SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_018234152.1 NCBI__GCF_000378965.1:WP_018234152.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5zaiC Crystal structure of 3-hydroxypropionyl-coa dehydratase from metallosphaera sedula (see paper)
28% identity, 69% coverage: 14:204/276 of query aligns to 5:183/259 of 5zaiC

query
sites
5zaiC
T
 
T
L
 
I
S
 
E
Y
 
T
D
 
K
D
 
K
K
 
E
R
 
G
R
 
N
T
 
L
Y
 
F
W
 
W
C
 
I
R
 
T
L
 
L
H
 
N
-
 
R
P
 
P
H
 
D
P
x
K
R
x
L
P
 
N
C
 
A
F
 
L
S
 
N
S
 
A
E
 
K
L
 
L
L
 
L
G
 
E
E
 
E
L
 
L
S
 
D
Q
 
R
V
 
A
S
 
-
T
 
-
R
 
-
I
 
-
P
 
-
K
 
-
E
 
-
V
 
V
T
 
S
T
 
Q
L
 
A
Q
 
E
S
 
S
E
 
D
P
 
P
H
 
E
Y
 
I
F
 
R
V
 
V
L
 
I
C
 
I
S
 
I
D
 
T
I
 
G
P
 
K
G
 
G
-
 
K
V
 
A
F
 
F
N
 
C
L
x
A
G
|
G
G
x
A
D
|
D
L
x
I
D
 
T
L
 
Q
F
|
F
A
 
N
Q
 
Q
L
 
L
V
 
T
R
 
P
E
 
A
R
 
E
N
 
A
Y
 
W
R
 
K
G
 
-
L
 
F
V
x
S
E
 
K
Y
 
K
G
 
G
Q
x
R
K
 
E
C
 
I
L
 
M
R
 
D
M
 
K
V
 
I
T
 
E
A
 
A
N
 
L
S
 
S
S
 
K
G
 
-
L
 
-
Q
 
-
G
 
-
H
 
-
A
 
-
T
 
P
T
 
T
I
 
I
A
 
A
L
 
M
V
 
I
Q
 
N
G
 
G
D
 
Y
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
F
 
L
E
|
E
A
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
C
H
 
D
V
 
I
L
 
R
I
 
I
A
 
A
E
 
A
E
 
E
G
 
E
T
 
A
K
 
Q
L
 
L
G
 
G
F
 
L
P
|
P
E
|
E
V
 
I
L
 
N
F
 
L
N
 
G
L
x
I
F
 
Y
P
|
P
G
|
G
M
 
Y
G
 
G
A
 
G
Y
 
T
H
 
Q
M
 
R
L
 
L
S
 
T
R
 
R
R
 
V
L
 
I
P
 
G
V
 
K
K
 
G
R
 
R
A
 
A
E
 
L
Q
 
E
L
 
M
M
 
M
L
 
M
S
 
T
G
 
G
E
 
D
L
x
R
Y
 
I
S
 
P
A
 
G
E
 
K
D
 
D
L
 
A
H
 
E
A
 
K
R
 
Y
G
 
G
V
 
L
V
 
V
D
 
N
V
 
R
L
 
V
A
 
V
P
 
P

Sites not aligning to the query:

6yswA E. Coli anaerobic trifunctional enzyme subunit-alpha in complex with coenzyme a
31% identity, 61% coverage: 66:232/276 of query aligns to 53:215/707 of 6yswA

query
sites
6yswA
V
 
V
L
 
F
C
 
V
S
 
S
D
 
A
I
 
K
P
 
P
G
 
D
V
 
N
F
 
F
N
 
I
L
 
A
G
 
G
G
x
A
D
|
D
L
x
I
D
 
N
L
 
M
F
x
I
A
 
G
Q
 
N
L
 
C
V
 
K
R
 
T
E
 
A
R
 
Q
N
 
E
Y
 
A
R
 
E
G
 
A
L
 
L
V
x
A
E
 
R
Y
 
Q
G
 
G
Q
|
Q
K
 
Q
C
 
L
L
 
M
R
 
A
M
 
E
V
 
I
T
 
H
A
 
A
N
 
L
S
 
P
S
 
-
G
 
-
L
 
-
Q
 
-
G
 
-
H
 
-
A
 
I
T
 
Q
T
 
V
I
 
I
A
 
A
L
 
A
V
 
I
Q
 
H
G
 
G
D
 
A
A
 
C
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
F
 
L
E
|
E
A
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
C
H
 
H
-
 
G
-
 
R
V
 
V
L
 
C
I
 
T
A
 
D
E
 
D
E
 
P
G
 
K
T
 
T
K
 
V
L
 
L
G
 
G
F
 
L
P
|
P
E
|
E
V
 
V
L
 
Q
F
x
L
N
 
G
L
 
L
F
 
L
P
 
P
G
|
G
M
 
S
G
 
G
A
 
G
Y
 
T
H
 
Q
M
 
R
L
 
L
S
 
P
R
 
R
R
 
L
L
 
I
P
 
G
V
 
V
K
 
S
R
 
T
A
 
A
E
 
L
Q
 
E
L
 
M
M
 
I
L
 
L
S
 
T
G
 
G
E
 
K
L
 
Q
Y
 
L
S
 
R
A
 
A
E
 
K
D
 
Q
L
 
A
H
 
L
A
 
K
R
 
L
G
 
G
V
 
L
V
 
V
D
 
D
V
 
D
L
 
V
A
 
V
P
 
P
R
 
H
G
 
S
Q
 
I
G
 
L
S
 
L
E
 
E
A
 
A
V
 
A
E
 
V
E
 
E
Y
 
L
I
 
A
R
 
K
S
 
K
E
 
E
R
 
R
A
 
P
Y
 
S
A
 
S
R
 
R
G
 
P
A
 
L
A
 
P
A
 
V
I
 
R
R
 
E
R
 
R
I
 
I

Sites not aligning to the query:

P40939 Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial; 78 kDa gastrin-binding protein; Monolysocardiolipin acyltransferase; TP-alpha; EC 2.3.1.-; EC 4.2.1.17; EC 1.1.1.211 from Homo sapiens (Human) (see 5 papers)
30% identity, 65% coverage: 36:214/276 of query aligns to 64:234/763 of P40939

query
sites
P40939
F
 
L
S
 
S
S
 
K
E
 
E
L
 
L
L
 
H
G
 
S
E
 
E
L
 
F
S
 
S
Q
 
E
V
 
V
S
 
M
T
 
N
R
 
E
I
 
I
P
 
-
K
 
-
E
 
-
V
 
-
T
 
-
T
 
W
L
 
A
Q
 
S
S
 
D
E
 
Q
P
 
I
H
 
R
Y
 
S
F
 
A
V
 
V
L
 
L
C
 
I
S
 
S
D
 
S
I
 
K
P
 
P
G
 
G
V
 
C
F
 
F
N
 
I
L
 
A
G
 
G
G
 
A
D
 
D
L
 
I
D
 
N
L
 
M
F
 
L
A
 
A
Q
 
A
L
 
C
V
 
K
R
 
T
E
 
L
R
 
Q
N
 
E
Y
 
V
R
 
T
G
 
Q
L
 
L
V
 
S
E
 
Q
Y
 
E
G
 
A
Q
 
Q
K
 
R
C
 
I
L
 
V
R
 
E
M
 
K
V
 
L
T
 
E
A
 
K
N
 
S
S
 
T
S
 
K
G
 
P
L
 
I
Q
 
-
G
 
-
H
 
-
A
 
-
T
 
-
T
 
-
I
 
V
A
 
A
L
 
A
V
 
I
Q
 
N
G
 
G
D
 
S
A
 
C
L
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
F
 
L
E
 
E
A
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
S
A
 
C
H
 
Q
V
 
Y
L
 
R
I
 
I
A
 
A
-
 
T
-
 
K
E
 
D
E
 
R
G
 
K
T
 
T
K
 
V
L
 
L
G
 
G
F
 
T
P
 
P
E
 
E
V
 
V
L
 
L
F
 
L
N
 
G
L
 
A
F
 
L
P
 
P
G
 
G
M
 
A
G
 
G
A
 
G
Y
 
T
H
 
Q
M
 
R
L
 
L
S
 
P
R
 
K
R
 
M
L
 
V
P
 
G
V
 
V
K
 
P
R
 
A
A
 
A
E
 
L
Q
 
D
L
 
M
M
 
M
L
 
L
S
 
T
G
 
G
E
 
R
L
 
S
Y
 
I
S
 
R
A
 
A
E
 
D
D
 
R
L
 
A
H
 
K
A
 
K
R
 
M
G
 
G
V
 
L
V
 
V
D
 
D
V
 
Q
L
 
L
A
 
V
-
 
E
P
 
P
R
 
L
G
 
G
Q
 
P
G
 
G
S
 
L
E
 
K
A
 
P
V
 
P
E
 
E
E
 
E

Sites not aligning to the query:

3h81A Crystal structure of enoyl-coa hydratase from mycobacterium tuberculosis (see paper)
29% identity, 58% coverage: 45:204/276 of query aligns to 29:180/256 of 3h81A

query
sites
3h81A
S
 
S
Q
 
Q
V
 
V
S
 
M
T
 
N
R
 
E
I
 
V
P
 
T
K
 
S
E
 
A
V
 
A
T
 
T
T
 
E
L
 
L
Q
 
D
S
 
D
E
 
D
P
 
P
H
 
D
Y
 
I
-
 
G
F
 
A
V
 
I
L
 
I
C
 
I
S
 
T
D
 
G
I
 
S
P
 
A
G
 
K
V
 
A
F
 
F
N
 
A
L
 
A
G
 
G
G
x
A
D
 
D
L
 
I
D
 
K
L
 
E
F
x
M
A
 
A
Q
 
D
L
 
L
V
 
T
R
 
F
E
 
A
R
 
D
N
 
A
Y
 
F
R
x
T
G
 
A
-
 
D
-
 
F
L
x
F
V
 
A
E
 
T
Y
 
W
G
 
G
Q
 
K
K
 
-
C
 
-
L
 
L
R
 
A
M
 
A
V
 
V
T
 
-
A
 
-
N
 
-
S
 
-
S
 
-
G
 
-
L
 
-
Q
 
-
G
 
-
H
 
R
A
 
T
T
 
P
T
 
T
I
 
I
A
 
A
L
 
A
V
 
V
Q
 
A
G
 
G
D
 
Y
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
F
 
C
E
|
E
A
 
L
A
 
A
L
 
M
A
 
M
A
 
C
H
 
D
V
 
V
L
 
L
I
 
I
A
 
A
E
 
A
E
 
D
G
 
T
T
 
A
K
 
K
L
 
F
G
 
G
F
 
Q
P
|
P
E
|
E
V
 
I
L
 
K
F
 
L
N
 
G
L
x
V
F
 
L
P
|
P
G
|
G
M
 
M
G
 
G
A
 
G
Y
 
S
H
 
Q
M
 
R
L
 
L
S
 
T
R
 
R
R
 
A
L
 
I
P
 
G
V
 
K
K
 
A
R
 
K
A
 
A
E
 
M
Q
 
D
L
 
L
M
 
I
L
 
L
S
 
T
G
 
G
E
 
R
L
 
T
Y
 
M
S
 
D
A
 
A
E
 
A
D
 
E
L
 
A
H
 
E
A
 
R
R
 
S
G
 
G
V
 
L
V
 
V
D
 
S
V
 
R
L
 
V
A
 
V
P
 
P

Sites not aligning to the query:

3q0jC Crystal structure of the mycobacterium tuberculosis crotonase in complex with the inhibitor acetoacetylcoa
29% identity, 58% coverage: 45:204/276 of query aligns to 30:181/255 of 3q0jC

query
sites
3q0jC
S
 
S
Q
 
Q
V
 
V
S
 
M
T
 
N
R
 
E
I
 
V
P
 
T
K
 
S
E
 
A
V
 
A
T
 
T
T
 
E
L
 
L
Q
 
D
S
 
D
E
 
D
P
 
P
H
 
D
Y
 
I
-
 
G
F
 
A
V
 
I
L
 
I
C
 
I
S
 
T
D
 
G
I
 
S
P
 
A
G
 
K
V
 
A
F
 
F
N
 
A
L
x
A
G
|
G
G
x
A
D
|
D
L
x
I
D
x
K
L
 
E
F
x
M
A
 
A
Q
 
D
L
 
L
V
 
T
R
 
F
E
 
A
R
 
D
N
 
A
Y
 
F
R
x
T
G
 
A
-
 
D
-
 
F
L
x
F
V
 
A
E
 
T
Y
 
W
G
 
G
Q
 
K
K
 
-
C
 
-
L
 
L
R
 
A
M
 
A
V
 
V
T
 
-
A
 
-
N
 
-
S
 
-
S
 
-
G
 
-
L
 
-
Q
 
-
G
 
-
H
 
R
A
 
T
T
 
P
T
 
T
I
 
I
A
 
A
L
 
A
V
 
V
Q
 
A
G
 
G
D
 
Y
A
 
A
L
 
L
G
|
G
G
|
G
G
 
G
F
 
C
E
|
E
A
 
L
A
 
A
L
 
M
A
 
M
A
 
C
H
 
D
V
 
V
L
 
L
I
 
I
A
 
A
E
 
A
E
 
D
G
 
T
T
 
A
K
 
K
L
 
F
G
 
G
F
 
Q
P
|
P
E
|
E
V
 
I
L
 
K
F
 
L
N
 
G
L
x
V
F
 
L
P
|
P
G
|
G
M
|
M
G
 
G
A
 
G
Y
 
S
H
 
Q
M
 
R
L
 
L
S
 
T
R
 
R
R
 
A
L
 
I
P
 
G
V
 
K
K
 
A
R
 
K
A
 
A
E
 
M
Q
 
D
L
 
L
M
 
I
L
 
L
S
 
T
G
 
G
E
 
R
L
 
T
Y
 
M
S
 
D
A
 
A
E
 
A
D
 
E
L
 
A
H
 
E
A
 
R
R
 
S
G
 
G
V
 
L
V
 
V
D
 
S
V
 
R
L
 
V
A
 
V
P
 
P

Sites not aligning to the query:

3q0gC Crystal structure of the mycobacterium tuberculosis crotonase bound to a reaction intermediate derived from crotonyl coa
29% identity, 58% coverage: 45:204/276 of query aligns to 30:181/255 of 3q0gC

query
sites
3q0gC
S
 
S
Q
 
Q
V
 
V
S
 
M
T
 
N
R
 
E
I
 
V
P
 
T
K
 
S
E
 
A
V
 
A
T
 
T
T
 
E
L
 
L
Q
 
D
S
 
D
E
 
D
P
 
P
H
 
D
Y
 
I
-
 
G
F
 
A
V
 
I
L
 
I
C
 
I
S
 
T
D
 
G
I
 
S
P
 
A
G
 
K
V
 
A
F
 
F
N
 
A
L
x
A
G
 
G
G
x
A
D
 
D
L
x
I
D
x
K
L
 
E
F
x
M
A
 
A
Q
 
D
L
 
L
V
 
T
R
 
F
E
 
A
R
 
D
N
 
A
Y
 
F
R
x
T
G
 
A
-
 
D
-
 
F
L
x
F
V
 
A
E
 
T
Y
 
W
G
 
G
Q
 
K
K
 
-
C
 
-
L
 
L
R
 
A
M
 
A
V
 
V
T
 
-
A
 
-
N
 
-
S
 
-
S
 
-
G
 
-
L
 
-
Q
 
-
G
 
-
H
 
R
A
 
T
T
 
P
T
 
T
I
 
I
A
 
A
L
 
A
V
 
V
Q
 
A
G
 
G
D
x
Y
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
F
 
C
E
|
E
A
 
L
A
 
A
L
 
M
A
 
M
A
 
C
H
 
D
V
 
V
L
 
L
I
 
I
A
 
A
E
 
A
E
 
D
G
 
T
T
 
A
K
 
K
L
 
F
G
 
G
F
 
Q
P
|
P
E
|
E
V
 
I
L
 
K
F
x
L
N
 
G
L
x
V
F
 
L
P
|
P
G
|
G
M
 
M
G
 
G
A
 
G
Y
 
S
H
 
Q
M
 
R
L
 
L
S
 
T
R
 
R
R
 
A
L
 
I
P
 
G
V
 
K
K
 
A
R
 
K
A
 
A
E
 
M
Q
 
D
L
 
L
M
 
I
L
 
L
S
 
T
G
 
G
E
 
R
L
 
T
Y
 
M
S
 
D
A
 
A
E
 
A
D
 
E
L
 
A
H
 
E
A
 
R
R
 
S
G
 
G
V
 
L
V
 
V
D
 
S
V
 
R
L
 
V
A
 
V
P
 
P

Sites not aligning to the query:

3q0gD Crystal structure of the mycobacterium tuberculosis crotonase bound to a reaction intermediate derived from crotonyl coa
40% identity, 31% coverage: 120:204/276 of query aligns to 92:176/250 of 3q0gD

query
sites
3q0gD
T
 
T
I
 
I
A
 
A
L
 
A
V
 
V
Q
 
A
G
 
G
D
 
Y
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
F
 
C
E
|
E
A
 
L
A
 
A
L
 
M
A
 
M
A
 
C
H
 
D
V
 
V
L
 
L
I
 
I
A
 
A
E
 
A
E
 
D
G
 
T
T
 
A
K
 
K
L
 
F
G
 
G
F
 
Q
P
|
P
E
|
E
V
 
I
L
 
K
F
 
L
N
 
G
L
x
V
F
 
L
P
|
P
G
|
G
M
 
M
G
 
G
A
 
G
Y
 
S
H
 
Q
M
 
R
L
 
L
S
 
T
R
 
R
R
 
A
L
 
I
P
 
G
V
 
K
K
 
A
R
 
K
A
 
A
E
 
M
Q
 
D
L
 
L
M
 
I
L
 
L
S
 
T
G
 
G
E
 
R
L
 
T
Y
 
M
S
 
D
A
 
A
E
 
A
D
 
E
L
 
A
H
 
E
A
 
R
R
 
S
G
 
G
V
 
L
V
 
V
D
 
S
V
 
R
L
 
V
A
 
V
P
 
P

Sites not aligning to the query:

5jbxB Crystal structure of liuc in complex with coenzyme a and malonic acid (see paper)
27% identity, 66% coverage: 25:207/276 of query aligns to 18:188/261 of 5jbxB

query
sites
5jbxB
W
 
W
C
 
T
R
 
I
L
 
D
H
 
G
P
 
E
H
x
S
P
x
R
R
|
R
P
 
N
C
x
A
F
 
I
S
 
S
S
 
R
E
 
A
L
 
M
L
 
L
G
 
K
E
 
E
L
 
L
S
 
G
Q
 
E
V
 
L
S
 
V
T
 
T
R
 
R
I
 
V
P
 
S
K
 
S
E
 
-
V
 
-
T
 
-
T
 
-
L
 
-
Q
 
S
S
 
R
E
 
D
P
 
V
H
 
R
Y
 
A
F
 
V
V
 
V
L
 
I
C
 
T
S
 
G
D
 
A
I
 
G
P
 
D
G
 
K
V
 
A
F
 
F
N
 
C
L
x
A
G
 
G
G
x
A
D
|
D
L
|
L
D
x
K
L
 
E
F
x
R
A
 
A
Q
 
T
L
 
M
V
 
A
R
 
-
E
 
E
R
 
D
N
 
E
Y
 
V
R
 
R
G
 
A
L
 
F
V
x
L
E
 
D
Y
 
G
G
 
L
Q
x
R
K
 
R
C
 
T
L
 
F
R
 
R
M
 
A
V
 
I
T
 
E
A
 
-
N
 
-
S
 
-
S
 
-
G
 
-
L
 
-
Q
 
K
G
 
S
H
 
D
A
 
C
T
 
V
T
 
F
I
 
I
A
 
A
L
 
A
V
 
I
Q
 
N
G
 
G
D
 
A
A
 
A
L
|
L
G
|
G
G
|
G
G
 
G
F
 
T
E
|
E
A
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
C
H
 
D
V
 
L
L
 
R
I
 
V
A
 
A
E
 
A
E
 
P
G
 
A
T
 
A
K
 
E
L
 
L
G
 
G
F
 
L
P
x
T
E
|
E
V
 
V
L
 
K
F
x
L
N
 
G
L
x
I
F
 
I
P
|
P
G
|
G
M
 
G
G
 
G
A
 
G
Y
 
T
H
 
Q
M
 
R
L
 
L
S
 
A
R
 
R
R
 
L
L
 
V
P
 
G
V
 
P
K
 
G
R
 
R
A
 
A
E
 
K
Q
 
D
L
 
L
M
 
I
L
 
L
S
 
T
G
 
A
E
 
R
L
x
R
Y
 
I
S
 
N
A
 
A
E
 
A
D
 
E
L
 
A
H
 
F
A
 
S
R
 
V
G
 
G
V
 
L
V
 
A
D
 
N
V
 
R
L
 
L
A
 
A
P
 
P
R
 
E
G
 
G
Q
 
H

Sites not aligning to the query:

6eqoA Tri-functional propionyl-coa synthase of erythrobacter sp. Nap1 with bound NADP+ and phosphomethylphosphonic acid adenylate ester (see paper)
37% identity, 46% coverage: 121:248/276 of query aligns to 955:1095/1804 of 6eqoA

query
sites
6eqoA
I
 
I
A
 
A
L
 
A
V
 
I
Q
 
Q
G
 
G
D
 
V
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
F
 
M
E
|
E
A
 
F
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
C
H
 
H
V
 
Y
L
 
R
I
 
V
A
 
A
E
 
E
E
 
P
G
 
K
T
 
A
K
 
R
L
 
F
G
 
G
F
 
Q
P
 
P
E
|
E
V
 
I
L
 
N
F
 
L
N
 
R
L
 
L
F
 
L
P
 
P
G
|
G
M
 
Y
G
 
G
A
 
G
Y
 
T
H
 
Q
M
 
R
L
 
L
S
 
P
R
 
R
R
 
L
L
 
L
P
 
A
-
 
D
-
 
G
-
 
G
-
 
G
-
 
E
-
 
T
-
 
G
V
 
L
K
 
R
R
 
D
A
 
A
E
 
L
Q
 
D
L
 
L
M
 
I
L
 
L
S
 
G
G
 
G
E
 
R
L
 
A
Y
 
I
S
 
D
A
 
A
E
 
D
D
 
A
L
 
A
H
 
L
A
 
A
R
 
V
G
 
G
V
 
A
V
 
V
D
 
D
V
 
A
L
 
L
A
 
A
P
 
-
R
 
-
G
 
-
Q
 
D
G
 
G
S
 
S
E
 
D
-
 
N
-
 
A
-
 
L
-
 
S
-
 
H
-
 
A
-
 
H
-
 
A
A
 
M
V
 
V
E
 
R
E
 
E
Y
 
F
I
 
V
R
 
R
S
 
S
E
 
G
R
 
D
A
 
D
Y
 
S
A
 
A
R
 
L
G
 
G
A
 
K
A
 
A
-
 
F
A
 
A
I
 
A
R
 
R
R
 
K
I
 
T
G
 
Q
G
 
T
H
 
Q
L
 
S
D
 
W
Q
 
H
V
 
E
P
 
P
A
 
A
S
 
S
S
 
I
L
 
D
S
 
L
D
 
D
V
 
A
V
 
V

Sites not aligning to the query:

Q08426 Peroxisomal bifunctional enzyme; PBE; PBFE; L-bifunctional protein; LBP; Multifunctional enzyme 1; MFE1; EC 4.2.1.17; EC 5.3.3.8; EC 1.1.1.35 from Homo sapiens (Human) (see 5 papers)
30% identity, 50% coverage: 120:258/276 of query aligns to 90:220/723 of Q08426

query
sites
Q08426
T
 
V
I
 
V
A
 
A
L
 
A
V
 
I
Q
 
Q
G
 
G
D
 
M
A
 
A
L
 
F
G
 
G
G
 
G
G
 
G
F
 
L
E
 
E
A
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
G
A
 
C
H
 
H
V
 
Y
L
 
R
I
 
I
A
 
A
E
 
H
E
 
A
G
 
E
T
 
A
K
 
Q
L
 
V
G
 
G
F
 
L
P
 
P
E
 
E
V
 
V
L
 
T
F
 
L
N
 
G
L
 
L
F
 
L
P
 
P
G
 
G
M
 
A
G
 
R
A
 
G
Y
 
T
H
 
Q
M
 
L
L
 
L
S
 
P
R
 
R
R
 
L
L
 
T
P
 
G
V
 
V
K
 
P
R
 
A
A
 
A
E
 
L
Q
 
D
L
 
L
M
 
I
L
 
T
S
 
S
G
 
G
E
 
R
L
 
R
Y
 
I
S
 
L
A
 
A
E
 
D
D
 
E
L
 
A
H
 
L
A
x
K
R
 
L
G
 
G
V
 
I
V
 
L
D
 
D
V
x
K
L
 
V
A
 
V
P
 
-
R
 
-
G
 
-
Q
 
-
G
 
N
S
 
S
E
 
D
A
 
P
V
 
V
E
 
E
E
 
E
Y
 
A
I
 
I
R
 
R
S
 
F
E
 
A
R
 
Q
A
 
R
Y
 
V
A
 
S
R
 
D
G
 
Q
A
 
P
A
 
L
A
 
E
I
 
S
R
 
R
R
 
R
I
 
-
G
 
-
G
 
-
H
 
-
L
 
L
D
 
C
Q
 
N
V
 
K
P
 
P
A
 
I
S
 
Q
S
 
S
L
 
L
S
 
P
D
 
N
V
 
M
V
 
D
T
 
S
L
 
I
W
 
F
V
 
S
D
 
E
S
 
A
A
 
L
M
 
L
R
 
K
L
 
M

Sites not aligning to the query:

2dubA Enoyl-coa hydratase complexed with octanoyl-coa (see paper)
34% identity, 39% coverage: 121:229/276 of query aligns to 95:200/254 of 2dubA

query
sites
2dubA
I
 
I
A
 
A
L
 
A
V
 
V
Q
 
N
G
 
G
D
 
Y
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
F
 
C
E
|
E
A
 
L
A
 
A
L
 
M
A
 
M
A
 
C
H
 
D
V
 
I
L
 
I
I
 
Y
A
 
A
E
 
G
E
 
E
G
 
K
T
 
A
K
 
Q
L
 
F
G
 
G
F
 
Q
P
|
P
E
|
E
V
 
I
L
 
L
F
 
L
N
 
G
L
x
T
F
 
I
P
|
P
G
|
G
M
x
A
G
 
G
A
 
G
Y
 
T
H
 
Q
M
 
R
L
 
L
S
 
T
R
 
R
R
 
A
L
 
V
P
 
G
V
 
K
K
 
S
R
 
L
A
 
A
E
 
M
Q
 
E
L
 
M
M
 
V
L
 
L
S
 
T
G
 
G
E
 
D
L
 
R
Y
 
I
S
 
S
A
 
A
E
 
Q
D
 
D
L
 
A
H
 
K
A
 
Q
R
 
A
G
 
G
V
 
L
V
 
V
D
 
S
V
 
K
L
 
I
A
 
F
P
 
P
R
 
V
G
 
-
Q
 
-
G
 
-
S
 
E
E
 
T
A
 
L
V
 
V
E
 
E
E
 
E
Y
 
A
I
 
I
R
 
Q
S
 
C
E
 
A
R
 
E
A
 
K
Y
 
I
A
 
A
R
 
N
G
 
N
A
 
S
A
 
K
A
 
I
I
 
I

Sites not aligning to the query:

1mj3A Crystal structure analysis of rat enoyl-coa hydratase in complex with hexadienoyl-coa (see paper)
34% identity, 39% coverage: 121:229/276 of query aligns to 99:204/258 of 1mj3A

query
sites
1mj3A
I
 
I
A
 
A
L
 
A
V
 
V
Q
 
N
G
 
G
D
 
Y
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
F
 
C
E
|
E
A
 
L
A
 
A
L
 
M
A
 
M
A
 
C
H
 
D
V
 
I
L
 
I
I
 
Y
A
 
A
E
 
G
E
 
E
G
 
K
T
 
A
K
 
Q
L
 
F
G
 
G
F
 
Q
P
|
P
E
|
E
V
 
I
L
 
L
F
x
L
N
 
G
L
x
T
F
 
I
P
|
P
G
|
G
M
 
A
G
 
G
A
 
G
Y
 
T
H
 
Q
M
 
R
L
 
L
S
 
T
R
 
R
R
 
A
L
 
V
P
 
G
V
 
K
K
 
S
R
 
L
A
 
A
E
 
M
Q
 
E
L
 
M
M
 
V
L
 
L
S
 
T
G
 
G
E
 
D
L
 
R
Y
 
I
S
 
S
A
 
A
E
 
Q
D
 
D
L
 
A
H
 
K
A
 
Q
R
 
A
G
 
G
V
 
L
V
 
V
D
 
S
V
 
K
L
 
I
A
 
F
P
 
P
R
 
V
G
 
-
Q
 
-
G
 
-
S
 
E
E
 
T
A
 
L
V
 
V
E
 
E
E
 
E
Y
 
A
I
 
I
R
 
Q
S
 
C
E
 
A
R
 
E
A
 
K
Y
 
I
A
 
A
R
 
N
G
 
N
A
 
S
A
 
K
A
 
I
I
 
I

Sites not aligning to the query:

1dubA 2-enoyl-coa hydratase, data collected at 100 k, ph 6.5 (see paper)
34% identity, 39% coverage: 121:229/276 of query aligns to 101:206/260 of 1dubA

query
sites
1dubA
I
 
I
A
 
A
L
 
A
V
 
V
Q
 
N
G
 
G
D
x
Y
A
 
A
L
 
L
G
|
G
G
|
G
G
 
G
F
 
C
E
|
E
A
 
L
A
 
A
L
 
M
A
 
M
A
 
C
H
 
D
V
 
I
L
 
I
I
 
Y
A
 
A
E
 
G
E
 
E
G
 
K
T
 
A
K
 
Q
L
 
F
G
 
G
F
 
Q
P
|
P
E
|
E
V
 
I
L
 
L
F
x
L
N
 
G
L
x
T
F
 
I
P
|
P
G
|
G
M
 
A
G
 
G
A
 
G
Y
 
T
H
 
Q
M
 
R
L
 
L
S
 
T
R
 
R
R
 
A
L
 
V
P
 
G
V
 
K
K
 
S
R
 
L
A
 
A
E
 
M
Q
 
E
L
 
M
M
 
V
L
 
L
S
 
T
G
 
G
E
 
D
L
 
R
Y
 
I
S
 
S
A
 
A
E
 
Q
D
 
D
L
 
A
H
 
K
A
 
Q
R
 
A
G
 
G
V
 
L
V
 
V
D
 
S
V
 
K
L
 
I
A
 
F
P
 
P
R
 
V
G
 
-
Q
 
-
G
 
-
S
 
E
E
 
T
A
 
L
V
 
V
E
 
E
E
 
E
Y
 
A
I
 
I
R
 
Q
S
 
C
E
 
A
R
 
E
A
 
K
Y
 
I
A
 
A
R
 
N
G
 
N
A
 
S
A
 
K
A
 
I
I
 
I

Sites not aligning to the query:

1ey3A Structure of enoyl-coa hydratase complexed with the substrate dac-coa (see paper)
34% identity, 39% coverage: 121:229/276 of query aligns to 99:204/258 of 1ey3A

query
sites
1ey3A
I
 
I
A
 
A
L
 
A
V
 
V
Q
 
N
G
 
G
D
 
Y
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
F
 
C
E
|
E
A
 
L
A
 
A
L
 
M
A
 
M
A
 
C
H
 
D
V
 
I
L
 
I
I
 
Y
A
 
A
E
 
G
E
 
E
G
 
K
T
 
A
K
 
Q
L
 
F
G
 
G
F
 
Q
P
|
P
E
|
E
V
 
I
L
 
L
F
x
L
N
 
G
L
x
T
F
 
I
P
|
P
G
|
G
M
 
A
G
 
G
A
 
G
Y
 
T
H
 
Q
M
 
R
L
 
L
S
 
T
R
 
R
R
 
A
L
 
V
P
 
G
V
 
K
K
 
S
R
 
L
A
 
A
E
 
M
Q
 
E
L
 
M
M
 
V
L
 
L
S
 
T
G
 
G
E
 
D
L
 
R
Y
 
I
S
 
S
A
 
A
E
 
Q
D
 
D
L
 
A
H
 
K
A
 
Q
R
 
A
G
 
G
V
 
L
V
 
V
D
 
S
V
 
K
L
 
I
A
 
F
P
 
P
R
 
V
G
 
-
Q
 
-
G
 
-
S
 
E
E
 
T
A
 
L
V
 
V
E
 
E
E
 
E
Y
 
A
I
 
I
R
 
Q
S
 
C
E
 
A
R
 
E
A
 
K
Y
 
I
A
 
A
R
 
N
G
 
N
A
 
S
A
 
K
A
 
I
I
 
I

Sites not aligning to the query:

P14604 Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial; mECH; mECH1; Enoyl-CoA hydratase 1; ECHS1; Short-chain enoyl-CoA hydratase; SCEH; EC 4.2.1.17; EC 5.3.3.8 from Rattus norvegicus (Rat) (see 3 papers)
34% identity, 40% coverage: 120:229/276 of query aligns to 130:236/290 of P14604

query
sites
P14604
T
 
V
I
 
I
A
 
A
L
 
A
V
 
V
Q
 
N
G
 
G
D
 
Y
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
F
 
C
E
|
E
A
 
L
A
 
A
L
 
M
A
 
M
A
 
C
H
 
D
V
 
I
L
 
I
I
 
Y
A
 
A
E
 
G
E
 
E
G
 
K
T
 
A
K
 
Q
L
 
F
G
 
G
F
 
Q
P
 
P
E
|
E
V
 
I
L
 
L
F
 
L
N
 
G
L
 
T
F
 
I
P
 
P
G
 
G
M
 
A
G
 
G
A
 
G
Y
 
T
H
 
Q
M
 
R
L
 
L
S
 
T
R
 
R
R
 
A
L
 
V
P
 
G
V
 
K
K
 
S
R
 
L
A
 
A
E
 
M
Q
 
E
L
 
M
M
 
V
L
 
L
S
 
T
G
 
G
E
 
D
L
 
R
Y
 
I
S
 
S
A
 
A
E
 
Q
D
 
D
L
 
A
H
 
K
A
 
Q
R
 
A
G
 
G
V
 
L
V
 
V
D
 
S
V
 
K
L
 
I
A
 
F
P
 
P
R
 
V
G
 
-
Q
 
-
G
 
-
S
 
E
E
 
T
A
 
L
V
 
V
E
 
E
E
 
E
Y
 
A
I
 
I
R
 
Q
S
 
C
E
 
A
R
 
E
A
 
K
Y
 
I
A
 
A
R
 
N
G
 
N
A
 
S
A
 
K
A
 
I
I
 
I

Sites not aligning to the query:

Q4WF54 Mevalonyl-coenzyme A hydratase sidH; Siderophore biosynthesis protein H; EC 4.2.1.- from Aspergillus fumigatus (strain ATCC MYA-4609 / CBS 101355 / FGSC A1100 / Af293) (Neosartorya fumigata) (see paper)
29% identity, 62% coverage: 30:200/276 of query aligns to 29:186/270 of Q4WF54

query
sites
Q4WF54
P
 
P
H
 
E
P
 
K
R
 
R
P
 
N
C
 
C
F
 
I
S
 
S
S
 
L
E
 
-
L
 
-
L
 
-
G
 
-
E
 
-
L
 
-
S
 
-
Q
 
A
V
 
T
S
 
S
T
 
A
R
 
E
I
 
I
P
 
Q
K
 
R
E
 
L
V
 
W
T
 
T
T
 
W
L
 
F
Q
 
D
S
 
T
E
 
Q
P
 
P
H
 
A
-
 
L
Y
 
Y
F
 
V
V
 
A
L
 
I
C
 
I
S
 
T
D
 
G
I
 
T
P
 
G
G
 
E
V
 
S
F
 
F
N
 
C
L
 
A
G
 
G
G
 
A
D
 
D
L
 
L
D
 
K
L
 
E
F
 
W
A
 
N
Q
 
D
L
 
L
V
 
-
R
 
-
E
 
-
R
 
-
N
 
N
Y
 
A
R
 
R
G
 
G
L
 
I
V
 
T
E
 
N
Y
 
-
G
 
-
Q
 
-
K
 
-
C
 
-
L
 
-
R
 
E
M
 
M
V
 
T
T
 
A
A
 
P
N
 
G
S
 
L
S
 
A
G
 
G
L
 
L
-
 
P
-
 
R
-
 
R
Q
 
R
G
 
G
H
 
S
A
 
K
T
 
P
T
 
I
I
 
I
A
 
A
L
 
A
V
 
V
Q
 
N
G
 
G
D
 
Y
A
 
C
L
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
F
 
F
E
 
E
A
 
M
A
 
V
L
 
A
A
 
N
A
 
C
H
 
D
V
 
I
L
 
V
I
 
V
A
 
A
E
 
S
E
 
E
G
 
N
T
 
A
K
 
T
L
 
F
G
 
G
F
 
L
P
 
P
E
 
E
V
 
V
L
 
Q
F
 
R
N
 
G
L
 
I
F
 
A
P
 
A
G
 
V
M
 
A
G
 
G
A
 
S
Y
 
L
H
 
P
M
 
R
L
 
L
S
 
V
R
 
R
R
 
V
L
 
L
P
 
G
V
 
K
K
 
Q
R
 
R
A
 
A
E
 
A
Q
 
E
L
 
I
M
 
A
L
 
L
S
 
S
G
 
G
E
 
L
L
 
S
Y
 
F
S
 
S
A
 
A
E
 
S
D
 
Q
L
 
L
H
 
E
A
 
R
R
 
W
G
 
G
V
 
L
V
 
V
D
 
N

Sites not aligning to the query:

1wdlA Fatty acid beta-oxidation multienzyme complex from pseudomonas fragi, form ii (native4) (see paper)
31% identity, 44% coverage: 117:237/276 of query aligns to 103:211/715 of 1wdlA

query
sites
1wdlA
H
 
N
A
 
V
T
 
P
T
 
T
I
 
V
A
 
A
L
 
A
V
 
I
Q
 
N
G
 
G
D
 
I
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
F
 
L
E
|
E
A
 
M
A
 
C
L
 
L
A
 
A
A
 
A
H
 
D
V
 
F
L
 
R
I
 
V
A
 
M
E
 
A
E
 
D
G
 
S
T
 
A
K
 
K
L
 
I
G
 
G
F
 
L
P
|
P
E
|
E
V
 
V
L
 
K
F
 
L
N
 
G
L
 
I
F
 
Y
P
|
P
G
|
G
M
 
F
G
 
G
A
 
G
Y
 
T
H
 
V
M
 
R
L
 
L
S
 
P
R
 
R
R
 
L
L
 
I
P
 
G
V
 
V
K
 
D
R
 
N
A
 
A
E
 
V
Q
 
E
L
 
W
M
 
I
L
 
A
S
 
S
G
 
G
E
 
K
L
 
E
Y
 
N
S
 
R
A
 
A
E
 
E
D
 
D
L
 
A
H
 
L
A
 
K
R
 
V
G
 
S
V
 
A
V
 
V
D
 
D
V
 
A
L
 
V
A
 
V
P
 
T
R
 
A
G
 
D
Q
 
K
G
 
L
S
 
G
E
 
A
A
 
A
V
 
A
E
 
L
E
 
D
Y
 
L
I
 
I
R
 
K
S
 
-
E
 
-
R
 
-
A
 
-
Y
 
-
A
 
-
R
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
I
 
-
R
 
R
R
 
A
I
 
I
G
 
S
G
 
G
H
 
E
L
 
L
D
 
D

Sites not aligning to the query:

P28793 Fatty acid oxidation complex subunit alpha; EC 4.2.1.17; EC 5.1.2.3; EC 5.3.3.8; EC 1.1.1.35 from Pseudomonas fragi (see paper)
31% identity, 44% coverage: 117:237/276 of query aligns to 103:211/715 of P28793

query
sites
P28793
H
 
N
A
 
V
T
 
P
T
 
T
I
 
V
A
 
A
L
 
A
V
 
I
Q
 
N
G
 
G
D
 
I
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
F
 
L
E
 
E
A
 
M
A
 
C
L
 
L
A
 
A
A
 
A
H
 
D
V
 
F
L
 
R
I
 
V
A
 
M
E
 
A
E
 
D
G
 
S
T
 
A
K
 
K
L
 
I
G
 
G
F
 
L
P
 
P
E
 
E
V
 
V
L
 
K
F
 
L
N
 
G
L
 
I
F
 
Y
P
 
P
G
 
G
M
 
F
G
 
G
A
 
G
Y
 
T
H
 
V
M
 
R
L
 
L
S
 
P
R
 
R
R
 
L
L
 
I
P
 
G
V
 
V
K
 
D
R
 
N
A
 
A
E
 
V
Q
 
E
L
 
W
M
 
I
L
 
A
S
 
S
G
 
G
E
 
K
L
 
E
Y
 
N
S
 
R
A
 
A
E
 
E
D
 
D
L
 
A
H
 
L
A
 
K
R
 
V
G
 
S
V
 
A
V
 
V
D
 
D
V
 
A
L
 
V
A
 
V
P
 
T
R
 
A
G
 
D
Q
 
K
G
 
L
S
 
G
E
 
A
A
 
A
V
 
A
E
 
L
E
 
D
Y
 
L
I
 
I
R
 
K
S
 
-
E
 
-
R
 
-
A
 
-
Y
 
-
A
 
-
R
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
I
 
-
R
 
R
R
 
A
I
 
I
G
 
S
G
 
G
H
 
E
L
 
L
D
 
D

Sites not aligning to the query:

1wdmA Fatty acid beta-oxidation multienzyme complex from pseudomonas fragi, form i (native3) (see paper)
31% identity, 44% coverage: 117:237/276 of query aligns to 103:211/707 of 1wdmA

query
sites
1wdmA
H
 
N
A
 
V
T
 
P
T
 
T
I
 
V
A
 
A
L
 
A
V
 
I
Q
 
N
G
 
G
D
 
I
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
F
 
L
E
|
E
A
 
M
A
 
C
L
 
L
A
 
A
A
 
A
H
 
D
V
 
F
L
 
R
I
 
V
A
 
M
E
 
A
E
 
D
G
 
S
T
 
A
K
 
K
L
 
I
G
 
G
F
 
L
P
|
P
E
|
E
V
 
V
L
x
K
F
 
L
N
 
G
L
 
I
F
 
Y
P
|
P
G
|
G
M
 
F
G
 
G
A
 
G
Y
 
T
H
 
V
M
 
R
L
 
L
S
 
P
R
 
R
R
 
L
L
 
I
P
 
G
V
 
V
K
 
D
R
 
N
A
 
A
E
 
V
Q
 
E
L
 
W
M
 
I
L
 
A
S
 
S
G
 
G
E
 
K
L
 
E
Y
 
N
S
 
R
A
 
A
E
 
E
D
 
D
L
 
A
H
 
L
A
 
K
R
 
V
G
 
S
V
 
A
V
 
V
D
 
D
V
 
A
L
 
V
A
 
V
P
 
T
R
 
A
G
 
D
Q
 
K
G
 
L
S
 
G
E
 
A
A
 
A
V
 
A
E
 
L
E
 
D
Y
 
L
I
 
I
R
 
K
S
 
-
E
 
-
R
 
-
A
 
-
Y
 
-
A
 
-
R
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
I
 
-
R
 
R
R
 
A
I
 
I
G
 
S
G
 
G
H
 
E
L
 
L
D
 
D

Sites not aligning to the query:

2hw5C The crystal structure of human enoyl-coenzyme a (coa) hydratase short chain 1, echs1
35% identity, 30% coverage: 121:204/276 of query aligns to 101:184/260 of 2hw5C

query
sites
2hw5C
I
 
I
A
 
A
L
 
A
V
 
V
Q
 
N
G
 
G
D
 
Y
A
 
A
L
x
F
G
 
G
G
|
G
G
 
G
F
 
C
E
|
E
A
 
L
A
 
A
L
 
M
A
 
M
A
 
C
H
 
D
V
 
I
L
 
I
I
 
Y
A
 
A
E
 
G
E
 
E
G
 
K
T
 
A
K
 
Q
L
 
F
G
 
A
F
 
Q
P
|
P
E
|
E
V
 
I
L
 
L
F
 
I
N
 
G
L
x
T
F
 
I
P
|
P
G
|
G
M
 
A
G
 
G
A
 
G
Y
 
T
H
 
Q
M
 
R
L
 
L
S
 
T
R
 
R
R
 
A
L
 
V
P
 
G
V
 
K
K
 
S
R
 
L
A
 
A
E
 
M
Q
 
E
L
 
M
M
 
V
L
 
L
S
 
T
G
 
G
E
 
D
L
 
R
Y
 
I
S
 
S
A
 
A
E
 
Q
D
 
D
L
 
A
H
 
K
A
 
Q
R
 
A
G
 
G
V
 
L
V
 
V
D
 
S
V
 
K
L
 
I
A
 
C
P
 
P

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_018234152.1 NCBI__GCF_000378965.1:WP_018234152.1
MSTTNNKNTFKHLTLSYDDKRRTYWCRLHPHPRPCFSSELLGELSQVSTRIPKEVTTLQS
EPHYFVLCSDIPGVFNLGGDLDLFAQLVRERNYRGLVEYGQKCLRMVTANSSGLQGHATT
IALVQGDALGGGFEAALAAHVLIAEEGTKLGFPEVLFNLFPGMGAYHMLSRRLPVKRAEQ
LMLSGELYSAEDLHARGVVDVLAPRGQGSEAVEEYIRSERAYARGAAAIRRIGGHLDQVP
ASSLSDVVTLWVDSAMRLTERDLKLMGRIVSRQNHL

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory