D
 
D
R
 
I
W
 
P
A
 
V
L
 
L
R
 
Q
G
 
G
L
 
L
S
 
S
F
 
L
T
 
E
L
 
V
Q
 
K
A
 
K
G
 
G
E
 
Q
K
 
T
L
 
L
A
 
A
L
 
L
V
 
V
G
 
G
E
 
S
N
 
S
G
 
G
A
 
C
G
 
G
K
 
K
T
 
S
T
 
T
L
 
V
V
 
V
K
 
Q
L
 
L
L
 
L
A
 
E
R
 
R
L
 
F
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
T
 
L
E
 
A
G
 
G
R
 
K
I
 
V
L
 
L
L
 
L
D
 
D
G
 
G
H
 
K
D
 
E
L
 
I
R
 
K
D
 
R
Y
 
L
D
 
N
L
 
V
D
 
Q
D
 
W
L
 
L
R
 
R
R
 
A
H
 
H
I
 
L
G
 
G
V
 
I
I
 
V
F
 
S
Q
 
Q
D
 
E
Y
 
P
I
 
I
R
 
L
F
 
F
K
 
D
M
 
C
S
 
S
A
 
I
G
 
A
T
 
E
N
 
N
I
 
I
A
 
A
V
 
Y
G
 
G
D
 
D
I
 
N
D
 
S
E
 
R
R
 
V
T
 
V
N
 
S
Q
 
Q
P
 
E
R
 
E
I
 
I
E
 
V
T
 
R
S
 
A
A
 
A
Q
 
K
R
 
E
S
 
A
L
 
N
A
 
I
D
 
H
T
 
A
V
 
F
I
 
I
A
 
E
K
 
S
L
 
L
A
 
P
G
 
N
G
 
K
Y
 
Y
S
 
S
Q
 
T
Q
 
K
L
 
V
G
 
G
K
 
-
S
 
-
F
 
-
N
 
D
Q
 
K
G
 
G
V
 
T
E
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
W
 
K
Q
 
Q
K
 
R
V
 
I
A
 
A
L
 
I
G
 
A
R
 
R
A
 
A
Y
 
L
M
 
V
R
 
R
D
 
Q
A
 
P
Q
 
H
L
 
I
I
 
L
I
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
A
T
 
T
A
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
T
R
 
E
A
 
S
E
 
E
Y
 
K
E
 
V
V
 
V
F
 
Q
Q
 
E
R
 
A
F
 
L
N
 
D
A
 
K
L
 
A
T
 
R
E
 
E
G
 
G
K
 
R
S
 
T
S
 
C
V
 
I
I
 
V
I
 
I
S
 
A
H
 
H
R
 
R
F
 
L
S
 
S
T
 
T
V
 
I
R
 
Q
M
 
N
A
 
A
D
 
D
R
 
L
I
 
I
L
 
V
V
 
V
L
 
F
E
 
Q
N
 
N
G
 
G
Q
 
R
L
 
V
L
 
K
E
 
E
I
 
H
G
 
G
S
 
T
H
 
H
E
 
Q
A
 
Q
L
 
L
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
K
 
K
G
 
G
R
 
I
Y
 
Y
A
 
F
E
 
S
L
 
M
F
 
V
T
 
S
L
 
V
Q
 
Q
A
 
A

Sites not aligning to the query:

4mrvA Structure of a bacterial atm1-family abc transporter (see paper)
36% identity, 52% coverage: 300:622/626 of query aligns to 275:590/600 of 4mrvA

query
sites
4mrvA
G
 
G
A
 
A
Y
 
M
V
 
A
W
 
W
I
 
T
V
 
V
Q
 
Y
R
 
G
A
 
W
V
 
S
T
 
Q
G
 
G
Q
 
K
I
 
L
S
 
T
L
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
T
 
V
F
 
F
L
 
V
A
 
N
G
 
T
S
 
Y
F
 
L
R
 
T
Q
 
Q
V
 
L
R
 
F
S
 
R
S
 
P
L
 
L
E
x
D
G
x
M
I
x
L
L
x
G
L
x
M
Q
 
V
F
 
Y
S
x
R
S
 
T
L
 
I
T
 
R
Q
 
Q
E
 
G
A
 
L
V
 
I
Y
 
D
L
 
M
Q
 
A
D
 
E
L
 
M
F
 
F
D
 
R
Y
 
L
F
 
I
A
 
D
I
 
T
Q
 
H
P
 
I
L
 
E
I
 
V
H
 
A
S
 
D
P
 
V
K
 
P
T
 
N
A
 
A
L
 
-
P
 
-
F
 
-
P
 
P
A
 
A
Q
 
L
V
 
V
-
 
V
-
 
N
R
 
R
S
 
P
G
 
S
F
 
V
T
 
T
F
 
F
E
 
D
N
 
N
V
 
V
G
 
V
F
 
F
K
 
G
Y
 
Y
A
 
-
N
 
D
S
 
R
D
 
D
R
 
R
W
 
E
A
 
I
L
 
L
R
 
H
G
 
G
L
 
L
S
 
S
F
 
F
T
 
E
L
 
V
Q
 
A
A
 
A
G
 
G
E
 
S
K
 
R
L
 
V
A
 
A
L
 
I
V
 
V
G
 
G
E
 
P
N
x
S
G
 
G
A
 
A
G
|
G
K
 
K
T
x
S
T
 
T
L
 
I
V
 
A
K
 
R
L
 
L
L
 
L
A
 
F
R
 
R
L
 
F
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
T
 
W
E
 
E
G
 
G
R
 
R
I
 
I
L
 
L
L
 
I
D
 
D
G
 
G
H
 
Q
D
 
D
L
 
I
R
 
A
D
 
H
Y
 
V
D
 
T
L
 
Q
D
 
T
D
 
S
L
 
L
R
 
R
R
 
A
H
 
A
I
 
L
G
 
G
V
 
I
I
 
V
F
 
P
Q
 
Q
D
 
D
Y
 
S
I
 
V
R
 
L
F
 
F
K
 
N
M
 
D
S
 
T
A
 
I
G
 
G
T
 
Y
N
 
N
I
 
I
A
 
A
V
 
Y
G
 
G
D
 
R
I
 
-
D
 
-
E
 
D
R
 
G
T
 
A
N
 
S
Q
 
R
P
 
A
R
 
E
I
 
V
E
 
D
T
 
A
S
 
A
A
 
A
Q
 
K
R
 
G
S
 
A
L
 
A
A
 
I
D
 
A
T
 
D
V
 
F
I
 
I
A
 
A
K
 
R
L
 
L
A
 
P
G
 
Q
G
 
G
Y
 
Y
S
 
D
Q
 
T
Q
 
E
L
 
V
G
 
G
K
 
E
S
 
-
F
 
-
N
 
-
Q
 
R
G
 
G
V
 
L
E
 
K
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
W
 
K
Q
 
Q
K
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
I
G
 
A
R
 
R
A
 
T
Y
 
L
M
 
V
R
 
K
D
 
N
A
 
P
Q
 
P
L
 
I
I
 
L
I
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
A
T
 
T
A
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
T
R
 
R
A
 
T
E
 
E
Y
 
Q
E
 
D
V
 
I
F
 
L
Q
 
S
R
 
T
F
 
M
N
 
R
A
 
A
L
 
V
T
 
A
E
 
S
G
 
H
K
 
R
S
 
T
S
 
T
V
 
I
I
 
S
I
 
I
S
 
A
H
 
H
R
 
R
F
 
L
S
 
S
T
 
T
V
 
I
R
 
A
M
 
D
A
 
S
D
 
D
R
 
T
I
 
I
L
 
L
V
 
V
L
 
L
E
 
D
N
 
Q
G
 
G
Q
 
R
L
 
L
L
 
A
E
 
E
I
 
Q
G
 
G
S
 
S
H
 
H
E
 
L
A
 
D
L
 
L
L
 
L
A
 
R
Q
 
R
K
 
D
G
 
G
R
 
L
Y
 
Y
A
 
A
E
 
E
L
 
M
F
 
W
T
 
A
L
 
R
Q
 
Q
A
 
A

Sites not aligning to the query:

4mrsA Structure of a bacterial atm1-family abc transporter (see paper)
36% identity, 52% coverage: 300:622/626 of query aligns to 275:590/600 of 4mrsA

query
sites
4mrsA
G
 
G
A
 
A
Y
 
M
V
 
A
W
 
W
I
 
T
V
 
V
Q
 
Y
R
 
G
A
 
W
V
 
S
T
 
Q
G
 
G
Q
 
K
I
 
L
S
 
T
L
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
T
 
V
F
 
F
L
 
V
A
 
N
G
 
T
S
 
Y
F
 
L
R
 
T
Q
 
Q
V
 
L
R
 
F
S
 
R
S
 
P
L
 
L
E
x
D
G
x
M
I
 
L
L
x
G
L
x
M
Q
 
V
F
 
Y
S
 
R
S
 
T
L
 
I
T
 
R
Q
 
Q
E
 
G
A
 
L
V
 
I
Y
 
D
L
 
M
Q
 
A
D
 
E
L
 
M
F
 
F
D
 
R
Y
 
L
F
 
I
A
 
D
I
 
T
Q
 
H
P
 
I
L
 
E
I
 
V
H
 
A
S
 
D
P
 
V
K
 
P
T
 
N
A
 
A
L
 
-
P
 
-
F
 
-
P
 
P
A
 
A
Q
 
L
V
 
V
-
 
V
-
 
N
R
 
R
S
 
P
G
 
S
F
 
V
T
 
T
F
 
F
E
 
D
N
 
N
V
 
V
G
 
V
F
 
F
K
 
G
Y
 
Y
A
 
-
N
 
D
S
 
R
D
 
D
R
 
R
W
 
E
A
 
I
L
 
L
R
 
H
G
 
G
L
 
L
S
 
S
F
 
F
T
 
E
L
 
V
Q
 
A
A
 
A
G
 
G
E
 
S
K
 
R
L
 
V
A
 
A
L
 
I
V
 
V
G
 
G
E
 
P
N
x
S
G
 
G
A
 
A
G
|
G
K
 
K
T
x
S
T
 
T
L
 
I
V
 
A
K
 
R
L
 
L
L
 
L
A
 
F
R
 
R
L
 
F
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
T
 
W
E
 
E
G
 
G
R
 
R
I
 
I
L
 
L
L
 
I
D
 
D
G
 
G
H
 
Q
D
 
D
L
 
I
R
 
A
D
 
H
Y
 
V
D
 
T
L
 
Q
D
 
T
D
 
S
L
 
L
R
 
R
R
 
A
H
 
A
I
 
L
G
 
G
V
 
I
I
 
V
F
 
P
Q
 
Q
D
 
D
Y
 
S
I
 
V
R
 
L
F
 
F
K
 
N
M
 
D
S
 
T
A
 
I
G
 
G
T
 
Y
N
 
N
I
 
I
A
 
A
V
 
Y
G
 
G
D
 
R
I
 
-
D
 
-
E
 
D
R
 
G
T
 
A
N
 
S
Q
 
R
P
 
A
R
 
E
I
 
V
E
 
D
T
 
A
S
 
A
A
 
A
Q
 
K
R
 
G
S
 
A
L
 
A
A
 
I
D
 
A
T
 
D
V
 
F
I
 
I
A
 
A
K
 
R
L
 
L
A
 
P
G
 
Q
G
 
G
Y
 
Y
S
 
D
Q
 
T
Q
 
E
L
 
V
G
 
G
K
 
E
S
 
-
F
 
-
N
 
-
Q
 
R
G
 
G
V
 
L
E
 
K
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
W
 
K
Q
 
Q
K
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
I
G
 
A
R
 
R
A
 
T
Y
 
L
M
 
V
R
 
K
D
 
N
A
 
P
Q
 
P
L
 
I
I
 
L
I
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
A
T
 
T
A
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
T
R
 
R
A
 
T
E
 
E
Y
 
Q
E
 
D
V
 
I
F
 
L
Q
 
S
R
 
T
F
 
M
N
 
R
A
 
A
L
 
V
T
 
A
E
 
S
G
 
H
K
 
R
S
 
T
S
 
T
V
 
I
I
 
S
I
 
I
S
 
A
H
 
H
R
 
R
F
 
L
S
 
S
T
 
T
V
 
I
R
 
A
M
 
D
A
 
S
D
 
D
R
 
T
I
 
I
L
 
L
V
 
V
L
 
L
E
 
D
N
 
Q
G
 
G
Q
 
R
L
 
L
L
 
A
E
 
E
I
 
Q
G
 
G
S
 
S
H
 
H
E
 
L
A
 
D
L
 
L
L
 
L
A
 
R
Q
 
R
K
 
D
G
 
G
R
 
L
Y
 
Y
A
 
A
E
 
E
L
 
M
F
 
W
T
 
A
L
 
R
Q
 
Q
A
 
A

Sites not aligning to the query: