SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_018232926.1 NCBI__GCF_000378965.1:WP_018232926.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 13 hits to proteins with known functional sites (download)

P0A7B5 Glutamate 5-kinase; Gamma-glutamyl kinase; GK; EC 2.7.2.11 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
42% identity, 98% coverage: 8:373/375 of query aligns to 1:365/367 of P0A7B5

query
sites
P0A7B5
L
 
M
G
 
S
K
 
D
A
 
S
R
 
Q
R
 
T
W
 
L
V
 
V
I
 
V
K
 
K
I
 
L
G
 
G
S
 
T
A
 
S
L
 
V
L
 
L
T
 
T
N
 
G
E
 
G
G
 
S
R
 
R
G
 
R
L
 
L
D
 
N
H
 
R
D
 
A
S
 
H
L
 
I
A
 
V
A
 
E
W
 
L
A
 
V
E
 
R
Q
 
Q
I
 
C
A
 
A
R
 
Q
L
 
L
R
 
H
G
 
A
T
 
A
G
 
G
R
 
H
E
 
R
V
 
I
V
 
V
L
 
I
V
 
V
S
 
T
S
|
S
G
 
G
A
 
A
V
 
I
A
 
A
E
 
A
G
 
G
M
 
R
R
 
E
R
 
H
L
 
L
G
 
G
W
 
Y
T
 
P
V
 
E
R
 
L
P
 
P
H
 
A
A
 
T
L
 
I
H
 
A
E
 
S
L
 
K
Q
 
Q
A
 
L
A
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
M
 
S
G
 
R
L
 
L
V
 
I
Q
 
Q
A
 
L
Y
 
W
E
 
E
S
 
Q
I
 
L
F
 
F
Q
 
S
R
 
I
H
 
Y
G
 
G
L
 
I
R
 
H
A
 
V
A
 
G
Q
 
Q
V
 
M
L
 
L
L
 
L
T
 
T
H
 
R
D
 
A
D
 
D
L
 
M
S
 
E
D
 
D
R
 
R
R
 
E
R
 
R
Y
 
F
L
 
L
N
 
N
A
 
A
R
 
R
S
 
D
T
 
T
L
 
L
R
 
R
T
 
A
L
 
L
L
 
L
G
 
D
L
 
N
G
 
N
V
 
I
I
 
V
P
 
P
V
 
V
V
 
I
N
 
N
E
 
E
N
 
N
D
|
D
T
 
A
V
 
V
A
 
A
T
 
T
D
 
A
E
 
E
I
 
I
R
 
K
F
 
V
G
 
G
D
 
D
N
|
N
D
 
D
T
 
N
L
 
L
A
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
A
G
 
A
N
 
I
L
 
L
T
 
A
E
 
G
A
 
A
Q
 
D
V
 
K
L
 
L
V
 
L
I
 
L
L
 
L
T
 
T
D
 
D
Q
 
Q
Q
 
K
G
 
G
L
 
L
F
 
Y
D
 
T
R
 
A
D
 
D
P
 
P
R
 
R
T
 
S
H
 
N
Q
 
P
D
 
Q
A
 
A
T
 
E
L
 
L
I
 
I
S
 
K
E
 
D
G
 
V
M
 
Y
A
 
G
A
 
I
D
 
D
P
 
D
E
 
A
L
 
L
L
 
R
K
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
G
P
 
D
G
 
S
F
 
V
G
 
S
H
 
G
L
 
L
G
 
G
R
 
T
G
 
G
G
 
G
M
 
M
T
 
S
T
 
T
K
 
K
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
D
R
 
V
A
 
A
A
 
C
R
 
R
S
 
A
G
 
G
T
 
I
Y
 
D
T
 
T
L
 
I
I
 
I
A
 
A
S
 
A
G
 
G
R
 
S
E
 
K
P
 
P
R
 
G
V
 
V
L
 
I
E
 
G
R
 
D
I
 
V
A
 
M
D
 
E
G
 
G
E
 
I
P
 
S
L
 
V
G
 
G
T
 
T
L
 
L
L
 
F
C
 
H
P
 
A
D
 
Q
R
 
A
E
 
T
P
 
P
I
 
L
A
 
E
A
 
N
R
 
R
K
 
K
Q
 
R
W
 
W
I
 
I
A
 
F
G
 
G
Q
 
A
M
 
P
V
 
-
S
 
P
K
 
A
G
 
G
E
 
E
L
 
I
L
 
T
L
 
V
D
 
D
A
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
T
R
 
A
V
 
A
V
 
I
R
 
L
E
 
E
S
 
R
G
 
G
R
 
S
S
 
S
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
K
G
 
G
V
 
I
T
 
K
H
 
S
V
 
V
K
 
T
G
 
G
T
 
N
F
 
F
T
 
S
R
 
R
G
 
G
D
 
E
V
 
V
V
 
I
T
 
R
C
 
I
L
 
C
D
 
N
P
 
L
D
 
E
G
 
G
R
 
R
P
 
D
V
 
I
A
 
A
R
 
H
G
 
G
L
 
V
V
 
S
N
 
R
Y
 
Y
S
 
N
A
 
S
E
 
D
E
 
A
S
 
L
R
 
R
R
 
R
I
 
I
M
 
A
R
 
G
H
 
H
R
 
H
A
 
S
D
 
Q
E
 
E
I
 
I
E
 
D
G
 
A
I
 
I
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
V
 
E
D
 
Y
E
 
G
P
 
P
E
 
V
L
 
A
I
 
V
H
 
H
R
 
R
D
 
D
N
 
D
L
 
M
V
 
I

2j5tD Glutamate 5-kinase from escherichia coli complexed with glutamate (see paper)
42% identity, 97% coverage: 11:373/375 of query aligns to 2:363/365 of 2j5tD

query
sites
2j5tD
A
 
S
R
 
Q
R
 
T
W
 
L
V
 
V
I
 
V
K
 
K
I
 
L
G
 
G
S
 
T
A
 
S
L
 
V
L
 
L
T
 
T
N
 
G
E
 
G
G
 
S
R
 
R
G
 
R
L
 
L
D
 
N
H
 
R
D
 
A
S
 
H
L
 
I
A
 
V
A
 
E
W
 
L
A
 
V
E
 
R
Q
 
Q
I
 
C
A
 
A
R
 
Q
L
 
L
R
 
H
G
 
A
T
 
A
G
 
G
R
 
H
E
 
R
V
 
I
V
 
V
L
 
I
V
 
V
S
 
T
S
|
S
G
|
G
A
|
A
V
 
I
A
 
A
E
 
A
G
 
G
M
 
R
R
 
E
R
 
H
L
 
L
G
 
G
W
 
Y
T
 
P
V
 
E
R
 
L
P
 
P
H
 
A
A
 
T
L
 
I
H
 
A
E
 
S
L
 
K
Q
 
Q
A
 
L
A
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
M
 
S
G
 
R
L
 
L
V
 
I
Q
 
Q
A
 
L
Y
 
W
E
 
E
S
 
Q
I
 
L
F
 
F
Q
 
S
R
 
I
H
 
Y
G
 
G
L
 
I
R
 
H
A
 
V
A
 
G
Q
 
Q
V
 
M
L
 
L
L
 
L
T
 
T
H
 
R
D
 
A
D
 
D
L
 
M
S
 
E
D
 
D
R
 
R
R
 
E
R
 
R
Y
 
F
L
 
L
N
 
N
A
 
A
R
 
R
S
 
D
T
 
T
L
 
L
R
 
R
T
 
A
L
 
L
L
 
L
G
 
D
L
 
N
G
 
N
V
 
V
I
 
V
P
 
P
V
 
V
V
 
I
N
|
N
E
 
E
N
 
N
D
|
D
T
 
A
V
 
V
A
 
A
T
 
T
D
 
A
E
 
E
I
 
I
R
 
K
F
 
V
G
 
G
D
|
D
N
|
N
D
 
D
T
 
N
L
 
L
A
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
A
G
 
A
N
 
I
L
 
L
T
 
A
E
 
G
A
 
A
Q
 
D
V
 
K
L
 
L
V
 
L
I
 
L
L
 
L
T
 
T
D
 
D
Q
 
Q
Q
 
K
G
 
G
L
 
L
F
 
Y
D
 
T
R
 
A
D
 
D
P
 
P
R
 
R
T
 
S
H
 
N
Q
 
P
D
 
Q
A
 
A
T
 
E
L
 
L
I
 
I
S
 
K
E
 
D
G
 
V
M
 
Y
A
 
G
A
 
I
D
 
D
P
 
D
E
 
A
L
 
L
L
 
R
K
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
G
P
 
D
G
 
S
F
 
V
G
 
S
H
 
G
L
 
L
G
 
G
R
 
T
G
 
G
G
 
G
M
 
M
T
 
S
T
 
T
K
 
K
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
D
R
 
V
A
 
A
A
 
C
R
 
R
S
 
A
G
 
G
T
 
I
Y
 
D
T
 
T
L
 
I
I
 
I
A
 
A
S
 
A
G
 
G
R
 
S
E
 
K
P
 
P
R
 
G
V
 
V
L
 
I
E
 
G
R
 
D
I
 
V
A
 
M
D
 
E
G
 
G
E
 
I
P
 
S
L
 
V
G
 
G
T
 
T
L
 
L
L
 
F
C
 
H
P
 
A
D
 
Q
R
 
A
E
 
T
P
 
P
I
 
L
A
 
E
A
 
N
R
 
R
K
 
K
Q
 
R
W
 
W
I
 
I
A
 
F
G
 
G
Q
 
A
M
 
P
V
 
-
S
 
P
K
 
A
G
 
G
E
 
E
L
 
I
L
 
T
L
 
V
D
 
D
A
 
E
G
 
G
A
|
A
A
 
T
R
 
A
V
x
A
V
 
I
R
 
L
E
 
E
S
 
R
G
 
G
R
 
S
S
 
S
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
K
G
 
G
V
 
I
T
 
K
H
 
S
V
 
V
K
 
T
G
 
G
T
 
N
F
 
F
T
 
S
R
 
R
G
 
G
D
 
E
V
 
V
V
 
I
T
 
R
C
 
I
L
 
C
D
 
N
P
 
L
D
 
E
G
 
G
R
 
R
P
 
D
V
 
I
A
 
A
R
 
H
G
 
G
L
 
V
V
 
S
N
 
R
Y
 
Y
S
 
N
A
 
S
E
 
D
E
 
A
S
 
L
R
 
R
R
 
R
I
 
I
M
 
A
R
 
G
H
 
H
R
 
H
A
 
S
D
 
Q
E
 
E
I
 
I
E
 
D
G
 
A
I
 
I
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
V
 
E
D
 
Y
E
 
G
P
 
P
E
 
V
L
 
A
I
 
V
H
 
H
R
 
R
D
 
D
N
 
D
L
 
M
V
 
I

2j5vB Glutamate 5-kinase from escherichia coli complexed with glutamyl-5- phosphate and pyroglutamic acid (see paper)
39% identity, 96% coverage: 15:373/375 of query aligns to 6:323/325 of 2j5vB

query
sites
2j5vB
V
 
V
I
 
V
K
|
K
I
 
L
G
 
G
S
x
T
A
 
S
L
 
V
L
 
L
T
 
T
N
 
G
E
 
G
G
 
S
R
 
R
G
 
R
L
 
L
D
 
N
H
 
R
D
 
A
S
 
H
L
 
I
A
 
V
A
 
E
W
 
L
A
 
V
E
 
R
Q
 
Q
I
 
C
A
 
A
R
 
Q
L
 
L
R
 
H
G
 
A
T
 
A
G
 
G
R
 
H
E
 
R
V
 
I
V
 
V
L
 
I
V
 
V
S
 
T
S
|
S
G
|
G
A
|
A
V
x
I
A
|
A
E
 
A
G
 
G
M
 
R
R
 
E
R
 
H
L
 
L
G
 
G
W
 
Y
T
 
P
V
 
E
R
 
L
P
 
P
H
 
A
A
 
T
L
 
I
H
 
A
E
 
S
L
 
K
Q
 
Q
A
 
L
A
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
M
 
S
G
 
R
L
 
L
V
 
I
Q
 
Q
A
 
L
Y
 
W
E
 
E
S
 
Q
I
 
L
F
 
F
Q
 
S
R
 
I
H
 
Y
G
 
G
L
 
I
R
 
H
A
 
V
A
 
G
Q
 
Q
V
 
M
L
 
L
L
 
L
T
 
T
H
 
R
D
 
A
D
 
D
L
 
M
S
 
E
D
 
D
R
 
R
R
 
E
R
 
R
Y
 
F
L
 
L
N
 
N
A
 
A
R
 
R
S
 
D
T
 
T
L
 
L
R
 
R
T
 
A
L
 
L
L
 
L
G
 
D
L
 
N
G
 
N
V
 
V
I
 
V
P
 
P
V
 
V
V
 
I
N
 
N
E
 
E
N
 
N
D
|
D
T
 
A
V
 
V
A
 
A
T
 
T
D
 
A
E
 
E
I
 
I
R
 
K
F
 
V
G
|
G
D
|
D
N
|
N
D
 
D
T
 
N
L
 
L
A
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
A
G
 
A
N
 
I
L
 
L
T
 
A
E
 
G
A
 
A
Q
 
D
V
 
K
L
 
L
V
 
L
I
 
L
L
 
L
T
 
T
D
 
D
Q
 
Q
Q
 
-
G
 
-
L
 
-
F
 
-
D
 
-
R
 
-
D
 
-
P
 
-
R
 
-
T
 
-
H
 
-
Q
 
-
D
 
-
A
 
-
T
 
-
L
 
-
I
 
-
S
 
-
E
 
-
G
 
-
M
 
-
A
 
-
A
 
-
D
 
-
P
 
-
E
 
-
L
 
-
L
 
-
K
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
F
 
-
G
 
-
H
 
-
L
 
-
G
 
-
R
 
-
G
 
G
G
 
G
M
 
M
T
 
S
T
 
T
K
 
K
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
D
R
 
V
A
 
A
A
 
C
R
 
R
S
 
A
G
 
G
T
 
I
Y
 
D
T
 
T
L
 
I
I
 
I
A
 
A
S
 
A
G
 
G
R
 
S
E
 
K
P
 
P
R
 
G
V
 
V
L
 
I
E
 
G
R
 
D
I
 
V
A
 
M
D
 
E
G
 
G
E
 
I
P
 
S
L
 
V
G
 
G
T
 
T
L
 
L
L
 
F
C
 
H
P
 
A
D
 
Q
R
 
A
E
 
T
P
 
P
I
 
L
A
 
E
A
 
N
R
 
R
K
 
K
Q
 
R
W
 
W
I
 
I
A
 
F
G
 
G
Q
 
A
M
 
P
V
 
-
S
 
P
K
 
A
G
 
G
E
 
E
L
 
I
L
 
T
L
 
V
D
 
D
A
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
T
R
 
A
V
 
A
V
 
I
R
 
L
E
 
E
S
 
R
G
 
G
R
 
S
S
 
S
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
K
G
 
G
V
 
I
T
 
K
H
 
S
V
 
V
K
 
T
G
 
G
T
 
N
F
 
F
T
 
S
R
 
R
G
 
G
D
 
E
V
 
V
V
 
I
T
 
R
C
 
I
L
 
C
D
 
N
P
 
L
D
 
E
G
 
G
R
 
R
P
 
D
V
 
I
A
 
A
R
 
H
G
 
G
L
 
V
V
 
S
N
 
R
Y
 
Y
S
 
N
A
 
S
E
 
D
E
 
A
S
 
L
R
 
R
R
 
R
I
 
I
M
 
A
R
 
G
H
 
H
R
 
H
A
 
S
D
 
Q
E
 
E
I
 
I
E
 
D
G
 
A
I
 
I
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
V
 
E
D
 
Y
E
 
G
P
 
P
E
 
V
L
 
A
I
 
V
H
 
H
R
 
R
D
 
D
N
 
D
L
 
M
V
 
I

2j5vA Glutamate 5-kinase from escherichia coli complexed with glutamyl-5- phosphate and pyroglutamic acid (see paper)
38% identity, 96% coverage: 15:373/375 of query aligns to 6:321/323 of 2j5vA

query
sites
2j5vA
V
 
V
I
 
V
K
|
K
I
 
L
G
|
G
S
x
T
A
 
S
L
 
V
L
 
L
T
 
T
N
 
G
E
 
G
G
 
S
R
 
R
G
 
R
L
 
L
D
 
N
H
 
R
D
 
A
S
 
H
L
 
I
A
 
V
A
 
E
W
 
L
A
 
V
E
 
R
Q
 
Q
I
 
C
A
 
A
R
 
Q
L
 
L
R
 
H
G
 
A
T
 
A
G
 
G
R
 
H
E
 
R
V
 
I
V
 
V
L
 
I
V
 
V
S
 
T
S
|
S
G
|
G
A
|
A
V
x
I
A
 
A
E
 
A
G
 
G
M
 
R
R
 
E
R
 
H
L
 
L
G
 
G
W
 
Y
T
 
P
V
 
E
R
 
L
P
 
P
H
 
A
A
 
T
L
 
I
H
 
A
E
 
S
L
 
K
Q
 
Q
A
 
L
A
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
M
 
S
G
 
R
L
 
L
V
 
I
Q
 
Q
A
 
L
Y
 
W
E
 
E
S
 
Q
I
 
L
F
 
F
Q
 
S
R
 
I
H
 
Y
G
 
G
L
 
I
R
 
H
A
 
V
A
 
G
Q
 
Q
V
 
M
L
 
L
L
 
L
T
 
T
H
 
R
D
 
A
D
 
D
L
 
M
S
 
E
D
 
D
R
 
R
R
 
E
R
 
R
Y
 
F
L
 
L
N
 
N
A
 
A
R
 
R
S
 
D
T
 
T
L
 
L
R
 
R
T
 
A
L
 
L
L
 
L
G
 
D
L
 
N
G
 
N
V
 
V
I
 
V
P
 
P
V
 
V
V
 
I
N
 
N
E
 
E
N
 
N
D
|
D
T
 
A
V
 
V
A
 
A
T
 
T
D
 
A
E
 
E
I
 
I
R
 
K
F
 
V
G
 
G
D
|
D
N
|
N
D
 
D
T
 
N
L
 
L
A
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
A
G
 
A
N
 
I
L
 
L
T
 
A
E
 
G
A
 
A
Q
 
D
V
 
K
L
 
L
V
 
L
I
 
L
L
|
L
T
 
T
D
 
D
Q
 
Q
Q
 
-
G
 
-
L
 
-
F
 
-
D
 
-
R
 
-
D
 
-
P
 
-
R
 
-
T
 
-
H
 
-
Q
 
-
D
 
-
A
 
-
T
 
-
L
 
-
I
 
-
S
 
-
E
 
-
G
 
-
M
 
-
A
 
-
A
 
-
D
 
-
P
 
-
E
 
-
L
 
-
L
 
-
K
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
F
 
-
G
 
-
H
 
-
L
 
-
G
 
-
R
 
-
G
 
-
G
 
-
M
 
M
T
 
S
T
 
T
K
 
K
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
D
R
 
V
A
 
A
A
 
C
R
 
R
S
 
A
G
 
G
T
 
I
Y
 
D
T
 
T
L
 
I
I
 
I
A
 
A
S
 
A
G
 
G
R
 
S
E
 
K
P
 
P
R
 
G
V
 
V
L
 
I
E
 
G
R
 
D
I
 
V
A
 
M
D
 
E
G
 
G
E
 
I
P
 
S
L
 
V
G
 
G
T
 
T
L
 
L
L
 
F
C
 
H
P
 
A
D
 
Q
R
 
A
E
 
T
P
 
P
I
 
L
A
 
E
A
 
N
R
 
R
K
 
K
Q
 
R
W
 
W
I
 
I
A
 
F
G
 
G
Q
 
A
M
 
P
V
 
-
S
 
P
K
 
A
G
 
G
E
 
E
L
 
I
L
 
T
L
 
V
D
 
D
A
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
T
R
 
A
V
 
A
V
 
I
R
 
L
E
 
E
S
 
R
G
 
G
R
 
S
S
 
S
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
K
G
 
G
V
 
I
T
 
K
H
 
S
V
 
V
K
 
T
G
 
G
T
 
N
F
 
F
T
 
S
R
 
R
G
 
G
D
 
E
V
 
V
V
 
I
T
 
R
C
 
I
L
 
C
D
 
N
P
 
L
D
 
E
G
 
G
R
 
R
P
 
D
V
 
I
A
 
A
R
 
H
G
 
G
L
 
V
V
 
S
N
 
R
Y
 
Y
S
 
N
A
 
S
E
 
D
E
 
A
S
 
L
R
 
R
R
 
R
I
 
I
M
 
A
R
 
G
H
 
H
R
 
H
A
 
S
D
 
Q
E
 
E
I
 
I
E
 
D
G
 
A
I
 
I
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
V
 
E
D
 
Y
E
 
G
P
 
P
E
 
V
L
 
A
I
 
V
H
 
H
R
 
R
D
 
D
N
 
D
L
 
M
V
 
I

7wx3B Gk domain of drosophila p5cs filament with glutamate, atp, and NADPH (see paper)
33% identity, 69% coverage: 5:262/375 of query aligns to 6:256/258 of 7wx3B

query
sites
7wx3B
R
 
R
T
 
S
Q
 
Q
L
 
L
G
 
K
K
 
Y
A
 
A
R
 
R
R
 
R
W
 
L
V
 
V
I
 
V
K
 
K
I
 
L
G
 
G
S
 
S
A
 
A
L
 
V
L
 
I
T
 
T
N
 
R
E
 
E
-
 
D
G
 
N
R
 
H
G
 
G
L
 
L
D
 
A
H
 
L
D
 
G
S
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
S
W
 
I
A
 
V
E
 
E
Q
 
Q
I
 
V
A
 
A
R
 
E
L
 
C
R
 
H
G
 
L
T
 
E
G
 
G
R
 
R
E
 
E
V
 
V
V
 
M
L
 
M
V
 
V
S
 
T
S
|
S
G
 
G
A
|
A
V
 
V
A
 
A
E
 
F
G
 
G
M
 
K
R
 
Q
R
 
K
L
 
L
G
 
A
-
 
Q
-
x
E
-
 
L
-
 
L
-
x
M
-
 
S
W
x
L
T
x
S
V
x
M
R
|
R
P
 
E
H
 
T
A
 
L
L
 
N
H
 
L
E
 
E
L
 
P
Q
 
R
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
A
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
M
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
M
Q
 
S
A
 
L
Y
 
Y
E
 
D
S
 
A
I
 
M
F
 
F
Q
 
A
R
 
Q
H
 
Y
G
 
G
L
 
V
R
 
K
A
 
I
A
 
A
Q
 
Q
V
 
V
L
 
L
L
 
V
T
 
T
H
 
K
D
 
P
D
 
D
L
 
F
S
 
Y
D
 
N
R
 
E
R
 
E
R
 
T
Y
 
R
L
 
N
N
 
N
A
 
L
R
 
F
S
 
C
T
 
T
L
 
L
R
 
S
T
 
E
L
 
L
L
 
I
G
 
S
L
 
L
G
 
N
V
 
I
I
 
V
P
 
P
V
 
I
V
 
I
N
|
N
E
x
T
N
 
N
D
|
D
T
 
A
V
 
V
A
 
S
T
 
P
D
 
P
E
x
M
-
 
F
I
 
I
R
 
P
F
 
I
G
 
K
D
 
D
N
|
N
D
 
D
T
 
S
L
 
L
A
 
S
A
 
A
L
 
M
V
 
L
G
 
A
N
 
A
L
 
E
T
 
V
E
 
Q
A
 
A
Q
 
D
V
 
L
L
 
L
V
 
I
I
 
L
L
 
M
T
 
S
D
 
D
Q
 
V
Q
 
D
G
 
G
L
 
I
F
 
Y
D
 
N
R
 
K
D
 
P
P
 
P
R
 
-
T
 
-
H
 
W
Q
 
E
D
 
D
A
 
G
T
 
A
L
 
K
I
 
L
S
 
M
E
 
H
G
 
T
M
 
Y
A
 
T
A
 
S
D
 
D
P
 
D
E
 
-
L
 
-
L
 
-
K
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
F
 
-
G
 
-
H
 
-
L
 
-
G
 
S
R
 
N
G
 
S
G
 
I
M
 
M
T
 
D
T
 
S
K
 
K
L
 
V
Q
 
K
A
 
A
A
 
A
A
 
T
R
 
W
A
 
A
A
 
L
R
 
D
S
 
R
G
 
G
T
 
V
Y
 
S
T
 
V
L
 
V
I
 
I
A
 
C
S
 
N
G
 
G
R
 
M
E
 
Q
P
 
E
R
 
K
V
 
A
L
 
I
E
 
K
R
 
T
I
 
I
A
 
I
D
 
G
G
 
G
E
 
R
P
 
K
L
 
V
G
 
G
T
 
T
L
 
F
L
 
F

7f5xA Gk domain of drosophila p5cs filament with glutamate (see paper)
32% identity, 69% coverage: 5:262/375 of query aligns to 6:234/236 of 7f5xA

query
sites
7f5xA
R
 
R
T
 
S
Q
 
Q
L
 
L
G
 
K
K
 
Y
A
 
A
R
 
R
R
 
R
W
 
L
V
 
V
I
 
V
K
 
K
I
 
L
G
 
G
S
 
S
A
 
A
L
 
V
L
 
I
T
 
T
N
 
R
E
 
E
-
 
D
G
 
N
R
 
H
G
 
G
L
 
L
D
 
A
H
 
L
D
 
G
S
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
S
W
 
I
A
 
V
E
 
E
Q
 
Q
I
 
V
A
 
A
R
 
E
L
 
C
R
 
H
G
 
L
T
 
E
G
 
G
R
 
R
E
 
E
V
 
V
V
 
M
L
 
M
V
 
V
S
 
T
S
|
S
G
 
G
A
|
A
V
 
V
A
 
A
E
 
F
G
 
G
M
 
K
R
 
Q
R
 
K
L
 
L
G
 
A
W
 
Q
T
 
E
V
 
L
R
 
L
P
 
M
H
 
S
A
 
L
L
 
S
H
 
M
E
 
R
L
 
P
Q
 
R
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
A
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
M
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
M
Q
 
S
A
 
L
Y
 
Y
E
 
D
S
 
A
I
 
M
F
 
F
Q
 
A
R
 
Q
H
 
Y
G
 
G
L
 
V
R
 
K
A
 
I
A
 
A
Q
 
Q
V
 
V
L
 
L
L
 
V
T
 
T
H
 
K
D
 
P
D
 
D
L
 
F
S
 
Y
D
 
N
R
 
E
R
 
E
R
 
T
Y
 
R
L
 
N
N
 
N
A
 
L
R
 
F
S
 
C
T
 
T
L
 
L
R
 
S
T
 
E
L
 
L
L
 
I
G
 
S
L
 
L
G
 
N
V
 
I
I
 
V
P
 
P
V
 
I
V
 
I
N
|
N
E
 
T
N
 
N
D
|
D
T
 
A
V
 
V
A
 
S
T
 
P
D
 
-
E
 
-
I
 
-
R
 
-
F
 
-
G
 
-
D
 
D
N
 
N
D
 
D
T
 
S
L
 
L
A
 
S
A
 
A
L
 
M
V
 
L
G
 
A
N
 
A
L
 
E
T
 
V
E
 
Q
A
 
A
Q
 
D
V
 
L
L
 
L
V
 
I
I
 
L
L
 
M
T
 
S
D
 
D
Q
 
V
Q
 
D
G
 
G
L
 
I
F
 
Y
D
 
N
R
 
K
D
 
P
P
 
P
R
 
W
T
 
-
H
 
E
Q
 
D
D
 
G
A
 
A
T
 
K
L
 
L
I
 
M
S
 
H
E
 
T
G
 
-
M
 
-
A
 
-
A
 
-
D
 
-
P
 
-
E
 
-
L
 
-
L
 
-
K
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
F
 
-
G
 
-
H
 
-
L
 
-
G
 
-
R
 
-
G
 
-
G
 
-
M
 
Y
T
 
T
T
 
S
K
 
K
L
 
V
Q
 
K
A
 
A
A
 
A
A
 
T
R
 
W
A
 
A
A
 
L
R
 
D
S
 
R
G
 
G
T
 
V
Y
 
S
T
 
V
L
 
V
I
 
I
A
 
C
S
 
N
G
 
G
R
 
M
E
 
Q
P
 
E
R
 
K
V
 
A
L
 
I
E
 
K
R
 
T
I
 
I
A
 
I
D
 
G
G
 
G
E
 
R
P
 
K
L
 
V
G
 
G
T
 
T
L
 
F
L
 
F

2akoA Crystal structure of glutamate 5-kinase from campylobacter jejuni
32% identity, 63% coverage: 12:248/375 of query aligns to 1:224/241 of 2akoA

query
sites
2akoA
R
 
K
R
 
R
W
 
I
V
 
V
I
 
V
K
 
K
I
 
V
G
 
G
S
 
S
A
x
H
L
 
V
L
 
I
T
 
S
N
 
E
E
 
E
G
 
N
R
 
T
G
 
-
L
 
L
D
 
S
H
 
F
D
 
E
S
 
R
L
 
L
A
 
K
A
 
N
W
 
L
A
 
V
E
 
A
Q
 
F
I
 
L
A
 
A
R
 
K
L
 
L
R
 
M
G
 
-
T
 
E
G
 
K
R
 
Y
E
 
E
V
 
V
V
 
I
L
 
L
V
 
V
S
 
T
S
 
S
G
 
A
A
 
A
V
 
I
A
 
S
E
 
A
G
 
G
M
 
H
R
 
T
R
 
K
L
 
L
G
 
D
W
 
I
T
 
D
V
 
-
R
 
R
P
 
K
H
 
N
A
 
L
L
 
I
H
 
N
E
 
K
L
 
-
Q
 
Q
A
 
V
A
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
I
G
 
G
Q
 
Q
M
 
P
G
 
F
L
 
L
V
 
I
Q
 
S
A
 
V
Y
 
Y
E
 
N
S
 
E
I
 
L
F
 
L
Q
 
A
R
 
K
H
 
F
G
 
N
L
 
K
R
 
L
A
 
G
A
 
G
Q
 
Q
V
 
I
L
 
L
L
 
L
T
 
T
H
 
G
D
 
K
D
 
D
L
 
F
S
 
D
D
 
S
R
 
R
R
 
K
R
 
A
Y
 
T
L
 
K
N
 
H
A
 
A
R
 
K
S
 
N
T
 
A
L
 
I
R
 
D
T
 
M
L
 
M
L
 
I
G
 
N
L
 
L
G
 
G
V
 
I
I
 
L
P
 
P
V
 
I
V
 
I
N
 
N
E
 
E
N
 
N
D
 
D
T
 
A
V
 
T
A
 
A
T
 
I
D
 
E
E
 
E
I
 
I
R
 
V
F
 
F
G
 
G
D
 
D
N
 
N
D
 
D
T
 
S
L
 
L
A
 
S
A
 
A
L
 
Y
V
 
A
G
 
T
N
 
H
L
 
F
T
 
F
E
 
D
A
 
A
Q
 
D
V
 
L
L
 
L
V
 
V
I
 
I
L
 
L
T
x
S
D
|
D
Q
x
I
Q
 
D
G
 
G
L
x
F
F
x
Y
D
 
D
R
 
K
D
x
N
P
|
P
R
 
S
T
 
E
H
 
F
Q
 
S
D
 
D
A
 
A
T
 
K
L
 
R
I
 
L
S
 
E
E
 
K
G
 
I
M
 
T
A
 
H
A
 
I
D
 
K
P
 
E
E
 
E
L
 
W
L
 
L
K
 
H
L
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
F
 
-
G
 
-
H
 
-
L
 
-
G
 
G
R
x
T
G
 
G
G
|
G
M
 
I
T
 
V
T
 
T
K
|
K
L
 
L
Q
 
K
A
 
A
A
 
A
A
 
K
R
 
F
A
 
L
A
 
L
R
 
E
S
 
H
G
 
N
T
 
K
Y
 
K
T
 
M
L
 
F
I
 
L
A
 
A
S
 
S
G
 
G
R
 
F
E
 
D
P
 
L
R
 
S
V
 
V

8j0eB Gk monomer complexes with catalytic intermediate
35% identity, 68% coverage: 12:265/375 of query aligns to 11:265/269 of 8j0eB

query
sites
8j0eB
R
 
K
R
 
R
W
 
I
V
 
V
I
 
V
K
|
K
I
 
V
G
|
G
S
x
T
A
|
A
L
 
V
L
 
V
T
 
T
N
 
G
E
 
K
G
 
G
R
 
G
G
 
R
L
 
L
D
 
A
H
 
L
D
 
G
S
 
R
L
 
L
A
 
G
A
 
A
W
 
I
A
 
C
E
 
E
Q
 
Q
I
 
L
A
 
A
R
 
E
L
 
L
R
 
N
G
 
S
T
 
D
G
 
G
R
 
F
E
 
E
V
 
V
V
 
I
L
 
L
V
 
V
S
 
S
S
|
S
G
|
G
A
 
A
V
|
V
A
 
G
E
 
L
G
 
G
M
 
R
R
 
Q
R
 
R
L
 
L
G
 
R
W
x
Y
-
 
R
-
 
Q
-
x
L
-
x
V
-
 
N
-
x
S
-
 
S
-
x
F
-
 
A
-
 
D
T
 
L
V
x
Q
R
 
K
P
 
P
H
 
Q
A
 
M
L
 
E
H
 
L
E
 
D
L
 
G
Q
 
K
A
 
A
A
 
C
A
 
A
A
 
G
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
M
 
S
G
 
S
L
 
L
V
 
M
Q
 
A
A
 
Y
Y
 
Y
E
 
E
S
 
T
I
 
M
F
 
F
Q
 
D
R
 
Q
H
 
L
G
 
D
L
 
V
R
 
T
A
 
V
A
 
A
Q
 
Q
V
 
M
L
 
L
L
 
V
T
 
T
H
 
D
D
 
S
D
 
S
L
 
F
S
 
R
D
 
D
R
 
K
R
 
D
R
 
F
Y
 
R
L
 
K
N
 
Q
A
 
L
R
 
S
S
 
E
T
 
T
L
 
V
R
 
K
T
 
A
L
 
M
L
 
L
G
 
R
L
 
M
G
 
R
V
 
V
I
 
I
P
 
P
V
 
V
V
 
F
N
 
N
E
 
E
N
 
N
D
|
D
T
 
A
V
 
I
A
 
S
T
 
T
D
 
-
E
 
-
I
 
-
R
 
R
F
 
F
G
 
W
D
 
D
N
|
N
D
|
D
T
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
L
G
 
S
N
 
L
L
 
E
T
 
L
E
 
K
A
 
A
Q
 
D
V
 
L
L
 
L
V
 
I
I
 
L
L
 
L
T
 
S
D
 
D
Q
x
V
Q
 
E
G
 
G
L
 
L
F
 
Y
D
 
T
R
 
G
D
 
P
P
|
P
R
 
S
T
 
D
H
 
S
Q
 
T
D
 
S
A
 
K
-
 
L
-
 
I
-
 
H
T
 
T
L
 
F
I
 
I
S
 
K
E
 
E
G
 
K
M
 
H
A
 
Q
A
 
D
D
 
E
P
 
I
E
 
T
L
 
-
L
 
-
K
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
F
 
F
G
 
G
H
 
E
L
 
-
G
x
K
R
|
R
G
|
G
G
|
G
M
|
M
T
 
T
T
 
A
K
 
K
L
 
V
Q
 
K
A
 
A
A
 
A
A
 
V
R
 
N
A
 
A
A
 
A
R
 
Y
S
 
G
G
 
G
T
 
V
Y
 
P
T
 
V
L
 
I
I
 
I
A
 
T
S
 
S
G
 
G
R
 
Y
E
 
A
P
 
A
R
 
E
V
 
N
L
 
I
E
 
S
R
 
K
I
 
V
A
 
L
D
 
R
G
 
G
E
 
L
P
 
R
L
 
V
G
 
G
T
 
T
L
 
L
L
 
F
C
 
H
P
 
Q
D
 
D

8j0gB Gk monomer complexes with glutamate and atp
34% identity, 68% coverage: 12:265/375 of query aligns to 8:270/274 of 8j0gB

query
sites
8j0gB
R
 
K
R
 
R
W
 
I
V
 
V
I
 
V
K
|
K
I
 
V
G
|
G
S
x
T
A
|
A
L
 
V
L
 
V
T
 
T
N
 
G
E
 
K
G
 
G
R
 
G
G
 
R
L
 
L
D
 
A
H
 
L
D
 
G
S
 
R
L
 
L
A
 
G
A
 
A
W
 
I
A
 
C
E
 
E
Q
 
Q
I
 
L
A
 
A
R
 
E
L
 
L
R
 
N
G
 
S
T
 
D
G
 
G
R
 
F
E
 
E
V
 
V
V
 
I
L
 
L
V
 
V
S
 
S
S
 
S
G
 
G
A
|
A
V
 
V
A
 
G
E
 
L
G
 
G
M
 
R
R
 
Q
R
 
R
L
 
L
G
 
R
W
x
Y
-
 
R
-
 
Q
-
x
L
-
x
V
-
 
N
-
 
S
-
 
S
-
x
F
-
 
A
-
 
D
T
 
L
V
 
Q
R
 
K
P
 
P
H
 
Q
A
 
M
L
 
E
H
 
L
E
 
D
L
 
G
Q
 
K
A
 
A
A
 
C
A
 
A
A
 
G
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
M
 
S
G
 
S
L
 
L
V
 
M
Q
 
A
A
 
Y
Y
 
Y
E
 
E
S
 
T
I
 
M
F
 
F
Q
 
D
R
 
Q
H
 
L
G
 
D
L
 
V
R
 
T
A
 
V
A
 
A
Q
 
Q
V
 
M
L
 
L
L
 
V
T
 
T
H
 
D
D
 
S
D
 
S
L
 
F
S
 
R
D
 
D
R
 
K
R
 
D
R
 
F
Y
 
R
L
 
K
N
 
Q
A
 
L
R
 
S
S
 
E
T
 
T
L
 
V
R
 
K
T
 
A
L
 
M
L
 
L
G
 
R
L
 
M
G
 
R
V
 
V
I
 
I
P
 
P
V
 
V
V
 
F
N
|
N
E
 
E
N
 
N
D
|
D
T
 
A
V
 
I
A
 
S
T
 
T
D
 
R
E
 
R
I
 
T
R
 
G
-
 
I
F
 
F
G
 
W
D
 
D
N
|
N
D
 
D
T
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
L
G
 
S
N
 
L
L
 
E
T
 
L
E
 
K
A
 
A
Q
 
D
V
 
L
L
 
L
V
 
I
I
 
L
L
 
L
T
 
S
D
 
D
Q
x
V
Q
 
E
G
 
G
L
 
L
F
 
Y
D
 
T
R
x
G
D
 
P
P
|
P
R
 
S
T
 
D
H
 
S
Q
 
T
D
 
S
A
 
K
-
 
L
-
 
I
-
 
H
T
 
T
L
 
F
I
 
I
S
 
K
E
 
E
G
 
K
M
 
H
A
 
Q
A
 
D
D
 
E
P
 
I
E
 
T
L
x
F
L
 
G
K
 
E
L
 
K
A
 
S
A
 
-
P
 
-
G
 
-
F
 
-
G
 
-
H
 
K
L
 
L
G
 
G
R
|
R
G
|
G
G
|
G
M
|
M
T
 
T
T
 
A
K
|
K
L
 
V
Q
 
K
A
 
A
A
 
A
A
 
V
R
 
N
A
 
A
A
 
A
R
 
Y
S
 
G
G
 
G
T
 
V
Y
 
P
T
 
V
L
 
I
I
 
I
A
 
T
S
 
S
G
 
G
R
 
Y
E
 
A
P
 
A
R
 
E
V
 
N
L
 
I
E
 
S
R
 
K
I
 
V
A
 
L
D
 
R
G
 
G
E
 
L
P
 
R
L
 
V
G
 
G
T
 
T
L
 
L
L
 
F
C
 
H
P
 
Q
D
 
D

8j0fA Gk tetramer with adjacent hooks at reaction state (see paper)
33% identity, 71% coverage: 1:265/375 of query aligns to 1:264/270 of 8j0fA

query
sites
8j0fA
M
 
I
K
 
D
Q
 
R
T
 
S
R
 
R
T
 
A
Q
 
F
L
 
A
G
 
K
K
 
D
A
 
V
R
 
K
R
 
R
W
 
I
V
 
V
I
 
V
K
|
K
I
 
V
G
 
G
S
x
T
A
|
A
L
 
V
L
 
V
T
 
T
N
 
G
E
 
K
G
 
G
R
 
G
G
 
R
L
 
L
D
 
A
H
 
L
D
 
G
S
 
R
L
 
L
A
 
G
A
 
A
W
 
I
A
 
C
E
 
E
Q
 
Q
I
 
L
A
 
A
R
 
E
L
 
L
R
 
N
G
 
S
T
 
D
G
 
G
R
 
F
E
 
E
V
 
V
V
 
I
L
 
L
V
 
V
S
 
S
S
|
S
G
 
G
A
 
A
V
 
V
A
 
G
E
 
L
G
 
G
M
 
R
R
 
Q
R
 
R
L
 
L
G
 
R
W
 
Y
-
 
R
-
 
Q
-
x
L
-
x
V
-
x
N
-
x
S
-
x
S
-
x
F
-
x
A
-
 
D
T
x
L
V
 
Q
R
 
K
P
 
P
H
 
Q
A
 
M
L
 
E
H
 
L
E
 
D
L
 
G
Q
 
K
A
 
A
A
 
C
A
 
A
A
 
G
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
M
 
S
G
 
S
L
 
L
V
 
M
Q
 
A
A
 
Y
Y
 
Y
E
 
E
S
 
T
I
 
M
F
 
F
Q
 
D
R
 
Q
H
 
L
G
 
D
L
 
V
R
 
T
A
 
V
A
 
A
Q
 
Q
V
 
M
L
 
L
L
 
V
T
 
T
H
 
D
D
 
S
D
 
S
L
 
F
S
 
R
D
 
D
R
 
K
R
 
D
R
 
F
Y
 
R
L
 
K
N
 
Q
A
 
L
R
 
S
S
 
E
T
 
T
L
 
V
R
 
K
T
 
A
L
 
M
L
 
L
G
 
R
L
 
M
G
 
R
V
 
V
I
 
I
P
 
P
V
 
V
V
 
F
N
 
N
E
 
E
N
 
N
D
|
D
T
 
A
V
 
I
A
 
S
T
 
T
D
 
-
E
 
-
I
 
-
R
 
R
F
 
W
G
 
-
D
 
D
N
|
N
D
 
D
T
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
L
G
 
S
N
 
L
L
 
E
T
 
L
E
 
K
A
 
A
Q
 
D
V
 
L
L
 
L
V
 
I
I
 
L
L
 
L
T
 
S
D
|
D
Q
x
V
Q
 
E
G
 
G
L
 
L
F
x
Y
D
 
T
R
x
G
D
 
P
P
 
P
R
 
S
T
 
D
H
 
S
Q
 
T
D
 
S
A
 
K
-
 
L
-
 
I
-
 
H
T
 
T
L
 
F
I
 
I
S
 
K
E
 
E
G
 
K
M
 
H
A
 
Q
A
 
D
D
 
E
P
 
I
E
 
T
L
 
-
L
 
-
K
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
F
|
F
G
 
G
H
 
E
L
 
-
G
 
-
R
|
R
G
|
G
G
|
G
M
|
M
T
 
T
T
 
A
K
 
K
L
 
V
Q
 
K
A
 
A
A
 
A
A
 
V
R
 
N
A
 
A
A
 
A
R
 
Y
S
 
G
G
 
G
T
 
V
Y
 
P
T
 
V
L
 
I
I
 
I
A
 
T
S
 
S
G
 
G
R
 
Y
E
 
A
P
 
A
R
 
E
V
 
N
L
 
I
E
 
S
R
 
K
I
 
V
A
 
L
D
 
R
G
 
G
E
 
L
P
 
R
L
 
V
G
 
G
T
 
T
L
 
L
L
 
F
C
 
H
P
 
Q
D
 
D

8u0mA Crystal structure of isopentenyl phosphate kinase from thermococcus paralvinellae bound to (e)-2-methylbut-2-en-1-yl monophosphate and atp (see paper)
29% identity, 36% coverage: 128:262/375 of query aligns to 120:243/247 of 8u0mA

query
sites
8u0mA
L
 
L
R
 
R
T
 
K
L
 
L
L
 
L
G
 
E
L
 
L
G
 
K
V
 
F
I
 
I
P
 
P
V
 
V
V
 
L
N
 
F
E
x
G
N
 
D
D
 
T
T
 
A
V
 
I
A
 
A
T
 
L
D
 
D
E
 
K
-
 
G
I
 
I
R
 
D
F
x
I
G
 
L
D
 
S
N
x
G
D
 
D
T
 
Q
L
 
I
A
 
V
A
 
S
L
 
Y
V
 
L
G
 
A
N
 
K
L
 
M
T
 
L
E
 
K
A
 
P
Q
 
S
V
 
K
L
 
V
V
 
I
I
 
F
L
 
L
T
 
M
D
 
D
Q
x
V
Q
 
D
G
 
G
L
 
I
F
x
Y
D
 
D
R
|
R
D
 
N
P
|
P
R
 
K
T
 
-
H
 
E
Q
 
R
D
 
D
A
 
A
T
 
K
L
 
L
I
 
I
S
 
E
E
 
E
G
 
-
M
 
-
A
 
-
A
 
-
D
 
-
P
 
-
E
 
-
L
 
-
L
 
-
K
 
-
L
 
L
A
 
N
A
 
V
P
 
E
G
 
E
F
 
I
G
 
R
H
 
H
L
 
L
G
 
L
R
 
E
G
 
S
G
|
G
M
x
I
T
 
G
T
 
N
K
|
K
L
 
L
Q
 
R
A
 
E
A
 
A
A
 
L
R
 
K
A
 
I
A
 
A
R
 
K
S
 
H
G
 
S
T
 
E
Y
 
V
T
 
Y
L
 
F
I
 
I
A
 
-
S
 
N
G
 
G
R
 
K
E
 
V
P
 
K
R
 
E
V
 
N
L
 
L
E
 
G
R
 
K
I
 
A
A
 
I
D
 
R
G
 
G
E
 
E
P
 
K
L
 
V
G
 
G
T
 
T
L
 
R
L
 
L

Sites not aligning to the query:

Q8U122 Uridylate kinase; UK; Uridine monophosphate kinase; UMP kinase; UMPK; EC 2.7.4.22 from Pyrococcus furiosus (strain ATCC 43587 / DSM 3638 / JCM 8422 / Vc1) (see paper)
30% identity, 29% coverage: 156:264/375 of query aligns to 120:225/225 of Q8U122

query
sites
Q8U122
N
x
T
D
|
D
T
 
A
L
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
L
G
 
A
N
 
E
L
 
F
T
 
L
E
 
K
A
 
A
Q
 
D
V
 
L
L
 
L
V
 
V
I
 
V
L
 
I
T
 
T
D
 
N
Q
 
V
Q
 
D
G
 
G
L
 
V
F
 
Y
D
 
T
R
 
A
D
 
D
P
 
P
R
 
K
T
 
K
H
 
D
Q
 
P
D
 
T
A
 
A
T
 
K
L
 
K
I
 
I
S
 
K
E
 
K
G
 
-
M
 
M
A
 
K
A
 
P
D
 
E
P
 
-
E
 
E
L
 
L
L
 
L
K
 
E
L
 
I
A
 
V
A
 
G
P
 
K
G
 
G
F
 
I
G
 
E
H
 
K
L
 
A
G
|
G
R
 
S
G
 
S
G
x
S
M
 
V
T
 
I
T
 
D
K
 
P
L
 
L
Q
 
-
A
 
A
A
 
A
A
 
K
R
 
I
A
 
I
A
 
A
R
 
R
S
 
S
G
 
G
T
 
I
Y
 
K
T
 
T
L
 
I
I
 
V
A
 
I
S
 
G
G
 
K
R
 
E
E
 
D
P
 
A
R
 
K
V
 
D
L
 
L
E
 
F
R
 
R
I
 
V
A
 
I
D
 
K
G
 
G
E
 
D
P
 
H
L
 
N
G
 
G
T
 
T
L
 
T
L
 
I
C
 
E
P
 
P

Sites not aligning to the query:

2bmuB Ump kinase from pyrococcus furiosus complexed with its substrate ump and its substrate analog amppnp (see paper)
30% identity, 29% coverage: 156:264/375 of query aligns to 121:226/226 of 2bmuB

query
sites
2bmuB
N
x
T
D
|
D
T
 
A
L
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
L
G
 
A
N
 
E
L
 
F
T
 
L
E
 
K
A
 
A
Q
 
D
V
 
L
L
 
L
V
 
V
I
 
V
L
 
I
T
|
T
D
x
N
Q
 
V
Q
 
D
G
 
G
L
x
V
F
x
Y
D
 
T
R
x
A
D
|
D
P
|
P
R
 
K
T
 
K
H
 
D
Q
 
P
D
 
T
A
 
A
T
 
K
L
 
K
I
 
I
S
 
K
E
 
K
G
 
-
M
 
M
A
 
K
A
 
P
D
 
E
P
 
-
E
 
E
L
 
L
L
 
L
K
 
E
L
 
I
A
 
V
A
 
G
P
 
K
G
 
G
F
 
I
G
 
E
H
 
K
L
x
A
G
 
G
R
 
S
G
x
S
G
x
S
M
x
V
T
 
I
T
 
D
K
 
P
L
 
L
Q
 
-
A
 
A
A
 
A
A
 
K
R
 
I
A
 
I
A
 
A
R
 
R
S
 
S
G
 
G
T
 
I
Y
 
K
T
 
T
L
 
I
I
 
V
A
 
I
S
 
G
G
 
K
R
 
E
E
 
D
P
 
A
R
 
K
V
 
D
L
 
L
E
 
F
R
 
R
I
 
V
A
 
I
D
 
K
G
 
G
E
 
D
P
 
H
L
 
N
G
 
G
T
 
T
L
 
T
L
 
I
C
 
E
P
 
P

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_018232926.1 NCBI__GCF_000378965.1:WP_018232926.1
MKQTRTQLGKARRWVIKIGSALLTNEGRGLDHDSLAAWAEQIARLRGTGREVVLVSSGAV
AEGMRRLGWTVRPHALHELQAAAAVGQMGLVQAYESIFQRHGLRAAQVLLTHDDLSDRRR
YLNARSTLRTLLGLGVIPVVNENDTVATDEIRFGDNDTLAALVGNLTEAQVLVILTDQQG
LFDRDPRTHQDATLISEGMAADPELLKLAAPGFGHLGRGGMTTKLQAAARAARSGTYTLI
ASGREPRVLERIADGEPLGTLLCPDREPIAARKQWIAGQMVSKGELLLDAGAARVVRESG
RSLLPVGVTHVKGTFTRGDVVTCLDPDGRPVARGLVNYSAEESRRIMRHRADEIEGILGY
VDEPELIHRDNLVLL

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory