SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_017617176.1 NCBI__GCF_002263495.1:WP_017617176.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4wecA Crystal structure of a short chain dehydrogenase from mycobacterium smegmatis
70% identity, 100% coverage: 2:254/254 of query aligns to 6:258/258 of 4wecA

query
sites
4wecA
Q
 
Q
R
 
R
Y
 
L
E
 
A
G
 
G
R
 
K
V
 
V
A
 
A
V
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
G
x
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
L
A
 
A
T
 
T
A
 
G
L
 
R
R
 
R
L
 
L
A
 
R
S
 
A
E
 
E
G
 
G
G
 
A
T
 
T
V
 
V
V
 
V
A
 
V
V
 
G
D
|
D
L
x
I
D
 
D
R
 
P
D
 
T
A
 
T
G
 
G
E
 
K
A
 
A
V
 
A
A
 
A
K
 
D
E
 
E
T
 
L
G
 
E
G
 
G
L
 
L
Y
 
F
I
 
V
A
 
P
A
x
V
D
|
D
V
|
V
T
 
S
D
 
E
E
 
Q
E
 
E
A
 
A
V
 
V
K
 
D
A
 
N
A
 
L
F
 
F
A
 
D
E
 
T
V
 
A
K
 
A
E
 
S
V
 
T
Y
 
F
G
 
G
R
 
R
V
 
V
D
 
D
V
 
I
A
 
A
F
 
F
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
S
 
S
P
 
P
P
 
P
D
 
E
D
 
D
D
 
D
S
 
L
I
 
I
L
 
E
D
 
N
T
 
T
G
 
D
I
 
L
E
 
P
A
 
A
W
 
W
R
 
Q
K
 
R
V
 
V
Q
 
Q
E
 
D
V
 
I
N
 
N
L
 
L
T
 
K
S
 
S
V
 
V
Y
 
Y
L
 
L
C
 
S
C
 
C
K
 
R
Y
 
A
A
 
A
L
 
L
P
 
R
Y
 
H
M
 
M
R
 
V
E
 
P
Q
 
A
G
 
G
K
 
K
G
 
G
A
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
T
|
T
A
 
A
S
|
S
F
 
F
V
 
V
A
 
A
T
 
V
M
 
M
G
 
G
A
 
S
A
 
A
T
 
T
S
 
S
Q
|
Q
I
 
I
S
 
S
Y
|
Y
T
 
T
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
G
 
G
V
 
V
L
 
L
A
 
A
M
 
M
S
 
S
R
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
F
 
Y
A
 
A
R
 
R
D
 
Q
G
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
L
S
 
C
P
|
P
G
 
G
P
|
P
V
|
V
N
 
N
T
 
T
P
 
P
L
 
L
L
 
L
K
 
Q
E
 
E
L
 
L
F
 
F
A
 
A
K
 
K
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
A
 
A
Q
 
A
R
 
R
R
 
R
L
 
L
V
 
V
H
 
H
V
 
I
P
 
P
F
 
L
G
 
G
R
 
R
F
 
F
A
 
A
E
 
E
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
L
A
 
A
S
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
D
A
 
A
S
 
S
F
 
F
I
 
I
T
 
T
A
 
G
S
 
S
N
 
T
F
 
F
L
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
I
 
I
S
 
S
G
 
S
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
T
 
T
P
 
P
L
 
L

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
40% identity, 97% coverage: 1:246/254 of query aligns to 2:242/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
M
 
M
Q
 
S
R
 
R
Y
 
L
E
 
Q
G
 
D
R
 
K
V
 
V
A
 
A
V
 
I
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
 
A
S
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
L
A
 
E
T
 
A
A
 
A
L
 
R
R
 
V
L
 
F
A
 
M
S
 
K
E
 
E
G
 
G
G
 
A
T
 
K
V
 
V
V
 
V
A
 
I
V
 
A
D
|
D
L
x
F
D
 
N
R
 
E
D
 
A
A
 
A
G
 
G
-
 
K
E
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
E
K
 
A
E
 
N
T
 
P
G
 
G
G
 
V
L
 
V
Y
 
F
I
 
I
A
 
R
A
x
V
D
|
D
V
|
V
T
 
S
D
 
D
E
 
R
E
 
E
A
 
S
V
 
V
K
 
H
A
 
R
A
 
L
F
 
V
A
 
E
E
 
N
V
 
V
K
 
A
E
 
E
V
 
R
Y
 
F
G
 
G
R
 
K
V
 
I
D
 
D
V
 
I
A
 
L
F
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
S
 
T
P
 
-
P
 
-
D
 
-
D
 
R
D
|
D
S
 
S
I
 
M
L
 
L
D
 
S
-
x
K
T
 
M
G
 
T
I
 
V
E
 
D
A
 
Q
W
 
F
R
 
Q
K
 
Q
V
 
V
Q
 
I
E
 
N
V
 
V
N
|
N
L
 
L
T
 
T
S
 
G
V
 
V
Y
 
F
L
 
H
C
 
C
C
 
T
K
 
Q
Y
 
A
A
 
V
L
 
L
P
 
P
Y
 
Y
M
 
M
R
 
A
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
K
 
K
G
 
G
A
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
T
|
T
A
 
S
S
|
S
F
 
V
V
 
T
A
 
G
T
 
T
M
 
Y
G
 
G
A
 
-
A
x
N
T
x
V
S
 
G
Q
|
Q
I
 
T
S
 
N
Y
|
Y
T
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
I
A
 
G
M
 
M
S
 
T
R
 
K
E
 
T
L
 
W
G
 
A
V
 
K
Q
 
E
F
 
L
A
 
A
R
 
R
D
 
K
G
 
G
V
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
V
S
 
A
P
|
P
G
 
G
P
x
F
V
x
T
N
 
E
T
|
T
P
 
A
L
x
M
L
 
V
K
 
A
E
 
E
L
 
V
F
 
-
A
 
-
K
 
-
D
 
-
P
 
P
E
 
E
R
 
K
A
 
V
Q
 
I
R
 
E
R
x
K
L
 
M
-
 
K
V
 
A
H
 
Q
V
 
V
P
 
P
F
 
M
G
 
G
R
 
R
F
 
L
A
 
G
E
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
D
I
 
I
A
 
A
S
 
N
A
 
A
V
 
Y
A
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
H
D
 
E
A
 
S
S
 
D
F
 
Y
I
 
V
T
 
N
A
 
G
S
 
H
N
 
V
F
 
L
L
 
H
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
I
 
I

Q9LBG2 Levodione reductase; (6R)-2,2,6-trimethyl-1,4-cyclohexanedione reductase; EC 1.1.1.- from Leifsonia aquatica (Corynebacterium aquaticum) (see paper)
41% identity, 98% coverage: 3:250/254 of query aligns to 10:267/267 of Q9LBG2

query
sites
Q9LBG2
R
 
R
Y
 
F
E
 
T
G
 
D
R
 
R
V
 
V
A
 
V
V
x
L
I
|
I
T
|
T
G
|
G
A
x
G
G
|
G
S
|
S
G
|
G
I
x
L
G
|
G
K
x
R
A
|
A
T
|
T
A
|
A
L
x
V
R
|
R
L
|
L
A
|
A
S
x
A
E
|
E
G
|
G
G
x
A
T
x
K
V
x
L
V
x
S
A
x
L
V
 
V
D
 
D
L
 
V
D
 
S
R
 
S
D
 
E
A
 
G
G
 
L
E
 
E
A
 
A
-
 
S
-
 
K
-
 
A
-
 
A
-
 
V
-
 
L
-
 
E
V
 
T
A
 
A
K
 
P
E
 
D
T
 
A
G
 
E
G
 
V
L
 
L
Y
 
T
I
 
T
A
 
V
A
 
A
D
 
D
V
 
V
T
 
S
D
 
D
E
 
E
E
 
A
A
 
Q
V
 
V
K
 
E
A
 
A
A
 
Y
F
 
V
A
 
T
E
 
A
V
 
T
K
 
T
E
 
E
V
 
R
Y
 
F
G
 
G
R
 
R
V
 
I
D
 
D
V
 
G
A
 
F
F
 
F
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
S
x
E
P
 
G
P
 
K
D
 
Q
D
 
N
D
 
P
S
 
T
I
 
E
L
 
S
D
 
F
T
 
T
G
 
A
I
 
A
E
 
E
A
 
-
W
 
F
R
 
D
K
 
K
V
 
V
Q
 
V
E
 
S
V
 
I
N
 
N
L
 
L
T
 
R
S
 
G
V
 
V
Y
 
F
L
 
L
C
 
G
C
 
L
K
 
E
Y
 
K
A
 
V
L
 
L
P
 
K
Y
 
I
M
 
M
R
 
R
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
K
 
S
G
 
G
A
 
M
I
 
V
V
 
V
N
 
N
T
 
T
A
 
A
S
 
S
F
 
V
V
 
G
A
 
G
T
 
I
M
 
R
G
 
G
A
 
I
A
 
G
T
 
-
S
 
N
Q
 
Q
I
 
S
S
 
G
Y
 
Y
T
 
A
A
 
A
S
 
A
K
 
K
G
 
H
G
 
G
V
 
V
L
 
V
A
 
G
M
 
L
S
 
T
R
 
R
E
 
N
L
 
S
G
 
A
V
 
V
Q
 
E
F
 
Y
A
 
G
R
 
R
D
 
Y
G
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
A
L
 
I
S
 
A
P
 
P
G
 
G
P
 
A
V
 
I
N
 
W
T
 
T
P
 
P
L
 
M
-
 
V
-
 
E
-
 
N
-
 
S
L
 
M
K
 
K
E
 
Q
L
 
L
F
 
D
A
 
P
K
 
E
D
 
N
P
 
P
E
 
R
R
 
K
A
 
A
Q
 
A
R
 
E
R
 
E
L
 
F
V
 
I
H
 
Q
V
 
V
-
 
N
P
 
P
F
 
S
G
 
K
R
 
R
F
 
Y
A
 
G
E
 
E
P
 
A
E
 
P
E
 
E
I
 
I
A
 
A
S
 
A
A
 
V
V
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
L
S
 
S
D
 
D
D
 
D
A
 
A
S
 
S
F
 
Y
I
 
V
T
 
N
A
 
A
S
 
T
N
 
V
F
 
V
L
 
P
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
I
 
Q
S
 
S
G
 
A
A
 
A
Y
 
Y

1iy8A Crystal structure of levodione reductase (see paper)
41% identity, 98% coverage: 3:250/254 of query aligns to 1:258/258 of 1iy8A

query
sites
1iy8A
R
 
R
Y
 
F
E
 
T
G
 
D
R
 
R
V
 
V
A
 
V
V
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
G
 
G
S
|
S
G
|
G
I
x
L
G
 
G
K
 
R
A
 
A
T
 
T
A
 
A
L
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
S
 
A
E
 
E
G
 
G
G
 
A
T
 
K
V
 
L
V
 
S
A
 
L
V
 
V
D
|
D
L
x
V
D
 
S
R
 
S
D
 
E
A
 
G
G
 
L
E
 
E
A
 
A
-
 
S
-
 
K
-
 
A
-
 
A
-
 
V
-
 
L
-
 
E
V
 
T
A
 
A
K
 
P
E
 
D
T
 
A
G
 
E
G
 
V
L
 
L
Y
 
T
I
 
T
A
 
V
A
|
A
D
|
D
V
|
V
T
 
S
D
 
D
E
 
E
E
 
A
A
 
Q
V
 
V
K
 
E
A
 
A
A
 
Y
F
 
V
A
 
T
E
 
A
V
 
T
K
 
T
E
 
E
V
 
R
Y
 
F
G
 
G
R
 
R
V
 
I
D
 
D
V
 
G
A
 
F
F
 
F
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
|
I
S
 
E
P
 
G
P
 
K
D
 
Q
D
 
N
D
 
P
S
 
T
I
 
E
L
 
S
D
 
F
T
 
T
G
 
A
I
 
A
E
 
E
A
 
-
W
 
F
R
 
D
K
 
K
V
 
V
Q
 
V
E
 
S
V
 
I
N
 
N
L
 
L
T
 
R
S
 
G
V
 
V
Y
 
F
L
 
L
C
 
G
C
 
L
K
 
E
Y
 
K
A
 
V
L
 
L
P
 
K
Y
 
I
M
 
M
R
 
R
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
K
 
S
G
 
G
A
 
M
I
 
V
V
 
V
N
 
N
T
|
T
A
 
A
S
|
S
F
 
V
V
 
G
A
 
G
T
 
I
M
 
R
G
 
G
A
 
I
A
 
G
T
 
-
S
 
N
Q
|
Q
I
 
S
S
 
G
Y
|
Y
T
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
H
G
 
G
V
 
V
L
 
V
A
 
G
M
 
L
S
 
T
R
 
R
E
 
N
L
 
S
G
 
A
V
 
V
Q
 
E
F
 
Y
A
 
G
R
 
R
D
 
Y
G
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
A
L
 
I
S
 
A
P
|
P
G
|
G
P
 
A
V
 
I
N
 
W
T
|
T
P
|
P
L
x
M
-
 
V
-
 
E
-
 
N
-
 
S
L
 
M
K
 
K
E
 
Q
L
 
L
F
 
D
A
 
P
K
 
E
D
 
N
P
 
P
E
 
R
R
 
K
A
 
A
Q
 
A
R
 
E
R
 
E
L
 
F
V
 
I
H
 
Q
V
 
V
-
 
N
P
 
P
F
 
S
G
 
K
R
 
R
F
 
Y
A
 
G
E
 
E
P
 
A
E
 
P
E
 
E
I
 
I
A
 
A
S
 
A
A
 
V
V
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
L
S
 
S
D
 
D
D
 
D
A
 
A
S
 
S
F
 
Y
I
 
V
T
 
N
A
 
A
S
 
T
N
 
V
F
 
V
L
 
P
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
I
 
Q
S
 
S
G
 
A
A
 
A
Y
 
Y

H9XP47 Meso-2,3-butanediol dehydrogenase; BDH; meso-2,3-BDH; (R,S)-butane-2,3-diol dehydrogenase; NAD(H)-dependent meso-2,3-BDH; SmBdh; EC 1.1.1.- from Serratia marcescens (see paper)
40% identity, 99% coverage: 2:253/254 of query aligns to 1:248/251 of H9XP47

query
sites
H9XP47
Q
 
M
R
 
R
Y
 
F
E
 
D
G
 
N
R
 
K
V
 
V
A
 
V
V
 
V
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
S
x
N
G
 
G
I
x
M
G
 
G
K
 
E
A
 
A
T
 
A
A
 
A
L
 
R
R
 
R
L
 
F
A
 
S
S
 
A
E
 
E
G
 
G
G
 
A
T
 
I
V
 
V
V
 
V
A
 
L
V
 
A
D
|
D
L
 
W
D
 
A
R
 
K
D
 
E
A
 
A
G
 
V
E
 
D
A
 
K
V
 
V
A
 
A
K
 
A
-
 
S
-
 
L
-
 
P
E
 
K
T
 
G
G
 
R
G
 
A
L
 
M
Y
 
A
I
 
V
A
 
H
A
 
I
D
|
D
V
|
V
T
 
S
D
 
D
E
 
H
E
 
V
A
 
A
V
 
V
K
 
E
A
 
K
A
 
M
F
 
M
A
 
N
E
 
E
V
 
V
K
 
A
E
 
E
V
 
K
Y
 
L
G
 
G
R
 
R
V
 
I
D
 
D
V
 
V
A
 
L
F
 
L
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
V
S
 
H
P
 
V
P
 
A
D
 
G
D
 
-
D
 
-
S
 
S
I
 
V
L
 
L
D
 
E
T
 
T
G
 
S
I
 
I
E
 
D
A
 
D
W
 
W
R
 
R
K
 
R
V
 
I
Q
 
A
E
 
G
V
 
V
N
 
D
L
 
I
T
 
D
S
 
G
V
 
V
Y
 
V
L
 
F
C
 
C
C
 
S
K
 
K
Y
 
F
A
 
A
L
 
L
P
 
P
Y
 
H
M
 
L
R
 
L
E
 
K
Q
 
T
G
 
-
K
 
K
G
 
G
A
 
C
I
 
I
V
 
V
N
 
N
T
 
T
A
 
A
S
|
S
F
 
-
V
|
V
A
x
S
T
 
G
M
 
L
G
 
G
A
 
G
A
 
D
T
 
W
S
 
G
Q
 
A
I
 
A
S
 
Y
Y
|
Y
T
 
C
A
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
G
G
 
A
V
 
V
L
 
V
A
 
N
M
 
L
S
 
T
R
 
R
E
 
A
L
 
M
G
 
A
V
 
L
Q
 
D
F
 
H
A
 
G
R
 
G
D
 
D
G
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
S
L
 
V
S
 
C
P
 
P
G
 
S
P
 
L
V
|
V
N
 
K
T
|
T
P
 
N
L
 
M
L
 
T
-
 
N
-
 
G
-
 
W
-
 
P
K
 
Q
E
 
E
L
 
I
F
x
R
A
x
D
K
|
K
D
 
F
P
 
N
E
 
E
R
 
R
A
 
-
Q
 
-
R
 
-
R
 
-
L
 
-
V
 
-
H
 
-
V
 
I
P
 
A
F
 
L
G
 
G
R
 
R
F
 
A
A
 
A
E
 
E
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
S
 
A
A
 
V
V
 
M
A
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
D
A
 
A
S
 
S
F
 
F
I
 
I
T
 
N
A
 
G
S
 
A
N
 
N
F
 
I
L
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
I
 
A
S
 
T
G
 
A
A
 
S
Y
 
D
V
 
G
T
x
Q
P
 
P

6vspB Structure of serratia marcescens 2,3-butanediol dehydrogenase mutant q247a (see paper)
39% identity, 99% coverage: 3:253/254 of query aligns to 4:250/252 of 6vspB

query
sites
6vspB
R
 
R
Y
 
F
E
 
D
G
 
N
R
 
K
V
 
V
A
 
V
V
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
 
G
S
x
N
G
|
G
I
 
M
G
 
G
K
 
E
A
 
A
T
 
A
A
 
A
L
 
R
R
 
R
L
 
F
A
 
S
S
 
A
E
 
E
G
 
G
G
 
A
T
 
I
V
 
V
V
 
V
A
 
L
V
 
A
D
|
D
L
x
W
D
 
A
R
 
K
D
 
E
A
 
A
G
 
V
E
 
D
A
 
K
V
 
V
A
 
A
K
 
A
-
 
S
-
 
L
-
 
P
E
 
K
T
 
G
G
 
R
G
 
A
L
 
M
Y
 
A
I
 
V
A
 
H
A
x
I
D
|
D
V
|
V
T
 
S
D
 
D
E
 
H
E
 
V
A
 
A
V
 
V
K
 
E
A
 
K
A
 
M
F
 
M
A
 
N
E
 
E
V
 
V
K
 
A
E
 
E
V
 
K
Y
 
L
G
 
G
R
 
R
V
 
I
D
 
D
V
 
V
A
 
L
F
 
L
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
|
G
I
 
V
S
 
H
P
 
V
P
 
A
D
 
G
D
 
-
D
 
-
S
 
S
I
 
V
L
 
L
D
 
E
T
 
T
G
 
S
I
 
I
E
 
D
A
 
D
W
 
W
R
 
R
K
 
R
V
 
I
Q
 
A
E
 
G
V
 
V
N
 
D
L
 
I
T
 
D
S
 
G
V
 
V
Y
 
V
L
 
F
C
 
C
C
 
S
K
 
K
Y
 
F
A
 
A
L
 
L
P
 
P
Y
 
H
M
 
L
R
 
L
E
 
K
Q
 
T
G
 
-
K
 
K
G
 
G
A
 
C
I
 
I
V
 
V
N
 
N
T
 
T
A
 
A
S
|
S
F
 
-
V
 
V
A
 
S
T
 
G
M
 
L
G
 
G
A
 
G
A
 
D
T
 
W
S
 
G
Q
 
A
I
 
A
S
 
Y
Y
|
Y
T
 
C
A
 
A
S
 
A
K
 
K
G
 
G
G
 
A
V
 
V
L
 
V
A
 
N
M
 
L
S
 
T
R
 
R
E
 
A
L
 
M
G
 
A
V
 
L
Q
 
D
F
 
H
A
 
G
R
 
G
D
 
D
G
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
S
L
 
V
S
 
C
P
 
P
G
 
S
P
 
L
V
 
V
N
 
K
T
 
T
P
 
N
L
 
M
L
 
T
K
 
N
E
 
G
L
 
W
F
 
P
A
 
Q
K
 
E
D
 
I
P
 
R
E
 
D
R
 
K
A
 
F
Q
 
N
R
 
E
R
 
R
L
 
-
V
 
-
H
 
-
V
 
I
P
 
A
F
 
L
G
 
G
R
 
R
F
 
A
A
 
A
E
 
E
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
S
 
A
A
 
V
V
 
M
A
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
D
A
 
A
S
 
S
F
 
F
I
 
I
T
 
N
A
 
G
S
 
A
N
 
N
F
 
I
L
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
I
 
A
S
 
T
G
 
A
A
 
S
Y
 
D
V
 
G
T
 
A
P
 
P

6vspA Structure of serratia marcescens 2,3-butanediol dehydrogenase mutant q247a (see paper)
39% identity, 99% coverage: 3:253/254 of query aligns to 2:248/251 of 6vspA

query
sites
6vspA
R
 
R
Y
 
F
E
 
D
G
 
N
R
 
K
V
 
V
A
 
V
V
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
 
G
S
x
N
G
|
G
I
x
M
G
 
G
K
 
E
A
 
A
T
 
A
A
 
A
L
 
R
R
 
R
L
 
F
A
 
S
S
 
A
E
 
E
G
 
G
G
 
A
T
 
I
V
 
V
V
 
V
A
 
L
V
 
A
D
|
D
L
x
W
D
x
A
R
 
K
D
 
E
A
 
A
G
 
V
E
 
D
A
 
K
V
 
V
A
 
A
K
 
A
-
 
S
-
 
L
-
 
P
E
 
K
T
 
G
G
 
R
G
 
A
L
 
M
Y
 
A
I
 
V
A
 
H
A
x
I
D
|
D
V
|
V
T
 
S
D
 
D
E
 
H
E
 
V
A
 
A
V
 
V
K
 
E
A
 
K
A
 
M
F
 
M
A
 
N
E
 
E
V
 
V
K
 
A
E
 
E
V
 
K
Y
 
L
G
 
G
R
 
R
V
 
I
D
 
D
V
 
V
A
 
L
F
 
L
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
x
V
S
 
H
P
 
V
P
 
A
D
 
G
D
 
-
D
 
-
S
 
S
I
 
V
L
 
L
D
 
E
T
 
T
G
 
S
I
 
I
E
 
D
A
 
D
W
 
W
R
 
R
K
 
R
V
 
I
Q
 
A
E
 
G
V
|
V
N
 
D
L
 
I
T
 
D
S
 
G
V
 
V
Y
 
V
L
 
F
C
 
C
C
 
S
K
 
K
Y
 
F
A
 
A
L
 
L
P
 
P
Y
 
H
M
 
L
R
 
L
E
 
K
Q
 
T
G
 
-
K
 
K
G
 
G
A
 
C
I
 
I
V
 
V
N
 
N
T
|
T
A
 
A
S
|
S
F
 
-
V
 
V
A
 
S
T
 
G
M
 
L
G
 
G
A
 
G
A
 
D
T
 
W
S
 
G
Q
 
A
I
 
A
S
 
Y
Y
|
Y
T
 
C
A
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
G
G
 
A
V
 
V
L
 
V
A
 
N
M
 
L
S
 
T
R
 
R
E
 
A
L
 
M
G
 
A
V
 
L
Q
 
D
F
 
H
A
 
G
R
 
G
D
 
D
G
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
S
L
 
V
S
 
C
P
|
P
G
x
S
P
x
L
V
|
V
N
 
K
T
|
T
P
x
N
L
x
M
L
x
T
K
 
N
E
 
G
L
 
W
F
 
P
A
 
Q
K
 
E
D
 
I
P
 
R
E
 
D
R
 
K
A
 
F
Q
 
N
R
 
E
R
 
R
L
 
-
V
 
-
H
 
-
V
 
I
P
 
A
F
 
L
G
 
G
R
 
R
F
 
A
A
 
A
E
 
E
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
S
 
A
A
 
V
V
 
M
A
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
D
A
 
A
S
 
S
F
 
F
I
 
I
T
 
N
A
 
G
S
 
A
N
 
N
F
 
I
L
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
I
 
A
S
 
T
G
 
A
A
 
S
Y
 
D
V
 
G
T
 
A
P
 
P

6xewA Structure of serratia marcescens 2,3-butanediol dehydrogenase (see paper)
40% identity, 99% coverage: 3:253/254 of query aligns to 2:248/251 of 6xewA

query
sites
6xewA
R
 
R
Y
 
F
E
 
D
G
 
N
R
 
K
V
 
V
A
 
V
V
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
 
G
S
x
N
G
|
G
I
x
M
G
 
G
K
 
E
A
 
A
T
 
A
A
 
A
L
 
R
R
 
R
L
 
F
A
 
S
S
 
A
E
 
E
G
 
G
G
 
A
T
 
I
V
 
V
V
 
V
A
 
L
V
 
A
D
|
D
L
x
W
D
x
A
R
 
K
D
 
E
A
 
A
G
 
V
E
 
D
A
 
K
V
 
V
A
 
A
K
 
A
-
 
S
-
 
L
-
 
P
E
 
K
T
 
G
G
 
R
G
 
A
L
 
M
Y
 
A
I
 
V
A
 
H
A
x
I
D
|
D
V
|
V
T
 
S
D
 
D
E
 
H
E
 
V
A
 
A
V
 
V
K
 
E
A
 
K
A
 
M
F
 
M
A
 
N
E
 
E
V
 
V
K
 
A
E
 
E
V
 
K
Y
 
L
G
 
G
R
 
R
V
 
I
D
 
D
V
 
V
A
 
L
F
 
L
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
V
S
 
H
P
 
V
P
 
A
D
 
G
D
 
-
D
 
-
S
 
S
I
 
V
L
 
L
D
 
E
T
 
T
G
 
S
I
 
I
E
 
D
A
 
D
W
 
W
R
 
R
K
 
R
V
 
I
Q
 
A
E
 
G
V
|
V
N
 
D
L
 
I
T
 
D
S
 
G
V
 
V
Y
 
V
L
 
F
C
 
C
C
 
S
K
 
K
Y
 
F
A
 
A
L
 
L
P
 
P
Y
 
H
M
 
L
R
 
L
E
 
K
Q
 
T
G
 
-
K
 
K
G
 
G
A
 
C
I
 
I
V
 
V
N
 
N
T
|
T
A
 
A
S
|
S
F
 
-
V
 
V
A
x
S
T
 
G
M
 
L
G
 
G
A
 
G
A
 
D
T
 
W
S
 
G
Q
 
A
I
 
A
S
 
Y
Y
|
Y
T
 
C
A
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
G
G
 
A
V
 
V
L
 
V
A
 
N
M
 
L
S
 
T
R
 
R
E
 
A
L
 
M
G
 
A
V
 
L
Q
 
D
F
 
H
A
 
G
R
 
G
D
 
D
G
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
S
L
 
V
S
 
C
P
 
P
G
x
S
P
x
L
V
|
V
N
 
K
T
|
T
P
x
N
L
x
M
L
x
T
-
 
N
-
 
G
-
 
W
-
 
P
K
 
Q
E
 
E
L
 
I
F
 
R
A
 
D
K
 
K
D
 
F
P
 
N
E
 
E
R
 
R
A
 
-
Q
 
-
R
 
-
R
 
-
L
 
-
V
 
-
H
 
-
V
 
I
P
 
A
F
 
L
G
 
G
R
 
R
F
 
A
A
 
A
E
 
E
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
S
 
A
A
 
V
V
 
M
A
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
D
A
 
A
S
 
S
F
 
F
I
 
I
T
 
N
A
 
G
S
 
A
N
 
N
F
 
I
L
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
I
 
A
S
 
T
G
 
A
A
 
S
Y
 
D
V
 
G
T
 
Q
P
 
P

6ixmC Crystal structure of the ketone reductase chkred20 from the genome of chryseobacterium sp. Ca49 complexed with NAD (see paper)
39% identity, 95% coverage: 5:245/254 of query aligns to 4:244/248 of 6ixmC

query
sites
6ixmC
E
 
D
G
 
N
R
 
K
V
 
V
A
 
A
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
 
G
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
L
A
 
A
T
 
V
A
 
A
L
 
H
R
 
S
L
 
Y
A
 
A
S
 
K
E
 
E
G
 
G
G
 
A
T
 
K
V
 
V
V
 
I
A
 
V
V
 
S
D
|
D
L
x
I
D
 
N
R
 
E
D
 
D
A
 
H
G
 
G
E
 
N
A
 
K
V
 
A
A
 
V
-
 
E
-
 
D
-
 
I
K
 
K
E
 
A
T
 
Q
G
 
G
G
 
G
-
 
E
-
 
A
L
 
S
Y
 
F
I
 
V
A
 
K
A
|
A
D
|
D
V
x
T
T
 
S
D
 
N
E
 
P
E
 
E
A
 
E
V
 
V
K
 
E
A
 
A
A
 
L
F
 
V
A
 
K
E
 
R
V
 
T
K
 
V
E
 
E
V
 
I
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
V
 
L
D
 
D
V
 
I
A
 
A
F
 
C
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
S
 
G
P
 
G
P
 
-
D
 
E
D
 
Q
D
 
A
S
 
L
I
 
A
L
 
G
D
 
D
T
 
Y
G
 
G
I
 
L
E
 
D
A
 
S
W
 
W
R
 
R
K
 
K
V
 
V
Q
 
L
E
 
S
V
 
I
N
 
N
L
 
L
T
 
D
S
 
G
V
 
V
Y
 
F
L
 
Y
C
 
G
C
 
C
K
 
K
Y
 
Y
A
 
E
L
 
L
P
 
E
Y
 
Q
M
 
M
R
 
E
E
 
K
Q
 
N
G
 
G
K
 
G
G
 
G
A
 
V
I
 
I
V
 
V
N
 
N
T
x
M
A
 
A
S
|
S
F
 
I
V
 
H
A
 
G
T
 
I
M
 
V
G
 
A
A
 
A
A
 
P
T
 
L
S
 
S
Q
 
S
I
 
-
S
 
A
Y
|
Y
T
 
T
A
 
S
S
 
A
K
|
K
G
 
H
G
 
A
V
 
V
L
 
V
A
 
G
M
 
L
S
 
T
R
 
K
E
 
N
L
 
I
G
 
G
V
 
A
Q
 
E
F
 
Y
A
 
G
R
 
Q
D
 
K
G
 
N
V
 
I
R
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
A
L
 
V
S
 
G
P
|
P
G
x
A
P
x
Y
V
x
I
N
 
E
T
 
T
P
 
P
L
|
L
L
 
L
K
 
E
E
 
S
L
 
L
F
 
-
A
 
-
K
 
-
D
 
T
P
 
K
E
 
E
R
 
M
A
 
K
Q
 
E
R
 
A
R
 
L
L
 
I
V
 
S
H
 
K
V
 
H
P
 
P
F
 
M
G
 
G
R
 
R
F
 
L
A
 
G
E
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
S
 
E
A
 
L
V
 
V
A
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
S
S
 
S
D
 
E
D
 
K
A
 
S
S
 
S
F
 
F
I
 
M
T
 
T
A
 
G
S
 
G
N
 
Y
F
 
Y
L
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

8y83A Crystal structure of a ketoreductase from sphingobacterium siyangense sy1 with co-enzyme
37% identity, 96% coverage: 1:245/254 of query aligns to 1:245/249 of 8y83A

query
sites
8y83A
M
 
M
Q
 
K
R
 
I
Y
 
L
E
 
A
G
 
D
R
 
K
V
 
V
A
 
A
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
S
G
 
G
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
L
A
 
A
T
 
V
A
 
A
L
 
L
R
 
A
L
 
Y
A
 
G
S
 
K
E
 
E
G
 
G
G
 
A
T
 
K
V
 
V
V
 
V
A
 
I
V
 
S
D
|
D
L
x
I
D
 
N
R
 
E
D
 
Q
A
 
A
G
 
G
E
 
N
A
 
E
V
 
T
A
 
V
K
 
K
E
 
Q
T
 
I
-
 
E
-
 
S
-
 
L
G
 
G
G
 
G
-
 
E
-
 
A
L
 
V
Y
 
F
I
 
F
A
 
K
A
|
A
D
|
D
V
x
S
T
 
S
D
 
S
E
 
P
E
 
A
A
 
D
V
 
N
K
 
E
A
 
A
A
 
L
F
 
V
A
 
G
E
 
Y
V
 
A
K
 
V
E
 
K
V
 
T
Y
 
F
G
 
G
R
 
R
V
 
L
D
 
D
V
 
I
A
 
A
F
 
C
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
S
 
G
P
 
-
P
 
-
D
 
-
D
 
G
D
 
E
S
 
A
I
 
A
L
 
L
-
 
T
-
 
G
D
 
D
T
 
Y
G
 
S
I
 
L
E
 
D
A
 
G
W
 
W
R
 
K
K
 
K
V
 
V
Q
 
I
E
 
D
V
 
I
N
 
N
L
 
F
T
 
N
S
 
G
V
 
V
Y
 
F
L
 
Y
C
 
G
C
 
C
K
 
K
Y
 
Y
A
 
Q
L
 
I
P
 
E
Y
 
A
M
 
M
R
 
E
E
 
R
Q
 
N
G
 
G
K
 
G
G
 
G
A
 
V
I
 
I
V
 
V
N
 
N
T
x
M
A
 
A
S
 
S
F
 
I
V
 
H
A
 
G
T
 
T
M
 
V
G
 
A
A
 
A
A
 
P
T
 
M
S
 
S
Q
 
S
I
 
-
S
 
A
Y
|
Y
T
 
T
A
 
S
S
 
A
K
|
K
G
 
H
G
 
A
V
 
V
L
 
V
A
 
G
M
 
L
S
 
T
R
 
K
E
 
N
L
 
I
G
 
G
V
 
A
Q
 
E
F
 
Y
A
 
G
R
 
Q
D
 
K
G
 
N
V
 
I
R
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
A
L
 
V
S
 
G
P
|
P
G
|
G
P
x
Y
V
x
I
N
 
D
T
 
T
P
 
P
L
|
L
L
 
L
K
 
A
E
 
K
L
 
L
F
 
-
A
 
-
K
 
-
D
 
D
P
 
K
E
 
E
R
 
H
A
 
I
Q
 
N
R
 
A
R
 
L
L
 
I
V
 
S
H
 
K
V
 
H
P
 
P
F
 
I
G
 
G
R
 
R
F
 
L
A
 
G
E
 
K
P
 
A
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
S
 
E
A
 
L
V
 
V
A
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
S
S
 
S
D
 
D
D
 
K
A
 
S
S
 
S
F
 
F
I
 
M
T
 
T
A
 
G
S
 
G
N
 
Y
F
 
Y
L
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

5jc8D Crystal structure of a putative short-chain dehydrogenase/reductase from burkholderia xenovorans
38% identity, 96% coverage: 3:247/254 of query aligns to 3:258/262 of 5jc8D

query
sites
5jc8D
R
 
R
Y
 
L
E
 
Q
G
 
G
R
 
K
V
 
V
A
 
A
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
S
 
C
-
 
I
-
 
G
-
 
P
-
 
G
-
 
W
G
|
G
I
 
N
G
 
G
K
 
R
A
 
A
T
 
I
A
 
A
L
 
V
R
 
R
L
 
F
A
 
A
S
 
E
E
 
E
G
 
G
G
 
A
T
 
H
V
 
V
V
 
I
A
 
A
V
 
V
D
 
D
L
 
R
D
 
D
-
 
L
-
 
A
-
 
S
R
 
M
D
 
D
A
 
A
G
 
T
E
 
L
A
 
E
V
 
L
A
 
V
K
 
R
E
 
A
T
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
S
Y
 
V
-
 
T
-
 
P
I
 
C
A
 
L
A
 
C
D
 
D
V
 
V
T
 
T
D
 
D
E
 
S
E
 
A
A
 
S
V
 
V
K
 
E
A
 
R
A
 
L
F
 
V
A
 
A
E
 
D
V
 
S
K
 
V
E
 
A
V
 
R
Y
 
C
G
 
G
R
 
R
V
 
V
D
 
D
V
 
I
A
 
L
F
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
V
G
 
G
I
 
A
S
 
P
P
 
S
P
 
P
D
 
G
D
 
G
D
 
P
S
 
V
I
 
A
L
 
L
D
 
D
T
 
E
G
 
A
I
 
-
E
 
-
A
 
Q
W
 
W
R
 
A
K
 
M
V
 
Q
Q
 
L
E
 
E
V
 
L
N
 
N
L
 
L
T
 
T
S
 
T
V
 
A
Y
 
F
L
 
L
C
 
M
C
 
C
K
 
K
Y
 
Y
A
 
V
L
 
L
P
 
P
Y
 
V
M
 
M
R
 
E
E
 
Q
Q
 
Q
G
 
G
K
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
T
 
I
A
 
A
S
|
S
F
 
T
V
 
S
A
 
G
T
 
I
M
 
R
G
 
W
A
 
T
A
 
G
T
 
A
S
 
A
Q
 
Q
I
 
V
S
 
G
Y
|
Y
T
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
V
 
M
L
 
I
A
 
Q
M
 
M
S
 
G
R
 
R
E
 
V
L
 
V
G
 
A
V
 
V
Q
 
E
F
 
Y
A
 
A
R
 
A
D
 
K
G
 
N
V
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
S
L
 
V
S
 
V
P
 
P
G
 
G
P
 
L
V
 
L
N
 
H
T
 
T
P
|
P
L
x
M
L
 
V
K
 
D
E
 
T
L
 
K
F
 
I
A
 
A
K
 
H
D
 
N
P
 
G
E
 
D
-
 
V
-
 
E
-
 
L
R
 
L
A
 
L
Q
 
R
R
 
K
R
 
R
L
 
Q
V
 
A
H
 
R
V
 
I
P
 
P
F
 
M
G
 
P
R
 
F
F
 
M
A
 
G
E
 
D
P
 
G
E
 
R
E
 
D
I
 
T
A
 
A
S
 
N
A
 
A
V
 
A
A
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
E
A
 
A
S
 
R
F
 
F
I
 
V
T
 
T
A
 
G
S
 
T
N
 
E
F
 
I
L
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
I
 
M
S
 
S

3op4A Crystal structure of putative 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase from vibrio cholerae o1 biovar eltor str. N16961 in complex with NADP+ (see paper)
38% identity, 95% coverage: 5:246/254 of query aligns to 7:244/247 of 3op4A

query
sites
3op4A
E
 
E
G
 
G
R
 
K
V
 
V
A
 
A
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
x
S
S
x
R
G
 
G
I
|
I
G
 
G
K
 
K
A
 
A
T
 
I
A
 
A
L
 
E
R
 
L
L
 
L
A
 
A
S
 
E
E
 
R
G
 
G
G
 
A
T
 
K
V
 
V
V
 
I
A
 
G
V
 
T
D
 
A
L
x
T
D
 
S
R
 
E
D
 
S
A
 
G
G
 
A
E
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
S
K
 
D
E
 
Y
T
 
L
G
 
G
-
 
D
-
 
N
G
 
G
L
 
K
Y
 
G
I
 
M
A
 
A
A
 
L
D
x
N
V
|
V
T
 
T
D
 
N
E
 
P
E
 
E
A
 
S
V
 
I
K
 
E
A
 
A
A
 
V
F
 
L
A
 
K
E
 
A
V
 
I
K
 
T
E
 
D
V
 
E
Y
 
F
G
 
G
R
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
I
A
 
L
F
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
|
I
S
 
T
P
 
R
P
 
-
D
 
-
D
 
D
D
 
N
S
 
L
I
 
L
L
 
M
D
 
R
T
 
M
G
 
K
I
 
E
E
 
E
A
 
E
W
 
W
R
 
S
K
 
D
V
 
I
Q
 
M
E
 
E
V
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
T
S
 
S
V
 
I
Y
 
F
L
 
R
C
 
L
C
 
S
K
 
K
Y
 
A
A
 
V
L
 
L
P
 
R
Y
 
G
M
 
M
R
 
M
E
 
K
Q
 
K
G
 
R
K
 
Q
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
T
x
V
A
 
G
S
|
S
F
 
V
V
 
V
A
 
G
T
 
T
M
 
M
G
 
G
A
 
N
A
 
A
T
 
-
S
 
G
Q
 
Q
I
 
A
S
 
N
Y
|
Y
T
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
I
A
 
G
M
 
F
S
 
T
R
 
K
E
 
S
L
 
M
G
 
A
V
 
R
Q
 
E
F
 
V
A
 
A
R
 
S
D
 
R
G
 
G
V
 
V
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
T
L
 
V
S
 
A
P
|
P
G
|
G
P
 
F
V
x
I
N
 
E
T
|
T
P
 
D
L
x
M
L
 
T
K
 
K
E
 
A
L
 
L
F
 
-
A
 
-
K
 
-
D
 
N
P
 
D
E
 
E
R
 
Q
A
 
R
Q
 
T
R
 
A
R
 
T
L
 
L
V
 
A
H
 
Q
V
 
V
P
 
P
F
 
A
G
 
G
R
 
R
F
 
L
A
 
G
E
 
D
P
 
P
E
 
R
E
 
E
I
 
I
A
 
A
S
 
S
A
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
P
D
 
E
A
 
A
S
 
A
F
 
Y
I
 
I
T
 
T
A
 
G
S
 
E
N
 
T
F
 
L
L
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
I
 
M

7djsD Crystal structure of isopiperitenol dehydrogenase from pseudomonas aeruginosa complexed with NAD
41% identity, 94% coverage: 6:245/254 of query aligns to 5:247/251 of 7djsD

query
sites
7djsD
G
 
G
R
 
Q
V
 
V
A
 
A
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
G
 
A
S
 
A
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
R
A
 
A
T
 
T
A
 
A
L
 
Q
R
 
A
L
 
F
A
 
A
S
 
A
E
 
A
G
 
G
G
 
V
T
 
K
V
 
V
V
 
V
A
 
V
V
 
A
D
|
D
L
|
L
D
 
D
R
 
S
D
 
A
A
 
G
G
 
G
E
 
E
A
 
G
V
 
T
A
 
V
-
 
E
-
 
A
-
 
I
K
 
R
E
 
Q
T
 
A
G
 
G
G
 
G
-
 
E
-
 
A
L
 
V
Y
 
F
I
 
I
A
 
R
A
x
C
D
|
D
V
|
V
T
 
T
D
 
R
E
 
D
E
 
A
A
 
E
V
 
V
K
 
K
A
 
A
A
 
L
F
 
V
A
 
E
E
 
G
V
 
C
K
 
A
E
 
A
V
 
A
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
V
 
L
D
 
D
V
 
Y
A
 
A
F
 
F
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
S
 
E
P
 
I
P
 
-
D
 
-
D
 
E
D
 
Q
S
 
G
I
 
K
L
 
L
D
 
A
T
 
D
G
 
G
I
 
N
E
 
E
A
 
A
-
 
E
W
 
F
R
 
D
K
 
A
V
 
I
Q
 
M
E
 
A
V
 
V
N
 
N
L
 
V
T
 
K
S
 
G
V
 
V
Y
 
W
L
 
L
C
 
C
C
 
M
K
 
K
Y
 
H
A
 
Q
L
 
I
P
 
P
Y
 
L
M
 
M
R
 
L
E
 
A
Q
 
Q
G
 
G
K
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
T
|
T
A
 
A
S
|
S
F
 
-
V
 
V
A
 
A
T
 
G
M
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
T
 
P
S
 
K
Q
 
M
I
 
S
S
 
I
Y
|
Y
T
 
A
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
H
G
 
A
V
 
V
L
 
I
A
 
G
M
 
L
S
 
T
R
 
K
E
 
S
L
 
A
G
 
A
V
 
I
Q
 
E
F
 
Y
A
 
A
R
 
K
D
 
K
G
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
V
S
 
C
P
 
P
G
x
A
P
x
V
V
 
I
N
 
D
T
 
T
P
 
D
L
 
M
L
 
F
K
 
R
E
 
R
L
 
A
F
 
Y
A
 
E
K
 
A
D
 
D
P
 
P
E
 
R
R
 
K
A
 
A
Q
 
E
R
 
F
R
 
A
L
 
A
V
 
A
H
 
M
V
 
H
P
 
P
F
 
L
G
 
G
R
 
R
F
 
V
A
 
G
E
 
R
P
 
V
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
S
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
L
F
 
Y
L
 
L
A
 
C
S
 
S
D
 
D
D
 
N
A
 
A
S
 
G
F
 
F
I
 
T
T
 
T
A
 
G
S
 
I
N
 
A
F
 
L
L
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

4i08A Crystal structure of beta-ketoacyl-acyl carrier protein reductase (fabg) from vibrio cholerae in complex with NADPH (see paper)
37% identity, 95% coverage: 5:246/254 of query aligns to 7:240/243 of 4i08A

query
sites
4i08A
E
 
E
G
 
G
R
 
K
V
 
V
A
 
A
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
x
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
K
A
 
A
T
 
I
A
 
A
L
 
E
R
 
L
L
 
L
A
 
A
S
 
E
E
 
R
G
 
G
G
 
A
T
 
K
V
 
V
V
 
I
A
 
G
V
 
T
D
 
A
L
x
T
D
 
S
R
 
E
D
 
S
A
 
G
G
 
A
E
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
S
K
 
D
E
 
Y
T
 
L
G
 
G
-
 
D
-
 
N
G
 
G
L
 
K
Y
 
G
I
 
M
A
 
A
A
 
L
D
x
N
V
|
V
T
 
T
D
 
N
E
 
P
E
 
E
A
 
S
V
 
I
K
 
E
A
 
A
A
 
V
F
 
L
A
 
K
E
 
A
V
 
I
K
 
T
E
 
D
V
 
E
Y
 
F
G
 
G
R
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
I
A
 
L
F
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
S
 
T
P
 
R
P
 
-
D
 
-
D
 
D
D
 
N
S
 
L
I
 
L
L
 
M
D
 
R
T
 
M
G
 
K
I
 
E
E
 
E
A
 
E
W
 
W
R
 
S
K
 
D
V
 
I
Q
 
M
E
 
E
V
 
T
N
|
N
L
 
L
T
 
T
S
 
S
V
 
I
Y
 
F
L
 
R
C
 
L
C
 
S
K
 
K
Y
 
A
A
 
V
L
 
L
P
 
R
Y
 
G
M
 
M
R
 
M
E
 
K
Q
 
K
G
 
R
K
 
Q
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
T
 
V
A
x
G
S
|
S
F
 
V
V
 
V
A
 
G
T
 
T
M
 
M
G
 
G
A
 
N
A
 
A
T
 
-
S
 
G
Q
|
Q
I
 
A
S
 
N
Y
|
Y
T
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
I
A
 
G
M
 
F
S
 
T
R
 
K
E
 
S
L
 
M
G
 
A
V
 
R
Q
 
E
F
 
V
A
 
A
R
 
S
D
 
R
G
 
G
V
 
V
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
T
L
 
V
S
 
A
P
|
P
G
|
G
P
 
F
V
 
I
N
 
E
T
|
T
P
 
D
L
 
M
L
 
-
K
 
-
E
 
-
L
 
-
F
 
-
A
 
-
K
 
-
D
 
N
P
 
D
E
 
E
R
 
Q
A
 
R
Q
 
T
R
 
A
R
 
T
L
 
L
V
 
A
H
 
Q
V
 
V
P
 
P
F
 
A
G
 
G
R
 
R
F
 
L
A
 
G
E
 
D
P
 
P
E
 
R
E
 
E
I
 
I
A
 
A
S
 
S
A
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
P
D
 
E
A
 
A
S
 
A
F
 
Y
I
 
I
T
 
T
A
 
G
S
 
E
N
 
T
F
 
L
L
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
I
 
M

2cfcA Structural basis for stereo selectivity in the (r)- and (s)- hydroxypropylethane thiosulfonate dehydrogenases (see paper)
38% identity, 94% coverage: 7:244/254 of query aligns to 3:245/250 of 2cfcA

query
sites
2cfcA
R
 
R
V
 
V
A
 
A
V
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
 
S
S
|
S
G
|
G
I
x
N
G
 
G
K
 
L
A
 
A
T
 
I
A
 
A
L
 
T
R
 
R
L
 
F
A
 
L
S
 
A
E
 
R
G
 
G
G
 
D
T
 
R
V
 
V
V
 
A
A
 
A
V
 
L
D
|
D
L
|
L
D
 
S
R
 
A
D
 
E
A
 
T
G
 
L
E
 
E
A
 
E
V
 
T
A
 
A
K
 
R
E
 
T
T
 
H
G
 
W
G
 
H
L
 
A
Y
 
Y
-
 
A
-
 
D
-
 
K
-
 
V
-
 
L
-
 
R
I
 
V
A
 
R
A
|
A
D
|
D
V
|
V
T
 
A
D
 
D
E
 
E
E
 
G
A
 
D
V
 
V
K
 
N
A
 
A
A
 
A
F
 
I
A
 
A
E
 
A
V
 
T
K
 
M
E
 
E
V
 
Q
Y
 
F
G
 
G
R
 
A
V
 
I
D
 
D
V
 
V
A
 
L
F
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
S
 
T
P
 
G
P
 
N
D
 
S
D
 
E
D
 
A
S
 
G
I
 
V
L
 
L
D
 
H
T
 
T
G
 
T
-
 
P
I
 
V
E
 
E
A
 
Q
W
 
F
R
 
D
K
 
K
V
 
V
Q
 
M
E
 
A
V
 
V
N
 
N
L
 
V
T
 
R
S
 
G
V
 
I
Y
 
F
L
 
L
C
 
G
C
 
C
K
 
R
Y
 
A
A
 
V
L
 
L
P
 
P
Y
 
H
M
 
M
R
 
L
E
 
L
Q
 
Q
G
 
G
K
 
A
G
 
G
A
 
V
I
 
I
V
 
V
N
 
N
T
x
I
A
 
A
S
|
S
F
 
-
V
 
V
A
 
A
T
 
S
M
 
L
G
 
V
A
 
A
A
x
F
T
 
P
S
 
G
Q
x
R
I
 
S
S
 
A
Y
|
Y
T
 
T
A
 
T
S
 
S
K
|
K
G
 
G
G
 
A
V
 
V
L
 
L
A
 
Q
M
 
L
S
 
T
R
 
K
E
 
S
L
 
V
G
 
A
V
 
V
Q
 
D
F
 
Y
A
 
A
R
 
G
D
 
S
G
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
A
L
 
V
S
 
C
P
|
P
G
|
G
P
x
M
V
x
I
N
 
E
T
|
T
P
|
P
L
x
M
L
x
T
K
 
Q
E
x
W
L
x
R
F
 
L
A
 
-
K
 
D
D
 
Q
P
 
P
E
 
E
R
 
L
A
 
R
Q
 
D
R
 
Q
R
 
V
L
 
L
V
 
A
H
 
R
V
 
I
P
 
P
F
 
Q
G
 
K
R
 
E
F
 
I
A
 
G
E
 
T
P
 
A
E
 
A
E
 
Q
I
 
V
A
 
A
S
 
D
A
 
A
V
 
V
A
 
M
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
G
D
 
E
D
 
D
A
 
A
S
 
T
F
 
Y
I
 
V
T
 
N
A
 
G
S
 
A
N
 
A
F
 
L
L
 
V
V
 
M
D
 
D
G
 
G

Q56840 2-(R)-hydroxypropyl-CoM dehydrogenase; R-HPCDH; 2-[(R)-2-hydroxypropylthio]ethanesulfonate dehydrogenase; Aliphatic epoxide carboxylation component III; Epoxide carboxylase component III; RHPCDH1; EC 1.1.1.268 from Xanthobacter autotrophicus (strain ATCC BAA-1158 / Py2) (see 4 papers)
38% identity, 94% coverage: 7:244/254 of query aligns to 3:245/250 of Q56840

query
sites
Q56840
R
 
R
V
 
V
A
 
A
V
 
I
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
S
S
|
S
G
|
G
I
x
N
G
 
G
K
 
L
A
 
A
T
 
I
A
 
A
L
 
T
R
 
R
L
 
F
A
 
L
S
 
A
E
 
R
G
 
G
G
 
D
T
 
R
V
 
V
V
 
A
A
 
A
V
 
L
D
|
D
L
 
L
D
 
S
R
 
A
D
 
E
A
 
T
G
 
L
E
 
E
A
 
E
V
 
T
A
 
A
K
 
R
E
 
T
T
 
H
G
 
W
G
 
H
L
 
A
Y
 
Y
-
 
A
-
 
D
-
 
K
-
 
V
-
 
L
-
 
R
I
 
V
A
 
R
A
 
A
D
|
D
V
|
V
T
 
A
D
 
D
E
 
E
E
 
G
A
 
D
V
 
V
K
 
N
A
 
A
A
 
A
F
 
I
A
 
A
E
 
A
V
 
T
K
 
M
E
 
E
V
 
Q
Y
 
F
G
 
G
R
 
A
V
 
I
D
 
D
V
 
V
A
 
L
F
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
S
 
T
P
 
G
P
 
N
D
 
S
D
 
E
D
 
A
S
 
G
I
 
V
L
 
L
D
 
H
T
 
T
G
 
T
-
 
P
I
 
V
E
 
E
A
 
Q
W
 
F
R
 
D
K
 
K
V
 
V
Q
 
M
E
 
A
V
 
V
N
 
N
L
 
V
T
 
R
S
 
G
V
 
I
Y
 
F
L
 
L
C
 
G
C
 
C
K
 
R
Y
 
A
A
 
V
L
 
L
P
 
P
Y
 
H
M
 
M
R
 
L
E
 
L
Q
 
Q
G
 
G
K
 
A
G
 
G
A
 
V
I
 
I
V
 
V
N
 
N
T
 
I
A
 
A
S
|
S
F
 
-
V
 
V
A
 
A
T
 
S
M
 
L
G
 
V
A
 
A
A
 
F
T
 
P
S
 
G
Q
x
R
I
 
S
S
 
A
Y
|
Y
T
 
T
A
 
T
S
 
S
K
|
K
G
 
G
G
 
A
V
 
V
L
 
L
A
 
Q
M
 
L
S
 
T
R
 
K
E
 
S
L
 
V
G
 
A
V
 
V
Q
 
D
F
 
Y
A
 
A
R
 
G
D
 
S
G
 
G
V
 
I
R
|
R
V
 
C
N
 
N
A
 
A
L
 
V
S
 
C
P
 
P
G
 
G
P
 
M
V
x
I
N
x
E
T
|
T
P
|
P
L
x
M
L
 
T
K
 
Q
E
x
W
L
x
R
F
 
L
A
 
-
K
 
D
D
 
Q
P
 
P
E
 
E
R
 
L
A
x
R
Q
 
D
R
 
Q
R
 
V
L
 
L
V
 
A
H
x
R
V
 
I
P
 
P
F
 
Q
G
 
K
R
 
E
F
 
I
A
 
G
E
 
T
P
 
A
E
 
A
E
 
Q
I
 
V
A
 
A
S
 
D
A
 
A
V
 
V
A
 
M
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
G
D
 
E
D
 
D
A
 
A
S
 
T
F
 
Y
I
 
V
T
 
N
A
 
G
S
 
A
N
 
A
F
 
L
L
 
V
V
 
M
D
 
D
G
 
G

Sites not aligning to the query:

5en4A Complex of 17-beta-hydroxysteroid dehydrogenase type 14 with inhibitor. (see paper)
39% identity, 88% coverage: 28:250/254 of query aligns to 28:250/251 of 5en4A

query
sites
5en4A
S
 
N
E
 
S
G
 
G
G
 
A
T
 
R
V
 
V
V
 
V
A
 
I
V
 
C
D
|
D
L
x