SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_020175713.1 NCBI__GCF_000385335.1:WP_020175713.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3uwuA Crystal structure of staphylococcus aureus triosephosphate isomerase complexed with glycerol-3-phosphate (see paper)
42% identity, 97% coverage: 6:246/249 of query aligns to 3:250/253 of 3uwuA

query
sites
3uwuA
V
 
T
P
 
P
L
 
I
V
 
I
A
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
G
 
-
L
 
-
R
 
-
R
 
K
D
 
T
L
 
V
D
 
Q
E
 
E
I
 
A
R
 
K
A
 
D
I
 
F
A
 
V
G
 
N
A
 
A
S
 
L
A
 
P
H
 
T
L
 
L
P
 
P
R
 
D
P
 
S
-
 
K
-
 
E
-
 
V
E
 
E
I
 
S
L
 
V
I
 
I
C
 
C
P
 
A
P
 
P
A
 
A
T
 
I
L
 
Q
L
 
L
M
 
D
A
 
A
-
 
L
-
 
T
-
 
T
A
 
A
A
 
V
E
 
K
I
 
E
C
 
G
A
 
K
G
 
A
T
 
Q
A
 
G
V
 
L
R
 
E
L
 
I
G
 
G
G
 
A
Q
 
Q
D
 
N
C
 
T
H
 
Y
N
 
F
E
 
E
P
 
D
S
 
N
G
 
G
M
 
A
H
 
F
T
 
T
G
 
G
D
 
E
L
 
T
S
 
S
A
 
P
E
 
V
M
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
L
G
 
G
A
 
V
A
 
K
Y
 
Y
V
 
V
I
 
V
L
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
A
 
E
E
 
L
H
 
F
G
 
H
E
 
E
T
 
T
S
 
D
E
 
E
E
 
E
V
 
I
R
 
N
I
 
K
K
 
K
A
 
A
H
 
H
A
 
A
A
 
I
L
 
F
R
 
K
A
 
H
G
 
G
L
 
M
M
 
T
P
 
P
I
 
I
I
 
I
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
R
 
D
A
 
E
E
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
S
G
 
G
E
 
K
A
 
A
L
 
N
A
 
D
L
 
V
V
 
V
G
 
G
A
 
E
Q
 
Q
L
 
V
K
 
K
-
 
K
-
 
A
-
 
V
A
 
A
S
 
G
I
 
L
P
 
S
P
 
E
H
 
D
P
 
Q
G
 
L
P
 
K
G
 
S
L
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
I
 
I
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
H
 
K
T
 
S
P
 
S
T
 
T
P
 
S
T
 
E
E
 
D
V
 
A
A
 
N
E
 
E
M
 
M
H
 
C
T
 
A
F
 
F
I
 
V
R
 
R
S
 
Q
E
 
T
L
 
I
G
 
A
-
 
D
I
 
L
G
 
S
L
 
S
G
 
K
V
 
E
G
 
V
G
 
S
T
 
E
K
 
A
V
 
T
R
 
R
L
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
R
 
K
S
 
P
E
 
N
N
 
N
V
 
I
K
 
K
E
 
E
W
 
Y
V
 
M
A
 
A
I
 
Q
D
 
T
N
 
D
V
 
I
N
 
D
G
 
G
V
 
A
L
|
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
S
 
V
A
 
E
D
 
D
F
 
F
M
 
V
Q
 
Q
I
 
L
V
 
L
K
 
E

Q6GIL6 Triosephosphate isomerase; TIM; TPI; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Staphylococcus aureus (strain MRSA252) (see paper)
42% identity, 97% coverage: 6:246/249 of query aligns to 3:250/253 of Q6GIL6

query
sites
Q6GIL6
V
 
T
P
 
P
L
 
I
V
 
I
A
 
A
G
 
G
N
|
N
W
|
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
G
 
-
L
 
-
R
 
-
R
 
K
D
 
T
L
 
V
D
 
Q
E
 
E
I
 
A
R
 
K
A
 
D
I
 
F
A
 
V
G
 
N
A
 
A
S
 
L
A
 
P
H
 
T
L
 
L
P
 
P
R
 
D
P
 
S
-
 
K
-
 
E
-
 
V
E
 
E
I
 
S
L
 
V
I
 
I
C
 
C
P
 
A
P
 
P
A
 
A
T
 
I
L
 
Q
L
 
L
M
 
D
A
 
A
-
 
L
-
 
T
-
 
T
A
 
A
A
 
V
E
 
K
I
 
E
C
 
G
A
 
K
G
 
A
T
 
Q
A
 
G
V
 
L
R
 
E
L
 
I
G
 
G
G
 
A
Q
 
Q
D
 
N
C
 
T
H
 
Y
N
 
F
E
 
E
P
 
D
S
 
N
G
 
G
M
 
A
H
 
F
T
 
T
G
 
G
D
 
E
L
 
T
S
 
S
A
 
P
E
 
V
M
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
L
G
 
G
A
 
V
A
 
K
Y
 
Y
V
 
V
I
 
V
L
 
I
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
A
 
E
E
 
L
H
 
F
G
 
H
E
 
E
T
 
T
S
 
D
E
 
E
E
 
E
V
 
I
R
 
N
I
 
K
K
 
K
A
 
A
H
 
H
A
 
A
A
 
I
L
 
F
R
 
K
A
 
H
G
 
G
L
 
M
M
 
T
P
 
P
I
 
I
I
 
I
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
R
 
D
A
 
E
E
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
S
G
 
G
E
 
K
A
 
A
L
 
N
A
 
D
L
 
V
V
 
V
G
 
G
A
 
E
Q
 
Q
L
 
V
K
 
K
-
 
K
-
 
A
-
 
V
A
 
A
S
 
G
I
 
L
P
 
S
P
 
E
H
 
D
P
 
Q
G
 
L
P
 
K
G
 
S
L
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
I
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
H
 
K
T
 
S
P
 
S
T
 
T
P
 
S
T
 
E
E
 
D
V
 
A
A
 
N
E
 
E
M
 
M
H
 
C
T
 
A
F
 
F
I
 
V
R
 
R
S
 
Q
E
 
T
L
 
I
G
 
A
-
 
D
I
 
L
G
 
S
L
 
S
G
 
K
V
 
E
G
 
V
G
 
S
T
 
E
K
 
A
V
 
T
R
 
R
L
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
R
 
K
S
 
P
E
 
N
N
 
N
V
 
I
K
 
K
E
 
E
W
 
Y
V
 
M
A
 
A
I
 
Q
D
 
T
N
 
D
V
 
I
N
 
D
G
 
G
V
 
A
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
S
 
V
A
 
E
D
 
D
F
 
F
M
 
V
Q
 
Q
I
 
L
V
 
L
K
 
E

3uwzA Crystal structure of staphylococcus aureus triosephosphate isomerase complexed with glycerol-2-phosphate (see paper)
42% identity, 97% coverage: 6:246/249 of query aligns to 4:251/254 of 3uwzA

query
sites
3uwzA
V
 
T
P
 
P
L
 
I
V
 
I
A
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
G
 
-
L
 
-
R
 
-
R
 
K
D
 
T
L
 
V
D
 
Q
E
 
E
I
 
A
R
 
K
A
 
D
I
 
F
A
 
V
G
 
N
A
 
A
S
 
L
A
 
P
H
 
T
L
 
L
P
 
P
R
 
D
P
 
S
-
 
K
-
 
E
-
 
V
E
 
E
I
 
S
L
 
V
I
 
I
C
 
C
P
 
A
P
 
P
A
 
A
T
 
I
L
 
Q
L
 
L
M
 
D
A
 
A
-
 
L
-
 
T
-
 
T
A
 
A
A
 
V
E
 
K
I
 
E
C
 
G
A
 
K
G
 
A
T
 
Q
A
 
G
V
 
L
R
 
E
L
 
I
G
 
G
G
 
A
Q
 
Q
D
 
N
C
 
T
H
 
Y
N
 
F
E
 
E
P
 
D
S
 
N
G
 
G
M
 
A
H
 
F
T
 
T
G
 
G
D
 
E
L
 
T
S
 
S
A
 
P
E
 
V
M
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
L
G
 
G
A
 
V
A
 
K
Y
 
Y
V
 
V
I
 
V
L
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
A
 
E
E
 
L
H
 
F
G
 
H
E
 
E
T
 
T
S
 
D
E
 
E
E
 
E
V
 
I
R
 
N
I
 
K
K
 
K
A
 
A
H
 
H
A
 
A
A
 
I
L
 
F
R
 
K
A
 
H
G
 
G
L
 
M
M
 
T
P
 
P
I
 
I
I
 
I
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
R
 
D
A
 
E
E
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
S
G
 
G
E
 
K
A
 
A
L
 
N
A
 
D
L
 
V
V
 
V
G
 
G
A
 
E
Q
 
Q
L
 
V
K
 
K
-
 
K
-
 
A
-
 
V
A
 
A
S
 
G
I
 
L
P
 
S
P
 
E
H
 
D
P
 
Q
G
 
L
P
 
K
G
 
S
L
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
I
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
H
 
K
T
 
S
P
 
S
T
 
T
P
 
S
T
 
E
E
 
D
V
 
A
A
 
N
E
 
E
M
 
M
H
 
C
T
 
A
F
 
F
I
 
V
R
 
R
S
 
Q
E
 
T
L
 
I
G
 
A
-
 
D
I
 
L
G
 
S
L
 
S
G
 
K
V
 
E
G
 
V
G
 
S
T
 
E
K
 
A
V
 
T
R
 
R
L
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
|
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
R
 
K
S
 
P
E
 
N
N
 
N
V
 
I
K
 
K
E
 
E
W
 
Y
V
 
M
A
 
A
I
 
Q
D
 
T
N
 
D
V
 
I
N
 
D
G
 
G
V
 
A
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
S
 
V
A
 
E
D
 
D
F
 
F
M
 
V
Q
 
Q
I
 
L
V
 
L
K
 
E

3uwwA Crystal structure of staphylococcus aureus triosephosphate isomerase complexed with 3-phosphoglyceric acid (see paper)
42% identity, 97% coverage: 6:246/249 of query aligns to 4:251/254 of 3uwwA

query
sites
3uwwA
V
 
T
P
 
P
L
 
I
V
 
I
A
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
G
 
-
L
 
-
R
 
-
R
 
K
D
 
T
L
 
V
D
 
Q
E
 
E
I
 
A
R
 
K
A
 
D
I
 
F
A
 
V
G
 
N
A
 
A
S
 
L
A
 
P
H
 
T
L
 
L
P
 
P
R
 
D
P
 
S
-
 
K
-
 
E
-
 
V
E
 
E
I
 
S
L
 
V
I
 
I
C
 
C
P
 
A
P
 
P
A
 
A
T
 
I
L
 
Q
L
 
L
M
 
D
A
 
A
-
 
L
-
 
T
-
 
T
A
 
A
A
 
V
E
 
K
I
 
E
C
 
G
A
 
K
G
 
A
T
 
Q
A
 
G
V
 
L
R
 
E
L
 
I
G
 
G
G
 
A
Q
 
Q
D
 
N
C
 
T
H
 
Y
N
 
F
E
 
E
P
 
D
S
 
N
G
 
G
M
 
A
H
 
F
T
 
T
G
 
G
D
 
E
L
 
T
S
 
S
A
 
P
E
 
V
M
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
L
G
 
G
A
 
V
A
 
K
Y
 
Y
V
 
V
I
 
V
L
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
A
 
E
E
 
L
H
 
F
G
 
H
E
 
E
T
 
T
S
 
D
E
 
E
E
 
E
V
 
I
R
 
N
I
 
K
K
 
K
A
 
A
H
 
H
A
 
A
A
 
I
L
 
F
R
 
K
A
 
H
G
 
G
L
 
M
M
 
T
P
 
P
I
 
I
I
 
I
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
R
 
D
A
 
E
E
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
S
G
 
G
E
 
K
A
 
A
L
 
N
A
 
D
L
 
V
V
 
V
G
 
G
A
 
E
Q
 
Q
L
 
V
K
 
K
-
 
K
-
 
A
-
 
V
A
 
A
S
 
G
I
 
L
P
 
S
P
 
E
H
 
D
P
 
Q
G
 
L
P
 
K
G
 
S
L
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
I
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
H
 
K
T
 
S
P
 
S
T
 
T
P
 
S
T
 
E
E
 
D
V
 
A
A
 
N
E
 
E
M
 
M
H
 
C
T
 
A
F
 
F
I
 
V
R
 
R
S
 
Q
E
 
T
L
 
I
G
 
A
-
 
D
I
 
L
G
 
S
L
 
S
G
 
K
V
 
E
G
 
V
G
 
S
T
 
E
K
 
A
V
 
T
R
 
R
L
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
R
 
K
S
 
P
E
 
N
N
 
N
V
 
I
K
 
K
E
 
E
W
 
Y
V
 
M
A
 
A
I
 
Q
D
 
T
N
 
D
V
 
I
N
 
D
G
 
G
V
 
A
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
S
 
V
A
 
E
D
 
D
F
 
F
M
 
V
Q
 
Q
I
 
L
V
 
L
K
 
E

3uwvA Crystal structure of staphylococcus aureus triosephosphate isomerase complexed with 2-phosphoglyceric acid (see paper)
42% identity, 97% coverage: 6:246/249 of query aligns to 5:252/255 of 3uwvA

query
sites
3uwvA
V
 
T
P
 
P
L
 
I
V
 
I
A
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
G
 
-
L
 
-
R
 
-
R
 
K
D
 
T
L
 
V
D
 
Q
E
 
E
I
 
A
R
 
K
A
 
D
I
 
F
A
 
V
G
 
N
A
 
A
S
 
L
A
 
P
H
 
T
L
 
L
P
 
P
R
 
D
P
 
S
-
 
K
-
 
E
-
 
V
E
 
E
I
 
S
L
 
V
I
 
I
C
 
C
P
 
A
P
 
P
A
 
A
T
 
I
L
 
Q
L
 
L
M
 
D
A
 
A
-
 
L
-
 
T
-
 
T
A
 
A
A
 
V
E
 
K
I
 
E
C
 
G
A
 
K
G
 
A
T
 
Q
A
 
G
V
 
L
R
 
E
L
 
I
G
 
G
G
 
A
Q
 
Q
D
 
N
C
 
T
H
 
Y
N
 
F
E
 
E
P
 
D
S
 
N
G
 
G
M
 
A
H
 
F
T
 
T
G
 
G
D
 
E
L
 
T
S
 
S
A
 
P
E
 
V
M
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
L
G
 
G
A
 
V
A
 
K
Y
 
Y
V
 
V
I
 
V
L
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
A
 
E
E
 
L
H
 
F
G
 
H
E
 
E
T
 
T
S
 
D
E
 
E
E
 
E
V
 
I
R
 
N
I
 
K
K
 
K
A
 
A
H
 
H
A
 
A
A
 
I
L
 
F
R
 
K
A
 
H
G
 
G
L
 
M
M
 
T
P
 
P
I
 
I
I
 
I
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
R
 
D
A
 
E
E
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
S
G
 
G
E
 
K
A
 
A
L
 
N
A
 
D
L
 
V
V
 
V
G
 
G
A
 
E
Q
 
Q
L
 
V
K
 
K
-
 
K
-
 
A
-
 
V
A
 
A
S
 
G
I
 
L
P
 
S
P
 
E
H
 
D
P
 
Q
G
 
L
P
 
K
G
 
S
L
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
I
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
H
 
K
T
 
S
P
 
S
T
 
T
P
 
S
T
 
E
E
 
D
V
 
A
A
 
N
E
 
E
M
 
M
H
 
C
T
 
A
F
 
F
I
 
V
R
 
R
S
 
Q
E
 
T
L
 
I
G
 
A
-
 
D
I
 
L
G
 
S
L
 
S
G
 
K
V
 
E
G
 
V
G
 
S
T
 
E
K
 
A
V
 
T
R
 
R
L
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
R
x
K
S
 
P
E
 
N
N
 
N
V
 
I
K
 
K
E
 
E
W
 
Y
V
 
M
A
 
A
I
 
Q
D
 
T
N
 
D
V
 
I
N
 
D
G
 
G
V
 
A
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
S
 
V
A
 
E
D
 
D
F
 
F
M
 
V
Q
 
Q
I
 
L
V
 
L
K
 
E

P27876 Triosephosphate isomerase; TIM; TPI; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Bacillus subtilis (strain 168) (see paper)
41% identity, 98% coverage: 7:249/249 of query aligns to 4:251/253 of P27876

query
sites
P27876
P
 
P
L
 
I
V
 
I
A
 
A
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
M
 
M
N
 
N
G
 
K
-
 
T
L
 
L
R
 
G
R
 
E
D
 
A
L
 
V
D
 
S
E
 
F
I
 
V
R
 
E
A
 
E
I
 
V
A
 
K
G
 
S
A
 
S
S
 
I
A
 
P
H
 
A
L
 
A
P
 
D
R
 
K
P
 
A
E
 
E
I
 
A
L
 
V
I
 
V
C
 
C
P
 
A
P
 
P
A
 
A
T
 
L
L
 
F
L
 
L
M
 
E
A
 
K
A
 
L
A
 
A
E
 
S
I
 
A
C
 
V
A
 
K
G
 
G
T
 
T
A
 
D
V
 
L
R
 
K
L
 
V
G
 
G
G
 
A
Q
 
Q
D
 
N
C
 
M
H
 
H
N
 
F
E
 
E
P
 
E
S
 
S
G
 
G
M
 
A
H
 
F
T
 
T
G
 
G
D
 
E
L
 
I
S
 
S
A
 
P
E
 
V
M
 
A
L
 
L
A
 
K
D
 
D
A
 
L
G
 
G
A
 
V
A
 
D
Y
 
Y
V
 
C
I
 
V
L
 
I
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
A
 
E
E
 
M
H
 
F
G
 
A
E
 
E
T
 
T
S
 
D
E
 
E
E
 
T
V
 
V
R
 
N
I
 
K
K
 
K
A
 
A
H
 
H
A
 
A
A
 
A
L
 
F
R
 
K
A
 
H
G
 
G
L
 
I
M
 
V
P
 
P
I
 
I
I
 
I
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
R
 
L
A
 
E
E
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
E
 
K
A
 
T
L
 
N
A
 
D
L
 
L
V
 
V
G
 
A
A
 
D
Q
 
Q
L
 
V
K
 
K
-
 
K
-
 
G
-
 
L
A
 
A
S
 
G
I
 
L
P
 
S
P
 
E
H
 
E
P
 
Q
G
 
V
P
 
A
G
 
A
L
 
S
V
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
I
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
H
 
K
T
 
S
P
 
S
T
 
T
P
 
A
T
 
K
E
 
D
V
 
A
A
 
N
E
 
D
M
 
V
H
 
C
T
 
A
F
 
H
I
 
I
R
 
R
S
 
K
E
 
T
L
 
V
G
 
A
I
 
E
G
 
S
L
 
F
G
 
S
V
 
Q
-
 
E
G
 
A
G
 
A
T
 
D
K
 
K
V
 
L
R
 
R
L
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
R
 
K
S
 
P
E
 
A
N
 
N
V
 
I
K
 
K
E
 
E
W
 
Y
V
 
M
A
 
A
I
 
E
D
 
S
N
 
D
V
 
I
N
 
D
G
 
G
V
 
A
L
 
L
V
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
E
S
 
P
A
 
Q
D
 
S
F
 
F
M
 
V
Q
 
Q
I
 
L
V
 
L
K
 
E
A
 
E
F
 
G
Q
 
Q

6neeB Crystal structure of a reconstructed ancestor of triosephosphate isomerase from eukaryotes (see paper)
41% identity, 97% coverage: 8:249/249 of query aligns to 7:252/252 of 6neeB

query
sites
6neeB
L
 
F
V
 
V
A
 
G
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
G
 
G
L
 
T
R
 
-
R
 
-
D
 
-
L
 
L
D
 
E
E
 
S
I
 
I
R
 
K
A
 
A
I
 
L
A
 
V
G
 
E
A
 
T
-
 
L
-
 
N
S
 
S
A
 
A
H
 
Q
L
 
L
-
 
D
P
 
P
R
 
N
P
 
T
E
 
E
I
 
V
L
 
V
I
 
V
C
 
A
P
 
P
P
 
P
A
 
A
T
 
I
L
 
Y
L
 
L
-
 
P
M
 
F
A
 
A
A
 
R
A
 
S
E
 
K
I
 
L
C
 
K
A
 
K
G
 
P
T
 
K
A
 
E
V
 
I
R
 
Q
L
 
V
G
 
A
G
 
A
Q
 
Q
D
 
N
C
 
C
H
 
Y
N
 
T
E
 
K
P
 
P
S
 
N
G
 
G
M
 
A
H
 
F
T
 
T
G
 
G
D
 
E
L
 
I
S
 
S
A
 
A
E
 
E
M
 
M
L
 
L
A
 
K
D
 
D
A
 
L
G
 
G
A
 
V
A
 
P
Y
 
W
V
 
V
I
 
I
L
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
A
 
T
E
 
I
H
 
F
G
 
G
E
 
E
T
 
S
S
 
D
E
 
E
E
 
L
V
 
I
R
 
A
I
 
E
K
 
K
A
 
V
H
 
K
A
 
Y
A
 
A
L
 
L
R
 
D
A
 
Q
G
 
G
L
 
L
M
 
K
P
 
V
I
 
I
I
 
A
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
R
 
L
A
 
E
E
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
E
 
K
A
 
T
L
 
M
A
 
E
L
 
V
V
 
V
G
 
A
A
 
R
Q
 
Q
L
 
I
K
 
L
A
 
K
S
 
A
I
 
I
P
 
A
P
 
D
-
 
K
-
 
I
H
 
K
P
 
D
G
 
W
P
 
S
G
 
N
L
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
I
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
H
 
K
T
 
V
P
 
A
T
 
T
P
 
P
T
 
E
E
 
Q
V
 
A
A
 
Q
E
 
E
M
 
V
H
 
H
T
 
A
F
 
A
I
 
L
R
 
R
S
 
K
E
 
W
L
 
L
G
 
K
I
 
E
G
 
N
L
 
V
G
 
S
V
 
P
G
 
E
-
 
V
G
 
A
T
 
E
K
 
S
V
 
T
R
 
R
L
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
|
G
S
|
S
V
 
V
R
 
N
S
 
A
E
 
A
N
 
N
V
 
C
K
 
K
E
 
E
W
 
L
V
 
A
A
 
K
I
 
Q
D
 
P
N
 
D
V
 
I
N
 
D
G
 
G
V
 
F
L
|
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
S
 
A
A
 
P
D
 
E
F
 
F
M
 
V
Q
 
D
I
 
I
V
 
I
K
 
N
A
 
A
F
 
R
Q
 
Q

P00943 Triosephosphate isomerase; TIM; TPI; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Geobacillus stearothermophilus (Bacillus stearothermophilus) (see 2 papers)
40% identity, 97% coverage: 7:247/249 of query aligns to 4:249/253 of P00943

query
sites
P00943
P
 
P
L
 
I
V
 
I
A
 
A
G
 
G
N
|
N
W
|
W
K
|
K
M
 
M
N
x
H
G
 
-
L
 
-
R
x
K
R
 
T
D
 
L
L
 
A
D
 
E
E
 
A
I
 
V
R
 
Q
A
 
F
I
 
V
A
 
E
G
 
D
A
 
V
S
 
K
A
 
G
H
 
H
L
 
V
P
 
P
R
 
P
P
 
A
E
 
D
I
 
E
L
 
V
I
 
I
-
 
S
-
 
V
-
 
V
C
 
C
P
 
A
P
 
P
A
 
F
T
 
L
L
 
F
L
 
L
M
 
D
A
 
R
A
 
L
A
 
V
E
 
Q
I
 
A
C
 
A
A
 
D
G
 
G
T
 
T
A
 
D
V
 
L
R
 
K
L
 
I
G
 
G
G
 
A
Q
 
Q
D
 
T
C
 
M
H
 
H
N
 
F
E
 
A
P
 
D
S
 
Q
G
 
G
M
 
A
H
 
Y
T
 
T
G
 
G
D
 
E
L
 
V
S
 
S
A
 
P
E
 
V
M
 
M
L
 
L
A
 
K
D
 
D
A
 
L
G
 
G
A
 
V
A
 
T
Y
 
Y
V
 
V
I
 
I
L
 
L
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
A
 
Q
E
 
M
H
 
F
G
 
A
E
 
E
T
 
T
S
 
D
E
 
E
E
 
T
V
 
V
R
 
N
I
 
K
K
 
K
A
 
V
H
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
F
R
 
T
A
 
R
G
 
G
L
 
L
M
 
I
P
 
P
I
 
I
I
 
I
C
 
C
V
 
C
G
 
G
E
 
E
T
 
S
R
 
L
A
 
E
E
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
E
 
Q
A
 
T
L
 
N
A
 
A
L
 
V
V
 
V
G
 
A
A
 
S
Q
 
Q
L
 
V
K
 
E
-
 
K
-
 
A
-
 
L
A
 
A
S
 
G
I
 
L
P
 
T
P
 
P
H
 
E
P
 
Q
G
 
V
P
 
K
G
 
Q
L
 
A
V
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
I
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
H
 
K
T
 
S
P
 
S
T
 
T
P
 
P
T
 
E
E
 
D
V
 
A
A
 
N
E
 
S
M
 
V
H
 
C
T
 
G
F
 
H
I
 
I
R
 
R
S
 
S
E
 
V
L
 
V
G
 
S
I
 
R
G
 
L
L
 
F
G
 
G
V
 
P
G
 
E
G
 
A
T
 
A
K
 
E
-
 
A
V
 
I
R
 
R
L
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
R
 
K
S
 
P
E
 
D
N
 
N
V
 
I
K
 
R
E
 
D
W
 
F
V
 
L
A
 
A
I
 
Q
D
 
Q
N
 
Q
V
 
I
N
 
D
G
 
G
V
 
P
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
E
S
 
P
A
 
A
D
 
S
F
 
F
M
 
L
Q
 
Q
I
 
L
V
 
V
K
 
E
A
 
A

1btmA Triosephosphate isomerase (tim) complexed with 2-phosphoglycolic acid (see paper)
40% identity, 97% coverage: 7:247/249 of query aligns to 3:248/251 of 1btmA

query
sites
1btmA
P
 
P
L
 
I
V
 
I
A
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
H
G
 
-
L
 
-
R
 
K
R
 
T
D
 
L
L
 
A
D
 
E
E
 
A
I
 
V
R
 
Q
A
 
F
I
 
V
A
 
E
G
 
D
A
 
V
S
 
K
A
 
G
H
 
H
L
 
V
P
 
P
R
 
P
P
 
A
E
 
D
I
 
E
L
 
V
I
 
I
-
 
S
-
 
V
-
 
V
C
 
C
P
 
A
P
 
P
A
 
F
T
 
L
L
 
F
L
 
L
M
 
D
A
 
R
A
 
L
A
 
V
E
 
Q
I
 
A
C
 
A
A
 
D
G
 
G
T
 
T
A
 
D
V
 
L
R
 
K
L
 
I
G
 
G
G
 
A
Q
 
Q
D
 
T
C
 
M
H
 
H
N
 
F
E
 
A
P
 
D
S
 
Q
G
 
G
M
 
A
H
 
Y
T
 
T
G
 
G
D
 
E
L
 
V
S
 
S
A
 
P
E
 
V
M
 
M
L
 
L
A
 
K
D
 
D
A
 
L
G
 
G
A
 
V
A
 
T
Y
 
Y
V
 
V
I
 
I
L
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
A
 
Q
E
 
M
H
 
F
G
 
A
E
 
E
T
 
T
S
 
D
E
 
E
E
 
T
V
 
V
R
 
N
I
 
K
K
 
K
A
 
V
H
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
F
R
 
T
A
 
R
G
 
G
L
 
L
M
 
I
P
 
P
I
 
I
I
 
I
C
 
C
V
 
C
G
 
G
E
 
E
T
 
S
R
 
L
A
 
E
E
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
E
 
Q
A
 
T
L
 
N
A
 
A
L
 
V
V
 
V
G
 
A
A
 
S
Q
 
Q
L
 
V
K
 
E
-
 
K
-
 
A
-
 
L
A
 
A
S
 
G
I
 
L
P
 
T
P
 
P
H
 
E
P
 
Q
G
 
V
P
 
K
G
 
Q
L
 
A
V
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
I
 
I
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
H
 
K
T
 
S
P
 
S
T
 
T
P
 
P
T
 
E
E
 
D
V
 
A
A
 
N
E
 
S
M
 
V
H
 
C
T
 
G
F
 
H
I
 
I
R
 
R
S
 
S
E
 
V
L
 
V
G
 
S
I
 
R
G
 
L
L
 
F
G
 
G
V
 
P
G
 
E
G
 
A
T
 
A
K
 
E
-
 
A
V
 
I
R
 
R
L
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
R
 
K
S
 
P
E
 
D
N
 
N
V
 
I
K
 
R
E
 
D
W
 
F
V
 
L
A
 
A
I
 
Q
D
 
Q
N
 
Q
V
 
I
N
 
D
G
 
G
V
 
P
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
E
S
 
P
A
 
A
D
 
S
F
 
F
M
 
L
Q
 
Q
I
 
L
V
 
V
K
 
E
A
 
A

6bveA Triosephosphate isomerase of synechocystis in complex with 2- phosphoglycolic acid (see paper)
41% identity, 97% coverage: 8:249/249 of query aligns to 5:241/242 of 6bveA

query
sites
6bveA
L
 
I
V
 
I
A
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
H
G
 
K
L
 
T
R
 
Q
R
 
A
D
 
E
-
 
A
-
 
Q
-
 
A
-
 
F
L
 
L
D
 
Q
E
 
G
I
 
F
R
 
K
A
 
P
I
 
L
A
 
I
G
 
E
A
 
D
S
 
A
A
 
A
H
 
E
L
 
-
P
 
-
R
 
S
P
 
R
E
 
E
I
 
V
L
 
V
I
 
L
C
 
C
P
 
V
P
 
P
A
 
F
T
 
T
L
 
D
L
 
L
M
 
S
A
 
G
A
 
M
A
 
S
E
 
Q
I
 
Q
C
 
L
A
 
H
G
 
G
T
 
G
A
 
R
V
 
V
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
A
Q
 
Q
D
 
N
C
 
V
H
 
H
N
 
W
E
 
E
P
 
A
S
 
S
G
 
G
M
 
A
H
 
Y
T
 
T
G
 
G
D
 
E
L
 
I
S
 
S
A
 
A
E
 
A
M
 
M
L
 
L
A
 
T
D
 
E
A
 
I
G
 
G
A
 
I
A
 
H
Y
 
Y
V
 
V
I
 
V
L
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
A
 
Q
E
 
Y
H
 
F
G
 
G
E
 
E
T
 
T
S
 
D
E
 
E
E
 
T
V
 
A
R
 
N
I
 
L
K
 
R
A
 
V
H
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
Q
R
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
M
 
I
P
 
P
I
 
I
I
 
L
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
S
R
 
K
A
 
A
E
 
Q
R
 
R
E
 
D
A
 
A
G
 
G
E
 
E
A
 
T
L
 
E
A
 
Q
L
 
V
V
 
I
G
 
V
A
 
D
Q
 
Q
L
 
V
K
 
K
A
 
K
S
 
G
I
 
L
P
 
V
P
 
N
H
 
V
P
 
D
G
 
Q
P
 
S
G
 
N
L
 
L
V
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
I
 
I
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
H
 
D
T
 
T
P
 
C
T
 
A
P
 
A
T
 
T
E
 
E
V
 
A
A
 
N
E
 
R
M
 
V
H
 
I
T
 
G
F
 
L
I
 
I
R
 
R
S
 
E
E
 
Q
L
 
L
G
 
-
I
 
-
G
 
-
L
 
-
G
 
-
V
 
-
G
 
T
G
 
N
T
 
S
K
 
Q
V
 
V
R
 
T
L
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
|
G
S
|
S
V
 
V
R
 
N
S
 
A
E
 
N
N
 
N
V
 
V
K
 
D
E
 
E
W
 
I
V
 
M
A
 
A
I
 
Q
D
 
P
N
 
E
V
 
I
N
 
D
G
 
G
V
 
A
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
E
S
 
P
A
 
Q
D
 
S
F
 
F
M
 
A
Q
 
R
I
 
I
V
 
V
K
 
N
A
 
-
F
 
F
Q
 
Q

3uwzB Crystal structure of staphylococcus aureus triosephosphate isomerase complexed with glycerol-2-phosphate (see paper)
41% identity, 96% coverage: 7:246/249 of query aligns to 4:247/250 of 3uwzB

query
sites
3uwzB
P
 
P
L
 
I
V
 
I
A
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
G
 
-
L
 
-
R
 
-
R
 
K
D
 
T
L
 
V
D
 
Q
E
 
E
I
 
A
R
 
K
A
 
D
I
 
F
A
 
V
G
 
N
A
 
A
S
 
L
A
 
P
H
 
T
L
 
L
P
 
P
R
 
D
P
 
S
-
 
K
-
 
E
-
 
V
E
 
E
I
 
S
L
 
V
I
 
I
C
 
C
P
 
A
P
 
P
A
 
A
T
 
I
L
 
Q
L
 
L
M
 
D
A
 
A
-
 
L
-
 
T
-
 
T
A
 
A
A
 
V
E
 
K
I
 
E
C
 
G
A
 
K
G
 
A
T
 
Q
A
 
G
V
 
L
R
 
E
L
 
I
G
 
G
G
 
A
Q
 
Q
D
 
N
C
 
T
H
 
Y
N
 
F
E
 
E
P
 
D
S
 
N
G
 
G
M
 
A
H
 
F
T
 
T
G
 
G
D
 
E
L
 
T
S
 
S
A
 
P
E
 
V
M
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
L
G
 
G
A
 
V
A
 
K
Y
 
Y
V
 
V
I
 
V
L
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
A
 
E
E
 
L
H
 
F
G
 
H
E
 
E
T
 
T
S
 
D
E
 
E
E
 
E
V
 
I
R
 
N
I
 
K
K
 
K
A
 
A
H
 
H
A
 
A
A
 
I
L
 
F
R
 
K
A
 
H
G
 
G
L
 
M
M
 
T
P
 
P
I
 
I
I
 
I
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
R
 
D
A
 
E
E
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
S
G
 
G
E
 
K
A
 
A
L
 
N
A
 
D
L
 
V
V
 
V
G
 
G
A
 
E
Q
 
Q
L
 
V
K
 
K
-
 
K
-
 
A
-
 
V
A
 
A
S
 
G
I
 
L
P
 
S
P
 
E
H
 
D
P
 
Q
G
 
L
P
 
K
G
 
S
L
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
I
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
-
T
 
-
G
 
-
H
 
K
T
 
S
P
 
S
T
 
T
P
 
S
T
 
E
E
 
D
V
 
A
A
 
N
E
 
E
M
 
M
H
 
C
T
 
A
F
 
F
I
 
V
R
 
R
S
 
Q
E
 
T
L
 
I
G
 
A
-
 
D
I
 
L
G
 
S
L
 
S
G
 
K
V
 
E
G
 
V
G
 
S
T
 
E
K
 
A
V
 
T
R
 
R
L
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
R
 
K
S
 
P
E
 
N
N
 
N
V
 
I
K
 
K
E
 
E
W
 
Y
V
x
M
A
 
A
I
x
Q
D
 
T
N
 
D
V
x
I
N
 
D
G
 
G
V
 
A
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
S
 
V
A
 
E
D
 
D
F
 
F
M
 
V
Q
 
Q
I
 
L
V
 
L
K
 
E

6ooiC Crystal structure of triosephosphate isomerase from schistosoma mansoni in complex with 2pg (see paper)
40% identity, 97% coverage: 8:249/249 of query aligns to 11:255/255 of 6ooiC

query
sites
6ooiC
L
 
F
V
 
V
A
 
G
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
G
 
G
L
 
S
R
 
R
R
 
D
D
 
D
L
 
N
D
 
D
E
 
K
I
 
L
R
 
L
A
 
K
I
 
L
A
 
L
G
 
S
A
 
E
S
 
A
A
 
H
H
 
F
L
 
D
P
 
D
R
 
N
P
 
T
E
 
E
I
 
V
L
 
L
I
 
I
C
 
A
P
 
P
P
 
P
A
 
S
T
 
V
L
 
F
L
 
L
M
 
H
A
 
E
A
 
I
A
 
R
E
 
K
I
 
-
C
 
S
A
 
L
G
 
K
T
 
K
A
 
E
V
 
I
R
 
H
L
 
V
G
 
A
G
 
A
Q
 
Q
D
 
N
C
 
C
H
 
Y
N
 
K
E
 
V
P
 
S
S
 
K
G
 
G
M
 
A
H
 
F
T
 
T
G
 
G
D
 
E
L
 
I
S
 
S
A
 
P
E
 
A
M
 
M
L
 
I
A
 
R
D
 
D
A
 
I
G
 
G
A
 
C
A
 
D
Y
 
W
V
 
V
I
 
I
L
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
A
 
N
E
 
I
H
 
F
G
 
G
E
 
E
T
 
S
S
 
D
E
 
E
E
 
L
V
 
I
R
 
A
I
 
E
K
 
K
A
 
V
H
 
Q
A
 
H
A
 
A
L
 
L
R
 
A
A
 
E
G
 
G
L
 
L
M
 
S
P
 
V
I
 
I
I
 
A
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
R
 
L
A
 
S
E
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
S
G
 
N
E
 
K
A
 
T
L
 
E
A
 
E
L
 
V
V
 
C
G
 
V
A
 
R
Q
 
Q
L
 
L
K
 
K
A
 
A
S
 
I
I
 
A
P
 
N
P
 
K
-
 
I
-
 
K
-
 
S
-
 
A
H
 
D
P
 
E
G
 
W
P
 
K
G
 
R
L
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
I
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
H
 
K
T
 
V
P
 
A
T
 
T
P
 
P
T
 
Q
E
 
Q
V
 
A
A
 
Q
E
 
E
M
 
V
H
 
H
T
 
N
F
 
F
I
 
L
R
 
R
S
 
K
E
 
W
L
 
F
G
 
K
I
 
T
G
 
N
L
 
A
G
 
P
V
 
N
G
 
G
-
 
V
G
 
D
T
 
E
K
 
K
V
 
I
R
 
R
L
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
|
G
S
|
S
V
 
V
R
 
T
S
 
A
E
 
A
N
 
N
V
 
C
K
 
K
E
 
E
W
 
L
V
 
A
A
 
Q
I
 
Q
D
 
H
N
 
D
V
 
V
N
 
D
G
 
G
V
 
F
L
|
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
S
 
-
A
 
P
D
 
E
F
 
F
M
 
T
Q
 
E
I
 
I
V
 
C
K
 
K
A
 
A
F
 
R
Q
 
Q

P36204 Bifunctional PGK/TIM; EC 2.7.2.3; EC 5.3.1.1 from Thermotoga maritima (strain ATCC 43589 / DSM 3109 / JCM 10099 / NBRC 100826 / MSB8) (see paper)
38% identity, 96% coverage: 8:246/249 of query aligns to 405:647/654 of P36204

query
sites
P36204
L
 
I
V
 
L
A
 
A
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
M
 
M
N
 
H
G
 
K
L
 
T
R
 
I
R
 
S
D
 
E
L
 
A
D
 
K
E
 
K
I
 
F
R
 
V
A
 
S
I
 
L
A
 
L
G
 
V
A
 
N
S
 
E
A
 
L
H
 
H
-
 
D
L
 
V
P
 
K
R
 
E
P
 
F
E
 
E
I
 
I
L
 
V
I
 
V
C
 
C
P
 
P
P
 
P
A
 
F
T
 
T
L
 
A
L
 
L
M
 
S
A
 
E
A
 
V
A
 
G
E
 
E
I
 
I
C
 
L
A
 
S
G
 
G
T
 
R
A
 
N
V
 
I
R
 
K
L
 
L
G
 
G
G
 
A
Q
 
Q
D
 
N
C
 
V
H
 
F
N
 
Y
E
 
E
P
 
D
S
 
Q
G
 
G
M
 
A
H
 
F
T
 
T
G
 
G
D
 
E
L
 
I
S
 
S
A
 
P
E
 
L
M
 
M
L
 
L
A
 
Q
D
 
E
A
 
I
G
 
G
A
 
V
A
 
E
Y
 
Y
V
 
V
I
 
I
L
 
V
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
A
 
R
E
 
I
H
 
F
G
 
K
E
 
E
T
 
D
S
 
D
E
 
E
E
 
F
V
 
I
R
 
N
I
 
R
K
 
K
A
 
V
H
 
K
A
 
A
A
 
V
L
 
L
R
 
E
A
 
K
G
 
G
L
 
M
M
 
T
P
 
P
I
 
I
I
 
L
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
R
 
L
A
 
E
E
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
K
G
 
G
E
 
L
A
 
T
L
 
F
A
 
C
L
 
V
V
 
V
G
 
E
A
 
K
Q
 
Q
L
 
V
K
 
R
A
 
E
-
 
G
-
 
F
-
 
Y
S
 
G
I
 
L
P
 
D
P
 
K
H
 
E
P
 
E
G
 
A
P
 
K
G
 
R
L
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
I
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
H
 
R
T
 
V
P
 
A
T
 
T
P
 
P
T
 
Q
E
 
Q
V
 
A
A
 
Q
E
 
E
M
 
V
H
 
H
T
 
A
F
 
F
I
 
I
R
 
R
-
 
K
-
 
L
-
 
L
S
 
S
E
 
E
L
 
M
G
 
Y
I
 
D
G
 
E
L
 
E
G
 
T
V
 
A
G
 
G
G
 
S
T
 
-
K
 
-
V
 
I
R
 
R
L
 
I
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
 
S
V
 
I
R
 
K
S
 
P
E
 
D
N
 
N
V
 
F
K
 
L
E
 
G
W
 
L
V
 
I
A
 
V
I
 
Q
D
 
K
N
 
D
V
 
I
N
 
D
G
 
G
V
 
G
L
 
L
V
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
S
 
E
A
 
S
D
 
-
F
 
F
M
 
I
Q
 
E
I
 
L
V
 
A
K
 
R

Sites not aligning to the query:

4mvaA 1.43 angstrom resolution crystal structure of triosephosphate isomerase (tpia) from escherichia coli in complex with acetyl phosphate. (see paper)
40% identity, 97% coverage: 7:247/249 of query aligns to 4:248/255 of 4mvaA

query
sites
4mvaA
P
 
P
L
 
L
V
 
V
A
 
M
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
M
 
L
N
 
N
G
 
G
L
 
S
R
 
R
R
 
H
D
 
M
L
 
V
D
 
H
E
 
E
I
 
L
-
 
V
-
 
S
-
 
N
-
 
L
-
 
R
R
 
K
A
 
E
I
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
V
S
 
A
A
 
G
H
 
-
L
 
-
P
 
-
R
 
-
P
 
C
E
 
A
I
 
V
L
 
A
I
 
I
C
 
A
P
 
P
P
 
P
A
 
E
T
 
M
L
 
Y
L
 
I
M
 
D
A
 
M
A
 
A
A
 
K
E
 
R
I
 
E
C
 
A
A
 
E
G
 
G
T
 
S
A
 
H
V
 
I
R
 
M
L
 
L
G
 
G
G
 
A
Q
 
Q
D
 
N
C
 
V
H
 
D
N
 
L
E
 
N
P
 
L
S
 
S
G
 
G
M
 
A
H
 
F
T
 
T
G
 
G
D
 
E
L
 
T
S
 
S
A
 
A
E
 
A
M
 
M
L
 
L
A
 
K
D
 
D
A
 
I
G
 
G
A
 
A
A
 
Q
Y
 
Y
V
 
I
I
 
I
L
 
I
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
A
 
T
E
 
Y
H
 
H
G
 
K
E
 
E
T
 
S
S
 
D
E
 
E
E
 
L
V
 
I
R
 
A
I
 
K
K
 
K
A
 
F
H
 
A
A
 
V
A
 
L
L
 
K
R
 
E
A
 
Q
G
 
G
L
 
L
M
 
T
P
 
P
I
 
V
I
 
L
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
R
 
E
A
 
A
E
 
E
R
 
N
E
 
E
A
 
A
G
 
G
E
 
K
A
 
T
L
 
E
A
 
E
L
 
V
V
 
C
G
 
A
A
 
R
Q
 
Q
L
 
I
K
 
D
A
 
A
S
 
V
I
 
L
P
 
K
P
 
T
H
 
Q
P
 
G
G
 
A
-
 
A
-
 
A
-
 
F
P
 
E
G
 
G
L
 
A
V
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
I
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
H
 
K
T
 
S
P
 
A
T
 
T
P
 
P
T
 
A
E
 
Q
V
 
A
A
 
Q
E
 
A
M
 
V
H
 
H
T
 
K
F
 
F
I
 
I
R
 
R
S
 
D
E
 
H
L
 
I
G
 
A
I
 
K
G
 
V
L
 
D
G
 
A
V
 
N
G
 
I
G
 
A
T
 
E
K
 
Q
V
 
V
R
 
I
L
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
R
 
N
S
 
A
E
 
S
N
 
N
V
 
A
K
 
A
E
 
E
W
 
L
V
 
F
A
 
A
I
 
Q
D
 
P
N
 
D
V
 
I
N
 
D
G
 
G
V
 
A
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
S
 
A
A
 
D
D
 
A
F
 
F
M
 
A
Q
 
V
I
 
I
V
 
V
K
 
K
A
 
A

B1XB85 Triosephosphate isomerase; TIM; TPI; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Escherichia coli (strain K12 / DH10B) (see paper)
40% identity, 97% coverage: 7:247/249 of query aligns to 4:248/255 of B1XB85

query
sites
B1XB85
P
 
P
L
 
L
V
 
V
A
 
M
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
M
 
L
N
 
N
G
 
G
L
 
S
R
 
R
R
 
H
D
 
M
L
 
V
D
 
H
E
 
E
I
 
L
-
 
V
-
 
S
-
 
N
-
 
L
-
 
R
R
 
K
A
 
E
I
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
V
S
 
A
A
 
G
H
 
-
L
 
-
P
 
-
R
 
-
P
 
C
E
 
A
I
 
V
L
 
A
I
 
I
C
 
A
P
 
P
P
 
P
A
 
E
T
 
M
L
 
Y
L
 
I
M
 
D
A
 
M
A
 
A
A
 
K
E
 
R
I
 
E
C
 
A
A
 
E
G
 
G
T
 
S
A
 
H
V
 
I
R
 
M
L
 
L
G
 
G
G
 
A
Q
 
Q
D
 
N
C
 
V
H
 
D
N
 
L
E
 
N
P
 
L
S
 
S
G
 
G
M
 
A
H
 
F
T
 
T
G
 
G
D
 
E
L
 
T
S
 
S
A
 
A
E
 
A
M
 
M
L
 
L
A
 
K
D
 
D
A
 
I
G
 
G
A
 
A
A
 
Q
Y
 
Y
V
 
I
I
 
I
L
 
I
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
A
 
T
E
 
Y
H
 
H
G
 
K
E
 
E
T
 
S
S
 
D
E
 
E
E
 
L
V
 
I
R
 
A
I
 
K
K
 
K
A
 
F
H
 
A
A
 
V
A
 
L
L
 
K
R
 
E
A
 
Q
G
 
G
L
 
L
M
 
T
P
 
P
I
 
V
I
 
L
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
R
 
E
A
 
A
E
 
E
R
 
N
E
 
E
A
 
A
G
 
G
E
 
K
A
 
T
L
 
E
A
 
E
L
 
V
V
 
C
G
 
A
A
 
R
Q
 
Q
L
 
I
K
 
D
A
 
A
S
 
V
I
 
L
P
 
K
P
 
T
H
 
Q
P
 
G
G
 
A
-
 
A
-
 
A
-
 
F
P
 
E
G
 
G
L
 
A
V
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
I
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
H
 
K
T
 
S
P
 
A
T
 
T
P
 
P
T
 
A
E
 
Q
V
 
A
A
 
Q
E
 
A
M
 
V
H
 
H
T
 
K
F
 
F
I
 
I
R
 
R
S
 
D
E
 
H
L
 
I
G
 
A
I
 
K
G
 
V
L
 
D
G
 
A
V
 
N
G
 
I
G
 
A
T
 
E
K
 
Q
V
 
V
R
 
I
L
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
R
 
N
S
 
A
E
 
S
N
 
N
V
 
A
K
 
A
E
 
E
W
 
L
V
 
F
A
 
A
I
 
Q
D
 
P
N
 
D
V
 
I
N
 
D
G
 
G
V
 
A
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
S
 
A
A
 
D
D
 
A
F
 
F
M
 
A
Q
 
V
I
 
I
V
 
V
K
 
K
A
 
A

6oogA Crystal structure of triosephosphate isomerase from taenia solium in complex with 2pg (see paper)
40% identity, 96% coverage: 8:247/249 of query aligns to 8:250/252 of 6oogA

query
sites
6oogA
L
 
F
V
 
V
A
 
G
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
G
 
G
L
 
S
R
 
Y
R
 
S
D
 
H
L
 
I
D
 
N
E
 
T
I
 
F
R
 
F
A
 
D
I
 
T
A
 
L
G
 
Q
A
 
K
S
 
A
A
 
D
H
 
T
L
 
D
P
 
P
R
 
N
P
 
A
E
 
D
I
 
I
L
 
V
I
 
I
C
 
G
P
 
V
P
 
P
A
 
A
T
 
C
L
 
Y
L
 
L
M
 
K
A
 
Y
A
 
A
A
 
Q
E
 
D
I
 
K
C
 
-
A
 
A
G
 
P
T
 
K
A
 
G
V
 
I
R
 
K
L
 
I
G
 
A
G
 
A
Q
 
E
D
 
N
C
 
C
H
 
Y
N
 
K
E
 
V
P
 
G
S
 
S
G
 
G
M
 
A
H
 
F
T
 
T
G
 
G
D
 
E
L
 
I
S
 
S
A
 
T
E
 
E
M
 
M
L
 
I
A
 
K
D
 
D
A
 
C
G
 
G
A
 
C
A
 
E
Y
 
W
V
 
V
I
 
I
L
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
A
 
H
E
 
I
H
 
F
G
 
G
E
 
E
T
 
S
S
 
N
E
 
E
E
 
L
V
 
I
R
 
G
I
 
E
K
 
K
A
 
V
H
 
K
A
 
H
A
 
A
L
 
L
R
 
D
A
 
S
G
 
G
L
 
L
M
 
N
P
 
V
I
 
I
I
 
P
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
L
R
 
L
A
 
S
E
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
E
 
K
A
 
T
L
 
N
A
 
D
L
 
V
V
 
C
G
 
F
A
 
A
Q
 
Q
L
 
M
K
 
D
A
 
A
-
 
I
-
 
A
-
 
K
S
 
N
I
 
V
P
 
P
P
 
S
H
 
K
P
 
E
G
 
A
-
 
W
P
 
D
G
 
K
L
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
I
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
H
 
K
T
 
T
P
 
A
T
 
T
P
 
P
T
 
A
E
 
Q
V
 
A
A
 
Q
E
 
E
M
 
V
H
 
H
T
 
K
F
 
V
I
 
V
R
 
R
S
 
D
E
 
W
L
 
I
G
 
R
I
 
K
G
 
H
L
 
V
G
 
D
V
 
A
G
 
G
-
 
I
G
 
A
T
 
D
K
 
K
V
 
V
R
 
R
L
 
I
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
R
 
T
S
 
A
E
 
S
N
 
N
V
 
A
K
 
K
E
 
D
W
 
L
V
 
G
A
 
T
I
 
Q
D
 
P
N
 
D
V
 
V
N
 
D
G
 
G
V
 
F
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
S
 
P
A
 
-
D
 
D
F
 
F
M
 
I
Q
 
T
I
 
I
V
 
I
K
 
N
A
 
A

4y96A Crystal structure of triosephosphate isomerase from gemmata obscuriglobus (see paper)
40% identity, 96% coverage: 8:247/249 of query aligns to 5:248/250 of 4y96A

query
sites
4y96A
L
 
F
V
 
V
A
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
G
 
-
L
 
-
R
 
-
R
 
T
D
 
T
L
 
L
D
 
A
E
 
E
I
 
A
R
 
K
A
 
A
I
 
L
A
 
G
G
 
A
A
 
A
S
 
V
A
 
A
H
 
K
-
 
G
-
 
V
-
 
T
L
 
D
P
 
D
R
 
R
P
 
V
E
 
T
I
 
V
L
 
A
I
 
V
C
 
F
P
 
P
P
 
P
A
 
Y
T
 
P
L
 
W
L
 
L
M
 
T
A
 
A
A
 
V
A
 
G
E
 
E
I
 
V
C
 
L
A
 
K
G
 
G
T
 
S
A
 
P
V
 
V
R
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
A
Q
 
Q
D
 
D
C
 
V
H
 
S
N
 
S
E
 
E
P
 
K
S
 
K
G
 
G
M
 
A
H
 
F
T
 
T
G
 
G
D
 
E
L
 
V
S
 
S
A
 
P
E
 
A
M
 
M
L
 
L
A
 
L
D
 
E
A
 
T
G
 
G
A
 
C
A
 
K
Y
 
Y
V
 
A
I
 
L
L
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
A
 
H
E
 
I
H
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
S
S
 
E
E
 
T
E
 
F
V
 
I
R
 
N
I
 
H
K
 
K
A
 
V
H
 
H
A
 
T
A
 
A
L
 
L
R
 
E
A
 
E
G
 
G
L
 
L
M
 
S
P
 
V
I
 
V
I
 
L
C
 
C
V
 
M
G
 
G
E
 
E
T
 
T
R
 
L
A
 
A
E
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
R
G
 
G
E
 
L
A
 
Q
L
 
E
A
 
R
L
 
V
V
 
F
G
 
Q
A
 
R
Q
 
Q
L
 
V
K
 
Y
A
 
A
S
 
A
-
 
C
-
 
A
-
 
G
I
 
L
P
 
T
P
 
D
H
 
E
P
 
Q
G
 
F
P
 
G
G
 
R
L
 
I
V
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
I
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
H
 
K
T
 
V
P
 
A
T
 
T
P
 
P
T
 
E
E
 
Q
V
 
A
A
 
Q
E
 
E
M
 
A
H
 
H
T
 
A
F
 
F
I
 
V
R
 
R
S
 
S
E
 
K
L
 
L
G
 
R
I
 
L
G
 
L
L
 
Y
G
 
G
V
 
D
G
 
K
-
 
I
G
 
A
T
 
D
K
 
S
V
 
T
R
 
P
L
 
I
L
 
V
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
R
 
T
S
 
P
E
 
D
N
 
N
V
 
T
K
 
V
E
 
G
W
 
L
V
 
M
A
 
S
I
 
Q
D
 
P
N
 
D
V
 
V
N
 
D
G
 
G
V
 
A
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
S
 
A
A
 
D
D
 
S
F
 
F
M
 
L
Q
 
A
I
 
I
V
 
V
K
 
K
A
 
A

P00942 Triosephosphate isomerase; TIM; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (Baker's yeast) (see 2 papers)
38% identity, 96% coverage: 8:247/249 of query aligns to 6:246/248 of P00942

query
sites
P00942
L
 
F
V
 
V
A
 
G
G
 
G
N
|
N
W
 
F
K
|
K
M
 
L
N
 
N
G
 
G
L
 
S
R
 
K
R
 
Q
D
 
S
L
 
I
D
 
K
E
 
E
I
 
I
R
 
V
A
 
E
I
 
R
A
 
L
G
 
N
A
 
T
S
 
A
A
 
S
H
 
I
L
 
P
P
 
E
R
 
N
P
 
V
E
 
E
I
 
V
L
 
V
I
 
I
C
 
C
P
 
P
P
 
P
A
 
A
T
 
T
L
 
Y
L
 
L
M
 
D
A
 
Y
A
 
S
A
 
V
E
 
S
I
 
L
C
 
V
A
 
K
G
 
K
T
 
P
A
 
Q
V
 
V
R
 
T
L
 
V
G
 
G
G
 
A
Q
 
Q
D
 
N
C
 
A
H
 
Y
N
 
L
E
 
K
P
 
A
S
 
S
G
 
G
M
 
A
H
 
F
T
 
T
G
 
G
D
 
E
L
 
N
S
 
S
A
 
V
E
 
D
M
 
Q
L
 
I
A
 
K
D
 
D
A
 
V
G
 
G
A
 
A
A
 
K
Y
 
W
V
 
V
I
 
I
L
 
L
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
A
 
S
E
 
Y
H
 
F
G
 
H
E
 
E
T
 
D
S
 
D
E
 
K
E
 
F
V
 
I
R
 
A
I
 
D
K
 
K
A
 
T
H
 
K
A
 
F
A
 
A
L
 
L
R
 
G
A
 
Q
G
 
G
L
 
V
M
 
G
P
 
V
I
 
I
I
 
L
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
R
 
L
A
 
E
E
 
E
R
 
K
E
 
K
A
 
A
G
 
G
E
 
K
A
 
T
L
 
L
A
 
D
L
 
V
V
 
V
G
 
E
A
 
R
Q
 
Q
L
 
L
K
 
N
A
 
A
S
 
V
I
 
L
P
 
E
P
 
E
-
 
V
H
 
K
P
 
D
G
 
W
P
 
T
G
 
N
L
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
I
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
H
 
L
T
 
A
P
 
A
T
 
T
P
 
P
T
 
E
E
 
D
V
 
A
A
 
Q
E
 
D
M
 
I
H
 
H
T
 
A
F
 
S
I
 
I
R
 
R
S
 
K
E
 
F
L
 
L
G
 
A
I
 
S
G
 
K
L
 
L
G
 
G
-
 
D
V
 
K
G
 
A
G
 
A
T
 
S
K
 
E
V
 
L
R
 
R
L
 
I
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
 
S
V
 
A
R
 
N
S
 
G
E
 
S
N
 
N
V
 
A
K
 
V
E
 
T
W
 
F
V
 
K
A
 
D
I
 
K
D
 
A
N
 
D
V
 
V
N
 
D
G
 
G
V
 
F
L
 
L
V
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
S
 
-
A
 
P
D
 
E
F
 
F
M
 
V
Q
 
D
I
 
I
V
 
I
K
 
N
A
 
S

Sites not aligning to the query:

3ypiA Electrophilic catalysis in triosephosphase isomerase: the role of histidine-95 (see paper)
38% identity, 96% coverage: 8:247/249 of query aligns to 5:245/247 of 3ypiA

query
sites
3ypiA
L
 
F
V
 
V
A
 
G
G
 
G
N
|
N
W
 
F
K
|
K
M
 
L
N
 
N
G
 
G
L
 
S
R
 
K
R
 
Q
D
 
S
L
 
I
D
 
K
E
 
E
I
 
I
R
 
V
A
 
E
I
 
R
A
 
L
G
 
N
A
 
T
S
 
A
A
 
S
H
 
I
L
 
P
P
 
E
R
 
N
P
 
V
E
 
E
I
 
V
L
 
V
I
 
I
C
 
C
P
 
P
P
 
P
A
 
A
T
 
T
L
 
Y
L
 
L
M
 
D
A
 
Y
A
 
S
A
 
V
E
 
S
I
 
L
C
 
V
A
 
K
G
 
K
T
 
P
A
 
Q
V
 
V
R
 
T
L
 
V
G
 
G
G
 
A
Q
 
Q
D
 
N
C
 
A
H
 
Y
N
 
L
E
 
K
P
 
A
S
 
S
G
 
G
M
 
A
H
 
F
T
 
T
G
 
G
D
 
E
L
 
N
S
 
S
A
 
V
E
 
D
M
 
Q
L
 
I
A
 
K
D
 
D
A
 
V
G
 
G
A
 
A
A
 
K
Y
 
W
V
 
V
I
 
I
L
 
L
G
 
G
H
x
Q
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
A
 
S
E
 
Y
H
 
F
G
 
H
E
 
E
T
 
D
S
 
D
E
 
K
E
 
F
V
 
I
R
 
A
I
 
D
K
 
K
A
 
T
H
 
K
A
 
F
A
 
A
L
 
L
R
 
G
A
 
Q
G
 
G
L
 
V
M
 
G
P
 
V
I
 
I
I
 
L
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
R
 
L
A
 
E
E
 
E
R
 
K
E
 
K
A
 
A
G
 
G
E
 
K
A
 
T
L
 
L
A
 
D
L
 
V
V
 
V
G
 
E
A
 
R
Q
 
Q
L
 
L
K
 
N
A
 
A
S
 
V
I
 
L
P
 
E
P
 
E
-
 
V
H
 
K
P
 
D
G
 
W
P
 
T
G
 
N
L
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
I
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
H
 
L
T
 
A
P
 
A
T
 
T
P
 
P
T
 
E
E
 
D
V
 
A
A
 
Q
E
 
D
M
 
I
H
 
H
T
 
A
F
 
S
I
 
I
R
 
R
S
 
K
E
 
F
L
 
L
G
 
A
I
 
S
G
 
K
L
 
L
G
 
G
-
 
D
V
 
K
G
 
A
G
 
A
T
 
S
K
 
E
V
 
L
R
 
R
L
 
I
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
A
R
 
N
S
 
G
E
 
S
N
 
N
V
 
A
K
 
V
E
 
T
W
 
F
V
 
K
A
 
D
I
 
K
D
 
A
N
 
D
V
 
V
N
 
D
G
 
G
V
 
F
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
S
 
-
A
 
P
D
 
E
F
 
F
M
 
V
Q
 
D
I
 
I
V
 
I
K
 
N
A
 
S

4y90A Crystal structure of triosephosphate isomerase from deinococcus radiodurans (see paper)
44% identity, 97% coverage: 8:249/249 of query aligns to 4:244/244 of 4y90A

query
sites
4y90A
L
 
L
V
 
L
A
 
A
G
 
L
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
G
 
-
L
 
-
R
 
-
R
 
K
D
 
T
L
 
P
D
 
T
E
 
E
I
 
A
R
 
R
A
 
S
I
 
W
A
 
A
G
 
E
A
 
E
S
 
L
A
 
T
H
 
T
L
 
K
P
 
Y
R
 
A
P
 
P
-
 
A
-
 
E
-
 
G
-
 
V
E
 
D
I
 
L
L
 
A
I
 
V
C
 
L
P
 
A
P
 
P
A
 
A
T
 
L
L
 
D
L
 
L
M
 
S
A
 
A
-
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
N
I
 
L
C
 
P
A
 
A
G
 
G
T
 
I
A
 
A
V
 
-
R
 
-
L
 
F
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
D
 
D
C
 
V
H
 
S
N
 
A
E
 
H
P
 
E
S
 
S
G
 
G
M
 
A
H
 
Y
T
 
T
G
 
G
D
 
E
L
 
I
S
 
S
A
 
A
E
 
A
M
 
M
L
 
L
A
 
K
D
 
D
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
S
Y
 
C
V
 
V
I
 
V
L
 
V
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
A
 
E
E
 
Y
H
 
H
G
 
D
E
 
E
T
 
S
S
 
D
E
 
A
E
 
T
V
 
V
R
 
A
I
 
A
K
 
K
A
 
A
H
 
R
A
 
Q
A
 
A
L
 
Q
R
 
A
A
 
N
G
 
G
L
 
L
M
 
L
P
 
P
I
 
I
I
 
V
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
N
R
 
L
A
 
D
E
 
V
R
 
R
E
 
E
A
 
R
G
 
G
E
 
E
A
 
H
L
 
V
A
 
P
L
 
Q
V
 
T
G
 
L
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
K
 
R
A
 
G
S
 
S
I
 
L
P
 
-
P
 
E
H
 
G
P
 
V
G
 
G
P
 
A
G
 
D
L
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
I
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
H
 
K
T
 
T
P
 
A
T
 
T
P
 
A
T
 
D
E
 
D
V
 
A
A
 
E
E
 
E
M
 
L
H
 
A
T
 
A
F
 
A
I
 
I
R
 
R
S
 
G
E
 
A
L
 
L
G
 
R
I
 
E
G
 
Q
L
 
Y
G
 
G
V
 
A
G
 
R
G
 
A
T
 
E
K
 
G
V
 
I
R
 
R
L
 
V
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
R
 
K
S
 
P
E
 
E
N
 
N
V
 
I
K
 
A
E
 
E
W
 
I
V
 
C
A
 
G
I
 
K
D
 
P
N
 
N
V
 
V
N
 
N
G
 
G
V
 
A
L
|
L
V
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
S
 
V
A
 
P
D
 
D
F
 
V
M
 
L
Q
 
G
I
 
M
V
 
L
K
 
D
A
 
A
F
 
L
Q
 
R

Query Sequence

>WP_020175713.1 NCBI__GCF_000385335.1:WP_020175713.1
MTDGLVPLVAGNWKMNGLRRDLDEIRAIAGASAHLPRPEILICPPATLLMAAAEICAGTA
VRLGGQDCHNEPSGMHTGDLSAEMLADAGAAYVILGHSERRAEHGETSEEVRIKAHAALR
AGLMPIICVGETRAEREAGEALALVGAQLKASIPPHPGPGLVVAYEPIWAIGTGHTPTPT
EVAEMHTFIRSELGIGLGVGGTKVRLLYGGSVRSENVKEWVAIDNVNGVLVGGASLKSAD
FMQIVKAFQ

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory