SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_017549750.1 NCBI__GCF_000330705.1:WP_017549750.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P07821 Iron(3+)-hydroxamate import ATP-binding protein FhuC; Ferric hydroxamate uptake protein C; Ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC; Iron(III)-hydroxamate import ATP-binding protein FhuC; EC 7.2.2.16 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
36% identity, 93% coverage: 2:253/271 of query aligns to 10:261/265 of P07821

query
sites
P07821
T
 
T
S
 
T
V
 
F
A
 
A
L
 
L
K
 
R
D
 
N
I
 
I
K
 
S
V
 
F
E
 
R
L
 
V
N
 
P
D
 
G
R
 
R
A
 
T
I
 
L
L
 
L
H
 
H
N
 
P
I
 
L
N
 
S
M
 
L
E
 
T
L
 
F
M
 
P
E
 
A
G
 
G
R
 
K
V
 
V
T
 
T
T
 
G
I
 
L
I
 
I
G
 
G
P
 
H
N
 
N
G
 
G
C
 
S
G
 
G
K
|
K
S
 
S
T
 
T
M
 
L
L
 
L
K
 
K
T
 
M
I
 
L
S
 
G
R
 
R
I
 
H
I
 
Q
S
 
P
A
 
P
K
 
S
E
 
E
G
 
G
G
 
E
V
 
I
Y
 
L
I
 
L
N
 
D
D
 
A
I
 
Q
N
 
P
I
 
L
R
 
E
Q
 
S
M
 
W
K
 
S
S
 
S
K
 
K
E
 
A
V
 
F
A
 
A
K
 
R
K
 
K
I
 
V
S
 
A
I
 
Y
L
 
L
S
 
P
Q
 
Q
R
 
Q
N
 
L
K
 
P
L
 
P
Q
 
A
Y
 
E
D
 
G
V
 
M
K
 
T
V
 
V
E
 
R
D
 
E
L
 
L
V
 
V
S
 
A
F
 
I
S
 
G
R
 
R
Y
 
Y
P
 
P
H
 
W
L
 
H
K
 
G
R
 
A
F
 
L
Q
 
G
S
 
R
L
 
F
K
 
G
E
 
A
H
 
A
D
 
D
I
 
R
E
 
E
I
 
K
I
 
V
N
 
E
W
 
E
A
 
A
M
 
I
R
 
S
E
 
L
T
 
V
G
 
G
A
 
L
D
 
K
E
 
P
F
 
L
R
 
A
K
 
H
R
 
R
M
 
L
M
 
V
S
 
D
E
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
E
A
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
A
W
 
W
I
 
I
S
 
A
L
 
M
L
 
L
L
 
V
A
 
A
Q
 
Q
E
 
D
A
 
S
D
 
R
V
 
C
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
|
D
E
|
E
P
 
P
T
 
T
T
 
S
Y
 
A
L
 
L
D
 
D
I
 
I
H
 
A
H
 
H
Q
 
Q
L
 
V
E
 
D
T
 
V
L
 
L
N
 
S
I
 
L
V
 
V
K
 
H
E
 
R
L
 
L
N
 
S
E
 
Q
Q
 
E
S
 
R
H
 
G
Q
 
L
T
 
T
V
 
V
V
 
I
M
 
A
V
 
V
L
 
L
H
 
H
D
 
D
I
 
I
N
 
N
H
 
M
A
 
A
I
 
A
K
 
R
Y
 
Y
S
 
C
D
 
D
N
 
Y
L
 
L
V
 
V
V
 
A
M
 
L
K
 
R
D
 
G
G
 
G
D
 
E
I
 
M
I
 
I
T
 
A
S
 
Q
G
 
G
H
 
T
P
 
P
T
 
A
E
 
E
V
 
I
L
 
M
T
 
R
N
 
G
E
 
E
I
 
T
L
 
L
N
 
E
D
 
M
V
 
I
F
 
Y
N
 
G
I
 
I
N
 
P
G
 
M
K
 
G
I
 
I
S
 
L
I
 
P
D
 
H
P
 
P
I
 
A
T
 
G
K
 
A
K
 
A
P
 
P
I
 
V

4u00A Crystal structure of ttha1159 in complex with adp (see paper)
28% identity, 79% coverage: 18:230/271 of query aligns to 17:226/241 of 4u00A

query
sites
4u00A
I
x
V
L
 
L
H
 
K
N
 
G
I
 
I
N
 
H
M
 
L
E
 
E
L
 
V
M
 
A
E
 
P
G
 
G
R
 
E
V
 
K
T
 
L
T
 
V
I
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
C
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
M
 
L
L
 
I
K
 
R
T
 
T
I
 
I
S
 
N
R
 
R
I
 
L
I
 
E
S
 
D
A
 
F
K
 
Q
E
 
E
G
 
G
G
 
E
V
 
V
Y
 
V
I
 
V
N
 
D
D
 
G
I
 
L
N
 
S
I
 
V
R
 
K
Q
 
D
M
 
D
K
 
R
S
 
A
-
 
L
K
 
R
E
 
E
V
 
I
A
 
R
K
 
R
K
 
E
I
 
V
S
 
G
I
 
M
L
 
V
S
 
F
Q
 
Q
R
 
-
N
 
-
K
 
-
L
 
-
Q
 
-
Y
 
-
D
 
-
V
 
-
K
 
-
V
 
-
E
 
-
D
 
-
L
 
-
V
 
-
S
 
Q
F
 
F
S
 
N
R
 
L
Y
 
F
P
 
P
H
 
H
L
 
M
K
 
T
R
 
V
F
 
L
Q
 
E
S
 
N
L
 
V
K
 
T
E
 
L
H
 
A
D
 
P
I
 
M
E
 
R
I
 
V
I
 
R
N
 
R
W
 
W
A
 
P
-
 
R
-
 
E
-
 
K
-
 
A
-
 
E
-
 
K
-
 
K
-
 
A
-
 
L
-
 
E
-
 
L
M
 
L
R
 
E
E
 
R
T
 
V
G
 
G
A
 
I
D
 
L
E
 
D
F
 
Q
R
 
A
K
 
R
R
 
K
M
 
Y
M
 
P
S
 
A
E
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
A
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
W
 
A
I
 
I
S
 
A
L
 
R
L
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
M
E
 
E
A
 
P
D
 
K
V
 
I
L
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
T
 
S
Y
 
A
L
 
L
D
 
D
I
 
P
H
 
E
H
 
M
Q
 
V
L
 
G
E
 
E
T
 
V
L
 
L
N
 
D
I
 
V
V
 
M
K
 
R
E
 
D
L
 
L
N
 
A
E
 
-
Q
 
Q
S
 
G
H
 
G
Q
 
M
T
 
T
V
 
M
V
 
V
M
 
V
V
 
V
L
 
T
H
 
H
D
 
E
I
 
M
N
 
G
H
 
F
A
 
A
I
 
R
K
 
E
Y
 
V
S
 
A
D
 
D
N
 
R
L
 
V
V
 
V
V
 
F
M
 
M
K
 
D
D
 
G
G
 
G
D
 
Q
I
 
I
I
 
V
T
 
E
S
 
E
G
 
G
H
 
R
P
 
P
T
 
E
E
 
E
V
 
I
L
 
F
T
 
T
N
 
R

Sites not aligning to the query:

1vciA Crystal structure of the atp-binding cassette of multisugar transporter from pyrococcus horikoshii ot3 complexed with atp (see paper)
29% identity, 87% coverage: 1:237/271 of query aligns to 4:224/353 of 1vciA

query
sites
1vciA
M
 
M
T
 
V
S
 
E
V
 
V
A
 
K
L
 
L
K
 
E
D
 
N
I
 
L
K
 
T
V
 
K
E
 
R
L
x
F
N
 
G
D
 
N
R
x
F
A
 
T
I
 
A
L
 
V
H
 
N
N
 
K
I
 
L
N
 
N
M
 
L
E
 
T
L
 
I
M
 
K
E
 
D
G
 
G
R
 
E
V
 
F
T
 
L
T
 
V
I
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
C
 
C
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
M
 
T
L
 
L
K
 
R
T
 
M
I
 
I
S
 
A
R
 
G
I
 
L
I
 
E
S
 
E
A
 
P
K
 
T
E
 
E
G
 
G
G
 
R
V
 
I
Y
 
Y
I
 
F
N
 
G
D
 
D
I
 
R
N
 
D
I
 
V
R
 
T
Q
 
Y
M
 
L
K
 
P
S
 
P
K
 
K
E
 
D
V
 
-
A
 
-
K
 
R
K
 
N
I
 
I
S
 
S
I
 
M
L
 
V
S
 
F
Q
 
Q
R
 
H
N
 
-
K
 
-
L
 
-
Q
 
-
Y
 
-
D
 
-
V
 
M
K
 
T
V
 
V
E
 
Y
D
 
E
L
 
N
V
 
I
S
 
A
F
 
F
S
 
P
R
 
-
Y
 
-
P
 
-
H
 
-
L
 
L
K
 
K
R
 
K
F
 
F
Q
 
P
S
 
-
L
 
-
K
 
K
E
 
D
H
 
E
D
 
I
I
 
D
E
 
K
I
 
R
I
 
V
N
 
R
W
 
W
A
 
A
M
 
A
R
 
E
E
 
L
T
 
L
G
 
Q
A
 
I
D
 
E
E
 
E
F
 
L
R
 
L
K
 
N
R
 
R
M
 
Y
M
 
P
S
 
A
E
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
A
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
W
 
A
I
 
V
S
 
A
L
 
R
L
 
A
L
 
I
A
 
V
Q
 
V
E
 
E
A
 
P
D
 
D
V
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
L
T
 
S
Y
 
N
L
 
L
D
 
D
I
 
A
H
 
K
H
 
L
Q
 
R
L
 
V
E
 
A
T
 
M
L
 
R
N
 
A
I
 
E
V
 
I
K
 
K
E
 
K
L
 
L
N
 
Q
E
 
Q
Q
 
K
S
 
L
H
 
K
Q
 
V
T
 
T
V
 
T
V
 
I
M
 
Y
V
 
V
L
 
T
H
 
H
D
 
D
I
 
Q
N
 
V
H
 
E
A
 
A
I
 
M
K
 
T
Y
 
M
S
 
G
D
 
D
N
 
R
L
 
I
V
 
A
V
 
V
M
 
M
K
 
N
D
 
R
G
 
G
D
 
Q
I
 
L
I
 
L
T
 
Q
S
 
I
G
 
G
H
 
S
P
 
P
T
 
T
E
 
E
V
 
V
L
 
Y
T
 
L
N
 
R
E
 
P
I
 
-
L
 
-
N
 
N
D
 
S
V
 
V
F
 
F

1f3oA Crystal structure of mj0796 atp-binding cassette (see paper)
33% identity, 74% coverage: 19:218/271 of query aligns to 21:223/232 of 1f3oA

query
sites
1f3oA
L
 
L
H
 
K
N
 
N
I
 
V
N
 
N
M
 
L
E
 
N
L
 
I
M
 
K
E
 
E
G
 
G
R
 
E
V
 
F
T
 
V
T
 
S
I
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
|
G
C
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
M
 
M
L
 
L
K
 
N
T
 
I
I
 
I
S
 
G
R
 
C
I
 
L
I
 
D
S
 
K
A
 
P
K
 
T
E
 
E
G
 
G
G
 
E
V
 
V
Y
 
Y
I
 
I
N
 
D
D
 
N
I
 
I
N
 
K
I
 
T
R
 
N
Q
 
D
M
 
L
K
 
D
S
 
D
K
 
D
E
 
E
V
 
L
A
 
T
K
 
K
-
 
I
-
 
R
-
 
R
-
 
D
K
 
K
I
 
I
S
 
G
-
 
F
I
 
V
L
 
F
S
 
Q
Q
 
Q
R
 
F
N
 
N
K
 
L
L
 
I
Q
 
P
Y
 
L
D
 
L
V
 
T
K
 
A
V
 
L
E
 
E
-
 
N
-
 
V
D
 
E
L
 
L
V
 
P
S
 
L
F
 
I
S
 
F
R
 
K
Y
 
Y
P
 
R
H
 
G
L
 
A
K
 
M
R
 
S
F
 
G
Q
 
E
S
 
E
L
 
R
K
 
R
E
 
K
H
 
R
D
 
A
I
 
L
E
 
E
I
 
C
I
 
L
N
 
K
W
 
M
A
 
A
M
 
E
R
 
L
E
 
E
T
 
-
G
 
-
A
 
-
D
 
E
E
 
R
F
 
F
R
 
A
K
 
N
R
 
H
M
 
K
M
 
P
S
 
N
E
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
A
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
W
 
A
I
 
I
S
 
A
L
 
R
L
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
N
E
 
N
A
 
P
D
 
P
V
 
I
L
 
I
L
 
L
L
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
T
 
G
Y
 
A
L
 
L
D
 
D
I
 
S
H
 
K
H
 
T
Q
 
G
L
 
E
E
 
K
T
 
I
L
 
M
N
 
Q
I
 
L
V
 
L
K
 
K
E
 
K
L
 
L
N
 
N
E
 
E
Q
 
E
S
 
D
H
 
G
Q
 
K
T
 
T
V
 
V
V
 
V
M
 
V
V
 
V
L
 
T
H
 
H
D
 
D
I
 
I
N
 
N
H
 
V
A
 
A
I
 
-
K
 
R
Y
 
F
S
 
G
D
 
E
N
 
R
L
 
I
V
 
I
V
 
Y
M
 
L
K
 
K
D
 
D
G
 
G
D
 
E
I
 
V

Sites not aligning to the query:

1l2tA Dimeric structure of mj0796, a bacterial abc transporter cassette (see paper)
33% identity, 74% coverage: 19:218/271 of query aligns to 21:223/230 of 1l2tA

query
sites
1l2tA
L
 
L
H
 
K
N
 
N
I
 
V
N
 
N
M
 
L
E
 
N
L
 
I
M
 
K
E
 
E
G
 
G
R
 
E
V
 
F
T
 
V
T
 
S
I
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
C
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
M
 
M
L
 
L
K
 
N
T
 
I
I
 
I
S
 
G
R
 
C
I
 
L
I
 
D
S
 
K
A
 
P
K
 
T
E
 
E
G
 
G
G
 
E
V
 
V
Y
 
Y
I
 
I
N
 
D
D
 
N
I
 
I
N
 
K
I
 
T
R
 
N
Q
 
D
M
 
L
K
 
D
S
 
D
K
 
D
E
 
E
V
 
L
A
 
T
K
 
K
-
 
I
-
 
R
-
 
R
-
 
D
K
 
K
I
 
I
S
 
G
-
 
F
I
 
V
L
 
F
S
 
Q
Q
 
Q
R
 
F
N
 
N
K
 
L
L
 
I
Q
 
P
Y
 
L
D
 
L
V
 
T
K
 
A
V
 
L
E
 
E
-
 
N
-
 
V
D
 
E
L
 
L
V
 
P
S
 
L
F
 
I
S
 
F
R
 
K
Y
 
Y
P
 
R
H
 
G
L
 
A
K
 
M
R
 
S
F
 
G
Q
 
E
S
 
E
L
 
R
K
 
R
E
 
K
H
 
R
D
 
A
I
 
L
E
 
E
I
 
C
I
 
L
N
 
K
W
 
M
A
 
A
M
 
E
R
 
L
E
 
E
T
 
-
G
 
-
A
 
-
D
 
E
E
 
R
F
|
F
R
 
A
K
 
N
R
 
H
M
 
K
M
 
P
S
 
N
E
x
Q
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
Q
|
Q
A
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
W
 
A
I
 
I
S
 
A
L
 
R
L
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
N
E
 
N
A
 
P
D
 
P
V
 
I
L
 
I
L
 
L
L
 
A
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
T
T
 
G
Y
 
A
L
 
L
D
 
D
I
 
S
H
 
K
H
 
T
Q
 
G
L
 
E
E
 
K
T
 
I
L
 
M
N
 
Q
I
 
L
V
 
L
K
 
K
E
 
K
L
 
L
N
 
N
E
 
E
Q
 
E
S
 
D
H
 
G
Q
 
K
T
 
T
V
 
V
V
 
V
M
 
V
V
 
V
L
 
T
H
|
H
D
 
D
I
 
I
N
 
N
H
 
V
A
 
A
I
 
-
K
 
R
Y
 
F
S
 
G
D
 
E
N
 
R
L
 
I
V
 
I
V
 
Y
M
 
L
K
 
K
D
 
D
G
 
G
D
 
E
I
 
V

Sites not aligning to the query:

7chaI Cryo-em structure of p.Aeruginosa mlafebd with amppnp (see paper)
29% identity, 82% coverage: 3:224/271 of query aligns to 3:224/262 of 7chaI

query
sites
7chaI
S
 
A
V
 
V
A
 
E
L
 
L
K
 
K
D
 
G
I
 
L
K
 
T
V
 
F
E
 
K
L
x
R
N
 
G
D
 
S
R
 
R
A
 
A
I
 
I
L
 
F
H
 
D
N
 
N
I
 
I
N
 
D
M
 
V
E
 
R
L
 
I
M
 
P
E
 
R
G
 
G
R
 
K
V
 
V
T
 
T
T
 
G
I
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
C
|
C
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
M
 
L
L
 
L
K
 
R
T
 
L
I
 
I
S
 
A
R
 
S
I
 
Q
I
 
L
S
 
R
A
 
P
K
 
S
E
 
K
G
 
G
G
 
E
V
 
V
Y
 
W
I
 
V
N
 
N
D
 
G
I
 
Q
N
 
N
I
 
L
R
 
P
Q
 
Q
M
 
L
K
 
S
S
 
R
K
 
G
E
 
D
V
 
L
-
 
F
-
 
D
-
 
M
A
 
R
K
 
K
K
 
Q
I
 
F
S
 
G
I
 
V
L
 
L
S
 
F
Q
 
Q
R
 
S
N
 
G
K
 
A
L
 
L
Q
 
F
Y
 
T
D
 
D
V
 
L
K
 
D
V
 
V
E
 
F
D
 
E
L
 
N
V
 
V
S
 
A
F
 
F
S
 
P
R
 
-
Y
 
-
P
 
-
H
 
-
L
 
L
K
 
R
R
 
V
F
 
H
Q
 
T
S
 
Q
L
 
L
K
 
P
E
 
E
H
 
E
D
 
M
I
 
I
-
 
R
E
 
D
I
 
I
I
 
V
N
 
L
W
 
M
A
 
K
M
 
L
R
 
Q
E
 
A
T
 
V
G
 
G
A
 
L
D
 
R
E
 
G
F
 
A
R
 
V
K
 
E
R
 
L
M
 
M
M
 
P
S
 
D
E
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
A
 
K
Q
 
R
R
 
R
V
 
V
W
 
A
I
 
L
S
 
A
L
 
R
L
 
A
L
 
I
A
 
A
Q
 
L
E
 
D
A
 
P
D
 
Q
V
 
I
L
 
L
L
 
L
L
 
Y
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
F
T
 
V
Y
 
G
L
 
Q
D
 
D
I
 
P
H
 
I
H
 
A
Q
 
M
L
 
G
E
 
V
T
 
L
L
 
V
N
 
R
I
 
L
V
 
I
K
 
R
E
 
L
L
 
L
N
 
N
E
 
D
Q
 
A
S
 
L
H
 
G
Q
 
I
T
 
T
V
 
S
V
 
I
M
 
V
V
 
V
L
 
S
H
 
H
D
 
D
I
 
L
N
 
A
H
 
E
A
 
T
I
 
A
K
 
S
Y
 
I
S
 
A
D
 
D
N
 
Y
L
 
I
V
 
Y
V
 
I
M
 
V
K
 
G
D
 
D
G
 
G
D
 
R
I
 
V
I
 
L
T
 
G
S
 
H
G
 
G
H
 
T
P
 
P

7ahhC Opua inhibited inward-facing, sbd docked (see paper)
28% identity, 78% coverage: 19:230/271 of query aligns to 42:253/382 of 7ahhC

query
sites
7ahhC
L
 
V
H
 
Y
N
 
D
I
 
T
N
 
N
M
 
F
E
 
E
L
 
I
M
 
N
E
 
E
G
 
G
R
 
E
V
 
I
T
 
F
T
 
V
I
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
L
N
 
S
G
|
G
C
 
S
G
|
G
K
|
K
S
 
S
T
 
T
M
 
L
L
 
L
K
 
R
T
 
L
I
 
L
S
 
N
R
 
R
I
 
L
I
 
I
S
 
E
A
 
P
K
 
T
E
 
S
G
 
G
G
 
K
V
 
I
Y
 
F
I
 
I
N
 
D
D
 
N
I
 
-
N
 
-
I
 
-
R
 
-
Q
 
-
M
 
-
K
 
-
S
 
-
K
 
-
E
 
-
V
 
-
A
 
-
K
 
Q
K
 
D
I
 
V
S
 
A
I
 
T
L
 
L
S
 
N
Q
 
K
R
 
E
N
 
D
K
 
L
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
V
D
 
R
V
 
R
K
 
K
V
 
T
E
 
M
D
 
S
L
 
M
V
 
V
-
 
F
-
 
Q
S
 
N
F
 
F
S
 
G
R
 
L
Y
 
F
P
 
P
H
 
H
L
 
R
K
 
T
R
 
I
F
 
L
Q
 
E
S
 
N
L
 
-
K
 
T
E
 
E
H
 
Y
D
 
G
I
 
L
E
 
E
I
 
V
I
 
Q
N
 
N
W
 
V
-
 
P
-
 
K
-
 
E
-
 
E
-
 
R
-
 
R
-
 
K
-
 
R
-
 
A
-
 
E
-
 
K
A
 
A
M
 
L
R
 
D
E
 
N
T
 
A
G
 
N
A
 
L
D
 
L
E
 
D
F
 
F
R
 
K
K
 
D
R
 
Q
M
 
Y
M
 
P
S
 
K
E
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
A
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
W
 
G
I
 
L
S
 
A
L
 
R
L
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
N
E
 
D
A
 
P
D
 
E
V
 
I
L
 
L
L
 
L
L
 
M
D
|
D
E
|
E
P
 
A
T
 
F
T
 
S
Y
 
A
L
 
L
D
 
D
I
 
P
H
 
L
H
 
I
Q
 
R
L
 
R
E
 
E
T
 
M
L
 
Q
N
 
D
I
 
E
V
 
L
K
 
L
E
 
E
L
 
L
N
 
Q
E
 
A
Q
 
K
S
 
F
H
 
Q
Q
 
K
T
 
T
V
 
I
V
 
I
M
 
F
V
 
V
L
 
S
H
 
H
D
 
D
I
 
L
N
 
N
H
 
E
A
 
A
I
 
L
K
 
R
Y
 
I
S
 
G
D
 
D
N
 
R
L
 
I
V
 
A
V
 
I
M
 
M
K
 
K
D
 
D
G
 
G
D
 
K
I
 
I
I
 
M
T
 
Q
S
 
I
G
 
G
H
 
T
P
 
G
T
 
E
E
 
E
V
 
I
L
 
L
T
 
T
N
 
N

Sites not aligning to the query:

7aheC Opua inhibited inward facing (see paper)
28% identity, 78% coverage: 19:230/271 of query aligns to 42:253/382 of 7aheC

query
sites
7aheC
L
 
V
H
 
Y
N
 
D
I
 
T
N
 
N
M
 
F
E
 
E
L
 
I
M
 
N
E
 
E
G
 
G
R
 
E
V
 
I
T
 
F
T
 
V
I
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
L
N
 
S
G
 
G
C
 
S
G
 
G
K
 
K
S
 
S
T
 
T
M
 
L
L
 
L
K
 
R
T
 
L
I
 
L
S
 
N
R
 
R
I
 
L
I
 
I
S
 
E
A
 
P
K
 
T
E
 
S
G
 
G
G
 
K
V
 
I
Y
 
F
I
 
I
N
 
D
D
 
N
I
 
-
N
 
-
I
 
-
R
 
-
Q
 
-
M
 
-
K
 
-
S
 
-
K
 
-
E
 
-
V
 
-
A
 
-
K
 
Q
K
 
D
I
 
V
S
 
A
I
 
T
L
 
L
S
 
N
Q
 
K
R
 
E
N
 
D
K
 
L
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
V
D
 
R
V
 
R
K
 
K
V
 
T
E
 
M
D
 
S
L
 
M
V
 
V
-
 
F
-
 
Q
S
 
N
F
 
F
S
 
G
R
 
L
Y
 
F
P
 
P
H
 
H
L
 
R
K
 
T
R
 
I
F
 
L
Q
 
E
S
 
N
L
 
-
K
 
T
E
 
E
H
 
Y
D
 
G
I
 
L
E
 
E
I
 
V
I
 
Q
N
 
N
W
 
V
-
 
P
-
 
K
-
 
E
-
 
E
-
 
R
-
 
R
-
 
K
-
 
R
-
 
A
-
 
E
-
 
K
A
 
A
M
 
L
R
 
D
E
 
N
T
 
A
G
 
N
A
 
L
D
 
L
E
 
D
F
 
F
R
 
K
K
 
D
R
 
Q
M
 
Y
M
 
P
S
 
K
E
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
A
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
W
 
G
I
 
L
S
 
A
L
 
R
L
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
N
E
 
D
A
 
P
D
 
E
V
 
I
L
 
L
L
 
L
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
A
T
 
F
T
 
S
Y
 
A
L
 
L
D
 
D
I
 
P
H
 
L
H
 
I
Q
 
R
L
 
R
E
 
E
T
 
M
L
 
Q
N
 
D
I
 
E
V
 
L
K
 
L
E
 
E
L
 
L
N
 
Q
E
 
A
Q
 
K
S
 
F
H
 
Q
Q
 
K
T
 
T
V
 
I
V
 
I
M
 
F
V
 
V
L
 
S
H
 
H
D
 
D
I
 
L
N
 
N
H
 
E
A
 
A
I
 
L
K
 
R
Y
 
I
S
 
G
D
 
D
N
 
R
L
 
I
V
 
A
V
 
I
M
 
M
K
 
K
D
 
D
G
 
G
D
 
K
I
 
I
I
 
M
T
 
Q
S
 
I
G
 
G
H
 
T
P
 
G
T
 
E
E
 
E
V
 
I
L
 
L
T
 
T
N
 
N

Sites not aligning to the query:

4ymuJ Crystal structure of an amino acid abc transporter complex with arginines and atps (see paper)
29% identity, 78% coverage: 18:228/271 of query aligns to 16:224/240 of 4ymuJ

query
sites
4ymuJ
I
x
V
L
 
L
H
 
K
N
 
G
I
 
V
N
 
T
M
 
L
E
 
K
L
 
V
M
 
N
E
 
K
G
 
G
R
 
E
V
 
V
T
 
V
T
 
V
I
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
C
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
M
 
L
L
 
L
K
 
R
T
 
C
I
 
I
S
 
N
R
 
L
I
 
L
I
 
E
S
 
E
A
 
P
K
 
T
E
 
K
G
 
G
G
 
E
V
 
V
Y
 
F
I
 
I
N
 
D
D
 
G
I
 
V
N
 
K
I
 
I
R
 
N
Q
 
N
M
 
G
K
 
K
S
 
V
K
 
N
-
 
I
-
 
N
E
 
K
V
 
V
A
 
R
K
 
Q
K
 
K
I
 
V
S
 
G
I
 
M
L
 
V
S
 
F
Q
 
Q
R
 
H
N
 
-
K
 
-
L
 
-
Q
 
-
Y
 
-
D
 
-
V
 
-
K
 
-
V
 
-
E
 
-
D
 
-
L
 
-
V
 
-
S
 
-
F
 
F
S
 
N
R
 
L
Y
 
F
P
 
P
H
 
H
L
 
L
K
 
T
R
 
A
F
 
I
Q
 
E
S
 
N
L
 
I
K
 
T
E
 
L
H
 
A
D
 
P
I
 
V
E
 
K
I
 
V
I
 
K
N
 
K
W
 
M
A
 
N
M
 
K
R
 
K
E
 
E
T
 
-
G
 
-
A
 
A
D
 
E
E
 
E
F
 
L
R
 
A
K
 
V
R
 
D
M
 
L
M
 
L
S
 
A
E
 
K
-
 
V
-
 
G
-
 
L
-
 
L
-
 
D
-
 
K
-
 
K
-
 
D
-
 
Q
-
 
Y
-
 
P
-
 
I
-
 
K
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
A
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
L
W
 
A
I
 
I
S
 
A
L
 
R
L
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
M
E
 
Q
A
 
P
D
 
E
V
 
V
L
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
T
T
 
S
Y
 
A
L
 
L
D
 
D
I
 
P
H
 
E
H
 
M
Q
 
V
L
 
K
E
 
E
T
 
V
L
 
L
N
 
N
I
 
V
V
 
M
K
 
K
E
 
Q
L
 
L
N
 
A
E
 
N
Q
 
E
S
 
G
H
 
-
Q
 
M
T
 
T
V
 
M
V
 
V
M
 
V
V
 
V
L
 
T
H
|
H
D
 
E
I
 
M
N
 
G
H
 
F
A
 
A
I
 
R
K
 
E
Y
 
V
S
 
G
D
 
D
N
 
R
L
 
V
V
 
I
V
 
F
M
 
M
K
 
D
D
 
D
G
 
G
D
 
V
I
 
I
I
 
V
T
 
E
S
 
E
G
 
G
H
 
T
P
 
P
T
 
E
E
 
E
V
 
I
L
 
F

Sites not aligning to the query:

7ahdC Opua (e190q) occluded (see paper)
28% identity, 78% coverage: 19:230/271 of query aligns to 42:253/260 of 7ahdC

query
sites
7ahdC
L
 
V
H
 
Y
N
 
D
I
 
T
N
 
N
M
 
F
E
 
E
L
 
I
M
 
N
E
 
E
G
 
G
R
 
E
V
 
I
T
 
F
T
 
V
I
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
L
N
x
S
G
|
G
C
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
M
 
L
L
 
L
K
 
R
T
 
L
I
 
L
S
 
N
R
 
R
I
 
L
I
 
I
S
 
E
A
 
P
K
 
T
E
 
S
G
 
G
G
 
K
V
 
I
Y
 
F
I
 
I
N
 
D
D
 
N
I
 
-
N
 
-
I
 
-
R
 
-
Q
 
-
M
 
-
K
 
-
S
 
-
K
 
-
E
 
-
V
 
-
A
 
-
K
 
Q
K
 
D
I
 
V
S
 
A
I
 
T
L
 
L
S
 
N
Q
 
K
R
 
E
N
 
D
K
 
L
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
V
D
 
R
V
 
R
K
 
K
V
 
T
E
 
M
D
 
S
L
 
M
V
 
V
-
 
F
-
x
Q
S
 
N
F
 
F
S
 
G
R
 
L
Y
 
F
P
 
P
H
 
H
L
 
R
K
 
T
R
 
I
F
 
L
Q
 
E
S
 
N
L
 
-
K
 
T
E
 
E
H
 
Y
D
 
G
I
 
L
E
 
E
I
 
V
I
 
Q
N
 
N
W
 
V
-
 
P
-
 
K
-
 
E
-
 
E
-
 
R
-
 
R
-
 
K
-
 
R
-
 
A
-
 
E
-
 
K
A
 
A
M
 
L
R
 
D
E
 
N
T
 
A
G
 
N
A
 
L
D
 
L
E
 
D
F
 
F
R
 
K
K
 
D
R
 
Q
M
 
Y
M
 
P
S
x
K
E
x
Q
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
Q
x
M
A
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
W
 
G
I
 
L
S
 
A
L
 
R
L
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
N
E
 
D
A
 
P
D
 
E
V
 
I
L
 
L
L
 
L
L
 
M
D
 
D
E
x
Q
P
 
A
T
 
F
T
 
S
Y
 
A
L
 
L
D
 
D
I
 
P
H
 
L
H
 
I
Q
 
R
L
 
R
E
 
E
T
 
M
L
 
Q
N
 
D
I
 
E
V
 
L
K
 
L
E
 
E
L
 
L
N
 
Q
E
 
A
Q
 
K
S
 
F
H
 
Q
Q
 
K
T
 
T
V
 
I
V
 
I
M
 
F
V
 
V
L
 
S
H
|
H
D
 
D
I
 
L
N
 
N
H
 
E
A
 
A
I
 
L
K
 
R
Y
 
I
S
 
G
D
 
D
N
 
R
L
 
I
V
 
A
V
 
I
M
 
M
K
 
K
D
 
D
G
 
G
D
 
K
I
 
I
I
 
M
T
 
Q
S
 
I
G
 
G
H
 
T
P
 
G
T
 
E
E
 
E
V
 
I
L
 
L
T
 
T
N
 
N

Sites not aligning to the query:

3c4jA Abc protein artp in complex with atp-gamma-s
28% identity, 85% coverage: 9:237/271 of query aligns to 9:242/242 of 3c4jA

query
sites
3c4jA
I
 
L
K
 
K
V
 
K
E
 
S
L
x
F
N
 
G
D
 
S
R
 
L
A
 
E
I
x
V
L
 
L
H
 
K
N
 
G
I
 
I
N
 
N
M
 
V
E
 
H
L
 
I
M
 
R
E
 
E
G
 
G
R
 
E
V
 
V
T
 
V
T
 
V
I
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
C
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
M
 
F
L
 
L
K
 
R
T
 
C
I
 
L
S
 
N
R
 
L
I
 
L
I
 
E
S
 
D
A
 
F
K
 
D
E
 
E
G
 
G
G
 
E
V
 
I
Y
 
I
I
 
I
N
 
D
D
 
G
I
 
I
N
 
N
I
 
L
R
 
K
Q
 
A
M
 
K
K
 
D
S
 
T
-
 
N
-
 
L
K
 
N
E
 
K
V
 
V
A
 
R
K
 
E
K
 
E
I
 
V
S
 
G
I
 
M
L
 
V
S
 
F
Q
 
Q
R
 
R
N
 
-
K
 
-
L
 
-
Q
 
-
Y
 
-
D
 
-
V
 
-
K
 
-
V
 
-
E
 
-
D
 
-
L
 
-
V
 
-
S
 
-
F
 
F
S
 
N
R
 
L
Y
 
F
P
 
P
H
 
H
L
 
M
K
 
T
R
 
V
F
 
L
Q
 
N
S
 
N
L
 
I
K
 
T
E
 
L
H
 
A
D
 
P
I
 
M
E
 
K
I
 
V
I
 
R
N
 
K
W
 
W
A
 
P
-
 
R
-
 
E
-
 
K
-
 
A
-
 
E
-
 
A
-
 
K
-
 
A
-
 
M
-
 
E
-
 
L
M
 
L
R
 
D
E
 
K
T
 
V
G
 
G
A
 
L
D
 
K
E
 
D
F
 
K
R
 
A
K
 
H
R
 
A
M
 
Y
M
 
P
S
 
D
E
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
W
 
A
I
 
I
S
 
A
L
 
R
L
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
M
E
 
E
A
 
P
D
 
K
V
 
I
L
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
T
 
S
Y
 
A
L
 
L
D
 
D
I
 
P
H
 
E
H
 
M
Q
 
V
L
 
G
E
 
E
T
 
V
L
 
L
N
 
S
I
 
V
V
 
M
K
 
K
E
 
Q
L
 
L
N
 
A
E
 
N
Q
 
E
S
 
G
H
 
-
Q
 
M
T
 
T
V
 
M
V
 
V
M
 
V
V
 
V
L
 
T
H
 
H
D
 
E
I
 
M
N
 
G
H
 
F
A
 
A
I
 
R
K
 
E
Y
 
V
S
 
G
D
 
D
N
 
R
L
 
V
V
 
L
V
 
F
M
 
M
K
 
D
D
 
G
G
 
G
D
 
Y
I
 
I
I
 
I
T
 
E
S
 
E
G
 
G
H
 
K
P
 
P
T
 
E
E
 
D
V
 
L
L
 
F
-
 
D
-
 
R
-
 
P
-
 
Q
-
 
H
-
 
E
-
 
R
T
 
T
N
 
K
E
 
A
I
 
F
L
 
L
N
 
S
D
 
K
V
 
V
F
 
F

3c41J Abc protein artp in complex with amp-pnp/mg2+
28% identity, 85% coverage: 9:237/271 of query aligns to 9:242/242 of 3c41J

query
sites
3c41J
I
 
L
K
 
K
V
 
K
E
 
S
L
x
F
N
 
G
D
 
S
R
 
L
A
 
E
I
x
V
L
 
L
H
 
K
N
 
G
I
 
I
N
 
N
M
 
V
E
 
H
L
 
I
M
 
R
E
 
E
G
 
G
R
 
E
V
 
V
T
 
V
T
 
V
I
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
C
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
M
 
F
L
 
L
K
 
R
T
 
C
I
 
L
S
 
N
R
 
L
I
 
L
I
 
E
S
 
D
A
 
F
K
 
D
E
 
E
G
 
G
G
 
E
V
 
I
Y
 
I
I
 
I
N
 
D
D
 
G
I
 
I
N
 
N
I
 
L
R
 
K
Q
 
A
M
 
K
K
 
D
S
 
T
-
 
N
-
 
L
K
 
N
E
 
K
V
 
V
A
 
R
K
 
E
K
 
E
I
 
V
S
 
G
I
 
M
L
 
V
S
 
F
Q
 
Q
R
 
R
N
 
-
K
 
-
L
 
-
Q
 
-
Y
 
-
D
 
-
V
 
-
K
 
-
V
 
-
E
 
-
D
 
-
L
 
-
V
 
-
S
 
-
F
 
F
S
 
N
R
 
L
Y
 
F
P
 
P
H
 
H
L
 
M
K
 
T
R
 
V
F
 
L
Q
 
N
S
 
N
L
 
I
K
 
T
E
 
L
H
 
A
D
 
P
I
 
M
E
 
K
I
 
V
I
 
R
N
 
K
W
 
W
A
 
P
-
 
R
-
 
E
-
 
K
-
 
A
-
 
E
-
 
A
-
 
K
-
 
A
-
 
M
-
 
E
-
 
L
M
 
L
R
 
D
E
 
K
T
 
V
G
 
G
A
 
L
D
 
K
E
 
D
F
 
K
R
 
A
K
 
H
R
 
A
M
 
Y
M
 
P
S
 
D
E
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
W
 
A
I
 
I
S
 
A
L
 
R
L
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
M
E
 
E
A
 
P
D
 
K
V
 
I
L
 
M
L
 
L
L
 
F
D
|
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
T
 
S
Y
 
A
L
 
L
D
 
D
I
 
P
H
 
E
H
 
M
Q
 
V
L
 
G
E
 
E
T
 
V
L
 
L
N
 
S
I
 
V
V
 
M
K
 
K
E
 
Q
L
 
L
N
 
A
E
 
N
Q
 
E
S
 
G
H
 
-
Q
 
M
T
 
T
V
 
M
V
 
V
M
 
V
V
 
V
L
 
T
H
 
H
D
 
E
I
 
M
N
 
G
H
 
F
A
 
A
I
 
R
K
 
E
Y
 
V
S
 
G
D
 
D
N
 
R
L
 
V
V
 
L
V
 
F
M
 
M
K
 
D
D
 
G
G
 
G
D
 
Y
I
 
I
I
 
I
T
 
E
S
 
E
G
 
G
H
 
K
P
 
P
T
 
E
E
 
D
V
 
L
L
 
F
-
 
D
-
 
R
-
 
P
-
 
Q
-
 
H
-
 
E
-
 
R
T
 
T
N
 
K
E
 
A
I
 
F
L
 
L
N
 
S
D
 
K
V
 
V
F
 
F

2olkA Abc protein artp in complex with adp-beta-s
28% identity, 85% coverage: 9:237/271 of query aligns to 9:242/242 of 2olkA

query
sites
2olkA
I
 
L
K
 
K
V
 
K
E
 
S
L
x
F
N
 
G
D
 
S
R
 
L
A
 
E
I
x
V
L
 
L
H
 
K
N
 
G
I
 
I
N
 
N
M
 
V
E
 
H
L
 
I
M
 
R
E
 
E
G
 
G
R
 
E
V
 
V
T
 
V
T
 
V
I
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
C
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
M
 
F
L
 
L
K
 
R
T
 
C
I
 
L
S
 
N
R
 
L
I
 
L
I
 
E
S
 
D
A
 
F
K
 
D
E
 
E
G
 
G
G
 
E
V
 
I
Y
 
I
I
 
I
N
 
D
D
 
G
I
 
I
N
 
N
I
 
L
R
 
K
Q
 
A
M
 
K
K
 
D
S
 
T
-
 
N
-
 
L
K
 
N
E
 
K
V
 
V
A
 
R
K
 
E
K
 
E
I
 
V
S
 
G
I
 
M
L
 
V
S
 
F
Q
 
Q
R
 
R
N
 
-
K
 
-
L
 
-
Q
 
-
Y
 
-
D
 
-
V
 
-
K
 
-
V
 
-
E
 
-
D
 
-
L
 
-
V
 
-
S
 
-
F
 
F
S
 
N
R
 
L
Y
 
F
P
 
P
H
 
H
L
 
M
K
 
T
R
 
V
F
 
L
Q
 
N
S
 
N
L
 
I
K
 
T
E
 
L
H
 
A
D
 
P
I
 
M
E
 
K
I
 
V
I
 
R
N
 
K
W
 
W
A
 
P
-
 
R
-
 
E
-
 
K
-
 
A
-
 
E
-
 
A
-
 
K
-
 
A
-
 
M
-
 
E
-
 
L
M
 
L
R
 
D
E
 
K
T
 
V
G
 
G
A
 
L
D
 
K
E
 
D
F
 
K
R
 
A
K
 
H
R
 
A
M
 
Y
M
 
P
S
 
D
E
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
W
 
A
I
 
I
S
 
A
L
 
R
L
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
M
E
 
E
A
 
P
D
 
K
V
 
I
L
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
T
 
S
Y
 
A
L
 
L
D
 
D
I
 
P
H
 
E
H
 
M
Q
 
V
L
 
G
E
 
E
T
 
V
L
 
L
N
 
S
I
 
V
V
 
M
K
 
K
E
 
Q
L
 
L
N
 
A
E
 
N
Q
 
E
S
 
G
H
 
-
Q
 
M
T
 
T
V
 
M
V
 
V
M
 
V
V
 
V
L
 
T
H
 
H
D
 
E
I
 
M
N
 
G
H
 
F
A
 
A
I
 
R
K
 
E
Y
 
V
S
 
G
D
 
D
N
 
R
L
 
V
V
 
L
V
 
F
M
 
M
K
 
D
D
 
G
G
 
G
D
 
Y
I
 
I
I
 
I
T
 
E
S
 
E
G
 
G
H
 
K
P
 
P
T
 
E
E
 
D
V
 
L
L
 
F
-
 
D
-
 
R
-
 
P
-
 
Q
-
 
H
-
 
E
-
 
R
T
 
T
N
 
K
E
 
A
I
 
F
L
 
L
N
 
S
D
 
K
V
 
V
F
 
F

2oljA Abc protein artp in complex with adp/mg2+
28% identity, 85% coverage: 9:237/271 of query aligns to 9:242/242 of 2oljA

query
sites
2oljA
I
 
L
K
 
K
V
 
K
E
 
S
L
x
F
N
 
G
D
 
S
R
 
L
A
 
E
I
x
V
L
 
L
H
 
K
N
 
G
I
 
I
N
 
N
M
 
V
E
 
H
L
 
I
M
 
R
E
 
E
G
 
G
R
 
E
V
 
V
T
 
V
T
 
V
I
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
C
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
M
 
F
L
 
L
K
 
R
T
 
C
I
 
L
S
 
N
R
 
L
I
 
L
I
 
E
S
 
D
A
 
F
K
 
D
E
 
E
G
 
G
G
 
E
V
 
I
Y
 
I
I
 
I
N
 
D
D
 
G
I
 
I
N
 
N
I
 
L
R
 
K
Q
 
A
M
 
K
K
 
D
S
 
T
-
 
N
-
 
L
K
 
N
E
 
K
V
 
V
A
 
R
K
 
E
K
 
E
I
 
V
S
 
G
I
 
M
L
 
V
S
 
F
Q
 
Q
R
 
R
N
 
-
K
 
-
L
 
-
Q
 
-
Y
 
-
D
 
-
V
 
-
K
 
-
V
 
-
E
 
-
D
 
-
L
 
-
V
 
-
S
 
-
F
 
F
S
 
N
R
 
L
Y
 
F
P
 
P
H
 
H
L
 
M
K
 
T
R
 
V
F
 
L
Q
 
N
S
 
N
L
 
I
K
 
T
E
 
L
H
 
A
D
 
P
I
 
M
E
 
K
I
 
V
I
 
R
N
 
K
W
 
W
A
 
P
-
 
R
-
 
E
-
 
K
-
 
A
-
 
E
-
 
A
-
 
K
-
 
A
-
 
M
-
 
E
-
 
L
M
 
L
R
 
D
E
 
K
T
 
V
G
 
G
A
 
L
D
 
K
E
 
D
F
 
K
R
 
A
K
 
H
R
 
A
M
 
Y
M
 
P
S
 
D
E
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
W
 
A
I
 
I
S
 
A
L
 
R
L
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
M
E
 
E
A
 
P
D
 
K
V
 
I
L
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
T
 
S
Y
 
A
L
 
L
D
 
D
I
 
P
H
 
E
H
 
M
Q
 
V
L
 
G
E
 
E
T
 
V
L
 
L
N
 
S
I
 
V
V
 
M
K
 
K
E
 
Q
L
 
L
N
 
A
E
 
N
Q
 
E
S
 
G
H
 
-
Q
 
M
T
 
T
V
 
M
V
 
V
M
 
V
V
 
V
L
 
T
H
 
H
D
 
E
I
 
M
N
 
G
H
 
F
A
 
A
I
 
R
K
 
E
Y
 
V
S
 
G
D
 
D
N
 
R
L
 
V
V
 
L
V
 
F
M
 
M
K
 
D
D
 
G
G
 
G
D
 
Y
I
 
I
I
 
I
T
 
E
S
 
E
G
 
G
H
 
K
P
 
P
T
 
E
E
 
D
V
 
L
L
 
F
-
 
D
-
 
R
-
 
P
-
 
Q
-
 
H
-
 
E
-
 
R
T
 
T
N
 
K
E
 
A
I
 
F
L
 
L
N
 
S
D
 
K
V
 
V
F
 
F

P19566 Maltose/maltodextrin import ATP-binding protein MalK; EC 7.5.2.1 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
28% identity, 84% coverage: 1:227/271 of query aligns to 1:221/369 of P19566

query
sites
P19566
M
 
M
T
 
A
S
 
S
V
 
V
A
 
Q
L
 
L
K
 
R
D
 
N
I
 
V
K
 
T
V
 
K
E
 
A
L
 
W
N
 
G
D
 
D
R
 
V
A
 
V
I
 
V
L
 
S
H
 
K
N
 
D
I
 
I
N
 
N
M
 
L
E
 
D
L
 
I
M
 
H
E
 
D
G
 
G
R
 
E
V
 
F
T
 
V
T
 
V
I
 
F
I
 
V
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
 
G
C
 
C
G
 
G
K
 
K
S
 
S
T
 
T
M
 
L
L
 
L
K
 
R
T
 
M
I
 
I
S
 
A
R
 
G
I
 
L
I
 
E
S
 
T
A
 
I
K
 
T
E
 
S
G
 
G
G
 
D
V
 
L
Y
 
F
I
 
I
N
 
G
D
 
E
I
 
T
N
 
R
I
 
M
R
 
N
Q
 
D
M
 
I
K
 
P
S
 
P
K
 
A
E
 
E
V
 
-
A
 
-
K
 
R
K
 
G
I
 
V
S
 
G
I
 
M
L
 
V
S
 
F
Q
 
Q
R
 
S
N
 
Y
K
 
A
L
|
L
Q
 
Y
Y
 
P
D
 
H
V
 
L
K
 
S
V
 
V
E
 
A
D
 
E
L
 
N
V
 
M
S
 
S
F
 
F
S
 
G
R
 
-
Y
 
-
P
 
-
H
 
-
L
 
L
K
 
K
R
 
L
F
 
A
Q
 
G
S
 
A
L
 
K
K
 
K
E
 
E
H
 
V
D
 
M
I
 
N
E
 
Q
I
 
R
I
 
V
N
 
N
W
 
Q
A
 
V
M
 
A
R
 
E
E
 
V
T
 
L
G
 
Q
A
 
L
D
 
A
E
 
H
F
 
L
R
 
L
K
 
E
R
 
R
M
 
K
M
 
P
S
 
K
E
 
A
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
A
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
W
 
A
I
 
I
S
 
G
L
 
R
L
 
T
L
 
L
A
 
V
Q
 
A
E
 
E
A
 
P
D
 
R
V
 
V
L
 
F
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
|
P
T
 
L
T
 
S
Y
 
N
L
 
L
D
|
D
I
 
A
H
 
A
H
 
L
Q
 
R
L
 
V
E
 
Q
T
 
M
L
 
R
N
 
I
I
 
E
V
 
I
K
 
S
E
 
R
L
 
L
N
 
H
E
 
K
Q
 
R
S
 
L
H
 
G
Q
 
R
T
 
T
V
 
M
V
 
I
M
 
Y
V
 
V
L
 
T
H
 
H
D
 
D
I
 
Q
N
 
V
H
 
E
A
 
A
I
 
M
K
 
T
Y
 
L
S
 
A
D
 
D
N
 
K
L
 
I
V
 
V
V
 
V
M
 
L
K
 
D
D
 
A
G
 
G
D
 
R
I
 
V
I
 
A
T
 
Q
S
 
V
G
 
G
H
 
K
P
 
P
T
 
L
E
 
E
V
 
L

Sites not aligning to the query:

7d0aB Acinetobacter mlafedb complex in adp-vanadate trapped vclose conformation (see paper)
28% identity, 83% coverage: 4:227/271 of query aligns to 5:228/263 of 7d0aB

query
sites
7d0aB
V
 
I
A
 
E
L
 
V
K
 
K
D
 
N
I
 
L
K
 
S
V
 
F
E
 
N
L
 
R
N
 
G
D
 
E
R
 
R
A
 
V
I
 
I
L
 
Y
H
 
D
N
 
N
I
 
I
N
 
S
M
 
L
E
 
N
L
 
I
M
 
R
E
 
R
G
 
G
R
 
Q
V
 
I
T
 
T
T
 
A
I
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
 
G
C
x
T
G
|
G
K
|
K
S
 
T
T
 
T
M
 
L
L
 
L
K
 
R
T
 
L
I
 
I
S
 
G
R
 
G
I
 
Q
I
 
L
S
 
V
A
 
P
K
 
D
E
 
Q
G
 
G
G
 
E
V
 
V
Y
 
L
I
 
L
N
 
D
D
 
G
I
 
K
N
 
D
I
 
I
R
 
A
Q
 
Q
M
 
M
K
 
S
S
 
R
K
 
Q
E
 
E
V
 
L
-
 
F
-
 
A
-
 
A
A
 
R
K
 
A
K
 
R
I
 
M
S
 
G
I
 
M
L
 
L
S
 
F
Q
 
Q
R
 
S
N
 
G
K
 
A
L
 
L
Q
 
F
Y
 
T
D
 
D
V
 
M
K
 
S
V
 
V
E
 
Y
D
 
E
L
 
N
V
 
V
S
 
A
F
 
F
S
 
P
R
 
I
Y
 
R
P
 
A
H
 
H
L
 
T
K
 
K
R
 
-
F
 
-
Q
 
-
S
 
-
L
 
L
K
 
S
E
 
E
H
 
N
D
 
L
I
 
I
-
 
A
E
 
E
I
 
L
I
 
V
N
 
A
W
 
L
A
 
K
M
 
L
R
 
E
E
 
S
T
 
V
G
 
G
A
 
L
D
 
R
E
 
G
F
 
T
R
 
E
K
 
Q
R
 
L
M
 
M
M
 
P
S
 
T
E
|
E
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
 
G
Q
x
M
A
 
N
Q
 
R
R
 
R
V
 
V
W
 
A
I
 
L
S
 
A
L
 
R
L
 
A
L
 
I
A
 
A
Q
 
L
E
 
D
A
 
P
D
 
D
V
 
L
L
 
I
L
 
M
L
 
Y
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
F
T
 
A
Y
 
G
L
 
Q
D
 
D
I
 
P
H
 
I
H
 
V
Q
 
K
L
 
G
E
 
V
T
 
L
L
 
T
N
 
R
I
 
L
V
 
I
K
 
R
E
 
S
L
 
L
N
 
R
E
 
E
Q
 
A
S
 
L
H
 
D
Q
 
L
T
 
T
V
 
T
V
 
I
M
 
I
V
 
V
L
 
S
H
 
H
D
 
D
I
 
V
N
 
P
H
 
E
A
 
T
I
 
L
K
 
S
Y
 
I
S
 
A
D
 
D
N
 
Y
L
 
I
V
 
Y
V
 
V
M
 
V
K
 
A
D
 
E
G
 
G
D
 
K
I
 
I
I
 
Q
T
 
G
S
 
E
G
 
G
H
 
T
P
 
P
T
 
E
E
 
E
V
 
L

7d08B Acinetobacter mlafedb complex in atp-bound vtrans1 conformation (see paper)
28% identity, 83% coverage: 4:227/271 of query aligns to 5:228/263 of 7d08B

query
sites
7d08B
V
 
I
A
 
E
L
 
V
K
 
K
D
 
N
I
 
L
K
 
S
V
 
F
E
 
N
L
x
R
N
 
G
D
 
E
R
|
R
A
 
V
I
 
I
L
 
Y
H
 
D
N
 
N
I
 
I
N
 
S
M
 
L
E
 
N
L
 
I
M
 
R
E
 
R
G
 
G
R
 
Q
V
 
I
T
 
T
T
 
A
I
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
|
G
C
x
T
G
 
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
M
 
L
L
 
L
K
 
R
T
 
L
I
 
I
S
 
G
R
 
G
I
 
Q
I
 
L
S
 
V
A
 
P
K
 
D
E
 
Q
G
 
G
G
 
E
V
 
V
Y
 
L
I
 
L
N
 
D
D
 
G
I
 
K
N
 
D
I
 
I
R
 
A
Q
 
Q
M
 
M
K
 
S
S
 
R
K
 
Q
E
 
E
V
 
L
-
 
F
-
 
A
-
 
A
A
 
R
K
 
A
K
 
R
I
 
M
S
 
G
I
 
M
L
 
L
S
 
F
Q
 
Q
R
 
S
N
 
G
K
 
A
L
 
L
Q
 
F
Y
 
T
D
 
D
V
 
M
K
 
S
V
 
V
E
 
Y
D
 
E
L
 
N
V
 
V
S
 
A
F
 
F
S
 
P
R
 
I
Y
 
R
P
 
A
H
 
H
L
 
T
K
 
K
R
 
-
F
 
-
Q
 
-
S
 
-
L
 
L
K
 
S
E
 
E
H
 
N
D
 
L
I
 
I
-
 
A
E
 
E
I
 
L
I
 
V
N
 
A
W
 
L
A
 
K
M
 
L
R
 
E
E
 
S
T
 
V
G
 
G
A
 
L
D
 
R
E
 
G
F
 
T
R
 
E
K
 
Q
R
 
L
M
 
M
M
 
P
S
 
T
E
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
A
 
N
Q
 
R
R
 
R
V
 
V
W
 
A
I
 
L
S
 
A
L
 
R
L
 
A
L
 
I
A
 
A
Q
 
L
E
 
D
A
 
P
D
 
D
V
 
L
L
 
I
L
 
M
L
 
Y
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
F
T
 
A
Y
 
G
L
 
Q
D
 
D
I
 
P
H
 
I
H
 
V
Q
 
K
L
 
G
E
 
V
T
 
L
L
 
T
N
 
R
I
 
L
V
 
I
K
 
R
E
 
S
L
 
L
N
 
R
E
 
E
Q
 
A
S
 
L
H
 
D
Q
 
L
T
 
T
V
 
T
V
 
I
M
 
I
V
 
V
L
 
S
H
 
H
D
 
D
I
 
V
N
 
P
H
 
E
A
 
T
I
 
L
K
 
S
Y
 
I
S
 
A
D
 
D
N
 
Y
L
 
I
V
 
Y
V
 
V
M
 
V
K
 
A
D
 
E
G
 
G
D
 
K
I
 
I
I
 
Q
T
 
G
S
 
E
G
 
G
H
 
T
P
 
P
T
 
E
E
 
E
V
 
L

6z5uK Cryo-em structure of the a. Baumannii mlabdef complex bound to appnhp (see paper)
28% identity, 83% coverage: 4:227/271 of query aligns to 3:226/253 of 6z5uK

query
sites
6z5uK
V
 
I
A
 
E
L
 
V
K
 
K
D
 
N
I
 
L
K
 
S
V
 
F
E
 
N
L
x
R
N
 
G
D
 
E
R
 
R
A
 
V
I
 
I
L
 
Y
H
 
D
N
 
N
I
 
I
N
 
S
M
 
L
E
 
N
L
 
I
M
 
R
E
 
R
G
 
G
R
 
Q
V
 
I
T
 
T
T
 
A
I
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
C
 
T
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
M
 
L
L
 
L
K
 
R
T
 
L
I
 
I
S
 
G
R
 
G
I
 
Q
I
 
L
S
 
V
A
 
P
K
 
D
E
 
Q
G
 
G
G
 
E
V
 
V
Y
 
L
I
 
L
N
 
D
D
 
G
I
 
K
N
 
D
I
 
I
R
 
A
Q
 
Q
M
 
M
K
 
S
S
 
R
K
 
Q
E
 
E
V
 
L
-
 
F
-
 
A
-
 
A
A
 
R
K
 
A
K
 
R
I
 
M
S
 
G
I
 
M
L
 
L
S
 
F
Q
|
Q
R
 
S
N
 
G
K
 
A
L
 
L
Q
 
F
Y
 
T
D
 
D
V
 
M
K
 
S
V
 
V
E
 
Y
D
 
E
L
 
N
V
 
V
S
 
A
F
 
F
S
 
P
R
 
I
Y
 
R
P
 
A
H
 
H
L
 
T
K
 
K
R
 
-
F
 
-
Q
 
-
S
 
-
L
 
L
K
 
S
E
 
E
H
 
N
D
 
L
I
 
I
-
 
A
E
 
E
I
 
L
I
 
V
N
 
A
W
 
L
A
 
K
M
 
L
R
 
E
E
 
S
T
 
V
G
 
G
A
 
L
D
 
R
E
 
G
F
 
T
R
 
E
K
 
Q
R
 
L
M
 
M
M
 
P
S
 
T
E
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
A
 
N
Q
 
R
R
 
R
V
 
V
W
 
A
I
 
L
S
 
A
L
 
R
L
 
A
L
 
I
A
 
A
Q
 
L
E
 
D
A
 
P
D
 
D
V
 
L
L
 
I
L
 
M
L
 
Y
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
F
T
 
A
Y
 
G
L
 
Q
D
 
D
I
 
P
H
 
I
H
 
V
Q
 
K
L
 
G
E
 
V
T
 
L
L
 
T
N
 
R
I
 
L
V
 
I
K
 
R
E
 
S
L
 
L
N
 
R
E
 
E
Q
 
A
S
 
L
H
 
D
Q
 
L
T
 
T
V
 
T
V
 
I
M
 
I
V
 
V
L
 
S
H
|
H
D
 
D
I
 
V
N
 
P
H
 
E
A
 
T
I
 
L
K
 
S
Y
 
I
S
 
A
D
 
D
N
 
Y
L
 
I
V
 
Y
V
 
V
M
 
V
K
 
A
D
 
E
G
 
G
D
 
K
I
 
I
I
 
Q
T
 
G
S
 
E
G
 
G
H
 
T
P
 
P
T
 
E
E
 
E
V
 
L

5d3mA Folate ecf transporter: amppnp bound state (see paper)
29% identity, 79% coverage: 16:228/271 of query aligns to 20:231/280 of 5d3mA

query
sites
5d3mA
R
 
R
A
 
P
I
 
A
L
 
L
H
 
S
N
 
D
I
 
L
N
 
S
M
 
F
E
 
A
L
 
I
M
 
E
E
 
R
G
 
G
R
 
S
V
 
W
T
 
T
T
 
A
I
 
L
I
 
I
G
 
G
P
 
H
N
|
N
G
|
G
C
 
S
G
 
G
K
|
K
S
|
S
T
 
T
M
 
V
L
 
S
K
 
K
T
 
L
I
 
I
S
 
N
R
 
G
I
 
L
I
 
L
S
 
A
A
 
P
K
 
D
E
 
D
-
 
L
-
 
D
-
 
K
G
 
S
G
 
S
V
 
I
Y
 
T
I
 
V
N
 
D
D
 
G
I
 
V
N
 
K
I
 
L
R
 
G
Q
 
A
M
 
D
K
 
T
S
 
V
K
 
W
E
 
E
V
 
V
A
 
R
K
 
E
K
 
K
I
 
V
S
 
G
I
 
I
L
 
V
S
 
F
Q
 
Q
R
 
N
N
 
P
K
 
D
L
 
N
Q
 
Q
Y
 
F
-
 
V
D
 
G
V
 
A
K
 
T
V
 
V
E
 
S
D
 
D
L
 
D
V
 
V
S
 
A
F
 
F
S
 
G
R
 
-
Y
 
-
P
 
-
H
 
-
L
 
L
K
 
E
R
 
N
F
 
R
Q
 
A
S
 
V
L
 
P
K
 
R
E
 
P
H
 
E
D
 
M
I
 
L
E
 
K
I
 
I
I
 
V
N
 
A
W
 
Q
A
 
A
M
 
V
R
 
A
E
 
D
T
 
V
G
 
G
A
 
M
D
 
A
E
 
D
F
 
Y
R
 
A
K
 
D
R
 
S
M
 
E
M
 
P
S
 
S
E
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
A
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
W
 
A
I
 
I
S
 
A
L
 
G
L
 
I
L
 
L
A
 
A
Q
 
V
E
 
K
A
 
P
D
 
Q
V
 
V
L
 
I
L
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
S
T
 
T
T
 
S
Y
 
M
L
 
L
D
 
D
I
 
P
H
 
E
H
 
G
Q
 
K
L
 
E
E
 
Q
T
 
I
L
 
L
N
 
D
I
 
L
V
 
V
K
 
R
E
 
K
L
 
I
N
 
K
E
 
E
Q
 
D
S
 
N
H
 
N
Q
 
L
T
 
T
V
 
V
V
 
I
M
 
S
V
 
I
L
 
T
H
 
H
D
 
D
I
 
L
N
 
E
H
 
E
A
 
A
I
 
A
K
 
G
Y
 
-
S
 
A
D
 
D
N
 
Q
L
 
V
V
 
L
V
 
V
M
 
L
K
 
D
D
 
D
G
 
G
D
 
Q
I
 
L
I
 
L
T
 
D
S
 
Q
G
 
G
H
 
K
P
 
P
T
 
E
E
 
E
V
 
I
L
 
F

Sites not aligning to the query:

8bmpA Cryo-em structure of the folate-specific ecf transporter complex in msp2n2 lipid nanodiscs bound to atp and adp (see paper)
29% identity, 79% coverage: 16:228/271 of query aligns to 17:228/278 of 8bmpA

query
sites
8bmpA
R
 
R
A
 
P
I
 
A
L
 
L
H
 
S
N
 
D
I
 
L
N
 
S
M
 
F
E
 
A
L
 
I
M
 
E
E
 
R
G
 
G
R
 
S
V
 
W
T
 
T
T
 
A
I
 
L
I
 
I
G
 
G
P
 
H
N
|
N
G
 
G
C
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
M
 
V
L
 
S
K
 
K
T
 
L
I
 
I
S
 
N
R
 
G
I
 
L
I
 
L
S
 
A
A
 
P
K
 
D
E
 
D
-
 
L
-
 
D
-
 
K
G
 
S
G
 
S
V
 
I
Y
 
T
I
 
V
N
 
D
D
 
G
I
 
V
N
 
K
I
 
L
R
 
G
Q
 
A
M
 
D
K
 
T
S
 
V
K
 
W
E
 
E
V
 
V
A
 
R
K
 
E
K
 
K
I
 
V
S
 
G
I
 
I
L
 
V
S
 
F
Q
 
Q
R
 
N
N
 
P
K
 
D
L
 
N
Q
 
Q
Y
 
F
-
 
V
D
 
G
V
 
A
K
 
T
V
 
V
E
 
S
D
 
D
L
 
D
V
 
V
S
 
A
F
 
F
S
 
G
R
 
-
Y
 
-
P
 
-
H
 
-
L
 
L
K
 
E
R
 
N
F
 
R
Q
 
A
S
 
V
L
 
P
K
 
R
E
 
P
H
 
E
D
 
M
I
 
L
E
 
K
I
 
I
I
 
V
N
 
A
W
 
Q
A
 
A
M
 
V
R
 
A
E
 
D
T
 
V
G
 
G
A
 
M
D
 
A
E
 
D
F
 
Y
R
 
A
K
 
D
R
 
S
M
 
E
M
 
P
S
 
S
E
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
A
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
W
 
A
I
 
I
S
 
A
L
 
G
L
 
I
L
 
L
A
 
A
Q
 
V
E
 
K
A
 
P
D
 
Q
V
 
V
L
 
I
L
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P