SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_015799638.1 NCBI__GCF_000022745.1:WP_015799638.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6cerD Human pyruvate dehydrogenase complex e1 component v138m mutation (see paper)
56% identity, 69% coverage: 136:455/461 of query aligns to 3:326/331 of 6cerD

query
sites
6cerD
V
 
L
S
 
Q
M
 
V
T
 
T
V
 
V
R
 
R
E
 
D
A
 
A
L
 
I
R
 
N
D
 
Q
A
 
G
M
 
M
A
 
D
E
 
E
E
 
E
M
 
L
R
 
E
R
 
R
D
 
D
P
 
E
D
 
K
V
 
V
F
 
F
I
 
L
M
 
L
G
 
G
E
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
A
Q
 
Q
Y
 
Y
Q
 
D
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
K
 
K
I
 
V
T
 
S
Q
 
R
G
 
G
L
 
L
L
 
W
D
 
K
E
 
K
F
 
Y
G
 
G
P
 
D
K
 
K
R
 
R
V
 
I
V
 
I
D
 
D
T
 
T
P
 
P
I
|
I
T
 
S
E
|
E
H
 
M
G
 
G
F
 
F
A
 
A
G
 
G
V
 
I
G
 
A
V
 
V
G
 
G
A
 
A
A
 
A
F
 
M
A
 
A
G
 
G
L
 
L
K
 
R
P
 
P
I
 
I
V
 
C
E
 
E
F
 
F
M
|
M
T
 
T
F
 
F
N
 
N
F
|
F
A
 
S
M
 
M
Q
 
Q
A
 
A
I
 
I
D
 
D
Q
 
Q
I
 
V
V
 
I
N
 
N
S
 
S
A
 
A
A
 
A
K
 
K
T
 
T
L
 
Y
Y
 
Y
V
 
M
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
L
M
 
Q
G
 
P
A
 
V
P
 
P
M
 
I
V
 
V
F
 
F
R
 
R
G
 
G
P
 
P
S
 
N
G
 
G
A
 
A
A
 
S
A
 
A
R
 
G
V
 
V
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
H
|
H
S
 
S
Q
 
Q
C
 
C
Y
 
F
A
 
A
A
 
A
W
 
W
Y
 
Y
S
 
G
H
 
H
I
 
C
P
 
P
G
 
G
L
 
L
K
 
K
V
 
V
V
 
V
M
 
S
P
 
P
Y
 
W
T
 
N
A
 
S
A
 
E
D
 
D
A
 
A
K
 
K
G
 
G
L
 
L
L
 
I
K
 
K
A
 
S
A
 
A
I
 
I
R
 
R
D
 
D
P
 
N
N
 
N
P
 
P
V
 
V
I
 
V
F
 
V
L
 
L
E
 
E
N
 
N
E
 
E
I
 
L
L
 
M
Y
 
Y
G
 
G
H
 
V
H
 
P
F
 
F
D
 
E
V
 
F
P
 
P
-
 
P
-
 
E
-
 
A
K
 
Q
L
 
S
D
 
K
D
 
D
F
 
F
V
 
L
L
 
I
P
 
P
I
 
I
G
 
G
K
 
K
A
 
A
R
 
K
I
 
I
H
 
E
K
 
R
Q
 
Q
G
 
G
K
 
T
D
 
H
A
 
I
T
 
T
I
 
V
V
 
V
S
 
S
F
 
H
G
 
S
I
 
R
G
 
P
M
 
V
T
 
G
Y
 
H
A
 
C
V
 
L
K
 
E
A
 
A
A
 
A
E
 
A
E
 
V
L
 
L
A
 
S
G
 
K
Q
 
E
G
 
G
I
 
V
D
 
E
V
 
C
E
 
E
I
 
V
I
 
I
D
 
N
L
 
M
R
 
R
T
 
T
I
 
I
R
 
R
P
 
P
M
 
M
D
 
D
I
 
M
P
 
E
T
 
T
V
 
I
V
 
E
E
 
A
S
 
S
V
 
V
K
 
M
K
 
K
T
 
T
G
 
N
R
 
H
L
 
L
V
 
V
T
 
T
V
 
V
E
 
E
E
 
G
G
 
G
F
 
W
P
 
P
Q
 
Q
S
 
F
S
 
G
V
 
V
G
 
G
T
 
A
E
 
E
I
 
I
A
 
C
T
 
A
R
 
R
V
 
I
M
 
M
Q
 
E
Q
 
G
-
 
P
A
 
A
F
 
F
D
 
N
Y
 
F
L
 
L
D
 
D
A
 
A
P
 
P
I
 
A
L
 
V
T
 
R
I
 
V
A
 
T
G
 
G
K
 
A
D
 
D
V
 
V
P
 
P
M
 
M
P
 
P
Y
 
Y
A
 
A
A
 
K
N
 
I
L
 
L
E
 
E
K
 
D
L
 
N
A
 
S
L
 
I
P
 
P
S
 
Q
V
 
V
A
 
K
E
 
D
V
 
I
V
 
I
E
 
F
A
 
A
V
 
I
K
 
K

6cfoB Human pyruvate dehydrogenase e1 component complex with covalent tdp adduct acetyl phosphinate (see paper)
56% identity, 69% coverage: 136:455/461 of query aligns to 2:325/330 of 6cfoB

query
sites
6cfoB
V
 
L
S
 
Q
M
 
V
T
 
T
V
 
V
R
 
R
E
 
D
A
 
A
L
 
I
R
 
N
D
 
Q
A
 
G
M
 
M
A
 
D
E
 
E
E
 
E
M
 
L
R
 
E
R
 
R
D
 
D
P
 
E
D
 
K
V
 
V
F
 
F
I
 
L
M
 
L
G
 
G
E
|
E
E
 
E
V
 
V
A
 
A
Q
 
Q
Y
 
Y
Q
 
D
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
K
 
K
I
 
V
T
 
S
Q
 
R
G
 
G
L
 
L
L
 
W
D
 
K
E
 
K
F
 
Y
G
 
G
P
 
D
K
 
K
R
 
R
V
 
I
V
 
I
D
 
D
T
 
T
P
 
P
I
|
I
T
 
S
E
|
E
H
 
M
G
 
G
F
 
F
A
 
A
G
 
G
V
 
I
G
 
A
V
 
V
G
 
G
A
 
A
A
 
A
F
 
M
A
 
A
G
 
G
L
 
L
K
 
R
P
 
P
I
 
I
V
 
C
E
 
E
F
 
F
M
 
M
T
 
T
F
 
F
N
 
N
F
|
F
A
 
S
M
 
M
Q
|
Q
A
 
A
I
 
I
D
 
D
Q
 
Q
I
 
V
V
 
I
N
 
N
S
 
S
A
 
A
A
 
A
K
 
K
T
 
T
L
 
Y
Y
 
Y
V
 
M
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
L
M
 
Q
G
 
P
A
 
V
P
 
P
M
 
I
V
 
V
F
 
F
R
 
R
G
 
G
P
 
P
S
 
N
G
 
G
A
 
A
A
 
S
A
 
A
R
 
G
V
 
V
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
H
|
H
S
 
S
Q
 
Q
C
 
C
Y
 
F
A
 
A
A
 
A
W
 
W
Y
 
Y
S
 
G
H
 
H
I
 
C
P
 
P
G
 
G
L
 
L
K
 
K
V
 
V
V
 
V
M
 
S
P
 
P
Y
 
W
T
 
N
A
 
S
A
 
E
D
 
D
A
 
A
K
 
K
G
 
G
L
 
L
L
 
I
K
 
K
A
 
S
A
 
A
I
 
I
R
 
R
D
 
D
P
 
N
N
 
N
P
 
P
V
 
V
I
 
V
F
 
V
L
 
L
E
 
E
N
 
N
E
 
E
I
 
L
L
 
M
Y
 
Y
G
 
G
H
 
V
H
 
P
F
 
F
D
 
E
V
 
F
P
 
P
-
 
P
-
 
E
-
 
A
K
 
Q
L
 
S
D
 
K
D
 
D
F
 
F
V
 
L
L
 
I
P
 
P
I
 
I
G
 
G
K
 
K
A
 
A
R
 
K
I
 
I
H
 
E
K
 
R
Q
 
Q
G
 
G
K
 
T
D
 
H
A
 
I
T
 
T
I
 
V
V
 
V
S
 
S
F
 
H
G
 
S
I
 
R
G
 
P
M
 
V
T
 
G
Y
 
H
A
 
C
V
 
L
K
 
E
A
 
A
A
 
A
E
 
A
E
 
V
L
 
L
A
 
S
G
 
K
Q
 
E
G
 
G
I
 
V
D
 
E
V
 
C
E
 
E
I
 
V
I
 
I
D
 
N
L
 
M
R
 
R
T
 
T
I
 
I
R
 
R
P
 
P
M
 
M
D
 
D
I
 
M
P
 
E
T
 
T
V
 
I
V
 
E
E
 
A
S
 
S
V
 
V
K
 
M
K
 
K
T
 
T
G
 
N
R
 
H
L
 
L
V
 
V
T
 
T
V
 
V
E
 
E
E
 
G
G
 
G
F
 
W
P
 
P
Q
 
Q
S
 
F
S
 
G
V
 
V
G
 
G
T
 
A
E
 
E
I
 
I
A
 
C
T
 
A
R
 
R
V
 
I
M
 
M
Q
 
E
Q
 
G
-
 
P
A
 
A
F
 
F
D
 
N
Y
 
F
L
 
L
D
 
D
A
 
A
P
 
P
I
 
A
L
 
V
T
 
R
I
 
V
A
 
T
G
 
G
K
 
A
D
 
D
V
 
V
P
 
P
M
 
M
P
 
P
Y
 
Y
A
 
A
A
 
K
N
 
I
L
 
L
E
 
E
K
 
D
L
 
N
A
 
S
L
 
I
P
 
P
S
 
Q
V
 
V
A
 
K
E
 
D
V
 
I
V
 
I
E
 
F
A
 
A
V
 
I
K
 
K

P11177 Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit beta, mitochondrial; PDHE1-B; EC 1.2.4.1 from Homo sapiens (Human) (see 8 papers)
56% identity, 69% coverage: 136:455/461 of query aligns to 31:354/359 of P11177

query
sites
P11177
V
x
L
S
 
Q
M
 
V
T
 
T
V
 
V
R
 
R
E
 
D
A
 
A
L
 
I
R
 
N
D
 
Q
A
 
G
M
 
M
A
 
D
E
 
E
E
 
E
M
 
L
R
 
E
R
 
R
D
 
D
P
 
E
D
 
K
V
 
V
F
 
F
I
 
L
M
 
L
G
 
G
E
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
A
Q
 
Q
Y
 
Y
Q
 
D
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
K
 
K
I
 
V
T
 
S
Q
 
R
G
 
G
L
 
L
L
 
W
D
 
K
E
 
K
F
 
Y
G
 
G
P
 
D
K
 
K
R
 
R
V
 
I
V
 
I
D
 
D
T
 
T
P
 
P
I
 
I
T
 
S
E
|
E
H
 
M
G
 
G
F
 
F
A
 
A
G
 
G
V
 
I
G
 
A
V
 
V
G
 
G
A
 
A
A
 
A
F
 
M
A
 
A
G
 
G
L
 
L
K
 
R
P
 
P
I
 
I
V
 
C
E
 
E
F
 
F
M
 
M
T
 
T
F
 
F
N
 
N
F
 
F
A
 
S
M
 
M
Q
 
Q
A
 
A
I
 
I
D
 
D
Q
 
Q
I
 
V
V
 
I
N
 
N
S
 
S
A
 
A
A
 
A
K
 
K
T
 
T
L
 
Y
Y
 
Y
V
 
M
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
L
M
 
Q
G
 
P
A
 
V
P
 
P
M
x
I
V
 
V
F
 
F
R
 
R
G
 
G
P
 
P
S
 
N
G
 
G
A
 
A
A
 
S
A
 
A
R
 
G
V
 
V
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
H
 
H
S
 
S
Q
 
Q
C
 
C
Y
 
F
A
 
A
A
 
A
W
 
W
Y
 
Y
S
 
G
H
 
H
I
 
C
P
 
P
G
 
G
L
 
L
K
 
K
V
 
V
V
 
V
M
 
S
P
 
P
Y
 
W
T
 
N
A
 
S
A
 
E
D
 
D
A
 
A
K
 
K
G
 
G
L
 
L
L
 
I
K
 
K
A
 
S
A
|
A
I
|
I
R
 
R
D
|
D
P
 
N
N
|
N
P
 
P
V
 
V
I
 
V
F
 
V
L
 
L
E
 
E
N
 
N
E
 
E
I
 
L
L
 
M
Y
 
Y
G
 
G
H
 
V
H
 
P
F
 
F
D
 
E
V
 
F
P
 
P
-
 
P
-
 
E
-
 
A
K
 
Q
L
 
S
D
 
K
D
 
D
F
 
F
V
 
L
L
 
I
P
 
P
I
 
I
G
 
G
K
 
K
A
 
A
R
 
K
I
 
I
H
 
E
K
 
R
Q
 
Q
G
 
G
K
 
T
D
 
H
A
 
I
T
 
T
I
 
V
V
 
V
S
 
S
F
 
H
G
 
S
I
 
R
G
 
P
M
 
V
T
 
G
Y
 
H
A
 
C
V
 
L
K
 
E
A
 
A
A
 
A
E
 
A
E
 
V
L
 
L
A
 
S
G
 
K
Q
x
E
G
 
G
I
 
V
D
x
E
V
 
C
E
|
E
I
 
V
I
 
I
D
 
N
L
 
M
R
 
R
T
 
T
I
 
I
R
 
R
P
 
P
M
 
M
D
 
D
I
 
M
P
 
E
T
 
T
V
 
I
V
 
E
E
 
A
S
 
S
V
 
V
K
 
M
K
 
K
T
 
T
G
 
N
R
 
H
L
 
L
V
 
V
T
 
T
V
 
V
E
 
E
E
 
G
G
 
G
F
 
W
P
 
P
Q
 
Q
S
 
F
S
 
G
V
 
V
G
 
G
T
 
A
E
 
E
I
 
I
A
 
C
T
 
A
R
 
R
V
 
I
M
 
M
Q
 
E
Q
 
G
-
 
P
A
 
A
F
 
F
D
 
N
Y
 
F
L
 
L
D
|
D
A
 
A
P
 
P
I
 
A
L
 
V
T
 
R
I
 
V
A
 
T
G
 
G
K
 
A
D
 
D
V
 
V
P
 
P
M
 
M
P
 
P
Y
 
Y
A
 
A
A
 
K
N
 
I
L
 
L
E
 
E
K
 
D
L
 
N
A
 
S
L
 
I
P
 
P
S
 
Q
V
 
V
A
 
K
E
 
D
V
 
I
V
 
I
E
 
F
A
 
A
V
 
I
K
 
K

Sites not aligning to the query:

Q5SLR3 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta; Branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component beta chain; BCKDH E1-beta; EC 1.2.4.4 from Thermus thermophilus (strain ATCC 27634 / DSM 579 / HB8) (see paper)
43% identity, 70% coverage: 135:455/461 of query aligns to 1:319/324 of Q5SLR3

query
sites
Q5SLR3
M
 
M
V
 
A
S
 
L
M
 
M
T
 
T
V
 
M
R
 
V
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
R
 
N
D
 
R
A
 
A
M
 
L
A
 
D
E
 
E
E
 
E
M
 
M
R
 
A
R
 
K
D
 
D
P
 
P
D
 
R
V
 
V
F
 
V
I
 
V
M
 
L
G
 
G
E
|
E
E
 
D
V
 
V
A
 
G
Q
 
K
Y
 
R
Q
 
G
G
 
G
A
 
V
Y
 
F
K
 
L
I
 
V
T
 
T
Q
 
E
G
 
G
L
 
L
L
 
L
D
 
Q
E
 
K
F
 
Y
G
 
G
P
 
P
K
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
M
D
 
D
T
 
T
P
 
P
I
 
L
T
 
S
E
 
E
H
 
A
G
 
A
F
 
I
A
 
V
G
 
G
V
 
A
G
 
A
V
 
L
G
 
G
A
 
M
A
 
A
F
 
A
A
 
H
G
 
G
L
 
L
K
 
R
P
 
P
I
 
V
V
 
A
E
 
E
F
 
I
M
x
Q
T
 
F
F
 
A
N
 
D
F
 
Y
A
 
I
M
 
F
Q
 
P
A
 
G
I
 
F
D
 
D
Q
 
Q
I
 
L
V
 
V
N
 
S
S
 
Q
A
 
V
A
 
A
K
 
K
T
 
L
L
 
R
Y
 
Y
V
 
R
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
M
 
F
G
 
T
A
 
A
P
 
P
M
 
L
V
 
V
F
 
V
R
 
R
G
 
M
P
 
P
S
 
S
G
 
G
A
 
G
A
 
G
A
 
V
R
 
R
V
 
G
A
 
G
A
 
H
Q
 
H
H
 
H
S
 
S
Q
 
Q
C
 
S
Y
 
P
A
 
E
A
 
A
W
 
H
Y
 
F
S
 
V
H
 
H
I
 
T
P
 
A
G
 
G
L
 
L
K
 
K
V
 
V
V
 
V
M
 
A
P
 
V
Y
 
S
T
 
T
A
 
P
A
 
Y
D
 
D
A
 
A
K
 
K
G
 
G
L
 
L
L
 
L
K
 
K
A
 
A
A
 
A
I
 
I
R
 
R
D
 
D
P
 
E
N
 
D
P
 
P
V
 
V
I
 
V
F
 
F
L
 
L
E
 
E
N
 
P
E
 
K
I
 
R
L
 
L
Y
 
Y
G
 
R
H
 
S
-
 
V
H
 
K
F
 
E
D
 
E
V
 
V
P
 
P
K
 
E
L
 
-
D
 
E
D
 
D
F
 
Y
V
 
T
L
 
L
P
 
P
I
 
I
G
 
G
K
 
K
A
 
A
R
 
A
I
 
L
H
 
R
K
 
R
Q
 
E
G
 
G
K
 
K
D
 
D
A
 
L
T
 
T
I
 
L
V
 
I
S
 
G
F
 
Y
G
 
G
I
 
T
G
 
V
M
 
M
T
 
P
Y
 
E
A
 
V
V
 
L
K
 
Q
A
 
A
A
 
A
E
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
K
Q
 
A
G
 
G
I
 
V
D
 
S
V
 
A
E
 
E
I
 
V
I
 
L
D
 
D
L
 
L
R
 
R
T
 
T
I
 
L
R
 
M
P
 
P
M
 
W
D
 
D
I
 
Y
P
 
E
T
 
A
V
 
V
V
 
M
E
 
N
S
 
S
V
 
V
K
 
A
K
 
K
T
 
T
G
 
G
R
 
R
L
 
V
V
 
V
T
 
L
V
 
V
E
 
S
E
 
D
G
 
A
F
 
P
P
 
R
Q
 
H
S
 
A
S
 
S
V
 
F
G
 
V
T
 
S
E
 
E
I
 
V
A
 
A
T
 
A
R
 
T
V
 
I
M
 
A
Q
 
E
Q
 
D
A
 
L
F
 
L
D
 
D
Y
 
M
L
 
L
D
 
L
A
 
A
P
 
P
I
 
P
L
 
I
T
 
R
I
 
V
A
 
T
G
 
G
K
 
F
D
 
D
V
 
T
P
 
P
M
 
Y
P
 
P
Y
 
Y
A
 
A
A
 
Q
N
 
D
L
 
-
E
 
-
K
 
K
L
 
L
A
 
Y
L
 
L
P
 
P
S
 
T
V
 
V
A
 
T
E
 
R
V
 
I
V
 
L
E
 
N
A
 
A
V
 
A
K
 
K

1umdD Branched-chain 2-oxo acid dehydrogenase (e1) from thermus thermophilus hb8 with 4-methyl-2-oxopentanoate as an intermediate (see paper)
44% identity, 69% coverage: 138:455/461 of query aligns to 3:318/323 of 1umdD

query
sites
1umdD
M
 
M
T
 
T
V
 
M
R
 
V
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
R
 
N
D
 
R
A
 
A
M
 
L
A
 
D
E
 
E
E
 
E
M
 
M
R
 
A
R
 
K
D
 
D
P
 
P
D
 
R
V
 
V
F
 
V
I
 
V
M
 
L
G
 
G
E
|
E
E
 
D
V
 
V
A
 
G
Q
 
K
Y
 
R
Q
 
G
G
 
G
A
 
V
Y
 
F
K
 
L
I
 
V
T
 
T
Q
 
E
G
 
G
L
 
L
L
 
L
D
 
Q
E
 
K
F
 
Y
G
 
G
P
 
P
K
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
M
D
 
D
T
 
T
P
 
P
I
x
L
T
 
S
E
|
E
H
 
A
G
 
A
F
 
I
A
 
V
G
 
G
V
 
A
G
 
A
V
 
L
G
 
G
A
 
M
A
 
A
F
 
A
A
 
H
G
 
G
L
 
L
K
 
R
P
 
P
I
 
V
V
 
A
E
 
E
F
 
I
M
x
Q
T
 
F
F
 
A
N
 
D
F
x
Y
A
 
I
M
 
F
Q
x
P
A
 
G
I
 
F
D
 
D
Q
 
Q
I
 
L
V
 
V
N
 
S
S
 
Q
A
 
V
A
 
A
K
 
K
T
 
L
L
 
R
Y
 
Y
V
 
R
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
M
 
F
G
 
T
A
 
A
P
 
P
M
 
L
V
 
V
F
 
V
R
 
R
G
 
M
P
 
P
S
 
S
G
 
G
A
 
G
A
 
G
A
 
V
R
 
R
V
 
G
A
 
G
A
 
H
Q
 
H
H
|
H
S
 
S
Q
 
Q
C
 
S
Y
 
P
A
 
E
A
 
A
W
 
H
Y
 
F
S
 
V
H
 
H
I
 
T
P
 
A
G
 
G
L
 
L
K
 
K
V
 
V
V
 
V
M
 
A
P
 
V
Y
 
S
T
 
T
A
 
P
A
 
Y
D
 
D
A
 
A
K
 
K
G
 
G
L
 
L
L
 
L
K
 
K
A
 
A
A
 
A
I
 
I
R
 
R
D
 
D
P
 
E
N
 
D
P
 
P
V
 
V
I
 
V
F
 
F
L
 
L
E
 
E
N
 
P
E
 
K
I
 
R
L
 
L
Y
 
Y
G
 
R
H
 
S
-
 
V
H
 
K
F
 
E
D
 
E
V
 
V
P
 
P
K
 
E
L
 
-
D
 
E
D
 
D
F
 
Y
V
 
T
L
 
L
P
 
P
I
 
I
G
 
G
K
 
K
A
 
A
R
 
A
I
 
L
H
 
R
K
 
R
Q
 
E
G
 
G
K
 
K
D
 
D
A
 
L
T
 
T
I
 
L
V
 
I
S
 
C
F
 
Y
G
 
G
I
 
T
G
 
V
M
 
M
T
 
P
Y
 
E
A
 
V
V
 
L
K
 
Q
A
 
A
A
 
A
E
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
K
Q
 
A
G
 
G
I
 
V
D
 
S
V
 
A
E
 
E
I
 
V
I
 
L
D
 
D
L
 
L
R
 
R
T
 
T
I
 
L
R
 
M
P
 
P
M
 
W
D
 
D
I
 
Y
P
 
E
T
 
A
V
 
V
V
 
M
E
 
N
S
 
S
V
 
V
K
 
A
K
 
K
T
 
T
G
 
G
R
 
R
L
 
V
V
 
V
T
 
L
V
 
V
E
 
S
E
 
D
G
 
A
F
 
P
P
 
R
Q
 
H
S
 
A
S
 
S
V
 
F
G
 
V
T
 
S
E
 
E
I
 
V
A
 
A
T
 
A
R
 
T
V
 
I
M
 
A
Q
 
E
Q
 
D
A
 
L
F
 
L
D
 
D
Y
 
M
L
 
L
D
 
L
A
 
A
P
 
P
I
 
P
L
 
I
T
 
R
I
 
V
A
 
T
G
 
G
K
 
F
D
 
D
V
 
T
P
 
P
M
 
Y
P
 
P
Y
 
Y
A
 
A
A
 
Q
N
 
D
L
 
-
E
 
-
K
 
K
L
 
L
A
 
Y
L
 
L
P
 
P
S
 
T
V
 
V
A
 
T
E
 
R
V
 
I
V
 
L
E
 
N
A
 
A
V
 
A
K
 
K

1umcD Branched-chain 2-oxo acid dehydrogenase (e1) from thermus thermophilus hb8 with 4-methylpentanoate (see paper)
44% identity, 69% coverage: 138:455/461 of query aligns to 3:318/323 of 1umcD

query
sites
1umcD
M
 
M
T
 
T
V
 
M
R
 
V
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
R
 
N
D
 
R
A
 
A
M
 
L
A
 
D
E
 
E
E
 
E
M
 
M
R
 
A
R
 
K
D
 
D
P
 
P
D
 
R
V
 
V
F
 
V
I
 
V
M
 
L
G
 
G
E
|
E
E
 
D
V
 
V
A
 
G
Q
 
K
Y
 
R
Q
 
G
G
 
G
A
 
V
Y
 
F
K
 
L
I
 
V
T
 
T
Q
 
E
G
 
G
L
 
L
L
 
L
D
 
Q
E
 
K
F
 
Y
G
 
G
P
 
P
K
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
M
D
 
D
T
 
T
P
 
P
I
x
L
T
 
S
E
|
E
H
 
A
G
 
A
F
 
I
A
 
V
G
 
G
V
 
A
G
 
A
V
 
L
G
 
G
A
 
M
A
 
A
F
 
A
A
 
H
G
 
G
L
 
L
K
 
R
P
 
P
I
 
V
V
 
A
E
 
E
F
 
I
M
 
Q
T
 
F
F
 
A
N
 
D
F
x
Y
A
 
I
M
 
F
Q
x
P
A
 
G
I
 
F
D
 
D
Q
 
Q
I
 
L
V
 
V
N
 
S
S
 
Q
A
 
V
A
 
A
K
 
K
T
 
L
L
 
R
Y
 
Y
V
 
R
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
M
 
F
G
 
T
A
 
A
P
 
P
M
 
L
V
 
V
F
 
V
R
 
R
G
 
M
P
 
P
S
 
S
G
 
G
A
 
G
A
 
G
A
 
V
R
 
R
V
 
G
A
 
G
A
 
H
Q
x
H
H
|
H
S
 
S
Q
 
Q
C
 
S
Y
 
P
A
 
E
A
 
A
W
 
H
Y
 
F
S
 
V
H
 
H
I
 
T
P
 
A
G
 
G
L
 
L
K
 
K
V
 
V
V
 
V
M
 
A
P
 
V
Y
 
S
T
 
T
A
 
P
A
 
Y
D
 
D
A
 
A
K
 
K
G
 
G
L
 
L
L
 
L
K
 
K
A
 
A
A
 
A
I
 
I
R
 
R
D
 
D
P
 
E
N
 
D
P
 
P
V
 
V
I
 
V
F
 
F
L
 
L
E
 
E
N
 
P
E
 
K
I
 
R
L
 
L
Y
 
Y
G
 
R
H
 
S
-
 
V
H
 
K
F
 
E
D
 
E
V
 
V
P
 
P
K
 
E
L
 
-
D
 
E
D
 
D
F
 
Y
V
 
T
L
 
L
P
 
P
I
 
I
G
 
G
K
 
K
A
 
A
R
 
A
I
 
L
H
 
R
K
 
R
Q
 
E
G
 
G
K
 
K
D
 
D
A
 
L
T
 
T
I
 
L
V
 
I
S
 
C
F
 
Y
G
 
G
I
 
T
G
 
V
M
 
M
T
 
P
Y
 
E
A
 
V
V
 
L
K
 
Q
A
 
A
A
 
A
E
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
K
Q
 
A
G
 
G
I
 
V
D
 
S
V
 
A
E
 
E
I
 
V
I
 
L
D
 
D
L
 
L
R
 
R
T
 
T
I
 
L
R
 
M
P
 
P
M
 
W
D
 
D
I
 
Y
P
 
E
T
 
A
V
 
V
V
 
M
E
 
N
S
 
S
V
 
V
K
 
A
K
 
K
T
 
T
G
 
G
R
 
R
L
 
V
V
 
V
T
 
L
V
 
V
E
 
S
E
 
D
G
 
A
F
 
P
P
 
R
Q
 
H
S
 
A
S
 
S
V
 
F
G
 
V
T
 
S
E
 
E
I
 
V
A
 
A
T
 
A
R
 
T
V
 
I
M
 
A
Q
 
E
Q
 
D
A
 
L
F
 
L
D
 
D
Y
 
M
L
 
L
D
 
L
A
 
A
P
 
P
I
 
P
L
 
I
T
 
R
I
 
V
A
 
T
G
 
G
K
 
F
D
 
D
V
 
T
P
 
P
M
 
Y
P
 
P
Y
 
Y
A
 
A
A
 
Q
N
 
D
L
 
-
E
 
-
K
 
K
L
 
L
A
 
Y
L
 
L
P
 
P
S
 
T
V
 
V
A
 
T
E
 
R
V
 
I
V
 
L
E
 
N
A
 
A
V
 
A
K
 
K

1umbD Branched-chain 2-oxo acid dehydrogenase (e1) from thermus thermophilus hb8 in holo-form (see paper)
44% identity, 69% coverage: 138:455/461 of query aligns to 3:318/323 of 1umbD

query
sites
1umbD
M
 
M
T
 
T
V
 
M
R
 
V
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
R
 
N
D
 
R
A
 
A
M
 
L
A
 
D
E
 
E
E
 
E
M
 
M
R
 
A
R
 
K
D
 
D
P
 
P
D
 
R
V
 
V
F
 
V
I
 
V
M
 
L
G
 
G
E
|
E
E
 
D
V
 
V
A
 
G
Q
 
K
Y
 
R
Q
 
G
G
 
G
A
 
V
Y
 
F
K
 
L
I
 
V
T
 
T
Q
 
E
G
 
G
L
 
L
L
 
L
D
 
Q
E
 
K
F
 
Y
G
 
G
P
 
P
K
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
M
D
 
D
T
 
T
P
 
P
I
x
L
T
 
S
E
|
E
H
 
A
G
 
A
F
 
I
A
 
V
G
 
G
V
 
A
G
 
A
V
 
L
G
 
G
A
 
M
A
 
A
F
 
A
A
 
H
G
 
G
L
 
L
K
 
R
P
 
P
I
 
V
V
 
A
E
 
E
F
 
I
M
 
Q
T
 
F
F
 
A
N
 
D
F
x
Y
A
 
I
M
 
F
Q
x
P
A
 
G
I
 
F
D
 
D
Q
 
Q
I
 
L
V
 
V
N
 
S
S
 
Q
A
 
V
A
 
A
K
 
K
T
 
L
L
 
R
Y
 
Y
V
 
R
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
M
 
F
G
 
T
A
 
A
P
 
P
M
 
L
V
 
V
F
 
V
R
 
R
G
 
M
P
 
P
S
 
S
G
 
G
A
 
G
A
 
G
A
 
V
R
 
R
V
 
G
A
 
G
A
 
H
Q
 
H
H
|
H
S
 
S
Q
 
Q
C
 
S
Y
 
P
A
 
E
A
 
A
W
 
H
Y
 
F
S
 
V
H
 
H
I
 
T
P
 
A
G
 
G
L
 
L
K
 
K
V
 
V
V
 
V
M
 
A
P
 
V
Y
 
S
T
 
T
A
 
P
A
 
Y
D
 
D
A
 
A
K
 
K
G
 
G
L
 
L
L
 
L
K
 
K
A
 
A
A
 
A
I
 
I
R
 
R
D
 
D
P
 
E
N
 
D
P
 
P
V
 
V
I
 
V
F
 
F
L
 
L
E
 
E
N
 
P
E
 
K
I
 
R
L
 
L
Y
 
Y
G
 
R
H
 
S
-
 
V
H
 
K
F
 
E
D
 
E
V
 
V
P
 
P
K
 
E
L
 
-
D
 
E
D
 
D
F
 
Y
V
 
T
L
 
L
P
 
P
I
 
I
G
 
G
K
 
K
A
 
A
R
 
A
I
 
L
H
 
R
K
 
R
Q
 
E
G
 
G
K
 
K
D
 
D
A
 
L
T
 
T
I
 
L
V
 
I
S
 
C
F
 
Y
G
 
G
I
 
T
G
 
V
M
 
M
T
 
P
Y
 
E
A
 
V
V
 
L
K
 
Q
A
 
A
A
 
A
E
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
K
Q
 
A
G
 
G
I
 
V
D
 
S
V
 
A
E
 
E
I
 
V
I
 
L
D
 
D
L
 
L
R
 
R
T
 
T
I
 
L
R
 
M
P
 
P
M
 
W
D
 
D
I
 
Y
P
 
E
T
 
A
V
 
V
V
 
M
E
 
N
S
 
S
V
 
V
K
 
A
K
 
K
T
 
T
G
 
G
R
 
R
L
 
V
V
 
V
T
 
L
V
 
V
E
 
S
E
 
D
G
 
A
F
 
P
P
 
R
Q
 
H
S
 
A
S
 
S
V
 
F
G
 
V
T
 
S
E
 
E
I
 
V
A
 
A
T
 
A
R
 
T
V
 
I
M
 
A
Q
 
E
Q
 
D
A
 
L
F
 
L
D
 
D
Y
 
M
L
 
L
D
 
L
A
 
A
P
 
P
I
 
P
L
 
I
T
 
R
I
 
V
A
 
T
G
 
G
K
 
F
D
 
D
V
 
T
P
 
P
M
 
Y
P
 
P
Y
 
Y
A
 
A
A
 
Q
N
 
D
L
 
-
E
 
-
K
 
K
L
 
L
A
 
Y
L
 
L
P
 
P
S
 
T
V
 
V
A
 
T
E
 
R
V
 
I
V
 
L
E
 
N
A
 
A
V
 
A
K
 
K

3dv0D Snapshots of catalysis in the e1 subunit of the pyruvate dehydrogenase multi-enzyme complex (see paper)
40% identity, 70% coverage: 137:457/461 of query aligns to 2:321/324 of 3dv0D

query
sites
3dv0D
S
 
Q
M
 
M
T
 
T
V
 
M
R
 
V
E
 
Q
A
 
A
L
 
I
R
 
T
D
 
D
A
 
A
M
 
L
A
 
R
E
 
I
E
 
E
M
 
L
R
 
K
R
 
N
D
 
D
P
 
P
D
 
N
V
 
V
F
 
L
I
 
I
M
 
F
G
 
G
E
 
E
E
 
D
V
 
V
A
 
G
Q
 
V
Y
 
N
Q
 
G
G
 
G
A
 
V
Y
 
F
K
 
R
I
 
A
T
 
T
Q
 
E
G
 
G
L
 
L
L
 
Q
D
 
A
E
 
E
F
 
F
G
 
G
P
 
E
K
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
F
D
 
D
T
 
T
P
 
P
I
x
L
T
 
A
E
|
E
H
 
S
G
 
G
F
 
I
A
 
G
G
 
G
V
 
L
G
 
A
V
 
I
G
 
G
A
 
L
A
 
A
F
 
L
A
 
Q
G
 
G
L
 
F
K
 
R
P
 
P
I
 
V
V
 
P
E
 
E
F
 
I
M
 
Q
T
x
F
F
 
F
N
 
G
F
|
F
A
 
V
M
 
Y
Q
x
E
A
 
V
I
 
M
D
 
D
Q
 
S
I
 
I
V
 
C
N
 
G
S
 
Q
A
 
M
A
 
A
K
 
R
T
 
I
L
 
R
Y
 
Y
V
 
R
S
 
T
G
 
G
G
 
G
Q
 
R
M
 
Y
G
 
H
A
 
M
P
 
P
M
 
I
V
 
T
F
 
I
R
 
R
G
 
S
P
 
P
S
 
F
G
 
G
A
 
G
A
 
G
A
 
V
R
 
H
V
 
T
A
 
P
A
 
E
Q
 
L
H
|
H
S
 
S
Q
 
D
C
 
S
Y
 
L
A
 
E
A
 
G
W
 
L
Y
 
V
S
 
A
H
 
Q
I
 
Q
P
 
P
G
 
G
L
 
L
K
 
K
V
 
V
V
 
V
M
 
I
P
 
P
Y
 
S
T
 
T
A
 
P
A
 
Y
D
 
D
A
 
A
K
 
K
G
 
G
L
 
L
L
 
L
K
 
I
A
 
S
A
 
A
I
 
I
R
 
R
D
 
D
P
 
N
N
 
D
P
 
P
V
 
V
I
 
I
F
 
F
L
 
L
E
 
E
N
 
H
E
 
L
I
 
K
L
 
L
Y
 
Y
-
 
R
G
 
S
H
 
F
H
 
R
F
 
Q
D
 
E
V
 
V
P
 
P
K
 
E
L
 
-
D
 
G
D
 
E
F
 
Y
V
 
T
L
 
I
P
 
P
I
 
I
G
 
G
K
 
K
A
 
A
R
 
D
I
 
I
H
 
K
K
 
R
Q
 
E
G
 
G
K
 
K
D
 
D
A
 
I
T
 
T
I
 
I
V
 
I
S
 
A
F
 
Y
G
 
G
I
 
A
G
 
M
M
 
V
T
 
H
Y
 
E
A
 
S
V
 
L
K
 
K
A
 
A
A
 
A
E
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
E
G
 
K
Q
 
E
G
 
G
I
 
I
D
 
S
V
 
A
E
 
E
I
 
V
I
 
V
D
 
D
L
 
L
R
 
R
T
 
T
I
 
V
R
 
Q
P
 
P
M
 
L
D
 
D
I
 
I
P
 
E
T
 
T
V
 
I
V
 
I
E
 
G
S
 
S
V
 
V
K
 
E
K
 
K
T
 
T
G
 
G
R
 
R
L
 
A
V
 
I
T
 
V
V
 
V
E
 
Q
E
 
E
G
 
A
F
 
Q
P
 
R
Q
 
Q
S
 
A
S
 
G
V
 
I
G
 
A
T
 
A
E
 
N
I
 
V
A
 
V
T
 
A
R
 
E
V
 
I
M
 
N
Q
 
E
Q
 
R
A
 
A
F
 
I
D
 
L
Y
 
S
L
 
L
D
 
E
A
 
A
P
 
P
I
 
V
L
 
L
T
 
R
I
 
V
A
 
A
G
 
A
K
 
P
D
 
D
V
 
T
P
 
V
M
 
Y
P
 
P
Y
 
F
A
 
-
A
 
A
N
 
Q
L
 
A
E
 
E
K
 
S
L
 
V
A
 
W
L
 
L
P
 
P
S
 
N
V
 
F
A
 
K
E
 
D
V
 
V
V
 
I
E
 
E
A
 
T
V
 
A
K
 
K
A
 
K
V
 
V

3dv0B Snapshots of catalysis in the e1 subunit of the pyruvate dehydrogenase multi-enzyme complex (see paper)
40% identity, 70% coverage: 137:457/461 of query aligns to 2:321/324 of 3dv0B

query
sites
3dv0B
S
 
Q
M
 
M
T
 
T
V
 
M
R
 
V
E
 
Q
A
 
A
L
 
I
R
 
T
D
 
D
A
 
A
M
 
L
A
 
R
E
 
I
E
 
E
M
 
L
R
 
K
R
 
N
D
 
D
P
 
P
D
 
N
V
 
V
F
 
L
I
 
I
M
 
F
G
 
G
E
 
E
E
 
D
V
 
V
A
 
G
Q
 
V
Y
 
N
Q
 
G
G
 
G
A
 
V
Y
 
F
K
 
R
I
 
A
T
 
T
Q
 
E
G
 
G
L
 
L
L
 
Q
D
 
A
E
 
E
F
 
F
G
 
G
P
 
E
K
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
F
D
 
D
T
 
T
P
 
P
I
x
L
T
 
A
E
|
E
H
 
S
G
 
G
F
 
I
A
 
G
G
 
G
V
 
L
G
 
A
V
 
I
G
 
G
A
 
L
A
 
A
F
 
L
A
 
Q
G
 
G
L
 
F
K
 
R
P
 
P
I
 
V
V
 
P
E
 
E
F
 
I
M
 
Q
T
 
F
F
 
F
N
 
G
F
|
F
A
 
V
M
 
Y
Q
x
E
A
 
V
I
 
M
D
 
D
Q
 
S
I
 
I
V
 
C
N
 
G
S
 
Q
A
 
M
A
 
A
K
 
R
T
 
I
L
 
R
Y
 
Y
V
 
R
S
 
T
G
 
G
G
 
G
Q
 
R
M
 
Y
G
 
H
A
 
M
P
 
P
M
 
I
V
 
T
F
 
I
R
 
R
G
 
S
P
 
P
S
 
F
G
 
G
A
 
G
A
 
G
A
 
V
R
 
H
V
 
T
A
 
P
A
 
E
Q
 
L
H
|
H
S
 
S
Q
 
D
C
 
S
Y
 
L
A
 
E
A
 
G
W
 
L
Y
 
V
S
 
A
H
 
Q
I
 
Q
P
 
P
G
 
G
L
 
L
K
 
K
V
 
V
V
 
V
M
 
I
P
 
P
Y
 
S
T
 
T
A
 
P
A
 
Y
D
 
D
A
 
A
K
 
K
G
 
G
L
 
L
L
 
L
K
 
I
A
 
S
A
 
A
I
 
I
R
 
R
D
 
D
P
 
N
N
 
D
P
 
P
V
 
V
I
 
I
F
 
F
L
 
L
E
 
E
N
 
H
E
 
L
I
 
K
L
 
L
Y
 
Y
-
 
R
G
 
S
H
 
F
H
 
R
F
 
Q
D
 
E
V
 
V
P
 
P
K
 
E
L
 
-
D
 
G
D
 
E
F
 
Y
V
 
T
L
 
I
P
 
P
I
 
I
G
 
G
K
 
K
A
 
A
R
 
D
I
 
I
H
 
K
K
 
R
Q
 
E
G
 
G
K
 
K
D
 
D
A
 
I
T
 
T
I
 
I
V
 
I
S
 
A
F
 
Y
G
 
G
I
 
A
G
 
M
M
 
V
T
 
H
Y
 
E
A
 
S
V
 
L
K
 
K
A
 
A
A
 
A
E
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
E
G
 
K
Q
 
E
G
 
G
I
 
I
D
 
S
V
 
A
E
 
E
I
 
V
I
 
V
D
 
D
L
 
L
R
 
R
T
 
T
I
 
V
R
 
Q
P
 
P
M
 
L
D
 
D
I
 
I
P
 
E
T
 
T
V
 
I
V
 
I
E
 
G
S
 
S
V
 
V
K
 
E
K
 
K
T
 
T
G
 
G
R
 
R
L
 
A
V
 
I
T
 
V
V
 
V
E
 
Q
E
 
E
G
 
A
F
 
Q
P
 
R
Q
 
Q
S
 
A
S
 
G
V
 
I
G
 
A
T
 
A
E
 
N
I
 
V
A
 
V
T
 
A
R
 
E
V
 
I
M
 
N
Q
 
E
Q
 
R
A
 
A
F
 
I
D
 
L
Y
 
S
L
 
L
D
 
E
A
 
A
P
 
P
I
 
V
L
 
L
T
 
R
I
 
V
A
 
A
G
 
A
K
 
P
D
 
D
V
 
T
P
 
V
M
 
Y
P
 
P
Y
 
F
A
 
-
A
 
A
N
 
Q
L
 
A
E
 
E
K
 
S
L
 
V
A
 
W
L
 
L
P
 
P
S
 
N
V
 
F
A
 
K
E
 
D
V
 
V
V
 
I
E
 
E
A
 
T
V
 
A
K
 
K
A
 
K
V
 
V

3dufD Snapshots of catalysis in the e1 subunit of the pyruvate dehydrogenase multi-enzyme complex (see paper)
40% identity, 70% coverage: 137:457/461 of query aligns to 2:321/324 of 3dufD

query
sites
3dufD
S
 
Q
M
 
M
T
 
T
V
 
M
R
 
V
E
 
Q
A
 
A
L
 
I
R
 
T
D
 
D
A
 
A
M
 
L
A
 
R
E
 
I
E
 
E
M
 
L
R
 
K
R
 
N
D
 
D
P
 
P
D
 
N
V
 
V
F
 
L
I
 
I
M
 
F
G
 
G
E
 
E
E
 
D
V
 
V
A
 
G
Q
 
V
Y
 
N
Q
 
G
G
 
G
A
 
V
Y
 
F
K
 
R
I
 
A
T
 
T
Q
 
E
G
 
G
L
 
L
L
 
Q
D
 
A
E
 
E
F
 
F
G
 
G
P
 
E
K
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
F
D
 
D
T
 
T
P
 
P
I
x
L
T
 
A
E
|
E
H
 
S
G
 
G
F
 
I
A
 
G
G
 
G
V
 
L
G
 
A
V
 
I
G
 
G
A
 
L
A
 
A
F
 
L
A
 
Q
G
 
G
L
 
F
K
 
R
P
 
P
I
 
V
V
 
P
E
 
E
F
 
I
M
 
Q
T
 
F
F
 
F
N
 
G
F
|
F
A
 
V
M
 
Y
Q
x
E
A
 
V
I
 
M
D
 
D
Q
 
S
I
 
I
V
 
C
N
 
G
S
 
Q
A
 
M
A
 
A
K
 
R
T
 
I
L
 
R
Y
 
Y
V
 
R
S
 
T
G
 
G
G
 
G
Q
 
R
M
 
Y
G
 
H
A
 
M
P
 
P
M
 
I
V
 
T
F
 
I
R
 
R
G
 
S
P
 
P
S
 
F
G
 
G
A
 
G
A
 
G
A
 
V
R
 
H
V
 
T
A
 
P
A
 
E
Q
 
L
H
|
H
S
 
S
Q
 
D
C
 
S
Y
 
L
A
 
E
A
 
G
W
 
L
Y
 
V
S
 
A
H
 
Q
I
 
Q
P
 
P
G
 
G
L
 
L
K
 
K
V
 
V
V
 
V
M
 
I
P
 
P
Y
 
S
T
 
T
A
 
P
A
 
Y
D
 
D
A
 
A
K
 
K
G
 
G
L
 
L
L
 
L
K
 
I
A
 
S
A
 
A
I
 
I
R
 
R
D
 
D
P
 
N
N
 
D
P
 
P
V
 
V
I
 
I
F
 
F
L
 
L
E
 
E
N
 
H
E
 
L
I
 
K
L
 
L
Y
 
Y
-
 
R
G
 
S
H
 
F
H
 
R
F
 
Q
D
 
E
V
 
V
P
 
P
K
 
E
L
 
-
D
 
G
D
 
E
F
 
Y
V
 
T
L
 
I
P
 
P
I
 
I
G
 
G
K
 
K
A
 
A
R
 
D
I
 
I
H
 
K
K
 
R
Q
 
E
G
 
G
K
 
K
D
 
D
A
 
I
T
 
T
I
 
I
V
 
I
S
 
A
F
 
Y
G
 
G
I
 
A
G
 
M
M
 
V
T
 
H
Y
 
E
A
 
S
V
 
L
K
 
K
A
 
A
A
 
A
E
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
E
G
 
K
Q
 
E
G
 
G
I
 
I
D
 
S
V
 
A
E
 
E
I
 
V
I
 
V
D
 
D
L
 
L
R
 
R
T
 
T
I
 
V
R
 
Q
P
 
P
M
 
L
D
 
D
I
 
I
P
 
E
T
 
T
V
 
I
V
 
I
E
 
G
S
 
S
V
 
V
K
 
E
K
 
K
T
 
T
G
 
G
R
 
R
L
 
A
V
 
I
T
 
V
V
 
V
E
 
Q
E
 
E
G
 
A
F
 
Q
P
 
R
Q
 
Q
S
 
A
S
 
G
V
 
I
G
 
A
T
 
A
E
 
N
I
 
V
A
 
V
T
 
A
R
 
E
V
 
I
M
 
N
Q
 
E
Q
 
R
A
 
A
F
 
I
D
 
L
Y
 
S
L
 
L
D
 
E
A
 
A
P
 
P
I
 
V
L
 
L
T
 
R
I
 
V
A
 
A
G
 
A
K
 
P
D
 
D
V
 
T
P
 
V
M
 
Y
P
 
P
Y
 
F
A
 
-
A
 
A
N
 
Q
L
 
A
E
 
E
K
 
S
L
 
V
A
 
W
L
 
L
P
 
P
S
 
N
V
 
F
A
 
K
E
 
D
V
 
V
V
 
I
E
 
E
A
 
T
V
 
A
K
 
K
A
 
K
V
 
V

1w85B The crystal structure of pyruvate dehydrogenase e1 bound to the peripheral subunit binding domain of e2 (see paper)
40% identity, 70% coverage: 137:457/461 of query aligns to 2:321/324 of 1w85B

query
sites
1w85B
S
 
Q
M
 
M
T
 
T
V
 
M
R
 
V
E
 
Q
A
 
A
L
 
I
R
 
T
D
 
D
A
 
A
M
 
L
A
 
R
E
 
I
E
 
E
M
 
L
R
 
K
R
 
N
D
 
D
P
 
P
D
 
N
V
 
V
F
 
L
I
 
I
M
 
F
G
 
G
E
|
E
E
 
D
V
 
V
A
 
G
Q
 
V
Y
 
N
Q
 
G
G
 
G
A
 
V
Y
 
F
K
 
R
I
 
A
T
 
T
Q
 
E
G
 
G
L
 
L
L
 
Q
D
 
A
E
 
E
F
 
F
G
 
G
P
 
E
K
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
F
D
 
D
T
 
T
P
 
P
I
x
L
T
 
A
E
|
E
H
 
S
G
 
G
F
 
I
A
 
G
G
 
G
V
 
L
G
 
A
V
 
I
G
 
G
A
 
L
A
 
A
F
 
L
A
 
Q
G
 
G
L
 
F
K
 
R
P
 
P
I
 
V
V
 
P
E
 
E
F
 
I
M
 
Q
T
 
F
F
 
F
N
 
G
F
|
F
A
 
V
M
 
Y
Q
x
E
A
 
V
I
 
M
D
 
D
Q
 
S
I
 
I
V
 
C
N
 
G
S
 
Q
A
 
M
A
 
A
K
 
R
T
 
I
L
 
R
Y
 
Y
V
 
R
S
 
T
G
 
G
G
 
G
Q
 
R
M
 
Y
G
 
H
A
 
M
P
 
P
M
 
I
V
 
T
F
 
I
R
 
R
G
 
S
P
 
P
S
 
F
G
 
G
A
 
G
A
 
G
A
 
V
R
 
H
V
 
T
A
 
P
A
 
E
Q
 
L
H
|
H
S
 
S
Q
 
D
C
 
S
Y
 
L
A
 
E
A
 
G
W
 
L
Y
 
V
S
 
A
H
 
Q
I
 
Q
P
 
P
G
 
G
L
 
L
K
 
K
V
 
V
V
 
V
M
 
I
P
 
P
Y
 
S
T
 
T
A
 
P
A
 
Y
D
 
D
A
 
A
K
 
K
G
 
G
L
 
L
L
 
L
K
 
I
A
 
S
A
 
A
I
 
I
R
 
R
D
 
D
P
 
N
N
 
D
P
 
P
V
 
V
I
 
I
F
 
F
L
 
L
E
 
E
N
 
H
E
 
L
I
 
K
L
 
L
Y
 
Y
-
 
R
G
 
S
H
 
F
H
 
R
F
 
Q
D
 
E
V
 
V
P
 
P
K
 
E
L
 
-
D
 
G
D
 
E
F
 
Y
V
 
T
L
 
I
P
 
P
I
 
I
G
 
G
K
 
K
A
 
A
R
 
D
I
 
I
H
 
K
K
 
R
Q
 
E
G
 
G
K
 
K
D
 
D
A
 
I
T
 
T
I
 
I
V
 
I
S
 
A
F
 
Y
G
 
G
I
 
A
G
 
M
M
 
V
T
 
H
Y
 
E
A
 
S
V
 
L
K
 
K
A
 
A
A
 
A
E
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
E
G
 
K
Q
 
E
G
 
G
I
 
I
D
 
S
V
 
A
E
 
E
I
 
V
I
 
V
D
 
D
L
 
L
R
 
R
T
 
T
I
 
V
R
 
Q
P
 
P
M
 
L
D
 
D
I
 
I
P
 
E
T
 
T
V
 
I
V
 
I
E
 
G
S
 
S
V
 
V
K
 
E
K
 
K
T
 
T
G
 
G
R
 
R
L
 
A
V
 
I
T
 
V
V
 
V
E
 
Q
E
 
E
G
 
A
F
 
Q
P
 
R
Q
 
Q
S
 
A
S
 
G
V
 
I
G
 
A
T
 
A
E
 
N
I
 
V
A
 
V
T
 
A
R
 
E
V
 
I
M
 
N
Q
 
E
Q
 
R
A
 
A
F
 
I
D
 
L
Y
 
S
L
 
L
D
 
E
A
 
A
P
 
P
I
 
V
L
 
L
T
 
R
I
 
V
A
 
A
G
 
A
K
 
P
D
 
D
V
 
T
P
 
V
M
 
Y
P
 
P
Y
 
F
A
 
-
A
 
A
N
 
Q
L
 
A
E
 
E
K
 
S
L
 
V
A
 
W
L
 
L
P
 
P
S
 
N
V
 
F
A
 
K
E
 
D
V
 
V
V
 
I
E
 
E
A
 
T
V
 
A
K
 
K
A
 
K
V
 
V

1qs0B Crystal structure of pseudomonas putida 2-oxoisovalerate dehydrogenase (branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase, e1b) (see paper)
38% identity, 70% coverage: 137:457/461 of query aligns to 4:335/338 of 1qs0B

query
sites
1qs0B
S
 
T
M
 
M
T
 
T
V
 
M
R
 
I
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
R
 
R
D
 
S
A
 
A
M
 
M
A
 
D
E
 
V
E
 
M
M
 
L
R
 
E
R
 
R
D
 
D
P
 
D
D
 
N
V
 
V
F
 
V
I
 
V
M
 
Y
G
 
G
E
 
Q
E
 
D
V
 
V
A
 
G
Q
 
Y
Y
 
F
Q
 
G
G
 
G
A
 
V
Y
 
F
K
 
R
I
 
C
T
 
T
Q
 
E
G
 
G
L
 
L
L
 
Q
D
 
T
E
 
K
F
 
Y
G
 
G
P
 
K
K
 
S
R
 
R
V
 
V
V
 
F
D
 
D
T
 
A
P
 
P
I
 
I
T
 
S
E
|
E
H
 
S
G
 
G
F
 
I
A
 
V
G
 
G
V
 
T
G
 
A
V
 
V
G
 
G
A
 
M
A
 
G
F
 
A
A
 
Y
G
 
G
L
 
L
K
 
R
P
 
P
I
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
I
M
 
Q
T
 
F
F
 
A
N
 
D
F
x
Y
A
 
F
M
 
Y
Q
 
P
A
 
A
I
 
S
D
 
D
Q
 
Q
I
 
I
V
 
V
N
 
S
S
 
E
A
 
M
A
 
A
K
 
R
T
 
L
L
 
R
Y
 
Y
V
 
R
S
 
S
G
 
A
G
 
G
Q
 
E
M
 
F
G
 
I
A
 
A
P
 
P
M
 
L
V
 
T
F
 
L
R
 
R
G
 
M
P
 
P
S
 
C
G
 
G
A
 
G
A
 
G
A
 
I
R
 
Y
V
 
G
A
 
G
A
 
Q
Q
 
T
H
|
H
S
 
S
Q
 
Q
C
 
S
Y
 
P
A
 
E
A
 
A
W
 
M
Y
 
F
S
 
T
H
 
Q
I
 
V
P
 
C
G
 
G
L
 
L
K
 
R
V
 
T
V
 
V
M
 
M
P
 
P
Y
 
S
T
 
N
A
 
P
A
 
Y
D
 
D
A
 
A
K
 
K
G
 
G
L
 
L
L
 
L
K
 
I
A
 
A
A
 
S
I
 
I
R
 
E
D
 
C
P
 
D
N
 
D
P
 
P
V
 
V
I
 
I
F
 
F
L
 
L
E
 
E
N
 
P
E
 
K
I
 
R
L
 
L
Y
 
Y
-
 
N
-
 
G
-
 
P
-
 
F
-
 
D
G
 
G
H
 
H
H
 
H
F
 
-
D
 
D
V
 
R
P
 
P
-
 
V
-
 
T
-
 
P
-
 
W
-
 
S
-
 
K
-
 
H
-
 
P
-
 
H
-
 
S
K
 
A
L
 
V
D
 
P
D
 
D
-
 
G
-
 
Y
F
 
Y
V
 
T
L
 
V
P
 
P
I
 
L
G
 
D
K
 
K
A
 
A
R
 
A
I
 
I
H
 
T
K
 
R
Q
 
P
G
 
G
K
 
N
D
 
D
A
 
V
T
 
S
I
 
V
V
 
L
S
 
T
F
 
Y
G
 
G
I
 
T
G
 
T
M
 
V
T
 
Y
Y
 
V
A
 
A
V
 
Q
K
 
V
A
 
A
A
 
A
E
 
E
E
 
E
L
 
-
A
 
-
G
 
-
Q
 
S
G
 
G
I
 
V
D
 
D
V
 
A
E
 
E
I
 
V
I
 
I
D
 
D
L
 
L
R
 
R
T
 
S
I
 
L
R
 
W
P
 
P
M
 
L
D
 
D
I
 
L
P
 
D
T
 
T
V
 
I
V
 
V
E
 
E
S
 
S
V
 
V
K
 
K
K
 
K
T
 
T
G
 
G
R
 
R
L
 
C
V
 
V
T
 
V
V
 
V
E
 
H
E
 
E
G
 
A
F
 
T
P
 
R
Q
 
T
S
 
C
S
 
G
V
 
F
G
 
G
T
 
A
E
 
E
I
 
L
A
 
V
T
 
S
R
 
L
V
 
V
M
 
Q
Q
 
E
Q
 
H
A
 
C
F
 
F
D
 
H
Y
 
H
L
 
L
D
 
E
A
 
A
P
 
P
I
 
I
L
 
E
T
 
R
I
 
V
A
 
T
G
 
G
K
 
W
D
 
D
V
 
T
P
 
P
M
 
Y
P
 
P
Y
 
H
A
 
A
A
 
Q
N
 
-
L
 
-
E
 
E
K
 
W
L
 
A
A
 
Y
L
 
F
P
 
P
S
 
G
V
 
P
A
 
S
E
 
R
V
 
V
V
 
G
E
 
A
A
 
A
V
 
L
K
 
K
A
 
K
V
 
V

P21953 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial; Branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component beta chain; BCKDE1B; BCKDH E1-beta; EC 1.2.4.4 from Homo sapiens (Human) (see 2 papers)
34% identity, 72% coverage: 126:455/461 of query aligns to 59:387/392 of P21953

query
sites
P21953
D
 
D
P
 
P
D
 
E
I
 
P
P
 
R
A
 
E
G
 
Y
T
 
G
E
 
Q
M
 
T
V
 
Q
S
 
K
M
 
M
T
 
N
V
 
L
R
 
F
E
 
Q
A
 
S
L
 
V
R
 
T
D
 
S
A
 
A
M
 
L
A
 
D
E
 
N
E
 
S
M
 
L
R
 
A
R
 
K
D
 
D
P
 
P
D
 
T
V
 
A
F
 
V
I
 
I
M
 
F
G
 
G
E
 
E
E
 
D
V
 
V
A
 
A
Q
 
-
Y
 
F
Q
 
G
G
 
G
A
 
V
Y
 
F
K
 
R
I
 
C
T
 
T
Q
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
R
D
 
D
E
 
K
F
 
Y
G
 
G
P
 
K
K
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
F
D
 
N
T
 
T
P
 
P
I
 
L
T
 
C
E
 
E
H
 
Q
G
 
G
F
 
I
A
 
V
G
 
G
V
 
F
G
 
G
V
 
I
G
 
G
A
 
I
A
 
A
F
 
V
A
 
T
G
 
G
L
 
A
K
 
T
P
 
A
I
 
I
V
 
A
E
 
E
F
 
I
M
 
Q
T
 
F
F
 
A
N
 
D
F
x
Y
A
 
I
M
 
F
Q
 
P
A
 
A
I
 
F
D
 
D
Q
 
Q
I
 
I
V
 
V
N
 
N
S
 
E
A
 
A
A
 
A
K
 
K
T
 
Y
L
 
R
Y
 
Y
V
 
R
S
 
S
G
 
G
G
 
D
Q
 
L
M
 
F
G
x
N
A
 
C
-
x
G
P
 
S
M
x
L
V
x
T
F
 
I
R
 
R
G
 
S
P
 
P
S
 
W
G
 
G
A
 
C
A
 
V
A
 
G
R
 
H
V
 
G
A
 
A
A
 
L
Q
 
Y
H
 
H
S
 
S
Q
 
Q
C
 
S
Y
 
P
A
 
E
A
 
A
W
 
F
Y
 
F
S
 
A
H
|
H
I
 
C
P
 
P
G
 
G
L
 
I
K
 
K
V
 
V
V
 
V
M
 
I
P
 
P
Y
 
R
T
 
S
A
 
P
A
 
F
D
 
Q
A
 
A
K
 
K
G
 
G
L
 
L
L
 
L
K
 
L
A
 
S
A
x
C
I
 
I
R
 
E
D
|
D
P
 
K
N
|
N
P
 
P
V
 
C
I
 
I
F
 
F
L
 
F
E
 
E
N
 
P
E
 
K
I
 
I
L
 
L
Y
 
Y
G
 
R
H
 
A
H
 
A
F
 
A
D
 
E
V
 
E
P
 
V
K
 
P
L
 
I
D
 
E
D
 
P
F
 
Y
V
 
N
L
 
I
P
 
P
I
 
L
G
 
S
K
 
Q
A
 
A
R
 
E
I
 
V
H
 
I
K
 
Q
Q
 
E
G
 
G
K
 
S
D
 
D
A
 
V
T
 
T
I
 
L
V
 
V
S
 
A
F
 
W
G
 
G
I
 
T
G
 
-
M
 
Q
T
 
V
Y
 
H
A
 
V
V
 
I
K
 
R
A
 
E
A
 
V
E
 
A
E
 
S
L
 
M
A
 
A
G
 
K
Q
 
E
-
 
K
-
 
L
G
 
G
I
 
V
D
 
S
V
 
C
E
 
E
I
 
V
I
 
I
D
 
D
L
 
L
R
 
R
T
 
T
I
 
I
R
 
I
P
 
P
M
 
W
D
 
D
I
 
V
P
 
D
T
 
T
V
 
I
V
 
C
E
 
K
S
 
S
V
 
V
K
 
I
K
 
K
T
 
T
G
 
G
R
 
R
L
 
L
V
 
L
T
 
I
V
 
S
E
 
H
E
 
E
G
 
A
F
 
P
P
 
L
Q
 
T
S
 
G
S
 
G
V
 
F
G
 
A
T
 
S
E
 
E
I
 
I
A
 
S
T
 
S
R
 
T
V
 
V
M
 
Q
Q
 
E
Q
 
E
A
 
C
F
 
F
D
 
L
Y
 
N
L
 
L
D
 
E
A
 
A
P
 
P
I
 
I
L
 
S
T
 
R
I
 
V
A
 
C
G
 
G
K
 
Y
D
 
D
V
 
T
P
 
P
M
 
F
P
 
P
Y
 
H
A
 
I
A
 
-
N
 
-
L
 
F
E
 
E
K
 
P
L
 
F
A
 
Y
L
 
I
P
 
P
S
 
D
V
 
K
A
 
W
E
 
K
V
 
C
V
 
Y
E
 
D
A
 
A
V
 
L
K
 
R

1dtwB Human branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase (see paper)
35% identity, 69% coverage: 138:455/461 of query aligns to 5:321/326 of 1dtwB

query
sites
1dtwB
M
 
M
T
 
N
V
 
L
R
 
F
E
 
Q
A
 
S
L
 
V
R
 
T
D
 
S
A
 
A
M
 
L
A
 
D
E
 
N
E
 
S
M
 
L
R
 
A
R
 
K
D
 
D
P
 
P
D
 
T
V
 
A
F
 
V
I
 
I
M
 
F
G
 
G
E
 
E
E
 
D
V
 
V
A
 
A
Q
 
-
Y
 
F
Q
 
G
G
 
G
A
 
V
Y
 
F
K
 
R
I
 
C
T
 
T
Q
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
R
D
 
D
E
 
K
F
 
Y
G
 
G
P
 
K
K
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
F
D
 
N
T
 
T
P
 
P
I
 
L
T
 
C
E
|
E
H
 
Q
G
 
G
F
 
I
A
 
V
G
 
G
V
 
F
G
 
G
V
 
I
G
 
G
A
 
I
A
 
A
F
 
V
A
 
T
G
 
G
L
 
A
K
 
T
P
 
A
I
 
I
V
 
A
E
 
E
F
 
I
M
 
Q
T
 
F
F
 
A
N
 
D
F
 
Y
A
 
I
M
 
F
Q
 
P
A
 
A
I
 
F
D
 
D
Q
 
Q
I
 
I
V
 
V
N
 
N
S
 
E
A
 
A
A
 
A
K
 
K
T
 
Y
L
 
R
Y
 
Y
V
 
R
S
 
S
G
 
G
G
 
D
Q
 
L
M
 
F
G
 
N
A
 
C
-
x
G
P
x
S
M
x
L
V
x
T
F
 
I
R
 
R
G
 
S
P
 
P
S
 
W
G
 
G
A
 
C
A
 
V
A
 
G
R
 
H
V
 
G
A
 
A
A
 
L
Q
 
Y
H
|
H
S
 
S
Q
 
Q
C
 
S
Y
 
P
A
 
E
A
 
A
W
 
F
Y
 
F
S
 
A
H
 
H
I
 
C
P
 
P
G
 
G
L
 
I
K
 
K
V
 
V
V
 
V
M
 
I
P
 
P
Y
 
R
T
 
S
A
 
P
A
 
F
D
 
Q
A
 
A
K
 
K
G
 
G
L
 
L
L
 
L
K
 
L
A
 
S
A
x
C
I
|
I
R
 
E
D
|
D
P
 
K
N
|
N
P
|
P
V
x
C
I
 
I
F
 
F
L
 
F
E
 
E
N
 
P
E
 
K
I
 
I
L
 
L
Y
 
Y
G
 
R
H
 
A
H
 
A
F
 
A
D
 
E
V
 
E
P
 
V
K
 
P
L
 
I
D
 
E
D
 
P
F
 
Y
V
 
N
L
 
I
P
 
P
I
 
L
G
 
S
K
 
Q
A
 
A
R
 
E
I
 
V
H
 
I
K
 
Q
Q
 
E
G
 
G
K
 
S
D
 
D
A
 
V
T
 
T
I
 
L
V
 
V
S
 
A
F
 
W
G
 
G
I
 
T
G
 
-
M
 
Q
T
 
V
Y
 
H
A
 
V
V
 
I
K
 
R
A
 
E
A
 
V
E
 
A
E
 
S
L
 
M
A
 
A
G
 
K
Q
 
E
-
 
K
-
 
L
G
 
G
I
 
V
D
 
S
V
 
C
E
 
E
I
 
V
I
 
I
D
 
D
L
 
L
R
 
R
T
 
T
I
 
I
R
 
I
P
 
P
M
 
W
D
 
D
I
 
V
P
 
D
T
 
T
V
 
I
V
 
C
E
 
K
S
 
S
V
 
V
K
 
I
K
 
K
T
 
T
G
 
G
R
 
R
L
 
L
V
 
L
T
 
I
V
 
S
E
 
H
E
 
E
G
 
A
F
 
P
P
 
L
Q
 
T
S
 
G
S
 
G
V
 
F
G
 
A
T
 
S
E
 
E
I
 
I
A
 
S
T
 
S
R
 
T
V
 
V
M
 
Q
Q
 
E
Q
 
E
A
 
C
F
 
F
D
 
L
Y
 
N
L
 
L
D
 
E
A
 
A
P
 
P
I
 
I
L
 
S
T
 
R
I
 
V
A
 
C
G
 
G
K
 
Y
D
 
D
V
 
T
P
 
P
M
 
F
P
 
P
Y
 
H
A
 
I
A
 
-
N
 
-
L
 
F
E
 
E
K
 
P
L
 
F
A
 
Y
L
 
I
P
 
P
S
 
D
V
 
K
A
 
W
E
 
K
V
 
C
V
 
Y
E
 
D
A
 
A
V
 
L
K
 
R

2j9fD Human branched-chain alpha-ketoacid dehydrogenase-decarboxylase e1b (see paper)
35% identity, 69% coverage: 138:455/461 of query aligns to 8:324/329 of 2j9fD

query
sites
2j9fD
M
 
M
T
 
N
V
 
L
R
 
F
E
 
Q
A
 
S
L
 
V
R
 
T
D
 
S
A
 
A
M
 
L
A
 
D
E
 
N
E
 
S
M
 
L
R
 
A
R
 
K
D
 
D
P
 
P
D
 
T
V
 
A
F
 
V
I
 
I
M
 
F
G
 
G
E
|
E
E
 
D
V
 
V
A
 
A
Q
 
-
Y
 
F
Q
 
G
G
 
G
A
 
V
Y
 
F
K
 
R
I
 
C
T
 
T
Q
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
R
D
 
D
E
 
K
F
 
Y
G
 
G
P
 
K
K
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
F
D
 
N
T
 
T
P
 
P
I
x
L
T
 
C
E
|
E
H
 
Q
G
 
G
F
 
I
A
 
V
G
 
G
V
 
F
G
 
G
V
 
I
G
 
G
A
 
I
A
 
A
F
 
V
A
 
T
G
 
G
L
 
A
K
 
T
P
 
A
I
 
I
V
 
A
E
 
E
F
 
I
M
x
Q
T
 
F
F
 
A
N
 
D
F
x
Y
A
 
I
M
 
F
Q
 
P
A
 
A
I
 
F
D
 
D
Q
 
Q
I
 
I
V
 
V
N
 
N
S
 
E
A
 
A
A
 
A
K
 
K
T
 
Y
L
 
R
Y
 
Y
V
 
R
S
 
S
G
 
G
G
 
D
Q
 
L
M
 
F
G
 
N
A
 
C
-
 
G
P
 
S
M
 
L
V
 
T
F
 
I
R
 
R
G
 
S
P
 
P
S
 
W
G
 
G
A
 
C
A
 
V
A
 
G
R
 
H
V
 
G
A
 
A
A
 
L
Q
 
Y
H
|
H
S
 
S
Q
 
Q
C
 
S
Y
 
P
A
 
E
A
 
A
W
 
F
Y
 
F
S
 
A
H
 
H
I
 
C
P
 
P
G
 
G
L
 
I
K
 
K
V
 
V
V
 
V
M
 
I
P
 
P
Y
 
R
T
 
S
A
 
P
A
 
F
D
 
Q
A
 
A
K
 
K
G
 
G
L
 
L
L
 
L
K
 
L
A
 
S
A
 
C
I
 
I
R
 
E
D
 
D
P
 
K
N
 
N
P
 
P
V
 
C
I
 
I
F
 
F
L
 
F
E
 
E
N
 
P
E
 
K
I
 
I
L
 
L
Y
 
Y
G
 
R
H
 
A
H
 
A
F
 
A
D
 
E
V
 
E
P
 
V
K
 
P
L
 
I
D
 
E
D
 
P
F
 
Y
V
 
N
L
 
I
P
 
P
I
 
L
G
 
S
K
 
Q
A
 
A
R
 
E
I
 
V
H
 
I
K
 
Q
Q
 
E
G
 
G
K
 
S
D
 
D
A
 
V
T
 
T
I
 
L
V
 
V
S
 
A
F
 
W
G
 
G
I
 
T
G
 
-
M
 
Q
T
 
V
Y
 
H
A
 
V
V
 
I
K
 
R
A
 
E
A
 
V
E
 
A
E
 
S
L
 
M
A
 
A
G
 
K
Q
 
E
-
 
K
-
 
L
G
 
G
I
 
V
D
 
S
V
 
C
E
 
E
I
 
V
I
 
I
D
 
D
L
 
L
R
 
R
T
 
T
I
 
I
R
 
I
P
 
P
M
 
W
D
 
D
I
 
V
P
 
D
T
 
T
V
 
I
V
 
C
E
 
K
S
 
S
V
 
V
K
 
I
K
 
K
T
 
T
G
 
G
R
 
R
L
 
L
V
 
L
T
 
I
V
 
S
E
 
H
E
 
E
G
 
A
F
 
P
P
 
L
Q
 
T
S
 
G
S
 
G
V
 
F
G
 
A
T
 
S
E
 
E
I
 
I
A
 
S
T
 
S
R
 
T
V
 
V
M
 
Q
Q
 
E
Q
 
E
A
 
C
F
 
F
D
 
L
Y
 
N
L
 
L
D
 
E
A
 
A
P
 
P
I
 
I
L
 
S
T
 
R
I
 
V
A
 
C
G
 
G
K
 
Y
D
 
D
V
 
T
P
 
P
M
 
F
P
 
P
Y
 
H
A
 
I
A
 
-
N
 
-
L
 
F
E
 
E
K
 
P
L
 
F
A
 
Y
L
 
I
P
 
P
S
 
D
V
 
K
A
 
W
E
 
K
V
 
C
V
 
Y
E
 
D
A
 
A
V
 
L
K
 
R

O00330 Pyruvate dehydrogenase protein X component, mitochondrial; Dihydrolipoamide dehydrogenase-binding protein of pyruvate dehydrogenase complex; E3-binding protein; E3BP; Lipoyl-containing pyruvate dehydrogenase complex component X; proX from Homo sapiens (Human) (see 5 papers)
51% identity, 18% coverage: 2:82/461 of query aligns to 56:136/501 of O00330

query
sites
O00330
P
 
P
I
 
I
E
 
K
I
 
I
L
 
L
M
 
M
P
 
P
A
 
S
L
 
L
S
 
S
P
 
P
T
 
T
M
 
M
E
 
E
E
 
E
G
 
G
K
 
N
L
 
I
S
 
V
K
 
K
W
 
W
L
 
L
K
 
K
K
 
K
E
 
E
G
 
G
D
 
E
K
 
A
V
 
V
T
 
S
S
 
A
G
 
G
D
 
D
V
 
A
I
 
L
A
 
C
E
 
E
I
 
I
E
 
E
T
 
T
D
 
D
K
|
K
A
 
A
T
 
V
M
 
V
E
 
T
V
 
L
E
 
D
A
 
A
V
 
S
D
 
D
E
 
D
G
 
G
T
 
I
I
 
L
G
 
A
K
 
K
L
 
I
L
 
V
V
 
V
D
 
E
E
 
E
G
 
G
T
 
S
E
 
K
G
 
N
V
 
I
K
 
R
V
 
L
N
 
G
T
 
S
P
 
L
I
 
I
A
 
G
V
 
L
L
 
I
L
 
V
G
 
E
D
 
E
G
 
G
E
 
E

Sites not aligning to the query:

G0S5Q0 Pyruvate dehydrogenase complex protein X component, mitochondrial; Dihydrolipoamide dehydrogenase-binding protein of pyruvate dehydrogenase complex; E3-binding protein; Pyruvate dehydrogenase complex component E3BP from Chaetomium thermophilum (strain DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719) (Thermochaetoides thermophila) (see paper)
51% identity, 17% coverage: 4:82/461 of query aligns to 39:117/442 of G0S5Q0

query
sites
G0S5Q0
E
 
N
I
 
F
L
 
M
M
 
M
P
 
P
A
 
A
L
 
L
S
 
S
P
 
P
T
 
T
M
 
M
E
 
T
E
 
E
G
 
G
K
 
N
L
 
I
S
 
A
K
 
S
W
 
W
L
 
R
K
 
V
K
 
K
E
 
E
G
 
G
D
 
E
K
 
R
V
 
F
T
 
S
S
 
A
G
 
G
D
 
D
V
 
V
I
 
L
A
 
L
E
 
E
I
 
I
E
 
E
T
 
T
D
 
D
K
 
K
A
 
A
T
 
T
M
 
M
E
 
D
V
 
V
E
 
E
A
 
A
V
 
Q
D
 
E
E
 
D
G
 
G
T
 
I
I
 
L
G
 
M
K
 
K
L
 
I
L
 
I
V
 
Q
D
 
P
E
 
D
G
 
G
T
 
S
E
 
K
G
 
G
V
 
V
K
 
Q
V
 
V
N
 
G
T
 
T
P
 
R
I
 
I
A
 
A
V
 
V
L
 
V
L
 
A
G
 
E
D
 
E
G
 
G
E
 
D

Sites not aligning to the query:

P10515 Dihydrolipoyllysine-residue acetyltransferase component of pyruvate dehydrogenase complex, mitochondrial; 70 kDa mitochondrial autoantigen of primary biliary cirrhosis; PBC; Dihydrolipoamide acetyltransferase component of pyruvate dehydrogenase complex; M2 antigen complex 70 kDa subunit; Pyruvate dehydrogenase complex component E2; PDC-E2; PDCE2; EC 2.3.1.12 from Homo sapiens (Human) (see 4 papers)
47% identity, 19% coverage: 3:89/461 of query aligns to 219:302/647 of P10515

query
sites
P10515
I
 
M
E
 
Q
I
 
V
L
 
L
M
 
L
P
 
P
A
 
A
L
 
L
S
 
S
P
 
P
T
 
T
M
 
M
E
 
T
E
 
M
G
 
G
K
 
T
L
 
V
S
 
Q
K
 
R
W
 
W
L
 
E
K
 
K
K
 
K
E
 
V
G
 
G
D
 
E
K
 
K
V
 
L
T
 
S
S
 
E
G
 
G
D
 
D
V
 
L
I
 
L
A
 
A
E
 
E
I
 
I
E
 
E
T
 
T
D
 
D
K
|
K
A
 
A
T
 
T
M
 
I
E
 
G
V
 
F
E
 
E
A
 
V
V
 
Q
D
 
E
E
 
E
G
 
G
T
 
Y
I
 
L
G
 
A
K
 
K
L
 
I
L
 
L
V
 
V
D
 
P
E
 
E
G
 
G
T
 
T
E
 
R
G
 
D
V
 
V
K
 
P
V
 
L
N
 
G
T
 
T
P
 
P
I
 
L
A
 
C
V
 
I
L
 
I
L
 
V
G
 
-
D
 
-
G
 
-
E
 
E
S
 
K
A
 
E
A
 
A
D
 
D
I
 
I
G
 
S
S
 
A

Sites not aligning to the query:

A0A0D2Y5A7 Dihydrolipoyllysine-residue acetyltransferase component of pyruvate dehydrogenase complex, mitochondrial; FoDLAT; DLAT; EC 2.3.1.12 from Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici (strain 4287 / CBS 123668 / FGSC 9935 / NRRL 34936) (Fusarium vascular wilt of tomato) (see paper)
53% identity, 17% coverage: 5:81/461 of query aligns to 39:115/457 of A0A0D2Y5A7

query
sites
A0A0D2Y5A7
I
 
I
L
 
K
M
 
M
P
 
P
A
 
A
L
 
L
S
 
S
P
 
P
T
 
T
M
 
M
E
 
Q
E
 
A
G
 
G
K
 
N
L
 
I
S
 
G
K
 
A
W
 
W
L
 
Q
K
 
K
K
 
K
E
 
P
G
 
G
D
 
D
K
 
S
V
 
I
T
 
A
S
 
P
G
 
G
D
 
D
V
 
V
I
 
L
A
 
V
E
 
E
I
 
I
E
 
E
T
 
T
D
 
D
K
 
K
A
 
A
T
 
Q
M
 
M
E
 
D
V
 
F
E
 
E
A
 
F
V
 
Q
D
 
E
E
 
E
G
 
G
T
 
V
I
 
I
G
 
A
K
 
K
L
 
I
L
 
L
V
 
K
D
 
D
E
 
A
G
 
G
T
 
E
E
 
K
G
 
D
V
 
I
K
 
P
V
 
V
N
 
G
T
 
S
P
 
P
I
 
I
A
 
A
V
 
V
L
 
L
L
 
V
G
 
E
D
 
E
G
 
G

Sites not aligning to the query:

P11180 Dihydrolipoyllysine-residue acetyltransferase component of pyruvate dehydrogenase complex; Dihydrolipoamide acetyltransferase component of pyruvate dehydrogenase complex; Pyruvate dehydrogenase complex component E2; PDC-E2; PDCE2; EC 2.3.1.12 from Bos taurus (Bovine) (see paper)
47% identity, 18% coverage: 3:87/461 of query aligns to 219:300/647 of P11180

query
sites
P11180
I
 
M
E
 
Q
I
 
V
L
 
L
M
 
L
P
 
P
A
 
A
L
 
L
S
 
S
P
 
P
T
 
T
M
 
M
E
 
T
E
 
M
G
 
G
K
 
T
L
 
V
S
 
Q
K
 
R
W
 
W
L
 
E
K
 
K
K
 
K
E
 
V
G
 
G
D
 
E
K
 
K
V
 
L
T
 
N
S
 
E
G
 
G
D
 
D
V
 
L
I
 
L
A
 
A
E
 
E
I
 
I
E
 
E
T
 
T
D
 
D
K
 
K
A
 
A
T
 
T
M
 
I
E
 
G
V
 
F
E
 
E
A
 
V
V
 
Q
D
 
E
E
 
E
G
 
G
T
 
Y
I
 
L
G
 
A
K
 
K
L
 
I
L
 
L
V
 
I
D
 
P
E
 
E
G
 
G
T
 
T
E
 
R
G
 
D
V
 
V
K
 
P
V
 
L
N
 
G
T
 
T
P
 
P
I
 
L
A
 
C
V
 
I
L
 
I
L
 
V
G
 
-
D
 
-
G
 
-
E
 
E
S
 
K
A
 
E
A
 
A
D
 
D
I
 
I

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_015799638.1 NCBI__GCF_000022745.1:WP_015799638.1
MPIEILMPALSPTMEEGKLSKWLKKEGDKVTSGDVIAEIETDKATMEVEAVDEGTIGKLL
VDEGTEGVKVNTPIAVLLGDGESAADIGSAPAAKAEAAKEEPKAEENKADAVPAAPKAPA
VEVASDPDIPAGTEMVSMTVREALRDAMAEEMRRDPDVFIMGEEVAQYQGAYKITQGLLD
EFGPKRVVDTPITEHGFAGVGVGAAFAGLKPIVEFMTFNFAMQAIDQIVNSAAKTLYVSG
GQMGAPMVFRGPSGAAARVAAQHSQCYAAWYSHIPGLKVVMPYTAADAKGLLKAAIRDPN
PVIFLENEILYGHHFDVPKLDDFVLPIGKARIHKQGKDATIVSFGIGMTYAVKAAEELAG
QGIDVEIIDLRTIRPMDIPTVVESVKKTGRLVTVEEGFPQSSVGTEIATRVMQQAFDYLD
APILTIAGKDVPMPYAANLEKLALPSVAEVVEAVKAVTYTA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory