SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_016557073.1 NCBI__GCF_000298315.2:WP_016557073.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 7 hits to proteins with known functional sites (download)

8hkbA Tpa bound-form of periplasmic terephthalate binding protein (tbp) from ideonella sakaiensis mutant k184d (see paper)
28% identity, 76% coverage: 25:264/314 of query aligns to 7:245/302 of 8hkbA

query
sites
8hkbA
I
 
I
M
 
I
A
 
V
P
 
P
A
x
Y
A
 
P
P
 
A
G
 
G
G
|
G
G
 
T
W
x
A
D
 
D
Q
 
I
T
 
L
A
 
P
R
 
R
S
 
V
L
 
V
Q
 
A
T
 
E
V
 
K
M
 
L
Q
 
R
K
 
A
E
 
Q
G
 
F
I
 
P
S
 
A
G
 
G
N
 
-
V
 
V
Q
 
L
V
 
I
Q
 
D
N
 
N
V
 
R
P
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
N
I
 
I
G
 
G
L
 
A
-
 
E
A
 
A
Q
 
V
F
 
F
T
 
R
G
 
A
Q
 
E
N
 
P
N
 
D
G
 
G
N
 
N
A
 
T
N
 
L
A
 
L
L
 
A
I
 
S
V
x
P
G
 
P
G
 
G
Y
 
P
V
 
I
M
 
A
V
 
I
G
 
N
A
 
H
I
 
H
L
 
L
T
 
Y
N
 
R
Q
 
K
S
 
M
P
 
A
V
 
F
T
 
D
L
 
P
K
 
S
D
 
K
V
 
W
T
 
E
P
 
P
I
 
V
A
 
T
R
 
V
L
 
L
T
 
A
G
 
T
E
 
V
Y
 
P
E
 
N
A
 
V
I
 
L
V
 
V
V
 
V
P
 
N
A
 
P
A
 
R
S
 
L
D
 
P
I
 
V
K
 
K
T
 
N
M
 
V
A
 
Q
D
 
E
L
 
F
V
 
I
A
 
A
K
 
Y
L
 
A
K
 
K
Q
 
A
D
 
N
P
 
P
G
 
G
S
 
K
V
 
V
S
 
T
W
 
Y
G
 
G
G
 
S
G
x
Q
S
 
G
A
 
N
G
 
G
G
x
T
T
|
T
D
 
S
H
 
H
I
 
L
A
 
T
V
 
A
G
 
S
L
 
L
I
 
F
A
 
M
K
 
Q
A
 
L
A
 
T
G
 
G
V
 
-
D
 
-
P
 
-
T
 
T
K
 
E
I
 
M
N
 
V
Y
 
H
V
 
V
A
 
P
F
 
Y
S
 
D
G
|
G
G
x
T
G
 
A
E
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
V
A
 
D
I
 
L
L
 
V
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
V
 
I
T
 
D
A
 
V
G
 
F
I
 
F
S
 
D
G
 
N
Y
 
I
G
 
S
E
 
S
F
 
S
E
 
L
S
 
P
Q
 
F
V
 
H
K
 
Q
A
 
A
G
 
G
Q
 
K
L
 
L
R
 
R
L
 
I
L
 
L
A
 
G
V
 
V
S
 
A
G
 
D
E
 
E
Q
 
Q
R
 
R
L
 
S
D
 
A
G
 
A
V
 
L
-
 
P
D
 
E
A
 
V
P
 
P
T
 
T
L
 
F
K
 
A
E
 
E
S
 
Q
G
 
G
L
 
L
-
 
P
D
 
S
V
 
M
A
 
N
V
 
A
Q
 
V
N
x
T
W
 
W
R
x
F
M
 
A
V
 
V
A
 
V
A
 
A
A
 
P
P
 
P
G
 
G
L
 
T
S
 
P
A
 
A
E
 
A
Q
 
K
T
 
V
A
 
A
A
 
A
I
 
L
T
 
Q
A
 
K
D
 
S
F
 
F

2dvzA Structure of a periplasmic transporter (see paper)
28% identity, 44% coverage: 103:241/314 of query aligns to 89:225/300 of 2dvzA

query
sites
2dvzA
L
 
I
K
 
K
D
 
D
V
 
F
T
 
Q
P
 
P
I
 
V
A
 
T
R
 
N
L
 
F
T
 
A
G
 
N
E
 
T
Y
 
A
E
 
N
A
 
V
I
 
V
V
 
A
V
 
V
P
 
N
A
 
P
A
 
K
S
 
F
D
 
P
I
 
A
K
 
K
T
 
D
M
 
F
A
 
K
D
 
G
L
 
F
V
 
L
A
 
E
K
 
E
L
 
L
K
 
K
Q
 
K
D
 
N
P
 
P
G
 
G
S
 
K
V
 
Y
S
 
S
W
 
Y
G
 
G
G
 
S
G
x
S
S
 
G
A
 
T
G
 
C
G
 
G
T
x
V
D
x
L
H
 
H
I
 
L
A
 
M
V
 
G
G
 
E
L
 
S
I
 
F
A
 
K
K
 
M
A
 
A
A
 
T
G
 
G
V
 
T
D
 
D
P
 
-
T
 
-
K
 
-
I
 
I
N
 
V
Y
 
H
V
 
V
A
 
P
F
 
Y
S
 
K
G
|
G
G
 
S
G
 
G
E
 
P
A
 
A
L
 
V
A
 
A
A
 
D
I
 
A
L
 
V
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
V
 
I
T
 
E
A
 
L
G
 
I
I
 
F
S
 
D
G
x
N
Y
 
L
G
 
P
E
 
S
F
 
S
E
 
M
S
 
P
Q
 
Q
V
 
I
K
 
Q
A
 
A
G
 
G
Q
 
K
L
 
L
R
 
R
L
 
A
L
 
M
A
 
A
V
 
I
S
 
A
G
 
W
E
 
P
Q
 
T
R
 
R
L
 
I
D
 
D
G
 
A
V
 
I
-
 
K
D
 
D
A
 
V
P
 
P
T
 
T
L
 
F
K
 
A
E
 
D
S
 
A
G
 
G
L
 
F
D
 
P
V
 
V
A
 
L
V
 
N
Q
 
Q

Sites not aligning to the query:

7ndsA Crystal structure of tphc in a closed conformation (see paper)
26% identity, 74% coverage: 25:255/314 of query aligns to 7:236/294 of 7ndsA

query
sites
7ndsA
I
 
I
M
 
V
A
 
V
P
 
P
A
x
F
A
 
S
P
 
A
G
 
G
G
|
G
G
 
T
W
x
A
D
 
D
Q
 
V
T
 
L
A
 
P
R
 
R
S
 
L
L
 
V
Q
 
A
T
 
E
V
 
K
M
 
I
Q
 
R
K
 
A
E
 
D
G
 
-
I
 
Y
S
 
A
G
 
G
N
 
G
V
 
V
Q
 
I
V
 
I
Q
 
E
N
 
N
V
 
K
P
 
P
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
N
I
 
I
G
 
G
L
 
A
-
 
D
A
 
L
Q
 
V
F
 
F
T
 
R
G
 
A
Q
 
P
N
 
P
N
 
D
G
 
G
N
 
M
A
 
T
N
 
V
A
 
L
L
 
A
I
 
S
V
x
P
G
 
P
G
 
G
Y
 
P
V
 
I
M
 
A
V
 
I
G
 
N
A
 
H
I
 
N
L
 
L
T
 
Y
N
 
Q
Q
 
K
S
 
L
P
 
S
V
 
F
T
 
D
L
 
P
K
 
T
D
 
R
V
 
W
T
 
V
P
 
P
I
 
V
A
 
T
R
 
I
L
 
L
T
 
A
G
 
T
E
 
V
Y
 
P
E
 
N
A
 
V
I
 
L
V
 
V
V
 
I
P
 
N
A
 
P
A
 
K
S
 
L
D
 
P
I
 
V
K
 
K
T
 
S
M
 
L
A
 
G
D
 
E
L
 
F
V
 
I
A
 
A
K
 
Y
L
 
A
K
 
K
Q
 
A
D
 
N
P
 
P
G
 
K
S
 
K
V
 
V
S
 
T
W
 
V
G
 
A
G
 
T
G
x
Q
S
 
G
A
 
D
G
 
G
G
x
S
T
|
T
D
 
S
H
 
H
I
 
L
A
 
T
V
 
A
G
 
A
L
 
M
I
 
F
A
 
M
K
 
Q
A
 
L
A
 
T
G
 
G
V
 
-
D
 
-
P
 
-
T
 
T
K
 
E
I
 
L
N
 
T
Y
 
V
V
 
I
A
 
P
F
 
Y
S
 
K
G
|
G
G
x
T
G
 
A
E
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
I
A
 
D
I
 
L
L
 
I
G
 
G
G
 
G
Q
 
N
V
 
V
T
 
D
A
 
V
G
 
F
I
 
F
S
 
D
G
x
N
Y
 
I
G
 
S
E
 
S
F
 
S
E
 
A
S
 
T
Q
 
Y
V
 
H
K
 
Q
A
 
A
G
 
G
Q
 
K
L
 
V
R
 
R
L
 
I
L
 
L
A
 
A
V
 
V
S
 
A
G
 
D
E
 
E
Q
 
Q
R
 
R
L
 
S
D
 
Q
G
 
I
V
 
L
-
 
P
D
 
Q
A
 
V
P
 
P
T
 
T
L
 
F
K
 
A
E
 
E
S
 
Q
G
 
Q
L
 
W
D
 
P
V
 
-
A
 
A
V
 
M
Q
 
Q
-
 
A
-
 
V
N
x
T
W
 
F
R
x
F
M
 
S
V
 
V
A
 
V
A
 
A
A
 
P
P
 
P
G
 
G
L
 
T
S
 
S
A
 
A
E
 
E

7ndrD Crystal structure of tphc in an open conformation (see paper)
26% identity, 74% coverage: 25:255/314 of query aligns to 7:236/293 of 7ndrD

query
sites
7ndrD
I
 
I
M
 
V
A
 
V
P
 
P
A
 
F
A
 
S
P
 
A
G
 
G
G
 
G
G
 
T
W
 
A
D
 
D
Q
 
V
T
 
L
A
 
P
R
 
R
S
 
L
L
 
V
Q
 
A
T
 
E
V
 
K
M
 
I
Q
 
R
K
 
A
E
 
D
G
 
-
I
 
Y
S
 
A
G
 
G
N
 
G
V
 
V
Q
 
I
V
 
I
Q
 
E
N
 
N
V
 
K
P
 
P
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
N
I
 
I
G
 
G
L
 
A
-
 
D
A
 
L
Q
 
V
F
|
F
T
 
R
G
 
A
Q
 
P
N
 
P
N
 
D
G
 
G
N
 
M
A
 
T
N
 
V
A
 
L
L
 
A
I
 
S
V
 
P
G
 
P
G
 
G
Y
 
P
V
 
I
M
 
A
V
 
I
G
 
N
A
 
H
I
 
N
L
 
L
T
 
Y
N
 
Q
Q
 
K
S
 
L
P
x
S
V
x
F
T
x
D
L
 
P
K
 
T
D
x
R
V
 
W
T
 
V
P
 
P
I
 
V
A
 
T
R
 
I
L
 
L
T
 
A
G
 
T
E
 
V
Y
 
P
E
 
N
A
 
V
I
 
L
V
 
V
V
 
I
P
 
N
A
 
P
A
 
K
S
 
L
D
 
P
I
 
V
K
 
K
T
 
S
M
 
L
A
 
G
D
 
E
L
 
F
V
 
I
A
 
A
K
 
Y
L
 
A
K
 
K
Q
 
A
D
 
N
P
 
P
G
 
K
S
 
K
V
 
V
S
 
T
W
 
V
G
 
A
G
 
T
G
 
Q
S
 
G
A
 
D
G
 
G
G
 
S
T
 
T
D
 
S
H
 
H
I
 
L
A
 
T
V
 
A
G
 
A
L
 
M
I
 
F
A
 
M
K
 
Q
A
 
L
A
 
T
G
 
G
V
 
-
D
 
-
P
 
-
T
 
T
K
 
E
I
 
L
N
 
T
Y
 
V
V
 
I
A
 
P
F
 
Y
S
 
K
G
 
G
G
 
T
G
 
A
E
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
I
A
 
D
I
 
L
L
 
I
G
 
G
G
 
G
Q
 
N
V
 
V
T
 
D
A
 
V
G
 
F
I
 
F
S
 
D
G
 
N
Y
 
I
G
 
S
E
 
S
F
 
S
E
 
A
S
 
T
Q
 
Y
V
 
H
K
 
Q
A
 
A
G
 
G
Q
 
K
L
 
V
R
 
R
L
 
I
L
 
L
A
 
A
V
 
V
S
 
A
G
 
D
E
 
E
Q
 
Q
R
 
R
L
 
S
D
 
Q
G
 
I
V
 
L
-
 
P
D
 
Q
A
 
V
P
 
P
T
 
T
L
 
F
K
 
A
E
 
E
S
 
Q
G
 
Q
L
 
W
D
 
P
V
 
-
A
 
A
V
 
M
Q
 
Q
-
 
A
-
 
V
N
 
T
W
 
F
R
 
F
M
 
S
V
 
V
A
 
V
A
 
A
A
 
P
P
 
P
G
 
G
L
 
T
S
 
S
A
 
A
E
 
E

5okuA R. Palustris rpa4515 with adipate (see paper)
24% identity, 74% coverage: 24:255/314 of query aligns to 8:239/299 of 5okuA

query
sites
5okuA
T
 
T
I
 
L
M
 
V
A
 
V
P
 
P
A
x
F
A
 
T
P
 
S
G
 
G
G
 
G
G
 
T
W
x
T
D
 
D
Q
 
M
T
 
L
A
 
A
R
 
R
S
 
L
L
 
I
Q
 
A
T
 
A
V
 
R
M
 
L
Q
 
S
K
 
-
E
 
E
G
 
H
I
 
Y
S
 
G
G
 
Q
N
 
S
V
 
F
Q
 
V
V
 
I
Q
 
D
N
 
N
V
 
R
P
 
S
G
 
G
A
 
E
G
 
S
G
 
G
T
 
N
I
 
I
G
 
A
L
 
-
A
 
A
Q
 
S
F
 
Y
T
 
V
G
 
A
Q
 
K
N
 
V
N
 
P
G
 
A
N
 
D
A
 
G
N
 
Y
A
 
T
L
 
F
I
 
I
V
 
I
G
 
G
G
 
-
Y
 
-
V
 
-
M
 
T
V
x
P
G
 
G
A
 
I
I
 
H
L
 
A
T
 
T
N
 
N
Q
 
R
-
 
L
-
 
V
-
 
Y
-
 
R
-
 
T
-
 
M
-
 
G
-
 
Y
S
 
D
P
 
P
V
 
A
T
 
T
L
 
-
K
 
-
D
 
D
V
 
F
T
 
T
P
 
P
I
 
V
A
 
I
R
 
V
L
 
I
T
 
A
G
 
R
E
 
V
Y
 
P
E
 
N
A
 
L
I
 
L
V
 
S
V
 
V
P
 
T
A
 
K
A
 
S
S
 
L
D
 
P
I
 
V
K
 
T
T
 
S
M
 
V
A
 
A
D
 
D
L
 
L
V
 
I
A
 
S
K
 
Y
L
 
A
K
 
R
Q
 
Q
D
 
R
P
 
P
G
 
R
S
 
E
V
 
L
S
 
F
W
 
Y
G
 
G
G
 
V
G
 
S
S
 
A
A
 
L
G
 
G
G
x
S
T
|
T
D
 
G
H
 
H
I
 
L
A
 
S
V
 
T
G
 
E
L
 
L
I
 
F
A
 
K
K
 
T
A
 
M
A
 
T
G
 
G
V
 
V
D
 
E
P
 
-
T
 
-
K
 
-
I
 
I
N
 
T
Y
 
A
V
 
V
A
 
P
F
 
Y
S
 
K
G
 
G
G
x
S
G
 
A
E
 
P
A
 
M
L
 
L
A
 
R
A
 
D
I
 
L
L
 
A
G
 
E
G
 
G
Q
 
R
V
 
V
T
 
H
A
 
L
G
 
T
I
 
I
S
 
D
G
x
N
Y
 
L
G
 
P
E
 
A
F
 
S
E
 
K
S
 
P
Q
 
L
V
 
L
K
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
E
L
 
I
R
 
R
L
 
P
L
 
L
A
 
A
V
 
V
S
 
T
G
 
T
E
 
A
Q
 
K
R
 
R
L
 
W
D
 
P
G
 
P
V
 
L
D
 
S
A
 
H
-
 
L
P
 
P
T
 
T
L
 
I
K
 
A
E
 
E
S
 
A
G
 
G
L
 
V
D
 
P
-
 
G
V
 
Y
A
 
E
V
 
T
Q
 
A
N
x
S
W
 
W
R
 
F
M
 
T
V
 
V
A
 
G
A
 
A
A
 
P
P
 
R
G
 
G
L
 
T
S
 
P
A
 
T
E
 
E

5oeiA R. Palustris rpa4515 with oxoadipate (see paper)
24% identity, 74% coverage: 24:255/314 of query aligns to 8:239/299 of 5oeiA

query
sites
5oeiA
T
 
T
I
 
L
M
 
V
A
 
V
P
 
P
A
x
F
A
 
T
P
 
S
G
 
G
G
 
G
G
 
T
W
x
T
D
 
D
Q
 
M
T
 
L
A
 
A
R
 
R
S
 
L
L
 
I
Q
 
A
T
 
A
V
 
R
M
 
L
Q
 
S
K
 
-
E
 
E
G
 
H
I
 
Y
S
 
G
G
 
Q
N
 
S
V
 
F
Q
 
V
V
 
I
Q
 
D
N
 
N
V
 
R
P
 
S
G
 
G
A
 
E
G
 
S
G
 
G
T
 
N
I
 
I
G
 
A
L
 
-
A
 
A
Q
 
S
F
 
Y
T
 
V
G
 
A
Q
 
K
N
 
V
N
 
P
G
 
A
N
 
D
A
 
G
N
 
Y
A
 
T
L
 
F
I
 
I
V
 
I
G
 
G
G
 
-
Y
 
-
V
 
-
M
 
T
V
 
P
G
 
G
A
 
I
I
 
H
L
 
A
T
 
T
N
 
N
Q
 
R
-
 
L
-
 
V
-
 
Y
-
 
R
-
 
T
-
 
M
-
 
G
-
 
Y
S
 
D
P
 
P
V
 
A
T
 
T
L
 
-
K
 
-
D
 
D
V
 
F
T
 
T
P
 
P
I
 
V
A
 
I
R
 
V
L
 
I
T
 
A
G
 
R
E
 
V
Y
 
P
E
 
N
A
 
L
I
 
L
V
 
S
V
 
V
P
 
T
A
 
K
A
 
S
S
 
L
D
 
P
I
 
V
K
 
T
T
 
S
M
 
V
A
 
A
D
 
D
L
 
L
V
 
I
A
 
S
K
 
Y
L
 
A
K
 
R
Q
 
Q
D
 
R
P
 
P
G
 
R
S
 
E
V
 
L
S
 
F
W
 
Y
G
 
G
G
 
V
G
x
S
S
 
A
A
 
L
G
 
G
G
x
S
T
|
T
D
 
G
H
 
H
I
 
L
A
 
S
V
 
T
G
 
E
L
 
L
I
 
F
A
 
K
K
 
T
A
 
M
A
 
T
G
 
G
V
 
V
D
 
E
P
 
-
T
 
-
K
 
-
I
 
I
N
 
T
Y
 
A
V
 
V
A
 
P
F
 
Y
S
 
K
G
 
G
G
x
S
G
 
A
E
 
P
A
 
M
L
 
L
A
 
R
A
 
D
I
 
L
L
 
A
G
 
E
G
 
G
Q
 
R
V
 
V
T
 
H
A
 
L
G
 
T
I
 
I
S
 
D
G
x
N
Y
 
L
G
 
P
E
 
A
F
 
S
E
 
K
S
 
P
Q
 
L
V
 
L
K
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
E
L
 
I
R
 
R
L
 
P
L
 
L
A
 
A
V
 
V
S
 
T
G
 
T
E
 
A
Q
 
K
R
 
R
L
 
W
D
 
P
G
 
P
V
 
L
D
 
S
A
 
H
-
 
L
P
 
P
T
 
T
L
 
I
K
 
A
E
 
E
S
 
A
G
 
G
L
 
V
D
 
P
-
 
G
V
 
Y
A
 
E
V
 
T
Q
 
A
N
x
S
W
 
W
R
 
F
M
 
T
V
 
V
A
 
G
A
 
A
A
 
P
P
 
R
G
 
G
L
 
T
S
 
P
A
 
T
E
 
E

6hkeB Matc (rpa3494) from rhodopseudomonas palustris with bound malate (see paper)
26% identity, 66% coverage: 30:236/314 of query aligns to 13:218/296 of 6hkeB

query
sites
6hkeB
A
 
A
P
 
K
G
 
G
G
 
G
G
x
P
W
x
T
D
 
D
Q
 
T
T
 
V
A
 
A
R
 
R
S
 
L
L
 
I
Q
 
T
T
 
A
V
 
E
M
 
M
Q
 
A
K
 
K
E
 
T
G
 
-
I
 
L
S
 
G
G
 
Q
N
 
P
V
 
I
Q
 
E
V
 
I
Q
 
E
N
 
N
V
 
M
P
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
T
I
 
L
G
 
A
L
 
-
A
 
A
Q
 
T
F
 
R
T
 
V
G
 
A
Q
 
H
N
 
A
N
 
A
G
 
P
N
 
D
A
 
G
N
 
H
A
 
T
L
 
L
I
 
I
V
 
V
G
 
G
G
x
H
Y
 
L
V
 
G
M
 
T
V
 
H
G
 
G
-
 
A
-
 
A
-
 
V
A
 
A
I
 
L
L
 
F
T
 
P
N
 
K
Q
 
L
S
 
A
P
 
Y
V
 
R
T
 
P
L
 
D
K
 
K
D
 
D
V
 
F
T
 
T
P
 
P
I
 
V
A
 
A
R
 
L
L
 
L
T
 
T
G
 
E
E
 
M
Y
 
P
E
 
V
A
 
L
I
 
L
V
 
L
V
 
A
P
 
R
A
 
K
A
 
Q
S
 
F
D
 
P
I
 
P
K
 
K
T
 
D
M
 
L
A
 
S
D
 
E
L
 
F
V
 
A
A
 
S
K
 
Y
L
 
V
K
 
E
Q
 
S
D
 
H
P
 
T
G
 
D
S
 
N
V
 
L
S
 
N
W
 
V
G
 
A
G
 
H
G
 
A
S
 
G
A
 
F
G
 
G
G
x
S
T
x
V
D
x
S
H
 
Y
I
 
A
A
 
S
V
 
C
G
 
L
L
 
L
I
 
L
A
 
N
K
 
R
A
 
L
A
 
L
G
 
K
V
 
V
D
 
D
P
 
P
T
 
T
K
 
G
I
 
-
N
 
-
Y
 
-
V
 
V
A
 
P
F
 
F
S
 
S
G
|
G
G
x
T
G
 
G
E
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
Q
A
 
A
I
 
L
L
 
V
G
 
E
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
T
 
D
A
 
Y
G
 
M
I
 
C
S
 
D
G
x
Q
Y
 
I
G
 
V
E
 
N
F
 
A
E
 
V
S
 
P
Q
 
A
V
 
L
K
 
R
A
 
E
G
 
G
Q
 
K
L
 
V
R
 
K
L
 
A
L
 
Y
A
 
V
V
 
I
S
 
A
G
 
A
E
 
S
Q
 
E
R
 
R
L
 
-
D
 
D
G
 
P
V
 
V
-
 
V
-
 
P
D
 
D
A
 
V
P
 
P
T
 
T
L
 
A
K
 
R
E
 
E
S
 
A
G
 
G
L
 
L

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_016557073.1 NCBI__GCF_000298315.2:WP_016557073.1
MKHTLLATIFAAAIALPAYAADYTIMAPAAPGGGWDQTARSLQTVMQKEGISGNVQVQNV
PGAGGTIGLAQFTGQNNGNANALIVGGYVMVGAILTNQSPVTLKDVTPIARLTGEYEAIV
VPAASDIKTMADLVAKLKQDPGSVSWGGGSAGGTDHIAVGLIAKAAGVDPTKINYVAFSG
GGEALAAILGGQVTAGISGYGEFESQVKAGQLRLLAVSGEQRLDGVDAPTLKESGLDVAV
QNWRMVAAAPGLSAEQTAAITADFDKLSKSASWQEILKTKGWADTYLAGDAFKAQLDKDV
SATEGILKEIGLVQ

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory