SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_017558945.1 NCBI__GCF_000341205.1:WP_017558945.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 13 hits to proteins with known functional sites (download)

Q9CIV8 PTS-dependent dihydroxyacetone kinase, dihydroxyacetone-binding subunit DhaK; EC 2.7.1.121 from Lactococcus lactis subsp. lactis (strain IL1403) (Streptococcus lactis) (see paper)
38% identity, 52% coverage: 3:312/591 of query aligns to 6:316/332 of Q9CIV8

query
sites
Q9CIV8
V
 
I
L
 
I
G
 
N
R
 
Q
A
 
P
A
 
Q
T
 
D
F
 
V
K
 
V
R
 
S
D
 
E
W
 
M
L
 
L
D
 
D
G
 
G
F
 
L
A
 
T
T
 
Y
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
R
 
D
T
 
L
V
 
I
R
 
E
K
 
K
V
 
V
P
 
P
G
 
D
A
 
-
Y
 
F
G
 
E
V
 
I
V
 
I
A
 
Q
R
 
R
E
 
K
R
 
S
P
 
P
R
 
K
T
 
S
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
V
 
L
V
 
V
I
 
S
G
 
G
G
 
G
G
|
G
C
x
S
G
|
G
H
|
H
Y
 
K
P
 
P
A
 
A
F
 
H
A
 
A
G
 
G
L
 
F
V
 
V
G
 
G
P
 
E
G
 
G
L
 
M
A
 
L
D
 
S
G
 
A
A
 
A
V
 
V
V
 
C
G
 
G
D
 
A
V
 
I
F
 
F
T
 
T
S
 
S
P
 
P
S
 
T
A
 
P
E
 
D
Q
 
Q
V
 
I
Y
 
Y
R
 
E
T
 
A
A
 
I
R
 
K
E
 
S
A
 
A
D
 
D
D
 
E
G
 
G
G
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
L
F
 
L
G
 
I
Y
 
I
G
x
K
N
 
N
Y
 
Y
Q
 
L
G
 
G
D
|
D
V
 
V
L
 
M
H
 
N
F
 
F
G
 
E
L
 
M
A
 
A
A
 
R
R
 
E
R
 
M
L
 
A
A
 
E
A
 
M
E
 
E
G
 
E
I
 
I
D
 
K
S
 
V
R
 
E
T
 
Q
V
 
I
L
 
I
V
 
V
T
 
D
D
 
D
D
 
D
V
 
I
A
 
A
S
 
V
G
 
E
P
 
N
A
 
S
E
 
L
Q
 
Y
A
 
T
G
 
Q
R
 
G
R
 
R
R
 
R
G
 
G
V
 
V
A
 
A
G
 
G
D
 
T
F
 
V
F
 
L
V
 
V
F
 
H
K
 
K
V
 
I
A
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
H
R
 
Q
G
 
E
D
 
A
D
 
S
L
 
L
A
 
D
G
 
E
V
 
I
H
 
K
A
 
D
A
 
L
A
 
A
E
 
D
R
 
K
A
 
V
N
 
V
A
 
K
A
 
N
T
 
I
R
 
K
T
 
T
F
 
I
G
 
G
V
 
L
A
 
A
F
 
L
G
 
S
G
 
A
C
 
A
T
 
T
L
 
V
P
 
P
G
 
E
A
 
V
D
 
G
G
 
K
P
 
P
L
 
G
F
 
F
T
 
V
V
 
L
D
 
D
D
 
D
G
 
N
A
 
E
M
 
I
E
 
E
L
 
Y
G
 
G
L
 
V
G
 
G
I
 
I
H
|
H
G
 
S
E
 
E
P
 
P
G
 
G
V
 
Y
R
 
R
T
 
R
V
 
E
G
 
K
R
 
M
L
 
K
G
 
T
A
 
S
E
 
Y
E
 
E
L
 
L
A
 
A
D
 
T
E
 
E
L
 
L
V
 
V
D
 
G
G
 
K
L
 
L
L
 
K
P
 
E
E
 
E
L
 
F
P
 
K
S
 
F
Q
 
E
G
 
A
-
 
G
-
 
Q
R
 
K
V
 
Y
A
 
G
V
 
I
L
 
L
L
 
V
N
 
N
G
 
G
L
 
M
G
 
G
R
 
A
T
 
T
K
 
P
Y
 
L
E
 
M
E
 
E
M
 
Q
F
 
F
T
 
I
V
 
F
C
 
M
T
 
N
R
 
D
V
 
V
H
 
A
E
 
K
R
 
L
L
 
L
A
 
T
G
 
E
A
 
E
G
 
N
L
 
I
L
 
E
P
 
I
V
 
L
H
 
F
T
 
K
E
 
K
A
 
V
G
 
G
E
 
N
F
 
Y
V
 
M
T
 
T
S
 
S
L
 
I
D
 
D
M
 
M
A
 
A
G
 
G
L
 
L
S
 
S
L
 
L
S
 
T
V
 
M
M
 
I
V
 
K
L
 
L
D
 
E
D
 
D
E
 
D

Q3LXA3 Triokinase/FMN cyclase; Bifunctional ATP-dependent dihydroxyacetone kinase/FAD-AMP lyase (cyclizing); EC 2.7.1.28; EC 2.7.1.29; EC 4.6.1.15 from Homo sapiens (Human) (see 4 papers)
31% identity, 86% coverage: 44:553/591 of query aligns to 47:558/575 of Q3LXA3

query
sites
Q3LXA3
G
 
G
K
 
R
V
 
V
A
 
A
V
 
L
V
 
L
I
 
S
G
 
G
G
 
G
G
 
G
C
 
S
G
 
G
H
 
H
Y
 
E
P
 
P
A
 
A
F
 
H
A
 
A
G
 
G
L
 
F
V
 
I
G
 
G
P
 
K
G
 
G
L
 
M
A
 
L
D
 
T
G
 
G
A
 
V
V
 
I
V
 
A
G
 
G
D
 
A
V
 
V
F
 
F
T
 
T
S
 
S
P
 
P
S
 
A
A
 
V
E
 
G
Q
 
S
V
 
I
Y
 
L
R
 
A
T
 
A
A
 
I
R
 
R
E
 
A
A
 
V
D
 
A
D
 
Q
G
 
A
G
 
G
-
 
T
-
 
V
G
 
G
V
 
T
L
 
L
F
 
L
G
 
I
Y
 
V
G
 
K
N
 
N
Y
 
Y
Q
x
T
G
 
G
D
 
D
V
 
R
L
 
L
H
 
N
F
 
F
G
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
R
R
 
E
R
 
Q
L
 
A
A
 
R
A
 
A
E
 
E
G
 
G
I
 
I
D
 
P
S
 
V
R
 
E
T
 
M
V
 
V
L
 
V
V
 
I
T
 
G
D
 
D
D
 
D
V
 
S
A
 
A
S
 
F
G
 
T
P
 
V
A
 
L
E
 
K
Q
 
K
A
 
A
G
 
G
R
 
-
R
 
R
R
 
R
G
 
G
V
 
L
A
 
C
G
 
G
D
 
T
F
 
V
F
 
L
V
 
I
F
 
H
K
 
K
V
 
V
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
L
A
 
A
E
 
E
R
 
A
G
 
G
D
 
-
D
 
-
L
 
-
A
 
V
G
 
G
V
 
L
H
 
E
A
 
E
A
 
I
A
 
A
E
 
K
R
 
Q
A
 
V
N
 
N
A
 
V
A
 
V
T
x
A
R
 
K
-
 
A
-
 
M
-
 
G
T
 
T
F
 
L
G
 
G
V
 
V
A
 
S
F
 
L
G
 
S
G
 
S
C
 
C
T
 
S
L
 
V
P
 
P
G
 
G
A
 
S
D
x
K
G
 
-
P
 
P
L
 
T
F
 
F
T
 
E
V
 
L
D
 
S
D
 
A
G
 
D
A
 
E
M
 
V
E
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
I
 
I
H
|
H
G
 
G
E
 
E
P
 
A
G
 
G
V
 
V
R
 
R
T
 
R
V
 
I
G
 
K
R
 
M
L
 
A
G
 
T
A
 
A
E
 
D
E
 
E
L
 
I
A
 
V
D
 
K
E
 
L
L
 
M
V
 
L
D
 
D
G
 
H
L
 
M
L
 
T
-
 
N
-
 
T
-
 
T
-
 
N
-
 
A
P
 
S
E
 
H
L
 
V
P
 
P
S
 
V
Q
 
Q
-
 
P
-
 
G
G
 
S
R
 
S
V
 
V
A
 
V
V
 
M
L
 
M
L
 
V
N
 
N
G
 
N
L
 
L
G
 
G
R
 
G
T
 
L
K
 
S
Y
 
F
E
 
L
E
 
E
M
 
L
F
 
G
T
 
I
V
 
I
C
 
A
T
 
D
R
 
A
V
 
T
H
 
V
E
 
R
R
 
S
L
 
L
A
 
E
G
 
G
A
 
R
G
 
G
L
 
V
L
 
K
P
 
I
V
 
A
H
 
R
T
 
A
E
 
L
A
 
V
G
 
G
E
 
T
F
 
F
V
 
M
T
 
S
S
 
A
L
 
L
D
 
E
M
 
M
A
 
P
G
 
G
L
 
I
S
 
S
L
 
L
S
 
T
V
 
L
M
 
L
V
 
L
L
 
V
D
 
D
D
 
E
E
 
P
L
 
L
A
 
L
E
 
K
L
 
L
Y
 
I
A
 
D
A
 
A
P
 
E
C
 
T
D
 
T
T
 
A
P
 
A
G
 
A
Y
 
W
R
 
P
S
 
N
A
 
V
G
 
A
A
 
A
-
 
V
-
 
S
-
 
I
-
 
T
-
 
G
-
 
R
-
 
K
-
 
R
-
 
S
R
 
R
L
 
V
E
 
A
P
 
P
V
 
A
E
 
E
P
 
P
V
 
Q
R
 
-
T
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
E
 
E
R
 
A
P
 
P
D
 
D
D
 
S
Q
 
T
A
 
A
A
 
A
A
 
G
G
 
G
P
 
S
V
 
A
D
 
S
R
 
K
A
 
R
L
 
M
S
 
A
A
 
L
A
 
V
M
 
L
V
 
E
R
 
R
L
 
V
E
 
C
E
 
S
A
 
T
-
 
L
-
 
L
-
 
G
-
 
L
E
 
E
D
 
E
E
 
H
L
 
L
G
 
N
R
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
R
V
 
A
A
 
A
A
 
G
D
|
D
G
 
G
D
|
D
H
x
C
G
 
G
L
 
T
G
 
T
M
 
H
T
 
S
R
 
R
G
 
A
I
 
A
R
 
R
A
 
A
A
 
I
V
 
Q
A
 
E
A
 
W
A
 
L
R
 
K
A
 
E
A
 
G
E
 
P
A
 
P
D
 
P
G
 
A
E
 
S
P
 
P
V
 
A
S
 
Q
G
 
L
A
 
L
L
 
-
L
 
S
A
 
K
A
 
L
G
 
S
T
 
V
A
 
L
F
 
L
A
 
L
D
 
E
A
 
K
A
 
M
G
 
G
G
|
G
A
x
S
S
 
S
G
 
G
A
 
A
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
V
 
L
L
 
F
L
 
L
A
 
T
E
 
A
T
 
A
G
 
A
A
 
Q
G
 
P
L
 
L
E
 
K
G
 
A
K
 
K
D
 
T
T
 
S
A
 
L
R
 
P
I
 
-
T
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
A
L
 
W
A
 
S
D
 
A
A
 
A
V
 
M
D
 
D
R
 
A
A
 
G
V
 
L
A
 
E
A
 
A
F
 
M
T
 
Q
E
 
K
L
 
Y
G
 
G
G
 
K
A
 
A
R
 
A
P
 
P
G
 
G
D
 
D
K
 
R
T
 
T
M
 
M
L
 
L
D
 
D
A
 
S
I
 
-
D
 
-
P
 
-
F
 
-
R
 
-
G
 
-
I
 
L
L
 
W
R
 
A
K
 
A
G
 
G
A
 
Q
E
 
E
A
 
L
S
 
Q
P
 
A
P
 
W
G
 
K
A
 
S
G
 
P
A
 
G
A
 
A
E
 
D
A
 
L
A
 
L
A
 
Q
C
 
V
W
 
L
A
 
T
A
 
K
A
 
A
A
 
V
E
 
K
E
 
S
A
 
A
R
 
E
E
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
E
A
 
A
T
 
T
A
 
K
G
 
N
L
 
M
T
 
E
P
 
A
A
 
G
K
 
A
G
 
G
R
|
R
A
 
A
A
 
S
R
 
Y
L
 
I
A
 
S
A
 
S
R
 
A
S
 
R
H
 
L
G
 
E
H
 
Q
P
 
P
D
|
D
P
 
P
G
 
G

P45510 Dihydroxyacetone kinase; DHA kinase; Glycerone kinase; EC 2.7.1.29 from Citrobacter freundii (see 2 papers)
31% identity, 91% coverage: 32:569/591 of query aligns to 37:551/552 of P45510

query
sites
P45510
A
 
A
Y
 
I
G
 
R
V
 
I
V
 
V
A
 
V
R
 
R
E
 
R
R
 
D
P
 
L
R
 
N
T
 
K
G
 
N
K
 
N
V
 
V
A
 
A
V
 
V
V
 
I
I
 
S
G
 
G
G
 
G
G
 
G
C
 
S
G
 
G
H
 
H
Y
 
E
P
 
P
A
 
A
F
 
H
A
 
V
G
 
G
L
 
F
V
 
I
G
 
G
P
 
K
G
 
G
L
 
M
A
 
L
D
 
T
G
 
A
A
 
A
V
 
V
V
 
C
G
 
G
D
 
D
V
 
V
F
 
F
T
 
A
S
 
S
P
 
P
S
 
S
A
 
V
E
 
D
Q
 
A
V
 
V
Y
 
L
R
 
T
T
 
A
A
 
I
R
 
Q
E
 
A
A
 
V
D
 
T
D
 
G
G
 
E
G
 
A
G
 
G
V
 
C
L
 
L
F
 
L
G
 
I
Y
 
V
G
 
K
N
 
N
Y
 
Y
Q
 
T
G
 
G
D
 
D
V
 
R
L
 
L
H
 
N
F
 
F
G
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
A
R
 
E
R
 
K
L
 
A
A
 
R
A
 
R
E
 
L
G
 
G
I
 
Y
D
 
N
S
 
V
R
 
E
T
 
M
V
 
L
L
 
I
V
 
V
T
 
G
D
 
D
D
 
D
V
 
I
A
 
-
S
 
S
G
 
L
P
 
P
A
 
D
E
 
N
Q
 
K
A
 
-
G
 
-
R
 
H
R
 
P
R
 
R
G
 
G
V
 
I
A
 
A
G
 
G
D
 
T
F
 
I
F
 
L
V
 
V
F
 
H
K
 
K
V
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
Y
A
 
F
A
 
A
E
 
E
R
 
R
G
 
G
D
 
Y
D
 
N
L
 
L
A
 
A
G
 
T
V
 
V
H
 
L
A
 
R
A
 
E
A
 
A
E
 
Q
R
 
Y
A
 
A
N
 
A
A
 
S
A
 
N
T
 
T
R
 
F
T
 
S
F
 
L
G
 
G
V
 
V
A
 
A
F
 
L
G
 
S
G
 
S
C
 
C
T
 
H
L
 
L
P
 
P
G
 
Q
A
 
E
D
 
T
G
 
D
P
 
A
L
 
A
F
 
P
T
 
R
V
 
H
D
 
H
D
 
P
G
 
G
A
 
H
M
 
A
E
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
M
G
 
G
I
 
I
H
|
H
G
 
G
E
 
E
P
 
P
G
 
G
V
 
A
R
 
S
T
 
V
V
 
I
G
 
D
R
 
T
L
 
Q
G
 
N
A
 
S
E
 
A
E
 
Q
L
 
V
A
 
V
D
 
N
E
 
L
L
 
M
V
 
V
D
 
D
G
 
K
L
 
L
L
 
L
P
 
A
E
 
A
L
 
L
P
 
P
S
 
E
Q
 
T
G
 
G
R
 
R
V
 
L
A
 
A
V
 
V
L
 
M
L
 
I
N
 
N
G
 
N
L
 
L
G
 
G
R
 
G
T
 
V
K
 
S
Y
 
V
E
 
A
E
 
E
M
 
M
F
 
-
T
 
A
V
 
I
C
 
I
T
 
T
R
 
R
V
 
-
H
 
-
E
 
-
R
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
S
A
 
S
G
 
-
L
 
-
L
 
-
P
 
P
V
 
L
H
 
H
T
 
S
E
 
R
A
 
I
-
 
D
-
 
W
-
 
L
-
 
I
-
 
G
-
 
P
G
 
A
E
 
S
F
 
L
V
 
V
T
 
T
S
 
A
L
 
L
D
 
D
M
 
M
A
 
K
G
 
G
L
 
F
S
 
S
L
 
L
S
 
T
V
 
A
M
 
I
V
 
V
L
 
L
D
 
E
D
 
E
E
 
S
L
 
I
A
 
E
E
 
K
L
 
A
Y
 
L
A
 
L
A
 
T
P
 
E
C
 
V
D
 
E
T
 
T
P
 
S
G
 
N
Y
 
W
R
 
P
S
 
T
A
 
-
G
 
-
A
 
-
R
 
-
L
 
-
E
 
-
P
 
P
V
 
V
E
 
P
P
 
P
V
 
R
R
 
E
T
 
I
V
 
T
D
 
C
A
 
V
G
 
V
L
 
S
E
 
S
R
 
H
P
 
A
D
 
S
D
 
A
Q
 
R
A
 
V
A
 
E
A
 
F
G
 
Q
P
 
P
V
 
S
D
 
A
R
 
N
A
 
A
L
 
L
S
 
V
A
 
A
A
 
G
M
 
I
V
 
V
R
 
E
L
 
L
E
 
V
E
 
T
A
 
A
-
 
T
-
 
L
-
 
S
-
 
D
-
 
L
E
 
E
D
 
T
E
 
H
L
 
L
G
 
N
R
 
A
L
 
L
D
|
D
A
 
A
V
 
K
A
 
V
A
 
G
D
|
D
G
|
G
D
|
D
H
x
T
G
 
G
L
 
S
G
 
T
M
 
F
T
 
A
R
 
A
G
 
A
I
 
A
R
 
R
A
 
E
A
 
I
V
 
A
A
 
S
A
 
L
A
 
L
R
 
H
A
 
R
A
 
Q
E
 
Q
A
 
L
D
 
P
G
 
L
E
 
N
P
 
N
V
 
L
S
 
A
G
 
T
A
 
L
L
 
F
L
 
A
A
 
L
A
 
I
G
 
G
T
 
E
A
 
R
F
 
L
A
 
T
D
 
V
A
 
V
A
 
M
G
 
G
G
 
G
A
x
S
S
|
S
G
 
G
A
 
V
L
 
L
Y
 
M
G
 
S
V
 
I
L
 
F
L
 
F
A
 
T
E
 
A
T
 
A
G
 
G
A
 
Q
G
 
K
L
 
L
E
 
E
G
 
-
K
 
-
D
 
-
T
 
-
A
 
-
R
 
-
I
 
-
T
 
-
P
 
Q
G
 
G
A
 
A
-
 
N
L
 
V
A
 
V
D
 
E
A
 
A
V
 
L
D
 
N
R
 
T
A
 
G
V
 
L
A
 
A
A
 
Q
F
 
M
T
 
K
E
 
F
L
 
Y
G
|
G
G
 
G
A
 
A
R
 
D
P
 
E
G
 
G
D
 
D
K
 
R
T
|
T
M
|
M
L
 
I
D
 
D
A
 
A
I
 
L
D
 
Q
P
 
P
F
 
A
R
 
L
G
 
T
I
 
S
L
 
L
R
 
L
-
 
A
-
 
Q
-
 
P
K
 
K
G
 
N
A
 
L
E
 
Q
A
 
A
S
 
A
P
 
F
P
 
D
G
 
A
A
 
A
G
 
Q
A
 
A
A
 
G
E
 
A
A
 
E
A
 
R
A
 
T
C
 
C
W
 
L
A
 
S
A
 
S
A
 
K
A
 
A
E
 
N
E
 
A
A
 
G
R
 
R
E
 
A
A
 
S
A
 
Y
L
 
L
A
 
S
T
 
S
A
 
E
G
 
S
L
 
L
T
 
L
P
 
-
A
 
-
K
 
-
G
 
-
R
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
-
S
 
-
H
 
-
G
 
G
H
 
N
P
 
M
D
|
D
P
|
P
G
|
G
A
 
A
T
 
Q
S
 
R
F
 
L
A
 
A
H
 
M
L
 
V
V
 
F
T
 
K
A
 
A
V
 
L
S
 
A
E
 
E
V
 
S
A
 
E
L
 
L

Sites not aligning to the query:

3ct4A Structure of dha-kinase subunit dhak from l. Lactis (see paper)
37% identity, 52% coverage: 3:312/591 of query aligns to 3:303/318 of 3ct4A

query
sites
3ct4A
V
 
I
L
 
I
G
 
N
R
 
Q
A
 
P
A
 
Q
T
 
D
F
 
V
K
 
V
R
 
S
D
 
E
W
 
M
L
 
L
D
 
D
G
 
G
F
 
L
A
 
T
T
 
Y
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
R
 
D
T
 
L
V
 
I
R
 
E
K
 
K
V
 
V
P
 
P
G
 
D
A
 
-
Y
 
F
G
 
E
V
 
I
V
 
I
A
 
Q
R
 
R
E
 
K
R
 
S
P
 
P
R
 
K
T
 
S
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
V
 
L
V
 
V
I
 
S
G
 
G
G
|
G
G
|
G
C
 
S
G
 
G
H
|
H
Y
 
E
P
 
P
A
 
A
F
 
H
A
 
A
G
 
G
L
 
F
V
 
V
G
 
G
P
 
E
G
 
G
L
 
M
A
 
L
D
 
S
G
 
A
A
 
A
V
 
V
V
 
C
G
 
G
D
 
A
V
 
I
F
|
F
T
 
T
S
 
S
P
 
P
S
 
T
A
 
P
E
 
D
Q
 
Q
V
 
I
Y
 
Y
R
 
E
T
 
A
A
 
I
R
 
K
E
 
S
A
 
A
D
 
D
D
 
E
G
 
G
G
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
L
F
 
L
G
 
I
Y
 
I
G
x
K
N
 
N
Y
 
Y
Q
 
L
G
 
G
D
|
D
V
 
V
L
 
M
H
 
N
F
 
F
G
 
E
L
 
M
A
 
A
A
 
R
R
 
E
R
 
M
L
 
A
A
 
E
A
 
M
E
 
E
G
 
E
I
 
I
D
 
K
S
 
V
R
 
E
T
 
Q
V
 
I
L
 
I
V
 
V
T
 
D
D
 
D
D
 
D
V
 
I
A
 
A
S
 
V
G
 
E
P
 
N
A
 
S
E
 
L
Q
 
Y
A
 
T
G
 
Q
R
 
G
R
 
R
R
 
R
G
 
G
V
 
V
A
 
A
G
 
G
D
 
T
F
 
V
F
 
L
V
 
V
F
 
H
K
 
K
V
 
I
A
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
H
R
 
Q
G
 
E
D
 
A
D
 
S
L
 
L
A
 
D
G
 
E
V
 
I
H
 
K
A
 
D
A
 
L
A
 
A
E
 
D
R
 
K
A
 
V
N
 
V
A
 
K
A
 
N
T
 
I
R
 
K
T
 
T
F
 
I
G
 
G
V
 
L
A
 
A
F
 
L
G
 
S
G
 
A
C
 
A
T
 
T
L
 
V
P
 
P
G
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
P
 
-
L
 
-
F
 
-
T
 
-
V
 
-
D
 
-
D
 
D
G
 
N
A
 
E
M
 
I
E
 
E
L
 
Y
G
 
G
L
 
V
G
 
G
I
 
I
H
|
H
G
 
S
E
 
E
P
 
P
G
 
G
V
 
Y
R
 
R
T
 
R
V
 
E
G
 
K
R
 
M
L
 
K
G
 
T
A
 
S
E
 
Y
E
 
E
L
 
L
A
 
A
D
 
T
E
 
E
L
 
L
V
 
V
D
 
G
G
 
K
L
 
L
L
 
K
P
 
E
E
 
E
L
 
F
P
 
K
S
 
F
Q
 
E
G
 
A
-
 
G
-
 
Q
R
 
K
V
 
Y
A
 
G
V
 
I
L
 
L
L
 
V
N
 
N
G
 
G
L
 
M
G
 
G
R
 
A
T
 
T
K
 
P
Y
 
L
E
 
M
E
 
E
M
 
Q
F
 
F
T
 
I
V
 
F
C
 
M
T
 
N
R
 
D
V
 
V
H
 
A
E
 
K
R
 
L
L
 
L
A
 
T
G
 
E
A
 
E
G
 
N
L
 
I
L
 
E
P
 
I
V
 
L
H
 
F
T
 
K
E
 
K
A
 
V
G
 
G
E
 
N
F
 
Y
V
 
M
T
 
T
S
 
S
L
 
I
D
 
D
M
 
M
A
 
A
G
 
G
L
 
L
S
 
S
L
 
L
S
 
T
V
 
M
M
 
I
V
 
K
L
 
L
D
 
E
D
 
D
E
 
D

P76015 PEP-dependent dihydroxyacetone kinase, dihydroxyacetone-binding subunit DhaK; EC 2.7.1.121 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
37% identity, 48% coverage: 41:324/591 of query aligns to 41:350/356 of P76015

query
sites
P76015
P
 
P
R
 
V
T
 
A
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
V
 
L
V
 
L
I
 
S
G
 
G
G
 
G
G
|
G
C
x
S
G
|
G
H
|
H
Y
 
E
P
 
P
A
 
M
F
 
H
A
 
C
G
 
G
L
 
Y
V
 
I
G
 
G
P
 
Q
G
 
G
L
 
M
A
 
L
D
 
S
G
 
G
A
 
A
V
 
C
V
 
P
G
 
G
D
 
E
V
 
I
F
 
F
T
 
T
S
 
S
P
 
P
S
 
T
A
 
P
E
 
D
Q
 
K
V
 
I
Y
 
F
R
 
E
T
 
C
A
 
A
R
 
M
E
 
Q
A
 
V
D
 
D
D
 
G
G
 
G
G
 
E
G
 
G
V
 
V
L
 
L
F
 
L
G
 
I
Y
 
I
G
x
K
N
 
N
Y
 
Y
Q
 
T
G
 
G
D
|
D
V
 
I
L
 
L
H
 
N
F
 
F
G
 
E
L
 
T
A
 
A
A
 
T
R
 
E
R
 
L
L
 
L
A
 
H
A
 
D
E
 
S
G
 
G
I
 
V
D
 
K
S
 
V
R
 
T
T
 
T
V
 
V
L
 
V
V
 
I
T
 
D
D
 
D
D
 
D
V
 
V
A
 
A
S
 
V
G
 
K
P
 
D
A
 
S
E
 
L
Q
 
Y
A
 
T
G
 
A
R
 
G
R
 
R
R
 
R
G
 
G
V
 
V
A
 
A
G
 
N
D
 
T
F
 
V
F
 
L
V
 
I
F
 
E
K
 
K
V
 
L
A
 
V
G
 
G
A
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
E
R
 
R
G
 
G
D
 
D
D
 
S
L
 
L
A
 
D
G
 
A
V
 
C
H
 
A
A
 
E
A
 
L
A
 
G
E
 
R
R
 
K
A
 
L
N
 
N
A
 
N
A
 
Q
T
 
G
R
 
H
T
 
S
F
 
I
G
 
G
V
 
I
A
 
A
F
 
L
G
 
G
G
 
A
C
 
C
T
 
T
L
 
V
P
 
P
G
 
A
A
 
A
D
 
G
G
 
K
P
 
P
L
 
S
F
 
F
T
 
T
V
 
L
D
 
A
D
 
D
G
 
N
A
 
E
M
 
M
E
 
E
L
 
F
G
 
G
L
 
V
G
 
G
I
 
I
H
|
H
G
 
G
E
 
E
P
 
P
G
 
G
V
 
I
R
 
D
T
 
R
V
 
R
G
 
P
R
 
F
L
 
S
G
 
S
A
 
L
E
 
D
E
 
Q
L
 
T
A
 
V
D
 
D
E
 
E
L
 
M
V
 
F
D
 
D
G
 
T
L
 
L
L
 
L
P
 
V
E
 
N
-
 
G
-
 
S
-
 
Y
-
 
H
-
 
R
-
 
T
-
 
L
-
 
R
-
 
F
-
 
W
-
 
D
-
 
Y
-
 
Q
-
 
Q
-
 
G
-
 
S
-
 
W
-
 
Q
-
 
E
-
 
E
-
 
Q
-
 
Q
-
 
T
-
 
K
-
 
Q
-
 
P
L
 
L
P
 
Q
S
 
S
Q
 
G
G
 
D
R
 
R
V
 
V
A
 
I
V
 
A
L
 
L
L
 
V
N
 
N
G
 
N
L
 
L
G
 
G
R
 
A
T
 
T
K
 
P
Y
 
L
E
 
S
E
 
E
M
 
L
F
 
Y
T
 
G
V
 
V
C
 
Y
T
 
N
R
 
R
V
 
L
H
 
T
E
 
T
R
 
R
L
 
C
A
 
Q
G
 
Q
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
T
P
 
I
V
 
E
H
 
R
T
 
N
E
 
L
A
 
I
G
 
G
E
 
A
F
 
Y
V
 
C
T
 
T
S
 
S
L
 
L
D
 
D
M
 
M
A
 
T
G
 
G
L
 
F
S
 
S
L
 
I
S
 
T
V
 
L
M
 
L
V
 
K
L
 
V
D
 
D
D
 
D
E
 
E
L
 
T
A
 
L
E
 
A
L
 
L
Y
 
W
A
 
D
A
 
A
P
 
P
C
 
V
D
 
H
T
 
T
P
 
P

1un9A Crystal structure of the dihydroxyacetone kinase from c. Freundii in complex with amp-pnp and mg2+ (see paper)
32% identity, 78% coverage: 32:490/591 of query aligns to 37:483/537 of 1un9A

query
sites
1un9A
A
 
A
Y
 
I
G
 
R
V
 
I
V
 
V
A
 
V
R
 
R
E
 
R
R
 
D
P
 
L
R
 
N
T
 
K
G
 
N
K
 
N
V
 
V
A
 
A
V
 
V
V
 
I
I
 
S
G
 
G
G
|
G
G
 
G
C
 
S
G
 
G
H
|
H
Y
 
E
P
 
P
A
 
A
F
 
H
A
 
V
G
 
G
L
 
F
V
 
I
G
 
G
P
 
K
G
 
G
L
 
M
A
 
L
D
 
T
G
 
A
A
 
A
V
 
V
V
 
C
G
 
G
D
 
D
V
 
V
F
|
F
T
 
A
S
 
S
P
 
P
S
 
S
A
 
V
E
 
D
Q
 
A
V
 
V
Y
 
L
R
 
T
T
 
A
A
 
I
R
 
Q
E
 
A
A
 
V
D
 
T
D
 
G
G
 
E
G
 
A
G
 
G
V
 
C
L
 
L
F
 
L
G
 
I
Y
 
V
G
x
K
N
 
N
Y
 
Y
Q
 
T
G
 
G
D
|
D
V
 
R
L
 
L
H
 
N
F
 
F
G
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
A
R
 
E
R
 
K
L
 
A
A
 
R
A
 
R
E
 
L
G
 
G
I
 
Y
D
 
N
S
 
V
R
 
E
T
 
M
V
 
L
L
 
I
V
 
V
T
 
G
D
 
D
D
 
D
V
 
I
A
 
-
S
 
S
G
 
L
P
 
P
A
 
D
E
 
N
Q
 
K
A
 
-
G
 
-
R
 
H
R
 
P
R
 
R
G
 
G
V
 
I
A
 
A
G
 
G
D
 
T
F
 
I
F
 
L
V
 
V
F
 
H
K
 
K
V
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
Y
A
 
F
A
 
A
E
 
E
R
 
R
G
 
G
D
 
Y
D
 
N
L
 
L
A
 
A
G
 
T
V
 
V
H
 
L
A
 
R
A
 
E
A
 
A
E
 
Q
R
 
Y
A
 
A
N
 
A
A
 
S
A
 
N
T
 
T
R
 
F
T
 
S
F
 
L
G
 
G
V
 
V
A
 
A
F
 
L
G
 
S
G
 
S
C
 
C
T
 
H
L
 
L
P
 
P
G
 
Q
A
 
E
D
 
T
G
 
D
P
 
A
L
 
A
F
 
P
T
 
R
V
 
H
D
 
H
D
 
P
G
 
G
A
 
H
M
 
A
E
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
M
G
 
G
I
 
I
H
|
H
G
 
G
E
 
E
P
 
P
G
 
G
V
 
A
R
 
S
T
 
V
V
 
I
G
 
D
R
 
T
L
 
Q
G
 
N
A
 
S
E
 
A
E
 
Q
L
 
V
A
 
V
D
 
N
E
 
L
L
 
M
V
 
V
D
 
D
G
 
K
L
 
L
L
 
L
P
 
A
E
 
A
L
 
L
P
 
P
S
 
E
Q
 
T
G
 
G
R
 
R
V
 
L
A
 
A
V
 
V
L
 
M
L
 
I
N
 
N
G
 
N
L
 
L
G
 
G
R
 
G
T
 
V
K
 
S
Y
 
V
E
 
A
E
 
E
M
 
M
F
 
-
T
 
A
V
 
I
C
 
I
T
 
T
R
 
R
V
 
-
H
 
-
E
 
-
R
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
S
A
 
S
G
 
-
L
 
-
L
 
-
P
 
P
V
 
L
H
 
H
T
 
S
E
 
R
A
 
I
-
 
D
-
 
W
-
 
L
-
 
I
-
 
G
-
 
P
G
 
A
E
 
S
F
 
L
V
 
V
T
 
T
S
 
A
L
 
L
D
 
D
M
 
M
A
 
K
G
 
G
L
 
F
S
 
S
L
 
L
S
 
T
V
 
A
M
 
I
V
 
V
L
 
L
D
 
E
D
 
E
E
 
S
L
 
I
A
 
E
E
 
K
L
 
A
Y
 
L
A
 
L
A
 
T
P
 
E
C
 
V
D
 
E
T
 
T
P
 
S
G
 
N
Y
 
W
R
 
P
S
 
T
A
 
-
G
 
-
A
 
-
R
 
-
L
 
-
E
 
-
P
 
P
V
 
V
E
 
P
P
 
P
V
 
R
R
 
E
T
 
I
V
 
T
D
 
C
A
 
V
G
 
V
L
 
S
E
 
S
R
 
H
P
 
A
D
 
S
D
 
A
Q
 
R
A
 
V
A
 
E
A
 
F
G
 
Q
P
 
P
V
 
S
D
 
A
R
 
N
A
 
A
L
 
L
S
 
V
A
 
A
A
 
G
M
 
I
V
 
V
R
 
E
L
 
L
E
 
V
E
 
T
A
 
A
-
 
T
-
 
L
-
 
S
-
 
D
-
 
L
E
 
E
D
 
T
E
 
H
L
 
L
G
 
N
R
 
A
L
 
L
D
|
D
A
 
A
V
 
K
A
 
V
A
 
G
D
|
D
G
 
G
D
|
D
H
x
T
G
 
G
L
 
S
G
x
T
M
 
F
T
 
A
R
 
A
G
 
A
I
 
A
R
 
R
A
 
E
A
 
I
V
 
A
A
 
S
A
 
L
A
 
L
R
 
H
A
 
R
A
 
Q
E
 
Q
A
 
L
D
 
P
G
 
L
E
 
N
P
 
N
V
 
L
S
 
A
G
 
T
A
 
L
L
 
F
L
 
A
A
 
L
A
 
I
G
 
G
T
 
E
A
 
R
F
 
L
A
 
T
D
 
V
A
 
V
A
 
M
G
 
G
G
|
G
A
x
S
S
|
S
G
 
G
A
 
V
L
|
L
Y
 
M
G
 
S
V
 
I
L
 
F
L
 
F
A
 
T
E
 
A
T
 
A
G
 
G
A
 
Q
G
 
K
L
 
L
E
 
E
G
 
Q
K
 
G
D
 
-
T
 
-
A
 
-
R
 
-
I
 
-
T
 
-
P
 
-
G
 
A
A
 
N
L
 
V
A
 
V
D
 
E
A
 
A
V
 
L
D
 
N
R
 
T
A
 
G
V
 
L
A
 
A
A
 
Q
F
 
M
T
 
K
E
 
F
L
 
Y
G
|
G
G
 
G
A
|
A
R
 
D
P
 
E
G
 
G
D
 
D
K
 
R
T
|
T
M
|
M
L
 
I
D
 
D
A
 
A
I
 
L
D
 
Q
P
 
P

Sites not aligning to the query:

1uodA Crystal structure of the dihydroxyacetone kinase from e. Coli in complex with dihydroxyacetone-phosphate (see paper)
35% identity, 48% coverage: 41:324/591 of query aligns to 32:330/336 of 1uodA

query
sites
1uodA
P
 
P
R
 
V
T
 
A
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
V
 
L
V
 
L
I
 
S
G
 
G
G
|
G
G
|
G
C
 
S
G
 
G
H
|
H
Y
 
E
P
 
P
A
 
M
F
 
H
A
 
C
G
 
G
L
 
Y
V
 
I
G
 
G
P
 
Q
G
 
G
L
 
M
A
 
L
D
 
S
G
 
G
A
 
A
V
 
C
V
 
P
G
 
G
D
 
E
V
 
I
F
|
F
T
|
T
S
 
S
P
 
P
S
 
T
A
 
P
E
 
D
Q
 
K
V
 
I
Y
 
F
R
 
E
T
 
C
A
 
A
R
 
M
E
 
Q
A
 
V
D
 
D
D
 
G
G
 
G
G
 
E
G
 
G
V
 
V
L
 
L
F
 
L
G
 
I
Y
 
I
G
x
K
N
 
N
Y
|
Y
Q
 
T
G
|
G
D
|
D
V
 
I
L
 
L
H
 
N
F
 
F
G
 
E
L
 
T
A
 
A
A
 
T
R
 
E
R
 
L
L
 
L
A
 
H
A
 
D
E
 
S
G
 
G
I
 
V
D
 
K
S
 
V
R
 
T
T
 
T
V
 
V
L
 
V
V
 
I
T
 
D
D
 
D
D
 
D
V
 
V
A
 
A
S
 
V
G
 
K
P
 
D
A
 
S
E
 
L
Q
 
Y
A
 
T
G
 
A
R
 
G
R
 
R
R
 
R
G
 
G
V
 
V
A
 
A
G
 
N
D
 
T
F
 
V
F
 
L
V
 
I
F
 
E
K
 
K
V
 
L
A
 
V
G
 
G
A
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
E
R
 
R
G
 
G
D
 
D
D
 
S
L
 
L
A
 
D
G
 
A
V
 
C
H
 
A
A
 
E
A
 
L
A
 
G
E
 
R
R
 
K
A
 
L
N
 
N
A
 
N
A
 
Q
T
 
G
R
 
H
T
 
S
F
 
I
G
 
G
V
 
I
A
 
A
F
 
L
G
 
G
G
 
A
C
 
C
T
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
P
 
-
L
 
-
F
 
-
T
 
-
V
 
L
D
 
A
D
 
D
G
 
N
A
 
E
M
 
M
E
 
E
L
 
F
G
 
G
L
 
V
G
 
G
I
 
I
H
|
H
G
 
G
E
 
E
P
 
P
G
 
G
V
 
I
R
 
D
T
 
R
V
 
R
G
 
P
R
 
F
L
 
S
G
 
S
A
 
L
E
 
D
E
 
Q
L
 
T
A
 
V
D
 
D
E
 
E
L
 
M
V
 
F
D
 
D
G
 
T
L
 
L
L
 
L
P
 
V
E
 
N
-
 
G
-
 
S
-
 
Y
-
 
H
-
 
R
-
 
T
-
 
L
-
 
R
-
 
F
-
 
W
-
 
D
-
 
Y
-
 
Q
-
 
Q
-
 
G
-
 
S
-
 
W
-
 
Q
-
 
E
-
 
E
-
 
Q
-
 
Q
-
 
T
-
 
K
-
 
Q
-
 
P
L
 
L
P
 
Q
S
 
S
Q
 
G
G
 
D
R
 
R
V
 
V
A
 
I
V
 
A
L
 
L
L
 
V
N
 
N
G
 
N
L
 
L
G
 
G
R
 
A
T
 
T
K
 
P
Y
 
L
E
 
S
E
 
E
M
 
L
F
 
Y
T
 
G
V
 
V
C
 
Y
T
 
N
R
 
R
V
 
L
H
 
T
E
 
T
R
 
R
L
 
C
A
 
Q
G
 
Q
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
T
P
 
I
V
 
E
H
 
R
T
 
N
E
 
L
A
 
I
G
 
G
E
 
A
F
 
Y
V
 
C
T
 
T
S
 
S
L
 
L
D
 
D
M
 
M
A
 
T
G
 
G
L
 
F
S
 
S
L
 
I
S
 
T
V
 
L
M
 
L
V
 
K
L
 
V
D
 
D
D
 
D
E
 
E
L
 
T
A
 
L
E
 
A
L
 
L
Y
 
W
A
 
D
A
 
A
P
 
P
C
 
V
D
 
H
T
 
T
P
 
P

1uoeA Crystal structure of the dihydroxyacetone kinase from e. Coli in complex with glyceraldehyde (see paper)
35% identity, 48% coverage: 41:324/591 of query aligns to 32:330/336 of 1uoeA

query
sites
1uoeA
P
 
P
R
 
V
T
 
A
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
V
 
L
V
 
L
I
 
S
G
 
G
G
|
G
G
|
G
C
 
S
G
 
G
H
|
H
Y
 
E
P
 
P
A
 
M
F
 
H
A
 
C
G
 
G
L
 
Y
V
 
I
G
 
G
P
 
Q
G
 
G
L
 
M
A
 
L
D
 
S
G
 
G
A
 
A
V
 
C
V
 
P
G
 
G
D
 
E
V
 
I
F
|
F
T
 
T
S
|
S
P
 
P
S
 
T
A
 
P
E
 
D
Q
 
K
V
 
I
Y
 
F
R
 
E
T
 
C
A
 
A
R
 
M
E
 
Q
A
 
V
D
 
D
D
 
G
G
 
G
G
 
E
G
 
G
V
 
V
L
 
L
F
 
L
G
 
I
Y
 
I
G
 
K
N
 
N
Y
|
Y
Q
 
T
G
 
G
D
|
D
V
 
I
L
 
L
H
 
N
F
 
F
G
 
E
L
 
T
A
 
A
A
 
T
R
 
E
R
 
L
L
 
L
A
 
H
A
 
D
E
 
S
G
 
G
I
 
V
D
 
K
S
 
V
R
 
T
T
 
T
V
 
V
L
 
V
V
 
I
T
 
D
D
 
D
D
 
D
V
 
V
A
 
A
S
 
V
G
 
K
P
 
D
A
 
S
E
 
L
Q
 
Y
A
 
T
G
 
A
R
 
G
R
 
R
R
 
R
G
 
G
V
 
V
A
 
A
G
 
N
D
 
T
F
 
V
F
 
L
V
 
I
F
 
E
K
 
K
V
 
L
A
 
V
G
 
G
A
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
E
R
 
R
G
 
G
D
 
D
D
 
S
L
 
L
A
 
D
G
 
A
V
 
C
H
 
A
A
 
E
A
 
L
A
 
G
E
 
R
R
 
K
A
 
L
N
 
N
A
 
N
A
 
Q
T
 
G
R
 
H
T
 
S
F
 
I
G
 
G
V
 
I
A
 
A
F
 
L
G
 
G
G
 
A
C
 
C
T
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
P
 
-
L
 
-
F
 
-
T
 
-
V
 
L
D
 
A
D
 
D
G
 
N
A
 
E
M
 
M
E
 
E
L
 
F
G
 
G
L
 
V
G
 
G
I
 
I
H
|
H
G
 
G
E
 
E
P
 
P
G
 
G
V
 
I
R
 
D
T
 
R
V
 
R
G
 
P
R
 
F
L
 
S
G
 
S
A
 
L
E
 
D
E
 
N
L
 
T
A
 
V
D
 
D
E
 
E
L
 
M
V
 
F
D
 
D
G
 
T
L
 
L
L
 
L
P
 
V
E
 
N
-
 
G
-
 
S
-
 
Y
-
 
H
-
 
R
-
 
T
-
 
L
-
 
R
-
 
F
-
 
W
-
 
D
-
 
Y
-
 
Q
-
 
Q
-
 
G
-
 
S
-
 
W
-
 
Q
-
 
E
-
 
E
-
 
Q
-
 
Q
-
 
T
-
 
K
-
 
Q
-
 
P
L
 
L
P
 
Q
S
 
S
Q
 
G
G
 
D
R
 
R
V
 
V
A
 
I
V
 
A
L
 
L
L
 
V
N
 
N
G
 
N
L
 
L
G
 
G
R
 
A
T
 
T
K
 
P
Y
 
L
E
 
S
E
 
E
M
 
L
F
 
Y
T
 
G
V
 
V
C
 
Y
T
 
N
R
 
R
V
 
L
H
 
T
E
 
T
R
 
R
L
 
C
A
 
Q
G
 
Q
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
T
P
 
I
V
 
E
H
 
R
T
 
N
E
 
L
A
 
I
G
 
G
E
 
A
F
 
Y
V
 
C
T
 
T
S
 
S
L
 
L
D
 
D
M
 
M
A
 
T
G
 
G
L
 
F
S
 
S
L
 
I
S
 
T
V
 
L
M
 
L
V
 
K
L
 
V
D
 
D
D
 
D
E
 
E
L
 
T
A
 
L
E
 
A
L
 
L
Y
 
W
A
 
D
A
 
A
P
 
P
C
 
V
D
 
H
T
 
T
P
 
P

3pnqD Crystal structure of e.Coli dha kinase dhak (h56n) complex with dha (see paper)
35% identity, 48% coverage: 41:324/591 of query aligns to 32:328/334 of 3pnqD

query
sites
3pnqD
P
 
P
R
 
V
T
 
A
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
V
 
L
V
 
L
I
 
S
G
 
G
G
|
G
G
|
G
C
 
S
G
 
G
H
 
N
Y
 
E
P
 
P
A
 
M
F
 
H
A
 
C
G
 
G
L
 
Y
V
 
I
G
 
G
P
 
Q
G
 
G
L
 
M
A
 
L
D
 
S
G
 
G
A
 
A
V
 
C
V
 
P
G
 
G
D
 
E
V
 
I
F
 
F
T
 
T
S
|
S
P
 
P
S
 
T
A
 
P
E
 
D
Q
 
K
V
 
I
Y
 
F
R
 
E
T
 
C
A
 
A
R
 
M
E
 
Q
A
 
V
D
 
D
D
 
G
G
 
G
G
 
E
G
 
G
V
 
V
L
 
L
F
 
L
G
 
I
Y
 
I
G
x
K
N
 
N
Y
|
Y
Q
 
T
G
 
G
D
|
D
V
 
I
L
 
L
H
 
N
F
 
F
G
 
E
L
 
T
A
 
A
A
 
T
R
 
E
R
 
L
L
 
L
A
 
H
A
 
D
E
 
S
G
 
G
I
 
V
D
 
K
S
 
V
R
 
T
T
 
T
V
 
V
L
 
V
V
 
I
T
 
D
D
 
D
D
 
D
V
 
V
A
 
A
S
 
V
G
 
K
P
 
D
A
 
S
E
 
L
Q
 
Y
A
 
T
G
 
A
R
 
G
R
 
R
R
 
R
G
 
G
V
 
V
A
 
A
G
 
N
D
 
T
F
 
V
F
 
L
V
 
I
F
 
E
K
 
K
V
 
L
A
 
V
G
 
G
A
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
E
R
 
R
G
 
G
D
 
D
D
 
S
L
 
L
A
 
D
G
 
A
V
 
C
H
 
A
A
 
E
A
 
L
A
 
G
E
 
R
R
 
K
A
 
L
N
 
N
A
 
N
A
 
Q
T
 
G
R
 
H
T
 
S
F
 
I
G
 
G
V
 
I
A
 
A
F
 
L
G
 
G
G
 
-
C
 
-
T
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
P
 
-
L
 
-
F
 
-
T
 
-
V
 
L
D
 
A
D
 
D
G
 
N
A
 
E
M
 
M
E
 
E
L
 
F
G
 
G
L
 
V
G
 
G
I
 
I
H
|
H
G
 
G
E
 
E
P
 
P
G
 
G
V
 
I
R
 
D
T
 
R
V
 
R
G
 
P
R
 
F
L
 
S
G
 
S
A
 
L
E
 
D
E
 
Q
L
 
T
A
 
V
D
 
D
E
 
E
L
 
M
V
 
F
D
 
D
G
 
T
L
 
L
L
 
L
P
 
V
E
 
N
-
 
G
-
 
S
-
 
Y
-
 
H
-
 
R
-
 
T
-
 
L
-
 
R
-
 
F
-
 
W
-
 
D
-
 
Y
-
 
Q
-
 
Q
-
 
G
-
 
S
-
 
W
-
 
Q
-
 
E
-
 
E
-
 
Q
-
 
Q
-
 
T
-
 
K
-
 
Q
-
 
P
L
 
L
P
 
Q
S
 
S
Q
 
G
G
 
D
R
 
R
V
 
V
A
 
I
V
 
A
L
 
L
L
 
V
N
 
N
G
 
N
L
 
L
G
 
G
R
 
A
T
 
T
K
 
P
Y
 
L
E
 
S
E
 
E
M
 
L
F
 
Y
T
 
G
V
 
V
C
 
Y
T
 
N
R
 
R
V
 
L
H
 
T
E
 
T
R
 
R
L
 
C
A
 
Q
G
 
Q
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
T
P
 
I
V
 
E
H
 
R
T
 
N
E
 
L
A
 
I
G
 
G
E
 
A
F
 
Y
V
 
C
T
 
T
S
 
S
L
 
L
D
 
D
M
 
M
A
 
T
G
 
G
L
 
F
S
 
S
L
 
I
S
 
T
V
 
L
M
 
L
V
 
K
L
 
V
D
 
D
D
 
D
E
 
E
L
 
T
A
 
L
E
 
A
L
 
L
Y
 
W
A
 
D
A
 
A
P
 
P
C
 
V
D
 
H
T
 
T
P
 
P

Q9CIV7 PTS-dependent dihydroxyacetone kinase, ADP-binding subunit DhaL; EC 2.7.1.121 from Lactococcus lactis subsp. lactis (strain IL1403) (Streptococcus lactis) (see paper)
30% identity, 34% coverage: 368:567/591 of query aligns to 17:190/192 of Q9CIV7

query
sites
Q9CIV7
R
 
K
L
 
I
E
 
Q
E
 
E
A
 
N
E
 
K
D
 
A
E
 
Y
L
 
L
G
 
S
R
 
E
L
 
L
D
|
D
A
 
G
V
 
P
A
 
I
A
 
G
D
|
D
G
 
G
D
|
D
H
|
H
G
|
G
L
x
A
G
x
N
M
 
M
T
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
M
R
 
S
A
 
E
A
 
T
V
 
M
A
 
K
A
 
A
A
 
L
R
 
E
A
 
V
A
 
S
E
 
N
A
 
F
D
 
G
G
 
N
E
 
-
P
 
-
V
 
V
S
 
S
G
 
E
A
 
I
L
 
F
L
 
K
A
 
K
A
 
V
G
 
A
T
 
M
A
 
T
F
 
L
A
 
M
D
 
S
A
 
K
A
 
V
G
 
G
G
 
G
A
|
A
S
|
S
G
 
G
A
 
P
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
-
 
S
V
 
A
L
 
F
L
 
L
A
 
A
E
 
M
T
 
S
G
 
K
A
 
T
G
 
A
L
 
I
E
 
E
G
 
T
K
 
L
D
 
D
T
 
T
A
 
S
R
 
E
I
 
L
T
 
I
P
 
Y
G
 
A
A
 
G
L
 
L
A
 
E
D
 
-
A
 
-
V
 
-
D
 
-
R
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
-
A
 
A
F
 
I
T
 
Q
E
 
K
L
x
R
G
|
G
G
 
K
A
 
A
R
 
Q
P
 
V
G
 
G
D
 
E
K
 
K
T
 
T
M
|
M
L
 
V
D
 
D
A
 
I
I
 
W
D
 
S
P
 
A
F
 
F
R
 
L
G
 
N
I
 
D
L
 
L
R
 
Q
K
 
T
G
 
D
A
 
S
E
 
-
A
 
-
S
 
-
P
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
C
 
-
W
 
-
A
 
-
A
 
A
A
 
S
A
 
K
E
 
D
E
 
N
A
 
L
R
 
E
E
 
K
A
 
V
A
 
V
L
 
K
A
 
A
T
 
S
A
 
A
G
 
G
L
 
L
T
 
L
P
 
A
A
 
T
K
 
K
G
 
G
R
|
R
A
 
A
A
 
S
R
x
Y
L
 
L
A
 
G
A
 
E
R
 
R
S
 
S
H
 
I
G
 
G
H
 
H
P
 
I
D
|
D
P
|
P
G
|
G
A
 
T
T
 
Q
S
 
S
F
 
S
A
 
A
H
 
Y
L
 
L
V
 
F
T
 
E
A
 
T
V
 
L
S
 
L
E
 
E
V
 
V

3cr3A Structure of a transient complex between dha-kinase subunits dham and dhal from lactococcus lactis (see paper)
30% identity, 34% coverage: 368:567/591 of query aligns to 17:190/192 of 3cr3A

query
sites
3cr3A
R
 
K
L
 
I
E
 
Q
E
 
E
A
 
N
E
 
K
D
 
A
E
 
Y
L
 
L
G
 
S
R
 
E
L
 
L
D
|
D
A
 
G
V
 
P
A
 
I
A
 
G
D
|
D
G
 
G
D
|
D
H
|
H
G
 
G
L
 
A
G
x
N
M
 
M
T
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
M
R
 
S
A
 
E
A
 
T
V
 
M
A
 
K
A
 
A
A
 
L
R
 
E
A
 
V
A
 
S
E
 
N
A
 
F
D
 
G
G
 
N
E
 
-
P
 
-
V
 
V
S
 
S
G
 
E
A
 
I
L
 
F
L
 
K
A
 
K
A
 
V
G
 
A
T
 
M
A
 
T
F
 
L
A
 
M
D
 
S
A
 
K
A
 
V
G
 
G
G
|
G
A
|
A
S
|
S
G
 
G
A
 
P
L
|
L
Y
 
Y
G
 
G
-
 
S
V
 
A
L
 
F
L
 
L
A
 
A
E
 
M
T
 
S
G
 
K
A
 
T
G
 
A
L
 
I
E
 
E
G
 
T
K
 
L
D
 
D
T
 
T
A
 
S
R
 
E
I
 
L
T
 
I
P
 
Y
G
 
A
A
 
G
L
 
L
A
 
E
D
 
-
A
 
-
V
 
-
D
 
-
R
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
-
A
 
A
F
 
I
T
 
Q
E
 
K
L
 
R
G
|
G
G
 
K
A
|
A
R
 
Q
P
 
V
G
 
G
D
 
E
K
 
K
T
|
T
M
 
M
L
 
V
D
 
D
A
 
I
I
 
W
D
 
S
P
 
A
F
 
F
R
 
L
G
 
N
I
 
D
L
 
L
R
 
Q
K
 
T
G
 
D
A
 
S
E
 
-
A
 
-
S
 
-
P
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
C
 
-
W
 
-
A
 
-
A
 
A
A
 
S
A
 
K
E
 
D
E
 
N
A
 
L
R
 
E
E
 
K
A
 
V
A
 
V
L
 
K
A
 
A
T
 
S
A
 
A
G
 
G
L
 
L
T
 
L
P
 
A
A
 
T
K
 
K
G
 
G
R
 
R
A
 
A
A
 
S
R
 
Y
L
 
L
A
 
G
A
 
E
R
 
R
S
 
S
H
 
I
G
 
G
H
 
H
P
 
I
D
|
D
P
|
P
G
|
G
A
 
T
T
 
Q
S
 
S
F
 
S
A
 
A
H
 
Y
L
 
L
V
 
F
T
 
E
A
 
T
V
 
L
S
 
L
E
 
E
V
 
V

P76014 PEP-dependent dihydroxyacetone kinase, ADP-binding subunit DhaL; EC 2.7.1.121 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
32% identity, 31% coverage: 379:564/591 of query aligns to 29:204/210 of P76014

query
sites
P76014
L
 
L
D
|
D
A
 
R
V
 
E
A
 
I
A
 
G
D
|
D
G
 
A
D
|
D
H
|
H
G
|
G
L
|
L
G
x
N
M
 
M
T
 
N
R
 
R
G
 
G
I
 
F
R
 
-
A
 
S
A
 
K
V
 
V
A
 
V
A
 
E
A
 
K
R
 
L
A
 
P
A
 
A
E
 
I
A
 
A
D
 
D
G
 
K
E
 
D
P
 
-
V
 
I
S
 
G
G
 
F
A
 
I
L
 
L
L
 
K
A
 
N
A
 
T
G
 
G
T
 
M
A
 
T
F
 
L
A
 
L
D
 
S
A
 
S
A
 
V
G
 
G
G
 
G
A
|
A
S
|
S
G
 
G
A
 
P
L
 
L
Y
 
F
G
 
G
V
 
T
L
 
F
L
 
F
A
 
I
E
 
R
T
 
A
G
 
A
A
 
Q
G
 
A
L
 
T
E
 
Q
G
 
A
K
 
R
D
 
Q
T
 
S
A
 
-
R
 
-
I
 
L
T
 
T
P
 
L
G
 
E
A
 
E
L
 
L
A
 
Y
D
 
Q
A
 
M
V
 
F
D
 
R
R
 
D
A
 
G
V
 
A
A
 
D
A
 
G
F
 
V
T
 
I
E
 
S
L
 
R
G
|
G
G
 
K
A
 
A
R
 
E
P
 
P
G
 
G
D
 
D
K
 
K
T
 
T
M
|
M
L
 
C
D
 
D
A
 
V
I
 
W
D
 
V
P
 
P
F
 
V
R
 
V
G
 
E
I
 
S
L
 
L
R
 
R
K
 
Q
G
 
S
A
 
S
E
 
E
A
 
Q
S
 
N
P
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
L
E
 
S
A
 
V
A
 
P
A
 
V
C
 
A
W
 
L
A
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
S
E
 
S
E
 
I
A
 
A
R
 
E
E
 
S
A
 
A
A
 
A
L
 
Q
A
 
S
T
 
T
A
 
I
G
 
T
L
 
M
T
 
Q
P
 
A
A
 
R
K
 
K
G
 
G
R
|
R
A
 
A
A
 
S
R
 
Y
L
 
L
A
 
G
A
 
E
R
 
R
S
 
S
H
 
I
G
 
G
H
 
H
P
 
Q
D
|
D
P
|
P
G
|
G
A
 
A
T
 
T
S
 
S
F
 
V
A
 
M
H
 
F
L
 
M
V
 
M
T
 
Q
A
 
M
V
 
L

4lrzA Crystal structure of the e.Coli dhar(n)-dhal complex (see paper)
32% identity, 31% coverage: 379:564/591 of query aligns to 30:205/211 of 4lrzA

query
sites
4lrzA
L
 
L
D
|
D
A
 
R
V
 
E
A
 
I
A
 
G
D
|
D
G
 
A
D
|
D
H
|
H
G
 
G
L
 
L
G
 
N
M
 
M
T
 
N
R
 
R
G
 
G
I
 
F
R
 
-
A
 
S
A
 
K
V
 
V
A
 
V
A
 
E
A
 
K
R
 
L
A
 
P
A
 
A
E
 
I
A
 
A
D
 
D
G
 
K
E
 
D
P
 
-
V
 
I
S
 
G
G
 
F
A
 
I
L
 
L
L
 
K
A
 
N
A
 
T
G
 
G
T
 
M
A
 
T
F
 
L
A
 
L
D
 
S
A
 
S
A
 
V
G
 
G
G
|
G
A
|
A
S
|
S
G
 
G
A
 
P
L
|
L
Y
 
F
G
 
G
V
 
T
L
 
F
L
 
F
A
 
I
E
 
R
T
 
A
G
 
A
A
 
Q
G
 
A
L
 
T
E
 
Q
G
 
A
K
 
R
D
 
Q
T
 
S
A
 
-
R
 
-
I
 
L
T
 
T
P
 
L
G
 
E
A
 
E
L
 
L
A
 
Y
D
 
Q
A
 
M
V
 
F
D
 
R
R
 
D
A
 
G
V
 
A
A
 
D
A
 
G
F
 
V
T
 
I
E
 
S
L
 
R
G
|
G
G
 
K
A
 
A
R
 
E
P
 
P
G
 
G
D
 
D
K
 
K
T
|
T
M
|
M
L
 
C
D
 
D
A
 
V
I
 
W
D
 
V
P
 
P
F
 
V
R
 
V
G
 
E
I
 
S
L
 
L
R
 
R
K
 
Q
G
 
S
A
 
S
E
 
E
A
 
Q
S
 
N
P
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
L
E
 
S
A
 
V
A
 
P
A
 
V
C
 
A
W
 
L
A
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
S
E
 
S
E
 
I
A
 
A
R
 
E
E
 
S
A
 
A
A
 
A
L
 
Q
A
 
S
T
 
T
A
 
I
G
 
T
L
 
M
T
 
Q
P
 
A
A
 
R
K
 
K
G
|
G
R
 
R
A
 
A
A
 
S
R
 
Y
L
 
L
A
 
G
A
 
E
R
 
R
S
 
S
H
 
I
G
 
G
H
 
H
P
 
Q
D
|
D
P
|
P
G
|
G
A
 
A
T
 
T
S
 
S
F
 
V
A
 
M
H
 
F
L
 
M
V
 
M
T
 
Q
A
 
M
V
 
L

Query Sequence

>WP_017558945.1 NCBI__GCF_000341205.1:WP_017558945.1
MTVLGRAATFKRDWLDGFATAYGRTVRKVPGAYGVVARERPRTGKVAVVIGGGCGHYPAF
AGLVGPGLADGAVVGDVFTSPSAEQVYRTAREADDGGGVLFGYGNYQGDVLHFGLAARRL
AAEGIDSRTVLVTDDVASGPAEQAGRRRGVAGDFFVFKVAGAAAERGDDLAGVHAAAERA
NAATRTFGVAFGGCTLPGADGPLFTVDDGAMELGLGIHGEPGVRTVGRLGAEELADELVD
GLLPELPSQGRVAVLLNGLGRTKYEEMFTVCTRVHERLAGAGLLPVHTEAGEFVTSLDMA
GLSLSVMVLDDELAELYAAPCDTPGYRSAGARLEPVEPVRTVDAGLERPDDQAAAGPVDR
ALSAAMVRLEEAEDELGRLDAVAADGDHGLGMTRGIRAAVAAARAAEADGEPVSGALLAA
GTAFADAAGGASGALYGVLLAETGAGLEGKDTARITPGALADAVDRAVAAFTELGGARPG
DKTMLDAIDPFRGILRKGAEASPPGAGAAEAAACWAAAAEEAREAALATAGLTPAKGRAA
RLAARSHGHPDPGATSFAHLVTAVSEVALKAAAARADGPATTGAQGEGSRG

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory