SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_017548686.1 NCBI__GCF_000330705.1:WP_017548686.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1nfqA Rv2002 gene product from mycobacterium tuberculosis (see paper)
47% identity, 99% coverage: 2:242/243 of query aligns to 2:239/244 of 1nfqA

query
sites
1nfqA
G
 
G
R
 
R
V
 
L
N
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
V
V
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
S
G
 
G
G
 
G
T
 
A
G
x
R
G
|
G
M
|
M
G
 
G
A
 
A
S
 
S
H
 
H
V
 
V
K
 
R
K
 
A
F
 
M
V
 
V
S
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
V
 
V
F
 
F
T
 
G
D
|
D
L
 
I
D
x
L
E
 
D
G
 
E
A
 
E
G
 
G
R
 
K
V
 
A
L
 
M
Q
 
A
D
 
A
E
 
E
M
 
L
G
 
A
P
 
D
Q
 
A
S
 
A
L
 
R
F
 
Y
I
 
V
K
 
H
Q
x
L
D
|
D
V
|
V
T
 
T
D
 
Q
S
 
P
E
 
A
S
 
Q
W
 
W
N
 
K
K
 
A
V
 
A
I
 
V
V
 
D
E
 
T
T
 
A
E
 
V
K
 
T
N
 
A
L
 
F
G
 
G
P
 
G
V
 
L
N
 
H
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
V
 
I
N
x
L
Y
 
N
S
 
I
E
 
G
E
 
T
T
 
I
E
 
E
A
 
D
F
 
Y
P
 
A
E
 
L
D
 
T
E
 
E
Y
 
W
D
 
Q
R
 
R
V
 
I
I
 
L
E
 
D
V
 
V
N
 
N
Q
 
L
K
 
T
A
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
L
G
 
G
M
 
I
K
 
R
A
 
A
V
 
V
I
 
V
P
 
K
S
 
P
M
 
M
K
 
K
K
 
E
A
 
A
A
 
G
S
 
R
G
 
G
S
 
S
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
|
I
S
 
S
S
|
S
I
 
I
G
x
E
G
 
G
I
 
L
R
 
A
G
 
G
R
 
T
M
 
V
E
 
A
S
x
C
V
 
H
A
 
G
Y
|
Y
S
 
T
A
 
A
S
 
T
K
|
K
F
 
F
A
 
A
V
 
V
T
 
R
G
 
G
M
 
L
T
 
T
K
 
K
V
 
S
G
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
L
G
 
G
K
 
P
Y
 
S
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
S
 
S
V
 
I
H
 
H
P
|
P
S
 
G
L
 
L
V
|
V
N
 
K
T
|
T
G
x
P
L
x
M
F
x
T
S
 
D
E
 
W
S
 
-
T
 
-
G
 
-
G
 
-
K
 
-
A
 
-
V
|
V
A
 
P
S
 
E
D
 
D
-
x
I
-
x
F
-
 
Q
R
 
T
P
 
A
L
 
L
G
 
G
R
 
R
V
 
A
L
 
A
T
 
E
K
 
P
E
 
V
E
 
E
V
 
V
S
 
S
A
 
N
L
 
L
V
 
V
L
 
V
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
E
S
 
S
S
 
S
Y
 
Y
T
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
E
 
E
H
 
F
V
 
V
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
T
T
 
V
A
 
A

1nffA Crystal structure of rv2002 gene product from mycobacterium tuberculosis (see paper)
47% identity, 99% coverage: 2:242/243 of query aligns to 2:239/244 of 1nffA

query
sites
1nffA
G
 
G
R
 
R
V
 
L
N
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
V
V
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
S
G
|
G
G
 
G
T
 
A
G
x
R
G
|
G
M
|
M
G
 
G
A
 
A
S
 
S
H
 
H
V
 
V
K
 
R
K
 
A
F
 
M
V
 
V
S
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
V
 
V
F
 
F
T
 
G
D
|
D
L
x
I
D
x
L
E
 
D
G
 
E
A
 
E
G
 
G
R
 
K
V
 
A
L
 
M
Q
 
A
D
 
A
E
 
E
M
 
L
G
 
A
P
 
D
Q
 
A
S
 
A
L
 
R
F
 
Y
I
 
V
K
 
H
Q
x
L
D
|
D
V
|
V
T
 
T
D
 
Q
S
 
P
E
 
A
S
 
Q
W
 
W
N
 
K
K
 
A
V
 
A
I
 
V
V
 
D
E
 
T
T
 
A
E
 
V
K
 
T
N
 
A
L
 
F
G
 
G
P
 
G
V
 
L
N
 
H
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
x
I
N
 
L
Y
 
N
S
 
I
E
 
G
E
 
T
T
 
I
E
 
E
A
 
D
F
 
Y
P
 
A
E
 
L
D
 
T
E
 
E
Y
 
W
D
 
Q
R
 
R
V
 
I
I
 
L
E
 
D
V
 
V
N
 
N
Q
 
L
K
 
T
A
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
L
G
 
G
M
 
I
K
 
R
A
 
A
V
 
V
I
 
V
P
 
K
S
 
P
M
 
M
K
 
K
K
 
E
A
 
A
A
 
G
S
 
R
G
 
G
S
 
S
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
|
I
S
 
S
S
|
S
I
 
I
G
 
E
G
 
G
I
 
L
R
 
A
G
 
G
R
 
T
M
 
V
E
 
A
S
 
C
V
 
H
A
 
G
Y
|
Y
S
 
T
A
 
A
S
 
T
K
|
K
F
 
F
A
 
A
V
 
V
T
 
R
G
 
G
M
 
L
T
 
T
K
 
K
V
 
S
G
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
L
G
 
G
K
 
P
Y
 
S
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
S
 
S
V
 
I
H
 
H
P
|
P
S
 
G
L
 
L
V
|
V
N
 
K
T
|
T
G
x
P
L
x
M
F
x
T
S
 
D
E
 
W
S
 
-
T
 
-
G
 
-
G
 
-
K
 
-
A
 
-
V
 
V
A
 
P
S
 
E
D
 
D
-
 
I
-
 
F
-
 
Q
R
 
T
P
 
A
L
 
L
G
 
G
R
 
R
V
 
A
L
 
A
T
 
E
K
 
P
E
 
V
E
 
E
V
 
V
S
 
S
A
 
N
L
 
L
V
 
V
L
 
V
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
E
S
 
S
S
 
S
Y
 
Y
T
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
E
 
E
H
 
F
V
 
V
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
T
T
 
V
A
 
A

P9WGT1 3-alpha-(or 20-beta)-hydroxysteroid dehydrogenase; NADH-dependent 3alpha, 20beta-hydroxysteroid dehydrogenase; EC 1.1.1.53 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see paper)
47% identity, 99% coverage: 2:242/243 of query aligns to 3:240/260 of P9WGT1

query
sites
P9WGT1
G
 
G
R
 
R
V
 
L
N
x
I
G
 
G
K
 
K
V
 
V
V
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
S
G
 
G
G
 
G
T
 
A
G
x
R
G
|
G
M
|
M
G
 
G
A
 
A
S
 
S
H
 
H
V
 
V
K
 
R
K
 
A
F
 
M
V
 
V
S
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
V
 
V
F
 
F
T
 
G
D
|
D
L
 
I
D
 
L
E
 
D
G
 
E
A
 
E
G
 
G
R
 
K
V
 
A
L
x
V
Q
 
A
D
 
A
E
 
E
M
 
L
G
 
A
P
 
D
Q
 
A
S
 
A
L
 
R
F
 
Y
I
 
V
K
 
H
Q
 
L
D
|
D
V
|
V
T
 
T
D
 
Q
S
 
P
E
 
A
S
 
Q
W
 
W
N
x
T
K
 
A
V
 
A
I
 
V
V
 
D
E
 
T
T
 
A
E
 
V
K
 
T
N
 
A
L
 
F
G
 
G
P
 
G
V
 
L
N
 
H
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
N
 
L
Y
 
N
S
 
I
E
 
G
E
 
T
T
 
I
E
 
E
A
 
D
F
 
Y
P
 
A
E
 
L
D
 
T
E
 
E
Y
 
W
D
 
Q
R
 
R
V
 
I
I
 
L
E
 
D
V
 
V
N
 
N
Q
 
L
K
 
T
A
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
L
G
 
G
M
 
I
K
 
R
A
 
A
V
 
V
I
 
V
P
 
K
S
 
P
M
 
M
K
 
K
K
 
E
A
 
A
A
 
G
S
 
R
G
 
G
S
 
S
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
I
S
 
S
S
|
S
I
 
I
G
 
E
G
 
G
I
 
L
R
 
A
G
 
G
R
 
T
M
 
V
E
 
A
S
 
C
V
 
H
A
 
G
Y
|
Y
S
 
T
A
 
A
S
 
T
K
|
K
F
 
F
A
 
A
V
 
V
T
 
R
G
 
G
M
 
L
T
 
T
K
 
K
V
 
S
G
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
L
G
 
G
K
 
P
Y
 
S
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
S
 
S
V
 
I
H
 
H
P
|
P
S
x
G
L
|
L
V
|
V
N
x
K
T
|
T
G
x
P
L
x
M
F
x
T
S
 
D
E
 
W
S
 
-
T
 
-
G
 
-
G
 
-
K
 
-
A
 
-
V
 
V
A
 
P
S
 
E
D
 
D
-
 
I
-
 
F
-
 
Q
R
 
T
P
 
A
L
 
L
G
 
G
R
 
R
V
 
A
L
 
A
T
 
E
K
 
P
E
 
V
E
 
E
V
 
V
S
 
S
A
 
N
L
 
L
V
 
V
L
 
V
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
E
S
 
S
S
 
S
Y
 
Y
T
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
E
 
E
H
 
F
V
 
V
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
T
T
 
V
A
 
A

7ejhA Crystal structure of kred mutant-f147l/l153q/y190p/l199a/m205f/m206f and 2-hydroxyisoindoline-1,3-dione complex
41% identity, 99% coverage: 3:243/243 of query aligns to 5:253/253 of 7ejhA

query
sites
7ejhA
R
 
R
V
 
L
N
 
K
G
 
G
K
 
K
V
 
V
V
 
A
I
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
T
|
T
G
 
L
G
 
G
M
x
I
G
 
G
A
 
L
S
 
A
H
 
I
V
 
A
K
 
D
K
 
K
F
 
F
V
 
V
S
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
V
 
V
F
 
I
T
 
T
D
 
G
L
x
R
D
x
H
E
 
A
G
 
D
A
 
V
G
 
G
R
 
E
V
 
K
L
 
A
Q
 
A
D
 
K
E
 
S
M
 
I
G
 
G
P
 
G
Q
 
T
S
 
D
L
 
V
-
 
I
-
 
R
F
 
F
I
 
V
K
 
Q
Q
 
H
D
|
D
V
x
A
T
 
S
D
 
D
S
 
E
E
 
A
S
 
G
W
 
W
N
 
T
K
 
K
V
 
L
I
 
F
V
 
D
E
 
T
T
 
T
E
 
E
K
 
E
N
 
A
L
 
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
N
 
T
V
 
T
L
 
V
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
V
 
I
N
 
A
Y
 
V
S
 
S
E
 
K
E
 
S
T
 
V
E
 
E
A
 
D
F
 
T
P
 
T
E
 
T
D
 
E
E
 
E
Y
 
W
D
 
R
R
 
K
V
 
L
I
 
L
E
 
S
V
|
V
N
 
N
Q
 
L
K
 
D
A
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
F
G
 
G
M
 
T
K
 
R
A
 
L
V
 
G
I
 
I
P
 
Q
S
 
R
M
 
M
K
 
K
-
 
N
K
 
K
A
 
G
A
 
L
S
 
G
G
 
A
S
 
S
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
x
M
S
 
S
S
|
S
I
|
I
G
x
E
G
 
G
I
 
L
R
 
V
G
 
G
R
 
D
M
 
P
E
 
T
S
 
Q
V
 
G
A
 
A
Y
|
Y
S
 
N
A
 
A
S
 
S
K
|
K
F
 
G
A
 
A
V
 
V
T
 
R
G
 
I
M
 
M
T
 
S
K
 
K
V
 
S
G
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
D
-
 
C
-
 
A
L
 
L
G
 
K
K
 
D
Y
 
Y
G
 
D
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
S
 
T
V
 
V
H
 
H
P
|
P
S
x
G
L
x
P
V
x
I
N
 
K
T
|
T
G
x
P
L
|
L
F
x
V
S
 
D
E
 
D
S
 
A
T
 
E
G
 
G
G
 
A
K
 
E
A
 
E
V
 
F
A
x
F
S
 
S
D
 
Q
R
 
R
-
 
T
-
 
K
-
 
T
P
 
P
L
 
M
G
 
G
R
 
H
V
 
I
L
 
G
T
 
E
K
 
P
E
 
N
E
 
D
V
 
I
S
 
A
A
 
W
L
 
I
V
 
C
L
 
V
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
E
S
 
S
S
 
K
Y
 
F
T
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
A
E
 
E
H
 
F
V
 
V
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
Y
T
 
T
A
 
A
R
 
Q

7ejiB Crystal structure of kred f147l/l153q/y190p/l199a/m205f/m206f variant and methyl methacrylate complex
41% identity, 99% coverage: 3:243/243 of query aligns to 3:251/251 of 7ejiB

query
sites
7ejiB
R
 
R
V
 
L
N
 
K
G
 
G
K
 
K
V
 
V
V
 
A
I
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
T
|
T
G
x
L
G
|
G
M
x
I
G
 
G
A
 
L
S
 
A
H
 
I
V
 
A
K
 
D
K
 
K
F
 
F
V
 
V
S
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
V
 
V
F
 
I
T
 
T
D
 
G
L
x
R
D
x
H
E
 
A
G
 
D
A
 
V
G
 
G
R
 
E
V
 
K
L
 
A
Q
 
A
D
 
K
E
 
S
M
 
I
G
 
G
P
 
G
Q
 
T
S
 
D
L
 
V
-
 
I
-
 
R
F
 
F
I
 
V
K
 
Q
Q
 
H
D
|
D
V
x
A
T
 
S
D
 
D
S
 
E
E
 
A
S
 
G
W
 
W
N
 
T
K
 
K
V
 
L
I
 
F
V
 
D
E
 
T
T
 
T
E
 
E
K
 
E
N
 
A
L
 
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
N
 
T
V
 
T
L
 
V
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
V
 
I
N
 
A
Y
 
V
S
 
S
E
 
K
E
 
S
T
 
V
E
 
E
A
 
D
F
 
T
P
 
T
E
 
T
D
 
E
E
 
E
Y
 
W
D
 
R
R
 
K
V
 
L
I
 
L
E
 
S
V
|
V
N
 
N
Q
 
L
K
 
D
A
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
F
G
 
G
M
 
T
K
 
R
A
 
L
V
 
G
I
 
I
P
 
Q
S
 
R
M
 
M
K
 
K
-
 
N
K
 
K
A
 
G
A
 
L
S
 
G
G
 
A
S
 
S
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
x
M
S
 
S
S
|
S
I
|
I
G
 
E
G
 
G
I
 
L
R
 
V
G
 
G
R
 
D
M
 
P
E
 
T
S
 
Q
V
 
G
A
 
A
Y
|
Y
S
 
N
A
 
A
S
 
S
K
|
K
F
 
G
A
 
A
V
 
V
T
 
R
G
 
I
M
 
M
T
 
S
K
 
K
V
 
S
G
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
D
-
 
C
-
 
A
L
 
L
G
 
K
K
 
D
Y
 
Y
G
 
D
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
S
 
T
V
 
V
H
 
H
P
|
P
S
 
G
L
x
P
V
x
I
N
 
K
T
|
T
G
x
P
L
|
L
F
 
V
S
 
D
E
 
D
S
 
A
T
 
E
G
 
G
G
 
A
K
 
E
A
 
E
V
 
F
A
x
F
S
 
S
D
 
Q
R
 
R
-
 
T
-
 
K
-
 
T
P
 
P
L
 
M
G
 
G
R
 
H
V
 
I
L
 
G
T
 
E
K
 
P
E
 
N
E
 
D
V
 
I
S
 
A
A
 
W
L
 
I
V
 
C
L
 
V
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
E
S
 
S
S
 
K
Y
 
F
T
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
A
E
 
E
H
 
F
V
 
V
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
Y
T
 
T
A
 
A
R
 
Q

1zk1A Structure of r-specific alcohol dehydrogenase (mutant g37d) from lactobacillus brevis in complex with phenylethanol and NAD (see paper)
41% identity, 99% coverage: 3:243/243 of query aligns to 3:251/251 of 1zk1A

query
sites
1zk1A
R
 
R
V
 
L
N
 
D
G
 
G
K
 
K
V
 
V
V
 
A
I
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
T
 
T
G
x
L
G
|
G
M
x
I
G
 
G
A
 
L
S
 
A
H
 
I
V
 
A
K
 
T
K
 
K
F
 
F
V
 
V
S
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
V
 
M
F
 
I
T
 
T
D
|
D
L
 
R
D
 
H
E
 
S
G
 
D
A
 
V
G
 
G
R
 
E
V
 
K
L
 
A
Q
 
A
D
 
K
E
 
S
M
 
V
G
 
G
P
 
T
-
 
P
-
 
D
Q
 
Q
S
 
I
L
 
Q
F
 
F
I
 
F
K
 
Q
Q
x
H
D
|
D
V
x
S
T
 
S
D
 
D
S
 
E
E
 
D
S
 
G
W
 
W
N
 
T
K
 
K
V
 
L
I
 
F
V
 
D
E
 
A
T
 
T
E
 
E
K
 
K
N
 
A
L
 
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
N
 
S
V
 
T
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
V
x
I
N
x
A
Y
 
V
S
x
N
E
 
K
E
 
S
T
 
V
E
 
E
A
 
E
F
 
T
P
 
T
E
 
T
D
 
A
E
 
E
Y
 
W
D
 
R
R
 
K
V
 
L
I
 
L
E
 
A
V
 
V
N
 
N
Q
 
L
K
 
D
A
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
F
G
 
G
M
 
T
K
 
R
A
 
L
V
 
G
I
 
I
P
 
Q
S
 
R
M
 
M
K
 
K
-
 
N
K
 
K
A
 
G
A
 
L
S
 
G
G
 
A
S
 
S
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
x
M
S
 
S
S
|
S
I
 
I
G
 
E
G
 
G
I
 
F
R
 
V
G
 
G
R
 
D
M
 
P
E
 
S
S
 
L
V
 
G
A
 
A
Y
|
Y
S
 
N
A
 
A
S
 
S
K
|
K
F
 
G
A
 
A
V
 
V
T
 
R
G
 
I
M
 
M
T
 
S
K
 
K
V
 
S
G
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
D
-
 
C
-
 
A
L
 
L
G
 
K
K
 
D
Y
 
Y
G
 
D
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
S
 
T
V
 
V
H
 
H
P
 
P
S
x
G
L
x
Y
V
x
I
N
 
K
T
 
T
G
 
P
L
|
L
F
 
V
S
 
D
E
 
D
S
 
L
T
 
P
G
 
G
G
 
A
K
 
E
A
 
E
V
 
A
A
 
M
S
 
S
D
 
Q
R
 
R
-
 
T
-
 
K
-
 
T
P
 
P
L
 
M
G
 
G
R
 
H
V
 
I
L
 
G
T
 
E
K
 
P
E
 
N
E
 
D
V
 
I
S
 
A
A
 
Y
L
 
I
V
 
C
L
 
V
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
N
E
 
E
S
 
S
S
 
K
Y
 
F
T
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
S
E
 
E
H
 
F
V
 
V
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
Y
T
 
T
A
 
A
R
 
Q

1zjzA Structure of r-specific alcohol dehydrogenase (mutant g37d) from lactobacillus brevis in complex with phenylethanol and NAD (see paper)
41% identity, 99% coverage: 3:243/243 of query aligns to 3:251/251 of 1zjzA

query
sites
1zjzA
R
 
R
V
 
L
N
 
D
G
 
G
K
 
K
V
 
V
V
 
A
I
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
T
 
T
G
x
L
G
|
G
M
x
I
G
 
G
A
 
L
S
 
A
H
 
I
V
 
A
K
 
T
K
 
K
F
 
F
V
 
V
S
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
V
 
M
F
 
I
T
 
T
D
|
D
L
 
R
D
 
H
E
 
S
G
 
D
A
 
V
G
 
G
R
 
E
V
 
K
L
 
A
Q
 
A
D
 
K
E
 
S
M
 
V
G
 
G
P
 
T
-
 
P
-
 
D
Q
 
Q
S
 
I
L
 
Q
F
 
F
I
 
F
K
 
Q
Q
 
H
D
|
D
V
 
S
T
 
S
D
 
D
S
 
E
E
 
D
S
 
G
W
 
W
N
 
T
K
 
K
V
 
L
I
 
F
V
 
D
E
 
A
T
 
T
E
 
E
K
 
K
N
 
A
L
 
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
N
 
S
V
 
T
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
x
I
N
x
A
Y
 
V
S
x
N
E
 
K
E
 
S
T
 
V
E
 
E
A
 
E
F
 
T
P
 
T
E
 
T
D
 
A
E
 
E
Y
 
W
D
 
R
R
 
K
V
 
L
I
 
L
E
 
A
V
 
V
N
 
N
Q
 
L
K
 
D
A
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
F
G
 
G
M
 
T
K
 
R
A
 
L
V
 
G
I
 
I
P
 
Q
S
 
R
M
 
M
K
 
K
-
 
N
K
 
K
A
 
G
A
 
L
S
 
G
G
 
A
S
 
S
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
M
S
 
S
S
|
S
I
 
I
G
 
E
G
 
G
I
 
F
R
 
V
G
 
G
R
 
D
M
 
P
E
 
S
S
x
L
V
 
G
A
 
A
Y
|
Y
S
 
N
A
 
A
S
 
S
K
|
K
F
 
G
A
 
A
V
 
V
T
 
R
G
 
I
M
 
M
T
 
S
K
 
K
V
 
S
G
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
D
-
 
C
-
 
A
L
 
L
G
 
K
K
 
D
Y
 
Y
G
 
D
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
S
 
T
V
 
V
H
 
H
P
 
P
S
x
G
L
 
Y
V
x
I
N
 
K
T
 
T
G
 
P
L
|
L
F
 
V
S
 
D
E
 
D
S
 
L
T
 
P
G
 
G
G
 
A
K
 
E
A
 
E
V
 
A
A
 
M
S
 
S
D
 
Q
R
 
R
-
 
T
-
 
K
-
 
T
P
 
P
L
 
M
G
 
G
R
 
H
V
 
I
L
 
G
T
 
E
K
 
P
E
 
N
E
 
D
V
 
I
S
 
A
A
 
Y
L
 
I
V
 
C
L
 
V
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
N
E
 
E
S
 
S
S
 
K
Y
 
F
T
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
S
E
 
E
H
 
F
V
 
V
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
Y
T
 
T
A
 
A
R
 
Q

1zjyA Structure of r-specific alcohol dehydrogenase (mutant g37d) from lactobacillus brevis in complex with phenylethanol and nadh (see paper)
41% identity, 99% coverage: 3:243/243 of query aligns to 3:251/251 of 1zjyA

query
sites
1zjyA
R
 
R
V
 
L
N
 
D
G
 
G
K
 
K
V
 
V
V
 
A
I
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
T
 
T
G
x
L
G
|
G
M
x
I
G
 
G
A
 
L
S
 
A
H
 
I
V
 
A
K
 
T
K
 
K
F
 
F
V
 
V
S
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
V
 
M
F
 
I
T
 
T
D
|
D
L
 
R
D
 
H
E
 
S
G
 
D
A
 
V
G
 
G
R
 
E
V
 
K
L
 
A
Q
 
A
D
 
K
E
 
S
M
 
V
G
 
G
P
 
T
-
 
P
-
 
D
Q
 
Q
S
 
I
L
 
Q
F
 
F
I
 
F
K
 
Q
Q
 
H
D
|
D
V
 
S
T
 
S
D
 
D
S
 
E
E
 
D
S
 
G
W
 
W
N
 
T
K
 
K
V
 
L
I
 
F
V
 
D
E
 
A
T
 
T
E
 
E
K
 
K
N
 
A
L
 
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
N
 
S
V
 
T
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
x
I
N
x
A
Y
 
V
S
x
N
E
 
K
E
 
S
T
 
V
E
 
E
A
 
E
F
 
T
P
 
T
E
 
T
D
 
A
E
 
E
Y
 
W
D
 
R
R
 
K
V
 
L
I
 
L
E
 
A
V
 
V
N
 
N
Q
 
L
K
 
D
A
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
F
G
 
G
M
 
T
K
 
R
A
 
L
V
 
G
I
 
I
P
 
Q
S
 
R
M
 
M
K
 
K
-
 
N
K
 
K
A
 
G
A
 
L
S
 
G
G
 
A
S
 
S
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
M
S
 
S
S
|
S
I
 
I
G
 
E
G
 
G
I
 
F
R
 
V
G
 
G
R
 
D
M
 
P
E
 
S
S
x
L
V
 
G
A
 
A
Y
|
Y
S
 
N
A
 
A
S
 
S
K
|
K
F
 
G
A
 
A
V
 
V
T
 
R
G
 
I
M
 
M
T
 
S
K
 
K
V
 
S
G
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
D
-
 
C
-
 
A
L
 
L
G
 
K
K
 
D
Y
 
Y
G
 
D
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
S
 
T
V
 
V
H
 
H
P
 
P
S
x
G
L
x
Y
V
x
I
N
 
K
T
 
T
G
 
P
L
|
L
F
 
V
S
 
D
E
 
D
S
 
L
T
 
P
G
 
G
G
 
A
K
 
E
A
 
E
V
 
A
A
 
M
S
 
S
D
 
Q
R
 
R
-
 
T
-
 
K
-
 
T
P
 
P
L
 
M
G
 
G
R
 
H
V
 
I
L
 
G
T
 
E
K
 
P
E
 
N
E
 
D
V
 
I
S
 
A
A
 
Y
L
 
I
V
 
C
L
 
V
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
N
E
 
E
S
 
S
S
 
K
Y
 
F
T
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
S
E
 
E
H
 
F
V
 
V
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
Y
T
 
T
A
 
A
R
 
Q

Q6WVP7 NADP-dependent (R)-specific alcohol dehydrogenase; (R)-specific ADH; Ketoreductase; KRED; EC 1.1.1.- from Lentilactobacillus kefiri (Lactobacillus kefiri) (see paper)
41% identity, 99% coverage: 3:243/243 of query aligns to 4:252/252 of Q6WVP7

query
sites
Q6WVP7
R
 
R
V
 
L
N
 
K
G
 
G
K
 
K
V
 
V
V
 
A
I
 
I
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
T
|
T
G
x
L
G
|
G
M
x
I
G
 
G
A
 
L
S
 
A
H
 
I
V
 
A
K
 
D
K
 
K
F
 
F
V
 
V
S
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
V
 
V
F
 
I
T
 
T
D
 
G
L
x
R
D
x
H
E
 
A
G
 
D
A
 
V
G
 
G
R
 
E
V
 
K
L
 
A
Q
 
A
D
 
K
E
 
S
M
 
I
G
 
G
P
 
G
Q
 
T
S
 
D
L
 
V
-
 
I
-
 
R
F
 
F
I
 
V
K
 
Q
Q
 
H
D
|
D
V
x
A
T
 
S
D
 
D
S
 
E
E
 
A
S
 
G
W
 
W
N
 
T
K
 
K
V
 
L
I
 
F
V
 
D
E
 
T
T
 
T
E
 
E
K
 
E
N
 
A
L
 
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
N
 
T
V
 
T
L
 
V
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
N
 
A
Y
 
V
S
 
S
E
 
K
E
 
S
T
 
V
E
 
E
A
 
D
F
 
T
P
 
T
E
 
T
D
 
E
E
 
E
Y
 
W
D
 
R
R
 
K
V
 
L
I
 
L
E
 
S
V
 
V
N
 
N
Q
 
L
K
 
D
A
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
F
G
 
G
M
 
T
K
 
R
A
 
L
V
 
G
I
 
I
P
 
Q
S
 
R
M
 
M
K
 
K
-
 
N
K
 
K
A
 
G
A
 
L
S
 
G
G
 
A
S
 
S
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
M
S
 
S
S
 
S
I
 
I
G
 
E
G
 
G
I
 
F
R
 
V
G
 
G
R
 
D
M
 
P
E
 
T
S
 
L
V
 
G
A
 
A
Y
|
Y
S
 
N
A
 
A
S
 
S
K
|
K
F
 
G
A
 
A
V
 
V
T
 
R
G
 
I
M
 
M
T
 
S
K
 
K
V
 
S
G
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
D
-
 
C
-
 
A
L
 
L
G
 
K
K
 
D
Y
 
Y
G
 
D
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
S
 
T
V
 
V
H
 
H
P
 
P
S
 
G
L
 
Y
V
x
I
N
x
K
T
|
T
G
x
P
L
|
L
F
 
V
S
 
D
E
 
D
S
 
L
T
 
E
G
 
G
G
 
A
K
 
E
A
 
E
V
 
M
A
 
M
S
 
S
D
 
Q
R
 
R
-
 
T
-
 
K
-
 
T
P
 
P
L
 
M
G
 
G
R
 
H
V
 
I
L
 
G
T
 
E
K
 
P
E
 
N
E
 
D
V
 
I
S
 
A
A
 
W
L
 
I
V
 
C
L
 
V
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
E
S
 
S
S
 
K
Y
 
F
T
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
A
E
 
E
H
 
F
V
 
V
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
Y
T
 
T
A
 
A
R
x
Q

2hsdA The refined three-dimensional structure of 3alpha,20beta- hydroxysteroid dehydrogenase and possible roles of the residues conserved in short-chain dehydrogenases (see paper)
41% identity, 98% coverage: 4:241/243 of query aligns to 3:242/253 of 2hsdA

query
sites
2hsdA
V
 
L
N
 
S
G
 
G
K
 
K
V
 
T
V
 
V
I
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
T
 
A
G
x
R
G
|
G
M
x
L
G
 
G
A
 
A
S
 
E
H
 
A
V
 
A
K
 
R
K
 
Q
F
 
A
V
 
V
S
 
A
E
 
A
G
 
G
A
 
A
Q
 
R
V
 
V
V
 
V
F
 
L
T
 
A
D
|
D
L
x
V
D
 
L
E
 
D
G
 
E
A
 
E
G
 
G
R
 
A
V
 
A
L
 
T
Q
 
A
D
 
R
E
 
E
M
 
L
G
 
G
P
 
D
Q
 
A
S
 
A
L
 
R
F
 
Y
I
 
Q
K
 
H
Q
x
L
D
 
D
V
|
V
T
 
T
D
 
I
S
 
E
E
 
E
S
 
D
W
 
W
N
 
Q
K
 
R
V
 
V
I
 
V
V
 
A
E
 
Y
T
 
A
E
 
R
K
 
E
N
 
E
L
 
F
G
 
G
P
 
S
V
 
V
N
 
D
V
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
V
 
I
N
 
S
Y
 
T
S
 
G
E
 
M
E
 
F
T
 
L
E
 
E
A
 
T
F
 
E
P
 
S
E
 
V
D
 
E
E
 
R
Y
 
F
D
 
R
R
 
K
V
 
V
I
 
V
E
 
E
V
 
I
N
 
N
Q
 
L
K
 
T
A
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
I
G
 
G
M
 
M
K
 
K
A
 
T
V
 
V
I
 
I
P
 
P
S
 
A
M
 
M
K
 
K
K
 
D
A
 
A
A
 
G
S
 
G
G
 
G
S
 
S
I
 
I
I
 
V
N
 
N
I
 
I
S
 
S
S
|
S
I
 
A
G
 
A
G
 
G
I
 
L
R
 
M
G
 
G
R
 
L
M
 
A
E
 
L
S
 
T
V
 
S
A
 
S
Y
|
Y
S
 
G
A
 
A
S
 
S
K
|
K
F
 
W
A
 
G
V
 
V
T
 
R
G
 
G
M
 
L
T
 
S
K
 
K
V
 
L
G
 
A
A
 
A
L
 
V
E
 
E
L
 
L
G
 
G
K
 
T
Y
 
D
G
 
R
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
S
 
S
V
 
V
H
 
H
P
|
P
S
x
G
L
 
M
V
x
T
N
 
Y
T
 
T
G
 
P
L
 
M
F
 
T
S
 
A
E
 
E
S
 
T
-
 
G
-
 
I
T
 
R
G
 
Q
G
 
G
K
 
E
A
 
G
V
 
N
A
 
Y
S
 
P
D
 
N
R
 
T
P
 
P
L
 
M
G
 
G
R
 
R
V
 
V
L
 
G
T
 
E
K
 
P
E
 
G
E
 
E
V
 
I
S
 
A
A
 
G
L
 
A
V
 
V
L
 
V
Y
 
K
L
 
L
A
 
L
S
 
S
D
 
D
E
 
T
S
 
S
S
 
S
Y
 
Y
T
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
E
 
E
H
 
L
V
 
A
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
W
T
 
T

1hdcA Mechanism of inhibition of 3alpha,20beta-hydroxysteroid dehydrogenase by a licorice-derived steroidal inhibitor (see paper)
41% identity, 98% coverage: 4:241/243 of query aligns to 3:242/253 of 1hdcA

query
sites
1hdcA
V
 
L
N
 
S
G
 
G
K
 
K
V
 
T
V
 
V
I
 
I
V
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
G
T
 
A
G
 
R
G
|
G
M
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
E
H
 
A
V
 
A
K
 
R
K
 
Q
F
 
A
V
 
V
S
 
A
E
 
A
G
 
G
A
 
A
Q
 
R
V
 
V
V
 
V
F
 
L
T
 
A
D
 
D
L
 
V
D
 
L
E
 
D
G
 
E
A
 
E
G
 
G
R
 
A
V
 
A
L
 
T
Q
 
A
D
 
R
E
 
E
M
 
L
G
 
G
P
 
D
Q
 
A
S
 
A
L
 
R
F
 
Y
I
 
Q
K
 
H
Q
 
L
D
 
D
V
 
V
T
 
T
D
 
I
S
 
E
E
 
E
S
 
D
W
 
W
N
 
Q
K
 
R
V
 
V
I
 
V
V
 
A
E
 
Y
T
 
A
E
 
R
K
 
E
N
 
E
L
 
F
G
 
G
P
 
S
V
 
V
N
 
D
V
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
N
x
S
Y
x
T
S
x
G
E
 
M
E
 
F
T
 
L
E
 
E
A
 
T
F
 
E
P
 
S
E
 
V
D
 
E
E
 
R
Y
 
F
D
 
R
R
 
K
V
 
V
I
 
V
E
 
E
V
 
I
N
 
N
Q
 
L
K
 
T
A
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
I
G
 
G
M
 
M
K
 
K
A
 
T
V
 
V
I
 
I
P
 
P
S
 
A
M
 
M
K
 
K
K
 
D
A
 
A
A
 
G
S
 
G
G
 
G
S
 
S
I
 
I
I
 
V
N
 
N
I
 
I
S
 
S
S
|
S
I
 
A
G
 
A
G
 
G
I
 
L
R
 
M
G
 
G
R
 
L
M
 
A
E
x
L
S
 
T
V
 
S
A
 
S
Y
|
Y
S
 
G
A
 
A
S
 
S
K
|
K
F
 
W
A
 
G
V
 
V
T
 
R
G
 
G
M
 
L
T
 
S
K
 
K
V
 
L
G
 
A
A
 
A
L
 
V
E
 
E
L
 
L
G
 
G
K
 
T
Y
 
D
G
 
R
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
S
 
S
V
 
V
H
 
H
P
 
P
S
 
G
L
x
M
V
 
T
N
 
Y
T
 
T
G
 
P
L
x
M
F
x
T
S
 
A
E
 
E
S
x
T
-
 
G
-
 
I
T
 
R
G
 
Q
G
 
G
K
 
E
A
 
G
V
 
N
A
 
Y
S
 
P
D
 
N
R
 
T
P
 
P
L
 
M
G
 
G
R
 
R
V
 
V
L
 
G
T
 
E
K
 
P
E
 
G
E
 
E
V
 
I
S
 
A
A
 
G
L
 
A
V
 
V
L
 
V
Y
 
K
L
 
L
A
 
L
S
 
S
D
 
D
E
 
T
S
 
S
S
 
S
Y
 
Y
T
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
E
 
E
H
 
L
V
 
A
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
W
T
 
T

6y0sAAA R-specific alcohol dehydrogenase (see paper)
40% identity, 99% coverage: 3:243/243 of query aligns to 3:251/251 of 6y0sAAA

query
sites
6y0sAAA
R
 
R
V
 
L
N
 
D
G
 
G
K
 
K
V
 
V
V
 
A
I
 
I
V
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
G
T
|
T
G
 
L
G
|
G
M
 
I
G
 
G
A
 
L
S
 
A
H
 
I
V
 
A
K
 
T
K
 
K
F
 
F
V
 
V
S
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
V
 
M
F
 
I
T
 
T
D
x
G
L
 
R
D
x
H
E
 
S
G
 
D
A
x
V
G
 
G
R
 
E
V
 
K
L
 
A
Q
 
A
D
 
K
E
 
S
M
 
V
G
 
G
P
 
T
-
 
P
-
 
D
Q
 
Q
S
 
I
L
 
Q
F
 
F
I
 
F
K
 
Q
Q
 
H
D
 
D
V
 
S
T
 
S
D
 
D
S
 
E
E
 
D
S
 
G
W
 
W
N
 
T
K
 
K
V
 
L
I
 
F
V
 
D
E
 
A
T
 
T
E
 
E
K
 
K
N
 
A
L
 
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
N
 
S
V
 
T
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
N
 
A
Y
 
V
S
 
N
E
 
K
E
 
S
T
 
V
E
 
E
A
 
E
F
 
T
P
 
E
E
 
T
D
 
A
E
 
E
Y
 
W
D
 
R
R
 
K
V
 
L
I
 
L
E
 
A
V
 
V
N
 
N
Q
 
L
K
 
D
A
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
F
G
 
G
M
 
T
K
 
R
A
 
L
V
 
G
I
 
I
P
 
Q
S
 
R
M
 
M
K
 
K
-
 
N
K
 
K
A
 
G
A
 
L
S
x
G
G
x
A
S
 
S
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
M
S
 
S
S
|
S
I
 
I
G
 
E
G
 
G
I
 
F
R
 
V
G
 
G
R
 
D
M
 
P
E
 
S
S
 
L
V
 
G
A
 
A
Y
|
Y
S
 
N
A
 
A
S
 
S
K
 
K
F
 
G
A
 
A
V
 
V
T
 
R
G
 
I
M
 
M
T
 
S
K
 
K
V
 
S
G
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
D
-
 
C
-
 
A
L
 
L
G
 
K
K
 
D
Y
 
Y
G
x
D
I
 
V
R
|
R
V
 
V
N
 
N
S
 
T
V
 
V
H
 
H
P
 
P
S
 
G
L
 
Y
V
 
I
N
 
K
T
 
T
G
 
P
L
 
L
F
 
V
S
 
D
E
 
D
S
 
L
T
 
P
G
 
G
G
 
A
K
 
E
A
 
E
V
 
A
A
 
M
S
 
S
D
 
Q
R
 
R
-
 
T
-
 
K
-
 
T
P
 
P
L
 
M
G
 
G
R
 
H
V
 
I
L
 
G
T
 
E
K
 
P
E
 
N
E
 
D
V
 
I
S
 
A
A
 
Y
L
 
I
V
 
C
L
 
V
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
N
E
 
E
S
 
S
S
 
K
Y
 
F
T
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
S
E
 
E
H
 
F
V
 
V
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
Y
T
 
T
A
 
A
R
 
Q

1zk4A Structure of r-specific alcohol dehydrogenase (wildtype) from lactobacillus brevis in complex with acetophenone and NADP (see paper)
40% identity, 99% coverage: 3:243/243 of query aligns to 3:251/251 of 1zk4A

query
sites
1zk4A
R
 
R
V
 
L
N
 
D
G
 
G
K
 
K
V
 
V
V
 
A
I
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
T
|
T
G
x
L
G
|
G
M
x
I
G
 
G
A
 
L
S
 
A
H
 
I
V
 
A
K
 
T
K
 
K
F
 
F
V
 
V
S
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
V
 
M
F
 
I
T
|
T
D
x
G
L
x
R
D
 
H
E
 
S
G
 
D
A
 
V
G
 
G
R
 
E
V
 
K
L
 
A
Q
 
A
D
 
K
E
 
S
M
 
V
G
 
G
P
 
T
-
 
P
-
 
D
Q
 
Q
S
 
I
L
 
Q
F
 
F
I
 
F
K
 
Q
Q
x
H
D
|
D
V
 
S
T
 
S
D
 
D
S
 
E
E
 
D
S
 
G
W
 
W
N
 
T
K
 
K
V
 
L
I
 
F
V
 
D
E
 
A
T
 
T
E
 
E
K
 
K
N
 
A
L
 
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
N
 
S
V
 
T
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
x
I
N
x
A
Y
 
V
S
 
N
E
 
K
E
 
S
T
 
V
E
 
E
A
 
E
F
 
T
P
 
T
E
 
T
D
 
A
E
 
E
Y
 
W
D
 
R
R
 
K
V
 
L
I
 
L
E
 
A
V
 
V
N
 
N
Q
 
L
K
 
D
A
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
F
G
 
G
M
 
T
K
 
R
A
 
L
V
 
G
I
 
I
P
 
Q
S
 
R
M
 
M
K
 
K
-
 
N
K
 
K
A
 
G
A
 
L
S
 
G
G
 
A
S
 
S
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
M
S
 
S
S
|
S
I
 
I
G
 
E
G
 
G
I
 
F
R
 
V
G
 
G
R
 
D
M
 
P
E
 
S
S
 
L
V
 
G
A
 
A
Y
|
Y
S
 
N
A
 
A
S
 
S
K
|
K
F
 
G
A
 
A
V
 
V
T
 
R
G
 
I
M
 
M
T
 
S
K
 
K
V
 
S
G
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
D
-
 
C
-
 
A
L
 
L
G
 
K
K
 
D
Y
 
Y
G
 
D
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
S
 
T
V
 
V
H
 
H
P
 
P
S
x
G
L
x
Y
V
x
I
N
 
K
T
|
T
G
 
P
L
|
L
F
 
V
S
 
D
E
 
D
S
 
L
T
 
P
G
 
G
G
 
A
K
 
E
A
 
E
V
 
A
A
 
M
S
 
S
D
 
Q
R
 
R
-
 
T
-
 
K
-
 
T
P
 
P
L
 
M
G
 
G
R
 
H
V
 
I
L
 
G
T
 
E
K
 
P
E
 
N
E
 
D
V
 
I
S
 
A
A
 
Y
L
 
I
V
 
C
L
 
V
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
N
E
 
E
S
 
S
S
 
K
Y
 
F
T
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
S
E
 
E
H
 
F
V
 
V
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
Y
T
 
T
A
 
A
R
 
Q

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
36% identity, 99% coverage: 1:240/243 of query aligns to 2:242/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
M
 
M
G
 
S
R
 
R
V
 
L
N
 
Q
G
 
D
K
 
K
V
 
V
V
 
A
I
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
T
 
A
G
x
N
G
|
G
M
x
I
G
 
G
A
 
L
S
 
E
H
 
A
V
 
A
K
 
R
K
 
V
F
 
F
V
 
M
S
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
V
 
V
F
 
I
T
 
A
D
|
D
L
x
F
D
 
N
E
 
E
G
 
A
A
 
A
G
 
G
R
 
K
V
 
E
L
 
A
Q
 
V
D
 
-
E
 
E
M
 
A
G
 
N
P
 
P
Q
 
G
S
 
V
L
 
V
F
 
F
I
 
I
K
 
R
Q
x
V
D
|
D
V
|
V
T
 
S
D
 
D
S
 
R
E
 
E
S
 
S
W
 
V
N
 
H
K
 
R
V
 
L
I
 
V
V
 
E
E
 
N
T
 
V
E
 
A
K
 
E
N
 
R
L
 
F
G
 
G
P
 
K
V
 
I
N
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
x
I
N
 
T
Y
 
R
S
x
D
E
 
S
E
 
M
T
 
L
E
 
S
A
x
K
F
 
M
P
 
T
E
 
V
D
 
D
E
 
Q
Y
 
F
D
 
Q
R
 
Q
V
 
V
I
 
I
E
 
N
V
 
V
N
|
N
Q
 
L
K
 
T
A
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
H
G
 
C
M
 
T
K
 
Q
A
 
A
V
 
V
I
 
L
P
 
P
S
 
Y
M
 
M
K
 
A
K
 
E
A
 
Q
A
 
G
S
 
K
G
 
G
S
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
x
T
S
 
S
S
|
S
I
 
V
G
 
T
G
 
G
I
 
T
R
 
Y
G
 
G
R
x
N
M
x
V
E
 
G
S
x
Q
V
 
T
A
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
F
 
A
A
 
G
V
 
V
T
 
I
G
 
G
M
 
M
T
 
T
K
 
K
V
 
T
G
 
W
A
 
A
L
 
K
E
 
E
L
 
L
G
 
A
K
 
R
Y
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
S
 
A
V
 
V
H
 
A
P
|
P
S
 
G
L
x
F
V
x
T
N
 
E
T
|
T
G
 
A
L
x
M
F
 
V
S
 
A
E
 
E
S
 
V
T
 
P
G
 
E
G
 
K
-
 
V
-
 
I
K
 
E
A
x
K
V
 
M
A
 
K
S
 
A
D
 
Q
R
 
V
P
 
P
L
 
M
G
 
G
R
 
R
V
 
L
L
 
G
T
 
K
K
 
P
E
 
E
E
 
D
V
 
I
S
 
A
A
 
N
L
 
A
V
 
Y
L
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
H
E
 
E
S
 
S
S
 
D
Y
 
Y
T
 
V
T
 
N
G
 
G
A
 
H
E
 
V
H
 
L
V
 
H
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
I

6zzqA Crystal structure of (r)-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from acinetobacter baumannii complexed with NAD+ and acetoacetate (see paper)
35% identity, 99% coverage: 4:243/243 of query aligns to 4:260/260 of 6zzqA

query
sites
6zzqA
V
 
L
N
 
D
G
 
G
K
 
K
V
 
V
V
 
A
I
 
F
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
S
T
 
A
G
x
S
G
|
G
M
x
I
G
 
G
A
 
L
S
 
E
H
 
I
V
 
A
K
 
K
K
 
K
F
 
F
V
 
A
S
 
Q
E
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
V
 
V
F
 
I
T
 
S
D
|
D
L
x
M
D
 
N
-
 
A
-
 
E
-
 
K
-
 
C
-
 
Q
E
 
E
G
 
T
A
 
A
G
 
N
R
 
S
V
 
L
L
 
-
Q
 
-
D
 
K
E
 
E
M
 
Q
G
 
G
P
 
F
Q
 
D
S
 
A
L
 
L
F
 
S
I
 
A
K
 
P
Q
 
C
D
|
D
V
|
V
T
 
T
D
 
D
S
 
E
E
 
D
S
 
A
W
 
Y
N
 
K
K
 
Q
V
 
A
I
 
I
V
 
E
E
 
L
T
 
T
E
 
Q
K
 
K
N
 
T
L
 
F
G
 
G
P
 
T
V
 
V
N
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
 
F
N
x
Q
Y
 
H
S
 
V
E
 
A
E
 
P
T
 
I
E
 
E
A
 
E
F
 
F
P
 
P
E
 
T
D
 
A
E
 
V
Y
 
F
D
 
Q
R
 
K
V
 
L
I
 
V
E
 
Q
V
 
V
N
 
M
Q
 
L
K
 
T
A
 
G
V
 
A
F
 
F
L
 
I
G
 
G
M
 
I
K
 
K
A
 
H
V
 
V
I
 
L
P
 
P
S
 
I
M
 
M
K
 
K
K
 
A
A
 
Q
A
 
K
S
 
Y
G
 
G
S
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
x
M
S
x
A
S
|
S
I
 
I
G
 
N
G
 
G
I
 
L
R
 
I
G
 
G
R
 
F
M
 
A
E
 
G
S
x
K
V
 
A
A
 
G
Y
|
Y
S
 
N
A
 
S
S
 
A
K
|
K
F
 
H
A
 
G
V
 
V
T
 
I
G
 
G
M
 
L
T
 
T
K
 
K
V
 
V
G
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
C
G
 
A
K
 
R
Y
 
D
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
S
 
A
V
 
L
H
 
C
P
 
P
S
 
G
L
x
Y
V
|
V
N
 
D
T
|
T
-
 
P
-
 
L
-
 
V
-
 
R
G
 
G
L
x
Q
F
 
I
S
 
A
E
 
D
S
 
L
T
 
A
G
 
K
G
 
T
K
 
R
A
 
N
V
 
V
A
 
S
S
 
L
D
 
D
R
 
S
-
 
A
-
 
L
-
 
E
-
 
D
-
 
V
-
 
I
-
 
L
-
 
A
-
 
M
-
 
V
P
 
P
L
 
Q
G
 
K
R
 
R
V
 
L
L
 
L
T
 
S
K
 
V
E
 
E
E
 
E
V
 
I
S
 
A
A
 
D
L
 
Y
V
 
A
L
 
I
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
S
E
 
K
S
 
A
S
 
G
Y
 
G
T
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
Q
E
 
A
H
 
V
V
 
V
I
 
M
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
Y
T
 
T
A
 
A
R
 
Q

6zzsD Crystal structure of (r)-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from acinetobacter baumannii complexed with NAD+ and 3-oxovalerate (see paper)
35% identity, 99% coverage: 4:243/243 of query aligns to 5:261/261 of 6zzsD

query
sites
6zzsD
V
 
L
N
 
D
G
 
G
K
 
K
V
 
V
V
 
A
I
 
F
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
S
T
 
A
G
x
S
G
|
G
M
x
I
G
 
G
A
 
L
S
 
E
H
 
I
V
 
A
K
 
K
K
 
K
F
 
F
V
 
A
S
 
Q
E
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
V
 
V
F
 
I
T
 
S
D
|
D
L
x
M
D
 
N
-
 
A
-
 
E
-
 
K
-
 
C
-
 
Q
E
 
E
G
 
T
A
 
A
G
 
N
R
 
S
V
 
L
L
 
-
Q
 
-
D
 
K
E
 
E
M
 
Q
G
 
G
P
 
F
Q
 
D
S
 
A
L
 
L
F
 
S
I
 
A
K
 
P
Q
 
C
D
|
D
V
|
V
T
 
T
D
 
D
S
 
E
E
 
D
S
 
A
W
 
Y
N
 
K
K
 
Q
V
 
A
I
 
I
V
 
E
E
 
L
T
 
T
E
 
Q
K
 
K
N
 
T
L
 
F
G
 
G
P
 
T
V
 
V
N
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
 
F
N
x
Q
Y
 
H
S
 
V
E
 
A
E
 
P
T
 
I
E
 
E
A
 
E
F
 
F
P
 
P
E
 
T
D
 
A
E
 
V
Y
 
F
D
 
Q
R
 
K
V
 
L
I
 
V
E
 
Q
V
 
V
N
 
M
Q
 
L
K
 
T
A
 
G
V
 
A
F
 
F
L
 
I
G
 
G
M
 
I
K
 
K
A
 
H
V
 
V
I
 
L
P
 
P
S
 
I
M
 
M
K
 
K
K
 
A
A
 
Q
A
 
K
S
 
Y
G
 
G
S
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
x
M
S
x
A
S
|
S
I
 
I
G
x
N
G
 
G
I
 
L
R
 
I
G
 
G
R
 
F
M
 
A
E
 
G
S
x
K
V
 
A
A
 
G
Y
|
Y
S
 
N
A
 
S
S
 
A
K
|
K
F
 
H
A
 
G
V
 
V
T
 
I
G
 
G
M
 
L
T
 
T
K
 
K
V
 
V
G
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
C
G
 
A
K
 
R
Y
 
D
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
S
 
A
V
 
L
H
 
C
P
|
P
S
x
G
L
 
Y
V
|
V
N
 
D
T
|
T
-
 
P
-
x
L
-
 
V
-
 
R
G
 
G
L
x
Q
F
 
I
S
 
A
E
 
D
S
 
L
T
 
A
G
 
K
G
 
T
K
 
R
A
 
N
V
 
V
A
 
S
S
 
L
D
 
D
R
 
S
-
 
A
-
 
L
-
 
E
-
 
D
-
 
V
-
 
I
-
 
L
-
 
A
-
 
M
-
 
V
P
 
P
L
 
Q
G
 
K
R
 
R
V
 
L
L
 
L
T
 
S
K
 
V
E
 
E
E
 
E
V
 
I
S
 
A
A
 
D
L
 
Y
V
 
A
L
 
I
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
S
E
 
K
S
 
A
S
 
G
Y
 
G
T
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
Q
E
 
A
H
 
V
V
 
V
I
 
M
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
Y
T
 
T
A
 
A
R
 
Q

4wecA Crystal structure of a short chain dehydrogenase from mycobacterium smegmatis
34% identity, 99% coverage: 3:242/243 of query aligns to 7:252/258 of 4wecA

query
sites
4wecA
R
 
R
V
 
L
N
 
A
G
 
G
K