SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_015898939.1 NCBI__GCF_000021565.1:WP_015898939.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6thqB Crystal structure of branched-chain aminotransferase from thermophilic archaea thermoproteus uzoniensis with norvaline
42% identity, 99% coverage: 4:301/302 of query aligns to 9:300/301 of 6thqB

query
sites
6thqB
I
 
V
Y
 
W
F
 
L
E
 
D
G
 
G
K
 
R
I
 
L
V
 
V
P
 
D
E
 
E
D
 
E
Q
 
E
A
 
A
K
 
K
I
 
V
S
 
T
I
 
V
K
 
L
T
 
S
N
 
P
S
 
S
F
 
L
H
 
N
Y
 
Y
G
 
G
T
 
F
A
 
G
I
 
V
F
|
F
E
 
E
G
 
G
I
 
I
R
 
R
A
 
A
Y
 
Y
Y
 
W
D
 
N
K
 
G
D
 
E
T
 
N
D
 
-
R
 
-
M
 
L
W
 
Y
G
 
V
L
 
F
F
 
R
F
 
L
K
 
R
E
 
D
H
 
H
Y
 
M
E
 
E
R
|
R
L
 
L
F
 
L
Q
 
R
N
 
S
M
 
A
K
 
K
V
 
I
L
 
I
N
 
G
M
 
L
E
 
D
I
 
V
E
 
P
E
 
Y
S
 
T
I
 
A
D
 
E
Q
 
E
L
 
L
V
 
S
E
 
K
I
 
A
T
 
V
K
 
V
E
 
E
L
 
T
I
 
V
R
 
R
K
 
A
N
 
N
N
 
G
I
 
F
K
 
K
D
 
E
D
 
D
I
 
L
Y
|
Y
I
 
I
R
 
R
P
 
P
I
 
V
V
 
A
Y
 
Y
F
 
I
S
 
S
D
 
K
L
 
P
K
 
Q
I
 
I
S
 
S
P
 
L
K
 
D
L
 
V
V
 
R
G
 
G
Y
 
L
K
 
Q
S
 
A
R
 
S
I
 
V
A
 
A
I
 
I
Y
 
A
T
 
A
Y
 
I
P
 
P
L
 
F
G
 
G
D
 
K
Y
 
Y
I
 
L
D
 
K
I
 
V
N
 
-
K
 
E
G
 
G
I
 
V
K
 
R
A
 
A
I
 
A
V
 
V
S
 
V
S
 
S
W
 
W
T
 
R
R
 
R
I
 
V
N
 
H
D
 
T
N
 
S
M
 
M
I
 
M
P
 
P
P
 
V
R
 
M
L
 
A
K
|
K
V
 
A
A
 
T
G
 
G
S
 
I
Y
|
Y
V
 
L
N
 
N
S
 
S
A
 
I
F
 
M
S
 
A
K
 
A
T
 
V
E
 
E
A
 
A
I
 
R
L
 
A
A
 
R
G
 
G
A
 
Y
D
 
D
E
 
E
A
 
A
I
 
I
V
 
M
L
 
L
N
 
N
K
 
A
N
 
E
G
 
G
Y
 
K
V
 
V
S
 
V
E
|
E
G
 
G
S
 
S
A
x
G
E
|
E
N
|
N
I
 
I
F
 
F
I
 
I
V
 
V
R
 
R
D
 
R
G
 
G
K
 
V
L
 
L
I
 
M
T
 
T
P
 
P
P
 
P
V
 
L
S
 
E
D
 
D
D
 
G
I
 
I
L
|
L
E
 
E
G
|
G
I
|
I
T
|
T
R
 
R
N
 
E
A
 
T
I
 
V
I
 
I
T
 
S
I
 
I
A
 
A
K
 
G
D
 
D
L
 
L
G
 
G
Y
 
I
Q
 
P
V
 
L
I
 
L
E
 
E
R
 
K
H
 
S
I
 
I
S
 
T
R
 
R
T
 
E
E
 
E
L
 
L
Y
 
Y
I
 
A
A
 
A
D
 
D
E
 
E
I
 
A
F
 
F
F
 
F
C
 
V
G
|
G
T
|
T
G
x
A
A
 
A
Q
 
E
V
 
I
S
 
T
P
 
P
V
 
I
V
 
I
E
 
E
V
 
I
D
 
D
H
 
G
R
 
R
K
 
V
I
 
L
G
 
-
D
 
-
G
 
-
S
 
Q
P
 
R
G
 
G
K
 
P
I
 
I
T
 
T
K
 
Q
E
 
K
I
 
I
Q
 
A
E
 
E
V
 
T
Y
 
Y
F
 
R
N
 
R
A
 
I
V
 
V
R
 
L
G
 
G
K
 
K
I
 
E
E
 
E
K
 
K
Y
 
Y
R
 
L
H
 
P
W
 
W
V
 
L
I
 
T
P
 
P
I
 
V

2ej0B Crystal structure of t.Th.Hb8 branched-chain amino acid aminotransferase with pyridoxamine 5'-phosphate
42% identity, 99% coverage: 4:302/302 of query aligns to 7:305/305 of 2ej0B

query
sites
2ej0B
I
 
I
Y
 
W
F
 
M
E
 
N
G
 
G
K
 
A
I
 
F
V
 
V
P
 
P
E
 
Q
D
 
E
Q
 
E
A
 
A
K
 
K
I
 
T
S
 
S
I
 
V
K
 
L
T
 
S
N
 
H
S
 
A
F
 
L
H
 
H
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
A
 
S
I
 
V
F
|
F
E
 
E
G
|
G
I
 
I
R
 
R
A
 
A
Y
 
Y
Y
 
-
D
 
-
K
 
-
D
 
E
T
 
T
D
 
A
R
 
K
M
 
G
W
 
P
G
 
A
L
 
I
F
 
F
-
 
R
F
 
L
K
 
K
E
 
E
H
 
H
Y
 
V
E
 
K
R
|
R
L
 
F
F
 
Y
Q
 
N
N
 
S
M
 
A
K
 
K
V
 
V
L
 
L
N
 
R
M
 
M
E
 
E
I
 
I
E
 
P
E
 
F
S
 
A
I
 
P
D
 
E
Q
 
E
L
 
L
V
 
E
E
 
E
I
 
A
T
 
I
K
 
K
E
 
E
L
 
V
I
 
V
R
 
R
K
 
R
N
 
N
N
 
G
I
 
Y
K
 
R
D
 
S
D
 
-
I
 
C
Y
 
Y
I
 
I
R
 
R
P
 
P
I
 
L
V
 
A
Y
 
W
F
 
M
S
 
G
D
 
A
-
 
K
-
 
A
L
 
L
K
 
G
I
 
V
S
 
N
P
 
P
K
 
-
L
 
L
V
 
P
G
 
N
Y
 
N
K
 
P
S
 
A
R
 
E
I
 
V
A
 
M
I
 
V
Y
 
A
T
 
A
Y
 
W
P
 
E
L
 
W
G
 
G
D
 
A
Y
 
Y
I
 
L
D
 
G
-
 
E
-
 
E
-
 
A
I
 
V
N
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
A
K
 
R
A
 
L
I
 
I
V
 
T
S
 
S
S
 
S
W
 
W
T
 
A
R
 
R
I
 
F
N
 
P
D
 
A
N
 
N
M
 
V
I
 
M
P
 
P
P
 
G
R
 
K
L
 
A
K
|
K
V
 
V
A
 
G
G
 
G
S
 
N
Y
|
Y
V
 
V
N
 
N
S
 
S
A
 
A
F
 
L
S
 
A
K
 
K
T
 
M
E
 
E
A
 
A
I
 
V
L
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
E
 
E
A
 
A
I
 
L
V
 
L
L
 
L
N
 
D
K
 
E
N
 
E
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
S
 
A
E
|
E
G
 
G
S
 
S
A
x
G
E
|
E
N
 
N
I
 
L
F
 
F
I
 
F
V
 
V
R
 
R
D
 
D
G
 
G
K
 
V
L
 
I
I
 
Y
T
 
A
P
 
L
P
 
E
V
 
H
S
 
S
D
 
V
D
 
N
I
 
-
L
|
L
E
 
E
G
|
G
I
|
I
T
|
T
R
 
R
N
 
D
A
 
S
I
 
V
I
 
I
T
 
R
I
 
I
A
 
A
K
 
K
D
 
D
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
E
V
 
V
I
 
Q
E
 
V
R
 
V
H
 
R
I
 
A
S
 
T
R
 
R
T
 
D
E
 
Q
L
 
L
Y
 
Y
I
 
M
A
 
A
D
 
D
E
 
E
I
 
V
F
 
F
F
 
M
C
 
T
G
|
G
T
|
T
G
 
A
A
 
A
Q
 
E
V
 
V
S
 
T
P
 
P
V
 
V
V
 
S
E
 
M
V
 
I
D
 
D
H
 
W
R
 
R
K
 
P
I
 
I
G
 
G
D
 
K
G
 
G
S
 
T
P
 
A
G
 
G
K
 
P
I
 
V
T
 
A
K
 
L
E
 
R
I
 
L
Q
 
R
E
 
E
V
 
V
Y
 
Y
F
 
L
N
 
E
A
 
A
V
 
V
R
 
T
G
 
G
K
 
R
I
 
R
E
 
P
K
 
E
Y
 
Y
R
 
E
H
 
G
W
 
W
V
 
L
I
 
T
P
 
Y
I
 
V
D
 
N

1iyeA Crystal structure of eschelichia coli branched-chain amino acid aminotransferase (see paper)
41% identity, 98% coverage: 2:298/302 of query aligns to 3:300/304 of 1iyeA

query
sites
1iyeA
E
 
D
Y
 
Y
I
 
I
Y
 
W
F
 
F
E
 
N
G
 
G
K
 
E
I
 
M
V
 
V
P
 
R
E
 
W
D
 
E
Q
 
D
A
 
A
K
 
K
I
 
V
S
 
H
I
 
V
K
 
M
T
 
S
N
 
H
S
 
A
F
 
L
H
 
H
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
A
 
S
I
 
V
F
|
F
E
 
E
G
|
G
I
 
I
R
 
R
A
 
C
Y
 
Y
Y
 
-
D
 
-
K
 
-
D
 
D
T
 
S
D
 
H
R
 
K
M
 
G
W
 
P
G
 
V
L
 
V
F
 
F
-
 
R
F
 
H
K
 
R
E
 
E
H
 
H
Y
 
M
E
 
Q
R
|
R
L
 
L
F
 
H
Q
 
D
N
 
S
M
 
A
K
 
K
V
 
I
L
 
Y
N
 
R
M
 
F
E
 
P
I
 
V
E
 
S
E
 
Q
S
 
S
I
 
I
D
 
D
Q
 
E
L
 
L
V
 
M
E
 
E
I
 
A
T
 
C
K
 
R
E
 
D
L
 
V
I
 
I
R
 
R
K
 
K
N
 
N
N
 
N
I
 
L
K
 
T
D
 
S
D
 
-
I
 
A
Y
|
Y
I
 
I
R
 
R
P
 
P
I
 
L
V
 
I
Y
 
F
F
 
V
S
 
G
D
 
D
-
 
V
-
 
G
L
 
M
K
 
G
I
 
V
S
 
N
P
 
P
K
 
P
L
 
-
V
 
A
G
 
G
Y
 
Y
K
 
S
S
 
T
R
 
D
I
 
V
A
 
I
I
 
I
Y
 
A
T
 
A
Y
 
F
P
 
P
L
 
W
G
 
G
D
 
A
Y
|
Y
I
 
L
D
 
G
-
 
A
-
 
E
-
 
A
I
 
L
N
 
E
K
 
Q
G
 
G
I
 
I
K
 
D
A
 
A
I
 
M
V
 
V
S
 
S
S
 
S
W
 
W
T
 
N
R
 
R
I
 
A
N
 
A
D
 
P
N
 
N
M
 
T
I
 
I
P
 
P
P
 
T
R
 
A
L
 
A
K
|
K
V
x
A
A
 
G
G
 
G
S
 
N
Y
|
Y
V
 
L
N
 
S
S
 
S
A
 
L
F
 
L
S
 
V
K
 
G
T
 
S
E
 
E
A
 
A
I
 
R
L
 
R
A
 
H
G
 
G
A
 
Y
D
 
Q
E
 
E
A
 
G
I
 
I
V
 
A
L
 
L
N
 
D
K
 
V
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
V
 
I
S
 
S
E
|
E
G
 
G
S
 
A
A
x
G
E
|
E
N
|
N
I
 
L
F
 
F
I
 
E
V
 
V
R
 
K
D
 
D
G
 
G
K
 
V
L
 
L
I
 
F
T
 
T
P
 
P
P
 
P
V
 
F
S
 
T
D
 
S
D
 
S
I
 
A
L
|
L
E
 
P
G
|
G
I
|
I
T
|
T
R
 
R
N
 
D
A
 
A
I
 
I
I
 
I
T
 
K
I
 
L
A
 
A
K
 
K
D
 
E
L
 
L
G
 
G
Y
 
I
Q
 
E
V
 
V
I
 
R
E
 
E
R
 
Q
H
 
V
I
 
L
S
 
S
R
 
R
T
 
E
E
 
S
L
 
L
Y
 
Y
I
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
I
 
V
F
 
F
F
 
M
C
 
S
G
|
G
T
|
T
G
x
A
A
 
A
Q
 
E
V
 
I
S
 
T
P
 
P
V
 
V
V
 
R
E
 
S
V
 
V
D
 
D
H
 
G
R
 
I
K
 
Q
I
 
V
G
 
G
D
 
E
G
 
G
S
 
R
P
 
C
G
 
G
K
 
P
I
 
V
T
 
T
K
 
K
E
 
R
I
 
I
Q
 
Q
E
 
Q
V
 
A
Y
 
F
F
 
F
N
 
G
A
 
L
V
 
F
R
 
T
G
 
G
K
 
E
I
 
T
E
 
E
K
 
D
Y
 
K
R
 
W
H
 
G
W
 
W
V
 
L

1iydA Crystal structure of eschelichia coli branched-chain amino acid aminotransferase (see paper)
41% identity, 98% coverage: 2:298/302 of query aligns to 3:300/304 of 1iydA

query
sites
1iydA
E
 
D
Y
 
Y
I
 
I
Y
 
W
F
 
F
E
 
N
G
 
G
K
 
E
I
 
M
V
 
V
P
 
R
E
 
W
D
 
E
Q
 
D
A
 
A
K
 
K
I
 
V
S
 
H
I
 
V
K
 
M
T
 
S
N
 
H
S
 
A
F
 
L
H
 
H
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
A
 
S
I
 
V
F
|
F
E
 
E
G
|
G
I
 
I
R
 
R
A
 
C
Y
 
Y
Y
 
-
D
 
-
K
 
-
D
 
D
T
 
S
D
 
H
R
 
K
M
 
G
W
 
P
G
 
V
L
 
V
F
 
F
-
 
R
F
 
H
K
 
R
E
 
E
H
 
H
Y
 
M
E
 
Q
R
|
R
L
 
L
F
 
H
Q
 
D
N
 
S
M
 
A
K
 
K
V
 
I
L
 
Y
N
 
R
M
 
F
E
 
P
I
 
V
E
 
S
E
 
Q
S
 
S
I
 
I
D
 
D
Q
 
E
L
 
L
V
 
M
E
 
E
I
 
A
T
 
C
K
 
R
E
 
D
L
 
V
I
 
I
R
 
R
K
 
K
N
 
N
N
 
N
I
 
L
K
 
T
D
 
S
D
 
-
I
 
A
Y
|
Y
I
 
I
R
 
R
P
 
P
I
 
L
V
 
I
Y
 
F
F
 
V
S
 
G
D
 
D
-
 
V
-
 
G
L
 
M
K
 
G
I
 
V
S
 
N
P
 
P
K
 
P
L
 
-
V
 
A
G
 
G
Y
 
Y
K
 
S
S
 
T
R
 
D
I
 
V
A
 
I
I
 
I
Y
 
A
T
 
A
Y
 
F
P
 
P
L
 
W
G
 
G
D
 
A
Y
|
Y
I
 
L
D
 
G
-
 
A
-
 
E
-
 
A
I
 
L
N
 
E
K
 
Q
G
 
G
I
 
I
K
 
D
A
 
A
I
 
M
V
 
V
S
 
S
S
 
S
W
 
W
T
 
N
R
 
R
I
 
A
N
 
A
D
 
P
N
 
N
M
 
T
I
 
I
P
 
P
P
 
T
R
 
A
L
 
A
K
|
K
V
x
A
A
 
G
G
 
G
S
 
N
Y
|
Y
V
 
L
N
 
S
S
 
S
A
 
L
F
 
L
S
 
V
K
 
G
T
 
S
E
 
E
A
 
A
I
 
R
L
 
R
A
 
H
G
 
G
A
 
Y
D
 
Q
E
 
E
A
 
G
I
 
I
V
 
A
L
 
L
N
 
D
K
 
V
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
V
 
I
S
 
S
E
|
E
G
 
G
S
 
A
A
x
G
E
|
E
N
 
N
I
 
L
F
 
F
I
 
E
V
 
V
R
 
K
D
 
D
G
 
G
K
 
V
L
 
L
I
 
F
T
 
T
P
 
P
P
 
P
V
 
F
S
 
T
D
 
S
D
 
S
I
 
A
L
|
L
E
 
P
G
|
G
I
|
I
T
|
T
R
 
R
N
 
D
A
 
A
I
 
I
I
 
I
T
 
K
I
 
L
A
 
A
K
 
K
D
 
E
L
 
L
G
 
G
Y
 
I
Q
 
E
V
 
V
I
 
R
E
 
E
R
 
Q
H
 
V
I
 
L
S
 
S
R
 
R
T
 
E
E
 
S
L
 
L
Y
 
Y
I
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
I
 
V
F
 
F
F
 
M
C
 
S
G
 
G
T
|
T
G
x
A
A
 
A
Q
 
E
V
 
I
S
 
T
P
 
P
V
 
V
V
 
R
E
 
S
V
 
V
D
 
D
H
 
G
R
 
I
K
 
Q
I
 
V
G
 
G
D
 
E
G
 
G
S
 
R
P
 
C
G
 
G
K
 
P
I
 
V
T
 
T
K
 
K
E
 
R
I
 
I
Q
 
Q
E
 
Q
V
 
A
Y
 
F
F
 
F
N
 
G
A
 
L
V
 
F
R
 
T
G
 
G
K
 
E
I
 
T
E
 
E
K
 
D
Y
 
K
R
 
W
H
 
G
W
 
W
V
 
L

1i1mA Crystal structure of escherichia coli branched-chain amino acid aminotransferase. (see paper)
41% identity, 98% coverage: 2:298/302 of query aligns to 3:300/304 of 1i1mA

query
sites
1i1mA
E
 
D
Y
 
Y
I
 
I
Y
 
W
F
 
F
E
 
N
G
 
G
K
 
E
I
 
M
V
 
V
P
 
R
E
 
W
D
 
E
Q
 
D
A
 
A
K
 
K
I
 
V
S
 
H
I
 
V
K
 
M
T
 
S
N
 
H
S
 
A
F
 
L
H
 
H
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
A
 
S
I
 
V
F
 
F
E
 
E
G
 
G
I
 
I
R
 
R
A
 
C
Y
 
Y
Y
 
-
D
 
-
K
 
-
D
 
D
T
 
S
D
 
H
R
 
K
M
 
G
W
 
P
G
 
V
L
 
V
F
 
F
-
 
R
F
 
H
K
 
R
E
 
E
H
 
H
Y
 
M
E
 
Q
R
|
R
L
 
L
F
 
H
Q
 
D
N
 
S
M
 
A
K
 
K
V
 
I
L
 
Y
N
 
R
M
 
F
E
 
P
I
 
V
E
 
S
E
 
Q
S
 
S
I
 
I
D
 
D
Q
 
E
L
 
L
V
 
M
E
 
E
I
 
A
T
 
C
K
 
R
E
 
D
L
 
V
I
 
I
R
 
R
K
 
K
N
 
N
N
 
N
I
 
L
K
 
T
D
 
S
D
 
-
I
 
A
Y
|
Y
I
 
I
R
 
R
P
 
P
I
 
L
V
 
I
Y
 
F
F
 
V
S
 
G
D
 
D
-
 
V
-
 
G
L
 
M
K
 
G
I
 
V
S
 
N
P
 
P
K
 
P
L
 
-
V
 
A
G
 
G
Y
 
Y
K
 
S
S
 
T
R
 
D
I
 
V
A
 
I
I
 
I
Y
 
A
T
 
A
Y
 
F
P
 
P
L
 
W
G
 
G
D
 
A
Y
 
Y
I
 
L
D
 
G
-
 
A
-
 
E
-
 
A
I
 
L
N
 
E
K
 
Q
G
 
G
I
 
I
K
 
D
A
 
A
I
 
M
V
 
V
S
 
S
S
 
S
W
 
W
T
 
N
R
 
R
I
 
A
N
 
A
D
 
P
N
 
N
M
 
T
I
 
I
P
 
P
P
 
T
R
 
A
L
 
A
K
|
K
V
 
A
A
 
G
G
 
G
S
 
N
Y
|
Y
V
 
L
N
 
S
S
 
S
A
 
L
F
 
L
S
 
V
K
 
G
T
 
S
E
 
E
A
 
A
I
 
R
L
 
R
A
 
H
G
 
G
A
 
Y
D
 
Q
E
 
E
A
 
G
I
 
I
V
 
A
L
 
L
N
 
D
K
 
V
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
V
 
I
S
 
S
E
|
E
G
 
G
S
 
A
A
x
G
E
|
E
N
 
N
I
 
L
F
 
F
I
 
E
V
 
V
R
 
K
D
 
D
G
 
G
K
 
V
L
 
L
I
 
F
T
 
T
P
 
P
P
 
P
V
 
F
S
 
T
D
 
S
D
 
S
I
 
A
L
|
L
E
 
P
G
|
G
I
|
I
T
|
T
R
 
R
N
 
D
A
 
A
I
 
I
I
 
I
T
 
K
I
 
L
A
 
A
K
 
K
D
 
E
L
 
L
G
 
G
Y
 
I
Q
 
E
V
 
V
I
 
R
E
 
E
R
 
Q
H
 
V
I
 
L
S
 
S
R
 
R
T
 
E
E
 
S
L
 
L
Y
 
Y
I
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
I
 
V
F
 
F
F
 
M
C
 
S
G
|
G
T
|
T
G
x
A
A
 
A
Q
 
E
V
 
I
S
 
T
P
 
P
V
 
V
V
 
R
E
 
S
V
 
V
D
 
D
H
 
G
R
 
I
K
 
Q
I
 
V
G
 
G
D
 
E
G
 
G
S
 
R
P
 
C
G
 
G
K
 
P
I
 
V
T
 
T
K
 
K
E
 
R
I
 
I
Q
 
Q
E
 
Q
V
 
A
Y
 
F
F
 
F
N
 
G
A
 
L
V
 
F
R
 
T
G
 
G
K
 
E
I
 
T
E
 
E
K
 
D
Y
 
K
R
 
W
H
 
G
W
 
W
V
 
L

1i1lA Crystal structure of eschelichia coli branched-chain amino acid aminotransferase. (see paper)
41% identity, 98% coverage: 2:298/302 of query aligns to 3:300/304 of 1i1lA

query
sites
1i1lA
E
 
D
Y
 
Y
I
 
I
Y
 
W
F
 
F
E
 
N
G
 
G
K
 
E
I
 
M
V
 
V
P
 
R
E
 
W
D
 
E
Q
 
D
A
 
A
K
 
K
I
 
V
S
 
H
I
 
V
K
 
M
T
 
S
N
 
H
S
 
A
F
 
L
H
 
H
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
A
 
S
I
 
V
F
 
F
E
 
E
G
 
G
I
 
I
R
 
R
A
 
C
Y
 
Y
Y
 
-
D
 
-
K
 
-
D
 
D
T
 
S
D
 
H
R
 
K
M
 
G
W
 
P
G
 
V
L
 
V
F
 
F
-
 
R
F
 
H
K
 
R
E
 
E
H
 
H
Y
 
M
E
 
Q
R
|
R
L
 
L
F
 
H
Q
 
D
N
 
S
M
 
A
K
 
K
V
 
I
L
 
Y
N
 
R
M
 
F
E
 
P
I
 
V
E
 
S
E
 
Q
S
 
S
I
 
I
D
 
D
Q
 
E
L
 
L
V
 
M
E
 
E
I
 
A
T
 
C
K
 
R
E
 
D
L
 
V
I
 
I
R
 
R
K
 
K
N
 
N
N
 
N
I
 
L
K
 
T
D
 
S
D
 
-
I
 
A
Y
|
Y
I
 
I
R
 
R
P
 
P
I
 
L
V
 
I
Y
 
F
F
 
V
S
 
G
D
 
D
-
 
V
-
 
G
L
 
M
K
 
G
I
 
V
S
 
N
P
 
P
K
 
P
L
 
-
V
 
A
G
 
G
Y
 
Y
K
 
S
S
 
T
R
 
D
I
 
V
A
 
I
I
 
I
Y
 
A
T
 
A
Y
 
F
P
 
P
L
 
W
G
 
G
D
 
A
Y
 
Y
I
 
L
D
 
G
-
 
A
-
 
E
-
 
A
I
 
L
N
 
E
K
 
Q
G
 
G
I
 
I
K
 
D
A
 
A
I
 
M
V
 
V
S
 
S
S
 
S
W
 
W
T
 
N
R
 
R
I
 
A
N
 
A
D
 
P
N
 
N
M
 
T
I
 
I
P
 
P
P
 
T
R
 
A
L
 
A
K
|
K
V
 
A
A
 
G
G
 
G
S
 
N
Y
|
Y
V
 
L
N
 
S
S
 
S
A
 
L
F
 
L
S
 
V
K
 
G
T
 
S
E
 
E
A
 
A
I
 
R
L
 
R
A
 
H
G
 
G
A
 
Y
D
 
Q
E
 
E
A
 
G
I
 
I
V
 
A
L
 
L
N
 
D
K
 
V
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
V
 
I
S
 
S
E
|
E
G
 
G
S
 
A
A
x
G
E
 
E
N
 
N
I
 
L
F
 
F
I
 
E
V
 
V
R
 
K
D
 
D
G
 
G
K
 
V
L
 
L
I
 
F
T
 
T
P
 
P
P
 
P
V
 
F
S
 
T
D
 
S
D
 
S
I
 
A
L
 
L
E
 
P
G
|
G
I
|
I
T
|
T
R
 
R
N
 
D
A
 
A
I
 
I
I
 
I
T
 
K
I
 
L
A
 
A
K
 
K
D
 
E
L
 
L
G
 
G
Y
 
I
Q
 
E
V
 
V
I
 
R
E
 
E
R
 
Q
H
 
V
I
 
L
S
 
S
R
 
R
T
 
E
E
 
S
L
 
L
Y
 
Y
I
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
I
 
V
F
 
F
F
 
M
C
 
S
G
 
G
T
|
T
G
x
A
A
 
A
Q
 
E
V
 
I
S
 
T
P
 
P
V
 
V
V
 
R
E
 
S
V
 
V
D
 
D
H
 
G
R
 
I
K
 
Q
I
 
V
G
 
G
D
 
E
G
 
G
S
 
R
P
 
C
G
 
G
K
 
P
I
 
V
T
 
T
K
 
K
E
 
R
I
 
I
Q
 
Q
E
 
Q
V
 
A
Y
 
F
F
 
F
N
 
G
A
 
L
V
 
F
R
 
T
G
 
G
K
 
E
I
 
T
E
 
E
K
 
D
Y
 
K
R
 
W
H
 
G
W
 
W
V
 
L

2ej3A Crystal structure of t.Th.Hb8 branched-chain amino acid aminotransferase complexed with gabapentin
42% identity, 98% coverage: 4:298/302 of query aligns to 7:293/297 of 2ej3A

query
sites
2ej3A
I
 
I
Y
 
W
F
 
M
E
 
N
G
 
G
K
 
A
I
 
F
V
 
V
P
 
P
E
 
Q
D
 
E
Q
 
E
A
 
A
K
 
K
I
 
T
S
 
S
I
 
V
K
 
L
T
 
S
N
 
H
S
 
A
F
 
L
H
 
H
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
A
 
S
I
 
V
F
|
F
E
 
E
G
|
G
I
 
I
R
 
R
A
 
A
Y
 
Y
Y
 
-
D
 
-
K
 
-
D
 
E
T
 
T
D
 
A
R
 
K
M
 
G
W
 
P
G
 
A
L
 
I
F
 
F
-
 
R
F
 
L
K
 
K
E
 
E
H
 
H
Y
 
V
E
 
K
R
|
R
L
 
F
F
 
Y
Q
 
N
N
 
S
M
 
A
K
 
K
V
 
V
L
 
L
N
 
R
M
 
M
E
 
E
I
 
I
E
 
P
E
 
F
S
 
A
I
 
P
D
 
E
Q
 
E
L
 
L
V
 
E
E
 
E
I
 
A
T
 
I
K
 
K
E
 
E
L
 
V
I
 
V
R
 
R
K
 
R
N
 
N
N
 
G
I
 
Y
K
 
R
D
 
S
D
 
-
I
 
C
Y
 
Y
I
 
I
R
 
R
P
 
P
I
 
L
V
 
A
Y
 
W
F
 
M
S
 
G
D
 
A
-
 
K
-
 
A
L
 
L
K
 
G
I
 
V
S
 
N
P
 
P
K
 
-
L
 
L
V
 
P
G
 
N
Y
 
N
K
 
P
S
 
A
R
 
E
I
 
V
A
 
M
I
 
V
Y
 
A
T
 
A
Y
 
W
P
 
E
L
 
W
G
 
-
D
 
-
Y
 
-
I
 
-
D
 
-
I
 
V
N
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
A
K
 
R
A
 
L
I
 
I
V
 
T
S
 
S
S
 
S
W
 
W
T
 
A
R
 
R
I
 
F
N
 
P
D
 
A
N
 
N
M
 
V
I
 
M
P
 
P
P
 
G
R
 
K
L
 
A
K
|
K
V
 
V
A
 
G
G
 
G
S
 
N
Y
|
Y
V
 
V
N
 
N
S
 
S
A
 
A
F
 
L
S
 
A
K
 
K
T
 
M
E
 
E
A
 
A
I
 
V
L
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
E
 
E
A
 
A
I
 
L
V
 
L
L
 
L
N
 
D
K
 
E
N
 
E
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
S
 
A
E
|
E
G
 
G
S
 
S
A
x
G
E
 
E
N
 
N
I
 
L
F
 
F
I
 
F
V
 
V
R
 
R
D
 
D
G
 
G
K
 
V
L
 
I
I
 
Y
T
 
A
P
 
L
P
 
E
V
 
H
S
 
S
D
 
V
D
 
N
I
 
-
L
|
L
E
 
E
G
|
G
I
|
I
T
|
T
R
 
R
N
 
D
A
 
S
I
 
V
I
 
I
T
 
R
I
 
I
A
 
A
K
 
K
D
 
D
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
E
V
 
V
I
 
Q
E
 
V
R
 
V
H
 
R
I
 
A
S
 
T
R
 
R
T
 
D
E
 
Q
L
 
L
Y
 
Y
I
 
M
A
 
A
D
 
D
E
 
E
I
 
V
F
 
F
F
 
M
C
 
T
G
|
G
T
|
T
G
x
A
A
 
A
Q
 
E
V
 
V
S
 
T
P
 
P
V
 
V
V
 
S
E
 
M
V
 
I
D
 
D
H
 
W
R
 
R
K
 
P
I
 
I
G
 
G
D
 
K
G
 
G
S
 
T
P
 
A
G
 
G
K
 
P
I
 
V
T
 
A
K
 
L
E
 
R
I
 
L
Q
 
R
E
 
E
V
 
V
Y
 
Y
F
 
L
N
 
E
A
 
A
V
 
V
R
 
T
G
 
G
K
 
R
I
 
R
E
 
P
K
 
E
Y
 
Y
R
 
E
H
 
G
W
 
W
V
 
L

2eiyA Crystal structure of t.Th.Hb8 branched-chain amino acid aminotransferase complexed with 4-methylvaleric acid
42% identity, 98% coverage: 4:298/302 of query aligns to 7:293/297 of 2eiyA

query
sites
2eiyA
I
 
I
Y
 
W
F
 
M
E
 
N
G
 
G
K
 
A
I
 
F
V
 
V
P
 
P
E
 
Q
D
 
E
Q
 
E
A
 
A
K
 
K
I
 
T
S
 
S
I
 
V
K
 
L
T
 
S
N
 
H
S
 
A
F
 
L
H
 
H
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
A
 
S
I
 
V
F
|
F
E
 
E
G
|
G
I
 
I
R
 
R
A
 
A
Y
 
Y
Y
 
-
D
 
-
K
 
-
D
 
E
T
 
T
D
 
A
R
 
K
M
 
G
W
 
P
G
 
A
L
 
I
F
 
F
-
 
R
F
 
L
K
 
K
E
 
E
H
 
H
Y
 
V
E
 
K
R
|
R
L
 
F
F
 
Y
Q
 
N
N
 
S
M
 
A
K
 
K
V
 
V
L
 
L
N
 
R
M
 
M
E
 
E
I
 
I
E
 
P
E
 
F
S
 
A
I
 
P
D
 
E
Q
 
E
L
 
L
V
 
E
E
 
E
I
 
A
T
 
I
K
 
K
E
 
E
L
 
V
I
 
V
R
 
R
K
 
R
N
 
N
N
 
G
I
 
Y
K
 
R
D
 
S
D
 
-
I
 
C
Y
|
Y
I
 
I
R
 
R
P
 
P
I
 
L
V
 
A
Y
 
W
F
 
M
S
 
G
D
 
A
-
 
K
-
 
A
L
 
L
K
 
G
I
 
V
S
 
N
P
 
P
K
 
-
L
 
L
V
 
P
G
 
N
Y
 
N
K
 
P
S
 
A
R
 
E
I
 
V
A
 
M
I
 
V
Y
 
A
T
 
A
Y
 
W
P
 
E
L
 
W
G
 
-
D
 
-
Y
 
-
I
 
-
D
 
-
I
 
V
N
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
A
K
 
R
A
 
L
I
 
I
V
 
T
S
 
S
S
 
S
W
 
W
T
 
A
R
 
R
I
 
F
N
 
P
D
 
A
N
 
N
M
 
V
I
 
M
P
 
P
P
 
G
R
 
K
L
 
A
K
|
K
V
 
V
A
 
G
G
 
G
S
 
N
Y
|
Y
V
 
V
N
 
N
S
 
S
A
 
A
F
 
L
S
 
A
K
 
K
T
 
M
E
 
E
A
 
A
I
 
V
L
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
E
 
E
A
 
A
I
 
L
V
 
L
L
 
L
N
 
D
K
 
E
N
 
E
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
S
 
A
E
|
E
G
 
G
S
 
S
A
x
G
E
|
E
N
 
N
I
 
L
F
 
F
I
 
F
V
 
V
R
 
R
D
 
D
G
 
G
K
 
V
L
 
I
I
 
Y
T
 
A
P
 
L
P
 
E
V
 
H
S
 
S
D
 
V
D
 
N
I
 
-
L
|
L
E
 
E
G
|
G
I
|
I
T
|
T
R
 
R
N
 
D
A
 
S
I
 
V
I
 
I
T
 
R
I
 
I
A
 
A
K
 
K
D
 
D
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
E
V
 
V
I
 
Q
E
 
V
R
 
V
H
 
R
I
 
A
S
 
T
R
 
R
T
 
D
E
 
Q
L
 
L
Y
 
Y
I
 
M
A
 
A
D
 
D
E
 
E
I
 
V
F
 
F
F
 
M
C
 
T
G
|
G
T
|
T
G
x
A
A
 
A
Q
 
E
V
 
V
S
 
T
P
 
P
V
 
V
V
 
S
E
 
M
V
 
I
D
 
D
H
 
W
R
 
R
K
 
P
I
 
I
G
 
G
D
 
K
G
 
G
S
 
T
P
 
A
G
 
G
K
 
P
I
 
V
T
 
A
K
 
L
E
 
R
I
 
L
Q
 
R
E
 
E
V
 
V
Y
 
Y
F
 
L
N
 
E
A
 
A
V
 
V
R
 
T
G
 
G
K
 
R
I
 
R
E
 
P
K
 
E
Y
 
Y
R
 
E
H
 
G
W
 
W
V
 
L

1wrvA Crystal structure of t.Th.Hb8 branched-chain amino acid aminotransferase
42% identity, 98% coverage: 4:298/302 of query aligns to 7:293/297 of 1wrvA

query
sites
1wrvA
I
 
I
Y
 
W
F
 
M
E
 
N
G
 
G
K
 
A
I
 
F
V
 
V
P
 
P
E
 
Q
D
 
E
Q
 
E
A
 
A
K
 
K
I
 
T
S
 
S
I
 
V
K
 
L
T
 
S
N
 
H
S
 
A
F
 
L
H
 
H
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
A
 
S
I
 
V
F
|
F
E
 
E
G
|
G
I
 
I
R
 
R
A
 
A
Y
 
Y
Y
 
-
D
 
-
K
 
-
D
 
E
T
 
T
D
 
A
R
 
K
M
 
G
W
 
P
G
 
A
L
 
I
F
 
F
-
 
R
F
 
L
K
 
K
E
 
E
H
 
H
Y
 
V
E
 
K
R
|
R
L
 
F
F
 
Y
Q
 
N
N
 
S
M
 
A
K
 
K
V
 
V
L
 
L
N
 
R
M
 
M
E
 
E
I
 
I
E
 
P
E
 
F
S
 
A
I
 
P
D
 
E
Q
 
E
L
 
L
V
 
E
E
 
E
I
 
A
T
 
I
K
 
K
E
 
E
L
 
V
I
 
V
R
 
R
K
 
R
N
 
N
N
 
G
I
 
Y
K
 
R
D
 
S
D
 
-
I
 
C
Y
 
Y
I
 
I
R
 
R
P
 
P
I
 
L
V
 
A
Y
 
W
F
 
M
S
 
G
D
 
A
-
 
K
-
 
A
L
 
L
K
 
G
I
 
V
S
 
N
P
 
P
K
 
-
L
 
L
V
 
P
G
 
N
Y
 
N
K
 
P
S
 
A
R
 
E
I
 
V
A
 
M
I
 
V
Y
 
A
T
 
A
Y
 
W
P
 
E
L
 
W
G
 
-
D
 
-
Y
 
-
I
 
-
D
 
-
I
 
V
N
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
A
K
 
R
A
 
L
I
 
I
V
 
T
S
 
S
S
 
S
W
 
W
T
 
A
R
 
R
I
 
F
N
 
P
D
 
A
N
 
N
M
 
V
I
 
M
P
 
P
P
 
G
R
 
K
L
 
A
K
|
K
V
 
V
A
 
G
G
 
G
S
 
N
Y
|
Y
V
 
V
N
 
N
S
 
S
A
 
A
F
 
L
S
 
A
K
 
K
T
 
M
E
 
E
A
 
A
I
 
V
L
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
E
 
E
A
 
A
I
 
L
V
 
L
L
 
L
N
 
D
K
 
E
N
 
E
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
S
 
A
E
|
E
G
 
G
S
 
S
A
x
G
E
 
E
N
 
N
I
 
L
F
 
F
I
 
F
V
 
V
R
 
R
D
 
D
G
 
G
K
 
V
L
 
I
I
 
Y
T
 
A
P
 
L
P
 
E
V
 
H
S
 
S
D
 
V
D
 
N
I
 
-
L
|
L
E
 
E
G
|
G
I
|
I
T
|
T
R
 
R
N
 
D
A
 
S
I
 
V
I
 
I
T
 
R
I
 
I
A
 
A
K
 
K
D
 
D
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
E
V
 
V
I
 
Q
E
 
V
R
 
V
H
 
R
I
 
A
S
 
T
R
 
R
T
 
D
E
 
Q
L
 
L
Y
 
Y
I
 
M
A
 
A
D
 
D
E
 
E
I
 
V
F
 
F
F
 
M
C
 
T
G
 
G
T
|
T
G
 
A
A
 
A
Q
 
E
V
 
V
S
 
T
P
 
P
V
 
V
V
 
S
E
 
M
V
 
I
D
 
D
H
 
W
R
 
R
K
 
P
I
 
I
G
 
G
D
 
K
G
 
G
S
 
T
P
 
A
G
 
G
K
 
P
I
 
V
T
 
A
K
 
L
E
 
R
I
 
L
Q
 
R
E
 
E
V
 
V
Y
 
Y
F
 
L
N
 
E
A
 
A
V
 
V
R
 
T
G
 
G
K
 
R
I
 
R
E
 
P
K
 
E
Y
 
Y
R
 
E
H
 
G
W
 
W
V
 
L

2ej2A Crystal structure of t.Th.Hb8 branched-chain amino acid aminotransferase complexed with n-(5'-phosphopyridoxyl)-l-glutamate
42% identity, 98% coverage: 4:298/302 of query aligns to 7:290/294 of 2ej2A

query
sites
2ej2A
I
 
I
Y
 
W
F
 
M
E
 
N
G
 
G
K
 
A
I
 
F
V
 
V
P
 
P
E
 
Q
D
 
E
Q
 
E
A
 
A
K
 
K
I
 
T
S
 
S
I
 
V
K
 
L
T
 
S
N
 
H
S
 
A
F
 
L
H
 
H
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
A
 
S
I
 
V
F
|
F
E
 
E
G
|
G
I
 
I
R
 
R
A
 
A
Y
 
Y
Y
 
-
D
 
-
K
 
-
D
 
E
T
 
T
D
 
A
R
 
K
M
 
G
W
 
P
G
 
A
L
 
I
F
 
F
-
 
R
F
 
L
K
 
K
E
 
E
H
 
H
Y
 
V
E
 
K
R
|
R
L
 
F
F
 
Y
Q
 
N
N
 
S
M
 
A
K
 
K
V
 
V
L
 
L
N
 
R
M
 
M
E
 
E
I
 
I
E
 
P
E
 
F
S
 
A
I
 
P
D
 
E
Q
 
E
L
 
L
V
 
E
E
 
E
I
 
A
T
 
I
K
 
K
E
 
E
L
 
V
I
 
V
R
 
R
K
 
R
N
 
N
N
 
G
I
 
Y
K
 
R
D
 
S
D
 
-
I
 
C
Y
|
Y
I
 
I
R
 
R
P
 
P
I
 
L
V
 
A
Y
 
W
F
 
M
S
 
G
D
 
A
-
 
K
-
 
A
L
 
L
K
 
G
I
 
V
S
 
N
P
 
P
K
 
-
L
 
L
V
 
P
G
 
N
Y
 
N
K
 
P
S
 
A
R
 
E
I
 
V
A
 
M
I
 
V
Y
 
A
T
 
A
Y
 
W
P
 
-
L
 
-
G
 
-
D
 
-
Y
 
-
I
 
-
D
 
-
I
 
-
N
 
E
K
 
W
G
 
G
I
 
A
K
 
R
A
 
L
I
 
I
V
 
T
S
 
S
S
 
S
W
 
W
T
 
A
R
 
R
I
 
F
N
 
P
D
 
A
N
 
N
M
 
V
I
 
M
P
 
P
P
 
G
R
 
K
L
 
A
K
|
K
V
 
V
A
 
G
G
 
G
S
 
N
Y
|
Y
V
 
V
N
 
N
S
 
S
A
 
A
F
 
L
S
 
A
K
 
K
T
 
M
E
 
E
A
 
A
I
 
V
L
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
E
 
E
A
 
A
I
 
L
V
 
L
L
 
L
N
 
D
K
 
E
N
 
E
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
S
 
A
E
|
E
G
 
G
S
 
S
A
x
G
E
|
E
N
 
N
I
 
L
F
 
F
I
 
F
V
 
V
R
 
R
D
 
D
G
 
G
K
 
V
L
 
I
I
 
Y
T
 
A
P
 
L
P
 
E
V
 
H
S
 
S
D
 
V
D
 
N
I
 
-
L
|
L
E
 
E
G
|
G
I
|
I
T
|
T
R
 
R
N
 
D
A
 
S
I
 
V
I
 
I
T
 
R
I
 
I
A
 
A
K
 
K
D
 
D
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
E
V
 
V
I
 
Q
E
 
V
R
 
V
H
 
R
I
 
A
S
 
T
R
 
R
T
 
D
E
 
Q
L
 
L
Y
 
Y
I
 
M
A
 
A
D
 
D
E
 
E
I
 
V
F
 
F
F
 
M
C
 
T
G
 
G
T
|
T
G
x
A
A
 
A
Q
 
E
V
 
V
S
 
T
P
 
P
V
 
V
V
 
S
E
 
M
V
 
I
D
 
D
H
 
W
R
 
R
K
 
P
I
 
I
G
 
G
D
 
K
G
 
G
S
 
T
P
 
A
G
 
G
K
 
P
I
 
V
T
 
A
K
 
L
E
 
R
I
 
L
Q
 
R
E
 
E
V
 
V
Y
 
Y
F
 
L
N
 
E
A
 
A
V
 
V
R
 
T
G
 
G
K
 
R
I
 
R
E
 
P
K
 
E
Y
 
Y
R
 
E
H
 
G
W
 
W
V
 
L

6q8eA Crystal structure of branched-chain amino acid aminotransferase from thermobaculum terrenum in pmp-form (see paper)
36% identity, 99% coverage: 2:301/302 of query aligns to 4:304/307 of 6q8eA

query
sites
6q8eA
E
 
K
Y
 
Y
I
 
L
Y
 
W
F
 
W
E
 
N
G
 
H
K
 
R
I
 
I
V
 
I
P
 
P
E
 
W
D
 
E
Q
 
E
A
 
A
K
 
T
I
 
V
S
 
H
I
 
L
K
 
T
T
 
D
N
 
Y
S
 
W
F
 
W
H
 
A
Y
 
S
G
 
V
T
 
T
A
 
A
I
 
V
F
|
F
E
 
E
G
 
G
I
 
I
R
 
R
A
 
G
Y
 
Y
Y
 
W
D
 
N
K
 
N
D
 
A
T
 
E
D
 
G
R
 
E
M
 
M
W
 
Y
G
 
I
L
 
F
F
 
R
F
 
L
K
 
E
E
 
D
H
 
H
Y
 
A
E
 
R
R
|
R
L
 
L
F
 
E
Q
 
Q
N
 
S
M
 
M
K
 
Q
V
 
L
L
 
I
N
 
R
M
 
M
E
 
P
I
 
K
E
 
E
E
 
F
S
 
T
I
 
V
D
 
D
Q
 
E
L
 
I
V
 
C
E
 
Q
I
 
A
T
 
T
K
 
I
E
 
D
L
 
L
I
 
V
R
 
R
K
 
A
N
 
N
N
 
D
I
 
Y
K
 
R
D
 
G
D
 
D
I
 
V
Y
 
Y
I
 
I
R
 
M
P
 
P
I
 
L
V
 
A
Y
 
Y
F
 
A
S
 
V
D
 
G
L
 
N
K
 
K
I
 
A
S
 
F
P
 
S
K
 
V
L
 
V
V
 
G
G
 
D
Y
 
R
K
 
T
S
 
T
R
 
E
I
 
M
A
 
F
I
 
I
Y
 
Y
T
 
S
Y
 
R
P
 
P
L
 
A
G
 
V
D
 
S
Y
 
R
I
 
L
D
 
E
I
 
E
N
 
D
K
 
F
G
 
S
I
 
L
K
 
H
A
 
A
I
 
C
V
 
Y
S
 
S
S
 
S
W
 
W
T
 
T
R
 
R
I
 
I
N
 
N
D
 
E
N
 
R
M
 
V
I
 
L
P
 
P
P
 
P
R
 
R
L
 
I
K
|
K
V
 
A
A
 
L
G
 
A
S
 
N
Y
|
Y
V
 
R
N
 
N
S
 
S
A
 
Q
F
 
L
S
 
A
K
 
S
T
 
S
E
 
E
A
 
A
I
 
A
L
 
M
A
 
N
G
 
G
A
 
Y
D
 
D
E
 
T
A
 
A
I
 
L
V
 
F
L
 
L
N
 
N
K
 
P
N
 
E
G
 
G
Y
 
K
V
 
V
S
 
A
E
|
E
G
 
G
S
 
T
A
x
G
E
x
S
N
x
C
I
 
V
F
 
F
I
 
F
V
 
V
R
 
R
D
 
K
G
 
G
K
 
K
L
 
L
I
 
I
T
 
T
P
 
P
P
 
D
V
 
I
S
 
T
D
 
S
D
 
G
I
 
I
L
|
L
E
 
E
G
x
S
I
|
I
T
|
T
R
 
R
N
 
D
A
 
T
I
 
V
I
 
I
T
 
H
I
 
L
A
 
A
K
 
R
D
 
E
-
 
V
L
 
L
G
 
G
Y
 
L
Q
 
E
V
 
V
I
 
E
E
 
E
R
 
R
H
 
V
I
 
V
S
 
D
R
 
R
T
 
T
E
 
E
L
 
T
Y
 
Y
I
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
I
 
A
F
 
F
F
 
L
C
 
C
G
|
G
T
|
T
G
 
H
A
 
A
Q
 
E
V
 
I
S
 
T
P
 
P
V
 
I
V
 
A
E
 
S
V
 
I
D
 
D
H
 
R
R
 
H
K
 
E
I
 
M
G
 
K
D
 
H
G
 
G
S
 
A
P
 
P
G
 
G
K
 
P
I
 
I
T
 
T
K
 
R
E
 
Q
I
 
L
Q
 
R
E
 
D
V
 
I
Y
 
Y
F
 
R
N
 
E
A
 
V
V
 
V
R
 
Y
G
 
G
K
 
R
I
 
D
E
 
F
K
 
R
Y
 
Y
R
 
R
H
 
N
W
 
W
V
 
L
I
 
T
P
 
P
I
 
V

6h65C Crystal structure of the branched-chain-amino-acid aminotransferase from haliangium ochraceum
36% identity, 99% coverage: 3:301/302 of query aligns to 6:306/308 of 6h65C

query
sites
6h65C
Y
 
Y
I
 
G
Y
 
W
F
 
M
E
 
N
G
 
G
K
 
Q
I
 
C
V
 
I
P
 
P
E
 
W
D
 
D
Q
 
Q
A
 
C
K
 
S
I
 
L
S
 
H
I
 
V
K
 
S
T
 
T
N
 
Q
S
 
A
F
 
A
H
 
F
Y
 
F
G
 
G
T
 
A
A
 
S
I
 
L
F
|
F
E
 
E
G
 
G
I
 
V
R
 
R
A
 
A
Y
 
Y
Y
 
W
D
 
N
K
 
A
D
 
E
T
 
R
D
 
E
R
 
Q
M
 
L
W
 
Y
G
 
V
L
 
F
F
 
R
F
 
L
K
 
D
E
 
E
H
 
H
Y
 
L
E
 
R
R
|
R
L
 
L
F
 
E
Q
 
Q
N
 
S
M
 
A
K
 
K
V
 
M
L
 
L
N
 
R
M
 
M
E
 
K
I
 
L
E
 
S
E
 
M
S
 
P
I
 
I
D
 
A
Q
 
D
L
 
I
V
 
R
E
 
Q
I
 
G
T
 
V
K
 
L
E
 
E
L
 
L
I
 
L
R
 
R
K
 
A
N
 
N
N
 
E
I
 
F
K
 
R
D
 
S
D
 
D
I
 
V
Y
 
H
I
 
L
R
 
Y
P
 
V
I
 
A
V
 
S
Y
 
Y
F
 
F
S
 
G
-
 
I
-
 
N
-
 
H
-
 
D
-
 
P
D
 
D
L
 
P
K
 
L
I
 
F
S
 
P
P
 
T
K
 
D
L
 
D
V
 
T
G
 
G
-
 
V
Y
 
Y
K
 
V
S
 
T
R
 
G
I
 
T
A
 
A
I
 
V
Y
 
S
T
 
R
Y
 
L
P
 
P
L
 
L
G
 
-
D
 
-
Y
 
-
I
 
-
D
 
-
I
 
V
N
 
H
K
 
T
G
 
G
I
 
I
K
 
S
A
 
A
I
 
C
V
 
M
S
 
S
S
 
S
W
 
W
T
 
R
R
 
R
I
 
I
N
 
S
D
 
D
N
 
D
M
 
S
I
 
V
P
 
P
P
 
P
R
 
R
L
 
I
K
|
K
V
 
I
A
 
G
G
 
A
S
 
N
Y
|
Y
V
 
Q
N
 
N
S
 
S
A
 
R
F
 
L
S
 
A
K
 
Q
T
 
T
E
 
E
A
 
A
I
 
R
L
 
V
A
 
N
G
 
G
A
 
Y
D
 
H
E
 
T
A
 
S
I
 
V
V
 
L
L
 
L
N
 
N
K
 
S
N
 
R
G
 
G
Y
 
K
V
 
V
S
 
S
E
|
E
G
 
T
S
 
P
A
 
G
E
x
A
N
 
C
I
 
L
F
 
L
I
 
M
V
 
V
R
 
R
D
 
D
G
 
G
K
 
R
L
 
V
I
 
I
T
 
S
P
 
P
P
 
P
V
 
V
S
 
T
D
 
A
D
 
D
I
 
I
L
|
L
E
 
E
G
x
S
I
x
V
T
|
T
R
 
R
N
 
K
A
 
T
I
 
L
I
 
M
T
 
S
I
 
L
A
 
S
K
 
E
-
 
A
D
 
E
L
 
L
G
 
D
Y
 
S
Q
 
P
V
 
V
I
 
I
E
 
E
R
 
R
H
 
D
I
 
M
S
 
D
R
 
R
T
 
T
E
 
E
L
 
L
Y
 
Y
I
 
I
A
 
A
D
 
E
E
 
E
I
 
V
F
 
F
F
 
L
C
 
C
G
|
G
T
|
T
G
 
I
A
 
A
Q
 
E
V
 
I
S
 
L
P
 
P
V
 
V
V
 
T
E
 
T
V
 
I
D
 
D
H
 
R
R
 
I
K
 
Q
I
 
V
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
E
P
 
V
G
 
G
K
 
P
I
 
V
T
 
T
K
 
R
E
 
R
I
 
L
Q
 
Q
E
 
E
V
 
L
Y
 
Y
F
 
F
N
 
G
A
 
V
V
 
T
R
 
S
G
 
G
K
 
Q
I
 
L
E
 
E
K
 
A
Y
 
Y
R
 
K
H
 
S
W
 
W
V
 
L
I
 
L
P
 
P
I
 
V

4whxA X-ray crystal structure of an amino acid aminotransferase from burkholderia pseudomallei bound to the co-factor pyridoxal phosphate
40% identity, 99% coverage: 4:301/302 of query aligns to 9:306/306 of 4whxA

query
sites
4whxA
I
 
I
Y
 
W
F
 
M
E
 
D
G
 
G
K
 
K
I
 
L
V
 
I
P
 
E
E
 
W
D
 
R
Q
 
D
A
 
A
K
 
K
I
 
I
S
 
H
I
 
V
K
 
L
T
 
T
N
 
H
S
 
T
F
 
L
H
 
H
Y
 
Y
G
 
G
T
 
M
A
 
G
I
 
V
F
|
F
E
 
E
G
 
G
I
 
V
R
 
R
A
 
A
Y
 
Y
Y
 
-
D
 
-
K
 
K
D
 
T
T
 
A
D
 
D
R
 
G
M
 
G
W
 
T
G
 
A
L
 
I
F
 
F
-
 
R
F
 
L
K
 
K
E
 
E
H
 
H
Y
 
T
E
 
K
R
 
R
L
 
L
F
 
L
Q
 
N
N
 
S
M
 
A
K
 
K
V
 
I
L
 
F
N
 
Q
M
 
M
E
 
D
I
 
V
E
 
P
E
 
F
S
 
D
I
 
Q
D
 
E
Q
 
T
L
 
L
V
 
E
E
 
A
I
 
A
T
 
Q
K
 
R
E
 
D
L
 
V
I
 
V
R
 
R
K
 
E
N
 
N
N
 
K
I
 
L
K
 
-
D
 
E
D
 
S
I
 
C
Y
|
Y
I
 
L
R
 
R
P
 
P
I
 
I
V
 
I
Y
 
W
F
 
I
S
 
G
D
 
S
L
 
E
K
 
K
I
 
L
S
 
G
P
 
V
K
 
S
L
 
A
V
 
K
G
 
G
Y
 
N
K
 
T
S
 
I
R
 
H
I
 
V
A
 
A
I
 
I
Y
 
A
T
 
A
Y
 
W
P
 
P
L
 
W
G
 
G
D
 
A
Y
 
Y
I
 
L
D
 
G
-
 
E
-
 
E
-
 
G
I
 
L
N
 
A
K
 
K
G
 
G
I
 
I
K
 
R
A
 
V
I
 
K
V
 
T
S
 
S
S
 
S
W
 
F
T
 
T
R
 
R
I
 
H
N
 
H
D
 
V
N
 
N
M
 
V
I
 
S
P
 
M
P
 
V
R
 
R
L
 
A
K
|
K
V
 
A
A
 
S
G
 
G
S
 
W
Y
 
Y
V
 
V
N
 
N
S
 
S
A
 
I
F
 
L
S
 
A
K
 
N
T
 
Q
E
 
E
A
 
A
I
 
T
L
 
A
A
 
D
G
 
G
A
 
Y
D
 
D
E
 
E
A
 
A
I
 
L
V
 
L
L
 
L
N
 
D
K
 
V
N
 
D
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
S
 
S
E
|
E
G
 
G
S
 
S
A
 
G
E
 
E
N
 
N
I
 
F
F
 
F
I
 
L
V
 
V
R
 
N
D
 
R
G
 
G
K
 
K
L
 
L
I
 
Y
T
 
T
P
 
P
P
 
D
V
 
L
S
 
A
D
 
S
D
 
-
I
 
C
L
|
L
E
 
D
G
 
G
I
 
I
T
 
T
R
 
R
N
 
D
A
 
T
I
 
V
I
 
I
T
 
T
I
 
L
A
 
A
K
 
K
D
 
E
L
 
A
G
 
G
Y
 
I
Q
 
E
V
 
V
I
 
I
E
 
E
R
 
K
H
 
R
I
 
I
S
 
T
R
 
R
T
 
D
E
 
E
L
 
V
Y
 
Y
I
 
T
A
 
A
D
 
D
E
 
E
I
 
A
F
 
F
F
 
F
C
 
T
G
 
G
T
 
T
G
x
A
A
 
A
Q
 
E
V
 
V
S
 
T
P
 
P
V
 
I
V
 
R
E
 
E
V
 
L
D
 
D
H
 
N
R
 
R
K
 
T
I
 
I
G
 
G
D
 
G
G
 
G
S
 
A
P
 
R
G
 
G
K
 
P
I
 
I
T
 
T
K
 
E
E
 
K
I
 
L
Q
 
Q
E
 
S
V
 
A
Y
 
F
F
 
F
N
 
D
A
 
V
V
 
V
R
 
N
G
 
G
K
 
K
I
 
S
E
 
A
K
 
K
Y
 
H
R
 
A
H
 
D
W
 
W
V
 
L
I
 
T
P
 
K
I
 
I

7neaA Crystal structure of branched-chain amino acid aminotransferase from thermobaculum terrenum (m3 mutant). (see paper)
35% identity, 99% coverage: 2:301/302 of query aligns to 4:304/309 of 7neaA

query
sites
7neaA
E
 
K
Y
 
Y
I
 
L
Y
 
W
F
 
W
E
 
N
G
 
H
K
 
R
I
 
I
V
 
I
P
 
P
E
 
W
D
 
E
Q
 
E
A
 
A
K
 
T
I
 
V
S
 
H
I
 
L
K
 
T
T
 
D
N
 
Y
S
 
W
F
 
W
H
 
A
Y
 
S
G
 
V
T
 
T
A
 
A
I
 
V
F
|
F
E
 
E
G
 
V
I
 
I
R
 
S
A
 
G
Y
 
Y
Y
 
W
D
 
N
K
 
N
D
 
A
T
 
E
D
 
G
R
 
E
M
 
M
W
 
Y
G
 
I
L
 
F
F
 
R
F
 
L
K
 
E
E
 
D
H
 
H
Y
 
A
E
 
R
R
|
R
L
 
L
F
 
E
Q
 
Q
N
 
S
M
 
M
K
 
Q
V
 
L
L
 
I
N
 
R
M
 
M
E
 
P
I
 
K
E
 
E
E
 
F
S
 
T
I
 
V
D
 
D
Q
 
E
L
 
I
V
 
C
E
 
Q
I
 
A
T
 
T
K
 
I
E
 
D
L
 
L
I
 
V
R
 
R
K
 
A
N
 
N
N
 
D
I
 
Y
K
 
R
D
 
G
D
 
D
I
 
V
Y
 
F
I
 
I
R
 
M
P
 
P
I
 
L
V
 
A
Y
 
Y
F
 
A
S
 
V
D
 
G
L
 
N
K
 
K
I
 
A
S
 
F
P
 
S
K
 
V
L
 
V
V
 
G
G
 
D
Y
 
R
K
 
T
S
 
T
R
 
E
I
 
M
A
 
F
I
 
I
Y
 
Y
T
 
S
Y
 
R
P
 
P
L
 
A
G
 
V
D
 
S
Y
 
R
I
 
L
D
 
E
I
 
E
N
 
D
K
 
F
G
 
S
I
 
L
K
 
H
A
 
A
I
 
C
V
 
Y
S
 
S
S
 
S
W
 
W
T
 
T
R
 
R
I
 
I
N
 
N
D
 
E
N
 
R
M
 
V
I
 
L
P
 
P
P
 
P
R
 
R
L
 
I
K
|
K
V
 
A
A
 
L
G
 
A
S
 
N
Y
|
Y
V
 
R
N
 
N
S
 
S
A
 
Q
F
 
L
S
 
A
K
 
S
T
 
S
E
 
E
A
 
A
I
 
A
L
 
M
A
 
N
G
 
G
A
 
Y
D
 
D
E
 
T
A
 
A
I
 
L
V
 
F
L
 
L
N
 
N
K
 
P
N
 
E
G
 
G
Y
 
K
V
 
V
S
 
A
E
|
E
G
 
G
S
 
T
A
x
G
E
x
S
N
 
C
I
 
V
F
 
F
I
 
F
V
 
V
R
 
R
D
 
K
G
 
G
K
 
K
L
 
L
I
 
I
T
 
T
P
 
P
P
 
D
V
 
I
S
 
T
D
 
S
D
 
G
I
 
I
L
|
L
E
 
E
G
x
S
I
|
I
T
|
T
R
 
R
N
 
D
A
 
T
I
 
V
I
 
I
T
 
H
I
 
L
A
 
A
K
 
R
D
 
E
-
 
V
L
 
L
G
 
G
Y
 
L
Q
 
E
V
 
V
I
 
E
E
 
E
R
 
R
H
 
V
I
 
V
S
 
D
R
 
R
T
 
T
E
 
E
L
 
T
Y
 
Y
I
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
I
 
A
F
 
F
F
 
L
C
 
C
G
 
G
T
|
T
G
 
H
A
 
A
Q
 
E
V
 
I
S
 
T
P
 
P
V
 
I
V
 
A
E
 
S
V
 
I
D
 
D
H
 
R
R
 
H
K
 
E
I
 
M
G
 
K
D
 
H
G
 
G
S
 
A
P
 
P
G
 
G
K
 
P
I
 
I
T
 
T
K
 
R
E
 
Q
I
 
L
Q
 
R
E
 
D
V
 
I
Y
 
Y
F
 
R
N
 
E
A
 
V
V
 
V
R
 
Y
G
 
G
K
 
R
I
 
D
E
 
F
K
 
R
Y
 
Y
R
 
R
H
 
N
W
 
W
V
 
L
I
 
T
P
 
P
I
 
V

5mr0D Thermophilic archaeal branched-chain amino acid transaminases from geoglobus acetivorans and archaeoglobus fulgidus: biochemical and structural characterisation (see paper)
44% identity, 94% coverage: 1:283/302 of query aligns to 1:277/290 of 5mr0D

query
sites
5mr0D
M
 
M
E
 
L
Y
 
Y
I
 
V
Y
 
Y
F
 
M
E
 
D
G
 
G
K
 
E
I
 
F
V
 
V
P
 
P
E
 
E
D
 
N
Q
 
E
A
 
A
K
 
K
I
 
V
S
 
S
I
 
I
K
 
F
T
 
D
N
 
H
S
 
G
F
 
F
H
 
L
Y
 
Y
G
 
G
T
 
D
A
 
G
I
 
V
F
|
F
E
 
E
G
|
G
I
 
I
R
 
R
A
 
A
Y
 
Y
Y
 
-
D
 
-
K
 
-
D
 
-
T
 
N
D
 
G
R
 
R
M
 
V
W
 
F
G
 
R
L
 
L
F
 
-
F
 
-
K
 
K
E
 
E
H
 
H
Y
 
I
E
 
D
R
|
R
L
 
L
F
 
Y
Q
 
D
N
 
S
M
 
A
K
 
K
V
 
A
L
 
I
N
 
D
M
 
L
E
 
E
I
 
I
E
 
P
E
 
I
S
 
T
I
 
K
D
 
E
Q
 
E
L
 
F
V
 
M
E
 
E
I
 
I
T
 
I
K
 
L
E
 
E
L
 
T
I
 
L
R
 
R
K
 
K
N
 
N
N
 
N
I
 
L
K
 
R
D
 
D
D
 
-
I
 
A
Y
 
Y
I
 
I
R
 
R
P
 
P
I
 
I
V
 
V
Y
 
T
-
 
R
-
 
G
F
 
I
S
 
G
D
 
D
L
 
L
K
x
G
I
x
L
S
 
D
P
 
P
K
 
R
L
 
K
V
 
C
G
 
Q
Y
 
N
K
 
P
S
 
S
R
 
I
I
 
I
A
 
V
I
 
I
Y
 
-
T
 
T
Y
 
K
P
 
P
L
 
W
G
 
G
D
 
K
-
 
L
Y
 
Y
I
 
G
D
 
D
I
 
L
-
 
Y
N
 
E
K
 
K
G
 
G
I
 
L
K
 
T
A
 
A
I
 
I
V
 
T
S
 
V
S
 
A
W
 
V
T
 
R
R
 
R
I
 
N
N
 
S
D
 
F
N
 
D
M
 
A
I
 
L
P
 
P
P
 
P
R
 
N
L
 
I
K
|
K
V
 
-
A
 
S
G
 
L
S
 
N
Y
|
Y
V
 
L
N
 
N
S
 
N
A
 
I
F
 
L
S
 
A
K
 
K
T
 
I
E
 
E
A
 
A
I
 
N
L
 
A
A
 
K
G
 
G
A
 
G
D
 
D
E
 
E
A
 
A
I
 
I
V
 
F
L
 
L
N
 
D
K
 
R
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
S
 
S
E
|
E
G
 
G
S
 
S
A
x
G
E
x
D
N
 
N
I
 
I
F
 
F
I
 
V
V
 
V
R
 
K
D
 
N
G
 
G
K
 
A
L
 
I
I
 
T
T
 
T
P
 
P
P
 
P
V
 
T
S
 
I
D
 
N
D
 
N
I
 
-
L
|
L
E
 
R
G
 
G
I
|
I
T
|
T
R
 
R
N
 
E
A
 
A
I
 
V
I
 
I
T
 
E
I
 
I
A
 
I
K
 
N
D
 
R
L
 
L
G
 
G
Y
 
I
Q
 
P
V
 
F
I
 
K
E
 
E
R
 
T
H
 
N
I
 
I
S
 
G
R
 
L
T
 
Y
E
 
D
L
 
L
Y
 
Y
I
 
T
A
 
A
D
 
D
E
 
E
I
 
V
F
 
F
F
 
V
C
 
T
G
|
G
T
|
T
G
 
A
A
 
A
Q
 
E
V
 
I
S
 
A
P
 
P
V
 
I
V
 
V
E
 
V
V
 
I
D
 
D
H
 
G
R
 
R
K
 
K
I
 
I
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
K
P
 
P
G
 
G
K
 
E
I
 
I
T
 
T
K
 
R
E
 
K
I
 
L
Q
 
M
E
 
E
V
 
E
Y
 
F

5e25A Crystal structure of branched-chain aminotransferase from thermophilic archaea geoglobus acetivorans complexed with alpha-ketoglutarate (see paper)
41% identity, 93% coverage: 4:283/302 of query aligns to 5:278/290 of 5e25A

query
sites
5e25A
I
 
V
Y
 
Y
F
 
M
E
 
N
G
 
G
K
 
E
I
 
F
V
 
V
P
 
P
E
 
E
D
 
S
Q
 
Q
A
 
A
K
 
K
I
 
V
S
 
S
I
 
V
K
 
F
T
 
D
N
 
H
S
 
G
F
 
F
H
 
L
Y
 
Y
G
 
G
T
 
D
A
 
G
I
 
V
F
|
F
E
 
E
G
|
G
I
 
I
R
 
R
A
 
A
Y
 
Y
Y
 
N
D
 
G
K
 
K
D
 
-
T
 
-
D
 
-
R
 
-
M
 
V
W
 
F
G
 
K
L
 
L
F
 
Y
F
 
-
K
 
-
E
 
E
H
 
H
Y
 
I
E
 
D
R
|
R
L
 
L
F
 
Y
Q
 
D
N
 
C
M
 
A
K
 
R
V
 
V
L
 
I
N
 
D
M
 
L
E
 
K
I
 
I
E
 
P
E
 
L
S
 
S
I
 
K
D
 
E
Q
 
E
L
 
F
V
 
A
E
 
E
I
 
A
T
 
I
K
 
L
E
 
E
L
 
T
I
 
L
R
 
R
K
 
R
N
 
N
N
 
N
I
 
L
K
 
R
D
 
D
D
 
-
I
 
A
Y
|
Y
I
 
I
R
 
R
P
 
P
I
 
I
V
 
V
Y
 
T
-
 
R
-
 
G
F
 
A
S
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
G
I
 
L
S
 
D
P
 
P
K
 
R
L
 
K
V
 
C
G
 
P
Y
 
-
K
 
S
S
 
P
R
 
N
I
 
V
A
 
I
I
 
I
Y
 
I
T
 
T
Y
 
K
P
 
P
L
 
W
G
 
G
D
 
K
-
 
L
Y
 
Y
I
 
G
D
 
D
I
 
L
-
 
Y
N
 
E
K
 
K
G
 
G
I
 
L
K
 
K
A
 
A
I
 
I
V
 
T
S
 
V
S
 
A
W
 
I
T
 
R
R
 
R
I
 
N
N
 
A
D
 
I
N
 
D
M
 
S
I
 
L
P
 
P
P
 
P
R
 
N
L
 
I
K
|
K
V
 
-
A
 
S
G
 
L
S
 
N
Y
|
Y
V
 
L
N
 
N
S
 
N
A
 
I
F
 
L
S
 
A
K
 
K
T
 
I
E
 
E
A
 
A
I
 
N
L
 
A
A
 
K
G
 
G
A
 
G
D
 
D
E
 
E
A
 
A
I
 
I
V
 
F
L
 
L
N
 
D
K
 
H
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
V
 
I
S
 
S
E
|
E
G
 
G
S
 
S
A
x
G
E
x
D
N
 
N
I
 
I
F
 
F
I
 
I
V
 
V
R
 
K
D
 
N
G
 
G
K
 
T
L
 
I
I
 
T
T
 
T
P
 
P
P
 
P
V
 
T
S
 
L
D
 
N
D
 
N
I
 
-
L
|
L
E
 
K
G
|
G
I
|
I
T
|
T
R
 
R
N
 
Q
A
 
V
I
 
V
I
 
I
T
 
E
I
 
L
A
 
I
K
 
N
D
 
E
L
 
L
G
 
E
Y
 
I
Q
 
P
V
 
F
I
 
R
E
 
E
R
 
A
H
 
N
I
 
I
S
 
G
R
 
L
T
 
F
E
 
D
L
 
L
Y
 
Y
I
 
S
A
 
A
D
 
D
E
 
E
I
 
I
F
 
F
F
 
V
C
 
T
G
|
G
T
|
T
G
x
A
A
 
A
Q
 
E
V
 
I
S
 
A
P
 
P
V
 
V
V
 
T
E
 
Y
V
 
I
D
 
D
H
 
G
R
 
R
K
 
T
I
 
V
G
 
G
D
 
N
G
 
G
S
 
K
P
 
P
G
 
G
K
 
K
I
 
V
T
 
T
K
 
K
E
 
M
I
 
L
Q
 
M
E
 
E
V
 
K
Y
 
F

7p3tB Transaminase of gamma-proteobacterium (see paper)
33% identity, 93% coverage: 4:284/302 of query aligns to 6:280/299 of 7p3tB

query
sites
7p3tB
I
 
I
Y
 
Y
F
 
I
E
 
N
G
 
G
K
 
D
I
 
Y
V
 
L
P
 
P
E
 
L
D
 
S
Q
 
Q
A
 
A
K
 
R
I
 
V
S
 
S
I
 
P
K
 
V
T
 
D
N
 
Q
S
 
G
F
 
F
H
 
L
Y
 
L
G
 
G
T
 
D
A
 
G
I
 
V
F
 
F
E
 
D
G
 
V
I
 
V
R
 
S
A
 
A
Y
 
W
Y
 
K
D
 
-
K
 
-
D
 
-
T
 
-
D
 
-
R
 
-
M
 
-
W
 
-
G
 
G
L
 
N
F
 
I
F
 
F
K
 
K
-
 
L
-
 
D
E
 
A
H
 
H
Y
 
L
E
 
D
R
|
R
L
 
F
F
 
F
Q
 
D
N
 
S
M
 
I
K
 
Q
V
 
A
L
 
A
N
 
R
M
 
L
E
 
N
I
 
H
E
 
D
E
 
M
S
 
S
I
 
R
D
 
D
Q
 
A
L
 
W
V
 
K
E
 
E
I
 
A
T
 
I
K
 
I
E
 
E
L
 
T
I
 
T
R
 
R
K
 
R
N
 
N
N
 
G
I
 
L
K
 
-
D
 
D
D
 
D
I
 
A
Y
 
S
I
 
I
R
 
R
P
 
F
I
 
I
V
 
V
Y
 
T
F
 
R
S
 
G
D
 
E
L
 
P
K
 
K
-
 
G
I
 
V
S
 
V
P
 
A
K
 
D
L
 
P
V
 
R
G
 
D
Y
 
F
K
 
K
S
 
P
R
 
T
I
 
C
A
 
I
I
 
V
Y
 
W
T
 
V
Y
 
A
P
 
P
-
 
Y
-
 
I
-
 
F
L
 
L
G
 
A
D
 
D
Y
 
E
I
 
E
D
 
K
I
 
R
N
 
R
K
 
N
G
 
G
I
 
I
K
 
R
A
 
L
I
 
M
V
 
I
S
 
S
S
 
A
W
 
T
T
 
R
R
 
G
I
 
F
N
 
P
D
 
A
N
 
D
M
 
T
I
 
L
P
 
D
P
 
P
R
 
R
L
 
Y
K
|
K
V
 
C
A
 
L
G
 
-
S
 
D
Y
x
R
V
 
L
N
 
H
S
 
S
A
 
Q
F
 
L
S
 
I
K
 
R
T
 
L
E
 
E
A
 
A
I
 
L
L
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
Y
D
 
D
E
 
D
A
 
A
I
 
L
V
 
W
L
 
L
N
 
D
K
 
H
N
 
S
G
 
G
Y
 
H
V
 
V
S
 
S
E
|
E
G
x
S
S
x
A
A
|
A
E
x
S
N
 
N
I
 
L
F
 
F
I
 
I
V
 
V
R
 
K
D
 
N
G
 
G
K
 
V
L
 
L
I
 
Y
T
 
T
P
 
P
P
 
-
V
 
-
S
 
S
D
 
A
D
 
G
I
 
I
L
 
L
E
 
R
G
|
G
I
|
I
T
|
T
R
 
R
N
 
D
A
 
T
I
 
I
I
 
L
T
 
E
I
 
L
A
 
A
K
 
T
D
 
E
L
 
L
G
 
D
Y
 
I
Q
 
P
V
 
W
I
 
K
E
 
E
R
 
R
H
 
Q
I
 
L
S
 
S
R
 
A
T
 
F
E
 
D
L
 
V
Y
 
Y
I
 
I
A
 
A
D
 
D
E
 
E
I
 
V
F
 
F
F
 
T
C
 
C
G
 
S
T
|
T
G
 
A
A
 
G
Q
 
G
V
 
A
S
 
L
P
 
P
V
 
V
V
 
R
E
 
E
V
 
V
D
 
A
H
 
G
R
 
R
K
 
T
I
 
I
G
 
R
D
 
G
G
 
T
S
 
T
P
 
P
G
 
G
K
 
P
I
 
I
T
 
T
K
 
Q
E
 
A
I
 
I
Q
 
D
E
 
N
V
 
A
Y
 
Y
F
 
W

3cswC Crystal structure of a putative branched-chain amino acid aminotransferase (tm0831) from thermotoga maritima at 2.15 a resolution
29% identity, 93% coverage: 4:283/302 of query aligns to 5:261/275 of 3cswC

query
sites
3cswC
I
 
I
Y
 
W
F
 
W
E
 
R
G
 
G
K
 
K
I
 
F
V
 
R
P
 
R
E
 
A
D
 
D
Q
 
E
A
 
I
K
 
S
I
 
L
S
 
D
I
 
F
K
 
S
T
 
L
N
 
F
S
 
E
F
 
K
H
 
S
Y
 
L
G
 
Q
T
 
G
A
 
A
I
 
V
F
x
Y
E
 
E
G
 
T
I
 
L
R
 
R
A
 
T
Y
 
Y
Y
 
-
D
 
-
K
 
-
D
 
-
T
 
-
D
 
S
R
 
R
M
 
A
W
 
P
G
 
F
L
 
A
F
 
A
F
 
Y
K
 
K
E
 
-
H
 
H
Y
 
Y
E
 
T
R
|
R
L
 
L
F
 
K
Q
 
R
N
 
S
M
 
A
K
 
D
V
 
F
L
 
F
N
 
N
M
 
L
E
 
P
I
 
L
E
 
S
E
 
L
S
 
S
I
 
F
D
 
D
Q
 
E
L
 
F
V
 
T
E
 
K
I
 
V
T
 
L
K
 
K
E
 
A
L
 
-
I
 
-
R
 
G
K
 
A
N
 
D
N
 
E
I
 
F
K
 
K
D
 
Q
D
 
E
I
 
V
Y
 
R
I
 
I
R
 
K
P
 
-
I
 
V
V
 
Y
Y
 
L
F
 
F
S
 
P
D
 
D
L
 
-
K
 
-
I
 
-
S
 
-
P
 
-
K
 
-
L
 
-
V
 
-
G
 
-
Y
 
-
K
 
-
S
 
S
R
 
G
I
 
E
A
 
V
I
 
L
Y
 
F
T
 
V
Y
 
F
P
 
S
L
 
P
G
 
L
D
 
N
Y
 
I
I
 
P
D
 
D
I
 
L
N
 
E
K
 
T
G
 
G
I
 
V
K
 
E
A
 
V
I
 
K
V
 
I
S
 
S
S
 
N
W
 
V
T
 
R
R
 
R
I
 
I
N
 
P
D
 
D
N
 
L
M
 
S
I
 
T
P
 
P
P
 
P
R
 
A
L
 
L
K
|
K
V
 
I
A
 
T
G
 
G
S
 
-
Y
 
-
V
 
-
N
 
-
S
 
-
A
 
-
F
 
-
S
 
-
K
 
R
T
 
T
E
 
D
A
 
I
I
 
V
L
 
L
A
 
A
G
 
R
A
 
R
D
 
E
-
 
I
-
 
V
-
 
D
-
 
C
-
 
Y
E
 
D
A
 
V
I
 
I
V
 
L
L
 
L
N
 
G
K
 
L
N
 
N
G
 
G
Y
 
Q
V
 
V
S
 
C
E
|
E
G
 
G
S
 
S
A
x
F
E
x
S
N
 
N
I
 
V
F
 
F
I
 
L
V
 
V
R
 
K
D
 
E
G
 
G
K
 
K
L
 
L
I
 
I
T
 
T
P
 
P
P
 
S
V
 
L
S
 
D
D
 
S
D
 
G
I
 
I
L
|
L
E
 
D
G
|
G
I
|
I
T
|
T
R
 
R
N
 
E
A
 
N
I
 
V
I
 
I
T
 
K
I
 
L
A
 
A
K
 
K
D
 
S
L
 
L
G
 
E
Y
 
I
Q
 
P
V
 
V
I
 
E
E
 
E
R
 
R
H
 
V
I
 
V
S
 
W
R
 
V
T
 
W
E
 
E
L
 
L
Y
 
F
I
 
E
A
 
A
D
 
D
E
 
E
I
 
M
F
 
F
F
 
L
C
 
T
G
 
H
T
|
T
G
 
S
A
 
A
Q
 
G
V
 
V
S
 
V
P
 
P
V
 
V
V
 
R
E
 
R
V
 
L
D
 
N
H
 
E
R
 
H
K
 
S
I
 
F
G
 
F
D
 
E
G
 
E
S
 
E
P
 
P
G
 
G
K
 
P
I
 
V
T
 
T
K
 
A
E
 
T
I
 
L
Q
 
M
E
 
E
V
 
N
Y
 
F

P19938 D-alanine aminotransferase; D-amino acid aminotransferase; D-amino acid transaminase; DAAT; D-aspartate aminotransferase; EC 2.6.1.21 from Bacillus sp. (strain YM-1) (see 5 papers)
27% identity, 94% coverage: 1:283/302 of query aligns to 1:273/283 of P19938

query
sites
P19938
M
|
M
E
 
G
Y
 
Y
I
 
T
Y
 
L
F
 
W
E
 
N
G
 
D
K
 
Q
I
 
I
V
 
V
P
 
K
E
 
D
D
 
E
Q
 
E
A
 
V
K
 
K
I
 
I
S
 
D
I
 
K
K
 
E
T
 
D
N
 
R
S
 
G
F
 
Y
H
 
Q
Y
 
F
G
 
G
T
 
D
A
 
G
I
 
V
F
x
Y
E
 
E
G
 
V
I
 
V
R
 
K
A
 
V
Y
 
Y
Y
 
-
D
 
-
K
 
-
D
 
-
T
 
N
D
 
G
R
 
E
M
 
M
W
 
F
G
 
T
L
 
V
F
 
-
F
 
-
K
 
N
E
 
E
H
 
H
Y
 
I
E
 
D
R
|
R
L
 
L
F
 
Y
Q
 
A
N
 
S
M
 
A
K
 
E
V
 
K
L
 
I
N
 
R
M
 
I
E
 
T
I
 
I
E
 
P
E
 
Y
S
 
T
I
 
K
D
 
D
Q
 
K
L
 
F
V
 
H
E
 
Q
I
 
L
T
 
L
K
 
H
E
 
E
L
 
L
I
 
V
R
 
E
K
 
K
N
 
N
N
 
E
I
 
L
K
 
N
D
 
T
-
 
G
D
 
H
I
 
I
Y
 
Y
I
 
F
R
 
Q
-
 
V
-
 
T
-
 
R
-
 
G
-
 
T
-
 
S
P
 
P
I
x
R
V
 
A
Y
x
H
-
 
Q
F
 
F
S
 
P
D
 
E
L
 
N
K
 
T
I
 
V
S
 
K
P
 
P
K
 
V
L
 
I
V
 
I
G
 
G
Y
 
Y
K
 
T
S
 
K
R
 
E
I
 
-
A
 
-
I
 
-
Y
 
N
T
 
P
Y
 
R
P
 
P
L
 
L
G
 
E
D
 
N
Y
 
-
I
 
-
D
 
-
I
 
L
N
 
E
K
 
K
G
 
G
I
 
V
K
 
K
A
 
A
I
 
T
V
 
F
S
 
V
S
 
E
-
 
D
-
 
I
-
 
R
W
 
W
T
 
L
R
 
R
I
 
C
N
 
D
D
 
I
N
x
K
M
 
S
I
 
L
P
 
-
P
 
-
R
 
-
L
 
-
K
 
-
V
 
-
A
 
-
G
 
-
S
 
N
Y
 
L
V
 
L
N
 
G
S
 
A
A
 
V
F
 
L
S
 
A
K
 
K
T
 
Q
E
 
E
A
 
A
I
 
H
L
 
E
A
 
K
G
 
G
A
 
C
D
 
Y
E
 
E
A
 
A
I
 
I
V
 
-
L
 
L
N
 
H
K
 
R
N
 
N
G
 
N
Y
 
T
V
 
V
S
 
T
E
|
E
G
 
G
S
 
S
A
 
S
E
 
S
N
 
N
I
 
V
F
 
F
I
 
G
V
 
I
R
 
K
D
 
D
G
 
G
K
 
I
L
 
L
I
 
Y
T
 
T
P
 
H
P
 
P
V
 
A
S
 
N
D
 
N
D
 
M
I
 
I
L
|
L
E
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
T
R
 
R
N
 
D
A
 
V
I
 
V
I
 
I
T
 
A
I
 
C
A
 
A
K
 
N
D
 
E
L
 
I
G
 
N
Y
 
M
Q
 
P
V
 
V
I
 
K
E
 
E
R
 
I
H
 
P
I
 
F
S
 
T
R
 
T
T
 
H
E
 
E
L
 
A
Y
 
L
I
 
K
A
 
M
D
 
D
E
 
E
I
 
L
F
 
F
F
 
V
C
 
T
G
 
S
T
 
T
G
 
T
A
 
S
Q
 
E
V
 
I
S
 
T
P
 
P
V
 
V
V
 
I
E
 
E
V
 
I
D
 
D
H
 
G
R
 
K
K
 
L
I
 
I
G
 
R
D
 
D
G
 
G
S
 
K
P
 
V
G
 
G
K
 
E
I
 
W
T
 
T
K
 
R
E
 
K
I
 
L
Q
 
Q
E
 
K
V
 
Q
Y
 
F

3daaA Crystallographic structure of d-amino acid aminotransferase inactivated by pyridoxyl-d-alanine (see paper)
27% identity, 93% coverage: 3:283/302 of query aligns to 2:272/277 of 3daaA

query
sites
3daaA
Y
 
Y
I
 
T
Y
 
L
F
 
W
E
 
N
G
 
D
K
 
Q
I
 
I
V
 
V
P
 
K
E
 
D
D
 
E
Q
 
E
A
 
V
K
 
K
I
 
I
S
 
D
I
 
K
K
 
E
T
 
D
N
 
R
S
 
G
F
 
Y
H
 
Q
Y
 
F
G
 
G
T
 
D
A
 
G
I
 
V
F
x
Y
E
 
E
G
x
V
I
 
V
R
 
K
A
 
V
Y
 
Y
Y
 
-
D
 
-
K
 
-
D
 
-
T
 
N
D
 
G
R
 
E
M
 
M
W
 
F
G
 
T
L
 
V
F
 
-
F
 
-
K
 
N
E
 
E
H
 
H
Y
 
I
E
 
D
R
|
R
L
 
L
F
 
Y
Q
 
A
N
 
S
M
 
A
K
 
E
V
 
K
L
 
I
N
 
R
M
 
I
E
 
T
I
 
I
E
 
P
E
 
Y
S
 
T
I
 
K
D
 
D
Q
 
K
L
 
F
V
 
H
E
 
Q
I
 
L
T
 
L
K
 
H
E
 
E
L
 
L
I
 
V
R
 
E
K
 
K
N
 
N
N
 
E
I
 
L
K
 
N
D
 
T
-
 
G
D
 
H
I
 
I
Y
 
Y
I
 
F
R
 
Q
-
 
V
-
 
T
-
 
R
-
 
G
-
 
T
-
 
S
P
 
P
I
 
R
V
 
A
Y
 
H
-
 
Q
F
 
F
S
 
P
D
 
E
L
 
N
K
 
T
I
 
V
S
 
K
P
 
P
K
 
V
L
 
I
V
 
I
G
 
G
Y
 
Y
K
 
T
S
 
K
R
 
E
I
 
-
A
 
-
I
 
-
Y
 
N
T
 
P
Y
 
R
P
 
P
L
 
L
G
 
E
D
 
N
Y
 
-
I
 
-
D
 
-
I
 
L
N
 
E
K
 
K
G
 
G
I
 
V
K
 
K
A
 
A
I
 
T
V
 
F
S
 
V
S
 
E
-
 
D
-
 
I
-
 
R
W
 
W
T
 
L
R
 
R
I
 
C
N
 
D
D
 
I
N
x
K
M
 
S
I
 
L
P
 
-
P
 
-
R
 
-
L
 
-
K
 
-
V
 
-
A
 
-
G
 
-
S
 
N
Y
 
L
V
 
L
N
 
G
S
 
A
A
 
V
F
 
L
S
 
A
K
 
K
T
 
Q
E
 
E
A
 
A
I
 
H
L
 
E
A
 
K
G
 
G
A
 
C
D
 
Y
E
 
E
A
 
A
I
 
I
V
 
-
L
 
L
N
 
H
K
 
R
N
 
N
G
 
N
Y
 
T
V
 
V
S
 
T
E
|
E
G
 
G
S
 
S
A
x
S
E
x
S
N
 
N
I
 
V
F
 
F
I
 
G
V
 
I
R
 
K
D
 
D
G
 
G
K
 
I
L
 
L
I
 
Y
T
 
T
P
 
H
P
 
P
V
 
A
S
 
N
D
 
N
D
 
M
I
 
I
L
|
L
E
 
K
G
|
G
I
|
I
T
|
T
R
 
R
N
 
D
A
 
V
I
 
V
I
 
I
T
 
A
I
 
C
A
 
A
K
 
N
D
 
E
L
 
I
G
 
N
Y
 
M
Q
 
P
V
 
V
I
 
K
E
 
E
R
 
I
H
 
P
I
 
F
S
 
T
R
 
T
T
 
H
E
 
E
L
 
A
Y
 
L
I
 
K
A
 
M
D
 
D
E
 
E
I
 
L
F
 
F
F
 
V
C
 
T
G
x
S
T
|
T
G
 
T
A
 
S
Q
 
E
V
 
I
S
 
T
P
 
P
V
 
V
V
 
I
E
 
E
V
 
I
D
 
D
H
 
G
R
 
K
K
 
L
I
 
I
G
 
R
D
 
D
G
 
G
S
 
K
P
 
V
G
 
G
K
 
E
I
 
W
T
 
T
K
 
R
E
 
K
I
 
L
Q
 
Q
E
 
K
V
 
Q
Y
 
F

Query Sequence

>WP_015898939.1 NCBI__GCF_000021565.1:WP_015898939.1
MEYIYFEGKIVPEDQAKISIKTNSFHYGTAIFEGIRAYYDKDTDRMWGLFFKEHYERLFQ
NMKVLNMEIEESIDQLVEITKELIRKNNIKDDIYIRPIVYFSDLKISPKLVGYKSRIAIY
TYPLGDYIDINKGIKAIVSSWTRINDNMIPPRLKVAGSYVNSAFSKTEAILAGADEAIVL
NKNGYVSEGSAENIFIVRDGKLITPPVSDDILEGITRNAIITIAKDLGYQVIERHISRTE
LYIADEIFFCGTGAQVSPVVEVDHRKIGDGSPGKITKEIQEVYFNAVRGKIEKYRHWVIP
ID

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory