SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_015448446.1 NCBI__GCF_000230695.2:WP_015448446.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 17 hits to proteins with known functional sites (download)

4lhmA Thymidine phosphorylase from e.Coli with 3'-azido-3'-deoxythymidine (see paper)
46% identity, 96% coverage: 6:432/444 of query aligns to 4:432/440 of 4lhmA

query
sites
4lhmA
A
 
A
T
 
Q
G
 
E
L
 
I
I
 
I
R
 
R
C
 
K
K
 
K
R
 
R
D
 
D
G
 
G
G
 
H
Q
 
A
L
 
L
D
 
S
A
 
D
S
 
E
Q
 
E
L
 
I
R
 
R
A
 
F
V
 
F
A
 
I
Q
 
N
G
 
G
I
 
I
G
 
R
S
 
D
G
 
N
A
 
T
W
 
I
S
 
S
E
 
E
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
A
 
A
F
 
L
A
 
A
M
 
M
A
 
T
V
 
I
A
 
F
W
 
F
R
 
H
G
 
D
M
 
M
S
 
T
T
 
M
P
 
P
E
 
E
C
 
R
R
 
V
Q
 
S
F
 
L
T
 
T
L
 
M
A
 
A
L
 
M
R
 
R
D
 
D
S
 
S
G
 
G
Q
 
T
C
 
V
L
 
L
R
 
D
W
 
W
D
 
K
-
 
S
-
 
L
H
 
H
L
 
L
P
 
N
G
 
G
P
 
P
T
 
I
L
 
V
D
|
D
K
|
K
H
|
H
S
|
S
T
|
T
G
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
G
D
 
D
G
 
V
V
 
T
S
|
S
L
 
L
L
 
M
L
 
L
A
 
G
P
 
P
L
 
M
L
 
V
A
 
A
A
 
A
C
 
C
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
V
 
I
P
 
P
M
 
M
I
 
I
S
|
S
G
 
G
R
 
R
G
 
G
L
 
L
G
 
G
H
 
H
T
 
T
G
 
G
G
 
G
T
|
T
L
 
L
D
 
D
K
 
K
L
 
L
E
 
E
S
 
S
L
 
I
A
 
P
G
 
G
Y
 
F
D
 
D
V
 
I
H
 
F
P
 
P
S
 
D
T
 
D
A
 
N
R
 
R
L
 
F
R
 
R
Q
 
E
V
 
I
V
 
I
E
 
K
E
 
D
V
 
V
G
 
G
C
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
I
G
 
G
Q
 
Q
G
 
T
D
 
S
E
 
S
L
 
L
V
 
A
P
 
P
A
 
A
D
|
D
R
 
K
R
 
R
L
 
F
Y
|
Y
A
 
A
V
 
T
R
|
R
D
 
D
V
 
I
T
 
T
A
|
A
T
 
T
V
|
V
D
|
D
V
 
S
A
 
I
D
 
P
L
 
L
M
 
I
V
 
T
A
 
A
S
|
S
I
 
I
L
 
L
S
 
A
K
|
K
K
|
K
L
 
L
A
 
A
G
 
E
G
 
G
A
 
L
R
 
D
V
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
M
D
 
D
I
 
V
K
 
K
T
 
V
G
 
G
N
 
S
G
 
G
A
 
A
Q
x
F
L
 
M
P
 
P
G
 
T
M
 
Y
A
 
E
A
 
L
A
 
S
R
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
E
R
 
A
M
 
I
L
 
V
A
 
G
V
 
V
A
 
A
E
 
N
G
 
G
S
 
A
G
 
G
L
 
V
D
x
R
L
 
T
R
 
T
V
 
A
V
 
L
Y
 
L
S
 
T
D
 
D
M
 
M
D
 
N
Q
 
Q
L
 
V
L
 
L
G
 
A
R
 
S
E
 
S
A
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
A
L
 
V
E
 
E
L
 
V
R
|
R
A
 
E
V
 
A
L
 
V
D
 
Q
L
 
F
L
 
L
C
 
T
S
 
G
R
 
E
G
 
Y
D
 
R
N
 
N
P
 
P
R
 
R
L
 
L
L
 
F
S
 
D
L
 
V
T
 
T
L
 
M
E
 
A
L
 
L
A
 
C
A
 
V
A
 
E
L
 
M
L
 
L
C
 
I
T
 
S
G
 
G
G
x
K
L
 
L
A
 
A
D
 
K
D
 
D
R
 
D
N
 
A
D
 
E
A
 
A
E
 
R
R
 
A
R
 
K
L
 
L
R
 
Q
R
 
A
A
 
V
L
 
L
D
 
D
T
 
N
G
 
G
E
 
K
A
 
A
A
 
A
E
 
E
R
 
V
F
 
F
A
 
G
R
 
R
M
 
M
V
 
V
V
 
A
A
 
A
L
 
Q
G
 
K
G
 
G
P
 
P
A
 
T
D
 
D
L
 
F
L
 
V
Q
 
E
R
 
N
A
 
Y
D
 
A
V
 
K
H
 
Y
L
 
L
A
 
P
R
 
T
A
 
A
P
 
M
I
 
L
Q
 
T
R
 
K
E
 
A
V
 
V
R
 
Y
S
 
A
P
 
D
G
 
T
S
 
E
G
 
G
Y
 
F
V
 
V
V
 
S
A
 
E
V
 
M
D
 
D
V
 
T
R
 
R
A
 
A
L
 
L
G
 
G
Q
 
M
A
 
A
V
 
V
V
 
V
E
 
A
L
 
M
G
 
G
G
 
G
G
 
G
R
 
R
S
 
R
R
 
Q
P
 
A
G
 
S
Q
 
D
A
 
T
L
 
I
D
 
D
H
 
Y
A
 
S
V
 
V
G
 
G
L
 
F
A
 
T
E
 
D
V
 
M
L
 
A
G
 
R
C
 
L
G
 
G
S
 
D
A
 
Q
V
 
V
E
 
D
A
 
G
G
 
Q
Q
 
R
P
 
P
L
 
L
A
 
A
I
 
V
I
 
I
H
|
H
A
 
A
R
 
K
R
 
D
A
 
E
D
 
N
D
 
N
A
 
W
E
 
Q
A
 
E
V
 
A
Q
 
A
R
 
K
R
 
A
V
 
V
A
 
K
C
 
A
A
 
A
F
 
I
R
 
K
I
 
L
T
 
A
S
 
D
E
 
K
M
 
A
P
 
P
P
 
E
S
 
S
R
 
T
P
 
P

Sites not aligning to the query:

4eadA Thymidine phosphorylase from e.Coli with 3'-azido-2'-fluoro- dideoxyuridine
46% identity, 96% coverage: 6:432/444 of query aligns to 4:432/440 of 4eadA

query
sites
4eadA
A
 
A
T
 
Q
G
 
E
L
 
I
I
 
I
R
 
R
C
 
K
K
 
K
R
 
R
D
 
D
G
 
G
G
 
H
Q
 
A
L
 
L
D
 
S
A
 
D
S
 
E
Q
 
E
L
 
I
R
 
R
A
 
F
V
 
F
A
 
I
Q
 
N
G
 
G
I
 
I
G
 
R
S
 
D
G
 
N
A
 
T
W
 
I
S
 
S
E
 
E
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
A
 
A
F
 
L
A
 
A
M
 
M
A
 
T
V
 
I
A
 
F
W
 
F
R
 
H
G
 
D
M
 
M
S
 
T
T
 
M
P
 
P
E
 
E
C
 
R
R
 
V
Q
 
S
F
 
L
T
 
T
L
 
M
A
 
A
L
 
M
R
 
R
D
 
D
S
 
S
G
 
G
Q
 
T
C
 
V
L
 
L
R
 
D
W
 
W
D
 
K
-
 
S
-
 
L
H
 
H
L
 
L
P
 
N
G
 
G
P
 
P
T
 
I
L
 
V
D
|
D
K
|
K
H
|
H
S
|
S
T
|
T
G
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
G
D
 
D
G
 
V
V
 
T
S
 
S
L
 
L
L
 
M
L
 
L
A
 
G
P
 
P
L
 
M
L
 
V
A
 
A
A
 
A
C
 
C
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
V
 
I
P
 
P
M
 
M
I
 
I
S
 
S
G
 
G
R
 
R
G
 
G
L
 
L
G
 
G
H
 
H
T
 
T
G
 
G
G
 
G
T
|
T
L
 
L
D
 
D
K
 
K
L
 
L
E
 
E
S
 
S
L
 
I
A
 
P
G
 
G
Y
 
F
D
 
D
V
 
I
H
 
F
P
 
P
S
 
D
T
 
D
A
 
N
R
 
R
L
 
F
R
 
R
Q
 
E
V
 
I
V
 
I
E
 
K
E
 
D
V
 
V
G
 
G
C
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
I
G
 
G
Q
 
Q
G
 
T
D
 
S
E
 
S
L
 
L
V
 
A
P
 
P
A
 
A
D
|
D
R
 
K
R
 
R
L
 
F
Y
|
Y
A
 
A
V
 
T
R
|
R
D
 
D
V
 
I
T
 
T
A
 
A
T
 
T
V
|
V
D
 
D
V
 
S
A
 
I
D
 
P
L
 
L
M
 
I
V
 
T
A
 
A
S
|
S
I
 
I
L
 
L
S
 
A
K
|
K
K
|
K
L
 
L
A
 
A
G
 
E
G
 
G
A
 
L
R
 
D
V
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
M
D
 
D
I
 
V
K
 
K
T
 
V
G
 
G
N
 
S
G
 
G
A
 
A
Q
x
F
L
 
M
P
 
P
G
 
T
M
 
Y
A
 
E
A
 
L
A
 
S
R
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
E
R
 
A
M
 
I
L
 
V
A
 
G
V
 
V
A
 
A
E
 
N
G
 
G
S
 
A
G
 
G
L
 
V
D
 
R
L
 
T
R
 
T
V
 
A
V
 
L
Y
 
L
S
 
T
D
 
D
M
 
M
D
 
N
Q
 
Q
L
 
V
L
 
L
G
 
A
R
 
S
E
 
S
A
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
A
L
 
V
E
 
E
L
 
V
R
 
R
A
 
E
V
 
A
L
 
V
D
 
Q
L
 
F
L
 
L
C
 
T
S
 
G
R
 
E
G
 
Y
D
 
R
N
 
N
P
 
P
R
 
R
L
 
L
L
 
F
S
 
D
L
 
V
T
 
T
L
 
M
E
 
A
L
 
L
A
 
C
A
 
V
A
 
E
L
 
M
L
 
L
C
 
I
T
 
S
G
 
G
G
 
K
L
 
L
A
 
A
D
 
K
D
 
D
R
 
D
N
 
A
D
 
E
A
 
A
E
 
R
R
 
A
R
 
K
L
 
L
R
 
Q
R
 
A
A
 
V
L
 
L
D
 
D
T
 
N
G
 
G
E
 
K
A
 
A
A
 
A
E
 
E
R
 
V
F
 
F
A
 
G
R
 
R
M
 
M
V
 
V
V
 
A
A
 
A
L
 
Q
G
 
K
G
 
G
P
 
P
A
 
T
D
 
D
L
 
F
L
 
V
Q
 
E
R
 
N
A
 
Y
D
 
A
V
 
K
H
 
Y
L
 
L
A
 
P
R
 
T
A
 
A
P
 
M
I
 
L
Q
 
T
R
 
K
E
 
A
V
 
V
R
 
Y
S
 
A
P
 
D
G
 
T
S
 
E
G
 
G
Y
 
F
V
 
V
V
 
S
A
 
E
V
 
M
D
 
D
V
 
T
R
 
R
A
 
A
L
 
L
G
 
G
Q
 
M
A
 
A
V
 
V
V
 
V
E
 
A
L
 
M
G
 
G
G
 
G
G
 
G
R
 
R
S
 
R
R
 
Q
P
 
A
G
 
S
Q
 
D
A
 
T
L
 
I
D
 
D
H
 
Y
A
 
S
V
 
V
G
 
G
L
 
F
A
 
T
E
 
D
V
 
M
L
 
A
G
 
R
C
 
L
G
 
G
S
 
D
A
 
Q
V
 
V
E
 
D
A
 
G
G
 
Q
Q
 
R
P
 
P
L
 
L
A
 
A
I
 
V
I
 
I
H
 
H
A
 
A
R
 
K
R
 
D
A
 
E
D
 
N
D
 
N
A
 
W
E
 
Q
A
 
E
V
 
A
Q
 
A
R
 
K
R
 
A
V
 
V
A
 
K
C
 
A
A
 
A
F
 
I
R
 
K
I
 
L
T
 
A
S
 
D
E
 
K
M
 
A
P
 
P
P
 
E
S
 
S
R
 
T
P
 
P

4yyyB X-ray structure of the thymidine phosphorylase from salmonella typhimurium in complex with uridine (see paper)
47% identity, 90% coverage: 6:405/444 of query aligns to 4:405/440 of 4yyyB

query
sites
4yyyB
A
 
A
T
 
Q
G
 
E
L
 
I
I
 
I
R
 
R
C
 
K
K
 
K
R
 
R
D
 
D
G
 
G
G
 
H
Q
 
A
L
 
L
D
 
S
A
 
D
S
 
E
Q
 
E
L
 
I
R
 
R
A
 
F
V
 
F
A
 
I
Q
 
N
G
 
G
I
 
I
G
 
R
S
 
D
G
 
N
A
 
T
W
 
I
S
 
S
E
 
E
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
A
 
A
F
 
L
A
 
A
M
 
M
A
 
T
V
 
I
A
 
F
W
 
F
R
 
H
G
 
D
M
 
M
S
 
T
T
 
M
P
 
P
E
 
E
C
 
R
R
 
V
Q
 
S
F
 
L
T
 
T
L
 
M
A
 
A
L
 
M
R
 
R
D
 
D
S
 
S
G
 
G
Q
 
T
C
 
V
L
 
L
R
 
D
W
 
W
D
 
K
-
 
S
-
 
L
H
 
N
L
 
L
P
 
N
G
 
G
P
 
P
T
 
I
L
 
V
D
|
D
K
|
K
H
|
H
S
|
S
T
|
T
G
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
G
D
 
D
G
 
V
V
 
T
S
 
S
L
 
L
L
 
M
L
 
L
A
 
G
P
 
P
L
 
M
L
 
V
A
 
A
A
 
A
C
 
C
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
P
 
P
M
 
M
I
 
I
S
 
S
G
 
G
R
 
R
G
 
G
L
 
L
G
|
G
H
 
H
T
 
T
G
 
G
G
 
G
T
|
T
L
 
L
D
 
D
K
 
K
L
 
L
E
 
E
S
 
A
L
 
I
A
 
P
G
 
G
Y
 
F
D
 
D
V
 
I
H
 
F
P
 
P
S
 
D
T
 
D
A
 
N
R
 
R
L
 
F
R
 
R
Q
 
E
V
 
I
V
 
I
E
 
Q
E
 
D
V
 
V
G
 
G
C
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
I
G
 
G
Q
 
Q
G
 
T
D
 
S
E
 
S
L
 
L
V
 
A
P
 
P
A
 
A
D
|
D
R
 
K
R
 
R
L
 
F
Y
|
Y
A
 
A
V
 
T
R
|
R
D
 
D
V
 
I
T
 
T
A
 
A
T
 
T
V
 
V
D
 
D
V
 
S
A
 
I
D
 
P
L
 
L
M
 
I
V
 
T
A
 
G
S
|
S
I
|
I
L
 
L
S
 
A
K
|
K
K
|
K
L
 
L
A
 
A
G
 
E
G
 
G
A
 
L
R
 
D
V
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
M
D
 
D
I
 
V
K
 
K
T
 
V
G
 
G
N
 
S
G
 
G
A
 
A
Q
 
F
L
 
M
P
 
P
G
 
T
M
 
Y
A
 
E
A
 
L
A
 
S
R
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
E
R
 
A
M
 
I
L
 
V
A
 
G
V
 
V
A
 
A
E
 
N
G
 
G
S
 
A
G
 
G
L
 
V
D
 
R
L
 
T
R
 
T
V
 
A
V
 
L
Y
 
L
S
 
T
D
 
D
M
 
M
D
 
N
Q
 
Q
L
 
V
L
 
L
G
 
A
R
x
S
E
 
S
A
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
A
L
 
V
E
 
E
L
 
V
R
 
R
A
 
E
V
 
A
L
 
V
D
x
Q
L
 
F
L
 
L
C
 
T
S
 
G
R
 
E
G
x
Y
D
 
R
N
 
N
P
 
P
R
 
R
L
 
L
L
 
F
S
 
D
L
 
V
T
 
T
L
 
M
E
 
A
L
 
L
A
 
C
A
 
V
A
 
E
L
 
M
L
 
L
C
 
I
T
 
S
G
 
G
G
 
Q
L
 
L
A
 
A
D
 
K
D
 
D
R
 
D
N
 
A
D
 
E
A
 
A
E
 
R
R
 
A
R
 
K
L
 
L
R
 
Q
R
 
A
A
 
V
L
 
L
D
 
D
T
 
N
G
 
G
E
 
K
A
 
A
A
 
A
E
 
E
R
 
V
F
 
F
A
 
G
R
 
R
M
 
M
V
 
V
V
 
A
A
 
A
L
 
Q
G
 
K
G
 
G
P
 
P
A
 
S
D
 
D
L
 
F
L
 
V
Q
 
E
R
 
N
A
 
Y
D
 
D
V
 
K
H
 
Y
L
 
L
A
 
P
R
 
T
A
 
A
P
 
M
I
 
L
Q
 
S
R
 
K
E
 
A
V
 
V
R
 
Y
S
 
A
P
 
D
G
 
T
S
 
E
G
 
G
Y
 
F
V
 
I
V
 
S
A
 
A
V
 
M
D
 
D
V
 
T
R
 
R
A
 
A
L
 
L
G
 
G
Q
 
M
A
 
A
V
 
V
V
 
V
E
 
S
L
 
M
G
 
G
G
 
G
G
 
G
R
 
R
S
 
R
R
 
Q
P
 
A
G
 
S
Q
 
D
A
 
T
L
 
I
D
 
D
H
 
Y
A
 
S
V
 
V
G
 
G
L
 
F
A
 
T
E
 
D
V
 
M
L
 
A
G
 
R
C
 
L
G
 
G
S
 
D
A
 
S
V
 
I
E
 
D
A
 
G
G
 
Q
Q
 
R
P
 
P
L
 
L
A
 
A
I
 
V
I
 
I
H
 
H
A
 
A
R
 
K

4yekA X-ray structure of the thymidine phosphorylase from salmonella typhimurium in complex with thymidine (see paper)
47% identity, 90% coverage: 6:405/444 of query aligns to 4:405/440 of 4yekA

query
sites
4yekA
A
 
A
T
 
Q
G
 
E
L
 
I
I
 
I
R
 
R
C
 
K
K
 
K
R
 
R
D
 
D
G
 
G
G
 
H
Q
 
A
L
 
L
D
 
S
A
 
D
S
 
E
Q
 
E
L
 
I
R
 
R
A
 
F
V
 
F
A
 
I
Q
 
N
G
 
G
I
 
I
G
 
R
S
 
D
G
 
N
A
 
T
W
 
I
S
 
S
E
 
E
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
A
 
A
F
 
L
A
 
A
M
 
M
A
 
T
V
 
I
A
 
F
W
 
F
R
 
H
G
 
D
M
 
M
S
 
T
T
 
M
P
 
P
E
 
E
C
 
R
R
 
V
Q
 
S
F
 
L
T
 
T
L
 
M
A
 
A
L
 
M
R
 
R
D
 
D
S
 
S
G
 
G
Q
 
T
C
 
V
L
 
L
R
 
D
W
 
W
D
 
K
-
 
S
-
 
L
H
 
N
L
 
L
P
 
N
G
 
G
P
 
P
T
 
I
L
 
V
D
|
D
K
|
K
H
|
H
S
|
S
T
|
T
G
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
G
D
 
D
G
 
V
V
 
T
S
 
S
L
 
L
L
 
M
L
 
L
A
 
G
P
 
P
L
 
M
L
 
V
A
 
A
A
 
A
C
 
C
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
P
 
P
M
 
M
I
 
I
S
 
S
G
 
G
R
 
R
G
 
G
L
 
L
G
 
G
H
 
H
T
 
T
G
 
G
G
 
G
T
|
T
L
 
L
D
 
D
K
 
K
L
 
L
E
 
E
S
 
A
L
 
I
A
 
P
G
 
G
Y
 
F
D
 
D
V
 
I
H
 
F
P
 
P
S
 
D
T
 
D
A
 
N
R
 
R
L
 
F
R
 
R
Q
 
E
V
 
I
V
 
I
E
 
Q
E
 
D
V
 
V
G
 
G
C
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
I
G
 
G
Q
 
Q
G
 
T
D
 
S
E
 
S
L
 
L
V
 
A
P
 
P
A
 
A
D
|
D
R
 
K
R
 
R
L
 
F
Y
|
Y
A
 
A
V
 
T
R
|
R
D
 
D
V
 
I
T
 
T
A
 
A
T
 
T
V
 
V
D
 
D
V
 
S
A
 
I
D
 
P
L
 
L
M
 
I
V
 
T
A
 
G
S
|
S
I
 
I
L
 
L
S
 
A
K
|
K
K
|
K
L
 
L
A
 
A
G
 
E
G
 
G
A
 
L
R
 
D
V
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
M
D
 
D
I
 
V
K
 
K
T
 
V
G
 
G
N
 
S
G
 
G
A
 
A
Q
x
F
L
 
M
P
 
P
G
 
T
M
 
Y
A
 
E
A
 
L
A
 
S
R
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
E
R
 
A
M
 
I
L
 
V
A
 
G
V
 
V
A
 
A
E
 
N
G
 
G
S
 
A
G
 
G
L
 
V
D
 
R
L
 
T
R
 
T
V
 
A
V
 
L
Y
 
L
S
 
T
D
 
D
M
 
M
D
 
N
Q
 
Q
L
 
V
L
 
L
G
 
A
R
x
S
E
 
S
A
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
A
L
 
V
E
 
E
L
 
V
R
 
R
A
 
E
V
 
A
L
 
V
D
x
Q
L
 
F
L
 
L
C
 
T
S
 
G
R
 
E
G
x
Y
D
 
R
N
 
N
P
 
P
R
 
R
L
 
L
L
 
F
S
 
D
L
 
V
T
 
T
L
 
M
E
 
A
L
 
L
A
 
C
A
 
V
A
 
E
L
 
M
L
 
L
C
 
I
T
 
S
G
 
G
G
 
Q
L
 
L
A
 
A
D
 
K
D
 
D
R
 
D
N
 
A
D
 
E
A
 
A
E
 
R
R
 
A
R
 
K
L
 
L
R
 
Q
R
 
A
A
 
V
L
 
L
D
 
D
T
 
N
G
 
G
E
 
K
A
 
A
A
 
A
E
 
E
R
 
V
F
 
F
A
 
G
R
 
R
M
 
M
V
 
V
V
 
A
A
 
A
L
 
Q
G
 
K
G
 
G
P
 
P
A
 
S
D
 
D
L
 
F
L
 
V
Q
 
E
R
 
N
A
 
Y
D
 
D
V
 
K
H
 
Y
L
 
L
A
 
P
R
 
T
A
 
A
P
 
M
I
 
L
Q
 
S
R
 
K
E
 
A
V
 
V
R
 
Y
S
 
A
P
 
D
G
 
T
S
 
E
G
 
G
Y
 
F
V
 
I
V
 
S
A
 
A
V
 
M
D
 
D
V
 
T
R
 
R
A
 
A
L
 
L
G
 
G
Q
 
M
A
 
A
V
 
V
V
 
V
E
 
S
L
 
M
G
 
G
G
 
G
G
 
G
R
 
R
S
 
R
R
 
Q
P
 
A
G
 
S
Q
 
D
A
 
T
L
 
I
D
 
D
H
 
Y
A
 
S
V
 
V
G
 
G
L
 
F
A
x
T
E
x
D
V
 
M
L
 
A
G
 
R
C
 
L
G
 
G
S
 
D
A
 
S
V
 
I
E
 
D
A
 
G
G
 
Q
Q
 
R
P
 
P
L
 
L
A
 
A
I
 
V
I
 
I
H
 
H
A
 
A
R
 
K

5ey3A X-ray structure of the thymidine phosphorylase from salmonella typhimurium in complex with cytidine and sulphate
47% identity, 90% coverage: 6:405/444 of query aligns to 6:407/442 of 5ey3A

query
sites
5ey3A
A
 
A
T
 
Q
G
 
E
L
 
I
I
 
I
R
 
R
C
 
K
K
 
K
R
 
R
D
 
D
G
 
G
G
 
H
Q
 
A
L
 
L
D
 
S
A
 
D
S
 
E
Q
 
E
L
 
I
R
 
R
A
 
F
V
 
F
A
 
I
Q
 
N
G
 
G
I
 
I
G
 
R
S
 
D
G
 
N
A
 
T
W
 
I
S
 
S
E
 
E
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
A
 
A
F
 
L
A
 
A
M
 
M
A
 
T
V
 
I
A
 
F
W
 
F
R
 
H
G
 
D
M
 
M
S
 
T
T
 
M
P
 
P
E
 
E
C
 
R
R
 
V
Q
 
S
F
 
L
T
 
T
L
 
M
A
 
A
L
 
M
R
 
R
D
 
D
S
 
S
G
 
G
Q
 
T
C
 
V
L
 
L
R
 
D
W
 
W
D
 
K
-
 
S
-
 
L
H
 
N
L
 
L
P
 
N
G
 
G
P
 
P
T
 
I
L
 
V
D
|
D
K
|
K
H
|
H
S
|
S
T
 
T
G
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
G
D
 
D
G
 
V
V
 
T
S
 
S
L
 
L
L
 
M
L
 
L
A
 
G
P
 
P
L
 
M
L
 
V
A
 
A
A
 
A
C
 
C
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
P
 
P
M
 
M
I
 
I
S
 
S
G
 
G
R
|
R
G
 
G
L
 
L
G
 
G
H
 
H
T
 
T
G
 
G
G
 
G
T
|
T
L
 
L
D
 
D
K
 
K
L
 
L
E
|
E
S
 
A
L
 
I
A
 
P
G
 
G
Y
 
F
D
 
D
V
 
I
H
 
F
P
 
P
S
 
D
T
 
D
A
 
N
R
 
R
L
 
F
R
 
R
Q
 
E
V
 
I
V
 
I
E
 
Q
E
 
D
V
 
V
G
 
G
C
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
I
G
 
G
Q
 
Q
G
 
T
D
 
S
E
 
S
L
 
L
V
 
A
P
 
P
A
 
A
D
|
D
R
 
K
R
 
R
L
 
F
Y
 
Y
A
 
A
V
 
T
R
|
R
D
 
D
V
 
I
T
 
T
A
 
A
T
 
T
V
 
V
D
 
D
V
 
S
A
 
I
D
 
P
L
 
L
M
 
I
V
 
T
A
 
G
S
|
S
I
 
I
L
 
L
S
 
A
K
|
K
K
|
K
L
 
L
A
 
A
G
 
E
G
 
G
A
 
L
R
 
D
V
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
M
D
 
D
I
 
V
K
 
K
T
 
V
G
 
G
N
 
S
G
 
G
A
 
A
Q
 
F
L
 
M
P
 
P
G
 
T
M
 
Y
A
 
E
A
 
L
A
 
S
R
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
E
R
 
A
M
 
I
L
 
V
A
 
G
V
 
V
A
 
A
E
 
N
G
 
G
S
 
A
G
 
G
L
 
V
D
 
R
L
 
T
R
 
T
V
 
A
V
 
L
Y
 
L
S
 
T
D
 
D
M
 
M
D
 
N
Q
 
Q
L
 
V
L
 
L
G
 
A
R
 
S
E
 
S
A
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
A
L
 
V
E
 
E
L
 
V
R
 
R
A
 
E
V
 
A
L
 
V
D
 
Q
L
 
F
L
 
L
C
 
T
S
 
G
R
 
E
G
 
Y
D
 
R
N
 
N
P
 
P
R
 
R
L
 
L
L
 
F
S
 
D
L
 
V
T
 
T
L
 
M
E
 
A
L
 
L
A
 
C
A
 
V
A
 
E
L
 
M
L
 
L
C
 
I
T
 
S
G
 
G
G
 
Q
L
 
L
A
 
A
D
 
K
D
 
D
R
 
D
N
 
A
D
 
E
A
 
A
E
 
R
R
 
A
R
 
K
L
 
L
R
 
Q
R
 
A
A
 
V
L
 
L
D
 
D
T
 
N
G
 
G
E
 
K
A
 
A
A
 
A
E
 
E
R
 
V
F
 
F
A
 
G
R
 
R
M
 
M
V
 
V
V
 
A
A
 
A
L
 
Q
G
 
K
G
 
G
P
 
P
A
 
S
D
 
D
L
 
F
L
 
V
Q
 
E
R
 
N
A
 
Y
D
 
D
V
 
K
H
 
Y
L
 
L
A
 
P
R
 
T
A
 
A
P
 
M
I
 
L
Q
 
S
R
 
K
E
 
A
V
 
V
R
 
Y
S
 
A
P
 
D
G
 
T
S
 
E
G
 
G
Y
 
F
V
 
I
V
 
S
A
 
A
V
 
M
D
 
D
V
 
T
R
 
R
A
 
A
L
 
L
G
 
G
Q
 
M
A
 
A
V
 
V
V
 
V
E
 
S
L
 
M
G
 
G
G
 
G
G
 
G
R
 
R
S
 
R
R
 
Q
P
 
A
G
 
S
Q
 
D
A
 
T
L
 
I
D
 
D
H
 
Y
A
 
S
V
 
V
G
 
G
L
 
F
A
 
T
E
 
D
V
 
M
L
 
A
G
 
R
C
 
L
G
 
G
S
 
D
A
 
S
V
 
I
E
 
D
A
 
G
G
 
Q
Q
 
R
P
 
P
L
 
L
A
 
A
I
 
V
I
 
I
H
 
H
A
 
A
R
 
K

7m7kB Crystal structure of uridine bound to geobacillus thermoglucosidasius pyrimidine nucleoside phosphorylase pynp
38% identity, 97% coverage: 9:437/444 of query aligns to 5:429/432 of 7m7kB

query
sites
7m7kB
L
 
L
I
 
I
R
 
A
C
 
K
K
 
K
R
 
R
D
 
D
G
 
G
G
 
Y
Q
 
E
L
 
L
D
 
S
A
 
K
S
 
E
Q
 
E
L
 
I
R
 
D
A
 
F
V
 
I
A
 
I
Q
 
R
G
 
G
I
 
Y
G
 
T
S
 
N
G
 
G
A
 
D
W
 
I
S
 
P
E
 
D
G
 
Y
Q
 
Q
I
 
M
A
 
S
A
 
A
F
 
F
A
 
A
M
 
M
A
 
A
V
 
V
A
 
F
W
 
F
R
 
R
G
 
G
M
 
M
S
 
T
T
 
E
P
 
E
E
 
E
C
 
T
R
 
A
Q
 
A
F
 
L
T
 
T
L
 
M
A
 
A
L
 
M
R
 
V
D
 
R
S
 
S
G
 
G
Q
 
D
C
 
V
L
 
I
R
 
D
W
 
L
D
 
S
H
 
K
L
 
I
P
 
E
G
 
G
P
 
M
T
 
K
L
 
V
D
 
D
K
 
K
H
 
H
S
 
S
T
|
T
G
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
G
D
 
D
G
 
T
V
 
T
S
 
T
L
 
L
L
 
V
L
 
L
A
 
G
P
 
P
L
 
L
L
 
V
A
 
A
A
 
S
C
 
V
G
 
G
G
 
V
Y
 
P
V
 
V
P
 
A
M
 
K
I
 
M
S
 
S
G
 
G
R
 
R
G
 
G
L
 
L
G
 
G
H
 
H
T
 
T
G
 
G
G
 
G
T
 
T
L
 
I
D
 
D
K
 
K
L
 
L
E
 
E
S
 
S
L
 
V
A
 
P
G
 
G
Y
 
F
D
 
H
V
 
V
H
 
E
P
 
I
S
 
D
T
 
N
A
 
E
R
 
Q
L
 
F
R
 
I
Q
 
E
V
 
L
V
 
V
E
 
N
E
 
K
V
 
N
G
 
K
C
 
I
A
 
A
I
 
I
V
 
I
G
 
G
Q
 
Q
G
 
T
D
 
G
E
 
N
L
 
L
V
 
T
P
 
P
A
 
A
D
 
D
R
 
K
R
 
K
L
 
L
Y
|
Y
A
 
A
V
 
L
R
|
R
D
 
D
V
 
V
T
 
T
A
 
A
T
 
T
V
 
V
D
 
D
V
 
S
A
 
I
D
 
P
L
 
L
M
 
I
V
 
A
A
 
S
S
|
S
I
 
I
L
 
M
S
 
S
K
|
K
K
 
K
L
 
I
A
 
A
G
 
A
G
 
G
A
 
A
R
 
D
V
 
A
L
 
I
V
 
V
L
 
L
D
 
D
I
 
V
K
 
K
T
 
T
G
 
G
N
 
A
G
 
G
A
 
A
Q
x
F
L
 
M
P
 
K
G
 
D
M
 
F
A
 
A
A
 
G
A
 
A
R
 
K
A
 
R
L
 
L
A
 
A
G
 
T
R
 
A
M
 
M
L
 
V
A
 
E
V
 
I
A
 
G
E
 
K
G
 
R
S
 
V
G
 
G
L
 
R
D
 
K
L
 
T
R
 
M
V
 
A
V
 
V
Y
 
I
S
 
S
D
 
D
M
 
M
D
 
S
Q
 
Q
L
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
Y
E
 
A
A
 
V
G
 
G
N
 
N
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
V
R
 
K
A
 
E
V
 
A
L
 
I
D
 
D
L
 
T
L
 
L
C
 
-
S
 
-
R
 
K
G
 
G
D
 
K
N
 
G
P
 
P
R
 
E
-
 
D
L
 
L
L
 
Q
S
 
E
L
 
L
T
 
C
L
 
L
E
 
T
L
 
L
A
 
G
A
 
S
A
 
Y
L
 
M
L
 
V
C
 
Y
T
 
L
G
 
A
G
 
E
L
 
K
A
 
A
D
 
S
D
 
S
R
 
L
N
 
E
D
 
E
A
 
A
E
 
R
R
 
A
R
 
L
L
 
L
R
 
E
R
 
A
A
 
S
L
 
I
D
 
R
T
 
E
G
 
G
E
 
K
A
 
A
A
 
L
E
 
E
R
 
T
F
 
F
A
 
K
R
 
V
M
 
F
V
 
L
V
 
S
A
 
A
L
 
Q
G
 
G
G
 
G
P
 
D
A
 
A
D
 
S
L
 
V
L
 
V
Q
 
D
R
 
D
A
 
P
D
 
-
V
 
T
H
 
K
L
 
L
A
 
P
R
 
Q
A
 
A
P
 
K
I
 
Y
Q
 
R
R
 
W
E
 
E
V
 
L
R
 
E
S
 
A
P
 
P
G
 
E
S
 
D
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
V
 
A
A
 
E
V
 
I
D
 
V
V
 
A
R
 
D
A
 
E
L
 
V
G
 
G
Q
 
T
A
 
A
V
 
A
V
 
M
E
 
L
L
 
L
G
 
G
G
 
A
G
 
G
R
 
R
S
 
A
R
 
T
P
 
K
G
 
E
Q
 
A
A
 
T
L
 
I
D
 
D
H
 
L
A
 
S
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
V
E
 
L
V
 
H
L
 
K
G
 
K
C
 
V
G
 
G
S
 
D
A
 
A
V
 
V
E
 
K
A
 
K
G
 
G
Q
 
E
P
 
S
L
 
L
A
 
V
I
 
T
I
 
I
H
 
Y
A
 
S
R
 
-
R
 
N
A
 
T
D
 
E
D
 
N
A
 
I
E
 
E
A
 
E
V
 
V
Q
 
K
R
 
Q
R
 
K
V
 
L
A
 
A
C
 
K
A
 
S
F
 
I
R
 
R
I
 
L
T
 
S
S
 
S
E
 
-
M
 
I
P
 
P
P
 
V
S
 
A
R
 
K
P
 
P
L
 
T
W
 
L
Q
 
I
W
 
Y
H
 
E

1brwB The crystal structure of pyrimidine nucleoside phosphorylase in a closed conformation (see paper)
39% identity, 96% coverage: 5:432/444 of query aligns to 2:425/433 of 1brwB

query
sites
1brwB
R
 
R
A
 
M
T
 
V
G
 
D
L
 
L
I
 
I
R
 
A
C
 
K
K
 
K
R
 
R
D
 
D
G
 
G
G
 
K
Q
 
A
L
 
L
D
 
T
A
 
K
S
 
E
Q
 
E
L
 
I
R
 
E
A
 
W
V
 
I
A
 
V
Q
 
R
G
 
G
I
 
Y
G
 
T
S
 
N
G
 
G
A
 
D
W
 
I
S
 
P
E
 
D
G
 
Y
Q
 
Q
I
 
M
A
 
S
A
 
A
F
 
L
A
 
A
M
 
M
A
 
A
V
 
I
A
 
Y
W
 
F
R
 
R
G
 
G
M
 
M
S
 
T
T
 
E
P
 
E
E
 
E
C
 
T
R
 
A
Q
 
A
F
 
L
T
 
T
L
 
M
A
 
A
L
 
M
R
 
V
D
 
Q
S
 
S
G
 
G
Q
 
E
C
 
M
L
 
L
R
 
D
W
 
L
D
 
S
H
 
S
L
 
I
P
 
R
G
 
G
P
 
V
T
 
K
L
 
V
D
|
D
K
|
K
H
|
H
S
|
S
T
|
T
G
 
G
G
 
G
V
 
V
G
|
G
D
 
D
G
 
T
V
 
T
S
x
T
L
 
L
L
 
V
L
 
L
A
 
G
P
 
P
L
 
L
L
 
V
A
 
A
A
 
S
C
 
V
G
 
G
G
 
V
Y
 
P
V
 
V
P
 
A
M
x
K
I
 
M
S
|
S
G
 
G
R
 
R
G
 
G
L
|
L
G
 
G
H
 
H
T
 
T
G
 
G
G
 
G
T
|
T
L
 
I
D
 
D
K
 
K
L
 
L
E
 
E
S
 
S
L
 
V
A
 
P
G
 
G
Y
 
F
D
 
H
V
 
V
H
 
E
P
 
I
S
 
S
T
 
K
A
 
D
R
 
E
L
 
F
R
 
I
Q
 
R
V
 
L
V
 
V
E
 
N
E
 
E
V
 
N
G
 
G
C
 
I
A
 
A
I
 
I
V
 
I
G
 
G
Q
 
Q
G
 
T
D
 
G
E
 
D
L
 
L
V
 
T
P
 
P
A
 
A
D
|
D
R
 
K
R
 
K
L
 
L
Y
|
Y
A
 
A
V
 
L
R
|
R
D
 
D
V
 
V
T
 
T
A
 
A
T
 
T
V
 
V
D
 
N
V
 
S
A
 
I
D
 
P
L
 
L
M
x
I
V
 
A
A
 
S
S
|
S
I
|
I
L
 
M
S
 
S
K
|
K
K
|
K
L
 
I
A
 
A
G
 
A
G
 
G
A
 
A
R
 
D
V
 
A
L
 
I
V
 
V
L
 
L
D
 
D
I
 
V
K
 
K
T
 
T
G
 
G
N
 
A
G
 
G
A
 
A
Q
 
F
L
 
M
P
 
K
G
 
K
M
 
L
A
 
D
A
 
E
A
 
A
R
 
R
A
 
R
L
 
L
A
 
A
G
 
R
R
 
V
M
 
M
L
 
V
A
 
D
V
 
I
A
 
G
E
 
K
G
 
R
S
 
V
G
 
G
L
 
R
D
 
R
L
 
T
R
 
M
V
 
A
V
 
V
Y
 
I
S
 
S
D
 
D
M
 
M
D
 
S
Q
 
Q
L
 
P
L
|
L
G
 
G
R
 
Y
E
x
A
A
 
V
G
 
G
N
 
N
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
V
R
 
K
A
x
E
V
 
A
L
 
I
D
 
E
L
 
T
L
 
L
C
 
-
S
 
-
R
 
K
G
 
G
D
 
N
N
 
G
P
 
P
R
 
H
-
 
D
L
 
L
L
 
T
S
 
E
L
 
L
T
 
C
L
 
L
E
 
T
L
 
L
A
 
G
A
 
S
A
 
H
L
 
M
L
 
V
C
 
Y
T
 
L
G
 
A
G
 
E
L
 
K
A
 
A
D
 
P
D
 
S
R
 
L
N
 
D
D
 
E
A
 
A
E
 
R
R
 
R
R
 
L
L
 
L
R
 
E
R
 
E
A
 
A
L
 
I
D
 
R
T
 
S
G
 
G
E
 
A
A
 
A
A
 
I
E
 
A
R
 
A
F
 
F
A
 
K
R
 
T
M
 
F
V
 
L
V
 
A
A
 
A
L
 
Q
G
 
G
G
 
G
P
 
D
A
 
A
D
 
S
L
 
V
L
 
V
Q
 
D
R
 
D
A
 
L
D
 
D
V
 
-
H
 
K
L
 
L
A
 
P
R
 
K
A
 
A
P
 
A
I
 
Y
Q
 
T
R
 
S
E
 
T
V
 
V
R
 
T
S
 
A
P
 
A
G
 
A
S
 
D
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
V
 
A
A
 
E
V
 
M
D
 
A
V
 
A
R
 
D
A
 
D
L
 
I
G
 
G
Q
 
T
A
 
A
V
 
A
V
 
M
E
 
W
L
 
L
G
 
G
G
 
A
G
 
G
R
 
R
S
 
A
R
 
K
P
 
K
G
 
E
Q
 
D
A
 
V
L
 
I
D
 
D
H
 
L
A
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
I
A
 
V
E
 
L
V
 
H
L
 
K
G
 
K
C
 
I
G
 
G
S
 
D
A
 
R
V
 
V
E
 
Q
A
 
K
G
 
G
Q
 
E
P
 
A
L
 
L
A
 
A
I
 
T
I
 
I
H
 
H
A
 
S
R
 
N
R
 
R
A
 
P
D
 
D
D
 
V
A
 
L
E
 
D
A
 
-
V
 
V
Q
 
K
R
 
E
R
 
K
V
 
I
A
 
E
C
 
A
A
 
A
F
 
I
R
 
R
I
 
L
T
 
S
S
 
P
E
 
Q
M
 
-
P
 
P
P
 
V
S
 
A
R
 
R
P
 
P

1brwA The crystal structure of pyrimidine nucleoside phosphorylase in a closed conformation (see paper)
39% identity, 96% coverage: 5:432/444 of query aligns to 2:425/433 of 1brwA

query
sites
1brwA
R
 
R
A
 
M
T
 
V
G
 
D
L
 
L
I
 
I
R
 
A
C
 
K
K
 
K
R
 
R
D
 
D
G
 
G
G
 
K
Q
 
A
L
 
L
D
 
T
A
 
K
S
 
E
Q
 
E
L
 
I
R
 
E
A
 
W
V
 
I
A
 
V
Q
 
R
G
 
G
I
 
Y
G
 
T
S
 
N
G
 
G
A
 
D
W
 
I
S
 
P
E
 
D
G
 
Y
Q
 
Q
I
 
M
A
 
S
A
 
A
F
 
L
A
 
A
M
 
M
A
 
A
V
 
I
A
 
Y
W
 
F
R
 
R
G
 
G
M
 
M
S
 
T
T
 
E
P
 
E
E
 
E
C
 
T
R
 
A
Q
 
A
F
 
L
T
 
T
L
 
M
A
 
A
L
 
M
R
 
V
D
 
Q
S
 
S
G
 
G
Q
 
E
C
 
M
L
 
L
R
 
D
W
 
L
D
 
S
H
 
S
L
 
I
P
 
R
G
 
G
P
 
V
T
 
K
L
 
V
D
 
D
K
|
K
H
|
H
S
|
S
T
 
T
G
 
G
G
 
G
V
 
V
G
|
G
D
 
D
G
x
T
V
 
T
S
x
T
L
 
L
L
 
V
L
 
L
A
 
G
P
 
P
L
 
L
L
 
V
A
 
A
A
 
S
C
 
V
G
 
G
G
 
V
Y
 
P
V
 
V
P
 
A
M
x
K
I
 
M
S
 
S
G
 
G
R
 
R
G
 
G
L
 
L
G
 
G
H
 
H
T
 
T
G
 
G
G
 
G
T
 
T
L
 
I
D
 
D
K
 
K
L
 
L
E
 
E
S
 
S
L
 
V
A
 
P
G
 
G
Y
 
F
D
 
H
V
 
V
H
 
E
P
 
I
S
 
S
T
 
K
A
 
D
R
 
E
L
 
F
R
 
I
Q
 
R
V
 
L
V
 
V
E
 
N
E
 
E
V
 
N
G
 
G
C
 
I
A
 
A
I
 
I
V
 
I
G
 
G
Q
 
Q
G
 
T
D
 
G
E
 
D
L
 
L
V
 
T
P
 
P
A
 
A
D
|
D
R
 
K
R
 
K
L
 
L
Y
 
Y
A
 
A
V
 
L
R
|
R
D
 
D
V
 
V
T
 
T
A
 
A
T
 
T
V
 
V
D
 
N
V
 
S
A
 
I
D
 
P
L
 
L
M
 
I
V
 
A
A
 
S
S
|
S
I
 
I
L
 
M
S
 
S
K
|
K
K
 
K
L
 
I
A
 
A
G
 
A
G
 
G
A
 
A
R
 
D
V
 
A
L
 
I
V
 
V
L
 
L
D
 
D
I
 
V
K
 
K
T
 
T
G
 
G
N
 
A
G
 
G
A
 
A
Q
 
F
L
 
M
P
 
K
G
 
K
M
 
L
A
 
D
A
 
E
A
 
A
R
 
R
A
 
R
L
 
L
A
 
A
G
 
R
R
 
V
M
 
M
L
 
V
A
 
D
V
 
I
A
 
G
E
 
K
G
 
R
S
 
V
G
 
G
L
 
R
D
 
R
L
 
T
R
 
M
V
 
A
V
 
V
Y
 
I
S
 
S
D
 
D
M
 
M
D
 
S
Q
 
Q
L
 
P
L
|
L
G
 
G
R
 
Y
E
x
A
A
 
V
G
 
G
N
 
N
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
V
R
 
K
A
x
E
V
 
A
L
 
I
D
 
E
L
 
T
L
 
L
C
 
-
S
 
-
R
 
K
G
 
G
D
 
N
N
 
G
P
 
P
R
 
H
-
 
D
L
 
L
L
 
T
S
 
E
L
 
L
T
 
C
L
 
L
E
 
T
L
 
L
A
 
G
A
 
S
A
 
H
L
 
M
L
 
V
C
 
Y
T
 
L
G
 
A
G
 
E
L
 
K
A
 
A
D
 
P
D
 
S
R
 
L
N
 
D
D
 
E
A
 
A
E
 
R
R
 
R
R
 
L
L
 
L
R
 
E
R
 
E
A
 
A
L
 
I
D
 
R
T
 
S
G
 
G
E
 
A
A
 
A
A
 
I
E
 
A
R
 
A
F
 
F
A
 
K
R
 
T
M
 
F
V
 
L
V
 
A
A
 
A
L
 
Q
G
 
G
G
 
G
P
 
D
A
 
A
D
 
S
L
 
V
L
 
V
Q
 
D
R
 
D
A
 
L
D
 
D
V
 
-
H
 
K
L
 
L
A
 
P
R
 
K
A
 
A
P
 
A
I
 
Y
Q
 
T
R
 
S
E
 
T
V
 
V
R
 
T
S
 
A
P
 
A
G
 
A
S
 
D
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
V
 
A
A
 
E
V
 
M
D
 
A
V
 
A
R
 
D
A
 
D
L
 
I
G
 
G
Q
 
T
A
 
A
V
 
A
V
 
M
E
 
W
L
 
L
G
 
G
G
 
A
G
 
G
R
 
R
S
 
A
R
 
K
P
 
K
G
 
E
Q
 
D
A
 
V
L
 
I
D
 
D
H
 
L
A
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
I
A
 
V
E
 
L
V
 
H
L
 
K
G
 
K
C
 
I
G
 
G
S
 
D
A
 
R
V
 
V
E
 
Q
A
 
K
G
 
G
Q
 
E
P
 
A
L
 
L
A
 
A
I
 
T
I
 
I
H
 
H
A
 
S
R
 
N
R
 
R
A
 
P
D
 
D
D
 
V
A
 
L
E
 
D
A
 
-
V
 
V
Q
 
K
R
 
E
R
 
K
V
 
I
A
 
E
C
 
A
A
 
A
F
 
I
R
 
R
I
 
L
T
 
S
S
 
P
E
 
Q
M
 
-
P
 
P
P
 
V
S
 
A
R
 
R
P
 
P

P77836 Pyrimidine-nucleoside phosphorylase; PYNP; Py-NPase; EC 2.4.2.2 from Geobacillus stearothermophilus (Bacillus stearothermophilus) (see paper)
37% identity, 97% coverage: 5:436/444 of query aligns to 2:429/433 of P77836

query
sites
P77836
R
 
R
A
 
M
T
 
V
G
 
D
L
 
L
I
 
I
R
 
E
C
 
K
K
 
K
R
 
R
D
 
D
G
 
G
G
 
H
Q
 
A
L
 
L
D
 
T
A
 
K
S
 
E
Q
 
E
L
 
I
R
 
Q
A
 
F
V
 
I
A
 
I
Q
 
E
G
 
G
I
 
Y
G
 
T
S
 
K
G
 
G
A
 
D
W
 
I
S
 
P
E
 
D
G
 
Y
Q
 
Q
I
 
M
A
 
S
A
 
A
F
 
L
A
 
A
M
 
M
A
 
A
V
 
I
A
 
F
W
 
F
R
 
R
G
 
G
M
 
M
S
 
N
T
 
E
P
 
E
E
 
E
C
 
T
R
 
A
Q
 
E
F
 
L
T
 
T
L
 
M
A
 
A
L
 
M
R
 
V
D
 
H
S
 
S
G
 
G
Q
 
D
C
 
T
L
 
I
R
 
D
W
 
L
D
 
S
H
 
R
L
 
I
P
 
E
G
 
G
P
 
I
T
 
K
L
 
V
D
 
D
K
|
K
H
|
H
S
|
S
T
 
T
G
 
G
G
 
G
V
 
V
G
|
G
D
 
D
G
x
T
V
 
T
S
x
T
L
 
L
L
 
V
L
 
L
A
 
G
P
 
P
L
 
L
L
 
V
A
 
A
A
 
S
C
 
V
G
 
G
G
 
V
Y
 
P
V
 
V
P
 
A
M
x
K
I
x
M
S
|
S
G
 
G
R
 
R
G
 
G
L
 
L
G
 
G
H
 
H
T
 
T
G
 
G
G
 
G
T
|
T
L
 
I
D
 
D
K
 
K
L
 
L
E
 
E
S
 
S
L
 
V
A
 
P
G
 
G
Y
 
F
D
 
H
V
 
V
H
 
E
P
 
I
S
 
T
T
 
N
A
 
D
R
 
E
L
 
F
R
 
I
Q
 
D
V
 
L
V
 
V
E
 
N
E
 
K
V
 
N
G
 
K
C
 
I
A
 
A
I
 
V
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
G
 
S
D
 
G
E
 
N
L
 
L
V
 
T
P
 
P
A
 
A
D
 
D
R
 
K
R
 
K
L
 
L
Y
 
Y
A
 
A
V
 
L
R
|
R
D
 
D
V
 
V
T
 
T
A
 
A
T
 
T
V
 
V
D
 
N
V
 
S
A
 
I
D
 
P
L
 
L
M
 
I
V
 
A
A
 
S
S
 
S
I
 
I
L
 
M
S
 
S
K
|
K
K
 
K
L
 
I
A
 
A
G
 
A
G
 
G
A
 
A
R
 
D
V
 
A
L
 
I
V
 
V
L
 
L
D
 
D
I
 
V
K
 
K
T
 
T
G
 
G
N
 
V
G
 
G
A
 
A
Q
 
F
L
 
M
P
 
K
G
 
D
M
 
L
A
 
N
A
 
D
A
 
A
R
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
K
R
 
A
M
 
M
L
 
V
A
 
D
V
 
I
A
 
G
E
 
N
G
 
R
S
 
V
G
 
G
L
 
R
D
 
K
L
 
T
R
 
M
V
 
A
V
 
I
Y
 
I
S
 
S
D
 
D
M
 
M
D
 
S
Q
 
Q
L
 
P
L
|
L
G
 
G
R
 
Y
E
x
A
A
 
I
G
 
G
N
 
N
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
V
R
 
K
A
x
E
V
 
A
L
 
I
D
 
D
L
 
T
L
 
L
C
 
-
S
 
-
R
 
K
G
 
G
D
 
E
N
 
G
P
 
P
R
 
E
-
 
D
L
 
F
L
 
Q
S
 
E
L
 
L
T
 
C
L
 
L
E
 
V
L
 
L
A
 
G
A
 
S
A
 
H
L
 
M
L
 
V
C
 
Y
T
 
L
G
 
A
G
 
E
L
 
K
A
 
A
D
 
S
D
 
S
R
 
L
N
 
E
D
 
E
A
 
A
E
 
R
R
 
H
R
 
M
L
 
L
R
 
E
R
 
K
A
 
A
L
 
M
D
 
K
T
 
D
G
 
G
E
 
S
A
 
A
A
 
L
E
 
Q
R
 
T
F
 
F
A
 
K
R
 
T
M
 
F
V
 
L
V
 
A
A
 
A
L
 
Q
G
 
G
G
 
G
P
 
D
A
 
A
D
 
S
L
 
V
L
 
V
Q
 
D
R
 
D
A
 
P
D
 
S
V
 
-
H
 
K
L
 
L
A
 
P
R
 
Q
A
 
A
P
 
K
I
 
Y
Q
 
I
R
 
I
E
 
E
V
 
L
R
 
E
S
 
A
P
 
K
G
 
E
S
 
D
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
V
 
S
A
 
E
V
 
I
D
 
V
V
 
A
R
 
D
A
 
A
L
 
V
G
 
G
Q
 
T
A
 
A
V
 
A
V
 
M
E
 
W
L
 
L
G
 
G
G
 
A
G
 
G
R
 
R
S
 
A
R
 
T
P
 
K
G
 
E
Q
 
S
A
 
T
L
 
I
D
 
D
H
 
L
A
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
V
E
 
L
V
 
R
L
 
K
G
 
K
C
 
V
G
 
G
S
 
D
A
 
A
V
 
V
E
 
K
A
 
K
G
 
G
Q
 
E
P
 
S
L
 
L
A
 
V
I
 
T
I
 
I
H
 
Y
A
 
S
R
 
N
R
 
R
A
 
-
D
 
E
D
 
Q
A
 
V
E
 
D
A
 
D
V
 
V
Q
 
K
R
 
Q
R
 
K
V
 
L
A
 
Y
C
 
E
A
 
N
F
 
I
R
 
R
I
 
I
T
 
-
S
 
S
E
 
A
M
 
T
P
 
P
P
 
V
S
 
Q
R
 
A
P
 
P
L
 
T
W
 
L
Q
 
I
W
 
Y

2j0fA Structural basis for non-competitive product inhibition in human thymidine phosphorylase: implication for drug design (see paper)
45% identity, 89% coverage: 9:403/444 of query aligns to 6:408/446 of 2j0fA

query
sites
2j0fA
L
 
L
I
 
I
R
 
R
C
 
M
K
 
K
R
 
R
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Q
 
R
L
 
L
D
 
S
A
 
E
S
 
A
Q
 
D
L
 
I
R
 
R
A
 
G
V
 
F
A
 
V
Q
 
A
G
 
A
I
 
V
G
 
V
S
 
N
G
 
G
A
 
S
W
 
A
S
 
Q
E
 
G
G
 
A
Q
 
Q
I
 
I
A
 
G
A
 
A
F
 
M
A
 
L
M
 
M
A
 
A
V
 
I
A
 
R
W
 
L
R
 
R
G
 
G
M
 
M
S
 
D
T
 
L
P
 
E
E
 
E
C
 
T
R
 
S
Q
 
V
F
 
L
T
 
T
L
 
Q
A
 
A
L
 
L
R
 
A
D
 
Q
S
 
S
G
 
G
Q
 
Q
C
 
Q
L
 
L
R
 
E
W
 
W
D
 
P
H
 
E
L
 
A
P
 
W
G
 
R
P
 
Q
T
 
Q
L
 
L
-
 
V
D
|
D
K
|
K
H
|
H
S
|
S
T
|
T
G
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
G
D
 
D
G
 
K
V
 
V
S
 
S
L
 
L
L
 
V
L
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
C
 
C
G
 
G
G
 
C
Y
 
K
V
 
V
P
 
P
M
 
M
I
 
I
S
 
S
G
 
G
R
 
R
G
 
G
L
|
L
G
 
G
H
 
H
T
 
T
G
 
G
G
 
G
T
|
T
L
 
L
D
 
D
K
 
K
L
 
L
E
 
E
S
 
S
L
 
I
A
 
P
G
 
G
Y
 
F
D
 
N
V
 
V
H
 
I
P
 
Q
S
 
S
T
 
P
A
 
E
R
 
Q
L
 
M
R
 
Q
Q
 
V
V
 
L
V
 
L
E
 
D
E
 
Q
V
 
A
G
 
G
C
 
C
A
 
C
I
 
I
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
G
 
S
D
 
E
E
 
Q
L
 
L
V
 
V
P
 
P
A
 
A
D
|
D
R
 
G
R
 
I
L
 
L
Y
|
Y
A
 
A
V
 
A
R
|
R
D
 
D
V
 
V
T
 
T
A
 
A
T
 
T
V
 
V
D
 
D
V
 
S
A
 
L
D
 
P
L
 
L
M
x
I
V
 
T
A
 
A
S
|
S
I
 
I
L
 
L
S
 
S
K
|
K
K
|
K
L
 
L
A
 
V
G
 
E
G
 
G
A
 
L
R
 
S
V
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
V
D
 
D
I
 
V
K
 
K
T
 
F
G
 
G
N
 
A
G
 
G
A
 
A
Q
 
V
L
 
F
P
 
P
G
 
N
M
 
Q
A
 
E
A
 
Q
A
 
A
R
 
R
A
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
K
R
 
T
M
 
L
L
 
V
A
 
G
V
 
V
A
 
G
E
 
A
G
 
S
S
 
L
G
 
G
L
 
L
D
 
R
L
 
V
R
 
A
V
 
A
V
 
A
Y
 
L
S
 
T
D
 
A
M
 
M
D
 
D
Q
 
K
L
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
R
E
 
C
A
 
V
G
 
G
N
 
H
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
V
R
 
E
A
 
E
V
 
A
L
 
-
D
 
-
L
 
L
L
 
L
C
 
C
S
 
M
R
 
D
G
 
G
D
 
A
N
 
G
-
 
P
P
 
P
R
 
D
L
 
L
L
 
R
S
 
D
L
 
L
T
 
V
L
 
T
E
 
T
L
 
L
A
 
G
A
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
L
C
 
W
T
 
L
G
 
S
G
 
G
L
 
H
A
 
A
D
 
G
D
 
T
R
 
Q
N
 
A
D
 
Q
A
 
G
E
 
A
R
 
A
R
 
R
L
 
V
R
 
A
R
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
T
 
D
G
 
G
E
 
S
A
 
A
A
 
L
E
 
G
R
 
R
F
 
F
A
 
E
R
 
R
M
 
M
V
 
L
V
 
A
A
 
A
L
 
Q
-
 
G
-
 
V
-
 
D
-
 
P
-
 
G
-
 
L
-
 
A
-
 
R
-
 
A
-
 
L
-
 
C
-
 
S
G
 
G
G
 
S
P
 
P
A
 
A
D
 
E
L
 
R
L
 
R
Q
 
Q
R
 
-
A
 
-
D
 
-
V
 
-
H
 
L
L
 
L
A
 
P
R
 
R
A
 
A
P
 
R
I
 
E
Q
 
Q
R
 
E
E
 
E
V
 
L
R
 
L
S
 
A
P
 
P
G
 
A
S
 
D
G
 
G
Y
 
T
V
 
V
V
 
E
A
 
L
V
 
V
D
 
R
V
 
A
R
 
L
A
 
P
L
 
L
G
 
A
Q
 
L
A
 
V
V
 
L
V
 
H
E
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
A
G
 
G
R
 
R
S
 
S
R
 
R
P
 
A
G
 
G
Q
 
E
A
 
P
L
 
L
D
 
R
H
 
L
A
 
G
V
 
V
G
 
G
L
 
A
A
 
E
E
 
L
V
 
L
L
 
V
G
 
D
C
 
V
G
 
G
S
 
Q
A
 
R
V
 
L
E
 
R
A
 
R
G
 
G
Q
 
T
P
 
P
L
 
W
A
 
L
I
 
R
I
 
V
H
 
H

2wk6A Structural features of native human thymidine phosphorylase and in complex with 5-iodouracil (see paper)
44% identity, 89% coverage: 9:403/444 of query aligns to 5:407/446 of 2wk6A

query
sites
2wk6A
L
 
L
I
 
I
R
 
R
C
 
M
K
 
K
R
 
R
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Q
 
R
L
 
L
D
 
S
A
 
E
S
 
A
Q
 
D
L
 
I
R
 
R
A
 
G
V
 
F
A
 
V
Q
 
A
G
 
A
I
 
V
G
 
V
S
 
N
G
 
G
A
 
S
W
 
A
S
 
Q
E
 
G
G
 
A
Q
 
Q
I
 
I
A
 
G
A
 
A
F
 
M
A
 
L
M
 
M
A
 
A
V
 
I
A
 
R
W
 
L
R
 
R
G
 
G
M
 
M
S
 
D
T
 
L
P
 
E
E
 
E
C
 
T
R
 
S
Q
 
V
F
 
L
T
 
T
L
 
Q
A
 
A
L
 
L
R
 
A
D
 
Q
S
 
S
G
 
G
Q
 
Q
C
 
Q
L
 
L
R
 
E
W
 
W
D
 
P
H
 
E
L
 
A
P
 
W
G
 
R
P
 
Q
T
 
Q
L
 
L
-
 
V
D
|
D
K
|
K
H
|
H
S
|
S
T
|
T
G
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
G
D
 
D
G
 
K
V
 
V
S
 
S
L
 
L
L
 
V
L
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
C
 
C
G
 
G
G
 
C
Y
 
K
V
 
V
P
 
P
M
 
M
I
 
I
S
 
S
G
 
G
R
 
R
G
 
G
L
|
L
G
 
G
H
 
H
T
 
T
G
 
G
G
 
G
T
|
T
L
 
L
D
 
D
K
 
K
L
 
L
E
 
E
S
 
S
L
 
I
A
 
P
G
 
G
Y
 
F
D
 
N
V
 
V
H
 
I
P
 
Q
S
 
S
T
 
P
A
 
E
R
 
Q
L
 
M
R
 
Q
Q
 
V
V
 
L
V
 
L
E
 
D
E
 
Q
V
 
A
G
 
G
C
 
C
A
 
C
I
 
I
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
G
 
S
D
 
E
E
 
Q
L
 
L
V
 
V
P
 
P
A
 
A
D
|
D
R
 
G
R
 
I
L
 
L
Y
|
Y
A
 
A
V
 
A
R
|
R
D
 
D
V
 
V
T
 
T
A
 
A
T
 
T
V
 
V
D
 
D
V
 
S
A
 
L
D
 
P
L
 
L
M
x
I
V
 
T
A
 
A
S
|
S
I
|
I
L
 
L
S
 
S
K
|
K
K
|
K
L
 
L
A
 
V
G
 
E
G
 
G
A
 
L
R
 
S
V
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
V
D
 
D
I
 
V
K
 
K
T
 
F
G
 
G
N
 
G
G
 
A
A
 
A
Q
 
V
L
 
F
P
 
P
G
 
N
M
 
Q
A
 
E
A
 
Q
A
 
A
R
 
R
A
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
K
R
 
T
M
 
L
L
 
V
A
 
G
V
 
V
A
 
G
E
 
A
G
 
S
S
 
L
G
 
G
L
 
L
D
 
R
L
 
V
R
 
A
V
 
A
V
 
A
Y
 
L
S
 
T
D
 
A
M
 
M
D
 
D
Q
 
K
L
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
R
E
 
C
A
 
V
G
 
G
N
 
H
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
V
R
 
E
A
 
E
V
 
A
L
 
-
D
 
-
L
 
L
L
 
L
C
 
C
S
 
M
R
 
D
G
 
G
D
 
A
N
 
G
-
 
P
P
 
P
R
 
D
L
 
L
L
 
R
S
 
D
L
 
L
T
 
V
L
 
T
E
 
T
L
 
L
A
 
G
A
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
L
C
 
W
T
 
L
G
 
S
G
 
G
L
 
H
A
 
A
D
 
G
D
 
T
R
 
Q
N
 
A
D
 
Q
A
 
G
E
 
A
R
 
A
R
 
R
L
 
V
R
 
A
R
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
T
 
D
G
 
G
E
 
S
A
 
A
A
 
L
E
 
G
R
 
R
F
 
F
A
 
E
R
 
R
M
 
M
V
 
L
V
 
A
A
 
A
L
 
Q
-
 
G
-
 
V
-
 
D
-
 
P
-
 
G
-
 
L
-
 
A
-
 
R
-
 
A
-
 
L
-
 
C
-
 
S
G
 
G
G
 
S
P
 
P
A
 
A
D
 
E
L
 
R
L
 
R
Q
 
Q
R
 
-
A
 
-
D
 
-
V
 
-
H
 
L
L
 
L
A
 
P
R
 
R
A
 
A
P
 
R
I
 
E
Q
 
Q
R
 
E
E
 
E
V
 
L
R
 
L
S
 
A
P
 
P
G
 
A
S
 
D
G
 
G
Y
 
T
V
 
V
V
 
E
A
 
L
V
 
V
D
 
R
V
 
A
R
 
L
A
 
P
L
 
L
G
 
A
Q
 
L
A
 
V
V
 
L
V
 
H
E
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
A
G
 
G
R
 
R
S
 
S
R
 
R
P
 
A
G
 
G
Q
 
E
A
 
P
L
 
L
D
 
R
H
 
L
A
 
G
V
 
V
G
 
G
L
 
A
A
 
E
E
 
L
V
 
L
L
 
V
G
 
D
C
 
V
G
 
G
S
 
Q
A
 
R
V
 
L
E
 
R
A
 
R
G
 
G
Q
 
T
P
 
P
L
 
W
A
 
L
I
 
R
I
 
V
H
 
H

P19971 Thymidine phosphorylase; TP; Gliostatin; Platelet-derived endothelial cell growth factor; PD-ECGF; TdRPase; EC 2.4.2.4 from Homo sapiens (Human) (see 3 papers)
44% identity, 89% coverage: 9:403/444 of query aligns to 39:441/482 of P19971

query
sites
P19971
L
 
L
I
 
I
R
 
R
C
 
M
K
 
K
R
 
R
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Q
 
R
L
 
L
D
 
S
A
 
E
S
 
A
Q
 
D
L
 
I
R
 
R
A
 
G
V
 
F
A
 
V
Q
 
A
G
 
A
I
 
V
G
 
V
S
 
N
G
 
G
A
 
S
W
 
A
S
 
Q
E
 
G
G
 
A
Q
 
Q
I
 
I
A
 
G
A
 
A
F
 
M
A
 
L
M
 
M
A
 
A
V
 
I
A
 
R
W
 
L
R
 
R
G
 
G
M
 
M
S
 
D
T
 
L
P
 
E
E
 
E
C
 
T
R
 
S
Q
 
V
F
 
L
T
 
T
L
 
Q
A
 
A
L
 
L
R
 
A
D
 
Q
S
 
S
G
 
G
Q
 
Q
C
 
Q
L
 
L
R
 
E
W
 
W
D
 
P
H
 
E
L
 
A
P
 
W
G
 
R
P
 
Q
T
 
Q
L
 
L
-
 
V
D
 
D
K
 
K
H
 
H
S
 
S
T
 
T
G
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
G
D
 
D
G
 
K
V
 
V
S
 
S
L
 
L
L
 
V
L
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
C
 
C
G
 
G
G
 
C
Y
 
K
V
 
V
P
 
P
M
 
M
I
 
I
S
 
S
G
 
G
R
 
R
G
 
G
L
 
L
G
 
G
H
 
H
T
 
T
G
 
G
G
 
G
T
 
T
L
 
L
D
 
D
K
 
K
L
 
L
E
 
E
S
 
S
L
 
I
A
 
P
G
 
G
Y
 
F
D
 
N
V
 
V
H
 
I
P
 
Q
S
 
S
T
 
P
A
 
E
R
 
Q
L
 
M
R
 
Q
Q
 
V
V
 
L
V
 
L
E
 
D
E
 
Q
V
 
A
G
 
G
C
 
C
A
 
C
I
 
I
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
G
 
S
D
 
E
E
 
Q
L
 
L
V
 
V
P
 
P
A
 
A
D
 
D
R
 
G
R
 
I
L
 
L
Y
|
Y
A
 
A
V
 
A
R
 
R
D
 
D
V
 
V
T
 
T
A
 
A
T
 
T
V
 
V
D
 
D
V
 
S
A
 
L
D
 
P
L
 
L
M
 
I
V
 
T
A
 
A
S
 
S
I
 
I
L
 
L
S
 
S
K
 
K
K
 
K
L
 
L
A
 
V
G
 
E
G
 
G
A
 
L
R
 
S
V
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
V
D
 
D
I
 
V
K
 
K
T
 
F
G
 
G
N
 
G
G
 
A
A
 
A
Q
 
V
L
 
F
P
 
P
G
 
N
M
 
Q
A
 
E
A
 
Q
A
 
A
R
 
R
A
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
K
R
 
T
M
 
L
L
 
V
A
 
G
V
 
V
A
 
G
E
 
A
G
 
S
S
 
L
G
 
G
L
 
L
D
 
R
L
 
V
R
 
A
V
 
A
V
 
A
Y
 
L
S
 
T
D
 
A
M
 
M
D
 
D
Q
 
K
L
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
R
E
 
C
A
 
V
G
 
G
N
 
H
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
V
R
 
E
A
 
E
V
 
A
L
 
-
D
 
-
L
 
L
L
 
L
C
 
C
S
 
M
R
 
D
G
 
G
D
 
A
N
 
G
P
 
P
R
 
P
-
 
D
L
 
L
L
 
R
S
 
D
L
 
L
T
 
V
L
 
T
E
 
T
L
 
L
A
 
G
A
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
L
C
 
W
T
 
L
G
 
S
G
 
G
L
 
H
A
 
A
D
 
G
D
 
T
R
 
Q
N
 
A
D
 
Q
A
 
G
E
 
A
R
 
A
R
 
R
L
 
V
R
 
A
R
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
T
 
D
G
 
G
E
 
S
A
 
A
A
 
L
E
 
G
R
 
R
F
 
F
A
 
E
R
 
R
M
 
M
V
 
L
V
 
A
A
 
A
L
 
Q
-
 
G
-
 
V
-
 
D
-
 
P
-
 
G
-
 
L
-
 
A
-
 
R
-
 
A
-
 
L
-
 
C
-
 
S
G
 
G
G
 
S
P
 
P
A
 
A
D
 
E
L
 
R
L
 
R
Q
 
Q
R
 
-
A
 
-
D
 
-
V
 
-
H
 
L
L
 
L
A
 
P
R
 
R
A
 
A
P
 
R
I
 
E
Q
 
Q
R
 
E
E
 
E
V
 
L
R
 
L
S
 
A
P
 
P
G
 
A
S
 
D
G
 
G
Y
 
T
V
 
V
V
 
E
A
 
L
V
 
V
D
 
R
V
 
A
R
 
L
A
 
P
L
 
L
G
 
A
Q
 
L
A
 
V
V
 
L
V
 
H
E
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
A
G
 
G
R
 
R
S
 
S
R
 
R
P
 
A
G
 
G
Q
 
E
A
 
P
L
 
L
D
 
R
H
 
L
A
 
G
V
 
V
G
 
G
L
 
A
A
 
E
E
 
L
V
 
L
L
 
V
G
 
D
C
 
V
G
 
G
S
 
Q
A
 
R
V
 
L
E
 
R
A
 
R
G
 
G
Q
 
T
P
 
P
L
 
W
A
 
L
I
 
R
I
 
V
H
 
H

Sites not aligning to the query:

5olnB X-ray structure of the complex pyrimidine-nucleoside phosphorylase from bacillus subtilis at 1.88 a (see paper)
36% identity, 95% coverage: 3:426/444 of query aligns to 1:421/434 of 5olnB

query
sites
5olnB
A
 
A
Q
 
M
R
 
R
A
 
M
T
 
V
G
 
D
L
 
I
I
 
I
R
 
I
C
 
K
K
 
K
R
 
Q
D
 
N
G
 
G
G
 
K
Q
 
E
L
 
L
D
 
T
A
 
T
S
 
E
Q
 
E
L
 
I
R
 
Q
A
 
F
V
 
F
A
 
V
Q
 
N
G
 
G
I
 
Y
G
 
T
S
 
D
G
 
G
A
 
S
W
 
I
S
 
P
E
 
D
G
 
Y
Q
 
Q
I
 
A
A
 
S
A
 
A
F
 
L
A
 
A
M
 
M
A
 
A
V
 
I
A
 
F
W
 
F
R
 
Q
G
 
D
M
 
M
S
 
S
T
 
D
P
 
R
E
 
E
C
 
R
R
 
A
Q
 
D
F
 
L
T
 
T
L
 
M
A
 
A
L
 
M
R
 
V
D
 
N
S
 
S
G
 
G
Q
 
E
C
 
T
L
 
I
R
 
D
W
 
L
D
 
S
H
 
A
L
 
I
P
 
E
G
 
G
P
 
I
T
 
K
L
 
V
D
 
D
K
 
K
H
|
H
S
 
S
T
 
T
G
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
G
D
 
D
G
 
T
V
 
T
S
x
T
L
 
L
L
 
V
L
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
L
L
 
V
A
 
A
A
 
A
C
 
L
G
 
D
G
 
V
Y
 
P
V
 
V
P
 
A
M
 
K
I
 
M
S
|
S
G
 
G
R
 
R
G
 
G
L
 
L
G
 
G
H
 
H
T
 
T
G
 
G
G
 
G
T
|
T
L
 
I
D
 
D
K
 
K
L
 
L
E
 
E
S
 
A
L
 
I
A
 
M
G
 
G
Y
 
F
D
 
H
V
 
V
H
 
E
P
 
L
S
 
T
T
 
K
A
 
D
R
 
E
L
 
F
R
 
I
Q
 
K
V
 
L
V
 
V
E
 
N
E
 
R
V
 
D
G
 
K
C
 
V
A
 
A
I
 
V
V
 
I
G
 
G
Q
 
Q
G
 
S
D
 
G
E
 
N
L
 
L
V
 
T
P
 
P
A
 
A
D
|
D
R
 
K
R
 
K
L
 
L
Y
|
Y
A
 
A
V
 
L
R
|
R
D
 
D
V
 
V
T
 
T
A
 
G
T
 
T
V
 
V
D
 
N
V
 
S
A
 
I
D
 
P
L
 
L
M
x
I
V
 
A
A
 
S
S
|
S
I
 
I
L
 
M
S
 
S
K
|
K
K
 
K
L
 
I
A
 
A
G
 
A
G
 
G
A
 
A
R
 
D
V
 
A
L
 
I
V
 
V
L
 
L
D
 
D
I
 
V
K
 
K
T
 
T
G
 
G
N
 
A
G
 
G
A
 
A
Q
 
F
L
 
M
P
 
K
G
 
T
M
 
E
A
 
E
A
 
D
A
 
A
R
 
A
A
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
K
R
 
A
M
 
M
L
 
V
A
 
R
V
 
I
A
 
G
E
 
N
G
 
N
S
 
V
G
 
G
L
 
R
D
 
Q
L
 
T
R
 
M
V
 
A
V
 
V
Y
 
I
S
 
S
D
 
D
M
 
M
D
 
S
Q
 
Q
L
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
F
E
 
A
A
 
I
G
 
G
N
 
N
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
V
R
 
K
A
 
E
V
 
A
L
 
I
D
 
D
L
 
T
L
 
L
C
 
-
S
 
-
R
 
K
G
 
G
D
 
E
N
 
G
P
 
P
R
 
E
-
 
D
L
 
L
L
 
H
S
 
E
L
 
L
T
 
V
L
 
L
E
 
T
L
 
L
A
 
G
A
 
S
A
 
Q
L
 
M
L
 
V
C
 
V
T
 
L
G
 
A
G
 
K
L
 
K
A
 
A
D
 
D
D
 
T
R
 
L
N
 
D
D
 
E
A
 
A
E
 
R
R
 
A
R
 
K
L
 
L
R
 
E
R
 
E
A
 
V
L
 
M
D
 
K
T
 
N
G
 
G
E
 
K
A
 
A
A
 
L
E
 
E
R
 
K
F
 
F
A
 
K
R
 
D
M
 
F
V
 
L
V
 
K
A
 
N
L
 
Q
G
 
G
G
 
G
P
 
D
A
 
S
D
 
S
L
 
I
L
 
V
Q
 
D
R
 
D
A
 
P
D
 
S
V
 
-
H
 
K
L
 
L
A
 
P
R
 
Q
A
 
A
P
 
A
I
 
Y
Q
 
Q
R
 
I
E
 
D
V
 
V
R
 
P
S
 
A
P
 
K
G
 
E
S
 
A
G
 
G
Y
 
V
V
 
V
V
 
S
A
 
E
V
 
I
D
 
V
V
 
A
R
 
D
A
 
E
L
 
I
G
 
G
Q
 
V
A
 
A
V
 
A
V
 
M
E
 
L
L
 
L
G
 
G
G
 
A
G
 
G
R
 
R
S
 
A
R
 
T
P
 
K
G
 
E
Q
 
D
A
 
E
L
 
I
D
 
D
H
 
L
A
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
I
A
 
M
E
 
L
V
 
R
L
 
K
G
 
K
C
 
V
G
 
G
S
 
D
A
 
K
V
 
V
E
 
E
A
 
K
G
 
G
Q
 
E
P
 
P
L
 
L
A
 
V
I
 
T
I
 
L
H
 
Y
A
 
A
R
 
N
R
 
R
A
 
-
D
 
E
D
 
N
A
 
V
E
 
D
A
 
E
V
 
V
Q
 
I
R
 
A
R
 
K
V
 
V
A
 
Y
C
 
D
A
 
N
F
 
I
R
 
R
I
 
I
T
 
A
S
 
A
E
 
E

1uouA Crystal structure of human thymidine phosphorylase in complex with a small molecule inhibitor (see paper)
44% identity, 89% coverage: 9:403/444 of query aligns to 7:399/438 of 1uouA

query
sites
1uouA
L
 
L
I
 
I
R
 
R
C
 
M
K
 
K
R
 
R
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Q
 
R
L
 
L
D
 
S
A
 
E
S
 
A
Q
 
D
L
 
I
R
 
R
A
 
G
V
 
F
A
 
V
Q
 
A
G
 
A
I
 
V
G
 
V
S
 
N
G
 
G
A
 
S
W
 
A
S
 
Q
E
 
G
G
 
A
Q
 
Q
I
 
I
A
 
G
A
 
A
F
 
M
A
 
L
M
 
M
A
 
A
V
 
I
A
 
R
W
 
L
R
 
R
G
 
G
M
 
M
S
 
D
T
 
L
P
 
E
E
 
E
C
 
T
R
 
S
Q
 
V
F
 
L
T
 
T
L
 
Q
A
 
A
L
 
L
R
 
A
D
 
Q
S
 
S
G
 
G
Q
 
Q
C
 
Q
L
 
L
R
 
E
W
 
W
D
 
P
H
 
E
L
 
A
P
 
W
G
 
R
P
 
Q
T
 
Q
L
 
L
-
 
V
D
|
D
K
|
K
H
|
H
S
|
S
T
|
T
G
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
G
D
 
D
G
 
K
V
 
V
S
 
S
L
 
L
L
 
V
L
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
C
 
C
G
 
G
G
 
C
Y
 
K
V
 
V
P
 
P
M
 
M
I
 
I
S
 
S
G
 
G
R
 
R
G
 
G
L
|
L
G
 
G
H
 
H
T
 
T
G
 
G
G
 
G
T
|
T
L
 
L
D
 
D
K
 
K
L
 
L
E
 
E
S
 
S
L
 
I
A
 
P
G
 
G
Y
 
F
D
 
N
V
 
V
H
 
I
P
 
Q
S
 
S
T
 
P
A
 
E
R
 
Q
L
 
M
R
 
Q
Q
 
V
V
 
L
V
 
L
E
 
D
E
 
Q
V
 
A
G
 
G
C
 
C
A
 
C
I
 
I
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
G
 
S
D
 
E
E
 
Q
L
 
L
V
 
V
P
 
P
A
 
A
D
|
D
R
 
G
R
 
I
L
 
L
Y
|
Y
A
 
A
V
 
A
R
|
R
D
 
D
V
 
V
T
 
T
A
 
A
T
 
T
V
 
V
D
 
D
V
 
S
A
 
L
D
 
P
L
 
L
M
x
I
V
 
T
A
 
A
S
|
S
I
 
I
L
 
L
S
 
S
K
|
K
K
|
K
L
 
L
A
 
V
G
 
E
G
 
G
A
 
L
R
 
S
V
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
V
D
 
D
I
 
V
K
 
K
T
 
F
G
 
-
N
 
-
G
 
G
A
 
A
Q
 
V
L
 
F
P
 
P
G
 
N
M
 
Q
A
 
E
A
 
Q
A
 
A
R
 
R
A
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
K
R
 
T
M
 
L
L
 
V
A
 
G
V
 
V
A
 
G
E
 
A
G
 
S
S
 
L
G
 
G
L
 
L
D
 
R
L
 
V
R
 
A
V
 
A
V
 
A
Y
 
L
S
 
T
D
 
A
M
 
M
D
 
D
Q
 
K
L
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
R
E
 
C
A
 
V
G
 
G
N
 
H
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
V
R
 
E
A
 
E
V
 
A
L
 
-
D
 
-
L
 
L
L
 
L
C
 
C
S
 
M
R
 
D
G
 
G
D
 
A
N
 
G
-
 
P
P
 
P
R
 
D
L
 
L
L
 
R
S
 
D
L
 
L
T
 
V
L
 
T
E
 
T
L
 
L
A
 
G
A
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
L
C
 
W
T
 
L
G
 
S
G
 
G
L
 
H
A
 
A
D
 
G
D
 
T
R
 
Q
N
 
A
D
 
Q
A
 
G
E
 
A
R
 
A
R
 
R
L
 
V
R
 
A
R
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
T
 
D
G
 
G
E
 
S
A
 
A
A
 
L
E
 
G
R
 
R
F
 
F
A
 
E
R
 
R
M
 
M
V
 
L
V
 
A
A
 
A
L
 
Q
-
 
G
-
 
V
-
 
D
-
 
P
-
 
G
-
 
L
-
 
A
-
 
R
-
 
A
-
 
L
-
 
C
-
 
S
G
 
G
G
 
S
P
 
P
A
 
A
D
 
E
L
 
R
L
 
R
Q
 
Q
R
 
L
A
 
-
D
 
-
V
 
-
H
 
-
L
 
L
A
 
P
R
 
R
A
 
A
P
 
R
I
 
E
Q
 
Q
R
 
E
E
 
E
V
 
L
R
 
L
S
 
A
P
 
P
G
 
A
S
 
D
G
 
G
Y
 
T
V
 
V
V
 
E
A
 
L
V
 
V
D
 
R
V
 
A
R
 
L
A
 
P
L
 
L
G
 
A
Q
 
L
A
 
V
V
 
L
V
 
H
E
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
-
G
 
-
R
 
-
S
 
-
R
 
-
P
 
-
G
 
-
Q
 
-
A
 
A
L
 
L
D
 
R
H
 
L
A
 
G
V
 
V
G
 
G
L
 
A
A
 
E
E
 
L
V
 
L
L
 
V
G
 
D
C
 
V
G
 
G
S
 
Q
A
 
R
V
 
L
E
 
R
A
 
R
G
 
G
Q
 
T
P
 
P
L
 
W
A
 
L
I
 
R
I
 
V
H
 
H

4ga4A Crystal structure of amp phosphorylase n-terminal deletion mutant (see paper)
29% identity, 92% coverage: 10:416/444 of query aligns to 7:402/418 of 4ga4A

query
sites
4ga4A
I
 
I
R
 
K
C
 
K
K
 
K
R
 
M
D
 
H
G
 
G
G
 
E
Q
 
K
L
 
L
D
 
R
A
 
K
S
 
V
Q
 
E
L
 
I
R
 
E
A
 
A
V
 
I
A
 
V
Q
 
R
G
 
D
I
 
I
G
 
V
S
 
D
G
 
R
A
 
K
W
 
L
S
 
R
E
 
D
G
 
I
Q
 
E
I
 
I
A
 
S
A
 
S
F
 
F
A
 
V
M
 
T
A
 
A
V
 
L
A
 
E
W
 
I
R
 
N
G
 
G
M
 
L
S
 
D
T
 
M
P
 
D
E
 
E
C
 
I
R
 
A
Q
 
A
F
 
L
T
 
T
L
 
I
A
 
A
L
 
M
R
 
A
D
 
E
S
 
T
G
 
G
Q
 
D
C
 
M
L
 
L
R
 
D
W
 
I
D
 
D
H
 
R
L
 
-
P
 
-
G
 
K
P
 
P
T
 
I
L
 
M
D
|
D
K
x
V
H
|
H
S
|
S
T
 
I
G
 
G
G
 
G
V
 
V
-
 
P
G
 
G
D
 
N
G
 
K
V
 
T
S
x
N
L
 
I
L
 
L
L
 
V
A
 
V
P
 
P
L
 
I
L
 
V
A
 
A
A
 
A
C
 
A
G
 
G
G
 
L
Y
 
T
V
 
I
P
 
P
M
 
K
I
 
T
S
 
S
G
 
S
R
 
R
G
 
A
L
 
I
G
 
T
H
 
S
T
 
A
G
 
A
G
 
G
T
|
T
L
 
A
D
 
D
K
 
V
L
 
V
E
 
E
S
 
V
L
 
F
A
 
A
G
 
-
Y
 
-
D
 
D
V
 
V
H
 
S
P
 
F
S
 
S
T
 
L
A
 
D
R
 
E
L
 
I
R
 
K
Q
 
R
V
 
I
V
 
V
E
 
E
E
 
K
V
 
V
G
 
G
-
 
A
C
 
C
A
 
L
I
 
V
V
 
W
G
 
G
Q
 
G
G
 
A
D
 
L
E
 
N
L
 
L
V
 
A
P
 
P
A
 
A
D
|
D
R
 
-
R
 
-
L
 
-
Y
 
-
A
 
-
V
 
-
R
 
-
D
 
D
V
 
I
T
 
T
A
 
I
-
 
K
-
x
A
-
 
E
-
 
R
-
 
A
-
 
L
T
 
S
V
 
I
D
 
D
V
 
P
A
 
T
D
 
G
L
 
L
M
 
M
V
 
L
A
 
A
S
|
S
I
 
I
L
 
M
S
 
S
K
|
K
K
|
K
L
 
Y
A
 
A
G
 
M
G
 
G
A
 
S
R
 
Q
V
 
Y
L
 
V
V
 
L
L
 
I
D
 
D
I
 
I
K
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
K
G
 
G
A
 
V
Q
 
K
L
 
V
P
 
E
G
 
T
M
 
V
A
 
E
A
 
E
A
 
A
R
 
R
A
 
S
L
 
L
A
 
A
G
 
R
R
 
D
M
 
F
L
 
I
A
 
E
V
 
L
A
 
G
E
 
K
G
 
R
S
 
L
G
 
G
L
 
Q
D
 
Y
L
 
V
R
 
E
V
 
V
V
 
A
Y
 
I
S
 
T
D
 
Y
M
 
G
D
 
G
Q
 
Q
L
 
P
L
 
I
G
 
G
R
 
H
E
 
T
A
 
V
G
 
G
N
 
P
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
A
R
 
R
A
 
E
V
 
A
L
 
L
D
 
S
L
 
A
L
 
L
C
 
M
S
 
T
R
 
G
G
 
K
D
 
G
N
 
P
P
 
G
R
 
S
L
 
L
L
 
I
S
 
E
L
 
K
T
 
A
L
 
T
E
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
G
A
 
I
L
 
L
L
 
L
C
 
E
T
 
M
G
 
G
G
 
G
L
 
V
A
 
A
D
 
-
D
 
P
R
 
A
N
 
G
D
 
T
A
 
G
E
 
K
R
 
K
R
 
M
L
 
A
R
 
K
R
 
E
A
 
I
L
 
L
D
 
E
T
 
S
G
 
G
E
 
K
A
 
A
A
 
W
E
 
E
R
 
K
F
 
M
A
 
K
R
 
E
M
 
I
V
 
I
V
 
E
A
 
A
L
 
Q
G
 
G
G
 
G
P
 
-
A
 
-
D
 
-
L
 
-
L
 
-
Q
 
-
R
 
D
A
 
P
D
 
N
V
 
I
H
 
K
L
 
P
A
 
E
R
 
E
A
 
I
P
 
P
I
 
I
Q
 
G
R
 
D
E
 
K
V
 
T
R
 
Y
S
 
T
-
 
F
-
 
T
-
 
A
P
 
A
G
 
T
S
 
S
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
V
 
T
A
 
A
V
 
I
D
 
D
V
 
-
R
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
N
Q
 
R
A
 
A
V
 
I
V
 
T
E
 
A
L
 
I
G
 
A
G
 
R
G
 
A
R
 
A
S
 
G
R
 
A
P
 
P
G
 
E
Q
 
-
A
 
-
L
 
-
D
 
D
H
 
K
A
 
G
V
 
A
G
 
G
L
 
I
A
 
E
E
 
L
V
 
Y
L
 
V
G
 
K
C
 
V
G
 
G
S
 
E
A
 
K
V
 
V
E
 
K
A
 
E
G
 
G
Q
 
D
P
 
P
L
 
L
A
 
F
I
 
T
I
 
I
H
 
H
A
 
A
R
 
E
-
 
H
-
 
E
-
 
A
R
 
R
A
 
L
D
 
D
D
 
Q
A
 
A
E
 
I
A
 
V
V
 
L
Q
 
A
R
 
R
R
 
R

4ga6A Crystal structure of amp phosphorylasE C-terminal deletion mutant in complex with substrates (see paper)
30% identity, 92% coverage: 10:416/444 of query aligns to 91:486/493 of 4ga6A

query
sites
4ga6A
I
 
I
R
 
K
C
 
K
K
 
K
R
 
M
D
 
H
G
 
G
G
 
E
Q
 
K
L
 
L
D
 
R
A
 
K
S
 
V
Q
 
E
L
 
I
R
 
E
A
 
A
V
 
I
A
 
V
Q
 
R
G
 
D
I
 
I
G
 
V
S
 
D
G
 
R
A
 
K
W
 
L
S
 
R
E
 
D
G
 
I
Q
 
E
I
 
I
A
 
S
A
 
S
F
 
F
A
 
V
M
 
T
A
 
A
V
 
L
A
 
E
W
 
I
R
 
N
G
 
G
M
 
L
S
 
D
T
 
M
P
 
D
E
 
E
C
 
I
R
 
A
Q
 
A
F
 
L
T
 
T
L
 
I
A
 
A
L
 
M
R
 
A
D
 
E
S
 
T
G
 
G
Q
 
D
C
 
M
L
 
L
R
 
D
W
 
I
D
 
D
H
 
R
L
 
-
P
 
-
G
 
K
P
 
P
T
 
I
L
 
M
D
|
D
K
x
V
H
|
H
S
|
S
T
x
I
G
 
G
G
 
G
V
 
V
-
 
P
G
 
G
D
 
N
G
 
K
V
 
T
S
 
N
L
 
I
L
 
L
L
 
V
A
 
V
P
 
P
L
 
I
L
 
V
A
 
A
A
 
A
C
 
A
G
 
G
G
 
L
Y
 
T
V
 
I
P
 
P
M
 
K
I
 
T
S
 
S
G
x
S
R
 
R
G
x
A
L
x
I
G
x
T
H
x
S
T
 
A
G
 
A
G
 
G
T
|
T
L
 
A
D
 
D
K
 
V
L
 
V
E
 
E
S
 
V
L
 
F
A
 
A
G
 
-
Y
 
-
D
 
D
V
 
V
H
 
S
P
 
F
S
 
S
T
 
L
A
 
D
R
 
E
L
 
I
R
 
K
Q
 
R
V
 
I
V
 
V
E
 
E
E
 
K
V
 
V
G
 
G
-
 
A
C
 
C
A
 
L
I
 
V
V
 
W
G
 
G
Q
 
G
G
 
A
D
 
L
E
 
N
L
 
L
V
 
A
P
 
P
A
 
A
D
|
D
R
 
-
R
 
-
L
 
-
Y
 
-
A
 
-
V
 
-
R
 
-
D
 
D
V
 
I
T
 
T
A
 
I
-
 
K
-
x
A
-
 
E
-
 
R
-
 
A
-
 
L
T
 
S
V
 
I
D
|
D
V
 
P
A
 
T
D
 
G
L
 
L
M
|
M
V
 
L
A
 
A
S
|
S
I
 
I
L
 
M
S
 
S
K
|
K
K
|
K
L
 
Y
A
 
A
G
 
M
G
 
G
A
 
S
R
 
Q
V
 
Y
L
 
V
V
 
L
L
 
I
D
 
D
I
 
I
K
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
K
G
 
G
A
 
V
Q
x
K
L
 
V
P
 
E
G
 
T
M
 
V
A
 
E
A
 
E
A
 
A
R
 
R
A
 
S
L
 
L
A
 
A
G
 
R
R
 
D
M
 
F
L
 
I
A
 
E
V
 
L
A
 
G
E
 
K
G
 
R
S
 
L
G
 
G
L
 
Q
D
 
Y
L
 
V
R
 
E
V
 
V
V
 
A
Y
 
I
S
 
T
D
 
Y
M
 
G
D
 
G
Q
 
Q
L
 
P
L
 
I
G
 
G
R
 
H
E
 
T
A
 
V
G
 
G
N
 
P
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
A
R
 
R
A
 
E
V
 
A
L
 
L
D
 
S
L
 
A
L
 
L
C
 
M
S
 
T
R
 
-
G
 
G
D
 
K
N
 
G
P
 
P
-
 
G
R
 
S
L
 
L
L
 
I
S
 
E
L
 
K
T
 
A
L
 
T
E
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
G
A
 
I
L
 
L
L
 
L
C
 
E
T
 
M
G
 
G
G
 
G
L
 
V
A
 
A
D
 
-
D
 
P
R
 
A
N
 
G
D
 
T
A
 
G
E
 
K
R
 
K
R
 
M
L
 
A
R
 
K
R
 
E
A
 
I
L
 
L
D
 
E
T
 
S
G
 
G
E
 
K
A
 
A
A
 
W
E
 
E
R
 
K
F
 
M
A
 
K
R
 
E
M
 
I
V
 
I
V
 
E
A
 
A
L
 
Q
G
 
G
G
 
G
P
 
-
A
 
-
D
 
-
L
 
-
L
 
-
Q
 
-
R
 
D
A
 
P
D
 
N
V
 
I
H
 
K
L
 
P
A
 
E
R
 
E
A
 
I
P
 
P
I
 
I
Q
 
G
R
 
D
E
 
K
V
 
T
R
 
Y
S
 
T
-
 
F
-
 
T
-
 
A
P
 
A
G
 
T
S
 
S
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
V
 
T
A
 
A
V
 
I
D
 
D
V
 
-
R
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
N
Q
 
R
A
 
A
V
 
I
V
 
T
E
 
A
L
 
I
G
 
A
G
 
R
G
 
A
R
 
A
S
 
G
R
 
A
P
 
P
G
 
E
Q
 
-
A
 
-
L
 
-
D
 
D
H
 
K
A
 
G
V
 
A
G
 
G
L
 
I
A
 
E
E
 
L
V
 
Y
L
 
V
G
 
K
C
 
V
G
 
G
S
 
E
A
 
K
V
 
V
E
 
K
A
 
E
G
 
G
Q
 
D
P
 
P
L
 
L
A
 
F
I
 
T
I
 
I
H
 
H
A
 
A
R
 
E
-
 
H
-
 
E
-
 
A
R
 
R
A
 
L
D
 
D
D
 
Q
A
 
A
E
 
I
A
 
V
V
 
L
Q
 
A
R
 
R
R
 
R

Q5JCX3 AMP phosphorylase; AMPpase; Nucleoside monophosphate phosphorylase; NMP phosphorylase; EC 2.4.2.57 from Thermococcus kodakarensis (strain ATCC BAA-918 / JCM 12380 / KOD1) (Pyrococcus kodakaraensis (strain KOD1)) (see paper)
30% identity, 92% coverage: 10:416/444 of query aligns to 91:486/503 of Q5JCX3

query
sites
Q5JCX3
I
 
I
R
 
K
C
 
K
K
 
K
R
 
M
D
 
H
G
 
G
G
 
E
Q
 
K
L
 
L
D
 
R
A
 
K
S
 
V
Q
 
E
L
 
I
R
 
E
A
 
A
V
 
I
A
 
V
Q
 
R
G
 
D
I
 
I
G
 
V
S
 
D
G
 
R
A
 
K
W
 
L
S
 
R
E
 
D
G
 
I
Q
 
E
I
 
I
A
 
S
A
 
S
F
 
F
A
 
V
M
 
T
A
 
A
V
 
L
A
 
E
W
 
I
R
 
N
G
 
G
M
 
L
S
 
D
T
 
M
P
 
D
E
 
E
C
 
I
R
 
A
Q
 
A
F
 
L
T
 
T
L
 
I
A
 
A
L
 
M
R
 
A
D
 
E
S
 
T
G
 
G
Q
 
D
C
 
M
L
 
L
R
 
D
W
 
I
D
 
D
H
 
R
L
 
-
P
 
-
G
 
K
P
 
P
T
 
I
L
 
M
D
 
D
K
 
V
H
 
H
S
 
S
T
 
I
G
 
G
G
|
G
V
 
V
-
 
P
G
 
G
D
 
N
G
 
K
V
 
T
S
 
N
L
 
I
L
 
L
L
 
V
A
 
V
P
 
P
L
 
I
L
 
V
A
 
A
A
 
A
C
 
A
G
 
G
G
 
L
Y
 
T
V
 
I
P
 
P
M
 
K
I
 
T
S
 
S
G
x
S
R
|
R
G
x
A
L
x
I
G
x
T
H
x
S
T
 
A
G
 
A
G
 
G
T
|
T
L
 
A
D
 
D
K
 
V
L
 
V
E
 
E
S
 
V
L
 
F
A
 
A
G
 
-
Y
 
-
D
 
D
V
 
V
H
 
S
P
 
F
S
 
S
T
 
L
A
 
D
R
 
E
L
 
I
R
 
K
Q
 
R
V
 
I
V
 
V
E
 
E
E
 
K
V
 
V
G
 
G
-
 
A
C
 
C
A
 
L
I
 
V
V
 
W
G
 
G
Q
 
G
G
 
A
D
 
L
E
 
N
L
 
L
V
 
A
P
 
P
A
 
A
D
 
D
R
 
-
R
 
-
L
 
-
Y
 
-
A
 
-
V
 
-
R
 
-
D
 
D
V
 
I
T
 
T
A
 
I
-
 
K
-
 
A
-
 
E
-
 
R
-
 
A
-
 
L
T
 
S
V
 
I
D
|
D
V
 
P
A
 
T
D
 
G
L
 
L
M
 
M
V
 
L
A
 
A
S
|
S
I
 
I
L
 
M
S
 
S
K
 
K
K
 
K
L
 
Y
A
 
A
G
 
M
G
 
G
A
 
S
R
 
Q
V
 
Y
L
 
V
V
 
L
L
 
I
D
 
D
I
 
I
K
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
K
G
 
G
A
 
V
Q
x
K
L
 
V
P
 
E
G
 
T
M
 
V
A
 
E
A
 
E
A
 
A
R
 
R
A
 
S
L
 
L
A
 
A
G
 
R
R
 
D
M
 
F
L
 
I
A
 
E
V
 
L
A
 
G
E
 
K
G
 
R
S
 
L
G
 
G
L
 
Q
D
 
Y
L
 
V
R
 
E
V
 
V
V
 
A
Y
 
I
S
 
T
D
 
Y
M
 
G
D
 
G
Q
 
Q
L
 
P
L
 
I
G
 
G
R
 
H
E
 
T
A
 
V
G
 
G
N
 
P
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
A
R
 
R
A
 
E
V
 
A
L
 
L
D
 
S
L
 
A
L
 
L
C
 
M
S
 
T
R
 
-
G
 
G
D
 
K
N
 
G
P
 
P
-
 
G
R
 
S
L
 
L
L
 
I
S
 
E
L
 
K
T
 
A
L
 
T
E
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
G
A
 
I
L
 
L
L
 
L
C
 
E
T
 
M
G
 
G
G
 
G
L
 
V
A
 
A
D
 
-
D
 
P
R
 
A
N
 
G
D
 
T
A
 
G
E
 
K
R
 
K
R
 
M
L
 
A
R
 
K
R
 
E
A
 
I
L
 
L
D
 
E
T
 
S
G
 
G
E
 
K
A
 
A
A
 
W
E
 
E
R
 
K
F
 
M
A
 
K
R
 
E
M
 
I
V
 
I
V
 
E
A
 
A
L
 
Q
G
 
G
G
 
G
P
 
-
A
 
-
D
 
-
L
 
-
L
 
-
Q
 
-
R
 
D
A
 
P
D
 
N
V
 
I
H
 
K
L
 
P
A
 
E
R
 
E
A
 
I
P
 
P
I
 
I
Q
 
G
R
 
D
E
 
K
V
 
T
R
 
Y
S
 
T
-
 
F
-
 
T
-
 
A
P
 
A
G
 
T
S
 
S
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
V
 
T
A
 
A
V
 
I
D
 
D
V
 
-
R
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
N
Q
 
R
A
 
A
V
 
I
V
 
T
E
 
A
L
 
I
G
 
A
G
 
R
G
 
A
R
 
A
S
 
G
R
 
A
P
 
P
G
 
E
Q
 
-
A
 
-
L
 
-
D
 
D
H
 
K
A
 
G
V
 
A
G
 
G
L
 
I
A
 
E
E
 
L
V
 
Y
L
 
V
G
 
K
C
 
V
G
 
G
S
 
E
A
 
K
V
 
V
E
 
K
A
 
E
G
 
G
Q
 
D
P
 
P
L
 
L
A
 
F
I
 
T
I
 
I
H
 
H
A
 
A
R
 
E
-
 
H
-
 
E
-
 
A
R
 
R
A
 
L
D
 
D
D
 
Q
A
 
A
E
 
I
A
 
V
V
 
L
Q
 
A
R
 
R
R
 
R

Query Sequence

>WP_015448446.1 NCBI__GCF_000230695.2:WP_015448446.1
MSAQRATGLIRCKRDGGQLDASQLRAVAQGIGSGAWSEGQIAAFAMAVAWRGMSTPECRQ
FTLALRDSGQCLRWDHLPGPTLDKHSTGGVGDGVSLLLAPLLAACGGYVPMISGRGLGHT
GGTLDKLESLAGYDVHPSTARLRQVVEEVGCAIVGQGDELVPADRRLYAVRDVTATVDVA
DLMVASILSKKLAGGARVLVLDIKTGNGAQLPGMAAARALAGRMLAVAEGSGLDLRVVYS
DMDQLLGREAGNALELRAVLDLLCSRGDNPRLLSLTLELAAALLCTGGLADDRNDAERRL
RRALDTGEAAERFARMVVALGGPADLLQRADVHLARAPIQREVRSPGSGYVVAVDVRALG
QAVVELGGGRSRPGQALDHAVGLAEVLGCGSAVEAGQPLAIIHARRADDAEAVQRRVACA
FRITSEMPPSRPLWQWHVPAERVA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory