SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_015799002.1 NCBI__GCF_000023265.1:WP_015799002.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4q9dB X-ray structure of a putative thiamin diphosphate-dependent enzyme isolated from mycobacterium smegmatis (see paper)
28% identity, 31% coverage: 334:492/506 of query aligns to 351:502/519 of 4q9dB

query
sites
4q9dB
A
 
A
A
 
P
L
 
M
D
 
T
G
 
S
S
 
N
T
 
A
L
 
V
A
 
Y
A
 
E
V
 
V
I
 
L
A
 
S
R
 
N
A
 
V
V
 
K
Q
 
P
A
 
D
D
 
D
D
 
A
V
 
A
V
 
V
I
 
V
D
x
M
E
 
E
A
x
S
R
 
T
T
 
S
A
 
T
A
 
M
P
 
L
A
 
D
L
 
L
Y
 
F
E
 
T
Q
 
W
L
 
L
A
 
P
D
 
T
A
 
T
R
 
H
R
 
P
H
 
A
H
 
S
Y
 
F
I
 
F
G
 
A
H
 
T
P
 
G
G
 
S
G
|
G
A
 
G
I
|
I
G
 
G
E
 
W
G
 
G
A
 
V
S
 
P
L
 
A
A
 
A
L
 
V
G
 
G
A
 
I
A
 
A
T
 
L
-
 
G
-
 
D
-
 
R
-
 
A
-
 
R
-
 
G
L
 
V
G
 
D
A
 
R
S
 
T
V
 
V
L
 
V
A
 
A
V
 
T
V
 
I
A
 
G
D
|
D
G
 
G
G
 
S
F
 
F
L
 
Q
Y
 
Y
A
 
S
P
 
I
Q
 
Q
A
 
A
I
 
I
W
 
W
T
 
T
M
 
A
V
 
A
R
 
Q
E
 
H
H
 
K
L
 
L
D
 
P
V
 
I
T
 
V
V
 
F
V
 
V
L
 
V
A
 
L
V
 
R
N
|
N
G
 
G
G
x
E
Y
|
Y
R
 
A
I
|
I
L
 
-
E
 
-
I
 
-
E
 
-
Q
 
-
T
 
-
I
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
D
 
-
L
 
-
H
 
-
P
 
P
E
 
N
L
 
V
T
 
P
R
 
G
L
 
L
D
 
Q
D
 
L
P
 
P
G
 
G
W
 
L
D
 
D
F
 
I
A
 
S
G
 
S
L
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
G
M
 
F
G
 
G
A
 
C
R
 
R
T
 
T
T
 
A
T
 
T
A
 
V
T
 
E
T
 
S
V
 
T
A
 
D
E
 
M
L
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
E
L
 
L
R
 
K

Sites not aligning to the query:

5d6rB Acetolactate synthase from klebsiella pneumoniae in complex with mechanism-based inhibitor
25% identity, 97% coverage: 2:492/506 of query aligns to 6:518/548 of 5d6rB

query
sites
5d6rB
N
 
H
G
 
G
A
 
A
E
 
D
L
 
L
A
 
V
A
 
V
L
 
S
T
 
Q
L
 
L
S
 
E
D
 
A
L
 
Q
G
 
G
V
 
V
G
 
R
V
 
Q
V
 
V
F
 
F
A
 
G
N
x
I
P
 
P
G
|
G
T
x
A
S
x
K
E
x
I
L
 
D
V
 
K
L
 
V
V
 
F
D
 
D
A
 
S
L
 
L
E
 
L
R
 
D
R
 
S
G
 
S
P
 
I
R
 
R
P
 
I
I
 
I
L
 
P
V
 
V
T
 
R
H
 
H
E
|
E
L
 
A
V
 
N
A
 
A
M
 
A
G
 
F
A
 
M
A
 
A
D
 
A
A
 
A
H
 
V
G
 
G
R
|
R
L
 
I
-
 
T
G
 
G
R
 
K
L
 
A
G
 
G
A
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
H
x
T
L
 
S
G
 
G
P
 
P
G
 
G
L
 
C
S
 
S
N
 
N
G
 
L
L
 
I
A
 
T
F
 
G
V
 
M
H
 
A
D
 
T
A
 
A
R
 
N
R
 
S
A
 
E
H
 
G
T
 
D
P
 
P
M
 
V
L
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
G
G
 
G
E
 
A
H
 
V
P
 
K
R
 
R
S
 
A
H
 
D
R
 
K
A
 
A
L
 
K
D
 
Q
T
 
V
P
x
H
L
x
Q
T
x
S
M
 
M
R
 
D
I
 
T
A
 
V
S
 
A
L
 
M
A
 
F
E
 
S
A
 
P
I
 
V
D
 
T
V
 
K
P
 
Y
M
 
A
I
 
I
A
 
E
I
 
V
D
 
T
D
 
A
P
 
P
A
 
D
L
 
A
I
 
L
A
 
A
P
 
E
Q
 
V
L
 
V
R
 
S
A
 
N
A
 
A
A
 
F
T
 
R
I
 
A
A
 
A
T
 
E
T
 
Q
Q
 
G
R
 
R
-
 
P
T
 
G
P
 
S
V
 
A
V
 
F
V
 
V
T
 
S
L
 
L
D
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
-
M
 
-
E
 
-
R
 
-
E
 
-
A
 
-
T
 
-
P
 
P
S
x
Q
D
 
D
P
 
V
S
 
V
A
 
D
P
 
G
P
 
P
T
 
V
T
 
S
A
 
G
H
 
K
E
 
V
A
 
L
P
 
P
S
 
A
I
 
S
P
 
P
R
 
Q
-
 
M
-
 
G
A
 
A
R
 
A
L
 
P
E
 
D
A
 
D
A
 
A
I
 
I
D
 
D
L
 
Q
V
 
V
-
 
A
-
 
K
-
 
L
-
 
I
-
 
A
R
 
Q
A
 
A
G
 
K
E
 
N
C
 
P
T
 
I
L
 
F
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
L
R
 
M
V
 
A
L
 
S
E
x
Q
P
 
P
D
 
E
A
 
-
R
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
I
 
-
A
 
-
D
 
N
D
 
S
T
 
K
G
 
A
L
 
L
R
 
R
L
 
R
L
 
L
A
 
L
E
 
E
T
 
T
-
 
S
-
 
H
F
 
I
P
 
P
A
 
V
S
 
T
H
 
S
R
 
T
Y
 
Y
G
 
-
E
 
Q
G
 
A
A
 
A
G
 
G
R
 
A
I
 
V
E
 
N
R
 
Q
L
 
D
A
 
N
Y
 
F
L
 
S
P
 
R
L
 
F
M
 
A
A
 
G
R
 
R
P
 
V
Q
 
G
L
|
L
A
 
F
T
 
N
A
 
N
R
 
Q
S
 
A
-
 
G
-
 
D
-
 
R
V
 
L
L
 
L
V
 
Q
L
 
L
G
 
A
T
 
D
D
 
L
A
 
V
P
 
I
S
 
C
A
 
I
W
 
G
F
 
Y
A
 
S
H
 
P
L
 
V
E
 
E
Q
 
Y
D
x
E
P
 
P
R
 
A
L
 
M
W
 
W
P
 
N
L
 
S
A
 
G
-
 
N
A
 
A
P
 
T
L
 
L
V
 
V
R
 
H
L
 
I
D
 
D
-
 
V
-
 
L
-
 
P
-
 
A
-
 
Y
-
 
E
G
 
E
Q
 
R
D
 
N
E
 
Y
D
 
T
P
 
P
R
 
D
V
 
V
-
 
E
-
 
L
-
 
V
-
 
G
-
 
D
-
 
I
-
 
A
-
 
G
V
 
T
L
 
L
E
 
N
H
 
K
L
 
L
A
 
A
K
 
Q
A
 
N
L
 
I
G
 
D
V
 
H
T
 
R
P
 
L
A
 
V
P
 
L
P
 
S
P
 
P
T
 
Q
S
 
A
Q
 
A
P
 
E
I
 
I
P
 
L
A
 
R
P
 
D
D
 
R
P
 
Q
H
 
H
A
 
Q
A
 
R
-
 
E
-
 
L
L
 
L
D
 
D
-
 
R
-
 
R
G
 
G
S
 
A
T
 
Q
L
 
L
A
 
N
A
 
Q
V
 
F
-
 
A
-
 
L
-
 
H
-
 
P
-
 
L
-
 
R
I
 
I
A
 
V
R
 
R
A
 
A
V
 
M
Q
 
Q
A
 
-
D
 
-
D
 
D
V
 
I
V
 
V
I
 
N
D
 
S
E
 
D
A
 
V
R
 
T
T
 
L
A
 
T
A
 
V
P
 
D
A
x
M
L
x
G
Y
x
S
E
 
F
Q
 
H
L
 
I
A
 
W
D
 
I
A
 
A
R
 
R
-
 
Y
-
 
L
-
 
Y
-
 
S
-
 
F
-
 
R
-
 
A
R
 
R
H
 
Q
H
 
V
Y
 
M
I
 
I
G
 
S
H
 
N
P
 
G
G
 
Q
G
x
Q
A
 
T
I
x
M
G
 
G
E
 
V
G
 
A
A
 
L
S
 
P
L
 
W
A
 
A
L
 
I
G
 
G
A
 
A
A
 
W
T
 
L
L
 
V
G
 
N
-
 
P
-
 
E
A
 
R
S
 
K
V
 
V
L
 
V
A
 
S
V
 
V
V
 
S
A
 
G
D
|
D
G
|
G
G
 
G
F
 
F
L
 
L
Y
 
Q
A
 
S
P
 
S
Q
 
M
A
 
E
I
 
L
W
 
E
T
 
T
M
 
A
V
 
V
R
 
R
E
 
L
H
 
K
L
 
A
D
 
N
V
 
V
T
 
L
V
 
H
V
 
L
L
 
I
A
 
W
V
 
V
N
x
D
G
 
N
G
|
G
Y
|
Y
R
x
N
I
x
M
L
x
V
E
 
A
I
 
I
E
x
Q
-
 
E
-
 
E
-
 
K
-
 
K
-
 
Y
Q
 
Q
T
 
R
I
 
L
A
 
S
G
 
G
L
 
V
D
 
E
L
 
F
H
 
G
P
 
P
E
 
-
L
 
-
T
 
-
R
 
-
L
 
-
D
 
-
D
 
-
P
 
-
G
 
-
W
 
M
D
 
D
F
 
F
A
 
K
G
 
A
L
 
Y
A
 
A
A
 
E
A
 
S
M
 
F
G
 
G
A
 
A
R
 
K
T
 
G
T
 
F
T
 
A
A
 
V
T
 
E
T
 
S
V
 
A
A
 
E
E
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
P
A
 
T
L
 
L
R
 
R

Sites not aligning to the query:

7orxCCC jostii RHA1 thiamine diphosphate-dependent 4-hydroxybenzoylformate decarboxylase
27% identity, 31% coverage: 334:492/506 of query aligns to 354:511/531 of 7orxCCC

query
sites
7orxCCC
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
 
D
G
 
P
S
 
A
T
 
Q
L
 
L
A
 
F
A
 
A
V
 
L
I
 
V
A
 
R
R
 
A
A
 
G
V
 
A
Q
 
P
A
 
D
D
 
D
D
 
A
V
 
I
V
 
Y
I
 
V
D
 
N
E
 
E
A
x
S
R
x
T
T
x
S
A
 
T
A
 
S
P
 
D
A
 
A
L
 
F
Y
 
W
E
 
S
Q
 
Q
L
 
M
A
 
D
D
 
L
A
 
S
R
 
H
R
 
Q
H
 
G
H
 
S
Y
 
Y
I
 
Y
G
 
F
H
 
P
P
 
A
G
 
S
G
|
G
A
 
G
I
x
L
G
 
G
E
 
F
G
 
G
A
 
L
S
 
P
L
 
A
A
 
A
L
 
V
G
 
G
A
 
A
-
 
Q
-
 
L
A
 
A
T
 
S
L
 
P
G
 
D
A
 
R
S
 
Q
V
 
V
L
 
I
A
 
G
V
 
L
V
 
I
A
x
G
D
|
D
G
|
G
G
x
S
F
 
A
L
 
N
Y
|
Y
A
 
G
P
 
I
Q
 
T
A
 
A
I
 
L
W
 
W
T
 
S
M
 
A
V
 
A
R
 
Q
E
 
Y
H
 
K
L
 
I
D
 
P
V
 
V
T
 
V
V
 
I
V
 
I
L
 
I
A
 
L
V
 
N
N
|
N
G
 
G
G
x
T
Y
|
Y
R
x
G
I
x
A
L
|
L
E
 
R
I
 
G
E
x
F
Q
 
S
T
 
K
I
 
I
A
 
L
G
 
N
L
 
T
D
 
G
L
 
-
H
 
-
P
 
-
E
 
E
L
 
T
T
 
P
R
 
G
L
 
L
D
 
D
D
 
V
P
 
P
G
 
G
W
 
I
D
 
D
F
 
F
A
 
V
G
 
H
L
 
L
A
 
A
A
 
E
A
 
G
M
 
Y
G
 
G
A
 
V
R
 
R
T
 
G
T
 
T
T
 
A
A
 
V
T
 
A
T
 
T
V
 
A
A
 
E
E
 
D
L
 
F
E
 
T
A
 
T
A
 
A
L
 
F
R
 
K

Sites not aligning to the query:

5dx6B Acetolactate synthase from klebsiella pneumoniae soaked with beta- fluoropyruvate
24% identity, 97% coverage: 2:492/506 of query aligns to 18:524/557 of 5dx6B

query
sites
5dx6B
N
 
H
G
 
G
A
 
A
E
 
D
L
 
L
A
 
V
A
 
V
L
 
S
T
 
Q
L
 
L
S
 
E
D
 
A
L
 
Q
G
 
G
V
 
V
G
 
R
V
 
Q
V
 
V
F
 
F
A
 
G
N
x
I
P
 
P
G
|
G
T
x
A
S
x
K
E
x
I
L
 
D
V
 
K
L
 
V
V
 
F
D
 
D
A
 
S
L
 
L
E
 
L
R
 
D
R
 
S
G
 
S
P
 
I
R
 
R
P
 
I
I
 
I
L
 
P
V
 
V
T
 
R
H
 
H
E
|
E
L
 
A
V
 
N
A
 
A
M
 
A
G
 
F
A
 
M
A
 
A
D
 
A
A
 
A
H
 
V
G
 
G
R
 
R
L
 
I
-
 
T
G
 
G
R
 
K
L
 
A
G
 
G
A
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
H
x
T
L
 
S
G
 
G
P
 
P
G
 
G
L
 
C
S
 
S
N
 
N
G
 
L
L
 
I
A
 
T
F
 
G
V
 
M
H
 
A
D
 
T
A
 
A
R
 
N
R
 
S
A
 
E
H
 
G
T
 
D
P
 
P
M
 
V
L
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
G
G
 
G
E
 
A
H
 
V
P
 
K
R
 
R
S
 
A
H
 
D
R
 
K
A
 
A
L
 
K
D
 
Q
T
 
V
P
x
H
L
x
Q
T
x
S
M
 
M
R
 
D
I
 
T
A
 
V
S
 
A
L
 
M
A
 
F
E
x
S
A
 
P
I
 
V
D
x
T
V
 
K
P
 
Y
M
 
A
I
 
I
A
 
E
I
 
V
D
 
T
D
 
A
P
 
P
A
 
D
L
 
A
I
 
L
A
 
A
P
 
E
Q
 
V
L
 
V
R
 
S
A
 
N
A
 
A
A
 
F
T
 
R
I
 
A
A
 
A
T
 
E
T
 
Q
Q
 
G
R
 
R
-
 
P
T
 
G
P
 
S
V
 
A
V
 
F
V
 
V
T
 
S
L
 
L
D
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
-
M
 
-
E
 
-
R
 
-
E
 
-
A
 
-
T
 
-
P
 
P
S
x
Q
D
 
D
P
 
V
S
 
V
A
 
D
P
 
G
P
 
P
T
 
V
T
 
S
A
 
G
H
 
K
E
 
V
A
 
L
P
 
P
S
 
A
I
 
S
P
 
G
R
 
A
A
 
P
R
 
Q
L
 
M
E
 
G
A
 
A
A
 
A
I
 
P
D
 
D
-
 
D
-
 
A
-
 
I
-
 
D
-
 
Q
-
 
V
-
 
A
-
 
K
-
 
L
L
 
I
V
 
A
R
 
Q
A
 
A
G
 
K
E
 
N
C
 
P
T
 
I
L
 
F
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
L
R
 
M
V
 
A
L
 
S
E
 
Q
P
 
P
D
 
E
A
 
-
R
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
I
 
-
A
 
-
D
 
N
D
 
S
T
 
K
G
 
A
L
 
L
R
 
R
L
 
R
L
 
L
A
 
L
E
 
E
T
 
T
-
 
S
-
 
H
F
 
I
P
 
P
A
 
V
S
 
T
H
 
S
R
 
T
Y
 
Y
G
 
-
E
 
Q
G
 
A
A
 
A
G
 
G
R
 
A
I
 
V
E
 
N
R
 
Q
L
 
D
A
 
N
Y
 
F
L
 
S
P
 
R
L
 
F
M
 
A
A
x
G
R
|
R
P
 
V
Q
 
G
L
|
L
A
 
F
T
 
N
A
 
N
R
x
Q
S
 
A
-
 
G
-
 
D
-
 
R
V
 
L
L
 
L
V
 
Q
L
 
L
G
 
A
T
 
D
D
 
L
A
 
V
P
 
I
S
 
C
A
 
I
W
 
G
F
 
Y
A
 
S
H
 
P
L
 
V
E
 
E
Q
 
Y
D
x
E
P
 
P
R
 
A
L
 
M
W
 
W
P
 
N
L
 
S
A
 
G
-
 
N
A
 
A
P
 
T
L
 
L
V
 
V
R
 
H
L
 
I
D
 
D
-
 
V
-
 
L
-
 
P
-
 
A
-
 
Y
-
 
E
G
 
E
Q
 
R
D
 
N
E
 
Y
D
 
T
P
 
P
R
 
D
V
 
V
-
 
E
-
 
L
-
 
V
-
 
G
-
 
D
-
 
I
-
 
A
-
 
G
V
 
T
L
 
L
E
 
N
H
 
K
L
 
L
A
 
A
K
 
Q
A
 
N
L
 
I
G
 
D
V
 
H
T
 
R
P
 
L
A
 
V
P
 
L
P
 
S
P
 
P
T
 
Q
S
 
A
Q
 
A
P
 
E
I
 
I
P
 
L
A
 
R
P
 
D
D
 
R
P
 
Q
H
 
H
A
 
Q
-
 
R
A
 
E
L
 
L
D
 
N
G
 
Q
S
 
F
T
 
A
L
 
L
A
 
H
A
 
P
V
 
L
-
 
R
I
 
I
A
 
V
R
 
R
A
 
A
V
 
M
Q
 
Q
A
 
-
D
 
-
D
 
D
V
 
I
V
 
V
I
 
N
D
 
S
E
 
D
A
 
V
R
 
T
T
 
L
A
 
T
A
 
V
P
 
D
A
x
M
L
x
G
Y
x
S
E
x
F
Q
 
H
L
 
I
A
 
W
D
 
I
A
|
A
R
|
R
-
 
Y
-
 
L
-
x
Y
-
 
S
-
 
F
-
 
R
-
 
A
R
 
R
H
 
Q
H
 
V
Y
 
M
I
 
I
G
 
S
H
 
N
P
 
G
G
 
Q
G
x
Q
A
 
T
I
x
M
G
 
G
E
 
V
G
 
A
A
 
L
S
 
P
L
 
W
A
 
A
L
 
I
G
 
G
A
 
A
A
 
W
T
 
L
L
 
V
G
 
N
-
 
P
-
 
E
A
 
R
S
 
K
V
 
V
L
 
V
A
 
S
V
 
V
V
 
S
A
x
G
D
|
D
G
|
G
G
 
G
F
 
F
L
 
L
Y
 
Q
A
 
S
P
 
S
Q
 
M
A
 
E
I
 
L
W
 
E
T
 
T
M
 
A
V
 
V
R
 
R
E
 
L
H
 
K
L
 
A
D
 
N
V
 
V
T
 
L
V
 
H
V
 
L
L
 
I
A
 
W
V
 
V
N
x
D
G
 
N
G
|
G
Y
|
Y
R
x
N
I
x
M
L
x
V
E
 
A
I
 
I
E
x
Q
-
 
E
-
 
E
-
 
K
-
 
K
-
 
Y
Q
 
Q
T
 
R
I
 
L
A
 
S
G
 
G
L
 
V
D
 
E
L
 
F
H
 
G
P
 
P
E
 
-
L
 
-
T
 
-
R
 
-
L
 
-
D
 
-
D
 
-
P
 
-
G
 
-
W
 
M
D
 
D
F
 
F
A
 
K
G
 
A
L
 
Y
A
 
A
A
 
E
A
 
S
M
 
F
G
 
G
A
 
A
R
 
K
T
 
G
T
 
F
T
 
A
A
 
V
T
 
E
T
 
S
V
 
A
A
 
E
E
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
P
A
 
T
L
 
L
R
 
R

Sites not aligning to the query:

1ozgA The crystal structure of klebsiella pneumoniae acetolactate synthase with enzyme-bound cofactor and with an unusual intermediate (see paper)
24% identity, 97% coverage: 2:492/506 of query aligns to 7:521/549 of 1ozgA

query
sites
1ozgA
N
 
H
G
 
G
A
 
A
E
 
D
L
 
L
A
 
V
A
 
V
L
 
S
T
 
Q
L
 
L
S
 
E
D
 
A
L
 
Q
G
 
G
V
 
V
G
 
R
V
 
Q
V
 
V
F
 
F
A
 
G
N
x
I
P
 
P
G
|
G
T
x
A
S
x
K
E
x
I
L
 
D
V
 
K
L
 
V
V
 
F
D
 
D
A
 
S
L
 
L
E
 
L
R
 
D
R
 
S
G
 
S
P
 
I
R
 
R
P
 
I
I
 
I
L
 
P
V
 
V
T
 
R
H
 
H
E
|
E
L
 
A
V
 
N
A
 
A
M
 
A
G
 
F
A
 
M
A
 
A
D
 
A
A
 
A
H
 
V
G
 
G
R
 
R
L
 
I
-
 
T
G
 
G
R
 
K
L
 
A
G
 
G
A
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
H
x
T
L
 
S
G
 
G
P
 
P
G
 
G
L
 
C
S
 
S
N
 
N
G
 
L
L
 
I
A
 
T
F
 
G
V
 
M
H
 
A
D
 
T
A
 
A
R
 
N
R
 
S
A
 
E
H
 
G
T
 
D
P
 
P
M
 
V
L
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
G
G
 
G
E
 
A
H
 
V
P
 
K
R
 
R
S
 
A
H
 
D
R
 
K
A
 
A
L
 
K
D
 
Q
T
 
V
P
x
H
L
x
Q
T
x
S
M
 
M
R
 
D
I
 
T
A
 
V
S
 
A
L
 
M
A
 
F
E
 
S
A
 
P
I
 
V
D
 
T
V
 
K
P
 
Y
M
 
A
I
 
I
A
 
E
I
 
V
D
 
T
D
 
A
P
 
P
A
 
D
L
 
A
I
 
L
A
 
A
P
 
E
Q
 
V
L
 
V
R
 
S
A
 
N
A
 
A
A
 
F
T
 
R
I
 
A
A
 
A
T
 
E
T
 
Q
Q
 
G
R
 
R
-
 
P
T
 
G
P
 
S
V
 
A
V
 
F
V
 
V
T
 
S
L
 
L
D
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
-
M
 
-
E
 
-
R
 
-
E
 
-
A
 
-
T
 
-
P
 
P
S
x
Q
D
 
D
P
 
V
S
 
V
A
 
D
P
 
G
P
 
P
T
 
V
T
 
S
A
 
G
H
 
K
E
 
V
A
 
L
P
 
P
S
 
A
I
 
S
P
 
G
R
 
A
A
 
P
R
 
Q
L
 
M
E
 
G
A
 
A
A
 
A
I
 
P
D
 
D
-
 
D
-
 
A
-
 
I
-
 
D
-
 
Q
-
 
V
-
 
A
-
 
K
-
 
L
L
 
I
V
 
A
R
 
Q
A
 
A
G
 
K
E
 
N
C
 
P
T
 
I
L
 
F
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
L
R
 
M
V
 
A
L
 
S
E
 
Q
P
 
P
D
 
E
A
 
-
R
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
I
 
-
A
 
-
D
 
N
D
 
S
T
 
K
G
 
A
L
 
L
R
 
R
L
 
R
L
 
L
A
 
L
E
 
E
T
 
T
-
 
S
-
 
H
F
 
I
P
 
P
A
 
V
S
 
T
H
 
S
R
 
T
Y
 
Y
G
 
-
E
 
Q
G
 
A
A
 
A
G
 
G
R
 
A
I
 
V
E
 
N
R
 
Q
L
 
D
A
 
N
Y
 
F
L
 
S
P
 
R
L
 
F
M
 
A
A
x
G
R
|
R
P
 
V
Q
 
G
L
|
L
A
 
F
T
 
N
A
 
N
R
x
Q
S
 
A
-
 
G
-
 
D
-
 
R
V
 
L
L
 
L
V
 
Q
L
 
L
G
 
A
T
 
D
D
 
L
A
 
V
P
 
I
S
 
C
A
 
I
W
 
G
F
 
Y
A
 
S
H
 
P
L
 
V
E
 
E
Q
 
Y
D
x
E
P
 
P
R
 
A
L
 
M
W
 
W
P
 
N
L
 
S
A
 
G
-
 
N
A
 
A
P
 
T
L
 
L
V
 
V
R
 
H
L
 
I
D
 
D
-
 
V
-
 
L
-
 
P
-
 
A
-
 
Y
-
 
E
G
 
E
Q
 
R
D
 
N
E
 
Y
D
 
T
P
 
P
R
 
D
V
 
V
-
 
E
-
 
L
-
 
V
-
 
G
-
 
D
-
 
I
-
 
A
-
 
G
V
 
T
L
 
L
E
 
N
H
 
K
L
 
L
A
 
A
K
 
Q
A
 
N
L
 
I
G
 
D
V
 
H
T
 
R
P
 
L
A
 
V
P
 
L
P
 
S
P
 
P
T
 
Q
S
 
A
Q
 
A
P
 
E
I
 
I
P
 
L
A
 
R
P
 
D
D
x
R
P
 
Q
H
 
H
A
 
Q
A
 
R
-
 
E
-
 
L
L
 
L
D
 
D
-
 
R
-
 
R
G
 
G
S
 
A
T
 
Q
L
 
L
A
 
N
A
 
Q
V
 
F
-
 
A
-
 
L
-
 
H
-
 
P
-
 
L
-
 
R
I
 
I
A
 
V
R
 
R
A
 
A
V
 
M
Q
 
Q
A
 
-
D
 
-
D
 
D
V
 
I
V
 
V
I
 
N
D
 
S
E
 
D
A
 
V
R
 
T
T
 
L
A
 
T
A
 
V
P
 
D
A
x
M
L
x
G
Y
x
S
E
x
F
Q
 
H
L
 
I
A
 
W
D
 
I
A
 
A
R
|
R
-
 
Y
-
 
L
-
x
Y
-
 
T
-
 
F
-
 
R
-
 
A
R
 
R
H
 
Q
H
 
V
Y
 
M
I
 
I
G
 
S
H
 
N
P
 
G
G
 
Q
G
x
Q
A
 
T
I
x
M
G
 
G
E
 
V
G
 
A
A
 
L
S
 
P
L
 
W
A
 
A
L
 
I
G
 
G
A
 
A
A
 
W
T
 
L
L
 
V
G
 
N
-
 
P
-
 
E
A
 
R
S
 
K
V
 
V
L
 
V
A
 
S
V
 
V
V
 
S
A
x
G
D
|
D
G
|
G
G
 
G
F
 
F
L
 
L
Y
 
Q
A
 
S
P
 
S
Q
 
M
A
 
E
I
 
L
W
 
E
T
 
T
M
 
A
V
 
V
R
 
R
E
 
L
H
 
K
L
 
A
D
 
N
V
 
V
T
 
L
V
 
H
V
 
L
L
 
I
A
 
W
V
 
V
N
x
D
G
 
N
G
|
G
Y
|
Y
R
x
N
I
x
M
L
x
V
E
 
A
I
 
I
E
x
Q
-
 
E
-
 
E
-
 
K
-
 
K
-
 
Y
Q
 
Q
T
 
R
I
 
L
A
 
S
G
 
G
L
 
V
D
 
E
L
 
F
H
 
G
P
 
P
E
 
-
L
 
-
T
 
-
R
 
-
L
 
-
D
 
-
D
 
-
P
 
-
G
 
-
W
 
M
D
 
D
F
 
F
A
 
K
G
 
A
L
 
Y
A
 
A
A
 
E
A
 
S
M
 
F
G
 
G
A
 
A
R
 
K
T
 
G
T
 
F
T
 
A
A
 
V
T
 
E
T
 
S
V
 
A
A
 
E
E
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
P
A
 
T
L
 
L
R
 
R

Sites not aligning to the query:

4rjkG Acetolactate synthase from bacillus subtilis bound to lthdp - crystal form ii (see paper)
34% identity, 28% coverage: 3:145/506 of query aligns to 3:146/553 of 4rjkG

query
sites
4rjkG
G
 
G
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
V
A
 
V
L
 
D
T
 
C
L
 
L
S
 
V
D
 
E
L
 
Q
G
 
G
V
 
V
G
 
T
V
 
H
V
 
V
F
 
F
A
 
G
N
 
I
P
 
P
G
 
G
T
 
A
S
 
K
E
 
I
L
 
D
V
 
A
L
 
V
V
 
F
D
 
D
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
R
 
D
R
 
K
G
 
G
P
 
P
R
 
E
P
 
I
I
 
I
L
 
V
V
 
A
T
 
R
H
 
H
E
|
E
L
 
Q
V
 
N
A
 
A
M
 
A
G
 
F
A
 
M
A
 
A
D
 
Q
A
 
A
H
 
V
G
 
G
R
 
R
L
 
L
-
 
T
G
 
G
R
 
K
L
 
P
G
 
G
A
 
V
A
 
V
L
 
L
V
 
V
H
 
T
L
 
S
G
 
G
P
 
P
G
 
G
L
 
A
S
 
S
N
 
N
G
 
L
L
 
A
A
 
T
F
 
G
V
 
L
H
 
L
D
 
T
A
 
A
R
 
N
R
 
T
A
 
E
H
 
G
T
 
D
P
 
P
M
 
V
L
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
A
G
 
G
E
 
N
H
 
V
P
 
I
R
 
R
S
 
A
H
 
D
R
 
R
A
 
L
L
 
K
D
 
R
T
 
T
P
 
H
L
x
Q
T
 
S
M
 
L
R
 
D
I
 
N
A
 
A
S
 
A
L
 
L
A
 
F
E
 
Q
A
 
P
I
 
I
D
 
T
V
 
K
P
 
Y
M
 
S
I
 
V
A
 
E
I
 
V
D
 
Q
D
 
D
P
 
V
A
 
K
L
 
N
I
 
I
A
 
P
P
 
E
Q
 
A
L
 
V
R
 
T
A
 
N
A
 
A
A
 
F
T
 
R
I
 
I
A
 
A
T
 
S

Sites not aligning to the query:

4rjiC Acetolactate synthase from bacillus subtilis bound to thdp - crystal form i (see paper)
34% identity, 28% coverage: 3:145/506 of query aligns to 4:147/555 of 4rjiC

query
sites
4rjiC
G
 
G
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
V
A
 
V
L
 
D
T
 
C
L
 
L
S
 
V
D
 
E
L
 
Q
G
 
G
V
 
V
G
 
T
V
 
H
V
 
V
F
 
F
A
 
G
N
 
I
P
|
P
G
 
G
T
 
A
S
 
K
E
 
I
L
 
D
V
 
A
L
 
V
V
 
F
D
 
D
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
R
 
D
R
 
K
G
 
G
P
 
P
R
 
E
P
 
I
I
 
I
L
 
V
V
 
A
T
 
R
H
 
H
E
|
E
L
 
Q
V
 
N
A
 
A
M
 
A
G
 
F
A
 
M
A
 
A
D
 
Q
A
 
A
H
 
V
G
 
G
R
 
R
L
 
L
-
 
T
G
 
G
R
 
K
L
 
P
G
 
G
A
 
V
A
 
V
L
 
L
V
 
V
H
 
T
L
 
S
G
 
G
P
|
P
G
 
G
L
 
A
S
 
S
N
 
N
G
 
L
L
 
A
A
 
T
F
 
G
V
 
L
H
 
L
D
 
T
A
 
A
R
 
N
R
 
T
A
 
E
H
 
G
T
 
D
P
 
P
M
 
V
L
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
A
G
 
G
E
 
N
H
 
V
P
 
I
R
 
R
S
 
A
H
 
D
R
 
R
A
 
L
L
 
K
D
 
R
T
 
T
P
 
H
L
 
Q
T
 
S
M
 
L
R
 
D
I
 
N
A
 
A
S
 
A
L
 
L
A
 
F
E
 
Q
A
 
P
I
 
I
D
 
T
V
 
K
P
 
Y
M
 
S
I
 
V
A
 
E
I
 
V
D
 
Q
D
 
D
P
 
V
A
 
K
L
 
N
I
 
I
A
 
P
P
 
E
Q
 
A
L
 
V
R
 
T
A
 
N
A
 
A
A
 
F
T
 
R
I
 
I
A
 
A
T
 
S

Sites not aligning to the query:

2ezuA Pyruvate oxidase variant f479w in complex with reaction intermediate 2-acetyl-thiamin diphosphate (see paper)
27% identity, 54% coverage: 11:284/506 of query aligns to 13:301/585 of 2ezuA

query
sites
2ezuA
L
 
L
S
 
E
D
 
A
L
 
W
G
 
G
V
 
V
G
 
D
V
 
H
V
 
L
F
 
Y
A
 
G
N
x
I
P
 
P
G
|
G
T
x
G
S
|
S
E
x
I
L
 
N
V
 
S
L
 
I
V
 
M
D
 
D
A
 
A
L
 
L
-
 
S
-
 
A
E
 
E
R
 
R
R
 
D
G
 
R
P
 
I
R
 
H
P
 
Y
I
 
I
L
 
Q
V
 
V
T
 
R
H
 
H
E
|
E
L
 
E
V
 
V
A
 
G
M
 
A
G
 
M
A
 
A
A
 
A
D
 
A
A
 
A
H
 
D
G
 
A
R
 
K
L
 
L
-
 
T
G
 
G
R
 
K
L
 
I
G
 
G
A
 
V
A
 
C
L
 
F
V
 
G
H
x
S
L
 
A
G
 
G
P
 
P
G
 
G
L
 
G
S
 
T
N
 
H
G
 
L
L
 
M
A
 
N
F
 
G
V
 
L
H
 
Y
D
 
D
A
 
A
R
 
R
R
 
E
A
 
D
H
|
H
T
 
V
P
 
P
M
 
V
L
 
L
V
 
A
L
 
L
V
 
I
G
 
G
E
 
Q
H
 
F
P
 
G
R
 
T
S
 
T
H
 
G
R
 
M
A
 
N
L
 
M
D
 
D
T
 
T
P
x
F
L
x
Q
T
x
E
M
 
M
R
 
N
I
 
E
A
 
N
S
 
P
L
 
I
-
 
Y
A
 
A
E
 
D
A
 
V
I
 
A
D
 
D
V
 
Y
P
 
N
M
 
V
I
 
T
A
 
A
I
 
V
D
 
N
D
 
A
P
 
A
A
 
T
L
 
L
I
 
-
A
 
-
P
 
P
Q
 
H
L
 
V
R
 
I
A
 
D
A
 
E
A
 
A
T
 
I
I
 
R
A
 
R
T
 
A
T
 
Y
Q
 
A
R
 
H
T
 
Q
P
 
G
V
 
V
V
 
A
V
 
V
T
 
V
L
 
Q
D
 
I
A
 
P
V
|
V
A
 
D
M
 
L
E
 
P
R
 
W
E
 
Q
A
 
Q
T
 
I
P
 
P
S
 
A
D
 
E
P
 
D
S
 
W
A
 
Y
P
 
A
P
 
S
T
 
A
T
 
N
A
 
S
H
 
Y
E
 
Q
A
 
T
P
 
P
S
 
L
I
 
L
P
 
P
R
 
E
A
 
P
R
 
D
L
 
V
E
 
Q
A
 
A
A
 
V
I
 
T
D
 
R
L
 
L
V
 
T
R
 
Q
-
 
T
-
 
L
-
 
L
A
 
A
G
 
A
E
 
E
C
 
R
T
 
P
L
 
L
L
 
I
-
 
Y
-
 
Y
-
x
G
L
x
I
G
|
G
A
 
A
R
 
R
V
 
K
L
 
A
E
 
G
P
 
K
D
 
E
A
 
L
R
 
E
A
 
Q
L
 
L
A
 
S
R
 
K
A
 
T
I
 
-
A
 
-
D
 
-
D
 
-
T
 
-
G
 
-
L
 
L
R
 
K
L
 
I
-
 
P
L
 
L
A
 
M
E
 
S
T
|
T
F
x
Y
P
|
P
A
 
A
S
 
K
-
 
G
-
 
I
-
 
V
-
 
A
H
 
D
R
 
R
Y
 
Y
G
 
P
E
 
A
G
 
Y
A
 
L
G
 
G
R
 
S
I
x
A
E
x
N
R
|
R
L
x
V
A
 
A
Y
 
Q
L
 
K
P
 
P
L
 
-
M
 
-
A
 
A
R
 
N
P
 
E
Q
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
Q
A
 
A
R
 
D
S
 
V
V
 
V
L
 
L
V
 
F
L
 
V
G
|
G
T
x
N
D
x
N
A
 
Y
P
|
P
S
x
F
A
 
A
-
x
E
-
 
V
-
 
S
-
 
K
-
 
A
-
 
F
-
 
K
-
 
N
-
 
T
-
 
R
W
 
Y
F
 
F
A
 
L
H
 
Q
L
 
I
E
x
D
Q
x
I
D
 
D
P
 
P

Sites not aligning to the query:

2ez9A Pyruvate oxidase variant f479w in complex with reaction intermediate analogue 2-phosphonolactyl-thiamin diphosphate (see paper)
27% identity, 54% coverage: 11:284/506 of query aligns to 13:301/585 of 2ez9A

query
sites
2ez9A
L
 
L
S
 
E
D
 
A
L
 
W
G
 
G
V
 
V
G
 
D
V
 
H
V
 
L
F
 
Y
A
 
G
N
x
I
P
 
P
G
|
G
T
x
G
S
|
S
E
x
I
L
 
N
V
 
S
L
 
I
V
 
M
D
 
D
A
 
A
L
 
L
-
 
S
-
 
A
E
 
E
R
 
R
R
 
D
G
 
R
P
 
I
R
 
H
P
 
Y
I
 
I
L
 
Q
V
 
V
T
 
R
H
 
H
E
|
E
L
 
E
V
 
V
A
 
G
M
 
A
G
 
M
A
 
A
A
 
A
D
 
A
A
 
A
H
 
D
G
 
A
R
 
K
L
 
L
-
 
T
G
 
G
R
 
K
L
 
I
G
 
G
A
 
V
A
 
C
L
 
F
V
 
G
H
x
S
L
 
A
G
 
G
P
 
P
G
 
G
L
 
G
S
 
T
N
 
H
G
 
L
L
 
M
A
 
N
F
 
G
V
 
L
H
 
Y
D
 
D
A
 
A
R
 
R
R
 
E
A
 
D
H
|
H
T
 
V
P
 
P
M
 
V
L
 
L
V
 
A
L
 
L
V
 
I
G
 
G
E
 
Q
H
 
F
P
 
G
R
 
T
S
 
T
H
 
G
R
 
M
A
 
N
L
 
M
D
 
D
T
 
T
P
x
F
L
x
Q
T
x
E
M
 
M
R
 
N
I
 
E
A
 
N
S
 
P
L
 
I
-
 
Y
A
 
A
E
 
D
A
 
V
I
 
A
D
 
D
V
 
Y
P
 
N
M
 
V
I
 
T
A
 
A
I
 
V
D
 
N
D
 
A
P
 
A
A
 
T
L
 
L
I
 
-
A
 
-
P
 
P
Q
 
H
L
 
V
R
 
I
A
 
D
A
 
E
A
 
A
T
 
I
I
 
R
A
 
R
T
 
A
T
 
Y
Q
 
A
R
 
H
T
 
Q
P
 
G
V
 
V
V
 
A
V
 
V
T
 
V
L
 
Q
D
 
I
A
 
P
V
|
V
A
 
D
M
 
L
E
 
P
R
 
W
E
 
Q
A
 
Q
T
 
I
P
 
P
S
 
A
D
 
E
P
 
D
S
 
W
A
 
Y
P
 
A
P
 
S
T
 
A
T
 
N
A
 
S
H
 
Y
E
 
Q
A
 
T
P
 
P
S
 
L
I
 
L
P
 
P
R
 
E
A
 
P
R
 
D
L
 
V
E
 
Q
A
 
A
A
 
V
I
 
T
D
 
R
L
 
L
V
 
T
R
 
Q
-
 
T
-
 
L
-
 
L
A
 
A
G
 
A
E
 
E
C
 
R
T
 
P
L
 
L
L
 
I
-
 
Y
-
 
Y
-
x
G
L
x
I
G
|
G
A
 
A
R
 
R
V
 
K
L
 
A
E
 
G
P
 
K
D
 
E
A
 
L
R
 
E
A
 
Q
L
 
L
A
 
S
R
 
K
A
 
T
I
 
-
A
 
-
D
 
-
D
 
-
T
 
-
G
 
-
L
 
L
R
 
K
L
 
I
-
 
P
L
 
L
A
 
M
E
 
S
T
|
T
F
x
Y
P
|
P
A
 
A
S
 
K
-
 
G
-
 
I
-
 
V
-
 
A
H
 
D
R
 
R
Y
 
Y
G
 
P
E
 
A
G
 
Y
A
 
L
G
 
G
R
 
S
I
x
A
E
x
N
R
|
R
L
x
V
A
 
A
Y
 
Q
L
 
K
P
 
P
L
 
-
M
 
-
A
 
A
R
 
N
P
 
E
Q
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
Q
A
 
A
R
 
D
S
 
V
V
 
V
L
 
L
V
 
F
L
 
V
G
|
G
T
x
N
D
x
N
A
 
Y
P
|
P
S
x
F
A
 
A
-
x
E
-
 
V
-
 
S
-
 
K
-
 
A
-
 
F
-
 
K
-
 
N
-
 
T
-
 
R
W
 
Y
F
 
F
A
 
L
H
 
Q
L
 
I
E
x
D
Q
x
I
D
 
D
P
 
P

Sites not aligning to the query:

2ez8A Pyruvate oxidase variant f479w in complex with reaction intermediate 2-lactyl-thiamin diphosphate (see paper)
27% identity, 54% coverage: 11:284/506 of query aligns to 13:301/585 of 2ez8A

query
sites
2ez8A
L
 
L
S
 
E
D
 
A
L
 
W
G
 
G
V
 
V
G
 
D
V
 
H
V
 
L
F
 
Y
A
 
G
N
x
I
P
 
P
G
|
G
T
x
G
S
|
S
E
x
I
L
 
N
V
 
S
L
 
I
V
 
M
D
 
D
A
 
A
L
 
L
-
 
S
-
 
A
E
 
E
R
 
R
R
 
D
G
 
R
P
 
I
R
 
H
P
 
Y
I
 
I
L
 
Q
V
 
V
T
 
R
H
 
H
E
|
E
L
 
E
V
 
V
A
 
G
M
 
A
G
 
M
A
 
A
A
 
A
D
 
A
A
 
A
H
 
D
G
 
A
R
 
K
L
 
L
-
 
T
G
 
G
R
 
K
L
 
I
G
 
G
A
 
V
A
 
C
L
 
F
V
 
G
H
x
S
L
 
A
G
 
G
P
 
P
G
 
G
L
 
G
S
 
T
N
 
H
G
 
L
L
 
M
A
 
N
F
 
G
V
 
L
H
 
Y
D
 
D
A
 
A
R
 
R
R
 
E
A
 
D
H
|
H
T
 
V
P
 
P
M
 
V
L
 
L
V
 
A
L
 
L
V
 
I
G
 
G
E
 
Q
H
 
F
P
 
G
R
 
T
S
 
T
H
 
G
R
 
M
A
 
N
L
 
M
D
 
D
T
 
T
P
x
F
L
x
Q
T
x
E
M
 
M
R
 
N
I
 
E
A
 
N
S
 
P
L
 
I
-
 
Y
A
 
A
E
 
D
A
 
V
I
 
A
D
 
D
V
 
Y
P
 
N
M
 
V
I
 
T
A
 
A
I
 
V
D
 
N
D
 
A
P
 
A
A
 
T
L
 
L
I
 
-
A
 
-
P
 
P
Q
 
H
L
 
V
R
 
I
A
 
D
A
 
E
A
 
A
T
 
I
I
 
R
A
 
R
T
 
A
T
 
Y
Q
 
A
R
 
H
T
 
Q
P
 
G
V
 
V
V
 
A
V
 
V
T
 
V
L
 
Q
D
 
I
A
 
P
V
|
V
A
 
D
M
 
L
E
 
P
R
 
W
E
 
Q
A
 
Q
T
 
I
P
 
P
S
 
A
D
 
E
P
 
D
S
 
W
A
 
Y
P
 
A
P
 
S
T
 
A
T
 
N
A
 
S
H
 
Y
E
 
Q
A
 
T
P
 
P
S
 
L
I
 
L
P
 
P
R
 
E
A
 
P
R
 
D
L
 
V
E
 
Q
A
 
A
A
 
V
I
 
T
D
 
R
L
 
L
V
 
T
R
 
Q
-
 
T
-
 
L
-
 
L
A
 
A
G
 
A
E
 
E
C
 
R
T
 
P
L
 
L
L
 
I
-
 
Y
-
 
Y
-
x
G
L
x
I
G
|
G
A
 
A
R
 
R
V
 
K
L
 
A
E
 
G
P
 
K
D
 
E
A
 
L
R
 
E
A
 
Q
L
 
L
A
 
S
R
 
K
A
 
T
I
 
-
A
 
-
D
 
-
D
 
-
T
 
-
G
 
-
L
 
L
R
 
K
L
 
I
-
 
P
L
 
L
A
 
M
E
 
S
T
|
T
F
x
Y
P
|
P
A
 
A
S
 
K
-
 
G
-
 
I
-
 
V
-
 
A
H
 
D
R
 
R
Y
 
Y
G
 
P
E
 
A
G
 
Y
A
 
L
G
 
G
R
 
S
I
x
A
E
x
N
R
|
R
L
x
V
A
 
A
Y
 
Q
L
 
K
P
 
P
L
 
-
M
 
-
A
 
A
R
 
N
P
 
E
Q
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
Q
A
 
A
R
 
D
S
 
V
V
 
V
L
 
L
V
 
F
L
 
V
G
|
G
T
x
N
D
x
N
A
 
Y
P
|
P
S
x
F
A
 
A
-
x
E
-
 
V
-
 
S
-
 
K
-
 
A
-
 
F
-
 
K
-
 
N
-
 
T
-
 
R
W
 
Y
F
 
F
A
 
L
H
 
Q
L
 
I
E
x
D
Q
x
I
D
 
D
P
 
P

Sites not aligning to the query:

2ez4B Pyruvate oxidase variant f479w (see paper)
27% identity, 54% coverage: 11:284/506 of query aligns to 13:301/585 of 2ez4B

query
sites
2ez4B
L
 
L
S
 
E
D
 
A
L
 
W
G
 
G
V
 
V
G
 
D
V
 
H
V
 
L
F
 
Y
A
 
G
N
x
I
P
 
P
G
|
G
T
x
G
S
|
S
E
x
I
L
 
N
V
 
S
L
 
I
V
 
M
D
 
D
A
 
A
L
 
L
-
 
S
-
 
A
E
 
E
R
 
R
R
 
D
G
 
R
P
 
I
R
 
H
P
 
Y
I
 
I
L
 
Q
V
 
V
T
 
R
H
 
H
E
|
E
L
 
E
V
 
V
A
 
G
M
 
A
G
 
M
A
 
A
A
 
A
D
 
A
A
 
A
H
 
D
G
 
A
R
 
K
L
 
L
-
 
T
G
 
G
R
 
K
L
 
I
G
 
G
A
 
V
A
 
C
L
 
F
V
 
G
H
x
S
L
 
A
G
 
G
P
 
P
G
 
G
L
 
G
S
 
T
N
 
H
G
 
L
L
 
M
A
 
N
F
 
G
V
 
L
H
 
Y
D
 
D
A
 
A
R
 
R
R
 
E
A
 
D
H
|
H
T
 
V
P
 
P
M
 
V
L
 
L
V
 
A
L
 
L
V
 
I
G
 
G
E
 
Q
H
 
F
P
 
G
R
 
T
S
 
T
H
 
G
R
 
M
A
 
N
L
 
M
D
 
D
T
 
T
P
x
F
L
x
Q
T
x
E
M
 
M
R
 
N
I
 
E
A
 
N
S
 
P
L
 
I
-
 
Y
A
 
A
E
 
D
A
 
V
I
 
A
D
 
D
V
 
Y
P
 
N
M
 
V
I
 
T
A
 
A
I
 
V
D
 
N
D
 
A
P
 
A
A
 
T
L
 
L
I
 
-
A
 
-
P
 
P
Q
 
H
L
 
V
R
 
I
A
 
D
A
 
E
A
 
A
T
 
I
I
 
R
A
 
R
T
 
A
T
 
Y
Q
 
A
R
 
H
T
 
Q
P
 
G
V
 
V
V
 
A
V
 
V
T
 
V
L
 
Q
D
 
I
A
 
P
V
|
V
A
 
D
M
 
L
E
 
P
R
 
W
E
 
Q
A
 
Q
T
 
I
P
 
P
S
 
A
D
 
E
P
 
D
S
 
W
A
 
Y
P
 
A
P
 
S
T
 
A
T
 
N
A
 
S
H
 
Y
E
 
Q
A
 
T
P
 
P
S
 
L
I
 
L
P
 
P
R
 
E
A
 
P
R
 
D
L
 
V
E
 
Q
A
 
A
A
 
V
I
 
T
D
 
R
L
 
L
V
 
T
R
 
Q
-
 
T
-
 
L
-
 
L
A
 
A
G
 
A
E
 
E
C
 
R
T
 
P
L
 
L
L
 
I
-
 
Y
-
 
Y
-
x
G
L
x
I
G
|
G
A
 
A
R
 
R
V
 
K
L
 
A
E
 
G
P
 
K
D
 
E
A
 
L
R
 
E
A
 
Q
L
 
L
A
 
S
R
 
K
A
 
T
I
 
-
A
 
-
D
 
-
D
 
-
T
 
-
G
 
-
L
 
L
R
 
K
L
 
I
-
 
P
L
 
L
A
 
M
E
 
S
T
|
T
F
x
Y
P
|
P
A
 
A
S
 
K
-
 
G
-
 
I
-
 
V
-
 
A
H
 
D
R
 
R
Y
 
Y
G
 
P
E
 
A
G
 
Y
A
 
L
G
 
G
R
 
S
I
x
A
E
x
N
R
|
R
L
x
V
A
 
A
Y
 
Q
L
 
K
P
 
P
L
 
-
M
 
-
A
 
A
R
 
N
P
 
E
Q
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
Q
A
 
A
R
 
D
S
 
V
V
 
V
L
 
L
V
 
F
L
 
V
G
|
G
T
x
N
D
x
N
A
 
Y
P
|
P
S
x
F
A
 
A
-
x
E
-
 
V
-
 
S
-
 
K
-
 
A
-
 
F
-
 
K
-
 
N
-
 
T
-
 
R
W
 
Y
F
 
F
A
 
L
H
 
Q
L
 
I
E
x
D
Q
x
I
D
 
D
P
 
P

Sites not aligning to the query:

4rjkF Acetolactate synthase from bacillus subtilis bound to lthdp - crystal form ii (see paper)
34% identity, 28% coverage: 3:145/506 of query aligns to 3:146/552 of 4rjkF

query
sites
4rjkF
G
 
G
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
V
A
 
V
L
 
D
T
 
C
L
 
L
S
 
V
D
 
E
L
 
Q
G
 
G
V
 
V
G
 
T
V
 
H
V
 
V
F
 
F
A
 
G
N
 
I
P
|
P
G
 
G
T
x
A
S
x
K
E
 
I
L
 
D
V
 
A
L
 
V
V
 
F
D
 
D
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
R
 
D
R
 
K
G
 
G
P
 
P
R
 
E
P
 
I
I
 
I
L
 
V
V
 
A
T
 
R
H
 
H
E
|
E
L
 
Q
V
 
N
A
 
A
M
 
A
G
 
F
A
 
M
A
 
A
D
 
Q
A
 
A
H
 
V
G
 
G
R
 
R
L
 
L
-
 
T
G
 
G
R
 
K
L
 
P
G
 
G
A
 
V
A
 
V
L
 
L
V
 
V
H
 
T
L
 
S
G
 
G
P
|
P
G
 
G
L
 
A
S
 
S
N
 
N
G
 
L
L
 
A
A
 
T
F
 
G
V
 
L
H
 
L
D
 
T
A
 
A
R
 
N
R
 
T
A
 
E
H
 
G
T
 
D
P
 
P
M
 
V
L
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
A
G
 
G
E
 
N
H
 
V
P
 
I
R
 
R
S
 
A
H
 
D
R
 
R
A
 
L
L
 
K
D
 
R
T
 
T
P
 
H
L
 
Q
T
 
S
M
 
L
R
 
D
I
 
N
A
 
A
S
 
A
L
 
L
A
 
F
E
 
Q
A
 
P
I
 
I
D
 
T
V
 
K
P
 
Y
M
 
S
I
 
V
A
 
E
I
 
V
D
 
Q
D
 
D
P
 
V
A
 
K
L
 
N
I
 
I
A
 
P
P
 
E
Q
 
A
L
 
V
R
 
T
A
 
N
A
 
A
A
 
F
T
 
R
I
 
I
A
 
A
T
 
S

Sites not aligning to the query:

1powA The refined structures of a stabilized mutant and of wild-type pyruvate oxidase from lactobacillus plantarum (see paper)
27% identity, 55% coverage: 11:287/506 of query aligns to 13:294/585 of 1powA

query
sites
1powA
L
 
L
S
 
E
D
 
A
L
 
W
G
 
G
V
 
V
G
 
D
V
 
H
V
 
L
F
 
Y
A
 
G
N
x
I
P
 
P
G
|
G
T
x
G
S
|
S
E
x
I
L
 
N
V
 
S
L
 
I
V
 
M
D
 
D
A
 
A
L
 
L
-
 
S
-
 
A
E
 
E
R
 
R
R
 
D
G
 
R
P
 
I
R
 
H
P
 
Y
I
 
I
L
 
Q
V
 
V
T
 
R
H
 
H
E
|
E
L
 
E
V
 
V
A
 
G
M
 
A
G
 
M
A
 
A
A
 
A
D
 
A
A
 
A
H
 
D
G
 
A
R
 
K
L
 
L
-
 
T
G
 
G
R
 
K
L
 
I
G
 
G
A
 
V
A
 
C
L
 
F
V
 
G
H
x
S
L
 
A
G
 
G
P
 
P
G
 
G
L
 
G
S
 
T
N
 
H
G
 
L
L
 
M
A
 
N
F
 
G
V
 
L
H
 
Y
D
 
D
A
 
A
R
 
R
R
 
E
A
 
D
H
|
H
T
 
V
P
 
P
M
 
V
L
 
L
V
 
A
L
 
L
V
 
I
G
 
G
E
 
Q
H
 
F
P
 
G
R
 
T
S
 
T
H
 
G
R
 
M
A
 
N
L
 
M
D
 
D
T
 
T
P
x
F
L
x
Q
T
x
E
M
 
M
R
 
N
I
 
E
A
 
N
S
 
P
L
 
I
-
 
Y
A
 
A
E
 
D
A
 
V
I
 
A
D
 
D
V
 
Y
P
 
N
M
 
V
I
 
T
A
 
A
I
 
V
D
 
N
D
 
A
P
 
A
A
 
T
L
 
L
I
 
-
A
 
-
P
 
P
Q
 
H
L
 
V
R
 
I
A
 
D
A
 
E
A
 
A
T
 
I
I
 
R
A
 
R
T
 
A
T
 
Y
Q
 
A
R
 
H
T
 
Q
P
 
G
V
 
V
V
 
A
V
 
V
T
 
V
L
 
Q
D
 
I
A
 
P
V
|
V
A
 
D
M
 
L
E
 
P
R
 
W
E
 
Q
A
 
Q
T
 
I
P
 
P
S
 
A
D
 
E
P
 
D
S
 
W
A
 
Y
P
 
A
P
 
S
T
 
A
T
 
N
A
 
S
H
 
Y
E
 
Q
A
 
T
P
 
P
S
 
L
I
 
L
P
 
P
R
 
E
A
 
P
R
 
D
L
 
V
E
 
Q
A
 
A
A
 
V
I
 
T
D
 
R
L
 
L
V
 
T
R
 
Q
-
 
T
-
 
L
-
 
L
A
 
A
G
 
A
E
 
E
C
 
R
T
 
P
L
 
L
L
 
I
-
 
Y
-
 
Y
-
x
G
L
x
I
G
|
G
A
 
A
R
 
R
V
 
K
L
 
A
E
 
G
P
 
K
D
 
E
A
 
L
R
 
E
A
 
Q
L
 
L
A
 
S
R
 
K
A
 
T
I
 
-
A
 
-
D
 
-
D
 
-
T
 
-
G
 
-
L
 
L
R
 
K
L
 
I
-
 
P
L
 
L
A
 
M
E
 
S
T
|
T
F
x
Y
P
 
P
A
 
A
S
 
K
-
 
G
-
 
I
-
 
V
-
 
A
H
 
D
R
 
R
Y
 
Y
G
 
P
E
 
A
G
 
Y
A
 
L
G
 
G
R
 
S
I
x
A
E
 
N
R
|
R
L
x
V
A
 
A
Y
 
Q
L
 
K
P
 
P
L
 
-
M
 
-
A
 
A
R
 
N
P
 
E
Q
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
Q
A
 
A
R
 
D
S
 
V
V
 
V
L
 
L
V
 
F
L
 
V
G
|
G
T
x
N
D
x
N
A
x
Y
P
|
P
S
x
F
A
 
A
W
x
E
F
 
V
A
 
S
H
 
K
L
 
A
E
 
F
Q
 
K
D
 
N
P
 
T
R
 
R
L
 
Y
W
 
F

Sites not aligning to the query:

4feeA High-resolution structure of pyruvate oxidase in complex with reaction intermediate 2-hydroxyethyl-thiamin diphosphate carbanion-enamine, crystal b (see paper)
27% identity, 55% coverage: 11:287/506 of query aligns to 13:294/586 of 4feeA

query
sites
4feeA
L
 
L
S
 
E
D
 
A
L
 
W
G
 
G
V
 
V
G
 
D
V
 
H
V
 
L
F
 
Y
A
 
G
N
 
I
P
 
P
G
 
G
T
 
G
S
 
S
E
 
I
L
 
N
V
 
S
L
 
I
V
 
M
D
 
D
A
 
A
L
 
L
-
 
S
-
 
A
E
 
E
R
 
R
R
 
D
G
 
R
P
 
I
R
 
H
P
 
Y
I
 
I
L
 
Q
V
 
V
T
 
R
H
 
H
E
 
E
L
 
E
V
 
V
A
 
G
M
 
A
G
 
M
A
 
A
A
 
A
D
 
A
A
 
A
H
 
D
G
 
A
R
 
K
L
 
L
-
 
T
G
 
G
R
 
K
L
 
I
G
 
G
A
 
V
A
 
C
L
 
F
V
 
G
H
 
S
L
 
A
G
 
G
P
 
P
G
 
G
L
 
G
S
 
T
N
 
H
G
 
L
L
 
M
A
 
N
F
 
G
V
 
L
H
 
Y
D
 
D
A
 
A
R
 
R
R
 
E
A
 
D
H
|
H
T
 
V
P
 
P
M
 
V
L
 
L
V
 
A
L
 
L
V
 
I
G
 
G
E
 
Q
H
 
F
P
 
G
R
 
T
S
 
T
H
 
G
R
 
M
A
 
N
L
 
M
D
 
D
T
 
T
P
 
F
L
 
Q
T
 
E
M
 
M
R
 
N
I
 
E
A
 
N
S
 
P
L
 
I
-
 
Y
A
 
A
E
 
D
A
 
V
I
 
A
D
 
D
V
 
Y
P
 
N
M
 
V
I
 
T
A
 
A
I
 
V
D
 
N
D
 
A
P
 
A
A
 
T
L
 
L
I
 
-
A
 
-
P
 
P
Q
 
H
L
 
V
R
 
I
A
 
D
A
 
E
A
 
A
T
 
I
I
 
R
A
 
R
T
 
A
T
 
Y
Q
 
A
R
 
H
T
 
Q
P
 
G
V
 
V
V
 
A
V
 
V
T
 
V
L
 
Q
D
 
I
A
 
P
V
 
V
A
 
D
M
 
L
E
 
P
R
 
W
E
 
Q
A
 
Q
T
 
I
P
 
P
S
 
A
D
 
E
P
 
D
S
 
W
A
 
Y
P
 
A
P
 
S
T
 
A
T
 
N
A
 
S
H
 
Y
E
 
Q
A
 
T
P
 
P
S
 
L
I
 
L
P
 
P
R
 
E
A
 
P
R
 
D
L
 
V
E
 
Q
A
 
A
A
 
V
I
 
T
D
 
R
L
 
L
V
 
T
R
 
Q
-
 
T
-
 
L
-
 
L
A
 
A
G
 
A
E
 
E
C
 
R
T
 
P
L
 
L
L
 
I
-
 
Y
-
 
Y
-
x
G
L
x
I
G
|
G
A
 
A
R
 
R
V
 
K
L
 
A
E
 
G
P
 
K
D
 
E
A
 
L
R
 
E
A
 
Q
L
 
L
A
 
S
R
 
K
A
 
T
I
 
-
A
 
-
D
 
-
D
 
-
T
 
-
G
 
-
L
 
L
R
 
K
L
 
I
-
 
P
L
 
L
A
 
M
E
 
S
T
|
T
F
x
Y
P
|
P
A
 
A
S
 
K
-
 
G
-
 
I
-
 
V
-
 
A
H
 
D
R
 
R
Y
 
Y
G
 
P
E
 
A
G
 
Y
A
 
L
G
 
G
R
 
S
I
x
A
E
x
N
R
|
R
L
x
V
A
 
A
Y
 
Q
L
 
K
P
 
P
L
 
-
M
 
-
A
 
A
R
 
N
P
 
E
Q
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
Q
A
 
A
R
 
D
S
 
V
V
 
V
L
 
L
V
 
F
L
 
V
G
|
G
T
x
N
D
x
N
A
 
Y
P
|
P
S
x
F
A
 
A
W
 
E
F
 
V
A
 
S
H
 
K
L
 
A
E
 
F
Q
 
K
D
 
N
P
 
T
R
 
R
L
 
Y
W
 
F

Sites not aligning to the query:

1ozfA The crystal structure of klebsiella pneumoniae acetolactate synthase with enzyme-bound cofactors (see paper)
25% identity, 97% coverage: 2:492/506 of query aligns to 6:517/545 of 1ozfA

query
sites
1ozfA
N
 
H
G
 
G
A
 
A
E
 
D
L
 
L
A
 
V
A
 
V
L
 
S
T
 
Q
L
 
L
S
 
E
D
 
A
L
 
Q
G
 
G
V
 
V
G
 
R
V
 
Q
V
 
V
F
 
F
A
 
G
N
x
I
P
 
P
G
|
G
T
x
A
S
x
K
E
x
I
L
 
D
V
 
K
L
 
V
V
 
F
D
 
D
A
 
S
L
 
L
E
 
L
R
 
D
R
 
S
G
 
S
P
 
I
R
 
R
P
 
I
I
 
I
L
 
P
V
 
V
T
 
R
H
 
H
E
|
E
L
 
A
V
 
N
A
 
A
M
 
A
G
 
F
A
 
M
A
 
A
D
 
A
A
 
A
H
 
V
G
 
G
R
 
R
L
 
I
-
 
T
G
 
G
R
 
K
L
 
A
G
 
G
A
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
H
x
T
L
 
S
G
 
G
P
 
P
G
 
G
L
 
C
S
 
S
N
 
N
G
 
L
L
 
I
A
 
T
F
 
G
V
 
M
H
 
A
D
 
T
A
 
A
R
 
N
R
 
S
A
 
E
H
 
G
T
 
D
P
 
P
M
 
V
L
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
G
G
 
G
E
 
A
H
 
V
P
 
K
R
 
R
S
 
A
H
 
D
R
 
K
A
 
A
L
 
K
D
 
Q
T
 
V
P
x
H
L
x
Q
T
x
S
M
 
M
R
 
D
I
 
T
A
 
V
S
 
A
L
 
M
A
 
F
E
 
S
A
 
P
I
 
V
D
 
T
V
 
K
P
 
Y
M
 
A
I
 
I
A
 
E
I
 
V
D
 
T
D
 
A
P
 
P
A
 
D
L
 
A
I
 
L
A
 
A
P
 
E
Q
 
V
L
 
V
R
 
S
A
 
N
A
 
A
A
 
F
T
 
R
I
 
A
A
 
A
T
 
E
T
 
Q
Q
 
G
R
 
R
-
 
P
T
 
G
P
 
S
V
 
A
V
 
F
V
 
V
T
 
S
L
 
L
D
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
-
M
 
-
E
 
-
R
 
-
E
 
-
A
 
-
T
 
-
P
 
P
S
x
Q
D
 
D
P
 
V
S
 
V
A
 
D
P
 
G
P
 
P
T
 
V
T
 
S
A
 
G
H
 
K
E
 
V
A
 
L
P
 
P
S
 
A
I
 
-
P
 
P
R
 
Q
-
 
M
-
 
G
A
 
A
R
 
A
L
 
P
E
 
D
A
 
D
A
 
A
I
 
I
D
 
D
L
 
Q
V
 
V
-
 
A
-
 
K
-
 
L
-
 
I
-
 
A
R
 
Q
A
 
A
G
 
K
E
 
N
C
 
P
T
 
I
L
 
F
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
L
R
 
M
V
 
A
L
 
S
E
 
Q
P
 
P
D
 
E
A
 
-
R
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
I
 
-
A
 
-
D
 
N
D
 
S
T
 
K
G
 
A
L
 
L
R
 
R
L
 
R
L
 
L
A
 
L
E
 
E
T
 
T
-
 
S
-
 
H
F
 
I
P
 
P
A
 
V
S
 
T
H
 
S
R
 
T
Y
 
Y
G
 
-
E
 
Q
G
 
A
A
 
A
G
 
G
R
 
A
I
 
V
E
 
N
R
 
Q
L
 
D
A
 
N
Y
 
F
L
 
S
P
 
R
L
 
F
M
 
A
A
x
G
R
|
R
P
 
V
Q
 
G
L
|
L
A
 
F
T
 
N
A
 
N
R
x
Q
S
 
A
-
 
G
-
 
D
-
 
R
V
 
L
L
 
L
V
 
Q
L
 
L
G
 
A
T
 
D
D
 
L
A
 
V
P
 
I
S
 
C
A
 
I
W
 
G
F
 
Y
A
 
S
H
 
P
L
 
V
E
 
E
Q
 
Y
D
x
E
P
 
P
R
 
A
L
 
M
W
 
W
P
 
N
L
 
S
A
 
G
-
 
N
A
 
A
P
 
T
L
 
L
V
 
V
R
 
H
L
 
I
D
 
D
-
 
V
-
 
L
-
 
P
-
 
A
-
 
Y
-
 
E
G
 
E
Q
 
R
D
 
N
E
 
Y
D
 
T
P
 
P
R
 
D
V
 
V
-
 
E
-
 
L
-
 
V
-
 
G
-
 
D
-
 
I
-
 
A
-
 
G
V
 
T
L
 
L
E
 
N
H
 
K
L
 
L
A
 
A
K
 
Q
A
 
N
L
 
I
G
 
D
V
 
H
T
 
R
P
 
L
A
 
V
P
 
L
P
 
S
P
 
P
T
 
Q
S
 
A
Q
 
A
P
 
E
I
 
I
P
 
L
A
 
R
P
 
D
D
x
R
P
 
Q
H
 
H
A
 
Q
A
 
R
-
 
E
-
 
L
L
 
L
D
 
D
-
 
R
-
 
R
G
 
G
S
 
A
T
 
Q
L
 
L
A
 
N
A
 
Q
V
 
F
-
 
A
-
 
L
-
 
H
-
 
P
-
 
L
-
 
R
I
 
I
A
 
V
R
 
R
A
 
A
V
 
M
Q
 
Q
A
 
-
D
 
-
D
 
D
V
 
I
V
 
V
I
 
N
D
 
S
E
 
D
A
 
V
R
 
T
T
 
L
A
 
T
A
 
V
P
 
D
A
x
M
L
x
G
Y
x
S
E
x
F
Q
 
H
L
 
I
A
 
W
D
 
I
A
 
A
R
|
R
-
 
Y
-
x
L
-
x
Y
-
 
T
-
 
F
-
 
R
-
 
A
R
 
R
H
 
Q
H
 
V
Y
 
M
I
 
I
G
 
S
H
 
N
P
 
G
G
 
Q
G
x
Q
A
 
T
I
x
M
G
 
G
E
 
V
G
 
A
A
 
L
S
 
P
L
 
W
A
 
A
L
 
I
G
 
G
A
 
A
A
 
W
T
 
L
L
 
V
G
 
N
-
 
P
-
 
E
A
 
R
S
 
K
V
 
V
L
 
V
A
 
S
V
 
V
V
 
S
A
x
G
D
|
D
G
|
G
G
 
G
F
 
F
L
 
L
Y
 
Q
A
 
S
P
 
S
Q
 
M
A
 
E
I
 
L
W
 
E
T
 
T
M
 
A
V
 
V
R
 
R
E
 
L
H
 
K
L
 
A
D
 
N
V
 
V
T
 
L
V
 
H
V
 
L
L
 
I
A
 
W
V
 
V
N
x
D
G
 
N
G
|
G
Y
|
Y
R
x
N
I
x
M
L
x
V
E
 
A
I
 
I
E
x
Q
-
 
E
-
 
E
-
 
K
-
 
K
-
 
Y
Q
 
Q
T
 
R
I
 
L
A
 
S
G
 
G
L
 
V
D
 
E
L
 
F
H
 
G
P
 
P
E
 
-
L
 
-
T
 
-
R
 
-
L
 
-
D
 
-
D
 
-
P
 
-
G
 
-
W
 
M
D
 
D
F
 
F
A
 
K
G
 
A
L
 
Y
A
 
A
A
 
E
A
 
S
M
 
F
G
 
G
A
 
A
R
 
K
T
 
G
T
 
F
T
 
A
A
 
V
T
 
E
T
 
S
V
 
A
A
 
E
E
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
P
A
 
T
L
 
L
R
 
R

Sites not aligning to the query:

6a50A Structure of benzoylformate decarboxylases in complex with cofactor tpp
26% identity, 30% coverage: 354:505/506 of query aligns to 371:525/527 of 6a50A

query
sites
6a50A
V
 
I
V
 
Y
I
 
L
D
 
N
E
 
E
A
 
S
R
x
T
T
x
S
A
 
T
A
 
T
P
 
A
A
 
Q
L
 
M
Y
 
W
E
 
Q
Q
 
R
L
 
L
A
 
N
D
 
M
A
 
R
R
 
N
R
 
P
H
 
G
H
 
S
Y
 
Y
I
 
Y
G
 
F
H
 
C
P
 
A
G
 
A
G
|
G
A
 
G
I
x
L
G
 
G
E
 
F
G
 
A
A
 
L
S
 
P
L
 
A
A
 
A
L
 
I
G
 
G
A
 
V
-
 
Q
-
 
L
A
 
A
T
 
E
L
 
P
G
 
E
A
 
R
S
 
Q
V
 
V
L
 
I
A
 
A
V
 
V
V
 
I
A
x
G
D
|
D
G
|
G
G
x
S
F
 
A
L
 
N
Y
|
Y
A
 
S
P
 
I
Q
 
S
A
 
A
I
 
L
W
 
W
T
 
T
M
 
A
V
 
A
R
 
Q
E
 
Y
H
 
N
L
 
I
D
 
P
V
 
T
T
 
I
V
 
F
V
 
V
L
 
I
A
 
M
V
 
N
N
|
N
G
 
G
G
x
T
Y
|
Y
R
x
G
I
x
M
L
|
L
E
 
-
I
 
-
E
 
-
Q
 
R
T
 
W
I
 
F
A
 
A
G
 
G
L
 
V
D
 
L
L
 
E
H
 
A
P
 
E
E
 
N
L
 
V
T
 
P
R
 
G
L
 
L
D
 
D
D
 
V
P
 
P
G
 
G
W
 
I
D
 
D
F
 
F
A
 
R
G
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
K
A
 
G
M
 
Y
G
 
G
A
 
V
R
 
Q
T
 
A
T
 
L
T
 
K
A
 
A
T
 
D
T
 
N
V
 
L
A
 
E
E
 
Q
L
 
L
E
 
K
A
 
G
A
 
S
L
 
L
R
 
Q
D
 
E
-
 
A
-
 
L
-
 
S
-
 
A
R
 
K
H
 
G
G
 
P
V
 
V
H
 
L
V
 
I
I
 
E
V
 
V
A
 
S
T
 
T
V
 
V
S
 
S

Sites not aligning to the query:

1y9dD Pyruvate oxidase variant v265a from lactobacillus plantarum (see paper)
27% identity, 54% coverage: 11:284/506 of query aligns to 13:276/560 of 1y9dD

query
sites
1y9dD
L
 
L
S
 
E
D
 
A
L
 
W
G
 
G
V
 
V
G
 
D
V
 
H
V
 
L
F
 
Y
A
 
G
N
x
I
P
 
P
G
|
G
T
x
G
S
|
S
E
x
I
L
 
N
V
 
S
L
 
I
V
 
M
D
 
D
A
 
A
L
 
L
-
 
S
-
 
A
E
 
E
R
 
R
R
 
D
G
 
R
P
 
I
R
 
H
P
 
Y
I
 
I
L
 
Q
V
 
V
T
 
R
H
 
H
E
|
E
L
 
E
V
 
V
A
 
G
M
 
A
G
 
M
A
 
A
A
 
A
D
 
A
A
 
A
H
 
D
G
 
A
R
 
K
L
 
L
-
 
T
G
 
G
R
 
K
L
 
I
G
 
G
A
 
V
A
 
C
L
 
F
V
 
G
H
x
S
L
 
A
G
 
G
P
|
P
G
 
G
L
 
G
S
 
T
N
x
H
G
 
L
L
 
M
A
 
N
F
 
G
V
 
L
H
 
Y
D
 
D
A
 
A
R
 
R
R
 
E
A
 
D
H
 
H
T
 
V
P
 
P
M
 
V
L
 
L
V
 
A
L
 
L
V
 
I
G
 
G
E
 
Q
H
 
F
P
 
G
R
 
T
S
 
T
H
 
G
R
x
E
A
 
M
L
 
N
D
 
E
T
 
N
P
 
P
L
 
I
T
 
-
M
 
-
R
 
-
I
 
-
A
 
-
S
 
-
L
 
Y
A
 
A
E
 
D
A
 
V
I
 
A
D
 
D
V
 
Y
P
 
N
M
 
V
I
 
T
A
 
A
I
 
V
D
 
N
D
 
A
P
 
A
A
 
T
L
 
L
I
 
-
A
 
-
P
 
P
Q
 
H
L
 
V
R
 
I
A
 
D
A
 
E
A
 
A
T
 
I
I
 
R
A
 
R
T
 
A
T
 
Y
Q
 
A
R
 
H
T
 
Q
P
 
G
V
 
V
V
 
A
V
 
V
T
 
V
L
 
Q
D
 
I
A
 
P
V
|
V
A
 
D
M
 
L
E
 
P
R
 
W
E
 
Q
A
 
Q
T
 
I
P
 
P
S
 
A
D
 
E
P
 
D
-
 
W
-
 
Y
-
 
A
S
 
S
A
 
A
P
 
P
P
 
E
T
 
P
T
 
D
A
 
V
H
 
Q
E
 
A
A
 
V
P
 
T
S
 
R
I
 
L
P
 
T
R
 
Q
A
 
T
R
 
L
L
 
L
E
 
A
A
 
A
A
 
E
I
 
R
D
 
P
L
 
L
V
 
I
R
 
Y
A
 
Y
G
 
G
E
 
-
C
 
-
T
 
-
L
 
-
L
 
-
L
x
I
G
|
G
A
 
A
R
 
R
V
 
K
L
 
A
E
 
G
P
 
K
D
 
E
A
 
L
R
 
E
A
 
Q
L
 
L
A
 
S
R
 
K
A
 
T
I
 
-
A
 
-
D
 
-
D
 
-
T
 
-
G
 
-
L
 
L
R
 
K
L
 
I
-
 
P
L
 
L
A
 
M
E
 
S
T
|
T
F
 
Y
P
|
P
A
 
A
S
 
K
-
 
G
-
 
I
-
 
V
-
 
A
H
 
D
R
 
R
Y
 
Y
G
 
P
E
 
A
G
 
Y
A
 
L
G
 
G
R
 
S
I
 
A
E
 
N
R
|
R
L
 
A
A
 
A
Y
 
Q
L
 
K
P
 
P
L
 
-
M
 
-
A
 
A
R
 
N
P
 
E
Q
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
Q
A
 
A
R
 
D
S
 
V
V
 
V
L
 
L
V
 
F
L
 
V
G
|
G
T
x
N
D
x
N
A
 
Y
P
 
N
S
 
T
A
 
R
W
 
Y
F
 
F
A
 
L
H
 
Q
L
 
I
E
x
D
Q
x
I
D
 
D
P
 
P

Sites not aligning to the query:

3f6bX Crystal structure of benzoylformate decarboxylase in complex with the pyridyl inhibitor paa (see paper)
26% identity, 30% coverage: 354:505/506 of query aligns to 370:524/525 of 3f6bX

query
sites
3f6bX
V
 
I
V
 
Y
I
 
L
D
 
N
E
 
E
A
 
S
R
 
T
T
 
S
A
 
T
A
 
T
P
 
A
A
 
Q
L
 
M
Y
 
W
E
 
Q
Q
 
R
L
 
L
A
 
N
D
 
M
A
 
R
R
 
N
R
 
P
H
 
G
H
 
S
Y
 
Y
I
 
Y
G
 
F
H
 
C
P
 
A
G
 
A
G
|
G
A
 
G
I
 
L
G
 
G
E
 
F
G
 
A
A
 
L
S
 
P
L
 
A
A
 
A
L
 
I
G
 
G
A
 
V
-
 
Q
-
 
L
A
 
A
T
 
E
L
 
P
G
 
E
A
 
R
S
 
Q
V
 
V
L
 
I
A
 
A
V
 
V
V
 
I
A
 
G
D
|
D
G
 
G
G
 
S
F
 
A
L
 
N
Y
 
Y
A
 
S
P
 
I
Q
 
S
A
 
A
I
 
L
W
 
W
T
 
T
M
 
A
V
 
A
R
 
Q
E
 
Y
H
 
N
L
 
I
D
 
P
V
 
T
T
 
I
V
 
F
V
 
V
L
 
I
A
 
M
V
 
N
N
|
N
G
 
G
G
x
T
Y
|
Y
R
 
G
I
x
A
L
|
L
E
 
-
I
 
-
E
 
-
Q
 
R
T
 
W
I
 
F
A
 
A
G
 
G
L
 
V
D
 
L
L
 
E
H
 
A
P
 
E
E
 
N
L
 
V
T
 
P
R
 
G
L
 
L
D
 
D
D
 
V
P
 
P
G
 
G
W
 
I
D
 
D
F
 
F
A
 
R
G
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
K
A
 
G
M
 
Y
G
 
G
A
 
V
R
 
Q
T
 
A
T
 
L
T
 
K
A
 
A
T
 
D
T
 
N
V
 
L
A
 
E
E
 
Q
L
 
L
E
 
K
A
 
G
A
 
S
L
 
L
R
 
Q
D
 
E
-
 
A
-
 
L
-
 
S
-
 
A
R
 
K
H
 
G
G
 
P
V
 
V
H
 
L
V
 
I
I
 
E
V
 
V
A
 
S
T
 
T
V
 
V
S
|
S

Sites not aligning to the query:

5deiA Benzoylformate decarboxylase from pseudomonas putida
26% identity, 30% coverage: 354:505/506 of query aligns to 370:524/524 of 5deiA

query
sites
5deiA
V
 
I
V
 
Y
I
 
L
D
 
N
E
 
E
A
x
S
R
x
T
T
x
S
A
 
T
A
 
T
P
 
A
A
 
Q
L
 
M
Y
 
W
E
 
Q
Q
 
R
L
 
L
A
 
N
D
 
M
A
 
R
R
 
N
R
 
P
H
 
G
H
 
S
Y
 
Y
I
 
Y
G
 
F
H
 
C
P
 
A
G
 
A
G
|
G
A
 
G
I
x
L
G
 
G
E
 
F
G
 
A
A
 
L
S
 
P
L
 
A
A
 
A
L
 
I
G
 
G
A
 
V
-
 
Q
-
 
L
A
 
A
T
 
E
L
 
P
G
 
E
A
 
R
S
 
Q
V
 
V
L
 
I
A
 
A
V
 
V
V
 
I
A
x
G
D
|
D
G
|
G
G
x
S
F
 
A
L
 
N
Y
|
Y
A
 
S
P
 
I
Q
 
S
A
 
A
I
 
L
W
 
W
T
 
T
M
 
A
V
 
A
R
 
Q
E
 
Y
H
 
N
L
 
I
D
 
P
V
 
T
T
 
I
V
 
F
V
 
V
L
 
I
A
 
M
V
 
N
N
|
N
G
 
G
G
x
T
Y
|
Y
R
x
G
I
x
A
L
|
L
E
 
-
I
 
-
E
 
-
Q
 
R
T
 
W
I
x
F
A
 
A
G
 
G
L
 
V
D
 
L
L
 
E
H
 
A
P
 
E
E
 
N
L
 
V
T
 
P
R
 
G
L
 
L
D
 
D
D
 
V
P
 
P
G
 
G
W
 
I
D
 
D
F
 
F
A
 
R
G
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
K
A
 
G
M
 
Y
G
 
G
A
 
V
R
 
Q
T
 
A
T
 
L
T
 
K
A
 
A
T
 
D
T
 
N
V
 
L
A
 
E
E
 
Q
L
 
L
E
 
K
A
 
G
A
 
S
L
 
L
R
 
Q
D
 
E
-
 
A
-
 
L
-
 
S
-
 
A
R
 
K
H
 
G
G
 
P
V
 
V
H
 
L
V
 
I
I
 
E
V
 
V
A
 
S
T
 
T
V
 
V
S
|
S

Sites not aligning to the query:

3fsjX Crystal structure of benzoylformate decarboxylase in complex with the inhibitor mbp (see paper)
26% identity, 30% coverage: 354:505/506 of query aligns to 370:524/524 of 3fsjX

query
sites
3fsjX
V
 
I
V
 
Y
I
 
L
D
 
N
E
 
E
A
 
S
R
x
T
T
x
S
A
 
T
A
 
T
P
 
A
A
 
Q
L
 
M
Y
 
W
E
 
Q
Q
 
R
L
 
L
A
 
N
D
 
M
A
 
R
R
 
N
R
 
P
H
 
G
H
 
S
Y
 
Y
I
 
Y
G
x
F
H
 
C
P
 
A
G
 
A
G
|
G
A
 
G
I
x
L
G
 
G
E
 
F
G
 
A
A
 
L
S
 
P
L
 
A
A
 
A
L
 
I
G
 
G
A
 
V
-
 
Q
-
 
L
A
 
A
T
 
E
L
 
P
G
 
E
A
 
R
S
 
Q
V
 
V
L
 
I
A
 
A
V
 
V
V
 
I
A
x
G
D
|
D
G
|
G
G
x
S
F
 
A
L
 
N
Y
|
Y
A
 
S
P
 
I
Q
 
S
A
 
A
I
 
L
W
 
W
T
 
T
M
 
A
V
 
A
R
 
Q
E
 
Y
H
 
N
L
 
I
D
 
P
V
 
T
T
 
I
V
 
F
V
 
V
L
 
I
A
 
M
V
 
N
N
|
N
G
 
G
G
x
T
Y
|
Y
R
x
G
I
x
A
L
|
L
E
 
-
I
 
-
E
 
-
Q
 
R
T
 
W
I
x
F
A
 
A
G
 
G
L
 
V
D
 
L
L
 
E
H
 
A
P
 
E
E
 
N
L
 
V
T
 
P
R
 
G
L
 
L
D
 
D
D
 
V
P
 
P
G
 
G
W
 
I
D
 
D
F
 
F
A
 
R
G
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
K
A
 
G
M
 
Y
G
 
G
A
 
V
R
 
Q
T
 
A
T
 
L
T
 
K
A
 
A
T
 
D
T
 
N
V
 
L
A
 
E
E
 
Q
L
 
L
E
 
K
A
 
G
A
 
S
L
 
L
R
 
Q
D
 
E
-
 
A
-
 
L
-
 
S
-
 
A
R
 
K
H
 
G
G
 
P
V
 
V
H
 
L
V
 
I
I
 
E
V
 
V
A
 
S
T
 
T
V
|
V
S
|
S

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_015799002.1 NCBI__GCF_000023265.1:WP_015799002.1
MNGAELAALTLSDLGVGVVFANPGTSELVLVDALERRGPRPILVTHELVAMGAADAHGRL
GRLGAALVHLGPGLSNGLAFVHDARRAHTPMLVLVGEHPRSHRALDTPLTMRIASLAEAI
DVPMIAIDDPALIAPQLRAAATIATTQRTPVVVTLDAVAMEREATPSDPSAPPTTAHEAP
SIPRARLEAAIDLVRAGECTLLLGARVLEPDARALARAIADDTGLRLLAETFPASHRYGE
GAGRIERLAYLPLMARPQLATARSVLVLGTDAPSAWFAHLEQDPRLWPLAAPLVRLDGQD
EDPRVVLEHLAKALGVTPAPPPTSQPIPAPDPHAALDGSTLAAVIARAVQADDVVIDEAR
TAAPALYEQLADARRHHYIGHPGGAIGEGASLALGAATLGASVLAVVADGGFLYAPQAIW
TMVREHLDVTVVLAVNGGYRILEIEQTIAGLDLHPELTRLDDPGWDFAGLAAAMGARTTT
ATTVAELEAALRDRHGVHVIVATVSQ

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory