SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_015928057.1 NCBI__GCF_000022085.1:WP_015928057.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3triA Structure of a pyrroline-5-carboxylate reductase (proc) from coxiella burnetii (see paper)
36% identity, 97% coverage: 8:271/272 of query aligns to 3:268/272 of 3triA

query
sites
3triA
A
 
S
S
 
N
L
 
I
V
 
T
L
 
F
V
 
I
G
|
G
A
 
G
G
|
G
K
x
N
M
|
M
G
 
A
G
 
R
A
 
N
M
 
I
L
 
V
E
 
V
G
 
G
W
 
L
L
 
I
A
 
A
G
 
N
G
 
G
L
 
Y
D
 
D
G
 
P
S
 
N
R
 
R
I
 
I
A
 
C
V
 
V
V
 
T
D
x
N
P
x
R
G
x
S
A
 
L
S
 
D
P
x
K
-
 
L
-
 
D
D
 
F
L
 
F
T
 
K
A
 
E
L
 
K
C
 
C
G
 
G
R
 
V
H
 
H
G
 
T
I
 
T
A
 
Q
L
 
D
N
|
N
P
 
R
E
 
Q
G
 
G
L
 
A
T
 
L
P
 
N
P
 
A
E
 
D
A
 
V
L
 
V
V
 
V
L
 
L
A
|
A
I
x
V
K
|
K
P
 
P
Q
 
H
G
x
Q
L
 
I
E
 
K
A
x
M
A
 
V
S
 
C
S
 
E
A
 
E
V
 
L
A
 
K
P
 
D
L
 
I
V
 
L
G
 
S
P
 
E
-
 
T
D
 
K
T
 
I
L
 
L
V
 
V
V
 
I
S
 
S
V
x
L
L
x
A
A
x
V
G
 
G
K
 
V
T
 
T
V
 
T
A
 
P
N
 
L
L
 
I
K
 
E
A
 
K
R
 
W
L
 
L
P
 
G
Q
 
K
A
 
A
R
 
S
A
 
R
V
 
I
V
 
V
R
 
R
A
 
A
M
|
M
P
|
P
N
 
N
L
 
T
P
 
P
A
 
S
S
 
S
I
 
V
G
 
R
R
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
L
A
 
F
A
 
A
S
 
N
P
 
E
E
 
T
T
 
V
S
 
D
E
 
K
R
 
D
Q
 
Q
R
 
K
R
 
N
M
 
L
A
 
A
D
 
E
A
 
S
L
 
I
L
 
M
S
 
R
G
 
A
I
 
V
G
 
G
L
 
L
V
 
V
E
 
I
W
 
W
L
 
V
A
 
S
D
 
S
E
 
E
S
 
D
L
 
Q
I
 
I
D
 
E
A
 
K
V
 
I
T
 
A
A
 
A
V
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
I
F
 
F
L
 
L
L
 
I
A
 
M
E
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
Q
E
 
E
A
 
A
G
 
A
A
 
E
A
 
Q
A
 
L
G
 
G
L
 
L
P
 
T
P
 
K
D
 
E
V
 
T
A
 
A
A
 
E
R
 
L
L
 
L
A
 
T
R
 
E
Q
 
Q
T
 
T
V
 
V
A
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
A
 
R
L
 
M
L
 
A
A
 
L
E
 
E
S
 
T
P
 
E
L
 
Q
E
 
S
P
 
V
G
 
V
I
 
Q
L
 
L
R
 
R
Q
 
Q
N
 
F
V
 
V
T
 
T
S
 
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
T
T
 
T
A
 
E
A
 
Q
A
 
A
L
 
I
G
 
K
V
 
V
L
 
L
M
 
-
A
 
E
A
 
S
G
 
G
G
 
N
L
 
L
P
 
R
D
 
E
L
 
L
L
 
F
R
 
I
A
 
K
A
 
A
V
 
L
A
 
T
A
 
A
A
 
A
K
 
V
S
 
N
R
 
R
S
 
A
A
 
K
E
 
E
L
 
L
S
 
S

5bshA Crystal structure of medicago truncatula (delta)1-pyrroline-5- carboxylate reductase (mtp5cr) in complex with l-proline (see paper)
39% identity, 97% coverage: 9:271/272 of query aligns to 10:272/272 of 5bshA

query
sites
5bshA
S
 
T
L
 
L
V
 
G
L
 
F
V
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
M
 
M
G
 
A
G
 
E
A
 
S
M
 
I
L
 
A
E
 
K
G
 
G
W
 
A
L
 
V
A
 
R
G
 
S
G
 
G
-
 
V
L
 
L
D
 
S
G
 
P
S
 
S
R
 
R
I
 
I
A
 
K
V
 
T
V
 
A
D
 
I
P
 
H
G
 
S
A
 
N
S
 
P
P
 
A
D
 
R
L
 
R
T
 
T
A
 
A
L
 
F
-
 
E
-
 
S
C
 
I
G
 
G
R
 
I
H
 
T
G
 
V
I
 
L
A
 
S
L
 
S
N
 
N
P
 
D
E
 
D
G
 
V
L
 
V
T
 
R
P
 
D
P
 
S
E
 
N
A
 
V
L
 
V
V
 
V
L
 
F
A
 
S
I
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
Q
G
 
L
L
 
L
E
 
K
A
 
D
A
 
V
S
 
V
S
 
L
A
 
K
V
 
L
A
 
K
P
 
P
L
 
L
V
 
L
G
 
T
P
 
K
D
 
D
T
 
K
L
 
L
V
 
L
V
 
V
S
 
S
V
 
V
L
 
A
A
 
A
G
 
G
K
 
I
T
 
K
V
 
M
A
 
K
N
 
D
L
 
L
K
 
Q
A
 
E
R
 
W
L
 
A
P
 
G
Q
 
H
A
 
E
R
 
R
A
 
-
V
 
F
V
 
I
R
 
R
A
 
V
M
 
M
P
 
P
N
 
N
L
 
T
P
 
A
A
 
A
S
 
T
I
 
V
G
 
G
R
 
E
G
 
A
A
 
A
T
 
S
G
 
V
A
 
M
A
 
S
A
 
L
S
 
G
P
 
G
E
 
A
T
 
A
S
 
T
E
 
E
R
 
E
Q
 
D
R
 
A
R
 
N
M
 
L
A
 
I
D
 
S
A
 
Q
L
 
L
L
 
F
S
 
G
G
 
S
I
 
I
G
 
G
L
 
K
V
 
I
E
 
-
W
 
W
L
 
K
A
 
A
D
 
D
E
 
D
S
 
K
L
 
Y
I
 
F
D
 
D
A
 
A
V
 
I
T
 
T
A
 
G
V
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
I
F
 
Y
L
 
L
L
 
A
A
 
I
E
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
D
A
 
G
G
 
G
A
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
P
 
R
D
 
D
V
 
L
A
 
A
A
 
L
R
 
S
L
 
L
A
 
A
R
 
S
Q
 
Q
T
 
T
V
 
V
A
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
A
 
S
L
 
M
L
 
A
A
 
T
E
 
Q
S
 
S
P
 
G
L
 
K
E
 
H
P
 
P
G
 
G
I
 
Q
L
 
L
R
 
K
Q
 
D
N
 
D
V
|
V
T
 
T
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
|
T
T
|
T
A
 
I
A
 
A
A
 
G
L
 
V
G
 
H
V
 
E
L
 
L
M
 
E
A
 
K
A
 
A
G
 
G
G
 
F
L
 
R
P
 
G
D
 
I
L
 
L
L
 
M
R
 
N
A
 
A
A
 
V
V
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
K
S
 
-
R
 
R
S
 
S
A
 
Q
E
 
E
L
 
L
S
 
S

5bsgA Crystal structure of medicago truncatula (delta)1-pyrroline-5- carboxylate reductase (mtp5cr) in complex with NADP+ (see paper)
39% identity, 97% coverage: 9:271/272 of query aligns to 10:272/272 of 5bsgA

query
sites
5bsgA
S
 
T
L
 
L
V
 
G
L
 
F
V
 
I
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
M
|
M
G
 
A
G
 
E
A
 
S
M
 
I
L
 
A
E
 
K
G
 
G
W
 
A
L
 
V
A
 
R
G
 
S
G
 
G
-
 
V
L
 
L
D
 
S
G
 
P
S
 
S
R
 
R
I
 
I
A
 
K
V
 
T
V
 
A
D
 
I
P
x
H
G
x
S
A
x
N
S
 
P
P
 
A
D
 
R
L
 
R
T
 
T
A
 
A
L
 
F
-
 
E
-
 
S
C
 
I
G
 
G
R
 
I
H
 
T
G
 
V
I
 
L
A
 
S
L
 
S
N
|
N
P
 
D
E
 
D
G
 
V
L
 
V
T
 
R
P
 
D
P
 
S
E
 
N
A
 
V
L
 
V
V
 
V
L
 
F
A
x
S
I
x
V
K
|
K
P
 
P
Q
 
Q
G
x
L
L
 
L
E
 
K
A
 
D
A
x
V
S
 
V
S
 
L
A
 
K
V
 
L
A
 
K
P
 
P
L
 
L
V
 
L
G
 
T
P
 
K
D
 
D
T
 
K
L
 
L
V
 
L
V
 
V
S
 
S
V
|
V
L
x
A
A
|
A
G
 
G
K
 
I
T
 
K
V
 
M
A
 
K
N
 
D
L
 
L
K
 
Q
A
 
E
R
 
W
L
 
A
P
 
G
Q
 
H
A
 
E
R
 
R
A
 
-
V
 
F
V
 
I
R
 
R
A
 
V
M
 
M
P
|
P
N
 
N
L
 
T
P
 
A
A
 
A
S
 
T
I
 
V
G
 
G
R
 
E
G
 
A
A
 
A
T
 
S
G
 
V
A
 
M
A
 
S
A
 
L
S
 
G
P
 
G
E
 
A
T
 
A
S
 
T
E
 
E
R
 
E
Q
 
D
R
 
A
R
 
N
M
 
L
A
 
I
D
 
S
A
 
Q
L
 
L
L
 
F
S
 
G
G
 
S
I
 
I
G
 
G
L
 
K
V
 
I
E
 
-
W
 
W
L
 
K
A
 
A
D
 
D
E
 
D
S
 
K
L
 
Y
I
 
F
D
 
D
A
 
A
V
 
I
T
 
T
A
 
G
V
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
I
F
 
Y
L
 
L
L
 
A
A
 
I
E
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
D
A
 
G
G
 
G
A
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
P
 
R
D
 
D
V
 
L
A
 
A
A
 
L
R
 
S
L
 
L
A
 
A
R
 
S
Q
 
Q
T
 
T
V
 
V
A
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
A
 
S
L
 
M
L
 
A
A
 
T
E
 
Q
S
 
S
P
 
G
L
 
K
E
 
H
P
 
P
G
 
G
I
 
Q
L
 
L
R
 
K
Q
 
D
N
 
D
V
 
V
T
 
T
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
T
T
|
T
A
 
I
A
 
A
A
 
G
L
 
V
G
 
H
V
 
E
L
 
L
M
 
E
A
 
K
A
 
A
G
 
G
G
 
F
L
 
R
P
 
G
D
 
I
L
 
L
L
 
M
R
 
N
A
 
A
A
 
V
V
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
K
S
 
-
R
 
R
S
 
S
A
 
Q
E
 
E
L
 
L
S
 
S

5bsfA Crystal structure of medicago truncatula (delta)1-pyrroline-5- carboxylate reductase (mtp5cr) in complex with NAD+ (see paper)
39% identity, 97% coverage: 9:271/272 of query aligns to 10:272/272 of 5bsfA

query
sites
5bsfA
S
 
T
L
 
L
V
 
G
L
 
F
V
 
I
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
M
|
M
G
 
A
G
 
E
A
 
S
M
 
I
L
 
A
E
 
K
G
 
G
W
 
A
L
 
V
A
 
R
G
 
S
G
 
G
-
 
V
L
 
L
D
 
S
G
 
P
S
 
S
R
 
R
I
 
I
A
 
K
V
 
T
V
 
A
D
 
I
P
x
H
G
 
S
A
 
N
S
 
P
P
 
A
D
 
R
L
 
R
T
 
T
A
 
A
L
 
F
-
 
E
-
 
S
C
 
I
G
 
G
R
 
I
H
 
T
G
 
V
I
 
L
A
 
S
L
 
S
N
|
N
P
 
D
E
 
D
G
 
V
L
 
V
T
 
R
P
 
D
P
 
S
E
 
N
A
 
V
L
 
V
V
 
V
L
 
F
A
x
S
I
x
V
K
|
K
P
 
P
Q
 
Q
G
x
L
L
 
L
E
 
K
A
 
D
A
x
V
S
 
V
S
 
L
A
 
K
V
 
L
A
 
K
P
 
P
L
 
L
V
 
L
G
 
T
P
 
K
D
 
D
T
 
K
L
 
L
V
 
L
V
 
V
S
 
S
V
|
V
L
 
A
A
|
A
G
 
G
K
 
I
T
 
K
V
 
M
A
 
K
N
 
D
L
 
L
K
 
Q
A
 
E
R
 
W
L
 
A
P
 
G
Q
 
H
A
 
E
R
 
R
A
 
-
V
 
F
V
 
I
R
 
R
A
 
V
M
 
M
P
|
P
N
 
N
L
 
T
P
 
A
A
 
A
S
 
T
I
 
V
G
 
G
R
 
E
G
 
A
A
 
A
T
 
S
G
 
V
A
 
M
A
 
S
A
 
L
S
 
G
P
 
G
E
 
A
T
 
A
S
 
T
E
 
E
R
 
E
Q
 
D
R
 
A
R
 
N
M
 
L
A
 
I
D
 
S
A
 
Q
L
 
L
L
 
F
S
 
G
G
 
S
I
 
I
G
 
G
L
 
K
V
 
I
E
 
-
W
 
W
L
 
K
A
 
A
D
 
D
E
 
D
S
 
K
L
 
Y
I
 
F
D
 
D
A
 
A
V
 
I
T
 
T
A
 
G
V
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
I
F
 
Y
L
 
L
L
 
A
A
 
I
E
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
D
A
 
G
G
 
G
A
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
P
 
R
D
 
D
V
 
L
A
 
A
A
 
L
R
 
S
L
 
L
A
 
A
R
 
S
Q
 
Q
T
 
T
V
 
V
A
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
A
 
S
L
 
M
L
 
A
A
 
T
E
 
Q
S
 
S
P
 
G
L
 
K
E
 
H
P
 
P
G
 
G
I
 
Q
L
 
L
R
 
K
Q
 
D
N
 
D
V
 
V
T
 
T
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
T
T
|
T
A
 
I
A
 
A
A
 
G
L
 
V
G
 
H
V
 
E
L
 
L
M
 
E
A
 
K
A
 
A
G
 
G
G
 
F
L
 
R
P
 
G
D
 
I
L
 
L
L
 
M
R
 
N
A
 
A
A
 
V
V
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
K
S
 
-
R
 
R
S
 
S
A
 
Q
E
 
E
L
 
L
S
 
S

5bseA Crystal structure of medicago truncatula (delta)1-pyrroline-5- carboxylate reductase (mtp5cr) (see paper)
39% identity, 97% coverage: 9:271/272 of query aligns to 10:272/272 of 5bseA

query
sites
5bseA
S
 
T
L
 
L
V
 
G
L
 
F
V
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
M
 
M
G
 
A
G
 
E
A
 
S
M
 
I
L
 
A
E
 
K
G
 
G
W
 
A
L
 
V
A
 
R
G
 
S
G
 
G
-
 
V
L
 
L
D
 
S
G
 
P
S
 
S
R
 
R
I
 
I
A
 
K
V
 
T
V
 
A
D
 
I
P
 
H
G
 
S
A
 
N
S
 
P
P
 
A
D
 
R
L
 
R
T
 
T
A
 
A
L
 
F
-
 
E
-
 
S
C
 
I
G
 
G
R
 
I
H
 
T
G
 
V
I
 
L
A
 
S
L
 
S
N
 
N
P
 
D
E
 
D
G
 
V
L
 
V
T
 
R
P
 
D
P
 
S
E
 
N
A
 
V
L
 
V
V
 
V
L
 
F
A
 
S
I
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
Q
G
 
L
L
 
L
E
 
K
A
 
D
A
 
V
S
 
V
S
 
L
A
 
K
V
 
L
A
 
K
P
 
P
L
 
L
V
 
L
G
 
T
P
 
K
D
 
D
T
 
K
L
 
L
V
 
L
V
 
V
S
 
S
V
 
V
L
 
A
A
 
A
G
 
G
K
 
I
T
 
K
V
 
M
A
 
K
N
 
D
L
 
L
K
 
Q
A
 
E
R
 
W
L
 
A
P
 
G
Q
 
H
A
 
E
R
 
R
A
 
-
V
 
F
V
 
I
R
 
R
A
 
V
M
 
M
P
 
P
N
 
N
L
 
T
P
 
A
A
 
A
S
 
T
I
 
V
G
 
G
R
 
E
G
 
A
A
 
A
T
 
S
G
 
V
A
 
M
A
 
S
A
 
L
S
 
G
P
 
G
E
 
A
T
 
A
S
 
T
E
 
E
R
 
E
Q
 
D
R
 
A
R
 
N
M
 
L
A
 
I
D
 
S
A
 
Q
L
 
L
L
 
F
S
 
G
G
 
S
I
 
I
G
 
G
L
 
K
V
 
I
E
 
-
W
 
W
L
 
K
A
 
A
D
 
D
E
 
D
S
 
K
L
 
Y
I
 
F
D
 
D
A
 
A
V
 
I
T
 
T
A
 
G
V
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
I
F
 
Y
L
 
L
L
 
A
A
 
I
E
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
D
A
 
G
G
 
G
A
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
P
 
R
D
 
D
V
 
L
A
 
A
A
 
L
R
 
S
L
 
L
A
 
A
R
 
S
Q
 
Q
T
 
T
V
 
V
A
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
A
 
S
L
 
M
L
 
A
A
 
T
E
 
Q
S
 
S
P
 
G
L
 
K
E
 
H
P
 
P
G
 
G
I
 
Q
L
 
L
R
 
K
Q
 
D
N
 
D
V
 
V
T
 
T
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
T
T
|
T
A
 
I
A
 
A
A
 
G
L
 
V
G
 
H
V
 
E
L
 
L
M
 
E
A
 
K
A
 
A
G
 
G
G
 
F
L
 
R
P
 
G
D
 
I
L
 
L
L
 
M
R
 
N
A
 
A
A
 
V
V
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
K
S
 
-
R
 
R
S
 
S
A
 
Q
E
 
E
L
 
L
S
 
S

2ag8A NADP complex of pyrroline-5-carboxylate reductase from neisseria meningitidis (see paper)
37% identity, 97% coverage: 9:271/272 of query aligns to 2:259/263 of 2ag8A

query
sites
2ag8A
S
 
N
L
 
V
V
 
Y
L
 
F
V
x
L
G
|
G
A
 
G
G
|
G
K
x
N
M
|
M
G
 
A
G
 
A
A
 
A
M
 
V
L
 
A
E
 
G
G
 
G
W
 
L
L
 
V
A
 
K
G
 
Q
G
 
G
L
 
-
D
 
-
G
 
G
S
 
Y
R
 
R
I
 
I
A
 
Y
V
 
I
V
x
A
D
x
N
P
x
R
G
|
G
A
 
A
S
 
E
P
x
K
D
 
R
-
 
E
-
 
R
L
 
L
T
 
E
A
 
K
L
 
E
C
 
L
G
 
G
R
 
V
H
 
E
G
 
T
I
 
S
A
 
A
L
 
T
N
 
L
P
 
P
E
 
E
G
 
-
L
 
L
T
 
H
P
 
S
P
 
D
E
 
D
A
 
V
L
 
L
V
 
I
L
 
L
A
|
A
I
x
V
K
|
K
P
 
P
Q
 
Q
G
 
D
L
 
M
E
 
E
A
 
A
A
|
A
S
 
C
S
 
K
A
 
N
V
 
I
A
 
R
P
 
T
L
 
-
V
 
-
G
 
-
P
 
N
D
 
G
T
 
A
L
 
L
V
 
V
V
 
L
S
 
S
V
|
V
L
x
A
A
|
A
G
 
G
K
 
L
T
 
S
V
 
V
A
 
G
N
 
T
L
 
L
K
 
S
A
 
R
R
 
Y
L
 
L
P
 
G
Q
 
G
A
 
T
R
 
R
A
 
R
V
 
I
V
 
V
R
 
R
A
 
V
M
|
M
P
|
P
N
 
N
L
 
T
P
 
P
A
 
G
S
 
K
I
 
I
G
 
G
R
 
L
G
 
G
A
 
V
T
 
S
G
 
G
A
 
M
A
 
Y
A
 
A
S
 
E
P
 
A
E
 
E
T
 
V
S
 
S
E
 
E
R
 
T
Q
 
D
R
 
R
R
 
R
M
 
I
A
 
A
D
 
D
A
 
R
L
 
I
L
 
M
S
 
K
G
 
S
I
 
V
G
 
G
L
 
L
V
 
T
E
 
V
W
 
W
L
 
L
A
 
D
D
 
D
E
 
E
S
 
E
L
 
K
I
 
M
D
 
H
A
 
G
V
 
I
T
 
T
A
 
G
V
 
I
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
F
 
F
L
 
Y
L
 
L
A
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
Q
E
 
N
A
 
A
G
 
A
A
 
I
A
 
R
A
 
Q
G
 
G
L
 
F
P
 
D
P
 
M
D
 
A
V
 
E
A
 
A
A
 
R
R
 
A
L
 
L
A
 
S
R
 
L
Q
 
A
T
 
T
V
 
F
A
 
K
G
 
G
A
 
A
G
 
V
A
 
A
L
 
L
L
 
A
A
 
E
E
 
Q
S
 
T
P
 
G
L
 
E
E
 
D
P
 
F
G
 
E
I
 
K
L
 
L
R
 
Q
Q
 
K
N
 
N
V
 
V
T
 
T
S
 
S
P
 
K
G
 
G
G
 
G
T
 
T
T
 
T
A
 
H
A
 
E
A
 
A
L
 
V
G
 
E
V
 
A
L
 
F
M
 
R
A
 
R
A
 
H
G
 
-
G
 
R
L
 
V
P
 
A
D
 
E
L
 
A
L
 
I
R
 
S
A
 
E
A
 
G
V
 
V
A
 
C
A
 
A
A
 
C
K
 
V
S
 
R
R
 
R
S
 
S
A
 
Q
E
 
E
L
 
M
S
 
E

8tdcA Structure of pycr1 complexed with nadh and 1,3-dithiane-2-carboxylic acid (see paper)
36% identity, 96% coverage: 12:271/272 of query aligns to 6:270/276 of 8tdcA

query
sites
8tdcA
L
 
F
V
 
I
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
x
Q
M
x
L
G
 
A
G
 
F
A
 
A
M
 
L
L
 
A
E
 
K
G
 
G
W
 
F
L
 
T
A
 
A
G
 
A
G
 
G
-
 
V
L
 
L
D
 
A
G
 
A
S
 
H
R
 
K
I
 
I
A
 
M
V
 
A
V
 
S
D
x
S
P
|
P
G
 
D
A
 
M
S
 
D
P
 
L
D
 
A
L
 
T
T
 
V
A
 
S
L
 
A
C
 
L
G
 
R
R
 
K
H
 
M
G
 
G
I
 
V
A
 
K
L
 
L
N
 
T
P
 
P
-
 
H
-
x
N
-
 
K
E
 
E
G
 
T
L
 
V
T
 
Q
P
 
H
P
 
S
E
 
D
A
 
V
L
 
L
V
 
F
L
 
L
A
|
A
I
x
V
K
|
K
P
 
P
Q
 
H
G
 
I
L
 
I
E
 
P
A
 
F
A
x
I
S
 
L
S
 
D
A
 
E
V
 
I
A
 
G
P
 
A
L
 
D
V
 
I
G
 
E
P
 
D
D
 
R
T
 
H
L
 
I
V
 
V
V
 
V
S
 
S
V
x
C
L
x
A
A
|
A
G
 
G
K
 
V
T
 
T
V
 
I
A
 
S
N
 
S
L
 
I
K
 
E
A
 
K
R
 
K
L
 
L
P
 
S
Q
 
A
A
 
F
R
 
R
-
 
P
-
 
A
-
 
P
A
 
R
V
 
V
V
 
I
R
 
R
A
 
C
M
|
M
P
x
T
N
 
N
L
x
T
P
 
P
A
 
V
S
 
V
I
 
V
G
 
R
R
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
T
G
 
V
A
 
Y
A
 
A
A
 
T
S
 
G
P
 
T
E
 
H
T
 
A
S
 
Q
E
 
V
R
 
E
Q
 
D
R
 
G
R
 
R
M
 
L
A
 
M
D
 
E
A
 
Q
L
 
L
L
 
L
S
 
S
G
 
S
I
 
V
G
 
G
L
 
F
V
 
C
E
 
T
W
 
E
L
 
V
A
 
-
D
 
E
E
 
E
S
 
D
L
 
L
I
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
G
V
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
L
 
T
L
 
A
A
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
D
A
 
G
G
 
G
A
 
V
A
 
K
A
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
P
 
R
D
 
R
V
 
L
A
 
A
A
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
G
R
 
A
Q
 
Q
T
 
A
V
 
L
A
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
A
 
K
L
 
M
L
 
L
A
 
L
E
 
H
S
 
S
P
 
E
L
 
Q
E
 
H
P
 
P
G
 
G
I
 
Q
L
 
L
R
 
K
Q
 
D
N
 
N
V
|
V
T
 
S
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
|
G
T
x
A
T
|
T
A
 
I
A
 
H
A
 
A
L
 
L
G
 
H
V
 
V
L
 
L
M
 
-
A
 
E
A
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
F
P
 
R
D
 
S
L
 
L
L
 
L
R
 
I
A
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
S
K
 
C
S
 
I
R
 
R
S
 
T
A
 
R
E
 
E
L
 
L
S
 
Q

8td8A Structure of pycr1 complexed with nadh and 2s-hydroxy-3,3- dimethylbutyric acid (see paper)
36% identity, 96% coverage: 12:271/272 of query aligns to 6:270/276 of 8td8A

query
sites
8td8A
L
 
F
V
 
I
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
x
Q
M
x
L
G
 
A
G
 
F
A
 
A
M
 
L
L
 
A
E
 
K
G
 
G
W
 
F
L
 
T
A
 
A
G
 
A
G
 
G
-
 
V
L
 
L
D
 
A
G
 
A
S
 
H
R
 
K
I
 
I
A
 
M
V
 
A
V
 
S
D
 
S
P
|
P
G
 
D
A
 
M
S
 
D
P
 
L
D
 
A
L
 
T
T
 
V
A
 
S
L
 
A
C
 
L
G
 
R
R
 
K
H
 
M
G
 
G
I
 
V
A
 
K
L
 
L
N
 
T
P
 
P
-
 
H
-
x
N
-
 
K
E
 
E
G
 
T
L
 
V
T
 
Q
P
 
H
P
 
S
E
 
D
A
 
V
L
 
L
V
 
F
L
 
L
A
|
A
I
x
V
K
|
K
P
 
P
Q
 
H
G
 
I
L
 
I
E
 
P
A
 
F
A
 
I
S
 
L
S
 
D
A
 
E
V
 
I
A
 
G
P
 
A
L
 
D
V
 
I
G
 
E
P
 
D
D
 
R
T
 
H
L
 
I
V
 
V
V
 
V
S
 
S
V
x
C
L
x
A
A
|
A
G
 
G
K
 
V
T
 
T
V
 
I
A
 
S
N
 
S
L
 
I
K
 
E
A
 
K
R
 
K
L
 
L
P
 
S
Q
 
A
A
 
F
R
 
R
-
 
P
-
 
A
-
 
P
A
 
R
V
 
V
V
 
I
R
 
R
A
 
C
M
|
M
P
x
T
N
 
N
L
x
T
P
 
P
A
 
V
S
 
V
I
 
V
G
 
R
R
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
T
G
 
V
A
 
Y
A
 
A
A
 
T
S
 
G
P
 
T
E
 
H
T
 
A
S
 
Q
E
 
V
R
 
E
Q
 
D
R
 
G
R
 
R
M
 
L
A
 
M
D
 
E
A
 
Q
L
 
L
L
 
L
S
 
S
G
 
S
I
 
V
G
 
G
L
 
F
V
 
C
E
 
T
W
 
E
L
 
V
A
 
-
D
 
E
E
 
E
S
 
D
L
 
L
I
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
G
V
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
L
 
T
L
 
A
A
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
D
A
 
G
G
 
G
A
 
V
A
 
K
A
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
P
 
R
D
 
R
V
 
L
A
 
A
A
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
G
R
 
A
Q
 
Q
T
 
A
V
 
L
A
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
A
 
K
L
 
M
L
 
L
A
 
L
E
 
H
S
 
S
P
 
E
L
 
Q
E
 
H
P
 
P
G
 
G
I
 
Q
L
 
L
R
 
K
Q
 
D
N
 
N
V
|
V
T
 
S
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
|
T
A
 
I
A
 
H
A
 
A
L
 
L
G
 
H
V
 
V
L
 
L
M
 
-
A
 
E
A
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
F
P
 
R
D
 
S
L
 
L
L
 
L
R
 
I
A
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
S
K
 
C
S
 
I
R
 
R
S
 
T
A
 
R
E
 
E
L
 
L
S
 
Q

8td2A Structure of pycr1 complexed with nadh and cyclobutane-1,1- dicarboxylic acid (see paper)
36% identity, 96% coverage: 12:271/272 of query aligns to 6:270/276 of 8td2A

query
sites
8td2A
L
 
F
V
 
I
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
x
Q
M
x
L
G
 
A
G
 
F
A
 
A
M
 
L
L
 
A
E
 
K
G
 
G
W
 
F
L
 
T
A
 
A
G
 
A
G
 
G
-
 
V
L
 
L
D
 
A
G
 
A
S
 
H
R
 
K
I
 
I
A
 
M
V
 
A
V
 
S
D
 
S
P
|
P
G
 
D
A
 
M
S
 
D
P
x
L
D
 
A
L
 
T
T
 
V
A
 
S
L
 
A
C
 
L
G
 
R
R
 
K
H
 
M
G
 
G
I
 
V
A
 
K
L
 
L
N
 
T
P
 
P
-
 
H
-
x
N
-
 
K
E
 
E
G
 
T
L
 
V
T
 
Q
P
 
H
P
 
S
E
 
D
A
 
V
L
 
L
V
 
F
L
 
L
A
|
A
I
x
V
K
 
K
P
|
P
Q
 
H
G
 
I
L
 
I
E
 
P
A
 
F
A
x
I
S
 
L
S
 
D
A
 
E
V
 
I
A
 
G
P
 
A
L
 
D
V
 
I
G
 
E
P
 
D
D
 
R
T
 
H
L
 
I
V
 
V
V
 
V
S
 
S
V
x
C
L
x
A
A
|
A
G
 
G
K
 
V
T
 
T
V
 
I
A
 
S
N
 
S
L
 
I
K
 
E
A
 
K
R
 
K
L
 
L
P
 
S
Q
 
A
A
 
F
R
 
R
-
 
P
-
 
A
-
 
P
A
 
R
V
 
V
V
 
I
R
 
R
A
 
C
M
|
M
P
x
T
N
 
N
L
x
T
P
 
P
A
 
V
S
 
V
I
 
V
G
 
R
R
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
T
G
 
V
A
 
Y
A
 
A
A
 
T
S
 
G
P
 
T
E
 
H
T
 
A
S
 
Q
E
 
V
R
 
E
Q
 
D
R
 
G
R
 
R
M
 
L
A
 
M
D
 
E
A
 
Q
L
 
L
L
 
L
S
 
S
G
 
S
I
 
V
G
 
G
L
 
F
V
 
C
E
 
T
W
 
E
L
 
V
A
 
-
D
 
E
E
 
E
S
 
D
L
 
L
I
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
G
V
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
L
 
T
L
 
A
A
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
D
A
 
G
G
 
G
A
 
V
A
 
K
A
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
P
 
R
D
 
R
V
 
L
A
 
A
A
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
G
R
 
A
Q
 
Q
T
 
A
V
 
L
A
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
A
 
K
L
 
M
L
 
L
A
 
L
E
 
H
S
 
S
P
 
E
L
 
Q
E
 
H
P
 
P
G
 
G
I
 
Q
L
 
L
R
 
K
Q
 
D
N
 
N
V
|
V
T
 
S
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
x
A
T
|
T
A
 
I
A
 
H
A
 
A
L
 
L
G
 
H
V
 
V
L
 
L
M
 
-
A
 
E
A
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
F
P
 
R
D
 
S
L
 
L
L
 
L
R
 
I
A
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
S
K
 
C
S
 
I
R
 
R
S
 
T
A
 
R
E
 
E
L
 
L
S
 
Q

5uavA Structure of human pycr-1 complexed with NADPH and l-tetrahydrofuroic acid (see paper)
36% identity, 96% coverage: 12:271/272 of query aligns to 9:273/278 of 5uavA

query
sites
5uavA
L
 
F
V
 
I
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
x
Q
M
x
L
G
 
A
G
 
F
A
 
A
M
 
L
L
 
A
E
 
K
G
 
G
W
 
F
L
 
T
A
 
A
G
 
A
G
 
G
-
 
V
L
 
L
D
 
A
G
 
A
S
 
H
R
 
K
I
 
I
A
 
M
V
 
A
V
 
S
D
x
S
P
|
P
G
x
D
A
 
M
S
 
D
P
 
L
D
 
A
L
 
T
T
 
V
A
 
S
L
 
A
C
 
L
G
 
R
R
 
K
H
 
M
G
 
G
I
 
V
A
 
K
L
 
L
N
 
T
P
 
P
-
 
H
-
x
N
-
 
K
E
 
E
G
 
T
L
 
V
T
 
Q
P
 
H
P
 
S
E
 
D
A
 
V
L
 
L
V
 
F
L
 
L
A
|
A
I
x
V
K
|
K
P
 
P
Q
 
H
G
 
I
L
 
I
E
 
P
A
 
F
A
x
I
S
 
L
S
 
D
A
 
E
V
 
I
A
 
G
P
 
A
L
 
D
V
 
I
G
 
E
P
 
D
D
 
R
T
 
H
L
 
I
V
 
V
V
 
V
S
 
S
V
x
C
L
x
A
A
|
A
G
 
G
K
 
V
T
 
T
V
 
I
A
 
S
N
 
S
L
 
I
K
 
E
A
 
K
R
 
K
L
 
L
P
 
S
Q
 
A
A
 
F
R
 
R
-
 
P
-
 
A
-
 
P
A
 
R
V
 
V
V
 
I
R
 
R
A
 
C
M
|
M
P
x
T
N
 
N
L
x
T
P
 
P
A
 
V
S
 
V
I
 
V
G
 
R
R
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
T
G
 
V
A
 
Y
A
 
A
A
 
T
S
 
G
P
 
T
E
 
H
T
 
A
S
 
Q
E
 
V
R
 
E
Q
 
D
R
 
G
R
 
R
M
 
L
A
 
M
D
 
E
A
 
Q
L
 
L
L
 
L
S
 
S
G
 
S
I
 
V
G
 
G
L
 
F
V
 
C
E
 
T
W
 
E
L
 
V
A
 
-
D
 
E
E
 
E
S
 
D
L
 
L
I
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
G
V
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
L
 
T
L
 
A
A
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
D
A
 
G
G
 
G
A
 
V
A
 
K
A
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
P
 
R
D
 
R
V
 
L
A
 
A
A
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
G
R
 
A
Q
 
Q
T
 
A
V
 
L
A
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
A
 
K
L
 
M
L
 
L
A
 
L
E
 
H
S
 
S
P
 
E
L
 
Q
E
 
H
P
 
P
G
 
G
I
 
Q
L
 
L
R
 
K
Q
 
D
N
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
G
 
G
G
|
G
T
x
A
T
|
T
A
 
I
A
 
H
A
 
A
L
 
L
G
 
H
V
 
V
L
 
L
M
 
-
A
 
E
A
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
F
P
 
R
D
 
S
L
 
L
L
 
L
R
 
I
A
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
S
K
 
C
S
 
I
R
 
R
S
 
T
A
 
R
E
 
E
L
 
L
S
 
Q

8tddA Structure of pycr1 complexed with nadh and 2-(furan-2-yl)acetic acid (see paper)
36% identity, 96% coverage: 12:271/272 of query aligns to 8:272/278 of 8tddA

query
sites
8tddA
L
 
F
V
 
I
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
x
Q
M
x
L
G
 
A
G
 
F
A
 
A
M
 
L
L
 
A
E
 
K
G
 
G
W
 
F
L
 
T
A
 
A
G
 
A
G
 
G
-
 
V
L
 
L
D
 
A
G
 
A
S
 
H
R
 
K
I
 
I
A
 
M
V
 
A
V
 
S
D
x
S
P
|
P
G
 
D
A
 
M
S
 
D
P
 
L
D
 
A
L
 
T
T
 
V
A
 
S
L
 
A
C
 
L
G
 
R
R
 
K
H
 
M
G
 
G
I
 
V
A
 
K
L
 
L
N
 
T
P
 
P
-
 
H
-
x
N
-
 
K
E
 
E
G
 
T
L
 
V
T
 
Q
P
 
H
P
 
S
E
 
D
A
 
V
L
 
L
V
 
F
L
 
L
A
|
A
I
x
V
K
 
K
P
|
P
Q
 
H
G
 
I
L
 
I
E
 
P
A
 
F
A
x
I
S
 
L
S
 
D
A
 
E
V
 
I
A
 
G
P
 
A
L
 
D
V
 
I
G
 
E
P
 
D
D
 
R
T
 
H
L
 
I
V
 
V
V
 
V
S
 
S
V
x
C
L
x
A
A
|
A
G
 
G
K
 
V
T
 
T
V
 
I
A
 
S
N
 
S
L
 
I
K
 
E
A
 
K
R
 
K
L
 
L
P
 
S
Q
 
A
A
 
F
R
 
R
-
 
P
-
 
A
-
 
P
A
 
R
V
 
V
V
 
I
R
 
R
A
 
C
M
|
M
P
x
T
N
 
N
L
x
T
P
 
P
A
 
V
S
 
V
I
 
V
G
 
R
R
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
T
G
 
V
A
 
Y
A
 
A
A
 
T
S
 
G
P
 
T
E
 
H
T
 
A
S
 
Q
E
 
V
R
 
E
Q
 
D
R
 
G
R
 
R
M
 
L
A
 
M
D
 
E
A
 
Q
L
 
L
L
 
L
S
 
S
G
 
S
I
 
V
G
 
G
L
 
F
V
 
C
E
 
T
W
 
E
L
 
V
A
 
-
D
 
E
E
 
E
S
 
D
L
 
L
I
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
|
T
A
 
G
V
 
L
S
 
S
G
|
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
L
 
T
L
 
A
A
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
D
A
 
G
G
 
G
A
 
V
A
 
K
A
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
P
 
R
D
 
R
V
 
L
A
 
A
A
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
G
R
 
A
Q
 
Q
T
 
A
V
 
L
A
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
A
 
K
L
 
M
L
 
L
A
 
L
E
 
H
S
 
S
P
 
E
L
 
Q
E
 
H
P
 
P
G
 
G
I
 
Q
L
 
L
R
 
K
Q
 
D
N
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
A
 
I
A
 
H
A
 
A
L
 
L
G
 
H
V
 
V
L
 
L
M
 
-
A
 
E
A
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
F
P
 
R
D
 
S
L
 
L
L
 
L
R
 
I
A
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
S
K
 
C
S
 
I
R
 
R
S
 
T
A
 
R
E
 
E
L
 
L
S
 
Q

8tcuA Structure of pycr1 complexed with 2-chloro-5-(2-oxoimidazolidin-1-yl) benzoic acid (see paper)
36% identity, 96% coverage: 12:271/272 of query aligns to 12:276/279 of 8tcuA

query
sites
8tcuA
L
 
F
V
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
Q
M
 
L
G
 
A
G
 
F
A
 
A
M
 
L
L
 
A
E
 
K
G
 
G
W
 
F
L
 
T
A
 
A
G
 
A
G
 
G
-
 
V
L
 
L
D
 
A
G
 
A
S
 
H
R
 
K
I
 
I
A
 
M
V
 
A
V
 
S
D
 
S
P
 
P
G
 
D
A
 
M
S
 
D
P
 
L
D
 
A
L
 
T
T
 
V
A
 
S
L
 
A
C
 
L
G
 
R
R
 
K
H
 
M
G
 
G
I
 
V
A
 
K
L
 
L
N
 
T
P
 
P
-
 
H
-
 
N
-
 
K
E
 
E
G
 
T
L
 
V
T
 
Q
P
 
H
P
 
S
E
 
D
A
 
V
L
 
L
V
 
F
L
 
L
A
|
A
I
x
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
G
 
I
L
 
I
E
 
P
A
 
F
A
 
I
S
 
L
S
 
D
A
 
E
V
 
I
A
 
G
P
 
A
L
 
D
V
 
I
G
 
E
P
 
D
D
 
R
T
 
H
L
 
I
V
 
V
V
 
V
S
 
S
V
 
C
L
x
A
A
|
A
G
 
G
K
 
V
T
 
T
V
 
I
A
 
S
N
 
S
L
 
I
K
 
E
A
 
K
R
 
K
L
 
L
P
 
S
Q
 
A
A
 
F
R
 
R
-
 
P
-
 
A
-
 
P
A
 
R
V
 
V
V
 
I
R
 
R
A
 
C
M
|
M
P
 
T
N
 
N
L
 
T
P
 
P
A
 
V
S
 
V
I
 
V
G
 
R
R
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
T
G
 
V
A
 
Y
A
 
A
A
 
T
S
 
G
P
 
T
E
 
H
T
 
A
S
 
Q
E
 
V
R
 
E
Q
 
D
R
 
G
R
 
R
M
 
L
A
 
M
D
 
E
A
 
Q
L
 
L
L
 
L
S
 
S
G
 
S
I
 
V
G
 
G
L
 
F
V
 
C
E
 
T
W
 
E
L
 
V
A
 
-
D
 
E
E
 
E
S
 
D
L
 
L
I
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
G
V
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
L
 
T
L
 
A
A
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
D
A
 
G
G
 
G
A
 
V
A
 
K
A
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
P
 
R
D
 
R
V
 
L
A
 
A
A
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
G
R
 
A
Q
 
Q
T
 
A
V
 
L
A
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
A
 
K
L
 
M
L
 
L
A
 
L
E
 
H
S
 
S
P
 
E
L
 
Q
E
 
H
P
 
P
G
 
G
I
 
Q
L
 
L
R
 
K
Q
 
D
N
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
G
 
G
G
|
G
T
x
A
T
|
T
A
 
I
A
 
H
A
 
A
L
 
L
G
 
H
V
 
V
L
 
L
M
 
-
A
 
E
A
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
F
P
 
R
D
 
S
L
 
L
L
 
L
R
 
I
A
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
S
K
 
C
S
 
I
R
 
R
S
 
T
A
 
R
E
 
E
L
 
L
S
 
Q

8tdbA Structure of pycr1 complexed with nadh and 1-hydroxyethane-1-sulfonate (see paper)
36% identity, 96% coverage: 12:271/272 of query aligns to 5:269/275 of 8tdbA

query
sites
8tdbA
L
 
F
V
 
I
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
x
Q
M
x
L
G
 
A
G
 
F
A
 
A
M
 
L
L
 
A
E
 
K
G
 
G
W
 
F
L
 
T
A
 
A
G
 
A
G
 
G
-
 
V
L
 
L
D
 
A
G
 
A
S
 
H
R
 
K
I
 
I
A
 
M
V
 
A
V
 
S
D
x
S
P
|
P
G
 
D
A
 
M
S
 
D
P
 
L
D
 
A
L
 
T
T
 
V
A
 
S
L
 
A
C
 
L
G
 
R
R
 
K
H
 
M
G
 
G
I
 
V
A
 
K
L
 
L
N
 
T
P
 
P
-
 
H
-
x
N
-
 
K
E
 
E
G
 
T
L
 
V
T
 
Q
P
 
H
P
 
S
E
 
D
A
 
V
L
 
L
V
 
F
L
 
L
A
 
A
I
x
V
K
|
K
P
|
P
Q
 
H
G
 
I
L
 
I
E
 
P
A
 
F
A
x
I
S
 
L
S
 
D
A
 
E
V
 
I
A
 
G
P
 
A
L
 
D
V
 
I
G
 
E
P
 
D
D
 
R
T
 
H
L
 
I
V
 
V
V
 
V
S
 
S
V
 
C
L
x
A
A
|
A
G
 
G
K
 
V
T
 
T
V
 
I
A
 
S
N
 
S
L
 
I
K
 
E
A
 
K
R
 
K
L
 
L
P
 
S
Q
 
A
A
 
F
R
 
R
-
 
P
-
 
A
-
 
P
A
 
R
V
 
V
V
 
I
R
 
R
A
 
C
M
 
M
P
x
T
N
 
N
L
x
T
P
 
P
A
 
V
S
 
V
I
 
V
G
 
R
R
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
T
G
 
V
A
 
Y
A
 
A
A
 
T
S
 
G
P
 
T
E
 
H
T
 
A
S
 
Q
E
 
V
R
 
E
Q
 
D
R
 
G
R
 
R
M
 
L
A
 
M
D
 
E
A
 
Q
L
 
L
L
 
L
S
 
S
G
 
S
I
 
V
G
 
G
L
 
F
V
 
C
E
 
T
W
 
E
L
 
V
A
 
-
D
 
E
E
 
E
S
 
D
L
 
L
I
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
G
V
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
L
 
T
L
 
A
A
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
D
A
 
G
G
 
G
A
 
V
A
 
K
A
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
P
 
R
D
 
R
V
 
L
A
 
A
A
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
G
R
 
A
Q
 
Q
T
 
A
V
 
L
A
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
A
 
K
L
 
M
L
 
L
A
 
L
E
 
H
S
 
S
P
 
E
L
 
Q
E
 
H
P
 
P
G
 
G
I
 
Q
L
 
L
R
 
K
Q
 
D
N
 
N
V
|
V
T
 
S
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
|
T
A
 
I
A
 
H
A
 
A
L
 
L
G
 
H
V
 
V
L
 
L
M
 
-
A
 
E
A
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
F
P
 
R
D
 
S
L
 
L
L
 
L
R
 
I
A
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
S
K
 
C
S
 
I
R
 
R
S
 
T
A
 
R
E
 
E
L
 
L
S
 
Q

8td4A Structure of pycr1 complexed with nadh and 1,3-dithiolane-2-carboxylic acid (see paper)
36% identity, 96% coverage: 12:271/272 of query aligns to 8:272/279 of 8td4A

query
sites
8td4A
L
 
F
V
 
I
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
x
Q
M
x
L
G
 
A
G
 
F
A
 
A
M
 
L
L
 
A
E
 
K
G
 
G
W
 
F
L
 
T
A
 
A
G
 
A
G
 
G
-
 
V
L
 
L
D
 
A
G
 
A
S
 
H
R
 
K
I
 
I
A
 
M
V
 
A
V
 
S
D
x
S
P
|
P
G
 
D
A
 
M
S
 
D
P
x
L
D
 
A
L
 
T
T
 
V
A
 
S
L
 
A
C
 
L
G
 
R
R
 
K
H
 
M
G
 
G
I
 
V
A
 
K
L
 
L
N
 
T
P
 
P
-
 
H
-
x
N
-
 
K
E
 
E
G
 
T
L
 
V
T
 
Q
P
 
H
P
 
S
E
 
D
A
 
V
L
 
L
V
 
F
L
 
L
A
|
A
I
x
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
G
 
I
L
 
I
E
 
P
A
 
F
A
x
I
S
 
L
S
 
D
A
 
E
V
 
I
A
 
G
P
 
A
L
 
D
V
 
I
G
 
E
P
 
D
D
 
R
T
 
H
L
 
I
V
 
V
V
 
V
S
 
S
V
x
C
L
x
A
A
|
A
G
 
G
K
 
V
T
 
T
V
 
I
A
 
S
N
 
S
L
 
I
K
 
E
A
 
K
R
 
K
L
 
L
P
 
S
Q
 
A
A
 
F
R
 
R
-
 
P
-
 
A
-
 
P
A
 
R
V
 
V
V
 
I
R
 
R
A
 
C
M
|
M
P
x
T
N
 
N
L
x
T
P
 
P
A
 
V
S
 
V
I
 
V
G
 
R
R
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
T
G
 
V
A
 
Y
A
 
A
A
 
T
S
 
G
P
 
T
E
 
H
T
 
A
S
 
Q
E
 
V
R
 
E
Q
 
D
R
 
G
R
 
R
M
 
L
A
 
M
D
 
E
A
 
Q
L
 
L
L
 
L
S
 
S
G
 
S
I
 
V
G
 
G
L
 
F
V
 
C
E
 
T
W
 
E
L
 
V
A
 
-
D
 
E
E
 
E
S
 
D
L
 
L
I
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
G
V
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
L
 
T
L
 
A
A
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
D
A
 
G
G
 
G
A
 
V
A
 
K
A
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
P
 
R
D
 
R
V
 
L
A
 
A
A
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
G
R
 
A
Q
 
Q
T
 
A
V
 
L
A
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
A
 
K
L
 
M
L
 
L
A
 
L
E
 
H
S
 
S
P
 
E
L
 
Q
E
 
H
P
 
P
G
 
G
I
 
Q
L
 
L
R
 
K
Q
 
D
N
 
N
V
|
V
T
 
S
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
x
A
T
|
T
A
 
I
A
 
H
A
 
A
L
 
L
G
 
H
V
 
V
L
 
L
M
 
-
A
 
E
A
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
F
P
 
R
D
 
S
L
 
L
L
 
L
R
 
I
A
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
S
K
 
C
S
 
I
R
 
R
S
 
T
A
 
R
E
 
E
L
 
L
S
 
Q

8tcvB Structure of pycr1 complexed with 4-bromobenzene-1,3-dicarboxylic acid (see paper)
36% identity, 96% coverage: 12:271/272 of query aligns to 11:275/279 of 8tcvB

query
sites
8tcvB
L
 
F
V
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
Q
M
 
L
G
 
A
G
 
F
A
 
A
M
 
L
L
 
A
E
 
K
G
 
G
W
 
F
L
 
T
A
 
A
G
 
A
G
 
G
-
 
V
L
 
L
D
 
A
G
 
A
S
 
H
R
 
K
I
 
I
A
 
M
V
 
A
V
 
S
D
 
S
P
 
P
G
 
D
A
 
M
S
 
D
P
 
L
D
 
A
L
 
T
T
 
V
A
 
S
L
 
A
C
 
L
G
 
R
R
 
K
H
 
M
G
 
G
I
 
V
A
 
K
L
 
L
N
 
T
P
 
P
-
 
H
-
 
N
-
 
K
E
 
E
G
 
T
L
 
V
T
 
Q
P
 
H
P
 
S
E
 
D
A
 
V
L
 
L
V
 
F
L
 
L
A
 
A
I
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
G
 
I
L
 
I
E
 
P
A
 
F
A
 
I
S
 
L
S
 
D
A
 
E
V
 
I
A
 
G
P
 
A
L
 
D
V
 
I
G
 
E
P
 
D
D
 
R
T
 
H
L
 
I
V
 
V
V
 
V
S
 
S
V
 
C
L
 
A
A
 
A
G
 
G
K
 
V
T
 
T
V
 
I
A
 
S
N
 
S
L
 
I
K
 
E
A
 
K
R
 
K
L
 
L
P
 
S
Q
 
A
A
 
F
R
 
R
-
 
P
-
 
A
-
 
P
A
 
R
V
 
V
V
 
I
R
 
R
A
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
L
 
T
P
 
P
A
 
V
S
 
V
I
 
V
G
 
R
R
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
T
G
 
V
A
 
Y
A
 
A
A
 
T
S
 
G
P
 
T
E
 
H
T
 
A
S
 
Q
E
 
V
R
 
E
Q
 
D
R
 
G
R
 
R
M
 
L
A
 
M
D
 
E
A
 
Q
L
 
L
L
 
L
S
 
S
G
 
S
I
 
V
G
 
G
L
 
F
V
 
C
E
 
T
W
 
E
L
 
V
A
 
-
D
 
E
E
 
E
S
 
D
L
 
L
I
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
G
V
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
L
 
T
L
 
A
A
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
D
A
 
G
G
 
G
A
 
V
A
 
K
A
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
P
 
R
D
 
R
V
 
L
A
 
A
A
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
G
R
 
A
Q
 
Q
T
 
A
V
 
L
A
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
A
 
K
L
 
M
L
 
L
A
 
L
E
 
H
S
 
S
P
 
E
L
 
Q
E
 
H
P
 
P
G
 
G
I
 
Q
L
 
L
R
 
K
Q
 
D
N
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
G
 
G
G
|
G
T
x
A
T
|
T
A
 
I
A
 
H
A
 
A
L
 
L
G
 
H
V
 
V
L
 
L
M
 
-
A
 
E
A
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
F
P
 
R
D
 
S
L
 
L
L
 
L
R
 
I
A
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
S
K
 
C
S
 
I
R
 
R
S
 
T
A
 
R
E
 
E
L
 
L
S
 
Q

5uatC Structure of human pycr-1 complexed with NADPH (see paper)
36% identity, 96% coverage: 12:271/272 of query aligns to 9:273/277 of 5uatC

query
sites
5uatC
L
 
F
V
 
I
G
 
G
A
|
A
G
|
G
K
x
Q
M
x
L
G
 
A
G
 
F
A
 
A
M
 
L
L
 
A
E
 
K
G
 
G
W
 
F
L
 
T
A
 
A
G
 
A
G
 
G
-
 
V
L
 
L
D
 
A
G
 
A
S
 
H
R
 
K
I
 
I
A
 
M
V
 
A
V
 
S
D
x
S
P
|
P
G
x
D
A
 
M
S
 
D
P
 
L
D
 
A
L
 
T
T
 
V
A
 
S
L
 
A
C
 
L
G
 
R
R
 
K
H
 
M
G
 
G
I
 
V
A
 
K
L
 
L
N
 
T
P
 
P
-
 
H
-
x
N
-
 
K
E
 
E
G
 
T
L
 
V
T
 
Q
P
 
H
P
 
S
E
 
D
A
 
V
L
 
L
V
 
F
L
 
L
A
|
A
I
x
V
K
|
K
P
|
P
Q
 
H
G
 
I
L
 
I
E
 
P
A
 
F
A
x
I
S
 
L
S
 
D
A
 
E
V
 
I
A
 
G
P
 
A
L
 
D
V
 
I
G
 
E
P
 
D
D
 
R
T
 
H
L
 
I
V
 
V
V
 
V
S
 
S
V
x
C
L
x
A
A
|
A
G
 
G
K
 
V
T
 
T
V
 
I
A
 
S
N
 
S
L
 
I
K
 
E
A
 
K
R
 
K
L
 
L
P
 
S
Q
 
A
A
 
F
R
 
R
-
 
P
-
 
A
-
 
P
A
 
R
V
 
V
V
 
I
R
 
R
A
 
C
M
|
M
P
 
T
N
 
N
L
x
T
P
 
P
A
 
V
S
 
V
I
 
V
G
 
R
R
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
T
G
 
V
A
 
Y
A
 
A
A
 
T
S
 
G
P
 
T
E
 
H
T
 
A
S
 
Q
E
 
V
R
 
E
Q
 
D
R
 
G
R
 
R
M
 
L
A
 
M
D
 
E
A
 
Q
L
 
L
L
 
L
S
 
S
G
 
S
I
 
V
G
 
G
L
 
F
V
 
C
E
 
T
W
 
E
L
 
V
A
 
-
D
 
E
E
 
E
S
 
D
L
 
L
I
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
G
V
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
L
 
T
L
 
A
A
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
D
A
 
G
G
 
G
A
 
V
A
 
K
A
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
P
 
R
D
 
R
V
 
L
A
 
A
A
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
G
R
 
A
Q
 
Q
T
 
A
V
 
L
A
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
A
 
K
L
 
M
L
 
L
A
 
L
E
 
H
S
 
S
P
 
E
L
 
Q
E
 
H
P
 
P
G
 
G
I
 
Q
L
 
L
R
 
K
Q
 
D
N
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
A
 
I
A
 
H
A
 
A
L
 
L
G
 
H
V
 
V
L
 
L
M
 
-
A
 
E
A
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
F
P
 
R
D
 
S
L
 
L
L
 
L
R
 
I
A
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
S
K
 
C
S
 
I
R
 
R
S
 
T
A
 
R
E
 
E
L
 
L
S
 
Q

8td9A Structure of pycr1 complexed with nadh and l-pipecolic acid (see paper)
36% identity, 96% coverage: 12:271/272 of query aligns to 9:273/279 of 8td9A

query
sites
8td9A
L
 
F
V
 
I
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
x
Q
M
x
L
G
 
A
G
 
F
A
 
A
M
 
L
L
 
A
E
 
K
G
 
G
W
 
F
L
 
T
A
 
A
G
 
A
G
 
G
-
 
V
L
 
L
D
 
A
G
 
A
S
 
H
R
 
K
I
 
I
A
 
M
V
 
A
V
 
S
D
x
S
P
|
P
G
 
D
A
 
M
S
 
D
P
x
L
D
 
A
L
 
T
T
 
V
A
 
S
L
 
A
C
 
L
G
 
R
R
 
K
H
 
M
G
 
G
I
 
V
A
 
K
L
 
L
N
 
T
P
 
P
-
 
H
-
x
N
-
 
K
E
 
E
G
 
T
L
 
V
T
 
Q
P
 
H
P
 
S
E
 
D
A
 
V
L
 
L
V
 
F
L
 
L
A
|
A
I
x
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
G
 
I
L
 
I
E
 
P
A
 
F
A
x
I
S
 
L
S
 
D
A
 
E
V
 
I
A
 
G
P
 
A
L
 
D
V
 
I
G
 
E
P
 
D
D
 
R
T
 
H
L
 
I
V
 
V
V
 
V
S
 
S
V
x
C
L
x
A
A
|
A
G
 
G
K
 
V
T
 
T
V
 
I
A
 
S
N
 
S
L
 
I
K
 
E
A
 
K
R
 
K
L
 
L
P
 
S
Q
 
A
A
 
F
R
 
R
-
 
P
-
 
A
-
 
P
A
 
R
V
 
V
V
 
I
R
 
R
A
 
C
M
|
M
P
 
T
N
 
N
L
x
T
P
 
P
A
 
V
S
 
V
I
 
V
G
 
R
R
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
T
G
 
V
A
 
Y
A
 
A
A
 
T
S
 
G
P
 
T
E
 
H
T
 
A
S
 
Q
E
 
V
R
 
E
Q
 
D
R
 
G
R
 
R
M
 
L
A
 
M
D
 
E
A
 
Q
L
 
L
L
 
L
S
 
S
G
 
S
I
 
V
G
 
G
L
 
F
V
 
C
E
 
T
W
 
E
L
 
V
A
 
-
D
 
E
E
 
E
S
 
D
L
 
L
I
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
G
V
 
L
S
 
S
G
|
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
L
 
T
L
 
A
A
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
D
A
 
G
G
 
G
A
 
V
A
 
K
A
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
P
 
R
D
 
R
V
 
L
A
 
A
A
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
G
R
 
A
Q
 
Q
T
 
A
V
 
L
A
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
A
 
K
L
 
M
L
 
L
A
 
L
E
 
H
S
 
S
P
 
E
L
 
Q
E
 
H
P
 
P
G
 
G
I
 
Q
L
 
L
R
 
K
Q
 
D
N
 
N
V
|
V
T
 
S
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
|
T
A
 
I
A
 
H
A
 
A
L
 
L
G
 
H
V
 
V
L
 
L
M
 
-
A
 
E
A
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
F
P
 
R
D
 
S
L
 
L
L
 
L
R
 
I
A
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
S
K
 
C
S
 
I
R
 
R
S
 
T
A
 
R
E
 
E
L
 
L
S
 
Q

8td5A Structure of pycr1 complexed with nadh and tetrahydrothiophene-2- carboxylic acid (see paper)
36% identity, 96% coverage: 12:271/272 of query aligns to 12:276/280 of 8td5A

query
sites
8td5A
L
 
F
V
 
I
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
x
Q
M
x
L
G
 
A
G
 
F
A
 
A
M
 
L
L
 
A
E
 
K
G
 
G
W
 
F
L
 
T
A
 
A
G
 
A
G
 
G
-
 
V
L
 
L
D
 
A
G
 
A
S
 
H
R
 
K
I
 
I
A
 
M
V
 
A
V
 
S
D
x
S
P
|
P
G
 
D
A
 
M
S
 
D
P
x
L
D
 
A
L
 
T
T
 
V
A
 
S
L
 
A
C
 
L
G
 
R
R
 
K
H
 
M
G
 
G
I
 
V
A
 
K
L
 
L
N
 
T
P
 
P
-
 
H
-
x
N
-
 
K
E
 
E
G
 
T
L
 
V
T
 
Q
P
 
H
P
 
S
E
 
D
A
 
V
L
 
L
V
 
F
L
 
L
A
|
A
I
x
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
G
 
I
L
 
I
E
 
P
A
 
F
A
x
I
S
 
L
S
 
D
A
 
E
V
 
I
A
 
G
P
 
A
L
 
D
V
 
I
G
 
E
P
 
D
D
 
R
T
 
H
L
 
I
V
 
V
V
 
V
S
 
S
V
x
C
L
x
A
A
|
A
G
 
G
K
 
V
T
 
T
V
 
I
A
 
S
N
 
S
L
 
I
K
 
E
A
 
K
R
 
K
L
 
L
P
 
S
Q
 
A
A
 
F
R
 
R
-
 
P
-
 
A
-
 
P
A
 
R
V
 
V
V
 
I
R
 
R
A
 
C
M
|
M
P
 
T
N
 
N
L
x
T
P
 
P
A
 
V
S
 
V
I
 
V
G
 
R
R
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
T
G
 
V
A
 
Y
A
 
A
A
 
T
S
 
G
P
 
T
E
 
H
T
 
A
S
 
Q
E
 
V
R
 
E
Q
 
D
R
 
G
R
 
R
M
 
L
A
 
M
D
 
E
A
 
Q
L
 
L
L
 
L
S
 
S
G
 
S
I
 
V
G
 
G
L
 
F
V
 
C
E
 
T
W
 
E
L
 
V
A
 
-
D
 
E
E
 
E
S
 
D
L
 
L
I
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
G
V
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
L
 
T
L
 
A
A
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
D
A
 
G
G
 
G
A
 
V
A
 
K
A
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
P
 
R
D
 
R
V
 
L
A
 
A
A
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
G
R
 
A
Q
 
Q
T
 
A
V
 
L
A
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
A
 
K
L
 
M
L
 
L
A
 
L
E
 
H
S
 
S
P
 
E
L
 
Q
E
 
H
P
 
P
G
 
G
I
 
Q
L
 
L
R
 
K
Q
 
D
N
 
N
V
 
V
T
 
S
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
x
A
T
|
T
A
 
I
A
 
H
A
 
A
L
 
L
G
 
H
V
 
V
L
 
L
M
 
-
A
 
E
A
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
F
P
 
R
D
 
S
L
 
L
L
 
L
R
 
I
A
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
S
K
 
C
S
 
I
R
 
R
S
 
T
A
 
R
E
 
E
L
 
L
S
 
Q

8td1A Structure of pycr1 complexed with 3-(6-oxa-9-azaspiro(4.5)decane-9- carbonyl)benzoic acid (see paper)
36% identity, 96% coverage: 12:271/272 of query aligns to 12:276/280 of 8td1A

query
sites
8td1A
L
 
F
V
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
Q
M
 
L
G
 
A
G
 
F
A
 
A
M
 
L
L
 
A
E
 
K
G
 
G
W
 
F
L
 
T
A
 
A
G
 
A
G
 
G
-
 
V
L
 
L
D
 
A
G
 
A
S
 
H
R
 
K
I
 
I
A
 
M
V
 
A
V
 
S
D
 
S
P
 
P
G
 
D
A
 
M
S
 
D
P
 
L
D
 
A
L
 
T
T
 
V
A
 
S
L
 
A
C
 
L
G
 
R
R
 
K
H
 
M
G
 
G
I
 
V
A
 
K
L
 
L
N
 
T
P
 
P
-
 
H
-
 
N
-
 
K
E
 
E
G
 
T
L
 
V
T
 
Q
P
 
H
P
 
S
E
 
D
A
 
V
L
 
L
V
 
F
L
 
L
A
 
A
I
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
G
 
I
L
 
I
E
 
P
A
 
F
A
 
I
S
 
L
S
 
D
A
 
E
V
 
I
A
 
G
P
 
A
L
 
D
V
 
I
G
 
E
P
 
D
D
 
R
T
 
H
L
 
I
V
 
V
V
 
V
S
 
S
V
 
C
L
x
A
A
|
A
G
 
G
K
 
V
T
 
T
V
 
I
A
 
S
N
 
S
L
 
I
K
 
E
A
 
K
R
 
K
L
 
L
P
 
S
Q
 
A
A
 
F
R
 
R
-
 
P
-
 
A
-
 
P
A
 
R
V
 
V
V
 
I
R
 
R
A
 
C
M
|
M
P
 
T
N
 
N
L
 
T
P
 
P
A
 
V
S
 
V
I
 
V
G
 
R
R
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
T
G
 
V
A
 
Y
A
 
A
A
 
T
S
 
G
P
 
T
E
 
H
T
 
A
S
 
Q
E
 
V
R
 
E
Q
 
D
R
 
G
R
 
R
M
 
L
A
 
M
D
 
E
A
 
Q
L
 
L
L
 
L
S
 
S
G
 
S
I
 
V
G
 
G
L
 
F
V
 
C
E
 
T
W
 
E
L
 
V
A
 
-
D
 
E
E
 
E
S
 
D
L
 
L
I
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
G
V
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
L
 
T
L
 
A
A
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
D
A
 
G
G
 
G
A
 
V
A
 
K
A
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
P
 
R
D
 
R
V
 
L
A
 
A
A
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
G
R
 
A
Q
 
Q
T
 
A
V
 
L
A
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
A
 
K
L
 
M
L
 
L
A
 
L
E
 
H
S
 
S
P
 
E
L
 
Q
E
 
H
P
 
P
G
 
G
I
 
Q
L
 
L
R
 
K
Q
 
D
N
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
G
 
G
G
|
G
T
x
A
T
|
T
A
 
I
A
 
H
A
 
A
L
 
L
G
 
H
V
 
V
L
 
L
M
 
-
A
 
E
A
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
F
P
 
R
D
 
S
L
 
L
L
 
L
R
 
I
A
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
S
K
 
C
S
 
I
R
 
R
S
 
T
A
 
R
E
 
E
L
 
L
S
 
Q

8td0A Structure of pycr1 complexed with 5-oxo-7a-phenyl-hexahydropyrrolo[2, 1-b][1,3]thiazole-3-carboxylic acid (see paper)
36% identity, 96% coverage: 12:271/272 of query aligns to 12:276/280 of 8td0A

query
sites
8td0A
L
 
F
V
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
Q
M
x
L
G
 
A
G
 
F
A
 
A
M
 
L
L
 
A
E
 
K
G
 
G
W
 
F
L
 
T
A
 
A
G
 
A
G
 
G
-
 
V
L
 
L
D
 
A
G
 
A
S
 
H
R
 
K
I
 
I
A
 
M
V
 
A
V
 
S
D
 
S
P
 
P
G
 
D
A
 
M
S
 
D
P
 
L
D
 
A
L
 
T
T
 
V
A
 
S
L
 
A
C
 
L
G
 
R
R
 
K
H
 
M
G
 
G
I
 
V
A
 
K
L
 
L
N
 
T
P
 
P
-
 
H
-
 
N
-
 
K
E
 
E
G
 
T
L
 
V
T
 
Q
P
 
H
P
 
S
E
 
D
A
 
V
L
 
L
V
 
F
L
 
L
A
 
A
I
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
G
 
I
L
 
I
E
 
P
A
 
F
A
 
I
S
 
L
S
 
D
A
 
E
V
 
I
A
 
G
P
 
A
L
 
D
V
 
I
G
 
E
P
 
D
D
 
R
T
 
H
L
 
I
V
 
V
V
 
V
S
 
S
V
 
C
L
 
A
A
 
A
G
 
G
K
 
V
T
 
T
V
 
I
A
 
S
N
 
S
L
 
I
K
 
E
A
 
K
R
 
K
L
 
L
P
 
S
Q
 
A
A
 
F
R
 
R
-
 
P
-
 
A
-
 
P
A
 
R
V
 
V
V
 
I
R
 
R
A
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
L
x
T
P
 
P
A
 
V
S
 
V
I
 
V
G
 
R
R
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
T
G
 
V
A
 
Y
A
 
A
A
 
T
S
 
G
P
 
T
E
 
H
T
 
A
S
 
Q
E
 
V
R
 
E
Q
 
D
R
 
G
R
 
R
M
 
L
A
 
M
D
 
E
A
 
Q
L
 
L
L
 
L
S
 
S
G
 
S
I
 
V
G
 
G
L
 
F
V
 
C
E
 
T
W
 
E
L
 
V
A
 
-
D
 
E
E
 
E
S
 
D
L
 
L
I
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
G
V
 
L
S
 
S
G
|
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
L
 
T
L
 
A
A
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
D
A
 
G
G
 
G
A
 
V
A
 
K
A
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
P
 
R
D
 
R
V
 
L
A
 
A
A
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
G
R
 
A
Q
 
Q
T
 
A
V
 
L
A
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
A
 
K
L
 
M
L
 
L
A
 
L
E
 
H
S
 
S
P
 
E
L
 
Q
E
 
H
P
 
P
G
 
G
I
 
Q
L
 
L
R
 
K
Q
 
D
N
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
A
 
I
A
 
H
A
 
A
L
 
L
G
 
H
V
 
V
L
 
L
M
 
-
A
 
E
A
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
F
P
 
R
D
 
S
L
 
L
L
 
L
R
 
I
A
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
S
K
 
C
S
 
I
R
 
R
S
 
T
A
 
R
E
 
E
L
 
L
S
 
Q

Query Sequence

>WP_015928057.1 NCBI__GCF_000022085.1:WP_015928057.1
MTASDLPASLVLVGAGKMGGAMLEGWLAGGLDGSRIAVVDPGASPDLTALCGRHGIALNP
EGLTPPEALVLAIKPQGLEAASSAVAPLVGPDTLVVSVLAGKTVANLKARLPQARAVVRA
MPNLPASIGRGATGAAASPETSERQRRMADALLSGIGLVEWLADESLIDAVTAVSGSGPA
YVFLLAEALAEAGAAAGLPPDVAARLARQTVAGAGALLAESPLEPGILRQNVTSPGGTTA
AALGVLMAAGGLPDLLRAAVAAAKSRSAELSG

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory