SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_015332711.1 NCBI__GCF_000331105.1:WP_015332711.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1z05A Crystal structure of the rok family transcriptional regulator, homolog of e.Coli mlc protein.
28% identity, 79% coverage: 65:315/316 of query aligns to 136:385/396 of 1z05A

query
sites
1z05A
L
 
V
S
 
T
G
 
S
I
 
I
G
 
A
I
 
I
A
 
T
I
 
L
P
 
P
G
 
G
I
 
L
V
 
V
D
 
N
P
 
-
I
 
-
N
 
S
K
 
E
R
 
Q
V
 
G
L
 
I
T
 
V
I
 
L
N
 
Q
G
 
M
K
 
P
Y
 
H
S
 
Y
D
 
N
A
 
V
P
 
K
N
 
N
L
 
L
D
 
A
L
 
L
P
 
G
A
 
P
W
 
E
A
 
I
H
 
Y
E
 
K
T
 
A
W
 
T
G
 
G
L
 
L
P
 
P
L
 
V
Y
 
F
L
 
V
E
 
A
N
 
N
D
 
D
T
 
T
R
 
R
A
 
A
A
 
W
L
 
A
L
 
L
G
 
A
E
 
E
W
 
K
Q
 
L
H
 
F
G
 
G
S
 
H
G
 
S
R
 
Q
G
 
D
Y
 
V
D
 
D
N
 
N
V
 
S
V
 
V
L
 
L
M
 
I
T
 
S
L
 
I
G
 
H
T
 
H
G
 
G
I
 
L
G
 
G
T
 
A
S
 
G
A
 
I
V
 
V
I
 
L
E
 
D
G
 
G
R
 
R
L
 
V
L
 
L
R
 
Q
G
 
G
R
 
R
H
 
H
F
 
G
Q
 
N
A
 
I
G
 
G
I
 
E
L
 
L
G
 
-
G
 
G
H
|
H
V
 
I
V
 
Q
I
 
I
N
 
D
T
 
P
Q
 
Q
G
 
G
N
 
K
Q
 
R
C
|
C
N
 
H
C
|
C
G
 
G
T
 
N
V
 
Y
G
 
G
C
|
C
A
 
L
E
 
E
A
 
T
E
 
V
A
 
A
S
 
S
T
 
S
W
 
Q
S
 
A
L
 
I
N
 
R
E
 
D
R
 
Q
A
 
V
T
 
T
A
 
A
-
 
R
-
 
I
H
 
Q
A
 
A
T
 
G
Y
 
E
P
 
P
Q
 
-
S
 
S
L
 
C
L
 
L
C
 
A
G
 
T
Y
 
V
D
 
E
T
 
E
V
 
I
D
 
S
Y
 
I
E
 
E
A
 
D
V
 
I
F
 
C
R
 
A
C
 
A
A
 
A
Q
 
A
Q
 
D
G
 
G
D
 
D
A
 
P
L
 
L
A
 
A
T
 
V
T
 
D
L
 
V
R
 
I
N
 
Q
D
 
Q
S
 
L
I
 
G
A
 
R
V
 
Y
W
 
L
A
 
G
A
 
A
C
 
A
A
 
I
Y
 
A
N
 
I
L
 
V
V
 
I
Q
 
N
A
 
L
Y
 
F
D
 
N
P
 
P
E
 
E
V
 
K
L
 
I
I
 
L
L
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
V
V
 
I
M
 
N
A
 
Q
S
 
A
R
 
K
D
 
S
A
 
I
I
 
L
I
 
Y
P
 
P
P
 
S
I
 
I
Q
 
E
E
 
Q
R
 
C
L
 
I
N
 
R
Q
 
E
N
 
Q
A
 
S
W
 
L
A
 
P
T
 
V
W
 
Y
G
 
H
H
 
Q
-
 
D
V
 
L
A
 
K
V
 
L
V
 
V
P
 
E
G
 
S
T
 
R
L
 
F
S
 
Y
D
 
K
S
 
Q
A
 
A
A
 
T
L
 
M
L
 
P
G
 
G
V
 
A
A
 
A
T
 
L
L
 
I
A
 
K
Y
 
Q
N
 
A
L
 
L
H
 
Y

3vglA Crystal structure of a rok family glucokinase from streptomyces griseus in complex with glucose and amppnp (see paper)
32% identity, 97% coverage: 6:311/316 of query aligns to 3:309/312 of 3vglA

query
sites
3vglA
T
 
T
I
 
I
A
 
G
I
 
V
D
 
D
L
 
I
G
|
G
G
 
G
T
|
T
R
x
K
I
 
I
K
 
A
L
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
V
-
 
D
R
 
E
A
 
E
G
 
G
T
 
R
V
 
I
L
 
L
L
 
S
T
 
T
S
 
F
Q
 
K
M
 
V
E
 
-
S
 
-
Q
 
-
S
 
-
G
 
-
Q
 
-
G
 
-
L
 
-
Q
 
-
A
 
A
R
 
T
L
 
P
P
 
P
Q
 
T
L
 
A
E
 
E
T
 
G
A
 
I
I
 
V
N
 
D
A
 
A
M
 
I
L
 
C
A
 
A
Q
 
A
A
 
V
R
 
A
L
 
G
T
 
A
A
 
S
A
 
E
-
 
G
-
 
H
D
 
D
L
 
V
S
 
E
G
 
A
I
 
V
G
 
G
I
 
I
A
 
G
I
 
A
P
 
A
G
|
G
I
 
Y
V
 
V
D
 
D
P
 
D
I
 
K
N
 
R
K
 
A
R
 
T
V
 
V
L
 
L
T
 
F
I
 
-
N
 
-
G
 
-
K
 
-
Y
 
-
S
 
-
D
 
-
A
 
A
P
|
P
N
 
N
L
 
I
D
 
D
L
 
-
P
 
-
A
 
-
W
 
W
A
 
R
H
 
H
E
 
E
T
 
P
W
 
L
-
 
K
-
 
D
-
 
K
-
 
V
-
 
E
-
 
Q
-
 
R
-
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
P
L
 
V
Y
 
V
L
 
V
E
 
E
N
|
N
D
|
D
T
 
A
R
 
N
A
 
A
A
 
A
L
 
A
L
 
W
G
 
G
E
 
E
W
 
Y
Q
 
R
H
 
F
G
 
G
S
 
A
G
 
G
R
 
Q
G
 
G
Y
 
H
D
 
D
N
 
D
V
 
V
V
 
I
L
 
C
M
 
I
T
 
T
L
 
L
G
|
G
T
|
T
G
 
G
I
x
L
G
|
G
T
 
G
S
 
G
A
 
I
V
 
I
I
 
I
E
 
G
G
 
N
R
 
K
L
 
L
L
 
R
R
 
R
G
 
G
R
 
R
H
 
-
F
 
F
Q
 
G
A
 
V
G
 
A
I
 
A
L
x
E
G
 
F
G
 
G
H
|
H
V
 
I
V
 
R
I
 
V
N
 
V
T
 
P
Q
 
D
G
 
G
N
 
L
Q
 
L
C
|
C
N
 
G
C
|
C
G
 
G
T
 
S
V
 
Q
G
 
G
C
|
C
A
 
W
E
|
E
A
 
Q
E
 
Y
A
 
A
S
 
S
T
x
G
W
 
R
S
 
A
L
 
L
-
 
V
-
 
R
-
 
Y
-
 
A
N
 
K
E
 
Q
R
 
R
A
 
A
T
 
N
A
 
A
H
 
T
A
 
P
T
 
E
Y
 
N
P
 
A
Q
 
A
S
 
V
L
 
L
L
 
L
-
 
G
-
 
L
-
 
G
-
 
D
C
 
G
G
 
S
Y
 
V
D
 
D
T
 
G
V
 
I
D
 
E
Y
x
G
E
 
K
A
 
H
V
 
I
F
x
S
R
 
E
C
 
A
A
 
A
Q
 
R
Q
 
Q
G
 
G
D
 
D
A
 
P
L
 
V
A
 
A
T
 
V
-
 
D
T
 
S
L
 
F
R
 
R
N
 
E
D
 
-
S
 
-
I
 
L
A
 
A
V
 
R
W
 
W
A
 
A
A
 
G
C
 
A
A
 
G
Y
 
L
-
 
A
N
 
D
L
 
L
V
 
A
Q
 
S
A
 
L
Y
 
F
D
 
D
P
 
P
E
 
S
V
 
A
L
 
F
I
 
I
L
 
V
G
 
G
G
 
G
G
|
G
V
|
V
M
 
S
A
 
D
S
x
E
R
 
G
D
 
E
A
 
L
I
 
V
I
 
L
P
 
D
P
 
P
I
 
I
Q
 
R
E
 
K
R
 
S
L
 
F
N
 
R
Q
 
R
N
 
-
A
 
-
W
 
W
A
 
L
T
 
I
W
 
G
G
 
G
-
 
E
-
 
W
-
 
R
-
 
P
H
 
H
V
 
A
A
 
Q
V
 
V
V
 
L
P
 
A
G
 
A
T
 
Q
L
 
L
S
 
G
D
 
G
S
 
K
A
 
A
A
 
G
L
 
L
L
 
V
G
 
G
V
 
A
A
 
A
T
 
D
L
 
L
A
 
A

3vgkB Crystal structure of a rok family glucokinase from streptomyces griseus (see paper)
32% identity, 97% coverage: 6:311/316 of query aligns to 3:309/312 of 3vgkB

query
sites
3vgkB
T
 
T
I
 
I
A
 
G
I
 
V
D
 
D
L
 
I
G
 
G
G
 
G
T
 
T
R
 
K
I
 
I
K
 
A
L
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
V
-
 
D
R
 
E
A
 
E
G
 
G
T
 
R
V
 
I
L
 
L
L
 
S
T
 
T
S
 
F
Q
 
K
M
 
V
E
 
-
S
 
-
Q
 
-
S
 
-
G
 
-
Q
 
-
G
 
-
L
 
-
Q
 
-
A
 
A
R
 
T
L
 
P
P
 
P
Q
 
T
L
 
A
E
 
E
T
 
G
A
 
I
I
 
V
N
 
D
A
 
A
M
 
I
L
 
C
A
 
A
Q
 
A
A
 
V
R
 
A
L
 
G
T
 
A
A
 
S
A
 
E
-
 
G
-
 
H
D
 
D
L
 
V
S
 
E
G
 
A
I
 
V
G
 
G
I
 
I
A
 
G
I
 
A
P
 
A
G
 
G
I
 
Y
V
 
V
D
 
D
P
 
D
I
 
K
N
 
R
K
 
A
R
 
T
V
 
V
L
 
L
T
 
F
I
 
-
N
 
-
G
 
-
K
 
-
Y
 
-
S
 
-
D
 
-
A
 
A
P
 
P
N
 
N
L
 
I
D
 
D
L
 
-
P
 
-
A
 
-
W
 
W
A
 
R
H
 
H
E
 
E
T
 
P
W
 
L
-
 
K
-
 
D
-
 
K
-
 
V
-
 
E
-
 
Q
-
 
R
-
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
P
L
 
V
Y
 
V
L
 
V
E
 
E
N
 
N
D
 
D
T
 
A
R
 
N
A
 
A
A
 
A
L
 
A
L
 
W
G
 
G
E
 
E
W
 
Y
Q
 
R
H
 
F
G
 
G
S
 
A
G
 
G
R
 
Q
G
 
G
Y
 
H
D
 
D
N
 
D
V
 
V
V
 
I
L
 
C
M
 
I
T
 
T
L
 
L
G
 
G
T
 
T
G
 
G
I
 
L
G
 
G
T
 
G
S
 
G
A
 
I
V
 
I
I
 
I
E
 
G
G
 
N
R
 
K
L
 
L
L
 
R
R
 
R
G
 
G
R
 
R
H
 
-
F
 
F
Q
 
G
A
 
V
G
 
A
I
 
A
L
 
E
G
 
F
G
 
G
H
|
H
V
 
I
V
 
R
I
 
V
N
 
V
T
 
P
Q
 
D
G
 
G
N
 
L
Q
 
L
C
|
C
N
 
G
C
|
C
G
 
G
T
 
S
V
 
Q
G
 
G
C
|
C
A
 
W
E
 
E
A
 
Q
E
 
Y
A
 
A
S
 
S
T
 
G
W
 
R
S
 
A
L
 
L
-
 
V
-
 
R
-
 
Y
-
 
A
N
 
K
E
 
Q
R
 
R
A
 
A
T
 
N
A
 
A
H
 
T
A
 
P
T
 
E
Y
 
N
P
 
A
Q
 
A
S
 
V
L
 
L
L
 
L
-
 
G
-
 
L
-
 
G
-
 
D
C
 
G
G
 
S
Y
 
V
D
 
D
T
 
G
V
 
I
D
 
E
Y
 
G
E
 
K
A
 
H
V
 
I
F
 
S
R
 
E
C
 
A
A
 
A
Q
 
R
Q
 
Q
G
 
G
D
 
D
A
 
P
L
 
V
A
 
A
T
 
V
-
 
D
T
 
S
L
 
F
R
 
R
N
 
E
D
 
-
S
 
-
I
 
L
A
 
A
V
 
R
W
 
W
A
 
A
A
 
G
C
 
A
A
 
G
Y
 
L
-
 
A
N
 
D
L
 
L
V
 
A
Q
 
S
A
 
L
Y
 
F
D
 
D
P
 
P
E
 
S
V
 
A
L
 
F
I
 
I
L
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
V
 
V
M
 
S
A
 
D
S
 
E
R
 
G
D
 
E
A
 
L
I
 
V
I
 
L
P
 
D
P
 
P
I
 
I
Q
 
R
E
 
K
R
 
S
L
 
F
N
 
R
Q
 
R
N
 
-
A
 
-
W
 
W
A
 
L
T
 
I
W
 
G
G
 
G
-
 
E
-
 
W
-
 
R
-
 
P
H
 
H
V
 
A
A
 
Q
V
 
V
V
 
L
P
 
A
G
 
A
T
 
Q
L
 
L
S
 
G
D
 
G
S
 
K
A
 
A
A
 
G
L
 
L
L
 
V
G
 
G
V
 
A
A
 
A
T
 
D
L
 
L
A
 
A

2qm1B Crystal structure of glucokinase from enterococcus faecalis
28% identity, 99% coverage: 3:314/316 of query aligns to 5:322/325 of 2qm1B

query
sites
2qm1B
E
 
D
K
 
K
A
 
K
T
 
I
I
 
I
A
 
G
I
 
I
D
 
D
L
 
L
G
 
G
G
 
G
T
 
T
R
 
T
I
 
I
K
 
K
L
 
F
G
 
A
-
 
I
L
 
L
V
 
T
R
 
T
A
 
D
G
 
G
T
 
V
V
 
V
L
 
Q
L
 
Q
T
 
K
S
 
W
Q
 
S
M
 
I
E
 
E
S
 
T
Q
 
N
S
 
I
G
 
L
Q
 
E
G
 
D
L
 
G
Q
 
K
A
 
H
R
 
I
L
 
V
P
 
P
Q
 
S
L
 
I
E
 
I
T
 
E
A
 
S
I
 
I
N
 
R
A
 
H
M
 
R
L
 
I
A
 
D
Q
 
L
A
 
Y
R
 
N
L
 
M
T
 
K
A
 
K
A
 
E
D
 
D
L
 
F
S
 
V
G
 
G
I
 
I
G
 
G
I
 
M
A
 
G
I
 
T
P
 
P
G
 
G
I
 
S
V
 
V
D
 
D
P
 
-
I
 
I
N
 
E
K
 
K
R
 
G
V
 
-
L
 
-
T
 
T
I
 
V
N
 
V
G
 
G
K
 
A
Y
 
Y
S
 
-
D
 
-
A
 
-
P
 
-
N
 
N
L
 
L
D
 
N
-
 
W
-
 
T
-
 
T
-
 
V
-
 
Q
-
 
P
L
 
V
P
 
K
A
 
E
W
 
Q
A
 
I
H
 
E
E
 
S
T
 
A
W
 
L
G
 
G
L
 
I
P
 
P
L
 
F
Y
 
A
L
 
L
E
 
D
N
|
N
D
 
D
T
 
A
R
x
N
A
 
V
A
 
A
L
 
A
L
 
L
G
 
G
E
 
E
W
 
R
Q
 
W
H
 
K
G
 
G
S
 
A
G
 
G
R
 
E
G
 
N
Y
 
N
D
 
P
N
 
D
V
 
V
V
 
I
L
 
F
M
 
I
T
 
T
L
 
L
G
 
G
T
 
T
G
 
G
I
 
V
G
 
G
T
x
G
S
 
G
A
 
I
V
 
V
I
 
A
E
 
A
G
 
G
R
 
K
L
 
L
L
 
L
R
 
H
G
 
G
R
 
V
H
 
A
F
 
G
Q
 
C
A
 
A
G
 
G
I
 
E
L
 
V
G
 
-
G
 
G
H
|
H
V
 
V
V
 
T
I
 
V
N
 
D
T
 
P
Q
 
N
G
 
G
N
 
F
Q
 
D
C
|
C
N
 
T
C
|
C
G
 
G
T
 
K
V
 
R
G
 
G
C
|
C
A
 
L
E
 
E
A
 
T
E
 
V
A
 
S
S
 
S
T
 
A
W
 
T
S
 
G
-
 
V
-
 
V
-
 
R
-
 
V
-
 
A
-
 
R
-
 
H
L
 
L
N
 
S
E
 
E
R
 
E
A
 
F
T
 
A
A
 
G
H
 
D
A
 
S
T
 
E
Y
 
L
P
 
K
Q
 
Q
S
 
A
L
 
I
L
 
D
C
 
D
G
 
G
Y
 
Q
D
 
D
T
 
-
V
 
V
D
 
S
Y
 
S
E
 
K
A
 
D
V
 
V
F
 
F
R
 
E
C
 
F
A
 
A
Q
 
E
Q
 
K
G
 
G
D
 
D
A
 
H
L
 
F
A
 
A
T
 
L
T
 
M
L
 
V
R
 
V
N
 
D
D
 
R
S
 
V
I
 
C
A
 
F
V
 
Y
W
 
L
A
 
G
A
 
L
C
 
A
A
 
T
Y
 
G
N
 
N
L
 
L
V
 
G
Q
 
N
A
 
T
Y
 
L
D
 
N
P
 
P
E
 
D
V
 
S
L
 
V
I
 
V
L
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
V
 
V
M
 
S
A
 
A
S
 
A
R
 
G
D
 
E
A
 
F
I
 
L
I
 
R
P
 
S
P
 
R
I
 
V
Q
 
E
E
 
K
R
 
Y
L
 
F
N
 
Q
Q
 
E
N
 
F
A
 
T
W
 
F
-
 
P
A
 
Q
T
 
V
W
 
R
G
 
N
H
 
S
V
 
T
A
 
K
V
 
I
V
 
K
P
 
L
G
 
A
T
 
E
L
 
L
S
 
G
D
 
N
S
 
E
A
 
A
A
 
G
L
 
V
L
 
I
G
 
G
V
 
A
A
 
A
T
 
S
L
 
L
A
 
A
Y
 
L
N
 
Q
L
 
F

Q93LQ8 Beta-glucoside kinase; EC 2.7.1.85 from Klebsiella pneumoniae (see paper)
28% identity, 82% coverage: 8:266/316 of query aligns to 5:245/297 of Q93LQ8

query
sites
Q93LQ8
A
 
A
I
 
F
D
|
D
L
 
I
G
|
G
G
 
G
T
 
T
R
 
A
I
 
L
K
 
K
L
 
M
G
 
G
L
 
V
V
 
M
-
 
A
R
 
R
A
 
D
G
 
G
T
 
R
V
 
L
L
 
L
L
 
E
T
 
T
S
 
A
Q
 
R
M
 
Q
E
 
S
S
 
I
Q
 
N
S
 
D
G
 
S
Q
 
D
G
 
G
L
 
-
Q
 
-
A
 
-
R
 
-
L
 
-
P
 
-
Q
 
-
L
 
-
E
 
D
T
 
R
A
 
I
I
 
L
N
 
Q
A
 
A
M
 
M
L
 
L
A
 
S
Q
 
W
A
 
L
R
 
-
L
 
A
T
 
A
A
 
H
A
 
P
D
 
S
L
 
C
S
 
E
G
 
G
I
 
I
G
 
A
I
 
I
A
 
S
I
 
A
P
 
P
G
 
G
I
 
Y
V
 
I
D
 
D
P
 
P
I
 
-
N
 
H
K
 
S
R
 
G
V
 
L
L
 
I
T
 
T
I
 
M
N
 
G
G
 
G
K
 
A
Y
 
I
S
 
R
D
 
R
A
 
F
P
 
D
N
 
N
L
 
F
D
 
A
L
 
M
P
 
K
A
 
S
W
 
W
A
 
L
H
 
E
E
 
T
T
 
R
W
 
T
G
 
G
L
 
L
P
 
P
L
 
V
Y
 
S
L
 
V
E
 
E
N
 
N
D
|
D
T
 
A
R
 
N
A
 
C
A
 
V
L
 
L
L
 
L
G
 
A
E
 
E
W
 
R
Q
 
W
H
 
Q
G
 
G
S
 
K
G
 
A
R
 
A
G
 
E
Y
 
M
D
 
A
N
 
N
V
 
F
V
 
L
L
 
V
M
 
L
T
 
T
L
 
I
G
 
G
T
 
T
G
|
G
I
 
I
G
|
G
T
 
G
S
 
A
A
 
I
V
 
F
I
 
C
E
 
Q
G
 
H
R
 
Q
L
 
L
L
 
I
R
 
N
G
 
G
R
 
A
H
 
R
F
 
F
Q
 
R
A
 
A
G
 
G
I
 
E
L
 
F
G
 
-
G
 
G
H
 
Y
V
 
M
V
 
L
I
 
T
N
 
D
T
 
R
Q
 
P
G
 
G
N
 
G
Q
 
R
C
 
-
N
 
-
C
 
-
G
 
-
T
 
-
V
 
-
G
 
-
C
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
-
E
 
D
A
 
P
S
 
R
T
 
R
W
 
Y
S
 
S
L
 
M
N
 
N
E
 
E
R
 
N
A
 
C
T
 
T
A
 
L
H
 
R
A
 
V
-
 
L
-
 
R
-
 
H
T
 
R
Y
 
Y
P
 
A
Q
 
Q
S
 
H
L
 
I
L
 
G
C
 
A
G
 
P
Y
 
L
D
 
D
T
 
S
V
 
V
D
 
T
Y
 
G
E
 
E
A
 
L
V
 
I
F
 
F
R
 
D
C
 
R
A
 
Y
Q
 
D
Q
 
A
G
 
G
D
 
D
A
 
P
L
 
V
A
 
C
T
 
Q
T
 
R
L
 
L
R
 
V
N
 
A
D
 
E
S
 
F
I
 
F
A
 
N
V
 
G
W
 
L
A
 
G
A
 
H
C
 
G
A
 
L
Y
 
Y
N
 
N
L
 
L
V
 
V
Q
 
H
A
 
I
Y
 
F
D
 
D
P
 
P
E
 
Q
V
 
T
L
 
I
I
 
F
L
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
V
 
V
M
 
V

5f7qE Rok repressor lmo0178 from listeria monocytogenes bound to operator (see paper)
29% identity, 78% coverage: 65:310/316 of query aligns to 142:384/396 of 5f7qE

query
sites
5f7qE
L
 
L
S
 
L
G
 
G
I
 
V
G
 
G
I
 
I
A
 
A
I
 
I
P
 
S
G
 
G
I
 
L
V
 
V
D
 
N
P
 
-
I
 
-
N
 
R
K
 
K
R
 
K
V
 
G
L
 
T
T
 
V
I
 
I
N
 
R
G
 
S
K
 
T
Y
 
M
S
 
L
D
 
G
A
 
W
P
 
E
N
 
N
L
 
V
D
 
A
L
 
L
P
 
E
A
 
A
W
 
M
A
 
L
H
 
H
E
 
A
T
 
H
W
 
F
-
 
P
G
 
D
L
 
I
P
 
P
L
 
V
Y
 
Y
L
 
V
E
 
D
N
 
K
D
 
N
T
 
I
R
 
N
A
 
C
A
 
Y
L
 
T
L
 
L
G
 
A
E
 
E
W
 
L
Q
 
W
H
 
L
G
 
G
S
 
E
G
 
G
R
 
K
G
 
Q
Y
 
S
D
 
N
N
 
N
V
 
F
V
 
A
L
 
T
M
 
V
T
 
S
L
 
V
G
 
G
T
 
A
G
 
G
I
 
L
G
 
G
T
 
L
S
 
S
A
 
V
V
 
V
I
 
I
E
 
N
G
 
R
R
 
Q
L
 
I
L
 
Y
R
 
Y
G
 
G
R
 
A
H
 
Q
F
 
G
Q
 
G
A
 
A
G
 
G
I
 
E
L
 
F
G
 
-
G
 
G
H
|
H
V
 
T
V
 
T
I
 
I
N
 
Q
T
 
P
Q
 
G
G
 
G
N
 
Y
Q
 
K
C
|
C
N
 
H
C
|
C
G
 
G
T
 
Q
V
 
K
G
 
G
C
|
C
A
 
L
E
 
E
A
 
M
E
 
Y
A
 
A
S
 
S
T
 
E
W
 
F
S
 
Y
L
 
F
N
 
R
E
 
N
R
 
R
A
 
G
T
 
E
A
 
E
-
 
L
H
 
K
A
 
E
T
 
A
Y
 
Y
P
 
P
Q
 
T
S
 
S
L
 
E
L
 
L
C
 
-
G
 
-
Y
 
-
D
 
N
T
 
D
V
 
F
D
 
H
Y
 
F
E
 
D
A
 
K
V
 
V
F
 
A
R
 
K
C
 
S
A
 
A
Q
 
R
Q
 
A
G
 
G
D
 
D
A
 
E
L
 
M
A
 
A
T
 
T
T
 
E
L
 
L
R
 
M
N
 
G
D
 
K
S
 
M
I
 
G
A
 
E
V
 
Y
W
 
L
A
 
G
A
 
Y
C
 
G
A
 
I
Y
 
R
N
 
N
L
 
I
V
 
I
Q
 
N
A
 
T
Y
 
F
D
 
N
P
 
P
E
 
E
V
 
K
L
 
V
I
 
I
L
 
I
G
 
V
G
 
G
G
 
E
V
 
G
M
 
L
A
 
H
S
 
H
R
 
R
D
 
D
A
 
L
I
 
F
I
 
L
P
 
T
P
 
K
I
 
I
Q
 
D
E
 
E
R
 
I
L
 
A
N
 
S
Q
 
Q
N
 
N
A
 
F
W
 
F
A
 
S
T
 
G
W
 
A
G
 
G
-
 
F
H
 
E
V
 
T
A
 
E
V
 
I
V
 
T
P
 
T
G
 
T
T
 
S
L
 
L
S
 
E
D
 
D
S
 
P
A
 
A
A
 
W
L
 
L
L
 
Q
G
 
G
V
 
A
A
 
A
T
 
L
L
 
L

Sites not aligning to the query:

5f7rA Rok repressor lmo0178 from listeria monocytogenes bound to inducer (see paper)
29% identity, 78% coverage: 65:310/316 of query aligns to 61:300/306 of 5f7rA

query
sites
5f7rA
L
 
L
S
 
L
G
 
G
I
 
V
G
 
G
I
 
I
A
 
A
I
 
I
P
 
S
G
|
G
I
 
L
V
 
V
D
 
N
P
 
-
I
 
-
N
 
R
K
 
K
R
 
K
V
 
G
L
 
T
T
 
V
I
 
I
N
 
R
G
 
S
K
 
T
Y
 
M
S
 
L
D
 
G
A
 
W
P
 
E
N
 
N
L
 
V
D
 
A
L
 
L
P
 
E
A
 
A
W
 
M
A
 
L
H
 
H
E
 
A
T
 
H
W
 
F
-
 
P
G
 
D
L
 
I
P
 
P
L
 
V
Y
 
Y
L
 
V
E
 
D
N
 
K
D
x
N
T
 
I
R
 
N
A
 
C
A
 
Y
L
 
T
L
 
L
G
 
A
E
 
E
W
 
L
Q
 
W
H
 
L
G
 
G
S
 
E
G
 
G
R
 
K
G
 
Q
Y
 
S
D
 
N
N
 
N
V
 
F
V
 
A
L
 
T
M
 
V
T
x
S
L
x
V
G
 
G
T
 
A
G
|
G
I
x
L
G
|
G
T
 
L
S
 
S
A
 
V
V
 
V
I
 
I
E
 
N
G
 
R
R
 
Q
L
 
I
L
 
Y
R
 
Y
G
 
G
R
 
A
H
 
Q
F
 
G
Q
 
G
A
 
A
G
 
G
I
x
E
L
 
F
G
 
-
G
 
G
H
|
H
V
 
T
V
 
T
I
 
I
N
 
Q
T
 
P
Q
 
G
G
 
G
N
 
Y
Q
 
K
C
|
C
N
 
H
C
|
C
G
 
G
T
 
Q
V
 
K
G
 
G
C
|
C
A
 
L
E
|
E
A
 
M
E
 
Y
A
 
A
S
 
S
T
 
E
W
 
F
S
 
Y
L
 
F
N
 
R
E
 
N
R
 
R
A
 
G
T
 
E
A
 
E
-
 
L
H
 
K
A
 
E
T
 
A
Y
 
Y
P
 
P
Q
 
-
S
 
-
L
 
-
L
 
-
C
 
-
G
 
-
Y
 
L
D
 
N
T
 
D
V
 
F
D
 
H
Y
 
F
E
 
D
A
 
K
V
 
V
F
 
A
R
 
K
C
 
S
A
 
A
Q
 
R
Q
 
A
G
 
G
D
 
D
A
 
E
L
 
M
A
 
A
T
 
T
T
 
E
L
 
L
R
 
M
N
 
G
D
 
K
S
 
M
I
 
G
A
 
E
V
 
Y
W
 
L
A
 
G
A
 
Y
C
 
G
A
 
I
Y
 
R
N
 
N
L
 
I
V
 
I
Q
 
N
A
 
T
Y
 
F
D
 
N
P
 
P
E
 
E
V
 
K
L
 
V
I
 
I
L
 
I
G
 
V
G
 
G
G
x
E
V
 
G
M
 
L
A
 
H
S
 
H
R
 
R
D
 
D
A
 
L
I
 
F
I
 
L
P
 
T
P
 
K
I
 
I
Q
 
D
E
 
E
R
 
I
L
 
A
N
 
S
Q
 
Q
N
 
N
A
 
F
W
 
F
A
 
S
T
 
G
W
 
A
G
 
G
-
 
F
H
 
E
V
 
T
A
 
E
V
 
I
V
 
T
P
 
T
G
 
T
T
 
S
L
 
L
S
 
E
D
 
D
S
 
P
A
 
A
A
x
W
L
 
L
L
 
Q
G
 
G
V
 
A
A
 
A
T
 
L
L
 
L

Sites not aligning to the query:

1z6rA Crystal structure of mlc from escherichia coli (see paper)
24% identity, 93% coverage: 15:308/316 of query aligns to 67:364/382 of 1z6rA

query
sites
1z6rA
R
 
R
I
 
I
K
 
S
L
 
R
G
 
G
L
 
E
V
 
I
R
 
F
A
 
L
G
 
A
T
 
L
V
 
R
L
 
D
L
 
L
T
 
S
S
 
S
Q
 
K
M
 
L
E
 
V
S
 
V
Q
 
E
S
 
E
G
 
S
Q
 
Q
-
 
E
-
 
L
G
 
A
L
 
L
Q
 
K
A
 
D
R
 
D
L
 
L
P
 
P
Q
 
L
L
 
L
E
 
D
-
 
R
-
 
I
-
 
I
T
 
S
A
 
H
I
 
I
N
 
D
A
 
Q
M
 
F
L
 
F
A
 
I
Q
 
R
A
 
H
R
 
Q
L
 
K
T
 
K
A
 
L
A
 
E
D
 
R
L
 
L
S
 
T
G
 
S
I
 
I
G
 
A
I
 
I
A
 
T
I
 
L
P
 
P
G
 
G
I
 
I
V
 
I
D
 
D
P
 
T
I
 
E
N
 
N
K
 
G
R
 
I
V
 
V
L
 
H
T
 
R
I
 
M
N
 
P
G
 
F
K
 
-
Y
 
Y
S
 
E
D
 
D
A
 
V
P
 
K
N
 
E
L
 
M
D
 
P
L
 
L
P
 
G
A
 
E
W
 
A
A
 
L
H
 
E
E
 
Q
T
 
H
W
 
T
G
 
G
L
 
V
P
 
P
L
 
V
Y
 
Y
L
 
I
E
 
Q
N
 
H
D
 
D
T
 
I
R
 
S
A
 
A
A
 
W
L
 
T
L
 
M
G
 
A
E
 
E
W
 
A
Q
 
L
H
 
F
G
 
G
S
 
A
G
 
S
R
 
R
G
 
G
Y
 
A
D
 
R
N
 
D
V
 
V
V
 
I
L
 
Q
M
 
V
T
 
V
L
 
I
G
 
D
T
 
H
G
 
N
I
 
V
G
 
G
T
 
A
S
 
G
A
 
V
V
 
I
I
 
T
E
 
D
G
 
G
R
 
H
L
 
L
L
 
L
R
 
H
G
 
A
R
 
G
H
 
S
F
 
-
Q
 
S
A
 
S
G
 
L
I
 
V
L
 
E
G
 
I
G
 
G
H
|
H
V
 
T
V
 
Q
I
 
V
N
 
D
T
 
P
Q
 
Y
G
 
G
N
 
K
Q
 
R
C
|
C
N
 
Y
C
|
C
G
 
G
T
 
N
V
 
H
G
 
G
C
|
C
A
 
L
E
 
E
A
 
T
E
 
I
A
 
A
S
 
S
T
 
V
W
 
D
S
 
S
L
 
I
N
 
L
E
 
E
R
 
L
A
 
A
T
 
Q
A
 
L
H
 
R
A
 
L
T
 
N
Y
 
Q
P
 
S
Q
 
M
S
 
S
L
 
S
L
 
M
C
 
L
G
 
H
Y
 
G
D
 
Q
T
 
P
V
 
L
D
 
T
Y
 
V
E
 
D
A
 
S
V
 
L
F
 
C
R
 
Q
C
 
A
A
 
A
Q
 
L
Q
 
R
G
 
G
D
 
D
A
 
L
L
 
L
A
 
A
T
 
K
T
 
D
L
 
I
R
 
I
N
 
T
D
 
G
S
 
V
I
 
G
A
 
A
V
 
H
W
 
V
A
 
G
A
 
R
C
 
I
A
 
L
Y
 
A
N
 
I
L
 
M
V
 
V
Q
 
N
A
 
L
Y
 
F
D
 
N
P
 
P
E
 
Q
V
 
K
L
 
I
I
 
L
L
 
I
G
 
G
G
 
S
G
 
P
V
 
L
M
 
S
A
 
K
S
 
A
R
 
A
D
 
D
A
 
I
I
 
L
I
 
F
P
 
P
P
 
V
I
 
I
Q
 
S
E
 
D
R
 
S
L
 
I
N
 
R
Q
 
Q
N
 
Q
A
 
A
W
 
L
A
 
P
T
 
A
W
 
Y
G
 
S
-
 
Q
H
 
H
V
 
I
A
 
S
V
 
V
V
 
E
P
 
S
G
 
T
T
 
Q
L
 
F
S
 
S
D
 
N
S
 
Q
A
 
G
A
 
T
L
 
M
L
 
A
G
 
G
V
 
A
A
 
A

P50456 DNA-binding transcriptional repressor Mlc; Making large colonies protein; Membrane linked control from Escherichia coli (strain K12) (see 4 papers)
24% identity, 93% coverage: 15:308/316 of query aligns to 91:388/406 of P50456

query
sites
P50456
R
 
R
I
 
I
K
 
S
L
 
R
G
 
G
L
 
E
V
 
I
R
 
F
A
 
L
G
 
A
T
 
L
V
 
R
L
 
D
L
 
L
T
 
S
S
 
S
Q
 
K
M
 
L
E
 
V
S
 
V
Q
 
E
S
 
E
G
 
S
Q
 
Q
-
 
E
-
 
L
G
 
A
L
 
L
Q
 
K
A
 
D
R
 
D
L
 
L
P
 
P
Q
 
L
L
 
L
E
 
D
-
 
R
-
 
I
-
 
I
T
 
S
A
 
H
I
 
I
N
 
D
A
 
Q
M
 
F
L
x
F
A
 
I
Q
 
R
A
 
H
R
 
Q
L
 
K
T
 
K
A
 
L
A
 
E
D
 
R
L
 
L
S
 
T
G
 
S
I
 
I
G
 
A
I
 
I
A
 
T
I
 
L
P
 
P
G
 
G
I
 
I
V
 
I
D
 
D
P
 
T
I
 
E
N
 
N
K
 
G
R
 
I
V
 
V
L
 
H
T
 
R
I
 
M
N
 
P
G
 
F
K
 
-
Y
 
Y
S
 
E
D
 
D
A
 
V
P
 
K
N
 
E
L
 
M
D
 
P
L
 
L
P
 
G
A
 
E
W
 
A
A
 
L
H
 
E
E
 
Q
T
 
H
W
 
T
G
 
G
L
 
V
P
 
P
L
 
V
Y
 
Y
L
 
I
E
 
Q
N
 
H
D
 
D
T
 
I
R
 
S
A
 
A
A
 
W
L
 
T
L
 
M
G
 
A
E
 
E
W
 
A
Q
 
L
H
 
F
G
 
G
S
 
A
G
 
S
R
 
R
G
 
G
Y
 
A
D
 
R
N
 
D
V
 
V
V
 
I
L
 
Q
M
 
V
T
 
V
L
 
I
G
 
D
T
 
H
G
 
N
I
 
V
G
 
G
T
 
A
S
 
G
A
 
V
V
 
I
I
 
T
E
 
D
G
 
G
R
 
H
L
 
L
L
 
L
R
 
H
G
 
A
R
 
G
H
 
S
F
 
-
Q
 
S
A
 
S
G
 
L
I
 
V
L
 
E
G
 
I
G
 
G
H
|
H
V
 
T
V
 
Q
I
 
V
N
 
D
T
 
P
Q
 
Y
G
 
G
N
 
K
Q
 
R
C
|
C
N
 
Y
C
|
C
G
 
G
T
 
N
V
 
H
G
 
G
C
|
C
A
 
L
E
 
E
A
 
T
E
 
I
A
 
A
S
 
S
T
 
V
W
 
D
S
 
S
L
 
I
N
 
L
E
 
E
R
 
L
A
 
A
T
 
Q
A
 
L
H
 
R
A
 
L
T
 
N
Y
 
Q
P
 
S
Q
 
M
S
 
S
L
 
S
L
 
M
C
 
L
G
 
H
Y
 
G
D
 
Q
T
 
P
V
 
L
D
 
T
Y
 
V
E
 
D
A
 
S
V
 
L
F
 
C
R
 
Q
C
 
A
A
 
A
Q
 
L
Q
x
R
G
 
G
D
 
D
A
 
L
L
|
L
A
 
A
T
 
K
T
 
D
L
 
I
R
 
I
N
 
T
D
 
G
S
 
V
I
 
G
A
 
A
V
 
H
W
 
V
A
 
G
A
 
R
C
 
I
A
 
L
Y
 
A
N
 
I
L
 
M
V
 
V
Q
 
N
A
 
L
Y
 
F
D
 
N
P
 
P
E
 
Q
V
 
K
L
 
I
I
 
L
L
 
I
G
 
G
G
 
S
G
 
P
V
 
L
M
 
S
A
 
K
S
 
A
R
 
A
D
 
D
A
 
I
I
 
L
I
 
F
P
 
P
P
 
V
I
 
I
Q
 
S
E
 
D
R
 
S
L
 
I
N
 
R
Q
 
Q
N
 
Q
A
 
A
W
 
L
A
 
P
T
 
A
W
 
Y
G
 
S
-
 
Q
H
 
H
V
 
I
A
 
S
V
 
V
V
 
E
P
 
S
G
 
T
T
 
Q
L
 
F
S
 
S
D
 
N
S
 
Q
A
 
G
A
 
T
L
 
M
L
 
A
G
 
G
V
 
A
A
 
A

Sites not aligning to the query:

2yi1A Crystal structure of n-acetylmannosamine kinase in complex with n- acetyl mannosamine 6-phosphate and adp. (see paper)
28% identity, 89% coverage: 5:284/316 of query aligns to 4:278/308 of 2yi1A

query
sites
2yi1A
A
 
S
T
 
A
I
 
L
A
 
A
I
 
V
D
 
D
L
 
L
G
|
G
G
|
G
T
|
T
R
x
N
I
 
L
K
x
R
L
 
V
G
 
A
L
 
I
V
 
V
-
 
S
-
 
M
R
 
K
A
 
G
G
 
E
T
 
I
V
 
V
L
 
K
L
 
K
T
 
Y
S
 
T
Q
 
Q
M
 
F
E
 
N
S
 
P
Q
 
K
S
 
T
G
 
Y
Q
 
E
G
 
E
L
 
R
Q
 
I
A
 
N
R
 
L
L
 
I
P
 
L
Q
 
Q
L
 
M
-
 
C
-
 
V
E
 
E
T
 
A
A
 
A
I
 
A
N
 
E
A
 
A
M
 
V
L
 
K
A
 
L
Q
 
N
A
 
C
R
 
R
L
 
I
T
 
L
A
 
-
A
 
-
D
 
-
L
 
-
S
 
-
G
 
G
I
 
V
G
 
G
I
 
I
A
 
S
I
 
T
P
x
G
G
|
G
I
x
R
V
 
V
D
 
N
P
 
P
I
 
R
N
 
E
K
 
G
R
 
I
V
 
V
L
 
L
T
 
H
I
x
S
N
x
T
G
 
K
K
x
L
Y
 
I
S
 
Q
D
 
E
A
 
W
P
 
N
N
 
S
L
 
V
D
 
D
L
 
L
P
 
R
A
 
T
W
 
P
A
 
L
H
 
S
E
 
D
T
 
T
W
 
L
G
 
H
L
 
L
P
 
P
L
 
V
Y
 
W
L
 
V
E
 
D
N
|
N
D
|
D
T
 
G
R
x
N
A
 
C
A
 
A
L
 
A
L
 
L
G
 
A
E
 
E
W
 
R
Q
 
K
H
 
F
G
 
G
S
 
Q
G
 
G
R
 
K
G
 
G
Y
 
L
D
 
E
N
 
N
V
 
F
V
 
V
L
 
T
M
 
L
T
 
I
L
 
T
G
|
G
T
|
T
G
|
G
I
|
I
G
 
G
T
x
G
S
 
G
A
 
I
V
 
I
I
 
H
E
 
Q
G
 
H
R
 
E
L
 
L
L
 
I
R
 
H
G
 
G
R
 
S
H
 
S
F
 
F
Q
 
C
A
 
A
G
x
A
I
x
E
L
 
L
G
 
-
G
 
G
H
|
H
V
 
L
V
 
V
I
 
V
N
 
S
T
 
L
Q
 
D
G
 
G
N
 
P
Q
 
D
C
|
C
N
 
S
C
|
C
G
 
G
T
 
S
V
 
H
G
 
G
C
|
C
A
 
I
E
|
E
A
 
A
E
 
Y
A
 
A
S
 
S
T
x
G
W
 
M
S
 
A
L
 
L
N
 
Q
E
 
R
R
 
E
A
 
A
T
 
K
A
 
K
H
 
L
A
 
H
T
 
D
Y
 
E
P
 
D
Q
 
L
S
 
L
L
 
L
L
 
V
C
 
E
G
 
G
Y
 
M
D
 
S
T
 
A
V
 
V
D
 
G
Y
 
A
E
x
L
A
 
H
V
 
L
F
 
I
R
 
Q
C
 
A
A
 
A
Q
 
K
Q
 
L
G
 
G
D
 
N
A
 
A
L
 
K
A
 
A
T
 
Q
T
 
S
L
 
I
R
 
L
N
 
R
D
 
T
S
 
A
I
 
G
A
 
T
V
 
A
W
 
L
A
 
G
A
 
L
C
 
G
A
 
V
Y
 
V
N
 
N
L
 
I
V
 
L
Q
 
H
A
 
T
Y
 
M
D
 
N
P
 
P
E
 
S
V
 
L
L
 
V
I
 
I
L
 
L
G
 
-
G
 
S
G
 
G
V
|
V
M
 
L
A
 
A
S
 
S
R
 
H
D
 
-
A
 
-
I
 
Y
I
 
I
P
 
H
P
 
I
I
 
V
Q
 
K
E
 
D
R
 
V
L
 
I
N
 
R
Q
 
Q
N
 
Q
A
 
A

2yhyA Structure of n-acetylmannosamine kinase in complex with n- acetylmannosamine and adp (see paper)
28% identity, 89% coverage: 5:284/316 of query aligns to 4:278/308 of 2yhyA

query
sites
2yhyA
A
 
S
T
 
A
I
 
L
A
 
A
I
 
V
D
 
D
L
 
L
G
|
G
G
|
G
T
|
T
R
x
N
I
 
L
K
x
R
L
 
V
G
 
A
L
 
I
V
 
V
-
 
S
-
 
M
R
 
K
A
 
G
G
 
E
T
 
I
V
 
V
L
 
K
L
 
K
T
 
Y
S
 
T
Q
 
Q
M
 
F
E
 
N
S
 
P
Q
 
K
S
 
T
G
 
Y
Q
 
E
G
 
E
L
 
R
Q
 
I
A
 
N
R
 
L
L
 
I
P
 
L
Q
 
Q
L
 
M
-
 
C
-
 
V
E
 
E
T
 
A
A
 
A
I
 
A
N
 
E
A
 
A
M
 
V
L
 
K
A
 
L
Q
 
N
A
 
C
R
 
R
L
 
I
T
 
L
A
 
-
A
 
-
D
 
-
L
 
-
S
 
-
G
 
G
I
 
V
G
 
G
I
 
I
A
 
S
I
 
T
P
 
G
G
 
G
I
 
R
V
 
V
D
 
N
P
 
P
I
 
R
N
 
E
K
 
G
R
 
I
V
 
V
L
 
L
T
 
H
I
 
S
N
 
T
G
 
K
K
 
L
Y
 
I
S
 
Q
D
 
E
A
 
W
P
 
N
N
 
S
L
 
V
D
 
D
L
 
L
P
 
R
A
 
T
W
 
P
A
 
L
H
 
S
E
 
D
T
 
T
W
 
L
G
 
H
L
 
L
P
 
P
L
 
V
Y
 
W
L
 
V
E
 
D
N
|
N
D
 
D
T
 
G
R
x
N
A
 
C
A
 
A
L
 
A
L
 
L
G
 
A
E
 
E
W
 
R
Q
 
K
H
 
F
G
 
G
S
 
Q
G
 
G
R
 
K
G
 
G
Y
 
L
D
 
E
N
 
N
V
 
F
V
 
V
L
 
T
M
 
L
T
 
I
L
 
T
G
 
G
T
|
T
G
 
G
I
 
I
G
 
G
T
x
G
S
 
G
A
 
I
V
 
I
I
 
H
E
 
Q
G
 
H
R
 
E
L
 
L
L
 
I
R
 
H
G
 
G
R
 
S
H
 
S
F
 
F
Q
 
C
A
 
A
G
x
A
I
 
E
L
 
L
G
 
-
G
 
G
H
|
H
V
 
L
V
 
V
I
 
V
N
 
S
T
 
L
Q
 
D
G
 
G
N
 
P
Q
 
D
C
|
C
N
 
S
C
|
C
G
 
G
T
 
S
V
 
H
G
 
G
C
|
C
A
 
I
E
 
E
A
 
A
E
 
Y
A
 
A
S
 
S
T
x
G
W
 
M
S
 
A
L
 
L
N
 
Q
E
 
R
R
 
E
A
 
A
T
 
K
A
 
K
H
 
L
A
 
H
T
 
D
Y
 
E
P
 
D
Q
 
L
S
 
L
L
 
L
L
 
V
C
 
E
G
 
G
Y
 
M
D
 
S
T
 
A
V
 
V
D
 
G
Y
 
A
E
x
L
A
 
H
V
 
L
F
 
I
R
 
Q
C
 
A
A
 
A
Q
 
K
Q
 
L
G
 
G
D
 
N
A
 
A
L
 
K
A
 
A
T
 
Q
T
 
S
L
 
I
R
 
L
N
 
R
D
 
T
S
 
A
I
 
G
A
 
T
V
 
A
W
 
L
A
 
G
A
 
L
C
 
G
A
 
V
Y
 
V
N
 
N
L
 
I
V
 
L
Q
 
H
A
 
T
Y
 
M
D
 
N
P
 
P
E
 
S
V
 
L
L
 
V
I
 
I
L
 
L
G
 
-
G
 
S
G
 
G
V
|
V
M
 
L
A
 
A
S
 
S
R
 
H
D
 
-
A
 
-
I
 
Y
I
 
I
P
 
H
P
 
I
I
 
V
Q
 
K
E
 
D
R
 
V
L
 
I
N
 
R
Q
 
Q
N
 
Q
A
 
A

Q9Y223 Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase; UDP-GlcNAc-2-epimerase/ManAc kinase; EC 3.2.1.183; EC 2.7.1.60 from Homo sapiens (Human) (see 18 papers)
29% identity, 85% coverage: 1:268/316 of query aligns to 404:673/722 of Q9Y223

query
sites
Q9Y223
M
 
L
E
 
E
E
 
T
K
 
L
A
 
S
T
 
A
I
 
L
A
 
A
I
 
V
D
|
D
L
 
L
G
 
G
G
|
G
T
|
T
R
x
N
I
 
L
K
x
R
L
 
V
G
 
A
L
 
I
V
 
V
-
 
S
-
 
M
R
 
K
A
 
G
G
 
E
T
 
I
V
 
V
L
 
K
L
 
K
T
 
Y
S
 
T
Q
 
Q
M
 
F
E
 
N
S
 
P
Q
 
K
S
 
T
G
 
Y
Q
 
E
G
 
E
L
 
R
Q
 
I
A
 
N
R
 
L
L
 
I
P
 
L
Q
 
Q
L
 
M
-
 
C
-
 
V
E
 
E
T
 
A
A
 
A
I
 
A
N
 
E
A
 
A
M
 
V
L
 
K
A
 
L
Q
 
N
A
 
C
R
 
R
L
 
I
T
 
L
A
 
-
A
 
-
D
 
-
L
 
-
S
 
-
G
 
G
I
 
V
G
 
G
I
|
I
A
 
S
I
 
T
P
 
G
G
|
G
I
x
R
V
 
V
D
 
N
P
 
P
I
 
R
N
 
E
K
 
G
R
 
I
V
 
V
L
 
L
T
 
H
I
 
S
N
x
T
G
 
K
K
 
L
Y
 
I
S
 
Q
D
 
E
A
 
W
P
 
N
N
 
S
L
 
V
D
 
D
L
 
L
P
 
R
A
 
T
W
 
P
A
 
L
H
 
S
E
 
D
T
 
T
W
 
L
G
 
H
L
 
L
P
 
P
L
 
V
Y
 
W
L
 
V
E
 
D
N
|
N
D
|
D
T
 
G
R
x
N
A
 
C
A
 
A
L
 
A
L
 
L
G
x
A
E
 
E
W
 
R
Q
 
K
H
x
F
G
 
G
S
 
Q
G
 
G
R
 
K
G
 
G
Y
 
L
D
 
E
N
 
N
V
 
F
V
 
V
L
 
T
M
 
L
T
 
I
L
 
T
G
 
G
T
 
T
G
|
G
I
 
I
G
 
G
T
 
G
S
 
G
A
 
I
V
 
I
I
 
H
E
 
Q
G
 
H
R
 
E
L
 
L
L
 
I
R
 
H
G
 
G
R
 
S
H
 
S
F
 
F
Q
 
C
A
 
A
G
 
A
I
x
E
L
 
L
G
 
-
G
 
G
H
|
H
V
 
L
V
 
V
I
x
V
N
 
S
T
 
L
Q
 
D
G
|
G
N
 
P
Q
 
D
C
|
C
N
 
S
C
|
C
G
 
G
T
 
S
V
 
H
G
 
G
C
|
C
A
x
I
E
|
E
A
 
A
E
 
Y
A
 
A
S
 
S
T
 
G
W
 
M
S
 
A
L
 
L
N
 
Q
E
 
R
R
 
E
A
 
A
T
 
K
A
 
K
H
 
L
A
 
H
T
 
D
Y
 
E
P
 
D
Q
 
L
S
 
L
L
 
L
L
 
V
C
 
E
G
 
G
Y
 
M
D
 
S
T
 
V
V
 
P
D
 
K
Y
 
D
E
 
E
A
 
A
V
 
V
-
 
G
-
 
A
-
 
L
-
 
H
-
 
L
F
 
I
R
 
Q
C
x
A
A
|
A
Q
 
K
Q
 
L
G
 
G
D
 
N
A
 
A
L
 
K
A
 
A
T
 
Q
T
 
S
L
 
I
R
 
L
N
 
R
D
 
T
S
 
A
I
 
G
A
 
T
V
 
A
W
 
L
A
 
G
A
 
L
C
 
G
A
 
V
Y
 
V
N
 
N
L
 
I
V
 
L
Q
 
H
A
 
T
Y
 
M
D
 
N
P
 
P
E
 
S
V
 
L
L
 
V
I
 
I
L
 
L
G
 
-
G
 
S
G
 
G
V
 
V
M
 
L
A
 
A
S
 
S

Sites not aligning to the query:

O35826 Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase; UDP-GlcNAc-2-epimerase/ManAc kinase; EC 3.2.1.183; EC 2.7.1.60 from Rattus norvegicus (Rat) (see paper)
28% identity, 85% coverage: 1:268/316 of query aligns to 404:673/722 of O35826

query
sites
O35826
M
 
L
E
 
E
E
x
T
K
x
L
A
x
S
T
x
A
I
x
L
A
|
A
I
x
V
D
|
D
L
|
L
G
|
G
G
|
G
T
|
T
R
x
N
I
x
L
K
x
R
L
x
V
G
x
A
L
x
I
V
|
V
-
x
S
-
x
M
R
x
K
A
x
G
G
x
E
T
x
I
V
|
V
L
x
K
L
x
K
T
x
Y
S
x
T
Q
|
Q
M
x
F
E
x
N
S
x
P
Q
x
K
S
x
T
G
x
Y
Q
x
E
G
x
E
L
x
R
Q
x
I
A
x
S
R
x
L
L
x
I
P
x
L
Q
|
Q
L
x
M
-
x
C
-
x
V
E
|
E
T
x
A
A
|
A
I
x
A
N
x
E
A
|
A
M
x
V
L
x
K
A
x
L
Q
x
N
A
x
C
R
|
R
L
x
I
T
x
L
A
 
-
A
 
-
D
 
-
L
 
-
S
 
-
G
|
G
I
x
V
G
|
G
I
|
I
A
x
S
I
x
T
P
x
G
G
|
G
I
x
R
V
|
V
D
x
N
P
|
P
I
x
Q
N
x
E
K
x
G
R
x
V
V
|
V
L
|
L
T
x
H
I
x
S
N
x
T
G
x
K
K
x
L
Y
x
I
S
x
Q
D
x
E
A
x
W
P
x
N
N
x
S
L
x
V
D
|
D
L
|
L
P
x
R
A
x
T
W
x
P
A
x
L
H
x
S
E
x
D
T
|
T
W
x
L
G
x
H
L
|
L
P
|
P
L
x
V
Y
x
W
L
x
V
E
x
D
N
|
N
D
|
D
T
x
G
R
x
N
A
x
C
A
|
A
L
x
A
L
x
M
G
x
A
E
|
E
W
x
R
Q
x
K
H
x
F
G
|
G
S
x
Q
G
|
G
R
x
K
G
|
G
Y
x
Q
D
x
E
N
|
N
V
x
F
V
|
V
L
x
T
M
x
L
T
x
I
L
x
T
G
|
G
T
|
T
G
|
G
I
|
I
G
|
G
T
x
G
S
x
G
A
x
I
V
x
I
I
x
H
E
x
Q
G
x
H
R
x
E
L
|
L
L
x
I
R
x
H
G
|
G
R
x
S
H
x
S
F
|
F
Q
x
C
A
|
A
G
x
A
I
x
E
L
|
L
G
 
-
G
|
G
H
|
H
V
x
L
V
|
V
I
x
V
N
x
S
T
x
L
Q
x
D
G
|
G
N
x
P
Q
x
D
C
|
C
N
x
S
C
|
C
G
|
G
T
x
S
V
x
H
G
|
G
C
|
C
A
x
I
E
|
E
A
|
A
E
x
Y
A
|
A
S
|
S
T
x
G
W
x
M
S
x
A
L
|
L
N
x
Q
E
x
R
R
x
E
A
|
A
T
x
K
A
x
K
H
x
L
A
x
H
T
x
D
Y
x
E
P
x
D
Q
x
L
S
x
L
L
|
L
L
x
V
C
x
E
G
|
G
Y
x
M
D
x
S
T
x
V
V
x
P
D
x
K
Y
x
D
E
|
E
A
|
A
V
|
V
-
x
G
-
x
A
-
x
L
-
x
H
-
x
L
F
x
I
R
x
Q
C
x
A
A
|
A
Q
x
K
Q
x
L
G
|
G
D
x
N
A
x
V
L
x
K
A
|
A
T
x
Q
T
x
S
L
x
I
R
x
L
N
x
R
D
x
T
S
x
A
I
x
G
A
x
T
V
x
A
W
x
L
A
x
G
A
x
L
C
x
G
A
x
V
Y
x
V
N
|
N
L
x
I
V
x
L
Q
x
H
A
x
T
Y
x
M
D
x
N
P
|
P
E
x
S
V
x
L
L
x
V
I
|
I
L
|
L
G
 
-
G
x
S
G
|
G
V
|
V
M
x
L
A
|
A
S
|
S

Sites not aligning to the query:

2yhwA High-resolution crystal structures of n-acetylmannosamine kinase: insights about substrate specificity, activity and inhibitor modelling. (see paper)
28% identity, 89% coverage: 5:284/316 of query aligns to 4:279/309 of 2yhwA

query
sites
2yhwA
A
 
S
T
 
A
I
 
L
A
 
A
I
 
V
D
 
D
L
 
L
G
 
G
G
 
G
T
 
T
R
 
N
I
 
L
K
 
R
L
 
V
G
 
A
L
 
I
V
 
V
-
 
S
-
 
M
R
 
K
A
 
G
G
 
E
T
 
I
V
 
V
L
 
K
L
 
K
T
 
Y
S
 
T
Q
 
Q
M
 
F
E
 
N
S
 
P
Q
 
K
S
 
T
G
 
Y
Q
 
E
G
 
E
L
 
R
Q
 
I
A
 
N
R
 
L
L
 
I
P
 
L
Q
 
Q
L
 
M
-
 
C
-
 
V
E
 
E
T
 
A
A
 
A
I
 
A
N
 
E
A
 
A
M
 
V
L
 
K
A
 
L
Q
 
N
A
 
C
R
 
R
L
 
I
T
 
L
A
 
-
A
 
-
D
 
-
L
 
-
S
 
-
G
 
G
I
 
V
G
 
G
I
 
I
A
 
S
I
 
T
P
 
G
G
 
G
I
 
R
V
 
V
D
 
N
P
 
P
I
 
R
N
 
E
K
 
G
R
 
I
V
 
V
L
 
L
T
 
H
I
 
S
N
 
T
G
 
K
K
 
L
Y
 
I
S
 
Q
D
 
E
A
 
W
P
 
N
N
 
S
L
 
V
D
 
D
L
 
L
P
 
R
A
 
T
W
 
P
A
 
L
H
 
S
E
 
D
T
 
T
W
 
L
G
 
H
L
 
L
P
 
P
L
 
V
Y
 
W
L
 
V
E
 
D
N
|
N
D
 
D
T
 
G
R
x
N
A
 
C
A
 
A
L
 
A
L
 
L
G
 
A
E
 
E
W
 
R
Q
 
K
H
 
F
G
 
G
S
 
Q
G
 
G
R
 
K
G
 
G
Y
 
L
D
 
E
N
 
N
V
 
F
V
 
V
L
 
T
M
 
L
T
 
I
L
 
T
G
 
G
T
 
T
G
 
G
I
 
I
G
 
G
T
x
G
S
 
G
A
 
I
V
 
I
I
 
H
E
 
Q
G
 
H
R
 
E
L
 
L
L
 
I
R
 
H
G
 
G
R
 
S
H
 
S
F
 
F
Q
 
C
A
 
A
G
x
A
I
 
E
L
 
L
G
 
-
G
 
G
H
|
H
V
 
L
V
 
V
I
 
V
N
 
S
T
 
L
Q
 
N
G
 
G
N
 
P
Q
 
D
C
|
C
N
 
S
C
|
C
G
 
G
T
 
S
V
 
H
G
 
G
C
|
C
A
 
I
E
 
E
A
 
A
E
 
Y
A
 
A
S
 
S
T
 
G
W
 
M
S
 
A
L
 
L
N
 
Q
E
 
R
R
 
E
A
 
A
T
 
K
A
 
K
H
 
L
A
 
H
T
 
D
Y
 
E
P
 
D
Q
 
L
S
 
L
L
 
L
L
 
V
C
 
E
G
 
G
Y
 
M
D
 
S
T
 
V
-
 
A
V
 
V
D
 
G
Y
 
A
E
 
L
A
 
H
V
 
L
F
 
I
R
 
Q
C
 
A
A
 
A
Q
 
K
Q
 
L
G
 
G
D
 
N
A
 
A
L
 
K
A
 
A
T
 
Q
T
 
S
L
 
I
R
 
L
N
 
R
D
 
T
S
 
A
I
 
G
A
 
T
V
 
A
W
 
L
A
 
G
A
 
L
C
 
G
A
 
V
Y
 
V
N
 
N
L
 
I
V
 
L
Q
 
H
A
 
T
Y
 
M
D
 
N
P
 
P
E
 
S
V
 
L
L
 
V
I
 
I
L
 
L
G
 
-
G
 
S
G
 
G
V
 
V
M
 
L
A
 
A
S
 
S
R
 
H
D
 
-
A
 
-
I
 
Y
I
 
I
P
 
H
P
 
I
I
 
V
Q
 
K
E
 
D
R
 
V
L
 
I
N
 
R
Q
 
Q
N
 
Q
A
 
A

6jdoA Crystal structure of n-acetyl mannosmaine kinase with amp-pnp from pasteurella multocida
25% identity, 96% coverage: 7:308/316 of query aligns to 4:283/293 of 6jdoA

query
sites
6jdoA
I
 
L
A
 
A
I
 
L
D
 
D
L
 
I
G
 
G
G
 
G
T
 
T
R
 
K
I
 
I
K
 
A
L
 
S
G
 
A
L
 
I
V
 
V
R
 
T
A
 
D
G
 
G
T
 
K
V
 
I
L
 
E
L
 
Q
T
 
R
S
 
Q
Q
 
Q
M
 
I
E
 
A
S
 
T
Q
 
P
S
 
Q
G
 
A
Q
 
D
G
 
A
L
 
A
Q
 
N
A
 
A
R
 
M
L
 
H
P
 
D
Q
 
T
L
 
L
E
 
A
T
 
N
A
 
I
I
 
L
N
 
A
A
 
L
M
 
Y
L
 
A
A
 
G
Q
 
Q
A
 
F
R
 
D
L
 
Y
T
 
V
A
 
A
A
 
-
D
 
-
L
 
V
S
 
A
G
 
S
I
 
T
G
 
G
I
 
I
A
 
I
I
 
N
P
 
H
G
 
G
I
 
V
V
 
L
D
 
T
P
 
A
I
 
L
N
&nb