SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_015798110.1 NCBI__GCF_000023265.1:WP_015798110.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 11 hits to proteins with known functional sites (download)

5xoyA Crystal structure of lysk from thermus thermophilus in complex with lysine (see paper)
28% identity, 96% coverage: 3:331/344 of query aligns to 2:323/341 of 5xoyA

query
sites
5xoyA
D
 
D
P
 
P
V
 
V
E
 
E
L
 
F
A
 
L
A
 
K
A
 
G
Y
 
A
L
 
L
E
 
E
V
 
I
P
 
P
S
 
S
V
 
P
T
 
S
G
 
G
D
 
K
E
 
E
A
 
R
A
 
L
L
 
V
A
 
A
R
 
E
L
 
Y
V
 
L
G
 
A
E
 
E
H
 
G
L
 
M
D
 
Q
A
 
K
A
 
L
G
 
G
L
 
L
R
 
K
V
 
-
E
 
G
V
 
F
V
 
V
A
 
D
G
 
E
C
 
A
V
 
D
V
 
N
A
 
A
R
 
R
N
 
G
H
 
Q
G
 
V
G
 
G
D
 
E
S
 
G
S
 
P
A
 
V
T
 
Q
L
 
V
-
 
V
L
 
L
V
 
L
G
 
G
H
 
H
L
 
I
D
 
D
T
 
T
V
 
V
P
 
P
G
 
G
E
 
Q
L
 
I
P
 
P
V
 
V
A
 
R
V
 
L
D
 
E
E
 
G
L
 
G
V
 
R
L
 
L
R
 
F
G
 
G
R
 
R
G
 
G
A
 
A
V
 
V
D
 
D
M
 
A
K
 
K
A
 
-
G
 
G
L
 
P
A
 
F
V
 
V
A
 
A
V
 
M
A
 
I
L
 
F
A
 
A
C
 
A
S
 
A
E
 
G
P
 
L
S
 
S
-
 
E
-
 
E
-
 
A
-
 
R
-
 
K
-
 
R
V
 
L
P
 
T
V
 
V
T
 
H
V
 
L
V
 
V
A
 
G
Y
 
A
P
 
T
G
 
E
E
|
E
E
 
E
G
 
A
P
 
P
I
 
S
T
x
S
G
 
K
N
 
G
G
 
-
L
 
-
A
 
A
H
 
R
L
 
F
V
 
V
A
 
A
E
 
P
R
 
R
P
 
-
E
 
-
L
 
-
L
 
L
A
 
K
G
 
P
A
 
H
R
 
Y
G
 
A
V
 
V
L
 
I
L
 
G
E
 
E
P
 
P
T
 
S
G
 
G
-
 
W
G
 
E
F
 
G
L
 
I
E
 
T
L
 
L
G
 
G
C
 
Y
Q
 
K
G
 
G
V
 
-
V
 
-
R
 
R
A
 
L
T
 
L
L
 
V
R
 
K
L
 
A
R
 
R
G
 
R
R
 
E
R
 
K
A
 
D
H
 
H
-
 
E
-
 
P
-
 
N
-
 
A
-
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
L
-
 
I
-
 
S
-
 
Y
-
 
F
-
 
V
V
 
A
A
 
I
R
 
K
A
 
A
W
 
W
-
 
A
-
 
E
-
 
A
-
 
M
-
 
N
M
 
V
G
 
G
R
 
Q
N
 
R
A
 
P
I
 
F
D
 
D
R
 
Q
V
 
V
G
 
Q
E
 
Y
A
 
T
L
 
L
G
 
R
T
 
D
L
 
F
R
 
R
A
 
V
L
 
H
E
 
P
R
 
R
R
 
Q
E
 
-
P
 
-
Q
 
-
I
 
-
G
 
-
P
 
-
V
 
-
R
 
-
Y
 
-
R
 
-
E
 
-
A
 
-
I
 
-
E
 
-
V
 
-
V
 
-
G
 
-
V
 
-
R
 
-
G
 
-
G
 
-
V
 
-
A
 
-
W
 
-
N
 
-
V
 
-
V
 
-
P
 
-
D
 
-
L
 
V
V
 
A
E
 
E
I
 
M
D
 
F
V
 
F
S
 
D
Y
 
L
R
|
R
F
 
L
A
 
P
P
 
P
D
 
R
L
 
L
D
 
P
A
 
P
A
 
E
R
 
E
A
 
A
R
 
I
Q
 
R
R
 
H
L
 
L
E
 
T
E
 
A
A
 
Y
V
 
A
R
 
P
P
 
P
V
 
T
M
 
I
D
 
E
-
 
L
-
 
E
-
 
F
D
 
F
G
 
G
D
 
R
D
 
E
L
 
V
E
 
P
V
 
Y
A
 
Q
E
 
G
A
 
P
V
 
K
P
 
D
G
 
T
A
 
P
V
 
L
S
 
T
D
 
R
L
 
A
G
 
F
R
 
R
F
 
Q
G
 
A
A
 
I
L
 
R
R
 
K
S
 
A
G
 
G
A
 
G
F
 
R
G
 
P
V
 
V
-
 
F
R
 
K
A
 
L
K
 
K
L
 
T
G
 
G
W
x
T
T
 
S
D
 
D
V
 
M
A
 
N
Q
 
V
L
 
L
V
 
A
A
 
P
A
 
H
-
 
W
G
 
P
V
 
V
P
 
P
A
 
M
V
 
V
N
 
A
F
 
Y
G
 
G
P
 
P
G
 
G
D
 
D
P
 
S
E
 
T
L
 
L
A
 
D
H
 
H
T
 
T
D
 
P
Q
 
Y
E
 
E
M
 
H
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
E
 
E
V
 
F

7t1qA Crystal structure of the succinyl-diaminopimelate desuccinylase (dape) from acinetobacter baumannii in complex with succinic acid
25% identity, 69% coverage: 15:251/344 of query aligns to 16:274/377 of 7t1qA

query
sites
7t1qA
P
 
P
S
 
S
V
 
V
T
 
T
G
 
P
D
 
I
E
 
D
A
 
H
A
 
T
L
 
C
A
 
Q
R
 
T
L
 
I
V
 
M
G
 
A
E
 
D
H
 
R
L
 
L
D
 
A
A
 
K
A
 
V
G
 
G
L
 
F
R
 
H
V
 
I
E
 
E
V
 
P
V
 
M
-
 
R
-
 
F
-
 
G
-
 
D
A
 
V
G
 
D
C
 
N
V
 
L
V
 
W
A
 
A
R
 
R
N
 
R
H
 
-
G
 
G
G
 
T
D
 
E
S
 
G
S
 
P
A
 
V
T
 
F
L
 
C
L
 
F
V
 
A
G
 
G
H
|
H
L
 
T
D
 
D
T
 
V
V
 
V
P
 
P
-
 
T
G
 
G
E
 
R
L
 
L
-
 
D
-
 
A
-
 
W
-
 
N
-
 
S
-
 
D
P
 
P
V
 
F
A
 
A
-
 
P
-
 
E
V
 
I
D
 
R
E
 
D
L
 
G
V
 
K
L
 
L
R
 
Y
G
 
G
R
 
R
G
 
G
A
 
S
V
 
A
D
|
D
M
 
M
K
 
K
A
 
T
G
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
A
A
 
M
V
 
V
A
 
V
-
 
A
-
 
S
-
 
E
-
 
R
L
 
F
A
 
V
C
 
A
S
 
K
E
 
H
P
 
P
S
 
N
V
 
H
P
 
K
-
 
G
-
 
S
V
 
I
T
 
A
V
 
F
V
 
L
A
 
I
Y
 
T
P
 
S
G
 
D
E
 
E
E
|
E
G
 
G
P
 
P
I
 
A
T
 
V
G
 
-
N
 
N
G
 
G
L
 
T
A
 
V
H
 
K
L
 
V
V
 
I
A
 
E
-
 
T
-
 
L
-
 
E
E
 
K
R
 
R
P
 
N
E
 
E
L
 
K
L
 
I
A
 
T
G
 
W
A
 
C
R
 
-
G
 
-
V
 
L
L
 
V
L
 
G
E
|
E
P
 
P
T
 
S
-
 
S
-
 
T
-
 
H
-
 
K
-
 
L
G
 
G
G
 
D
F
 
I
L
 
V
E
 
K
L
 
N
G
 
G
C
 
R
Q
 
R
G
 
G
V
 
S
V
 
L
R
 
N
A
 
A
T
 
V
L
 
L
R
 
K
L
 
V
R
 
Q
G
 
G
R
 
K
R
 
Q
A
 
G
H
 
H
V
 
V
A
 
A
R
 
Y
A
 
P
W
 
H
M
 
L
G
 
A
R
 
R
N
 
N
A
 
P
I
 
I
D
 
H
R
 
E
V
 
A
G
 
S
E
 
P
A
 
A
L
 
L
G
 
A
T
 
E
L
 
L
-
 
C
R
 
Q
A
 
T
L
 
V
E
 
W
R
 
D
R
 
N
E
 
G
P
 
N
Q
 
E
I
 
Y
G
 
F
P
 
P
V
 
A
R
 
T
Y
 
-
R
 
-
E
 
-
A
 
S
I
 
F
E
 
Q
V
 
I
V
 
S
G
 
N
V
 
I
R
 
H
G
 
A
G
 
G
V
 
T
-
 
G
A
 
A
W
 
T
N
 
N
V
 
V
V
 
I
P
 
P
D
 
G
L
 
A
V
 
L
E
 
E
I
 
V
D
 
T
V
 
F
S
 
N
Y
 
F
R
 
R
F
 
Y
A
 
S
P
 
T
D
 
E
L
 
V
D
 
T
A
 
A
A
 
E
R
 
Q
A
 
L
R
 
K
Q
 
Q
R
 
R
L
 
V
E
 
H
E
 
E

Sites not aligning to the query:

4pqaA Crystal structure of succinyl-diaminopimelate desuccinylase from neisseria meningitidis mc58 in complex with the inhibitor captopril (see paper)
24% identity, 71% coverage: 5:249/344 of query aligns to 6:272/375 of 4pqaA

query
sites
4pqaA
V
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
K
A
 
E
Y
 
L
L
 
I
E
 
S
V
 
R
P
 
P
S
 
S
V
 
V
T
 
T
G
 
P
D
 
D
E
 
D
A
 
R
A
 
D
L
 
C
A
 
Q
R
 
K
L
 
L
V
 
L
G
 
A
E
 
E
H
 
R
L
 
L
D
 
H
A
 
K
A
 
I
G
 
G
L
 
F
R
 
A
V
 
A
E
 
E
V
 
E
V
 
L
A
 
-
G
 
-
C
 
-
V
 
-
V
 
-
A
 
-
R
 
-
N
 
-
H
 
H
G
 
F
G
 
G
D
 
D
S
 
T
S
 
K
A
 
N
T
 
I
L
 
W
L
 
L
-
 
R
-
 
R
-
 
G
-
 
T
-
 
K
-
 
A
-
 
P
-
 
V
-
 
V
-
 
C
-
 
F
V
 
A
G
 
G
H
|
H
L
 
T
D
 
D
T
 
V
V
 
V
P
 
P
G
 
T
-
 
G
-
 
P
-
 
V
-
 
E
-
 
K
-
 
W
-
 
D
-
 
S
-
 
P
E
 
P
L
 
F
P
 
E
V
 
P
A
 
A
V
 
E
D
 
R
E
 
D
L
 
G
V
 
R
L
 
L
R
 
Y
G
 
G
R
 
R
G
 
G
A
 
A
V
 
A
D
|
D
M
 
M
K
 
K
A
 
T
G
 
S
L
 
I
A
 
A
V
 
C
A
 
F
V
 
V
A
 
T
L
 
-
A
 
A
C
 
C
S
 
E
E
 
R
P
 
-
S
 
-
V
 
-
P
 
-
V
 
-
T
 
F
V
 
V
V
 
A
A
 
K
Y
 
H
P
 
P
G
 
N
E
 
H
E
 
Q
G
 
G
P
 
S
I
 
I
T
 
A
-
 
L
-
 
L
-
 
I
-
 
T
-
 
S
-
 
D
-
x
E
-
x
E
G
 
G
N
 
D
G
 
A
L
 
L
-
 
D
-
 
G
-
 
T
-
 
T
-
 
K
-
 
V
A
 
V
H
 
D
L
 
V
V
 
L
A
 
K
E
 
A
R
 
R
P
 
D
E
 
E
L
 
L
L
 
I
A
 
D
G
 
Y
A
 
C
R
 
-
G
 
-
V
 
I
L
 
V
L
 
G
E
|
E
P
 
P
T
 
T
-
 
A
-
 
V
-
 
D
-
 
K
-
 
L
G
 
G
G
 
D
F
 
M
L
 
I
E
 
K
L
 
N
G
 
G
C
 
R
Q
 
R
G
 
G
V
 
S
V
 
L
R
 
S
A
 
G
T
 
N
L
 
L
R
 
T
L
 
V
R
 
K
G
 
G
R
 
K
R
 
Q
A
 
G
H
 
H
V
 
I
A
 
A
R
 
Y
A
 
P
W
 
H
M
 
L
G
 
A
R
 
I
N
 
N
A
 
P
I
 
V
D
 
H
R
 
T
V
 
F
G
 
A
E
 
P
A
 
A
L
 
L
-
 
L
-
 
E
G
 
L
T
 
T
L
 
Q
R
 
E
A
 
V
L
 
W
E
 
D
R
 
E
R
 
G
E
 
N
P
 
E
Q
 
Y
I
 
F
G
 
P
P
 
P
V
 
T
R
 
S
Y
 
F
R
 
-
E
 
-
A
 
-
I
 
-
E
 
Q
V
 
I
V
 
S
G
 
N
V
 
I
R
 
N
G
 
G
G
 
G
V
 
T
-
 
G
A
 
A
W
 
T
N
 
N
V
 
V
V
 
I
P
 
P
D
 
G
L
 
E
V
 
L
E
 
N
I
 
V
D
 
K
V
 
F
S
 
N
Y
 
F
R
 
R
F
 
F
A
 
S
P
 
T
D
 
E
L
 
S
D
 
T
A
 
E
A
 
A
R
 
G
A
 
L
R
 
K
Q
 
Q
R
 
R
L
 
V

Sites not aligning to the query:

4o23A Crystal structure of mono-zinc form of succinyl diaminopimelate desuccinylase from neisseria meningitidis mc58 (see paper)
24% identity, 71% coverage: 5:249/344 of query aligns to 6:272/376 of 4o23A

query
sites
4o23A
V
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
K
A
 
E
Y
 
L
L
 
I
E
 
S
V
 
R
P
 
P
S
 
S
V
 
V
T
 
T
G
 
P
D
 
D
E
 
D
A
 
R
A
 
D
L
 
C
A
 
Q
R
 
K
L
 
L
V
 
L
G
 
A
E
 
E
H
 
R
L
 
L
D
 
H
A
 
K
A
 
I
G
 
G
L
 
F
R
 
A
V
 
A
E
 
E
V
 
E
V
 
L
A
 
-
G
 
-
C
 
-
V
 
-
V
 
-
A
 
-
R
 
-
N
 
-
H
 
H
G
 
F
G
 
G
D
 
D
S
 
T
S
 
K
A
 
N
T
 
I
L
 
W
L
 
L
-
 
R
-
 
R
-
 
G
-
 
T
-
 
K
-
 
A
-
 
P
-
 
V
-
 
V
-
 
C
-
 
F
V
 
A
G
 
G
H
|
H
L
 
T
D
 
D
T
 
V
V
 
V
P
 
P
G
 
T
-
 
G
-
 
P
-
 
V
-
 
E
-
 
K
-
 
W
-
 
D
-
 
S
-
 
P
E
 
P
L
 
F
P
 
E
V
 
P
A
 
A
V
 
E
D
 
R
E
 
D
L
 
G
V
 
R
L
 
L
R
 
Y
G
 
G
R
 
R
G
 
G
A
 
A
V
 
A
D
|
D
M
 
M
K
 
K
A
 
T
G
 
S
L
 
I
A
 
A
V
 
C
A
 
F
V
 
V
A
 
T
L
 
-
A
 
A
C
 
C
S
 
E
E
 
R
P
 
-
S
 
-
V
 
-
P
 
-
V
 
-
T
 
F
V
 
V
V
 
A
A
 
K
Y
 
H
P
 
P
G
 
N
E
 
H
E
 
Q
G
 
G
P
 
S
I
 
I
T
 
A
-
 
L
-
 
L
-
 
I
-
 
T
-
 
S
-
 
D
-
 
E
-
 
E
G
 
G
N
 
D
G
 
A
L
 
L
-
 
D
-
 
G
-
 
T
-
 
T
-
 
K
-
 
V
A
 
V
H
 
D
L
 
V
V
 
L
A
 
K
E
 
A
R
 
R
P
 
D
E
 
E
L
 
L
L
 
I
A
 
D
G
 
Y
A
 
C
R
 
-
G
 
-
V
 
I
L
 
V
L
 
G
E
|
E
P
 
P
T
 
T
-
 
A
-
 
V
-
 
D
-
 
K
-
 
L
G
 
G
G
 
D
F
 
M
L
 
I
E
 
K
L
 
N
G
 
G
C
 
R
Q
 
R
G
 
G
V
 
S
V
 
L
R
 
S
A
 
G
T
 
N
L
 
L
R
 
T
L
 
V
R
 
K
G
 
G
R
 
K
R
 
Q
A
 
G
H
 
H
V
 
I
A
 
A
R
 
Y
A
 
P
W
 
H
M
 
L
G
 
A
R
 
I
N
 
N
A
 
P
I
 
V
D
 
H
R
 
T
V
 
F
G
 
A
E
 
P
A
 
A
L
 
L
-
 
L
-
 
E
G
 
L
T
 
T
L
 
Q
R
 
E
A
 
V
L
 
W
E
 
D
R
 
E
R
 
G
E
 
N
P
 
E
Q
 
Y
I
 
F
G
 
P
P
 
P
V
 
T
R
 
S
Y
 
F
R
 
-
E
 
-
A
 
-
I
 
-
E
 
Q
V
 
I
V
 
S
G
 
N
V
 
I
R
 
N
G
 
G
G
 
G
V
 
T
-
 
G
A
 
A
W
 
T
N
 
N
V
 
V
V
 
I
P
 
P
D
 
G
L
 
E
V
 
L
E
 
N
I
 
V
D
 
K
V
 
F
S
 
N
Y
 
F
R
 
R
F
 
F
A
 
S
P
 
T
D
 
E
L
 
S
D
 
T
A
 
E
A
 
A
R
 
G
A
 
L
R
 
K
Q
 
Q
R
 
R
L
 
V

8uw6B Acetylornithine deacetylase from escherichia coli, di-zinc form. (see paper)
23% identity, 99% coverage: 5:343/344 of query aligns to 7:376/381 of 8uw6B

query
sites
8uw6B
V
 
I
E
 
E
L
 
I
A
 
Y
A
 
R
A
 
A
Y
 
L
L
 
I
E
 
A
V
 
T
P
 
P
S
 
S
V
 
I
T
 
S
G
 
A
D
 
T
E
 
E
A
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
D
R
 
Q
-
 
S
-
 
N
-
 
A
-
 
D
-
 
L
-
 
I
-
 
T
L
 
L
V
 
L
G
 
A
E
 
D
H
 
W
L
 
F
D
 
K
A
 
D
A
 
L
G
 
G
L
 
F
R
 
N
V
 
V
E
 
E
V
 
V
-
 
Q
-
 
P
V
 
V
A
 
P
G
 
G
C
 
T
V
 
R
V
 
N
A
 
K
R
 
F
N
 
N
H
 
M
-
 
L
-
 
A
-
 
S
-
 
T
G
 
G
G
 
Q
D
 
G
S
 
A
S
 
G
A
 
G
T
 
L
L
 
L
L
 
L
V
 
A
G
 
G
H
|
H
L
 
T
D
 
D
T
 
T
V
 
V
P
 
P
G
 
F
E
 
D
L
 
D
-
 
G
-
 
R
-
 
W
-
 
T
-
 
R
-
 
D
P
 
P
V
 
F
A
 
T
V
 
L
D
 
T
E
 
E
L
 
H
-
 
D
-
 
G
V
 
K
L
 
L
R
 
Y
G
 
G
R
 
L
G
 
G
A
 
T
V
 
A
D
|
D
M
 
M
K
 
K
A
 
G
G
 
F
L
 
F
A
 
A
V
 
F
A
 
I
V
 
L
A
 
D
-
 
A
-
 
L
-
 
R
-
 
D
L
 
V
A
 
D
C
 
V
S
 
T
E
 
K
P
 
L
S
 
K
V
 
K
P
 
P
V
 
L
T
 
Y
V
 
I
V
 
L
A
 
A
Y
 
T
P
 
A
G
 
D
E
 
E
E
|
E
G
 
T
P
 
S
I
 
M
T
 
A
G
 
G
-
 
A
N
 
R
G
 
Y
L
 
F
A
 
A
H
 
E
L
 
T
V
 
T
A
 
A
E
 
L
R
 
R
P
 
P
E
 
D
L
 
C
L
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
R
 
-
G
 
A
V
 
I
L
 
I
L
 
G
E
|
E
P
 
P
T
 
T
G
 
S
G
 
L
F
 
Q
L
 
P
E
 
V
L
 
R
G
 
A
C
 
H
Q
 
K
G
 
G
V
 
H
V
 
I
R
 
S
A
 
N
T
 
A
L
 
I
R
 
R
L
 
I
R
 
Q
G
 
G
R
 
Q
R
 
S
A
 
G
H
 
H
V
 
S
A
 
S
R
 
D
A
 
P
W
 
A
M
 
R
G
 
G
R
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
I
D
 
E
R
 
L
V
 
M
G
 
H
E
 
D
A
 
A
L
 
I
G
 
G
T
 
H
L
 
I
R
 
L
A
 
Q
L
 
L
-
 
R
-
 
D
-
 
N
-
 
L
-
 
K
E
 
E
R
 
R
R
 
Y
E
 
H
P
 
Y
Q
 
E
I
 
A
G
 
F
P
 
T
V
 
V
R
 
P
Y
 
Y
R
 
-
E
 
P
A
 
T
I
 
L
E
 
N
V
 
L
V
 
G
G
 
H
V
 
I
R
 
H
G
 
G
G
 
G
V
 
D
A
 
A
W
 
S
N
 
N
V
 
R
V
 
I
P
 
C
D
 
A
L
 
W
V
 
C
E
 
E
I
 
L
D
 
H
V
 
M
S
 
D
Y
 
I
R
 
R
F
 
P
A
 
L
P
 
P
D
 
G
L
 
M
D
 
T
A
 
L
A
 
N
R
 
E
A
 
L
R
 
N
Q
 
G
R
 
L
L
 
L
E
 
N
E
 
D
A
 
A
V
 
L
R
 
A
P
 
P
V
 
V
M
 
S
D
 
E
D
 
R
G
 
W
D
 
P
D
 
G
L
 
R
-
 
L
-
 
T
-
 
V
-
 
D
E
 
E
V
 
L
A
 
H
E
 
P
A
 
P
V
 
I
P
 
P
G
 
G
A
 
Y
-
 
E
V
 
C
S
 
P
D
 
P
L
 
N
G
 
H
R
 
Q
F
 
L
G
 
V
A
 
E
L
 
V
R
 
V
S
 
E
G
 
K
A
 
L
F
 
L
G
 
G
V
 
A
R
 
K
A
 
T
K
 
E
-
 
V
L
 
V
G
 
N
W
 
Y
T
 
C
D
 
T
V
 
E
A
 
A
Q
 
P
L
 
F
V
 
I
A
 
Q
A
 
T
G
 
L
V
 
C
P
 
P
A
 
T
V
 
L
N
 
V
F
 
L
G
 
G
P
 
P
G
 
G
D
 
S
P
 
I
E
 
N
L
 
Q
A
 
A
H
|
H
T
 
Q
D
 
P
Q
 
D
E
 
E
M
 
Y
V
 
L
E
 
E
V
 
T
A
 
R
E
 
F
V
 
I
R
 
K
H
 
P
V
 
T
A
 
R
Q
 
E
A
 
L
L
 
I
W
 
T
R
 
Q
W
 
V
L
 
I
H
|
H

Sites not aligning to the query:

P37111 Aminoacylase-1; ACY-1; N-acyl-L-amino-acid amidohydrolase; EC 3.5.1.14 from Sus scrofa (Pig) (see paper)
26% identity, 94% coverage: 5:329/344 of query aligns to 13:381/407 of P37111

query
sites
P37111
V
 
V
E
 
T
L
 
L
A
 
F
A
 
R
A
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
E
 
R
V
 
I
P
 
R
S
 
T
V
 
V
T
 
Q
G
 
P
-
 
E
-
 
P
D
 
D
E
 
Y
A
 
G
A
 
A
L
 
A
A
 
V
R
 
A
L
 
F
V
 
L
G
 
E
E
 
E
H
 
R
L
 
A
D
 
R
A
 
Q
A
 
L
G
 
G
L
 
L
-
 
G
-
 
C
-
 
Q
R
 
K
V
 
V
E
 
E
V
 
V
V
 
V
A
 
P
G
 
G
C
 
H
V
 
V
V
 
V
A
 
T
-
 
V
-
 
L
-
 
T
-
 
W
R
 
P
N
 
G
H
 
T
G
 
N
G
 
P
D
 
T
S
 
L
S
 
S
A
 
S
T
 
I
L
 
L
L
 
L
V
 
N
G
 
S
H
 
H
L
 
T
D
 
D
T
 
V
V
 
V
P
 
P
-
 
V
G
 
F
E
 
K
L
 
E
P
 
H
V
 
W
A
 
S
V
 
H
D
 
D
E
 
P
L
 
F
-
 
E
-
 
G
-
 
F
-
 
K
-
 
D
-
 
A
-
 
D
-
 
G
V
 
Y
L
 
I
R
 
Y
G
 
G
R
 
R
G
 
G
A
 
A
V
 
Q
D
 
D
M
 
M
K
 
K
A
 
C
-
 
V
-
 
S
-
 
I
-
 
Q
G
 
Y
L
 
L
A
 
E
V
 
A
A
 
V
V
 
R
A
 
R
L
 
L
A
 
K
C
 
V
S
 
E
E
 
G
P
 
H
S
 
H
V
 
F
P
 
P
V
 
R
T
 
T
V
 
I
-
 
H
-
 
M
V
 
T
A
 
F
Y
 
V
P
 
P
G
 
D
E
 
E
E
 
E
G
 
-
P
 
-
I
 
V
T
 
G
G
 
G
N
 
H
G
 
Q
L
 
G
A
 
M
H
 
E
L
 
L
V
 
F
A
 
V
E
 
K
R
 
R
P
 
P
E
 
E
L
 
F
L
 
Q
A
 
A
G
 
L
A
 
R
R
 
A
G
 
G
V
 
F
L
 
A
L
 
L
E
 
D
-
 
E
-
 
G
-
 
L
-
 
A
-
 
S
P
 
P
T
 
T
G
 
D
G
 
A
F
 
F
L
 
T
E
 
V
L
 
F
G
 
Y
C
 
S
Q
 
E
G
 
-
V
 
-
V
 
-
R
 
R
A
 
S
T
 
P
L
 
W
R
 
W
L
 
L
R
 
R
-
 
V
-
 
T
-
 
S
-
 
T
G
 
G
R
 
K
R
 
P
A
 
G
H
 
H
V
 
G
A
 
S
R
 
R
A
 
-
W
 
F
M
 
I
G
 
E
R
 
D
N
 
T
A
 
A
I
 
A
D
 
E
R
 
K
V
 
L
G
 
H
E
 
K
A
 
V
L
 
I
G
 
N
T
 
S
L
 
I
R
 
L
A
 
A
L
 
F
E
 
R
R
 
E
R
 
K
E
 
E
P
 
K
Q
 
Q
-
 
R
I
 
L
G
 
Q
P
 
S
V
 
N
R
 
Q
Y
 
L
R
 
K
-
 
P
-
 
G
-
 
A
-
 
V
E
 
T
A
 
S
I
 
V
E
 
N
V
 
L
V
 
T
G
 
M
V
 
L
R
 
E
G
 
G
G
 
G
V
 
V
A
 
A
W
 
Y
N
 
N
V
 
V
V
 
V
P
 
P
D
 
A
L
 
T
V
 
M
E
 
S
I
 
A
D
 
C
V
 
F
S
 
D
Y
 
F
R
 
R
F
 
V
A
 
A
P
 
P
D
 
D
L
 
V
D
 
D
A
 
L
A
 
K
R
 
A
A
 
F
R
 
E
Q
 
E
R
 
Q
L
 
L
E
 
Q
E
 
S
A
 
W
V
 
C
R
 
Q
P
 
-
V
 
A
M
 
A
D
 
G
D
 
E
G
 
G
D
 
V
D
 
T
L
 
F
E
 
E
V
 
F
A
 
V
-
 
Q
-
 
K
-
 
W
-
 
M
E
 
E
A
 
T
V
 
Q
P
 
V
G
 
T
A
 
S
V
 
T
S
 
D
D
 
D
L
 
S
G
 
D
R
 
P
F
 
W
G
 
W
A
 
A
L
 
A
R
 
F
S
 
S
G
 
G
A
 
V
F
 
F
G
 
K
V
 
-
R
 
D
A
 
M
K
 
K
L
 
L
G
 
A
W
 
L
-
 
E
-
 
L
-
 
E
-
 
I
-
 
C
-
 
P
-
 
A
-
 
S
T
 
T
D
 
D
V
 
A
A
 
R
Q
 
Y
L
 
I
V
 
R
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
A
 
A
V
 
L
N
 
G
F
 
F
G
 
S
P
 
P
G
 
M
D
 
N
-
 
H
-
 
T
P
 
P
E
 
V
L
 
L
A
 
L
H
 
H
T
 
D
D
 
H
Q
 
D
E
 
E
M
 
R
V
 
L
E
 
H
V
 
E
A
 
A

Sites not aligning to the query:

P44514 Succinyl-diaminopimelate desuccinylase; SDAP desuccinylase; N-succinyl-LL-2,6-diaminoheptanedioate amidohydrolase; EC 3.5.1.18 from Haemophilus influenzae (strain ATCC 51907 / DSM 11121 / KW20 / Rd) (see 3 papers)
22% identity, 73% coverage: 5:254/344 of query aligns to 6:277/377 of P44514

query
sites
P44514
V
 
V
E
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
Q
A
 
D
Y
 
L
L
 
I
E
 
R
V
 
R
P
 
P
S
 
S
V
 
I
T
 
S
G
 
P
D
 
N
E
 
D
A
 
E
A
 
G
L
 
C
A
 
Q
R
 
Q
L
 
I
V
 
I
G
 
A
E
 
E
H
 
R
L
 
L
D
 
E
A
 
K
A
 
L
G
 
G
L
 
F
R
 
Q
V
 
I
E
 
E
V
 
W
V
 
M
A
 
P
G
 
F
C
 
N
V
 
D
V
 
T
A
 
L
R
 
N
-
 
L
-
 
W
-
 
A
N
 
K
H
 
H
G
 
G
G
 
T
D
 
S
S
 
E
S
 
P
A
 
V
T
 
I
L
 
A
L
 
F
V
 
A
G
 
G
H
|
H
L
 
T
D
 
D
T
 
V
V
 
V
P
 
P
-
 
T
-
 
G
-
 
D
-
 
E
-
 
N
-
 
Q
-
 
W
G
 
S
E
 
S
L
 
P
P
 
P
V
 
F
A
 
S
V
 
A
D
 
E
E
 
I
L
 
I
-
 
D
-
 
G
V
 
M
L
 
L
R
 
Y
G
 
G
R
 
R
G
 
G
A
 
A
V
 
A
D
|
D
M
 
M
K
 
K
A
 
G
G
 
S
L
 
L
A
 
A
V
 
-
A
 
A
V
 
M
A
 
I
L
 
V
A
 
A
C
 
A
S
 
E
E
 
E
P
 
-
S
 
-
V
 
-
P
 
-
V
 
-
T
 
Y
V
 
V
V
 
K
A
 
A
Y
 
N
P
 
P
G
 
N
E
 
H
E
 
K
G
 
G
P
 
T
I
 
I
-
 
A
-
 
L
-
 
L
-
 
I
-
 
T
-
 
S
-
 
D
-
x
E
-
x
E
-
 
A
-
 
T
T
 
A
G
 
K
N
 
D
G
 
G
L
 
T
A
 
I
H
 
H
L
 
V
V
 
V
A
 
E
E
 
-
R
 
-
P
 
-
E
 
T
L
 
L
L
 
M
A
 
A
G
 
R
A
 
D
R
 
E
G
 
K
V
 
I
L
 
T
L
 
Y
-
 
C
-
 
M
-
 
V
-
 
G
E
|
E
P
 
P
T
 
S
-
 
S
-
 
A
-
 
K
-
 
N
-
 
L
G
 
G
G
 
D
F
 
V
L
 
V
E
 
K
L
 
N
G
 
G
C
 
R
Q
 
R
G
 
G
V
 
S
V
 
I
R
 
T
A
 
G
T
 
N
L
 
L
R
 
Y
L
 
I
R
 
Q
G
 
G
R
 
I
R
 
Q
A
 
G
H
 
H
V
 
V
A
 
A
R
 
Y
A
 
P
W
 
H
M
 
L
G
 
A
R
 
E
N
 
N
A
 
P
I
 
I
D
 
H
R
 
K
V
 
A
G
 
A
E
 
L
A
 
F
L
 
L
G
 
Q
T
 
E
L
 
L
R
 
T
A
 
T
L
 
Y
E
 
Q
-
 
W
R
 
D
R
 
K
E
 
G
P
 
N
Q
 
E
I
 
F
G
 
F
P
 
P
V
 
P
R
 
T
Y
 
-
R
 
-
E
 
-
A
 
S
I
 
L
E
 
Q
V
 
I
V
 
A
G
 
N
V
 
I
R
 
H
G
 
A
G
 
G
V
 
T
-
 
G
A
 
S
W
 
N
N
 
N
V
 
V
V
 
I
P
 
P
D
 
A
L
 
E
V
 
L
E
 
Y
I
 
I
D
 
Q
V
 
F
S
 
N
Y
 
L
R
 
R
F
 
Y
A
 
C
P
 
T
D
 
E
L
 
V
D
 
T
A
 
D
A
 
E
R
 
I
A
 
I
R
 
K
Q
 
Q
R
 
K
L
 
V
E
 
A
E
 
E
A
 
M
V
 
L
R
 
E

Sites not aligning to the query:

5vo3A Crystal structure of dape in complex with the products (succinic acid and diaminopimelic acid) (see paper)
22% identity, 73% coverage: 5:254/344 of query aligns to 10:281/380 of 5vo3A

query
sites
5vo3A
V
 
V
E
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
Q
A
 
D
Y
 
L
L
 
I
E
 
R
V
 
R
P
 
P
S
 
S
V
 
I
T
 
S
G
 
P
D
 
N
E
 
D
A
 
E
A
 
G
L
 
C
A
 
Q
R
 
Q
L
 
I
V
 
I
G
 
A
E
 
E
H
 
R
L
 
L
D
 
E
A
 
K
A
 
L
G
 
G
L
 
F
R
 
Q
V
 
I
E
 
E
V
 
W
V
 
M
A
 
P
G
 
F
C
 
N
V
 
D
V
 
T
A
 
L
R
 
N
-
 
L
-
 
W
-
 
A
N
 
K
H
 
H
G
 
G
G
 
T
D
 
S
S
 
E
S
 
P
A
 
V
T
 
I
L
 
A
L
 
F
V
 
A
G
 
G
H
|
H
L
 
T
D
 
D
T
 
V
V
 
V
P
 
P
-
 
T
-
 
G
-
 
D
-
 
E
-
 
N
-
 
Q
-
 
W
G
 
S
E
 
S
L
 
P
P
 
P
V
 
F
A
 
S
V
 
A
D
 
E
E
 
I
L
 
I
-
 
D
-
 
G
V
 
M
L
 
L
R
 
Y
G
 
G
R
 
R
G
 
G
A
 
A
V
 
A
D
|
D
M
 
M
K
 
K
A
 
G
G
 
S
L
 
L
A
 
A
V
 
-
A
 
A
V
 
M
A
 
I
L
 
V
A
 
A
C
 
A
S
 
E
E
 
E
P
 
-
S
 
-
V
 
-
P
 
-
V
 
-
T
 
Y
V
 
V
V
 
K
A
 
A
Y
 
N
P
 
P
G
 
N
E
 
H
E
 
K
G
 
G
P
 
T
I
 
I
-
 
A
-
 
L
-
 
L
-
 
I
-
 
T
-
 
S
-
 
D
-
x
E
-
x
E
-
x
A
-
 
T
T
 
A
G
 
K
N
 
D
G
 
G
L
 
T
A
 
I
H
 
H
L
 
V
V
 
V
A
 
E
E
 
-
R
 
-
P
 
-
E
 
T
L
 
L
L
 
M
A
 
A
G
 
R
A
 
D
R
 
E
G
 
K
V
 
I
L
 
T
L
 
Y
-
 
C
-
 
M
-
 
V
-
 
G
E
|
E
P
 
P
T
 
S
-
 
S
-
 
A
-
 
K
-
 
N
-
 
L
G
 
G
G
 
D
F
 
V
L
 
V
E
 
K
L
 
N
G
 
G
C
x
R
Q
 
R
G
 
G
V
x
S
V
 
I
R
 
T
A
 
G
T
 
N
L
 
L
R
 
Y
L
 
I
R
 
Q
G
 
G
R
 
I
R
 
Q
A
 
G
H
 
H
V
 
V
A
 
A
R
 
Y
A
 
P
W
 
H
M
 
L
G
 
A
R
 
E
N
 
N
A
 
P
I
 
I
D
 
H
R
 
K
V
 
A
G
 
A
E
 
L
A
 
F
L
 
L
G
 
Q
T
 
E
L
 
L
R
 
T
A
 
T
L
 
Y
E
 
Q
-
 
W
R
 
D
R
 
K
E
 
G
P
 
N
Q
 
E
I
 
F
G
 
F
P
 
P
V
 
-
R
 
-
Y
 
-
R
 
P
E
 
T
A
 
S
I
 
L
E
 
Q
V
 
I
V
 
A
G
 
N
V
 
I
R
 
H
G
 
A
G
 
G
V
 
T
-
 
G
A
 
S
W
 
N
N
 
N
V
 
V
V
 
I
P
 
P
D
 
A
L
 
E
V
 
L
E
 
Y
I
 
I
D
 
Q
V
 
F
S
 
N
Y
 
L
R
|
R
F
 
Y
A
 
C
P
 
T
D
 
E
L
 
V
D
 
T
A
 
D
A
 
E
R
 
I
A
 
I
R
 
K
Q
 
Q
R
 
K
L
 
V
E
 
A
E
 
E
A
 
M
V
 
L
R
 
E

Sites not aligning to the query:

7lgpB Dape enzyme from shigella flexneri
24% identity, 69% coverage: 5:240/344 of query aligns to 8:264/377 of 7lgpB

query
sites
7lgpB
V
 
I
E
 
E
L
 
L
A
 
T
A
 
Q
A
 
Q
Y
 
L
L
 
I
E
 
R
V
 
R
P
 
P
S
 
S
V
 
L
T
 
S
G
 
P
D
 
D
E
 
D
A
 
A
A
 
G
L
 
C
A
 
Q
R
 
A
L
 
L
V
 
L
G
 
I
E
 
E
H
 
R
L
 
L
D
 
Q
A
 
A
A
 
I
G
 
G
L
 
F
R
 
T
V
 
V
E
 
E
V
 
R
V
 
M
A
 
D
G
 
F
C
 
A
V
 
D
V
 
T
A
 
Q
R
 
N
N
 
F
H
 
W
G
 
A
-
 
W
-
 
R
G
 
G
D
 
Q
S
 
G
S
 
E
A
 
T
T
 
L
L
 
A
L
 
F
V
 
A
G
 
G
H
|
H
L
 
T
D
 
D
T
 
V
V
 
V
P
 
P
-
 
P
G
 
G
E
 
D
-
 
A
-
 
D
-
 
R
-
 
W
-
 
I
-
 
N
-
 
P
-
 
P
L
 
F
P
 
E
V
 
P
A
 
T
V
 
I
D
 
R
E
 
D
L
 
G
V
 
M
L
 
L
R
 
F
G
 
G
R
 
R
G
 
G
A
 
A
V
 
A
D
|
D
M
 
M
K
 
K
A
 
G
G
 
S
L
 
L
A
 
A
V
 
A
A
 
M
V
 
V
A
 
V
L
 
A
A
 
A
C
 
-
S
 
-
E
 
-
P
 
-
S
 
-
V
 
-
P
 
E
V
 
R
T
 
F
V
 
V
V
 
A
A
 
Q
Y
 
H
P
 
P
G
 
N
E
 
H
E
 
T
G
 
G
P
 
R
I
 
L
T
 
A
-
 
F
-
 
L
-
 
I
-
 
T
-
 
S
-
 
D
-
 
E
-
 
E
-
 
A
-
 
S
-
 
A
G
 
H
N
 
N
G
 
G
L
 
T
A
 
V
H
 
K
L
 
V
V
 
V
-
 
E
-
 
A
-
 
L
-
 
M
-
 
A
-
 
R
A
 
N
E
 
E
R
 
R
P
 
L
E
 
D
L
 
Y
L
 
C
A
 
L
G
 
V
A
 
G
R
x
E
G
 
P
V
 
S
L
 
S
L
 
I
E
 
E
P
 
V
T
 
V
G
 
G
G
 
D
F
 
V
L
 
V
E
 
K
L
 
N
G
 
G
C
 
R
Q
 
R
G
 
G
V
 
S
V
 
L
R
 
T
A
 
C
T
 
N
L
 
L
R
 
T
L
 
I
R
 
H
G
 
G
R
 
V
R
 
Q
A
 
G
H
 
H
V
 
V
A
 
A
R
 
Y
A
 
P
W
 
H
M
 
L
G
 
A
R
 
D
N
 
N
A
 
P
I
 
V
D
 
H
R
 
R
V
 
A
G
 
A
E
 
P
A
 
F
L
 
L
G
 
N
T
 
E
L
 
L
R
 
V
A
 
A
L
 
I
E
 
E
R
 
W
R
 
D
E
 
Q
-
 
G
P
 
N
Q
 
E
I
 
F
G
 
F
P
 
P
V
 
A
R
 
-
Y
 
-
R
 
-
E
 
T
A
 
S
I
 
M
E
 
Q
V
 
I
V
 
A
G
 
N
V
 
I
R
 
Q
G
 
A
G
 
G
V
 
T
-
 
G
A
 
S
W
 
N
N
 
N
V
 
V
V
 
I
P
 
P
D
 
G
L
 
E
V
 
L
E
 
F
I
 
V
D
 
Q
V
 
F
S
 
N
Y
 
F
R
 
R
F
 
F
A
 
S
P
 
T
D
 
E
L
 
L

7uoiA Crystallographic structure of dape from enterococcus faecium (see paper)
26% identity, 92% coverage: 12:328/344 of query aligns to 18:364/383 of 7uoiA

query
sites
7uoiA
L
 
I
E
 
R
V
 
I
P
 
K
S
 
S
V
 
V
T
 
N
G
 
G
D
 
N
E
 
E
-
 
G
-
 
E
-
 
V
-
 
A
A
 
A
A
 
Y
L
 
L
A
 
N
R
 
K
L
 
L
V
 
L
G
 
A
E
 
R
H
 
H
L
 
-
D
 
D
A
 
I
A
 
T
G
 
G
L
 
E
R
 
I
V
 
V
E
 
S
V
 
Y
V
 
R
A
 
D
G
 
G
-
 
R
-
 
D
C
 
N
V
 
L
V
 
I
A
 
A
R
 
R
N
 
Y
H
 
Q
G
 
K
G
 
G
D
 
Q
S
 
S
S
 
G
A
 
K
T
 
V
L
 
L
-
 
G
L
 
L
V
 
S
G
 
G
H
|
H
L
 
M
D
 
D
T
 
V
V
 
V
P
 
A
G
 
A
-
 
G
-
 
D
-
 
E
-
 
S
-
 
S
-
 
W
-
 
T
E
 
Y
L
 
A
P
 
P
V
 
F
A
 
A
-
 
A
-
 
E
V
 
I
D
 
H
E
 
G
L
 
N
V
 
R
L
 
L
R
 
Y
G
 
G
R
 
R
G
 
G
A
 
A
V
 
T
D
|
D
M
 
M
K
 
K
A
 
S
G
 
G
L
 
L
A
 
A
V
 
A
A
 
M
V
 
V
-
 
I
-
 
A
A
 
M
L
 
I
A
 
E
C
 
L
S
 
K
E
 
E
P
 
S
S
 
G
V
 
K
P
 
P
V
 
F
T
 
-
V
 
-
V
 
-
A
 
-
Y
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
-
E
 
-
G
 
-
P
 
-
I
 
-
T
 
-
G
 
-
N
 
N
G
 
G
L
 
T
A
 
V
H
 
K
L
 
L
V
 
L
A
 
A
E
 
T
R
 
V
P
 
G
E
 
E
L
 
E
L
 
V
A
 
G
G
 
E
A
 
L
R
 
G
G
 
G
V
 
E
L
 
Q
L
 
L
-
 
T
-
 
K
-
 
A
-
 
G
-
 
Y
-
 
V
-
 
D
-
 
D
-
 
L
-
 
D
-
 
A
-
 
L
-
 
I
-
 
I
-
 
G
E
|
E
P
 
P
T
 
T
G
 
N
G
 
Y
F
 
S
L
 
L
E
 
M
L
 
Y
G
 
T
C
 
H
Q
 
M
G
 
G
V
 
S
V
 
I
R
 
N
A
 
Y
T
 
T
L
 
V
R
 
T
L
 
S
R
 
H
G
 
G
R
 
K
R
 
E
A
 
A
H
 
H
V
 
S
A
 
S
R
 
M
A
 
P
W
 
D
M
 
Q
G
 
G
R
 
Y
N
 
N
A
 
A
I
 
I
D
 
N
R
 
H
V
 
L
G
 
N
E
 
E
A
 
F
L
 
I
G
 
T
T
 
K
L
 
A
R
 
N
A
 
A
L
 
E
E
 
M
R
 
N
R
 
H
-
 
L
-
 
A
E
 
E
P
 
T
Q
 
I
I
 
E
G
 
N
P
 
P
V
 
V
R
 
L
Y
 
G
R
 
K
E
 
T
A
 
I
I
 
H
E
 
N
V
 
V
V
 
T
G
 
L
V
 
I
R
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
N
A
 
Q
W
 
V
N
 
N
V
 
S
V
 
I
P
 
P
D
 
S
L
 
H
V
 
A
E
 
Q
I
 
L
D
 
Q
V
 
G
S
 
N
Y
 
I
R
 
R
F
 
S
A
 
I
P
 
P
D
 
E
L
 
Y
D
 
P
A
 
N
A
 
D
R
 
K
A
 
I
R
 
I
Q
 
A
R
 
L
L
 
L
E
 
Q
E
 
S
A
 
I
V
 
V
R
 
N
P
 
E
V
 
L
M
 
N
D
 
Q
D
 
E
G
 
T
D
 
D
-
 
Y
D
 
H
L
 
L
E
 
E
V
 
L
A
 
M
-
 
I
-
 
D
-
 
Y
E
 
N
A
 
K
V
 
I
P
 
P
-
 
V
G
 
K
A
 
A
V
 
D
S
 
P
D
 
D
L
 
S
G
 
P
R
 
L
F
 
I
G
 
H
A
 
S
L
 
I
R
 
Q
-
 
Q
-
 
Q
-
 
F
S
 
S
G
 
Q
A
 
P
F
 
L
G
 
P
V
 
L
R
 
V
A
 
G
K
 
A
L
 
A
G
 
A
W
 
T
T
 
T
D
 
D
V
 
A
A
 
A
Q
 
E
L
 
F
V
 
T
A
 
K
A
 
A
G
 
N
-
 
H
-
 
S
V
 
F
P
 
D
A
 
F
V
 
V
N
 
V
F
 
F
G
 
G
P
 
P
G
 
G
D
 
V
P
 
V
E
 
T
L
 
L
A
 
P
H
 
H
T
 
Q
D
 
V
Q
 
D
E
 
E
M
 
Y
V
 
V
E
 
E
V
 
I

3pfoA Crystal structure of a putative acetylornithine deacetylase (rpa2325) from rhodopseudomonas palustris cga009 at 1.90 a resolution
31% identity, 50% coverage: 46:218/344 of query aligns to 87:276/426 of 3pfoA

query
sites
3pfoA
V
 
V
V
 
A
A
 
T
R
 
A
N
 
D
H
 
S
G
 
D
G
 
G
D
 
K
S
 
G
S
 
R
A
 
S
T
 
L
L
 
I
L
 
L
V
 
Q
G
 
G
H
|
H
L
 
I
D
 
D
T
 
V
V
 
V
P
 
P
G
 
-
E
 
E
L
 
G
P
 
P
V
 
V
-
 
D
-
 
L
-
 
W
-
 
S
-
 
D
-
 
P
-
 
P
-
 
Y
-
 
E
-
 
A
A
 
K
V
 
V
D
 
R
E
 
D
L
 
G
V
 
W
L
 
M
R
 
I
G
 
G
R
 
R
G
 
G
A
 
A
V
 
Q
D
|
D
M
 
M
K
 
K
A
 
G
G
 
G
L
 
V
A
 
S
V
 
A
-
 
M
-
 
I
-
 
F
-
 
A
-
 
L
-
 
D
A
 
A
V
 
I
A
 
R
L
 
T
A
 
A
C
 
G
S
 
Y
E
 
A
P
 
P
S
 
D
V
 
A
P
 
R
V
 
V
T
 
H
V
 
V
V
 
Q
A
 
T
Y
 
V
P
 
T
G
 
E
E
 
E
E
|
E
G
 
S
P
 
-
I
 
-
T
 
T
G
 
G
N
 
N
G
 
G
L
 
A
A
 
L
H
 
S
L
 
T
V
 
-
A
 
-
E
 
-
R
 
-
P
 
-
E
 
-
L
 
L
L
 
M
A
 
R
G
 
G
A
 
Y
R
 
R
G
 
A
-
 
D
-
 
A
-
 
C
V
 
L
L
 
I
L
 
P
E
|
E
P
 
P
T
 
T
G
 
G
G
 
H
F
 
T
L
 
L
E
 
T
L
 
R
G
 
A
C
 
Q
Q
 
V
G
 
G
V
 
A
V
 
V
R
 
W
A
 
F
T
 
R
L
 
L
R
 
R
L
 
V
R
 
R
G
 
G
R
 
T
R
 
P
A
 
V
H
 
H
V
 
V
A
 
A
R
 
Y
A
 
S
W
 
E
M
 
T
G
 
G
R
 
T
N
 
S
A
 
A
I
 
I
D
 
-
R
 
-
V
 
-
G
 
L
E
 
S
A
 
A
L
 
M
G
 
H
T
 
L
L
 
I
R
 
R
A
 
A
L
 
F
E
 
E
R
 
E
-
 
Y
-
 
T
-
 
K
-
 
E
-
 
L
-
 
N
-
 
A
-
 
Q
-
 
A
-
 
V
R
 
R
E
 
D
P
 
P
Q
 
W
I
 
F
G
 
G
P
 
Q
V
 
V
R
 
K
Y
 
N
R
 
P
E
 
I
A
 
K
I
 
F
E
 
N
V
 
V
V
 
G
G
 
I
V
 
I
R
 
K
G
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_015798110.1 NCBI__GCF_000023265.1:WP_015798110.1
MRDPVELAAAYLEVPSVTGDEAALARLVGEHLDAAGLRVEVVAGCVVARNHGGDSSATLL
VGHLDTVPGELPVAVDELVLRGRGAVDMKAGLAVAVALACSEPSVPVTVVAYPGEEGPIT
GNGLAHLVAERPELLAGARGVLLEPTGGFLELGCQGVVRATLRLRGRRAHVARAWMGRNA
IDRVGEALGTLRALERREPQIGPVRYREAIEVVGVRGGVAWNVVPDLVEIDVSYRFAPDL
DAARARQRLEEAVRPVMDDGDDLEVAEAVPGAVSDLGRFGALRSGAFGVRAKLGWTDVAQ
LVAAGVPAVNFGPGDPELAHTDQEMVEVAEVRHVAQALWRWLHA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory