SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_017895435.1 NCBI__GCF_000816635.1:WP_017895435.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

8gobA Crystal structure of glycerol dehydrogenase in the presence of NAD+ (see paper)
48% identity, 99% coverage: 5:364/364 of query aligns to 3:364/367 of 8gobA

query
sites
8gobA
K
 
R
L
 
I
L
 
I
R
 
Q
A
 
S
P
 
P
L
 
G
K
 
K
Y
 
Y
L
 
I
Q
 
Q
G
 
G
R
 
A
G
 
D
A
 
V
L
 
I
L
 
N
N
 
R
F
 
L
Y
 
G
E
 
E
E
 
Y
T
 
L
K
 
K
D
 
P
L
 
L
G
 
A
S
 
E
S
 
R
Y
 
W
L
 
L
F
 
V
I
 
V
C
 
G
S
x
D
K
 
K
S
x
F
G
 
V
Y
 
L
K
 
G
Y
 
F
C
 
A
H
 
Q
E
 
S
K
 
T
I
 
V
E
 
E
K
 
K
S
 
S
F
 
F
E
 
K
G
 
D
S
 
A
D
 
G
C
 
L
K
 
V
L
 
V
H
 
E
F
 
I
E
 
A
V
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
E
S
 
C
S
 
S
K
 
Q
S
 
N
E
 
E
I
 
I
Q
 
D
K
 
R
M
 
L
R
 
R
K
 
G
I
 
I
V
 
A
Q
 
E
D
 
T
E
 
A
G
 
Q
I
 
C
Q
 
G
V
 
A
V
 
I
V
 
L
G
 
G
I
 
I
G
 
G
G
|
G
G
|
G
S
x
K
A
 
T
I
 
L
D
|
D
T
 
T
A
 
A
K
 
K
A
 
A
T
 
L
A
 
A
H
 
H
Y
 
F
E
 
M
K
 
G
L
 
V
P
 
P
V
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
A
P
 
P
T
|
T
V
x
I
T
 
A
A
x
S
T
|
T
D
|
D
A
|
A
P
 
P
C
 
C
T
x
S
G
 
A
L
|
L
S
 
S
V
|
V
I
 
I
Y
|
Y
N
 
T
D
 
D
D
 
E
E
 
G
T
 
E
F
 
F
D
 
D
T
 
R
Y
 
Y
L
 
L
F
 
L
Y
 
L
P
 
P
K
 
N
N
 
N
P
 
P
E
 
N
A
 
M
V
 
V
I
 
I
V
 
V
D
 
D
S
 
T
E
 
K
I
 
I
I
 
V
A
 
A
N
 
G
A
|
A
P
 
P
T
 
A
K
 
R
F
 
L
L
 
L
V
 
A
A
 
A
G
 
G
M
 
I
G
 
G
D
|
D
A
 
A
L
 
L
G
 
A
T
 
T
Y
 
W
F
 
F
E
 
E
A
 
A
R
 
R
A
 
A
C
 
C
K
 
S
R
 
R
S
 
S
D
 
G
S
 
A
P
 
T
S
 
T
L
 
M
E
 
A
N
 
G
G
 
G
G
 
K
I
 
C
S
 
T
L
 
Q
S
 
A
A
 
A
M
 
L
A
 
A
L
 
L
C
 
A
E
 
E
L
 
L
C
 
C
Y
 
Y
K
 
N
T
 
T
L
 
L
L
 
L
E
 
E
N
 
E
G
 
G
Y
 
E
Q
 
K
A
 
A
K
 
M
L
 
L
S
 
A
C
 
A
E
 
E
N
 
Q
H
 
H
L
 
V
I
 
V
T
 
T
P
 
P
A
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
R
I
 
V
I
 
I
E
 
E
A
 
A
N
 
N
V
 
T
Y
 
Y
L
 
L
S
 
S
G
 
G
V
 
V
G
 
G
A
 
F
D
 
E
N
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
L
A
 
A
V
 
A
S
 
A
H
|
H
S
 
A
V
 
V
Y
 
H
N
 
N
G
 
G
F
 
L
T
 
T
A
 
A
L
 
I
K
 
P
E
 
D
C
 
A
E
 
H
S
 
H
T
 
Y
M
 
Y
H
|
H
G
 
G
S
 
E
I
 
K
V
 
V
A
 
A
F
 
F
G
 
G
T
 
T
I
 
L
A
 
T
Q
 
Q
L
 
L
I
 
V
L
 
L
E
 
E
N
 
N
A
 
A
P
 
P
K
 
V
E
 
E
E
 
E
I
 
I
K
 
E
K
 
T
V
 
V
M
 
A
D
 
A
F
 
L
C
 
S
Y
 
H
S
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
P
V
 
I
T
 
T
L
 
L
K
 
A
E
 
Q
I
 
L
G
 
D
I
 
I
T
 
K
-
 
E
D
 
D
V
 
V
-
 
P
Q
 
A
R
 
K
V
 
M
H
 
R
I
 
I
A
 
V
A
 
A
E
 
E
N
 
A
A
 
A
C
 
C
V
 
A
P
 
E
G
 
G
E
 
E
T
 
T
A
 
I
H
 
H
N
 
N
L
 
M
V
 
P
G
 
G
D
 
G
V
 
A
T
 
T
P
 
P
D
 
D
Q
 
Q
L
 
V
Y
 
Y
D
 
A
A
 
A
L
 
L
L
 
L
T
 
V
A
 
A
D
 
D
L
 
Q
L
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
E
 
R
Y
 
F
F
 
L
K
 
Q

8goaA Crystal structure of glycerol dehydrogenase in the absence of NAD+ (see paper)
48% identity, 99% coverage: 5:364/364 of query aligns to 3:364/367 of 8goaA

query
sites
8goaA
K
 
R
L
 
I
L
 
I
R
 
Q
A
 
S
P
 
P
L
 
G
K
 
K
Y
 
Y
L
 
I
Q
 
Q
G
 
G
R
 
A
G
 
D
A
 
V
L
 
I
L
 
N
N
 
R
F
 
L
Y
 
G
E
 
E
E
 
Y
T
 
L
K
 
K
D
 
P
L
 
L
G
 
A
S
 
E
S
 
R
Y
 
W
L
 
L
F
 
V
I
 
V
C
 
G
S
 
D
K
 
K
S
 
F
G
 
V
Y
 
L
K
 
G
Y
 
F
C
 
A
H
 
Q
E
 
S
K
 
T
I
 
V
E
 
E
K
 
K
S
 
S
F
 
F
E
 
K
G
 
D
S
 
A
D
 
G
C
 
L
K
 
V
L
 
V
H
 
E
F
 
I
E
 
A
V
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
E
S
 
C
S
 
S
K
 
Q
S
 
N
E
 
E
I
 
I
Q
 
D
K
 
R
M
 
L
R
 
R
K
 
G
I
 
I
V
 
A
Q
 
E
D
 
T
E
 
A
G
 
Q
I
 
C
Q
 
G
V
 
A
V
 
I
V
 
L
G
 
G
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
K
A
 
T
I
 
L
D
 
D
T
 
T
A
 
A
K
 
K
A
 
A
T
 
L
A
 
A
H
 
H
Y
 
F
E
 
M
K
 
G
L
 
V
P
 
P
V
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
A
P
 
P
T
 
T
V
 
I
T
 
A
A
 
S
T
 
T
D
 
D
A
 
A
P
 
P
C
 
C
T
 
S
G
 
A
L
 
L
S
 
S
V
 
V
I
 
I
Y
 
Y
N
 
T
D
 
D
D
 
E
E
 
G
T
 
E
F
 
F
D
 
D
T
 
R
Y
 
Y
L
 
L
F
 
L
Y
 
L
P
 
P
K
 
N
N
 
N
P
 
P
E
 
N
A
 
M
V
 
V
I
 
I
V
 
V
D
 
D
S
 
T
E
 
K
I
 
I
I
 
V
A
 
A
N
 
G
A
 
A
P
 
P
T
 
A
K
 
R
F
 
L
L
 
L
V
 
A
A
 
A
G
 
G
M
 
I
G
 
G
D
|
D
A
 
A
L
 
L
G
 
A
T
 
T
Y
 
W
F
 
F
E
 
E
A
 
A
R
 
R
A
 
A
C
 
C
K
 
S
R
 
R
S
 
S
D
 
G
S
 
A
P
 
T
S
 
T
L
 
M
E
 
A
N
 
G
G
 
G
G
 
K
I
 
C
S
 
T
L
 
Q
S
 
A
A
 
A
M
 
L
A
 
A
L
 
L
C
 
A
E
 
E
L
 
L
C
 
C
Y
 
Y
K
 
N
T
 
T
L
 
L
L
 
L
E
 
E
N
 
E
G
 
G
Y
 
E
Q
 
K
A
 
A
K
 
M
L
 
L
S
 
A
C
 
A
E
 
E
N
 
Q
H
 
H
L
 
V
I
 
V
T
 
T
P
 
P
A
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
R
I
 
V
I
 
I
E
 
E
A
 
A
N
 
N
V
 
T
Y
 
Y
L
 
L
S
 
S
G
 
G
V
 
V
G
 
G
A
 
F
D
 
E
N
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
L
A
 
A
V
 
A
S
 
A
H
|
H
S
 
A
V
 
V
Y
 
H
N
 
N
G
 
G
F
 
L
T
 
T
A
 
A
L
 
I
K
 
P
E
 
D
C
 
A
E
 
H
S
 
H
T
 
Y
M
 
Y
H
|
H
G
 
G
S
 
E
I
 
K
V
 
V
A
 
A
F
 
F
G
 
G
T
 
T
I
 
L
A
 
T
Q
 
Q
L
 
L
I
 
V
L
 
L
E
 
E
N
 
N
A
 
A
P
 
P
K
 
V
E
 
E
E
 
E
I
 
I
K
 
E
K
 
T
V
 
V
M
 
A
D
 
A
F
 
L
C
 
S
Y
 
H
S
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
P
V
 
I
T
 
T
L
 
L
K
 
A
E
 
Q
I
 
L
G
 
D
I
 
I
T
 
K
-
 
E
D
 
D
V
 
V
-
 
P
Q
 
A
R
 
K
V
 
M
H
 
R
I
 
I
A
 
V
A
 
A
E
 
E
N
 
A
A
 
A
C
 
C
V
 
A
P
 
E
G
 
G
E
 
E
T
 
T
A
 
I
H
 
H
N
 
N
L
 
M
V
 
P
G
 
G
D
 
G
V
 
A
T
 
T
P
 
P
D
 
D
Q
 
Q
L
 
V
Y
 
Y
D
 
A
A
 
A
L
 
L
L
 
L
T
 
V
A
 
A
D
 
D
L
 
Q
L
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
E
 
R
Y
 
F
F
 
L
K
 
Q

5zxlA Structure of glda from e.Coli (see paper)
48% identity, 99% coverage: 5:364/364 of query aligns to 3:364/367 of 5zxlA

query
sites
5zxlA
K
 
R
L
 
I
L
 
I
R
 
Q
A
 
S
P
 
P
L
 
G
K
 
K
Y
 
Y
L
 
I
Q
 
Q
G
 
G
R
 
A
G
 
D
A
 
V
L
 
I
L
 
N
N
 
R
F
 
L
Y
 
G
E
 
E
E
 
Y
T
 
L
K
 
K
D
 
P
L
 
L
G
 
A
S
 
E
S
 
R
Y
 
W
L
 
L
F
 
V
I
 
V
C
 
G
S
 
D
K
 
K
S
 
F
G
 
V
Y
 
L
K
 
G
Y
 
F
C
 
A
H
 
Q
E
 
S
K
 
T
I
 
V
E
 
E
K
 
K
S
 
S
F
 
F
E
 
K
G
 
D
S
 
A
D
 
G
C
 
L
K
 
V
L
 
V
H
 
E
F
 
I
E
 
A
V
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
E
S
 
C
S
 
S
K
 
Q
S
 
N
E
 
E
I
 
I
Q
 
D
K
 
R
M
 
L
R
 
R
K
 
G
I
 
I
V
 
A
Q
 
E
D
 
T
E
 
A
G
 
Q
I
 
C
Q
 
G
V
 
A
V
 
I
V
 
L
G
 
G
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
K
A
 
T
I
 
L
D
 
D
T
 
T
A
 
A
K
 
K
A
 
A
T
 
L
A
 
A
H
 
H
Y
 
F
E
 
M
K
 
G
L
 
V
P
 
P
V
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
A
P
 
P
T
 
T
V
 
I
T
 
A
A
 
S
T
 
T
D
|
D
A
 
A
P
 
P
C
 
C
T
 
S
G
 
A
L
 
L
S
 
S
V
 
V
I
 
I
Y
 
Y
N
 
T
D
 
D
D
 
E
E
 
G
T
 
E
F
 
F
D
 
D
T
 
R
Y
 
Y
L
 
L
F
 
L
Y
 
L
P
 
P
K
 
N
N
 
N
P
 
P
E
 
N
A
 
M
V
 
V
I
 
I
V
 
V
D
 
D
S
 
T
E
 
K
I
 
I
I
 
V
A
 
A
N
 
G
A
 
A
P
 
P
T
 
A
K
 
R
F
 
L
L
 
L
V
 
A
A
 
A
G
 
G
M
 
I
G
 
G
D
|
D
A
 
A
L
 
L
G
 
A
T
 
T
Y
 
W
F
 
F
E
 
E
A
 
A
R
 
R
A
 
A
C
 
C
K
 
S
R
 
R
S
 
S
D
 
G
S
 
A
P
 
T
S
 
T
L
 
M
E
 
A
N
 
G
G
 
G
G
 
K
I
 
C
S
 
T
L
 
Q
S
 
A
A
 
A
M
 
L
A
 
A
L
 
L
C
 
A
E
 
E
L
 
L
C
 
C
Y
 
Y
K
 
N
T
 
T
L
 
L
L
 
L
E
 
E
N
 
E
G
 
G
Y
 
E
Q
 
K
A
 
A
K
 
M
L
 
L
S
 
A
C
 
A
E
 
E
N
 
Q
H
 
H
L
 
V
I
 
V
T
 
T
P
 
P
A
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
R
I
 
V
I
 
I
E
 
E
A
 
A
N
 
N
V
 
T
Y
 
Y
L
 
L
S
 
S
G
 
G
V
 
V
G
 
G
A
x
F
D
 
E
N
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
L
A
 
A
V
 
A
S
 
A
H
|
H
S
 
A
V
 
V
Y
x
H
N
 
N
G
 
G
F
 
L
T
 
T
A
 
A
L
 
I
K
 
P
E
 
D
C
 
A
E
 
H
S
 
H
T
 
Y
M
 
Y
H
|
H
G
 
G
S
 
E
I
 
K
V
 
V
A
 
A
F
 
F
G
 
G
T
 
T
I
 
L
A
 
T
Q
 
Q
L
 
L
I
 
V
L
 
L
E
 
E
N
 
N
A
 
A
P
 
P
K
 
V
E
 
E
E
 
E
I
 
I
K
 
E
K
 
T
V
 
V
M
 
A
D
 
A
F
 
L
C
 
S
Y
 
H
S
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
P
V
 
I
T
 
T
L
 
L
K
 
A
E
 
Q
I
 
L
G
 
D
I
 
I
T
 
K
-
 
E
D
 
D
V
 
V
-
 
P
Q
 
A
R
 
K
V
 
M
H
 
R
I
 
I
A
 
V
A
 
A
E
 
E
N
 
A
A
 
A
C
 
C
V
 
A
P
 
E
G
 
G
E
 
E
T
 
T
A
 
I
H
 
H
N
 
N
L
 
M
V
 
P
G
 
G
D
 
G
V
 
A
T
 
T
P
 
P
D
 
D
Q
 
Q
L
 
V
Y
 
Y
D
 
A
A
 
A
L
 
L
L
 
L
T
 
V
A
 
A
D
 
D
L
 
Q
L
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
E
 
R
Y
 
F
F
 
L
K
 
Q

P0A9S5 Glycerol dehydrogenase; GDH; GLDH; (R)-aminopropanol dehydrogenase; 1,2-propanediol dehydrogenase; D-1-amino-2-propanol oxidoreductase; EC 1.1.1.6; EC 1.1.1.75 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
48% identity, 99% coverage: 5:364/364 of query aligns to 3:364/367 of P0A9S5

query
sites
P0A9S5
K
 
R
L
 
I
L
 
I
R
 
Q
A
 
S
P
 
P
L
 
G
K
 
K
Y
 
Y
L
 
I
Q
 
Q
G
 
G
R
 
A
G
 
D
A
 
V
L
 
I
L
 
N
N
 
R
F
 
L
Y
 
G
E
 
E
E
 
Y
T
 
L
K
 
K
D
 
P
L
 
L
G
 
A
S
 
E
S
 
R
Y
 
W
L
 
L
F
 
V
I
 
V
C
 
G
S
 
D
K
 
K
S
 
F
G
 
V
Y
 
L
K
 
G
Y
 
F
C
 
A
H
 
Q
E
 
S
K
 
T
I
 
V
E
 
E
K
 
K
S
 
S
F
 
F
E
 
K
G
 
D
S
 
A
D
 
G
C
 
L
K
 
V
L
 
V
H
 
E
F
 
I
E
 
A
V
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
E
S
 
C
S
 
S
K
 
Q
S
 
N
E
 
E
I
 
I
Q
 
D
K
 
R
M
 
L
R
 
R
K
 
G
I
 
I
V
 
A
Q
 
E
D
 
T
E
 
A
G
 
Q
I
 
C
Q
 
G
V
 
A
V
 
I
V
 
L
G
 
G
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
K
A
 
T
I
 
L
D
 
D
T
 
T
A
 
A
K
 
K
A
 
A
T
 
L
A
 
A
H
 
H
Y
 
F
E
 
M
K
 
G
L
 
V
P
 
P
V
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
A
P
 
P
T
 
T
V
 
I
T
 
A
A
 
S
T
 
T
D
|
D
A
 
A
P
 
P
C
 
C
T
 
S
G
 
A
L
 
L
S
 
S
V
 
V
I
 
I
Y
 
Y
N
 
T
D
 
D
D
 
E
E
 
G
T
 
E
F
 
F
D
 
D
T
 
R
Y
 
Y
L
 
L
F
 
L
Y
 
L
P
 
P
K
 
N
N
 
N
P
 
P
E
 
N
A
 
M
V
 
V
I
 
I
V
 
V
D
 
D
S
 
T
E
 
K
I
 
I
I
 
V
A
 
A
N
 
G
A
 
A
P
 
P
T
 
A
K
 
R
F
 
L
L
 
L
V
 
A
A
 
A
G
 
G
M
 
I
G
 
G
D
|
D
A
 
A
L
 
L
G
 
A
T
 
T
Y
 
W
F
 
F
E
 
E
A
 
A
R
 
R
A
 
A
C
 
C
K
 
S
R
 
R
S
 
S
D
 
G
S
 
A
P
 
T
S
 
T
L
 
M
E
 
A
N
 
G
G
 
G
G
 
K
I
 
C
S
 
T
L
 
Q
S
 
A
A
 
A
M
 
L
A
 
A
L
 
L
C
 
A
E
 
E
L
 
L
C
 
C
Y
 
Y
K
 
N
T
 
T
L
 
L
L
 
L
E
 
E
N
 
E
G
 
G
Y
 
E
Q
 
K
A
 
A
K
 
M
L
 
L
S
 
A
C
 
A
E
 
E
N
 
Q
H
 
H
L
 
V
I
 
V
T
 
T
P
 
P
A
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
R
I
 
V
I
 
I
E
 
E
A
 
A
N
 
N
V
 
T
Y
 
Y
L
 
L
S
 
S
G
 
G
V
 
V
G
 
G
A
 
F
D
 
E
N
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
L
A
 
A
V
 
A
S
 
A
H
|
H
S
 
A
V
 
V
Y
 
H
N
 
N
G
 
G
F
 
L
T
 
T
A
 
A
L
 
I
K
 
P
E
 
D
C
 
A
E
 
H
S
 
H
T
 
Y
M
 
Y
H
|
H
G
 
G
S
 
E
I
 
K
V
 
V
A
 
A
F
 
F
G
 
G
T
 
T
I
 
L
A
 
T
Q
 
Q
L
 
L
I
 
V
L
 
L
E
 
E
N
 
N
A
 
A
P
 
P
K
 
V
E
 
E
E
 
E
I
 
I
K
 
E
K
 
T
V
 
V
M
 
A
D
 
A
F
 
L
C
 
S
Y
 
H
S
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
P
V
 
I
T
 
T
L
 
L
K
 
A
E
 
Q
I
 
L
G
 
D
I
 
I
T
 
K
-
 
E
D
 
D
V
 
V
-
 
P
Q
 
A
R
 
K
V
 
M
H
 
R
I
 
I
A
 
V
A
 
A
E
 
E
N
 
A
A
 
A
C
 
C
V
 
A
P
 
E
G
 
G
E
 
E
T
 
T
A
 
I
H
 
H
N
 
N
L
 
M
V
 
P
G
 
G
D
 
G
V
 
A
T
 
T
P
 
P
D
 
D
Q
 
Q
L
 
V
Y
 
Y
D
 
A
A
 
A
L
 
L
L
 
L
T
 
V
A
 
A
D
 
D
L
 
Q
L
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
E
 
R
Y
 
F
F
 
L
K
 
Q

8k1hA Crystal structure of ethylene glycol-bound glycerol dehydrogenase from klebsiella pneumoniae
47% identity, 99% coverage: 5:364/364 of query aligns to 3:364/367 of 8k1hA

query
sites
8k1hA
K
 
R
L
 
I
L
 
I
R
 
Q
A
 
S
P
 
P
L
 
G
K
 
K
Y
 
Y
L
 
I
Q
 
Q
G
 
G
R
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
I
L
 
K
N
 
R
F
 
L
Y
 
G
E
 
D
E
 
Y
T
 
L
K
 
K
D
 
P
L
 
L
G
 
A
S
 
E
S
 
R
Y
 
W
L
 
L
F
 
V
I
 
V
C
 
G
S
x
D
K
 
K
S
x
F
G
 
V
Y
 
L
K
 
G
Y
 
F
C
 
A
H
 
E
E
 
E
K
 
M
I
 
L
E
 
R
K
 
K
S
 
S
F
 
L
E
 
A
G
 
D
S
 
A
D
 
G
C
 
L
K
 
A
L
 
A
H
 
E
F
 
I
E
 
A
V
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
E
S
 
C
S
 
S
K
 
H
S
 
N
E
 
E
I
 
I
Q
 
N
K
 
R
M
 
L
R
 
R
K
 
D
I
 
I
V
 
A
Q
 
G
D
 
N
E
 
A
G
 
K
I
 
C
Q
 
T
V
 
A
V
 
V
V
 
L
G
 
G
I
 
I
G
 
G
G
|
G
G
|
G
S
x
K
A
 
T
I
 
L
D
|
D
T
 
T
A
 
A
K
 
K
A
 
A
T
 
L
A
 
A
H
 
H
Y
 
F
E
 
M
K
 
N
L
 
V
P
 
P
V
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
A
P
 
P
T
|
T
V
x
I
T
 
A
A
 
S
T
|
T
D
 
D
A
|
A
P
 
P
C
 
C
T
x
S
G
 
A
L
|
L
S
 
S
V
|
V
I
 
I
Y
|
Y
N
 
T
D
 
D
D
 
E
E
 
G
T
 
E
F
 
F
D
 
D
T
 
S
Y
 
Y
L
 
L
F
 
M
Y
 
L
P
 
P
K
 
R
N
 
N
P
 
P
E
 
N
A
 
M
V
 
V
I
 
I
V
 
V
D
 
D
S
 
T
E
 
Q
I
 
I
I
 
V
A
 
A
N
 
G
A
 
A
P
 
P
T
 
A
K
 
R
F
 
L
L
 
L
V
 
A
A
 
A
G
 
G
M
 
I
G
 
G
D
|
D
A
 
A
L
 
L
G
 
A
T
 
T
Y
 
W
F
 
F
E
 
E
A
 
A
R
 
R
A
 
A
C
 
C
K
 
S
R
 
R
S
 
S
D
 
G
S
 
A
P
 
T
S
 
T
L
 
M
E
 
A
N
 
G
G
 
G
G
 
K
I
 
C
S
 
T
L
 
Q
S
 
A
A
 
A
M
 
L
A
 
A
L
 
L
C
 
A
E
 
E
L
 
L
C
 
C
Y
 
Y
K
 
N
T
 
T
L
 
L
L
 
L
E
 
E
N
 
E
G
 
G
Y
 
E
Q
 
K
A
 
A
K
 
M
L
 
L
S
 
A
C
 
A
E
 
E
N
 
Q
H
 
H
L
 
V
I
 
V
T
 
T
P
 
P
A
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
R
I
 
V
I
 
V
E
 
E
A
 
A
N
 
N
V
 
T
Y
 
Y
L
 
L
S
 
S
G
 
G
V
 
V
G
 
G
A
 
F
D
 
E
N
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
L
A
 
A
V
 
A
S
 
A
H
|
H
S
 
A
V
 
I
Y
 
H
N
 
N
G
 
G
F
 
M
T
 
T
A
 
A
L
 
I
K
 
P
E
 
D
C
 
A
E
 
H
S
 
H
T
 
Y
M
 
Y
H
|
H
G
 
G
S
 
E
I
 
K
V
 
V
A
 
A
F
 
F
G
 
G
T
 
T
I
 
L
A
 
T
Q
 
Q
L
 
L
I
 
V
L
 
L
E
 
E
N
 
N
A
 
A
P
 
P
K
 
V
E
 
D
E
 
E
I
 
I
K
 
E
K
 
T
V
 
V
M
 
A
D
 
A
F
 
L
C
 
C
Y
 
H
S
 
S
V
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
P
V
 
I
T
 
T
L
 
L
K
 
A
E
 
Q
I
 
L
G
 
D
I
 
I
T
 
K
-
 
G
D
 
D
V
 
I
-
 
P
Q
 
T
R
 
K
V
 
M
H
 
R
I
 
L
A
 
V
A
 
A
E
 
E
N
 
A
A
 
A
C
 
C
V
 
A
P
 
E
G
 
G
E
 
E
T
 
T
A
 
I
H
 
H
N
 
N
L
 
M
V
 
P
G
 
G
D
 
G
V
 
V
T
 
D
P
 
S
D
 
D
Q
 
Q
L
 
V
Y
 
Y
D
 
A
A
 
A
L
 
L
L
 
L
T
 
V
A
 
A
D
 
D
L
 
Q
L
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
E
 
R
Y
 
F
F
 
L
K
 
Q

8k1gA Crystal structure of ethylene glycol-bound glycerol dehydrogenase from klebsiella pneumoniae
47% identity, 99% coverage: 5:364/364 of query aligns to 3:364/367 of 8k1gA

query
sites
8k1gA
K
 
R
L
 
I
L
 
I
R
 
Q
A
 
S
P
 
P
L
 
G
K
 
K
Y
 
Y
L
 
I
Q
 
Q
G
 
G
R
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
I
L
 
K
N
 
R
F
 
L
Y
 
G
E
 
D
E
 
Y
T
 
L
K
 
K
D
 
P
L
 
L
G
 
A
S
 
E
S
 
R
Y
 
W
L
 
L
F
 
V
I
 
V
C
 
G
S
 
D
K
 
K
S
 
F
G
 
V
Y
 
L
K
 
G
Y
 
F
C
 
A
H
 
E
E
 
E
K
 
M
I
 
L
E
 
R
K
 
K
S
 
S
F
 
L
E
 
A
G
 
D
S
 
A
D
 
G
C
 
L
K
 
A
L
 
A
H
 
E
F
 
I
E
 
A
V
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
E
S
 
C
S
 
S
K
 
H
S
 
N
E
 
E
I
 
I
Q
 
N
K
 
R
M
 
L
R
 
R
K
 
D
I
 
I
V
 
A
Q
 
G
D
 
N
E
 
A
G
 
K
I
 
C
Q
 
T
V
 
A
V
 
V
V
 
L
G
 
G
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
K
A
 
T
I
 
L
D
 
D
T
 
T
A
 
A
K
 
K
A
 
A
T
 
L
A
 
A
H
 
H
Y
 
F
E
 
M
K
 
N
L
 
V
P
 
P
V
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
A
P
 
P
T
 
T
V
 
I
T
 
A
A
 
S
T
 
T
D
|
D
A
 
A
P
 
P
C
 
C
T
 
S
G
 
A
L
 
L
S
 
S
V
 
V
I
 
I
Y
 
Y
N
 
T
D
 
D
D
 
E
E
 
G
T
 
E
F
 
F
D
 
D
T
 
S
Y
 
Y
L
 
L
F
 
M
Y
 
L
P
 
P
K
 
R
N
 
N
P
 
P
E
 
N
A
 
M
V
 
V
I
 
I
V
 
V
D
 
D
S
 
T
E
 
Q
I
 
I
I
 
V
A
 
A
N
 
G
A
 
A
P
 
P
T
 
A
K
 
R
F
 
L
L
 
L
V
 
A
A
 
A
G
 
G
M
 
I
G
 
G
D
|
D
A
 
A
L
 
L
G
 
A
T
 
T
Y
 
W
F
 
F
E
 
E
A
 
A
R
 
R
A
 
A
C
 
C
K
 
S
R
 
R
S
 
S
D
 
G
S
 
A
P
 
T
S
 
T
L
 
M
E
 
A
N
 
G
G
 
G
G
 
K
I
 
C
S
 
T
L
 
Q
S
 
A
A
 
A
M
 
L
A
 
A
L
 
L
C
 
A
E
 
E
L
 
L
C
 
C
Y
 
Y
K
 
N
T
 
T
L
 
L
L
 
L
E
 
E
N
 
E
G
 
G
Y
 
E
Q
 
K
A
 
A
K
 
M
L
 
L
S
 
A
C
 
A
E
 
E
N
 
Q
H
 
H
L
 
V
I
 
V
T
 
T
P
 
P
A
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
R
I
 
V
I
 
V
E
 
E
A
 
A
N
 
N
V
 
T
Y
 
Y
L
 
L
S
 
S
G
 
G
V
 
V
G
 
G
A
 
F
D
 
E
N
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
L
A
 
A
V
 
A
S
 
A
H
 
H
S
 
A
V
 
I
Y
 
H
N
 
N
G
 
G
F
 
M
T
 
T
A
 
A
L
 
I
K
 
P
E
 
D
C
 
A
E
 
H
S
 
H
T
 
Y
M
 
Y
H
|
H
G
 
G
S
 
E
I
 
K
V
 
V
A
 
A
F
 
F
G
 
G
T
 
T
I
 
L
A
 
T
Q
 
Q
L
 
L
I
 
V
L
 
L
E
 
E
N
 
N
A
 
A
P
 
P
K
 
V
E
 
D
E
 
E
I
 
I
K
 
E
K
 
T
V
 
V
M
 
A
D
 
A
F
 
L
C
 
C
Y
 
H
S
 
S
V
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
P
V
 
I
T
 
T
L
 
L
K
 
A
E
 
Q
I
 
L
G
 
D
I
 
I
T
 
K
-
 
G
D
 
D
V
 
I
-
 
P
Q
 
T
R
 
K
V
 
M
H
 
R
I
 
L
A
 
V
A
 
A
E
 
E
N
 
A
A
 
A
C
 
C
V
 
A
P
 
E
G
 
G
E
 
E
T
 
T
A
 
I
H
 
H
N
 
N
L
 
M
V
 
P
G
 
G
D
 
G
V
 
V
T
 
D
P
 
S
D
 
D
Q
 
Q
L
 
V
Y
 
Y
D
 
A
A
 
A
L
 
L
L
 
L
T
 
V
A
 
A
D
 
D
L
 
Q
L
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
E
 
R
Y
 
F
F
 
L
K
 
Q

4mcaA Crystal structure of glycerol dehydrogenase from serratia to 1.9a
44% identity, 99% coverage: 3:364/364 of query aligns to 1:364/367 of 4mcaA

query
sites
4mcaA
I
 
M
L
 
L
K
 
R
L
 
I
L
 
I
R
 
Q
A
 
S
P
 
P
L
 
G
K
 
K
Y
 
Y
L
 
I
Q
 
Q
G
 
G
R
 
A
G
 
N
A
 
A
L
 
L
L
 
A
N
 
A
F
 
V
Y
 
G
E
 
Q
E
 
Y
T
 
A
K
 
K
D
 
S
L
 
L
G
 
A
S
 
D
S
x
H
Y
 
Y
L
 
L
F
 
V
I
 
I
C
 
A
S
 
D
K
 
D
S
 
F
G
 
V
Y
 
M
K
 
K
Y
 
L
C
 
A
H
 
G
E
 
D
K
 
T
I
 
L
E
 
M
K
 
G
S
 
S
F
 
L
E
 
Q
G
 
Q
S
 
H
D
 
G
C
 
V
K
 
K
L
 
H
H
 
H
F
 
A
E
 
A
V
 
L
F
 
F
G
 
N
G
 
G
V
 
E
S
 
C
S
 
C
K
 
H
S
 
K
E
 
E
I
 
I
Q
 
D
K
 
R
M
 
L
R
 
G
K
 
R
I
 
E
V
 
L
Q
 
K
D
 
A
E
 
H
G
 
G
I
x
C
Q
 
R
V
 
G
V
 
V
V
 
I
G
 
G
I
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
K
A
 
T
I
 
L
D
 
D
T
 
T
A
 
A
K
 
K
A
 
A
T
 
I
A
 
A
H
 
H
Y
 
Y
E
 
Q
K
 
Q
L
 
L
P
 
P
V
 
V
A
 
V
I
 
L
V
 
I
P
 
P
T
 
T
V
 
I
T
 
A
A
 
S
T
 
T
D
 
D
A
 
A
P
 
P
C
 
T
T
 
S
G
 
A
L
 
L
S
 
S
V
 
V
I
 
I
Y
 
Y
N
 
T
D
 
E
D
 
Q
E
 
G
T
 
E
F
 
F
D
 
A
T
 
E
Y
 
Y
L
 
L
F
 
I
Y
 
Y
P
 
P
K
 
R
N
 
N
P
 
P
E
 
D
A
 
M
V
 
V
I
 
V
V
 
M
D
 
D
S
 
V
E
 
A
I
 
I
I
 
I
A
 
A
N
 
K
A
 
A
P
 
P
T
 
V
K
 
R
F
 
L
L
 
L
V
 
V
A
 
A
G
 
G
M
 
M
G
 
G
D
|
D
A
 
A
L
 
L
G
 
S
T
 
T
Y
 
Y
F
 
F
E
 
E
A
 
A
R
 
Q
A
 
A
C
 
C
K
 
F
R
 
D
S
 
A
D
 
Q
S
 
A
P
 
T
S
 
S
L
 
M
E
 
A
N
 
G
G
 
G
G
 
K
I
 
S
S
 
T
L
 
L
S
 
A
A
 
A
M
 
L
A
 
S
L
 
L
C
 
A
E
 
R
L
 
L
C
 
C
Y
 
Y
K
 
D
T
 
T
L
 
L
L
 
L
E
 
A
N
 
E
G
 
G
Y
 
V
Q
 
K
A
 
A
K
 
K
L
 
L
S
 
A
C
 
V
E
 
E
N
 
A
H
 
G
L
 
V
I
 
V
T
 
T
P
 
E
A
 
A
L
 
V
E
 
E
A
 
R
I
 
I
I
 
I
E
 
E
A
 
A
N
 
N
V
 
T
Y
 
Y
L
 
L
S
 
S
G
 
G
V
 
I
G
 
G
A
 
F
D
 
E
N
 
S
G
 
S
G
 
G
L
 
L
A
 
A
V
 
A
S
 
A
H
|
H
S
 
A
V
 
I
Y
 
H
N
 
N
G
 
G
F
 
F
T
 
T
A
 
V
L
 
L
K
 
E
E
 
E
C
 
C
E
 
H
S
 
H
T
 
L
M
 
Y
H
|
H
G
 
G
S
 
E
I
 
K
V
 
V
A
 
A
F
 
F
G
 
G
T
 
T
I
 
L
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
I
 
V
L
 
L
E
 
Q
N
 
N
A
 
S
P
 
P
K
 
M
E
 
A
E
 
Q
I
 
I
K
 
E
K
 
T
V
 
V
M
 
L
D
 
A
F
 
F
C
 
C
Y
 
H
S
 
R
V
 
I
G
 
G
L
 
L
P
 
P
V
 
I
T
 
T
L
 
L
K
 
A
E
 
E
I
 
M
G
 
G
I
 
V
T
 
S
D
 
G
-
 
D
-
 
A
V
 
V
Q
 
E
R
 
K
V
 
I
H
 
M
I
 
A
A
 
V
A
 
A
E
 
Q
N
 
A
A
 
S
C
 
C
V
 
A
P
 
A
G
 
G
E
 
E
T
 
T
A
 
I
H
 
H
N
 
N
L
 
M
V
 
P
G
 
F
D
 
K
V
 
V
T
 
T
P
 
P
D
 
A
Q
 
G
L
 
V
Y
 
Q
D
 
A
A
 
A
L
 
I
L
 
L
T
 
T
A
 
A
D
 
D
L
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
S
E
 
A
Y
 
W
F
 
L
K
 
Q

5xn8A Structure of glycerol dehydrogenase crystallised as a contaminant
46% identity, 99% coverage: 3:363/364 of query aligns to 1:363/365 of 5xn8A

query
sites
5xn8A
I
 
M
L
 
L
K
 
K
L
 
V
L
 
I
R
 
Q
A
 
S
P
 
P
L
 
G
K
 
K
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
Q
G
 
G
R
 
P
G
 
D
A
 
A
L
 
S
L
 
T
N
 
L
F
 
F
Y
 
G
E
 
A
E
 
Y
T
 
A
K
 
K
D
 
N
L
 
L
G
 
A
S
 
E
S
 
S
Y
 
F
L
 
F
F
 
V
I
 
I
C
 
A
S
 
D
K
 
D
S
 
F
G
 
V
Y
 
M
K
 
K
Y
 
L
C
 
A
H
 
G
E
 
D
K
 
K
I
 
V
E
 
L
K
 
N
S
 
G
F
 
L
E
 
H
G
 
S
S
 
H
D
 
D
C
 
I
K
 
S
L
 
L
H
 
H
F
 
A
E
 
E
V
 
R
F
 
F
G
 
N
G
 
G
V
 
E
S
 
C
S
 
S
K
 
H
S
 
V
E
 
E
I
 
I
Q
 
R
K
 
R
M
 
L
R
 
I
K
 
A
I
 
I
V
 
L
Q
 
K
D
 
Q
E
 
H
G
 
G
I
 
C
Q
 
R
V
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
I
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
K
A
 
T
I
 
L
D
 
D
T
 
T
A
 
A
K
 
K
A
 
A
T
 
I
A
 
G
H
 
Y
Y
 
Y
E
 
Q
K
 
K
L
 
L
P
 
P
V
 
V
A
 
V
I
 
V
V
 
I
P
 
P
T
 
T
V
 
I
T
 
A
A
 
S
T
 
T
D
 
D
A
 
A
P
 
P
C
 
T
T
 
S
G
 
A
L
 
L
S
 
S
V
 
V
I
 
I
Y
 
Y
N
 
T
D
 
E
D
 
A
E
 
G
T
 
E
F
 
F
D
 
E
T
 
E
Y
 
Y
L
 
L
F
 
I
Y
 
Y
P
 
P
K
 
K
N
 
N
P
 
P
E
 
D
A
 
M
V
 
V
I
 
V
V
 
M
D
 
D
S
 
T
E
 
A
I
 
I
I
 
I
A
 
A
N
 
K
A
 
A
P
 
P
T
 
V
K
 
R
F
 
L
L
 
L
V
 
V
A
 
S
G
 
G
M
 
M
G
 
G
D
|
D
A
 
A
L
 
L
G
 
S
T
 
T
Y
 
W
F
 
F
E
 
E
A
 
A
R
 
K
A
 
A
C
 
C
K
 
Y
R
 
D
S
 
A
D
 
R
S
 
A
P
 
T
S
 
S
L
 
M
E
 
A
N
 
G
G
 
G
G
 
Q
I
 
S
S
 
T
L
 
E
S
 
A
A
 
A
M
 
L
A
 
S
L
 
L
C
 
A
E
 
R
L
 
L
C
 
C
Y
 
Y
K
 
D
T
 
T
L
 
L
L
 
L
E
 
A
N
 
E
G
 
G
Y
 
E
Q
 
K
A
 
A
K
 
R
L
 
L
S
 
A
C
 
A
E
 
Q
N
 
A
H
 
G
L
 
V
I
 
V
T
 
T
P
 
D
A
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
R
I
 
I
I
 
I
E
 
E
A
 
A
N
 
N
V
 
T
Y
 
Y
L
 
L
S
 
S
G
 
G
V
 
I
G
 
G
A
 
F
D
 
E
N
 
S
G
 
S
G
 
G
L
 
L
A
 
A
V
 
A
S
 
A
H
|
H
S
 
A
V
 
I
Y
 
H
N
 
N
G
 
G
F
 
F
T
 
T
A
 
I
L
 
L
K
 
E
E
 
E
C
 
C
E
 
H
S
 
H
T
 
L
M
 
Y
H
|
H
G
 
G
S
 
E
I
 
K
V
 
V
A
 
A
F
 
F
G
 
G
T
 
T
I
 
L
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
I
 
V
L
 
L
E
 
Q
N
 
N
A
 
S
P
 
P
K
 
M
E
 
E
E
 
E
I
 
I
K
 
E
K
 
T
V
 
V
M
 
L
D
 
G
F
 
F
C
 
C
Y
 
E
S
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
P
V
 
V
T
 
T
L
 
L
K
 
A
E
 
Q
I
 
M
G
 
G
I
 
V
T
 
K
D
 
E
-
 
G
-
 
I
V
 
D
Q
 
D
R
 
K
V
 
I
H
 
A
I
 
A
A
 
V
A
 
A
E
 
K
N
 
A
A
 
T
C
 
C
V
 
A
P
 
E
G
 
G
E
 
E
T
 
T
A
 
I
H
 
H
N
 
N
L
 
M
V
 
P
G
 
F
D
 
A
V
 
V
T
 
T
P
 
P
D
 
E
Q
 
Q
L
 
V
Y
 
H
D
 
A
A
 
A
L
 
I
L
 
L
T
 
T
A
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
E
 
Q
Y
 
W
F
 
L

Q9WYQ4 Glycerol dehydrogenase; GDH; GLDH; EC 1.1.1.6 from Thermotoga maritima (strain ATCC 43589 / DSM 3109 / JCM 10099 / NBRC 100826 / MSB8) (see paper)
45% identity, 96% coverage: 10:360/364 of query aligns to 8:358/364 of Q9WYQ4

query
sites
Q9WYQ4
P
 
P
L
 
G
K
 
R
Y
 
Y
L
 
V
Q
 
Q
G
 
G
R
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
I
L
 
N
N
 
I
F
 
L
Y
 
E
E
 
E
E
 
E
T
 
L
K
 
S
D
 
R
L
 
F
G
 
G
-
 
E
S
 
R
S
 
A
Y
 
F
L
 
V
F
 
V
I
 
I
C
 
D
S
 
D
K
 
F
S
 
V
G
 
D
Y
 
K
K
 
N
Y
 
V
C
 
L
H
 
G
E
 
E
K
 
N
I
 
F
E
 
F
K
 
S
S
 
S
F
 
F
E
 
-
G
 
-
S
 
T
D
 
K
C
 
V
K
 
R
L
 
V
H
 
N
F
 
K
E
 
Q
V
 
I
F
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
E
S
 
C
S
 
S
K
 
D
S
 
E
E
 
E
I
 
I
Q
 
E
K
 
R
M
 
L
R
 
S
K
 
G
I
 
L
V
 
V
Q
 
E
D
 
E
E
 
E
G
 
-
I
 
T
Q
 
D
V
 
V
V
 
V
V
 
V
G
 
G
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
K
A
 
T
I
 
L
D
 
D
T
 
T
A
 
A
K
 
K
A
 
A
T
 
V
A
 
A
H
 
Y
Y
 
K
E
 
L
K
 
K
L
 
K
P
 
P
V
 
V
A
 
V
I
 
I
V
 
V
P
 
P
T
 
T
V
 
I
T
 
A
A
 
S
T
 
T
D
 
D
A
 
A
P
 
P
C
 
C
T
 
S
G
 
A
L
 
L
S
 
S
V
 
V
I
 
I
Y
 
Y
N
 
T
D
 
P
D
 
N
E
 
G
T
 
E
F
 
F
D
 
K
T
 
R
Y
 
Y
L
 
L
F
 
F
Y
 
L
P
 
P
K
 
R
N
 
N
P
 
P
E
 
D
A
 
V
V
 
V
I
 
L
V
 
V
D
 
D
S
 
T
E
 
E
I
 
I
I
 
V
A
 
A
N
 
K
A
 
A
P
 
P
T
 
A
K
 
R
F
 
F
L
 
L
V
 
V
A
 
A
G
 
G
M
 
M
G
 
G
D
|
D
A
 
A
L
 
L
G
 
A
T
 
T
Y
 
W
F
 
F
E
 
E
A
 
A
R
 
E
A
 
S
C
 
C
K
 
K
R
 
Q
S
 
K
D
 
Y
S
 
A
P
 
P
S
 
N
L
 
M
E
 
T
N
 
G
G
 
R
G
 
L
I
 
G
S
 
S
L
 
M
S
 
T
A
 
A
M
 
Y
A
 
A
L
 
L
C
 
A
E
 
R
L
 
L
C
 
C
Y
 
Y
K
 
E
T
 
T
L
 
L
L
 
L
E
 
E
N
 
Y
G
 
G
Y
 
V
Q
 
L
A
 
A
K
 
K
L
 
R
S
 
S
C
 
V
E
 
E
N
 
E
H
 
K
L
 
S
I
 
V
T
 
T
P
 
P
A
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
K
I
 
I
I
 
V
E
 
E
A
 
A
N
 
N
V
 
T
Y
 
L
L
 
L
S
 
S
G
 
G
V
 
L
G
 
G
A
 
F
D
 
E
N
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
L
A
 
A
V
 
A
S
 
A
H
|
H
S
 
A
V
 
I
Y
 
H
N
 
N
G
 
G
F
 
L
T
 
T
A
 
V
L
 
L
K
 
E
E
 
N
C
 
T
E
 
H
S
 
K
T
 
Y
M
 
L
H
|
H
G
 
G
S
 
E
I
 
K
V
 
V
A
 
A
F
 
I
G
 
G
T
 
V
I
 
L
A
 
A
Q
 
S
L
 
L
I
 
F
L
 
L
E
 
T
N
 
D
A
 
K
P
 
P
K
 
R
E
 
K
E
 
M
I
 
I
K
 
E
K
 
E
V
 
V
M
 
Y
D
 
S
F
 
F
C
 
C
Y
 
E
S
 
E
V
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
P
V
 
T
T
 
T
L
 
L
K
 
A
E
 
E
I
 
I
G
 
G
I
 
L
T
 
D
D
 
G
V
 
V
-
 
S
-
 
D
Q
 
E
R
 
D
V
 
L
H
 
M
I
 
K
A
 
V
A
 
A
E
 
E
N
 
K
A
 
A
C
 
C
V
 
D
P
 
K
G
 
N
E
 
E
T
 
T
A
 
I
H
 
H
N
 
N
L
 
E
V
 
P
G
 
Q
D
 
P
V
 
V
T
 
T
P
 
S
D
 
K
Q
 
D
L
 
V
Y
 
F
D
 
F
A
 
A
L
 
L
L
 
K
T
 
A
A
 
A
D
 
D
L
 
R
L
 
Y
G
 
G
Q
 
R

1kq3A Crystal structure of a glycerol dehydrogenase (tm0423) from thermotoga maritima at 1.5 a resolution (see paper)
45% identity, 96% coverage: 10:360/364 of query aligns to 9:359/364 of 1kq3A

query
sites
1kq3A
P
 
P
L
 
G
K
 
R
Y
 
Y
L
 
V
Q
 
Q
G
 
G
R
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
I
L
 
N
N
 
I
F
 
L
Y
 
E
E
 
E
E
 
E
T
 
L
K
 
S
D
 
R
L
 
F
G
 
G
-
 
E
S
 
R
S
 
A
Y
 
F
L
 
V
F
 
V
I
 
I
C
 
D
S
 
D
K
 
F
S
 
V
G
 
D
Y
 
K
K
 
N
Y
 
V
C
 
L
H
 
G
E
 
E
K
 
N
I
 
F
E
 
F
K
 
S
S
 
S
F
 
F
E
 
-
G
 
-
S
 
T
D
 
K
C
 
V
K
 
R
L
 
V
H
 
N
F
 
K
E
 
Q
V
 
I
F
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
E
S
 
C
S
 
S
K
 
D
S
 
E
E
 
E
I
 
I
Q
 
E
K
 
R
M
 
L
R
 
S
K
 
G
I
 
L
V
 
V
Q
 
E
D
 
E
E
 
E
G
 
-
I
 
T
Q
 
D
V
 
V
V
 
V
V
 
V
G
 
G
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
K
A
 
T
I
 
L
D
 
D
T
 
T
A
 
A
K
 
K
A
 
A
T
 
V
A
 
A
H
 
Y
Y
 
K
E
 
L
K
 
K
L
 
K
P
 
P
V
 
V
A
 
V
I
 
I
V
 
V
P
 
P
T
 
T
V
 
I
T
 
A
A
 
S
T
 
T
D
 
D
A
 
A
P
 
P
C
 
C
T
 
S
G
 
A
L
 
L
S
 
S
V
 
V
I
 
I
Y
 
Y
N
 
T
D
 
P
D
 
N
E
 
G
T
 
E
F
 
F
D
 
K
T
 
R
Y
 
Y
L
 
L
F
 
F
Y
 
L
P
 
P
K
 
R
N
 
N
P
 
P
E
 
D
A
 
V
V
 
V
I
 
L
V
 
V
D
 
D
S
 
T
E
 
E
I
 
I
I
 
V
A
 
A
N
 
K
A
 
A
P
 
P
T
 
A
K
 
R
F
 
F
L
 
L
V
 
V
A
 
A
G
 
G
M
 
M
G
 
G
D
|
D
A
 
A
L
 
L
G
 
A
T
 
T
Y
 
W
F
 
F
E
 
E
A
 
A
R
 
E
A
 
S
C
 
C
K
 
K
R
 
Q
S
 
K
D
 
Y
S
 
A
P
 
P
S
 
N
L
 
M
E
 
T
N
 
G
G
 
R
G
 
L
I
 
G
S
 
S
L
 
M
S
 
T
A
 
A
M
 
Y
A
 
A
L
 
L
C
 
A
E
 
R
L
 
L
C
 
C
Y
 
Y
K
 
E
T
 
T
L
 
L
L
 
L
E
 
E
N
 
Y
G
 
G
Y
 
V
Q
 
L
A
 
A
K
 
K
L
 
R
S
 
S
C
 
V
E
 
E
N
 
E
H
 
K
L
 
S
I
 
V
T
 
T
P
 
P
A
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
K
I
 
I
I
 
V
E
 
E
A
 
A
N
 
N
V
 
T
Y
 
L
L
 
L
S
 
S
G
 
G
V
 
L
G
 
G
A
 
F
D
 
E
N
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
L
A
 
A
V
 
A
S
 
A
H
|
H
S
 
A
V
 
I
Y
x
H
N
 
N
G
 
G
F
 
L
T
 
T
A
 
V
L
 
L
K
 
E
E
 
N
C
 
T
E
 
H
S
 
K
T
 
Y
M
 
L
H
|
H
G
 
G
S
 
E
I
 
K
V
 
V
A
 
A
F
 
I
G
 
G
T
 
V
I
 
L
A
 
A
Q
 
S
L
 
L
I
 
F
L
 
L
E
 
T
N
 
D
A
 
K
P
 
P
K
 
R
E
 
K
E
 
M
I
 
I
K
 
E
K
 
E
V
 
V
M
 
Y
D
 
S
F
 
F
C
 
C
Y
 
E
S
 
E
V
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
P
V
 
T
T
 
T
L
 
L
K
 
A
E
 
E
I
 
I
G
 
G
I
 
L
T
 
D
D
 
G
V
 
V
-
 
S
-
 
D
Q
 
E
R
 
D
V
 
L
H
 
M
I
 
K
A
 
V
A
 
A
E
 
E
N
 
K
A
 
A
C
 
C
V
 
D
P
 
K
G
 
N
E
 
E
T
 
T
A
 
I
H
 
H
N
 
N
L
 
E
V
 
P
G
 
Q
D
 
P
V
 
V
T
 
T
P
 
S
D
 
K
Q
 
D
L
 
V
Y
 
F
D
 
F
A
 
A
L
 
L
L
 
K
T
 
A
A
 
A
D
 
D
L
 
R
L
 
Y
G
 
G
Q
 
R

P32816 Glycerol dehydrogenase; GDH; GLDH; GlyDH; EC 1.1.1.6 from Geobacillus stearothermophilus (Bacillus stearothermophilus) (see 2 papers)
39% identity, 99% coverage: 1:362/364 of query aligns to 1:364/370 of P32816

query
sites
P32816
M
 
M
A
 
A
I
 
A
L
 
E
K
 
R
L
 
V
L
 
F
R
 
I
A
 
S
P
 
P
L
 
A
K
 
K
Y
 
Y
L
 
V
Q
 
Q
G
 
G
R
 
K
G
 
N
A
 
V
L
 
I
L
 
T
N
 
K
F
 
I
Y
 
A
E
 
N
E
 
Y
T
 
L
K
 
E
D
 
G
L
 
I
G
 
G
S
 
N
S
 
K
Y
 
T
L
 
V
F
 
V
I
 
I
C
 
A
S
x
D
K
 
E
S
 
I
G
 
V
Y
 
W
K
 
K
Y
 
I
C
 
A
H
 
G
E
 
H
K
 
T
I
 
I
E
 
V
K
 
N
S
 
E
F
 
L
E
 
K
G
 
K
S
 
G
D
 
N
C
 
I
K
 
A
L
 
A
H
 
E
F
 
E
E
 
V
V
 
V
F
 
F
G
 
S
G
 
G
V
 
E
S
 
A
S
 
S
K
 
R
S
 
N
E
 
E
I
 
V
Q
 
E
K
 
R
M
 
I
R
 
A
K
 
N
I
 
I
V
 
A
Q
 
R
D
 
K
E
 
A
G
 
E
I
 
A
Q
 
A
V
 
I
V
 
V
V
 
I
G
 
G
I
 
V
G
 
G
G
 
G
G
|
G
S
x
K
A
 
T
I
 
L
D
 
D
T
 
T
A
 
A
K
 
K
A
 
A
T
 
V
A
 
A
H
 
D
Y
 
E
E
 
L
K
 
D
L
 
A
P
 
Y
V
 
I
A
 
V
I
 
I
V
 
V
P
 
P
T
|
T
V
 
A
T
 
A
A
x
S
T
 
T
D
|
D
A
 
A
P
 
P
C
 
T
T
x
S
G
 
A
L
|
L
S
 
S
V
 
V
I
 
I
Y
|
Y
N
 
S
D
 
D
D
 
D
E
 
G
T
 
V
F
 
F
D
 
E
T
 
S
Y
 
Y
L
 
R
F
 
F
Y
 
Y
P
 
K
K
 
K
N
 
N
P
 
P
E
 
D
A
 
L
V
 
V
I
 
L
V
 
V
D
 
D
S
 
T
E
 
K
I
 
I
I
 
I
A
 
A
N
 
N
A
 
A
P
 
P
T
 
P
K
 
R
F
 
L
L
 
L
V
 
A
A
 
S
G
 
G
M
 
I
G
 
A
D
|
D
A
 
A
L
 
L
G
 
A
T
 
T
Y
 
W
F
 
V
E
 
E
A
 
A
R
 
R
A
 
S
C
 
V
K
 
I
R
 
K
S
 
S
D
 
G
S
 
G
P
 
K
S
 
T
L
 
M
E
 
A
N
 
G
G
 
G
G
 
I
I
 
P
S
 
T
L
 
I
S
 
A
A
 
A
M
 
E
A
 
A
L
 
I
C
 
A
E
 
E
L
 
K
C
 
C
Y
 
E
K
 
Q
T
 
T
L
 
L
L
 
F
E
 
K
N
 
Y
G
 
G
Y
 
K
Q
 
L
A
 
A
K
 
Y
L
 
E
S
 
S
C
 
V
E
 
K
N
 
A
H
 
K
L
 
V
I
 
V
T
 
T
P
 
P
A
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
A
I
 
V
I
 
V
E
 
E
A
 
A
N
 
N
V
 
T
Y
 
L
L
 
L
S
 
S
G
 
G
V
 
L
G
 
G
A
 
F
D
 
E
N
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
L
A
 
A
V
 
A
S
 
A
H
|
H
S
 
A
V
 
I
Y
 
H
N
 
N
G
 
G
F
 
F
T
 
T
A
 
A
L
 
L
K
 
E
-
 
G
E
 
E
C
 
I
E
 
H
S
 
H
T
 
L
M
 
T
H
|
H
G
 
G
S
 
E
I
 
K
V
 
V
A
 
A
F
 
F
G
 
G
T
 
T
I
 
L
A
 
V
Q
 
Q
L
 
L
I
 
A
L
 
L
E
 
E
N
 
E
A
 
H
P
 
S
K
 
Q
E
 
Q
E
 
E
I
 
I
K
 
E
K
 
R
V
 
Y
M
 
I
D
 
E
F
 
L
C
 
Y
Y
 
L
S
|
S
V
 
L
G
 
D
L
 
L
P
 
P
V
 
V
T
 
T
L
 
L
K
 
E
E
 
D
I
 
I
G
 
K
I
 
L
T
 
K
D
 
D
V
 
A
Q
 
S
R
 
R
V
 
E
H
 
D
I
 
I
-
 
L
-
 
K
A
 
V
A
 
A
E
 
K
N
 
A
A
 
A
C
 
T
V
 
A
P
 
E
G
 
G
E
 
E
T
 
T
A
 
I
H
 
H
N
 
N
L
 
A
V
 
F
G
 
-
D
 
N
V
 
V
T
 
T
P
 
A
D
 
D
Q
 
D
L
 
V
Y
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
I
L
 
F
T
 
A
A
 
A
D
 
D
L
 
Q
L
 
Y
G
 
A
Q
 
K
E
 
A
Y
 
Y

1jq5A Bacillus stearothermophilus glycerol dehydrogenase complex with NAD+ (see paper)
39% identity, 98% coverage: 5:362/364 of query aligns to 4:363/366 of 1jq5A

query
sites
1jq5A
K
 
R
L
 
V
L
 
F
R
 
I
A
 
S
P
 
P
L
 
A
K
 
K
Y
 
Y
L
 
V
Q
 
Q
G
 
G
R
 
K
G
 
N
A
 
V
L
 
I
L
 
T
N
 
K
F
 
I
Y
 
A
E
 
N
E
 
Y
T
 
L
K
 
E
D
 
G
L
 
I
G
 
G
S
 
N
S
 
K
Y
 
T
L
 
V
F
 
V
I
 
I
C
 
A
S
x
D
K
 
E
S
 
I
G
 
V
Y
 
W
K
 
K
Y
x
I
C
 
A
H
 
G
E
 
H
K
 
T
I
 
I
E
 
V
K
 
N
S
 
E
F
 
L
E
 
K
G
 
K
S
 
G
D
 
N
C
 
I
K
 
A
L
 
A
H
 
E
F
 
E
E
 
V
V
 
V
F
 
F
G
 
S
G
 
G
V
 
E
S
 
A
S
 
S
K
 
R
S
 
N
E
 
E
I
 
V
Q
 
E
K
 
R
M
 
I
R
 
A
K
 
N
I
 
I
V
 
A
Q
 
R
D
 
K
E
 
A
G
 
E
I
 
A
Q
 
A
V
 
I
V
 
V
V
 
I
G
 
G
I
 
V
G
 
G
G
|
G
G
|
G
S
x
K
A
 
T
I
 
L
D
|
D
T
 
T
A
 
A
K
 
K
A
 
A
T
 
V
A
 
A
H
 
D
Y
 
E
E
 
L
K
 
D
L
 
A
P
 
Y
V
 
I
A
 
V
I
 
I
V
 
V
P
 
P
T
|
T
V
 
A
T
 
A
A
x
S
T
|
T
D
|
D
A
|
A
P
 
P
C
 
T
T
x
S
G
 
A
L
|
L
S
 
S
V
|
V
I
 
I
Y
|
Y
N
 
S
D
 
D
D
 
D
E
 
G
T
 
V
F
 
F
D
 
E
T
 
S
Y
 
Y
L
 
R
F
 
F
Y
 
Y
P
 
K
K
 
K
N
 
N
P
 
P
E
 
D
A
 
L
V
 
V
I
 
L
V
 
V
D
 
D
S
 
T
E
 
K
I
 
I
I
 
I
A
 
A
N
 
N
A
|
A
P
|
P
T
 
P
K
 
R
F
 
L
L
 
L
V
 
A
A
 
S
G
 
G
M
 
I
G
 
A
D
|
D
A
 
A
L
 
L
G
 
A
T
 
T
Y
 
W
F
 
V
E
 
E
A
 
A
R
 
R
A
 
S
C
 
V
K
 
I
R
 
K
S
 
S
D
 
G
S
 
G
P
 
K
S
 
T
L
 
M
E
 
A
N
 
G
G
 
G
G
 
I
I
 
P
S
 
T
L
 
I
S
 
A
A
 
A
M
 
E
A
 
A
L
 
I
C
 
A
E
 
E
L
 
K
C
 
C
Y
 
E
K
 
Q
T
 
T
L
 
L
L
 
F
E
 
K
N
 
Y
G
 
G
Y
 
K
Q
 
L
A
 
A
K
 
Y
L
 
E
S
 
S
C
 
V
E
 
K
N
 
A
H
 
K
L
 
V
I
 
V
T
 
T
P
 
P
A
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
A
I
 
V
I
 
V
E
 
E
A
 
A
N
 
N
V
 
T
Y
 
L
L
 
L
S
 
S
G
 
G
V
 
L
G
 
G
A
 
F
D
 
E
N
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
L
A
 
A
V
 
A
S
 
A
H
|
H
S
 
A
V
 
I
Y
x
H
N
 
N
G
 
G
F
 
F
T
 
T
A
 
A
L
 
L
K
 
E
-
 
G
E
|
E
C
 
I
E
 
H
S
x
H
T
 
L
M
 
T
H
|
H
G
 
G
S
 
E
I
 
K
V
 
V
A
 
A
F
 
F
G
 
G
T
 
T
I
 
L
A
 
V
Q
 
Q
L
 
L
I
 
A
L
 
L
E
 
E
N
 
E
A
 
H
P
 
S
K
 
Q
E
 
Q
E
 
E
I
 
I
K
 
E
K
 
R
V
 
Y
M
 
I
D
 
E
F
 
L
C
 
Y
Y
 
L
S
 
C
V
 
L
G
 
D
L
 
L
P
 
P
V
 
V
T
 
T
L
 
L
K
 
E
E
 
D
I
 
I
G
 
K
I
 
L
T
 
K
D
 
D
V
 
A
Q
 
S
R
 
R
V
 
E
H
 
D
I
 
I
-
 
L
-
 
K
A
 
V
A
 
A
E
 
K
N
 
A
A
 
A
C
 
T
V
 
A
P
 
E
G
 
G
E
 
E
T
 
T
A
 
I
H
 
H
N
 
N
L
 
A
V
 
F
G
 
-
D
 
N
V
 
V
T
 
T
P
 
A
D
 
D
Q
 
D
L
 
V
Y
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
I
L
 
F
T
 
A
A
 
A
D
 
D
L
 
Q
L
 
Y
G
 
A
Q
 
K
E
 
A
Y
 
Y

1jqaA Bacillus stearothermophilus glycerol dehydrogenase complex with glycerol (see paper)
38% identity, 98% coverage: 5:362/364 of query aligns to 3:358/361 of 1jqaA

query
sites
1jqaA
K
 
R
L
 
V
L
 
F
R
 
I
A
 
S
P
 
P
L
 
A
K
 
K
Y
 
Y
L
 
V
Q
 
Q
G
 
G
R
 
K
G
 
N
A
 
V
L
 
I
L
 
T
N
 
K
F
 
I
Y
 
A
E
 
N
E
 
Y
T
 
L
K
 
E
D
 
G
L
 
I
G
 
G
S
 
N
S
 
K
Y
 
T
L
 
V
F
 
V
I
 
I
C
 
A
S
 
D
K
 
E
S
 
I
G
 
V
Y
 
W
K
 
K
Y
 
I
C
 
A
H
 
G
E
 
H
K
 
T
I
 
I
E
 
V
K
 
N
S
 
E
F
 
L
E
 
K
G
 
K
S
 
G
D
 
N
C
 
I
K
 
A
L
 
A
H
 
E
F
 
E
E
 
V
V
 
V
F
 
F
G
 
S
G
 
G
V
 
E
S
 
A
S
 
S
K
 
R
S
 
N
E
 
E
I
 
V
Q
 
E
K
 
R
M
 
I
R
 
A
K
 
N
I
 
I
V
 
A
Q
 
R
D
 
K
E
 
A
G
 
E
I
 
A
Q
 
A
V
 
I
V
 
V
V
 
I
G
 
G
I
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
K
A
 
T
I
 
L
D
 
D
T
 
T
A
 
A
K
 
K
A
 
A
T
 
V
A
 
A
H
 
D
Y
 
E
E
 
L
K
 
D
L
 
A
P
 
Y
V
 
I
A
 
V
I
 
I
V
 
V
P
 
P
T
 
T
V
 
A
T
 
A
A
 
S
T
 
T
D
|
D
A
 
A
P
 
P
C
 
T
T
 
S
G
 
A
L
 
L
S
 
S
V
 
V
I
 
I
Y
 
Y
N
 
-
D
 
-
D
 
-
E
 
-
T
 
V
F
 
F
D
 
E
T
 
S
Y
 
Y
L
 
R
F
 
F
Y
 
Y
P
 
K
K
 
K
N
 
N
P
 
P
E
 
D
A
 
L
V
 
V
I
 
L
V
 
V
D
 
D
S
 
T
E
 
K
I
 
I
I
 
I
A
 
A
N
 
N
A
 
A
P
 
P
T
 
P
K
 
R
F
 
L
L
 
L
V
 
A
A
 
S
G
 
G
M
 
I
G
 
A
D
|
D
A
 
A
L
 
L
G
 
A
T
 
T
Y
 
W
F
 
V
E
 
E
A
 
A
R
 
R
A
 
S
C
 
V
K
 
I
R
 
K
S
 
S
D
 
G
S
 
G
P
 
K
S
 
T
L
 
M
E
 
A
N
 
G
G
 
G
G
 
I
I
 
P
S
 
T
L
 
I
S
 
A
A
 
A
M
 
E
A
 
A
L
 
I
C
 
A
E
 
E
L
 
K
C
 
C
Y
 
E
K
 
Q
T
 
T
L
 
L
L
 
F
E
 
K
N
 
Y
G
 
G
Y
 
K
Q
 
L
A
 
A
K
 
Y
L
 
E
S
 
S
C
 
V
E
 
K
N
 
A
H
 
K
L
 
V
I
 
V
T
 
T
P
 
P
A
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
A
I
 
V
I
 
V
E
 
E
A
 
A
N
 
N
V
 
T
Y
 
L
L
 
L
S
 
S
G
 
G
V
 
L
G
 
G
A
x
F
D
 
E
N
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
L
A
 
A
V
 
A
S
 
A
H
|
H
S
 
A
V
 
I
Y
x
H
N
 
N
G
 
G
F
 
F
T
 
T
A
 
A
L
 
L
K
 
E
-
 
G
E
|
E
C
 
I
E
 
H
S
x
H
T
 
L
M
 
T
H
|
H
G
 
G
S
 
E
I
 
K
V
 
V
A
 
A
F
 
F
G
 
G
T
 
T
I
 
L
A
 
V
Q
 
Q
L
 
L
I
 
A
L
 
L
E
 
E
N
 
E
A
 
H
P
 
S
K
 
Q
E
 
Q
E
 
E
I
 
I
K
 
E
K
 
R
V
 
Y
M
 
I
D
 
E
F
 
L
C
 
Y
Y
 
L
S
 
C
V
 
L
G
 
D
L
 
L
P
 
P
V
 
V
T
 
T
L
 
L
K
 
E
E
 
D
I
 
I
G
 
K
I
 
L
T
 
K
D
 
D
V
 
A
Q
 
S
R
 
R
V
 
E
H
 
D
I
 
I
-
 
L
-
 
K
A
 
V
A
 
A
E
 
K
N
 
A
A
 
A
C
 
T
V
 
A
P
 
E
G
 
G
E
 
E
T
 
T
A
 
I
H
 
H
N
 
N
L
 
A
V
 
F
G
 
-
D
 
N
V
 
V
T
 
T
P
 
A
D
 
D
Q
 
D
L
 
V
Y
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
I
L
 
F
T
 
A
A
 
A
D
 
D
L
 
Q
L
 
Y
G
 
A
Q
 
K
E
 
A
Y
 
Y

1ta9B Crystal structure of glycerol dehydrogenase from schizosaccharomyces pombe
36% identity, 98% coverage: 5:362/364 of query aligns to 8:368/394 of 1ta9B

query
sites
1ta9B
K
 
R
L
 
I
L
 
F
R
 
T
A
 
S
P
 
P
L
 
Q
K
 
K
Y
 
Y
L
 
V
Q
 
Q
G
 
G
R
 
R
G
 
H
A
 
A
L
 
F
L
 
T
N
 
R
F
 
S
Y
 
Y
E
 
M
E
 
Y
T
 
V
K
 
K
D
 
K
L
 
W
G
 
A
S
 
T
-
 
K
S
 
S
Y
 
A
L
 
V
F
 
V
I
 
L
C
 
A
S
 
D
K
 
Q
S
 
N
G
 
V
Y
 
W
K
 
N
Y
 
I
C
 
C
H
 
A
E
 
N
K
 
K
I
 
I
E
 
V
K
 
D
S
 
S
F
 
L
E
 
S
G
 
Q
S
 
N
D
 
G
C
 
M
K
 
T
L
 
V
H
 
T
F
 
K
E
 
L
V
 
V
F
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
E
S
 
A
S
 
S
K
 
L
S
 
V
E
 
E
I
 
L
Q
 
D
K
 
K
M
 
L
R
 
R
K
 
K
I
 
Q
V
 
C
Q
 
P
D
 
D
E
 
D
G
 
-
I
 
T
Q
 
Q
V
 
V
V
 
I
V
 
I
G
 
G
I
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
K
A
 
T
I
 
M
D
 
D
T
 
S
A
 
A
K
 
K
A
 
Y
T
 
I
A
 
A
H
 
H
Y
 
S
E
 
M
K
 
N
L
 
L
P
 
P
V
 
S
A
 
I
I
 
I
V
 
C
P
 
P
T
 
T
V
 
T
T
 
A
A
 
S
T
 
S
D
 
D
A
 
A
P
 
A
C
 
T
T
 
S
G
 
S
L
 
L
S
 
S
V
 
V
I
 
I
Y
 
Y
N
 
T
D
 
P
D
 
D
E
 
G
T
 
Q
F
 
F
D
 
Q
T
 
K
Y
 
Y
L
 
S
F
 
F
Y
 
Y
P
 
P
K
 
L
N
 
N
P
 
P
E
 
N
A
 
L
V
 
I
I
 
F
V
 
I
D
 
D
S
 
T
E
 
D
I
 
V
I
 
I
A
 
V
N
 
R
A
 
A
P
 
P
T
 
V
K
 
R
F
 
F
L
 
L
V
 
I
A
 
S
G
 
G
M
 
I
G
 
G
D
|
D
A
 
A
L
 
L
G
 
S
T
 
T
Y
 
W
F
 
V
E
 
E
A
 
T
R
 
E
A
 
S
C
 
V
K
 
I
R
 
R
S
 
S
D
 
N
S
 
S
P
 
T
S
 
S
L
 
F
E
 
A
N
 
G
G
 
G
G
 
V
I
 
A
S
 
S
L
 
I
S
 
A
A
 
G
M
 
R
A
 
Y
L
 
I
C
 
A
E
 
R
L
 
A
C
 
C
Y
 
K
K
 
D
T
 
T
L
 
L
L
 
E
E
 
K
N
 
Y
G
 
A
Y
 
L
Q
 
S
A
 
A
K
 
I
L
 
L
S
 
S
C
 
N
E
 
T
N
 
R
H
 
G
L
 
V
I
 
C
T
 
T
P
 
E
A
 
A
L
 
F
E
 
E
A
 
N
I
 
V
I
 
V
E
 
E
A
 
A
N
 
N
V
 
T
Y
 
L
L
 
M
S
 
S
G
 
G
V
 
L
G
 
G
A
 
F
D
 
E
N
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
L
A
 
A
V
 
A
S
 
A
H
|
H
S
 
A
V
 
I
Y
x
H
N
 
N
G
 
G
F
 
M
T
 
T
A
 
A
L
 
I
K
 
H
-
 
G
E
 
P
C
 
V
E
 
H
S
 
R
T
 
L
M
 
M
H
|
H
G
 
G
S
 
E
I
 
K
V
 
V
A
 
A
F
 
Y
G
 
G
T
 
T
I
 
L
A
 
V
Q
 
Q
L
 
V
I
 
V
L
 
L
E
 
E
N
 
D
A
 
W
P
 
P
K
 
L
E
 
E
E
 
D
I
 
F
K
 
N
K
 
N
V
 
L
M
 
A
D
 
S
F
 
F
C
 
M
Y
 
A
S
 
K
V
 
C
G
 
H
L
 
L
P
 
P
V
 
I
T
 
T
L
 
L
K
 
E
E
 
E
I
 
L
G
 
G
I
 
I
T
 
P
D
 
N
V
 
V
-
 
T
-
 
D
Q
 
E
R
 
E
V
 
L
H
 
L
I
 
M
A
 
V
A
 
G
E
 
R
N
 
A
A
 
T
C
 
L
V
 
R
P
 
P
G
 
D
E
 
E
T
 
S
A
 
I
H
 
H
N
 
N
L
 
M
V
 
S
G
 
K
D
 
K
V
 
F
T
 
N
P
 
P
D
 
S
Q
 
Q
L
 
I
Y
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
I
L
 
K
T
 
A
A
 
V
D
 
D
L
 
S
L
 
Y
G
 
S
Q
 
Q
E
 
K
Y
 
W

O13702 Glycerol dehydrogenase 1; GDH; GLDH; EC 1.1.1.6 from Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) (Fission yeast)
36% identity, 98% coverage: 5:362/364 of query aligns to 64:424/450 of O13702

query
sites
O13702
K
 
R
L
 
I
L
 
F
R
 
T
A
 
S
P
 
P
L
 
Q
K
 
K
Y
 
Y
L
 
V
Q
 
Q
G
 
G
R
 
R
G
 
H
A
 
A
L
 
F
L
 
T
N
 
R
F
 
S
Y
 
Y
E
 
M
E
 
Y
T
 
V
K
 
K
D
 
K
L
 
W
G
 
A
S
 
T
-
 
K
S
 
S
Y
 
A
L
 
V
F
 
V
I
 
L
C
 
A
S
 
D
K
 
Q
S
 
N
G
 
V
Y
 
W
K
 
N
Y
 
I
C
 
C
H
 
A
E
 
N
K
 
K
I
 
I
E
 
V
K
 
D
S
 
S
F
 
L
E
 
S
G
 
Q
S
 
N
D
 
G
C
 
M
K
 
T
L
 
V
H
 
T
F
 
K
E
 
L
V
 
V
F
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
E
S
 
A
S
 
S
K
 
L
S
 
V
E
 
E
I
 
L
Q
 
D
K
 
K
M
 
L
R
 
R
K
 
K
I
 
Q
V
 
C
Q
 
P
D
 
D
E
 
D
G
 
-
I
 
T
Q
 
Q
V
 
V
V
 
I
V
 
I
G
 
G
I
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
K
A
 
T
I
 
M
D
 
D
T
 
S
A
 
A
K
 
K
A
 
Y
T
 
I
A
 
A
H
 
H
Y
 
S
E
 
M
K
 
N
L
 
L
P
 
P
V
 
S
A
 
I
I
 
I
V
 
C
P
 
P
T
 
T
V
 
T
T
 
A
A
 
S
T
 
S
D
 
D
A
 
A
P
 
A
C
 
T
T
 
S
G
 
S
L
 
L
S
 
S
V
 
V
I
 
I
Y
 
Y
N
 
T
D
 
P
D
 
D
E
 
G
T
 
Q
F
 
F
D
 
Q
T
 
K
Y
 
Y
L
 
S
F
 
F
Y
 
Y
P
 
P
K
 
L
N
 
N
P
 
P
E
 
N
A
 
L
V
 
I
I
 
F
V
 
I
D
 
D
S
 
T
E
 
D
I
 
V
I
 
I
A
 
V
N
 
R
A
 
A
P
 
P
T
 
V
K
 
R
F
 
F
L
 
L
V
 
I
A
 
S
G
 
G
M
 
I
G
 
G
D
|
D
A
 
A
L
 
L
G
 
S
T
 
T
Y
 
W
F
 
V
E
 
E
A
 
T
R
 
E
A
 
S
C
 
V
K
 
I
R
 
R
S
 
S
D
 
N
S
 
S
P
 
T
S
 
S
L
 
F
E
 
A
N
 
G
G
 
G
G
 
V
I
 
A
S
 
S
L
 
I
S
 
A
A
 
G
M
 
R
A
 
Y
L
 
I
C
 
A
E
 
R
L
 
A
C
 
C
Y
 
K
K
 
D
T
 
T
L
 
L
L
 
E
E
 
K
N
 
Y
G
 
A
Y
 
L
Q
 
S
A
 
A
K
 
I
L
 
L
S
 
S
C
 
N
E
 
T
N
 
R
H
 
G
L
 
V
I
 
C
T
 
T
P
 
E
A
 
A
L
 
F
E
 
E
A
 
N
I
 
V
I
 
V
E
 
E
A
 
A
N
 
N
V
 
T
Y
 
L
L
 
M
S
 
S
G
 
G
V
 
L
G
 
G
A
 
F
D
 
E
N
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
L
A
 
A
V
 
A
S
 
A
H
|
H
S
 
A
V
 
I
Y
 
H
N
 
N
G
 
G
F
 
M
T
 
T
A
 
A
L
 
I
K
 
H
-
 
G
E
 
P
C
 
V
E
 
H
S
 
R
T
 
L
M
 
M
H
|
H
G
 
G
S
 
E
I
 
K
V
 
V
A
 
A
F
 
Y
G
 
G
T
 
T
I
 
L
A
 
V
Q
 
Q
L
 
V
I
 
V
L
 
L
E
 
E
N
 
D
A
 
W
P
 
P
K
 
L
E
 
E
E
 
D
I
 
F
K
 
N
K
 
N
V
 
L
M
 
A
D
 
S
F
 
F
C
 
M
Y
 
A
S
 
K
V
 
C
G
 
H
L
 
L
P
 
P
V
 
I
T
 
T
L
 
L
K
 
E
E
 
E
I
 
L
G
 
G
I
 
I
T
 
P
D
 
N
V
 
V
-
 
T
-
 
D
Q
 
E
R
 
E
V
 
L
H
 
L
I
 
M
A
 
V
A
 
G
E
 
R
N
 
A
A
 
T
C
 
L
V
 
R
P
 
P
G
 
D
E
 
E
T
 
S
A
 
I
H
 
H
N
 
N
L
 
M
V
 
S
G
 
K
D
 
K
V
 
F
T
 
N
P
 
P
D
 
S
Q
 
Q
L
 
I
Y
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
I
L
 
K
T
 
A
A
 
V
D
 
D
L
 
S
L
 
Y
G
 
S
Q
 
Q
E
 
K
Y
 
W

3uhjA Crystal structure of a probable glycerol dehydrogenase from sinorhizobium meliloti 1021
37% identity, 96% coverage: 10:360/364 of query aligns to 8:355/357 of 3uhjA

query
sites
3uhjA
P
 
P
L
 
N
K
 
K
Y
 
Y
L
 
I
Q
 
Q
G
 
R
R
 
A
G
 
G
A
 
E
L
 
I
L
 
D
N
 
K
F
 
L
Y
 
A
E
 
A
E
 
Y
T
 
L
K
 
A
D
 
P
L
 
L
G
 
G
S
 
K
S
 
R
Y
 
A
L
 
L
F
 
V
I
 
L
C
 
I
S
 
D
K
 
R
S
 
V
G
 
L
Y
 
F
K
 
D
Y
 
A
C
 
L
H
 
S
E
 
E
K
 
R
I
 
I
E
 
S
K
 
-
S
 
-
F
 
-
E
 
-
G
 
-
S
 
-
D
 
-
C
 
L
K
 
D
L
 
I
H
 
R
F
 
F
E
 
E
V
 
R
F
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
E
S
 
C
S
 
C
K
 
T
S
 
S
E
 
E
I
 
I
Q
 
E
K
 
R
M
 
V
R
 
R
K
 
K
I
 
V
V
 
A
Q
 
I
D
 
E
E
 
H
G
 
G
I
 
S
Q
 
D
V
 
I
V
 
L
V
 
V
G
 
G
I
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
K
A
 
T
I
 
A
D
 
D
T
 
T
A
 
A
K
 
K
A
 
I
T
 
V
A
 
A
H
 
I
Y
 
D
E
 
T
K
 
G
L
 
A
P
 
R
V
 
I
A
 
V
I
 
I
V
 
A
P
 
P
T
 
T
V
 
I
T
 
A
A
 
S
T
 
T
D
 
D
A
 
A
P
 
P
C
 
C
T
 
S
G
 
A
L
 
I
S
 
A
V
 
V
I
 
R
Y
 
Y
N
 
T
D
 
E
D
 
H
E
 
G
T
 
V
F
 
Y
D
 
E
T
 
E
Y
 
A
L
 
L
F
 
R
Y
 
L
P
 
P
K
 
R
N
 
N
P
 
P
E
 
D
A
 
A
V
 
V
I
 
V
V
 
V
D
 
D
S
 
S
E
 
A
I
 
L
I
 
V
A
 
A
N
 
A
A
 
A
P
 
P
T
 
A
K
 
R
F
 
F
L
 
L
V
 
V
A
 
A
G
 
G
M
 
I
G
 
G
D
|
D
A
 
A
L
 
L
G
 
S
T
 
T
Y
 
W
F
 
F
E
 
E
A
 
A
R
 
R
A
 
S
C
 
N
K
 
I
R
 
E
S
 
S
D
 
R
S
 
T
P
 
D
S
 
N
L
 
Y
E
 
V
N
 
A
G
 
G
G
 
G
I
 
F
-
 
P
-
 
A
S
 
T
L
 
E
S
 
A
A
 
G
M
 
M
A
 
A
L
 
I
C
 
A
E
 
R
L
 
H
C
 
C
Y
 
Q
K
 
D
T
 
V
L
 
L
L
 
T
E
 
R
N
 
D
G
 
A
Y
 
V
Q
 
K
A
 
A
K
 
K
L
 
I
S
 
A
C
 
V
E
 
E
N
 
A
H
 
G
L
 
L
I
 
L
T
 
T
P
 
P
A
 
A
L
 
V
E
 
E
A
 
N
I
 
I
I
 
I
E
 
E
A
 
A
N
 
N
V
 
T
Y
 
L
L
 
L
S
 
S
G
 
G
V
 
L
G
 
G
A
 
F
D
 
E
N
 
N
G
 
C
G
 
G
L
 
C
A
 
S
V
 
A
S
 
A
H
|
H
S
 
G
V
 
I
Y
x
H
N
 
D
G
 
G
F
 
L
T
 
T
A
 
V
L
 
L
K
 
E
E
 
E
C
 
V
E
 
H
S
 
G
T
 
Y
M
 
F
H
|
H
G
 
G
S
 
E
I
 
K
V
 
V
A
 
A
F
 
F
G
 
G
T
 
T
I
 
L
A
 
C
Q
 
L
L
 
L
I
 
M
L
 
L
E
 
E
N
 
N
A
 
R
P
 
D
K
 
R
E
 
A
E
 
E
I
 
I
K
 
E
K
 
A
V
 
M
M
 
I
D
 
R
F
 
F
C
 
C
Y
 
R
S
 
S
V
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
P
V
 
T
T
 
K
L
 
L
K
 
A
E
 
D
I
 
L
G
 
G
I
 
I
T
 
V
D
 
D
-
 
D
-
 
V
V
 
P
Q
 
A
R
 
K
V
 
I
H
 
G
I
 
R
A
 
V
A
 
A
E
 
E
N
 
A
A
 
A
C
 
C
V
 
R
P
 
P
G
 
G
E
 
N
T
 
I
A
 
I
H
 
Y
N
 
A
L
 
T
V
 
P
G
 
V
D
 
T
V
 
I
T
 
T
P
 
V
D
 
P
Q
 
A
L
 
V
Y
 
R
D
 
D
A
 
A
L
 
I
L
 
L
T
 
A
A
 
L
D
 
D
L
 
A
L
 
F
G
 
S
Q
 
R

5fb3F Structure of glycerophosphate dehydrogenase in complex with NADPH (see paper)
28% identity, 72% coverage: 82:342/364 of query aligns to 66:313/337 of 5fb3F

query
sites
5fb3F
V
 
L
Q
 
E
D
 
K
E
 
P
G
 
G
I
 
F
Q
 
D
V
 
L
V
 
V
V
 
I
G
 
G
I
 
I
G
 
G
G
|
G
G
|
G
S
x
R
A
 
P
I
 
L
D
|
D
T
 
M
A
 
A
K
 
K
A
 
V
T
 
Y
A
 
S
H
 
Y
Y
 
I
E
 
H
K
 
K
L
 
K
P
 
P
V
 
F
A
 
V
I
 
A
V
 
I
P
 
P
T
|
T
V
 
S
T
 
A
A
x
S
T
x
H
D
 
D
A
 
G
P
 
I
C
 
A
T
 
S
G
 
P
L
x
Y
S
 
-
V
|
V
I
x
S
Y
 
F
N
 
S
D
 
L
D
 
T
E
 
Q
T
 
R
F
 
F
D
 
S
T
 
K
Y
 
Y
L
 
G
F
 
K
Y
 
I
P
 
S
K
 
S
N
 
S
P
 
P
E
 
V
A
 
A
V
 
I
I
 
I
V
 
A
D
 
D
S
 
T
E
 
S
I
|
I
I
 
I
A
 
L
N
x
S
A
|
A
P
 
P
T
 
S
K
 
R
F
x
L
L
 
L
V
 
K
A
 
A
G
 
G
M
 
I
G
 
G
D
|
D
A
 
L
L
 
L
G
 
G
T
 
K
Y
 
I
F
 
I
E
 
A
A
 
V
R
 
R
A
 
D
C
 
W
K
 
Q
R
 
L
S
 
A
D
 
H
S
 
-
P
 
-
S
 
R
L
 
L
E
 
K
N
 
G
G
 
E
G
 
E
I
 
Y
S
 
S
L
 
E
S
 
Y
A
 
A
M
 
A
A
 
H
L
 
L
C
 
S
E
 
L
L
 
T
C
 
S
Y
 
Y
K
 
K
T
 
I
L
 
A
L
 
V
E
 
G
N
 
N
G
 
A
Y
 
Q
Q
 
K
A
 
I
K
 
K
L
 
N
S
 
F
C
 
I
E
 
R
N
 
E
H
 
E
L
 
D
I
 
V
T
 
R
P
 
V
A
 
L
L
 
V
E
 
K
A
 
A
I
 
L
I
 
I
E
 
G
A
 
C
N
 
G
V
 
V
Y
 
A
L
 
M
S
 
G
G
 
I
V
 
A
G
 
G
A
 
S
D
 
S
N
 
R
G
 
P
G
 
C
L
 
S
A
 
G
V
 
S
S
 
E
H
|
H
S
 
L
V
 
F
Y
x
A
N
 
H
G
 
A
F
 
I
T
 
E
A
 
V
L
 
R
K
 
V
E
 
E
C
 
K
E
 
E
S
 
D
-
 
E
T
 
V
M
 
V
H
|
H
G
 
G
S
 
E
I
 
L
V
 
V
A
 
A
F
 
L
G
 
G
T
 
T
I
 
I
A
 
I
Q
 
M
L
 
A
I
 
Y
L
 
L
E
 
H
N
 
G
A
 
I
P
 
N
K
 
W
E
 
R
E
 
R
I
 
I
K
 
K
K
 
R
V
 
I
M
 
A
D
 
D
F
 
I
C
 
-
Y
 
-
S
 
-
V
 
I
G
 
G
L
 
L
P
 
P
V
 
T
T
 
S
L
 
L
K
 
R
E
 
Q
I
 
A
G
 
N
I
 
I
T
 
D
D
 
-
V
 
-
Q
 
-
R
 
-
V
 
V
H
 
D
I
 
L
A
 
A
A
 
L
E
 
E
N
 
A
A
 
L
C
 
T
V
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
-
T
 
T
A
 
A
H
 
H
N
 
T
L
 
L
V
 
R
G
 
P
D
 
D

Sites not aligning to the query:

Q9YER2 Glycerol-1-phosphate dehydrogenase [NAD(P)+]; G1P dehydrogenase; G1PDH; Gro1PDH; Enantiomeric glycerophosphate synthase; sn-glycerol-1-phosphate dehydrogenase; EC 1.1.1.261 from Aeropyrum pernix (strain ATCC 700893 / DSM 11879 / JCM 9820 / NBRC 100138 / K1) (see paper)
25% identity, 82% coverage: 31:327/364 of query aligns to 35:323/352 of Q9YER2

query
sites
Q9YER2
G
 
G
S
 
S
S
 
Y
Y
 
V
L
 
L
F
 
V
I
 
V
C
 
S
S
 
G
K
 
P
S
 
T
G
 
V
Y
 
S
K
 
S
Y
 
K
C
 
Y
H
 
F
E
 
E
K
 
R
I
 
L
E
 
R
K
 
A
S
 
S
F
 
L
E
 
E
G
 
A
S
 
E
D
 
G
C
 
L
K
 
T
L
 
V
H
 
G
F
 
L
E
 
K
V
 
I
F
 
I
G
 
R
G
 
D
V
 
A
S
 
T
S
 
V
K
 
E
S
 
T
E
 
A
I
 
E
Q
 
E
K
 
V
M
 
A
R
 
R
K
 
E
I
 
A
V
 
L
Q
 
E
D
 
S
E
 
R
G
 
-
I
 
I
Q
 
E
V
 
V
V
 
V
V
 
A
G
 
G
I
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
K
A
 
S
I
 
I
D
 
D
T
 
V
A
 
A
K
 
K
A
 
Y
T
 
A
A
 
S
H
 
K
Y
 
R
E
 
A
K
 
G
L
 
S
P
 
V
V
 
F
A
 
V
I
 
S
V
 
I
P
 
P
T
 
T
V
 
V
T
 
A
A
 
S
T
 
H
D
|
D
A
 
-
P
 
-
C
 
-
T
 
-
G
 
G
L
 
I
S
 
T
V
 
S
I
 
P
Y
 
F
N
 
S
D
 
S
D
 
L
E
 
K
T
 
G
F
 
F
D
 
D
T
 
K
Y
 
P
L
 
I
F
 
S
Y
 
R
P
 
P
-
 
A
K
 
K
N
 
A
P
 
P
E
 
E
A
 
A
V
 
I
I
 
I
V
 
I
D
 
D
S
 
V
E
 
D
I
 
V
I
 
I
A
 
A
N
 
E
A
 
A
P
 
P
T
 
R
K
 
R
F
 
Y
L
 
N
V
 
I
A
 
A
G
 
G
M
 
F
G
 
G
D
|
D
A
 
L
L
 
I
G
 
G
T
 
K
Y
 
Y
F
 
T
E
 
A
A
 
V
R
 
L
A
 
D
C
 
W
K
 
R
R
 
L
S
 
A
D
 
H
S
 
K
P
 
L
S
 
R
L
 
L
E
 
E
N
 
Y
G
 
Y
G
 
G
I
 
E
S
 
Y
L
 
A
S
 
A
A
 
S
M
 
L
A
 
A
L
 
L
C
 
-
E
 
-
L
 
L
C
 
S
Y
 
A
K
 
K
T
 
H
L
 
V
L
 
S
E
 
Q
N
 
Y
G
 
A
Y
 
E
Q
 
E
A
 
I
K
 
A
L
 
L
S
 
G
C
 
T
-
 
R
E
 
E
N
 
G
H
 
Y
L
 
R
I
 
V
T
 
L
P
 
-
A
 
-
L
 
L
E
 
E
A
 
A
I
 
L
I
 
V
E
 
S
A
 
S
N
 
G
V
 
V
Y
 
S
L
 
M
S
 
C
G
 
I
V
 
A
G
 
G
A
 
S
D
 
T
N
 
R
G
 
P
G
 
A
L
 
S
A
 
G
V
 
S
S
 
E
H
|
H
S
 
L
V
 
F
Y
 
A
N
 
H
G
 
A
F
 
L
T
 
H
A
 
I
L
 
V
K
 
A
E
 
R
C
 
N
E
 
K
S
 
P
T
 
-
M
 
L
H
|
H
G
 
G
S
 
E
I
 
A
V
 
V
A
 
G
F
 
V
G
 
G
T
 
T
I
 
I
A
 
M
Q
 
M
L
 
A
I
 
Y
L
 
L
E
 
H
N
 
G
A
 
-
P
 
-
K
 
-
E
 
K
E
 
N
I
 
W
K
 
R
K
 
R
V
 
I
M
 
R
D
 
G
F
 
L
C
 
L
Y
 
K
S
 
T
V
 
V
G
 
G
L
 
A
P
 
P
V
 
T
T
 
N
L
 
A
K
 
K
E
 
E
I
 
L
G
 
G
I
 
V
T
 
E
D
 
D
-
 
D
-
 
E
-
 
V
V
 
V
Q
 
E
R
 
A
V
 
L
H
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
A
E
 
R

4rgqB Crystal structure of the methanocaldococcus jannaschii g1pdh with NADPH and dhap (see paper)
25% identity, 71% coverage: 56:315/364 of query aligns to 36:291/333 of 4rgqB

query
sites
4rgqB
G
|
G
S
 
K
D
x
N
C
x
T
K
 
K
L
 
K
H
 
Y
F
 
C
E
 
R
V
 
F
F
 
F
G
 
Y
G
 
D
V
 
I
S
 
V
S
 
Y
K
x
Y
S
 
D
E
 
E
I
 
I
Q
 
L
K
 
N
M
 
N
R
 
L
K
 
E
I
 
I
V
 
K
Q
 
K
D
 
Y
E
 
T
G
 
A
I
 
Y
Q
 
D
V
 
C
V
 
V
V
 
I
G
 
G
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
|
G
S
x
R
A
 
S
I
 
I
D
 
D
T
 
T
A
 
G
K
 
K
A
 
Y
T
 
L
A
 
A
H
 
Y
Y
 
K
E
 
L
K
 
G
L
 
I
P
 
P
V
 
F
A
 
I
I
 
S
V
 
V
P
 
P
T
|
T
V
x
T
T
 
A
A
x
S
T
x
N
D
|
D
A
x
G
P
 
I
C
 
A
T
 
S
G
 
P
L
x
I
S
 
V
V
x
S
I
 
I
Y
 
R
N
 
Q
D
 
P
D
x
S
E
 
F
T
 
M
F
 
V
D
 
D
T
 
A
Y
 
-
L
 
-
F
 
-
Y
 
-
P
 
-
K
 
-
N
 
-
P
 
P
E
 
I
A
 
A
V
 
I
I
 
I
V
 
A
D
 
D
S
 
T
E
 
E
I
 
I
I
 
I
A
 
K
N
 
K
A
 
S
P
 
P
T
 
R
K
 
R
F
x
L
L
 
L
V
 
S
A
 
A
G
 
G
M
 
M
G
 
G
D
|
D
A
 
I
L
 
V
G
 
S
T
 
N
Y
 
I
F
 
T
E
 
A
A
 
V
R
 
L
A
 
D
C
 
W
K
 
K
R
 
L
S
 
A
D
 
Y
S
 
K
P
 
E
S
 
K
L
 
G
E
 
E
N
 
K
G
 
-
G
 
-
I
 
Y
S
 
S
L
 
E
S
 
S
A
 
S
M
 
A
A
 
I
L
 
F
C
 
S
E
 
K
L
 
T
C
 
I
Y
 
A
K
 
K
T
 
E
L
 
L
L
 
I
E
 
S
N
 
Y
G
 
V
Y
 
L
Q
 
N
A
 
S
K
 
D
L
 
L
S
 
S
C
 
-
E
 
E
N
 
Y
H
 
H
L
 
-
I
 
-
T
 
N
P
 
K
A
 
L
L
 
V
E
 
K
A
 
A
I
 
L
I
 
V
E
 
G
A
 
S
N
 
G
V
 
I
Y
 
A
L
 
I
S
 
A
G
 
I
V
 
A
G
 
N
A
 
S
D
x
S
N
 
R
G
 
P
G
 
A
L
x
S
A
 
G
V
 
S
S
 
E
H
|
H
S
 
L
V
 
F
Y
x
S
N
x
H
G
 
A
F
 
L
T
 
D
A
 
K
L
 
L
K
 
K
E
 
E
-
 
E
-
 
Y
-
 
N
-
 
L
C
 
N
E
 
I
S
 
N
T
 
S
M
 
L
H
|
H
G
 
G
S
 
E
I
 
Q
V
 
C
A
 
G
F
 
I
G
 
G
T
 
T
I
 
I
A
 
M
Q
 
M
L
 
S
I
 
Y
L
 
L
E
 
H
N
 
E
A
 
K
P
 
E
K
 
N
E
 
K
E
 
K
I
 
L
-
 
S
-
 
G
-
 
L
-
 
H
K
 
E
K
 
K
V
 
I
M
 
K
D
 
M
F
 
S
C
 
L
Y
 
K
S
 
K
V
 
V
G
 
D
L
 
A
P
 
P
V
 
T
T
 
T
L
 
A
K
 
K
E
 
E
I
 
L
G
 
G

3ce9A Crystal structure of glycerol dehydrogenase (np_348253.1) from clostridium acetobutylicum at 2.37 a resolution
30% identity, 36% coverage: 43:173/364 of query aligns to 41:167/349 of 3ce9A

query
sites
3ce9A
Y
 
Y
K
 
E
Y
 
L
C
 
F
H
 
G
E
 
E
K
 
T
I
 
I
E
 
E
K
 
K
S
 
S
F
 
I
E
 
K
G
 
S
S
 
S
D
 
N
C
 
I
K
 
E
L
 
I
H
 
E
F
 
-
E
 
-
V
 
-
F
 
-
G
 
-
G
 
-
V
 
-
S
 
-
S
 
-
K
 
-
S
 
-
E
 
A
I
 
V
Q
 
E
K
 
T
M
 
V
R
 
K
K
 
N
I
 
I
V
 
D
Q
 
F
D
 
D
E
 
E
-
 
I
-
 
G
-
 
T
-
 
N
-
 
A
-
 
F
-
 
K
-
 
I
-
 
P
-
 
A
G
 
E
I
 
V
Q
 
D
V
 
A
V
 
L
V
 
I
G
 
G
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
K
A
 
A
I
 
I
D
 
D
T
 
A
A
 
V
K
 
K
A
 
Y
T
 
M
A
 
A
H
 
F
Y
 
L
E
 
R
K
 
K
L
 
L
P
 
P
V
 
F
A
 
I
I
 
S
V
 
V
P
 
P
T
 
T
V
 
S
T
 
T
A
 
S
T
 
N
D
 
D
A
 
G
P
 
F
C
 
S
T
 
S
G
 
P
L
 
V
-
 
A
S
 
S
V
 
L
I
 
L
Y
 
I
N
 
N
D
 
G
D
 
K
E
 
R
T
 
T
F
 
-
D
 
-
T
 
-
Y
 
-
L
 
S
F
 
V
Y
 
P
P
 
A
K
 
K
N
 
T
P
 
P
E
 
D
A
 
G
V
 
I
I
 
V
V
 
V
D
 
D
S
 
I
E
 
D
I
 
V
I
 
I
A
 
K
N
 
G
A
 
S
P
 
P
T
 
E
K
 
K
F
 
F
L
 
I
V
 
Y
A
 
S
G
 
G
M
 
I
G
 
G
D
|
D

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_017895435.1 NCBI__GCF_000816635.1:WP_017895435.1
MAILKLLRAPLKYLQGRGALLNFYEETKDLGSSYLFICSKSGYKYCHEKIEKSFEGSDCK
LHFEVFGGVSSKSEIQKMRKIVQDEGIQVVVGIGGGSAIDTAKATAHYEKLPVAIVPTVT
ATDAPCTGLSVIYNDDETFDTYLFYPKNPEAVIVDSEIIANAPTKFLVAGMGDALGTYFE
ARACKRSDSPSLENGGISLSAMALCELCYKTLLENGYQAKLSCENHLITPALEAIIEANV
YLSGVGADNGGLAVSHSVYNGFTALKECESTMHGSIVAFGTIAQLILENAPKEEIKKVMD
FCYSVGLPVTLKEIGITDVQRVHIAAENACVPGETAHNLVGDVTPDQLYDALLTADLLGQ
EYFK

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory