SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_017549807.1 NCBI__GCF_000330705.1:WP_017549807.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3na8A Crystal structure of a putative dihydrodipicolinate synthetase from pseudomonas aeruginosa
32% identity, 96% coverage: 13:292/293 of query aligns to 11:290/291 of 3na8A

query
sites
3na8A
I
 
I
T
 
T
P
 
P
M
 
F
H
 
A
G
 
A
D
 
D
Y
 
G
S
 
G
V
 
L
N
 
D
Y
 
L
E
 
P
G
 
A
M
 
L
K
 
G
A
 
R
N
 
S
V
 
I
Q
 
E
Y
 
R
Y
 
L
L
 
I
D
 
D
Q
 
G
Q
 
G
A
 
V
A
 
H
G
 
A
I
 
I
V
 
A
I
 
P
V
 
L
G
 
G
S
|
S
T
 
T
G
 
G
E
 
E
F
 
G
A
 
A
S
 
Y
L
 
L
D
 
S
E
 
D
A
 
P
E
 
E
K
 
W
K
 
D
K
 
E
I
 
V
V
 
V
E
 
D
L
 
F
V
 
T
G
 
L
P
 
K
M
 
T
V
 
V
K
 
A
D
 
H
T
 
R
D
 
-
T
 
V
A
 
P
L
 
T
L
 
I
V
 
V
G
 
S
I
 
V
A
 
S
D
 
D
E
 
L
R
 
T
T
 
T
S
 
A
K
 
K
V
 
T
I
 
V
E
 
R
Y
 
R
A
 
A
R
 
Q
H
 
F
A
 
A
E
 
E
A
 
S
N
 
L
H
 
G
A
 
A
D
 
E
G
 
A
L
 
V
L
 
M
L
 
V
I
 
L
N
 
P
S
 
I
F
 
S
Y
|
Y
Q
 
W
T
 
K
P
 
L
T
 
N
E
 
E
E
 
A
E
 
E
A
 
V
F
 
F
H
 
Q
Q
 
H
F
 
Y
K
 
R
D
 
A
V
 
V
N
 
G
D
 
E
V
 
A
V
 
I
T
 
G
Q
 
V
P
 
P
L
 
V
M
 
M
M
 
L
Y
|
Y
N
 
N
N
 
N
P
 
P
F
 
G
T
|
T
A
 
S
N
 
G
V
 
I
N
 
D
L
 
M
E
 
S
D
 
V
A
 
E
T
 
L
I
 
I
C
 
L
R
 
R
I
 
I
D
x
V
R
 
R
E
 
E
L
x
V
D
|
D
K
 
N
V
|
V
Q
 
T
Y
 
M
I
 
V
K
|
K
E
 
E
S
 
S
S
 
T
G
 
G
D
 
D
I
 
I
R
 
Q
-
 
R
-
 
M
-
 
H
K
 
K
V
 
L
R
 
R
A
 
L
V
 
L
A
 
G
D
 
E
N
 
G
T
 
-
D
 
R
L
 
V
V
 
P
L
 
F
F
 
Y
C
 
N
G
 
G
S
 
C
D
 
N
D
 
P
L
 
L
A
 
A
F
 
L
E
 
E
S
 
A
F
 
F
V
 
V
Q
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
K
G
 
G
W
 
W
V
x
C
S
 
S
V
 
A
A
 
A
A
 
P
N
 
N
I
 
L
A
 
I
P
 
P
N
 
T
S
 
L
A
 
N
A
 
G
Q
 
Q
L
 
L
Y
 
Y
E
 
Q
L
 
A
V
 
V
K
 
L
A
 
D
G
 
G
K
 
D
Y
 
L
D
 
E
E
 
K
A
 
A
K
 
R
T
 
A
L
 
L
N
 
F
K
 
Y
D
 
R
L
 
Q
L
 
L
P
 
P
L
 
L
C
 
L
E
 
D
F
 
F
L
 
I
E
 
L
D
 
R
S
 
R
G
 
G
K
 
L
Y
 
P
V
 
T
Q
 
T
I
 
I
V
 
-
K
 
K
K
 
A
A
 
G
M
 
L
D
 
G
L
 
L
K
 
S
G
 
G
L
 
L
A
 
E
G
 
V
G
 
G
P
 
A
S
 
P
R
 
R
K
 
L
P
 
P
R
 
V
L
 
Q
G
 
A
L
 
L
T
 
D
D
 
T
D
 
E
E
 
G
V
 
C
S
 
R
Q
 
Y
L
 
L
K
 
Q
S
 
G
L
 
L
M
 
L
E
 
E
K
 
E
L
 
L

4dxvA Crystal structure of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii complexed with mg and cl ions at 1.80 a resolution
30% identity, 83% coverage: 5:246/293 of query aligns to 2:243/291 of 4dxvA

query
sites
4dxvA
F
 
I
E
 
Q
G
 
G
A
 
S
F
 
I
P
 
V
V
 
A
L
 
I
I
 
V
T
 
T
P
 
P
M
 
M
H
 
L
G
 
K
D
 
D
Y
 
G
S
 
G
V
 
V
N
 
D
Y
 
W
E
 
K
G
 
S
M
 
L
K
 
E
A
 
K
N
 
L
V
 
V
Q
 
E
Y
 
W
Y
 
H
L
 
I
D
 
E
Q
 
Q
Q
 
G
A
 
T
A
 
N
G
 
S
I
 
I
V
 
V
I
 
A
V
 
V
G
 
G
S
x
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
F
 
A
A
 
S
S
 
T
L
 
L
D
 
S
E
 
M
A
 
E
E
 
E
K
 
H
K
 
T
K
 
Q
I
 
V
V
 
I
-
 
K
E
 
E
L
 
I
V
 
I
G
 
-
P
 
-
M
 
R
V
 
V
K
 
A
D
 
N
T
 
K
D
 
R
T
 
I
A
 
P
L
 
I
L
 
I
V
 
A
G
 
G
I
 
T
A
 
G
D
 
A
E
 
N
R
 
S
T
 
T
S
 
R
K
 
E
V
 
A
I
 
I
E
 
E
Y
 
L
A
 
T
R
 
K
H
 
A
A
 
A
E
 
K
A
 
D
N
 
L
H
 
G
A
 
A
D
 
D
G
 
A
L
 
A
L
 
L
L
 
L
I
 
V
N
x
T
S
 
P
F
 
Y
Y
|
Y
Q
 
N
T
 
K
P
 
P
T
 
T
E
 
Q
E
 
E
E
 
G
A
 
L
F
 
Y
H
 
Q
Q
 
H
F
 
Y
K
 
K
D
 
A
V
 
I
N
 
A
D
 
E
V
 
A
V
 
V
T
 
E
Q
 
L
P
 
P
L
 
L
M
 
I
M
 
L
Y
|
Y
N
|
N
N
x
V
P
|
P
F
 
G
T
x
R
A
x
T
N
 
G
V
 
V
N
 
D
L
 
L
E
 
S
D
 
N
A
 
D
T
 
T
I
 
A
C
 
V
R
 
R
I
 
L
D
 
-
R
 
A
E
 
E
L
 
I
D
 
P
K
 
N
V
 
I
Q
 
V
Y
 
G
I
 
I
K
|
K
E
 
D
S
 
A
S
 
T
G
 
G
D
 
D
I
 
V
R
 
P
K
 
R
V
 
G
R
 
K
A
 
A
V
 
L
A
 
I
D
 
D
-
 
A
-
 
L
N
 
N
T
 
G
D
 
K
L
 
M
V
 
A
L
 
V
F
 
Y
C
 
S
G
 
G
S
 
D
D
 
D
D
 
E
L
 
T
A
 
A
F
 
W
E
 
E
S
 
L
F
 
M
V
 
L
Q
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
D
G
 
G
W
 
N
V
x
I
S
 
S
V
 
V
A
 
T
A
 
A
N
 
N
I
 
I
A
 
A
P
 
P
N
 
K
S
 
A
A
 
M
A
 
S
Q
 
E
L
 
V
Y
 
C
E
 
A
L
 
V
V
 
A
K
 
I
A
 
A
G
 
K
K
 
D
Y
 
E
D
 
Q
E
 
Q
A
 
A
K
 
K
T
 
T
L
 
L
N
 
N
K
 
N
D
 
K
L
 
I
L
 
A
P
 
N
L
 
L
C
 
H
E
 
N
F
 
I
L
 
L

3u8gA Crystal structure of the complex of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with oxalic acid at 1.80 a resolution
30% identity, 83% coverage: 5:246/293 of query aligns to 2:243/291 of 3u8gA

query
sites
3u8gA
F
 
I
E
 
Q
G
 
G
A
 
S
F
 
I
P
 
V
V
x
A
L
 
I
I
 
V
T
 
T
P
 
P
M
 
M
H
 
L
G
 
K
D
 
D
Y
 
G
S
 
G
V
 
V
N
 
D
Y
 
W
E
 
K
G
 
S
M
 
L
K
 
E
A
 
K
N
 
L
V
 
V
Q
 
E
Y
 
W
Y
 
H
L
 
I
D
 
E
Q
 
Q
Q
 
G
A
 
T
A
 
N
G
 
S
I
 
I
V
 
V
I
 
A
V
 
V
G
|
G
S
x
T
T
|
T
G
 
G
E
 
E
F
 
A
A
 
S
S
 
T
L
 
L
D
 
S
E
 
M
A
 
E
E
 
E
K
 
H
K
 
T
K
 
Q
I
 
V
V
 
I
-
 
K
E
 
E
L
 
I
V
 
I
G
 
-
P
 
-
M
 
R
V
 
V
K
 
A
D
 
N
T
 
K
D
 
R
T
 
I
A
 
P
L
 
I
L
 
I
V
 
A
G
 
G
I
 
T
A
 
G
D
 
A
E
 
N
R
 
S
T
 
T
S
 
R
K
 
E
V
 
A
I
 
I
E
 
E
Y
 
L
A
 
T
R
 
K
H
 
A
A
 
A
E
 
K
A
 
D
N
 
L
H
 
G
A
 
A
D
 
D
G
 
A
L
 
A
L
|
L
L
 
L
I
 
V
N
 
T
S
 
P
F
 
Y
Y
|
Y
Q
 
N
T
 
K
P
 
P
T
 
T
E
 
Q
E
 
E
E
 
G
A
 
L
F
 
Y
H
 
Q
Q
 
H
F
 
Y
K
 
K
D
 
A
V
 
I
N
 
A
D
 
E
V
 
A
V
 
V
T
 
E
Q
 
L
P
 
P
L
 
L
M
 
I
M
 
L
Y
|
Y
N
 
N
N
 
V
P
 
P
F
 
G
T
x
R
A
 
T
N
 
G
V
 
V
N
 
D
L
 
L
E
 
S
D
 
N
A
 
D
T
 
T
I
 
A
C
 
V
R
 
R
I
 
L
D
 
-
R
 
A
E
 
E
L
 
I
D
 
P
K
 
N
V
 
I
Q
 
V
Y
 
G
I
 
I
K
|
K
E
 
D
S
 
A
S
 
T
G
 
G
D
 
D
I
 
V
R
 
P
K
 
R
V
 
G
R
 
K
A
 
A
V
 
L
A
 
I
D
 
D
-
 
A
-
 
L
N
 
N
T
 
G
D
 
K
L
 
M
V
 
A
L
 
V
F
 
Y
C
 
S
G
 
G
S
 
D
D
 
D
D
 
E
L
 
T
A
 
A
F
 
W
E
 
E
S
 
L
F
 
M
V
 
L
Q
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
D
G
 
G
W
 
N
V
x
I
S
 
S
V
 
V
A
 
T
A
 
A
N
 
N
I
 
I
A
 
A
P
 
P
N
 
K
S
 
A
A
 
M
A
 
S
Q
 
E
L
 
V
Y
 
C
E
 
A
L
 
V
V
 
A
K
 
I
A
 
A
G
 
K
K
 
D
Y
 
E
D
 
Q
E
 
Q
A
 
A
K
 
K
T
 
T
L
 
L
N
 
N
K
 
N
D
 
K
L
 
I
L
 
A
P
 
N
L
 
L
C
 
H
E
 
N
F
 
I
L
 
L

3tdfA Crystal structure of the complex of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with 2-ketobutanoic acid at 1.99 a resolution
30% identity, 83% coverage: 5:246/293 of query aligns to 2:243/291 of 3tdfA

query
sites
3tdfA
F
 
I
E
 
Q
G
 
G
A
 
S
F
 
I
P
 
V
V
x
A
L
 
I
I
 
V
T
 
T
P
 
P
M
 
M
H
 
L
G
 
K
D
 
D
Y
 
G
S
 
G
V
 
V
N
 
D
Y
 
W
E
 
K
G
 
S
M
 
L
K
 
E
A
 
K
N
 
L
V
 
V
Q
 
E
Y
 
W
Y
 
H
L
 
I
D
 
E
Q
 
Q
Q
 
G
A
 
T
A
 
N
G
 
S
I
 
I
V
 
V
I
 
A
V
 
V
G
 
G
S
x
T
T
|
T
G
 
G
E
 
E
F
 
A
A
 
S
S
 
T
L
 
L
D
 
S
E
 
M
A
 
E
E
 
E
K
 
H
K
 
T
K
 
Q
I
 
V
V
 
I
-
 
K
E
 
E
L
 
I
V
 
I
G
 
-
P
 
-
M
 
R
V
 
V
K
 
A
D
 
N
T
 
K
D
 
R
T
 
I
A
 
P
L
 
I
L
 
I
V
 
A
G
 
G
I
 
T
A
 
G
D
 
A
E
 
N
R
 
S
T
 
T
S
 
R
K
 
E
V
 
A
I
 
I
E
 
E
Y
 
L
A
 
T
R
 
K
H
 
A
A
 
A
E
 
K
A
 
D
N
 
L
H
 
G
A
 
A
D
 
D
G
 
A
L
 
A
L
 
L
L
 
L
I
 
V
N
 
T
S
 
P
F
 
Y
Y
|
Y
Q
 
N
T
 
K
P
 
P
T
 
T
E
 
Q
E
 
E
E
 
G
A
 
L
F
 
Y
H
 
Q
Q
 
H
F
 
Y
K
 
K
D
 
A
V
 
I
N
 
A
D
 
E
V
 
A
V
 
V
T
 
E
Q
 
L
P
 
P
L
 
L
M
 
I
M
 
L
Y
|
Y
N
 
N
N
 
V
P
 
P
F
 
G
T
x
R
A
 
T
N
 
G
V
 
V
N
 
D
L
 
L
E
 
S
D
 
N
A
 
D
T
 
T
I
 
A
C
 
V
R
 
R
I
 
L
D
 
-
R
 
A
E
 
E
L
 
I
D
 
P
K
 
N
V
 
I
Q
 
V
Y
 
G
I
 
I
K
|
K
E
 
D
S
 
A
S
 
T
G
 
G
D
 
D
I
 
V
R
 
P
K
 
R
V
 
G
R
 
K
A
 
A
V
 
L
A
 
I
D
 
D
-
 
A
-
 
L
N
 
N
T
 
G
D
 
K
L
 
M
V
 
A
L
 
V
F
 
Y
C
 
S
G
 
G
S
 
D
D
 
D
D
 
E
L
 
T
A
 
A
F
 
W
E
 
E
S
 
L
F
 
M
V
 
L
Q
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
D
G
 
G
W
 
N
V
x
I
S
 
S
V
 
V
A
 
T
A
 
A
N
 
N
I
 
I
A
 
A
P
 
P
N
 
K
S
 
A
A
 
M
A
 
S
Q
 
E
L
 
V
Y
 
C
E
 
A
L
 
V
V
 
A
K
 
I
A
 
A
G
 
K
K
 
D
Y
 
E
D
 
Q
E
 
Q
A
 
A
K
 
K
T
 
T
L
 
L
N
 
N
K
 
N
D
 
K
L
 
I
L
 
A
P
 
N
L
 
L
C
 
H
E
 
N
F
 
I
L
 
L

3tceA Crystal structure of the complex of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with 5-hydroxylysine at 2.6 a resolution
30% identity, 83% coverage: 5:246/293 of query aligns to 2:243/291 of 3tceA

query
sites
3tceA
F
 
I
E
 
Q
G
 
G
A
 
S
F
 
I
P
 
V
V
 
A
L
 
I
I
 
V
T
 
T
P
 
P
M
 
M
H
 
L
G
 
K
D
 
D
Y
 
G
S
 
G
V
 
V
N
 
D
Y
 
W
E
 
K
G
 
S
M
 
L
K
 
E
A
 
K
N
 
L
V
 
V
Q
 
E
Y
 
W
Y
 
H
L
 
I
D
 
E
Q
 
Q
Q
 
G
A
 
T
A
 
N
G
 
S
I
 
I
V
 
V
I
 
A
V
 
V
G
 
G
S
x
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
F
 
A
A
x
S
S
 
T
L
|
L
D
 
S
E
 
M
A
 
E
E
 
E
K
x
H
K
 
T
K
 
Q
I
 
V
V
 
I
-
 
K
E
 
E
L
 
I
V
 
I
G
 
-
P
 
-
M
 
R
V
 
V
K
 
A
D
 
N
T
 
K
D
 
R
T
 
I
A
 
P
L
 
I
L
 
I
V
 
A
G
 
G
I
 
T
A
 
G
D
 
A
E
 
N
R
 
S
T
 
T
S
 
R
K
 
E
V
 
A
I
 
I
E
 
E
Y
 
L
A
 
T
R
 
K
H
 
A
A
 
A
E
 
K
A
 
D
N
 
L
H
 
G
A
 
A
D
 
D
G
 
A
L
 
A
L
 
L
L
 
L
I
 
V
N
 
T
S
 
P
F
x
Y
Y
|
Y
Q
 
N
T
 
K
P
 
P
T
 
T
E
 
Q
E
 
E
E
 
G
A
 
L
F
 
Y
H
 
Q
Q
 
H
F
 
Y
K
 
K
D
 
A
V
 
I
N
 
A
D
 
E
V
 
A
V
 
V
T
 
E
Q
 
L
P
 
P
L
 
L
M
 
I
M
 
L
Y
|
Y
N
 
N
N
 
V
P
 
P
F
 
G
T
x
R
A
 
T
N
 
G
V
 
V
N
 
D
L
 
L
E
 
S
D
 
N
A
 
D
T
 
T
I
 
A
C
 
V
R
 
R
I
 
L
D
 
-
R
 
A
E
 
E
L
 
I
D
 
P
K
 
N
V
 
I
Q
 
V
Y
 
G
I
 
I
K
|
K
E
 
D
S
 
A
S
 
T
G
 
G
D
 
D
I
 
V
R
 
P
K
 
R
V
 
G
R
 
K
A
 
A
V
 
L
A
 
I
D
 
D
-
 
A
-
 
L
N
 
N
T
 
G
D
 
K
L
 
M
V
 
A
L
 
V
F
 
Y
C
 
S
G
 
G
S
 
D
D
 
D
D
 
E
L
 
T
A
 
A
F
 
W
E
 
E
S
 
L
F
 
M
V
 
L
Q
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
D
G
 
G
W
 
N
V
x
I
S
 
S
V
 
V
A
 
T
A
 
A
N
 
N
I
 
I
A
 
A
P
 
P
N
 
K
S
 
A
A
 
M
A
 
S
Q
 
E
L
 
V
Y
 
C
E
 
A
L
 
V
V
 
A
K
 
I
A
 
A
G
 
K
K
 
D
Y
 
E
D
 
Q
E
 
Q
A
 
A
K
 
K
T
 
T
L
 
L
N
 
N
K
 
N
D
 
K
L
 
I
L
 
A
P
 
N
L
 
L
C
 
H
E
 
N
F
 
I
L
 
L

3rk8A Crystal structure of the chloride inhibited dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii complexed with pyruvate at 1.8 a resolution
30% identity, 83% coverage: 5:246/293 of query aligns to 2:243/291 of 3rk8A

query
sites
3rk8A
F
 
I
E
 
Q
G
 
G
A
 
S
F
 
I
P
 
V
V
 
A
L
 
I
I
 
V
T
 
T
P
 
P
M
 
M
H
 
L
G
 
K
D
 
D
Y
 
G
S
 
G
V
 
V
N
 
D
Y
 
W
E
 
K
G
 
S
M
 
L
K
 
E
A
 
K
N
 
L
V
 
V
Q
 
E
Y
 
W
Y
 
H
L
 
I
D
 
E
Q
 
Q
Q
 
G
A
 
T
A
 
N
G
 
S
I
 
I
V
 
V
I
 
A
V
 
V
G
 
G
S
x
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
F
 
A
A
 
S
S
 
T
L
 
L
D
 
S
E
 
M
A
 
E
E
 
E
K
 
H
K
 
T
K
 
Q
I
 
V
V
 
I
-
 
K
E
 
E
L
 
I
V
 
I
G
 
-
P
 
-
M
 
R
V
 
V
K
 
A
D
 
N
T
 
K
D
 
R
T
 
I
A
 
P
L
 
I
L
 
I
V
 
A
G
 
G
I
 
T
A
 
G
D
 
A
E
 
N
R
 
S
T
 
T
S
 
R
K
 
E
V
 
A
I
 
I
E
 
E
Y
 
L
A
 
T
R
 
K
H
 
A
A
 
A
E
 
K
A
 
D
N
 
L
H
 
G
A
 
A
D
 
D
G
 
A
L
 
A
L
 
L
L
 
L
I
 
V
N
 
T
S
 
P
F
 
Y
Y
|
Y
Q
 
N
T
 
K
P
 
P
T
 
T
E
 
Q
E
 
E
E
 
G
A
 
L
F
 
Y
H
 
Q
Q
 
H
F
 
Y
K
 
K
D
 
A
V
 
I
N
 
A
D
 
E
V
 
A
V
 
V
T
 
E
Q
 
L
P
 
P
L
 
L
M
 
I
M
 
L
Y
|
Y
N
 
N
N
 
V
P
 
P
F
 
G
T
x
R
A
 
T
N
 
G
V
 
V
N
 
D
L
 
L
E
 
S
D
 
N
A
 
D
T
 
T
I
 
A
C
 
V
R
 
R
I
 
L
D
 
-
R
 
A
E
 
E
L
 
I
D
 
P
K
 
N
V
 
I
Q
 
V
Y
 
G
I
 
I
K
|
K
E
 
D
S
 
A
S
 
T
G
 
G
D
 
D
I
 
V
R
 
P
K
 
R
V
 
G
R
 
K
A
 
A
V
 
L
A
 
I
D
 
D
-
 
A
-
 
L
N
 
N
T
 
G
D
 
K
L
 
M
V
 
A
L
 
V
F
 
Y
C
 
S
G
|
G
S
 
D
D
 
D
D
 
E
L
 
T
A
 
A
F
 
W
E
 
E
S
 
L
F
 
M
V
 
L
Q
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
D
G
 
G
W
 
N
V
x
I
S
 
S
V
 
V
A
 
T
A
 
A
N
 
N
I
 
I
A
 
A
P
 
P
N
 
K
S
 
A
A
 
M
A
 
S
Q
 
E
L
 
V
Y
 
C
E
 
A
L
 
V
V
 
A
K
 
I
A
 
A
G
 
K
K
 
D
Y
 
E
D
 
Q
E
 
Q
A
 
A
K
 
K
T
 
T
L
 
L
N
 
N
K
 
N
D
 
K
L
 
I
L
 
A
P
 
N
L
 
L
C
 
H
E
 
N
F
 
I
L
 
L

Sites not aligning to the query:

3pueB Crystal structure of the complex of dhydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with lysine at 2.6a resolution
30% identity, 83% coverage: 5:246/293 of query aligns to 2:243/291 of 3pueB

query
sites
3pueB
F
 
I
E
 
Q
G
 
G
A
 
S
F
 
I
P
 
V
V
 
A
L
 
I
I
 
V
T
 
T
P
 
P
M
 
M
H
 
L
G
 
K
D
 
D
Y
 
G
S
 
G
V
 
V
N
 
D
Y
 
W
E
 
K
G
 
S
M
 
L
K
 
E
A
 
K
N
 
L
V
 
V
Q
 
E
Y
 
W
Y
 
H
L
 
I
D
 
E
Q
 
Q
Q
 
G
A
 
T
A
 
N
G
 
S
I
 
I
V
 
V
I
 
A
V
 
V
G
 
G
S
x
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
F
 
A
A
 
S
S
 
T
L
 
L
D
 
S
E
 
M
A
 
E
E
 
E
K
 
H
K
 
T
K
 
Q
I
 
V
V
 
I
-
 
K
E
 
E
L
 
I
V
 
I
G
 
-
P
 
-
M
 
R
V
 
V
K
 
A
D
 
N
T
 
K
D
 
R
T
 
I
A
 
P
L
 
I
L
 
I
V
 
A
G
 
G
I
 
T
A
 
G
D
 
A
E
 
N
R
 
S
T
 
T
S
 
R
K
 
E
V
 
A
I
 
I
E
 
E
Y
 
L
A
 
T
R
 
K
H
 
A
A
 
A
E
 
K
A
 
D
N
 
L
H
 
G
A
 
A
D
 
D
G
 
A
L
 
A
L
 
L
L
 
L
I
 
V
N
 
T
S
 
P
F
 
Y
Y
|
Y
Q
 
N
T
 
K
P
 
P
T
 
T
E
 
Q
E
 
E
E
 
G
A
 
L
F
 
Y
H
 
Q
Q
 
H
F
 
Y
K
 
K
D
 
A
V
 
I
N
 
A
D
 
E
V
 
A
V
 
V
T
 
E
Q
 
L
P
 
P
L
 
L
M
 
I
M
 
L
Y
|
Y
N
 
N
N
 
V
P
 
P
F
 
G
T
x
R
A
 
T
N
 
G
V
 
V
N
 
D
L
 
L
E
 
S
D
 
N
A
 
D
T
 
T
I
 
A
C
 
V
R
 
R
I
 
L
D
 
-
R
 
A
E
 
E
L
 
I
D
 
P
K
 
N
V
 
I
Q
 
V
Y
 
G
I
 
I
K
|
K
E
 
D
S
 
A
S
 
T
G
 
G
D
 
D
I
 
V
R
 
P
K
 
R
V
 
G
R
 
K
A
 
A
V
 
L
A
 
I
D
 
D
-
 
A
-
 
L
N
 
N
T
 
G
D
 
K
L
 
M
V
 
A
L
 
V
F
 
Y
C
 
S
G
 
G
S
 
D
D
 
D
D
 
E
L
 
T
A
 
A
F
 
W
E
 
E
S
 
L
F
 
M
V
 
L
Q
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
D
G
 
G
W
 
N
V
x
I
S
 
S
V
 
V
A
 
T
A
 
A
N
 
N
I
 
I
A
 
A
P
 
P
N
 
K
S
 
A
A
 
M
A
 
S
Q
 
E
L
 
V
Y
 
C
E
 
A
L
 
V
V
 
A
K
 
I
A
 
A
G
 
K
K
 
D
Y
 
E
D
 
Q
E
 
Q
A
 
A
K
 
K
T
 
T
L
 
L
N
 
N
K
 
N
D
 
K
L
 
I
L
 
A
P
 
N
L
 
L
C
 
H
E
 
N
F
 
I
L
 
L

Sites not aligning to the query:

Q8UGL3 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase; HTPA synthase; EC 4.3.3.7 from Agrobacterium fabrum (strain C58 / ATCC 33970) (Agrobacterium tumefaciens (strain C58)) (see paper)
30% identity, 81% coverage: 5:242/293 of query aligns to 2:240/294 of Q8UGL3

query
sites
Q8UGL3
F
 
F
E
 
K
G
 
G
A
 
S
F
 
I
P
 
P
V
 
A
L
 
L
I
 
I
T
 
T
P
 
P
M
 
F
H
 
T
G
 
D
D
 
N
Y
 
G
S
 
S
V
 
V
N
 
D
Y
 
E
E
 
K
G
 
A
M
 
F
K
 
A
A
 
A
N
 
H
V
 
V
Q
 
E
Y
 
W
Y
 
Q
L
 
I
D
 
A
Q
 
E
Q
 
G
A
 
S
A
 
N
G
 
G
I
 
L
V
 
V
I
 
P
V
 
V
G
 
G
S
 
T
T
|
T
G
 
G
E
 
E
F
 
S
A
x
P
S
 
T
L
 
L
D
 
S
E
 
H
A
 
D
E
 
E
K
x
H
K
 
K
K
 
R
I
 
V
V
 
V
E
 
E
L
 
L
V
 
C
G
 
-
P
 
I
M
 
E
V
 
V
K
 
A
D
 
A
T
 
K
D
 
R
T
 
V
A
 
P
L
 
V
L
 
I
V
 
A
G
 
G
I
 
A
A
 
G
D
 
S
E
x
N
R
 
N
T
 
T
S
 
D
K
x
E
V
 
A
I
 
I
E
 
E
Y
 
L
A
 
A
R
 
L
H
 
H
A
 
A
E
 
Q
A
 
E
N
 
A
H
 
G
A
 
A
D
 
D
G
 
A
L
 
L
L
 
L
L
 
V
I
 
V
N
 
T
S
 
P
F
x
Y
Y
 
Y
Q
 
N
T
 
K
P
 
P
T
 
T
E
 
Q
E
 
K
E
 
G
A
 
L
F
 
F
H
 
A
Q
 
H
F
 
F
K
 
S
D
 
A
V
 
V
N
 
A
D
 
E
V
 
A
V
 
V
T
 
K
Q
 
L
P
 
P
L
 
I
M
 
V
M
 
I
Y
 
Y
N
 
N
N
 
I
P
 
P
F
 
P
T
 
R
A
 
S
N
 
V
V
 
V
N
 
D
L
 
M
E
 
S
D
 
P
A
 
E
T
 
T
I
 
M
C
 
G
R
 
A
I
 
L
D
 
V
R
 
K
E
 
A
L
 
H
D
 
K
K
 
N
V
 
I
Q
 
I
Y
 
G
I
 
V
K
|
K
E
 
D
S
 
A
S
 
T
G
 
G
D
 
K
I
 
L
R
 
D
K
 
R
V
 
V
-
 
S
-
 
E
R
 
Q
A
 
R
V
 
I
A
 
S
D
 
C
N
 
G
T
 
K
D
 
D
L
 
F
V
 
V
L
 
Q
F
 
L
C
 
S
G
 
G
S
 
E
D
 
D
D
 
G
L
 
T
A
 
A
F
 
L
E
 
G
S
 
F
F
 
N
V
 
A
Q
 
H
G
 
G
A
 
G
T
 
V
G
 
G
W
 
C
V
 
I
S
 
S
V
 
V
A
 
T
A
 
A
N
 
N
I
 
V
A
 
A
P
 
P
N
 
R
S
 
L
A
 
C
A
 
S
Q
 
E
L
 
F
Y
 
Q
E
 
A
L
 
A
V
 
M
K
 
L
A
 
A
G
 
G
K
 
D
Y
 
Y
D
 
A
E
 
K
A
 
A
K
 
L
T
 
E
L
 
Y
N
 
Q
K
 
D
D
 
R
L
 
L
L
 
M
P
 
P
L
 
L

4i7wA Agrobacterium tumefaciens dhdps with lysine and pyruvate
29% identity, 81% coverage: 5:242/293 of query aligns to 2:240/294 of 4i7wA

query
sites
4i7wA
F
 
F
E
 
K
G
 
G
A
 
S
F
 
I
P
 
P
V
 
A
L
 
L
I
 
I
T
 
T
P
 
P
M
 
F
H
 
T
G
 
D
D
 
N
Y
 
G
S
 
A
V
 
V
N
 
D
Y
 
E
E
 
Q
G
 
A
M
 
F
K
 
A
A
 
A
N
 
H
V
 
V
Q
 
E
Y
 
W
Y
 
Q
L
 
I
D
 
A
Q
 
E
Q
 
G
A
 
S
A
 
N
G
 
G
I
 
L
V
 
V
I
 
P
V
 
V
G
 
G
S
x
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
F
x
S
A
x
P
S
 
T
L
|
L
D
 
S
E
 
H
A
 
D
E
 
E
K
x
H
K
 
K
K
 
R
I
 
V
V
 
V
E
 
E
L
 
L
V
 
C
G
 
-
P
 
I
M
 
E
V
 
V
K
 
A
D
 
A
T
 
K
D
 
R
T
 
V
A
 
P
L
 
V
L
 
I
V
 
A
G
 
G
I
 
A
A
 
G
D
 
S
E
x
N
R
 
N
T
 
T
S
 
D
K
x
E
V
 
A
I
 
I
E
 
E
Y
 
L
A
 
A
R
 
L
H
 
H
A
 
A
E
 
Q
A
 
D
N
 
A
H
 
G
A
 
A
D
 
D
G
 
A
L
 
L
L
 
L
L
 
V
I
 
V
N
 
T
S
 
P
F
x
Y
Y
|
Y
Q
 
N
T
 
K
P
 
P
T
 
T
E
 
Q
E
 
K
E
 
G
A
 
L
F
 
F
H
 
A
Q
 
H
F
 
F
K
 
S
D
 
A
V
 
V
N
 
A
D
 
E
V
 
A
V
 
V
T
 
K
Q
 
L
P
 
P
L
 
I
M
 
V
M
 
I
Y
|
Y
N
 
N
N
 
I
P
 
P
F
 
P
T
x
R
A
 
S
N
 
V
V
 
V
N
 
D
L
 
M
E
 
S
D
 
P
A
 
E
T
 
T
I
 
M
C
 
G
R
 
A
I
 
L
D
 
V
R
 
K
E
 
A
L
 
H
D
 
K
K
 
N
V
 
I
Q
 
V
Y
 
G
I
 
V
K
|
K
E
 
D
S
 
A
S
 
T
G
 
G
D
 
K
I
 
L
R
 
D
K
 
R
V
 
V
-
 
S
-
 
E
R
 
Q
A
 
R
V
 
I
A
 
S
D
 
C
N
 
G
T
 
K
D
 
D
L
 
F
V
 
I
L
 
Q
F
 
L
C
 
S
G
 
G
S
 
E
D
 
D
D
 
S
L
 
T
A
 
A
F
 
L
E
 
G
S
 
F
F
 
N
V
 
A
Q
 
H
G
 
G
A
 
G
T
 
V
G
 
G
W
 
C
V
x
I
S
 
S
V
 
V
A
 
S
A
 
A
N
 
N
I
 
V
A
 
A
P
 
P
N
 
R
S
 
L
A
 
C
A
 
S
Q
 
E
L
 
F
Y
 
Q
E
 
A
L
 
A
V
 
M
K
 
L
A
 
A
G
 
G
K
 
D
Y
 
Y
D
 
A
E
 
K
A
 
A
K
 
L
T
 
E
L
 
Y
N
 
Q
K
 
D
D
 
R
L
 
L
L
 
M
P
 
P
L
 
L

Q07607 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase; HTPA synthase; Protein MosA; EC 4.3.3.7 from Rhizobium meliloti (Ensifer meliloti) (Sinorhizobium meliloti) (see paper)
28% identity, 83% coverage: 5:247/293 of query aligns to 2:246/292 of Q07607

query
sites
Q07607
F
 
F
E
 
E
G
 
G
A
 
S
F
 
I
P
 
T
V
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
P
 
P
M
 
F
H
 
-
G
 
A
D
 
D
Y
 
D
S
 
R
V
 
I
N
 
D
Y
 
E
E
 
V
G
 
A
M
 
L
K
 
H
A
 
D
N
 
L
V
 
V
Q
 
E
Y
 
W
Y
 
Q
L
 
I
D
 
E
Q
 
E
Q
 
G
A
 
S
A
 
F
G
 
G
I
 
L
V
 
V
I
 
P
V
 
C
G
 
G
S
 
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
F
 
S
A
 
P
S
 
T
L
 
L
D
 
S
E
 
K
A
 
S
E
 
E
K
 
H
K
 
E
K
 
Q
I
 
V
V
 
V
E
 
E
L
 
I
V
 
T
G
 
-
P
 
-
M
 
-
V
 
I
K
 
K
D
 
T
T
 
A
D
 
N
-
 
G
-
 
R
T
 
V
A
 
P
L
 
V
L
 
I
V
 
A
G
 
G
I
 
A
A
 
G
D
 
S
E
 
N
R
 
S
T
 
T
S
 
A
K
 
E
V
 
A
I
 
I
E
 
A
Y
 
F
A
 
V
R
 
R
H
 
H
A
 
A
E
 
Q
A
 
N
N
 
A
H
 
G
A
 
A
D
 
D
G
 
G
L
 
V
L
 
L
L
 
I
I
 
V
N
 
S
S
 
P
F
 
Y
Y
 
Y
Q
 
N
T
 
K
P
 
P
T
 
T
E
 
Q
E
 
E
E
 
G
A
 
I
F
 
Y
H
 
Q
Q
 
H
F
 
F
K
 
K
D
 
A
V
 
I
N
 
D
D
 
A
V
 
A
V
 
S
T
 
T
Q
 
I
P
 
P
L
 
I
M
 
I
M
 
V
Y
 
Y
N
 
N
N
 
I
P
 
P
F
 
G
T
 
R
A
 
S
N
 
A
V
 
I
N
 
E
L
 
I
E
 
H
D
 
V
A
 
E
T
 
T
I
 
L
C
 
A
R
 
R
I
 
I
D
 
F
R
 
E
E
 
D
L
 
C
D
 
P
K
 
N
V
 
V
Q
 
K
Y
 
G
I
 
V
K
|
K
E
 
D
S
 
A
S
 
T
G
 
G
D
 
N
I
 
L
R
 
L
K
 
R
-
 
P
-
 
S
V
 
L
R
 
E
A
 
R
V
 
M
A
 
A
D
 
C
N
 
G
T
 
E
D
 
D
L
 
F
V
 
N
L
 
L
F
 
L
C
 
T
G
 
G
S
 
E
D
 
D
D
 
G
L
 
T
A
 
A
F
 
L
E
 
G
S
 
Y
F
 
M
V
 
A
Q
 
H
G
 
G
A
 
G
T
 
H
G
 
G
W
 
C
V
 
I
S
 
S
V
 
V
A
 
T
A
 
A
N
 
N
I
 
V
A
 
A
P
 
P
N
 
A
S
 
L
A
 
C
A
 
A
Q
 
D
L
 
F
Y
 
Q
E
 
Q
L
 
A
V
 
C
K
 
L
A
 
N
G
 
G
K
 
D
Y
 
F
D
 
A
E
 
A
A
 
A
K
 
L
T
 
K
L
 
L
N
 
Q
K
 
D
D
 
R
L
 
L
L
 
M
P
 
P
L
 
L
C
 
H
E
 
R
-
 
A
-
 
L
F
 
F
L
 
L
E
 
E

1o5kA Crystal structure of dihydrodipicolinate synthase (tm1521) from thermotoga maritima at 1.80 a resolution
26% identity, 98% coverage: 5:291/293 of query aligns to 3:291/295 of 1o5kA

query
sites
1o5kA
F
 
F
E
 
R
G
 
G
A
 
V
F
 
G
P
 
T
V
 
A
L
 
I
I
 
V
T
 
T
P
 
P
M
 
F
H
 
K
G
 
-
D
 
N
Y
 
G
S
 
E
V
 
L
N
 
D
Y
 
L
E
 
E
G
 
S
M
 
Y
K
 
E
A
 
R
N
 
L
V
 
V
Q
 
R
Y
 
Y
Y
 
Q
L
 
L
D
 
E
Q
 
N
Q
 
G
A
 
V
A
 
N
G
 
A
I
 
L
V
 
I
I
 
V
V
 
L
G
 
G
S
x
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
F
 
S
A
 
P
S
 
T
L
 
V
D
 
N
E
 
E
A
 
D
E
 
E
K
 
R
K
 
E
K
 
K
I
 
L
V
 
V
E
 
S
L
 
R
V
 
T
G
 
L
P
x
E
M
 
I
V
 
V
K
 
-
D
|
D
T
 
G
D
 
K
T
 
I
A
 
P
L
 
V
L
 
I
V
 
V
G
 
G
I
 
A
A
 
G
D
 
T
E
 
N
R
 
S
T
 
T
S
 
E
K
 
K
V
 
T
I
 
L
E
 
K
Y
 
L
A
 
V
R
 
K
H
 
Q
A
 
A
E
 
E
A
 
K
N
 
L
H
 
G
A
 
A
D
 
N
G
 
G
L
 
V
L
 
L
L
 
V
I
 
V
N
 
T
S
 
P
F
 
Y
Y
|
Y
Q
 
N
T
 
K
P
 
P
T
 
T
E
 
Q
E
 
E
E
 
G
A
 
L
F
 
Y
H
 
Q
Q
 
H
F
 
Y
K
 
K
D
 
Y
V
 
I
N
 
S
D
 
E
V
 
R
V
 
T
T
 
D
Q
 
L
P
 
G
L
 
I
M
 
V
M
 
V
Y
|
Y
N
 
N
N
 
V
P
 
P
F
 
G
T
x
R
A
 
T
N
 
G
V
 
V
N
 
N
L
 
V
E
 
L
D
 
P
A
 
E
T
 
T
I
 
A
C
 
A
R
 
R
I
 
I
D
 
A
R
 
A
E
 
D
L
 
L
D
 
K
K
 
N
V
 
V
Q
 
V
Y
 
G
I
 
I
K
|
K
E
 
E
S
 
A
S
 
N
G
 
P
D
 
D
I
 
I
R
 
D
K
 
Q
V
 
I
-
 
D
R
 
R
A
 
T
V
 
V
A
 
S
-
 
L
-
 
T
-
 
K
-
 
Q
D
 
A
N
 
R
T
 
S
D
 
D
L
 
F
V
 
M
L
 
V
F
 
W
C
 
S
G
 
G
S
 
N
D
 
D
D
 
D
L
 
R
A
 
T
F
 
F
E
 
Y
S
 
L
F
 
L
V
 
C
Q
 
A
G
 
G
A
 
G
T
 
D
G
 
G
W
 
V
V
x
I
S
 
S
V
 
V
A
 
V
A
 
S
N
 
N
I
 
V
A
 
A
P
 
P
N
 
K
S
 
Q
A
 
M
A
 
V
Q
 
E
L
 
L
Y
 
C
E
 
A
L
 
E
V
 
Y
K
 
F
A
 
S
G
 
G
K
 
N
Y
 
L
D
 
E
E
 
K
A
 
S
K
 
R
T
 
E
L
 
V
N
 
H
K
 
R
D
 
K
L
 
L
L
 
R
P
 
P
L
 
L
C
 
M
E
 
K
F
 
A
L
 
L
E
 
F
D
 
V
S
 
E
G
 
T
K
 
N
Y
 
P
V
 
I
Q
 
P
I
 
-
V
 
V
K
 
K
K
 
A
A
 
A
M
 
L
D
 
N
L
 
L
K
 
M
G
 
G
L
 
F
A
 
I
G
 
E
G
 
N
P
 
E
S
 
L
R
 
R
K
 
L
P
 
P
R
 
L
L
 
V
G
 
P
L
 
A
T
 
S
D
 
E
D
 
K
E
 
T
V
 
V
S
 
E
Q
 
L
L
 
L
K
 
R
S
 
N
L
 
V
M
 
L
E
 
K
K
 
E

Q9X1K9 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase; HTPA synthase; EC 4.3.3.7 from Thermotoga maritima (strain ATCC 43589 / DSM 3109 / JCM 10099 / NBRC 100826 / MSB8) (see paper)
26% identity, 98% coverage: 5:291/293 of query aligns to 2:290/294 of Q9X1K9

query
sites
Q9X1K9
F
 
F
E
 
R
G
 
G
A
 
V
F
 
G
P
 
T
V
 
A
L
 
I
I
 
V
T
 
T
P
 
P
M
 
F
H
 
K
G
 
-
D
 
N
Y
 
G
S
 
E
V
 
L
N
 
D
Y
 
L
E
 
E
G
 
S
M
 
Y
K
 
E
A
 
R
N
 
L
V
 
V
Q
 
R
Y
 
Y
Y
 
Q
L
 
L
D
 
E
Q
 
N
Q
 
G
A
 
V
A
 
N
G
 
A
I
 
L
V
 
I
I
 
V
V
 
L
G
 
G
S
 
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
F
 
S
A
 
P
S
 
T
L
 
V
D
 
N
E
 
E
A
 
D
E
 
E
K
 
R
K
 
E
K
 
K
I
 
L
V
 
V
E
 
S
L
 
R
V
 
T
G
 
L
P
 
E
M
 
I
V
 
V
K
 
-
D
 
D
T
 
G
D
 
K
T
 
I
A
 
P
L
 
V
L
 
I
V
 
V
G
 
G
I
 
A
A
 
G
D
 
T
E
 
N
R
 
S
T
 
T
S
 
E
K
 
K
V
 
T
I
 
L
E
 
K
Y
 
L
A
 
V
R
 
K
H
 
Q
A
 
A
E
 
E
A
 
K
N
 
L
H
 
G
A
 
A
D
 
N
G
 
G
L
 
V
L
 
L
L
 
V
I
 
V
N
 
T
S
 
P
F
 
Y
Y
 
Y
Q
 
N
T
 
K
P
 
P
T
 
T
E
 
Q
E
 
E
E
 
G
A
 
L
F
 
Y
H
 
Q
Q
 
H
F
 
Y
K
 
K
D
 
Y
V
 
I
N
 
S
D
 
E
V
 
R
V
 
T
T
 
D
Q
 
L
P
 
G
L
 
I
M
 
V
M
 
V
Y
 
Y
N
 
N
N
 
V
P
 
P
F
 
G
T
 
R
A
 
T
N
 
G
V
 
V
N
 
N
L
 
V
E
 
L
D
 
P
A
 
E
T
 
T
I
 
A
C
 
A
R
 
R
I
 
I
D
 
A
R
 
A
E
 
D
L
 
L
D
 
K
K
 
N
V
 
V
Q
 
V
Y
 
G
I
 
I
K
 
K
E
 
E
S
 
A
S
 
N
G
 
P
D
|
D
I
|
I
R
x
D
K
 
Q
V
 
I
-
 
D
R
 
R
A
 
T
V
 
V
A
 
S
-
 
L
-
 
T
-
 
K
-
 
Q
D
 
A
N
 
R
T
 
S
D
 
D
L
 
F
V
 
M
L
 
V
F
 
W
C
 
S
G
 
G
S
 
N
D
 
D
D
 
D
L
 
R
A
 
T
F
 
F
E
 
Y
S
 
L
F
 
L
V
 
C
Q
 
A
G
 
G
A
 
G
T
 
D
G
 
G
W
 
V
V
 
I
S
 
S
V
 
V
A
 
V
A
 
S
N
 
N
I
 
V
A
 
A
P
 
P
N
 
K
S
 
Q
A
 
M
A
 
V
Q
 
E
L
 
L
Y
 
C
E
 
A
L
 
E
V
 
Y
K
 
F
A
 
S
G
 
G
K
 
N
Y
 
L
D
 
E
E
 
K
A
 
S
K
 
R
T
 
E
L
 
V
N
 
H
K
 
R
D
 
K
L
 
L
L
 
R
P
 
P
L
 
L
C
 
M
E
 
K
F
 
A
L
 
L
E
 
F
D
 
V
S
 
E
G
 
T
K
 
N
Y
 
P
V
 
I
Q
 
P
I
 
-
V
 
V
K
 
K
K
 
A
A
 
A
M
 
L
D
 
N
L
 
L
K
 
M
G
 
G
L
 
F
A
 
I
G
 
E
G
 
N
P
 
E
S
 
L
R
 
R
K
 
L
P
 
P
R
 
L
L
 
V
G
 
P
L
 
A
T
 
S
D
 
E
D
 
K
E
 
T
V
 
V
S
 
E
Q
 
L
L
 
L
K
 
R
S
 
N
L
 
V
M
 
L
E
 
K
K
 
E

7kg2A Dihydrodipicolinate synthase (dhdps) from c.Jejuni, h59k mutant with pyruvate bound in the active site and l-histidine bound at the allosteric site
27% identity, 97% coverage: 7:291/293 of query aligns to 6:290/296 of 7kg2A

query
sites
7kg2A
G
 
G
A
 
A
F
 
M
P
 
T
V
 
A
L
 
L
I
 
I
T
 
T
P
 
P
M
 
F
H
 
K
G
 
-
D
 
N
Y
 
G
S
 
K
V
 
V
N
 
D
Y
 
E
E
 
Q
G
 
S
M
 
Y
K
 
A
A
 
R
N
 
L
V
 
I
Q
 
K
Y
 
R
Y
 
Q
L
 
I
D
 
E
Q
 
N
Q
 
G
A
 
I
A
 
D
G
 
A
I
 
V
V
 
V
I
 
P
V
 
V
G
 
G
S
 
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
F
x
S
A
|
A
S
 
T
L
|
L
D
 
T
E
 
H
A
 
E
E
 
E
K
|
K
K
 
R
K
 
T
I
 
C
V
 
I
E
 
E
L
 
I
V
 
A
G
 
V
P
 
E
M
 
T
V
 
C
K
 
K
D
 
G
T
 
T
D
 
K
T
 
V
A
 
K
L
 
V
L
 
L
V
 
A
G
 
G
I
 
A
A
 
G
D
 
S
E
x
N
R
 
A
T
 
T
S
 
H
K
x
E
V
 
A
I
 
V
E
 
G
Y
 
L
A
 
A
R
 
K
H
 
F
A
 
A
E
 
K
A
 
E
N
 
H
H
 
G
A
 
A
D
 
D
G
 
G
L
 
I
L
 
L
L
 
S
I
 
V
N
 
A
S
 
P
F
x
Y
Y
 
Y
Q
 
N
T
 
K
P
 
P
T
 
T
E
 
Q
E
 
Q
E
 
G
A
 
L
F
 
Y
H
 
E
Q
 
H
F
 
Y
K
 
K
D
 
A
V
 
I
N
 
A
D
 
Q
V
 
S
V
 
V
T
 
D
Q
 
I
P
 
P
L
 
V
M
 
L
M
 
L
Y
 
Y
N
 
N
N
 
V
P
 
P
F
 
G
T
 
R
A
 
T
N
 
G
V
 
C
N
 
E
L
 
I
E
 
S
D
 
T
A
 
D
T
 
T
I
 
I
C
 
I
R
 
K
I
 
L
D
 
F
R
 
R
E
 
D
L
 
C
D
 
E
K
 
N
V
 
I
Q
 
Y
Y
 
G
I
 
V
K
 
K
E
 
E
S
 
A
S
 
S
G
 
G
D
 
N
I
 
I
R
 
D
K
 
K
-
 
C
V
 
V
R
 
D
A
 
L
V
 
L
A
 
A
D
 
H
N
 
E
T
 
P
D
 
R
L
 
M
V
 
M
L
 
L
F
 
I
C
 
S
G
 
G
S
 
E
D
 
D
D
 
A
L
 
I
A
 
N
F
 
Y
E
 
P
S
 
I
F
 
L
V
 
S
Q
 
N
G
 
G
A
 
G
T
 
K
G
 
G
W
 
V
V
 
I
S
 
S
V
 
V
A
 
T
A
 
S
N
 
N
I
 
L
A
 
L
P
 
P
N
 
D
S
 
M
A
 
I
A
 
S
Q
 
A
L
 
L
Y
 
T
E
 
H
L
 
F
V
 
A
K
 
L
A
 
D
G
 
E
K
 
N
Y
 
Y
D
 
K
E
 
E
A
 
A
K
 
K
T
 
K
L
 
I
N
 
N
K
 
D
D
 
E
L
 
L
L
 
Y
P
 
N
L
 
I
C
 
N
E
 
K
F
 
I
L
 
L
E
 
F
D
 
C
S
 
E
G
 
S
K
 
N
Y
 
P
V
 
I
Q
 
P
I
 
I
V
 
-
K
 
K
K
 
T
A
 
A
M
 
M
D
 
Y
L
 
L
K
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
I
G
 
E
G
 
S
P
 
L
S
 
E
-
 
F
R
 
R
K
 
L
P
 
P
R
 
L
L
 
C
G
 
S
L
 
P
T
 
S
D
 
K
D
 
E
E
 
N
V
 
F
S
 
A
Q
 
K
L
 
I
K
 
E
S
 
E
L
 
V
M
 
M
E
 
K
K
 
K

7mjfA Crystal structure of candidatus liberibacter solanacearum dihydrodipicolinate synthase with pyruvate and succinic semi-aldehyde bound in active site
27% identity, 89% coverage: 5:264/293 of query aligns to 2:261/296 of 7mjfA

query
sites
7mjfA
F
 
F
E
 
Q
G
 
R
A
 
S
F
 
I
P
 
P
V
x
A
L
 
L
I
 
I
T
 
T
P
 
P
M
 
F
H
 
T
G
 
K
D
 
D
Y
 
N
S
 
L
V
 
I
N
 
D
Y
 
E
E
 
D
G
 
S
M
 
F
K
 
V
A
 
D
N
 
H
V
 
I
Q
 
E
Y
 
W
Y
 
Q
L
 
I
D
 
S
Q
 
E
Q
 
G
A
 
S
A
 
S
G
 
G
I
 
L
V
 
V
I
 
P
V
 
A
G
 
G
S
x
T
T
|
T
G
 
G
E
 
E
F
 
S
A
 
S
S
 
T
L
 
L
D
 
S
E
 
Y
A
 
E
E
 
E
K
 
H
K
 
C
K
 
R
I
 
V
V
 
V
E
 
E
L
 
L
V
 
C
G
 
-
P
 
-
M
 
-
V
 
V
K
 
K
D
 
T
T
 
A
-
 
A
-
 
G
D
 
R
T
 
V
A
 
P
L
 
V
L
 
M
V
 
A
G
 
G
I
 
A
A
 
G
D
 
S
E
 
N
R
 
N
T
 
T
S
 
K
K
 
E
V
 
S
I
 
I
E
 
E
Y
 
L
A
 
A
R
 
Q
H
 
Y
A
 
A
E
 
Q
A
 
N
N
 
T
H
 
G
A
 
A
D
 
D
G
 
A
L
 
L
L
 
L
L
 
V
I
 
V
N
 
V
S
 
P
F
 
Y
Y
 
Y
Q
 
N
T
 
K
P
 
P
T
 
N
E
 
K
E
 
K
E
 
G
A
 
L
F
 
L
H
 
A
Q
 
H
F
 
F
K
 
G
D
 
S
V
 
I
N
 
A
D
 
N
V
 
A
V
 
V
T
 
S
Q
 
L
P
 
P
L
 
I
M
 
Y
M
 
I
Y
|
Y
N
 
N
N
 
N
P
 
P
F
 
S
T
x
R
A
 
T
N
 
V
V
 
I
N
 
E
L
 
M
E
 
D
D
 
V
A
 
D
T
 
T
I
 
M
C
 
A
R
 
E
I
 
L
D
 
V
R
 
K
E
 
T
L
 
Y
D
 
S
K
 
N
V
 
I
Q
 
V
Y
 
G
I
 
V
K
|
K
E
 
D
S
 
A
S
 
T
G
 
G
D
 
R
I
 
I
R
 
E
K
 
L
V
 
A
R
 
S
A
 
G
-
 
Q
-
 
R
V
 
I
A
 
A
D
 
C
N
 
G
T
 
S
D
 
D
L
 
F
V
 
I
L
 
Q
F
 
L
C
 
S
G
|
G
S
 
D
D
 
D
D
 
S
L
 
S
A
 
A
F
 
L
E
 
G
S
 
F
F
 
N
V
 
V
Q
 
H
G
 
G
A
 
G
T
 
V
G
 
G
W
 
C
V
 
I
S
 
S
V
 
V
A
 
T
A
 
A
N
 
N
I
 
V
A
 
A
P
 
P
N
 
R
S
 
I
A
 
C
A
 
A
Q
 
E
L
 
F
Y
 
Q
E
 
K
L
 
A
V
 
I
K
 
S
A
 
E
G
 
G
K
 
D
Y
 
Y
D
 
R
E
 
Q
A
 
A
K
 
L
T
 
E
L
 
Y
N
 
Q
K
 
D
D
 
K
L
 
L
L
 
F
P
 
P
L
 
L
C
 
H
E
 
Q
-
 
A
-
 
L
F
 
F
L
 
I
E
 
E
D
 
P
S
 
S
G
 
-
K
 
-
Y
 
-
V
 
I
Q
 
S
I
 
S
V
 
V
K
 
K
K
 
Y
A
 
A
M
 
L
D
 
S
L
 
R
K
 
L
G
 
G

7lvlA Dihydrodipicolinate synthase bound with allosteric inhibitor (s)- lysine from candidatus liberibacter solanacearum
27% identity, 89% coverage: 5:264/293 of query aligns to 2:261/296 of 7lvlA

query
sites
7lvlA
F
 
F
E
 
Q
G
 
R
A
 
S
F
 
I
P
 
P
V
 
A
L
 
L
I
 
I
T
 
T
P
 
P
M
 
F
H
 
T
G
 
K
D
 
D
Y
 
N
S
 
L
V
 
I
N
 
D
Y
 
E
E
 
D
G
 
S
M
 
F
K
 
V
A
 
D
N
 
H
V
 
I
Q
 
E
Y
 
W
Y
 
Q
L
 
I
D
 
S
Q
 
E
Q
 
G
A
 
S
A
 
S
G
 
G
I
 
L
V
 
V
I
 
P
V
 
A
G
 
G
S
x
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
F
x
S
A
x
S
S
 
T
L
|
L
D
 
S
E
 
Y
A
 
E
E
 
E
K
 
H
K
 
C
K
 
R
I
 
V
V
 
V
E
 
E
L
 
L
V
 
C
G
 
-
P
 
-
M
 
-
V
 
V
K
 
K
D
 
T
T
 
A
-
 
A
-
 
G
D
 
R
T
 
V
A
 
P
L
 
V
L
 
M
V
 
A
G
 
G
I
 
A
A
 
G
D
 
S
E
 
N
R
 
N
T
 
T
S
 
K
K
 
E
V
 
S
I
 
I
E
 
E
Y
 
L
A
 
A
R
 
Q
H
 
Y
A
 
A
E
 
Q
A
 
N
N
 
T
H
 
G
A
 
A
D
 
D
G
 
A
L
 
L
L
 
L
L
 
V
I
 
V
N
 
V
S
 
P
F
x
Y
Y
|
Y
Q
 
N
T
 
K
P
 
P
T
 
N
E
 
K
E
 
K
E
 
G
A
 
L
F
 
L
H
 
A
Q
 
H
F
 
F
K
 
G
D
 
S
V
 
I
N
 
A
D
 
N
V
 
A
V
 
V
T
 
S
Q
 
L
P
 
P
L
 
I
M
 
Y
M
 
I
Y
|
Y
N
 
N
N
 
N
P
 
P
F
 
S
T
x
R
A
 
T
N
 
V
V
 
I
N
 
E
L
 
M
E
 
D
D
 
V
A
 
D
T
 
T
I
 
M
C
 
A
R
 
E
I
 
L
D
 
V
R
 
K
E
 
T
L
 
Y
D
 
S
K
 
N
V
 
I
Q
 
V
Y
 
G
I
 
V
K
|
K
E
 
D
S
 
A
S
 
T
G
 
G
D
 
R
I
 
I
R
 
E
K
 
L
V
 
A
R
 
S
A
 
G
-
 
Q
-
 
R
V
 
I
A
 
A
D
 
C
N
 
G
T
 
S
D
 
D
L
 
F
V
 
I
L
 
Q
F
 
L
C
 
S
G
 
G
S
 
D
D
 
D
D
 
S
L
 
S
A
 
A
F
 
L
E
 
G
S
 
F
F
 
N
V
 
V
Q
 
H
G
 
G
A
 
G
T
 
V
G
 
G
W
 
C
V
x
I
S
 
S
V
 
V
A
 
T
A
 
A
N
 
N
I
 
V
A
 
A
P
 
P
N
 
R
S
 
I
A
 
C
A
 
A
Q
 
E
L
 
F
Y
 
Q
E
 
K
L
 
A
V
 
I
K
 
S
A
 
E
G
 
G
K
 
D
Y
 
Y
D
 
R
E
 
Q
A
 
A
K
 
L
T
 
E
L
 
Y
N
 
Q
K
 
D
D
 
K
L
 
L
L
 
F
P
 
P
L
 
L
C
 
H
E
 
Q
-
 
A
-
 
L
F
 
F
L
 
I
E
 
E
D
 
P
S
 
S
G
 
-
K
 
-
Y
 
-
V
 
I
Q
 
S
I
 
S
V
 
V
K
 
K
K
 
Y
A
 
A
M
 
L
D
 
S
L
 
R
K
 
L
G
 
G

6u01B Dihydrodipicolinate synthase (dhdps) from c.Jejuni, n84d mutant with pyruvate bound in the active site (see paper)
26% identity, 97% coverage: 7:291/293 of query aligns to 6:290/296 of 6u01B

query
sites
6u01B
G
 
G
A
 
A
F
 
M
P
 
T
V
 
A
L
 
L
I
 
I
T
 
T
P
 
P
M
 
F
H
 
K
G
 
-
D
 
N
Y
 
G
S
 
K
V
 
V
N
 
D
Y
 
E
E
 
Q
G
 
S
M
 
Y
K
 
A
A
 
R
N
 
L
V
 
I
Q
 
K
Y
 
R
Y
 
Q
L
 
I
D
 
E
Q
 
N
Q
 
G
A
 
I
A
 
D
G
 
A
I
 
V
V
 
V
I
 
P
V
 
V
G
 
G
S
x
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
F
 
S
A
 
A
S
 
T
L
 
L
D
 
T
E
 
H
A
 
E
E
 
E
K
 
H
K
 
R
K
 
T
I
 
C
V
 
I
E
 
E
L
 
I
V
 
A
G
 
V
P
 
E
M
 
T
V
 
C
K
 
K
D
 
G
T
 
T
D
 
K
T
 
V
A
 
K
L
 
V
L
 
L
V
 
A
G
 
G
I
 
A
A
 
G
D
 
S
E
 
D
R
 
A
T
 
T
S
 
H
K
 
E
V
 
A
I
 
V
E
 
G
Y
 
L
A
 
A
R
 
K
H
 
F
A
 
A
E
 
K
A
 
E
N
 
H
H
 
G
A
 
A
D
 
D
G
 
G
L
 
I
L
 
L
L
 
S
I
 
V
N
 
A
S
 
P
F
 
Y
Y
|
Y
Q
 
N
T
 
K
P
 
P
T
 
T
E
 
Q
E
 
Q
E
 
G
A
 
L
F
 
Y
H
 
E
Q
 
H
F
 
Y
K
 
K
D
 
A
V
 
I
N
 
A
D
 
Q
V
 
S
V
 
V
T
 
D
Q
 
I
P
 
P
L
 
V
M
 
L
M
 
L
Y
|
Y
N
 
N
N
 
V
P
 
P
F
 
G
T
x
R
A
 
T
N
 
G
V
 
C
N
 
E
L
 
I
E
 
S
D
 
T
A
 
D
T
 
T
I
 
I
C
 
I
R
 
K
I
 
L
D
 
F
R
 
R
E
 
D
L
 
C
D
 
E
K
 
N
V
 
I
Q
 
Y
Y
 
G
I
 
V
K
|
K
E
 
E
S
 
A
S
 
S
G
 
G
D
 
N
I
 
I
R
 
D
K
 
K
-
 
C
V
 
V
R
 
D
A
 
L
V
 
L
A
 
A
D
 
H
N
 
E
T
 
P
D
 
R
L
 
M
V
 
M
L
 
L
F
 
I
C
x
S
G
 
G
S
x
E
D
|
D
D
 
A
L
 
I
A
x
N
F
 
Y
E
 
P
S
 
I
F
 
L
V
 
S
Q
 
N
G
 
G
A
 
G
T
 
K
G
 
G
W
 
V
V
x
I
S
 
S
V
 
V
A
 
T
A
 
S
N
 
N
I
 
L
A
 
L
P
 
P
N
 
D
S
 
M
A
 
I
A
 
S
Q
 
A
L
 
L
Y
 
T
E
 
H
L
 
F
V
 
A
K
 
L
A
 
D
G
 
E
K
 
N
Y
 
Y
D
 
K
E
 
E
A
 
A
K
 
K
T
 
K
L
 
I
N
 
N
K
 
D
D
 
E
L
 
L
L
 
Y
P
 
N
L
 
I
C
 
N
E
 
K
F
 
I
L
 
L
E
 
F
D
 
C
S
 
E
G
 
S
K
 
N
Y
 
P
V
 
I
Q
 
P
I
 
I
V
 
-
K
 
K
K
 
T
A
 
A
M
 
M
D
 
Y
L
 
L
K
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
I
G
 
E
G
 
S
P
 
L
S
 
E
-
 
F
R
 
R
K
 
L
P
 
P
R
 
L
L
 
C
G
 
S
L
 
P
T
 
S
D
 
K
D
 
E
E
 
N
V
 
F
S
 
A
Q
 
K
L
 
I
K
 
E
S
 
E
L
 
V
M
 
M
E
 
K
K
 
K

4m19A Dihydrodipicolinate synthase from c. Jejuni with pyruvate bound to the active site and lysine bound to allosteric site (see paper)
26% identity, 97% coverage: 7:291/293 of query aligns to 6:290/296 of 4m19A

query
sites
4m19A
G
 
G
A
 
A
F
 
M
P
 
T
V
 
A
L
 
L
I
 
I
T
 
T
P
 
P
M
 
F
H
 
K
G
 
N
D
 
G
Y
 
-
S
 
K
V
 
V
N
 
D
Y
 
E
E
 
Q
G
 
S
M
 
Y
K
 
A
A
 
R
N
 
L
V
 
I
Q
 
K
Y
 
R
Y
 
Q
L
 
I
D
 
E
Q
 
N
Q
 
G
A
 
I
A
 
D
G
 
A
I
 
V
V
 
V
I
 
P
V
 
V
G
 
G
S
x
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
F
x
S
A
|
A
S
 
T
L
|
L
D
 
T
E
x
H
A
 
E
E
 
E
K
x
H
K
 
R
K
 
T
I
 
C
V
 
I
E
 
E
L
 
I
V
 
A
G
 
V
P
 
E
M
 
T
V
 
C
K
 
K
D
 
G
T
 
T
D
 
K
T
 
V
A
 
K
L
 
V
L
 
L
V
 
A
G
 
G
I
 
A
A
 
G
D
 
S
E
x
N
R
 
A
T
 
T
S
 
H
K
x
E
V
 
A
I
 
V
E
 
G
Y
 
L
A
 
A
R
 
K
H
 
F
A
 
A
E
 
K
A
 
E
N
 
H
H
 
G
A
 
A
D
 
D
G
 
G
L
 
I
L
 
L
L
 
S
I
 
V
N
 
A
S
 
P
F
x
Y
Y
|
Y
Q
 
N
T
 
K
P
 
P
T
 
T
E
 
Q
E
 
Q
E
 
G
A
 
L
F
 
Y
H
 
E
Q
 
H
F
 
Y
K
 
K
D
 
A
V
 
I
N
 
A
D
 
Q
V
 
S
V
 
V
T
 
D
Q
 
I
P
 
P
L
 
V
M
 
L
M
 
L
Y
|
Y
N
 
N
N
 
V
P
 
P
F
 
G
T
x
R
A
 
T
N
 
G
V
 
C
N
 
E
L
 
I
E
 
S
D
 
T
A
 
D
T
 
T
I
 
I
C
 
I
R
 
K
I
 
L
D
 
F
R
 
R
E
 
D
L
 
C
D
 
E
K
 
N
V
 
I
Q
 
Y
Y
 
G
I
 
V
K
|
K
E
 
E
S
 
A
S
 
S
G
 
G
D
 
N
I
 
I
R
 
D
K
 
K
-
 
C
V
 
V
R
 
D
A
 
L
V
 
L
A
 
A
D
 
H
N
 
E
T
 
P
D
 
R
L
 
M
V
 
M
L
 
L
F
 
I
C
 
S
G
 
G
S
 
E
D
 
D
D
 
A
L
 
I
A
 
N
F
 
Y
E
 
P
S
 
I
F
 
L
V
 
S
Q
 
N
G
 
G
A
 
G
T
 
K
G
 
G
W
 
V
V
x
I
S
 
S
V
 
V
A
 
T
A
 
S
N
 
N
I
 
L
A
 
L
P
 
P
N
 
D
S
 
M
A
 
I
A
 
S
Q
 
A
L
 
L
Y
 
T
E
 
H
L
 
F
V
 
A
K
 
L
A
 
D
G
 
E
K
 
N
Y
 
Y
D
 
K
E
 
E
A
 
A
K
 
K
T
 
K
L
 
I
N
 
N
K
 
D
D
 
E
L
 
L
L
 
Y
P
 
N
L
 
I
C
 
N
E
 
K
F
 
I
L
 
L
E
 
F
D
 
C
S
 
E
G
 
S
K
 
N
Y
 
P
V
 
I
Q
 
P
I
 
I
V
 
-
K
 
K
K
 
T
A
 
A
M
 
M
D
 
Y
L
 
L
K
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
I
G
 
E
G
 
S
P
 
L
S
 
E
-
 
F
R
 
R
K
 
L
P
 
P
R
 
L
L
 
C
G
 
S
L
 
P
T
 
S
D
 
K
D
 
E
E
 
N
V
 
F
S
 
A
Q
 
K
L
 
I
K
 
E
S
 
E
L
 
V
M
 
M
E
 
K
K
 
K

7kkdB Dihydrodipicolinate synthase (dhdps) from c.Jejuni, n84a mutant with pyruvate bound in the active site and r,r-bislysine bound at the allosteric site
26% identity, 97% coverage: 7:291/293 of query aligns to 16:300/306 of 7kkdB

query
sites
7kkdB
G
 
G
A
 
A
F
 
M
P
 
T
V
 
A
L
 
L
I
 
I
T
 
T
P
 
P
M
 
F
H
 
K
G
 
-
D
 
N
Y
 
G
S
 
K
V
 
V
N
 
D
Y
 
E
E
 
Q
G
 
S
M
 
Y
K
 
A
A
 
R
N
 
L
V
 
I
Q
 
K
Y
 
R
Y
 
Q
L
 
I
D
 
E
Q
 
N
Q
 
G
A
 
I
A
 
D
G
 
A
I
 
V
V
 
V
I
 
P
V
 
V
G
 
G
S
 
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
F
x
S
A
 
A
S
 
T
L
|
L
D
 
T
E
 
H
A
 
E
E
 
E
K
x
H
K
 
R
K
 
T
I
 
C
V
 
I
E
 
E
L
 
I
V
 
A
G
 
V
P
 
E
M
 
T
V
 
C
K
 
K
D
 
G
T
 
T
D
 
K
T
 
V
A
 
K
L
 
V
L
 
L
V
 
A
G
 
G
I
 
A
A
 
G
D
 
S
E
 
A
R
 
A
T
 
T
S
 
H
K
x
E
V
 
A
I
 
V
E
 
G
Y
 
L
A
 
A
R
 
K
H
 
F
A
 
A
E
 
K
A
 
E
N
 
H
H
 
G
A
 
A
D
 
D
G
 
G
L
 
I
L
 
L
L
 
S
I
 
V
N
 
A
S
 
P
F
x
Y
Y
 
Y
Q
 
N
T
 
K
P
 
P
T
 
T
E
 
Q
E
 
Q
E
 
G
A
 
L
F
 
Y
H
 
E
Q
 
H
F
 
Y
K
 
K
D
 
A
V
 
I
N
 
A
D
 
Q
V
 
S
V
 
V
T
 
D
Q
 
I
P
 
P
L
 
V
M
 
L
M
 
L
Y
 
Y
N
 
N
N
 
V
P
 
P
F
 
G
T
 
R
A
 
T
N
 
G
V
 
C
N
 
E
L
 
I
E
 
S
D
 
T
A
 
D
T
 
T
I
 
I
C
 
I
R
 
K
I
 
L
D
 
F
R
 
R
E
 
D
L
 
C
D
 
E
K
 
N
V
 
I
Q
 
Y
Y
 
G
I
 
V
K
 
K
E
 
E
S
 
A
S
 
S
G
 
G
D
 
N
I
 
I
R
 
D
K
 
K
-
 
C
V
 
V
R
 
D
A
 
L
V
 
L
A
 
A
D
 
H
N
 
E
T
 
P
D
 
R
L
 
M
V
 
M
L
 
L
F
 
I
C
 
S
G
 
G
S
 
E
D
 
D
D
 
A
L
 
I
A
 
N
F
 
Y
E
 
P
S
 
I
F
 
L
V
 
S
Q
 
N
G
 
G
A
 
G
T
 
K
G
 
G
W
 
V
V
 
I
S
 
S
V
 
V
A
 
T
A
 
S
N
 
N
I
 
L
A
 
L
P
 
P
N
 
D
S
 
M
A
 
I
A
 
S
Q
 
A
L
 
L
Y
 
T
E
 
H
L
 
F
V
 
A
K
 
L
A
 
D
G
 
E
K
 
N
Y
 
Y
D
 
K
E
 
E
A
 
A
K
 
K
T
 
K
L
 
I
N
 
N
K
 
D
D
 
E
L
 
L
L
 
Y
P
 
N
L
 
I
C
 
N
E
 
K
F
 
I
L
 
L
E
 
F
D
 
C
S
 
E
G
 
S
K
 
N
Y
 
P
V
 
I
Q
 
P
I
 
I
V
 
-
K
 
K
K
 
T
A
 
A
M
 
M
D
 
Y
L
 
L
K
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
I
G
 
E
G
 
S
P
 
L
S
 
E
-
 
F
R
 
R
K
 
L
P
 
P
R
 
L
L
 
C
G
 
S
L
 
P
T
 
S
D
 
K
D
 
E
E
 
N
V
 
F
S
 
A
Q
 
K
L
 
I
K
 
E
S
 
E
L
 
V
M
 
M
E
 
K
K
 
K

1xxxA Crystal structure of dihydrodipicolinate synthase (dapa, rv2753c) from mycobacterium tuberculosis (see paper)
28% identity, 95% coverage: 12:290/293 of query aligns to 15:290/296 of 1xxxA

query
sites
1xxxA
L
 
M
I
 
V
T
 
T
P
 
P
M
 
F
H
 
S
G
 
G
D
 
D
Y
 
G
S
 
S
V
 
L
N
 
D
Y
 
T
E
 
A
G
 
T
M
 
A
K
 
A
A
 
R
N
 
L
V
 
A
Q
 
N
Y
 
H
Y
 
L
L
 
V
D
 
D
Q
 
Q
Q
 
G
A
 
C
A
 
D
G
 
G
I
 
L
V
 
V
I
 
V
V
 
S
G
 
G
S
x
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
F
 
S
A
 
P
S
 
T
L
 
T
D
 
T
E
 
D
A
 
G
E
 
E
K
 
K
K
 
I
K
 
E
I
 
L
V
 
L
E
 
R
L
 
A
V
 
V
G
 
L
P
 
E
M
 
A
V
 
V
K
 
G
D
 
D
T
 
R
D
 
-
T
 
A
A
 
R
L
 
V
L
 
I
V
 
A
G
 
G
I
 
A
A
 
G
D
 
T
E
 
Y
R
 
D
T
 
T
S
 
A
K
 
H
V
 
S
I
 
I
E
 
R
Y
 
L
A
 
A
R
 
K
H
 
A
A
 
C
E
 
A
A
 
A
N
 
E
H
 
G
A
 
A
D
 
H
G
 
G
L
 
L
L
 
L
L
 
V
I
 
V
N
 
T
S
 
P
F
 
Y
Y
|
Y
Q
 
S
T
 
K
P
 
P
T
 
P
E
 
Q
E
 
R
E
 
G
A
 
L
F
 
Q
H
 
A
Q
 
H
F
 
F
K
 
T
D
 
A
V
 
V
N
 
A
D
 
D
V
 
A
V
 
T
T
 
E
Q
 
L
P
 
P
L
 
M
M
 
L
M
 
L
Y
|
Y
N
 
D
N
 
I
P
 
P
F
 
G
T
x
R
A
 
S
N
 
A
V
 
V
N
 
P
L
 
I
E
 
E
D
 
P
A
 
D
T
 
T
I
 
I
C
 
-
R
 
R
I
 
A
D
 
L
R
x
A
E
 
S
L
x
H
D
 
P
K
 
N
V
x
I
Q
 
V
Y
 
G
I
 
V
K
|
K
E
 
D
S
 
A
S
 
K
G
 
A
D
 
D
I
 
L
R
 
H
K
 
S
V
 
G
R
 
A
A
 
Q
V
 
I
A
 
M
D
 
A
N
 
D
T
 
T
D
 
G
L
 
L
V
 
A
L
 
Y
F
 
Y
C
 
S
G
 
G
S
 
D
D
 
D
D
 
A
L
 
L
A
 
N
F
 
L
E
 
P
S
 
W
F
 
L
V
 
A
Q
 
M
G
 
G
A
 
A
T
 
T
G
 
G
W
 
F
V
x
I
S
 
S
V
 
V
A
 
I
A
 
A
N
 
H
I
 
L
A
 
A
P
 
-
N
 
-
S
 
-
A
 
A
A
 
G
Q
 
Q
L
 
L
Y
 
R
E
 
E
L
 
L
V
 
L
K
 
S
A
 
A
-
 
F
-
 
G
-
 
S
G
 
G
K
 
D
Y
 
I
D
 
A
E
 
T
A
 
A
K
 
R
T
 
K
L
 
I
N
 
N
K
 
I
D
 
A
L
 
V
L
 
A
P
 
P
L
 
L
C
 
C
E
 
N
F
 
A
L
 
M
E
 
S
D
 
R
S
 
L
G
 
G
K
 
G
Y
 
-
V
 
V
Q
 
T
I
 
L
V
 
S
K
 
K
K
 
A
A
 
G
M
 
L
D
 
R
L
 
L
K
 
Q
G
 
G
L
 
I
A
 
D
G
 
V
G
 
G
P
 
D
S
 
P
R
 
R
K
 
L
P
 
P
R
 
Q
L
 
V
G
 
A
L
 
A
T
 
T
D
 
P
D
 
E
E
 
Q
V
 
I
S
 
D
Q
 
A
L
 
L
K
 
A
S
 
A
L
 
D
M
 
M
E
 
R

5j5dA Crystal structure of dihydrodipicolinate synthase from mycobacterium tuberculosis in complex with alpha-ketopimelic acid (see paper)
28% identity, 95% coverage: 12:290/293 of query aligns to 16:291/297 of 5j5dA

query
sites
5j5dA
L
 
M
I
 
V
T
 
T
P
 
P
M
 
F
H
 
S
G
 
G
D
 
D
Y
 
G
S
 
S
V
 
L
N
 
D
Y
 
T
E
 
A
G
 
T
M
 
A
K
 
A
A
 
R
N
 
L
V
 
A
Q
 
N
Y
 
H
Y
 
L
L
 
V
D
 
D
Q
 
Q
Q
 
G
A
 
C
A
 
D
G
 
G
I
 
L
V
 
V
I
 
V
V
 
S
G
 
G
S
x
T
T
|
T
G
 
G
E
 
E
F
 
S
A
 
P
S
 
T
L
 
T
D
 
T
E
 
D
A
 
G
E
 
E
K
 
K
K
 
I
K
 
E
I
 
L
V
 
L
E
 
R
L
 
A
V
 
V
G
 
L
P
 
E
M
 
A
V
 
V
K
 
G
D
 
D
T
 
R
D
 
-
T
 
A
A
 
R
L
 
V
L
 
I
V
 
A
G
 
G
I
 
A
A
 
G
D
 
T
E
 
Y
R
 
D
T
 
T
S
 
A
K
 
H
V
 
S
I
 
I
E
 
R
Y
 
L
A
 
A
R
 
K
H
 
A
A
 
C
E
 
A
A
 
A
N
 
E
H
 
G
A
 
A
D
 
H
G
 
G
L
 
L
L
 
L
L
 
V
I
 
V
N
 
T
S
 
P
F
 
Y
Y
|
Y
Q
 
S
T
 
K
P
 
P
T
 
P
E
 
Q
E
 
R
E
 
G
A
 
L
F
 
Q
H
 
A
Q
 
H
F
 
F
K
 
T
D
 
A
V
 
V
N
 
A
D
 
D
V
 
A
V
 
T
T
 
E
Q
 
L
P
 
P
L
 
M
M
 
L
M
 
L
Y
|
Y
N
 
D
N
 
I
P
 
P
F
 
G
T
x
R
A
 
S
N
 
A
V
 
V
N
 
P
L
 
I
E
 
E
D
 
P
A
 
D
T
 
T
I
 
I
C
 
-
R
 
R
I
 
A
D
 
L
R
 
A
E
 
S
L
 
H
D
 
P
K
 
N
V
 
I
Q
 
V
Y
 
G
I
 
V
K
|
K
E
 
D
S
 
A
S
 
K
G
 
A
D
 
D
I
 
L
R
 
H
K
 
S
V
 
G
R
 
A
A
 
Q
V
 
I
A
 
M
D
 
A
N
 
D
T
 
T
D
 
G
L
 
L
V
 
A
L
 
Y
F
 
Y
C
 
S
G
|
G
S
 
D
D
 
D
D
 
A
L
 
L
A
 
N
F
 
L
E
 
P
S
 
W
F
 
L
V
 
A
Q
 
M
G
 
G
A
 
A
T
 
T
G
 
G
W
 
F
V
x
I
S
 
S
V
 
V
A
 
I
A
 
A
N
 
H
I
 
L
A
 
A
P
 
-
N
 
-
S
 
-
A
 
A
A
 
G
Q
 
Q
L
 
L
Y
 
R
E
 
E
L
 
L
V
 
L
K
 
S
A
 
A
-
 
F
-
 
G
-
 
S
G
 
G
K
 
D
Y
 
I
D
 
A
E
 
T
A
 
A
K
 
R
T
 
K
L
 
I
N
 
N
K
 
I
D
 
A
L
 
V
L
 
A
P
 
P
L
 
L
C
 
C
E
 
N
F
 
A
L
 
M
E
 
S
D
 
R
S
 
L
G
 
G
K
 
G
Y
 
-
V
 
V
Q
 
T
I
 
L
V
 
S
K
 
K
K
 
A
A
 
G
M
 
L
D
 
R
L
 
L
K
 
Q
G
 
G
L
 
I
A
 
D
G
 
V
G
 
G
P
 
D
S
 
P
R
 
R
K
 
L
P
 
P
R
 
Q
L
 
V
G
 
A
L
 
A
T
 
T
D
 
P
D
 
E
E
 
Q
V
 
I
S
 
D
Q
 
A
L
 
L
K
 
A
S
 
A
L
 
D
M
 
M
E
 
R

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_017549807.1 NCBI__GCF_000330705.1:WP_017549807.1
MKKQFEGAFPVLITPMHGDYSVNYEGMKANVQYYLDQQAAGIVIVGSTGEFASLDEAEKK
KIVELVGPMVKDTDTALLVGIADERTSKVIEYARHAEANHADGLLLINSFYQTPTEEEAF
HQFKDVNDVVTQPLMMYNNPFTANVNLEDATICRIDRELDKVQYIKESSGDIRKVRAVAD
NTDLVLFCGSDDLAFESFVQGATGWVSVAANIAPNSAAQLYELVKAGKYDEAKTLNKDLL
PLCEFLEDSGKYVQIVKKAMDLKGLAGGPSRKPRLGLTDDEVSQLKSLMEKLD

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory