SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_017866878.1 NCBI__GCF_000349725.1:WP_017866878.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

7m1zC Targeting enterococcus faecalis hmg-coa reductase with a novel non- statin inhibitor
45% identity, 97% coverage: 6:417/424 of query aligns to 14:422/422 of 7m1zC

query
sites
7m1zC
K
 
R
Y
 
F
Y
 
Y
R
 
Q
K
 
M
T
 
S
W
 
P
S
 
E
Q
 
E
R
 
R
L
 
L
D
 
A
I
 
S
L
 
L
T
 
L
Q
 
N
Q
 
E
N
 
G
K
x
Q
L
x
I
S
 
S
E
 
A
K
 
D
Q
 
T
V
 
K
E
 
K
Q
 
E
L
 
F
K
 
E
Q
 
N
N
 
T
A
 
A
V
 
L
T
 
S
P
 
S
V
 
Q
L
 
I
G
 
A
E
 
N
A
 
H
Q
 
M
I
 
I
E
 
E
N
 
N
F
 
Q
L
 
I
T
 
S
Q
 
E
F
 
T
Q
 
E
L
 
V
P
 
P
E
 
M
G
 
G
L
 
V
A
 
G
L
 
L
N
 
H
F
 
L
V
 
T
I
 
V
D
 
D
G
 
E
K
 
T
E
 
D
Y
 
Y
L
 
L
I
 
V
P
 
P
M
 
M
V
 
A
I
 
T
E
 
E
E
|
E
P
|
P
S
 
S
V
 
V
I
 
I
A
 
A
G
 
A
A
 
L
S
 
S
H
 
N
G
 
G
A
 
A
A
 
K
I
 
I
V
 
A
K
 
Q
K
 
-
T
 
-
G
 
-
G
 
G
F
 
F
H
 
K
T
 
T
K
 
V
S
 
N
S
 
Q
R
 
Q
R
 
R
A
 
L
M
 
M
R
 
R
G
 
G
Q
 
Q
V
 
I
V
 
V
L
 
F
E
 
Y
N
 
D
V
 
V
T
 
A
D
 
D
L
 
P
V
 
E
A
 
S
T
 
L
K
 
I
K
 
D
K
 
K
I
 
L
E
 
Q
E
 
V
Q
 
R
E
 
E
T
 
A
E
 
E
L
 
I
M
 
F
Q
 
Q
A
 
Q
A
 
A
V
 
E
D
 
L
A
 
S
H
 
Y
P
 
P
S
|
S
I
 
I
V
 
V
K
 
K
R
|
R
G
 
G
G
 
G
G
 
G
P
 
L
L
 
R
A
x
D
L
|
L
K
 
Q
V
 
Y
R
 
R
I
 
A
L
 
F
E
 
D
Q
 
E
G
 
S
L
 
F
L
 
V
S
 
S
V
 
V
D
 
D
L
 
F
I
 
L
I
 
V
D
 
D
T
x
V
K
|
K
E
 
D
A
|
A
M
|
M
G
|
G
A
|
A
N
|
N
M
 
I
I
 
V
N
 
N
S
 
A
M
 
M
L
 
L
E
 
E
A
 
G
V
 
V
A
 
A
D
 
E
K
 
L
L
 
F
R
 
R
T
 
E
-
 
W
T
 
F
G
 
A
H
 
E
H
 
Q
D
 
K
V
 
I
L
 
L
M
 
F
A
 
S
I
 
I
L
 
L
S
 
S
N
|
N
Y
 
Y
T
 
A
T
 
T
E
 
E
C
 
S
L
 
V
V
 
V
T
 
T
A
 
M
S
 
K
C
 
T
Q
 
A
I
 
I
P
 
P
V
 
V
A
 
S
N
 
R
L
 
L
A
 
S
K
 
K
N
 
-
G
 
G
L
 
S
P
 
N
G
 
G
L
 
R
K
 
E
I
 
I
A
 
A
Q
 
E
K
 
K
L
 
I
A
 
V
Q
 
L
A
 
A
S
 
S
R
 
R
V
 
Y
A
 
A
Q
 
S
V
 
L
D
 
D
P
 
P
Y
 
Y
R
|
R
A
 
A
A
 
V
T
|
T
H
 
H
N
 
N
K
|
K
G
 
G
I
 
I
M
 
M
N
|
N
G
 
G
I
 
I
D
 
E
A
 
A
A
 
V
V
 
V
I
 
L
A
 
A
S
 
T
G
 
G
N
 
N
D
 
D
W
 
T
R
 
R
A
 
A
I
 
V
E
 
S
A
 
A
A
 
S
A
 
C
H
 
H
A
 
A
Y
 
F
A
 
A
A
 
V
R
 
K
D
 
E
G
 
G
Q
 
R
Y
 
Y
R
 
Q
G
 
G
L
 
L
S
 
T
T
 
S
W
 
W
K
 
T
V
 
L
A
 
D
G
 
G
D
 
E
Q
 
Q
L
 
L
E
 
I
G
 
G
E
 
E
L
 
I
S
 
S
L
 
V
P
 
P
V
 
L
P
 
A
V
 
L
G
 
A
S
 
T
V
|
V
G
 
G
G
|
G
S
 
A
I
 
T
G
 
K
I
 
V
V
 
L
P
 
P
L
 
K
V
 
S
Q
 
Q
V
 
A
N
 
A
S
 
A
A
 
D
L
 
L
R
 
L
S
 
A
E
 
V
K
 
T
D
 
D
A
 
A
L
 
K
G
 
E
L
 
L
E
 
S
K
 
R
I
 
V
I
 
V
A
 
A
S
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
L
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
L
Y
 
R
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
S
D
 
E
G
 
G
I
 
I
Q
 
Q
K
 
K
G
 
G
H
|
H
M
 
M
N
 
A
L
|
L
Q
 
Q
M
 
A
K
x
R
S
 
S
L
 
L
A
 
A
V
 
M
S
 
T
V
 
V
G
 
G
A
 
A
K
 
T
E
 
G
D
 
K
E
 
E
I
 
V
E
 
E
Q
 
A
V
 
V
V
 
A
S
 
Q
V
 
Q
L
 
L
-
 
K
-
 
R
Q
 
Q
K
 
K
L
 
T
P
 
M
Q
x
N
Q
|
Q
D
 
D
Q
 
R
A
 
A
I
 
L
A
 
A
Q
 
-
H
 
-
V
 
I
L
 
L
D
 
N
E
 
D
I
 
L
R
 
R

7m3hA Targeting enterococcus faecalis hmg-coa reductase with a novel non- statin inhibitor
45% identity, 97% coverage: 6:417/424 of query aligns to 1:409/409 of 7m3hA

query
sites
7m3hA
K
 
R
Y
 
F
Y
 
Y
R
 
Q
K
 
M
T
 
S
W
 
P
S
 
E
Q
 
E
R
 
R
L
 
L
D
 
A
I
 
S
L
 
L
T
 
L
Q
 
N
Q
 
E
N
 
G
K
 
Q
L
 
I
S
 
S
E
 
A
K
 
D
Q
 
T
V
 
K
E
 
K
Q
 
E
L
 
F
K
 
E
Q
 
N
N
 
T
A
 
A
V
 
L
T
 
S
P
 
S
V
 
Q
L
 
I
G
 
A
E
 
N
A
 
H
Q
 
M
I
 
I
E
 
E
N
 
N
F
 
Q
L
 
I
T
 
S
Q
 
E
F
 
T
Q
 
E
L
 
V
P
 
P
E
 
M
G
 
G
L
 
V
A
 
G
L
 
L
N
 
H
F
 
L
V
 
T
I
 
V
D
 
D
G
 
E
K
 
T
E
 
D
Y
 
Y
L
 
L
I
 
V
P
 
P
M
 
M
V
 
A
I
 
T
E
 
E
E
 
E
P
 
P
S
 
S
V
 
V
I
 
I
A
 
A
G
x
A
A
 
L
S
 
S
H
x
N
G
 
G
A
 
A
A
 
K
I
 
I
V
 
A
K
 
Q
K
 
-
T
 
-
G
 
-
G
 
G
F
 
F
H
 
K
T
 
T
K
 
V
S
 
N
S
 
Q
R
 
Q
R
 
R
A
 
L
M
 
M
R
 
R
G
 
G
Q
 
Q
V
 
I
V
 
V
L
 
F
E
 
Y
N
 
D
V
 
V
T
 
A
D
 
D
L
 
P
V
 
E
A
 
S
T
 
L
K
 
I
K
 
D
K
 
K
I
 
L
E
 
Q
E
 
V
Q
 
R
E
 
E
T
 
A
E
 
E
L
 
I
M
 
F
Q
 
Q
A
 
Q
A
 
A
V
 
E
D
 
L
A
 
S
H
 
Y
P
 
P
S
 
S
I
 
I
V
 
V
K
 
K
R
 
R
G
 
G
G
 
G
G
 
G
P
 
L
L
 
R
A
 
D
L
 
L
K
 
Q
V
 
Y
R
 
R
I
 
A
L
 
F
E
 
D
Q
 
E
G
 
S
L
 
F
L
 
V
S
 
S
V
 
V
D
 
D
L
 
F
I
 
L
I
 
V
D
 
D
T
 
V
K
 
K
E
 
D
A
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
A
N
 
N
M
 
I
I
 
V
N
 
N
S
 
A
M
 
M
L
 
L
E
 
E
A
 
G
V
 
V
A
 
A
D
 
E
K
 
L
L
 
F
R
 
R
T
 
E
-
 
W
T
 
F
G
 
A
H
 
E
H
 
Q
D
 
K
V
 
I
L
 
L
M
 
F
A
 
S
I
 
I
L
 
L
S
 
S
N
 
N
Y
 
Y
T
 
A
T
 
T
E
 
E
C
 
S
L
 
V
V
 
V
T
 
T
A
 
M
S
 
K
C
 
T
Q
 
A
I
 
I
P
 
P
V
 
V
A
 
S
N
 
R
L
 
L
A
 
S
K
 
K
N
 
-
G
 
G
L
 
S
P
 
N
G
 
G
L
 
R
K
 
E
I
 
I
A
 
A
Q
 
E
K
 
K
L
 
I
A
 
V
Q
 
L
A
 
A
S
 
S
R
 
R
V
 
Y
A
 
A
Q
 
S
V
 
L
D
 
D
P
 
P
Y
 
Y
R
|
R
A
 
A
A
 
V
T
 
T
H
 
H
N
 
N
K
 
K
G
 
G
I
 
I
M
 
M
N
|
N
G
 
G
I
 
I
D
 
E
A
 
A
A
 
V
V
 
V
I
 
L
A
 
A
S
 
T
G
 
G
N
 
N
D
 
D
W
 
T
R
 
R
A
 
A
I
 
V
E
 
S
A
 
A
A
 
S
A
 
C
H
 
H
A
 
A
Y
 
F
A
 
A
A
 
V
R
 
K
D
 
E
G
 
G
Q
 
R
Y
 
Y
R
 
Q
G
 
G
L
 
L
S
 
T
T
 
S
W
 
W
K
 
T
V
 
L
A
 
D
G
 
G
D
 
E
Q
 
Q
L
 
L
E
 
I
G
 
G
E
 
E
L
 
I
S
 
S
L
 
V
P
 
P
V
 
L
P
 
A
V
 
L
G
 
A
S
 
T
V
 
V
G
 
G
G
 
G
S
 
A
I
 
T
G
 
K
I
 
V
V
 
L
P
 
P
L
 
K
V
 
S
Q
 
Q
V
 
A
N
 
A
S
 
A
A
 
D
L
 
L
R
 
L
S
 
A
E
 
V
K
 
T
D
 
D
A
 
A
L
 
K
G
 
E
L
 
L
E
 
S
K
 
R
I
 
V
I
 
V
A
 
A
S
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
|
Q
N
 
N
L
 
L
A
 
A
A
|
A
L
 
L
Y
 
R
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
S
D
 
E
G
 
G
I
|
I
Q
 
Q
K
 
K
G
 
G
H
|
H
M
 
M
N
 
A
L
 
L
Q
 
Q
M
 
A
K
 
R
S
 
S
L
 
L
A
 
A
V
 
M
S
 
T
V
 
V
G
 
G
A
 
A
K
 
T
E
 
G
D
 
K
E
 
E
I
 
V
E
 
E
Q
 
A
V
 
V
V
 
A
S
 
Q
V
 
Q
L
 
L
-
 
K
-
 
R
Q
 
Q
K
 
K
L
 
T
P
 
M
Q
 
N
Q
 
Q
D
 
D
Q
 
R
A
 
A
I
 
L
A
 
A
Q
 
-
H
 
-
V
 
I
L
 
L
D
 
N
E
 
D
I
 
L
R
 
R

7m1zB Targeting enterococcus faecalis hmg-coa reductase with a novel non- statin inhibitor
45% identity, 97% coverage: 6:417/424 of query aligns to 17:425/425 of 7m1zB

query
sites
7m1zB
K
 
R
Y
 
F
Y
 
Y
R
 
Q
K
 
M
T
 
S
W
 
P
S
 
E
Q
 
E
R
 
R
L
 
L
D
 
A
I
 
S
L
 
L
T
 
L
Q
 
N
Q
 
E
N
 
G
K
 
Q
L
 
I
S
 
S
E
 
A
K
 
D
Q
 
T
V
 
K
E
 
K
Q
 
E
L
 
F
K
 
E
Q
 
N
N
 
T
A
 
A
V
 
L
T
 
S
P
 
S
V
 
Q
L
 
I
G
 
A
E
 
N
A
 
H
Q
 
M
I
 
I
E
 
E
N
 
N
F
 
Q
L
 
I
T
 
S
Q
 
E
F
 
T
Q
 
E
L
 
V
P
 
P
E
 
M
G
 
G
L
 
V
A
 
G
L
 
L
N
x
H
F
 
L
V
 
T
I
 
V
D
 
D
G
 
E
K
 
T
E
 
D
Y
 
Y
L
 
L
I
 
V
P
 
P
M
 
M
V
 
A
I
 
T
E
 
E
E
|
E
P
 
P
S
|
S
V
 
V
I
 
I
A
|
A
G
x
A
A
 
L
S
 
S
H
x
N
G
 
G
A
 
A
A
x
K
I
 
I
V
 
A
K
 
Q
K
 
-
T
 
-
G
 
-
G
 
G
F
 
F
H
 
K
T
 
T
K
 
V
S
 
N
S
 
Q
R
 
Q
R
 
R
A
 
L
M
 
M
R
 
R
G
 
G
Q
 
Q
V
 
I
V
 
V
L
 
F
E
 
Y
N
 
D
V
 
V
T
 
A
D
 
D
L
 
P
V
 
E
A
 
S
T
 
L
K
 
I
K
 
D
K
 
K
I
 
L
E
 
Q
E
 
V
Q
 
R
E
 
E
T
 
A
E
 
E
L
 
I
M
 
F
Q
 
Q
A
 
Q
A
 
A
V
 
E
D
 
L
A
 
S
H
x
Y
P
 
P
S
|
S
I
 
I
V
 
V
K
 
K
R
|
R
G
 
G
G
 
G
G
 
G
P
 
L
L
 
R
A
x
D
L
|
L
K
 
Q
V
 
Y
R
 
R
I
 
A
L
 
F
E
 
D
Q
 
E
G
 
S
L
 
F
L
 
V
S
 
S
V
 
V
D
 
D
L
 
F
I
 
L
I
 
V
D
 
D
T
x
V
K
 
K
E
x
D
A
|
A
M
 
M
G
 
G
A
|
A
N
|
N
M
 
I
I
 
V
N
 
N
S
 
A
M
 
M
L
 
L
E
 
E
A
 
G
V
 
V
A
 
A
D
 
E
K
 
L
L
 
F
R
 
R
T
 
E
-
 
W
T
 
F
G
 
A
H
 
E
H
 
Q
D
 
K
V
 
I
L
 
L
M
 
F
A
 
S
I
 
I
L
|
L
S
 
S
N
|
N
Y
 
Y
T
 
A
T
 
T
E
 
E
C
 
S
L
 
V
V
 
V
T
 
T
A
 
M
S
 
K
C
 
T
Q
 
A
I
 
I
P
 
P
V
 
V
A
 
S
N
 
R
L
 
L
A
 
S
K
|
K
N
 
-
G
 
G
L
 
S
P
 
N
G
 
G
L
 
R
K
 
E
I
 
I
A
 
A
Q
 
E
K
 
K
L
 
I
A
 
V
Q
 
L
A
 
A
S
 
S
R
 
R
V
 
Y
A
 
A
Q
 
S
V
 
L
D
 
D
P
 
P
Y
 
Y
R
|
R
A
 
A
A
 
V
T
|
T
H
 
H
N
 
N
K
 
K
G
 
G
I
 
I
M
 
M
N
 
N
G
 
G
I
 
I
D
 
E
A
 
A
A
 
V
V
 
V
I
 
L
A
 
A
S
 
T
G
 
G
N
 
N
D
 
D
W
 
T
R
 
R
A
 
A
I
 
V
E
 
S
A
 
A
A
 
S
A
 
C
H
 
H
A
 
A
Y
 
F
A
 
A
A
 
V
R
 
K
D
 
E
G
 
G
Q
 
R
Y
 
Y
R
 
Q
G
 
G
L
 
L
S
 
T
T
 
S
W
 
W
K
 
T
V
 
L
A
 
D
G
 
G
D
 
E
Q
 
Q
L
 
L
E
 
I
G
 
G
E
 
E
L
 
I
S
 
S
L
 
V
P
 
P
V
 
L
P
 
A
V
 
L
G
 
A
S
 
T
V
|
V
G
 
G
G
 
G
S
 
A
I
 
T
G
 
K
I
 
V
V
 
L
P
 
P
L
 
K
V
 
S
Q
 
Q
V
 
A
N
 
A
S
 
A
A
 
D
L
 
L
R
 
L
S
 
A
E
 
V
K
 
T
D
 
D
A
 
A
L
 
K
G
 
E
L
 
L
E
 
S
K
 
R
I
 
V
I
 
V
A
 
A
S
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
L
 
L
A
 
A
A
|
A
L
 
L
Y
 
R
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
S
D
 
E
G
 
G
I
|
I
Q
 
Q
K
 
K
G
 
G
H
 
H
M
 
M
N
 
A
L
|
L
Q
 
Q
M
 
A
K
 
R
S
 
S
L
 
L
A
 
A
V
 
M
S
 
T
V
 
V
G
 
G
A
 
A
K
 
T
E
 
G
D
 
K
E
 
E
I
 
V
E
 
E
Q
 
A
V
 
V
V
 
A
S
 
Q
V
 
Q
L
 
L
-
 
K
-
 
R
Q
 
Q
K
 
K
L
 
T
P
 
M
Q
 
N
Q
 
Q
D
 
D
Q
 
R
A
 
A
I
 
L
A
 
A
Q
 
-
H
 
-
V
 
I
L
 
L
D
 
N
E
 
D
I
 
L
R
 
R

5wpkB Structure of the class ii 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coa reductase from streptococcus pneumoniae bound to hmg-coa and in a partially closed conformation (see paper)
47% identity, 98% coverage: 3:418/424 of query aligns to 5:422/422 of 5wpkB

query
sites
5wpkB
G
 
G
F
 
F
E
x
S
K
 
K
Y
 
-
Y
 
-
R
 
-
K
 
K
T
 
S
W
 
Y
S
 
Q
Q
 
E
R
 
R
L
 
L
D
 
E
I
 
L
L
 
L
T
 
K
Q
 
A
Q
 
Q
N
 
A
K
 
L
L
 
L
S
 
S
-
 
P
E
 
E
K
 
R
Q
 
Q
V
 
A
E
 
S
Q
 
L
L
 
E
K
 
K
Q
 
D
N
 
E
A
 
Q
V
 
M
T
 
S
P
 
V
V
 
T
L
 
V
G
 
A
E
 
D
A
 
Q
Q
 
L
I
 
S
E
|
E
N
|
N
F
 
V
L
 
V
T
 
G
Q
 
T
F
 
F
Q
 
S
L
 
L
P
 
P
E
 
Y
G
 
S
L
 
L
A
 
V
L
 
P
N
 
E
F
 
V
V
 
L
I
 
V
D
 
N
G
 
G
K
 
Q
E
 
E
Y
 
Y
L
 
T
I
 
V
P
 
P
M
 
Y
V
 
V
I
 
T
E
 
E
E
|
E
P
 
P
S
 
S
V
 
V
I
 
V
A
|
A
G
x
A
A
 
A
S
 
S
H
x
Y
G
 
A
A
 
S
A
 
K
I
 
I
V
 
I
K
 
K
K
 
R
T
 
A
G
 
G
G
 
G
F
 
F
H
 
T
T
 
A
K
 
Q
S
 
V
S
 
H
R
 
Q
R
 
R
A
 
Q
M
 
M
R
 
I
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
V
 
A
L
 
L
E
 
Y
N
 
Q
V
 
V
T
 
A
D
 
N
L
 
P
V
 
K
A
 
L
T
 
A
K
 
Q
K
 
E
K
 
K
I
 
I
E
 
A
E
 
S
Q
 
K
E
 
K
T
 
A
E
 
E
L
 
L
M
 
L
Q
 
E
A
 
L
A
 
A
V
 
N
D
 
Q
A
 
A
H
 
Y
P
 
P
S
 
S
I
 
I
V
 
V
K
 
K
R
 
R
G
 
G
G
 
G
G
 
G
P
 
A
L
 
R
A
 
D
L
 
L
K
 
H
V
 
V
R
 
E
I
 
Q
L
 
I
-
 
K
-
 
G
E
 
E
Q
 
P
G
 
D
L
 
F
L
 
L
S
 
V
V
 
V
D
 
Y
L
 
I
I
 
H
I
 
V
D
 
D
T
 
T
K
 
Q
E
 
E
A
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
A
N
 
N
M
 
M
I
 
L
N
 
N
S
 
T
M
 
M
L
 
L
E
 
E
A
 
A
V
 
L
A
 
K
D
 
P
K
 
V
L
 
L
R
 
E
T
 
E
T
 
L
G
 
S
H
 
Q
H
 
G
D
 
Q
V
 
S
L
 
L
M
 
M
A
 
G
I
 
I
L
 
L
S
 
S
N
 
N
Y
 
Y
T
 
A
T
 
T
E
 
D
C
 
S
L
 
L
V
 
V
T
 
T
A
 
A
S
 
S
C
 
C
Q
 
R
I
 
I
P
 
A
V
 
F
A
 
R
N
 
Y
L
 
L
A
 
S
K
 
R
N
 
Q
G
 
K
L
 
D
P
 
Q
G
 
G
L
 
R
K
 
E
I
 
I
A
 
A
Q
 
E
K
 
K
L
 
I
A
 
A
Q
 
L
A
 
A
S
 
S
R
 
Q
V
 
F
A
 
A
Q
 
Q
V
 
A
D
 
D
P
 
P
Y
 
Y
R
|
R
A
 
A
A
 
A
T
|
T
H
 
H
N
 
N
K
 
K
G
 
G
I
 
I
M
 
F
N
 
N
G
 
G
I
 
I
D
 
D
A
 
A
A
 
I
V
 
L
I
 
I
A
 
A
S
 
T
G
 
G
N
 
N
D
 
D
W
 
W
R
 
R
A
 
A
I
 
I
E
 
E
A
 
A
A
 
G
A
 
A
H
 
H
A
 
A
Y
 
F
A
 
A
A
 
S
R
 
R
D
 
D
G
 
G
Q
 
R
Y
 
Y
R
 
Q
G
 
G
L
 
L
S
 
S
T
 
C
W
 
W
K
 
T
-
 
L
-
 
D
V
 
L
A
 
E
G
 
R
D
 
E
Q
 
E
L
 
L
E
 
V
G
 
G
E
 
E
L
 
M
S
 
T
L
 
L
P
 
P
V
 
M
P
 
P
V
 
V
G
 
A
S
 
T
V
 
K
G
 
G
G
 
G
S
 
S
I
 
I
G
 
G
I
 
L
V
 
N
P
 
P
L
 
R
V
 
V
Q
 
A
V
 
L
N
 
S
S
 
H
A
 
D
L
 
L
R
 
L
S
 
G
E
 
N
K
 
P
D
 
S
A
 
A
L
 
R
G
 
E
L
 
L
E
 
A
K
 
Q
I
 
I
I
 
I
A
 
E
S
 
S
V
 
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
L
 
F
A
 
A
A
|
A
L
 
L
Y
 
K
A
 
A
L
|
L
V
 
V
T
 
S
D
 
T
G
 
G
I
|
I
Q
 
Q
K
 
Q
G
 
G
H
 
H
M
 
M
N
x
K
L
|
L
Q
 
Q
M
 
A
K
 
K
S
 
S
L
 
L
A
 
A
V
 
L
S
 
L
V
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
S
E
 
E
D
 
S
E
 
E
I
 
V
E
 
A
Q
 
P
V
 
L
V
 
V
S
 
E
V
 
R
L
 
L
Q
 
I
K
 
S
L
 
D
P
 
K
Q
 
T
Q
 
F
D
 
N
Q
 
L
A
 
E
I
 
T
A
 
A
Q
 
Q
H
 
R
V
 
Y
L
 
L
D
 
E
E
 
N
I
 
L
R
 
R
N
 
S

5wpjA Structure of the class ii 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coa reductase from streptococcus pneumoniae bound to NADPH in open conformations (see paper)
48% identity, 86% coverage: 3:365/424 of query aligns to 5:369/369 of 5wpjA

query
sites
5wpjA
G
 
G
F
 
F
E
 
S
K
 
K
Y
 
-
Y
 
-
R
 
-
K
 
K
T
 
S
W
 
Y
S
 
Q
Q
 
E
R
 
R
L
 
L
D
 
E
I
 
L
L
 
L
T
 
K
Q
 
A
Q
 
Q
N
 
A
K
 
L
L
 
L
S
 
S
-
 
P
E
 
E
K
 
R
Q
 
Q
V
 
A
E
 
S
Q
 
L
L
 
E
K
 
K
Q
 
D
N
 
E
A
 
Q
V
 
M
T
 
S
P
 
V
V
 
T
L
 
V
G
 
A
E
 
D
A
 
Q
Q
 
L
I
 
S
E
 
E
N
 
N
F
 
V
L
 
V
T
 
G
Q
 
T
F
 
F
Q
 
S
L
 
L
P
 
P
E
 
Y
G
 
S
L
 
L
A
 
V
L
 
P
N
 
E
F
 
V
V
 
L
I
 
V
D
 
N
G
 
G
K
 
Q
E
 
E
Y
 
Y
L
 
T
I
 
V
P
 
P
M
 
Y
V
 
V
I
 
T
E
 
E
E
 
E
P
 
P
S
 
S
V
 
V
I
 
V
A
 
A
G
 
A
A
 
A
S
 
S
H
 
Y
G
 
A
A
 
S
A
 
K
I
 
I
V
 
I
K
 
K
K
 
R
T
 
A
G
 
G
G
 
G
F
 
F
H
 
T
T
 
A
K
 
Q
S
 
V
S
 
H
R
 
Q
R
 
R
A
 
Q
M
 
M
R
 
I
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
V
 
A
L
 
L
E
 
Y
N
 
Q
V
 
V
T
 
A
D
 
N
L
 
P
V
 
K
A
 
L
T
 
A
K
 
Q
K
 
E
K
 
K
I
 
I
E
 
A
E
 
S
Q
 
K
E
 
K
T
 
A
E
 
E
L
 
L
M
 
L
Q
 
E
A
 
L
A
 
A
V
 
N
D
 
Q
A
 
A
H
 
Y
P
 
P
S
 
S
I
 
I
V
 
V
K
 
K
R
|
R
G
 
G
G
 
G
G
 
G
P
 
A
L
 
R
A
 
D
L
 
L
K
 
H
V
 
V
R
 
E
I
 
Q
L
 
I
-
 
K
-
 
G
E
 
E
Q
 
P
G
 
D
L
 
F
L
 
L
S
 
V
V
 
V
D
 
Y
L
 
I
I
 
H
I
 
V
D
 
D
T
|
T
K
 
Q
E
|
E
A
|
A
M
|
M
G
|
G
A
|
A
N
|
N
M
 
M
I
 
L
N
 
N
S
 
T
M
 
M
L
 
L
E
 
E
A
 
A
V
 
L
A
 
K
D
 
P
K
 
V
L
 
L
R
 
E
T
 
E
T
 
L
G
 
S
H
 
Q
H
 
G
D
 
Q
V
 
S
L
 
L
M
 
M
A
 
G
I
 
I
L
 
L
S
 
S
N
|
N
Y
 
Y
T
 
A
T
 
T
E
 
D
C
 
S
L
 
L
V
 
V
T
 
T
A
 
A
S
 
S
C
 
C
Q
 
R
I
 
I
P
 
A
V
 
F
A
 
R
N
 
Y
L
 
L
A
 
S
K
 
R
N
 
Q
G
 
K
L
 
D
P
 
Q
G
 
G
L
 
R
K
 
E
I
 
I
A
 
A
Q
 
E
K
 
K
L
 
I
A
 
A
Q
 
L
A
 
A
S
 
S
R
 
Q
V
 
F
A
 
A
Q
 
Q
V
 
A
D
 
D
P
 
P
Y
 
Y
R
 
R
A
 
A
A
 
A
T
 
T
H
 
H
N
 
N
K
 
K
G
 
G
I
 
I
M
 
F
N
 
N
G
 
G
I
 
I
D
 
D
A
 
A
A
 
I
V
 
L
I
 
I
A
 
A
S
 
T
G
 
G
N
 
N
D
 
D
W
 
W
R
 
R
A
 
A
I
 
I
E
 
E
A
 
A
A
 
G
A
 
A
H
 
H
A
 
A
Y
 
F
A
 
A
A
 
S
R
 
R
D
 
D
G
 
G
Q
 
R
Y
 
Y
R
 
Q
G
 
G
L
 
L
S
 
S
T
 
C
W
 
W
K
 
T
-
 
L
-
 
D
V
 
L
A
 
E
G
 
R
D
 
E
Q
 
E
L
 
L
E
 
V
G
 
G
E
 
E
L
 
M
S
 
T
L
 
L
P
 
P
V
 
M
P
 
P
V
 
V
G
 
A
S
 
T
V
 
K
G
 
G
G
 
G
S
 
S
I
 
I
G
 
G
I
 
L
V
 
N
P
 
P
L
 
R
V
 
V
Q
 
A
V
 
L
N
 
S
S
 
H
A
 
D
L
 
L
R
 
L
S
 
G
E
 
N
K
 
P
D
 
S
A
 
A
L
 
R
G
 
E
L
 
L
E
 
A
K
 
Q
I
 
I
I
 
I
A
 
E
S
 
S
V
 
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
L
 
F
A
 
A
A
 
A
L
 
L
Y
 
K
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
S

6dioC Structure of class ii hmg-coa reductase from delftia acidovorans with NAD bound (see paper)
40% identity, 92% coverage: 4:394/424 of query aligns to 6:402/428 of 6dioC

query
sites
6dioC
F
 
L
E
 
P
K
 
N
Y
 
F
Y
 
R
R
 
A
K
 
L
T
 
T
W
 
P
S
 
A
Q
 
Q
R
 
R
L
 
R
D
 
D
I
 
F
L
 
L
T
 
A
Q
 
D
Q
 
A
N
 
C
K
 
G
L
 
L
S
 
S
E
 
D
K
 
A
Q
 
E
V
 
R
E
 
A
Q
 
L
L
 
L
K
 
A
Q
 
A
N
 
P
A
 
G
V
 
A
T
 
L
P
 
P
V
 
L
-
 
A
L
 
L
G
 
A
E
 
D
A
 
G
Q
 
M
I
 
I
E
 
E
N
 
N
F
 
V
L
 
F
T
 
G
Q
 
S
F
 
F
Q
 
E
L
 
L
P
 
P
E
 
L
G
 
G
L
 
V
A
 
A
L
 
G
N
 
N
F
 
F
V
 
R
I
 
V
D
 
N
G
 
G
K
 
R
E
 
D
Y
 
V
L
 
L
I
 
V
P
 
P
M
 
M
V
 
A
I
 
V
E
 
E
E
|
E
P
 
P
S
 
S
V
 
V
I
 
V
A
 
A
G
 
A
A
 
A
S
 
S
H
 
Y
G
 
M
A
 
A
A
 
K
I
 
L
V
 
A
K
 
R
K
 
E
T
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
F
H
 
Q
T
 
T
K
 
S
S
 
S
S
 
T
R
 
L
R
 
P
A
 
L
M
 
M
R
 
R
G
 
A
Q
 
Q
V
 
V
V
 
Q
L
 
V
E
 
L
N
 
G
V
 
V
T
 
T
D
 
D
L
 
P
V
 
H
A
 
G
T
 
A
K
 
R
K
 
L
K
 
A
I
 
V
E
 
L
E
 
Q
Q
 
A
E
 
R
T
 
A
E
 
Q
L
 
I
M
 
I
Q
 
E
A
 
R
A
 
A
V
 
N
D
 
S
A
 
R
H
 
D
P
 
K
S
 
V
I
 
L
V
 
I
K
 
G
R
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
P
 
C
L
 
K
A
 
D
L
 
I
K
 
E
V
 
V
R
 
H
I
 
V
L
 
F
E
 
P
Q
 
D
G
 
T
-
 
P
-
 
R
-
 
G
-
 
P
L
 
M
L
 
L
S
 
V
V
 
V
D
 
H
L
 
L
I
 
I
I
 
V
D
 
D
T
 
V
K
 
R
E
 
D
A
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
A
N
 
N
M
 
T
I
 
V
N
 
N
S
 
T
M
 
M
L
 
A
E
 
E
A
 
S
V
 
V
A
 
A
D
 
P
K
 
L
L
 
V
R
 
E
T
 
K
T
 
I
G
 
T
H
 
G
H
 
G
D
 
S
V
 
V
L
 
R
M
 
L
A
 
R
I
 
I
L
 
L
S
 
S
N
 
N
Y
 
L
T
 
A
T
 
D
E
 
L
C
 
R
L
 
L
V
 
A
T
 
R
A
 
A
S
 
R
C
 
V
Q
 
R
I
 
L
P
 
T
V
 
P
A
 
Q
N
 
T
L
 
L
A
 
A
K
 
T
N
 
Q
G
 
D
L
 
R
P
 
S
G
 
G
L
 
E
K
 
E
I
 
I
A
 
I
Q
 
E
K
 
G
L
 
V
A
 
L
Q
 
D
A
 
A
S
 
Y
R
 
T
V
 
F
A
 
A
Q
 
A
V
 
I
D
 
D
P
 
P
Y
 
Y
R
 
R
A
 
A
A
 
A
T
 
T
H
 
H
N
 
N
K
|
K
G
 
G
I
 
I
M
 
M
N
 
N
G
 
G
I
 
I
D
 
D
A
 
P
A
 
V
V
 
I
I
 
V
A
 
A
S
 
T
G
 
G
N
 
N
D
 
D
W
 
W
R
 
R
A
 
A
I
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
G
A
 
A
H
 
H
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
S
R
 
R
D
 
S
G
 
G
Q
 
S
Y
 
Y
R
 
T
G
 
S
L
 
L
S
 
T
T
 
R
W
 
W
-
 
E
K
 
K
V
 
D
A
 
A
G
 
G
D
 
G
Q
 
A
L
 
L
E
 
V
G
 
G
E
 
S
L
 
I
S
 
E
L
 
L
P
 
P
V
 
M
P
 
P
V
 
V
G
 
G
S
 
L
V
 
V
G
 
G
G
 
G
S
 
A
I
 
T
G
 
K
I
 
T
V
 
H
P
 
P
L
 
L
V
 
A
Q
 
R
V
 
L
N
 
A
S
 
L
A
 
K
L
 
I
R
 
M
S
 
D
E
 
L
K
 
Q
D
 
S
A
 
A
L
 
Q
G
 
Q
L
 
L
E
 
G
K
 
E
I
 
I
I
 
A
A
 
A
S
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
L
 
L
A
 
G
A
 
A
L
 
L
Y
 
R
A
 
A
L
 
L
V
 
A
T
 
T
D
 
E
G
 
G
I
 
I
Q
 
Q
K
 
R
G
 
G
H
 
H
M
 
M
N
 
A
L
 
L
Q
 
H
M
 
A
K
 
R
S
 
N
L
 
I
A
 
A
V
 
L
S
 
V
V
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
T
E
 
G
D
 
D
E
 
E
I
 
V
E
 
D
Q
 
A
V
 
V

Sites not aligning to the query:

1qaxA Ternary complex of pseudomonas mevalonii hmg-coa reductase with hmg- coa and NAD+ (see paper)
40% identity, 90% coverage: 15:394/424 of query aligns to 15:400/425 of 1qaxA

query
sites
1qaxA
R
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
H
L
 
I
T
 
G
Q
 
Q
Q
 
L
N
 
L
K
 
G
L
 
L
S
 
S
E
 
H
K
 
D
Q
 
D
V
 
V
E
 
S
Q
 
L
L
 
L
K
 
A
Q
 
N
N
 
A
A
 
G
V
 
A
T
 
L
P
 
P
V
 
M
-
 
D
L
 
I
G
 
A
E
 
N
A
 
G
Q
 
M
I
 
I
E
 
E
N
 
N
F
 
V
L
 
I
T
 
G
Q
 
T
F
 
F
Q
 
E
L
 
L
P
 
P
E
 
Y
G
 
A
L
 
V
A
 
A
L
 
S
N
 
N
F
 
F
V
 
Q
I
 
I
D
 
N
G
 
G
K
 
R
E
 
D
Y
 
V
L
 
L
I
 
V
P
 
P
M
 
L
V
 
V
I
 
V
E
 
E
E
|
E
P
 
P
S
 
S
V
 
I
I
 
V
A
|
A
G
 
A
A
 
A
S
 
S
H
x
Y
G
 
M
A
 
A
A
x
K
I
 
L
V
 
A
K
 
R
K
 
A
T
 
N
G
 
G
G
 
G
F
 
F
H
 
T
T
 
T
K
 
S
S
 
S
S
 
S
R
 
A
R
 
P
A
 
L
M
 
M
R
 
H
G
 
A
Q
 
Q
V
 
V
V
 
Q
L
 
I
E
 
V
N
 
G
V
 
I
T
 
Q
D
 
D
L
 
P
V
 
L
A
 
N
T
 
A
K
 
R
K
 
L
K
 
S
I
 
L
E
 
L
E
 
R
Q
 
R
E
 
K
T
 
D
E
 
E
L
 
I
M
 
I
Q
 
E
A
 
L
A
 
A
V
 
N
D
 
R
A
 
K
H
 
D
P
 
Q
S
 
L
I
 
L
V
 
N
K
 
S
R
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
P
 
C
L
 
R
A
 
D
L
 
I
K
 
E
V
 
V
R
 
H
I
 
T
L
 
F
E
 
A
Q
 
D
G
 
T
-
 
P
-
 
R
-
 
G
-
 
P
L
 
M
L
 
L
S
 
V
V
 
A
D
 
H
L
 
L
I
 
I
I
 
V
D
 
D
T
 
V
K
 
R
E
 
D
A
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
A
N
 
N
M
 
T
I
 
V
N
 
N
S
 
T
M
 
M
L
 
A
E
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
A
D
 
P
K
 
L
L
 
M
R
 
E
T
 
A
T
 
I
G
 
T
H
 
G
H
 
G
D
 
Q
V
 
V
L
 
R
M
 
L
A
 
R
I
 
I
L
 
L
S
 
S
N
 
N
Y
 
L
T
 
A
T
 
D
E
 
L
C
 
R
L
 
L
V
 
A
T
 
R
A
 
A
S
 
Q
C
 
V
Q
 
R
I
 
I
P
 
T
V
 
P
A
 
Q
N
 
Q
L
 
L
A
 
E
K
 
T
N
 
A
G
 
E
L
 
F
P
 
S
G
 
G
L
 
E
K
 
A
I
 
V
A
 
I
Q
 
E
K
 
G
L
 
I
A
 
L
Q
 
D
A
 
A
S
 
Y
R
 
A
V
 
F
A
 
A
Q
 
A
V
 
V
D
 
D
P
 
P
Y
 
Y
R
|
R
A
 
A
A
 
A
T
|
T
H
 
H
N
 
N
K
|
K
G
|
G
I
 
I
M
 
M
N
|
N
G
 
G
I
 
I
D
 
D
A
 
P
A
 
L
V
 
I
I
 
V
A
 
A
S
 
T
G
 
G
N
 
N
D
 
D
W
 
W
R
 
R
A
 
A
I
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
G
A
 
A
H
 
H
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
C
R
 
R
D
 
S
G
 
G
Q
 
H
Y
 
Y
R
 
G
G
 
S
L
 
L
S
 
T
T
 
T
W
 
W
-
 
E
K
 
K
V
 
D
A
 
N
G
 
N
D
 
G
Q
 
H
L
 
L
E
 
V
G
 
G
E
 
T
L
 
L
S
 
E
L
 
M
P
 
P
V
 
M
P
 
P
V
 
V
G
 
G
S
 
L
V
 
V
G
 
G
G
 
G
S
 
A
I
 
T
G
 
K
I
 
T
V
 
H
P
 
P
L
 
L
V
 
A
Q
 
Q
V
 
L
N
 
S
S
 
L
A
 
R
L
 
I
R
 
L
S
 
G
E
 
V
K
 
K
D
 
T
A
 
A
L
 
Q
G
 
A
L
 
L
E
 
A
K
 
E
I
 
I
I
 
A
A
 
V
S
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
|
Q
N
 
N
L
 
L
A
 
G
A
|
A
L
 
M
Y
 
R
A
 
A
L
|
L
V
 
A
T
 
T
D
 
E
G
 
G
I
 
I
Q
 
Q
K
 
R
G
 
G
H
 
H
M
 
M
N
 
A
L
 
L
Q
 
H
M
 
A
K
 
R
S
 
N
L
 
I
A
 
A
V
 
V
S
 
V
V
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
R
E
 
G
D
 
D
E
 
E
I
 
V
E
 
D
Q
 
W
V
 
V

Sites not aligning to the query:

P13702 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase; HMG-CoA reductase; EC 1.1.1.88 from Pseudomonas mevalonii (see 2 papers)
40% identity, 90% coverage: 15:394/424 of query aligns to 18:403/428 of P13702

query
sites
P13702
R
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
H
L
 
I
T
 
G
Q
 
Q
Q
 
L
N
 
L
K
 
G
L
 
L
S
 
S
E
 
H
K
 
D
Q
 
D
V
 
V
E
 
S
Q
 
L
L
 
L
K
 
A
Q
 
N
N
 
A
A
 
G
V
 
A
T
 
L
P
 
P
V
 
M
-
 
D
L
 
I
G
 
A
E
 
N
A
 
G
Q
 
M
I
 
I
E
|
E
N
 
N
F
 
V
L
 
I
T
 
G
Q
 
T
F
 
F
Q
 
E
L
 
L
P
 
P
E
 
Y
G
 
A
L
 
V
A
 
A
L
 
S
N
 
N
F
 
F
V
 
Q
I
 
I
D
 
N
G
 
G
K
 
R
E
 
D
Y
 
V
L
 
L
I
 
V
P
 
P
M
 
L
V
 
V
I
 
V
E
 
E
E
|
E
P
 
P
S
 
S
V
 
I
I
 
V
A
 
A
G
 
A
A
 
A
S
 
S
H
 
Y
G
 
M
A
 
A
A
 
K
I
 
L
V
 
A
K
 
R
K
 
A
T
 
N
G
 
G
G
 
G
F
 
F
H
 
T
T
 
T
K
 
S
S
 
S
S
 
S
R
 
A
R
 
P
A
 
L
M
 
M
R
 
H
G
 
A
Q
 
Q
V
 
V
V
 
Q
L
 
I
E
 
V
N
 
G
V
 
I
T
 
Q
D
 
D
L
 
P
V
 
L
A
 
N
T
 
A
K
 
R
K
 
L
K
 
S
I
 
L
E
 
L
E
 
R
Q
 
R
E
 
K
T
 
D
E
 
E
L
 
I
M
 
I
Q
 
E
A
 
L
A
 
A
V
 
N
D
 
R
A
 
K
H
 
D
P
 
Q
S
 
L
I
 
L
V
 
N
K
 
S
R
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
P
 
C
L
 
R
A
 
D
L
 
I
K
 
E
V
 
V
R
 
H
I
 
T
L
 
F
E
 
A
Q
 
D
G
 
T
-
 
P
-
 
R
-
 
G
-
 
P
L
 
M
L
 
L
S
 
V
V
 
A
D
 
H
L
 
L
I
 
I
I
 
V
D
 
D
T
 
V
K
 
R
E
x
D
A
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
A
N
 
N
M
 
T
I
 
V
N
 
N
S
 
T
M
 
M
L
 
A
E
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
A
D
 
P
K
 
L
L
 
M
R
 
E
T
 
A
T
 
I
G
 
T
H
 
G
H
 
G
D
 
Q
V
 
V
L
 
R
M
 
L
A
 
R
I
 
I
L
 
L
S
 
S
N
 
N
Y
 
L
T
 
A
T
 
D
E
 
L
C
 
R
L
 
L
V
 
A
T
 
R
A
 
A
S
 
Q
C
 
V
Q
 
R
I
 
I
P
 
T
V
 
P
A
 
Q
N
 
Q
L
 
L
A
 
E
K
 
T
N
 
A
G
 
E
L
 
F
P
 
S
G
 
G
L
 
E
K
 
A
I
 
V
A
 
I
Q
 
E
K
 
G
L
 
I
A
 
L
Q
 
D
A
 
A
S
 
Y
R
 
A
V
 
F
A
 
A
Q
 
A
V
 
V
D
 
D
P
 
P
Y
 
Y
R
 
R
A
 
A
A
 
A
T
 
T
H
 
H
N
 
N
K
 
K
G
 
G
I
 
I
M
 
M
N
 
N
G
 
G
I
 
I
D
 
D
A
 
P
A
 
L
V
 
I
I
 
V
A
 
A
S
 
T
G
 
G
N
 
N
D
 
D
W
 
W
R
 
R
A
 
A
I
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
G
A
 
A
H
 
H
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
C
R
 
R
D
 
S
G
 
G
Q
 
H
Y
 
Y
R
 
G
G
 
S
L
 
L
S
 
T
T
 
T
W
 
W
-
 
E
K
 
K
V
 
D
A
 
N
G
 
N
D
 
G
Q
 
H
L
 
L
E
 
V
G
 
G
E
 
T
L
 
L
S
 
E
L
 
M
P
 
P
V
 
M
P
 
P
V
 
V
G
 
G
S
 
L
V
 
V
G
 
G
G
 
G
S
 
A
I
 
T
G
 
K
I
 
T
V
 
H
P
 
P
L
 
L
V
 
A
Q
 
Q
V
 
L
N
 
S
S
 
L
A
 
R
L
 
I
R
 
L
S
 
G
E
 
V
K
 
K
D
 
T
A
 
A
L
 
Q
G
 
A
L
 
L
E
 
A
K
 
E
I
 
I
I
 
A
A
 
V
S
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
L
 
L
A
 
G
A
 
A
L
 
M
Y
 
R
A
 
A
L
 
L
V
 
A
T
 
T
D
 
E
G
 
G
I
 
I
Q
 
Q
K
 
R
G
 
G
H
|
H
M
 
M
N
 
A
L
 
L
Q
 
H
M
 
A
K
 
R
S
 
N
L
 
I
A
 
A
V
 
V
S
 
V
V
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
R
E
 
G
D
 
D
E
 
E
I
 
V
E
 
D
Q
 
W
V
 
V

8vlqA 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase (see paper)
40% identity, 90% coverage: 13:394/424 of query aligns to 15:402/421 of 8vlqA

query
sites
8vlqA
S
 
A
Q
 
A
R
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
H
L
 
I
T
 
G
Q
 
Q
Q
 
L
N
 
L
K
 
G
L
 
L
S
 
S
E
 
H
K
 
D
Q
 
D
V
 
V
E
 
S
Q
 
L
L
 
L
K
 
A
Q
 
N
N
 
A
A
 
G
V
 
A
T
 
L
P
 
P
V
 
M
-
 
D
L
 
I
G
 
A
E
 
N
A
 
G
Q
 
M
I
 
I
E
 
E
N
 
N
F
 
V
L
 
I
T
 
G
Q
 
T
F
 
F
Q
 
E
L
 
L
P
 
P
E
 
Y
G
 
A
L
 
V
A
 
A
L
 
S
N
 
N
F
 
F
V
 
Q
I
 
I
D
 
N
G
 
G
K
 
R
E
 
D
Y
 
V
L
 
L
I
 
V
P
 
P
M
 
L
V
 
V
I
 
V
E
 
E
E
|
E
P
 
P
S
|
S
V
 
I
I
 
V
A
|
A
G
x
A
A
 
A
S
 
S
H
x
Y
G
 
M
A
 
A
A
 
K
I
 
L
V
 
A
K
 
R
K
 
A
T
 
N
G
 
G
G
 
G
F
 
F
H
 
T
T
 
T
K
 
S
S
 
S
S
 
S
R
 
A
R
 
P
A
 
L
M
 
M
R
 
H
G
 
A
Q
 
Q
V
 
V
V
 
Q
L
 
I
E
 
V
N
 
G
V
 
I
T
 
Q
D
 
D
L
 
P
V
 
L
A
 
N
T
 
A
K
 
R
K
 
L
K
 
S
I
 
L
E
 
L
E
 
R
Q
 
R
E
 
K
T
 
D
E
 
E
L
 
I
M
 
I
Q
 
E
A
 
L
A
 
A
V
 
N
D
 
R
A
 
K
H
 
D
P
 
Q
S
 
L
I
 
L
V
 
N
K
 
S
R
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
P
 
C
L
 
R
A
 
D
L
 
I
K
 
E
V
 
V
R
 
H
I
 
T
L
 
F
E
 
A
Q
 
D
G
 
T
-
 
P
-
 
R
-
 
G
-
 
P
L
 
M
L
 
L
S
 
V
V
 
A
D
 
H
L
 
L
I
 
I
I
 
V
D
 
D
T
 
V
K
 
R
E
 
D
A
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
A
N
 
N
M
 
T
I
 
V
N
 
N
S
 
T
M
 
M
L
 
A
E
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
A
D
 
P
K
 
L
L
 
M
R
 
E
T
 
A
T
 
I
G
 
T
H
 
G
H
 
G
D
 
Q
V
 
V
L
 
R
M
 
L
A
 
R
I
 
I
L
 
L
S
 
S
N
 
N
Y
 
L
T
 
A
T
 
D
E
 
L
C
 
R
L
 
L
V
 
A
T
 
R
A
 
A
S
 
Q
C
 
V
Q
 
R
I
 
I
P
 
T
V
 
P
A
 
Q
N
 
Q
L
 
L
A
 
E
K
 
T
N
 
A
G
 
E
L
 
F
P
 
S
G
 
G
L
 
E
K
 
A
I
 
V
A
 
I
Q
 
E
K
 
G
L
 
I
A
 
L
Q
 
D
A
 
A
S
 
Y
R
 
A
V
 
F
A
 
A
Q
 
A
V
 
V
D
 
D
P
 
P
Y
 
Y
R
|
R
A
 
A
A
 
A
T
|
T
H
 
H
N
 
N
K
|
K
G
 
G
I
 
I
M
 
M
N
|
N
G
 
G
I
 
I
D
 
D
A
 
P
A
 
L
V
 
I
I
 
V
A
 
A
S
 
T
G
 
G
N
 
N
D
 
D
W
 
W
R
 
R
A
 
A
I
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
G
A
 
A
H
 
H
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
C
R
 
R
D
 
S
G
 
G
Q
 
H
Y
 
Y
R
 
G
G
 
S
L
 
L
S
 
T
T
 
T
W
 
W
-
 
E
K
 
K
V
 
D
A
 
N
G
 
N
D
 
G
Q
 
H
L
 
L
E
 
V
G
 
G
E
 
T
L
 
L
S
 
E
L
 
M
P
 
P
V
 
M
P
 
P
V
 
V
G
 
G
S
 
L
V
 
V
G
 
G
G
 
G
S
 
A
I
 
T
G
 
K
I
 
T
V
 
H
P
 
P
L
 
L
V
 
A
Q
 
Q
V
 
L
N
 
S
S
 
L
A
 
R
L
 
I
R
 
L
S
 
G
E
 
V
K
 
K
D
 
T
A
 
A
L
 
Q
G
 
A
L
 
L
E
 
A
K
 
E
I
 
I
I
 
A
A
 
V
S
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
L
 
L
A
 
G
A
|
A
L
 
M
Y
 
R
A
 
A
L
 
L
V
 
A
T
 
T
D
 
E
G
 
G
I
|
I
Q
 
Q
K
x
R
G
|
G
H
|
H
M
 
M
N
 
A
L
 
L
Q
x
H
M
 
A
K
 
R
S
 
N
L
 
I
A
 
A
V
 
V
S
x
V
V
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
R
E
 
G
D
 
D
E
 
E
I
 
V
E
 
D
Q
 
W
V
 
V

Sites not aligning to the query:

8gdnA Structure of pmhmgr bound to mevalonate, coa and NAD. (see paper)
40% identity, 90% coverage: 13:394/424 of query aligns to 15:402/421 of 8gdnA

query
sites
8gdnA
S
 
A
Q
 
A
R
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
H
L
 
I
T
 
G
Q
 
Q
Q
 
L
N
 
L
K
 
G
L
 
L
S
 
S
E
 
H
K
 
D
Q
 
D
V
 
V
E
 
S
Q
 
L
L
 
L
K
 
A
Q
 
N
N
 
A
A
 
G
V
 
A
T
 
L
P
 
P
V
 
M
-
 
D
L
 
I
G
 
A
E
 
N
A
 
G
Q
 
M
I
 
I
E
 
E
N
 
N
F
 
V
L
 
I
T
 
G
Q
 
T
F
 
F
Q
 
E
L
 
L
P
 
P
E
 
Y
G
 
A
L
 
V
A
 
A
L
 
S
N
 
N
F
 
F
V
 
Q
I
 
I
D
 
N
G
 
G
K
 
R
E
 
D
Y
 
V
L
 
L
I
 
V
P
 
P
M
 
L
V
 
V
I
 
V
E
 
E
E
|
E
P
 
P
S
|
S
V
 
I
I
 
V
A
|
A
G
x
A
A
 
A
S
 
S
H
x
Y
G
 
M
A
 
A
A
x
K
I
 
L
V
 
A
K
x
R
K
 
A
T
 
N
G
 
G
G
 
G
F
 
F
H
 
T
T
 
T
K
 
S
S
 
S
S
 
S
R
 
A
R
 
P
A
 
L
M
 
M
R
 
H
G
 
A
Q
 
Q
V
 
V
V
 
Q
L
 
I
E
 
V
N
 
G
V
 
I
T
 
Q
D
 
D
L
 
P
V
 
L
A
 
N
T
 
A
K
 
R
K
 
L
K
 
S
I
 
L
E
 
L
E
 
R
Q
 
R
E
 
K
T
 
D
E
 
E
L
 
I
M
 
I
Q
 
E
A
 
L
A
 
A
V
 
N
D
 
R
A
 
K
H
 
D
P
 
Q
S
 
L
I
 
L
V
 
N
K
 
S
R
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
P
 
C
L
 
R
A
 
D
L
 
I
K
 
E
V
 
V
R
 
H
I
 
T
L
 
F
E
 
A
Q
 
D
G
 
T
-
 
P
-
 
R
-
 
G
-
 
P
L
 
M
L
 
L
S
 
V
V
 
A
D
 
H
L
 
L
I
 
I
I
 
V
D
 
D
T
 
V
K
 
R
E
 
D
A
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
A
N
 
N
M
 
T
I
 
V
N
 
N
S
 
T
M
 
M
L
 
A
E
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
A
D
 
P
K
 
L
L
 
M
R
 
E
T
 
A
T
 
I
G
 
T
H
 
G
H
 
G
D
 
Q
V
 
V
L
 
R
M
 
L
A
 
R
I
 
I
L
 
L
S
 
S
N
 
N
Y
 
L
T
 
A
T
 
D
E
 
L
C
 
R
L
 
L
V
 
A
T
 
R
A
 
A
S
 
Q
C
 
V
Q
 
R
I
 
I
P
 
T
V
 
P
A
 
Q
N
 
Q
L
 
L
A
 
E
K
 
T
N
 
A
G
 
E
L
 
F
P
 
S
G
 
G
L
 
E
K
 
A
I
 
V
A
 
I
Q
 
E
K
 
G
L
 
I
A
 
L
Q
 
D
A
 
A
S
 
Y
R
 
A
V
 
F
A
 
A
Q
 
A
V
 
V
D
 
D
P
 
P
Y
 
Y
R
|
R
A
 
A
A
 
A
T
|
T
H
 
H
N
 
N
K
|
K
G
 
G
I
 
I
M
 
M
N
|
N
G
 
G
I
 
I
D
 
D
A
 
P
A
 
L
V
 
I
I
 
V
A
 
A
S
 
T
G
 
G
N
 
N
D
 
D
W
 
W
R
 
R
A
 
A
I
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
G
A
 
A
H
 
H
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
C
R
 
R
D
 
S
G
 
G
Q
 
H
Y
 
Y
R
 
G
G
 
S
L
 
L
S
 
T
T
 
T
W
 
W
-
 
E
K
 
K
V
 
D
A
 
N
G
 
N
D
 
G
Q
 
H
L
 
L
E
 
V
G
 
G
E
 
T
L
 
L
S
 
E
L
 
M
P
 
P
V
 
M
P
 
P
V
 
V
G
 
G
S
 
L
V
 
V
G
 
G
G
 
G
S
 
A
I
 
T
G
 
K
I
 
T
V
 
H
P
 
P
L
 
L
V
 
A
Q
 
Q
V
 
L
N
 
S
S
 
L
A
 
R
L
 
I
R
 
L
S
 
G
E
 
V
K
 
K
D
 
T
A
 
A
L
 
Q
G
 
A
L
 
L
E
 
A
K
 
E
I
 
I
I
 
A
A
 
V
S
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
L
 
L
A
 
G
A
|
A
L
 
M
Y
 
R
A
 
A
L
 
L
V
 
A
T
 
T
D
 
E
G
 
G
I
 
I
Q
 
Q
K
 
R
G
 
G
H
|
H
M
 
M
N
 
A
L
 
L
Q
x
H
M
 
A
K
 
R
S
 
N
L
x
I
A
 
A
V
 
V
S
x
V
V
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
R
E
 
G
D
 
D
E
 
E
I
 
V
E
 
D
Q
 
W
V
 
V

Sites not aligning to the query:

4i4bA Hmg-coa reductase from pseudomonas mevalonii complexed with NAD and intermediate hemiacetal form of hmg-coa (see paper)
40% identity, 89% coverage: 13:388/424 of query aligns to 14:395/410 of 4i4bA

query
sites
4i4bA
S
 
A
Q
 
A
R
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
H
L
 
I
T
 
G
Q
 
Q
Q
 
L
N
 
L
K
 
G
L
 
L
S
 
S
E
 
H
K
 
D
Q
 
D
V
 
V
E
 
S
Q
 
L
L
 
L
K
 
A
Q
 
N
N
 
A
A
 
G
V
 
A
T
 
L
P
 
P
V
 
M
-
 
D
L
 
I
G
 
A
E
 
N
A
 
G
Q
 
M
I
 
I
E
 
E
N
 
N
F
 
V
L
 
I
T
 
G
Q
 
T
F
 
F
Q
 
E
L
 
L
P
 
P
E
 
Y
G
 
A
L
 
V
A
 
A
L
 
S
N
 
N
F
 
F
V
 
Q
I
 
I
D
 
N
G
 
G
K
 
R
E
 
D
Y
 
V
L
 
L
I
 
V
P
 
P
M
 
L
V
 
V
I
 
V
E
 
E
E
|
E
P
 
P
S
|
S
V
 
I
I
 
V
A
|
A
G
x
A
A
 
A
S
 
S
H
x
Y
G
 
M
A
 
A
A
x
K
I
 
L
V
 
A
K
 
R
K
 
A
T
 
N
G
 
G
G
 
G
F
 
F
H
 
T
T
 
T
K
 
S
S
 
S
S
 
S
R
 
A
R
 
P
A
 
L
M
 
M
R
 
H
G
 
A
Q
 
Q
V
 
V
V
 
Q
L
 
I
E
 
V
N
 
G
V
 
I
T
 
Q
D
 
D
L
 
P
V
 
L
A
 
N
T
 
A
K
 
R
K
 
L
K
 
S
I
 
L
E
 
L
E
 
R
Q
 
R
E
 
K
T
 
D
E
 
E
L
 
I
M
 
I
Q
 
E
A
 
L
A
 
A
V
 
N
D
 
R
A
 
K
H
 
D
P
 
Q
S
 
L
I
 
L
V
 
N
K
 
S
R
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
P
 
C
L
 
R
A
 
D
L
 
I
K
 
E
V
 
V
R
 
H
I
 
T
L
 
F
E
 
A
Q
 
D
G
 
T
-
 
P
-
 
R
-
 
G
-
 
P
L
 
M
L
 
L
S
 
V
V
 
A
D
 
H
L
 
L
I
 
I
I
 
V
D
 
D
T
 
V
K
 
R
E
 
D
A
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
A
N
 
N
M
 
T
I
 
V
N
 
N
S
 
T
M
 
M
L
 
A
E
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
A
D
 
P
K
 
L
L
 
M
R
 
E
T
 
A
T
 
I
G
 
T
H
 
G
H
 
G
D
 
Q
V
 
V
L
 
R
M
 
L
A
 
R
I
 
I
L
 
L
S
 
S
N
 
N
Y
 
L
T
 
A
T
 
D
E
 
L
C
 
R
L
 
L
V
 
A
T
 
R
A
 
A
S
 
Q
C
 
V
Q
 
R
I
 
I
P
 
T
V
 
P
A
 
Q
N
 
Q
L
 
L
A
 
E
K
 
T
N
 
A
G
 
E
L
 
F
P
 
S
G
 
G
L
 
E
K
 
A
I
 
V
A
 
I
Q
 
E
K
 
G
L
 
I
A
 
L
Q
 
D
A
 
A
S
 
Y
R
 
A
V
 
F
A
 
A
Q
 
A
V
 
V
D
 
D
P
 
P
Y
 
Y
R
|
R
A
 
A
A
 
A
T
|
T
H
 
H
N
 
N
K
|
K
G
 
G
I
 
I
M
 
M
N
 
N
G
 
G
I
 
I
D
 
D
A
 
P
A
 
L
V
 
I
I
 
V
A
 
A
S
 
T
G
 
G
N
 
N
D
 
D
W
 
W
R
 
R
A
 
A
I
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
G
A
 
A
H
 
H
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
C
R
 
R
D
 
S
G
 
G
Q
 
H
Y
 
Y
R
 
G
G
 
S
L
 
L
S
 
T
T
 
T
W
 
W
-
 
E
K
 
K
V
 
D
A
 
N
G
 
N
D
 
G
Q
 
H
L
 
L
E
 
V
G
 
G
E
 
T
L
 
L
S
 
E
L
 
M
P
 
P
V
 
M
P
 
P
V
 
V
G
 
G
S
 
L
V
 
V
G
 
G
G
 
G
S
 
A
I
 
T
G
 
K
I
 
T
V
 
H
P
 
P
L
 
L
V
 
A
Q
 
Q
V
 
L
N
 
S
S
 
L
A
 
R
L
 
I
R
 
L
S
 
G
E
 
V
K
 
K
D
 
T
A
 
A
L
 
Q
G
 
A
L
 
L
E
 
A
K
 
E
I
 
I
I
 
A
A
 
V
S
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
L
 
L
A
 
G
A
|
A
L
 
M
Y
 
R
A
 
A
L
 
L
V
 
A
T
 
T
D
 
E
G
 
G
I
|
I
Q
 
Q
K
 
R
G
 
G
H
 
H
M
 
M
N
 
A
L
 
L
Q
x
H
M
 
A
K
 
R
S
 
N
L
x
I
A
 
A
V
 
V
S
x
V
V
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
R
E
 
Q

Sites not aligning to the query:

1qayA Ternary complex of pseudomonas mevalonii hmg-coa reductase with mevalonate and NAD+ (see paper)
40% identity, 86% coverage: 15:378/424 of query aligns to 15:384/384 of 1qayA

query
sites
1qayA
R
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
H
L
 
I
T
 
G
Q
 
Q
Q
 
L
N
 
L
K
 
G
L
 
L
S
 
S
E
 
H
K
 
D
Q
 
D
V
 
V
E
 
S
Q
 
L
L
 
L
K
 
A
Q
 
N
N
 
A
A
 
G
V
 
A
T
 
L
P
 
P
V
 
M
-
 
D
L
 
I
G
 
A
E
 
N
A
 
G
Q
 
M
I
 
I
E
 
E
N
 
N
F
 
V
L
 
I
T
 
G
Q
 
T
F
 
F
Q
 
E
L
 
L
P
 
P
E
 
Y
G
 
A
L
 
V
A
 
A
L
 
S
N
 
N
F
 
F
V
 
Q
I
 
I
D
 
N
G
 
G
K
 
R
E
 
D
Y
 
V
L
 
L
I
 
V
P
 
P
M
 
L
V
 
V
I
 
V
E
 
E
E
|
E
P
 
P
S
 
S
V
 
I
I
 
V
A
 
A
G
 
A
A
 
A
S
 
S
H
 
Y
G
 
M
A
 
A
A
 
K
I
 
L
V
 
A
K
 
R
K
 
A
T
 
N
G
 
G
G
 
G
F
 
F
H
 
T
T
 
T
K
 
S
S
 
S
S
 
S
R
 
A
R
 
P
A
 
L
M
 
M
R
 
H
G
 
A
Q
 
Q
V
 
V
V
 
Q
L
 
I
E
 
V
N
 
G
V
 
I
T
 
Q
D
 
D
L
 
P
V
 
L
A
 
N
T
 
A
K
 
R
K
 
L
K
 
S
I
 
L
E
 
L
E
 
R
Q
 
R
E
 
K
T
 
D
E
 
E
L
 
I
M
 
I
Q
 
E
A
 
L
A
 
A
V
 
N
D
 
R
A
 
K
H
 
D
P
 
Q
S
 
L
I
 
L
V
 
N
K
 
S
R
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
P
 
C
L
 
R
A
 
D
L
 
I
K
 
E
V
 
V
R
 
H
I
 
T
L
 
F
E
 
A
Q
 
D
G
 
T
-
 
P
-
 
R
-
 
G
-
 
P
L
 
M
L
 
L
S
 
V
V
 
A
D
 
H
L
 
L
I
 
I
I
 
V
D
 
D
T
 
V
K
 
R
E
 
D
A
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
A
N
 
N
M
 
T
I
 
V
N
 
N
S
 
T
M
 
M
L
 
A
E
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
A
D
 
P
K
 
L
L
 
M
R
 
E
T
 
A
T
 
I
G
 
T
H
 
G
H
 
G
D
 
Q
V
 
V
L
 
R
M
 
L
A
 
R
I
 
I
L
 
L
S
 
S
N
 
N
Y
 
L
T
 
A
T
 
D
E
 
L
C
 
R
L
 
L
V
 
A
T
 
R
A
 
A
S
 
Q
C
 
V
Q
 
R
I
 
I
P
 
T
V
 
P
A
 
Q
N
 
Q
L
 
L
A
 
E
K
 
T
N
 
A
G
 
E
L
 
F
P
 
S
G
 
G
L
 
E
K
 
A
I
 
V
A
 
I
Q
 
E
K
 
G
L
 
I
A
 
L
Q
 
D
A
 
A
S
 
Y
R
 
A
V
 
F
A
 
A
Q
 
A
V
 
V
D
 
D
P
 
P
Y
 
Y
R
|
R
A
 
A
A
 
A
T
|
T
H
 
H
N
 
N
K
|
K
G
 
G
I
 
I
M
 
M
N
 
N
G
 
G
I
 
I
D
 
D
A
 
P
A
 
L
V
 
I
I
 
V
A
 
A
S
 
T
G
 
G
N
 
N
D
 
D
W
 
W
R
 
R
A
 
A
I
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
G
A
 
A
H
 
H
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
C
R
 
R
D
 
S
G
 
G
Q
 
H
Y
 
Y
R
 
G
G
 
S
L
 
L
S
 
T
T
 
T
W
 
W
-
 
E
K
 
K
V
 
D
A
 
N
G
 
N
D
 
G
Q
 
H
L
 
L
E
 
V
G
 
G
E
 
T
L
 
L
S
 
E
L
 
M
P
 
P
V
 
M
P
 
P
V
 
V
G
 
G
S
 
L
V
 
V
G
 
G
G
 
G
S
 
A
I
 
T
G
 
K
I
 
T
V
 
H
P
 
P
L
 
L
V
 
A
Q
 
Q
V
 
L
N
 
S
S
 
L
A
 
R
L
 
I
R
 
L
S
 
G
E
 
V
K
 
K
D
 
T
A
 
A
L
 
Q
G
 
A
L
 
L
E
 
A
K
 
E
I
 
I
I
 
A
A
 
V
S
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
L
 
L
A
 
G
A
|
A
L
 
M
Y
 
R
A
 
A
L
|
L
V
 
A
T
 
T
D
 
E
G
 
G
I
 
I
Q
 
Q
K
 
R
G
 
G
H
|
H
M
 
M
N
 
A
L
 
L
Q
 
H
M
 
A
K
 
R

6eevA Structure of class ii hmg-coa reductase from delftia acidovorans with mevalonate bound (see paper)
39% identity, 86% coverage: 4:367/424 of query aligns to 5:374/374 of 6eevA

query
sites
6eevA
F
 
L
E
 
P
K
 
N
Y
 
F
Y
 
R
R
 
A
K
 
L
T
 
T
W
 
P
S
 
A
Q
 
Q
R
 
R
L
 
R
D
 
D
I
 
F
L
 
L
T
 
A
Q
 
D
Q
 
A
N
 
C
K
 
G
L
 
L
S
 
S
E
 
D
K
 
A
Q
 
E
V
 
R
E
 
A
Q
 
L
L
 
L
K
 
A
Q
 
A
N
 
P
A
 
G
V
 
A
T
 
L
P
 
P
V
 
L
-
 
A
L
 
L
G
 
A
E
 
D
A
 
G
Q
 
M
I
 
I
E
 
E
N
 
N
F
 
V
L
 
F
T
 
G
Q
 
S
F
 
F
Q
 
E
L
 
L
P
 
P
E
 
L
G
 
G
L
 
V
A
 
A
L
 
G
N
 
N
F
 
F
V
 
R
I
 
V
D
x
N
G
 
G
K
 
R
E
 
D
Y
 
V
L
 
L
I
 
V
P
 
P
M
 
M
V
 
A
I
 
V
E
 
E
E
|
E
P
 
P
S
 
S
V
 
V
I
 
V
A
 
A
G
 
A
A
 
A
S
 
S
H
 
Y
G
 
M
A
 
A
A
 
K
I
 
L
V
 
A
K
 
R
K
 
E
T
x
D
G
 
G
G
 
G
F
 
F
H
 
Q
T
 
T
K
 
S
S
 
S
S
 
T
R
 
L
R
 
P
A
 
L
M
 
M
R
 
R
G
 
A
Q
 
Q
V
 
V
V
 
Q
L
 
V
E
 
L
N
 
G
V
 
V
T
 
T
D
 
D
L
 
P
V
 
H
A
 
G
T
 
A
K
 
R
K
 
L
K
 
A
I
 
V
E
 
L
E
 
Q
Q
 
A
E
 
R
T
 
A
E
 
Q
L
 
I
M
 
I
Q
 
E
A
 
R
A
 
A
V
 
N
D
 
S
A
 
R
H
 
D
P
 
K
S
 
V
I
 
L
V
 
I
K
 
G
R
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
P
 
C
L
 
K
A
 
D
L
 
I
K
 
E
V
 
V
R
 
H
I
 
V
L
 
F
E
 
P
Q
 
D
G
 
T
-
 
P
-
 
R
-
 
G
-
 
P
L
 
M
L
 
L
S
 
V
V
 
V
D
 
H
L
 
L
I
 
I
I
 
V
D
 
D
T
 
V
K
 
R
E
 
D
A
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
A
N
 
N
M
 
T
I
 
V
N
 
N
S
 
T
M
 
M
L
 
A
E
 
E
A
 
S
V
 
V
A
 
A
D
 
P
K
 
L
L
 
V
R
 
E
T
 
K
T
 
I
G
 
T
H
 
G
H
 
G
D
 
S
V
 
V
L
 
R
M
 
L
A
 
R
I
 
I
L
 
L
S
 
S
N
 
N
Y
 
L
T
 
A
T
 
D
E
 
L
C
 
R
L
 
L
V
 
A
T
 
R
A
 
A
S
x
R
C
 
V
Q
x
R
I
 
L
P
 
T
V
 
P
A
 
Q
N
 
T
L
 
L
A
 
A
K
 
T
N
 
Q
G
 
D
L
 
R
P
 
S
G
 
G
L
 
E
K
 
E
I
 
I
A
 
I
Q
 
E
K
 
G
L
 
V
A
 
L
Q
 
D
A
 
A
S
 
Y
R
 
T
V
 
F
A
 
A
Q
 
A
V
 
I
D
 
D
P
 
P
Y
 
Y
R
|
R
A
 
A
A
 
A
T
|
T
H
 
H
N
 
N
K
 
K
G
 
G
I
 
I
M
 
M
N
|
N
G
 
G
I
 
I
D
 
D
A
 
P
A
 
V
V
 
I
I
 
V
A
 
A
S
 
T
G
 
G
N
 
N
D
 
D
W
 
W
R
 
R
A
 
A
I
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
G
A
 
A
H
 
H
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
S
R
 
R
D
 
S
G
 
G
Q
 
S
Y
 
Y
R
 
T
G
 
S
L
 
L
S
 
T
T
 
R
W
 
W
-
 
E
K
 
K
V
 
D
A
 
A
G
 
G
D
 
G
Q
 
A
L
 
L
E
 
V
G
 
G
E
 
S
L
 
I
S
 
E
L
 
L
P
 
P
V
 
M
P
 
P
V
 
V
G
 
G
S
 
L
V
 
V
G
 
G
G
 
G
S
 
A
I
 
T
G
 
K
I
 
T
V
 
H
P
 
P
L
 
L
V
 
A
Q
 
R
V
 
L
N
 
A
S
 
L
A
 
K
L
 
I
R
 
M
S
 
D
E
 
L
K
 
Q
D
 
S
A
 
A
L
 
Q
G
x
Q
L
 
L
E
 
G
K
x
E
I
 
I
I
 
A
A
 
A
S
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
L
 
L
A
 
G
A
|
A
L
 
L
Y
 
R
A
 
A
L
 
L
V
 
A
T
 
T
D
 
E
G
 
G

4i6yB 3-hydroxy-3-methyl (hmg) coenzyme a reductase bound to r-mevalonate (see paper)
40% identity, 84% coverage: 15:370/424 of query aligns to 16:377/377 of 4i6yB

query
sites
4i6yB
R
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
H
L
 
I
T
 
G
Q
 
Q
Q
 
L
N
 
L
K
 
G
L
 
L
S
 
S
E
 
H
K
 
D
Q
 
D
V
 
V
E
 
S
Q
 
L
L
 
L
K
 
A
Q
 
N
N
 
A
A
 
G
V
 
A
T
 
L
P
 
P
V
 
M
-
 
D
L
 
I
G
 
A
E
 
N
A
 
G
Q
 
M
I
 
I
E
 
E
N
 
N
F
 
V
L
 
I
T
 
G
Q
 
T
F
 
F
Q
 
E
L
 
L
P
 
P
E
 
Y
G
 
A
L
 
V
A
 
A
L
 
S
N
 
N
F
 
F
V
 
Q
I
 
I
D
 
N
G
 
G
K
 
R
E
 
D
Y
 
V
L
 
L
I
 
V
P
 
P
M
 
L
V
 
V
I
 
V
E
 
E
E
|
E
P
 
P
S
 
S
V
 
I
I
 
V
A
 
A
G
 
A
A
 
A
S
 
S
H
 
Y
G
 
M
A
 
A
A
 
K
I
 
L
V
 
A
K
 
R
K
 
A
T
 
N
G
 
G
G
 
G
F
 
F
H
 
T
T
 
T
K
x
S
S
|
S
S
 
S
R
 
A
R
 
P
A
 
L
M
 
M
R
 
H
G
 
A
Q
 
Q
V
 
V
V
 
Q
L
 
I
E
 
V
N
 
G
V
 
I
T
 
Q
D
 
D
L
 
P
V
 
L
A
 
N
T
 
A
K
 
R
K
 
L
K
 
S
I
 
L
E
 
L
E
 
R
Q
 
R
E
 
K
T
 
D
E
 
E
L
 
I
M
 
I
Q
 
E
A
 
L
A
 
A
V
 
N
D
 
R
A
 
K
H
 
D
P
 
Q
S
 
L
I
 
L
V
 
N
K
 
S
R
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
P
 
C
L
 
R
A
 
D
L
 
I
K
 
E
V
 
V
R
 
H
I
 
T
L
 
F
E
 
A
Q
 
D
G
 
T
-
 
P
-
 
R
-
 
G
-
 
P
L
 
M
L
 
L
S
 
V
V
 
A
D
 
H
L
 
L
I
 
I
I
 
V
D
 
D
T
 
V
K
 
R
E
 
D
A
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
A
N
 
N
M
 
T
I
 
V
N
 
N
S
 
T
M
 
M
L
 
A
E
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
A
D
 
P
K
 
L
L
 
M
R
 
E
T
 
A
T
 
I
G
 
T
H
 
G
H
 
G
D
 
Q
V
 
V
L
 
R
M
 
L
A
 
R
I
 
I
L
 
L
S
 
S
N
 
N
Y
 
L
T
 
A
T
 
D
E
 
L
C
 
R
L
 
L
V
 
A
T
x
R
A
 
A
S
 
Q
C
 
V
Q
 
R
I
 
I
P
 
T
V
 
P
A
 
Q
N
 
Q
L
 
L
A
 
E
K
 
T
N
 
A
G
 
E
L
 
F
P
 
S
G
 
G
L
 
E
K
 
A
I
 
V
A
 
I
Q
 
E
K
 
G
L
 
I
A
 
L
Q
 
D
A
 
A
S
 
Y
R
 
A
V
 
F
A
 
A
Q
 
A
V
 
V
D
 
D
P
 
P
Y
 
Y
R
|
R
A
 
A
A
 
A
T
|
T
H
 
H
N
 
N
K
 
K
G
 
G
I
 
I
M
 
M
N
|
N
G
 
G
I
 
I
D
 
D
A
 
P
A
 
L
V
 
I
I
 
V
A
 
A
S
 
T
G
 
G
N
 
N
D
 
D
W
 
W
R
 
R
A
 
A
I
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
G
A
 
A
H
 
H
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
C
R
 
R
D
 
S
G
 
G
Q
 
H
Y
 
Y
R
 
G
G
 
S
L
 
L
S
 
T
T
 
T
W
 
W
-
 
E
K
 
K
V
 
D
A
 
N
G
 
N
D
 
G
Q
 
H
L
 
L
E
 
V
G
 
G
E
 
T
L
 
L
S
 
E
L
 
M
P
 
P
V
 
M
P
 
P
V
 
V
G
 
G
S
 
L
V
 
V
G
 
G
G
 
G
S
 
A
I
 
T
G
 
K
I
 
T
V
 
H
P
 
P
L
 
L
V
 
A
Q
 
Q
V
 
L
N
 
S
S
 
L
A
 
R
L
 
I
R
 
L
S
 
G
E
 
V
K
 
K
D
 
T
A
 
A
L
 
Q
G
 
A
L
 
L
E
 
A
K
 
E
I
 
I
I
 
A
A
 
V
S
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
L
 
L
A
 
G
A
 
A
L
 
M
Y
 
R
A
 
A
L
 
L
V
 
A
T
 
T
D
 
E
G
 
G
I
 
I
Q
 
Q
K
 
R

8sz6B Pmhmgr bound to mevaldehyde and coa (see paper)
40% identity, 84% coverage: 15:369/424 of query aligns to 17:377/377 of 8sz6B

query
sites
8sz6B
R
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
H
L
 
I
T
 
G
Q
 
Q
Q
 
L
N
 
L
K
 
G
L
 
L
S
 
S
E
 
H
K
 
D
Q
 
D
V
 
V
E
 
S
Q
 
L
L
 
L
K
 
A
Q
 
N
N
 
A
A
 
G
V
 
A
T
 
L
P
 
P
V
 
M
-
 
D
L
 
I
G
 
A
E
 
N
A
 
G
Q
 
M
I
 
I
E
|
E
N
|
N
F
 
V
L
 
I
T
 
G
Q
 
T
F
 
F
Q
 
E
L
 
L
P
 
P
E
 
Y
G
 
A
L
 
V
A
 
A
L
 
S
N
 
N
F
 
F
V
 
Q
I
 
I
D
 
N
G
 
G
K
 
R
E
 
D
Y
 
V
L
 
L
I
 
V
P
 
P
M
 
L
V
 
V
I
 
V
E
 
E
E
|
E
P
 
P
S
 
S
V
 
I
I
 
V
A
 
A
G
 
A
A
 
A
S
 
S
H
 
Y
G
 
M
A
 
A
A
x
K
I
 
L
V
 
A
K
x
R
K
 
A
T
 
N
G
 
G
G
 
G
F
 
F
H
 
T
T
 
T
K
 
S
S
 
S
S
 
S
R
 
A
R
 
P
A
 
L
M
 
M
R
 
H
G
 
A
Q
 
Q
V
 
V
V
 
Q
L
 
I
E
 
V
N
 
G
V
 
I
T
 
Q
D
 
D
L
 
P
V
 
L
A
 
N
T
 
A
K
 
R
K
 
L
K
 
S
I
 
L
E
 
L
E
 
R
Q
 
R
E
 
K
T
 
D
E
 
E
L
 
I
M
 
I
Q
 
E
A
 
L
A
 
A
V
 
N
D
 
R
A
 
K
H
 
D
P
 
Q
S
 
L
I
 
L
V
 
N
K
 
S
R
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
P
 
C
L
 
R
A
 
D
L
 
I
K
 
E
V
 
V
R
 
H
I
 
T
L
 
F
E
 
A
Q
 
D
G
 
T
-
 
P
-
 
R
-
 
G
-
 
P
L
 
M
L
 
L
S
 
V
V
 
A
D
 
H
L
 
L
I
 
I
I
 
V
D
 
D
T
 
V
K
 
R
E
 
D
A
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
A
N
 
N
M
 
T
I
 
V
N
 
N
S
 
T
M
 
M
L
 
A
E
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
A
D
 
P
K
 
L
L
 
M
R
 
E
T
 
A
T
 
I
G
 
T
H
 
G
H
 
G
D
 
Q
V
 
V
L
 
R
M
 
L
A
 
R
I
 
I
L
 
L
S
 
S
N
 
N
Y
 
L
T
 
A
T
 
D
E
 
L
C
 
R
L
 
L
V
 
A
T
 
R
A
 
A
S
 
Q
C
 
V
Q
 
R
I
 
I
P
 
T
V
 
P
A
 
Q
N
 
Q
L
 
L
A
 
E
K
 
T
N
 
A
G
 
E
L
 
F
P
 
S
G
 
G
L
 
E
K
 
A
I
 
V
A
 
I
Q
 
E
K
 
G
L
 
I
A
 
L
Q
 
D
A
 
A
S
 
Y
R
 
A
V
 
F
A
 
A
Q
 
A
V
 
V
D
 
D
P
 
P
Y
 
Y
R
|
R
A
 
A
A
 
A
T
|
T
H
 
H
N
 
N
K
 
K
G
 
G
I
 
I
M
 
M
N
|
N
G
 
G
I
 
I
D
 
D
A
 
P
A
 
L
V
 
I
I
 
V
A
 
A
S
 
T
G
 
G
N
 
N
D
 
D
W
 
W
R
 
R
A
 
A
I
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
G
A
 
A
H
 
H
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
C
R
 
R
D
 
S
G
 
G
Q
 
H
Y
 
Y
R
 
G
G
 
S
L
 
L
S
 
T
T
 
T
W
 
W
-
 
E
K
 
K
V
 
D
A
 
N
G
 
N
D
 
G
Q
 
H
L
 
L
E
 
V
G
 
G
E
 
T
L
 
L
S
 
E
L
 
M
P
 
P
V
 
M
P
 
P
V
 
V
G
 
G
S
 
L
V
 
V
G
 
G
G
 
G
S
 
A
I
 
T
G
 
K
I
 
T
V
 
H
P
 
P
L
 
L
V
 
A
Q
 
Q
V
 
L
N
 
S
S
 
L
A
 
R
L
 
I
R
 
L
S
 
G
E
 
V
K
 
K
D
 
T
A
 
A
L
 
Q
G
 
A
L
 
L
E
 
A
K
 
E
I
 
I
I
 
A
A
 
V
S
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
L
 
L
A
 
G
A
 
A
L
 
M
Y
 
R
A
 
A
L
 
L
V
 
A
T
 
T
D
 
E
G
 
G
I
 
I
Q
 
Q

Sites not aligning to the query:

8sz6A Pmhmgr bound to mevaldehyde and coa (see paper)
40% identity, 84% coverage: 15:369/424 of query aligns to 17:377/377 of 8sz6A

query
sites
8sz6A
R
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
H
L
 
I
T
 
G
Q
 
Q
Q
 
L
N
 
L
K
 
G
L
 
L
S
 
S
E
 
H
K
 
D
Q
 
D
V
 
V
E
 
S
Q
 
L
L
 
L
K
 
A
Q
 
N
N
 
A
A
 
G
V
 
A
T
 
L
P
 
P
V
 
M
-
 
D
L
 
I
G
 
A
E
 
N
A
 
G
Q
 
M
I
 
I
E
 
E
N
 
N
F
 
V
L
 
I
T
 
G
Q
 
T
F
 
F
Q
 
E
L
 
L
P
 
P
E
 
Y
G
 
A
L
 
V
A
 
A
L
 
S
N
 
N
F
 
F
V
 
Q
I
 
I
D
 
N
G
 
G
K
 
R
E
 
D
Y
 
V
L
 
L
I
 
V
P
 
P
M
 
L
V
 
V
I
 
V
E
 
E
E
|
E
P
 
P
S
|
S
V
 
I
I
 
V
A
|
A
G
x
A
A
 
A
S
 
S
H
x
Y
G
 
M
A
 
A
A
 
K
I
 
L
V
 
A
K
 
R
K
 
A
T
 
N
G
 
G
G
 
G
F
 
F
H
 
T
T
 
T
K
 
S
S
 
S
S
 
S
R
 
A
R
 
P
A
 
L
M
 
M
R
 
H
G
 
A
Q
 
Q
V
 
V
V
 
Q
L
 
I
E
 
V
N
 
G
V
 
I
T
 
Q
D
 
D
L
 
P
V
 
L
A
 
N
T
 
A
K
 
R
K
 
L
K
 
S
I
 
L
E
 
L
E
 
R
Q
 
R
E
 
K
T
 
D
E
 
E
L
 
I
M
 
I
Q
 
E
A
 
L
A
 
A
V
 
N
D
 
R
A
 
K
H
 
D
P
 
Q
S
 
L
I
 
L
V
 
N
K
 
S
R
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
P
 
C
L
 
R
A
 
D
L
 
I
K
 
E
V
 
V
R
 
H
I
 
T
L
 
F
E
 
A
Q
 
D
G
 
T
-
 
P
-
 
R
-
 
G
-
 
P
L
 
M
L
 
L
S
 
V
V
 
A
D
 
H
L
 
L
I
 
I
I
 
V
D
 
D
T
 
V
K
 
R
E
 
D
A
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
A
N
 
N
M
 
T
I
 
V
N
 
N
S
 
T
M
 
M
L
 
A
E
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
A
D
 
P
K
 
L
L
 
M
R
 
E
T
 
A
T
 
I
G
 
T
H
 
G
H
 
G
D
 
Q
V
 
V
L
 
R
M
 
L
A
 
R
I
 
I
L
 
L
S
 
S
N
 
N
Y
 
L
T
 
A
T
 
D
E
 
L
C
 
R
L
 
L
V
 
A
T
 
R
A
 
A
S
 
Q
C
 
V
Q
 
R
I
 
I
P
 
T
V
 
P
A
 
Q
N
 
Q
L
 
L
A
 
E
K
 
T
N
 
A
G
 
E
L
 
F
P
 
S
G
 
G
L
 
E
K
 
A
I
 
V
A
 
I
Q
 
E
K
 
G
L
 
I
A
 
L
Q
 
D
A
 
A
S
 
Y
R
 
A
V
 
F
A
 
A
Q
 
A
V
 
V
D
 
D
P
 
P
Y
 
Y
R
|
R
A
 
A
A
 
A
T
|
T
H
 
H
N
 
N
K
 
K
G
 
G
I
 
I
M
 
M
N
|
N
G
 
G
I
 
I
D
 
D
A
 
P
A
 
L
V
 
I
I
 
V
A
 
A
S
 
T
G
 
G
N
 
N
D
 
D
W
 
W
R
 
R
A
 
A
I
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
G
A
 
A
H
 
H
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
C
R
 
R
D
 
S
G
 
G
Q
 
H
Y
 
Y
R
 
G
G
 
S
L
 
L
S
 
T
T
 
T
W
 
W
-
 
E
K
 
K
V
 
D
A
 
N
G
 
N
D
 
G
Q
 
H
L
 
L
E
 
V
G
 
G
E
 
T
L
 
L
S
 
E
L
 
M
P
 
P
V
 
M
P
 
P
V
 
V
G
 
G
S
 
L
V
 
V
G
 
G
G
 
G
S
 
A
I
 
T
G
 
K
I
 
T
V
 
H
P
 
P
L
 
L
V
 
A
Q
 
Q
V
 
L
N
 
S
S
 
L
A
 
R
L
 
I
R
 
L
S
 
G
E
 
V
K
 
K
D
 
T
A
 
A
L
 
Q
G
 
A
L
 
L
E
 
A
K
 
E
I
 
I
I
 
A
A
 
V
S
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
L
 
L
A
 
G
A
|
A
L
 
M
Y
 
R
A
 
A
L
 
L
V
 
A
T
 
T
D
 
E
G
 
G
I
|
I
Q
 
Q

Sites not aligning to the query:

4i4bB Hmg-coa reductase from pseudomonas mevalonii complexed with NAD and intermediate hemiacetal form of hmg-coa (see paper)
40% identity, 84% coverage: 15:369/424 of query aligns to 16:376/376 of 4i4bB

query
sites
4i4bB
R
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
H
L
 
I
T
 
G
Q
 
Q
Q
 
L
N
 
L
K
 
G
L
 
L
S
 
S
E
 
H
K
 
D
Q
 
D
V
 
V
E
 
S
Q
 
L
L
 
L
K
 
A
Q
 
N
N
 
A
A
 
G
V
 
A
T
 
L
P
 
P
V
 
M
-
 
D
L
 
I
G
 
A
E
 
N
A
 
G
Q
 
M
I
 
I
E
|
E
N
|
N
F
 
V
L
 
I
T
 
G
Q
 
T
F
 
F
Q
 
E
L
 
L
P
 
P
E
 
Y
G
 
A
L
 
V
A
 
A
L
 
S
N
 
N
F
 
F
V
 
Q
I
 
I
D
 
N
G
 
G
K
 
R
E
 
D
Y
 
V
L
 
L
I
 
V
P
 
P
M
 
L
V
 
V
I
 
V
E
 
E
E
|
E
P
 
P
S
 
S
V
 
I
I
 
V
A
 
A
G
 
A
A
 
A
S
 
S
H
 
Y
G
 
M
A
 
A
A
 
K
I
 
L
V
 
A
K
 
R
K
 
A
T
 
N
G
 
G
G
 
G
F
 
F
H
 
T
T
 
T
K
 
S
S
 
S
S
 
S
R
 
A
R
 
P
A
 
L
M
 
M
R
 
H
G
 
A
Q
 
Q
V
 
V
V
 
Q
L
 
I
E
 
V
N
 
G
V
 
I
T
 
Q
D
 
D
L
 
P
V
 
L
A
 
N
T
 
A
K
 
R
K
 
L
K
 
S
I
 
L
E
 
L
E
 
R
Q
 
R
E
 
K
T
 
D
E
 
E
L
 
I
M
 
I
Q
 
E
A
 
L
A
 
A
V
 
N
D
 
R
A
 
K
H
x
D
P
 
Q
S
x
L
I
 
L
V
 
N
K
 
S
R
x
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
P
 
C
L
 
R
A
 
D
L
 
I
K
 
E
V
 
V
R
 
H
I
 
T
L
 
F
E
 
A
Q
 
D
G
 
T
-
 
P
-
 
R
-
 
G
-
 
P
L
 
M
L
 
L
S
 
V
V
 
A
D
 
H
L
 
L
I
 
I
I
 
V
D
 
D
T
 
V
K
x
R
E
x
D
A
|
A
M
|
M
G
|
G
A
|
A
N
|
N
M
x
T
I
 
V
N
 
N
S
 
T
M
 
M
L
 
A
E
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
A
D
 
P
K
 
L
L
 
M
R
 
E
T
 
A
T
 
I
G
 
T
H
 
G
H
 
G
D
 
Q
V
 
V
L
 
R
M
 
L
A
 
R
I
 
I
L
|
L
S
 
S
N
|
N
Y
 
L
T
 
A
T
 
D
E
 
L
C
 
R
L
 
L
V
 
A
T
 
R
A
 
A
S
 
Q
C
 
V
Q
 
R
I
 
I
P
 
T
V
 
P
A
 
Q
N
 
Q
L
 
L
A
 
E
K
 
T
N
 
A
G
 
E
L
 
F
P
 
S
G
 
G
L
 
E
K
 
A
I
 
V
A
 
I
Q
 
E
K
 
G
L
 
I
A
 
L
Q
 
D
A
 
A
S
 
Y
R
 
A
V
 
F
A
 
A
Q
 
A
V
 
V
D
 
D
P
 
P
Y
 
Y
R
|
R
A
 
A
A
 
A
T
|
T
H
 
H
N
 
N
K
|
K
G
 
G
I
 
I
M
 
M
N
|
N
G
 
G
I
 
I
D
 
D
A
 
P
A
 
L
V
 
I
I
 
V
A
 
A
S
 
T
G
 
G
N
 
N
D
|
D
W
 
W
R
 
R
A
 
A
I
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
G
A
 
A
H
 
H
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
C
R
 
R
D
 
S
G
 
G
Q
 
H
Y
 
Y
R
 
G
G
 
S
L
 
L
S
 
T
T
 
T
W
 
W
-
 
E
K
 
K
V
 
D
A
 
N
G
 
N
D
 
G
Q
 
H
L
 
L
E
 
V
G
 
G
E
 
T
L
 
L
S
 
E
L
 
M
P
 
P
V
 
M
P
 
P
V
 
V
G
 
G
S
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
S
 
A
I
 
T
G
 
K
I
 
T
V
 
H
P
 
P
L
 
L
V
 
A
Q
 
Q
V
 
L
N
 
S
S
 
L
A
 
R
L
 
I
R
 
L
S
 
G
E
 
V
K
 
K
D
 
T
A
 
A
L
 
Q
G
 
A
L
 
L
E
 
A
K
 
E
I
 
I
I
 
A
A
 
V
S
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
L
 
L
A
 
G
A
 
A
L
 
M
Y
 
R
A
 
A
L
 
L
V
 
A
T
 
T
D
 
E
G
 
G
I
 
I
Q
 
Q

1r31A Hmg-coa reductase from pseudomonas mevalonii complexed with hmg-coa
40% identity, 84% coverage: 15:369/424 of query aligns to 16:376/376 of 1r31A

query
sites
1r31A
R
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
H
L
 
I
T
 
G
Q
 
Q
Q
 
L
N
 
L
K
 
G
L
 
L
S
 
S
E
 
H
K
 
D
Q
 
D
V
 
V
E
 
S
Q
 
L
L
 
L
K
 
A
Q
 
N
N
 
A
A
 
G
V
 
A
T
 
L
P
 
P
V
 
M
-
 
D
L
 
I
G
 
A
E
 
N
A
 
G
Q
 
M
I
 
I
E
 
E
N
 
N
F
 
V
L
 
I
T
 
G
Q
 
T
F
 
F
Q
 
E
L
 
L
P
 
P
E
 
Y
G
 
A
L
 
V
A
 
A
L
 
S
N
 
N
F
 
F
V
 
Q
I
 
I
D
 
N
G
 
G
K
 
R
E
 
D
Y
 
V
L
 
L
I
 
V
P
 
P
M
 
L
V
 
V
I
 
V
E
 
E
E
|
E
P
 
P
S
|
S
V
 
I
I
 
V
A
|
A
G
 
A
A
 
A
S
 
S
H
x
Y
G
 
M
A
 
A
A
x
K
I
 
L
V
 
A
K
 
R
K
 
A
T
 
N
G
 
G
G
 
G
F
 
F
H
 
T
T
 
T
K
 
S
S
 
S
S
 
S
R
 
A
R
 
P
A
 
L
M
 
M
R
 
H
G
 
A
Q
 
Q
V
 
V
V
 
Q
L
 
I
E
 
V
N
 
G
V
 
I
T
 
Q
D
 
D
L
 
P
V
 
L
A
 
N
T
 
A
K
 
R
K
 
L
K
 
S
I
 
L
E
 
L
E
 
R
Q
 
R
E
 
K
T
 
D
E
 
E
L
 
I
M
 
I
Q
 
E
A
 
L
A
 
A
V
 
N
D
 
R
A
 
K
H
 
D
P
 
Q
S
 
L
I
 
L
V
 
N
K
 
S
R
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
P
 
C
L
 
R
A
 
D
L
 
I
K
 
E
V
 
V
R
 
H
I
 
T
L
 
F
E
 
A
Q
 
D
G
 
T
-
 
P
-
 
R
-
 
G
-
 
P
L
 
M
L
 
L
S
 
V
V
 
A
D
 
H
L
 
L
I
 
I
I
 
V
D
 
D
T
 
V
K
 
R
E
 
D
A
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
A
N
 
N
M
 
T
I
 
V
N
 
N
S
 
T
M
 
M
L
 
A
E
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
A
D
 
P
K
 
L
L
 
M
R
 
E
T
 
A
T
 
I
G
 
T
H
 
G
H
 
G
D
 
Q
V
 
V
L
 
R
M
 
L
A
 
R
I
 
I
L
 
L
S
 
S
N
 
N
Y
 
L
T
 
A
T
 
D
E
 
L
C
 
R
L
 
L
V
 
A
T
 
R
A
 
A
S
 
Q
C
 
V
Q
 
R
I
 
I
P
 
T
V
 
P
A
 
Q
N
 
Q
L
 
L
A
 
E
K
 
T
N
 
A
G
 
E
L
 
F
P
 
S
G
 
G
L
 
E
K
 
A
I
 
V
A
 
I
Q
 
E
K
 
G
L
 
I
A
 
L
Q
 
D
A
 
A
S
 
Y
R
 
A
V
 
F
A
 
A
Q
 
A
V
 
V
D
 
D
P
 
P
Y
 
Y
R
|
R
A
 
A
A
 
A
T
|
T
H
 
H
N
 
N
K
 
K
G
 
G
I
 
I
M
 
M
N
|
N
G
 
G
I
 
I
D
 
D
A
 
P
A
 
L
V
 
I
I
 
V
A
 
A
S
 
T
G
 
G
N
 
N
D
 
D
W
 
W
R
 
R
A
 
A
I
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
G
A
 
A
H
 
H
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
C
R
 
R
D
 
S
G
 
G
Q
 
H
Y
 
Y
R
 
G
G
 
S
L
 
L
S
 
T
T
 
T
W
 
W
-
 
E
K
 
K
V
 
D
A
 
N
G
 
N
D
 
G
Q
 
H
L
 
L
E
 
V
G
 
G
E
 
T
L
 
L
S
 
E
L
 
M
P
 
P
V
 
M
P
 
P
V
 
V
G
 
G
S
 
L
V
 
V
G
 
G
G
 
G
S
 
A
I
 
T
G
 
K
I
 
T
V
 
H
P
 
P
L
 
L
V
 
A
Q
 
Q
V
 
L
N
 
S
S
 
L
A
 
R
L
 
I
R
 
L
S
 
G
E
 
V
K
 
K
D
 
T
A
 
A
L
 
Q
G
 
A
L
 
L
E
 
A
K
 
E
I
 
I
I
 
A
A
 
V
S
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
L
 
L
A
 
G
A
|
A
L
 
M
Y
 
R
A
 
A
L
 
L
V
 
A
T
 
T
D
 
E
G
 
G
I
 
I
Q
 
Q

Sites not aligning to the query:

4i56A Hmg-coa reductase from pseudomonas mevalonii complexed with dithio- hmg-coa (see paper)
39% identity, 83% coverage: 13:366/424 of query aligns to 14:373/373 of 4i56A

query
sites
4i56A
S
 
A
Q
 
A
R
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
H
L
 
I
T
 
G
Q
 
Q
Q
 
L
N
 
L
K
 
G
L
 
L
S
 
S
E
 
H
K
 
D
Q
 
D
V
 
V
E
 
S
Q
 
L
L
 
L
K
 
A
Q
 
N
N
 
A
A
 
G
V
 
A
T
 
L
P
 
P
V
 
M
-
 
D
L
 
I
G
 
A
E
 
N
A
 
G
Q
 
M
I
 
I
E
 
E
N
 
N
F
 
V
L
 
I
T
 
G
Q
 
T
F
 
F
Q
 
E
L
 
L
P
 
P
E
 
Y
G
 
A
L
 
V
A
 
A
L
 
S
N
 
N
F
 
F
V
 
Q
I
 
I
D
 
N
G
 
G
K
 
R
E
 
D
Y
 
V
L
 
L
I
 
V
P
 
P
M
 
L
V
 
V
I
 
V
E
 
E
E
 
E
P
 
P
S
|
S
V
 
I
I
 
V
A
|
A
G
x
A
A
 
A
S
 
S
H
x
Y
G
 
M
A
 
A
A
x
K
I
 
L
V
 
A
K
 
R
K
 
A
T
 
N
G
 
G
G
 
G
F
 
F
H
 
T
T
 
T
K
 
S
S
 
S
S
 
S
R
 
A
R
 
P
A
 
L
M
 
M
R
 
H
G
 
A
Q
 
Q
V
 
V
V
 
Q
L
 
I
E
 
V
N
 
G
V
 
I
T
 
Q
D
 
D
L
 
P
V
 
L
A
 
N
T
 
A
K
 
R
K
 
L
K
 
S
I
 
L
E
 
L
E
 
R
Q
 
R
E
 
K
T
 
D
E
 
E
L
 
I
M
 
I
Q
 
E
A
 
L
A
 
A
V
 
N
D
 
R
A
 
K
H
 
D
P
 
Q
S
 
L
I
 
L
V
 
N
K
 
S
R
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
P
 
C
L
 
R
A
 
D
L
 
I
K
 
E
V
 
V
R
 
H
I
 
T
L
 
F
E
 
A
Q
 
D
G
 
T
-
 
P
-
 
R
-
 
G
-
 
P
L
 
M
L
 
L
S
 
V
V
 
A
D
 
H
L
 
L
I
 
I
I
 
V
D
 
D
T
 
V
K
 
R
E
 
D
A
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
A
N
 
N
M
 
T
I
 
V
N
 
N
S
 
T
M
 
M
L
 
A
E
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
A
D
 
P
K
 
L
L
 
M
R
 
E
T
 
A
T
 
I
G
 
T
H
 
G
H
 
G
D
 
Q
V
 
V
L
 
R
M
 
L
A
 
R
I
 
I
L
 
L
S
 
S
N
 
N
Y
 
L
T
 
A
T
 
D
E
 
L
C
 
R
L
 
L
V
 
A
T
 
R
A
 
A
S
 
Q
C
 
V
Q
 
R
I
 
I
P
 
T
V
 
P
A
 
Q
N
 
Q
L
 
L
A
 
E
K
 
T
N
 
A
G
 
E
L
 
F
P
 
S
G
 
G
L
 
E
K
 
A
I
 
V
A
 
I
Q
 
E
K
 
G
L
 
I
A
 
L
Q
 
D
A
 
A
S
 
Y
R
 
A
V
 
F
A
 
A
Q
 
A
V
 
V
D
 
D
P
 
P
Y
 
Y
R
|
R
A
 
A
A
 
A
T
|
T
H
 
H
N
 
N
K
 
K
G
|
G
I
 
I
M
 
M
N
|
N
G
 
G
I
 
I
D
 
D
A
 
P
A
 
L
V
 
I
I
 
V
A
 
A
S
 
T
G
 
G
N
 
N
D
 
D
W
 
W
R
 
R
A
 
A
I
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
G
A
 
A
H
 
H
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
C
R
 
R
D
 
S
G
 
G
Q
 
H
Y
 
Y
R
 
G
G
 
S
L
 
L
S
 
T
T
 
T
W
 
W
-
 
E
K
 
K
V
 
D
A
 
N
G
 
N
D
 
G
Q
 
H
L
 
L
E
 
V
G
 
G
E
 
T
L
 
L
S
 
E
L
 
M
P
 
P
V
 
M
P
 
P
V
 
V
G
 
G
S
 
L
V
 
V
G
 
G
G
 
G
S
 
A
I
 
T
G
 
K
I
 
T
V
 
H
P
 
P
L
 
L
V
 
A
Q
 
Q
V
 
L
N
 
S
S
 
L
A
 
R
L
 
I
R
 
L
S
 
G
E
 
V
K
 
K
D
 
T
A
 
A
L
 
Q
G
 
A
L
 
L
E
 
A
K
 
E
I
 
I
I
 
A
A
 
V
S
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
L
 
L
A
x
G
A
|
A
L
 
M
Y
 
R
A
|
A
L
 
L
V
 
A
T
 
T
D
 
E

Sites not aligning to the query:

1t02A Crystal structure of a statin bound to class ii hmg-coa reductase (see paper)
39% identity, 83% coverage: 13:365/424 of query aligns to 13:371/371 of 1t02A

query
sites
1t02A
S
 
A
Q
 
A
R
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
H
L
 
I
T
 
G
Q
 
Q
Q
 
L
N
 
L
K
 
G
L
 
L
S
 
S
E
 
H
K
 
D
Q
 
D
V
 
V
E
 
S
Q
 
L
L
 
L
K
 
A
Q
 
N
N
 
A
A
 
G
V
 
A
T
 
L
P
 
P
V
 
M
-
 
D
L
 
I
G
 
A
E
 
N
A
 
G
Q
 
M
I
 
I
E
 
E
N
 
N
F
 
V
L
 
I
T
 
G
Q
 
T
F
 
F
Q
 
E
L
 
L
P
 
P
E
 
Y
G
 
A
L
 
V
A
 
A
L
 
S
N
 
N
F
 
F
V
 
Q
I
 
I
D
 
N
G
 
G
K
 
R
E
 
D
Y
 
V
L
 
L
I
 
V
P
 
P
M
 
L
V
 
V
I
 
V
E
 
E
E
|
E
P
 
P
S
|
S
V
 
I
I
 
V
A
 
A
G
x
A
A
 
A
S
 
S
H
 
Y
G
 
M
A
 
A
A
 
K
I
 
L
V
 
A
K
 
R
K
 
A
T
 
N
G
 
G
G
 
G
F
 
F
H
 
T
T
 
T
K
 
S
S
 
S
S
 
S
R
 
A
R
 
P
A
 
L
M
 
M
R
 
H
G
 
A
Q
 
Q
V
 
V
V
 
Q
L
 
I
E
 
V
N
 
G
V
 
I
T
 
Q
D
 
D
L
 
P
V
 
L
A
 
N
T
 
A
K
 
R
K
 
L
K
 
S
I
 
L
E
 
L
E
 
R
Q
 
R
E
 
K
T
 
D
E
 
E
L
 
I
M
 
I
Q
 
E
A
 
L
A
 
A
V
 
N
D
 
R
A
 
K
H
 
D
P
 
Q
S
 
L
I
 
L
V
 
N
K
 
S
R
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
P
 
C
L
 
R
A
 
D
L
 
I
K
 
E
V
 
V
R
 
H
I
 
T
L
 
F
E
 
A
Q
 
D
G
 
T
-
 
P
-
 
R
-
 
G
-
 
P
L
 
M
L
 
L
S
 
V
V
 
A
D
 
H
L
 
L
I
 
I
I
 
V
D
 
D
T
 
V
K
 
R
E
 
D
A
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
A
N
 
N
M
 
T
I
 
V
N
 
N
S
 
T
M
 
M
L
 
A
E
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
A
D
 
P
K
 
L
L
 
M
R
 
E
T
 
A
T
 
I
G
 
T
H
 
G
H
 
G
D
 
Q
V
 
V
L
 
R
M
 
L
A
 
R
I
 
I
L
 
L
S
 
S
N
 
N
Y
 
L
T
 
A
T
 
D
E
 
L
C
 
R
L
 
L
V
 
A
T
 
R
A
 
A
S
 
Q
C
 
V
Q
 
R
I
 
I
P
 
T
V
 
P
A
 
Q
N
 
Q
L
 
L
A
 
E
K
 
T
N
 
A
G
 
E
L
 
F
P
 
S
G
 
G
L
 
E
K
 
A
I
 
V
A
 
I
Q
 
E
K
 
G
L
 
I
A
 
L
Q
 
D
A
 
A
S
 
Y
R
 
A
V
 
F
A
 
A
Q
 
A
V
 
V
D
 
D
P
 
P
Y
 
Y
R
|
R
A
 
A
A
 
A
T
|
T
H
 
H
N
 
N
K
|
K
G
 
G
I
 
I
M
 
M
N
|
N
G
 
G
I
 
I
D
 
D
A
 
P
A
 
L
V
 
I
I
 
V
A
 
A
S
 
T
G
 
G
N
 
N
D
 
D
W
 
W
R
 
R
A
 
A
I
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
G
A
 
A
H
 
H
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
C
R
 
R
D
 
S
G
 
G
Q
 
H
Y
 
Y
R
 
G
G
 
S
L
 
L
S
 
T
T
 
T
W
 
W
-
 
E
K
 
K
V
 
D
A
 
N
G
 
N
D
 
G
Q
 
H
L
 
L
E
 
V
G
 
G
E
 
T
L
 
L
S
 
E
L
 
M
P
 
P
V
 
M
P
 
P
V
 
V
G
 
G
S
 
L
V
 
V
G
 
G
G
 
G
S
 
A
I
 
T
G
 
K
I
 
T
V
 
H
P
 
P
L
 
L
V
 
A
Q
 
Q
V
 
L
N
 
S
S
 
L
A
 
R
L
 
I
R
 
L
S
 
G
E
 
V
K
 
K
D
 
T
A
 
A
L
 
Q
G
 
A
L
 
L
E
 
A
K
 
E
I
 
I
I
 
A
A
 
V
S
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
|
Q
N
 
N
L
 
L
A
 
G
A
|
A
L
 
M
Y
 
R
A
 
A
L
 
L
V
 
A
T
 
T

Query Sequence

>WP_017866878.1 NCBI__GCF_000349725.1:WP_017866878.1
MQGFEKYYRKTWSQRLDILTQQNKLSEKQVEQLKQNAVTPVLGEAQIENFLTQFQLPEGL
ALNFVIDGKEYLIPMVIEEPSVIAGASHGAAIVKKTGGFHTKSSRRAMRGQVVLENVTDL
VATKKKIEEQETELMQAAVDAHPSIVKRGGGPLALKVRILEQGLLSVDLIIDTKEAMGAN
MINSMLEAVADKLRTTGHHDVLMAILSNYTTECLVTASCQIPVANLAKNGLPGLKIAQKL
AQASRVAQVDPYRAATHNKGIMNGIDAAVIASGNDWRAIEAAAHAYAARDGQYRGLSTWK
VAGDQLEGELSLPVPVGSVGGSIGIVPLVQVNSALRSEKDALGLEKIIASVGLAQNLAAL
YALVTDGIQKGHMNLQMKSLAVSVGAKEDEIEQVVSVLQKLPQQDQAIAQHVLDEIRNEA
SENE

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory