SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_015448445.1 NCBI__GCF_000230695.2:WP_015448445.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 6 hits to proteins with known functional sites (download)

P0A6K6 Phosphopentomutase; Phosphodeoxyribomutase; Phosphoribomutase; EC 5.4.2.7 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
52% identity, 99% coverage: 1:399/402 of query aligns to 1:407/407 of P0A6K6

query
sites
P0A6K6
M
 
M
T
 
K
R
 
R
A
 
A
I
 
F
W
 
I
L
 
M
V
 
V
C
 
L
D
 
D
S
 
S
L
 
F
G
 
G
L
 
I
G
 
G
A
 
A
A
 
T
P
 
E
D
 
D
A
 
A
A
 
E
A
 
R
Y
 
F
G
 
G
D
 
D
L
 
V
G
 
G
A
 
A
D
 
D
T
 
T
F
 
L
G
 
G
H
 
H
I
 
I
A
 
A
A
 
E
A
 
A
C
 
C
V
 
A
A
 
K
A
 
G
A
 
E
-
 
A
-
 
D
-
 
N
-
 
G
-
 
R
R
 
K
G
 
G
P
 
P
L
 
L
R
 
N
L
 
L
P
 
P
Q
 
N
F
 
L
S
 
T
R
 
R
L
 
L
G
 
G
L
 
L
P
 
A
Q
 
K
A
 
A
H
 
H
A
 
E
A
 
G
I
 
S
H
 
T
G
 
G
Q
 
F
A
 
I
A
 
P
P
 
A
G
 
G
F
 
M
V
 
D
G
 
G
L
 
N
P
 
A
A
 
E
P
 
V
E
 
I
G
 
G
L
 
A
W
 
Y
G
 
A
H
 
W
A
 
A
V
 
H
E
 
E
R
 
M
A
 
S
R
 
S
G
 
G
K
 
K
D
 
D
T
 
T
P
 
P
S
 
S
G
 
G
H
 
H
W
 
W
E
 
E
T
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
V
V
 
P
L
 
V
T
 
L
Q
 
F
P
 
E
F
 
W
G
 
G
V
 
Y
F
 
F
G
 
S
Q
 
D
A
 
H
E
 
E
H
 
N
S
 
S
F
 
F
P
 
P
P
 
Q
A
 
E
L
 
L
L
 
L
Q
 
D
A
 
K
L
 
L
V
 
V
T
 
E
Q
 
R
G
 
A
D
 
N
V
 
L
P
 
P
G
 
G
V
 
Y
L
 
L
G
 
G
N
 
N
C
 
C
H
 
H
A
 
S
S
 
S
G
 
G
T
 
T
E
 
V
I
 
I
I
 
L
Q
 
D
R
 
Q
L
 
L
G
 
G
A
 
E
E
 
E
H
 
H
L
 
M
R
 
K
N
 
T
G
 
G
C
 
K
P
 
P
I
 
I
V
 
F
Y
 
Y
T
 
T
S
 
S
A
 
A
D
 
D
S
 
S
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
A
 
C
H
 
H
E
 
E
Q
 
E
A
 
T
F
 
F
G
 
G
L
 
L
E
 
D
R
 
K
L
 
L
Y
 
Y
R
 
E
L
 
L
C
 
C
E
 
E
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
E
L
 
E
L
 
L
A
 
T
D
 
N
-
 
G
-
 
G
Y
 
Y
H
 
N
I
 
I
G
 
G
R
 
R
V
 
V
I
 
I
A
 
A
R
 
R
P
 
P
F
 
F
V
 
I
G
 
G
D
 
D
A
 
K
E
 
A
T
 
G
G
 
N
F
 
F
S
 
Q
R
 
R
T
 
T
V
 
G
H
 
N
R
 
R
R
 
H
D
 
D
Y
 
L
A
 
A
L
 
V
P
 
E
P
 
P
P
 
P
A
 
A
P
 
P
T
 
T
L
 
V
F
 
L
D
 
Q
A
 
K
L
 
L
-
 
V
Q
 
D
A
 
E
A
 
K
G
 
H
G
 
G
E
 
Q
V
 
V
I
 
V
A
 
S
I
 
V
G
 
G
K
 
K
I
 
I
D
 
A
D
 
D
I
 
I
F
 
Y
A
 
A
H
 
N
R
 
C
G
 
G
V
 
I
S
 
T
R
 
K
V
 
K
V
 
V
H
 
K
A
 
A
Y
 
T
G
 
G
H
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
L
F
 
F
D
 
D
A
 
A
T
 
T
L
 
I
A
x
K
A
 
E
M
 
M
A
 
K
Q
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
D
H
 
N
S
 
T
L
 
I
I
 
V
A
 
F
T
 
T
N
 
N
F
 
F
V
 
V
D
 
D
F
 
F
D
 
D
M
 
S
L
 
S
Y
 
W
G
 
G
H
 
H
R
 
R
R
 
R
D
 
D
V
 
V
L
 
A
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
G
L
 
L
E
 
E
A
 
L
L
 
F
D
 
D
A
 
R
R
 
R
L
 
L
P
 
P
E
 
E
L
 
L
L
 
M
Q
 
S
A
 
L
L
 
L
Q
 
R
P
 
D
G
 
D
D
 
D
L
 
I
L
 
L
V
 
I
V
 
L
S
 
T
A
 
A
D
 
D
H
 
H
G
 
G
C
 
C
D
 
D
P
 
P
V
 
T
W
 
W
P
 
T
G
 
G
S
 
T
D
 
D
H
 
H
T
 
T
R
 
R
E
 
E
C
 
H
I
 
I
P
 
P
V
 
V
L
 
L
A
 
V
F
 
Y
A
 
G
P
 
P
G
 
K
L
 
V
A
 
K
P
 
P
R
 
G
A
 
S
L
 
L
G
 
G
R
 
H
R
 
R
D
 
E
S
 
T
F
 
F
A
 
A
D
 
D
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
S
 
T
M
 
L
A
 
A
S
 
K
H
 
Y
L
 
F
G
 
G
L
 
T
P
 
S
P
 
D
L
 
M
A
 
E
A
 
Y
G
 
G
R
 
K
S
 
A
F
 
M
L
 
F

3ot9A Phosphopentomutase from bacillus cereus bound to glucose-1,6- bisphosphate (see paper)
44% identity, 99% coverage: 3:400/402 of query aligns to 5:389/391 of 3ot9A

query
sites
3ot9A
R
 
R
A
 
I
I
 
F
W
 
L
L
 
V
V
 
V
C
 
M
D
|
D
S
 
S
L
 
V
G
 
G
L
 
I
G
 
G
A
 
E
A
 
A
P
 
P
D
 
D
A
 
A
A
 
E
A
 
Q
Y
 
F
G
|
G
D
|
D
L
 
L
G
 
G
A
 
S
D
 
D
T
 
T
F
 
I
G
 
G
H
 
H
I
 
I
A
 
A
A
 
E
A
 
H
C
 
M
V
 
N
A
 
G
A
 
-
A
 
-
R
 
-
G
 
-
P
 
-
L
 
L
R
 
Q
L
 
M
P
 
P
Q
 
N
F
 
M
S
 
V
R
 
K
L
 
L
G
 
G
L
 
L
P
 
G
Q
 
N
A
 
I
H
 
-
A
 
-
A
 
-
I
 
-
H
 
-
G
 
-
Q
 
R
A
 
E
A
 
M
P
 
K
G
 
G
F
 
I
V
 
S
G
 
K
L
 
V
P
 
E
A
 
K
P
 
P
E
 
L
G
 
G
L
 
Y
W
 
Y
G
 
T
H
 
K
A
 
M
V
 
Q
E
 
E
R
 
K
A
 
S
R
 
T
G
 
G
K
 
K
D
 
D
T
|
T
P
 
M
S
 
T
G
 
G
H
 
H
W
 
W
E
 
E
T
 
I
A
 
M
G
 
G
V
 
L
V
 
Y
L
 
I
T
 
D
Q
 
T
P
 
P
F
 
F
G
 
Q
V
 
V
F
 
F
G
 
P
Q
 
E
A
 
G
E
 
-
H
 
-
S
 
-
F
 
F
P
 
P
P
 
K
A
 
E
L
 
L
L
 
L
Q
 
D
A
 
E
L
 
L
V
 
E
T
 
E
Q
 
K
G
 
T
D
 
G
V
 
R
P
 
K
G
 
-
V
 
I
L
 
I
G
 
G
N
 
N
C
 
K
H
 
P
A
 
A
S
|
S
G
|
G
T
 
T
E
 
E
I
 
I
I
 
L
Q
 
D
R
 
E
L
 
L
G
 
G
A
 
Q
E
 
E
H
 
Q
L
 
M
R
 
E
N
 
T
G
 
G
C
 
S
P
 
L
I
 
I
V
 
V
Y
 
Y
T
 
T
S
|
S
A
 
A
D
|
D
S
 
S
V
 
V
F
 
L
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
A
 
A
H
 
H
E
 
E
Q
 
E
A
 
V
F
 
V
G
 
P
L
 
L
E
 
D
R
 
E
L
 
L
Y
 
Y
R
 
K
L
 
I
C
 
C
E
 
K
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
E
L
 
L
L
 
T
A
 
L
D
 
D
-
 
E
-
 
K
Y
 
Y
H
 
M
I
 
V
G
 
G
R
 
R
V
 
V
I
 
I
A
 
A
R
|
R
P
 
P
F
 
F
V
 
V
G
 
G
D
 
E
A
 
P
E
 
-
T
 
G
G
 
N
F
 
F
S
 
T
R
|
R
T
 
T
V
 
P
H
 
N
R
|
R
R
 
H
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
P
 
K
P
 
P
P
 
F
A
 
G
P
 
R
T
 
T
L
 
V
F
 
M
D
 
N
A
 
E
L
 
L
Q
 
K
A
 
D
A
 
S
G
 
D
G
 
Y
E
 
D
V
 
V
I
 
I
A
 
A
I
 
I
G
 
G
K
|
K
I
 
I
D
 
S
D
 
D
I
 
I
F
 
Y
A
 
D
H
 
G
R
 
E
G
 
G
V
 
V
S
 
T
R
 
E
V
 
S
V
 
L
H
 
R
A
 
T
Y
 
K
-
 
S
-
 
N
-
 
M
-
 
D
G
 
G
H
 
M
D
 
D
A
 
K
L
 
L
F
 
V
D
 
D
A
 
T
T
 
-
L
 
-
A
 
L
A
 
N
M
 
M
A
 
D
Q
 
F
A
 
T
G
 
G
A
 
L
H
 
S
S
 
F
L
 
L
I
 
-
A
 
-
T
 
-
N
 
N
F
 
L
V
 
V
D
 
D
F
 
F
D
|
D
M
 
A
L
 
L
Y
 
F
G
 
G
H
|
H
R
 
R
R
 
R
D
 
D
V
 
P
L
 
Q
G
 
G
Y
 
Y
A
 
G
A
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
A
 
E
L
 
Y
D
 
D
A
 
A
R
 
R
L
 
L
P
 
P
E
 
E
L
 
V
L
 
F
Q
 
A
A
 
K
L
 
L
Q
 
K
P
 
E
G
 
D
D
 
D
L
 
L
L
 
L
V
 
L
V
 
I
S
 
T
A
 
A
D
|
D
H
|
H
G
 
G
C
 
N
D
 
D
P
 
P
V
 
I
W
x
H
P
 
P
G
 
G
S
 
T
D
 
D
H
|
H
T
 
T
R
 
R
E
 
E
C
 
Y
I
 
V
P
 
P
V
 
L
L
 
L
A
 
A
F
 
Y
A
 
S
P
 
P
G
 
S
L
 
M
A
 
K
P
 
E
-
 
G
-
 
G
R
 
Q
A
 
E
L
 
L
G
 
P
R
 
L
R
 
R
D
 
Q
S
 
T
F
 
F
A
 
A
D
 
D
I
 
I
G
 
G
Q
 
A
S
 
T
M
 
V
A
 
A
S
 
E
H
 
N
L
 
F
G
 
G
L
 
V
P
 
K
P
 
M
L
 
P
A
 
E
A
 
Y
G
 
G
R
 
T
S
 
S
F
 
F
L
 
L
S
 
N

3m8zA Phosphopentomutase from bacillus cereus bound with ribose-5-phosphate (see paper)
44% identity, 99% coverage: 3:400/402 of query aligns to 5:389/391 of 3m8zA

query
sites
3m8zA
R
 
R
A
 
I
I
 
F
W
 
L
L
 
V
V
 
V
C
 
M
D
|
D
S
 
S
L
 
V
G
 
G
L
 
I
G
 
G
A
 
E
A
 
A
P
 
P
D
 
D
A
 
A
A
 
E
A
 
Q
Y
 
F
G
|
G
D
|
D
L
 
L
G
 
G
A
 
S
D
 
D
T
 
T
F
 
I
G
 
G
H
 
H
I
 
I
A
 
A
A
 
E
A
 
H
C
 
M
V
 
N
A
 
G
A
 
-
A
 
-
R
 
-
G
 
-
P
 
-
L
 
L
R
 
Q
L
 
M
P
 
P
Q
 
N
F
 
M
S
 
V
R
 
K
L
 
L
G
 
G
L
 
L
P
 
G
Q
 
N
A
 
I
H
 
-
A
 
-
A
 
-
I
 
-
H
 
-
G
 
-
Q
 
R
A
 
E
A
 
M
P
 
K
G
 
G
F
 
I
V
 
S
G
 
K
L
 
V
P
 
E
A
 
K
P
 
P
E
 
L
G
 
G
L
 
Y
W
 
Y
G
 
T
H
 
K
A
 
M
V
 
Q
E
 
E
R
 
K
A
 
S
R
 
T
G
 
G
K
 
K
D
 
D
T
|
T
P
 
M
S
 
T
G
 
G
H
 
H
W
 
W
E
 
E
T
 
I
A
 
M
G
 
G
V
 
L
V
 
Y
L
 
I
T
 
D
Q
 
T
P
 
P
F
 
F
G
 
Q
V
 
V
F
 
F
G
 
P
Q
 
E
A
 
G
E
 
-
H
 
-
S
 
-
F
 
F
P
 
P
P
 
K
A
 
E
L
 
L
L
 
L
Q
 
D
A
 
E
L
 
L
V
 
E
T
 
E
Q
 
K
G
 
T
D
 
G
V
 
R
P
 
K
G
 
-
V
 
I
L
 
I
G
 
G
N
 
N
C
 
K
H
 
P
A
 
A
S
|
S
G
|
G
T
 
T
E
 
E
I
 
I
I
 
L
Q
 
D
R
 
E
L
 
L
G
 
G
A
 
Q
E
 
E
H
 
Q
L
 
M
R
 
E
N
 
T
G
 
G
C
 
S
P
 
L
I
 
I
V
 
V
Y
|
Y
T
 
T
S
|
S
A
 
A
D
|
D
S
 
S
V
 
V
F
 
L
Q
|
Q
I
 
I
A
 
A
A
 
A
H
 
H
E
 
E
Q
 
E
A
 
V
F
 
V
G
 
P
L
 
L
E
 
D
R
 
E
L
 
L
Y
 
Y
R
 
K
L
 
I
C
 
C
E
 
K
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
E
L
 
L
L
 
T
A
 
L
D
 
D
-
 
E
-
 
K
Y
 
Y
H
 
M
I
 
V
G
 
G
R
|
R
V
 
V
I
 
I
A
 
A
R
|
R
P
 
P
F
 
F
V
 
V
G
 
G
D
 
E
A
 
P
E
 
-
T
 
G
G
 
N
F
 
F
S
 
T
R
|
R
T
 
T
V
 
P
H
 
N
R
 
R
R
 
H
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
P
 
K
P
 
P
P
 
F
A
 
G
P
 
R
T
 
T
L
 
V
F
 
M
D
 
N
A
 
E
L
 
L
Q
 
K
A
 
D
A
 
S
G
 
D
G
 
Y
E
 
D
V
 
V
I
 
I
A
 
A
I
 
I
G
 
G
K
 
K
I
 
I
D
 
S
D
 
D
I
 
I
F
 
Y
A
 
D
H
 
G
R
 
E
G
 
G
V
 
V
S
 
T
R
 
E
V
 
S
V
 
L
H
 
R
A
 
T
Y
 
K
-
 
S
-
 
N
-
 
M
-
 
D
G
 
G
H
 
M
D
 
D
A
 
K
L
 
L
F
 
V
D
 
D
A
 
T
T
 
-
L
 
-
A
 
L
A
 
N
M
 
M
A
 
D
Q
 
F
A
 
T
G
 
G
A
 
L
H
 
S
S
 
F
L
 
L
I
 
-
A
 
-
T
 
-
N
 
N
F
 
L
V
|
V
D
 
D
F
 
F
D
|
D
M
x
A
L
 
L
Y
 
F
G
 
G
H
|
H
R
 
R
R
 
R
D
 
D
V
 
P
L
 
Q
G
 
G
Y
 
Y
A
 
G
A
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
A
 
E
L
 
Y
D
 
D
A
 
A
R
 
R
L
 
L
P
 
P
E
 
E
L
 
V
L
 
F
Q
 
A
A
 
K
L
 
L
Q
 
K
P
 
E
G
 
D
D
 
D
L
 
L
L
 
L
V
 
L
V
 
I
S
 
T
A
 
A
D
|
D
H
|
H
G
 
G
C
 
N
D
 
D
P
 
P
V
 
I
W
x
H
P
 
P
G
 
G
S
 
T
D
 
D
H
|
H
T
 
T
R
 
R
E
 
E
C
 
Y
I
 
V
P
 
P
V
 
L
L
 
L
A
 
A
F
 
Y
A
 
S
P
 
P
G
 
S
L
 
M
A
 
K
P
 
E
-
 
G
-
 
G
R
 
Q
A
 
E
L
 
L
G
 
P
R
 
L
R
 
R
D
 
Q
S
 
T
F
 
F
A
 
A
D
 
D
I
 
I
G
 
G
Q
 
A
S
 
T
M
 
V
A
 
A
S
 
E
H
 
N
L
 
F
G
 
G
L
 
V
P
 
K
P
 
M
L
 
P
A
 
E
A
 
Y
G
 
G
R
 
T
S
 
S
F
 
F
L
 
L
S
 
N

4lr9A Phosphopentomutase s154a variant soaked with 2,3-dideoxyribose 5- phosphate (see paper)
43% identity, 99% coverage: 3:400/402 of query aligns to 5:389/391 of 4lr9A

query
sites
4lr9A
R
 
R
A
 
I
I
 
F
W
 
L
L
 
V
V
 
V
C
 
M
D
|
D
S
 
S
L
 
V
G
 
G
L
 
I
G
 
G
A
 
E
A
 
A
P
 
P
D
 
D
A
 
A
A
 
E
A
 
Q
Y
 
F
G
|
G
D
|
D
L
 
L
G
 
G
A
 
S
D
 
D
T
 
T
F
 
I
G
 
G
H
 
H
I
 
I
A
 
A
A
 
E
A
 
H
C
 
M
V
 
N
A
 
G
A
 
-
A
 
-
R
 
-
G
 
-
P
 
-
L
 
L
R
 
Q
L
 
M
P
 
P
Q
 
N
F
 
M
S
 
V
R
 
K
L
 
L
G
 
G
L
 
L
P
 
G
Q
 
N
A
 
I
H
 
-
A
 
-
A
 
-
I
 
-
H
 
-
G
 
-
Q
 
R
A
 
E
A
 
M
P
 
K
G
 
G
F
 
I
V
 
S
G
 
K
L
 
V
P
 
E
A
 
K
P
 
P
E
 
L
G
 
G
L
 
Y
W
 
Y
G
 
T
H
 
K
A
 
M
V
 
Q
E
 
E
R
 
K
A
 
S
R
 
T
G
 
G
K
 
K
D
 
D
T
|
T
P
 
M
S
 
T
G
 
G
H
 
H
W
 
W
E
 
E
T
 
I
A
 
M
G
 
G
V
 
L
V
 
Y
L
 
I
T
 
D
Q
 
T
P
 
P
F
 
F
G
 
Q
V
 
V
F
 
F
G
 
P
Q
 
E
A
 
G
E
 
-
H
 
-
S
 
-
F
 
F
P
 
P
P
 
K
A
 
E
L
 
L
L
 
L
Q
 
D
A
 
E
L
 
L
V
 
E
T
 
E
Q
 
K
G
 
T
D
 
G
V
 
R
P
 
K
G
 
-
V
 
I
L
 
I
G
 
G
N
 
N
C
 
K
H
 
P
A
 
A
S
|
S
G
 
G
T
 
T
E
 
E
I
 
I
I
 
L
Q
 
D
R
 
E
L
 
L
G
 
G
A
 
Q
E
 
E
H
 
Q
L
 
M
R
 
E
N
 
T
G
 
G
C
 
S
P
 
L
I
 
I
V
 
V
Y
 
Y
T
 
T
S
 
A
A
 
A
D
|
D
S
 
S
V
 
V
F
 
L
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
A
 
A
H
 
H
E
 
E
Q
 
E
A
 
V
F
 
V
G
 
P
L
 
L
E
 
D
R
 
E
L
 
L
Y
 
Y
R
 
K
L
 
I
C
 
C
E
 
K
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
E
L
 
L
L
 
T
A
 
L
D
 
D
-
 
E
-
 
K
Y
 
Y
H
 
M
I
 
V
G
 
G
R
 
R
V
 
V
I
 
I
A
 
A
R
|
R
P
 
P
F
 
F
V
 
V
G
 
G
D
 
E
A
 
P
E
 
-
T
 
G
G
 
N
F
 
F
S
 
T
R
|
R
T
 
T
V
 
P
H
 
N
R
 
R
R
 
H
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
P
 
K
P
 
P
P
 
F
A
 
G
P
 
R
T
 
T
L
 
V
F
 
M
D
 
N
A
 
E
L
 
L
Q
 
K
A
 
D
A
 
S
G
 
D
G
 
Y
E
 
D
V
 
V
I
 
I
A
 
A
I
 
I
G
 
G
K
 
K
I
 
I
D
 
S
D
 
D
I
 
I
F
 
Y
A
 
D
H
 
G
R
 
E
G
 
G
V
 
V
S
 
T
R
 
E
V
 
S
V
 
L
H
 
R
A
 
T
Y
 
K
-
 
S
-
 
N
-
 
M
-
 
D
G
 
G
H
 
M
D
 
D
A
 
K
L
 
L
F
 
V
D
 
D
A
 
T
T
 
-
L
 
-
A
 
L
A
 
N
M
 
M
A
 
D
Q
 
F
A
 
T
G
 
G
A
 
L
H
 
S
S
 
F
L
 
L
I
 
-
A
 
-
T
 
-
N
 
N
F
 
L
V
 
V
D
 
D
F
 
F
D
|
D
M
 
A
L
 
L
Y
 
F
G
 
G
H
|
H
R
 
R
R
 
R
D
 
D
V
 
P
L
 
Q
G
 
G
Y
 
Y
A
 
G
A
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
A
 
E
L
 
Y
D
 
D
A
 
A
R
 
R
L
 
L
P
 
P
E
 
E
L
 
V
L
 
F
Q
 
A
A
 
K
L
 
L
Q
 
K
P
 
E
G
 
D
D
 
D
L
 
L
L
 
L
V
 
L
V
 
I
S
 
T
A
 
A
D
|
D
H
|
H
G
 
G
C
 
N
D
 
D
P
 
P
V
 
I
W
x
H
P
 
P
G
 
G
S
 
T
D
 
D
H
|
H
T
 
T
R
 
R
E
 
E
C
 
Y
I
 
V
P
 
P
V
 
L
L
 
L
A
 
A
F
 
Y
A
 
S
P
 
P
G
 
S
L
 
M
A
 
K
P
 
E
-
 
G
-
 
G
R
 
Q
A
 
E
L
 
L
G
 
P
R
 
L
R
 
R
D
 
Q
S
 
T
F
 
F
A
 
A
D
 
D
I
 
I
G
 
G
Q
 
A
S
 
T
M
 
V
A
 
A
S
 
E
H
 
N
L
 
F
G
 
G
L
 
V
P
 
K
P
 
M
L
 
P
A
 
E
A
 
Y
G
 
G
R
 
T
S
 
S
F
 
F
L
 
L
S
 
N

4lr7A Phosphopentomutase s154a variant (see paper)
43% identity, 99% coverage: 3:400/402 of query aligns to 5:389/391 of 4lr7A

query
sites
4lr7A
R
 
R
A
 
I
I
 
F
W
 
L
L
 
V
V
 
V
C
 
M
D
|
D
S
 
S
L
 
V
G
 
G
L
 
I
G
 
G
A
 
E
A
 
A
P
 
P
D
 
D
A
 
A
A
 
E
A
 
Q
Y
 
F
G
|
G
D
|
D
L
 
L
G
 
G
A
 
S
D
 
D
T
 
T
F
 
I
G
 
G
H
 
H
I
 
I
A
 
A
A
 
E
A
 
H
C
 
M
V
 
N
A
 
G
A
 
-
A
 
-
R
 
-
G
 
-
P
 
-
L
 
L
R
 
Q
L
 
M
P
 
P
Q
 
N
F
 
M
S
 
V
R
 
K
L
 
L
G
 
G
L
 
L
P
 
G
Q
 
N
A
 
I
H
 
-
A
 
-
A
 
-
I
 
-
H
 
-
G
 
-
Q
 
R
A
 
E
A
 
M
P
 
K
G
 
G
F
 
I
V
 
S
G
 
K
L
 
V
P
 
E
A
 
K
P
 
P
E
 
L
G
 
G
L
 
Y
W
 
Y
G
 
T
H
 
K
A
 
M
V
 
Q
E
 
E
R
 
K
A
 
S
R
 
T
G
 
G
K
 
K
D
 
D
T
|
T
P
 
M
S
 
T
G
 
G
H
 
H
W
 
W
E
 
E
T
 
I
A
 
M
G
 
G
V
 
L
V
 
Y
L
 
I
T
 
D
Q
 
T
P
 
P
F
 
F
G
 
Q
V
 
V
F
 
F
G
 
P
Q
 
E
A
 
G
E
 
-
H
 
-
S
 
-
F
 
F
P
 
P
P
 
K
A
 
E
L
 
L
L
 
L
Q
 
D
A
 
E
L
 
L
V
 
E
T
 
E
Q
 
K
G
 
T
D
 
G
V
 
R
P
 
K
G
 
-
V
 
I
L
 
I
G
 
G
N
 
N
C
 
K
H
 
P
A
 
A
S
 
S
G
 
G
T
 
T
E
 
E
I
 
I
I
 
L
Q
 
D
R
 
E
L
 
L
G
 
G
A
 
Q
E
 
E
H
 
Q
L
 
M
R
 
E
N
 
T
G
 
G
C
 
S
P
 
L
I
 
I
V
 
V
Y
 
Y
T
 
T
S
 
A
A
 
A
D
|
D
S
 
S
V
 
V
F
 
L
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
A
 
A
H
 
H
E
 
E
Q
 
E
A
 
V
F
 
V
G
 
P
L
 
L
E
 
D
R
 
E
L
 
L
Y
 
Y
R
 
K
L
 
I
C
 
C
E
 
K
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
E
L
 
L
L
 
T
A
 
L
D
 
D
-
 
E
-
 
K
Y
 
Y
H
 
M
I
 
V
G
 
G
R
 
R
V
 
V
I
 
I
A
 
A
R
 
R
P
 
P
F
 
F
V
 
V
G
 
G
D
 
E
A
 
P
E
 
-
T
 
G
G
 
N
F
 
F
S
 
T
R
 
R
T
 
T
V
 
P
H
 
N
R
 
R
R
 
H
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
P
 
K
P
 
P
P
 
F
A
 
G
P
 
R
T
 
T
L
 
V
F
 
M
D
 
N
A
 
E
L
 
L
Q
 
K
A
 
D
A
 
S
G
 
D
G
 
Y
E
 
D
V
 
V
I
 
I
A
 
A
I
 
I
G
 
G
K
 
K
I
 
I
D
 
S
D
 
D
I
 
I
F
 
Y
A
 
D
H
 
G
R
 
E
G
 
G
V
 
V
S
 
T
R
 
E
V
 
S
V
 
L
H
 
R
A
 
T
Y
 
K
-
 
S
-
 
N
-
 
M
-
 
D
G
 
G
H
 
M
D
 
D
A
 
K
L
 
L
F
 
V
D
 
D
A
 
T
T
 
-
L
 
-
A
 
L
A
 
N
M
 
M
A
 
D
Q
 
F
A
 
T
G
 
G
A
 
L
H
 
S
S
 
F
L
 
L
I
 
-
A
 
-
T
 
-
N
 
N
F
 
L
V
 
V
D
 
D
F
 
F
D
|
D
M
 
A
L
 
L
Y
 
F
G
 
G
H
|
H
R
 
R
R
 
R
D
 
D
V
 
P
L
 
Q
G
 
G
Y
 
Y
A
 
G
A
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
A
 
E
L
 
Y
D
 
D
A
 
A
R
 
R
L
 
L
P
 
P
E
 
E
L
 
V
L
 
F
Q
 
A
A
 
K
L
 
L
Q
 
K
P
 
E
G
 
D
D
 
D
L
 
L
L
 
L
V
 
L
V
 
I
S
 
T
A
 
A
D
|
D
H
|
H
G
 
G
C
 
N
D
 
D
P
 
P
V
 
I
W
x
H
P
 
P
G
 
G
S
 
T
D
 
D
H
|
H
T
 
T
R
 
R
E
 
E
C
 
Y
I
 
V
P
 
P
V
 
L
L
 
L
A
 
A
F
 
Y
A
 
S
P
 
P
G
 
S
L
 
M
A
 
K
P
 
E
-
 
G
-
 
G
R
 
Q
A
 
E
L
 
L
G
 
P
R
 
L
R
 
R
D
 
Q
S
 
T
F
 
F
A
 
A
D
 
D
I
 
I
G
 
G
Q
 
A
S
 
T
M
 
V
A
 
A
S
 
E
H
 
N
L
 
F
G
 
G
L
 
V
P
 
K
P
 
M
L
 
P
A
 
E
A
 
Y
G
 
G
R
 
T
S
 
S
F
 
F
L
 
L
S
 
N

4n7tA Crystal structure of phosphorylated phosphopentomutase from streptococcus mutans
37% identity, 99% coverage: 1:399/402 of query aligns to 3:398/402 of 4n7tA

query
sites
4n7tA
M
 
F
T
 
N
R
 
R
A
 
I
I
 
H
W
 
L
L
 
V
V
 
V
C
 
L
D
|
D
S
 
S
L
 
V
G
 
G
L
 
I
G
 
G
A
 
A
A
 
A
P
 
P
D
 
D
A
 
A
A
 
N
A
 
N
Y
 
F
G
 
S
D
 
N
L
 
A
G
 
G
-
 
V
-
 
P
-
 
D
-
 
G
-
 
A
A
 
S
D
 
D
T
 
T
F
 
L
G
 
G
H
 
H
I
 
I
A
 
S
A
 
K
A
 
T
C
 
V
V
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
-
G
 
-
P
 
G
L
 
L
R
 
N
L
 
V
P
 
P
Q
 
N
F
 
M
S
 
A
R
 
K
L
 
I
G
 
G
L
 
L
P
 
G
Q
 
N
A
 
I
H
 
P
A
 
R
A
 
D
I
 
T
H
 
P
G
 
L
Q
 
K
A
 
T
A
 
V
P
 
P
G
 
A
F
 
-
V
 
-
G
 
-
L
 
E
P
 
N
A
 
H
P
 
P
E
 
T
G
 
G
L
 
Y
W
 
V
G
 
T
H
 
K
A
 
L
V
 
E
E
 
E
R
 
V
A
 
S
R
 
L
G
 
G
K
 
K
D
 
D
T
|
T
P
 
M
S
 
T
G
 
G
H
 
H
W
 
W
E
 
E
T
 
I
A
 
M
G
 
G
V
 
L
V
 
N
L
 
I
T
 
T
Q
 
E
P
 
P
F
 
F
G
 
D
V
 
T
F
 
F
G
 
W
Q
 
N
A
 
G
E
 
-
H
 
-
S
 
-
F
 
F
P
 
P
P
 
E
A
 
E
L
 
I
L
 
I
Q
 
S
A
 
K
L
 
I
V
 
E
T
 
K
-
 
F
Q
 
S
G
 
G
D
 
R
V
 
K
P
 
V
G
 
I
V
 
R
L
 
E
G
 
A
N
 
N
C
 
K
H
 
P
A
 
Y
S
 
S
G
 
G
T
 
T
E
 
A
I
 
V
I
 
I
Q
 
D
R
 
D
L
 
F
G
 
G
A
 
P
E
 
R
H
 
Q
L
 
M
R
 
E
N
 
T
G
 
G
C
 
E
P
 
L
I
 
I
V
 
I
Y
 
Y
T
 
T
S
 
S
A
 
A
D
 
D
S
 
P
V
 
V
F
 
L
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
A
 
A
H
 
H
E
 
E
Q
 
D
A
 
V
F
 
I
G
 
P
L
 
L
E
 
D
R
 
E
L
 
L
Y
 
Y
R
 
R
L
 
I
C
 
C
E
 
E
L
 
Y
A
 
A
R
 
R
A
 
S
L
 
I
L
 
T
A
 
L
D
 
E
Y
 
R
-
 
P
-
 
A
H
 
L
I
 
L
G
 
G
R
 
R
V
 
I
I
 
I
A
 
A
R
 
R
P
 
P
F
 
Y
V
 
V
G
 
G
D
 
K
A
 
P
E
 
R
T
 
N
G
 
-
F
 
F
S
 
T
R
 
R
T
 
T
V
 
A
H
 
N
R
 
R
R
 
H
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
P
 
S
P
 
P
P
 
F
A
 
A
P
 
P
T
 
T
L
 
V
F
 
L
D
 
N
A
 
K
L
 
L
Q
 
A
A
 
D
A
 
A
G
 
G
G
 
V
E
 
S
V
 
T
I
 
Y
A
 
A
I
 
V
G
 
G
K
 
K
I
 
I
D
 
N
D
 
D
I
 
I
F
 
F
A
 
N
H
 
G
R
 
S
G
 
G
V
 
I
S
 
T
R
 
N
V
 
D
V
 
M
-
 
G
H
 
H
A
 
N
Y
 
K
G
 
S
H
 
N
D
 
S
A
 
H
L
 
G
F
 
V
D
 
D
A
 
T
T
 
L
L
 
I
A
 
K
A
 
T
M
 
M
A
 
G
-
 
L
Q
 
S
A
 
A
G
 
F
A
 
T
H
 
K
S
 
G
L
 
F
I
 
S
A
 
F
T
 
T
N
 
N
F
 
L
V
 
V
D
 
D
F
 
F
D
|
D
M
 
A
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
H
|
H
R
 
R
R
 
R
D
 
N
V
 
A
L
 
H
G
 
G
Y
 
Y
A
 
R
A
 
D
A
 
C
L
 
L
E
 
H
A
 
E
L
 
F
D
 
D
A
 
E
R
 
R
L
 
L
P
 
P
E
 
E
L
 
I
L
 
I
Q
 
A
A
 
A
L
 
M
Q
 
K
P
 
V
G
 
D
D
 
D
L
 
L
L
 
L
V
 
L
V
 
I
S
 
T
A
 
A
D
|
D
H
|
H
G
 
G
C
 
N
D
 
D
P
 
P
V
 
T
W
 
Y
P
 
A
G
 
G
S
 
T
D
 
D
H
|
H
T
 
T
R
 
R
E
 
E
C
 
Y
I
 
V
P
 
P
V
 
L
L
 
L
A
 
A
F
 
Y
A
 
S
P
 
P
G
 
S
L
 
F
A
 
T
P
 
G
R
 
N
A
 
G
L
 
V
G
 
L
R
 
P
R
 
V
D
 
G
S
 
H
F
 
Y
A
 
A
D
 
D
I
 
I
G
 
S
Q
 
A
S
 
T
M
 
I
A
 
A
S
 
D
H
 
N
L
 
F
G
 
G
L
 
V
P
 
D
P
 
T
L
 
A
A
 
M
A
 
I
G
 
G
R
 
E
S
 
S
F
 
F
L
 
L

Query Sequence

>WP_015448445.1 NCBI__GCF_000230695.2:WP_015448445.1
MTRAIWLVCDSLGLGAAPDAAAYGDLGADTFGHIAAACVAAARGPLRLPQFSRLGLPQAH
AAIHGQAAPGFVGLPAPEGLWGHAVERARGKDTPSGHWETAGVVLTQPFGVFGQAEHSFP
PALLQALVTQGDVPGVLGNCHASGTEIIQRLGAEHLRNGCPIVYTSADSVFQIAAHEQAF
GLERLYRLCELARALLADYHIGRVIARPFVGDAETGFSRTVHRRDYALPPPAPTLFDALQ
AAGGEVIAIGKIDDIFAHRGVSRVVHAYGHDALFDATLAAMAQAGAHSLIATNFVDFDML
YGHRRDVLGYAAALEALDARLPELLQALQPGDLLVVSADHGCDPVWPGSDHTRECIPVLA
FAPGLAPRALGRRDSFADIGQSMASHLGLPPLAAGRSFLSPA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory