SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_019557414.1 NCBI__GCF_000381085.1:WP_019557414.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 9 hits to proteins with known functional sites (download)

8bftA The e. Coli trpd2 protein ybib in complex with a c-terminal peptide from obge (see paper)
25% identity, 79% coverage: 19:293/348 of query aligns to 4:283/321 of 8bftA

query
sites
8bftA
F
 
Y
Q
 
R
F
 
K
Y
 
I
I
 
I
Q
 
K
T
 
E
V
 
I
G
 
G
R
 
R
G
 
G
Q
 
K
K
 
N
R
 
H
R
 
A
R
 
R
S
 
D
L
 
L
T
 
D
Q
 
R
A
 
D
E
 
T
A
 
A
Q
 
R
D
 
G
A
 
L
M
 
Y
S
 
A
M
 
H
I
 
M
L
 
L
A
 
N
G
 
G
Q
 
E
V
 
V
S
 
P
E
 
D
M
 
L
Q
 
E
L
 
L
G
 
G
A
 
G
F
 
V
L
 
L
M
 
I
L
 
A
I
 
L
R
|
R
V
 
I
R
 
K
E
 
G
E
 
E
T
 
G
P
 
E
E
 
A
E
 
E
A
 
M
A
 
L
G
 
G
F
 
F
L
 
Y
Q
 
E
A
 
A
I
 
M
R
 
Q
D
 
N
-
 
H
-
 
T
-
 
I
-
 
K
V
 
L
M
 
T
K
 
P
A
 
P
P
 
A
N
 
G
C
 
K
E
 
P
V
 
M
D
 
P
L
 
I
D
 
V
W
 
I
G
 
P
T
 
S
Y
 
Y
A
 
N
G
 
G
K
 
A
R
|
R
R
 
K
Q
 
Q
L
 
A
P
 
N
W
 
L
F
 
T
I
 
P
L
 
L
A
 
L
L
 
A
T
 
I
I
 
L
L
 
L
K
 
H
D
 
K
K
 
L
G
 
G
Y
 
F
K
 
P
V
 
V
F
 
V
L
 
V
H
 
H
G
 
G
V
 
-
V
 
V
G
 
S
N
 
E
E
 
D
S
 
P
N
 
T
R
|
R
L
 
V
Y
 
L
T
 
T
K
 
E
E
 
T
V
 
I
A
 
F
E
 
E
L
 
L
L
 
M
G
 
G
W
 
I
P
 
T
M
 
P
A
 
T
D
 
L
S
 
H
L
 
G
A
 
G
K
 
Q
A
 
A
K
 
Q
T
 
A
M
 
K
I
 
L
E
 
D
T
 
E
S
 
H
G
 
Q
F
 
P
C
 
V
Y
 
F
L
 
M
D
 
P
V
 
V
K
 
G
D
 
A
F
 
F
A
 
C
P
 
P
Q
 
P
I
 
L
K
 
E
T
 
K
L
 
Q
M
 
L
N
 
A
Y
 
M
R
 
R
D
 
W
E
 
R
L
 
M
G
 
G
L
 
V
R
|
R
S
 
N
P
 
S
I
 
A
H
 
H
S
x
T
L
 
L
A
 
A
R
 
K
M
 
L
L
 
A
N
 
T
P
 
P
F
 
F
-
 
A
-
 
E
N
 
G
A
 
E
R
 
A
L
 
L
S
 
R
V
 
L
H
 
S
G
x
S
V
 
V
F
 
S
H
 
H
K
 
P
G
 
E
Y
 
Y
D
 
I
D
 
G
I
 
-
H
 
-
Q
 
-
Q
 
R
S
 
V
A
 
A
A
 
K
L
 
F
L
 
F
D
 
S
D
 
D
Q
 
I
M
 
G
T
 
G
A
 
R
S
 
A
F
 
L
C
 
L
G
 
M
D
 
H
G
 
G
G
 
T
E
|
E
A
x
G
E
 
E
V
 
V
-
 
Y
-
 
A
R
 
N
P
 
P
D
 
Q
R
 
R
K
 
C
T
 
P
E
 
Q
I
 
I
K
 
-
M
 
-
V
 
-
E
 
-
N
 
N
I
 
L
F
 
I
D
 
D
D
 
R
H
 
E
G
 
G
E
 
M
R
 
R
V
 
V
-
 
L
-
 
Y
T
 
E
S
 
K
I
 
Q
D
 
D
Q
 
T
A
 
A
W
 
G
S
 
S
F
 
E
F
 
L
M
 
L
P
 
P
K
 
Q
T
 
A
Y
 
-
L
 
-
N
 
-
S
 
K
D
 
D
P
 
P
-
 
E
-
 
T
-
 
T
-
 
A
-
 
Q
-
 
W
T
 
I
D
 
E
K
 
R
C
 
C
L
 
L

1gxbA Anthranilate phosphoribosyltransferase in complex with pyrophosphate and magnesium (see paper)
28% identity, 65% coverage: 32:257/348 of query aligns to 12:232/339 of 1gxbA

query
sites
1gxbA
R
 
N
R
 
K
R
 
S
S
 
D
L
 
L
T
 
E
Q
 
I
A
 
N
E
 
E
A
 
A
Q
 
E
D
 
E
A
 
L
M
 
A
S
 
K
M
 
A
I
 
I
L
 
I
A
 
R
G
 
G
Q
 
E
V
 
V
S
 
P
E
 
E
M
 
I
Q
 
L
L
 
V
G
 
S
A
 
A
F
 
I
L
 
L
M
 
V
L
 
A
I
 
L
R
 
R
V
 
M
R
 
K
E
 
G
E
 
E
T
 
S
P
 
K
E
 
N
E
 
E
A
 
I
A
 
V
G
 
G
F
 
F
L
 
A
Q
 
R
A
 
A
I
 
M
R
 
R
D
 
E
V
 
L
-
 
A
-
 
I
-
 
K
M
 
I
K
 
D
A
 
V
P
 
P
N
 
N
C
 
A
E
 
-
V
 
I
D
 
D
L
 
T
D
 
A
W
 
G
G
 
G
T
 
L
Y
 
G
A
 
T
G
 
V
K
x
N
R
 
V
R
x
S
Q
x
T
L
 
A
P
 
S
W
 
A
F
 
I
I
 
L
L
 
L
A
 
S
L
 
L
T
 
V
I
 
-
L
 
-
K
 
-
D
 
-
K
 
-
G
 
-
Y
 
N
K
 
P
V
 
V
F
 
A
L
x
K
H
 
H
G
 
G
-
 
N
-
 
R
V
 
A
V
 
V
G
 
S
N
 
G
E
 
K
S
 
S
N
 
G
R
 
-
L
 
-
Y
 
-
T
x
S
K
 
A
E
 
D
V
 
V
A
 
L
E
 
E
L
 
A
L
 
L
G
 
G
W
 
Y
P
 
N
M
 
I
A
 
I
D
 
V
S
 
P
L
 
P
A
 
E
K
 
R
A
 
A
K
 
K
T
 
E
M
 
L
I
 
V
E
 
N
T
 
K
S
 
T
G
 
N
F
 
F
C
 
V
Y
 
F
L
 
L
D
 
F
V
 
A
K
 
Q
D
 
Y
F
 
Y
A
 
H
P
 
P
Q
 
A
I
 
M
K
 
K
T
 
N
L
 
V
M
 
A
N
 
N
Y
 
V
R
 
R
D
 
K
E
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
R
 
R
S
 
T
P
 
I
I
 
F
H
 
N
S
 
I
L
 
L
A
 
G
R
 
P
M
 
L
L
 
T
N
 
N
P
 
P
F
 
A
N
 
N
A
 
A
R
 
K
L
 
Y
S
 
Q
V
 
L
H
 
M
G
 
G
V
 
V
F
 
F
H
 
S
K
 
K
G
 
D
Y
 
H
D
 
L
D
 
D
I
 
L
H
 
L
Q
 
S
Q
 
K
S
 
S
A
 
A
A
 
Y
L
 
E
L
 
L
D
 
D
D
 
F
Q
 
N
M
 
K
T
 
I
A
 
I
S
 
L
F
 
V
C
 
Y
G
 
G
D
 
E
G
 
P
G
 
G
E
 
I
A
 
D
E
|
E
V
 
V
R
 
S
P
 
P
D
 
I
R
 
G
K
 
N
T
 
T
E
 
F
I
 
M
K
 
K
M
 
I
V
 
V

1zxyA Anthranilate phosphoribosyltransferase from sulfolobus solfataricus in complex with prpp and magnesium (see paper)
28% identity, 65% coverage: 32:257/348 of query aligns to 12:236/344 of 1zxyA

query
sites
1zxyA
R
 
N
R
 
K
R
 
S
S
 
D
L
 
L
T
 
E
Q
 
I
A
 
N
E
 
E
A
 
A
Q
 
E
D
 
E
A
 
L
M
 
A
S
 
K
M
 
A
I
 
I
L
 
I
A
 
R
G
 
G
Q
 
E
V
 
V
S
 
P
E
 
E
M
 
I
Q
 
L
L
 
V
G
 
S
A
 
A
F
 
I
L
 
L
M
 
V
L
 
A
I
 
L
R
 
R
V
 
M
R
 
K
E
 
G
E
 
E
T
 
S
P
 
K
E
 
N
E
 
E
A
 
I
A
 
V
G
 
G
F
 
F
L
 
A
Q
 
R
A
 
A
I
 
M
R
 
R
D
 
E
V
 
L
-
 
A
-
 
I
-
 
K
M
 
I
K
 
D
A
 
V
P
 
P
N
 
N
C
 
A
E
 
-
V
 
-
D
 
-
L
 
I
D
 
D
W
 
T
G
x
A
T
x
G
Y
 
T
A
 
G
G
 
G
K
x
D
R
 
G
R
 
L
Q
 
G
L
x
T
P
 
V
W
x
N
F
 
V
I
x
S
L
x
T
A
 
A
L
 
S
T
 
A
I
 
I
L
 
L
K
 
L
D
 
S
K
 
L
G
 
V
Y
 
N
K
 
P
V
 
V
F
 
A
L
x
K
H
 
H
G
 
G
-
 
N
-
 
R
V
 
A
V
 
V
G
 
S
N
 
G
E
 
K
S
 
S
N
 
G
R
 
-
L
 
-
Y
 
-
T
x
S
K
 
A
E
 
D
V
 
V
A
 
L
E
 
E
L
 
A
L
 
L
G
 
G
W
 
Y
P
 
N
M
 
I
A
 
I
D
 
V
S
 
P
L
 
P
A
 
E
K
 
R
A
 
A
K
 
K
T
 
E
M
 
L
I
 
V
E
 
N
T
 
K
S
 
T
G
 
N
F
 
F
C
 
V
Y
 
F
L
 
L
D
 
F
V
 
A
K
 
Q
D
 
Y
F
 
Y
A
 
H
P
 
P
Q
 
A
I
 
M
K
 
K
T
 
N
L
 
V
M
 
A
N
 
N
Y
 
V
R
 
R
D
 
K
E
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
R
 
R
S
 
T
P
 
I
I
 
F
H
 
N
S
 
I
L
 
L
A
 
G
R
 
P
M
 
L
L
 
T
N
 
N
P
 
P
F
 
A
N
 
N
A
 
A
R
 
K
L
 
Y
S
 
Q
V
 
L
H
 
M
G
 
G
V
 
V
F
 
F
H
 
S
K
 
K
G
 
D
Y
 
H
D
 
L
D
 
D
I
 
L
H
 
L
Q
 
S
Q
 
K
S
 
S
A
 
A
A
 
Y
L
 
E
L
 
L
D
 
D
D
 
F
Q
 
N
M
 
K
T
 
I
A
 
I
S
 
L
F
 
V
C
 
Y
G
 
G
D
 
E
G
 
P
G
 
G
E
 
I
A
x
D
E
|
E
V
 
V
R
 
S
P
 
P
D
 
I
R
 
G
K
 
N
T
 
T
E
 
F
I
 
M
K
 
K
M
 
I
V
 
V

2gvqD Anthranilate phosphoribosyl-transferase (trpd) from s. Solfataricus in complex with anthranilate (see paper)
28% identity, 65% coverage: 32:257/348 of query aligns to 12:236/345 of 2gvqD

query
sites
2gvqD
R
 
N
R
 
K
R
 
S
S
 
D
L
 
L
T
 
E
Q
 
I
A
 
N
E
 
E
A
 
A
Q
 
E
D
 
E
A
 
L
M
 
A
S
 
K
M
 
A
I
 
I
L
 
I
A
 
R
G
 
G
Q
 
E
V
 
V
S
 
P
E
 
E
M
 
I
Q
 
L
L
 
V
G
 
S
A
 
A
F
 
I
L
 
L
M
 
V
L
 
A
I
 
L
R
 
R
V
 
M
R
 
K
E
 
G
E
 
E
T
 
S
P
 
K
E
 
N
E
 
E
A
 
I
A
 
V
G
 
G
F
 
F
L
 
A
Q
 
R
A
 
A
I
 
M
R
 
R
D
 
E
V
 
L
-
 
A
-
 
I
-
 
K
M
 
I
K
 
D
A
 
V
P
 
P
N
 
N
C
 
A
E
 
-
V
 
-
D
 
-
L
 
I
D
 
D
W
 
T
G
 
A
T
 
G
Y
 
T
A
 
G
G
 
G
K
 
D
R
 
G
R
 
L
Q
 
G
L
 
T
P
 
V
W
 
N
F
 
V
I
 
S
L
 
T
A
 
A
L
 
S
T
 
A
I
 
I
L
 
L
K
 
L
D
 
S
K
 
L
G
 
V
Y
 
N
K
 
P
V
 
V
F
 
A
L
 
K
H
|
H
G
|
G
-
x
N
-
 
R
V
 
A
V
 
V
G
 
S
N
 
G
E
 
K
S
 
S
N
 
G
R
 
-
L
 
-
Y
 
-
T
 
S
K
 
A
E
 
D
V
 
V
A
 
L
E
 
E
L
 
A
L
 
L
G
 
G
W
 
Y
P
 
N
M
 
I
A
 
I
D
 
V
S
 
P
L
 
P
A
 
E
K
 
R
A
 
A
K
 
K
T
 
E
M
 
L
I
 
V
E
 
N
T
 
K
S
 
T
G
 
N
F
 
F
C
 
V
Y
 
F
L
 
L
D
 
F
V
 
A
K
x
Q
D
 
Y
F
 
Y
A
x
H
P
 
P
Q
 
A
I
x
M
K
 
K
T
 
N
L
 
V
M
 
A
N
 
N
Y
 
V
R
|
R
D
 
K
E
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
R
 
R
S
 
T
P
 
I
I
 
F
H
 
N
S
 
I
L
 
L
A
x
G
R
x
P
M
 
L
L
 
T
N
 
N
P
 
P
F
 
A
N
 
N
A
 
A
R
 
K
L
 
Y
S
 
Q
V
 
L
H
 
M
G
 
G
V
 
V
F
 
F
H
 
S
K
 
K
G
 
D
Y
 
H
D
 
L
D
 
D
I
 
L
H
 
L
Q
 
S
Q
 
K
S
 
S
A
 
A
A
 
Y
L
 
E
L
 
L
D
 
D
D
 
F
Q
 
N
M
 
K
T
 
I
A
 
I
S
 
L
F
 
V
C
 
Y
G
 
G
D
 
E
G
 
P
G
 
G
E
 
I
A
 
D
E
 
E
V
 
V
R
 
S
P
 
P
D
 
I
R
 
G
K
 
N
T
 
T
E
 
F
I
 
M
K
 
K
M
 
I
V
 
V

P50384 Anthranilate phosphoribosyltransferase; EC 2.4.2.18 from Saccharolobus solfataricus (strain ATCC 35092 / DSM 1617 / JCM 11322 / P2) (Sulfolobus solfataricus) (see 2 papers)
28% identity, 65% coverage: 32:257/348 of query aligns to 12:236/345 of P50384

query
sites
P50384
R
 
N
R
 
K
R
 
S
S
 
D
L
 
L
T
 
E
Q
 
I
A
 
N
E
 
E
A
 
A
Q
 
E
D
 
E
A
 
L
M
 
A
S
 
K
M
 
A
I
 
I
L
 
I
A
 
R
G
 
G
Q
 
E
V
 
V
S
 
P
E
 
E
M
 
I
Q
 
L
L
 
V
G
 
S
A
 
A
F
 
I
L
 
L
M
 
V
L
 
A
I
 
L
R
 
R
V
 
M
R
 
K
E
 
G
E
 
E
T
 
S
P
 
K
E
 
N
E
 
E
A
 
I
A
 
V
G
 
G
F
 
F
L
 
A
Q
 
R
A
 
A
I
 
M
R
 
R
D
 
E
V
 
L
-
 
A
-
 
I
-
 
K
M
 
I
K
 
D
A
 
V
P
 
P
N
 
N
C
 
A
E
 
-
V
 
-
D
 
-
L
 
I
D
 
D
W
 
T
G
 
A
T
 
G
Y
 
T
A
 
G
G
 
G
K
 
D
R
 
G
R
 
L
Q
 
G
L
x
T
P
 
V
W
 
N
F
 
V
I
 
S
L
 
T
A
 
A
L
 
S
T
 
A
I
 
I
L
 
L
K
 
L
D
 
S
K
 
L
G
 
V
Y
 
N
K
 
P
V
 
V
F
 
A
L
x
K
H
|
H
G
 
G
-
 
N
-
 
R
V
 
A
V
 
V
G
 
S
N
 
G
E
 
K
S
 
S
N
 
G
R
 
-
L
 
-
Y
 
-
T
x
S
K
 
A
E
 
D
V
 
V
A
 
L
E
 
E
L
 
A
L
 
L
G
 
G
W
 
Y
P
 
N
M
 
I
A
 
I
D
 
V
S
 
P
L
 
P
A
 
E
K
 
R
A
 
A
K
 
K
T
 
E
M
 
L
I
 
V
E
 
N
T
 
K
S
 
T
G
 
N
F
 
F
C
 
V
Y
 
F
L
 
L
D
 
F
V
 
A
K
 
Q
D
 
Y
F
 
Y
A
x
H
P
 
P
Q
 
A
I
 
M
K
 
K
T
 
N
L
 
V
M
 
A
N
 
N
Y
 
V
R
|
R
D
 
K
E
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
R
 
R
S
 
T
P
 
I
I
 
F
H
 
N
S
 
I
L
 
L
A
 
G
R
 
P
M
 
L
L
 
T
N
 
N
P
 
P
F
 
A
N
 
N
A
 
A
R
 
K
L
 
Y
S
 
Q
V
 
L
H
 
M
G
 
G
V
 
V
F
 
F
H
 
S
K
 
K
G
 
D
Y
 
H
D
 
L
D
 
D
I
 
L
H
 
L
Q
 
S
Q
 
K
S
 
S
A
 
A
A
 
Y
L
 
E
L
 
L
D
 
D
D
 
F
Q
 
N
M
 
K
T
 
I
A
 
I
S
 
L
F
 
V
C
 
Y
G
 
G
D
 
E
G
 
P
G
 
G
E
 
I
A
x
D
E
|
E
V
 
V
R
 
S
P
 
P
D
 
I
R
 
G
K
 
N
T
 
T
E
 
F
I
 
M
K
 
K
M
 
I
V
 
V

3gbrA Anthranilate phosphoribosyl-transferase (trpd) double mutant d83g f149s from s. Solfataricus (see paper)
28% identity, 65% coverage: 33:257/348 of query aligns to 13:233/341 of 3gbrA

query
sites
3gbrA
R
 
K
R
 
S
S
 
D
L
 
L
T
 
E
Q
 
I
A
 
N
E
 
E
A
 
A
Q
 
E
D
 
E
A
 
L
M
 
A
S
 
K
M
 
A
I
 
I
L
 
I
A
 
R
G
 
G
Q
 
E
V
 
V
S
 
P
E
 
E
M
 
I
Q
 
L
L
 
V
G
 
S
A
 
A
F
 
I
L
 
L
M
 
V
L
 
A
I
 
L
R
 
R
V
 
M
R
 
K
E
 
G
E
 
E
T
 
S
P
 
K
E
 
N
E
 
E
A
 
I
A
 
V
G
 
G
F
 
F
L
 
A
Q
 
R
A
 
A
I
 
M
R
 
R
D
 
E
V
 
L
-
 
A
-
 
I
-
 
K
M
 
I
K
 
D
A
 
V
P
 
P
N
 
N
C
 
A
E
 
-
V
 
-
D
 
-
L
 
I
D
 
D
W
 
T
G
x
A
T
x
G
Y
x
T
A
x
G
G
 
G
K
 
G
R
 
G
R
 
L
Q
 
G
L
 
T
P
 
V
W
x
N
F
x
V
I
x
S
L
x
T
A
 
A
L
 
S
T
 
A
I
 
I
L
 
L
K
 
L
D
 
S
K
 
L
G
 
V
Y
 
N
K
 
P
V
 
V
F
 
A
L
x
K
H
 
H
G
 
G
V
 
-
V
 
-
G
 
-
N
 
-
E
 
-
S
 
-
N
 
N
R
 
R
L
 
A
Y
 
K
T
 
S
-
x
G
-
 
S
K
 
A
E
 
D
V
 
V
A
 
L
E
 
E
L
 
A
L
 
L
G
 
G
W
 
Y
P
 
N
M
 
I
A
 
I
D
 
V
S
 
P
L
 
P
A
 
E
K
 
R
A
 
A
K
 
K
T
 
E
M
 
L
I
 
V
E
 
N
T
 
K
S
 
T
G
 
N
F
 
F
C
 
V
Y
 
F
L
 
L
D
 
S
V
 
A
K
 
Q
D
 
Y
F
 
Y
A
 
H
P
 
P
Q
 
A
I
 
M
K
 
K
T
 
N
L
 
V
M
 
A
N
 
N
Y
 
V
R
 
R
D
 
K
E
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
R
 
R
S
 
T
P
 
I
I
 
F
H
 
N
S
 
I
L
 
L
A
 
G
R
 
P
M
 
L
L
 
T
N
 
N
P
 
P
F
 
A
N
 
N
A
 
A
R
 
K
L
 
Y
S
 
Q
V
 
L
H
 
M
G
 
G
V
 
V
F
 
F
H
 
S
K
 
K
G
 
D
Y
 
H
D
 
L
D
 
D
I
 
L
H
 
L
Q
 
S
Q
 
K
S
 
S
A
 
A
A
 
Y
L
 
E
L
 
L
D
 
D
D
 
F
Q
 
N
M
 
K
T
 
I
A
 
I
S
 
L
F
 
V
C
 
Y
G
 
G
D
 
E
G
 
P
G
 
G
E
 
I
A
x
D
E
|
E
V
 
V
R
 
S
P
 
P
D
 
I
R
 
G
K
 
N
T
 
T
E
 
F
I
 
M
K
 
K
M
 
I
V
 
V

1kgzB Crystal structure analysis of the anthranilate phosphoribosyltransferase from erwinia carotovora (current name, pectobacterium carotovorum) (see paper)
25% identity, 86% coverage: 32:329/348 of query aligns to 11:304/330 of 1kgzB

query
sites
1kgzB
R
 
K
R
 
S
R
 
Q
S
 
S
L
 
M
T
 
T
Q
 
Q
A
 
E
E
 
E
A
 
S
Q
 
H
D
 
Q
A
 
L
M
 
F
S
 
A
M
 
A
I
 
I
L
 
V
A
 
R
G
 
G
Q
 
E
V
 
L
S
 
E
E
 
D
M
 
S
Q
 
Q
L
 
L
G
 
A
A
 
A
F
 
A
L
 
L
M
 
I
L
 
S
I
 
M
R
 
K
V
 
M
R
 
R
E
 
G
E
 
E
T
 
R
P
 
P
E
 
E
E
 
E
A
 
I
A
 
A
G
 
G
F
 
A
L
 
A
Q
 
S
A
 
A
-
 
L
I
 
L
R
 
A
D
 
D
V
 
A
M
 
Q
K
 
P
A
 
F
P
 
P
N
 
R
C
 
P
E
 
D
V
 
Y
D
 
D
L
 
F
D
 
A
-
 
D
-
 
I
W
x
V
G
 
G
T
 
T
Y
x
G
A
x
G
G
 
D
K
 
G
R
 
T
R
 
N
Q
 
S
L
 
I
P
x
N
W
x
I
F
x
S
I
x
T
L
 
A
A
 
S
L
 
A
T
 
F
I
 
V
L
 
A
K
 
A
D
 
S
K
 
C
G
 
G
Y
 
A
K
 
K
V
 
V
F
 
A
L
x
K
H
 
H
G
 
-
V
 
-
V
 
-
G
 
G
N
 
N
E
 
R
S
 
S
N
 
V
R
 
L
L
 
A
Y
 
G
T
x
S
K
 
C
E
 
D
V
 
L
A
 
L
E
 
Q
L
 
A
L
 
F
G
 
G
W
 
I
P
 
R
M
 
L
A
 
D
D
 
M
S
 
S
L
 
A
A
 
E
K
 
D
A
 
S
K
 
R
T
 
Q
M
 
A
I
 
L
E
 
D
T
 
D
S
 
L
G
 
N
F
 
V
C
 
C
Y
 
F
L
 
L
D
 
-
V
 
-
K
 
-
D
 
-
F
 
F
A
 
A
P
 
P
Q
 
Q
I
 
Y
K
 
H
T
 
T
-
 
G
-
 
F
-
 
R
-
 
H
L
 
A
M
 
M
N
 
P
Y
 
V
R
 
R
D
 
Q
E
 
Q
L
 
L
G
 
K
L
 
T
R
 
R
S
 
T
P
 
I
I
 
F
H
 
N
S
 
V
L
 
L
A
 
G
R
 
P
M
 
L
L
 
I
N
 
N
P
 
P
F
 
A
N
 
R
A
 
P
R
 
P
L
 
K
S
 
A
V
 
L
H
 
I
G
 
G
V
 
V
F
 
Y
H
 
S
K
 
P
G
 
E
Y
 
L
D
 
V
D
 
L
I
 
P
H
 
I
Q
 
A
Q
 
Q
S
 
A
A
 
L
A
 
K
L
 
V
L
 
L
D
 
G
D
 
Y
Q
 
K
M
 
N
T
 
A
A
 
A
S
 
V
F
 
V
C
 
H
G
 
G
D
 
-
G
 
G
G
 
G
E
 
M
A
x
D
E
|
E
V
 
V
R
 
A
P
 
I
D
 
H
R
 
T
K
 
P
T
 
T
E
 
Q
I
 
V
K
 
A
M
 
E
V
 
L
E
 
N
N
 
N
I
 
-
F
 
-
D
 
-
D
 
-
H
 
-
G
 
G
E
 
E
R
 
I
V
 
E
T
 
S
S
 
Y
I
 
Q
D
 
L
Q
 
S
A
 
P
W
 
Q
S
 
D
F
 
F
F
 
G
M
 
L
P
 
Q
K
 
S
T
 
Y
Y
 
S
L
 
L
N
 
N
S
 
A
-
 
L
-
 
Q
-
 
G
-
 
G
D
 
T
P
 
P
T
 
E
D
 
E
K
 
-
C
 
-
L
 
-
D
 
N
T
 
R
D
 
D
V
 
I
L
 
L
L
 
A
A
 
R
V
 
L
W
 
L
Q
 
Q
G
 
G
K
 
K
A
 
G
E
 
D
H
 
A
A
 
A
Y
 
H
G
 
A
-
 
R
Q
 
Q
A
 
V
A
 
A
V
 
A
I
 
N
Q
 
V
T
 
A
L
 
L
A
 
L
M
 
L
A
 
K
L
 
L
M
 
F
A
 
G
L
 
Q
D
 
D
N
 
N
L
 
L

5nofA Anthranilate phosphoribosyltransferase from thermococcus kodakaraensis (see paper)
25% identity, 58% coverage: 58:259/348 of query aligns to 33:232/325 of 5nofA

query
sites
5nofA
L
 
I
G
 
G
A
 
A
F
 
Y
L
 
L
M
 
A
L
 
A
I
 
L
R
 
Q
V
 
T
R
 
K
E
 
G
E
 
Y
T
 
T
P
 
G
E
|
E
E
 
E
A
 
L
A
 
A
G
 
G
F
 
L
L
 
A
Q
 
R
A
 
A
I
 
M
R
 
R
D
 
D
V
 
-
M
 
-
K
 
-
A
 
-
P
 
-
N
 
-
C
 
S
E
 
A
V
 
V
D
 
K
L
 
L
D
 
D
W
 
L
G
 
G
T
 
K
Y
 
V
A
 
A
-
 
D
-
 
T
-
 
A
-
 
G
-
 
T
-
 
G
G
 
G
K
x
D
R
 
G
R
 
S
Q
 
S
L
 
T
P
 
I
W
 
N
F
 
V
I
 
S
L
 
T
A
 
A
L
 
S
T
 
A
I
 
L
L
 
I
K
 
L
D
 
S
K
 
A
G
 
F
Y
 
T
K
 
R
V
 
V
F
 
A
L
 
K
H
 
H
G
 
G
V
 
N
V
 
V
G
 
-
N
 
S
E
 
I
S
 
T
N
 
S
R
 
K
L
 
S
Y
 
G
T
 
S
K
 
A
E
 
N
V
 
V
A
 
L
E
 
E
L
 
A
L
 
L
G
 
G
W
 
L
P
 
N
M
 
I
A
 
R
D
 
V
S
 
S
L
 
P
A
 
E
K
 
R
A
 
A
K
 
R
T
 
E
M
 
M
I
 
V
E
 
E
T
 
S
S
 
T
G
 
N
F
 
F
C
 
T
Y
 
F
L
 
I
D
 
F
V
 
A
K
 
P
D
 
A
F
 
Y
A
 
H
P
 
P
Q
 
A
I
 
L
K
 
R
T
 
P
L
 
I
M
 
M
N
 
P
Y
 
V
R
 
R
D
 
K
E
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
I
R
 
K
S
 
T
P
 
V
I
 
F
H
 
N
S
 
V
L
 
I
A
 
G
R
 
P
M
 
L
L
 
A
N
 
N
P
 
P
F
 
A
N
 
D
A
 
P
R
 
A
L
 
Y
S
 
Q
V
 
V
H
 
V
G
 
G
V
 
V
F
 
N
H
 
S
K
 
P
G
 
E
Y
 
L
D
 
L
D
 
E
I
 
P
H
 
V
Q
 
A
Q
x
E
S
 
A
A
 
L
A
 
E
L
 
F
L
 
L
D
 
G
D
 
V
Q
 
E
M
 
R
T
 
A
A
 
L
S
 
V
F
 
V
C
 
H
G
 
G
D
 
S
G
 
G
G
 
M
E
x
D
A
 
-
E
|
E
V
 
V
R
 
S
P
 
P
D
 
H
R
 
R
K
 
E
T
 
T
E
 
L
I
 
V
K
 
L
M
 
E
V
 
V
E
 
G
N
 
N

4yi7A Anthranilate bound at active site of anthranilate phosphoribosyl transferase from acinetobacter (anprt; trpd)
26% identity, 51% coverage: 36:214/348 of query aligns to 17:183/331 of 4yi7A

query
sites
4yi7A
L
 
L
T
 
T
Q
 
Q
A
 
A
E
 
Q
A
 
M
Q
 
E
D
 
D
A
 
V
M
 
M
S
 
R
M
 
S
I
 
I
L
 
M
A
 
Q
G
 
G
Q
 
E
V
 
A
S
 
T
E
 
E
M
 
A
Q
 
Q
L
 
I
G
 
G
A
 
A
F
 
L
L
 
M
M
 
M
L
 
G
I
 
L
R
 
R
V
 
M
R
 
K
E
 
G
E
 
E
T
 
S
P
 
I
E
 
D
E
 
E
A
 
-
A
 
-
G
 
-
F
 
-
L
 
I
Q
 
T
A
 
A
I
 
A
R
 
A
D
 
R
V
 
V
M
 
M
K
 
R
A
 
E
P
 
L
N
 
A
C
 
I
E
 
K
V
 
I
D
 
D
L
 
V
D
 
S
W
 
D
G
 
I
T
 
Q
Y
 
Y
-
 
L
-
 
V
-
 
D
-
 
I
-
x
V
-
x
G
A
 
T
G
 
G
K
 
G
R
 
D
R
 
N
Q
 
L
L
 
F
P
 
N
W
 
V
F
 
S
I
 
T
L
 
A
A
 
S
L
 
S
T
 
F
I
 
V
L
 
I
K
 
A
D
 
A
K
 
A
G
 
G
Y
 
A
K
 
T
V
 
I
F
 
A
L
 
K
H
|
H
G
 
G
V
 
-
V
 
-
G
 
-
N
 
-
E
 
-
S
 
-
N
 
N
R
 
R
L
 
-
Y
 
-
T
 
S
K
 
S
E
 
D
V
 
L
A
 
L
E
 
E
L
 
Q
L
 
A
G
 
G
W
 
I
P
 
N
M
 
L
A
 
D
D
 
L
S
 
D
L
 
M
A
 
Q
K
 
Q
A
 
T
K
 
E
T
 
R
M
 
C
I
 
I
E
 
R
T
 
E
S
 
M
G
 
G
F
 
V
C
 
G
Y
 
F
L
 
L
D
 
-
V
 
-
K
 
-
D
 
-
F
 
F
A
 
A
P
 
-
Q
 
-
I
 
M
K
 
K
T
 
Y
L
 
A
M
 
V
N
 
G
Y
 
P
R
|
R
D
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
I
R
 
R
S
 
S
P
 
I
I
 
F
H
 
N
S
 
L
L
 
L
A
x
G
R
 
P
M
 
L
L
 
T
N
 
N
P
 
P
F
 
A
N
 
G
A
 
V
R
 
K
L
 
R
S
 
F
V
 
V
H
 
I
G
 
G
V
 
V
F
 
F

Query Sequence

>WP_019557414.1 NCBI__GCF_000381085.1:WP_019557414.1
MSKNDIKIAESKTVESKPFQFYIQTVGRGQKRRRSLTQAEAQDAMSMILAGQVSEMQLGA
FLMLIRVREETPEEAAGFLQAIRDVMKAPNCEVDLDWGTYAGKRRQLPWFILALTILKDK
GYKVFLHGVVGNESNRLYTKEVAELLGWPMADSLAKAKTMIETSGFCYLDVKDFAPQIKT
LMNYRDELGLRSPIHSLARMLNPFNARLSVHGVFHKGYDDIHQQSAALLDDQMTASFCGD
GGEAEVRPDRKTEIKMVENIFDDHGERVTSIDQAWSFFMPKTYLNSDPTDKCLDTDVLLA
VWQGKAEHAYGQAAVIQTLAMALMALDNLTLGEAFATAESLWLQRLAS

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory