SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_015798095.1 NCBI__GCF_000023265.1:WP_015798095.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P9WP25 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase; HTPA synthase; EC 4.3.3.7 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see paper)
45% identity, 90% coverage: 7:285/309 of query aligns to 12:287/300 of P9WP25

query
sites
P9WP25
F
 
L
G
 
G
P
 
T
E
 
L
I
 
L
T
 
T
A
 
A
M
 
M
A
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
F
G
 
S
T
 
G
D
 
D
G
 
G
A
 
S
L
 
L
D
 
D
L
 
T
A
 
A
A
 
T
A
 
A
E
 
A
R
 
R
V
 
L
A
 
A
R
 
N
W
 
H
L
 
L
V
 
V
D
 
D
Q
 
Q
G
 
G
S
 
C
S
 
D
A
 
G
I
 
L
V
 
V
V
 
V
T
 
S
G
 
G
S
 
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
S
 
S
A
 
P
T
 
T
L
 
T
S
 
T
D
 
D
D
 
G
E
 
E
R
 
K
A
 
I
T
 
E
L
 
L
W
 
L
R
 
R
V
 
A
V
 
V
A
 
L
A
 
E
A
 
A
V
 
V
D
 
G
-
 
D
-
 
R
V
 
A
P
 
R
V
 
V
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
G
T
 
T
N
 
Y
D
 
D
T
 
T
A
 
A
H
 
H
S
 
S
L
 
I
R
 
R
L
 
L
V
 
A
D
 
K
A
 
A
A
 
C
E
 
A
R
 
A
A
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
H
G
 
G
I
 
L
L
 
L
A
 
V
V
 
V
V
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
 
Y
N
 
S
R
 
K
P
 
P
P
 
P
Q
 
Q
A
 
R
G
 
G
L
 
L
V
 
Q
R
 
A
H
 
H
F
 
F
G
 
T
Q
 
A
I
 
V
A
 
A
R
 
D
A
 
A
T
 
T
S
 
E
L
 
L
P
 
P
V
 
M
L
 
L
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
V
 
I
P
 
P
A
 
G
R
 
R
T
 
S
G
 
A
R
 
V
R
 
P
L
 
I
E
 
E
P
 
P
E
 
D
T
 
T
T
 
I
R
 
R
E
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
-
T
 
S
S
 
H
T
 
P
N
 
N
V
 
I
V
 
V
G
 
G
L
 
V
K
|
K
D
 
D
A
 
A
S
 
K
G
 
A
D
 
D
L
 
L
A
 
H
A
 
S
A
 
G
A
 
A
A
 
Q
L
 
I
V
 
M
A
 
A
E
 
D
A
 
T
P
 
-
D
 
-
G
 
G
F
 
L
V
 
A
L
 
Y
Y
 
Y
C
 
S
G
 
G
D
 
D
D
 
D
A
 
A
L
 
L
V
 
N
L
 
L
P
 
P
Y
 
W
L
 
L
A
|
A
I
 
M
G
 
G
A
 
A
V
 
T
G
 
G
V
 
F
V
 
I
S
 
S
V
 
V
A
 
I
G
 
A
H
 
H
W
 
L
A
 
A
G
 
A
P
 
G
L
 
Q
Q
 
L
R
 
R
V
 
E
M
 
L
I
 
L
E
 
S
A
 
A
A
 
F
R
 
G
S
 
S
G
 
G
D
 
D
W
 
I
E
 
A
R
 
T
A
 
A
R
 
R
R
 
K
L
 
I
N
 
N
A
 
I
A
 
A
L
 
V
E
 
A
A
 
P
S
 
L
Y
 
C
R
 
N
F
 
A
E
 
M
N
 
S
Q
 
R
L
 
L
A
 
G
Y
 
G
P
 
V
N
 
T
P
 
L
I
 
S
P
 
K
T
 
A
K
 
G
A
 
L
M
 
R
L
 
L
A
 
Q
A
 
G
L
 
I
G
 
D
L
 
V
A
 
G
E
 
D
P
 
P
V
 
-
C
 
-
R
 
R
S
 
L
P
 
P
L
 
Q
I
 
V
D
 
A
P
 
A
T
 
T
P
 
P
T
 
E
L
 
Q
I
 
I
D
 
D

1xxxA Crystal structure of dihydrodipicolinate synthase (dapa, rv2753c) from mycobacterium tuberculosis (see paper)
45% identity, 90% coverage: 7:285/309 of query aligns to 8:283/296 of 1xxxA

query
sites
1xxxA
F
 
L
G
 
G
P
 
T
E
 
L
I
 
L
T
 
T
A
 
A
M
 
M
A
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
F
G
 
S
T
 
G
D
 
D
G
 
G
A
 
S
L
 
L
D
 
D
L
 
T
A
 
A
A
 
T
A
 
A
E
 
A
R
 
R
V
 
L
A
 
A
R
 
N
W
 
H
L
 
L
V
 
V
D
 
D
Q
 
Q
G
 
G
S
 
C
S
 
D
A
 
G
I
 
L
V
 
V
V
 
V
T
 
S
G
 
G
S
x
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
S
 
S
A
 
P
T
 
T
L
 
T
S
 
T
D
 
D
D
 
G
E
 
E
R
 
K
A
 
I
T
 
E
L
 
L
W
 
L
R
 
R
V
 
A
V
 
V
A
 
L
A
 
E
A
 
A
V
 
V
D
 
G
-
 
D
-
 
R
V
 
A
P
 
R
V
 
V
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
G
T
 
T
N
 
Y
D
 
D
T
 
T
A
 
A
H
 
H
S
 
S
L
 
I
R
 
R
L
 
L
V
 
A
D
 
K
A
 
A
A
 
C
E
 
A
R
 
A
A
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
H
G
 
G
I
 
L
L
 
L
A
 
V
V
 
V
V
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
N
 
S
R
 
K
P
 
P
P
 
P
Q
 
Q
A
 
R
G
 
G
L
 
L
V
 
Q
R
 
A
H
 
H
F
 
F
G
 
T
Q
 
A
I
 
V
A
 
A
R
 
D
A
 
A
T
 
T
S
 
E
L
 
L
P
 
P
V
 
M
L
 
L
L
 
L
Y
|
Y
D
 
D
V
 
I
P
 
P
A
 
G
R
|
R
T
 
S
G
 
A
R
 
V
R
 
P
L
 
I
E
 
E
P
 
P
E
 
D
T
 
T
T
 
I
R
 
R
E
 
A
L
 
L
A
|
A
R
 
-
T
 
S
S
x
H
T
 
P
N
 
N
V
x
I
V
 
V
G
 
G
L
 
V
K
|
K
D
 
D
A
 
A
S
 
K
G
 
A
D
 
D
L
 
L
A
 
H
A
 
S
A
 
G
A
 
A
A
 
Q
L
 
I
V
 
M
A
 
A
E
 
D
A
 
T
P
 
-
D
 
-
G
 
G
F
 
L
V
 
A
L
 
Y
Y
 
Y
C
 
S
G
 
G
D
 
D
D
 
D
A
 
A
L
 
L
V
 
N
L
 
L
P
 
P
Y
 
W
L
 
L
A
 
A
I
 
M
G
 
G
A
 
A
V
 
T
G
 
G
V
 
F
V
x
I
S
 
S
V
 
V
A
 
I
G
 
A
H
 
H
W
 
L
A
 
A
G
 
A
P
 
G
L
 
Q
Q
 
L
R
 
R
V
 
E
M
 
L
I
 
L
E
 
S
A
 
A
A
 
F
R
 
G
S
 
S
G
 
G
D
 
D
W
 
I
E
 
A
R
 
T
A
 
A
R
 
R
R
 
K
L
 
I
N
 
N
A
 
I
A
 
A
L
 
V
E
 
A
A
 
P
S
 
L
Y
 
C
R
 
N
F
 
A
E
 
M
N
 
S
Q
 
R
L
 
L
A
 
G
Y
 
G
P
 
V
N
 
T
P
 
L
I
 
S
P
 
K
T
 
A
K
 
G
A
 
L
M
 
R
L
 
L
A
 
Q
A
 
G
L
 
I
G
 
D
L
 
V
A
 
G
E
 
D
P
 
P
V
 
-
C
 
-
R
 
R
S
 
L
P
 
P
L
 
Q
I
 
V
D
 
A
P
 
A
T
 
T
P
 
P
T
 
E
L
 
Q
I
 
I
D
 
D

5j5dA Crystal structure of dihydrodipicolinate synthase from mycobacterium tuberculosis in complex with alpha-ketopimelic acid (see paper)
45% identity, 90% coverage: 7:285/309 of query aligns to 9:284/297 of 5j5dA

query
sites
5j5dA
F
 
L
G
 
G
P
 
T
E
 
L
I
 
L
T
 
T
A
|
A
M
 
M
A
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
F
G
 
S
T
 
G
D
 
D
G
 
G
A
 
S
L
 
L
D
 
D
L
 
T
A
 
A
A
 
T
A
 
A
E
 
A
R
 
R
V
 
L
A
 
A
R
 
N
W
 
H
L
 
L
V
 
V
D
 
D
Q
 
Q
G
 
G
S
 
C
S
 
D
A
 
G
I
 
L
V
 
V
V
 
V
T
 
S
G
 
G
S
x
T
T
|
T
G
 
G
E
 
E
S
 
S
A
 
P
T
 
T
L
 
T
S
 
T
D
 
D
D
 
G
E
 
E
R
 
K
A
 
I
T
 
E
L
 
L
W
 
L
R
 
R
V
 
A
V
 
V
A
 
L
A
 
E
A
 
A
V
 
V
D
 
G
-
 
D
-
 
R
V
 
A
P
 
R
V
 
V
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
G
T
 
T
N
 
Y
D
 
D
T
 
T
A
 
A
H
 
H
S
 
S
L
 
I
R
 
R
L
 
L
V
 
A
D
 
K
A
 
A
A
 
C
E
 
A
R
 
A
A
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
H
G
 
G
I
 
L
L
 
L
A
 
V
V
 
V
V
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
N
 
S
R
 
K
P
 
P
P
 
P
Q
 
Q
A
 
R
G
 
G
L
 
L
V
 
Q
R
 
A
H
 
H
F
 
F
G
 
T
Q
 
A
I
 
V
A
 
A
R
 
D
A
 
A
T
 
T
S
 
E
L
 
L
P
 
P
V
 
M
L
 
L
L
 
L
Y
|
Y
D
 
D
V
 
I
P
 
P
A
 
G
R
|
R
T
 
S
G
 
A
R
 
V
R
 
P
L
 
I
E
 
E
P
 
P
E
 
D
T
 
T
T
 
I
R
 
R
E
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
-
T
 
S
S
 
H
T
 
P
N
 
N
V
 
I
V
 
V
G
 
G
L
 
V
K
|
K
D
 
D
A
 
A
S
 
K
G
 
A
D
 
D
L
 
L
A
 
H
A
 
S
A
 
G
A
 
A
A
 
Q
L
 
I
V
 
M
A
 
A
E
 
D
A
 
T
P
 
-
D
 
-
G
 
G
F
 
L
V
 
A
L
 
Y
Y
 
Y
C
 
S
G
|
G
D
 
D
D
 
D
A
 
A
L
 
L
V
 
N
L
 
L
P
 
P
Y
 
W
L
 
L
A
 
A
I
 
M
G
 
G
A
 
A
V
 
T
G
 
G
V
 
F
V
x
I
S
 
S
V
 
V
A
 
I
G
 
A
H
 
H
W
 
L
A
 
A
G
 
A
P
 
G
L
 
Q
Q
 
L
R
 
R
V
 
E
M
 
L
I
 
L
E
 
S
A
 
A
A
 
F
R
 
G
S
 
S
G
 
G
D
 
D
W
 
I
E
 
A
R
 
T
A
 
A
R
 
R
R
 
K
L
 
I
N
 
N
A
 
I
A
 
A
L
 
V
E
 
A
A
 
P
S
 
L
Y
 
C
R
 
N
F
 
A
E
 
M
N
 
S
Q
 
R
L
 
L
A
 
G
Y
 
G
P
 
V
N
 
T
P
 
L
I
 
S
P
 
K
T
 
A
K
 
G
A
 
L
M
 
R
L
 
L
A
 
Q
A
 
G
L
 
I
G
 
D
L
 
V
A
 
G
E
 
D
P
 
P
V
 
-
C
 
-
R
 
R
S
 
L
P
 
P
L
 
Q
I
 
V
D
 
A
P
 
A
T
 
T
P
 
P
T
 
E
L
 
Q
I
 
I
D
 
D

3l21B The crystal structure of a dimeric mutant of dihydrodipicolinate synthase (dapa, rv2753c) from mycobacterium tuberculosis - dhdps- a204r
45% identity, 90% coverage: 7:285/309 of query aligns to 7:282/295 of 3l21B

query
sites
3l21B
F
 
L
G
 
G
P
 
T
E
 
L
I
 
L
T
 
T
A
 
A
M
 
M
A
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
F
G
 
S
T
 
G
D
 
D
G
 
G
A
 
S
L
 
L
D
 
D
L
 
T
A
 
A
A
 
T
A
 
A
E
 
A
R
 
R
V
 
L
A
 
A
R
 
N
W
 
H
L
 
L
V
 
V
D
 
D
Q
 
Q
G
 
G
S
 
C
S
 
D
A
 
G
I
 
L
V
 
V
V
 
V
T
 
S
G
 
G
S
x
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
S
 
S
A
 
P
T
 
T
L
 
T
S
 
T
D
 
D
D
 
G
E
 
E
R
 
K
A
 
I
T
 
E
L
 
L
W
 
L
R
 
R
V
 
A
V
 
V
A
 
L
A
 
E
A
 
A
V
 
V
D
 
G
-
 
D
-
 
R
V
 
A
P
 
R
V
 
V
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
G
T
 
T
N
 
Y
D
 
D
T
 
T
A
 
A
H
 
H
S
 
S
L
 
I
R
 
R
L
 
L
V
 
A
D
 
K
A
 
A
A
 
C
E
 
A
R
 
A
A
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
H
G
 
G
I
 
L
L
 
L
A
 
V
V
 
V
V
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
N
 
S
R
 
K
P
 
P
P
 
P
Q
 
Q
A
 
R
G
 
G
L
 
L
V
 
Q
R
 
A
H
 
H
F
 
F
G
 
T
Q
 
A
I
 
V
A
 
A
R
 
D
A
 
A
T
 
T
S
 
E
L
 
L
P
 
P
V
 
M
L
 
L
L
 
L
Y
|
Y
D
 
D
V
 
I
P
 
P
A
 
G
R
|
R
T
 
S
G
 
A
R
 
V
R
 
P
L
 
I
E
 
E
P
 
P
E
 
D
T
 
T
T
 
I
R
 
R
E
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
-
T
 
S
S
 
H
T
 
P
N
 
N
V
 
I
V
 
V
G
 
G
L
 
V
K
|
K
D
 
D
A
 
A
S
 
K
G
 
A
D
 
D
L
 
L
A
 
H
A
 
S
A
 
G
A
 
A
A
 
Q
L
 
I
V
 
M
A
 
A
E
 
D
A
 
T
P
 
-
D
 
-
G
 
G
F
 
L
V
 
A
L
 
Y
Y
 
Y
C
 
S
G
 
G
D
 
D
D
 
D
A
 
A
L
 
L
V
 
N
L
 
L
P
 
P
Y
 
W
L
 
L
A
 
R
I
 
M
G
 
G
A
 
A
V
x
T
G
 
G
V
 
F
V
x
I
S
 
S
V
 
V
A
 
I
G
 
A
H
 
H
W
 
L
A
 
A
G
 
A
P
 
G
L
 
Q
Q
 
L
R
 
R
V
 
E
M
 
L
I
x
L
E
 
S
A
 
A
A
 
F
R
 
G
S
 
S
G
 
G
D
 
D
W
 
I
E
 
A
R
 
T
A
 
A
R
 
R
R
 
K
L
 
I
N
 
N
A
 
I
A
 
A
L
 
V
E
 
A
A
 
P
S
 
L
Y
 
C
R
 
N
F
 
A
E
 
M
N
 
S
Q
 
R
L
 
L
A
 
G
Y
 
G
P
 
V
N
 
T
P
 
L
I
 
S
P
 
K
T
 
A
K
 
G
A
 
L
M
 
R
L
 
L
A
 
Q
A
 
G
L
 
I
G
 
D
L
 
V
A
 
G
E
 
D
P
 
P
V
 
-
C
 
-
R
 
R
S
 
L
P
 
P
L
 
Q
I
 
V
D
 
A
P
 
A
T
 
T
P
 
P
T
 
E
L
 
Q
I
 
I
D
 
D

5ktlA Dihydrodipicolinate synthase from the industrial and evolutionarily important cyanobacteria anabaena variabilis. (see paper)
43% identity, 94% coverage: 7:295/309 of query aligns to 5:293/295 of 5ktlA

query
sites
5ktlA
F
 
F
G
 
G
P
 
T
E
 
V
I
 
L
T
 
T
A
 
A
M
 
M
A
 
I
T
 
T
P
 
P
F
 
F
G
 
K
T
 
A
D
 
D
G
 
G
A
 
S
L
 
V
D
 
N
L
 
Y
A
 
A
A
 
V
A
 
A
E
 
A
R
 
E
V
 
L
A
 
A
R
 
A
W
 
H
L
 
L
V
 
V
D
 
D
Q
 
N
G
 
G
S
 
T
S
 
D
A
 
T
I
 
L
V
 
V
V
 
V
T
 
C
G
 
G
S
x
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
S
|
S
A
 
P
T
 
T
L
|
L
S
 
S
D
 
W
D
 
D
E
 
E
R
x
E
A
 
Y
T
 
N
L
 
L
W
 
F
R
 
V
V
x
E
V
 
V
A
 
L
A
x
Q
A
 
T
V
 
V
-
 
A
-
 
G
D
 
K
V
 
A
P
 
K
V
 
V
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
C
T
 
G
T
 
S
N
 
N
D
 
S
T
 
T
A
 
K
H
 
E
S
 
A
L
 
I
R
 
A
L
 
A
V
 
T
D
 
Q
A
 
K
A
 
A
E
 
A
R
 
K
A
 
I
G
 
G
A
 
V
K
 
H
G
 
G
I
 
T
L
 
L
A
 
Q
V
 
V
V
 
V
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
N
 
N
R
 
K
P
 
P
P
 
P
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
Y
R
 
Q
H
 
H
F
 
F
G
 
Q
Q
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
Q
A
 
A
T
 
C
-
 
P
S
 
D
L
 
L
P
 
P
V
 
L
L
 
L
L
 
L
Y
|
Y
D
 
N
V
 
V
P
 
P
A
 
G
R
|
R
T
 
T
G
 
G
R
 
Q
R
 
N
L
 
L
E
 
S
P
 
P
E
 
E
T
 
T
T
 
V
R
 
V
E
 
R
L
 
L
A
 
A
R
 
E
T
 
I
S
 
D
T
 
-
N
 
N
V
 
I
V
 
I
G
 
G
L
 
V
K
|
K
D
 
E
A
 
A
S
 
S
G
 
G
D
 
N
L
 
L
A
 
D
A
 
Q
A
 
A
A
 
G
A
 
E
L
 
I
V
 
R
A
 
R
E
 
S
A
 
T
P
 
P
D
 
K
G
 
E
F
 
F
V
 
Q
L
 
I
Y
 
Y
C
 
A
G
 
G
D
 
D
D
 
D
A
 
S
L
 
L
V
 
T
L
 
L
P
 
P
Y
 
L
L
 
L
A
 
A
I
 
I
G
 
G
A
 
A
V
 
K
G
 
G
V
 
V
V
|
V
S
 
S
V
 
V
A
 
A
G
 
S
H
 
H
W
 
L
A
 
V
G
 
G
P
 
N
L
 
Q
Q
 
L
R
 
Q
V
 
Q
M
 
M
I
 
I
E
 
Q
A
 
A
A
 
F
R
 
N
S
 
S
G
 
G
D
 
Q
W
 
V
E
 
T
R
 
V
A
 
A
R
 
S
R
 
D
L
 
I
N
 
H
A
 
-
A
 
-
L
 
L
E
 
R
A
 
L
S
 
L
Y
 
P
R
 
L
F
 
F
E
 
K
N
 
A
Q
 
L
L
 
F
A
 
I
Y
 
T
P
 
T
N
 
N
P
 
P
I
 
I
P
 
P
T
 
I
K
 
K
A
 
Q
M
 
A
L
 
L
A
 
K
A
 
L
L
 
Q
G
 
G
L
 
W
A
 
E
E
 
V
P
 
G
V
 
S
C
 
T
R
 
R
S
 
P
P
 
P
L
 
L
I
 
S
D
 
D
P
 
A
T
 
D
P
 
A
T
 
E
L
 
V
I
 
S
D
 
Q
E
 
K
A
 
L
R
 
E
S
 
A
V
 
V
L
 
M
A
 
K
D
 
H
L
 
L
H
 
N

5ud6C Crystal structure of dhdps from cyanidioschyzon merolae with lysine bound
43% identity, 92% coverage: 7:291/309 of query aligns to 4:292/299 of 5ud6C

query
sites
5ud6C
F
 
F
G
 
G
P
 
R
E
 
V
I
 
I
T
 
T
A
 
A
M
 
L
A
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
F
G
 
K
T
 
L
D
 
T
G
 
G
A
 
V
-
 
E
L
 
V
D
 
D
L
 
Y
A
 
G
A
 
V
A
 
A
E
 
E
R
 
S
V
 
L
A
 
A
R
 
A
W
 
H
L
 
L
V
 
A
D
 
E
Q
 
N
G
 
G
S
 
S
S
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
I
V
 
V
T
x
A
G
 
G
S
x
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
S
|
S
A
|
A
T
 
T
L
 
L
S
 
T
D
x
W
D
 
S
E
 
E
R
x
E
A
 
Y
T
 
E
L
 
L
W
 
F
R
 
R
V
 
V
V
 
V
A
 
K
A
 
S
A
 
A
V
 
V
-
 
A
-
 
G
-
 
T
D
 
K
V
 
C
P
 
R
V
 
V
I
 
I
A
 
A
G
|
G
A
 
A
T
 
G
T
 
S
N
|
N
D
 
S
T
 
T
A
 
E
H
x
E
S
 
A
L
 
I
R
 
E
L
 
A
V
 
T
D
 
K
A
 
K
A
 
S
E
 
A
R
 
K
A
 
L
G
 
G
A
 
L
K
 
D
G
 
G
I
 
T
L
 
L
A
 
Q
V
 
V
V
 
V
P
 
P
Y
|
Y
Y
|
Y
N
 
N
R
 
K
P
 
P
P
 
P
Q
 
Q
A
 
Q
G
 
G
L
 
I
V
 
M
R
 
A
H
 
H
F
 
F
G
 
R
Q
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
N
A
 
A
T
 
A
-
 
P
S
 
D
L
 
L
P
 
P
V
 
M
L
 
M
L
 
L
Y
|
Y
D
 
N
V
 
I
P
 
P
A
 
G
R
|
R
T
 
T
G
 
G
R
 
I
R
 
N
L
 
M
E
 
T
P
 
A
E
 
E
T
 
T
T
 
S
R
 
I
E
 
K
L
 
L
A
 
A
R
 
E
T
 
M
S
 
C
T
 
P
N
 
N
V
 
I
V
 
V
G
 
A
L
 
L
K
|
K
D
 
E
A
 
A
S
 
S
G
 
G
D
 
N
L
 
L
A
 
E
A
 
Q
A
 
F
A
 
A
A
 
R
L
 
I
V
 
R
-
 
R
A
 
A
E
 
T
A
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
-
F
 
F
V
 
A
L
 
L
Y
 
Y
C
 
S
G
 
G
D
 
D
D
 
D
A
 
A
L
 
L
V
 
T
L
 
L
P
 
P
Y
 
L
L
 
L
A
 
S
I
 
L
G
 
G
A
 
G
V
 
N
G
 
G
V
 
V
V
|
V
S
 
S
V
 
V
A
 
A
G
 
S
H
 
H
W
 
F
A
 
I
G
 
G
P
 
P
-
 
E
L
 
I
Q
 
Q
R
 
R
V
 
M
M
 
I
I
 
E
E
 
H
A
 
F
A
 
V
R
 
D
S
 
L
G
 
G
D
 
N
W
 
P
E
 
E
R
 
E
A
 
A
R
 
F
R
 
R
L
 
I
N
 
H
A
 
C
A
 
-
L
 
-
E
 
R
A
 
Y
S
 
M
Y
 
D
R
 
L
F
 
F
E
 
E
N
 
A
Q
 
L
L
 
F
A
 
V
Y
 
M
P
 
A
N
 
N
P
 
P
I
 
I
P
 
P
T
 
A
K
 
K
A
 
A
M
 
A
L
 
L
A
 
R
A
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
W
A
 
P
E
 
V
P
 
G
V
 
P
C
 
T
R
 
R
S
 
L
P
 
P
L
 
L
I
 
T
D
 
D
P
 
I
T
 
T
P
 
A
T
 
S
L
 
A
I
 
E
D
 
Q
E
 
Q
A
 
L
R
 
R
S
 
Q
V
 
A
L
 
M

1o5kA Crystal structure of dihydrodipicolinate synthase (tm1521) from thermotoga maritima at 1.80 a resolution
38% identity, 91% coverage: 12:293/309 of query aligns to 8:291/295 of 1o5kA

query
sites
1o5kA
T
 
T
A
 
A
M
 
I
A
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
F
G
 
-
T
 
K
D
 
N
G
 
G
A
 
E
L
 
L
D
 
D
L
 
L
A
 
E
A
 
S
A
 
Y
E
 
E
R
 
R
V
 
L
A
 
V
R
 
R
W
 
Y
L
 
Q
V
 
L
D
 
E
Q
 
N
G
 
G
S
 
V
S
 
N
A
 
A
I
 
L
V
 
I
V
 
V
T
 
L
G
 
G
S
x
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
S
 
S
A
 
P
T
 
T
L
 
V
S
 
N
D
 
E
D
 
D
E
 
E
R
 
R
A
 
E
T
 
K
L
 
L
W
 
V
R
 
S
V
 
R
V
 
T
A
 
L
A
x
E
A
 
I
V
 
V
D
|
D
-
 
G
-
 
K
V
 
I
P
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
V
G
 
G
A
 
A
T
 
G
T
 
T
N
 
N
D
 
S
T
 
T
A
 
E
H
 
K
S
 
T
L
 
L
R
 
K
L
 
L
V
 
V
D
 
K
A
 
Q
A
 
A
E
 
E
R
 
K
A
 
L
G
 
G
A
 
A
K
 
N
G
 
G
I
 
V
L
 
L
A
 
V
V
 
V
V
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
N
 
N
R
 
K
P
 
P
P
 
T
Q
 
Q
A
 
E
G
 
G
L
 
L
V
 
Y
R
 
Q
H
 
H
F
 
Y
G
 
K
Q
 
Y
I
 
I
A
 
S
R
 
E
A
 
R
T
 
T
S
 
D
L
 
L
P
 
G
V
 
I
L
 
V
L
 
V
Y
|
Y
D
 
N
V
 
V
P
 
P
A
 
G
R
|
R
T
 
T
G
 
G
R
 
V
R
 
N
L
 
V
E
 
L
P
 
P
E
 
E
T
 
T
T
 
A
R
 
A
E
 
R
L
 
I
A
 
A
R
 
A
T
 
D
S
 
L
T
 
K
N
 
N
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
I
K
|
K
D
 
E
A
 
A
S
 
N
G
 
P
D
 
D
L
 
I
A
 
D
A
 
Q
-
 
I
-
 
D
-
 
R
A
 
T
A
 
V
A
 
S
L
 
L
V
 
T
A
 
K
E
 
Q
A
 
A
P
 
R
D
 
S
G
 
D
F
 
F
V
 
M
L
 
V
Y
 
W
C
 
S
G
 
G
D
 
N
D
 
D
A
 
D
L
 
R
V
 
T
L
 
F
P
 
Y
Y
 
L
L
 
L
A
 
C
I
 
A
G
 
G
A
 
G
V
 
D
G
 
G
V
 
V
V
x
I
S
 
S
V
 
V
A
 
V
G
 
S
H
 
N
W
 
V
A
 
A
G
 
-
P
 
P
L
 
K
Q
 
Q
R
 
M
V
 
V
M
 
E
I
 
L
E
 
C
A
 
A
A
 
E
R
 
Y
-
 
F
S
 
S
G
 
G
D
 
N
W
 
L
E
 
E
R
 
K
A
 
S
R
 
R
R
 
E
L
 
V
N
 
H
A
 
R
A
 
K
L
 
L
E
 
R
A
 
P
S
 
L
Y
 
M
R
 
K
F
 
A
E
 
-
N
 
-
Q
 
L
L
 
F
A
 
V
Y
 
E
P
 
T
N
 
N
P
 
P
I
 
I
P
 
P
T
 
V
K
 
K
A
 
A
M
 
A
L
 
L
A
 
N
A
 
L
L
 
M
G
 
G
L
 
F
A
 
I
E
 
E
P
 
N
V
 
E
C
 
L
R
 
R
S
 
L
P
 
P
L
 
L
I
 
V
D
 
P
P
 
A
T
 
S
P
 
E
T
 
K
L
 
T
I
 
V
D
 
E
E
 
L
A
 
L
R
 
R
S
 
N
V
 
V
L
 
L
A
 
K
D
 
E

Q9X1K9 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase; HTPA synthase; EC 4.3.3.7 from Thermotoga maritima (strain ATCC 43589 / DSM 3109 / JCM 10099 / NBRC 100826 / MSB8) (see paper)
38% identity, 91% coverage: 12:293/309 of query aligns to 7:290/294 of Q9X1K9

query
sites
Q9X1K9
T
 
T
A
 
A
M
 
I
A
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
F
G
 
-
T
 
K
D
 
N
G
 
G
A
 
E
L
 
L
D
 
D
L
 
L
A
 
E
A
 
S
A
 
Y
E
 
E
R
 
R
V
 
L
A
 
V
R
 
R
W
 
Y
L
 
Q
V
 
L
D
 
E
Q
 
N
G
 
G
S
 
V
S
 
N
A
 
A
I
 
L
V
 
I
V
 
V
T
 
L
G
 
G
S
 
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
S
 
S
A
 
P
T
 
T
L
 
V
S
 
N
D
 
E
D
 
D
E
 
E
R
 
R
A
 
E
T
 
K
L
 
L
W
 
V
R
 
S
V
 
R
V
 
T
A
 
L
A
 
E
A
 
I
V
 
V
D
 
D
-
 
G
-
 
K
V
 
I
P
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
V
G
 
G
A
 
A
T
 
G
T
 
T
N
 
N
D
 
S
T
 
T
A
 
E
H
 
K
S
 
T
L
 
L
R
 
K
L
 
L
V
 
V
D
 
K
A
 
Q
A
 
A
E
 
E
R
 
K
A
 
L
G
 
G
A
 
A
K
 
N
G
 
G
I
 
V
L
 
L
A
 
V
V
 
V
V
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
 
Y
N
 
N
R
 
K
P
 
P
P
 
T
Q
 
Q
A
 
E
G
 
G
L
 
L
V
 
Y
R
 
Q
H
 
H
F
 
Y
G
 
K
Q
 
Y
I
 
I
A
 
S
R
 
E
A
 
R
T
 
T
S
 
D
L
 
L
P
 
G
V
 
I
L
 
V
L
 
V
Y
 
Y
D
 
N
V
 
V
P
 
P
A
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
R
 
V
R
 
N
L
 
V
E
 
L
P
 
P
E
 
E
T
 
T
T
 
A
R
 
A
E
 
R
L
 
I
A
 
A
R
 
A
T
 
D
S
 
L
T
 
K
N
 
N
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
I
K
 
K
D
 
E
A
 
A
S
 
N
G
 
P
D
|
D
L
x
I
A
x
D
A
 
Q
-
 
I
-
 
D
-
 
R
A
 
T
A
 
V
A
 
S
L
 
L
V
 
T
A
 
K
E
 
Q
A
 
A
P
 
R
D
 
S
G
 
D
F
 
F
V
 
M
L
 
V
Y
 
W
C
 
S
G
 
G
D
 
N
D
 
D
A
 
D
L
 
R
V
 
T
L
 
F
P
 
Y
Y
 
L
L
 
L
A
 
C
I
 
A
G
 
G
A
 
G
V
 
D
G
 
G
V
 
V
V
 
I
S
 
S
V
 
V
A
 
V
G
 
S
H
 
N
W
 
V
A
 
A
G
 
-
P
 
P
L
 
K
Q
 
Q
R
 
M
V
 
V
M
 
E
I
 
L
E
 
C
A
 
A
A
 
E
R
 
Y
-
 
F
S
 
S
G
 
G
D
 
N
W
 
L
E
 
E
R
 
K
A
 
S
R
 
R
R
 
E
L
 
V
N
 
H
A
 
R
A
 
K
L
 
L
E
 
R
A
 
P
S
 
L
Y
 
M
R
 
K
F
 
A
E
 
-
N
 
-
Q
 
L
L
 
F
A
 
V
Y
 
E
P
 
T
N
 
N
P
 
P
I
 
I
P
 
P
T
 
V
K
 
K
A
 
A
M
 
A
L
 
L
A
 
N
A
 
L
L
 
M
G
 
G
L
 
F
A
 
I
E
 
E
P
 
N
V
 
E
C
 
L
R
 
R
S
 
L
P
 
P
L
 
L
I
 
V
D
 
P
P
 
A
T
 
S
P
 
E
T
 
K
L
 
T
I
 
V
D
 
E
E
 
L
A
 
L
R
 
R
S
 
N
V
 
V
L
 
L
A
 
K
D
 
E

2atsA Dihydrodipicolinate synthase co-crystallised with (s)-lysine
40% identity, 87% coverage: 7:276/309 of query aligns to 2:271/292 of 2atsA

query
sites
2atsA
F
 
F
G
 
T
P
 
G
E
 
S
I
 
I
T
 
V
A
 
A
M
 
I
A
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
G
 
D
T
 
E
D
 
K
G
 
G
A
 
N
L
 
V
D
 
C
L
 
R
A
 
A
A
 
S
A
 
L
E
 
K
R
 
K
V
 
L
A
 
I
R
 
D
W
 
Y
L
 
H
V
 
V
D
 
A
Q
 
S
G
 
G
S
 
T
S
 
S
A
 
A
I
 
I
V
 
V
V
 
S
T
 
V
G
 
G
S
x
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
S
 
S
A
|
A
T
 
T
L
|
L
S
 
N
D
x
H
D
 
D
E
 
E
R
x
H
A
 
A
T
 
D
L
 
V
W
 
V
R
 
M
V
 
M
V
 
T
A
 
L
A
 
D
A
 
L
V
 
A
D
 
D
-
 
G
-
 
R
V
 
I
P
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
T
T
 
G
T
 
A
N
|
N
D
 
A
T
 
T
A
 
A
H
x
E
S
 
A
L
 
I
R
 
S
L
 
L
V
 
T
D
 
Q
A
 
R
A
 
F
E
 
N
R
 
D
A
 
S
G
 
G
A
 
I
K
 
V
G
 
G
I
 
C
L
 
L
A
 
T
V
 
V
V
 
T
P
 
P
Y
|
Y
Y
|
Y
N
 
N
R
 
R
P
 
P
P
 
S
Q
 
Q
A
 
E
G
 
G
L
 
L
V
 
Y
R
 
Q
H
 
H
F
 
F
G
 
K
Q
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
E
A
 
H
T
 
T
S
 
D
L
 
L
P
 
P
V
 
Q
L
 
I
L
 
L
Y
|
Y
D
 
N
V
 
V
P
 
P
A
 
S
R
|
R
T
 
T
G
 
G
R
 
C
R
 
D
L
 
L
E
 
L
P
 
P
E
 
E
T
 
T
T
 
V
R
 
G
E
 
R
L
 
L
A
 
A
R
 
K
T
 
V
S
 
K
T
 
-
N
 
N
V
 
I
V
 
I
G
 
G
L
 
I
K
|
K
D
 
E
A
 
A
S
 
T
G
 
G
D
 
N
L
 
L
A
 
T
A
 
R
A
 
V
A
 
N
A
 
Q
L
 
I
V
 
K
A
 
E
E
 
L
A
 
V
P
 
S
D
 
D
G
 
D
F
 
F
V
 
V
L
 
L
Y
 
L
C
 
S
G
 
G
D
 
D
D
 
D
A
 
A
L
 
S
V
 
A
L
 
L
P
 
D
Y
 
F
L
 
M
A
 
Q
I
 
L
G
 
G
A
 
G
V
 
H
G
 
G
V
 
V
V
x
I
S
 
S
V
 
V
A
 
T
G
 
A
H
 
N
W
 
V
A
 
A
G
 
A
P
 
R
L
 
D
Q
 
M
R
 
A
V
 
Q
M
 
M
I
 
C
E
 
K
A
 
L
A
 
A
R
 
A
S
 
E
G
 
G
D
 
H
W
 
F
E
 
A
R
 
E
A
 
A
R
 
R
R
 
V
L
 
I
N
 
N
A
 
Q
A
 
R
L
 
L
E
 
-
A
 
-
S
 
-
Y
 
M
R
 
P
F
 
L
E
 
H
N
 
N
Q
 
K
L
 
L
-
 
F
A
 
V
Y
 
E
P
 
P
N
 
N
P
 
P
I
 
I
P
 
P
T
 
V
K
 
K
A
 
W
M
 
A
L
 
C
A
 
K
A
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
L
-
 
V
A
 
A
E
 
T
P
 
D
V
 
T
C
 
L
R
 
R
S
 
L
P
 
P
L
 
M

P0A6L2 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase; HTPA synthase; EC 4.3.3.7 from Escherichia coli (strain K12) (see 7 papers)
40% identity, 87% coverage: 7:276/309 of query aligns to 2:271/292 of P0A6L2

query
sites
P0A6L2
F
 
F
G
 
T
P
 
G
E
 
S
I
 
I
T
 
V
A
 
A
M
 
I
A
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
G
 
D
T
 
E
D
 
K
G
 
G
A
 
N
L
 
V
D
 
C
L
 
R
A
 
A
A
 
S
A
 
L
E
 
K
R
 
K
V
 
L
A
 
I
R
 
D
W
 
Y
L
 
H
V
 
V
D
 
A
Q
 
S
G
 
G
S
 
T
S
 
S
A
 
A
I
 
I
V
 
V
V
 
S
T
 
V
G
 
G
S
x
T
T
|
T
G
 
G
E
 
E
S
 
S
A
 
A
T
 
T
L
 
L
S
 
N
D
 
H
D
 
D
E
 
E
R
 
H
A
 
A
T
 
D
L
 
V
W
 
V
R
 
M
V
 
M
V
 
T
A
 
L
A
 
D
A
 
L
V
 
A
D
 
D
-
 
G
-
 
R
V
 
I
P
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
T
T
 
G
T
 
A
N
 
N
D
 
A
T
 
T
A
 
A
H
 
E
S
 
A
L
 
I
R
 
S
L
 
L
V
 
T
D
 
Q
A
 
R
A
 
F
E
 
N
R
 
D
A
 
S
G
 
G
A
 
I
K
 
V
G
 
G
I
 
C
L
 
L
A
 
T
V
 
V
V
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
N
 
N
R
 
R
P
 
P
P
 
S
Q
 
Q
A
 
E
G
 
G
L
 
L
V
 
Y
R
 
Q
H
 
H
F
 
F
G
 
K
Q
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
E
A
 
H
T
 
T
S
 
D
L
 
L
P
 
P
V
 
Q
L
 
I
L
 
L
Y
|
Y
D
 
N
V
 
V
P
 
P
A
 
S
R
|
R
T
 
T
G
 
G
R
 
C
R
 
D
L
 
L
E
 
L
P
 
P
E
 
E
T
 
T
T
 
V
R
 
G
E
 
R
L
 
L
A
 
A
R
 
K
T
 
V
S
 
K
T
 
-
N
 
N
V
 
I
V
 
I
G
 
G
L
 
I
K
|
K
D
 
E
A
 
A
S
 
T
G
 
G
D
 
N
L
 
L
A
 
T
A
 
R
A
 
V
A
 
N
A
 
Q
L
 
I
V
 
K
A
 
E
E
 
L
A
 
V
P
 
S
D
 
D
G
 
D
F
 
F
V
 
V
L
 
L
Y
 
L
C
 
S
G
 
G
D
 
D
D
 
D
A
 
A
L
 
S
V
 
A
L
 
L
P
 
D
Y
 
F
L
 
M
A
 
Q
I
x
L
G
 
G
A
 
G
V
 
H
G
 
G
V
 
V
V
x
I
S
 
S
V
 
V
A
 
T
G
 
A
H
 
N
W
 
V
A
 
A
G
 
A
P
 
R
L
 
D
Q
 
M
R
 
A
V
 
Q
M
 
M
I
 
C
E
 
K
A
 
L
A
 
A
R
 
A
S
 
E
G
 
G
D
 
H
W
 
F
E
 
A
R
 
E
A
 
A
R
 
R
R
 
V
L
 
I
N
 
N
A
 
Q
A
 
R
L
 
L
E
 
-
A
 
-
S
 
-
Y
 
M
R
 
P
F
 
L
E
 
H
N
 
N
Q
 
K
L
 
L
-
 
F
A
 
V
Y
 
E
P
 
P
N
 
N
P
 
P
I
 
I
P
 
P
T
 
V
K
 
K
A
 
W
M
 
A
L
 
C
A
 
K
A
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
L
-
 
V
A
 
A
E
 
T
P
 
D
V
 
T
C
 
L
R
 
R
S
 
L
P
 
P
L
 
M

5t25A Kinetic, spectral and structural characterization of the slow binding inhibitor acetopyruvate with dihydrodipicolinate synthase from escherichia coli.
40% identity, 87% coverage: 7:276/309 of query aligns to 3:272/293 of 5t25A

query
sites
5t25A
F
 
F
G
 
T
P
 
G
E
 
S
I
 
I
T
 
V
A
 
A
M
 
I
A
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
G
 
D
T
 
E
D
 
K
G
 
G
A
 
N
L
 
V
D
 
C
L
 
R
A
 
A
A
 
S
A
 
L
E
 
K
R
 
K
V
 
L
A
 
I
R
 
D
W
 
Y
L
 
H
V
 
V
D
 
A
Q
 
S
G
 
G
S
 
T
S
 
S
A
 
A
I
 
I
V
 
V
V
 
S
T
 
V
G
 
G
S
x
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
S
 
S
A
|
A
T
 
T
L
|
L
S
 
N
D
x
H
D
 
D
E
 
E
R
 
H
A
 
A
T
 
D
L
 
V
W
 
V
R
 
M
V
 
M
V
 
T
A
 
L
A
 
D
A
 
L
V
 
A
D
 
D
-
 
G
-
 
R
V
 
I
P
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
T
T
 
G
T
 
A
N
|
N
D
 
A
T
 
T
A
 
A
H
x
E
S
 
A
L
 
I
R
 
S
L
 
L
V
 
T
D
 
Q
A
 
R
A
 
F
E
 
N
R
 
D
A
 
S
G
 
G
A
 
I
K
 
V
G
 
G
I
 
C
L
 
L
A
 
T
V
 
V
V
 
T
P
 
P
Y
|
Y
Y
|
Y
N
 
N
R
 
R
P
 
P
P
 
S
Q
 
Q
A
 
E
G
 
G
L
 
L
V
 
Y
R
 
Q
H
 
H
F
 
F
G
 
K
Q
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
E
A
 
H
T
 
T
S
 
D
L
 
L
P
 
P
V
 
Q
L
 
I
L
 
L
Y
|
Y
D
 
N
V
 
V
P
 
P
A
 
S
R
|
R
T
 
T
G
 
G
R
 
C
R
 
D
L
 
L
E
 
L
P
 
P
E
 
E
T
 
T
T
 
V
R
 
G
E
 
R
L
 
L
A
 
A
R
 
K
T
 
V
S
 
K
T
 
-
N
 
N
V
 
I
V
 
I
G
 
G
L
 
I
K
|
K
D
 
E
A
 
A
S
 
T
G
 
G
D
 
N
L
 
L
A
 
T
A
 
R
A
 
V
A
 
N
A
 
Q
L
 
I
V
 
K
A
 
E
E
 
L
A
 
V
P
 
S
D
 
D
G
 
D
F
 
F
V
 
V
L
 
L
Y
 
L
C
 
S
G
 
G
D
 
D
D
 
D
A
 
A
L
 
S
V
 
A
L
 
L
P
 
D
Y
 
F
L
 
M
A
 
Q
I
 
L
G
 
G
A
 
G
V
 
H
G
 
G
V
 
V
V
x
I
S
 
S
V
 
V
A
 
T
G
 
A
H
 
N
W
 
V
A
 
A
G
 
A
P
 
R
L
 
D
Q
 
M
R
 
A
V
 
Q
M
 
M
I
 
C
E
 
K
A
 
L
A
 
A
R
 
A
S
 
E
G
 
G
D
 
H
W
 
F
E
 
A
R
 
E
A
 
A
R
 
R
R
 
V
L
 
I
N
 
N
A
 
Q
A
 
R
L
 
L
E
 
-
A
 
-
S
 
-
Y
 
M
R
 
P
F
 
L
E
 
H
N
 
N
Q
 
K
L
 
L
-
 
F
A
 
V
Y
 
E
P
 
P
N
 
N
P
 
P
I
 
I
P
 
P
T
 
V
K
 
K
A
 
W
M
 
A
L
 
C
A
 
K
A
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
L
-
 
V
A
 
A
E
 
T
P
 
D
V
 
T
C
 
L
R
 
R
S
 
L
P
 
P
L
 
M

3i7sA Dihydrodipicolinate synthase mutant - k161a - with the substrate pyruvate bound in the active site. (see paper)
39% identity, 87% coverage: 7:276/309 of query aligns to 2:271/292 of 3i7sA

query
sites
3i7sA
F
 
F
G
 
T
P
 
G
E
 
S
I
 
I
T
 
V
A
|
A
M
 
I
A
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
G
 
D
T
 
E
D
 
K
G
 
G
A
 
N
L
 
V
D
 
C
L
 
R
A
 
A
A
 
S
A
 
L
E
 
K
R
 
K
V
 
L
A
 
I
R
 
D
W
 
Y
L
 
H
V
 
V
D
 
A
Q
 
S
G
 
G
S
 
T
S
 
S
A
 
A
I
 
I
V
 
V
V
 
S
T
 
V
G
 
G
S
x
T
T
|
T
G
 
G
E
 
E
S
 
S
A
 
A
T
 
T
L
 
L
S
 
N
D
 
H
D
 
D
E
 
E
R
 
H
A
 
A
T
 
D
L
 
V
W
 
V
R
 
M
V
 
M
V
 
T
A
 
L
A
 
D
A
 
L
V
 
A
D
 
D
-
 
G
-
 
R
V
 
I
P
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
T
T
 
G
T
 
A
N
 
N
D
 
A
T
 
T
A
 
A
H
 
E
S
 
A
L
 
I
R
 
S
L
 
L
V
 
T
D
 
Q
A
 
R
A
 
F
E
 
N
R
 
D
A
 
S
G
 
G
A
 
I
K
 
V
G
 
G
I
 
C
L
 
L
A
 
T
V
 
V
V
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
N
 
N
R
 
R
P
 
P
P
 
S
Q
 
Q
A
 
E
G
 
G
L
 
L
V
 
Y
R
 
Q
H
 
H
F
 
F
G
 
K
Q
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
E
A
 
H
T
 
T
S
 
D
L
 
L
P
 
P
V
 
Q
L
 
I
L
 
L
Y
|
Y
D
 
N
V
 
V
P
 
P
A
 
S
R
|
R
T
 
T
G
 
G
R
 
C
R
 
D
L
 
L
E
 
L
P
 
P
E
 
E
T
 
T
T
 
V
R
 
G
E
 
R
L
 
L
A
 
A
R
 
K
T
 
V
S
 
K
T
 
-
N
 
N
V
 
I
V
 
I
G
 
G
L
 
I
K
x
R
D
 
E
A
 
A
S
 
T
G
 
G
D
 
N
L
 
L
A
 
T
A
 
R
A
 
V
A
 
N
A
 
Q
L
 
I
V
 
K
A
 
E
E
 
L
A
 
V
P
 
S
D
 
D
G
 
D
F
 
F
V
 
V
L
 
L
Y
 
L
C
 
S
G
 
G
D
 
D
D
 
D
A
 
A
L
 
S
V
 
A
L
 
L
P
 
D
Y
 
F
L
 
M
A
 
Q
I
 
L
G
 
G
A
 
G
V
 
H
G
 
G
V
 
V
V
x
I
S
 
S
V
 
V
A
 
T
G
 
A
H
 
N
W
 
V
A
 
A
G
 
A
P
 
R
L
 
D
Q
 
M
R
 
A
V
 
Q
M
 
M
I
 
C
E
 
K
A
 
L
A
 
A
R
 
A
S
 
E
G
 
G
D
 
H
W
 
F
E
 
A
R
 
E
A
 
A
R
 
R
R
 
V
L
 
I
N
 
N
A
 
Q
A
 
R
L
 
L
E
 
-
A
 
-
S
 
-
Y
 
M
R
 
P
F
 
L
E
 
H
N
 
N
Q
 
K
L
 
L
-
 
F
A
 
V
Y
 
E
P
 
P
N
 
N
P
 
P
I
 
I
P
 
P
T
 
V
K
 
K
A
 
W
M
 
A
L
 
C
A
 
K
A
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
L
-
 
V
A
 
A
E
 
T
P
 
D
V
 
T
C
 
L
R
 
R
S
 
L
P
 
P
L
 
M

4fhaA Structure of dihydrodipicolinate synthase from streptococcus pneumoniae,bound to pyruvate and lysine
37% identity, 88% coverage: 11:281/309 of query aligns to 11:279/307 of 4fhaA

query
sites
4fhaA
I
 
I
T
 
T
A
 
A
M
 
F
A
 
I
T
 
T
P
 
P
F
 
F
G
 
H
T
 
E
D
 
D
G
 
G
A
 
S
L
 
I
D
 
N
L
 
F
A
 
D
A
 
A
A
 
I
E
 
P
R
 
A
V
 
L
A
 
I
R
 
E
W
 
H
L
 
L
V
 
L
D
 
A
Q
 
H
G
 
H
S
 
T
S
 
D
A
 
G
I
 
I
V
 
L
V
 
L
T
 
A
G
 
G
S
 
T
T
 
T
G
 
A
E
 
E
S
|
S
A
x
P
T
 
T
L
|
L
S
 
T
D
x
H
D
 
D
E
 
E
R
x
E
A
 
L
T
 
E
L
 
L
W
 
F
R
 
A
V
 
A
V
 
V
A
 
Q
A
 
K
A
 
V
V
 
V
D
 
N
-
 
G
-
 
R
V
 
V
P
 
P
V
 
L
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
V
T
 
G
T
 
T
N
 
N
D
 
D
T
 
T
A
 
R
H
 
D
S
 
S
L
 
I
R
 
E
L
 
F
V
 
V
-
 
K
D
 
E
A
 
V
A
 
A
E
 
E
R
 
F
A
 
G
G
 
G
A
 
F
K
 
A
G
 
A
I
 
G
L
 
L
A
 
A
V
 
I
V
 
V
P
 
P
Y
|
Y
Y
 
Y
N
 
N
R
 
K
P
 
P
P
 
S
Q
 
Q
A
 
E
G
 
G
L
 
M
V
 
Y
R
 
Q
H
 
H
F
 
F
G
 
K
Q
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
D
A
 
A
T
 
S
S
 
D
L
 
L
P
 
P
V
 
I
L
 
I
L
 
I
Y
 
Y
D
 
N
V
 
I
P
 
P
A
 
G
R
 
R
T
 
V
G
 
V
R
 
V
R
 
E
L
 
L
E
 
T
P
 
P
E
 
E
T
 
T
T
 
M
R
 
L
E
 
R
L
 
L
A
 
A
R
 
-
T
 
D
S
 
H
T
 
P
N
 
N
V
 
I
V
 
I
G
 
G
L
 
V
K
 
K
D
 
E
A
 
C
S
 
T
G
 
S
D
 
-
L
 
L
A
 
A
A
 
N
A
 
M
A
 
A
A
 
Y
L
 
L
V
 
I
A
 
E
E
 
H
A
 
K
P
 
P
D
 
E
G
 
E
F
 
F
V
 
L
L
 
I
Y
 
Y
C
 
T
G
 
G
D
 
E
D
 
D
A
 
G
L
 
D
V
 
A
L
 
F
P
 
H
Y
 
A
L
 
M
A
 
N
I
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
D
G
 
G
V
 
V
V
 
I
S
 
S
V
 
V
A
 
A
G
 
S
H
 
H
W
 
T
A
 
N
G
 
G
P
 
D
L
 
E
Q
 
M
R
 
H
V
 
E
M
 
M
I
 
F
E
 
T
A
 
A
A
 
I
R
 
A
S
 
E
G
 
S
D
 
D
W
 
M
E
 
K
R
 
K
A
 
A
R
 
-
R
 
-
L
 
-
N
 
-
A
 
A
A
 
A
L
 
I
E
 
Q
A
 
R
S
 
K
Y
 
F
-
 
I
-
 
P
R
 
K
F
 
V
E
 
N
N
 
A
Q
 
L
L
 
F
A
 
S
Y
 
Y
P
 
P
N
 
S
P
 
P
I
 
A
P
 
P
T
 
V
K
 
K
A
 
A
M
 
I
L
 
L
A
 
N
A
 
Y
L
 
M
G
 
G
L
 
F
A
 
E
E
 
A
P
 
G
V
 
P
C
 
T
R
 
R
S
 
L
P
 
P
L
 
L
I
 
V
D
 
-
P
 
P
T
 
A
P
 
P

7kg2A Dihydrodipicolinate synthase (dhdps) from c.Jejuni, h59k mutant with pyruvate bound in the active site and l-histidine bound at the allosteric site
36% identity, 87% coverage: 11:280/309 of query aligns to 8:277/296 of 7kg2A

query
sites
7kg2A
I
 
M
T
 
T
A
 
A
M
 
L
A
 
I
T
 
T
P
 
P
F
 
F
G
 
-
T
 
K
D
 
N
G
 
G
A
 
K
L
 
V
D
 
D
L
 
E
A
 
Q
A
 
S
A
 
Y
E
 
A
R
 
R
V
 
L
A
 
I
R
 
K
W
 
R
L
 
Q
V
 
I
D
 
E
Q
 
N
G
 
G
S
 
I
S
 
D
A
 
A
I
 
V
V
 
V
V
 
P
T
 
V
G
 
G
S
 
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
S
|
S
A
|
A
T
 
T
L
|
L
S
 
T
D
 
H
D
 
E
E
 
E
R
x
K
A
 
R
T
 
T
L
 
C
W
 
I
R
 
E
V
 
I
-
 
A
-
 
V
-
 
E
V
 
T
A
 
C
A
 
K
A
 
G
V
 
T
D
 
K
V
 
V
P
 
K
V
 
V
I
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
G
T
 
S
N
|
N
D
 
A
T
 
T
A
 
H
H
x
E
S
 
A
L
 
V
R
 
G
L
 
L
V
 
A
D
 
K
A
 
F
A
 
A
E
 
K
R
 
E
A
 
H
G
 
G
A
 
A
K
 
D
G
 
G
I
 
I
L
 
L
A
 
S
V
 
V
V
 
A
P
 
P
Y
|
Y
Y
 
Y
N
 
N
R
 
K
P
 
P
P
 
T
Q
 
Q
A
 
Q
G
 
G
L
 
L
V
 
Y
R
 
E
H
 
H
F
 
Y
G
 
K
Q
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
Q
A
 
S
T
 
V
S
 
D
L
 
I
P
 
P
V
 
V
L
 
L
L
 
L
Y
 
Y
D
 
N
V
 
V
P
 
P
A
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
R
 
C
R
 
E
L
 
I
E
 
S
P
 
T
E
 
D
T
 
T
T
 
I
R
 
I
E
 
K
L
 
L
A
 
F
R
 
R
T
 
D
S
 
C
T
 
E
N
 
N
V
 
I
V
 
Y
G
 
G
L
 
V
K
 
K
D
 
E
A
 
A
S
 
S
G
 
G
D
 
N
L
 
I
A
 
D
A
 
K
A
 
C
A
 
V
A
 
D
L
 
L
V
 
L
A
 
A
E
 
H
A
 
E
P
 
P
D
 
R
G
 
-
F
 
M
V
 
M
L
 
L
Y
 
I
C
 
S
G
 
G
D
 
E
D
 
D
A
 
A
L
 
I
V
 
N
L
 
Y
P
 
P
Y
 
I
L
 
L
A
 
S
I
 
N
G
 
G
A
 
G
V
 
K
G
 
G
V
 
V
V
 
I
S
 
S
V
 
V
A
 
T
G
 
S
H
 
N
W
 
L
A
 
L
G
 
P
P
 
D
L
 
M
Q
 
I
R
 
S
V
 
A
M
 
L
I
 
T
E
 
H
A
 
F
A
 
A
R
 
L
S
 
D
G
 
E
D
 
N
W
 
Y
E
 
K
R
 
E
A
 
A
R
 
K
R
 
K
L
 
I
N
 
N
A
 
D
A
 
E
L
 
L
E
 
-
A
 
-
S
 
-
Y
 
Y
R
 
N
F
 
I
E
 
-
N
 
N
Q
 
K
L
 
I
A
 
L
Y
 
F
-
 
C
-
 
E
P
 
S
N
 
N
P
 
P
I
 
I
P
 
P
T
 
I
K
 
K
A
 
T
M
 
A
L
 
M
A
 
Y
A
 
L
L
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
I
E
 
E
P
 
S
V
 
L
-
 
E
C
 
F
R
 
R
S
 
L
P
 
P
L
 
L
I
 
C
D
 
S
P
 
P
T
 
S

4m19A Dihydrodipicolinate synthase from c. Jejuni with pyruvate bound to the active site and lysine bound to allosteric site (see paper)
36% identity, 87% coverage: 11:280/309 of query aligns to 8:277/296 of 4m19A

query
sites
4m19A
I
 
M
T
 
T
A
 
A
M
 
L
A
 
I
T
 
T
P
 
P
F
 
F
G
 
-
T
 
K
D
 
N
G
 
G
A
 
K
L
 
V
D
 
D
L
 
E
A
 
Q
A
 
S
A
 
Y
E
 
A
R
 
R
V
 
L
A
 
I
R
 
K
W
 
R
L
 
Q
V
 
I
D
 
E
Q
 
N
G
 
G
S
 
I
S
 
D
A
 
A
I
 
V
V
 
V
V
 
P
T
 
V
G
 
G
S
x
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
S
|
S
A
|
A
T
 
T
L
|
L
S
 
T
D
x
H
D
 
E
E
 
E
R
x
H
A
 
R
T
 
T
L
 
C
W
 
I
R
 
E
V
 
I
-
 
A
-
 
V
-
 
E
V
 
T
A
 
C
A
 
K
A
 
G
V
 
T
D
 
K
V
 
V
P
 
K
V
 
V
I
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
G
T
 
S
N
|
N
D
 
A
T
 
T
A
 
H
H
x
E
S
 
A
L
 
V
R
 
G
L
 
L
V
 
A
D
 
K
A
 
F
A
 
A
E
 
K
R
 
E
A
 
H
G
 
G
A
 
A
K
 
D
G
 
G
I
 
I
L
 
L
A
 
S
V
 
V
V
 
A
P
 
P
Y
|
Y
Y
|
Y
N
 
N
R
 
K
P
 
P
P
 
T
Q
 
Q
A
 
Q
G
 
G
L
 
L
V
 
Y
R
 
E
H
 
H
F
 
Y
G
 
K
Q
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
Q
A
 
S
T
 
V
S
 
D
L
 
I
P
 
P
V
 
V
L
 
L
L
 
L
Y
|
Y
D
 
N
V
 
V
P
 
P
A
 
G
R
|
R
T
 
T
G
 
G
R
 
C
R
 
E
L
 
I
E
 
S
P
 
T
E
 
D
T
 
T
T
 
I
R
 
I
E
 
K
L
 
L
A
 
F
R
 
R
T
 
D
S
 
C
T
 
E
N
 
N
V
 
I
V
 
Y
G
 
G
L
 
V
K
|
K
D
 
E
A
 
A
S
 
S
G
 
G
D
 
N
L
 
I
A
 
D
A
 
K
A
 
C
A
 
V
A
 
D
L
 
L
V
 
L
A
 
A
E
 
H
A
 
E
P
 
P
D
 
R
G
 
-
F
 
M
V
 
M
L
 
L
Y
 
I
C
 
S
G
 
G
D
 
E
D
 
D
A
 
A
L
 
I
V
 
N
L
 
Y
P
 
P
Y
 
I
L
 
L
A
 
S
I
 
N
G
 
G
A
 
G
V
 
K
G
 
G
V
 
V
V
x
I
S
 
S
V
 
V
A
 
T
G
 
S
H
 
N
W
 
L
A
 
L
G
 
P
P
 
D
L
 
M
Q
 
I
R
 
S
V
 
A
M
 
L
I
 
T
E
 
H
A
 
F
A
 
A
R
 
L
S
 
D
G
 
E
D
 
N
W
 
Y
E
 
K
R
 
E
A
 
A
R
 
K
R
 
K
L
 
I
N
 
N
A
 
D
A
 
E
L
 
L
E
 
-
A
 
-
S
 
-
Y
 
Y
R
 
N
F
 
I
E
 
-
N
 
N
Q
 
K
L
 
I
A
 
L
Y
 
F
-
 
C
-
 
E
P
 
S
N
 
N
P
 
P
I
 
I
P
 
P
T
 
I
K
 
K
A
 
T
M
 
A
L
 
M
A
 
Y
A
 
L
L
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
I
E
 
E
P
 
S
V
 
L
-
 
E
C
 
F
R
 
R
S
 
L
P
 
P
L
 
L
I
 
C
D
 
S
P
 
P
T
 
S

4dxvA Crystal structure of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii complexed with mg and cl ions at 1.80 a resolution
36% identity, 86% coverage: 11:276/309 of query aligns to 6:270/291 of 4dxvA

query
sites
4dxvA
I
 
I
T
 
V
A
 
A
M
 
I
A
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
G
 
L
T
 
K
D
 
D
G
 
G
A
 
G
L
 
V
D
 
D
L
 
W
A
 
K
A
 
S
A
 
L
E
 
E
R
 
K
V
 
L
A
 
V
R
 
E
W
 
W
L
 
H
V
 
I
D
 
E
Q
 
Q
G
 
G
S
 
T
S
 
N
A
 
S
I
 
I
V
 
V
V
 
A
T
 
V
G
 
G
S
x
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
S
 
A
A
 
S
T
 
T
L
 
L
S
 
S
D
 
M
D
 
E
E
 
E
R
 
H
A
 
T
T
 
Q
L
 
V
W
 
I
R
 
K
V
 
E
V
 
I
-
 
I
-
 
R
A
 
V
A
 
A
A
 
N
V
 
K
D
 
R
V
 
I
P
 
P
V
 
I
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
T
T
 
G
T
 
A
N
 
N
D
 
S
T
 
T
A
 
R
H
 
E
S
 
A
L
 
I
R
 
E
L
 
L
V
 
T
D
 
K
A
 
A
A
 
A
E
 
K
R
 
D
A
 
L
G
 
G
A
 
A
K
 
D
G
 
A
I
 
A
L
 
L
A
 
L
V
 
V
V
x
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
N
 
N
R
 
K
P
 
P
P
 
T
Q
 
Q
A
 
E
G
 
G
L
 
L
V
 
Y
R
 
Q
H
 
H
F
 
Y
G
 
K
Q
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
E
A
 
A
T
 
V
S
 
E
L
 
L
P
 
P
V
 
L
L
 
I
L
 
L
Y
|
Y
D
x
N
V
|
V
P
|
P
A
 
G
R
|
R
T
|
T
G
 
G
R
 
V
R
 
D
L
 
L
E
 
S
P
 
N
E
 
D
T
 
T
T
 
A
R
 
V
E
 
R
L
 
L
A
 
A
R
 
E
T
 
I
S
 
P
T
 
-
N
 
N
V
 
I
V
 
V
G
 
G
L
 
I
K
|
K
D
 
D
A
 
A
S
 
T
G
 
G
D
 
D
L
 
V
A
 
P
A
 
R
A
 
G
A
 
K
A
 
A
L
 
L
V
 
I
A
 
D
E
 
A
A
 
L
P
 
N
D
 
G
G
 
K
F
 
M
V
 
A
L
 
V
Y
 
Y
C
 
S
G
 
G
D
 
D
D
 
D
A
 
E
L
 
T
V
 
A
L
 
W
P
 
E
Y
 
L
L
 
M
A
 
L
I
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
D
G
 
G
V
 
N
V
x
I
S
 
S
V
 
V
A
 
T
G
 
A
H
 
N
W
 
I
A
 
A
G
 
P
P
 
K
L
 
A
Q
 
M
R
 
S
V
 
E
M
 
V
I
 
C
E
 
A
A
 
V
A
 
A
R
 
I
S
 
A
G
 
K
D
 
D
W
 
E
E
 
Q
R
 
Q
A
 
A
R
 
K
R
 
T
L
 
L
N
 
N
A
 
N
A
 
K
L
 
I
E
 
A
A
 
N
S
 
L
Y
 
H
R
 
N
F
 
I
E
 
-
N
 
-
Q
 
L
L
 
F
A
 
C
Y
 
E
P
 
S
N
 
N
P
 
P
I
 
I
P
 
P
T
 
V
K
 
K
A
 
W
M
 
A
L
 
L
A
 
H
A
 
E
L
 
M
G
 
G
L
 
L
A
 
I
E
 
D
P
 
T
V
 
G
C
 
I
R
 
R
S
 
L
P
 
P
L
 
L

3u8gA Crystal structure of the complex of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with oxalic acid at 1.80 a resolution
36% identity, 86% coverage: 11:276/309 of query aligns to 6:270/291 of 3u8gA

query
sites
3u8gA
I
 
I
T
 
V
A
|
A
M
 
I
A
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
G
 
L
T
 
K
D
 
D
G
 
G
A
 
G
L
 
V
D
 
D
L
 
W
A
 
K
A
 
S
A
 
L
E
 
E
R
 
K
V
 
L
A
 
V
R
 
E
W
 
W
L
 
H
V
 
I
D
 
E
Q
 
Q
G
 
G
S
 
T
S
 
N
A
 
S
I
 
I
V
 
V
V
 
A
T
 
V
G
|
G
S
x
T
T
|
T
G
 
G
E
 
E
S
 
A
A
 
S
T
 
T
L
 
L
S
 
S
D
 
M
D
 
E
E
 
E
R
 
H
A
 
T
T
 
Q
L
 
V
W
 
I
R
 
K
V
 
E
V
 
I
-
 
I
-
 
R
A
 
V
A
 
A
A
 
N
V
 
K
D
 
R
V
 
I
P
 
P
V
 
I
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
T
T
 
G
T
 
A
N
 
N
D
 
S
T
 
T
A
 
R
H
 
E
S
 
A
L
 
I
R
 
E
L
 
L
V
 
T
D
 
K
A
 
A
A
 
A
E
 
K
R
 
D
A
 
L
G
 
G
A
 
A
K
 
D
G
 
A
I
 
A
L
|
L
A
 
L
V
 
V
V
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
N
 
N
R
 
K
P
 
P
P
 
T
Q
 
Q
A
 
E
G
 
G
L
 
L
V
 
Y
R
 
Q
H
 
H
F
 
Y
G
 
K
Q
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
E
A
 
A
T
 
V
S
 
E
L
 
L
P
 
P
V
 
L
L
 
I
L
 
L
Y
|
Y
D
 
N
V
 
V
P
 
P
A
 
G
R
|
R
T
 
T
G
 
G
R
 
V
R
 
D
L
 
L
E
 
S
P
 
N
E
 
D
T
 
T
T
 
A
R
 
V
E
 
R
L
 
L
A
 
A
R
 
E
T
 
I
S
 
P
T
 
-
N
 
N
V
 
I
V
 
V
G
 
G
L
 
I
K
|
K
D
 
D
A
 
A
S
 
T
G
 
G
D
 
D
L
 
V
A
 
P
A
 
R
A
 
G
A
 
K
A
 
A
L
 
L
V
 
I
A
 
D
E
 
A
A
 
L
P
 
N
D
 
G
G
 
K
F
 
M
V
 
A
L
 
V
Y
 
Y
C
 
S
G
 
G
D
 
D
D
 
D
A
 
E
L
 
T
V
 
A
L
 
W
P
 
E
Y
 
L
L
 
M
A
 
L
I
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
D
G
 
G
V
 
N
V
x
I
S
 
S
V
 
V
A
 
T
G
 
A
H
 
N
W
 
I
A
 
A
G
 
P
P
 
K
L
 
A
Q
 
M
R
 
S
V
 
E
M
 
V
I
 
C
E
 
A
A
 
V
A
 
A
R
 
I
S
 
A
G
 
K
D
 
D
W
 
E
E
 
Q
R
 
Q
A
 
A
R
 
K
R
 
T
L
 
L
N
 
N
A
 
N
A
 
K
L
 
I
E
 
A
A
 
N
S
 
L
Y
 
H
R
 
N
F
 
I
E
 
-
N
 
-
Q
 
L
L
 
F
A
 
C
Y
 
E
P
 
S
N
 
N
P
 
P
I
 
I
P
 
P
T
 
V
K
 
K
A
 
W
M
 
A
L
 
L
A
 
H
A
 
E
L
 
M
G
 
G
L
 
L
A
 
I
E
 
D
P
 
T
V
 
G
C
 
I
R
 
R
S
 
L
P
 
P
L
 
L

3tdfA Crystal structure of the complex of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with 2-ketobutanoic acid at 1.99 a resolution
36% identity, 86% coverage: 11:276/309 of query aligns to 6:270/291 of 3tdfA

query
sites
3tdfA
I
 
I
T
 
V
A
|
A
M
 
I
A
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
G
 
L
T
 
K
D
 
D
G
 
G
A
 
G
L
 
V
D
 
D
L
 
W
A
 
K
A
 
S
A
 
L
E
 
E
R
 
K
V
 
L
A
 
V
R
 
E
W
 
W
L
 
H
V
 
I
D
 
E
Q
 
Q
G
 
G
S
 
T
S
 
N
A
 
S
I
 
I
V
 
V
V
 
A
T
 
V
G
 
G
S
x
T
T
|
T
G
 
G
E
 
E
S
 
A
A
 
S
T
 
T
L
 
L
S
 
S
D
 
M
D
 
E
E
 
E
R
 
H
A
 
T
T
 
Q
L
 
V
W
 
I
R
 
K
V
 
E
V
 
I
-
 
I
-
 
R
A
 
V
A
 
A
A
 
N
V
 
K
D
 
R
V
 
I
P
 
P
V
 
I
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
T
T
 
G
T
 
A
N
 
N
D
 
S
T
 
T
A
 
R
H
 
E
S
 
A
L
 
I
R
 
E
L
 
L
V
 
T
D
 
K
A
 
A
A
 
A
E
 
K
R
 
D
A
 
L
G
 
G
A
 
A
K
 
D
G
 
A
I
 
A
L
 
L
A
 
L
V
 
V
V
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
N
 
N
R
 
K
P
 
P
P
 
T
Q
 
Q
A
 
E
G
 
G
L
 
L
V
 
Y
R
 
Q
H
 
H
F
 
Y
G
 
K
Q
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
E
A
 
A
T
 
V
S
 
E
L
 
L
P
 
P
V
 
L
L
 
I
L
 
L
Y
|
Y
D
 
N
V
 
V
P
 
P
A
 
G
R
|
R
T
 
T
G
 
G
R
 
V
R
 
D
L
 
L
E
 
S
P
 
N
E
 
D
T
 
T
T
 
A
R
 
V
E
 
R
L
 
L
A
 
A
R
 
E
T
 
I
S
 
P
T
 
-
N
 
N
V
 
I
V
 
V
G
 
G
L
 
I
K
|
K
D
 
D
A
 
A
S
 
T
G
 
G
D
 
D
L
 
V
A
 
P
A
 
R
A
 
G
A
 
K
A
 
A
L
 
L
V
 
I
A
 
D
E
 
A
A
 
L
P
 
N
D
 
G
G
 
K
F
 
M
V
 
A
L
 
V
Y
 
Y
C
 
S
G
 
G
D
 
D
D
 
D
A
 
E
L
 
T
V
 
A
L
 
W
P
 
E
Y
 
L
L
 
M
A
 
L
I
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
D
G
 
G
V
 
N
V
x
I
S
 
S
V
 
V
A
 
T
G
 
A
H
 
N
W
 
I
A
 
A
G
 
P
P
 
K
L
 
A
Q
 
M
R
 
S
V
 
E
M
 
V
I
 
C
E
 
A
A
 
V
A
 
A
R
 
I
S
 
A
G
 
K
D
 
D
W
 
E
E
 
Q
R
 
Q
A
 
A
R
 
K
R
 
T
L
 
L
N
 
N
A
 
N
A
 
K
L
 
I
E
 
A
A
 
N
S
 
L
Y
 
H
R
 
N
F
 
I
E
 
-
N
 
-
Q
 
L
L
 
F
A
 
C
Y
 
E
P
 
S
N
 
N
P
 
P
I
 
I
P
 
P
T
 
V
K
 
K
A
 
W
M
 
A
L
 
L
A
 
H
A
 
E
L
 
M
G
 
G
L
 
L
A
 
I
E
 
D
P
 
T
V
 
G
C
 
I
R
 
R
S
 
L
P
 
P
L
 
L

3tceA Crystal structure of the complex of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with 5-hydroxylysine at 2.6 a resolution
36% identity, 86% coverage: 11:276/309 of query aligns to 6:270/291 of 3tceA

query
sites
3tceA
I
 
I
T
 
V
A
 
A
M
 
I
A
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
G
 
L
T
 
K
D
 
D
G
 
G
A
 
G
L
 
V
D
 
D
L
 
W
A
 
K
A
 
S
A
 
L
E
 
E
R
 
K
V
 
L
A
 
V
R
 
E
W
 
W
L
 
H
V
 
I
D
 
E
Q
 
Q
G
 
G
S
 
T
S
 
N
A
 
S
I
 
I
V
 
V
V
 
A
T
 
V
G
 
G
S
x
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
S
 
A
A
x
S
T
 
T
L
|
L
S
 
S
D
 
M
D
 
E
E
 
E
R
x
H
A
 
T
T
 
Q
L
 
V
W
 
I
R
 
K
V
 
E
V
 
I
-
 
I
-
 
R
A
 
V
A
 
A
A
 
N
V
 
K
D
 
R
V
 
I
P
 
P
V
 
I
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
T
T
 
G
T
 
A
N
 
N
D
 
S
T
 
T
A
 
R
H
 
E
S
 
A
L
 
I
R
 
E
L
 
L
V
 
T
D
 
K
A
 
A
A
 
A
E
 
K
R
 
D
A
 
L
G
 
G
A
 
A
K
 
D
G
 
A
I
 
A
L
 
L
A
 
L
V
 
V
V
 
T
P
 
P
Y
|
Y
Y
|
Y
N
 
N
R
 
K
P
 
P
P
 
T
Q
 
Q
A
 
E
G
 
G
L
 
L
V
 
Y
R
 
Q
H
 
H
F
 
Y
G
 
K
Q
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
E
A
 
A
T
 
V
S
 
E
L
 
L
P
 
P
V
 
L
L
 
I
L
 
L
Y
|
Y
D
 
N
V
 
V
P
 
P
A
 
G
R
|
R
T
 
T
G
 
G
R
 
V
R
 
D
L
 
L
E
 
S
P
 
N
E
 
D
T
 
T
T
 
A
R
 
V
E
 
R
L
 
L
A
 
A
R
 
E
T
 
I
S
 
P
T
 
-
N
 
N
V
 
I
V
 
V
G
 
G
L
 
I
K
|
K
D
 
D
A
 
A
S
 
T
G
 
G
D
 
D
L
 
V
A
 
P
A
 
R
A
 
G
A
 
K
A
 
A
L
 
L
V
 
I
A
 
D
E
 
A
A
 
L
P
 
N
D
 
G
G
 
K
F
 
M
V
 
A
L
 
V
Y
 
Y
C
 
S
G
 
G
D
 
D
D
 
D
A
 
E
L
 
T
V
 
A
L
 
W
P
 
E
Y
 
L
L
 
M
A
 
L
I
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
D
G
 
G
V
 
N
V
x
I
S
 
S
V
 
V
A
 
T
G
 
A
H
 
N
W
 
I
A
 
A
G
 
P
P
 
K
L
 
A
Q
 
M
R
 
S
V
 
E
M
 
V
I
 
C
E
 
A
A
 
V
A
 
A
R
 
I
S
 
A
G
 
K
D
 
D
W
 
E
E
 
Q
R
 
Q
A
 
A
R
 
K
R
 
T
L
 
L
N
 
N
A
 
N
A
 
K
L
 
I
E
 
A
A
 
N
S
 
L
Y
 
H
R
 
N
F
 
I
E
 
-
N
 
-
Q
 
L
L
 
F
A
 
C
Y
 
E
P
 
S
N
 
N
P
 
P
I
 
I
P
 
P
T
 
V
K
 
K
A
 
W
M
 
A
L
 
L
A
 
H
A
 
E
L
 
M
G
 
G
L
 
L
A
 
I
E
 
D
P
 
T
V
 
G
C
 
I
R
 
R
S
 
L
P
 
P
L
 
L

3rk8A Crystal structure of the chloride inhibited dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii complexed with pyruvate at 1.8 a resolution
36% identity, 86% coverage: 11:276/309 of query aligns to 6:270/291 of 3rk8A

query
sites
3rk8A
I
 
I
T
 
V
A
 
A
M
 
I
A
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
G
 
L
T
 
K
D
 
D
G
 
G
A
 
G
L
 
V
D
 
D
L
 
W
A
 
K
A
 
S
A
 
L
E
 
E
R
 
K
V
 
L
A
 
V
R
 
E
W
 
W
L
 
H
V
 
I
D
 
E
Q
 
Q
G
 
G
S
 
T
S
 
N
A
 
S
I
 
I
V
 
V
V
 
A
T
 
V
G
 
G
S
x
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
S
 
A
A
 
S
T
 
T
L
 
L
S
 
S
D
 
M
D
 
E
E
 
E
R
 
H
A
 
T
T
 
Q
L
 
V
W
 
I
R
 
K
V
 
E
V
 
I
-
 
I
-
 
R
A
 
V
A
 
A
A
 
N
V
 
K
D
 
R
V
 
I
P
 
P
V
 
I
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
T
T
 
G
T
 
A
N
 
N
D
 
S
T
 
T
A
 
R
H
 
E
S
 
A
L
 
I
R
 
E
L
 
L
V
 
T
D
 
K
A
 
A
A
 
A
E
 
K
R
 
D
A
 
L
G
 
G
A
 
A
K
 
D
G
 
A
I
 
A
L
 
L
A
 
L
V
 
V
V
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
N
 
N
R
 
K
P
 
P
P
 
T
Q
 
Q
A
 
E
G
 
G
L
 
L
V
 
Y
R
 
Q
H
 
H
F
 
Y
G
 
K
Q
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
E
A
 
A
T
 
V
S
 
E
L
 
L
P
 
P
V
 
L
L
 
I
L
 
L
Y
|
Y
D
 
N
V
 
V
P
 
P
A
 
G
R
|
R
T
 
T
G
 
G
R
 
V
R
 
D
L
 
L
E
 
S
P
 
N
E
 
D
T
 
T
T
 
A
R
 
V
E
 
R
L
 
L
A
 
A
R
 
E
T
 
I
S
 
P
T
 
-
N
 
N
V
 
I
V
 
V
G
 
G
L
 
I
K
|
K
D
 
D
A
 
A
S
 
T
G
 
G
D
 
D
L
 
V
A
 
P
A
 
R
A
 
G
A
 
K
A
 
A
L
 
L
V
 
I
A
 
D
E
 
A
A
 
L
P
 
N
D
 
G
G
 
K
F
 
M
V
 
A
L
 
V
Y
 
Y
C
 
S
G
|
G
D
 
D
D
 
D
A
 
E
L
 
T
V
 
A
L
 
W
P
 
E
Y
 
L
L
 
M
A
 
L
I
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
D
G
 
G
V
 
N
V
x
I
S
 
S
V
 
V
A
 
T
G
 
A
H
 
N
W
 
I
A
 
A
G
 
P
P
 
K
L
 
A
Q
 
M
R
 
S
V
 
E
M
 
V
I
 
C
E
 
A
A
 
V
A
 
A
R
 
I
S
 
A
G
 
K
D
 
D
W
 
E
E
 
Q
R
 
Q
A
 
A
R
 
K
R
 
T
L
 
L
N
 
N
A
 
N
A
 
K
L
 
I
E
 
A
A
 
N
S
 
L
Y
 
H
R
 
N
F
 
I
E
 
-
N
 
-
Q
 
L
L
x
F
A
 
C
Y
 
E
P
 
S
N
 
N
P
 
P
I
 
I
P
 
P
T
 
V
K
 
K
A
 
W
M
 
A
L
 
L
A
 
H
A
 
E
L
 
M
G
 
G
L
 
L
A
 
I
E
 
D
P
 
T
V
 
G
C
 
I
R
 
R
S
 
L
P
 
P
L
 
L

Query Sequence

>WP_015798095.1 NCBI__GCF_000023265.1:WP_015798095.1
MAPTVAFGPEITAMATPFGTDGALDLAAAERVARWLVDQGSSAIVVTGSTGESATLSDDE
RATLWRVVAAAVDVPVIAGATTNDTAHSLRLVDAAERAGAKGILAVVPYYNRPPQAGLVR
HFGQIARATSLPVLLYDVPARTGRRLEPETTRELARTSTNVVGLKDASGDLAAAAALVAE
APDGFVLYCGDDALVLPYLAIGAVGVVSVAGHWAGPLQRVMIEAARSGDWERARRLNAAL
EASYRFENQLAYPNPIPTKAMLAALGLAEPVCRSPLIDPTPTLIDEARSVLADLHAQADK
EGIELRVKA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory