SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_019386992.1 NCBI__GCF_000283015.1:WP_019386992.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 3 hits to proteins with known functional sites (download)

P52697 6-phosphogluconolactonase; 6-P-gluconolactonase; Pgl; EC 3.1.1.31 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
28% identity, 83% coverage: 42:359/381 of query aligns to 15:313/331 of P52697

query
sites
P52697
I
 
I
H
 
H
V
 
V
Y
 
W
E
 
N
F
 
L
D
 
-
N
 
N
H
 
H
T
 
E
G
 
G
K
 
A
S
 
L
T
 
T
L
 
L
K
 
T
F
 
Q
T
 
V
V
 
V
D
 
D
S
 
V
I
 
P
I
 
G
N
 
Q
T
 
V
S
 
Q
F
 
P
L
 
M
R
 
V
L
 
V
A
 
S
Q
 
P
N
 
D
G
 
K
K
 
R
Y
 
Y
L
 
L
Y
 
Y
S
 
V
V
 
G
V
 
V
E
 
R
S
 
P
Q
 
E
M
 
F
N
 
-
Y
 
-
N
 
-
G
 
-
K
 
R
I
 
V
A
 
L
A
 
A
F
 
Y
A
 
R
V
 
I
D
 
A
S
 
P
I
 
D
N
 
D
Y
 
G
K
 
A
L
 
L
K
 
T
L
 
F
L
 
A
N
 
A
M
 
E
Q
 
S
D
 
A
T
 
L
G
 
P
G
 
G
R
 
-
N
 
S
P
 
P
A
 
T
H
 
H
L
 
I
E
 
S
I
 
T
S
 
D
K
 
H
T
 
Q
G
 
G
E
 
Q
Y
 
F
L
 
V
V
 
F
N
 
V
S
 
G
N
 
S
Y
 
Y
S
 
N
D
 
A
P
 
G
S
 
N
L
 
V
S
 
S
V
 
V
F
 
T
K
 
R
I
 
L
N
 
-
Q
 
E
N
 
D
G
 
G
S
 
L
L
 
P
K
 
V
S
 
G
Y
 
V
N
 
V
Q
 
D
V
 
V
I
 
V
R
 
E
F
 
G
K
 
L
D
 
D
S
 
G
S
 
C
I
 
-
I
 
-
E
 
-
S
 
-
R
 
-
Q
 
-
E
 
-
S
 
-
A
 
-
H
 
-
I
 
-
H
 
H
S
 
S
S
 
A
N
 
N
F
 
I
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
N
K
 
R
F
 
T
L
 
L
F
 
W
A
 
V
Q
 
P
D
 
A
L
 
L
G
 
K
S
 
Q
D
 
D
K
 
R
I
 
I
R
 
C
G
 
L
F
 
F
N
 
T
F
 
-
I
 
V
S
 
S
N
 
D
H
 
D
K
 
G
D
 
H
S
 
L
V
 
V
L
 
A
Q
 
Q
N
 
D
E
 
P
N
 
A
E
 
E
I
 
V
K
 
T
V
 
T
K
 
V
P
 
E
G
 
G
S
 
A
G
 
G
P
 
P
R
 
R
H
 
H
F
 
M
A
 
V
F
 
F
H
 
H
P
 
P
N
 
N
G
 
E
K
 
Q
F
 
Y
G
 
A
Y
 
Y
G
 
C
V
 
V
A
 
N
E
 
E
L
 
L
S
 
N
G
 
S
K
 
S
I
 
V
T
 
D
A
 
V
Y
 
W
E
 
E
Y
 
L
N
 
K
N
 
D
-
 
P
-
 
H
G
 
G
N
 
N
L
 
I
T
 
E
F
 
C
I
 
V
E
 
Q
D
 
T
Y
 
L
-
 
D
L
 
M
S
 
M
Y
 
P
Q
 
E
Q
 
N
I
 
F
Q
 
S
D
 
D
I
 
T
Y
 
R
R
 
W
A
 
A
A
 
A
D
 
D
I
 
I
H
 
H
I
 
I
S
 
T
P
 
P
D
 
D
G
 
G
K
 
R
F
 
H
L
 
L
Y
 
Y
A
 
A
S
 
C
N
 
D
R
 
R
G
 
-
P
 
-
E
 
T
E
 
A
D
 
S
S
 
L
I
 
I
S
 
T
I
 
V
F
 
F
L
 
S
I
 
V
N
 
S
Q
 
E
D
 
D
L
 
G
G
 
S
T
 
V
L
 
L
S
 
S
L
 
K
V
 
E
G
 
G
H
 
F
E
 
Q
P
 
P
T
 
T
Y
 
E
G
 
T
E
 
Q
H
 
-
P
 
P
R
 
R
N
 
G
F
 
F
A
 
N
I
 
V
S
 
D
P
 
H
D
 
S
G
 
G
N
x
K
F
 
Y
L
 
L
L
 
I
V
 
A
A
 
A
N
 
G
Q
 
Q
F
 
K
T
 
S
D
 
H
N
 
H
I
 
I
I
 
S
V
 
V
F
 
Y
K
 
E
R
 
I
N
 
V
L
 
G
Q
 
E
T
 
Q
G
 
G
T
 
L
L
 
L
K
 
H
K
 
E

1jofB Neurospora crassa 3-carboxy-cis,cis-mucoante lactonizing enzyme (see paper)
23% identity, 40% coverage: 141:292/381 of query aligns to 123:275/365 of 1jofB

query
sites
1jofB
V
 
V
F
 
F
K
 
S
I
 
V
N
 
S
Q
 
E
N
 
T
G
 
G
S
 
K
L
 
L
K
 
E
S
 
K
Y
 
N
N
 
V
Q
 
Q
V
 
N
I
 
Y
R
 
E
F
 
Y
K
 
-
D
 
-
S
 
-
S
 
-
I
 
-
I
 
-
E
 
-
S
 
-
R
 
-
Q
 
Q
E
 
E
S
 
N
A
 
T
H
 
G
I
 
I
H
|
H
S
 
G
S
 
M
N
 
V
F
 
F
S
 
D
P
 
P
D
 
T
G
 
E
K
 
T
F
 
Y
L
 
L
F
 
Y
A
 
S
Q
 
A
D
 
D
L
 
L
G
 
T
S
 
A
D
 
N
K
 
K
I
 
L
R
 
W
G
 
T
F
 
H
N
 
R
F
 
K
I
 
L
S
 
A
N
 
S
H
 
G
K
 
E
D
 
V
S
 
E
V
 
L
L
 
V
Q
 
G
N
 
S
E
 
V
N
 
D
E
 
-
I
 
-
K
 
A
V
 
P
K
 
D
P
 
P
G
 
G
S
 
D
G
 
H
P
 
P
R
|
R
H
 
W
F
 
V
A
 
A
F
 
M
H
 
H
P
 
P
N
 
T
G
 
G
K
 
N
F
 
Y
G
 
L
Y
 
Y
G
 
A
V
 
L
A
 
M
E
|
E
L
 
A
S
 
G
G
 
N
K
 
R
I
 
I
T
 
C
A
 
E
Y
 
Y
E
 
V
Y
 
I
N
 
D
N
 
P
G
 
A
N
 
T
L
 
H
T
 
M
F
 
P
I
 
V
E
 
Y
D
 
T
Y
 
H
L
 
H
S
 
S
Y
 
F
Q
 
P
Q
 
L
I
 
I
-
 
P
-
 
P
-
 
G
-
 
I
-
 
P
-
 
D
-
 
R
-
 
D
-
 
P
-
 
E
-
 
T
-
 
G
Q
 
K
D
 
G
I
 
L
Y
 
Y
R
 
R
A
 
A
A
 
D
D
 
V
I
 
C
H
 
A
I
 
L
S
 
T
P
 
F
D
 
S
G
 
G
K
 
K
F
 
Y
L
 
M
Y
 
F
A
 
A
S
 
S
N
 
S
R
|
R
G
 
A

Sites not aligning to the query:

5c2vB Kuenenia stuttgartiensis hydrazine synthase (see paper)
27% identity, 45% coverage: 179:349/381 of query aligns to 149:348/352 of 5c2vB

query
sites
5c2vB
F
 
I
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
K
 
K
F
 
T
L
 
L
F
 
V
A
 
A
-
 
I
-
 
L
Q
 
D
D
 
T
L
 
V
G
 
G
S
 
S
D
 
I
K
 
N
I
 
-
R
 
R
G
 
S
F
 
V
N
 
D
F
 
F
I
 
I
S
 
D
N
 
I
H
 
A
K
 
S
D
 
G
S
 
R
V
 
V
L
 
V
Q
 
E
N
 
N
E
 
R
N
 
-
E
 
-
I
 
-
K
 
V
V
 
I
K
 
H
P
 
E
G
 
S
S
 
S
G
 
N
P
 
L
R
 
R
H
 
D
F
 
V
A
 
V
F
 
Y
H
 
T
P
 
P
N
 
D
G
 
G
K
 
K
F
 
Y
G
 
-
Y
 
I
G
 
A
V
 
V
A
 
T
E
 
H
L
 
Q
S
 
T
G
 
P
K
 
K
-
 
N
-
 
W
I
 
L
T
 
P
A
 
V
Y
 
C
E
 
E
Y
 
A
N
 
E
N
 
N
G
 
G
-
 
Q
-
 
V
-
 
F
-
 
T
-
 
N
N
 
N
L
 
V
T
 
T
F
 
I
I
 
I
E
 
E
D
 
T
Y
 
K
-
 
A
-
 
G
-
 
G
-
 
K
L
 
V
S
 
A
Y
 
R
Q
 
L
Q
 
P
I
 
L
Q
 
D
D
 
D
I
 
L
Y
 
N
R
 
N
-
 
Y
-
 
D
-
 
G
-
 
N
A
 
P
A
 
Y
D
 
G
I
 
M
H
 
A
I
 
M
S
 
D
P
 
P
D
 
K
G
 
G
K
 
K
F
 
Y
L
 
L
Y
 
Y
A
 
I
S
 
G
N
 
V
R
 
R
G
 
G
P
 
M
E
 
H
E
 
R
D
 
V
S
 
T
I
 
I
-
 
L
-
 
D
-
 
M
-
 
D
-
 
K
-
 
V
-
 
L
-
 
G
-
 
L
-
 
V
-
 
R
-
 
S
-
 
S
-
 
T
-
 
Q
-
 
E
S
 
E
I
 
L
F
 
D
L
 
Y
I
 
L
N
 
R
Q
 
D
D
 
D
L
 
L
G
 
G
T
 
L
L
 
V
S
 
R
-
 
D
-
 
Y
L
 
L
V
 
V
G
 
A
H
 
R
E
 
V
P
 
P
T
 
T
Y
 
-
G
 
G
E
 
L
H
 
G
P
 
P
R
 
S
N
 
S
F
 
V
A
 
C
I
 
L
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
N
 
K
F
 
F
L
 
C
L
 
Y
V
 
A
A
 
A
N
 
N
Q
 
Y
F
 
F
T
 
S
D
 
N
N
 
N
I
 
V
I
 
T
V
 
V
F
 
I
K
 
R

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_019386992.1 NCBI__GCF_000283015.1:WP_019386992.1
MKYYQILVFFIMLCSVISCKTEKERTLLFVGSFTDKKPGKGIHVYEFDNHTGKSTLKFTV
DSIINTSFLRLAQNGKYLYSVVESQMNYNGKIAAFAVDSINYKLKLLNMQDTGGRNPAHL
EISKTGEYLVNSNYSDPSLSVFKINQNGSLKSYNQVIRFKDSSIIESRQESAHIHSSNFS
PDGKFLFAQDLGSDKIRGFNFISNHKDSVLQNENEIKVKPGSGPRHFAFHPNGKFGYGVA
ELSGKITAYEYNNGNLTFIEDYLSYQQIQDIYRAADIHISPDGKFLYASNRGPEEDSISI
FLINQDLGTLSLVGHEPTYGEHPRNFAISPDGNFLLVANQFTDNIIVFKRNLQTGTLKKL
QEDIDVSSPASIQMRTYRIKN

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory