SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_015449052.1 NCBI__GCF_000230695.2:WP_015449052.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 11 hits to proteins with known functional sites (download)

1itwA Crystal structure of the monomeric isocitrate dehydrogenase in complex with isocitrate and mn (see paper)
76% identity, 99% coverage: 4:740/741 of query aligns to 2:740/740 of 1itwA

query
sites
1itwA
T
 
T
P
 
P
R
 
K
I
 
I
I
 
I
Y
 
Y
T
 
T
L
 
L
T
 
T
D
 
D
E
 
E
A
 
A
P
 
P
F
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
T
Q
 
Y
S
 
S
L
 
L
L
 
L
P
 
P
I
 
I
V
 
I
A
 
K
A
 
A
F
 
F
A
 
T
G
 
G
T
 
S
A
 
S
G
 
G
I
 
I
K
 
A
V
 
V
E
 
E
T
 
T
R
 
R
D
 
D
I
 
I
S
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
G
R
 
R
I
 
L
I
 
I
A
 
A
L
 
T
F
 
F
P
 
P
E
 
E
A
 
Y
L
 
L
K
 
T
E
 
D
G
 
T
Q
 
Q
R
 
K
L
 
I
P
 
S
D
 
D
D
 
D
L
 
L
A
 
A
E
 
E
L
 
L
G
 
G
K
 
K
L
 
L
A
 
A
T
 
T
T
 
T
P
 
P
E
 
D
A
 
A
N
 
N
I
 
I
I
 
I
K
 
K
L
 
L
P
 
P
N
 
N
I
 
I
S
 
S
A
 
A
S
 
S
M
 
V
P
 
P
Q
 
Q
L
 
L
K
 
K
A
 
A
A
 
A
I
 
I
K
 
K
E
 
E
L
 
L
Q
 
Q
G
 
Q
Q
 
Q
G
 
G
Y
 
Y
A
 
K
L
 
L
P
 
P
D
 
D
Y
 
Y
P
 
P
D
 
E
A
 
E
P
 
P
K
 
K
D
 
T
D
 
D
S
 
T
E
 
E
K
 
K
D
 
D
I
 
V
R
 
K
A
 
A
R
 
R
Y
 
Y
D
 
D
R
 
K
V
 
I
K
 
K
G
 
G
S
 
S
A
 
A
V
 
V
N
 
N
P
 
P
V
 
V
L
 
L
R
 
R
E
 
E
G
 
G
N
 
N
S
 
S
D
 
D
R
 
R
R
 
R
A
 
A
P
 
P
A
 
L
S
 
S
V
 
V
K
 
K
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
K
 
K
H
 
H
P
 
P
H
 
H
K
 
K
M
 
M
G
 
G
A
 
A
W
 
W
S
 
S
R
 
A
D
 
D
S
 
S
K
 
K
T
 
S
H
 
H
V
 
V
A
 
A
H
 
H
M
 
M
G
 
D
G
 
N
G
 
G
D
 
D
F
 
F
Y
 
Y
G
 
G
T
 
S
E
 
E
K
 
K
S
 
A
A
 
A
L
 
L
I
 
I
G
 
G
Q
 
A
A
 
P
G
 
G
N
 
S
V
 
V
S
 
K
I
 
I
E
 
E
W
 
L
F
 
I
G
 
A
K
 
K
D
 
D
G
 
G
S
 
S
H
 
S
A
 
T
V
 
V
L
 
L
K
 
K
P
 
A
K
 
K
T
 
T
A
 
S
L
 
V
L
 
Q
A
 
A
G
 
G
E
 
E
I
 
I
I
 
I
D
 
D
G
 
S
A
 
S
V
 
V
M
 
M
S
 
S
R
 
K
R
 
N
A
 
A
L
 
L
A
 
R
G
 
N
F
 
F
I
 
I
D
 
A
A
 
A
Q
 
E
I
 
I
A
 
E
D
 
D
A
 
A
K
 
K
Q
 
K
Q
 
Q
G
 
G
V
 
V
L
 
L
F
 
L
S
 
S
L
 
V
H
 
H
L
 
L
K
 
K
A
 
A
T
 
T
M
 
M
M
 
M
K
 
K
V
 
V
S
 
S
D
 
D
P
 
P
I
 
I
M
 
M
F
 
F
G
 
G
V
 
Q
A
 
I
V
 
V
G
 
S
E
 
E
F
 
F
Y
 
Y
R
 
K
D
 
D
V
 
A
L
 
L
A
 
T
K
 
K
H
 
H
A
 
A
A
 
E
A
 
V
L
 
L
K
 
K
Q
 
Q
V
 
I
G
 
G
F
 
F
N
 
D
P
 
V
N
 
N
N
 
N
G
 
G
I
 
I
G
 
G
D
 
D
L
 
L
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
L
 
I
G
 
K
S
 
T
L
 
L
P
 
P
E
 
E
A
 
A
Q
 
K
Q
 
Q
A
 
K
A
 
E
I
 
I
K
 
E
A
 
A
D
 
D
L
 
I
D
 
Q
A
 
A
E
 
V
Y
 
Y
A
 
A
Q
 
Q
R
 
R
P
 
P
G
 
Q
V
 
L
A
 
A
M
 
M
V
 
V
N
 
N
S
 
S
D
 
D
K
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
T
N
 
N
L
 
L
H
 
H
V
 
V
P
 
P
S
 
S
D
 
D
V
 
V
I
 
I
V
 
V
D
|
D
A
 
A
S
 
S
M
 
M
P
 
P
A
 
A
M
 
M
I
 
I
R
 
R
D
 
D
S
 
S
G
 
G
K
 
K
M
 
M
W
 
W
N
 
G
A
 
P
Q
 
D
G
 
G
Q
 
K
L
 
L
Q
 
H
D
 
D
V
 
T
K
 
K
A
 
A
V
 
V
I
 
I
P
 
P
D
 
D
R
 
R
S
 
C
Y
 
Y
A
 
A
G
 
G
V
 
V
Y
 
Y
Q
 
Q
A
 
V
T
 
V
I
 
I
D
 
E
D
 
D
C
 
C
K
 
K
A
 
Q
H
 
H
G
 
G
A
 
A
F
 
F
D
 
D
P
 
P
A
 
T
T
 
T
M
 
M
G
 
G
S
 
S
V
 
V
P
 
P
N
 
N
V
 
V
G
 
G
L
 
L
M
 
M
A
 
A
Q
 
Q
A
 
K
A
 
A
E
 
E
E
 
E
Y
 
Y
G
 
G
S
 
S
H
 
H
D
 
D
K
 
K
T
 
T
F
 
F
Q
 
Q
I
 
I
A
 
P
G
 
A
D
 
D
G
 
G
V
 
V
V
 
V
K
 
R
V
 
V
L
 
T
D
 
D
E
 
E
A
 
S
G
 
G
T
 
K
V
 
L
L
 
L
L
 
L
Q
 
E
H
 
Q
D
 
S
V
 
V
E
 
E
A
 
A
G
 
G
D
 
D
I
 
I
W
 
W
R
 
R
M
 
M
C
 
C
Q
 
Q
T
 
A
K
 
K
D
 
D
A
 
A
P
 
P
I
 
I
R
 
Q
D
 
D
W
 
W
V
 
V
K
 
K
L
 
L
A
 
A
V
 
V
S
 
N
R
 
R
A
 
A
R
 
R
-
 
A
-
 
T
H
 
N
T
 
T
P
 
P
A
 
A
V
 
V
F
 
F
W
 
W
L
 
L
D
 
D
P
 
P
A
 
A
R
 
R
A
 
A
H
 
H
D
 
D
A
 
A
Q
 
Q
V
 
V
I
 
I
A
 
A
K
 
K
V
 
V
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
D
 
D
H
 
Y
D
 
D
T
 
T
S
 
S
G
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
I
R
 
R
I
 
I
M
 
L
D
 
S
P
 
P
V
 
V
A
 
E
A
 
A
T
 
T
K
 
R
F
 
F
S
 
S
L
 
L
E
 
A
R
 
R
I
 
I
R
 
R
Q
 
E
G
 
G
L
 
K
D
 
D
T
 
T
I
 
I
S
 
S
V
 
V
T
 
T
G
 
G
N
 
N
V
 
V
L
 
L
R
 
R
D
|
D
Y
 
Y
L
 
L
T
 
T
D
 
D
L
 
L
F
 
F
P
 
P
I
 
I
M
 
M
E
 
E
L
 
L
G
 
G
T
 
T
S
 
S
A
 
A
K
 
K
M
 
M
L
 
L
S
 
S
I
 
I
V
 
V
P
 
P
L
 
L
M
 
M
A
 
S
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
L
F
 
F
E
 
E
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
A
 
A
P
 
P
K
 
K
H
 
H
V
 
V
Q
 
Q
Q
 
Q
F
 
F
L
 
L
Q
 
E
E
 
E
N
 
G
Y
 
Y
L
 
L
R
 
R
W
 
W
D
 
D
S
 
S
L
 
L
G
 
G
E
 
E
F
 
F
L
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
S
 
S
L
 
L
E
 
E
F
 
H
V
 
L
A
 
G
G
 
N
R
 
A
Q
 
Y
G
 
K
S
 
N
A
 
P
E
 
K
V
 
A
D
 
L
V
 
V
L
 
L
A
 
A
K
 
S
T
 
T
L
 
L
D
 
D
Q
 
Q
A
 
A
N
 
T
G
 
G
K
 
K
F
 
I
L
 
L
D
 
D
T
 
N
D
 
N
K
 
K
S
 
S
P
 
P
S
 
A
R
 
R
K
 
K
L
 
V
G
 
G
G
 
E
I
 
I
D
 
D
N
 
N
R
 
R
G
 
G
S
 
S
H
 
H
F
 
F
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
L
 
L
Y
 
Y
W
 
W
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
D
 
T
V
 
E
N
 
D
A
 
K
A
 
E
L
 
L
K
 
Q
A
 
A
K
 
Q
F
 
F
A
 
T
P
 
G
L
 
I
A
 
A
K
 
K
A
 
A
L
 
L
T
 
T
E
 
D
H
 
N
E
 
E
A
 
T
T
 
K
I
 
I
V
 
V
D
 
G
E
 
E
L
 
L
V
 
A
R
 
A
V
 
A
Q
 
Q
G
 
G
K
 
K
P
 
P
A
 
V
D
 
D
I
 
I
G
 
A
G
 
G
Y
 
Y
Y
 
Y
H
 
H
P
 
P
D
 
N
L
 
T
A
 
D
R
 
L
V
 
T
S
 
S
A
 
K
A
 
A
M
 
M
R
 
R
P
 
P
S
 
S
A
 
A
T
 
T
F
 
F
N
 
N
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
P
L
 
L
S
 
A

1j1wA Crystal structure of the monomeric isocitrate dehydrogenase in complex with NADP+ (see paper)
77% identity, 99% coverage: 4:739/741 of query aligns to 1:738/738 of 1j1wA

query
sites
1j1wA
T
 
T
P
 
P
R
 
K
I
 
I
I
 
I
Y
 
Y
T
 
T
L
 
L
T
 
T
D
 
D
E
 
E
A
 
A
P
 
P
F
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
T
Q
 
Y
S
 
S
L
 
L
L
 
L
P
 
P
I
 
I
V
 
I
A
 
K
A
 
A
F
 
F
A
 
T
G
 
G
T
 
S
A
 
S
G
 
G
I
 
I
K
 
A
V
 
V
E
 
E
T
 
T
R
 
R
D
 
D
I
 
I
S
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
G
R
 
R
I
 
L
I
 
I
A
 
A
L
 
T
F
 
F
P
 
P
E
 
E
A
 
Y
L
 
L
K
 
T
E
 
D
G
 
T
Q
 
Q
R
 
K
L
 
I
P
 
S
D
 
D
D
 
D
L
 
L
A
 
A
E
 
E
L
 
L
G
 
G
K
 
K
L
 
L
A
 
A
T
 
T
T
 
T
P
 
P
E
 
D
A
 
A
N
 
N
I
 
I
I
 
I
K
 
K
L
 
L
P
|
P
N
|
N
I
 
I
S
|
S
A
 
A
S
 
S
M
 
V
P
 
P
Q
 
Q
L
 
L
K
 
K
A
 
A
A
 
A
I
 
I
K
 
K
E
 
E
L
 
L
Q
 
Q
G
 
Q
Q
 
Q
G
 
G
Y
 
Y
A
 
K
L
 
L
P
 
P
D
 
D
Y
 
Y
P
 
P
D
 
E
A
 
E
P
 
P
K
 
K
D
 
T
D
 
D
S
 
T
E
 
E
K
 
K
D
 
D
I
 
V
R
 
K
A
 
A
R
 
R
Y
 
Y
D
 
D
R
 
K
V
 
I
K
 
K
G
 
G
S
 
S
A
 
A
V
 
V
N
|
N
P
 
P
V
 
V
L
 
L
R
 
R
E
 
E
G
 
G
N
 
N
S
 
S
D
 
D
R
 
R
R
 
R
A
 
A
P
 
P
A
 
L
S
 
S
V
 
V
K
 
K
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
K
 
K
H
 
H
P
 
P
H
 
H
K
 
K
M
 
M
G
 
G
A
 
A
W
 
W
S
 
S
R
 
A
D
 
D
S
 
S
K
 
K
T
 
S
H
 
H
V
 
V
A
 
A
H
 
H
M
 
M
G
 
D
G
 
N
G
 
G
D
 
D
F
 
F
Y
 
Y
G
 
G
T
 
S
E
 
E
K
 
K
S
 
A
A
 
A
L
 
L
I
 
I
G
 
G
Q
 
A
A
 
P
G
 
G
N
 
S
V
 
V
S
 
K
I
 
I
E
 
E
W
 
L
F
 
I
G
 
A
K
 
K
D
 
D
G
 
G
S
 
S
H
 
S
A
 
T
V
 
V
L
 
L
K
 
K
P
 
A
K
 
K
T
 
T
A
 
S
L
 
V
L
 
Q
A
 
A
G
 
G
E
 
E
I
 
I
I
 
I
D
 
D
G
 
S
A
 
S
V
 
V
M
 
M
S
 
S
R
 
K
R
 
N
A
 
A
L
 
L
A
 
R
G
 
N
F
 
F
I
 
I
D
 
A
A
 
A
Q
 
E
I
 
I
A
 
E
D
 
D
A
 
A
K
 
K
Q
 
K
Q
 
Q
G
 
G
V
 
V
L
 
L
F
 
L
S
 
S
L
 
V
H
 
H
L
 
L
K
 
K
A
 
A
T
 
T
M
 
M
M
 
M
K
 
K
V
 
V
S
 
S
D
 
D
P
 
P
I
 
I
M
 
M
F
 
F
G
 
G
V
 
Q
A
 
I
V
 
V
G
 
S
E
 
E
F
 
F
Y
 
Y
R
 
K
D
 
D
V
 
A
L
 
L
A
 
T
K
 
K
H
 
H
A
 
A
A
 
E
A
 
V
L
 
L
K
 
K
Q
 
Q
V
 
I
G
 
G
F
 
F
N
 
D
P
 
V
N
 
N
N
 
N
G
 
G
I
 
I
G
 
G
D
 
D
L
 
L
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
L
 
I
G
 
K
S
 
T
L
 
L
P
 
P
E
 
E
A
 
A
Q
 
K
Q
 
Q
A
 
K
A
 
E
I
 
I
K
 
E
A
 
A
D
 
D
L
 
I
D
 
Q
A
 
A
E
 
V
Y
 
Y
A
 
A
Q
 
Q
R
 
R
P
 
P
G
 
Q
V
 
L
A
 
A
M
 
M
V
 
V
N
 
N
S
 
S
D
 
D
K
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
T
N
 
N
L
 
L
H
 
H
V
 
V
P
 
P
S
 
S
D
 
D
V
 
V
I
 
I
V
 
V
D
 
D
A
 
A
S
 
S
M
 
M
P
 
P
A
 
A
M
 
M
I
 
I
R
 
R
D
 
D
S
 
S
G
 
G
K
 
K
M
 
M
W
 
W
N
 
G
A
 
P
Q
 
D
G
 
G
Q
 
K
L
 
L
Q
 
H
D
 
D
V
 
T
K
 
K
A
 
A
V
 
V
I
 
I
P
 
P
D
 
D
R
 
R
S
 
C
Y
 
Y
A
 
A
G
 
G
V
 
V
Y
 
Y
Q
 
Q
A
 
V
T
 
V
I
 
I
D
 
E
D
 
D
C
 
C
K
 
K
A
 
Q
H
 
H
G
 
G
A
 
A
F
 
F
D
 
D
P
 
P
A
 
T
T
 
T
M
 
M
G
 
G
S
 
S
V
 
V
P
 
P
N
 
N
V
 
V
G
 
G
L
 
L
M
 
M
A
 
A
Q
 
Q
A
 
K
A
 
A
E
 
E
E
 
E
Y
 
Y
G
 
G
S
 
S
H
 
H
D
 
D
K
 
K
T
 
T
F
 
F
Q
 
Q
I
 
I
A
 
P
G
 
A
D
 
D
G
 
G
V
 
V
V
 
V
K
 
R
V
 
V
L
 
T
D
 
D
E
 
E
A
 
S
G
 
G
T
 
K
V
 
L
L
 
L
L
 
L
Q
 
E
H
 
Q
D
 
S
V
 
V
E
 
E
A
 
A
G
 
G
D
 
D
I
 
I
W
 
W
R
 
R
M
 
M
C
 
C
Q
 
Q
T
 
A
K
 
K
D
 
D
A
 
A
P
 
P
I
 
I
R
 
Q
D
 
D
W
 
W
V
 
V
K
 
K
L
 
L
A
 
A
V
 
V
S
 
N
R
 
R
A
 
A
R
 
R
-
 
A
-
 
T
H
 
N
T
 
T
P
 
P
A
 
A
V
 
V
F
 
F
W
 
W
L
 
L
D
 
D
P
 
P
A
 
A
R
 
R
A
 
A
H
 
H
D
 
D
A
 
A
Q
 
Q
V
 
V
I
 
I
A
 
A
K
 
K
V
 
V
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
D
 
D
H
 
Y
D
 
D
T
 
T
S
 
S
G
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
I
R
 
R
I
 
I
M
 
L
D
 
S
P
 
P
V
 
V
A
 
E
A
 
A
T
 
T
K
 
R
F
 
F
S
 
S
L
 
L
E
 
A
R
 
R
I
 
I
R
 
R
Q
 
E
G
 
G
L
 
K
D
 
D
T
 
T
I
 
I
S
 
S
V
 
V
T
 
T
G
 
G
N
 
N
V
 
V
L
 
L
R
 
R
D
 
D
Y
 
Y
L
 
L
T
 
T
D
 
D
L
 
L
F
 
F
P
 
P
I
 
I
M
 
M
E
 
E
L
 
L
G
 
G
T
|
T
S
 
S
A
|
A
K
 
K
M
 
M
L
 
L
S
 
S
I
 
I
V
 
V
P
 
P
L
 
L
M
 
M
A
 
S
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
L
F
 
F
E
 
E
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
|
G
G
|
G
S
|
S
A
 
A
P
 
P
K
 
K
H
|
H
V
 
V
Q
 
Q
Q
 
Q
F
 
F
L
 
L
Q
 
E
E
 
E
N
 
G
Y
 
Y
L
 
L
R
|
R
W
|
W
D
|
D
S
 
S
L
 
L
G
 
G
E
 
E
F
 
F
L
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
S
 
S
L
 
L
E
 
E
F
 
H
V
 
L
A
 
G
G
 
N
R
 
A
Q
 
Y
G
 
K
S
 
N
A
 
P
E
 
K
V
 
A
D
 
L
V
 
V
L
 
L
A
 
A
K
 
S
T
 
T
L
 
L
D
 
D
Q
 
Q
A
 
A
N
 
T
G
 
G
K
 
K
F
 
I
L
 
L
D
 
D
T
 
N
D
 
N
K
 
K
S
 
S
P
 
P
S
 
A
R
|
R
K
 
K
L
 
V
G
 
G
G
 
E
I
 
I
D
 
D
N
 
N
R
 
R
G
 
G
S
 
S
H
 
H
F
 
F
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
L
 
L
Y
 
Y
W
 
W
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
D
 
T
V
 
E
N
 
D
A
 
K
A
 
E
L
 
L
K
 
Q
A
 
A
K
 
Q
F
 
F
A
 
T
P
 
G
L
 
I
A
 
A
K
 
K
A
 
A
L
 
L
T
 
T
E
 
D
H
 
N
E
 
E
A
 
T
T
 
K
I
 
I
V
 
V
D
 
G
E
 
E
L
 
L
V
 
A
R
 
A
V
 
A
Q
 
Q
G
 
G
K
 
K
P
 
P
A
 
V
D
 
D
I
 
I
G
 
A
G
 
G
Y
 
Y
Y
 
Y
H
 
H
P
 
P
D
 
N
L
 
T
A
 
D
R
 
L
V
 
T
S
 
S
A
 
K
A
 
A
M
 
M
R
 
R
P
 
P
S
 
S
A
 
A
T
 
T
F
 
F
N
 
N
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
P
L
 
L

P16100 Isocitrate dehydrogenase [NADP]; IDH; Oxalosuccinate decarboxylase; EC 1.1.1.42 from Azotobacter vinelandii (see 2 papers)
76% identity, 99% coverage: 4:740/741 of query aligns to 3:741/741 of P16100

query
sites
P16100
T
 
T
P
 
P
R
 
K
I
 
I
I
 
I
Y
 
Y
T
 
T
L
 
L
T
 
T
D
 
D
E
 
E
A
 
A
P
 
P
F
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
T
Q
 
Y
S
 
S
L
 
L
L
 
L
P
 
P
I
 
I
V
 
I
A
 
K
A
 
A
F
 
F
A
 
T
G
 
G
T
 
S
A
 
S
G
 
G
I
 
I
K
 
A
V
 
V
E
 
E
T
 
T
R
 
R
D
 
D
I
 
I
S
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
G
R
 
R
I
 
L
I
 
I
A
 
A
L
 
T
F
 
F
P
 
P
E
 
E
A
 
Y
L
 
L
K
 
T
E
 
D
G
 
T
Q
 
Q
R
 
K
L
 
I
P
 
S
D
 
D
D
 
D
L
 
L
A
 
A
E
 
E
L
 
L
G
 
G
K
 
K
L
 
L
A
 
A
T
 
T
T
 
T
P
 
P
E
 
D
A
 
A
N
 
N
I
 
I
I
 
I
K
 
K
L
 
L
P
 
P
N
 
N
I
 
I
S
 
S
A
 
A
S
 
S
M
 
V
P
 
P
Q
 
Q
L
 
L
K
 
K
A
 
A
A
 
A
I
 
I
K
 
K
E
 
E
L
 
L
Q
 
Q
G
 
Q
Q
 
Q
G
 
G
Y
 
Y
A
 
K
L
 
L
P
 
P
D
 
D
Y
 
Y
P
 
P
D
 
E
A
 
E
P
 
P
K
 
K
D
 
T
D
 
D
S
 
T
E
 
E
K
 
K
D
 
D
I
 
V
R
 
K
A
 
A
R
 
R
Y
 
Y
D
 
D
R
 
K
V
 
I
K
 
K
G
 
G
S
 
S
A
 
A
V
 
V
N
 
N
P
 
P
V
 
V
L
 
L
R
 
R
E
 
E
G
 
G
N
 
N
S
 
S
D
 
D
R
 
R
R
 
R
A
 
A
P
 
P
A
 
L
S
 
S
V
 
V
K
 
K
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
K
 
K
H
 
H
P
 
P
H
 
H
K
 
K
M
 
M
G
 
G
A
 
A
W
 
W
S
 
S
R
 
A
D
 
D
S
 
S
K
 
K
T
 
S
H
 
H
V
 
V
A
 
A
H
 
H
M
 
M
G
 
D
G
 
N
G
 
G
D
 
D
F
 
F
Y
 
Y
G
 
G
T
 
S
E
 
E
K
 
K
S
 
A
A
 
A
L
 
L
I
 
I
G
 
G
Q
 
A
A
 
P
G
 
G
N
 
S
V
 
V
S
 
K
I
 
I
E
 
E
W
 
L
F
 
I
G
 
A
K
 
K
D
 
D
G
 
G
S
 
S
H
 
S
A
 
T
V
 
V
L
 
L
K
 
K
P
 
A
K
 
K
T
 
T
A
 
S
L
 
V
L
 
Q
A
 
A
G
 
G
E
 
E
I
 
I
I
 
I
D
 
D
G
 
S
A
 
S
V
 
V
M
 
M
S
 
S
R
 
K
R
 
N
A
 
A
L
 
L
A
 
R
G
 
N
F
 
F
I
 
I
D
 
A
A
 
A
Q
 
E
I
 
I
A
 
E
D
 
D
A
 
A
K
 
K
Q
 
K
Q
 
Q
G
 
G
V
 
V
L
 
L
F
 
L
S
 
S
L
 
V
H
 
H
L
 
L
K
 
K
A
 
A
T
 
T
M
 
M
M
 
M
K
 
K
V
 
V
S
 
S
D
 
D
P
 
P
I
 
I
M
 
M
F
 
F
G
 
G
V
 
Q
A
 
I
V
 
V
G
 
S
E
 
E
F
 
F
Y
 
Y
R
 
K
D
 
D
V
 
A
L
 
L
A
 
T
K
 
K
H
 
H
A
 
A
A
 
E
A
 
V
L
 
L
K
 
K
Q
 
Q
V
 
I
G
 
G
F
 
F
N
 
D
P
 
V
N
 
N
N
 
N
G
 
G
I
 
I
G
 
G
D
 
D
L
 
L
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
L
 
I
G
 
K
S
 
T
L
 
L
P
 
P
E
 
E
A
 
A
Q
 
K
Q
 
Q
A
 
K
A
 
E
I
 
I
K
 
E
A
 
A
D
 
D
L
 
I
D
 
Q
A
 
A
E
 
V
Y
 
Y
A
 
A
Q
 
Q
R
 
R
P
 
P
G
 
Q
V
 
L
A
 
A
M
 
M
V
 
V
N
 
N
S
 
S
D
 
D
K
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
T
N
 
N
L
 
L
H
 
H
V
 
V
P
 
P
S
 
S
D
 
D
V
 
V
I
 
I
V
 
V
D
|
D
A
 
A
S
 
S
M
 
M
P
 
P
A
 
A
M
 
M
I
 
I
R
 
R
D
 
D
S
 
S
G
 
G
K
 
K
M
 
M
W
 
W
N
 
G
A
 
P
Q
 
D
G
 
G
Q
 
K
L
 
L
Q
 
H
D
 
D
V
 
T
K
 
K
A
 
A
V
 
V
I
 
I
P
 
P
D
 
D
R
 
R
S
 
C
Y
 
Y
A
 
A
G
 
G
V
 
V
Y
 
Y
Q
 
Q
A
 
V
T
 
V
I
 
I
D
 
E
D
 
D
C
 
C
K
 
K
A
 
Q
H
 
H
G
 
G
A
 
A
F
 
F
D
 
D
P
 
P
A
 
T
T
 
T
M
 
M
G
 
G
S
 
S
V
 
V
P
 
P
N
 
N
V
 
V
G
 
G
L
 
L
M
 
M
A
 
A
Q
 
Q
A
 
K
A
 
A
E
 
E
E
 
E
Y
 
Y
G
 
G
S
 
S
H
 
H
D
 
D
K
 
K
T
 
T
F
 
F
Q
 
Q
I
 
I
A
 
P
G
 
A
D
 
D
G
 
G
V
 
V
V
 
V
K
 
R
V
 
V
L
 
T
D
 
D
E
 
E
A
 
S
G
 
G
T
 
K
V
 
L
L
 
L
L
 
L
Q
 
E
H
 
Q
D
 
S
V
 
V
E
 
E
A
 
A
G
 
G
D
 
D
I
 
I
W
 
W
R
 
R
M
 
M
C
 
C
Q
 
Q
T
 
A
K
 
K
D
 
D
A
 
A
P
 
P
I
 
I
R
 
Q
D
 
D
W
 
W
V
 
V
K
 
K
L
 
L
A
 
A
V
 
V
S
 
N
R
 
R
A
 
A
R
 
R
-
 
A
-
 
T
H
 
N
T
 
T
P
 
P
A
 
A
V
 
V
F
 
F
W
 
W
L
 
L
D
 
D
P
 
P
A
 
A
R
 
R
A
 
A
H
 
H
D
 
D
A
 
A
Q
 
Q
V
 
V
I
 
I
A
 
A
K
 
K
V
 
V
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
D
 
D
H
 
Y
D
 
D
T
 
T
S
 
S
G
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
I
R
 
R
I
 
I
M
 
L
D
 
S
P
 
P
V
 
V
A
 
E
A
 
A
T
 
T
K
 
R
F
 
F
S
 
S
L
 
L
E
 
A
R
 
R
I
 
I
R
 
R
Q
 
E
G
 
G
L
 
K
D
 
D
T
 
T
I
 
I
S
 
S
V
 
V
T
 
T
G
 
G
N
 
N
V
 
V
L
 
L
R
 
R
D
|
D
Y
 
Y
L
 
L
T
 
T
D
 
D
L
 
L
F
 
F
P
 
P
I
 
I
M
 
M
E
 
E
L
 
L
G
 
G
T
 
T
S
 
S
A
 
A
K
 
K
M
 
M
L
 
L
S
 
S
I
 
I
V
 
V
P
 
P
L
 
L
M
 
M
A
 
S
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
L
F
 
F
E
 
E
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
A
 
A
P
 
P
K
 
K
H
 
H
V
 
V
Q
 
Q
Q
 
Q
F
 
F
L
 
L
Q
 
E
E
 
E
N
 
G
Y
 
Y
L
 
L
R
 
R
W
 
W
D
 
D
S
 
S
L
 
L
G
 
G
E
 
E
F
 
F
L
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
S
 
S
L
 
L
E
 
E
F
 
H
V
 
L
A
 
G
G
 
N
R
 
A
Q
 
Y
G
 
K
S
 
N
A
 
P
E
 
K
V
 
A
D
 
L
V
 
V
L
 
L
A
 
A
K
 
S
T
 
T
L
 
L
D
 
D
Q
 
Q
A
 
A
N
 
T
G
 
G
K
 
K
F
 
I
L
 
L
D
 
D
T
 
N
D
 
N
K
 
K
S
 
S
P
 
P
S
 
A
R
 
R
K
 
K
L
 
V
G
 
G
G
 
E
I
 
I
D
 
D
N
 
N
R
 
R
G
 
G
S
 
S
H
 
H
F
 
F
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
L
 
L
Y
 
Y
W
 
W
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
D
 
T
V
 
E
N
 
D
A
 
K
A
 
E
L
 
L
K
 
Q
A
 
A
K
 
Q
F
 
F
A
 
T
P
 
G
L
 
I
A
 
A
K
 
K
A
 
A
L
 
L
T
 
T
E
 
D
H
 
N
E
 
E
A
 
T
T
 
K
I
 
I
V
 
V
D
 
G
E
 
E
L
 
L
V
 
A
R
 
A
V
 
A
Q
 
Q
G
 
G
K
 
K
P
 
P
A
 
V
D
 
D
I
 
I
G
 
A
G
 
G
Y
 
Y
Y
 
Y
H
 
H
P
 
P
D
 
N
L
 
T
A
 
D
R
 
L
V
 
T
S
 
S
A
 
K
A
 
A
M
 
I
R
 
R
P
 
P
S
 
S
A
 
A
T
 
T
F
 
F
N
 
N
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
P
L
 
L
S
 
A

Sites not aligning to the query:

6g3uA Structure of pseudomonas aeruginosa isocitrate dehydrogenase, idh (see paper)
65% identity, 99% coverage: 6:740/741 of query aligns to 2:737/737 of 6g3uA

query
sites
6g3uA
R
 
K
I
 
I
I
 
T
Y
 
Y
T
 
T
L
 
F
T
 
T
D
 
D
E
 
E
A
 
A
P
 
P
F
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
T
Q
 
Y
S
 
S
L
 
L
L
 
L
P
 
P
I
 
I
V
 
V
A
 
K
A
 
A
F
 
F
A
 
A
G
 
A
T
 
S
A
 
A
G
 
G
I
 
I
K
 
D
V
 
V
E
 
E
T
 
T
R
 
S
D
 
D
I
 
I
S
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
L
A
 
A
L
 
N
F
 
F
P
 
A
E
 
D
A
 
R
L
 
L
K
 
E
E
 
A
G
 
D
Q
 
Q
R
 
R
L
 
I
P
 
E
D
 
D
D
 
D
L
 
L
A
 
A
E
 
R
L
 
L
G
 
A
K
 
V
L
 
L
A
 
A
T
 
T
T
 
S
P
 
P
E
 
D
A
 
A
N
 
N
I
 
I
I
 
I
K
 
K
L
 
L
P
|
P
N
|
N
I
 
I
S
|
S
A
 
A
S
 
S
M
 
V
P
 
P
Q
 
Q
L
 
L
K
 
K
A
 
G
A
 
A
I
 
I
K
 
A
E
 
E
L
 
L
Q
 
Q
G
 
G
Q
 
L
G
 
G
Y
 
Y
A
 
K
L
 
V
P
 
P
D
 
D
Y
 
F
P
 
P
D
 
E
A
 
D
P
 
P
K
 
Q
D
 
T
D
 
D
S
 
E
E
 
E
K
 
K
D
 
E
I
 
V
R
 
R
A
 
A
R
 
R
Y
 
Y
D
 
A
R
 
K
V
 
I
K
 
L
G
 
G
S
|
S
A
 
A
V
 
V
N
|
N
P
 
P
V
 
V
L
 
L
R
 
R
E
 
E
G
 
G
N
 
N
S
 
S
D
 
D
R
|
R
R
 
R
A
 
A
P
 
P
A
 
A
S
 
A
V
 
V
K
 
K
N
 
A
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
K
 
K
H
 
H
P
 
P
H
 
H
K
 
S
M
 
M
G
 
G
A
 
K
W
 
W
S
 
S
R
 
M
D
 
A
S
 
S
K
 
R
T
 
S
H
 
H
V
 
A
A
 
D
H
 
Y
M
 
M
G
 
R
G
 
G
G
 
G
D
 
D
F
 
F
Y
 
F
G
 
S
T
 
S
E
 
E
K
 
Q
S
 
S
A
 
I
L
 
T
I
 
M
G
 
A
Q
 
K
A
 
A
G
 
G
N
 
D
V
 
V
S
 
R
I
 
I
E
 
E
W
 
F
F
 
V
G
 
G
K
 
K
D
 
D
G
 
G
S
 
K
H
 
V
A
 
E
V
 
V
L
 
-
K
 
K
P
 
K
K
 
Q
T
 
L
A
 
S
L
 
L
L
 
Q
A
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
V
I
 
L
D
 
D
G
 
S
A
 
M
V
 
F
M
 
M
S
 
S
R
 
C
R
 
G
A
 
K
L
 
L
A
 
R
G
 
D
F
 
F
I
 
F
D
 
E
A
 
K
Q
 
T
I
 
L
A
 
Q
D
 
D
A
 
C
K
 
K
Q
 
E
Q
 
T
G
 
G
V
 
V
L
 
M
F
 
W
S
 
S
L
 
L
H
 
H
L
 
V
K
|
K
A
 
A
T
 
T
M
 
M
M
 
M
K
 
K
V
 
I
S
 
S
D
 
H
P
 
P
I
 
I
M
 
V
F
 
F
G
 
G
V
 
H
A
 
A
V
 
V
G
 
S
E
 
V
F
 
Y
Y
 
Y
R
 
K
D
 
D
V
 
V
L
 
F
A
 
D
K
 
K
H
 
W
A
 
G
A
 
Q
A
 
L
L
 
F
K
 
E
Q
 
E
V
 
L
G
 
G
F
 
V
N
 
N
P
 
P
N
 
N
N
 
N
G
 
G
I
 
I
G
 
S
D
 
S
L
 
V
Y
 
Y
A
 
D
R
 
K
L
 
I
G
 
K
S
 
S
L
 
L
P
 
P
E
 
A
A
 
S
Q
 
Q
Q
 
Q
A
 
E
A
 
E
I
 
I
K
 
L
A
 
H
D
 
D
L
 
I
D
 
H
A
 
E
E
 
V
Y
 
Y
A
 
S
Q
 
H
R
 
R
P
 
P
G
 
E
V
 
M
A
 
A
M
 
M
V
 
V
N
 
D
S
 
S
D
 
V
K
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
T
N
 
N
L
 
L
H
 
H
V
 
I
P
 
P
S
 
S
D
 
D
V
 
V
I
|
I
V
 
V
D
 
D
A
|
A
S
 
S
M
 
M
P
 
P
A
 
A
M
 
M
I
 
I
R
 
R
D
 
N
S
 
S
G
 
G
K
 
Q
M
 
M
W
 
W
N
 
G
A
 
K
Q
 
D
G
 
G
Q
 
K
L
 
Q
Q
 
K
D
 
D
V
 
T
K
 
K
A
 
A
V
 
V
I
 
M
P
 
P
D
 
E
R
 
S
S
 
T
Y
 
Y
A
 
A
G
 
R
V
 
I
Y
 
Y
Q
 
Q
A
 
E
T
 
M
I
 
I
D
 
N
D
 
F
C
 
C
K
 
K
A
 
T
H
 
N
G
 
G
A
 
A
F
 
F
D
 
D
P
 
P
A
 
T
T
 
T
M
 
M
G
 
G
S
 
S
V
 
V
P
 
P
N
 
N
V
 
V
G
 
G
L
 
L
M
 
M
A
 
A
Q
 
Q
A
 
K
A
 
A
E
 
E
E
 
E
Y
|
Y
G
 
G
S
 
S
H
 
H
D
 
D
K
 
K
T
 
T
F
 
F
Q
 
E
I
 
M
A
 
T
G
 
A
D
 
D
G
 
G
V
 
T
V
 
M
K
 
R
V
 
V
L
 
V
D
 
L
E
 
A
A
 
D
G
 
G
T
 
S
V
 
V
L
 
L
L
 
M
Q
 
Q
H
 
H
D
 
K
V
 
V
E
 
E
A
 
T
G
 
G
D
 
D
I
 
I
W
 
W
R
 
R
M
 
A
C
 
C
Q
 
Q
T
 
T
K
 
K
D
 
D
A
 
A
P
 
P
I
 
I
R
 
R
D
 
D
W
 
W
V
 
V
K
 
K
L
 
L
A
 
A
V
 
V
S
 
T
R
 
R
A
 
A
R
 
R
H
 
Q
-
 
S
-
 
D
T
 
T
P
 
P
A
 
A
V
 
I
F
 
F
W
 
W
L
 
L
D
 
D
P
 
P
A
 
E
R
 
R
A
 
A
H
 
H
D
 
D
A
 
R
Q
 
E
V
 
L
I
 
R
A
 
K
K
 
K
V
 
V
E
 
E
R
 
L
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
D
 
D
H
 
H
D
 
D
T
 
L
S
 
T
G
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
I
R
 
S
I
 
I
M
 
M
D
 
G
P
 
Y
V
 
N
A
 
E
A
 
A
T
 
I
K
 
R
F
 
V
S
 
S
L
 
M
E
 
E
R
 
R
I
 
L
R
 
I
Q
 
R
G
 
G
L
 
K
D
 
D
T
 
T
I
 
I
S
 
S
V
 
V
T
 
T
G
 
G
N
 
N
V
 
V
L
 
L
R
|
R
D
|
D
Y
 
Y
L
 
L
T
 
T
D
 
D
L
 
L
F
 
F
P
 
P
I
 
I
M
 
M
E
 
E
L
 
L
G
 
G
T
|
T
S
 
S
A
|
A
K
 
K
M
 
M
L
 
L
S
 
S
I
 
I
V
 
V
P
 
P
L
 
L
M
 
M
A
 
A
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
M
F
 
Y
E
 
E
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
|
G
G
|
G
S
|
S
A
|
A
P
|
P
K
 
K
H
|
H
V
 
V
Q
 
Q
Q
 
Q
F
 
L
L
 
V
Q
 
E
E
 
E
N
 
N
Y
 
Y
L
 
L
R
|
R
W
|
W
D
|
D
S
 
S
L
 
L
G
 
G
E
 
E
F
 
F
L
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
V
S
 
S
L
 
L
E
 
E
F
 
E
V
 
T
A
 
G
G
 
I
R
 
K
Q
 
T
G
 
G
S
 
N
A
 
A
E
 
K
V
 
A
D
 
K
V
 
L
L
 
L
A
 
G
K
 
K
T
 
A
L
 
L
D
 
D
Q
 
E
A
 
A
N
 
T
G
 
G
K
 
K
F
 
L
L
 
L
D
 
D
T
 
N
D
 
N
K
 
K
S
 
S
P
 
P
S
 
S
R
|
R
K
 
K
L
 
V
G
 
G
G
 
D
I
 
I
D
 
D
N
 
N
R
 
R
G
 
G
S
 
S
H
 
H
F
 
F
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
L
 
M
Y
 
Y
W
 
W
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
D
 
N
V
 
E
N
 
D
A
 
A
A
 
E
L
 
L
K
 
K
A
 
A
K
 
H
F
 
F
A
 
A
P
 
P
L
 
L
A
 
A
K
 
K
A
 
A
L
 
L
T
 
T
E
 
E
H
 
Q
E
 
E
A
 
A
T
 
T
I
 
I
V
 
V
D
 
A
E
 
E
L
 
L
V
 
N
R
 
A
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
K
 
K
P
 
P
A
 
A
D
 
E
I
 
I
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
Y
 
Y
H
 
R
P
 
S
D
 
N
L
 
P
A
 
E
R
 
L
V
 
T
S
 
S
A
 
K
A
 
V
M
 
M
R
 
R
P
 
P
S
 
S
A
 
A
T
 
T
F
 
F
N
 
N
A
 
A
A
 
A
L
 
I
A
 
D
L
 
S
L
 
L
S
 
A

5z16B A novel dimeric isocitrate dehydrogenase from acinetobacter baumannii
63% identity, 99% coverage: 7:737/741 of query aligns to 3:736/739 of 5z16B

query
sites
5z16B
I
 
I
I
 
I
Y
 
Y
T
 
T
L
 
L
T
 
T
D
 
D
E
 
E
A
 
A
P
 
P
F
 
L
L
 
L
A
 
A
T
 
T
Q
 
Y
S
 
S
L
 
L
L
 
L
P
 
P
I
 
I
V
 
I
A
 
E
A
 
T
F
 
F
A
 
T
G
 
K
T
 
P
A
 
A
G
 
G
I
 
I
K
 
E
V
 
I
E
 
V
T
 
K
R
 
S
D
 
D
I
 
I
S
 
S
L
 
V
A
 
A
A
 
A
R
 
R
I
 
V
I
 
L
A
 
A
L
 
E
F
 
F
P
 
A
E
 
D
A
 
Y
L
 
L
K
 
S
E
 
E
G
 
E
Q
 
Q
R
 
K
L
 
V
P
 
S
D
 
D
D
 
N
L
 
L
A
 
A
E
 
E
L
 
L
G
 
G
K
 
R
L
 
L
A
 
T
T
 
Q
T
 
D
P
 
P
E
 
D
A
 
T
N
 
N
I
 
I
I
 
I
K
 
K
L
 
L
P
 
P
N
 
N
I
 
I
S
 
S
A
 
A
S
 
S
M
 
V
P
 
A
Q
 
Q
L
 
L
K
 
T
A
 
A
A
 
C
I
 
I
K
 
K
E
 
E
L
 
L
Q
 
Q
G
 
S
Q
 
K
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
L
 
I
P
 
P
D
 
D
Y
 
Y
P
 
P
D
 
E
A
 
N
P
 
P
K
 
A
D
 
T
D
 
E
S
 
E
E
 
E
K
 
K
D
 
T
I
 
I
R
 
K
A
 
A
R
 
R
Y
 
Y
D
 
G
R
 
K
V
 
C
K
 
L
G
 
G
S
 
S
A
 
A
V
 
V
N
 
N
P
 
P
V
 
V
L
 
L
R
 
R
E
 
E
G
 
G
N
 
N
S
 
S
D
 
D
R
 
R
R
 
R
A
 
A
P
 
P
A
 
A
S
 
A
V
 
V
K
 
K
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
R
 
K
K
 
K
H
 
H
P
 
P
H
 
H
K
 
S
M
 
M
G
 
S
A
 
E
W
 
W
S
 
K
R
 
Q
D
 
W
S
 
S
K
 
Q
T
 
T
H
 
H
V
 
V
A
 
S
H
 
H
M
 
M
G
 
E
G
 
E
G
 
G
D
 
D
F
 
F
Y
 
Y
G
 
H
T
 
G
E
 
E
K
 
K
S
 
S
A
 
M
L
 
T
I
 
L
G
 
D
Q
 
R
A
 
P
G
 
R
N
 
N
V
 
V
S
 
K
I
 
M
E
 
E
W
 
L
F
 
I
G
 
T
K
 
N
D
 
S
G
 
G
S
 
K
H
 
S
A
 
I
V
 
V
L
 
L
K
 
K
P
 
P
K
 
K
T
 
V
A
 
A
L
 
L
L
 
Q
A
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
I
I
 
I
D
 
D
G
 
S
A
 
M
V
 
F
M
 
M
S
 
S
R
 
K
R
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
C
G
 
D
F
 
F
I
 
Y
D
 
E
A
 
K
Q
 
Q
I
 
L
A
 
D
D
 
D
A
 
C
K
 
R
Q
 
E
Q
 
A
G
 
G
V
 
I
L
 
L
F
 
F
S
 
S
L
 
L
H
 
H
L
 
V
K
 
K
A
 
A
T
 
T
M
 
M
M
 
M
K
 
K
V
 
V
S
 
S
D
 
H
P
 
P
I
 
I
M
 
V
F
 
F
G
 
G
V
 
H
A
 
C
V
 
V
G
 
K
E
 
I
F
 
Y
Y
 
Y
R
 
K
D
 
E
V
 
A
L
 
F
A
 
E
K
 
K
H
 
H
A
 
G
A
 
K
A
 
L
L
 
F
K
 
D
Q
 
E
V
 
L
G
 
G
F
 
I
N
 
N
P
 
V
N
 
N
N
 
N
G
 
G
I
 
M
G
 
A
D
 
G
L
 
L
Y
 
Y
A
 
E
R
 
K
L
 
I
G
 
E
S
 
T
L
 
L
P
 
P
E
 
T
A
 
S
Q
 
L
Q
 
R
A
 
E
A
 
E
I
 
I
K
 
I
A
 
E
D
 
D
L
 
L
D
 
H
A
 
A
E
 
C
Y
 
Q
A
 
E
Q
 
H
R
 
R
P
 
P
G
 
A
V
 
L
A
 
A
M
 
M
V
 
V
N
 
D
S
 
S
D
 
A
K
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
T
N
 
N
L
 
F
H
 
H
V
 
S
P
 
P
S
 
N
D
 
D
V
 
I
I
 
I
V
 
V
D
|
D
A
 
A
S
 
S
M
 
M
P
 
P
A
 
A
M
 
M
I
 
I
R
 
R
D
 
A
S
 
G
G
 
G
K
 
K
M
 
M
W
 
W
N
 
G
A
 
A
Q
 
D
G
 
G
Q
 
K
L
 
Q
Q
 
Y
D
 
D
V
 
A
K
 
K
A
 
A
V
 
V
I
 
M
P
 
P
D
 
E
R
 
S
S
 
T
Y
 
F
A
 
A
G
 
R
V
 
I
Y
 
Y
Q
 
Q
A
 
E
T
 
M
I
 
I
D
 
N
D
 
F
C
 
C
K
 
K
A
 
W
H
 
H
G
 
G
A
 
N
F
 
F
D
 
D
P
 
P
A
 
K
T
 
T
M
 
M
G
 
G
S
 
T
V
 
V
P
 
P
N
 
N
V
 
V
G
 
G
L
 
L
M
 
M
A
 
A
Q
 
Q
A
 
K
A
 
A
E
 
E
E
 
E
Y
 
Y
G
 
G
S
 
S
H
 
H
D
 
D
K
 
K
T
 
T
F
 
F
Q
 
E
I
 
I
A
 
P
G
 
E
D
 
A
G
 
G
V
 
I
V
 
A
K
 
N
V
 
I
L
 
T
D
 
D
-
 
L
E
 
D
A
 
T
G
 
G
T
 
E
V
 
V
L
 
L
L
 
L
Q
 
T
H
 
Q
D
 
N
V
 
V
E
 
E
A
 
E
G
 
G
D
 
D
I
 
I
W
 
W
R
 
R
M
 
M
C
 
C
Q
 
Q
T
 
V
K
 
K
D
 
D
A
 
A
P
 
P
I
 
I
R
 
R
D
 
D
W
 
W
V
 
V
K
 
K
L
 
L
A
 
A
V
 
V
S
 
T
R
 
R
A
 
A
R
 
R
H
 
N
T
 
S
-
 
G
-
 
M
P
 
P
A
 
A
V
 
I
F
 
F
W
 
W
L
 
L
D
 
D
P
 
P
A
 
Y
R
 
R
A
 
P
H
 
H
D
 
E
A
 
N
Q
 
E
V
 
L
I
 
I
A
 
K
K
 
K
V
 
V
E
 
Q
R
 
K
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
D
 
D
H
 
H
D
 
D
T
 
T
S
 
T
G
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
I
R
 
Q
I
 
I
M
 
M
D
 
S
P
 
Q
V
 
V
A
 
R
A
 
A
T
 
M
K
 
R
F
 
Y
S
 
T
L
 
L
E
 
E
R
 
R
I
 
V
R
 
V
Q
 
R
G
 
G
L
 
L
D
 
D
T
 
T
I
 
I
S
 
S
V
 
V
T
 
T
G
 
G
N
 
N
V
 
I
L
 
L
R
 
R
D
|
D
Y
 
Y
L
 
L
T
 
T
D
|
D
L
 
L
F
 
F
P
 
P
I
 
I
M
 
M
E
 
E
L
 
L
G
 
G
T
 
T
S
 
S
A
 
A
K
 
K
M
 
M
L
 
L
S
 
S
I
 
I
V
 
V
P
 
P
L
 
L
M
 
M
A
 
A
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
M
F
 
Y
E
 
E
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
A
 
A
P
 
P
K
 
K
H
 
H
V
 
V
Q
 
Q
Q
 
Q
F
 
L
L
 
V
Q
 
E
E
 
E
N
 
N
Y
 
H
L
 
L
R
 
R
W
 
W
D
 
D
S
 
S
L
 
L
G
 
G
E
 
E
F
 
F
L
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
V
S
 
S
L
 
L
E
 
E
F
 
E
V
 
M
A
 
G
G
 
I
R
 
K
Q
 
E
G
 
N
S
 
N
A
 
A
E
 
R
V
 
T
D
 
K
V
 
L
L
 
L
A
 
A
K
 
K
T
 
T
L
 
L
D
 
D
Q
 
E
A
 
A
N
 
T
G
 
G
K
 
K
F
 
L
L
 
L
D
 
D
T
 
N
D
 
D
K
 
K
S
 
S
P
 
P
S
 
S
R
 
R
K
 
R
L
 
T
G
 
G
G
 
E
I
 
L
D
 
D
N
 
N
R
 
R
G
 
G
S
 
S
H
 
H
F
 
F
Y
 
Y
L
 
L
A
 
S
L
 
L
Y
 
Y
W
 
W
A
 
A
Q
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
D
 
N
V
 
E
N
 
D
A
 
A
A
 
E
L
 
L
K
 
K
A
 
A
K
 
K
F
 
F
A
 
A
P
 
P
L
 
L
A
 
A
K
 
K
A
 
A
L
 
L
T
 
A
E
 
E
H
 
N
E
 
E
A
 
Q
T
 
K
I
 
I
V
 
V
D
 
A
E
 
E
L
 
L
V
 
A
R
 
Q
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
K
 
K
P
 
P
A
 
A
D
 
D
I
 
I
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
Y
 
Y
H
 
A
P
 
V
D
 
D
L
 
P
A
 
A
R
 
K
V
 
V
S
 
S
A
 
A
A
 
V
M
 
M
R
 
R
P
 
P
S
 
S
A
 
A
T
 
T
F
 
F
N
 
N
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
S

5kvuA Crystal structure of isocitrate dehydrogenase-2 in complex with NADP(+) from mycobacterium tuberculosis
63% identity, 99% coverage: 5:736/741 of query aligns to 2:735/738 of 5kvuA

query
sites
5kvuA
P
 
P
R
 
T
I
 
I
I
 
I
Y
 
Y
T
 
T
L
 
L
T
 
T
D
 
D
E
 
E
A
 
A
P
 
P
F
 
L
L
 
L
A
 
A
T
 
T
Q
 
Y
S
 
A
L
 
F
L
 
L
P
 
P
I
 
I
V
 
V
A
 
R
A
 
A
F
 
F
A
 
A
G
 
E
T
 
P
A
 
A
G
 
G
I
 
I
K
 
K
V
 
I
E
 
E
T
 
A
R
 
S
D
 
D
I
 
I
S
 
S
L
 
V
A
 
A
A
 
A
R
 
R
I
 
I
I
 
L
A
 
A
L
 
E
F
 
F
P
 
P
E
 
D
A
 
Y
L
 
L
K
 
T
E
 
E
G
 
E
Q
 
Q
R
 
R
L
 
V
P
 
P
D
 
D
D
 
N
L
 
L
A
 
A
E
 
E
L
 
L
G
 
G
K
 
R
L
 
L
A
 
T
T
 
Q
T
 
L
P
 
P
E
 
D
A
 
T
N
 
N
I
 
I
I
 
I
K
 
K
L
 
L
P
|
P
N
|
N
I
 
I
S
|
S
A
 
A
S
 
S
M
 
V
P
 
P
Q
 
Q
L
 
L
K
 
V
A
 
A
A
 
A
I
 
I
K
 
K
E
 
E
L
 
L
Q
 
Q
G
 
D
Q
 
K
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
L
 
V
P
 
P
D
 
D
Y
 
Y
P
 
P
D
 
A
A
 
D
P
 
P
K
 
T
D
 
D
D
 
-
S
 
Q
E
 
E
K
 
K
D
 
A
I
 
I
R
 
K
A
 
E
R
 
R
Y
 
Y
D
 
A
R
 
R
V
 
C
K
 
L
G
 
G
S
 
S
A
 
A
V
 
V
N
|
N
P
 
P
V
 
V
L
 
L
R
 
R
E
 
Q
G
 
G
N
 
N
S
 
S
D
 
D
R
 
R
R
 
R
A
 
A
P
 
P
A
 
K
S
 
A
V
 
V
K
 
K
N
 
E
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
K
 
K
H
 
H
P
 
P
H
 
H
K
 
S
M
 
M
G
 
G
A
 
E
W
 
W
S
 
S
R
 
M
D
 
A
S
 
S
K
 
R
T
 
T
H
 
H
V
 
V
A
 
A
H
 
H
M
 
M
G
 
R
G
 
H
G
 
G
D
 
D
F
 
F
Y
 
Y
G
 
A
T
 
G
E
 
E
K
 
K
S
 
S
A
 
M
L
 
T
I
 
L
G
 
D
Q
 
R
A
 
A
G
 
R
N
 
N
V
 
V
S
 
R
I
 
M
E
 
E
W
 
L
F
 
L
G
 
A
K
 
K
D
 
S
G
 
G
S
 
K
H
 
T
A
 
I
V
 
V
L
 
L
K
 
K
P
 
P
K
 
E
T
 
V
A
 
P
L
 
L
L
 
D
A
 
D
G
 
G
E
 
D
I
 
V
I
 
I
D
 
D
G
 
S
A
 
M
V
 
F
M
 
M
S
 
S
R
 
K
R
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
C
G
 
D
F
 
F
I
 
Y
D
 
E
A
 
E
Q
 
Q
I
 
M
A
 
Q
D
 
D
A
 
A
K
 
F
Q
 
E
Q
 
T
G
 
G
V
 
V
L
 
M
F
 
F
S
 
S
L
 
L
H
 
H
L
 
V
K
 
K
A
 
A
T
 
T
M
 
M
M
 
M
K
 
K
V
 
V
S
 
S
D
 
H
P
 
P
I
 
I
M
 
V
F
 
F
G
 
G
V
 
H
A
 
A
V
 
V
G
 
R
E
 
I
F
 
F
Y
 
Y
R
 
K
D
 
D
V
 
A
L
 
F
A
 
A
K
 
K
H
 
H
A
 
Q
A
 
E
A
 
L
L
 
F
K
 
D
Q
 
D
V
 
L
G
 
G
F
 
V
N
 
N
P
 
V
N
 
N
N
 
N
G
 
G
I
 
L
G
 
S
D
 
D
L
 
L
Y
 
Y
A
 
S
R
 
K
L
 
I
G
 
E
S
 
S
L
 
L
P
 
P
E
 
A
A
 
S
Q
 
Q
Q
 
R
A
 
D
A
 
E
I
 
I
K
 
I
A
 
E
D
 
D
L
 
L
D
 
H
A
 
R
E
 
C
Y
 
H
A
 
E
Q
 
H
R
 
R
P
 
P
G
 
E
V
 
L
A
 
A
M
 
M
V
 
V
N
 
D
S
 
S
D
 
A
K
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
S
N
 
N
L
 
F
H
 
H
V
 
S
P
 
P
S
 
S
D
 
D
V
 
V
I
|
I
V
 
V
D
 
D
A
|
A
S
 
S
M
 
M
P
 
P
A
 
A
M
 
M
I
 
I
R
 
R
D
 
A
S
 
G
G
 
G
K
 
K
M
 
M
W
 
Y
N
 
G
A
 
A
Q
 
D
G
 
G
Q
 
K
L
 
L
Q
 
K
D
 
D
V
 
T
K
 
K
A
 
A
V
 
V
I
 
N
P
 
P
D
 
E
R
 
S
S
 
T
Y
 
F
A
 
S
G
 
R
V
 
I
Y
 
Y
Q
 
Q
A
 
E
T
 
I
I
 
I
D
 
N
D
 
F
C
 
C
K
 
K
A
 
T
H
 
N
G
 
G
A
 
Q
F
 
F
D
 
D
P
 
P
A
 
T
T
 
T
M
 
M
G
 
G
S
 
T
V
 
V
P
 
P
N
 
N
V
 
V
G
 
G
L
 
L
M
 
M
A
 
A
Q
 
Q
A
 
Q
A
 
A
E
 
E
E
 
E
Y
 
Y
G
 
G
S
 
S
H
 
H
D
 
D
K
 
K
T
 
T
F
 
F
Q
 
E
I
 
I
A
 
P
G
 
E
D
 
D
G
 
G
V
 
V
V
 
A
K
 
N
V
 
I
L
 
V
D
 
D
E
 
V
A
 
A
-
 
T
G
 
G
T
 
E
V
 
V
L
 
L
L
 
L
Q
 
T
H
 
E
D
 
N
V
 
V
E
 
E
A
 
A
G
 
G
D
 
D
I
 
I
W
 
W
R
 
R
M
 
M
C
 
C
Q
 
I
T
 
V
K
 
K
D
 
D
A
 
A
P
 
P
I
 
I
R
 
R
D
 
D
W
 
W
V
 
V
K
 
K
L
 
L
A
 
A
V
 
V
S
 
T
R
 
R
A
 
A
R
 
R
H
 
I
T
 
S
-
 
G
-
 
M
P
 
P
A
 
V
V
 
L
F
 
F
W
 
W
L
 
L
D
 
D
P
 
P
A
 
Y
R
 
R
A
 
P
H
 
H
D
 
E
A
 
N
Q
 
E
V
 
L
I
 
I
A
 
K
K
 
K
V
 
V
E
 
K
R
 
T
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
D
 
D
H
 
H
D
 
D
T
 
T
S
 
E
G
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
I
R
 
Q
I
 
I
M
 
M
D
 
S
P
 
Q
V
 
V
A
 
R
A
 
S
T
 
M
K
 
R
F
 
Y
S
 
T
L
 
C
E
 
E
R
 
R
I
 
L
R
 
V
Q
 
R
G
 
G
L
 
L
D
 
D
T
 
T
I
 
I
S
 
A
V
 
A
T
 
T
G
 
G
N
 
N
V
 
I
L
 
L
R
 
R
D
 
D
Y
 
Y
L
 
L
T
 
T
D
 
D
L
 
L
F
 
F
P
 
P
I
 
I
M
 
L
E
 
E
L
 
L
G
 
G
T
|
T
S
 
S
A
|
A
K
 
K
M
 
M
L
 
L
S
 
S
I
 
V
V
 
V
P
 
P
L
 
L
M
 
M
A
 
A
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
M
F
 
Y
E
 
E
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
|
G
S
|
S
A
|
A
P
 
P
K
 
K
H
|
H
V
 
V
Q
 
K
Q
 
Q
F
 
L
L
 
V
Q
 
E
E
 
E
N
 
N
Y
 
H
L
 
L
R
|
R
W
|
W
D
|
D
S
 
S
L
 
L
G
 
G
E
 
E
F
 
F
L
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
G
A
 
A
S
 
G
L
 
F
E
 
E
F
 
D
V
 
I
A
 
G
G
 
I
R
 
K
Q
 
T
G
 
G
S
 
N
A
 
E
E
 
R
V
 
A
D
 
K
V
 
L
L
 
L
A
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
D
 
D
Q
 
A
A
 
A
N
 
I
G
 
G
K
 
K
F
 
L
L
 
L
D
 
D
T
 
N
D
 
D
K
 
K
S
 
S
P
 
P
S
 
S
R
|
R
K
 
K
L
 
T
G
 
G
G
 
E
I
 
L
D
 
D
N
 
N
R
 
R
G
 
G
S
 
S
H
 
Q
F
 
F
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
L
 
M
Y
 
Y
W
 
W
A
 
A
Q
 
Q
A
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
D
 
T
V
 
D
N
 
D
A
 
Q
A
 
Q
L
 
L
K
 
A
A
 
E
K
 
H
F
 
F
A
 
A
P
 
S
L
 
L
A
 
A
K
 
D
A
 
V
L
 
L
T
 
T
E
 
K
H
 
N
E
 
E
A
 
D
T
 
V
I
 
I
V
 
V
D
 
R
E
 
E
L
 
L
V
 
T
R
 
E
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
K
 
E
P
 
P
A
 
V
D
 
D
I
 
I
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
Y
 
Y
H
 
A
P
 
P
D
 
D
L
 
S
A
 
D
R
 
M
V
 
T
S
 
T
A
 
A
A
 
V
M
 
M
R
 
R
P
 
P
S
 
S
A
 
K
T
 
T
F
 
F
N
 
N
A
 
A
A
 
A
L
 
L

4zdaA Crystal structure of isocitrate dehydrogenase in complex with isocitrate and mn from m. Smegmatis
62% identity, 99% coverage: 5:736/741 of query aligns to 1:735/735 of 4zdaA

query
sites
4zdaA
P
 
P
R
 
T
I
 
I
I
 
I
Y
 
Y
T
 
T
L
 
L
T
 
T
D
 
D
E
 
E
A
 
A
P
 
P
F
 
L
L
 
L
A
 
A
T
 
T
Q
 
Y
S
 
A
L
 
F
L
 
L
P
 
P
I
 
V
V
 
V
A
 
R
A
 
K
F
 
F
A
 
A
G
 
E
T
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
I
K
 
D
V
 
V
E
 
K
T
 
T
R
 
S
D
 
D
I
 
I
S
 
S
L
 
V
A
 
A
A
 
A
R
 
R
I
 
I
I
 
L
A
 
A
L
 
E
F
 
F
P
 
G
E
 
D
A
 
H
L
 
L
K
 
T
E
 
E
G
 
E
Q
 
Q
R
 
R
L
 
V
P
 
P
D
 
D
D
 
N
L
 
L
A
 
G
E
 
E
L
 
L
G
 
G
K
 
A
L
 
L
A
 
T
T
 
Q
T
 
D
P
 
P
E
 
S
A
 
A
N
 
N
I
 
I
I
 
I
K
 
K
L
 
L
P
 
P
N
 
N
I
 
I
S
 
S
A
 
A
S
 
S
M
 
V
P
 
P
Q
 
Q
L
 
L
K
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
I
K
 
K
E
 
E
L
 
L
Q
 
Q
G
 
G
Q
 
K
G
 
G
Y
 
Y
A
 
N
L
 
V
P
 
P
D
 
D
Y
 
Y
P
 
P
D
 
A
A
 
N
P
 
P
K
 
K
D
 
T
D
 
D
S
 
D
E
 
E
K
 
K
D
 
K
I
 
I
R
 
K
A
 
D
R
 
R
Y
 
Y
D
 
A
R
 
K
V
 
I
K
 
L
G
 
G
S
 
S
A
 
A
V
 
V
N
 
N
P
 
P
V
 
V
L
 
L
R
 
R
E
 
E
G
 
G
N
 
N
S
 
S
D
 
D
R
 
R
R
 
R
A
 
A
P
 
P
A
 
K
S
 
A
V
 
V
K
 
K
N
 
E
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
K
 
K
H
 
H
P
 
P
H
 
H
K
 
S
M
 
M
G
 
G
A
 
E
W
 
W
S
 
S
R
 
Q
D
 
A
S
 
S
K
 
R
T
 
T
H
 
H
V
 
V
A
 
A
H
 
T
M
 
M
G
 
K
G
 
T
G
 
G
D
 
D
F
 
F
Y
 
Y
G
 
H
T
 
G
E
 
E
K
 
K
S
 
S
A
 
M
L
 
T
I
 
L
G
 
D
Q
 
R
A
 
D
G
 
R
N
 
R
V
 
V
S
 
K
I
 
M
E
 
V
W
 
L
F
 
K
G
 
T
K
 
K
D
 
S
G
 
G
S
 
E
H
 
E
A
 
I
V
 
V
L
 
L
K
 
K
P
 
P
K
 
E
T
 
V
A
 
K
L
 
L
L
 
D
A
 
A
G
 
G
E
 
D
I
 
I
I
 
I
D
 
D
G
 
S
A
 
M
V
 
Y
M
 
M
S
 
S
R
 
K
R
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
I
G
 
A
F
 
F
I
 
Y
D
 
E
A
 
E
Q
 
Q
I
 
I
A
 
E
D
 
D
A
 
A
K
 
Y
Q
 
K
Q
 
T
G
 
G
V
 
V
L
 
M
F
 
F
S
 
S
L
 
L
H
 
H
L
 
V
K
 
K
A
 
A
T
 
T
M
 
M
M
 
M
K