SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_017557777.1 NCBI__GCF_000341205.1:WP_017557777.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P18157 Glycerol kinase; ATP:glycerol 3-phosphotransferase; Glycerokinase; GK; EC 2.7.1.30 from Bacillus subtilis (strain 168) (see paper)
47% identity, 98% coverage: 3:483/492 of query aligns to 5:490/496 of P18157

query
sites
P18157
V
 
I
L
 
L
T
 
S
I
 
L
D
 
D
A
 
Q
G
 
G
T
 
T
T
 
T
G
 
S
V
 
S
T
 
R
A
 
A
L
 
I
M
 
L
V
 
F
G
 
N
E
 
K
D
 
E
G
 
G
R
 
K
V
 
I
L
 
V
S
 
H
R
 
S
G
 
A
Y
 
Q
Q
 
K
E
 
E
F
 
F
A
 
T
Q
 
Q
H
 
Y
Y
 
F
P
 
P
E
 
H
A
 
P
G
 
G
W
 
W
V
 
V
E
 
E
H
 
H
V
 
N
P
 
A
E
 
N
E
 
E
I
 
I
W
 
W
Q
 
G
A
 
S
A
 
V
L
 
L
A
 
A
A
 
V
C
 
I
Q
 
A
S
 
S
A
 
V
L
 
I
D
 
S
A
 
E
A
 
S
G
 
G
T
 
I
P
 
S
P
 
A
T
 
S
C
 
Q
V
 
I
-
 
A
-
 
G
-
 
I
G
 
G
I
 
I
T
 
T
N
 
N
Q
 
Q
R
 
R
E
 
E
T
 
T
A
 
T
V
 
V
L
 
V
W
 
W
N
 
D
R
 
K
K
 
D
R
 
T
G
 
G
S
 
S
S
 
P
P
 
V
R
 
Y
R
 
N
A
 
A
V
 
I
V
 
V
W
 
W
Q
 
Q
D
 
S
R
 
R
R
 
Q
T
 
T
A
 
S
G
 
G
I
 
I
C
 
C
T
 
E
E
 
E
L
 
L
R
 
R
E
 
E
A
 
K
G
 
G
H
 
Y
E
 
N
D
 
D
R
 
K
V
 
F
T
 
R
E
 
E
V
 
K
T
 
T
G
 
G
L
 
L
R
 
L
L
 
I
D
 
D
P
 
P
Y
 
Y
F
 
F
T
 
S
G
 
G
T
 
T
K
 
K
L
 
V
T
 
K
W
 
W
I
 
I
K
 
L
R
 
D
N
 
N
D
 
V
Q
 
E
R
 
G
A
 
A
W
 
R
S
 
E
G
 
K
V
 
A
E
 
E
S
 
K
G
 
G
E
 
E
T
 
L
A
 
L
V
 
F
G
 
G
T
 
T
V
 
I
D
 
D
S
 
T
Y
 
W
I
 
L
I
 
I
A
 
W
R
 
K
L
 
M
T
 
S
G
 
G
G
 
G
A
 
K
R
 
A
H
 
H
V
 
V
T
 
T
D
 
D
A
 
Y
S
 
S
N
 
N
A
 
A
S
 
S
R
 
R
T
 
T
L
 
L
L
 
M
Y
 
F
D
 
N
I
 
I
R
 
Y
R
 
D
G
 
L
A
 
K
W
 
W
S
 
D
E
 
D
E
 
E
M
 
L
C
 
L
E
 
D
L
 
I
F
 
L
G
 
G
V
 
V
P
 
P
V
 
K
S
 
S
A
 
M
L
 
L
P
 
P
E
 
E
V
 
V
V
 
K
P
 
P
S
 
S
Y
 
S
G
 
H
S
 
V
V
 
Y
G
 
A
E
 
E
T
 
T
D
 
V
P
 
D
E
 
Y
E
x
H
F
 
F
L
x
F
G
 
G
L
 
K
R
 
N
L
 
I
P
 
P
V
 
I
S
 
A
G
 
G
I
 
A
A
 
A
G
 
G
D
 
D
Q
 
Q
Q
 
Q
A
 
S
A
 
A
M
 
L
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
N
 
A
C
 
C
Y
 
F
R
 
E
P
 
E
G
 
G
T
 
M
S
 
G
K
 
K
C
 
N
T
 
T
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
G
 
G
S
 
C
F
 
F
I
 
M
L
 
L
V
 
M
N
 
N
T
 
T
G
 
G
E
 
E
E
 
K
T
 
A
V
 
I
A
 
K
P
 
S
D
 
E
H
 
H
G
 
G
L
 
L
L
 
L
S
 
T
T
 
T
V
 
I
L
 
A
W
 
W
Q
 
-
H
 
G
P
 
I
D
 
D
G
 
G
R
 
K
L
 
V
E
 
N
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
E
 
E
G
 
G
S
 
S
I
 
I
F
 
F
V
 
V
T
 
A
G
 
G
A
 
S
A
 
A
V
 
I
Q
 
Q
W
 
W
L
 
L
R
 
R
D
 
D
G
 
G
L
 
L
G
 
R
L
 
M
I
 
F
D
 
Q
T
 
D
A
 
S
A
 
S
Q
 
L
S
 
S
E
 
E
G
 
S
L
 
Y
A
 
A
A
 
E
S
 
K
V
 
V
P
 
D
D
 
S
S
 
T
G
 
D
G
 
G
V
 
V
V
 
Y
F
 
V
V
 
V
P
 
P
A
 
A
L
 
F
T
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
T
P
 
P
D
 
Y
W
 
W
D
 
D
P
 
S
H
 
D
A
 
V
R
 
R
G
 
G
A
 
S
V
 
V
F
 
F
G
 
G
I
 
L
T
 
T
R
 
R
G
 
G
T
 
T
G
 
T
R
 
K
A
 
E
H
 
H
L
 
F
A
 
I
R
 
R
A
 
A
T
 
T
L
 
L
D
 
E
A
 
S
I
 
L
A
 
A
F
 
Y
E
 
Q
V
 
T
R
 
K
D
 
D
V
 
V
A
 
L
E
 
D
A
 
A
M
 
M
A
 
E
R
 
A
A
 
D
S
 
S
G
 
N
T
 
I
Q
 
S
V
 
L
P
 
K
E
 
T
L
 
L
R
 
R
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
V
A
 
K
N
 
N
D
 
N
L
 
F
L
 
L
C
 
M
Q
 
Q
I
 
F
Q
 
Q
A
 
G
D
 
D
Q
 
L
L
 
L
G
 
N
V
 
V
S
 
P
V
 
V
A
 
E
R
 
R
P
 
P
Q
 
E
V
 
I
Q
 
N
E
 
E
T
 
T
T
 
T
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
I
G
 
A
T
 
V
G
 
G
V
 
F
W
 
W
S
 
K
S
 
D
T
 
R
D
 
S
E
 
E
L
 
I
E
 
A
R
 
N
T
 
Q
W
 
W
K
 
N
L
 
L
D
 
D
R
 
K
R
 
R
F
 
F
E
 
E
P
 
P
-
 
E
-
 
L
-
 
E
G
 
E
E
 
E
R
 
K
D
 
R
D
 
N
A
 
E
Q
 
L
Y
 
Y
R
 
K
R
 
G
W
 
W
R
 
Q
T
 
K
A
 
A
V
 
V
E
 
K

3ge1A 2.7 angstrom crystal structure of glycerol kinase (glpk) from staphylococcus aureus in complex with adp and glycerol
48% identity, 98% coverage: 3:486/492 of query aligns to 6:494/499 of 3ge1A

query
sites
3ge1A
V
 
I
L
 
L
T
 
S
I
 
I
D
 
D
A
 
Q
G
 
G
T
 
T
T
 
T
G
 
S
V
 
S
T
 
R
A
 
A
L
 
I
M
 
L
V
 
F
G
 
N
E
 
Q
D
 
K
G
 
G
R
 
E
V
 
I
L
 
A
S
 
G
R
 
V
G
 
A
Y
 
Q
Q
 
R
E
 
E
F
 
F
A
 
K
Q
 
Q
H
 
Y
Y
 
F
P
 
P
E
 
Q
A
 
S
G
 
G
W
 
W
V
 
V
E
 
E
H
 
H
V
 
D
P
 
A
E
 
N
E
 
E
I
 
I
W
 
W
Q
 
T
A
 
S
A
 
V
L
 
L
A
 
A
A
 
V
C
 
M
Q
 
T
S
 
E
A
 
V
L
 
I
-
 
N
-
 
E
-
 
N
D
 
D
A
 
V
A
 
R
G
 
A
T
 
D
P
 
Q
P
 
I
T
 
A
C
 
G
V
 
I
G
 
G
I
 
I
T
 
T
N
 
N
Q
 
Q
R
 
R
E
 
E
T
 
T
A
 
T
V
 
V
L
 
V
W
 
W
N
 
D
R
 
K
K
 
H
R
 
T
G
 
G
S
 
R
S
 
P
P
 
I
R
 
Y
R
 
H
A
 
A
V
 
I
V
 
V
W
 
W
Q
 
Q
D
 
S
R
 
R
R
 
Q
T
 
T
A
 
Q
G
 
S
I
 
I
C
 
C
T
 
S
E
 
E
L
 
L
R
 
K
E
 
Q
A
 
Q
G
 
G
H
 
Y
E
 
E
D
 
Q
R
 
T
V
 
F
T
 
R
E
 
D
V
 
K
T
 
T
G
 
G
L
 
L
R
 
L
L
 
L
D
 
D
P
 
P
Y
 
Y
F
 
F
T
 
A
G
 
G
T
 
T
K
 
K
L
 
V
T
 
K
W
 
W
I
 
I
K
 
L
R
 
D
N
 
N
D
 
V
Q
 
E
R
 
G
A
 
A
W
 
R
S
 
E
G
 
K
V
 
A
E
 
E
S
 
N
G
 
G
E
 
D
T
 
L
A
 
L
V
 
F
G
 
G
T
 
T
V
 
I
D
 
D
S
 
T
Y
 
W
I
 
L
I
 
V
A
 
W
R
 
K
L
 
L
T
 
S
G
 
G
G
 
K
A
 
A
R
 
A
H
 
H
V
 
I
T
 
T
D
 
D
A
 
Y
S
 
S
N
 
N
A
 
A
S
 
S
R
 
R
T
 
T
L
 
L
L
 
M
Y
 
F
D
 
N
I
 
I
R
 
H
R
 
D
G
 
L
A
 
E
W
 
W
S
 
D
E
 
D
E
 
E
M
 
L
C
 
L
E
 
E
L
 
L
F
 
L
G
 
T
V
 
V
P
 
P
V
 
K
S
 
N
A
 
M
L
 
L
P
 
P
E
 
E
V
 
V
V
 
K
P
 
A
S
 
S
Y
 
S
G
 
E
S
 
V
V
 
Y
G
 
G
E
 
K
T
 
T
D
 
I
P
 
D
E
 
Y
E
 
H
F
 
F
L
 
Y
G
 
G
L
 
Q
R
 
E
L
 
V
P
 
P
V
 
I
S
 
A
G
 
G
I
 
V
A
 
A
G
 
G
D
 
D
Q
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
M
 
L
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
N
 
A
C
 
C
Y
 
F
R
 
E
P
 
R
G
 
G
T
 
D
S
 
V
K
 
K
C
 
N
T
 
T
Y
 
Y
G
|
G
T
|
T
G
 
G
S
 
G
F
 
F
I
 
M
L
 
L
V
 
M
N
 
N
T
 
T
G
 
G
E
 
D
E
 
K
T
 
A
V
 
V
A
 
K
P
 
S
D
 
E
H
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
S
 
T
T
 
T
V
 
I
L
 
A
W
 
Y
Q
 
-
H
 
G
P
 
I
D
 
D
G
 
G
R
 
K
L
 
V
E
 
N
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
E
 
E
G
 
G
S
 
S
I
 
I
F
 
F
V
 
V
T
 
S
G
|
G
A
 
S
A
 
A
V
x
I
Q
|
Q
W
 
W
L
 
L
R
 
R
D
 
D
G
 
G
L
 
L
G
 
R
L
 
M
I
 
I
D
 
N
T
 
S
A
|
A
A
x
P
Q
 
Q
S
 
S
E
 
E
G
 
S
L
 
Y
A
 
A
A
 
T
S
 
R
V
 
V
P
 
D
D
 
S
S
 
T
G
 
E
G
 
G
V
 
V
V
 
Y
F
 
V
V
 
V
P
 
P
A
 
A
L
 
F
T
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
T
P
 
P
D
 
Y
W
 
W
D
 
D
P
 
S
H
 
E
A
 
A
R
 
R
G
 
G
A
 
A
V
 
I
F
 
F
G
 
G
I
 
L
T
 
T
R
 
R
G
 
G
T
 
T
G
 
E
R
 
K
A
 
E
H
 
H
L
 
F
A
 
I
R
 
R
A
 
A
T
 
T
L
 
L
D
 
E
A
 
S
I
 
L
A
 
C
F
 
Y
E
 
Q
V
 
T
R
 
R
D
 
D
V
 
V
A
 
M
E
 
E
A
 
A
M
 
M
A
 
S
R
 
K
A
 
D
S
 
S
G
 
G
T
 
I
Q
 
D
V
 
V
P
 
Q
E
 
S
L
 
L
R
 
R
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
|
G
A
|
A
S
 
V
A
 
K
N
|
N
D
 
N
L
 
F
L
 
I
C
 
M
Q
 
Q
I
 
F
Q
 
Q
A
 
A
D
 
D
Q
 
I
L
 
V
G
 
N
V
 
T
S
 
S
V
 
V
A
 
E
R
 
R
P
 
P
Q
 
E
V
 
I
Q
 
Q
E
 
E
T
 
T
T
 
T
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
A
T
 
V
G
 
G
V
 
F
W
 
W
S
 
E
S
 
S
T
 
K
D
 
D
E
 
D
L
 
I
E
 
A
R
 
K
T
 
N
W
 
W
K
 
K
L
 
L
D
 
E
R
 
E
R
 
K
F
 
F
E
 
D
P
 
P
-
 
K
-
 
M
-
 
D
-
 
E
G
 
G
E
 
E
R
 
R
D
 
E
D
 
K
A
 
L
Q
 
-
Y
 
Y
R
 
R
R
 
G
W
 
W
R
 
K
T
 
K
A
 
A
V
 
V
E
 
E
R
 
A
S
 
T
K
 
Q

Q5HGD2 Glycerol kinase; ATP:glycerol 3-phosphotransferase; Glycerokinase; GK; EC 2.7.1.30 from Staphylococcus aureus (strain COL)
48% identity, 98% coverage: 3:486/492 of query aligns to 5:493/498 of Q5HGD2

query
sites
Q5HGD2
V
 
I
L
 
L
T
 
S
I
 
I
D
 
D
A
 
Q
G
 
G
T
|
T
T
 
T
G
 
S
V
 
S
T
x
R
A
 
A
L
 
I
M
 
L
V
 
F
G
 
N
E
 
Q
D
 
K
G
 
G
R
 
E
V
 
I
L
 
A
S
 
G
R
 
V
G
 
A
Y
 
Q
Q
 
R
E
 
E
F
 
F
A
 
K
Q
 
Q
H
 
Y
Y
 
F
P
 
P
E
 
Q
A
 
S
G
 
G
W
 
W
V
 
V
E
 
E
H
 
H
V
 
D
P
 
A
E
 
N
E
 
E
I
 
I
W
 
W
Q
 
T
A
 
S
A
 
V
L
 
L
A
 
A
A
 
V
C
 
M
Q
 
T
S
 
E
A
 
V
L
 
I
-
 
N
-
 
E
-
 
N
D
 
D
A
 
V
A
 
R
G
 
A
T
 
D
P
 
Q
P
 
I
T
 
A
C
 
G
V
 
I
G
 
G
I
 
I
T
 
T
N
 
N
Q
 
Q
R
|
R
E
|
E
T
 
T
A
 
T
V
 
V
L
 
V
W
 
W
N
 
D
R
 
K
K
 
H
R
 
T
G
 
G
S
 
R
S
 
P
P
 
I
R
 
Y
R
 
H
A
 
A
V
 
I
V
 
V
W
 
W
Q
 
Q
D
 
S
R
 
R
R
 
Q
T
 
T
A
 
Q
G
 
S
I
 
I
C
 
C
T
 
S
E
 
E
L
 
L
R
 
K
E
 
Q
A
 
Q
G
 
G
H
 
Y
E
 
E
D
 
Q
R
 
T
V
 
F
T
 
R
E
 
D
V
 
K
T
 
T
G
 
G
L
 
L
R
 
L
L
 
L
D
 
D
P
 
P
Y
|
Y
F
 
F
T
 
A
G
 
G
T
 
T
K
 
K
L
 
V
T
 
K
W
 
W
I
 
I
K
 
L
R
 
D
N
 
N
D
 
V
Q
 
E
R
 
G
A
 
A
W
 
R
S
 
E
G
 
K
V
 
A
E
 
E
S
 
N
G
 
G
E
 
D
T
 
L
A
 
L
V
 
F
G
 
G
T
 
T
V
 
I
D
 
D
S
 
T
Y
 
W
I
 
L
I
 
V
A
 
W
R
 
K
L
 
L
T
 
S
G
 
G
G
 
K
A
 
A
R
 
A
H
 
H
V
 
I
T
 
T
D
 
D
A
 
Y
S
 
S
N
 
N
A
 
A
S
 
S
R
 
R
T
 
T
L
 
L
L
 
M
Y
 
F
D
 
N
I
 
I
R
 
H
R
 
D
G
 
L
A
 
E
W
 
W
S
 
D
E
 
D
E
 
E
M
 
L
C
 
L
E
 
E
L
 
L
F
 
L
G
 
T
V
 
V
P
 
P
V
 
K
S
 
N
A
 
M
L
 
L
P
 
P
E
 
E
V
 
V
V
 
K
P
 
A
S
 
S
Y
 
S
G
 
E
S
 
V
V
 
Y
G
 
G
E
 
K
T
 
T
D
 
I
P
 
D
E
 
Y
E
 
H
F
 
F
L
 
Y
G
 
G
L
 
Q
R
 
E
L
 
V
P
 
P
V
 
I
S
 
A
G
 
G
I
 
V
A
 
A
G
 
G
D
|
D
Q
|
Q
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
M
 
L
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
N
 
A
C
 
C
Y
 
F
R
 
E
P
 
R
G
 
G
T
 
D
S
 
V
K
 
K
C
 
N
T
 
T
Y
 
Y
G
 
G
T
|
T
G
 
G
S
 
G
F
 
F
I
 
M
L
 
L
V
 
M
N
 
N
T
 
T
G
 
G
E
 
D
E
 
K
T
 
A
V
 
V
A
 
K
P
 
S
D
 
E
H
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
S
 
T
T
 
T
V
 
I
L
 
A
W
 
Y
Q
 
-
H
 
G
P
 
I
D
 
D
G
 
G
R
 
K
L
 
V
E
 
N
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
E
 
E
G
 
G
S
 
S
I
 
I
F
 
F
V
 
V
T
 
S
G
|
G
A
 
S
A
 
A
V
 
I
Q
|
Q
W
 
W
L
 
L
R
 
R
D
 
D
G
 
G
L
 
L
G
 
R
L
 
M
I
 
I
D
 
N
T
 
S
A
 
A
A
 
P
Q
 
Q
S
 
S
E
 
E
G
 
S
L
 
Y
A
 
A
A
 
T
S
 
R
V
 
V
P
 
D
D
 
S
S
 
T
G
 
E
G
 
G
V
 
V
V
 
Y
F
 
V
V
 
V
P
 
P
A
 
A
L
 
F
T
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
T
P
 
P
D
 
Y
W
 
W
D
 
D
P
 
S
H
 
E
A
 
A
R
 
R
G
 
G
A
 
A
V
 
I
F
 
F
G
 
G
I
 
L
T
 
T
R
 
R
G
 
G
T
 
T
G
 
E
R
 
K
A
 
E
H
 
H
L
 
F
A
 
I
R
 
R
A
 
A
T
 
T
L
 
L
D
 
E
A
 
S
I
 
L
A
 
C
F
 
Y
E
 
Q
V
 
T
R
 
R
D
 
D
V
 
V
A
 
M
E
 
E
A
 
A
M
 
M
A
 
S
R
 
K
A
 
D
S
 
S
G
 
G
T
 
I
Q
 
D
V
 
V
P
 
Q
E
 
S
L
 
L
R
 
R
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
|
G
A
 
A
S
 
V
A
 
K
N
|
N
D
 
N
L
 
F
L
 
I
C
 
M
Q
 
Q
I
 
F
Q
 
Q
A
 
A
D
 
D
Q
 
I
L
 
V
G
 
N
V
 
T
S
 
S
V
 
V
A
 
E
R
 
R
P
 
P
Q
 
E
V
 
I
Q
 
Q
E
 
E
T
 
T
T
 
T
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
A
T
 
V
G
 
G
V
 
F
W
 
W
S
 
E
S
 
S
T
 
K
D
 
D
E
 
D
L
 
I
E
 
A
R
 
K
T
 
N
W
 
W
K
 
K
L
 
L
D
 
E
R
 
E
R
 
K
F
 
F
E
 
D
P
 
P
-
 
K
-
 
M
-
 
D
-
 
E
G
 
G
E
 
E
R
 
R
D
 
E
D
 
K
A
 
L
Q
 
-
Y
 
Y
R
 
R
R
 
G
W
 
W
R
 
K
T
 
K
A
 
A
V
 
V
E
 
E
R
 
A
S
 
T
K
 
Q

6udeB Crystal structure of glycerol kinase from elizabethkingia anophelis nuhp1 in complex with adp and glycerol
48% identity, 99% coverage: 3:490/492 of query aligns to 5:494/495 of 6udeB

query
sites
6udeB
V
 
I
L
 
L
T
 
A
I
 
L
D
 
D
A
 
Q
G
|
G
T
|
T
T
|
T
G
x
S
V
 
S
T
x
R
A
 
A
L
 
I
M
 
L
V
 
F
G
 
N
E
 
K
D
 
S
G
 
G
R
 
E
V
 
I
L
 
K
S
 
F
R
 
V
G
 
S
Y
 
Q
Q
 
K
E
 
S
F
 
F
A
 
E
Q
 
Q
H
 
I
Y
 
F
P
 
P
E
 
T
A
 
P
G
 
G
W
 
W
V
 
V
E
 
E
H
 
H
V
 
D
P
 
P
E
 
N
E
 
E
I
 
I
W
 
W
Q
 
S
A
 
S
A
 
Q
L
 
I
A
 
S
A
 
V
C
 
A
Q
 
A
S
 
E
A
 
V
L
 
I
D
 
A
A
 
K
A
 
A
G
 
G
T
 
I
P
 
S
-
 
G
-
 
L
-
 
E
P
 
V
T
 
A
C
 
A
V
 
I
G
 
G
I
 
I
T
 
T
N
 
N
Q
 
Q
R
 
R
E
 
E
T
 
T
A
 
T
V
 
V
L
 
V
W
 
W
N
 
D
R
 
R
K
 
H
R
 
T
G
 
S
S
 
E
S
 
P
P
 
I
R
 
Y
R
 
N
A
 
A
V
 
I
V
 
V
W
 
W
Q
 
Q
D
 
D
R
 
R
R
 
R
T
 
T
A
 
S
G
 
K
I
 
Y
C
 
C
T
 
D
E
 
E
L
 
L
R
 
K
E
 
S
A
 
Q
G
 
G
H
 
H
E
 
T
D
 
D
R
 
E
V
 
I
T
 
K
E
 
Q
V
 
K
T
 
T
G
 
G
L
 
L
R
 
V
L
 
L
D
 
D
P
 
A
Y
 
Y
F
 
F
T
 
S
G
 
A
T
 
T
K
 
K
L
 
L
T
 
K
W
 
W
I
 
I
K
 
L
R
 
D
N
 
N
D
 
V
Q
 
E
R
 
G
A
 
A
W
 
R
S
 
E
G
 
K
V
 
A
E
 
E
S
 
A
G
 
G
E
 
D
T
 
L
A
 
C
V
 
F
G
 
G
T
 
T
V
 
V
D
 
D
S
 
T
Y
 
W
I
 
L
I
 
I
A
 
W
R
 
K
L
 
L
T
 
T
G
 
R
G
 
G
A
 
K
R
 
M
H
 
F
V
 
I
T
 
T
D
 
D
A
 
V
S
 
S
N
 
N
A
 
A
S
 
S
R
 
R
T
 
T
L
 
M
L
 
M
Y
 
F
D
 
N
I
 
I
R
 
R
R
 
T
G
 
M
A
 
D
W
 
W
S
 
D
E
 
D
E
 
D
M
 
L
C
 
L
E
 
K
L
 
L
F
 
F
G
 
N
V
 
I
P
 
P
V
 
R
S
 
A
A
 
I
L
 
L
P
 
P
E
 
E
V
 
V
V
 
K
P
 
Q
S
 
S
Y
 
S
G
 
E
S
 
V
V
 
Y
G
 
G
E
 
E
T
 
T
D
 
S
P
 
T
E
 
T
E
 
-
F
 
-
L
 
-
G
 
S
L
 
T
R
 
K
L
 
I
P
 
P
V
 
I
S
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
A
G
 
G
D
 
D
Q
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
M
 
L
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
N
 
M
C
 
C
Y
 
T
R
 
K
P
 
P
G
 
G
T
 
M
S
 
V
K
 
K
C
 
N
T
 
T
Y
 
Y
G
|
G
T
|
T
G
 
G
S
 
C
F
 
F
I
 
L
L
 
L
V
 
M
N
 
N
T
 
T
G
 
G
E
 
N
E
 
E
T
 
A
V
 
V
A
 
Y
P
 
S
D
 
K
H
 
N
G
 
N
L
 
L
L
 
L
S
 
T
T
 
T
V
 
V
L
 
A
W
 
W
Q
 
K
H
 
-
P
 
I
D
 
N
G
 
G
R
 
E
L
 
V
E
 
S
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
E
 
E
G
 
G
S
 
S
I
 
V
F
 
F
V
 
V
T
 
G
G
|
G
A
 
A
A
 
A
V
x
I
Q
 
Q
W
 
W
L
 
L
R
 
R
D
 
D
G
 
G
L
 
L
G
 
K
L
 
I
I
 
I
D
 
H
T
 
D
A
 
S
A
x
S
Q
 
E
S
 
V
E
 
S
G
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
E
S
 
T
V
 
V
P
 
E
D
 
D
S
 
N
G
 
G
G
 
G
V
 
V
V
 
Y
F
 
F
V
 
V
P
 
P
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
P
 
P
D
 
Y
W
 
W
D
 
D
P
 
Q
H
 
Y
A
 
A
R
 
R
G
 
G
A
 
T
V
 
I
F
 
I
G
 
G
I
 
V
T
 
T
R
 
R
G
 
G
T
 
T
G
 
T
R
 
D
A
 
G
H
 
H
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
T
 
T
L
 
L
D
 
E
A
 
G
I
 
I
A
 
A
F
 
F
E
 
Q
V
 
V
R
 
Y
D
 
D
V
 
I
A
 
V
E
 
K
A
 
A
M
 
M
A
 
E
R
 
A
A
 
D
S
 
A
G
 
E
T
 
T
Q
 
Q
V
 
S
P
 
T
E
 
E
L
 
L
R
 
R
V
 
V
D
 
D
G
|
G
G
|
G
A
|
A
S
 
S
A
 
A
N
 
S
D
 
N
L
 
L
L
 
L
C
 
M
Q
 
Q
I
 
I
Q
 
Q
A
 
S
D
 
D
Q
 
L
L
 
F
G
 
G
V
 
F
S
 
K
V
 
I
A
 
I
R
 
R
P
 
P
Q
 
K
V
 
T
Q
 
L
E
 
E
T
 
T
T
 
T
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
A
T
 
V
G
 
G
V
 
F
W
 
W
S
 
E
S
 
S
T
 
I
D
 
D
E
 
E
L
 
I
E
 
Q
R
 
S
T
 
Q
W
 
W
K
 
I
L
 
I
D
 
E
R
 
K
R
 
E
F
 
F
E
 
T
P
 
P
G
 
K
E
 
E
-
 
D
-
 
K
-
 
T
R
 
K
D
 
I
D
 
D
A
 
N
Q
 
M
Y
 
V
R
 
S
R
 
F
W
 
W
R
 
H
T
 
K
A
 
A
V
 
V
E
 
K
R
 
R
S
 
S
K
 
Q
G
 
A
W
 
W
A
 
I
E
 
E

6k76A Glycerol kinase form thermococcus kodakarensis, complex structure with substrate.
51% identity, 99% coverage: 3:491/492 of query aligns to 1:483/485 of 6k76A

query
sites
6k76A
V
 
V
L
 
L
T
 
S
I
 
L
D
 
D
A
 
E
G
 
G
T
|
T
T
 
T
G
 
S
V
 
A
T
 
R
A
 
A
L
 
I
M
 
I
V
 
F
G
 
D
E
 
R
D
 
E
G
 
S
R
 
N
V
 
I
L
 
H
S
 
G
R
 
I
G
 
G
Y
 
Q
Q
 
Y
E
 
E
F
 
F
A
 
P
Q
 
Q
H
 
H
Y
 
Y
P
 
P
E
 
R
A
 
P
G
 
G
W
 
W
V
 
V
E
 
E
H
 
H
V
 
N
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
I
W
 
W
Q
 
D
A
 
A
A
 
Q
L
 
L
A
 
R
A
 
A
C
 
I
Q
 
K
S
 
D
A
 
A
L
 
I
D
 
Q
A
 
S
A
 
A
G
 
R
T
 
E
P
 
P
P
 
N
-
 
Q
-
 
I
T
 
A
C
 
A
V
 
I
G
 
G
I
 
V
T
 
T
N
 
N
Q
 
Q
R
 
R
E
 
E
T
 
T
A
 
T
V
 
L
L
 
V
W
 
W
N
 
D
R
 
-
K
 
K
R
 
D
G
 
G
S
 
K
S
 
P
P
 
L
R
 
Y
R
 
N
A
 
A
V
 
I
V
 
V
W
 
W
Q
 
Q
D
 
C
R
 
R
R
 
R
T
 
T
A
 
A
G
 
E
I
 
M
C
 
V
T
 
E
E
 
E
L
 
I
-
 
K
R
 
R
E
 
E
A
 
Y
G
 
G
H
 
-
E
 
-
D
 
T
R
 
M
V
 
I
T
 
K
E
 
E
V
 
K
T
 
T
G
 
G
L
 
L
R
 
V
L
 
P
D
 
D
P
 
A
Y
 
Y
F
 
F
T
 
S
G
 
A
T
 
S
K
 
K
L
 
L
T
 
K
W
 
W
I
 
L
K
 
L
R
 
D
N
 
N
D
 
V
Q
 
P
R
 
G
A
 
L
W
 
R
S
 
E
G
 
K
V
 
A
E
 
E
S
 
K
G
 
G
E
 
E
T
 
V
A
 
M
V
 
F
G
 
G
T
 
T
V
 
V
D
 
D
S
 
T
Y
 
F
I
 
L
I
 
I
A
 
Y
R
 
R
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
-
A
 
-
R
 
E
H
 
H
V
 
V
T
 
T
D
 
D
A
 
Y
S
 
S
N
 
N
A
 
A
S
 
S
R
 
R
T
 
T
L
 
M
L
 
L
Y
 
F
D
 
N
I
 
I
R
 
K
R
 
K
G
 
L
A
 
D
W
 
W
S
 
D
E
 
D
E
 
E
M
 
L
C
 
L
E
 
E
L
 
L
F
 
F
G
 
D
V
 
I
P
 
P
V
 
E
S
 
S
A
 
V
L
 
L
P
 
P
E
 
E
V
 
V
V
 
R
P
 
E
S
 
S
Y
 
S
G
 
E
S
 
V
V
 
Y
G
 
G
E
 
Y
T
 
T
D
 
K
P
 
K
E
 
E
E
 
-
F
 
-
L
 
-
G
 
L
L
 
A
R
 
E
L
 
I
P
 
P
V
 
V
S
 
S
G
 
G
I
 
D
A
 
A
G
 
G
D
 
D
Q
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
M
 
L
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
N
 
A
C
 
A
Y
 
F
R
 
E
P
 
A
G
 
G
T
 
M
S
 
V
K
 
K
C
 
A
T
 
T
Y
 
Y
G
 
G
T
|
T
G
 
G
S
 
S
F
 
F
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
T
 
T
G
 
D
E
 
K
E
 
M
T
 
V
V
 
L
A
 
Y
P
 
S
D
 
D
H
 
N
G
 
-
L
 
L
L
 
L
S
 
T
T
 
T
V
 
I
L
 
A
W
 
W
Q
 
-
H
 
G
P
 
L
D
 
N
G
 
G
R
 
R
L
 
V
E
 
S
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
E
 
E
G
 
G
S
 
S
I
 
I
F
 
F
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
V
|
V
Q
|
Q
W
 
W
L
 
L
R
 
R
D
 
D
G
 
G
L
 
I
G
 
K
L
 
I
I
 
I
D
 
K
T
 
H
A
 
A
A
 
S
Q
 
E
S
 
T
E
 
E
G
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
T
S
 
K
V
 
L
P
 
E
D
 
S
S
 
N
G
 
E
G
 
G
V
 
V
V
 
Y
F
 
F
V
 
V
P
 
P
A
 
A
L
 
F
T
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
P
 
P
D
 
Y
W
 
W
D
 
D
P
 
Q
H
 
F
A
 
A
R
 
R
G
 
G
A
 
I
V
 
I
F
 
I
G
 
G
I
 
I
T
 
T
R
 
R
G
 
G
T
 
T
G
 
G
R
 
R
A
 
E
H
 
H
L
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
T
 
T
L
 
L
D
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
A
F
 
Y
E
 
L
V
 
T
R
 
R
D
 
D
V
 
V
A
 
V
E
 
D
A
 
E
M
 
M
A
 
E
R
 
K
A
 
L
S
 
-
G
 
-
T
 
V
Q
 
Q
V
 
I
P
 
K
E
 
E
L
 
L
R
 
R
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
|
G
A
|
A
S
 
T
A
 
A
N
|
N
D
 
D
L
 
F
L
 
L
C
 
M
Q
 
Q
I
 
F
Q
 
Q
A
 
A
D
 
D
Q
 
I
L
 
L
G
 
N
V
 
R
S
 
K
V
 
V
A
 
I
R
 
R
P
 
P
Q
 
V
V
 
V
Q
 
K
E
 
E
T
 
T
T
 
T
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
A
T
 
V
G
 
D
V
 
Y
W
 
W
S
 
A
S
 
D
T
 
T
D
 
R
E
 
E
L
 
I
E
 
A
R
 
E
T
 
L
W
 
W
K
 
K
L
 
A
D
 
E
R
 
R
R
 
I
F
 
F
E
 
E
P
 
P
G
 
K
E
 
M
R
 
D
D
 
E
D
 
K
A
 
T
Q
 
R
-
 
E
-
 
R
-
 
L
Y
 
Y
R
 
K
R
 
G
W
 
W
R
 
K
T
 
E
A
 
A
V
 
V
E
 
K
R
 
R
S
 
A
K
 
M
G
 
G
W
 
W
A
 
A
E
 
K
L
 
V

1bu6Y Crystal structures of escherichia coli glycerol kinase and the mutant a65t in an inactive tetramer: conformational changes and implications for allosteric regulation (see paper)
47% identity, 99% coverage: 3:490/492 of query aligns to 5:497/499 of 1bu6Y

query
sites
1bu6Y
V
 
I
L
 
V
T
 
A
I
 
L
D
 
D
A
 
Q
G
 
G
T
 
T
T
 
T
G
 
S
V
 
S
T
 
R
A
 
A
L
 
V
M
 
V
V
 
M
G
 
D
E
 
H
D
 
D
G
 
A
R
 
N
V
 
I
L
 
I
S
 
S
R
 
V
G
 
S
Y
 
Q
Q
 
R
E
 
E
F
 
F
A
 
E
Q
 
Q
H
 
I
Y
 
Y
P
 
P
E
 
K
A
 
P
G
 
G
W
 
W
V
 
V
E
 
E
H
 
H
V
 
D
P
 
P
E
 
M
E
 
E
I
 
I
W
 
W
-
 
A
-
 
T
-
 
Q
Q
 
S
A
 
S
A
 
T
L
 
L
A
 
V
A
 
E
C
 
V
Q
 
L
S
 
T
A
 
K
L
 
A
D
 
D
A
 
I
A
 
S
G
 
S
T
 
D
P
 
Q
P
 
I
T
 
A
C
 
A
V
 
I
G
 
G
I
 
I
T
 
T
N
 
N
Q
|
Q
R
|
R
E
|
E
T
 
T
A
 
T
V
 
I
L
 
V
W
 
W
N
 
E
R
 
K
K
 
E
R
 
T
G
 
G
S
 
K
S
 
P
P
 
I
R
 
Y
R
 
N
A
 
A
V
 
I
V
 
V
W
|
W
Q
 
Q
D
 
C
R
 
R
R
 
R
T
 
T
A
 
A
G
 
E
I
 
I
C
 
C
T
 
E
E
 
H
L
 
L
R
 
K
E
 
R
A
 
D
G
 
G
H
 
L
E
 
E
D
 
D
R
 
Y
V
 
I
T
 
R
E
 
S
V
 
N
T
 
T
G
 
G
L
 
L
R
 
V
L
 
I
D
 
D
P
 
P
Y
|
Y
F
 
F
T
 
S
G
 
G
T
 
T
K
 
K
L
 
V
T
 
K
W
 
W
I
 
I
K
 
L
R
 
D
N
 
H
D
 
V
Q
 
E
R
 
G
A
 
S
W
 
R
S
 
E
G
 
R
V
 
A
E
 
R
S
 
R
G
 
G
E
 
E
T
 
L
A
 
L
V
 
F
G
 
G
T
 
T
V
 
V
D
 
D
S
 
T
Y
 
W
I
 
L
I
 
I
A
 
W
R
 
K
L
 
M
T
 
T
G
 
Q
G
 
G
A
 
R
R
 
V
H
 
H
V
 
V
T
 
T
D
 
D
A
 
Y
S
 
T
N
 
N
A
 
A
S
 
S
R
 
R
T
 
T
L
 
M
L
 
L
Y
 
F
D
 
N
I
 
I
R
 
H
R
 
T
G
 
L
A
 
D
W
 
W
S
 
D
E
 
D
E
 
K
M
 
M
C
 
L
E
 
E
L
 
V
F
 
L
G
 
D
V
 
I
P
 
P
V
 
R
S
 
E
A
 
M
L
 
L
P
 
P
E
 
E
V
 
V
V
 
R
P
 
R
S
 
S
Y
 
S
G
 
E
S
 
V
V
 
Y
G
 
G
E
 
Q
T
 
T
D
 
N
P
 
I
E
 
G
E
 
G
F
 
K
L
 
G
G
 
G
L
 
T
R
 
R
L
 
I
P
 
P
V
 
I
S
 
S
G
 
G
I
 
I
A
 
A
G
 
G
D
|
D
Q
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
M
 
L
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
N
 
L
C
 
C
Y
 
V
R
 
K
P
 
E
G
 
G
T
 
M
S
 
A
K
 
K
C
 
N
T
 
T
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
G
 
G
S
 
C
F
 
F
I
 
M
L
 
L
V
 
M
N
 
N
T
 
T
G
 
G
E
 
E
E
 
K
T
 
A
V
 
V
A
 
K
P
 
S
D
 
E
H
 
N
G
 
G
L
 
L
L
 
L
S
 
T
T
 
T
V
 
I
L
 
A
W
 
C
Q
 
-
H
 
G
P
 
P
D
 
T
G
 
G
R
 
E
L
 
V
E
 
N
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
E
 
E
G
 
G
S
 
A
I
 
V
F
 
F
V
 
M
T
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
S
V
 
I
Q
 
Q
W
 
W
L
 
L
R
 
R
D
 
D
G
 
E
L
 
M
G
 
K
L
 
L
I
 
I
D
 
N
T
 
D
A
 
A
A
 
Y
Q
 
D
S
 
S
E
 
E
G
 
Y
L
 
F
A
 
A
A
 
T
S
 
K
V
 
V
P
 
Q
D
 
N
S
 
T
G
 
N
G
 
G
V
 
V
V
 
Y
F
 
V
V
 
V
P
 
P
A
 
A
L
 
F
T
 
T
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
P
 
P
D
 
Y
W
 
W
D
 
D
P
 
P
H
 
Y
A
 
A
R
 
R
G
 
G
A
 
A
V
 
I
F
 
F
G
 
G
I
 
L
T
 
T
R
 
R
G
 
G
T
 
V
G
 
N
R
 
A
A
 
N
H
 
H
L
 
I
A
 
I
R
 
R
A
 
A
T
 
T
L
 
L
D
 
E
A
 
S
I
 
I
A
 
A
F
 
Y
E
 
Q
V
 
T
R
 
R
D
 
D
V
 
V
A
 
L
E
 
E
A
 
A
M
 
M
A
 
Q
R
 
A
A
 
D
S
 
S
G
 
G
T
 
I
Q
 
R
V
 
L
P
 
H
E
 
A
L
 
L
R
 
R
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
V
A
 
A
N
 
N
D
 
N
L
 
F
L
 
L
C
 
M
Q
 
Q
I
 
F
Q
 
Q
A
 
S
D
 
D
Q
 
I
L
 
L
G
 
G
V
 
T
S
 
R
V
 
V
A
 
E
R
 
R
P
 
P
Q
 
E
V
 
V
Q
 
R
E
 
E
T
 
V
T
 
T
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
A
T
 
V
G
 
G
V
 
F
W
 
W
S
 
Q
S
 
N
T
 
L
D
 
D
E
 
E
L
 
L
E
 
Q
R
 
E
T
 
K
W
 
A
K
 
V
L
 
I
D
 
E
R
 
R
R
 
E
F
 
F
E
 
R
P
 
P
G
 
G
-
 
I
E
 
E
R
 
T
D
 
T
D
 
E
A
 
R
Q
 
N
Y
 
Y
R
 
R
R
 
Y
-
 
A
-
 
G
W
 
W
R
 
K
T
 
K
A
 
A
V
 
V
E
 
K
R
 
R
S
 
A
K
 
M
G
 
A
W
 
W
A
 
E
E
 
E

P0A6F3 Glycerol kinase; ATP:glycerol 3-phosphotransferase; Glycerokinase; GK; EC 2.7.1.30 from Escherichia coli (strain K12) (see 10 papers)
47% identity, 99% coverage: 3:490/492 of query aligns to 7:499/502 of P0A6F3

query
sites
P0A6F3
V
 
I
L
 
V
T
 
A
I
 
L
D
 
D
A
 
Q
G
 
G
T
|
T
T
 
T
G
 
S
V
 
S
T
x
R
A
 
A
L
 
V
M
 
V
V
 
M
G
 
D
E
 
H
D
 
D
G
 
A
R
 
N
V
 
I
L
 
I
S
 
S
R
 
V
G
 
S
Y
 
Q
Q
 
R
E
 
E
F
 
F
A
 
E
Q
 
Q
H
 
I
Y
 
Y
P
 
P
E
 
K
A
 
P
G
 
G
W
 
W
V
 
V
E
 
E
H
 
H
V
 
D
P
 
P
E
 
M
E
 
E
I
 
I
W
 
W
-
 
A
-
 
T
-
 
Q
Q
 
S
A
x
S
A
 
T
L
 
L
A
 
V
A
 
E
C
 
V
Q
 
L
S
x
A
A
 
K
L
 
A
D
 
D
A
 
I
A
 
S
G
 
S
T
 
D
P
 
Q
P
 
I
T
 
A
C
 
A
V
 
I
G
 
G
I
 
I
T
 
T
N
 
N
Q
 
Q
R
|
R
E
|
E
T
 
T
A
 
T
V
 
I
L
 
V
W
 
W
N
 
E
R
 
K
K
 
E
R
 
T
G
 
G
S
 
K
S
 
P
P
 
I
R
 
Y
R
 
N
A
 
A
V
 
I
V
 
V
W
 
W
Q
 
Q
D
 
C
R
 
R
R
 
R
T
 
T
A
 
A
G
 
E
I
 
I
C
 
C
T
 
E
E
 
H
L
 
L
R
 
K
E
 
R
A
 
D
G
 
G
H
 
L
E
 
E
D
 
D
R
 
Y
V
 
I
T
 
R
E
 
S
V
 
N
T
 
T
G
 
G
L
 
L
R
 
V
L
 
I
D
 
D
P
 
P
Y
|
Y
F
 
F
T
 
S
G
 
G
T
 
T
K
 
K
L
 
V
T
 
K
W
 
W
I
 
I
K
 
L
R
 
D
N
 
H
D
 
V
Q
 
E
R
 
G
A
 
S
W
 
R
S
 
E
G
 
R
V
 
A
E
 
R
S
 
R
G
 
G
E
 
E
T
 
L
A
 
L
V
 
F
G
 
G
T
 
T
V
 
V
D
 
D
S
 
T
Y
 
W
I
 
L
I
 
I
A
 
W
R
 
K
L
 
M
T
 
T
G
 
Q
G
 
G
A
 
R
R
 
V
H
 
H
V
 
V
T
 
T
D
 
D
A
 
Y
S
 
T
N
 
N
A
 
A
S
 
S
R
 
R
T
 
T
L
 
M
L
 
L
Y
 
F
D
 
N
I
 
I
R
 
H
R
 
T
G
 
L
A
 
D
W
 
W
S
 
D
E
 
D
E
 
K
M
 
M
C
 
L
E
 
E
L
 
V
F
 
L
G
 
D
V
 
I
P
 
P
V
 
R
S
 
E
A
 
M
L
 
L
P
 
P
E
 
E
V
 
V
V
 
R
P
 
R
S
 
S
Y
 
S
G
 
E
S
 
V
V
 
Y
G
 
G
E
 
Q
T
 
T
D
 
N
P
 
I
E
x
G
E
 
G
F
x
K
L
 
G
G
|
G
L
 
T
R
|
R
L
 
I
P
 
P
V
 
I
S
 
S
G
 
G
I
 
I
A
 
A
G
 
G
D
|
D
Q
|
Q
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
M
 
L
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
N
 
L
C
 
C
Y
 
V
R
 
K
P
 
E
G
 
G
T
 
M
S
 
A
K
 
K
C
 
N
T
 
T
Y
 
Y
G
 
G
T
|
T
G
 
G
S
 
C
F
 
F
I
 
M
L
 
L
V
 
M
N
 
N
T
 
T
G
 
G
E
 
E
E
 
K
T
 
A
V
 
V
A
 
K
P
 
S
D
 
E
H
 
N
G
 
G
L
 
L
L
 
L
S
 
T
T
 
T
V
 
I
L
 
A
W
 
C
Q
 
-
H
 
G
P
 
P
D
 
T
G
 
G
R
 
E
L
 
V
E
 
N
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
E
 
E
G
|
G
S
 
A
I
 
V
F
 
F
V
 
M
T
 
A
G
|
G
A
 
A
A
 
S
V
 
I
Q
 
Q
W
 
W
L
 
L
R
 
R
D
 
D
G
 
E
L
 
M
G
 
K
L
 
L
I
 
I
D
 
N
T
 
D
A
 
A
A
 
Y
Q
 
D
S
 
S
E
 
E
G
 
Y
L
 
F
A
 
A
A
 
T
S
 
K
V
 
V
P
 
Q
D
 
N
S
 
T
G
 
N
G
 
G
V
 
V
V
 
Y
F
 
V
V
 
V
P
 
P
A
 
A
L
 
F
T
 
T
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
P
 
P
D
 
Y
W
 
W
D
 
D
P
 
P
H
 
Y
A
 
A
R
 
R
G
 
G
A
 
A
V
 
I
F
 
F
G
 
G
I
 
L
T
 
T
R
 
R
G
 
G
T
 
V
G
 
N
R
 
A
A
 
N
H
 
H
L
 
I
A
 
I
R
 
R
A
 
A
T
 
T
L
 
L
D
 
E
A
 
S
I
 
I
A
 
A
F
 
Y
E
 
Q
V
 
T
R
 
R
D
 
D
V
 
V
A
 
L
E
 
E
A
 
A
M
 
M
A
 
Q
R
 
A
A
 
D
S
 
S
G
 
G
T
 
I
Q
 
R
V
 
L
P
 
H
E
 
A
L
 
L
R
 
R
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
|
G
A
 
A
S
 
V
A
 
A
N
|
N
D
 
N
L
 
F
L
 
L
C
 
M
Q
 
Q
I
 
F
Q
 
Q
A
 
S
D
 
D
Q
 
I
L
 
L
G
 
G
V
 
T
S
 
R
V
 
V
A
 
E
R
 
R
P
 
P
Q
 
E
V
 
V
Q
 
R
E
 
E
T
 
V
T
 
T
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
A
T
 
V
G
 
G
V
 
F
W
 
W
S
 
Q
S
 
N
T
 
L
D
 
D
E
 
E
L
 
L
E
 
Q
R
 
E
T
 
K
W
 
A
K
 
V
L
 
I
D
 
E
R
 
R
R
 
E
F
 
F
E
 
R
P
 
P
G
 
G
-
x
I
E
 
E
R
 
T
D
 
T
D
x
E
A
x
R
Q
 
N
Y
 
Y
R
 
R
R
 
Y
-
 
A
-
 
G
W
 
W
R
 
K
T
 
K
A
 
A
V
 
V
E
 
K
R
 
R
S
 
A
K
 
M
G
 
A
W
 
W
A
 
E
E
 
E

Sites not aligning to the query:

1gllO Escherichia coli glycerol kinase mutant with bound atp analog showing substantial domain motion (see paper)
47% identity, 99% coverage: 3:490/492 of query aligns to 5:493/494 of 1gllO

query
sites
1gllO
V
 
I
L
 
V
T
 
A
I
 
L
D
 
D
A
 
Q
G
 
G
T
|
T
T
|
T
G
 
S
V
 
S
T
 
R
A
 
A
L
 
V
M
 
V
V
 
M
G
 
D
E
 
H
D
 
D
G
 
A
R
 
N
V
 
I
L
 
I
S
 
S
R
 
V
G
 
S
Y
 
Q
Q
 
R
E
 
E
F
 
F
A
 
E
Q
 
Q
H
 
I
Y
 
Y
P
 
P
E
 
K
A
 
P
G
 
G
W
 
W
V
 
V
E
 
E
H
 
H
V
 
D
P
 
P
E
 
M
E
 
E
I
 
I
W
 
W
Q
 
A
A
 
T
-
 
Q
-
 
S
-
 
W
A
 
T
L
 
L
A
 
V
A
 
E
C
 
V
Q
 
L
S
 
A
A
 
K
L
 
A
D
 
D
A
 
I
A
 
S
G
 
S
T
 
D
P
 
Q
P
 
I
T
 
A
C
 
A
V
 
I
G
 
G
I
 
I
T
 
T
N
 
N
Q
 
Q
R
|
R
E
|
E
T
 
T
A
 
T
V
 
I
L
 
V
W
 
W
N
 
E
R
 
K
K
 
E
R
 
T
G
 
G
S
 
K
S
 
P
P
 
I
R
 
Y
R
 
N
A
 
A
V
 
I
V
 
V
W
 
W
Q
 
Q
D
 
C
R
 
R
R
 
R
T
 
T
A
 
A
G
 
E
I
 
I
C
 
C
T
 
E
E
 
H
L
 
L
R
 
K
E
 
R
A
 
D
G
 
G
H
 
L
E
 
E
D
 
D
R
 
Y
V
 
I
T
 
R
E
 
S
V
 
N
T
 
T
G
 
G
L
 
L
R
 
V
L
 
I
D
 
D
P
 
P
Y
|
Y
F
 
F
T
 
S
G
 
G
T
 
T
K
 
K
L
 
V
T
 
K
W
 
W
I
 
I
K
 
L
R
 
D
N
 
H
D
 
V
Q
 
E
R
 
G
A
 
S
W
 
R
S
 
E
G
 
R
V
 
A
E
 
R
S
 
R
G
 
G
E
 
E
T
 
L
A
 
L
V
 
F
G
 
G
T
 
T
V
 
V
D
 
D
S
 
T
Y
 
W
I
 
L
I
 
I
A
 
W
R
 
K
L
 
M
T
 
T
G
 
Q
G
 
G
A
 
R
R
 
V
H
 
H
V
 
V
T
 
T
D
 
D
A
 
Y
S
 
T
N
 
N
A
 
A
S
 
S
R
 
R
T
 
T
L
 
M
L
 
L
Y
 
F
D
 
N
I
 
I
R
 
H
R
 
T
G
 
L
A
 
D
W
 
W
S
 
D
E
 
D
E
 
K
M
 
M
C
 
L
E
 
E
L
 
V
F
 
L
G
 
D
V
 
I
P
 
P
V
 
R
S
 
E
A
 
M
L
 
L
P
 
P
E
 
E
V
 
V
V
 
R
P
 
R
S
 
S
Y
 
S
G
 
E
S
 
V
V
 
Y
G
 
G
E
 
Q
T
 
T
D
 
N
P
 
-
E
 
-
E
 
-
F
 
-
L
 
I
G
 
G
L
 
T
R
 
R
L
 
I
P
 
P
V
 
I
S
 
S
G
 
G
I
 
I
A
 
A
G
 
G
D
|
D
Q
|
Q
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
M
 
L
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
N
 
L
C
 
C
Y
 
V
R
 
K
P
 
E
G
 
G
T
 
M
S
 
A
K
 
K
C
 
N
T
 
T
Y
 
Y
G
|
G
T
|
T
G
 
G
S
 
C
F
|
F
I
 
M
L
 
L
V
 
M
N
 
N
T
 
T
G
 
G
E
 
E
E
 
K
T
 
A
V
 
V
A
 
K
P
 
S
D
 
E
H
 
N
G
 
G
L
 
L
L
 
L
S
 
T
T
 
T
V
 
I
L
 
A
W
 
-
Q
 
C
H
 
G
P
 
P
D
 
T
G
 
G
R
 
E
L
 
V
E
 
N
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
E
 
E
G
 
G
S
 
A
I
 
V
F
 
F
V
 
M
T
 
A
G
|
G
A
 
A
A
 
S
V
x
I
Q
|
Q
W
 
W
L
 
L
R
 
R
D
 
D
G
 
E
L
 
M
G
 
K
L
 
L
I
 
I
D
 
N
T
 
D
A
|
A
A
 
Y
Q
 
D
S
 
S
E
 
E
G
 
Y
L
 
F
A
 
A
A
 
T
S
 
K
V
 
V
P
 
Q
D
 
N
S
 
T
G
 
N
G
 
G
V
 
V
V
 
Y
F
 
V
V
 
V
P
 
P
A
 
A
L
 
F
T
 
T
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
P
 
P
D
 
Y
W
 
W
D
 
D
P
 
P
H
 
Y
A
 
A
R
 
R
G
 
G
A
 
A
V
 
I
F
 
F
G
 
G
I
 
L
T
 
T
R
 
R
G
 
G
T
 
V
G
 
N
R
 
A
A
 
N
H
 
H
L
 
I
A
 
I
R
 
R
A
 
A
T
 
T
L
 
L
D
 
E
A
 
S
I
 
I
A
 
A
F
 
Y
E
 
Q
V
 
T
R
 
R
D
 
D
V
 
V
A
 
L
E
 
E
A
 
A
M
 
M
A
 
Q
R
 
A
A
 
D
S
 
S
G
 
G
T
 
I
Q
 
R
V
 
L
P
 
H
E
 
A
L
 
L
R
 
R
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
|
G
A
 
A
S
 
V
A
 
A
N
|
N
D
 
N
L
 
F
L
 
L
C
 
M
Q
 
Q
I
 
F
Q
 
Q
A
 
S
D
 
D
Q
 
I
L
 
L
G
 
G
V
 
T
S
 
R
V
 
V
A
 
E
R
 
R
P
 
P
Q
 
E
V
 
V
Q
 
R
E
 
E
T
 
V
T
 
T
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
A
T
 
V
G
 
G
V
 
F
W
 
W
S
 
Q
S
 
N
T
 
L
D
 
D
E
 
E
L
 
L
E
 
Q
R
 
E
T
 
K
W
 
A
K
 
V
L
 
I
D
 
E
R
 
R
R
 
E
F
 
F
E
 
R
P
 
P
G
 
G
-
 
I
E
 
E
R
 
T
D
 
T
D
 
E
A
 
R
Q
 
N
Y
 
Y
R
 
R
R
 
Y
-
 
A
-
 
G
W
 
W
R
 
K
T
 
K
A
 
A
V
 
V
E
 
K
R
 
R
S
 
A
K
 
M
G
 
A
W
 
W
A
 
E
E
 
E

1gljO Escherichia coli glycerol kinase mutant with bound atp analog showing substantial domain motion (see paper)
47% identity, 99% coverage: 3:490/492 of query aligns to 5:493/494 of 1gljO

query
sites
1gljO
V
 
I
L
 
V
T
 
A
I
 
L
D
 
D
A
 
Q
G
 
G
T
|
T
T
|
T
G
 
S
V
 
S
T
 
R
A
 
A
L
 
V
M
 
V
V
 
M
G
 
D
E
 
H
D
 
D
G
 
A
R
 
N
V
 
I
L
 
I
S
 
S
R
 
V
G
 
S
Y
 
Q
Q
 
R
E
 
E
F
 
F
A
 
E
Q
 
Q
H
 
I
Y
 
Y
P
 
P
E
 
K
A
 
P
G
 
G
W
 
W
V
 
V
E
 
E
H
 
H
V
 
D
P
 
P
E
 
M
E
 
E
I
 
I
W
 
W
Q
 
A
A
 
T
-
 
Q
-
 
S
-
 
W
A
 
T
L
 
L
A
 
V
A
 
E
C
 
V
Q
 
L
S
 
A
A
 
K
L
 
A
D
 
D
A
 
I
A
 
S
G
 
S
T
 
D
P
 
Q
P
 
I
T
 
A
C
 
A
V
 
I
G
 
G
I
 
I
T
 
T
N
 
N
Q
 
Q
R
|
R
E
|
E
T
 
T
A
 
T
V
 
I
L
 
V
W
 
W
N
 
E
R
 
K
K
 
E
R
 
T
G
 
G
S
 
K
S
 
P
P
 
I
R
 
Y
R
 
N
A
 
A
V
 
I
V
 
V
W
|
W
Q
 
Q
D
 
C
R
 
R
R
 
R
T
 
T
A
 
A
G
 
E
I
 
I
C
 
C
T
 
E
E
 
H
L
 
L
R
 
K
E
 
R
A
 
D
G
 
G
H
 
L
E
 
E
D
 
D
R
 
Y
V
 
I
T
 
R
E
 
S
V
 
N
T
 
T
G
 
G
L
 
L
R
 
V
L
 
I
D
 
D
P
 
P
Y
|
Y
F
 
F
T
 
S
G
 
G
T
 
T
K
 
K
L
 
V
T
 
K
W
 
W
I
 
I
K
 
L
R
 
D
N
 
H
D
 
V
Q
 
E
R
 
G
A
 
S
W
 
R
S
 
E
G
 
R
V
 
A
E
 
R
S
 
R
G
 
G
E
 
E
T
 
L
A
 
L
V
 
F
G
 
G
T
 
T
V
 
V
D
 
D
S
 
T
Y
 
W
I
 
L
I
 
I
A
 
W
R
 
K
L
 
M
T
 
T
G
 
Q
G
 
G
A
 
R
R
 
V
H
 
H
V
 
V
T
 
T
D
 
D
A
 
Y
S
 
T
N
 
N
A
 
A
S
 
S
R
 
R
T
 
T
L
 
M
L
 
L
Y
 
F
D
 
N
I
 
I
R
 
H
R
 
T
G
 
L
A
 
D
W
 
W
S
 
D
E
 
D
E
 
K
M
 
M
C
 
L
E
 
E
L
 
V
F
 
L
G
 
D
V
 
I
P
 
P
V
 
R
S
 
E
A
 
M
L
 
L
P
 
P
E
 
E
V
 
V
V
 
R
P
 
R
S
 
S
Y
 
S
G
 
E
S
 
V
V
 
Y
G
 
G
E
 
Q
T
 
T
D
 
N
P
 
-
E
 
-
E
 
-
F
 
-
L
 
I
G
 
G
L
 
T
R
 
R
L
 
I
P
 
P
V
 
I
S
 
S
G
 
G
I
 
I
A
 
A
G
 
G
D
|
D
Q
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
M
 
L
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
N
 
L
C
 
C
Y
 
V
R
 
K
P
 
E
G
 
G
T
 
M
S
 
A
K
 
K
C
 
N
T
 
T
Y
 
Y
G
|
G
T
|
T
G
 
G
S
 
C
F
|
F
I
 
M
L
 
L
V
 
M
N
 
N
T
 
T
G
 
G
E
 
E
E
 
K
T
 
A
V
 
V
A
 
K
P
 
S
D
 
E
H
 
N
G
 
G
L
 
L
L
 
L
S
 
T
T
 
T
V
 
I
L
 
A
W
 
-
Q
 
C
H
 
G
P
 
P
D
 
T
G
 
G
R
 
E
L
 
V
E
 
N
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
E
 
E
G
 
G
S
 
A
I
 
V
F
 
F
V
 
M
T
 
A
G
|
G
A
 
A
A
 
S
V
 
I
Q
|
Q
W
 
W
L
 
L
R
 
R
D
 
D
G
 
E
L
 
M
G
 
K
L
 
L
I
 
I
D
 
N
T
 
D
A
|
A
A
 
Y
Q
 
D
S
 
S
E
 
E
G
 
Y
L
 
F
A
 
A
A
 
T
S
 
K
V
 
V
P
 
Q
D
 
N
S
 
T
G
 
N
G
 
G
V
 
V
V
 
Y
F
 
V
V
 
V
P
 
P
A
 
A
L
 
F
T
 
T
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
P
 
P
D
 
Y
W
 
W
D
 
D
P
 
P
H
 
Y
A
 
A
R
 
R
G
 
G
A
 
A
V
 
I
F
 
F
G
 
G
I
 
L
T
 
T
R
 
R
G
 
G
T
 
V
G
 
N
R
 
A
A
 
N
H
 
H
L
 
I
A
 
I
R
 
R
A
 
A
T
 
T
L
 
L
D
 
E
A
 
S
I
 
I
A
 
A
F
 
Y
E
 
Q
V
 
T
R
 
R
D
 
D
V
 
V
A
 
L
E
 
E
A
 
A
M
 
M
A
 
Q
R
 
A
A
 
D
S
 
S
G
 
G
T
 
I
Q
 
R
V
 
L
P
 
H
E
 
A
L
 
L
R
 
R
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
|
G
A
|
A
S
 
V
A
 
A
N
 
N
D
 
N
L
 
F
L
 
L
C
 
M
Q
 
Q
I
 
F
Q
 
Q
A
 
S
D
 
D
Q
 
I
L
 
L
G
 
G
V
 
T
S
 
R
V
 
V
A
 
E
R
 
R
P
 
P
Q
 
E
V
 
V
Q
 
R
E
 
E
T
 
V
T
 
T
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
A
T
 
V
G
 
G
V
 
F
W
 
W
S
 
Q
S
 
N
T
 
L
D
 
D
E
 
E
L
 
L
E
 
Q
R
 
E
T
 
K
W
 
A
K
 
V
L
 
I
D
 
E
R
 
R
R
 
E
F
 
F
E
 
R
P
 
P
G
 
G
-
 
I
E
 
E
R
 
T
D
 
T
D
 
E
A
 
R
Q
 
N
Y
 
Y
R
 
R
R
 
Y
-
 
A
-
 
G
W
 
W
R
 
K
T
 
K
A
 
A
V
 
V
E
 
K
R
 
R
S
 
A
K
 
M
G
 
A
W
 
W
A
 
E
E
 
E

1bwfO Escherichia coli glycerol kinase mutant with bound atp analog showing substantial domain motion (see paper)
47% identity, 99% coverage: 3:490/492 of query aligns to 5:493/494 of 1bwfO

query
sites
1bwfO
V
 
I
L
 
V
T
 
A
I
 
L
D
 
D
A
 
Q
G
 
G
T
|
T
T
|
T
G
 
S
V
 
S
T
 
R
A
 
A
L
 
V
M
 
V
V
 
M
G
 
D
E
 
H
D
 
D
G
 
A
R
 
N
V
 
I
L
 
I
S
 
S
R
 
V
G
 
S
Y
 
Q
Q
 
R
E
 
E
F
 
F
A
 
E
Q
 
Q
H
 
I
Y
 
Y
P
 
P
E
 
K
A
 
P
G
 
G
W
 
W
V
 
V
E
 
E
H
 
H
V
 
D
P
 
P
E
 
M
E
 
E
I
 
I
W
 
W
Q
 
A
A
 
T
-
 
Q
-
 
S
-
 
W
A
 
T
L
 
L
A
 
V
A
 
E
C
 
V
Q
 
L
S
 
A
A
 
K
L
 
A
D
 
D
A
 
I
A
 
S
G
 
S
T
 
D
P
 
Q
P
 
I
T
 
A
C
 
A
V
 
I
G
 
G
I
 
I
T
 
T
N
 
N
Q
 
Q
R
|
R
E
|
E
T
 
T
A
 
T
V
 
I
L
 
V
W
 
W
N
 
E
R
 
K
K
 
E
R
 
T
G
 
G
S
 
K
S
 
P
P
 
I
R
 
Y
R
 
N
A
 
A
V
 
I
V
 
V
W
|
W
Q
 
Q
D
 
C
R
 
R
R
 
R
T
 
T
A
 
A
G
 
E
I
 
I
C
 
C
T
 
E
E
 
H
L
 
L
R
 
K
E
 
R
A
 
D
G
 
G
H
 
L
E
 
E
D
 
D
R
 
Y
V
 
I
T
 
R
E
 
S
V
 
N
T
 
T
G
 
G
L
 
L
R
 
V
L
 
I
D
 
D
P
 
P
Y
|
Y
F
 
F
T
 
S
G
 
G
T
 
T
K
 
K
L
 
V
T
 
K
W
 
W
I
 
I
K
 
L
R
 
D
N
 
H
D
 
V
Q
 
E
R
 
G
A
 
S
W
 
R