SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_017537035.1 NCBI__GCF_000341205.1:WP_017537035.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 8 hits to proteins with known functional sites (download)

4lrzA Crystal structure of the e.Coli dhar(n)-dhal complex (see paper)
44% identity, 96% coverage: 9:206/207 of query aligns to 12:210/211 of 4lrzA

query
sites
4lrzA
W
 
W
V
 
L
E
 
T
A
 
R
A
 
C
A
 
G
D
 
D
A
 
I
V
 
F
S
 
S
A
 
T
G
 
E
A
 
S
E
 
E
E
 
Y
L
 
L
S
 
T
R
 
G
L
 
L
D
|
D
A
 
R
A
 
E
I
 
I
G
 
G
D
|
D
G
 
A
D
|
D
H
|
H
G
 
G
T
 
L
N
 
N
M
 
M
D
 
N
R
 
R
G
 
G
L
 
F
T
 
S
A
 
K
A
 
V
R
 
V
R
 
E
A
 
K
V
 
L
A
 
P
D
 
A
L
 
I
E
 
A
A
 
D
D
 
K
G
 
D
P
 
I
G
 
G
P
 
F
V
 
I
L
 
L
V
 
K
K
 
N
T
 
T
G
 
G
M
 
M
T
 
T
M
 
L
I
 
L
S
 
S
R
 
S
V
 
V
G
 
G
G
|
G
A
|
A
S
|
S
G
 
G
P
 
P
L
|
L
Y
 
F
G
 
G
T
 
T
L
 
F
L
 
F
R
 
I
T
 
R
A
 
A
G
 
A
K
 
Q
R
 
A
L
 
T
E
 
Q
G
 
A
G
 
R
E
 
Q
A
 
S
-
 
L
G
 
T
L
 
L
A
 
E
D
 
E
L
 
L
A
 
Y
A
 
Q
A
 
M
L
 
F
R
 
R
A
 
D
G
 
G
L
 
A
E
 
D
A
 
G
V
 
V
Q
 
I
K
 
S
M
 
R
G
|
G
A
 
K
A
 
A
K
 
E
P
 
P
G
 
G
D
 
D
K
 
K
T
|
T
L
x
M
V
 
C
D
 
D
A
 
V
L
 
W
S
 
V
P
 
P
A
 
V
V
 
V
E
 
E
A
 
S
L
 
L
E
 
R
K
 
Q
A
 
S
A
 
S
G
 
E
Q
 
Q
G
 
N
A
 
L
P
 
S
L
 
V
S
 
P
E
 
V
A
 
A
A
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
S
G
 
S
A
 
I
A
 
A
E
 
E
Q
 
S
G
 
A
A
 
A
R
 
Q
A
 
S
T
 
T
V
 
I
P
 
T
L
 
M
Q
 
Q
A
 
A
R
 
R
K
 
K
G
|
G
R
 
R
A
 
A
S
 
S
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
E
 
E
R
 
R
S
 
S
I
 
I
G
 
G
H
 
H
E
 
Q
D
|
D
P
|
P
G
|
G
A
 
A
A
 
T
S
 
S
S
 
V
A
 
M
L
 
F
L
 
M
M
 
M
R
 
Q
A
 
M
L
 
L
A
 
A
D
 
L
A
 
A
C
 
A
R
 
K

P76014 PEP-dependent dihydroxyacetone kinase, ADP-binding subunit DhaL; EC 2.7.1.121 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
44% identity, 94% coverage: 9:202/207 of query aligns to 11:205/210 of P76014

query
sites
P76014
W
 
W
V
 
L
E
 
T
A
 
R
A
 
C
A
 
G
D
 
D
A
 
I
V
 
F
S
 
S
A
 
T
G
 
E
A
 
S
E
 
E
E
 
Y
L
 
L
S
 
T
R
 
G
L
 
L
D
|
D
A
 
R
A
 
E
I
 
I
G
 
G
D
|
D
G
 
A
D
|
D
H
|
H
G
|
G
T
x
L
N
|
N
M
 
M
D
 
N
R
 
R
G
 
G
L
 
F
T
 
S
A
 
K
A
 
V
R
 
V
R
 
E
A
 
K
V
 
L
A
 
P
D
 
A
L
 
I
E
 
A
A
 
D
D
 
K
G
 
D
P
 
I
G
 
G
P
 
F
V
 
I
L
 
L
V
 
K
K
 
N
T
 
T
G
 
G
M
 
M
T
 
T
M
 
L
I
 
L
S
 
S
R
 
S
V
 
V
G
 
G
G
 
G
A
|
A
S
|
S
G
 
G
P
 
P
L
 
L
Y
 
F
G
 
G
T
 
T
L
 
F
L
 
F
R
 
I
T
 
R
A
 
A
G
 
A
K
 
Q
R
 
A
L
 
T
E
 
Q
G
 
A
G
 
R
E
 
Q
A
 
S
-
 
L
G
 
T
L
 
L
A
 
E
D
 
E
L
 
L
A
 
Y
A
 
Q
A
 
M
L
 
F
R
 
R
A
 
D
G
 
G
L
 
A
E
 
D
A
 
G
V
 
V
Q
 
I
K
 
S
M
 
R
G
|
G
A
 
K
A
 
A
K
 
E
P
 
P
G
 
G
D
 
D
K
 
K
T
 
T
L
x
M
V
 
C
D
 
D
A
 
V
L
 
W
S
 
V
P
 
P
A
 
V
V
 
V
E
 
E
A
 
S
L
 
L
E
 
R
K
 
Q
A
 
S
A
 
S
G
 
E
Q
 
Q
G
 
N
A
 
L
P
 
S
L
 
V
S
 
P
E
 
V
A
 
A
A
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
S
G
 
S
A
 
I
A
 
A
E
 
E
Q
 
S
G
 
A
A
 
A
R
 
Q
A
 
S
T
 
T
V
 
I
P
 
T
L
 
M
Q
 
Q
A
 
A
R
 
R
K
 
K
G
 
G
R
|
R
A
 
A
S
 
S
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
E
 
E
R
 
R
S
 
S
I
 
I
G
 
G
H
 
H
E
 
Q
D
|
D
P
|
P
G
|
G
A
 
A
A
 
T
S
 
S
S
 
V
A
 
M
L
 
F
L
 
M
M
 
M
R
 
Q
A
 
M
L
 
L
A
 
A

Q9CIV7 PTS-dependent dihydroxyacetone kinase, ADP-binding subunit DhaL; EC 2.7.1.121 from Lactococcus lactis subsp. lactis (strain IL1403) (Streptococcus lactis) (see paper)
39% identity, 99% coverage: 1:205/207 of query aligns to 4:191/192 of Q9CIV7

query
sites
Q9CIV7
M
 
I
D
 
D
T
 
T
A
 
T
L
 
I
A
 
E
K
 
-
A
 
-
W
 
W
V
 
L
E
 
G
A
 
K
A
 
F
A
 
N
D
 
E
A
 
K
V
 
I
S
 
Q
A
 
E
G
 
N
A
 
K
E
 
A
E
 
Y
L
 
L
S
 
S
R
 
E
L
 
L
D
|
D
A
 
G
A
 
P
I
 
I
G
 
G
D
|
D
G
 
G
D
|
D
H
|
H
G
|
G
T
x
A
N
|
N
M
 
M
D
 
A
R
 
R
G
 
G
L
 
M
T
 
S
A
 
E
A
 
T
R
 
M
R
 
K
A
 
A
V
 
L
A
 
E
D
 
V
L
 
S
E
 
N
A
 
F
D
 
G
G
 
N
P
 
V
G
 
S
P
 
E
V
 
I
L
 
F
V
 
K
K
 
K
T
 
V
G
 
A
M
 
M
T
 
T
M
 
L
I
 
M
S
 
S
R
 
K
V
 
V
G
 
G
G
 
G
A
|
A
S
|
S
G
 
G
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
T
 
S
-
 
A
-
 
F
-
 
L
-
 
A
L
 
M
L
 
S
R
 
K
T
 
T
A
 
A
G
 
I
K
 
E
R
 
T
L
 
L
E
 
-
G
 
-
G
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
A
 
-
D
 
D
L
 
T
A
 
S
A
 
E
A
 
L
L
 
I
R
 
Y
A
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
E
A
 
A
V
 
I
Q
 
Q
K
 
K
M
x
R
G
|
G
A
 
K
A
 
A
K
 
Q
P
 
V
G
 
G
D
 
E
K
 
K
T
 
T
L
x
M
V
 
V
D
 
D
A
 
I
L
 
W
S
 
S
P
 
A
A
 
F
V
 
L
E
 
N
A
 
D
L
 
L
E
 
Q
K
 
T
A
 
D
A
 
S
G
 
A
Q
 
S
G
 
K
A
 
D
P
 
N
L
 
L
S
 
E
E
 
K
A
 
V
A
 
V
E
 
K
A
 
A
A
 
S
A
 
A
G
 
G
A
 
-
A
 
-
E
 
-
Q
 
-
G
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
T
 
-
V
 
-
P
 
-
L
 
L
Q
 
L
A
 
A
R
 
T
K
 
K
G
 
G
R
|
R
A
 
A
S
 
S
Y
|
Y
L
 
L
G
 
G
E
 
E
R
 
R
S
 
S
I
 
I
G
 
G
H
 
H
E
 
I
D
|
D
P
|
P
G
|
G
A
 
T
A
 
Q
S
 
S
S
 
S
A
 
A
L
 
Y
L
 
L
M
 
F
R
 
E
A
 
T
L
 
L
A
 
L
D
 
E
A
 
V
C
 
V

3cr3A Structure of a transient complex between dha-kinase subunits dham and dhal from lactococcus lactis (see paper)
39% identity, 99% coverage: 1:205/207 of query aligns to 4:191/192 of 3cr3A

query
sites
3cr3A
M
 
I
D
 
D
T
 
T
A
 
T
L
 
I
A
 
E
K
 
-
A
 
-
W
 
W
V
 
L
E
 
G
A
 
K
A
 
F
A
 
N
D
 
E
A
 
K
V
 
I
S
 
Q
A
 
E
G
 
N
A
 
K
E
 
A
E
 
Y
L
 
L
S
 
S
R
 
E
L
 
L
D
|
D
A
 
G
A
 
P
I
 
I
G
 
G
D
|
D
G
 
G
D
|
D
H
|
H
G
 
G
T
 
A
N
|
N
M
 
M
D
 
A
R
 
R
G
 
G
L
 
M
T
 
S
A
 
E
A
 
T
R
 
M
R
 
K
A
 
A
V
 
L
A
 
E
D
 
V
L
 
S
E
 
N
A
 
F
D
 
G
G
 
N
P
 
V
G
 
S
P
 
E
V
 
I
L
 
F
V
 
K
K
 
K
T
 
V
G
 
A
M
 
M
T
 
T
M
 
L
I
 
M
S
 
S
R
 
K
V
 
V
G
 
G
G
|
G
A
|
A
S
|
S
G
 
G
P
 
P
L
|
L
Y
 
Y
G
 
G
T
 
S
-
 
A
-
 
F
-
 
L
-
 
A
L
 
M
L
 
S
R
 
K
T
 
T
A
 
A
G
 
I
K
 
E
R
 
T
L
 
L
E
 
-
G
 
-
G
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
A
 
-
D
 
D
L
 
T
A
 
S
A
 
E
A
 
L
L
 
I
R
 
Y
A
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
E
A
 
A
V
 
I
Q
 
Q
K
 
K
M
 
R
G
|
G
A
 
K
A
|
A
K
 
Q
P
 
V
G
 
G
D
 
E
K
 
K
T
|
T
L
 
M
V
 
V
D
 
D
A
 
I
L
 
W
S
 
S
P
 
A
A
 
F
V
 
L
E
 
N
A
 
D
L
 
L
E
 
Q
K
 
T
A
 
D
A
 
S
G
 
A
Q
 
S
G
 
K
A
 
D
P
 
N
L
 
L
S
 
E
E
 
K
A
 
V
A
 
V
E
 
K
A
 
A
A
 
S
A
 
A
G
 
G
A
 
-
A
 
-
E
 
-
Q
 
-
G
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
T
 
-
V
 
-
P
 
-
L
 
L
Q
 
L
A
 
A
R
 
T
K
 
K
G
 
G
R
 
R
A
 
A
S
 
S
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
E
 
E
R
 
R
S
 
S
I
 
I
G
 
G
H
 
H
E
 
I
D
|
D
P
|
P
G
|
G
A
 
T
A
 
Q
S
 
S
S
 
S
A
 
A
L
 
Y
L
 
L
M
 
F
R
 
E
A
 
T
L
 
L
A
 
L
D
 
E
A
 
V
C
 
V

Q3LXA3 Triokinase/FMN cyclase; Bifunctional ATP-dependent dihydroxyacetone kinase/FAD-AMP lyase (cyclizing); EC 2.7.1.28; EC 2.7.1.29; EC 4.6.1.15 from Homo sapiens (Human) (see 4 papers)
39% identity, 82% coverage: 22:190/207 of query aligns to 390:558/575 of Q3LXA3

query
sites
Q3LXA3
E
 
E
E
 
H
L
 
L
S
 
N
R
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
R
A
 
A
I
 
A
G
 
G
D
|
D
G
 
G
D
|
D
H
x
C
G
 
G
T
 
T
N
 
T
M
 
H
D
 
S
R
 
R
G
 
-
L
 
-
T
 
-
A
 
-
A
 
A
R
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
I
A
 
Q
D
 
E
L
 
W
E
 
L
A
 
K
D
 
E
G
 
G
P
 
P
G
 
P
P
 
P
-
 
A
-
 
S
-
 
P
-
 
A
-
 
Q
V
 
L
L
 
L
V
 
S
K
 
K
T
 
L
G
 
S
M
 
V
T
 
L
M
 
L
I
 
L
S
 
E
R
 
K
V
 
M
G
 
G
G
|
G
A
x
S
S
 
S
G
 
G
P
 
A
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
T
 
L
L
 
F
L
 
L
R
 
T
T
 
A
A
 
A
G
 
A
K
 
Q
R
 
P
L
 
L
E
 
K
G
 
A
G
 
-
E
 
K
A
 
T
G
 
S
L
 
L
A
 
P
D
 
A
L
 
W
A
 
S
A
 
A
A
 
A
L
 
M
R
 
D
A
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
E
A
 
A
V
 
M
Q
 
Q
K
 
K
M
 
Y
G
 
G
A
 
K
A
 
A
K
 
A
P
 
P
G
 
G
D
 
D
K
 
R
T
 
T
L
 
M
V
 
L
D
 
D
A
 
S
L
 
L
S
 
W
P
 
A
A
 
A
V
 
G
E
 
Q
A
 
E
L
 
L
E
 
Q
K
 
A
A
 
W
A
 
K
G
 
S
Q
 
P
G
 
G
A
 
A
P
 
D
L
 
L
S
 
L
E
 
Q
A
 
V
A
 
L
E
 
T
A
 
K
A
 
A
A
 
V
G
 
K
A
 
S
A
 
A
E
 
E
Q
 
A
G
 
A
A
 
A
R
 
E
A
 
A
T
 
T
V
 
K
P
 
N
L
 
M
Q
 
E
A
 
A
R
 
G
K
 
A
G
 
G
R
|
R
A
 
A
S
 
S
Y
 
Y
L
 
I
G
 
S
E
 
S
R
 
A
S
 
R
I
 
L
G
 
E
H
 
Q
E
 
P
D
|
D
P
 
P
G
 
G

Sites not aligning to the query:

P45510 Dihydroxyacetone kinase; DHA kinase; Glycerone kinase; EC 2.7.1.29 from Citrobacter freundii (see 2 papers)
35% identity, 98% coverage: 3:204/207 of query aligns to 355:549/552 of P45510

query
sites
P45510
T
 
N
A
 
A
L
 
L
A
 
V
K
 
A
A
 
G
W
 
I
V
 
V
E
 
E
A
 
L
A
 
V
A
 
T
D
 
A
A
 
T
V
 
L
S
 
S
A
 
D
G
 
L
A
 
E
E
 
T
E
 
H
L
 
L
S
 
N
R
 
A
L
 
L
D
|
D
A
 
A
A
 
K
I
 
V
G
 
G
D
|
D
G
|
G
D
|
D
H
x
T
G
 
G
T
 
S
N
 
T
M
 
-
D
 
-
R
 
-
G
 
-
L
 
F
T
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
A
R
 
R
A
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
S
L
 
L
E
 
L
A
 
H
D
 
R
G
 
Q
P
 
Q
G
 
L
P
 
P
V
 
L
-
 
N
-
 
N
-
 
L
-
 
A
-
 
T
-
 
L
-
 
F
-
 
A
L
 
L
V
 
I
K
 
G
T
 
E
G
 
R
M
 
L
T
 
T
M
 
V
I
 
V
S
 
-
R
 
-
V
 
M
G
 
G
G
 
G
A
x
S
S
|
S
G
 
G
P
 
V
L
 
L
Y
 
M
G
 
S
T
 
I
L
 
F
L
 
F
R
 
T
T
 
A
A
 
A
G
 
G
K
 
Q
R
 
K
L
 
L
E
 
E
G
 
Q
G
 
G
E
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
A
 
A
D
 
N
L
 
V
A
 
V
A
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
N
A
 
T
G
 
G
L
 
L
E
 
A
A
 
Q
V
 
M
Q
 
K
K
 
F
M
 
Y
G
|
G
A
 
G
A
 
A
K
 
D
P
 
E
G
 
G
D
 
D
K
 
R
T
|
T
L
x
M
V
 
I
D
 
D
A
 
A
L
 
L
S
 
Q
P
 
P
A
 
A
V
 
L
E
 
T
A
 
S
L
 
L
E
 
-
K
 
-
A
 
-
A
 
L
G
 
A
Q
 
Q
G
 
P
A
 
K
P
 
N
L
 
L
S
 
Q
E
 
A
A
 
A
A
 
F
E
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
Q
G
 
A
A
 
G
A
 
A
E
 
E
Q
 
-
G
 
-
A
 
-
R
 
R
A
 
T
T
 
C
V
 
L
P
 
S
L
 
S
Q
 
K
A
 
A
R
 
N
K
 
A
G
 
G
R
 
R
A
 
A
S
 
S
Y
 
Y
L
 
L
G
 
S
E
 
S
R
 
E
S
 
S
-
 
L
I
 
L
G
 
G
H
 
N
E
 
M
D
|
D
P
|
P
G
|
G
A
 
A
A
 
Q
S
 
R
S
 
L
A
 
A
L
 
M
L
 
V
M
 
F
R
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
E
A
 
S

Sites not aligning to the query:

1un9A Crystal structure of the dihydroxyacetone kinase from c. Freundii in complex with amp-pnp and mg2+ (see paper)
31% identity, 98% coverage: 3:204/207 of query aligns to 355:536/537 of 1un9A

query
sites
1un9A
T
 
N
A
 
A
L
 
L
A
 
V
K
 
A
A
 
G
W
 
I
V
 
V
E
 
E
A
 
L
A
 
V
A
 
T
D
 
A
A
 
T
V
 
L
S
 
S
A
 
D
G
 
L
A
 
E
E
 
T
E
 
H
L
 
L
S
 
N
R
 
A
L
 
L
D
|
D
A
 
A
A
 
K
I
 
V
G
 
G
D
|
D
G
 
G
D
|
D
H
x
T
G
 
G
T
 
S
N
x
T
M
 
-
D
 
-
R
 
-
G
 
-
L
 
F
T
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
A
R
 
R
A
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
S
L
 
L
E
 
L
A
 
H
D
 
R
G
 
Q
P
 
Q
G
 
L
P
 
P
V
 
L
-
 
N
-
 
N
-
 
L
-
 
A
-
 
T
-
 
L
-
 
F
-
 
A
L
 
L
V
 
I
K
 
G
T
 
E
G
 
R
M
 
L
T
 
T
M
 
V
I
 
V
S
 
-
R
 
-
V
 
M
G
 
G
G
|
G
A
x
S
S
|
S
G
 
G
P
 
V
L
|
L
Y
 
M
G
 
S
T
 
I
L
 
F
L
 
F
R
 
T
T
 
A
A
 
A
G
 
G
K
 
Q
R
 
K
L
 
L
E
 
E
G
 
Q
G
 
G
E
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
A
 
A
D
 
N
L
 
V
A
 
V
A
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
N
A
 
T
G
 
G
L
 
L
E
 
A
A
 
Q
V
 
M
Q
 
K
K
 
F
M
 
Y
G
|
G
A
 
G
A
|
A
K
 
D
P
 
E
G
 
G
D
 
D
K
 
R
T
|
T
L
x
M
V
 
I
D
 
D
A
 
A
L
 
L
S
 
Q
P
 
P
A
 
A
V
 
L
E
 
T
A
 
S
L
 
L
E
 
-
K
 
-
A
 
-
A
 
L
G
 
A
Q
 
Q
G
 
P
A
 
K
P
 
N
L
 
L
S
 
Q
E
 
A
A
 
A
A
 
F
E
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
Q
G
 
A
A
 
G
A
 
A
E
 
E
Q
 
R
G
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
T
 
-
V
 
-
P
 
-
L
 
-
Q
 
-
A
 
-
R
 
-
K
 
-
G
 
-
R
 
-
A
 
-
S
 
T
Y
 
C
L
 
L
G
 
S
E
 
S
R
 
K
S
 
A
I
 
L
G
 
G
H
 
N
E
 
M
D
|
D
P
 
P
G
|
G
A
 
A
A
 
Q
S
 
A
S
 
L
A
 
A
L
 
M
L
 
V
M
 
F
R
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
E
A
 
S

Sites not aligning to the query:

7w7hA S suis faka-fakb2 complex structure (see paper)
32% identity, 61% coverage: 3:128/207 of query aligns to 5:131/541 of 7w7hA

query
sites
7w7hA
T
 
T
A
 
S
L
 
L
A
 
F
K
 
Q
A
 
E
W
 
M
V
 
V
E
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
S
D
 
T
A
 
R
V
 
L
S
 
N
A
 
K
G
 
Q
A
 
A
E
 
E
E
 
Y
L
 
V
S
 
N
R
 
S
L
 
L
D
 
N
A
 
V
A
 
F
-
 
P
I
 
V
G
 
P
D
 
D
G
 
G
D
 
D
H
 
T
G
 
G
T
 
T
N
 
N
M
 
M
D
 
G
R
 
M
G
 
T
L
 
I
T
 
P
A
 
N
A
 
G
R
 
A
R
 
K
A
 
E
V
 
V
A
 
A
D
 
D
L
 
K
E
 
S
A
 
A
D
 
S
G
 
T
P
 
V
G
 
G
P
 
E
V
 
V
-
 
A
-
 
Q
L
 
I
V
 
L
K
 
S
T
 
K
G
 
G
M
 
L
T
 
L
M
 
M
I
 
G
S
 
A
R
 
R
V
 
-
G
 
-
G
 
G
A
 
N
S
 
S
G
 
G
P
 
V
L
 
I
Y
 
T
G
 
S
T
 
Q
L
 
L
L
 
F
R
 
R
T
 
G
A
 
F
G
 
G
K
 
Q
R
 
S
L
 
V
E
 
K
G
 
G
G
 
K
-
 
V
E
 
E
A
 
L
G
 
D
L
 
G
A
 
K
D
 
D
L
 
L
A
 
A
A
 
Q
A
 
A
L
 
F
R
 
Q
A
 
H
G
 
G
L
 
V
E
 
E
A
 
V
V
 
A
Q
 
Y
K
 
K
M
 
-
G
 
A
A
 
V
A
 
M
K
 
K
P
 
P
G
 
V
D
 
E
K
 
G
T
 
T
L
 
I
V
 
L

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_017537035.1 NCBI__GCF_000341205.1:WP_017537035.1
MDTALAKAWVEAAADAVSAGAEELSRLDAAIGDGDHGTNMDRGLTAARRAVADLEADGPG
PVLVKTGMTMISRVGGASGPLYGTLLRTAGKRLEGGEAGLADLAAALRAGLEAVQKMGAA
KPGDKTLVDALSPAVEALEKAAGQGAPLSEAAEAAAGAAEQGARATVPLQARKGRASYLG
ERSIGHEDPGAASSALLMRALADACRA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory