SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_017547432.1 NCBI__GCF_000330705.1:WP_017547432.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

2j5nA 1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase from thermus thermophirus with bound inhibitor glycine and NAD.
49% identity, 100% coverage: 2:514/514 of query aligns to 3:516/516 of 2j5nA

query
sites
2j5nA
V
 
V
L
 
E
P
 
P
Y
 
F
S
 
R
A
 
N
E
 
E
P
 
P
A
 
I
T
 
E
D
 
T
F
 
F
T
 
Q
Q
 
T
E
 
E
E
 
E
N
 
A
K
 
R
K
 
R
A
 
A
F
 
M
K
 
R
A
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
R
N
 
R
A
 
V
K
 
R
N
 
E
D
 
E
F
 
F
G
 
G
V
 
R
K
 
H
R
 
Y
P
 
P
L
 
L
I
 
Y
I
 
I
G
 
G
G
 
G
E
 
E
H
 
W
I
 
V
E
 
D
T
 
T
D
 
K
D
 
E
Q
 
R
I
 
M
T
 
V
S
 
S
Y
 
L
N
 
N
P
 
P
S
 
S
D
 
A
K
 
P
E
 
S
Q
 
E
A
 
V
V
 
V
G
 
G
H
 
T
V
 
T
S
 
A
K
 
K
A
 
A
T
 
G
Q
 
K
G
 
A
H
 
E
I
 
A
D
 
E
A
 
A
A
 
A
F
 
L
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
G
 
W
E
 
K
A
 
A
F
 
F
E
 
K
T
 
T
W
 
W
S
 
K
E
 
D
W
 
W
D
 
P
P
 
Q
K
 
E
D
 
D
R
 
R
A
 
S
E
 
R
L
 
L
L
 
L
I
 
L
R
 
K
V
 
A
A
 
A
A
 
A
I
 
L
I
 
M
R
 
R
R
 
R
R
 
R
K
 
K
H
 
R
E
 
E
F
 
L
S
 
E
A
 
A
L
 
T
M
 
L
V
 
V
H
 
Y
E
 
E
A
 
V
G
 
G
K
 
K
P
 
N
W
 
W
N
 
V
E
 
E
A
 
A
D
 
S
G
 
A
D
 
D
T
 
V
N
 
A
E
 
E
G
 
A
I
 
I
D
 
D
F
 
F
I
 
I
E
 
E
Y
 
Y
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
S
 
A
M
 
A
M
 
L
E
 
R
L
 
Y
A
 
R
-
 
Y
D
 
P
G
 
A
K
 
V
P
 
E
V
 
V
L
 
V
D
 
P
R
 
Y
E
 
P
G
 
G
E
 
E
H
 
D
N
 
N
K
 
E
Y
 
S
F
 
F
Y
 
Y
Q
 
V
P
 
P
M
 
L
G
 
G
T
 
A
G
 
G
V
 
V
T
 
V
I
|
I
S
x
A
P
|
P
W
|
W
N
|
N
F
 
F
P
 
P
F
 
V
A
 
A
I
|
I
M
 
F
T
 
T
G
 
G
T
 
M
T
 
I
V
 
V
A
 
G
P
 
P
I
 
V
I
 
A
A
 
V
G
 
G
N
 
N
T
 
T
V
 
V
L
 
I
L
 
A
K
|
K
P
 
P
A
 
A
E
|
E
D
 
D
T
 
A
P
 
V
L
 
V
I
 
V
S
 
G
Y
 
A
K
 
K
L
 
V
M
 
F
E
 
E
V
 
I
F
 
F
E
 
H
E
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
F
P
 
P
K
 
P
G
 
G
V
 
V
V
 
V
N
 
N
F
 
F
V
 
L
T
 
P
G
 
G
D
 
V
P
x
G
G
 
E
V
 
E
I
 
V
G
 
G
D
 
A
Y
 
Y
M
 
L
V
 
V
D
 
E
H
 
H
H
 
P
K
 
R
T
 
I
H
 
R
F
 
F
I
 
I
T
 
N
F
|
F
T
|
T
G
|
G
S
|
S
K
 
L
S
 
E
T
x
V
G
 
G
L
 
L
R
 
K
I
 
I
S
 
Y
E
 
E
R
 
A
A
 
A
S
 
G
V
 
R
V
 
L
Q
 
A
E
 
P
G
 
G
Q
 
Q
H
 
T
F
 
W
L
 
F
K
 
K
R
 
R
V
 
A
I
 
Y
T
 
V
E
|
E
M
x
T
G
 
G
G
 
G
K
 
K
D
 
D
T
 
A
I
 
I
I
 
I
V
 
V
D
 
D
K
 
E
T
 
T
A
 
A
D
 
D
L
 
F
D
 
D
L
 
L
A
 
A
A
 
A
D
 
E
S
 
G
I
 
V
V
 
V
S
 
V
S
 
S
A
 
A
F
 
Y
G
 
G
F
 
F
A
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
C
|
C
S
|
S
A
 
A
G
 
A
S
 
S
R
 
R
A
 
L
V
 
I
I
 
L
H
 
T
E
 
Q
D
 
G
V
 
A
Y
 
Y
D
 
E
E
 
P
V
 
V
L
 
L
K
 
E
K
 
R
A
 
V
V
 
L
E
 
K
L
 
R
T
 
A
E
 
E
E
 
R
L
 
L
T
 
S
V
 
V
G
 
G
N
 
P
P
 
A
V
 
E
D
 
E
E
 
N
T
 
P
Y
 
D
M
 
L
G
 
G
P
 
P
V
 
V
I
 
V
S
 
S
R
 
A
K
 
E
Q
 
Q
F
 
E
D
 
R
M
 
K
I
 
V
K
 
L
G
 
S
Y
 
Y
I
 
I
D
 
E
I
 
I
G
 
G
K
 
K
G
 
N
E
 
E
G
 
G
T
 
Q
L
 
L
K
 
V
I
 
L
G
 
G
G
 
G
E
 
K
T
 
R
D
 
L
D
 
E
S
 
G
K
 
E
G
 
G
Y
 
Y
F
 
F
I
 
I
Q
 
A
P
 
P
T
 
T
I
 
V
F
 
F
A
 
T
D
 
E
L
 
V
D
 
P
P
 
P
K
 
K
A
 
A
R
 
R
I
 
I
M
 
A
Q
 
Q
E
 
E
E
|
E
I
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
V
 
L
A
 
S
F
 
V
A
 
I
K
 
R
A
 
V
K
 
K
D
 
D
F
 
F
D
 
A
E
 
E
L
 
A
L
 
L
E
 
E
I
 
V
A
 
A
N
 
N
N
 
D
T
 
T
V
 
P
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
T
 
T
G
 
G
S
 
G
V
 
V
I
 
Y
T
 
S
N
 
R
T
 
K
R
 
R
E
 
E
N
 
H
W
 
L
I
 
E
K
 
W
A
 
A
Q
 
R
K
 
R
K
 
E
F
 
F
H
 
H
V
 
V
G
 
G
N
 
N
L
 
L
Y
 
Y
L
 
F
N
 
N
R
 
R
G
 
K
C
 
I
T
 
T
A
x
G
A
|
A
V
 
L
M
 
V
G
 
G
Y
 
V
H
 
Q
P
 
P
F
|
F
G
 
G
G
 
G
F
 
F
K
 
K
L
 
L
S
 
S
G
 
G
T
 
T
D
 
N
Q
 
A
K
 
K
T
|
T
G
 
G
S
 
A
P
 
L
D
 
D
Y
 
Y
M
 
L
L
 
R
N
 
L
F
 
F
L
 
L
E
 
E
Q
 
M
K
 
K
V
 
A
V
 
V
S
 
A
E
 
E
M
 
R
F
 
F

2ej6A Crystal analysis of delta1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase from thermus thermophilus with bound d-proline
49% identity, 100% coverage: 2:514/514 of query aligns to 3:516/516 of 2ej6A

query
sites
2ej6A
V
 
V
L
 
E
P
 
P
Y
 
F
S
 
R
A
 
N
E
 
E
P
 
P
A
 
I
T
 
E
D
 
T
F
 
F
T
 
Q
Q
 
T
E
 
E
E
 
E
N
 
A
K
 
R
K
 
R
A
 
A
F
 
M
K
 
R
A
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
R
N
 
R
A
 
V
K
 
R
N
 
E
D
 
E
F
 
F
G
 
G
V
 
R
K
 
H
R
 
Y
P
 
P
L
 
L
I
 
Y
I
 
I
G
 
G
G
 
G
E
 
E
H
 
W
I
 
V
E
 
D
T
 
T
D
 
K
D
 
E
Q
 
R
I
 
M
T
 
V
S
 
S
Y
 
L
N
 
N
P
 
P
S
 
S
D
 
A
K
 
P
E
 
S
Q
 
E
A
 
V
V
 
V
G
 
G
H
 
T
V
 
T
S
 
A
K
 
K
A
 
A
T
 
G
Q
 
K
G
 
A
H
 
E
I
 
A
D
 
E
A
 
A
A
 
A
F
 
L
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
G
 
W
E
 
K
A
 
A
F
 
F
E
 
K
T
 
T
W
 
W
S
 
K
E
 
D
W
 
W
D
 
P
P
 
Q
K
 
E
D
 
D
R
 
R
A
 
S
E
 
R
L
 
L
L
 
L
I
 
L
R
 
K
V
 
A
A
 
A
A
 
A
I
 
L
I
 
M
R
 
R
R
 
R
R
 
R
K
 
K
H
 
R
E
 
E
F
 
L
S
 
E
A
 
A
L
 
T
M
 
L
V
 
V
H
 
Y
E
 
E
A
 
V
G
 
G
K
 
K
P
 
N
W
 
W
N
 
V
E
 
E
A
 
A
D
 
S
G
 
A
D
 
D
T
 
V
N
 
A
E
|
E
G
 
A
I
 
I
D
 
D
F
 
F
I
 
I
E
 
E
Y
 
Y
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
S
 
A
M
 
A
M
 
L
E
 
R
L
 
Y
A
 
R
-
 
Y
D
 
P
G
 
A
K
 
V
P
 
E
V
 
V
L
 
V
D
 
P
R
 
Y
E
 
P
G
 
G
E
 
E
H
 
D
N
 
N
K
 
E
Y
 
S
F
 
F
Y
 
Y
Q
 
V
P
 
P
M
 
L
G
 
G
T
 
A
G
 
G
V
 
V
T
 
V
I
 
I
S
 
A
P
 
P
W
 
W
N
|
N
F
|
F
P
 
P
F
 
V
A
 
A
I
 
I
M
 
F
T
 
T
G
 
G
T
 
M
T
 
I
V
 
V
A
 
G
P
 
P
I
 
V
I
 
A
A
 
V
G
 
G
N
 
N
T
 
T
V
 
V
L
 
I
L
 
A
K
|
K
P
 
P
A
 
A
E
 
E
D
 
D
T
 
A
P
 
V
L
 
V
I
 
V
S
 
G
Y
 
A
K
 
K
L
 
V
M
 
F
E
 
E
V
 
I
F
 
F
E
 
H
E
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
F
P
 
P
K
 
P
G
 
G
V
 
V
V
 
V
N
 
N
F
 
F
V
 
L
T
 
P
G
 
G
D
 
V
P
 
G
G
 
E
V
 
E
I
 
V
G
 
G
D
 
A
Y
 
Y
M
 
L
V
 
V
D
 
E
H
 
H
H
 
P
K
 
R
T
 
I
H
 
R
F
 
F
I
 
I
T
 
N
F
 
F
T
 
T
G
 
G
S
 
S
K
 
L
S
 
E
T
 
V
G
 
G
L
 
L
R
 
K
I
 
I
S
 
Y
E
 
E
R
 
A
A
 
A
S
 
G
V
 
R
V
 
L
Q
 
A
E
 
P
G
 
G
Q
 
Q
H
 
T
F
 
W
L
 
F
K
 
K
R
 
R
V
 
A
I
 
Y
T
 
V
E
|
E
M
 
T
G
 
G
G
 
G
K
 
K
D
 
D
T
 
A
I
 
I
I
 
I
V
 
V
D
 
D
K
 
E
T
 
T
A
 
A
D
 
D
L
 
F
D
 
D
L
 
L
A
 
A
A
 
A
D
 
E
S
 
G
I
 
V
V
 
V
S
 
V
S
 
S
A
 
A
F
 
Y
G
 
G
F
 
F
A
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
C
|
C
S
|
S
A
 
A
G
 
A
S
 
S
R
 
R
A
 
L
V
 
I
I
 
L
H
 
T
E
 
Q
D
 
G
V
 
A
Y
 
Y
D
 
E
E
 
P
V
 
V
L
 
L
K
 
E
K
 
R
A
 
V
V
 
L
E
 
K
L
 
R
T
 
A
E
 
E
E
 
R
L
 
L
T
 
S
V
 
V
G
 
G
N
 
P
P
 
A
V
 
E
D
 
E
E
 
N
T
 
P
Y
 
D
M
 
L
G
 
G
P
 
P
V
 
V
I
 
V
S
 
S
R
 
A
K
 
E
Q
 
Q
F
 
E
D
 
R
M
 
K
I
 
V
K
 
L
G
 
S
Y
 
Y
I
 
I
D
 
E
I
 
I
G
 
G
K
 
K
G
 
N
E
 
E
G
 
G
T
 
Q
L
 
L
K
 
V
I
 
L
G
 
G
G
 
G
E
 
K
T
 
R
D
 
L
D
 
E
S
 
G
K
 
E
G
 
G
Y
 
Y
F
 
F
I
 
I
Q
 
A
P
 
P
T
 
T
I
 
V
F
 
F
A
 
T
D
 
E
L
 
V
D
 
P
P
 
P
K
 
K
A
 
A
R
 
R
I
 
I
M
 
A
Q
 
Q
E
 
E
E
|
E
I
 
I
F
 
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
V
 
L
A
 
S
F
 
V
A
 
I
K
 
R
A
 
V
K
 
K
D
 
D
F
 
F
D
 
A
E
 
E
L
 
A
L
 
L
E
 
E
I
 
V
A
 
A
N
 
N
N
 
D
T
 
T
V
 
P
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
T
 
T
G
 
G
S
 
G
V
 
V
I
 
Y
T
 
S
N
 
R
T
 
K
R
 
R
E
 
E
N
 
H
W
 
L
I
 
E
K
 
W
A
 
A
Q
 
R
K
 
R
K
 
E
F
 
F
H
 
H
V
 
V
G
 
G
N
 
N
L
 
L
Y
 
Y
L
 
F
N
 
N
R
 
R
G
 
K
C
 
I
T
 
T
A
x
G
A
|
A
V
 
L
M
 
V
G
 
G
Y
 
V
H
 
Q
P
 
P
F
|
F
G
 
G
G
 
G
F
 
F
K
 
K
L
 
L
S
 
S
G
 
G
T
 
T
D
 
N
Q
 
A
K
 
K
T
|
T
G
 
G
S
 
A
P
 
L
D
 
D
Y
 
Y
M
 
L
L
 
R
N
 
L
F
 
F
L
 
L
E
 
E
Q
 
M
K
 
K
V
 
A
V
 
V
S
 
A
E
 
E
M
 
R
F
 
F

2eitA Crystal analysis of delta1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase from thermus thermophilus with bound l-alanine and NAD
49% identity, 100% coverage: 2:514/514 of query aligns to 3:516/516 of 2eitA

query
sites
2eitA
V
 
V
L
 
E
P
 
P
Y
 
F
S
 
R
A
 
N
E
 
E
P
 
P
A
 
I
T
 
E
D
 
T
F
 
F
T
 
Q
Q
 
T
E
 
E
E
 
E
N
 
A
K
 
R
K
 
R
A
 
A
F
 
M
K
 
R
A
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
R
N
 
R
A
 
V
K
 
R
N
 
E
D
 
E
F
 
F
G
 
G
V
 
R
K
 
H
R
 
Y
P
 
P
L
 
L
I
 
Y
I
 
I
G
 
G
G
 
G
E
 
E
H
 
W
I
 
V
E
 
D
T
 
T
D
 
K
D
 
E
Q
 
R
I
 
M
T
 
V
S
 
S
Y
 
L
N
 
N
P
 
P
S
 
S
D
 
A
K
 
P
E
 
S
Q
 
E
A
 
V
V
 
V
G
 
G
H
 
T
V
 
T
S
 
A
K
 
K
A
 
A
T
 
G
Q
 
K
G
 
A
H
 
E
I
 
A
D
 
E
A
 
A
A
 
A
F
 
L
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
G
 
W
E
 
K
A
 
A
F
 
F
E
 
K
T
 
T
W
 
W
S
 
K
E
 
D
W
 
W
D
 
P
P
 
Q
K
 
E
D
 
D
R
 
R
A
 
S
E
 
R
L
 
L
L
 
L
I
 
L
R
 
K
V
 
A
A
 
A
A
 
A
I
 
L
I
 
M
R
 
R
R
 
R
R
 
R
K
 
K
H
 
R
E
 
E
F
 
L
S
 
E
A
 
A
L
 
T
M
 
L
V
 
V
H
 
Y
E
 
E
A
 
V
G
 
G
K
 
K
P
 
N
W
 
W
N
 
V
E
 
E
A
 
A
D
 
S
G
 
A
D
 
D
T
 
V
N
 
A
E
 
E
G
 
A
I
 
I
D
 
D
F
 
F
I
 
I
E
 
E
Y
 
Y
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
S
 
A
M
 
A
M
 
L
E
 
R
L
 
Y
A
 
R
-
 
Y
D
 
P
G
 
A
K
 
V
P
 
E
V
 
V
L
 
V
D
 
P
R
 
Y
E
 
P
G
 
G
E
 
E
H
 
D
N
 
N
K
 
E
Y
 
S
F
 
F
Y
 
Y
Q
 
V
P
 
P
M
 
L
G
 
G
T
 
A
G
 
G
V
 
V
T
 
V
I
|
I
S
x
A
P
 
P
W
|
W
N
|
N
F
 
F
P
 
P
F
 
V
A
 
A
I
|
I
M
 
F
T
 
T
G
 
G
T
 
M
T
 
I
V
 
V
A
 
G
P
 
P
I
 
V
I
 
A
A
 
V
G
 
G
N
 
N
T
 
T
V
 
V
L
 
I
L
 
A
K
|
K
P
 
P
A
 
A
E
|
E
D
 
D
T
 
A
P
 
V
L
 
V
I
 
V
S
 
G
Y
 
A
K
 
K
L
 
V
M
 
F
E
 
E
V
 
I
F
 
F
E
 
H
E
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
F
P
 
P
K
 
P
G
 
G
V
 
V
V
 
V
N
 
N
F
 
F
V
 
L
T
 
P
G
 
G
D
 
V
P
x
G
G
x
E
V
 
E
I
 
V
G
|
G
D
 
A
Y
 
Y
M
 
L
V
 
V
D
 
E
H
 
H
H
 
P
K
 
R
T
 
I
H
 
R
F
 
F
I
 
I
T
 
N
F
|
F
T
|
T
G
|
G
S
|
S
K
 
L
S
 
E
T
x
V
G
 
G
L
 
L
R
 
K
I
 
I
S
 
Y
E
 
E
R
 
A
A
 
A
S
 
G
V
 
R
V
 
L
Q
 
A
E
 
P
G
 
G
Q
 
Q
H
 
T
F
 
W
L
 
F
K
 
K
R
 
R
V
 
A
I
 
Y
T
 
V
E
|
E
M
 
T
G
|
G
G
 
G
K
 
K
D
 
D
T
 
A
I
 
I
I
 
I
V
 
V
D
 
D
K
 
E
T
 
T
A
 
A
D
 
D
L
 
F
D
 
D
L
 
L
A
 
A
A
 
A
D
 
E
S
 
G
I
 
V
V
 
V
S
 
V
S
 
S
A
 
A
F
 
Y
G
 
G
F
 
F
A
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
C
|
C
S
|
S
A
 
A
G
 
A
S
 
S
R
 
R
A
 
L
V
 
I
I
 
L
H
 
T
E
 
Q
D
 
G
V
 
A
Y
 
Y
D
 
E
E
 
P
V
 
V
L
 
L
K
 
E
K
 
R
A
 
V
V
 
L
E
 
K
L
 
R
T
 
A
E
 
E
E
 
R
L
 
L
T
 
S
V
 
V
G
 
G
N
 
P
P
 
A
V
 
E
D
 
E
E
 
N
T
 
P
Y
 
D
M
 
L
G
 
G
P
 
P
V
 
V
I
 
V
S
 
S
R
 
A
K
 
E
Q
 
Q
F
 
E
D
 
R
M
 
K
I
 
V
K
 
L
G
 
S
Y
 
Y
I
 
I
D
 
E
I
 
I
G
 
G
K
 
K
G
 
N
E
 
E
G
 
G
T
 
Q
L
 
L
K
 
V
I
 
L
G
 
G
G
 
G
E
 
K
T
 
R
D
 
L
D
 
E
S
 
G
K
 
E
G
 
G
Y
 
Y
F
 
F
I
 
I
Q
 
A
P
 
P
T
 
T
I
 
V
F
 
F
A
 
T
D
 
E
L
 
V
D
 
P
P
 
P
K
 
K
A
 
A
R
 
R
I
 
I
M
 
A
Q
 
Q
E
 
E
E
|
E
I
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
V
 
L
A
 
S
F
 
V
A
 
I
K
 
R
A
 
V
K
 
K
D
 
D
F
 
F
D
 
A
E
 
E
L
 
A
L
 
L
E
 
E
I
 
V
A
 
A
N
 
N
N
 
D
T
 
T
V
 
P
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
T
 
T
G
 
G
S
 
G
V
 
V
I
 
Y
T
 
S
N
 
R
T
 
K
R
 
R
E
 
E
N
 
H
W
 
L
I
 
E
K
 
W
A
 
A
Q
 
R
K
 
R
K
 
E
F
 
F
H
 
H
V
 
V
G
 
G
N
 
N
L
 
L
Y
 
Y
L
 
F
N
 
N
R
 
R
G
 
K
C
 
I
T
 
T
A
x
G
A
|
A
V
 
L
M
 
V
G
 
G
Y
 
V
H
 
Q
P
 
P
F
|
F
G
 
G
G
 
G
F
 
F
K
 
K
L
 
L
S
 
S
G
 
G
T
 
T
D
 
N
Q
 
A
K
 
K
T
|
T
G
 
G
S
 
A
P
 
L
D
 
D
Y
 
Y
M
 
L
L
 
R
N
 
L
F
 
F
L
 
L
E
 
E
Q
 
M
K
 
K
V
 
A
V
 
V
S
 
A
E
 
E
M
 
R
F
 
F

2eiiA Crystal analysis of delta1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase from thermus thermophilus with bound l-valine and NAD.
49% identity, 100% coverage: 2:514/514 of query aligns to 3:516/516 of 2eiiA

query
sites
2eiiA
V
 
V
L
 
E
P
 
P
Y
 
F
S
 
R
A
 
N
E
 
E
P
 
P
A
 
I
T
 
E
D
 
T
F
 
F
T
 
Q
Q
 
T
E
 
E
E
 
E
N
 
A
K
 
R
K
 
R
A
 
A
F
 
M
K
 
R
A
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
R
N
 
R
A
 
V
K
 
R
N
 
E
D
 
E
F
 
F
G
 
G
V
 
R
K
 
H
R
 
Y
P
 
P
L
 
L
I
 
Y
I
 
I
G
 
G
G
 
G
E
 
E
H
 
W
I
 
V
E
 
D
T
 
T
D
 
K
D
 
E
Q
 
R
I
 
M
T
 
V
S
 
S
Y
 
L
N
 
N
P
 
P
S
 
S
D
 
A
K
 
P
E
 
S
Q
 
E
A
 
V
V
 
V
G
 
G
H
 
T
V
 
T
S
 
A
K
 
K
A
 
A
T
 
G
Q
 
K
G
 
A
H
 
E
I
 
A
D
 
E
A
 
A
A
 
A
F
 
L
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
G
 
W
E
 
K
A
 
A
F
 
F
E
 
K
T
 
T
W
 
W
S
 
K
E
 
D
W
 
W
D
 
P
P
 
Q
K
 
E
D
 
D
R
 
R
A
 
S
E
 
R
L
 
L
L
 
L
I
 
L
R
 
K
V
 
A
A
 
A
A
 
A
I
 
L
I
 
M
R
 
R
R
 
R
R
 
R
K
 
K
H
 
R
E
 
E
F
 
L
S
 
E
A
 
A
L
 
T
M
 
L
V
 
V
H
 
Y
E
 
E
A
 
V
G
 
G
K
 
K
P
 
N
W
 
W
N
 
V
E
 
E
A
 
A
D
 
S
G
 
A
D
 
D
T
 
V
N
 
A
E
|
E
G
 
A
I
 
I
D
 
D
F
 
F
I
 
I
E
 
E
Y
 
Y
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
S
 
A
M
 
A
M
 
L
E
 
R
L
 
Y
A
 
R
-
 
Y
D
 
P
G
 
A
K
 
V
P
 
E
V
 
V
L
 
V
D
 
P
R
 
Y
E
 
P
G
 
G
E
 
E
H
 
D
N
 
N
K
 
E
Y
 
S
F
 
F
Y
 
Y
Q
 
V
P
 
P
M
 
L
G
 
G
T
 
A
G
 
G
V
 
V
T
 
V
I
|
I
S
x
A
P
|
P
W
|
W
N
|
N
F
|
F
P
 
P
F
 
V
A
 
A
I
|
I
M
 
F
T
 
T
G
 
G
T
 
M
T
 
I
V
 
V
A
 
G
P
 
P
I
 
V
I
 
A
A
 
V
G
 
G
N
 
N
T
 
T
V
 
V
L
 
I
L
 
A
K
|
K
P
 
P
A
 
A
E
|
E
D
 
D
T
 
A
P
 
V
L
 
V
I
 
V
S
 
G
Y
 
A
K
 
K
L
 
V
M
 
F
E
 
E
V
 
I
F
 
F
E
 
H
E
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
F
P
 
P
K
 
P
G
 
G
V
 
V
V
 
V
N
 
N
F
 
F
V
 
L
T
 
P
G
 
G
D
 
V
P
x
G
G
x
E
V
 
E
I
 
V
G
|
G
D
 
A
Y
 
Y
M
 
L
V
 
V
D
 
E
H
 
H
H
 
P
K
 
R
T
 
I
H
 
R
F
 
F
I
 
I
T
 
N
F
|
F
T
|
T
G
|
G
S
|
S
K
 
L
S
 
E
T
x
V
G
 
G
L
 
L
R
 
K
I
 
I
S
 
Y
E
 
E
R
 
A
A
 
A
S
 
G
V
 
R
V
 
L
Q
 
A
E
 
P
G
 
G
Q
 
Q
H
 
T
F
 
W
L
 
F
K
 
K
R
 
R
V
 
A
I
 
Y
T
 
V
E
|
E
M
x
T
G
 
G
G
 
G
K
 
K
D
 
D
T
 
A
I
 
I
I
 
I
V
 
V
D
 
D
K
 
E
T
 
T
A
 
A
D
 
D
L
 
F
D
 
D
L
 
L
A
 
A
A
 
A
D
 
E
S
 
G
I
 
V
V
 
V
S
 
V
S
 
S
A
 
A
F
 
Y
G
 
G
F
 
F
A
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
C
|
C
S
|
S
A
 
A
G
 
A
S
 
S
R
 
R
A
 
L
V
 
I
I
 
L
H
 
T
E
 
Q
D
 
G
V
 
A
Y
 
Y
D
 
E
E
 
P
V
 
V
L
 
L
K
 
E
K
 
R
A
 
V
V
 
L
E
 
K
L
 
R
T
 
A
E
 
E
E
 
R
L
 
L
T
 
S
V
 
V
G
 
G
N
 
P
P
 
A
V
 
E
D
 
E
E
 
N
T
 
P
Y
 
D
M
 
L
G
 
G
P
 
P
V
 
V
I
 
V
S
 
S
R
 
A
K
 
E
Q
 
Q
F
 
E
D
 
R
M
 
K
I
 
V
K
 
L
G
 
S
Y
 
Y
I
 
I
D
 
E
I
 
I
G
 
G
K
 
K
G
 
N
E
 
E
G
 
G
T
 
Q
L
 
L
K
 
V
I
 
L
G
 
G
G
 
G
E
 
K
T
 
R
D
 
L
D
 
E
S
 
G
K
 
E
G
 
G
Y
 
Y
F
 
F
I
 
I
Q
 
A
P
 
P
T
 
T
I
 
V
F
 
F
A
 
T
D
 
E
L
 
V
D
 
P
P
 
P
K
 
K
A
 
A
R
 
R
I
 
I
M
 
A
Q
 
Q
E
 
E
E
|
E
I
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
V
 
L
A
 
S
F
 
V
A
 
I
K
 
R
A
 
V
K
 
K
D
 
D
F
 
F
D
 
A
E
 
E
L
 
A
L
 
L
E
 
E
I
 
V
A
 
A
N
 
N
N
 
D
T
 
T
V
 
P
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
T
 
T
G
 
G
S
 
G
V
 
V
I
 
Y
T
 
S
N
 
R
T
 
K
R
 
R
E
 
E
N
 
H
W
 
L
I
 
E
K
 
W
A
 
A
Q
 
R
K
 
R
K
 
E
F
 
F
H
 
H
V
 
V
G
 
G
N
 
N
L
 
L
Y
 
Y
L
 
F
N
 
N
R
 
R
G
 
K
C
 
I
T
 
T
A
x
G
A
|
A
V
 
L
M
 
V
G
 
G
Y
 
V
H
 
Q
P
 
P
F
|
F
G
 
G
G
 
G
F
 
F
K
 
K
L
 
L
S
 
S
G
 
G
T
 
T
D
 
N
Q
 
A
K
 
K
T
|
T
G
 
G
S
 
A
P
 
L
D
 
D
Y
 
Y
M
 
L
L
 
R
N
 
L
F
 
F
L
 
L
E
 
E
Q
 
M
K
 
K
V
 
A
V
 
V
S
 
A
E
 
E
M
 
R
F
 
F

2ehuA Crystal analysis of 1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase from thermus with bound NAD and inhibitor l-serine
49% identity, 100% coverage: 2:514/514 of query aligns to 3:516/516 of 2ehuA

query
sites
2ehuA
V
 
V
L
 
E
P
 
P
Y
 
F
S
 
R
A
 
N
E
 
E
P
 
P
A
 
I
T
 
E
D
 
T
F
 
F
T
 
Q
Q
 
T
E
 
E
E
 
E
N
 
A
K
 
R
K
 
R
A
 
A
F
 
M
K
 
R
A
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
R
N
 
R
A
 
V
K
 
R
N
 
E
D
 
E
F
 
F
G
 
G
V
 
R
K
 
H
R
 
Y
P
 
P
L
 
L
I
 
Y
I
 
I
G
 
G
G
 
G
E
 
E
H
 
W
I
 
V
E
 
D
T
 
T
D
 
K
D
 
E
Q
 
R
I
 
M
T
 
V
S
 
S
Y
 
L
N
 
N
P
 
P
S
 
S
D
 
A
K
 
P
E
 
S
Q
 
E
A
 
V
V
 
V
G
 
G
H
 
T
V
 
T
S
 
A
K
 
K
A
 
A
T
 
G
Q
 
K
G
 
A
H
 
E
I
 
A
D
 
E
A
 
A
A
 
A
F
 
L
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
G
 
W
E
 
K
A
 
A
F
 
F
E
 
K
T
 
T
W
 
W
S
 
K
E
 
D
W
 
W
D
 
P
P
 
Q
K
 
E
D
 
D
R
 
R
A
 
S
E
 
R
L
 
L
L
 
L
I
 
L
R
 
K
V
 
A
A
 
A
A
 
A
I
 
L
I
 
M
R
 
R
R
 
R
R
 
R
K
 
K
H
 
R
E
 
E
F
 
L
S
 
E
A
 
A
L
 
T
M
 
L
V
 
V
H
 
Y
E
 
E
A
 
V
G
 
G
K
 
K
P
 
N
W
 
W
N
 
V
E
 
E
A
 
A
D
 
S
G
 
A
D
 
D
T
 
V
N
 
A
E
 
E
G
 
A
I
 
I
D
 
D
F
 
F
I
 
I
E
 
E
Y
 
Y
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
S
 
A
M
 
A
M
 
L
E
 
R
L
 
Y
A
 
R
-
 
Y
D
 
P
G
 
A
K
 
V
P
 
E
V
 
V
L
 
V
D
 
P
R
 
Y
E
 
P
G
 
G
E
 
E
H
 
D
N
 
N
K
 
E
Y
 
S
F
 
F
Y
 
Y
Q
 
V
P
 
P
M
 
L
G
 
G
T
 
A
G
 
G
V
 
V
T
 
V
I
|
I
S
x
A
P
|
P
W
|
W
N
|
N
F
|
F
P
 
P
F
 
V
A
 
A
I
|
I
M
 
F
T
 
T
G
 
G
T
 
M
T
 
I
V
 
V
A
 
G
P
 
P
I
 
V
I
 
A
A
 
V
G
 
G
N
 
N
T
 
T
V
 
V
L
 
I
L
 
A
K
|
K
P
 
P
A
 
A
E
|
E
D
 
D
T
 
A
P
 
V
L
 
V
I
 
V
S
 
G
Y
 
A
K
 
K
L
 
V
M
 
F
E
 
E
V
 
I
F
 
F
E
 
H
E
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
F
P
 
P
K
 
P
G
 
G
V
 
V
V
 
V
N
 
N
F
 
F
V
 
L
T
 
P
G
 
G
D
 
V
P
x
G
G
 
E
V
 
E
I
 
V
G
 
G
D
 
A
Y
 
Y
M
 
L
V
 
V
D
 
E
H
 
H
H
 
P
K
 
R
T
 
I
H
 
R
F
 
F
I
 
I
T
 
N
F
|
F
T
|
T
G
|
G
S
|
S
K
 
L
S
 
E
T
x
V
G
 
G
L
 
L
R
 
K
I
 
I
S
 
Y
E
 
E
R
 
A
A
 
A
S
 
G
V
 
R
V
 
L
Q
 
A
E
 
P
G
 
G
Q
 
Q
H
 
T
F
 
W
L
 
F
K
 
K
R
 
R
V
 
A
I
 
Y
T
 
V
E
|
E
M
x
T
G
 
G
G
 
G
K
 
K
D
 
D
T
 
A
I
 
I
I
 
I
V
 
V
D
 
D
K
 
E
T
 
T
A
 
A
D
 
D
L
 
F
D
 
D
L
 
L
A
 
A
A
 
A
D
 
E
S
 
G
I
 
V
V
 
V
S
 
V
S
 
S
A
 
A
F
 
Y
G
 
G
F
 
F
A
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
C
|
C
S
|
S
A
 
A
G
 
A
S
 
S
R
 
R
A
 
L
V
 
I
I
 
L
H
 
T
E
 
Q
D
 
G
V
 
A
Y
 
Y
D
 
E
E
 
P
V
 
V
L
 
L
K
 
E
K
 
R
A
 
V
V
 
L
E
 
K
L
 
R
T
 
A
E
 
E
E
 
R
L
 
L
T
 
S
V
 
V
G
 
G
N
 
P
P
 
A
V
 
E
D
 
E
E
 
N
T
 
P
Y
 
D
M
 
L
G
 
G
P
 
P
V
 
V
I
 
V
S
 
S
R
 
A
K
 
E
Q
 
Q
F
 
E
D
 
R
M
 
K
I
 
V
K
 
L
G
 
S
Y
 
Y
I
 
I
D
 
E
I
 
I
G
 
G
K
 
K
G
 
N
E
 
E
G
 
G
T
 
Q
L
 
L
K
 
V
I
 
L
G
 
G
G
 
G
E
 
K
T
 
R
D
 
L
D
 
E
S
 
G
K
 
E
G
 
G
Y
 
Y
F
 
F
I
 
I
Q
 
A
P
 
P
T
 
T
I
 
V
F
 
F
A
 
T
D
 
E
L
 
V
D
 
P
P
 
P
K
 
K
A
 
A
R
 
R
I
 
I
M
 
A
Q
 
Q
E
 
E
E
|
E
I
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
V
 
L
A
 
S
F
 
V
A
 
I
K
 
R
A
 
V
K
 
K
D
 
D
F
 
F
D
 
A
E
 
E
L
 
A
L
 
L
E
 
E
I
 
V
A
 
A
N
 
N
N
 
D
T
 
T
V
 
P
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
T
 
T
G
 
G
S
 
G
V
 
V
I
 
Y
T
 
S
N
 
R
T
 
K
R
 
R
E
 
E
N
 
H
W
 
L
I
 
E
K
 
W
A
 
A
Q
 
R
K
 
R
K
 
E
F
 
F
H
 
H
V
 
V
G
 
G
N
 
N
L
 
L
Y
 
Y
L
 
F
N
 
N
R
 
R
G
 
K
C
 
I
T
 
T
A
x
G
A
|
A
V
 
L
M
 
V
G
 
G
Y
 
V
H
 
Q
P
 
P
F
|
F
G
 
G
G
 
G
F
 
F
K
 
K
L
 
L
S
 
S
G
 
G
T
 
T
D
 
N
Q
 
A
K
 
K
T
|
T
G
 
G
S
 
A
P
 
L
D
 
D
Y
 
Y
M
 
L
L
 
R
N
 
L
F
 
F
L
 
L
E
 
E
Q
 
M
K
 
K
V
 
A
V
 
V
S
 
A
E
 
E
M
 
R
F
 
F

2ehqA Crystal analysis of 1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase from thermus with bound NADP (see paper)
49% identity, 100% coverage: 2:514/514 of query aligns to 3:516/516 of 2ehqA

query
sites
2ehqA
V
 
V
L
 
E
P
 
P
Y
 
F
S
 
R
A
 
N
E
 
E
P
 
P
A
 
I
T
 
E
D
 
T
F
 
F
T
 
Q
Q
 
T
E
 
E
E
 
E
N
 
A
K
 
R
K
 
R
A
 
A
F
 
M
K
 
R
A
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
R
N
 
R
A
 
V
K
 
R
N
 
E
D
 
E
F
 
F
G
 
G
V
 
R
K
 
H
R
 
Y
P
 
P
L
 
L
I
 
Y
I
 
I
G
 
G
G
 
G
E
 
E
H
 
W
I
 
V
E
 
D
T
 
T
D
 
K
D
 
E
Q
 
R
I
 
M
T
 
V
S
 
S
Y
 
L
N
 
N
P
 
P
S
 
S
D
 
A
K
 
P
E
 
S
Q
 
E
A
 
V
V
 
V
G
 
G
H
 
T
V
 
T
S
 
A
K
 
K
A
 
A
T
 
G
Q
 
K
G
 
A
H
 
E
I
 
A
D
 
E
A
 
A
A
 
A
F
 
L
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
G
 
W
E
 
K
A
 
A
F
 
F
E
 
K
T
 
T
W
 
W
S
 
K
E
 
D
W
 
W
D
 
P
P
 
Q
K
 
E
D
 
D
R
 
R
A
 
S
E
 
R
L
 
L
L
 
L
I
 
L
R
 
K
V
 
A
A
 
A
A
 
A
I
 
L
I
 
M
R
 
R
R
 
R
R
 
R
K
 
K
H
 
R
E
 
E
F
 
L
S
 
E
A
 
A
L
 
T
M
 
L
V
 
V
H
 
Y
E
 
E
A
 
V
G
 
G
K
 
K
P
 
N
W
 
W
N
 
V
E
 
E
A
 
A
D
 
S
G
 
A
D
 
D
T
 
V
N
 
A
E
 
E
G
 
A
I
 
I
D
 
D
F
 
F
I
 
I
E
 
E
Y
 
Y
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
S
 
A
M
 
A
M
 
L
E
 
R
L
 
Y
A
 
R
-
 
Y
D
 
P
G
 
A
K
 
V
P
 
E
V
 
V
L
 
V
D
 
P
R
 
Y
E
 
P
G
 
G
E
 
E
H
 
D
N
 
N
K
 
E
Y
 
S
F
 
F
Y
 
Y
Q
 
V
P
 
P
M
 
L
G
 
G
T
 
A
G
 
G
V
 
V
T
 
V
I
|
I
S
x
A
P
|
P
W
|
W
N
|
N
F
 
F
P
 
P
F
 
V
A
 
A
I
|
I
M
 
F
T
 
T
G
 
G
T
 
M
T
 
I
V
 
V
A
 
G
P
 
P
I
 
V
I
 
A
A
 
V
G
 
G
N
 
N
T
 
T
V
 
V
L
 
I
L
 
A
K
|
K
P
 
P
A
|
A
E
|
E
D
 
D
T
 
A
P
 
V
L
 
V
I
 
V
S
 
G
Y
 
A
K
 
K
L
 
V
M
 
F
E
 
E
V
 
I
F
 
F
E
 
H
E
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
F
P
 
P
K
 
P
G
 
G
V
 
V
V
 
V
N
 
N
F
 
F
V
 
L
T
 
P
G
 
G
D
x
V
P
x
G
G
x
E
V
 
E
I
 
V
G
 
G
D
 
A
Y
 
Y
M
 
L
V
 
V
D
 
E
H
 
H
H
 
P
K
 
R
T
 
I
H
 
R
F
 
F
I
 
I
T
 
N
F
|
F
T
|
T
G
|
G
S
|
S
K
 
L
S
 
E
T
x
V
G
 
G
L
 
L
R
 
K
I
 
I
S
 
Y
E
 
E
R
 
A
A
 
A
S
 
G
V
 
R
V
 
L
Q
 
A
E
 
P
G
 
G
Q
 
Q
H
 
T
F
 
W
L
 
F
K
 
K
R
 
R
V
 
A
I
 
Y
T
 
V
E
|
E
M
x
T
G
 
G
G
 
G
K
 
K
D
 
D
T
 
A
I
 
I
I
 
I
V
 
V
D
 
D
K
 
E
T
 
T
A
 
A
D
 
D
L
 
F
D
 
D
L
 
L
A
 
A
A
 
A
D
 
E
S
 
G
I
 
V
V
 
V
S
 
V
S
 
S
A
 
A
F
 
Y
G
 
G
F
 
F
A
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
C
|
C
S
 
S
A
 
A
G
 
A
S
 
S
R
 
R
A
 
L
V
 
I
I
 
L
H
 
T
E
 
Q
D
 
G
V
 
A
Y
 
Y
D
 
E
E
 
P
V
 
V
L
 
L
K
 
E
K
 
R
A
 
V
V
 
L
E
 
K
L
 
R
T
 
A
E
 
E
E
 
R
L
 
L
T
 
S
V
 
V
G
 
G
N
 
P
P
 
A
V
 
E
D
 
E
E
 
N
T
 
P
Y
 
D
M
 
L
G
 
G
P
 
P
V
 
V
I
 
V
S
 
S
R
 
A
K
 
E
Q
 
Q
F
 
E
D
 
R
M
 
K
I
 
V
K
 
L
G
 
S
Y
 
Y
I
 
I
D
 
E
I
 
I
G
 
G
K
 
K
G
 
N
E
 
E
G
 
G
T
 
Q
L
 
L
K
 
V
I
 
L
G
 
G
G
 
G
E
 
K
T
 
R
D
 
L
D
 
E
S
 
G
K
 
E
G
 
G
Y
 
Y
F
 
F
I
 
I
Q
 
A
P
 
P
T
 
T
I
 
V
F
 
F
A
 
T
D
 
E
L
 
V
D
 
P
P
 
P
K
 
K
A
 
A
R
 
R
I
 
I
M
 
A
Q
 
Q
E
 
E
E
|
E
I
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
V
 
L
A
 
S
F
 
V
A
 
I
K
 
R
A
 
V
K
 
K
D
 
D
F
 
F
D
 
A
E
 
E
L
 
A
L
 
L
E
 
E
I
 
V
A
 
A
N
 
N
N
 
D
T
 
T
V
 
P
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
T
 
T
G
 
G
S
 
G
V
 
V
I
 
Y
T
 
S
N
 
R
T
 
K
R
 
R
E
 
E
N
 
H
W
 
L
I
 
E
K
 
W
A
 
A
Q
 
R
K
 
R
K
 
E
F
 
F
H
 
H
V
 
V
G
 
G
N
 
N
L
 
L
Y
 
Y
L
 
F
N
 
N
R
 
R
G
 
K
C
 
I
T
 
T
A
 
G
A
 
A
V
 
L
M
 
V
G
 
G
Y
 
V
H
 
Q
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
F
 
F
K
 
K
L
 
L
S
 
S
G
 
G
T
 
T
D
 
N
Q
 
A
K
 
K
T
|
T
G
 
G
S
 
A
P
 
L
D
 
D
Y
 
Y
M
 
L
L
 
R
N
 
L
F
 
F
L
 
L
E
 
E
Q
 
M
K
 
K
V
 
A
V
 
V
S
 
A
E
 
E
M
 
R
F
 
F

2bhqA Crystal analysis of 1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase from thermus with bound product glutamate. (see paper)
49% identity, 100% coverage: 2:514/514 of query aligns to 3:516/516 of 2bhqA

query
sites
2bhqA
V
 
V
L
 
E
P
 
P
Y
 
F
S
 
R
A
 
N
E
 
E
P
 
P
A
 
I
T
 
E
D
 
T
F
 
F
T
 
Q
Q
 
T
E
 
E
E
 
E
N
 
A
K
 
R
K
 
R
A
 
A
F
 
M
K
 
R
A
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
R
N
 
R
A
 
V
K
 
R
N
 
E
D
 
E
F
 
F
G
 
G
V
 
R
K
 
H
R
 
Y
P
 
P
L
 
L
I
 
Y
I
 
I
G
 
G
G
 
G
E
 
E
H
 
W
I
 
V
E
 
D
T
 
T
D
 
K
D
 
E
Q
 
R
I
 
M
T
 
V
S
 
S
Y
 
L
N
 
N
P
 
P
S
 
S
D
 
A
K
 
P
E
 
S
Q
 
E
A
 
V
V
 
V
G
 
G
H
 
T
V
 
T
S
 
A
K
 
K
A
 
A
T
 
G
Q
 
K
G
 
A
H
 
E
I
 
A
D
 
E
A
 
A
A
 
A
F
 
L
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
G
 
W
E
 
K
A
 
A
F
 
F
E
 
K
T
 
T
W
 
W
S
 
K
E
 
D
W
 
W
D
 
P
P
 
Q
K
 
E
D
 
D
R
 
R
A
 
S
E
 
R
L
 
L
L
 
L
I
 
L
R
 
K
V
 
A
A
 
A
A
 
A
I
 
L
I
 
M
R
 
R
R
 
R
R
 
R
K
 
K
H
 
R
E
 
E
F
 
L
S
 
E
A
 
A
L
 
T
M
 
L
V
 
V
H
 
Y
E
 
E
A
 
V
G
 
G
K
 
K
P
 
N
W
 
W
N
 
V
E
 
E
A
 
A
D
 
S
G
 
A
D
 
D
T
 
V
N
 
A
E
 
E
G
 
A
I
 
I
D
 
D
F
 
F
I
 
I
E
 
E
Y
 
Y
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
S
 
A
M
 
A
M
 
L
E
 
R
L
 
Y
A
 
R
-
 
Y
D
 
P
G
 
A
K
 
V
P
 
E
V
 
V
L
 
V
D
 
P
R
 
Y
E
 
P
G
 
G
E
 
E
H
 
D
N
 
N
K
 
E
Y
 
S
F
 
F
Y
 
Y
Q
 
V
P
 
P
M
 
L
G
 
G
T
 
A
G
 
G
V
 
V
T
 
V
I
 
I
S
 
A
P
 
P
W
 
W
N
|
N
F
|
F
P
 
P
F
 
V
A
 
A
I
|
I
M
 
F
T
 
T
G
 
G
T
 
M
T
 
I
V
 
V
A
 
G
P
 
P
I
 
V
I
 
A
A
 
V
G
 
G
N
 
N
T
 
T
V
 
V
L
 
I
L
 
A
K
|
K
P
 
P
A
 
A
E
 
E
D
 
D
T
 
A
P
 
V
L
 
V
I
 
V
S
 
G
Y
 
A
K
 
K
L
 
V
M
 
F
E
 
E
V
 
I
F
 
F
E
 
H
E
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
F
P
 
P
K
 
P
G
 
G
V
 
V
V
 
V
N
 
N
F
 
F
V
 
L
T
 
P
G
 
G
D
 
V
P
 
G
G
 
E
V
 
E
I
 
V
G
 
G
D
 
A
Y
 
Y
M
 
L
V
 
V
D
 
E
H
 
H
H
 
P
K
 
R
T
 
I
H
 
R
F
 
F
I
 
I
T
 
N
F
 
F
T
 
T
G
 
G
S
 
S
K
 
L
S
 
E
T
 
V
G
 
G
L
 
L
R
 
K
I
 
I
S
 
Y
E
 
E
R
 
A
A
 
A
S
 
G
V
 
R
V
 
L
Q
 
A
E
 
P
G
 
G
Q
 
Q
H
 
T
F
 
W
L
 
F
K
 
K
R
 
R
V
 
A
I
 
Y
T
 
V
E
|
E
M
 
T
G
 
G
G
 
G
K
 
K
D
 
D
T
 
A
I
 
I
I
 
I
V
 
V
D
 
D
K
 
E
T
 
T
A
 
A
D
 
D
L
 
F
D
 
D
L
 
L
A
 
A
A
 
A
D
 
E
S
 
G
I
 
V
V
 
V
S
 
V
S
 
S
A
 
A
F
 
Y
G
 
G
F
 
F
A
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
K
|
K
C
|
C
S
|
S
A
 
A
G
 
A
S
 
S
R
 
R
A
 
L
V
 
I
I
 
L
H
 
T
E
 
Q
D
 
G
V
 
A
Y
 
Y
D
 
E
E
 
P
V
 
V
L
 
L
K
 
E
K
 
R
A
 
V
V
 
L
E
 
K
L
 
R
T
 
A
E
 
E
E
 
R
L
 
L
T
 
S
V
 
V
G
 
G
N
 
P
P
 
A
V
 
E
D
 
E
E
 
N
T
 
P
Y
 
D
M
 
L
G
 
G
P
 
P
V
 
V
I
 
V
S
 
S
R
 
A
K
 
E
Q
 
Q
F
 
E
D
 
R
M
 
K
I
 
V
K
 
L
G
 
S
Y
 
Y
I
 
I
D
 
E
I
 
I
G
 
G
K
 
K
G
 
N
E
 
E
G
 
G
T
 
Q
L
 
L
K
 
V
I
 
L
G
 
G
G
 
G
E
 
K
T
 
R
D
 
L
D
 
E
S
 
G
K
 
E
G
 
G
Y
 
Y
F
 
F
I
 
I
Q
 
A
P
 
P
T
 
T
I
 
V
F
 
F
A
 
T
D
 
E
L
 
V
D
 
P
P
 
P
K
 
K
A
 
A
R
 
R
I
 
I
M
 
A
Q
 
Q
E
 
E
E
|
E
I
 
I
F
 
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
V
 
L
A
 
S
F
 
V
A
 
I
K
 
R
A
 
V
K
 
K
D
 
D
F
 
F
D
 
A
E
 
E
L
 
A
L
 
L
E
 
E
I
 
V
A
 
A
N
 
N
N
 
D
T
 
T
V
 
P
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
T
 
T
G
 
G
S
 
G
V
 
V
I
 
Y
T
 
S
N
 
R
T
 
K
R
 
R
E
 
E
N
 
H
W
 
L
I
 
E
K
 
W
A
 
A
Q
 
R
K
 
R
K
 
E
F
 
F
H
 
H
V
 
V
G
 
G
N
 
N
L
 
L
Y
 
Y
L
 
F
N
 
N
R
 
R
G
 
K
C
 
I
T
|
T
A
x
G
A
|
A
V
 
L
M
 
V
G
 
G
Y
 
V
H
 
Q
P
 
P
F
|
F
G
 
G
G
 
G
F
 
F
K
 
K
L
 
L
S
 
S
G
 
G
T
 
T
D
 
N
Q
 
A
K
 
K
T
|
T
G
 
G
S
 
A
P
 
L
D
 
D
Y
 
Y
M
 
L
L
 
R
N
 
L
F
 
F
L
 
L
E
 
E
Q
 
M
K
 
K
V
 
A
V
 
V
S
 
A
E
 
E
M
 
R
F
 
F

2bhpA Crystal analysis of 1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase from thermus with bound NAD. (see paper)
49% identity, 100% coverage: 2:514/514 of query aligns to 3:516/516 of 2bhpA

query
sites
2bhpA
V
 
V
L
 
E
P
 
P
Y
 
F
S
 
R
A
 
N
E
 
E
P
 
P
A
 
I
T
 
E
D
 
T
F
 
F
T
 
Q
Q
 
T
E
 
E
E
 
E
N
 
A
K
 
R
K
 
R
A
 
A
F
 
M
K
 
R
A
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
R
N
 
R
A
 
V
K
 
R
N
 
E
D
 
E
F
 
F
G
 
G
V
 
R
K
 
H
R
 
Y
P
 
P
L
 
L
I
 
Y
I
 
I
G
 
G
G
 
G
E
 
E
H
 
W
I
 
V
E
 
D
T
 
T
D
 
K
D
 
E
Q
 
R
I
 
M
T
 
V
S
 
S
Y
 
L
N
 
N
P
 
P
S
 
S
D
 
A
K
 
P
E
 
S
Q
 
E
A
 
V
V
 
V
G
 
G
H
 
T
V
 
T
S
 
A
K
 
K
A
 
A
T
 
G
Q
 
K
G
 
A
H
 
E
I
 
A
D
 
E
A
 
A
A
 
A
F
 
L
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
G
 
W
E
 
K
A
 
A
F
 
F
E
 
K
T
 
T
W
 
W
S
 
K
E
 
D
W
 
W
D
 
P
P
 
Q
K
 
E
D
 
D
R
 
R
A
 
S
E
 
R
L
 
L
L
 
L
I
 
L
R
 
K
V
 
A
A
 
A
A
 
A
I
 
L
I
 
M
R
 
R
R
 
R
R
 
R
K
 
K
H
 
R
E
 
E
F
 
L
S
 
E
A
 
A
L
 
T
M
 
L
V
 
V
H
 
Y
E
 
E
A
 
V
G
 
G
K
 
K
P
 
N
W
 
W
N
 
V
E
 
E
A
 
A
D
 
S
G
 
A
D
 
D
T
 
V
N
 
A
E
 
E
G
 
A
I
 
I
D
 
D
F
 
F
I
 
I
E
 
E
Y
 
Y
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
S
 
A
M
 
A
M
 
L
E
 
R
L
 
Y
A
 
R
-
 
Y
D
 
P
G
 
A
K
 
V
P
 
E
V
 
V
L
 
V
D
 
P
R
 
Y
E
 
P
G
 
G
E
 
E
H
 
D
N
 
N
K
 
E
Y
 
S
F
 
F
Y
 
Y
Q
 
V
P
 
P
M
 
L
G
 
G
T
 
A
G
 
G
V
 
V
T
 
V
I
|
I
S
x
A
P
|
P
W
|
W
N
|
N
F
 
F
P
 
P
F
 
V
A
 
A
I
|
I
M
 
F
T
 
T
G
 
G
T
 
M
T
 
I
V
 
V
A
 
G
P
 
P
I
 
V
I
 
A
A
 
V
G
 
G
N
 
N
T
 
T
V
 
V
L
 
I
L
 
A
K
|
K
P
 
P
A
 
A
E
|
E
D
 
D
T
 
A
P
 
V
L
 
V
I
 
V
S
 
G
Y
 
A
K
 
K
L
 
V
M
 
F
E
 
E
V
 
I
F
 
F
E
 
H
E
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
F
P
 
P
K
 
P
G
 
G
V
 
V
V
 
V
N
 
N
F
 
F
V
 
L
T
 
P
G
 
G
D
 
V
P
x
G
G
x
E
V
 
E
I
 
V
G
 
G
D
 
A
Y
 
Y
M
 
L
V
 
V
D
 
E
H
 
H
H
 
P
K
 
R
T
 
I
H
 
R
F
 
F
I
 
I
T
 
N
F
|
F
T
|
T
G
|
G
S
|
S
K
 
L
S
 
E
T
x
V
G
 
G
L
 
L
R
 
K
I
 
I
S
 
Y
E
 
E
R
 
A
A
 
A
S
 
G
V
 
R
V
 
L
Q
 
A
E
 
P
G
 
G
Q
 
Q
H
 
T
F
 
W
L
 
F
K
 
K
R
 
R
V
 
A
I
 
Y
T
 
V
E
|
E
M
x
T
G
 
G
G
 
G
K
 
K
D
 
D
T
 
A
I
 
I
I
 
I
V
 
V
D
 
D
K
 
E
T
 
T
A
 
A
D
 
D
L
 
F
D
 
D
L
 
L
A
 
A
A
 
A
D
 
E
S
 
G
I
 
V
V
 
V
S
 
V
S
 
S
A
 
A
F
 
Y
G
 
G
F
 
F
A
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
C
|
C
S
 
S
A
 
A
G
 
A
S
 
S
R
 
R
A
 
L
V
 
I
I
 
L
H
 
T
E
 
Q
D
 
G
V
 
A
Y
 
Y
D
 
E
E
 
P
V
 
V
L
 
L
K
 
E
K
 
R
A
 
V
V
 
L
E
 
K
L
 
R
T
 
A
E
 
E
E
 
R
L
 
L
T
 
S
V
 
V
G
 
G
N
 
P
P
 
A
V
 
E
D
 
E
E
 
N
T
 
P
Y
 
D
M
 
L
G
 
G
P
 
P
V
 
V
I
 
V
S
 
S
R
 
A
K
 
E
Q
 
Q
F
 
E
D
 
R
M
 
K
I
 
V
K
 
L
G
 
S
Y
 
Y
I
 
I
D
 
E
I
 
I
G
 
G
K
 
K
G
 
N
E
 
E
G
 
G
T
 
Q
L
 
L
K
 
V
I
 
L
G
 
G
G
 
G
E
 
K
T
 
R
D
 
L
D
 
E
S
 
G
K
 
E
G
 
G
Y
 
Y
F
 
F
I
 
I
Q
 
A
P
 
P
T
 
T
I
 
V
F
 
F
A
 
T
D
 
E
L
 
V
D
 
P
P
 
P
K
 
K
A
 
A
R
 
R
I
 
I
M
 
A
Q
 
Q
E
 
E
E
|
E
I
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
V
 
L
A
 
S
F
 
V
A
 
I
K
 
R
A
 
V
K
 
K
D
 
D
F
 
F
D
 
A
E
 
E
L
 
A
L
 
L
E
 
E
I
 
V
A
 
A
N
 
N
N
 
D
T
 
T
V
 
P
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
T
 
T
G
 
G
S
 
G
V
 
V
I
 
Y
T
 
S
N
 
R
T
 
K
R
 
R
E
 
E
N
 
H
W
 
L
I
 
E
K
 
W
A
 
A
Q
 
R
K
 
R
K
 
E
F
 
F
H
 
H
V
 
V
G
 
G
N
 
N
L
 
L
Y
 
Y
L
 
F
N
 
N
R
 
R
G
 
K
C
 
I
T
 
T
A
 
G
A
 
A
V
 
L
M
 
V
G
 
G
Y
 
V
H
 
Q
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
F
 
F
K
 
K
L
 
L
S
 
S
G
 
G
T
 
T
D
 
N
Q
 
A
K
 
K
T
|
T
G
 
G
S
 
A
P
 
L
D
 
D
Y
 
Y
M
 
L
L
 
R
N
 
L
F
 
F
L
 
L
E
 
E
Q
 
M
K
 
K
V
 
A
V
 
V
S
 
A
E
 
E
M
 
R
F
 
F

2eiwA Crystal analysis of delta1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase from thermus thermophilus with bound l-proline
49% identity, 100% coverage: 2:514/514 of query aligns to 3:516/516 of 2eiwA

query
sites
2eiwA
V
 
V
L
 
E
P
 
P
Y
 
F
S
 
R
A
 
N
E
 
E
P
 
P
A
 
I
T
 
E
D
 
T
F
 
F
T
 
Q
Q
 
T
E
 
E
E
 
E
N
 
A
K
 
R
K
 
R
A
 
A
F
 
M
K
 
R
A
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
R
N
 
R
A
 
V
K
 
R
N
 
E
D
 
E
F
 
F
G
 
G
V
 
R
K
 
H
R
 
Y
P
 
P
L
 
L
I
 
Y
I
 
I
G
 
G
G
 
G
E
 
E
H
 
W
I
 
V
E
 
D
T
 
T
D
 
K
D
 
E
Q
 
R
I
 
M
T
 
V
S
 
S
Y
 
L
N
 
N
P
 
P
S
 
S
D
 
A
K
 
P
E
 
S
Q
 
E
A
 
V
V
 
V
G
 
G
H
 
T
V
 
T
S
 
A
K
 
K
A
 
A
T
 
G
Q
 
K
G
 
A
H
 
E
I
 
A
D
 
E
A
 
A
A
 
A
F
 
L
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
G
 
W
E
 
K
A
 
A
F
 
F
E
 
K
T
 
T
W
 
W
S
 
K
E
 
D
W
 
W
D
 
P
P
 
Q
K
 
E
D
 
D
R
 
R
A
 
S
E
 
R
L
 
L
L
 
L
I
 
L
R
 
K
V
 
A
A
 
A
A
 
A
I
 
L
I
 
M
R
 
R
R
 
R
R
 
R
K
 
K
H
 
R
E
 
E
F
 
L
S
 
E
A
 
A
L
 
T
M
 
L
V
 
V
H
 
Y
E
 
E
A
 
V
G
 
G
K
 
K
P
 
N
W
 
W
N
 
V
E
 
E
A
 
A
D
 
S
G
 
A
D
 
D
T
 
V
N
 
A
E
|
E
G
 
A
I
 
I
D
 
D
F
 
F
I
 
I
E
 
E
Y
 
Y
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
S
 
A
M
 
A
M
 
L
E
 
R
L
 
Y
A
 
R
-
 
Y
D
 
P
G
 
A
K
 
V
P
 
E
V
 
V
L
 
V
D
 
P
R
 
Y
E
 
P
G
 
G
E
 
E
H
 
D
N
 
N
K
 
E
Y
 
S
F
 
F
Y
 
Y
Q
 
V
P
 
P
M
 
L
G
 
G
T
 
A
G
 
G
V
 
V
T
 
V
I
 
I
S
 
A
P
 
P
W
 
W
N
|
N
F
|
F
P
 
P
F
 
V
A
 
A
I
 
I
M
 
F
T
 
T
G
 
G
T
 
M
T
 
I
V
 
V
A
 
G
P
 
P
I
 
V
I
 
A
A
 
V
G
 
G
N
 
N
T
 
T
V
 
V
L
 
I
L
 
A
K
|
K
P
 
P
A
 
A
E
 
E
D
 
D
T
 
A
P
 
V
L
 
V
I
 
V
S
 
G
Y
 
A
K
 
K
L
 
V
M
 
F
E
 
E
V
 
I
F
 
F
E
 
H
E
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
F
P
 
P
K
 
P
G
 
G
V
 
V
V
 
V
N
 
N
F
 
F
V
 
L
T
 
P
G
 
G
D
 
V
P
 
G
G
 
E
V
 
E
I
 
V
G
 
G
D
 
A
Y
 
Y
M
 
L
V
 
V
D
 
E
H
 
H
H
 
P
K
 
R
T
 
I
H
 
R
F
&