SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_017730597.1 NCBI__GCF_000346615.1:WP_017730597.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3gbuA Crystal structure of an uncharacterized sugar kinase ph1459 from pyrococcus horikoshii in complex with atp
31% identity, 84% coverage: 3:250/296 of query aligns to 2:252/302 of 3gbuA

query
sites
3gbuA
V
 
I
L
 
A
S
 
S
F
 
I
G
 
G
E
 
E
I
 
L
L
 
L
F
 
I
D
 
D
I
 
L
I
 
I
-
 
S
-
 
V
-
 
E
E
 
E
G
 
G
-
 
D
-
 
L
-
 
K
-
 
D
-
 
V
-
 
R
-
 
L
-
 
F
E
 
E
N
 
K
Y
 
H
L
 
P
G
 
G
G
 
G
A
 
A
P
 
P
L
 
A
N
 
N
F
 
V
A
 
A
A
 
V
H
 
G
L
 
V
A
 
S
Q
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
V
E
 
K
S
 
S
Y
 
S
I
 
L
F
 
I
S
 
S
R
 
K
V
 
V
G
 
G
D
 
N
D
 
D
E
 
P
L
 
F
G
 
G
K
 
E
A
 
Y
A
 
L
L
 
I
E
 
E
Q
 
E
I
 
L
R
 
S
K
 
K
I
 
E
R
 
N
I
 
V
K
 
D
T
 
T
D
 
R
F
 
G
I
 
I
Q
 
V
K
 
K
D
 
D
N
 
E
Q
 
K
H
 
K
P
 
H
T
 
T
G
 
G
T
 
I
V
 
V
P
 
F
V
 
V
E
 
Q
F
 
L
K
 
K
D
 
G
G
 
A
Q
 
S
P
 
P
D
 
S
Y
 
F
T
 
L
I
 
L
T
 
Y
K
 
D
N
 
D
V
 
V
A
 
A
Y
 
Y
-
 
F
-
 
N
-
 
M
-
 
T
-
 
L
D
 
N
Y
 
D
I
 
I
N
 
N
F
 
W
R
 
D
A
 
I
S
 
V
K
 
E
Q
 
E
A
 
A
I
 
-
D
 
-
P
 
-
M
 
-
S
 
-
F
 
-
D
 
K
V
 
I
L
 
V
Y
 
N
F
 
F
G
 
G
T
 
S
-
 
V
L
 
I
A
 
L
Q
 
A
R
 
R
N
 
N
L
 
P
E
 
S
S
 
R
E
 
E
S
 
T
A
 
V
L
 
M
K
 
K
Q
 
V
L
 
I
L
 
K
Q
 
K
R
 
I
K
 
K
A
 
G
F
 
S
K
 
S
H
 
L
I
 
I
F
 
A
Y
 
F
D
 
D
I
 
V
N
 
N
L
 
L
R
 
R
K
 
L
D
 
D
C
 
L
F
 
W
T
 
R
A
 
G
E
 
Q
-
 
E
-
 
E
-
 
E
-
 
M
-
 
I
-
 
K
I
 
V
I
 
L
K
 
E
Q
 
E
S
 
S
L
 
I
R
 
K
A
 
L
C
 
A
T
 
D
I
 
I
F
 
V
K
|
K
L
 
A
N
 
S
D
 
E
E
 
E
E
 
E
V
 
V
R
 
-
V
 
-
V
 
-
S
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
L
Y
 
Y
Q
 
L
Q
 
E
E
 
N
L
 
Q
S
 
G
L
 
V
E
 
E
E
 
-
F
 
-
V
 
V
K
 
K
Q
 
G
A
 
S
S
 
M
K
 
-
D
 
-
N
 
-
N
 
-
I
 
-
E
 
-
L
 
L
I
 
T
L
 
A
I
 
I
T
|
T
A
 
L
G
|
G
A
 
P
E
 
K
G
 
G
C
 
F
Y
 
R
I
 
L
Y
 
I
E
 
K
K
 
N
Q
 
E
T
 
T
L
 
V
K
 
V
F
 
D
V
 
V
K
 
P
G
 
S
Y
 
Y
P
 
N
A
x
V
N
 
N
V
x
P
V
 
L
D
 
D
T
 
T
V
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
A
F
 
F
S
 
M
A
 
A
A
 
A
F
 
L
V
 
L

Sites not aligning to the query:

3ih0A Crystal structure of an uncharacterized sugar kinase ph1459 from pyrococcus horikoshii in complex with amp-pnp
31% identity, 84% coverage: 3:250/296 of query aligns to 3:253/304 of 3ih0A

query
sites
3ih0A
V
 
I
L
 
A
S
 
S
F
 
I
G
 
G
E
 
E
I
 
L
L
 
L
F
 
I
D
 
D
I
 
L
I
 
I
-
 
S
-
 
V
-
 
E
E
 
E
G
 
G
-
 
D
-
 
L
-
 
K
-
 
D
-
 
V
-
 
R
-
 
L
-
 
F
E
 
E
N
 
K
Y
 
H
L
 
P
G
 
G
G
 
G
A
 
A
P
 
P
L
 
A
N
 
N
F
 
V
A
 
A
A
 
V
H
 
G
L
 
V
A
 
S
Q
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
V
E
 
K
S
 
S
Y
 
S
I
 
L
F
 
I
S
 
S
R
 
K
V
 
V
G
 
G
D
 
N
D
 
D
E
 
P
L
 
F
G
 
G
K
 
E
A
 
Y
A
 
L
L
 
I
E
 
E
Q
 
E
I
 
L
R
 
S
K
 
K
I
 
E
R
 
N
I
 
V
K
 
D
T
 
T
D
 
R
F
 
G
I
 
I
Q
 
V
K
 
K
D
 
D
N
 
E
Q
 
K
H
 
K
P
 
H
T
 
T
G
 
G
T
 
I
V
 
V
P
 
F
V
 
V
E
 
Q
F
 
L
K
 
K
D
 
G
G
 
A
Q
 
S
P
 
P
D
 
S
Y
 
F
T
 
L
I
 
L
T
 
Y
K
 
D
N
 
D
V
 
V
A
 
A
Y
 
Y
-
 
F
-
 
N
-
 
M
-
 
T
-
 
L
D
 
N
Y
 
D
I
 
I
N
 
N
F
 
W
R
 
D
A
 
I
S
 
V
K
 
E
Q
 
E
A
 
A
I
 
-
D
 
-
P
 
-
M
 
-
S
 
-
F
 
-
D
 
K
V
 
I
L
 
V
Y
 
N
F
 
F
G
 
G
T
 
S
-
 
V
L
 
I
A
 
L
Q
 
A
R
 
R
N
 
N
L
 
P
E
 
S
S
 
R
E
 
E
S
 
T
A
 
V
L
 
M
K
 
K
Q
 
V
L
 
I
L
 
K
Q
 
K
R
 
I
K
 
K
A
 
G
F
 
S
K
 
S
H
 
L
I
 
I
F
 
A
Y
 
F
D
 
D
I
 
V
N
 
N
L
 
L
R
 
R
K
 
L
D
 
D
C
 
L
F
 
W
T
 
R
A
 
G
E
 
Q
-
 
E
-
 
E
-
 
E
-
 
M
-
 
I
-
 
K
I
 
V
I
 
L
K
 
E
Q
 
E
S
 
S
L
 
I
R
 
K
A
 
L
C
 
A
T
 
D
I
 
I
F
 
V
K
 
K
L
 
A
N
 
S
D
 
E
E
 
E
E
 
E
V
 
V
R
 
-
V
 
-
V
 
-
S
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
L
Y
 
Y
Q
 
L
Q
 
E
E
 
N
L
 
Q
S
 
G
L
 
V
E
 
E
E
 
-
F
 
-
V
 
V
K
 
K
Q
 
G
A
 
S
S
 
M
K
 
-
D
 
-
N
 
-
N
 
-
I
 
-
E
 
-
L
 
L
I
 
T
L
 
A
I
 
I
T
|
T
A
 
L
G
|
G
A
 
P
E
 
K
G
 
G
C
 
F
Y
 
R
I
 
L
Y
 
I
E
 
K
K
 
N
Q
 
E
T
 
T
L
 
V
K
 
V
F
 
D
V
 
V
K
 
P
G
 
S
Y
 
Y
P
 
N
A
x
V
N
 
N
V
 
P
V
 
L
D
 
D
T
 
T
V
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
A
F
 
F
S
 
M
A
 
A
A
 
A
F
 
L
V
 
L

Sites not aligning to the query:

5eynA Crystal structure of fructokinase from vibrio cholerae o395 in fructose, adp, beryllium trifluoride and calcium ion bound form
26% identity, 94% coverage: 2:280/296 of query aligns to 3:292/306 of 5eynA

query
sites
5eynA
R
 
R
V
 
V
L
 
W
S
 
L
F
 
T
G
 
G
E
x
D
I
 
A
L
 
V
F
 
V
D
|
D
I
 
L
I
 
I
E
 
P
G
 
D
-
 
G
-
 
Q
E
 
Q
N
 
H
Y
 
Y
L
 
L
-
 
K
-
 
C
-
 
P
G
 
G
G
|
G
A
|
A
P
 
P
L
 
A
N
|
N
F
 
V
A
 
A
A
 
V
H
 
A
L
 
I
A
 
A
Q
 
R
L
 
L
G
 
S
V
 
G
E
 
R
S
 
S
Y
 
A
I
 
F
F
 
F
S
 
G
R
 
R
V
 
V
G
 
G
D
 
N
D
 
D
E
 
P
L
 
F
G
 
G
K
 
R
A
 
F
A
 
M
L
 
Q
E
 
Q
Q
 
T
I
 
L
R
 
T
K
 
D
I
 
E
R
 
Q
I
 
V
K
 
D
T
 
C
D
 
Q
F
 
H
I
 
L
Q
 
H
K
 
F
D
 
D
N
 
P
Q
 
V
H
 
H
P
 
R
T
 
T
G
 
S
T
 
T
V
 
V
P
 
V
V
 
V
E
 
D
F
 
L
K
 
D
D
 
E
-
x
H
G
 
G
Q
 
E
P
 
R
D
 
S
Y
x
F
T
 
T
I
x
F
T
 
M
K
 
V
N
 
K
V
 
P
A
 
S
Y
 
A
D
 
D
Y
 
Q
I
 
F
N
 
-
F
 
-
R
 
-
A
 
-
S
 
-
K
 
L
Q
 
Q
A
 
L
I
 
S
D
 
D
P
 
I
M
 
P
S
 
S
F
 
F
-
 
Q
-
 
K
-
 
G
D
 
E
V
 
W
L
 
L
Y
 
H
F
 
V
G
 
C
T
 
S
L
 
I
A
 
A
Q
 
L
R
 
A
N
 
N
L
 
Q
E
 
P
S
 
S
E
 
R
S
 
S
-
 
S
-
 
T
-
 
F
-
 
A
A
 
A
L
 
I
K
 
A
Q
 
Q
L
 
M
L
 
-
Q
 
-
R
 
K
K
 
E
A
 
V
F
 
G
K
 
G
H
 
Y
I
 
V
F
 
S
Y
 
F
D
 
D
I
 
P
N
 
N
L
 
L
R
|
R
K
 
E
D
 
E
C
 
V
F
 
W
T
 
S
-
 
E
-
 
P
A
 
Q
E
 
E
I
 
L
I
 
Q
K
 
A
Q
 
T
S
 
V
L
 
M
R
 
R
A
 
A
-
 
V
-
 
G
-
 
L
C
 
A
T
 
D
I
 
V
F
 
V
K
 
K
L
 
F
N
 
S
D
 
E
E
 
E
E
 
E
V
 
L
R
 
Q
V
 
F
V
 
L
S
 
T
A
 
G
L
 
-
L
 
-
Y
 
-
Q
 
-
Q
 
-
E
 
T
L
 
Q
S
 
S
L
 
I
E
 
E
E
 
E
F
 
G
V
 
L
K
 
-
Q
 
Q
A
 
A
S
 
I
K
 
A
D
 
D
N
 
F
N
 
Q
I
 
I
E
 
P
L
 
L
I
 
V
L
 
V
I
 
V
T
|
T
A
 
L
G
|
G
A
|
A
E
 
K
G
 
G
C
 
A
Y
 
L
I
 
V
Y
 
A
E
 
T
K
 
P
Q
 
N
T
 
S
L
 
Q
K
 
Q
F
 
I
V
 
V
K
 
S
G
 
G
Y
 
K
P
x
A
A
x
V
N
 
K
V
 
P
V
 
I
D
 
D
T
|
T
V
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
A
F
|
F
S
 
V
A
 
G
A
 
G
F
 
L
V
 
L
H
 
Y
H
 
R
-
 
L
-
 
S
-
 
V
-
 
A
-
 
Q
-
 
D
Y
 
W
L
 
H
R
 
N
E
 
Q
K
 
A
N
 
T
A
 
I
L
 
L
Q
 
D
A
 
A
A
 
V
D
 
K
V
 
W
S
 
A
N
|
N
R
 
G
L
 
C
G
|
G
A
|
A
F
 
L
V
 
A
A
 
T
S
 
T
S
 
Q
R
 
K
G
 
G
P
 
A
L
 
M

5yggA Crystal structure of fructokinase double-mutant (t261c-h108c) from vibrio cholerae o395 in fructose, adp and potassium ion bound form (see paper)
26% identity, 94% coverage: 2:280/296 of query aligns to 7:296/310 of 5yggA

query
sites
5yggA
R
 
R
V
 
V
L
 
W
S
 
L
F
 
T
G
 
G
E
x
D
I
 
A
L
 
V
F
 
V
D
|
D
I
 
L
I
 
I
E
 
P
G
 
D
-
 
G
-
 
Q
E
 
Q
N
 
H
Y
 
Y
L
 
L
-
 
K
-
 
C
-
 
P
G
 
G
G
|
G
A
|
A
P
 
P
L
 
A
N
 
N
F
 
V
A
 
A
A
 
V
H
 
A
L
 
I
A
 
A
Q
 
R
L
 
L
G
 
S
V
 
G
E
 
R
S
 
S
Y
 
A
I
 
F
F
 
F
S
 
G
R
 
R
V
 
V
G
 
G
D
 
N
D
 
D
E
 
P
L
 
F
G
 
G
K
 
R
A
 
F
A
 
M
L
 
Q
E
 
Q
Q
 
T
I
 
L
R
 
T
K
 
D
I
 
E
R
 
Q
I
 
V
K
 
D
T
 
C
D
 
Q
F
 
H
I
 
L
Q
 
H
K
 
F
D
 
D
N
 
P
Q
 
V
H
 
H
P
 
R
T
 
T
G
 
S
T
 
T
V
 
V
P
 
V
V
 
V
E
 
D
F
 
L
K
 
D
D
 
E
-
 
C
G
 
G
Q
 
E
P
 
R
D
 
S
Y
x
F
T
 
T
I
x
F
T
 
M
K
 
V
N
 
K
V
 
P
A
 
S
Y
 
A
D
 
D
Y
 
Q
I
 
F
N
 
-
F
 
-
R
 
-
A
 
-
S
 
-
K
 
L
Q
 
Q
A
 
L
I
 
S
D
 
D
P
 
I
M
 
P
S
 
S
F
 
F
-
 
Q
-
 
K
-
 
G
D
 
E
V
 
W
L
 
L
Y
 
H
F
 
V
G
 
C
T
 
S
L
 
I
A
 
A
Q
 
L
R
 
A
N
 
N
L
 
Q
E
 
P
S
 
S
E
 
R
S
 
S
-
 
S
-
 
T
-
 
F
-
 
A
A
 
A
L
 
I
K
 
A
Q
 
Q
L
 
M
L
 
-
Q
 
-
R
 
K
K
 
E
A
 
V
F
 
G
K
 
G
H
 
Y
I
 
V
F
 
S
Y
 
F
D
 
D
I
 
P
N
 
N
L
 
L
R
|
R
K
 
E
D
 
E
C
 
V
F
 
W
T
 
S
-
 
E
-
 
P
A
 
Q
E
 
E
I
 
L
I
 
Q
K
 
A
Q
 
T
S
 
V
L
 
M
R
 
R
A
 
A
-
 
V
-
 
G
-
 
L
C
 
A
T
 
D
I
 
V
F
 
V
K
|
K
L
 
F
N
 
S
D
 
E
E
 
E
E
 
E
V
 
L
R
 
Q
V
 
F
V
 
L
S
 
T
A
 
G
L
 
-
L
 
-
Y
 
-
Q
 
-
Q
 
-
E
 
T
L
 
Q
S
 
S
L
 
I
E
 
E
E
 
E
F
 
G
V
 
L
K
 
-
Q
 
Q
A
 
A
S
 
I
K
 
A
D
 
D
N
 
F
N
 
Q
I
 
I
E
 
P
L
 
L
I
 
V
L
 
V
I
 
V
T
|
T
A
 
L
G
|
G
A
 
A
E
 
K
G
 
G
C
 
A
Y
 
L
I
 
V
Y
 
A
E
 
T
K
 
P
Q
 
N
T
 
S
L
 
Q
K
 
Q
F
 
I
V
 
V
K
 
S
G
 
G
Y
 
K
P
x
A
A
x
V
N
 
K
V
 
P
V
 
I
D
 
D
T
 
C
V
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
|
D
S
 
A
F
|
F
S
 
V
A
 
G
A
 
G
F
 
L
V
 
L
H
 
Y
H
 
R
-
 
L
-
 
S
-
 
V
-
 
A
-
 
Q
-
 
D
Y
 
W
L
 
H
R
 
N
E
 
Q
K
 
A
N
 
T
A
 
I
L
 
L
Q
 
D
A
 
A
A
 
V
D
 
K
V
 
W
S
 
A
N
|
N
R
 
G
L
 
C
G
|
G
A
|
A
F
 
L
V
 
A
A
 
T
S
 
T
S
 
Q
R
 
K
G
 
G
P
 
A
L
 
M

4wjmA Crystal structure of fructokinase from brucella abortus 2308 with bound amppnp
26% identity, 96% coverage: 3:287/296 of query aligns to 8:312/312 of 4wjmA

query
sites
4wjmA
V
 
I
L
 
L
S
 
C
F
 
C
G
 
G
E
 
E
I
 
A
L
 
L
F
 
I
D
 
D
I
 
M
I
 
L
E
 
P
G
 
R
E
 
E
N
 
T
-
 
T
-
 
G
-
 
G
-
 
E
-
 
T
-
 
A
-
 
F
-
 
Q
-
 
P
Y
 
F
L
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
S
P
 
V
L
 
F
N
 
N
F
 
T
A
 
A
A
 
I
H
 
A
L
 
L
A
 
G
Q
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
V
E
 
P
S
 
T
Y
 
G
I
 
F
F
 
F
S
 
S
R
 
G
V
 
I
G
 
S
D
 
S
D
 
D
E
 
F
L
 
F
G
 
G
K
 
D
A
 
V
A
 
L
L
 
R
E
 
D
Q
 
T
I
 
L
R
 
A
K
 
R
I
 
S
R
 
N
I
 
V
K
 
D
T
 
Y
D
 
S
F
 
F
I
 
A
Q
 
A
K
 
I
D
 
S
N
 
N
Q
 
R
H
 
-
P
 
P
T
 
T
G
 
T
T
 
L
V
 
A
P
 
F
V
 
V
E
 
R
F
 
L
K
 
V
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
P
 
A
D
 
R
Y
 
Y
T
 
A
I
 
F
T
 
Y
K
 
D
N
 
E
V
 
N
A
 
T
Y
 
A
D
 
G
Y
 
R
I
 
M
N
 
L
F
 
S
R
 
R
A
 
N
S
 
D
K
 
M
Q
 
P
A
 
Y
I
 
V
D
 
D
P
 
E
M
 
-
S
 
T
F
 
I
D
 
S
V
 
A
L
 
M
Y
 
L
F
 
F
G
 
G
T
 
C
L
 
I
A
 
S
Q
 
L
R
 
I
N
 
S
L
 
E
E
 
P
S
 
C
E
 
G
S
 
S
A
 
V
L
 
Y
K
 
E
Q
 
T
L
 
L
L
 
L
Q
 
A
R
 
R
K
 
E
A
 
A
F
 
P
K
 
N
H
 
R
I
 
V
-
 
M
F
 
F
Y
 
L
D
 
D
I
 
P
N
 
N
L
 
I
R
 
R
K
 
A
D
 
N
C
 
L
F
 
I
T
 
T
A
 
V
E
 
R
I
 
K
-
 
T
-
 
H
-
 
L
-
 
T
-
 
R
I
 
M
K
 
K
Q
 
R
S
 
M
L
 
I
R
 
A
A
 
L
C
 
A
T
 
D
I
 
I
F
 
V
K
 
K
L
 
L
N
 
S
D
 
D
E
 
E
E
 
D
V
 
L
R
 
D
V
 
W
V
 
F
S
 
G
A
 
E
L
 
K
L
 
G
Y
 
S
Q
 
H
Q
 
D
E
 
E
L
 
I
S
 
A
L
 
-
E
 
A
E
 
E
F
 
W
V
 
L
K
 
K
Q
 
L
A
 
G
S
 
P
K
 
K
D
 
-
N
 
-
N
 
-
I
 
-
E
 
-
L
 
L
I
 
V
L
 
V
I
 
I
T
|
T
A
 
K
G
|
G
A
|
A
E
 
H
G
|
G
C
 
A
Y
 
V
I
 
A
Y
 
Y
E
 
T
K
 
N
Q
 
H
T
 
A
L
 
T
K
 
V
F
 
P
V
 
V
K
 
P
G
 
G
Y
 
V
P
 
K
A
 
V
N
 
D
V
 
V
V
 
V
D
 
D
T
 
T
V
 
V
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
T
F
x
V
S
 
N
A
 
A
A
 
G
F
 
I
V
 
L
-
 
A
-
 
S
-
 
L
-
 
H
H
 
S
H
 
Q
Y
 
G
L
 
L
R
 
L
E
 
T
K
 
K
N
 
D
A
 
A
L
 
L
-
 
A
-
 
N
-
 
L
-
 
S
-
 
E
-
 
D
-
 
Q
-
 
I
-
 
H
Q
 
S
A
 
A
A
 
V
D
 
A
V
 
L
S
 
G
N
x
V
R
 
R
L
 
A
G
x
A
A
 
A
F
 
V
V
 
T
A
 
V
S
 
S
S
 
R
R
 
A
G
 
G
P
 
A
L
 
N
P
 
P
T
 
P
Y
 
W
S
 
A
S
 
H
E
 
E
I
 
M

3in1A Crystal structure of a putative ribokinase in complex with adp from e.Coli
25% identity, 87% coverage: 21:278/296 of query aligns to 39:293/312 of 3in1A

query
sites
3in1A
G
 
G
G
 
G
A
 
D
P
 
A
L
 
I
N
 
N
F
 
E
A
 
A
A
 
T
H
 
I
L
 
I
A
 
S
Q
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
H
E
 
R
S
 
T
Y
 
A
I
 
L
F
 
M
S
 
S
R
 
R
V
 
I
G
 
G
D
 
K
D
 
D
E
 
A
L
 
A
G
 
G
K
 
Q
A
 
F
A
 
I
L
 
L
E
 
D
Q
 
H
I
 
C
R
 
R
K
 
K
I
 
E
R
 
N
I
 
I
K
 
D
T
 
I
D
 
Q
F
 
S
I
 
L
Q
 
K
K
 
Q
D
 
D
N
 
V
Q
 
S
H
 
I
P
 
D
T
 
T
G
 
S
-
 
I
T
 
N
V
 
V
P
 
G
V
 
L
E
 
V
F
 
T
K
 
E
D
 
D
G
 
G
Q
 
E
P
x
R
D
 
T
Y
 
F
T
 
V
I
 
T
T
 
N
K
 
R
N
 
N
V
 
G
A
 
S
Y
 
L
D
 
W
Y
 
K
I
 
L
N
 
N
F
 
I
R
 
-
A
 
-
S
 
-
K
 
-
Q
 
-
A
 
-
I
 
-
D
 
-
P
 
-
M
 
-
S
 
-
F
 
-
D
 
D
V
 
D
L
 
V
Y
 
D
F
 
F
G
 
A
T
 
R
L
 
F
A
 
S
Q
 
Q
R
 
A
N
 
K
L
 
L
E
 
L
S
 
S
E
 
L
S
 
A
A
 
S
L
 
I
-
 
F
-
 
N
K
 
S
Q
 
P
L
 
L
L
 
L
Q
 
D
R
 
G
K
 
K
A
 
A
F
 
L
K
 
T
H
 
E
I
 
I
F
 
F
Y
 
T
D
 
Q
I
 
A
N
 
K
L
 
A
R
 
R
K
 
Q
D
 
M
C
 
I
F
 
I
T
 
C
A
 
A
E
 
D
I
 
M
I
 
I
K
 
K
Q
 
P
S
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
C
 
-
T
 
-
I
 
-
F
 
-
K
 
R
L
 
L
N
 
N
D
 
E
E
 
T
E
 
L
V
 
D
R
 
D
V
 
I
V
 
C
S
 
E
A
 
A
L
 
L
L
 
S
Y
 
Y
Q
 
V
Q
 
D
E
 
Y
L
 
L
-
 
F
-
 
P
-
x
N
-
 
F
-
 
A
-
 
E
-
 
A
-
 
K
-
 
L
-
 
L
-
 
T
-
 
G
-
 
K
-
 
E
S
 
T
L
 
L
E
 
D
E
 
E
F
 
-
V
 
I
K
 
A
Q
 
D
A
 
C
S
 
F
K
 
L
D
 
A
N
 
C
N
 
G
I
 
V
E
 
K
L
 
T
I
 
V
L
 
V
I
 
I
T
x
K
A
 
T
G
|
G
A
 
K
E
 
D
G
|
G
C
 
C
Y
 
F
I
 
I
Y
 
K
E
 
R
-
 
G
K
 
D
Q
 
M
T
 
T
L
 
M
K
 
K
F
 
V
V
 
P
K
x
A
G
 
V
Y
 
A
P
 
G
A
 
I
N
 
T
V
 
A
V
 
I
D
 
D
T
|
T
V
 
I
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
N
F
 
F
S
 
A
A
 
S
A
 
G
F
 
F
V
 
I
H
 
A
H
 
A
Y
 
L
L
 
L
R
 
E
E
 
G
K
 
K
N
 
N
A
 
L
L
 
R
Q
 
E
A
 
C
A
 
A
D
 
R
V
 
F
S
 
A
N
|
N
R
 
A
L
 
T
G
x
A
A
 
A
F
 
I
V
 
S
A
 
V
S
 
L
S
 
S
R
 
V
G
 
G

Q8ZKR2 Aminoimidazole riboside kinase; AIRs kinase; EC 2.7.1.223 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
23% identity, 94% coverage: 2:280/296 of query aligns to 6:294/319 of Q8ZKR2

query
sites
Q8ZKR2
R
 
K
V
 
V
L
 
W
S
 
V
F
 
I
G
 
G
E
 
D
I
 
A
L
 
S
F
 
V
D
|
D
I
 
L
I
 
V
-
 
P
E
 
E
G
 
K
E
 
Q
N
 
N
-
 
S
Y
 
Y
L
 
L
-
 
K
-
 
C
-
 
P
G
 
G
G
|
G
A
 
A
P
 
S
L
 
A
N
 
N
F
 
V
A
 
G
A
 
V
H
 
C
L
 
V
A
 
A
Q
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
G
E
 
E
S
 
C
Y
 
G
I
 
F
F
 
I
S
 
G
R
 
C
V
 
L
G
 
G
D
 
D
D
 
D
E
 
D
L
 
A
G
 
G
K
 
R
A
 
F
A
 
L
L
 
R
E
 
Q
Q
 
V
I
 
F
R
 
Q
K
 
D
I
 
N
R
 
G
I
 
V
K
 
D
T
 
V
D
 
T
F
 
F
I
 
L
Q
 
R
K
 
L
D
 
D
N
 
A
Q
 
D
H
 
L
P
 
T
T
 
S
G
 
A
T
 
V
V
 
L
P
 
I
V
 
V
E
 
N
F
 
L
K
 
T
-
 
A
D
 
D
G
 
G
Q
 
E
P
 
R
D
 
S
Y
 
F
T
 
T
I
x
Y
T
 
L
K
 
V
N
 
H
V
 
P
A
 
G
Y
 
A
D
 
D
-
 
T
Y
 
Y
I
 
V
N
 
-
F
 
-
R
 
-
A
 
-
S
 
S
K
 
P
Q
 
Q
A
 
D
I
 
L
D
 
P
P
 
P
M
 
F
-
 
R
S
 
Q
F
 
Y
D
 
E
V
 
W
L
 
F
Y
 
Y
F
 
F
G
 
S
T
 
S
L
 
I
A
 
G
Q
 
L
R
 
T
N
 
D
L
 
R
E
 
P
S
 
A
E
 
R
S
 
E
A
 
A
L
 
C
K
 
L
Q
 
E
L
 
G
L
 
A
Q
 
R
-
 
R
-
 
M
R
 
R
K
 
E
A
 
A
F
 
G
K
 
G
H
 
Y
I
 
V
F
 
L
Y
 
F
D
 
D
I
 
V
N
 
N
L
 
L
R
|
R
K
 
S
D
 
K
C
 
M
F
 
W
-
 
G
-
 
N
-
 
T
-
 
D
-
 
E
T
 
I
A
 
P
E
 
E
I
 
L
I
 
I
K
 
A
Q
 
R
S
 
S
L
x
A
R
x
A
A
 
L
C
x
A
T
 
S
I
 
I
F
 
C
K
 
K
L
 
V
N
 
S
D
 
A
E
 
D
E
 
E
V
 
L
R
 
C
V
 
Q
V
 
L
S
 
S
A
 
G
L
 
A
L
 
S
Y
 
H
Q
 
W
Q
 
Q
E
 
D
L
 
-
S
 
-
L
 
-
E
 
-
E
 
-
F
 
-
V
 
A
K
 
R
Q
 
Y
A
 
Y
S
 
L
K
 
R
D
 
D
N
 
L
N
x
G
I
 
C
E
 
D
L
 
T
I
 
T
L
 
I
I
 
I
T
 
S
A
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
D
G
 
G
C
 
A
Y
 
L
I
 
L
Y
 
I
E
 
T
K
 
A
Q
 
E
T
 
G
L
 
E
K
 
F
F
 
H
V
 
F
K
 
P
G
 
A
Y
 
P
P
 
R
A
 
V
N
 
D
V
 
V
V
 
V
D
|
D
T
 
T
V
x
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
|
D
S
 
A
F
 
F
S
 
V
A
 
G
A
 
G
F
 
L
V
 
L
H
 
F
H
 
T
Y
 
L
L
 
S
R
 
R
E
 
A
K
 
N
-
 
C
-
 
W
-
 
D
N
 
H
A
 
A
L
 
L
Q
 
L
A
 
A
A
 
E
D
 
A
V
 
I
S
 
S
-
 
N
-
 
A
N
 
N
R
 
A
L
 
C
G
 
G
A
 
A
F
 
M
V
x
A
A
 
V
S
 
T
S
x
A
R
 
K
G
|
G
P
 
A
L
 
M

2afbA Crystal structure of 2-dehydro-3- deoxygluconokinase (ec 2.7.1.45) (tm0067) from thermotoga maritima at 2.05 a resolution (see paper)
24% identity, 86% coverage: 1:254/296 of query aligns to 6:289/329 of 2afbA

query
sites
2afbA
M
 
M
R
 
K
V
 
V
L
 
V
S
 
T
F
 
F
G
 
G
E
 
E
I
 
I
L
 
M
F
 
L
D
 
R
-
 
L
-
 
S
-
 
P
-
 
P
-
 
D
-
 
H
-
 
K
-
 
R
I
 
I
I
 
F
E
 
Q
G
 
T
E
 
D
N
 
S
Y
 
F
-
 
D
-
 
V
-
 
T
L
 
Y
G
 
G
G
 
G
A
 
A
P
 
E
L
 
A
N
 
N
F
 
V
A
 
A
A
 
A
H
 
F
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
L
 
M
G
 
G
V
 
L
E
 
D
S
 
A
Y
 
Y
I
 
F
F
 
V
S
 
T
R
 
K
V
 
L
G
 
P
D
 
N
D
 
N
E
 
P
L
 
L
G
 
G
K
 
D
A
 
A
A
 
A
L
 
A
E
 
G
Q
 
H
I
 
L
R
 
R
K
 
K
I
 
F
R
 
G
I
 
V
K
 
K
T
 
T
D
 
D
F
 
Y
I
 
I
Q
 
A
K
 
R
D
 
G
N
 
G
Q
 
N
H
 
R
P
 
-
T
 
I
G
 
G
T
 
I
V
 
Y
P
 
F
V
 
L
E
 
E
F
 
I
K
 
G
D
 
A
G
 
S
Q
 
Q
P
 
R
D
 
P
Y
 
S
T
 
K
I
 
V
T
 
V
K
 
Y
N
 
D
V
 
R
A
 
A
Y
 
H
D
 
S
Y
 
A
I
 
I
N
 
S
F
 
-
R
 
E
A
 
A
S
 
K
K
 
R
Q
 
E
A
 
D
I
 
F
D
 
D
P
 
W
M
 
E
S
 
K
F
 
I
-
 
L
-
 
D
-
 
G
-
 
A
D
 
R
V
 
W
L
 
F
Y
 
H
F
 
F
G
 
S
T
 
G
L
 
I
A
 
T
-
 
P
-
 
P
-
 
L
-
 
G
-
 
K
Q
 
E
R
 
L
N
 
P
L
 
L
E
 
I
S
 
L
E
 
E
S
 
D
A
 
A
L
 
L
K
 
K
Q
 
V
L
 
A
L
 
N
Q
 
E
R
 
K
K
 
G
A
 
V
F
 
T
K
 
-
H
 
-
I
 
V
F
 
S
Y
 
C
D
 
D
I
 
L
N
 
N
L
 
Y
R
 
R
K
 
A
D
 
R
C
 
L
F
 
W
T
 
T
A
 
K
E
 
E
-
 
E
-
 
A
-
 
Q
-
 
K
I
 
V
I
 
M
K
 
I
Q
 
P
S
 
F
L
 
M
R
 
E
A
 
Y
C
 
V
T
 
D
I
 
V
F
 
L
K
 
I
L
 
A
N
 
N
D
 
E
E
 
E
E
 
D
V
 
I
R
 
E
V
 
K
V
 
V
S
 
L
A
 
G
L
 
I
L
 
S
Y
 
V
Q
 
E
Q
 
G
E
 
-
L
 
L
S
 
N
L
 
R
E
 
E
E
 
A
F
 
Y
V
 
A
K
 
K
-
 
I
-
 
A
-
 
E
Q
 
E
A
 
V
S
 
T
K
 
R
D
 
K
N
 
Y
N
 
N
I
 
F
E
 
K
L
 
T
I
 
V
L
 
G
I
 
I
-
 
T
-
 
L
-
 
R
-
 
E
-
 
S
-
 
I
-
 
S
-
 
A
T
 
T
A
 
V
G
 
N
A
 
Y
E
 
W
G
 
S
C
 
V
Y
 
M
I
 
V
Y
 
F
E
 
E
K
 
N
Q
 
G
T
 
Q
L
 
P
K
 
H
F
 
F
V
 
S
K
 
N
G
 
R
Y
 
Y
P
 
E
A
 
I
N
 
H
V
 
I
V
 
V
D
 
D
T
 
R
V
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
 
D
S
 
S
F
 
F
S
 
A
A
 
G
A
 
A
F
 
L
V
 
I
H
 
Y
H
 
G
Y
 
S
L
 
L

Sites not aligning to the query:

3iq0B Crystal structure of a putative ribokinase ii in complex with atp and mg+2 from e.Coli
24% identity, 94% coverage: 2:280/296 of query aligns to 3:292/308 of 3iq0B

query
sites
3iq0B
R
 
K
V
 
V
L
 
F
S
 
T
F
 
I
G
 
G
E
 
E
I
 
I
L
 
L
F
 
V
D
 
E
I
 
I
-
 
M
-
 
A
-
 
S
-
 
K
-
 
I
-
 
G
-
 
Q
-
 
P
-
 
F
-
 
D
-
 
Q
-
 
P
-
 
G
I
 
I
E
 
W
G
 
N
E
 
G
N
 
P
Y
 
Y
L
 
P
G
 
S
G
 
G
A
 
A
P
 
P
L
 
A
N
 
I
F
 
F
A
 
I
A
 
D
H
 
Q
L
 
V
A
 
T
Q
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
V
E
 
P
S
 
C
Y
 
G
I
 
I
F
 
I
S
 
S
R
 
C
V
 
V
G
 
G
D
 
N
D
 
D
E
 
G
L
 
F
G
 
G
K
 
D
A
 
I
A
 
N
L
 
I
E
 
H
Q
 
R
I
 
L
R
 
A
K
 
A
I
 
D
R
 
G
I
 
V
K
 
D
T
 
I
D
 
R
F
 
G
I
 
I
Q
 
S
K
 
V
D
 
L
N
 
P
Q
 
L
H
 
E
P
 
A
T
 
T
G
 
G
T
 
S
V
 
A
P
 
F
V
 
V
E
 
T
F
 
Y
K
 
G
D
 
D
G
 
R
Q
 
D
P
 
F
D
 
I
Y
 
F
T
 
N
I
 
I
T
 
-
K
 
K
N
 
N
V
 
A
A
 
A
Y
 
C
D
 
G
Y
 
-
I
 
-
N
 
-
F
 
-
R
 
K
A
 
L
S
 
S
K
 
A
Q
 
Q
A
 
H
I
 
V
D
 
D
P
 
E
M
 
N
S
 
I
F
 
L
-
 
K
D
 
D
V
 
C
L
 
T
Y
 
H
F
 
F
G
 
H
T
 
I
L
 
M
A
 
G
Q
 
S
R
 
S
-
 
L
-
 
F
N
 
S
L
 
F
E
 
H
S
 
M
E
 
V
S
 
D
A
 
A
L
 
V
K
 
K
Q
 
K
L
 
A
L
 
V
Q
 
T
-
 
I
-
 
V
R
 
K
K
 
A
A
 
N
F
 
G
K
 
G
H
 
V
I
 
I
F
 
S
Y
 
F
D
 
D
I
 
P
N
 
N
L
 
I
R
 
R
K
 
K
D
 
E
C
 
M
F
 
L
T
 
D
A
 
I
E
 
P
I
 
E
I
 
M
K
 
R
Q
 
D
S
 
A
L
 
L
R
 
H
A
 
-
C
 
-
T
 
F
I
 
V
F
 
L
K
 
E
L
 
L
N
 
T
D
 
D
E
 
I
E
 
Y
V
 
M
R
 
P
V
x
S
V
 
E
S
 
G
A
 
E
L
 
V
L
 
L
Y
 
L
Q
 
L
Q
 
S
E
 
P
L
 
H
S
 
S
L
 
T
E
 
P
E
 
E
F
 
R
V
 
A
K
 
I
Q
 
A
A
 
G
S
 
F
K
 
L
D
 
E
N
 
E
N
 
G
I
 
V
E
 
K
L
 
E
I
 
V
L
 
I
I
 
V
T
x
K
A
 
R
G
|
G
A
 
N
E
 
Q
G
 
G
C
 
A
Y
 
S
I
 
Y
Y
 
Y
E
 
S
K
 
A
Q
 
N
T
 
E
L
 
Q
K
 
F
F
 
H
V
 
V
K
 
E
G
 
S
Y
 
Y
P
 
P
A
 
V
N
 
E
V
x
E
V
 
V
D
 
D
T
 
P
V
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
C
F
|
F
S
 
G
A
 
G
A
 
A
F
 
W
V
 
I
H
 
A
H
 
C
Y
 
R
L
 
Q
R
 
L
E
 
G
K
 
F
N
 
D
A
 
A
L
 
H
Q
 
R
A
 
A
A
 
L
D
 
Q
V
 
Y
S
 
A
N
|
N
R
 
A
L
 
C
G
|
G
A
 
A
F
 
L
V
 
A
A
 
V
S
 
T
S
 
R
R
 
R
G
 
G
P
 
P
L
 
M

7fcaD Pfkb(mycobacterium marinum) (see paper)
25% identity, 88% coverage: 2:262/296 of query aligns to 3:248/282 of 7fcaD

query
sites
7fcaD
R
 
R
V
 
G
L
 
L
S
 
V
F
 
I
G
 
G
E
 
E
I
 
A
L
 
L
F
 
I
D
 
D
I
 
I
I
 
V
E
 
D
G
 
G
E
 
P
N
 
D
-
 
P
-
 
A
-
 
E
Y
 
Y
L
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
S
P
 
P
L
 
L
N
 
N
F
 
V
A
 
A
A
 
V
H
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
R
E
 
D
S
 
V
Y
 
D
I
 
L
F
 
L
S
 
T
R
 
H
V
 
I
G
 
G
D
x
R
D
 
D
E
 
A
L
 
R
G
 
G
K
 
R
A
 
R
A
 
I
L
 
A
E
 
E
Q
 
Y
I
 
I
R
 
E
K
 
S
I
 
S
R
 
G
I
 
V
K
 
Q
-
 
L
T
 
V
D
x
S
F
x
G
I
 
S
Q
 
Q
K
 
T
D
 
A
N
 
D
Q
 
R
H
 
T
P
 
P
T
 
T
G
 
A
T
 
T
V
 
A
P
 
-
V
 
-
E
 
-
F
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
Q
 
-
P
 
-
D
 
-
Y
 
-
T
 
-
I
 
-
T
 
-
K
 
R
N
 
T
V
 
Y
A
 
A
Y
 
F
D
 
D
Y
 
L
-
 
E
I
 
W
N
 
Q
F
 
I
R
 
P
A
 
D
S
 
T
K
 
P
Q
 
P
A
 
V
I
 
A
D
 
P
P
 
P
M
 
L
S
 
-
F
 
-
D
 
-
V
 
L
L
 
V
Y
 
H
F
 
T
G
 
G
T
 
S
L
 
I
A
 
A
Q
 
A
R
 
A
N
 
R
L
 
E
E
 
P
S
 
G
E
 
C
S
 
L
A
 
A
L
 
V
K
 
A
Q
 
A
L
 
L
L
 
L
Q
 
D
R
 
A
-
 
Y
K
 
R
A
 
A
F
 
A
K
 
A
H
 
T
I
 
V
F
 
S
Y
 
F
D
 
D
I
 
P
N
 
N
L
 
V
R
 
R
K
 
P
D
 
S
C
 
L
-
 
S
-
 
A
-
 
D
-
 
P
-
 
D
F
 
L
T
 
T
A
 
R
E
 
R
I
 
R
I
 
I
K
 
Q
Q
 
R
S
 
L
L
 
V
R
 
E
A
 
R
C
 
S
T
 
D
I
 
I
F
 
I
K
 
K
L
 
A
N
 
S
D
 
A
E
 
E
E
 
D
V
 
-
R
 
-
V
 
-
V
 
-
S
 
-
A
 
-
L
 
L
L
 
H
Y
 
W
Q
 
I
Q
 
D
E
 
P
L
 
T
S
 
Q
L
 
P
E
 
P
E
 
E
F
 
Q
V
 
T
K
 
A
Q
 
R
A
 
A
S
 
W
K
 
L
D
 
A
N
 
C
N
 
G
I
 
P
E
 
A
L
 
I
I
 
V
L
 
A
I
 
L
T
 
T
A
 
L
G
 
G
A
 
D
E
 
Q
G
 
G
C
 
A
Y
 
V
I
 
A
Y
 
F
E
 
C
K
 
A
Q
 
A
T
 
G
L
 
P
K
 
A
F
 
S
V
 
V
K
 
P
G
 
A
Y
 
Q
P
 
P
A
 
-
N
 
-
V
 
V
V
 
V
D
 
D
T
 
T
V
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
 
D
S
 
A
F
 
F
S
 
M
A
 
A
A
 
G
F
 
L
V
 
L
H
 
-
H
 
D
Y
 
T
L
 
L
R
 
W
E
 
E
K
 
Q
N
 
G
A
 
L
L
 
L
Q
 
G
A
 
A

2dcnA Crystal structure of 2-keto-3-deoxygluconate kinase from sulfolobus tokodaii complexed with 2-keto-6-phosphogluconate (alpha-furanose form)
23% identity, 90% coverage: 17:282/296 of query aligns to 28:297/308 of 2dcnA

query
sites
2dcnA
E
 
E
N
 
K
Y
 
H
L
 
V
G
 
A
G
|
G
A
 
S
P
 
E
L
 
A
N
 
N
F
 
Y
A
 
C
A
 
V
H
 
A
L
 
F
A
 
I
Q
 
K
L
 
Q
G
 
G
V
 
N
E
 
E
S
 
C
Y
 
G
I
 
I
F
 
I
S
 
A
R
 
K
V
 
V
G
 
G
D
 
D
D
 
D
E
 
E
L
 
F
G
 
G
K
 
Y
A
 
N
A
 
A
L
 
I
E
 
E
Q
 
W
I
 
L
R
 
R
K
 
G
I
 
Q
R
 
G
I
 
V
K
 
D
T
 
V
D
 
S
F
 
H
I
 
M
Q
 
K
K
 
I
D
 
D
N
 
P
Q
 
S
H
 
A
P
 
P
T
 
T
G
 
G
T
 
I
V
x
F
P
 
F
V
 
I
E
 
-
F
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
Q
 
Q
P
 
R
D
 
H
Y
 
Y
T
 
P
I
 
V
T
 
P
K
 
L
N
 
K
V
 
S
A
 
E
Y
 
S
D
 
I
Y
|
Y
I
 
Y
N
x
R
F
 
K
R
 
G
A
 
S
S
 
A
K
 
G
Q
 
S
A
 
K
I
 
L
D
 
S
P
 
P
M
 
E
S
 
D
F
 
V
D
 
D
V
 
E
L
 
E
Y
 
Y
F
 
V
G
 
K
-
 
S
-
 
A
-
 
D
-
 
L
-
 
V
-
 
H
-
 
S
-
 
S
-
 
G
-
x
I
T
 
T
L
 
L
A
 
A
Q
 
I
R
 
S
N
 
S
L
 
T
E
 
A
S
 
K
E
 
E
S
 
A
A
 
V
L
 
Y
K
 
K
-
 
A
-
 
F
Q
 
E
L
 
I
L
 
A
Q
 
S
R
 
N
K
 
R
A
 
S
F
 
F
K
 
-
H
 
-
I
 
-
F
 
-
Y
 
-
D
 
D
I
 
T
N
 
N
L
 
I
R
|
R
K
 
L
D
 
K
C
 
L
F
 
W
T
 
S
A
 
A
E
 
E
I
 
E
I
 
A
K
 
K
Q
 
R
S
 
E
-
 
I
L
 
L
R
 
K
A
 
L
C
 
L
T
 
S
I
 
K
F
 
F
K
 
H
L
 
L
N
 
K
D
 
F
E
 
L
E
 
I
V
 
T
R
x
D
V
 
T
V
 
D
S
 
D
A
 
S
L
 
K
L
 
I
Y
 
I
Q
 
L
Q
 
G
E
 
E
L
 
S
S
 
D
L
 
P
E
 
D
E
 
K
F
 
A
V
 
A
K
 
K
Q
 
A
A
 
F
S
 
S
K
 
-
D
 
-
N
 
D
N
 
Y
I
 
A
E
 
E
L
 
I
I
 
I
L
 
V
I
 
M
T
x
K
A
 
L
G
|
G
A
x
P
E
 
K
G
|
G
C
 
A
Y
 
I
I
 
V
Y
 
Y
E
 
Y
K
 
D
Q
 
G
T
 
K
L
 
K
K
 
Y
F
 
Y
V
 
S
K
 
S
G
 
G
Y
 
Y
P
 
Q
A
 
V
N
 
P
V
|
V
V
 
E
D
 
D
T
 
V
V
x
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
A
F
 
L
S
 
G
A
 
G
A
 
T
F
 
F
V
 
L
H
 
S
H
 
L
Y
 
Y
L
 
Y
R
 
K
-
 
G
-
 
F
-
 
E
E
 
M
K
 
E
N
 
K
A
 
A
L
 
L
Q
 
D
A
 
Y
A
 
A
D
x
I
V
 
V
S
 
A
N
x
S
R
 
T
L
 
L
G
 
N
A
x
V
F
 
M
V
 
I
A
 
R
S
 
G
S
x
D
R
 
Q
G
 
E
P
 
N
L
 
L
P
 
P
T
 
T

5byfA Crystal structure of human ribokinase in complex with amp
26% identity, 90% coverage: 21:285/296 of query aligns to 40:298/313 of 5byfA

query
sites
5byfA
G
 
G
G
 
G
A
 
K
P
 
G
L
 
A
N
 
N
F
 
Q
A
 
C
A
 
V
H
 
Q
L
 
A
A
 
A
Q
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
A
E
 
M
S
 
T
Y
 
S
I
 
M
F
 
V
S
 
C
R
 
K
V
 
V
G
 
G
D
 
K
D
 
D
E
 
S
L
 
F
G
 
G
K
 
N
A
 
D
A
 
Y
L
 
I
E
 
E
Q
 
N
I
 
L
R
 
K
K
 
Q
I
 
N
R
 
D
I
 
I
K
 
S
T
 
T
D
 
E
F
 
F
I
 
T
Q
 
Y
K
 
Q
D
 
T
N
 
K
Q
 
D
H
 
A
P
 
A
T
 
T
G
 
G
T
 
T
V
 
A
P
 
S
V
 
I
E
 
I
F
 
V
K
 
N
D
 
N
-
 
E
G
 
G
Q
 
Q
P
 
N
D
 
I
Y
 
I
T
 
V
I
 
I
T
 
V
-
 
A
-
 
G
K
 
A
N
 
N
V
 
L
A
 
L
Y
 
L
D
 
N
Y
 
T
I
 
E
N
 
D
F
 
L
R
 
R
A
 
A
S
 
A
K
 
A
Q
 
N
A
 
V
I
 
I
D
 
S
P
 
R
M
 
A
S
 
K
F
 
V
D
 
M
V
 
V
L
 
C
Y
 
Q
F
 
L
G
 
E
T
 
I
L
 
T
A
 
P
Q
 
A
R
 
T
N
 
S
L
 
L
E
 
E
S
 
A
E
 
L
S
 
T
A
 
-
L
 
-
K
 
-
Q
 
-
L
 
M
L
 
A
Q
 
R
R
 
R
K
 
S
A
 
G
F
 
V
K
 
K
H
 
T
I
 
L
F
 
F
Y
 
-
D
 
-
I
 
-
N
 
-
L
 
-
R
 
N
K
 
P
D
 
A
C
 
P
F
 
A
T
 
I
A
 
A
E
 
D
I
 
L
I
 
D
K
 
P
Q
 
Q
S
 
F
L
 
Y
R
 
T
A
 
L
C
 
S
T
 
D
I
 
V
F
 
F
K
 
C
L
 
C
N
 
N
D
 
E
E
 
S
E
 
E
V
 
A
R
 
E
V
 
I
V
 
L
S
 
T
A
 
G
L
 
L
L
 
T
Y
 
V
Q
 
G
Q
 
S
E
 
A
L
 
A
S
 
D
L
 
A
E
 
G
E
 
E
F
 
A
V
 
A
K
 
L
Q
 
V
A
 
L
S
 
L
K
 
K
D
 
-
N
 
R
N
 
G
I
 
C
E
 
Q
L
 
V
I
 
V
L
 
I
I
 
I
T
|
T
A
 
L
G
|
G
A
|
A
E
 
E
G
|
G
C
 
C
Y
 
V
I
 
V
Y
 
L
E
 
-
K
 
S
Q
 
Q
T
 
T
L
 
E
K
 
P
F
 
E
V
 
P
K
 
K
G
 
H
Y
 
I
P
 
P
A
 
T
-
 
E
-
 
K
-
 
V
N
 
K
V
 
A
V
 
V
D
 
D
T
 
T
V
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
S
F
 
F
S
 
V
A
 
G
A
 
A
F
 
L
V
 
A
H
 
-
H
 
F
Y
 
Y
L
 
L
R
 
A
E
 
Y
K
 
Y
N
 
P
A
 
N
L
 
L
Q
 
S
A
 
L
A
 
E
D
 
D
V
 
M
S
 
L
N
 
N
R
 
R
L
 
S
G
x
N
A
 
F
F
 
I
V
x
A
A
 
A
S
 
V
S
 
S
R
 
V
G
 
Q
P
 
A
L
 
A
P
 
G
T
 
T
Y
 
Q
S
 
S
S
 
S

6wjzA Crystal structure of human ribokinase in complex with ampcp
25% identity, 93% coverage: 12:285/296 of query aligns to 27:297/315 of 6wjzA

query
sites
6wjzA
D
 
E
I
 
T
I
 
I
E
 
H
G
 
G
E
 
H
N
 
K
Y
 
F
L
 
F
-
 
I
-
 
G
-
 
F
G
 
G
G
 
G
A
 
K
P
 
G
L
 
A
N
 
N
F
 
Q
A
 
C
A
 
V
H
 
Q
L
 
A
A
 
A
Q
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
A
E
 
M
S
 
T
Y
 
S
I
 
M
F
 
V
S
 
C
R
 
K
V
 
V
G
 
G
D
 
K
D
 
D
E
 
S
L
 
F
G
 
G
K
 
N
A
 
D
A
 
Y
L
 
I
E
 
E
Q
 
N
I
 
L
R
 
K
K
 
Q
I
 
N
R
 
D
I
 
I
K
 
S
T
 
T
D
 
E
F
 
F
I
 
T
Q
 
Y
K
 
Q
D
 
T
N
 
K
Q
 
D
H
 
A
P
 
A
T
 
T
G
 
G
T
 
T
V
 
A
P
 
S
V
 
I
E
 
I
F
 
V
K
 
N
D
 
N
-
 
E
G
 
G
Q
 
Q
P
 
N
D
 
I
Y
 
I
T
 
V
I
 
I
T
 
V
-
 
A
-
 
G
K
 
A
N
 
N
V
 
L
A
 
L
Y
 
L
D
 
N
Y
 
T
I
 
E
N
 
D
F
 
L
R
 
R
A
 
A
S
 
A
K
 
A
Q
 
N
A
 
V
I
 
I
D
 
S
P
 
R
M
 
A
S
 
K
F
 
V
D
 
M
V
 
V
L
 
C
Y
 
Q
F
 
L
G
 
E
T
 
I
L
 
T
A
 
P
Q
 
A
R
 
T
N
 
S
L
 
L
E
 
E
S
 
A
E
 
L
S
 
T
A
 
-
L
 
-
K
 
-
Q
 
-
L
 
M
L
 
A
Q
 
R
R
 
R
K
 
S
A
 
G
F
 
V
K
 
K
H
 
T
I
 
L
F
 
F
Y
 
-
D
 
-
I
 
-
N
 
-
L
 
-
R
 
N
K
 
P
D
 
A
C
 
P
F
 
A
T
 
I
A
 
A
E
 
D
I
 
L
I
 
D
K
 
P
Q
 
Q
S
 
F
L
 
Y
R
 
T
A
 
L
C
 
S
T
 
D
I
 
V
F
 
F
K
 
C
L
 
C
N
|
N
D
 
E
E
 
S
E
 
E
V
 
A
R
 
E
V
 
I
V
 
L
S
 
T
A
 
G
L
 
L
L
 
T
Y
 
V
Q
 
G
Q
 
S
E
 
A
L
 
A
S
 
D
L
 
A
E
 
G
E
 
E
F
 
A
V
 
A
K
 
L
Q
 
V
A
 
L
S
 
L
K
 
K
D
 
-
N
 
R
N
 
G
I
 
C
E
 
Q
L
 
V
I
 
V
L
 
I
I
 
I
T
|
T
A
 
L
G
|
G
A
|
A
E
 
E
G
|
G
C
 
C
Y
 
V
I
 
V
Y
 
L
E
 
-
K
 
S
Q
 
Q
T
 
T
L
 
E
K
 
P
F
 
E
V
 
P
K
 
K
G
 
H
Y
 
I
P
 
P
A
x
T
-
 
E
-
 
K
-
x
V
N
 
K
V
 
A
V
 
V
D
 
D
T
 
T
V
 
T
G
 
G
A
|
A
G
|
G
D
 
D
S
 
S
F
 
F
S
 
V
A
 
G
A
 
A
F
 
L
V
 
A
H
 
-
H
 
F
Y
 
Y
L
 
L
R
 
A
E
 
Y
K
 
Y
N
 
P
A
 
N
L
 
L
Q
 
S
A
 
L
A
 
E
D
 
D
V
 
M
S
 
L
N
 
N
R
 
R
L
 
S
G
x
N
A
 
F
F
 
I
V
x
A
A
|
A
S
 
V
S
 
S
R
x
V
G
 
Q
P
 
A
L
 
A
P
 
G
T
 
T
Y
 
Q
S
 
S
S
 
S

6wk0B Crystal structure of human ribokinase in complex with amppcp and ribose
26% identity, 90% coverage: 21:285/296 of query aligns to 39:297/311 of 6wk0B

query
sites
6wk0B
G
 
G
G
|
G
A
x
K
P
 
G
L
 
A
N
|
N
F
 
Q
A
 
C
A
 
V
H
 
Q
L
 
A
A
 
A
Q
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
A
E
 
M
S
 
T
Y
 
S
I
 
M
F
 
V
S
 
C
R
 
K
V
 
V
G
 
G
D
 
K
D
 
D
E
 
S
L
 
F
G
 
G
K
 
N
A
 
D
A
 
Y
L
 
I
E
 
E
Q
 
N
I
 
L
R
 
K
K
 
Q
I
 
N
R
 
D
I
 
I
K
 
S
T
 
T
D
 
E
F
 
F
I
 
T
Q
 
Y
K
 
Q
D
 
T
N
 
K
Q
 
D
H
 
A
P
 
A
T
 
T
G
 
G
T
 
T
V
x
A
P
 
S
V
 
I
E
 
I
F
 
V
K
 
N
D
 
N
-
 
E
G
 
G
Q
 
Q
P
 
N
D
 
I
Y
 
I
T
 
V
I
 
I
T
 
V
-
 
A
-
 
G
K
 
A
N
 
N
V
 
L
A
 
L
Y
 
L
D
 
N
Y
 
T
I
 
E
N
 
D
F
 
L
R
 
R
A
 
A
S
 
A
K
 
A
Q
 
N
A
 
V
I
 
I
D
 
S
P
 
R
M
 
A
S
 
K
F
 
V
D
 
M
V
 
V
L
 
C
Y
 
Q
F
 
L
G
x
E
T
 
I
L
 
T
A
 
P
Q
 
A
R
 
T
N
 
S
L
 
L
E
 
E
S
 
A
E
 
L
S
 
T
A
 
-
L
 
-
K
 
-
Q
 
-
L
 
M
L
 
A
Q
 
R
R
 
R
K
 
S
A
 
G
F
 
V
K
 
K
H
 
T
I
 
L
F
 
F
Y
 
-
D
 
-
I
 
-
N
 
-
L
 
-
R
 
N
K
 
P
D
 
A
C
 
P
F
 
A
T
 
I
A
 
A
E
 
D
I
 
L
I
 
D
K
 
P
Q
 
Q
S
 
F
L
 
Y
R
 
T
A
 
L
C
 
S
T
 
D
I
 
V
F
 
F
K
 
C
L
 
C
N
|
N
D
 
E
E
 
S
E
 
E
V
 
A
R
 
E
V
 
I
V
 
L
S
 
T
A
 
G
L
 
L
L
 
T
Y
 
V
Q
 
G
Q
 
S
E
 
A
L
 
A
S
 
D
L
 
A
E
 
G
E
 
E
F
 
A
V
 
A
K
 
L
Q
 
V
A
 
L
S
 
L
K
 
K
D
 
-
N
 
R
N
 
G
I
 
C
E
 
Q
L
 
V
I
 
V
L
 
I
I
 
I
T
|
T
A
 
L
G
|
G
A
|
A
E
 
E
G
|
G
C
 
C
Y
 
V
I
 
V
Y
 
L
E
 
-
K
 
S
Q
 
Q
T
 
T
L
 
E
K
 
P
F
 
E
V
 
P
K
 
K
G
 
H
Y
 
I
P
 
P
A
x
T
-
 
E
-
 
K
-
x
V
N
 
K
V
 
A
V
 
V
D
 
D
T
 
T
V
 
T
G
 
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
S
F
 
F
S
 
V
A
 
G
A
 
A
F
 
L
V
 
A
H
 
-
H
 
F
Y
 
Y
L
 
L
R
 
A
E
 
Y
K
 
Y
N
 
P
A
 
N
L
 
L
Q
 
S
A
 
L
A
 
E
D
 
D
V
 
M
S
 
L
N
 
N
R
 
R
L
 
S
G
x
N
A
 
F
F
 
I
V
x
A
A
|
A
S
 
V
S
 
S
R
x
V
G
 
Q
P
 
A
L
 
A
P
 
G
T
 
T
Y
 
Q
S
 
S
S
 
S

Sites not aligning to the query:

5c41A Crystal structure of human ribokinase in complex with amppcp in p21 spacegroup and with 4 protomers
26% identity, 90% coverage: 21:285/296 of query aligns to 39:297/317 of 5c41A

query
sites
5c41A
G
 
G
G
 
G
A
 
K
P
 
G
L
 
A
N
 
N
F
 
Q
A
 
C
A
 
V
H
 
Q
L
 
A
A
 
A
Q
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
A
E
 
M
S
 
T
Y
 
S
I
 
M
F
 
V
S
 
C
R
 
K
V
 
V
G
 
G
D
 
K
D
 
D
E
 
S
L
 
F
G
 
G
K
 
N
A
 
D
A
 
Y
L
 
I
E
 
E
Q
 
N
I
 
L
R
 
K
K
 
Q
I
 
N
R
 
D
I
 
I
K
 
S
T
 
T
D
 
E
F
 
F
I
 
T
Q
 
Y
K
 
Q
D
 
T
N
 
K
Q
 
D
H
 
A
P
 
A
T
 
T
G
 
G
T
 
T
V
 
A
P
 
S
V
 
I
E
 
I
F
 
V
K
 
N
D
 
N
-
 
E
G
 
G
Q
 
Q
P
 
N
D
 
I
Y
 
I
T
 
V
I
 
I
T
 
V
-
 
A
-
 
G
K
 
A
N
 
N
V
 
L
A
 
L
Y
 
L
D
 
N
Y
 
T
I
 
E
N
 
D
F
 
L
R
 
R
A
 
A
S
 
A
K
 
A
Q
 
N
A
 
V
I
 
I
D
 
S
P
 
R
M
 
A
S
 
K
F
 
V
D
 
M
V
 
V
L
 
C
Y
 
Q
F
 
L
G
 
E
T
 
I
L
 
T
A
 
P
Q
 
A
R
 
T
N
 
S
L
 
L
E
 
E
S
 
A
E
 
L
S
 
T
A
 
-
L
 
-
K
 
-
Q
 
-
L
 
M
L
 
A
Q
 
R
R
 
R
K
 
S
A
 
G
F
 
V
K
 
K
H
 
T
I
 
L
F
 
F
Y
 
-
D
 
-
I
 
-
N
 
-
L
 
-
R
 
N
K
 
P
D
 
A
C
 
P
F
 
A
T
 
I
A
 
A
E
 
D
I
 
L
I
 
D
K
 
P
Q
 
Q
S
 
F
L
 
Y
R
 
T
A
 
L
C
 
S
T
 
D
I
 
V
F
 
F
K
 
C
L
 
C
N
|
N
D
 
E
E
 
S
E
 
E
V
 
A
R
 
E
V
 
I
V
 
L
S
 
T
A
 
G
L
 
L
L
 
T
Y
 
V
Q
 
G
Q
 
S
E
 
A
L
 
A
S
 
D
L
 
A
E
 
G
E
 
E
F
 
A
V
 
A
K
 
L
Q
 
V
A
 
L
S
 
L
K
 
K
D
 
-
N
 
R
N
 
G
I
 
C
E
 
Q
L
 
V
I
 
V
L
 
I
I
 
I
T
|
T
A
 
L
G
|
G
A
|
A
E
 
E
G
|
G
C
 
C
Y
 
V
I
 
V
Y
 
L
E
 
-
K
 
S
Q
 
Q
T
 
T
L
 
E
K
 
P
F
 
E
V
 
P
K
 
K
G
 
H
Y
 
I
P
 
P
A
 
T
-
 
E
-
 
K
-
x
V
N
 
K
V
 
A
V
 
V
D
 
D
T
 
T
V
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
S
F
 
F
S
 
V
A
 
G
A
 
A
F
 
L
V
 
A
H
 
-
H
 
F
Y
 
Y
L
 
L
R
 
A
E
 
Y
K
 
Y
N
 
P
A
 
N
L
 
L
Q
 
S
A
 
L
A
 
E
D
 
D
V
 
M
S
 
L
N
 
N
R
 
R
L
 
S
G
x
N
A
 
F
F
 
I
V
x
A
A
|
A
S
 
V
S
 
S
R
 
V
G
 
Q
P
 
A
L
 
A
P
 
G
T
 
T
Y
 
Q
S
 
S
S
 
S

1tz3A Crystal structure of aminoimidazole riboside kinase complexed with aminoimidazole riboside (see paper)
23% identity, 94% coverage: 2:280/296 of query aligns to 2:283/299 of 1tz3A

query
sites
1tz3A
R
 
K
V
 
V
L
 
W
S
 
V
F
 
I
G
 
G
E
x
D
I
 
A
L
x
S
F
 
V
D
|
D
I
 
L
I
 
V
-
 
P
E
 
E
G
 
K
E
 
Q
N
 
N
-
 
S
Y
 
Y
L
 
L
-
 
K
-
x
C
-
 
P
G
 
G
G
|
G
A
 
A
P
 
S
L
 
A
N
 
N
F
 
V
A
 
G
A
 
V
H
 
C
L
 
V
A
 
A
Q
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
G
E
 
E
S
 
C
Y
 
G
I
 
F
F
 
I
S
 
G
R
 
C
V
 
L
G
 
G
D
 
D
D
 
D
E
 
D
L
 
A
G
 
G
K
 
R
A
 
F
A
 
L
L
 
R
E
 
Q
Q
 
V
I
 
F
R
 
Q
K
 
D
I
 
N
R
 
G
I
 
V
K
 
D
T
 
V
D
 
T
F
 
F
I
 
L
Q
 
R
K
 
L
D
 
D
N
 
A
Q
 
D
H
 
L
P
 
T
T
 
S
G
 
A
T
 
V
V
x
L
P
 
I
V
 
V
E
 
N
F
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
Q
 
-
P
 
-
D
 
S
Y
x
F
T
 
T
I
x
Y
T
 
L
K
 
V
N
 
H
V
 
P
A
 
G
Y
 
A
D
 
D
-
 
T
Y
 
Y
I
 
V
N
 
-
F
 
-
R
 
-
A
 
-
S
 
S
K
 
P
Q
 
Q
A
 
D
I
 
L
D
 
P
P
 
P
M
 
F
-
 
R
S
 
Q
F
 
Y
D
 
E
V
 
W
L
 
F
Y
 
Y
F
 
F
G
 
S
T
 
S
L
 
I
A
 
G
Q
 
L
R
 
T
N
 
D
L
 
R
E
 
P
S
 
A
E
 
R
S
 
E
A
 
A
L
 
C
K
 
L
Q
 
E
L
 
G
L
 
A
Q
 
R
-
 
R
-
 
M
R
 
R
K
 
E
A
 
A
F
 
G
K
 
G
H
 
Y
I
 
V
F
 
L
Y
 
F
D
 
D
I
 
V
N
 
N
L
 
L
R
|
R
K
 
S
D
 
K
C
x
M
F
 
W
-
 
G
-
 
N
-
 
T
-
 
D
-
 
E
T
 
I
A
 
P
E
 
E
I
 
L
I
 
I
K
 
A
Q
 
R
S
 
S
L
 
A
R
 
A
A
 
L
C
 
A
T
 
S
I
 
I
F
 
C
K
 
K
L
 
V