SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_020174512.1 NCBI__GCF_000385335.1:WP_020174512.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5v6qB Crystal structure of NADPH-dependent glyoxylate/hydroxypyruvate reductase smc04462 (smghrb) from sinorhizobium meliloti in complex with NADP and malonate (see paper)
48% identity, 99% coverage: 1:321/323 of query aligns to 1:317/319 of 5v6qB

query
sites
5v6qB
M
 
M
S
 
S
E
 
R
F
 
P
D
 
R
L
 
I
L
 
L
M
 
V
P
 
P
A
 
G
F
 
K
L
 
I
T
 
N
D
 
P
F
 
R
L
 
V
V
 
L
D
 
E
G
 
R
L
 
L
S
 
P
K
 
E
N
 
M
H
 
F
T
 
E
L
 
T
H
 
V
K
 
R
L
 
I
W
 
-
E
 
E
A
 
R
P
 
A
D
 
D
P
 
A
A
 
A
A
 
L
K
 
V
I
 
T
S
 
A
A
 
D
V
 
M
K
 
R
D
 
D
R
 
V
V
 
S
R
 
G
A
 
I
L
 
A
I
 
V
S
 
S
G
 
G
G
 
-
I
 
-
G
 
-
R
 
-
F
 
-
K
 
K
V
 
L
T
 
P
A
 
V
D
 
P
F
 
L
I
 
M
A
 
D
Q
 
A
F
 
F
P
 
P
N
 
S
L
 
L
E
 
E
A
 
I
I
 
V
F
 
A
H
 
N
M
 
F
G
 
G
V
|
V
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
L
 
G
V
 
V
D
 
D
A
 
V
A
 
S
Y
 
R
A
 
A
G
 
A
A
 
A
H
 
R
G
 
G
I
 
I
I
 
V
V
 
V
T
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
D
V
 
V
L
|
L
D
 
T
E
 
E
D
 
E
V
|
V
A
 
A
D
 
D
I
 
T
A
 
A
M
 
I
A
 
G
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
N
A
 
T
T
 
L
R
 
R
Q
 
L
I
 
L
P
 
P
Q
 
Q
S
 
A
D
 
E
A
 
Q
F
 
W
L
 
L
R
 
R
S
 
Q
G
 
G
K
 
R
W
 
W
L
 
V
-
 
R
T
 
E
G
 
G
T
 
A
Y
 
F
P
 
P
L
 
L
T
 
S
A
 
P
-
 
L
T
 
S
L
 
L
R
 
R
G
 
G
R
 
R
T
 
T
M
 
V
G
 
G
I
 
L
L
x
F
G
 
G
L
|
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
K
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
R
R
 
R
A
 
L
E
 
E
A
 
A
F
 
F
D
 
G
L
 
V
K
 
S
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
G
x
T
R
|
R
T
 
T
Q
 
P
Q
 
R
A
 
E
G
 
G
V
 
L
A
 
G
Y
 
F
P
 
T
Y
 
Y
Y
 
H
A
 
P
T
 
T
P
 
L
I
 
V
A
 
G
L
 
M
A
 
A
A
 
E
A
 
A
C
 
V
D
 
D
V
 
T
L
 
L
M
 
I
V
 
V
V
 
I
A
x
V
P
|
P
G
 
G
G
 
T
A
 
A
E
x
S
T
|
T
K
 
L
H
 
K
I
 
A
V
 
V
N
 
N
K
 
A
A
 
D
V
 
V
L
 
L
E
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
P
D
 
K
G
 
G
I
 
V
L
 
L
I
 
I
N
 
N
V
|
V
A
x
G
R
|
R
G
 
G
S
 
S
L
 
T
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
I
 
V
E
 
T
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
T
 
N
G
 
G
K
 
T
I
 
I
L
 
A
A
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
E
 
E
F
 
N
E
|
E
P
 
P
K
 
N
V
 
V
P
 
P
Q
 
E
A
 
A
L
 
L
I
 
L
D
 
S
C
 
F
Q
 
P
N
 
N
T
 
V
V
 
S
L
 
L
L
 
L
P
 
P
H
|
H
V
 
V
G
x
A
S
 
S
A
 
A
T
 
S
H
 
V
Y
 
V
T
 
T
R
 
R
Q
 
N
A
 
A
M
 
M
A
 
S
Q
 
D
L
 
L
V
 
V
I
 
V
D
 
D
N
 
N
V
 
L
A
 
K
S
 
A
W
 
W
T
 
F
S
 
S
G
 
T
K
 
G
G
 
E
P
 
A
L
 
L
T
 
T
P
 
P
V
 
V
A
 
A
E
 
E
T
 
T
P
 
P
W
 
F
Q
 
R
R
 
R

5v7nA Crystal structure of NADPH-dependent glyoxylate/hydroxypyruvate reductase smc04462 (smghrb) from sinorhizobium meliloti in complex with NADP and 2-keto-d-gluconic acid (see paper)
55% identity, 82% coverage: 58:321/323 of query aligns to 51:316/319 of 5v7nA

query
sites
5v7nA
K
 
K
V
 
L
T
 
P
A
 
V
D
 
P
F
 
L
I
 
M
A
 
D
Q
 
A
F
 
F
P
 
P
N
 
S
L
 
L
E
 
E
A
 
I
I
 
V
F
 
A
H
 
N
M
 
F
G
|
G
V
|
V
G
|
G
Y
 
Y
D
 
D
L
 
G
V
 
V
D
 
D
A
 
V
A
 
S
Y
 
R
A
 
A
G
 
A
A
 
A
H
 
R
G
 
G
I
 
I
I
 
V
V
 
V
T
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
D
V
 
V
L
|
L
D
 
T
E
 
E
D
 
E
V
|
V
A
 
A
D
 
D
I
 
T
A
 
A
M
 
I
A
 
G
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
N
A
 
T
T
 
L
R
 
R
Q
 
L
I
 
L
P
 
P
Q
 
Q
S
 
A
D
 
E
A
 
Q
F
 
W
L
 
L
R
 
R
S
 
Q
G
 
G
K
 
R
W
 
W
L
 
V
-
 
R
T
 
E
G
 
G
T
 
A
Y
 
F
P
 
P
L
 
L
T
 
S
A
 
P
-
 
L
T
 
S
L
 
L
R
 
R
G
 
G
R
 
R
T
 
T
M
 
V
G
 
G
I
 
L
L
 
F
G
 
G
L
|
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
K
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
R
R
 
R
A
 
L
E
 
E
A
 
A
F
 
F
D
 
G
L
 
V
K
 
S
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
G
x
T
R
|
R
T
 
T
Q
 
P
Q
 
R
A
 
E
G
 
G
V
 
L
A
 
G
Y
 
F
P
 
T
Y
 
Y
Y
 
H
A
 
P
T
 
T
P
 
L
I
 
V
A
 
G
L
 
M
A
 
A
A
 
E
A
 
A
C
 
V
D
 
D
V
 
T
L
 
L
M
 
I
V
 
V
V
 
I
A
x
V
P
|
P
G
 
G
G
 
T
A
 
A
E
x
S
T
|
T
K
 
L
H
 
K
I
 
A
V
 
V
N
 
N
K
 
A
A
 
D
V
 
V
L
 
L
E
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
P
D
 
K
G
 
G
I
 
V
L
 
L
I
 
I
N
 
N
V
|
V
A
x
G
R
|
R
G
 
G
S
 
S
L
 
T
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
I
 
V
E
 
T
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
T
 
N
G
 
G
K
 
T
I
 
I
L
 
A
A
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
E
 
E
F
 
N
E
|
E
P
 
P
K
 
N
V
 
V
P
 
P
Q
 
E
A
 
A
L
 
L
I
 
L
D
 
S
C
 
F
Q
 
P
N
 
N
T
 
V
V
 
S
L
 
L
L
 
L
P
 
P
H
|
H
V
 
V
G
x
A
S
|
S
A
 
A
T
 
S
H
 
V
Y
 
V
T
 
T
R
|
R
Q
 
N
A
 
A
M
 
M
A
 
S
Q
 
D
L
 
L
V
 
V
I
 
V
D
 
D
N
 
N
V
 
L
A
 
K
S
 
A
W
 
W
T
 
F
S
 
S
G
 
T
K
 
G
G
 
E
P
 
A
L
 
L
T
 
T
P
 
P
V
 
V
A
 
A
E
 
E
T
 
T
P
 
P
W
 
F
Q
 
R
R
 
R

5j23A Crystal structure of NADPH-dependent glyoxylate/hydroxypyruvate reductase smc04462 (smghrb) from sinorhizobium meliloti in complex with 2'-phospho-adp-ribose (see paper)
55% identity, 82% coverage: 58:321/323 of query aligns to 50:315/318 of 5j23A

query
sites
5j23A
K
 
K
V
 
L
T
 
P
A
 
V
D
 
P
F
 
L
I
 
M
A
 
D
Q
 
A
F
 
F
P
 
P
N
 
S
L
 
L
E
 
E
A
 
I
I
 
V
F
 
A
H
 
N
M
 
F
G
 
G
V
|
V
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
L
 
G
V
 
V
D
 
D
A
 
V
A
 
S
Y
 
R
A
 
A
G
 
A
A
 
A
H
 
R
G
 
G
I
 
I
I
 
V
V
 
V
T
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
D
V
 
V
L
|
L
D
 
T
E
 
E
D
 
E
V
 
V
A
 
A
D
 
D
I
 
T
A
 
A
M
 
I
A
 
G
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
N
A
 
T
T
 
L
R
 
R
Q
 
L
I
 
L
P
 
P
Q
 
Q
S
 
A
D
 
E
A
 
Q
F
 
W
L
 
L
R
 
R
S
 
Q
G
 
G
K
 
R
W
 
W
L
 
V
-
 
R
T
 
E
G
 
G
T
 
A
Y
 
F
P
 
P
L
 
L
T
 
S
A
 
P
-
 
L
T
 
S
L
 
L
R
 
R
G
 
G
R
 
R
T
 
T
M
 
V
G
 
G
I
 
L
L
 
F
G
 
G
L
|
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
K
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
R
R
 
R
A
 
L
E
 
E
A
 
A
F
 
F
D
 
G
L
 
V
K
 
S
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
G
x
T
R
|
R
T
 
T
Q
 
P
Q
 
R
A
 
E
G
 
G
V
 
L
A
 
G
Y
 
F
P
 
T
Y
 
Y
Y
 
H
A
 
P
T
 
T
P
 
L
I
 
V
A
 
G
L
 
M
A
 
A
A
 
E
A
 
A
C
 
V
D
 
D
V
 
T
L
 
L
M
 
I
V
 
V
V
 
I
A
 
V
P
|
P
G
 
G
G
 
T
A
 
A
E
x
S
T
|
T
K
 
L
H
 
K
I
 
A
V
 
V
N
 
N
K
 
A
A
 
D
V
 
V
L
 
L
E
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
P
D
 
K
G
 
G
I
 
V
L
 
L
I
 
I
N
 
N
V
 
V
A
 
G
R
|
R
G
 
G
S
 
S
L
 
T
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
I
 
V
E
 
T
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
T
 
N
G
 
G
K
 
T
I
 
I
L
 
A
A
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
E
 
E
F
 
N
E
|
E
P
 
P
K
 
N
V
 
V
P
 
P
Q
 
E
A
 
A
L
 
L
I
 
L
D
 
S
C
 
F
Q
 
P
N
 
N
T
 
V
V
 
S
L
 
L
L
 
L
P
 
P
H
|
H
V
 
V
G
 
A
S
 
S
A
 
A
T
 
S
H
 
V
Y
 
V
T
 
T
R
 
R
Q
 
N
A
 
A
M
 
M
A
 
S
Q
 
D
L
 
L
V
 
V
I
 
V
D
 
D
N
 
N
V
 
L
A
 
K
S
 
A
W
 
W
T
 
F
S
 
S
G
 
T
K
 
G
G
 
E
P
 
A
L
 
L
T
 
T
P
 
P
V
 
V
A
 
A
E
 
E
T
 
T
P
 
P
W
 
F
Q
 
R
R
 
R

5v7gA Crystal structure of NADPH-dependent glyoxylate/hydroxypyruvate reductase smc04462 (smghrb) from sinorhizobium meliloti in complex with NADPH and oxalate (see paper)
55% identity, 82% coverage: 58:321/323 of query aligns to 50:315/317 of 5v7gA

query
sites
5v7gA
K
 
K
V
 
L
T
 
P
A
 
V
D
 
P
F
 
L
I
 
M
A
 
D
Q
 
A
F
 
F
P
 
P
N
 
S
L
 
L
E
 
E
A
 
I
I
 
V
F
 
A
H
 
N
M
 
F
G
|
G
V
|
V
G
|
G
Y
 
Y
D
 
D
L
 
G
V
 
V
D
 
D
A
 
V
A
 
S
Y
 
R
A
 
A
G
 
A
A
 
A
H
 
R
G
 
G
I
 
I
I
 
V
V
 
V
T
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
D
V
 
V
L
|
L
D
 
T
E
 
E
D
 
E
V
|
V
A
 
A
D
 
D
I
 
T
A
 
A
M
 
I
A
 
G
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
N
A
 
T
T
 
L
R
 
R
Q
 
L
I
 
L
P
 
P
Q
 
Q
S
 
A
D
 
E
A
 
Q
F
 
W
L
 
L
R
 
R
S
 
Q
G
 
G
K
 
R
W
 
W
L
 
V
-
 
R
T
 
E
G
 
G
T
 
A
Y
 
F
P
 
P
L
 
L
T
 
S
A
 
P
-
 
L
T
 
S
L
 
L
R
 
R
G
 
G
R
 
R
T
 
T
M
 
V
G
 
G
I
 
L
L
x
F
G
 
G
L
|
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
K
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
R
R
 
R
A
 
L
E
 
E
A
 
A
F
 
F
D
 
G
L
 
V
K
 
S
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
G
x
T
R
|
R
T
 
T
Q
 
P
Q
 
R
A
 
E
G
 
G
V
 
L
A
 
G
Y
 
F
P
 
T
Y
 
Y
Y
 
H
A
 
P
T
 
T
P
 
L
I
 
V
A
 
G
L
 
M
A
 
A
A
 
E
A
 
A
C
 
V
D
 
D
V
 
T
L
 
L
M
 
I
V
 
V
V
 
I
A
x
V
P
|
P
G
 
G
G
 
T
A
 
A
E
x
S
T
|
T
K
 
L
H
 
K
I
 
A
V
 
V
N
 
N
K
 
A
A
 
D
V
 
V
L
 
L
E
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
P
D
 
K
G
 
G
I
 
V
L
 
L
I
 
I
N
 
N
V
|
V
A
x
G
R
|
R
G
 
G
S
 
S
L
 
T
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
I
 
V
E
 
T
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
T
 
N
G
 
G
K
 
T
I
 
I
L
 
A
A
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
E
 
E
F
 
N
E
|
E
P
 
P
K
 
N
V
 
V
P
 
P
Q
 
E
A
 
A
L
 
L
I
 
L
D
 
S
C
 
F
Q
 
P
N
 
N
T
 
V
V
 
S
L
 
L
L
 
L
P
 
P
H
|
H
V
 
V
G
x
A
S
 
S
A
 
A
T
 
S
H
 
V
Y
 
V
T
 
T
R
 
R
Q
 
N
A
 
A
M
 
M
A
 
S
Q
 
D
L
 
L
V
 
V
I
 
V
D
 
D
N
 
N
V
 
L
A
 
K
S
 
A
W
 
W
T
 
F
S
 
S
G
 
T
K
 
G
G
 
E
P
 
A
L
 
L
T
 
T
P
 
P
V
 
V
A
 
A
E
 
E
T
 
T
P
 
P
W
 
F
Q
 
R
R
 
R

Q65CJ7 Hydroxyphenylpyruvate reductase; HPPR; EC 1.1.1.237 from Plectranthus scutellarioides (Coleus) (Solenostemon scutellarioides) (see paper)
43% identity, 97% coverage: 1:314/323 of query aligns to 1:312/313 of Q65CJ7

query
sites
Q65CJ7
M
 
M
S
 
E
E
 
A
F
 
I
D
 
G
L
 
V
L
 
L
M
 
M
P
 
M
A
 
C
F
 
P
L
 
M
T
 
S
D
 
T
F
 
Y
L
 
L
V
 
E
D
 
Q
G
 
E
L
 
L
S
 
D
K
 
K
N
 
R
H
 
F
T
 
K
L
 
L
H
 
F
K
 
R
L
 
Y
W
 
W
E
 
T
A
 
Q
P
 
P
D
 
A
P
 
Q
A
 
R
A
 
D
K
 
F
I
 
L
S
 
A
A
 
L
V
 
Q
K
 
A
D
 
E
R
 
S
V
 
I
R
 
R
A
 
A
L
 
V
I
 
V
S
 
-
G
 
-
G
 
G
I
 
N
G
 
S
R
 
N
F
 
A
K
 
G
V
 
A
T
 
D
A
 
A
D
 
E
F
 
L
I
 
I
A
 
D
Q
 
A
F
 
L
P
 
P
N
 
K
L
 
L
E
 
E
A
 
I
I
 
V
F
 
S
H
 
S
M
 
F
G
 
S
V
 
V
G
 
G
Y
 
L
D
 
D
L
 
K
V
 
V
D
 
D
A
 
L
A
 
I
Y
 
K
A
 
C
G
 
E
A
 
E
H
 
K
G
 
G
I
 
V
I
 
R
V
 
V
T
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
D
V
 
V
L
 
L
D
 
T
E
 
D
D
 
D
V
 
V
A
 
A
D
 
D
I
 
L
A
 
A
M
 
I
A
 
G
L
 
L
L
 
I
L
 
L
D
 
A
A
 
V
T
 
L
R
 
R
Q
 
R
I
 
I
P
 
C
Q
 
E
S
 
C
D
 
D
A
 
K
F
 
Y
L
 
V
R
 
R
S
 
R
G
 
G
K
 
A
W
 
W
L
 
K
T
 
F
G
 
G
T
 
D
Y
 
F
P
 
K
L
 
L
T
 
T
A
 
T
T
 
K
L
 
F
R
 
S
G
 
G
R
 
K
T
 
R
M
 
V
G
 
G
I
 
I
L
 
I
G
 
G
L
|
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
K
 
L
A
 
A
I
 
V
A
 
A
K
 
E
R
 
R
A
 
A
E
 
E
A
 
A
F
 
F
D
 
D
L
 
C
K
 
P
I
 
I
A
 
S
Y
 
Y
H
 
F
G
x
S
R
|
R
T
x
S
Q
 
K
Q
 
K
A
 
P
G
 
N
V
 
T
A
 
N
Y
 
Y
P
 
T
Y
 
Y
Y
 
Y
A
 
G
T
 
S
P
 
V
I
 
V
A
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
S
A
 
N
C
 
S
D
 
D
V
 
I
L
 
L
M
 
V
V
 
V
V
 
A
A
 
C
P
 
P
G
 
L
G
 
T
A
 
P
E
 
E
T
 
T
K
 
T
H
 
H
I
 
I
V
 
I
N
 
N
K
 
R
A
 
E
V
 
V
L
 
I
E
 
D
A
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
P
D
 
K
G
 
G
I
 
V
L
 
L
I
 
I
N
 
N
V
x
I
A
 
G
R
 
R
G
 
G
S
 
P
L
 
H
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
P
A
 
E
L
 
L
I
 
V
E
 
S
A
 
A
L
 
L
Q
 
V
T
 
E
G
 
G
K
 
R
I
 
L
L
 
G
A
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
E
 
E
F
 
R
E
 
E
P
 
P
K
 
E
V
 
V
P
 
P
Q
 
E
A
 
K
L
 
L
I
 
F
D
 
G
C
 
L
Q
 
E
N
 
N
T
 
V
V
 
V
L
 
L
L
 
L
P
 
P
H
 
H
V
 
V
G
 
G
S
 
S
A
 
G
T
 
T
H
 
V
Y
 
E
T
 
T
R
 
R
Q
 
K
A
 
V
M
 
M
A
 
A
Q
 
D
L
 
L
V
 
V
I
 
V
D
 
G
N
 
N
V
 
L
A
 
E
S
 
A
W
 
H
T
 
F
S
 
S
G
 
G
K
 
K
G
 
P
P
 
L
L
 
L
T
 
T
P
 
P
V
 
V

3bazA Structure of hydroxyphenylpyruvate reductase from coleus blumei in complex with NADP+ (see paper)
43% identity, 96% coverage: 6:314/323 of query aligns to 4:310/311 of 3bazA

query
sites
3bazA
L
 
V
L
 
L
M
 
M
P
 
M
A
 
C
F
 
P
L
 
M
T
 
S
D
 
T
F
 
Y
L
 
L
V
 
E
D
 
Q
G
 
E
L
 
L
S
 
D
K
 
K
N
 
R
H
 
F
T
 
K
L
 
L
H
 
F
K
 
R
L
 
Y
W
 
W
E
 
T
A
 
Q
P
 
P
D
 
A
P
 
Q
A
 
R
A
 
D
K
 
F
I
 
L
S
 
A
A
 
L
V
 
Q
K
 
A
D
 
E
R
 
S
V
 
I
R
 
R
A
 
A
L
 
V
I
 
V
S
 
-
G
 
-
G
 
G
I
 
N
G
 
S
R
 
N
F
 
A
K
 
G
V
 
A
T
 
D
A
 
A
D
 
E
F
 
L
I
 
I
A
 
D
Q
 
A
F
 
L
P
 
P
N
 
K
L
 
L
E
 
E
A
 
I
I
 
V
F
 
S
H
 
S
M
 
F
G
 
S
V
|
V
G
 
G
Y
 
L
D
 
D
L
 
K
V
 
V
D
 
D
A
 
L
A
 
I
Y
 
K
A
 
C
G
 
E
A
 
E
H
 
K
G
 
G
I
 
V
I
 
R
V
 
V
T
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
D
V
 
V
L
|
L
D
 
T
E
 
D
D
 
D
V
 
V
A
 
A
D
 
D
I
 
L
A
 
A
M
 
I
A
 
G
L
 
L
L
 
I
L
 
L
D
 
A
A
 
V
T
 
L
R
 
R
Q
 
R
I
 
I
P
 
C
Q
 
E
S
 
C
D
 
D
A
 
K
F
 
Y
L
 
V
R
 
R
S
 
R
G
 
G
K
 
A
W
 
W
L
 
K
T
 
F
G
 
G
T
 
D
Y
 
F
P
 
K
L
 
L
T
 
T
A
 
T
T
 
K
L
 
F
R
 
S
G
 
G
R
 
K
T
 
R
M
 
V
G
 
G
I
 
I
L
 
I
G
|
G
L
|
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
K
 
L
A
 
A
I
 
V
A
 
A
K
 
E
R
 
R
A
 
A
E
 
E
A
 
A
F
 
F
D
 
D
L
 
C
K
 
P
I
 
I
A
 
S
Y
 
Y
H
 
F
G
x
S
R
|
R
T
x
S
Q
 
K
Q
 
K
A
 
P
G
 
N
V
 
T
A
 
N
Y
 
Y
P
 
T
Y
 
Y
Y
 
Y
A
 
G
T
 
S
P
 
V
I
 
V
A
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
S
A
 
N
C
 
S
D
 
D
V
 
I
L
 
L
M
 
V
V
 
V
V
 
A
A
x
C
P
|
P
G
 
L
G
 
T
A
 
P
E
 
E
T
|
T
K
 
T
H
 
H
I
 
I
V
 
I
N
 
N
K
 
R
A
 
E
V
 
V
L
 
I
E
 
D
A
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
P
D
 
K
G
 
G
I
 
V
L
 
L
I
 
I
N
 
N
V
x
I
A
x
G
R
|
R
G
 
G
S
 
P
L
 
H
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
P
A
 
E
L
 
L
I
 
V
E
 
S
A
 
A
L
 
L
Q
 
V
T
 
E
G
 
G
K
 
R
I
 
L
L
 
G
A
 
G
A
|
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
E
 
E
F
 
R
E
|
E
P
 
P
K
 
E
V
 
V
P
 
P
Q
 
E
A
 
K
L
 
L
I
 
F
D
 
G
C
 
L
Q
 
E
N
 
N
T
 
V
V
 
V
L
 
L
L
 
L
P
 
P
H
|
H
V
 
V
G
|
G
S
 
S
A
 
G
T
 
T
H
 
V
Y
 
E
T
 
T
R
 
R
Q
 
K
A
 
V
M
 
M
A
 
A
Q
 
D
L
 
L
V
 
V
I
 
V
D
 
G
N
 
N
V
 
L
A
 
E
S
 
A
W
 
H
T
 
F
S
 
S
G
 
G
K
 
K
G
 
P
P
 
L
L
 
L
T
 
T
P
 
P
V
 
V

5aovA Ternary crystal structure of pyrococcus furiosus glyoxylate hydroxypyruvate reductase in presence of glyoxylate (see paper)
39% identity, 80% coverage: 58:314/323 of query aligns to 56:321/334 of 5aovA

query
sites
5aovA
K
 
R
V
 
I
T
 
D
A
 
Q
D
 
E
F
 
V
I
 
F
A
 
E
Q
 
N
F
 
A
P
 
P
N
 
R
L
 
L
E
 
R
A
 
I
I
 
V
F
 
A
H
 
N
M
x
Y
G
x
A
V
|
V
G
|
G
Y
 
Y
D
 
D
L
 
N
V
 
I
D
 
D
A
 
V
A
 
E
Y
 
E
A
 
A
G
 
T
A
 
R
H
 
R
G
 
G
I
 
I
I
 
Y
V
 
V
T
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
D
V
 
V
L
|
L
D
 
T
E
 
N
D
 
A
V
x
T
A
 
A
D
 
D
I
 
H
A
 
A
M
 
F
A
 
A
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
A
A
 
T
T
 
A
R
 
R
Q
 
H
I
 
V
P
 
V
Q
 
K
S
 
G
D
 
D
A
 
K
F
 
F
L
 
V
R
 
R
S
 
S
G
 
G
K
 
E
W
 
W
L
 
K
T
 
R
G
 
K
-
 
G
-
 
I
-
 
A
-
 
W
-
 
H
-
 
P
T
 
K
Y
 
W
P
 
F
L
 
L
T
 
G
A
 
Y
T
 
E
L
 
L
R
 
Y
G
 
G
R
 
K
T
 
T
M
 
I
G
 
G
I
 
I
L
 
V
G
 
G
L
x
F
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
K
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
R
R
 
R
A
 
A
E
 
K
A
 
G
F
 
F
D
 
N
L
 
M
K
 
R
I
 
I
A
 
L
Y
 
Y
H
 
Y
G
x
S
R
|
R
T
 
T
Q
 
R
Q
 
K
A
 
S
G
 
Q
V
 
A
A
 
E
Y
 
K
P
 
E
Y
 
L
-
 
G
-
 
A
-
 
E
Y
 
Y
A
 
R
T
 
P
P
 
L
I
 
E
A
 
E
L
 
V
A
 
L
A
 
K
A
 
E
C
 
S
D
 
D
V
 
F
L
 
V
M
 
I
V
 
L
V
x
A
A
x
V
P
|
P
G
 
L
G
 
T
A
 
K
E
 
E
T
|
T
K
 
M
H
 
Y
I
 
M
V
 
I
N
 
N
K
 
E
A
 
E
V
 
R
L
 
L
E
 
K
A
 
L
L
 
M
G
 
K
P
 
P
D
 
T
G
 
A
I
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
V
x
I
A
|
A
R
|
R
G
 
G
S
 
K
L
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
T
A
 
K
A
 
A
L
 
L
I
 
I
E
 
K
A
 
A
L
 
L
Q
 
K
T
 
E
G
 
G
K
 
W
I
 
I
L
 
A
A
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
E
 
E
F
 
E
E
|
E
P
 
P
K
 
Y
V
 
Y
P
 
N
Q
 
E
A
 
E
L
 
L
I
 
F
D
 
S
C
 
L
Q
 
D
N
 
N
T
 
V
V
 
V
L
 
L
L
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
I
G
|
G
S
 
S
A
 
A
T
 
T
H
 
F
Y
 
E
T
 
A
R
 
R
Q
 
E
A
 
A
M
 
M
A
 
A
Q
 
E
L
 
L
V
 
V
I
 
A
D
 
R
N
 
N
V
 
L
A
 
I
S
 
A
W
 
F
T
 
K
S
 
R
G
 
G
K
 
E
G
 
I
P
 
P
L
 
P
T
 
T
P
 
L
V
 
V

Sites not aligning to the query:

6biiA Crystal structure of pyrococcus yayanosii glyoxylate hydroxypyruvate reductase in complex with NADP and malonate (re-refinement of 5aow) (see paper)
41% identity, 80% coverage: 58:314/323 of query aligns to 55:320/332 of 6biiA

query
sites
6biiA
K
 
K
V
 
I
T
 
D
A
 
R
D
 
E
F
 
V
I
 
F
A
 
D
Q
 
A
F
 
A
P
 
P
N
 
R
L
 
L
E
 
R
A
 
I
I
 
V
F
 
A
H
 
N
M
 
Y
G
 
A
V
|
V
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
L
 
N
V
 
I
D
 
D
A
 
I
A
 
E
Y
 
E
A
 
A
G
 
T
A
 
K
H
 
R
G
 
G
I
 
I
I
 
Y
V
 
V
T
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
D
V
 
V
L
|
L
D
 
T
E
 
D
D
 
A
V
x
T
A
 
A
D
 
D
I
 
L
A
 
A
M
 
W
A
 
A
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
A
A
 
A
T
 
A
R
 
R
Q
 
H
I
 
V
P
 
V
Q
 
K
S
 
G
D
 
D
A
 
K
F
 
F
L
 
V
R
 
R
S
 
S
G
 
G
K
 
E
W
 
W
L
 
K
T
 
R
-
 
R
-
 
G
-
 
I
G
 
A
T
 
W
Y
 
H
P
 
P
-
 
K
-
 
M
-
 
F
L
 
L
T
 
G
A
 
Y
T
 
D
L
 
V
R
 
Y
G
 
G
R
 
K
T
 
T
M
 
I
G
 
G
I
 
I
L
 
V
G
|
G
L
x
F
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
K
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
K
R
 
R
A
 
A
E
 
K
A
 
G
F
 
F
D
 
G
L
 
M
K
 
R
I
 
I
A
 
L
Y
 
Y
H
 
T
G
x
A
R
|
R
T
x
S
Q
 
R
Q
x
K
A
 
P
G
 
E
V
 
A
A
 
E
Y
 
K
P
 
E
Y
 
L
Y
 
G
A
 
A
-
 
E
-
 
F
T
 
K
P
 
P
I
 
L
A
 
E
-
 
E
L
 
L
A
 
L
A
 
R
A
 
E
C
 
S
D
 
D
V
 
F
L
 
V
M
 
V
V
 
L
V
 
A
A
x
V
P
|
P
G
 
L
G
 
T
A
 
K
E
|
E
T
|
T
K
 
Y
H
 
H
I
 
M
V
 
I
N
 
N
K
 
E
A
 
E
V
 
R
L
 
L
E
 
R
A
 
L
L
 
M
G
 
K
P
 
P
D
 
T
G
 
A
I
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
V
|
V
A
|
A
R
|
R
G
 
G
S
 
K
L
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
T
A
 
K
A
 
A
L
 
L
I
 
I
E
 
R
A
 
A
L
 
L
Q
 
K
T
 
E
G
 
G
K
 
W
I
 
I
L
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
E
 
E
F
 
E
E
|
E
P
 
P
K
 
Y
V
 
Y
P
 
D
Q
 
E
A
 
E
L
 
L
I
 
F
D
 
A
C
 
L
Q
 
D
N
 
N
T
 
V
V
 
V
L
 
L
L
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
I
G
|
G
S
 
S
A
 
A
T
 
T
H
 
F
Y
 
G
T
 
A
R
 
R
Q
 
E
A
 
G
M
 
M
A
 
A
Q
 
E
L
 
L
V
 
V
I
 
A
D
 
K
N
 
N
V
 
L
A
 
I
S
 
A
W
 
F
T
 
K
S
 
N
G
 
G
K
 
E
G
 
V
P
 
P
L
 
P
T
 
T
P
 
L
V
 
V

O58320 Glyoxylate reductase; EC 1.1.1.26 from Pyrococcus horikoshii (strain ATCC 700860 / DSM 12428 / JCM 9974 / NBRC 100139 / OT-3)
40% identity, 80% coverage: 58:314/323 of query aligns to 56:321/334 of O58320

query
sites
O58320
K
 
R
V
 
I
T
 
D
A
 
K
D
 
E
F
 
V
I
 
F
A
 
E
Q
 
N
F
 
A
P
 
P
N
 
K
L
 
L
E
 
R
A
 
I
I
 
V
F
 
A
H
 
N
M
 
Y
G
 
A
V
 
V
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
L
 
N
V
 
I
D
 
D
A
 
I
A
 
E
Y
 
E
A
 
A
G
 
T
A
 
K
H
 
R
G
 
G
I
 
I
I
 
Y
V
 
V
T
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
D
V
 
V
L
 
L
D
 
T
E
 
D
D
 
A
V
 
T
A
 
A
D
 
D
I
 
L
A
 
A
M
 
F
A
 
A
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
A
A
 
T
T
 
A
R
 
R
Q
 
H
I
 
V
P
 
V
Q
 
K
S
 
G
D
 
D
A
 
R
F
 
F
L
 
V
R
 
R
S
 
S
G
 
G
K
 
E
W
 
W
L
 
K
T
 
K
G
 
R
-
 
G
-
 
V
-
 
A
-
 
W
-
 
H
-
 
P
T
 
K
Y
 
W
P
 
F
L
 
L
T
 
G
A
 
Y
T
 
D
L
 
V
R
 
Y
G
 
G
R
 
K
T
 
T
M
 
I
G
 
G
I
 
I
L
 
I
G
 
G
L
|
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
K
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
K
R
 
R
A
 
A
E
 
K
A
 
G
F
 
F
D
 
N
L
 
M
K
 
R
I
 
I
A
 
L
Y
 
Y
H
 
Y
G
x
S
R
|
R
T
|
T
Q
 
R
Q
 
K
A
 
E
G
 
E
V
 
V
A
 
E
Y
 
R
P
 
E
Y
 
L
Y
 
N
A
 
A
-
 
E
-
 
F
T
 
K
P
 
P
I
 
L
A
 
E
-
 
D
L
 
L
A
 
L
A
 
R
A
 
E
C
 
S
D
 
D
V
 
F
L
 
V
M
 
V
V
 
L
V
 
A
A
 
V
P
 
P
G
 
L
G
 
T
A
 
R
E
 
E
T
 
T
K
 
Y
H
 
H
I
 
L
V
 
I
N
 
N
K
 
E
A
 
E
V
 
R
L
 
L
E
 
K
A
 
L
L
 
M
G
 
K
P
 
K
D
 
T
G
 
A
I
 
I
L
 
L
I
 
I
N
 
N
V
x
I
A
|
A
R
|
R
G
 
G
S
 
K
L
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
T
A
 
N
A
 
A
L
 
L
I
 
V
E
 
K
A
 
A
L
 
L
Q
 
K
T
 
E
G
 
G
K
 
W
I
 
I
L
 
A
A
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
E
F
 
E
E
 
E
P
 
P
K
 
Y
V
 
Y
P
 
N
Q
 
E
A
 
E
L
 
L
I
 
F
D
 
K
C
 
L
Q
 
D
N
 
N
T
 
V
V
 
V
L
 
L
L
 
T
P
 
P
H
|
H
V
x
I
G
|
G
S
 
S
A
 
A
T
 
S
H
 
F
Y
 
G
T
 
A
R
 
R
Q
 
E
A
 
G
M
 
M
A
 
A
Q
 
E
L
 
L
V
 
V
I
 
A
D
 
K
N
 
N
V
 
L
A
 
I
S
 
A
W
 
F
T
 
K
S
 
R
G
 
G
K
 
E
G
 
I
P
 
P
L
 
P
T
 
T
P
 
L
V
 
V

2dbqA Crystal structure of glyoxylate reductase (ph0597) from pyrococcus horikoshii ot3, complexed with NADP (i41) (see paper)
40% identity, 80% coverage: 58:314/323 of query aligns to 56:321/333 of 2dbqA

query
sites
2dbqA
K
 
R
V
 
I
T
 
D
A
 
K
D
 
E
F
 
V
I
 
F
A
 
E
Q
 
N
F
 
A
P
 
P
N
 
K
L
 
L
E
 
R
A
 
I
I
 
V
F
 
A
H
 
N
M
 
Y
G
 
A
V
|
V
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
L
 
N
V
 
I
D
 
D
A
 
I
A
 
E
Y
 
E
A
 
A
G
 
T
A
 
K
H
 
R
G
 
G
I
 
I
I
 
Y
V
 
V
T
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
D
V
 
V
L
|
L
D
 
T
E
 
D
D
 
A
V
x
T
A
 
A
D
 
D
I
 
L
A
 
A
M
 
F
A
 
A
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
A
A
 
T
T
 
A
R
 
R
Q
 
H
I
 
V
P
 
V
Q
 
K
S
 
G
D
 
D
A
 
R
F
 
F
L
 
V
R
 
R
S
 
S
G
 
G
K
 
E
W
 
W
L
 
K
T
 
K
G
 
R
-
 
G
-
 
V
-
 
A
-
 
W
-
 
H
-
 
P
T
 
K
Y
 
W
P
 
F
L
 
L
T
 
G
A
 
Y
T
 
D
L
 
V
R
 
Y
G
 
G
R
 
K
T
 
T
M
 
I
G
 
G
I
 
I
L
 
I
G
 
G
L
|
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
K
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
K
R
 
R
A
 
A
E
 
K
A
 
G
F
 
F
D
 
N
L
 
M
K
 
R
I
 
I
A
 
L
Y
 
Y
H
 
Y
G
x
S
R
|
R
T
|
T
Q
 
R
Q
 
K
A
 
E
G
 
E
V
 
V
A
 
E
Y
 
R
P
 
E
Y
 
L
Y
 
N
A
 
A
-
 
E
-
 
F
T
 
K
P
 
P
I
 
L
A
 
E
-
 
D
L
 
L
A
 
L
A
 
R
A
 
E
C
 
S
D
 
D
V
 
F
L
 
V
M
 
V
V
 
L
V
x
A
A
x
V
P
|
P
G
 
L
G
 
T
A
 
R
E
 
E
T
|
T
K
 
Y
H
 
H
I
 
L
V
 
I
N
 
N
K
 
E
A
 
E
V
 
R
L
 
L
E
 
K
A
 
L
L
 
M
G
 
K
P
 
K
D
 
T
G
 
A
I
 
I
L
 
L
I
 
I
N
 
N
V
x
I
A
|
A
R
|
R
G
 
G
S
 
K
L
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
T
A
 
N
A
 
A
L
 
L
I
 
V
E
 
K
A
 
A
L
 
L
Q
 
K
T
 
E
G
 
G
K
 
W
I
 
I
L
 
A
A
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
E
 
E
F
 
E
E
|
E
P
 
P
K
 
Y
V
 
Y
P
 
N
Q
 
E
A
 
E
L
 
L
I
 
F
D
 
K
C
 
L
Q
 
D
N
 
N
T
 
V
V
 
V
L
 
L
L
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
I
G
|
G
S
 
S
A
 
A
T
 
S
H
 
F
Y
 
G
T
 
A
R
 
R
Q
 
E
A
 
G
M
 
M
A
 
A
Q
 
E
L
 
L
V
 
V
I
 
A
D
 
K
N
 
N
V
 
L
A
 
I
S
 
A
W
 
F
T
 
K
S
 
R
G
 
G
K
 
E
G
 
I
P
 
P
L
 
P
T
 
T
P
 
L
V
 
V

O43175 D-3-phosphoglycerate dehydrogenase; 3-PGDH; 2-oxoglutarate reductase; Malate dehydrogenase; EC 1.1.1.95; EC 1.1.1.399; EC 1.1.1.37 from Homo sapiens (Human) (see 3 papers)
33% identity, 78% coverage: 58:308/323 of query aligns to 58:310/533 of O43175

query
sites
O43175
K
 
K
V
 
V
T
 
T
A
 
A
D
 
D
F
 
V
I
 
I
A
 
N
Q
 
A
F
 
A
P
 
E
N
 
K
L
 
L
E
 
Q
A
 
V
I
 
V
F
 
G
H
 
R
M
 
A
G
 
G
V
x
T
G
 
G
Y
 
V
D
 
D
L
 
N
V
 
V
D
 
D
A
 
L
A
 
E
Y
 
A
A
 
A
G
 
T
A
 
R
H
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
L
V
 
V
T
 
M
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
N
V
 
G
L
 
N
D
 
S
E
 
L
D
 
S
V
 
A
A
 
A
D
 
E
I
 
L
A
 
T
M
 
C
A
 
G
L
 
M
L
 
I
L
 
M
D
 
C
A
 
L
T
 
A
R
 
R
Q
 
Q
I
 
I
P
 
P
Q
 
Q
S
 
A
D
 
T
A
 
A
F
 
S
L
 
M
R
 
K
S
 
D
G
 
G
K
 
K
W
 
W
L
 
E
T
x
R
G
 
K
T
 
K
Y
 
F
P
 
-
L
 
M
T
 
G
A
 
T
T
 
E
L
 
L
R
 
N
G
 
G
R
 
K
T
 
T
M
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
K
 
R
A
 
E
I
 
V
A
 
A
K
 
T
R
 
R
A
 
M
E
 
Q
A
 
S
F
 
F
D
 
G
L
 
M
K
 
K
I
 
T
A
 
I
Y
 
G
H
 
Y
G
x
D
R
 
P
T
 
I
Q
 
I
Q
 
S
A
 
P
G
 
E
V
 
V
A
 
S
Y
 
A
P
 
S
Y
 
F
Y
 
G
A
 
V
T
 
Q
P
 
Q
I
 
L
A
 
P
L
 
L
A
 
E
A
 
E
A
 
I
-
 
W
-
 
P
-
 
L
C
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
M
 
T
V
 
V
V
 
H
A
x
T
P
 
P
G
 
L
G
 
L
A
 
P
E
 
S
T
 
T
K
 
T
H
 
G
I
 
L
V
 
L
N
 
N
K
 
D
A
 
N
V
 
T
L
 
F
E
 
A
A
 
Q
L
 
C
G
 
K
P
 
K
D
 
G
G
 
V
I
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
V
x
C
A
|
A
R
|
R
G
 
G
S
 
G
L
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
L
E
 
R
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
T
 
S
G
 
G
K
 
Q
I
 
C
L
 
A
A
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
|
D
V
|
V
F
 
F
E
 
T
F
 
E
E
 
E
P
 
P
K
 
P
V
 
R
P
 
D
Q
 
R
A
 
A
L
 
L
I
 
V
D
 
D
C
 
H
Q
 
E
N
 
N
T
 
V
V
 
I
L
 
S
L
 
C
P
 
P
H
|
H
V
x
L
G
|
G
S
x
A
A
 
S
T
 
T
H
 
K
Y
 
E
T
 
A
R
 
Q
Q
 
S
A
 
R
M
 
C
A
 
G
Q
 
E
L
 
E
V
 
I
I
 
A
D
 
V
N
 
Q
V
 
F
A
 
V
S
 
D
W
 
M
T
 
V
S
 
K
G
 
G
K
 
K

Sites not aligning to the query:

6rj3A Crystal structure of phgdh in complex with compound 15 (see paper)
35% identity, 71% coverage: 58:287/323 of query aligns to 52:283/297 of 6rj3A

query
sites
6rj3A
K
 
K
V
 
V
T
 
T
A
 
A
D
 
D
F
 
V
I
 
I
A
 
N
Q
 
A
F
 
A
P
 
E
N
 
K
L
 
L
E
 
Q
A
 
V
I
 
V
F
 
G
H
 
R
M
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
Y
 
V
D
 
D
L
 
N
V
 
V
D
 
D
A
 
L
A
 
E
Y
 
A
A
 
A
G
 
T
A
 
R
H
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
L
V
 
V
T
 
M
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
N
V
 
G
L
 
N
D
 
S
E
 
L
D
 
S
V
 
A
A
 
A
D
 
E
I
 
L
A
 
T
M
 
C
A
 
G
L
 
M
L
 
I
L
 
M
D
 
C
A
 
L
T
 
A
R
 
R
Q
 
Q
I
 
I
P
 
P
Q
 
Q
S
 
A
D
 
T
A
 
A
F
 
S
L
 
M
R
 
K
S
 
D
G
 
G
K
 
K
W
 
W
L
 
E
T
 
R
G
 
K
T
 
K
Y
 
F
P
 
-
L
 
M
T
 
G
A
 
T
T
 
E
L
 
L
R
 
N
G
 
G
R
 
K
T
 
T
M
 
L
G
 
G
I
 
I
L
|
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
I
G
 
G
K
 
R
A
 
E
I
 
V
A
 
A
K
 
T
R
 
R
A
 
M
E
 
Q
A
 
S
F
 
F
D
 
G
L
 
M
K
 
K
I
 
T
A
 
I
Y
 
G
H
x
Y
G
x
D
R
x
P
T
x
I
Q
x
I
Q
 
S
A
 
P
G
 
E
V
 
V
A
 
S
Y
 
A
P
 
S
Y
 
F
Y
 
G
A
 
V
T
 
Q
P
 
Q
I
 
L
A
 
P
L
 
L
A
 
E
A
 
E
A
 
I
-
 
W
-
 
P
-
 
L
C
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
M
 
T
V
 
V
V
x
H
A
x
T
P
|
P
G
 
L
G
 
L
A
 
P
E
 
S
T
 
T
K
 
T
H
 
G
I
x
L
V
 
L
N
 
N
K
 
D
A
 
N
V
 
T
L
 
F
E
 
A
A
 
Q
L
 
C
G
 
K
P
 
K
D
 
G
G
 
V
I
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
V
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
S
 
G
L
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
L
E
 
R
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
T
 
S
G
 
G
K
 
Q
I
 
C
L
 
A
A
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
T
F
 
E
E
 
E
P
 
P
K
 
P
V
 
R
P
 
D
Q
 
R
A
 
A
L
 
L
I
 
V
D
 
D
C
 
H
Q
 
E
N
 
N
T
 
V
V
 
I
L
 
S
L
 
C
P
 
P
H
 
H
V
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
S
T
 
T
H
 
K

6rj2A Crystal structure of phgdh in complex with compound 40 (see paper)
35% identity, 71% coverage: 58:287/323 of query aligns to 50:281/299 of 6rj2A

query
sites
6rj2A
K
 
K
V
 
V
T
 
T
A
 
A
D
 
D
F
 
V
I
 
I
A
 
N
Q
 
A
F
 
A
P
 
E
N
 
K
L
 
L
E
 
Q
A
 
V
I
 
V
F
 
G
H
 
R
M
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
Y
 
V
D
 
D
L
 
N
V
 
V
D
 
D
A
 
L
A
 
E
Y
 
A
A
 
A
G
 
T
A
 
R
H
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
L
V
 
V
T
 
M
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
N
V
 
G
L
 
N
D
 
S
E
 
L
D
 
S
V
 
A
A
 
A
D
 
E
I
 
L
A
 
T
M
 
C
A
 
G
L
 
M
L
 
I
L
 
M
D
 
C
A
 
L
T
 
A
R
 
R
Q
 
Q
I
 
I
P
 
P
Q
 
Q
S
 
A
D
 
T
A
 
A
F
 
S
L
 
M
R
 
K
S
 
D
G
 
G
K
 
K
W
 
W
L
 
E
T
 
R
G
 
K
T
 
K
Y
 
F
P
 
-
L
 
M
T
 
G
A
 
T
T
 
E
L
 
L
R
 
N
G
 
G
R
 
K
T
 
T
M
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
|
G
R
 
R
I
|
I
G
 
G
K
 
R
A
 
E
I
 
V
A
 
A
K
 
T
R
 
R
A
 
M
E
 
Q
A
 
S
F
 
F
D
 
G
L
 
M
K
 
K
I
 
T
A
 
I
Y
 
G
H
x
Y
G
x
D
R
x
P
T
x
I
Q
x
I
Q
 
S
A
 
P
G
 
E
V
 
V
A
 
S
Y
 
A
P
 
S
Y
 
F
Y
 
G
A
 
V
T
 
Q
P
 
Q
I
 
L
A
 
P
L
 
L
A
 
E
A
 
E
A
 
I
-
 
W
-
 
P
-
 
L
C
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
M
 
T
V
 
V
V
x
H
A
x
T
P
 
P
G
 
L
G
 
L
A
 
P
E
 
S
T
 
T
K
 
T
H
 
G
I
x
L
V
 
L
N
 
N
K
 
D
A
 
N
V
 
T
L
 
F
E
 
A
A
 
Q
L
 
C
G
 
K
P
 
K
D
 
G
G
 
V
I
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
V
 
C
A
 
A
R
|
R
G
 
G
S
 
G
L
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
L
E
 
R
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
T
 
S
G
 
G
K
 
Q
I
 
C
L
 
A
A
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
T
F
 
E
E
 
E
P
 
P
K
 
P
V
 
R
P
 
D
Q
 
R
A
 
A
L
 
L
I
 
V
D
 
D
C
 
H
Q
 
E
N
 
N
T
 
V
V
 
I
L
 
S
L
 
C
P
 
P
H
 
H
V
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
S
T
 
T
H
 
K

6cwaA Crystal structure phgdh in complex with nadh and 3-phosphoglycerate at 1.77 a resolution (see paper)
35% identity, 71% coverage: 58:287/323 of query aligns to 52:283/299 of 6cwaA

query
sites
6cwaA
K
 
K
V
 
V
T
 
T
A
 
A
D
 
D
F
 
V
I
 
I
A
 
N
Q
 
A
F
 
A
P
 
E
N
 
K
L
 
L
E
 
Q
A
 
V
I
 
V
F
 
G
H
 
R
M
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
Y
 
V
D
 
D
L
 
N
V
 
V
D
 
D
A
 
L
A
 
E
Y
 
A
A
 
A
G
 
T
A
 
R
H
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
L
V
 
V
T
 
M
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
N
V
 
G
L
x
N
D
 
S
E
 
L
D
 
S
V
x
A
A
 
A
D
 
E
I
 
L
A
 
T
M
 
C
A
 
G
L
 
M
L
 
I
L
 
M
D
 
C
A
 
L
T
 
A
R
 
R
Q
 
Q
I
 
I
P
 
P
Q
 
Q
S
 
A
D
 
T
A
 
A
F
 
S
L
 
M
R
 
K
S
 
D
G
 
G
K
 
K
W
 
W
L
 
E
T
 
R
G
 
K
T
 
K
Y
 
F
P
 
-
L
 
M
T
 
G
A
 
T
T
 
E
L
 
L
R
 
N
G
 
G
R
 
K
T
 
T
M
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
K
 
R
A
 
E
I
 
V
A
 
A
K
 
T
R
 
R
A
 
M
E
 
Q
A
 
S
F
 
F
D
 
G
L
 
M
K
 
K
I
 
T
A
 
I
Y
 
G
H
x
Y
G
x
D
R
x
P
T
x
I
Q
 
I
Q
 
S
A
 
P
G
 
E
V
 
V
A
 
S
Y
 
A
P
 
S
Y
 
F
Y
 
G
A
 
V
T
 
Q
P
 
Q
I
 
L
A
 
P
L
 
L
A
 
E
A
 
E
A
 
I
-
 
W
-
 
P
-
 
L
C
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
M
 
T
V
 
V
V
x
H
A
x
T
P
|
P
G
 
L
G
 
L
A
 
P
E
 
S
T
|
T
K
 
T
H
 
G
I
 
L
V
 
L
N
 
N
K
 
D
A
 
N
V
 
T
L
 
F
E
 
A
A
 
Q
L
 
C
G
 
K
P
 
K
D
 
G
G
 
V
I
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
V
x
C
A
|
A
R
|
R
G
 
G
S
 
G
L
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
L
E
 
R
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
T
 
S
G
 
G
K
 
Q
I
 
C
L
 
A
A
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
T
F
 
E
E
 
E
P
 
P
K
 
P
V
 
R
P
 
D
Q
 
R
A
 
A
L
 
L
I
 
V
D
 
D
C
 
H
Q
 
E
N
 
N
T
 
V
V
 
I
L
 
S
L
 
C
P
 
P
H
|
H
V
 
L
G
|
G
S
 
A
A
 
S
T
 
T
H
 
K

7ewhA Crystal structure of human phgdh in complex with homoharringtonine (see paper)
35% identity, 71% coverage: 58:287/323 of query aligns to 53:284/302 of 7ewhA

query
sites
7ewhA
K
 
K
V
 
V
T
 
T
A
 
A
D
 
D
F
 
V
I
 
I
A
 
N
Q
 
A
F
 
A
P
 
E
N
 
K
L
 
L
E
 
Q
A
 
V
I
 
V
F
 
G
H
 
R
M
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
Y
 
V
D
 
D
L
 
N
V
 
V
D
 
D
A
 
L
A
 
E
Y
 
A
A
 
A
G
 
T
A
 
R
H
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
L
V
 
V
T
 
M
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
N
V
 
G
L
 
N
D
 
S
E
 
L
D
 
S
V
 
A
A
 
A
D
 
E
I
 
L
A
 
T
M
 
C
A
 
G
L
 
M
L
 
I
L
 
M
D
 
C
A
 
L
T
 
A
R
 
R
Q
 
Q
I
 
I
P
 
P
Q
 
Q
S
 
A
D
 
T
A
 
A
F
 
S
L
 
M
R
 
K
S
 
D
G
 
G
K
 
K
W
 
W
L
 
E
T
 
R
G
 
K
T
 
K
Y
 
F
P
 
-
L
 
M
T
 
G
A
 
T
T
 
E
L
 
L
R
 
N
G
 
G
R
 
K
T
 
T
M
 
L
G
 
G
I
 
I
L
|
L
G
|
G
L
|
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
|
G
K
 
R
A
 
E
I
 
V
A
 
A
K
 
T
R
 
R
A
 
M
E
 
Q
A
 
S
F
 
F
D
 
G
L
 
M
K
 
K
I
 
T
A
 
I
Y
 
G
H
 
Y
G
x
D
R
 
P
T
 
I
Q
 
I
Q
 
S
A
 
P
G
 
E
V
 
V
A
 
S
Y
 
A
P
 
S
Y
 
F
Y
 
G
A
 
V
T
 
Q
P
 
Q
I
 
L
A
 
P
L
 
L
A
 
E
A
 
E
A
 
I
-
 
W
-
 
P
-
 
L
C
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
M
 
T
V
 
V
V
x
H
A
x
T
P
|
P
G
 
L
G
 
L
A
 
P
E
 
S
T
 
T
K
 
T
H
 
G
I
 
L
V
 
L
N
 
N
K
 
D
A
 
N
V
 
T
L
 
F
E
 
A
A
 
Q
L
 
C
G
 
K
P
 
K
D
 
G
G
 
V
I
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
V
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
S
 
G
L
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
L
E
 
R
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
T
 
S
G
 
G
K
 
Q
I
 
C
L
 
A
A
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
T
F
 
E
E
 
E
P
 
P
K
 
P
V
 
R
P
 
D
Q
 
R
A
 
A
L
 
L
I
 
V
D
 
D
C
 
H
Q
 
E
N
 
N
T
 
V
V
 
I
L
 
S
L
 
C
P
 
P
H
 
H
V
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
S
T
 
T
H
 
K

6rihA Crystal structure of phgdh in complex with compound 9 (see paper)
35% identity, 71% coverage: 58:287/323 of query aligns to 53:284/302 of 6rihA

query
sites
6rihA
K
 
K
V
 
V
T
 
T
A
 
A
D
 
D
F
 
V
I
 
I
A
 
N
Q
 
A
F
 
A
P
 
E
N
 
K
L
 
L
E
 
Q
A
 
V
I
 
V
F
 
G
H
 
R
M
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
Y
 
V
D
 
D
L
 
N
V
 
V
D
 
D
A
 
L
A
 
E
Y
 
A
A
 
A
G
 
T
A
 
R
H
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
L
V
 
V
T
 
M
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
N
V
 
G
L
 
N
D
 
S
E
 
L
D
 
S
V
 
A
A
 
A
D
 
E
I
 
L
A
 
T
M
 
C
A
 
G
L
 
M
L
 
I
L
 
M
D
 
C
A
 
L
T
 
A
R
 
R
Q
 
Q
I
 
I
P
 
P
Q
 
Q
S
 
A
D
 
T
A
 
A
F
 
S
L
 
M
R
 
K
S
 
D
G
 
G
K
 
K
W
 
W
L
 
E
T
 
R
G
 
K
T
 
K
Y
 
F
P
 
-
L
 
M
T
 
G
A
 
T
T
 
E
L
 
L
R
 
N
G
 
G
R
 
K
T
 
T
M
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
|
G
R
 
R
I
 
I
G
 
G
K
 
R
A
 
E
I
 
V
A
 
A
K
 
T
R
 
R
A
 
M
E
 
Q
A
 
S
F
 
F
D
 
G
L
 
M
K
 
K
I
 
T
A
 
I
Y
 
G
H
x
Y
G
x
D
R
x
P
T
x
I
Q
x
I
Q
 
S
A
 
P
G
 
E
V
 
V
A
 
S
Y
 
A
P
 
S
Y
 
F
Y
 
G
A
 
V
T
 
Q
P
 
Q
I
 
L
A
 
P
L
 
L
A
 
E
A
 
E
A
 
I
-
 
W
-
 
P
-
 
L
C
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
M
 
T
V
 
V
V
 
H
A
x
T
P
|
P
G
 
L
G
 
L
A
 
P
E
 
S
T
 
T
K
 
T
H
 
G
I
x
L
V
 
L
N
 
N
K
 
D
A
 
N
V
 
T
L
 
F
E
 
A
A
 
Q
L
 
C
G
 
K
P
 
K
D
 
G
G
 
V
I
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
V
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
S
 
G
L
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
L
E
 
R
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
T
 
S
G
 
G
K
 
Q
I
 
C
L
 
A
A
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
T
F
 
E
E
 
E
P
 
P
K
 
P
V
 
R
P
 
D
Q
 
R
A
 
A
L
 
L
I
 
V
D
 
D
C
 
H
Q
 
E
N
 
N
T
 
V
V
 
I
L
 
S
L
 
C
P
 
P
H
 
H
V
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
S
T
 
T
H
 
K

7dkmA Phgdh covalently linked to oridonin (see paper)
35% identity, 71% coverage: 58:287/323 of query aligns to 54:285/306 of 7dkmA

query
sites
7dkmA
K
 
K
V
 
V
T
 
T
A
 
A
D
 
D
F
 
V
I
 
I
A
 
N
Q
 
A
F
 
A
P
 
E
N
 
K
L
 
L
E
 
Q
A
 
V
I
 
V
F
 
G
H
 
R
M
 
A
G
 
G
V
x
T
G
 
G
Y
 
V
D
 
D
L
 
N
V
 
V
D
 
D
A
 
L
A
 
E
Y
 
A
A
 
A
G
 
T
A
 
R
H
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
L
V
 
V
T
 
M
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
N
V
 
G
L
 
N
D
 
S
E
 
L
D
 
S
V
x
A
A
 
A
D
 
E
I
 
L
A
 
T
M
 
C
A
 
G
L
 
M
L
 
I
L
 
M
D
 
C
A
 
L
T
 
A
R
 
R
Q
 
Q
I
 
I
P
 
P
Q
 
Q
S
 
A
D
 
T
A
 
A
F
 
S
L
 
M
R
 
K
S
 
D
G
 
G
K
 
K
W
 
W
L
 
E
T
 
R
G
 
K
T
 
K
Y
 
F
P
 
-
L
 
M
T
 
G
A
 
T
T
 
E
L
 
L
R
 
N
G
 
G
R
 
K
T
 
T
M
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
L
G
|
G
L
 
L
G
 
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
K
 
R
A
 
E
I
 
V
A
 
A
K
 
T
R
 
R
A
 
M
E
 
Q
A
 
S
F
 
F
D
 
G
L
 
M
K
 
K
I
 
T
A
 
I
Y
 
G
H
x
Y
G
x
D
R
x
P
T
x
I
Q
 
I
Q
 
S
A
 
P
G
 
E
V
 
V
A
 
S
Y
 
A
P
 
S
Y
 
F
Y
 
G
A
 
V
T
 
Q
P
 
Q
I
 
L
A
 
P
L
 
L
A
 
E
A
 
E
A
 
I
-
 
W
-
 
P
-
 
L
C
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
M
 
T
V
 
V
V
x
H
A
x
T
P
|
P
G
 
L
G
 
L
A
 
P
E
 
S
T
|
T
K
 
T
H
 
G
I
 
L
V
 
L
N
 
N
K
 
D
A
 
N
V
 
T
L
 
F
E
 
A
A
 
Q
L
 
C
G
 
K
P
 
K
D
 
G
G
 
V
I
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
V
x
C
A
|
A
R
|
R
G
 
G
S
 
G
L
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
L
E
 
R
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
T
 
S
G
 
G
K
 
Q
I
 
C
L
 
A
A
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
T
F
 
E
E
 
E
P
 
P
K
 
P
V
 
R
P
 
D
Q
 
R
A
 
A
L
 
L
I
 
V
D
 
D
C
 
H
Q
 
E
N
 
N
T
 
V
V
 
I
L
 
S
L
 
C
P
 
P
H
|
H
V
 
L
G
|
G
S
 
A
A
 
S
T
 
T
H
 
K

Sites not aligning to the query:

6plgA Crystal structure of human phgdh complexed with compound 15 (see paper)
35% identity, 71% coverage: 58:287/323 of query aligns to 53:284/303 of 6plgA

query
sites
6plgA
K
 
K
V
 
V
T
 
T
A
 
A
D
 
D
F
 
V
I
 
I
A
 
N
Q
 
A
F
 
A
P
 
E
N
 
K
L
 
L
E
 
Q
A
 
V
I
 
V
F
 
G
H
 
R
M
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
Y
 
V
D
 
D
L
 
N
V
 
V
D
 
D
A
 
L
A
 
E
Y
 
A
A
 
A
G
 
T
A
 
R
H
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
L
V
 
V
T
 
M
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
N
V
 
G
L
 
N
D
 
S
E
 
L
D
 
S
V
 
A
A
 
A
D
 
E
I
 
L
A
 
T
M
 
C
A
 
G
L
 
M
L
 
I
L
 
M
D
 
C
A
 
L
T
 
A
R
 
R
Q
 
Q
I
 
I
P
 
P
Q
 
Q
S
 
A
D
 
T
A
 
A
F
 
S
L
 
M
R
 
K
S
 
D
G
 
G
K
 
K
W
 
W
L
 
E
T
 
R
G
 
K
T
 
K
Y
 
F
P
 
-
L
 
M
T
 
G
A
 
T
T
 
E
L
 
L
R
 
N
G
 
G
R
 
K
T
 
T
M
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
|
G
R
|
R
I
 
I
G
 
G
K
 
R
A
 
E
I
 
V
A
 
A
K
 
T
R
 
R
A
 
M
E
 
Q
A
 
S
F
 
F
D
 
G
L
 
M
K
 
K
I
 
T
A
 
I
Y
 
G
H
 
Y
G
x
D
R
x
P
T
x
I
Q
x
I
Q
 
S
A
 
P
G
 
E
V
 
V
A
 
S
Y
 
A
P
 
S
Y
 
F
Y
 
G
A
 
V
T
 
Q
P
 
Q
I
 
L
A
 
P
L
 
L
A
 
E
A
 
E
A
 
I
-
 
W
-
 
P
-
 
L
C
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
M
 
T
V
 
V
V
x
H
A
x
T
P
 
P
G
 
L
G
x
L
A
 
P
E
 
S
T
 
T
K
 
T
H
 
G
I
 
L
V
 
L
N
 
N
K
 
D
A
 
N
V
 
T
L
 
F
E
 
A
A
 
Q
L
 
C
G
 
K
P
 
K
D
 
G
G
 
V
I
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
V
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
S
 
G
L
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
L
E
 
R
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
T
 
S
G
 
G
K
 
Q
I
 
C
L
 
A
A
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
T
F
 
E
E
 
E
P
 
P
K
 
P
V
 
R
P
 
D
Q
 
R
A
 
A
L
 
L
I
 
V
D
 
D
C
 
H
Q
 
E
N
 
N
T
 
V
V
 
I
L
 
S
L
 
C
P
 
P
H
 
H
V
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
S
T
 
T
H
 
K

6plfA Crystal structure of human phgdh complexed with compound 1 (see paper)
35% identity, 71% coverage: 58:287/323 of query aligns to 54:285/305 of 6plfA

query
sites
6plfA
K
 
K
V
 
V
T
 
T
A
 
A
D
 
D
F
 
V
I
 
I
A
 
N
Q
 
A
F
 
A
P
 
E
N
 
K
L
 
L
E
 
Q
A
 
V
I
 
V
F
 
G
H
 
R
M
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
Y
 
V
D
 
D
L
 
N
V
 
V
D
 
D
A
 
L
A
 
E
Y
 
A
A
 
A
G
 
T
A
 
R
H
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
L
V
 
V
T
 
M
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
N
V
 
G
L
 
N
D
 
S
E
 
L
D
 
S
V
 
A
A
 
A
D
 
E
I
 
L
A
 
T
M
 
C
A
 
G
L
 
M
L
 
I
L
 
M
D
 
C
A
 
L
T
 
A
R
 
R
Q
 
Q
I
 
I
P
 
P
Q
 
Q
S
 
A
D
 
T
A
 
A
F
 
S
L
 
M
R
 
K
S
 
D
G
 
G
K
 
K
W
 
W
L
 
E
T
 
R
G
 
K
T
 
K
Y
 
F
P
 
-
L
 
M
T
 
G
A
 
T
T
 
E
L
 
L
R
 
N
G
 
G
R
 
K
T
 
T
M
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
I
G
 
G
K
 
R
A
 
E
I
 
V
A
 
A
K
 
T
R
 
R
A
 
M
E
 
Q
A
 
S
F
 
F
D
 
G
L
 
M
K
 
K
I
 
T
A
 
I
Y
 
G
H
x
Y
G
x
D
R
x
P
T
 
I
Q
 
I
Q
 
S
A
 
P
G
 
E
V
 
V
A
 
S
Y
 
A
P
 
S
Y
 
F
Y
 
G
A
 
V
T
 
Q
P
 
Q
I
 
L
A
 
P
L
|
L
A
 
E
A
 
E
A
 
I
-
 
W
-
 
P
-
 
L
C
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
M
 
T
V
 
V
V
x
H
A
x
T
P
|
P
G
 
L
G
 
L
A
 
P
E
 
S
T
 
T
K
 
T
H
 
G
I
x
L
V
 
L
N
 
N
K
 
D
A
 
N
V
 
T
L
 
F
E
 
A
A
 
Q
L
 
C
G
 
K
P
 
K
D
 
G
G
 
V
I
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
V
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
S
 
G
L
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
L
E
 
R
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
T
 
S
G
 
G
K
 
Q
I
 
C
L
 
A
A
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
T
F
 
E
E
 
E
P
 
P
K
 
P
V
 
R
P
 
D
Q
 
R
A
 
A
L
 
L
I
 
V
D
 
D
C
 
H
Q
 
E
N
 
N
T
 
V
V
 
I
L
 
S
L
 
C
P
 
P
H
 
H
V
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
S
T
 
T
H
 
K

6rj5A Crystal structure of phgdh in complex with compound 39 (see paper)
35% identity, 71% coverage: 58:287/323 of query aligns to 53:284/301 of 6rj5A

query
sites
6rj5A
K
 
K
V
 
V
T
 
T
A
 
A
D
 
D
F
 
V
I
 
I
A
 
N
Q
 
A
F
 
A
P
 
E
N
 
K
L
 
L
E
 
Q
A
 
V
I
 
V
F
 
G
H
 
R
M
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
Y
 
V
D
 
D
L
 
N
V
 
V
D
 
D
A
 
L
A
 
E
Y
 
A
A
 
A
G
 
T
A
 
R
H
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
L
V
 
V
T
 
M
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
N
V
 
G
L
 
N
D
 
S
E
 
L
D
 
S
V
 
A
A
 
A
D
 
E
I
 
L
A
 
T
M
 
C
A
 
G
L
 
M
L
 
I
L
 
M
D
 
C
A
 
L
T
 
A
R
 
R
Q
 
Q
I
 
I
P
 
P
Q
 
Q
S
 
A
D
 
T
A
 
A
F
 
S
L
 
M
R
 
K
S
 
D
G
 
G
K
 
K
W
 
W
L
 
E
T
 
R
G
 
K
T
 
K
Y
 
F
P
 
-
L
 
M
T
 
G
A
 
T
T
 
E
L
 
L
R
 
N
G
 
G
R
 
K
T
 
T
M
 
L
G
 
G
I
 
I
L
|
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
I
G
 
G
K
 
R
A
 
E
I
 
V
A
 
A
K
 
T
R
 
R
A
 
M
E
 
Q
A
 
S
F
 
F
D
 
G
L
 
M
K
 
K
I
 
T
A
 
I
Y
 
G
H
x
Y
G
x
D
R
x
P
T
 
I
Q
x
I
Q
 
S
A
 
P
G
 
E
V
 
V
A
 
S
Y
 
A
P
 
S
Y
 
F
Y
 
G
A
 
V
T
 
Q
P
 
Q
I
 
L
A
 
P
L
 
L
A
 
E
A
 
E
A
 
I
-
 
W
-
 
P
-
 
L
C
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
M
 
T
V
 
V
V
x
H
A
x
T
P
|
P
G
 
L
G
 
L
A
 
P
E
 
S
T
 
T
K
 
T
H
 
G
I
x
L
V
 
L
N
 
N
K
 
D
A
 
N
V
 
T
L
 
F
E
 
A
A
 
Q
L
 
C
G
 
K
P
 
K
D
 
G
G
 
V
I
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
V
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
S
 
G
L
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
L
E
 
R
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
T
 
S
G
 
G
K
 
Q
I
 
C
L
 
A
A
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
T
F
 
E
E
 
E
P
 
P
K
 
P
V
 
R
P
 
D
Q
 
R
A
 
A
L
 
L
I
 
V
D
 
D
C
 
H
Q
 
E
N
 
N
T
 
V
V
 
I
L
 
S
L
 
C
P
 
P
H
 
H
V
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
S
T
 
T
H
 
K

Query Sequence

>WP_020174512.1 NCBI__GCF_000385335.1:WP_020174512.1
MSEFDLLMPAFLTDFLVDGLSKNHTLHKLWEAPDPAAKISAVKDRVRALISGGIGRFKVT
ADFIAQFPNLEAIFHMGVGYDLVDAAYAGAHGIIVTNTPGVLDEDVADIAMALLLDATRQ
IPQSDAFLRSGKWLTGTYPLTATLRGRTMGILGLGRIGKAIAKRAEAFDLKIAYHGRTQQ
AGVAYPYYATPIALAAACDVLMVVAPGGAETKHIVNKAVLEALGPDGILINVARGSLVDE
AALIEALQTGKILAAGLDVFEFEPKVPQALIDCQNTVLLPHVGSATHYTRQAMAQLVIDN
VASWTSGKGPLTPVAETPWQRLN

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory