SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_015820561.1 NCBI__GCF_000023025.1:WP_015820561.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

8bcjB Crystal structure of short-chain dehydrogenase pa3128 from pseudomonas aeruginosa pao1 in complex with NADP+
59% identity, 98% coverage: 6:249/250 of query aligns to 6:249/250 of 8bcjB

query
sites
8bcjB
V
 
V
A
 
M
I
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
S
|
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
A
E
 
A
T
 
T
A
 
A
K
 
L
L
 
L
L
 
A
A
 
A
L
 
E
N
 
R
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
C
 
V
V
 
L
N
 
N
Y
 
Y
L
|
L
Q
x
R
D
x
N
D
 
R
A
 
E
A
 
A
A
 
A
Q
 
E
S
 
A
L
 
L
K
 
R
R
 
Q
E
 
R
I
 
I
S
 
E
D
 
R
M
 
Q
D
 
G
V
 
G
K
 
E
C
 
A
I
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
A
A
|
A
D
|
D
V
|
V
S
 
A
R
 
E
F
 
E
S
 
G
D
 
D
V
 
V
S
 
E
R
 
R
L
 
L
F
 
F
E
 
A
T
 
S
V
 
I
D
 
D
K
 
E
E
 
R
L
 
F
G
 
G
S
 
R
L
 
L
S
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
M
L
 
L
R
 
E
Q
 
A
Q
 
Q
C
 
T
R
 
R
L
 
L
D
 
E
E
 
N
I
 
I
S
 
D
E
 
A
D
 
A
R
 
R
F
 
L
S
 
H
E
 
R
V
 
V
L
 
F
R
 
A
V
x
T
N
 
N
V
 
V
M
 
T
G
 
G
C
 
S
F
 
F
L
 
L
C
 
C
C
 
A
K
 
R
E
 
E
A
 
A
V
 
V
K
 
K
R
 
R
M
 
L
S
 
S
T
 
T
K
 
R
Y
 
H
G
 
G
G
 
G
V
 
R
G
 
G
G
 
G
A
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
N
V
|
V
S
 
S
S
|
S
R
 
M
A
 
A
S
 
S
V
 
R
T
 
L
G
 
G
S
 
S
P
 
P
N
 
N
E
 
E
Y
 
Y
V
 
I
D
 
D
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
G
A
 
A
I
 
I
D
 
D
T
 
S
L
 
M
T
 
T
R
 
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
L
 
R
E
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
A
E
 
E
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
A
V
 
V
R
 
R
P
|
P
G
|
G
L
 
L
I
|
I
Y
 
D
T
|
T
E
 
E
M
x
I
H
|
H
A
 
A
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
S
 
P
N
 
G
R
 
R
V
 
I
K
 
E
R
 
R
L
 
L
E
 
K
N
 
G
K
 
G
I
 
I
P
 
P
M
 
L
Q
 
G
R
 
R
G
 
G
G
 
G
E
 
T
P
 
A
S
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
A
E
 
R
A
 
A
I
 
I
Y
 
L
W
 
W
L
 
L
V
 
A
S
 
S
N
 
D
K
 
E
S
 
A
A
 
S
F
 
Y
V
 
S
T
 
T
G
 
G
S
 
T
F
 
F
I
 
I
E
 
D
P
 
V
S
 
S
G
 
G
G
 
G

4iqgD Crystal structure of bpro0239 oxidoreductase from polaromonas sp. Js666 in NADP bound form
56% identity, 98% coverage: 4:249/250 of query aligns to 2:247/248 of 4iqgD

query
sites
4iqgD
N
 
S
K
 
K
V
 
V
A
 
V
I
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
S
|
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
A
E
 
A
T
 
S
A
 
A
K
 
L
L
 
L
L
 
A
A
 
A
L
 
R
N
 
Q
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
C
 
A
V
 
V
N
|
N
Y
 
Y
L
x
A
Q
x
S
D
x
N
D
 
S
A
 
A
A
 
A
A
 
A
Q
 
D
S
 
E
L
 
V
K
 
V
R
 
R
E
 
Q
I
 
I
S
 
R
D
 
E
M
 
A
D
 
G
V
 
G
K
 
Q
C
 
A
I
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
Q
A
|
A
D
|
D
V
|
V
S
 
A
R
 
K
F
 
E
S
 
R
D
 
E
V
 
V
S
 
L
R
 
A
L
 
M
F
 
F
E
 
E
T
 
T
V
 
V
D
 
D
K
 
A
E
 
Q
L
 
L
G
 
G
S
 
R
L
 
L
S
 
S
V
 
A
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
V
L
 
V
R
 
D
Q
 
Q
Q
 
T
C
 
T
R
 
R
L
 
V
D
 
D
E
 
G
I
 
I
S
 
T
E
 
L
D
 
E
R
 
R
F
 
L
S
 
Q
E
 
R
V
 
M
L
 
F
R
 
E
V
 
I
N
|
N
V
 
V
M
 
F
G
 
G
C
 
S
F
 
F
L
 
L
C
 
C
C
 
A
K
 
R
E
 
E
A
 
A
V
 
V
K
 
K
R
 
R
M
 
M
S
 
S
T
 
T
K
 
R
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
V
 
S
G
 
G
G
 
G
A
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
N
V
|
V
S
 
S
S
|
S
R
 
A
A
 
A
S
 
A
V
 
R
T
 
L
G
 
G
S
 
S
P
 
P
N
 
G
E
 
Q
Y
|
Y
V
 
V
D
 
D
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
G
A
 
A
I
 
I
D
 
D
T
 
T
L
 
F
T
 
T
R
 
L
G
 
G
L
 
L
A
 
A
L
 
K
E
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
T
E
 
E
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
A
V
 
V
R
 
R
P
|
P
G
|
G
L
 
I
I
|
I
Y
 
E
T
|
T
E
 
D
M
x
I
H
|
H
A
 
A
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
L
S
 
P
N
 
N
R
 
R
V
 
A
K
 
R
R
 
D
L
 
V
E
 
A
N
 
P
K
 
Q
I
 
V
P
 
P
M
 
M
Q
 
Q
R
 
R
G
 
A
G
 
G
E
 
T
P
 
A
S
 
R
E
 
E
V
 
V
A
 
A
E
 
E
A
 
A
I
 
I
Y
 
V
W
 
W
L
 
L
V
 
L
S
 
G
N
 
D
K
 
Q
S
 
A
A
 
S
F
 
Y
V
 
T
T
 
T
G
 
G
S
 
A
F
 
L
I
 
L
E
 
D
P
 
V
S
 
T
G
 
G
G
 
G

7v0hG Crystal structure of putative glucose 1-dehydrogenase from burkholderia cenocepacia in complex with NADP and a potential reaction product
38% identity, 98% coverage: 5:250/250 of query aligns to 12:252/253 of 7v0hG

query
sites
7v0hG
K
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
S
|
S
R
x
K
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
A
E
 
A
T
 
I
A
 
A
K
 
K
L
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
D
N
 
E
G
 
G
Y
 
A
A
 
A
V
 
V
C
 
V
V
 
V
N
 
N
Y
 
Y
L
x
A
Q
x
S
D
x
S
D
 
K
A
 
A
A
 
G
A
 
A
Q
 
D
S
 
A
L
 
V
K
 
V
R
 
S
E
 
A
I
 
I
S
 
T
D
 
E
M
 
A
D
 
G
V
 
G
K
 
R
C
 
A
I
 
V
A
 
A
V
 
V
K
 
G
A
x
G
D
|
D
V
|
V
S
 
S
R
 
K
F
 
A
S
 
A
D
 
D
V
 
A
S
 
Q
R
 
R
L
 
I
F
 
V
E
 
D
T
 
T
V
 
A
D
 
I
K
 
E
E
 
T
L
 
Y
G
 
G
S
 
R
L
 
L
S
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
x
S
G
|
G
I
 
V
L
x
Y
R
 
-
Q
 
E
Q
 
F
C
 
A
R
 
P
L
 
I
D
 
E
E
 
A
I
 
I
S
 
T
E
 
E
D
 
E
R
 
H
F
 
Y
S
 
R
E
 
R
V
 
Q
L
 
F
R
 
D
V
 
T
N
 
N
V
 
V
M
 
F
G
 
G
C
 
V
F
 
L
L
 
L
C
 
T
C
 
T
K
 
Q
E
 
A
A
 
A
V
 
V
K
 
K
R
 
H
M
 
L
S
 
-
T
 
-
K
 
-
Y
 
-
G
 
-
G
 
G
V
 
E
G
 
G
G
 
A
A
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
x
I
S
 
S
S
|
S
R
 
V
A
 
V
S
 
T
V
 
S
T
 
I
G
 
T
S
 
P
P
 
P
N
 
A
E
 
S
Y
 
A
V
 
V
D
 
-
Y
|
Y
A
 
S
A
 
G
S
 
T
K
|
K
G
 
G
A
 
A
I
 
V
D
 
D
T
 
A
L
 
I
T
 
T
R
 
G
G
 
V
L
 
L
A
 
A
L
 
L
E
 
E
V
 
L
A
 
G
A
 
P
E
 
R
G
 
K
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
A
V
 
I
R
 
N
P
|
P
G
|
G
L
x
M
I
|
I
Y
 
V
T
|
T
E
 
E
M
x
G
H
x
T
A
 
H
S
 
S
G
 
A
G
 
G
-
x
I
-
 
I
E
 
G
S
 
S
N
 
D
R
 
L
V
 
E
K
 
A
R
 
Q
L
 
V
E
 
L
N
 
G
K
 
Q
I
 
T
P
 
P
M
 
L
Q
 
G
R
 
R
G
 
L
G
 
G
E
 
E
P
 
P
S
 
N
E
 
D
V
 
I
A
 
A
E
 
S
A
 
V
I
 
A
Y
 
V
W
 
F
L
 
L
V
 
A
S
 
S
N
 
D
K
 
D
S
 
A
A
 
R
F
 
W
V
 
M
T
 
T
G
 
G
S
 
E
F
 
H
I
 
L
E
 
V
P
 
V
S
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
L

9clyB Crystal structure of the 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase, cylg, from streptococcus agalactiae 2603v/r
37% identity, 98% coverage: 5:250/250 of query aligns to 4:239/242 of 9clyB

query
sites
9clyB
K
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
S
 
T
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
E
 
A
T
 
I
A
 
T
K
 
K
L
 
E
L
 
L
A
 
Y
L
 
K
N
 
E
G
 
G
Y
 
Y
A
 
K
V
 
V
C
 
I
V
 
A
N
 
I
Y
|
Y
L
x
N
Q
x
S
D
 
N
D
 
D
A
 
A
A
 
K
A
 
A
Q
 
R
S
 
A
L
 
L
K
 
Q
R
 
E
E
 
E
I
 
L
S
 
P
D
 
K
M
 
L
D
 
D
V
 
V
K
 
-
C
 
-
I
 
-
A
 
-
V
 
Y
K
 
K
A
x
C
D
x
N
V
x
I
S
 
S
R
 
D
F
 
A
S
 
K
D
 
A
V
 
V
S
 
Q
R
 
K
L
 
L
F
 
V
E
 
T
T
 
K
V
 
I
D
 
F
K
 
R
E
 
E
L
 
Y
G
 
G
S
 
G
L
 
I
S
 
D
V
 
C
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
L
 
V
R
 
R
Q
 
D
Q
 
G
C
 
F
R
 
F
L
 
L
D
 
-
E
 
M
I
 
M
S
 
S
E
 
K
D
 
E
R
 
K
F
 
W
S
 
M
E
 
D
V
 
V
L
 
I
R
 
N
V
 
I
N
 
N
V
 
I
M
 
M
G
 
G
C
 
L
F
 
V
L
 
N
C
 
M
C
 
S
K
 
K
E
 
A
A
 
V
V
 
L
K
 
K
R
 
I
M
 
M
S
 
K
T
 
A
K
 
K
Y
 
R
G
 
-
G
 
-
V
 
I
G
 
Q
G
 
G
A
 
K
I
 
V
V
 
I
N
 
N
V
x
I
S
 
S
S
|
S
R
 
T
A
 
S
S
 
G
V
 
I
T
 
A
G
 
G
S
 
Q
P
 
I
N
 
G
E
 
Q
Y
 
-
V
 
A
D
 
N
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
T
K
|
K
G
 
G
A
 
A
I
 
I
D
 
I
T
 
S
L
 
I
T
 
T
R
 
K
G
 
T
L
 
L
A
 
A
L
 
K
E
 
E
V
 
F
A
 
A
A
 
S
E
 
D
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
I
N
 
N
G
 
C
V
 
V
R
 
S
P
 
P
G
|
G
L
 
F
I
|
I
Y
 
E
T
|
T
E
 
D
M
|
M
H
 
-
A
 
-
S
 
T
G
 
N
G
 
E
E
 
L
S
 
Q
N
 
N
R
 
K
V
 
E
K
 
E
R
 
L
L
 
K
E
 
E
N
 
H
K
 
L
I
 
I
P
 
P
M
 
L
Q
 
K
R
 
R
G
 
F
G
 
G
E
 
Q
P
 
P
S
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
A
E
 
W
A
 
L
I
 
V
Y
 
S
W
 
F
L
 
L
V
 
A
S
 
S
N
 
E
K
 
K
S
 
A
A
 
N
F
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
K
F
 
N
I
 
I
E
 
V
P
 
I
S
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M

3i3oA 2.06 angstrom resolution crystal structure of a short chain dehydrogenase from bacillus anthracis str. 'Ames ancestor' in complex with NAD-acetone
33% identity, 99% coverage: 3:250/250 of query aligns to 37:278/282 of 3i3oA

query
sites
3i3oA
R
 
K
N
 
G
K
 
K
V
 
N
A
 
V
I
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
S
x
D
R
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
E
 
A
T
 
V
A
 
S
K
 
I
L
 
A
L
 
F
A
 
A
L
 
K
N
 
E
G
 
G
Y
 
A
A
 
N
V
 
I
C
 
A
V
 
I
N
 
A
Y
|
Y
L
|
L
Q
 
D
D
x
E
D
 
E
A
 
G
A
 
D
A
 
A
Q
 
N
S
 
E
L
 
T
K
 
K
R
 
Q
E
 
Y
I
 
V
S
 
E
D
 
K
M
 
E
D
 
G
V
 
V
K
 
K
C
 
C
I
 
V
A
 
L
V
 
L
K
 
P
A
x
G
D
|
D
V
x
L
S
 
S
R
 
D
F
 
E
S
 
Q
D
 
H
V
 
C
S
 
K
R
 
D
L
 
I
F
 
V
E
 
Q
T
 
E
V
 
T
D
 
V
K
 
R
E
 
Q
L
 
L
G
 
G
S
 
S
L
 
L
S
 
N
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
x
V
G
x
A
I
x
Q
L
x
Q
R
 
Y
Q
 
P
Q
 
Q
C
 
Q
R
 
G
L
 
L
D
 
E
E
 
Y
I
 
I
S
 
T
E
 
A
D
 
E
R
 
Q
F
 
L
S
 
E
E
 
K
V
 
T
L
 
F
R
 
R
V
x
I
N
 
N
V
 
I
M
 
F
G
 
S
C
 
Y
F
 
F
L
 
H
C
 
V
C
 
T
K
 
K
E
 
A
A
 
A
V
 
L
K
 
S
R
 
H
M
 
L
S
 
K
T
 
Q
K
 
-
Y
 
-
G
 
-
G
 
-
V
 
-
G
 
G
G
 
D
A
 
V
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
x
T
S
 
A
S
|
S
R
 
I
A
 
V
S
 
A
V
 
Y
T
 
E
G
 
G
S
 
N
P
 
-
N
 
E
E
 
T
Y
x
L
V
 
I
D
 
D
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
T
K
|
K
G
 
G
A
 
A
I
 
I
D
 
V
T
 
A
L
 
F
T
 
T
R
 
R
G
 
S
L
 
L
A
 
S
L
 
Q
E
 
S
V
 
L
A
 
V
A
 
Q
E
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
G
V
 
V
R
 
A
P
|
P
G
|
G
L
 
P
I
|
I
Y
 
W
T
|
T
E
 
P
M
x
L
H
 
I
A
 
P
S
 
S
G
 
S
G
 
F
E
 
D
S
 
E
N
x
K
R
 
K
V
 
V
K
 
S
R
 
Q
L
 
F
E
 
G
N
 
S
K
 
N
I
 
V
P
 
P
M
 
M
Q
 
Q
R
 
R
G
 
P
G
 
G
E
 
Q
P
 
P
S
 
Y
E
 
E
V
 
L
A
 
A
E
 
P
A
 
A
I
 
Y
Y
 
V
W
 
Y
L
 
L
V
 
A
S
 
S
N
 
S
K
 
D
S
 
S
A
 
S
F
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
 
G
S
 
Q
F
 
M
I
 
I
E
 
H
P
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
V

3ijrF 2.05 angstrom resolution crystal structure of a short chain dehydrogenase from bacillus anthracis str. 'Ames ancestor' in complex with NAD+
33% identity, 99% coverage: 3:250/250 of query aligns to 45:286/290 of 3ijrF

query
sites
3ijrF
R
 
K
N
 
G
K
 
K
V
 
N
A
 
V
I
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
G
S
x
D
R
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
E
 
A
T
 
V
A
 
S
K
 
I
L
 
A
L
 
F
A
 
A
L
 
K
N
 
E
G
 
G
Y
 
A
A
 
N
V
 
I
C
 
A
V
 
I
N
 
A
Y
|
Y
L
|
L
Q
 
D
D
x
E
D
 
E
A
 
G
A
 
D
A
 
A
Q
 
N
S
 
E
L
 
T
K
 
K
R
 
Q
E
 
Y
I
 
V
S
 
E
D
 
K
M
 
E
D
 
G
V
 
V
K
 
K
C
 
C
I
 
V
A
 
L
V
 
L
K
 
P
A
x
G
D
|
D
V
x
L
S
 
S
R
 
D
F
 
E
S
 
Q
D
 
H
V
 
C
S
 
K
R
 
D
L
 
I
F
 
V
E
 
Q
T
 
E
V
 
T
D
 
V
K
 
R
E
 
Q
L
 
L
G
 
G
S
 
S
L
 
L
S
 
N
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
x
V
G
x
A
I
x
Q
L
 
Q
R
 
Y
Q
 
P
Q
 
Q
C
 
Q
R
 
G
L
 
L
D
 
E
E
 
Y
I
 
I
S
 
T
E
 
A
D
 
E
R
 
Q
F
 
L
S
 
E
E
 
K
V
 
T
L
 
F
R
 
R
V
x
I
N
 
N
V
 
I
M
 
F
G
 
S
C
 
Y
F
 
F
L
 
H
C
 
V
C
 
T
K
 
K
E
 
A
A
 
A
V
 
L
K
 
S
R
 
H
M
 
L
S
 
K
T
 
Q
K
 
-
Y
 
-
G
 
-
G
 
-
V
 
-
G
 
G
G
 
D
A
 
V
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
x
T
S
 
A
S
|
S
R
 
I
A
 
V
S
 
A
V
 
Y
T
 
E
G
 
G
S
 
N
P
 
-
N
 
E
E
 
T
Y
x
L
V
 
I
D
 
D
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
T
K
|
K
G
 
G
A
 
A
I
 
I
D
 
V
T
 
A
L
 
F
T
 
T
R
 
R
G
 
S
L
 
L
A
 
S
L
 
Q
E
 
S
V
 
L
A
 
V
A
 
Q
E
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
G
V
 
V
R
 
A
P
|
P
G
|
G
L
x
P
I
|
I
Y
 
W
T
|
T
E
 
P
M
x
L
H
 
I
A
 
P
S
 
S
G
 
S
G
 
F
E
 
D
S
 
E
N
x
K
R
 
K
V
 
V
K
 
S
R
 
Q
L
 
F
E
 
G
N
 
S
K
 
N
I
 
V
P
 
P
M
 
M
Q
 
Q
R
 
R
G
 
P
G
 
G
E
 
Q
P
 
P
S
 
Y
E
 
E
V
 
L
A
 
A
E
 
P
A
 
A
I
 
Y
Y
 
V
W
 
Y
L
 
L
V
 
A
S
 
S
N
 
S
K
 
D
S
 
S
A
 
S
F
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
 
G
S
 
Q
F
 
M
I
 
I
E
 
H
P
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
V

Sites not aligning to the query:

3osuA Crystal structure of the 3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase, fabg, from staphylococcus aureus
35% identity, 100% coverage: 1:250/250 of query aligns to 1:244/246 of 3osuA

query
sites
3osuA
M
 
M
S
 
K
R
 
M
N
 
T
K
 
K
V
 
S
A
 
A
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
S
 
S
R
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
A
 
R
E
 
S
T
 
I
A
 
A
K
 
L
L
 
Q
L
 
L
A
 
A
L
 
E
N
 
E
G
 
G
Y
 
Y
A
 
N
V
 
V
C
 
A
V
 
V
N
 
N
Y
 
Y
L
 
A
Q
 
G
D
 
S
D
 
K
A
 
E
A
 
K
A
 
A
Q
 
E
S
 
A
L
 
V
K
 
V
R
 
E
E
 
E
I
 
I
S
 
K
D
 
A
M
 
K
D
 
G
V
 
V
K
 
D
C
 
S
I
 
F
A
 
A
V
 
I
K
 
Q
A
 
A
D
 
N
V
 
V
S
 
A
R
 
D
F
 
A
S
 
D
D
 
E
V
 
V
S
 
K
R
 
A
L
 
M
F
 
I
E
 
K
T
 
E
V
 
V
D
 
V
K
 
S
E
 
Q
L
 
F
G
 
G
S
 
S
L
 
L
S
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
L
 
T
R
 
R
Q
 
D
Q
 
N
C
 
L
R
 
-
L
 
L
D
 
M
E
 
R
I
 
M
S
 
K
E
 
E
D
 
Q
R
 
E
F
 
W
S
 
D
E
 
D
V
 
V
L
 
I
R
 
D
V
 
T
N
 
N
V
 
L
M
 
K
G
 
G
C
 
V
F
 
F
L
 
N
C
 
C
C
 
I
K
 
Q
E
 
K
A
 
A
V
 
T
K
 
P
R
 
Q
M
 
M
S
 
L
T
 
R
K
 
Q
Y
 
R
G
 
-
G
 
-
V
 
-
G
 
S
G
 
G
A
 
A
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
 
L
S
 
S
S
|
S
R
 
V
A
 
V
S
 
G
V
 
A
T
 
V
G
 
G
S
 
N
P
 
P
N
 
G
E
x
Q
Y
 
-
V
 
A
D
 
N
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
S
 
T
K
|
K
G
 
A
A
 
G
I
 
V
D
 
I
T
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
K
G
 
S
L
 
A
A
 
A
L
 
R
E
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
S
E
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
G
 
A
V
 
V
R
 
A
P
 
P
G
 
G
L
 
F
I
 
I
Y
 
V
T
 
S
E
 
D
M
 
M
H
 
-
A
 
-
S
 
T
G
 
D
G
 
A
E
 
L
S
 
S
N
 
D
R
 
E
V
 
L
K
 
K
-
 
E
R
 
Q
L
 
M
E
 
L
N
 
T
K
 
Q
I
 
I
P
 
P
M
 
L
Q
 
A
R
 
R
G
 
F
G
 
G
E
 
Q
P
 
D
S
 
T
E
 
D
V
 
I
A
 
A
E
 
N
A
 
T
I
 
V
Y
 
A
W
 
F
L
 
L
V
 
A
S
 
S
N
 
D
K
 
K
S
 
A
A
 
K
F
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
Q
F
 
T
I
 
I
E
 
H
P
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M

P40288 Glucose 1-dehydrogenase; EC 1.1.1.47 from Priestia megaterium (Bacillus megaterium) (see 2 papers)
38% identity, 98% coverage: 5:250/250 of query aligns to 8:250/261 of P40288

query
sites
P40288
K
 
K
V
 
V
A
 
V
I
x
V
I
|
I
T
|
T
G
|
G
G
x
S
S
|
S
R
x
T
G
|
G
I
x
L
G
|
G
A
x
K
E
x
S
T
x
M
A
|
A
K
x
I
L
x
R
L
x
F
A
|
A
L
x
T
N
x
E
G
x
K
Y
x
A
A
x
K
V
|
V
C
x
V
V
 
V
N
 
N
Y
 
Y
L
 
R
Q
 
S
D
 
K
D
 
E
A
 
D
A
 
E
A
 
A
Q
 
N
S
 
S
L
 
V
K
 
L
R
 
E
E
 
E
I
 
I
S
 
K
D
 
K
M
 
V
D
 
G
V
 
G
K
 
E
C
 
A
I
 
I
A
 
A
V
 
V
K
 
K
A
 
G
D
 
D
V
 
V
S
 
T
R
 
V
F
 
E
S
 
S
D
 
D
V
 
V
S
 
I
R
 
N
L
 
L
F
 
V
E
 
Q
T
 
S
V
 
A
D
 
I
K
 
K
E
 
E
L
 
F
G
 
G
S
 
K
L
 
L
S
 
D
V
 
V
L
 
M
V
 
I
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
-
L
 
L
R
x
E
Q
 
N
Q
 
P
C
 
V
R
 
S
L
 
S
D
 
H
E
 
E
I
 
M
S
 
S
E
 
L
D
 
S
R
x
D
F
 
W
S
 
N
E
 
K
V
|
V
L
 
I
R
 
D
V
 
T
N
 
N
V
 
L
M
 
T
G
 
G
C
 
A
F
 
F
L
 
L
C
 
G
C
 
S
K
 
R
E
 
E
A
 
A
V
 
I
K
 
K
R
 
Y
M
 
F
S
 
V
T
x
E
K
 
N
Y
 
-
G
 
-
G
 
D
V
 
I
G
 
K
G
 
G
A
 
T
I
 
V
V
 
I
N
 
N
V
 
M
S
 
S
S
 
S
R
 
V
A
 
H
S
 
E
V
 
K
T
 
I
G
 
P
S
 
W
P
 
P
N
 
-
E
 
L
Y
 
F
V
 
V
D
 
H
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
S
K
 
K
G
 
G
A
 
G
I
 
M
D
 
K
T
 
L
L
 
M
T
 
T
R
 
E
G
 
T
L
 
L
A
 
A
L
 
L
E
 
E
V
 
Y
A
 
A
A
 
P
E
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
|
V
N
 
N
G
 
N
V
 
I
R
 
G
P
 
P
G
 
G
L
 
A
I
 
I
Y
 
N
T
 
T
E
x
P
M
 
I
H
 
N
A
 
A
S
 
E
G
 
K
-
 
F
G
 
A
E
 
D
S
 
P
N
 
E
R
 
Q
V
 
R
K
 
A
R
 
D
L
 
V
E
|
E
N
 
S
K
 
M
I
 
I
P
 
P
M
 
M
Q
 
G
R
x
Y
G
 
I
G
 
G
E
 
E
P
 
P
S
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
A
E
 
A
A
 
V
I
 
A
Y
 
A
W
 
W
L
 
L
V
 
A
S
 
S
N
 
S
K
 
E
S
 
A
A
 
S
F
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
 
G
S
 
I
F
 
T
I
 
L
E
 
F
P
 
A
S
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M

Sites not aligning to the query:

1g6kA Crystal structure of glucose dehydrogenase mutant e96a complexed with NAD+
38% identity, 98% coverage: 5:250/250 of query aligns to 8:250/261 of 1g6kA

query
sites
1g6kA
K
 
K
V
 
V
A
 
V
I
 
V
I
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
S
S
 
S
R
x
T
G
|
G
I
x
L
G
 
G
A
 
K
E
 
S
T
 
M
A
 
A
K
 
I
L
 
R
L
 
F
A
 
A
L
 
T
N
 
E
G
 
K
Y
 
A
A
 
K
V
 
V
C
 
V
V
 
V
N
 
N
Y
 
Y
L
x
R
Q
 
S
D
 
K
D
 
E
A
 
D
A
 
E
A
 
A
Q
 
N
S
 
S
L
 
V
K
 
L
R
 
E
E
 
E
I
 
I
S
 
K
D
 
K
M
 
V
D
 
G
V
 
G
K
 
E
C
 
A
I
 
I
A
 
A
V
 
V
K
 
K
A
 
G
D
|
D
V
|
V
S
 
T
R
 
V
F
 
E
S
 
S
D
 
D
V
 
V
S
 
I
R
 
N
L
 
L
F
 
V
E
 
Q
T
 
S
V
 
A
D
 
I
K
 
K
E
 
E
L
 
F
G
 
G
S
 
K
L
 
L
S
 
D
V
 
V
L
 
M
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
-
L
 
L
R
 
A
Q
 
N
Q
 
P
C
 
V
R
 
S
L
 
S
D
 
H
E
 
E
I
 
M
S
 
S
E
 
L
D
 
S
R
 
D
F
 
W
S
 
N
E
 
K
V
 
V
L
 
I
R
 
D
V
 
T
N
 
N
V
 
L
M
 
T
G
 
G
C
 
A
F
 
F
L
 
L
C
 
G
C
 
S
K
 
R
E
 
E
A
 
A
V
 
I
K
 
K
R
 
Y
M
 
F
S
 
V
T
 
E
K
 
N
Y
 
-
G
 
-
G
 
D
V
 
I
G
 
K
G
 
G
A
 
T
I
 
V
V
 
I
N
 
N
V
x
M
S
 
S
S
|
S
R
 
V
A
 
H
S
 
E
V
 
K
T
 
I
G
 
P
S
 
W
P
 
P
N
 
-
E
 
L
Y
 
F
V
 
V
D
 
H
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
A
 
G
I
 
M
D
 
K
T
 
L
L
 
M
T
 
T
R
 
E
G
 
T
L
 
L
A
 
A
L
 
L
E
 
E
V
 
Y
A
 
A
A
 
P
E
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
N
V
 
I
R
 
G
P
|
P
G
|
G
L
 
A
I
|
I
Y
 
N
T
|
T
E
 
P
M
 
I
H
 
N
A
 
A
S
 
E
G
 
K
-
 
F
G
 
A
E
 
D
S
 
P
N
 
E
R
 
Q
V
 
R
K
 
A
R
 
D
L
 
V
E
 
E
N
 
S
K
 
M
I
 
I
P
 
P
M
 
M
Q
 
G
R
 
Y
G
 
I
G
 
G
E
 
E
P
 
P
S
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
A
E
 
A
A
 
V
I
 
A
Y
 
A
W
 
W
L
 
L
V
 
A
S
 
S
N
 
S
K
 
E
S
 
A
A
 
S
F
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
 
G
S
 
I
F
 
T
I
 
L
E
 
F
P
 
A
S
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M

3ay6B Crystal structure of bacillus megaterium glucose dehydrogenase 4 a258f mutant in complex with nadh and d-glucose (see paper)
36% identity, 99% coverage: 3:250/250 of query aligns to 12:256/267 of 3ay6B

query
sites
3ay6B
R
 
K
N
 
D
K
 
K
V
 
V
A
 
V
I
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
S
 
S
R
x
T
G
|
G
I
x
L
G
 
G
A
 
R
E
 
A
T
 
M
A
 
A
K
 
V
L
 
R
L
 
F
A
 
G
L
 
Q
N
 
E
G
 
E
Y
 
A
A
 
K
V
 
V
C
 
V
V
 
I
N
 
N
Y
 
Y
L
x
Y
Q
 
N
D
 
N
D
 
E
A
 
E
A
 
E
A
 
A
Q
 
L
S
 
D
L
 
A
K
 
K
R
 
K
E
 
E
I
 
V
S
 
E
D
 
E
M
 
A
D
 
G
V
 
G
K
 
Q
C
 
A
I
 
I
A
 
I
V
 
V
K
 
Q
A
 
G
D
|
D
V
|
V
S
 
T
R
 
K
F
 
E
S
 
E
D
 
D
V
 
V
S
 
V
R
 
N
L
 
L
F
 
V
E
 
Q
T
 
T
V
 
A
D
 
I
K
 
K
E
 
E
L
 
F
G
 
G
S
 
T
L
 
L
S
 
D
V
 
V
L
 
M
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
x
V
L
 
-
R
x
E
Q
 
N
Q
 
P
C
 
V
R
 
P
L
 
S
D
 
H
E
 
E
I
 
L
S
 
S
E
 
L
D
 
D
R
 
N
F
 
W
S
 
N
E
 
K
V
 
V
L
 
I
R
 
D
V
 
T
N
 
N
V
 
L
M
 
T
G
 
G
C
 
A
F
 
F
L
 
L
C
 
G
C
 
S
K
 
R
E
 
E
A
 
A
V
 
I
K
 
K
R
 
Y
M
 
F
S
 
V
T
 
E
K
 
N
Y
 
-
G
 
-
G
 
D
V
 
I
G
 
K
G
 
G
A
 
N
I
 
V
V
 
I
N
 
N
V
x
M
S
 
S
S
|
S
R
 
V
A
x
H
S
 
E
V
 
M
T
 
I
G
 
P
S
x
W
P
 
P
N
 
-
E
 
L
Y
 
F
V
 
V
D
 
H
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
A
 
G
I
 
M
D
 
K
T
 
L
L
 
M
T
 
T
R
 
E
G
 
T
L
 
L
A
 
A
L
 
L
E
 
E
V
 
Y
A
 
A
A
 
P
E
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
N
V
 
I
R
 
G
P
|
P
G
|
G
L
 
A
I
x
M
Y
 
N
T
|
T
E
x
P
M
x
I
H
x
N
A
 
A
S
 
E
G
x
K
G
 
F
E
 
-
S
 
A
N
 
D
R
 
P
V
 
V
K
 
Q
R
 
R
-
 
A
-
 
D
L
 
V
E
 
E
N
 
S
K
 
M
I
 
I
P
 
P
M
 
M
Q
 
G
R
 
Y
G
 
I
G
 
G
E
 
K
P
 
P
S
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
A
E
 
A
A
 
V
I
 
A
Y
 
A
W
 
F
L
 
L
V
 
A
S
 
S
N
 
S
K
 
Q
S
 
A
A
 
S
F
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
 
G
S
 
I
F
 
T
I
 
L
E
 
F
P
 
A
S
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M

3sj7A Structure of beta-ketoacetyl-coa reductase (fabg) from staphylococcus aureus complex with NADPH (see paper)
35% identity, 98% coverage: 5:250/250 of query aligns to 2:237/239 of 3sj7A

query
sites
3sj7A
K
 
K
V
 
S
A
 
A
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
S
|
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
E
 
S
T
 
I
A
 
A
K
 
L
L
 
Q
L
 
L
A
 
A
L
 
E
N
 
E
G
 
G
Y
 
Y
A
 
N
V
 
V
C
 
A
V
 
V
N
|
N
Y
|
Y
L
x
A
Q
x
G
D
x
S
D
 
K
A
 
E
A
 
K
A
 
A
Q
 
E
S
 
A
L
 
V
K
 
V
R
 
E
E
 
E
I
 
I
S
 
K
D
 
A
M
 
K
D
 
G
V
 
V
K
 
D
C
 
S
I
 
F
A
 
A
V
 
I
K
 
Q
A
|
A
D
x
N
V
|
V
S
 
A
R
 
D
F
 
A
S
 
D
D
 
E
V
 
V
S
 
K
R
 
A
L
 
M
F
 
I
E
 
K
T
 
E
V
 
V
D
 
V
K
 
S
E
 
Q
L
 
F
G
 
G
S
 
S
L
 
L
S
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
L
 
T
R
 
R
Q
 
D
Q
 
N
C
 
L
R
 
-
L
 
L
D
 
M
E
 
R
I
 
M
S
 
K
E
 
E
D
 
Q
R
 
E
F
 
W
S
 
D
E
 
D
V
 
V
L
 
I
R
 
D
V
x
T
N
 
N
V
 
L
M
 
K
G
 
G
C
 
V
F
 
F
L
 
N
C
 
C
C
 
I
K
 
Q
E
 
K
A
 
A
V
 
T
K
 
P
R
 
Q
M
 
M
S
 
L
T
 
R
K
 
Q
Y
 
R
G
 
-
G
 
-
V
 
-
G
 
S
G
 
G
A
 
A
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
 
L
S
 
S
S
|
S
R
 
V
A
 
V
S
 
G
V
 
A
T
 
V
G
 
G
S
 
N
P
 
P
N
 
G
E
x
Q
Y
 
-
V
 
A
D
 
N
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
S
 
T
K
|
K
G
 
A
A
 
G
I
 
V
D
 
I
T
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
K
G
 
S
L
 
A
A
 
A
L
 
R
E
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
S
E
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
G
 
A
V
 
V
R
 
A
P
|
P
G
|
G
L
 
F
I
 
I
Y
 
V
T
 
S
E
 
D
M
 
M
H
 
T
A
 
D
S
 
E
G
 
L
G
 
K
E
 
E
S
 
-
N
 
-
R
 
-
V
 
-
K
 
-
R
 
Q
L
 
M
E
 
L
N
 
T
K
 
Q
I
 
I
P
 
P
M
 
L
Q
 
A
R
 
R
G
 
F
G
 
G
E
 
Q
P
 
D
S
 
T
E
 
D
V
 
I
A
 
A
E
 
N
A
 
T
I
 
V
Y
 
A
W
 
F
L
 
L
V
 
A
S
 
S
N
 
D
K
 
K
S
 
A
A
 
K
F
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
Q
F
 
T
I
 
I
E
 
H
P
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M

4iinA Crystal structure of a putative 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase from helicobacter pylori 26695 complexed with NAD+
37% identity, 98% coverage: 5:250/250 of query aligns to 7:234/236 of 4iinA

query
sites
4iinA
K
 
K
V
 
N
A
 
V
I
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
S
 
S
R
 
K
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
A
E
 
E
T
 
I
A
 
A
K
 
K
L
 
T
L
 
L
A
 
A
L
 
S
N
 
M
G
 
G
Y
 
L
A
 
K
V
 
V
C
 
W
V
 
I
N
|
N
Y
 
Y
L
x
R
Q
 
S
D
 
N
D
 
A
A
 
E
A
 
V
A
 
A
Q
 
D
S
 
A
L
 
L
K
 
K
R
 
N
E
 
E
I
 
L
S
 
E
D
 
E
M
 
K
D
 
G
V
 
Y
K
 
K
C
 
A
I
 
A
A
 
V
V
 
I
K
 
K
A
 
F
D
 
D
V
x
A
S
 
A
R
 
S
F
 
E
S
 
S
D
 
D
V
 
F
S
 
I
R
 
E
L
 
A
F
 
I
E
 
Q
T
 
T
V
 
I
D
 
V
K
 
Q
E
 
S
L
 
D
G
 
G
S
 
G
L
 
L
S
 
S
V
 
Y
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
V
L
 
V
R
 
R
Q
 
D
Q
 
K
C
 
L
R
 
A
L
 
I
D
 
K
E
 
M
I
 
K
S
 
T
E
 
E
D
 
D
R
 
-
F
 
F
S
 
H
E
 
H
V
 
V
L
 
I
R
 
D
V
 
N
N
 
N
V
 
L
M
 
T
G
 
S
C
 
A
F
 
F
L
 
I
C
 
G
C
 
C
K
 
R
E
 
E
A
 
A
V
 
L
K
 
K
R
 
V
M
 
M
S
 
S
-
 
K
T
 
S
K
 
R
Y
 
F
G
 
-
G
 
-
V
 
-
G
 
-
G
 
G
A
 
S
I
 
V
V
 
V
N
 
N
V
|
V
S
 
A
S
|
S
R
 
I
A
 
I
S
 
G
V
 
E
T
 
R
G
 
G
S
 
N
P
 
M
N
 
G
E
 
Q
Y
 
-
V
 
T
D
 
N
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
A
 
G
I
 
M
D
 
I
T
 
A
L
 
M
T
 
S
R
 
K
G
 
S
L
 
F
A
 
A
L
 
Y
E
 
E
V
 
G
A
 
A
A
 
L
E
 
R
G
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
F
N
 
N
G
 
S
V
 
V
R
 
T
P
|
P
G
 
G
L
 
F
I
 
I
Y
 
-
T
 
-
E
 
-
M
 
-
H
 
-
A
 
-
S
 
-
G
 
-
G
 
-
E
 
E
S
 
T
N
 
D
R
 
Y
V
 
V
K
 
K
R
 
N
L
 
-
E
 
-
N
 
-
K
 
-
I
 
I
P
 
P
M
 
L
Q
 
N
R
 
R
G
 
L
G
 
G
E
 
S
P
 
A
S
 
K
E
 
E
V
 
V
A
 
A
E
 
E
A
 
A
I
 
V
Y
 
A
W
 
F
L
 
L
V
 
L
S
 
S
N
 
D
K
 
H
S
 
S
A
 
S
F
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
E
F
 
T
I
 
L
E
 
K
P
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
L

8w0oA Gdh-105 crystal structure
34% identity, 99% coverage: 3:250/250 of query aligns to 6:250/259 of 8w0oA

query
sites
8w0oA
R
 
K
N
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
V
I
 
A
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
S
 
A
R
x
S
G
|
G
I
x
L
G
 
G
A
 
K
E
 
A
T
 
M
A
 
A
K
 
I
L
 
R
L
 
F
A
 
G
L
 
K
N
 
E
G
 
Q
Y
 
A
A
 
K
V
 
V
C
 
V
V
 
I
N
 
N
Y
 
Y
L
x
Y
Q
 
S
D
 
N
D
 
K
A
x
Q
A
 
D
A
 
P
Q
 
N
S
 
E
L
 
V
K
 
K
R
 
E
E
 
E
I
 
V
S
 
I
D
 
K
M
 
A
D
 
G
V
 
G
K
 
E
C
 
A
I
 
V
A
 
V
V
 
V
K
 
Q
A
 
G
D
|
D
V
|
V
S
 
T
R
 
K
F
 
E
S
 
E
D
 
D
V
 
V
S
 
K
R
 
N
L
 
I
F
 
V
E
 
Q
T
 
T
V
 
A
D
 
I
K
 
K
E
 
E
L
 
F
G
 
G
S
 
T
L
 
L
S
 
D
V
 
I
L
 
M
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
-
L
 
L
R
 
E
Q
 
N
Q
 
P
C
 
V
R
 
P
L
 
S
D
 
H
E
 
E
I
 
M
S
 
P
E
 
L
D
 
K
R
 
D
F
 
W
S
 
D
E
 
K
V
 
V
L
 
I
R
 
G
V
 
T
N
 
N
V
 
L
M
 
T
G
 
G
C
 
A
F
 
F
L
 
L
C
 
G
C
 
S
K
 
R
E
 
E
A
 
A
V
 
I
K
 
K
R
 
Y
M
 
F
S
 
V
T
 
E
K
 
N
Y
 
-
G
 
-
G
 
D
V
 
I
G
 
K
G
 
G
A
 
N
I
 
V
V
 
I
N
 
N
V
x
M
S
 
S
S
 
S
R
 
V
A
 
H
S
 
E
V
 
V
T
 
I
G
 
P
S
 
W
P
 
P
N
 
-
E
 
L
Y
 
F
V
 
V
D
 
H
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
A
 
G
I
 
M
D
 
K
T
 
L
L
 
M
T
 
T
R
 
K
G
 
T
L
 
L
A
 
A
L
 
L
E
 
E
V
 
Y
A
 
A
A
 
P
E
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
N
V
 
I
R
 
G
P
|
P
G
|
G
L
 
A
I
|
I
Y
 
N
T
|
T
E
 
T
M
 
I
H
 
N
A
 
A
S
 
E
G
 
K
G
 
F
E
 
A
S
 
D
N
 
P
R
 
K
V
 
Q
K
 
K
-
 
A
R
 
D
L
 
V
E
 
E
N
 
S
K
 
M
I
 
I
P
 
P
M
 
M
Q
 
G
R
 
Y
G
 
I
G
 
G
E
 
E
P
 
P
S
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
A
E
 
A
A
 
V
I
 
A
Y
 
A
W
 
W
L
 
L
V
 
A
S
 
S
N
 
K
K
 
E
S
 
A
A
 
S
F
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
 
G
S
 
I
F
 
T
I
 
L
E
 
F
P
 
A
S
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
34% identity, 99% coverage: 3:250/250 of query aligns to 4:245/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
R
 
Q
N
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
S
|
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
E
 
D
T
 
I
A
 
A
K
 
I
L
 
N
L
 
L
A
 
A
L
 
K
N
 
E
G
 
G
Y
 
A
A
 
N
V
 
I
C
 
F
V
 
F
N
|
N
Y
|
Y
L
x
N
Q
x
G
D
x
S
D
 
P
A
 
E
A
 
A
A
 
A
Q
 
E
S
 
E
L
 
T
K
 
A
R
 
K
E
 
L
I
 
V
S
 
A
D
 
E
M
 
H
D
 
G
V
 
V
K
 
E
C
 
V
I
 
E
A
 
A
V
 
M
K
 
K
A
 
A
D
x
N
V
|
V
S
 
A
R
 
I
F
 
A
S
 
E
D
 
D
V
 
V
S
 
D
R
 
A
L
 
F
F
 
F
E
 
K
T
 
Q
V
 
A
D
 
I
K
 
E
E
 
R
L
 
F
G
 
G
S
 
R
L
 
V
S
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
|
I
L
 
T
R
 
R
Q
 
D
Q
 
N
C
 
L
R
 
-
L
 
L
D
 
M
E
 
R
I
 
M
S
 
K
E
 
E
D
 
D
R
 
E
F
 
W
S
 
D
E
 
D
V
 
V
L
 
I
R
 
N
V
x
I
N
 
N
V
 
L
M
 
K
G
 
G
C
 
T
F
 
F
L
 
L
C
 
C
C
 
T
K
 
K
E
 
A
A
 
V
V
 
S
K
 
R
R
 
T
M
 
M
S
 
M
T
 
K
K
 
Q
Y
 
R
G
 
-
G
 
-
V
 
-
G
 
A
G
 
G
A
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
 
M
S
 
A
S
|
S
R
 
V
A
 
V
S
 
G
V
 
L
T
 
I
G
 
G
S
 
N
P
 
A
N
 
G
E
x
Q
Y
 
-
V
 
A
D
 
N
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
A
A
 
G
I
 
V
D
 
I
T
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
K
G
 
T
L
 
T
A
 
A
L
 
R
E
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
P
E
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
G
 
A
V
 
V
R
 
A
P
|
P
G
 
G
L
 
F
I
|
I
Y
 
T
T
|
T
E
 
D
M
 
M
H
 
T
A
 
D
S
 
K
G
 
L
G
 
D
E
 
E
S
 
K
N
 
T
R
 
K
V
 
E
K
 
A
R
 
M
L
 
L
E
 
A
N
 
-
K
 
Q
I
 
I
P
 
P
M
 
L
Q
 
G
R
 
A
G
 
Y
G
 
G
E
 
T
P
 
T
S
 
E
E
 
D
V
 
I
A
 
A
E
 
N
A
 
A
I
 
V
Y
 
L
W
 
F
L
 
L
V
 
A
S
 
S
N
 
D
K
 
A
S
 
S
A
 
K
F
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
Q
F
 
T
I
 
L
E
 
S
P
 
V
S
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M

4cqmF Crystal structure of heterotetrameric human ketoacyl reductase complexed with NAD and NADP (see paper)
38% identity, 99% coverage: 4:250/250 of query aligns to 6:237/241 of 4cqmF

query
sites
4cqmF
N
 
D
K
 
K
V
 
V
A
 
C
I
 
A
I
 
V
T
 
F
G
|
G
G
 
G
S
 
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
E
 
A
T
 
V
A
 
A
K
 
Q
L
 
L
L
 
M
A
 
A
L
 
R
N
 
K
G
 
G
Y
 
Y
-
 
R
-
 
L
A
 
A
V
 
V
C
 
I
V
x
A
N
x
R
Y
x
N
L
 
L
Q
 
E
D
 
G
D
 
A
A
 
K
A
 
A
A
 
A
Q
 
A
S
 
G
L
 
-
K
 
-
R
 
-
E
 
-
I
 
-
S
 
-
D
 
D
M
 
L
D
 
G
V
 
G
K
 
D
C
 
H
I
 
L
A
 
A
V
 
F
K
 
S
A
 
C
D
|
D
V
|
V
S
 
A
R
 
K
F
 
E
S
 
H
D
 
D
V
 
V
S
 
Q
R
 
N
L
 
T
F
 
F
E
 
E
T
 
E
V
 
L
D
 
E
K
 
K
E
 
H
L
 
L
G
 
G
S
 
R
L
 
V
S
 
N
V
 
F
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
x
A
A
|
A
G
|
G
I
 
I
L
 
N
R
 
R
Q
 
D
Q
 
G
C
 
L
R
 
L
L
 
V
D
 
R
E
 
T
I
 
K
S
 
T
E
 
E
D
 
D
R
 
M
F
 
V
S
 
S
E
 
Q
V
 
-
L
 
L
R
 
H
V
 
T
N
 
N
V
 
L
M
 
L
G
 
G
C
 
S
F
 
M
L
 
L
C
 
T
C
 
C
K
 
K
E
 
A
A
 
A
V
 
M
K
 
R
R
 
T
M
 
M
S
 
I
T
 
Q
K
 
Q
Y
 
Q
G
 
G
G
 
G
V
 
-
G
 
-
G
 
-
A
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
N
V
|
V
S
 
G
S
|
S
R
 
I
A
 
V
S
 
G
V
 
L
T
 
K
G
 
G
S
 
N
P
 
S
N
 
G
E
x
Q
Y
 
S
V
 
V
D
 
-
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
A
 
G
I
 
L
D
 
V
T
 
G
L
 
F
T
 
S
R
 
R
G
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
K
E
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
R
E
 
K
G
 
K
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
V
V
 
V
R
 
A
P
 
P
G
 
G
L
 
F
I
x
V
Y
 
H
T
|
T
E
 
D
M
|
M
H
 
T
A
 
K
S
 
D
G
 
L
G
 
K
E
 
E
S
 
E
N
 
H
R
 
-
V
 
-
K
 
-
R
 
-
L
 
L
E
 
K
N
 
K
K
 
N
I
 
I
P
 
P
M
 
L
Q
 
G
R
 
R
G
 
F
G
 
G
E
 
E
P
 
T
S
 
I
E
 
E
V
 
V
A
 
A
E
 
H
A
 
A
I
 
V
Y
 
V
W
 
F
L
 
L
V
 
L
S
 
-
N
 
-
K
 
E
S
 
S
A
 
P
F
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
H
F
 
V
I
 
L
E
 
V
P
 
V
S
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
L

8jfgA Crystal structure of 3-oxoacyl-acp reductase fabg in complex with NADP+ and 3-keto-octanoyl-acp from helicobacter pylori (see paper)
36% identity, 98% coverage: 5:250/250 of query aligns to 7:246/248 of 8jfgA

query
sites
8jfgA
K
 
K
V
 
N
A
 
V
I
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
S
 
S
R
x
K
G
 
G
I
|
I
G
 
G
A
 
A
E
 
E
T
 
I
A
 
A
K
 
R
L
 
T
L
 
L
A
 
A
L
 
S
N
 
M
G
 
G
Y
 
L
A
 
K
V
 
V
C
 
W
V
 
I
N
 
N
Y
 
Y
L
x
R
Q
 
S
D
 
N
D
 
A
A
 
E
A
 
V
A
 
A
Q
 
D
S
 
A
L
 
L
K
 
K
R
 
N
E
 
E
I
 
L
S
 
E
D
 
E
M
 
K
D
 
G
V
 
Y
K
 
K
C
 
A
I
 
A
A
 
V
V
 
I
K
 
K
A
 
F
D
 
D
V
x
A
S
 
A
R
 
S
F
 
E
S
 
S
D
 
D
V
 
F
S
 
V
R
 
E
L
 
A
F
 
I
E
 
Q
T
 
A
V
 
I
D
 
V
K
 
Q
E
 
S
L
 
D
G
 
G
S
 
G
L
 
L
S
 
S
V
 
Y
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
V
L
 
V
R
 
R
Q
x
D
Q
 
K
C
 
L
R
 
A
L
 
I
D
 
K
E
 
M
I
 
K
S
 
T
E
 
E
D
 
D
R
 
-
F
 
F
S
 
H
E
 
H
V
 
V
L
 
I
R
 
D
V
 
N
N
 
N
V
 
L
M
 
T
G
 
S
C
 
A
F
 
F
L
 
I
C
 
G
C
 
C
K
 
R
E
 
E
A
 
A
V
 
L
K
 
K
R
 
V
M
 
M
S
 
S
-
 
K
T
 
S
K
 
R
Y
 
F
G
 
-
G
 
-
V
 
-
G
 
-
G
 
G
A
 
S
I
 
V
V
 
V
N
 
N
V
 
I
S
x
A
S
|
S
R
 
I
A
x
I
S
 
G
V
 
E
T
 
R
G
 
G
S
 
N
P
x
M
N
x
G
E
x
Q
Y
 
-
V
 
T
D
 
N
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
A
 
G
I
 
M
D
 
I
T
 
A
L
 
M
T
 
S
R
 
K
G
 
S
L
 
F
A
 
A
L
 
Y
E
 
E
V
 
G
A
 
A
A
 
L
E
 
R
G
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
F
N
 
N
G
 
S
V
 
V
R
 
T
P
|
P
G
|
G
L
x
F
I
|
I
Y
 
E
T
|
T
E
 
D
M
|
M
H
x
N
A
 
A
S
 
N
G
 
L
G
 
K
E
 
D
S
 
E
N
 
L
R
 
K
V
 
A
K
 
D
R
x
Y
L
 
V
E
 
K
N
 
N
K
 
-
I
 
I
P
 
P
M
 
L
Q
 
N
R
 
R
G
 
L
G
 
G
E
 
A
P
 
A
S
 
K
E
 
E
V
 
V
A
 
A
E
 
E
A
 
A
I
 
V
Y
 
A
W
 
F
L
 
L
V
 
L
S
 
S
N
 
D
K
 
H
S
 
S
A
 
S
F
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
E
F
 
T
I
 
L
E
 
K
P
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
L

Q8N4T8 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase; 3-ketoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase beta subunit; KAR beta subunit; Carbonyl reductase family member 4; CBR4; Quinone reductase CBR4; Short chain dehydrogenase/reductase family 45C member 1; EC 1.1.1.100; EC 1.6.5.10 from Homo sapiens (Human) (see 4 papers)
38% identity, 99% coverage: 4:250/250 of query aligns to 2:233/237 of Q8N4T8

query
sites
Q8N4T8
N
 
D
K
 
K
V
 
V
A
 
C
I
 
A
I
 
V
T
 
F
G
|
G
G
 
G
S
|
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
E
 
A
T
 
V
A
 
A
K
 
Q
L
 
L
L
 
M
A
 
A
L
 
R
N
 
K
G
 
G
Y
 
Y
-
 
R
-
 
L
A
 
A
V
 
V
C
 
I
V
 
A
N
x
R
Y
x
N
L
 
L
Q
 
E
D
 
G
D
 
A
A
 
K
A
 
A
A
 
A
Q
 
A
S
 
G
L
 
-
K
 
-
R
 
-
E
 
-
I
 
-
S
 
-
D
 
D
M
 
L
D
 
G
V
 
G
K
 
D
C
 
H
I
 
L
A
 
A
V
 
F
K
 
S
A
 
C
D
|
D
V
 
V
S
 
A
R
 
K
F
 
E
S
 
H
D
 
D
V
 
V
S
 
Q
R
 
N
L
 
T
F
 
F
E
 
E
T
 
E
V
x
L
D
 
E
K
 
K
E
 
H
L
 
L
G
 
G
S
 
R
L
 
V
S
 
N
V
 
F
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
x
A
A
|
A
G
|
G
I
 
I
L
 
N
R
 
R
Q
 
D
Q
 
G
C
 
L
R
 
L
L
 
V
D
 
R
E
 
T
I
 
K
S
 
T
E
 
E
D
 
D
R
 
M
F
 
V
S
 
S
E
 
Q
V
 
-
L
 
L
R
 
H
V
 
T
N
 
N
V
 
L
M
 
L
G
 
G
C
 
S
F
 
M
L
 
L
C
 
T
C
 
C
K
 
K
E
 
A
A
 
A
V
 
M
K
 
R
R
 
T
M
 
M
S
 
I
T
 
Q
K
 
Q
Y
 
Q
G
 
G
G
 
G
V
 
-
G
 
-
G
 
-
A
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
N
V
 
V
S
 
G
S
|
S
R
 
I
A
 
V
S
 
G
V
 
L
T
 
K
G
 
G
S
 
N
P
 
S
N
 
G
E
 
Q
Y
 
S
V
 
V
D
 
-
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
A
 
G
I
 
L
D
 
V
T
 
G
L
 
F
T
 
S
R
 
R
G
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
K
E
 
E
V
 
V
A
 
A
A
x
R
E
x
K
G
 
K
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
V
V
 
V
R
 
A
P
 
P
G
 
G
L
 
F
I
x
V
Y
x
H
T
|
T
E
 
D
M
 
M
H
 
T
A
 
K
S
 
D
G
 
L
G
 
K
E
 
E
S
 
E
N
 
H
R
 
-
V
 
-
K
 
-
R
 
-
L
 
L
E
 
K
N
 
K
K
 
N
I
 
I
P
 
P
M
 
L
Q
 
G
R
 
R
G
 
F
G
 
G
E
 
E
P
 
T
S
 
I
E
 
E
V
 
V
A
 
A
E
 
H
A
 
A
I
 
V
Y
 
V
W
 
F
L
 
L
V
 
L
S
 
-
N
 
-
K
 
E
S
 
S
A
 
P
F
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
H
F
 
V
I
 
L
E
 
V
P
 
V
S
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
L

P73574 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; EC 1.1.1.100 from Synechocystis sp. (strain PCC 6803 / Kazusa) (see paper)
37% identity, 98% coverage: 5:250/250 of query aligns to 7:244/247 of P73574

query
sites
P73574
K
 
Q
V
 
V
A
 
A
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
G
x
A
S
 
S
R
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
K
E
 
A
T
 
T
A
 
A
K
 
L
L
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
A
N
 
T
G
 
G
Y
 
M
A
 
K
V
 
V
C
 
V
V
 
V
N
 
N
Y
 
Y
L
 
A
Q
 
Q
D
 
S
D
 
S
A
 
T
A
 
A
A
 
A
Q
 
D
S
 
A
L
 
V
K
 
V
R
 
A
E
 
E
I
 
I
S
 
I
D
 
A
M
 
N
D
 
G
V
 
G
K
 
E
C
 
A
I
 
I
A
 
A
V
 
V
K
 
Q
A
 
A
D
 
N
V
 
V
S
 
A
R
 
N
F
 
A
S
 
D
D
 
E
V
 
V
S
 
D
R
 
Q
L
 
L
F
 
I
E
 
K
T
 
T
V
 
T
D
 
L
K
 
D
E
 
K
L
 
F
G
 
S
S
 
R
L
 
I
S
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
L
 
T
R
 
R
Q
 
D
Q
 
T
C
 
L
R
 
L
L
 
L
D
 
R
E
 
M
I
 
K
S
 
L
E
 
E
D
 
D
R
 
-
F
 
W
S
 
Q
E
 
A
V
 
V
L
 
I
R
 
D
V
 
L
N
 
N
V
 
L
M
 
T
G
 
G
C
 
V
F
 
F
L
 
L
C
 
C
C
 
T
K
 
K
E
 
A
A
 
V
V
 
S
K
 
K
R
 
L
M
 
M
S
 
L
T
 
K
K
 
Q
Y
 
K
G
 
-
G
 
-
V
 
-
G
 
S
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
 
I
S
 
T
S
 
S
R
 
V
A
 
A
S
 
G
V
 
M
T
 
M
G
 
G
S
 
N
P
|
P
N
 
G
E
 
Q
Y
 
-
V
 
A
D
 
N
Y
 
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
A
A
 
G
I
 
V
D
 
I
T
 
G
L
 
F
T
 
T
R
 
K
G
 
T
L
 
V
A
 
A
L
 
K
E
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
S
E
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
T
V
 
V
N
 
N
G
 
A
V
 
V
R
 
A
P
 
P
G
 
G
L
x
F
I
 
I
Y
 
A
T
 
T
E
 
D
M
 
M
H
 
T
A
 
-
S
 
-
G
 
-
G
 
-
E
 
E
S
 
N
N
 
L
R
x
N
V
 
A
K
 
E
R
 
P
L
 
I
E
 
L
N
 
Q
K
 
F
I
 
I
P
 
P
M
 
L
Q
 
A
R
 
R
G
 
Y
G
 
G
E
 
Q
P
 
P
S
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
A
E
 
G
A
 
T
I
 
I
Y
 
R
W
 
F
L
 
L
V
 
A
S
 
T
N
 
D
K
 
P
-
 
A
S
 
A
A
 
A
F
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
Q
F
 
T
I
 
F
E
 
N
P
 
V
S
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M

3r3sA Structure of the ygha oxidoreductase from salmonella enterica
33% identity, 95% coverage: 3:240/250 of query aligns to 46:279/292 of 3r3sA

query
sites
3r3sA
R
 
K
N
 
D
K
 
R
V
 
K
A
 
A
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
S
x
D
R
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
E
 
A
T
 
A
A
 
A
K
 
I
L
 
A
L
 
Y
A
 
A
L
 
R
N
 
E
G
 
G
Y
 
A
A
 
D
V
 
V
C
 
A
V
 
I
N
 
N
Y
 
Y
L
|
L
Q
 
P
-
 
A
D
x
E
D
 
E
A
 
E
A
 
D
A
 
A
Q
 
Q
S
 
Q
L
 
V
K
 
K
R
 
A
E
 
L
I
 
I
S
 
E
D
 
E
M
 
C
D
 
G
V
 
R
K
 
K
C
 
A
I
 
V
A
 
L
V
 
L
K
 
P
A
 
G
D
|
D
V
x
L
S
 
S
R
 
D
F
 
E
S
 
S
D
 
F
V
 
A
S
 
R
R
 
S
L
 
L
F
 
V
E
 
H
T
 
K
V
 
A
D
 
R
K
 
E
E
 
A
L
 
L
G
 
G
S
 
G
L
 
L
S
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
A
N
 
L
N
x
V
A
|
A
G
|
G
I
 
K
L
 
Q
R
 
T
Q
 
A
Q
 
I
C
 
P
R
 
E
L
 
I
D
 
K
E
 
D
I
 
L
S
 
T
E
 
S
D
 
E
R
 
Q
F
 
F
S
 
Q
E
 
Q
V
 
T
L
 
F
R
 
A
V
 
V
N
 
N
V
 
V
M
 
F
G
 
A
C
 
L
F
 
F
L
 
W
C
 
I
C
 
T
K
 
Q
E
 
E
A
 
A
V
 
I
K
 
P
R
 
L
M
 
L
S
 
P
T
 
K
K
 
-
Y
 
-
G
 
-
G
 
-
V
 
-
G
 
G
G
 
A
A
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
T
V
 
T
S
 
S
S
|
S
R
 
I
A
 
Q
S
 
A
V
 
Y
T
 
Q
G
 
P
S
 
S
P
 
P
N
 
H
E
 
-
Y
x
L
V
 
L
D
 
D
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
T
K
|
K
G
 
A
A
 
A
I
 
I
D
 
L
T
 
N
L
 
Y
T
 
S
R
 
R
G
 
G
L
 
L
A
 
A
L
 
K
E
 
Q
V
 
V
A
 
A
A
 
E
E
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
I
V
 
V
R
 
A
P
|
P
G
|
G
L
 
P
I
|
I
Y
 
W
T
|
T
E
 
A
M
x
L
H
x
Q
A
 
I
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
S
 
T
-
x
Q
N
 
D
R
 
K
V
 
I
K
 
P
R
 
Q
L
 
F
E
 
G
N
 
Q
K
 
Q
I
 
T
P
 
P
M
 
M
Q
 
K
R
 
R
G
 
A
G
 
G
E
 
Q
P
 
P
S
 
A
E
 
E
V
 
L
A
 
A
E
 
P
A
 
V
I
 
Y
Y
 
V
W
 
Y
L
 
L
V
 
A
S
 
S
N
 
Q
K
 
E
S
 
S
A
 
S
F
 
Y
V
 
V
T
 
T

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
33% identity, 100% coverage: 1:250/250 of query aligns to 2:242/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
M
 
M
S
 
S
R
 
R
-
 
L
-
 
Q
N
 
D
K
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
I
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
S
 
A
R
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
E
 
E
T
 
A
A
 
A
K
 
R
L
 
V
L
 
F
A
 
M
L
 
K
N
 
E
G
 
G
Y
 
A
A
 
K
V
 
V
C
 
V
V
 
I
N
 
A
Y
x
D
L
x
F
Q
 
N
D
 
E
D
 
A
A
 
A
A
 
G
A
 
-
Q
 
-
S
 
-
L
 
-
K
 
-
R
 
K
E
 
E
I
 
A
S
 
V
D
 
E
M
 
A
D
 
N
V
 
P
K
 
G
C
 
V
I
 
V
A
 
F
V
 
I
K
 
R
A
x
V
D
|
D
V
|
V
S
 
S
R
 
D
F
 
R
S
 
E
D
 
S
V
 
V
S
 
H
R
 
R
L
 
L
F
 
V
E
 
E
T
 
N
V
 
V
D
 
A
K
 
E
E
 
R
L
 
F
G
 
G
S
 
K
L
 
I
S
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
L
 
T
R
 
R
Q
x
D
Q
 
S
C
 
M
R
 
-
L
 
L
D
 
S
E
x
K
I
 
M
S
 
T
E
 
V
D
 
D
R
 
Q
F
 
F
S
 
Q
E
 
Q
V
 
V
L
 
I
R
 
N
V
 
V
N
|
N
V
 
L
M
 
T
G
 
G
C
 
V
F
 
F
L
 
H
C
 
C
C
 
T
K
 
Q
E
 
A
A
 
V
V
 
L
K
 
P
R
 
Y
M
 
M
S
 
A
T
 
E
K
 
Q
Y
 
G
G
 
K
G
 
G
V
 
-
G
 
-
G
 
-
A
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
x
T
S
 
S
S
|
S
R
 
V
A
 
T
S
 
G
V
 
T
T
 
Y
G
 
G
S
x
N
P
x
V
N
 
G
E
x
Q
Y
 
-
V
 
T
D
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
A
A
 
G
I
 
V
D
 
I
T
 
G
L
 
M
T
 
T
R
 
K
G
 
T
L
 
W
A
 
A
L
 
K
E
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
R
E
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
G
 
A
V
 
V
R
 
A
P
|
P
G
 
G
L
x
F
I
x
T
Y
 
E
T
|
T
E
 
A
M
|
M
H
 
V
A
 
A
S
 
E
G
 
V
G
 
P
E
 
E
S
 
K
N
 
-
R
 
V
V
 
I
K
 
E
R
x
K
L
 
M
E
 
K
N
 
A
K
 
Q
I
 
V
P
 
P
M
 
M
Q
 
G
R
 
R
G
 
L
G
 
G
E
 
K
P
 
P
S
 
E
E
 
D
V
 
I
A
 
A
E
 
N
A
 
A
I
 
Y
Y
 
L
W
 
F
L
 
L
V
 
A
S
 
S
N
 
H
K
 
E
S
 
S
A
 
D
F
 
Y
V
 
V
T
 
N
G
 
G
S
 
H
F
 
V
I
 
L
E
 
H
P
 
V
S
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
I

Query Sequence

>WP_015820561.1 NCBI__GCF_000023025.1:WP_015820561.1
MSRNKVAIITGGSRGIGAETAKLLALNGYAVCVNYLQDDAAAQSLKREISDMDVKCIAVK
ADVSRFSDVSRLFETVDKELGSLSVLVNNAGILRQQCRLDEISEDRFSEVLRVNVMGCFL
CCKEAVKRMSTKYGGVGGAIVNVSSRASVTGSPNEYVDYAASKGAIDTLTRGLALEVAAE
GIRVNGVRPGLIYTEMHASGGESNRVKRLENKIPMQRGGEPSEVAEAIYWLVSNKSAFVT
GSFIEPSGGL

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory